lowQualScore : 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 555 11 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22222222222 222222222222 4444444444444444444444444444444 1 11111111 1111111 5555555555555 11111111111 22222222222222222 1 1111 1111 333333333333333333 00000000000000000000000000000000000000 111 1111 4
lowQualScore : 5 11 222 7 88 88 8 1 3 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3333 222 1 55 3333 0 3333 222 55555555555 1 11 55 2222 888 2222 4444444 1 11 333333333333 44444444 333 8888 2 3333333333333333333333333333333 4 33 1 66666666 5555555 444 5 0 6666666666666 3 22 777 5555 666666 222 33333333333 33 888888888 22 2 33 1 1 11111111111111111 1 3333 1 9 1 222 66666 444444 11 2 4444 555 333 22 44 3333 4444 2 2 00 555555555555555555 0 0 66 3 55 0 444 33 99999999999999999999999999999999999999 77 3 555 44 2222 0
lowQualScore : . .. ... . .. .. . . . ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ .... ... . .. .... . .... ... ........... . .. .. .... ... .... ....... . .. ............ ........ ... .... . ............................... . .. . ........ ....... ... . . ............. . .. ... .... ...... ... ........... .. ......... .. . .. . . ................. . .... . . . ... ..... ...... .. . .... ... ... .. .. .... .... . . .. .................. . . .. . .. . ... .. ...................................... .. . ... .. .... .
lowQualScore : 0 00 000 3 33 66 0 8 2 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 777 5 22 1111 9 1111 555 11111111111 4 99 88 8888 444 9999 5555555 9 88 999999999999 00000000 333 1111 2 8888888888888888888888888888888 9 99 4 66666666 0000000 111 4 2 9999999999999 2 22 222 2222 555555 666 00000000000 77 222222222 00 7 11 3 3 11111111111111111 4 0000 4 9 5 666 99999 333333 88 3 4444 222 333 88 55 1111 2222 0 0 66 111111111111111111 2 7 55 5 66 2 444 99 00000000000000000000000000000000000000 33 1 111 11 5555 0
consensus : ATTTGAAGCCAAGTTGCATAATATG--GTTATCGANT-TTTGGTNCAATT-AATCTTGACC-TTTA---TCG-TTTTGAAT--G-GTA-------AATCT-T-------------TCAC-A---TTN----T----C----T-TGTCAGCACTA---C---T---CC-T---A---A-ACTTCTCA--ACCGA------TTTTGGC-CAAA--CTTGNTAGGGAGTAT---------CA-GT---A------T--------G------------TT--G-T----GC----A------T----ATC---GT---C---G---T----GT--TCTG---GTCCATCGA-C-T--TTT-G---GC-GNA-GT----T-ATG-GCC--CTTTGATT-----AA-T-TTG--AT-N--GTAAATC-------------AT---C--TGTA--TCA-C----ACT--TT-CT-GTC-C--GCT-CTAC---N-C---C----T------C--TC-AACT--------GATT-TTGGCCAA--A---C-----TTGCT----A---GGGA----GT-ATCAG----ATG-A--GT--GAAGTCC------AGTTG----C-G----CATA--GTCA---TCG---C----G--TTCTG---GT----C--C----ATTGAC---T-T--TN-----G----TG--NA---G---TTA-TGGC-C---CTTT---------G-A---T--T--ATTT-----------A----AT-GTAAATCT--T--GT----A--------T-TTA----CANCA-C---C-----T--T-TC--T---------------T----GA---T-T--TT----GAC----CAAAC---TTG---TT---NGG-G--AA--T----AT--CA----G-------TATGAAGTCCAG--TTG--C---TC---TTGTCA----TCATC---GTCACGT-TCTG----CTCCAT--CGA-C---TCG-NGATGGAGT--TACGGCCCTTT----AATTAT----T--TT---TAATTGTAATTC-T-TTATTCT-GTC-AG--C---ACTA---C------T---C---C---T---A--AA-C-------TTCT--CAACTGATTNTGGC-C-A-AACTT-GC---------TAG-CG-A----G-TATCAG-TAT---GAAGT-----TCA------GTTGT-GCATATCGTC--A-T---C---TC--TG--TAGTAGTA-CTA----C-TG-TCACTAGT-C--A-AAN--CTCAT--TAGTCAAATGGCATTGCTA-CAATAAGGC---TACAGGCACA--GT-GGNGC--A--T-TNGTGTC-G--A--G-------G-CA--CA-TTTCTAG--TTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( gi|1 ) : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATG--GTTATTGCAT-TCTGATCCAATCGAATTTTGACCATTTA---TCAATTTTGAAT--G-GTA-------AATCT-T-------------TCAC-A---TTG----T----T----T-TATCACCACTA---C---A---AC-T---G---A-ACTTTTCA--ATCGA------TTTTTGC-CAAA--TTTGCTAAGGAATAT---------CA-GT---A------T--------G------------TT--G-T----GC----A------T----ATC---GT---T---G---T----GT--TCTG---GTCCATCGA-C-T--ATT-G---GC-ATA-GT----T-ATG-TCC--CTTTGATT--G--GA-T-TTG--AG-G--GTAAATC-------------AT---C--TGTA--TCA-C----ACT--TT-CTAGTC-C--GCT-CTAC---C-C---C----T------C--TT-AACT--------GATT-TTAGCCAA--A---T-----TTGCT----A---GGGA----GG-ATCAGA---ATG-AG-GT--GAAGTCT------AGTTG----T-G----TATAAAGTCA---TCG---T----G--TTCTG---GT----C--C----ATTGAC--CT-T--TT-----G----TG--TA---A---TTA-TGGC-C---CTTT---------A-A---T--T--ATTT--------GC-A----ATGGTAAATCT-AT--GT----A--------T-TTA----CATCA-CG--C-----T--T-TC--T---------------T----GA---T-T--TT----GAC----CAAAC---TTG---TT---CAG-G--AA--T----AT--AA----G-------TATGAAGTTCAG--TTG--C---TT---TTGTCA----TCATC---ATCACAT-TCAG----TTCCGT--CGA-C---TCGAAGATGGAAT--TATTGCCCTGT----AGTTAT----T--TT---TAATTGTAATTC-TATTATTCTAGTC-AG--C---ACTA---C------T---C---C---C---A--AA-T-------TTCT--CAACTGATTATGGT-C-A-AACTT-AC---------TAA-CA-A----G-TGTCAG-TAT---GAAGT-----TCA------GTTGT-GCATTTTGTC--T-T---C---TC--TG--TAGTAGTG-TTA----C-TG-TCACTAGT-C--A-AAT--GTTAT--TAGTCAAATGACATTGCTA-CAATAAGGC---TACAGGCACA--GTTAGTGA--A--T-TAGTATC-A--A--GC------G-CA--CA-TTTCTAA--TTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATT--ATTGTCGCAT-TCCTATCTA-TTGA----TGAAC------------TTTTCAAT--G-GTA-------AATCT-C------------------------------------------ATCAGTATTA---C---T---CC-T-------A-ACCT--CA-------------------T-CAAA--CTTGGTATGGAGTAT---------CG-GT---A------T--------GAAACCTGT----TT--G-A----GC----T------T----ACC---ATCA-T---T---T----GT--TCTG---GTTCATTGA-T-G--TTT-G---GC-ATA-GT----T-ATG-TCC--CTTTGTTT--
gi|4 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcCATGATCTG--GTTTATGAATGTTTGGCTTAATTAAATCCCG--TAATAA---TTAATTT-AAAT--G-GTA-------AATCT-TCATATGTACAATATCAA-AA--TTA----C----T----T-T-TCAGCTCTATTCC---T---CC-T---A---A-A--TTTCACTATCAA------TTCTGGC-CGGC--CTTGTTTGGGAATAT---------CA-TT---A------T--------GGGA---------TTAAG-T-----C----A------T----ATC---AT---T---T---T----TG--TCT----ATCCATTTA---T--ATT-G------------------ATG-GCC--CTTTGAT------AA-T-TTG--AATG--GCAAAT--------------------------------------CT--TT-----TC-A--GC----AC---A-T---C----T------C--TT--ACG--------AAAT-TCAGTTGA--C---T-----TTGCT----A---AGGG----GGTTTC-------TG-A--GT----AATCC------AGTTA----T-G----CATA------------------------TTTG---CT----T--C----ATTGAA--GT-T--TG-----A----CG--GA-------------GC-T---CATT---------A-A---A--T--AGTT--------ATAA----ATCGTAATTCT--T--GT----A------------AG---CAATA-CT--CCTAAAC--T-TC--T---------------CGACAGA---T-T--AT----GGT----CAAAC---TTG---CT---AGG-G--AG--T----AT--CA----G-------TATCAAGTTCAG--TTG--C---TC---ATTTCT----TCA
gi|21 : gttgtAATATGAAGTCATCACGT-TCTGCTCCA--------TTGA---TTTA---TGG---TGGAGT--G-ATAGCCCTTTAATTA-T-------------TTATTA---TTGAAATT----C----T-TGTCAGCATTT---T---T---CC-T---A---A-ACTTCTCA--GCTGA------TTGTCGA-CAAA--CTTAACAGCAAGTAT---------CA-GT---G------T--------GAAGTTTAC----TT--G-T----GC----A------T----ATT---Gattgtgtagtagaaaccttttagtcaaatgggattgctaataacacaattacaggtacaacagggtattcctgtcaacagtcacatttctagttaaagagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|3 : ttattagggaatataTATTGACT-TTTGGTGCAGTTTA---TTGCCCTTTCA---TTA-TTTTTAAT--T-GTA-------AATCT-T------------------------------------------GTCAGCACTT---C---T---CC-TT--A---A-ACTTTTAA--ACTGG------TTTTGAC-CAAA--CTCATTAGGAAGTTT---------CA-GT---A------TGAAGTTCCG------------TT--G-T----TT----A------T----ATC---GCCAGT---G---C----AT--TCTT---GACTATTGA-T-T--GAA-G---GT-GCA-GT----T-Aacagtctggaggtaaacctttgttccaagatcaaaacttcttt
gi|15 : tttgggcatatcattattgtgctccagtgTATTGACT-TTTGATGCAATT--ATC---ACCCTTTAATTTCA--TTTGA-T--G-GTA-------AATCT-T-------------T---------------T----C----T-GATCAAGCCTA---T---A---A--T---A---ATATCTTACA--A---A------T----G---AAA--CTAGGTAGGGAGTAT---------CA-GA---A------T--------GAAGTCAAATAAATT--C-T----GC----A------T----ATT---GT---C---T---C----TT--TCTG---CTCCATTGA-C-TGCAT-------C-ATA-GTATAAT-ATG-GAC--TTTTAATT--ATTTA-T-TTG--CT-G--GTAActgatcttaccaatttaataattctcaactgatttgataaaattttacggaatataaactggtgtaatattaagtttctcttatcattatcacagtttgctccatcaacttgaaggcagagttacagcccttgaattatttttagttgtaattattcttgtcagttttacttctcctgtaaaacttctcaactgattattgtcaaacttgctagcaagtattggtacaaaaatcagttattgtcagctctgtagtagtaccactgtctgtcaatagtcaaaactcagtagtggaattgcattgatgcaaaaggctacagccacagtgggcacattcttgtcgacaggcacatttttattttattttgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|7 : tgaccaaactaagggagaatcagtgtaaagtctagtttctcgttcattgtgcattcaaatctttgCCATTTT---TCG---TTGAGTTTG-ATA-------A---T-T-------------TTA--A---TTG----TGTATC----T-TATCAGCGCTA---C---TTCTCC-T---A---A-ATATCTCA--ACTGA------TTTTGAC-CAAA--CTTGTTAGAGGCTAT---------AA-GT---A------TAAATCCCAG------------TT--G-T----TT----T------T----ATC---AT---C---AACAC----AT--TCTG---CTCCATCGA-CAT--ATC-G---ttaaatcttgtcatt
gi|23 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatggggctcattcacctctcgatcgaaactgattttggtcaaatattctaagtaatgttatgtaagtaggaattcctgttgtacacgttgtcgatacgttacggtATTTT-AAT--T-GTA----------CG-T-------------TTAT-T---TTG----T----CAGCAT-TACCAGTACT----C---A---CCAT---G---A-ACTTTTCA--ATCGA------TTATGGC-CAAA--CTTGGTAGTAAGTAT---------CA-GT---A------cggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|14 : TAAAT--G-GTC-------AATTC-A-------------TCCC-A---TTT----T----C----T-TGTCAGCTTTA---C---T----C-T---TTTCA-ACTTCTCA--ATCGA------TTTTCAC-CAAA--CTTGCTAGGGAGTAT---------CA-AT---A------T--------GAAGTC-------TT--GTT----GCTGAAA------TC---ATC---CT---C---A---T----TT--TTTA---GTCTATCAG-C-T--TTT-A---GT-GTA-GA----T-ATagaagttcaggtttgcaaattgtcatctatgtagtactactgttagcagtctaatatcgttaggcaaataacattgctgctataaagttacaggcacagt
gi|13 : GAGT--T-GTG-------GATCT-T-------------TCAT-AATTTTA----T----T----TGTATTTTCAGTA---C---T---TC-TCAGA---A-ACTT------ACTGA------TTTAGAC-CAAG--GTAGATAGGGGAAAT---------AA-GT---A------T--------A------------C---G-T----CC----AGT----T----GTT---GT---T---G---TC---ATCATCTG---CTTCCTTAA-C-T--TAT-G---AA-AGA-GT----A-ACG-ACA--CTTTGATT------A-T-TT----------TAAAT----------------------TGTAATTCA-----------TT-CT----------C-CTA----------------------------AACT--------GATT-ATGGTCAA--A---C-----TTGTT----A---ACAA----GT-ATCAGT---ACG-AT-GT--A-----C------AGTTG----T-G----CATAtttagttcaggttattttaaatgcagaatatatgtgcatgtgtctgacacacatattactgaatatctgtataaagtccagttgctgttattgttgtactccatcaacttttagtggcgttacagccctttactttgttttat
gi|28 : tctttttataagtgAT--GCGTA-------CATCTATAGA----------TCAC-A---CTT----T----A----T-TGTCAGCACTAT--C---C---TC-T---T---A-ACTTTTCA--ACCGA------TTTTGGC-AAAA--CATACTAttattctctctggagaagtgttattgagcacttgtcgaaactc
gi|8 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgCC-T-------------TC-C-A---TTA----T----TG---T-CAGCATTATTC---C---T---CC-T---A---A-ACTTTTCT--ACGGA------TTTTGTC-CAAA--CTTGCAAGGGTGTTT---------TA-CT---AG-----TCCA-----G------------TT--G-T----GA----A------T----ACT---GC---T---G---T----G-----CG---TTACATCAG-T-T--ATTCT---GT-AGA-GT----T-ATG-TCA--CTTGGAgtttat
gi|8 : ggc-------------TCAC-A---TTT----T----C----T-TGTCCTCTCTT---CTTCC---CC-T---A---A-ATTTCTTA--TCTGA------CTTTAGC-CAAA--CTTGC-------------------CA-G--------------------------------------------GC----C------T----ATC---TT---T---G---TTAC-AT--TCTG---GTTCATAAA-C-T--TTT-G---G----A-GC----T-ATG-GCC--CTTTAATTACA--AA-T-TTT--AT-T--GTA-----------------AT---T--TTTG--TCAGC----ACT--Tgaaatttaatttcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|5 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatataca----T----T----T-TGTCAGAACTA---C---T---CC-T---A---A-AATTTGCA--ACAGA------TATTGGT-CAAA--AT-GTTGAGAAATTT---------CA-GT---AAGGTCCT--------G------------TT--G-A----AC----A------T----A--------------G---T----GT--C--A---ATGCATTGA-T-T--TTT-A---GT-GAC-GT----T-ATG-GAT--CTTTGAT------AATT-TTA--AT-T--GTAAAT--------------ATTGAC--GGCG--TTA--------T--TT-CT----------C-CTAA---A-C---T----T------C--TC-AACT--------GA-T-TTGGCCAA--A---T--------------------AA----GT-ATT------------------AAGTCC------AATTGGTCCT-G----T-CA---CCA---TCA---T----G--TTCTT---CT----C--C----ATTGAC--TTAT--TT-----A----T---TA---A---CTcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|12 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaa---A-ACTTCTCA--ACTGA------TCTTGAC-CAAACATTT--TAGAGAATAT---------CA-GC---A------T--------G------------AT--G-T----CC----AGTTGCTC----ATC---AT---C---A---C----AT--TCCA---CTCCATCGA-C-T--TAT-G---GC-TTA-cagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|7 : -ACCTCTCG--ATCGAAACTGATTTTGGT-CAAA--TATTCTAAGTAATGT---------TATGT---A------A--------G------------TA--G------GA----A------T-----------T---C---C---T----GT--T------GTACA-CG--------TT-G---TCGATACGT----T-ACGGTCCATTTTTCGTT--G--AG-T-TTG--A------TAATTTTA-----------AT---TG-TGTA--TC---------T--TA-TCAG---C--GCTACTTC---T-C---C----TAAATATC--TC-AACT--------GATT-TTGACCAA--A---C-----TTGTT----A-----GA----GG-CT-------ATA-AGTAT--AAATCCC------AGTTG----T-T----TTTATCATCA---ACA---C----A--TTCTG---CT----C--C----ATCGAC--AT-A--TC-----G----CG--GA---T---TTA-CTGCACTAACTTT---------A-GGTTT--T--A-TT--------GT-A----ATtcctaaactattcaactgattatagtctaaacttgctagaatgtaaaagtacaaggttcagttgtgcatattgtcatctctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|3 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatggggctcattcTTCTCA--ACTGA------TTT--GA-TAAAA-TTT--TACGGAATATAAACTGGTGTA-AT---A------TTAA-----G------------TT--T-C----TC----T------T----ATC---AT---T---A---TCACAGT--T-TG---CTCCATCAA-C-T----T-GAAGGC-AGA-GT----T-ACA-GCC--CTTGAATT------A-T-TTT--TA-GTTGTAA-TT-------------AT---T--CTTG--TCA------GTT--TTACT--TC-T--CCT-GTAA---AAC---T----T------C--TC-AACT--------GATT-ATTGTCAA--A---C-----TTGCT----A---GCAA----GT-ATtcttcttgtcagtactgctcc
gi|2 : tttgggcatatcattattgtgctccagtgtattgacttttggtgcagtttattgccctttcattatttttaattgtaaatcttgtcagcacttctccttaaacttttaaactggttttgaccaaactcattaggaagtttcagtatgaagttccgttgtttatatcgccagtgcattcttgactattgattgaaggtgcagttactgatcttaccaatttaataaTTTTA--ACAGA------TTTTCCC-CAAA--TATGAT------TAT---------TA-TT---A------T--------GATGAAGTCTAC-TT--T-T----GC----A------T----ATCCTGAT---C---G---T----AT--GCAG---GTCTAT--ATC-T--TTT-T---GT-ATA-GT----T-ATG-GCC--CTTTTAAT------A-T-TTT--AA-T--GTTAAT---------------T---T--TGT----CA-CCAGGACTACTC-CTAAAC-T--GTT-C------------------------------AGCT--------GATT-TTTACCAA--T---C-----TTGGT----A---GGGA----GT-TTCGGC---AT------TTAAAAATCC------AGTTG----C-A----CA---AGTTG---TCG---TTTGCA--TTTCG---GT----CTAC----AT--AT---T-T--TT-----G----AA--GA---G---TTA-TGGT-C----TTC---------G-G---C--T--AAT-----------------ATG---AAT----T--GT----A--------T-T------CCTC------C-----TAAC-TT--T---------------T----GAAGAT-T--TT----GGC----AAAAG---TT-----T---TAG-G--GA--T-----T--A-------------TATGAAGTCTAG--TTG--C---TC---TTATTG----TCATC---ATGGTTT-TC-------TCCAT--TGAGC---TC---GGCAGAGT--TATGTCCCTGT----tggtacaaaaatcagttattgtcagctctgtagtagtaccactgtctgtcaatagtcaaaactcagtagtggaattgcattgatgcaaaaggctacagccacagtgggcacattcttgtcgacaggcacatttttattttattttgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|31 : attagatggtatggttaatcttgtcagcatttcttcctttaaacttctcaagtgatattttgcagctcttctcttctttcagCA--GTCGA------T-TTTGCTCAGA--CTTACCAGGGAGTAT---------CA-GCTTGA------T--------G------------TTCAG-TTGTCAC----A------T----GTC---GT---T---G---T----cagcgctactcgtaaacttctcatctgtattgtcgaattttctagtaaatatcagcatgaagttcagttccacaaatcgccatatctgtatttgtaactattgtcacttgtcgaaacccattatccaaataaaaccacatgcacagagcatgtctggtaacagccacatttcctattttaattgttatatgcatgttatatacatatttaacag
gi|24 : A--ACTGA------TTTTGGC-CAAA--CTCCCTATGGAGTAT---------CA-GT---G------T--------G-----------------------------A------T----ATCTA-GT---T---G---T----Gcacatgtcagtctgttgacctttggttggccattaaact
gi|21 : cagagttactgccctttagtaattttcatcctgTTATTAGGGAATAT---------AA-AT---A------T--------G-----------------------------A------A----GTC---AT---C---A---C----GT--TCTG---CTCCATTGA-T-T--TAT-G---GT-GGA-GT----G-ATA-GCC--CTTTAATT------A-T-TTATTAT-T--G-AAAT---------------T---C--T-TG--TCAGC----ATT--TT-----TC--------CTAA---A-C---T----T------C--TC-AGCT--------GATT-GTCGACAA--A---C-----TTAAC----A---GCAA----GT-ATCAG-----T-----GT--GAAGTTT------ACTTG----T-G----CATAcacacaattttctttgtagtagtatttcagtcggtagacaaaactcggtaatctaatgttggttaagtaaggcaaaagtcagtggtggcatttgtgtaaa
gi|8 : ---------CA-GT----------T--------G------------CT--C-T----TT----A------T----ATC---AT---T-------------C--TCTGTCAGTCCACCAA-T-T---TG-G---GC-ATA-TT----T-ATG-GCC--CTTTGAT------AA-TATTA--AT-G--ATAAATCCAAGTAAAAAACCAT---A--TACA--TCA-C----ATT--TT-CTTGTC-C--TCT-CTTCTTCC-C---C----TAAATTTC--TT-ATCT--------GACT-TTAGCCAA--A---C-----TTGCC----A---GGttgacagtctggaggtaaacctttgttccaagatcaaaacttcttt
gi|3 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtc------------TT--G-G----GC----A------T----ATC---AT---TATTG---T----GC--TCCA---GTGTATTGA-C-T--TTT-G---GT-GCA-GT----TTATT-GCC--CTTTCATT--A--TT-T-TTA--AT-T--GTAAATC------------------T--TGT----CAGC----ACT--TC-----TC-C------TTAA---A-C---T----T------T--TA-AACT--------GGTT-TTGACCAA--A---C-----TCATT----A---GGAA----GT-TTCAGT---ATG-AA-GT------TCC-------GTTG----T-T----TATATCGCCA---GTG---C----A--TTCTT---GA----C--T----ATTGA---------TT-----GAAGGTG--CA---G---TTACTGAT-C-----TT---------A-C---C--A--ATTT-----------A----AT---AATTCT-----------------------------CA--A-C----------------------------------T----GA---T-T--T-----GAT----AAAAT---TT----TA---C-G-G--AA--T----AT--AAACTGG-------TGTAATATTAAG--TTT--C---TC---TT---A----TCATT---ATCACAG-TTTG----CTCCAT--CAA-C---TTGAAGGCAGAGT--TACAGCCCTTG----AATTAT----T--TT---TAGTTGTAATT------ATTCTTGTC-AG--TTTTACTT---C------T---C---C---TGTAA--AA-C-------TTCT--CAACTGATTATTGT-C-A-AACTT-GC---------TAG-CA-A----G-TATTGG-TAC---AAAAA-----TCA------GTTA-------TTGTC--A-G---C---TC--TG--TAGTAGTA-CCACTGTC-TG-TCAATAGT-C--A-AAA--CTCAG--TAGTGGAATTGCATTGATG-CAA-AAGGC---TACAGCCACA--GTGGGCAC--A--T-TCTTGTC-GACA--G-------G-CA--CA-TTTTTAT--TTTATTTTcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|15 : t------------TT--G-T----GC----A------TTCAAATC---TT---T---G---T----AT--T-------------GA-C-T--TTT-G---AT-GCA-AT----T-ATC-ACC--CTTTAATT--T--CA-T-TTG--AT-G--GTAAATC-------------------------------------TT--TT-CTGATC-A--AGC-CTA---------------T------A--AT-AAT----------ATC-TTA--CAA--A---TGAAACTAGGT----A---GGGA----GT-ATCAGA---ATG-AA-GT--CAAATA-------AATTC----T-G----CATATTGTC----TC----T-------TTCTG---CT----C--C----ATTGACTGCA-TCATA-----G----TA--TA---A----TA-TGGA-C---TTTT---------A-A---T--T--ATTTATTTGCTGGT-A----AT--TAAATCT--T--GTC---A--------T-Tgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|14 : tgaccaaactaagggagaatcagtgtaaagtctagtttctcgttcaTAAATG-------------GT---CAATTCA--TCC-C----ATT--TT-CTTGTC-A--GCT-TTAC---T-C---T----T------T--TC-AACTTCTCAATCGATT-TTCACCAA--A---C-----TTGCT----A---GGGA----GT-ATC--A---AT-----AT--GAAGTCT------TGTTG----C--------TGAAATCATCCTCA---T----T--TTTTA---GT----C--T----ATCAGC--TT-T--TA-----G----TG--TAGATA---TTT-TAG-------TTC---------AGG---T--T--ATTT--------TA-A----ATGCAGAATAT-AT--GT----G--------------------CA-TG---------------------------------T----G------T--CT----GA-----CACAC---ATA---TT---ACT-G--AA--T----AT--CT----G-------TATAAAGTCCAG--TTG--C---------TGTTA----TTGTT---GT-AC------------TCCAT--CAA-C---TTTTAG-TGGCGT--TACAGCCCTTT----ACTTTG----T--TT---TA
gi|22 : C-------------AC---C--TATACATTA-C----ACT--TT-CTTGTC-CAGGTTACTAC---T-C---CAAAAT------GAATT-AACT--------GATC-TTGGCCAA--A---C-----TTGTT--------GGGA----GT-ATCAGC---A-------T--GAATTCT------AGTt
gi|28 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtcC-------------AT---C--TATAGATCA-C----ACT--TT-ATTGTC-A--GCA-CTA----T-C---C----T------C--TT-AACTTTTCAACCGATT-TTGGCAAA--A---C-----ATACT----A---G
gi|27 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgatgcgta-C----ACT--TT-CTTGCC-A--GCT-TAAC---T-C---C----T------C--CTAAACTTCTCAACAGATT-TCGGCCAA--A---C-----TTTCT----A---GAGA----Gtttat
gi|6 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggCT--TA-TTAGTCAT--GCT-TTTC---T-CAACT----T------C--TC-AACT--------GATT-TCGACCAA--ACCTT-----TTACTTTTTA---AAAA----T--ATAAGAT--ATA-AATAT--GAAATCA------AGTTG----T-TCTTTTATA---TAA---TCA---T----G--TTCTA---GA----CA-C----A--GA----------------------G--GA---T---TGA-TTGC-T---CTGT---------A-G---T--T--ATTT--------TA-A----GTTATAATTCT--T--GT----------------------CAGCA-C--------------TG--G---------------T----GA---T-T--AT----GGT----CAAAC---TTGAC-TG---CAA-G------T----AT--CA----G-------TATGAAATTCAG--TTG--T---GTATATTGTCG----TCtaacatgttatcgactcttatatca
gi|12 : ttttataattgtcattataagt-C---T----T------C--TC-AACT--------GATC-TTGACCAAACA---T-----TT--T----A---GAGA----AT-ATCAGC---ATG-A---T-----GTCC------AGTTG----C-T----CA-----TCA---TCA---C----A--TTCCA---CT----C--C----ATCGAC---------------------------------TTA-TGGC------------------------T--T--ATCC--------------------TAAAC--------T----A--------T-TCA--------A-C----------------------------------T----GA---T-TA-TA----GTC----TAAAC---TTG---CT-----A-G--AA--T----GTAAAA----G-------TACAAGGTTCAG--TTG--TGCATA---TTGTCA----TCtctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|29 : aa-C---T----T------C--TA-AACT--------GATT-TTGACCAA--A---C-----TTGTT----ATTCGGAA----AT-AT---ATTTATG-AA-GT--AAAAT-T------ACTCT----T-A----T----CGTCA---TCA---T----G--TTTTtctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|16 : agcactactcatcctaaa----T------C--TT-GACT--------GATTATGGGACAA--A---T-----T-GC-----A---GGCAAACTGGCATCAGT---ACA-A--------AGTTC------AGTTG----T-G----TATA---TCA---TCA---T-------CTCTA---GTAGTAC--T----ATTGtaggacagagttacaaccc
gi|13 : ttaatgtaattcttgtcagcaccactctttcaaagtt------C--TT-A-CT--------GATT-TAGACCAA--G---G-----TAGAT----A---GGGG----AA-ATAAGT---AT----------ACGTCC------AGTTG----TTG----T-T---GTCA---TCA---T---------CTG---CT----T--C----CTTAAC--------TT-----A----TG--AA---AGAGTAA-CGAC-A---CTTT---------G-A---T--T--ATTT--------------------TAAAT----T--GT----A--------A-TT-----CATT------------C--T-CC--TAAAC-----------T----GA---T-T--AT----GGT----CAAAC---TTG---TT---AAC-A--AG--T----AT--CA----G-------TACGATGTACAG--TTG--cttataatacaatggcatgctacaataacgctacaggcacaggggggacattaatgtcggtaggattatttctatatttttcaaattcataataatctcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|24 : tctttttataagtggagttgtggatctttcataattttatttgtattttcagtacttctcagaaa------C--TG-AACT--------GATT-TTGGCCAA--A---C-----TCCCT----A---TGGA----GT-ATCAG-----T-----GT--GATATCT------AGTTG----T-G----CACAtgcatattattctctctggagaagtgttattgagcacttgtcgaaactc
gi|20 : cagagttactgccctttagtaattttcatc--TT-AACT--------GAAT-TTAGGCTA--A---T-----TTGCA----A---GCGA----GT-ATC------AT-----TT--GAAGCCA------AGTTG----C-A----TATATTATTG---TCG---C----A--TTCCT---AT----C--T----ATTG-------------------------------------A-TGAA-C---TTTT----------------------------------C-A----ATGGTAAATCTCATCAGT----A----------TTA----C--------------------TC--C---------------T----AA---C-C--TC-----AT----CAAAC---TTG---GT---ATG-G--AG--T----AT--CG----G-------TATGAAACCTGT--TTG--A---GC---TTACCA----TCATcaattttctttgtagtagtatttcagtcggtagacaaaactcggtaatctaatgttggttaagtaaggcaaaagtcagtggtggcatttgtgtaaa
gi|7 : aaattta-AACT--------GATT-TTGGTCAA--A---T-----ATTCT----A---AGTA----AT-GTTA------TGTAA-GTAGGAATTCC------TGTTG----T-A----CAC---GTTG---TCGATAC----G--TTACG---GT----C--C----ATT------T-T--TC-----G----T---TG---A---------G-------TTT---------G-A---T--A--ATTT--------------------TAA--TT-GT--GT----A--------T-CT-----TATCAGCG--C-----TACT-TC--TCCTAAATATCTCAACT----GA---T-T--TT----GAC----CAAAC---TTG---TT---AGA-G--GC--T----AT--AA----G-------TATAAATCCCAG--TTG--T---TT---TT---A----TCATC---AACACAT-TCTG----CTCCAT--CGA-CATATCGCGGAT----T--TACTGCACTAA----CTTTAG----G--TT---TTATTGTAATTC------TTCTTGTC-AG--T---ACTG---C------T---C---C---ttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|15 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatggggctcattcacctctcgatcgaCCAA--A------------CT----AA--GGGA----GA-ATCAG-----TG-----T--AAAGTCT------AGTTT----C-T----CGT----TCA---TTG---T----GCATTCAA---AT----C--TTTGTATTGAC--TT-T--TG-----A----TG--CA---A---TTA-TCAC-C---CTTT---------A-A---T--TTCATTT--------G-------ATGGTAAATCT------T----T--------T-CTG-----ATCA-AG--C-----C--TATA--A---------------T----AA---TAT--CT----TACAAATGAAAC---TAG---GT---AGG-G--AG--T----AT--CA----G-------AATGAAGTCAAA--TAA--A---TT---CTG-CA----T-ATT---GTCTCTT-TCTG----CTCCAT--TGA-C---TGCATCATAGTATAATATGGACTTTT----AATTAT----TTATT---TGCTGGTAATT
gi|20 : tgaCAA--A---C-----TTGGT----A---TGGA----GT-ATCGGT---ATG-A--------AACCT------GTTTG----A-G----CTTACCATCA---TT----T----G--TTCTG---GT----T--C----ATTGAT--GT-T--TG-----G----CA--TA---G---TTA-TGTC-C---CTTT---------aaatcttgtcatt
gi|5 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcatttgaagccaagttgcatatattattgtcgcattcctatctattgatgaacttttcaatggtaaatctcatcagtattactcctaacctcatAA--A---T-----TTGCA----A---CAGATATTGG--TCAAA---ATG-TT-GA--GAAATTTCAGTAAGGTCC----T-G----T-TGAA--CA---TAG---T----G--TC--A---AT----G--C----ATTGAT--TT-T--TA-----G----TG--AC---G---TTA-TGGA-T---CTTT---------G-A---T--A--ATTT---------T-A----ATTGTAAAT-------------A--------T-TGA----CGGCG-TT--A-----T--T-TC--TCC-------------T----AA---A-C--TT------C----TCAAC---TGA---TT---TGG-C--CA--A----AT--AA----G-------TATTAAGTCCAA--TTG--G---TC---CTGTCA----CCATC---AT---GT-TCTT----CTCCAT--TGA-C---Tgttt
gi|10 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaAAGTCC------ATTTG----C-T----CTTGACATTA---TCA---T----G--TTCTA---GT----C--C----ATTGAC--AT-T--TG-----T----TG--AA---C---TTA-CAGT-C---C------------------------ATTT--------TC-A----ATTAT-AAT--------T----G--------T-TTA-----AGCA-CA--C-----A--G-TC------------------------------T--TT----G----------C---TTG----G---CAT-G------T----AT--CA----G-------TTTGAAGATAAG--TTG-----------TTGTCA----CTGTA---GTTACAT-Ttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|8 : GTCC------AGTTGCTC-T-T----TATA---TCA---TT------------CTCTGTCAGT----C--C----ACCAA------T--TT-----G----GGCATA---T---TTA-TGGC-C---CTTT---------G-A---TAAT--ATT------------A----ATGATAAATCC-AA--GT----AAAAAACCAT-ATA----CATCA-CA--T-----T--T-TC--T---------------T----Gtcacatgtcaaatttcattaatcaaatagcgttgtcacaataaggctacaaggacattttggcatcgtgcccacatgcacatttcttgtttcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|21 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttat----TATGAAGTCA---TCA---C----G--TTCTG---CT----C--C----ATTGAT--TT-A--TG-----G----TG--GA---G---TGA-TAGC-C---CTTT---------A-A---T--T--ATTT--------AT-T----ATTGAAATTCT--T--GTCAGCA--------T-TTT----TCCTA-AA--C-----T--TCTCAGC---------------T----GA---T-TG-TC----GA-----CAAAC---TTA----A---CAG-C--AAG-T----AT--CA----G-------TGTGAAGTTTAC--TTG--tcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|13 : ttattagggaatataaa--CT-T--TTTATAAG----TG--GA---G---TTG-TGGA-T---CTTT---------C-A---T--A--ATTT--------------------TA----T-TT--GT----A--------T-TTT----CAGTA-C------------T-TC--TCAGAAACTTAC----T----GA---T-T--TA----GAC----CAAGG---TAG---AT---AGG-G--GA--A----AT--AA----G-------TAT-ACGTCCAG--TTG--T---TG---TTGTCA----TCATC---------T-GC------TTCC-T--TAA-C---TT-ATGAAAGAGT--AACGACACTTT----GATTAT----T--TT---AAATTGTAATTC-----ATTCT-------------------------------C---C---T---A--AA------------------CTGATTATGGT-C-A-AACTT-GT---------TAA-CA-A----G-TATCAG-TAC---GATGT-----ACA------GTTGT-GCATATTATT--C-T---C---TC--TG--GAGAAGTG-TTA----T-TGAGCACTTGT-C--G-AAtgcatattgacagtctggaggtaaacctttgttccaagatcaaaacttcttt
gi|9 : t---A---TTA-TGAC-C---CTTTCATATTTAAG-A---T--T--ATTT--------GC-ATTTTATTTTCAGCCT-AT--AC----A--------TATCATGTTCATCA-TAAAT-----T--T-TC--TAC-------------T----GA---T-T--TG----GGC----CATAC---TTT---AT---AGG-G--AAATT----AT--CA----G-------TATGAATCTCAA--CTG--C----T---GTGCCC----T--TC---ATCATAT-TC------TT----------C---TCAAAG------T--TATGGCCCCTTTCAAAGTTATGCACC--TTACATAGTTTCAATTG-TATTAT--------AG--C---ACTT---C------T---C-----------------T-------T-------ACTGATTAGGGT-C-AGAATTT--------------G-CA-A----G-AG--AC-TAT---A-----------A------GTTGT-ACAAATCGTT--G-T---C---TC--TA--TAGTAA-A-CTA----C-TA-ACACTAAT-C--A------------------AAATGGCATAAGTA-CAATAAGGC---TAAATGCACA--GTGGGGGC--ATTT-TTGTGTC-G--A------------CAGTCA-TTT-TA-----AGTTTTTAAAT--actc
gi|23 : -----T--T-TCAAT---------------C----GA---T-T--AT----GGC----CAAAC---TTG---GT----AG-T--AAG-T----AT--CA----G-------TAAGAAGTTCAGGTTTG--CA--AA---TTGTCA----TC
gi|16 : attttaattgtacgtttattttgtcagcattaccagtactcaccatgaact-----T--T-TC--T---------------T----GA---C-TGATTATGGGAC-----AAA----TTG--------CAG-GCAAA--CTGGCAT--CA----G-------TACAAAGTTCAG--TTG--T---GT---ATATCA----TCATC---tatgtagtactactgttagcagtctaatatcgttaggcaaataacattgctgctataaagttacaggcacagt
gi|19 : ttaatgtaattcttgtcagcaccactctttcaaag--T---------------T----AA---C-C--TT----GAT----CACAC---TTG---TT----AG-A--AAG-T----AT--TA----G-------TAGGAAGTTCAG--GTG--T---GTATATTGTCA----TCtctagtagtactattgcttataatacaatggcatgctacaataacgctacaggcacaggggggacattaatgtcggtaggattatttctatatttttcaaattcataataatctcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|31 : --T---------------C----GA---T-T--TT----GCT----CAGAC---TTA---CC---AGG-G--AG--T----AT--CA----G-------CTTGATGTTCAG----------------TTGTCACATGTCGTT---GTCACATGTCAG-----TCTGT--TGA-C---tctgtagtagtattactgactttagtcataactcatttctcaaatggcattgctgcaatatgactacagacacaatgtgggtacttgtgtcgactggcatatttctagttctggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|6 : cag---------------T----GA---T-T--TC----GAC----CAAACCTTTTACTTTT---TAA-A--AA--T----AT--AA----GATATAAATATGAAATCAAG--TTGTTC---TT---TTAT-A----TAATC---AT---------G----TTC--T--AGA-C---AC--AGA-GGATT--GATTGCTCTGT----AGTTAT----T--TT---AAGTTATAATTC-T-------T-GTC-AG--C---ACTG---G------T----------------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGAC---------T-G-CA-A----G-TATCAG-TAT---GAAAT-----TCA------GTTGT-GTATATTGTC--G-T---C---TC--TG--TAGTGGTA-CTA----C-TG-TCACTAGT-TGAA-AATC-ATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACA--G--AGGGG--CT-T-TAATGTC-AACA--GC--------CA--CATTTTTTAA--TAAAGTTTTAAAT--ctttggttggccattaaact
gi|12 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgcttttctcaacttctcaac---------------T----GA---T-C--TT----GAC----CAAAC---AT----TT---TAGAG--AA--T----AT--CA----G-------CATGATGTCCAG--TTG--C------------------TCATC---ATCACAT-TCCA----CTCCAT--CGA-C---Tctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|24 : aacttctcaac---------------T----GA---T-T--TT----GGC----CAAAC---TCC---CT---ATG-G--AG--T----AT--CA----G-------TGTGATATCTAG--TTG--tatggcttatcctaaactattcaactgattatagtctaaacttgctagaatgtaaaagtacaaggttcagttgtgcatattgtcatctctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|29 : cagagttactgccctttagtaattttcatcctgaac---------------T----GA---T-T--TT----GAC----CAAAC---TTG---TTATTCGG-A--AA--T----AT--AT----T-------TATGAAGTAAAA--TTA--C---TC---TTATCG----TCATC---ATtgcacacaattttctttgtagtagtatttcagtcggtagacaaaactcggtaatctaatgttggttaagtaaggcaaaagtcagtggtggcatttgtgtaaa
gi|22 : agcactactcatcctaaacttctaaac---------------T----GA---T-C--TT----GGC----CAAAC---TTG---TT----GG-G--AG--T----AT--CA----G-------CATGAATTCTAG--Tgtttttaggacagagttacaaccc
gi|2 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccacctatacattacactttcttgtccaggttactactccaaaatgaattaac----GA---T-T--TT----CCC----CAAAT---ATG---AT---TAT-T--AT--T----AT--GA--------------TGAAGTCTA--------C---TT---TTG-CA----T-ATCCTGATCGTAT-GCAG----GTCTATATCTT-T---TTG----TATAGT--TATGGCCCTTT------TAATA---T--TT---TAATGTTAATTT-TGTCAC------C-AG--G---ACTA---C------T---C---C---T---A--AA-C-------TGTT--CAGCTGATTTTTAC-C-A-ATCTT-GG---------TAG-GG-A----G-TTTCGG-CATTTAAAAAT-----CCA------GTTGC-ACAAGTTGTC--
gi|32 : attagatggtatggttaatcttgtcagcatttcttcctttaaacttctcaagtgatattttgcagctcttctcttctttcagttttaaca----GA---T-T--TT----GAC----CAAAC---TTG---TA---AGG-G--AG--T----Agtttgcatttcggtctacatatttttgaagagttatggtcttcggctaatatgaattgtattcctcctaacttttgaagattttggcaaaagttttagggattatatgaagtctagttgctcttattgtcatcatggttttctccattgagctcggcagagttatgtccctgtcagcgctactcgtaaacttctcatctgtattgtcgaattttctagtaaatatcagcatgaagttcagttccacaaatcgccatatctgtatttgtaactattgtcacttgtcgaaacccattatccaaataaaaccacatgcacagagcatgtctggtaacagccacatttcctattttaattgttatatgcatgttatatacatatttaacag
gi|15 : ttaattgttaatcttttcagctttactcctaagcttcccaacaT----GAC----CAAAC---TAA---------GG-G--AG--A----AT--CA----G-------TGTAAAGTCTAG--TT-------TC---TCGT------TCATT---GT-GCAT-TCAAATCTTTGTAT--TGA-C---TTT-TGATGCAAT--TATCACCCTTT----AATTTC----A--TT---TGATGGTAAATC-T-T--TTCTGATCAAG--C----CTA---TAA----T------------------AA-T-------ATCTTACAA------ATG-----A-AACTA-GG---------TAG-GG-A----G-TATCAG-AAT---GAAGTCAAA-TAA------ATTCT-GCATATTGTC--TCT---T---TC--TG--
