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Reference ( gi|11 ) : TGCTCCA-GAT-A-A--T-T-T--T-TT-------------GA-TAAGAG-GATA--TT-----TTACC--CCCAAAATTG-AA-A--A------G---A-TT------------G-----G-G----------------G---------T--A-T------T------T-AACT--CCCA---GATTTT---CA-C--AGAC--GAGA------G----T-A---A--T----GA----A-GCA-T-A---C-A-GT-C-GT-A--A--GATACAT-TAAA--A--T---TTTA-CT--TA------T---TGCA--AA--AT--TCAG---AATTTTCA-TTTATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-T----AT-A---TAA--T----ATTATTTA-GAT-----TA-----A-GT-AGTTTACACTTTCATTTGC--T-ATC--TAAGACA--CATGAGCCTCTAAGATATGAAATCAGTA
gi|2 : TGCTCCA-GAT-A-A--C-T-T--TATT-------------GA-TAAGAG-GGTA--TT-----TTACC--CCAAAAATGG-AA-A--G------A---A-AA------------G-----G-G----------------G---------T--A-T------T------T-AACT--CTCA---GATTTT---CA-G--AGGT--GAAT------G----T-A---A--T----GA----A-GCA-G-A---C-A-GC-C-AT-A--A--GATACAT-TAAA--A--T---CTTA-CT--TA------T---TTTA--A----T--TCAG---AATTTTCA-TT-ATTTC---AATTT-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-T----AC-A---TGA--T----ATTATTTA-GAT-----TA-----A-GT-AATTTACACTTTCATTTGC--T-ATC--CAAGACA--CATGGGCCTCCAAGATATTAAACCATTA
gi|10 : TGCTCCA-GAT-A-ACAT-T-T--T-TT-------------GA-TAAGAG-GGTA--TT-----TTACC--CCACAAATTG-AA-A--A------G---A-TG------------G-----G-A----------------G------------------------------------CTCA---GATTTT---CA-G--AAGG--GAGG------G----T-A---A--T----AA----A-GCA-T-A---C-A-GT-C-GT-T--A--GATACAT-TTAA--A--T---CTTA-CT--TA------T---TGCA--AA--AT--TCAG---AATTTTCA-TTTATTTC---AGTTA-------AA--AA----CG--TT------ACTT--------AC---T-T----AC-A---TAA--T----ATTATTTA-GAT-----TA-----A------TTTTCACTTTCATTTGC--T-ATC--TAAGACA--CGTGCGTCTTTAAGATATGAAATCAtacatattatatttt
gi|4 : gTGCTCCA-GAT-A-A--C-T-T--TATT-------------GA-TAAGAG-GGTA--TT-----TTACC--CCCAGAATAG-GA-A--A------G---A-TC------------G-----G-G----------------G---------T----T------T------T-AATT--CAGA---GATTTT------C--AGACGTGAGG------G----T-A---A--T----GC----A-TCA-T-A---C-A-GT-C-GT-A--A--GATACAT-TAAA--A--T---CTTA-CT--AA------C---TGCA--AA--AT--TCAG---AATTTTCATTTTATTTC---AATTT-------AA--AA----CT--TT------A-TT--------AC-----T----A------------------TATTTA-GAT-----TA-----A-GT-AATTTATACTTTCATTTGC--T-ATC--TAAGACA--CAAAGGTCTCCAAGATATGAAATCATTAtatgacatgtatt
gi|13 : agTGCTCCA-GAT-A-A--CAT-T--T-TT-------------GA-TAAGAG-GGTA--TT-----TTACT--CCAAAAATTG-AA-A--A------G---A-TT------------------------------------------------------------------T-AACT--CCCA---GATTTT---CA-G--AGGT--GAGG------G----T-A---A--T----GA----A-GCA-T-A---C-A-TT------------AATACAT-TAAA--AA-T---CTTA-CT--TA--------------------AT---CAG---AATTTTTA-TATATTTT---AGTTA-------AA--AA----CT----------ACTT--------AC---T-T----AA-A---TAG--T----ATTATTTA-GAT-----AA-----A-GT-AATTTAAACTTTCATTTGC--T-ATC--TAAGACA--CATGGGTCTCCAAGATATGAAATCATTAtacatgtatttta
gi|7 : TGCCCCA-TAT-T-A--C-T-T--T-TT-------------AAATATGAG-GGCA--AT-----TTAAC--CCCAAACTGG-AA-A--A------G---A-TA------------T-----G-G----------------G---------T--A-T------T------T-AGCT--CCAA---ATTTTT---CA-G--AGAT--GAGG------A----T-A---G--A----GA----A-GTATT-A---C-A--T-C--T-A--A--GAAAC------A--G--T---CCTA-CT--TA------T---AGCA--AA--AT--TCAG---AGTTTTCA-TTTA--TC---A--TAAAAT---AA--AA----CT--TT------ACTT--------ACATAT-A----AT-A---TAA--TATGCATTATTTA-GAT-----TA-----A-GT-AGTTTACAATTTCATTTGC--T-ATC--T-AGACG--CACAGGTCTACAACATATAAAGTCAtacatgtatttta
gi|3 : gTGCCCCA-GAT-A-T--C-T-T--T-TT-------------AA-TAAGTG-GTTA--AT-----TTTCC--CTTAAAATGG-AA-A--A------A---AGCT------------G-----G-GTGGGGGGTGAGGAGGGG---------T--A-T------TTACTTGT-AACT--CCTA---GAGTAT---AG-C--AG-C-----------------------A--T----AA----A-GTA-T-A---T-A---------A--A--GATACAT-TGCA--A--T---CTTA-CTAATA------T---TGCA--AA--AT--TCAG---AATTTTAA-TTTATTTC---AGTTT-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-TAACGAT-A---TAC--T----ATTATTTA--AT-----TA-----A-AC-AATTTACAATTTC-TTTGC--T-ATC--T-AGACA--CACTAGTCTACAAGATAtgtgt
gi|16 : gTGCTGCA-GAT-A-G--C-T-TAATATT-------------AA-TAAGAG-GGTA--AT-----TTACC--ACCAAGATAG-TA-A--A------A---A-TG------------T-----G-G----------------G---------T--A-CCAGTCAT------C-AACT--CCAAA--GATTTT---CA-A--AGAT--ATAG------G----T-A---A--G----GA----A-GCA-T-A---A-A-GT-T--T-A--A--GATA------AA--A--T---ATAA-CT--TA------T---TGTA--AA--TT--TCAG---AATGTTCA-TATATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--GT------ACTTTA------AC---A-T----AC-A---TAA--T----ATTATTTA-TGT-----TT-----A-GT-AATTTACAaagctatata
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gi|23 : acagTGGTCCA-GAT-A-A--C-T-T--T-TTC------------AA-TAAAAG-GGTA--TT-----TTACC--CCCAAAATTG-AA---------------------------------------------------------------------A-T------T------T-AACG--ATCA---GATTTT---CA-G--AGGT--GActggtccgcaattaaaaagtcatatattttt
gi|19 : TGCCCCA-GAT-A-A--C-T-T--T-AA-------------AA-TAAGAA-GGTA--AT-----TTACCGCCCCA---------------------------------------------------------------------------C--A-C------T------C-AACC--CCCAATGGA--------A-A--AGAT--GGGA------GG---T-A---A--A----GA----T-GCA-T-A---A-T-GT-C--C-A--A--GATAAGT-TGCA--A--T---TTTA-TT--TA------T---TAAA--AA--AT--TCAA---ACTTTTCA-T------------TTA-------AA--AT----CT--TT------ACTT--------GC---T-T----GT-------A--T----ATGATTTA-GAA-----TATTGCGA-GT-AATTTACAATTTCATTTGC--T-ATC---GAGACA--TATG-GTCTGCAAGATATAAATTCAagaatttttatttatttcagtaaaaaactttccttacttacataatattatttagattaagaaatttacaaattcatttgctatttaagacacatgggtctacgagatatcaagtcattatgcatatattttaatt
