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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                     AAAGACGAATAATAGTTTGTTTTAATATGT-----------------------CAAATATA-CA-G-A----------------------AAC-AA----TT------TTAAGCAA----------AGAGAGCTATCCTGTTT--ACATCTTT-----ATCTCTTCTTCAATAAAAAA--AACAAAACAATAAAGAAATCATAAATTTTAGTAAATTT---AT-TT--TGGAGGCGAGTACGAGTAAAAGACGTTCCATAATAAACAACC--------------AATAAGTGTTCATCCTCCTTTG-CTATTTAAAA----CTTA-ATAATCAAGATAAAACAT-ATCAGGAA-T-ACTTTCTTACTCGAAAAAT-GTGATTGCGAGCTATGTAG---ATTTTAAACTTTTGTAAT-TAT-TGTTAATACTTTTGTATTGATTTGTCACGTA-AATG--T------CAT------CG----TATGT---TTTACATGA-TGAGAAA---TAGTA---GT---TTAAGTGAATAAAATATCGTCT
gi|4                          :                                                                                                                                      AAGACAAATATCATTTTGTTTTTATATGC-----------------------CAAACATA-TA-G-AGAAAATAGAAGTAAATATATTAAAC-GA----TT------TTATAAAC----------AGAGACTTAACATGTGG--ATATTTTTTTTTTATCTCCTCTTCAATCAAGAA--G------CAATGAATTAATCATAAATTATAGTAAATTT---CT-TT--CAGAAGC-ATTATG--TAAAAGACGTTCCATAATAAACAACC--------------AATAAGTGTTCATCCTCTTTTG-ATATT---GATTTTTTTATATAATTAATATAAAACA
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Reference ( family-718 )      :                                                                        NAAGACGAATANCATTTTGTTTTAATATGTCAAATATA-CG-----------G----------------------AAACAA-TTTTANACACAGAGACCTAACATGTTGACATTTTTT-TT--ATCTCTTCTTCAATCAAA----CAAA-CAATAAAGAAATCATAAATTTTAGTAAATTT----CTTTCAG--AAGC-ATTATG--TAAAAGACGTTCC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCCTTTGATATTGAANATTT--TATAATTAATATAGAACATAATAAAAAT-A-CCTTCTTACTCGAAAAAT-GTGATTGAGAGCTATGTAG---ATTTTGAACTTTTGTAATTATTGTTAAAACNTGTGCATTGATTTGTCACGTA-AATG--T-----TAT-------TG----TATGT---TTTATATGA-TGAGAAA---C---AGT---A---GT---TTAAACCA-ATAAAATNTCGTCT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                       AAATTT----CTTTCAG--AAGC-ATTATG--TAAAAGACGATCC---TTTA-----------TTAAAAACCAATAAGTGCTCTTCCTCCTTTGATATGGAATATAT--TATAACTAATATGGAACATGATTAAAATAA-CCTTCTT---------AT-GTGATTGATGGCTATTTAGATTATTTTAAACGTTTGTAATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaatatttataaaggcatcaAATAAAGGGTATATTTAAACT-G-CCTACTTACTCGAGAAAC-ATT-TTGCGAA-TATTTAA---ATTGGGGAAT---GTA--TAT-ATTAAAACGTTTACATTGATTT-TCACGTA-AATG--------CATAAAACA-TG----TATGTATGTTTGTATGA-T--AAAA---T---GGT---AACTGT---TTAAACTA-ACGAAATTTCTTCTg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACTT--TATAAT-AATACAGAACATA------------CTTATTACTCGTATAATAGCG-TTGATAGCTCTTTCG---ATTTTAAACTTTT-CAA--ATTGTTAAAACTGTTGCATTGCTGTGTTACGTA-AACG--TAAAAGTAT-------TG----TATTT---TTtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ataCTATGTGG---ATTTTAAACTGGTGT---TATTGTTAAACCTTGTGCATTGATTTGTCACGTA-AATGTAT-----TGTACATGTATG----TATGT---TTTGTACGA-TGAAAAA---C---AGT---A---ATAAATTAAATCA-ATAAAATGTTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aTGTGCAG---ATTTTGAA---TTGTTATCCTTGTTAAAACATTTGCATTGATTTATCAAGTATAA----C-----TAT-------TG----T---T---TTTATAT-A-TGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aCATTGATTTGTTACGTA-AATG--------TAT-------TGTATATATGT---TTTATATAATTGGGAAACTGC---AAT---A---GT---TTAAACCA-GTAAAAtttata
