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gi|14                         :                                                                                       tttattttggaAACAG-A-GT-T-GC-----TAT-CAAAGA---GAAAT-G-TGT----A-C--A-T-GATACACG--TGACTGACACGTGA-CTG------AAG--A----------CTGTAGATTA-GTT---TA------CT----TCCAATT--AC----TC--------TCA--C--AAG--CGA-TT-----A---AC-CG-A---T--TCAGACCAGCT-TA--AA------AAAG----T-T-T--AT-TGTACA---TGTT-ATAT-G---CATTGTA--G-T--GT----TTCAAACA-CTGT---T-TCAGAT-AA----CTG---ACTG--GTAG----C--CAG-A--AC----TGA------TTT----------TG--ACATTGTTTT--G--T-G-------------TAA--CTG---------ACC-----------G----T---TTTCCACTAGCTTA-------TT-------ACC---GAT-A---C-----T-----T---G--T-----GTGA--A-----AA-----TG-----AA----G----C---TT--TGTAA---------C--tcta
gi|32                         :                                                                                      aatctatttctactgaatgtaagatcc-----TAT-GAAATG---GGAAT-A-TGT----A-C--A-T-G------G--TG-----C-TCTAGCCTT------ATG--T----------CAGTAGAACA-GTT---TG------CC----TTTATAT--TT----GT--------TTT--C--GCA--CGAGTT-----A---GG-TATA---T--TCTGATT---------AG------CTGA----TAT-TATAT-TACATG---T--T-ATAT-G---CGA--TA--T-G--ACC-A-TTGAAA-A-AAGT---T-
gi|25                         :                                                                                                                 -----TAT-CAGAGG---GAAAT-G-T-T----A-C--A-T-G------G--TT-----CACATTA-CTG------GAG--A-----------------GCA-GTT---TA------CT----TTGATCT--AT----TC--------TCA--C--ATG--CCA-TT-----G---GC-
gi|16                         :                                                                                                         tcaaacagtgttgaAT-AAAAAC-----AAC-G-CGTTATCA-C--A-A-G------G---A-----CACGTGA-TTG------ACG--A----------CAGTAGAACT-GTT---AA------TG----TTTACCT--AG----TC--------TAT--C--ACG--CGA-TT-----G---AC-CA-A---T--CCAGATTG-TC-TG--AA---------A----T-----AATGTACAAG---TAAA-ATAT-G---T----T---T-G--GTC-ATTTGAGA-A-T-GC---T-TCAAA----------------TG--TCTG----A--CG-----GC-------------TCG-----A-AATTA--AT-T------------------------TTTTAA--CT-----------------------------G---TTTCCACTGAC-TT-------AT------CATC---AAC-A---A-----T-----C---A--T-----GGTGTTA-----GG-----TA-----TA----G----C---TT--GGTGA--------------CA---TGGA--AA-CA----atgaattgggttacctgatataatcattagcacaaaatgtaatatgcaccgtggccgtggctacaaacttctgattgattgacagtaagaac
gi|41                         :                                                                                       agtatgagaagttaagaaatcttcataaaaggctaaAGAGG---GAAAT-T-TAT----A-C--A-T-G------G--TG-----CACGTGA-CTG------AAG--A----------CAGTAAAGC--------TG------TT----TTCA-----AT----TC--------Tgagaaa
gi|23                         :                                                                                                                     aatgacAAAAG-----AAT-GCTGTTATCA-C--A-T-G------A--TA-----CACATGA--TG--------G--G----------CAGTACAACT-GTT---TG------GT----TTTACCT--------TA--------TCT--T--GTAGATGA-TT-----G---GC-GA-A---C--TGAGATTT-CCGGA--AA------C--A----T-G-TA---ATG---A---TAAT-AT-T-G---C----------G--GTG-A-TGGAAA-A-TTGC---T-TCTAAT-GA----TTG---ATTG--aatgttttccct
gi|8                          :                                                                                                 tcttgcataccacatttacttaagaatAAAGTGAGAAAT-A-TGT----A-C--A-TTG------G--TA-----CACATGA-CTG------ACA--A----------CAGTAGAGCT-GTT---TG------TT----TTTACCT--GC----CCA-------CCTAAC--ATG--TGA-TT-----G---GC-TG-A---T--ACAGGT--------------------------T-T-TA---ATGAACA---TGGT-ATGTAG---G----CACTGTG--GTT-A-ATAAAA-A-TTGC---T-TCAAAT-GA----CTG---ACTG--AGAGCATTG--TAA-A--GCTAGTT-A------TTT-----ACAAG-A--A----GGTTT-CA--TCA---ATA--------GA--CTG--ATT--C-CCATTGGCTAGGCCG----G---GTACCATTGGC-TA-------AT------CATT---ACC-A---A-----T-----C---A--T-----G-----A-----TGTCATATG-----GG----A----T---TT--TGTGA---------C--A-TG---TG----AA-Cacagctagaagttt
gi|4                          :                                         tagttttctctggagtaatacatctgagcactgaagtgtaggtggaataattactggagtagctccctcatcaccagtcacaatcAA---GAAAT-A-TTT----A-C--A-T-G------G--TA------ATGTGG-CTG------CCA--A----------CAGTAGACCC-GTT---TA------TC----TTTAACT--GT----TC--------TTA--C--ATA--TGC-CT-----C---TC-TA-A---T--TCAGATTA-AC-TG--AAATA---TTGG----T-C-TAA-TGTGTATT---TACT-ATG------------------------A-TTGAAA-A-CTGC---A-TCAAAT-GA----TTG---AGTG--ACAG----A--TAA-A---C----T-T------TTTTTTTTA-A--TACCAT-TTGTCT--CA--T-----ATAGAATTTTTGA--TTG--ATT--G-GCC-----------A----G---TTTCCATTGGC-TA-------TT------CATG---ACA-A---A-----T-----C---A--TGCCAAG-----A-----GG-----TG-----GA----G----C---TT--AGTGATATTTTAGTT--A-CA---TGTTTAAA-CT----ATCAAAAC-----AA--AATGG-C--Cta
gi|29                         :                                                                                                                                ---GAAAT-G-TGA----G-C--A-T-G------G--TG-----CATGTGA-CTG------GCA--A----------TAGTAGAGTA-GTT---TG------TT----TTTGCCT--GT----TC--------TTA--C--ATA--TTA-TT-----G---GC-CA-A---T--TCAGATTA-GC-TA--AA------ATAA----T-TATAAgatacgctggtttcttttatactgttagacttcttaagaaatgctgtgagcatttaaaactttaaatcaatatgcagggtgtaaataaaggga
gi|22                         :                                                                              atcttgagtaatgcatgtaggtcatggtatatcagacagtgttgggatcatataAAATTA-TGT----A-C--A-C-G------A--TG-----CTCTTGA-CT-----------------------CTGTATCGCCTGTTCTGTG------TT----TTTACAT--AT----TC--------ATA--C--ACA--CGA-TT-----T---GC-CT-A---T--ATAcaaacatt
gi|5                          :                                                                                                                          caaacatgtaataT-G-TAT----ATC--A-T-G------G--TG-----CACACAA-CTT------GTG--A----------CAGTAGAGCT-GTT---TG------CT----TTGAACT--AA----AC--------TTA--C--ACT--CGA-TT-----G---GT-CA-T---T--TCAGAC--------------------------------AAT-TGTACA---CAGT---------------------G--GTC-A-TTAAAA-A-CTGC---T-TCAAAT-GA----CTG---AT------------A--TAC-A--AC----T-AGAATGTTTT-----A-AAGTC--A--TTGTTTA-CA--C-----ATA----TTTTGA--CTA--ATG------A-----------GTC--A---TTTTTGCT--C-TA-------AT------CATC----AT-G---A-----T---------G--T-----G-----A-----GA-----CA-----AC----G----T---TT--TGTGG---------C--T-TG---TG----AA-AT----ATCAAAACAATAGGC--AAAGGAT--CAG-A-----ACAGC-----------TGA-AAA--AAATG--C------T--GT--TT-T-T---CTattttaatgtacattgtacgtgaccgtaatatgtgtcagaagattgattcacagctagttggttacacaatggtttcactcagaccaggattccaatggtt
gi|12                         :                                          tagtgttccttttattaatgctctgagcatgagagaaggtggagtattttactatgccttgcattatctccaatttacaataagttaaaacaattctgatattattt--A-T-G------C--TG-----CATGCAA-CTG------ATG--A----------CAGTAAGGCT-GTT---TG------TT----TTTAC-C--AA----TC--------TCG--CAAGTG--AGA-TT-----T---GCGCA-GATTT--GCAGA-AA-C------AA------CCG-----T-----AATGTACAAA---TGAA-ATAT-GACAC----CG--T-G--GTC-A-TTGAAA-ACTGCT---TATTACAT-AC----TGACATATTA--ACAG----C--TAA-A--AC------A------TTTA----A-AAGCC--AG-TTGCTTA-CC--TCT---ATG----TTTTGA--CTG--ATAGGC-ACA--------------------TTTTCATAGGC-TG-------AT------CAT-----ACTA---A-----C-----T---A--T-----G-----T-----TG-----CG-----AG----G----C---
gi|9                          :                                                                      gattcagtttgtaaatgtttactacacccaatataataagttagagaatgtccatatacgataataacactgatatcagaggcaaa------G--TT-----CACATGA-CTA------ATG--A----------CAGTATATAA-GTT---TG------CT----ATTACTT--AT----TC--------ACA--A--TTA--CAA-TTT----G---GT-GA-A---T---CAGATTA-GG-AG--AAATAATTCTGA----T-T---AACATGCAT-------C-ATGC-A---C----CA--T-G--GTC-A-TTAAAA-A-CTG----------AC-AG----TTA---A------------------A-A--CT----T-T------TTT-----A-AAG-A--CT-GTATCTGACA--T-G---ATG----TATGAA--CTG--ATA--C-GCT-----------G----G---TTTCCATTGAC-TA----------------ATT---GCC-A---G-----T-----C---A--T-----GATACAA-----GG-----CG-----GA----G----C---TG--TGT--------------G-TAAATTG----TC-CA----ATCAAAA-------------GG-T--CAG-A-----CCAGT--------GACTAA-AAGTCA---C--C------A--CA--T--T-T---CTT--T--GAT-TTAATT-TTTTagacat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                         TC---TG------TT----TTCACATCGGC----TT--------TCA--C--ATG--CGA-TT-----C---GA-CG-A---T--CCAGATTA-GC-TG--AA------TTAA----T-T-CCA--ATGTATA---TTTT-ATAT-----------A--T-G--GTA-A-TTGACA-A-CTGT---T-TCAAAT-TG----TT----------TGAC----A--TCA-A--GA----T-C------GTG-----A-TAATC--AT-ATGTTTTACA--C-T---AT-----TTTTGT--C-A--ATG--C-AT------------T----G---TTCTCATTTGCTTA-------TT-------ATT---TAC-ttaaagaaatcatgccaacaaacattcaaaaccttaacttaatatgcaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -T-TAAATACGGATA---TACT-ATAT-G---C----CA--C-ATTTTT-A-TTAAAA-A-CTGC---T-TCAAA----------A---ACTGAATGAA----AACTAA-A--AC----T-A------TTG-----A-AAGTA--AG-TTGCTTA-CA--------ATG----TT-------TG--TCA--G-AGA-----------G----GTCATTTTTATTGAC-TA-------AT------TATT---AAT-A---G-----T-----C---A--T-----G-----A-----AG-----TG-----AGACATG----C---TT--TGTGG---------C--A-TG---TG----GGTTA----CTCAAACA-----G---AAAGG-T--TTG-A-----ATAGT--------G--CAA-TAA--A---A--C------A--CT--CG-T-TTCCCTT--T--GATATCAACT-GTTTAAGAA-ACACCATGG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---ATG----TTTTGA--CAG--ATT--G-GTG-----------GT---A---TTTCCATTGGC-TG-------AT------CATT---ATC-A---A-----T-----A---A--T-----G-----A-----CG-----TG-----AG----G----CAGTTT--TGTCA---------CTTG-CG----G----AC-CA----TTCGAGA------AT--AAGGG-TTGCA--A-----ATGGT--------G--CAA-AAA--A---AACT------AATGT--TA-T-T---CTT--T--GATAactttgaatccctaacttgatacatgtatgtatggtgtagtatttattttattttgaagaaatgtatttacacttgataccttatgga
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aTA----TTTTAAAGCTT--CTA--C-AAC-----------T----G---TTTCCATTAGC-TAATCAAAATT------CATT---ATC-A---A-----T-----C---G--T-----GGCAGGA-----GG-----CA-----GG----A----C---TT--TGCGA---------C--A-TG---CA----AA-TT----ATCAAAA------GCAAAAGGG-T--CAG-T-----ACAAC--------A--CAA-AAA--AG--G--C------T--GC--TT-T-T---CTCTTT--GATACCAATA-TTTTAAGGA-ACACCACAAATATTCActgatgtttaaggaaaagttgtgaaccttcctgacttactggatatgcaaagcgtagactgtatacatgtatatatttctgtgtttaaaaactactg
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtgtatgttatatacaccttgggcattgaaaacctgactctagtgactgactggaagccagaaatatatatacgatcaA--CCG--ATA--G-GCT-----------G----G---TATCCATTGAC-TA-------CTAGTGATCATT---ACC-A---A-----T-----C---A--T-----G-----A--------------------T----G----T---TT--TTTAT---------C--G-------G----AA--A----ATATAAAC-----A---GAGAA-T--CAG-A-----ACAGT--------G--AAA-AAT--A---G--A------A--AC--T--T-T---CTT--C--AATAT-AATT-TTTTAgaaaaag
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11 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|31 ): TGATGCACAATCATTTACAAACATGACAGCATGCAGACATTTGCTTTATAGCATGTTAAAATTCAAAACAAAAGGGTTAAAACAGCGCAAAAGAATTCTGTTTTTTTCTTTGATAACAACTGAAACACTTTCAATATTTGAAACTTTT
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Unaligned ( gi|34 ): GATATCAGACAGACATTTGTGGCATGAAAACATTCAAAACAAACAGTCAAAACCTTGCAAAAAATGTACTTTTCTTATCATACGGACTATCTGGGGAAAGTTGCAAACATGTGAAACTCTACCTTGATATGCAAGGTGCAGTA
Unaligned ( gi|35 ): GGGTTTTAGTGACATTTGAACTTTCGAAACAGAAGGGTCAAAATGATTAAAAAAGTTTTCTTTCTTTCATTCATATCGATCTTTTAAGGAACTTGAATATTCGAAGCTCTCATATGAAATACAGAACA
Unaligned ( gi|36 ): ATTGACAGCTAGGACATTTGAATGCAGTTGCTACAATAGTAACATCTATTGTTTTGACTGGTACCTGGATTTTATAGGCTTATCGTGTCTTAAGGTAGGCCTTTG
Unaligned ( gi|37 ): GGTGAGGTTTTGTGGCATGTGAACATTCCAGATATTAGATTCAAAACAGTACATGAAATTTGTTTTTCTTTAATATTGACTGCTAAATACACGCCAAA
Unaligned ( gi|38 ): AACACGTGGCTGACAAAGTAGAACTGTTCAGTTTCACGCGATTAACCGATTCACATTATAATACATGTATTATGATTGAAACTGCTTCAAA
Unaligned ( gi|39 ): ATGACATGAGAAGGACTTTTGTGACATGAAAAGCTATCGAAACGTGAGATGTCAAACCCGTGCAAAACGAGTTTTTTTTTTATGTAC
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Reference ( family-714 )      :                                                                                       NNTTTCCACTC-T---TTAGATCA----AAACG-A-GC-C-ATTATCAAAG--GG-AAAT-G-T-GT----A-C--A-T-G------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CAGTAGAGCN-GTT---TG------CT-TT--TAC--CT----AT---TC--TCACACGC----------GA---T-T-----G---GC-CGATTCAGAT------TANCTGA---ANTGAT--T----TAAATGTGCATA---TAAT---AT---AT--G----C---A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCTT----C-A-AAT-GATTGATTG--AG--A---TAAA-GC-----T---A------TT-T-AA-AG--T-AA-T-T-G---CT---TNCA-C-----GAT-A----TT------TT-G----ACT------GATAC-GCNGGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--T-----G-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----C---TT--T-GTG-----------AC--G-CG--TGA---A-CA--ATCAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------AACAG-TG-C-GA-AAAA-G--C-----A---G--T--TN---T-TC-T--TC-G---ATA----TCGACTTTTT---A-AGAAACACCGCGGATATTCA
gi|1                          :                                                                                         TTTCCACTT-TATGCTAGA-CA----GAACA-ATGT-A-GATATCAAAG--GG-AAAT-G-T-GG----G-C--A-T-G------GTG-----CACCTGA-CTG----AAGA------------CAGTAGAGCA-GGT---GG------AT-TT--TAC--CT----AT-------TCATA-------------AA---TAT-----G---GT----------T------TAGTTGA---AATCAT--T----GTAATGTAAATG---CAAC---AT---GT--G----A---A---GAGGTAA-T---TG----CAA-GC-TGCTT----T-A-AAT-GATTGATTGGTAG--A---AAGA-AT-----T---T------TT-G-AA-AGC-C-AG-T-T-C---AT---TGCA-C-----AAC-A----TT------TT-G----ACT------GACAG-GCTAAT---TTCCATTGG-------------------TTA------ATC---A-------TTGCCAAC-A---A-----T-----G---ATGT-----G-----A-----G---G-----TG-----GG-----A----C---GT--T-ATG-----------AC--A-TG--CAA---T-TT--ATCAAAA-TA------AAAG-----------G-AT--CAGTGCTAATACAGTACAAAACAG-TG-C--A-AAAA-C--CTTCATA---G--T--TT---T-TC-T--TT-A---ATA----CTGAATATTT---A-ACAAACACTG
gi|10                         :                                                               aatacaacaacaactaccatcatgataagttagag-T---TTGGAT-A----AAACA-ACGT-C-AGAATAAAAG--AG-AAAA-G-T-AT----A-T--A-T-G------ATG-----CACGTGA-CTG----ACGG------------CAGTAAAGCA-GTT---TGCCTAGTCT-TT--TAT--CT----AT---TT--ATACAAGC----------GA---T-TAC---G---GC----TTCAGA--------AAAAAA---AGTGAT--C----TAA---TGTATAGTTCAGT---ACGTAAT--A----C---A---------A-C---TG-----AA-AC-TGATT----C-A-TTT-GACTCAGTA--AATCACATTAAATGC-----C---T------TT-T-AA-AAC-C-GG-C-C-A---CG---TTGA-C-----AAT-A----TT------TT-G----AAT------GA-ACTTCTGAT---TGCCATTAA-------------------ATA------GTC---A--------T---ACC-A---A-----T-----C---A--T-----A-----A---------------CGTTCATAG-----A----C---TG--T-ATG-----------AA--G-TG--TGA---A-TA--ATTAAAA-CA------AAAA-----------T-AT--CAA----------------AACAG-TG-T-AA-AGAgaggtcaccatggctaacttaatatttaagaaagtagaaagtgtaaataaaaattcttatattctgtcggtatcttaacaaacttgacta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttat--T----TAAATACGGATA---TACT---AT---AT--G----CCACA---T-TTTTA-T---TA----AAA-AC-TGCTT----C-A-AA--AACTGAATG--AA--AAC-TAAA-AC-----T---A------TT-G-AA-AG--T-AAGT-T-G---CT---TACA--------AT-G----TT------T--G----TCA------GAGAG-GTCA-T---TTTTATTGA-------------------CTA------ATT---A-------TT---AAT-A---G-----T-----C---A--T-----G-----A-----A---G-----TG-----AGACAT-G----C---TT--T-GTG-----------GC--A-TG--TGG---G-TT--ACTCAAA-CA------GAAA-----------G-GT--TTG----------------AATAG-TG-C-AA-TAAA-A--C-----ACTCG--T--TT---C-CC-T--TT-G---ATA----TCAACTGTTT---A-AGAAACACCATGGAtcta
gi|12                         :                                                                                                                                  TATCAGAG--GC-AAA-----------------A-T-G------CTG-----CATGCAA-CTG----ATGA------------CAGTAAGGCT-GTT---TG------TT-TT--TAC--C-----AA---TC--TCGCAAGT----------GAGATT-T-----G------CG---CAGAT------TTGCAGA---AACAAC--C----GTAATGTACAAA---TGAA---AT---AT--GACACC---G---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCTTATTAC-ATACT-GACATATTAACAG--C---TAAA-AC---------A------TT-T-AA-AAGCC-AG-T-T-G---CT---TACCTC-----TAT-G----TT------TT-G----ACT------GATAG-GCACAT---TTTCATAGG-------------------CTG------ATC---A-------T-----ACTA---A-----C-----T---A--T-----G-----T-----T---G-----CG-----AG-----G----C---ctttgaatccctaacttgatacatgtatgtatggtgtagtatttattttattttgaagaaatgtatttacacttgataccttatgga
gi|13                         :                           gattcagtttgtaaatgtttactacacccaatataataagttagagaatgtccatatacgataataacactga---TTAGATAA----AAAC--A-GC------ATCAAAC--GG-AAGT-A-TTAT----A----A-T-A------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CCA-AGAGCT-CTT---TG------CT-AC---GC--CTCAGTAT---TC--TCACAAGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATTCGAAT------AAACTGA---AATAAT--T----TGAAGGTGCTTA---TAAT---A-------------------------TCA-C---TG----AAA-A---AGTT----T-A-AAT-GACTGATTG--GC--A---TA--------------------------AA-AG--T-AA-T--------T---TA---------AAT-A----TT------TT-G----ATG------AATAG-ACTG-----------CGG-------------------CTA------AAC---A-------TTGA-AAC-AC--A-----T-----TTAGA--T-----C-----A-----G---T-----C------GG-----A----T---TT--T-GTA-----------GC--A--A--TGA---A-CA--TTTAAAA-agacat
gi|14                         :                                               ataaataaattatactacgcctaaattgtgtaacagtattgagaatctcagcattacgAGATCC----AACAG-A-GT-T-GCTATCAAAG--AG-AAAT-G-T-GT----A-C--A-T-GATACACGTGACTGACACGTGA-CTG----AAGA------------CTGTAGATTA-GTT---TA------CT-TC--CAA--TT----AC---TC--TCACAAGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCAGAC------CAGCTTA---AAAAAG--T----TTATTGTACATG---T--T---AT---AT--G----C---A---T-TGT-A-G---TGTTTCAAACAC-TGTTT----C-A-GAT-AACTGACT----G--G---T--A-GC-----C---A-----------GA-AC--T-GA-T-T------T---TG-A-C-----ATT-G----TT------TT-GTGTAACT------GA-----CCGTT---TTCCACTAG-------------------CTT------ATT---A-------CC---GAT-A---C-----T-----T---G--T-----GTGA--A-----A---A-----TG-----AA-----G----C---TT--T-GTA-----------AC--