gi|5 : agTGTCCCA-GAT-A-A--C-TAT--T-TC-------------TA-TAAGAG-GATA--AT-----ATACC--CTCAAAATGG-AA-A--A------G---A-TTGGGGAGGGGTGGG-----G-G----------------G---------T--ATT------T------T-AACT--CCAA---GATTTA---CA-G--AAAT--GTGG------A----T-A---G--A----GA----ATTTA-T-C---CTA-GT-C-A--A--A--GATATAT-TGCA--A--T---CTTA-CT--TT------T---TG----AA--ATGGTCAG---CAATGCCA-TTT-TTT-----GT-------------AA----C-----------A--------------------------G---TCA--T----CTTATTGA-GAT-----TA-----G-AT-AATTCATAATTTCATTTGC--T-ATC--TATAAT---CATTGGTTTACAAGATATAAAGTCAtatatttta
gi|17 : gTGCCCAA-GAT-T-A--C-G-T--T-TTA------------GA-TAAGAG-GGTT--AT-----TCATC--CGCAAAACAA-AA-A--A------ATATA-TT------------G-----G-G----------------A---------T--A-T------G------T-G------------------------------T--GAAA------A----T-A---A---------------GCA-T-A---A-A-GT-C--T-A--T--GTGACAT-TGCA--A--TCCTTTTT-TT--TT------T---TG----AA--AT--TCAG---AGTTTTTA-CTTATTTC---AGCTATGCAGTTGACTGA----CT--TCTGTGTAATTT--------AC---T-T----AC-T---TAA--T----ATTATATA-TAT-----TT-----A-GT-AATTTAGA-----ATTTGC--T-TTCAGTTATATA--CATGTGTCT-TAAtacgtatatttta
gi|45 : tcagTGCCCCA-TATTA-AC-T-T-T--T-TT-------------GA-TAAGAC-GGTA--TC-----TTACC--ACTGAATTTG-AA-A--A------T---G-TA------------G-----A-G----------------G---------T--aca
gi|9 : taaGCCTTA-GGT-A-A--C-T-T--T-TA-------------AA-TGAGAG-T-TA--AT-----TCACC--CGTAAATAGG-AA-A--A------G---A-T-------------G-----G-G----------------G---------T--A-T------A------T-GACT--ACCA---GATTTT---CA-G--AGAT--CAGG------A----T-A---A--A----GA----T-GCA-T-A---A-A-GT-C-TTGA--A--GTCACAT-TGCA--A--T---TTTA-TT--TA------T---TAAA--AA--AT--T-------ATTTTTG-TTTATTTT---AGTTG-------AA--AT----CT--TT------ATAT--------GC---T-T----GC-A---TAA--T----ATTATTTA-GATGATTGTA-----A-GT-AATTTACAATTTCATTTGC--C-GTC--T-AGACA--CACAGGTCTTCAAGATAT
gi|27 : GCCCCA-GAT-A-T--T-A-A--T-TT-------------AA-TAAGAG-GTTA--AT-----TTACA--CAAAAAATTG-TA-A--A------G---A-TG------------G-----T-G----------------A---------T--A-T------TATA---T-A-------CA---GGTTTT---CA-A--AGAT--GTGA------G----TGA---A--T-----A----G-GCA-T-----C-A-GTGCAGT-ATCA--G-TACATGTAAC--A--G---TTTA--G--TA------T---TTC----A--AT--T------AAATTTC-----ATTTC---------------AA--AG----TT--TT------GCTT--------AC---T-T----GC-A---TAT--T----A-TATTTA-TAT-----Tttaagttatattt
gi|46 : gGCCCAA-GAT-A-A--T-G-T--T-TT------------------AGAGTGTTA--TT-----T-ACT--CCCCAAATCG-GG-A--A------G---A-TA------------G-----G-G----------------G---------T--A-T------T------T-AACt
gi|50 : GCCCTA-AAT-A-A--C-T-T--T-TA-------------G--TAAGAG-GGTA--AT-----TTACC--CATAAAAT
gi|20 : aCTCCA-GAT-A-AC-T-T-T--T-TT-------------GA-TAAGAG-AGTA--TT-----CAACT--CTCAA
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gi|21 : gttCCCCA-GAT-A-A--C-T-T--TCTT-------------AA-TAAGAG-GGTT--TT-----TTACC--CCCAAAATGG-TA-A--A------A---A-TG------------T-----G-G----------------G---------T--T-T------T------C-AGCT--CCCA---GATTTT---CA-G--AGAT--ATGG------G----T-A---A--G----GA----A-GCA-T-T---A-A-GT-T--T-A--A--GATACA---AGA----------TTA-CT--TA------T---TGTA--AA--AC--TCAG---TATTTTCA-TATATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--GT------ACTTTA------AC---A-T----AT-A---TAA--T----GTTATTTA-GGC-----TT-----A-AT-AATT
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gi|29 : tatTCCAAGAC-A-A--T-T-T--T-TT-------------AA-TAAAAG-AGTA--AT-----TTACC--CCCAAAA-TG-AA-A--AT-----G---A-TG------------G-----G-G----------------G---------T--A-T------T------A-AACT--CTCA---GGTTTC---CA-G--AGAT--GTCG------G----T-A---A-----------------A-T------------------------ATGCAT-TA-----------TTTAGAT--TA------T---TATA--AATTAT--CTAC---AA-TTTCA-TTTa
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gi|31 : CCA-AAT-A-C--G-T-T--T-TT-------------GA-TAAGAG-GATA--AT-----TTACT--CTCCAAATTG-AA-A--T------G---G-TG------------T-----G-G----------------G---------T--ATT------T------T-CGTT--TCTA---GATTCT---TA-T--A------AGAATTTG-G----T-ATATA--T----GT----T-CCATT-G---C-A-GT-C-------A--G-TATAT-TAAA---------------C--TG------T---TG--------------AG---ATTTTCCA-TTTATTTT---A
gi|18 : agaattctggcgtggccagagaaCA-GAT-A-A--T-T-T--T-TTTTTTTGGTAATTAAA-TAAGAG-GGTA--TT-----TTATC--CCCAAAATTGAAA-A--A------A---A-TG------------G-----G-G----------------G---------T--A-T------T------T-AACT--CTC----------------T--AGAT--AAGA------G----T-A---A--A----GA----A-GCA-TAA---T-A-GT-C--T-A--A--GACAC-----AA--T--T---TTTA-----TAC-----T---TGTA--AA--AT--TTAG---AATATTCA-T------------TTG-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------TC---T-C----AT-ATATTAA--T----ATTATTTA-GAT-----TA-----A-TT-AGTTTACAATTCCA-TTGC--T-Atctgaa
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gi|14 : cctA-GAT-A-A--C-T-T--T----------------AA-TAAGAG-GGTA--AT-----TTACT--CCCAGAATGG-AA-A--A----------A-TT------------G-----GAG----------------G---------C--A-T------T------T-AACA--ACAA---AGTTTT---CA-G--AGTT--GTGG------GCTTTT-A---A-------GA----C-GCA-T-A---A-A-GT-C--T-A--A--TATACAT-TGCA--A--T---TTTA-TT--TA------T---------------------------------TTCATTTC---ATTTA-------AA--AG----TT--TT------ACTT--------AC---T-T----GC-A---T-A--T----ATTATTTA-AATTATTGTA-----A-GT-AATTTACAATTTCATTTGG--C-ATC--T-AGACA--CGCAAGTCAACAAGATGTAAATTAAGtataaattcaaagtaccagaacattttgatagtaagaagacaatttttaatttacccaaaaaaat
gi|26 : cgcaA-GAT-A-A--T-TAT--T-GT-------------GA-TAAGGG-GATA--AT-----TTACC--CACAAACTTG-CA-A--T------A---A-CT------------GGTAAAG-G----------------G---------TTAA-T------G------T-TACTTACCCA---GTTTTT---C--------C--ATGA------T----T-A---A--A----TA----G-GCA-C-A---T---GC-T-GT-A--A--GATCCAC-TGCA------------G-CC--TG-----------GGAGTAA--AT----AG------TTTCACTTTATTTT---AGTTA-------GA--TT----CTTGTT------GCAT--------AA---TGT----AC-A---TAG--C----ATTGTTTA-GAT-----TA-----catatatttta
