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Reference ( gi|1 )            :                                                                              TTTAATGTTCGTCAATTATTATTTTTCTTGTCGTTTCCCTTAATCACA--AGGGGTGAGCCTGTACACGCATTTTCTTAC--CC-GT---ACAATATGTACGCGCTTTTTTTGCACCTGTGTGTAA--CGTACA--TACAA--TTCGGCACCCATGAACA----CATGATA--CA---GTA--CACGCG-AACTAAA-AT-ATTT-T-GCGT-TT-----ATTTG----------ACAAAATGAGGGTTCCCTCGTCAGGTATTTAAATTTAAATAGATTTGAATATTTTAAAACGATTGTAATTGATATACTTGTTTGTATGCACTGGACTTTTTCTCATTGAAATCAGTAGTTGCTGTAGAGAGATTTACATAAAACACTTTTTT----TT--------TTACGCGGATG--AGCAAAATACGGAAA----AT--CG-CAATGAAA-AGA----GATACCAGACGCAAACGGAAGTA-ATAAA-------------TGTGCTG--------TATTAACATATGTTTAAATTTAACGATGTCATTTTC---ACC-TCTTTGTTGAAGGAATTTAAT---AAAACTCGGTTTCAAATAAC-----------------CAAGTAA----ACGGTACTCGTCAGGCAATAATACG---------------------GCACCCGTGAATTTTCTAATTAAA----ATTT--CAAGACATGTGTGCCGTGCAAAAGTT------T-----GTATG---T--AAACGATGATTTTGAGCT---------AA--TTG------------CTATGCAAATTTCCAG-GATTG-TAGTTGAGTA--AGGCT--T-CAAA--ATGATTGGTA-TCCC--ATATTT-GATTTTATTTCATGTCAATATAAC-A-----ATATATCAC-A-ATAAGATATGTTGCCAGGATCTTT----C-TACTACACCGTTATTTT-T--GATATTATAATGCATGTTTAACTATAAATTGGA-TATAGATGGACCATA-------T-ATGTT--AATA-----ACACGGT---TATAATTCAC--CTAAATGGGTGGAATTTGCTGTAACATGATATTACTTACATTGTGTT-CTTTTCCTTTG-TTTACGAGTGCC-----GTATAT--TGAGCT-T-----AC--GGGTGCA----G-AA-AGGCGCCA---C-TGTACAATTTTTTTAC-GGGTACGAAAAAGC-GCGTA-ATTACTGGCTCACCCGCTGT
gi|7                          :                                                                                                                     TTAAT-ACGGGAGGGTTGGTTCGGTACAC-CTTTTTTTCGCAATT-GTGA-AAAAAATGTACGAGCGTTTTG-GCACCCGTGTATAG--TGTACA--TACAA--TTCTGTAACCGTAAACA----CAAACTA--CG---GTA--CCCGTG-AATCAAA-
gi|5                          : atttcaattggattggactatatatggaacatattgttttaatattattacatatataattgaccaaattaagtgaaattaggtttaacaagaggctgcttagattttcttccttttccATTACA--AGGC-TGTGCCAGTATGCGCTTTTTCGCCC--CCTGTG--AAAATATG--CGCG---TTTTGGCACCCTTGCATAG--TGTACACATACAAAACTCGGCACACATAAACAAATTCACGAGA--CG---GTA--ACCGTGAAACTAAACAC-ATCTAC-ACAT-CTGAACAATCTGAGGTGATGCTACAAAATGAAGATTATCTTGTC
gi|3                          :                                                                   aaataagtttgtgttgtttatattcaaaacttgtctttggtttcattctaaataatccatgtttcttaaaggatcgtACGCAGTTTTTT-------GTGAAAAAAT-TGTACATG-TTTTTTGGCACCCATGTATAG--TGTACA--TACAA--TTAGGCACCCATGGACA----CAAGATA--TG---GCACCCATG-G-AACCAAA-GTAATCT-T-G-GG-TG-----ATATG----------AGAAAATGAGTATACCAT-GTCAGGTATTAAAATTTAAATAAATTTGAATATTTAAATACATTTGTAGCCAATGTA------TGTATGCACTAGG-TTTTTC-CATTGAAATCAGT--TTG------------------AAACCA-TGTTTT----TT--------TTATGAAAATT--CACAAAACACGGAAA----AT--CT-CAATCAAA-ACA----AATACCAGAAGCAAATGAAAGTA-ATAAATTGTATAAATAATTGTAATGAATAATTATATTGTCATTTGCTTTAATTTAACAATGTCATTTTT---ACC-CCTTTTTTTAAGGAATTTAAT---GAAAATTGGTTTCAAATAAC-----------------CATGTGA----ACTTCACCCATCAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                  tgt---ACAAAATGTGCGC---TTTTTCGCACCCATGAACAAATTGTACA--CGTGA--TTTGGCACCCGTG----------T-ATA--GA---GTA--CA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                             cacgatggtgTATAG--TATACA--TACAA--TTCAGCACCCTTGAAAA----CATGATAGTCATAGGTC--TGTG-G-AACCAAA-AT-ATTC-TGGGGTGTT-----A--TG----------ACAAAATGAGGATT-----ATCAAGTATCT-AATTCAAttaaattctgcacccgtaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gaaaaaattgttcatcatacatgtatcATTTTTCCCCAGTGAAATCAGT------TGTAGAGAAATTTACGTAAAACA--TGAGT----TT--------TTATGTGAATT--A--AAAAAACGGAAA----ATACCATCAATCAAA-AGA----GATACCAGAACAAAACTGAAGAA-GTAAAA------------TGTGTTG--------AATTATCATTTATATTGATTTAACGATGCCATTTTT---ACA-TTTCTGTTGAAGGAACTTGATGAAAAAAGT--GTTTTAAATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atatgcgcaacacTTTTTCATTGAAGTAAGTTGCTGCTGTAGA----TTTGCATAAAACA------TGAGGTT--------TTACCCGGATT--AAAGAAATATGGAAA----AT--CT-CAAACAAA-CGA----TATACCAGAAACAAACTGAAGTGCAT----------------TAT-CT-----------TTAA-ATTTGTTTTTATTTAACGATGTCATTTTTTTAACC-TTTTGGTTAAAGGAACTTAAT---GAAAATCAGCTTTAAGTAACAGGATGAACGGCACCCCCAGGCAATGACACGGCACCC-CCGGGCAATGATACGGCAGCCCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATGCTCTAATGACCTTTTATTT--CAAGACACGTACGCCGTAC-ACATTT------T-----GCATAGATT--AAATGATGATTTTGAGCTTAATGTTCCAA--TAT------------CTATGCAAATTTGCAG-GATTG-CAGAAGATTT--ATGCT--T-T------TAAGTGGTATTCTC--AGATTTAGTTTTTATCTTATGTTAATGTAACTACATGCATATACAACGA-ATAA-ATATGTTGCCAGGATCTAG----C-AAATACACCGTTATTTA-C--GACATTATAATGCATATTTAACTATGGTTTGGA-TATAGCAGGACCACA-------TAATGTT--GATA-----ATACAGA---TATATATCAC--ACAAATGAG-----TTTACTGTAACACGATATAACTAATATTTTGTTCCTTTTCTTTTGATTCACGAGTG-------GTATCT--GGAGCT-T-----AC--GGGTGCA----G-CATTGG----A---C-TATAC---------AC-GGGTGCAGAAAAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcgctacagttgTGTTGTAGAGAAAAATGCATAA--------TGC----TT--------TTATGCAGATT--AACAAAAAATGGAAA----TT--CT-TAATCAAA-AGA----AATGCAAGAAGTAAACTAAAG------AA-------------TG--------------ATCA-CTTAT-TCTAA-TATAATGATGTCATTTTA---ACCATTTTAGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT----TTGTAGAAACTTACATGGATATTA-CAAAATGCAAAAACAAAAT--CA--ACCGAAATAGATCTAAATACCAGAAACAAACTGAATTA-AGAAT-------------TATGTTA--------TATTAGCATTTGTTTTA-TGTAACGATTTCATTTTT---ACC-TTTTTGTTGAATTAATTTAAT-----------GTTT-AA--AAC-----------------CGAGAGA----ACGGCAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATA-ATAAA-------------TGTGTT---------TATCA-------TTTA--TTTAA----------TTA---ACC-TTTTTGTTGAAGGAAATAAAT---GACAATCGGTGTCAAGTAAC-----------------CGAGTGA----Atc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGGAACTTAAT---GAAAATTAATTTCAAATAAC-----------------CAAGTAA----ATAGCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATG---------------------GTACCCATTAATTTTCTAAT-AAA----ATTTATCAAGACATGTG--CCATACAAAAATTGCA---TAGCGAGTATG---T--AAACGATGATATTGGTCT---------AA--ATGTGTGTCCAATAGCTATACAAAGTTGCAG-GATTG-CAGGAGAGTA--A--TTAAT-CAAA--ATG-TTGATT-TCCC--AGATTTTG--TTTATTTCACATCAATGTAAC-A-----ATATACCAT-G-ATTAAGTATGct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAAAT---ATTT--CAGGACACACGTGGCTACCAAAAATTATAAAGT-----GGATA---TTGAAATGACGATTTCTAGCT---------CAGTTTG------------CT-T-CTAATAGCTAT-GACAGATA-TT----------CT--T-CAAA--ATGAT-GACA-ACACTGATAAT---ATTACAATTTGTGTCAATATAAT-A-----ATATAAAACAA-ATAA-ATATGATGCCAGGATTTTG----C-AAATACAACA-TATTTT-TACGGTATTAAAAAACATTTGTCACTGTAGTTTGGA-TATAAGT--ACTCTG-------TCATGCT--AACA-----AGACAGaaagtactttgtaatttatgacattaaatgtaaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggtgctgtatatgaGTG------T-----ATACG---G--AAACGATGATTTTGAGCC-------------TTA-------------TCTGCG----TCCAGCGACT-----TTGAATA-----TT--TGCAAGCCATGATTG-TA---AC--AGATTT-TATGTAATTTTATGTCAA-ATTAC-A-----ATATGTCAC-A-AAAAGGTACGTTGCCATTATTTCCGGCAC-GACTACAAAGCTATTTA-T--GATATTA-AAAACA----TAATTACAATTAGGA-TATAAATGGACCATGTGTCATTT-ATTTT--GATA-----TTATAGG---TATATTTCACAAAAAAAT-GATGGAGAATGCTATAACgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -----GTATG---T--AAA--------TTGAGC----------AA--TAG------------GTATGCACATTTGCAG-GATTG-TAG--GAGCATTTTTTT--T-CAAA--ATGGTTG----TCCT--AGATTG-GATTGTATTTTATGTCAAGTTAAC-A-----ATATGCC-C-AGAGAAAGTATGTTGCCAGGATTTGA----C-GAATACAATGCTAGGCTAC--GATATTATAATGCATATCTAACTATAATGTTGA-TATCGTTGGACCACA-------T-GT-TT--AAAA-----A
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgaaaattgcatagcagTTAT-A-ATAAGA-ATATTGCCATGATTTCA----CATA-TAGAACGCTATTTA-T--GGTATTAAAAAGCATAATTCACT-CAGGTTGGAATACAAATGGACCATAT------T-GTGTT--AATA-----TTACGACATATATAAATGAC--CTAAATAAGTTGAATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTGGACTATATATGGAACATA-------T--TGTTTTAATATTATTACATA-----TATAATTGAC--CAAATTAAGTGAAATTAGGTTTAACAAGAGGCTGCTTAGATTTTCTTCCTTTTCCTTTGATTCACGGGTACC-----GTAGTT--TGTGTT-T-----AC--GGTTACA----G-AA-TTGTA--------TGTACA--CTATACAC-GGGTGCCAAAACGC-TCGTACATTggaggttacttagattt
