lowQualScore : 111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 000000000000000 1 1 33333333333333 111 1 666666666666666666666666 1 2222222 1 1 222222222 1 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333333333333333 222222 1 1 333333333 1 1 22 11 11111111111 22222222222222222222 1111111111111 11111111 1 55555555 1111 111 1 22222222222
lowQualScore : 55 999999999999999 66 0 5 0 6 2 7 6 6 55555555555555 4 4 7 1 4 0 777 999 5 666 666 3 3 666 3 111111111111111111111111 4 3333333 4 5 000000000 5 66 1 1 6 4 0 99999 666 555 8 5 3 3 44 7 6 0 5 0 8 55555555 44 8888 22 555 88888888 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 1 6666 5555 888888888888888888 222222 6 4 1 55 5 5 666666666 3 44 0 4 3 3 3 4 33 6 3 1 00 33 3 2 88 7 6 777 44 1 00 88888888 6 33333333333 7 1 77777777777777777777 6666666666666 00000000 4 1 4 77777777 9999999 6666 888 33 6 6 2 3 66666666666 5 555 5 3
lowQualScore : .. ............... .. . . . . . . . . .............. . . . . . . ... ... . ... ... . . ... . ........................ . ....... . . ......... . .. . . . . . ..... ... ... . . . . .. . . . . . . ........ .. .... .. ... ........ ............................................................................. . . .... .... .................. ...... . . . .. . . ......... . .. . . . . . . .. . . . .. .. . . .. . . ... .. . .. ........ . ........... . . .................... ............. ........ . . . ........ ....... .... ... .. . . . . ........... . ... . .
lowQualScore : 66 888888888888888 99 4 0 9 0 7 5 0 0 00000000000000 4 4 0 9 0 7 888 000 5 444 444 6 3 444 6 555555555555555555555555 4 2222222 8 0 000000000 0 44 6 6 0 5 5 11111 999 888 8 0 3 3 66 7 0 8 7 1 6 99999999 66 5555 55 000 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 4 1111 0000 111111111111111111 666666 1 4 2 55 0 6 888888888 1 22 8 7 5 7 1 8 55 7 1 5 66 11 3 9 99 8 8 888 66 8 88 99999999 0 00000000000 3 9 11111111111111111111 9999999999999 11111111 4 1 9 33333333 3333333 6666 888 99 3 7 7 6 88888888888 3 000 6 0
consensus : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTT-C--T-TGCGTTTT-TTA--GTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCC-GGTAAAATCACATT---CCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACA----T--AGTTGTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTGTTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACGAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCT---GTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTACCC---TGCCCAA--------CTT-------C-------A-----T-T------------A-----------------------A--NG--TA-ATGG--AGAGTAACGGA-A----TGAAGT----T-----G--G--GC-----ACCAGACT------AAATTTTGTTGGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATAC-T--T-CG-T-TG--TTCTTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAT-TATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTC-AAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTNTTCAA-TTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AA--AAAAAGTATTCTAC----CTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTAT--TAATACTACATTTTGTA-------TAT-CCTAGTT--AAA--GAATTCGTACAAATGCCTCCCCAA-TACGGTTACGCAACCCCATG-C---------TC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGACCCCGCCTCATGGCGGCG
Reference ( gi|3 ) : CAGGAAATTTACTTCTACTTGCACCTTTT------T--------TTA--GTTTATCCAAAGTAAGTAGGATTTGAATGTGCAATTTTTTCTCAACCAGTTACTCTACTGGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGCCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTTC-GGTAAAATCACATT---CCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGACTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----TA-----A-----TTATCGACA----A--AGTTGTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCATATATTTCACACCCGTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCTCATGCAAATAATGTAAACATCACATGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATT--GCT---GTATGTTGTCGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACATGATGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTACCC---TGCCCAA--------CTT-------T-------A-----T-T------------A------A---A------------A--AG--TA-ATGG-TAGAGTAACAGA-A----TGAAGT----T-----G--G--GC-----ACCAGACT------AAATTTTGTTGGGACTTGCTAGTATAAT--GACTTTTCATATATTTGGAAAACAAATATAAAATAC-T--C-TA-T-TG--TTCTTTTTATTTTAAATTCAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGTAT-TATATTCTAACCTGTTGTAATGGCAAAT-AAATAAGTTTTTT-AAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAG-TTTTTGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTGC--AA--AAAAAGTATTCTAC----CTTTAAAGTAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGACATTTTCCACCAAACTTAT--TAGT-CTACATTTTGTA-------TAT-CTAAGTT--TAA--GAATTTGTACAAATGCCTCCACAA-TACGGTTATGCAACCCCATG-A---------TC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGACCCCACCTTATGGCGGCG
gi|2 : CAGGAAATTTACTTCTACGAGCACCCTTT------TGCGTT---TTACAGTTTATCCAAAATAAGCATGATTTCAATGTGCAACTTAATCTGGACCAGTTGCTCTACTAGCAACTT--------------TT-C-AGATAAAACATGTCTATCACCTACTGTAGTCCCATTTTCC-GGTAAAATCACATT---CCTGTGACTTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAAT------CTTAGTCTATCTACATTGAAGGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGATATTAACGAGTT-GAAATAAG---GC-AATCAGCG-----CA-----A-----CTAACGACA----T--AGTTGTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCACATATTTCACCCCCTTGGTGGAAATTGCCTACAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTAACAAGATAAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCA---GTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACGTGACGAAGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTACCC---TGTCGAA--------TTT-------C-------A-----T-T------------------------------------C--CG--TT-ATTC-TCTATT-AC-GA-A----GGACCT----T-----G--G--GCAGGGTACCAGACT------AAA-TTTGTTGGGACTAGCTAGTATTAC--GGCTTTT-AGATGTTTGAAGAACAAGTATGAAATACGT--G-CG-T-TT--TTCTTTTTGTTTTAAATACAACTACAACATATAGTAAGAATAAACGTAT-TATGTGCAAACCTGTAATAATGACGAAT-AAATTAGTTTTTA-AGGC----AT----GTTTTTAATCTC-AA-AATGTTTAGATTTTCGATGCCTTGGTGTGTCTAAGAAAGATGTCATTACAAAA--AAAAAGTGTTCTAC----CTTCAAAATAAAAAAAT------A----AAAA-AACTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATAGAGT-------------TAA-------TGTACTGGGGAAAGTTTCAACAAATTTA---TAATACAACATTTTGTA-------TAT-CGTAGTT--AAA--GAATTCGTACAAATGCCTCCCCAA-TACGGTTACGC------------------------AATTCTAGAA--------------GGACCCCGCCTCATGGCGGCG
gi|1 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaataCAAGAAATTAACTTCTACGTGCACCTTTT------TGCGTCT--TTA--GTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGTGCAACTTTATCTTCACCAGTTGCTCTACCAACAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTTTCGCCTACTTCAGTCCCGTTTTCC-G-------------------GTGACCTTGACCACTTACTTCATTCAATACCGCAAAA-CTACATCTAAGTCTGCTTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATA--CGACATTACCGAGCT-GGAAAAAG---GC-AAGCAACG-----CA-----A-----TTATGGACA----A--AGTAGTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATAATCCACACCCTTGGTGGAAATTGGTTAATA---------C-CATCTTAGCTTTCTTTTACGCGCGTCTTCCTGCTAGCACGTATTGAAGTACCTCCATGCAAATAATGTGAACATCACGTGACAAGAATAGCACA-----TTTGATTTGCTGATTGAAATATC--GCT---GTGTGTTGTGGAACCTGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATATCG-TGCCAA-A--TTTGT--TG----TA--ATCTGGTACCC---TGCCCAATTTCATTCCTT-------TACTCTCCA-----T-T------------A------C---G------------A--AGGACA-TTGGCCAGGATACCAGA-C----TAAATT----T-----GTTG--TC-----ACTAG-----------------------CTTG----TATAAT--AACTTTTCAGATATTTGAAGAAC-AATATTAAATACTT--C-CG-T-TG--TT-------------------CTACAATATGTAGTAAGAACTAACATAT-TATGTTCTAACCGGTAATAATGGCGAATAAAATAAGTTTTTC-AAGTCCAAATTTTAATTTTTAATCTCTTG-ATTTTTCAA-TTTTCAATCCCTTGATTTGTCTAAGGGAATAGTCATTAC---A--AAAAAGTAATCTAC----CTCCAAAATTAACAATT------A----AAAC-AAT--ATGTTTCCTACATACAACTG--------------------GAAATACAAAATATACAGTAATATATACAGTATAG-------TGTACTTGCAAAATTCTTACCAACTTTA---TAATACTACATTTTGTA-------TAT-AAAAGTT--AAA--GAATTCATACAAATGCCTCGCCAA-TACGGTTACGCAACCCCATG-C---------TC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGACCCCGTCCTATGGCGGCGcacaata
gi|4 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatgCAGGAAATTTATTTCTATGTGCATCTTTT------TGCTTTTTTTTA--GTTTGTCCAAAGTTAGTATGATTTGAGTGTGCAACTTTATCTCGACTAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-TTAGG-AAAACATGTCTGTCTCCTATTTCAGTCC-ATTTTTCCGGTAAAATCACATT---C-TGTAACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAACATT-ACGTCTAAATCTACCTACATTCAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAA-G---GC-AA-----GAAACGCA-----A-----TTAACGACGTACGAGTAGTTGTGCATTGTAAACCATTAACAGGCGCAAATATGTCACACTCTTGGTGGAAACAGCCTAAAA---------C-CATATTTGCTTTATTTTCCACGCGTCTACCTACTAGCGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACACGATTAGCACA-----TTTGCTTGGCTGATTGAAGTACC--AAT---GTGTGTTGTccg