gi|21 : ---TTA---TT---AGG-G--AA--T----AT--AA----A-------TATGAAGT----------------------------------C---ATCACGT-TCTG----CTCCAT--TGA-T---TT-ATGGTGGAGT--GATAGCCCTTT----AATTAT----T--TA---TTATTGAAATTC-T-------T-GTC-AG--C---ATTT---T------T---C---C---T---A--AA-C-------TTCT--CAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTT-AA---------CAG-CA-A----G-TATCAG-TGT---GAAGT-----TTA------CTTGT-GCATATTGctccattgactgcatcatagtataatatggacttttaattatttatttgctggtaattaaatcttgtcatt
gi|5 : T---CAT-G--TA--T----AC--AA----G-------TATGAAGTCAAA--TTG--C---TC------CCA----TCACC---ATTATGT-TCTG----CTCCAT--TGA-C---Tacagtctggaggtaaacctttgttccaagatcaaaacttcttt
gi|26 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaata--T----AT--CA----G-------TATGAAGTTCAG--TTGGACA--TT---CTGTCA----TCACC---tgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|11 : tatattcaaactttGAAGTCCAG--TTG--C---TT---TT---A----TCAGT---GTCGGGT-TATG----CTCCAT--TCA-----TAGTTGATGGAAC--TAT-GACATTT----AACTGT----G--TC---CA-TTGTAATTC-T------CT--TT-AG--C---AC-A---T------T---C---G---C---AC-AA-T-------T-----CAAACGATTATGGT-T-A-GATTT-G----------TAATCG-A----G-TATTGA-TAT---AAAGT-----GCA------AGTGT-GCACATCGTC--G-T---C---TTGATGATTAGTAG----TA----C-TG-TCACTGTT-C--G-AAC-----------------TGACATTAATT-CAA-AAAGC---TAAAGGCACT--GTGGGAGC--A--T-TCGTGTT-GTTA--G-------G-AA--CA-TTGATAG--TTAtttgttgttgttttactgacagtagtggaaactcattgtcaaatggcaatgggggcatttgtgatgacaggcatatttatattttaaacctaaattttaacatgatttaatt
gi|8 : A----TCTTT---GTTACAT-TCTG----GTTCAT--AAA-C---TTT----TGGAGC--TATGGCCCTTT----AATTACAAA-T--TT---TA-TTGTAATTT-T-------T-GTC-AG--C---ACTT---C------T---T---C---T---G--AA-C-------TTCA--AAGCTGATTATGtcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|18 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctGAGT--TATTACCCT-T----AA--AT----T--GT---TA----TAAATCATATT-TTTT-GTC-AG--C---ACTA---C------T---C---C---T---A--CA-T-------TTTG--CAACATATTATGGT-C-A-AACAA-AC---------CAA-CC-T----G-TATCAG-TAT---G---T-----TCA------GTTGC-G-ATATTGTC--A-T---C---TC--TA--TTGTTGTA-TTA----C-TG-TCACTAGA-C--A--------TAT--------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACA--GT-GGAGC--A--T-TCCTCTT-G--A------------CA--CA-TTTCTAT--TT--TTTTT--AT--AAAAT
gi|23 : ctttgtca----T--TT---TAATTGTACGTT-TATT-TT---GTC-AG--C---ATTA---CCAGTACT---CA--C---C---ATGAA-C-------TTTT--CAATCGATTATGGC-C-A-AACTT-GG---------TAG-TA-A----G-TATCAG-TAA---GAAGT-----TCA------GGTTT-GCAAATTGTC--A-T---C---TA--TG--TAGTA----CTA----C-TG-TTAGCAGT-C--T-AAT--ATCGT--TAGGCAAATAACATTGCTG-CTATAAAGT---TACAGGCACA--GTatctgcatgat
gi|17 : a--TT---TAATTACAATTC-T--TAGTCAA--C-AA--C---ACTC---C------T---C---C---T---G--AA-T-------TTCT--CAACT-----------------TT-AT---------TAG-CA-A----G-TTTTAG-TAG---GAAGC-----TCA------GTTGT-GCATATTCTC--A-T---C---TC--TGG-TAGTAACA-GTG----C-TG-TCACTAGT------AGTCCCTCAA--TAGTCAAATGACAATGCTA-CAGTAAAGC---TGCAGGCACA--G--------------------C-A--G--GG------G-CA--CA-TTCCTAG--TTCCTTGTTAA
gi|4 : ---TAGTTATAAATCGTA--ATTCTTGTA-AG--C---AATA---C------T---C---C---T---A--AA-C-------TTCT--CGACAGATTATGGT-C-A-AACTT-GC---------TAG-GG-A----G-TATCAG-TAT---CAAGT-----TCA------GTTGC-TCATTT---C--T-T---CAATTG--TG--TAGTAG---------------------------A-AAC--CTT-T--TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACA--A-CAGGGT--A--T-TCCTGTC-A--A--CA------GTCA--CA-TTTCTAG--TTAAtgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|7 : gttgtcatgatctggtttatgaatgtttggcttaattaaatcccgtaataattaatttaaatggtaaatcttcatatgtacaatatcaaaattacttttcagctctattcctcctaaatttcactatcaattctggccggccttgtttgggaatatcattatgggattaagtcatatcatttttgtctatccatttatattgatggccctttgataatttgaatggcaaatcttttcagcacatctcttacgaaattcagttgactttgctaagggggtttctgagtaatccagttatgcatatttgcttcattgaagtttgacggagctcattaaa---TAATTTTAATTG-TGT-ATCTTA-TC-AG--C---GCTA---C------TTCTC---C---T---A--AA-T-------ATCT--CAACTGATTTTGAC-C-A-AACTT-GT---------TAG--A-G----GCTATAAG-TAT---AAATC-----CCA------GTTGT----TTTTATC--A-T---C---agagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatggggctcattcacctctcgatcgaaactgattttggtcaaatattctaagtaatgttatgtaagtaggaattcctgttgtacacgttgtcgatacgttacggtccatttttcgttgagtttgaTTTTAATTC-T--TGTT--AG---AG--CT--ACTC---C------T---C---C---T---A--AA-C-------TTCT--CAACTGACTGTGG--G-G-AATTT------------TGA-TATA----G-TA--AG-TAT---GAGGTAACGATCATGTCTGGTGGT-GGATATTGTC--A-T---C---TT--TG--TAACGGTG-CTG----C-TG-Taacacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|32 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccTAATT---GTTAATCTTTTC-AG--C---TTTA---C------T---C---C---T---A--AG-C-------TTCC--CAACAGATTTTGAC-C-A-AACTT-
gi|14 : tATCC-CATT-TTCTTGTC-AG--C---TTTA---C------T---C---TTTTC---A--A--C-------TTCT--CAATCGATTTTCAC-C-A-AACTT-GC---------TAG-GG-A----G-TATCAA-TAT---GAAGT-----CTT------GTTGgtaagggagta
gi|8 : taaatggtcaattcTTC-CATTATT---GTC-AG--C---ATTATTCC------T---C---C---T---A--AA-C-------TTTT--CTACGGATTTTGTC-C-A-AACTT-GCAAGGGTGTTTTA-CT-A----G-T-CCAGTTGT---GAA-T-----ACT------GCTGT-GCGTTACATCAGT-TA--T---TC--TG--TAG-A--G-TTA------TG-TCACTctgaaatcatcctcattttttagtctatcagcttttagtgtagatattttagttcaggttattttaaatgcagaatatatgtgcatgtgtctgacacacatattactgaatatctgtataaagtccagttgctgttattgttgtactccatcaacttttagtggcgttacagccctttactttgttttat
gi|28 : ggcccTTATT---GTC-AG--C---ACTATC-C------T---C---T---T---A--AC-T-------TT-T--CAACCGATTTTGGC-A-A-AACAT-AC---------TAtggagaaatttaatttcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|16 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgatgcgtacatctatagatcacactATTCTTGTC-AG--C---ACCA---C------T---C---TTT-C---A--AAGT-------TTCT--TGACTGATTATGGGAC-A-AA-TT-GC---------AGG-CA-AACTGG-CATCAG-TAC---AAAGT-----TCA------GTTGT-GTATATCATC--A-T---C---TC------TAGTAGTA-CTA----T-TG-C-------------------TTA---TAATACAATGGCA-TGCTA-CAATAACGC---TACAGGCACA--G-GGGGGAC-A--T-TAATGTC-G--G--TA------G-GAT-TA-TTTCTA----TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCgtttat
gi|22 : ttaatgtaTTCTTGTCCAGGTT---ACTA---C------T---C---C---A---A--AA-T-------GAAT--TAACTGATCTTGGC-C-A-AACTT-GT---------TGG--G-A----G-TATCAG-CAT---GAATT-----CTA------GTtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|27 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccacctatacattacactTTCTTGCC-AG--CTTAACTC---C------T---C---C---T---A--AA-C-------TTCT--CAACAGATTTCGGC-C-A-AACTT-TC---------TAG-AG-A----G-T
gi|2 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggcactGTC-AG--C---GCTA---C------T---C---G---T---A--AA-C-------TTCT--CATCTG--TATTGT-C-G-AATTT-TC---------TAG-TA-A----A-TATCAG-CAT---GAAGT-----TCA------GTTCC-ACAAATCGCC--A-T---A---TC--TG--TATTTGTAACTA----T-TG-TCACTTGT-C--G-AAA--CCCAT--TATCCAAAT---------------AAAAC---CACATGCACA--G--AGCAT--G--TCTGGTAAC-A-----GC--------CA--CA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--aacatgttatcgactcttatatca
gi|29 : attagatggtatggttaatcttgtcagcatttcttcctttaaacttctcaagtgatattttgcagctcttctcttctttcagttttaacagattttccccaaatatgattattattatgatgaagtctacttttgcatatcctgatcgtatgcaggtctatatctttttgtatagttatggcccttttaatattttaatgttaattttgtcaccaggactactcctaaactgttcagctgatttttaccaatcttggtagggagtttcggcatttaaaaatccagttgcacaagttgtcgtttgcatttcggtctacatatttttgaagagttatggtcttcggctaatatgaattgtattcctcctaacttttgaagattttggcaaaagttttagggattatatgaagtctagttgctcttattgtcatcatggttttctccattgagctcggcagagttatgtccct-AG--C---ACTA---C------T---CATCC---T---A--AA-C-------TTCT--AAACTGATTTTGAC-C-A-AACTT-GT---------TAgcatgttatatacatatttaacag
gi|12 : ------T---C---C---T---A--AA-C-------TATT--CAACTGATTATAGT-CTA-AACTT-GC---------TAG-AA-T----G-TAAAAG-TAC---AAGGT-----TCA------GTTGT-GCATATTGTC--A-T---C---TC--TG--TAGTAGTA-CTA----C-TG-TCAC------------T--GCTAT--TAGTCAACTAGTATTGCTA-CAATAATGC---TGCTGGCAAA--GTCACT-------T-CAAT----A--G--GC------A-CA--CA-TCTttcggaaatatatttatgaagtaaaattactcttatcgtcatcatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|25 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggctta---C---C---C---A--AA-TCATCTCTTTCT--CGACTGACTATCAT-C-A-AA----------------GA--A-A----G-C-------------AAGT-----TCG------GAT-----ATATTATC--T-T---C---TC--TG--TATAAGTA-CAA----C-TG-TCACCAGTAG--A-AAT---TCAT--TAGTCTGATAGCATTGCTA-CACT--TGC---TACAAGCACAATGCTGGC----A--T-TATTCTCAA--A--AT------A-TA--CA-TTTCTAA--aggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|24 : -------TCCT--GAACTGATTTTGGC-C-A-AACTC-CC---------TAT-GG-A----G-TATCAG-TGT---GATAT-----CTA------GTTGT-GCACACAATT--T-T---C---TT--TG--TAGTAGTA-TTT----C-AG-TCGGTAGA-C--A-AAA--CTCGG--TAATCTAATG---TTGGTT-AAGTAAGGC---
gi|31 : cagagttactgccctttagtaattttca--CAGTCGATTTTGCT-C-A-GACTT-AC---------CAG-GG-A----G-TATCAG-CTT---GATGT-----TCA------GTTGTCACATGTCGTaaaagtcagtggtggcatttgtgtaaa
gi|26 : TATATT-C-A-AACTT------------T-------------TATCAG-TAT---GAAGT-----TCA------GTTGG-ACATTCTGTC--A-TCACC---TT--TG--TTGTTGTT-TTA----C-TG-ACAGTAGT-G--G-AAA--CTCAT--T-GTCAAATGGCAATGtgtcacatgtcagtctgttgacctttggttggccattaaact
gi|19 : TGAT-C-A-CACTT-GT---------TAG-AA-A----G-TATTAG-TAG---GAAGT-----TCA------GGTGT-GTATATTGTC--A-T---C---TC--TG--TAGTAGTA-TTA----C-TG-ACTTTAGT-C--ATAAC---TCAT--TTCTCAAATGGCATTGCTG-CAATATGAC---TACAGACACA--AT--GTGGGTA--C-TTGTGTC-G--ACTG-------G-CA--TA-TTTCTAG--TTggggcatttgtgatgacaggcatatttatattttaaacctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttaacct-C-A-AACTT-AC---------TAG-AA-A----G-T---AG---C---GAAGT-----TTA------ATTTT-GCATctggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|10 : ttcac-CA-T----G-TATCAG-TTT---GAAGA-----TAA------GTTGT-------TGTC--A----------C--TG--TAGT------TA----CATT-TCACATGT-C--A-AAT--TTCAT--TAATCAAATAGCGTTGTCA-CAATAAGGC---TACAAGGACA---TT----------T-TGGCATC-G--T--GCCCACATG-CA--CA-TTTCTatctgcgtgcttacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|33 : aagtccatttgctcttgacattatcatgttctagtccattgacatttgttgaacttacagtccattttcaattataattgtttaagcacacagtctttgcttgg--TAGTAGTA-TT-----C-TG-TCACAAGA-A--A-AAA--TTTAT--TAGTCAGATGGCATTG-TA-CAATAAGGC---tgtttcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTGCCATTGTGTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCATACGCAGGAATACCACTTTCTTGTTTAGAATAGTACTTCTGAAAACCTTATCAACCGATTATGACAAAACATG
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 11 1 1 1 55555555555555555555 1 11111 111111111 1111 44444444444444444444444444444 3333333333333333333333 1111 111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111111111111 33333333333333333333333 333333333333333 1111111111111 55555555555 11111111111111111111111111111111111 111111111 33333333333 11 1
lowQualScore : 2 2 5 5 2 66 6 0 11 2 3 2 33333333333333333333 0 77777 0 6666 1 888 444444444 0000 555 9999 999999 5 2 1 2 66666666666666666666666666666 3 0000000000000000000000 3 666 1 6 77 3 888 3 2 55 2 2222 44 8 000000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 33 44 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 2 777 2 6666 2 444 88888 66 33 222222222222222222 333 2 00000000000000000000000 1 2 2 111111111111111 33 33 66666666 3333333333333 33 4444 2 2 00000000000 333 1 77777777777777777777777777777777777 1 1 1 0 1 66 1 1 22 333 44 3333 22 44444 777777 222 0 44444 22 44 1 44 44444 1 0 1 1 44 55555 1 5555 0 333 666666666 2 666666 55 11111111111 33 2 2 11 33 99 1 3
lowQualScore : . . . . . .. . . .. . . . .................... . ..... . .... . ... ......... .... ... .... ...... . . . . ............................. . ...................... . ... . . .. . ... . . .. . .... .. . ...... ........................................................................................................................ . .. .. .............................................................................................................................................................................................................. .... . ... . .... . ... ..... .. .. .................. ... . ....................... . . . ............... .. .. ........ ............. .. .... . . ........... ... . ................................... . . . . . .. . . .. ... .. .... .. ..... ...... ... . ..... .. .. . .. ..... . . . . .. ..... . .... . ... ......... . ...... .. ........... .. . . .. .. .. . .
lowQualScore : 5 5 5 5 5 00 0 7 77 3 3 0 77777777777777777777 0 11111 1 4444 4 555 777777777 6666 000 3333 444444 9 9 0 0 44444444444444444444444444444 7 5555555555555555555555 6 444 2 4 66 6 444 6 8 00 0 4444 33 0 111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 88 66 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 7777 9 999 7 1111 9 777 55555 33 44 666666666666666666 999 9 77777777777777777777777 9 1 5 666666666666666 22 44 66666666 8888888888888 22 7777 4 5 00000000000 999 0 44444444444444444444444444444444444 2 6 1 4 7 66 8 8 33 222 11 9999 44 22222 777777 999 4 33333 66 33 8 33 11111 8 8 9 5 88 33333 5 9999 5 999 444444444 5 888888 77 11111111111 77 7 7 00 55 22 0 3
consensus : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG---ACC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TNTCTTGTC---AG--C---A--CTA---CT---CCTAAA---CTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAGTATC---AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT----GTT--C-CG---GTCCATCGA-CT-TTTGGCGTAGTT-ATGNCCCTT--TGATT---A-AT-TT-AA-TNGTAAA----TC-------------AT---CTGTA-----TCA-CACT--TTCT-GTCC-GCTC-TACNCCT------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCAG-A--T--GA--T--GAAGTCCA--GTTG--C--N--------CATA--GTCGTC----G---C---G--TTCCGGTC--C----ATCGAC-TT-TC---G-TGNAGTTATGGCCCTTT------GATT--A-----TTT--AAT-G-TA-AATCT-TGTATTT-CAGC--A--C--CTC----------TC---------T----TG----AT-T---TTGAC----CA-AAC---TTG---TTA-GGGAA--TAT--A--A----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-C---T-CGT-GACG--GAGT--TACGGCCCTTT----AA--TTAT-------------T--T----TTAA-TTGTAATTC-T-TTATT-T-GTCAGC---ACTAC--------------T--------C---C---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CTA---GCGA----G--TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGCGCA---TATCGT-----CATCTC--TG--TA-GTAGT--ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACTCAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-GG-CA--T---TCGTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( family-525 ) : ATTTGAAGCCAAGTTGCATAATATGGTTATCGANTTTTGGTNCAATT-AATCTTG---ACC-TTTATCG-TTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TNTCTTGTC---AG--C---A--CTA---CT---CCTAAA---CTTC-----TCAACCGATTTTGGCCAAACTTGNTAGGGAGTATC---AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT----GTT--C-TG---GTCCATCGA-CT-TTTGGCGNAGTT-ATGGCCCTT--TGATT---A-AT-TT-GA-TNGTAAA----TC-------------AT---CTGTA-----TCA-CACT--TTCT-GTCC-GCTC-TACNCCT------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCAG-A--T--GAG-T--GAAGTCCA--GTTG--C--G--------CATA--GTCATC----G---C---G--TTCTGGTC--C----ATTGAC-TT-TN---G-TGNAGTTATGGCCCTTT------GATT--A-----TTT--AAT-G-TA-AATCT-TGTATTTACANC--A--C--CTT----------TC---------T----TG----AT-T---TTGAC----CA-AAC---TTG---TTN-GGGAA--TAT--C--A----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCGTCACGTTCTGCTCCATCGA-C---T-CGN-GATG--GAGT--TACGGCCCTTT----AA--TTAT-------------T--T----TTAA-TTGTAATTC-T-TTATTCT-GTCAGC---ACTAC--------------T--------C---C---T---AAACTTCTCAACTGATTNTGGC-C-A-AACTTG-CTA---GCGA----G--TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGT-----CATCTC--TG--TA-GTAGT--ACTA----CTG-TCACTAG-TCAAANCTCAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-NG-CA--T---TNGTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
gi|1 : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATGGTTATTGCATTCTGATCCAATCGAATTTTG---ACCATTTATCAATTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TGTTTTATC---AC--C---A--CTA---CA---ACTGAA---CTTT-----TCAATCGATTTTTGCCAAATTTGCTAAGGAATATC---AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTT---GT----GTT--C-TG---GTCCATCGA-CT-ATTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGATT---GGAT-TT-GA-GGGTAAA----TC-------------AT---CTGTA-----TCA-CACT--TTCTAGTCC-GCTC-TACCCCT------C-------TT------A----------A------CT--------G---ATTTTAGCCAAATTTGCTAGGGAG--GATCAG-AA-T--GAGGT--GAAGTCTA--GTTG--T--G--------TATAAAGTCATC----G---T---G--TTCTGGTC--C----ATTGACCTT-TT---G-TGTAATTATGGCCCTTT------AATT--A-----TTTGCAAT-GGTA-AATCTATGTATTTACATC--A--CG-CTT----------TC---------T----TG----AT-T---TTGAC----CA-AAC---TTG---TTC-AGGAA--TAT--A--A----G-------TATG---AAGTTCAGTTG-CTT---TTGTCATCATCATCACATTCAGTTCCGTCGA-C---T-CGAAGATG--GAAT--TATTGCCCTGT----AG--TTAT-------------T--T----TTAA-TTGTAATTC-TATTATTCTAGTCAGC---ACTAC--------------T--------C---C---C---AAATTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTA-CTA---ACAA----G--TGTCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TTTTGT-----CTTCTC--TG--TA-GTAGT--GTTA----CTG-TCACTAG-TCAAATGTTAT-----TAGTCAAATGACATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGTT-A-G-TG-AA--T---TAGTATC--A--A--GC-GCA--CA-TTT-CTA-ATTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|10 : ---AAGTCCATTTG-CTC---TTGACATTA---TCATGTTCTAGTCCATTGA-C---A-TTT-GTTG--AACT--TACAGTCC-------------AT-------------T--T----TCAA-TTATAATTG-T-TTA--------AGC---AC------------------------------------------------ACAGTCTTTG---------CTTG-------GCAT----G--TATCAGTTTGAAGA-----TAA------GTTG---------TTGT-----CA---C--TG--TA-GT--T--AC-A----TT--TCACATG-TCAAATTTCAT-----TAATCAAATAGCGTTGTC-ACAATAAGGC---TACAAGGACAT-T-T-T-GG-CA------TCGTGCCCAC--A--T--GCA--CA-TTT-CTT-GTT
gi|11 : G---AAGTCCAGTTG-CTT---TT---ATCAGTGTCGGGTTATGCTCCATTCA-----T-AGTTGATG--GAAC--TATGACA-TTT----AA--CTGT-------------G--T----CCA--TTGTAATTC-T-CT-------TTAGC---AC-AT--------------T--------C---G---C---ACAATTC--AAACGATTATGGT-T-A-GATTTG-TAA---TCGA----G--TATTGATATAAAGT-----GCA------AGTGTGCA---CATCGT-----CGTCTTGATG---A-TTAGT--AGTA----CTG-TCACTGT-TCGAAC------------------TGACATTAAT-TCAA-AAAGC---TAAAGGCACTG-TGG-G-AG-CA--T---TCGTGTT--GTTA--G--GAA--CA-TTG-ATA-GTTAtcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|12 : CTT------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATCTTGACCAAACATTTTAGAGAA--TATCAGCA--T--GA--T-----GTCCA--GTTG--C--T--------CA-----TCATC----A---C---A--TTCCACTC--C----ATCGAC----------------TTATGGC-------------TT--A-----TCC--------TA-AAC-----TATT--CAAC-------------------------------------TG----AT-TA--TAGTC----TA-AAC---TTG---CTA---GAA--TGTAAA--A----G-------TACA---AGGTTCAGTTG-TGCATATTGTCATCtcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|12 : aa----TG----AT-C---TTGAC----CA-AAC---ATT---TTA-GAGAA--TAT--C--A----G-------CATG---ATGTCCAGTTG-C-----------TCATCATCACATTCCACTCCATCGA-C---T-tctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|12 : aacttctcaac--------------T--------C---C---T---AAACTATTCAACTGATTATAGT-CTA-AACTTG-CTA---GAAT----G--TAAAAGTACAAGGT-----TCA------GTTGTGCA---TATTGT-----CATCTC--TG--TA-GTAGT--ACTA----CTG-TCACT--------GCT-AT-----TAGTCAACTAGTATTGCT-ACAATAATGC---TGCTGGCAAAG-T--------CA--C---T----TC--AATA--G--GCA--CA-CAT-CTA-GGTAtatggcttatcctaaactattcaactgattatagtctaaacttgctagaatgtaaaagtacaaggttcagttgtgcatattgtcatctctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|13 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggctta---G-TGGAGTTGTGGATCTTT------CATA--A-----TTT--TAT----------T-TGTATTTTCAGT--A--C--TTC----------TCAGAAACTTAC----TG----AT-T---TAGAC----CA-AGG---TAG---ATA-GGGGA--AAT--A--A----G-------TAT----ACGTCCAGTTG-TTG---TTGTCATCATC---------TGCTTCCTTAA-C---T-TAT-GAAA--GAGT--AACGACACTTT----GA--TTAT-------------T--T----TAAA-TTGTAATTC-----ATT----------------C--------------T--------C---C---T---A--------AACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-TTA---ACAA----G--TATCAGTACGATGT-----ACA------GTTGTGCA---TATTAT-----TCTCTC--TG--GA-GAAGT--GTTA----TTGAGCACTTG-TCGAAACTCttcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|14 : tctttttataaA-TGGTCAA----T---------------T---C---A-----TCC-CATT--TTCTTGTCA-GCTT-TACTCTT------T-------TC------A----------A------CTTCTCAATCG---ATTTTCACCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA--A--T----A-T--GAAGTCTT--GTTG--CTGA--------AATC--ATCCTC----A---T---T--TTTTAGTC--T----ATCAGCTTT-TA---G-TGTAGATAT-----TTTAGTTCAGGTT--A-----TTTTAAAT-G-CAGAA----TATATGTGCA---------------------------------------TG----TG-T---CTGA-----CA-CAC---ATA---TTA-CTGAA--TAT--C--T----G-------TATA---AAGTCCAGTTG-C------TGTTAT--------TGTTGTACTCCATCAA-C---T-TTT-AGTG--GCGT--TACAGCCCTTT----AC--TTTG-------------T--T----TTA
gi|15 : taaTGACCAAACTA---AGGGAG--AATCAG----T--G---T--AAAGTCTA--GTTT--C--T--------CGT----TCATT----G---T---GCATTCAAATC--TTTGTATTGAC-TT-TT---GATGCAATTATCACCCTTT------AATTTCA-----TTT--GATGG-TA-AATCT-T---TTCTGATC--AAGC--CTA----------TA---------A----TA----ATAT---CTTACAAATGA-AAC---TAG---GTA-GGGAG--TAT--C--A----G-------AATG---AAGTCAAATAA-ATT---CTG-CAT-ATTGTCTCTTTCTGCTCCATTGA-C---TGCAT-CATA--GTATAATATGGACTTTT----AA--TTAT-------------TTAT----TTGC-TGGTAATTt
gi|16 : ----TTAA-T-GTAATTC-T-T-------GTCAGC---ACCAC--------------T--------C---T---TTCAAAGTTTCTTGACTGATTATGGGAC-A-AA-TTG-CAG---GCAAACTGG--CATCAGTACAAAGT-----TCA------GTTGTGTA---TATCAT-----CATCTC------TA-GTAGT--ACTA----TTG---------------CTTA------TAATACAATGGCA-TGCT-ACAATAACGC---TACAGGCACAG-G-G-G-GGACA--T---TAATGTC--GGTA--G--GAT--TA-TTT-CTA---TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCaaatcttgtcatt
gi|17 : --T----TTAA-TTACAATTC-T-T-AGTCA-A-CAAC---ACTCC--------------T--------C---C---T---GAATTTCTCAACT-----------------TTA-TTA---GCAA----G--TTTTAGTAGGAAGC-----TCA------GTTGTGCA---TATTCT-----CATCTC--TGG-TA-GTAAC--AGTG----CTG-TCACTAG-TAGTCCCTCAA-----TAGTCAAATGACAATGCT-ACAGTAAAGC---TGCAGGCACA---------G-CA---------------G--G--G--GCA--CA-TTC-CTA-GTTCCTTGTTAAtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|18 : --GAGT--TATTACCCTTA----AA--TTGT-------------T--A----TAAA-TCATA-------TT-TTTT-GTCAGC---ACTAC--------------T--------C---C---T---ACATTTTGCAACATATTATGGT-C-A-AACAAA-CCA---ACCT----G--TATCAGTAT---GT-----TCA------GTTGCG-A---TATTGT-----CATCTC--TA--TT-GTTGT--ATTA----CTG-TCACTAG-ACA-----TAT-----------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACAG-T-G-G-AG-CA--T---TCCTCTT--G--A------CA--CA-TTT-CTA-TTT--TTTTT--AT--AAAAT-tgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|19 : ctttgtcaTGAT-C-A-CACTTG-TTA---GAAA----G--TATTAGTAGGAAGT-----TCA------GGTGTGTA---TATTGT-----CATCTC--TG--TA-GTAGT--ATTA----CTG-ACTTTAG-TCATAACTCAT-----TTCTCAAATGGCATTGCT-GCAATATGAC---TACAGACACAA-T-GTG-GG-TA--C---TTGTGTC--G--ACTG--GCA--TA-TTT-CTA-GTTtctgcatgat
gi|2 : ttaacctTGGTATGGTT-AATCTTGTCAGCA-TTTCTTC-CTTT--------AAACTT-C---TCAAGTGATATTTTG-C---AG--C---T--CTT---CT---CTT------CTTTCAGTTTTAACAGATTTTCCCCAAATATGAT------TATT---ATTA------T---GATGAAGTCTACTTTTGCATATCCTGATC---GT----ATG--C-AG---GTCTAT--ATCT-TTTTGTATAGTT-ATGGCCCTT--TTAAT---A-TT-TT-AA-T-GTTAA----T---------------T---TTGT----------CAC----------CA-GGAC-TACTCCTAAACTGT-------TC------A----------G------CT--------G---ATTTTTACCAATCTTGGTAGGGAG--TTTCGGCA--TTTAA------AAATCCA--GTTG--C--A--------CA-A--GTTGTCGTTTG---C---A--TTTCGGTCTAC----AT--AT-TT-TT---G-AAGAGTTATGG-TCTTC------GG-----------CT--AAT-A-TG-AA--T-TGTATTC-CTCCTAA--C--TTT----------TG---------A----AG----AT-T---TTGGC----AA-AAG---TT----TTA-GGGAT--TA-------------------TATG---AAGTCTAGTTG-CTC---TTATTGTCATCAT--GGTTTT-CTCCATTGAGC---T-CGG-CA----GAGT--TATGTCCCTctggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|2 : attagaG--T---A--TTC---CT---CCTAA----CTTT-----TGAA--GATTTTGGCAAAAGTT-TTAGGGATTATATGAAGTC------TA--G-----------TTGCTCTTATT---GTC---ATCATGGTT--T-TC----TCCATTGAGCT-C--GGCAGAGTT-ATGTCCCT-----GTC---A-GCGCT-AC-TCGTAAACTTCTC-------------AT---CTGTATTG--TCG-AATT--TTCT-gtcagcgctactcgtaaacttctcatctgtattgtcgaattttctagtaaatatcagcatgaagttcagttccacaaatcgccatatctgtatttgtaactattgtcacttgtcgaaacccattatccaaataaaaccacatgcacagagcatgtctggtaacagccacatttcctattttaattgttatatgcatgttatatacatatttaacag
gi|2 : attagatggtatggttaatcttgtcagcatttcttcctttaaacttctcaagtgatattttgcagctcttctcttctttcagttttaacagattttccccaaatatgattattattatgatgaagtctacttttgcatatcctgatcgtatgcaggtctatatctttttgtatagttatggcccttttaatattttaatgttaattttgtcaccaggactactcctaaactgttcagctgatttttaccaatcttggtagggagtttcggcatttaaaaatccagttgcacaagttgtcgtttgcatttcggtctacatatttttgaagagttatggtcttcggctaatatgaattCT-GTCAGC---GCTAC--------------T--------C---G---T---AAACTTCTCATCTG--TATTGT-C-G-AATTTT-CTA---GTAA----A--TATCAGCATGAAGT-----TCA------GTTCCACA---AATCGC-----CATATC--TG--TA-TTTGTA-ACTA----TTG-TCACTTG-TCGAAACCCAT-----TATCCA---------------AATAAAAC---CACATGCACA------G-AG-CA--TGTCTGGTAAC-----A--G--CCA--CA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--GCAagtaaatatcagcatgaagttcagttccacaaatcgccatatctgtatttgtaactattgtcacttgtcgaaacccattatccaaataaaaccacatgcacagagcatgtctggtaacagccacatttcctattttaattgttatatgcatgttatatacatatttaacag
gi|20 : attagatggtatggttaatcttgtcagcatttcttcctttaaacttctcaagtgatattttgcagctcttctcttctttcagttttaacagattttccccaaatatgattattattatgatgaagtctacttttgcatatcctgatcgtatgcaggtctatatctttttgtatagttatggcccttttaatattttaatgttaattttgtcaccaggactactcctaaactgttcagctgatttttaccaatcttggtagggagtttcggcatttaaaaatccagttgcacaagttgtcgtttgcatttcggtctacatatttttgaagagttatggtcttcggctaatatgaattgtattcctcctaacttttgaagattttggcaaaagttttagggattatatgaagtctagttgctcttattgtcatcatggttttctccattgagctcggcagagttatgtcc---AAATTTATTAACTGAATTTAGG-C-T-AATTTG-CAA---GCGA----G--TATCATT-TGAAGC-----CAA------GTTGCATA---TATTATTGTCGCATTCC--TATCTA-TTGATGAACT------TT-TCAATGG-T-AAATCTCAT-----CAGTtgttatatacatatttaacag
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATTATTGTCGCATTCCTATCTA-TT-GAT---G---AAC-TTT-TC-------AATG-GTAAATCT--------CAT----------C---AG--T---A--TTA---CT---CCTAA------CC-----TCA-----------TCAAACTTGGTATGGAGTATC---GGTA------T---GAAACCTGT---TTGAGCTTACC---ATC---ATTT--GTT--C-TG---GTTCATTGA-TG-TTTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGTTT---attactcctaacctcatcaaacttggtatggagtatcggtatgaaacctgtttgagcttaccatcatttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|21 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatc---TTA---TTA-GGGAA--TAT--A--A----A-------TATG---AAGTC------------------------ATCACGTTCTGCTCCATTGA-T---T-TAT-GGTG--GAGT--GATAGCCCTTT----AA--TTAT-------------T--T----ATTA-TTGAAATTC-T-T-------GTCAGC---ATTTT--------------T--------C---C---T---AAACTTCTCAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTTA-ACA---GCAA----G--TATCAGTGTGAAGT-----TTA------CTTGTGCA---TATTGA-----CA-GTC--TG--GAGGTAA---ACCT----TTG-TTCCAAGATCAAAACT
gi|22 : ---TTACAC--TTTCTTGTCC--AGGTT---A--CTA---CT---CCAAAA---TGAA-----TTAACTGATCTTGGCCAAACTTGTT-GGGAGTATC---AGCA------T---G-----------tcttt
gi|22 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccacctataca----TG----AT-C---TTGGC----CA-AAC---TTG---TT--GGGAG--TAT--C--A----G-------CATG---AATTCTAGTaattctagt
gi|23 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccacctatacattacactttcttgtccaggttactactccaaaatgaattaac-------------T--T----TTAA-TTGTA---CGT-TTATTTT-GTCAGC---ATTAC--------------CAGTACTCAC---CA--T---GAACTTTTCAATCGATTATGGC-C-A-AACTTG-GTA---GTAA----G--TATCAGTAAGAAGT-----TCA------GGTTTGCA---AATTGT-----CATCTA--T------GTAGT--ACTA----CTG-TTAGCAG-TCTAATATCGT-----TAGGCAAATAACATTGCT-GCTATAAAGT---TACAGGCACAG-T-
gi|24 : aTCCTGAACTGATTTTGGC-C-A-AACTCC-CTA---TGGA----G--TATCAGTGTGATAT-----CTA------GTTGTGCA---CACAAT-----TTTCTT--TG--TA-GTAGT--ATTT----CAG-TCGGTAG-ACAAAACTCGG-----TAATCTAATG---TTGGT-TAAGTAAGGC---AAAAGT--CAG-T-G-GTGG-CA--T---TTGTGT
gi|25 : cagagttactgccctttagtaattttcaAAGT-----TCG------GAT----A---TATTAT-----CTTCTC--TG--TA-TAAGT--ACAA----CTG-TCACCAG-TAGAAATTCAT-----TAGTCTGATAGCATTGCT-ACACT--TGC---TACAAGCACAA-T-GCT-GG-CA--T---TATTCTC--A--A--AATATA--CA-TTT-CTA-aaa
gi|26 : cccaaatcatctctttctcgactgactatcatcaaagaaagc--TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGGACATTCTGTCAT-----CACCTT--TG--TT-GTTGT--TTTA----CTG-ACAGTAG-TGGAAACTCAT-----T-GTCAAATGGCAATG------------------------------G-G-GG-CA--T---TTGTGAT--GACA--G--GCA--TA-TTT-ATA-------TTTTAAAa
gi|27 : tatattcaaactttC-C-A-AACTTA-CTA---GAAA----G--TAGC-----GAAGT-----TTA------ATTTTGCA---TATCcctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttcaCAC--TTTCTTGCC---AG--CTTAA--CTC---CT---CCTAAA---CTTC-----TCAACAGATTTCGGCCAAACTTTCTAGAGAGTAAC------A------T---G-----------TTATtgcgtgcttacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|28 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggATGCGTACATCTATAGATCACAC--TTTATTGTC---AG--C---A--CTATC-CT---CTTAA----CTTT-----TCAACCGATTTTGGCAAAACATACTAGcgactcttatatca
gi|29 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgAGC---ACTAC--------------T--------CATCC---T---AAACTTCTAAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TTATTCGGAA----A--TATATTTATGAAGT-----AAA------ATTACTCT---TATCGT-----CATCtttat
gi|3 : -----------TTGGGCATATC---ATTATTGT----GCT--C-CA---GTGTATTGA-CT-TTTGGTGCAGTTTATTGCCCTT--TCATT---A-TT-TTTAA-TTGTAAA----TC------------------TTGT-------CAGCACT--TC----TCC----T-TAAACTT------T-------TA------A----------A------CT--------G---GTTTTGACCAAACTCATTAGGAAG--TTTCAG----T--A---T--GAAGTTCC--GTTG--T--T--------TATATCGCCAGT----G---C---A--TTCTTGAC--T----ATTGA---T-TGAAGG-TGCAGTTACTGATCTT--------ACC--AA----TTT--AAT----A-ATTCT---------CAAC-------------------------------------TG----AT-T---T-GAT----AA-AAT---TT-----TA-CGGAA--TAT--A--AACTGG-------TGTA---ATATTAAGTTT-CTC---TTATCATTATCA-CA-GTT-TGCTCCATCAA-C---T-TGAAGGCA--GAGT--TACAGCCCTTG----AA--TTAT-------------T--T----TTAG-TTGTAATT------ATTCTTGTCAGTTTTACTTC--------------T--------C---C---TGTAAAACTTCTCAACTGATTATTGT-C-A-AACTTG-CTA---GCAA----G--TATTGGTACAAAAA-----TCA------GT---------TATTGT-----CAGCTC--TG--TA-GTAGT--ACCACTGTCTG-TCAATAG-TCAAAACTCAG-----TAGTGGAATTGCATTGAT-GCAA-AAGGC---TACAGCCACAG-TGG-G-CA-CA--T---TCTTGTC--GACA--G--GCA--CA-TTT-TTA-TTTTATTTTatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|30 : tCAC--TTTCTTGTTTAGAA--T---A--GTA---CT---TCTGAAAACCTTA-----TCAACCGATTATGACAAAACATGgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|31 : tgtgccattgtgtgtccgtctgtccatctgtccatacgcaggaatacC------A----------G------TC--------G---ATTTTGCTCAGACTTACCAGGGAG--TATCAG-C--T------T--GATGTTCA--GTTGT-C--A--------CATGTCGTTGTC----A---C---A--TGTCAGTC--T----GTTGAC-CT-TT---G-----GT--TGGCCATT
gi|32 : TCTTTTC---AG--C---T--TTA---CT---CCTAAG---CTTC-----CCAACAGATTTTGACCAAACTTGTAAGGGAGTAaaact
gi|33 : ttaattgttaa--TA-GTAGT--ATT-----CTG-TCACAAG-AAAAAATTTAT-----TAGTCAGATGGCATTG-T-ACAATAAGGC---
gi|4 : TT---GTC---AT----GAT--C-TG---GTTTATGAA-TG-TTTGGCTTAATT-AAATCCCGTAATAATT---A-AT-TT-AAATGGTAAA----TCTTC----------AT---ATGTACAATATCA-AAAT--TACT-TTTCAGCTC-TATTCCT------C-------CT------A----------AATTTCACT--------ATCAATTCTGGCCGGCCTTGTTTGGGAA--TATCATTA--T--GGGAT--TAAGTC-----------------------ATA---TCAT----------------TTTTG-TC--T----ATCCAT-TTATA---T-TG-----ATGGCCCTTT------GATA--A-----TTTG-AAT-GGCA-AATCT-T----TT-CAGC--A--C--ATC----------TC---------T----TACGAAAT-TCAGTTGAC----T--------TTG---CTAAGGGGG--TTT--CTGA----G-------TA-------ATCCAGTTA--------TG----------CATATT-TGCTTCATTGA-A---G-TTT-GACG--GAG--------CTCATT----AA--ATAG-------------T--T----ATAAATCGTAATTC-T-T-------GTAAGC---AATAC--------------T--------C---C---T---AAACTTCTCGACAGATTATGGT-C-A-AACTTG-CTA---GGGA----G--TATCAGTATCAAGT-----TCA------GTTGCTCA---TTTCTT-----CAATTG--TG--TA-GTAG-------------------------AAACCTT-T-----TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACAA-C-A-G-GG-TA--T---TCCTGTC--AACA--G--TCA--CA-TTT-CTA-GTTAA