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|15                         :                                                                   GCGC-TTTTTCGCACC---C--ATGAACAAATTGTACA--CG--TGATTT-GGCACCCGTGTATAGAGT--ACATTA--AATTCTGCACCCGTAAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cacgatggtgacaaaatgtAATAATAAA-TGT-------GTT-T--------AT---------CATTT------ATTTAA----------TTA---ACC-TTTTTGTTGAAGGAAATAAATGACAATCG-GTGTCAAGTAAC-----------------CGAGTGA----A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGGAACTTAATGAAAATTA-ATTTCAAATAAC-----------------CAAGTAA----ATAGCACC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCGCTACAGTTGTTTTTCATTGAAGTAAGTTGCTGCTGTAGA----TTTGCATAAAACA--T-GAGGTTTTACCCGGAT-TAAAGAAATATGGAAA--AT--C-TCAAACAAAC--GA----TATACCAGAAACAAACTGAAGT--------GC-------ATTAT--------CTTTA------AATTTGTTTTTATTTAACGATGTCATTTTTTTAACC-TTTTGGTTAAAGGAACTTAATGAAAATCA-GCTTTAAGTAACAGGATGAACGGCACCCCCAGGCAATGACACGGCACCC-CCGGGCAATGATACGGCAGCCCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATGCTCTAATGACCTTTTATTT--CAAGACACGTACGCCGTAC-ACATTTTGCA---T-----AGAT---T--AAATGATGATTTTGAGCTTAATGTTCC---AA--TATCTATGCAAATTTGC-AG-GATTGCAGAAG-ATTTA-TGCT-TTTAAG-------TGGTATTCTCAGA-TTTAGTTTTTAT--CTTATGTTAATGTAACTACATGCATATACAACGA-A-TAAA-TATGTTGCCAGGATCTA----GCAAATACACCGTTA--TTTACGACATTATAATGCATATTTAACTATGGTTTGG-A-TATAGCAGGACCACA-------TAATGTT--GATA--AT---ACAGATATATATCACACAAAT------GAGTTTACTGTAACACGATATAACTAATATTTTGTTCCTTTTCTTTTGATTCACGAGTG--GTATCTGGAGCTTACGGGTGCAG--------CATTGGAC----TATACACGGGTGCAGAAAAGt
gi|3                          :                                                               GTACGCAG-TTTTTT-----------GTGAAAAAATTGTACA--TG--TT-TTTTGGCACCCATGTATAGTGT--ACATAC--AATTAGGCACCCATGGACA----CAAGATA--T---GGCACCCATGGAACCAAA-GTAATCTT---G-GG-TGATAT-GAGAAAATGAGTATACCAT---GTCAGGTATTAAAATTTAAATAAATTTGAATATTTAAATACATTTGTAGCCAATGTA------TGTATGCACTA-GGTTTTT--CCATTGAAATCAGT--TTG------------------AAACCA--TGTTTTTTTTATGAAAAT-TCACAAAACACGGAAA--AT--C-TCAATCAAAA--CA----AATACCAGAAGCAAATGAAAGTAATAAATTGTATAAATAATTGTAATGAATAATT-ATATTGTCATTTGCTTTAATTTAACAATGTCATTTTT---ACC-CCTTTTTTTAAGGAATTTAATGAAAATTG-GTTTCAAATAAC-----------------CATGTGA----ACTTCACCCATCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tTGATAAA----TATTT--CAGGACACACGTGGC-TACCAAAAATTATAAAGT-----GGAT--ATTGAAATGACGATTTCTAGCT------------CAGTTTGCT-TCTAA--TAGCTAT-GA---CAGA-----TAT-T--C-TTCAAA--ATGAT-GACAA-CACTGA-T---AATATTACAATTTGTGTCAATATAAT---A---ATATAAAAC-A-AATAAA-TATGATGCCAGGATTTT----GCAAATACAACA-TATTTTTACGGTATTAAAAAACATTTGTCACTGTAGTTTGG-A-TATAAGT--ACTCTG-------TCATGCT--AACA--AG---ACAGGT
gi|5                          :                                ggtgctgtataATTAC---AAGGCTGTGCCAGTATGCGC-TTTTTCGC-CC---CCTGTGAAAA-TATG--CG--CG--TT-TT--GGCACCCTTGCATAGTGTACACATACAAAACTCGGCACACATAAACAAATTCACGAGA--C---GGTAACCGTGAAACTAAACACA-TCT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaataagtttgtgttgtttatattcaaaacttgtctttggtttcattctaaataatccatgtttcttaaaggatcgt---T-----GTATACGG--AAACGATGATTTTGAGCC----------------TTA-TCTGCG----TCC-AGCGACT----TTG-AATA--T--T-TGCAAGCCATGATTG-TA---ACAGA-TTT-TATGTAAT--TTTATGTCAA-ATTAC---A---ATATGTCAC-A-A-AAAGGTACGTTGCCATTATTTCCGGCACGACTACAAAGCTA--TTTATGATATTAAAAA-CA----TAATTACAATTAGG-A-TATAAATGGACCATGTGTCATTT-ATTTT--GATA--TT---ATAGGTATATTTCACAAAAAAATGATGGAGAATGCTATAACacacatctgaacaatctgaggtgatgctacaaaatgaagattatcttgtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTTGG-ACTATATATGGAACATA-------T--TGTTTTAATATTATT--ACATATATAATTGACCAAATTAAG-TGAAATTAGGTTTAACAAGAGGCTGCTTAGATTTTCTTCCTTTTCCTTTGATTCACGGGTACCGTAGTTTGTGTTTACGGTTACAGAATTGTA----TGTACA--CTATACACGGGTGCCAAAACGCTCGT-A