gi|12 : AT-A-A--T-G-T--T-TT-------------AA-TAAGGG-TGCAATTT-----TTA----------ATTA-AA-A--A----------A-TA------------G-----G-G----------------G---------T--A-TC-----T------T-AACT--TCTA---GATTGG---CA-G--ATAT--GTGG------A----T-A---A--A----GA----C-ACA-T-A-----A-AT-A-TT-C--A--GATATAT-TACG--A--T---CTTA-TT--TA------T---TG-A--AG--AT--TTAG---AATTCACA-TTTATTTC---AGCT--------AA--TT----TT--TT------ATTC--------GC---T-T----AC-A---TAA--T----ATTATTAA-GATTGTTATA-----T-CT-AATTTACAATTTCATTTGC--C-ATC--TACAATATCTACAGGTCTACAAGATATAAAGTCA
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gi|49 : -T-T--T-TC-------------AA-TGAGAG-GGTA--TT-----TTACC--CCAAAAATGG-AA-A--
gi|44 : agaaaagg--T-TT-------------AA-TAAGAG-GATA--AT-----CTA-C--CCAAAAATTG-AA-AACA------GTGCA-TG------------G-----G-G----------------G---------TA-A-C------T------T-CATT--CCCC---AATTCT---AAGC--AAAT--GTGG------A----T-A---A--
gi|8 : T-------------GA-TAAGAG-GGTT--TT-----TTAAC--TCCAATATTC-AA-A--A------G---A-TG------------G-----G-G----------------G---------T--A-T------T------T-AACA--CCCA---GATTTT---CA-G--AGGT--GAGG------G----A-A---A--T----GA----A-GCA-T-A---C-A-GT-A-GT-A--A--TTTACAT-TAAA--AAGT---CTTA-CT--TA------T---TGCA--AA--AT--TCTA---AATTTTCA-TTT-TTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--TT------ATTT--------AC---T-T----AC-G---TTA--T----ATTATTTA-GAT-----TA-----A-GT-AATTTACACTATCATTTGC--T-ATC--TTAGACA--CATGGGTCTCCAAGATATGAAATC
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gi|33 : -GGTA--AT-----TTACC--CCCTAAGTAG-TA-A--A------A---A-TG------------G-----G-G----------------G---------T--A-T------T------C-ATCT--CCCA---GATAT------------------GG------G----T-A---A--G----GA----A-GCA-T-A---A-A-GT-T--T-A--A--GATA------AG--A--T---ATTA-CT--TACCTGTAT---TGTA--AG--AA--TGAG---AATTTTCA-TATATTTC---AGTTA-------AA--GA----CT--GT------ACTcaggtcaacaatat
gi|48 : cccca--TT-----TTACC--ACAAAAATGG-AA-A--ATATGAGGCCCA-TT------------AA----G-G----------------G---------T--A-T------T------T-AACT--CTCA---GATTTT---
gi|20 : TTG-AT-A--A------G---A---------------------G-A----------------G---------T--A-T------T------C-AACT--CTCA---ATTTTT---CA-G--AGGT--GAGG------G----T-A---T--T----AA----A-GCA-T-A---A-A-GT-T-AT-G--A--GAAATAT-CAAA--A--T---TTTA-CT--TA------T---TGCA--AA--AT--TCAG---AATTTTCA-TTAATTTC---AGTTA-------AA--AC----CT--TT------ACTT--------AC---T-T----G--A---C-A--T----ACTATTTA-TAT-----TA-----A-GT-AATTTACACTTTCATTTGC--TGATC--TAAGACA--CATGGGTCGTCAAGATATGAAATCATTAt
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gi|22 : ----------------G---------T--A-T------T------T-GACT--CCGA---GATTTT---CA-----GGT--GAGG------G----T-C---A--T----GA----A-GCA-T-A---C-A-GT-T-GT-A--A--GATACAT-TAAAACA--C---CTTA-TT--TT------C---TGCA--AA--AT--TCAG---AATTTTCA-TTTATTTC---AGTTA-------AA--AA----C----T------ACTT--------AC---T-T----AC-A---TAA--T----ATTATTGA-GAT-----TA-----A-GC-AATTTACACTTTCATTTGC--T-ATC--TAACACA--CATGGGTTTCCAAGATATGAAAACATTAtatttttatcaagccttaccatgaatactgtaatcatatttctgttttgaaacctagttaaaatatttggaatgtgtaaacttgtcccctatttcaaa
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gi|15 : cgcaTGCCCCAAAT-ATATA-T-C--T-T-T-------------AA-TAAGAGGGTAGTT------TACC--CCCAAATTGGAA-A--A-------------T---G-T------------G----G----GG----------GGGCGGGGGGT--A-T------T---TTA------ACT--CCTG---TATTTT---CC---G-AGATGTG-G------A---TAA----A--GAAGCA-TA---A-AGT--T--A---A-----------------------------------TGTA--A-A--AT--T----CAA---AATTTTAT-TTT--CTTTC---AATTA-------AA--AA----CT--T-------------------------------AC-ATA---A--T----GTTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACAATTCCATTT--GC--T--TTTAAGACA--TGTGCTGGTCCGCAAT-TAAAAAGTCATagtcatatatttta
gi|16 : acagTGCTGCAGAT-A-GC--T-TAATAT-T-------------AA-TAAGAGGGTAATT------TACC--ACCAAGATAGTA-A--A-------------A---A-T------------G----T----GG----------G---------T--A-CCAGTCAT---C-A------ACT--CCAAA--GATTTT---CA---A-AGATATA-G------G---TAA----G--GAAGCA-TA---A-AGTT-T--A---AGAT---A-A----AA--T--A-TAA--CT--TA-TTGTA--A-A--TT--T----CAG---AATGTTCA-TAT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--GT------ACTTTA------AC---A-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TA-TGT-----------------------T-----T-----A-GTAATTTACAAatattttt
gi|17 : catTGCCCAAGAT-T-AC--G-T--T-T-TA------------GA-TAAGAGGGTTATT------CATC--CGCAAAACAAAA-A--A-------------------------------------------------------------------A-T------A---T-A----------------------TT---GG---G-ATATGTG-T------G---AAA----A--TAAGCA-TA---A-AGTC-T--A---TGTG---ACATTGCAA--T--CCTTT--TT--TT-TTTTG--A-A--AT--T----CAG---AGTTTTTA-CTT--ATTTC---AGCTATGCAGTTGACTGA----CT--TCTGTGTAATTT--------AC---T-T----AC-TTA---A--T----ATTATA---TA-TAT-----------------------T-----T-----A-GTAATTTAGAATTTGCTTTCAGT--T-AT-----ATA--CATG--TGTCTTAAAgggtaaagatatatgtcatacattttaa
gi|18 : tcagCAGAT-A-AT--T-T--T-T-TTTTTTGGTAATTAAA-TAAGAGGGTATTT------TATC--CCCAAAATTGAA-A--A-------------A---AAT------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--CTC---------T----------AGATAAG-A------G---TAA----A--GAAGCA-TA---ATAGTC-T--A---AGAC---ACAAT------T--T-TTA------TACTTGTA--A-A--AT--T----TAG---AATATTCA-TTT--G-------------------AA--AA----CT--TT------ACTT--------TC---T-C----AT-ATATTAA--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-TTAGTTTACAATTCCA-TT--GC--T-Aca
