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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taAGGCAAAAAAA---------TGTGTTTCTGGTGGCAT-GTAAAAAAAACAAC-A--GCAGGCAGGTgaacagaaacaactctttttttttaaagcctaagccactggaaggattttcataatactagcatatcagttgtttacctcatcaata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aataGGCAAAAAAA-CAAA----------TCTGGTGGCTTGACCCAAAAAAAACCCAGGGTGGATAGGTAGGT----TGT-TTTCTTATTTTT---GAAACGT-T----TG----TTCATGC--AGGTATCAGCTGT---ATATAT--------TATTTTAA-------ATAT--------------g
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAAAAAAT-------TGTGTTTCTGATAGAATGGCAAAGAAAACAAC-AGCGCTGGTAGGTA---GTT----ACTT---------TC--AAGTATATATT-TGCTATTTAAT-T--TGAAATTTTCAAT---AT-CATGAATATTGTC-------------ATGT--------------TTGCCACATTGTAACACCACATTATAGT-CTTGTATTAATGATATGATTAAATATTGGATAAA----ATAAGACAG----TAAATGGTAAATC--TG-TT----TAAATACCTCTACC-TTC-ACATCCACATATCTTTTTGATATAGGGTGAT---AT-TTAAC-----TGACAGCATTTCAACAAAAGATCTTTATTTTTTATAATCTCAGACTGTGTTTTTATGTGACTTAAAGATA-A-ATCTA-A---ACATATTTA----T----TACCCA-TTAAATGTTTC--TCA-------------TGAAGACTTGAAAGAGTATGTTTTAAAAAA---AAA-ATTTTTTagtcatgtttgcc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acgttgcatctttacaaaggtgtttgtttttttaatgccaAATAAAAA-AAAAAGTTATGTTTCTGTTGGCATGACttcatccatgaggtgaaaaagttatggtctgttgggctaccagaaacaactcttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatctgaaataaactcaaatgtgtgttaaatgtttcctttcacatttctttataacctagatgggtgaaaaaaatttttttttgttttcatccatgaggccataaaaaaattcgtcggctctgaaaaattatggtccGTACTT-TTTTATTTGC---ACCAT-TATC-TA----TTCATGT--AGGTATTTGCTGT---AT----GTAT----TATTTAAA-------ATATCCATATTGTCAGGTTTGCCACATTGTAACACCAAATTACAGTTATTAAGTTAATGAGTTGATTAAATATTcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taTAATATT-GAC-------ATAT--------------TTGCCACATTGTAATACCCCATTACTGTTCTTACGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAA----ATAAGAAAGGAAATTGATGGTAAATCTTTGTTT----TAGATACCTTTACC-TTC-ACTTGCACATACCTTTTTAATATAGGATGAT---AT-TTAACA-----AACAGCATTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------ATGT--------------TTGCCACATTGTAACACTACATTATAGTTCGTGTGTTAATGATTTGATTAAATCTGTGATAAA----ATAAGAAAG----TATATGGTAAATATTTGTTTTAAATAAATACTTGTA-C-CTCTAAATGCACATATATTTTTAATATAGGGTTAT---AT-TTAACA-----AATAACATTTCACCAAAAAATCTTTATTCTTT------TTAATCTCTG------------TAGAAG--ACATATCTATAaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatcaatattgtt-------ATGT--------------TTGCTACATTGTAACACCACATTGCAGTTCTTGTGTTACTGtatgtttcctttcttatttcattatgatctcaatggatgaaaaaaaaatcataaaaaatatggtcggcggtgacaattactgtcggtcgggtcacataacagaaacaaaacttttctatatactgatttgttaccgacttaattgacgaatatggtaatcttctcaaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caatactgtcTATTTGATAAA----ATAAGAAAG----TAAATGGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTA-CATCC-ACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATCTTACAAACAGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GATTAA----AT--GTATG----TAAATGGTAATTCTTTGTTT----TAAATACCTC-------C-ACATGCACAT-TTTTTTTAATATAGGGTGATA--TT-TAAA-AAAAA-AACAGAATTCCAACAAAAAGTCTTAATTCTTTATAATCTCAAAGTCTGTTTTTATGTGACTAGAAAACATAT--CTATAGATACATATTTA----TAACTT----A-TTAAAGGCGTTTCTCA-------------CAAAGACAAGAAAGAGTATATTTTAAAAAAAGAAAA-------TACAGTG--------AAAATTGACATTTAAATGAAAGAGTGTGTGACCTATGGTGAGTATCTGAAATAATCTC-AAATGTATCTTAATTGTTCCCTTTCTCGTTTC-TTTTGTATTTACAA--AGTAAT-AAATCTAAT-TCTAA-CAGCAAATCCCAGCAAAGAAATt