gi|14 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgCAGGATATTTACTTCTACA-GCACCTTTT------TGCGTTTT-TTA--GTTTATCCAAAGTATGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTTGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TTAC-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTCCC-GGTAAAATCACATT---CCTGTGATCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAA-TTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTTTAT-CGACATTACCGAGCTGGAAAAAAG---GC-AATCAACG-----CA-----A-----TCAATGACA----T--AGCTGTAGACTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATATTTCACACCgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|21 : catgtcaatgCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTT------TGCGTTTT-TTA--GTTTATTCAAAGTAAGTATGATTTGATTGCGCAACTTTTTCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAA-AT--------------TT-C-AGGTTAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATGTTCC-GATAAA
gi|16 : tttcacttgattacgcgatttcacatgttgatgCAGGAAATTTATTTCTACGTGCACCTTTTGCGTTTT--------TTA--GTTTATCCAAAGAAAGCATGATTTGAATGTGCcattgaccacta
gi|19 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTCCCGT-T--------TTA--GTTTATCCAAAGTAAGCCTGATTTGAATG--CAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTATAACA-------CA--TATTTCGATCCCATTCTTttccaatatccggtaaaatgacattcctgtgtccttgaccactacctccattcattaccgcaaaattacgtctcagtgtgcctacattgaatggcgaatctgctatatcgacataaccgagcagcaaaaaggctcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|28 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgCAGGAAATTTACTTCTATGTGCACCTTTTGCGTTGT--------TTA--GTTTGTCCAAAGTAAGTATAATTTGAATGTGAAAgttctttttgttttaaatacaactacaatatttagtaagagttaacgaattgtgttccaacctgtaataatggcgaat
gi|5 : tttcacttggtgactcgattacacatgtcattgGTTGCTCTACTAGCAACATGTTCTAATGACATGTC-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTGAGTCCCATTTTCA-GATAAAATCACATT---CCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGTGAA---TCTG---CTATGTTCGACATTACCAAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACACAATTAATGACA----T--AGTTGTACATTTCAAACCATTTAAAGGC--AAATATTTCACAACCTTGGTGGAAATTGCCTAAA----------C-CATCTTTGCTTTCTTTCCCGCATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGCACATTAATTTTGATTGGCTGATTGAAATATC--ACT---G--TGTTGTGGAACTCGTATGCATA-AA-TAT--AAACAT-A---GACGAGGTCAGCACTTCTGATTGGTTGCTTGTA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTG
gi|7 : CTCTACTAGTAACATG-------------TT-C-AGATAAAACCTGTCTAGCGACTATTTCAATCCCATTTTCC-TGTAAAATCACATT---TCTGTGACCATGACCACTAAC------------CGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGTCTACATTGAATGGCGAA---TC----------------ATTACCGAGTT-AAAAAAAG---GC-AA-----G-----CAGCAGAA-----TTAACGACA----A--AGCTGTAAAATGCAATCCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACAATATCGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCT--CTTTTCCAGGCGTCTTCCTGCTGGCGCG--------------CATACAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTAATTGGTTGATTGAAATATT--GCT--------TTGT-------GTATGCGTA-GA-TAT--CAACACCAAGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTGGAATATTTCG-TGTACA-A--TTTGT--CG----atagcactagctagtataatgactttccagatatttggagaacaaatataaaatactggggttgttctttttgttttaaattcaactacaatatgttatacgaattaacgtattatgttttaacctgtaatactggtgaataaataagtttttcaagccctgattttaatttttgatctcttgatttttcaatttcgatcccctgatttgtcattacaatactttccaaataaaccataaaaaaattaaggtttcctacatacaactgaaactttcaggtttactttcaaagtacaaaatatacagttaatgtacatggaaattttccaccaaatttataatactacattttgtatatcctaaagaaatcgtacaaatgcctcccctaaacggttatgcaaccccatgcaaccccatgctcaaattctagaagccttcctagtggaccctgctacatggcggtgcccaaaa
gi|15 : gCTACTAGCAACATG-------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTGCAGTCCCATTTTCT-GGTAAAATCACATT---CCTGTGACCTTGATCGCTAACTTCATTCATTACCGTAAAATT-AAGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---CTTG---CTATAT-CGACATAACCAAGCT-GA----------C-A------------TA-----A-----TTAACGACA----T--AGTTGTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCACATATTTTACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCATCTTCCTGCTAACGTggattagctatttttcagataattggataacaaatataaaatacttgagttgttctttttgttttaaaaacaactgcaatatgtagtaagaattaacgttttatgttttaacaagtaattatggcgagtaaataagttttttaactttaaattttgatatcttgatcattcaattttcgatcccatcatttgtcgaagagactagtcattacaaaaaagtactctatcttcaaaataaacaattaaacaaatcaaggtttcctacataaactgaacatacaaaataaacagtttaggtactttgaaagtttccaccaaatttataatactacattttgaatatcctagttaaggaattcgtacaaatgcctcaccagtacgattacgcaaccctatgatcaaattctagaagcattcctaatgggccccgcttcctggctgcgcccaat
gi|26 : ATTTCTATCTCATCTTTT---TA---TTTCATTAATCCTGTGACTTTGACCACTAACTTAATTCATTACGGCAAA-TTTACGTATCAATCTGCCTACATTGAATATCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAA
gi|16 : TTCCAATATCC-GGTAAAATGACATT---CCTGTGTCCTTGACCACTACCTCCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAGTGTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATAACCGAGCA-GCAAAAAG---GC-
gi|43 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgcaggaaatttatttctacgtgcaccttttgcgttttttagtttatccaaagaaagcatgatttgaatgtgcCTTTGACCACTAACTTCTTTCATTACCGCAAAG-TTATGTCTCtcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|25 : TTATTACCACAAAAATTACGT----------------TGAATGACGAA---TCTGTAGCTATAT-CGACATTACCCGGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACGCAATTAACGAAA----T--AGTTGTACAATGCAAACCATTAAAAGGTGCAAATATTTCACACCTTTGGTGGAAATTGCCTAA
gi|6 : CTGTCTACATTGAATGGCGAAATGTCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAGGCAAGC-AAC----G-----CA-----A-----TTCACGACA----T--AACTGTACATTGCAATCCATTAAAAGACGCAAATATTTTACACACTTTGTAGAAATTGCCTAAAATTCCCCTTAC-CATCTTTGAGTTCTTTTCCGCACGTTTTCCTACTAACGTGTGTTGAAGAACCCTTATGCAAAATATGTTAACATCACGTGACAATATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCT---GT--GTTGTGGAACCCGTATGGA-A-AA-TATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACATTTGATTGGCTGATTGAA-ATATCGCTG----------TGT--TG----T-------GGAACCCGTATGCATAA--------------------------A-----TAT------------A------A---A------------C--AT--CACATGA-CGAGGT--CAGC-ACCTTTGA--T----T-----G--GTTGC-----TTCAAATTTCGTGCAAAATGTGTTTGGACTAGCTAATATAAT--GACTTTTCAGATATTTGCAGAACAA-TAAAAAATACAT--T-CA-T-TG--TTGTTTTT--TTTAAATACGACTAAAATAAGTAGTAAGAATAAACGTTC-TATGTTCTAACCTGTAAAAATGGCGAAT-AAATTAGATTGTC-AAGGTCTAATTTTAATTATTAATCTCTTG-ATTTTTCAA-TTTTCGATACCTTGATTTTTCTTAGGGACTAGTCATTAC--AT--GAAGAGTATTCTAC----C-GTAAAACAAACAATT------A----AAAA-ATTCCAGGTTCCCTACATACAACTG--------------------AAAATATAAAATATACAGT-------------TAA-------AGTACTTGGAAGTTTACCACCAAATTTAT--TATA-CTACACTTTGTA-------TAT-TCTAGTT--AAA--G---------AAATTCGTCCCCAA-TAC---------ATCCCATG-C---------TC-GAATTCTAAAAGCATTCCTACTACTAGTCCCCACCTTATGGCGGCG
gi|18 : CATTCCCAAACT-GAAAAAAG---GCTAATAGT-G-----CA-----A-----CTAACGCCA----T--TGCTGTACATTGCATGCCCCCATAGGGCAAAAATATTTTAGAACCTTGGTGGAAATTCCCCAGAA---------CACCTCTTcttaataa
gi|17 : atcagtgtgagatagatagcgaaattgctgcattggttgcataacatgtgcgtacaaattgttcccttcatacaaaatgcaatcaacatcaacggctgttatagccgaaaaagagtCACGCGTCTTCTTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCACATGCAAATAATGTAAACATCACATGACGAGATAAGCACA-----TTTAATTGGCTAATTGAAATATCTCGCT---GTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACGTAACGTGACGAGGTCAGCACGTTTGATCGATTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTGT--TG----TA--GTCTGGTACCC---TACCCAA--------CTT-------C-------A-----T-T------------accattgttattgtt
gi|8 : CTGCTAGAGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAAAAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGTACA-----TTTGATTGGTTGATTGAAATAAC--GCT---GTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AA-TGT--AAACATCACGTGACCAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCGTCAA-ATTTCG-TTCAAA-A--TTTGT--TGGGACTA--G-CTAGTAccgttatgtgaacattagatattgatag
gi|9 : TGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AATATAAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACC-----TTTGATTGGTTGCT--AAAAATT---TT---GTAGG--GACGAGCTTGTATttatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaatacatacaactgaaaatacaaaatgaacaattaatgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|13 : ATGCATA-AATATAAATATCACGTGACGAGATAAGCACC-----TTTGATTGGTTGCTTGAAAaatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtACTAGATTAGCACA-----TTTGACTGGGTGATTGAAATATC--GCT---GTGTGTTGTgttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|8 : T--GCTAGAGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAA-AAATGT--AAACATCATGTGACAAGATTAGTACATTTGATTGGTTGATTGAA-ATAACGCTG--------TGTGT--TG----T-------GGAACCCGTATGCATAA--------------------------A-----TGT------------A------A---A------------C--AT--CACGTGA-CCAGGT--CAGC-ACCTTTGA--T----T-----G--GTTGC-----GTCAAATTTCGTTCAAAATTTGTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGATATTTGGTAAACAAATATAAAATAC-TTGC-T--T-TG--CTCTTTTTGCTCTAAATACTACTACAATATGTAGTTAGAATAAATGTAT-TATGTTCTAACCTGCAACAATAGCGAAT-AAATTAG-TTATC-AAGGCCTAATTTT-ATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAC-TTTTCGATCCATTGATTTGTCTAAAGGAATA--CA-TAC--AACTGAAAA------TAC--------AAAATGAACAATT------A----Aatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|4 : c---GTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAA-TGT--AAACATCACGTGACACGATTAGCACATTTGCTTGGCTGATTGAA------G-TACCAATG--TGTGTTGTG----TA--GTCTGGTACCC---TGTCCAA--------CTT-------T-------G-----T-T-------------------------------------------T---TGT-T------ACTTA-A----TGAAGT----T-----G--G--GCAGGGTACCAGACT------Atgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|9 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcTGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACCTTTGATTGGTTGCTAAAA-ATTTTG-Ttgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : CGTATGCATA-AA-TAT--AAAGATCTCGTGACGAGGTAAGCACCTTTGGTTGGTTACTTCAA-ATTTCG-TGCAGA-A--TTTGT--TG----agggacgagcttgtataatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