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gi|3                          : aaaacaggagaaacacattaaacttaatatatttttttcagtattctttattgccacttaggtaacatcacatataaatacgtgttgaaacaacatgaggcataaacgtcacaaacgtatttgtatttttttgtaataatgacattgAACGA-TCTTATACACAGAAACATAACATATGGAG---TTTT-TC--ATCTCTTCTCCAATTAA-----CAAA-CAATAAAGAAATAATAACTTTTAGTACATTT----CTTTTA--------------------AGACGTTCC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCCATTGATATTGATTTTTT--TATAAT-AACATAGGACGT---------------TCTGACTCGAAA--T-GTGATTAAGAGCCATGTTG---ATTTTGAACTTTT----TGATTGTTAAAACCTGTACATTGATTTATCAC---------------------------G----TATGT---TTTATATGA-T-----A---C---AGT--------T---TT---TCA-ATAAAATGT
gi|4                          :                               tgaaaacatacagagaaataagaagtaaatatattaatgtttAAGACAAATATCATTTTGTTTTTATATGCCAAACATA-TA-----------GAGAAAATAGAAGTAAATATATTAAACGA-TTTTATAAACAGAGACTTAACATGTGGATATTTTTT-TTTTATCTCCTCTTCAATCAAG-----AAG-CAATGAATTAATCATAAATTATAGTAAATTT----CTTTCAG--AAGC-ATTATG--TAAAAGACGTTCC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCTTTTGATATTGATTTTTTTATATAATTAATATAAAACAAAATAAAATT-A-CCGT-TTACTtttt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                      taaattcataatagtatgtttttccttttacattgacactgAATTGAGAAAACATAAATATTTGTAAATTT----CTTTCAG--AAAC-ATTTTG--TAAAAGACGTTCCTTAATAAACAACTTAGAATAAACAACAAATAAGTGCTCTTCCT---------TTGAACATTT--TATAATTAATAAAGAACATAATGAAAAC-AACCTTCTTA---------T-GTGTTTA-----TGTGTAG---ATTTTGATCTGTTGTAATT---GTTAAAATGTGTGCATTGCTTTTTCACGTA-AATG--T-----T-T-------TGTATATATGT---TTTATATGA-TGAGAAA---C---TGTAAAA---GA---TTAACTCATTTCAAATGTCTTCTt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                         aacatattTTAAGTAAATTT----CTTCCAG--AAGC-GTTTTA--TAAAAGACTTTCT---ATAA-----------TAAA--------AAGTGTGAATTCTCCTTGGACA------ATTT--TGTACTTAATATAGAACATAATAAAATT-A-CCTTTTTACTCGAAAAAT-GTGATCGAGA--T-TGTAG---ATTTTGAACTTTCGTA---ATTGTTAAAACTTGTGCATTGATTTGTCACGCA-AATG--------TAT-------TG----TATATATGTTAATATGA-TGTGAAA---CTGTAAT---A---GT---TTAAACGA-ATAACATTTC
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                       aaacatatagagaaataagaagtAATCAA-----CAAA-CAAAAAAGAAATCATAAATTTAAGTAAATTC----CTTTCAG--AAGC-ATTATG--TAAAGGACGTTTC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCTTTTGATATTGATATTTT--TGTAATTGAGATAGAATATAAC-AAAAT-A-AATTCTTACTCCAAAAAT-GTGATTGAGAGCGATGTAT---ATGTTGAATATTTGTA---ATTGTTAACATTTGTGCATTttatgttatgata
gi|9                          :                                                                             aaAGTACCATTTTGTTTTAATATGTCAAACATATCGTGAAACAAGAAGTTAATATATT------------AAACGA-TTTTATACTCAGAGAC-----ATGTTGACATTTTT------ATCTCTTTTCCAATCAA-----CACA-CAATAAGGAAATCATAAATTTTAGTAAATTC----CTTTCAG--AAGC-ATTATG--TAAAAGACGCTCC---AT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): GAATAACGAAAAACACACTATGCTATATGAATATCTATTACAATAGCAGT