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Reference ( family-63 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGGCAAAAAAAACAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGCATGGC--AAAAAAAA-AA-CAGGGTTGGCAGGTAG----GTG----GTACTTCTTTTTTTTTC-GAAACAT-TATT--CTGTTCATG---TNGGTAT-TTGCTGTATACAT------GNATAT--GTATTTAA--------A-TGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAA----ATAAGAAAGTAA----ATGGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTA-C-TCCACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATT---NAACAA----AA-CAGCATTTCAACAAAAAATCTTTATTCTTTATAATCTCAAACTCTGTTTTTATGTGACTAGAAGACA-ATATCTAT--A-TACA--T---ATT--TA----TT----ATTAAATGCGTTTCTCACAAAGACTAGAAAGAGTATGTTTTAAAAAAGGAAA-A---TC-CTTACAGT----GACTAGAAANTGACATTTAANTGAAAGGGTNTGTGACCTGTNGTGAGTATCTGAAATAANCTC-AAATGTGTNTTAAATGTTCCCTTTCACGTTTC-TTTNNNACTTACAATGAGTGATGAAANNNAATGTCCAACCANCAAGTCCCAGCAAAGAAATA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATTTGATAAA----ATAAGAAAGTAA----ATGGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTA-CATCCACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATC---TTAC-A----AA-CAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGCAAAAAAA---------TGTGTTTCTGGTGGCATGTA--AAAAAAAC-AA-CA------GCAGGCAG----GTG----at
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aata--------A-TGTTTGCTACATTGTAACACCACATTGCAGTTCTTGTGTTACTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caatactgtcTAGGCAAAAAA--CAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--CAAACAAA----CTGGGTTGGCAGGTAG----GTA----------CATTTTTTTTT-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTACTGAATATATTATTTAAAACAT------CAATAT---TGTC-----------A-TGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTCATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAGAAAGT
gi|3                          : tgacctgggtttgaactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatccccccccccccccccccgactccctaaataaaaacaacaatgtcccaaccccctgttttggttggttttctggaatgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctTAGGCAAAAAA--CAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--CAAACAAA----CTGGGTTGGCAGGTAG----AT-------AC--ATTTTTTTTTG-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTGCTGAATATATTATTTAAAACAT------CAATAT---TGTC-----------A-TGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAAAAAGT
gi|4                          :                  gacctgggtttggactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatcccccccactctctaaataaaaacaacaatgtcctcaccccctgttttggttggttttctggggtgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctCAAAAAAAA------ATTGTGTTTCTGATAGAATGGC--AAAGAAAACAA-CAGCGCTGGTAGGTAG-----T------TACTT---------TC--AAGTATATATTTGCTATTTAAT---TTGAAAT-TTTCAATAT-CAT------GAATAT---TGTC-----------A-TGTTTGCCACATTGTAACACCACATTATAGT-CTTGTATTAATGATATGATTAAATATTGGATAAA----ATAAGACAGTAA----ATGGTAAATCT--GTTT-----AAATACCTCTA-CCTTCACATCCACATATCTTTTTGATATAGGGTGATATT---TAACTG----A--CAGCATTTCAACAAAAGATCTTTATTTTTTATAATCTCAGACTGTGTTTTTATGTGACTTAAAGATA-A-ATCTA---A--ACA--T---ATT--TA----TTACCCATTAAAT--GTTTCTCATGAAGACTTGAAAGAGTATGTTTTAAAAAA--AAA-A---TT-TTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acgttgcatctttacaaaggtgtttgtttttttaatgc--------A-TGTTTGCCACATTGTAACACTACATTATAGTTCGTGTGTTAATGATTTGATTAAATCTGTGATAAA----ATAAGAAAGTAT----ATGGTAAATATTTGTTTTAAATAAATACTTGTACC-TCTAAATGCACATATATTTTTAATATAGGGTTATATT---TAAC-A----AA-TAACATTTCACCAAAAAATCTTTATTCTTTTTAAT------CTCTG------------TAGAAGAC--ATATCTAT--A-TATG--TTTCCTT--TC----TT----ATTtttcatccatgaggtgaaaaagttatggtctgttgggctaccagaaacaactcttt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcaatattgttGATTAA----AT--GTATGTAA----ATGGTAATTCTTTGTTT----TAAATACCTC-------CACATGCACAT-TTTTTTTAATATAGGGTGATATTTAAAAAAAA----AA-CAGAATTCCAACAAAAAGTCTTAATTCTTTATAATCTCAAAGTCTGTTTTTATGTGACTAGAAAAC--ATATCTATAGA-TACA--T---ATT--TATAACTT----ATTAAAGGCGTTTCTCACAAAGACAAGAAAGAGTATATTTTAAAAAAAGAAA-A--------TACAGT----GA----AAATTGACATTTAAATGAAAGAGTGTGTGACCTATGGTGAGTATCTGAAATAATCTC-AAATGTATCTTAATTGTTCCCTTTCTCGTTTC-TTTTGTATTTACAA--AGTAAT-AAATCTAAT-TCTAA-CAGCAAATCCCAGCAAAGAAATAtcattatgatctcaatggatgaaaaaaaaatcataaaaaatatggtcggcggtgacaattactgtcggtcgggtcacataacagaaacaaaacttttctatatactgatttgttaccgacttaattgacgaatatggtaatcttctcaaat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A--T---ATTATTA----TTG---ATTGAATTTGTTTCTCACAAAGACTAGAAAGAGTATGTTTTAAAATAGAAAAGA---TCACTGACAGT----GACTAGAAAGTGATATTTAATTGAAAGGGTCTGTGACCTGTTGTGAGTATCTGAAATAACCTCAAAATGTGTTTTACATATTCCCCTTCACATTTC-TTTATGACTT-CAATGAATGATGAAAAAAAATGTTCAACCATTAAGTC---ATAAAAAAATtc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaTATTGAC--------A-TATTTGCCACATTGTAATACCCCATTACTGTTCTTACGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAA----ATAAGAAAGGAAATTGATGGTAAATCTTTGTTT----TAGATACCTTTACC-TTCACTTGCACATACCTTTTTAATATAGGATGATATT---TAAC-A----AA-CAGCATTTtatagttggtctggtta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taaTATCTGAAATAAACTC-AAATGTGTGTTAAATGTTTCCTTTCACATTTC-TTTATAACCTA-GATGGGTGAAAAAAaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AATAAAAAAAAA-AGTTATGTTTCTGTTGGCATGAC--atttttttttgttttcatccatgaggccataaaaaaattcgtcggctctgaaaaattatggtccgtcatgccaacagaaacataacttttttttttattcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TGCCATATTCAACAAACAGTATTACAGTATACATTATCGTATAGGATGCAGAATTCA






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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTTTTTTATTT-GCACCAT-TAT---CTATTCATGTA---GGTAT-TTGCTGTATGTA------TTATTTAAAATATCCATATTGTC-----AG-GTTTGCCACATTGTAACACCAAATTACAGTTATTAAGTTAATGAGTTGATTAAATATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagtaGGCAAAAAAA-CAAAT----------CTGGTGGCTTGACCCAAAAAAAA-CC-CAGGGTGGATAGGTAG----GTT----GT-TTTCTTATTTTT---GAAACGT-T------TGTTCATGCA---GGTAT-CAGCTGTATATATTATTTTAA------------ATATAGTC------ATGTTTGCC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATTTGATAAA----ATAAGAAAGTAA----ATGGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTA-CATCCACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATCTTAC-A----AA---CAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGCAAAAAAA---------TGTGTTTCTGGTGGCATGTA--AAAAAAAC-AA-CA------GCAGGCAG----GTG----at
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aataA------------ATACTGTC-----A-TGTTTGCTACATTGTAACACCACATTGCAGTTCTTGTGTTACTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTAGGCAAAAAA--CAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--CAAACAAA----CTGGGTTGGCAGGTAG----GTA----------CATTTTTTTTT-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTACTGAATATATTATTTAAAACA------TCA------------ATATTGTC-----A-TGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTCATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAGAAAGT
gi|3                          : tgacctgggtttgaactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatccccccccccccccccccgactccctaaataaaaacaacaatgtcccaaccccctgttttggttggttttctggaatgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctTAGGCAAAAAA--CAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--CAAACAAA----CTGGGTTGGCAGGTAG----AT-------AC--ATTTTTTTTTG-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTGCTGAATATATTATTTAAAACA------TCA------------ATATTGTC-----A-TGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAAAAAGT
gi|4                          :                  gacctgggtttggactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatcccccccactctctaaataaaaacaacaatgtcctcaccccctgttttggttggttttctggggtgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctCAAAAAAAA------ATTGTGTTTCTGATAGAATGGC--AAAGAAAACAA-CAGCGCTGGTAGGTAG-----T------TACTT---------TC--AAGTATATATTTGCTATTTAATTT---GAAAT-TTTCAATAT-CA------TGA------------ATATTGTC-----A-TGTTTGCCACATTGTAACACCACATTATAGT-CTTGTATTAATGATATGATTAAATATTGGATAAA----ATAAGACAGTAA----ATGGTAAATCT--GTTT-----AAATACCTCTA-CCTTCACATCCACATATCTTTTTGATATAGGGTGATATTTAACTG----A----CAGCATTTCAACAAAAGATCTTTATTTTTTATAATCTCAGACTGTGTTTTTATGTGACTTAAAG--ATAAATCTA-A---ACA--T---ATT--TA----T----TACCCATTAAA--TGTTTCTCATGAAGACTTGAAAGAGTATGTTTTAAAAAA--AAA-A---TT-TTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgttgcatctttacaaaggtgtttgtttttttaatgcA------TCA------------ATATTGTT-----A-TGTTTGCCACATTGTAACACTACATTATAGTTCGTGTGTTAATGATTTGATTAAATCTGTGATAAA----ATAAGAAAGTAT----ATGGTAAATATTTGTTTTAAATAAATACTTGTACC-TCTAAATGCACATATATTTTTAATATAGGGTTATATTTAAC-A----AA---TAACATTTCACCAAAAAATCTTTATTCTTTTTAAT------CTCTG------------TAGAAG--ACATATCTATA--TATG--TTTCCTT--TC----T----T----ATTtttcatccatgaggtgaaaaagttatggtctgttgggctaccagaaacaactcttt
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Reference ( family-63 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGGCAAAAAAAACAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGCATGGC--AAAAAAAA-AA-CAGGGTTGGCAGGTAG----GTG----GTACTTCTTTTTTTTTC-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTN---GATAT-TTGCTGTATACA------TNA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAA----ATAAGAAAGTAA----ATGGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTA-C-TCCACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATTTAACAA----AA---CAGCATTTCAACAAAAAATCTTTATTCTTTATAATCTCAAACTCTGTTTTTATGTGACTAGAAG--ACATATCTATA--TACA--T---ATT--TA----T----T----ATTAAATGTGTTTCTCACAAAGACTAGAAAGAGTATGTTTTAAAAAAGGAAA-A---TT-CTTACAGT----GACTAGAAATTGACATTTAAATGAAAGAGTCTGTGACCTATGGTGAGTATCTGAAATAATCTC-AAATGTGTTTTAAATGTTCCCTTTCNCATTTC-TTTNTNACTTACAATGAGTGAT-AAATCAAAT-TTTAA-CATTAAATCCCAGCAAAGAAATA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATTTGATAAA----ATAAGAAAGTAA----ATGGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTA-CATCCACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATCTTAC-A----AA---CAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGCAAAAAAA---------TGTGTTTCTGGTGGCATGTA--AAAAAAAC-AA-CA------GCAGGCAG----GTG----at
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aataA------------ATACTGTC------ATGTTTGCTACATTGTAACACCACATTGCAGTTCTTGTGTTACTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTAGGCAAAAAA--CAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--CAAACAAA----CTGGGTTGGCAGGTAG----GTA----------CATTTTTTTTT-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTACTGAATATATTATTTAAAACA------TCA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTCATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAGAAAGT
