lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111 1111111111111
lowQualScore : 55 2222 2 111 3333333 1 1111 1 333 11 333333333333333333333 2222222222222222222222222222222 11 333333333333333333333 1 333333333333333333333333 11111 1 1111 222222 2222222222 1 55555555555555555555555555555555555 1111 1111 2222222222222 11111 1111 1111111 44444444444444444444444444444444444 11111 11111111 777777777777777777777777777777777777 1 11 88888888888888888888888888888888888 111111 222222222 1 1 111 111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33333333 2222222222222222 111111 222222222222222222 4444444444444 11 111 1 33333333 2222222 22 11 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111 777777777777777777777 11 999999999999999999999999 222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 55555555 22 1 1 2 2222222 000000000000000000000000000 1 666666666666666 11 11 8888888888888 22 33 77777 11 8888888888 4 666666666 4 77777777777777777777777 1 11111111111111 2222222222222222222222222222222222222 222222222222222 111 11 444444444444444 33 33 3333 1 4444444 333 33
lowQualScore : 55 2 1111 3 3 999 8 1111111 1 0 2 6666 1111 55 7 66 88 2 111 2 4 66 2 77 0 66666 2 999999 55 33 2 33 6 4 7777777 4 4 666666666666666666666 2 2 2 2222222222222222222222222222222 4 99 777 55 4 444444444444444444444 3 2 0 1 99999 8888 7 7 5 0 66 111111111111111111111111 11111 66 3 4 4444 1 6 666666 99 5 9999999999 2 88888888888888888888888888888888888 3 1111 33 77 33 5 6666 444 33 999 2 2 5 8888888 555 6666 444 5555 55 2 99 77777 1 2222222222222 1 2 777 4 00000 2 7 1111 0 1111111 777 77777777777777777777777777777777777 33 2 555 2 2 55555 33333333 0 777777777777777777777777777777777777 4 2 0 999 0 0 6 6 888 6 66 00000000000000000000000000000000000 555555 999999999 4 1 1 4 1 4 4 5 9 5 999 7 111 1 6 77 1 77 555 6 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 2 666 777 11111111 3 5 33 7777 7777777777777777 0 3 4 1 0 9 222222 2 2 666666666666666666 0 5 4 4 99 1 4444444444444 5 66 22 6666 4 8 4444 666 0 22222222 6666666 33 77 55 7 77 1 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333 6 6666 1 6 99 111111111111111111111 0 66 0 5 77 5 5 2 0 5 555555555555555555555555 2 99 777777 1 777 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 88 7 3 22222222 1 0 6 11 6 7 6 5 0 9999999 777777777777777777777777777 6 555555555555555 22 3 11 0 2222222222222 6 6 00 0 3 00 6 1 1 00000 4 88 6 2222222222 0 6 6 6 444444444 0 6 6 3 33333333333333333333333 5 6 5555 2 77777 33 333 4 1 00000000000000 1 3 4444 6666666666666666666666666666666666666 666 8888 111111111111111 111 3 4 99999 777 77 99 11 3 2 0 777777777777777 66 88 0 00 5555 4 4 6 2 4 6 77 0 4444444 7 6 3 555 55
lowQualScore : .. . .... . . ... . ....... . . . .... .... .. . .. .. . ... . . .. . .. . ..... . ...... .. .. . .. . . ....... . . ..................... . . . ............................... . .. ... .. . ..................... . . . . ..... .... . . . . .. ........................ ..... .. . . .... . . ...... .. . .......... . ................................... . .... .. .. .. . .... ... .. ... . . . ....... ... .... ... .... .. . .. ..... . ............. . . ... . ..... . . .... . ....... ... ................................... .. . ... . . ..... ........ . .................................... . . . ... . . . . ... . .. ................................... ...... ......... . . . . . . . . . . ... . ... . . .. . .. ... . .................................................................. . . ... ... ........ . . .. .... ................ . . . . . . ...... . . .................. . . . . .. . ............. . .. .. .... . . .... ... . ........ ....... .. .. .. . .. . . ................................................. . .... . . .. ..................... . .. . . .. . . . . . ........................ . .. ...... . ... ....................................................... .. . . ........ . . . .. . . . . . ....... ........................... . ............... .. . .. . ............. . . .. . . .. . . . ..... . .. . .......... . . . . ......... . . . . ....................... . . .... . ..... .. ... . . .............. . . .... ..................................... ... .... ............... ... . . ..... ... .. .. .. . . . ............... .. .. . .. .... . . . . . . .. . ....... . . . ... ..
lowQualScore : 00 5 0000 7 3 333 3 0000000 0 7 0 1111 4444 77 3 22 77 5 777 2 7 33 5 11 3 77777 7 777777 33 44 4 11 3 0 4444444 0 0 666666666666666666666 5 7 5 7777777777777777777777777777777 5 99 888 33 9 555555555555555555555 6 1 7 6 55555 5555 8 7 4 5 99 222222222222222222222222 55555 99 0 3 2222 8 7 777777 22 7 3333333333 5 99999999999999999999999999999999999 1 2222 99 33 77 3 2222 444 44 777 4 4 2 1111111 777 2222 444 4444 77 9 22 77777 2 2222222222222 0 0 000 5 22222 9 3 4444 3 4444444 999 99999999999999999999999999999999999 99 6 000 9 9 99999 22222222 6 444444444444444444444444444444444444 8 8 3 111 1 3 0 7 222 0 77 66666666666666666666666666666666666 777777 555555555 4 0 9 6 5 0 1 0 9 0 222 5 666 1 0 99 1 99 777 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 2 222 888 11111111 3 4 22 5555 5555555555555555 8 2 5 6 1 2 666666 8 2 555555555555555555 4 9 0 0 99 7 5555555555555 4 11 22 2222 4 2 9999 111 2 77777777 6666666 66 99 77 9 77 8 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888 7 8888 7 3 22 999999999999999999999 1 44 2 0 22 6 0 2 4 7 333333333333333333333333 8 55 888888 0 333 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00 3 7 00000000 0 7 7 00 0 0 0 0 0 5555555 222222222222222222222222222 0 888888888888888 88 0 00 8 4444444444444 0 0 00 8 2 00 0 4 4 66666 0 00 0 0000000000 0 0 0 0 000000000 0 0 0 0 88888888888888888888888 7 7 7777 7 44444 99 666 9 8 77777777777777 8 6 0000 2222222222222222222222222222222222222 666 3333 444444444444444 000 4 4 44444 888 99 22 00 2 5 2 222222222222222 00 33 7 55 0000 0 0 0 5 0 3 77 7 3333333 3 7 7 000 55
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATATTGANCACGNNNGTATNT-TCCATATC--CTACAG-TNTT--TACTGTTTGTTGATGCTATTGGCTGTTTACNTNAGATGTTACTANATAATTTGNTACCTCCTGTATTNGTGTCACTT--TT-TTAGC-TCACCTG-----A-G------C--A--AA-GC-TCA-AGGTGAGC-----TAT-TCTGATCG-C---C-TGTTGT-C--CNT--CGTC-TGT-CGT-CTAT-T---GTCCA-TCGTCTGTCTGTT----AACNTTN-TGT---TGTGTGCACTCTAG-------C----AC--NCG--TATTT-TTCATTGGATCTTCAC---CAA----ACTT-TACAGTANTTATATAACC--A-------TAA--------------TATCTTGGAC--AAGTTCNTGAACT----GGCCAA-ATC-G-ATNAT--T-AATGT-C-----AAGAGTTATGGCCC-TTG---A--AACATTAAAAAT-G-CATTA----TT-TGAC-NT--TGTGT--GC--AC-T--C-TAG---CAC--C-CGCATT-T-TTCATTNGA-------TCC--TCAC---CAAACT---TGC--AC-A-GTAG-TTATA----TAACCATA--AT--NTC-TTGGACAAGTTCTTGAA---CCGGCCAAATC-GG--ATNATTAATGTCA----GAGTTATGGCCC-TTGAANCGTTGAAAAA--T-----------GC-C-T---------TGTGT--GCACTCTA---G-CAC-C--CG-CATTT--------TTCATTTGAT----NTT-A--AAC--AN------AC------A---GTAGTTATATAACCATAATATCTTNGACAAGTTCTTGAACCGGCCAAATC-GG-ANTATTAATGTCAGAGT-T-ATGG-CCCTTGAAACATTGAA-AA-TGCACT-TTTGACT--NT-GTGTGCACTCTAGCACCCGCATTT-TTCATTTGATCCTCACCAAACTTACACAGTA-GTTATATAACCATAATATCTTNGACAAGTTCTTGA--ACCGGCCAAA--TCGG--ANTATTAATGTCAGG-GTNGTGGCCC-TTGAATCGTTGAAAATTGCGAC-TT-----TA--ACNTTG----TG---TGCACTCT--AG---CA---C--CNGTATTT-TTCATTTGATCCTCAC---CAAACTTATA---CAGTAGT---TATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTCTTGAA----CCGGCCAAATCG---GGTA--A--TT-A-ATGTCNG-AGTTATGG-CCCTTGAATCATCGAAAA--T-G-CNTTA-TTTGACNT--TGTGT--GC--ACTCT-AGCACCCGCATT-TTTCATTTG--TTCCC-ACCAAACTTACGCA--GTAGTTATATA--A--CCACAATATCTTNGACAAGTNCTT-GAA----CC----GACC-AA---TCGGA--TN-----ATTAATGTCANAGTT-GTGG-CCCTTGAAACATCGAA--AAT--G-C-TTGTTCG-NCG---TTGTGCGCACTCTAGC-ACCTGCATTT-TTCATTTGATCC-TCA---CCA-----AACT--CGCA--GTAGTTATATAACCATAATATC--TTAGACAAGTTCTTGAACCGACCAAATCG-GGTAATT-AT-GT---ATCNG--T---GNTC----CTTG--A--CATTGAAGA-TGCATTATTTGACNTCGTGTGCACTCT-GCACCCGTATTTTTCATTTGATCTNNNNNNTATTAATGTCAGAGTTGTGGCCCCTTGAAACGTTAAAAAT----TG---TTTA-ACT-GACGTCGNGTGCACTCTGGCA-CC-CGT--ATTTTTCATTNGATCCTCACC--AAACTTACACAGTTG--T-A-----GTTATATAACCATAATATCTTNGACAAGTTCTTGAACCGACCAAATCGGATAATTA----AATGNCCAAGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAAAATTTT--ATTTT--TACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGAT--TTACTCAAC-ATGAAANNNNNNNNGCTTCANAAGGT-CTATGTGTANCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGC-CGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--C-C-------TG-----G---------TG---TCCATC----GT-------------T-GACTT---TTANC-TTTT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTNGGCCAATTTT-----GATNTAAT-TTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGAC--TCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTGATTCGTCAAAAAACATGGCNNCCAGGGGGCGGGGCNAGTTTNATTAGTAAAAACTTAAAAAATGTTCTCGTCNGAAACTACTGGNCCGATTT---CGA-ATAATTTCACAGAAATGTTCCTTNGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGG
Reference ( gi|1 ) : AAATAAACTACAATAAAAAACAGATATGAAAACA--ACATATTAAGCACAAGTGTATGTGTCCATATT--CTACTG-TATT--TATTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACTTTAGATGTTGCTGTATAATTTGTTACCTCCTGCATCGATGTCACTT--TT-TTAGT-TCACCTG-----A-G------C--A--AA-GC-TCA-AGGTAAGC-----TAT-TCTGATCG-C---C-TGTTGT-T--CTT--CGTC-TGT-TGT-CTAT-T---GTCCA-TTGTCTGTCTGTT----AACTTTT-TGT---TGTACGCACTCTAG-------C----AC--ATG--TATTT-TTCATTGGATCTTCAC---TAA----ACTT-TATAGTAGTTATATAACC--A-------TAA--------------TATCTCGAAC--ATGTTCTTGAACT----GGCCAA-ATC-G-ATCAT--T-AATGT-T-----AAGAGTTGTGGCCT-TTG---A--AACATAAAAAAT-G-CATTA----TT-TGAC-CT--TGTGT--GC--AC-T--G-TAG---CAC--C-CGCATT-T-TTCATTTGA-------TCC--TCAC---CAAACT---TGC--AC-A-GTAG-TTATA----TAACCATA--AT--TTC-TTGGACAAGTTCTTGAA---CTGGTCAAATC-GG--ATTATTAATGTCA----GAGTTATTGCCC-TTGAAACATTAAAAAA--T-----------AC-C-T---------TGTGT--GCACTCTA---G-CAC-C--CA-CATTT--------TTCATTTGAT----ATT-A--AAC--AA------AC------A---GTAGTTATATAAACATAATATCTTGAACAAGTTCTTGAACTGGCTAAATC-GG-AATATTGATGTCACAGT-T-TTGG-TCCTTAAAACTTTAAACAA-CGCACTATTTGACT--GT-GTGTGCACTATAGTTCCCGCATTT-TTTATTTGATTCTCACCAGACTTACACAGTA-GTAATATAAGCATAATATCTCGAACAAATTCTTGG--ACTGGCTAAA--TCAG--AATATTGATGTCAGA-TTAATGGCCC-TTGAGTTGTTAAAAACTACAACATT-----CA--ACCTTG----TC---TACGCTCT--AG---CA---G--CAGTATTT-TTCATTTGATCCTCAC---CAAACTTATA---CATTTGT---TATATAACCATAATATCTTGGATAAGTTCTTTAA----CAGACCAAATCC---GGTA--A--CT-T-ATGTCTG-AGTTATGG-CCCTTGAATAATCAAAAA--TGG-CATTA-TTTGACCT--TGTGT--GC--ATTCT-AGTACTCGCAGC-TTTCACTTG--TTTTCAACCAAACTTAGGTA--GTAGT--TATA--A--CCAAAATATCTTTGACAAGTTCTT-G------TT----G----AA---TTAGA--TT-----ACTACTGTCACAGTT-ATGG-CCTTTGAAACATCAAA--AAT--GTTTTTGTTTG-TTG---TTGTGTACACTCTAGC-ATGTGCAGTT-TTTATTTGATCC-TCA---TTA-----A-----TGCG--ATAATTATATAATTATAATATC--TAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTG-AATAGTT-GT-GT---ATTTG--T---GTTT----TTTG--A--CCTTG-----TGTGTTATTTGACCTTGTGTGCA-TCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACC-TTGAATTGTCAGAAAT----TG---TTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCA-CT-CAA--AGTTAATATTTGATCTTCATT--AAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACAATTTTAATACAAAA-TTATGAATATACAATTATACAATATATACAAATTA--AAGATAATTACTCAACAATAAAACCCAGCTGGTTTCAAAAGGTCCTATG-ATGGTATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCATCTG-----AGC-CAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--C-C-------TG-----G---------TG---TCCATC----GT-------------T-AACTT---TTAGC-TTCT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTC-----AATTTAAC-TTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACACTCCACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTGATTCATCAAAAAACATGCTTGCCAGGGGGCGGGGCAAGTTTAATTAATAAAAACTTAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACAACTGGCTCGATTT--ATAA-ATAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCT---TGATTCGTC-AAAAAACATGGG
gi|11 : AGATATGAAAACACAACATATTGATCATGATTGTATATGTCCATATT--CTACAG-TTAG--TACTGTTTGTTGGTGCTATT-ATTGACTACTTGATATGTAACTAAATGAGTTGATACCTCATACATTAGTGTCACTCA-TT-TCATTATCAAGTA-----A-GTCCTCTC--C--AA-AC-TCA-ATGGATGCGTTTTTATATCTGGTCG-C---G-AGATGTCT--TTT--CGT
gi|28 : gTAAGCACCTGAGTATTT----ATATC--CTGAAG-TATTAGTATTGCCTATTGATGTTATTGGATGTTTACGGTAGCTGTTACCATATAATTTGAGACCTagctg
gi|6 : ATGT-TCCATATCACCTACTGGCGTT--TTCTGTTT-TTCATACCAT-GCCTGTTCA--TTA-ATATT----TATGATAT----CATGCTGTAT----GT-A-TT--TA-TTAGC-TCACCTG-----A-G------CCAA--AG-GC-TCACAGGTGAGC-----TTT-TGTGATTG-C---C-TGGTGT-C--CGT--CGTC-TGT---C-C---------TCCG-TCATCT-TTTGTT----AACTTT
gi|4 : tatataaatgtttattataatcctgaatacaacagaattcttcactatgatacaGTTATTGGCTGTTTATACCAG-TATT-CTAT----TTTCTTAA----TATATTT-TATTATTT--TA-CTAGC-TTACCTG-----A-G------C--A--GA-AA-TCA-AGTTGAGC-----GAT-TCTGATCA-C---C-----------CTG--AGTC-TGT-CGT-CCAT-------CCA-TTGTA------------GACTTTC-TGT---CGGGTGCACTCTGG-------C----AT--ATGAGTATTT-T--ATTGGATCCTCAC---CAA----ACTTATGTAGTAGTTATATAACC--A-------CAA--------------TATCTCTGAC--AAGTGATTGAACC----GGCCTA-ATCAG-ATAAT--T-AAAGT-T-----AA-AGTTATGGCCCCTTG---A--AAT-TAAAAAATTG-GACTT----TA-TGAC-AT--TGTCT--GC--AC-A--C-TGG---CAT--C-TGCATT-T-TTCATATGC-------TTC--TCAC---CAAACT---TAC--AC-A-GTAG-TTATA----TAACCATA--ACAATT------AC---TTCTTGAA---CCAACCAAATC-AG--GAAATTAATGTCT----GGCTAAAGGTCC-TTGAATCATTGAAGAT--T-----------GC-A-T---------TATTT--A-ACGTCATGTG-CAC-T--TG-CAGTT--------TTCATTTGAT----CTT-A--aacttctcctctgaaaccactgggccaattttgatataatttcacagaaatattccttgggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttgatttgtcaaaaacatggcagccagggagtggggttagttttatgtcaaatt
gi|47 : tcGTTGTTTACTTGAGATGTTACTGAATAAACTGTTACCTCCTGCGCTGGTGTCACTT--
gi|49 : GATGTTACTGAATAATTTGCTACCTCCTGTATTCGTGTCACAT--GT-TTAGA-TCA
gi|34 : ATGTTACTT--AT----GA-TCACCTG-----A-AA-----C--A--AA-GGGTCA-AGCTGTGC-----TTT-TCTGATTG-CTCAC-TGTTGG-T--CT-----TC-TGT-TCT-Cac
gi|42 : TATCATTTCATTATTAGT-TCAACTG-----A-G------C--A--AA-GG-TCA-AGGTGAGG-----TAT-TCTGTTCA-G---C-TGTTAT-G--CTTC-CATC-TGctcttct
gi|22 : TGTTA--T--TT-TTAGC-TCACCTG-----T-G------CCAA--AG-GC-TAA-TGGTTAGC-----ATT-TCTGATCATC---C-TGTCA-------------C-TGT-TAT-CCAT-T---G
gi|52 : aaaggtatgtgtagtttgattcCTT--TT-TGAGC-TAATCTG-----A-G------C--A--GA-GT-TCA-ACGTGAGC-----T-T-TCTGATTG-CT--C-TGacttttactttgtaac
gi|39 : TT--TT-TTAGC-TCACGTA-----A-G------C--A--AA-GC-TCA-AAGTAGGC-----TGT-TCTGAT---C---C-T-TTGT-GAAATT--CATCTTGC-TG---TA--T---GTCCA-CT
gi|41 : T--TT-TTAGC-TCATTTT-----A-G------CC-A--AATAC-TCTTAGATGAGT-----TTT-TCTGATCA-C---CATG-TGA-C--CAT--TGTC-TG
gi|44 : aagaactgta--TC-TTAAC-TTACCTG-----A-A------C--A--AA-GC-TCA-ACGTTAGC------ATGTCTGGTCG-C---C-CGTTGC-C--CGT--TGCC-CGT-TGT-CT
gi|33 : --TT-CTAGC-TCATATG-----A-G------C--A--AA-GT-TAA-AAGCAAGC------AT-TCTAATTA-C---C-TGTCATCC--CTT--TGTC-TGTCTGT-ATGT-T---TTGTA-TTGTC
gi|10 : --TT-CTAGC-TCATC---------G------CT-A--AG-GC-TCA-AGTTGAGC-----TTT-TGTAATTG-CT--C-TG-TGT-TA-CTTAATGTC-T-T-TGT-C----T---GTC----TGTCCATC-ATT----AATGTTC-TGT---TGT-----TTTTAG-------T---------------TTT-TTCATTGGATCTAAAT---TAACAATAC-T-TATA--AATAATAT-ACCTGA-------TAA--------------TGCATT-AAC--AGATTCATGTATT----GG---A-ACT-G-GT--T--T-G--GT-C--------AGTT-TGACCC-TTG-------ACATTTAAAAT-A-CATTA----AT-T
gi|20 : --TT-TTAGC-TCACCAG-----A-A------C--A--AA-GC-TAA-AGTTGAGC-----TAT-TTTTACGG-CA--C-TG-TG----------------GT-CAT-CTAT-T------CA--------TCTGTA----AACGTTGATGC---TGTGTGCTCTCTGA-------C----AC--CCT--CA-TT-TTCATTGCATCATCAT---TCA----ACT
gi|2 : cT-TTAGC-TCAGCTGTTTTTA-G------CCGA--AG-GC-TCACAGGTAAGC-----TTT-TGTGATCG-C---C-TGGTGT-C--TGT--CGTC-TGT-CGT-C
gi|50 : gttttatgT-TTAGT-TCATCTG-----AAG------C--ATAAA-G--TCA-AGGTGAAC-----TAT-TCTGATTG-T---C-TTTTGT-agtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatgttcttgtcagaaactactggctcgattttaaaataatttcacagaaatgttcctttggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttaatgattcgtcaaaaaaacatggcggccagggagtggggttagtttactatataagctatagtaaaaacttgtcagaaaccatcggatcaattttaaaacaatttcacagcaatgttccttgggtgaccctttaccaagtttgttcaagccgttgtgatttgttaaaaaacatgaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|46 : ------C--A--AA-TG-TCA-AGGTGAGC-----TAT-TCTGATCG-C---C-TGTTGT-T--------GCC-TGC-CGT-CTGC-T---GTCCG-Tct
gi|54 : A-GC-TCA-TGGTGAAC-----TAT-TCTGATCG-C---C-TGTTGT-C--TGT--CGT
gi|7 : A-AAGTGAGC-----CAT-TCTGATCG-A-----------------T--CGTC-TTA-TGT-CT-------GTCGA-TTGTCT---T-TT----ACCGCTT-CAT---TGTAAAC---CTAATTGCGTCC----AA--AT---TATTT-T--ATTGGATCTATAC---CAA----ATTT-TTCAGTATTTACATGACC--AGTCACGCTGAGAACATGCCAAAGTTGTATCAAACGGATGTTTATGGACTAAAGAACCAATAGC-T-TTCAT--TGGATAT-TGACCAAACAATTATAGCCA-TGGTATA--AAC---AAAAAT-G-CTTTAT---TT-TGA--AT--TGTGTAAGCCAAC-T--C-TAT---CAC--C-CTCTAT-T-TTCATatc
gi|40 : gggcgatagagaA-AAGTGAGC-----TAT-TCTGTTCGCC---C-TG-TGT-C--CAT--TGT----T-TGT-CTCC-T---GCCC----CTCTGTCTGTA----AACCTTT-
gi|30 : tgggggataaT-TCTGATTG-C---C-C--TGT----------ATC-TGT-TGT-CCATCT---GTCCT-CCATCTGACTGTA----AACTTTA-TGT---TGTGTTCACTCTAG-------C----ACCGACA--TATTT-CTCAg
gi|9 : ttT-TGTACTAT-TAATGTCCAAGTGTTTGCCATTT----AA--TCT-TGTCTCTCTGTGCTCTCCAG-------CTTCAGC--A-G--CATTT----ATGGTATCTTTAT---TTG----ACTT-TAAAGCATGTATATAATC--A-------TAA--------------AATATTGGAC--Ag
gi|23 : aatgccattatgatatcctaccacttacatttatttatttgaaacttatacagtgattatataaccatatgatccttaacaacttcctaaactgaccgaaGT-CAAC-C---GTCC--TCGTCTGTCCGTTCGTAAACGTTA-GAT---TGTGTGCAC-CTAG-------C----AC--ATCATTATTT-TTTATTAGATCATCAC---AAA----ACTT-TG-ACTAATTAactt
gi|3 : tctatgtccTT----AACTT----AA---TGTGAGTACTTTAG-------C----AC--CTG--CAGTT-TTCATTAGATCCTTAT---TAA----ACTTGCACTGTATCTATAAAACC--A-------CAA--------------TATCTTAGAC--AAGTTCTTGAACT----GGCCAA-ATCTG-GTAATTAT-AATAT-C------AGAGTAATGGCT-------------CA---------------------T-TGAC-CT--TGGGT--GC--AT-T--C-TTG---CAC--C-TGTATT-C-TTCATTGGA-------TTT--TCAC---CAAACT---TTT--AT-A-GTAA-CTATA----TAACTATG-------TC-TTCAACAAGTTTTT-AGTTTCCAGCCAAGCT------TTA-TAATTTAAACTGAAGTTGTGGCAT-TTGAATCGTGAAAAAA--A-----------AT-C-T---------
gi|5 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaatT---TGTGCGCACTCTAG-------C----AC--TCG--TATTT-TTCGTTTG--TTTCAT---CAA----ACTTACACAGTAGTTATAAAACC--A-------TAA--------------TATCTTGGCC--AAGTCCATGAACA----GGCCAA-ATT-GGATTAT--T-AATGT-C-----A-GAGTTGTGACCC-TTG---A--AACATTGAAAAT-G-CACTG----TT-TGAT-TG--TGTGT--GC--AC-T--C-TAG---CAC--C-CCTATT-T-TTCATTTGA-------TCC--TCAC---CAAACT---TGC--AC-A-GTAG-TTATA----TAACCATA--AT--ATC-TGAGACAAATTCTTGAA---CTGACCAAATT-GG--ATTATTAATGACA----GGGTTGTGGCCC-TTGAAACATTGAAAAT--T-----------GC-C-gatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|9 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgttcaaaaccatgaccctgggggcagaaCTAC-------C----AC--TTA--CATTTATTTATTTGA------------A----ACTTATACAGTGATTATATAACC--A-------TAT--------------GATCCTTAAC--AACTTCCTAAACT----GACCGA-ATT-GTACTAT--T-AATGTCC-----AAGTGTT-TGCCAT-TT----------------AAT------------CT-TGTC-TC--TCTGT--GC--TC-T--C-CAGCTTCAG--C-AGCATT-T-ATGGT---A-------TCT--TTAT---TTGACT---T-T--AA-A-GCAT-GTATA----TAATCATA--AA--ATA-TTGGACAACTTgtctttggcacagtttaacaatatgttgttttttttaat
gi|8 : aatgccattatgatatc--TATTT-TTCAGTTGATTTTCACCAACAA----ACCT-TACAGAAATTATAGAACC--G-------CAG--------------TAT---GGAC--AAGTTTTTG
gi|12 : tcttgttctgactcttgtgtgtgctctagaccctgaattggtcttgaccaaacttgcatatatttcattcaagacctaaaactgcccaaattgggtaactaacgtcatagcaatggaaaattgtactatattatcataattaccgt-AATGA-C-----AAGAGTTATTGCCC-TTA---A--ATGATTAAAAAA-A-C-----------TG-C-TT--TGTGT--TA--ACAT--GATAA---GAA--C-TTCATT-T-TTCATTCGA-------TCT--AGAC---TAAACC---TGC--AT-ATGTA---TATA----TAAACAcaatttatctacatttgcttagtact
