lowQualScore : 111111111111111111111111111 1111111111111
lowQualScore : 222 1 11 1 444444444444 111111111111111111111111111 1 1 8888888888888 1 1 2 11 1 1 1 1 2 11 1 1 222 11 1 1 4444444444 1 1 444444444444 1 2222 22222 11 111 55555555555 1 11111111111 2222222 111111 33333333 3333333333333333 1 1 1 1111 66666666666666666666666666666666666666 111 1 222222222 1 11 111111 111 111111111 11111111 1111111111 111111111 99999999999999999999999999999999999 1 33333333333 1111 111111111111 11111111111 111111111111111111111111 11 33333333333333 333333333333333333333333333 11111 11 11 1
lowQualScore : 111 7 22 5 6 6 999999999999 6 222222222222222222222222222 6 7 6 6 6 5 6 8888888888888 6 5 5 3 0 4 6 22 7 6 7 5 6 5 0 4 6 6 99 6 77 5 6 6 6 6 5 6 6 111 2 44 7 0 6 1111111111 88 6 5 3 4 3 888888888888 0 5 6 0 3 0 6 2222 3 8 55555 0 33 444 8 22222222222 4 2 888 77777777777 1 0 0 7777777 66 0 8888 444444 4 5 55555555 3 77 1 0000000000000000 5 5 1 7 4 3 6 6 6 2 4444 6 6 6 88888888888888888888888888888888888888 5 1 000 5 3 5 555555555 0 888 3 00 44 111111 4 6 666 000 666 444444444 33333333 0 5555555555 666666666 44 6 3 55555555555555555555555555555555555 888888 1 2 77777777777 7 7777 4 2 222222222222 2 00000000000 444444444444444444444444 22 33 88888888 55 55555 333 3333 22 1 9999999 1 22 1 22 22 4 00000000000000 2 5 2 000000000000000000000000000 333 1 1 7 8 88 1 444444 33 88888 1 222 22 1 77 22 222 1 9 2
lowQualScore : ... . .. . . . ............ . ........................... . . . . . . . ............. . . . . . . . .. . . . . . . . . . . .. . .. . . . . . . . . ... . .. . . . .......... .. . . . . . ............ . . . . . . . .... . . ..... . .. ... . ........... . . ... ........... . . . ....... .. . .... ...... . . ........ . .. . ................ . . . . . . . . . . .... . . . ...................................... . . ... . . . ......... . ... . .. .. ...... . . ... ... ... ......... ........ . .......... ......... .. . . ................................... ...... . . ........... . .... . . ............ . ........... ........................ .. .. ........ .. ..... ... .... .. . ....... . .. . .. .. . .............. . . . ........................... ... . . . . .. . ...... .. ..... . ... .. . .. .. ... . . .
lowQualScore : 000 0 00 0 0 0 000000000000 0 000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 0 0000000000000 0 0 0 0 0 0 7 77 0 7 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 55 0 0 0 0 0 0 0 0 000 5 55 0 5 0 0000000000 55 0 0 0 0 0 555555555555 7 0 0 7 7 7 0 0000 5 8 00000 2 00 000 0 88888888888 6 5 333 99999999999 4 7 1 1111111 99 2 9999 888888 0 0 00000000 4 99 0 8888888888888888 0 0 0 3 3 2 7 7 7 7 2222 7 7 7 22222222222222222222222222222222222222 7 7 000 0 0 0 444444444 0 888 6 55 88 888888 5 8 444 666 444 555555555 22222222 5 0000000000 777777777 66 7 3 77777777777777777777777777777777777 888888 9 5 99999999999 5 3333 7 4 444444444444 0 00000000000 999999999999999999999999 55 11 11111111 33 00000 333 9999 55 8 3333333 9 66 9 88 88 0 55555555555555 0 9 0 111111111111111111111111111 333 9 9 0 3 77 7 666666 88 00000 6 888 22 5 55 99 888 6 6 2
consensus : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGATAAATAAATAATTTTCAAACTGGATGAATATCTCTCAAATATTT-CTGATATTAAATATAATAGCCATAGCTTTGATTTATTTTAATAAACTTATATTACTTATTTTGAAGTATTCGTGTGAGATTTGGGAATTTCATAGCTAAAATACTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGANGCTGAACACTNACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGCGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCCTGGCATGAACGCTTGGACAANTTNNTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGNGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACTTTAAGATAGAATCTGGTAGGTGGCATAGACCGATACGTATCNCNNTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACNAATATCATTTCATTATGGNGTGTTCATTGTGTGTAGAATTACGNAGANCATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAAACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTCGGTAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAGTTTAAGCATGTATA--CGTTTAAANCTTTT-----GAAAAGAGGAACATCATTGAA---AATACATAACACTA-TTG-ATTTG-TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAACTGTATTTG--AT--A---NA---TATGTAAA----A--T--ATATACGTACGAATGTGTACATGTATATGCA-TGTGGTATGTAT-CGTGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATATTATATGCATAAATAAAGTGTTAAGCATGTTCATT-TTAA-A-TTACATG----AAATAAATTTATA-TT-TTTC-ATTGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTCTG-CTTGTAAACA---TGTTGATTNTGGC-TT-A-----AAAA-AA---TAA-TTTGTATATTCT-GAT--T---ATTATAAAGTATACTTAC---TTG--TGTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT--T-C-CG-----------TTG-----A----TTTNC------CACAA------ATTTTTGATGTATGGATTTG-ATTAAAT-----GTAACCTCA-TAAAT--NA-A-ACCAATTGATTAA-----------CAT-GTATC-----------TGGTATATATG------------T---TT------TATGTN-TGT--ATAT--------AT--GTA-----TGCACATT---TCGT----TATGTAT--ACG-TGAT------AT-T--T-TCT--C--TT-T--------------TTT-CTTTAC-A----C-A-TNTT---T-----------T---GTA-A-TATAAGATACAGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATGTAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAC-ACGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T-AAAGTTTCTTTT
Reference ( gi|1 ) : ATGACTAAAGCTGGAAAAGCTCAAAAAGCAATTTTAAAACTGAATAAATATCTTATAATTTTTTTCCGATATT---TCTATCAGTTATAGATAAGAACT-TTTTGATAAACTTATATAACCTATTCTAAATTATTCATGC----TT------TTTCATAGTTCAAATAATATTGAATGAGTACTTAAAATGTATTGTAAATGTATTGTAAATGTATTTTAAAGGTAAAACGTACAGCAAAAAATGATTTTGTTTTTGGTATTTTCAGAAGAATGAGTCTTATTAAGATATTACAAAATTGTAAGATATTGGTTGAAAACTTTGCATAGCTATGAAAATAAATATTGTAAAATTATATATAACATGTTGAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGAGTAACATAAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCATAAGTATATTTAGTCAAATAATTAAAGATATTAGTATACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGA-AATTTTTTTTTTTCTGAAATGTATAGATATATCCAAATTTAGGTTATCAATTACTGGACTAATTGTTTCATCGCACCACCTTAAAATAGAATCTTGTAGATGGTATAGACCGAGAAGTATCCCGTTTGAAGATAGAATATGCAACTTTTGTCAAACAATTGAAGATGAATATCATTTAATGATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATTTATAAGCTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAACGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATA--TTTTTAAATCGTTT-----GAAAAGAGGAACACCATTGAA---AATACATAACACTA-TTGAATGTG-TTTTTACCGTGTCCCTGGCTTAAACTGTATTTG--AT--A---AA---TGTGTAAA----A--T--ATATACGTATGAATGTGTTCATGAATACGCA-TATGGTATGTATGTGTGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACAAATATTACTGTATTA-ATGAATAAAGAAAATGTTAAACATGTTCATT-TTAA-A-TTACTTG----AAATAAATTTATA-TT-TTTC-ATTG-TCAGACT----------------GAAA-------AAGTCTG-CTTGTAAATA---TGTTCATTTTGGC-TT-A-----ACAA-AA---TAA-TTTGCATATTCT-AAT--T---ACTACAAAGTATACTTAC---TTA--TGTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT--T-C-CG-----------TTG-----A----TTTGA------CACAA------ATTTTTGATGTATGGAATTG-ATATACT-----GTAACCTCA-TAAAC--TA-A-ACCAATTGATTAA-----------TAT-GTATC-----------TGGTATATATG------------T---TT------TATGTT-TGT--ATAT--------AT--GTA-----TGCACATT---TCGT----TATGTAT--ACG-TGAT------GT-T--T-TCT--C--TT-T--------------TTT-CTTCAC-A----C-A-TATG---T-----------T---GTA-A-TATGAGATACAATAT-ATGTTA-CGT------CAT--GTATGTAACTGTTT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAC-TCGGGCCTATGATCTATTGAATTGCA---AA-T-AAAGTTTATTTT
gi|24 : TGGAAAAGATAAATAAATAATTTTCAAACTGGATGAATATCTCTCAAATATTT-CTGATATTAAATATAATAGCCATAGCTTTGATTTATTTTAATAAACTTATATTACTTATTTTGAAGTATTCGTGTGAGATTTGGGAATTTCATAGCTAAAATACTAT
gi|2 : tgactctataAAACATGATGCTGAA-ACTTACCCAAATAAAATTTCCTGGTTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATGTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCCTGACATGAACGCTTGGACAATT
gi|31 : ATGAGGTTAAACACTAACC-AAATAAAGTTTCTTGGCTAACATTAGTATGTGAGCTGCTATCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAATGCGTTGGTAAAGTAAACATTTTCTTAccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|13 : ACCCAAATAAAGTTTCCTGGGTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTT--------ATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGA-AAATTcggat
gi|13 : TTCTTTCTGAAGTGTATAACTATACCTAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCAccacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactatcagttctttctgaagtgtataactatacctaaatttagggtagcaattactagattaatcgtttca
gi|4 : acccaaataaagtttcctgggtaacattagtacgtgacctcttgtcatctttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcttggcatgaacgcttggaaaattccacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactatcagTATAAATATACCCAAATTTAGTGTAGCAATTACTAGATTAATTGTTTCATCGCACCACTTTAAGATAGAATCTGGTAGGTGGCATAGACCGATACGTATCGCAATTGAAAATAGAAAATGGAATTCTT----------TGAAGACTAATATCATTTTATTATAACGTGTTCATTGTGTGTAGAATTACGAAGACCAT------------ACTTTTGGCATGAACCAAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAG
gi|3 : GTATCCCTTTTGAAGATAGAAAATGTAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTCATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATATTTTTAGTATAGACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTAGGTAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAGTTTAAGCATGTATA--TGTTTAAAGCTTTT-----GAAAAGAAGAACATCATTGAA---AATACATAACACTA-T------TG-TATTTACCGTGTCTATGGCTTAAACT-TATTTG--AT--A---TA---TATGTAAAAT--A--T--ATATACGTATGAATGTGTTCATGTATATGCA-TATGGTA--------TGTGTTAGTAAGTACTTGTGTGTTATGACATGTGTTACTAAATTATATGCATAAATAAAATGTT-AACAAGTTCATT-TTAA-A-TCACATG----AAATAAATTTATA-TT-TTTCAATAA-TCTTACT----------------AAAAAAAAAAGAAGTCTA-CTTG-AAATA---TGTTGATTGTGGA-TTAA-----AAAA-AA---TAA-TTTGTATATTCT-GAT--A---ATTATAAAGTATACTTAC---TTG--TGTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCTTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TTTCT-C-TA-----------TTGTCTGTG----TTTGAATTTC-TACAA------ATTTTTTATGTATGGATTTG-ATTAAGT-----GTTACCTAA-TAAAA--TAGA-ACCAATTAATTAA-----------CAT-GTATC-----------TGGTATACATG------------T---TT------TATTTG-TGT--ATAT--------AT--GTA-----TGCACATT---GCGT----TATGTAT--ACG-TGAT------AT-T--T-TCT--C--TT-T--------------TTT-CTTTAC-A----C-G-TTTT---T-----------T---GTA-A-TATAAGATACAGTAT-GTGTTG-CGT------CTT--GTATGTAAATTTAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAC-ACGGGCCCACGGCCTATTGAATTGCA---AA-TAAAAGTTTtgcataacaatattgcatttgctttttaccgtgtcttaaactgtatttaatatatgtgtaatatgtatatacgtatgcatgtgtaaatgcatatgtaagtaagtacttgtgttatgatatctgttagtataaataaagtgttaaacatgttcatttttaattacatgaaataaatttgtagtaattctgaaaaataacttgtaaacatgttgattttggcttaaaaatagattaatttgcatgttctgattattataaagtaaacttgtgtcttaatcatacacttctccgtaaaaaatgattttcgcacaaaatgttgatgtatagatttaattaattattacctcataaataaaaacaattgaccaacatgtatctgttatgtatgtgtgcatacatatttcgtgtgtacgtgatatttctctttatttgcctggtattttcttttaacaatgttttgatataaaaaaacgtatgtgttacgtcatgtacgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcagacgggactatggcctattgaaatgcatataaaaaatatctttaagt
gi|2 : TTTGGTATAAACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTCGGTAGTAAAGATGAAAATGTGGTTAGAAATTTAAGCATGTATA--TTTTTAAATCTTTT-----GAAAAGAGGAACATAATTGAA---AATACATAACACTA-T------TG-TATTTACCGTGTCTCTGGCTTAAACTGTAATTG--AT--A---TA---TATGTAAAAT--A--T--ATATACGTATGATTGTGTACATGTATATGCA-TATGGTA--------CGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTAAATTATATGCAT-----AAATGTTAAGCATGTTCATT-TTAA-A-TCACATG----AAATAAATTTATA-TT-TTTC-AATGATCTGACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAA-------AAGTCTA-CTTGTAAACA---TATTGATTGTGGCTTT-A-----AAAATAA---TAA-TTTGTATATTCT-AAT--A---ATTATAAAGTATACTTAC---TTG--TGTA---TTA---------ACATCATGCATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGAC---------AGTATTTCTCTATTT--T-C-TGTGT--------TTG-----A----TTTTC------CACAA------ATTTTTGATGTATGGATTTG-ATTAAAT-----ATCACCTCATTAAAT--AA-A-ACCAATTGATTAC-----------CAT-GTATC-----------TGGTATATATG------------T---T
gi|4 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAA----TGTAGTTAGTGCATAACAATA-TTGCATTTGCTTTTTACCGTGTC------TTAAACTGTATTTA--AT--A---TA---TGTGTAAT----A--T--GTATA--TACG--------------TATGCA-TGTG---TAAATGCATATGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGA----TAT--CTGT--TA-GT--ATAAATAAAGTGTTAAACATGTTCATT-TTTA-A-TTACATG----AAATAAATTTGTA-GT----A-ATT-------CT----------------GAAA-------AA---TAACTTGTAAACA---TGTTGATTTTGGC-TT-A-----AAAA-TAGATTAA-TTTGCATGTTCT-GAT--T---ATTATAAAGTA-A---AC---TTG--TGTC---TTA---------A--TCATACAC-----TTCTCCGTAA-------------AAA-ATGA-----------------------TT--T-T-CG-----------------------------------CACAA------AATGTTGATGTATAGATTTA-ATTAATT-----ATTACCTCA-TAAAT--AA-A-AACAATTGACCAA-----------CAT-GTATC-----------TG--------------------------T------TATGT-------ATGT--------GT--GCA-----TACATATT---TCGT-------GTGT--ACG-TGAT------AT-T--T--CT--C--TT-TATTTGCCTGGTAT-TTT-CTTTTA-A----C-A--ATG---T-----------T---TTG-A-TATAAAAAAACGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTACGTAAATGTAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAG-ACGGGACTATGGCCTATTGAAATGCA---TA-T-AAA
gi|5 : tataaatatacccaaatttagtgtagcaattactagattaattgtttcatcgcaccactttaagatagaatctggtaggtggcatagaccgatacgtatcgcaattgaaaatagaaaatggaattctttgaagactaatatcattttattataacgtgttcattgtgtgtagaattacgaagaccatacttttggcatgaaccTTTAAATCTTTT-----AAAAAGCGGAACACCATTGAA---AATACATAACACTA-TTGTATTTG-TTTTAACCGTGCCGCTGGCATTAACTGTATTTA--AT--ATATAATTTTATGTAAA----ATGT--ATATGCGCATCAATGTGTACATGTATATGTA-TATGGTATGTA----TGTGTAAGTTAGTACT--TGAGTTATGACATGTGTTACTATATTATATGCATAAATAAAGTGTT----------ATT-TTTA-A-TTATATG----AAATAAATTTATATTT-TTTC-AATGATCGAACT----------------G-AA-------AAGTATA-CTTaaatatctttaagt
gi|8 : ---AATA-ATAACACCAATTGA---------TTAACATGTATCTGG--TA---TGTATCTGGTAT--A---AA---TGTTT----------T--ATGTATGTAT--ATATGT------ATGCACATTGCGTTATGTATACGTGacttgtgtattaacattatacatgtacttctcagtaacaagaaaacatgactgtattttccgtgtttgattcaccacaaatatttgatgtatggatttgattaaatttaacctcataaaaaaaccaattgataaacatgtgtctggtatatatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacatttcgttatgtatacgtgatatttttttatttttttctttacacatttttatgtagtatgagatacagtatgtgttacgtcatgtatgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcacatgggcctatggcctatttgattgcaaataaagttccttc