gi|19 : TGCCCCAGAT-A-AC--T-T--T-A-A-------------AA-TAAGAAGGTAATT------TACCGCCCCA-----------------------------------------------------------------------------C--A-C------T---C-A------ACC--CCCAATGGA--------A---A-AGATGGGAG------G---TAA----A--GATGCA-TA---A-TGTC-C--A---AGAT---AAGTTGCAA--T--T-TTA--TT--TA-TTAAA--A-A--AT--T----CAA---ACTTTTCA-T--------------TTA-------AA--AT----CT--TT------ACTT--------GC---T-T----GT-------A--T----ATGATT---TA-GAA-----------------------T-----ATTGCGA-GTAATTTACAATTTCATTT--GC--T-ATC-GAGACA--TAT---GGTCTGCAAGATATAAATTCATctggtctacatgttaattaaagaaacaacaca
gi|2 : agTGCTCCAGAT-A-AC--T-T--TAT-T-------------GA-TAAGAGGGTATTT------TACC--CCAAAAATGGAA-A--G-------------A---A-A------------A----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--CTCA---GATTTT---CA---G-AGGTGAA-T------G---TAA----T--GAAGCA-GA---C-AGCCAT--A---AGAT---ACATTAAAA--T--C-TTA--CT--TA-TTTTA--A-----T--T----CAG---AATTTTCA-TT---ATTTC---AATTT-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-T----AC-ATG---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACACTTTCATTT--GC--T-ATCCAAGACA--CATG--GGCCTCCAAGATATTAAACCATTAatatttta
gi|20 : CTCCAGAT-A-AC--T-T--T-TTT-------------GA-TAAGAGAGTATTC------AACT--CTCAAtacatattatatttt
gi|20 : tTTGAT-A--A-------------G---A------------------------GA----------G---------T--A-T------T---C-A------ACT--CTCA---ATTTTT---CA---G-AGGTGAG-G------G---TAT----T--AAAGCA-TA---A-AGTTAT--G---AGAA---ATATCAAAA--T--T-TTA--CT--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTA--ATTTC---AGTTA-------AA--AC----CT--TT------ACTT--------AC---T-TG---AC-------A--T----ACTATT---TA-TAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACACTTTCATTT--GC--TGATCTAAGACA--CATG--GGTCGTCAAGATATGAAATCATTAtttttcagaggtgagggtattaaagcataaagttatgagaaatatcaaaattttacttattgcaaaattcagaattttcattaatttcagttaaaacctttacttacttgacatactatttatattaagtaatttacactttcatttgctgatctaagacacatgggtcgtcaagatatgaaatcattatacatgtagttt
gi|21 : tctccagataacttttCCCCAGAT-A-AC--T-T--TCT-T-------------AA-TAAGAGGGTTTTT------TACC--CCCAAAATGGTA-A--A-------------A---A-T------------G----T----GG----------G---------T--T-T------T---C-A------GCT--CCCA---GATTTT---CA---G-AGATATG-G------G---TAA----G--GAAGCA-TT---A-AGTT-T--A---AGAT---A-----CAA--G--A-TTA--CT--TA-TTGTA--A-A--AC--T----CAG---TATTTTCA-TAT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--GT------ACTTTA------AC---A-T----AT-ATA---A--T----GTTATT---TA-GGC-----------------------T-----T-----A-ATAATTtacatgtagttt
gi|22 : ----------G---------T--A-T------T---T-G------ACT--CCGA---GATTTT---CA---G-G--TGAG-G------G---TCA----T--GAAGCA-TA---C-AGTTGT--A---AGAT---ACATTAAAA--CACC-TTA--TT--TT-CTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT----------ACTT--------AC---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---GA-GAT-----------------------T-----A-----A-GCAATTTACACTTTCATTT--GC--T-ATCTAACACA--CATG--GGTTTCCAAGATATGAAAACATTAgaaaagggtccttcaagatataacatcgacattctat
gi|23 : CCAGAT-A-AC--T-T--T-T-TC------------AA-TAAAAGGGTATTT------TACC--CCCAAAATTGAA------------------------------------------------------------------------A-T------T---T-A------ACG--ATCA---GATTTT---CA---G-AGGTGAA-G------tacacatatttta
gi|23 : tggtAG---AATTTTTA-TTT--ATTTC---AGTAA-------AA--AA----CT--TT------CCTT--------AC---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GAAATTTACAAATTCATTT--GC--T-ATTTAAGACA--CATG--GGTCTACGAGATATCAAGTCATTAaatttttatttatttcagtaaaaaactttccttacttacataatattatttagattaagaaatttacaaattcatttgctatttaagacacatgggtctacgagatatcaagtcattatgcatatattttaatt
gi|24 : tggtccagataactttttcaataaaagggtattttacccccaaaattgaaatttaacgatcagattttcagaggtgaGGGTAATT------TACC--CTCAAAGCGGAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GC----------T---------T----T------T---T-A------ACT--CCCA---GGTTAT---CA---G-AGATATG-A------A---CAA-------GAAGCA-GA---A-AGTC-T--A---AGAT--------GCAA--T--C-TTA--CT--TA-TTGTA--A-A--AT--A----CAG---AATTATCA-TTT------C---AGTTA-------AA--AA----CT--TC------ACTT--------AC---T-T----GC-ATA---C--T----TTTATT---TA-GG------------------------T-----A-----A-GTAATTTACATTTTCATTT--GC--T-TTCT-AGACA--CACA--GGTCAACAATATtgcatatattttaatt
gi|25 : -T------T---T-A------ACT--CCCA---AGTTGT---CA---G-AGATGTG-T------G---TAA----A--TAAGTA-TA---T-ACTC-T--A---AGAT---ACAATGCTA-----C-TTA---T--CG-TTGCG--A--------T----CAT---ACTATTCA-TTT--ATTTC---AGCCA-------AA--TA----TT--TT------ACGT--------AT---T-T----AC-TTA---A--T----ATTATT---TA-GCTA----------------------A-----A-----A-ATAATTTA------TATTT--GC--T-ATCC-AGACA--CATG--GGTCT--AAAATATAAA
gi|26 : AGAT-A-AT--TAT--T-G-T-------------GA-TAAGGGGATAATT------TACC--CACAAACTTGCA-AT-A-------------A---C-T------------G----GTAAAGG----------G---------TTAA-T------G---T-T------ACTTACCCA---GTTTTT---CC---A-TGAT---------------TAA----A--TAGGCA-CA---T-GCTG-T--A---AGAT---CCACTGCAG--C--C-------------TGGGAGTA-A--AT--------AG------TTTCACTTT--ATTTT---AGTTA-------GA--TT----CTTGTT------GCAT--------AA---TGT----AC-ATA---G--C----ATTGTT---TA-GAT-----------------------T-----A-----tatatataaagttacatattttaa
gi|27 : GCCCCAGAT-A-----T-TAAT-T-T-------------AA-TAAGAGGTTAATT------TACA--CAAAAAATTGTA-A--A-------------G---A-T------------G----G----TG----------A---------T--A-T------TATAT-A-------------CA---GGTTTT---CA---A-AGATGTG-A------G---TGA----A--TAGGCA-T----C-AGTG-C--A---GTAT----CAGTACA---------------------TGTA--ACA--GT--T----TAG---TA-TTTCA-ATTAAATTTC---ATTTC-------AA--AG----TT--TT------GCTT--------AC---T-T----GC-ATA---T--T----A-TATT---TA-TAT-----------------------T-----