gi|16 : AGAGTAACAGCCT-TTG---ATGAAT-TGAAAAAT-G-CAG-A----TT-TTGC-CT--TATAA--AC--AC-T--G-TAA---CAC--C-TTCATTCT-TTTATC--A-------TCCATTCAA---CAAATTATTTGCCAATTA-GCAGATTATAATTTTGGTGGTA--AT--TTC-TTTGAgagtaaaggatgtcttcttgatgaaggcagaatgaacaaagttgttgtacttg
gi|19 : atggacT-TTG---A--AA--TTAAAAAT-AACA--A----TT-TTAT-TT--TGTGT--TC--ATAT--G-T-G---CAC--CACACATT-T-TCCTTTCGAGGTATTGTCC--TTA------AAGT---TAC--AG-A-ACAA-TCACA--------CACG--AT--GTT-T--GACAATTTCTTGAA---CTTGTCA
gi|3 : ggtgAAT-G-CGTTAAAAATT-TAAC-TTAATGTGA--GT--AC-T--T-TAG---CAC--C-TGCAGT-T-TTCATTAGA-------TCC--TTAT---TAAACT---TGC--AC-T-GTAT-CTATA----AAACCACA--AT--ATC-TTAGACAAGTTCTTGAA---CTGGCCAAATCTGGTAATTA-TAATATCA----GAGTAATGGCT--------CATTG-------------------AC-C-T---------TGGGT--GCATTCTT---G-CAC-C--TG-TATTC--------TTCATTGGAT----TTT-C--ACC--AA------ACTTTTATA---GTAACTATATAACT---ATGTCTTCAACAAGTTTTT
gi|8 : aatctgatagataatgtcgaagttTTG----TTCTGACTCT--TGTGT--GT--GC-T--C-TAG----AC--C-C---------TGAATTGG-------TCT--TGAC---CAAACT---TGC--A----------TAT---------------AT--TTCATT---CAAGACCTAAAA---CTGCCCAAATT-GG--GTAACTAACGTCA----TAGCAA--------TGGAAAATTGTACTA--T-----------A----T---------TAT-----CA---TA---ATTAC-C--GT-TATTT--------TTCAGTTGAT----TTTCACCAAC--AAACCTT-AC------A---GAAATTATAGAACCGCAGTA---TGGACAAGTTTTTGagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|15 : tc----TT-TG----T--TGTGTCAAC--AC-TAAG-TAT---CAC--C-TTTAGT-T-TGCATTTTA-------TTT--TGAA---CAAACT---TGT--TT-A-GAAGCTTA-A----TGGTCA-A--A-----C-TGGGGCAAACATTT-AA---CCAGCCAAAGC--G--AGCAGTGATGACA----GAGTTATGA--C-TTGAAcaatttatctacatttgcttagtact
gi|20 : T-TGAT-GC--TGTGT--GC--TC-T--C-TGA---CAC--C-CTCA-T-T-TTCATTGCA-------TCA--TCAT---TCAACT---taattgag
gi|5 : cttttagctcaccagaacaaagctaaagttgagctatttttacggcactgtggtcatctattcatctgtaaacgT--TGTGC--GC--AC-T--C-TAG---CAC--T-CGTATT-T-TTCGTTTGT-------T----TCAT---CAAACT---TAC--AC-A-GTAG-TTATA----AAACCATA--AT--ATC-TTGGCCAAGTCCATGAA---CAGGCCAAATT-GG--ATTATTAATGTCA----GAGTTGTGACCC-TTGAAACATT-GAAAA--T-----------GCAC-TGTTTGATTGTGTGT--GCACTCTA---G-CAC-C--CC-TATTT--------TTCATTTGAT----CCT-C--ACC--AAACTTGCAC------A---GTAGTTATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGAACTGACCAAATT-GG-ATTATTAATGACAGGGT-T-GTGG-CCCTTGAAACATTGAA
gi|23 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgttcaaaaccatgaccctgggggcagaaT--TGTGT--GC--AC-C----TAG---CACATC-ATTATT-T-TTTATTAGA-------TCA--TCAC---AAAACT---Taattgccgtctttggcacagtttaacaatatgttgttttttttaat
gi|4 : tctatgtccgtcaaccgtcctcgtctgtccgttcgtaaacgttagaGT--GC--AC-T--C-TGG---CAT--A-TGAGTA-T-TTTATTGGA-------TCC--TCAC---CAAACT---TAT--GT-A-GTAG-TTATA----TAACCACA--AT--ATC-TCTGACAAGTGATTGAA---CCGGCCTAATC-AG--ATAATTAAAGTTA----AAGTTATGGCCCCTTGAAA--TTAAAAAA--TTGGACTTTATGAC-A-T---------TGTCT--GCACACTG---G-CAT-C--TG-CATTT--------TTCATATGCTTCTCACC-A--AACTTAC------AC------A---GTAGTTATATAACCATAACAATT---AC---TTCTTGAACCAACCAAATC-AG-GAAATTAATGTC-TGGC-TAAAGG-TCCTTGAATCATTGAAGAT-TGCATTATTTAAC---GTCATGTGCACT--------TGCAGTT-TTCATTTGATtgactaatta
gi|9 : tcgttattggctgtttataccagtattctattttcttaatatattttattattttactagcttacctgagcagaaatcaagttgagcgattctgatcaccctgagtctgtcgtccatccattgtagactttctgtcgg-TAC---CAC--T-TACATT-TATTTATTTGA---------------------AACT---TAT--AC-A-GTGA-TTATA----TAACCATATGA---TCC-TT-AACAACTTCCTAAA---CTGACCGAATT-GT--ACTATTAATGTCC----AAGTGTTTGCCA-TTTAATC-TT-----G--T------------C-T-C---------TCTGT--GCTCTCCA---G-CTT-CAGCAGCATTTATGGTATCTTTATTTGAC----TTT-A--A--------------------A---GCATGTATATAATCATAAAATATTGGACAACTTctta
gi|8 : aatgccattatgatatccATT-T-TTCAGTTGA-------TTT--TCACCAACAAACC---T-T--AC-A-GAAA-TTATA----GAACCGCA--GT------ATGGACAAGTTTTTG
gi|3 : tcttgttctgactcttgtgtgtgctctagaccctgaattggtcttgaccaaacttgcatatatttcattcaagacctaaaactgcccaaattgggtaactaacgtcatagcaatggaaaattgtactatattatcataattaccgttAATC-TG--ATAGATAATGTCG----AAGTTAATGC----------GTTAAAAAT--TTA---------AC-T-TAA-------TGTGA--GTACTTTA---G-CAC-C--TG-CAGTT--------TTCATTAGATCCTTATT-A--AACTTGC------AC------T---GTATCTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATCTGGTAATTATAATATCAGAGT-A-ATGG---CTCA----------------------TTGACC--TT-GGGTGCATTCTTGCACCTGTATTC-TTCATTGGATTTTCACCAAACTTTTATAGTA-ACTATATAACT---ATGTCTTCAACAAGTTTTTAGTTTCCAGCCAAGCTTTAT--AAT-TTAAACTGAAG-TT-GTGGCAT-TTGAATCGTGAAAAAcaatttatctacatttgcttagtact
gi|12 : AATGACAA---GAGTTATTGCCC-TTAAATGATTAAAAAAACT-----------GC-T-T---------TGTGTTAACATGATA---A-GAA-C--TT-CATTT--------TTCATTCGATCTAGACT-A--AAC--CT------GC------ATATGTA--TATATAAACAGAGTAaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|23 : AAACGTTAGA----------------------T---------TGTGT--GCAC-CTA---G-CACAT--CATTATTT--------TTTATTAGATC---ATC-----AC--AA------Aaaggatgtcttcttgatgaaggcagaatgaacaaagttgttgtacttg
gi|9 : tctatgtccgtcaaccgtcctcgtctgtccgttcgtAA--T-----------GC-CAT---------TATG---ATATCCTA---C-CAC-T--TA-CATTTA-------TTTATTTGAA----ACT------T--AT------AC------A---GTGATTATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAAACTGACCGAATT-GT-ACTATTAATGTCCAAGTGT-TTG---CC--A----TTTAATC-----------TTGTCT--CT-CTGTGCTCTCCAGCTTCAGCAGCA-TTTATGGTATCTTTATTTGACTT-TAAAGCATGT-ATATAATCATAAAATATTGGACAACTTactttgactaatta
gi|5 : -T---------TGTGC--GCACTCTA---G-CAC-T--CG-TATTT--------TTCGTTTGTTTC--ATC-A--AACTTAC------AC------A---GTAGTTATAAAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCATGAACAGGCCAAATT-GG-ATTATTAATGTCAGAGT-T-GTGA-CCCTTGAAACATTGAA-AA-TGCACTGTTTGATT--GT-GTGTGCACTCTAGCACCCCTATTT-TTCATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTA-GTTATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGA--ACTGACCAAA--TTGG--ATTATTAATGACAGG-GTTGTGGCCC-TTGAAACATTGAAAATTGC
gi|30 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgttcaaaaccatgaccctgggggcagaa-T---------TGTGT--TCACTCTA---G-CAC-C--GA-CATAT--------TTCcgtctttggcacagtttaacaatatgttgttttttttaat
gi|20 : ttttctgattgccctgtatctgttgtccatctgtcctccatctgactgtaaactttatg---------TGTGT--GCTCTCTG---A-CAC-C--CT-CA-TT--------TTCATTtcag
gi|4 : cttttagctcaccagaacaaagctaaagttgagctatttttacggcactgtggtcatctattcatctgtaaacgttgatgcGT--GCACTCTG---G-CAT-A--TG-AGTAT--------TTTATTGGAT----CCT-C--ACC--AA------ACTTATGTA---GTAGTTATATAACCACAATATCTCTGACAAGTGATTGAACCGGCCTAATC-AG-ATAATTAAAGTTAAAGT-T-ATGGCCCCTTGAAA--TTAAAAAATTGGACTTTATGACA--TT-GTCTGCACACTGGCATCTGCATTT-TTCATATGCTTCTCACCAAACTTACACAGTA-GTTATATAACCATAACAATT---AC---TTCTTGA--ACCAACCAAA--TCAG--GAAATTAATGTCTGG-CTAAAGGTCC-TTGAATCATTGAAGATTGCATTATT-----TA--AC---G----TCA--TGTGCACT--TG---CA---G--------TT-TTCATTTGATCTTgcatcatcattcaact
gi|3 : tcgttattggctgtttataccagtattctattttcttaatatattttattattttactagcttacctgagcagaaatcaagttgagcgattctgatcaccctgagtctgtcgtccatccattgtagactttctgtcggATTTAACTTAAT-GTGAGTACTTTAGCACCTGCAGTT-TTCATTAGATCCTTATTAAACTTGCACTGTA-TCTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGA--ACTGGCCAAA--TCTGGTAATTATAATATCAGA-GTAATGGCTC-----ATTG--------------------------ACCTTG----GG---TGCATTCT--TG---CA---C--CTGTATTC-TTCATTGGATTTTCAC---CAAACTTTTA---TAGTAAC---TATATAACT---ATGTCTTCAACAAGTT-TTTAGTTTCCAG-CCAAGCTT---TATA--A--TT-T-A-AACTGAAGTTGTGG-CATTTGAATCGTGAAAAA--a
gi|4 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaCT--GTCGGGTGCACTCTGGCATATGAGTAT-TTTATTGGATCCTCACCAAACTTATGTAGTA-GTTATATAACCACAATATCTCTGACAAGTGATTGA--ACCGGCCTAA--TCAG--ATAATTAAAGTTAAA-GTTATGGCCCCTTGAA--ATTAAAAAATTGGAC-TT-----TATGACATTG----TC---TGCACACT--GG---CA---T--CTGCATTT-TTCATATGCTTCTCAC---CAAACTTACA---CAGTAGT---TATATAACCATAACA------ATTACTTCTTGAA----CCAACCAAATCA---GGAA--A--TT-A-ATGTCTG-GCTAAAGG-TCCTTGAATCATTGAAGA--TTG-CATTA-TTTAACGT--CATGT--GC-----------ACTTGCAGT-TTTCATTTG--aaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|5 : tcgttattggctgtttataccagtattctattttcttaatatattttattattttactagcttacctgagcagaaatcaagttgagcgattctgatcaccctgagtctgtcgtccatccattgtagactttT-GTGCGCACTCTAGCACTCGTATTT-TTCGTTTG--TTTCATCAAACTTACACAGTA-GTTATAAAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCATGA--ACAGGCCAAA--TTGG--ATTATTAATGTCAGA-GTTGTGACCC-TTGAAACATTGAAAA-TGCACTGTT-----TG--ATTGTG----TG---TGCACTCT--AG---CA---C--CCCTATTT-TTCATTTGATCCTCAC---CAAACTTGCA---CAGTAGT---TATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGAA----CTGACCAAATTG---GATT--A--TT-A-ATGACAG-GGTTGTGG-CCCTTGAAACATTGAAAA--TTG-CCGTC-TTTGGCatctta
gi|9 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgttcaaaaccatgaccctgggggcagaatCATTTATTTATTTG---------AAACTTATACAGTG-ATTATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAA--ACTGACCGAA--TTGT--ACTATTAATGTC----------------CAAG-TGTT------TGC--CATT-----TA--ATCTTGTCTCTC---TGTGCTCTCCAGCTTCA---G--CAGCATTT-ATGGT---ATCTTTAT---TTGACTT-TAAAGCA--TG----TATATAATCATAAAATATTGGACAACTTacagtttaacaatatgttgttttttttaat
gi|3 : aatgccattatgatatcctaccacttaTAATGTCGAAGTTAATG-----------CGTTAAAAATT-TAAC--T-----TA--A---TG----TG---AGTACTTT--AG---CA---C--CTGCAGTT-TTCATTAGATCCTTAT---TAAACTTGCA---C---TGTATCTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGAA----CTGGCCAAATCT---GGTA--A--TTATAATATCAG-AGTAATGG-C----------TCA-----------------TTGACCT--TGGGT--GC--ATTCT-TGCACCTGTATT-CTTCA-TTGGATTTTC-ACCAAACTTTTATA--GTAACTATATA--A--CT---ATGTCTTCAACAAGTTTTTAG------TTTCCAGCC--AAGCTTTATAATTT-----AA-ACTG--A-AGTT-GTGG-CATTTGAATCGTGAAA--AA
gi|5 : aatctgatagaTTGTTCAAAACCATGACCCTGGGGGCA--GAATTG----TG---CGCACTCT--AG---CA---C--TCGTATTT-TTCGTTTGTT--TCAT---CAAACTTACA---CAGTAGT---TATAAAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCATGAA----CAGGCCAAATTG---GATT--A--TT-A-ATGTCAG-AGTTGTGA-CCCTTGAAACATTGAAAA--T-G-CACTG-TTTGATTG--TGTGT--GC--ACTCT-AGCACCCCTATT-TTTCATTTGA-TCCTC-ACCAAACTTGCACA--GTAGTTATATA--A--CCATAATATCTGAGACAAATTCTT-GAA----CT----GACCAAA---TTGGA--TT-----ATTAATGACAGGGTT-GTGG-CCCTTGAAACATTGAA--AA-------TTG-CCG-TCT---TTG-GCACAGTTTAACAATATGTTGTT-TTT-TTTAATaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|23 : tcagtttgtggtcctatctcaaatTTG----TG---TGCAC-CT--AG---CA---CATCATTATTT-TTTATTAGATCATCAC---AAAACTT
gi|4 : tctatgtccgtcaaccgtcctcgtctgtccgttcgtaaacgttagaTG----TCGGGTGCACTCT--GG---CATATG---AGTATTT-T--ATTGGATCCTCAC---CAAACTTATG---TAGTAGT---TATATAACCACAATATCTCTGACAAGTGATTGAA----CCGGCCTAATCA---GATA--A--TT-A-AAGTTAA-AGTTATGGCCCCTTGA--AATTAAAAAATTGGACTTTA---TGACAT--TGTCT--GC--ACACT-GGCATCTGCATT-TTTCATATG--CTTCTCACCAAACTTACACA--GTAGTTATATA--A--CCA---------TAACAATTACTT-C------TT----GAACCAA---CCAAA--TCAGGAAATTAATGTC-TGGCTAAAGG-TCCTTGAATCATTGAA--GAT--TGCATTATTTA-ACG---TCATGTGCACT---------TGCAGTT-TTCATTTGATCT-Ttgactaatta
gi|8 : tcgttattggctgtttataccagtattctattttcttaatatattttattattttactagcttacctgagcagaaatcaagttgagcgattctgatcaccctgagtctgtcgtccatccattgtagactttcTATTT-TTCAGTTGATTTTCACCAACAAACCT-TA---CAGAAAT---TATAGAACCGCAGTA---TGGACAAGTTTTTa
gi|9 : tcttgttctgactcttgtgtgtgctctagaccctgaattggtcttgaccaaacttgcatatatttcattcaagacctaaaactgcccaaattgggtaactaacgtcatagcaatggaaaattgtactatattatcataattaccgtATTTATTTATTTGA------------AACTTATA---CAGTGAT---TATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAAA----CTGACCGAATT-----GTACTA--TT-A-ATGTCCA-AGTGTTTG-CCATTTAATgcaatttatctacatttgcttagtact
gi|18 : aatgccattatgatatcctaccacttac-TTCATT-AATCTTGA-----AAATCT-TA---C--TTAT---TATGTAACCACGAGATCATGCACAATTTCTTTAA----TTGATT---TTCTGAGGTA--ATTTT-T-CTGTCTA-GATTATGT-CCCTTTAATTGTCAAATA--TCG-TA--G-TTTGGTCT--TGTcttgtctctctgtgctctccagcttcagcagcatttatggtatctttatttgactttaaagcatgtatataatcataaaatattggacaactt
gi|12 : G-AGTTATTG-CCCTTAAATGATTAAAAA----------A-ACTG-CTT--TGTGTTAAC--ATGATAAGAACTT-CATT-TTTCATTCG--ATCTAGACTAAACCTGCATAT-GTATA--TATA--A--ACAGAGTA
gi|7 : aatgacaa-AATTATAG-CCATGGTATAAACAAAAA--T-G-CTTTATTTTGA-AT--TGTGTAAGCCAACTCT-ATCACCCTCTAT-TTTCAaaggatgtcttcttgatgaaggcagaatgaacaaagttgttgtacttg
gi|3 : gggcgatagagaaaagtgagccattctgatcgatcgtcttatgtctgtcgattgtcttttaccgcttcattgtaaacctaattgcgtccaaattattttattggatctataccaaatttttcagtatttacatgaccagtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacA-TTTAACTTAATGTGA--GT--ACTTT-AGCACCTGCAGT-TTTCATTAG--ATCCTTATTAAACTT--GCACTGTATC--TATA--AAACCACAATATCTTAGACAAGTTC----------TT----G----AA---CTGGC--CA-----AAT-CTG--GTAATT-AT----------AATATCAGAGTAAT--G-----GCTCA-TTGACCTTGGGTGCATTCTTGC-ACCTGTATTC-TTCATTGGATTT-TCA---CCA-----AACTTTTATA--GTAACTATATAACT---ATGTC--TTCAACAAGTTTTt
gi|5 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaT--TGTGC--GC--ACTCT-AGCACTCGTATT-TTTCGTTTG--TTTC--ATCAAACTTACACA--GTAGT--TATA--AAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCAT-GAACAGGCC----A----AA---TTGGA--TT-----ATTAATGTCAGAGTT-GTGA-CCCTTGAAACATTGAA--AAT--GCACT-GTTTGATTG---T-GTGTGCACTCTAGC-ACCCCTATTT-TTCATTTGATCC-TCA---CCA-----AACT--TGCACAGTAGTTATATAACCATAATATC--TGAGACAAATTCTTGAACTGACCAAATTG-GATtagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|4 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgttcaaaaccatgaccctgggggcagaaGT--GC--ACTCT-GGCATATG-AGTATTTTATTGGA-TCCTCA-CCAAACTTATGTA--GTAGT--TATATAA--CCACAATATCTCTGACAAGTGATT-GAA----CC----GGCCTAA---TCAGA--TA-----ATTAAAGTTAAAGTT-ATGGCCCCTTGAAAT-TAAAA--AATTGGACTTTA--TG-ACA---TTGTCTGCACACTGGC-ATCTGCATTT-TTCATATGCTTC-TCA---CCAAACTTA-----CACA--GTAGTTATATAACCATAACAAT--T---AC---TTCTTGAACCAACCAAATCA-GGAAATT-A--AT---GTCTGGCTAAAGGTC----CTTG--AATCATTGAAGATTGCATTATTTAACGTCATGT--------GCACTTGCAGTTTTCATTTGATCTtattaatgacagggttgtggcccttgaaacattgaaaattgccgtctttggcacagtttaacaatatgttgttttttttaat
gi|9 : tcgttattggctgtttataccagtattctattttcttaatatattttattattttactagcttacctgagcagaaatcaagttgagcgattctgatcaccctgagtctgtcgtccatccattgtagactttctgtcggTG-CCA---TTATG-ATATCCTACC-ACTTACATTTATTTATTTGAAAC-TTA---T--------------ACA--GTGATTATATAACCATATGATCCTTA--ACAACTTCCTAAACTGACCGAATTGTACTATTA-AT-GT---CCAAG--T---GTTTGCCATTTA--A--TCTTG-----Tta
gi|5 : aa---TTGTGCGCACTCTAGC-ACTCGTATTT-TTCGTTTGTTTCATCAAACTTA-----------CACA--GTAGTTATAAAACCATAATATC--TTGGCCAAGTCCATGAACAGGCCAAATTG-GATTATTAAT-GTCAGAGTTG--T---GACC----CTTGAAA--CATTGAAAA-TGCACTGTTTGATTGTGTGTGCACTCTAGCACCCCTATTTTTCATTTctctctgtgctctccagcttcagcagcatttatggtatctttatttgactttaaagcatgtatataatcataaaatattggacaactt
gi|3 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgttcaaaaccatgaccctgggggcagaaTGTGAGTACTTTAGC-ACCTGCAGTT-TTCATTAGATCC-TTA---TTA-----AACT--TGCACTGTATCTATAAAACCACAATATC--TTAGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATCT-GGTAATT-ATAAT---ATCAG--A---GT------------A------A-----TGGCTCA-TTGACCTTGGGTGCATTCTTGCACCTGTATTCTTCATTgatcctcaccaaacttgcacagtagttatataaccataatatctgagacaaattcttgaactgaccaaattggattattaatgacagggttgtggcccttgaaacattgaaaattgccgtctttggcacagtttaacaatatgttgttttttttaat
gi|5 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaatttaacttaaTATTAATGTCAGAGTTGTGACCC-TTGAAACATTGAAAATGCACTG---TTTG-ATT--GTGT---GTGCACTCTAGCA-CC-CCT--ATTTTTCATTTGATCCTCACC--AAACTTGCACAGT------A-----GTTATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGAACTGACCAAATTGGATTATT-----AATGAC--AGGGggattttcaccaaacttttatagtaactatataactatgtcttcaacaagtttttagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|4 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgttcaaaaccatgaccctgggggcagaattgtgcgcactctagcactcgtatttttcgtttgtttcatcaaacttacacagtagttataaaaccataatatcttggccaagtccatgaacaggccaaattggatGTTAAAGTTATGGCCCCTTGAAAT-TAAAAAAT----TGGACTTTAT----GACATTGTCTGCACACTGGCATCTGCAT--TTTTCATAT--GCTTCTCACC--AAACTTACACAG-----TA------GTTATATAACCATAACAATT---AC---TTCTTGAACCAACCAAATCAGGAAATTAttgtggcccttgaaacattgaaaattgccgtctttggcacagtttaacaatatgttgttttttttaat
gi|3 : tcgttattggctgtttataccagtattctattttcttaatatattttattattttactagcttacctgagcagaaatcaagttgagcgattctgatcaccctgagtctgtcgtccatccattgtagactttctgtcgggtgcactctggcatatgagtattttattggatcctcaccaaacttatgtagtagttatataaccacaatatctctgacaagtgattgaaccggcctaatcagataattaaaGTTAAAAAT----T------TA-ACTTAATGT-GA--GTACTTTAGCA-CC-TGC--AGTTTTCATTAGATCCTTATT--AAACTTGCAC---TGTAT--------CTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATCTGGTAATTAatgtctggctaaaggtccttgaatcattgaagattgcattatttaacgtcatgtgcacttgcagttttcatttgatctta
gi|4 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcTGTCGGGTGCACTCTGGCA-TA-TGAGTATTT--TATTGGATCCTCACC--AAACTTATGTAGT------A-----GTTATATAACCACAATATCTCTGACAAGTGATTGAACCGGCCTAATCAGATAATTAtaatatcagagtaatggctcattgaccttgggtgcattcttgcacctgtattcttcattggattttcaccaaacttttatagtaactatataactatgtcttcaacaagtttttagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|9 : tcgttattggctgtttataccagtattctattttcttaatatattttattattttactagcttacctgagcagaaatcaagttgagcgattctgatcaccctgagtctgtcgtccatccattgtagactttcTTTATTTGAAACTTATACAG-TG----------ATTATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAAACTGACCGAATTGTACTATT-----AATGTCCAAGaagttaaagttatggccccttgaaattaaaaaattggactttatgacattgtctgcacactggcatctgcatttttcatatgcttctcaccaaacttacacagtagttatataaccataacaattacttcttgaaccaaccaaatcaggaaattaatgtctggctaaaggtccttgaatcattgaagattgcattatttaacgtcatgtgcacttgcagttttcatttgatctta
gi|36 : aatgccattatgatatcctaccacttacatttaAATAAAATTTT--ATTTT--TACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGAT--TTACTCAAC-ATGAAAtgtttgccatttaatcttgtctctctgtgctctccagcttcagcagcatttatggtatctttatttgactttaaagcatgtatataatcataaaatattggacaactt
gi|32 : GCTTCACAAA---CTAT--ATACCATTAAGAAGCATTT-TT-T----TTTTCGTTCTCCTG-----AAC-CCAAGAC--TC-----GTA--------------TGC-TTTTGTGA----TCT------G--C-C-------T------G---------TG---TCCA
gi|22 : AAAGGT---ATGTGTAGT-TTGA----TTCTG-TTAT----TTTTAGCTCACCTG-----TGC-CAAAGGC--TAAT--GGTT--------------AGC-ATTTCTGA----TC-------AT-C-C-------TGTCACTGT--------TA---TCCATT----G-----------------ACTT---TTACT-TTGT---AAC---
gi|43 : ATAAA----CACTTATG-TGAAGTTTTAGCTCACATG-----AGC-CAAAGGT--TCA-A-GATA--------------AGC-
gi|42 : tcatttatattttataacTAT----CATTT-CA-T----TATTAGTTCAACTG-----AGC--AAAGG---TCA-A-GGTG--------------AGG-TATTCTGT----TC-------A--G-C-------TGTT---A---------TGCT-TCCATC----
gi|41 : ACTG-TA-T----TTTTAGCTCATTTT-----AGC-CAAATAC--TCTTA-GATG--------------AGT-TTTTCTGA----TC-------A--C-C-------AT-----G---------TG---ACCATT----GT-------------tg
gi|2 : aagaTT-TTAT----GTTTAGCTCAGCTGTTTTTAGC-CGAAGGC--TCACA-GGTA--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--C-C-------TG-----G---------TG---TCTGTC----GTCTGTCGTCAGTCGT-AACTT---AAAGC-TTTT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--TAAACCACTTGGCCAATTTT-----GATATAAG-TTCACAGTAATGTTCCTTGGGTGAC--TCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTGATTCAT-AAAAAACATGGCCCCCAGGGGGCAGGGCAAGTTTAATTAGTAAAAACTTAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT--TAAA-ATAATTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGGctg
gi|4 : g-TT-T----TACTAGCTTACCTG-----AGC-AGAAA----TCA-A-GTTG--------------AGC-GATTCTGA----TC-------A--C-CCTGAGTCTG-----T---------CG---TCCATCCATTGT-------------A-GACTT---Tcggccagggagtggggttagtttactatataagctatagtaaaaacttgtcagaaaccatcggatcaattttaaaacaatttcacagcaatgttccttgggtgaccctttaccaagtttgttcaagccgttgtgatttgttaaaaaacatgaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|6 : tcgttattggctgtttataccagtattctattttcttaatatattttattaT-T----TATTAGCTCACCTG-----AGC-CAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TT-------G--C-C-------TG-----G---------TG---TCCGTC----GTC------------T-GTCCTCCGTCATC-TTTTGTTAACTTTAA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTT-----GATATAAT-TTCACAGAAATATTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTGATTTGTC-AAAAACATGGCAGCCAGGGAGTGGGGTTAGTTTTATctgtcgggtgcactctggcatatgagtattttattggatcctcaccaaacttatgtagtagttatataaccacaatatctctgacaagtgattgaaccggcctaatcagataattaaagttaaagttatggccccttgaaattaaaaaattggactttatgacattgtctgcacactggcatctgcatttttcatatgcttctcaccaaacttacacagtagttatataaccataacaattacttcttgaaccaaccaaatcaggaaattaatgtctggctaaaggtccttgaatcattgaagattgcattatttaacgtcatgtgcacttgcagttttcatttgatctta