gi|3                          : tgacctgggtttgaactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatccccccccccccccccccgactccctaaataaaaacaacaatgtcccaaccccctgttttggttggttttctggaatgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctTAGGCAAAAAA--CAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--CAAACAAA----CTGGGTTGGCAGGTAG----AT-------AC--ATTTTTTTTTG-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTGCTGAATATATTATTTAAAACA------TCA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAAAAAGT
gi|4                          :                  gacctgggtttggactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatcccccccactctctaaataaaaacaacaatgtcctcaccccctgttttggttggttttctggggtgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctCAAAAAAAA------ATTGTGTTTCTGATAGAATGGC--AAAGAAAACAA-CAGCGCTGGTAGGTAG-----T------TACTT---------TC--AAGTATATATTTGCTATTTAATTT---GAAAT-TTTCAATAT-CA------TGA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTATAGT-CTTGTATTAATGATATGATTAAATATTGGATAAA----ATAAGACAGTAA----ATGGTAAATCT--GTTT-----AAATACCTCTA-CCTTCACATCCACATATCTTTTTGATATAGGGTGATATTTAACTG----A----CAGCATTTCAACAAAAGATCTTTATTTTTTATAATCTCAGACTGTGTTTTTATGTGACTTAAAG--ATAAATCTA-A---ACA--T---ATT--TA----T----TACCCATTAAA--TGTTTCTCATGAAGACTTGAAAGAGTATGTTTTAAAAAA--AAA-A---TT-TTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgttgcatctttacaaaggtgtttgtttttttaatgcA------TCA------------ATATTGTT------ATGTTTGCCACATTGTAACACTACATTATAGTTCGTGTGTTAATGATTTGATTAAATCTGTGATAAA----ATAAGAAAGTAT----ATGGTAAATATTTGTTTTAAATAAATACTTGTACC-TCTAAATGCACATATATTTTTAATATAGGGTTATATTTAAC-A----AA---TAACATTTCACCAAAAAATCTTTATTCTTTTTAAT------CTCTG------------TAGAAG--ACATATCTATA--TATG--TTTCCTT--TC----T----T----ATTtttcatccatgaggtgaaaaagttatggtctgttgggctaccagaaacaactcttt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tGATTAA----AT--GTATGTAA----ATGGTAATTCTTTGTTT----TAAATACCTC-------CACATGCACAT-TTTTTTTAATATAGGGTGATATTTAAAAA----AAAAACAGAATTCCAACAAAAAGTCTTAATTCTTTATAATCTCAAAGTCTGTTTTTATGTGACTAGAAA--ACATATCTATAGATACA--T---ATT--TA----TAACTT----ATTAAAGGCGTTTCTCACAAAGACAAGAAAGAGTATATTTTAAAAAAAGAAA-A---T-----ACAGT----GA----AAATTGACATTTAAATGAAAGAGTGTGTGACCTATGGTGAGTATCTGAAATAATCTC-AAATGTATCTTAATTGTTCCCTTTCTCGTTTC-TTTTGTATTTACAA--AGTAAT-AAATCTAAT-TCTAA-CAGCAAATCCCAGCAAAGAAATAtcattatgatctcaatggatgaaaaaaaaatcataaaaaatatggtcggcggtgacaattactgtcggtcgggtcacataacagaaacaaaacttttctatatactgatttgttaccgacttaattgacgaatatggtaatcttctcaaat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--T---ATTATTA----T----TG---ATTGAATTTGTTTCTCACAAAGACTAGAAAGAGTATGTTTTAAAATAGAAAAGA---TCACTGACAGT----GACTAGAAAGTGATATTTAATTGAAAGGGTCTGTGACCTGTTGTGAGTATCTGAAATAACCTCAAAATGTGTTTTACATATTCCCCTTCACATTTC-TTTATGACTT-CAATGAATGATGAAAAAAAATGTTCAACCATTAAGTC---ATAAAAAAATtc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaA------------ATATTGAC------ATATTTGCCACATTGTAATACCCCATTACTGTTCTTACGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAA----ATAAGAAAGGAAATTGATGGTAAATCTTTGTTT----TAGATACCTTTACC-TTCACTTGCACATACCTTTTTAATATAGGATGATATTTAAC-A----AA---CAGCATTTtatagttggtctggtta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTATCTGAAATAAACTC-AAATGTGTGTTAAATGTTTCCTTTCACATTTC-TTTATAACCTA-GATGGGTGA--AAA--AAAT-TTTaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AATAAAAAAAAA-AGTTATGTTTCTGTTGGCATGAC--tttttgttttcatccatgaggccataaaaaaattcgtcggctctgaaaaattatggtccgtcatgccaacagaaacataacttttttttttattcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TGCCATATTCAACAAACAGTATTACAGTATACATTATCGTATAGGATGCAGAATTCA