gi|9 : agtctgcttgtaaacatgttgattgtggcttaaaaagtaatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatacatgtactttctccgtaacaagaatacatgacagtatttctcgattttctgtgtttgtttttcaacaaatttttgatgtatggatttgattaaatgtaacctcCTTAAACTGTATTTA--AA--G---TA---TATGTAAA----A--TGTATATACATATGAATGTTTACATCAATATGCA-TGTGGTATGTATGTGT----AAGTAAGTACT--TGTGTTATAGCATGTGTTA---TATTATATGCATAAATAAAGTGTCAAGCATGTTCATT-TAAA-A-TTACATG----AAATAAATCTATA-TT-TTCA-ATGA-TCAGTCT----------------GAAA-------AAGTCTG-CTTGTAAACT---TGTTGATTTTGGC-TT-A-----AAGA-AA---T-G-TATA-ATATTCA-GGT--T---ATTATAAAATGTACCT-T---TTT--TGTA---TTA---------ACATCATACCTGTACTTTCTCCATAACAAGA--------AAGCATGGC---------TGTA---------TT--T-C-CC-----------GTG----------TTTGATTGTCCCACAA------ATGTTTGATGTATGGATTTG-ATatagtttctctttatttctttacacaattttgtaatataagatacagtatgtgttacgtcatgtatgtaaatttattcctgttttgtatatgttcacacgggcctgtggcctattgaattgcaaataaaagtt
gi|16 : TGTCTTTC--ATTGA---AA---TAT-TGAATATGG--T--ATATATGTACAA---TGTTTATGAATGTGT----TTGTGTATAT-TGTATGTA--TATGTATT--TGTGTTATGGTATGTGTTA---TAAT--ATGCATAAATAAAGTTTTAATCATG-ACATTGTTAACATTTGATTGCCACAAATAAATTTATA-TTATTTC-Ataaatgtt
gi|36 : attgaataaatataaaaccatgatataatgcaacttgttta----A--C--ATATACTTA--AATGTGTACATGTATATGCA-TATGGTATGT--------GTAAGTAAGTACT--TGTGTTATataatca
gi|8 : tttatctaaccattaaatggtttAGTCTG-CTTGTAAACA---TGTTGATTGTGGC-TT-A-----A-AA-AG---TAA-TTTGTATATTCT-AAT--A---ATTATAAAGTATACTTAC---TTG--TGTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TT--T-CTCGATTTTCTGTGTTTG-----T----TTTTC------AACAA------ATTTTTGATGTATGGATTTG-ATTAAAT-----GTAACCTCAATAA----TA-ACACCAATTGATTAACATGTATCTGGTAT-GTATC-----------TGGTATAAATG------------T---TT------TATGTA-TGT--ATAT--------AT--GTA-----TGCACATT---GCGT----TATGTAT--ACG-TGAT------AG-T--T-TCT--C--TT-TA-------------TTT-CTTTAC-A----C-A--ATT---T-----------T---GTA-A-TATAAGATACAGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATTTAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAC-ACGGGCCTGTGGCCTATTGAATTGCA---AA-TAAAAGTT
gi|7 : GTCTG-CTTGTAAACG---TATTGATTGTGGC-TTTA-----AAAATAA---TAA-TTTGTATATTCT-AAT--A---ATTATAAAGTATACTTAC---TTG--TGTA---ATT---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGACAGTTTTTTTTCTA---------TT--T-T-CT-----------GTG----------TTTGATTTTTCCACAA------ATTTTTGATGTATGGATTTT-ATTCAAT-----GTAACATCATTAAAT--AA-A-ACCAATTGATTAC-----------CAT-GTATC-----------TGGTATATAAG------------T---TT------TATGTA-TGT--ATAT--------AT--GTA-----TGCACATT---GCTT----TATGCAT--ACG-TGGT------AT-T--T-TCT--C--TTGT--------------TTT-TTTAAC-ATTTTT-A-T-TT---T-----------T---GTA-A-TATAAGATACAGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATTTAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAC-ACGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T-AAA
gi|5 : TAAATAAAGTGTT-ATTTTTAA-TT-AT----ATGA-AA---TAAATTTATATTTTTTCAATGATCGAACTGAAAAGTATACTTAC---TTG--TGTA---TTA---------ACATTATACATGTAC-TTCTCAGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTAT--------TT--T-C-CGTGT--------TTG-----A----TTCAC------CACAA------ATATTTGATGTATGGATTTG-ATTAAAT-----TTAACCTCA-TAAAA---A-A-ACCAATTGATAAA-----------CAT-GTGTC-----------TGGTATATATGCNNNNNNNNNNNN---NN------NNNNNN-NNN--NNNN--------NN--NNN-----NNCACATT---TCGT----TATGTAT--ACG-TGAT------AT-T--T-TTTTAT--TT-T--------------TTT-CTTTAC-A----C-A-TTTT---TA----------T---GTA-G-TATGAGATACAGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATGTAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAC-ATGGGCCTATGGCCTATTTGATTGCA---AA-T-AAAGTTaaaaaaagttt
gi|10 : tttaaatcttttaaaaagcggaacaccattgaaaatacataacactattgtatttgttttaaccgtgccgctggcattaactgtatttaatatataattttatgtaaaatgtatatgcgcatcaatgtgtacatgtatatgtatatggtatgtatgtgtaagttagtacttgagttatgacatgtgttactatattatatgcaTCATTT-GAA-TT-ATGGACATAA-AA---TAT-TTT---TATACT-GAA--T---ATTATTAAGTATACCGGC---TTGGTTATA---TAA---------CCATCCTGCATGAACTTTCTCCGTAAACAGA--------AAAT-TGGC---------AGTC---------TT--TCC-CGTGC--------TTG-----AGTTCCTTGC------CAAAATTTGATATTTTTGATTAATTGAATT---T-TACC------TAACT-------AC--TA-A-AGAAATGTACCAA-----------TGT-ACATG-----------TTGCATGTATG------------T---ccttc
gi|15 : ttctgactttaatgtatttgatatatatgtataatgagtatgtttgtaaatatatggtgtgtatatgtaggtaagtccttgtgttgtggtatgtttgttgtaaacatttagatttttgctaaaaagatacaattaaaagaacaatgcaactcA-TTTAAAGGTTCT-AAT--T---ATTATAAAGTATTCTTAC---TCG--TGTA---TTATTATACATAACGTTATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATAAC---------TGTA---------TT--TCC-CGTGT--------TTT-----A----TTTTC------CACAA------ATTTTTCATGTAGGAAATTGCGTA-AAT-----GTAACCTCA-TCAA---TATA-ACAAATTGATTAA-----------CAT-GTATC-----------TGat
gi|38 : aataaagacaaaagggaaaatatcgtgttgatatttccattgattcagttatacatA-TTTAAAGGTTCT-TAT--T---ATTATAAAGTATACTTAC---TTG--TGTA---TTA---------ACGTTATACAT
gi|25 : -TTTACAAGTTCT-TAT--T---ATTCTAAAATATACTTGTATGTTA---GTAAGTTTT---------ACATCATAAACTTAATTTCTCCGT------A--------AAAT-TG-C---------TGTT---------TT--T-C-CAGCGT-------TTG-----AATTTTTTTA------C-CGA------A-TTCTAATGTGAAGATTGG-AT-----------TAATTTC----AACTATA-A-ACCAATTTATCAG-----------CAT-GTATtt
gi|11 : AACAAGAGATATGATAAACATGAC---------TGTA---------TT--T-C-CGGTGT-------TTG-----A----TTTTC------CACAA------ATTTGTTATGTATGGACTTG-ATTAAAT-----ATAACCTCA-TAAAT--TA-A-ACCAATTGATTAA-----------TAT-ATATCTGGTATATATCTGGTATATATG------------T---TT------TATGTT-TGT--ATTT--------AT--GTA-----TGTACATT---TCGT----TATGTAT--ACG-TGAT------AT-T--T-TCC--C--TT-T--------------TTT-CTTTAC-A----C-CTTTTT---T-----------T---GTG-A-TATAAGATACAGTTT-GTGTTA-CAT------CAT--GTATTTAAATGTAT-T---C--CTGTTTTACATATGTT-CAC-ATGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T-AAAGTTTCTT
gi|12 : C---------TGTA---------TT--T-C-CGGTGT-------TTG-----A----TTTTC------CACAA------ATTTTTTATGTATGGATTTG-ATTAAAT-----GTAACCTCA-TATAT--AA-A-ACCATTTGATTAA-----------CAT-GTATC-----------TGGTATAT--G------------T---TT------TATGCA-TGT--ATAT--------AT--GTACAGTATGCACATT---TCTT----TATGTTT--ACA-TGAT------AT-T--T-TCT--C--TT-T--------------TT--CTTTAC-A----C-A-TTTT---T-----------T---GTA-A-TATAAGATACAGTAT-GTGTTA-GGT------CAT--GTATGTAAATGTAT-T---C--CTGATTTGTATATGTT-CAC-ACGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T-AATGTTTCTTTgc
gi|21 : A------ACTTTTGGTGTG-------G-ATATTCTTTAAAGTAACCTAA-CAAAT--AA-A-ACCAATTGATCAA-----------CAT-GTATC-----------TGGTATATGTG------------------------TATATTGTGA--ATAT--------AT--ATT-----TACACAATACATCGT----TAGATAT--ACG-TGTC------TT-T--T-TAT--C--TT-T--------------TTT--TGCAC-G------G-TATT---TTTCTCAATAAAT---GCA-A-TATAAGACACAGTTT-GTGTTA-CGT------CAT--GCATGT
gi|23 : TTTGGATGTTTGGATTTG-ATTTCAT-----TTATCCTCA-TATAT--AA-A-ACCATTTTATCAA-----------CAT-GTATC-----------TGGAATATATG------------CAGGTT------T-TGGA-TGT--ATAC--------AT--GAA-----TACATACT---TAGTGTCATATGCATGAAAGTTCAT------GT-T--T-T
gi|14 : aGATGTATGAATTTG-ATTAAAT-----GTAACCTCT-TAAAT--AA-A-ATCACATGATTAA-----------CAT-GTATC-----------TAGTATATATG------------T---TT------TATGT-------------------------A-----TGCATATT---TCGT----TATGTAT--AGG-TGAT------AT-T--T--CT--C--TT-T--------------TTT-CTTTAC-A----C-A--ATT---T-----------T---GTA-A-TACAAGATACAGTAT-GTGTTA-CAT------CAT--GTATGTACATGTAT-T---C--CTGTTTTGCATATGTT-CAC-ACGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T-AAAgtatctgatcacacgggcttatggccttttgaattgcaaat
gi|6 : tctcgtgtttaaattttccacatattgttgatgtaggTATGAAATTG-ATTAAAT-----GTAACGTCA-TAAAC--TA-A-ACCAATTGATTAA-----------TAT-GTATC-----------TGGTATATATG------------T---TT------TATGT-------------------------A-----TGCACATT---TGGT----TATGTAA--ATG-TGAT------AT-TATT-TCT--C--TT-T--------------ATT-CTTTAC-A----C-A-TTTT---A-----------T---ATA-A-TGTAAGAAACAGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATGTTT-T---C--TTGTTTTGTATATGTT-CAC-ACGGGCCTATGTCCTATTGAATTGCA---AA-T-AAAGTTTa
gi|17 : tgtattaatgaattaaatgttgaatcaaaaacagttaaatgtcatttttataatgattttttatttctattataaactgttatcatatcaataattttaataaaataacaatttaagttgtatacttaaaatataaaatatgaaagtacacataatcaaaaaaaattatatttttattaaattttgttataccggtagttttaattaaggctttattttcaataatttttttaatagttttaattaagacttaaggctttttttgttttgttttCTCA-TTGAT--AA-A-ACCAATTGATTAA-----------CAT-GTATC-----------AGGTATATATG------------T---TT------TATATA-TGT--ATAT--------AT--GTA-----TGCACATT---TCGT----TATGTTT--ACG-TGAT------AT-T--T-TCT--C--TT-T--------------TTT-CTTTAC-A----C-A-TTTT---T-----------T---GTA-A-TATAAAATAAAGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATGTAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAC-ACGGGCTTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T-ATAGTT
gi|18 : A-A-ACCTATATACCAA-----------CAT-GTGTC-----------TGATGTATATG------------TA--GG------TATGTT--AC--ATAT--------GT--GTA-----TACATATT---CCAT----TAT-TAT--A----------------T--T-TCT--C--TT-TATTTGAATGGCATTTCT-CTTCAA-A----A-A-TA-G---T---------------GTA-A-TATAAAATA-AGCATGAT-TTA-CATAATTATCAT--GTATGTA------T-T---C--TTGTTG-GTGTTTTTT-CAC-ACGCGCCTACG-CCTGTTGAATTACA---AA-T-AAAGTTT
gi|16 : taATTGA--AA-----------TATTGAATA-----------TGGTATATATG------------T---AC------AATGTT-TAT--GAAT--------GT--GTT-----TGTGTATA---TTG-----TATGTAT--ATG-Tt
gi|20 : attgaataaatataaaaccatgatataatgcaacttgtttatgtctttcAT-GTATC-----------TGGNNNNNNNN------------N---NN------NNNNNN-NNN--NNNNNNNNNNNAAT--GCA-----TGTACATA---TCGT----TATGTAT--ACG-TGGT------AT-T--T--CT--C--TT-T--------------TTC-TTTC-C-A----C---TATG---T-----------T---TTA-A-TAAAAGATACGGTAT-GTGTTA-CGC------CAT--GTATGTCAATGTAT-A---C--CTGTTATGTATATGTT-AAC-ACAGACCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T-AAAGTatttgtgttatggtatgtgttataatatgcataaataaagttttaatcatgacattgttaacatttgattgccacaaataaatttatattatttcaataatca
gi|10 : AT-GTATT-----------TGATATATATG------------T---ATAATGAGTATGTT-TGTAAATAT--------ATG-GTG-----TGTATAT
gi|19 : ttctgactttaGTATATATG------------T---TT------TATGTA-TTT--ATAT--------AT--GTA-----TGTACATT---GCGT----TATGCAT--ACG-TGAT------AT-T--T-TCT--C--TT-T----------------------AC-A------A-TTTT---T-----------T---GTA-A-TATAAGATACAGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATTTAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CAC-ATGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TAAAAGTTTgtaggtaagtccttgtgttgtggtatgtttgttgtaaacatttagatttttgctaaaaagatacaattaaaagaacaatgcaactctcatttgaattatggacataaaatatttttatactgaatattattaagtataccggcttggttatataaccatcctgcatgaactttctccgtaaacagaaaattggcagtctttcccgtgcttgagttccttgccaaaatttgatatttttgattaattgaattttacctaactactaaagaaatgtaccaatgtacatgttgcatgtatgtat
gi|22 : gatcaaaacaattttactaccttcatttaacatT-CGT--GTAT--------GTTAGTT-----TGCCCAT-------------ATGTTT--ATG--AAT------GT-A--T-TGT--A--TT-T--------------TTC-TTTAGG-A---------ATG---T-----------T---GCA-----CGAG-T----TAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATATGCGTAAAT--CAGTTTTGAATATGTT-GAT-ACTGGCTTATGACCTATTGGATTACA---AA-T-AAAGCCTTTTTT
gi|30 : tcaccgataaaaccaacttacccaaaaacaTA-----TGCACATT---TCTG----TATGTAT--ACG-TGAT------AT-T--T-TCT--C--TT-T--------------TTTTCTTTAC-A----T-A-TTTT---T-----------T---GTA-A-TATAAGATACAGTAT--TATCA-CGT------CTT--GTATGTA-------------------TTTGTATATGTT-CAC-ACGGGCCTATGGCCTAATGAATTctt
gi|27 : -----TGCACATT---TCTT----TATGCAT--ACG-TGAT------AT-T--T-CCT--G--GGGTGGGGGG--------TTT-CTTTAC-A----C-A----G---T-----------TTTAGTA-A-TATAAGATAGAGTAT-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATATAT-T---C--ATGTT---TA---GTT-CAC-ACGGGCCTATGACCTAATAAATTGCA---AA-T-AAAGTTT
gi|28 : CACATT---TCGT----TATGAAT--ACG-TGATAGCATGGTAT--T-TCT-----------------------TTT-CT--AA-A------A-T-TG---T---------------GTA-A-TATAAGATAGAGTAG-GTGTTA-TGT------GAT--ATATACCAATGTGT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-CACATCGGGC-------CTATTGAATTGCAATTAA-A-AAAGTTTct
gi|29 : gaaACATT---GCGT----TATGCAT--ACG-TGAT------AT-T--T-TCT--C--TT-T--------------TTT-CTTTAC-A----T-T-TGTATTTT-----------T---GTA-A-TAT-AAATACAGTAT-GTGTGT-CGT------CAT--GTATGTAAATTTAT-T---C--CTGTTTTGTATATG--------------TATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TAAAAGTTTCTTct
gi|26 : T----TAT-TAT--A-G-T-AG------GT-T--TGTCT--CAATT-A--------------TTT--TTAACTG----CTA-TTTG---C-----------T---GTA-AGTAT---ACGCAGCAT-----TA---T------CATT-GTATGTACAAGTAT-T---T--CTGTTTAGTATATATC-CAC-ACGGGTCTATTTCCTATTCAATTGGA---AA-A-AGAGT
gi|23 : atactatgtctttctgaaaacagtttatta-----------T---GTATA-CATGA-ATACA---T-AC-TTAGTGT------CATATGCATGAAA--GTT------C--ATGTTTTGTATCTGAT-CAC-ACGGGCTTATGGCCTTTTGAATTGCA---AA-T-
gi|34 : atttggatgtttggatttgatttcatttatcctcatatataaaaccattttatcaacatgtatctggaatatatgcaggttttggaTACAGTAT-ATGTTA-CGT------CAT--GTATGCAAATGTGT-T---C--CTGTTTTGTATAGGTT-CAC-ACAGGCCTATGGCCTATTCAATTGCA---AA-T-AAAGTTT
gi|33 : gCATTAC-GTGTTA-CGT------CAT--GTATGTAAATATAT-T---C--CTGTTTTGTATATGTT-AAC-ACTGGCCTGCGGCCTATTGAATTGCA---AA-TAAAAGTTTct
gi|32 : ataataat-CGT------CA---GTGTATAATTATAT-A---CGTCTGTTTTATATATGTT-CAC-ACGGGTCTATGGCCTATTGAATGGCC---AA-TAAAAGTTTCTTCT
gi|35 : tgagacagttctttatctT------CTT--GTATGTATATGTGA-T---C--TTGTTTTGTATATGTT-CTC-ACTGGCCTAT--T------AATTGCA---AA-T-AA---TTA
gi|37 : cT-T---C--CTGATTTAGGTATGTT-CAC-ACGAGCCTTTGGTCTGTTGAATAGGA---AA-T-AAAGGTTCTTgggtactttccttctttcttc
gi|39 : ataGTTTTGCATTTTTTTCAC-ACGGCCCTATGGCCTGTTGAATTGTA---AAGT-AAAGGTTCTT
Alignments
lowQualScore : 22 222 1 333333333333 2 1 2222 1111 444444444444444 111111 11 11 11 555555555 222222222222 11111 111111 111111111 3333333333333333 1111111 111111111 11111111 1111111111 111111111 77777777777777777777777 1111 11111111111 1111111111111111 22222222222222222222222222 111111111111 11
lowQualScore : 3 3 4 2 4 44 4 111 3 4 2 88 4 5 4 2 444444444444 3 2 1 3 1 2 1 2 2 0 5 1 333 1 1 0 2 3 2 1 22 1 7 1 3 1 0 0 1 1 7 0 0 2222 1 8 7777 5 3 999999999999999 1 5 0 1 3 666666 66 33 33 00 2 0 4 0 222222222 66 222222222222 0 1 22222 777 0 5 444444 0 0 55 5 333333333 44 7777777777777777 8888888 66 4 9999 4 1 55 8 8 8 777 3 3 77777 555 44 44 555 333333333 0 22222222 1 3333333333 555555555 11111111111111111111111 555 2 2222 2 1 2 88888888 2 77 2 3 99999999999 00000000000 2222222222222222 5 444 99999999 55555 333 1 44 22 11111111111111111111111111 2 22 000000000000 333 999999999 1 333 1 1 1 3 1 3333 22 1 1 222 1 11
lowQualScore : . . . . . .. . ... . . . .. . . . . ............ . . . . . . . . . . . . ... . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . .... . . .... . . ............... . . . . . ...... .. .. .. .. . . . . ......... .. ............ . . ..... ... . . ...... . . .. . ......... .. ................ ....... .. . .... . . .. . . . ... . . ..... ... .. .. ... ......... . ........ . .......... ......... ....................... ... . .... . . . ........ . .. . . ........... ........... ................ . ... ........ ..... ... . .. .. .......................... . .. ............ ... ......... . ... . . . . . .... .. . . ... . ..