gi|13 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgGTATGCATA-AA-TAT--AAATATCACGTGACGAGATAAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-AGTTCG-TGCAAC-A--TTTGT--TT----T---GTCTggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtAGATTAGCACATTTGACTGGGTGATTGAA-ATATCGCTG--------TGTGT--TG----TATAGTCTGGTACCC---TGTCCCA--------CTT-------A-------A-----T-T-----------------------------------------------------CCGTTACTGA-A----TGAAGT----T-----G--G--GCAGGGTATCAGACT------Aaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|11 : actTTGATTGGTTGCTTGAACATTTCG-TGCAAA-AATTTTTT--TGGGACTA--G-CTAGTATTA---TG----A--------CTT-------T-------------T-C------------A------G---A------------A--AT--T-------TGGAG-AACGGATA----TAAAAT----tgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|2 : ----TA--GTCTGGTACCC---TGCCCAAGGTC----CTT-------C--------------------------------------------------------G--TA-ATAG--AGAATAACGGA-A----TGAAAT----TCGACAG--G--GT-----ACCAGACTACAAC-AAATTTTGacttgcaatgttctttttgttttaaatacaactacaatatgtagtaagaattaacgtaaatatgttttaacctataataatggcgaataaataagtttttcaagccataattttaaattttaatctcttgctattcaattttcgatcccttgatttgtctaagggactagtcattacaaaaaaatattctaccttcaaaataaacaattaaaaataaataaggtctcctacatacaaatgaatatacagaataaagagttaaggtactaggaaacttttaaccaaatttataataatacattttgtatatcctagttaaagaattcgtacaaatgtctccccaatatggttacgcgacgccatgctc
gi|1 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaatacaggaaatttacttctacgagcacccttttgcgttttacagtttatccaaaataagcatgatttcaatgtgcaacttaatctggaccagttgctctactagcaacttttcagataaaacatgtctatcacctactgtagtcccattttccggtaaaatcacattcctgtgactttgaccactaacttcattcattaccgcaaaatcttagtctatctacattgaagggcgaatctgctatatcgatattaacgagttgaaataaggcaatcagcgcaactaacgacatagttgtacattgcaaaccattaaaagacgcacatatttcacccccttggtggaaattgcctacaaccatctttgctttcttttccacgcgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcacgtaacaagataagcacatttgattggctgattgaaatatcgcagtgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacgtgacgaagtcagcacctttgattggttgcttgaaatttcgtg----TA--GTCTGGTATCC---TGGCCAA--------TGT-------C-------C-----T-T---------------------------------------CG--TA-ATGG--AGAGTAAAGGA-A----TGAAAT----T-----G--G--GCAGGGTACCAGATT------Aaatttgttgggactagctagtattacggcttttagatgtttgaagaacaagtatgaaatacgtgcgtttttctttttgttttaaatacaactacaacatatagtaagaataaacgtattatgtgcaaacctgtaataatgacgaataaattagtttttaaggcatgtttttaatctcaaaatgtttagattttcgatgccttggtgtgtctaagaaagatgtcattacaaaaaaaaagtgttctaccttcaaaataaaaaaataaaaaaactaaggtttcctacatacaactgaaaatacaaaatatagagttaatgtactggggaaagtttcaacaaatttataatacaacattttgtatatcgtagttaaagaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaattctagaaggaccccgcctcatggcggcgcacaata
gi|4 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatgcaagaaattaacttctacgtgcacctttttgcgtctttagtttatccaaagtaagcatgatttgaatgtgcaactttatcttcaccagttgctctaccaacaacatttcaggtaaaacatgtctttcgcctacttcagtcccgttttccggtgaccttgaccacttacttcattcaataccgcaaaactacatctaagtctgcttacattgaatggcgaatctgctatacgacattaccgagctggaaaaaggcaagcaacgcaattatggacaaagtagtacattgcaaaccattaaaagacgcaaataatccacacccttggtggaaattggttaataccatcttagctttcttttacgcgcgtcttcctgctagcacgtattgaagtacctccatgcaaataatgtgaacatcacgtgacaagaatagcacatttgatttgctgattgaaatatcgctgtgtgttgtggaacctgtatgcataaatataaacatcacgtgacgaggtcagcacctttgattggttgcttgaaatatcgtgccaaatttgttg----TA--GTCTGGTACCC---TGCCCAA--------CTT-------C-------A-----T-T------------A-----------------------------------------AGTAACAAA-A----CAAAGT----TGGACAG--G--GT-----ACCAGACT------Aaatttgttgtcactagcttgtataataacttttcagatatttgaagaacaatattaaatacttccgttgttctacaatatgtagtaagaactaacatattatgttctaaccggtaataatggcgaataaaataagtttttcaagtccaaattttaatttttaatctcttgatttttcaattttcaatcccttgatttgtctaagggaatagtcattacaaaaaagtaatctacctccaaaattaacaattaaaacaatatgtttcctacatacaactggaaatacaaaatatacagtaatatatacagtatagtgtacttgcaaaattcttaccaactttataatactacattttgtatataaaagttaaagaattcatacaaatgcctcgccaatacggttacgcaaccccatgctcaaattctagaagcatttctactggaccccgtcctatggcggcgccg
gi|13 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtg----TA--GTCTGATACCC---TGCCCAA--------CTT-------C-------A-----T-T-----------------------------------------------------CAGTAACGGA-A----TTAAGT----GGGACAG--G--GT-----ACCAGACT------Atgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|35 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgta----TA--GTCTGGTACCC---TGCCCAC--------CTtgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|23 : ----TA--GTCTGGTACCC---TGCCCAA--------CTT-------C-------A-----T-T------------ccgttccgttactctccacttcataacacggtatggagttgggcagggtaccagac
gi|27 : ----TA--GTCTAGTACCC---TGCACTA--------CTT-------C-------A-----T-T------------ctgttactctccattacgaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|30 : acacaatgtgtgccttcttcagtctggaaccctgcccaacaagtaatgaaaccagag----TA--GTCTGGTACCC---TGGCCAA--------CTT-------C-------A-----T-T------------ttattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|27 : A--GTCTGGAACCC---TGCCCAA--------C--------------------------------------------------------------A--AG--TA-ATG---AAACCAG-AGA-A----TGAAGTAG--TGCA--G--G--GT-----ACTAGACT------Accgttactctccattacatcttcgttatgaagaggaacgctatgaagatggccaggaaccagac
gi|35 : acacaatgtgtgccttcttc--GTCTGGTACCC---TGCCCAA--------CTCCATACCGT-------G-----T-T------------A------T---G------------A--AG------TGG--AGAGTAACGGA-A----CGGAGG----T-----G--G--GCAGGGTACCAGACT------Attattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|32 : --GTCTGGTACCC---TACCCTA--------CTC-------C-------A-----T-TCTGTTACTC---A------C---C------------ATTAG--GA-GTGG--AGAGTAACGGA-A----TGAAGT----G-----G--G--GC-----A
gi|31 : ctggtacct--GTCTGGTACCC---TTCCCAA--------CTT-------C-------A-----T-TCCGTTACCCTCCA------T---T------------A--CG--GA-ATG----GAGTAACGGA-A----TGAAGT-----------------------ACCAGA
gi|39 : cctggtaccttgctTCTGGTACCC---TGTCAAA--------CTT-------C-------AGTCCTT-T------------A------------------------------TA-GTGG--AGAGTAACGGA-A----TGAAAT----T-----G--G--GCATGGTACCAGA
gi|39 : TCTGGTACCA---TGCCCAA--------TTT-------C-------A-----T-T------------
gi|33 : tctggtaccctgtcaaacttcagtcctttatagtggagagtaacggCTGGTACCC---CGACCAA--------CTT-------C-------A-----T-TCCGTT-------ACCCTCCATGTA------------A--TG--TA-ATGG--AGGGTAACGGA-A----TGAAGT----T-----G--G--GC-----A
gi|32 : CTGGTACCT---TGCCCCA--------CTT-------C-------A-----T-TCCGTT-------ACTCTCCA---C------------T--CC--TA-ATGG-T-GAGTAACAGA-A----TGGAGTAGGGTA----G--G--GT-----ACCAGACggatacc
gi|37 : CTGGTATCC---TGCCCAA--------CTC-------C-------ATTCCGT-T------------ACTCTC-C---A------------A--AG-------GG---GAGGAACGGA-A----AGGAGT----TTTGCAG--G--GT-----ACCAGAC
gi|36 : TGGTACTC---TGCCCAA--------CTT-------T-------A-----T-TCCGTTTCTCTCCA------T---T------------T--CG--TA-ATGG--AGGGGAATGGA-A----TAGAGT----T-----G--G--AC-----A
gi|33 : ggtacccGGTATCC---TGCCCAA--------CTT-------C-------A-----T-TCCGTT-------ACCCTCCATT-A------------C--AT--TACATGG--AGGGTAACGGA-A----TGAAGT----TGGTCGG--G--GT-----ACCAG
gi|36 : GGTACCC---TGTCCAA--------CTC-------T-------A-----T-T------------C------C---ATTCCCCTCCATTA--CG--AA-ATGG--AGAGAAACGGA-A----TAAAGT----T-----G--G--GC-----A
gi|30 : ------------A------A---G------------A--TG--TA-ATGG--AGAGTAACGGA-A----TGAAGT----TGGCCAG--G--GT-----ACCAGACT------Agagtacca
gi|23 : G--TA-ATGG--AGAGTAACAGA-A----TGAAGT----T-----G--G--GCAGGGTACCAGACT------Acgttatgaagaggaacgctatgaagatggccaggaaccagac
gi|31 : G--TA-ATGG--AGGGTAACGGA-A----TGAAGT----TGGGAAG--G--GT-----ACCAGACgaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|34 : cctggtaccttgcttctggtacttcattccgttactccattcc--TA-ATGG--AGAGTAATGGA-A----TGAAGT----T-----G--G--G
gi|37 : tggttccttTGG--AGAGTAACGGA-A----TGGAGT----T-----G--G--GC-----Agtaataatggagagatacggaatgaagatggccaggctacca
gi|17 : ctggtatccTAACGGA-A----TGAAGT----TGGGTAG--G--GT-----ACCAGACTACAAC-AAGTTTTGaaggggaggaacggaaaggagttttgcagggtaccagac
gi|5 : cacgcgtcttcttgctagcgtgtattgaagaacccacatgcaaataatgtaaacatcacatgacgagataagcacatttaattggctaattgaaatatctcgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacgtaacgtgacgaggtcagcacgtttgatcgattgcttgaaatttcgtg------AAAACTTGATAGCACTAGCTAGTATAAT--GACTTTCCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATAC-T--G-GGGT-TG--TTCTTTTTGTTTTAAATTCAACTACAATATGTTATACGAATTAACGTAT-TATGTTTTAACCTGTAATACTGGTGAAT-AAATAAGTTTTTC-AAGCCCTGATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAA-TTTC-GATCCCCTGATTTGTC-------------ATTAC--AA-------------TAC----TTTCCAAATAAACCAT-------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTGAAACTTTCAGGTTTACTTTCAAAGTACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACATGGAAATTTTCCACCAAATTTA---TAATACTACATTTTGTA-------TATCCTA-------AA--GAAATCGTACAAATGCCTCCCCTA-AACGGTTATGCAACCCCATGCAACCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCCTTC---CTAGTGGACCCTGCTACATGGCGGTGtgtgaacattagatattgatag