gi|5 : gATTT-T---TTA-GT--AATTTTGTC---AG--A---A--CTA---CT---CCTAAA---ATTT-----GCAACAGATATTGGTCAAAA-TGTTGAGAAATTTC---AGTAAGGTCCT---G-----------TTGAACATA-----------GT----GT-----CA---ATGCATTGA-TT-TTTAGTGACGTT-ATGGATCTT--TGATA---A-TT-TT-AA-TTGTAAA----T--------------ATTGACGGCG-----TTA----T--TTCT--------CC-TAAACTT------C-------TC------A----------A------CT--------G---A-TTTGGCCAAA-----TA---AG--TATT-----------------AAGTCCA--ATTGGTC--C--------TGTC--ACCATC----A---T---G--TTCTTCTC--C----ATTGAC-TT-agagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttA--TAC--A--A----G-------TATG---AAGTCAAATTG-CTC---C---CATCACCATTATGTTCTGCTCCATTGA-C---T-TAT---TGCTGAGT--TAatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttatATGTTCTGCTCTATTGA-C---T-AAT-GACA--GAGT--TACATCCCTTT-----------------------------------------TAATTC-T-T-------GTTAGA---GCTAC--------------T--------C---CTCCT---AAACTTCTCAACTGACTGTGGG-G-A-ATTTTG-ATA-----TA----G--TA--AGTATGAGGTAACGATCATGTCTGGTGGTGGA---TATTGT-----CATCTT--TG--TA-ACGGT--GCTG----CTG-Tacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|6 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgTCTTATT---AGT-C---ATGCT----TT---TCTCAA---CTTC-----TCAACTGATTTCGACCAAACCTTTTA
gi|6 : ttttataattgtcattataag----TG----AT-T---TCGAC----CA-AACCTTTTACTTTTT-AAAAA--TAT--A--A----GATATAAATATG---AAATCAAGTTG-TTC---TT-TTAT-ATAATCATGTTCTA-------GA-C---A-C-A-GA-G--GATT--GATTGCTCTGT----AG--TTAT-------------T--T----TAAG-TTATAATTC-T-T-------GTCAGC---ACTGG--------------T---------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGACT----GCAA----G--TATCAGTATGAAAT-----TCA------GTTGTGTA---TATTGT-----CGTCTC--TG--TA-GTGGT--ACTA----CTG-TCACTAG-TTGAAAATCATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACAG-A-G-G-GG-CT--T---TAATGTC--AACA--G--CCA--CATTTT-TTA-ATAAAGTTTTAAAT--ctttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgcttttctcaacttctcaacTCTTATT---AG--CTCTG--CTA---CT---CCAAAA---CGTG-----TCCATCGATATTAATCAAAAGTGTTAAGGAGTATT---AGTA------T---GAAGTTTAT---TCATGCATAACT--GTC---GT----GGTAACACG---GTCTTCTGA-CT-TCTGctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : tat-GCTCATTCACCT------C-------TCGATCGAA----------A------CT--------G---ATTTTGGTCAAATATTCTAAGTAA--TGTTAT-G--T--AAG-TAGGAATTCCT--GTTG--T--A--------CAC---GTTGTC----GATAC---G--TTACGGTC--C----ATT----TT-TC---G-TTGAGTT---------T------GATA--A-----TTTT-AATTG-TG-TATCT-TAT-----CAGC--G--CTACTTCTCCTAAATATC---------TCAACTG----AT-T---TTGAC----CA-AAC---TTG---TTA-GAGGC--TAT--A--A----G-------TATA---AATCCCAGTTG-TTT---TT---ATCATCAACACATTCTGCTCCATCGA-CATAT-CGC----G--GATT--TACTGCAC--T----AACTTTAG-------------G--T----TTTA-TTGTAATTC-T----TCTT-GTCAGT---ACTGC--------------T--------C---C---taggtaatggggctcattcacctctcgatcgaaactgattttggtcaaatattctaagtaatgttatgtaagtaggaattcctgttgtacacgttgtcgatacgttacggtccatttttcgttgagtttgataattttaattgtgtatcttatcagcgctacttctcctaaatatctcaactgattttgaccaaacttgttagaggctataagtataaatcccagttgtttttatcatcaacacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|8 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatgggCC-T---TC-CAT--TAT--TGTC---AG--C---A--TTATTCCT---CCTAAA---CTTT-----TCTACGGATTTTGTCCAAACTTGCAAGGGTGTTTT---ACTAG-----TCCAG-----------TTGTGAATACT---GCT---GT----G------CG---TTACATCAG-TTATTCTGTAGAGTT-ATGTCACTT--GGAGA---A-AT-TT-AA-T
gi|8 : ggcC---AGT-------T---G-----------CTCTTTATATC---ATT----------CT--C-TGTCAGTCCACCAA--T-TTGGGCATATTT-ATGGCCCTT--TGAT----A-ATATT-AA-TGATAAA----TCCAAGTAAAAAACCAT---ATACA-----TCA-CATT--TTCTTGTCC-TCTC-TTCTTCC------C-------CT------A----------A------AT-------------TTCTTATCTGACTT--TAG--------CCAA-ACTT--G-----------CCA--G--G--C--C--------TATC--TTTGTT----A---C---A--TTCTGGTT--C----ATAAAC-TT-T------TGGAGCTATGGCCCTTT------AATT--ACAAATTTT--ATT-G-TA-ATTTT-TGT-----CAGC--A--C--TTC----------TT---------C----TG----Attcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|8 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtc---TCACAT--TTTCTTGTC---CT--C---T--CTT---CTTCCCCTAAA---TTTC-----TTATCTGACTTTAGCCAAACTTGCCAGGCC-TATC-----TT------T---G-----------TTA--CAT--------------------T--C-TG---GTTCATAAA-CT-TTTGG---AGCT-ATGGCCCTT--TAATTACAA-AT-TT-TA-TTGTA---------------------AT---TTTTG-----TCAGCACTTCTTCT-Gacttcaaagctgattatg
gi|9 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacaT--TATGACCCTTT----CA--T-AT-------------T--TAAGATTAT-TTGCA---T-T-TTATTTT---CAGC----CTATACATATCATGTTCAT--------C---A---T---AAATTT-TCTACTGATTTGGGC-C-A-TACTTT-ATA---GGGA----AATTATCAGTATGAATC-----TCAACT---GCTGTGCC---CTTCAT-----CATaacttcaaagctgattatg
gi|9 : aTT-ATGACCCTT--TCAT------AT-TT-AA------GA----TT-------------AT---TTGCA-----TTT-TATT--TTCA-GCC----TA-TACATAT------CATGTTCATC------ATAAATTTTCTA------CT--------G---ATTTGGGCCATACTTTATAGGGAAATTATCAGTA--T--GAA-T-----CTCAACTGCTG--T--GCCCTTCATCATA--TTCTTC----T---CAAAG--TTATGGCC--C---------C-TT-TC------AAAGTTATGCACC-----------TT--A-----CAT--AGT-T-TC-AA--T-TGTA-TTATAGC--A--C--TTC----------TC---------TTAC-TG----AT-T---AGGGT----CAGAAT---TTG---CAA-GAGAC--TAT--A--A----G-------T-TGTACAAATC--GTTGTCTC---Tattcttctcaaagttatggcccctttcaaagttatgcaccttacatagtttcaattgtattatagcacttctcttactgattagggtcagaatttgcaagagactataagttgtacaaatcgttgtctctatagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
gi|9 : aTT----------TC---------TAC--TG----AT-T---TGGGC----CA-TAC---TTT---ATA-GGGAAATTAT--C--A----G-------TATG---AATCTCAACTG-CTG---T-GCCCT--TCATCATATTCTTCTCAA----------------------AGT--TATGGCCCCTTTCAAAG--TTATGCACCTTACATAGT--T----TCAA-TTGTA-------TTAT-------AGC---ACTTC--------------T--------C---T---T---A----------CTGATTAGGGT-C-AGAATTTG-CAA---GAGA----C--TAT--------A---------A------GTTGTACA---AATCGT-----TGTCTC--TA--TA-GTAA---ACTA----CTA-ACACTAA-TCAAA------------------ATGGCATAAGT-ACAATAAGGC---TAAATGCACAG-TGG-G-GG-CATTT---TTGTGTC--G--A------CAGTCA-TTT--TA----AGTTTTTAAAT--atagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 11 4444444444444444444444 1 111111 111111111 1111 111111 4444444444444444444444 111111111111 1111 111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 1111111111111111111 22222222222222222222222 11111111 44444444444444 111111111111111111 33333333333 11 1
lowQualScore : 1 1 5 5 1 2 2 3 11 9999999999999999999999 3 0 3 555555 99999 2 4 4 333333333 3333 4 000000 2 0 1 2 66 5555555555555555555555 0 888888888888 77 3 5 1111 3 4 1 66 0 9999 5 4 111 0 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222222 555 66 44 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5555 444 2 777 3 5555 2 33 1111111 777 0000000000000000000 333 3 00000000000000000000000 3 0 55555 5 2 88888888 33 777 1 33 33 33 2 1 2 66666666666666 2 555 1 222222222222222222 0 11 1 1 33 77777777777 0 44444 555555 5 333 0 22 1 1 1 4444 1 0 3333 22 55555 1 1 7777 0 333 77777 2 5 2 33 2 9999 33333333333 33 2 2 11 33 99 1 3
lowQualScore : . . . . . . . . .. ...................... . . . ...... ..... . . . ......... .... . ...... . . . . .. ...................... . ............ .. . . .... . . . .. . .... . . ... . ............................................................................................................ ........ ... .. .. ..................................................................................................................................................................................................................... .... ... . ... . .... . .. ....... ... ................... ... . ....................... . . ..... . . ........ .. ... . .. .. .. . . . .............. . ... . .................. . .. . . .. ........... . ..... ...... . ... . .. . . . .... . . .... .. ..... . . .... . ... ..... . . . .. . .... ........... .. . . .. .. .. . .
lowQualScore : 0 0 5 5 0 5 0 3 00 7777777777777777777777 2 0 0 888888 99999 8 8 0 999999999 4444 7 555555 4 7 5 3 11 7777777777777777777777 1 666666666666 11 4 4 2222 1 4 0 11 1 3333 0 4 222 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111 888 66 22 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3333 444 7 333 5 7777 7 99 8888888 444 1111111111111111111 777 5 22222222222222222222222 6 2 99999 3 4 99999999 11 555 2 77 11 44 2 9 4 22222222222222 1 888 8 555555555555555555 2 99 7 7 99 00000000000 4 33333 000000 2 000 8 88 9 9 9 0000 9 5 9999 88 66666 0 5 2222 5 999 55555 5 0 5 44 5 8888 33333333333 77 7 7 00 55 22 0 3
consensus : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGC--TNTCTTGTC-AG--C---A--CTA---CTCCTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAGTATC--AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---G--TGTTCCGGTNCATCGA-CT-TTTGGCGTAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------AT---CTGCA-----TCA-CACTTTCT-GTCC-GCTC-TACNCC---------T------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCAG---T-A--T--GAAGTCCAGTTG--C--N-----------CATA--GTCGTC---G----C---G--TT--C-CGGTC--C----ATCGAC-TTTC---G-TGNAGTTATGGCCCTTT------GATT--A-----TTT--AAT-G-TA-AATCT-TGTATTT-C--AGC---A--C-CT--CTC---------C---T-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTC-----CATCGA-CT-CGT-GGCGGAGT--TACGGCCCTTTAA--TTATT--TT-TAA-TTGTAATTC-T-----TTAT-T---GTCA-GC---ACTACT--------C---C-T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CTA---GCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGCGCA---TATCGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( family-525 ) : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ACC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TNTCTTGTC-AG--C---A--CTA---CTCCTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAGTATC--AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---G--TGTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCGTAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TNGTAAATC-------------AT---CTGTA-----TCA-CACTTTCT-GTCC-GCTC-TACNCC---------T------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCAG-A-TGA--T--GAAGTCCAGTTG--C--N-----------CATA--GTCGTC---G----C---G--TT--C-CGGTC--C----ATCGAC-TTTC---G-TGNAGTTATGGCCCTTT------GATT--A-----TTT--AAT-G-TA-AATCT-TGTATTT-C--AGC---A--C-CT--CTC---------T---T-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTC-----CATCGA-CT-CGT-GACGGAGT--TACGGCCCTTTAA--TTATT--TT-TAA-TTGTAATTC-T-----TTAT-TT--GTCA-GC---ACTACT--------C---C-T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CTA---GCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGCGCA---TATCGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
gi|1 : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATGGTTATTGCATTCTGATCCAATCGAATTTTG-----ACCATTTATCAATTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TGTTTTATC-AC--C---A--CTA---CAACTGAACTTT-----TCAATCGATTTTTGCCAAATTTGCTAAGGAATATC--AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTT---G--TGTTCTGGTCCATCGA-CT-ATTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGATTGGAT-TT-GA-GGGTAAATC-------------AT---CTGTA-----TCA-CACTTTCTAGTCC-GCTC-TACCCC---------T------C-------TT------A----------A------CT--------G---ATTTTAGCCAAATTTGCTAGGGAG--GATCAG-AATGAGGT--GAAGTCTAGTTG--T--G-----------TATAAAGTCATC---G----T---G--TT--C-TGGTC--C----ATTGACCTTTT---G-TGTAATTATGGCCCTTT------AATT--A-----TTTGCAAT-GGTA-AATCTATGTATTTAC--ATC---A--CGCT--TTC---------T---T-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTC------AGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTTCAGTTG-CTT---TTGTCATCATCATCACATTCAGTTC-----CGTCGA-CT-CGAAGATGGAAT--TATTGCCCTGTAG--TTATT--TT-TAA-TTGTAATTC-TA----TTAT-TCTAGTCA-GC---ACTACT--------C---C-C---AAATTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTA-CTA---ACAA----GTGTCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TTTTGTCTTCTC--TG-TA-GTAGT-GTTA----CTG-TCACTAG-TCAAATGT--TAT-----TAGTCAAATGACATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGTT-A-G-T-G-AA--T-TA--GTATC--A--A--GC-GCA--CA-TTT-CTA-ATTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|10 : ---AAGTCCATTTG-CTC---TTGACATTATCAT---GTTCTAGTC-----CATTGA-CA-TTT-GTTGAACT--TACAGTCC---------ATT--TT-CAA-TTATAATTG-T-----TTA---------A-GC---AC-AC-------------------AGTCTT------TG---------------CTTG-------GCAT----GTATCAGTTTGAAGA-----TAA------GTTG---------TTGTCA---C--TG-TA-GT--T-AC-A----TT--TCACATG-TCAAATTT--CAT-----TAATCAAATAGCGTTGTC-ACAATAAGGC---TACAAGGACAT-T-T-T-G-G-CA----TC--GTGCCCAC--A--T--GCA--CA-TTT-CTT-GTT
gi|11 : G---AAGTCCAGTTG-CTT---TT---ATCAGTGTCGGGTTATGCTC-----CATTCA--T-AGTTGATGGAAC--TATGACA-TTTAA--CTGTG--TC-CA--TTGTAATTC-T-----CT--------TTA-GC---AC-ATT--------C---G-C---ACAATTC--AAACGATTATGGT-T-A-GATTTG-TAA---TCGA----GTATTGATATAAAGT-----GCA------AGTGTGCA---CATCGTCGTCTTGATG--A-TTAGT-AGTA----CTG-TCACTGT-TCG-AACTGACAT-----TA----------ATT-----CAA-AAAGC---TAAAGGCACTG-T-G-G-GAG-CA--T-TC--GTGTT--GTTA--G--GAA--CA-TTG-ATA-GTTAtcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|12 : CT---------T------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATCTTGACCAAACATTTTAGAGAA--TATCAGCA-TGA--T-----GTCCAGTTG--C--T-----------CA-----TCATC---A----C---A--TT--C-CACTC--C----ATCGAC---------------TTATGGC-------------TT--A-----TCC--------TA-AAC-----TA-TT-C--AAC----------------------------T-------------G----A---T-TA--TAGTC----TA-AACTTGCTA--------GAA---TGTAA---AA----G-------TACA---AGGTTCAGTTG-TGCATATTGTCATCtcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|12 : aaT--------C---C-T---AAACTATTCAACTGATTATAGT-CTA-AACTTG-CTA---GAAT----GTAAAAGTACAAGGT-----TCA------GTTGTGCA---TATTGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACT--------GCT---AT-----TAGTCAACTAGTATTGCT-ACAATAATGC---TGCTGGCAAAG-T---------CA--C-T------TC--AATA--G--GCA--CA-CAT-CTA-GGTAtctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|13 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggctta---G-TGGAGTTGTGGATCTTT------CATA--A-----TTT--TAT----------T-TGTATTTTC--AGT---A--C-TT--CTCAGAAACTTAC---T-------------G----A---T-T---TAGAC----CA-AGGTAGATA------GGGGA---AAT-----AA----G-------TAT----ACGTCCAGTTG-TTG---TTGTCATCATC---------TGCTT-----CCTTAA-CT-TAT-GAAAGAGT--AACGACACTTTGA--TTATT--TT-AAA-TTGTAATTC---------AT-T-----------------CT--------C---C-T---A--------AACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-TTA---ACAA----GTATCAGTACGATGT-----ACA------GTTGTGCA---TATTATTCTCTC--TG-GA-GAAGT-GTTA----TTGAGCACTTG-TCGAAACT--Cttcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|14 : tctttttataa-AA-TGGTCAAT---------------T---C---A-----TCC-CATTTTCTTGTCA-GCTT-TACTCT---------T------T-------TC------A----------A------CTTCTCAATCG---ATTTTCACCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA--A-T-A--T--GAAGTCTTGTTG--CTGA-----------AATC--ATCCTC---A----T---T--TT--T-TAGTC--T----ATCAGC-TTTTA--G-TGTAGATAT-----TTTAGTTCAGGTT--A-----TTTTAAAT-G-CAGAA----TATATGT-----GC---A--T-GT--GTC-------------T-------------G----A------------------CA-CACATATTA------CTGAA---TAT-----CT----G-------TATA---AAGTCCAGTTG-C------TGTTAT--------TGTTGTACTC-----CATCAA-CT-TTT-AGTGGCGT--TACAGCCCTTTAC--TTTGT--TT-TA
gi|15 : taTGACCAAACTA---AGGGAG--AATCAG---TG---T--AAAGTCTAGTTT--C--T-----------CGT----TCATT---G----T---GCATT--C-AAATC--TTTGTATTGAC-TTTT---GATGCAATTATCACCCTTT------AATTTCA-----TTT--GAT-GGTA-AATCT-----TTT-CTGATC---AAGC-CT--ATA---------A---T-------------A----A---TAT---CTTACAAATGA-AACTAGGTA------GGGAG---TAT-----CA----G-------AATG---AAGTCAAATAA-ATT---CTG-CAT-ATTGTCTCTTTCTGCTC-----CATTGA-CTGCAT-CATAGTATAATATGGACTTTTAA--TTATTTATT-TGC-TGGTAATTt
gi|16 : T-TAA-T-GTAATTC-T-----T--------GTCA-GC---ACCACT--------C---T-TTCAAAGTTTCTTGACTGATTATGGGAC-A-AA-TTG-CAG---GCAAACTGGCATCAGTACAAAGT-----TCA------GTTGTGTA---TATCATCATCTC--T---A-GTAGT-ACTA----TTG---------------CT--TAT------AATACAATGGCAT-GCT-ACAATAACGC---TACAGGCACAG-G-G-G-G-GACA--T-TA--ATGTC--GGTA--G--GAT--TA-TTT-CTA---TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCaaatcttgtcatt
gi|17 : --TT-TAA-TTACAATTC-T-----T-AG-TC--AACA-AC---ACTCCT--------C---C-T---GAATTTCTCAACT--TTAT----------------TA---GCAA----GTTTTAGTAGGAAGC-----TCA------GTTGTGCA---TATTCTCATCTC--TGGTA-GTAAC-AGTG----CTG-TCACTAG-TAGTCCCT--CAA-----TAGTCAAATGACAATGCT-ACAGTAAAGC---TGCAGGCACAG-C-A-G-G--------------------------G--GCA--CA-TTC-CTA-GTTCCTTGTTAAtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|18 : T-GTCAGAGT--TATTACCCTTAAA--TTGTT--AT-AAA-TCATA-----T-----TT-T-TT--GTCA-GC---ACTACT--------C---C-T---ACATTTTGCAACATATTATGGT-C-A-AACAAA-CCA---ACCT----GTATCAGTAT---GT-----TCA------GTTGCG-A---TATTGTCATCTC--TA-TT-GTTGT-ATTA----CTG-TCACTAG------ACA--TAT-----------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACAG-T-G-G-A-G-CA--T-TC--CTCTT--G--A------CA--CA-TTT-CTA-TTT--TTTTT--AT--AAAAT-tgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|19 : cttTGAT-C-A-CACTTG-TTA---GAAA----GTATTAGTAGGAAGT-----TCA------GGTGTGTA---TATTGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ATTA----CTG-ACTTTAG-TCATAACT--CAT-----TTCTCAAATGGCATTGCT-GCAATATGAC---TACAGACACAA-T-GTG-G-G-TA--C-TT--GTGTC--G--ACTG--GCA--TA-TTT-CTA-GTTtctgcatgat
gi|2 : ttaacctTGGTT-AATCTTGTCAGCATT-TCT-TC--CTTT-AA-------ACTT-C---TCAAGTGATATTTTG-C-AG--C---T--CTT---CTCTT---CTTTCAGTTTTAACAGATTTTCCCCAAATATGAT------TATT--ATTA------T---GATGAAGTCTACTTTTGCATATCCTGATC---G--TATGCAGGTCTAT--ATCT-TTTTGTATAGTT-ATGGCCCTT--TTAATA-TT-TT-AA-T-GTTAAT---------------T---TTGT----------CAC--------CA-GGAC-TACTCC---------TAAACTGT-------TC------A----------G------CT--------G---ATTTTTACCAATCTTGGTAGGGAG--TTTCGGCA-TTT--A--AAAATCCAGTTG--C--A-----------CA-A--GTTGTC---GTTTGC---A--TT--T-CGGTCTAC----AT--AT-TTTT---G-AAGAGTTATGGTC-TTC------GGCT--A-----------AT-A-TG-AAT---TGTATTC-C--T--------C-CTAACTT---------T---T-------------G----AAGAT-T---TTGGC----AA-AAGTT-TTA------GGGAT---TAT-----A---------------TG---AAGTCTAGTTG-CTC---TTATTGTCATCAT--GGTTTT-CTC-----CATTGAGCT-C---GGCAGAGT--TATGTCCCTctggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|2 : attagatggtaT--GTCA-GC---GCTACT--------C---G-T---AAACTTCTCATCTG--TATTGT-C-G-AATTTT-CTA---GTAA----ATATCAGCATGAAGT-----TCA------GTTCCACA---AATCGCCATATC--TG-TA-TTTGTAACTA----TTG-TCACTTG-TCGAAACC--CAT-----TATCCA---------------AATAAAAC---CACATGCACA------G-A-G-CA--TGTCTGGTAAC-----A--G--CCA--CA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--GCAgtcagcgctactcgtaaacttctcatctgtattgtcgaattttctagtaaatatcagcatgaagttcagttccacaaatcgccatatctgtatttgtaactattgtcacttgtcgaaacccattatccaaataaaaccacatgcacagagcatgtctggtaacagccacatttcctattttaattgttatatgcatgttatatacatatttaacag
gi|20 : attagatggtatggttaatcttgtcagcatttcttcctttaaacttctcaagtgatattttgcagctcttctcttctttcagttttaacagattttccccaaatatgattattattatgatgaagtctacttttgcatatcctgatcgtatgcaggtctatatctttttgtatagttatggcccttttaatattttaatgttaattttgtcaccaggactactcctaaactgttcagctgatttttaccaatcttggtagggagtttcggcatttaaaaatccagttgcacaagttgtcgtttgcatttcggtctacatatttttgaagagttatggtcttcggctaatatgaattgtattcctcctaacttttgaagattttggcaaaagttttagggattatatgaagtctagttgctcttattgtcatcatggttttctccattgagctcggcagagttatgtccc---AAATTTATTAACTGAATTTAGG-C-T-AATTTG-CAA---GCGA----GTATCATT-TGAAGC-----CAA------GTTGCATA---TATTATTGTCtgttatatacatatttaacag
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATTATTGTCGCATTCCTATCTA-TT-GA---TG-----AAC-TTT-TC-------AATG-GTAAATC------TCA------------TC-AG--T---A--TTA---CTCCTAA---CC-----TCA-----------TCAAACTTGGTATGGAGTATC--GGTA------T---GAAACCTGT---TTGAGCTTACC---ATC---ATTTGTTCTGGTTCATTGA-TG-TTTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGTTTgcattcctatctattgatgaacttttcaatggtaaatctcatcagtattactcctaacctcatcaaacttggtatggagtatcggtatgaaacctgtttgagcttaccatcatttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|21 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcTTATTA------GGGAA---TAT-----AA----A-------TATG---AAGTC------------------------ATCACGTTCTGCTC-----CATTGA-TT-TAT-GGTGGAGT--GATAGCCCTTTAA--TTATT--TA-TTA-TTGAAATTC-T-----T--------GTCA-GC---ATTTTT--------C---C-T---AAACTTCTCAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTTA-ACA---GCAA----GTATCAGTGTGAAGT-----TTA------CTTGTGCA---TATTGACA-GTC--TG-GAGGTAA--ACCT----TTG-TTCCAAGATCAAAACT--
gi|22 : ---TTACAC--TTTCTTGTCCAGGTT---A--CTA---CTCCAAAATGAA-----TTAACTGATCTTGGCCAAACTTGTT-GGGAGTATC--AGCA------T---G-----------tcttt
gi|22 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccacctataca---T-------------G----A---T-C---TTGGC----CA-AACTTGTT-------GGGAG---TAT-----CA----G-------CATG---AATTCTAGTaattctagt
gi|23 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccacctatacattacactttcttgtccaggttactactccaaaatgaattaacT--TT-TAA-TTGTA---CGT-----TTAT-TTT-GTCA-GC---ATTACCAGTACTCAC---CAT---GAACTTTTCAATCGATTATGGC-C-A-AACTTG-GTA---GTAA----GTATCAGTAAGAAGT-----TCA------GGTTTGCA---AATTGTCATCTA--T-----GTAGT-ACTA----CTG-TTAGCAG-TCTAATAT--CGT-----TAGGCAAATAACATTGCT-GCTATAAAGT---TACAGGCACAG-T-
gi|24 : aTCCTGAACTGATTTTGGC-C-A-AACTCC-CTA---TGGA----GTATCAGTGTGATAT-----CTA------GTTGTGCA---CACAATTTTCTT--TG-TA-GTAGT-ATTT----CAG-TCGGTAG-ACAAAACT--CGG-----TAATCTAATG---TTGGT-TAAGTAAGGC---AAAAGT--CAG-T-G-GTG-G-CA--T-TT--GTGT
gi|25 : cagagttactgccctttagtaattttcaTTCTCGACTGACTATCAT-C-A-AA---G-AAA---GC-----------------AAGT-----TCG------GAT----A---TATTATCTTCTC--TG-TA-TAAGT-ACAA----CTG-TCACCAG-TAGAAATT--CAT-----TAGTCTGATAGCATTGCT-ACACT--TGC---TACAAGCACAA-T-GCT-G-G-CA--T-TA--TTCTC--A--A--AATATA--CA-TTT-CTA-aaa
gi|26 : cccaaatcatctctTATATT-C-A-AACTT---T-------------TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGGACATTCTGTCATCACCTT--TG-TT-GTTGT-TTTA----CTG-ACAGTAG-TGGAAACT--CAT-----T-GTCAAATGGCAATG------------------------------G-G-G-G-CA--T-TT--GTGAT--GACA--G--GCA--TA-TTT-ATA-------TTTTAAAa
gi|27 : CCAAACTTACTAGAAAGTAGCGAAGTT------TA--A-----------TTTTGCATATC---TGC---G--TGCTcctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttcaCAC--TTTCTTGCC-AG--CTTAA--CTC---CTCCTAAACTTC-----TCAACAGATTTCGGCCAAACTTTCTAGAGAGTAAC-----A------T---G-----------TTATtacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|28 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggATGCGTACATCTATAGATCACAC--TTTATTGTC-AG--C---A--CTATC-CTCTTAA-CTTT-----TCAACCGATTTTGGCAAAACATACTAGcgactcttatatca
gi|29 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgA-GC---ACTACT--------CATCC-T---AAACTTCTAAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TTATTCGGAA----ATATATTTATGAAGT-----AAA------ATTACTCT---TATCGTCATCtttat
gi|29 : ---T-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTATTC---GGAAA---TAT-----AT----T-------TATG---AAGTAAAATTA-CTC---TT---ATCGTCATCATGTTTT-----------TAG---------GACAGAGT--TACAACCCatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|3 : agcactactcatcctaaacttctaaac-----------TTGGGCATATC---ATTATTG--TGCTCCAGTGTATTGA-CT-TTTGGTGCAGTTTATTGCCCTT--TCATTA-TT-TTTAA-TTGTAAATC------------------TTGT-------CAGCACTTC----TCC----T-TAAACT---------T------T-------TA------A----------A------CT--------G---GTTTTGACCAAACTCATTAGGAAG--TTTCAG---T-A--T--GAAGTTCCGTTG--T--T-----------TATA---TCGCCAGTG----C---A--TT--C-TTGAC--T----ATTGA---TTGAAGG-TGCAGTTACTGATCTT--------ACC--AA----TTT--AAT------AAT-------TCT-C--AAC----------------------------T-------------G----A---T-T---T-GAT----AA-AATTT--TA------CGGAA---TAT-----AAACTGG-------TGTA---ATATTAAGTTT-CTC---TTATCATTATCA-CA-GTT-TGCTC-----CATCAA-CT-TGAAGGCAGAGT--TACAGCCCTTGAA--TTATT--TT-TAG-TTGTAATTA-T-----TC---TT--GTCA-GTTTTACTTCT--------C---C-TGTAAAACTTCTCAACTGATTATTGT-C-A-AACTTG-CTA---GCAA----GTATTGGTACAAAAA-----TCA------GT---------TATTGTCAGCTC--TG-TA-GTAGT-ACCACTGTCTG-TCAATAG-TCAAAACT--CAG-----TAGTGGAATTGCATTGAT-GCAA-AAGGC---TACAGCCACAG-T-G-G-GCA-CA--T-TC--TTGTC--GACA--G--GCA--CA-TTT-TTA-TTTTATTTT
gi|31 : tC------A----------G------TC--------G---ATTTTGCTCAGACTTACCAGGGAG--TATCAG-C-T----T--GATGTTCAGTTGT-C--A-----------CATGTCGTTGTC---A----C---A--TG--T-CAGTC--T----GTTGAC-CTTT---G-----GT--TGGCCATTgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|32 : TCTTTTC-AG--C---T--TTA---CTCCTAAGCTTC-----CCAACAGATTTTGACCAAACTTGTAAGGGAGTAaaact
gi|33 : ttaattgttaa-TA-GTAGT-ATT-----CTG-TCACAAG-AAAAAATT--TAT-----TAGTCAGATGGCATTG-T-ACAATAAGGC---
gi|4 : TT---GTC---A--TGATCTGGTTTATGAA-TG-TTTGGCTTAATT-AAATCCCGTAATAATTA-AT-TT-AAATGGTAAATCTTC----------AT---ATGTACAATATCA-AAATTACT-TTTCAGCTC-TATTCC---------T------C-------CT------A----------AATTTCACT--------ATCAATTCTGGCCGGCCTTGTTTGGGAA--TATCA----TTA--T--GGGATTAAGT-------------------CATA---TCATT---------------TT--T---GTC--T----ATCCAT-TT--------ATATTGATGGCCCTTT------GATA--A-----TTTG-AAT-GGCA-AATCT-T----TT-C--AGC---A--C-AT--CTC---------T---T-------------ACGAAA---T-TCAGTTGAC----T-----TTGCTA------AGGGGGTTTCT-----GA----G-------TA-------ATCCAGTTA--------TG----------CATATT-TGCTT-----CATTGA-AG-TTT-GACGGAG--------CTCATTAA--ATAGT--TA-TAAATCGTAATTC-T-----T--------GTAA-GC---AATACT--------C---C-T---AAACTTCTCGACAGATTATGGT-C-A-AACTTG-CTA---GGGA----GTATCAGTATCAAGT-----TCA------GTTGCTCA---TTTCTTCAATTG--TG-TA-GTA-------------------------GAAACC--TTT-----TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACAA-C-A-G-G-G-TA--T-TC--CTGTC--AACA--G--TCA--CA-TTT-CTA-GTTAA
gi|5 : gATTT-T---TTA-GT--AATTTTGTC-AG--A---A--CTA---CTCCTAAAATTT-----GCAACAGATATTGGTCAAAA-TGTTGAGAAATTTC--AGTAAGGTCCT---G-----------TTGAACATA-----------G--TGT--CAATGCATTGA-TT-TTTAGTGACGTT-ATGGATCTT--TGATAA-TT-TT-AA-TTGTAAAT--------------ATTGACGGCG-----TTA----TTTCT--------CC-TAAACT---------T------C-------TC------A----------A------CT--------G---A-TTTGGCCAAA-----TA---AG--TATT--------------AAGTCCAATTGGTC--C-----------TGTC--ACCATC---A----T---G--TT--C-TTCTC--C----ATTGAC-TTagagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttA---TAC-----AA----G-------TATG---AAGTCAAATTG-CTC---C---CATCACCATTATGTTCTGCTC-----CATTGA-CT-TAT-TGCTGAGT--TAatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttatCATGATGTTCTGCTC-----TATTGA-CT-AAT-GACAGAGT--TACATCCCTTT---------------------TAATTC-T-----T-GT-TA--G--A-GCT--ACTCCT--------C---C-T---AAACTTCTCAACTGACTGTGGG-G-A-ATTTTG-ATA-----TA----GTA--AGTATGAGGTAACGATCATGTCTGGTGGTGGA---TATTGTCATCTT--TG-TA-ACGGT-GCTG----CTG-Tacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|6 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtataTT--TTATAA-TTGTCATTA-TAAGTCTTAT-TA--GTCATGC---TTTTCT--------C----------AACTTCTCAACTGATTTCGAC-C-A-AACCT
gi|6 : TCTTATT-AGT-C---ATGCT----TTTCTCAACTTC-----TCAACTGATTTCGACCAAACCTtttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|6 : ttttataattgtcattataagTCT-C--A-----A--C-TT--CTCAA-------C---T-------------G----A---T-T---TCGAC----CA-AACCTTTTACTTTTTAAAAA---TAT-----AA----GATATAAATATG---AAATCAAGTTG-TTC---TT-TTAT-ATAATCATGTTCTA------------GA-CA-CA--GA-GGATT--GATTGCTCTGTAG--TTATT--TT-AAG-TTATAATTC-T-----T--------GTCA-GC---ACTGGT-------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGACT----GCAA----GTATCAGTATGAAAT-----TCA------GTTGTGTA---TATTGTCGTCTC--TG-TA-GTGGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TTGAAAAT--CATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACAG-A-G-G-G-G-CT--T-TA--ATGTC--AACA--G--CCA--CATTTT-TTA-ATAAAGTTTTAAAT--tttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgctttC-TACTCCAAAACG---T------G-------TC------C----------A------TC--------G---ATATTAATCAAAAGTGTTAAGGAG--TATTAG---T-A--T--GAAGTTTATTCA--T--G-----------CATA--ACTGTC---G----T---G--GTAACACGGTC--T----TCTGAC-TTC------TGTAG------------------G-------------T--AAT-G-GG-GCTC-----ATT-------C---A--C-CT--CTCGATCGAAA-C---T-------------G----A---T-T---TTGGT----CA-AATATTCTA------AGTAA---TGTTATGTAA----G-------TAGG---AATTCCTGTTG-TAC---ACGTTGTCG--AT-ACGTTACGGTC-----CATTT--TT-CGT-T---GAGT--T---------TGA--TAATT--TT--AA-TTGTG------------TATCTT--ATCA-GC---GCTACTTCT-----C---C-T---AAATATCTCAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TTA---GAGG----CTATAAGTATAAATC-----CCA------GTTGTTTT---TATCATCActgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : tattcttattagctctg-GCTCATTCACC---------T------C-------TCGATCGAA----------A------CT--------G---ATTTTGGTCAAATATTCTAAGTAA--TGTTAT-G-TAAG-TAGGAATTCCTGTTG--T--A-----------CAC---GTTGTC---GATA-C---G--TT--A-CGGTC--C----ATT----TTTC---G-TTGAGTT---------T------GATA--A-----TTTT-AATTG-TG-TATCT-TAT-----C--AGCGCTA--C-TT--CTC---------C---TAAATATCTCAACTG----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GAGGC---TAT-----AA----G-------TATA---AATCCCAGTTG-TTT---TT---ATCATCAACACATTCTGCTC-----CATCGA-CA-TAT-CGCGGATT--TACTGCAC--TAACTTTAGG--TT-TTA-TTGTAATTC-T-----T--C-TT--GTCA-GT---ACTGCT--------C---C-acacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|8 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatgggCC-T---TC-CAT--TAT--TGTC-AG--C---A--TTATTCCTCCTAAACTTT-----TCTACGGATTTTGTCCAAACTTGCAAGGGTGTTTT--ACTAG-----TCCAG-----------TTGTGAATACT---GCT---G--TG---CGTTACATCAG-TTATTCTGTAGAGTT-ATGTCACTT--GGAGAA-AT-TT-AA-T
gi|8 : ggcC--AGT-------T---G-----------CTCTTTATATC---ATT---C--TCTGTCAGTCCACCAA--T-TTGGGCATATTT-ATGGCCCTT--TGAT-A-ATATT-AA-TGATAAATCCAAGTAAAAAACCAT---ATACA-----TCA-CATTTTCTTGTCC-TCTC-TTCTTCCCCTAAATTT------C-------TT------A----------T------CT--------G---ACTTTAGCCAAACTTGCCAG----------------------------------G--C--C-----------TATC--TTTGTT---A----C---A--TT--C-TGGTT--C----ATAAAC-TTT------TGGAGCTATGGCCCTTT------AATT--ACAAATTTT--ATT-G-TA-ATTTT-TG----T-C--AGC---A--C-TT--CTT---------C---T-------------G----A---ttcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|9 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtcTT-ATGACCCTT--TCAT---AT-TT-AA------GATT-------------AT---TTGCA-----TTT-TATTTTCA-GCC----TA-TACATA---------T------CATGTTCATC------ATAAATTTTCTA------CT--------G---ATTTGGGCCATACTTTATAGGGAAATTATCAG---T-A--T--GAATCTCAACTG--C--TGTGCCCTTCATCATA--TTCTTC---T----CAAAG--TT--A-TGGCC--C---------C-TTTC---A---AAGTTATGCACCTT-------------A-----CAT--AGT-T-TC-AAT---TGTATTA-T--AGC---A--C-TT--CTC---------TTACT-------------G----A---T-T---AGGGT----CAGAATTTGCAA------GAGAC---TAT-----AA----G-------T-TGTACAAATC--GTTGTCTC---Tacttcaaagctgattatg
gi|9 : aT--CTA---------C---T-------------G----A---T-T---TGGGC----CA-TACTTTATA------GGGAAAT-TAT-----CA----G-------TATG---AATCTCAACTG-CTG---T-GCCCT--TCATCATATTCTTCTCAAAGTTAT-GG-CC-CCT-TTCAAAGT--TATG-CACCTTAC--ATAGT--TT-CAA-TTGTA-----------TTAT--------A-GC---ACTTCT--------C---T-T---A----------CTGATTAGGGT-C-AGAATTTG-CAA---GAGA----CTAT--------A---------A------GTTGTACA---AATCGTTGTCTC--TA-TA-GTAA--ACTA----CTA-ACACTAA-TCAAAA--------------------TGGCATAAGT-ACAATAAGGC---TAAATGCACAG-TGG-G-G-G-CATTT-TT--GTGTC--G--A------CAGTCA-TTT--TA----AGTTTTTAAAT--atagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTGCCATTGTGTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCATACGCAGGAATACCACTTTCTTGTTTAGAATAGTACTTCTGAAAACCTTATCAACCGATTATGACAAAACATG
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 4444444444444444444444 1 333333333333333 111111 1111 11111 55555555555555555555555 111111111 1111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 1111111111111111111 11111111111111111111111 222222222222222 3333333333333 11111111111111111111 33333333333 11 1
lowQualScore : 1 1 5 5 1 2 2 3 2 7777777777777777777777 3 0 3 222222222222222 2 4 000000 5555 0 6 11111 2 1 2 66 33333333333333333333333 0 666666666 77777 1 5 1111 3 4 1 66 0 9999 5 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111111 555 55 33 77777 555 77777 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5555 444 2 77777 6666 2 55 3333333 777 1111111111111111111 333 3 66666666666666666666666 3 3 2 111111111111111 5555 777 1 777 22 22 55 2 0 3333333333333 2 333 1 44444444444444444444 1 1 1 1 1 77777777777 0 44444 555555 5 333 0 22 1 1 1 4444 1 0 3333 22 55555 1 1 7777 0 333 77777 2 5 2 33 2 9999 33333333333 33 2 2 11 33 99 1 3
lowQualScore : . . . . . . . . . ...................... . . . ............... . . ...... .... . . ..... . . . .. ....................... . ......... ..... . . .... . . . .. . .... . . . ............................................................................................................ ........ ... .. .. ..... ... ..... ........................................................................................................................................................................................ .... ... . ..... .... . .. ....... ... ................... ... . ....................... . . . ............... .... ... . ... .. .. .. . . ............. . ... . .................... . . . . . ........... . ..... ...... . ... . .. . . . .... . . .... .. ..... . . .... . ... ..... . . . .. . .... ........... .. . . .. .. .. . .