gi|28 : gCTCCAGAT-A-AT--GAT--T-T-T-------------GA-TAAGAGGGTATTT------TACC--GGCAACATTAAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---C-A------ACT--CTCA----ATTTT---GA---G-AG-TGAG-GTGAATGG---TAA----T--GATGCA-TA---A-AATCGT--G---AGAA---ATATCAAAA--T--C-TTA--CA--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTT--ATTTC---AGTTA-------AA--AC----CT--TA------ACTT--------At
gi|29 : gttTGTCCAAGAC-A-AT--T-T--T-T-T-------------AA-TAAAAGAGTAATT------TACC--CCCAAAATGAAA-A--T-------------G---A-T------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---A-A------ACT--CTCA---GGTTTC---CA---G-AGATGTC-G------G---TAA----A--TATGCA-T
gi|29 : g----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----ATTATAA-ATTATCTACAATTTCATTT--GC--T-ATCC-CGACA--CACA--GGTCTAAAAGATATAAAGCCATtatttagattattataaattatctacaatttcatttgctatcccgacacacaggtctaaaagatataaagccatatattta
gi|3 : gtgtccaagacaattttttaataaaagagtaatttacccccaaaatgaaaatgatgggggtattaaactctcaggtttccagagatgtcggtaaatatgcTGCCCCAGAT-A-TC--T-T--T-T-T-------------AA-TAAGTGGTTAATT------TTCC--CTTAAAATGGAA-A--AAAGCTGGGTGGGGG---G-T------------GAGGAG----GG----------G---------T--A-T------T---T-ACTTGTAACT--CCTA---GA-----------------------------G---TAT----A--GCAGCA-TA---A-AGTA-T--ATAAAGAT---ACATTGCAA--T--C-TTA--CTAATA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTAA-TTT--ATTTC---AGTTT-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-TAACGAT-ATA---C--T----ATTATT---TA--AT-----------------------T-----A-----A-ACAATTTACAATTTC-TTT--GC--T-ATCT-AGACA--CACT--AGTCTACAAGATAatattta
gi|30 : gGTC-T--A---AGAT---ACAATACAA--T--C-TTA--CT--GA-TTGTA--A-A--AT--T----CAG---AATTTCAA-TTT--TGTTT---AATTA-------AA--AA----CT--TA------ACTT--------AC----------AT-ATA---A--T----ATCATTTTATA-AATGATATGTTAAAGCATAGTATCATT-----A-----A-GAAATTTACAATTGCACTT--GC--C-AGCTAaagctatata
gi|31 : gcataacccatCCAAAT-A-CG--T-T--T-T-T-------------GA-TAAGAGGATAATT------TACT--CTCCAAATTGAA-A--T-------------G---G-T------------G----T----GG----------G---------T--ATT------T---T-C------GTT--TCTA---GATTCT---TAT--A-AGAATTT-G------G---TA------------TA-TA---T-GTTC----------------CATTGCAG--T--C---A--GTA-TA-TT--A--A-ACTGT--T----GAG---ATTTTCCA-TTT--ATTTT---Acacgatattaagtcatgtat
gi|32 : agaattctggcgtggccagagaa-A------ACT--CCTA---GATTTAGAACA---G-AGGTGAG-G------A---TAATTAAA--GAAGTG-CA---A-AGTC-T--A---AGAT---AAATTGCAA--T--T-TTA--CT--TA-TTGTA--A-A--AT--T----CCG---AATTTTCA-TTT--ACTTC---AATTA-------AA--AT----CT--TT------ACTT--------AC---T-T--------CA---ATTT----ATTATT---TA-GAT-----------------------A-----A-----A-tctgaa
gi|33 : gggtccGGTAATT------TACC--CCCTAAGTAGTA-A--A-------------A---A-T------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---C-A------TCT--CCCA---GAT---------------AT--G-G------G---TAA----G--GAAGCA-TA---A-AGTT-T--A---AGATAAGATATTA--------C-TTA--CCTGTA-TTGTA--A-G--AA--T----GAG---AATTTTCA-TAT--ATTTC---AGTTA-------AA--GA----CT--GT------ACT
gi|34 : cccca-TTA--CT--TA-----A--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-GTT--ATTTC---AGTTA-------AA---------------------------------------T----AC-ATT---A--T----AT-ATT-------AT-----------------------T-----A-------GTAATTTACGCTTTCATTT--GG--T-ATCTTAGACA--TATG--TGTCTCTGAGA---AAAATTAT
gi|35 : ---TAA----A--GAAGCA-TC---A-AATC-T--A---AG-T------TTGCAA--T--C-AAA--CT--TA-TTGAA--A-A--TT--T----CAGAATAATTTTGT-TTT--ATTTCAATAATTA-------CA--AA----CT--TA------ACTT--------AC---T-T----ACGGTA---A--T----ATCATT---TA-GAA-----------------------A-----A-----A-GTAacatgcat
gi|36 : CCAGAT-A-AC--T-T--T-T-T-------------GA-TAATAGGGTATTT------TACC--AACAAAATTGAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----AG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--TCAA---GATTTT---CA---G-AGGTGAG-G------G---TAA----C--AAAGCA-TA---T-ATTG-T--A---AGAT---ACA
gi|37 : tattCCTCAGAC-A-AC--T-T--T-T-TT------------AA-TAAGAGGGTAATT------TACC--CCCGAAATTGAa
gi|38 : -TTGCA--A-A--A----------A---AACCTT-G-TCT--ATTTC---AGTAA-------AC--AA----CT--CT------GCCT--------AC---T-T----AC-ACA---A---------TATT---TA-TA------------------------T-----A-----A-GTAAGTTTCTGTTTCATTT--GCCTT-CTCCAAGATA--TAtataaattcaaagtaccagaacattttgatagtaagaagacaatttttaatttacccaaaaaaat
gi|39 : T--ATTTC---AATTA-------AA--AA----CT--GT------ACTTTAACATACAT---G-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TA-GGT-----------------------T-----T-----A-GTAATTTACAA-------------------------------G--GGTCTACAAGATATAAAGTCATgtcatataac
gi|4 : cctaTGCTCCAGAT-A-AC--T-T--TAT-T-------------GA-TAAGAGGGTATTT------TACC--CCCAGAATAGGA-A--A-------------G---A-T------------C----G----GG----------G---------T----T------T---T-A------ATT--CAGA---GATTTT---CA---G-ACGTGAG-G------G---TAA----T--GCATCA-TA---C-AGTCGT--A---AGAT---ACATTAAAA--T--C-TTA--CT--AA-CTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTTT-ATTTC---AATTT-------AA--AA----CT--TT------A----------------T-T----AC----------T----AT-ATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTATACTTTCATTT--GC--T-ATCTAAGACA--CAAA--GGTCTCCAAGATATGAAATCATTAacattcta
gi|40 : agG---AGTTTCAA-TTA--ATTTC---AATAA-------AA--AAAAAACA--TG------GCTT---------C---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TATAAT-----------------------T-----A-----G-ATAATTTACTAGCTCATTT--GC--tacatgtatttta
gi|41 : CCAGAA-A-ATA-T-T--G-T-T-------------AA-TAAGAGGGTAATTAATAATTACC--CCCAAAA-AGAACA--A-------------G---G-T------------G----T----GG----------G---------T--A-T------T---TTA------AAT--CCCA---GATTTT---CA---G-AGActttaa