gi|7                          :                            atttcaattggaTTAAT-ACGGGAGGGTTGGTTCGGTACAC-C-TTTTTTTC-GCAATT--GTGAAAAAAATGTACGAGCG--TT-TT--GGCACCCGTGTATAGTGT--ACATAC--AATTCTGTAACCGTAAACA----CAAACTA--C---GGTACCCGTG-AATCAAA-catttttttcacaattgcgaaaaaaaggtgtaccgaaccaaccctcccgtattaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atttcaattggattggactatatatggaacatattgttttaatattattacatatataattgaccaaattaagtgaaattaggtttaacaagaggctgcttagattttcttccttttccATGGTACCCATTAATTTTCTAATAAA-----ATTTATCAAGACATGTGC--CATAC-AAAAATTGCA---TAGCGAGTAT--GT--AAACGATGATATTGGTCTAAATGTGTGTCCAA--TAGCTATACAAAGTTGC-AG-GATTGCAGGAG-AGTAA-T--TAATCAAA--ATG-TTGATTT-CCCAGATTTT-G--TTTAT--TTCACATCAATGTAAC---A---ATATACCAT-G-A-TTAAGTATG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAAATTGCA---TAGCAGGTAT--GT--AAA--------TTGAGC-------------AA--TAGGTATGCACATTTGC-AG-GATTGTAGGAGCATTTT-T--T-TTCAAA--ATGGTTG---T-CCTAGA-TTG-GATTGTAT--TTTATGTCAAGTTAAC---A---ATATGCC-C-AGA-GAAAGTATGTTGCCAGGATTTG----ACGAATACAATGCTAG-GCTACGATATTATAATGCATATCTAACTATAATGTTG-A-TATCGTTGGACCACA-------T-GT-TT--AAAA--Aaaagtactttgtaatttatgacattaaatgtaaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AAATAAATTTTGTCAATGTTCACAATTCTCTAAAAGTACCCAATATTGTTCCCTTAAATAAAACGCCTACTAT






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gi|13                         :                                                                                                                              ttTATAGTAT--ACATAC--AATTCAGCACCCTTGAAAA----CATGATAGTCATAGGT--CTGTGG-AACCAAA-ATA-T-TCTGGG-GTGTTA--T-GACAAAATGAGGAT--T----ATCAAGTATCT-AATTCAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaaaaaattgttcatcatacatgtatcTGTTGTAGAGAAAAATGCATAA---------TGCTTTTATGCAGAT-TAACAAAAAATGGAAA--TT--C-TTAATCAAAA--GA----AATGCAAGAAGTAAACTAAAG-----AA-TG---------------------AT---------CACTTATTCTAATATAATGATGTCATTTTA---ACCATTTTAGTT
gi|15                         :                                                                   GC-GCTTTTT--CGCAC-CC--ATGAACAAATTGTACA--CG--TGATTT-GGCACCCGTGTATAGAGT--ACATTA--AATTCTGCACCCGTAAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cacgatggtgacaaaatgtAATAATAAA-TGT-------GTT-T--------AT---------CATTT------ATTTAA----------TTA---ACC-TTTTTGTTGAAGGAAATAAATGACAATCG-GTGTCAAGTAACCGAGTGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGGAACTTAATGAAAATTA-ATTTCAAATAACCAAGTAAAT---------------------AGCACC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCGCTACAGTTGTTTTTCATTGAAGTAAGTTGCTGCTGTAGA----TTTGCATAAAACA--T-GAGGTTTTACCCGGAT-TAAAGAAATATGGAAA--AT--C-TCAAACAAAC--GA----TATACCAGAAACAAACTGAAGT--------GC-------ATTAT--------CTTTA------AATTTGTTTTTATTTAACGATGTCATTTTTTTAACC-TTTTGGTTAAAGGAACTTAATGAAAATCA-GCTTTAAGTAACAGGATGAACGGCACCCCCAGGCAATGACACGGCACCC-CCGGGCAATGATACGGCAGCCCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATGCTCTAATGACCTTTTATTT--CAAGACACGTACGCCGTAC-ACATTTTGCA---T-----AGAT---T--AAATGATGATTTTGAGC-TTAATGTTCC---AA--TATCTATGCAAATTTGCAG-GATTGCAGAAG-ATTTATGCT-TTTAAG-------TGGTATTCTCAGA-TTTAGTTTTTAT--CTTATGTTAATGTAACTACATGCATATACAACGA-ATAAA-TATGTTGCCAGGATCT----AGCAAATACACCGTTA--TTTACGACATTATAATGCATATTTAACTATGGTTTGG-A-TATAGCAGGACCACA-------TAATGTT--GATA--AT---ACAGATATATATCACACAAAT------GAGTTTACTGTAACACGATATAACTAATATTTTGTTCCTTTTCTTTTGATTCACGAGTG--GTATCTGGAGCTTACGGGTGCA-------G-CATTG--GA--CTATACACGGGTGCAGAAAAGt
gi|3                          :                                                               GTACGCAGTTTTTT------------GTGAAAAAATTGTACA--TG--TT-TTTTGGCACCCATGTATAGTGT--ACATAC--AATTAGGCACCCATGGACA----CAAGATA--T---GGCACCCAT-GGAACCAAA-GTAATCTT---G-GG-TGATAT-GAGAAAATGAGTATACCAT--GTCAGGTATTAAAATTTAAATAAATTTGAATATTTAAATACATTTGTAGCCAATGTA------TGTATGCACTA-GGTTTTT--CCATTGAAATCAGT--TTG------------------AAACCA--TGTTTTTTTTATGAAAAT-TCACAAAACACGGAAA--AT--C-TCAATCAAAA--CA----AATACCAGAAGCAAATGAAAGTAATAAATTGTATAAATAATTGTAATGAATAATT-ATATTGTCATTTGCTTTAATTTAACAATGTCATTTTT---ACC-CCTTTTTTTAAGGAATTTAATGAAAATTG-GTTTCAAATAACCATGTGAAC---------------------TTCACCCATCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tTGATAAA----TATTT--CAGGACACACGTGGC-TACCAAAAATTATAAAGT-----GGAT--ATTGAAATGACGATTTCTAGC-T------------CAGTTTGCT-T-CTAAT----AG---CTATGACAG-A-TATT--C-TTCAAA--ATGAT-GACAACA-CTGA-T---AATATTACAATTTGTGTCAATATAAT---A---ATATAAAACAA-ATAA-ATATGATGCCAGGATTT----TGCAAATACAACA-TATTTTTACGGTATTAAAAAACATTTGTCACTGTAGTTTGG-A-TATAAGT--ACTCTG-------TCATGCT--AACA--AG---ACAGGT