gi|10 : gttgctctactagcaacatgttctaatgacatgtccaggtaaaacatgtctatcacctatttgagtcccattttcagataaaatcacattcctgtgaccttgaccactaacttcattcattaccgcaaaattacgtctcaatctgcctacattgaatggtgaatctgctatgttcgacattaccaagctgaaaaaaggcaagcaacacaattaatgacatagttgtacatttcaaaccatttaaaggcaaatatttcacaaccttggtggaaattgcctaaaccatctttgctttctttcccgcatgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcatgtgacaagattagcacattaattttgattggctgattgaaatatcactgtgttgtggaactcgtatgcataaatataaacatagacgaggtcagcacttctgattggttgcttgtaatttcgtgc------AAATTT-GTTGGGACTAGCTAGAATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATAC-T--TGCA-T-TG--TTCTTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGTAT-TATGTTCTAACCTGTTATAATGGCGAAT-TAATAAGTTTTTC-AAGCACTACTTTTAATTTT-GATCTCTTGTATTATTC------------CCTTGATTTCTCTAAGAGATTAGTCATTAC--AA--AAACAGTATTATACAGTCCTTCAAAACAAACAATT------A----AAAATAATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AATATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGAACATTGAAATTTTCCACCAAACTTA---TAATACTACATTTTGTA-------TAT-CCAAGTT--AAA--GAATTTGTACAAATATCTCCCTTA-TGTGGTTACACAACCCCATG-C---------TC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGACCCTGCCTCAT-GTGGCGcccaaaa
gi|9 : ------AAATTTTGTAGGGACGAGCTTGTATAAT--GATTTTTCAGATATTTGGAGAATAAATATAAAATAC-T--TGCG-T-TG--TTTCTTTTATTTTAAA-----CGACAATGTGTAGTAGGAATCAACGTAT-TATGTTCTTACTTGTAATAATGGCGAAC-AAATCAATTTTCC-AAGCCCTAATTTTAATTTTTGATTTCTTG-ATTATTCAG-TTTTTGATCCCTTGATTTGTTAAAGGGACTAGTCATTAC--AA--AAAAAGTATTCCAC----CTTCAAAATAAACAATT------ATATTAAAA-AATAAAGGTTTCCAACATACAACTT--------------------AAAATACAAACTATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTTTCTACCATATTTA---TAATACTACATTTTGTATTATTTTTAT-CCTAGTTAAAAA--AAATTCGTACAAATG-CTCCCCAA-TACGGTTACGTAACCCCATT-----------TCAAAATTCTAAAAGCATTC---TTACTGGGTCCCGTCTCATGGCAGCGcccaataa
gi|11 : tgtgttgtggaatccgtatgcataaatataaacatcatgtgtcgaggtaagcacctttgattggttgctaa------AAATTTTTTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGAAATTTGGAGAACGGATATAAAATAC-T--TGCA-A-TG--TTCTTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAAATATGTTTTAACCTATAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTC-AAGCCATAATTTTAAATTTTAATCTCTTG--CTATTCAA-TTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AA--AAAAA-TATTCTAC----CTTCAAAATAAACAATT------A----AAAATAAATAAGGTCTCCTACATACAAATG--------------------AATATACAGAATAAAGAGT-------------TAA-------GGTACTAGGAAACTTTTAACCAAATTTATAATAA---TACATTTTGTA-------TAT-CCTAGTT--AAA--GAATTCGTACAAATGTCTCCCCAA-TATGGTTACGCGACGCCATG-C---------TC-
gi|7 : ttgattggttgcttgaacatttcgtgcaaTTTGTCGGGATTAGCTA-----------TTTTTCAGATAATTGGATAACAAATATAAAATAC-T--T-GAGT-TG--TTCTTTTTGTTTTAAAAACAACTGCAATATGTAGTAAGAATTAACGTTT-TATGTTTTAACAAGTAATTATGGCGAGT-AAATAAGTTTTTT-AA-------CTTTAAATTTTGATATCTTG-ATCATTCAA-TTTTCGATCCCATCATTTGTCGAAGAGACTAGTCATTAC--AA--AAAA-GTACTCTAT----CTTCAAAATAAACAATT------A----AACA-AATCAAGGTTTCCTACATA-AACTG--------------------AACATACAAAATAAACAGT-------------TTA-------GGTACTTTGAAAGTTTCCACCAAATTTAT---AATACTACATTTTGAA-------TAT-CCTAGTT--AAG--GAATTCGTACAAATGCCTCACCAG-TACGATTACGCAACCCTATG-A---------TC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTAATGGGCCCCGCTTCCTGGCTGCG
gi|13 : gctctactagtaacatgttcagataaaacctgtctagcgactatttcaatcccattttcctgtaaaatcacatttctgtgaccatgaccactaaccgcaaaattacgtctcaatctgtctacattgaatggcgaatcattaccgagttaaaaaaaggcaagcagcagaattaacgacaaagctgtaaaatgcaatccattaaaaggcgcaaatatttcacaatatcggtggaaattgcctaaaaccatctttgctcttttccaggcgtcttcctgctggcgcgcatacaaataatgtaaacatcacgtgacaagattagcacatttaattggttgattgaaatattgctttgtgtatgcgtagatatcaacaccaagtgacgaggtcagcacctttgattggttgctggaatatttcgtgtacaaTTTGTTTTGTCTAACTAGTGTAATATGACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATAC-cccaat
gi|4 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacaTTTGGAGAGGAAACATAAAATG--T--C-TG-CGTGGTTTCTTTTT--TTAAAATACAACTACAATATGTCGTAAGAATTAACGTAT-TATATTCTAATCTGT----------AAT-A---AAGTTTTTC-AAGCC--A--TTCAATTTTCGAACCCTTG-AT------------------------TTGTCTAAAGGACTAGTCATTAC---A--AAAAAGTATTCTAC----CTTCAAAATAAACAATT-----------AAAC-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTA--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTGTCCACCATATTTA---CAATATTAAATTTTATG-------TATGCT-AGTA--AAA--GAATTCTTACAAATGGCTCCCCAA-TACGGTTACGCCACCCAATG-C---------TCTAAACTTTAGAAGCATTC---atgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|12 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctt-T-TG--TTTCTTTTGTTTTAAATACAACTACAATTAGTAGTTAGAATTGACGTAT-TATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATCAGTTTTC--AAGCCCATATTATAATTTATGATCACTTG-ATTATTCAA-TTTTTGATTCCTTGATTTGTTTAAGGGACTAGTCATTCC--AA--AAAAAAT---CTAT----TTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATCAAGGTTTCCTACATACAAATA--------------------AAAATACAAAATATATAGT-------------TAAGGTGCAATGTACTTGGAAAGTTTCCATCAAATTTA---TAATACTACATTTTATA-------TAT-CCTAGTT--AAA--GAATTCGTACAAATGCCTCC-CAAGTACGGTAACTCAACCCCATG-C---------TC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGCCCCGTCTCATGCCGGTGatggcggcgcccaata
gi|20 : aaataattgcg-T-TG--TTCTTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGAAT-TGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTTCAAGTCTTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ACTATACAA-TTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC---A--AAAAAGTATTTAAC------TCAAAATAAACACTTCAAGTAG----AAAA-AAGTAAGGTTTCCTACAAACAACccctataaaag
gi|19 : -T-TG--TTCTTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGAAT-TGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-
gi|22 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaggaaatttacttctacgtgcaccttttcccgttttagtttatccaaagtaagcctgatttgaatgcaactttatctcgaccagttgctctactagcaacatttcaggtataacacatatttcgatcccattcGGTTTCTTACATACAAATG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGGAAATTTTCACCAAATTTA---TAATACTGCATTTTGTA-------TAT-CTTAGTT--TAA--GAATTAGTACAAATGCCTCCCCAA-TACGGTTATGCAACCCCATG-C---------TC-AAATTCTAGTAGCATTC---CTACTAGACC
gi|8 : atTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATGAACAAT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTACCAAAAAATTTAT---AATACTACAATT-GTA-------TAT-CCTAGT----AACTGAATTCGTACAAATGCCTCCCCAA-TACGGTTACGCAACCCCATG-C---------TA-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGTCCactcgctacattggcgta
gi|13 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcaaaatttgttgggactagctagtattatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaaAAATATAAAATACATG-------------------------CGTGGTTTCATTTTTTCCATCATATTTAT---AATACTAAATTTTGTA-------TAT-ATTAGTT--AAA--GAAGTCTTACAAATGCCTCCCCAA-TACGGTTACGCAACCCCATA-C---------TC-AAATTCTTGAAGCATTC---CTA------CCTTCCTCATGGCGGCG
gi|24 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaac-------TGTACTTGGAAATTTTACACCAAATCTAT---AATACTATATGTTGTA-------TAT-CCTAGTT--AAA--GATTTCGTACAAATGCCTCCCCAA-TACGGTTACGCAACCCCATG-C---------TC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGACCCCGCCTCATGGCGGCGccc
gi|38 : TCGTACAAATGCCTCCCCAA-TACGGTTATGCAACCCCATG-C---------TC-AAATTCTAGAAGCATTC---TTACTGGACCCCGCtccaat
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTCTGGTACCCTGTCTATTTCTTTCCGGATCACAGGCAATGAAGTTTGATAGGGTACCAGTGCACATATATATTAACATGTATGTATATATGTATCTATGT
Unaligned ( gi|40 ): CGATTAAAACAATTATATTCGGAACTAATGGTAGTCCCATTTTTTCGGTGTACAAATGAAACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTCTATGAATTGATCTAGTGCATATTGTTAGAAGTTTGCCAAATGATATGGCACTGTCCG
Unaligned ( gi|42 ): TAATTTCCAATAAAAAAAAATGTAGGTGTAAAATGCGGACTTT
Alignments
lowQualScore : 44444 33333333333333 111 444444444444444444444444 111111111 11111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 33333 111111111 11111111111 111111111 11111111111 22222222222222222222 1111111111111 22 1111111111
lowQualScore : 77777 1 0 11111111111111 4 4 555 555 555 3 3 555 3 333333333333333333333333 999999 44 0 777777777 4 0 6 1 4 22222 66 0 3 3 44 0 5 0 8 55555555 44 88888888 22 777 2 2 0 44444 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 22 1 333 2 1 3 4444 22 22 33333 22 66666 33 666666666 7 55555555555 1 44 2 2 999999999 33 1 2 2 2 3 0 0 3 2 666 3 1 6666 11111111111 6 1 55555555555555555555 6666666666666 9999999 0 55 8888888 33 2 0000000000 5 444 33 3
lowQualScore : ..... . . .............. . . ... ... ... . . ... . ........................ ...... .. . ......... . . . . . ..... .. . . . .. . . . . ........ .. ........ .. ... . . . ..... ........................................................ .. .. . ... . . . .... .. .. ..... .. ..... .. ......... . ........... . .. . . ......... .. . . . . . . . . . ... . . .... ........... . . .................... ............. ....... . .. ....... .. . .......... . ... .. .