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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTTTTTTATTT-GCACCAT-TAT---CTATTCATGTA---GGTAT-TTGCTGTATGTA------TTATTTAAAATATCCATATTGTC------AGGTTTGCCACATTGTAACACCAAATTACAGTTATTAAGTTAATGAGTTGATTAAATATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagtaGGCAAAAAAA-CAAAT----------CTGGTGGCTTGACCCAAAAAAAA-CC-CAGGGTGGATAGGTAG----GTT----GT-TTTCTTATTTTT---GAAACGT-T------TGTTCATGCA---GGTAT-CAGCTGTATATATTATTTTAA------------ATATAGTC------ATGTTTGCC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATTTGATAAA----ATAAGAAAGTAA----ATGGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTA-CATCCACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATCTTAC-A----AA---CAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGCAAAAAAA---------TGTGTTTCTGGTGGCATGTA--AAAAAAAC-AA-CA------GCAGGCAG----GTG----at
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aataA------------ATACTGTC------ATGTTTGCTACATTGTAACACCACATTGCAGTTCTTGTGTTACTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTAGGCAAAAAA--CAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--CAAACAAA----CTGGGTTGGCAGGTAG----GTA----------CATTTTTTTTT-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTACTGAATATATTATTTAAAACA------TCA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTCATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAGAAAGT
gi|3                          : tgacctgggtttgaactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatccccccccccccccccccgactccctaaataaaaacaacaatgtcccaaccccctgttttggttggttttctggaatgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctTAGGCAAAAAA--CAAATAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--CAAACAAA----CTGGGTTGGCAGGTAG----AT-------AC--ATTTTTTTTTG-GAAACAT-TATT--CTGTTCATGTGCTGAATATATTATTTAAAACA------TCA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAAAAAGT
gi|4                          :                  gacctgggtttggactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatcccccccactctctaaataaaaacaacaatgtcctcaccccctgttttggttggttttctggggtgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctCAAAAAAAA------ATTGTGTTTCTGATAGAATGGC--AAAGAAAACAA-CAGCGCTGGTAGGTAG-----T------TACTT---------TC--AAGTATATATTTGCTATTTAATTT---GAAAT-TTTCAATAT-CA------TGA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTATAGT-CTTGTATTAATGATATGATTAAATATTGGATAAA----ATAAGACAGTAA----ATGGTAAATCT--GTTT-----AAATACCTCTA-CCTTCACATCCACATATCTTTTTGATATAGGGTGATATTTAACTG----A----CAGCATTTCAACAAAAGATCTTTATTTTTTATAATCTCAGACTGTGTTTTTATGTGACTTAAAG--ATAAATCTA-A---ACA--T---ATT--TA----T----TACCCATTAAA--TGTTTCTCATGAAGACTTGAAAGAGTATGTTTTAAAAAA--AAA-A---TT-TTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgttgcatctttacaaaggtgtttgtttttttaatgcA------TCA------------ATATTGTT------ATGTTTGCCACATTGTAACACTACATTATAGTTCGTGTGTTAATGATTTGATTAAATCTGTGATAAA----ATAAGAAAGTAT----ATGGTAAATATTTGTTTTAAATAAATACTTGTACC-TCTAAATGCACATATATTTTTAATATAGGGTTATATTTAAC-A----AA---TAACATTTCACCAAAAAATCTTTATTCTTTTTAAT------CTCTG------------TAGAAG--ACATATCTATA--TATG--TTTCCTT--TC----T----T----ATTtttcatccatgaggtgaaaaagttatggtctgttgggctaccagaaacaactcttt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tGATTAA----AT--GTATGTAA----ATGGTAATTCTTTGTTT----TAAATACCTC-------CACATGCACAT-TTTTTTTAATATAGGGTGATATTTAAAAA----AAAAACAGAATTCCAACAAAAAGTCTTAATTCTTTATAATCTCAAAGTCTGTTTTTATGTGACTAGAAA--ACATATCTATAGATACA--T---ATT--TA----TAACTT----ATTAAAGGCGTTTCTCACAAAGACAAGAAAGAGTATATTTTAAAAAAAGAAA-A---T-----ACAGT----GA----AAATTGACATTTAAATGAAAGAGTGTGTGACCTATGGTGAGTATCTGAAATAATCTC-AAATGTATCTTAATTGTTCCCTTTCTCGTTTC-TTTTGTATTTACAA--AGTAAT-AAATCTAAT-TCTAA-CAGCAAATCCCAGCAAAGAAATAtcattatgatctcaatggatgaaaaaaaaatcataaaaaatatggtcggcggtgacaattactgtcggtcgggtcacataacagaaacaaaacttttctatatactgatttgttaccgacttaattgacgaatatggtaatcttctcaaat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--T---ATTATTA----T----TG---ATTGAATTTGTTTCTCACAAAGACTAGAAAGAGTATGTTTTAAAATAGAAAAGA---TCACTGACAGT----GACTAGAAAGTGATATTTAATTGAAAGGGTCTGTGACCTGTTGTGAGTATCTGAAATAACCTCAAAATGTGTTTTACATATTCCCCTTCACATTTC-TTTATGACTT-CAATGAATGATGAAAAAAAATGTTCAACCATTAAGTC---ATAAAAAAATtc
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTATCTGAAATAAACTC-AAATGTGTGTTAAATGTTTCCTTTCACATTTC-TTTATAACCTA-GATGGGTGA--AAA--AAAT-TTTaa
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Reference ( family-63 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGGCAAAAAAAA-AAATAGTTGTGTTTCTGGTGGCATGGC--A-AAAAAA--AA--C--AGGGTTGGCAGGTAG----GTG----GTACTTCTTTTTTTTT-TGAAACAT-TATT--CTGTTCATGTN---GATAT-TTGCTGTATACA------TNA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAA----ATAAGAAAGTAAAT----GGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTACCTCCACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATTTAACAAA-----CAGCATTTCAACAAAAAATCTTTATTCTTTATAATCTCAAACTCTGTTTTTATGTGACTAGAAGACATAT--CTATA--TACATATTTA-T-A-CTTATTAAATGTGTTTCTCACAAAGACTAGAAAGAGTATGTTTTAAAAAAGGAAA-A---TT-CTTACAGTG----ACTAGAAATTGACATTTAAATGAAAGAGTCTGTGACCTATGGTGAGTATCTGAAATAATCTC-AAATGTGTTTTAAATGTTCCCTTTCNCATTTC-TTTNTNACTTACAATGAGTGAT-AAATCAAAT-TTTAA-CATTAAATCCCAGCAAAGAAATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGGCAAAAAAAATAAACAGCTTTGTTTCTGGTGGCATGGC--A-AAAAAA--AAAAC--AAGGTCGGTAGGTAT----ATGTTTTGTACTTCTTTTTTTTTCTAAAACAT-TATT---TGTTCATGTT---GACAT-TTGCTGTATACA------TGT------------ATATAGTATTTAAAATATTTGCCACATTATTACACCACATTGCAGTTCTTGCGTTAATGATTTGATTAAATATTTGATAAA----ATAAGAAAGTCAAT----GGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTACTTC-ACATGCACATATTTTTTTAATACAGGGTGATTTTAAACAAAAACAACAGCATTTCAACAAAAAATCTTTATTCTTTG-AATCTTAAACTCTGTTTTTATGTGACTAGAAGATATATATCTATAG-TAGATATTTA-T-----TATTA----------TTACAAAGACTAGAAAGAGTATGTTTTAAAAAAGGCAA-ACATTT-CTTACAGTGTCAGACTAGAAATTGACATTTAAATGAAAGAGTCTGTGACCTATGGTGAATATCTAAAATAATCTC-AAATGTATTTTAAATGTTTCCTTTCTCATTTCTTTTTTTATTTACAA--AATAAT-AAATCAAAT-TTTAA-CATTAAATCTCAGCAAAGAAACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGCAAAAAAAA-AAATAGTAGTGTTTCTGGTGGCATGGCCAA-AAAAAA--GA--C--AGGATTGGTAGGTAGAACAGAA----ACAACTCTTTTTTTTT-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taCTCCACATGCAAATATCTTTTTAATATAA----------AACAAAAA---CAGCATTTCAACAAAAAATCTGTATTCTTTATAATCTCAAACTC--------TGTGACTAGAAGAC-TAT--C--CA--TACATATTTATT-A-ATTATTAAATGTGTTTCTCACAAAGACTAGAAAaaagcctaagccactggaaggattttcataatactagcatatcagttgtttacctcatcaata