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Reference ( family-718 )      :                                                                                                                     NAAGACGAATANCATTTTGTTTTAATATGTCAAACATACGGAGAAAATAGAAGTAAATATATTAA------ACGA-TTTTATACACAGAGACCTAACATGTNGACATTTT--TT-TTATCTCTTCTTCAATCAA-----CAAA-CAATAAAGAAATCATAAATTTTAGTAAATTT----CTTTC--AGAAGC-ATTATG--TAAAAGACGTTCC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCCTTTGATATTGAANATTT--TATAATTAATATAGAACATAA-T-AAAANTACCTTCTTACTCGAAAAAT-GTGATTGAGAGCTATGTAG---ATTTTGAACTTTTGTAATTATTGTTAAAACNTGTGCATTGATTTGTCACGTA-AATG--T-----TAT-------TG----TATGT---TTTATATGA-TGAGAAA---C---AGT---A---GT---TTAAACCA-ATAAAATGTCGTCT
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Reference ( family-718 )      :                                                                                                                     NAAGACGAATANCATTTTGTTTTAATATGTCAAACATACAGAGAAATAAGAAGTAAATATATTAA------ACGA-TTTTATACACAGAGACCTAACATGTNGACATTTT--TT-TTATCTCTTCTTCAATCAA-----CAAA-CAATAAAGAAATCATAAATTTTAGTAAATTT----CTTTC--AGAAGC-ATTATG--TAAAAGACGTTCC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCCTTTGATATTGAANATTT--TATAATTAATATAGAACATAA-T-AAAATTACCTTCTTACTCGAAAAAT-GTGATTGAGAGCTATGTAG---ATT-TTGAACTTTTGTAATTATTGTTAAAACNTGTGCATTGATTTGTCACGTA-AATG--T-----TAT-------TG----TATGT---TTTATATGA-TGAGAAA---C---AGT---A---GT---TTAAACCA-ATAAAATGTCGTCT
gi|1                          :                                                                                                                      AAGACGAATAATAGTTTGTTTTAATATGTCAAATATACAGA----------------------A------ACAA-TTTTAAGCAAAGAGAGCTATCCTGTTTACATCTT--T----ATCTCTTCTTCAATAAAAAAAACAAAACAATAAAGAAATCATAAATTTTAGTAAATTT----ATTTT--GGAGGCGAGTACGAGTAAAAGACGTTCC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCCTTTGCTATTTAAAACTT--AATAATCAAGATAAAACATAT-C-AGGAATACTTTCTTACTCGAAAAAT-GTGATTGCGAGCTATGTAG---ATT-TTAAACTTTTGTAATTATTGTTAATACTTTTGTATTGATTTGTCACGTA-AATG--T-----CAT-------CG----TATGT---TTTACATGA-TGAGAAA---T---AGT---A---GT---TTAAGTGA-ATAAAATATCGTCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aCC---ATAA-----------TATACAACCAATAAGTGTGCATCCTACTTTGATATTG-ATTTTT--TATAATTAAAATAGATTATAA---AAAATTACCTTCTTACTGGAAAAGT-GTGATTGAGAGC-----------TT-TTG-----------TTATTGTTAAAATGTGTGCATTGATATGTCACATC-AATGTAT-----TATA------TA----TATGT---TTTATATGA-TGAGAAA---C---TGT---A---AT---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATTT----CTTTC--AGAAGC-ATTATG--TAAAAGACGATCC---TTTA-----------TTAAAAACCAATAAGTGCTCTTCCTCCTTTGATATGGAATATAT--TATAACTAATATGGAACATGATT-AAAATAACCTTCTT---------AT-GTGATTGATGGCTATTTAGATTATT-TTAAACGTTTGTAATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaatatttataaaggcatcaAATAAAGGGTATAT-T-TAAACTGCCTACTTACTCGAGAAAC-ATT-TTGCGAA-TATTTAA---ATTGGGGAA----TGTA--TA-TATTAAAACGTTTACATTGATTT-TCACGTA-AATG--------CATAAAACA-TG----TATGTATGTTTGTATGA-T--AAAA---T---GGT---AACTGT---TTAAACTA-ACGAAATTTCTTCTg
