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gi|4 : tTGTTATT--AAGACAGCATTTACAAACTTGTCATGATTAATAAACTTGA-TGCAAAG-CCCAAAAAGTAGAAATTATAATGTAATACATACACTTG---TAAAG-CATTTATTCGAGGAGAAAC-AGGTAACTACCAGCAATCAATGTTTGCTCTTTGTACAAAAACCTTTGTAAacatgtatggacagatgtccaatgttgtaactattttcactgtttatcaactccacaatttgtatcatgttagcatttttctaacagtatttcttaataaatttgctttctaatgtcatgacttaatgggagttaaaatgaaatcttcaagtgtattgcatattttacactttcttactt
gi|5 : ttagaacaccgcctttaaacctgtaatatgctatttCATGTATCACGAATAAACTAG-TGATTTCAAA----CCTTAAACTAAAA-CAAATATTAATCAAAGACAACCTTAACACACTTGTCATGAAGAATAAACTTGAATCTTAAA-CCAAAATAGTAGAAATTATAAAGTTATATATACACCTG---TAAAG-CATTTATGTGAGGAGAAAC-GGGTAACTACAAGTAATTTATGTTTGATCTTTGTTC-AAAACCTTTGatatatatggatctgtgtccaactgttgaactgttctcactgcgtatcaactccacacatgttatg
gi|8 : AACCTAAATCCAAAA-CCCAAATAGTAGAAATTATAATGTAATATATACACATGACGTAAAA-CATTTATGTGAGGAGAAAT-GAGTAACAACAAGTAGTTTATGTTTGATCTTTGTTC-AAAACTTTTGTAA
gi|9 : TTTATTT-CATGCAAAAGACC--A--TAAAA-C--A--AG--------C-TA---TCATTGGAACGG--------TA-AAACAA--------CGGCA--CCGT--------ATTAACACATTTGTCATGAACAAACTAAAT----TCAAA----CTTTAAAA-AAAATCAAATGTTAATCAAAGA-AACTTTTACACACTTGCCATGAATAATATACTTAAATatatatatgaataggtgtctaatggttgaactataatgaataaactgaataatt
blockSeqs : T TTAGGCGGC TAAACAAA A TG AA C G GC TGA AGC T AGTGATT . T T T CA C A A T ACG T C C TT A
blockSeqs : . AAAGGCGG . A . AA T A . TTT CAA A AAAT . . . A CA C C . T . . C T A .
blockSeqs : . ATAGGCCT . T . CA A G . TGT AGT A A . . T . T . . A T C .
blockSeqs : . GTGTGTTC . C . G . . . . . A . A . . A C T .
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blockSeqs : . C . . A T C .
blockSeqs : A . . . . T
blockSeqCons :
originalCons : TATATTTATTT-CATGCAAAAGGCC--A--TGCGN-C--ATCAG--------CATANAATCAT--AAACGNACATGCAATACAAACAAGTAATCAGTGGCA--CCGTTGTACAGTATTCACACATTTATCATGAATAAACTAG-T----TCAAA----CTTTAAAC-AAAA-CAAATGTTAATCAAAGACAACTTTTACACACTTGTCATGAATAATAAACTTGAATTCAAAA-CCCAAATAGTAGAAATTATAATGTAATACATACACNTG---TAAAG-CATTCATGCGAGGAGAAAC-GGGAAACTACAAGTAATTTATGTTTGATCTTTGTTC-AAAACTTTTGTAA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TAAATATATATGGATATATGGTCTAATTGTTGAACTATTTTTAATTTTTGTCAACACCAACAATTTCAGCTTGTCATTATTTTTCAAAAGTATTTCTTAAAAAAATATCTTTAATGCCATTATATACTGGACATTCTAACAAAAAGTGAAATTTATCTTCGATTGTATTGCATTAACTTCACTTCTTTTCTTTGAAAGGTATTGTAACAG
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Alignments
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