lowQualScore : 0 0 0 5 0 00 0 555 0 0 5 00 0 5 0 5 555555555555 0 5 0 3 0 5 0 5 0 7 0 0 000 0 0 7 5 0 5 0 00 0 3 0 7 0 7 7 0 0 3 2 7 2222 0 0 0000 0 2 555555555555555 0 2 7 7 0 444444 99 88 88 88 6 9 4 1 888888888 11 888888888888 1 4 55555 444 1 0 444444 9 2 11 0 000000000 77 9999999999999999 6666666 11 4 4444 4 0 66 9 9 9 888 3 3 99999 555 66 66 888 333333333 4 11111111 2 2222222222 444444444 88888888888888888888888 444 9 9999 9 0 9 55555555 4 99 4 2 55555555555 00000000000 3333333333333333 6 111 11111111 66666 555 9 55 66 77777777777777777777777777 0 66 666666666666 333 555555555 9 333 9 8 6 1 5 4444 11 5 5 777 5 33
consensus : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGA-AATTCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATA--TNTTTAAATC-TTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-A-T-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAACTGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGNATATGCATATGGTATGTAT---TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTTCAAT-----GATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--TG-CTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA-AA---TAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TTT-C-----C---GTNT--------T---TG-A----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCTC--TT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TT---TT---------T-GTA---A-TATAAGA-TACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
Reference ( family-5962 ) : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGATAAATAAATAATTTTCAAACTGGATGAATATCTCTCAA-ATATTTCTGATATTAAATATAATAGCCATAGCTTTGATTTATTTTAATAAACTTATATTACTTATTTTGAAGTATTCGTGTGAGATTTGGGAATTTCATAGCTAAAATACTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGANGCTGAACACTNACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGCGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCCTGGCATGAACGCTTGGACAANTTNNTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGNGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACTTTAAGATAGAATCTGGTAGGTGGCATAGACCGATACGTATCNCNNTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACNAATATCATTTCATTATGGNGTGTTCATTGTGTGTAGAATTACGNAGANCATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAAACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTCGGTAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAGTTTAAGCATGTATA--CGTTTAAANC-TTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-A-T-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAACTGTATTTGATANATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTACGAATGTGTACATGTATATGCATGTGGTATGTAT-CGTGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTTCATT-----GATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--TG-CTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA-AA---TAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TTT-C-----C---G-----------T---TG-A----TT-TNC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATNAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTNTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCTC--TT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----NT---TT---------T-GTA---A-TATAAGA-TACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
gi|1 : TGGAAAAGCTCAAAAAGCAATTTTAAAACTGAATAAATATCTTATAATTTTTTTCCGATATT---TCTATCAGTTATAGATAAGAACT-TTTTGATAAACTTATATAACCTATTCTAAATTATTCATGC----TT------TTTCATAGTTCAAATAATAT
gi|1 : atgactaaagcAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGAGTAACATAAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCATAAGTATATTTAGTCAAATAATTAAAGATATTAGTATACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGA-AATTTTTTTTTTTCTGAAATGTATAGATATATCCAAATTTAGGTTATCAATTACTGGACTAATTGTTTCATCGCACCACCTTAAAATAGAATCTTGTAGATGGTATAGACCGAGAAGTATCCCGTTTGAAGATAGAATATGCAACTTTTGTCAAACAATTGAAGATGAATATCATTTAATGATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATTTATAAGCTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAACGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATA--TTTTTAAATC-GTTTGA----AAAGAGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTG-AAT-G--TG-----TTTTTACCGTGTCCCTGGCTTAAACTGTATTTGATAAATG------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGAATACGCATATGGTATGTATGTGTGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACAAATATTACTGTAT------TA-ATGAATAAAGAAA-----ATGTTA-AACATGTTCATT-TTAA------ATTACTTGAAATAAATTTATA-TT-TTTCATT-----G-TCAGACT----------------GAAA-------AAGTC--TG-CTTGTAAAT----ATGTTCA-TTTTGGC-TT-AAC-AA-AA---TAA-TTTGC-ATATTCT----AATT--ACTACAAAGTATACTTACTTA--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TTT-C-----C---G-----------T---TG-A----TT-TGA-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAA-TTGATATACTGTAACCTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATGTT--TTCTC--TT-------------T------------TTT-CTTC--ACAC----AT-----AT---GT---------T-GTA---A-TATGAGA-TACAATATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAACT----GTTTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACT-CGGGCCTATGATCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTATTTTtgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgaaacatgatgctgaaactaacccaaataaagtttcctgagtaacataagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcataagtatatttagtcaaataattaaagatattagtatacagtcttggcatgaacgcttggaaatttttttttttctgaaatgtatagatatatccaaatttaggttatcaattactggactaattgtttcatcgcaccaccttaaaatagaatcttgtagatggtatagaccgagaagtatcccgtttgaagatagaatatgcaacttttgtcaaacaattgaagatgaatatcatttaatgatggagtgttcattatatgtagaattacgtagaacatttataaataaatacttttggtatagaccaagtatttataagctggtacaacttttcggcagtaaagatgaaaacgtagttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcgtttgaaaagaggaacaccattgaaaatacataacactattgaatgtgtttttaccgtgtccctggcttaaactgtatttgataaatgtgtaaaatatatacgtatgaatgtgttcatgaatacgcatatggtatgtatgtgtgtgtaagtaagtacttgtgttatgacaaatattactgtattaatgaataaagaaaatgttaaacatgttcattttaaattacttgaaataaatttatatttttcattgtcagactgaaaaagtctgcttgtaaatatgttcattttggcttaacaaaataatttgcatattctaattactacaaagtatacttacttatgtattaacatcatacatgtactttctccgtaacaagaaaacatgactgtatttccgttgatttgacacaaatttttgatgtatggaattgatatactgtaacctcataaactaaaccaattgattaatatgtatctggtatatatgttttatgtttgtatatatgtatgcacatttcgttatgtatacgtgatgttttctcttttttcttcacacatatgttgtaatatgagatacaatatatgttacgtcatgtatgtaactgttttcctgttttgtatatgttcactcgggcctatgatctattgaattgcaaataaagtttatttt
gi|10 : atgactaaagctggaaaagctcaaaaagcaattttaaaactgaataaatatcttataatttttttccgatatttctatcagttatagataagaactttttgataaacttatataacctattctaaattattcatgctttttcatagttcaaataatattgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgATGTATTTGATATATAT----GTATAA-TGAGTA------TGTT--------TGTAAATATATGGTGTGTATATG--TAGGTAAGTCCTTGTGTTGTGGTATGTTTGTT-GTAA------AC------------ATTTAGA-TT-TTT-GCTAAAAAGATACAATT----------------AAAA-------GAA-CAATG-C-----AACTCTCAT-TTGAATTATGG-----ACATAA-AA---TA--TTTTT-ATA--CT----GAAT--ATTATTAAGTATACCGGCTTGGTT--ATA---TAA---------CCATCCTGCATGAACTTTCTCCGTAAACAGA--------AAAT-TGGC---------AGTC---------TTTCC-----C---GTGC--------T---TG-AGTTCCT-TGC-CA-AAA--TTTGATAT---------T---T-TTGATTAATTG-AATTTTACCT-AACT---ACTAA---A--GAAATGT-----------A-CCA-----------ATGTACATG------------T---TGCATGTATGT---AT
gi|11 : ttctgactttaAACAAGAGATATGATAAACATGAC---------TGTA---------TTT-C-----C---GGTGT-------T---TG-A----TT-TTC-CACAAATTTGTTATGTA--------TGGAC-TTGATTAAATATAACCTCA--T-AAATTAAACCAATTGATTAATATAT-----------ATCTGGTATATATCTGGTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATTT--------ATGTA-----TGTACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCCC--TT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----CT-----TT---TT---------TTGTG---A-TATAAGA-TACAGTTTGTGTTA-CATCAT-GT-ATTTAAAT----GTATTC--CTGTTTTACATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTT
gi|12 : C---------TGTA---------TTT-C-----C---GGTGT-------T---TG-A----TT-TTC-CACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-ATATAAAACCATTTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATAT--G------------T---TTTATGCATGT---ATAT--------ATGTACAGTATGCACATT---TCTTTATGTTTACAT-GATATT--TTCTC--TT-------------T------------T-T-CTTT--ACAC----AT-----TT---TT---------T-GTA---A-TATAAGA-TACAGTATGTGTTA-GGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGATTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AATGTTTCTTTgc
gi|13 : ACCCAAATAAAGTTTCCTGGGTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTT--------ATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGAAAATT
gi|13 : TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATACCTAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCAccacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactatcagttctttctgaagtgtataactatacctaaatttagggtagcaattactagattaatcgtttca
gi|14 : acccaaataaagtttcctgggtaacattagtacgtgacctcttgtcatctttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcttggcatgaacgcttggaaaattccacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaacta-A----TT-TTC-CACATATTGTTGATGTAGGGATGTATGAAT-TTGATTAAATGTAACCTCT--T-AAATAAAATCACATGATTAACATGT-----------ATCTA-----------GTATATATG------------T---TTTATGT-----------------------A-----TGCATATT---TCGTTATGTATAGGT-GATATT--T-CTC--TT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----A------AT---TT---------T-GTA---A-TACAAGA-TACAGTATGTGTTA-CATCAT-GT-ATGTACAT----GTATTC--CTGTTTTGCATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAA
gi|15 : tctcgtgtttaaA-TTTAA-AGGTTCT----AATT--ATTATAAAGTATTCTTACTCG--T--GTA---TTATTATACATAACGTTATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATAAC---------TGTA---------TTT-C-----CCGTG-----------T---TTTA----TT-TTC-CACAAATTTTTCATGTA--------GGAAA-TTGCGTAAATGTAACCTCA--T-CAATATAACAAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------a
gi|16 : aataaagacaaaagggaaaatatcgtgttgatatttccattgattcagttatacatATTGAATAAATATAAAACCAT-G-A-TATAATGCAACTTGTTTA---TGTCTTTCATTGAAA---TATT-GA---ATA------TG------GT--ATATA--TGTAC-AATGTTTA--TGAATGTGTTTGTG---TATAT-TGTATGTA--TATGTATT--TGTGTTATGGTATGTGTTA-TA----------ATATGCATAAATAAA-----GTTTTA-ATCATG-ACATTGTTAACATTTGATTGCCACAAATAAATTTATA-TTATTTCAAT-----AATC
gi|17 : CTCA--T-TGATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCAG-----------GTATATATG------------T---TTTATATATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTTTACGT-GATATT--TTCTC--TT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TT---TT---------T-GTA---A-TATAAAA-TAAAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCTTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--ATAGTTa
gi|18 : TAAAACCTATATACCAACATGT-----------GTCTG-----------ATGTATATG------------T------AGGTATGTTACATAT--------GTGTA-----TACATATT---CCATTAT-TATA---------T--TTCTC--TT-------------TATTTGAATGGCATTT-CTCT--TCAA----AA-----AT---AG---------T-GTA---A-TATAAAA-TA-AGCATGATTTA-CATAATTATCATGTA--T----GTATTC--TTGTTG-GTGTTTTTT-CACA-CGCGCCTACG-CCTGTTGAATTACA---AA-T--AAAGTTT
gi|19 : TTAACATGT-----------AT------------------ATATG------------T---TTTATGTATTT---ATAT--------ATGTA-----TGTACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCTC--TT-------------T----------------------ACA-----AT-----TT---TT---------T-GTA---A-TATAAGA-TACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTt
gi|2 : gatcaaaacaattttactaccttcatAAACATGATGCTGAA-ACTTACCCAAATAAAATTTCCTGGTTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATGTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCCTGACATGAACGCTTGGACAATT
gi|2 : TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|2 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaataTTTGGTATAAACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTCGGTAGTAAAGATGAAAATGTGGTTAGAAATTTAAGCATGTATA--TTTTTAAATC-TTTTGA----AAAGAGGAACATAATTGAAAATACATAACACTATTG---------------TATTTACCGTGTCTCTGGCTTAAACTGTAATTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATATACGTATGATTGTGTACATGTATATGCATATGGTACGT--------GTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAAT----------GTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTTCAAT-----GATCTGACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAA-------AAGTC--TA-CTTGTAAAC----ATATTGA-TTGTGGCTTT-AAA-AATAA---TAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATGCATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGAC---------AGTATTTCTCTATTTT-C-----T---GTGT--------T---TG-A----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATATCACCTCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|20 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-----------ATCTG-----------GNNNNNNNN------------N---NNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNAATGCA-----TGTACATA---TCGTTATGTATACGT-GGTATT--T-CTC--TT-------------T------------TT--CTTT--CCACT---AT-----GT---TT---------T---A---A-TAAAAGA-TACGGTATGTGTTA-CGCCAT-GT-ATGTCAAT----GTATAC--CTGTTATGTATATGTT-AACA-CAGACCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGT
gi|21 : AACTTTTGGTGT----------GGATATTCTTTAAA-GTAACCTAA--C-AAATAAAACCAATTGATCAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATGTG----------------TATAT-TGTGA---ATAT--------ATATT-----TACACAATACATCGTTAGATATACGT-GTCTTT--TTATC--TT-------------T------------T----TTT--GCACGGT-AT-----TT---TTCTCAATAAAT-GCA---A-TATAAGA-CACAGTTTGTGTTA-CGTCAT-GC-ATGT
gi|22 : TATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAATATGCGTAAAT--CAGTTTTGAATATGTT-GATA-CTGGCTTATGACCTATTGGATTACA---AA-T--AAAGCCTTTTTT
gi|23 : tcaccgataaaaccaacttacccaaaaacatcgtgtatgttagtttgcccatatgtttatgaatgtattgtatttttctttaggaatgttgcacgagtTTTGGATGTT--------TGGAT-TTGATTTCATTTATCCTCA--T-ATATAAAACCATTTTATCAACATGT-----------ATCTG-----------GAATATATG------------CAGGTTT-TGGATGT---ATAC--------ATGAA-----TACATACT---TAGTGTCATATGCAT-GAAAGT--TCATG--TT-------------T------------Tctt
gi|23 : aT--ATGC----AG-----GT---TT---------T-GGATGTA-TACATGAATACA-TAC---TTAGTGTCAT-AT-GCATGAAA----GT--TC--ATGTTTTGTATCTGAT-CACA-CGGGCTTATGGCCTTTTGAATTGCA---AA-T--gtatctgatcacacgggcttatggccttttgaattgcaaat
gi|24 : atttggatgtttggatttgatttcatttatcctcatatataaaaccattttatcaacatgtatctggaataTGGAAAAGATAAATAAATAATTTTCAAACTGGATGAATATCTCTCAA-ATATTTCTGATATTAAATATAATAGCCATAGCTTTGATTTATTTTAATAAACTTATATTACTTATTTTGAAGTATTCGTGTGAGATTTGGGAATTTCATAGCTAAAATACTAT
gi|25 : tgactctata-TTTAC-AAGTTCT----TATT--ATTCTAAAATATACTTGTATG--TTAGTAAGTTTT---------ACATCATAAACTTAATTTCTCCGTAA--------------AAT-TG-C---------TGTT---------TTT-C-----C---AGCGT-------T---TG-AAT--TT-TTT-TACCGAATTCTAATGTG--------AAGAT-TGGATTAATTTCAAC------T-A---TAAACCAATTTATCAGCATGT-----------AT
gi|26 : TTAT-TATA-GTAGGT-TT--GTCTC--AA-------------T------------TAT-TTTT--A-ACTGCTAT-----TT---GC---------T-GTA---AGTATACG----CAGCAT----TA---TCATTGT-ATGTACAA----GTATTT--CTGTTTAGTATATATC-CACA-CGGGTCTATTTCCTATTCAATTGGA---AA-A--AGAGT
gi|27 : atactatgtctttctgaaaacagtttatta-----TGCACATT---TCTTTATGCATACGT-GATATT--TCCTG--GGG------------TGGGGGG------TTT-CTTT--ACAC----AG-----TT---TT---------A-GTA---A-TATAAGA-TAGAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--ATGTT---TA---GTT-CACA-CGGGCCTATGACCTAATAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|28 : CACATT---TCGTTATGAATACGT-GATAGCA-TGGTA--TT-------------T------------CTT-TTCT--AAA------------AT---TG---------T-GTA---A-TATAAGA-TAGAGTAGGTGTTA-TGTGAT-AT-ATACCAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACATCG-------GGCCTATTGAATTGCAATTAA-A--AAAGTTTCT
gi|29 : gaaACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCTC--TT-------------T------------TTT-CTTT--ACAT----TT-----GTATTTT---------T-GTA---A-TATAA-A-TACAGTATGTGTGT-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATG--------------TATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTCTT
gi|3 : GTATCCCTTTTGAAGATAGAAAATGTAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTCATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATATTTTTAGTATAGACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTAGGTAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAGTTTAAGCATGTATA--TGTTTAAAGC-TTTTGA----AAAGAAGAACATCATTGAAAATACATAACACTA--------T--TG-----TATTTACCGTGTCTATGGCTTAAACT-TATTTGATATATA------TGTAAAATAT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGTATATGCATATGGTA--------TGTGTTAGTAAGTACTTGTGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAATAAA-----ATGTTA-A-CAAGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTTCAAT-----AATCTTACT----------------AAAAAAAAAAGAAGTC--TA-CTTG-AAAT----ATGTTGA-TTGTGGA-TTAAAA-AA-AA---TAA-TTTGT-ATATTCT----GATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCTTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TTT-CTCTATT---GTCTGTGT----T---TG-A----AT-TTC-TACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAGTGTTACCTAA--TAAAATAGAACCAATTAATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATACATG------------T---TTTATTTGTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCTC--TT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----GT-----TT---TT---------T-GTA---A-TATAAGA-TACAGTATGTGTTG-CGTCTT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCCACGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|30 : TA-----TGCACATT---TCTGTATGTATACGT-GATATT--TTCTC--TT-------------T------------TTTTCTTT--ACAT----AT-----TT---TT---------T-GTA---A-TATAAGA-TACAGTAT-TATCA-CGTCTT-GT-ATGTA-------------------TTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTAATGAATT
gi|31 : ATGAGGTTAAACACTAACC-AAATAAAGTTTCTTGGCTAACATTAGTATGTGAGCTGCTATCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAATGCGTTGGTAAAGTAAACATTTTCTTA
gi|32 : -CGTCA--GT-GTATAATT----ATATACGTCTGTTTTATATATGTT-CACA-CGGGTCTATGGCCTATTGAATGGCC---AA-TA-AAAGTTTCTTCTcggat
gi|33 : tgagacagttctttatctCATTACGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--CTGTTTTGTATATGTT-AACA-CTGGCCTGCGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|34 : ataataat-TACAGTATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGCAAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATAGGTT-CACA-CAGGCCTATGGCCTATTCAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|35 : gTCTT-GT-ATGTATAT----GTGATC--TTGTTTTGTATATGTT-CTCA-C-------TGGCCTATT-AATTGCA---AA-T--AA
gi|36 : c--AC--ATATA--CTTA--AATGTGTACATGTATATGCATATGGTA--------TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATttatgggtactttccttctttcttc
gi|37 : tttatctaaccattaaatggtttTATTC--CTGATTTAGGTATGTT-CACA-CGAGCCTTTGGTCTGTTGAATAGGA---AA-T--AAAGGTTCTT
gi|38 : aA-TTTAA-AGGTTCT----TATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACGTTATACAT
gi|39 : GTTTTGCATTTTTTTCACA-CGGCCCTATGGCCTGTTGAATTGTA---AAGT--AAAGGTTCTTtt
gi|4 : TATAAATATACCCAAATTTAGTGTAGCAATTACTAGATTAATTGTTTCATCGCACCACTTTAAGATAGAATCTGGTAGGTGGCATAGACCGATACGTATCGCAATTGAAAATAGAAAATGGAATTCT----------TTGAAGACTAATATCATTTTATTATAACGTGTTCATTGTGTGTAGAATTACGAAGACC------------ATACTTTTGGCATGAACCAAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAG
gi|4 : AAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAAT-GTAGTTAGTGCATAACAATATTGCA-T-T--TGC----TTTTTACCGTGTCT------TAAACTGTATTTAATATATG------TGTAAT--ATGTATATA--CGTATGCATGTGTAAATGCATATG---------------------TAAGTAAGTACT--TGTGTTATGATATCTGTTA-----------------GTATAAATAAA-----GTGTTA-AACATGTTCATT-TTTA------ATTACATGAAATAAATTTGTA-GT----AATT------------CT----------------GAAA-------AA-----TAACTTGTAAAC----ATGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-AA-TAGATTAA-TTTGC-ATGTTCT----GATT--ATTATAAAGTA-A---ACTTG--T--GTC---TTA-----------ATCATACA-----CTTCTCCGTAA----A--------AAA----------------------------------------------------------TG-A----TT-TTCGCACAAAATGTTGATGTA--------TAGAT-TTAATTAATTATTACCTCA--T-AAATAAAAACAATTGACCAACATGT-----------ATCTG-------------------------------------TTATGTATG-------T--------GTGCA-----TACATATT---TCG---TGTGTACGT-GATA-T--TTCTC--TTTATTTGCCTGGTAT------------TTT-CTTTTAACA-----AT-----GT---TT---------T-G-----A-TATAAAA-AAACGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ACGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CAGA-CGGGACTATGGCCTATTGAAATGCA---TA-TAAAAAATATCTTTtgcataacaatattgcatttgctttttaccgtgtcttaaactgtatttaatatatgtgtaatatgtatatacgtatgcatgtgtaaatgcatatgtaagtaagtacttgtgttatgatatctgttagtataaataaagtgttaaacatgttcatttttaattacatgaaataaatttgtagtaattctgaaaaataacttgtaaacatgttgattttggcttaaaaatagattaatttgcatgttctgattattataaagtaaacttgtgtcttaatcatacacttctccgtaaaaaatgattttcgcacaaaatgttgatgtatagatttaattaattattacctcataaataaaaacaattgaccaacatgtatctgttatgtatgtgtgcatacatatttcgtgtgtacgtgatatttctctttatttgcctggtattttcttttaacaatgttttgatataaaaaaacgtatgtgttacgtcatgtacgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcagacgggactatggcctattgaaatgcatataaaaaatatctttaagt
gi|5 : tataaatatacccaaatttagtgtagcaattactagattaattgtttcatcgcaccactttaagatagaatctggtaggtggcatagaccgatacgtatcgcaattgaaaatagaaaatggaattctttgaagactaatatcattttattataacgtgttcattgtgtgtagaattacgaagaccatacttttggcatgaaccTTTAAATC-TTTTAA----AAAGCGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGTA-T-T--TG-----TTTTAACCGTGCCGCTGGCATTAACTGTATTTAATATATAATTTTATGTAAA--AT--GTATATGCGCATCAATGTGTACATGTATATGTATATGGTATGTAT----GTGTAAGTTAGTACT--TGAGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTT-----------ATT-TTTA------ATTATATGAAATAAATTTATATTT-TTTCAAT-----GATCGAACT----------------G-AA-------AAGTA--TA-CTTaagt
gi|5 : TAAA-----GTGTT-A-TTTTTAA-TT-ATATGA-AA---TAAATTTAT-ATTTTTTCAATGATCGAACTGAAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATTATACATGTACTT-CTCAGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TTTTC-----C---G-----------TGTTTG-A----TT-CAC-CACAAATATTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATTTAACCTCA--T-AAA-AAAACCAATTGATAAACATGT-----------GTCTG-----------GTATATATGCNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNNN--------NNNNN-----NNCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTTTTATTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TT---TTA--------T-GTA---G-TATGAGA-TACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTTGATTGCA---AA-T--AAAGTTCCTTacttgtgtattaacattatacatgtacttctcagtaacaagaaaacatgactgtattttccgtgtttgattcaccacaaatatttgatgtatggatttgattaaatttaacctcataaaaaaaccaattgataaacatgtgtctggtatatatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacatttcgttatgtatacgtgatatttttttatttttttctttacacatttttatgtagtatgagatacagtatgtgttacgtcatgtatgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcacatgggcctatggcctatttgattgcaaataaagttccttc
gi|6 : tttaaatcttttaaaaagcggaacaccattgaaaatacataacactattgtatttgttttaaccgtgccgctggcattaactgtatttaatatataattttatgtaaaatgtatatgcgcatcaatgtgtacatgtatatgtatatggtatgtatgtgtaagttagtacttgagttatgacatgtgttactatattatatgcataaaTA--------TGAAA-TTGATTAAATGTAACGTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGT-----------------------A-----TGCACATT---TGGTTATGTAAATGT-GATATTATTTCTC--TT-------------T------------ATT-CTTT--ACAC----AT-----TT---TA---------T-ATA---A-TGTAAGA-AACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTTTTC--TTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGTCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTc
gi|7 : tgtattaatgaattaaatgttgaatcaaaaacagttaaatgtcatttttataatgattttttatttctattataaactgttatcatatcaataattttaataaaataacaatttaagttgtatacttaaaatataaaatatgaaagtacacataatcaaaaaaaattatatttttattaaattttgttataccggtagttttaattaaggctttattttcaataatttttttaatagttttaattaagacttaaggctttttttgttttgttttGTC--TG-CTTGTAAAC----GTATTGA-TTGTGGC-TTTAAA-AATAA---TAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---ATT---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGACAGTTTTTTTTCTAT--------TTT-C-----T---GTGT--------T---TG-AT---TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTTATTCAATGTAACATCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATAAG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCTTTATGCATACGT-GGTATT--TTCTC--TT-------------G------------TTT-TTTT--A-AC----ATTTTTATT---TT---------T-GTA---A-TATAAGA-TACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAA
gi|8 : AGTC--TG-CTTGTAAAC----ATGTTGA-TTGTGGC-TT-AAA-AA-G----TAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TTT-CT----C---GATTTTCTGTGTT---TG-T----TT-TTC-AACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--A-TAATAACACCAATTGATTAACATGTATCTGGTATGTATCTG-----------GTATAAATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATAGT--TTCTC--TT-------------TA-----------TTT-CTTT--ACAC----A------AT---TT---------T-GTA---A-TATAAGA-TACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTGTGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTaaaaaaagttt
gi|9 : CTTAAACTGTATTTAAAGTATA------TGTAAA--ATGTATATA--CATATGAATGTTTACATCAATATGCATGTGGTATGTAT----GTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATAGCATGTGTTA---TAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTCA-AGCATGTTCATT-TAAA------ATTACATGAAATAAATCTATA--T-TTTCAAT-----GATCAGTCT----------------GAAA-------AAGTC--TG-CTTGTAAAC----TTGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-GA-AA---TG----TATAATATTCA----GGTT--ATTATAAAATGTACCT-TTTT--T--GTA---TTA---------ACATCATACCTGTACTTTCTCCATAACAAGA--------AAGCATGGC---------TGTA---------TTTCC-----C---GTGT--------T---TG-A----TTGTCC-CACAAATGTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 333333333333 1 111 111 1111 44444444444444 111111 11 11 333333333 222222222222 11111 111111 3333333333333333 1111111 111 111111111 11111111 1111111111 222222222222222222222222222222222 1111 11111111111 1111111111111111 22222222222222222222222222 11111111111 111111111 11
lowQualScore : 1 1 1 1 1 66 1 111 1 1 1 22 1 5 1 1 444444444444 1 1 3 2 1 2 111 8 1 0 1 1 1 3 1 6 1 7 0 1 444 7777 5 3 99999999999999 1 5 77 666666 66 33 33 3 2 0 0 444444444 66 222222222222 0 1 22222 777 0 5 444444 0 0 55 5 5 888 00 44 7777777777777777 8888888 66 4 9999 4 1 55 8 8 666 3 3 77777 555 44 44 555 333333333 22222222 1 3333333333 000000000000000000000000000000000 666 5555 2 2 88888888 2 77 2 99999999999 00000000000 2222222222222222 6666 99999999 55555 333 1 44 22 11111111111111111111111111 2 22 11111111111 222222222 1 1 1 1 3 1 3333 22 1 1 222 1 11
lowQualScore : . . . . . .. . ... . . . .. . . . . ............ . . . . . . ... . . . . . . . . . . . . . ... .... . . .............. . . .. ...... .. .. .. . . . . ......... .. ............ . . ..... ... . . ...... . . .. . . ... .. .. ................ ....... .. . .... . . .. . . ... . . ..... ... .. .. ... ......... ........ . .......... ................................. ... .... . . ........ . .. . ........... ........... ................ .... ........ ..... ... . .. .. .......................... . .. ........... ......... . . . . . . .... .. . . ... . ..