gi|39 : tatataaatgtttattataatcctgaatacaacagaattcttcactatgatacaatgttccatatcacctactggcgttttctgtttttcataccatgcctgttcattaatatttatgatatcatgctgtatgtaT-T----TTTTAGCTCACGTA-----AGC---AAAGC--TCA-A-AGTA--------------GGC-TGTTCTGA----TC----------C-T-------TT-----G---------TGAAATTCATC----gtcaaatt
gi|26 : T-T----TTTAAGCTCATCTG-----GCC-CAA--GC--ACACA-GATG--------------CAT-TTTTGTGAACATTCAATTTCTG--T-C-------TG-----A---------TA---TCTATT----GT-------------TAAACTCA--TTAAC-CCTC---AAC---AA--Cttgctgtatgtccact
gi|52 : T-T----TTTGAGCTAATCTG-----AGC---AGAGT--TCA-A-CGTG--------------AGC-TTTC-TGA----TT-------G--CTC-------TG-----
gi|35 : c-T----TTTTAGCTTGACTG-----AAT-TGAAGGT--TC-CA-GGAG--------------AGC-TTTTGTGA----CC-------C--T-T-------CT-----G---------TG---GC---T----GT-------------T-GACTT---TTAGCATTAT---AGC---A
gi|17 : ta----TTTTAGTTCACCGG-----AAC-TGGGGAT--TCTCA-GGTG--------------AGT-TTTCGTGA----CT-------G--C-C-------AT-----G---------TG---TACATC----AT-------------T-AGCTC---TT-TC-TTTA---AAC---AAGTCGT--CTGTTCTTGGAAATCACTTGTTTACTTTT-----GCTCAAATGTTTACAGAA
gi|10 : ta----TTCTAGCTCATC--------GC-TAA-GGC--TCA-A-GTTG--------------AGC-TTTTGTAA----TT-------G--C-T-------CT-----G---------TG---Tgc
gi|29 : ----TTTAAACTAACCTG-----TGC-CAGAGAC--CCA-A-AATG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------A--T-G-------TG-----G---------tacttaatgtctttgtctgtctgtccatcattaatgttctgttgtttttagttttttcattggatctaaattaacaatacttataaataatatacctgataatgcattaacagattcatgtattggaactggtttggtcagtttgacccttgacatttaaaatacattaatt
gi|50 : accatgtctgtctgtcattgttgtttttttaagttgtttgtaTTTAGTTCATCTGA----AGCATAAAG----TCA-A-GGTG--------------AAC-TATTCTGA----TT-------G--T-C-------TT-----T---------TG---TC
gi|24 : TAGCTCACCTG-----AGC-CAAAGGTGATCGCCTGGTGTTCANNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN----NN-------N--N-N-------NN-----N---------NN---NNNNNN----NN-------------T-AACTT---TTAGC-TTCT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--t
gi|37 : CATCTG-----AGT-CGAATGC--TTACA-GCAG--------------AACATTTTGTGA----TC----------T-C-------TGT----G---------TG---TCCATCT---GT-------------G-G-------TCAAC-TTCC---AAT---AA--CTT--TTTC
gi|38 : cTG-----AGA-CAAAGGC--ACACA-GGTG--------------ACC-TTTTGTGA----TT-------GCTC-T-------TC-----GTCCATAATCTG---TCCATC----GT-------------T-AACTT---T
gi|46 : -CAAATG---TCA-A-GGTG--------------AGC-TATTCTGA----TC-------G--C-C-------TG-----T---------TG---Tggttcaaaaaa
gi|54 : GC--TCAT--GGTG--------------AAC-TATTCTGA----TC-------G--C-C-------TG-----T---------TG---TCTGTC----GT-------------tgcctgccgtctgctgtccgt
gi|40 : aA-AGTG--------------AGC-TATTCTGT----TC-------G--C-C-------CT-----G---------TG---TCCATT----GT-------------T-atc
gi|25 : tgggggataaa-TTTT---AAC---TA--CTTAACTTTATT--GAA-CTACTGAACCAATTTTGGCAAAATTT-----TCACA---ATGTTCCTTAAGTGGC---CCACtgtctcctgcccctctgtctgtaaacctttg
gi|6 : cctttttcaactatTTCTCCTCTGAAACCACTGGGCCAATTT---TGATATAATTTCACAGAAATATTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCT---TGATTTGTC--AAAAACATGGattattatatttg
gi|25 : tatataaatgtttattataatcctgaatacaacagaattcttcactatgatacaatgttccatatcacctactggcgttttctgtttttcataccatgcctgttcattaatatttatgatatcatgctgtatgtatttattagctcacctgagccaaaggctcacaggtgagcttttgtgattgcctggtgtccgtcgtctgtcctccgtcatcttttgttaactttaacAACTACTGAACCAATTTTGGCAA-A-ATTTTCACA---ATGTTCCTTAAGTGGCCCcagccagggagtggggttagttttatgtcaaatt
9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CACCTTATTATTCAAACGGTCATGTGAGGTTTTACTATCACATTGGCCGCTGGCAGCTTAATCATTGTCATGGTCTGTTATCTTTTACATTTTAATATCTTTCTCCGAAGCCACTGTGCTAAATTAAACTAATTTTTACAGGAATATTCCTT
Unaligned ( gi|14 ): TGAATTAATAAAAAAAGGGCTTACTATGTAGCGTATATTCAGTGATTGAATTTGTTTTACCCATGATGCTTTAGTCAGCTACATTTCTCAAGGCTGATTAATTGTACTTCATGTGAGTTAGTCCAGTGTATGGTCATTTCCTGCTC
Unaligned ( gi|21 ): TAATGGTGTTTTGCATGTAAACCATTGTTTATACATGTTTTTCTGTTTTATTAACTTGCCTAATCTTTAGGTTTGAGTTCAGTAATTTGGATCACCCTGTGTCTGTTGTCCATCCGTAAACT
Unaligned ( gi|27 ): ACGTGAATTAATATTGTAATTACCTGACATCATTATACAGATTTAGATGATTTTACATAGAGGTGCATTGTGCAAACAAATTATTATTACACAACT
Unaligned ( gi|31 ): TTTTAAATATCATTATCATTGGATCTTTTTTTATTATATATACATTTTGTATTGTATTTTTTAACTTCTTGATTTGTCACAATTTGTTTATT
Unaligned ( gi|45 ): CAAAGTTCCATATCACCTACTGATGTTTTCTGTTTCCATATCATGCTTGTCCATCAATACT
Unaligned ( gi|48 ): AACCAACAAATGAAAATAATAAATTTGAAAATAAATATCAACGAAAAATCAAATTT
Unaligned ( gi|51 ): TGAACATTTGAGTAAAACTGTAAAATCCAACAGGTTTAATTCCCTATCACAC
Unaligned ( gi|53 ): TCGGAACTCCCCGATTACACACTTTCACCGGATCGACTTATTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 11111111 1111111111
lowQualScore : 2222 22 11 11 11 111111 111 2222222222 111111 11111111 11111 111 3333333333 111 11 2222 11 111 111 1 1 11 222 33333333 111 3333333 1 33 111 11 11111111 111 111 1 2222 33 222222222222222 33333333333 111 1111 1 11 111111 666666666666666666666666666666 222222222222 1 1111 1 111111 1111111 222222 22222222 333333333 11 1 11 22 22 4444 1 55 1 22222222 11 1 666 11 22 1 11 7777 11 11 22 11 11 1 8888 11 4444 11 1 22 1 55 22 666666 1 555555555 11 5555555555 33333 8888 3333333333333333333333333333333333333 333 22 1 11 22 2 2222 11 2222 11111111111111 22222222222222222222222222222 2222222222222 111111 111 11111 11 111 11 44444444444444444 2222 111 333333 11111 3333 2
lowQualScore : 6 8888 4 1 3333 1 33 33 11 1 33 6 0 2 1 1 22 7 555 33 1 5 666 0 55 33 66 3 111111 66 33 44 2 33 444 4 2 000 3 0000000000 88 222222 33333333 22222 1 55 666 0 000 0 2222222222 5 55 3 1 222 0 1 33 1111 33 666 4 1 222 3 4 66 999 7 8 0 55 555 8 3 8 0 1 0 44444444 0 000 1 2222222 0 22 0 0 6 3 2 111 00 333 44 0 55 3 4 1 33 88888888 111 0 777 2 0 1111 0 66 1 11 4 9 0 1 1 999999999999999 1 8 00000000000 666 6 1 2222 6 6 3 99 99 9 66 88 0 3 0 44 1 6 0 0 33 1 7 555555 555555555555555555555555555555 1 888888888888 0 0 33 5 2 9999 8 111111 0 4444444 1 333333 0 999 55555555 1 2 7 44 222222222 1 99 33 0 88 77 2 2 00 2222 5 6 55 5 1 1 77777777 22 1 6 5 1 6 6 6 111 6 77 22 11 5 6 22 6666 22 6 22 33 6 6 6 6 6 22 6 6 77 1 22 5 5555 22 1 6 4444 22 6 5 11 666666 6 7 6 6 55 33 6 6 000000 6 6 77 5 6 111111111 1 6 22 6 2222222222 6 6 1 22222 6 5555 1 7777777777777777777777777777777777777 111 77 5 88 77 0 88888888 1 5555 33 1 3 1111 6 8 7777 66666 3 33 5555 55555555555555 2 6666 99999999999999999999999999999 555 3 1111111111111 3 999 1 3 666 555 555 55 777777 66 1 0 33 000 2 11111 99 11 444 44 8 22 11 1 33333333333333333 3 1 1111 000 6 33 0 1 999999 22222 11 1 3333 3
lowQualScore : . .... . . .... . .. .. .. . .. . . . . . .. . ... .. . . ... . .. .. .. . ...... .. .. .. . .. ... . . ... . .......... .. ...... ........ ..... . .. ... . ... . .......... . .. . . ... . . .. .... .. ... . . ... . . .. ... . . . .. ... . . . . . . ........ . ... . ....... . .. . . . . . ... .. ... .. . .. . . . .. ........ ... . ... . . .... . .. . .. . . . . . ............... . . ........... ... . . .... . . . .. .. . .. .. . . . .. . . . . .. . . ...... .............................. . ............ . . .. . . .... . ...... . ....... . ...... . ... ........ . . . .. ......... . .. .. . .. .. . . .. .... . . .. . . . ........ .. . . . . . . . ... . .. .. .. . . .. .... .. . .. .. . . . . . .. . . .. . .. . .... .. . . .... .. . . .. ...... . . . . .. .. . . ...... . . .. . . ......... . . .. . .......... . . . ..... . .... . ..................................... ... .. . .. .. . ........ . .... .. . . .... . . .... ..... . .. .... .............. . .... ............................. ... . ............. . ... . . ... ... ... .. ...... .. . . .. ... . ..... .. .. ... .. . .. .. . ................. . . .... ... . .. . . ...... ..... .. . .... .
lowQualScore : 7 3333 2 0 2222 0 22 88 22 0 88 5 8 2 0 0 11 1 333 00 0 7 000 2 55 99 88 1 111111 88 99 88 4 22 111 4 2 666 9 9999999999 44 777777 88888888 00000 0 44 000 1 000 1 6666666666 7 77 7 0 222 8 0 88 2222 88 777 7 0 777 3 0 88 000 0 0 8 66 000 0 8 0 2 0 2 00000000 2 555 0 5555555 2 88 2 0 5 2 5 333 33 000 33 7 00 7 7 0 33 88888888 555 8 555 0 0 5555 8 77 0 77 7 0 7 0 4 666666666666666 4 0 33333333333 777 7 0 7777 7 7 7 22 22 8 00 66 8 2 8 22 4 0 2 0 88 0 0 000000 000000000000000000000000000000 0 222222222222 2 0 55 6 8 0000 8 222222 8 8888888 0 222222 2 222 22222222 0 5 8 33 000000000 0 44 88 0 33 55 5 5 00 0000 0 0 00 0 0 0 00000000 00 0 0 0 0 0 0 0 000 0 00 00 00 0 0 00 0000 00 0 00 00 0 0 0 0 0 00 0 0 00 0 00 0 0000 00 0 0 0000 00 0 0 00 000000 0 0 0 0 00 00 0 0 000000 0 0 00 0 0 000000000 0 0 00 0 0000000000 0 0 0 00000 0 0000 0 0000000000000000000000000000000000000 555 55 5 00 55 0 00000000 0 7777 88 0 2 2222 7 0 1111 77777 5 77 9999 77777777777777 7 1111 44444444444444444444444444444 444 3 7777777777777 6 222 0 6 444 888 888 55 000000 11 0 2 66 999 1 88888 22 00 000 00 0 00 00 0 66666666666666666 2 2 2222 222 0 55 8 0 444444 22222 22 0 7777 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATATC--CTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT--CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTCGTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GACANGTTCTTGAACCGGCC-AATC-GAT-ATTAATGTCAAGAGTTATGGCCC-TTGAAACATTAAAAAA--TG-CATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTA---GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCATAACGTTT--GACAA-TTCTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGTGCGCACTCTA---GCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCAGAGTTN-TGGCCCTTGAAACATTGA-A-AATGCA-CT-TTTGACTN--T-GTGTGCACTCTAG---CACCCGCATT-TTTNATTTGATCC--TCACCAAACTTGCACAGTANTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCTTGAATCGTTGAAAATTG-CGAC-TTC-ACCTTGTGT--ACACTC--TAGC-ACCNNTATTTTTCATTTGATTTTCAC---CAAACTT-TACAGTAA-TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTTTAA---CCGGCCAAATCNGGTA--A--TTTATGTCTGAGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAA------T-GCNTTA-TTTGANNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGT--TATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTG--TTG---AATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAA---TGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTG----TGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGG-ACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTANC-T---TTT---AAC---AA--CTT------CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTGANATAA-T-TTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-A--AA-TA--ATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCGTCT--GTGATTCGTC-AAAAAACATGG
Reference ( family-643 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTGANCACGNNNGTATNT-TCCATATC--CTAC-AGTNTT--TACTGTTTGTTGATGCTATTGGCTGTTTACNTNAGATGTTACTANATAATTTGNTACC-TCCTGTATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT--CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCATCGTCTGTCTGTT----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--N-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCTTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTTGGACAAGTTCNTGAACTGGCCAAATC-GATNATTAATGTCAAGAGTTATGGCCC-TTGAAACATTAAAAA---TG-CATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTCTA---GCACC-CGCATTTTTCATTNGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCATAATNTCTTGGACAAGTTCTTGAACCGGCCAAATCGGATNATTAATGTCAGAGTTATGGCCCTTGAANCGTTGAAAAATGCC-TTGTGTGCACTCTA---GCACCCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAAC--ANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTNGACAAGTTCTTGAACCGGCCAAATCGGANTATTAATGTCAGAGTTA-TGGCCCTTGAAACATTGA-A-AATGCA-CT-TTTGACTN--T-GTGTGCACTCTAG---CACCCGCATT-TTTCATTTGATCC--TCACCAAACTTACACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTNGACAAGTTCTTGAACCGGCCAAATC-GG--ANTATTAATGTCAGGGTNGTGGCCCTTGAATCGTTGAAAATTG-CGAC-TTTAACNTTGTGT--GCACTC--TAGC-ACCNGTATTTTTCATTTGATCCTCAC---CAAACTTATACAGTAG-TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTCTTGAA---CCGGCCAAATCGGGTA--A--TTAATGTCNGAGTTATGGCCCTTGAATCATCGAAAA------T-GCNTTA-TTTGACNTT-GTGT--GC--ACTCTAGCACCCGCATTTTTCATTTGTTCCC-ACCAAACTTACGCAGTAGTTATATAACCACAATATCTTNGACAAGTNCTTGAACCGACCAATCGGATNATTAATGTCANAGTTGTGGCCCTTGAAACATCGAAAATG--CTTGTTCGNCGTTGTGCGCACTCTAGCACCTGCATTTTTCATTTGATCCTCACCAAACTCGCAGTAGTTATATAACCATAATATCTTAGACAAGTTCTTGAACCGACCAAATCGGGTAATTATGTATCNGTGNTCCTTGACATTGAAGATGCATTATTTGACNTCGTGTGCACTCTGCACCCGTATTTTTCATTTGATCTNNNNNNTATTAATGTCAGAGTTGTGGCCCCTTGAAACGTTAAAAATTGTT--TAACTGACGTCGNGTGCACTCTGGCACCCGTATTTTTCATTNGATCCTCACCAAACTTACACAGTTG--TA------GTTATATAACCATAATATCTTNGACAAGTTCTTGAACCGACCAAATCGGATAATT----AAATGNCCAAGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAAAATTT--TATTTT--TACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGAT--TTACTCAAC-ATGAAANNNNNNNNGCTTCANAAGGT-CTATGTGTANCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTANC-T---TTT---AAC---AA--CTT------CTCCTCT--GAAACCACTNGGCCAATTTTGATNTAA-T-TTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCNNCCAGGGGGCGGG--GCNAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAATGTTCTCGTCNGAAACTACTGGNCCGATTT-C-G--AA-TA--ATTTCACAGAAATGTTCCTTNGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGG
gi|1 : AGATATGAAAACA--ACATA----TTAAGCACAAGTGTATGTGTCCATATT--CTAC-TGTATT--TATTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACTTTAGATGTTGCTGTATAATTTGTTACC-TCCTGCATCGATGTCACT--T--TT--TTAGTTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTAAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-T-CTT--CGTCTGTT-GTCTAT-TGTCCATTGTCTGTCTGTT----AACTTT-TTGTTGTACGCACTCTA---GCAC--A-TG--T-ATT-TTTCATTGGATCTTCACTAAACTT-T-ATAGTAGTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTCGAACATGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GATCATTAATGTTAAGAGTTGTGGCCT-TTGAAACATAAAAAA---TG-CATTAT-TTGACCTTGTGTGCACTGTA---GCACC-CGCATTTTTCATTTGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCATAATTTCTTGGACAAGTTCTTGAACTGGTCAAATCGGATTATTAATGTCAGAGTTATTGCCCTTGAAACATTAAAAAATACC-TTGTGTGCACTCTA---GCACCCACATTT-TTCATTTGATA--TTAAAC--AAACAGTAGTTATATAAACATAATATCTTGAACAAGTTCTTGAACTGGCTAAATCGGAATATTGATGTCACAGTTT-TGGTCCTTAAAACTTTAA-ACAACGCA-CTATTTGACTG--T-GTGTGCACTATAG---TTCCCGCATT-TTTTATTTGATTC--TCACCAGACTTACACAGTAGTAATATAAGCATAATATCTCGAACAAATTCTTGGACTGGCTAAATC-AG--AATATTGATGTCAGATTAATGGCCCTTGAGTTGTTAAAAACTA-CAACATTCAACCTTGTCT--ACGCTC--TAGC-AGCAGTATTTTTCATTTGATCCTCAC---CAAACTTATACATTTG-TTATATAACCATAATATCTTGGATAAGTTCTTTAA---CAGACCAAATCCGGTA--A--CTTATGTCTGAGTTATGGCCCTTGAATAATCAAAAA------TGGCATTA-TTTGACCTT-GTGT--GC--ATTCTAGTACTCGCAGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGT--TATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTG--TTG---AATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAA---TGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTG----TGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGG-ACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACAATTTTAATAC-AAAATTATGAATATACAATTATACAATATATACAAATTA--AAGATAATTACTCAACAATAAAACCCAGCTGGTTTCAAAAGGTCCTATG-ATGGTATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCATCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---TTAGC-T---TCT---AAC---AA--CTT------CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTCAATTTAA-C-TTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACA--C--TCC--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCATCAAAAAA-CATGCTTGCCAGGGGGCGGG--GCAAGTTT--AAT-----------TAATAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACAACTGGCTCGATTTAT-A--AA-TA--ATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCT---TGATTCGTC-AAAAAACATGG
gi|10 : aaataaactacaataaaaaac--TT--CTAGCTCATC----G------CT-A--AGGC-TCA-A--GTTGAG---CTTT-TGTAATTG-CT--CTGTGTT-A-CTTAATGTCT-TT-GTCTGTCTGTCCATCAT--------T----AATGTT-CTGTTGT-----TTTTA---GT-------------TT-TTTCATTGGATCT-----AAA-TT-A-ACAATACTTATAAATAATATACCTGATAATGCATT-AACAGATTCATGTATTGG---AACT-GGT--TTG--GTC---AGTT-TGACCC-TTG--ACATTTAAAA---TA-CATTAA-TTg
gi|11 : AGATATGAAAACACAACATA----TTGATCATGATTGTATATGTCCATATT--CTAC-AGTTAG--TACTGTTTGTTGGTGCTATT-ATTGACTACTTGATATGTAACTAAATGAGTTGATACC-TCATACATTAGTGTCACTCAT--TTCATTA--TCAAGTAA-GTCCTCTC--C--AAAC-TCA-ATGGATGCGTTTTTATATCTGGTCG-C---GAGATGT-CTTTT--CGT
gi|12 : gAATGACAAGAGTTATTGCCC-TTAAATGATTAAAAAAACTG-CTTTGTGTTAACATGATAAGAACTT-------------CATTTTTCATTCGA-------TCTAGACTAAACCTGCATATGTA--TATATAAACAagctg
gi|13 : CTG---TTATC-T---TTT----AC---AT--TTTAATATCTTTCTCC--GAAGCCACTGTGCTAA-ATTAAACTAATT-TTTACAGGAATATTCCTTgagtaaaggatgtcttcttgatgaaggcagaatgaacaaagttgttgtacttg
gi|15 : caccttattattcaaacggtcatgtgaggttttactatcacattggccgctggcagcttaatcattgtcatggtTTGTGTCAACACTAAGTATC-ACCTTTAGTTTGCATTTTATTTTGAA---CAAACTTGTTTAGAAGCTTA-ATGGTCA-AA---CTGGGGCAAACATTT-AA---CCAGCCAAAGCGAGCA--G---TGATGACAGAGTTATGA--CTTGAATAATTGA
gi|16 : tttgCAGAGTAA-CAGCCTTTGATGAATTGAAA-AATGCAGAT-TTTGCCT---T-ATAAACACTGTAA---CACCTTCATTCTTTTATC--ATCCATTCAACAAATTg
gi|17 : atgga----TTTTAGTTCACCGG-----AACTGGGGAT--TCTCA-GGTG--------------AGT-TTTCGTGA----CT-------G--CCAT-----G---------TG---TACATC-AT-------------T-AGCTC---TT-TC-T---TTA---AAC---AAGTCGT------CTGTTCTTGGAAATCACTTGTTTACTTTTGCTCAAA-TGTTTACAGAAatttgccaattagcagattataattttggtggtaatttctttga
gi|18 : taTTCATT-AATCTTGA-----AAATCT-TAC--TTA-TTATGTAACCACGAGATCATGCACAATTTCTTTAA---TTGATTTTCTGAGGTA--ATTTTTCTGTCTAGATTATGTCCCTTTAATTGTCAAATA------T--CGTAG-TTTGGTCTT-GTgc
gi|19 : -TTGAAA--TTAAAAA---TAACA--AT-TTTATTTTGTGTTCA---TATGTGCACCACACATTTTCCTTTCGAGGTATTGTCCTTA---AAGTTACAGA-ACAATCACA----CACGATGTTT--GACAATTTCTTGAACTTGTCA
gi|2 : ggtgtTT-TTAT----GTTTAGCTCAGCTGTTTTTAGCCGAAGGC--TCACA-GGTA--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCTGTC-GTCTGTCGTCAGTCGT-AACTT---AAAGC-T---TTT---AAC---AA--CTT------CTCCTCT--TAAACCACTTGGCCAATTTTGATATAA-G-TTCACAGTAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCAT-AAAAAA-CATGGCCCCCAGGGGGCAGG--GCAAGTTT--AAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-TAA--AA-TA--ATTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTGACCCTCTACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGG
gi|2 : gTT------CTTGTCA--GAAACTACTGGCTCGATTTTAAAATAA-T-TTCACAGAAATGTTCCTTTGGTG--A--CCCTCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGGCGGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT---AC-----------TA-TATAAGCTATAGTAAAAA-----CTTGTCAGAAACCATCGGATCAATTT-T-A--AAACA--ATTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTGACCCTTTACCAAGTTTGTTCAAGCCGTT---GTGATTTGTT-AAAAAACATGcggccagggagtggggttagtttactatataagctatagtaaaaacttgtcagaaaccatcggatcaattttaaaacaatttcacagcaatgttccttgggtgaccctttaccaagtttgttcaagccgttgtgatttgttaaaaaacatgaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|2 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatgT---AAA---AA--CTT------GTCA-----GAAACCATCGGATCAATTTTAAAACAA-T-TTCACAGCAATGTTCCTTGGGTG--A--C--CCTTTACCAAGTTTGTTCAAGCCGTTGT---GATTTGTTAAAAAA-CATGACCACCA--CAGCGAGTTGCTAGTTTACTATATAGGCAGCTATAGTAAAATCT----TCAAAAGCCTTCTTGTCA-AATCT-CTGACCTGATTT-C----AA-TGTTATTTCACTGACATTTACCATGGGTGCACCTCTACCAAGTTTGaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|20 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatgttcttgtcagaaactactggctcgattttaaaataatttcacagaaatgttcctttggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttaatgattcgtcaaaaaaacatggcggccagggagtggggttagtttactatataagctatag--TT--TTAGCTCACCAGA-A------C--A--AAGC-TAA-A--GTTGAG---CTAT-TTTTACGG-CA--CTG-TG--------------GTC-ATCTAT-T---CA-------TCTGTA----AACGTTGATGCTGTGTGCTCTCTG---ACAC--C-CT--C-A-T-TTTCATTGCATCATCATTCAACTaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|22 : cAAGGT---ATGTGTAGT-TTGA----TTCTG-TTAT----TTTTAGCTCACCTG-----TGCCAAAGGC--TAAT--GGTT--------------AGC-ATTTCTGA----TC-------AT-CCTGTCACTGT--------TA---TCCA----T-------------T-GACTT---TTACT-T---TGT---AAC---