gi|15                         :                                                                                          aatctatttctactgaatgta----AAACA-ACAC-C-ATTATCAAAA--GG-AAA--G---GT----A-C--ATT-G------GTG-----CACATGA-CTG----AT-A------------CAATGGAGCT-GTT---CG------GTATT--TAT--CC----AT---TC--TCACACAT-----------A---T-G-----A---GC-CAATT---------------TGA---AACAAT--T----TGAATATACATG---TAAT---AT---
gi|16                         :            gtatatatcttccaattgataaaaaatgtcatattactttggcttgcattaaccaagtatgagaatctctgcattacattagataaaaatttTAAATAA----AAACA-A-CG-C-GTTATCACAA--GG-A--------------------------------------CACGTGA-TTG----ACGA------------CAGTAGAACT-GTTAA-TG---------TT--TAC--CT----AG---TC--TATCACGC----------GA---T-T-----G---AC-CAATCCAGAT------TGTCTGA---AAT------------AATGTACAAG---TAAA---AT---AT--G----T---T---T-GGTCATT---TG----AGA-A--TGCTT----C-A-AAT-GTCTGAC---------------G-GC----------------TC-G-AA-AT--T-AA-T-T------------------------------TT------TT-A----ACT----------------GT---TTCCACTGA-------------------CTT------ATC---A-------TC---AAC-A---A-----T-----C---A--T-----GGTGTTA-----G---G-----TA-----TA-----G----C---TT--G-GTG-----------AC--A-TG--GAA---A-CA--tgaaaatatgtaaaacaacagactctgcattaatgacaaacactgttttctttatattgacatattaagaatgcagtgaacattgaaa
gi|17                         :                                                                          agtatgagaagttaagaaatcttcataaaaggcATCA----AAACGCA-G----AT-ATCAAAG--GG-AAAC-A-G-GT----A-G--G---A------GTG-----GATGTGA-CTGTCCGATGAGAATGTTCTAAGCAGTAGAG----TT---TT------CA-TT--TAC--CT----AT---TC--ACACATGT----------GA---T-TTTGTGGTTTGC-CAATTGAAAA------TAACTGA---CATAAT--T-------GTATATATG---TGAT---ATTCAAT--G----C-------T-G-TCC-T---TG----AGA-AC-TGCTT----C-A-AAT-AAGTGATTG--AG---------A-G------T---A------TC-------A--T-A----T-G---C----TAAA-C-----GAT-G----TTAACAGGTTAA----ACT------GATAT-GTGGATATATGTCATTTG-------------------TTA------ATC---A-------TT---GTC-A---A-----A-----C---A--gagaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gctgaAAT---AT---GC--G----C---A---C-TGCCA-T---TA----AAT-AC-TATTT----C-G-AAG-GGCTGACTGGCAG--C---T-----C-----T---A------TT-TTAA-AG---------------CT---TCTA-C-----AA------------------------CT------G----------T---TTCCATTAG-------------------CTA------ATC---AAAATTCATT---ATC-A---A-----T-----C---G--T-----GGCAGGA-----G---G-----CA-----GG-----A----C---TT--T-GCG-----------AC--A-TG--CAA---A-TT--ATCAAAAGCA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------TACAA-CA-C-AA-AAAA-GG-C-----T---G--C--TT---T-TC-TCTTT-G---ATA----CCAATATTTT---A-AGGAACACCACAAATATTCAa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A---TAAA---AT---AT--G------------------A-C---TG----GAA-AC-CGCTT----C-A-AACCAACTGAC----AG--C---TAGA-AC---------A------TT-T-AA-AA----GG-C-T-G---CTATTCACA-C-----GAT-G----TT------TC-T----AAT------GATAG-GTCAGTCG-TTACAGTCC-------------------CCA------ATC-----------TT---GAC-G---A------------------------G-----A-----G---G-----CG-----GG-----A----C---TT--T-GTG-----------AC--G-TA--TGA---A-CT--ACCAAAA-CA------AAA------------C-TT--CAG----------------AATAA-TG-C-AA-GAAA-GA-C-----A---C--TAATT---T-TC-T--TC-G---AAA----CCAACGTTTT---C-ATAAACGCaaactcttgcttgatacacaaggcat
gi|2                          :                                                                                              ttcC-T---GTAGATCA----AAACA-A-TT-CTATTATCATCA--GG-AAAT-G---AT----A-CTAA-T-G------GTG-----CAAGTGA-CGG----ACAG------------CAATATAACT-GTT---TA---------TT--TGC---T----A--------------GC----------GG---T-T-----A---GC-AGATTAGGATCAACAGTAACTGA---A-TCAT--T----TTAATGTGAATG---TAA------------------C---A---T-GCT---T---T-------A-AC-TA--T----C-----T-GATTAAC----AG--A---TAGA--------T---A------T--------A--T-AA-T-T-G-------------------GAT-A----TT------TT-C----ATT------AATAT-G--AGT---CTTCATTTT-------------------CGT------ATC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--T-----G-----ACTTCAG---G-----TG-----AT-----T----T---TT--T-GTG-----------AC--T-TG--TAG---A-CA--TACGAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CCG----------------GACAG-T----GA-AA-------------------T--TA---TAAC-G--CC-G---ATA----TTGACTGTTT---T-AGAaaaaaaatatttgatacaaggtatagt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttcaccattttaA-AC-----T---G------TT-T-AA-AT--TCAA-G-T-G---------ACA-T-----AAT-G----AT------TC-A----ACT------GATG--GCTGGT---TTCCTGTGA-------------------TTA------AGC---A-------TT---ACC-A---G-----T-----C---A--T-----GGC---A-----T---G-----AG-----GT-----G----CAA-TT--T-GTG-----------AC--T-TG--TGACTCA-TATTATAAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TTA----------------ATCAG-TG-C-A----------------A---T--T--TT---T-TT-T--TCTA---ATA----CCAAGTTTTT---A-AGAAACGCCtatgcagtgaaaaactttcgaaatattaacttggtttacaagtactagtactatacaatcctaggttaaagaaaaataaaaatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tactacatcgttctcataaactctttctcactggacgtgttgacagcttgAT-G----TT------TT-G----ACA------GAT-T-GGTGGTAT-TTCCATTGG-------------------CTG------ATC---A-------TT---ATC-A---A-----T-----A---A--T-----G-----A-----C---G-----TG-----AG-----G----CAGTTT--T-GTC-----------ACTTG-CG---GA---C-CA--TTCGAGA--A------TAAG-----------G-GTTGCA-----------------AATGG-TG-C-AA-AAAA-AACT-----AAT-G--T--TA---T-TC-T--TT-G---ATA----CTGA-TGTTT---A-AGGAAttgcccatttga
gi|22                         :                                                                                                                                             a-AAATTA-T-GT----A-C--A-C-G------ATG-----CTCTTGA-CT---------------------CTGTATCGCCTGTTCTGTG------TT-TT--TAC--AT----AT---TC--ATACACAC----------GA---T-T-----T---GC-CTAT-----------------------ATAAT--T----TTAATGTACAT------------T---GT--A----C---G---T-GACCG-T---------AAT-A--TGTGT----C-A-GAA-GATTGATT-----------CACA-GC----------------------------T-AG-T-T-G---GT---TACA-C-----AAT-G----GT------TT-C----ACT------CAGAC--CAGGA---TTCCAATGG-------------------TTaagttgtgaaccttcctgacttactggatatgcaaagcgtagactgtatacatgtatatatttctgtgtttaaaaactactg
gi|23                         :                                                                                                                      caaacatgtaataATAAAAG------AAT-GCT-GTTATCA-C--A-T-G------ATA-----CACATGA--TG------GG------------CAGTACAACT-GTT---TG------GT-TT--TAC--CT----TA---TC--TTGTAGAT----------GA---T-T-----G---GC-GAACTGAGAT------TTCCGGA---AAC-AT--G----TAA---TG---A---TAAT---AT----T--G----C---------GGTGA-T---GG----AAA-AT-TGCTT----C-T-AAT-GATTGATTG--A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                        tcttgcataccacatttacttaagaTC---TG------TT-TT--CACATCG----GC---TT--TCACATGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATCCAGAT------TAGCTGA---ATTAAT--T----CCAATGT--ATA---TTTT---AT---AT-----------A---T-GGTAA-T---TG----ACA-AC-TGTTT----C-A-A----ATTGTTTG--AC--A---TCAA-GA-----T---C------GT-G-AT-AA--T-CA-TAT-GT--TT---TACA-C-----TAT------TT------TT-G----TC-------AATGC-ATT-GT---TCTCATTTG-------------------CTT------ATT---A-------TT---TAC-cagctagaagttt
gi|25                         :                                                                                                                                  TATCAGAG--GG-AAAT-G-T--T----A-C--A-T-G------GTT-----CACATTA-CTG----G-------------------AGAGCA-GTT---TA------CT-TT--GAT--CT----AT---TC--TCACATGC----------CA---T-T-----G---GCATGAATTGGGT------TACCTGA---TATAATCAT----TA-----GCACA---AAATGTAAT---AT--G----C---ACCGT-GGCCG-TGGCTA----CAA-A----CTT----C-----T-GATTGATTG--A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcaaacagtgttgaTTGG-------------------CAA------ATCGTAA-------TT---AAC-ACTGA-----TAA---C---G--T-----G-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----A---TT--A-GTG-----------GC--ATCA--TGA---G-CC--ATCAAAA-TA------AAAAT----------A-GC--CAG----------------AACAT-TG-C-GATAAGA-A--C-----T---C--T--TGATTT-TC-T--AC-G---ATA----TTGACTGTTT---A-AGAAATGCTGCcagtaagaac
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTGTATG---T--T---AT---AT--A----C---ACCTT-GGGCA-T---TG----AAA-ACCTGACT----C-T-AGT-GACTGACTG--G---------AA-GC-----C---A-----------GA-AA--T-A----T-A--------TATA-C-----GATCA----TT---------G----ACT------GATAT-GGCGGT---TTCCATTGA-------------------TTT------ATC---G-------TT---AAT-A---ACCATGT-----C---A--T-----G-----T-----G---G-----CA-----GT-----GTA--C---TT-----TG-----------GC--A-TG--TGA---A-CT--ATAAAAG-AA------AAAG-----------attaaacatttaaaattataaattgatttaaaaggcacagta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----ACC------GATAG-GCTGGT---ATCCATTGA-------------------CTACTAGTGATC---A-------TT---ACC-A---A-----T-----C---A--T-----G-----A-----------------------T-----G----T---TT--T-TTA-----------TC--G------GA---A--A--ATATAAA-C-------AGAG-----------A-AT--CAG----------------AACAG-TG-A-AA-AATA-G--A-----A---A--C--T----T-TC-T--TC-A---ATA----T-AATTTTTT---ATAAAAA
gi|29                         :                                                                                                                                   ATCATAT--AG-AAAT-G-T-GA----G-C--A-T-G------GTG-----CATGTGA-CTG----GCAA------------TAGTAGAGTA-GTT---TG------TT-TT--TGC--CT----GT---TC--TTACATAT----------TA---T-T-----G---GC-CAATTCAGAT------TAGCTAA---AATAAT--TA---TAAattaccagtatatgaatatttgtaactgaatgcaag
gi|3                          :                                           atcttgagtaatgcatgtaggtcatggtatatcagacagtgttgggTTTACACTC-T---TTACATTA----AAACG-A-GC-C-ATTATAAAAA--GG-AAAT-G-T-GT----A-C--A-T-G------GTG-----CATGTGG-CTG----AAGA------------CGGTAGAGCA-GTT---TG------TT-TT--TAC--AT----AT---TC--TCTCGTGC----------GA---T-T-----G---GC-CAATACAGAT------CACCTAA---ACTGAT--T----TAAATATGCATA---TAGT---AT---AT--G----CC--A---G-GGTCA-T---TG----AGA-AT-GGTTT----C-A-AAT-AGTTAATTGTGAG--A---TGAA-GC-----T---A------TT-T-AA-AG--T-AA-T-TTG---TT---TTCA-T-----GAT-A----TT------TT-G----ACT------GATAC-ACAGGT---TTCCATTAG-------------------CTA------TTC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--T-----G-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----C---TT--T-GTA-----------AC--G-CA--TGA---A-CA--ATCAAAA-TG------TAAT-----------G-GT--CAG----------------GACAG-TG-T-GA-AAAA-G--C-----A---G--T--TG---T-TC-T--CT-G---ACA----TCAACCTTTT---A-AATAGCACTGTGGTTATTCAcaaacatt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gcA------ATC---A-------TT---TAC-A---A-----A-----C---A--T-----G-----ACA---GCATG-----CA-----GACATTTG----C---TT--T-ATA-----------GC--A-TG--TTA---A-AA--TTCAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TAA----------------AACAG-CG-C-AA-AAGA-ATTC-----T---GTTT--TT---T-TC-T--TT-G---ATA----ACAACT----------GAAACACtacttt
gi|32                         :                                                                                                                          tgatgcacTATGAAAT--GG-GAAT-A-T-GT----A-C--A-T-G------GTG-----CTCTAGC-CTT----ATGT------------CAGTAGAACA-GTT---TG------CC-TTTATAT--TT----GT---TT--TCGCACGA----------GT---T-A-----G---GT-ATATTCTGAT------TAGCTGA---TATTATA-T----TACATGT-----------T---AT---AT--G----CGATA---T-GACCA-T---TG----AAA-Atttcaatatttgaaactttt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---TT--T-GTG-----------GC--A-TG--AAA---A-CA--TTCAAAA-C-------AAAC-----------A-GT--CAA----------------AACCT-TG-C-AA-AAAATG--T-----A---C--T--T----T-TC-TTATC-----ATA----CGGACTATCT---G-GGGAAaagtt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatatcagacagaca-----GG-----G----T---TT--TAGTG-----------AC--A-TT--TGA---A-CT--TTCGAAA-CA------GAAG-----------G-GT--CAA----------------AATGA-T--T-AA-AAAA-G--T-----T---T--T--CT---T-TCTT--TC-ATTCATA----TCGATCTTTT---A-AGGAA---CTTGAATATTCagttgcaaacatgtgaaactctaccttgatatgcaaggtgcagta
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gi|38                         :                                                                                                                                                                                 -----CACGTGG-CTG----ACAA-------------AGTAGAACT-GTT---CA------GT-TT-------------------------CACGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCACAT------TA------------------------------------TAAT---AC---AT--G----T---A---T-TATGA-T---TG-----AA-AC-TGCTT----C-A-AAaaa
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gi|41                         :                                                                                                                                     CAGAG--GG-AAAT-T-T-AT----A-C--A-T-G------GTG-----CACGTGA-CTG----AAGA------------CAGTAAAGCT-GTT---Tgatacctgccttataattgacttttg
gi|5                          :                                                                                                                                             aatgaT-G-T-AT----ATC--A-T-G------GTG-----CACACAA-CTT----GTGA------------CAGTAGAGCT-GTT---TG------CT-TT--GAA--CT----AA---AC--TTACACTC----------GA---T-T-----G---GT-CATTTCAGAC------------------------------AATTGTACACA----------------------------G---T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TGCTT----C-A-AAT-GACTGAT--------A---TACA-AC-----T---AGAATGTTT-T-AA-AG--T-CA-T-T-G---TT---TACA-C------AT-A----TT------TT-G----ACT------AATGA-GTC-AT---TTTTGCT---------------------CTA------ATC---A-------TC----AT-G---A-----T---------G--T-----G-----A-----G---A-----CA-----AC-----G----T---TT--T-GTG-----------GC--T-TG--TGA---A-AT--ATCAAAA-CAATAGGCAAAG-----------G-AT--CAG----------------AACAGCTG-A-AA-AAAATG--C-----T---G--T--TT---T-TC-T--tcaattctaatgttttccct
gi|6                          : tagtgttccttttattaatgctctgagcatgagagaaggtggagtattttactatgccttgcattatctccaatttacaataagttaaaacaattctgatattatttTCA----AGACA-ATGC-T-GTCATCAAAA--TG-AGAT-G---------A-C---------------G-----CATGTGA-AAA----GTAA------------CAGTAGAGCT-GTT---TG------CT-TT--TAC--AT----GT---ACCTTCACACACAATGTCATATGA---T-T-----G---GC-AGATTCAGGT------AAGGTGA---AATAAT--T----CAAATGTGTAAG---TAAT---AT---AC--G----C-----------------------------------------------T-GATTGAC----AG--C---TAGA-ACCT---T---A------AT-T-AA-GC--C-TA-T-T-G---GT---TACA-A-----GAT-G----CT------TT-G----ACT------GATAG-GTTGAT---TTCCACTGG-------------------CTA------ATC---A-------AC---AAC-A---G-----T-----C---G--T-----G-----A-----T---G-----AG-----AG-----GCAGAC---TT--T-GTA-----------AC--A-TG--TGA---A-AT--ATAAAAA-AA------AAAGAAAGAGAAAAAG-AT--CAG----------------AACAA-GG-CGGA-AAGA-T--C-----ACT-GT-T--TT---T-TC-G--TT-G---ATA----GCAAATATTT---A-AGAAACATCACAAACATTTA
gi|7                          :                                                                                               CTCAT---TTAGGTAAGTTCAAACA-A-CCTC-AATATCAAAG--AGTAAAT---T-GT----A-C--A-T-G------GGG-----TGCATAAACTG----ACGA------------CAGTAAAGAT-GTT---TG------CT-AT--TAC--CT----AT---TC--TCGCA---------------------------------TGATTCAGTT------TACCT-A---AGTTAT--T----T---TG---ATG---TAAT---TT---A------------A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCTT----CAA-AAT-GGTGAACTG--AC--AAC-TAA---T-----T---T------TT-T--------C-AA-T-T-G---CT---TACA-CCTATATAT-A----CT------TT-G----ACTATTAGAAATAG-GCCTGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TC----AC-AT--A-----TCTTGCC---A--T-----G-----A-----G---G-----CT-----AA-----G----C---TTTAT-ATA-----------AC--A-TG--TGA---A-CA--ATCAAaaacttttgatatga
gi|8                          :                                      atcactaacattttgataacaaaggtcaaaatgaagttgctatctcagataattttgatgtcattcatgaaaagaaactACC-A-GT-C-ACAATCAAAGTGAG-AAAT-A-T-GT----A-C--A-TTG------GTA-----CACATGA-CTG----ACAA------------CAGTAGAGCT-GTT---TG------TT-TT--TAC--CT----GCCCACC--TAACATGT----------GA---T-T-----G---GC-TGATACAGGT---------------------T--T----TAA---TGAACA---TGGT---AT---GTAGG----C---ACTGT-GGTTA-A---TA----AAA-AT-TGCTT----C-A-AAT-GACTGACTG--AG---------A-GC---------A------TTGT-AA-AGC-T-AG-T-T-A---TT---TACA-A-----GAA-G----GT------TT-C----ATC------AATAG-ACTGAT---TCCCATTGGCTAGGCCGGGTACCATTGGCTA------ATC---A-------TT---ACC-A---A-----T-----C---A--T-----G-----A-----T---GTCATATG-----GG-----A----T---TT--T-GTG-----------AC--A-TG--TGA---A-C
gi|9                          :                                                                                                tagttttctctggagtaatacatctgagcactgaagtgtaggtggaataattactggagtagctccctcatc------GTT-----CACATGA-CTA----ATGA------------CAGTATATAA-GTT---TG------CT-AT--TAC--TT----AT---TC--ACAATTAC----------AA---T-T-----T---GG-TGAATCAGAT------TAGGAGA---AATAAT--TCTGATTAACATGCATC-----AT---GC---AC-------C---A---T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TG--------------------AC----AG--T---TAAA-AC-----T---T------TT-TTAA-AG-----A-C-T-GTATCT---GACA-T-----GAT-G----TA------TG-A----ACT------GATAC-GCTGGT---TTCCATTGA-------------------CTA------------A-------TT---GCC-A---G-----T-----C---A--T-----GATACAA-----G---G-----CG-----GA-----G----C---TG--T-GT-------------------G--TAA---A-TT--GTCCAAT-CA------AAA------------G-GT--CAG----------------ACCAG-TGAC-TA-AAAG-T--C-----ACC-A--C--AT---T-TC-T--TT-G---AT-----TTAATTTTTTTTAA-AGAAAta