gi|42 : tA---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----AAGTAATTTACACTTTCATTT--GA--T--TGCAAGACA--CACG--AGT---TAAGATATGAAATCATTA
gi|43 : AT-A-AC--T-T--T-T-T-------------AA-TAGGAGGGTAATT------TGCC--CCCAAACTGGAA-A--A-------------G---A-A------------A----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--CCCA---GATTTT---CA---C-AGATGTG-G------G---TAA----A--GAtacatgtagtttaa
gi|44 : --T-T-T-------------AA-TAAGAGGATAATC------TA-C--CCAAAAATTGAA-AACA-------------GTGCA-T------------G----G----GG----------G---------TA-A-C------T---T-C------ATT--CCCC---AATTCT---AA---GCAAATGTG-G------A---TAA----
gi|45 : TGCCCCATATTA-AC--T-T--T-TTT-------------GA-TAAGACGGTATCT------TACC--ACTGAATTTGAA-A--A-------------T---G-T------------A----G----AG----------G---------T--
gi|46 : taaGCCCAAGAT-A-AT--G-T--T-T-T------------------AGAGTGTTATT------TACT--CCCCAAATCGGG-A--A-------------G---A-T------------A----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------AC
gi|47 : TCATTT--GC--T-ACCCAAGACG--TATG--AGTCTCCGAGGTATGAGATCATTA
gi|48 : TT------TACC--ACAAAAATGGAA-A--A-------------T---A-T------------G----A----GGCCCATTAAGGG---------T--A-T------T---T-A------ACT--CTCA---GATTTT---tacatgtattttaa
gi|49 : t--T-T--T-T-C-------------AA-TGAGAGGGTATTT------TACC--CCAAAAATGGAA-A--t
gi|5 : agaaaaggTGTCCCAGAT-A-AC--TAT--T-T-C-------------TA-TAAGAGGATAATA------TACC--CTCAAAATGGAA-A--A-------------G---A-TTGGGGAGGGGTGG----G----GG----------G---------T--ATT------T---T-A------ACT--CCAA---GATTTA---CA---G-AAATGTG-G------A---TAG----A--GAATT--TATCCT-AGTC-A--A---AGAT---ATATTGCAA--T--C-TTA--CT--TT-TTG----A-A--ATGGT----CAG---CAATGCCA-TTT---TTT-----GT-------------AA----C-----------A--------------------------GTC---A--T----CTTATT---GA-GAT-----------------------T-----A-----G-ATAATTCATAATTTCATTT--GC--T-ATCTATAAT---CATT--GGTTTACAAGATATAAAGTCAT
gi|50 : gGCCCTAAAT-A-AC--T-T--T-T-A-------------G--TAAGAGGGTAATT------TACC--CATAAAATacgtatatttta
gi|6 : a----------G---------T--A-T------T---TTC------ACC--CCCG---TAGTTT---CG---C-GTATGCG-G----------TAA----AATGGA-CA-TA---A-AATG-T--A---TGAT---CCGTTGCAA--T--CAGTAAATT--TA-T------A-A--GT--T----CAG---AATACTTG-TTT--ACCTT---AGTTA-------AA--AA----AT--TT-------------------------T----AC-ATG------T----AATCTT---TA-AAT-----------------------T-----A-----G-GTAATTTACTATTTTATT
gi|7 : TGCCCCATAT-T-AC--T-T--T-T-T-------------AAATATGAGGGCAATT------TAAC--CCCAAACTGGAA-A--A-------------G---A-T------------A----T----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------GCT--CCAA---ATTTTT---CA---G-AGATGAG-G------A---TAG----A--GAAGTATTA---C-A-TC-T--A---AGAA---A-----CAG--T--C-CTA--CT--TA-TAGCA--A-A--AT--T----CAG---AGTTTTCA-TTT--A--TC---A--TAAAAT---AA--AA----CT--TT------ACTT--------ACATAT-A----AT-ATA---A--TATGCATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAGTTTACAATTTCATTT--GC--T-ATCT-AGACG--CACA--GGTCTACAACATATAAAGTCATgcattcttcagatataaataaccattctaaccaatccttatttaattaatcacatgtcagtatagacacttcgttaaaatatttggaagtggtaaatttactccctgtttttaag
gi|8 : g-T-------------GA-TAAGAGGGTTTTT------TAAC--TCCAATATTCAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACA--CCCA---GATTTT---CA---G-AGGTGAG-G------G---AAA----T--GAAGCA-TA---C-AGTAGT--A---ATTT---ACATTAAAAAGT--C-TTA--CT--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CTA---AATTTTCA-TTT---TTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--TT------ATTT--------AC---T-T----AC-GTT---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACACTATCATTT--GC--T-ATCTTAGACA--CATG--GGTCTCCAAGATATGAAATCTTTAgtgt
gi|9 : GCCTTAGGT-A-AC--T-T--T-T-A-------------AA-TGAGAGT-TAATT------CACC--CGTAAATAGGAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GG--------------------T--A-T------A---T-G------ACT--ACCA---GATTTT---CA---G-AGATCAG-G------A---TAA----A--GATGCA-TA---A-AGTC-TTGA---AGTC---ACATTGCAA--T--T-TTA--TT--TA-TTAAA--A-A--AT--T-----------ATTTTTG-TTT--ATTTT---AGTTG-------AA--AT----CT--TT------ATAT--------GC---T-T----GC-ATA---A--T----ATTATT---TA-GATGATTG------------------T-----A-----A-GTAATTTACAATTTCATTT--GC--C-GTCT-AGACA--CACA--GGTCTTCAAGATATtacatgtatgtattttaa
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blockSeqs : . . . . . . . A . A . . T . . GATGG . . . . . . . . . . . . . A . . . T . A . . . . C AC . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CA A A
blockSeqs : . . . . . . . G . A . . T . . GATGG . . . . . . . . . . . . . A . . . G . C . . . . T AA . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CT A G
blockSeqs : . . . . . . . A . A . . T . . GGTGT . . . . . . . . . . . . . T . . . T . A . . . . C GC . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TG C G
blockSeqs : . . . . . . . G . T . . G . . AATGG . . . . . . . . . . . . . T . . . A . T . . . . C AC . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . AA A G
blockSeqs : . . . . . . . A . A . . G . . GATGG . . . . . . . . . . . . . T . . . A . T . . . . C GC . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . CG C A
blockSeqs : . . . . . . . A . A . . T . . GATCG . . . . . . . . . . . . . A . . . A . C . . . . A GC . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG C A
blockSeqs : . . . . . . . G . A . . A . . GGTGT . . . . . . . . . . . . . T . . . T . A . . . . T GC . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT A G
blockSeqs : . . . . . . . G . A . . T . . GAAAG . . . . . . . . . . . . . T . . . A . A . . . . C AA . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA A .