gi|23 : aTGTCCGTCAAC-CGTCC-TCGTCTGTCCGTTCGTAAACGTT-AGATTGTGTGCAC-CTA---GCAC--ATCA--TTATT-TTTTATTAGATCATCACAAAACTT-TGAC--TAATTA
gi|24 : tctaTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGTGATCGCCTGGTGTTCANNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN----NN-------N--NNNN-----N---------NN---NNNNNN-NN-------------T-AACTT---TTAGC-T---TCT---AAC---AA--CTT------CTCCTCT--
gi|25 : TT---TCAAC-TATTTTT---AAC---TA--CTTAA----CTTTATT--GAA-CTACTGAACCAATTTTGGCAAAATT-TTCAC---AATGTTCCTTAAGTG--G--C--CC
gi|25 : ccttAACTACTGAACCAATTT-T-GGCAA-AA--TTTTCACA---ATGTTCCTTAAGTGGCCCacattattatatttg
gi|26 : cctttttcaactatttttaactacttaactttattgT-T----TTTAAGCTCATCTG------GCCCAAG-C--ACACA-GATG--------------CAT-TTTTGTGAACATTCAATTTCTG--TCTG-----A---------TA---TCTATT-GT-------------TAAACTCA--TTAAC-C---CTC---AAC---AA--Cacattattatatttg
gi|28 : TAAGCACCTGAGTATTT----ATATC--CTGA-AGTATTAGTATTGCCTATTGATGTTATTGGATGTTTACGGTAGCTGTTACCATATAATTTGAGACC-T
gi|29 : ----TTTAAACTAACCTG-----TGCCAGAGAC--CCA-A-AATG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------A--TGTG-----G---------
gi|3 : accatgtctgtctgtcattgttgtttttttaagttgtttgtaTAATGTCGAAGTTAATG----------CGTTAA-A-AAT--------TTAACTTAAT-GTGAGTACTTTAG---CACCTGCAGT-TTTCATTAGATCC--TTATTAAACTTGCACTGTATCTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATCTGGTAATTA-TAATATCAGAGTAATGGC-------TCATTG-----------------ACCTTGGGT--GCATTC--TTGC-ACCTGTATTCTTCATTGGATTTTCAC---CAAACTTTTATAGTAA-CTATATAACT---ATGTCTTCAACAAGTTTTT-AGTTTCCAGCCAAGCTTTATA--A--TTTAAACTGAAGTTGTGGCATTTGAATCGT-GAAAAAAAATCT-GATTTA-ATTGAAATTAGTAT--G
gi|3 : aatctgatagaAAATTAAGTACCA--GTAATGTCTGAGTTATGGGCCTTGATTTATTACAAG------T--CACTA-ATTGttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|30 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaatttaacttaatgtgagtactttagcacctgcagttttcattagatccttattaaacttgcactgtatctataaaaccacaatatcttagacaagttcttgaactggccaaatctggtaattataatatcagagtaatggctcattgaccttgggtgcattcttgcacctgtattcttcattggattttcaccaaacttttatagtaactatataactatgtcttcaacaagtttttagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaT-TCTGATTG-C---CC--TGT---------ATCTGTT-GTCCATCTGTCCTCCATCTGACTGTA----AACTTT-ATGTTGTGTTCACTCTA---GCACCGA-CA--T-ATT-TCTCA
gi|32 : ttGCTTCACAAA---CTATAT--ACCATTAAGAAGCATTT-TT-T----TTTTCGTTCTCCTG-----AACCCAAGAC--TC-----GTA--------------TGC-TTTTGTGA----TCT------G--CCT------G---------TG---TCCAg
gi|33 : --TT--CTAGCTCATATGA-G------C--A--AAGT-TAA-A--AGCAAG---C-AT-TCTAATTA-C---CTGTCATCC-CTT--TGTCTGTCTGTATGT-TTTGTATTGTC
gi|34 : TGTTACT--T--AT-----GATCACCTGA-AA-----C--A--AAGGGTCA-A--GCTGTG---CTTT-TCTGATTG-CTCACTGTTG-----GT--CTTCTGT
gi|35 : a-T----TTTTAGCTTGACTG-----AATTGAAGGT--TC-CA-GGAG--------------AGC-TTTTGTGA----CC-------C--TTCT-----G---------TG---GC---T-GT-------------T-GACTT---TTAGCAT---TAT---AGC---Atctcctcttct
gi|36 : taAATAAAATTT--TATTTT--TACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGAT--TTACTCAAC-ATGAAA
gi|37 : CATCTG-----AGTCGAATGC--TTACA-GCAG--------------AACATTTTGTGA----TC----------TCTGT----G---------TG---TCCATCTGT-------------G-G-------TCAAC-T---TCC---AAT---AA--CTT------TTTC
gi|38 : cTG-----AGACAAAGGC--ACACA-GGTG--------------ACC-TTTTGTGA----TT-------GCTCTTC-----GTCCATAATCTG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---T
gi|39 : T--T--TT--TTAGCTCACGTAA-G------C--A--AAGC-TCA-A--AGTAGG---CTGT-TCTGATCC-T---TTGTggttcaaaaaa
gi|39 : T-T----TTTTAGCTCACGTA-----AGC--AAAGC--TCA-A-AGTA--------------GGC-TGTTCTGA----TC----------CTTT-----G---------TGAAATTCATC--T-------------T-Ggaaattcatcttgctgtatgtccact
gi|4 : GTTATTGGCTGTTTATACCAG-TATT-CTAT----TTTCTTAA-----TATATTT-TATTATT--T--TA--CTAGCTTACCTGA-G------C--A--GAAA-TCA-A--GTTGAG---CGAT-TCTGATCA-C---C---------CTG--AGTCTGTC-GTCCAT----CCAT--------TGTA----GACTTT-CTGTCGGGTGCACTCTG---GCAT--A-TGAGT-ATT-TT--ATTGGATCCTCACCAAACTTAT-GTAGTAGTTAT--ATA----ACC--ACAATATCTCTGACAAGTGATTGAACCGGCCTAATCAGATAATTAAAGTTAA-AGTTATGGCCCCTTGAAA--TTAAAAAAT-TG-GACTTT-ATGACATTGTCTGCACACTG---GCATC-TGCATTTTTCATATGC-------TTCTCACCAAACTTACACA-GTAGTTATATAACCATAACAATT---AC---TTCTTGAACCAACCAAATCAGGAAATTAATGTCTGGCTAAAGGTCCTTGAATCATTGAAGATTGCA-TTATTTA-ACGTCATGTGCACTTGCAGTT-TTCATTTGATC--TTActgtatgtccact
gi|40 : tcA-A--AGTGAG---CTAT-TCTGTTCGCC---CTG-TGT-C-CAT--TGTTTGTC--TC--C-TGCCC--C-TCTGTCTGTA----AACCTT-
gi|41 : tgggggataaACTG-TA-T----TTTTAGCTCATTTT-----AGCCAAATAC--TCTTA-GATG--------------AGT-TTTTCTGA----TC-------A--CCAT-----G---------TG---ACCATT-GT-------------tg
gi|42 : aagaTATCATT--TCATTA-TTAGTTCAACTGA-G------C--A--AAGG-TCA-A--GGTGAG---GTAT-TCTGTTCA-G---CTGTTAT-G-CTTC-CATCTGctg
gi|43 : TATAACATAAA----CACTTATG-TGAAGTTTTAGCTCACATG-----AGCCAAAGGT--TCA-A-GATA--------------AGC-
gi|44 : tcatttatattt--TC--TTAACTTACCTGA-A------C--A--AAGC-TCA-A--CGTTAG---C-ATGTCTGGTCG-C---CCGTTGC-C-CGT--TGCCCGTT-GTCT
gi|46 : ------C--A--AATG-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTG------T--TGCCTGCC-GTCTGC-TGTCCGT
gi|47 : GTTGTTTACTTGAGATGTTACTGAATAAACTGTTACC-TCCTGCGCTGGTGTCACT--T--
gi|49 : GATGTTACTGAATAATTTGCTACC-TCCTGTATTCGTGTCACA--T--GT--TTAGATCA
gi|5 : TCAAAACCATGACCCTGGGGGCA--GAA--------TTGTGCGCACTCTA---GCACTCGTATTT-TTCGTTTGTTTCATCAAACTTACACAGTAGTTATAAAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCATGAACAGGCCAAATTGGATTATTAATGTCAGAGTTG-TGACCCTTGAAACATTGA-A-AATGCA-CTGTTTGATTG--T-GTGTGCACTCTAG---CACCCCTATT-TTTCATTTGATCC--TCACCAAACTTGCACAGTAGTTATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGAACTGACCAAATT-GG--ATTATTAATGACAGGGTTGTGGCCCTTGAAACATTGAAAATTGCCGTC-TTTac
gi|50 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgtT--TTAGTTCATCTGAAG------C--ATAAAG--TCA-A--GGTGAA---CTAT-TCTGATTG-T---CTTTTGT-C-ggcacagtttaacaatatgttgttttttttaat
gi|52 : CT--T--TT--TGAGCTAATCTGA-G------C--A--GAGT-TCA-A--CGTGAG---CT-T-TCTGATTG-CT--CTGt
gi|54 : AGC-TCA-T--GGTGAA---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-TGT--CGT
gi|6 : AATACAACAGAATTCTTCACTATGATACAATGT-TCCATATCACCTACTGGCGTT--TTCTGTTT-TTCATACCAT-GCCTGTT--CATTA-ATATT------TA---TGATATCATGCTGTAT--GTAT------T--TA--TTAGCTCACCTGA-G------CCAA--AGGC-TCACA--GGTGAG---CTTT-TGTGATTG-C---CTGGTGT-C-CGT--CGTCTGTC---C------TCCGTCATCT-TTTGTT----AACTTT-atc
gi|6 : tatataaatgtttattataatcctgT-T----TATTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TT-------G--CCTG-----G---------TG---TCCGTC-GTC------------T-GTCCTCCGTCATC-T---TTTGTTAACTTTAA--CTT------CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTGATATAA-T-TTCACAGAAATATTCCTTGGGTG--ACCC--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTTGTC-AAAAA-CATGGCAGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT--TAT-------------GTCAAAaacttctcctctgaaaccactgggccaattttgatataatttcacagaaatattccttgggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttgatttgtcaaaaacatggcagccagggagtggggttagttttatgtcaaatt
gi|7 : tatataaatgtttattataatcctgaatacaacagaattcttcactatgatacaatgttccatatcacctactggcgttttctgtttttcataccatgcctgttcattaatatttatgatatcatgctgtatgtaA-A--AGTGAG---CCAT-TCTGATCG----------------AT--CGTCT-------TAT--GTCTGTCGATTGTCTTTT----ACCGCT-TCATTGTA---AACCTAATTGCGT--C-CA--A-ATTATTTTATTGGATCTATACCAAATTT-T-TCAGTATTTAC--ATG----ACC--Att
gi|7 : gggcgatagagaAATTATAGCCATGGTATAAACAAAAA------T-GCTTTATTTTGA-ATT-GTGTAAGCCAACTCTATCACCCTCTATTTTCATgtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacaattatagccatggtataaacaaaaatgctttattttgaattgtgtaagccaactctatcaccctctattttcat
gi|8 : gggcgatagagaaaagtgagccattctgatcgatcgtcttatgtctgtcgattgtcttttaccgcttcattgtaaacctaattgcgtccaaattattttattggatctataccaaatttttcagtatttacatgaccagtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacT-TCTGACTC--TTGTGTGTGCTCTAG----ACCC--------TGAATTGGTCT--TGACCAAACTTGCA-------TATAT--------T-TCATT--CAAGACCTAAAACTGCCCAAATT-GG--GTAACTAACGTCA------TAGC-----AAT-G--GAAAATTG-T-AC-T---ATATTAT-----CA-----TAATTACCGTTATTTTTCAGTTGATTTTCACCAACAAACCT-TACAGAAA-TTATAGAACCGCAGTA---TGGACAAGTTTTTG
gi|9 : tcttgAATGCCATTATG-ATATCCTA---CCACTTACATTTATTTATTTGA-------AACTTATACAGTGATTATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAAACTGACCGAATTGTACTATTAATGTCCAAGTGT-TTGC--------CATTTA-A---------T-CTTGTCTC--T-CTGTGCTCTCCAGCTTCAGCAGCATT-TATGGT---ATCT--TTATTTGACTT-TAAAGCATGTATATAATCATAAAATATTGGACAACTTcaatttatctacatttgcttagtact
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TGAATTAATAAAAAAAGGGCTTACTATGTAGCGTATATTCAGTGATTGAATTTGTTTTACCCATGATGCTTTAGTCAGCTACATTTCTCAAGGCTGATTAATTGTACTTCATGTGAGTTAGTCCAGTGTATGGTCATTTCCTGCTC
Unaligned ( gi|21 ): TAATGGTGTTTTGCATGTAAACCATTGTTTATACATGTTTTTCTGTTTTATTAACTTGCCTAATCTTTAGGTTTGAGTTCAGTAATTTGGATCACCCTGTGTCTGTTGTCCATCCGTAAACT
Unaligned ( gi|27 ): ACGTGAATTAATATTGTAATTACCTGACATCATTATACAGATTTAGATGATTTTACATAGAGGTGCATTGTGCAAACAAATTATTATTACACAACT
Unaligned ( gi|31 ): TTTTAAATATCATTATCATTGGATCTTTTTTTATTATATATACATTTTGTATTGTATTTTTTAACTTCTTGATTTGTCACAATTTGTTTATT
Unaligned ( gi|45 ): CAAAGTTCCATATCACCTACTGATGTTTTCTGTTTCCATATCATGCTTGTCCATCAATACT
Unaligned ( gi|48 ): AACCAACAAATGAAAATAATAAATTTGAAAATAAATATCAACGAAAAATCAAATTT
Unaligned ( gi|51 ): TGAACATTTGAGTAAAACTGTAAAATCCAACAGGTTTAATTCCCTATCACAC
Unaligned ( gi|53 ): TCGGAACTCCCCGATTACACACTTTCACCGGATCGACTTATTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 2222 1 11 11 11 111111 111 111111 11111 11111 11111 111 3333333333 111 11 2222 11 1 1 111 1111 333 1 11 11 22222 111 3333333 1 111 4444444444444 111 1111 2222222 1 2222 11 3333333333 3333333333 111 1111 1 11 6666666666666666666666666666666 1111 11111 11 1111 111111111111111 1111111 111 222222 333333333 1 11 11 111 11 1 11 11 1 2222 11 2222 11111111111111 22222222222222222222222222222 2222222222222 111 111 11111 111 11 44444444444444444 2222 111 111 111 33333333 222 1 1
lowQualScore : 6 8888 0 1 0 22 0 5 33 44 1 33 6 0 0 1 1 22 0 44 333 1 5 666 55 33 66 3 111111 66 33 44 2 33 444 4 2 000 3 888888 33 66 33333 44444 1 00000 1 55 666 0 000 0 0000000000 5 44 3 1 222 0 1 33 1111 33 3 3 1 0 888 8888 444 66 999 7 0 0 66 11 99 3 8 0 1 0 44444 0 000 2222222 0 22 0 0 6 3 2 777 2222222222222 44 22 1 1 1 000 5555 2222222 6 3 0 1111 0 7 1 1 0 0 1 55 11 9999999999 1 4 9999999999 222 8 7777 5 0 1 1 11 1 3 1 0 1 3 0 1 77 1 0 0 33 7 3333333333333333333333333333333 6666 44444 2 6 99 22 6 00 99 8888 888888888888888 0 4444444 1 444 0 333 444444 1 0 1 6 2 1 44 222222222 1 1 22 0 88 88 1 1 1 999 88 5 88 88 5 1 5555 55 0 3 1111 6 8 7777 66666 3 33 5555 55555555555555 2 6666 99999999999999999999999999999 555 3 1111111111111 3 000 1 4 777 0 666 666 66 66 0 66 1 000 1 5 1 11111 99 99 444 44 8 3 11 1 33333333333333333 3 1 1111 333 2 44 444 444 66666666 3 2 2 000 0 0
lowQualScore : . .... . . . .. . . .. .. . .. . . . . . .. . .. ... . . ... .. .. .. . ...... .. .. .. . .. ... . . ... . ...... .. .. ..... ..... . ..... . .. ... . ... . .......... . .. . . ... . . .. .... .. . . . . ... .... ... .. ... . . . .. .. .. . . . . . ..... . ... ....... . .. . . . . . ... ............. .. .. . . . ... .... ....... . . . .... . . . . . . . .. .. .......... . . .......... ... . .... . . . . .. . . . . . . . . .. . . . .. . ............................... .... ..... . . .. .. . .. .. .... ............... . ....... . ... . ... ...... . . . . . . .. ......... . . .. . .. .. . . . ... .. . .. .. . . .... .. . . .... . . .... ..... . .. .... .............. . .... ............................. ... . ............. . ... . . ... . ... ... .. .. . .. . ... . . . ..... .. .. ... .. . . .. . ................. . . .... ... . .. ... ... ........ . . . ... . .
lowQualScore : 7 3333 8 0 2 00 2 0 88 22 2 88 5 8 3 0 5 11 1 77 111 0 7 000 55 99 88 1 111111 88 99 88 4 22 111 4 2 666 9 555555 66 22 88888 77777 9 44444 0 44 000 1 000 1 9999999999 7 55 7 0 222 8 0 88 2222 88 3 3 0 7 333 0000 000 88 000 0 0 8 00 66 00 8 0 2 0 2 88888 2 555 5555555 2 88 2 0 5 2 5 555 5555555555555 33 00 0 0 0 000 2222 0000000 5 2 0 5555 8 3 0 0 7 7 0 00 00 5555555555 2 2 6666666666 000 0 2222 0 6 0 0 88 4 2 0 8 0 2 8 0 88 4 2 0 88 0 8888888888888888888888888888888 2222 55555 2 7 22 00 7 11 22 3333 555555555555555 8 8888888 0 222 2 888 666666 0 8 4 7 5 0 33 000000000 0 4 00 0 33 00 0 0 0 000 55 5 00 55 5 0 7777 99 2 2 2222 7 0 1111 77777 5 77 9999 77777777777777 7 1111 44444444444444444444444444444 444 3 7777777777777 6 000 0 0 000 5 444 444 11 11 4 99 7 000 0 7 6 88888 22 22 000 00 0 2 00 4 66666666666666666 2 2 2222 888 5 55 888 888 22222222 2 0 5 222 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATAT--CCTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCAC-TNTGGCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TTCTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCTTGA-NCGTTGAAAATTGC--AC-TTCG-CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCAC---CAAAC--TT-TACAGTAA--TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA--A--TTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAA------TG-CNTTATTTGGNNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-T---TTT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TC--TACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
Reference ( family-643 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATAT--CCTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCAC-TNTAGCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGTTT--GACAA-TTCTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCAGAGTTN-TGGCCCTTGAAACATTGAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCACTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTANTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCTTGAATCGTTGAAAATTGC-GAC-TTCA-CCTTGTGT--ACACTC--TAGC-A--CCNNTATT-TTTCATTTGATT--TTCAC---CAAAC--TT-TACAGTAA--TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA--A--TTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAA------TG-CNTTATTTGANNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTANC-T---TTT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TC--TACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCGTCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
gi|1 : AGATATGAAAACA--ACATA----TTAAGCACAAGTGTATGTGTCCATAT--TCTAC-TGTATT--TATTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACTTTAGATGTTGCTGTATAATTTGTTACC-TCCTGCATCGATGTCACT--T--TT--TTAGTTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTAAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-T-CTT-CGTCTGTT-GTCTAT-TGTCCATT-GTCTGTCTGTT----AACTTT-TTGTTGTACGCACTCTA---GCAC--A-TG--T-ATT-TTTCATTGGATCTTCACTAAACTT-T-ATAGTAGTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GAACATGTTCTTGAACTGGCC-AAATC-GATCA-TTAATGTTAAGAGTTGTGG-CCTTTGAAACAT-AAAAAA--TGCATTAT-TTGACCTTGTGTGCAC-TGTAGCACC-CGCATTTTTCATTTGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAATTTCTTGGACAAGTTCTTGAACTGGTCAAATCGGATTATTAATGTCAGAGTTATTGCCCTTGAAACATTAAAAAATACC-TTGT---GTG-CACTCTAGCACCCACATTT-TTCATTTGATA--TTAAAC--AAACAGTAGTTATATAAACATAATATCTTGAACAAGTTCTTGAACTGGCTAAATCGGAATATTGATGTCACAGTTT-TGGTCCTTAAAACTTTAAACAACGCACTATTTGACTG--T-GTGTGCACTATAG---TTCCCGCATTTTTTATTTGATTCTCACCAGACTTACACAGTAGTAATATAAGCATAATATCTCGAACAAATTCTTGGACTGGCTAAATC-AG--AATATTGATGTCAGATTAATGGCCCTTGAGTTGTTAAAAACTAC-AACATTCAACCTTGTCT--ACGCTC--TAGC-A--GCAGTATT-TTTCATTTGATC--CTCAC---CAAAC--TTATACATTTG--TTATATAACCATAATATCTTGGATAAGTTCTT--TAACAGACCAAATCCGGTA--A--CTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATAATCAAAAA------TGGCATTATTTGACCTT-GTGT--GC--ATTCTAGTACTCGCAGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACAATTTTAATAC-AAAATTATGAATATACAATTATACAATATATACAAATTA--AAGATAATTACTCAACAATAAAACCCAGCTGGTTTCAAAAGGTCCTATG-ATGGTATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCATCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---TTAGC-T---TCT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTCA---ATTTAA-CTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACA--C--TC--CACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCATCAAAAAA-CATGCTTGCCAGGGGGCGGG--GCAAGTTT--AAT-----------TAATAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACAACTGGCTCGATTTAT-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT---TGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
gi|10 : aaataaactacaataaaaaac--TT--CTAGCTCATC----G------CT-A--AGGC-TCA-A--GTTGAG---CTTT-TGTAATTG-CT--CTGTGTT-A-CTT-AAT------GTCT-T-TGTCTGTCTGTCCATC-ATT----AATGTT-CTGTTGT-----TTTTA---GT-------------TT-TTTCATTGGATCT-----AAA-TT-A-ACAATACTTATAAATAATATACCTGATAATGCATT-AA-CAGATTCATGTATTGG---AA-CT-GGT---TTG--GTC---AGTT-TGA-CCCTTG--ACATT-TAAAA--TACATTAA-TTg
gi|11 : AGATATGAAAACACAACATA----TTGATCATGATTGTATATGTCCATAT--TCTAC-AGTTAG--TACTGTTTGTTGGTGCTATT-ATTGACTACTTGATATGTAACTAAATGAGTTGATACC-TCATACATTAGTGTCACTCAT--TTCATTA--TCAAGTAA-GTCCTCTC--C--AAAC-TCA-ATGGATGCGTTTTTATATCTGGTCG-C---GAGATGT-CTTTT-CGT
gi|12 : gAATGACAAGAGTTATTG-CCCTTAAATGATTAAAAAAACTGCTTTGTGTTAACATGATAAGAAC-TT----------CATTTTTCATTCGA-------TCTAGACTAAACCTGCATATGTA--TATATAAACAGAGTAAAGGAT--GTC---TTCTTGAagctg
gi|15 : TTGTGTCAACACTAAGTATC-A--CCTTTAGT-TTGCATTTTATT--TTGAA---CAAAC--TTGTTTAG-AAGCTTA-ATGGTCA-AA---CTGGGGCAAACATTT---AACCAGCCAAAGCGAGCA--G---TGATGACAG-AGTTATGA--CTTGAATAATTGAtgaaggcagaatgaacaaagttgttgtacttg
gi|16 : tttgCAGAGTAACAGCCTTTGATGAATTGAAAAATGCAGAT-TTTG-CCTTATAA--ACACTG--TAAC-A--CCTTCATTCTTTTATC--ATCCATTCAA---CAAATTATT-TGC--CAA--TTAg
gi|17 : atgga----TTTTAGTTCACCGG-----AACTGGGGAT--TCTCA-GGTG--------------AGT-TTTCGTGA----CT-------G--CCAT-----G---------TG---TACATC-AT-------------T-AGCTC---TT-TC-T---TTA---AAC---AAGTCGT--CTGTTCTTGGAAATCACTTGTTTACTTTTGCTCAAATG---TTTACAGAAgcagattataattttggtggtaatttctttga
gi|18 : taTTCATT-AATC--TTGA-----AAAT--CT-TAC--TTA--TTATGTAACCACGAGATCATGCACAATTTCTT--TAATTGATTTTCTGAGGTA--ATTTTTCTGTCTA-GATTATGTCCCTTTAATTGTCAAATA------T--CGTAGTTTGGTCTT-GTgc
gi|19 : TTGAAA--TTAAAAAT--AACA--AT-TTTATTTTGTGTTCATATGT-GCACCACACATTTTCCTTTCGAGGTATTGTCCTTA---AAGTTACAGA-ACAATCACA----CA---CGATGTTT--GACAATTTCTTGAACTTGTCA
gi|2 : ggtgtTT-TTAT----GTTTAGCTCAGCTGTTTTTAGCCGAAGGC--TCACA-GGTA--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCTGTC-GTCTGTCGTCAGTCGT-AACTT---AAAGC-T---TTT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--TAAACCACTTGGCCAATTTTG---ATATAA-GTTCACAGTAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TC--TACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCAT-AAAAAA-CATGGCCCCCAGGGGGCAGG--GCAAGTTT--AAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-TAAA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCTTAATGAT-TCGTCAAAAAAACATGG