lowQualScore : 0 0 0 0 0 55 0 555 0 0 0 00 0 5 0 0 555555555555 0 0 3 5 0 5 000 0 0 7 0 0 0 7 0 7 0 3 2 0 000 0000 0 2 55555555555555 0 2 99 444444 99 88 88 6 8 9 8 000000000 11 888888888888 1 4 55555 444 1 0 444444 9 2 11 0 0 888 44 77 9999999999999999 6666666 11 4 4444 4 0 66 9 9 777 3 3 99999 555 66 66 888 333333333 11111111 2 2222222222 999999999999999999999999999999999 000 7777 9 9 55555555 4 99 4 55555555555 00000000000 3333333333333333 5555 11111111 66666 555 9 55 66 77777777777777777777777777 0 88 88888888888 999999999 9 9 9 6 1 5 4444 11 5 5 777 5 33
consensus : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-AT-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTAT----GTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
Reference ( family-5962 ) : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-AT-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGNATATGCATATGGTATGTAT---TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G-TNTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
gi|1 : TGGAAAAGCTCAAAAAGCAATTTTAAAACTGAATAAATATCTTATAATTTTTTTCCGATATT---TCTATCAGTTATAGATAAGAACT-TTTTGATAAACTTATATAACCTATTCTAAATTATTCATGC----TT------TTTCATAGTTCAAATAATAT
gi|1 : atgactaaagcAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGAGTAACATAAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCATAAGTATATTTAGTCAAATAATTAAAGATATTAGTATACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TTTTTTTTTTCTGAAATGTATAGATATATCCAAATTTAGGTTATCAATTACTGGACTAATTGTTTCATCGCACCACCTTAAAATAGAATCTTGTAGATGGTATAGACCGAGAAGTATCCCGTTTGAAGATAGAATATGCAACTTTTGTCAAACAATTGAAGATGAATATCATTTAATGATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATTTATAAGCTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAACGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATTT---TTAAATCGTTTGA----AAAGAGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGAAT-G--TG-----TTTTTACCGTGTCCCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATAAATG------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGAATACGCATATGGTATGTATGTGTGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACAAATATTACTGTAT------TA-ATGAATAAAGAAA-----ATGTTA-AACATGTTCATT-TTAA------ATTACTTGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---ATTG-TCAGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAT----ATGTTCA-TTTTGGC-TT-AAC-AA---AATAA-TTTGC-ATATTCT----AATT--ACTACAAAGTATACTTACTTA--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G----TTGA----TT-TGA-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAA-TTGATATACTGTAACCTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATGTT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTC--ACAC----AT-----ATGT---------T-GTA-A-TATGAGATACAATATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAACT----GTTTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACT-CGGGCCTATGATCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTATTTTtgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgaaacatgatgctgaaactaacccaaataaagtttcctgagtaacataagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcataagtatatttagtcaaataattaaagatattagtatacagtcttggcatgaacgcttggaaatttttttttttctgaaatgtatagatatatccaaatttaggttatcaattactggactaattgtttcatcgcaccaccttaaaatagaatcttgtagatggtatagaccgagaagtatcccgtttgaagatagaatatgcaacttttgtcaaacaattgaagatgaatatcatttaatgatggagtgttcattatatgtagaattacgtagaacatttataaataaatacttttggtatagaccaagtatttataagctggtacaacttttcggcagtaaagatgaaaacgtagttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcgtttgaaaagaggaacaccattgaaaatacataacactattgaatgtgtttttaccgtgtccctggcttaaactgtatttgataaatgtgtaaaatatatacgtatgaatgtgttcatgaatacgcatatggtatgtatgtgtgtgtaagtaagtacttgtgttatgacaaatattactgtattaatgaataaagaaaatgttaaacatgttcattttaaattacttgaaataaatttatatttttcattgtcagactgaaaaagtctgcttgtaaatatgttcattttggcttaacaaaataatttgcatattctaattactacaaagtatacttacttatgtattaacatcatacatgtactttctccgtaacaagaaaacatgactgtatttccgttgatttgacacaaatttttgatgtatggaattgatatactgtaacctcataaactaaaccaattgattaatatgtatctggtatatatgttttatgtttgtatatatgtatgcacatttcgttatgtatacgtgatgttttctcttttttcttcacacatatgttgtaatatgagatacaatatatgttacgtcatgtatgtaactgttttcctgttttgtatatgttcactcgggcctatgatctattgaattgcaaataaagtttatttt
gi|10 : atgactaaagctggaaaagctcaaaaagcaattttaaaactgaataaatatcttataatttttttccgatatttctatcagttatagataagaactttttgataaacttatataacctattctaaattattcatgctttttcatagttcaaataatattgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgATGTATTTGATATATAT----GTATAA-TGAGTA------TGTT--------TGTAAATATATGGTGTGTATATG--TAGGTAAGTCCTTGTGTTGTGGTATGTTTGTT-GTAA------AC------------ATTTAGA-TT-TTTGCTAAAAAGATACAATT----------------AAAA-------GAA-CAAT-GC-----AACTCTCAT-TTGAATTATGG-----ACATAA---AATA--TTTTT-ATA--CT----GAAT--ATTATTAAGTATACCGGCTTGGTT--ATA---TAA---------CCATCCTGCATGAACTTTCTCCGTAAACAGA--------AAAT-TGGC---------AGTC---------TT---------TCCC---------G-TGCTTGAGTTCCT-TGC-CA-AAA--TTTGATAT---------T---T-TTGATTAATTG-AATTTTACCT-AACT---ACTAA---A--GAAATGT-----------A-CCA-----------ATGTACATG------------T---TGCATGTATGT---AT
gi|11 : ttctgactttaAACAAGAGATATGATAAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------GGTGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTGTTATGTA--------TGGAC-TTGATTAAATATAACCTCA--T-AAATTAAACCAATTGATTAATATAT-----------ATCTGGTATATATCTGGTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATTT--------ATGTA-----TGTACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCC--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----CT-----TTTT---------TTGTG-A-TATAAGATACAGTTTGTGTTA-CATCAT-GT-ATTTAAAT----GTATTC--CTGTTTTACATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTT
gi|12 : C---------TGTA---------TT---------T-CC---------GGTGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-ATATAAAACCATTTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATAT--G------------T---TTTATGCATGT---ATAT--------ATGTACAGTATGCACATT---TCTTTATGTTTACAT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------T-T-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-GGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGATTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AATGTTTCTTTgc
gi|13 : ACCCAAATAAAGTTTCCTGGGTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTT--------ATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGAA-AAT-TC
gi|13 : -TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATACCTAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCAcacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactatcagttctttctgaagtgtataactatacctaaatttagggtagcaattactagattaatcgtttca
gi|14 : acccaaataaagtttcctgggtaacattagtacgtgacctcttgtcatctttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcttggcatgaacgcttggaaaattccacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactaC---------G-TGTTTAAA---TT-TTC-CACATATTGTTGATGTAGGGATGTATGAAT-TTGATTAAATGTAACCTCT--T-AAATAAAATCACATGATTAACATGT-----------ATCTA-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATG----------------------------CATATT---TCGTTATGTATAGGT-GATATT--T-CT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AA-----TTTT-----------GTA-A-TACAAGATACAGTATGTGTTA-CATCAT-GT-ATGTACAT----GTATTC--CTGTTTTGCATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAA
gi|15 : tctA-TTTAA-AGGTTCT----AATT--ATTATAAAGTATTCTTACTCG--T--GTA---TTATTATACATAACGTTATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATAAC---------TGTA---------TT---------T-CCC--------G-TGTTTTA----TT-TTC-CACAAATTTTTCATGTA--------GGAAA-TTGCGTAAATGTAACCTCA--T-CAATATAACAAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------a
gi|16 : aataaagacaaaagggaaaatatcgtgttgatatttccattgattcagttatacatATTGAATAAATATAAAACCAT-G-ATATAATGCAACTTGTTTA---TGTCTTTCATTGAAATATTGAATATGGTATATA------TGTACA--AT--GT-T-----TATGAATGTGT---T---TGTGTATATTGTATGTAT------------ATGTATT--TGTGTTATGGTATGTGTTA-TA----------ATATGCATAAATAAA-----GTTTTA-ATCATG-ACATTGTTAACATTTGATTGCCACAAATAAATTTATA-TTATTT-C---AATAATC
gi|17 : CTCA--T-TGATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCAG-----------GTATATATG------------T---TTTATATATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTTTACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAAATAAAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCTTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--ATAGTTa
gi|18 : TAAAACCTATATACCAACATGT-----------GTCTG-----------ATGTATATG------------T------AGGTATGTTACATAT--------GTGTA-----TACATATT---CCATTAT-TATA---------T--TTCT--CTT-------------TATTTGAATGGCATTT-CTCT--TCAA----AA-----ATAG---------T-GTA-A-TATAAAATA-AGCATGATTTA-CATAATTATCATGTA--T----GTATTC--TTGTTG-GTGTTTTTT-CACA-CGCGCCTACG-CCTGTTGAATTACA---AA-T--AAAGTTT
gi|19 : TTAACATGT-----------AT------------------ATATG------------T---TTTATGTATTT---ATAT--------ATGTA-----TGTACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T----------------------ACA-----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTt
gi|2 : gatcaaaacaattttactaccttcatAAACATGATGCTGAA-ACTTACCCAAATAAAATTTCCTGGTTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATGTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCCTGACATGAACGCTTGG-ACAAT-TC
gi|2 : -A-AATATCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATcacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|2 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttTTTGGTATAAACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTCGGTAGTAAAGATGAAAATGTGGTTAGAAATTTAAGCATGTATATTT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATAATTGAAAATACATAACACTATTG--------------TATTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTAATTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATATACGTATGATTGTGTACATGTATATGCATATGGTACGT--------GTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAAT----------GTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCTGACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAA-------AAGTC--T-ACTTGTAAAC----ATATTGA-TTGTGGCTTT-AAA-AAT--AATAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATGCATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGAC---------AGTATTTCTCTATTT---------T-CT---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATATCACCTCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|20 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-----------ATCTG-----------GNNNNNNNN------------N---NNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNAATGCA-----TGTACATA---TCGTTATGTATACGT-GGTATT--T-CT--CTT-------------T------------TT--CTTT--CCACT---AT-----GTTT---------T---A-A-TAAAAGATACGGTATGTGTTA-CGCCAT-GT-ATGTCAAT----GTATAC--CTGTTATGTATATGTT-AACA-CAGACCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGT
gi|21 : AACTTTTGGTGT----------GGATATTCTTTAAA-GTAACCTAA--C-AAATAAAACCAATTGATCAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATGTG----------------TATAT-TGTGA---ATAT--------ATATT-----TACACAATACATCGTTAGATATACGT-GTCTTT--TTAT--CTT-------------T------------T----TTT--GCACGGT-AT-----TTTTCTCAATAAAT-GCA-A-TATAAGACACAGTTTGTGTTA-CGTCAT-GC-ATGT
gi|22 : TATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAATATGCGTAAAT--CAGTTTTGAATATGTT-GATA-CTGGCTTATGACCTATTGGATTACA---AA-T--AAAGCCTTTTTT
gi|23 : tcaccgataaaaccaacttacccaaaaacatcgtgtatgttagtttgcccatatgtttatgaatgtattgtatttttctttaggaatgttgcacgagtTTTGGATGTT--------TGGAT-TTGATTTCATTTATCCTCA--T-ATATAAAACCATTTTATCAACATGT-----------ATCTG-----------GAATATATG------------CAGGTTT-TGGATGT---ATAC--------ATGAA-----TACATACT---TAGTGTCATATGCAT-GAAAGT--TCAT--GTT-------------T------------Tctt
gi|23 : a-----TTTTGGA------T-GTATA-CATGA-ATACA-TAC---TTAGTGTCAT-AT-GCATGAAA----GT--TC--ATGTTTTGTATCTGAT-CACA-CGGGCTTATGGCCTTTTGAATTGCA---AA-T--gtatctgatcacacgggcttatggccttttgaattgcaaat
gi|24 : atttggatgtttggatttgatttcatttatcctcatatataaaaccattttatcaacatgtatctggaatatatgcaggTGGAAAAGATAAATAAATAATTTTCAAACTGGATGAATATCTCTCAA-ATATTTCTGATATTAAATATAATAGCCATAGCTTTGATTTATTTTAATAAACTTATATTACTTATTTTGAAGTATTCGTGTGAGATTTGGGAATTTCATAGCTAAAATACTAT
gi|25 : tgactctata-TTTAC-AAGTTCT----TATT--ATTCTAAAATATACTTGTATG--TTAGTAAGTTTT---------ACATCATAAACTTAATTTCTCCGT------A--------AAAT-TG-C---------TGTT---------TT---------T-CCA--------G-CGTTTGAAT--TT-TTT-TACCGAATTCTAATGTG--------AAGAT-TGGATTAATTTCAAC--TA--T------AAACCAATTTATCAGCATGT-----------AT
gi|26 : TTAT-TATA-GTAGGT-TT--GTCT--CAA-------------T------------TAT-TTTT--A-ACTGCTAT-----TTGC---------T-GTA-AGTATACG---CAGCAT----TA---TCATTGT-ATGTACAA----GTATTT--CTGTTTAGTATATATC-CACA-CGGGTCTATTTCCTATTCAATTGGA---AA-A--AGAGT
gi|27 : atactatgtctttctgaaaacagtttatta-----TGCACATT---TCTTTATGCATACGT-GATATT--TCCT--GGGG------------TGGGGGG------TTT-CTTT--ACAC----AG-----TTTT---------A-GTA-A-TATAAGATAGAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--ATGTT---TA---GTT-CACA-CGGGCCTATGACCTAATAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|28 : CACATT---TCGTTATGAATACGT-GATAGCA-TGGT--ATT-------------T------------CTT-TTCT--A-AA----A-------TTG---------T-GTA-A-TATAAGATAGAGTAGGTGTTA-TGTGAT-AT-ATACCAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACATCG-------GGCCTATTGAATTGCAATTAA-A--AAAGTTTCT
gi|29 : gaaACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAT----TTGTA--TTTT---------T-GTA-A-TATAA-ATACAGTATGTGTGT-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATG--------------TATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTCTT
gi|3 : GTATCCCTTTTGAAGATAGAAAATGTAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTCATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATATTTTTAGTATAGACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTAGGTAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAGTTTAAGCATGTATATGT---TTAAAGCTTTTGA----AAAGAAGAACATCATTGAAAATACATAACACTA-------T--TG-----TATTTACCGTGTCTATGGCTTAAAC--T-TATTTGATATATA------TGTAAAATAT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGTATATGCATATGGTATGTGT---T-----AGTAAGTACTTGTGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAATAAA-----ATGTTA-A-CAAGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATAATCTTACT----------------AAAAAAAAAAGAAGTC--T-ACTTG-AAAT----ATGTTGA-TTGTGGA-TTAAAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCTTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TTTCTCTATTGT-CT---------G-TGTTTGA----AT-TTC-TACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAGTGTTACCTAA--TAAAATAGAACCAATTAATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATACATG------------T---TTTATTTGTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----GT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTG-CGTCTT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCCACGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|30 : TA-----TGCACATT---TCTGTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTTTCTTT--ACAT----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTAT-TATCA-CGTCTT-GT-ATGTA-------------------TTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTAATGAATT
gi|31 : ATGAGGTTAAACACTAACC-AAATAAAGTTTCTTGGCTAACATTAGTATGTGAGCTGCTATCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAATGCGTTGGTAAAGTAAACATTTTCTTA
gi|32 : -CGTCA--GT-GTATAATT----ATATACGTCTGTTTTATATATGTT-CACA-CGGGTCTATGGCCTATTGAATGGCC---AA-TA-AAAGTTTCTTCTcggat
gi|33 : tgagacagttctttatctCATTACGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--CTGTTTTGTATATGTT-AACA-CTGGCCTGCGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|34 : ataataatTACAGTATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGCAAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATAGGTT-CACA-CAGGCCTATGGCCTATTCAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|35 : gTCTT-GT-ATGTATAT----GTGATC--TTGTTTTGTATATGTT-CTCA-C-------TGGCCTATT-AATTGCA---AA-T--AA
gi|36 : c--AC--ATATA--CTTA--AATGTGTACATGTATATGCATATGGTA--------TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATttatgggtactttccttctttcttc
gi|37 : tttatctaaccattaaatggtttTATTC--CTGATTTAGGTATGTT-CACA-CGAGCCTTTGGTCTGTTGAATAGGA---AA-T--AAAGGTTCTT
gi|38 : aA-TTTAA-AGGTTCT----TATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACGTTATACAT
gi|39 : GTTTTGCATTTTTTTCACA-CGGCCCTATGGCCTGTTGAATTGTA---AAGT--AAAGGTTCTTtt
gi|4 : TATAAATATACCCAAATTTAGTGTAGCAATTACTAGATTAATTGTTTCATCGCACCACTTTAAGATAGAATCTGGTAGGTGGCATAGACCGATACGTATCGCAATTGAAAATAGAAAATGGAATTCTT----------TGAAGACTAATATCATTTTATTATAACGTGTTCATTGTGTGTAGAATTACGAAGACCAT------------ACTTTTGGCATGAACCAAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAG
gi|4 : AAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAAT-GTAGTTAGTGCATAACAATATTGCAT-T--TGC----TTTTTACCGTGTCT------TAAAC--TGTATTTAATATATG------TGTAAT--ATGTATATA--CGTATGCATGTGTAAATGCATATG---------------------TAAGTAAGTACT--TGTGTTATGATATCTGTTA-----------------GTATAAATAAA-----GTGTTA-AACATGTTCATT-TTTA------ATTACATGAAATAAATTTGTA-GT---------AAT--T----CT----------------GAAA-------AA-----TAACTTGTAAAC----ATGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-AATAGATTAA-TTTGC-ATGTTCT----GATT--ATTATAAAGTA-A---ACTTG--T--GTC---TTA-----------ATCATACA-----CTTCTCCGTAA----A--------AAA----------------------------------------------------------TGA----TT-TTCGCACAAAATGTTGATGTA--------TAGAT-TTAATTAATTATTACCTCA--T-AAATAAAAACAATTGACCAACATGT-----------ATCTG-------------------------------------TTATGTATG-------T--------GTGCA-----TACATATT---TCG---TGTGTACGT-GATA-T--TTCT--CTTTATTTGCCTGGTAT------------TTT-CTTTTAACA-----AT-----GTTT---------T-G---A-TATAAAAAAACGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ACGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CAGA-CGGGACTATGGCCTATTGAAATGCA---TA-TAAAAAATATCTTTtgcataacaatattgcatttgctttttaccgtgtcttaaactgtatttaatatatgtgtaatatgtatatacgtatgcatgtgtaaatgcatatgtaagtaagtacttgtgttatgatatctgttagtataaataaagtgttaaacatgttcatttttaattacatgaaataaatttgtagtaattctgaaaaataacttgtaaacatgttgattttggcttaaaaatagattaatttgcatgttctgattattataaagtaaacttgtgtcttaatcatacacttctccgtaaaaaatgattttcgcacaaaatgttgatgtatagatttaattaattattacctcataaataaaaacaattgaccaacatgtatctgttatgtatgtgtgcatacatatttcgtgtgtacgtgatatttctctttatttgcctggtattttcttttaacaatgttttgatataaaaaaacgtatgtgttacgtcatgtacgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcagacgggactatggcctattgaaatgcatataaaaaatatctttaagt
gi|5 : tataaatatacccaaatttagtgtagcaattactagattaattgtttcatcgcaccactttaagatagaatctggtaggtggcatagaccgatacgtatcgcaattgaaaatagaaaatggaattctttgaagactaatatcattttattataacgtgttcattgtgtgtagaattacgaagaccatacttttggcatgaaccT---TTAAATCTTTTAA----AAAGCGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGTAT-T--TG-----TTTTAACCGTGCCGCTGGCATTAAC--TGTATTTAATATATAATTTTATGTAAA--AT--GTATATGCGCATCAATGTGTACATGTATATGTATATGGTATGTAT----GTGTAAGTTAGTACT--TGAGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTT-----------ATT-TTTA------ATTATATGAAATAAATTTATATTT-TTT-C---AATGATCGAACT----------------G-AA-------AAGTA--T-ACTTaagt
gi|5 : TAAA-----GTGTT-A-TTTTTAA-TT-ATATGA---AATAAATTTAT-ATTTTTTCAATGATCGAACTGAAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATTATACATGTAC-TTCTCAGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTAT--------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-CAC-CACAAATATTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATTTAACCTCA--T-AAA-AAAACCAATTGATAAACATGT-----------GTCTG-----------GTATATATGCNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNNN--------NNNNN-----NNCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTTTTATTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTTA--------T-GTA-G-TATGAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTTGATTGCA---AA-T--AAAGTTCCTTacttgtgtattaacattatacatgtacttctcagtaacaagaaaacatgactgtattttccgtgtttgattcaccacaaatatttgatgtatggatttgattaaatttaacctcataaaaaaaccaattgataaacatgtgtctggtatatatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacatttcgttatgtatacgtgatatttttttatttttttctttacacatttttatgtagtatgagatacagtatgtgttacgtcatgtatgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcacatgggcctatggcctatttgattgcaaataaagttccttc
gi|6 : tttaaatcttttaaaaagcggaacaccattgaaaatacataacactattgtatttgttttaaccgtgccgctggcattaactgtatttaatatataattttatgtaaaatgtatatgcgcatcaatgtgtacatgtatatgtatatggtatgtatgtgtaagttagtacttgagttatgacatgtgttactatattatatgcataaaTA--------TGAAA-TTGATTAAATGTAACGTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATG----------------------------CACATT---TGGTTATGTAAATGT-GATATTATTTCT--CTT-------------T------------ATT-CTTT--ACAC----AT-----TTTA---------T-ATA-A-TGTAAGAAACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTTTTC--TTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGTCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTc
gi|7 : tgtattaatgaattaaatgttgaatcaaaaacagttaaatgtcatttttataatgattttttatttctattataaactgttatcatatcaataattttaataaaataacaatttaagttgtatacttaaaatataaaatatgaaagtacacataatcaaaaaaaattatatttttattaaattttgttataccggtagttttaattaaggctttattttcaataatttttttaatagttttaattaagacttaaggctttttttgttttgttttGTC--T-GCTTGTAAAC----GTATTGA-TTGTGGC-TTTAAA-AAT--AATAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---ATT---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGACAGTTTTTTTTCTAT--------TT---------T-CT---------G-TGTTTGAT---TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTTATTCAATGTAACATCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATAAG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCTTTATGCATACGT-GGTATT--TTCT--CTT-------------G------------TTT-TTTT--A-AC----ATTTTTATTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAA
gi|8 : AGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTGTGGC-TT-AAA-AA---G-TAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TT---------T-CTCGATTTTCTG-TGTTTGT----TT-TTC-AACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--A-TAATAACACCAATTGATTAACATGTATCTGGTATGTATCTG-----------GTATAAATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATAGT--TTCT--CTT-------------TA-----------TTT-CTTT--ACAC----A------ATTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTGTGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTaaaaaaagttt
gi|9 : CTTAAAC--TGTATTTAAAGTATA------TGTAAA--ATGTATATA--CATATGAATGTTTACATCAATATGCATGTGGTATGTAT----GTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATAGCATGTGTTA---TAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTCA-AGCATGTTCATT-TAAA------ATTACATGAAATAAATCTATA--T-TTT-C---AATGATCAGTCT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----TTGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-GA---AATG----TATAATATTCA----GGTT--ATTATAAAATGTACCT-TTTT--T--GTA---TTA---------ACATCATACCTGTACTTTCTCCATAACAAGA--------AAGCATGGC---------TGTA---------TT---------TCCC---------G-TGTTTGA----TTGTCC-CACAAATGTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 333333333333 1 111 111 1111 44444444444444 111111 11 11 1111111 11111 111111 3333333333333333 1111111 111 111111111 11111111 1111111111 222222222222222222222222222222222 1111 11111111111 1111111111111111 22222222222222222222222222 11111111111 111111111 11
lowQualScore : 1 1 1 1 1 66 1 111 1 1 1 22 1 5 1 1 444444444444 1 1 3 2 1 2 111 8 1 0 1 1 1 3 1 6 1 7 0 1 444 7777 5 3 99999999999999 1 5 77 666666 66 33 33 3 0 5 0 9999 66 0 8 0 4444444 0 1 22222 777 0 5 444444 0 0 55 5 5 888 00 44 7777777777777777 8888888 66 4 9999 4 1 55 8 8 666 3 3 77777 555 44 44 555 333333333 22222222 1 3333333333 000000000000000000000000000000000 5 5555 2 2 88888888 2 77 2 99999999999 00000000000 2222222222222222 6666 99999999 55555 333 1 44 22 11111111111111111111111111 2 22 11111111111 222222222 1 1 1 1 3 1 3333 22 1 1 222 1 11
lowQualScore : . . . . . .. . ... . . . .. . . . . ............ . . . . . . ... . . . . . . . . . . . . . ... .... . . .............. . . .. ...... .. .. .. . . . . .... .. . . . ....... . . ..... ... . . ...... . . .. . . ... .. .. ................ ....... .. . .... . . .. . . ... . . ..... ... .. .. ... ......... ........ . .......... ................................. . .... . . ........ . .. . ........... ........... ................ .... ........ ..... ... . .. .. .......................... . .. ........... ......... . . . . . . .... .. . . ... . ..