blockSeqs : . . . . . . . G . T . . T . . TGTAG . . . . . . . . . . . . . A . . . A . T . . . . C GC . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG C
blockSeqs : . . . . . . . A . A . . A . . GATAG . . . . . . . . . . . . . A . . . G . A . . . . T GC . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA T
blockSeqs : . . . . . . . A . T . . A . . TATGA . . . . . . . . . . . . . A . . . A . A . . . . C AA . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . A . A . . G . . GATAT . . . . . . . . . . . . . T . . . C . A . . . . C GC . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . G . A . . T . . GATGG . . . . . . . . . . . . . T . . . T . T . . . . C C . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . A . . T . . GATGG . . . . . . . . . . . . . T . . . A . C . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . T . . C . . ATAG . . . . . . . . . . . . . C . . . A . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . A . . G . . GAT . . . . . . . . . . . . . A . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . T . . G . . GA . . . . . . . . . . . . . A . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ** *** A****** N**** C** **** CG**
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finalCons : TGCCCCAGAT-A-AC--T-T--T-T-T-------------GA-TAAGAGGGTAATT------TACC--CCCAAAATNGAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--CCCA---GATTTT---CA---G-AGATGNG-G------G---TAAA------GAAGCA-TAN----AGTC-T--A---AGAT---ACATTGCAA--T--C-TTAC--T--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACAATTTCATTT--GC--T-ATCTAAGACA--CACG--GGTCTNCAAGATATGAAATCATTA
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Reference ( family-688 ) : TGCCCCAGAT-A-AC--T-T--T-T-T-------------GA-TAAGAGGGTAATT------TACC--CCCAAAATNGAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--CCCA---GATTTT---CA---G-AGATGNG-G------G---TAA----A--GAAGCA-TA---N-AGTC-T--A---AGAT---ACATTGCAA--T--C-TTA--CT--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACAATTTCATTT--GC--T-ATCTAAGACA--CACG--GGTCTNCAAGATATGAAATCATTA
gi|1 : G----------G---------T--A-T------T---T-T------GCT--CCAA---GATTTT---CGCCCA-AG-TAGG-A------G---TAA-------GA--------------TC-T--T---AGAT---ATATTGTAA--T--G-G-------------GTA--A-A--TT--TAAGCCAG---AGTTTCAA-TTC--ATTTC---AGCTG-------AA--AA----CT--GT------GCTT--------AC---T-T----AC-AAA---A--T----ATCATT---TA-AAG-----------------------A-----A-----A-GTAATGTACTATTTCACCT--TC------CTAAAATG--AA----------CAAGATGTAAAGTCAT
gi|10 : TGCTCCAGAT-A-ACATT-T--T-T-T-------------GA-TAAGAGGGTATTT------TACC--CCACAAATTGAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GA----------G---------------------------------------CTCA---GATTTT---CA---G-AAGGGAG-G------G---TAA----T--AAAGCA-TA---C-AGTCGT--T---AGAT---ACATTTAAA--T--C-TTA--CT--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CG--TT------ACTT--------AC---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TA-GAT--------------------------------------TAATTTTCACTTTCATTT--GC--T-ATCTAAGACA--CGTG--CGTCTTTAAGATATGAAATCATatttttatcaagccttaccatgaatactgtaatcatatttctgttttgaaacctagttaaaatatttggaatgtgtaaacttgtcccctatttcaaa
gi|11 : gTGCTCCAGAT-A-AT--T-T--T-T-T-------------GA-TAAGAGGATATTT------TACC--CCCAAAATTGAA-A--A-------------G---A-T------------T----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--CCCA---GATTTT---CA---C-AGACGAG-A------G---TAA----T--GAAGCA-TA---C-AGTCGT--A---AGAT---ACATTAAAA--T--T-TTA--CT--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-T----AT-ATA---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAGTTTACACTTTCATTT--GC--T-ATCTAAGACA--CATG--AGCCTCTAAGATATGAAATCAGTAatgacatgtatt
gi|12 : AT-A-AT--G-T--T-T-T-------------AA-TAAGGGTGCAATT------TTT--------AATTAAA-A--A-----------------A-T------------A----G----GG----------G---------T--A-TC-----T---T-A------ACT--TCTA---GATTGG---CA---G-ATATGTG-G------A---TAA----A--GACACA-TA---A-ATAT-T--C---AGAT---ATATTACGA--T--C-TTA--TT--TA-TTG-A--A-G--AT--T----TAG---AATTCACA-TTT--ATTTC---AGCTA-------AT--T-----TT--TT------ATTC--------GC---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---AA-GAT-----------------------TGTTATA-----T-CTAATTTACAATTTCATTT--GC--C-ATCTACAATATCTACA--GGTCTACAAGATATAAAGTCAT
gi|13 : atTGCTCCAGAT-A-ACA-T-T--T-T-T-------------GA-TAAGAGGGTATTT------TACT--CCAAAAATTGAA-A--A-------------G---A-T--------------------------------------------------------T---T-A------ACT--CCCA---GATTTT---CA---G-AGGTGAG-G------G---TAA----T--GAAGCA-TA---C-A--T-T--A---A--T---ACATTAAAAA-T--C-TTA--CT--TA-------------AT-------CAG---AATTTTTA-TAT--ATTTT---AGTTA-------AA--AA----CT----------ACTT--------AC---T-T----AA-ATA---G--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------A-----A-----A-GTAATTTAAACTTTCATTT--GC--T-ATCTAAGACA--CATG--GGTCTCCAAGATATGAAATCATTAatatttta
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gi|15 : cgcaTGCCCCAAAT-ATATA-T-C--T-T-T-------------AA-TAAGAGGGTAGTT------TACC--CCCAAATTGGAA-A--A-------------T---G-T------------G----G----GG----------GGGCGGGGGGT--A-T------T---TTA------ACT--CCTG---TATTTT---CC---G-AGATGTG-G------A---TAA----A--GAAGCA-TA---A-AGT--T--A---A-----------------------------------TGTA--A-A--AT--T----CAA---AATTTTAT-TTT--CTTTC---AATTA-------AA--AA----CT--T-------------------------------AC-ATA---A--T----GTTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACAATTCCATTT--GC--T--TTTAAGACA--TGTGCTGGTCCGCAAT-TAAAAAGTCATagtcatatatttta
gi|16 : acagTGCTGCAGAT-A-GC--T-TAATAT-T-------------AA-TAAGAGGGTAATT------TACC--ACCAAGATAGTA-A--A-------------A---A-T------------G----T----GG----------G---------T--A-CCAGTCAT---C-A------ACT--CCAAA--GATTTT---CA---A-AGATATA-G------G---TAA----G--GAAGCA-TA---A-AGTT-T--A---AGAT---A-A----AA--T--A-TAA--CT--TA-TTGTA--A-A--TT--T----CAG---AATGTTCA-TAT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--GT------ACTTTA------AC---A-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TA-TGT-----------------------T-----T-----A-GTAATTTACAAatattttt
gi|17 : catTGCCCAAGAT-T-AC--G-T--T-T-TA------------GA-TAAGAGGGTTATT------CATC--CGCAAAACAAAA-A--A-------------------------------------------------------------------A-T------A---T-A----------------------TT---GG---G-ATATGTG-T------G---AAA----A--TAAGCA-TA---A-AGTC-T--A---TGTG---ACATTGCAA--T--CCTTT--TT--TT-TTTTG--A-A--AT--T----CAG---AGTTTTTA-CTT--ATTTC---AGCTATGCAGTTGACTGA----CT--TCTGTGTAATTT--------AC---T-T----AC-TTA---A--T----ATTATA---TA-TAT-----------------------T-----T-----A-GTAATTTAGAATTTGCTTTCAGT--T-AT-----ATA--CATG--TGTCTTAAAgggtaaagatatatgtcatacattttaa