lowQualScore : 0 0 5 5 0 5 0 3 0 0000000000000000000000 2 0 0 888888888888888 2 4 777777 9999 8 2 11111 6 9 6 99 77777777777777777777777 1 111111111 88888 0 4 2222 1 4 0 11 1 3333 0 4 4 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222 444 99 99 11111 000 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 777 9 99999 1111 9 55 3333333 888 0000000000000000000 999 4 66666666666666666666666 5 1 5 555555555555555 0000 999 2 888 99 88 00 6 1 0000000000000 0 777 8 77777777777777777777 7 7 7 7 7 00000000000 4 33333 000000 2 000 8 88 9 9 9 0000 9 5 9999 88 66666 0 5 2222 5 999 55555 5 0 5 44 5 8888 33333333333 77 7 7 00 55 22 0 3
consensus : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TNTCTTGTCAG-C---A--CTA---CTCCTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAGTATC--AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTNCATCGA-CT-TTTGGCGTAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------AT---NTGCA---TCA-CACTTTCT-GTCC--GCT-C-TACNCC---------T------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG--C-----------NCATA--GTCGTC---G----C---G--TT--C-CGGTC--C----ATCGAC-TTTC---G-TGNAGTTATGGCCCTTT------GATT--A-----TTT--AAT-G-TA-AATCT-TGTATTT-C--AGC---A--C-CT--CTC---------CT-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCCTTTAA---TTATT--TT-TAA--TTGTAATTCT-----TT-TT---GTCA-GC---ACTACT--------C---C---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-A---GCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGCGCA---TATCGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( family-525 ) : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGC--TNTCTTGTCAG-C---A--CTA---CTCCTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAGTATC--AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTNCATCGA-CT-TTTGGCGTAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------AT---CTGCA---TCA-CACTTTCT-GTCC--GCT-C-TACNCC---------T------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG--C-----------NCATA--GTCGTC---G----C---G--TT--C-CGGTC--C----ATCGAC-TTTC---G-TGNAGTTATGGCCCTTT------GATT--A-----TTT--AAT-G-TA-AATCT-TGTATTT-C--AGC---A--C-CT--CTC---------CT-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCCTTTAA---TTATT--TT-TAA--TTGTAATTCT-----TTATT---GTCA-GC---ACTACT--------C---C---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-A---GCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGCGCA---TATCGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
gi|1 : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATGGTTATTGCATTCTGATCCAATCGAATTTTG-----ACCATTTATCAATTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TGTTTTATCAC-C---A--CTA---CAACTGAACTTT-----TCAATCGATTTTTGCCAAATTTGCTAAGGAATATC--AGTA------T---G-----------TTGTGCATATC---GTT---GT--GTTCTGGTCCATCGA-CT-ATTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGATTGGAT-TT-GA-GGGTAAATC-------------AT---CTGTA---TCA-CACTTTCTAGTCC--GCT-C-TACCCC---------T------C-------TT------A----------A------CT--------G---ATTTTAGCCAAATTTGCTAGGGAG--GATCA-----GAAT---GAGGTGAAGTCTAGTTG--T-----------GTATAAAGTCATC---G----T---G--TT--C-TGGTC--C----ATTGACCTTTT---G-TGTAATTATGGCCCTTT------AATT--A-----TTTGCAAT-GGTA-AATCTATGTATTTAC--ATC---A--CGCT--TTC---------TT-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTC------AGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTTCAGTTG-CTT---TTGTCATCATCATCACATTCAGTTCCGTCGA-CTCGA-AGAT-------GGAAT----TATTGCCCTGTAG---TTATT--TT-TAA--TTGTAATTCTA----TTATTCTAGTCA-GC---ACTACT--------C---C---C---AAATTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTA-CT-A---ACAA----GTGTCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TTTTGTCTTCTC--TG-TA-GTAGT-GTTA----CTG-TCACTAG-TCAAATGT--TAT-----TAGTCAAATGACATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGTT-A-G-T-G-AA--T-TA--GTATC--A--A--GC-GCA--CA-TTT-CTA-ATTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|10 : ---AAGTCCATTTG-CTC---TTGACATTATCAT---GTTCTAGTCCATTGA-CATTT-GT-T-------GAACT----TACAGTCC----------ATT--TT-CAA--TTATA------------ATT---GTT-----------------------------T---AAGC------AC-----ACAGT-C-----TTTG-CTTG---GCAT----GTATCAGTTTGAAGA-----TAA------GTTG---------TTGTCA---C--TG-TA-GT--T-AC-A----TT--TCACATG-TCAAATTT--CAT-----TAATCAAATAGCGTTGTC-ACAATAAGGC---TACAAGGACAT-T-T-T-G-G-CA----TC--GTGCCCAC--A--T--GCA--CA-TTT-CTT-GTT
gi|11 : G---AAGTCCAGTTG-CTT---TT---ATCAGTGTCGGGTTATGCTCCATTCA--TAGTTGA-T-------GGAAC----TATGACA-TTTAA---CTGTG--TC-CA---TTGTAATTCT-----CT-------TTA-GC---AC-ATT--------C---G---C---ACAATTC--AAACGATTATGGT-T-A-GATTTG-TA-A---TCGA----GTATTGATATAAAGT-----GCA------AGTGTGCA---CATCGTCGTCTTGATG--A-TTAGT-AGTA----CTG-TCACTGT-TCG-AACTGACAT-----TA----------ATT-----CAA-AAAGC---TAAAGGCACTG-T-G-G-GAG-CA--T-TC--GTGTT--GTTA--G--GAA--CA-TTG-ATA-GTTAtcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|12 : CT---------T------C-------TC------A----------A------CT--------G---ATCTTGACCAAACATTTTAGAGAA--TATCA-----GCAT---GA-----TGTCCAGTTG--C-----------TCA-----TCATC---A----C---A--TT--C-CACTC--C----ATCGAC---------------TTATGGC-------------TT--A-----TCC--------TA-AAC-----TA-TT-C--AA-------------------------CT-------------G----A---T-TA--TAGTC----TA-AACTTGCTA--------GAA---TGTAA---AA----G-------TACA---AGGTTCAGTTG-TGCATATTGTCATCtcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|12 : aaT--------C---C---T---AAACTATTCAACTGATTATAGT-CTA-AACTTG-CT-A---GAAT----GTAAAAGTACAAGGT-----TCA------GTTGTGCA---TATTGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACT--------GCT---AT-----TAGTCAACTAGTATTGCT-ACAATAATGC---TGCTGGCAAAG-T---------CA--C-T------TC--AATA--G--GCA--CA-CAT-CTA-GGTAtctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|13 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggctta---G-TGGAGTTGTGGATCTTT------CATA--A-----TTT--TAT----------T-TGTATTTTC--AGT---A--C-TT--CTCAGAAACTTACT-------------G----A---T-T---TAGAC----CA-AGGTAGATA------GGGGA---AAT-----AA----G-------TAT----ACGTCCAGTTG-TTG---TTGTCATCATC---------TGCTTCCTTAA-CTTAT-GA-A-------AGAGT----AACGACACTTTGA---TTATT--TT-AAA--TTGTAATTC--------ATT-----------------CT--------C---C---T---A--------AACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-TT-A---ACAA----GTATCAGTACGATGT-----ACA------GTTGTGCA---TATTATTCTCTC--TG-GA-GAAGT-GTTA----TTGAGCACTTG-TCGAAACT--Cttcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|14 : tctttttataa-AA-TGGTCAATT---------------------CA---TCC-CATTTTCTTGTCA--GCT-T-TACTCT---------T------T-------TC------A----------A------CTTCTCAATCG---ATTTTCACCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----ATAT---GA-----AGTCTTGTTG--CTG---------AAATC--ATCCTC---A----T---T--TT--T-TAGTC--T----ATCAGC-TTTTA--G-TGTAGATAT-----TTTAGTTCAGGTT--A-----TTTTAAAT-G-CAGAA----TATATGT-----GC---A--T-GT--GT----------CT-------------G----A------------------CA-CACATATTA------CTGAA---TAT-----CT----G-------TATA---AAGTCCAGTTG-C------TGTTAT--------TGTTGTACTCCATCAA-CTTTT-AG-T-------GGCGT----TACAGCCCTTTAC---TTTGT--TT-TA
gi|15 : taTGACCAAACTA---AGGGAG--AATCA-----GTGT---AA-----AGTCTAGTTT--C-----------TCGT----TCATT---G----T---GCATT--C-AAATC--TTTGTATTGAC-TTTT---GATGCAATTATCACCCTTT------AATTTCA-----TTT--GAT-GGTA-AATCT-----TTT-CTGATC---AAGC-CT--ATA---------AT-------------A----A---TAT---CTTACAAATGA-AACTAGGTA------GGGAG---TAT-----CA----G-------AATG---AAGTCAAATAA-ATT---CTG-CAT-ATTGTCTCTTTCTGCTCCATTGA-CT-GC-AT-C-------ATAGTATAATATGGACTTTTAA---TTATTTATT-TGC--TGGTAATTAA-----ATCTT---GTCA-t
gi|16 : T-TAA--T-GTAATTCT-----T-------GTCA-GC---ACCACT--------C---T---TTCAAAGTTTCTTGACTGATTATGGGAC-A-AA-TTG-CA-G---GCAAACTGGCATCAGTACAAAGT-----TCA------GTTGTGTA---TATCATCATCTC--T---A-GTAGT-ACTA----TTG---------------CT--TAT------AATACAATGGCAT-GCT-ACAATAACGC---TACAGGCACAG-G-G-G-G-GACA--T-TA--ATGTC--GGTA--G--GAT--TA-TTT-CTA---TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCtt
gi|17 : --TT-TAA--TTACAATTCT-----TAGTC---AACA-AC---ACTCCT--------C---C---T---GAATTTCTCAACT--TTAT----------------T-A---GCAA----GTTTTAGTAGGAAGC-----TCA------GTTGTGCA---TATTCTCATCTC--TGGTA-GTAAC-AGTG----CTG-TCACTAG-TAGTCCCT--CAA-----TAGTCAAATGACAATGCT-ACAGTAAAGC---TGCAGGCACAG-C-A-G-G--------------------------G--GCA--CA-TTC-CTA-GTTCCTTGTTAAtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|18 : T-GT-C-------AGAGT----TATTACCCTTAAA---TTGTT--AT-AAA--TCATA----T-----TTTTT---GTCA-GC---ACTACT--------C---C---T---ACATTTTGCAACATATTATGGT-C-A-AACAAA-CC-A---ACCT----GTATCAGTAT---GT-----TCA------GTTGCG-A---TATTGTCATCTC--TA-TT-GTTGT-ATTA----CTG-TCACTAG------ACA--TAT-----------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACAG-T-G-G-A-G-CA--T-TC--CTCTT--G--A------CA--CA-TTT-CTA-TTT--TTTTT--AT--AAAAT-tgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|19 : cttTGAT-C-A-CACTTG-TT-A---GAAA----GTATTAGTAGGAAGT-----TCA------GGTGTGTA---TATTGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ATTA----CTG-ACTTTAG-TCATAACT--CAT-----TTCTCAAATGGCATTGCT-GCAATATGAC---TACAGACACAA-T-GTG-G-G-TA--C-TT--GTGTC--G--ACTG--GCA--TA-TTT-CTA-GTTtctgcatgat
gi|2 : ttaacctTGGTT-AATCTTGTCAGCATT-TCT-TC--CTTT-AA-------ACTT-C---TCAAGTGATATTTTG-CAG-C---T--CTT---CTCTT---CTTTCAGTTTTAACAGATTTTCCCCAAATATGAT------TATT--ATTA------T---GATGAAGTCTACTTTTGCATATCCTGATC---GT--ATGCAGGTCTAT--ATCT-TTTTGTATAGTT-ATGGCCCTT--TTAATA-TT-TT-AA-TGTTAA-T---------------T---TTG-----TCA-C----------CA--GGA-C-TACTCC---------TAAACTGT-------TC------A----------G------CT--------G---ATTTTTACCAATCTTGGTAGGGAG--TTTCG-----GCATTTAAA-----AATCCAGTTG--C-----------ACA-A--GTTGTC---GTTTGC---A--TT--T-CGGTCTAC----AT--AT-TTTT---G-AAGAGTTATGGTC-TTC------GGCT--A-----------AT-A-TG-AAT---TGTATTC-C--T--------C-CTAACTT---------TT-------------G----AAGAT-T---TTGGC----AA-AAGTT-TTA------GGGAT---TAT-----A---------------TG---AAGTCTAGTTG-CTC---TTATTGTCATCAT--GGTTTT-CTCCATTGAGCTC---GG-C-------AGAGT----TATGTCCCTGTCAGCGCTACT--CG-TAAACTTCTCA-TCT-----GTATT---GTCctggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|2 : attagatggtaT---GTCA-GC---GCTACT--------C---G---T---AAACTTCTCATCTG--TATTGT-C-G-AATTTT-CT-A---GTAA----ATATCAGCATGAAGT-----TCA------GTTCCACA---AATCGCCATATC--TG-TA-TTTGTAACTA----TTG-TCACTTG-TCGAAACC--CAT-----TATCCA---------------AATAAAAC---CACATGCACA------G-A-G-CA--TGTCTGGTAAC-----A--G--CCA--CA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--GCAgaattttctagtaaatatcagcatgaagttcagttccacaaatcgccatatctgtatttgtaactattgtcacttgtcgaaacccattatccaaataaaaccacatgcacagagcatgtctggtaacagccacatttcctattttaattgttatatgcatgttatatacatatttaacag
gi|20 : attagatggtatggttaatcttgtcagcatttcttcctttaaacttctcaagtgatattttgcagctcttctcttctttcagttttaacagattttccccaaatatgattattattatgatgaagtctacttttgcatatcctgatcgtatgcaggtctatatctttttgtatagttatggcccttttaatattttaatgttaattttgtcaccaggactactcctaaactgttcagctgatttttaccaatcttggtagggagtttcggcatttaaaaatccagttgcacaagttgtcgtttgcatttcggtctacatatttttgaagagttatggtcttcggctaatatgaattgtattcctcctaacttttgaagattttggcaaaagttttagggattatatgaagtctagttgctcttattgtcatcatggttttctccattgagctcggcagagttatgtccc---AAATTTATTAACTGAATTTAGG-C-T-AATTTG-CA-A---GCGA----GTATCATT-TGAAGC-----CAA------GTTGCATA---TATTATTGTCtgttatatacatatttaacag
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATTATTGTCGCATTCCTATCTA-TT-GAT---G-----AAC-TTT-TC-------AATG-GTAAATCT------CA------------TCAG-T---A--TTA---CTCCTAA---CC-----TCA-----------TCAAACTTGGTATGGAGTATC--GGTA------T---GAAACCTGT---TTGAGCTTACC---ATC---ATTTGTTCTGGTTCATTGA-TG-TTTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGTTTgcattcctatctattgatgaacttttcaatggtaaatctcatcagtattactcctaacctcatcaaacttggtatggagtatcggtatgaaacctgtttgagcttaccatcatttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|21 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcTTATTA------GGGAA---TAT-----AA----A-------TATG---AAGTC------------------------ATCACGTTCTGCTCCATTGA-TTTAT-GG-T-------GGAGT----GATAGCCCTTTAA---TTATT--TA-TTA--TTGAAATTCT-----T-------GTCA-GC---ATTTTT--------C---C---T---AAACTTCTCAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTTA-AC-A---GCAA----GTATCAGTGTGAAGT-----TTA------CTTGTGCA---TATTGACA-GTC--TG-GAGGTAA--ACCT----TTG-TTCCAAGATCAAAACT--
gi|22 : TACA---TTA-CACTTTCTTGTCCAGGTTAC-TACTCCAAAA-----T------GAA-----TT------A----------A------CT--------G---ATCTTGGCCAAACTTGTT-GGGAG--TATCA-----GCAT---GA-----ATTCTAGTtcttt
gi|23 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccacctaT--TT-TAA--TTGTACGTTT-----ATTTT---GTCA-GC---ATTACCAGTACTCAC---CA--T---GAACTTTTCAATCGATTATGGC-C-A-AACTTG-GT-A---GTAA----GTATCAGTAAGAAGT-----TCA------GGTTTGCA---AATTGTCATCTA--T-----GTAGT-ACTA----CTG-TTAGCAG-TCTAATAT--CGT-----TAGGCAAATAACATTGCT-GCTATAAAGT---TACAGGCACAG-T-
gi|24 : aTCCTGAACTGATTTTGGC-C-A-AACTCC-CT-A---TGGA----GTATCAGTGTGATAT-----CTA------GTTGTGCA---CACAATTTTCTT--TG-TA-GTAGT-ATTT----CAG-TCGGTAG-ACAAAACT--CGG-----TAATCTAATG---TTGGT-TAAGTAAGGC---AAAAGT--CAG-T-G-GTG-G-CA--T-TT--GTGT
gi|25 : cagagttactgccctttagtaattttcaTTCTCGACTGACTATCAT-C-A-AA---G-AA-A---GC-----------------AAGT-----TCG------GAT----A---TATTATCTTCTC--TG-TA-TAAGT-ACAA----CTG-TCACCAG-TAGAAATT--CAT-----TAGTCTGATAGCATTGCT-ACACT--TGC---TACAAGCACAA-T-GCT-G-G-CA--T-TA--TTCTC--A--A--AATATA--CA-TTT-CTA-aaa
gi|26 : cccaaatcatctctTATATT-C-A-AACTT---T--------------TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGGACATTCTGTCATCACCTT--TG-TT-GTTGT-TTTA----CTG-ACAGTAG-TGGAAACT--CAT-----T-GTCAAATGGCAATG------------------------------G-G-G-G-CA--T-TT--GTGAT--GACA--G--GCA--TA-TTT-ATA-------TTTTAAAa
gi|27 : CCAAACTTACTAGAAAGTAGCGAAGTT------TA--A-----------TTTTGCATATC---TGC---GT--GCTcctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttcaCAC--TTTCTTGCCAG-CTTAA--CTC---CTCCTAAACTTC-----TCAACAGATTTCGGCCAAACTTTCTAGAGAGTAAC-----A------T---G-----------TTATtacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|28 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggATGCGTACATCTATAGATCACAC--TTTATTGTCAG-C---A--CTATC-CTCTTAA-CTTT-----TCAACCGATTTTGGCAAAACATACTAGcgactcttatatca
gi|29 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgA-GC---ACTACT--------CATCC---T---AAACTTCTAAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TT-ATTCGGAA----ATATATTTATGAAGT-----AAA------ATTACTCT---TATCGTCATCtttat
gi|29 : ---------CT-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTATTC---GGAAA---TAT-----AT----T-------TATG---AAGTAAAATTA-CTC---TTATCGTCATCATatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|3 : agcactactcatcctaaacttctaaa-----------TTGGGCATATC---ATTATTGT--GCTCCAGTGTATTGA-CT-TTTGGTGCAGTTTATTGCCCTT--TCATTA-TT-TTTAA-TTGTAAATC------------------TTG-----TCAGCACTTC----TCC------T-TAAACT---------T------T-------TA------A----------A------CT--------G---GTTTTGACCAAACTCATTAGGAAG--TTTCA-----GTAT---GA-----AGTTCCGTTG--T-----------TTATA---TCGCCAGTG----C---A--TT--C-TTGAC--T----ATTGA---TTGAAGG-TGCAGTTACTGATCTT--------ACC--AA----TTT--AAT------AAT-------TCT-C--AAC-------------------------T-------------G----A---T-T---T-GAT----AA-AATTT--TA------CGGAA---TAT-----AAACTGG-------TGTA---ATATTAAGTTT-CTC---TTATCATTATCA-CA-GTT-TGCTCCATCAA-CTTGAAGG-C-------AGAGT----TACAGCCCTTGAA---TTATT--TT-TAG--TTGTAATTAT-----TC-TT---GTCA-GTTTTACTTCT--------C---C---TGTAAAACTTCTCAACTGATTATTGT-C-A-AACTTG-CT-A---GCAA----GTATTGGTACAAAAA-----TCA------GT---------TATTGTCAGCTC--TG-TA-GTAGT-ACCACTGTCTG-TCAATAG-TCAAAACT--CAG-----TAGTGGAATTGCATTGAT-GCAA-AAGGC---TACAGCCACAG-T-G-G-GCA-CA--T-TC--TTGTC--GACA--G--GCA--CA-TTT-TTA-TTTTATTTTgtttttaggacagagttacaaccc
gi|31 : tC------A----------G------TC--------G---ATTTTGCTCAGACTTACCAGGGAG--TATCA-----GCTT---GA-----TGTTCAGTTGT-C-----------ACATGTCGTTGTC---A----C---A--TG--T-CAGTC--T----GTTGAC-CTTT---G-----GT--TGGCCATTgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|32 : TCTTTTCAG-C---T--TTA---CTCCTAAGCTTC-----CCAACAGATTTTGACCAAACTTGTAAGGGAGTAaaact
gi|33 : ttaattgttaa-TA-GTAGT-ATT-----CTG-TCACAAG-AAAAAATT--TAT-----TAGTCAGATGGCATTG-T-ACAATAAGGC---
gi|4 : TT---GTC---AT--GATCTGGTTTATGAA-TG-TTTGGCTTAATT-AAATCCCGTAATAATTA-AT-TT-AAATGGTAAATCTTCAT--------AT---GTACAATATCA-AAATTACT-TTTCA-GCT-C-TATTCC---------T------C-------CT------A----------AATTTCACT--------ATCAATTCTGGCCGGCCTTGTTTGGGAA--TATCA-----TTAT---GG-----GATTAAGT-----------------CATA---TCATT---------------TT--T---GTC--T----ATCCAT-TT--------ATATTGATGGCCCTTT------GATA--A-----TTTG-AAT-GGCA-AATCT-T----TT-C--AGC---A--C-AT--CTC---------TT-------------ACGAAA---T-TCAGTTGAC----T-----TTGCTA------AGGGGGTTTCT-----GA----G-------TA-------ATCCAGTTA--------TG----------CATATT-TGCTTCATTGA-AGTTT-GA-C-------GGAG----------CTCATTAA---ATAGT--TA-TAAA-TCGTAATTCT-----T-------GTAA-GC---AATACT--------C---C---T---AAACTTCTCGACAGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-A---GGGA----GTATCAGTATCAAGT-----TCA------GTTGCTCA---TTTCTTCAATTG--TG-TA-GTA-------------------------GAAACC--TTT-----TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACAA-C-A-G-G-G-TA--T-TC--CTGTC--AACA--G--TCA--CA-TTT-CTA-GTTAA
gi|5 : gATTT-T---TTA-GT--AATTTTGTCAG-A---A--CTA---CTCCTAAAATTT-----GCAACAGATATTGGTCAAAA-TGTTGAGAAATTTC--AGTAAGGTCCT---G-----------TTGAACATA-----------GT--GT--CAATGCATTGA-TT-TTTAGTGACGTT-ATGGATCTT--TGATAA-TT-TT-AA-TTGTAAAT--------------ATTGACGGCG---TTA----TTTCT---------C-C-TAAACT---------T------C-------TC------A----------A------CT--------G---A-TTTGGCCAAA-----TA-----------A-----GTAT---TA-----AGTCCAATTGGTC-----------CTGTC--ACCATC---A----T---G--TT--C-TTCTC--C----ATTGAC-TTagagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttA---TAC-----AA----G-------TATG---AAGTCAAATTG-CTC---C---CATCACCATTATGTTCTGCTCCATTGA-CTTAT-TG-C-------TGAGT----TAatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttatCATGATGTTCTGCTCTATTGA-CTAAT-GA-C-------AGAGT----TACATCCCTTT-----------------------TAATTCT-----T-------GTTA-GA---GCTACT--------C---CTCCT---AAACTTCTCAACTGACTGTGGG-G-A-ATTTTG-AT-A-----TA----GTA--AGTATGAGGTAACGATCATGTCTGGTGGTGGA---TATTGTCATCTT--TG-TA-ACGGT-GCTG----CTG-Tacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|6 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtataTT--TTATAA--TTGTCATTATAAGTCTTATTA--GTCATGC---TTTTCT--------C------------AACTTCTCAACTGATTTCGAC-C-A-AACCT
gi|6 : TCTTATTAGTC---ATGCT----TTTCTCAACTTC-----TCAACTGATTTCGACCAAACCTtttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|6 : ttttataattgtcattataagTCT-C--A-----A--C-TT--CTCAA-------CT-------------G----A---T-T---TCGAC----CA-AACCTTTTACTTTTTAAAAA---TAT-----AA----GATATAAATATG---AAATCAAGTTG-TTC---TT-TTAT-ATAATCATGTTCTA-------GA-CACA---G-A-------GGATT----GATTGCTCTGTAG---TTATT--TT-AAG--TTATAATTCT-----T-------GTCA-GC---ACTGGT---------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGACT-----GCAA----GTATCAGTATGAAAT-----TCA------GTTGTGTA---TATTGTCGTCTC--TG-TA-GTGGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TTGAAAAT--CATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACAG-A-G-G-G-G-CT--T-TA--ATGTC--AACA--G--CCA--CATTTT-TTA-ATAAAGTTTTAAAT--tttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgcttt-C-TACTCCAAAACG---T------G-------TC------C----------A------TC--------G---ATATTAATCAAAAGTGTTAAGGAG--TATTA-----GTAT---GA-----AGTTTATTCA--T-----------GCATA--ACTGTC---G----T---G--GTAACACGGTC--T----TCTGAC-TTC------TGTAG------------------G-------------T--AAT-G-GG-GCTC-----ATT-------C---A--C-CT--CTCGATCGAAA-CT-------------G----A---T-T---TTGGT----CA-AATATTCTA------AGTAA---TGTTATGTAA----G-------TAGG---AATTCCTGTTG-TAC---ACGTTGTCG--AT-ACGTTACGGTCCATTT--TTCGT-TG-----------AGT----T---------TGA---TAATT--TT--AA--TTGTG----T-----ATCTT---ATCA-GC---GCTACTTCT-----C---C---T---AAATATCTCAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TT-A---GAGG----CTATAAGTATAAATC-----CCA------GTTGTTTT---TATCATCActgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : tattcttattagctctg--GCT-CATTCACC---------T------C-------TCGATCGAA----------A------CT--------G---ATTTTGGTCAAATATTCTAAGTAA--TGTTATGTAAGTAG---GA-----ATTCCTGTTG--T-----------ACAC---GTTGTC---GATA-C---G--TT--A-CGGTC--C----ATT----TTTC---G-TTGAGTT---------T------GATA--A-----TTTT-AATTG-TG-TATCT-TAT-----C--AGCGCTA--C-TT--CTC---------CTAAATATCTCAACTG----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GAGGC---TAT-----AA----G-------TATA---AATCCCAGTTG-TTT---TT---ATCATCAACACATTCTGCTCCATCGA-CATAT-CG-C-------GGATT----TACTGCAC--TAACT-TTAGG--TT-TTA--TTGTAATTCT-----TC-TT---GTCA-GT---ACTGCT--------C---C---acacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|8 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatgggTTGTCAG-C---A--TTATTCCTCCTAAACTTT-----TCTACGGATTTTGTCCAAACTTGCAAGGGTGTTTT--ACTAG-----TCCAG-----------TTGTGAATACT---GCT---GT--G---CGTTACATCAG-TTATTCTGTAGAGTT-ATGTCACTT--GGAGAA-AT-TT-AA-T
gi|8 : ggcccttccattaC--AGT-------T---G-----------CTCTTTATATC---ATT---CT--CTGTCAGTCCACCAA--T-TTGGGCATATTT-ATGGCCCTT--TGAT-A-ATATT-AA-TGATAAATCCAAGTAAAAAACCAT---ATACA---TCA-CATTTTCTTGTCC--TCT-C-TTCTTCCCCTAAATTT------C-------TT------A----------T------CT--------G---ACTTTAGCCAAACTTGCCAG---------------------------------------G--C-----------CTATC--TTTGTT---A----C---A--TT--C-TGGTT--C----ATAAAC-TTT------TGGAGCTATGGCCCTTT------AATT--ACAAATTTT--ATT-G-TA-ATTTT-TG----T-C--AGC---A--C-TT--CTT---------CT-------------G----A---ttcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|9 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtcTT-ATGACCCTT--TCAT---AT-TT-AA------GATT-------------AT---TTGCA---TTT-TATTTTCA-GCC-----T-A-TACATA---------T------CATGTTCATC------ATAAATTTTCTA------CT--------G---ATTTGGGCCATACTTTATAGGGAAATTATCA-----GTAT---GA-----ATCTCAACTG--CTGTGCCCTTCATCATA--TTCTTC---T----CAAAG--TT--A-TGGCC--C---------C-TTTC------AAAGTTATGCACC-----------TT--A-----CAT--AGT-T-TC-AA--T-TGTATTA-T--AGC---A--C-TT--CTCTTA------CT-------------G----A---T-T---AGGGT----CAGAATTTGCAA------GAGAC---TAT-----AA----G-------T-TGTACAAATC--GTTGTCTC---Tacttcaaagctgattatg
gi|9 : aT--CTA---------CT-------------G----A---T-T---TGGGC----CA-TACTTTATA------GGGAAAT-TAT-----CA----G-------TATG---AATCTCAACTG-CTG---T-GCCCT--TCATCATATTCTTCTCAA---A-GTTAT-GG-CCCCTTTCAAAGT----TATG-CACCTTAC---ATAGT--TT-CAA--TTGTA----------TTAT-------A-GC---ACTTCT--------C---T---T---A----------CTGATTAGGGT-C-AGAATTTG-CA-A---GAGA----CTAT--------A---------A------GTTGTACA---AATCGTTGTCTC--TA-TA-GTAA--ACTA----CTA-ACACTAA-TCAAAA--------------------TGGCATAAGT-ACAATAAGGC---TAAATGCACAG-TGG-G-G-G-CATTT-TT--GTGTC--G--A------CAGTCA-TTT--TA----AGTTTTTAAAT--atagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTGCCATTGTGTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCATACGCAGGAATACCACTTTCTTGTTTAGAATAGTACTTCTGAAAACCTTATCAACCGATTATGACAAAACATG
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 4444444444444444444444 1 3333333333333333 111111111111 11111 55555555555555555555555 111111111 1111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 11111111111111111111111 222222222222222 2222222222 33333333333 11 1
lowQualScore : 1 1 5 5 1 2 2 3 2 7777777777777777777777 3 0 3 4444444444444444 1 0 5 999999999999 2 8 22222 2 3 11111111111111111111111 1 222222222 66 4 0 1 55 3333 5 5 1 66 1 888 5 5 9999 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00000000 555 33 33 77777 555 77777 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5555 444 2 99999 5555 2 1 77 3333333 777 99999 5555 7777777 333 2 99999999999999999999999 4 0 2 2 222222222222222 5555 33 444 666 2 1 33 22 2 2 2 4444444444 2 555 5555 999999999999999999 0 11 1 1 33 77777777777 0 44444 555555 5 333 0 22 1 1 1 4444 1 0 3333 22 55555 1 1 7777 0 333 77777 2 5 2 33 2 9999 33333333333 33 2 2 11 33 99 1 3
lowQualScore : . . . . . . . . . ...................... . . . ................ . . . ............ . . ..... . . ....................... . ......... .. . . . .. .... . . . .. . ... . . .... ......................................................................................................... ........ ... .. .. ..... ... ..... .............................................................................................................................................................................................. .... ... . ..... .... . . .. ....... ... ..... .... ....... ... . ....................... . . . . ............... .... .. ... ... . . .. .. . . . .......... . ... .... .................. . .. . . .. ........... . ..... ...... . ... . .. . . . .... . . .... .. ..... . . .... . ... ..... . . . .. . .... ........... .. . . .. .. .. . .