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-714 )      :                                                                                       NNTTTNCACTC-T---TTAGATCA----AAACGA-GC-C-GTTA---TCAAAG--GG-AAATG-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CAGTAGAGCNGTT--TG------CT-TT--TAC--CT----AT---TC--TCACACGC----------GA---T-T-----G---GC-CGATTCAGAT------TAGCTGAAATAAT--T-TNAATGT--------GC---ATGTA--ATAT---ATG----C---A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCT--TC-AAAT-GACTGAC--TG-----A--G--A---TAAA-GC--T---A------TT-T-----AA-AG--T-AA-T-TG---CT---TAC----A-C-----GATGTT------TT-G----ACT------GA---TAGGC-CGGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----C---TT--T-GTGA-----------CAT-GT--GA-----A-CNA-T-CAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------AACAG-TG-C-AA-A----AA----A-G--C-A---G--T--T---TTTC-T--TC-G---ATA----TCGACTNTTT---A-A-GAA---ACGCC-GC---GAATATTCA
gi|1                          :                                                                                         TTTCCACTT-TATGCTAGA-CA----GAACAATGT-A-GATA---TCAAAG--GG-AAATG-T-GG----G-C--AT-G------GTG-----CACCTGA-CTG----AAGA------------CAGTAGAGCAGGT--GG------AT-TT--TAC--CT----AT---TC----ATA-------------AA---TAT-----G---GT----------T------TAGTTGAAATCAT--T-GTAATGT--------AA---ATGCA--ACAT---GTG----A---A---GAGGTAA-T---TG----CAA-GC-TGCT--TT-AAAT-GATTGAT--TGGT---A--G--A---AAGA-AT--T---T------TT-G-----AA-AG--CCAG-T-TC---AT---TGC----A-C-----AACATT------TT-G----ACT------GA---CAGGC-TAAT---TTCCATTGG-------------------TTA------ATC---A-------TTGCCAAC-A---A-----T-----G---ATGTG-----A-----G---G-----TG-----GG-----A----C---GT--T-ATGA-----------CAT-GC--AA-----T-TTA-T-CAAAA-TA------AAAG-----------G-AT--CAGTGCTAATACAGTACAAAACAG-TG-C-AA-A----AACCTTC-A--T-A---G--T--T---TTTC-T--TT-A---ATA----CTGAATATTT---A-A-CAA---ACACT-G
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gi|16                         :            gtatatatcttccaattgataaaaaatgtcatattactttggcttgcattaaccaagtatgagaatctctgcattacattagataaaaatttTAAATAA----AAACAA-CG-C-GTTA---TCACAA--GG-A------------------------------------CACGTGA-TTG----ACGA------------CAGTAGAACTGTTAATG---------TT--TAC--CT----AG---TC--TATCACGC----------GA---T-T-----G---AC-CAATCCAGAT------TGTCTGAAAT---------AATGT--------AC---AAGTA--AAAT---ATG----T---T---T-GGTCATT---TG----AGA-A--TGCT--TC-AAAT-GTCTGAC----------------------G-GC-------------TC-G-----AA-AT--T-AA-T-T----------------------------TT------TT-A----ACT-------------------GT---TTCCACTGA-------------------CTT------ATC---A-------TC---AAC-A---A-----T-----C---A--TGGTGTTA-----G---G-----TA-----TA-----G----C---TT--G-GTGA-----------CAT-GG--AA-----A-Ctgaaaatatgtaaaacaacagactctgcattaatgacaaacactgttttctttatattgacatattaagaatgcagtgaacattgaaa
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TA--AAAT---ATG------------------A-C---TG----GAA-AC-CGCT--TC-AAACCAACTGAC---------A--G--C---TAGA-AC------A------TT-T-----AA-AA----GG-C-TG---CTATTCAC----A-C-----GATGTT------TC-T----AAT------GA---TAGGT-CAGTCG-TTACAGTCC-------------------CCA------ATC-----------TT---GAC-G---A-------------------G-----A-----G---G-----CG-----GG-----A----C---TT--T-GTGA-----------CGT-AT--GA-----A-CTA-C-CAAAA-CA------AAA------------C-TT--CAG----------------AATAA-TG-C-AA-G----AA----A-GA-C-A---C--TAAT---TTTC-T--TC-G---AAA----CCAACGTTTT---C-A-TAA---ACGCaaactcttgcttgatacacaaggcat
gi|2                          :                                                                                             ttcaC-T---GTAGATCA----AAACAA-TT-CTATTA---TCATCA--GG-AAATG---AT----A-CTAAT-G------GTG-----CAAGTGA-CGG----ACAG------------CAATATAACTGTT--TA---------TT--TGC---T----A--------------GC----------GG---T-T-----A---GC-AGATTAGGATCAACAGTAACTGAA-TCAT--T-TTAATGT--------GA---ATGTA--A-------------C---A---T-GCT---T---T-------A-AC-TA----TC----T-GATTAAC---------A--G--A---TAGA-----T---A------T------------A--T-AA-T-TG-----------------------GATATT------TT-C----ATT------AA---TATG---AGT---CTTCATTTT-------------------CGT------ATC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----ACTTCAG---G-----TG-----AT-----T----T---TT--T-GTGA-----------CTT-GT--AG-----A-C-A-TACGAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CCG----------------GACAG-TG---AA-ATTATAA----C-G--C------------------------C-G---ATA----TTGACTGTTT---T-A-GAT---ATGCA-GT---GAAaaaaaaatatttgatacaaggtatagt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttcaccattttaA-AC--T---G------TT-T-----AA-AT--TCAA-G-TG---------AC----A-T-----AATGAT------TC-A----ACT------GA---T-GGC-TGGT---TTCCTGTGA-------------------TTA------AGC---A-------TT---ACC-A---G-----T-----C---A--TGGC---A-----T---G-----AG-----GT-----G----CAA-TT--T-GTGA-----------CTT-GT--GACTCATA-TTA-T-AAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TTA----------------ATCAG-TG-C-A--------------------A---T--T--T---TTTT-T--TCTA---ATA----CCAAGTTTTT---A-A-GAA---ACGCC-aaactttcgaaatattaacttggtttacaagtactagtactatacaatcctaggttaaagaaaaataaaaatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tactacatcgttctcataaactctttctcactggacgtgttgacagcttgATGTT------TT-G----ACA------GA---TTGGT--GGTAT-TTCCATTGG-------------------CTG------ATC---A-------TT---ATC-A---A-----T-----A---A--TG-----A-----C---G-----TG-----AG-----G----CAGTTT--T-GTCA-----------CTT-GC--GG-----A-CCATT-CGAGA--A------TAAG-----------G-GTTGCA-----------------AATGG-TG-C-AA-A----AA----A-AACT-AAT-G--T--T---ATTC-T--TT-G---ATA----CTGA-TGTTT---A-AGGAA---AAGTT-GT---GAACCTTCttgcccatttga
gi|23                         :                                                                                                                                 aA---TAAAAG------AATGCT-GTTATCA-C--AT-G------ATA-----CACATGA--TG------GG------------CAGTACAACTGTT--TG------GT-TT--TAC--CT----TA---TC--TTGTAGAT----------GA---T-T-----G---GC-GAACTGAGAT------TTCCGGAAACA----T-GTAATG----------------ATA--ATAT----TG----C---------GGTGA-T---GG----AAA-AT-TGCT--TC-TAAT-GATTGAT--TG-----A--ctgacttactggatatgcaaagcgtagactgtatacatgtatatatttctgtgtttaaaaactactg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                       tcttgcataccacatttacttaagaTC--TG------TT-TT--CACATCG----GC---TT--TCACATGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATCCAGAT------TAGCTGAATTAAT--T-CCAATGT--------AT---ATTT----TAT---AT---------A---T-GGTAA-T---TG----ACA-AC-TGTT--TC-AAAT----TGTT--TG-----A--C--A---TCAA-GA--T---C------GT-G-----AT-AA--T-CA-TATGT--TT---TAC----A-C-----TAT-TT------TT-G----TC-------AA---T--GCATTGT---TCTCATTTG-------------------CTT------ATT---A-------TT---TAC-cagctagaagttt
gi|25                         :                                                                                                                                 TA---TCAGAG--GG-AAATG-T--T----A-C--AT-G------GTT-----CACATTA-CTG----G-------------------AGAGCAGTT--TA------CT-TT--GAT--CT----AT---TC--TCACATGC----------CA---T-T-----G---GCATGAATTGGGT------TACCTGATATAAT--CATTA--GC--------ACAAAATGTA----AT---ATG----C---ACCGT-GGCCG-TGGCTA----CAA-A----CT--TC----T-GATTGAT--TG-----A--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcaaacagtgttgaTTGG-------------------CAA------ATCGTAA-------TT---AAC-ACTGA-----TAA---C---G--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----A---TT--A-GTGG-----------CATCAT--GA-----G-CCA-T-CAAAA-TA------AAAAT----------A-GC--CAG----------------AACAT-TG-C-GATA----AG----A-A--C-T---C--T--TGATTTTC-T--AC-G---ATA----TTGACTGTTT---A-A-GAA---ATGCT-GCATTAAACATTTAcagtaagaac
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GT--------GT---ATGT----TAT---ATA----C---ACCTT-GGGCA-T---TG----AAA-ACCTGAC--TC-TAGT-GACTGAC--TG-----G-----------AA-GC--C---A---------------GA-AA--T-A----TA--------TAT----A-C-----GAT-CA------TT-G----ACT------GA---TATGG-CGGT---TTCCATTGA-------------------TTT------ATC---G-------TT---AAT-A---ACCATGT-----C---A--TG-----T-----G---G-----CA-----GT-----GTA--C---TT-----TGG-----------CAT-GT--GA-----A-CTA-T-AAAAG-AA------AAAG-----------aaattataaattgatttaaaaggcacagta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----ACC------GA---TAGGC-TGGT---ATCCATTGA-------------------CTACTAGTGATC---A-------TT---ACC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----T---G----------------------------TT--T-TT-------------TAT-CG--GA-----A--AA-T-ATAAA-C-------AGAG-----------A-AT--CAG----------------AACAG-TG-A-AA-A----AT----A-G--A-A---A-----C---TTTC-T--TC-A---ATA----T-AATTTTTT---ATA-AAA---A
gi|29                         :                                                                                                                                  A---TCATAT--AG-AAATG-T-GA----G-C--AT-G------GTG-----CATGTGA-CTG----GCAA------------TAGTAGAGTAGTT--TG------TT-TT--TGC--CT----GT---TC--TTACATAT----------TA---T-T-----G---GC-CAATTCAGAT------TAGCTAAAATAAT--T-attaccagtatatgaatatttgtaactgaatgcaag
gi|3                          :                                           atcttgagtaatgcatgtaggtcatggtatatcagacagtgttgggTTTACACTC-T---TTACATTA----AAACGA-GC-C-ATTA---TAAAAA--GG-AAATG-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CATGTGG-CTG----AAGA------------CGGTAGAGCAGTT--TG------TT-TT--TAC--AT----AT---TC--TCTCGTGC----------GA---T-T-----G---GC-CAATACAGAT------CACCTAAACTGAT--T-TAAATAT--------GC---ATATA--GTAT---ATGC---C---A---G-GGTCA-T---TG----AGA-AT-GGTT--TC-AAAT-AGTTAATTGTG-----A--G--A---TGAA-GC--T---A------TT-T-----AA-AG--T-AATT-TG---TT---TTC----A-T-----GATATT------TT-G----ACT------GA---TACAC-AGGT---TTCCATTAG-------------------CTA------TTC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----C---TT--T-GTAA-----------CGC-AT--GA-----A-CAA-T-CAAAA-TG------TAAT-----------G-GT--CAG----------------GACAG-TG-T-GA-A----AA----A-G--C-A---G--T--T---GTTC-T--CT-G---ACA----TCAACCTTTT---A-A-ATA---GCACT-GT---GGTTATTCAataacaaacatt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcTA------ATT---AAG-----TT---AAC-A---G-----T-----C---A--TG-----ACACCAG---G-----CG-----AG-----G----A---TG--C-GTGT-----------TAT-GT--GC-----A-CAT-T-CAAAT-TA------TTAG-----------A-GT--CA-----------------AATAG-TG-T-TA-A----AA----T-A--T-T---G--C--T---GCTC-T--TT-G---ACA----TCAAATGTC--------AAA---ACGCC-AC---AAACATTtacttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caA------ATC---A-------TT---TAC-A---A-----A-----C---A--TG-----ACA---GCATG-----CA-----GACATTTG----C---TT--T-ATAG-----------CAT-GT--TA-----A-AAT-T-CAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TAA----------------AACAG-CG-C-AA-A----AG----A-ATTC-T---GTTT--T---TTTC-T--TT-G---ATA----ACAACT-----------GAA---ACACT-TT---CAATATTaataactctacctcgatatgcaagtca
gi|32                         :                                                                                                                         tgatgcacTA---TGAAAT--GG-GAATA-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CTCTAGC-CTT----ATGT------------CAGTAGAACAGTT--TG------CC-TTTATAT--TT----GT---TT--TCGCACGA----------GT---T-A-----G---GT-ATATTCTGAT------TAGCTGATATTAT-------AT-T--------AC---ATGT----TAT---ATG----CGATA---T-GACCA-T---TG----AAA-Atgaaactttt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AC-A---A-----T-----C---A--CG-----ACGTAAG---G-----TG-----AA-----G----C---TA--G-TTAG-----------CAT-GT--AA-----A-CAT-T-CAAAT-CA------AAA------------G-GT--TAA----------------ATCAA-TA-C-AA-A---------------C-A---G--T--T---AT---T--TT-A---ACA----TCTATTATGT---A-A-GAaagtt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgatattgc---TT--T-GTGG-----------CAT-GA--AA-----A-CAT-T-CAAAA-C-------AAAC-----------A-GT--CAA----------------AACCT-TG-C-AA-A----AA----ATG--T-A------C--T---TTTC-TTATC-----ATA----CGGACTATCT---G-G-GGA---AAGTT-GC---AAACATtgatcttgaaacattctcaactctaacttgatatgca
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gatatcagacagaca-----GG-----G----T---TT--TAGTGA-----------CAT-TT--GA-----A-CTT-T-CGAAA-CA------GAAG-----------G-GT--CAA----------------AATGA-T--T-AA-A----AA----A-G--T-T---T--T--C---TTTCTT--TC-ATTCATA----TCGATCTTTT---A-A-GGA---A---C-TT---GAATATTCgtgaaactctaccttgatatgcaaggtgcagta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -----G---G-----TG-----AG-----G----T---TT--T-GTGG-----------CAT-GT--GA-----A-CAT-T-CCAGA-TA------TTAG-----------A-TT--CAA----------------AACAG-TA-C-AT-G----AA----A-T--T-T---G--T--T---TTTC-T--TT-A---ATA----TTGACTGCTA---A-A-TAC---ACGCC-gaagctctcatatgaaatacagaaca
gi|38                         :                                                                                                                                                                                 -----CACGTGG-CTG----ACAA-------------AGTAGAACTGTT--CA------GT-TT-------------------------CACGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCACAT------TA--------------------------------------TA--ATAC---ATG----T---A---T-TATGA-T---TG----AAA--C-TGCT--TC-AAAaaa
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aa-----C---A--TG-----A-----G---A-----AG-----GA-----C----T---TT--T-GTGA-----------CAT-GA--AA-----AGCTA-T-CGAAA-CG------TGAG-----------ATGT--CAA----------------ACCCG-TG-C-AA-A----A----------CGA---G--T--T---TTTT-T--T
gi|4                          :                                                                                                                                           atgaG-AAATA-T-TT----A-C--AT-G------GTA------ATGTGG-CTG----CCAA------------CAGTAGACCCGTT--TA------TC-TT--TAA--CT----GT---TC--TTACATAT----------GC---C-T-----C---TC-TAATTCAGAT------TAACTGAAATATTGGT-CTAATGT--------GT---ATTTA--CTAT---G--------------------A-T---TG----AAA-AC-TGCA--TC-AAAT-GATTGAG--TG-----ACAG--A---TAAA--C--T---T------TT-TTTTTTAATAC--C-AT-T-TGT--CTCA-TAT----A-G-----AAT-TT------TT-G----ATT------GA---TTGGC-CAGT---TTCCATTGG-------------------CTA------TTC---A-------TG---ACA-A---A-----T-----C---A--TGCCAAGA-----G---G-----TG-----GA-----G----C---TT--A-GTGATATTTTAGTTACAT-GTTTAA-----A-CTA-T-CAAAA-CA------AAAT-----------G-GC--CGA----------------TACGC-TG----------------------------G--T--T---TCTT-T--T------ATACTGTTAGACTTCTT---A-A-GAA---ATGCT-GT---GAGCATTTAttatgtac
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aa---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-AGCT--TT-AGAT-GATGGAC---------A--G--A---C--A-GC--TAGAA------CT-T-----AT-AG--TCAA-T-TG---CT---GAT----A-C-----aaactttaaatcaatatgcagggtgtaaataaaggga
gi|41                         :                                                                                                                                       CAGAG--GG-AAATT-T-AT----A-C--AT-G------GTG-----CACGTGA-CTG----AAGA------------CAGTAAAGCTGTT--Tctgccttataattgacttttg
gi|5                          :                                                                                                                                               aatgaTG-T-AT----ATC--AT-G------GTG-----CACACAA-CTT----GTGA------------CAGTAGAGCTGTT--TG------CT-TT--GAA--CT----AA---AC--TTACACTC----------GA---T-T-----G---GT-CATTTCAGAC----------------AAT--T------GT--------AC---A--------------------C---AG--T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TGCT--TC-AAAT-GACTGAT---------------A---TACA-AC--T---AGAATGTTT-T-----AA-AG--T-CA-T-TG---TT---TAC----A-C------ATATT------TT-G----ACT------AA---TGAGT-C-AT---TTTTGCT---------------------CTA------ATC---A-------TC----AT-G---A-----T---------G--TG-----A-----G---A-----CA-----AC-----G----T---TT--T-GTGG-----------CTT-GT--GA-----A-ATA-T-CAAAA-CAATAGGCAAAG-----------G-AT--CAG----------------AACAGCTG-A-AA-A----AA----ATG--C-T---G--T--T---TTTC-T--tcaattctaatgttttccct
gi|6                          : tagtgttccttttattaatgctctgagcatgagagaaggtggagtattttactatgccttgcattatctccaatttacaataagttaaaacaattctgatattatttTCA----AGACAATGC-T-GTCA---TCAAAA--TG-AGATG---------A-C--------------G-----CATGTGA-AAA----GTAA------------CAGTAGAGCTGTT--TG------CT-TT--TAC--AT----GT---ACCTTCACACACAATGTCATATGA---T-T-----G---GC-AGATTCAGGT------AAGGTGAAATAAT--T-CAAATGT--------GT---AAGTA--ATAT---ACG----C--------------------------------------------T-GATTGAC---------A--G--C---TAGA-ACCTT---A------AT-T-----AA-GC--C-TA-T-TG---GT---TAC----A-A-----GATGCT------TT-G----ACT------GA---TAGGT-TGAT---TTCCACTGG-------------------CTA------ATC---A-------AC---AAC-A---G-----T-----C---G--TG-----A-----T---G-----AG-----AG-----GCAGAC---TT--T-GTAA-----------CAT-GT--GA-----A-ATA-T-AAAAA-AA------AAAGAAAGAGAAAAAG-AT--CAG----------------AACAA-GG-CGGA-A----AG----A-T--C-ACT-GT-T--T---TTTC-G--TT-G---ATA----GCAAATATTT---A-A-GAA---ACATC-AC---AAACATTTA
gi|7                          :                                                                                               CTCAT---TTAGGTAAGTTCAAACAA-CCTC-AATA---TCAAAG--AGTAAAT--T-GT----A-C--AT-G------GGG-----TGCATAAACTG----ACGA------------CAGTAAAGATGTT--TG------CT-AT--TAC--CT----AT---TC--TCGCA---------------------------------TGATTCAGTT------TACCT-AAGTTAT--T-T---TG--------------ATGTA--ATTT---A----------A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCT--TCAAAAT-GGTGAAC--TG-----A--C--AAC-TAA---T--T---T------TT-T------------C-AA-T-TG---CT---TAC----A-CCTATATATACT------TT-G----ACTATTAGAAA---TAGGC-CTGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TC----AC-AT--A-----TCTTGCC---A--TG-----A-----G---G-----CT-----AA-----G----C---TTTAT-ATAA-----------CAT-GT--GA-----A-CAA-T-CAAaaacttttgatatga
gi|8                          :                                                   atcactaacattttgataacaaaggtcaaaatgaagttgctatctcagataattttgatgtcattcatgaaaagaaactA---TCAAAGTGAG-AAATA-T-GT----A-C--ATTG------GTA-----CACATGA-CTG----ACAA------------CAGTAGAGCTGTT--TG------TT-TT--TAC--CT----GCCCACC--TAACATGT----------GA---T-T-----G---GC-TGATACAG-------------------GT--T-TTAATGA--------AC---ATGGT--ATGT---AGG----C---ACTGT-GGTTA-A---TA----AAA-AT-TGCT--TC-AAAT-GACTGAC--TG-----A--G---------A-GC------A------TTGT-----AA-AGC-T-AG-T-TA---TT---TAC----A-A-----GAAGGT------TT-C----ATC------AA---TAGAC-TGAT---TCCCATTGGCTAGGCCGGGTACCATTGGCTA------ATC---A-------TT---ACC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----T---GTCATATG-----GG-----A----T---TT--T-GTGA-----------CAT-GT--GA-----A-CTA-
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                           gattcagtttgtaaatgtttactacacccaatataataagttagagaatgtccatatacgataataacactga---TTAGATAA----AAAC-A-GC------A---TCAAAC--GG-AAGT-A-TTAT----A----AT-A------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CCA-AGAGC-TCTT---TG------CT-AC---GC--CTCAGTATTC---TCACAAGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATTCGAAT------AAACTGAAATAAT--T-TGAAGGTGC---TTA-T--A--ATAT-----------------------CA-C---TG----AAA-A---AGT--TT-AAAT-GACTGAT--TG-----G--C--A---TAAA----------------------------AG--T-AA-T-------T---TA-------------AATATT------TT-G----ATG------AA---TAGAC-T-G-----------CGG-------------------CTA------AAC---A-------TTGA-AAC-AC--A-----T-----TTAGA--TC-----A-----G---T-----C------GG-----A----T---TT--T-GTAG-----------CA--AT--GA-----A-CAT-T-TAAAA-agacat
gi|14                         :                                               ataaataaattatactacgcctaaattgtgtaacagtattgagaatctcagcattacgAGATCC----AACAGA-GT-T-GCTA---TCAAAG--AG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-GATACACGTGACTGACACGTGA-CTG----AAGA------------CTGTAGATT-AGTT---TA------CT-TC--CAA--TT----ACTC---TCACAAGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCAGAC------CAGCTTAAAAAAG--T-TTATTGTAC---ATG-T------TAT---ATG----C---A---T-TGT-A-G---TGTTTCAAACAC-TGTT--TC-AGAT-AACTGAC--T---------G--G---T--A-GC--C---A---------------GA-AC--T-GA-T-T----TT---GAC----A-T-------TGTT------TT-GTGTAACT------GA-------C-C-GTT---TTCCACTAG-------------------CTT------ATT---A-------CC---GAT-A---C-----T-----T---G--TGTGA--A-----A---A-----TG-----AA-----G----C---TT--T-GTAA-----------C
gi|15                         :                                                                                          aatctatttctactgaatgta----AAACAACAC-C-ATTA---TCAAAA--GG-AAA--G---GT----A-C--ATTG------GTG-----CACATGA-CTG----AT-A------------CAATGGAGC-TGTT---CG------GTATT--TAT--CC----ATTC---TCACACAT-----------A---T-G-----A---GC-CAATT---------------TGAAACAAT--T-TGAATATAC---ATG-T--A--ATAT---
gi|16                         :            gtatatatcttccaattgataaaaaatgtcatattactttggcttgcattaaccaagtatgagaatctctgcattacattagataaaaatttTAAATAA----AAACAA-CG-C-GTTA---TCACAA--GG-A-------------------------------------CACGTGA-TTG----ACGA------------CAGTAGAAC-TGTTAA-TG---------TT--TAC--CT----AGTC---TATCACGC----------GA---T-T-----G---AC-CAATCCAGAT------TGTCTGAAA---------TAATGTAC---AAG-T--A--AAAT---ATG----T---T---T-GGTCATT---TG----AGA-A--TGCT--TC-AAAT-GTCTGAC----------------------G-GC-------------TC-G-----AA-AT--T-AA-T-T----------------------------TT------TT-A----ACT--------------------GT---TTCCACTGA-------------------CTT------ATC---A-------TC---AAC-A---A-----T-----C---A--TGGTGTTA-----G---G-----TA-----TA-----G----C---TT--G-GTGA-----------CAT-GG--AA-----A-Ctgaaaatatgtaaaacaacagactctgcattaatgacaaacactgttttctttatattgacatattaagaatgcagtgaacattgaaa
gi|17                         :                                                                          agtatgagaagttaagaaatcttcataaaaggcATCA----AAACG---C-A-GATA---TCAAAG--GG-AAAC-A-G-GT----A-G--G--A------GTG-----GATGTGA-CTGTCCGATGAGAATGTTCTAAGCAGTAGAG----TT---TT------CA-TT--TAC--CT----ATTC---ACACATGT----------GA---T-TTTGTGGTTTGC-CAATTGAAAA------TAACTGACATAAT--T-GTA---TAT---ATG-T--G--ATATTCAATG----C-------T-G-TCC-T---TG----AGA-AC-TGCT--TC-AAAT-AAGTGAT--TG-----A--G---------A-G---T---A------TC-----------A--T-A----TG---C----TAA----A-C-----GATGTTAACAGGTTAA----ACT------GA---TATGT-G-GATATATGTCATTTG-------------------TTA------ATC---A-------TT---GTC-A---A-----A-----C---A--agagaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gctga--A--ATAT---GCG----C---A---C-TGCCA-T---TA----AAT-AC-TATT--TC-GAAG-GGCTGAC--TGGC---A--G--C---T-----C--T---A------TT-TT----AA-AG--C----T-T-----C---TAC----A---------------------------ACT------G--------------T---TTCCATTAG-------------------CTA------ATC---AAAATTCATT---ATC-A---A-----T-----C---G--TGGCAGGA-----G---G-----CA-----GG-----A----C---TT--T-GCGA-----------CAT-GC--AA-----A-TTA-T-CAAAAGCA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------TACAA-CA-C-AA-A----AA----AGG--C-T---GCTT--T---TCTC-T--TT-G---ATA----CCAATATTTT---A-A-GGA---ACACC-AC---AAATATTCAa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T--A--AAAT---ATG------------------A-C---TG----GAA-AC-CGCT--TC-AAACCAACTGAC---------A--G--C---TAGA-AC------A------TT-T-----AA-AA----GG-C-TG---CTATTCAC----A-C-----GATGTT------TC-T----AAT------GA---TAGGT-C-AGTCG-TTACAGTCC-------------------CCA------ATC-----------TT---GAC-G---A-------------------G-----A-----G---G-----CG-----GG-----A----C---TT--T-GTGA-----------CGT-AT--GA-----A-CTA-C-CAAAA-CA------AAA------------C-TT--CAG----------------AATAA-TG-C-AA-G----AA----A-GA-C-A---C--TAAT---TTTC-T--TC-G---AAA----CCAACGTTTT---C-A-TAA---ACGCaaactcttgcttgatacacaaggcat
gi|2                          :                                                                                             ttcaC-T---GTAGATCA----AAACAA-TT-CTATTA---TCATCA--GG-AAAT-G---AT----A-CTAAT-G------GTG-----CAAGTGA-CGG----ACAG------------CAATATAAC-TGTT---TA---------TT--TGC---T----A------------GC----------GG---T-T-----A---GC-AGATTAGGATCAACAGTAACTGAA-TCAT--T-TTAATGTGA---ATG-T--A--A-------------C---A---T-GCT---T---T-------A-AC-TA----TC----T-GATTAAC---------A--G--A---TAGA-----T---A------T------------A--T-AA-T-TG-----------------------GATATT------TT-C----ATT------AA---TATG----AGT---CTTCATTTT-------------------CGT------ATC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----ACTTCAG---G-----TG-----AT-----T----T---TT--T-GTGA-----------CTT-GT--AG-----A-C-A-TACGAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CCG----------------GACAG-TG---AA-ATTATAA----C-G--C------------------------C-G---ATA----TTGACTGTTT---T-A-GAT---ATGCA-GT---GAAaaaaaaatatttgatacaaggtatagt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcaccattttaA-AC--T---G------TT-T-----AA-AT--TCAA-G-TG---------AC----A-T-----AATGAT------TC-A----ACT------GA---T-GGC-T-GGT---TTCCTGTGA-------------------TTA------AGC---A-------TT---ACC-A---G-----T-----C---A--TGGC---A-----T---G-----AG-----GT-----G----CAA-TT--T-GTGA-----------CTT-GT--GACTCATA-TTA-T-AAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TTA----------------ATCAG-TG-C-A--------------------A---T--T--T---TTTT-T--TCTA---ATA----CCAAGTTTTT---A-A-GAA---ACGCC-aaactttcgaaatattaacttggtttacaagtactagtactatacaatcctaggttaaagaaaaataaaaatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tactacatcgttctcataaactctttctcactggacgtgttgacagcttgATGTT------TT-G----ACA------GA---TTGGT---GGTAT-TTCCATTGG-------------------CTG------ATC---A-------TT---ATC-A---A-----T-----A---A--TG-----A-----C---G-----TG-----AG-----G----CAGTTT--T-GTCA-----------CTT-GC--GG-----A-CCATT-CGAGA--A------TAAG-----------G-GTTGCA-----------------AATGG-TG-C-AA-A----AA----A-AACT-AAT-G--T--T---ATTC-T--TT-G---ATA----CTGA-TGTTT---A-AGGAA---AAGTT-GT---GAACCTTCttgcccatttga
gi|22                         :                                                                                                                                               a-AAATTA-T-GT----A-C--AC-G------ATG-----CTCTTGA-CT---------------------CTGTATCGCCTGTTCTGTG------TT-TT--TAC--AT----ATTC---ATACACAC----------GA---T-T-----T---GC-CTAT--------------------ATAAT--T-TTAATGTAC---AT-----------T---GTA----C---G---T-GACCG-T---------AAT-A--TGTG--TC-AGAA-GATTGAT--T----------------CACA-GC-----------------------------T-AG-T-TG---GT---TAC----A-C-----AATGGT------TT-C----ACT-----------CAGAC-CAGGA---TTCCAATGG-------------------TTctgacttactggatatgcaaagcgtagactgtatacatgtatatatttctgtgtttaaaaactactg
gi|23                         :                                                                                                                     caaacatgtaataA---TAAAAG------AAT-GCT-GTTATCA-C--AT-G------ATA-----CACATGA--TG------GG------------CAGTACAAC-TGTT---TG------GT-TT--TAC--CT----TATC---TTGTAGAT----------GA---T-T-----G---GC-GAACTGAGAT------TTCCGGAAAC----------ATGTA----ATGAT--A--ATAT----TG----C---------GGTGA-T---GG----AAA-AT-TGCT--TC-TAAT-GATTGAT--TG-----A--
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                         tcttgcataccacatttacttaagaTC---TG------TT-TT--CACATCG----GCTT---TCACATGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATCCAGAT------TAGCTGAATTAAT--T-CCAATGTAT---ATT-T------TAT---AT---------A---T-GGTAA-T---TG----ACA-AC-TGTT--TC-AAAT----TGTT--TG-----A--C--A---TCAA-GA--T---C------GT-G-----AT-AA--T-CA-TATGT--TT---TAC----A-C-----TAT-TT------TT-G----TC-------AA---T--GCAT-TGT---TCTCATTTG-------------------CTT------ATT---A-------TT---TAC-cagctagaagttt
gi|25                         :                                                                                                                                 TA---TCAGAG--GG-AAAT-G-T--T----A-C--AT-G------GTT-----CACATTA-CTG----G-------------------AGAGC-AGTT---TA------CT-TT--GAT--CT----ATTC---TCACATGC----------CA---T-T-----G---GCATGAATTGGGT------TACCTGATATAAT--CATTA--GCACAAAATG-T--A----AT---ATG----C---ACCGT-GGCCG-TGGCTA----CAA-A----CT--TC----T-GATTGAT--TG-----A--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcaaacagtgttgaTTGG-------------------CAA------ATCGTAA-------TT---AAC-ACTGA-----TAA---C---G--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----A---TT--A-GTGG-----------CATCAT--GA-----G-CCA-T-CAAAA-TA------AAAAT----------A-GC--CAG----------------AACAT-TG-C-GATA----AG----A-A--C-T---C--T--TGATTTTC-T--AC-G---ATA----TTGACTGTTT---A-A-GAA---ATGCT-GCATTAAACATTTAcagtaagaac
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTGT---ATG-T------TAT---ATA----C---ACCTT-GGGCA-T---TG----AAA-ACCTGAC--TC-TAGT-GACTGAC--TG-----G-----------AA-GC--C---A---------------GA-AA--T-A----TA--------TAT----A-C-----GAT-CA------TT-G----ACT------GA---TATGG-C-GGT---TTCCATTGA-------------------TTT------ATC---G-------TT---AAT-A---ACCATGT-----C---A--TG-----T-----G---G-----CA-----GT-----GTA--C---TT-----TGG-----------CAT-GT--GA-----A-CTA-T-AAAAG-AA------AAAG-----------aaattataaattgatttaaaaggcacagta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----ACC------GA---TAGGC-T-GGT---ATCCATTGA-------------------CTACTAGTGATC---A-------TT---ACC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----T---G----------------------------TT--T-TT-------------TAT-CG--GA-----A--AA-T-ATAAA-C-------AGAG-----------A-AT--CAG----------------AACAG-TG-A-AA-A----AT----A-G--A-A---A-----C---TTTC-T--TC-A---ATA----T-AATTTTTT---ATA-AAA---A
gi|29                         :                                                                                                                                  A---TCATAT--AG-AAAT-G-T-GA----G-C--AT-G------GTG-----CATGTGA-CTG----GCAA------------TAGTAGAGT-AGTT---TG------TT-TT--TGC--CT----GTTC---TTACATAT----------TA---T-T-----G---GC-CAATTCAGAT------TAGCTAAAATAAT--T-ATAACAAAC---ATattaccagtatatgaatatttgtaactgaatgcaag
gi|3                          :                                           atcttgagtaatgcatgtaggtcatggtatatcagacagtgttgggTTTACACTC-T---TTACATTA----AAACGA-GC-C-ATTA---TAAAAA--GG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CATGTGG-CTG----AAGA------------CGGTAGAGC-AGTT---TG------TT-TT--TAC--AT----ATTC---TCTCGTGC----------GA---T-T-----G---GC-CAATACAGAT------CACCTAAACTGAT--T-TAAATATGC---ATA-T--A--GTAT---ATGC---C---A---G-GGTCA-T---TG----AGA-AT-GGTT--TC-AAAT-AGTTAATTGTG-----A--G--A---TGAA-GC--T---A------TT-T-----AA-AG--T-AATT-TG---TT---TTC----A-T-----GATATT------TT-G----ACT------GA---TACAC-A-GGT---TTCCATTAG-------------------CTA------TTC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----C---TT--T-GTAA-----------CGC-AT--GA-----A-CAA-T-CAAAA-TG------TAAT-----------G-GT--CAG----------------GACAG-TG-T-GA-A----AA----A-G--C-A---G--T--T---GTTC-T--CT-G---ACA----TCAACCTTTT---A-A-ATA---GCACT-GT---GGTTATTCAt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gcTA------ATT---AAG-----TT---AAC-A---G-----T-----C---A--TG-----ACACCAG---G-----CG-----AG-----G----A---TG--C-GTGT-----------TAT-GT--GC-----A-CAT-T-CAAAT-TA------TTAG-----------A-GT--CA-----------------AATAG-TG-T-TA-A----AA----T-A--T-T---G--C--T---GCTC-T--TT-G---ACA----TCAAATGTC--------AAA---ACGCC-AC---AAACATTtacttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caA------ATC---A-------TT---TAC-A---A-----A-----C---A--TG-----ACA---GCATG-----CA-----GACATTTG----C---TT--T-ATAG-----------CAT-GT--TA-----A-AAT-T-CAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TAA----------------AACAG-CG-C-AA-A----AG----A-ATTC-T---GTTT--T---TTTC-T--TT-G---ATA----ACAACT-----------GAA---ACACaataactctacctcgatatgcaagtca
gi|32                         :                                                                                                                         tgatgcacTA---TGAAAT--GG-GAAT-A-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CTCTAGC-CTT----ATGT------------CAGTAGAAC-AGTT---TG------CC-TTTATAT--TT----GTTT---TCGCACGA----------GT---T-A-----G---GT-ATATTCTGAT------TAGCTGATATTAT-------AT-TAC---ATG-T------TAT---ATG----CGATA---T-GACCA-T---TG----AAA-Atttcaatatttgaaactttt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AC-A---A-----T-----C---A--CG-----ACGTAAG---G-----TG-----AA-----G----C---TA--G-TTAG-----------CAT-GT--AA-----A-CAT-T-CAAAT-CA------AAA------------G-GT--TAA----------------ATCAA-TA-C-AA-A---------------C-A---G--T--T---AT---T--TT-A---ACA----TCTATTATGT---A-A-GAaagtt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgatattgc---TT--T-GTGG-----------CAT-GA--AA-----A-CAT-T-CAAAA-C-------AAAC-----------A-GT--CAA----------------AACCT-TG-C-AA-A----AA----ATG--T-A------C--T---TTTC-TTATC-----ATA----CGGACTATCT---G-G-GGA---AAGTT-GC---AAACATtgatcttgaaacattctcaactctaacttgatatgca
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gatatcagacagaca-----GG-----G----T---TT--TAGTGA-----------CAT-TT--GA-----A-CTT-T-CGAAA-CA------GAAG-----------G-GT--CAA----------------AATGA-T--T-AA-A----AA----A-G--T-T---T--T--C---TTTCTT--TC-ATTCATA----TCGATCTTTT---A-A-GGA---A---C-TT---GAATATTCgtgaaactctaccttgatatgcaaggtgcagta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -----G---G-----TG-----AG-----G----T---TT--T-GTGG-----------CAT-GT--GA-----A-CAT-T-CCAGA-TA------TTAG-----------A-TT--CAA----------------AACAG-TA-C-AT-G----AA----A-T--T-T---G--T--T---TTTC-T--TT-A---ATA----TTGACTGCTA---A-A-TAC---ACGCC-gaagctctcatatgaaatacagaaca
gi|38                         :                                                                                                                                                                                  -----CACGTGG-CTG----ACAA-------------AGTAGAAC-TGTT---CA------GT-TT-----------------------CACGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCACAT------TA----------------TAAT--AC---ATG-T--A---T-T---ATG------------------A-T---TG----AAA--C-TGCT--TC-AAAaaa
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gi|4                          :                                                                                                                                           atgaG-AAAT-A-T-TT----A-C--AT-G------GTA------ATGTGG-CTG----CCAA------------CAGTAGACC-CGTT---TA------TC-TT--TAA--CT----GTTC---TTACATAT----------GC---C-T-----C---TC-TAATTCAGAT------TAACTGAAATATTGGT-CTAATGTGT---ATT-T--A--CTAT---G--------------------A-T---TG----AAA-AC-TGCA--TC-AAAT-GATTGAG--TG-----ACAG--A---TAAA--C--T---T------TT-TTTTTTAATAC--C-AT-T-TGT--CTCA-TAT----A-G-----AAT-TT------TT-G----ATT------GA---TTGGC-C-AGT---TTCCATTGG-------------------CTA------TTC---A-------TG---ACA-A---A-----T-----C---A--TGCCAAGA-----G---G-----TG-----GA-----G----C---TT--A-GTGATATTTTAGTTACAT-GTTTAA-----A-CTA-T-CAAAA-CA------AAAT-----------G-GC--CGA----------------TACGC-TG----------------------------G--T--T---TCTT-T--T------ATACTGTTAGACTTCTT---A-A-GAA---ATGCT-GT---GAGCATTTAttatgtac
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gi|41                         :                                                                                                                                       CAGAG--GG-AAAT-T-T-AT----A-C--AT-G------GTG-----CACGTGA-CTG----AAGA------------CAGTAAAGC-TGTT---Tctgccttataattgacttttg
gi|5                          :                                                                                                                                               aatgaT-G-T-AT----ATC--AT-G------GTG-----CACACAA-CTT----GTGA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--GAA--CT----AAAC---TTACACTC----------GA---T-T-----G---GT-CATTTCAGAC----------------AAT--T------GTAC---A-----------------------C---AG--T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TGCT--TC-AAAT-GACTGAT---------------A---TACA-AC--T---AGAATGTTT-T-----AA-AG--T-CA-T-TG---TT---TAC----A-C------ATATT------TT-G----ACT------AA---TGAGT-C--AT---TTTTGCT---------------------CTA------ATC---A-------TC----AT-G---A-----T---------G--TG-----A-----G---A-----CA-----AC-----G----T---TT--T-GTGG-----------CTT-GT--GA-----A-ATA-T-CAAAA-CAATAGGCAAAG-----------G-AT--CAG----------------AACAGCTG-A-AA-A----AA----ATG--C-T---G--T--T---TTTC-T--tcaattctaatgttttccct