lowQualScore : 0 0 0 0 0 55 0 555 0 0 0 00 0 5 0 0 555555555555 0 0 3 5 0 5 000 0 0 7 0 0 0 7 0 7 0 3 2 0 000 0000 0 2 55555555555555 0 2 99 444444 99 88 88 6 9 7 7 4444 11 4 8 5 5555555 1 4 55555 444 1 0 444444 9 2 11 0 0 888 44 77 9999999999999999 6666666 11 4 4444 4 0 66 9 9 777 3 3 99999 555 66 66 888 333333333 11111111 2 2222222222 999999999999999999999999999999999 7 7777 9 9 55555555 4 99 4 55555555555 00000000000 3333333333333333 5555 11111111 66666 555 9 55 66 77777777777777777777777777 0 88 88888888888 999999999 9 9 9 6 1 5 4444 11 5 5 777 5 33
consensus : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-AT-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
Reference ( family-5962 ) : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-AT-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
gi|1 : TGGAAAAGCTCAAAAAGCAATTTTAAAACTGAATAAATATCTTATAATTTTTTTCCGATATT---TCTATCAGTTATAGATAAGAACT-TTTTGATAAACTTATATAACCTATTCTAAATTATTCATGC----TT------TTTCATAGTTCAAATAATAT
gi|1 : atgactaaagcAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGAGTAACATAAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCATAAGTATATTTAGTCAAATAATTAAAGATATTAGTATACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TTTTTTTTTTCTGAAATGTATAGATATATCCAAATTTAGGTTATCAATTACTGGACTAATTGTTTCATCGCACCACCTTAAAATAGAATCTTGTAGATGGTATAGACCGAGAAGTATCCCGTTTGAAGATAGAATATGCAACTTTTGTCAAACAATTGAAGATGAATATCATTTAATGATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATTTATAAGCTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAACGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATTT---TTAAATCGTTTGA----AAAGAGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGAAT-G--TG-----TTTTTACCGTGTCCCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATAAATG------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGAATACGCATATGGTATGTATGTGTGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACAAATATTACTGTAT------TA-ATGAATAAAGAAA-----ATGTTA-AACATGTTCATT-TTAA------ATTACTTGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---ATTG-TCAGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAT----ATGTTCA-TTTTGGC-TT-AAC-AA---AATAA-TTTGC-ATATTCT----AATT--ACTACAAAGTATACTTACTTA--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G----TTGA----TT-TGA-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAA-TTGATATACTGTAACCTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATGTT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTC--ACAC----AT-----ATGT---------T-GTA-A-TATGAGATACAATATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAACT----GTTTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACT-CGGGCCTATGATCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTATTTTtgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgaaacatgatgctgaaactaacccaaataaagtttcctgagtaacataagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcataagtatatttagtcaaataattaaagatattagtatacagtcttggcatgaacgcttggaaatttttttttttctgaaatgtatagatatatccaaatttaggttatcaattactggactaattgtttcatcgcaccaccttaaaatagaatcttgtagatggtatagaccgagaagtatcccgtttgaagatagaatatgcaacttttgtcaaacaattgaagatgaatatcatttaatgatggagtgttcattatatgtagaattacgtagaacatttataaataaatacttttggtatagaccaagtatttataagctggtacaacttttcggcagtaaagatgaaaacgtagttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcgtttgaaaagaggaacaccattgaaaatacataacactattgaatgtgtttttaccgtgtccctggcttaaactgtatttgataaatgtgtaaaatatatacgtatgaatgtgttcatgaatacgcatatggtatgtatgtgtgtgtaagtaagtacttgtgttatgacaaatattactgtattaatgaataaagaaaatgttaaacatgttcattttaaattacttgaaataaatttatatttttcattgtcagactgaaaaagtctgcttgtaaatatgttcattttggcttaacaaaataatttgcatattctaattactacaaagtatacttacttatgtattaacatcatacatgtactttctccgtaacaagaaaacatgactgtatttccgttgatttgacacaaatttttgatgtatggaattgatatactgtaacctcataaactaaaccaattgattaatatgtatctggtatatatgttttatgtttgtatatatgtatgcacatttcgttatgtatacgtgatgttttctcttttttcttcacacatatgttgtaatatgagatacaatatatgttacgtcatgtatgtaactgttttcctgttttgtatatgttcactcgggcctatgatctattgaattgcaaataaagtttatttt
gi|10 : atgactaaagctggaaaagctcaaaaagcaattttaaaactgaataaatatcttataatttttttccgatatttctatcagttatagataagaactttttgataaacttatataacctattctaaattattcatgctttttcatagttcaaataatattgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgATGTATTTGATATATA----TGTATAA-TGAGTA------TGTT--------TGTAAATATATGGTGTGTATATG--TAGGTAAGTCCTTGTGTTGTGGTATGTTTGTT-GTAA------AC------------ATTTAGA-TT-TTTGCTAAAAAGATACAATT----------------AAAA-------GAA-CAAT-GC-----AACTCTCAT-TTGAATTATGG-----ACATAA---AATA--TTTTT-ATA--CT----GAAT--ATTATTAAGTATACCGGCTTGGTT--ATA---TAA---------CCATCCTGCATGAACTTTCTCCGTAAACAGA--------AAAT-TGGC---------AGTC---------TT---------TCCC---------G-TGCTTGAGTTCCT-TGC-CA-AAA--TTTGATAT---------T---T-TTGATTAATTG-AATTTTACCT-AACT---ACTAA---A--GAAATGT-----------A-CCA-----------ATGTACATG------------T---TGCATGTATGT---AT
gi|11 : ttctgactttaAACAAGAGATATGATAAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------GGTGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTGTTATGTA--------TGGAC-TTGATTAAATATAACCTCA--T-AAATTAAACCAATTGATTAATATAT-----------ATCTGGTATATATCTGGTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATTT--------ATGTA-----TGTACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCC--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----CT-----TTTT---------TTGTG-A-TATAAGATACAGTTTGTGTTA-CATCAT-GT-ATTTAAAT----GTATTC--CTGTTTTACATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTT
gi|12 : C---------TGTA---------TT---------T-CC---------GGTGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-ATATAAAACCATTTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATAT--G------------T---TTTATGCATGT---ATAT--------ATGTACAGTATGCACATT---TCTTTATGTTTACAT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------T-T-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-GGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGATTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AATGTTTCTTTgc
gi|13 : ACCCAAATAAAGTTTCCTGGGTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTT--------ATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGAA-AAT-TC
gi|13 : -TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATACCTAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCAcacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactatcagttctttctgaagtgtataactatacctaaatttagggtagcaattactagattaatcgtttca
gi|14 : acccaaataaagtttcctgggtaacattagtacgtgacctcttgtcatctttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcttggcatgaacgcttggaaaattccacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactaC---------G-TGTTTAAA---TT-TTC-CACATATTGTTGATGTAGGGATGTATGAAT-TTGATTAAATGTAACCTCT--T-AAATAAAATCACATGATTAACATGT-----------ATCTA-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATG----------------------------CATATT---TCGTTATGTATAGGT-GATATT--T-CT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AA-----TTTT-----------GTA-A-TACAAGATACAGTATGTGTTA-CATCAT-GT-ATGTACAT----GTATTC--CTGTTTTGCATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAA
gi|15 : tctA-TTTAA-AGGTTCT----AATT--ATTATAAAGTATTCTTACTCG--T--GTA---TTATTATACATAACGTTATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATAAC---------TGTA---------TT---------T-CCC--------G-TGTTTTA----TT-TTC-CACAAATTTTTCATGTA--------GGAAA-TTGCGTAAATGTAACCTCA--T-CAATATAACAAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------a
gi|16 : aataaagacaaaagggaaaatatcgtgttgatatttccattgattcagttatacatATTGAATAAATATAAAACCAT-G-ATATAATGCAACTTGTTTA---TGTCTTTCATTGAAATATTGAATATGGTATATA------TGTACA--AT--GT-T-----TATGAATGTGT-----T-TGTGTATATTGTATGTA----TATGTA--------TT--TGTGTTATGGTATGTGTTA---TA--------ATATGCATAAATAAA-----GTTTTA-ATCATG-ACATTGTTAACATTTGATTGCCACAAATAAATTTATA-TTATTT-C---AATAATC
gi|17 : CTCA--T-TGATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCAG-----------GTATATATG------------T---TTTATATATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTTTACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAAATAAAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCTTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--ATAGTTa
gi|18 : TAAAACCTATATACCAACATGT-----------GTCTG-----------ATGTATATG------------T------AGGTATGTTACATAT--------GTGTA-----TACATATT---CCATTAT-TATA---------T--TTCT--CTT-------------TATTTGAATGGCATTT-CTCT--TCAA----AA-----ATAG---------T-GTA-A-TATAAAATA-AGCATGATTTA-CATAATTATCATGTA--T----GTATTC--TTGTTG-GTGTTTTTT-CACA-CGCGCCTACG-CCTGTTGAATTACA---AA-T--AAAGTTT
gi|19 : TTAACATGT-----------AT------------------ATATG------------T---TTTATGTATTT---ATAT--------ATGTA-----TGTACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T----------------------ACA-----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTt
gi|2 : gatcaaaacaattttactaccttcatAAACATGATGCTGAA-ACTTACCCAAATAAAATTTCCTGGTTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATGTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCCTGACATGAACGCTTGG-ACAAT-TC
gi|2 : -A-AATATCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATcacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|2 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttTTTGGTATAAACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTCGGTAGTAAAGATGAAAATGTGGTTAGAAATTTAAGCATGTATATTT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATAATTGAAAATACATAACACTATTG--------------TATTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTAATTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATATACGTATGATTGTGTACATGTATATGCATATGGTACGT--------GTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAAT----------GTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCTGACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAA-------AAGTC--T-ACTTGTAAAC----ATATTGA-TTGTGGCTTT-AAA-AAT--AATAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATGCATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGAC---------AGTATTTCTCTATTT---------T-CT---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATATCACCTCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|20 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-----------ATCTG-----------GNNNNNNNN------------N---NNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNAATGCA-----TGTACATA---TCGTTATGTATACGT-GGTATT--T-CT--CTT-------------T------------TT--CTTT--CCACT---AT-----GTTT---------T---A-A-TAAAAGATACGGTATGTGTTA-CGCCAT-GT-ATGTCAAT----GTATAC--CTGTTATGTATATGTT-AACA-CAGACCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGT
gi|21 : AACTTTTGGTGT----------GGATATTCTTTAAA-GTAACCTAA--C-AAATAAAACCAATTGATCAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATGTG----------------TATAT-TGTGA---ATAT--------ATATT-----TACACAATACATCGTTAGATATACGT-GTCTTT--TTAT--CTT-------------T------------T----TTT--GCACGGT-AT-----TTTTCTCAATAAAT-GCA-A-TATAAGACACAGTTTGTGTTA-CGTCAT-GC-ATGT
gi|22 : TATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAATATGCGTAAAT--CAGTTTTGAATATGTT-GATA-CTGGCTTATGACCTATTGGATTACA---AA-T--AAAGCCTTTTTT
gi|23 : tcaccgataaaaccaacttacccaaaaacatcgtgtatgttagtttgcccatatgtttatgaatgtattgtatttttctttaggaatgttgcacgagtTTTGGATGTT--------TGGAT-TTGATTTCATTTATCCTCA--T-ATATAAAACCATTTTATCAACATGT-----------ATCTG-----------GAATATATG------------CAGGTTT-TGGATGT---ATAC--------ATGAA-----TACATACT---TAGTGTCATATGCAT-GAAAGT--TCAT--GTT-------------T------------Tctt
gi|23 : a-----TTTTGGA------T-GTATA-CATGA-ATACA-TAC---TTAGTGTCAT-AT-GCATGAAA----GT--TC--ATGTTTTGTATCTGAT-CACA-CGGGCTTATGGCCTTTTGAATTGCA---AA-T--gtatctgatcacacgggcttatggccttttgaattgcaaat
gi|24 : atttggatgtttggatttgatttcatttatcctcatatataaaaccattttatcaacatgtatctggaatatatgcaggTGGAAAAGATAAATAAATAATTTTCAAACTGGATGAATATCTCTCAA-ATATTTCTGATATTAAATATAATAGCCATAGCTTTGATTTATTTTAATAAACTTATATTACTTATTTTGAAGTATTCGTGTGAGATTTGGGAATTTCATAGCTAAAATACTAT
gi|25 : tgactctata-TTTAC-AAGTTCT----TATT--ATTCTAAAATATACTTGTATG--TTAGTAAGTTTT---------ACATCATAAACTTAATTTCTCCGT------A--------AAAT-TG-C---------TGTT---------TT---------T-CCA--------G-CGTTTGAAT--TT-TTT-TACCGAATTCTAATGTG--------AAGAT-TGGATTAATTTCAAC--TA--T------AAACCAATTTATCAGCATGT-----------AT
gi|26 : TTAT-TATA-GTAGGT-TT--GTCT--CAA-------------T------------TAT-TTTT--A-ACTGCTAT-----TTGC---------T-GTA-AGTATACG---CAGCAT----TA---TCATTGT-ATGTACAA----GTATTT--CTGTTTAGTATATATC-CACA-CGGGTCTATTTCCTATTCAATTGGA---AA-A--AGAGT
gi|27 : atactatgtctttctgaaaacagtttatta-----TGCACATT---TCTTTATGCATACGT-GATATT--TCCT--GGGG------------TGGGGGG------TTT-CTTT--ACAC----AG-----TTTT---------A-GTA-A-TATAAGATAGAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--ATGTT---TA---GTT-CACA-CGGGCCTATGACCTAATAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|28 : CACATT---TCGTTATGAATACGT-GATAGCA-TGGT--ATT-------------T------------CTT-TTCT--A-AA----A-------TTG---------T-GTA-A-TATAAGATAGAGTAGGTGTTA-TGTGAT-AT-ATACCAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACATCG-------GGCCTATTGAATTGCAATTAA-A--AAAGTTTCT
gi|29 : gaaACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAT----TTGTA--TTTT---------T-GTA-A-TATAA-ATACAGTATGTGTGT-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATG--------------TATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTCTT
gi|3 : GTATCCCTTTTGAAGATAGAAAATGTAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTCATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATATTTTTAGTATAGACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTAGGTAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAGTTTAAGCATGTATATGT---TTAAAGCTTTTGA----AAAGAAGAACATCATTGAAAATACATAACACTA-------T--TG-----TATTTACCGTGTCTATGGCTTAAAC--T-TATTTGATATATA------TGTAAAATAT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGTATATGCATATG----GTA----TGTGTTAGTAAGTACTTGTGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAATAAA-----ATGTTA-A-CAAGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATAATCTTACT----------------AAAAAAAAAAGAAGTC--T-ACTTG-AAAT----ATGTTGA-TTGTGGA-TTAAAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCTTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TTTCTCTATTGT-CT---------G-TGTTTGA----AT-TTC-TACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAGTGTTACCTAA--TAAAATAGAACCAATTAATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATACATG------------T---TTTATTTGTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----GT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTG-CGTCTT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCCACGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|30 : TA-----TGCACATT---TCTGTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTTTCTTT--ACAT----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTAT-TATCA-CGTCTT-GT-ATGTA-------------------TTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTAATGAATT
gi|31 : ATGAGGTTAAACACTAACC-AAATAAAGTTTCTTGGCTAACATTAGTATGTGAGCTGCTATCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAATGCGTTGGTAAAGTAAACATTTTCTTA
gi|32 : -CGTCA--GT-GTATAATT----ATATACGTCTGTTTTATATATGTT-CACA-CGGGTCTATGGCCTATTGAATGGCC---AA-TA-AAAGTTTCTTCTcggat
gi|33 : tgagacagttctttatctCATTACGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--CTGTTTTGTATATGTT-AACA-CTGGCCTGCGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|34 : ataataatTACAGTATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGCAAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATAGGTT-CACA-CAGGCCTATGGCCTATTCAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|35 : gTCTT-GT-ATGTATAT----GTGATC--TTGTTTTGTATATGTT-CTCA-C-------TGGCCTATT-AATTGCA---AA-T--AA
gi|36 : c--AC--ATATA--CTTA--AATGTGTACATGTATATGCATATG----GTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATttatgggtactttccttctttcttc
gi|37 : tttatctaaccattaaatggtttTATTC--CTGATTTAGGTATGTT-CACA-CGAGCCTTTGGTCTGTTGAATAGGA---AA-T--AAAGGTTCTT
gi|38 : aA-TTTAA-AGGTTCT----TATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACGTTATACAT
gi|39 : GTTTTGCATTTTTTTCACA-CGGCCCTATGGCCTGTTGAATTGTA---AAGT--AAAGGTTCTTtt
gi|4 : TATAAATATACCCAAATTTAGTGTAGCAATTACTAGATTAATTGTTTCATCGCACCACTTTAAGATAGAATCTGGTAGGTGGCATAGACCGATACGTATCGCAATTGAAAATAGAAAATGGAATTCTT----------TGAAGACTAATATCATTTTATTATAACGTGTTCATTGTGTGTAGAATTACGAAGACCAT------------ACTTTTGGCATGAACCAAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAG
gi|4 : AAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAAT-GTAGTTAGTGCATAACAATATTGCAT-T--TGC----TTTTTACCGTGTCT------TAAAC--TGTATTTAATATATG------TGTAAT--ATGTATATA--CGTATGCATGTGTAAATGCATATG---------------------TAAGTAAGTACT--TGTGTTATGATATCTGTTA-----------------GTATAAATAAA-----GTGTTA-AACATGTTCATT-TTTA------ATTACATGAAATAAATTTGTA-GT---------AAT--T----CT----------------GAAA-------AA-----TAACTTGTAAAC----ATGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-AATAGATTAA-TTTGC-ATGTTCT----GATT--ATTATAAAGTA-A---ACTTG--T--GTC---TTA-----------ATCATACA-----CTTCTCCGTAA----A--------AAA----------------------------------------------------------TGA----TT-TTCGCACAAAATGTTGATGTA--------TAGAT-TTAATTAATTATTACCTCA--T-AAATAAAAACAATTGACCAACATGT-----------ATCTG-------------------------------------TTATGTATG-------T--------GTGCA-----TACATATT---TCG---TGTGTACGT-GATA-T--TTCT--CTTTATTTGCCTGGTAT------------TTT-CTTTTAACA-----AT-----GTTT---------T-G---A-TATAAAAAAACGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ACGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CAGA-CGGGACTATGGCCTATTGAAATGCA---TA-TAAAAAATATCTTTtgcataacaatattgcatttgctttttaccgtgtcttaaactgtatttaatatatgtgtaatatgtatatacgtatgcatgtgtaaatgcatatgtaagtaagtacttgtgttatgatatctgttagtataaataaagtgttaaacatgttcatttttaattacatgaaataaatttgtagtaattctgaaaaataacttgtaaacatgttgattttggcttaaaaatagattaatttgcatgttctgattattataaagtaaacttgtgtcttaatcatacacttctccgtaaaaaatgattttcgcacaaaatgttgatgtatagatttaattaattattacctcataaataaaaacaattgaccaacatgtatctgttatgtatgtgtgcatacatatttcgtgtgtacgtgatatttctctttatttgcctggtattttcttttaacaatgttttgatataaaaaaacgtatgtgttacgtcatgtacgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcagacgggactatggcctattgaaatgcatataaaaaatatctttaagt
gi|5 : tataaatatacccaaatttagtgtagcaattactagattaattgtttcatcgcaccactttaagatagaatctggtaggtggcatagaccgatacgtatcgcaattgaaaatagaaaatggaattctttgaagactaatatcattttattataacgtgttcattgtgtgtagaattacgaagaccatacttttggcatgaaccT---TTAAATCTTTTAA----AAAGCGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGTAT-T--TG-----TTTTAACCGTGCCGCTGGCATTAAC--TGTATTTAATATATAATTTTATGTAAA--AT--GTATATGCGCATCAATGTGTACATGTATATGTATATGGTATGTA----TGTGTAAGTTAGTACT--TGAGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTT-----------ATT-TTTA------ATTATATGAAATAAATTTATATTT-TTT-C---AATGATCGAACT----------------G-AA-------AAGTA--T-ACTTaagt