lowQualScore : 0 0 5 5 0 5 0 3 0 0000000000000000000000 2 0 0 7777777777777777 7 2 0 111111111111 0 1 55555 8 4 44444444444444444444444 4 555555555 99 1 4 0 77 3333 0 0 0 99 4 888 7 0 0000 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44444444 000 44 99 11111 000 11111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3333 444 7 55555 7777 7 5 00 4444444 444 11111 0000 6666666 777 7 22222222222222222222222 2 2 4 4 999999999999999 0000 66 111 333 5 6 11 99 2 2 2 3333333333 0 888 5555 000000000000000000 2 99 7 7 99 00000000000 4 33333 000000 2 000 8 88 9 9 9 0000 9 5 9999 88 66666 0 5 2222 5 999 55555 5 0 5 44 5 8888 33333333333 77 7 7 00 55 22 0 3
consensus : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTCCTAAACTTC-----TCAACNGATTTCGGCCAAACTTGCTAGGGAGTATC--AGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACACTTTCT-GTCC--GCT-C-TACTCC---------T------C-------T-C------A----------A------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C-----------NCATA--GTCGTC---G----C---G--TT--C-CGGTC--C----ATCGAC-TTTT---G-TGNAGTTATGGCCCTTT------GATT--A-----TTT--AAT-G-TA-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TT--CTC---------CT-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTA-ATT-CT----T--TT-GTCA-GC---ACTA---CT--------C---C-T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CTA---GCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGCGCA---TATCGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( family-525 ) : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTCCTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAGTATC--AGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTNCATCGA-CT-TTTGGCGTAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACACTTTCT-GTCC--GCT-C-TACNCC---------T------C-------T-C------A----------A------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C-----------NCATA--GTCGTC---G----C---G--TT--C-CGGTC--C----ATCGAC-TTTC---G-TGNAGTTATGGCCCTTT------GATT--A-----TTT--AAT-G-TA-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-CT--CTC---------CT-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTA-ATT-CT----T-TTT-GTCA-GC---ACTA---CT--------C---C-T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CTA---GCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGCGCA---TATCGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
gi|1 : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATGGTTATTGCATTCTGATCCAATCGAATTTTG-----ACCATTTATCAATTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TG-TTTTATCAC-C---A--CTA---CAACTGAACTTT-----TCAATCGATTTTTGCCAAATTTGCTAAGGAATATC--AGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTT---GT--GTTCTGGTCCATCGA-CT-ATTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGATTGGAT-TT-GA-GGGTAAATC-------------ATCTGTA---TCACACTTTCTAGTCC--GCT-C-TACCCC---------T------C-------T-T------A----------A------CT--------G---ATTTTAGCCAAATTTGCTAGGGAG--GATCA-----GAAT---GAGGTGAAGTCTAGTTG-T-----------GTATAAAGTCATC---G----T---G--TT--C-TGGTC--C----ATTGACCTTTT---G-TGTAATTATGGCCCTTT------AATT--A-----TTTGCAAT-GGTA-AATCTATG-------TATTTAC--ATC---A--CGCT--TTC---------TT-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTC------AGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTTCAGTTG-CTT---TTGTCATCATCATCACATTCAGTTCCGTCGA-CTCGA-AGAT-------GGAAT----TATTGCCC---TGTAG--TT-ATT--TT--TAA-TTGTA-ATT-CTATTAT-TCTAGTCA-GC---ACTA---CT--------C---C-C---AAATTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTA-CTA---ACAA----GTGTCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TTTTGTCTTCTC--TG-TA-GTAGT-GTTA----CTG-TCACTAG-TCAAATGT--TAT-----TAGTCAAATGACATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGTT-A-G-T-G-AA--T-TA--GTATC--A--A--GC-GCA--CA-TTT-CTA-ATTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|10 : ---AAGTCCATTTG-CTC---TTGACATTATCAT---GTTCTAGTCCATTGA-CATTT-GT-T-------GAACT----TACAGTCC-------------ATT--TT--CAA-TTATA-ATT-GT----T------TAA-GC---AC-A---C-------------------AGTCTT------TG---------------CTTG-------GCAT----GTATCAGTTTGAAGA-----TAA------GTTG---------TTGTCA---C--TG-TA-GT--T-AC-A----TT--TCACATG-TCAAATTT--CAT-----TAATCAAATAGCGTTGTC-ACAATAAGGC---TACAAGGACAT-T-T-T-G-G-CA----TC--GTGCCCAC--A--T--GCA--CA-TTT-CTT-GTT
gi|11 : G---AAGTCCAGTTG-CTT---TT---ATCAGTGTCGGGTTATGCTCCATTCA--TAGTTGA-T-------GGAAC----TATGACA----TTTAA--CT-GTG--TC--CA--TTGTA-ATT-CT----C-TTT----A-GC---AC-A---TT--------C---G-C---ACAATTC--AAACGATTATGGT-T-A-GATTTG-TAA---TCGA----GTATTGATATAAAGT-----GCA------AGTGTGCA---CATCGTCGTCTTGATG--A-TTAGT-AGTA----CTG-TCACTGT-TCG-AACTGACAT-----TA----------ATT-----CAA-AAAGC---TAAAGGCACTG-T-G-G-GAG-CA--T-TC--GTGTT--GTTA--G--GAA--CA-TTG-ATA-GTTAtcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|12 : CT---------T------C-------T-C------A----------A------CT--------G---ATCTTGACCAAACATTTTAGAGAA--TATCA-----GCAT---GA-----TGTCCAGTTG-C-----------TCA-----TCATC---A----C---A--TT--C-CACTC--C----ATCGAC---------------TTATGGC-------------TT--A-----TCC--------TA-AAC------------TA-TT-C--AA-------------------------CT-------------G----A---T-TA--TAGTC----TA-AACTTGCTA--------GAA---TGTAA---AA----G-------TACA---AGGTTCAGTTG-TGCATATTGTCATCtcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|12 : aaT--------C---C-T---AAACTATTCAACTGATTATAGT-CTA-AACTTG-CTA---GAAT----GTAAAAGTACAAGGT-----TCA------GTTGTGCA---TATTGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACT--------GCT---AT-----TAGTCAACTAGTATTGCT-ACAATAATGC---TGCTGGCAAAG-T---------CA--C-T------TC--AATA--G--GCA--CA-CAT-CTA-GGTAtctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|13 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggctta---G-TGGAGTTGTGGATCTTT------CATA--A-----TTT--TAT----------T-TG-------TATTTTC--AGT---A--C-TT--CTCAGAAACTTACT-------------G----A---T-T---TAGAC----CA-AGGTAGATA------GGGGA---AAT-----AA----G-------TAT----ACGTCCAGTTG-TTG---TTGTCATCATC---------TGCTTCCTTAA-CTTAT-GA-A-------AGAGT----AACGACAC---TTTGA--TT-ATT--TT--AAA-TTGTA-ATT-CA----T-T--------------------CT--------C---C-T---A--------AACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-TTA---ACAA----GTATCAGTACGATGT-----ACA------GTTGTGCA---TATTATTCTCTC--TG-GA-GAAGT-GTTA----TTGAGCACTTG-TCGAAACT--Cttcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|14 : tctttttataa-AA-TGGTCAATT------------------CA---TCCCATTTTCTTGTCA--GCT-T-TACTCT---------T------T-------T-C------A----------A------CTTCTCAATCG---ATTTTCACCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----ATAT---GA-----AGTCTTGTTG-CTG---------AAATC--ATCCTC---A----T---T--TT--T-TAGTC--T----ATCAGC-TTTTA--G-TGTAGATAT-----TTTAGTTCAGGTT--A-----TTTTAAAT-G-CAGAA----TA-------TATGT-----GC---A--T-GT--GT----------CT-------------G----A------------------CA-CACATATTA------CTGAA---TAT-----CT----G-------TATA---AAGTCCAGTTG-C------TGTTAT--------TGTTGTACTCCATCAA-CTTTT-AG-T-------GGCGT----TACAGCCC---TTTAC--TT-TGT--TT--TA
gi|15 : taTGACCAAACTA---AGGGAG--AATCA-----GTGT---AA-----AGTCTAGTTT-C-----------TCGT----TCATT---G----T---GCATT--C-AAATC--TTTGTATTGAC-TTTT---GATGCAATTATCACCCTTT------AATTTCA-----TTT--GAT-GGTA-AATCT------------TTT-CTGATC---AAGC-CT--ATA---------AT-------------A----A---TAT---CTTACAAATGA-AACTAGGTA------GGGAG---TAT-----CA----G-------AATG---AAGTCAAATAA-ATT---CTG-CAT-ATTGTCTCTTTCTGCTCCATTGA-CT-GC-AT-C-------ATAGTATAATATGGACT---TTTAA--TT-ATTTATT--TGC-TGGTA-ATTAAA----T-CTT-GTCA-t
gi|16 : T--TAA-T-GTA-ATT-CT----T-----GTCA-GC---ACCA---CT--------C---T-TTCAAAGTTTCTTGACTGATTATGGGAC-A-AA-TTG-CAG---GCAAACTGGCATCAGTACAAAGT-----TCA------GTTGTGTA---TATCATCATCTC--T---A-GTAGT-ACTA----TTG---------------CT--TAT------AATACAATGGCAT-GCT-ACAATAACGC---TACAGGCACAG-G-G-G-G-GACA--T-TA--ATGTC--GGTA--G--GAT--TA-TTT-CTA---TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCtt
gi|17 : --TT--TAA-TTACA-ATT-CT----TAGTC-AACA-AC---ACTC---CT--------C---C-T---GAATTTCTCAACT--TTAT----------------TA---GCAA----GTTTTAGTAGGAAGC-----TCA------GTTGTGCA---TATTCTCATCTC--TGGTA-GTAAC-AGTG----CTG-TCACTAG-TAGTCCCT--CAA-----TAGTCAAATGACAATGCT-ACAGTAAAGC---TGCAGGCACAG-C-A-G-G--------------------------G--GCA--CA-TTC-CTA-GTTCCTTGTTAAtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|18 : T-GT-C-------AGAGT----TATTACCC---TTAAA--TT-GTT--AT--AAA-TCATA-----TT----T-TTT-GTCA-GC---ACTA---CT--------C---C-T---ACATTTTGCAACATATTATGGT-C-A-AACAAA-CCA---ACCT----GTATCAGTAT---GT-----TCA------GTTGCG-A---TATTGTCATCTC--TA-TT-GTTGT-ATTA----CTG-TCACTAG------ACA--TAT-----------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACAG-T-G-G-A-G-CA--T-TC--CTCTT--G--A------CA--CA-TTT-CTA-TTT--TTTTT--AT--AAAAT-tgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|19 : cttTGAT-C-A-CACTTG-TTA---GAAA----GTATTAGTAGGAAGT-----TCA------GGTGTGTA---TATTGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ATTA----CTG-ACTTTAG-TCATAACT--CAT-----TTCTCAAATGGCATTGCT-GCAATATGAC---TACAGACACAA-T-GTG-G-G-TA--C-TT--GTGTC--G--ACTG--GCA--TA-TTT-CTA-GTTtctgcatgat
gi|2 : ttaacctTGGTT-AATCTTGTCAGCATT-TCT-TC--CTTT-AA-------ACTT-C---TCAAGTGATA-TTTTG-CAG-C---T--CTT---CTCTT---CTTTCAGTTTTAACAGATTTTCCCCAAATATGAT------TATT--ATTA-T---GATGAAGTCTACTTTTGCATATCCTGATC---GT--ATGCAGGTCTAT--ATCT-TTTTGTATAGTT-ATGGCCCTT--TTAATA-TT-TT-AA-TGTTAA-T---------------TTTG-----TCAC----------CA--GGA-C-TACTCC---------TAAACTGT-------T-C------A----------G------CT--------G---ATTTTTACCAATCTTGGTAGGGAG--TTTCG-----GCATTTAAA-----AATCCAGTTG-C-----------ACA-A--GTTGTC---GTTTGC---A--TT--T-CGGTCTAC----AT--AT-TTTT---G-AAGAGTTATGGTC-TTC------GGCT--A-----------AT-A-TG-AAT---TG-------TATTC-C--T--------C-CTAACTT---------TT-------------G----AAGAT-T---TTGGC----AA-AAGTT-TTA------GGGAT---TAT-----A---------------TG---AAGTCTAGTTG-CTC---TTATTGTCATCAT--GGTTTT-CTCCATTGAGCTC---GG-C-------AGAGT----TATGTCCC---Tctggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|2 : attagatggtaT-GTCA-GC---GCTA---CT--------C---G-T---AAACTTCTCATCTG--TATTGT-C-G-AATTTT-CTA---GTAA----ATATCAGCATGAAGT-----TCA------GTTCCACA---AATCGCCATATC--TG-TA-TTTGTAACTA----TTG-TCACTTG-TCGAAACC--CAT-----TATCCA---------------AATAAAAC---CACATGCACA------G-A-G-CA--TGTCTGGTAAC-----A--G--CCA--CA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--GCAgtcagcgctactcgtaaacttctcatctgtattgtcgaattttctagtaaatatcagcatgaagttcagttccacaaatcgccatatctgtatttgtaactattgtcacttgtcgaaacccattatccaaataaaaccacatgcacagagcatgtctggtaacagccacatttcctattttaattgttatatgcatgttatatacatatttaacag
gi|20 : attagatggtatggttaatcttgtcagcatttcttcctttaaacttctcaagtgatattttgcagctcttctcttctttcagttttaacagattttccccaaatatgattattattatgatgaagtctacttttgcatatcctgatcgtatgcaggtctatatctttttgtatagttatggcccttttaatattttaatgttaattttgtcaccaggactactcctaaactgttcagctgatttttaccaatcttggtagggagtttcggcatttaaaaatccagttgcacaagttgtcgtttgcatttcggtctacatatttttgaagagttatggtcttcggctaatatgaattgtattcctcctaacttttgaagattttggcaaaagttttagggattatatgaagtctagttgctcttattgtcatcatggttttctccattgagctcggcagagttatgtccc---AAATTTATTAACTGAATTTAGG-C-T-AATTTG-CAA---GCGA----GTATCATT-TGAAGC-----CAA------GTTGCATA---TATTATTGTCtgttatatacatatttaacag
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATTATTGTCGCATTCCTATCTA-TT-GAT---G-----AAC-TTT-TC-------AATG-GTAAATCT------CA-------------TCAG-T---A--TTA---CTCCTAA---CC-----TCA-----------TCAAACTTGGTATGGAGTATC--GGTA-T---GAAACCTGT---TTGAGCTTACC---ATC---ATTTGTTCTGGTTCATTGA-TG-TTTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGTTTgcattcctatctattgatgaacttttcaatggtaaatctcatcagtattactcctaacctcatcaaacttggtatggagtatcggtatgaaacctgtttgagcttaccatcatttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|21 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcTTATTA------GGGAA---TAT-----AA----A-------TATG---AAGTC------------------------ATCACGTTCTGCTCCATTGA-TTTAT-GG-T-------GGAGT----GATAGCCC---TTTAA--TT-ATT--TA--TTA-TTGAA-ATT-CT----T-----GTCA-GC---ATTT---TT--------C---C-T---AAACTTCTCAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTTA-ACA---GCAA----GTATCAGTGTGAAGT-----TTA------CTTGTGCA---TATTGACA-GTC--TG-GAGGTAA--ACCT----TTG-TTCCAAGATCAAAACT--
gi|22 : TATACA---TTACACTTTCTTGTCCAGGTTAC-TACTCCAAAA-----T------GAA-----T-T------A----------A------CT--------G---ATCTTGGCCAAACTTGTT-GGGAG--TATCA-----GCAT---GA-----ATTCTAGTtcttt
gi|23 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccaccT--TT--TAA-TTGTACGTT-TA----T-TTT-GTCA-GC---ATTA---CCAGTACTCAC---CAT---GAACTTTTCAATCGATTATGGC-C-A-AACTTG-GTA---GTAA----GTATCAGTAAGAAGT-----TCA------GGTTTGCA---AATTGTCATCTA--TG-TA-G---T-ACTA----CTG-TTAGCAG-TCTAATAT--CGT-----TAGGCAAATAACATTGCT-GCTATAAAGT---TACAGGCACAG-T-
gi|24 : aTCCTGAACTGATTTTGGC-C-A-AACTCC-CTA---TGGA----GTATCAGTGTGATAT-----CTA------GTTGTGCA---CACAATTTTCTT--TG-TA-GTAGT-ATTT----CAG-TCGGTAG-ACAAAACT--CGG-----TAATCTAATG---TTGGT-TAAGTAAGGC---AAAAGT--CAG-T-G-GTG-G-CA--T-TT--GTGT
gi|25 : cagagttactgccctttagtaattttcaTTCTCGACTGACTATCAT-C-A-AA---G-AAA---GC-----------------AAGT-----TCG------GAT----A---TATTATCTTCTC--TG-TA-TAAGT-ACAA----CTG-TCACCAG-TAGAAATT--CAT-----TAGTCTGATAGCATTGCT-ACACT--TGC---TACAAGCACAA-T-GCT-G-G-CA--T-TA--TTCTC--A--A--AATATA--CA-TTT-CTA-aaa
gi|26 : cccaaatcatctctTATATT-C-A-AACTT---T-------------TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGGACATTCTGTCATCACCTT--TG-TT-GTTGT-TTTA----CTG-ACAGTAG-TGGAAACT--CAT-----T-GTCAAATGGCAATG------------------------------G-G-G-G-CA--T-TT--GTGAT--GACA--G--GCA--TA-TTT-ATA-------TTTTAAAa
gi|27 : CCAAACTTACTAGAAAGTAGCGAAGTT-TA--A-----------TTTTGCATATC---TGC---GT--GCTcctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttca--TT-TCTTGCCAG-CTTAA--CTC---CTCCTAAACTTC-----TCAACAGATTTCGGCCAAACTTTCTAGAGAGTAAC-----A-T---G-----------TTATtacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|28 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggcacATGCGTACATCTATAGATCACAC--TT-TATTGTCAG-C---A--CTATC-CTCTTAA-CTTT-----TCAACCGATTTTGGCAAAACATACTAGcgactcttatatca
gi|29 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgA-GC---ACTA---CT--------CATCC-T---AAACTTCTAAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TTATTCGGAA----ATATATTTATGAAGT-----AAA------ATTACTCT---TATCGTCATCtttat
gi|29 : ---------CT-------------G----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTATTC---GGAAA---TAT-----AT----T-------TATG---AAGTAAAATTA-CTC---TTATCGTCATCATatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|3 : agcactactcatcctaaacttctaaa-----------TTGGGCATATC---ATTATTGT--GCTCCAGTGTATTGA-CT-TTTGGTGCAGTTTATTGCCCTT--TCATTA-TT-TTTAA-TTGTAAATC-------------TTGT-CA---GCAC---TTCT--------CC-T-TAAACT---------T------T-------T-A------A----------A------CT--------G---GTTTTGACCAAACTCATTAGGAAG--TTTCA-----GTAT---GA-----AGTTCCGTTG-T-----------TTATA---TCGCCAGTG----C---A--TT--C-TTGAC--T----ATTGA---TTGAAGG-TGCAGTTACTGATCTT--------ACC--AA----TTT--AAT------AAT--------------TCT-C--AAC-------------------------T-------------G----A---T-T---T-GAT----AA-AATTT--TA------CGGAA---TAT-----AAACTGG-------TGTA---ATATTAAGTTT-CTC---TTATCATTATCA-CA-GTT-TGCTCCATCAA-CTTGAAGG-C-------AGAGT----TACAGCCC---TTGAA--TT-ATT--TT--TAG-TTGTA-ATT-AT----T-CTT-GTCA-GTTTTACTT---CT--------C---C-TGTAAAACTTCTCAACTGATTATTGT-C-A-AACTTG-CTA---GCAA----GTATTGGTACAAAAA-----TCA------GT---------TATTGTCAGCTC--TG-TA-GTAGT-ACCACTGTCTG-TCAATAG-TCAAAACT--CAG-----TAGTGGAATTGCATTGAT-GCAA-AAGGC---TACAGCCACAG-T-G-G-GCA-CA--T-TC--TTGTC--GACA--G--GCA--CA-TTT-TTA-TTTTATTTTgtttttaggacagagttacaaccc
gi|31 : t-C------A----------G------TC--------G---ATTTTGCTCAGACTTACCAGGGAG--TATCA-----GCTT---GA-----TGTTCAGTTGTC-----------ACATGTCGTTGTC---A----C---A--TG--T-CAGTC--T----GTTGAC-CTTT---G-----GT--TGGCCATTgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|32 : GT--TAATCTTTTCAG-C---T--TTA---CTCCTAAGCTTC-----CCAACAGATTTTGACCAAACTTGTAAGGGAGTAaaact
gi|33 : ttaatt-TA-GTAGT-ATT-----CTG-TCACAAG-AAAAAATT--TAT-----TAGTCAGATGGCATTG-T-ACAATAAGGC---
gi|4 : TT---GTC---AT--GATCTGGTTTATGAA-TG-TTTGGCTTAATT-AAATCCCGTAATAATTA-AT-TT-AAATGGTAAATCTTCAT--------ATGTACAATATCAAAATTACT-TTTCA-GCT-C-TATTCC---------T------C-------C-T------A----------AATTTCACT--------ATCAATTCTGGCCGGCCTTGTTTGGGAA--TATCA-----TTAT---GG-----GATTAAGT----------------CATA---TCATT---------------TT--T---GTC--T----ATCCAT-TT--------ATATTGATGGCCCTTT------GATA--A-----TTTG-AAT-GGCA-AATCT-T-----------TT-C--AGC---A--C-AT--CTC---------TT-------------ACGAAA---T-TCAGTTGAC----T-----TTGCTA------AGGGGGTTTCT-----GA----G-------TA-------ATCCAGTTA--------TG----------CATATT-TGCTTCATTGA-AGTTT-GA-C-------GGAG----------CTC---ATTAA--AT-AGT--TA--TAAATCGTA-ATT-CT----T-----GTAA-GC---AATA---CT--------C---C-T---AAACTTCTCGACAGATTATGGT-C-A-AACTTG-CTA---GGGA----GTATCAGTATCAAGT-----TCA------GTTGCTCA---TTTCTTCAATTG--TG-TA-GTA-------------------------GAAACC--TTT-----TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACAA-C-A-G-G-G-TA--T-TC--CTGTC--AACA--G--TCA--CA-TTT-CTA-GTTAA
gi|5 : gTTTT-GTCA--GAA-C-TACTCC---------TAAAAT-T-------TGC------A----------A------CA--------G---ATATTGGTCAAAAT-GTTGAGAAA--TTTCA-----GTA-----A-----GGTCCTGTTG-A-----------ACATA--GT----------------G--T-----CAATG--C----ATTGAT-TTTTA--G-TGACGTTATGGATCTTT------GATA--A-----TTTT-AATTG-TA-AATAT-TGACGGCGTTATTT-C--TCCTAAA--C-TT--CTCAA-------CT-------------G----A---T-T---T-GGC----CA-AA-----------------------T-----AA----G-------TATT---AAGTCCAATTG-GTC---CTGTCACCATCAT---GTTCTTCTCCATTGA-CTagagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaaA---TAC-----AA----G-------TATG---AAGTCAAATTG-CTC---C---CATCACCATTATGTTCTGCTCCATTGA-CTTAT-TG-C-------TGAGT----TAtatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttatCATGATGTTCTGCTCTATTGA-CTAAT-GA-C-------AGAGT----TACATCCC---TTT-----------------------TA-ATT-CT----T-GTTAG--A-GCT--ACTC---CT--------C---C-T---AAACTTCTCAACTGACTGTGGG-G-A-ATTTTG-ATA-----TA----GTA--AGTATGAGGTAACGATCATGTCTGGTGGTGGA---TATTGTCATCTT--TG-TA-ACGGT-GCTG----CTG-Tacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|6 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtata---TTTA----T-AAT--TG--TCA-TTATA-AGT-CT----T-ATTAGTCATGC---TTTT---CT--------C----------AACTTCTCAACTGATTTCGAC-C-A-AACCT
gi|6 : t-TCTTATTAGTC---ATGCT----TTTCTCAACTTC-----TCAACTGATTTCGACCAAACCTtttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|6 : ttttataattgtcattataagTCT-C--A-----A--C-TT--CTCAA-------CT-------------G----A---T-T---TCGAC----CA-AACCTTTTACTTTTTAAAAA---TAT-----AA----GATATAAATATG---AAATCAAGTTG-TTC---TT-TTAT-ATAATCATGTTCTA-------GA-CACA---G-A-------GGATT----GATTGCTC---TGTAG--TT-ATT--TT--AAG-TTATA-ATT-CT----T-----GTCA-GC---ACTG---GT-------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGACT----GCAA----GTATCAGTATGAAAT-----TCA------GTTGTGTA---TATTGTCGTCTC--TG-TA-GTGGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TTGAAAAT--CATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACAG-A-G-G-G-G-CT--T-TA--ATGTC--AACA--G--CCA--CATTTT-TTA-ATAAAGTTTTAAAT--tttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgcttt-C-TACTCCAAAACG---T------G-------T-C------C----------A------TC--------G---ATATTAATCAAAAGTGTTAAGGAG--TATTA-----GTAT---GA-----AGTTTATTCA-T-----------GCATA--ACTGTC---G----T---G--GTAACACGGTC--T----TCTGAC-TTC------TGTAG------------------G-------------T--AAT-G-GG-GCTC------------ATT-------C---A--C-CT--CTCGATCGAAA-CT-------------G----A---T-T---TTGGT----CA-AATATTCTA------AGTAA---TGTTATGTAA----G-------TAGG---AATTCC---TG-------TTGT-------A-CACGTT-------GTCGA-TACGT---------------------TACGGTCCATTTTTCG--TTGAGT--TTGATAA-TTTTA-ATT-GTGTA-T-CTT-ATCA-GC---GCTACTTCT--------C---C-T---AAATATCTCAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TTA---GAGG----CTATAAGTATAAATC-----CCA------GTTGTTTT---TATCATCActgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : tattcttattagctctg--GCT-CATTCACC---------T------C-------T-CGATCGAA----------A------CT--------G---ATTTTGGTCAAATATTCTAAGTAA--TGTTATGTAAGTAG---GA-----ATTCCTGTTG-T-----------ACAC---GTTGTC---GATA-C---G--TT--A-CGGTC--C----ATT----TTTC---G-TTGAGTT---------T------GATA--A-----TTTT-AATTG-TG-TATCT-TA-------T-----C--AGCGCTA--C-TT--CTC---------CTAAATATCTCAACTG----A---T-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GAGGC---TAT-----AA----G-------TATA---AATCCCAGTTG-TTT---TT---ATCATCAACACATTCTGCTCCATCGA-CATAT-CG-C-------GGATT----TACTGCAC-----TAACTTT-AGG--TT--TTA-TTGTA-ATT-CT----T-CTT-GTCA-GT---ACTG---CT--------C---C-acacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|8 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatgggTTGTCAG-C---A--TTATTCCTCCTAAACTTT-----TCTACGGATTTTGTCCAAACTTGCAAGGGTGTTTT--ACTAGTCCAG-----------TTGTGAATACT---GCT---GT--G---CGTTACATCAG-TTATTCTGTAGAGTT-ATGTCACTT--GGAGAA-AT-TT-AA-T-TTCAGTT-------------ATGTCCAG--TTGCTCTTTAT-AT-C--ATT-C-TCTGTC---------A------G-------T-C------C----------A------CC--------A---ATTTGGGC
gi|8 : ggcccttccattaC--AGT--T---G-----------CTCTTTATATC---ATT---CT--CTGTCAGTCCACCAA--T-TTGGGCATATTT-ATGGCCCTT--TGAT-A-ATATT-AA-TGATAAATCCAAGTAAAAAACCATATACA---TCACATTTTCTTGTCC--TCT-C-TTCTTCCCCTAAATTT------C-------T-T------A----------T------CT--------G---ACTTTAGCCAAACTTGCCAG---------------------------------------G-C-----------CTATC--TTTGTT---A----C---A--TT--C-TGGTT--C----ATAAAC-TTT------TGGAGCTATGGCCCTTT------AATT--ACAAATTTT--ATT-G-TA-ATTTT-TG-----------T-C--AGC---A--C-TT--CTT---------CT-------------G----A---atatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|9 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtcTT-ATGACCCTT--TCAT---AT-TT-AA------GATT-------------ATTTGCA---TTTTATTTTCA-GCC-----T-A-TACATA---------T------CATGTTCAT-C------ATAAATTTTCTA------CT--------G---ATTTGGGCCATACTTTATAGGGAAATTATCA-----GTAT---GA-----ATCTCAACTG-CTGTGCCCTTCATCATA--TTCTTC---T----CAAAG--TT--A-TGGCC--C---------C-TTTC------AAAGTTATGCACC-----------TT--A-----CAT--AGT-T-TC-AA--T-TG-------TATTA-T--AGC---A--C-TT--CTCTTA------CT-------------G----A---T-T---AGGGT----CAGAATTTGCAA------GAGAC---TAT-----AA----G-------T-TGTACAAATC--GTTGTCTC---Tacttcaaagctgattatg
gi|9 : aT--CTA---------CT-------------G----A---T-T---TGGGC----CA-TACTTTATA------GGGAAAT-TAT-----CA----G-------TATG---AATCTCAACTG-CTG---T-GCCCT--TCATCATATTCTTCTCAA---A-GTTAT-GG-CCCCTTTCAAAGT----TATG-CAC---CTTAC--AT-AGT--TT--CAA-TTGTA--------------TT-AT-A-GC---ACTT---CT--------C---T-T---A----------CTGATTAGGGT-C-AGAATTTG-CAA---GAGA----CTAT--------A---------A------GTTGTACA---AATCGTTGTCTC--TA-TA-GTAA--ACTA----CTA-ACACTAA-TCAAAA--------------------TGGCATAAGT-ACAATAAGGC---TAAATGCACAG-TGG-G-G-G-CATTT-TT--GTGTC--G--A------CAGTCA-TTT--TA----AGTTTTTAAAT--atagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTGCCATTGTGTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCATACGCAGGAATACCACTTTCTTGTTTAGAATAGTACTTCTGAAAACCTTATCAACCGATTATGACAAAACATG
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 4444444444444444444444 1 3333333333333333 111111 1111 11111 55555555555555555555555 111111111 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111 11111111111111111111111 222222222222222 2222222222 33333333333 11 1
lowQualScore : 1 1 5 5 1 2 2 3 2 7777777777777777777777 3 0 3 4444444444444444 1 0 4 000000 5555 777 6 0 11111 2 555 777 11111111111111111111111 1 222222222 66 4 0 1 55 3333 5 1 66 1 888 5 5 55 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888888 11111111 555 33 33 77777 555 77777 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 2 99999 5555 2 1 77 3333333 777 99999 5555 7777777 333 2 99999999999999999999999 4 0 2 2 222222222222222 5555 33 444 666 2 2 22 22 2 7777777 222 4444444444 2 333 6666 99999999999999999 1 1 0 1 1 1 1 1 6666666 44444 555555 5 0 333 1 22 1 1 1 4444 1 0 3333 22 55555 1 1 7777 0 333 77777 2 5 2 33 2 9999 33333333333 33 2 2 11 33 99 1 3
lowQualScore : . . . . . . . . . ...................... . . . ................ . . . ...... .... ... . . ..... . ... ... ....................... . ......... .. . . . .. .... . . .. . ... . . .. ............................................................................................. ...... ........ ... .. .. ..... ... ..... .................................................................................................................................................................................................... .... . ..... .... . . .. ....... ... ..... .... ....... ... . ....................... . . . . ............... .... .. ... ... . . .. .. . ....... ... .......... . ... .... ................. . . . . . . . . ....... ..... ...... . . ... . .. . . . .... . . .... .. ..... . . .... . ... ..... . . . .. . .... ........... .. . . .. .. .. . .