gi|6                          : tagtgttccttttattaatgctctgagcatgagagaaggtggagtattttactatgccttgcattatctccaatttacaataagttaaaacaattctgatattatttTCA----AGACAATGC-T-GTCA---TCAAAA--TG-AGAT-G---------A-C--------------G-----CATGTGA-AAA----GTAA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--TAC--AT----GTACCT-TCACACACAATGTCATATGA---T-T-----G---GC-AGATTCAGGT------AAGGTGAAATAAT--T-CAAATGTGT---AAG-T--A--ATAT---ACG----C--------------------------------------------T-GATTGAC---------A--G--C---TAGA-ACCTT---A------AT-T-----AA-GC--C-TA-T-TG---GT---TAC----A-A-----GATGCT------TT-G----ACT------GA---TAGGT-T-GAT---TTCCACTGG-------------------CTA------ATC---A-------AC---AAC-A---G-----T-----C---G--TG-----A-----T---G-----AG-----AG-----GCAGAC---TT--T-GTAA-----------CAT-GT--GA-----A-ATA-T-AAAAA-AA------AAAGAAAGAGAAAAAG-AT--CAG----------------AACAA-GG-CGGA-A----AG----A-T--C-ACT-GT-T--T---TTTC-G--TT-G---ATA----GCAAATATTT---A-A-GAA---ACATC-AC---AAACATTTA
gi|7                          :                                                                                               CTCAT---TTAGGTAAGTTCAAACAA-CCTC-AATA---TCAAAG--AGTAAAT---T-GT----A-C--AT-G------GGG-----TGCATAAACTG----ACGA------------CAGTAAAGA-TGTT---TG------CT-AT--TAC--CT----ATTC---TCGCA---------------------------------TGATTCAGTT------TACCT-AAGTTAT--T-TTGATGTA----ATT-T--A--------------------A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCT--TCAAAAT-GGTGAAC--TG-----A--C--AAC-TAA---T--T---T------TT-T------------C-AA-T-TG---CT---TAC----A-CCTATATATACT------TT-G----ACTATTAGAAA---TAGGC-C-TGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TC----AC-AT--A-----TCTTGCC---A--TG-----A-----G---G-----CT-----AA-----G----C---TTTAT-ATAA-----------CAT-GT--GA-----A-CAA-T-CAAaaacttttgatatga
gi|8                          :                                                   atcactaacattttgataacaaaggtcaaaatgaagttgctatctcagataattttgatgtcattcatgaaaagaaactA---TCAAAGTGAG-AAAT-A-T-GT----A-C--ATTG------GTA-----CACATGA-CTG----ACAA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------TT-TT--TAC--CT----GCCCACCTAACATGT----------GA---T-T-----G---GC-TGATACAGGT------T----------------TTAATGAAC---ATG-G--T--ATGT---AGG----C---ACTGT-GGTTA-A---TA----AAA-AT-TGCT--TC-AAAT-GACTGAC--TG-----A--G---------A-GC------A------TTGT-----AA-AGC-T-AG-T-TA---TT---TAC----A-A-----GAAGGT------TT-C----ATC------AA---TAGAC-T-GAT---TCCCATTGGCTAGGCCGGGTACCATTGGCTA------ATC---A-------TT---ACC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----T---GTCATATG-----GG-----A----T---TT--T-GTGA-----------CAT-GT--GA-----A-CTA-
gi|9                          :                                                                                       tagttttctctggagtaatacatctgagcactgaagtgtaggtggaataattactggagtagctccctcatcaccagtcaca------GTT-----CACATGA-CTA----ATGA------------CAGTATATA-AGTT---TG------CT-AT--TAC--TT----ATTC---ACAATTAC----------AA---T-T-----T---GG-TGAATCAGAT------TAGGAGAAATAAT--T-CTGATTAAC---ATG-C--ATCATGC---AC-----C---A---T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TG-----------------AC---------A--G--T---TAAA-AC--T---T------TT-TT----AA-AG-----A-C-TGTATCT---GAC----A-T-----GATGTA------TG-A----ACT------GA---TACGC-T-GGT---TTCCATTGA-------------------CTA------------A-------TT---GCC-A---G-----T-----C---A--TGATACAA-----G---G-----CG-----GA-----G----C-------T-GTG--------------T-GT--AA-----A-TTG-T-CCAAT-CA------AAA------------G-GT--CAG----------------ACCAG-TGAC-TA-A----AA----G-T--C-ACC-A--C--A---TTTC-T--TT-G---AT-----TTAATTTTTTTTAA-A-GAAATCATGCCAAC---AAACATTCA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :                                                                                       NNTTTNCACTC-T---TTAGATCA----AAACGA-GC-C-GTTA---TCAAAG--GG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--TAC--CT----ATTC---TCACACGC----------GA---T-T-----G---GC-CGATTCAGAT------TAGCTGAAATAAT--T-TTAATGTAC---ATG-T--A--ATAT---ATG----C---A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCT--TC-AAAT-GACTGAC--TG-----A--G--A---TAAA-GC--T---A------TT-T-----AA-AG--T-AA-T-TG---CT---TAC----A-C-----GATGTT------TT-G----ACT------GA---TAGGC-C-GGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----C---TT--T-GTGA-----------CAT-GT--GA-----A-CNA-T-CAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------AACAG-TG-C-AA-A----AA----A-G--C-A---G--T--T---TTTC-T--TC-G---ATA----TCGACTNTTT---A-A-GAA---ACGCC-GC---GAACATTCA
Reference ( family-714 )      :                                                                                       NNTTTNCACTC-T---TTAGATCA----AAACGA-GC-C-GTTA---TCAAAG--GG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--TAC--CT----ATTC---TCACACGC----------GA---T-T-----G---GC-CGATTCAGAT------TAGCTGAAATAAT--T-TTAATGTAC---ATG-T--A--ATAT---ATG----C---A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCT--TC-AAAT-GACTGAC--TG-----A--G--A---TAAA-GC--T---A------TT-T-----AA-AG--T-AA-T-TG---CT---TAC----A-C-----GATGTT------TT-G----ACT------GA---TAGGC-C-GGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----C---TT--T-GTGA-----------CAT-GT--GA-----A-CNA-T-CAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------AACAG-TG-C-AA-A----AA----A-G--C-A---G--T--T---TTTC-T--TC-G---ATA----TCGACTNTTT---A-A-GAA---ACGCC-GC---GAACATTCA
gi|1                          :                                                                                         TTTCCACTT-TATGCTAGA-CA----GAACAATGT-A-GATA---TCAAAG--GG-AAAT-G-T-GG----G-C--AT-G------GTG-----CACCTGA-CTG----AAGA------------CAGTAGAGC-AGGT---GG------AT-TT--TAC--CT----ATTC-----ATA-------------AA---TAT-----G---GT----------T------TAGTTGAAATCAT--T-GTAATGTAA---ATG-C--A--ACAT---GTG----A---A---GAGGTAA-T---TG----CAA-GC-TGCT--TT-AAAT-GATTGAT--TGGT---A--G--A---AAGA-AT--T---T------TT-G-----AA-AG--CCAG-T-TC---AT---TGC----A-C-----AACATT------TT-G----ACT------GA---CAGGC-T-AAT---TTCCATTGG-------------------TTA------ATC---A-------TTGCCAAC-A---A-----T-----G---ATGTG-----A-----G---G-----TG-----GG-----A----C---GT--T-ATGA-----------CAT-GC--AA-----T-TTA-T-CAAAA-TA------AAAG-----------G-AT--CAGTGCTAATACAGTACAAAACAG-TG-C-AA-A----AACCTTC-A--T-A---G--T--T---TTTC-T--TT-A---ATA----CTGAATATTT---A-A-CAA---ACACT-G
gi|10                         :                                                               aatacaacaacaactaccatcatgataagttagag-T---TTGGAT-A----AAACAA----C-GTCAGAATAAAAG--AG-AAAA-G-T-AT----A-T--AT-G------ATG-----CACGTGA-CTG----ACGG------------CAGTAAAGC-AGTT---TGCCTAGTCT-TT--TAT--CT----ATTT---ATACAAGC----------GA---T-TAC---G---GC----TTCAGA--------AAAAAAAGTGA---T-CTAATGTAT---A-G-TTCA--GTACGTAATA----C---A---------A-C---TG-----AA-AC-TGAT--TC-ATTT-GACTCAG--TA-----A--ATCACATTAAATGC--C---T------TT-T-----AA-------AA-C-CG---GC---CACGTTGA-C-----AATATT------TT-G----AAT------GAACTT---C-T-GAT---TGCCATTAA-------------------ATA------GTC---A--------T---ACC-A---A-----T-----C---A--TA-----A---------------CGTTCATAG-----A----C---TG--T-ATGA-----------AGT-GT--GA-----A-TAA-T-TAAAA-CA------AAAA-----------T-AT--CAA----------------AACAG-TG-T-AA-A----GA----gaggtcaccatggctaacttaatatttaagaaagtagaaagtgtaaataaaaattcttatattctgtcggtatcttaacaaacttgacta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttat-TTAA-ATACGG-ATA-T--A--CTAT---ATG----CCACA---T-TTTTA-T---TA----AAA-AC-TGCT--TC-AAA--AACTGAA--TG-----A--A--AAC-TAAA-AC--T---A------TT-G-----AA-AG--T-AAGT-TG---CT---TAC----A--------ATG-T------TT-G----TCA------GA---GAGGT-C--AT---TTTTATTGA-------------------CTA------ATT---A-------TT---AAT-A---G-----T-----C---A--TG-----A-----A---G-----TG-----AGACAT-G----C---TT--T-GTGG-----------CAT-GT--GG-----G-TTA-C-TCAAA-CA------GAAA-----------G-GT--TTG----------------AATAG-TG-C-AA-T----AA----A-A--C-ACTCG--T--T---TCCC-T--TT-G---ATA----TCAACTGTTT---A-A-GAA---ACACC-AT---GGACTTTtcta
gi|12                         :                                                                                                                                 TA---TCAGAG--GC-AAA-----------------AT-G------CTG-----CATGCAA-CTG----ATGA------------CAGTAAGGC-TGTT---TG------TT-TT--TAC--C-----AATC---TCGCAAGT----------GAGATT-T-----G------CG---CAGAT------TTGCAGAAACAAC--C-GTAATGTAC---AAA-T--G--AAAT---ATGACACC---G---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCTTATT-ACAT--ACTGACA-TATTAACA--G--C---TAAA-AC------A------TT-T-----AA-AAGCC-AG-T-TG---CT---TAC----CTC-----TATGTT------TT-G----ACT------GA---TAGGC-A-CAT---TTTCATAGG-------------------CTG------ATC---A-------T-----ACTA---A-----C-----T---A--TG-----T-----T---G-----CG-----AG-----G----C---gaatccctaacttgatacatgtatgtatggtgtagtatttattttattttgaagaaatgtatttacacttgataccttatgga
gi|13                         :                           gattcagtttgtaaatgtttactacacccaatataataagttagagaatgtccatatacgataataacactga---TTAGATAA----AAAC-A-GC------A---TCAAAC--GG-AAGT-A-TTAT----A----AT-A------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CCA-AGAGC-TCTT---TG------CT-AC---GC--CTCAGTATTC---TCACAAGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATTCGAAT------AAACTGAAATAAT--T-TGAAGGTGC---TTA-T--A--ATAT-----------------------CA-C---TG----AAA-A---AGT--TT-AAAT-GACTGAT--TG-----G--C--A---TAAA----------------------------AG--T-AA-T-------T---TA-------------AATATT------TT-G----ATG------AA---TAGAC-T-G-----------CGG-------------------CTA------AAC---A-------TTGA-AAC-AC--A-----T-----TTAGA--TC-----A-----G---T-----C------GG-----A----T---TT--T-GTAG-----------CA--AT--GA-----A-CAT-T-TAAAA-agacat
gi|14                         :                                               ataaataaattatactacgcctaaattgtgtaacagtattgagaatctcagcattacgAGATCC----AACAGA-GT-T-GCTA---TCAAAG--AG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-GATACACGTGACTGACACGTGA-CTG----AAGA------------CTGTAGATT-AGTT---TA------CT-TC--CAA--TT----ACTC---TCACAAGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCAGAC------CAGCTTAAAAAAG--T-TTATTGTAC---ATG-T------TAT---ATG----C---A---T-TGT-A-G---TGTTTCAAACAC-TGTT--TC-AGAT-AACTGAC--T---------G--G---T--A-GC--C---A---------------GA-AC--T-GA-T-T----TT---GAC----A-T-------TGTT------TT-GTGTAACT------GA-------C-C-GTT---TTCCACTAG-------------------CTT------ATT---A-------CC---GAT-A---C-----T-----T---G--TGTGA--A-----A---A-----TG-----AA-----G----C---TT--T-GTAA-----------C
gi|15                         :                                                                                          aatctatttctactgaatgta----AAACAACAC-C-ATTA---TCAAAA--GG-AAA--G---GT----A-C--ATTG------GTG-----CACATGA-CTG----AT-A------------CAATGGAGC-TGTT---CG------GTATT--TAT--CC----ATTC---TCACACAT-----------A---T-G-----A---GC-CAATT---------------TGAAACAAT--T-TGAATATAC---ATG-T--A--ATAT---
gi|16                         :            gtatatatcttccaattgataaaaaatgtcatattactttggcttgcattaaccaagtatgagaatctctgcattacattagataaaaatttTAAATAA----AAACAA-CG-C-GTTA---TCACAA--GG-A-------------------------------------CACGTGA-TTG----ACGA------------CAGTAGAAC-TGTTAA-TG---------TT--TAC--CT----AGTC---TATCACGC----------GA---T-T-----G---AC-CAATCCAGAT------TGTCTGAAA---------TAATGTAC---AAG-T--A--AAAT---ATG----T---T---T-GGTCATT---TG----AGA-A--TGCT--TC-AAAT-GTCTGAC----------------------G-GC-------------TC-G-----AA-AT--T-AA-T-T----------------------------TT------TT-A----ACT--------------------GT---TTCCACTGA-------------------CTT------ATC---A-------TC---AAC-A---A-----T-----C---A--TGGTGTTA-----G---G-----TA-----TA-----G----C---TT--G-GTGA-----------CAT-GG--AA-----A-Ctgaaaatatgtaaaacaacagactctgcattaatgacaaacactgttttctttatattgacatattaagaatgcagtgaacattgaaa
gi|17                         :                                                                          agtatgagaagttaagaaatcttcataaaaggcATCA----AAACG---C-A-GATA---TCAAAG--GG-AAAC-A-G-GT----A-G--G--A------GTG-----GATGTGA-CTGTCCGATGAGAATGTTCTAAGCAGTAGAG----TT---TT------CA-TT--TAC--CT----ATTC---ACACATGT----------GA---T-TTTGTGGTTTGC-CAATTGAAAA------TAACTGACATAAT--T-GTA---TAT---ATG-T--G--ATATTCAATG----C-------T-G-TCC-T---TG----AGA-AC-TGCT--TC-AAAT-AAGTGAT--TG-----A--G---------A-G---T---A------TC-----------A--T-A----TG---C----TAA----A-C-----GATGTTAACAGGTTAA----ACT------GA---TATGT-G-GATATATGTCATTTG-------------------TTA------ATC---A-------TT---GTC-A---A-----A-----C---A--agagaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gctga--A--ATAT---GCG----C---A---C-TGCCA-T---TA----AAT-AC-TATT--TC-GAAG-GGCTGAC--TGGC---A--G--C---T-----C--T---A------TT-TT----AA-AG--C----T-T-----C---TAC----A---------------------------ACT------G--------------T---TTCCATTAG-------------------CTA------ATC---AAAATTCATT---ATC-A---A-----T-----C---G--TGGCAGGA-----G---G-----CA-----GG-----A----C---TT--T-GCGA-----------CAT-GC--AA-----A-TTA-T-CAAAAGCA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------TACAA-CA-C-AA-A----AA----AGG--C-T---GCTT--T---TCTC-T--TT-G---ATA----CCAATATTTT---A-A-GGA---ACACC-AC---AAATATTCAa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T--A--AAAT---ATG------------------A-C---TG----GAA-AC-CGCT--TC-AAACCAACTGAC---------A--G--C---TAGA-AC------A------TT-T-----AA-AA----GG-C-TG---CTATTCAC----A-C-----GATGTT------TC-T----AAT------GA---TAGGT-C-AGTCG-TTACAGTCC-------------------CCA------ATC-----------TT---GAC-G---A-------------------G-----A-----G---G-----CG-----GG-----A----C---TT--T-GTGA-----------CGT-AT--GA-----A-CTA-C-CAAAA-CA------AAA------------C-TT--CAG----------------AATAA-TG-C-AA-G----AA----A-GA-C-A---C--TAAT---TTTC-T--TC-G---AAA----CCAACGTTTT---C-A-TAA---ACGCaaactcttgcttgatacacaaggcat
gi|2                          :                                                                                             ttcaC-T---GTAGATCA----AAACAA-TT-CTATTA---TCATCA--GG-AAAT-G---AT----A-CTAAT-G------GTG-----CAAGTGA-CGG----ACAG------------CAATATAAC-TGTT---TA---------TT--TGC---T----A------------GC----------GG---T-T-----A---GC-AGATTAGGATCAACAGTAACTGAA-TCAT--T-TTAATGTGA---ATG-T--A--A-------------C---A---T-GCT---T---T-------A-AC-TA----TC----T-GATTAAC---------A--G--A---TAGA-----T---A------T------------A--T-AA-T-TG-----------------------GATATT------TT-C----ATT------AA---TATG----AGT---CTTCATTTT-------------------CGT------ATC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----ACTTCAG---G-----TG-----AT-----T----T---TT--T-GTGA-----------CTT-GT--AG-----A-C-A-TACGAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CCG----------------GACAG-TG---AA-ATTATAA----C-G--C------------------------C-G---ATA----TTGACTGTTT---T-A-GAT---ATGCA-GT---GAAaaaaaaatatttgatacaaggtatagt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcaccattttaA-AC--T---G------TT-T-----AA-AT--TCAA-G-TG---------AC----A-T-----AATGAT------TC-A----ACT------GA---T-GGC-T-GGT---TTCCTGTGA-------------------TTA------AGC---A-------TT---ACC-A---G-----T-----C---A--TGGC---A-----T---G-----AG-----GT-----G----CAA-TT--T-GTGA-----------CTT-GT--GACTCATA-TTA-T-AAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TTA----------------ATCAG-TG-C-A--------------------A---T--T--T---TTTT-T--TCTA---ATA----CCAAGTTTTT---A-A-GAA---ACGCC-aaactttcgaaatattaacttggtttacaagtactagtactatacaatcctaggttaaagaaaaataaaaatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tactacatcgttctcataaactctttctcactggacgtgttgacagcttgATGTT------TT-G----ACA------GA---TTGGT---GGTAT-TTCCATTGG-------------------CTG------ATC---A-------TT---ATC-A---A-----T-----A---A--TG-----A-----C---G-----TG-----AG-----G----CAGTTT--T-GTCA-----------CTT-GC--GG-----A-CCATT-CGAGA--A------TAAG-----------G-GTTGCA-----------------AATGG-TG-C-AA-A----AA----A-AACT-AAT-G--T--T---ATTC-T--TT-G---ATA----CTGA-TGTTT---A-AGGAA---AAGTT-GT---GAACCTTCttgcccatttga
gi|22                         :                                                                                                                                               a-AAATTA-T-GT----A-C--AC-G------ATG-----CTCTTGA-CT---------------------CTGTATCGCCTGTTCTGTG------TT-TT--TAC--AT----ATTC---ATACACAC----------GA---T-T-----T---GC-CTAT--------------------ATAAT--T-TTAATGTAC---AT-----------T---GTA----C---G---T-GACCG-T---------AAT-A--TGTG--TC-AGAA-GATTGAT--T----------------CACA-GC-----------------------------T-AG-T-TG---GT---TAC----A-C-----AATGGT------TT-C----ACT-----------CAGAC-CAGGA---TTCCAATGG-------------------TTctgacttactggatatgcaaagcgtagactgtatacatgtatatatttctgtgtttaaaaactactg
gi|23                         :                                                                                                                     caaacatgtaataA---TAAAAG------AAT-GCT-GTTATCA-C--AT-G------ATA-----CACATGA--TG------GG------------CAGTACAAC-TGTT---TG------GT-TT--TAC--CT----TATC---TTGTAGAT----------GA---T-T-----G---GC-GAACTGAGAT------TTCCGGAAAC----------ATGTA----ATGAT--A--ATAT----TG----C---------GGTGA-T---GG----AAA-AT-TGCT--TC-TAAT-GATTGAT--TG-----A--