lowQualScore : 00000 1 7 55555555555555 0 0 222 888 888 3 1 888 3 777777777777777777777777 666666 66 7 888888888 4 7 2 4 0 55555 99 4 3 3 66 8 7 1 6 99999999 66 77777777 99 444 9 1 6 88888 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888 66 66 9 222 9 0 8 0000 66 66 55555 88 88888 77 222222222 7 88888888888 5 66 9 9 777777777 77 2 9 9 5 1 8 6 1 1 555 1 6 5555 33333333333 7 0 00000000000000000000 9999999999999 3333333 4 55 7777777 77 7 9999999999 0 777 99 3
consensus : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTT----TGCGTTTTTTAGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGCC-CAACTTCA-----T--------------T----------------A--ACG------T-A-A--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGA--AGT--T-----GG--GC--G--ACC--AGACT---------AAATTTTGTT-----------GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATA-AAATA-C--TTGC-G-TTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAT-TATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
Reference ( family-5234 ) : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTT--CTTGCGTTTTTTAGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTGTTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACGAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGCC-CAACTTCA-----T--------------T----------------A--ANG------T-A-A--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGA--AGT--T-----GG--GC-----ACC--AGACT---------AAATTTTGTT-----------GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATA-AAATA-C--TT-C-G-TTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAT-TATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTNTTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|1 : CAAGAAATTAACTTCTACGTGCACCTTTT----TGCGTCTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGTGCAACTTTATCTTCACCAGTTGCTCTACCAACAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTTTCGCCTACTTCAGTCCCGTTTTCCG----------------GTGACCTTGACCACTTACTTCATTCAATACCGCAAAA-CTACATCTAAGTCTGCTTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATA--CGACATTACCGAGCT-GGAAAAAG---GC-AAGCAACG-----CA-----A-----TTATGGACAAA------GTA--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATAATCCACACCCTTGGTGGAAATTGGTTAATA---------C-CATCTTAGCTTTCTTTTACGCGCGTCTTCCTGCTAGCACGTATTGAAGTACCTCCATGCAAATAATGTGAACATCACGTGACAAGAATAGCACA-----TTTGATTTGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCTGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATATCG-TGCCAA-A--TTTGT--TG----TA--ATCTGGTAC--CC---TGCC-CAATTTCA-----T--------------T----------------C--CTT------T-A-C--------T--C--T-CC--ATT-AC-GA-A----GGA--CAT--T-----GG--CCAGGATACC--AGACT---------AAA-TTTGTT-----------GTCACTAGCTTGTATAAT--AACTTTTCAGATATTTGAAGAAC-AATATT-AAATA-C--TTCC-G-TTGTT---------------------CTACAATATGTAGTAAGAACTAACATAT-TATGTTCTAACCGGTAATAATGGCGAATAAAATAAG-TTTTTCAAGTCCAAATTTTAATTTTTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCAATCCCTTGATTTGTCTAAGGGAATAGTCATTAC---AA-AAAAGTAATCTA----CCTCCAAAATTAACAATT------A----AAAC-AAT--ATGTTTCCTACATACAACTG--------------------GAAATACAAAATATACAGTAATATATACAGTATAG-------TGTACTTGCAAAATTCTTACCAACTTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATAAAAGTT--AAAG-AATTCATACAAATGCCTCGCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCCGTCCTA-TGGCGGCG
gi|10 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatg---------AAATTT-GTT-----------GGGACTAGCTAGAATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATA-AAATA-C--TTGC-A-TTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGTAT-TATGTTCTAACCTGTTATAATGGCGAAT-TAATAAG-TTTTTCAAGCACTACTTTTAA-TTTTGATCTCTTGTATTAT-----------TCCCTTGATTTCTCTAAGAGATTAGTCATTAC--AAA-AACAGTATTATACAGTCCTTCAAAACAAACAATT------A----AAAATAATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AATATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGAACATTGAAATTTTCCACCAAACTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCCAAGTT--AAAG-AATTTGTACAAATATCTCCCTTATGTGGTTACACAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCTGCCTCA-T-GTGGCGccg
gi|11 : TTGATTGGTTGCTTGAACATTTCG-TGCAAA-AATTTTTT--TGGGACTA--G-CTAGTAT--TA---TG-----ACTT-------T--------------T----------------C--A-G------A-A-ATT------T--G--G-AG-----AACGGATA----TAA--AAT--cccaataa
gi|11 : ---------AAATTTTTTT-----------GGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGAAATTTGGAGAACGGATATA-AAATA-C--TTGC-A-ATGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAAATATGTTTTAACCTATAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCATAATTTTAAATTTTAATCTCTTG--CTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAA-TATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAATAAATAAGGTCTCCTACATACAAATG--------------------AATATACAGAATAAAGAGT-------------TAA-------GGTACTAGGAAACTTTTAACCAAATTTA-TAATAATACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGTCTCCCCAATATGGTTACGCGA----------CGCCATGCTC-acttgcaatgttctttttgttttaaatacaactacaatatgtagtaagaattaacgtaaatatgttttaacctataataatggcgaataaataagtttttcaagccataattttaaattttaatctcttgctattcaattttcgatcccttgatttgtctaagggactagtcattacaaaaaaatattctaccttcaaaataaacaattaaaaataaataaggtctcctacatacaaatgaatatacagaataaagagttaaggtactaggaaacttttaaccaaatttataataatacattttgtatatcctagttaaagaattcgtacaaatgtctccccaatatggttacgcgacgccatgctc
gi|12 : ttgattggttgcttgaacatttcgtgcaa-AAATA-A--TTGC-G-TTGTTT--CTTTTGTTTTAAATACAACTACAATTAGTAGTTAGAATTGACGTAT-TATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATCAG-TTTT-CAAGCCCATATTATAATTTATGATCACTTG-ATTATTCAATTTTTGATTCCTTGATTTGTTTAAGGGACTAGTCATTCC--AAA-AAAAAT---CTA----TTTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATCAAGGTTTCCTACATACAAATA--------------------AAAATACAAAATATATAGT-------------TAAGGTGCAATGTACTTGGAAAGTTTCCATCAAATTTAT-AATACTACATTTTATA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCAAGTACGGTAACTCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGC--CCCGTCTCA-TGCCGGTG
gi|13 : ACTAGATTAGCACATTTGACTGGGTGATTGAA-ATATCGCTG--------TGTGT--TG----TATAGTCTGGTAC--CC---TGTC-CCACTTAA-----T--------------T--------------------------------------------------C--CGTTACTGA-A----TGA--AGT--T-----GG--GCAGGGTATC--AGACT---------Accctataaaag
gi|13 : GTATGCATA-AA-TAT--AAATATCACGTGACGAGATAAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-AGTTCG-TGCAAC-A--TTTGT--TT----T---GTCTtgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtTTTGTT-----------TTGTCTAACTAGTGTAATATGACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATA-AAATA-CA-TG-C-G-TGGTTTCATTTTTaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacaTTTTCCATCATATTTAT-AATACTAAATTTTGTA-------TATATTAGTT--AAAG-AAGTCTTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATACTC-AAATTCTTGAAGCATTC---CTA--------CCTTCCTCA-TGGCGGCGtccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|14 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattCAGGATATTTACTTCTACA-GCACCTTTT----TGCGTTTTTTAGTTTATCCAAAGTATGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTTGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TTAC-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTCCCGGTAAAATCACATTCCTGTGATCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAA-TTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTTTAT-CGACATTACCGAGCTGGAAAAAAG---GC-AATCAACG-----CA-----A-----TCAATGACATA------GCT--GTAGACTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATATTTCACACCccc
gi|15 : catgtcaatgCTACTAGCAACATG-------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTGCAGTCCCATTTTCTGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGATCGCTAACTTCATTCATTACCGTAAAATT-AAGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---CTTG---CTATAT-CGACATAACCAAGCT-GA----------C-A------------TA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCACATATTTTACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCATCTTCCTGCTAACGT
gi|16 : CAGGAAATTTATTTCTACGTGCACCTTTT-----GCGTTTTTTAGTTTATCCAAAGAAAGCATGATTTGAATGTGC
gi|16 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgTTCCAATATCCGGTAAAATGACATTCCTGTGTCCTTGACCACTACCTCCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAGTGTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATAACCGAGCA-GCAAAAAG---GC---------------------------TCAA-AACATG------GTTTCTTACA-TACAAAttccaatatccggtaaaatgacattcctgtgtccttgaccactacctccattcattaccgcaaaattacgtctcagtgtgcctacattgaatggcgaatctgctatatcgacataaccgagcagcaaaaaggctcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|17 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgcaggaaatttatttctacgtgcaccttttgcgttttttagtttatccaaagaaagcatgatttgaatgtgcCACGCGTCTTCTTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCACATGCAAATAATGTAAACATCACATGACGAGATAAGCACA-----TTTAATTGGCTAATTGAAATATCTCGCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACGTAACGTGACGAGGTCAGCACGTTTGATCGATTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TACC-CAACTTCA-----T--------------T----------------
gi|18 : CATTCCCAAACT-GAAAAAAG---GCTAATAGT-G-----CA-----A-----CTAACGCCATT------GCT--GTACATTGCATGCCCCCATAGGGCAAAAATATTTTAGAACCTTGGTGGAAATTCCCCAGAA---------CACCTCTTccgttatgtgaacattagatattgatag
gi|19 : atcagtgtgagatagatagcgaaattgctgcattggttgcataacatgtgcgtacaaattgttcccttcatacaaaatgcaatcaacatcaacggctgttatagccgaaaaagagtCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTT--CCCG----TTTTAGTTTATCCAAAGTAAGCCTGATTTGAATGC--AACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTATAACA-------CA--TATTTCGATCCCATTCTaccattgttattgtt