lowQualScore : 0 0 5 5 0 5 0 3 0 0000000000000000000000 2 0 0 7777777777777777 7 2 4 777777 9999 888 2 8 11111 6 444 888 44444444444444444444444 4 555555555 99 1 4 7 77 3333 0 0 99 4 888 7 0 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 888888 22222222 444 44 99 11111 000 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3333 7 55555 7777 7 5 00 4444444 444 11111 0000 6666666 777 7 22222222222222222222222 2 2 4 4 999999999999999 0000 66 111 333 4 4 99 88 1 3333333 999 5555555555 1 999 3333 22222222222222222 2 6 2 7 7 7 8 8 2222222 55555 222222 9 5 222 3 88 9 9 9 0000 9 5 9999 88 66666 0 5 2222 5 999 55555 5 0 5 44 5 8888 33333333333 77 7 7 00 55 22 0 3
consensus : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATC--AGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTT--TT------GTCA-GC---ACTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTCGTCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( family-525 ) : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTCGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATC--AGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACACTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTT--TT------GTCA-GC---ACTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGCGCA---TATCGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
gi|1 : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATGGTTATTGCATTCTGATCCAATCGAATTTTG-----ACCATTTATCAATTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TG-TTTTATCAC-C---A--CTA---CAA---CTGAACTTT-----TCAATCGATTTTTGCCAAATTTGCTA---AGGAATATC--AGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTT---GT--GTTCTGGTCCATCGA-CT-ATTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGATTGGAT-TT-GA-GGGTAAATC-------------ATCTGTA---TCACACTTTCTAGTCC--GC-----T-C-TACCCC---------T------C--------T-T------AA------CT--------G---ATTTTAGCCAAATTTGCTAGGGAG--GATCA-----GAAT---GAGGTGAAGTCTAGTTG-T--GTATAAAGTCATC---G----TG--TT--C-TGGTC--C----ATTG-ACCTTTT-----G----T-GTAATTATGG-CCCTTT------AA---TT--A-----T-----TTGCA-AT-GGT---A-AATCTATG-------TATTTAC--ATC---A--CGCTTTC---------TT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTC------AGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTTCAGTTG-CTT---TTGTCATCATCATCACATTCAGTTCCGTCGA-CTCGA-AGAT-------GGAAT----TATTGCCC---TGTAG--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTA--TTATTCTAGTCA-GC---ACTA---CT--------CC---C---AAATTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTA-CT-AACAA----GTGTCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TTTTGTCTTCTC--TG-TA-GTAGT-GTTA----CTG-TCACTAG-TCAAATGT--TAT-----TAGTCAAATGACATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGTT-A-G-T-G-AA--T-TA--GTATC--A--A--GC-GCA--CA-TTT-CTA-ATTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|10 : ---AAGTCCATTTG-CTC---TTGACATTATCAT---GTTCTAGTCCATTGA-CATTT-GT-T-------GAACT----TACAGTCC-------------ATT--TT--CAA-TTATAA---------------TT------GTT-----------------------------T---AAGC------AC-----ACAGT-C-----TTTG-CTTGGCAT----GTATCAGTTTGAAGA-----TAA------GTTG---------TTGTCA---C--TG-TA-GT--T-AC-A----TT--TCACATG-TCAAATTT--CAT-----TAATCAAATAGCGTTGTC-ACAATAAGGC---TACAAGGACAT-T-T-T-G-G-CA----TC--GTGCCCAC--A--T--GCA--CA-TTT-CTT-GTT
gi|11 : G---AAGTCCAGTTG-CTT---TT---ATCAGTGTCGGGTTATGCTCCATTCA--TAGTTGA-T-------GGAAC----TATGACA----TTTAA--CT-GTG--TC--CA--TTGTAA--T----T--CTC--TT--------TA-GC---AC-A---TT--------CG---C---ACAATTC--AAACGATTATGGT-T-A-GATTTG-TA-ATCGA----GTATTGATATAAAGT-----GCA------AGTGTGCA---CATCGTCGTCTTGATG--A-TTAGT-AGTA----CTG-TCACTGT-TCG-AACTGACAT-----TA----------ATT-----CAA-AAAGC---TAAAGGCACTG-T-G-G-GAG-CA--T-TC--GTGTT--GTTA--G--GAA--CA-TTG-ATA-GTTAtcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|12 : CT---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATCTTGACCAAACATTTTAGAGAA--TATCA-----GCAT---GA-----TGTCCAGTTG-C--TCA-----TCATC---A----CA--TT--C-CACTC--C----ATCG-AC---------------------TTATGG-C----------------TT--A-----T-----CC---------T---A-AAC------------TA-TT-C--AA-----------------------CT-------------G----AT-TA--TAGTC----TA-AACTTGCTA--------GAA---TGTAA---AA----G-------TACA---AGGTTCAGTTG-TGCATATTGTCATCtcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|12 : aaT--------CC---T---AAACTATTCAACTGATTATAGT-CTA-AACTTG-CT-AGAAT----GTAAAAGTACAAGGT-----TCA------GTTGTGCA---TATTGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ACTA----CTG-TCACT--------GCT---AT-----TAGTCAACTAGTATTGCT-ACAATAATGC---TGCTGGCAAAG-T---------CA--C-T------TC--AATA--G--GCA--CA-CAT-CTA-GGTAtctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|13 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggcttaC-TTTTTATAAG----T-GGAGTTGTGG-ATCTTT------CA---TA--A-----T-----TT--T-AT-------------T-TG-------TATTTTC--AGT---A--C-TTCTCAGAAACTTACT-------------G----AT-T---TAGAC----CA-AGGTAGATA------GGGGA---AAT-----AA----G-------TAT----ACGTCCAGTTG-TTG---TTGTCATCATC---------TGCTTCCTTAA-CTTAT-GA-A-------AGAGT----AACGACAC---TTTGA--TT-ATT--TT--AAA-TTGTAA--T----T--CAT--T------------------------CT--------CC---T---A--------AACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-TT-AACAA----GTATCAGTACGATGT-----ACA------GTTGTGCA---TATTATTCTCTC--TG-GA-GAAGT-GTTA----TTGAGCACTTG-TCGAAACT--Cttcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|14 : t-AA-TGGTCAATT------------------CA---TCCCATTTTCTTGTCA--GC-----T-T-TACTCT---------T------T--------T-C------AA------CTTCTCAATCG---ATTTTCACCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----ATAT---GA-----AGTCTTGTTG-CTGAAATC--ATCCTC---A----TT--TT--T-TAGTC--T----ATCA-GC-TTTTA----G----T-GTAGATAT------TTTAGTTCAGG---TT--A-----T-----TTTAA-AT-G-C---AGAA----TA-------TATGT-----GC---A--T-GTGT----------CT-------------G----A---------------CA-CACATATTA------CTGAA---TAT-----CT----G-------TATA---AAGTCCAGTTG-C------TGTTAT--------TGTTGTACTCCATCAA-CTTTT-AG-T-------GGCGT----TACAGCCC---TTTAC--TT-TGT--TT--TA
gi|15 : taTGACCAAACTA---AGGGAG--AATCA-----GTGT---AA-----AGTCTAGTTT-C--TCGT----TCATT---G----TGCATT--C-AAATC--TTTGTATTG-AC-TTTT-----GA---T-GCAATTATCA-CCCTTT------AA---TTTCA-----T-----TT--G-ATGG-T---A-AATCT------------TTT-CTGATC---AAGC-CTATA---------AT-------------A----ATAT---CTTACAAATGA-AACTAGGTA------GGGAG---TAT-----CA----G-------AATG---AAGTCAAATAA-ATT---CTG-CAT-ATTGTCTCTTTCTGCTCCATTGA-CT-GC-AT-C-------ATAGTATAATATGGACT---TTTAA--TT-ATTTATT--TGC-TGGTAA--T----TAAATC--TT------GTCA-t
gi|16 : T--TAA-T-GTAA--T----T--CTT----------GTCA-GC---ACCA---CT--------CT---TTCAAAGTTTCTTGACTGATTATGGGAC-A-AA-TTG-CA-GGCAAACTGGCATCAGTACAAAGT-----TCA------GTTGTGTA---TATCATCATCTC--T---A-GTAGT-ACTA----TTG---------------CT--TAT------AATACAATGGCAT-GCT-ACAATAACGC---TACAGGCACAG-G-G-G-G-GACA--T-TA--ATGTC--GGTA--G--GAT--TA-TTT-CTA---TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCtt
gi|17 : --TT--TAA-TTACAA--T----T--CTTAGTC------AACA-AC---ACTC---CT--------CC---T---GAATTTCTCAACT--TTAT----------------T-AGCAA----GTTTTAGTAGGAAGC-----TCA------GTTGTGCA---TATTCTCATCTC--TGGTA-GTAAC-AGTG----CTG-TCACTAG-TAGTCCCT--CAA-----TAGTCAAATGACAATGCT-ACAGTAAAGC---TGCAGGCACAG-C-A-G-G--------------------------G--GCA--CA-TTC-CTA-GTTCCTTGTTAAtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|18 : T-GT-C-------AGAGT----TATTACCC---TTAAA--TT-GTT--AT--AAA-TCATA--------T--TTT--TT------GTCA-GC---ACTA---CT--------CC---T---ACATTTTGCAACATATTATGGT-C-A-AACAAA-CC-AACCT----GTATCAGTAT---GT-----TCA------GTTGCG-A---TATTGTCATCTC--TA-TT-GTTGT-ATTA----CTG-TCACTAG------ACA--TAT-----------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACAG-T-G-G-A-G-CA--T-TC--CTCTT--G--A------CA--CA-TTT-CTA-TTT--TTTTT--AT--AAAAT-tgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|19 : cttTGAT-C-A-CACTTG-TT-AGAAA----GTATTAGTAGGAAGT-----TCA------GGTGTGTA---TATTGTCATCTC--TG-TA-GTAGT-ATTA----CTG-ACTTTAG-TCATAACT--CAT-----TTCTCAAATGGCATTGCT-GCAATATGAC---TACAGACACAA-T-GTG-G-G-TA--C-TT--GTGTC--G--ACTG--GCA--TA-TTT-CTA-GTTtctgcatgat
gi|2 : ttaacctTGGTT-AATCTTGTCAGCATT-TCT-TC--CTTT-AA-------ACTT-C---TCAAGTGATA-TTTTG-CAG-C---T--CTT---CTC---TT---CTTTCAGTTTTAACAGATTTTCCCCAAATATGAT---------TATT--ATTA-T---GATGAAGTCTACTTTTGCATATCCTGATC---GT--ATGCAGGTCTAT--ATCT-TTTTGTATAGTT-ATGGCCCTT--TTAATA-TT-TT-AA-TGTTAA-T---------------TTTG-----TCAC----------CA--GG-----A-C-TACTCC---------TAAACTGT--------T-C------AG------CT--------G---ATTTTTACCAATCTTGGTAGGGAG--TTTCG-----GCATTTAAA-----AATCCAGTTG-C--ACA-A--GTTGTC---GTTTGCA--TT--T-CGGTCTAC----AT---AT-TTTT-----G----A-AGAGTTATGG-TC-TTC------GG---CT--A-----------------AT-A-T---G-AAT---TG-------TATTC-C--TCCTA-A--C-TTTTG---------AA-------------G----AT-T---TTGGC----AA-AAGTT-TTA------GGGAT---TAT-----A---------------TG---AAGTCTAGTTG-CTC---TTATTGTCATCAT--GGTTTT-CTCCATTGAGCTC---GG-C-------AGAGT----TATGTCCC---T---G--TC-AGC--GC--TAC-TCGTAA------------------------------------A---CT--------TC---T-----------CATCTG--TATTGT-C-G-AATTTT-CT-AGTAA----ATATCAGCATGAAGT-----TCA------GTTCCACA---AATCGCCATATC--TG-TA-TTTGTAACTA----TTG-TCACTTG-TCGAAACC--CAT-----TATCCA---------------AATAAAAC---CACATGCACA------G-A-G-CA--TGTCTGGTAAC-----A--G--CCA--CA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--GCActggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|20 : attagatggta---AAATTTATTAACTGAATTTAGG-C-T-AATTTG-CA-AGCGA----GTATCATT-TGAAGC-----CAA------GTTGCATA---TATTATTGTCtgttatatacatatttaacag
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATTATTGTCGCATTCCTATCTA-TT-GAT---G-----AAC-TTT-TC-------AATG-GTAAATCT------CA-------------TCAG-T---A--TTA---CTC---CTAA---CC-----TCA-----------TCAAACTTGGTA---TGGAGTATC--GGTA-T---GAAACCTGT---TTGAGCTTACC---ATC---ATTTGTTCTGGTTCATTGA-TG-TTTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGTTTgcattcctatctattgatgaacttttcaatggtaaatctcatcagtattactcctaacctcatcaaacttggtatggagtatcggtatgaaacctgtttgagcttaccatcatttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|21 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcTTATTA------GGGAA---TAT-----AA----A-------TATG---AAGTC------------------------ATCACGTTCTGCTCCATTGA-TTTAT-GG-T-------GGAGT----GATAGCCC---TTTAA--TT-ATT--TA--TTA-TTGAAA--T----T--CTT----------GTCA-GC---ATTT---TT--------CC---T---AAACTTCTCAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTTA-AC-AGCAA----GTATCAGTGTGAAGT-----TTA------CTTGTGCA---TATTGACA-GTC--TG-GAGGTAA--ACCT----TTG-TTCCAAGATCAAAACT--
gi|22 : TATACA---TTACACTTTCTTGTCCAGGT-----TAC-TACTCCAAAA-----T------GAA------T-T------AA------CT--------G---ATCTTGGCCAAACTTGTT-GGGAG--TATCA-----GCAT---GA-----ATTCTAGTtcttt
gi|23 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccaccT--TT--TAA-TTGTACGTT----T--ATT--TT------GTCA-GC---ATTA---CCAGTACTCACCA--T---GAACTTTTCAATCGATTATGGC-C-A-AACTTG-GT-AGTAA----GTATCAGTAAGAAGT-----TCA------GGTTTGCA---AATTGTCATCTA--T-----GTAGT-ACTA----CTG-TTAGCAG-TCTAATAT--CGT-----TAGGCAAATAACATTGCT-GCTATAAAGT---TACAGGCACAG-T-
gi|24 : aTCCTGAACTGATTTTGGC-C-A-AACTCC-CT-ATGGA----GTATCAGTGTGATAT-----CTA------GTTGTGCA---CACAATTTTCTT--TG-TA-GTAGT-ATTT----CAG-TCGGTAG-ACAAAACT--CGG-----TAATCTAATG---TTGGT-TAAGTAAGGC---AAAAGT--CAG-T-G-GTG-G-CA--T-TT--GTGT
gi|25 : cagagttactgccctttagtaattttcaTTCTCGACTGACTATCAT-C-A-AA---G-AA-AGC-----------------AAGT-----TCG------GAT----A---TATTATCTTCTC--TG-TA-TAAGT-ACAA----CTG-TCACCAG-TAGAAATT--CAT-----TAGTCTGATAGCATTGCT-ACACT--TGC---TACAAGCACAA-T-GCT-G-G-CA--T-TA--TTCTC--A--A--AATATA--CA-TTT-CTA-aaa
gi|26 : cccaaatcatctctTATATT-C-A-AACTT---T-----------TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGGACATTCTGTCATCACCTT--TG-TT-GTTGT-TTTA----CTG-ACAGTAG-TGGAAACT--CAT-----T-GTCAAATGGCAATG------------------------------G-G-G-G-CA--T-TT--GTGAT--GACA--G--GCA--TA-TTT-ATA-------TTTTAAAa
gi|27 : CCAAACTTACTA---GAAAGTAGCGAAGTT-TA--A-----------TTTTGCATATC---TGC---GT--GCTcctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttca--TT-TCTTGCCAG-CTTAA--CTC---CTC---CTAAACTTC-----TCAACAGATTTCGGCCAAACTTTCTA---GAGAGTAAC-----A-T---G-----------TTATtacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|28 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggcacATGCGTACATCTATAGATCACAC--TT-TATTGTCAG-C---A--CTATC-CTC---TT-AACTTT-----TCAACCGATTTTGGCAAAACATACTA---Gcgactcttatatca
gi|29 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgAG-C---A--CTA---CTCATCCTAAACTTC-----TAAACTGATTTTGACCAAACTTGTTATTCGGAAATATtttat
gi|29 : ---A--C-TTCTAAA-------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTATTC---GGAAA---TAT-----AT----T-------TATG---AAGTAAAATTA-CTC---TTATCGTCATCATatttatgaagtaaaattactcttatcgtcatcatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|3 : agcactactcatcctaa-----------TTGGGCATATC---ATTATTGT--GCTCCAGTGTATTGA-CT-TTTGGTGCAGTTTATTGCCCTT--TCATTA-TT-TTTAA-TTGTAAATC-------------TTGT-CA---GCAC---TTCT--------C-----C-T-TAAACT---------T------T--------T-A------AA------CT--------G---GTTTTGACCAAACTCATTAGGAAG--TTTCA-----GTAT---GA-----AGTTCCGTTG-T--TTATA---TCGCCAGTG----CA--TT--C-TTGAC--T----ATTG-A----TT-----GAAGGT-GCAGTTACTG-ATCTT--------A---CC--AA----T-----TT--A-AT---------AAT--------------TCT-C--AAC-----------------------T-------------G----AT-T---T-GAT----AA-AATTT--TA------CGGAA---TAT-----AAACTGG-------TGTA---ATATTAAGTTT-CTC---TTATCATTATCA-CA-GTT-TGCTCCATCAA-CTTGAAGG-C-------AGAGT----TACAGCCC---TTGAA--TT-ATT--TT--TAG-TTGTAA--T----T--ATTC-TT------GTCA-GTTTTACTT---CT--------CC---TGTAAAACTTCTCAACTGATTATTGT-C-A-AACTTG-CT-AGCAA----GTATTGGTACAAAAA-----TCA------GT---------TATTGTCAGCTC--TG-TA-GTAGT-ACCACTGTCTG-TCAATAG-TCAAAACT--CAG-----TAGTGGAATTGCATTGAT-GCAA-AAGGC---TACAGCCACAG-T-G-G-GCA-CA--T-TC--TTGTC--GACA--G--GCA--CA-TTT-TTA-TTTTATTTTgtttttaggacagagttacaaccc
gi|31 : t-C------AG------TC--------G---ATTTTGCTCAGACTTACCAGGGAG--TATCA-----GCTT---GA-----TGTTCAGTTGTC--ACATGTCGTTGTC---A----CA--TG--T-CAGTC--T----GTTG-AC-CTTT-----G---------GT--TGG-CCATTgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|32 : GT--TAATCTTTTCAG-C---T--TTA---CTC---CTAAGCTTC-----CCAACAGATTTTGACCAAACTTGTAA---GGGAGTAaaact
gi|33 : ttaatt-TA-GTAGT-ATT-----CTG-TCACAAG-AAAAAATT--TAT-----TAGTCAGATGGCATTG-T-ACAATAAGGC---
gi|4 : TT---GTC---AT--GATCTGGTTTATGAA-TG-TTTGGCTTAATT-AAATCCCGTAATAATTA-AT-TT-AAATGGTAAATCTTCAT--------ATGTACAATATCAAAATTACT-TTTCA-GC-----T-C-TATTCC---------T------C--------C-T------AAATTTCACT--------ATCAATTCTGGCCGGCCTTGTTTGGGAA--TATCA-----TTAT---GG-----GATTAAGT-------CATA---TCATT------------TT--T---GTC--T----ATCC-AT-TTAT-----A----T-----TGATGG-CCCTTT------GA---TA--A-----T-----TTG-A-AT-GGC---A-AATCT-T-----------TT-C--AGC---A--C-ATCTC---------TT-------------ACGAAAT-TCAGTTGAC----T-----TTGCTA------AGGGGGTTTCT-----GA----G-------TA-------ATCCAGTTA--------TG----------CATATT-TGCTTCATTGA-AGTTT-GA-C-------GGAG----------CTC---ATTAA--AT-AGT--TA--TAAATCGTAA--T----T--CTT----------GTAA-GC---AATA---CT--------CC---T---AAACTTCTCGACAGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGGGA----GTATCAGTATCAAGT-----TCA------GTTGCTCA---TTTCTTCAATTG--TG-TA-GTA-------------------------GAAACC--TTT-----TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACAA-C-A-G-G-G-TA--T-TC--CTGTC--AACA--G--TCA--CA-TTT-CTA-GTTAA
gi|5 : gTTTT-GTCA--GA-----A-C-TACTCC---------TAAAAT-T--------TGC------AA------CA--------G---ATATTGGTCAAAAT-GTTGAGAAA--TTTCA-----GTA-----A-----GGTCCTGTTG-A--ACATA--GT-------------G--T-----CAATG--C----ATTG-AT-TTTTA----G----T-GACGTTATGG-ATCTTT------GA---TA--A-----T-----TTT-A-ATTG-T---A-AATAT-TGACGGCGTTATTT-C--TCCTAAA--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-T---T-GGC----CA-AA-----------------------T-----AA----G-------TATT---AAGTCCAATTG-GTC---CTGTCACCATCAT---GTTCTTCTCCATTGA-CTagagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaaA---TAC-----AA----G-------TATG---AAGTCAAATTG-CTC---C---CATCACCATTATGTTCTGCTCCATTGA-CTTAT-TG-C-------TGAGT----TAtatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttatCATGATGTTCTGCTCTATTGA-CTAAT-GA-C-------AGAGT----TACATCCC---TTT-----------------------TAA--T----T--CTT----------GTTA-GA---GCTA---CT--------CCTCCT---AAACTTCTCAACTGACTGTGGG-G-A-ATTTTG-AT-A--TA----GTA--AGTATGAGGTAACGATCATGTCTGGTGGTGGA---TATTGTCATCTT--TG-TA-ACGGT-GCTG----CTG-Tacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|6 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtata---TTTA----T-AAT--TG--TCA-TTATAA--G----T--CTTA-TTA-----GTCATGC---TTTT---CT--------C---------AACTTCTCAACTGATTTCGAC-C-A-AACCT
gi|6 : t-TCTTATTAGTC---ATGCT----TTT---CTCAACTTC-----TCAACTGATTTCGACCAAACCTtttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|6 : ttttataattgtcattataagTCT-C--A-----A--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-T---TCGAC----CA-AACCTTTTACTTTTTAAAAA---TAT-----AA----GATATAAATATG---AAATCAAGTTG-TTC---TT-TTAT-ATAATCATGTTCTA-------GA-CACA---G-A-------GGATT----GATTGCTC---TGTAG--TT-ATT--TT--AAG-TTATAA--T----T--CTT----------GTCA-GC---ACTG---GT------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGACT--GCAA----GTATCAGTATGAAAT-----TCA------GTTGTGTA---TATTGTCGTCTC--TG-TA-GTGGT-ACTA----CTG-TCACTAG-TTGAAAAT--CATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACAG-A-G-G-G-G-CT--T-TA--ATGTC--AACA--G--CCA--CATTTT-TTA-ATAAAGTTTTAAAT--tttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgcttt-C-TACTCCAAAACG---T------G--------T-C------CA------TC--------G---ATATTAATCAAAAGTGTTAAGGAG--TATTA-----GTAT---GA-----AGTTTATTCA-T--GCATA--ACTGTC---G----TG--GTAACACGGTC--T----TCTG-AC-TTC-----------T-GTAG-------------------G---------------------T--A-AT-G-G---G-GCTC------------ATT-------C---A--C-CTCTCGATCGAAA-CT-------------G----AT-T---TTGGT----CA-AATATTCTA------AGTAA---TGTTATGTAA----G-------TAGG---AATTCC---TG-------TTGT-------A-CACGTT-------GTCGA-TACGT---------------------TACGGTCCATTTTTCG--TTGAGT--TTGATAA-TTTTAA--TTGTGT--ATC--TT------ATCA-GC---GCTACTTCT--------CC---T---AAATATCTCAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TT-AGAGG----CTATAAGTATAAATC-----CCA------GTTGTTTT---TATCATCActgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : tattcttattagctctgCC---------T------C--------T-CGATCGAAA------CT--------G---ATTTTGGTCAAATATTCTAAGTAA--TGTTATGTAAGTAG---GA-----ATTCCTGTTG-T--ACAC---GTTGTC---GATA-CG--TT--A-CGGTC--C----ATT-----TTTC-----G----T-TGAGTT----------T------GA---TA--A-----T-----TTT-A-ATTG-T---G-TATCT-TA-------T-----C--AGCGCTA--C-TTCTC---------CTAAATATCTCAACTG----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GAGGC---TAT-----AA----G-------TATA---AATCCCAGTTG-TTT---TT---ATCATCAACACATTCTGCTCCATCGA-CATAT-CG-C-------GGATT----TACTGCAC-----TAACTTT-AGG--TT--TTA-TTGTAA--T----T--CTTC-TT------GTCA-GT---ACTG---CT--------CC---acacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|8 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatggggctcattcaTTGTCAG-C---A--TTATTCCTC---CTAAACTTT-----TCTACGGATTTTGTCCAAACTTGCAA---GGGTGTTTT--ACTAGTCCAG-----------TTGTGAATACT---GCT---GT--G---CGTTACATCAG-TTATTCTGTAGAGTT-ATGTCACTT--GGAGAA-AT-TT-AA-T
gi|8 : ggcccttccattaC--AGT--T---G-----------CTCTTTATATC---ATT---CT--CTGTCAGTCCACCAA--T-TTGGGCATATTT-ATGGCCCTT--TGAT-A-ATATT-AA-TGATAAATCCAAGTAAAAAACCATATACA---TCACATTTTCTTGTCC--TC-----T-C-TTCTTCCCCTAAATTT------C--------T-T------AT------CT--------G---ACTTTAGCCAAACTTGCCAG---------------------------------------G-C--CTATC--TTTGTT---A----CA--TT--C-TGGTT--C----ATAA-AC-TTT-----------T-GGAGCTATGG-CCCTTT------AA---TT--ACAAATT-----TT--A-TT-G-T---A-ATTTT-TG-----------T-C--AGC---A--C-TTCTT---------CT-------------G----Attcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|9 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtcTT-ATGACCCTT--TCAT---AT-TT-AA------GATT-------------ATTTGCA---TTTTATTTTCA-GCCT--ATACATAT-CATGTTCA---------T------CATAAATTTT-C------TA------CT--------G---ATTTGGGCCATACTTTATAGGGAAATTATCA-----GTAT---GA-----ATCTCAACTG-C--T------GT-------G----C-------C-C--TT--C----ATCATAT-TCTT-----C----TCAAAGTTATGGCCCCTTT------CAAAGTT--A-----TGCACCTT--ACATAG-TTTCA-A---T-TG-------TATTA-T--AGC---A--C-TTCTCTTA------CT-------------G----AT-T---AGGGT----CAGAATTTGCAA------GAGAC---TAT-----AA----G-------T-TGTACAAATC--GTTGTCTC---Tacttcaaagctgattatg
gi|9 : a-TTCTA---------CT-------------G----AT-T---TGGGC----CA-TACTTTATA------GGGAAAT-TAT-----CA----G-------TATG---AATCTCAACTG-CTG---T-GCCCT--TCATCATATTCTTCTCAA---A-GTTAT-GG-CCCCTTTCAAAGT----TATG-CAC---CTTAC--AT-AGT--TT--CAA-TTGTA----------------TT------AT-A-GC---ACTT---CT--------CT---T---A----------CTGATTAGGGT-C-AGAATTTG-CA-AGAGA----CTAT--------A---------A------GTTGTACA---AATCGTTGTCTC--TA-TA-GTAA--ACTA----CTA-ACACTAA-TCAAAA--------------------TGGCATAAGT-ACAATAAGGC---TAAATGCACAG-TGG-G-G-G-CATTT-TT--GTGTC--G--A------CAGTCA-TTT--TA----AGTTTTTAAAT--atagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTGCCATTGTGTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCATACGCAGGAATACCACTTTCTTGTTTAGAATAGTACTTCTGAAAACCTTATCAACCGATTATGACAAAACATG
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 4444444444444444444444 1 3333333333333333 111111 1111 11111 444444444444444 111111111 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111 11111111111111111111111 222222222222222 22222222222222222222222 33333333333 11 1
lowQualScore : 1 1 5 5 1 2 2 3 2 7777777777777777777777 3 0 3 4444444444444444 1 0 4 000000 5555 777 0 6 11111 2 3 0 888 44 6 999999999999999 111111111 88888 0 1 55 3333 5 1 66 1 888 5 5 55 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888888 11111111 555 33 33 77777 555 77777 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 2 99999 5555 2 1 77 3333333 777 99999 5555 7777777 333 2 99999999999999999999999 4 0 2 2 222222222222222 5555 33 4444444444 2 1 33 22 2 33333333333333333333333 444 5555 88888888 88888888888 0 1 1 1 1 1 6666666 44444 555555 333 1 55 22 2 2 4444 2 1 5555 22 55555 1 0 7777 0 333 77777 2 5 2 33 2 9999 33333333333 33 2 2 11 33 99 1 3
lowQualScore : . . . . . . . . . ...................... . . . ................ . . . ...... .... ... . . ..... . . . ... .. . ............... ......... ..... . . .. .... . . .. . ... . . .. ............................................................................................. ...... ........ ... .. .. ..... ... ..... .................................................................................................................................................................................................... .... . ..... .... . . .. ....... ... ..... .... ....... ... . ....................... . . . . ............... .... .. .......... . . .. .. . ....................... ... .... ........ ........... . . . . . . ....... ..... ...... ... . .. .. . . .... . . .... .. ..... . . .... . ... ..... . . . .. . .... ........... .. . . .. .. .. . .
lowQualScore : 0 0 5 5 0 5 0 3 0 0000000000000000000000 2 0 0 7777777777777777 7 2 4 777777 9999 888 8 2 11111 6 7 2 888 22 7 555555555555555 444444444 99999 4 7 77 3333 0 0 99 4 888 7 0 11 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 22222222 444 44 99 11111 000 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3333 7 55555 7777 7 5 00 4444444 444 11111 0000 6666666 777 7 22222222222222222222222 2 2 4 4 999999999999999 0000 66 9999999999 5 5 11 99 2 33333333333333333333333 111 7777 11111111 22222222222 6 7 7 7 7 7 5555555 33333 000000 000 2 00 99 0 0 2222 0 0 3333 99 66666 0 2 2222 5 999 55555 5 0 5 44 5 8888 33333333333 77 7 7 00 55 22 0 3
consensus : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTT--TT------GTCAGC---ACTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTC-GTCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACTAGTCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( family-525 ) : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTT--TT------GTCAGC---ACTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTC-GTCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACTAGTCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
gi|1 : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATGGTTATTGCATTCTGATCCAATCGAATTTTG-----ACCATTTATCAATTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TG-TTTTATCAC-C---A--CTA---CAA---CTGAACTTT-----TCAATCGATTTTTGCCAAATTTGCTA---AGGAATATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTT---GT--GTTCTGGTCCATCGA-CT-ATTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGATTGGAT-TT-GA-GGGTAAATC-------------ATCTGTA---TCACACTTTCTAGTCC--GC-----T-C-TACCCC---------T------C--------T-T------AA------CT--------G---ATTTTAGCCAAATTTGCTAGGGAG--GATCA-----GAAT---GAGGTGAAGTCTAGTTG-T--GTATAAAGTCATC---G----TG--TT--C-TGGTC--C----ATTG-ACCTTTT-----G----T-GTAATTATGG-CCCTTT------AA---TT--A-----T-----TTGCA-AT-GGT---A-AATCTATG-------TATTTAC--ATC---A--CGCTTTC---------TT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTC------AGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTTCAGTTG-CTT---TTGTCATCATCATCACATTCAGTTCCGTCGA-CTCGA-AGAT-------GGAAT----TATTGCCC---TGTAG--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTA--TTATTCTAGTCAGC---ACTA---CT--------CC---C---AAATTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTA-CT-AACAA----GTGTCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TTTTGTC-TTCTC--TG-TAGTAGT-GTTA----CTG-TCACTAGTCAAATGT--TAT-----TAGTCAAATGACATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGTT-A-G-T-G-AA--T-TA--GTATC--A--A--GC-GCA--CA-TTT-CTA-ATTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|10 : ---AAGTCCATTTG-CTC---TTGACATTATCAT---GTTCTAGTCCATTGA-CATTT-GT-T-------GAACT----TACAGTCC-------------ATT--TT--CAA-TTATAA---------------TT------GTT----------------------------T---AAGC------AC-----ACAGT-C-----TTTG-CTTGGCAT----GTATCAGTTTGAAGA-----TAA------GTTGT------------T-GTCAC--TG-TAGT--T-AC-A----TT--TCACATGTCAAATTT--CAT-----TAATCAAATAGCGTTGTC-ACAATAAGGC---TACAAGGACAT-T-T-T-G-G-CA----TC--GTGCCCAC--A--T--GCA--CA-TTT-CTT-GTT
gi|11 : G---AAGTCCAGTTG-CTT---TT---ATCAGTGTCGGGTTATGCTCCATTCA--TAGTTGA-T-------GGAAC----TATGACA----TTTAA--CT-GTG--TC--CA--TTGTAA--T----T--CTC--TT--------TAGC---AC-A---TT--------CG---C---ACAATTC--AAACGATTATGGT-T-A-GATTTG-TA-ATCGA----GTATTGATATAAAGT-----GCA------AGTGTGCA---CATCGTC-GTCTTGATG--ATTAGT-AGTA----CTG-TCACTGTTCG-AACTGACAT-----TA----------ATT-----CAA-AAAGC---TAAAGGCACTG-T-G-G-GAG-CA--T-TC--GTGTT--GTTA--G--GAA--CA-TTG-ATA-GTTAtcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|12 : CT---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATCTTGACCAAACATTTTAGAGAA--TATCA-----GCAT---GA-----TGTCCAGTTG-C--TCA-----TCATC---A----CA--TT--C-CACTC--C----ATCG-AC---------------------TTATGG-C----------------TT--A-----T-----CC---------T---A-AAC------------TA-TT-C--AA-----------------------CT-------------G----AT-TA--TAGTC----TA-AACTTGCTA--------GAA---TGTAA---AA----G-------TACA---AGGTTCAGTTG-TGCATATTGTCATCtcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|12 : aaT--------CC---T---AAACTATTCAACTGATTATAGT-CTA-AACTTG-CT-AGAAT----GTAAAAGTACAAGGT-----TCA------GTTGTGCA---TATTGTC-ATCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACT-------GCT---AT-----TAGTCAACTAGTATTGCT-ACAATAATGC---TGCTGGCAAAG-T---------CA--C-T------TC--AATA--G--GCA--CA-CAT-CTA-GGTAtctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|13 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggcttaC-TTTTTATAAG----T-GGAGTTGTGG-ATCTTT------CA---TA--A-----T-----TT--T-AT-------------T-TG-------TATTTTC--AGT---A--C-TTCTCAGAAACTTACT-------------G----AT-T---TAGAC----CA-AGGTAGATA------GGGGA---AAT-----AA----G-------TAT----ACGTCCAGTTG-TTG---TTGTCATCATC---------TGCTTCCTTAA-CTTAT-GA-A-------AGAGT----AACGACAC---TTTGA--TT-ATT--TT--AAA-TTGTAA--T----T--CAT--T-----------------------CT--------CC---T---A--------AACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-TT-AACAA----GTATCAGTACGATGT-----ACA------GTTGTGCA---TATTATT-CTCTC--TG-GAGAAGT-GTTA----TTGAGCACTTGTCGAAACT--Cttcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|14 : t-AA-TGGTCAATT------------------CA---TCCCATTTTCTTGTCA--GC-----T-T-TACTCT---------T------T--------T-C------AA------CTTCTCAATCG---ATTTTCACCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----ATAT---GA-----AGTCTTGTTG-CTGAAATC--ATCCTC---A----TT--TT--T-TAGTC--T----ATCA-GC-TTTTA----G----T-GTAGATAT------TTTAGTTCAGG---TT--A-----T-----TTTAA-AT-G-C---AGAA----TA-------TATGT-----GC---A--T-GTGT----------CT-------------G----A---------------CA-CACATATTA------CTGAA---TAT-----CT----G-------TATA---AAGTCCAGTTG-C------TGTTAT--------TGTTGTACTCCATCAA-CTTTT-AG-T-------GGCGT----TACAGCCC---TTTAC--TT-TGT--TT--TA
gi|15 : taTGACCAAACTA---AGGGAG--AATCA-----GTGT---AA-----AGTCTAGTTT-C--TCGT----TCATT---G----TGCATT--C-AAATC--TTTGTATTG-AC-TTTT-----GA---T-GCAATTATCA-CCCTTT------AA---TTTCA-----T-----TT--G-ATGG-T---A-AATCT------------TTT-CTGATC---AAGC-CTATA---------AT-------------A----ATAT---CTTACAAATGA-AACTAGGTA------GGGAG---TAT-----CA----G-------AATG---AAGTCAAATAA-ATT---CTG-CAT-ATTGTCTCTTTCTGCTCCATTGA-CT-GC-AT-C-------ATAGTATAATATGGACT---TTTAA--TT-ATTTATT--TGC-TGGTAA--T----TAAATC--TT------GTCAt
gi|16 : T--TAA-T-GTAA--T----T--CTT----------GTCAGC---ACCA---CT--------CT---TTCAAAGTTTCTTGACTGATTATGGGAC-A-AA-TTG-CA-GGCAAACTGGCATCAGTACAAAGT-----TCA------GTTGTGTA---TATCATC-ATCTC--T---AGTAGT-ACTA----TTG--------------CT--TAT------AATACAATGGCAT-GCT-ACAATAACGC---TACAGGCACAG-G-G-G-G-GACA--T-TA--ATGTC--GGTA--G--GAT--TA-TTT-CTA---TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCtt
gi|17 : --TT--TAA-TTACAA--T----T--CTTAGTC------AACAAC---ACTC---CT--------CC---T---GAATTTCTCAACT--TTAT----------------T-AGCAA----GTTTTAGTAGGAAGC-----TCA------GTTGTGCA---TATTCTC-ATCTC--TGGTAGTAAC-AGTG----CTG-TCACTAGTAGTCCCT--CAA-----TAGTCAAATGACAATGCT-ACAGTAAAGC---TGCAGGCACAG-C-A-G-G--------------------------G--GCA--CA-TTC-CTA-GTTCCTTGTTAAtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|18 : T-GT-C-------AGAGT----TATTACCC---TTAAA--TT-GTT--AT--AAA-TCATA--------T--TTT--TT------GTCAGC---ACTA---CT--------CC---T---ACATTTTGCAACATATTATGGT-C-A-AACAAA-CC-AACCT----GTATCAGTAT---GT-----TCA------GTTGCG-A---TATTGTC-ATCTC--TA-TTGTTGT-ATTA----CTG-TCACTAG-----ACA--TAT-----------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACAG-T-G-G-A-G-CA--T-TC--CTCTT--G--A------CA--CA-TTT-CTA-TTT--TTTTT--AT--AAAAT-tgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|19 : cttTGAT-C-A-CACTTG-TT-AGAAA----GTATTAGTAGGAAGT-----TCA------GGTGTGTA---TATTGTC-ATCTC--TG-TAGTAGT-ATTA----CTG-ACTTTAGTCATAACT--CAT-----TTCTCAAATGGCATTGCT-GCAATATGAC---TACAGACACAA-T-GTG-G-G-TA--C-TT--GTGTC--G--ACTG--GCA--TA-TTT-CTA-GTTtctgcatgat
gi|2 : ttaacctTGGTT-AATCTTGTCAGCATT-TCT-TC--CTTT-AA-------ACTT-C---TCAAGTGATA-TTTTG-CAG-C---T--CTT---CTC---TT---CTTTCAGTTTTAACAGATTTTCCCCAAATATGAT---------TATTATTA-T---GATGAAGTCTACTTTTGCATATCCTGATC---GT--ATGCAGGTCTAT--ATCT-TTTTGTATAGTT-ATGGCCCTT--TTAATA-TT-TT-AA-TGTTAA-T---------------TTTG-----TCAC----------CA--GG-----A-C-TACTCC---------TAAACTGT--------T-C------AG------CT--------G---ATTTTTACCAATCTTGGTAGGGAG--TTTCG-----GCATTTAAA-----AATCCAGTTG-C--ACA-A--GTTGTC---GTTTGCA--TT--T-CGGTCTAC----AT---AT-TTTT-----G----A-AGAGTTATGG-TC-TTC------GG---CT--A-----------------AT-A-T---G-AAT---TG-------TATTC-C--TCCTA-A--C-TTTTG---------AA-------------G----AT-T---TTGGC----AA-AAGTT-TTA------GGGAT---TAT-----A---------------TG---AAGTCTAGTTG-CTC---TTATTGTCATCAT--GGTTTT-CTCCATTGAGCTC---GG-C-------AGAGT----TATGTCCC---T---G--TC-AGC--GC--TAC-TCGTAA-----------------------------------A---CT--------TC---T-----------CATCTG--TATTGT-C-G-AATTTT-CT-AGTAA----ATATCAGCATGAAGT-----TCA------GTTCCACA---AATCGCC-ATATC--TG-TATTTGTAACTA----TTG-TCACTTGTCGAAACC--CAT-----TATCCA---------------AATAAAAC---CACATGCACA------G-A-G-CA--TGTCTGGTAAC-----A--G--CCA--CA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--GCActggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|20 : attagatggta---AAATTTATTAACTGAATTTAGG-C-T-AATTTG-CA-AGCGA----GTATCATT-TGAAGC-----CAA------GTTGCATA---TATTATT-GTCtgttatatacatatttaacag
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATTATTGTCGCATTCCTATCTA-TT-GAT---G-----AAC-TTT-TC-------AATG-GTAAATCT------CA-------------TCAG-T---A--TTA---CTC---CTAA---CC-----TCA-----------TCAAACTTGGTA---TGGAGTATCGGTA-T---GAAACCTGT---TTGAGCTTACC---ATC---ATTTGTTCTGGTTCATTGA-TG-TTTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGTTTgcattcctatctattgatgaacttttcaatggtaaatctcatcagtattactcctaacctcatcaaacttggtatggagtatcggtatgaaacctgtttgagcttaccatcatttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|21 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcTTATTA------GGGAA---TAT-----AA----A-------TATG---AAGTC------------------------ATCACGTTCTGCTCCATTGA-TTTAT-GG-T-------GGAGT----GATAGCCC---TTTAA--TT-ATT--TA--TTA-TTGAAA--T----T--CTT----------GTCAGC---ATTT---TT--------CC---T---AAACTTCTCAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTTA-AC-AGCAA----GTATCAGTGTGAAGT-----TTA------CTTGTGCA---TATTGACAGTCT
gi|22 : TATACA---TTACACTTTCTTGTCCAGGT-----TAC-TACTCCAAAA-----T------GAA------T-T------AA------CT--------G---ATCTTGGCCAAACTTGTT-GGGAG--TATCA-----GCAT---GA-----ATTCTAGTggaggtaaacctttgttccaagatcaaaacttcttt
gi|23 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccaccT--TT--TAA-TTGTACGTT----T--ATT--TT------GTCAGC---ATTA---CCAGTACTCACCA--T---GAACTTTTCAATCGATTATGGC-C-A-AACTTG-GT-AGTAA----GTATCAGTAAGAAGT-----TCA------GGTTTGCA---AATTGTC-ATCTA--T----GTAGT-ACTA----CTG-TTAGCAGTCTAATAT--CGT-----TAGGCAAATAACATTGCT-GCTATAAAGT---TACAGGCACAG-T-
gi|24 : aTCCTGAACTGATTTTGGC-C-A-AACTCC-CT-ATGGA----GTATCAGTGTGATAT-----CTA------GTTGTGCA---CACAATT-TTCTT--TG-TAGTAGT-ATTT----CAG-TCGGTAGACAAAACT--CGG-----TAATCTAATG---TTGGT-TAAGTAAGGC---AAAAGT--CAG-T-G-GTG-G-CA--T-TT--GTGT
gi|25 : cagagttactgccctttagtaattttcaTTCTCGACTGACTATCAT-C-A-AA---G-AA-AGC-----------------AAGT-----TCG------GAT----A---TATTATC-TTCTC--TG-TATAAGT-ACAA----CTG-TCACCAGTAGAAATT--CAT-----TAGTCTGATAGCATTGCT-ACACT--TGC---TACAAGCACAA-T-GCT-G-G-CA--T-TA--TTCTC--A--A--AATATA--CA-TTT-CTA-aaa
gi|26 : cccaaatcatctctTATATT-C-A-AACTT---T-----------TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGGACATTCTGTCATC-ACCTT--TG-TTGTTGT-TTTA----CTG-ACAGTAGTGGAAACT--CAT-----T-GTCAAATGGCAATG------------------------------G-G-G-G-CA--T-TT--GTGAT--GACA--G--GCA--TA-TTT-ATA-------TTTTAAAa
gi|27 : -C-A-AACTTA-CT-AGAAA----GTAGC-----GAAGT-----TTA------ATTTTGCA---TATCcctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttcac--TT-TCTTGCCAG-CTTAA--CTC---CTC---CTAAACTTC-----TCAACAGATTTCGGCCAAACTTTCTA---GAGAGTAAC---A-T---G-----------TTATtgcgtgcttacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|28 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggcacATGCGTACATCTATAGATCACAC--TT-TATTGTCAG-C---A--CTATC-CTC---TTAA-CTTT-----TCAACCGATTTTGGCAAAACATACTA---Gcgactcttatatca
gi|29 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgAG-C---A--CTA---CTCATCCTAAACTTC-----TAAACTGATTTTGACCAAACTTGTTATTCGGAAATATtttat
gi|29 : ---A--C-TTCTAAA-------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTATTC---GGAAA---TAT-----AT----T-------TATG---AAGTAAAATTA-CTC---TTATCGTCATCATatttatgaagtaaaattactcttatcgtcatcatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|3 : agcactactcatcctaa-----------TTGGGCATATC---ATTATTGT--GCTCCAGTGTATTGA-CT-TTTGGTGCAGTTTATTGCCCTT--TCATTA-TT-TTTAA-TTGTAAATC-------------TTGT-CA---GCAC---TTCT--------C-----C-T-TAAACT---------T------T--------T-A------AA------CT--------G---GTTTTGACCAAACTCATTAGGAAG--TTTCA-----GTAT---GA-----AGTTCCGTTG-T--TTATA---TCGCCAGTG----CA--TT--C-TTGAC--T----ATTG-A----TT-----GAAGGT-GCAGTTACTG-ATCTT--------A---CC--AA----T-----TT--A-AT---------AAT--------------TCT-C--AAC-----------------------T-------------G----AT-T---T-GAT----AA-AATTT--TA------CGGAA---TAT-----AAACTGG-------TGTA---ATATTAAGTTT-CTC---TTATCATTATCA-CA-GTT-TGCTCCATCAA-CTTGAAGG-C-------AGAGT----TACAGCCC---TTGAA--TT-ATT--TT--TAG-TTGTAA--T----T--ATTC-TT------GTCAGTTTTACTT---CT--------CC---TGTAAAACTTCTCAACTGATTATTGT-C-A-AACTTG-CT-AGCAA----GTATTGGTACAAAAA-----TCA------GT---------TATTGTC-AGCTC--TG-TAGTAGT-ACCACTGTCTG-TCAATAGTCAAAACT--CAG-----TAGTGGAATTGCATTGAT-GCAA-AAGGC---TACAGCCACAG-T-G-G-GCA-CA--T-TC--TTGTC--GACA--G--GCA--CA-TTT-TTA-TTTTATTTTgtttttaggacagagttacaaccc
gi|31 : t-C------AG------TC--------G---ATTTTGCTCAGACTTACCAGGGAG--TATCA-----GCTT---GA-----TGTTCAGTTGTC--ACATGTCGTTGTC---A----CA--TG--T-CAGTC--T----GTTG-AC-CTTT-----G---------GT--TGG-CCATTgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|32 : GT--TAATCTTTTCAG-C---T--TTA---CTC---CTAAGCTTC-----CCAACAGATTTTGACCAAACTTGTAA---GGGAGTAaaact
gi|33 : ttaatt-TAGTAGT-ATT-----CTG-TCACAAGAAAAAATT--TAT-----TAGTCAGATGGCATTG-T-ACAATAAGGC---
gi|4 : TT---GTC---AT--GATCTGGTTTATGAA-TG-TTTGGCTTAATT-AAATCCCGTAATAATTA-AT-TT-AAATGGTAAATCTTCAT--------ATGTACAATATCAAAATTACT-TTTCA-GC-----T-C-TATTCC---------T------C--------C-T------AAATTTCACT--------ATCAATTCTGGCCGGCCTTGTTTGGGAA--TATCA-----TTAT---GG-----GATTAAGT-------CATA---TCATT------------TT--T---GTC--T----ATCC-AT-TTAT-----A----T-----TGATGG-CCCTTT------GA---TA--A-----T-----TTG-A-AT-GGC---A-AATCT-T-----------TT-C--AGC---A--C-ATCTC---------TT-------------ACGAAAT-TCAGTTGAC----T-----TTGCTA------AGGGGGTTTCT-----GA----G-------TA-------ATCCAGTTA--------TG----------CATATT-TGCTTCATTGA-AGTTT-GA-C-------GGAG----------CTC---ATTAA--AT-AGT--TA--TAAATCGTAA--T----T--CTT----------GTAAGC---AATA---CT--------CC---T---AAACTTCTCGACAGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGGGA----GTATCAGTATCAAGT-----TCA------GTTGCTCA---TTTCTTC-AATTG--TG-TAGTA------------------------GAAACC--TTT-----TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACAA-C-A-G-G-G-TA--T-TC--CTGTC--AACA--G--TCA--CA-TTT-CTA-GTTAA
gi|5 : gTTTT-GTCA--GA-----A-C-TACTCC---------TAAAAT-T--------TGC------AA------CA--------G---ATATTGGTCAAAAT-GTTGAGAAA--TTTCA-----GTA-----A-----GGTCCTGTTG-A--ACATA--GT-------------G--T-----CAATG--C----ATTG-AT-TTTTA----G----T-GACGTTATGG-ATCTTT------GA---TA--A-----T-----TTT-A-ATTG-T---A-AATAT-TGACGGCGTTATTT-C--TCCTAAA--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-T---T-GGC----CA-AA-----------------------T-----AA----G-------TATT---AAGTCCAATTG-GTC---CTGTCACCATCAT---GTTCTTCTCCATTGA-CTagagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaaA---TAC-----AA----G-------TATG---AAGTCAAATTG-CTC---C---CATCACCATTATGTTCTGCTCCATTGA-CTTAT-TG-C-------TGAGT----TAtatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttatCATGATGTTCTGCTCTATTGA-CTAAT-GA-C-------AGAGT----TACATCCC---TTT-----------------------TAA--T----T--CTT----------GTTAGA---GCTA---CT--------CCTCCT---AAACTTCTCAACTGACTGTGGG-G-A-ATTTTG-AT-A--TA----GTA--AGTATGAGGTAACGATCATGTCTGGTGGTGGA---TATTGTC-ATCTT--TG-TAACGGT-GCTG----CTG-Tacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|6 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtata-TCTTATTAGTC---ATGCT----TTT---CTCAACTTC-----TCAACTGATTTCGACCAAACCT
gi|6 : ttttataattgtcattataagTCT-C--A-----A--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-T---TCGAC----CA-AACCTTTTACTTTTTAAAAA---TAT-----AA----GATATAAATATG---AAATCAAGTTG-TTC---TT-TTAT-ATAATCATGTTCTA-------GA-CACA---G-A-------GGATT----GATTGCTC---TGTAG--TT-ATT--TT--AAG-TTATAA--T----T--CTT----------GTCAGC---ACTG---GT------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGACT--GCAA----GTATCAGTATGAAAT-----TCA------GTTGTGTA---TATTGTC-GTCTC--TG-TAGTGGT-ACTA----CTG-TCACTAGTTGAAAAT--CATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACAG-A-G-G-G-G-CT--T-TA--ATGTC--AACA--G--CCA--CATTTT-TTA-ATAAAGTTTTAAAT--tttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgcttt-C-TACTCCAAAACG---T------G--------T-C------CA------TC--------G---ATATTAATCAAAAGTGTTAAGGAG--TATTA-----GTAT---GA-----AGTTTATTCA-T--GCATA--ACTGTC---G----TG--GTAACACGGTC--T----TCTG-AC-TTC-----------T-GTAG-------------------G---------------------T--A-AT-G-G---G-GCTC------------ATT-------C---A--C-CTCTCGATCGAAA-CT-------------G----AT-T---TTGGT----CA-AATATTCTA------AGTAA---TGTTATGTAA----G-------TAGG---AATTCC---TG-------TTGT-------A-CACGTT-------GTCGA-TACGT---------------------TACGGTCCATTTTTCG--TTGAGT--TTGATAA-TTTTAA--TTGTGT--ATC--TT------ATCAGC---GCTACTTCT--------CC---T---AAATATCTCAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TT-AGAGG----CTATAAGTATAAATC-----CCA------GTTGTTTT---TATCATC-ctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : tattcttattagctctgCC---------T------C--------T-CGATCGAAA------CT--------G---ATTTTGGTCAAATATTCTAAGTAA--TGTTATGTAAGTAG---GA-----ATTCCTGTTG-T--ACAC---GTTGTC---GATA-CG--TT--A-CGGTC--C----ATT-----TTTC-----G----T-TGAGTT----------T------GA---TA--A-----T-----TTT-A-ATTG-T---G-TATCT-TA-------T-----C--AGCGCTA--C-TTCTC---------CTAAATATCTCAACTG----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GAGGC---TAT-----AA----G-------TATA---AATCCCAGTTG-TTT---TT---ATCATCAACACATTCTGCTCCATCGA-CATAT-CG-C-------GGATT----TACTGCAC-----TAACTTT-AGG--TT--TTA-TTGTAA--T----T--CTTC-TT------GTCAGT---ACTG---CT--------CC---aacacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|8 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatggggctcattcaTTGTCAG-C---A--TTATTCCTC---CTAAACTTT-----TCTACGGATTTTGTCCAAACTTGCAA---GGGTGTTTTACTAGTCCAG-----------TTGTGAATACT---GCT---GT--G---CGTTACATCAG-TTATTCTGTAGAGTT-ATGTCACTT--GGAGAA-AT-TT-AA-T
gi|8 : ggcccttccattaCAGT--T---G-----------CTCTTTATATC---ATT---CT--CTGTCAGTCCACCAA--T-TTGGGCATATTT-ATGGCCCTT--TGAT-A-ATATT-AA-TGATAAATCCAAGTAAAAAACCATATACA---TCACATTTTCTTGTCC--TC-----T-C-TTCTTCCCCTAAATTT------C--------T-T------AT------CT--------G---ACTTTAGCCAAACTTGCCAG---------------------------------------G-C--CTATC--TTTGTT---A----CA--TT--C-TGGTT--C----ATAA-AC-TTT-----------T-GGAGCTATGG-CCCTTT------AA---TT--ACAAATT-----TT--A-TT-G-T---A-ATTTT-TG-----------T-C--AGC---A--C-TTCTT---------CT-------------G----Attcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|9 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtcTT-ATGACCCTT--TCAT---AT-TT-AA------GATT-------------ATTTGCA---TTTTATTTTCA-GCCT--ATACATAT-CATGTTCA---------T------CATAAATTTT-C------TA------CT--------G---ATTTGGGCCATACTTTATAGGGAAATTATCA-----GTAT---GA-----ATCTCAACTG-C--T------GT-------G----C-------C-C--TT--C----ATCATAT-TCTT-----C----TCAAAGTTATGGCCCCTTT------CAAAGTT--A-----TGCACCTT--ACATAG-TTTCA-A---T-TG-------TATTA-T--AGC---A--C-TTCTCTTA------CT-------------G----AT-T---AGGGT----CAGAATTTGCAA------GAGAC---TAT-----AA----G-------T-TGTACAAATC--GTTGTCTC---Tacttcaaagctgattatg
gi|9 : a-TTCTA---------CT-------------G----AT-T---TGGGC----CA-TACTTTATA------GGGAAAT-TAT-----CA----G-------TATG---AATCTCAACTG-CTG---T-GCCCT--TCATCATATTCTTCTCAA---A-GTTAT-GG-CCCCTTTCAAAGT----TATG-CAC---CTTAC--AT-AGT--TT--CAA-TTGTA----------------TT------AT-AGC---ACTT---CT--------CT---T-------------ACTGATTAGGGT-C-AGAATTTG-CA-AGAGA----CTAT-A----------------A------GTTGTACA---AATCGTT-GTCTC--TA-TAGTAA--ACTA----CTA-ACACTAATCA--------------------AAATGGCATAAGT-ACAATAAGGC---TAAATGCACAG-TGG-G-G-G-CATTT-TT--GTGTC--G--A------CAGTCA-TTT--TA----AGTTTTTAAAT--atagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTGCCATTGTGTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCATACGCAGGAATACCACTTTCTTGTTTAGAATAGTACTTCTGAAAACCTTATCAACCGATTATGACAAAACATG
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 4444444444444444444444 1 3333333333333333 111111 1111 11111 444444444444444 111111111 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111 11111111111111111111111 222222222222222 22222222222222222222222 33333333333 11 1
lowQualScore : 1 1 5 5 1 2 2 3 2 7777777777777777777777 3 0 3 4444444444444444 1 0 4 000000 5555 777 0 6 11111 2 3 0 888 44 6 999999999999999 111111111 88888 0 1 55 3333 5 1 66 1 888 5 5 55 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888888 11111111 555 33 33 77777 555 77777 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 2 99999 5555 2 1 77 3333333 777 99999 5555 7777777 333 2 99999999999999999999999 4 0 2 2 222222222222222 5555 33 4444444444 2 1 33 22 2 33333333333333333333333 444 5555 88888888 88888888888 0 1 1 1 1 1 6666666 44444 555555 333 1 55 22 2 2 4444 2 1 5555 22 55555 1 0 7777 0 333 77777 2 5 2 33 2 9999 33333333333 33 2 2 11 33 99 1 3
lowQualScore : . . . . . . . . . ...................... . . . ................ . . . ...... .... ... . . ..... . . . ... .. . ............... ......... ..... . . .. .... . . .. . ... . . .. ............................................................................................. ...... ........ ... .. .. ..... ... ..... .................................................................................................................................................................................................... .... . ..... .... . . .. ....... ... ..... .... ....... ... . ....................... . . . . ............... .... .. .......... . . .. .. . ....................... ... .... ........ ........... . . . . . . ....... ..... ...... ... . .. .. . . .... . . .... .. ..... . . .... . ... ..... . . . .. . .... ........... .. . . .. .. .. . .