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTGTGCAG---ATT-TTGAA---TTGTTATCCTTGTTAAAACATTTGCATTGATTTATCAAGTATAA----C-----TAT-------TG----T---T---TTTATAT-A-TGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aCATTGATTTGTTACGTA-AATG--------TAT-------TGTATATATGT---TTTATATAATTGGGAAACTGC---AAT---A---GT---TTAAACCA-GTAAAAtttata
gi|2                          :                                                                                                                      AAGACGAATAGCATTTTGTTTTAATATGTGAATCATACAGAGAAATAAGAAGTAAATATATTAA------ACGAGTTTCATACACAGAAACCTAACATTTGGATATTTT--TT----TCTCTTTTTCAATCAA-----C--A-CAATAAACAAATAATAAA-TTTAGTAAATTTAAAATATTT--AAA----ATTATG--TGAAAGACGTTCC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                             taaattcataatagtatgtttttccttttacattgacactgAATTGAGAAAACATAAATATTTGTAAATTT----CTTTC--AGAAAC-ATTTTG--TAAAAGACGTTCCTTAATAAACAACTTAGAATAAACAACAAATAAGTGCTCTTCCT---------TTGAACATTT--TATAATTAATAAAGAACATAA-TGAAAACAACCTTCTTA---------T-GTGTTTA-----TGTGTAG---ATT-TTGATCTGTTGTAATT---GTTAAAATGTGTGCATTGCTTTTTCACGTA-AATG--T-----T-T-------TGTATATATGT---TTTATATGA-TGAGAAA---C---TGTAAAA---GA---TTAACTCATTTCAAATGTCTTCTt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                aacatattTTAAGTAAATTT----CTTCC--AGAAGC-GTTTTA--TAAAAGACTTTCT---ATAA-----------TAAA--------AAGTGTGAATTCTCCTTGGACA------ATTT--TGTACTTAATATAGAACATAA-T-AAAATTACCTTTTTACTCGAAAAAT-GTGATCGAGA--T-TGTAG---ATT-TTGAACTTTCGTA---ATTGTTAAAACTTGTGCATTGATTTGTCACGCA-AATG--------TAT-------TG----TATATATGTTAATATGA-TGTGAAA---CTGTAAT---A---GT---TTAAACGA-ATAACATTTC
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                     AATCAA-----CAAA-CAAAAAAGAAATCATAAATTTAAGTAAATTC----CTTTC--AGAAGC-ATTATG--TAAAGGACGTTTC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCTTTTGATATTGATATTTT--TGTAATTGAGATAGAATATAA-C-AAAA-TAAATTCTTACTCCAAAAAT-GTGATTGAGAGCGATGTAT---ATG-TTGAATATTTGTA---ATTGTTAACATTTGTGCATTttatgttatgata
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Reference ( family-718 )      :                                                                                                                     NAAGACGAATANCATTTTGTTTTAATATGTCAAACATACAGAGAAATAAGAAGTAAATATATTAA------ACGA-TTTTATACACAGAGACCTAACATGTNGACATTTT--TT-TTATCTCTTCTTCAATCAA-----CAAA-CAATAAAGAAATCATAAATTTTAGTAAATTT----CTTTC--AGAAGC-ATTATG--TAAAAGACGTTCC---ATAA-----------TAAACAACCAATAAGTGTTCATCCTCCTTTGATATTGAANATTT--TATAATTAATATAGAACATAA-T-AAAATTACCTTCTTACTCGAAAAAT-GTGATTGAGAGCTATGTAG---ATT-TTGAACTTTTGT-ATTATTGTTAAAACNTGTGCATTGATTTGTCACGTA-AAT------GT-AT------TG----TATGTATGTTTTATATGA-TGAGAAA---CAGTAA---T---TTAAACCA-ATAAAATGTCGTCT
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): GAATAACGAAAAACACACTATGCTATATGAATATCTATTACAATAGCAGT