gi|5                          :                                        ggtgctgtataAAGGCTGTGCCAGTATGC-GCTTTTT--CGC-C-CCCTGTG---AAAATATGCG--CG---T-TTT-GGCACCCTTGCATAGTGTACACATACAAAACTCGGCACACATAAACAAATTCACGAGA--C---GGTAACCGT-GAAACTAAACACA-TCT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaataagtttgtgttgtttatattcaaaacttgtctttggtttcattctaaataatccatgtttcttaaaggatcgtattac---T-----GTATACGG--AAACGATGATTTTGAGCCT------------TA--TC----TGCG----TCCAGCGACT----TTG-AATA-T--T-TGCAAGCCATGATTG-TA--A-CAGA-TTT-TATGTAAT--TTTATGTCAA-ATTAC---A---ATATGTCAC-A-AAAAGGTACGTTGCCATTATTTCCGGCACGACTACAAAGCTA--TTTATGATATTAAAAA-CA----TAATTACAATTAGG-A-TATAAATGGACCATGTGTCATTT-ATTTT--GATA--TT---ATAGGTATATTTCACAAAAAAATGATGGAGAATGCTATAACacacatctgaacaatctgaggtgatgctacaaaatgaagattatcttgtc
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gi|7                          :                            atttcaattggaTTAAT-ACGGGAGGGTTGGTTCGGTACAC--CTTTTTTTCGC-AATT--GTGAAAAAAATGTACGAGCG--TT-TT--GGCACCCGTGTATAGTGT--ACATAC--AATTCTGTAACCGTAAACA----CAAACTA--C---GGTACCCGT-G-AATCAAA-tttttcacaattgcgaaaaaaaggtgtaccgaaccaaccctcccgtattaa
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gi|3                          :                                                               GTACGCAGTTTTTT----------GTGAAAAAATTGTACA--TG--TT-TTTTGGCACCCATGTATAGTGT--ACATAC--AATTAGGCACCCATGGACA----CAAGATA--T---GGCACCCAT-GGAACCAAA-GTAATCTT---G-GG-TGATAT-GAGAAAATGAGTATACCAT-GTCAGGTATTAAAATTTAAATAAATTTGAATATTTAAATACATTTGTAGCCAATGTA------TGTATGCACTA-GGTTTTT--CCATTGAAATCAGT--TTG------------------AAACCA--TGTTTTTTTTATGAAAAT-TCACAAAACACGGAAA--AT--C-TCAATCAAAA--CA----AATACCAGAAGCAAATGAAAGTAATAAATTGTATAAATAATTGTAATGAATAATT-ATATTGTCATTTGCTTTAATTTAACAATGTCATTTTT---ACC-CCTTTTTTTAAGGAATTTAATGAAAATTG-GTTTCAAATAACCATGTGAAC---------------------TTCACCCATCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTGATAAA----TATTT--CAGGACACACGTGGC-TACCAAAAATTATAAAGT-----GGAT--ATTGAAATGACGATTTCTAGC-T---------CAGT----------TTGCT-T-CTAAT----AG---CTATGACAG-A-TATT--C-TTCAAA--ATGAT-GACAACA-CTGA-T---AATATTACAATTTGTGTCAATATAAT---A---ATATAAAACAA-ATAA-ATATGATGCCAGGATTT----TGCAAATACAACA-TATTTTTACGGTATTAAAAAACATTTGTCACTGTAGTTTGG-A-TATAAGT--ACTCTG-------TCATGCT--AACA--AG---ACAGGT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaataagtttgtgttgtttatattcaaaacttgtctttggtttcattctaaataatccatgtttcttaaaggatcgtattac---T-----GTATACGG--AAACGATGATTTTGAGCCT---------TA------------TC----TGCG----TCCAGCGACTTT----G-AATA-T--T-TGCAAGCCATGATTG-TA--A-CAGA-TTT-TATGTAAT--TTTATGTCAA-ATTAC---A---ATATGTCAC-A-AAAAGGTACGTTGCCATTATTTCCGGCACGACTACAAAGCTA--TTTATGATATTAAAAA-CA----TAATTACAATTAGG-A-TATAAATGGACCATGTGTCATTT-ATTTT--GATA--TT---ATAGGTATATTTCACAAAAAAATGATGGAGAATGCTATAACacacatctgaacaatctgaggtgatgctacaaaatgaagattatcttgtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gTTGG-ACTATATATGGAACATA-------T--TGTTTTAATATTATT--ACATATATAATTGACCAAATTAAG-TGAAATTAGGTTTAACAAGAGGCTGCTTAGATTTTCTTCCTTTTCCTTTGATTCACGGGTACCGTAGTTTGTGTTTACGGTTACAGAAT--TG-TA-TGTACA--CTATACACGGGTGCCAAAACGCTCGTACATT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atttcaattggattggactatatatggaacatattgttttaatattattacatatataattgaccaaattaagtgaaattaggtttaacaagaggctgcttagattttcttccttttccATGGTACCCATTAATTTTCTAATAAA-----ATTTATCAAGACATGTGC--CATAC-AAAAATTGCA---TAGCGAGTAT--GT--AAACGATGATATTGGTC-T---------AAATGTGTGTCCAATAGCTATACAAAGTTGCAG-GATTGCAGGAG-AGTAAT--TAATCAAA--ATG-TTGATTTCC-CAGATTTT-G--TTTAT--TTCACATCAATGTAAC---A---ATATACCAT-G-ATTAAGTATG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttttttgtagaaacAT-A-ATAAGA-ATATTGCCATGATTT----CACATATAGAACGCTA--TTTATGGTATTAAAAAGCATAATTCACT-CAGGTTGGAA-TACAAATGGACCATAT------T-GTGTT--AATA--TTACGACATATATAAATGACCTAAATAAG-TTGAATT----------GGAGGTTACTTAGATTT