gi|2 : gTT--CTTGTCA--GAAACTACTGGCTCGATTTTA---AAATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTG--A--CCCTC--TACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGGCGGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT---AC-----------TA-TATAAGCTATAGTAAAAA-----CTTGTCAGAAACCATCGGATCAATTT-T-AA-AACAATTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTGACCCTTTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCGT-T--GTGAT-TTGTT-AAAAAACATGcggccagggagtggggttagtttactatataagctatagtaaaaacttgtcagaaaccatcggatcaattttaaaacaatttcacagcaatgttccttgggtgaccctttaccaagtttgttcaagccgttgtgatttgttaaaaaacatgaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|2 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatgT---AAA---AA--CTT--GTCA-----GAAACCATCGGATCAATTTTA---AAACAA-TTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTG--A--C--CCTTTACCAAGTTTGTTCAAGCCGTTGT---GATTTGTTAAAAAA-CATGACCACCA--CAGCGAGTTGCTAGTTTACTATATAGGCAGCTATAGTAAAATCT----TCAAAAGCCTTCTTGTCA-AATCT-CTGACCTGATTT-C-AATG-TTATTTCACTGACATTTACCATGGGTGCACCTCTACCAAGTTTGAACTCTTCTTCA---CATCT--GTTACATCTTC-AAAAaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|20 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatgttcttgtcagaaactactggctcgattttaaaataatttcacagaaatgttcctttggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttaatgattcgtcaaaaaaacatggcggccagggagtggggttagtttactatataagctatag--TT--TTAGCTCACCAGA-A------C--A--AAGC-TAA-A--GTTGAG---CTAT-TTTTACGG-CA--CTG-TG-------------GTC-ATCTAT-T-----------CATCTGTA----AACGTTGATGCTGTGTGCTCTCTG---ACAC--C-CT--C-A-T-TTTCATTGCATCATCATTCAACTcaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|22 : cAAGGT---ATGTGTAGT-TTGA----TTCTG-TTAT----TTTTAGCTCACCTG-----TGCCAAAGGC--TAAT--GGTT--------------AGC-ATTTCTGA----TC-------AT-CCTGTCACTGT--------TA---TCCA----T-------------T-GACTT---TTACT-T---TGT---AAC---
gi|23 : aTGTCCGTCAAC-CGTCC-TC-GTCTGTCCGTTCGTAAACGTT-AGATTGTGTGCAC-CTA---GCAC--ATCA--TTATT-TTTTATTAGATCATCACAAAACTT-TGAC--TAATTA
gi|24 : tctaTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGTGATCGCCTGGTGTTCANNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN----NN-------N--NNNN-----N---------NN---NNNNNN-NN-------------T-AACTT---TTAGC-T---TCT---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--
gi|25 : TT---TCAAC-TATTTTT---AAC---TA--CTTAACTTTATT--GAA-CTACTGAACCAATTTTG---GCAAAATTTTCAC---AATGTTCCTTAAGTG--G--C--CC--
gi|26 : ccttT-T----TTTAAGCTCATCTG------GCCCAAG-C--ACACA-GATG--------------CAT-TTTTGTGAACATTCAATTTCTG--TCTG-----A---------TA---TCTATT-GT-------------TAAACTCA--TTAAC-C---CTC---AAC---AA--Cacattattatatttg
gi|28 : TAAGCACCTGAGTATTT----ATAT--CCTGA-AGTATTAGTATTGCCTATTGATGTTATTGGATGTTTACGGTAGCTGTTACCATATAATTTGAGACC-T
gi|29 : ----TTTAAACTAACCTG-----TGCCAGAGAC--CCA-A-AATG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------A--TGTG-----G---------
gi|3 : accatgtctgtctgtcattgttgtttttttaagttgtttgtaTAATGTCGAAGTTAATG----------CGTTAAA-AAT-------TTAACTTAAT-GTGAGTACTTTAG---CACCTGCAGTTTTCATTAGATCCTTATTAAACTTGCACTGTATCTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATCTGGTAATTA-TAATATCAGAGTAATGGC-------TCATTG----------------A-CCTTGGGT--GCATTC--TTGC-A--CCTGTATT-CTTCATTGGATT--TTCAC---CAAACT-TT-TATAGTAA--CTATATAACT---ATGTCTTCAACAAGTTTTTAGTTTCCAGCCAAGCTTTATA--A--TTTA-AACTGAAGTTGTGGCATTTGAATCGT-GAAAAAAAATCTG-ATTTAATTGAAATTAGTAT--G
gi|3 : aatctgatagaAAATTAAGTACCA--GTAATGTCTG-AGTTATGGGCCTTGATTTATTACAAG------T--CACTAATTGttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|30 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaatttaacttaatgtgagtactttagcacctgcagttttcattagatccttattaaacttgcactgtatctataaaaccacaatatcttagacaagttcttgaactggccaaatctggtaattataatatcagagtaatggctcattgaccttgggtgcattcttgcacctgtattcttcattggattttcaccaaacttttatagtaactatataactatgtcttcaacaagtttttagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaT-TCTGATTG-C---CC--TGT--------ATCTGTT-GTCCATCTGTCCTCC-ATCTGACTGTA----AACTTT-ATGTTGTGTTCACTCTA---GCACCGA-CA--T-ATT-TCTCA
gi|32 : ttGCTTCACAAA---CTAT--ATACCATTAAGAAGCATTT-TT-T----TTTTCGTTCTCCTG-----AACCCAAGAC--TC-----GTA--------------TGC-TTTTGTGA----TCT------G--CCT------G---------TG---TCCAg
gi|33 : --TT--CTAGCTCATATGA-G------C--A--AAGT-TAA-A--AGCAAG---C-AT-TCTAATTA-C---CTGTCATCC-CTT-TGTCTGTC-
gi|34 : TGTTACT--T--AT-----GATCACCTGA-AA-----C--A--AAGGGTCA-A--GCTGTG---CTTT-TCTGATTG-CTCACTGTTG-----GT-CTTCTGTtgtatgttttgtattgtc
gi|35 : a-T----TTTTAGCTTGACTG-----AATTGAAGGT--TC-CA-GGAG--------------AGC-TTTTGTGA----CC-------C--TTCT-----G---------TG---GC---T-GT-------------T-GACTT---TTAGCAT---TAT---AGC---Atctcctcttct
gi|36 : taAATAAAATTT--TATTTT--TACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGAT--TTACTCAAC-ATGAAA
gi|37 : CATCTG-----AGTCGAATGC--TTACA-GCAG--------------AACATTTTGTGA----TC----------TCTGT----G---------TG---TCCATCTGT-------------G-G-------TCAAC-T---TCC---AAT---AA--CTT--TTTC
gi|38 : cTG-----AGACAAAGGC--ACACA-GGTG--------------ACC-TTTTGTGA----TT-------GCTCTTC-----GTCCATAATCTG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---T
gi|39 : T--T--TT--TTAGCTCACGTAA-G------C--A--AAGC-TCA-A--AGTAGG---CTGT-TCTGATCC-T---TTGTggttcaaaaaa
gi|39 : T-T----TTTTAGCTCACGTA-----AGC--AAAGC--TCA-A-AGTA--------------GGC-TGTTCTGA----TC----------CTTT-----G---------TGAAATTCATC--T-------------T-Ggaaattcatcttgctgtatgtccact
gi|4 : GTTATTGGCTGTTTATACCAG----TATTCTAT--TTTCTTAA-----TATATTT-TATTATT--T--TA--CTAGCTTACCTGA-G------C--A--GAAA-TCA-A--GTTGAG---CGAT-TCTGATCA-C---C---------CTG-AGTCTGTC-GTCCAT----CCAT---------TGTA----GACTTT-CTGTCGGGTGCACTCTG---GCAT--A-TGAGT-ATT-TT--ATTGGATCCTCACCAAACTTAT-GTAGTAGTTAT--ATA----ACC--ACAATATCTCTGA-CAAGTGATTGAACCGGCCTAA-TCAGAT-AATTAAAGTTAA-AGTTATGGCCCCTTGAA--ATTAAAAAAT-TGGACTTT-ATGACATTGTCTGCAC-ACTGGCATC-TGCATTTTTCATATGC-------TTCTCACCAAACTTACACA-GTAGTTATATAACCA---TAACAATT---AC---TTCTTGAACCAACCAAATCAGGAAATTAATGTCTGGCTAAAGGTCCTTGAATCATTGAAGATTGCA-TTATTTAACGTCA-TGT-GCACTTGCAGTT-TTCATTTGATC--TTActgtatgtccact
gi|40 : tcA-A--AGTGAG---CTAT-TCTGTTCGCC---CTG-TGT-C-CAT-TGTTTGTC--TC--C-TGCCC--C--TCTGTCTGTA----AACCTT-
gi|41 : tgggggataaACTG-TA-T----TTTTAGCTCATTTT-----AGCCAAATAC--TCTTA-GATG--------------AGT-TTTTCTGA----TC-------A--CCAT-----G---------TG---ACCATT-GT-------------tg
gi|42 : aagaTATCATT--TCATTA-TTAGTTCAACTGA-G------C--A--AAGG-TCA-A--GGTGAG---GTAT-TCTGTTCA-G---CTGTTAT-G-CTTCCATCTGctg
gi|43 : TATAACATAAA----CACTTATG-TGAAGTTTTAGCTCACATG-----AGCCAAAGGT--TCA-A-GATA--------------AGC-
gi|44 : tcatttatattt--TC--TTAACTTACCTGA-A------C--A--AAGC-TCA-A--CGTTAG---C-ATGTCTGGTCG-C---CCGTTGC-C-CGT-TGCCCGTT-GTCT
gi|46 : ------C--A--AATG-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTG------T-TGCCTGCC-GTCTGC-TGTCCGT
gi|47 : GTTGTTTACTTGAGATGTTACTGAATAAACTGTTACC-TCCTGCGCTGGTGTCACT--T--
gi|49 : GATGTTACTGAATAATTTGCTACC-TCCTGTATTCGTGTCACA--T--GT--TTAGATCA
gi|5 : TCAAAACCATGACCCTGGGGGCA-----GAAT-----TGT---GCG-CACTCTAGCACTCGTATTT-TTCGTTTGTTTCATCAAACTTACACAGTAGTTATAAAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCATGAACAGGCCAAATTGGATTATTAATGTCAGAGTTG-TGACCCTTGAAACATTGAA-AATGCACTGTTTGATTG--T-GTGTGCACTCTAG---CACCCCTATTTTTCATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTAGTTATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGAACTGACCAAATT-GG--ATTATTAATGACAGGGTTGTGGCCCTTGAAACATTGAAAATTGC-------CG-TCTTTGGC--ACAGTT--TAAC-AATATGTTGTT-TTT--TTTAATac
gi|50 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgtT--TTAGTTCATCTGAAG------C--ATAAAG--TCA-A--GGTGAA---CTAT-TCTGATTG-T---CTTTTGT-C-
gi|52 : CT--T--TT--TGAGCTAATCTGA-G------C--A--GAGT-TCA-A--CGTGAG---CT-T-TCTGATTG-CT--CTGt
gi|54 : AGC-TCA-T--GGTGAA---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-TGT-CGT
gi|6 : AATACAACAGAATTCTTCACTATGATACAATGT-TCCATATCACCTACTGGCGTT--TTCTGTTT-TTCATACCA-TGCCTGTT--CATTA-ATATT------TA---TGATATCATGCTGTAT--GTA----T--T--TA--TTAGCTCACCTGA-G------CCAA--AGGC-TCACA--GGTGAG---CTTT-TGTGATTG-C---CTGGTGT-C-CGT-CGTCTGTC---C------TCCGTC-ATCT-TTTGTT----AACTTT-atc
gi|6 : tatataaatgtttattataatcctgT-T----TATTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TT-------G--CCTG-----G---------TG---TCCGTC-GTC------------T-GTCCTCCGTCATC-T---TTTGTTAACTTTAA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ATATAA-TTTCACAGAAATATTCCTTGGGTG--ACCC--TC--TACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTTGTC-AAAAA-CATGGCAGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT--TAT-------------GTCAAAaacttctcctctgaaaccactgggccaattttgatataatttcacagaaatattccttgggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttgatttgtcaaaaacatggcagccagggagtggggttagttttatgtcaaatt
gi|7 : tatataaatgtttattataatcctgaatacaacagaattcttcactatgatacaatgttccatatcacctactggcgttttctgtttttcataccatgcctgttcattaatatttatgatatcatgctgtatgtaA-A--AGTGAG---CCAT-TCTGATCG----------------AT-CGTCT-------TAT--GTCTGTC-GATTGTCTTTT----ACCGCT-TCATTGTA---AACCTAATTGCGT--C-CA--A-ATTATTTTATTGGATCTATACCAAATTT-T-TCAGTATTTAC--ATG----ACC--Att
gi|7 : gggcgatagaga-AATTATAGCCATGGTATAAACAAAAA------TG-CTTTATTTTGAATT-GTGTAAGCCAACTCTATCACCCTCTATTTTCAgtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacaattatagccatggtataaacaaaaatgctttattttgaattgtgtaagccaactctatcaccctctattttcat
gi|8 : gggcgatagagaaaagtgagccattctgatcgatcgtcttatgtctgtcgattgtcttttaccgcttcattgtaaacctaattgcgtccaaattattttattggatctataccaaatttttcagtatttacatgaccagtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacT-TCTGACTC--TTGTGTGTGCTCTAG----ACCC-------TGAATTGGTCTTGACCAAACTTGCATA-TATTT-------CAT------TC----AAGACCTAAAACTGCCCAAATT-GG--GTAACTAACGTCATAGCAATGG--------------AAAATTGT--AC-T--A-TATTAT-----CA-----TAATTA--CCGTTATT-TTTCAGTTGATT--TTCACCAACAAAC--CT-TACAGAAA--TTATAGAACCGCAGTA---TGGACAAGTTTTT--t
gi|9 : tcttgAATGCCATTAT---G-A-TATCCTACCACTTACATTTATTTATTTGA-------AACTTATACAGTGATTATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAAACTGACCGAATTGTACTATTAATGTCCAAGTGT-TTGC--------CATTTAA--------T-CTTGTCTC--T-CTGTGCTCTCCAGCTTCAGCAGCATTTATGGT---ATCTTTATTTGACTT-TAAAGCATGTATATAATCATAAAATATTGGACAACTTgcaatttatctacatttgcttagtact
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CACCTTATTATTCAAACGGTCATGTGAGGTTTTACTATCACATTGGCCGCTGGCAGCTTAATCATTGTCATGGTCTGTTATCTTTTACATTTTAATATCTTTCTCCGAAGCCACTGTGCTAAATTAAACTAATTTTTACAGGAATATTCCTT
Unaligned ( gi|14 ): TGAATTAATAAAAAAAGGGCTTACTATGTAGCGTATATTCAGTGATTGAATTTGTTTTACCCATGATGCTTTAGTCAGCTACATTTCTCAAGGCTGATTAATTGTACTTCATGTGAGTTAGTCCAGTGTATGGTCATTTCCTGCTC
Unaligned ( gi|21 ): TAATGGTGTTTTGCATGTAAACCATTGTTTATACATGTTTTTCTGTTTTATTAACTTGCCTAATCTTTAGGTTTGAGTTCAGTAATTTGGATCACCCTGTGTCTGTTGTCCATCCGTAAACT
Unaligned ( gi|27 ): ACGTGAATTAATATTGTAATTACCTGACATCATTATACAGATTTAGATGATTTTACATAGAGGTGCATTGTGCAAACAAATTATTATTACACAACT
Unaligned ( gi|31 ): TTTTAAATATCATTATCATTGGATCTTTTTTTATTATATATACATTTTGTATTGTATTTTTTAACTTCTTGATTTGTCACAATTTGTTTATT
Unaligned ( gi|45 ): CAAAGTTCCATATCACCTACTGATGTTTTCTGTTTCCATATCATGCTTGTCCATCAATACT
Unaligned ( gi|48 ): AACCAACAAATGAAAATAATAAATTTGAAAATAAATATCAACGAAAAATCAAATTT
Unaligned ( gi|51 ): TGAACATTTGAGTAAAACTGTAAAATCCAACAGGTTTAATTCCCTATCACAC
Unaligned ( gi|53 ): TCGGAACTCCCCGATTACACACTTTCACCGGATCGACTTATTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 2222 1 11 11 11 111111 111 111111 11111 11111 11111 111 3333333333 111 11 2222 11 1 1 111 1111 333 1 11 11 1111 111 3333333 1 111 33333333 1 111 1111 2222222 1 2222 11 333333333333 33333333333 111 1111 1 11 8888888888888888888888888888888888 111 111 11 111 111111111111111 11 111 222222 333333333 1 11 11 111 11 1 11 11 1 2222 11 2222 11111111111111 22222222222222222222222222222 2222222222222 111 111 11111 11 111 11 44444444444444444 2222 111 111 111 33333333 222 1 1
lowQualScore : 6 8888 0 1 0 22 0 5 33 44 1 33 6 0 0 1 1 22 0 44 333 1 5 666 0 55 33 66 3 111111 66 33 44 2 33 444 4 2 000 3 888888 33 66 33333 44444 1 00000 1 55 666 0 000 0 0000000000 5 44 3 1 222 0 1 33 1111 33 3 3 1 0 888 8888 444 66 999 7 0 0 66 11 99 3 8 0 1 0 2 4444 0 000 2222222 0 22 0 0 6 3 2 777 6666 22222222 0 44 22 1 1 1 000 5555 2222222 6 3 0 1111 0 7 1 1 0 0 1 55 11 000000000000 66666666666 222 8 4 7777 5 0 1 1 11 1 3 0 0 1 3 0 1 77 1 0 0 33 7 1111111111111111111111111111111111 000 000 0 6 99 1 6 00 99 6 111 888888888888888 0 22 5 11 444 0 333 444444 1 0 1 6 2 1 44 222222222 1 1 22 0 88 88 1 1 1 999 88 5 88 88 5 1 5555 55 0 3 1111 6 8 7777 66666 3 33 5555 55555555555555 2 6666 99999999999999999999999999999 555 3 1111111111111 3 111 4 4 3 666 666 66 66 0 66 1 000 1 5 1 11111 99 11 444 44 8 3 11 1 33333333333333333 3 1 1111 333 2 44 444 444 66666666 3 2 000 0 0
lowQualScore : . .... . . . .. . . .. .. . .. . . . . . .. . .. ... . . ... . .. .. .. . ...... .. .. .. . .. ... . . ... . ...... .. .. ..... ..... . ..... . .. ... . ... . .......... . .. . . ... . . .. .... .. . . . . ... .... ... .. ... . . . .. .. .. . . . . . . .... . ... ....... . .. . . . . . ... .... ........ . .. .. . . . ... .... ....... . . . .... . . . . . . . .. .. ............ ........... ... . . .... . . . . .. . . . . . . . . .. . . . .. . .................................. ... ... . . .. . . .. .. . ... ............... . .. . .. ... . ... ...... . . . . . . .. ......... . . .. . .. .. . . . ... .. . .. .. . . .... .. . . .... . . .... ..... . .. .... .............. . .... ............................. ... . ............. . ... . . . ... ... .. .. . .. . ... . . . ..... .. .. ... .. . . .. . ................. . . .... ... . .. ... ... ........ . . ... . .
lowQualScore : 7 3333 8 0 2 00 2 0 88 22 2 88 5 8 3 0 5 11 1 77 111 0 7 000 2 55 99 88 1 111111 88 99 88 4 22 111 4 2 666 9 555555 66 22 88888 77777 9 44444 0 44 000 1 000 1 9999999999 7 55 7 0 222 8 0 88 2222 88 3 3 0 7 333 0000 000 88 000 0 0 8 00 66 00 8 0 2 0 2 5 5555 2 555 5555555 2 88 2 0 5 2 5 555 8888 22222222 0 33 00 0 0 0 000 2222 0000000 5 2 0 5555 8 3 0 0 7 7 0 00 00 000000000000 66666666666 000 0 6 2222 0 6 0 0 88 4 2 6 8 0 2 8 0 88 4 2 0 88 0 0000000000000000000000000000000000 888 222 3 7 22 0 7 11 22 7 777 555555555555555 8 00 6 66 222 2 888 666666 0 8 4 7 5 0 33 000000000 0 4 00 0 33 00 0 0 0 000 55 5 00 55 5 0 7777 99 2 2 2222 7 0 1111 77777 5 77 9999 77777777777777 7 1111 44444444444444444444444444444 444 3 7777777777777 6 000 7 0 6 444 444 11 11 4 99 7 000 0 7 6 88888 22 00 000 00 0 2 00 4 66666666666666666 2 2 2222 888 5 55 888 888 22222222 2 5 222 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATATC--CTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTG-GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TT-CTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCTTG-ANC-G--TTGAAAATTGCA--C-TTCG-CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCACCAA---AC--TT-TACAGTAA--TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA--A--TTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAA------T-GCNTTATTTGGNNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
Reference ( family-643 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATATC--CTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTG-GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TT-CTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCTTG-ANC-G--TTGAAAATTGCA--C-TTCG-CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCACCAA---AC--TT-TACAGTAA--TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA--A--TTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAA------T-GCNTTATTTGGNNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
gi|1 : AGATATGAAAACA--ACATA----TTAAGCACAAGTGTATGTGTCCATATT--CTAC-TGTATT--TATTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACTTTAGATGTTGCTGTATAATTTGTTACC-TCCTGCATCGATGTCACT--T--TT--TTAGTTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTAAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-T-CTT-CGTCTGTT-GTCTAT-TGTCCATT-GTCTGTCTGTT----AACTTT-TTGTTGTACGCACTCTA---GCAC--A-TG--T-ATT-TTTCATTGGATCTTCACTAAACTT-T-ATAGTAGTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GAACATGTTCTTGAACTGGCC-AAATC-GATCA-TTAATGTTAAGAGTTGTGG-CCTTTGAAACAT-AAAAAA--TGCATTAT-TTGACCTTGTGTGCACTGTA-GCACC-CGCATTTTTCATTTGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAATTTCTTGGACAAGTT-CTTGAACTGGTCAAATCGGATTATTAATGTCAGAGTTATTGCCCTTGAAACATTAAAAAATACC-TTGT---GTG-CACTCTAGCACCCACATTT-TTCATTTGATA--TTAAAC--AAACAGTAGTTATATAAACATAATATCTTGAACAAGTTCTTGAACTGGCTAAATCGGAATATTGATGTCACAGTTT-TGGTCCTTAAAACTTTAAACAACGCACTATTTGACTG--T-GTGTGCACTATAG---TTCCCGCATTTTTTATTTGATTCTCACCAGACTTACACAGTAGTAATATAAGCATAATATCTCGAACAAATTCTTGGACTGGCTAAATC-AG--AATATTGATGTCAGATTAATGGCCCTTG-AGTTG--TTAAAAACTACAA-CATTCAACCTTGTCT--ACGCTC--TAGC-A--GCAGTATT-TTTCATTTGATC--CTCACCAA---AC--TTATACATTTG--TTATATAACCATAATATCTTGGATAAGTTCTT--TAACAGACCAAATCCGGTA--A--CTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATAATCAAAAA------TGGCATTATTTGACCTT-GTGT--GC--ATTCTAGTACTCGCAGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACAATTTTAATAC-AAAATTATGAATATACAATTATACAATATATACAAATTA--AAGATAATTACTCAACAATAAAACCCAGCTGGTTTCAAAAGGTCCTATG-ATGGTATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCATCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---TTAGC-TTC-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTCA---ATTTAA-CTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACA--C--TCC--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCATCAAAAAA-CATGCTTGCCAGGGGGCGGG--GCAAGTTT--AAT-----------TAATAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACAACTGGCTCGATTTAT-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT---TGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
gi|10 : aaataaactacaataaaaaac--TT--CTAGCTCATC----G------CT-A--AGGC-TCA-A--GTTGAG---CTTT-TGTAATTG-CT--CTGTGTT-A-CTT-AAT------GTCT-T-TGTCTGTCTGTCCATC-ATT----AATGTT-CTGTTGT-----TTTTA---GT-------------TT-TTTCATTGGATCT-----AAA-TT-A-ACAATACTTATAAATAATATACCTGATAATGCATT-AA-CAGATTCATGTATTGG---AA-CT-GGT---TTG--GTC---AGTT-TGA-CCCTTG--ACATT-TAAAA--TACATTAA-TTg
gi|11 : AGATATGAAAACACAACATA----TTGATCATGATTGTATATGTCCATATT--CTAC-AGTTAG--TACTGTTTGTTGGTGCTATT-ATTGACTACTTGATATGTAACTAAATGAGTTGATACC-TCATACATTAGTGTCACTCAT--TTCATTA--TCAAGTAA-GTCCTCTC--C--AAAC-TCA-ATGGATGCGTTTTTATATCTGGTCG-C---GAGATGT-CTTTT-CGT
gi|12 : gAATGACAAGAGTTATTG-CCCTTAAATGATTAAAAAAACTGCTTTGTGTTAACATGATAAGAACTT-----------CATTTTTCATTCGA-------TCTAGACTAAACCTGCATATGTA--TATATAAACAGAGTAAAGGAT--GTC---TT-CTTGAagctg
gi|15 : TTGTGTCAACACTAAGTATC-A--CCTTTAGT-TTGCATTTTATT--TTGAACAA---AC--TTGTTTAG-AAGCTTA-ATGGTCA-AA---CTGGGGCAAACATTT---AACCAGCCAAAGCGAGCA--G---TGATGACAG-AGTTATGA--CTTGAATAATTGAtgaaggcagaatgaacaaagttgttgtacttg
gi|16 : tttgCAGAGTAACAGCCTTTG-AT--GAATTGAAAAATGCAGAT-TTTG-CCTTATAA--ACACTG--TAAC-A--CCTTCATTCTTTTATC--ATCCATTCAACAA---ATTATT-TGC--CAA--TTAg
gi|17 : atgga----TTTTAGTTCACCGG-----AACTGGGGAT--TCTCA-GGTG--------------AGT-TTTCGTGA----CT-------G--CCAT-----G---------TG---TACATC-AT-------------T-AGCTC---TT-TC-TTT-A---AAC---AAGTCGT--CTGTTCTTGGAAATCACTTGTTTACTTTTGCTCAAATG---TTTACAGAAgcagattataattttggtggtaatttctttga
gi|18 : taTTCATT-AATC--TTGA--AA---AT--CT-TAC--TTA--TTATGTAACCACGAGATCATGCACAATTTCTT--TAATTGATTTTCTGAGGTA--ATTTTTCTGTCTA-GATTATGTCCCTTTAATTGTCAAATA------T--CGTAGTTTGGTCTT-GTgc