gi|5 : TAAA-----GTGTT-A-TTTTTAA-TT-ATATGA---AATAAATTTAT-ATTTTTTCAATGATCGAACTGAAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATTATACATGTAC-TTCTCAGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTAT--------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-CAC-CACAAATATTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATTTAACCTCA--T-AAA-AAAACCAATTGATAAACATGT-----------GTCTG-----------GTATATATGCNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNNN--------NNNNN-----NNCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTTTTATTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTTA--------T-GTA-G-TATGAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTTGATTGCA---AA-T--AAAGTTCCTTacttgtgtattaacattatacatgtacttctcagtaacaagaaaacatgactgtattttccgtgtttgattcaccacaaatatttgatgtatggatttgattaaatttaacctcataaaaaaaccaattgataaacatgtgtctggtatatatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacatttcgttatgtatacgtgatatttttttatttttttctttacacatttttatgtagtatgagatacagtatgtgttacgtcatgtatgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcacatgggcctatggcctatttgattgcaaataaagttccttc
gi|6 : tttaaatcttttaaaaagcggaacaccattgaaaatacataacactattgtatttgttttaaccgtgccgctggcattaactgtatttaatatataattttatgtaaaatgtatatgcgcatcaatgtgtacatgtatatgtatatggtatgtatgtgtaagttagtacttgagttatgacatgtgttactatattatatgcataaaTA--------TGAAA-TTGATTAAATGTAACGTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATG----------------------------CACATT---TGGTTATGTAAATGT-GATATTATTTCT--CTT-------------T------------ATT-CTTT--ACAC----AT-----TTTA---------T-ATA-A-TGTAAGAAACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTTTTC--TTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGTCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTc
gi|7 : tgtattaatgaattaaatgttgaatcaaaaacagttaaatgtcatttttataatgattttttatttctattataaactgttatcatatcaataattttaataaaataacaatttaagttgtatacttaaaatataaaatatgaaagtacacataatcaaaaaaaattatatttttattaaattttgttataccggtagttttaattaaggctttattttcaataatttttttaatagttttaattaagacttaaggctttttttgttttgttttGTC--T-GCTTGTAAAC----GTATTGA-TTGTGGC-TTTAAA-AAT--AATAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---ATT---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGACAGTTTTTTTTCTAT--------TT---------T-CT---------G-TGTTTGAT---TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTTATTCAATGTAACATCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATAAG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCTTTATGCATACGT-GGTATT--TTCT--CTT-------------G------------TTT-TTTT--A-AC----ATTTTTATTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAA
gi|8 : AGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTGTGGC-TT-AAA-AA---G-TAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TT---------T-CTCGATTTTCTG-TGTTTGT----TT-TTC-AACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--A-TAATAACACCAATTGATTAACATGTATCTGGTATGTATCTG-----------GTATAAATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATAGT--TTCT--CTT-------------TA-----------TTT-CTTT--ACAC----A------ATTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTGTGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTaaaaaaagttt
gi|9 : CTTAAAC--TGTATTTAAAGTATA------TGTAAA--ATGTATATA--CATATGAATGTTTACATCAATATGCATGTGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATAGCATGTGT---TATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTCA-AGCATGTTCATT-TAAA------ATTACATGAAATAAATCTATA--T-TTT-C---AATGATCAGTCT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----TTGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-GA---AATG----TATAATATTCA----GGTT--ATTATAAAATGTACCT-TTTT--T--GTA---TTA---------ACATCATACCTGTACTTTCTCCATAACAAGA--------AAGCATGGC---------TGTA---------TT---------TCCC---------G-TGTTTGA----TTGTCC-CACAAATGTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 333333333333 1 111 111 1111 44444444444444 111111 11 11 1111111 11111 111111 3333333333333333 1111111 111 111111111 11111111 1111111111 222222222222222222222222222222222 1111 11111111111 1111111111111111 22222222222222222222222222 11111111111 111111111 11
lowQualScore : 1 1 1 1 1 66 1 111 1 1 1 22 1 5 1 1 444444444444 1 1 3 2 1 2 111 8 1 0 1 1 1 3 1 6 1 7 0 1 444 7777 5 3 99999999999999 1 5 77 666666 66 33 33 3 0 5 0 9999 66 0 8 0 4444444 0 1 22222 777 0 5 444444 0 0 55 5 5 888 00 44 7777777777777777 8888888 66 4 9999 4 1 55 8 8 666 3 3 77777 555 44 44 555 333333333 22222222 1 3333333333 000000000000000000000000000000000 5 5555 2 2 88888888 2 77 2 99999999999 00000000000 2222222222222222 6666 99999999 55555 333 1 44 22 11111111111111111111111111 2 22 11111111111 222222222 1 1 1 1 3 1 3333 22 1 1 222 1 11
lowQualScore : . . . . . .. . ... . . . .. . . . . ............ . . . . . . ... . . . . . . . . . . . . . ... .... . . .............. . . .. ...... .. .. .. . . . . .... .. . . . ....... . . ..... ... . . ...... . . .. . . ... .. .. ................ ....... .. . .... . . .. . . ... . . ..... ... .. .. ... ......... ........ . .......... ................................. . .... . . ........ . .. . ........... ........... ................ .... ........ ..... ... . .. .. .......................... . .. ........... ......... . . . . . . .... .. . . ... . ..
lowQualScore : 0 0 0 0 0 55 0 555 0 0 0 00 0 5 0 0 555555555555 0 0 3 5 0 5 000 0 0 7 0 0 0 7 0 7 0 3 2 0 000 0000 0 2 55555555555555 0 2 99 444444 99 88 88 6 9 7 7 4444 11 4 8 5 5555555 1 4 55555 444 1 0 444444 9 2 11 0 0 888 44 77 9999999999999999 6666666 11 4 4444 4 0 66 9 9 777 3 3 99999 555 66 66 888 333333333 11111111 2 2222222222 999999999999999999999999999999999 7 7777 9 9 55555555 4 99 4 55555555555 00000000000 3333333333333333 5555 11111111 66666 555 9 55 66 77777777777777777777777777 0 88 88888888888 999999999 9 9 9 6 1 5 4444 11 5 5 777 5 33
consensus : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-AT-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
Reference ( family-5962 ) : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-AT-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
gi|1 : TGGAAAAGCTCAAAAAGCAATTTTAAAACTGAATAAATATCTTATAATTTTTTTCCGATATT---TCTATCAGTTATAGATAAGAACT-TTTTGATAAACTTATATAACCTATTCTAAATTATTCATGC----TT------TTTCATAGTTCAAATAATAT
gi|1 : atgactaaagcAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGAGTAACATAAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCATAAGTATATTTAGTCAAATAATTAAAGATATTAGTATACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TTTTTTTTTTCTGAAATGTATAGATATATCCAAATTTAGGTTATCAATTACTGGACTAATTGTTTCATCGCACCACCTTAAAATAGAATCTTGTAGATGGTATAGACCGAGAAGTATCCCGTTTGAAGATAGAATATGCAACTTTTGTCAAACAATTGAAGATGAATATCATTTAATGATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATTTATAAGCTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAACGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATTT---TTAAATCGTTTGA----AAAGAGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGAAT-G--TG-----TTTTTACCGTGTCCCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATAAATG------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGAATACGCATATGGTATGTATGTGTGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACAAATATTACTGTAT------TA-ATGAATAAAGAAA-----ATGTTA-AACATGTTCATT-TTAA------ATTACTTGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---ATTG-TCAGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAT----ATGTTCA-TTTTGGC-TT-AAC-AA---AATAA-TTTGC-ATATTCT----AATT--ACTACAAAGTATACTTACTTA--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G----TTGA----TT-TGA-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAA-TTGATATACTGTAACCTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATGTT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTC--ACAC----AT-----ATGT---------T-GTA-A-TATGAGATACAATATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAACT----GTTTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACT-CGGGCCTATGATCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTATTTTtgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgaaacatgatgctgaaactaacccaaataaagtttcctgagtaacataagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcataagtatatttagtcaaataattaaagatattagtatacagtcttggcatgaacgcttggaaatttttttttttctgaaatgtatagatatatccaaatttaggttatcaattactggactaattgtttcatcgcaccaccttaaaatagaatcttgtagatggtatagaccgagaagtatcccgtttgaagatagaatatgcaacttttgtcaaacaattgaagatgaatatcatttaatgatggagtgttcattatatgtagaattacgtagaacatttataaataaatacttttggtatagaccaagtatttataagctggtacaacttttcggcagtaaagatgaaaacgtagttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcgtttgaaaagaggaacaccattgaaaatacataacactattgaatgtgtttttaccgtgtccctggcttaaactgtatttgataaatgtgtaaaatatatacgtatgaatgtgttcatgaatacgcatatggtatgtatgtgtgtgtaagtaagtacttgtgttatgacaaatattactgtattaatgaataaagaaaatgttaaacatgttcattttaaattacttgaaataaatttatatttttcattgtcagactgaaaaagtctgcttgtaaatatgttcattttggcttaacaaaataatttgcatattctaattactacaaagtatacttacttatgtattaacatcatacatgtactttctccgtaacaagaaaacatgactgtatttccgttgatttgacacaaatttttgatgtatggaattgatatactgtaacctcataaactaaaccaattgattaatatgtatctggtatatatgttttatgtttgtatatatgtatgcacatttcgttatgtatacgtgatgttttctcttttttcttcacacatatgttgtaatatgagatacaatatatgttacgtcatgtatgtaactgttttcctgttttgtatatgttcactcgggcctatgatctattgaattgcaaataaagtttatttt
gi|10 : atgactaaagctggaaaagctcaaaaagcaattttaaaactgaataaatatcttataatttttttccgatatttctatcagttatagataagaactttttgataaacttatataacctattctaaattattcatgctttttcatagttcaaataatattgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgATGTATTTGATATATA----TGTATAA-TGAGTA------TGTT--------TGTAAATATATGGTGTGTATATG--TAGGTAAGTCCTTGTGTTGTGGTATGTTTGTT-GTAA------AC------------ATTTAGA-TT-TTTGCTAAAAAGATACAATT----------------AAAA-------GAA-CAAT-GC-----AACTCTCAT-TTGAATTATGG-----ACATAA---AATA--TTTTT-ATA--CT----GAAT--ATTATTAAGTATACCGGCTTGGTT--ATA---TAA---------CCATCCTGCATGAACTTTCTCCGTAAACAGA--------AAAT-TGGC---------AGTC---------TT---------TCCC---------G-TGCTTGAGTTCCT-TGC-CA-AAA--TTTGATAT---------T---T-TTGATTAATTG-AATTTTACCT-AACT---ACTAA---A--GAAATGT-----------A-CCA-----------ATGTACATG------------T---TGCATGTATGT---AT
gi|11 : ttctgactttaAACAAGAGATATGATAAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------GGTGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTGTTATGTA--------TGGAC-TTGATTAAATATAACCTCA--T-AAATTAAACCAATTGATTAATATAT-----------ATCTGGTATATATCTGGTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATTT--------ATGTA-----TGTACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCC--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----CT-----TTTT---------TTGTG-A-TATAAGATACAGTTTGTGTTA-CATCAT-GT-ATTTAAAT----GTATTC--CTGTTTTACATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTT
gi|12 : C---------TGTA---------TT---------T-CC---------GGTGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-ATATAAAACCATTTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATAT--G------------T---TTTATGCATGT---ATAT--------ATGTACAGTATGCACATT---TCTTTATGTTTACAT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------T-T-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-GGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGATTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AATGTTTCTTTgc
gi|13 : ACCCAAATAAAGTTTCCTGGGTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTT--------ATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGAA-AAT-TC
gi|13 : -TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATACCTAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCAcacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactatcagttctttctgaagtgtataactatacctaaatttagggtagcaattactagattaatcgtttca
gi|14 : acccaaataaagtttcctgggtaacattagtacgtgacctcttgtcatctttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcttggcatgaacgcttggaaaattccacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactaC---------G-TGTTTAAA---TT-TTC-CACATATTGTTGATGTAGGGATGTATGAAT-TTGATTAAATGTAACCTCT--T-AAATAAAATCACATGATTAACATGT-----------ATCTA-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATG----------------------------CATATT---TCGTTATGTATAGGT-GATATT--T-CT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AA-----TTTT-----------GTA-A-TACAAGATACAGTATGTGTTA-CATCAT-GT-ATGTACAT----GTATTC--CTGTTTTGCATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAA
gi|15 : tctA-TTTAA-AGGTTCT----AATT--ATTATAAAGTATTCTTACTCG--T--GTA---TTATTATACATAACGTTATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATAAC---------TGTA---------TT---------T-CCC--------G-TGTTTTA----TT-TTC-CACAAATTTTTCATGTA--------GGAAA-TTGCGTAAATGTAACCTCA--T-CAATATAACAAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------a
gi|16 : aataaagacaaaagggaaaatatcgtgttgatatttccattgattcagttatacatATTGAATAAATATAAAACCAT-G-ATATAATGCAACTTGTTTA---TGTCTTTCATTGAAATATTGAATATGGTATATA------TGTACA--AT--GT-T-----TATGAATGTGT-----T-TGTGTATATTGTATGTA----TATGTA--------TT--TGTGTTATGGTATGTGTTA---TA--------ATATGCATAAATAAA-----GTTTTA-ATCATG-ACATTGTTAACATTTGATTGCCACAAATAAATTTATA-TTATTT-C---AATAATC
gi|17 : CTCA--T-TGATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCAG-----------GTATATATG------------T---TTTATATATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTTTACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAAATAAAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCTTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--ATAGTTa
gi|18 : TAAAACCTATATACCAACATGT-----------GTCTG-----------ATGTATATG------------T------AGGTATGTTACATAT--------GTGTA-----TACATATT---CCATTAT-TATA---------T--TTCT--CTT-------------TATTTGAATGGCATTT-CTCT--TCAA----AA-----ATAG---------T-GTA-A-TATAAAATA-AGCATGATTTA-CATAATTATCATGTA--T----GTATTC--TTGTTG-GTGTTTTTT-CACA-CGCGCCTACG-CCTGTTGAATTACA---AA-T--AAAGTTT
gi|19 : TTAACATGT-----------AT------------------ATATG------------T---TTTATGTATTT---ATAT--------ATGTA-----TGTACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T----------------------ACA-----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTt
gi|2 : gatcaaaacaattttactaccttcatAAACATGATGCTGAA-ACTTACCCAAATAAAATTTCCTGGTTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATGTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCCTGACATGAACGCTTGG-ACAAT-TC
gi|2 : -A-AATATCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATcacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|2 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttTTTGGTATAAACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTCGGTAGTAAAGATGAAAATGTGGTTAGAAATTTAAGCATGTATATTT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATAATTGAAAATACATAACACTATTG--------------TATTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTAATTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATATACGTATGATTGTGTACATGTATATGCATATGGTACGT--------GTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAAT----------GTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCTGACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAA-------AAGTC--T-ACTTGTAAAC----ATATTGA-TTGTGGCTTT-AAA-AAT--AATAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATGCATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGAC---------AGTATTTCTCTATTT---------T-CT---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATATCACCTCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|20 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-----------ATCTG-----------GNNNNNNNN------------N---NNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNAATGCA-----TGTACATA---TCGTTATGTATACGT-GGTATT--T-CT--CTT-------------T------------TT--CTTT--CCACT---AT-----GTTT---------T---A-A-TAAAAGATACGGTATGTGTTA-CGCCAT-GT-ATGTCAAT----GTATAC--CTGTTATGTATATGTT-AACA-CAGACCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGT
gi|21 : AACTTTTGGTGT----------GGATATTCTTTAAA-GTAACCTAA--C-AAATAAAACCAATTGATCAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATGTG----------------TATAT-TGTGA---ATAT--------ATATT-----TACACAATACATCGTTAGATATACGT-GTCTTT--TTAT--CTT-------------T------------T----TTT--GCACGGT-AT-----TTTTCTCAATAAAT-GCA-A-TATAAGACACAGTTTGTGTTA-CGTCAT-GC-ATGT
gi|22 : TATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAATATGCGTAAAT--CAGTTTTGAATATGTT-GATA-CTGGCTTATGACCTATTGGATTACA---AA-T--AAAGCCTTTTTT
gi|23 : tcaccgataaaaccaacttacccaaaaacatcgtgtatgttagtttgcccatatgtttatgaatgtattgtatttttctttaggaatgttgcacgagtTTTGGATGTT--------TGGAT-TTGATTTCATTTATCCTCA--T-ATATAAAACCATTTTATCAACATGT-----------ATCTG-----------GAATATATG------------CAGGTTT-TGGATGT---ATAC--------ATGAA-----TACATACT---TAGTGTCATATGCAT-GAAAGT--TCAT--GTT-------------T------------Tctt
gi|23 : a-----TTTTGGA------T-GTATA-CATGA-ATACA-TAC---TTAGTGTCAT-AT-GCATGAAA----GT--TC--ATGTTTTGTATCTGAT-CACA-CGGGCTTATGGCCTTTTGAATTGCA---AA-T--gtatctgatcacacgggcttatggccttttgaattgcaaat
gi|24 : atttggatgtttggatttgatttcatttatcctcatatataaaaccattttatcaacatgtatctggaatatatgcaggTGGAAAAGATAAATAAATAATTTTCAAACTGGATGAATATCTCTCAA-ATATTTCTGATATTAAATATAATAGCCATAGCTTTGATTTATTTTAATAAACTTATATTACTTATTTTGAAGTATTCGTGTGAGATTTGGGAATTTCATAGCTAAAATACTAT
gi|25 : tgactctata-TTTAC-AAGTTCT----TATT--ATTCTAAAATATACTTGTATG--TTAGTAAGTTTT---------ACATCATAAACTTAATTTCTCCGT------A--------AAAT-TG-C---------TGTT---------TT---------T-CCA--------G-CGTTTGAAT--TT-TTT-TACCGAATTCTAATGTG--------AAGAT-TGGATTAATTTCAAC--TA--T------AAACCAATTTATCAGCATGT-----------AT
gi|26 : TTAT-TATA-GTAGGT-TT--GTCT--CAA-------------T------------TAT-TTTT--A-ACTGCTAT-----TTGC---------T-GTA-AGTATACG---CAGCAT----TA---TCATTGT-ATGTACAA----GTATTT--CTGTTTAGTATATATC-CACA-CGGGTCTATTTCCTATTCAATTGGA---AA-A--AGAGT
gi|27 : atactatgtctttctgaaaacagtttatta-----TGCACATT---TCTTTATGCATACGT-GATATT--TCCT--GGGG------------TGGGGGG------TTT-CTTT--ACAC----AG-----TTTT---------A-GTA-A-TATAAGATAGAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--ATGTT---TA---GTT-CACA-CGGGCCTATGACCTAATAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|28 : CACATT---TCGTTATGAATACGT-GATAGCA-TGGT--ATT-------------T------------CTT-TTCT--A-AA----A-------TTG---------T-GTA-A-TATAAGATAGAGTAGGTGTTA-TGTGAT-AT-ATACCAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACATCG-------GGCCTATTGAATTGCAATTAA-A--AAAGTTTCT
gi|29 : gaaACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAT----TTGTA--TTTT---------T-GTA-A-TATAA-ATACAGTATGTGTGT-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATG--------------TATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTCTT
gi|3 : GTATCCCTTTTGAAGATAGAAAATGTAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTCATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATATTTTTAGTATAGACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTAGGTAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAGTTTAAGCATGTATATGT---TTAAAGCTTTTGA----AAAGAAGAACATCATTGAAAATACATAACACTA-------T--TG-----TATTTACCGTGTCTATGGCTTAAAC--T-TATTTGATATATA------TGTAAAATAT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGTATATGCATATG----GTA----TGTGTTAGTAAGTACTTGTGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAATAAA-----ATGTTA-A-CAAGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATAATCTTACT----------------AAAAAAAAAAGAAGTC--T-ACTTG-AAAT----ATGTTGA-TTGTGGA-TTAAAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCTTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TTTCTCTATTGT-CT---------G-TGTTTGA----AT-TTC-TACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAGTGTTACCTAA--TAAAATAGAACCAATTAATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATACATG------------T---TTTATTTGTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----GT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTG-CGTCTT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCCACGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|30 : TA-----TGCACATT---TCTGTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTTTCTTT--ACAT----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTAT-TATCA-CGTCTT-GT-ATGTA-------------------TTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTAATGAATT
gi|31 : ATGAGGTTAAACACTAACC-AAATAAAGTTTCTTGGCTAACATTAGTATGTGAGCTGCTATCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAATGCGTTGGTAAAGTAAACATTTTCTTA
gi|32 : -CGTCA--GT-GTATAATT----ATATACGTCTGTTTTATATATGTT-CACA-CGGGTCTATGGCCTATTGAATGGCC---AA-TA-AAAGTTTCTTCTcggat
gi|33 : tgagacagttctttatctCATTACGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--CTGTTTTGTATATGTT-AACA-CTGGCCTGCGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|34 : ataataatTACAGTATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGCAAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATAGGTT-CACA-CAGGCCTATGGCCTATTCAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|35 : gTCTT-GT-ATGTATAT----GTGATC--TTGTTTTGTATATGTT-CTCA-C-------TGGCCTATT-AATTGCA---AA-T--AA
gi|36 : c--AC--ATATA--CTTA--AATGTGTACATGTATATGCATATG----GTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATttatgggtactttccttctttcttc
gi|37 : tttatctaaccattaaatggtttTATTC--CTGATTTAGGTATGTT-CACA-CGAGCCTTTGGTCTGTTGAATAGGA---AA-T--AAAGGTTCTT
gi|38 : aA-TTTAA-AGGTTCT----TATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACGTTATACAT
gi|39 : GTTTTGCATTTTTTTCACA-CGGCCCTATGGCCTGTTGAATTGTA---AAGT--AAAGGTTCTTtt
gi|4 : TATAAATATACCCAAATTTAGTGTAGCAATTACTAGATTAATTGTTTCATCGCACCACTTTAAGATAGAATCTGGTAGGTGGCATAGACCGATACGTATCGCAATTGAAAATAGAAAATGGAATTCTT----------TGAAGACTAATATCATTTTATTATAACGTGTTCATTGTGTGTAGAATTACGAAGACCAT------------ACTTTTGGCATGAACCAAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAG
gi|4 : AAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAAT-GTAGTTAGTGCATAACAATATTGCAT-T--TGC----TTTTTACCGTGTCT------TAAAC--TGTATTTAATATATG------TGTAAT--ATGTATATA--CGTATGCATGTGTAAATGCATATG---------------------TAAGTAAGTACT--TGTGTTATGATATCTGTTA-----------------GTATAAATAAA-----GTGTTA-AACATGTTCATT-TTTA------ATTACATGAAATAAATTTGTA-GT---------AAT--T----CT----------------GAAA-------AA-----TAACTTGTAAAC----ATGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-AATAGATTAA-TTTGC-ATGTTCT----GATT--ATTATAAAGTA-A---ACTTG--T--GTC---TTA-----------ATCATACA-----CTTCTCCGTAA----A--------AAA----------------------------------------------------------TGA----TT-TTCGCACAAAATGTTGATGTA--------TAGAT-TTAATTAATTATTACCTCA--T-AAATAAAAACAATTGACCAACATGT-----------ATCTG-------------------------------------TTATGTATG-------T--------GTGCA-----TACATATT---TCG---TGTGTACGT-GATA-T--TTCT--CTTTATTTGCCTGGTAT------------TTT-CTTTTAACA-----AT-----GTTT---------T-G---A-TATAAAAAAACGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ACGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CAGA-CGGGACTATGGCCTATTGAAATGCA---TA-TAAAAAATATCTTTtgcataacaatattgcatttgctttttaccgtgtcttaaactgtatttaatatatgtgtaatatgtatatacgtatgcatgtgtaaatgcatatgtaagtaagtacttgtgttatgatatctgttagtataaataaagtgttaaacatgttcatttttaattacatgaaataaatttgtagtaattctgaaaaataacttgtaaacatgttgattttggcttaaaaatagattaatttgcatgttctgattattataaagtaaacttgtgtcttaatcatacacttctccgtaaaaaatgattttcgcacaaaatgttgatgtatagatttaattaattattacctcataaataaaaacaattgaccaacatgtatctgttatgtatgtgtgcatacatatttcgtgtgtacgtgatatttctctttatttgcctggtattttcttttaacaatgttttgatataaaaaaacgtatgtgttacgtcatgtacgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcagacgggactatggcctattgaaatgcatataaaaaatatctttaagt
gi|5 : tataaatatacccaaatttagtgtagcaattactagattaattgtttcatcgcaccactttaagatagaatctggtaggtggcatagaccgatacgtatcgcaattgaaaatagaaaatggaattctttgaagactaatatcattttattataacgtgttcattgtgtgtagaattacgaagaccatacttttggcatgaaccT---TTAAATCTTTTAA----AAAGCGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGTAT-T--TG-----TTTTAACCGTGCCGCTGGCATTAAC--TGTATTTAATATATAATTTTATGTAAA--AT--GTATATGCGCATCAATGTGTACATGTATATGTATATGGTATGTA----TGTGTAAGTTAGTACT--TGAGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTT-----------ATT-TTTA------ATTATATGAAATAAATTTATATTT-TTT-C---AATGATCGAACT----------------G-AA-------AAGTA--T-ACTTaagt
gi|5 : TAAA-----GTGTT-A-TTTTTAA-TT-ATATGA---AATAAATTTAT-ATTTTTTCAATGATCGAACTGAAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATTATACATGTAC-TTCTCAGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTAT--------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-CAC-CACAAATATTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATTTAACCTCA--T-AAA-AAAACCAATTGATAAACATGT-----------GTCTG-----------GTATATATGCNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNNN--------NNNNN-----NNCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTTTTATTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTTA--------T-GTA-G-TATGAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTTGATTGCA---AA-T--AAAGTTCCTTacttgtgtattaacattatacatgtacttctcagtaacaagaaaacatgactgtattttccgtgtttgattcaccacaaatatttgatgtatggatttgattaaatttaacctcataaaaaaaccaattgataaacatgtgtctggtatatatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacatttcgttatgtatacgtgatatttttttatttttttctttacacatttttatgtagtatgagatacagtatgtgttacgtcatgtatgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcacatgggcctatggcctatttgattgcaaataaagttccttc
gi|6 : tttaaatcttttaaaaagcggaacaccattgaaaatacataacactattgtatttgttttaaccgtgccgctggcattaactgtatttaatatataattttatgtaaaatgtatatgcgcatcaatgtgtacatgtatatgtatatggtatgtatgtgtaagttagtacttgagttatgacatgtgttactatattatatgcataaaTA--------TGAAA-TTGATTAAATGTAACGTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATG----------------------------CACATT---TGGTTATGTAAATGT-GATATTATTTCT--CTT-------------T------------ATT-CTTT--ACAC----AT-----TTTA---------T-ATA-A-TGTAAGAAACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTTTTC--TTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGTCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTc
gi|7 : tgtattaatgaattaaatgttgaatcaaaaacagttaaatgtcatttttataatgattttttatttctattataaactgttatcatatcaataattttaataaaataacaatttaagttgtatacttaaaatataaaatatgaaagtacacataatcaaaaaaaattatatttttattaaattttgttataccggtagttttaattaaggctttattttcaataatttttttaatagttttaattaagacttaaggctttttttgttttgttttGTC--T-GCTTGTAAAC----GTATTGA-TTGTGGC-TTTAAA-AAT--AATAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---ATT---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGACAGTTTTTTTTCTAT--------TT---------T-CT---------G-TGTTTGAT---TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTTATTCAATGTAACATCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATAAG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCTTTATGCATACGT-GGTATT--TTCT--CTT-------------G------------TTT-TTTT--A-AC----ATTTTTATTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAA
gi|8 : AGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTGTGGC-TT-AAA-AA---G-TAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTA---------TT---------T-CTCGATTTTCTG-TGTTTGT----TT-TTC-AACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--A-TAATAACACCAATTGATTAACATGTATCTGGTATGTATCTG-----------GTATAAATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATAGT--TTCT--CTT-------------TA-----------TTT-CTTT--ACAC----A------ATTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTGTGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTaaaaaaagttt
gi|9 : CTTAAAC--TGTATTTAAAGTATA------TGTAAA--ATGTATATA--CATATGAATGTTTACATCAATATGCATGTGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATAGCATGTGT---TATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTCA-AGCATGTTCATT-TAAA------ATTACATGAAATAAATCTATA--T-TTT-C---AATGATCAGTCT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----TTGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-GA---AATG----TATAATATTCA----GGTT--ATTATAAAATGTACCT-TTTT--T--GTA---TTA---------ACATCATACCTGTACTTTCTCCATAACAAGA--------AAGCATGGC---------TGTA---------TT---------TCCC---------G-TGTTTGA----TTGTCC-CACAAATGTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGT
blockSeqs : A A T C T A A AAA A A C TT T A T G GAGATTTGGGAA A C C C G G AA A C G T C T T G C T T AGG CAGT A T ATATAATGCAACT G T AT ATTTTA AT GT TA A A . TG A TGGTGTG C TCCTT TGG G CATTTG TT A G TAA CA AAAAAAAAAAAGAAAA AAAAAAG AA A TCTC A A CT A T TAG A A CAATG CGA GT TA AGT TTATACATA GATATGAT A AGTTTTTTTT TTTCTCTATTTTCT G GTTC G G GGGATGTA A CC A ATCTGGTATGT GTATATATCTG CNNNNNNNNNNNN TTAC NNNNNNNA CAGTA ACA A AT TA TATTTGCCTGGTAT T TA ATTTTTA CTCAATAAA T T G G T C ATGC GT T T ATT G AA
blockSeqs : . C T G AC . C A G . T . G . . C T CATTTGC A C . . . GT TG T G . . C T C . AT . . T . . . TG . . . . . . G A T T T . . G T . . . . . A A TTTCTCTATTGTCT G AT . . . . T . . . CAGG T . . . . A . TATTTGAATGGCA . . TGCTAT GGA . . . . T . . . . . . . A
blockSeqs : . C . A . A A . . C T TATTTG A A . . . . . A G . . C T C . AG . . T . . . TT . . . . . . G C . . T . . A T . . . . . A T TTTCTCGATTTTCT . A . . . . T . . . T T . . . . . . GTGGGGGG . . GGTAT A . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . TTG T C . . . . . A G . . C T T . AA . . T . . . GA . . . . . . T A . . . . . A A . . . . . A T TTTCCC . T . . . . . . . . T T . . . . . . TA . . TTGTA . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . T . . . . . . A G . . . T C . AG . . T . . . AG . . . . . . T C . . . . . T T . . . . . A T TTTCCC . . . . . . . . . . T T . . . . . . T . . TAT . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . A . . . . . C . A . . G . . . . . . . . . . G C . . . . . G A . . . . . A A TTTCCA . . . . . . . . . . T T . . . . . . T . . CT . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C . . . . . T T . . . . . A T TTTTCC . . . . . . . . . . T N . . . . . . T . . AT . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . G T . . . . . A A TTTTCT . . . . . . . . . . T A . . . . . . T . . AA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A A . . . . . . T TTTCCC . . . . . . . . . . T T . . . . . . T . . AT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A A . . . . . . A TTTCC . . . . . . . . . . T T . . . . . . T . . AA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G T . . . . . . T TTTCC . . . . . . . . . . N N . . . . . . T . . AT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . T . . AG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T T . . . . . . T . . GT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . T . . AT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . T . . AT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . AT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . AT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : TATTGC******** **** TTTCCC***************************
originalCons : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTG-AT-T--TG-----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTA---------TT---------T-CC---------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
finalCons : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTGTATTGC--------TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTATTTCCC---------------------------G-TGTTTGA----TT-TTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----AT-----TTTT---------T-GTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 333333333333 1 111 111 1111 555555555555 111111 11 11 1111111 11111 111111 3333333333333333 1111111 111 111111111 11111111 1111111111 22222222 11111111 1111 11111111111 1111111111111111 22222222222222222222222222 111111111111 111111111 11
lowQualScore : 1 1 1 1 1 66 1 111 1 1 1 22 1 5 1 1 444444444444 1 1 3 2 1 2 111 8 1 0 1 1 1 3 1 6 1 7 0 1 444 7777 5 333333333333 5 77 666666 66 33 33 3 0 5 0 9999 66 0 8 0 4444444 0 1 22222 777 0 5 444444 0 0 55 5 5 888 00 44 7777777777777777 8888888 66 4 9999 4 1 55 8 8 666 3 3 77777 555 44 44 555 333333333 22222222 1 3333333333 00000000 0 00000000 2222 2 2 2 88888888 2 55 4 99999999999 00000000000 2222222222222222 6666 99999999 55555 333 1 44 22 11111111111111111111111111 2 22 333333333333 222222222 1 1 1 3 1 3333 22 1 1 222 1 11
lowQualScore : . . . . . .. . ... . . . .. . . . . ............ . . . . . . ... . . . . . . . . . . . . . ... .... . ............ . .. ...... .. .. .. . . . . .... .. . . . ....... . . ..... ... . . ...... . . .. . . ... .. .. ................ ....... .. . .... . . .. . . ... . . ..... ... .. .. ... ......... ........ . .......... ........ . ........ .... . . . ........ . .. . ........... ........... ................ .... ........ ..... ... . .. .. .......................... . .. ............ ......... . . . . . .... .. . . ... . ..
lowQualScore : 0 0 0 0 0 55 0 555 0 0 0 00 0 5 0 0 555555555555 0 0 3 5 0 5 000 0 0 7 0 0 0 7 0 7 0 3 2 0 000 0000 0 888888888888 2 99 444444 99 88 88 6 9 7 7 4444 11 4 8 5 5555555 1 4 55555 444 1 0 444444 9 2 11 0 0 888 44 77 9999999999999999 6666666 11 4 4444 4 0 66 9 9 777 3 3 99999 555 66 66 888 333333333 11111111 2 2222222222 77777777 6 44444444 9999 9 9 9 55555555 4 66 7 55555555555 00000000000 3333333333333333 5555 11111111 66666 555 9 55 66 77777777777777777777777777 0 88 888888888888 999999999 9 9 6 1 5 4444 11 5 5 777 5 33
consensus : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTGTAT--T-G-----TTTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTATTTC--------CCG--------TGTTTGA----TT-TT-C-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----A-T-----TTTT---------TGTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
Reference ( family-5962 ) : NNNNNNNNNNNTGGAAAAGNTNAANAAGCAATTTTNAAACTGGATGAATATCTCNCAATNTNTTTCCGATATTAAATNTANCAGCCATAGNTNNGANCTATTTTGATAAACTTATATNACCTATTCTGAANTATTCGTGCGAGATTTGGGAATTTCATAGCTNAAATANTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGGNTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAANTATACCCAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCATCGCACCACCTTAAGATAGAATCTNGTAGGTGGCATAGACCGANANGTATCCCGTTTGAAGATAGAAAATGNAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTNATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATGTATAAACTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATNT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTGTAT--T-GC----TNTTTACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTACATGTATATGCATATGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATTACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCNGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTNTGGC-TT-AAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTATTTC--------CCG--------TGTTTGA----TT-TT-C-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-AAATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----A-T-----TTTT---------TGTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTTTT
gi|1 : TGGAAAAGCTCAAAAAGCAATTTTAAAACTGAATAAATATCTTATAATTTTTTTCCGATATT---TCTATCAGTTATAGATAAGAACT-TTTTGATAAACTTATATAACCTATTCTAAATTATTCATGC----TT------TTTCATAGTTCAAATAATAT
gi|1 : atgactaaagcAAACATGATGCTGAA-ACTAACCCAAATAAAGTTTCCTGAGTAACATAAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCATAAGTATATTTAGTCAAATAATTAAAGATATTAGTATACAGTCTTGGCATGAACGCTTGG-A-AAT-TTTTTTTTTTCTGAAATGTATAGATATATCCAAATTTAGGTTATCAATTACTGGACTAATTGTTTCATCGCACCACCTTAAAATAGAATCTTGTAGATGGTATAGACCGAGAAGTATCCCGTTTGAAGATAGAATATGCAACTTTTGTCAAACAATTGAAGATGAATATCATTTAATGATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATACTTTTGGTATAGACCAAGTATTTATAAGCTGGTACAACTTTTCGGCAGTAAAGATGAAAACGTAGTTAGAAATTTAAGCATGTATATTT---TTAAATCGTTTGA----AAAGAGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGAATG-T-G-----TTTTTACCGTGTCCCTGGCTTAAAC--TGTATTTGATAAATG------TGTAAA--AT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGAATACGCATATGGTATGTATGTGTGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACAAATATTACTGTAT------TA-ATGAATAAAGAAA-----ATGTTA-AACATGTTCATT-TTAA------ATTACTTGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---ATTG-TCAGACT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAT----ATGTTCA-TTTTGGC-TT-AAC-AA---AATAA-TTTGC-ATATTCT----AATT--ACTACAAAGTATACTTACTTA--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTATTT---------CCG-----------TTGA----TT-TG-A-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAA-TTGATATACTGTAACCTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATGTT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTC--ACAC----A-T-----ATGT---------TGTA-A-TATGAGATACAATATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAACT----GTTTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACT-CGGGCCTATGATCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTATTTTtgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgaaacatgatgctgaaactaacccaaataaagtttcctgagtaacataagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcataagtatatttagtcaaataattaaagatattagtatacagtcttggcatgaacgcttggaaatttttttttttctgaaatgtatagatatatccaaatttaggttatcaattactggactaattgtttcatcgcaccaccttaaaatagaatcttgtagatggtatagaccgagaagtatcccgtttgaagatagaatatgcaacttttgtcaaacaattgaagatgaatatcatttaatgatggagtgttcattatatgtagaattacgtagaacatttataaataaatacttttggtatagaccaagtatttataagctggtacaacttttcggcagtaaagatgaaaacgtagttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcgtttgaaaagaggaacaccattgaaaatacataacactattgaatgtgtttttaccgtgtccctggcttaaactgtatttgataaatgtgtaaaatatatacgtatgaatgtgttcatgaatacgcatatggtatgtatgtgtgtgtaagtaagtacttgtgttatgacaaatattactgtattaatgaataaagaaaatgttaaacatgttcattttaaattacttgaaataaatttatatttttcattgtcagactgaaaaagtctgcttgtaaatatgttcattttggcttaacaaaataatttgcatattctaattactacaaagtatacttacttatgtattaacatcatacatgtactttctccgtaacaagaaaacatgactgtatttccgttgatttgacacaaatttttgatgtatggaattgatatactgtaacctcataaactaaaccaattgattaatatgtatctggtatatatgttttatgtttgtatatatgtatgcacatttcgttatgtatacgtgatgttttctcttttttcttcacacatatgttgtaatatgagatacaatatatgttacgtcatgtatgtaactgttttcctgttttgtatatgttcactcgggcctatgatctattgaattgcaaataaagtttatttt
gi|10 : atgactaaagctggaaaagctcaaaaagcaattttaaaactgaataaatatcttataatttttttccgatatttctatcagttatagataagaactttttgataaacttatataacctattctaaattattcatgctttttcatagttcaaataatattgaatgagtacttaaaatgtattgtaaatgtattgtaaatgtattttaaaggtaaaacgtacagcaaaaaatgattttgtttttggtattttcagaagaatgagtcttattaagatattacaaaattgtaagatattggttgaaaactttgcatagctatgaaaataaatattgtaaaattatatataacatgttgATGTATTTGATATATA----TGTATAA-TGAGTA------TGTT--------TGTAAATATATGGTGTGTATATG--TAGGTAAGTCCTTGTGTTGTGGTATGTTTGTT-GTAA------AC------------ATTTAGA-TT-TTTGCTAAAAAGATACAATT----------------AAAA-------GAA-CAAT-GC-----AACTCTCAT-TTGAATTATGG-----ACATAA---AATA--TTTTT-ATA--CT----GAAT--ATTATTAAGTATACCGGCTTGGTT--ATA---TAA---------CCATCCTGCATGAACTTTCTCCGTAAACAGA--------AAAT-TGGC---------AGTCTTTC--------CCG--------TGCTTGAGTTCCT-TG-C-CA-AAA--TTTGATAT---------T---T-TTGATTAATTG-AATTTTACCT-AACT---ACTAA---A--GAAATGT-----------A-CCA-----------ATGTACATG------------T---TGCATGTATGT---AT