gi|13                         :                                                                                                                            ttTATAGTAT--ACATAC--AATTCAGCACCCTTGAAAA----CATGATAGTCATAGGT--CTGTGG-AACCAAA-ATA-T-TCTGGG-GTGTTA--T-GACAAAATGAGGAT-----T-ATCAAGTATCT-AATTCAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gaaaaaattgttcatcatacatgtatcTGTTGTAGAGAAAAATGCATAA---------TGCTTTTATGCAGAT-TAACAAAAAATGGAAA--TT--C-TTAATCAAAA--GA----AATGCAAGAAGTAAACTAAAG-----AA-TG---------------------AT---------CACTTATTCTAATATAATGATGTCATTTTA---ACCATTTTAGTT
gi|15                         :                                                                   GC-GCTTTTT--CGCACCC-ATGAACAAATTGTACA--CG--TGATTT-GGCACCCGTGTATAGAGT--ACATTA--AATTCTGCACCCGTAAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cacgatggtgacaaaatgtAATAATAAA-TGT-------GTT-T--------AT---------CATTT------ATTTAA----------TTA---ACC-TTTTTGTTGAAGGAAATAAATGACAATCG-GTGTCAAGTAACCGAGTGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGAACTTAATGAAAATTA-ATTTCAAATAACCAAGTAAAT---------------------AGCACC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCGCTACAGTTGTTTTTCATTGAAGTAAGTTGCTGCTGTAGA----TTTGCATAAAACA--T-GAGGTTTTACCCGGAT-TAAAGAAATATGGAAA--AT--C-TCAAACAAAC--GA----TATACCAGAAACAAACTGAAGT--------GC-------ATTAT--------CTTTA------AATTTGTTTTTATTTAACGATGTCATTTTTTTAACC-TTTTGGTTAAAGGAACTTAATGAAAATCA-GCTTTAAGTAACAGGATGAACGGCACCCCCAGGCAATGACACGGCACCC-CCGGGCAATGATACGGCAGCCCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATGCTCTAATGACCTTTTATTT--CAAGACACGTACGCCGTAC-ACATTTTGCA---T-----AGAT---T--AAATGATGATTTTGAGC-TTAATGTTCCAA------------TATCTATGCAAATTTGCAG-GATTGCAGAAG-ATTTATGCT-TTTAAG-------TGGTATTCTCAGA-TTTAGTTTTTAT--CTTATGTTAATGTAACTACATGCATATACAACGA-ATAAA-TATGTTGCCAGGATCT----AGCAAATACACCGTTA--TTTACGACATTATAATGCATATTTAACTATGGTTTGG-A-TATAGCAGGACCACA-------TAATGTT--GATA--AT---ACAGATATATATCACACAAAT------GAGTTTACTGTAACACGATATAACTAATATTTTGTTCCTTTTCTTTTGATTCACGAGTG--GTATCTGGAGCTTACGGGTGCA-------G-CATTG--GA--CTATACACGGGTGCAGAAAAGt
gi|3                          :                                                               GTACGCAGTTTTTT----------GTGAAAAAATTGTACA--TG--TT-TTTTGGCACCCATGTATAGTGT--ACATAC--AATTAGGCACCCATGGACA----CAAGATA--T---GGCACCCAT-GGAACCAAA-GTAATCTT---G-GG-TGATAT-GAGAAAATGAGTATA-CCAT-GTCAGGTATTAAAATTTAAATAAATTTGAATATTTAAATACATTTGTAGCCAATGTA------TGTATGCACTA-GGTTTTT--CCATTGAAATCAGT--TTG------------------AAACCA--TGTTTTTTTTATGAAAAT-TCACAAAACACGGAAA--AT--C-TCAATCAAAA--CA----AATACCAGAAGCAAATGAAAGTAATAAATTGTATAAATAATTGTAATGAATAATT-ATATTGTCATTTGCTTTAATTTAACAATGTCATTTTT---ACC-CCTTTTTTTAAGGAATTTAATGAAAATTG-GTTTCAAATAACCATGTGAAC---------------------TTCACCCATCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTGATAAA----TATTT--CAGGACACACGTGGC-TACCAAAAATTATAAAGT-----GGAT--ATTGAAATGACGATTTCTAGC-T---------CAGT----------TTGCT-T-CTAAT----AG---CTATGACAG-A-TATT--C-TTCAAA--ATGAT-GACAACA-CTGA-T---AATATTACAATTTGTGTCAATATAAT---A---ATATAAAACAA-ATAA-ATATGATGCCAGGATTT----TGCAAATACAACA-TATTTTTACGGTATTAAAAAACATTTGTCACTGTAGTTTGG-A-TATAAGT--ACTCTG-------TCATGCT--AACA--AG---ACAGGT
gi|5                          :                                        ggtgctgtataAAGGCTGTGCCAGTATGC-GCTTTTT--CGCCCCCTGTGAA---AATATGCG--CG--TT-TT--GGCACCCTTGCATAGTGTACACATACAAAACTCGGCACACATAAACAAATTCACGAGA--C---GGTAACCGT-GAAACTAAACACA-TCT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaataagtttgtgttgtttatattcaaaacttgtctttggtttcattctaaataatccatgtttcttaaaggatcgtattac---T-----GTATACGG--AAACGATGATTTTGAGCCT---------TA------------TC----TGCG----TCCAGCGACTTT----G-AATA-T--T-TGCAAGCCATGATTG-TA--A-CAGA-TTT-TATGTAAT--TTTATGTCAA-ATTAC---A---ATATGTCAC-A-AAAAGGTACGTTGCCATTATTTCCGGCACGACTACAAAGCTA--TTTATGATATTAAAAA-CA----TAATTACAATTAGG-A-TATAAATGGACCATGTGTCATTT-ATTTT--GATA--TT---ATAGGTATATTTCACAAAAAAATGATGGAGAATGCTATAACacacatctgaacaatctgaggtgatgctacaaaatgaagattatcttgtc
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gi|7                          :                            atttcaattggaTTAAT-ACGGGAGGGTTGGTTCGGTACAC--CTTTTTTTCGCAATT-GTGAAAAAAATGTACGAGCG--TT-TT--GGCACCCGTGTATAGTGT--ACATAC--AATTCTGTAACCGTAAACA----CAAACTA--C---GGTACCCGT-G-AATCAAA-tttttcacaattgcgaaaaaaaggtgtaccgaaccaaccctcccgtattaa