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgACATTTCAGGTAT------AACACATATTTCGATC-CCATT-C---TTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGAAT-TGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-tgttctttttgttttaaatacaactacaatatttagtaagagttaacgaattgtgttccaacctgtaataatggcgaat
gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaggaaatttacttctacgtgcaccttttcccgttttagtttatccaaagtaagcctgatttgaatgcaactttatctcgaccagttgctctactagcaCAGGAAATTTACTTCTACGAGCACCCTTT----TGCGTTTTACAGTTTATCCAAAATAAGCATGATTTCAATGTGCAACTTAATCTGGACCAGTTGCTCTACTAGCAACTT--------------TT-C-AGATAAAACATGTCTATCACCTACTGTAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACTTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAAT------CTTAGTCTATCTACATTGAAGGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGATATTAACGAGTT-GAAATAAG---GC-AATCAGCG-----CA-----A-----CTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCACATATTTCACCCCCTTGGTGGAAATTGCCTACAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTAACAAGATAAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCAGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACGTGACGAAGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGTC-GAATTTCA-----T--------------T-------------------CCG------T-T-A--------T--T--C-TC--TATTAC-GA-A----GGA--CCT--T-----GG--GCAGGGTACC--AGACT---------AAA-TTTGTT-----------GGGACTAGCTAGTATTAC--GGCTTTT-AGATGTTTGAAGAACAAGTATG-AAATA-CG-TG-C-G-TTTTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAACATATAGTAAGAATAAACGTAT-TATGTGCAAACCTGTAATAATGACGAAT-AAATTAG-TTTTTAAGGC----AT----GTTTTTAATCTCAAA-ATGTTTAGATTTTCGATGCCTTGGTGTGTCTAAGAAAGATGTCATTACAAAAA-AAAAGTGTTCTA----CCTTCAAAATAAAAAAAT------A----AAAA-AACTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATAGAGT-------------TAA-------TGTACTGGGGAAAGTTTCAACAAATTTA-TAATACAACATTTTGTA-------TATCGTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGC------------------------AATTCTAGAA--------------GGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|20 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaata-TTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGAAT-TGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTTCAAGTCTTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ACTATACAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTTAA----C--TCAAAATAAACACTTCAAGTAG----AAAA-AAGTAAGGTTTCCTACAAACAACcacaata
gi|21 : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTT----TGCGTTTTTTAGTTTATTCAAAGTAAGTATGATTTGATTGCGCAACTTTTTCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAA-AT--------------TT-C-AGGTTAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATGTTCCGATAAA
gi|22 : tttcacttgattacgcgatttcacatgttgatgGGTTTCTTACATACAAATG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGGAAATTTTCACCAAATTTAT-AATACTGCATTTTGTA-------TATCTTAGTT--TAAG-AATTAGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGTAGCATTC---CTACTAGACCACTCGCTACATTGGCGcattgaccacta
gi|23 : atG------T-A-A--------T--G--G-AG--AGTAACAGA-A----TGA--AGT--T-----GG--GCAGGGTACC--AGACT---------Ata
gi|24 : -------TGTACTTGGAAATTTTACACCAAATCTAT-AATACTATATGTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-ATTTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCGgaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|25 : TTATTACCACAAAAATTACGT----------------TGAATGACGAA---TCTGTAGCTATAT-CGACATTACCCGGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACGCAATTAACGAAATA------GTT--GTACAATGCAAACCATTAAAAGGTGCAAATATTTCACACCTTTGGTGGAAATTGCCTAAtccaat
gi|26 : TCCTGTGACTTTGACCACTAACTTAATTCATTACGGCAAA-TTTACGTATCAATCTGCCTACATTGAATATCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAA
gi|27 : atttctatctcatctttttatttcattaaA--GTCTGGAAC--CC---TGCC-CAAC--------------------------------------------AAG------T-A-A--------T--G--A-AACCAG----AGA-A----TGA--AGTAGTGCA--GG--GT-----ACT--AGACT---------A
gi|28 : acacaatgtgtgccttcttcCAGGAAATTTACTTCTATGTGCACCTTTT-----GCGTTGTTTAGTTTGTCCAAAGTAAGTATAATTTGAATGTGAAAttattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|29 : tttcacttggtgactcgattacacatgtcattgCTGGTAC--CC---TATC-AAACTTCA-----T--------------T----------------GC-CTG------T-G-A--------TCCG--G-AA--AGAAATAGACA--------------------GG--GT-----ACC--AGACT---------
gi|3 : CAGGAAATTTACTTCTACTTGCACCTTTT-----------TTTAGTTTATCCAAAGTAAGTAGGATTTGAATGTGCAATTTTTTCTCAACCAGTTACTCTACTGGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGCCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTTCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGACTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----TA-----A-----TTATCGACAAA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCATATATTTCACACCCGTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCTCATGCAAATAATGTAAACATCACATGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATT--GCTGTATGTTGTCGAACCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCACATGATGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGCC-CAACTTTA-----T--------------TAA--------------A--AAG------T-A-A--------T--G--GTAG--AGTAACAGA-A----TGA--AGT--T-----GG--GC-----ACC--AGACT---------AAATTTTGTT-----------GGGACTTGCTAGTATAAT--GACTTTTCATATATTTGGAAAACAAATATA-AAATA-C--TC-T-A-TTGTTC--TTTTTATTTTAAATTCAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGTAT-TATATTCTAACCTGTTGTAATGGCAAAT-AAATAAG-TTTTTTAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTGC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTTAAAGTAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGACATTTTCCACCAAACTTATTAGT-CTACATTTTGTA-------TATCTAAGTT--TAAG-AATTTGTACAAATGCCTCCACAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtgcacatatatattaacatgtatgtatatatgtatctatgt
gi|30 : --GTCTGGT-T--CC---TGGC-CATCTTCA-----TAGCGTTCCTCTTCAT----------------A--ACGAAGATGT-A-A--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGA--AGT--TGGCCAGG--GT-----ACC--AGACT---------A
gi|31 : TCTGGTACTTCA---TTCCGTTACTCCA-----T--------------T----------------C---CG------T-A-A--------T--G--G-AG--GGTAACGGA-A----TGA--AGT--TGGGAAGG--GT-----ACC--AGAC
gi|32 : cctggtaccttgct--GTCTGGTAC--CC---TACC-CTACTCCA-----T--------------TCTGTTACTCACC----ATTAGG--------A-G--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGA--AGT--G-----GG--GC-----A
gi|33 : ctggtacctCTGGTAC--CC---CGAC-CAACTTCA-----T--------------TCCGTTACCCTCCATGTA--ATG------T-A-A--------T--G--G-AG--GGTAACGGA-A----TGA--AGT--T-----GG--GC-----A
gi|34 : CTCCA-----T--------------T----------------ATTAC-------T-A-A--------T--G--G-AG--AGTAATGGA-A----TGA--AGT--T-----GG--Gggatacc
gi|34 : tggttccttCTCCA-----T--------------T----------------A--GTAA-----T-A-A--------T--G--G-AG--AGATACGGA-A----TGA--AGA--T-----GG----------CC--AGGCT---------Aagatacggaatgaagatggccaggctacca
gi|35 : tggttccttcccaacttcattccattact--GTCTGGTAC--CC---TGCC-CAACTCCA-----TACCGTG--------T----------------T--ATG------A-A-G--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----CGG--AGG--T-----GG--GCAGGGTACC--AGACT---------Acca
gi|36 : GGTAC--CC---TGTC-CAACTCTA-----T--------------TCCATTCCCCTCC----ATTACG------A-A-A--------T--G--G-AG--AGAAACGGA-A----TAA--AGT--T-----GG--GC-----A
gi|37 : --GTCTGGTAC--CC---TGCA-AAACTCCT-----T--------------T----------------C---CG------T-T-CCTCCCCTTT--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGG--AGT--T-----GG--GC-----Agagtacca
gi|38 : ctggtatccTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---TTACTGGAC--CCCGC
gi|39 : TCTGGTAC--CC---TGTC-AAACTTCAGTCCTT--------------T----------------A-----------T-A-G--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGA--AAT--T-----GG--GCATGGTACC--AGA
gi|4 : CAGGAAATTTATTTCTATGTGCATCTTTTTGCTT---TTTTTTAGTTTGTCCAAAGTTAGTATGATTTGAGTGTGCAACTTTATCTCGACTAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-TTAGG-AAAACATGTCTGTCTCCTATTTCAGTCCATTTTTCCGGTAAAATCACATTC-TGTAACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAACATT-ACGTCTAAATCTACCTACATTCAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAA-G---GC-AA-----GAAACGCA-----A-----TTAACGACGTACGAGTAGTT--GTGCATTGTAAACCATTAACAGGCGCAAATATGTCACACTCTTGGTGGAAACAGCCTAAAA---------C-CATATTTGCTTTATTTTCCACGCGTCTACCTACTAGCGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACACGATTAGCACA-----TTTGCTTGGCTGATTGAAGTACC--AATGTGTGTTGTG
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAA-TGT--AAACATCACGTGACACGATTAGCACATTTGCTTGGCTGATTGAA------G-TACCAATG--TGTGTTGTG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGTC-CAACTTTG-----T--------------T----------------------------T------------T------------GTTACTTA-A----TGA--AGT--T-----GG--GCAGGGTACC--AGACT---------Atagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcCGTATGCATA-AA-TAT--AAAGATCTCGTGACGAGGTAAGCACCTTTGGTTGGTTACTTCAA-ATTTCG-TGCAGA-A--TTTGT--TG----tgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgTTTGTT-----------GGGACTAGCT---------------------T-TTTGGAGAGGAAACATA-AAATGTC--TG-C-G-TGGTTT--CTTTT-TTTAAAATACAACTACAATATGTCGTAAGAATTAACGTAT-TATATTCTAATCTGTAATAA--------------AG-TTTTTCAAGCC---ATT-------------------------CAATTTTCGAACCCTTGATTTGTCTAAAGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT-----------AAAC-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTA--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTGTCCACCATATTTA-CAATATTAAATTTTATG-------TATGCTAGTA--AAAG-AATTCTTACAAATGGCTCCCCAATACGGTTACGCCA----------CCCAATGCTCTAAACTTTAGAAGCATTC---ggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|43 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaaCTTTGACCACTAACTTCTTTCATTACCGCAAAG-TTATGTCTCatggcggcgcccaata