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                         tcttgcataccacatttacttaagaTC---TG------TT-TT--CACATCG----GCTT---TCACATGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATCCAGAT------TAGCTGAATTAAT--T-CCAATGTAT---ATT-T------TAT---AT---------A---T-GGTAA-T---TG----ACA-AC-TGTT--TC-AAAT----TGTT--TG-----A--C--A---TCAA-GA--T---C------GT-G-----AT-AA--T-CA-TATGT--TT---TAC----A-C-----TAT-TT------TT-G----TC-------AA---T--GCAT-TGT---TCTCATTTG-------------------CTT------ATT---A-------TT---TAC-cagctagaagttt
gi|25                         :                                                                                                                                 TA---TCAGAG--GG-AAAT-G-T--T----A-C--AT-G------GTT-----CACATTA-CTG----G-------------------AGAGC-AGTT---TA------CT-TT--GAT--CT----ATTC---TCACATGC----------CA---T-T-----G---GCATGAATTGGGT------TACCTGATATAAT--CATTA--GCACAAAATG-T--A----AT---ATG----C---ACCGT-GGCCG-TGGCTA----CAA-A----CT--TC----T-GATTGAT--TG-----A--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcaaacagtgttgaTTGG-------------------CAA------ATCGTAA-------TT---AAC-ACTGA-----TAA---C---G--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----A---TT--A-GTGG-----------CATCAT--GA-----G-CCA-T-CAAAA-TA------AAAAT----------A-GC--CAG----------------AACAT-TG-C-GATA----AG----A-A--C-T---C--T--TGATTTTC-T--AC-G---ATA----TTGACTGTTT---A-A-GAA---ATGCT-GCATTAAACATTTAcagtaagaac
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTGT---ATG-T------TAT---ATA----C---ACCTT-GGGCA-T---TG----AAA-ACCTGAC--TC-TAGT-GACTGAC--TG-----G-----------AA-GC--C---A---------------GA-AA--T-A----TA--------TAT----A-C-----GAT-CA------TT-G----ACT------GA---TATGG-C-GGT---TTCCATTGA-------------------TTT------ATC---G-------TT---AAT-A---ACCATGT-----C---A--TG-----T-----G---G-----CA-----GT-----GTA--C---TT-----TGG-----------CAT-GT--GA-----A-CTA-T-AAAAG-AA------AAAG-----------aaattataaattgatttaaaaggcacagta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----ACC------GA---TAGGC-T-GGT---ATCCATTGA-------------------CTACTAGTGATC---A-------TT---ACC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----T---G----------------------------TT--T-TT-------------TAT-CG--GA-----A--AA-T-ATAAA-C-------AGAG-----------A-AT--CAG----------------AACAG-TG-A-AA-A----AT----A-G--A-A---A-----C---TTTC-T--TC-A---ATA----T-AATTTTTT---ATA-AAA---A
gi|29                         :                                                                                                                                  A---TCATAT--AG-AAAT-G-T-GA----G-C--AT-G------GTG-----CATGTGA-CTG----GCAA------------TAGTAGAGT-AGTT---TG------TT-TT--TGC--CT----GTTC---TTACATAT----------TA---T-T-----G---GC-CAATTCAGAT------TAGCTAAAATAAT--T-ATAACAAAC---ATattaccagtatatgaatatttgtaactgaatgcaag
gi|3                          :                                           atcttgagtaatgcatgtaggtcatggtatatcagacagtgttgggTTTACACTC-T---TTACATTA----AAACGA-GC-C-ATTA---TAAAAA--GG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CATGTGG-CTG----AAGA------------CGGTAGAGC-AGTT---TG------TT-TT--TAC--AT----ATTC---TCTCGTGC----------GA---T-T-----G---GC-CAATACAGAT------CACCTAAACTGAT--T-TAAATATGC---ATA-T--A--GTAT---ATGC---C---A---G-GGTCA-T---TG----AGA-AT-GGTT--TC-AAAT-AGTTAATTGTG-----A--G--A---TGAA-GC--T---A------TT-T-----AA-AG--T-AATT-TG---TT---TTC----A-T-----GATATT------TT-G----ACT------GA---TACAC-A-GGT---TTCCATTAG-------------------CTA------TTC---A-------TT---AAC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----G---G-----CG-----GG-----G----C---TT--T-GTAA-----------CGC-AT--GA-----A-CAA-T-CAAAA-TG------TAAT-----------G-GT--CAG----------------GACAG-TG-T-GA-A----AA----A-G--C-A---G--T--T---GTTC-T--CT-G---ACA----TCAACCTTTT---A-A-ATA---GCACT-GT---GGTTATTCAt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gcTA------ATT---AAG-----TT---AAC-A---G-----T-----C---A--TG-----ACACCAG---G-----CG-----AG-----G----A---TG--C-GTGT-----------TAT-GT--GC-----A-CAT-T-CAAAT-TA------TTAG-----------A-GT--CA-----------------AATAG-TG-T-TA-A----AA----T-A--T-T---G--C--T---GCTC-T--TT-G---ACA----TCAAATGTC--------AAA---ACGCC-AC---AAACATTtacttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caA------ATC---A-------TT---TAC-A---A-----A-----C---A--TG-----ACA---GCATG-----CA-----GACATTTG----C---TT--T-ATAG-----------CAT-GT--TA-----A-AAT-T-CAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TAA----------------AACAG-CG-C-AA-A----AG----A-ATTC-T---GTTT--T---TTTC-T--TT-G---ATA----ACAACT-----------GAA---ACACaataactctacctcgatatgcaagtca
gi|32                         :                                                                                                                         tgatgcacTA---TGAAAT--GG-GAAT-A-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CTCTAGC-CTT----ATGT------------CAGTAGAAC-AGTT---TG------CC-TTTATAT--TT----GTTT---TCGCACGA----------GT---T-A-----G---GT-ATATTCTGAT------TAGCTGATATTAT-------AT-TAC---ATG-T------TAT---ATG----CGATA---T-GACCA-T---TG----AAA-Atttcaatatttgaaactttt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AC-A---A-----T-----C---A--CG-----ACGTAAG---G-----TG-----AA-----G----C---TA--G-TTAG-----------CAT-GT--AA-----A-CAT-T-CAAAT-CA------AAA------------G-GT--TAA----------------ATCAA-TA-C-AA-A---------------C-A---G--T--T---AT---T--TT-A---ACA----TCTATTATGT---A-A-GAaagtt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgatattgc---TT--T-GTGG-----------CAT-GA--AA-----A-CAT-T-CAAAA-C-------AAAC-----------A-GT--CAA----------------AACCT-TG-C-AA-A----AA----ATG--T-A------C--T---TTTC-TTATC-----ATA----CGGACTATCT---G-G-GGA---AAGTT-GC---AAACATtgatcttgaaacattctcaactctaacttgatatgca
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gatatcagacagaca-----GG-----G----T---TT--TAGTGA-----------CAT-TT--GA-----A-CTT-T-CGAAA-CA------GAAG-----------G-GT--CAA----------------AATGA-T--T-AA-A----AA----A-G--T-T---T--T--C---TTTCTT--TC-ATTCATA----TCGATCTTTT---A-A-GGA---A---C-TT---GAATATTCgtgaaactctaccttgatatgcaaggtgcagta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -----G---G-----TG-----AG-----G----T---TT--T-GTGG-----------CAT-GT--GA-----A-CAT-T-CCAGA-TA------TTAG-----------A-TT--CAA----------------AACAG-TA-C-AT-G----AA----A-T--T-T---G--T--T---TTTC-T--TT-A---ATA----TTGACTGCTA---A-A-TAC---ACGCC-gaagctctcatatgaaatacagaaca
gi|38                         :                                                                                                                                                                                  -----CACGTGG-CTG----ACAA-------------AGTAGAAC-TGTT---CA------GT-TT-----------------------CACGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCACAT------TA----------------TAAT--AC---ATG-T--A---T-T---ATG------------------A-T---TG----AAA--C-TGCT--TC-AAAaaa
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aa-----C---A--TG-----A-----G---A-----AG-----GA-----C----T---TT--T-GTGA-----------CAT-GA--AA-----AGCTA-T-CGAAA-CG------TGAG-----------ATGT--CAA----------------ACCCG-TG-C-AA-A----A----------CGA---G--T--T---TTTT-T--T
gi|4                          :                                                                                                                                           atgaG-AAAT-A-T-TT----A-C--AT-G------GTA------ATGTGG-CTG----CCAA------------CAGTAGACC-CGTT---TA------TC-TT--TAA--CT----GTTC---TTACATAT----------GC---C-T-----C---TC-TAATTCAGAT------TAACTGAAATATTGGT-CTAATGTGT---ATT-T--A--CTAT---G--------------------A-T---TG----AAA-AC-TGCA--TC-AAAT-GATTGAG--TG-----ACAG--A---TAAA--C--T---T------TT-TTTTTTAATAC--C-AT-T-TGT--CTCA-TAT----A-G-----AAT-TT------TT-G----ATT------GA---TTGGC-C-AGT---TTCCATTGG-------------------CTA------TTC---A-------TG---ACA-A---A-----T-----C---A--TGCCAAGA-----G---G-----TG-----GA-----G----C---TT--A-GTGATATTTTAGTTACAT-GTTTAA-----A-CTA-T-CAAAA-CA------AAAT-----------G-GC--CGA----------------TACGC-TG----------------------------G--T--T---TCTT-T--T------ATACTGTTAGACTTCTT---A-A-GAA---ATGCT-GT---GAGCATTTAttatgtac
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aa---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-AGCT--TT-AGAT-GATGGAC---------A--G--A---C--A-GC--TAGAA------CT-T-----AT-AG--TCAA-T-TG---CT---GAT----A-C-----aaactttaaatcaatatgcagggtgtaaataaaggga
gi|41                         :                                                                                                                                       CAGAG--GG-AAAT-T-T-AT----A-C--AT-G------GTG-----CACGTGA-CTG----AAGA------------CAGTAAAGC-TGTT---Tctgccttataattgacttttg
gi|5                          :                                                                                                                                               aatgaT-G-T-AT----ATC--AT-G------GTG-----CACACAA-CTT----GTGA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--GAA--CT----AAAC---TTACACTC----------GA---T-T-----G---GT-CATTTCAGAC----------------AAT--T------GTAC---A-----------------------C---AG--T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TGCT--TC-AAAT-GACTGAT---------------A---TACA-AC--T---AGAATGTTT-T-----AA-AG--T-CA-T-TG---TT---TAC----A-C------ATATT------TT-G----ACT------AA---TGAGT-C--AT---TTTTGCT---------------------CTA------ATC---A-------TC----AT-G---A-----T---------G--TG-----A-----G---A-----CA-----AC-----G----T---TT--T-GTGG-----------CTT-GT--GA-----A-ATA-T-CAAAA-CAATAGGCAAAG-----------G-AT--CAG----------------AACAGCTG-A-AA-A----AA----ATG--C-T---G--T--T---TTTC-T--tcaattctaatgttttccct
gi|6                          : tagtgttccttttattaatgctctgagcatgagagaaggtggagtattttactatgccttgcattatctccaatttacaataagttaaaacaattctgatattatttTCA----AGACAATGC-T-GTCA---TCAAAA--TG-AGAT-G---------A-C--------------G-----CATGTGA-AAA----GTAA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--TAC--AT----GTACCT-TCACACACAATGTCATATGA---T-T-----G---GC-AGATTCAGGT------AAGGTGAAATAAT--T-CAAATGTGT---AAG-T--A--ATAT---ACG----C--------------------------------------------T-GATTGAC---------A--G--C---TAGA-ACCTT---A------AT-T-----AA-GC--C-TA-T-TG---GT---TAC----A-A-----GATGCT------TT-G----ACT------GA---TAGGT-T-GAT---TTCCACTGG-------------------CTA------ATC---A-------AC---AAC-A---G-----T-----C---G--TG-----A-----T---G-----AG-----AG-----GCAGAC---TT--T-GTAA-----------CAT-GT--GA-----A-ATA-T-AAAAA-AA------AAAGAAAGAGAAAAAG-AT--CAG----------------AACAA-GG-CGGA-A----AG----A-T--C-ACT-GT-T--T---TTTC-G--TT-G---ATA----GCAAATATTT---A-A-GAA---ACATC-AC---AAACATTTA
gi|7                          :                                                                                               CTCAT---TTAGGTAAGTTCAAACAA-CCTC-AATA---TCAAAG--AGTAAAT---T-GT----A-C--AT-G------GGG-----TGCATAAACTG----ACGA------------CAGTAAAGA-TGTT---TG------CT-AT--TAC--CT----ATTC---TCGCA---------------------------------TGATTCAGTT------TACCT-AAGTTAT--T-TTGATGTA----ATT-T--A--------------------A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCT--TCAAAAT-GGTGAAC--TG-----A--C--AAC-TAA---T--T---T------TT-T------------C-AA-T-TG---CT---TAC----A-CCTATATATACT------TT-G----ACTATTAGAAA---TAGGC-C-TGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TC----AC-AT--A-----TCTTGCC---A--TG-----A-----G---G-----CT-----AA-----G----C---TTTAT-ATAA-----------CAT-GT--GA-----A-CAA-T-CAAaaacttttgatatga
gi|8                          :                                                   atcactaacattttgataacaaaggtcaaaatgaagttgctatctcagataattttgatgtcattcatgaaaagaaactA---TCAAAGTGAG-AAAT-A-T-GT----A-C--ATTG------GTA-----CACATGA-CTG----ACAA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------TT-TT--TAC--CT----GCCCACCTAACATGT----------GA---T-T-----G---GC-TGATACAGGT------T----------------TTAATGAAC---ATG-G--T--ATGT---AGG----C---ACTGT-GGTTA-A---TA----AAA-AT-TGCT--TC-AAAT-GACTGAC--TG-----A--G---------A-GC------A------TTGT-----AA-AGC-T-AG-T-TA---TT---TAC----A-A-----GAAGGT------TT-C----ATC------AA---TAGAC-T-GAT---TCCCATTGGCTAGGCCGGGTACCATTGGCTA------ATC---A-------TT---ACC-A---A-----T-----C---A--TG-----A-----T---GTCATATG-----GG-----A----T---TT--T-GTGA-----------CAT-GT--GA-----A-CTA-
gi|9                          :                                                                                       tagttttctctggagtaatacatctgagcactgaagtgtaggtggaataattactggagtagctccctcatcaccagtcaca------GTT-----CACATGA-CTA----ATGA------------CAGTATATA-AGTT---TG------CT-AT--TAC--TT----ATTC---ACAATTAC----------AA---T-T-----T---GG-TGAATCAGAT------TAGGAGAAATAAT--T-CTGATTAAC---ATG-C--ATCATGC---AC-----C---A---T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TG-----------------AC---------A--G--T---TAAA-AC--T---T------TT-TT----AA-AG-----A-C-TGTATCT---GAC----A-T-----GATGTA------TG-A----ACT------GA---TACGC-T-GGT---TTCCATTGA-------------------CTA------------A-------TT---GCC-A---G-----T-----C---A--TGATACAA-----G---G-----CG-----GA-----G----C-------T-GTG--------------T-GT--AA-----A-TTG-T-CCAAT-CA------AAA------------G-GT--CAG----------------ACCAG-TGAC-TA-A----AA----G-T--C-ACC-A--C--A---TTTC-T--TT-G---AT-----TTAATTTTTTTTAA-A-GAAATCATGCCAAC---AAACATTCA


blockSeqs                     :                                                                                            A     A .        A GTTC    AACACC   T  GAA      TG  T    GCTGTTATC   T TA  T ATACAC   ACTGA       A   TCCGAT  GAATGTTCTAAG         CT   CTG  CCTAGTC A  TA   AT  CAGT    ACC     CACAATGTCATAT  GAT . TTGTGGTTT  AT         CAACAGTAA       G  GGTC         AAA   A GAAATATGACACCGTGGTC               T GGC  TTTC   C CC  A TA  A    C       TGACAGATAAACTTTTTTTTTTAATACCATTTGTCTCATATAGA                                              A  AACAGG  A TGTA   ATTAGA  TATGTGGATATA              CTAGGCCGGGTACCATTGG   CTAGTG   GTA AAATTCA  GA    T CTG CCATG CTTGC TAG .   ACAGCATGCAGACATTTGC                           TA A    TATTTTAGTTA   C  TT  CTCAT G CAT A     G  ATAGGC   GAAAGAGAAAAA T  TG  A                     C  CG   T TTAT  AAACTAATG          AA GAT    T TA CATTC    CTGT    C G   TTA T G   ATC     A  ATT
blockSeqs                     :                                                                                                  . .        C .       AATTCT   C  .        .   .    ATTAT       . .   T .        .           .   AC      .                    A    AA   T       .  .    .   .       CT      AGC            .   . ACG        C          TTG             A  CAT          GG    . ACTATATGCCACATTTTT                . .    .      . C   C .   .    .       ATATTAACAGCTAAAACATTTAAAAGCCAGTTGCTTACCTCT                                                G  .       . .      .       TAGGTCAGTCG               .                     .        .   AG       .     . C   .     AA    .   .   GTGTTAGGTATAGC                                .  .    .             .  .   .     . AA  .     .  .        AT           .  .   G                     .  AC   . .     AATTCTGTT          .  .      . .  CTA      .       T T   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                  . .        A .       AATGCT   T  .        .   .    TATGT       . .   . .        .           .   AT      .                    T    .    C       .  .    .   .       .       AGT            .   . G          C          AAA             A  TC           .     . TATGTAGGCACTGTGGTT                . .    .      . C   C .   .    .       TAAATCACATTAAATGCCTTTTAAAACCGGCCACGTTGACA                                                 G  .       . .      .       TTGGTGGTAT                .                     .        .   .        .     . T   .     .     .   .   GCAGGAGGCAGGAC                                .  .    .             .  .   .     . TA  .     .  .        A            .  .   G                     .  T    . .     AACACTCG           .  .      . .  TG       .       C T   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                  . .        C .       AACCTC   T  .        .   .    GTAT        . .   . .        .           .   AC      .                    T    .    C       .  .    .   .       .       AGC            .   . C          C          CAG             A  CG           .     . GATATTCAATGCTGTC                  . .    .      . C   G .   .    .       TGTGAGATGAAGCTATTTAAAGTAATTTGTTTTCATG                                                     A  .       . .      .       CAGACCAGGA                .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   ACTTCAGGTGATTT                                .  .    .             .  .   .     . AT  .     .  .        A            .  .   G                     .  C    . .     AGGCTGCT           .  .      . .  TG       .       C G   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                    .        C .       GAGTT    A  .        .   .    GTGT        . .   . .        .           .   AA      .                    A    .    G       .  .    .   .       .       AGC            .   . A          C          TGT             A  TT           .     . AATATGCACCGTGGCC                  . .    .      . C   T .   .    .       TGACATCAAGATCGTGATAATCATATGTTTTACACT                                                      G  .       . .      .       ACTTCTGAT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   ACACCAGGCGAGGA                                .  .    .             .  .   .     . TA  .     .  .        G            .  .   G                     .  C    . .     ATCACTGT           .  .      . .  CG       .       G T   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                             T .       