lowQualScore : 0 0 5 5 0 5 0 3 0 0000000000000000000000 2 0 0 7777777777777777 7 2 4 777777 9999 888 8 2 11111 6 7 2 888 22 7 555555555555555 444444444 99999 4 7 77 3333 0 0 99 4 888 7 0 11 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 22222222 444 44 99 11111 000 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3333 7 55555 7777 7 5 00 4444444 444 11111 0000 6666666 777 7 22222222222222222222222 2 2 4 4 999999999999999 0000 66 9999999999 5 5 11 99 2 33333333333333333333333 111 7777 11111111 22222222222 6 7 7 7 7 7 5555555 33333 000000 000 2 00 99 0 0 2222 0 0 3333 99 66666 0 2 2222 5 999 55555 5 0 5 44 5 8888 33333333333 77 7 7 00 55 22 0 3
consensus : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTT--TT------GTCAGC---ACTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTC-GTCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACTAGTCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( family-525 ) : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTT--TT------GTCAGC---ACTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTC-GTCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACTAGTCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
gi|1 : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATGGTTATTGCATTCTGATCCAATCGAATTTTG-----ACCATTTATCAATTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TG-TTTTATCAC-C---A--CTA---CAA---CTGAACTTT-----TCAATCGATTTTTGCCAAATTTGCTA---AGGAATATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTT---GT--GTTCTGGTCCATCGA-CT-ATTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGATTGGAT-TT-GA-GGGTAAATC-------------ATCTGTA---TCACACTTTCTAGTCC--GC-----T-C-TACCCC---------T------C--------T-T------AA------CT--------G---ATTTTAGCCAAATTTGCTAGGGAG--GATCA-----GAAT---GAGGTGAAGTCTAGTTG-T--GTATAAAGTCATC---G----TG--TT--C-TGGTC--C----ATTG-ACCTTTT-----G----T-GTAATTATGG-CCCTTT------AA---TT--A-----T-----TTGCA-AT-GGT---A-AATCTATG-------TATTTAC--ATC---A--CGCTTTC---------TT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTC------AGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTTCAGTTG-CTT---TTGTCATCATCATCACATTCAGTTCCGTCGA-CTCGA-AGAT-------GGAAT----TATTGCCC---TGTAG--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTA--TTATTCTAGTCAGC---ACTA---CT--------CC---C---AAATTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTA-CT-AACAA----GTGTCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TTTTGTC-TTCTC--TG-TAGTAGT-GTTA----CTG-TCACTAGTCAAATGT--TAT-----TAGTCAAATGACATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGTT-A-G-T-G-AA--T-TA--GTATC--A--A--GC-GCA--CA-TTT-CTA-ATTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|10 : ---AAGTCCATTTG-CTC---TTGACATTATCAT---GTTCTAGTCCATTGA-CATTT-GT-T-------GAACT----TACAGTCC-------------ATT--TT--CAA-TTATAA---------------TT------GTT----------------------------T---AAGC------AC-----ACAGT-C-----TTTG-CTTGGCAT----GTATCAGTTTGAAGA-----TAA------GTTGT------------T-GTCAC--TG-TAGT--T-AC-A----TT--TCACATGTCAAATTT--CAT-----TAATCAAATAGCGTTGTC-ACAATAAGGC---TACAAGGACAT-T-T-T-G-G-CA----TC--GTGCCCAC--A--T--GCA--CA-TTT-CTT-GTT
gi|11 : G---AAGTCCAGTTG-CTT---TT---ATCAGTGTCGGGTTATGCTCCATTCA--TAGTTGA-T-------GGAAC----TATGACA----TTTAA--CT-GTG--TC--CA--TTGTAA--T----T--CTC--TT--------TAGC---AC-A---TT--------CG---C---ACAATTC--AAACGATTATGGT-T-A-GATTTG-TA-ATCGA----GTATTGATATAAAGT-----GCA------AGTGTGCA---CATCGTC-GTCTTGATG--ATTAGT-AGTA----CTG-TCACTGTTCG-AACTGACAT-----TA----------ATT-----CAA-AAAGC---TAAAGGCACTG-T-G-G-GAG-CA--T-TC--GTGTT--GTTA--G--GAA--CA-TTG-ATA-GTTAtcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|12 : CT---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATCTTGACCAAACATTTTAGAGAA--TATCA-----GCAT---GA-----TGTCCAGTTG-C--TCA-----TCATC---A----CA--TT--C-CACTC--C----ATCG-AC---------------------TTATGG-C----------------TT--A-----T-----CC---------T---A-AAC------------TA-TT-C--AA-----------------------CT-------------G----AT-TA--TAGTC----TA-AACTTGCTA--------GAA---TGTAA---AA----G-------TACA---AGGTTCAGTTG-TGCATATTGTCATCtcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|12 : aaT--------CC---T---AAACTATTCAACTGATTATAGT-CTA-AACTTG-CT-AGAAT----GTAAAAGTACAAGGT-----TCA------GTTGTGCA---TATTGTC-ATCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACT-------GCT---AT-----TAGTCAACTAGTATTGCT-ACAATAATGC---TGCTGGCAAAG-T---------CA--C-T------TC--AATA--G--GCA--CA-CAT-CTA-GGTAtctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|13 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggcttaC-TTTTTATAAG----T-GGAGTTGTGG-ATCTTT------CA---TA--A-----T-----TT--T-AT-------------T-TG-------TATTTTC--AGT---A--C-TTCTCAGAAACTTACT-------------G----AT-T---TAGAC----CA-AGGTAGATA------GGGGA---AAT-----AA----G-------TAT----ACGTCCAGTTG-TTG---TTGTCATCATC---------TGCTTCCTTAA-CTTAT-GA-A-------AGAGT----AACGACAC---TTTGA--TT-ATT--TT--AAA-TTGTAA--T----T--CAT--T-----------------------CT--------CC---T---A--------AACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-TT-AACAA----GTATCAGTACGATGT-----ACA------GTTGTGCA---TATTATT-CTCTC--TG-GAGAAGT-GTTA----TTGAGCACTTGTCGAAACT--Cttcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|14 : t-AA-TGGTCAATT------------------CA---TCCCATTTTCTTGTCA--GC-----T-T-TACTCT---------T------T--------T-C------AA------CTTCTCAATCG---ATTTTCACCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----ATAT---GA-----AGTCTTGTTG-CTGAAATC--ATCCTC---A----TT--TT--T-TAGTC--T----ATCA-GC-TTTTA----G----T-GTAGATAT------TTTAGTTCAGG---TT--A-----T-----TTTAA-AT-G-C---AGAA----TA-------TATGT-----GC---A--T-GTGT----------CT-------------G----A---------------CA-CACATATTA------CTGAA---TAT-----CT----G-------TATA---AAGTCCAGTTG-C------TGTTAT--------TGTTGTACTCCATCAA-CTTTT-AG-T-------GGCGT----TACAGCCC---TTTAC--TT-TGT--TT--TA
gi|15 : taTGACCAAACTA---AGGGAG--AATCA-----GTGT---AA-----AGTCTAGTTT-C--TCGT----TCATT---G----TGCATT--C-AAATC--TTTGTATTG-AC-TTTT-----GA---T-GCAATTATCA-CCCTTT------AA---TTTCA-----T-----TT--G-ATGG-T---A-AATCT------------TTT-CTGATC---AAGC-CTATA---------AT-------------A----ATAT---CTTACAAATGA-AACTAGGTA------GGGAG---TAT-----CA----G-------AATG---AAGTCAAATAA-ATT---CTG-CAT-ATTGTCTCTTTCTGCTCCATTGA-CT-GC-AT-C-------ATAGTATAATATGGACT---TTTAA--TT-ATTTATT--TGC-TGGTAA--T----TAAATC--TT------GTCAt
gi|16 : T--TAA-T-GTAA--T----T--CTT----------GTCAGC---ACCA---CT--------CT---TTCAAAGTTTCTTGACTGATTATGGGAC-A-AA-TTG-CA-GGCAAACTGGCATCAGTACAAAGT-----TCA------GTTGTGTA---TATCATC-ATCTC--T---AGTAGT-ACTA----TTG--------------CT--TAT------AATACAATGGCAT-GCT-ACAATAACGC---TACAGGCACAG-G-G-G-G-GACA--T-TA--ATGTC--GGTA--G--GAT--TA-TTT-CTA---TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCtt
gi|17 : --TT--TAA-TTACAA--T----T--CTTAGTC------AACAAC---ACTC---CT--------CC---T---GAATTTCTCAACT--TTAT----------------T-AGCAA----GTTTTAGTAGGAAGC-----TCA------GTTGTGCA---TATTCTC-ATCTC--TGGTAGTAAC-AGTG----CTG-TCACTAGTAGTCCCT--CAA-----TAGTCAAATGACAATGCT-ACAGTAAAGC---TGCAGGCACAG-C-A-G-G--------------------------G--GCA--CA-TTC-CTA-GTTCCTTGTTAAtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|18 : T-GT-C-------AGAGT----TATTACCC---TTAAA--TT-GTT--AT--AAA-TCATA--------T--TTT--TT------GTCAGC---ACTA---CT--------CC---T---ACATTTTGCAACATATTATGGT-C-A-AACAAA-CC-AACCT----GTATCAGTAT---GT-----TCA------GTTGCG-A---TATTGTC-ATCTC--TA-TTGTTGT-ATTA----CTG-TCACTAG-----ACA--TAT-----------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACAG-T-G-G-A-G-CA--T-TC--CTCTT--G--A------CA--CA-TTT-CTA-TTT--TTTTT--AT--AAAAT-tgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|19 : cttTGAT-C-A-CACTTG-TT-AGAAA----GTATTAGTAGGAAGT-----TCA------GGTGTGTA---TATTGTC-ATCTC--TG-TAGTAGT-ATTA----CTG-ACTTTAGTCATAACT--CAT-----TTCTCAAATGGCATTGCT-GCAATATGAC---TACAGACACAA-T-GTG-G-G-TA--C-TT--GTGTC--G--ACTG--GCA--TA-TTT-CTA-GTTtctgcatgat
gi|2 : ttaacctTGGTT-AATCTTGTCAGCATT-TCT-TC--CTTT-AA-------ACTT-C---TCAAGTGATA-TTTTG-CAG-C---T--CTT---CTC---TT---CTTTCAGTTTTAACAGATTTTCCCCAAATATGAT---------TATTATTA-T---GATGAAGTCTACTTTTGCATATCCTGATC---GT--ATGCAGGTCTAT--ATCT-TTTTGTATAGTT-ATGGCCCTT--TTAATA-TT-TT-AA-TGTTAA-T---------------TTTG-----TCAC----------CA--GG-----A-C-TACTCC---------TAAACTGT--------T-C------AG------CT--------G---ATTTTTACCAATCTTGGTAGGGAG--TTTCG-----GCATTTAAA-----AATCCAGTTG-C--ACA-A--GTTGTC---GTTTGCA--TT--T-CGGTCTAC----AT---AT-TTTT-----G----A-AGAGTTATGG-TC-TTC------GG---CT--A-----------------AT-A-T---G-AAT---TG-------TATTC-C--TCCTA-A--C-TTTTG---------AA-------------G----AT-T---TTGGC----AA-AAGTT-TTA------GGGAT---TAT-----A---------------TG---AAGTCTAGTTG-CTC---TTATTGTCATCAT--GGTTTT-CTCCATTGAGCTC---GG-C-------AGAGT----TATGTCCC---T---G--TC-AGC--GC--TAC-TCGTAA-----------------------------------A---CT--------TC---T-----------CATCTG--TATTGT-C-G-AATTTT-CT-AGTAA----ATATCAGCATGAAGT-----TCA------GTTCCACA---AATCGCC-ATATC--TG-TATTTGTAACTA----TTG-TCACTTGTCGAAACC--CAT-----TATCCA---------------AATAAAAC---CACATGCACA------G-A-G-CA--TGTCTGGTAAC-----A--G--CCA--CA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--GCActggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|20 : attagatggta---AAATTTATTAACTGAATTTAGG-C-T-AATTTG-CA-AGCGA----GTATCATT-TGAAGC-----CAA------GTTGCATA---TATTATT-GTCtgttatatacatatttaacag
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATTATTGTCGCATTCCTATCTA-TT-GAT---G-----AAC-TTT-TC-------AATG-GTAAATCT------CA-------------TCAG-T---A--TTA---CTC---CTAA---CC-----TCA-----------TCAAACTTGGTA---TGGAGTATCGGTA-T---GAAACCTGT---TTGAGCTTACC---ATC---ATTTGTTCTGGTTCATTGA-TG-TTTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGTTTgcattcctatctattgatgaacttttcaatggtaaatctcatcagtattactcctaacctcatcaaacttggtatggagtatcggtatgaaacctgtttgagcttaccatcatttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|21 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcTTATTA------GGGAA---TAT-----AA----A-------TATG---AAGTC------------------------ATCACGTTCTGCTCCATTGA-TTTAT-GG-T-------GGAGT----GATAGCCC---TTTAA--TT-ATT--TA--TTA-TTGAAA--T----T--CTT----------GTCAGC---ATTT---TT--------CC---T---AAACTTCTCAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTTA-AC-AGCAA----GTATCAGTGTGAAGT-----TTA------CTTGTGCA---TATTGACAGTCT
gi|22 : TATACA---TTACACTTTCTTGTCCAGGT-----TAC-TACTCCAAAA-----T------GAA------T-T------AA------CT--------G---ATCTTGGCCAAACTTGTT-GGGAG--TATCA-----GCAT---GA-----ATTCTAGTggaggtaaacctttgttccaagatcaaaacttcttt
gi|23 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccaccT--TT--TAA-TTGTACGTT----T--ATT--TT------GTCAGC---ATTA---CCAGTACTCACCA--T---GAACTTTTCAATCGATTATGGC-C-A-AACTTG-GT-AGTAA----GTATCAGTAAGAAGT-----TCA------GGTTTGCA---AATTGTC-ATCTA--T----GTAGT-ACTA----CTG-TTAGCAGTCTAATAT--CGT-----TAGGCAAATAACATTGCT-GCTATAAAGT---TACAGGCACAG-T-
gi|24 : aTCCTGAACTGATTTTGGC-C-A-AACTCC-CT-ATGGA----GTATCAGTGTGATAT-----CTA------GTTGTGCA---CACAATT-TTCTT--TG-TAGTAGT-ATTT----CAG-TCGGTAGACAAAACT--CGG-----TAATCTAATG---TTGGT-TAAGTAAGGC---AAAAGT--CAG-T-G-GTG-G-CA--T-TT--GTGT
gi|25 : cagagttactgccctttagtaattttcaTTCTCGACTGACTATCAT-C-A-AA---G-AA-AGC-----------------AAGT-----TCG------GAT----A---TATTATC-TTCTC--TG-TATAAGT-ACAA----CTG-TCACCAGTAGAAATT--CAT-----TAGTCTGATAGCATTGCT-ACACT--TGC---TACAAGCACAA-T-GCT-G-G-CA--T-TA--TTCTC--A--A--AATATA--CA-TTT-CTA-aaa
gi|26 : cccaaatcatctctTATATT-C-A-AACTT---T-----------TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGGACATTCTGTCATC-ACCTT--TG-TTGTTGT-TTTA----CTG-ACAGTAGTGGAAACT--CAT-----T-GTCAAATGGCAATG------------------------------G-G-G-G-CA--T-TT--GTGAT--GACA--G--GCA--TA-TTT-ATA-------TTTTAAAa
gi|27 : -C-A-AACTTA-CT-AGAAA----GTAGC-----GAAGT-----TTA------ATTTTGCA---TATCcctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttcac--TT-TCTTGCCAG-CTTAA--CTC---CTC---CTAAACTTC-----TCAACAGATTTCGGCCAAACTTTCTA---GAGAGTAAC---A-T---G-----------TTATtgcgtgcttacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|28 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggcacATGCGTACATCTATAGATCACAC--TT-TATTGTCAG-C---A--CTATC-CTC---TTAA-CTTT-----TCAACCGATTTTGGCAAAACATACTA---Gcgactcttatatca
gi|29 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgAG-C---A--CTA---CTCATCCTAAACTTC-----TAAACTGATTTTGACCAAACTTGTTATTCGGAAATATtttat
gi|29 : ---A--C-TTCTAAA-------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTATTC---GGAAA---TAT-----AT----T-------TATG---AAGTAAAATTA-CTC---TTATCGTCATCATatttatgaagtaaaattactcttatcgtcatcatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|3 : agcactactcatcctaa-----------TTGGGCATATC---ATTATTGT--GCTCCAGTGTATTGA-CT-TTTGGTGCAGTTTATTGCCCTT--TCATTA-TT-TTTAA-TTGTAAATC-------------TTGT-CA---GCAC---TTCT--------C-----C-T-TAAACT---------T------T--------T-A------AA------CT--------G---GTTTTGACCAAACTCATTAGGAAG--TTTCA-----GTAT---GA-----AGTTCCGTTG-T--TTATA---TCGCCAGTG----CA--TT--C-TTGAC--T----ATTG-A----TT-----GAAGGT-GCAGTTACTG-ATCTT--------A---CC--AA----T-----TT--A-AT---------AAT--------------TCT-C--AAC-----------------------T-------------G----AT-T---T-GAT----AA-AATTT--TA------CGGAA---TAT-----AAACTGG-------TGTA---ATATTAAGTTT-CTC---TTATCATTATCA-CA-GTT-TGCTCCATCAA-CTTGAAGG-C-------AGAGT----TACAGCCC---TTGAA--TT-ATT--TT--TAG-TTGTAA--T----T--ATTC-TT------GTCAGTTTTACTT---CT--------CC---TGTAAAACTTCTCAACTGATTATTGT-C-A-AACTTG-CT-AGCAA----GTATTGGTACAAAAA-----TCA------GT---------TATTGTC-AGCTC--TG-TAGTAGT-ACCACTGTCTG-TCAATAGTCAAAACT--CAG-----TAGTGGAATTGCATTGAT-GCAA-AAGGC---TACAGCCACAG-T-G-G-GCA-CA--T-TC--TTGTC--GACA--G--GCA--CA-TTT-TTA-TTTTATTTTgtttttaggacagagttacaaccc
gi|31 : t-C------AG------TC--------G---ATTTTGCTCAGACTTACCAGGGAG--TATCA-----GCTT---GA-----TGTTCAGTTGTC--ACATGTCGTTGTC---A----CA--TG--T-CAGTC--T----GTTG-AC-CTTT-----G---------GT--TGG-CCATTgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|32 : GT--TAATCTTTTCAG-C---T--TTA---CTC---CTAAGCTTC-----CCAACAGATTTTGACCAAACTTGTAA---GGGAGTAaaact
gi|33 : ttaatt-TAGTAGT-ATT-----CTG-TCACAAGAAAAAATT--TAT-----TAGTCAGATGGCATTG-T-ACAATAAGGC---
gi|4 : TT---GTC---AT--GATCTGGTTTATGAA-TG-TTTGGCTTAATT-AAATCCCGTAATAATTA-AT-TT-AAATGGTAAATCTTCAT--------ATGTACAATATCAAAATTACT-TTTCA-GC-----T-C-TATTCC---------T------C--------C-T------AAATTTCACT--------ATCAATTCTGGCCGGCCTTGTTTGGGAA--TATCA-----TTAT---GG-----GATTAAGT-------CATA---TCATT------------TT--T---GTC--T----ATCC-AT-TTAT-----A----T-----TGATGG-CCCTTT------GA---TA--A-----T-----TTG-A-AT-GGC---A-AATCT-T-----------TT-C--AGC---A--C-ATCTC---------TT-------------ACGAAAT-TCAGTTGAC----T-----TTGCTA------AGGGGGTTTCT-----GA----G-------TA-------ATCCAGTTA--------TG----------CATATT-TGCTTCATTGA-AGTTT-GA-C-------GGAG----------CTC---ATTAA--AT-AGT--TA--TAAATCGTAA--T----T--CTT----------GTAAGC---AATA---CT--------CC---T---AAACTTCTCGACAGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGGGA----GTATCAGTATCAAGT-----TCA------GTTGCTCA---TTTCTTC-AATTG--TG-TAGTA------------------------GAAACC--TTT-----TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACAA-C-A-G-G-G-TA--T-TC--CTGTC--AACA--G--TCA--CA-TTT-CTA-GTTAA
gi|5 : gTTTT-GTCA--GA-----A-C-TACTCC---------TAAAAT-T--------TGC------AA------CA--------G---ATATTGGTCAAAAT-GTTGAGAAA--TTTCA-----GTA-----A-----GGTCCTGTTG-A--ACATA--GT-------------G--T-----CAATG--C----ATTG-AT-TTTTA----G----T-GACGTTATGG-ATCTTT------GA---TA--A-----T-----TTT-A-ATTG-T---A-AATAT-TGACGGCGTTATTT-C--TCCTAAA--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-T---T-GGC----CA-AA-----------------------T-----AA----G-------TATT---AAGTCCAATTG-GTC---CTGTCACCATCAT---GTTCTTCTCCATTGA-CTagagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaaA---TAC-----AA----G-------TATG---AAGTCAAATTG-CTC---C---CATCACCATTATGTTCTGCTCCATTGA-CTTAT-TG-C-------TGAGT----TAtatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttatCATGATGTTCTGCTCTATTGA-CTAAT-GA-C-------AGAGT----TACATCCC---TTT-----------------------TAA--T----T--CTT----------GTTAGA---GCTA---CT--------CCTCCT---AAACTTCTCAACTGACTGTGGG-G-A-ATTTTG-AT-A--TA----GTA--AGTATGAGGTAACGATCATGTCTGGTGGTGGA---TATTGTC-ATCTT--TG-TAACGGT-GCTG----CTG-Tacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|6 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtata-TCTTATTAGTC---ATGCT----TTT---CTCAACTTC-----TCAACTGATTTCGACCAAACCT
gi|6 : ttttataattgtcattataagTCT-C--A-----A--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-T---TCGAC----CA-AACCTTTTACTTTTTAAAAA---TAT-----AA----GATATAAATATG---AAATCAAGTTG-TTC---TT-TTAT-ATAATCATGTTCTA-------GA-CACA---G-A-------GGATT----GATTGCTC---TGTAG--TT-ATT--TT--AAG-TTATAA--T----T--CTT----------GTCAGC---ACTG---GT------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGACT--GCAA----GTATCAGTATGAAAT-----TCA------GTTGTGTA---TATTGTC-GTCTC--TG-TAGTGGT-ACTA----CTG-TCACTAGTTGAAAAT--CATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACAG-A-G-G-G-G-CT--T-TA--ATGTC--AACA--G--CCA--CATTTT-TTA-ATAAAGTTTTAAAT--tttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgcttt-C-TACTCCAAAACG---T------G--------T-C------CA------TC--------G---ATATTAATCAAAAGTGTTAAGGAG--TATTA-----GTAT---GA-----AGTTTATTCA-T--GCATA--ACTGTC---G----TG--GTAACACGGTC--T----TCTG-AC-TTC-----------T-GTAG-------------------G---------------------T--A-AT-G-G---G-GCTC------------ATT-------C---A--C-CTCTCGATCGAAA-CT-------------G----AT-T---TTGGT----CA-AATATTCTA------AGTAA---TGTTATGTAA----G-------TAGG---AATTCC---TG-------TTGT-------A-CACGTT-------GTCGA-TACGT---------------------TACGGTCCATTTTTCG--TTGAGT--TTGATAA-TTTTAA--TTGTGT--ATC--TT------ATCAGC---GCTACTTCT--------CC---T---AAATATCTCAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TT-AGAGG----CTATAAGTATAAATC-----CCA------GTTGTTTT---TATCATC-ctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : tattcttattagctctgCC---------T------C--------T-CGATCGAAA------CT--------G---ATTTTGGTCAAATATTCTAAGTAA--TGTTATGTAAGTAG---GA-----ATTCCTGTTG-T--ACAC---GTTGTC---GATA-CG--TT--A-CGGTC--C----ATT-----TTTC-----G----T-TGAGTT----------T------GA---TA--A-----T-----TTT-A-ATTG-T---G-TATCT-TA-------T-----C--AGCGCTA--C-TTCTC---------CTAAATATCTCAACTG----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GAGGC---TAT-----AA----G-------TATA---AATCCCAGTTG-TTT---TT---ATCATCAACACATTCTGCTCCATCGA-CATAT-CG-C-------GGATT----TACTGCAC-----TAACTTT-AGG--TT--TTA-TTGTAA--T----T--CTTC-TT------GTCAGT---ACTG---CT--------CC---aacacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|8 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatggggctcattcaTTGTCAG-C---A--TTATTCCTC---CTAAACTTT-----TCTACGGATTTTGTCCAAACTTGCAA---GGGTGTTTTACTAGTCCAG-----------TTGTGAATACT---GCT---GT--G---CGTTACATCAG-TTATTCTGTAGAGTT-ATGTCACTT--GGAGAA-AT-TT-AA-T
gi|8 : ggcccttccattaCAGT--T---G-----------CTCTTTATATC---ATT---CT--CTGTCAGTCCACCAA--T-TTGGGCATATTT-ATGGCCCTT--TGAT-A-ATATT-AA-TGATAAATCCAAGTAAAAAACCATATACA---TCACATTTTCTTGTCC--TC-----T-C-TTCTTCCCCTAAATTT------C--------T-T------AT------CT--------G---ACTTTAGCCAAACTTGCCAG---------------------------------------G-C--CTATC--TTTGTT---A----CA--TT--C-TGGTT--C----ATAA-AC-TTT-----------T-GGAGCTATGG-CCCTTT------AA---TT--ACAAATT-----TT--A-TT-G-T---A-ATTTT-TG-----------T-C--AGC---A--C-TTCTT---------CT-------------G----Attcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|9 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtcTT-ATGACCCTT--TCAT---AT-TT-AA------GATT-------------ATTTGCA---TTTTATTTTCA-GCCT--ATACATAT-CATGTTCA---------T------CATAAATTTT-C------TA------CT--------G---ATTTGGGCCATACTTTATAGGGAAATTATCA-----GTAT---GA-----ATCTCAACTG-C--T------GT-------G----C-------C-C--TT--C----ATCATAT-TCTT-----C----TCAAAGTTATGGCCCCTTT------CAAAGTT--A-----TGCACCTT--ACATAG-TTTCA-A---T-TG-------TATTA-T--AGC---A--C-TTCTCTTA------CT-------------G----AT-T---AGGGT----CAGAATTTGCAA------GAGAC---TAT-----AA----G-------T-TGTACAAATC--GTTGTCTC---Tacttcaaagctgattatg
gi|9 : a-TTCTA---------CT-------------G----AT-T---TGGGC----CA-TACTTTATA------GGGAAAT-TAT-----CA----G-------TATG---AATCTCAACTG-CTG---T-GCCCT--TCATCATATTCTTCTCAA---A-GTTAT-GG-CCCCTTTCAAAGT----TATG-CAC---CTTAC--AT-AGT--TT--CAA-TTGTA----------------TT------AT-AGC---ACTT---CT--------CT---T-------------ACTGATTAGGGT-C-AGAATTTG-CA-AGAGA----CTAT-A----------------A------GTTGTACA---AATCGTT-GTCTC--TA-TAGTAA--ACTA----CTA-ACACTAATCA--------------------AAATGGCATAAGT-ACAATAAGGC---TAAATGCACAG-TGG-G-G-G-CATTT-TT--GTGTC--G--A------CAGTCA-TTT--TA----AGTTTTTAAAT--atagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
blockSeqs : G C T . T T G . C TCAGCATTTCTTCCTTT T C A ATAGATCACACTT T T TTAA ATTC ATC A CAGTT A C TTC AT G GATGAAGTCTAC CTGATC TTGTT C TG TCT T G AA T TA A T AT CCAAGTAAAAAACCATATACATCACATTTTCTTGTCCTCTCTTCTTCCCCTAAATTTCTT ATTTCA TCTCAATC TCA TT AT TGTAA TTA . CTCGTTCATTGTGCATTCAAATCTTTGTATTGACTTTTGATGCAATTATCACCCTTTAATTTCATTTGATGGTAAATCTTTTCTGATCAAGCCTATAAT CGAA A CAGTT AAAT G C GC CTTTTTA GTT TATGT ACTG ATATAAA TAC C ATTCTGCATATTGTCTC C T G TATGGCCCCTTTC ATAA AG ATTTTTCG G T TA GA A TTGTGTATCTT TTT ACTT AGTACTCA TTCAAAGT A T G A T CAAACTG AACGA TGTCTG TTC C AG GA G A CTGT A T TCAA GA TATAA A CTAA AAT TGT T A A TT G CTGG CACAT GT T C TT AT TC T .
blockSeqs : . . . AACTTTTC T . C CTCAAGTGATA C . ATG ATC . A . A G . GG . GAAACCTGT ATTATT ATG T TG TTA . T . G TA . . T TATTTGCATTTTATTTTCAGCCTATACATATCATGTTCATCATAAATTTTC . . . GC . . . . AACATAGTGTCAATGCATTGATTTTTAGTGACGTTATGGATCTTTGATAATTTTAATTGTAAATATTGACGGCGTTATTTCTCCTAAACTTCTCAACT . . ATA . . G GA TTCG AT AA . . . C CTCTTATTGTCATCATG A T . AGTTGAT . GA TTTAA . T . . . TTAAATCTT . A . TGTAAAAC . . . . . CAT . . . T G . . . . . G TCGA . . G TCA . TGC . C . . . CG GTTAG . . . G CC . A .
blockSeqs : . . . CA A . T T . G . C G . AC . CCAG ATC GCT G GA TG . G . C TA . . T CTTCATATGTACAATATCAAAATTACTTTTCAGCTCTATTCCTCCT . . . GG . . . . TACACGTTGTCGATACGTTACGGTCCATTTTTCGTTGAGTTTGATAATTTTAATTGTGTATCTTATCAGCGCTACTTCTCCTAAATATCTCAACT . . TA . . C AT G . . . . . C CTCTTATCATTATCACA G T . TGAAGGC . GA TTTGA . T . . . TTCTTAGTC . A . TCCTAAAC . . . . . CGA . . . T G . . . . . T TAGT . . A CTA . TGG . . . . . CG AATAG . . . G AA . C
blockSeqs : C . A A . A . T A . AG . G GTC GAT T CA CT . T . A AA . . T TCATCCCATTTTCTTGTCAGCTTTACTCTTTTC . . . GT . . . . CTGTGCCCTTCATCATATTCTTCTCAAAGTTATGGCCCCTTTCAAAGTTATGCACCTTACATAGTTTCAATTGTATTATAGCACTTCTCTTACT . . CT . . C GG C . . . . . C TTCTTTTATATAATCAT C C . TTTGTT . AG TTTAC . G . . . GTTTATTTT . C . ATGAAC . . . . . AAT . . . C A . . . . . A TCAT . . G CTA . TT . . . . . AA GGTAG . . . G TA .
blockSeqs : C . A C . A . A A . . . G GCT CTG A CA TG . T . G A . . T TTTGTCACCAGGACTACTCCTAAACTGTTC . . . AT . . . . CTGAAATCATCCTCATTTTTTAGTCTATCAGCTTTTAGTGTAGATATTTTAGTTCAGGTTATTTTAAATGCAGAATATATGTGCATGTGTCT . . TT . . G AT G . . . . . C CTCTTGACATTATCAT T T . TATGAA . GG TTTAA . T . . . TTATTCTT . A . TAAGC . . . . . CAA . . . T C . . . . . A TCGA . . C CTA . TG . . . . . CC GACTG . . . G AA .
blockSeqs : . . A A . . . T A . ATT G C . T . G . G . . . T CTTGTCAGCACTTCTCCTTAAACTTTTA . . . AC . . . . CCTATCTTTGTTACATTCTGGTTCATAAACTTTTGGAGCTATGGCCCTTTAATTACAAATTTTATTGTAATTTTTGTCAGCACTTCTTCT . . TT . . C GT G . . . . . A CTTTTATCAGTGTCGG C T . TTTAGT . TA TTAAA . T . . . TTCTTCTT . A . CACAA . . . . . CAA . . . T A . . . . . A TCTA . . T CTG . GG . . . . . TG AAAAT . . . T AA
blockSeqs : . T A . . . G T . . A . C . . . . . GT . . . . CACAAGTTGTCGTTTGCATTTCGGTCTACATATTTTTGAAGAGTTATGGTCTTCGGCTAATATGAATTGTATTCCTCCTAACTTTTGAA . . TC . . T GC G . . . . . T GTCCTGTCACCATCAT C T . TATGGT . GT TTTAA . G . . . TTCTCTT . T . TAAAC . . . . . CCT . . . T A . . . . . T ACAA . . G CTG . CA . . . . . TG GACAG . . . G AG
blockSeqs : . A . . . . . . . . . GT . . . . CATATCATTTTTGTCTATCCATTTATATTGATGGCCCTTTGATAATTTGAATGGCAAATCTTTTCAGCACATCTCTT . . TT . . C TT C . . . . . A CTCCCATCACCATTAT C C . TTTGAC . AG TTGAA . T . . . TTCATT . A . TGAAT . . . . . AAA . . . C A . . . . . A TAGA . . A GTT . TG . . . . . AT GACAG . . . T .