gi|5 : GTTGCTCTACTAGCAACATGTTCTAATGACATGTC-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTGAGTCCCATTTTCAGATAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGTGAA---TCTG---CTATGTTCGACATTACCAAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACACAATTAATGACATA------GTT--GTACATTTCAAACCATTTAAAGGC--AAATATTTCACAACCTTGGTGGAAATTGCCTAAA----------C-CATCTTTGCTTTCTTTCCCGCATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGCACATTAATTTTGATTGGCTGATTGAAATATC--AC--TGTGTTGTGGAACTCGTATGCATA-AA-TAT--AAACAT-A---GACGAGGTCAGCACTTCTGATTGGTTGCTTGTA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTG
gi|5 : ---------AAAACTTGAT-----------AGCACTAGCTAGTATAAT--GACTTTCCAGATATTTGGAGAACAAATATA-AAATA-C--TG-G-GGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATTCAACTACAATATGTTATACGAATTAACGTAT-TATGTTTTAACCTGTAATACTGGTGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTGATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAATTT-CGATCCCCTGATTTGTC-------------ATTAC--AA------------TA----CTTTCCAAATAAACCAT-------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTGAAACTTTCAGGTTTACTTTCAAAGTACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACATGGAAATTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCC----T--AAAG-AAATCGTACAAATGCCTCCCCTAAACGGTTATGCAACCCCATGCAACCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCCTTC---CTAGTGGAC--CCTGCTACA-TGGCGGTGatagcactagctagtataatgactttccagatatttggagaacaaatataaaatactggggttgttctttttgttttaaattcaactacaatatgttatacgaattaacgtattatgttttaacctgtaatactggtgaataaataagtttttcaagccctgattttaatttttgatctcttgatttttcaatttcgatcccctgatttgtcattacaatactttccaaataaaccataaaaaaattaaggtttcctacatacaactgaaactttcaggtttactttcaaagtacaaaatatacagttaatgtacatggaaattttccaccaaatttataatactacattttgtatatcctaaagaaatcgtacaaatgcctcccctaaacggttatgcaaccccatgcaaccccatgctcaaattctagaagccttcctagtggaccctgctacatggcggtgcccaaaa
gi|6 : gttgctctactagcaacatgttctaatgacatgtccaggtaaaacatgtctatcacctatttgagtcccattttcagataaaatcacattcctgtgaccttgaccactaacttcattcattaccgcaaaattacgtctcaatctgcctacattgaatggtgaatctgctatgttcgacattaccaagctgaaaaaaggcaagcaacacaattaatgacatagttgtacatttcaaaccatttaaaggcaaatatttcacaaccttggtggaaattgcctaaaccatctttgctttctttcccgcatgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcatgtgacaagattagcacattaattttgattggctgattgaaatatcactgtgttgtggaactcgtatgcataaatataaacatagacgaggtcagcacttctgattggttgcttgtaatttcgtgcCTGTCTACATTGAATGGCGAAATGTCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAGGCAAGC-AAC----G-----CA-----A-----TTCACGACATA------ACT--GTACATTGCAATCCATTAAAAGACGCAAATATTTTACACACTTTGTAGAAATTGCCTAAAATTCCCCTTAC-CATCTTTGAGTTCTTTTCCGCACGTTTTCCTACTAACGTGTGTTGAAGAACCCTTATGCAAAATATGTTAACATCACGTGACAATATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGT--TGTGGAACCCGTATGGA-A-AA-TATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACATTTGATTGGCTGATTGAA-ATATCGCTG----------TGT--TG----T-------GGAAC--CCGTATGCA-TAAAT--A-----T--------------A----------------A--ACA------TCACA--------T--GACG-AG---GT--CAGC-ACCTTTGA----T--T-----GGTTGC-----TTC--AAATTTCGTGC---AAAATGTGTT-----------TGGACTAGCTAATATAAT--GACTTTTCAGATATTTGCAGAACAA-TAAA-AAATA-CA-TT-C-A-TTGTTG--TTTTT--TTTAAATACGACTAAAATAAGTAGTAAGAATAAACGTTC-TATGTTCTAACCTGTAAAAATGGCGAAT-AAATTAG-ATTGTCAAGGTCTAATTTTAATTATTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCGATACCTTGATTTTTCTTAGGGACTAGTCATTAC--ATG-AAGAGTATTCTA----CCGT-AAAACAAACAATT------A----AAAA-ATTCCAGGTTCCCTACATACAACTG--------------------AAAATATAAAATATACAGT-------------TAA-------AGTACTTGGAAGTTTACCACCAAATTTATT-ATACTACACTTTGTA-------TATTCTAGTT--AAAGAAATTCG----------TCCCCAATAC---------A----------TCCCATGCTC-GAATTCTAAAAGCATTCCTACTACTAGTC--CCCACCTTA-TGGCGGCGcccaaaa
gi|7 : GCTCTACTAGTAACATG-------------TT-C-AGATAAAACCTGTCTAGCGACTATTTCAATCCCATTTTCCTGTAAAATCACATTTCTGTGACCATGACCACTAAC------------CGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGTCTACATTGAATGGCGAA---TC----------------ATTACCGAGTT-AAAAAAAG---GC-AA-----G-----CAGCAGAA-----TTAACGACAAA------GCT--GTAAAATGCAATCCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACAATATCGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCT--CTTTTCCAGGCGTCTTCCTGCTGGCG--------------CGCATACAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTAATTGGTTGATTGAAATATT--GCT-----TTGT-------GTATGCGTA-GA-TAT--CAACACCAAGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTGGAATATTTCG-TGTACA-A--TTTGT--CG----cttaataa
gi|7 : TTTGTC-----------GGGATTAGCTA-----------TTTTTCAGATAATTGGATAACAAATATA-AAATA-C--TT-GAG-TTGTTC--TTTTTGTTTTAAAAACAACTGCAATATGTAGTAAGAATTAACGTTT-TATGTTTTAACAAGTAATTATGGCGAGT-AAATAAG-TTTTT-------TAACTTTAAATTTTGATATCTTG-ATCATTCAATTTTCGATCCCATCATTTGTCGAAGAGACTAGTCATTAC--AAA-AAA-GTACTCTA----TCTTCAAAATAAACAATT------A----AACA-AATCAAGGTTTCCTACATA-AACTG--------------------AACATACAAAATAAACAGT-------------TTA-------GGTACTTTGAAAGTTTCCACCAAATTTAT-AATACTACATTTTGAA-------TATCCTAGTT--AAGG-AATTCGTACAAATGCCTCACCAGTACGATTACGCAA----------CCCTATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTAATGGGC--CCCGCTTCC-TGGCTGCGggattagctatttttcagataattggataacaaatataaaatacttgagttgttctttttgttttaaaaacaactgcaatatgtagtaagaattaacgttttatgttttaacaagtaattatggcgagtaaataagttttttaactttaaattttgatatcttgatcattcaattttcgatcccatcatttgtcgaagagactagtcattacaaaaaagtactctatcttcaaaataaacaattaaacaaatcaaggtttcctacataaactgaacatacaaaataaacagtttaggtactttgaaagtttccaccaaatttataatactacattttgaatatcctagttaaggaattcgtacaaatgcctcaccagtacgattacgcaaccctatgatcaaattctagaagcattcctaatgggccccgcttcctggctgcgcccaat
gi|8 : gctctactagtaacatgttcagataaaacctgtctagcgactatttcaatcccattttcctgtaaaatcacatttctgtgaccatgaccactaaccgcaaaattacgtctcaatctgtctacattgaatggcgaatcattaccgagttaaaaaaaggcaagcagcagaattaacgacaaagctgtaaaatgcaatccattaaaaggcgcaaatatttcacaatatcggtggaaattgcctaaaaccatctttgctcttttccaggcgtcttcctgctggcgcgcatacaaataatgtaaacatcacgtgacaagattagcacatttaattggttgattgaaatattgctttgtgtatgcgtagatatcaacaccaagtgacgaggtcagcacctttgattggttgctggaatatttcgtgtacaaGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAA-AAATGT--AAACATCATGTGACAAGATTAGTACATTTGATTGGTTGATTGAA-ATAACGCTG--------TGTGT--TG-----------TGGAAC--CCGTATG---------CA-----T--------------A----------------A--ATG------T-A-A----------------AC--A-TCACG--------TGACCAGG--T-----CA--GC-----ACCTTTGATTGGTTGCGTCAAATTTCGTTCAAAATTTGTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGATATTTGGTAAACAAATATA-AAATA-C--TTGC-T-TTGCTC--TTTTTGCTCTAAATACTACTACAATATGTAGTTAGAATAAATGTAT-TATGTTCTAACCTGCAACAATAGCGAAT-AAATTAG--TTATCAAGGCCTAATTTT-ATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCACTTTTCGATCCATTGATTTGTCTAAAGGAATA--CA-TAC--AACTGAAAATA-------------CAAAATGAACAATT------A----Acccaat
gi|8 : ctgctagaTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATGAACAAT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTACCAAAAAATTTAT-AATACTACAATT-GTA-------TATCCTAGTA--ACTG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTA-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGT--CCtgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|9 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcaaaatttgttgggactagctagtattatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaaTGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AA-TAT--AAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACCTTTGATTGGTTGCTAAAA-ATTTTG-T
gi|9 : ---------AAATTTTGTA-----------GGGACGAGCTTGTATAAT--GATTTTTCAGATATTTGGAGAATAAATATA-AAATA-C--TTGC-G-TTGTTT--CTTTTATTTTAAA-----CGACAATGTGTAGTAGGAATCAACGTAT-TATGTTCTTACTTGTAATAATGGCGAAC-AAATCAA-TTTTCCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATTTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTTAAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCCA----CCTTCAAAATAAACAATT------ATATTAAAA-AATAAAGGTTTCCAACATACAACTT--------------------AAAATACAAACTATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTTTCTACCATATTTA-TAATACTACATTTTGTATTATTTTTATCCTAGTTAAAAAA-AATTCGTACAAATG-CTCCCCAATACGGTTACGTAA----------CCCCAT-TTCAAAATTCTAAAAGCATTC---TTACTGGGT--CCCGTCTCA-TGGCAGCGagggacgagcttgtataatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CGATTAAAACAATTATATTCGGAACTAATGGTAGTCCCATTTTTTCGGTGTACAAATGAAACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTCTATGAATTGATCTAGTGCATATTGTTAGAAGTTTGCCAAATGATATGGCACTGTCCG
Unaligned ( gi|42 ): TAATTTCCAATAAAAAAAAATGTAGGTGTAAAATGCGGACTTT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333 111 444444444444444444444444 111111111 11111 1111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 66666 1 111 11111111111 22222222222222222222 1111111111111 22 1111111111
lowQualScore : 3 55 0 11111111111111 4 4 555 555 555 3 3 555 3 333333333333333333333333 999999 44 0 777777777 4 0 0 11111 66 3 44 5 5 3 44 44 4444 33 33 333 0 2 55555 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33333 2 333 2 1 4 4444 88888 33 666666 0 1 44 33 1 2 2 2 3 0 0 3 2 000 3 1 6666 11111111111 6 1 55555555555555555555 6666666666666 9999999 0 55 8888888 33 2 0000000000 5 444 33 3
lowQualScore : . .. . .............. . . ... ... ... . . ... . ........................ ...... .. . ......... . . . ..... .. . .. . . . .. .. .... .. .. ... . . ..... ............................................................... ..... . ... . . . .... ..... .. ...... . . .. .. . . . . . . . . . ... . . .... ........... . . .................... ............. ....... . .. ....... .. . .......... . ... .. .