gi|19 : TTGAAA--TTAAAAAT--AACA--AT-TTTATTTTGTGTTCA-TATGTGCACCACACATTTTCCTTTCGAGGTATTGTCCTTA---AAGTTACAGA-ACAATCACA----CA---CGATGTTT--GACAA-TTTCTTGAACTTGTCA
gi|2 : ggtgtTT-TTAT----GTTTAGCTCAGCTGTTTTTAGCCGAAGGC--TCACA-GGTA--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCTGTC-GTCTGTCGTCAGTCGT-AACTT---AAAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--TAAACCACTTGGCCAATTTTG---ATATAA-GTTCACAGTAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCAT-AAAAAA-CATGGCCCCCAGGGGGCAGG--GCAAGTTT--AAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-TAAA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCTTAATGAT-TCGTCAAAAAAACATGG
gi|2 : gTT--CTTGTCA--GAAACTACTGGCTCGATTTTA---AAATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTG--A--CCCTCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGGCGGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT---AC-----------TA-TATAAGCTATAGTAAAAA-----CTTGTCAGAAACCATCGGATCAATTT-T-AA-AACAATTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTGACCCTTTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCGT-T--GTGAT-TTGTT-AAAAAACATGcggccagggagtggggttagtttactatataagctatagtaaaaacttgtcagaaaccatcggatcaattttaaaacaatttcacagcaatgttccttgggtgaccctttaccaagtttgttcaagccgttgtgatttgttaaaaaacatgaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|2 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatg-T---AAA---AA--CTT--GTCA-----GAAACCATCGGATCAATTTTA---AAACAA-TTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTG--A--C--CCTTTACCAAGTTTGTTCAAGCCGTTGT---GATTTGTTAAAAAA-CATGACCACCA--CAGCGAGTTGCTAGTTTACTATATAGGCAGCTATAGTAAAATCT----TCAAAAGCCTTCTTGTCA-AATCT-CTGACCTGATTT-C-AATG-TTATTTCACTGACATTTACCATGGGTGCACCTCTACCAAGTTTGAACTCTTCTTCA---CATCT--GTTACATCTTC-AAAAaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|20 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatgttcttgtcagaaactactggctcgattttaaaataatttcacagaaatgttcctttggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttaatgattcgtcaaaaaaacatggcggccagggagtggggttagtttactatataagctatag--TT--TTAGCTCACCAGA-A------C--A--AAGC-TAA-A--GTTGAG---CTAT-TTTTACGG-CA--CTG-TG-------------GTC-ATCTAT-T-----------CATCTGTA----AACGTTGATGCTGTGTGCTCTCTG---ACAC--C-CT--C-A-T-TTTCATTGCATCATCATTCAACTcaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|22 : cAAGGT---ATGTGTAGT-TTGA----TTCTG-TTAT----TTTTAGCTCACCTG-----TGCCAAAGGC--TAAT--GGTT--------------AGC-ATTTCTGA----TC-------AT-CCTGTCACTGT--------TA---TCCA----T-------------T-GACTT---TTA-C-TTTGT---AAC---
gi|23 : aTGTCCGTCAAC-CGTCC-TC-GTCTGTCCGTTCGTAAACGTT-AGATTGTGTGCAC-CTA---GCAC--ATCA--TTATT-TTTTATTAGATCATCACAAAACTT-TGAC--TAATTA
gi|24 : tctaTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGTGATCGCCTGGTGTTCANNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN----NN-------N--NNNN-----N---------NN---NNNNNN-NN-------------T-AACTT---TTAGC-TTC-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--
gi|25 : -TTT-T---AAC---TA--CTTAACTTTATT--GAA-CTACTGAACCAATTTTG---GCAAAATTTTCAC---AATGTTCCTTAAGTG--G--C--CC
gi|26 : cctttttcaactatT-T----TTTAAGCTCATCTG------GCCCAAG-C--ACACA-GATG--------------CAT-TTTTGTGAACATTCAATTTCTG--TCTG-----A---------TA---TCTATT-GT-------------TAAACTCA--TTAAC-CCT-C---AAC---AA--Cacattattatatttg
gi|28 : TAAGCACCTGAGTATTT----ATATC--CTGA-AGTATTAGTATTGCCTATTGATGTTATTGGATGTTTACGGTAGCTGTTACCATATAATTTGAGACC-T
gi|29 : ----TTTAAACTAACCTG-----TGCCAGAGAC--CCA-A-AATG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------A--TGTG-----G---------
gi|3 : accatgtctgtctgtcattgttgtttttttaagttgtttgtaTAATGTCGAAGTTAATG----------CGTTAAA-AAT-------TTAACTTAAT-GTGAGTACTTTAG---CACCTGCAGTTTTCATTAGATCCTTATTAAACTTGCACTGTATCTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATCTGGTAATTA-TAATATCAGAGTAATGGC-------TC-A--TTGA-----------------CCTTGGGT--GCATTC--TTGC-A--CCTGTATT-CTTCATTGGATT--TTCACCAA---ACT-TT-TATAGTAA--CTATATAACT---ATGTCTTCAACAAGTTTTTAGTTTCCAGCCAAGCTTTATA--A--TTTA-AACTGAAGTTGTGGCATTTGAATCGT-GAAAAAAAATCT-GATTTAATTGAAATTAGTAT--G
gi|3 : aatctgatagaAAATTAAGTACCA--GTAATGTCTG-AGTTATGGGCCTTGATTTATTACAAG------T--CACTAATTGttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|30 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaatttaacttaatgtgagtactttagcacctgcagttttcattagatccttattaaacttgcactgtatctataaaaccacaatatcttagacaagttcttgaactggccaaatctggtaattataatatcagagtaatggctcattgaccttgggtgcattcttgcacctgtattcttcattggattttcaccaaacttttatagtaactatataactatgtcttcaacaagtttttagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaT-TCTGATTG-C---CC--TGT--------ATCTGTT-GTCCATCTGTCCTCC-ATCTGACTGTA----AACTTT-ATGTTGTGTTCACTCTA---GCACCGA-CA--T-ATT-TCTCA
gi|32 : ttGCTTCACAAA---CTAT--ATACCATTAAGAAGCATTT-TT-T----TTTTCGTTCTCCTG-----AACCCAAGAC--TC-----GTA--------------TGC-TTTTGTGA----TCT------G--CCT------G---------TG---TCCAg
gi|33 : --TT--CTAGCTCATATGA-G------C--A--AAGT-TAA-A--AGCAAG---C-AT-TCTAATTA-C---CTGTCATCC-CTT-TGTCTGTC-
gi|34 : TGTTACT--T--AT-----GATCACCTGA-AA-----C--A--AAGGGTCA-A--GCTGTG---CTTT-TCTGATTG-CTCACTGTTG-----GT-CTTCTGTtgtatgttttgtattgtc
gi|35 : a-T----TTTTAGCTTGACTG-----AATTGAAGGT--TC-CA-GGAG--------------AGC-TTTTGTGA----CC-------C--TTCT-----G---------TG---GC---T-GT-------------T-GACTT---TTAGCATTA-T---AGC---Atctcctcttct
gi|36 : taAATAAAATTT--TATTTT--TACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGAT--TTACTCAAC-ATGAAA
gi|37 : CATCTG-----AGTCGAATGC--TTACA-GCAG--------------AACATTTTGTGA----TC----------TCTGT----G---------TG---TCCATCTGT-------------G-G-------TCAAC-TTC-C---AAT---AA--CTT--TTTC
gi|38 : cTG-----AGACAAAGGC--ACACA-GGTG--------------ACC-TTTTGTGA----TT-------GCTCTTC-----GTCCATAATCTG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---T
gi|39 : T--T--TT--TTAGCTCACGTAA-G------C--A--AAGC-TCA-A--AGTAGG---CTGT-TCTGATCC-T---TTGTggttcaaaaaa
gi|39 : T-T----TTTTAGCTCACGTA-----AGC--AAAGC--TCA-A-AGTA--------------GGC-TGTTCTGA----TC----------CTTT-----G---------TGAAATTCATC--T-------------T-Ggaaattcatcttgctgtatgtccact
gi|4 : GTTATTGGCTGTTTATACCAG----TATTCTAT--TTTCTTAA-----TATATTT-TATTATT--T--TA--CTAGCTTACCTGA-G------C--A--GAAA-TCA-A--GTTGAG---CGAT-TCTGATCA-C---C---------CTG-AGTCTGTC-GTCCAT----CCAT---------TGTA----GACTTT-CTGTCGGGTGCACTCTG---GCAT--A-TGAGT-ATT-TT--ATTGGATCCTCACCAAACTTAT-GTAGTAGTTAT--ATA----ACC--ACAATATCTCTGA-CAAGTGATTGAACCGGCCTAA-TCAGAT-AATTAAAGTTAA-AGTTATGGCCCCTTGAA--ATTAAAAAAT-TGGACTTT-ATGACATTGTCTGCACACTG-GCATC-TGCATTTTTCATATGC-------TTCTCACCAAACTTACACA-GTAGTTATATAACCA---TAACAATT---AC---TT-CTTGAACCAACCAAATCAGGAAATTAATGTCTGGCTAAAGGTCCTTGAATCATTGAAGATTGCA-TTATTTAACGTCA-TGT-GCACTTGCAGTT-TTCATTTGATC--TTActgtatgtccact
gi|40 : tcA-A--AGTGAG---CTAT-TCTGTTCGCC---CTG-TGT-C-CAT-TGTTTGTC--TC--C-TGCCC--C--TCTGTCTGTA----AACCTT-
gi|41 : tgggggataaACTG-TA-T----TTTTAGCTCATTTT-----AGCCAAATAC--TCTTA-GATG--------------AGT-TTTTCTGA----TC-------A--CCAT-----G---------TG---ACCATT-GT-------------tg
gi|42 : aagaTATCATT--TCATTA-TTAGTTCAACTGA-G------C--A--AAGG-TCA-A--GGTGAG---GTAT-TCTGTTCA-G---CTGTTAT-G-CTTCCATCTGctg
gi|43 : TATAACATAAA----CACTTATG-TGAAGTTTTAGCTCACATG-----AGCCAAAGGT--TCA-A-GATA--------------AGC-
gi|44 : tcatttatattt--TC--TTAACTTACCTGA-A------C--A--AAGC-TCA-A--CGTTAG---C-ATGTCTGGTCG-C---CCGTTGC-C-CGT-TGCCCGTT-GTCT
gi|46 : ------C--A--AATG-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTG------T-TGCCTGCC-GTCTGC-TGTCCGT
gi|47 : GTTGTTTACTTGAGATGTTACTGAATAAACTGTTACC-TCCTGCGCTGGTGTCACT--T--
gi|49 : GATGTTACTGAATAATTTGCTACC-TCCTGTATTCGTGTCACA--T--GT--TTAGATCA
gi|5 : TCAAAACCATGACCCTGGGGGCA-----GAAT-----TGT---GCG-CACTCTAGCACTCGTATTT-TTCGTTTGTTTCATCAAACTTACACAGTAGTTATAAAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCATGAACAGGCCAAATTGGATTATTAATGTCAGAGTTG-TGACCCTTGAAACATTGAA-AATGCACTGTTTGATTG--T-GTGTGCACTCTAG---CACCCCTATTTTTCATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTAGTTATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGAACTGACCAAATT-GG--ATTATTAATGACAGGGTTGTGGCCCTTGAAAC-A--TTGAAAATTGC-------CG-TCTTTGGC--ACAGTT--TAAC-AATATGTTGTT-TTT--TTTAATac
gi|50 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgtT--TTAGTTCATCTGAAG------C--ATAAAG--TCA-A--GGTGAA---CTAT-TCTGATTG-T---CTTTTGT-C-
gi|52 : CT--T--TT--TGAGCTAATCTGA-G------C--A--GAGT-TCA-A--CGTGAG---CT-T-TCTGATTG-CT--CTGt
gi|54 : AGC-TCA-T--GGTGAA---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-TGT-CGT
gi|6 : AATACAACAGAATTCTTCACTATGATACAATGT-TCCATATCACCTACTGGCGTT--TTCTGTTT-TTCATACCAT-GCCTGTT--CATTA-ATATT------TA---TGATATCATGCTGTAT--GTAT------T--TA--TTAGCTCACCTGA-G------CCAA--AGGC-TCACA--GGTGAG---CTTT-TGTGATTG-C---CTGGTGT-C-CGT-CGTCTGTC---C------TCCGTC-ATCT-TTTGTT----AACTTT-atc
gi|6 : tatataaatgtttattataatcctgT-T----TATTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TT-------G--CCTG-----G---------TG---TCCGTC-GTC------------T-GTCCTCCGTCATC-TTT-TGTTAACTTTAA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ATATAA-TTTCACAGAAATATTCCTTGGGTG--ACCC--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTTGTC-AAAAA-CATGGCAGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT--TAT-------------GTCAAAaacttctcctctgaaaccactgggccaattttgatataatttcacagaaatattccttgggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttgatttgtcaaaaacatggcagccagggagtggggttagttttatgtcaaatt
gi|7 : tatataaatgtttattataatcctgaatacaacagaattcttcactatgatacaatgttccatatcacctactggcgttttctgtttttcataccatgcctgttcattaatatttatgatatcatgctgtatgtaA-A--AGTGAG---CCAT-TCTGATCG----------------AT-CGTCT-------TAT--GTCTGTC-GATTGTCTTTT----ACCGCT-TCATTGTA---AACCTAATTGCGT--C-CA--A-ATTATTTTATTGGATCTATACCAAATTT-T-TCAGTATTTAC--ATG----ACC--Att
gi|7 : gggcgatagaga-AATTATAGCCATGGTATAAACAAAAA------T-GCTTTATTTTGAATT-GTGTAAGCCAACTCTATCACCCTCTATTTTCAgtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacaattatagccatggtataaacaaaaatgctttattttgaattgtgtaagccaactctatcaccctctattttcat
gi|8 : gggcgatagagaaaagtgagccattctgatcgatcgtcttatgtctgtcgattgtcttttaccgcttcattgtaaacctaattgcgtccaaattattttattggatctataccaaatttttcagtatttacatgaccagtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacT-TCTGACTC--TTGTGTGTGCTCTAG----ACCC-------TGAATTGGTCTTGACCAAACTTGCATA-TATTT-------CAT------TC----AAGACCTAAAACTGCCCAAATT-GG--GTAACTAACGTCATAGCAATGG-----------------AAAATTGTA--C-T--------ATAT---TATCA--TAATTA--CCGTTATT-TTTCAGTTGATT--TTCACCAACAAAC--CT-TACAGAAA--TTATAGAACCGCAGTAT---GGACAAGTTTTT--t
gi|9 : tcttgAATGCCATTAT---G-A-TATCCTACCACTTACATTTATTTATTTGA-------AACTTATACAGTGATTATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAAACTGACCGAATTGTACTATTAATGTCCAAGTGT-TTGCCAT-------TTAA---------T-CTTGTCTC--T-CTGTGCTCTCCAGCTTCAGCAGCATTTATGGT---ATCTTTATTTGACTT-TAAAGCATGTATATAATCATAAAATATTGGACAACTTgcaatttatctacatttgcttagtact
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CACCTTATTATTCAAACGGTCATGTGAGGTTTTACTATCACATTGGCCGCTGGCAGCTTAATCATTGTCATGGTCTGTTATCTTTTACATTTTAATATCTTTCTCCGAAGCCACTGTGCTAAATTAAACTAATTTTTACAGGAATATTCCTT
Unaligned ( gi|14 ): TGAATTAATAAAAAAAGGGCTTACTATGTAGCGTATATTCAGTGATTGAATTTGTTTTACCCATGATGCTTTAGTCAGCTACATTTCTCAAGGCTGATTAATTGTACTTCATGTGAGTTAGTCCAGTGTATGGTCATTTCCTGCTC
Unaligned ( gi|21 ): TAATGGTGTTTTGCATGTAAACCATTGTTTATACATGTTTTTCTGTTTTATTAACTTGCCTAATCTTTAGGTTTGAGTTCAGTAATTTGGATCACCCTGTGTCTGTTGTCCATCCGTAAACT
Unaligned ( gi|27 ): ACGTGAATTAATATTGTAATTACCTGACATCATTATACAGATTTAGATGATTTTACATAGAGGTGCATTGTGCAAACAAATTATTATTACACAACT
Unaligned ( gi|31 ): TTTTAAATATCATTATCATTGGATCTTTTTTTATTATATATACATTTTGTATTGTATTTTTTAACTTCTTGATTTGTCACAATTTGTTTATT
Unaligned ( gi|45 ): CAAAGTTCCATATCACCTACTGATGTTTTCTGTTTCCATATCATGCTTGTCCATCAATACT
Unaligned ( gi|48 ): AACCAACAAATGAAAATAATAAATTTGAAAATAAATATCAACGAAAAATCAAATTT
Unaligned ( gi|51 ): TGAACATTTGAGTAAAACTGTAAAATCCAACAGGTTTAATTCCCTATCACAC
Unaligned ( gi|53 ): TCGGAACTCCCCGATTACACACTTTCACCGGATCGACTTATTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 2222 1 11 11 11 111111 111 111111 11111 11111 11111 111 3333333333 111 11 2222 11 1 1 111 1111 333 1 11 11 1111 111 3333333 1 111 33333333 1 111 1111 2222222 1 2222 11 333333333333 33333333333 111 1111 1 11 8888888888888888888888888888888888 111 111 11 111 111111111111111 11 111 222222 333333333 1 11 11 111 11 1 11 11 1 2222 11 2222 11111111111111 22222222222222222222222222222 2222222222222 111 111 11111 11 111 11 44444444444444444 2222 111 111 111 33333333 222 1 1
lowQualScore : 6 8888 0 1 0 22 0 5 33 44 1 33 6 0 0 1 1 22 0 44 333 1 5 666 0 55 33 66 3 111111 66 33 44 2 33 444 4 2 000 3 888888 33 66 33333 44444 1 00000 1 55 666 0 000 0 0000000000 5 44 3 1 222 0 1 33 1111 33 3 3 1 0 888 8888 444 66 999 7 0 0 66 11 99 3 8 0 1 0 2 4444 0 000 2222222 0 22 0 0 6 3 2 777 6666 22222222 0 44 22 1 1 1 000 5555 2222222 6 3 0 1111 0 7 1 1 0 0 1 55 11 000000000000 66666666666 222 8 4 7777 5 0 1 1 11 1 3 0 0 1 3 0 1 77 1 0 0 33 7 1111111111111111111111111111111111 000 000 0 6 99 1 6 00 99 6 111 888888888888888 0 22 5 11 444 0 333 444444 1 0 1 6 2 1 44 222222222 1 1 22 0 88 88 1 1 1 999 88 5 88 88 5 1 5555 55 0 3 1111 6 8 7777 66666 3 33 5555 55555555555555 2 6666 99999999999999999999999999999 555 3 1111111111111 3 111 4 4 3 666 666 66 66 0 66 1 000 1 5 1 11111 99 11 444 44 8 3 11 1 33333333333333333 3 1 1111 333 2 44 444 444 66666666 3 2 000 0 0
lowQualScore : . .... . . . .. . . .. .. . .. . . . . . .. . .. ... . . ... . .. .. .. . ...... .. .. .. . .. ... . . ... . ...... .. .. ..... ..... . ..... . .. ... . ... . .......... . .. . . ... . . .. .... .. . . . . ... .... ... .. ... . . . .. .. .. . . . . . . .... . ... ....... . .. . . . . . ... .... ........ . .. .. . . . ... .... ....... . . . .... . . . . . . . .. .. ............ ........... ... . . .... . . . . .. . . . . . . . . .. . . . .. . .................................. ... ... . . .. . . .. .. . ... ............... . .. . .. ... . ... ...... . . . . . . .. ......... . . .. . .. .. . . . ... .. . .. .. . . .... .. . . .... . . .... ..... . .. .... .............. . .... ............................. ... . ............. . ... . . . ... ... .. .. . .. . ... . . . ..... .. .. ... .. . . .. . ................. . . .... ... . .. ... ... ........ . . ... . .
lowQualScore : 7 3333 8 0 2 00 2 0 88 22 2 88 5 8 3 0 5 11 1 77 111 0 7 000 2 55 99 88 1 111111 88 99 88 4 22 111 4 2 666 9 555555 66 22 88888 77777 9 44444 0 44 000 1 000 1 9999999999 7 55 7 0 222 8 0 88 2222 88 3 3 0 7 333 0000 000 88 000 0 0 8 00 66 00 8 0 2 0 2 5 5555 2 555 5555555 2 88 2 0 5 2 5 555 8888 22222222 0 33 00 0 0 0 000 2222 0000000 5 2 0 5555 8 3 0 0 7 7 0 00 00 000000000000 66666666666 000 0 6 2222 0 6 0 0 88 4 2 6 8 0 2 8 0 88 4 2 0 88 0 0000000000000000000000000000000000 888 222 3 7 22 0 7 11 22 7 777 555555555555555 8 00 6 66 222 2 888 666666 0 8 4 7 5 0 33 000000000 0 4 00 0 33 00 0 0 0 000 55 5 00 55 5 0 7777 99 2 2 2222 7 0 1111 77777 5 77 9999 77777777777777 7 1111 44444444444444444444444444444 444 3 7777777777777 6 000 7 0 6 444 444 11 11 4 99 7 000 0 7 6 88888 22 00 000 00 0 2 00 4 66666666666666666 2 2 2222 888 5 55 888 888 22222222 2 5 222 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATATC--CTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTG-GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TT-CTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCTTG-ANC-G--TTGAAAATTGCA--C-TTCG-CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCACCAA---AC--TT-TACAGTAA--TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA--A--TTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAA------T-GCNTTATTTGGNNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
Reference ( family-643 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATATC--CTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTG-GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TT-CTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCTTG-ANC-G--TTGAAAATTGCA--C-TTCG-CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCACCAA---AC--TT-TACAGTAA--TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA--A--TTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAA------T-GCNTTATTTGGNNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
gi|1 : AGATATGAAAACA--ACATA----TTAAGCACAAGTGTATGTGTCCATATT--CTAC-TGTATT--TATTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACTTTAGATGTTGCTGTATAATTTGTTACC-TCCTGCATCGATGTCACT--T--TT--TTAGTTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTAAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-T-CTT-CGTCTGTT-GTCTAT-TGTCCATT-GTCTGTCTGTT----AACTTT-TTGTTGTACGCACTCTA---GCAC--A-TG--T-ATT-TTTCATTGGATCTTCACTAAACTT-T-ATAGTAGTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GAACATGTTCTTGAACTGGCC-AAATC-GATCA-TTAATGTTAAGAGTTGTGG-CCTTTGAAACAT-AAAAAA--TGCATTAT-TTGACCTTGTGTGCACTGTA-GCACC-CGCATTTTTCATTTGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAATTTCTTGGACAAGTT-CTTGAACTGGTCAAATCGGATTATTAATGTCAGAGTTATTGCCCTTGAAACATTAAAAAATACC-TTGT---GTG-CACTCTAGCACCCACATTT-TTCATTTGATA--TTAAAC--AAACAGTAGTTATATAAACATAATATCTTGAACAAGTTCTTGAACTGGCTAAATCGGAATATTGATGTCACAGTTT-TGGTCCTTAAAACTTTAAACAACGCACTATTTGACTG--T-GTGTGCACTATAG---TTCCCGCATTTTTTATTTGATTCTCACCAGACTTACACAGTAGTAATATAAGCATAATATCTCGAACAAATTCTTGGACTGGCTAAATC-AG--AATATTGATGTCAGATTAATGGCCCTTG-AGTTG--TTAAAAACTACAA-CATTCAACCTTGTCT--ACGCTC--TAGC-A--GCAGTATT-TTTCATTTGATC--CTCACCAA---AC--TTATACATTTG--TTATATAACCATAATATCTTGGATAAGTTCTT--TAACAGACCAAATCCGGTA--A--CTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATAATCAAAAA------TGGCATTATTTGACCTT-GTGT--GC--ATTCTAGTACTCGCAGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACAATTTTAATAC-AAAATTATGAATATACAATTATACAATATATACAAATTA--AAGATAATTACTCAACAATAAAACCCAGCTGGTTTCAAAAGGTCCTATG-ATGGTATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCATCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---TTAGC-TTC-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTCA---ATTTAA-CTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACA--C--TCC--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCATCAAAAAA-CATGCTTGCCAGGGGGCGGG--GCAAGTTT--AAT-----------TAATAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACAACTGGCTCGATTTAT-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT---TGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
gi|10 : aaataaactacaataaaaaac--TT--CTAGCTCATC----G------CT-A--AGGC-TCA-A--GTTGAG---CTTT-TGTAATTG-CT--CTGTGTT-A-CTT-AAT------GTCT-T-TGTCTGTCTGTCCATC-ATT----AATGTT-CTGTTGT-----TTTTA---GT-------------TT-TTTCATTGGATCT-----AAA-TT-A-ACAATACTTATAAATAATATACCTGATAATGCATT-AA-CAGATTCATGTATTGG---AA-CT-GGT---TTG--GTC---AGTT-TGA-CCCTTG--ACATT-TAAAA--TACATTAA-TTg
gi|11 : AGATATGAAAACACAACATA----TTGATCATGATTGTATATGTCCATATT--CTAC-AGTTAG--TACTGTTTGTTGGTGCTATT-ATTGACTACTTGATATGTAACTAAATGAGTTGATACC-TCATACATTAGTGTCACTCAT--TTCATTA--TCAAGTAA-GTCCTCTC--C--AAAC-TCA-ATGGATGCGTTTTTATATCTGGTCG-C---GAGATGT-CTTTT-CGT
gi|12 : gAATGACAAGAGTTATTG-CCCTTAAATGATTAAAAAAACTGCTTTGTGTTAACATGATAAGAACTT-----------CATTTTTCATTCGA-------TCTAGACTAAACCTGCATATGTA--TATATAAACAGAGTAAAGGAT--GTC---TT-CTTGAagctg
gi|15 : TTGTGTCAACACTAAGTATC-A--CCTTTAGT-TTGCATTTTATT--TTGAACAA---AC--TTGTTTAG-AAGCTTA-ATGGTCA-AA---CTGGGGCAAACATTT---AACCAGCCAAAGCGAGCA--G---TGATGACAG-AGTTATGA--CTTGAATAATTGAtgaaggcagaatgaacaaagttgttgtacttg
gi|16 : tttgCAGAGTAACAGCCTTTG-AT--GAATTGAAAAATGCAGAT-TTTG-CCTTATAA--ACACTG--TAAC-A--CCTTCATTCTTTTATC--ATCCATTCAACAA---ATTATT-TGC--CAA--TTAg
gi|17 : atgga----TTTTAGTTCACCGG-----AACTGGGGAT--TCTCA-GGTG--------------AGT-TTTCGTGA----CT-------G--CCAT-----G---------TG---TACATC-AT-------------T-AGCTC---TT-TC-TTT-A---AAC---AAGTCGT--CTGTTCTTGGAAATCACTTGTTTACTTTTGCTCAAATG---TTTACAGAAgcagattataattttggtggtaatttctttga
gi|18 : taTTCATT-AATC--TTGA--AA---AT--CT-TAC--TTA--TTATGTAACCACGAGATCATGCACAATTTCTT--TAATTGATTTTCTGAGGTA--ATTTTTCTGTCTA-GATTATGTCCCTTTAATTGTCAAATA------T--CGTAGTTTGGTCTT-GTgc
gi|19 : TTGAAA--TTAAAAAT--AACA--AT-TTTATTTTGTGTTCA-TATGTGCACCACACATTTTCCTTTCGAGGTATTGTCCTTA---AAGTTACAGA-ACAATCACA----CA---CGATGTTT--GACAA-TTTCTTGAACTTGTCA
gi|2 : ggtgtTT-TTAT----GTTTAGCTCAGCTGTTTTTAGCCGAAGGC--TCACA-GGTA--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCTGTC-GTCTGTCGTCAGTCGT-AACTT---AAAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--TAAACCACTTGGCCAATTTTG---ATATAA-GTTCACAGTAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCAT-AAAAAA-CATGGCCCCCAGGGGGCAGG--GCAAGTTT--AAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-TAAA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCTTAATGAT-TCGTCAAAAAAACATGG
gi|2 : gTT--CTTGTCA--GAAACTACTGGCTCGATTTTA---AAATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTG--A--CCCTCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGGCGGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT---AC-----------TA-TATAAGCTATAGTAAAAA-----CTTGTCAGAAACCATCGGATCAATTT-T-AA-AACAATTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTGACCCTTTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCGT-T--GTGAT-TTGTT-AAAAAACATGcggccagggagtggggttagtttactatataagctatagtaaaaacttgtcagaaaccatcggatcaattttaaaacaatttcacagcaatgttccttgggtgaccctttaccaagtttgttcaagccgttgtgatttgttaaaaaacatgaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|2 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatg-T---AAA---AA--CTT--GTCA-----GAAACCATCGGATCAATTTTA---AAACAA-TTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTG--A--C--CCTTTACCAAGTTTGTTCAAGCCGTTGT---GATTTGTTAAAAAA-CATGACCACCA--CAGCGAGTTGCTAGTTTACTATATAGGCAGCTATAGTAAAATCT----TCAAAAGCCTTCTTGTCA-AATCT-CTGACCTGATTT-C-AATG-TTATTTCACTGACATTTACCATGGGTGCACCTCTACCAAGTTTGAACTCTTCTTCA---CATCT--GTTACATCTTC-AAAAaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|20 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatgttcttgtcagaaactactggctcgattttaaaataatttcacagaaatgttcctttggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttaatgattcgtcaaaaaaacatggcggccagggagtggggttagtttactatataagctatag--TT--TTAGCTCACCAGA-A------C--A--AAGC-TAA-A--GTTGAG---CTAT-TTTTACGG-CA--CTG-TG-------------GTC-ATCTAT-T-----------CATCTGTA----AACGTTGATGCTGTGTGCTCTCTG---ACAC--C-CT--C-A-T-TTTCATTGCATCATCATTCAACTcaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|22 : cAAGGT---ATGTGTAGT-TTGA----TTCTG-TTAT----TTTTAGCTCACCTG-----TGCCAAAGGC--TAAT--GGTT--------------AGC-ATTTCTGA----TC-------AT-CCTGTCACTGT--------TA---TCCA----T-------------T-GACTT---TTA-C-TTTGT---AAC---
gi|23 : aTGTCCGTCAAC-CGTCC-TC-GTCTGTCCGTTCGTAAACGTT-AGATTGTGTGCAC-CTA---GCAC--ATCA--TTATT-TTTTATTAGATCATCACAAAACTT-TGAC--TAATTA
gi|24 : tctaTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGTGATCGCCTGGTGTTCANNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN----NN-------N--NNNN-----N---------NN---NNNNNN-NN-------------T-AACTT---TTAGC-TTC-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--
gi|25 : -TTT-T---AAC---TA--CTTAACTTTATT--GAA-CTACTGAACCAATTTTG---GCAAAATTTTCAC---AATGTTCCTTAAGTG--G--C--CC
gi|26 : cctttttcaactatT-T----TTTAAGCTCATCTG------GCCCAAG-C--ACACA-GATG--------------CAT-TTTTGTGAACATTCAATTTCTG--TCTG-----A---------TA---TCTATT-GT-------------TAAACTCA--TTAAC-CCT-C---AAC---AA--Cacattattatatttg
gi|28 : TAAGCACCTGAGTATTT----ATATC--CTGA-AGTATTAGTATTGCCTATTGATGTTATTGGATGTTTACGGTAGCTGTTACCATATAATTTGAGACC-T
gi|29 : ----TTTAAACTAACCTG-----TGCCAGAGAC--CCA-A-AATG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------A--TGTG-----G---------
gi|3 : accatgtctgtctgtcattgttgtttttttaagttgtttgtaTAATGTCGAAGTTAATG----------CGTTAAA-AAT-------TTAACTTAAT-GTGAGTACTTTAG---CACCTGCAGTTTTCATTAGATCCTTATTAAACTTGCACTGTATCTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATCTGGTAATTA-TAATATCAGAGTAATGGC-------TC-A--TTGA-----------------CCTTGGGT--GCATTC--TTGC-A--CCTGTATT-CTTCATTGGATT--TTCACCAA---ACT-TT-TATAGTAA--CTATATAACT---ATGTCTTCAACAAGTTTTTAGTTTCCAGCCAAGCTTTATA--A--TTTA-AACTGAAGTTGTGGCATTTGAATCGT-GAAAAAAAATCT-GATTTAATTGAAATTAGTAT--G
gi|3 : aatctgatagaAAATTAAGTACCA--GTAATGTCTG-AGTTATGGGCCTTGATTTATTACAAG------T--CACTAATTGttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|30 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaatttaacttaatgtgagtactttagcacctgcagttttcattagatccttattaaacttgcactgtatctataaaaccacaatatcttagacaagttcttgaactggccaaatctggtaattataatatcagagtaatggctcattgaccttgggtgcattcttgcacctgtattcttcattggattttcaccaaacttttatagtaactatataactatgtcttcaacaagtttttagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaT-TCTGATTG-C---CC--TGT--------ATCTGTT-GTCCATCTGTCCTCC-ATCTGACTGTA----AACTTT-ATGTTGTGTTCACTCTA---GCACCGA-CA--T-ATT-TCTCA
gi|32 : ttGCTTCACAAA---CTAT--ATACCATTAAGAAGCATTT-TT-T----TTTTCGTTCTCCTG-----AACCCAAGAC--TC-----GTA--------------TGC-TTTTGTGA----TCT------G--CCT------G---------TG---TCCAg
gi|33 : --TT--CTAGCTCATATGA-G------C--A--AAGT-TAA-A--AGCAAG---C-AT-TCTAATTA-C---CTGTCATCC-CTT-TGTCTGTC-
gi|34 : TGTTACT--T--AT-----GATCACCTGA-AA-----C--A--AAGGGTCA-A--GCTGTG---CTTT-TCTGATTG-CTCACTGTTG-----GT-CTTCTGTtgtatgttttgtattgtc
gi|35 : a-T----TTTTAGCTTGACTG-----AATTGAAGGT--TC-CA-GGAG--------------AGC-TTTTGTGA----CC-------C--TTCT-----G---------TG---GC---T-GT-------------T-GACTT---TTAGCATTA-T---AGC---Atctcctcttct
gi|36 : taAATAAAATTT--TATTTT--TACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGAT--TTACTCAAC-ATGAAA
gi|37 : CATCTG-----AGTCGAATGC--TTACA-GCAG--------------AACATTTTGTGA----TC----------TCTGT----G---------TG---TCCATCTGT-------------G-G-------TCAAC-TTC-C---AAT---AA--CTT--TTTC
gi|38 : cTG-----AGACAAAGGC--ACACA-GGTG--------------ACC-TTTTGTGA----TT-------GCTCTTC-----GTCCATAATCTG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---T
gi|39 : T--T--TT--TTAGCTCACGTAA-G------C--A--AAGC-TCA-A--AGTAGG---CTGT-TCTGATCC-T---TTGTggttcaaaaaa
gi|39 : T-T----TTTTAGCTCACGTA-----AGC--AAAGC--TCA-A-AGTA--------------GGC-TGTTCTGA----TC----------CTTT-----G---------TGAAATTCATC--T-------------T-Ggaaattcatcttgctgtatgtccact
gi|4 : GTTATTGGCTGTTTATACCAG----TATTCTAT--TTTCTTAA-----TATATTT-TATTATT--T--TA--CTAGCTTACCTGA-G------C--A--GAAA-TCA-A--GTTGAG---CGAT-TCTGATCA-C---C---------CTG-AGTCTGTC-GTCCAT----CCAT---------TGTA----GACTTT-CTGTCGGGTGCACTCTG---GCAT--A-TGAGT-ATT-TT--ATTGGATCCTCACCAAACTTAT-GTAGTAGTTAT--ATA----ACC--ACAATATCTCTGA-CAAGTGATTGAACCGGCCTAA-TCAGAT-AATTAAAGTTAA-AGTTATGGCCCCTTGAA--ATTAAAAAAT-TGGACTTT-ATGACATTGTCTGCACACTG-GCATC-TGCATTTTTCATATGC-------TTCTCACCAAACTTACACA-GTAGTTATATAACCA---TAACAATT---AC---TT-CTTGAACCAACCAAATCAGGAAATTAATGTCTGGCTAAAGGTCCTTGAATCATTGAAGATTGCA-TTATTTAACGTCA-TGT-GCACTTGCAGTT-TTCATTTGATC--TTActgtatgtccact
gi|40 : tcA-A--AGTGAG---CTAT-TCTGTTCGCC---CTG-TGT-C-CAT-TGTTTGTC--TC--C-TGCCC--C--TCTGTCTGTA----AACCTT-
gi|41 : tgggggataaACTG-TA-T----TTTTAGCTCATTTT-----AGCCAAATAC--TCTTA-GATG--------------AGT-TTTTCTGA----TC-------A--CCAT-----G---------TG---ACCATT-GT-------------tg
gi|42 : aagaTATCATT--TCATTA-TTAGTTCAACTGA-G------C--A--AAGG-TCA-A--GGTGAG---GTAT-TCTGTTCA-G---CTGTTAT-G-CTTCCATCTGctg
gi|43 : TATAACATAAA----CACTTATG-TGAAGTTTTAGCTCACATG-----AGCCAAAGGT--TCA-A-GATA--------------AGC-
gi|44 : tcatttatattt--TC--TTAACTTACCTGA-A------C--A--AAGC-TCA-A--CGTTAG---C-ATGTCTGGTCG-C---CCGTTGC-C-CGT-TGCCCGTT-GTCT
gi|46 : ------C--A--AATG-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTG------T-TGCCTGCC-GTCTGC-TGTCCGT
gi|47 : GTTGTTTACTTGAGATGTTACTGAATAAACTGTTACC-TCCTGCGCTGGTGTCACT--T--
gi|49 : GATGTTACTGAATAATTTGCTACC-TCCTGTATTCGTGTCACA--T--GT--TTAGATCA
gi|5 : TCAAAACCATGACCCTGGGGGCA-----GAAT-----TGT---GCG-CACTCTAGCACTCGTATTT-TTCGTTTGTTTCATCAAACTTACACAGTAGTTATAAAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCATGAACAGGCCAAATTGGATTATTAATGTCAGAGTTG-TGACCCTTGAAACATTGAA-AATGCACTGTTTGATTG--T-GTGTGCACTCTAG---CACCCCTATTTTTCATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTAGTTATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGAACTGACCAAATT-GG--ATTATTAATGACAGGGTTGTGGCCCTTGAAAC-A--TTGAAAATTGC-------CG-TCTTTGGC--ACAGTT--TAAC-AATATGTTGTT-TTT--TTTAATac
gi|50 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgtT--TTAGTTCATCTGAAG------C--ATAAAG--TCA-A--GGTGAA---CTAT-TCTGATTG-T---CTTTTGT-C-
gi|52 : CT--T--TT--TGAGCTAATCTGA-G------C--A--GAGT-TCA-A--CGTGAG---CT-T-TCTGATTG-CT--CTGt
gi|54 : AGC-TCA-T--GGTGAA---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-TGT-CGT
gi|6 : AATACAACAGAATTCTTCACTATGATACAATGT-TCCATATCACCTACTGGCGTT--TTCTGTTT-TTCATACCAT-GCCTGTT--CATTA-ATATT------TA---TGATATCATGCTGTAT--GTAT------T--TA--TTAGCTCACCTGA-G------CCAA--AGGC-TCACA--GGTGAG---CTTT-TGTGATTG-C---CTGGTGT-C-CGT-CGTCTGTC---C------TCCGTC-ATCT-TTTGTT----AACTTT-atc
gi|6 : tatataaatgtttattataatcctgT-T----TATTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TT-------G--CCTG-----G---------TG---TCCGTC-GTC------------T-GTCCTCCGTCATC-TTT-TGTTAACTTTAA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ATATAA-TTTCACAGAAATATTCCTTGGGTG--ACCC--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTTGTC-AAAAA-CATGGCAGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT--TAT-------------GTCAAAaacttctcctctgaaaccactgggccaattttgatataatttcacagaaatattccttgggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttgatttgtcaaaaacatggcagccagggagtggggttagttttatgtcaaatt
gi|7 : tatataaatgtttattataatcctgaatacaacagaattcttcactatgatacaatgttccatatcacctactggcgttttctgtttttcataccatgcctgttcattaatatttatgatatcatgctgtatgtaA-A--AGTGAG---CCAT-TCTGATCG----------------AT-CGTCT-------TAT--GTCTGTC-GATTGTCTTTT----ACCGCT-TCATTGTA---AACCTAATTGCGT--C-CA--A-ATTATTTTATTGGATCTATACCAAATTT-T-TCAGTATTTAC--ATG----ACC--Att
gi|7 : gggcgatagaga-AATTATAGCCATGGTATAAACAAAAA------T-GCTTTATTTTGAATT-GTGTAAGCCAACTCTATCACCCTCTATTTTCAgtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacaattatagccatggtataaacaaaaatgctttattttgaattgtgtaagccaactctatcaccctctattttcat
gi|8 : gggcgatagagaaaagtgagccattctgatcgatcgtcttatgtctgtcgattgtcttttaccgcttcattgtaaacctaattgcgtccaaattattttattggatctataccaaatttttcagtatttacatgaccagtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacT-TCTGACTC--TTGTGTGTGCTCTAG----ACCC-------TGAATTGGTCTTGACCAAACTTGCATA-TATTT-------CAT------TC----AAGACCTAAAACTGCCCAAATT-GG--GTAACTAACGTCATAGCAATGG-----------------AAAATTGTA--C-T--------ATAT---TATCA--TAATTA--CCGTTATT-TTTCAGTTGATT--TTCACCAACAAAC--CT-TACAGAAA--TTATAGAACCGCAGTAT---GGACAAGTTTTT--t
gi|9 : tcttgAATGCCATTAT---G-A-TATCCTACCACTTACATTTATTTATTTGA-------AACTTATACAGTGATTATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAAACTGACCGAATTGTACTATTAATGTCCAAGTGT-TTGCCAT-------TTAA---------T-CTTGTCTC--T-CTGTGCTCTCCAGCTTCAGCAGCATTTATGGT---ATCTTTATTTGACTT-TAAAGCATGTATATAATCATAAAATATTGGACAACTTgcaatttatctacatttgcttagtact
blockSeqs : C ATTC T TT G AC TG T AG G T G TA AA GAG A A TAG CA CA CA A TCCTCT CA TA GG C TG TTT A C TCA T TCTTT CC CG CATCT GTCTG A TCGTA G GA GTG ATT ATCATT A AT T C TG C AA ATAT TG T . G CCT TCA AA AT AAG A C AC TA AC T G A C ATGT ACA GGTATTG CT T A T A GAG AGGA GACAA T TT AA C A T TTG GCCA TTAACGT C A A TTCA T C A T GA AA ACCCTTGAAACA AAATGCACTG TAA T A CTTC G T C TA T G A C T TA G T TA T CTTTGATGAATTGAAAAATGCAGATTTTG CAA AAG T AT T C TT CA A CAA TTGTTTAGAAGC AC G TG AGT CGA ATTT G A A C A TG AAAATCTG G T TC A AA CA T T T T . A AC . . C GT GT A GAAG A A GAAG TTTTT G GA GCCT TTCANNNNNNNNNN A ACAT GCTCTTCGTCCATAATC AAA T CTGTCGTCAGTCG A CCG T A G GTT TTT GT AA TG T CTC A T A ACC CC TT AAT CA A C TT A ACTATATAGGCAGCTAT G A ATAG ATG G TA TA AA AACTCTTC A C TAA A A
blockSeqs : C . G GA . . A A . A G T GC AT AAT A . TGG . . A . A T . C . . . G . T A TCCCT A G TATT TCCA A T G C GTG . CGACAT . AT A C AT A . . . . . A . CT . AA AA A . TG TA T T . T C CTG TG . CC . G T C . TGTT GTC . CA A C G . GCA GCG T A . TC T T C C AG G GCCAT AAAT G . A C C T C TT C G T C T GA A . . C CCTTGAAACATTGAAAATTGCCG A G . . T . GG . A . TTTTATAGTAA GC T AT T GAG CCAG T T . C T CA TG T A AA . . C . A . . A . . G . TCA . . . ATCCTGTCACTGT . . C . A G . . . . . . . G . T . T A . . . TA . G . T AATT G G . GCC G CA T TG . A C G . .
blockSeqs : C TA . . A G . . A C GA CT AAA T . TCG . . . . . . . C . . . . . A T TACT C A AACC GTCA G A G A GTT . ATGAGT . CT C C A G . . . . . . . A TA . C . A . T . . . . . . . . CAAT AC . . GA . . . . CA T CG T C . G C G A G TT G G T T A TG G . . . AAAATTGTACT G C . . T . TA . C . TATTTGCCAA A T TT . TTT AT T A . G C TA T A A AA . . . . . . . A . ACA . . . AATTTCTGTCTGA . . . . . G . . . . . . . C . A . A A . . . A . C . T ACT G T . . . T C A . . . G . .
blockSeqs : T G GA GA AAT T . TT . . . . . . . C . . . . . T T TCCA T G TGCT GTCG G A T A GTG . CCTC . TA C T T T . T . . . C . T . . . G . T . . . . C C TCATTGA A T . . G . TG . C . CTTACAGAAA . . . TAA G A T . C T CA T T T . . . . A . ACA . . . GCCATG . . . . . A . . . . . . . A . A . C A . . . C . A . T TAT .
blockSeqs : A T G GA T C . G . . . . . . . T . . . . . . T TGCT C G TTT TCG G A T C A . CCAA . T . . . A . . G . A . . . CTTACTTA . . A G . . . . C . ACA . . . GCCTGG . . . . . G . . . . . . . A . C . A G .
blockSeqs : A . A A . . . . . . . . C . . . . . . T CCCG A G CAT AT G A C T . . . . . . . . A . ACA . . . NNNNNN . . . . . A . . . . . . . G . T . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . T TCTG T G TAT C . T T . . . C . TTA . . . ATGTGG . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . T TCCG T . CT . . T G . . . G . ACA . . . TGCCTG . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . T CT T . . . . . G . AT . . . CTTCTG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . T T C . . . A . AA . . . TCTGTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . G G C . . A . CA . . . ACCATG . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . A C . A . AA . . . GCCTGG .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . A . AA . . . CTTTG
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : ACAT****** T** TA CCATTGAAAATGCAC******************* CTTTTANNAA***** A***** T******** A**** ANT**************
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATATC--CTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTG-GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TT-CTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCTTG-ANC-G--TTGAAAATTGCA--C-TTCG-CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCACCAA---AC--TT-TACAGTAA--TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA--A--TTTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAA------T-GCNTTATTTGGNNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT--NAT-----------TAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATATC--CTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCACACAT------ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTTT--ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTG-GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TT-CTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCCCATTGAAAATGCAC-------------------CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCACCAA---ACCTTTTANNAA-----TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTAA-----TTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAAT--------CNTTATTTGGNNTT-GTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGA----C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTTANT--------------AGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CACCTTATTATTCAAACGGTCATGTGAGGTTTTACTATCACATTGGCCGCTGGCAGCTTAATCATTGTCATGGTCTGTTATCTTTTACATTTTAATATCTTTCTCCGAAGCCACTGTGCTAAATTAAACTAATTTTTACAGGAATATTCCTT
Unaligned ( gi|14 ): TGAATTAATAAAAAAAGGGCTTACTATGTAGCGTATATTCAGTGATTGAATTTGTTTTACCCATGATGCTTTAGTCAGCTACATTTCTCAAGGCTGATTAATTGTACTTCATGTGAGTTAGTCCAGTGTATGGTCATTTCCTGCTC
Unaligned ( gi|21 ): TAATGGTGTTTTGCATGTAAACCATTGTTTATACATGTTTTTCTGTTTTATTAACTTGCCTAATCTTTAGGTTTGAGTTCAGTAATTTGGATCACCCTGTGTCTGTTGTCCATCCGTAAACT
Unaligned ( gi|27 ): ACGTGAATTAATATTGTAATTACCTGACATCATTATACAGATTTAGATGATTTTACATAGAGGTGCATTGTGCAAACAAATTATTATTACACAACT
Unaligned ( gi|31 ): TTTTAAATATCATTATCATTGGATCTTTTTTTATTATATATACATTTTGTATTGTATTTTTTAACTTCTTGATTTGTCACAATTTGTTTATT
Unaligned ( gi|45 ): CAAAGTTCCATATCACCTACTGATGTTTTCTGTTTCCATATCATGCTTGTCCATCAATACT
Unaligned ( gi|48 ): AACCAACAAATGAAAATAATAAATTTGAAAATAAATATCAACGAAAAATCAAATTT
Unaligned ( gi|51 ): TGAACATTTGAGTAAAACTGTAAAATCCAACAGGTTTAATTCCCTATCACAC
Unaligned ( gi|53 ): TCGGAACTCCCCGATTACACACTTTCACCGGATCGACTTATTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 1 11 11 11 111111 111 111111 11111 11111 11111 111 2222222222 111 11 2222 11 1 1 111 1111 333 1 11 11 1111 111 3333333 1 111 33333333 1 111 1111 2222222 1 2222 11 333333333333 33333333333 111 1111 1 11 33333333333333333333333333333333333333333333 111111 111 11 111 1111 11 111 3333333 22 22 11 111 11 1 11 11 1 2222 11 2222 11111111111111 22222222222222222222222222222 2222222222222 111 111 11111 11 111 11 66666666666666666 2222 111 111 111 33333333 222 1 1
lowQualScore : 6 8888 0 1 0 22 0 5 33 44 1 33 6 0 0 1 1 22 0 44 333 1 5 666 55 33 66 3 111111 66 33 44 2 33 444 4 2 000 3 888888 33 66 33333 44444 1 00000 1 55 666 0 000 0 9999999999 5 44 3 1 222 0 1 33 1111 33 3 3 1 0 888 8888 444 66 999 7 0 0 66 11 99 3 8 0 1 0 2 4444 0 000 2222222 0 22 0 0 6 3 2 777 6666 22222222 0 44 22 1 1 1 000 5555 2222222 6 3 0 1111 0 7 1 1 0 0 1 55 11 000000000000 66666666666 222 8 4 7777 5 0 1 1 11 1 3 0 0 1 3 0 1 77 1 0 0 33 7 33333333333333333333333333333333333333333333 111111 000 0 6 99 1 6 00 99 6 111 0 8888 22 6 0 22 5 11 444 0 333 3333333 22 1 6 2 1 44 33 1 22 77 88 1 1 1 999 88 5 88 88 5 1 5555 55 0 3 1111 6 8 7777 66666 3 33 5555 55555555555555 2 6666 99999999999999999999999999999 555 3 1111111111111 3 111 4 4 3 666 666 66 66 0 66 1 000 1 5 1 11111 99 11 444 44 8 3 11 1 66666666666666666 6 1 1111 333 2 44 444 444 66666666 3 2 000 0 0
lowQualScore : . .... . . . .. . . .. .. . .. . . . . . .. . .. ... . . ... .. .. .. . ...... .. .. .. . .. ... . . ... . ...... .. .. ..... ..... . ..... . .. ... . ... . .......... . .. . . ... . . .. .... .. . . . . ... .... ... .. ... . . . .. .. .. . . . . . . .... . ... ....... . .. . . . . . ... .... ........ . .. .. . . . ... .... ....... . . . .... . . . . . . . .. .. ............ ........... ... . . .... . . . . .. . . . . . . . . .. . . . .. . ............................................ ...... ... . . .. . . .. .. . ... . .... .. . . .. . .. ... . ... ....... .. . . . . .. .. . .. .. .. . . . ... .. . .. .. . . .... .. . . .... . . .... ..... . .. .... .............. . .... ............................. ... . ............. . ... . . . ... ... .. .. . .. . ... . . . ..... .. .. ... .. . . .. . ................. . . .... ... . .. ... ... ........ . . ... . .