gi|11 : ttctgactttaAACAAGAGATATGATAAACATGAC---------TGTATTTC--------CGG--------TGTTTGA----TT-TT-C-CACAAATTTGTTATGTA--------TGGAC-TTGATTAAATATAACCTCA--T-AAATTAAACCAATTGATTAATATAT-----------ATCTGGTATATATCTGGTATATATG------------T---TTTATGTTTGT---ATTT--------ATGTA-----TGTACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCC--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----CTT-----TTTT---------TGTG-A-TATAAGATACAGTTTGTGTTA-CATCAT-GT-ATTTAAAT----GTATTC--CTGTTTTACATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCTT
gi|12 : C---------TGTATTTC--------CGG--------TGTTTGA----TT-TT-C-CACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--T-ATATAAAACCATTTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATAT--G------------T---TTTATGCATGT---ATAT--------ATGTACAGTATGCACATT---TCTTTATGTTTACAT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------T-T-CTTT--ACAC----A-T-----TTTT---------TGTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-GGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGATTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AATGTTTCTTTgc
gi|13 : ACCCAAATAAAGTTTCCTGGGTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTT--------ATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATTTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCTTGGCATGAACGCTTGGAA-AAT-TC
gi|13 : -TCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATACCTAAATTTAGGGTAGCAATTACTAGATTAATCGTTTCAcacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactatcagttctttctgaagtgtataactatacctaaatttagggtagcaattactagattaatcgtttca
gi|14 : acccaaataaagtttcctgggtaacattagtacgtgacctcttgtcatctttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacattttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcttggcatgaacgcttggaaaattccacaagggctagatttcttagagaaattattatttttaactaTC--------TCG--------TGTTTAAA---TT-TT-C-CACATATTGTTGATGTAGGGATGTATGAAT-TTGATTAAATGTAACCTCT--T-AAATAAAATCACATGATTAACATGT-----------ATCTA-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATG----------------------------CATATT---TCGTTATGTATAGGT-GATATT--T-CT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----A-A-----TTTT----------GTA-A-TACAAGATACAGTATGTGTTA-CATCAT-GT-ATGTACAT----GTATTC--CTGTTTTGCATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTAAATTGCA---AA-T--AAA
gi|15 : A-TTTAA-AGGTTCT----AATT--ATTATAAAGTATTCTTACTCG--T--GTA---TTATTATACATAACGTTATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------AAACATAAC---------TGTATTTC--------CCG--------TGTTTTA----TT-TT-C-CACAAATTTTTCATGTA--------GGAAA-TTGCGTAAATGTAACCTCA--T-CAATATAACAAATTGATTAACATGT-----------ATCTG-----------a
gi|16 : aataaagacaaaagggaaaatatcgtgttgatatttccattgattcagttatacatATTGAATAAATATAAAACCATGATATAAT-GCAACTTGTTTA---TGTCTTTCATTGAAATATTGAATATGGTATATA------TGTACA--AT--GT-T-----TATGAATGTGT-----T-TGTGTATATTGTATGTA----TATGTA--------TT--TGTGTTATGGTATGTGTTA---TA--------ATATGCATAAATAAA-----GTTTTA-ATCATG-ACATTGTTAACATTTGATTGCCACAAATAAATTTATA-TTATTT-C---AATAATC
gi|17 : CTCA--T-TGATAAAACCAATTGATTAACATGT-----------ATCAG-----------GTATATATG------------T---TTTATATATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---TCGTTATGTTTACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----A-T-----TTTT---------TGTA-A-TATAAAATAAAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCTTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--ATAGTTa
gi|18 : TAAAACCTATATACCAACATGT-----------GTCTG-----------ATGTATATG------------T------AGGTATGTTACATAT--------GTGTA-----TACATATT---CCATTAT-TATA---------T--TTCT--CTT-------------TATTTGAATGGCATTT-CTCT--TCAA----A-A-----ATAG---------TGTA-A-TATAAAATA-AGCATGATTTA-CATAATTATCATGTA--T----GTATTC--TTGTTG-GTGTTTTTT-CACA-CGCGCCTACG-CCTGTTGAATTACA---AA-T--AAAGTTT
gi|19 : TTAACATGT-----------AT------------------ATATG------------T---TTTATGTATTT---ATAT--------ATGTA-----TGTACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T----------------------ACA-----A-T-----TTTT---------TGTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTt
gi|2 : gatcaaaacaattttactaccttcatAAACATGATGCTGAA-ACTTACCCAAATAAAATTTCCTGGTTAACATTAGTACGTGACCTCTTGTCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAAGGTGTTGGTAATATAAACATGTTCTTAAGTATATTTAGTCAAAGAATTAAAGATACTAGTCTACAGTCCTGACATGAACGCTTGG-ACAAT-TC
gi|2 : -A-AATATCAGTTCTTTCTGAAGTGTATAACTATcacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|2 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttTTTGGTATAAACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTCGGTAGTAAAGATGAAAATGTGGTTAGAAATTTAAGCATGTATATTT---TTAAATCTTTTGA----AAAGAGGAACATAATTGAAAATACATAACACTATTGTAT--T-----------TACCGTGTCTCTGGCTTAAAC--TGTAATTGATATATA------TGTAAA--AT--ATATATACGTATGATTGTGTACATGTATATGCATATGGTACGT--------GTAAGTAAGTACT--TGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAAT----------GTTA-AGCATGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATGATCTGACTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAA-------AAGTC--T-ACTTGTAAAC----ATATTGA-TTGTGGCTTT-AAA-AAT--AATAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATGCATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGAC---------AGTATTTCTCTATTTTCTG--------TGTTTGA----TT-TT-C-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATATCACCTCAT-T-AAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggtataaaccaagtatgtataaactagtacaacttttcggtagtaaagatgaaaatgtggttagaaatttaagcatgtatatttttaaatcttttgaaaagaggaacataattgaaaatacataacactattgtatttaccgtgtctctggcttaaactgtaattgatatatatgtaaaatatatatacgtatgattgtgtacatgtatatgcatatggtacgtgtaagtaagtacttgtgttatgacatgtgttactaaattatatgcataaatgttaagcatgttcattttaaatcacatgaaataaatttatatttttcaatgatctgactaaaaaaaaaaagaaaaaaaaaagtctacttgtaaacatattgattgtggctttaaaaataataatttgtatattctaataattataaagtatacttacttgtgtattaacatcatgcatgtactttctccgtaacaaaaatacatgacagtatttctctattttctgtgtttgattttccacaaatttttgatgtatggatttgattaaatatcacctcattaaataaaaccaattgattaccatgtatctggtatatatgtt
gi|20 : aaacatgatgctgaaacttacccaaataaaatttcctggttaacattagtacgtgacctcttgtcatctttgggattttataatgtctggcttgcacaaggtgttggtaatataaacatgttcttaagtatatttagtcaaagaattaaagatactagtctacagtcctgacatgaacgcttggacaattccacaagggcaagattttttagagaaattattatttttaaatatcagttctttctgaagtgtataactatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-----------ATCTG-----------GNNNNNNNN------------N---NNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNAATGCA-----TGTACATA---TCGTTATGTATACGT-GGTATT--T-CT--CTT-------------T------------TT--CTTT--CCACT---A-T-----GTTT---------T--A-A-TAAAAGATACGGTATGTGTTA-CGCCAT-GT-ATGTCAAT----GTATAC--CTGTTATGTATATGTT-AACA-CAGACCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGT
gi|21 : AACTTTTGGTGT----------GGATATTCTTTAAA-GTAACCTAA--C-AAATAAAACCAATTGATCAACATGT-----------ATCTG-----------GTATATGTG----------------TATAT-TGTGA---ATAT--------ATATT-----TACACAATACATCGTTAGATATACGT-GTCTTT--TTAT--CTT-------------T------------T----TTT--GCACGGT-A-T-----TTTTCTCAATAAATGCA-A-TATAAGACACAGTTTGTGTTA-CGTCAT-GC-ATGT
gi|22 : TATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAATATGCGTAAAT--CAGTTTTGAATATGTT-GATA-CTGGCTTATGACCTATTGGATTACA---AA-T--AAAGCCTTTTTT
gi|23 : tcaccgataaaaccaacttacccaaaaacatcgtgtatgttagtttgcccatatgtttatgaatgtattgtatttttctttaggaatgttgcacgagtTTTGGATGTT--------TGGAT-TTGATTTCATTTATCCTCA--T-ATATAAAACCATTTTATCAACATGT-----------ATCTG-----------GAATATATG------------CAGGTTT-TGGATGT---ATAC--------ATGAA-----TACATACT---TAGTGTCATATGCAT-GAAAGT--TCAT--GTT-------------T------------Tctt
gi|23 : a-----TTTTGGA------TGTATA-CATGA-ATACA-TAC---TTAGTGTCAT-AT-GCATGAAA----GT--TC--ATGTTTTGTATCTGAT-CACA-CGGGCTTATGGCCTTTTGAATTGCA---AA-T--gtatctgatcacacgggcttatggccttttgaattgcaaat
gi|24 : atttggatgtttggatttgatttcatttatcctcatatataaaaccattttatcaacatgtatctggaatatatgcaggTGGAAAAGATAAATAAATAATTTTCAAACTGGATGAATATCTCTCAA-ATATTTCTGATATTAAATATAATAGCCATAGCTTTGATTTATTTTAATAAACTTATATTACTTATTTTGAAGTATTCGTGTGAGATTTGGGAATTTCATAGCTAAAATACTAT
gi|25 : tgactctata-TTTAC-AAGTTCT----TATT--ATTCTAAAATATACTTGTATG--TTAGTAAGTTTT---------ACATCATAAACTTAATTTCTCCGT------A--------AAAT-TG-C---------TGTTTTTC--------CAG--------CGTTTGAAT--TT-TT-T-TACCGAATTCTAATGTG--------AAGAT-TGGATTAATTTCAAC--TA--T------AAACCAATTTATCAGCATGT-----------AT
gi|26 : TTAT-TATA-GTAGGT-TT--GTCT--CAA-------------T------------TAT-TTTT--A-ACTGCTA-T-----TTGC---------TGTA-AGTATACG---CAGCAT----TA---TCATTGT-ATGTACAA----GTATTT--CTGTTTAGTATATATC-CACA-CGGGTCTATTTCCTATTCAATTGGA---AA-A--AGAGT
gi|27 : atactatgtctttctgaaaacagtttatta-----TGCACATT---TCTTTATGCATACGT-GATATT--TCCT--GGGG------------TGGGGGG------TTT-CTTT--ACAC----A-G-----TTTT---------AGTA-A-TATAAGATAGAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--ATGTT---TA---GTT-CACA-CGGGCCTATGACCTAATAAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|28 : CACATT---TCGTTATGAATACGT-GATAGCA-TGGT--ATT-------------T------------CTT-TTCT--A-AA----A--------TTG---------TGTA-A-TATAAGATAGAGTAGGTGTTA-TGTGAT-AT-ATACCAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACATCG-------GGCCTATTGAATTGCAATTAA-A--AAAGTTTCT
gi|29 : gaaACATT---GCGTTATGCATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAT----T-TGTA--TTTT---------TGTA-A-TATAA-ATACAGTATGTGTGT-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATG--------------TATGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTTCTT
gi|3 : GTATCCCTTTTGAAGATAGAAAATGTAACTCTTGTCAAACAATTGAAGACGAATATCATTTCATTATGGAGTGTTCATTATATGTAGAATTACGTAGAACATTTATAAATAAATATTTTTAGTATAGACCAAGTATGTATAAACTAGTACAACTTTTAGGTAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAGAAGTTTAAGCATGTATATGT---TTAAAGCTTTTGA----AAAGAAGAACATCATTGAAAATACATAACACTATTGTA-------------TTTACCGTGTCTATGGCTTAAAC--T-TATTTGATATATA------TGTAAAATAT--ATATA--CGTATGAATGTGTTCATGTATATGCATATG----GTA----TGTGTTAGTAAGTACTTGTGTGTTATGACATGTGTTACTAAAT------TATATGCATAAATAAA-----ATGTTA-A-CAAGTTCATT-TTAA------ATCACATGAAATAAATTTATA-TT-TTT-C---AATAATCTTACT----------------AAAAAAAAAAGAAGTC--T-ACTTG-AAAT----ATGTTGA-TTGTGGA-TTAAAA-AA---AATAA-TTTGT-ATATTCT----GATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCTTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTATTTCTCTATTGTCTG--------TGTTTGA----AT-TT-C-TACAAATTTTTTATGTA--------TGGAT-TTGATTAAGTGTTACCTAA--TAAAATAGAACCAATTAATTAACATGT-----------ATCTG-----------GTATACATG------------T---TTTATTTGTGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----G-T-----TTTT---------TGTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTG-CGTCTT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCCACGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|30 : TA-----TGCACATT---TCTGTATGTATACGT-GATATT--TTCT--CTT-------------T------------TTTTCTTT--ACAT----A-T-----TTTT---------TGTA-A-TATAAGATACAGTAT-TATCA-CGTCTT-GT-ATGTA-------------------TTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTAATGAATT
gi|31 : ATGAGGTTAAACACTAACC-AAATAAAGTTTCTTGGCTAACATTAGTATGTGAGCTGCTATCATCTTTGGGATTTTATAATGTCTGGCTTGCACAATGCGTTGGTAAAGTAAACATTTTCTTA
gi|32 : -CGTCA--GT-GTATAATT----ATATACGTCTGTTTTATATATGTT-CACA-CGGGTCTATGGCCTATTGAATGGCC---AA-TA-AAAGTTTCTTCTcggat
gi|33 : tgagacagttctttatctCATTACGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----ATATTC--CTGTTTTGTATATGTT-AACA-CTGGCCTGCGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTT
gi|34 : ataataatTACAGTATATGTTA-CGTCAT-GT-ATGCAAAT----GTGTTC--CTGTTTTGTATAGGTT-CACA-CAGGCCTATGGCCTATTCAATTGCA---AA-T--AAAGTTTCT
gi|35 : gTCTT-GT-ATGTATAT----GTGATC--TTGTTTTGTATATGTT-CTCA-C-------TGGCCTATT-AATTGCA---AA-T--AA
gi|36 : c--AC--ATATA--CTTA--AATGTGTACATGTATATGCATATG----GTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATttatgggtactttccttctttcttc
gi|37 : tttatctaaccattaaatggtttTATTC--CTGATTTAGGTATGTT-CACA-CGAGCCTTTGGTCTGTTGAATAGGA---AA-T--AAAGGTTCTT
gi|38 : aA-TTTAA-AGGTTCT----TATT--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACGTTATACAT
gi|39 : GTTTTGCATTTTTTTCACA-CGGCCCTATGGCCTGTTGAATTGTA---AAGT--AAAGGTTCTTtt
gi|4 : TATAAATATACCCAAATTTAGTGTAGCAATTACTAGATTAATTGTTTCATCGCACCACTTTAAGATAGAATCTGGTAGGTGGCATAGACCGATACGTATCGCAATTGAAAATAGAAAATGGAATTCTT----------TGAAGACTAATATCATTTTATTATAACGTGTTCATTGTGTGTAGAATTACGAAGACCAT------------ACTTTTGGCATGAACCAAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAATGTAGTTAG
gi|4 : AAGTATGTATAAACAGGTAAAACGTTTTGGCAGTAAAGATGAAAAT-GTAGTTAGTGCATAACAATATTGCAT--TTGC----TTTTTACCGTGTCT------TAAAC--TGTATTTAATATATG------TGTAAT--ATGTATATA--CGTATGCATGTGTAAATGCATATG---------------------TAAGTAAGTACT--TGTGTTATGATATCTGTTA-----------------GTATAAATAAA-----GTGTTA-AACATGTTCATT-TTTA------ATTACATGAAATAAATTTGTA-GT---------AAT--T----CT----------------GAAA-------AA-----TAACTTGTAAAC----ATGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-AATAGATTAA-TTTGC-ATGTTCT----GATT--ATTATAAAGTA-A---ACTTG--T--GTC---TTA-----------ATCATACA-----CTTCTCCGTAA----A--------AAA----------------------------------------------TGA----TT-TT-CGCACAAAATGTTGATGTA--------TAGAT-TTAATTAATTATTACCTCA--T-AAATAAAAACAATTGACCAACATGT-----------ATCTG-------------------------------------TTATGTATG-------T--------GTGCA-----TACATATT---TCG---TGTGTACGT-GATA-T--TTCT--CTTTATTTGCCTGGTAT------------TTT-CTTTTAACA-----A-T-----GTTT---------TG---A-TATAAAAAAACGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ACGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CAGA-CGGGACTATGGCCTATTGAAATGCA---TA-TAAAAAATATCTTTtgcataacaatattgcatttgctttttaccgtgtcttaaactgtatttaatatatgtgtaatatgtatatacgtatgcatgtgtaaatgcatatgtaagtaagtacttgtgttatgatatctgttagtataaataaagtgttaaacatgttcatttttaattacatgaaataaatttgtagtaattctgaaaaataacttgtaaacatgttgattttggcttaaaaatagattaatttgcatgttctgattattataaagtaaacttgtgtcttaatcatacacttctccgtaaaaaatgattttcgcacaaaatgttgatgtatagatttaattaattattacctcataaataaaaacaattgaccaacatgtatctgttatgtatgtgtgcatacatatttcgtgtgtacgtgatatttctctttatttgcctggtattttcttttaacaatgttttgatataaaaaaacgtatgtgttacgtcatgtacgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcagacgggactatggcctattgaaatgcatataaaaaatatctttaagt
gi|5 : tataaatatacccaaatttagtgtagcaattactagattaattgtttcatcgcaccactttaagatagaatctggtaggtggcatagaccgatacgtatcgcaattgaaaatagaaaatggaattctttgaagactaatatcattttattataacgtgttcattgtgtgtagaattacgaagaccatacttttggcatgaaccT---TTAAATCTTTTAA----AAAGCGGAACACCATTGAAAATACATAACACTATTGTAT--T-TG----TTTTAACCGTGCCGCTGGCATTAAC--TGTATTTAATATATAATTTTATGTAAA--AT--GTATATGCGCATCAATGTGTACATGTATATGTATATGGTATGTA----TGTGTAAGTTAGTACT--TGAGTTATGACATGTGTTACTATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTT-----------ATT-TTTA------ATTATATGAAATAAATTTATATTT-TTT-C---AATGATCGAACT----------------G-AA-------AAGTA--T-ACTTaagt
gi|5 : TAAA-----GTGTT-A-TTTTTAA-TT-ATATGA---AATAAATTTAT-ATTTTTTCAATGATCGAACTGAAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATTATACATGTACTT-CTCAGTAACAAGA--------AAACATGAC---------TGTATTTT--------CCG--------TGTTTGA----TT-CA-C-CACAAATATTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATTTAACCTCA--T-AAA-AAAACCAATTGATAAACATGT-----------GTCTG-----------GTATATATGCNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN---NNNN--------NNNNN-----NNCACATT---TCGTTATGTATACGT-GATATT--TTTTTATTT-------------T------------TTT-CTTT--ACAC----A-T-----TTTTA--------TGTA-G-TATGAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-TGGGCCTATGGCCTATTTGATTGCA---AA-T--AAAGTTCCTTacttgtgtattaacattatacatgtacttctcagtaacaagaaaacatgactgtattttccgtgtttgattcaccacaaatatttgatgtatggatttgattaaatttaacctcataaaaaaaccaattgataaacatgtgtctggtatatatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacatttcgttatgtatacgtgatatttttttatttttttctttacacatttttatgtagtatgagatacagtatgtgttacgtcatgtatgtaaatgtattcctgttttgtatatgttcacatgggcctatggcctatttgattgcaaataaagttccttc
gi|6 : tttaaatcttttaaaaagcggaacaccattgaaaatacataacactattgtatttgttttaaccgtgccgctggcattaactgtatttaatatataattttatgtaaaatgtatatgcgcatcaatgtgtacatgtatatgtatatggtatgtatgtgtaagttagtacttgagttatgacatgtgttactatattatatgcataaaTA--------TGAAA-TTGATTAAATGTAACGTCA--T-AAACTAAACCAATTGATTAATATGT-----------ATCTG-----------GTATATATG------------T---TTTATGTATG----------------------------CACATT---TGGTTATGTAAATGT-GATATTATTTCT--CTT-------------T------------ATT-CTTT--ACAC----A-T-----TTTA---------TATA-A-TGTAAGAAACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----GTTTTC--TTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGTCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAAGTTTc
gi|7 : tgtattaatgaattaaatgttgaatcaaaaacagttaaatgtcatttttataatgattttttatttctattataaactgttatcatatcaataattttaataaaataacaatttaagttgtatacttaaaatataaaatatgaaagtacacataatcaaaaaaaattatatttttattaaattttgttataccggtagttttaattaaggctttattttcaataatttttttaatagttttaattaagacttaaggctttttttgttttgttttGTC--T-GCTTGTAAAC----GTATTGA-TTGTGGC-TTTAAA-AAT--AATAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---ATT---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAAA--------ATACATGACAGTTTTTTTTCTATTTT--------CTG--------TGTTTGA----TT-TTTC-CACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTTATTCAATGTAACATCA--TTAAATAAAACCAATTGATTACCATGT-----------ATCTG-----------GTATATAAG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCTTTATGCATACGT-GGTATT--TTCT--CTT-------------G------------TTT-TTTT--A-AC----A-TTTTTATTTT---------TGTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTATGGCCTATTGAATTGCA---AA-T--AAA
gi|8 : AGTC--T-GCTTGTAAAC----ATGTTGA-TTGTGGC-TT-AAA-AA---G-TAA-TTTGT-ATATTCT----AATA--ATTATAAAGTATACTTACTTG--T--GTA---TTA---------ACATCATACATGTACTTTCTCCGTAACAAGA--------ATACATGAC---------AGTATTTC--------TCGATTTTCTGTGTTTGT----TT-TT-C-AACAAATTTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGTAACCTCA--A-TAATAACACCAATTGATTAACATGTATCTGGTATGTATCTG-----------GTATAAATG------------T---TTTATGTATGT---ATAT--------ATGTA-----TGCACATT---GCGTTATGTATACGT-GATAGT--TTCT--CTT-------------TA-----------TTT-CTTT--ACAC----A-------ATTT---------TGTA-A-TATAAGATACAGTATGTGTTA-CGTCAT-GT-ATGTAAAT----TTATTC--CTGTTTTGTATATGTT-CACA-CGGGCCTGTGGCCTATTGAATTGCA---AA-TA-AAAGTTaaaaaaagttt
gi|9 : CTTAAAC--TGTATTTAAAGTATA------TGTAAA--ATGTATATA--CATATGAATGTTTACATCAATATGCATGTGGTATGTA----TGTGTAAGTAAGTACT--TGTGTTATAGCATGTGT---TATAT------TATATGCATAAATAAA-----GTGTCA-AGCATGTTCATT-TAAA------ATTACATGAAATAAATCTATA--T-TTT-C---AATGATCAGTCT----------------GAAA-------AAGTC--T-GCTTGTAAAC----TTGTTGA-TTTTGGC-TT-AAA-GA---AATG----TATAATATTCA----GGTT--ATTATAAAATGTACCT-TTTT--T--GTA---TTA---------ACATCATACCTGTACTTTCTCCATAACAAGA--------AAGCATGGC---------TGTATTTC--------CCG--------TGTTTGA----TTGTC-C-CACAAATGTTTGATGTA--------TGGAT-TTGATTAAATGT