AACGC    T  .        .   .    AGGT        . .   . .        .           .   AT      .                    T    .    C       .  .    .   .       .       CAT            .   . A          C          TAA             A  TT           .     . TATATACACCTTGGGC                  . .    .      . C   C .   .    .       TGAAAACTAAAACTATTGAAAGTAAGTTGCTTACA                                                       G  .       . .      .       TAGGCACAT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   ACGTAAGGTGAAGC                                .  .    .             .  .   .     . TA  .     .  .        G            .  .   A                     .  C    . .     GTCACCA            .  .      . .  CG       .       C G   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                             C .       GAGCC    T  .        .   .    GTGA        . .   . .        .           .   AC      .                    T    .    T       .  .    .   .       .       CGC            .   . G          C          TTC             C  TT           .     . AGTATATGCCAGGGTC                  . .    .      . C   C .   .    .       ATACAACTAGAATGTTTTAAAGTCATTGTTTACAC                                                       G  .       . .      .       TATGGCGGT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   CCAAGAGGTGGAGC                                .  .    .             .  .   .     . TA  .     .  .        G            .  .   G                     .  C    . .     AGACAC             .  .      . .  TG       .       T G   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                             A .       AAC      T  .        .   .    GTGT        . .   . .        .           .   AC      .                    T    .    G       .  .    .   .       .       TGT            .   . A          A          TAG             A  TG           .     . TATATGCGATATGACC                  . .    .      . C   T .   .    .       TGACAACTAATTTTTTCAATTGCTTACACCTATAT                                                       A  .       . .      .       TAGGCTGGT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   ATGTCATATGGGAT                                .  .    .             .  .   .     . CA  .     .  .        G            .  .   G                     .  C    . .     ATGCTG             .  .      . .  CG       .       C T   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                             . .       AGC      A  .        .   .    ATGT        . .   . .        .           .   GC      .                    T    .    T       .  .    .   .       .       CAC            .   . T          C          TAC             A  TT           .     . ATCATGCACCATGGTC                  . .    .      . C   C .   .    .       AGCTAGAACCTTAATTAAGCCTATTGGTTACAAG                                                        G  .       . .      .       TACACAGGT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   ATACAAGGCGGAGC                                .  .    .             .  .   .     . TA  .     .  .        G            .  .   G                     .  C    . .     AACTC              .  .      . .  CA       .       A T   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .       GCA      .  .        .   .    ATTT        . .   . .        .           .   AA      .                    A    .    C       .  .    .   .       .       GAT            .   . G          G          TAG             A  TT           .     . TCAGTACGTAATACA                   . .    .      . T   T .   .    .       AGTTAAAACTTTTTTAAAGACTGTATCTGACATG                                                        G  .       . .      .       TTGGCCAGT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   AAGTGAGACATGC                                 .  .    .             .  .   .     . AA  .     .  .        G            .  .   A                     .  A    . .     AGAAA              .  .      . .  TG       .       C G   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .        .   .    TTAT        . .   . .        .           .   AT      .                    A    .    T       .  .    .   .       .       TGC            .   . C          C          CAC             A  TC           .     . AAAATATGTTTGGTC                   . .    .      . C   C .   .    .       AGCTAGAACATTTAAAAGGCTGCTATTCACACG                                                         G  .       . .      .       TAGGTTGAT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   GCATGAGGTGCAA                                 .  .    .             .  .   .     . AA  .     .  .        T            .  .   A                     .  T    . .     AGCAG              .  .      . .  TG       .       T A   .   . .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .        .   .    GTAT        . .   . .        .           .   AC      .                    A    .    T       .  .    .   .       .       TGC            .   . G          C          TAG             G  TA           .     . AATATGCGCACTGCC                   . .    .      . T   T .   .    .       TGAGAGCATTGTAAAGCTAGTTATTTACAAG                                                           A  .       . .      .       TAGGCCTGT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   ATGAGAGGCAGAC                                 .  .    .             .  .   .     . AT  .     .  .        G            .  .   A                     .  T    . .     TATTG              .  .      . .  TG       .       C A   .   . .   .       .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .        .   .    ATGT        . .   . .        .           .   CC      .                    A    .    C       .  .    .   .       .       TAT            .   . G          C          TAA             T  TT           .     . TATATGCATTGT                      . .    .      . C   C .   .    .       TGGCAGCTCTATTTTAAAGCTTCTACA                                                               A  .       . .      .       TAGACTGAT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   ACGTTCATAGAC                                  .  .    .             .  .   .     . AT  .     .  .        G            .  .   A                     .  C    . .     ATGTA              .  .      . .  TA       .       T T   .   . .   .       .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .        .   .    GGT         . .   . .        .           .   AA      .                    T    .    G       .  .    .   .       .       TGC            .   . G          A          AAG             A  TC           .     . AATATTGCGGTG                      . .    .      . C   A .   .    .       TGGTAGCCAGAACTGATTTTGACAT                                                                 G  .       . .      .       TACGCTGGT                 .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   TGAAAATGAAGC                                  .  .    .             .  .   .     . AT  .     .  .        C            .  .   A                     .  C    . .     AGTTT              .  .      . .  TA       .       C G   .   . .   .       .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .        .   .    GAT         . .   . .        .           .   GT      .                    C    .    T       .  .    .   .       .       CGA            .   . G          C          TAC             A  TT           .     . TGTACGTGACC                       . .    .      . C   T .   .    .       TGGAAGCCAGAAATATATATACG                                                                   A  .       . .      .       GAGGTCAT                  .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   ACGTGAGGCAGT                                  .  .    .             .  .   .     . AT  .     .  .        G            .  .   A                     .  C    . .     ATTTG              .  .      . .  TG       .       C T   .   . .   .             
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .        .   .    GTT         . .   . .        .           .   GT      .                    T    .    C       .  .    .   .       .       CGC            .   . A          T          TAG             A  TC           .     . TATATATGGTA                       . .    .      . C   C .   .    .       TGAGAGTATCATATGCTAAACG                                                                    G  .       . .      .       TGGCTGGT                  .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   TGGCAGTGTAC                                   .  .    .             .  .   .     . TT  .     .  .        G            .  .   A                     .  T    . .     CGAG               .  .      . .  TG       .       A A   .   . .   .             
blockSeqs                     :                                                                                                                                            .   .    TGT         . .   . .        .           .   AC      .                    T    .    C       .  .    .   .       .       TAT            .   . C          C          AA              T  T            .     . AATATACGC                         . .    .      . C   C .   .    .       TCACAGCTAGTTGGTTACACA                                                                     G  .       . .      .       TGCATTGT                  .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   TTGCGAGGC                                     .  .    .             .  .   .     . AT  .     .  .        G            .  .   G                     .  C    . .     CGC                .  .      . .  C        .       T T   .   . .   .             
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                .    .           . .   . .        .           .   AT      .                    T    .    T       .  .    .   .       .       TGT            .   . G          T          T               .  .            .     . AACATGCT                          . .    .      . C   C .   .    .       AGATAGATATATAATTGG                                                                        .  .       . .      .       TAGACTG                   .                     .        .   .        .     . .   .     .     .   .   AGGCGGGGA                                     .  .    .             .  .   .     . TA  .     .  .        G            .  .   G                     .  A    . .     AT                 .  .      . .                                                 
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-714 )      :                                                                                       NNTTTNCACTC-T---TTAGATCA----AAACGA-GC-C-GTTA---TCAAAG--GG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--TAC--CT----ATTC---TCACACGC----------GA---T-T-----G---GC-CGATTCAGAT------TAGCTGAAATAAT--T-TTAATGTAC---ATG-T--A--ATAT---ATG----C---A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCT--TC-AAAT-GACTGAC--TG-----A--G--A---TAAA-GC--T---A------TT-T-----AA-AG--T-AA-T-TG---CT---TAC----A-C-----GATGTT------TT-G----ACT------GA---TAGGC-C-GGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TT--AAC-A-ATCAT---GAC-GCGAGGCGGA-----G--CTT--T-GTGA-----------CAT-GT--GA-----A-CNA-T-CAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------AACAG-TG-C---A--A--AA-A-----A---T-GCT-G--TTTTTC-T--TCGATA----TCGACTNTTT---A-A-GAA---ACGCC-GC---GAACATTCA
gi|1                          :                                                                                         TTTCCACTT-TATGCTAGA-CA----GAACAATGT-A-GATA---TCAAAG--GG-AAAT-G-T-GG----G-C--AT-G------GTG-----CACCTGA-CTG----AAGA------------CAGTAGAGC-AGGT---GG------AT-TT--TAC--CT----ATTC-----ATA-------------AA---TAT-----G---GT----------T------TAGTTGAAATCAT--T-GTAATGTAA---ATG-C--A--ACAT---GTG----A---A---GAGGTAA-T---TG----CAA-GC-TGCT--TT-AAAT-GATTGAT--TGGT---A--G--A---AAGA-AT--T---T------TT-G-----AA-AG--CCAG-T-TC---AT---TGC----A-C-----AACATT------TT-G----ACT------GA---CAGGC-T-AAT---TTCCATTGG-------------------TTA------ATC---A-------TT--GCC-A-ACAAT---GAT-GTGAGGTGGG-----A--CGT--T-ATGA-----------CAT-GC--AA-----T-TTA-T-CAAAA-TA------AAAG-----------G-AT--CAGTGCTAATACAGTACAAAACAG-TG-C---A--A--AA-ACCTTCA---T-A---G--TTTTTC-T--TTAATA----CTGAATATTT---A-A-CAA---ACACT-G
gi|10                         :                                                               aatacaacaacaactaccatcatgataagttagag-T---TTGGAT-A----AAACAA----C-GTCAGAATAAAAG--AG-AAAA-G-T-AT----A-T--AT-G------ATG-----CACGTGA-CTG----ACGG------------CAGTAAAGC-AGTT---TGCCTAGTCT-TT--TAT--CT----ATTT---ATACAAGC----------GA---T-TAC---G---GC----TTCAGA--------AAAAAAAGTGA---T-CTAATGTAT---A-G-TTCA--GTACGTAATA----C---A---------A-C---TG-----AA-AC-TGAT--TC-ATTT-GACTCAG--TA-----A--ATCACATTAAATGC--C---T------TT-T-----AA-------AA-C-CG---GC---CACGTTGA-C-----AATATT------TT-G----AAT------GAACTT---C-T-GAT---TGCCATTAA-------------------ATA------GTC---A--------T--ACC-A-ATCAT---AAC-GT---TCATA-----GA-CTG--T-ATGA-----------AGT-GT--GA-----A-TAA-T-TAAAA-CA------AAAA-----------T-AT--CAA----------------AACAG-TG-T---A--A--AG-A-----gaggtcaccatggctaacttaatatttaagaaagtagaaagtgtaaataaaaattcttatattctgtcggtatcttaacaaacttgacta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttat-TTAA-ATACGG-ATA-T--A--CTAT---ATG----CCACA---T-TTTTA-T---TA----AAA-AC-TGCT--TC-AAA--AACTGAA--TG-----A--A--AAC-TAAA-AC--T---A------TT-G-----AA-AG--T-AAGT-TG---CT---TAC----A--------ATGTT------T--G----TCA------GA---GAGGT-C-A-T---TTTTATTGA-------------------CTA------ATT---A-------TT--AAT-A-GTCAT---GAA-GTGAGACAT------G--CTT--T-GTGG-----------CAT-GT--GG-----G-TTA-C-TCAAA-CA------GAAA-----------G-GT--TTG----------------AATAG-TG-C---A--AT-AA-A-----A---C-ACTCG--TTTCCC-T--TTGATA----TCAACTGTTT---A-A-GAA---ACACC-AT---GGACTTTtcta
gi|12                         :                                                                                                                                 TA---TCAGAG--GC-AAA-----------------AT-G------CTG-----CATGCAA-CTG----ATGA------------CAGTAAGGC-TGTT---TG------TT-TT--TAC--C-----AATC---TCGCAAGT----------GAGATT-T-----G------CG---CAGAT------TTGCAGAAACAAC--C-GTAATGTAC---AAA-T--G--AAAT---ATGACACC---G---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCTTATT-ACAT--ACTGACA-TATTAACA--G--C---TAAA-AC------A------TT-T-----AA-AAGCC-AG-T-TG---CT---TAC----CTC-----TATGTT------TT-G----ACT------GA---TAGGC-A-CAT---TTTCATAGG-------------------CTG------ATC---A-------T----ACTA-ACTAT---GTT-GCGAGGCAGA-----gaatccctaacttgatacatgtatgtatggtgtagtatttattttattttgaagaaatgtatttacacttgataccttatgga
gi|13                         :                           gattcagtttgtaaatgtttactacacccaatataataagttagagaatgtccatatacgataataacactga---TTAGATAA----AAAC-A-GC------A---TCAAAC--GG-AAGT-A-TTAT----A----AT-A------GTG-----CACGTGA-CTG----ACGA------------CCA-AGAGC-TCTT---TG------CT-AC---GC--CTCAGTATTC---TCACAAGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATTCGAAT------AAACTGAAATAAT--T-TGAAGGTGC---TTA-T--A--ATAT-----------------------CA-C---TG----AAA-A---AGT--TT-AAAT-GACTGAT--TG-----G--C--A---TAAA----------------------------AG--T-AA-T-------T---TA-------------AATATT------TT-G----ATG------AA---TAGAC-T-G-----------CGG-------------------CTA------AAC---A-------TTGAAAC-A---CATTTAGAT--C-AGTCGGA--------TTT--T-GTAG-----------CA--AT--GA-----A-CAT-T-TAAAA-cat
gi|14                         :                                               ataaataaattatactacgcctaaattgtgtaacagtattgagaatctcagcattacgAGATCC----AACAGA-GT-T-GCTA---TCAAAG--AG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-GATACACGTGACTGACACGTGA-CTG----AAGA------------CTGTAGATT-AGTT---TA------CT-TC--CAA--TT----ACTC---TCACAAGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCAGAC------CAGCTTAAAAAAG--T-TTATTGTAC---ATG-T------TAT---ATG----C---A---T-TGT-A-G---TGTTTCAAACAC-TGTT--TC-AGAT-AACTGAC--T---------G--G---T--A-GC--C---A---------------GA-AC--T-GA-T-T----TT---GAC----A-T-------TGTT------TT-GTGTAACT------GA-------C-C-GTT---TTCCACTAG-------------------CTT------ATT---A-------CC--GAT-A-CTTGT---G-T-G-AAAATGAA-----G--CTT--T-GTAA-----------C
gi|15                         :                                                                                          aatctatttctactgaatgta----AAACAACAC-C-ATTA---TCAAAA--GG-AAA--G---GT----A-C--ATTG------GTG-----CACATGA-CTG----AT-A------------CAATGGAGC-TGTT---CG------GTATT--TAT--CC----ATTC---TCACACAT-----------A---T-G-----A---GC-CAATT---------------TGAAACAAT--T-TGAATATAC---ATG-T--A--ATAT---
gi|16                         :            gtatatatcttccaattgataaaaaatgtcatattactttggcttgcattaaccaagtatgagaatctctgcattacattagataaaaatttTAAATAA----AAACAA-CG-C-GTTA---TCACAA--GG-A-------------------------------------CACGTGA-TTG----ACGA------------CAGTAGAAC-TGTTAA-TG---------TT--TAC--CT----AGTC---TATCACGC----------GA---T-T-----G---AC-CAATCCAGAT------TGTCTGAAA---------TAATGTAC---AAG-T--A--AAAT---ATG----T---T---T-GGTCATT---TG----AGA-A--TGCT--TC-AAAT-GTCTGAC----------------------G-GC-------------TC-G-----AA-AT--T-AA-T-T----------------------------TT------TT-A----ACT--------------------GT---TTCCACTGA-------------------CTT------ATC---A-------TC--AAC-A-ATCAT---GGT-GTTAGGTATA-----G--CTT--G-GTGA-----------CAT-GG--AA-----A-Ctgaaaatatgtaaaacaacagactctgcattaatgacaaacactgttttctttatattgacatattaagaatgcagtgaacattgaaa