lowQualScore : 7 3333 8 0 2 00 2 0 88 22 2 88 5 8 3 0 5 11 1 77 111 0 7 000 55 99 88 1 111111 88 99 88 4 22 111 4 2 666 9 555555 66 22 88888 77777 9 44444 0 44 000 1 000 1 3333333333 7 55 7 0 222 8 0 88 2222 88 3 3 0 7 333 0000 000 88 000 0 0 8 00 66 00 8 0 2 0 2 5 5555 2 555 5555555 2 88 2 0 5 2 5 555 8888 22222222 0 33 00 0 0 0 000 2222 0000000 5 2 0 5555 8 3 0 0 7 7 0 00 00 000000000000 66666666666 000 0 6 2222 0 6 0 0 88 4 2 6 8 0 2 8 0 88 4 2 0 88 0 22222222222222222222222222222222222222222222 333333 222 3 7 22 0 7 11 22 7 777 7 8888 00 7 8 00 6 66 222 2 888 0000000 00 4 7 5 0 33 88 0 00 55 00 0 0 0 000 55 5 00 55 5 0 7777 99 2 2 2222 7 0 1111 77777 5 77 9999 77777777777777 7 1111 44444444444444444444444444444 444 3 7777777777777 6 000 7 0 6 444 444 11 11 4 99 7 000 0 7 6 88888 22 00 000 00 0 2 00 4 88888888888888888 5 2 2222 888 5 55 888 888 22222222 2 5 222 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATAT--CCTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CG--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTG-GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TT-CTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCC-------CTTGA---ATTGAAAA--------T-G-CAN------CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCACCAA---ACTT-TT-TANNAA-TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA---A---TTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAATG-CGTTATTTGGNCTTGTGTAAGCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTTAA--------------TTAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
Reference ( family-643 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATATGAAAACACAACATA----TTAANCACGANNGTATGTGTCCATAT--CCTAC-GGTATT--TACTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACNTTAGATGTTACTGNATAATTTGNTACC-TCCTGCATTNGTGTCACT--T--TT--TTAGCTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-CNT-CGTCTGTC-GTCTAT-TGTCCGTC-GTCTGTCTGTN----AACNTT-NTGTTGTGTGCACTCTA---GCAC--A-CA--T-ATT-TTTCATTGGATCNTCACCAAACTT-T-ACAGTANTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GA-CANGTTCTTGAACCGGCC-AA-TC-GAT-A-TTAATGTCAAGAGTTATGG-CCCTTGAAACATTAAAAAA--TGCATTAT-TTGACNTTGTGTGCACTNTG-GCACC-CGCATTTTTCATTCGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAACGNTT--GACAA-TT-CTTGAACCGGTCAAATCGGGNNATTAATGTCAGANTNATGGCCCTTGAANCATTGAAGAATGCC-TTGT---GCG-CACTCTAGCACTCGCATTT-TTCATTTGATN--TTAAACTTANACAGTAGTTATATAACCATAATATCTTGAACAAGTTCNTGAACTGGCCGAATCGGANTATTAATGTCGAAGTTN-TGGCCCTTGAAACGTTAAA-AATGCACT-TTTGACTN--T-GTGTGCGCTCTAG---CACCCGCATTTTTNATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTATTTATATAACCATAATATCTCGGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATC-GG--ATTATTAATGTCAGAGTAATGGCC-------C-------ATTGAAAA--------T-G-CAC------CCTTGTGT--ACACTN--TAAC-A--CCNTTATT-TTTCATTTGATC--TTCACCAA---ACCT-TT-TANNAA-TTATATAACCACAATATCTTGGACAAGTTTTT--TAACCGGCCAAATCNGGTA---A---TTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATNATCGAAAAT--CNTTATTTGGNNTTGTGT--GCCAACTCTANCACCCNCNGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACNATTTTAATACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGATAATTACTCAACAATGAAACCCAGCTGGCTTCANAAGGT-CTATGTATAGCATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCACCTG-----AGCCGAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-GACTT---TTAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ANATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCGTCAAAAAA-CATGGCCGCCAGGGAGCGGG--GCTAGTTT-A--------------NTAGTAAAAACT----TAAAAAACGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-T-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT--GTGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
gi|1 : AGATATGAAAACA--ACATA----TTAAGCACAAGTGTATGTGTCCATAT--TCTAC-TGTATT--TATTGTCTGTTGATGTTATTGGTTGTTTACTTTAGATGTTGCTGTATAATTTGTTACC-TCCTGCATCGATGTCACT--T--TT--TTAGTTCACCTGA-G------C--A--AAGC-TCA-A--GGTAAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-T-CTT-CGTCTGTT-GTCTAT-TGTCCATT-GTCTGTCTGTT----AACTTT-TTGTTGTACGCACTCTA---GCAC--A-TG--T-ATT-TTTCATTGGATCTTCACTAAACTT-T-ATAGTAGTTAT--ATA----ACC--ATAATATCTC-GAACATGTTCTTGAACTGGCC-AAATC-GATCA-TTAATGTTAAGAGTTGTGG-CCTTTGAAACAT-AAAAAA--TGCATTAT-TTGACCTTGTGTGCACTGTA-GCACC-CGCATTTTTCATTTGA-------TCCTCACCAAACTTGCACA-GTAGTTATATAACCA---TAATTTCTTGGACAAGTT-CTTGAACTGGTCAAATCGGATTATTAATGTCAGAGTTATTGCCCTTGAAACATTAAAAAATACC-TTGT---GTG-CACTCTAGCACCCACATTT-TTCATTTGATA--TTAAAC--AAACAGTAGTTATATAAACATAATATCTTGAACAAGTTCTTGAACTGGCTAAATCGGAATATTGATGTCACAGTTT-TGGTCCTTAAAACTTTAAACAACGCACTATTTGACTG--T-GTGTGCACTATAG---TTCCCGCATTTTTTATTTGATTCTCACCAGACTTACACAGTAGTAATATAAGCATAATATCTCGAACAAATTCTTGGACTGGCTAAATC-AG--AATATTGATGTCAGATTAATGGCC-------CTTGAGTTGTTAAAAACTACAACAT-T-CAA------CCTTGTCT--ACGCTC--TAGC-A--GCAGTATT-TTTCATTTGATC--CTCACCAA---ACTT-ATACATTTG-TTATATAACCATAATATCTTGGATAAGTTCTT--TAACAGACCAAATCCGGTA---AC--TTATGTCTG-AGTTATGGCCCTTGAATAATCAAAAATGGCATTATTTGACCTTGTGT--GC--ATTCTAGTACTCGCAGCTTTCACTTGTTTTCAACCAAACTTAGGTAGTAGTTATAACCAAAATATCTTTGACAAGTTCTTGTTGAATTAGATTACTACTGTCACAGTTATGGCCTTTGAAACATCAAAAATGTTTTTGTTTGTTGTTGTGTACACTCTAGCATGTGCAGTTTTTATTTGATCCTCATTAATGCGATAATTATATAATTATAATATCTAGGACAAGTTTTCGAACTGGCCAAATTGAATAGTTGTGTATTTGTGTTTTTTGACCTTGTGTGTTATTTGACCTTGTGTGCATCAAGCACTTGCAGTTTTCATTTACTCTGTGTCGTACTATTGTCAGAGCTATGGACCTTGAATTGTCAGAAATTGTTTGTATTTGATGTTGAATGCACTCTTGCACTCAAAGTTAATATTTGATCTTCATTAAACTTATACAGTTGTTTAACTGTTGTTATGTAATCATAATATCTTGGACAAGTTCTTGAAAGGGTCAAATTGGATAATTAGCAAAATGACCAAGGGCCAACAACTCACGAGGGTAGAATAAAAGCACACACAAAGTAAAATTTACAATTTTAATAC-AAAATTATGAATATACAATTATACAATATATACAAATTA--AAGATAATTACTCAACAATAAAACCCAGCTGGTTTCAAAAGGTCCTATG-ATGGTATTAA----CACTT-TT-T----TTTTAGCTCATCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---TTAGC-TTC-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTCA---ATTTAA-CTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACA--C--TCC--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCATCAAAAAA-CATGCTTGCCAGGGGGCGGG--GCAAGTTTAA--------------TTAATAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACAACTGGCTCGATTTAT-AA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTGGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCT---TGAT-TCGTC-AAAAAACATGG
gi|10 : aaataaactacaataaaaaac--TT--CTAGCTCATC----G------CT-A--AGGC-TCA-A--GTTGAG---CTTT-TGTAATTG-CT--CTGTGTT-A-CTT-AAT------GTCT-T-TGTCTGTCTGTCCATC-ATT----AATGTT-CTGTTGT-----TTTTA---GT-------------TT-TTTCATTGGATCT-----AAA-TT-A-ACAATACTTATAAATAATATACCTGATAATGCATT-AA-CAGATTCATGTATTGG---AA-CT-GGT---TTG--GTC---AGTT-TGA-CCCTTG--ACATT-TAAAA--TACATTAA-TTg
gi|11 : AGATATGAAAACACAACATA----TTGATCATGATTGTATATGTCCATAT--TCTAC-AGTTAG--TACTGTTTGTTGGTGCTATT-ATTGACTACTTGATATGTAACTAAATGAGTTGATACC-TCATACATTAGTGTCACTCAT--TTCATTA--TCAAGTAA-GTCCTCTC--C--AAAC-TCA-ATGGATGCGTTTTTATATCTGGTCG-C---GAGATGT-CTTTT-CGT
gi|12 : gAATGACAAGAGTTATTG-CCCTTAAATGATTAAAAAAACTGCTTTGTGTTAACATGATAAGAACTT-----------CATTTTTCATTCGA-------TCTAGACTAAACCTGCATATGTA--TATATAAACAGAGTAAAGGAT--GTC---TT-CTTGAagctg
gi|15 : TTGTGTCAACACTAAGTATC-A--CCTTTAGT-TTGCATTTTATT--TTGAACAA---ACTTGTT-TAGAAGCTTA-ATGGTCA-AA---CTGGGGCAAACATTT---AACCAGCCAAAGCGAGCA---G---TGATGACAG-AGTTATGA--CTTGAATAATTGAtgaaggcagaatgaacaaagttgttgtacttg
gi|16 : tttgCAGAGTAACAGCC-------TTTGATGAATTGAAAAA-------T-G-CAGATTTTGCCTTATAA--ACACTG--TAAC-A--CCTTCATTCTTTTATC--ATCCATTCAACAA---ATTA-TT-TGCCAA-TTAg
gi|17 : atgga----TTTTAGTTCACCGG-----AACTGGGGAT--TCTCA-GGTG--------------AGT-TTTCGTGA----CT-------G--CCAT-----G---------TG---TACATC-AT-------------T-AGCTC---TT-TC-TTT-A---AAC---AAGTCGT--CTGTTCTTGGAAATCACTTGTTTACTTTTGCTCAAATG---TTTACAGAAgcagattataattttggtggtaatttctttga
gi|18 : taTTCATT-AATC--TTGA--AA---ATCT-T---ACTTA-TTATGTAACCACGAGATCATGCACAATTTCTT--TAATTGATTTTCTGAGGTA---ATTTTTCTGTCTA-GATTATGTCCCTTTAATTGTCAAATAT--CGTAGTTTGGTCTTGTgc
gi|19 : TTGAAA--TTAAAAAT--AACA--AT-TTTATTTTGTGTTCA-TATGTGCACCACACATTTTCCTTTCGAGGTATTGTCCTTA---AAGTTACAGA-ACAATCACA----CA---CGATGTTT--GACAA-TTTCTTGAACTTGTCA
gi|2 : ggtgtTT-TTAT----GTTTAGCTCAGCTGTTTTTAGCCGAAGGC--TCACA-GGTA--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------G--CCTG-----G---------TG---TCTGTC-GTCTGTCGTCAGTCGT-AACTT---AAAGC-TTT-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--TAAACCACTTGGCCAATTTTG---ATATAA-GTTCACAGTAATGTTCCTTGGGTG--A--C--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTCAT-AAAAAA-CATGGCCCCCAGGGGGCAGG--GCAAGTTTAA--------------TTAGTAAAAACT----TAAAAAATGTTCTTGTCAGAAACTACTGGCTCGATTT-TAAA-A-TAATTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTGACCCTCTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCATCTTAATGAT-TCGTCAAAAAAACATGG
gi|2 : gTT--CTTGTCA--GAAACTACTGGCTCGATTTTA---AAATAA-TTTCACAGAAATGTTCCTTTGGTG--A--CCCTCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTTAATGATTCGTCAAAAAAACATGGCGGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT-A--------------CTA-TATAAGCTATAGTAAAAA-----CTTGTCAGAAACCATCGGATCAATTT-T-AA-AACAATTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTGACCCTTTACCAAGTTTG--------TTCAAGCCGT-T--GTGAT-TTGTT-AAAAAACATGcggccagggagtggggttagtttactatataagctatagtaaaaacttgtcagaaaccatcggatcaattttaaaacaatttcacagcaatgttccttgggtgaccctttaccaagtttgttcaagccgttgtgatttgttaaaaaacatgaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|2 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatg-T---AAA---AA--CTT--GTCA-----GAAACCATCGGATCAATTTTA---AAACAA-TTTCACAGCAATGTTCCTTGGGTG--A--C--CCTTTACCAAGTTTGTTCAAGCCGTTGT---GATTTGTTAAAAAA-CATGACCACCA--CAGCGAGTTGCTAGTTT-ACTATATAGGCAGCTATAGTAAAATCT----TCAAAAGCCTTCTTGTCA-AATCT-CTGACCTGATTT-C-AATG-TTATTTCACTGACATTTACCATGGGTGCACCTCTACCAAGTTTGAACTCTTCTTCA---CATCT--GTTACATCTTC-AAAAaccaccacagcgagttgctagtttactatataggcagctatagtaaaatcttcaaaagccttcttgtcaaatctctgacctgatttcaatgttatttcactgacatttaccatgggtgcacctctaccaagtttgaactcttcttcacatctgttacatcttcaaaacaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|20 : gttttatgtttagctcagctgtttttagccgaaggctcacaggtaagcttttgtgatcgcctggtgtctgtcgtctgtcgtcagtcgtaacttaaagcttttaacaacttctcctcttaaaccacttggccaattttgatataagttcacagtaatgttccttgggtgactctaccaagtttgttcaagccatcttgattcataaaaaacatggcccccagggggcagggcaagtttaattagtaaaaacttaaaaaatgttcttgtcagaaactactggctcgattttaaaataatttcacagaaatgttcctttggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttaatgattcgtcaaaaaaacatggcggccagggagtggggttagtttactatataagctatag--TT--TTAGCTCACCAGA-A------C--A--AAGC-TAA-A--GTTGAG---CTAT-TTTTACGG-CA--CTG-TG-------------GTC-ATCTAT-T-----------CATCTGTA----AACGTTGATGCTGTGTGCTCTCTG---ACAC--C-CT--C-A-T-TTTCATTGCATCATCATTCAACTcaaatcaaaattcttgaccatctcttttttctggaattttaagtgtacatgtattatattatctccttaagttgggtgcctcaaggtcactcaggtgagcgatatagggccatcttggccctcttgtttgaaagattattatcattggatctgttattataatatatatataattattgacttcttgatttgtcacagcttttatatt
gi|22 : cAAGGT---ATGTGTAGT-TTGA----TTCTG-TTAT----TTTTAGCTCACCTG-----TGCCAAAGGC--TAAT--GGTT--------------AGC-ATTTCTGA----TC-------AT-CCTGTCACTGT--------TA---TCCA----T-------------T-GACTT---TTA-C-TTTGT---AAC---
gi|23 : aTGTCCGTCAAC-CGTCC-TC-GTCTGTCCGTTCGTAAACGTT-AGATTGTGTGCAC-CTA---GCAC--ATCA--TTATT-TTTTATTAGATCATCACAAAACTT-TGAC--TAATTA
gi|24 : tctaTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGTGATCGCCTGGTGTTCANNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN----NN-------N--NNNN-----N---------NN---NNNNNN-NN-------------T-AACTT---TTAGC-TTC-T---AAC---AA--CTT--CTCCTCT--
gi|25 : -TTT-T---AAC---TA--CTTAACTTTATT--GAA-CTACTGAACCAATTTTG---GCAAAATTTTCAC---AATGTTCCTTAAGTG--G--C--CC
gi|26 : cctttttcaactatT-T----TTTAAGCTCATCTG------GCCCAAG-C--ACACA-GATG--------------CAT-TTTTGTGAACATTCAATTTCTG--TCTG-----A---------TA---TCTATT-GT-------------TAAACTCA--TTAAC-CCT-C---AAC---AA--Cacattattatatttg
gi|28 : TAAGCACCTGAGTATTT----ATAT--CCTGA-AGTATTAGTATTGCCTATTGATGTTATTGGATGTTTACGGTAGCTGTTACCATATAATTTGAGACC-T
gi|29 : ----TTTAAACTAACCTG-----TGCCAGAGAC--CCA-A-AATG--------------AGC-TTTTGTGA----TC-------A--TGTG-----G---------
gi|3 : accatgtctgtctgtcattgttgtttttttaagttgtttgtaTAATGTCGAAGTTAATG----------CGTTAAA-AAT-------TTAACTTAAT-GTGAGTACTTTAG---CACCTGCAGTTTTCATTAGATCCTTATTAAACTTGCACTGTATCTATAAAACCACAATATCTTAGACAAGTTCTTGAACTGGCCAAATCTGGTAATTA-TAATATCAGAGTAATGGCT-------C-------ATTGA------------------------CCTTGGGT--GCATTC--TTGC-A--CCTGTATT-CTTCATTGGATT--TTCACCAA---ACTT-TTATAGTAA-CTATATAACT---ATGTCTTCAACAAGTTTTTAGTTTCCAGCCAAGCTTTATA---A---TTTAAACTGAAGTTGTGGCATTTGAATCGT-GAAAA
gi|3 : aatctgatagaAAATTAAGTACCAG---TAATGTCTG-AGTTATGGGCCTTGATTTATTACAAGT--CACTAATTGaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaaaattaagtaccagtaatgtctgagttatgggccttgatttattacaagtcactaattg
gi|30 : aatctgatagataatgtcgaagttaatgcgttaaaaatttaacttaatgtgagtactttagcacctgcagttttcattagatccttattaaacttgcactgtatctataaaaccacaatatcttagacaagttcttgaactggccaaatctggtaattataatatcagagtaatggctcattgaccttgggtgcattcttgcacctgtattcttcattggattttcaccaaacttttatagtaactatataactatgtcttcaacaagtttttagtttccagccaagctttataatttaaactgaagttgtggcatttgaatcgtgaaaaaaaatctgatttaattgaaattagtatgttttacagagaagaaaatacacacaaaacctctgagaatgcaccaatggtcattaacatttaatctctgaatttattattataacaT-TCTGATTG-C---CC--TGT--------ATCTGTT-GTCCATCTGTCCTCC-ATCTGACTGTA----AACTTT-ATGTTGTGTTCACTCTA---GCACCGA-CA--T-ATT-TCTCA
gi|32 : ttGCTTCACAAA---CTAT--ATACCATTAAGAAGCATTT-TT-T----TTTTCGTTCTCCTG-----AACCCAAGAC--TC-----GTA--------------TGC-TTTTGTGA----TCT------G--CCT------G---------TG---TCCAg
gi|33 : --TT--CTAGCTCATATGA-G------C--A--AAGT-TAA-A--AGCAAG---C-AT-TCTAATTA-C---CTGTCATCC-CTT-TGTCTGTC-
gi|34 : TGTTACT--T--AT-----GATCACCTGA-AA-----C--A--AAGGGTCA-A--GCTGTG---CTTT-TCTGATTG-CTCACTGTTG-----GT-CTTCTGTtgtatgttttgtattgtc
gi|35 : a-T----TTTTAGCTTGACTG-----AATTGAAGGT--TC-CA-GGAG--------------AGC-TTTTGTGA----CC-------C--TTCT-----G---------TG---GC---T-GT-------------T-GACTT---TTAGCATTA-T---AGC---Atctcctcttct
gi|36 : taAATAAAATTT--TATTTT--TACAAAAATTATGAATATACAATTACACAATATATGCAAATCAACAAGAT--TTACTCAAC-ATGAAA
gi|37 : CATCTG-----AGTCGAATGC--TTACA-GCAG--------------AACATTTTGTGA----TC----------TCTGT----G---------TG---TCCATCTGT-------------G-G-------TCAAC-TTC-C---AAT---AA--CTT--TTTC
gi|38 : cTG-----AGACAAAGGC--ACACA-GGTG--------------ACC-TTTTGTGA----TT-------GCTCTTC-----GTCCATAATCTG---TCCATC-GT-------------T-AACTT---T
gi|39 : T--T--TT--TTAGCTCACGTAA-G------C--A--AAGC-TCA-A--AGTAGG---CTGT-TCTGATCC-T---TTGTggttcaaaaaa
gi|39 : T-T----TTTTAGCTCACGTA-----AGC--AAAGC--TCA-A-AGTA--------------GGC-TGTTCTGA----TC----------CTTT-----G---------TGAAATTCATC--T-------------T-Ggaaattcatcttgctgtatgtccact
gi|4 : GTTATTGGCTGTTTATACCAG----TATTCTAT--TTTCTTAA-----TATATTT-TATTATT--T--TA--CTAGCTTACCTGA-G------C--A--GAAA-TCA-A--GTTGAG---CGAT-TCTGATCA-C---C---------CTG-AGTCTGTC-GTCCAT----CCAT---------TGTA----GACTTT-CTGTCGGGTGCACTCTG---GCAT--A-TGAGT-ATT-TT--ATTGGATCCTCACCAAACTTAT-GTAGTAGTTAT--ATA----ACC--ACAATATCTCTGA-CAAGTGATTGAACCGGCCTAA-TCAGAT-AATTAAAGTTAA-AGTTATGGCCCCTTGAA--ATTAAAAAAT-TGGACTTT-ATGACATTGTCTGCACACTG-GCATC-TGCATTTTTCATATGC-------TTCTCACCAAACTTACACA-GTAGTTATATAACCA---TAACAATT---AC---TT-CTTGAACCAACCAAATCAGGAAATTAATGTCTGGCTAAAGGTCCTTGAATCATTGAAGATTGCA-TTATTTAACGTCA-TGT-GCACTTGCAGTT-TTCATTTGATC--TTActgtatgtccact
gi|40 : tcA-A--AGTGAG---CTAT-TCTGTTCGCC---CTG-TGT-C-CAT-TGTTTGTC--TC--C-TGCCC--C--TCTGTCTGTA----AACCTT-
gi|41 : tgggggataaACTG-TA-T----TTTTAGCTCATTTT-----AGCCAAATAC--TCTTA-GATG--------------AGT-TTTTCTGA----TC-------A--CCAT-----G---------TG---ACCATT-GT-------------tg
gi|42 : aagaTATCATT--TCATTA-TTAGTTCAACTGA-G------C--A--AAGG-TCA-A--GGTGAG---GTAT-TCTGTTCA-G---CTGTTAT-G-CTTCCATCTGctg
gi|43 : TATAACATAAA----CACTTATG-TGAAGTTTTAGCTCACATG-----AGCCAAAGGT--TCA-A-GATA--------------AGC-
gi|44 : tcatttatattt--TC--TTAACTTACCTGA-A------C--A--AAGC-TCA-A--CGTTAG---C-ATGTCTGGTCG-C---CCGTTGC-C-CGT-TGCCCGTT-GTCT
gi|46 : ------C--A--AATG-TCA-A--GGTGAG---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTG------T-TGCCTGCC-GTCTGC-TGTCCGT
gi|47 : GTTGTTTACTTGAGATGTTACTGAATAAACTGTTACC-TCCTGCGCTGGTGTCACT--T--
gi|49 : GATGTTACTGAATAATTTGCTACC-TCCTGTATTCGTGTCACA--T--GT--TTAGATCA
gi|5 : TCAAAACCATGACCCTGGGGGCA-----GAAT-----TGT---GCG-CACTCTAGCACTCGTATTT-TTCGTTTGTTTCATCAAACTTACACAGTAGTTATAAAACCATAATATCTTGGCCAAGTCCATGAACAGGCCAAATTGGATTATTAATGTCAGAGTTG-TGACCCTTGAAACATTGAA-AATGCACTGTTTGATTG--T-GTGTGCACTCTAG---CACCCCTATTTTTCATTTGATCCTCACCAAACTTGCACAGTAGTTATATAACCATAATATCTGAGACAAATTCTTGAACTGACCAAATT-GG--ATTATTAATGACAGGGTTGTGGCCCTTGAAAC-------ATTGAAAAT-------T-GCCGT------CTTTG-GC--ACAGTT--TAAC-AATATGTTGTT-TTT--TTTAATac
gi|50 : tcagtttgtggtcctatctcaaatttgtT--TTAGTTCATCTGAAG------C--ATAAAG--TCA-A--GGTGAA---CTAT-TCTGATTG-T---CTTTTGT-C-
gi|52 : CT--T--TT--TGAGCTAATCTGA-G------C--A--GAGT-TCA-A--CGTGAG---CT-T-TCTGATTG-CT--CTGt
gi|54 : AGC-TCA-T--GGTGAA---CTAT-TCTGATCG-C---CTGTTGT-C-TGT-CGT
gi|6 : AATACAACAGAATTCTTCACTATGATACAATGT-TCCATATCACCTACTGGCGTT--TTCTGTTT-TTCATACCA-TGCCTGTT--CATTA-ATATT------TA---TGATATCATGCTGTAT--GTA----T--T--TA--TTAGCTCACCTGA-G------CCAA--AGGC-TCACA--GGTGAG---CTTT-TGTGATTG-C---CTGGTGT-C-CGT-CGTCTGTC---C------TCCGTC-ATCT-TTTGTT----AACTTT-atc
gi|6 : tatataaatgtttattataatcctgT-T----TATTAGCTCACCTG-----AGCCAAAGGC--TCACA-GGTG--------------AGC-TTTTGTGA----TT-------G--CCTG-----G---------TG---TCCGTC-GTC------------T-GTCCTCCGTCATC-TTT-TGTTAACTTTAA--CTT--CTCCTCT--GAAACCACTGGGCCAATTTTG---ATATAA-TTTCACAGAAATATTCCTTGGGTG--ACCC--TCT--ACCAAGTTTGTTCAAGCCATCTT---GATTTGTC-AAAAA-CATGGCAGCCAGGGAGTGGG--GTTAGTTT-aacttctcctctgaaaccactgggccaattttgatataatttcacagaaatattccttgggtgaccctctaccaagtttgttcaagccatcttgatttgtcaaaaacatggcagccagggagtggggttagttttatgtcaaatt
gi|7 : tatataaatgtttattataatcctgaatacaacagaattcttcactatgatacaatgttccatatcacctactggcgttttctgtttttcataccatgcctgttcattaatatttatgatatcatgctgtatgtaA-A--AGTGAG---CCAT-TCTGATCG----------------AT-CGTCT-------TAT--GTCTGTC-GATTGTCTTTT----ACCGCT-TCATTGTA---AACCTAATTGCGT--C-CA--A-ATTATTTTATTGGATCTATACCAAATTT-T-TCAGTATTTAC--ATG----ACC--Atatgtcaaatt
gi|7 : gggcgatagaga-AATTATAGCCATGGTATAAACAAAAATG-CTTTATTTTGAATTGTGTAAGCCAACTCTATCACCCTCTATTTTCAgtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacaattatagccatggtataaacaaaaatgctttattttgaattgtgtaagccaactctatcaccctctattttcat
gi|8 : gggcgatagagaaaagtgagccattctgatcgatcgtcttatgtctgtcgattgtcttttaccgcttcattgtaaacctaattgcgtccaaattattttattggatctataccaaatttttcagtatttacatgaccagtcacgctgagaacatgccaaagttgtatcaaacggatgtttatggactaaagaaccaatagctttcattggatattgaccaaacT-TCTGACTC--TTGTGTGTGCTCTAG----ACCC-------TGAATTGGTCTTGACCAAACTTGCATA-TATTT-------CAT------TC----AAGACCTAAAACTGCCCAAATT-GG--GTAACTAACGTCATAGCAATGG---------------------AAAA--------TTG-TAC---------TATAT---TATCA--TAATTA--CCGTTATT-TTTCAGTTGATT--TTCACCAACAAACCT-TA-CAGAAA-TTATAGAACCGCAGTAT---GGACAAGTTTTT--t
gi|9 : tcttgAATGCCATTAT---G-A-TATCCTACCACTTACATTTATTTATTTGA-------AACTTATACAGTGATTATATAACCATATGATCCTTAACAACTTCCTAAACTGACCGAATTGTACTATTAATGTCCAAGTGT-TTGCCAT-------TTAA---------T-CTTGTCTC--T-CTGTGCTCTCCAGCTTCAGCAGCATTTATGGT---ATCTTTATTTGACTT-TAAAGCATGTATATAATCATAAAATATTGGACAACTTgcaatttatctacatttgcttagtact
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CACCTTATTATTCAAACGGTCATGTGAGGTTTTACTATCACATTGGCCGCTGGCAGCTTAATCATTGTCATGGTCTGTTATCTTTTACATTTTAATATCTTTCTCCGAAGCCACTGTGCTAAATTAAACTAATTTTTACAGGAATATTCCTT
Unaligned ( gi|14 ): TGAATTAATAAAAAAAGGGCTTACTATGTAGCGTATATTCAGTGATTGAATTTGTTTTACCCATGATGCTTTAGTCAGCTACATTTCTCAAGGCTGATTAATTGTACTTCATGTGAGTTAGTCCAGTGTATGGTCATTTCCTGCTC
Unaligned ( gi|21 ): TAATGGTGTTTTGCATGTAAACCATTGTTTATACATGTTTTTCTGTTTTATTAACTTGCCTAATCTTTAGGTTTGAGTTCAGTAATTTGGATCACCCTGTGTCTGTTGTCCATCCGTAAACT
Unaligned ( gi|27 ): ACGTGAATTAATATTGTAATTACCTGACATCATTATACAGATTTAGATGATTTTACATAGAGGTGCATTGTGCAAACAAATTATTATTACACAACT
Unaligned ( gi|31 ): TTTTAAATATCATTATCATTGGATCTTTTTTTATTATATATACATTTTGTATTGTATTTTTTAACTTCTTGATTTGTCACAATTTGTTTATT
Unaligned ( gi|45 ): CAAAGTTCCATATCACCTACTGATGTTTTCTGTTTCCATATCATGCTTGTCCATCAATACT
Unaligned ( gi|48 ): AACCAACAAATGAAAATAATAAATTTGAAAATAAATATCAACGAAAAATCAAATTT
Unaligned ( gi|51 ): TGAACATTTGAGTAAAACTGTAAAATCCAACAGGTTTAATTCCCTATCACAC
Unaligned ( gi|53 ): TCGGAACTCCCCGATTACACACTTTCACCGGATCGACTTATTTGAAA