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gi|3                          :                                                               GTACGCAGTTTTTT----------GTGAAAAAATTGTACA--TG--TT-TTTTGGCACCCATGTATAGTGT--ACATAC--AATTAGGCACCCATGGACA----CAAGATA--T---GGCACCCAT-GGAACCAAA-GTAATCTT---G-GG-TGATAT-GAGAAAATGAGTATA-CCAT-GTCAGGTATTAAAATTTAAATAAATTTGAATATTTAAATACATTTGTAGCCAATGTA------TGTATGCACTA-GGTTTTT--CCATTGAAATCAGT--TTG------------------AAACCA--TGTTTTTTTTATGAAAAT-TCACAAAACACGGAAA--AT--C-TCAATCAAAA--CA----AATACCAGAAGCAAATGAAAGTAATAAATTGTATAAATAATTGTAATGAATAATT-ATATTGTCATTTGCTTTAATTTAACAATGTCATTTTT---ACC-CCTTTTTTTAAGGAATTTAATGAAAATTG-GTTTCAAATAACCATGTGAAC---------------------TTCACCCATCAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTGATAAA----TATTT--CAGGACACACGTGGC-TACCAAAAATTATAAAGT-----GGAT--ATTGAAATGACGATTTCTAGC-T---------CAGT----------TTGCT-T-CTAAT----AG---CTATGACAG-A-TATT--C-TTCAAA--ATGAT-GACAACA-CTGA-T---AATATTACAATTTGTGTCAATATAAT---A---ATATAAAACAA-ATAA-ATATGATGCCAGGATTT----TGCAAATACAACA-TATTTTTACGGTATTAAAAAACATTTGTCACTGTAGTTTGG-A-TATAAGT--ACTCTG-------TCATGCT--AACA--AG---ACAGGT
gi|5                          :                                        ggtgctgtataAAGGCTGTGCCAGTATGC-GCTTTTT--CGCCCCCTGTGAA---AATATGCG--CG--TT-TT--GGCACCCTTGCATAGTGTACACATACAAAACTCGGCACACATAAACAAATTCACGAGA--C---GGTAACCGT-GAAACTAAACACA-TCT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaataagtttgtgttgtttatattcaaaacttgtctttggtttcattctaaataatccatgtttcttaaaggatcgtattac---T-----GTATACGG--AAACGATGATTTTGAGCCT---------TA------------TC----TGCG----TCCAGCGACTTT----G-AATA-T--T-TGCAAGCCATGATTG-TA--A-CAGA-TTT-TATGTAAT--TTTATGTCAA-ATTAC---A---ATATGTCAC-A-AAAAGGTACGTTGCCATTATTTCCGGCACGACTACAAAGCTA--TTTATGATATTAAAAA-CA----TAATTACAATTAGG-A-TATAAATGGACCATGTGTCATTT-ATTTT--GATA--TT---ATAGGTATATTTCACAAAAAAATGATGGAGAATGCTATAACacacatctgaacaatctgaggtgatgctacaaaatgaagattatcttgtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gTTGG-ACTATATATGGAACATA-------T--TGTTTTAATATTATT--ACATATATAATTGACCAAATTAAG-TGAAATTAGGTTTAACAAGAGGCTGCTTAGATTTTCTTCCTTTTCCTTTGATTCACGGGTACCGTAGTTTGTGTTTACGGTTACAGAAT--TG-TA-TGTACA--CTATACACGGGTGCCAAAACGCTCGTACATT
gi|7                          :                            atttcaattggaTTAAT-ACGGGAGGGTTGGTTCGGTACAC--CTTTTTTTCGCAATT-GTGAAAAAAATGTACGAGCG--TT-TT--GGCACCCGTGTATAGTGT--ACATAC--AATTCTGTAACCGTAAACA----CAAACTA--C---GGTACCCGT-G-AATCAAA-tttttcacaattgcgaaaaaaaggtgtaccgaaccaaccctcccgtattaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atttcaattggattggactatatatggaacatattgttttaatattattacatatataattgaccaaattaagtgaaattaggtttaacaagaggctgcttagattttcttccttttccATGGTACCCATTAATTTTCTAATAAA-----ATTTATCAAGACATGTGC--CATAC-AAAAATTGCA---TAGCGAGTAT--GT--AAACGATGATATTGGTC-T---------AAATGTGTGTCCAATAGCTATACAAAGTTGCAG-GATTGCAGGAG-AGTAAT--TAATCAAA--ATG-TTGATTTCC-CAGATTTT-G--TTTAT--TTCACATCAATGTAAC---A---ATATACCAT-G-ATTAAGTATG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAATTGCA---TAGCAGGTAT--GT--AAA--------TTGAGC-----------AA------------TAGGTATGCACATTTGCAG-GATTGTAGGAGCATTTTT--T-TTCAAA--ATGGTTG---TCC-TAGA-TTG-GATTGTAT--TTTATGTCAAGTTAAC---A---ATATGCC-C-AGAGAAAGTATGTTGCCAGGATTT----GACGAATACAATGCTAG-GCTACGATATTATAATGCATATCTAACTATAATGTTG-A-TATCGTTGGACCACA-------T-GT-TT--AAAA--Aaaagtactttgtaatttatgacattaaatgtaaa


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blockSeqs                     :                                                       T  G   G      .       CGCCCCCT       A   T      .   .   .  T                   .       .      T      G      .     A    T              . A       .   . C TGGGTGATAT                    T                 .                                             .                C       TT              T    C      GAAAAA G     AA  TGA                 .   C    T       .   A             .   G                        TAAG   T  TGTTGAATTAT                          G    A                  T      .                           C .       