gi|18 : tcagCAGAT-A-AT--T-T--T-T-TTTTTTGGTAATTAAA-TAAGAGGGTATTT------TATC--CCCAAAATTGAA-A--A-------------A---AAT------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--CTC---------T----------AGATAAG-A------G---TAA----A--GAAGCA-TA---ATAGTC-T--A---AGAC---ACAAT------T--T-TTA------TACTTGTA--A-A--AT--T----TAG---AATATTCA-TTT--G-------------------AA--AA----CT--TT------ACTT--------TC---T-C----AT-ATATTAA--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-TTAGTTTACAATTCCA-TT--GC--T-Aca
gi|19 : TGCCCCAGAT-A-AC--T-T--T-A-A-------------AA-TAAGAAGGTAATT------TACCGCCCCA-----------------------------------------------------------------------------C--A-C------T---C-A------ACC--CCCAATGGA--------A---A-AGATGGGAG------G---TAA----A--GATGCA-TA---A-TGTC-C--A---AGAT---AAGTTGCAA--T--T-TTA--TT--TA-TTAAA--A-A--AT--T----CAA---ACTTTTCA-T--------------TTA-------AA--AT----CT--TT------ACTT--------GC---T-T----GT-------A--T----ATGATT---TA-GAA-----------------------T-----ATTGCGA-GTAATTTACAATTTCATTT--GC--T-ATC-GAGACA--TAT---GGTCTGCAAGATATAAATTCATctggtctacatgttaattaaagaaacaacaca
gi|2 : agTGCTCCAGAT-A-AC--T-T--TAT-T-------------GA-TAAGAGGGTATTT------TACC--CCAAAAATGGAA-A--G-------------A---A-A------------A----G----GG----------G---------T--A-T------T---T-A------ACT--CTCA---GATTTT---CA---G-AGGTGAA-T------G---TAA----T--GAAGCA-GA---C-AGCCAT--A---AGAT---ACATTAAAA--T--C-TTA--CT--TA-TTTTA--A-----T--T----CAG---AATTTTCA-TT---ATTTC---AATTT-------AA--AA----CT--TT------ACTT--------AC---T-T----AC-ATG---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACACTTTCATTT--GC--T-ATCCAAGACA--CATG--GGCCTCCAAGATATTAAACCATTAatatttta
gi|20 : CTCCAGAT-A-AC--T-T--T-TTT-------------GA-TAAGAGAGTATTC------AACT--CTCAAtacatattatatttt
gi|20 : tTTGAT-A--A-------------G---A------------------------GA----------G---------T--A-T------T---C-A------ACT--CTCA---ATTTTT---CA---G-AGGTGAG-G------G---TAT----T--AAAGCA-TA---A-AGTTAT--G---AGAA---ATATCAAAA--T--T-TTA--CT--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTA--ATTTC---AGTTA-------AA--AC----CT--TT------ACTT--------AC---T-TG---AC-------A--T----ACTATT---TA-TAT-----------------------T-----A-----A-GTAATTTACACTTTCATTT--GC--TGATCTAAGACA--CATG--GGTCGTCAAGATATGAAATCATTAtttttcagaggtgagggtattaaagcataaagttatgagaaatatcaaaattttacttattgcaaaattcagaattttcattaatttcagttaaaacctttacttacttgacatactatttatattaagtaatttacactttcatttgctgatctaagacacatgggtcgtcaagatatgaaatcattatacatgtagttt
gi|21 : tctccagataacttttCCCCAGAT-A-AC--T-T--TCT-T-------------AA-TAAGAGGGTTTTT------TACC--CCCAAAATGGTA-A--A-------------A---A-T------------G----T----GG----------G---------T--T-T------T---C-A------GCT--CCCA---GATTTT---CA---G-AGATATG-G------G---TAA----G--GAAGCA-TT---A-AGTT-T--A---AGAT---A-----CAA--G--A-TTA--CT--TA-TTGTA--A-A--AC--T----CAG---TATTTTCA-TAT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT--GT------ACTTTA------AC---A-T----AT-ATA---A--T----GTTATT---TA-GGC-----------------------T-----T-----A-ATAATTtacatgtagttt
gi|22 : ----------G---------T--A-T------T---T-G------ACT--CCGA---GATTTT---CA---G-G--TGAG-G------G---TCA----T--GAAGCA-TA---C-AGTTGT--A---AGAT---ACATTAAAA--CACC-TTA--TT--TT-CTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTT--ATTTC---AGTTA-------AA--AA----CT----------ACTT--------AC---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---GA-GAT-----------------------T-----A-----A-GCAATTTACACTTTCATTT--GC--T-ATCTAACACA--CATG--GGTTTCCAAGATATGAAAACATTAgaaaagggtccttcaagatataacatcgacattctat
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gi|23 : tggtAG---AATTTTTA-TTT--ATTTC---AGTAA-------AA--AA----CT--TT------CCTT--------AC---T-T----AC-ATA---A--T----ATTATT---TA-GAT-----------------------T-----A-----A-GAAATTTACAAATTCATTT--GC--T-ATTTAAGACA--CATG--GGTCTACGAGATATCAAGTCATTAaatttttatttatttcagtaaaaaactttccttacttacataatattatttagattaagaaatttacaaattcatttgctatttaagacacatgggtctacgagatatcaagtcattatgcatatattttaatt
gi|24 : tggtccagataactttttcaataaaagggtattttacccccaaaattgaaatttaacgatcagattttcagaggtgaGGGTAATT------TACC--CTCAAAGCGGAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GC----------T---------T----T------T---T-A------ACT--CCCA---GGTTAT---CA---G-AGATATG-A------A---CAA-------GAAGCA-GA---A-AGTC-T--A---AGAT--------GCAA--T--C-TTA--CT--TA-TTGTA--A-A--AT--A----CAG---AATTATCA-TTT------C---AGTTA-------AA--AA----CT--TC------ACTT--------AC---T-T----GC-ATA---C--T----TTTATT---TA-GG------------------------T-----A-----A-GTAATTTACATTTTCATTT--GC--T-TTCT-AGACA--CACA--GGTCAACAATATtgcatatattttaatt
gi|25 : -T------T---T-A------ACT--CCCA---AGTTGT---CA---G-AGATGTG-T------G---TAA----A--TAAGTA-TA---T-ACTC-T--A---AGAT---ACAATGCTA-----C-TTA---T--CG-TTGCG--A--------T----CAT---ACTATTCA-TTT--ATTTC---AGCCA-------AA--TA----TT--TT------ACGT--------AT---T-T----AC-TTA---A--T----ATTATT---TA-GCTA----------------------A-----A-----A-ATAATTTA------TATTT--GC--T-ATCC-AGACA--CATG--GGTCT--AAAATATAAA
gi|26 : AGAT-A-AT--TAT--T-G-T-------------GA-TAAGGGGATAATT------TACC--CACAAACTTGCA-AT-A-------------A---C-T------------G----GTAAAGG----------G---------TTAA-T------G---T-T------ACTTACCCA---GTTTTT---CC---A-TGAT---------------TAA----A--TAGGCA-CA---T-GCTG-T--A---AGAT---CCACTGCAG--C--C-------------TGGGAGTA-A--AT--------AG------TTTCACTTT--ATTTT---AGTTA-------GA--TT----CTTGTT------GCAT--------AA---TGT----AC-ATA---G--C----ATTGTT---TA-GAT-----------------------T-----A-----tatatataaagttacatattttaa
gi|27 : GCCCCAGAT-A-----T-TAAT-T-T-------------AA-TAAGAGGTTAATT------TACA--CAAAAAATTGTA-A--A-------------G---A-T------------G----G----TG----------A---------T--A-T------TATAT-A-------------CA---GGTTTT---CA---A-AGATGTG-A------G---TGA----A--TAGGCA-T----C-AGTG-C--A---GTAT----CAGTACA---------------------TGTA--ACA--GT--T----TAG---TA-TTTCA-ATTAAATTTC---ATTTC-------AA--AG----TT--TT------GCTT--------AC---T-T----GC-ATA---T--T----A-TATT---TA-TAT-----------------------T-----
gi|28 : gCTCCAGAT-A-AT--GAT--T-T-T-------------GA-TAAGAGGGTATTT------TACC--GGCAACATTAAA-A--A-------------G---A-T------------G----G----GG----------G---------T--A-T------T---C-A------ACT--CTCA----ATTTT---GA---G-AG-TGAG-GTGAATGG---TAA----T--GATGCA-TA---A-AATCGT--G---AGAA---ATATCAAAA--T--C-TTA--CA--TA-TTGCA--A-A--AT--T----CAG---AATTTTCA-TTT--ATTTC---AGTTA-------AA--AC----CT--TA------ACTT--------At
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