blockSeqs : . . . GT . . . . TTTATATCGCCAGTGCATTCTTGACTATTGATTGAAGGTGCAGTTACTGATCTTACCAATTTAATAATTCTCAACT . . TT . . T TC A . . . . . A TTTTTATCATCAACAC C T . TATTGC . AG ATTAA . T . . . TTTTTT . T . TACAT . . . . . TAA . . . T A . . . . . A TGGA . . G CTA . TG . . . . . TG AACAG . . . G .
blockSeqs : . . . TC . . . . TGCATAACTGTCGTGGTAACACGGTCTTCTGACTTCTGTAGGTAATGGGGCTCATTCACCTCTCGATCGAAACT . . AG . . C GT A . . . . . C CTGTGCCCTTCATCAT C T . AATGAC . AT TGTAG . G . . . TTCTT . A . TAAAC . . . . . CGA . . . T A . . . . . A TCAA . . G ATG . TG . . . . . CT AACAG . . . A
blockSeqs : . . . GC . . . . CTCATCATCACATTCCACTCCATCGACTTATGGCTTATCCTAAACTATTCAACT . . TG . . T GC G . . . . . C TTGTTGTCATCATC C T . TATCGC . TG TAACT . T . . . TTCTT . A . TAAAC . . . . . CAA . . . T G . . . . . A AAAA . . G GTA . CA . . . . . CC GA . . . .
blockSeqs : . . . TA . . . . . . T . . C TA G . . . . . A CTGTTATT C T . GCATC . GG CTTAC . G . . . TTCTT . G . TAAAT . . . . . TAA . . . A A . . . . . A TTGA . . G TA . AG . . . . . AA AG . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . T G . . . . . A TTGTACAC . C . CGGC . TG TTT . G . . . TTCTT . G . TA . . . . . GGA . . . T T . . . . . A TCG . . G CT . T . . . . . TG GA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C ATCAC . C . CAGA . G TG . G . . . TTCTT . T . T . . . . . AAA . . . C T . . . . . A TCA . . G . . G . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TGCAT . . . CGT . . . . . . . . TT . . . T . . . . . CAA . . . C A . . . . . A GA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . TT . . . . . . . . . GGA . . . T A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CAA . . . C A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AGG . . . T A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGA . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . . . TA . . . C G
blockSeqs : . . . . . C . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TA* ***** CTCTTGTCATCATCAC******* TATGGC********* TTCTT****************** CG*** GACAG******
originalCons : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGTCATCATCATCACGTTCTGCTCCATCGA-CTCGT-GG-C-------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAA--T----T--CTT--TT------GTCAGC---ACTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTC-GTCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACTAGTCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TC--GTGTC--G--A--G--GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
finalCons : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGAA---TAT-----AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTGCTCTTGTCATCATCAC-------GTTCTGCTCCATCGA-CTTATGGC---------GGAGT----TACGGCCC---TTTAA--TT-ATT--TT--TAA-TTGTAATTCTT------------------GTCAGC---ACTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTC-GTCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACTAGTCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGCG---G-G-G-CA--T-TC--GTGTCGACAG------GCA--CA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTGCCATTGTGTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCATACGCAGGAATACCACTTTCTTGTTTAGAATAGTACTTCTGAAAACCTTATCAACCGATTATGACAAAACATG
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 4444444444444444444444 1 3333333333333333 111111 1111 11111 444444444444444 111111111 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 111111111 11111 11 1
lowQualScore : 1 1 5 5 1 2 2 3 2 7777777777777777777777 3 0 3 4444444444444444 1 0 4 000000 5555 777 0 6 11111 2 3 0 888 44 6 999999999999999 111111111 88888 0 1 55 3333 5 1 66 1 888 5 5 55 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888888 11111111 555 33 33 77777 555 77777 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 2 77777 5555 2 0 66 2222222 000000000 33 4444 7777777 333 2 6666666 4 2 4444 2 5 2 2 77777777777777 4444 77 2 6666 1 33 2 777777777 4444 4444 7777777 4 444 444 7777 88888888 8888888 0 1 1 1 1 1 6666666 44444 555555 333 1 55 22 2 2 4444 2 1 5555 22 55555 1 0 7777 0 333 55555 2 5 2 33 2 99 1 2 2 2 11 33 99 1 3
lowQualScore : . . . . . . . . . ...................... . . . ................ . . . ...... .... ... . . ..... . . . ... .. . ............... ......... ..... . . .. .... . . .. . ... . . .. ............................................................................................. ...... ........ ... .. .. ..... ... ..... .................................................................................................................................................................................................... .... . ..... .... . . .. ....... ......... .. .... ....... ... . ....... . . .... . . . . .............. .... .. . .... . .. . ......... .... .... ....... . ... ... .... ........ ....... . . . . . . ....... ..... ...... ... . .. .. . . .... . . .... .. ..... . . .... . ... ..... . . . .. . .. . . . . .. .. .. . .
lowQualScore : 0 0 5 5 0 5 0 3 0 0000000000000000000000 2 0 0 7777777777777777 7 2 4 777777 9999 888 8 2 11111 6 7 2 888 22 7 555555555555555 444444444 99999 4 7 77 3333 0 0 99 4 888 7 0 11 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 22222222 444 44 99 11111 000 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0000 5 88888 3333 5 8 99 0000000 666666666 11 7777 2222222 555 0 6666666 0 0 7777 2 0 0 0 00000000000000 7777 99 8 6666 6 11 2 444444444 7777 5555 2222222 4 111 111 2222 11111111 1111111 9 7 7 7 7 7 5555555 33333 000000 000 2 00 99 0 0 2222 0 0 3333 99 66666 0 2 2222 5 999 44444 5 0 5 44 5 44 5 7 7 7 00 55 22 0 3
consensus : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGA-----A---TAT--AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGT-CAT-CATCA---CGTTCTGCTCCATCGA-CT-T-A--TGG-------CGGAGT----TACGGCCCTTTAA--TTATT--TTTAA-TTGTA-----A---T----T---CT-------T-GTCAGC---A---CTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTC-GTCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACTAGTCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-T-G-G-G-G-CA--T-TCGTGTCGACAG-GCACA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
Reference ( family-525 ) : ATTTNAAGNCAAGCTGCATAATATNGTTGTCGCATTCCGATCTAGTT-AATCTTG-----ANC-TTT-TC--CTTT-AATG-GTAAATCT-T---TCACGT--TN-TCTTGTCAG-C---A--CTA---CTC---CTAAACTTC-----TCAACNGATTTTGGCCAAACTTGCTA---GGGAGTATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTC---GT--GTTCCGGTCCATCGA-CT-TTTGGCATAGTT-ATGNCCCTT--TGATTA-AT-TT-AA-TGGTAAATC-------------ATNTGCA---TCACATTTTCT-GTCC--GC-----T-C-TACTCC---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATTTTGGCCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----GTAT---GA-----AGTCCAGTTG-C--NCATA--GTCGTC---G----CG--TT--C-CGGTC--C----ATCG-AC-TTTT-----G----T-GNAGTTATGG-CCCTTT------GA---TT--A-----T-----TT--A-AT-G-T---A-AATCT-TG-------TATTT-C--AGC---A--C-TTCTC---------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GGGA-----A---TAT--AA----G-------TATG---AAGTCCAGTTG-CTC---TTGT-CAT-CATCA---CGTTCTGCTCCATCGA-CT-T-A--TGG-------CGGAGT----TACGGCCCTTTAA--TTATT--TTTAA-TTGTA-----A---T----T---CT-------T-GTCAGC---A---CTA---CT--------CC---T---AAACTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGCGA----GTATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TATCGTC-GTCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACTAGTCGAAACT--CAT-----TAGTCAAATGGCATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAG-C-G-G-G-G-CA--T-TCGTGTCGACAG-GCACA-TTT-CTA-GTTAATTTTTAAAT--ANAAT-AATC
gi|1 : ATTTCAAAACAAAC-GCATAATATGGTTATTGCATTCTGATCCAATCGAATTTTG-----ACCATTTATCAATTTTGAATG-GTAAATCT-T---TCACAT--TG-TTTTATCAC-C---A--CTA---CAA---CTGAACTTT-----TCAATCGATTTTTGCCAAATTTGCTA---AGGAATATCAGTA-T---G-----------TTGTGCATATC---GTT---GT--GTTCTGGTCCATCGA-CT-ATTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGATTGGAT-TT-GA-GGGTAAATC-------------ATCTGTA---TCACACTTTCTAGTCC--GC-----T-C-TACCCC---------T------C--------T-T------AA------CT--------G---ATTTTAGCCAAATTTGCTAGGGAG--GATCA-----GAAT---GAGGTGAAGTCTAGTTG-T--GTATAAAGTCATC---G----TG--TT--C-TGGTC--C----ATTG-ACCTTTT-----G----T-GTAATTATGG-CCCTTT------AA---TT--A-----T-----TTGCA-AT-GGT---A-AATCTATG-------TATTTAC--ATC---A--CGCTTTC---------TT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTC------AGGA-----A---TAT--AA----G-------TATG---AAGTTCAGTTG-CTT---TTGT-CAT-CATCATCACATTCAGTTCCGTCGA-CT-CGA--AGA-------TGGAAT----TATTGCCCTGTAG--TTATT--TTTAA-TTGTA-----A---T----T---CTATTATTCTAGTCAGC---A---CTA---CT--------CC---C---AAATTTCTCAACTGATTATGGT-C-A-AACTTA-CT-AACAA----GTGTCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGTGCA---TTTTGTC-TTCTC--TG-TAGTAGT-GTTA----CTG-TCACTAGTCAAATGT--TAT-----TAGTCAAATGACATTGCT-ACAATAAGGC---TACAGGCACAGTT-A-G-T-G-AA--T-TAGTATCA--AGCGCACA-TTT-CTA-ATTAATTTTTAAAT--AGAATGAATC
gi|10 : ---AAGTCCATTTG-CTC---TTGA-CAT-TATCA---TGTTCTAGTCCATTGA-CA-T-T--TGT-------TGAACT----TACAGTCC---------ATT--TTCAA-TTATA-----A---T----T---GT-------T-----------------------------------T---AAGC------AC-----ACAGT-C-----TTTG-CTTGGCAT----GTATCAGTTTGAAGA-----TAA------GTTGT------------T-GTCAC--TG-TAGT--T-AC-A----TT--TCACATGTCAAATTT--CAT-----TAATCAAATAGCGTTGTC-ACAATAAGGC---TACAAGGACAT-T-T-T-G-G-CA----TCGTGCCCACAT-GCACA-TTT-CTT-GTT
gi|11 : G---AAGTCCAGTTG-CTT---TTAT-CAG-TGTCG---GGTTATGCTCCATTCA----T-AGTTGA-------TGGAAC----TATGACA-TTTAA--CTGTG--TCCA--TTGTA-----A---T----T---CT-------C-TTTAGC---A---C-A---TT--------CG---C---ACAATTC--AAACGATTATGGT-T-A-GATTTG-TA-ATCGA----GTATTGATATAAAGT-----GCA------AGTGTGCA---CATCGTC-GTCTTGATG--ATTAGT-AGTA----CTG-TCACTGTTCG-AACTGACAT-----TA----------ATT-----CAA-AAAGC---TAAAGGCACTG-T-G-G-GAG-CA--T-TCGTGTTGTTAG-GAACA-TTG-ATA-GTTAtcatataaaagttattaatgtattatttatgatgagacgcttgtaacatactccgatctttca
gi|12 : ---A--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-C---TTGAC----CA-AACATTTTA------GAGA-----A---TAT--CA----G-------CATG---ATGTCCAGTTG-C--------T-CAT-CATCA---CATTCCACTCCATCGA-CT-T-A--TGG-------Ctcaacaattataaacgataaatcagacaac
gi|12 : aCT---------T------C--------T-C------AA------CT--------G---ATCTTGACCAAACATTTTAGAGAA--TATCA-----GCAT---GA-----TGTCCAGTTG-C--TCA-----TCATC---A----CA--TT--C-CACTC--C----ATCG-AC---------------------TTATGG-C----------------TT--A-----T-----CC---------T---A-AAC------------TA-TT-C--AA-----------------------CT-------------G----AT-TA--TAGTC----TA-AACTTGCTA--------GA-----A---TGTAAAA----G-------TACA---AGGTTCAGTTG-TGCATATTGT-CAT-Cttatcctaaactattcaactgattatagtctaaacttgctagaatgtaaaagtacaaggttcagttgtgcatattgtcatctctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|12 : aaT--------CC---T---AAACTATTCAACTGATTATAGT-CTA-AACTTG-CT-AGAAT----GTAAAAGTACAAGGT-----TCA------GTTGTGCA---TATTGTC-ATCTC--TG-TAGTAGT-ACTA----CTG-TCACT-------GCT---AT-----TAGTCAACTAGTATTGCT-ACAATAATGC---TGCTGGCAAAG-T---------CA--C-T----TCAATAG-GCACA-CAT-CTA-GGTAtctgtagtagtactactgtcactgctattagtcaactagtattgctacaataatgctgctggcaaagtcacttcaataggcacacatctaggtattcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|13 : aacttctcaactgatcttgaccaaacattttagagaatatcagcatgatgtccagttgctcatcatcacattccactccatcgacttatggcttaC-TTTTTATAAG----T-GGAGTTGTGG-ATCTTT------CA---TA--A-----T-----TT--T-AT-------------T-TG-------TATTTTC--AGT---A--C-TTCTCAGAAACTTACT-------------G----AT-T---TAGAC----CA-AGGTAGATA------GGGG-----A---AAT--AA----G-------TAT----ACGTCCAGTTG-TTG---TTGT-CAT-CATC---------TGCTTCCTTAA-CT-T-A--TGA-------AAGAGT----AACGACACTTTGA--TTATT--TTAAA-TTGTA-----A---T----T-------------------C---A---TT----CT--------CC---T---A--------AACTGATTATGGT-C-A-AACTTG-TT-AACAA----GTATCAGTACGATGT-----ACA------GTTGTGCA---TATTATT-CTCTC--TG-GAGAAGT-GTTA----TTGAGCACTTGTCGAAACT--Cttcattgcaggtagatgtttaattttttat
gi|14 : t-AA-TGGTCAATT------------------CA---TCCCATTTTCTTGTCA--GC-----T-T-TACTCT---------T------T--------T-C------AA------CTTCTCAATCG---ATTTTCACCAAACTTGCTAGGGAG--TATCA-----ATAT---GA-----AGTCTTGTTG-CTGAAATC--ATCCTC---A----TT--TT--T-TAGTC--T----ATCA-GC-TTTTA----G----T-GTAGATAT------TTTAGTTCAGG---TT--A-----T-----TTTAA-AT-G-C---AGAA----TA-------TATGT-----GC---A--T-GTGT----------CT-------------G----A---------------CA-CACATATTA------CTGA-----A---TAT--CT----G-------TATA---AAGTCCAGTTG-C------TGT-TAT---------TGTTGTACTCCATCAA-CT-T-T--TAG-------TGGCGT----TACAGCCCTTTAC--TTTGT--TTTA
gi|15 : taTGACCAAACTA---AGGGAG--AATCA-----GTGT---AA-----AGTCTAGTTT-C--TCGT----TCATT---G----TGCATT--C-AAATC--TTTGTATTG-AC-TTTT-----GA---T-GCAATTATCA-CCCTTT------AA---TTTCA-----T-----TT--G-ATGG-T---A-AATCT------------TTT-CTGATC---AAGC-CTATA---------AT-------------A----ATAT---CTTACAAATGA-AACTAGGTA------GGGA-----G---TAT--CA----G-------AATG---AAGTCAAATAA-ATT---CTGCATAT-TGTCT---CTTTCTGCTCCATTGA-CTGC-A--T---------CATAGTATAATATGGACTTTTAA--TTATTTATTTGC-TGGTA-----A---TTAAAT---CT-------T-GTCAt
gi|16 : TTAA-T-GTA-----A---T----T---CT-------T-GTCAGC---A---CCA---CT--------CT---TTCAAAGTTTCTTGACTGATTATGGGAC-A-AA-TTG-CA-GGCAAACTGGCATCAGTACAAAGT-----TCA------GTTGTGTA---TATCATC-ATCTC--T---AGTAGT-ACTA----TTG--------------CT--TAT------AATACAATGGCAT-GCT-ACAATAACGC---TACAGGCACAG-G-G-G-G-GACA--T-TAATGTCGGTAG-GATTA-TTT-CTA---TATTTTTCAAATTCATAAT-AATCtt
gi|17 : --TTTAA-TTACA-----A---T----T---CT-------TAGTCAAC---AACACTC---CT--------CC---T---GAATTTCTCAACT--TTAT----------------T-AGCAA----GTTTTAGTAGGAAGC-----TCA------GTTGTGCA---TATTCTC-ATCTC--TGGTAGTAAC-AGTG----CTG-TCACTAGTAGTCCCT--CAA-----TAGTCAAATGACAATGCT-ACAGTAAAGC---TGCAGGCACAG-C-A-G-G--------------------G-GCACA-TTC-CTA-GTTCCTTGTTAAtcatgatttgttcaatttgttacactactaatattaatgattatccattaattta
gi|18 : -CT-T----TGT-------CAGAGT----TATTACCCTTAAA--TTGTT--ATAAA-TCATA-----T---T----T---TT-------T-GTCAGC---A---CTA---CT--------CC---T---ACATTTTGCAACATATTATGGT-C-A-AACAAA-CC-AACCT----GTATCAGTAT---GT-----TCA------GTTGCG-A---TATTGTC-ATCTC--TA-TTGTTGT-ATTA----CTG-TCACTAG-----ACA--TAT-----------AATACCATTGCTAATAATAAGGT---TACAGACACAG-T-G-G-A-G-CA--T-TCCTCTTGA-----CACA-TTT-CTA-TTT--TTTTT--AT--AAAAT-tgttaaaattcatactttaaaactacaaatcttattgaaaagtcctgctgtcattgagatgaaatgattttg
gi|19 : TGAT-C-A-CACTTG-TT-AGAAA----GTATTAGTAGGAAGT-----TCA------GGTGTGTA---TATTGTC-ATCTC--TG-TAGTAGT-ATTA----CTG-ACTTTAGTCATAACT--CAT-----TTCTCAAATGGCATTGCT-GCAATATGAC---TACAGACACAA-T-GTG-G-G-TA--C-TTGTGTCGACTG-GCATA-TTT-CTA-GTTtctgcatgat
gi|2 : ttaacctTGGTT-AATCTTGTCAGCATT-TCT-TC--CTTT-AA-------ACTT-C---TCAAGTGATA-TTTTG-CAG-C---T--CTT---CTC---TT---CTTTCAGTTTTAACAGATTTTCCCCAAATATGAT---------TATTATTA-T---GATGAAGTCTACTTTTGCATATCCTGATC---GT--ATGCAGGTCTAT--ATCT-TTTTGTATAGTT-ATGGCCCTT--TTAATA-TT-TT-AA-TGTTAA-T---------------TTTG-----TCAC----------CA--GG-----A-C-TACTCC---------TAAACTGT--------T-C------AG------CT--------G---ATTTTTACCAATCTTGGTAGGGAG--TTTCG-----GCATTTAAA-----AATCCAGTTG-C--ACA-A--GTTGTC---GTTTGCA--TT--T-CGGTCTAC----AT---AT-TTTT-----G----A-AGAGTTATGG-TC-TTC------GG---CT--A-----------------AT-A-T---G-AAT---TG-------TATTC-C--TCCTA-A--C-TTTTG---------AA-------------G----AT-T---TTGGC----AA-AAGTT-TTA------GGGA-----T---TAT--A---------------TG---AAGTCTAGTTG-CTC---TTAT-TGT-CATCA---TGGTTTTCTCCATTGAGCT------CGG-------CAGAGT----TATGTCCC----------------------------------------------------T-GTCAGC---G---CTA---CT--------CG---T---AAACTTCTCATCTG--TATTGT-C-G-AATTTT-CT-AGTAA----ATATCAGCATGAAGT-----TCA------GTTCCACA---AATCGCC-ATATC--TG-TATTTGTAACTA----TTG-TCACTTGTCGAAACC--CAT-----TATCCA---------------AATAAAAC---CACATGCACA------G-A-G-CA--TGTC-TGGTAACAG-CCACA-TTTCCTATTTTAATTGTTATAT--GCActggttgtgtcatgctagtttttaatatattgagtagaaattctttacaaacatcaatcactt
gi|20 : attagatggta---AAATTTATTAACTGAATTTAGG-C-T-AATTTG-CA-AGCGA----GTATCATT-TGAAGC-----CAA------GTTGCATA---TATTATT-GTCtgttatatacatatttaacag
gi|20 : ATTTGAAGCCAAGTTGCATA-TATTATTGTCGCATTCCTATCTA-TT-GAT---G-----AAC-TTT-TC-------AATG-GTAAATCT------CA-------------TCAG-T---A--TTA---CTC---CTAA---CC-----TCA-----------TCAAACTTGGTA---TGGAGTATCGGTA-T---GAAACCTGT---TTGAGCTTACC---ATC---ATTTGTTCTGGTTCATTGA-TG-TTTGGCATAGTT-ATGTCCCTT--TGTTTgcattcctatctattgatgaacttttcaatggtaaatctcatcagtattactcctaacctcatcaaacttggtatggagtatcggtatgaaacctgtttgagcttaccatcatttgttctggttcattgatgtttggcatagttatgtccctttgttt
gi|21 : aaatttattaactgaatttaggctaatttgcaagcgagtatcTTATTA------GGGA-----A---TAT--AA----A-------TATG---AAGTC-----------------------ATCA---CGTTCTGCTCCATTGA-TT-T-A--TGG-------TGGAGT----GATAGCCCTTTAA--TTATT--TATTA-TTGAA-----A---T----T---CT-------T-GTCAGC---A---TTT---TT--------CC---T---AAACTTCTCAGCTGATTGTCGA-C-A-AACTTA-AC-AGCAA----GTATCAGTGTGAAGT-----TTA------CTTGTGCA---TATTGACAGTCT
gi|22 : TATACA---TTACACTTTCTTGTCCAGGT-----TAC-TACTCCAAAA-----T------GAA------T-T------AA------CT--------G---ATCTTGGCCAAACTTGTT-GGGAG--TATCA-----GCAT---GA-----ATTCTAGTggaggtaaacctttgttccaagatcaaaacttcttt
gi|23 : tatttttatgcacctaccattaatgaggtgcggaggtgacagacatatataattaccaccatttgtcaatgtggctgtacgtctgtccatctatccgtccaccT--TTTAA-TTGTACGTTTA---T----T----T-------T-GTCAGC---A---TTA---CCAGTACTCACCA--T---GAACTTTTCAATCGATTATGGC-C-A-AACTTG-GT-AGTAA----GTATCAGTAAGAAGT-----TCA------GGTTTGCA---AATTGTC-ATCTA--T----GTAGT-ACTA----CTG-TTAGCAGTCTAATAT--CGT-----TAGGCAAATAACATTGCT-GCTATAAAGT---TACAGGCACAG-
gi|24 : aTCCTGAACTGATTTTGGC-C-A-AACTCC-CT-ATGGA----GTATCAGTGTGATAT-----CTA------GTTGTGCA---CACAATT-TTCTT--TG-TAGTAGT-ATTT----CAG-TCGGTAGACAAAACT--CGG-----TAATCTAATG---TTGGT-TAAGTAAGGC---AAAAGT--CAG-T-G-GTG-G-CA--T-TTGTGTt
gi|25 : cagagttactgccctttagtaattttcaTTCTCGACTGACTATCAT-C-A-AA---G-AA-AGC-----------------AAGT-----TCG------GAT----A---TATTATC-TTCTC--TG-TATAAGT-ACAA----CTG-TCACCAGTAGAAATT--CAT-----TAGTCTGATAGCATTGCT-ACACT--TGC---TACAAGCACAA-T-GCT-G-G-CA--T-TATTCTCAAAAT-ATACA-TTT-CTA-aaa
gi|26 : cccaaatcatctctTATATT-C-A-AACTT---T-----------TATCAGTATGAAGT-----TCA------GTTGGACATTCTGTCATC-ACCTT--TG-TTGTTGT-TTTA----CTG-ACAGTAGTGGAAACT--CAT-----T-GTCAAATGGCAATG------------------------------G-G-G-G-CA--T-TTGTGATGACAG-GCATA-TTT-ATA-------TTTTAAAa
gi|27 : -C-A-AACTTA-CT-AGAAA----GTAGC-----GAAGT-----TTA------ATTTTGCA---TATCcctaaattttaacatgatttaatt
gi|27 : ttcac--TT-TCTTGCCAG-CTTAA--CTC---CTC---CTAAACTTC-----TCAACAGATTTCGGCCAAACTTTCTA---GAGAGTAAC---A-T---G-----------TTATtgcgtgcttacgtggcactttcttgccagcttaactcctcctaaacttctcaacagatttcggccaaactttctagagagtaacatgttatcgactcttatatca
gi|28 : ttcaccaaacttactagaaagtagcgaagtttaattttgcatatctgcgtgcttacgtggcacATGCGTACATCTATAGATCACAC--TT-TATTGTCAG-C---A--CTATC-CTC---TTAA-CTTT-----TCAACCGATTTTGGCAAAACATACTA---Gcgactcttatatca
gi|29 : aaccctgccatttatgggtgtgtggaaggcaggaaagcattatagagttgtcctcggcgAG-C---A--CTA---CTCATCCTAAACTTC-----TAAACTGATTTTGACCAAACTTGTTATTCGGAAATATtttat
gi|29 : ---A--C-TTCTAAA-------CT-------------G----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTATTC---GGAA-----A---TAT--AT----T-------TATG---AAGTAAAATTA-CTC---TTAT-CGT-CATCA---TGTT-------------TT-T-A--GGA-------CAGAGT----TACAACCCatttatgaagtaaaattactcttatcgtcatcatgtttttaggacagagttacaaccc
gi|3 : agcactactcatcctaa-----------TTGGGCATATC---ATTATTGT--GCTCCAGTGTATTGA-CT-TTTGGTGCAGTTTATTGCCCTT--TCATTA-TT-TTTAA-TTGTAAATC-------------TTGT-CA---GCAC---TTCT--------C-----C-T-TAAACT---------T------T--------T-A------AA------CT--------G---GTTTTGACCAAACTCATTAGGAAG--TTTCA-----GTAT---GA-----AGTTCCGTTG-T--TTATA---TCGCCAGTG----CA--TT--C-TTGAC--T----ATTG-A----TT-----GAAGGT-GCAGTTACTG-ATCTT--------A---CC--AA----T-----TT--A-AT---------AAT--------------TCT-C--AAC-----------------------T-------------G----AT-T---T-GAT----AA-AATTT--TA------CGGA-----A---TAT--AAACTGG-------TGTA---ATATTAAGTTT-CTC---TTAT-CAT-TATCA---CAGTTTGCTCCATCAA-CT-TGA--AGG-------CAGAGT----TACAGCCCTTGAA--TTATT--TTTAG-TTGTA-----A---T----TATTCT-------T-GTCAGTTTTA---CTT---CT--------CC---TGTAAAACTTCTCAACTGATTATTGT-C-A-AACTTG-CT-AGCAA----GTATTGGTACAAAAA-----TCA------GT---------TATTGTC-AGCTC--TG-TAGTAGT-ACCACTGTCTG-TCAATAGTCAAAACT--CAG-----TAGTGGAATTGCATTGAT-GCAA-AAGGC---TACAGCCACAG-T-G-G-GCA-CA--T-TCTTGTCGACAG-GCACA-TTT-TTA-TTTTATTTT
gi|31 : t-C------AG------TC--------G---ATTTTGCTCAGACTTACCAGGGAG--TATCA-----GCTT---GA-----TGTTCAGTTGTC--ACATGTCGTTGTC---A----CA--TG--T-CAGTC--T----GTTG-AC-CTTT-----G---------GT--TGG-CCATTgtcacatgtacagctaacattttatcaaatggtatattttagttactgacatgtagtcacc
gi|32 : GT--TAATCTTTTCAG-C---T--TTA---CTC---CTAAGCTTC-----CCAACAGATTTTGACCAAACTTGTAA---GGGAGTAaaact
gi|33 : ttaatt-TAGTAGT-ATT-----CTG-TCACAAGAAAAAATT--TAT-----TAGTCAGATGGCATTG-T-ACAATAAGGC---
gi|4 : TT---GTC---AT--GATCTGGTTTATGAA-TG-TTTGGCTTAATT-AAATCCCGTAATAATTA-AT-TT-AAATGGTAAATCTTCAT--------ATGTACAATATCAAAATTACT-TTTCA-GC-----T-C-TATTCC---------T------C--------C-T------AAATTTCACT--------ATCAATTCTGGCCGGCCTTGTTTGGGAA--TATCA-----TTAT---GG-----GATTAAGT-------CATA---TCATT------------TT--T---GTC--T----ATCC-AT-TTAT-----A----T-----TGATGG-CCCTTT------GA---TA--A-----T-----TTG-A-AT-GGC---A-AATCT-T-----------TT-C--AGC---A--C-ATCTC---------TT-------------ACGAAAT-TCAGTTGAC----T-----TTGCTA------AGGG-----GGTTTCT--GA----G-------TA-------ATCCAGTTA--------TG---------CA---TATT-TGCTTCATTGA-AG-T-T--TGA-------CGGAG----------CTCATTAA--ATAGT--TATAAATCGTA-----A---T----T---CT-------T-GTAAGC---A---ATA---CT--------CC---T---AAACTTCTCGACAGATTATGGT-C-A-AACTTG-CT-AGGGA----GTATCAGTATCAAGT-----TCA------GTTGCTCA---TTTCTTC-AATTG--TG-TAGTA------------------------GAAACC--TTT-----TAGTCAAATGGGATTGCT---AATAACACAATTACAGGTACAA-C-A-G-G-G-TA--T-TCCTGTCAACAG-TCACA-TTT-CTA-GTTAA
gi|5 : gTTTT-GTCA--GA-----A-C-TACTCC---------TAAAAT-T--------TGC------AA------CA--------G---ATATTGGTCAAAAT-GTTGAGAAA--TTTCA-----GTA-----A-----GGTCCTGTTG-A--ACATA--GT-------------G--T-----CAATG--C----ATTG-AT-TTTTA----G----T-GACGTTATGG-ATCTTT------GA---TA--A-----T-----TTT-A-ATTG-T---A-AATAT-TGACGGCGTTATTT-C--TCCTAAA--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-T---T-GGC----CA-AA----------------------------T--AA----G-------TATT---AAGTCCAATTG-GTC---CTGT-CAC-CATCA---TGTTCTTCTCCATTGA-CT-T-A--Tagagattggttaagtaaaaacaaaaacaaaacaataatt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaa-----A---TAC--AA----G-------TATG---AAGTCAAATTG-CTC---CCAT-CAC-CATTA---TGTTCTGCTCCATTGA-CT-T-A--TTG-------CTGAGT----TAttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcatacttgtatacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|5 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttatC---TTGT--ATACATGA---TGTTCTGCTCTATTGA-CT-A-A--TGA-------CAGAGT----TACATCCCTTT--------------------TA-----A---T----T---CT-------T-GTTAGA---G---CTA---CT--------CCTCCT---AAACTTCTCAACTGACTGTGGG-G-A-ATTTTG-AT-A--TA----GTA--AGTATGAGGTAACGATCATGTCTGGTGGTGGA---TATTGTC-ATCTT--TG-TAACGGT-GCTG----CTG-Tacatgatgttctgctctattgactaatgacagagttacatcccttttaattcttgttagagctactcctcctaaacttctcaactgactgtggggaattttgatatagtaagtatgaggtaacgatcatgtctggtggtggatattgtcatctttgtaacggtgctgctgt
gi|6 : tatttatttttatttttaatgttagctgctggtagctctactcgtcctaaacttattttttagtaattttgtcagaactactcctaaaatttgcaacagatattggtcaaaatgttgagaaatttcagtaaggtcctgttgaacatagtgtcaatgcattgatttttagtgacgttatggatctttgataattttaattgtaaatattgacggcgttatttctcctaaacttctcaactgatttggccaaataagtattaagtccaattggtcctgtcaccatcatgttcttctccattgacttatttattaactcagcaataagtcaatggagcagaacataatggtgatgggagcaatttgacttcata-TCTTATTAGTC---ATGCT----TTT---CTCAACTTC-----TCAACTGATTTCGACCAAACCT
gi|6 : ttttataattgtcattataagTCT-C--A-----A--C-TTCTCAA-------CT-------------G----AT-T---TCGAC----CA-AACCTTTTACTTTTTAAAA-----A---TAT--AA----GATATAAATATG---AAATCAAGTTG-TTC---TTTTATAT-AATCA---TGTTCTA-------GA-C----A--CAG-------AGGATT----GATTGCTCTGTAG--TTATT--TTAAG-TTATA-----A---T----T---CT-------T-GTCAGC---A---CTG---GT------------------------------GATTATGGT-C-A-AACTTGACT--GCAA----GTATCAGTATGAAAT-----TCA------GTTGTGTA---TATTGTC-GTCTC--TG-TAGTGGT-ACTA----CTG-TCACTAGTTGAAAAT--CATTATAATAGTCTAATAGTAAT-------ATAAGGC---TACAGGTACAG-A-G-G-G-G-CT--T-TAATGTCAACAG-CCACATTTT-TTA-ATAAAGTTTTAAAT--tttactttttaaaaatataagatataaatatgaaatcaagttgttcttttatataatcatgttctagacacagaggattgattgctctgtagttattttaagttataattcttgtcagcactggtgattatggtcaaacttgactgcaagtatcagtatgaaattcagttgtgtatattgtcgtctctgtagtggtactactgtcactagttgaaaatcattataatagtctaatagtaatataaggctacaggtacagaggggctttaatgtcaacagccacattttttaataaagttttaaatctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : ttttataattgtcattataagtcttattagtcatgcttt-C-TACTCCAAAACG---T------G--------T-C------CA------TC--------G---ATATTAATCAAAAGTGTTAAGGAG--TATTA-----GTAT---GA-----AGTTTATTCA-T--GCATA--ACTGTC---G----TG--GTAACACGGTC--T----TCTG-AC-TTC-----------T-GTAG-------------------G---------------------T--A-AT-G-G---G-GCTC------------ATT-------C---A--C-CTCTCGATCGAAA-CT-------------G----AT-T---TTGGT----CA-AATATTCTA------AGTAATGTTA---TGT--AA----G-------TAGG---AATTCCTGTTG-TAC---ACGT-TGT-CGATA---CGTTACGGTCCAT-----T-T-T--TCG-------TTGAG-------------TTTGA---TAAT--TTTAA-TTGTG-----T---A----T---CT-------T-ATCAGC---G---CTACTTCT--------CC---T---AAATATCTCAACTGATTTTGAC-C-A-AACTTG-TT-AGAGG----CTATAAGTATAAATC-----CCA------GTTGTTTT---TATCATC-ctgacatataaataagttaaatgatcactattcatttacatgtagacttaaaatattgtaatctctttca
gi|7 : tattcttattagctctgCC---------T------C--------T-CGATCGAAA------CT--------G---ATTTTGGTCAAATATTCTAAGTAA--TGTTATGTAAGTAG---GA-----ATTCCTGTTG-T--ACAC---GTTGTC---GATA-CG--TT--A-CGGTC--C----ATT-----TTTC-----G----T-TGAGTT----------T------GA---TA--A-----T-----TTT-A-ATTG-T---G-TATCT-TA-------T-----C--AGCGCTA--C-TTCTC---------CTAAATATCTCAACTG----AT-T---TTGAC----CA-AACTTGTTA------GAGG-----C---TAT--AA----G-------TATA---AATCCCAGTTG-TTT---TTAT-CAT-CAACA---CATTCTGCTCCATCGA-CA-T-A--TCG-------CGGATT----TACTGCAC--TAACTTTAGG--TTTTA-TTGTA-----ATTCT----T---CT-------T-GTCAGT---A---CTG---CT--------CC---aacacattctgctccatcgacatatcgcggatttactgcactaactttaggttttattgtaattcttcttgtcagtactgctcc
gi|8 : tattcttattagctctgctactccaaaacgtgtccatcgatattaatcaaaagtgttaaggagtattagtatgaagtttattcatgcataactgtcgtggtaacacggtcttctgacttctgtaggtaatggggctcattcaTTGTCAG-C---A--TTATTCCTC---CTAAACTTT-----TCTACGGATTTTGTCCAAACTTGCAA---GGGTGTTTTACTAGTCCAG-----------TTGTGAATACT---GCT---GT--G---CGTTACATCAG-TTATTCTGTAGAGTT-ATGTCACTT--GGAGAA-AT-TT-AA-T
gi|8 : ggcccttccattaCAGT--T---G-----------CTCTTTATATC---ATT---CT--CTGTCAGTCCACCAA--T-TTGGGCATATTT-ATGGCCCTT--TGAT-A-ATATT-AA-TGATAAATCCAAGTAAAAAACCATATACA---TCACATTTTCTTGTCC--TC-----T-C-TTCTTCCCCTAAATTT------C--------T-T------AT------CT--------G---ACTTTAGCCAAACTTGCCAG---------------------------------------G-C--CTATC--TTTGTT---A----CA--TT--C-TGGTT--C----ATAA-AC-TTT-----------T-GGAGCTATGG-CCCTTT------AA---TT--ACAAATT-----TT--A-TT-G-T---A-ATTTT-TG-----------T-C--AGC---A--C-TTCTT---------CT-------------G----Attcagttatgtccagttgctctttatatcattctctgtcagtccaccaatttgggcatatttatggccctttgataatattaatgataaatccaagtaaaaaaccatatacatcacattttcttgtcctctcttcttcccctaaatttcttatctgactttagccaaacttgccaggcctatctttgttacattctggttcataaacttttggagctatggccctttaattacaaattttattgtaatttttgtcagcacttcttctgaacttcaaagctgattatg
gi|9 : ggcccttccattattgtcagcattattcctcctaaacttttctacggattttgtccaaacttgcaagggtgttttactagtccagttgtgaatactgctgtgcgttacatcagttattctgtagagttatgtcacttggagaaatttaatttcagttatgtcTT-ATGACCCTT--TCAT---AT-TT-AA------GATT-------------ATTTGCA---TTTTATTTTCA-GCCT--ATACATAT-CATGTTCA---------T------CATAAATTTT-C------TA------CT--------G---ATTTGGGCCATACTTTATAGGGAAATTATCA-----GTAT---GA-----ATCTCAACTG-C--T------GT-------G----C-------C-C--TT--C----ATCATAT-TCTT-----C----TCAAAGTTATGGCCCCTTT------CAAAGTT--A-----TGCACCTT--ACATAG-TTTCA-A---T-TG-------TATTA-T--AGC---A--C-TTCTCTTA------CT-------------G----AT-T---AGGGT----CAGAATTTGCAA------GAGA-----C---TAT--AA----G-------T-TGTACAAATC--GTTGTCTC---Tacttcaaagctgattatg
gi|9 : a-TTCTA---------CT-------------G----AT-T---TGGGC----CA-TACTTTATA------GGGA-----AAT-TAT--CA----G-------TATG---AATCTCAACTG-CTG---TGCC-CTT-CATCA---TATTCTTCTCAA---A-GT-T-A--TGGCCCCTTTCAAAGT----TAT-GCACCTTAC--ATAGT--TTCAA-TTGTA-------------------T-------T-AT-AGC---A---CTT---CT--------CT---T-------------ACTGATTAGGGT-C-AGAATTTG-CA-AGAGA----CTAT-A----------------A------GTTGTACA---AATCGTT-GTCTC--TA-TAGTAA--ACTA----CTA-ACACTAATCA--------------------AAATGGCATAAGT-ACAATAAGGC---TAAATGCACAG-TGG-G-G-G-CATTT-TTGTGTCGACAG-TCA----TT-TTA----AGTTTTTAAAT--atagtaaactactaacactaatcaaaatggcataagtacaataaggctaaatgcacagtgggggcatttttgtgtcgacagtcattttaagtttttaaat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTGCCATTGTGTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCATACGCAGGAATACCACTTTCTTGTTTAGAATAGTACTTCTGAAAACCTTATCAACCGATTATGACAAAACATG
Unaligned ( gi|34 ): TGTAAGACTGACTGTTTTCTCATGTTTTCAT