G                                                                                                  A  T        .             GG A   .       A  TAGCAG       ACGG     T             TTAATGTTCCAA              TG  A G  A  T C   .      G C  . A  ATTA        .    A   ACAACA     .   AA       .           TA    A               A .    GG                CA     A         T  G             T  TG   ATT     G        . .               TTG           .     TTATT           TA     C    AAG        T   A     C  T        T        C           A          .     T                 G          .  .   .               C             
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Reference ( family-621 )      : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATCACGGGAGGGNTGNGCCGGTACGC-GCTTTTT--CGCACCC-GTGAANAAAATGTACG--CG--TT-TTT-GGCACCCGTGTATAGTGT--ACATAC--AATTCGGCACCCGTGAACA----CANGATA--C---GGTACCCGT-G-AACCAAA-ATA-TCTC---G-GT-TTAT-T-GACAAAATGAGGAT--CC-T-GTCAGGTATTTAAATTTAAATAGATTTGAATATTTNAANACGNTTGTAGCCGATGTA------TGTACGCACTA-GGTTTTTTCCCATTGAAATCAGT-GTTGCTGTAGAGAAATTTGCATAAAACA---TG--GTTTTTACGCGGAT-TAACAAAANACGGAAA--AT--C-TCAATCAAAA--GA----AATACCAGAAGCAAACTGAAGTAATAAA-TGT-------GTTGT--------ATT-A------CATTTGTTTTAATTTAACGATGTCATTTTT---ACC-TTTTTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCG-GTTTCAAATAACCGAGTGAAC---------------------GGCACCCGTCGGGCAATGATACGGCAGCCCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATTTTCTAATAAA----TATTT--CAAGACACGTGCGCCGTAC-AAAAATTGCATAGC--G--TATGT--AAACGATGATTTTGAGCTNA--GT-------T--AATNGCTATGCAAATTTGCAG-GATTGTAGNAG-ANT-AT-TTTTCAAA--ATGATTGGTATCC-CAGA-TTT-GATTTTAT--TTTATGTCAATATAAC---A---ATATACCAC-A-ATAAGGTATGTTGCCAGGATTT----CGCGAATACAACGCTA--TTTACGATATTANAANGCATATTTAACTATAGTTTGG-A-TATAGATGGACCATA------TTGTGTTAATA--AT---ACAGATATAATTCACCNAAATAAG-TGGAATTTGCTGTAACANGANGTTACTTANATTTTGTTCCTTTTCCTTTGATTCACGAGTGCCGTATNTTGAGCTTACGGGTGCAGAA---CG-CACTGTACA--CTATACACGGGTGCGAAAAAGCNCGTACATTACTGGCTCACCC
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaataagtttgtgttgtttatattcaaaacttgtctttggtttcattctaaataatccatgtttcttaaaggatcgtattac--TACGG--AAACGATGATTTTGAGCC-----T-------T--A-----TCTGCG----TCCAGCGACTTT----G-AAT-AT-TTG-CAAGCCATGATTG-TA--A-CAGA-TTT-TATGTAAT--TTTATGTCAA-ATTAC---A---ATATGTCAC-A-AAAAGGTACGTTGCCATTATTTCCGGCACGACTACAAAGCTA--TTTATGATATTAAAAA-CA----TAATTACAATTAGG-A-TATAAATGGACCATGTGTCATTTATTTTGATA--TT---ATAGGTATATTTCACAAAAAAATGATGGAGAATGCTATAACacacatctgaacaatctgaggtgatgctacaaaatgaagattatcttgtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgtaTTGG-ACTATATATGGAACATA------TTGTTTTAATATTATT--ACATATATAATTGACCAAATTAAG-TGAAATTAGGTTTAACAAGAGGCTGCTTAGATTTTCTTCCTTTTCCTTTGATTCACGGGTACCGTAGTTTGTGTTTACGGTTACAGAAT--TG-TA-TGTACA--CTATACACGGGTGCCAAAACGCTCGTACATT
gi|7                          :                            atttcaattggaTTAAT-ACGGGAGGGTTGGTTCGGTACAC--CTTTTTTTCGCAATT-GTGAAAAAAATGTACGAGCG--TT-TT--GGCACCCGTGTATAGTGT--ACATAC--AATTCTGTAACCGTAAACA----CAAACTA--C---GGTACCCGT-G-AATCAAA-tttttcacaattgcgaaaaaaaggtgtaccgaaccaaccctcccgtattaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttcaattggattggactatatatggaacatattgttttaatattattacatatataattgaccaaattaagtgaaattaggtttaacaagaggctgcttagattttcttccttttccATGGTACCCATTAATTTTCTAATAAA-----ATTTATCAAGACATGTGC--CATAC-AAAAATTGCATAGC--GAGTATGT--AAACGATGATATTGGTCTAA--ATGTGTGTCC--AATAGCTATACAAAGTTGCAG-GATTGCAGGAG-AGTAAT-TAATCAAA--ATG-TTGATTTCC-CAGATTTT-G--TTTAT--TTCACATCAATGTAAC---A---ATATACCAT-G-ATTAAGTATG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAATTGCATAGCAGG--TATGT--AAA--------TTGAGC-----------------AATAGGTATGCACATTTGCAG-GATTGTAGGAGCATT-TT-TTTTCAAA--ATGGTTG---TCC-TAGA-TTG-GATTGTAT--TTTATGTCAAGTTAAC---A---ATATGCC-C-AGAGAAAGTATGTTGCCAGGATTT----GACGAATACAATGCTAG-GCTACGATATTATAATGCATATCTAACTATAATGTTG-A-TATCGTTGGACCACA-------TGT-TTAAAA--Aaaagtactttgtaatttatgacattaaatgtaaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AAATAAATTTTGTCAATGTTCACAATTCTCTAAAAGTACCCAATATTGTTCCCTTAAATAAAACGCCTACTAT