gi|17                         :                                                                          agtatgagaagttaagaaatcttcataaaaggcATCA----AAACG---C-A-GATA---TCAAAG--GG-AAAC-A-G-GT----A-G--G--A------GTG-----GATGTGA-CTGTCCGATGAGAATGTTCTAAGCAGTAGAG----TT---TT------CA-TT--TAC--CT----ATTC---ACACATGT----------GA---T-TTTGTGGTTTGC-CAATTGAAAA------TAACTGACATAAT--T-GTA---TAT---ATG-T--G--ATATTCAATG----C-------T-G-TCC-T---TG----AGA-AC-TGCT--TC-AAAT-AAGTGAT--TG-----A--G---------A-G---T---A------TC-----------A--T-A----TG---C----TAA----A-C-----GATGTTAACAGGTTAA----ACT------GA---TATGT-G-GATATATGTCATTTG-------------------TTA------ATC---A-------TT--GTC-A-AACAagagaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gctga--A--ATAT---GCG----C---A---C-TGCCA-T---TA----AAT-AC-TATT--TC-GAAG-GGCTGAC--TGGC---A--G--C---T-----C--T---A------TT-TT----AA-AG--C----T-T-----C---TAC----A---------------------------ACT------G--------------T---TTCCATTAG-------------------CTA------ATC---AAAATTCATT--ATC-A-ATCGT---GGC-AGGAGGCAGG-----A--CTT--T-GCGA-----------CAT-GC--AA-----A-TTA-T-CAAAAGCA------AAAG-----------G-GT--CAG----------------TACAA-CA-C---A--A--AA-A-----A---G-GCT-GCTTTTCTC-T--TTGATA----CCAATATTTT---A-A-GGA---ACACC-AC---AAATATTCAa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T--A--AAAT---ATG------------------A-C---TG----GAA-AC-CGCT--TC-AAACCAACTGAC---------A--G--C---TAGA-AC------A------TT-T-----AA-AA----GG-C-TG---CTATTCAC----A-C-----GATGTT------TC-T----AAT------GA---TAGGT-C-AGT------CGTTA---------------------CA------GTC---C-------C-----C-A-ATCTT---GAC-GAGAGGCGGG-----A--CTT--T-GTGA-----------CGT-AT--GA-----A-CTA-C-CAAAA-CA------AAA------------C-TT--CAG----------------AATAA-TG-C---AAGA--AA-G-----A---C-ACT-A--ATTTTC-T--TCGAAA----CCAACGTTTT---C-A-TAA---ACGCaaactcttgcttgatacacaaggcat
gi|2                          :                                                                                             ttcaC-T---GTAGATCA----AAACAA-TT-CTATTA---TCATCA--GG-AAAT-G---AT----A-CTAAT-G------GTG-----CAAGTGA-CGG----ACAG------------CAATATAAC-TGTT---TA---------TT--TGC---T----A------------GC----------GG---T-T-----A---GC-AGATTAGGATCAACAGTAACTGAA-TCAT--T-TTAATGTGA---ATG-T--A--A-------------C---A---T-GCT---T---T-------A-AC-TA----TC----T-GATTAAC---------A--G--A---TAGA-----T---A------T------------A--T-AA-T-TG-----------------------GATATT------TT-C----ATT------AA---TATG----AGT---CTTCATTTT-------------------CGT------ATC---A-------TT--AAC-A-ATCAT---GAC-TTCAGGTGAT-----T--TTT--T-GTGA-----------CTT-GT--AG-----A-C-A-TACGAAA-CA------AAAG-----------G-GT--CCG----------------GACAG-TG-A---A--ATTAT-A-----A---C-GC----------------CGATA----TTGACTGTTT---T-A-GAT---ATGCA-GT---GAAaaaaaaatatttgatacaaggtatagt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcaccattttaA-AC--T---G------TT-T-----AA-AT--TCAA-G-TG---------AC----A-T-----AATGAT------TC-A----ACT------GA---T-GGC-T-GGT---TTCCTGTGA-------------------TTA------AGC---A-------TT--ACC-A-GTCAT---GGC-ATGAGGTGCA-----A---TT--T-GTGA-----------CTT-GT--GACTCATA-TTA-T-AAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TTA----------------ATCAG-TG-C---A--A-------------------T-T--TTTTTT-T--CTAATA----CCAAGTTTTT---A-A-GAA---ACGCC-aaactttcgaaatattaacttggtttacaagtactagtactatacaatcctaggttaaagaaaaataaaaatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tactacatcgttctcataaactctttctcactggacgtgttgacagcttgATGTT------TT-G----ACA------GA---TTGGT---GGTAT-TTCCATTGG-------------------CTG------ATC---A-------TT--ATC-A-ATAAT---GAC-GTGAGGC--A-----G--TTT--T-GTCA-----------CTT-GC--GG-----A-CCATT-CGAGA--A------TAAG-----------G-GTTGCA-----------------AATGG-TG-C---A--A--AA-A-----AAACT-AAT-G--TTATTC-T--TTGATA----CTGA-TGTTT---A-AGGAA---AAGTT-GT---GAACCTTCttgcccatttga
gi|22                         :                                                                                                                                               a-AAATTA-T-GT----A-C--AC-G------ATG-----CTCTTGA-CT---------------------CTGTATCGCCTGTTCTGTG------TT-TT--TAC--AT----ATTC---ATACACAC----------GA---T-T-----T---GC-CTAT--------------------ATAAT--T-TTAATGTAC---AT-----------T---GTA----C---G---T-GACCG-T---------AAT-A--TGTG--TC-AGAA-GATTGAT--T----------------CACA-GC-----------------------------T-AG-T-TG---GT---TAC----A-C-----AATGGT------TT-C----ACT-----------CAGAC-CAGGA---TTCCAATGG-------------------TTctgacttactggatatgcaaagcgtagactgtatacatgtatatatttctgtgtttaaaaactactg
gi|23                         :                                                                                                                     caaacatgtaataA---TAAAAG------AAT-GCT-GTTATCA-C--AT-G------ATA-----CACATGA--TG------GG------------CAGTACAAC-TGTT---TG------GT-TT--TAC--CT----TATC---TTGTAGAT----------GA---T-T-----G---GC-GAACTGAGAT------TTCCGGAAAC----------ATGTA----ATGAT--A--ATAT----TG----C---------GGTGA-T---GG----AAA-AT-TGCT--TC-TAAT-GATTGAT--TG-----A--
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                         tcttgcataccacatttacttaagaTC---TG------TT-TT--CACATCG----GCTT---TCACATGC----------GA---T-T-----C---GA-CGATCCAGAT------TAGCTGAATTAAT--T-CCAATGTAT---ATT-T------TAT---AT---------A---T-GGTAA-T---TG----ACA-AC-TGTT--TC-AAAT----TGTT--TG-----A--C--A---TCAA-GA--T---C------GT-G-----AT-AA--T-CA-TATGT--TT---TAC----A-C-----TAT-TT------TT-G----TC-------AA---T--GCAT-TGT---TCTCATTTG-------------------CTT------ATT---A-------TT--TAC-cagctagaagttt
gi|25                         :                                                                                                                                 TA---TCAGAG--GG-AAAT-G-T--T----A-C--AT-G------GTT-----CACATTA-CTG----G-------------------AGAGC-AGTT---TA------CT-TT--GAT--CT----ATTC---TCACATGC----------CA---T-T-----G---GCATGAATTGGGT------TACCTGATATAAT--CATTA--GCACAAAATG-T--A----AT---ATG----C---ACCGT-GGCCG-TGGCTA----CAA-A----CT--TC----T-GATTGAT--TG-----A--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcaaacagtgttgaTTGG-------------------CAA------ATCGTAA-------TT--AAC-A-CTGAT---AAC-GTGAGGCGGG-----G--ATT--A-GTGG-----------CATCAT--GA-----G-CCA-T-CAAAA-TA------AAAAT----------A-GC--CAG----------------AACAT-TG-CGATA--A--GA-A-----C---T-CTT-G--ATTTTC-T--ACGATA----TTGACTGTTT---A-A-GAA---ATGCT-GCATTAAACATTTAcagtaagaac
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTGT---ATG-T------TAT---ATA----C---ACCTT-GGGCA-T---TG----AAA-ACCTGAC--TC-TAGT-GACTGAC--TG-----G-----------AA-GC--C---A---------------GA-AA--T-A----TA--------TAT----A-C-----GAT-CA------TT-G----ACT------GA---TATGG-C-GGT---TTCCATTGA-------------------TTT------ATC---G-------TT--AAT-A-ACCAT---GTC-ATGTGGCAGT-----GTACTT-----TGG-----------CAT-GT--GA-----A-CTA-T-AAAAG-AA------AAAG-----------aaattataaattgatttaaaaggcacagta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----ACC------GA---TAGGC-T-GGT---ATCCATTGA-------------------CTACTAGTGATC---A-------TT--ACC-A-ATCAT---GAT-G------------------TT--T-TT-------------TAT-CG--GA-----A--AA-T-ATAAA-C-------AGAG-----------A-AT--CAG----------------AACAG-TG--------A--AA-A-----A---T-AGA-A--ACTTTC-T--TCAATA----T-AATTTTTT---ATA-AAA---A
gi|29                         :                                                                                                                                  A---TCATAT--AG-AAAT-G-T-GA----G-C--AT-G------GTG-----CATGTGA-CTG----GCAA------------TAGTAGAGT-AGTT---TG------TT-TT--TGC--CT----GTTC---TTACATAT----------TA---T-T-----G---GC-CAATTCAGAT------TAGCTAAAATAAT--T-ATAACAAAC---ATattaccagtatatgaatatttgtaactgaatgcaag
gi|3                          :                                           atcttgagtaatgcatgtaggtcatggtatatcagacagtgttgggTTTACACTC-T---TTACATTA----AAACGA-GC-C-ATTA---TAAAAA--GG-AAAT-G-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CATGTGG-CTG----AAGA------------CGGTAGAGC-AGTT---TG------TT-TT--TAC--AT----ATTC---TCTCGTGC----------GA---T-T-----G---GC-CAATACAGAT------CACCTAAACTGAT--T-TAAATATGC---ATA-T--A--GTAT---ATGC---C---A---G-GGTCA-T---TG----AGA-AT-GGTT--TC-AAAT-AGTTAATTGTG-----A--G--A---TGAA-GC--T---A------TT-T-----AA-AG--T-AATT-TG---TT---TTC----A-T-----GATATT------TT-G----ACT------GA---TACAC-A-GGT---TTCCATTAG-------------------CTA------TTC---A-------TT--AAC-A-ATCAT---------GAGGCGGG-----G--CTT--T-GTAA-----------CGC-AT--GA-----A-CAA-T-CAAAA-TG------TAAT-----------G-GT--CAG----------------GACAG-TG-T---G--A--AA-A-----A-----GCA-G--TTGTTC-T--CTGACA----TCAACCTTTT---A-A-ATA---GCACT-GT---GGTTATTCAt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gcTA------ATT---AAG-----TT--AAC-A-GTCAT---GAC-ACCAGGCGAG-----G--ATG--C-GTGT-----------TAT-GT--GC-----A-CAT-T-CAAAT-TA------TTAG-----------A-GT--CA-----------------AATAG-TG-T------T--AA-A-----A---T-ATT-G--CTGCTC-T--TTGACA----TCAAATGTC--------AAA---ACGCC-AC---AAACATTtacttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caA------ATC---A-------TT--TAC-A-AACAT---GACAGC-ATGCAGACATTTG--CTT--T-ATAG-----------CAT-GT--TA-----A-AAT-T-CAAAA-CA------AAAG-----------G-GT--TAA----------------AACAG-CG-C---A--A--AAGA-----A---T-TCT-GTTTTTTTC-T--TTGATA----ACAACT-----------GAA---ACACaataactctacctcgatatgcaagtca
gi|32                         :                                                                                                                         tgatgcacTA---TGAAAT--GG-GAAT-A-T-GT----A-C--AT-G------GTG-----CTCTAGC-CTT----ATGT------------CAGTAGAAC-AGTT---TG------CC-TTTATAT--TT----GTTT---TCGCACGA----------GT---T-A-----G---GT-ATATTCTGAT------TAGCTGATATTAT-------AT-TAC---ATG-T------TAT---ATG----CGATA---T-GACCA-T---TG----AAA-Atttcaatatttgaaactttt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AC-A-ATCAC---GAC-GTAAGGTGAA-----G--CTA--G-TTAG-----------CAT-GT--AA-----A-CAT-T-CAAAT-CA------AAA------------G-GT--TAA----------------ATCAA-TA-C---A--A--AC-A-----------GTT-A--TTTT--------AACA----TCTATTATGT---A-A-GAaagtt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgatattgcAGACAGA-----C--ATT--T-GTGG-----------CAT-GA--AA-----A-CAT-T-CAAAA-CA------AACA-----------G--T--CAA----------------AACCT-TG-C---A--A--AA-A-----A---T-G-T-A--CTTTTC-TTATC-ATA----CGGACTATCT---G-G-GGA---AAGTT-GC---AAACATtgatcttgaaacattctcaactctaacttgatatgca
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatatcGG-----G--TTT--TAGTGA-----------CAT-TT--GA-----A-CTT-T-CGAAA-CA------GAAG-----------G-GT--CAA----------------AATGA-T--T---A--A--AA-A-----AGTTT-TCT-T--TCTTTCAT--TC-ATA----TCGATCTTTT---A-A-GGA---A---C-TT---GAATATTCgtgaaactctaccttgatatgcaaggtgcagta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGTGAG-----G--TTT--T-GTGG-----------CAT-GT--GA-----A-CAT-T-CCAGA-TA------TTAG-----------A-TT--CAA----------------AACAG-TA-C---A--T--GA-A-----A---T--TT-G--TTTTTC-T--TTAATA----TTGACTGCTA---A-A-TAC---ACGCC-gaagctctcatatgaaatacagaaca
gi|38                         :                                                                                                                                                                                  -----CACGTGG-CTG----ACAA-------------AGTAGAAC-TGTT---CA------GT-TT-----------------------CACGC----------GA---T-T-----A---AC-CGATTCACAT------TA----------------TAAT--AC---ATG-T--A---T-T---ATG------------------A-T---TG----AAA--C-TGCT--TC-AAAaaa
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaAT---GAC-ATGAGAAGGA-----C--TTT--T-GTGA-----------CAT-GA--AA-----AGCTA-T-CGAAA-CG------TGAG-----------ATGT--CAA----------------ACCCG-TG-C---A--A--AA-C-----G---A-GTT-T--TTTTTT-T--
gi|4                          :                                                                                                                                               G-AAAT-A-T-TT----A-C--AT-G------GTA------ATGTGG-CTG----CCAA------------CAGTAGACC-CGTT---TA------TC-TT--TAA--CT----GTTC---TTACATAT----------GC---C-T-----C---TC-TAATTCAGAT------TAACTGAAATATTGGT-CTAATGTGT---ATT-T--A--CTAT---G--------------------A-T---TG----AAA-AC-TGCA--TC-AAAT-GATTGAG--TG-----ACAG--A---TAAA--C--T---T------TT-TTTTTTAATAC--C-AT-T-TGT--CTCA-TAT----A-G-----AAT-TT------TT-G----ATT------GA---TTGGC-C-AGT---TTCCATTGG-------------------CTA------TTC---A-------TG--ACA-A-ATCAT---GCC-AAGAGGTGGA-----G--CTT--A-GTGATATTTTAGTTACAT-GTTTAA-----A-CTA-T-CAAAA-CA------AAAT-----------G-GC--C-G----------------A-----TA-C------------------------GCT-G---GTTTC-T--TTTATACTGTTAGACTTCTT---A-A-GAA---ATGCT-GT---GAGCATTTAatgtac
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aa---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-AGCT--TT-AGAT-GATGGAC---------A--G--A---C--A-GC--TAGAA------CT-T-----AT-AG--TCAA-T-TG---CT---GAT----A-C-----aaactttaaatcaatatgcagggtgtaaataaaggga
gi|41                         :                                                                                                                                       CAGAG--GG-AAAT-T-T-AT----A-C--AT-G------GTG-----CACGTGA-CTG----AAGA------------CAGTAAAGC-TGTT---Tctgccttataattgacttttg
gi|5                          :                                                                                                                                               aatgaT-G-T-AT----ATC--AT-G------GTG-----CACACAA-CTT----GTGA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--GAA--CT----AAAC---TTACACTC----------GA---T-T-----G---GT-CATTTCAGAC----------------AAT--T------GTAC---A-----------------------C---AG--T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TGCT--TC-AAAT-GACTGAT---------------A---TACA-AC--T---AGAATGTTT-T-----AA-AG--T-CA-T-TG---TT---TAC----A-C------ATATT------TT-G----ACT------AA---TGAGT-C--AT---TTTTGCT---------------------CTA------ATC---------------------ATCAT---GAT-GTGAGACAAC-----G--TTT--T-GTGG-----------CTT-GT--GA-----A-ATA-T-CAAAA-CAATAGGCAAAG-----------G-AT--CAG----------------AACAGCTG-A---A--A--AA-A-----A---T-GCT-G--TTTTTC-T--tcaattctaatgttttccct
gi|6                          : tagtgttccttttattaatgctctgagcatgagagaaggtggagtattttactatgccttgcattatctccaatttacaataagttaaaacaattctgatattatttTCA----AGACAATGC-T-GTCA---TCAAAA--TG-AGAT-G---------A-C--------------G-----CATGTGA-AAA----GTAA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------CT-TT--TAC--AT----GTACCT-TCACACACAATGTCATATGA---T-T-----G---GC-AGATTCAGGT------AAGGTGAAATAAT--T-CAAATGTGT---AAG-T--A--ATAT---ACG----C--------------------------------------------T-GATTGAC---------A--G--C---TAGA-ACCTT---A------AT-T-----AA-GC--C-TA-T-TG---GT---TAC----A-A-----GATGCT------TT-G----ACT------GA---TAGGT-T-GAT---TTCCACTGG-------------------CTA------ATC---A-------AC--AAC-A-GTCGT---GAT-GAGAGGCAGA--------CTT--T-GTAA-----------CAT-GT--GA-----A-ATA-T-AAAAA-AA------AAAGAAAGAGAAAAAG-AT--CAG----------------AACAA-GG-CG--G--A--AA-G-----A---TCACT-GT-TTTTTC-G--TTGATA----GCAAATATTT---A-A-GAA---ACATC-AC---AAACATTTA
gi|7                          :                                                                                               CTCAT---TTAGGTAAGTTCAAACAA-CCTC-AATA---TCAAAG--AGTAAAT---T-GT----A-C--AT-G------GGG-----TGCATAAACTG----ACGA------------CAGTAAAGA-TGTT---TG------CT-AT--TAC--CT----ATTC---TCGCA---------------------------------TGATTCAGTT------TACCT-AAGTTAT--T-TTGATGTA----ATT-T--A--------------------A---T-GGTCA-T---TG----AAA-AC-TGCT--TCAAAAT-GGTGAAC--TG-----A--C--AAC-TAA---T--T---T------TT-T------------C-AA-T-TG---CT---TAC----A-CCTATATATACT------TT-G----ACTATTAGAAA---TAGGC-C-TGT---TTCCATTGG-------------------CTA------ATC---A-------TC---AC-ATATCTT---GCC-ATGAGGCTAA-----G--CTTTAT-ATAA-----------CAT-GT--GA-----A-CAA-T-CAAaaacttttgatatga
gi|8                          :                                                   atcactaacattttgataacaaaggtcaaaatgaagttgctatctcagataattttgatgtcattcatgaaaagaaactA---TCAAAGTGAG-AAAT-A-T-GT----A-C--ATTG------GTA-----CACATGA-CTG----ACAA------------CAGTAGAGC-TGTT---TG------TT-TT--TAC--CT----GCCCACCTAACATGT----------GA---T-T-----G---GC-TGATACAGGT------T----------------TTAATGAAC---ATG-G--T--ATGT---AGG----C---ACTGT-GGTTA-A---TA----AAA-AT-TGCT--TC-AAAT-GACTGAC--TG-----A--G---------A-GC------A------TTGT-----AA-AGC-T-AG-T-TA---TT---TAC----A-A-----GAAGGT------TT-C----ATC------AA---TAGAC-T-GAT---TCCCATTGGCTAGGCCGGGTACCATTGGCTA------ATC---A-------TT--ACC-A-ATCAT---GAT-GTCATATGGG-----A--TTT--T-GTGA-----------CAT-GT--GA-----A-CTA-
gi|9                          :                                                                                       tagttttctctggagtaatacatctgagcactgaagtgtaggtggaataattactggagtagctccctcatcaccagtcaca------GTT-----CACATGA-CTA----ATGA------------CAGTATATA-AGTT---TG------CT-AT--TAC--TT----ATTC---ACAATTAC----------AA---T-T-----T---GG-TGAATCAGAT------TAGGAGAAATAAT--T-CTGATTAAC---ATG-C--ATCATGC---AC-----C---A---T-GGTCA-T---TA----AAA-AC-TG-----------------AC---------A--G--T---TAAA-AC--T---T------TT-TT----AA-AG-----A-C-TGTATCT---GAC----A-T-----GATGTA------TG-A----ACT------GA---TACGC-T-GGT---TTCCATTGA-------------------CTA------------A-------TT--GCC-A-GTCAT---GAT-ACAAGGCGGA-----G--C----T-GTG--------------T-GT--AA-----A-TTG-T-CCAAT-CA------AAA------------G-GT--CAG----------------ACCAG-TGAC---T--A--AA-A-----G---TCACC-A--CATTTC-T--TTGAT-----TTAATTTTTTTTAA-A-GAAATCATGCCAAC---AAACATTCA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): ATTGACAGCTAGGACATTTGAATGCAGTTGCTACAATAGTAACATCTATTGTTTTGACTGGTACCTGGATTTTATAGGCTTATCGTGTCTTAAGGTAGGCCTTTG
Unaligned ( gi|42 ): ACTTTACATACATAAAATAATGTTAATATCAATGTAGGAAACTGTATGAATGCATGGTGTT