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTCCACATGCAAATATCTTTTTAATATAA----------AACAAA-----CAGCATTTCAACAAAAAATCTGTACTCTTTATAATCTCAAACTC--------TGTGACTAGAAGAC-TAT--C--CA--TACATATTTA-TGA-CTTATTAAATGTGTTTCTCACAAAGACTAGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTTTTTATT-TGCACCAT-TAT---CTATTCATGTA---GGTAT-TTGCTGTATGTA------TTATTTAAAATATCCATATTGTC------AGGTTTGCCACATTGTAACACCAAATTACAGTTATTAAGTTAATGAGTTGATTAAATATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagtaGGCAAAAAAAC-AAAT----------CTGGTGGCTTGAC--CCAAAAAA--AA--CCCAGGGTGGATAGGTAG----GTT----GT---TTTCTTATTTT-TGAAACGT-T------TGTTCATGCA---GGTAT-CAGCTGTATATATTATTTTAA------------ATATAGTC------ATGTTTGCC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATTTGATAAA----ATAAGAAAGTAAAT----GGTAAATCTTTGTTT----TAAATACCTCTACATCCACATGCACATATCTTTTTAATATAGGGTGATATCTTACAAA-----CAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGCAAAAAAA---------TGTGTTTCTGGTGGCATGTA--A-AAAAAAC-AA--C--A------GCAGGCAG----GTG----at
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aataA------------ATACTGTC------ATGTTTGCTACATTGTAACACCACATTGCAGTTCTTGTGTTACTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTAGGCAAAAAACA-AA-TAGTTGTGTTTCTGGTGGTATGGC--C-AAACAA--A---C--TGGGTTGGCAGGTAG----GTA----------CATTTTTTTT-TGAAACAT-TATT--CTGTTCATGTACTGAATATATTATTTAAAACA------TCA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTACAGTTCTTGTGTTCATGATTTGATTAAATATTTGATAAAATTTATAAGAAAGT
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gi|4                          :                  gacctgggtttggactcacttcctaaagaaatttttaaaaagtgttttgtggcaatgtgtgtttgtaaagaaaaaatagaacacaaacatgtttggaaaatcatcccccccactctctaaataaaaacaacaatgtcctcaccccctgttttggttggttttctggggtgggggttattgggggttatgaattgggatgtatgttttagttaaaaggtgatttaggattcctctacaacaagaccacattnnnnnnnnnnttttgcaattaaccaaaaacatgtccctgcacacaattctaggcaacaacacactgcattacggtattatagtgtctCAAAAAAAA-A-----TTGTGTTTCTGATAGAATGGC--A-AAGAAAACAA--C--AGCGCTGGTAGGTA-----GT------TAC----------TT-TCAAGTATATATTTGCTATTTAATTT---GAAAT-TTTCAATAT-CA------TGA------------ATATTGTC------ATGTTTGCCACATTGTAACACCACATTATAG-TCTTGTATTAATGATATGATTAAATATTGGATAAA----ATAAGACAGTAAAT----GGTAAATC--TG-TT----TAAATACCTCTACCTTCACATCCACATATCTTTTTGATATAGGGTGATATTTAACTGA-----CAGCATTTCAACAAAAGATCTTTATTTTTTATAATCTCAGACTGTGTTTTTATGTGACTTAAAGATAAAT--CTA-A---ACATATTTATT-A-CCCATTAAA--TGTTTCTCATGAAGACTTGAAAGAGTATGTTTTAAAAAA--AAA-A---TT-TTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acgttgcatctttacaaaggtgtttgtttttttaatgcA------TCA------------ATATTGTT------ATGTTTGCCACATTGTAACACTACATTATAGTTCGTGTGTTAATGATTTGATTAAATCTGTGATAAA----ATAAGAAAGTATAT----GGTAAATATTTGTTTTAAATAAATACTTGTACCTCTAAATGCACATATATTTTTAATATAGGGTTATATTTAACAAA-----TAACATTTCACCAAAAAATCTTTATTCTTTTTAAT------CTCTG------------TAGAAGACATAT--CTATA--TATGTTTCCT-T-T-CTTATTtttcatccatgaggtgaaaaagttatggtctgttgggctaccagaaacaactcttt
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATATTAT-T-A-TTGATTGAATTTGTTTCTCACAAAGACTAGAAAGAGTATGTTTTAAAATAGAAAAGA---TCACTGACAGTG----ACTAGAAAGTGATATTTAATTGAAAGGGTCTGTGACCTGTTGTGAGTATCTGAAATAACCTCAAAATGTGTTTTACATATTCCCCTTCACATTTC-TTTATGACTT-CAATGAATGATGAAAAAAAATGTTCAACCATTAAGTC---ATAAAAAAATtc
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Unaligned ( gi|17 ): TGCCATATTCAACAAACAGTATTACAGTATACATTATCGTATAGGATGCAGAATTCA