lowQualScore : 6 22 7 55555555555555 0 0 222 888 888 3 1 888 3 777777777777777777777777 666666 66 7 888888888 4 7 1 11111 11 3 66 7 7 1 22 66 2222 77 11 999 9 2 00000 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 00000 0 888 2 5 0 2222 22222 77 888888 6 5 66 77 2 9 9 5 1 8 6 1 8 333 1 6 5555 33333333333 7 0 00000000000000000000 9999999999999 3333333 4 55 7777777 77 7 9999999999 0 777 99 3
consensus : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATAT--AAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGCC-CAACTTCA-----T--------------T----------------A--AC-G------T-------A-A--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGAAGTTGGGCAGGGTAC--CAGACT------AAANTTTGTTGGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
Reference ( family-5234 ) : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATAT--AAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGCC-CAACTTCA-----T--------------T----------------A--AC-G------T-------A-A--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGAAGTTGGGCG----AC--CAGACT------AAATTTTGTTGGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|1 : CAAGAAATTAACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTCTTT--AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGTGCAACTTTATCTTCACCAGTTGCTCTACCAACAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTTTCGCCTACTTCAGTCCCGTTTTCCG----------------GTGACCTTGACCACTTACTTCATTCAATACCGCAAAA-CTACATCTAAGTCTGCTTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATA--CGACATTACCGAGCT-GGAAAAAG---GC-AAGCAACG-----CA-----A-----TTATGGACAAA------GTA--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATAATCCACACCCTTGGTGGAAATTGGTTAATA---------C-CATCTTAGCTTTCTTTTACGCGCGTCTTCCTGCTAGCACGTATTGAAGTACCTCCATGCAAATAATGTGAACATCACGTGACAAGAATAGCACA-----TTTGATTTGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCTGTATGCATA-AATAT--AAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATATCG-TGCCAA-A--TTTGT--TG----TA--ATCTGGTAC--CC---TGCC-CAATTTCA-----T--------------T----------------C--CT-T------T-------A-C--------T--C--T-CC--ATT-AC-GA-A----GGACATTGGCCAGGATAC--CAGACT------AAA-TTTGTTGTCACTAGCTTGTATAAT--AACTTTTCAGATATTTGAAGAAC-AATATTAAATACTTCCGTTGTT---------------------CTACAATATGTAGTAAGAACTAACAT-ATTATGTTCTAACCGGTAATAATGGCGAATAAAATAAG-TTTTTCAAGTCCAAATTTTAATTTTTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCAATCCCTTGATTTGTCTAAGGGAATAGTCATTAC---AA-AAAAGTAATCTA----CCTCCAAAATTAACAATT------A----AAAC-AAT--ATGTTTCCTACATACAACTG--------------------GAAATACAAAATATACAGTAATATATACAGTATAG-------TGTACTTGCAAAATTCTTACCAACTTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATAAAAGTT--AAAG-AATTCATACAAATGCCTCGCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCCGTCCTA-TGGCGGCG
gi|10 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatg------AAATTT-GTTGGGACTAGCTAGAATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCATTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATGTTCTAACCTGTTATAATGGCGAAT-TAATAAG-TTTTTCAAGCACTACTTTTAA-TTTTGATCTCTTGTATTAT-----------TCCCTTGATTTCTCTAAGAGATTAGTCATTAC--AAA-AACAGTATTATACAGTCCTTCAAAACAAACAATT------A----AAAATAATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AATATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGAACATTGAAATTTTCCACCAAACTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCCAAGTT--AAAG-AATTTGTACAAATATCTCCCTTATGTGGTTACACAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCTGCCTCA-T-GTGGCGccg
gi|11 : TTGATTGGTTGCTTGAACATTTCG-TGCAAA-AATTTTTT--TGGGACTA--G-CTAGTAT--TA---TG-----ACTT-------T--------------T----------------C--A--G------A-------A-ATT------T--G--G-AG-----AACGGATA----TAAAATcccaataa
gi|11 : ------AAATTTTTTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGAAATTTGGAGAACGGATATAAAATACTTGCAATGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAAATATGTTTTAACCTATAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCATAATTTTAAATTTTAATCTCTTG--CTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAA-TATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAATAAATAAGGTCTCCTACATACAAATG--------------------AATATACAGAATAAAGAGT-------------TAA-------GGTACTAGGAAACTTTTAACCAAATTTA-TAATAATACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGTCTCCCCAATATGGTTACGCGA----------CGCCATGCTC-acttgcaatgttctttttgttttaaatacaactacaatatgtagtaagaattaacgtaaatatgttttaacctataataatggcgaataaataagtttttcaagccataattttaaattttaatctcttgctattcaattttcgatcccttgatttgtctaagggactagtcattacaaaaaaatattctaccttcaaaataaacaattaaaaataaataaggtctcctacatacaaatgaatatacagaataaagagttaaggtactaggaaacttttaaccaaatttataataatacattttgtatatcctagttaaagaattcgtacaaatgtctccccaatatggttacgcgacgccatgctc
gi|12 : ttgattggttgcttgaacatttcgtgcaaAAATAATTGCGTTGTTT--CTTTTGTTTTAAATACAACTACAATTAGTAGTTAGAATTGACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATCAG-TTTT-CAAGCCCATATTATAATTTATGATCACTTG-ATTATTCAATTTTTGATTCCTTGATTTGTTTAAGGGACTAGTCATTCC--AAA-AAAAAT---CTA----TTTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATCAAGGTTTCCTACATACAAATA--------------------AAAATACAAAATATATAGT-------------TAAGGTGCAATGTACTTGGAAAGTTTCCATCAAATTTAT-AATACTACATTTTATA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCAAGTACGGTAACTCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGC--CCCGTCTCA-TGCCGGTG
gi|13 : ACTAGATTAGCACATTTGACTGGGTGATTGAA-ATATCGCTG--------TGTGT--TG----TATAGTCTGGTAC--CC---TGTC-CCACTTAA-----T--------------T-------------------CC-G------T------------------T---------------ACTGA-A----TGAAGTTGGGCAGGGTAT--CAGACT------Accctataaaag
gi|13 : GTATGCATA-AATAT--AAATATCACGTGACGAGATAAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-AGTTCG-TGCAAC-A--TTTGT--TT----T---GTCTtgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtTTTGTTTTGTCTAACTAGTGTAATATGACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACATGCGTGGTTTCATTTTTaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacaTTTTCCATCATATTTAT-AATACTAAATTTTGTA-------TATATTAGTT--AAAG-AAGTCTTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATACTC-AAATTCTTGAAGCATTC---CTA--------CCTTCCTCA-TGGCGGCGtccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|14 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattCAGGATATTTACTTCTACA-GCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTATGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTTGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TTAC-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTCCCGGTAAAATCACATTCCTGTGATCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAA-TTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTTTAT-CGACATTACCGAGCTGGAAAAAAG---GC-AATCAACG-----CA-----A-----TCAATGACATA------GCT--GTAGACTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATATTTCACACCccc
gi|15 : catgtcaatgCTACTAGCAACATG-------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTGCAGTCCCATTTTCTGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGATCGCTAACTTCATTCATTACCGTAAAATT-AAGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---CTTG---CTATAT-CGACATAACCAAGCT-GA----------C-A------------TA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCACATATTTTACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCATCTTCCTGCTAACGT
gi|16 : CAGGAAATTTATTTCTACGTGCACCTTTT-GCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGAAAGCATGATTTGAATGTGC
gi|16 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgTTCCAATATCCGGTAAAATGACATTCCTGTGTCCTTGACCACTACCTCCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAGTGTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATAACCGAGCA-GCAAAAAG---GC---------------------------TCAA-AACATG------GTTTCTTACA-TACAAAttccaatatccggtaaaatgacattcctgtgtccttgaccactacctccattcattaccgcaaaattacgtctcagtgtgcctacattgaatggcgaatctgctatatcgacataaccgagcagcaaaaaggctcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|17 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgcaggaaatttatttctacgtgcaccttttgcgttttttagtttatccaaagaaagcatgatttgaatgtgcCACGCGTCTTCTTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCACATGCAAATAATGTAAACATCACATGACGAGATAAGCACA-----TTTAATTGGCTAATTGAAATATCTCGCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATAT--AAACGTAACGTGACGAGGTCAGCACGTTTGATCGATTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TACC-CAACTTCA-----T--------------T----------------
gi|18 : CATTCCCAAACT-GAAAAAAG---GCTAATAGT-G-----CA-----A-----CTAACGCCATT------GCT--GTACATTGCATGCCCCCATAGGGCAAAAATATTTTAGAACCTTGGTGGAAATTCCCCAGAA---------CACCTCTTccgttatgtgaacattagatattgatag
gi|19 : atcagtgtgagatagatagcgaaattgctgcattggttgcataacatgtgcgtacaaattgttcccttcatacaaaatgcaatcaacatcaacggctgttatagccgaaaaagagtCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTCCCGTTTT---AGTTTATCCAAAGTAAGCCTGATTTGAATGC--AACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTATAACA-------CA--TATTTCGATCCCATTCTaccattgttattgtt
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-tgttctttttgttttaaatacaactacaatatttagtaagagttaacgaattgtgttccaacctgtaataatggcgaat
gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaggaaatttacttctacgtgcaccttttcccgttttagtttatccaaagtaagcctgatttgaatgcaactttatctcgaccagttgctctactagcaacatttcaggtataacacatatttcgatcccattcCAGGAAATTTACTTCTACGAGCACCCTTTTGCGTTTTAC-AGTTTATCCAAAATAAGCATGATTTCAATGTGCAACTTAATCTGGACCAGTTGCTCTACTAGCAACTT--------------TT-C-AGATAAAACATGTCTATCACCTACTGTAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACTTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAAT------CTTAGTCTATCTACATTGAAGGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGATATTAACGAGTT-GAAATAAG---GC-AATCAGCG-----CA-----A-----CTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCACATATTTCACCCCCTTGGTGGAAATTGCCTACAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTAACAAGATAAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCAGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATAT--AAACATCACGTGACGAAGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGTC-GAATTTCA-----T--------------T-------------------CC-G------T-------T-A--------T--T--C-TC--TATTAC-GA-A----GGACCTTGGGCAGGGTAC--CAGACT------AAA-TTTGTTGGGACTAGCTAGTATTAC--GGCTTTT-AGATGTTTGAAGAACAAGTATGAAATACGTGCGTTTTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAACATATAGTAAGAATAAACGT-ATTATGTGCAAACCTGTAATAATGACGAAT-AAATTAG-TTTTTAAGGC----AT----GTTTTTAATCTCAAA-ATGTTTAGATTTTCGATGCCTTGGTGTGTCTAAGAAAGATGTCATTACAAAAA-AAAAGTGTTCTA----CCTTCAAAATAAAAAAAT------A----AAAA-AACTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATAGAGT-------------TAA-------TGTACTGGGGAAAGTTTCAACAAATTTA-TAATACAACATTTTGTA-------TATCGTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGC------------------------AATTCTAGAA--------------GGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|20 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaataTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTTCAAGTCTTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ACTATACAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTTAA----C--TCAAAATAAACACTTCAAGTAG----AAAA-AAGTAAGGTTTCCTACAAACAACcacaata
gi|21 : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATTCAAAGTAAGTATGATTTGATTGCGCAACTTTTTCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAA-AT--------------TT-C-AGGTTAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATGTTCCGATAAA
gi|22 : tttcacttgattacgcgatttcacatgttgatgGGTTTCTTACATACAAATG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGGAAATTTTCACCAAATTTAT-AATACTGCATTTTGTA-------TATCTTAGTT--TAAG-AATTAGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGTAGCATTC---CTACTAGACCACTCGCTACATTGGCGcattgaccacta
gi|23 : atC-G------T-------A-A--------T--G--G-AG--AGTAACAGA-A----TGAAGTTGGGCAGGGTAC--CAGACT------Ata
gi|24 : -------TGTACTTGGAAATTTTACACCAAATCTAT-AATACTATATGTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-ATTTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCGaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|25 : TTATTACCACAAAAATTACGT----------------TGAATGACGAA---TCTGTAGCTATAT-CGACATTACCCGGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACGCAATTAACGAAATA------GTT--GTACAATGCAAACCATTAAAAGGTGCAAATATTTCACACCTTTGGTGGAAATTGCCTAAtccaat
gi|26 : TCCTGTGACTTTGACCACTAACTTAATTCATTACGGCAAA-TTTACGTATCAATCTGCCTACATTGAATATCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAA
gi|27 : atttctatctcatctttttatttcattaaA--GTCTGGAAC--CC---TGCC-CAAC-----------------------------------------A--A--G------T-------A-A--------T--G--A-AACCAG----AGA-A----TGAAGTAGTGCAGGGTAC--TAGACT------A
gi|28 : acacaatgtgtgccttcttcCAGGAAATTTACTTCTATGTGCACCTTTT-GCGTTGTTT-AGTTTGTCCAAAGTAAGTATAATTTGAATGTGAAAttattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|29 : tttcacttggtgactcgattacacatgtcattgCTGGTAC--CC---TATC-AAACTTCA-----T--------------T----------------G--CCTG------T-------G-A--------TCCG--G-AA--AGAAATAGACA-----------GGGT-----AC--CAGACT------
gi|3 : CAGGAAATTTACTTCTACTTGCACCTTTTT-------TT-AGTTTATCCAAAGTAAGTAGGATTTGAATGTGCAATTTTTTCTCAACCAGTTACTCTACTGGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGCCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTTCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGACTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----TA-----A-----TTATCGACAAA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCATATATTTCACACCCGTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCTCATGCAAATAATGTAAACATCACATGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATT--GCTGTATGTTGTCGAACCCGTATGCATA-AATAT--AAACATCACATGATGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGCC-CAACTTTA-----T--------------TAA--------------A--AA-G------T-------A-A--------T--G--GTAG--AGTAACAGA-A----TGAAGTTGGGC-----AC--CAGACT------AAATTTTGTTGGGACTTGCTAGTATAAT--GACTTTTCATATATTTGGAAAACAAATATAAAATACTC-TATTGTTC--TTTTTATTTTAAATTCAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATATTCTAACCTGTTGTAATGGCAAAT-AAATAAG-TTTTTTAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTGC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTTAAAGTAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGACATTTTCCACCAAACTTATTAGT-CTACATTTTGTA-------TATCTAAGTT--TAAG-AATTTGTACAAATGCCTCCACAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtgcacatatatattaacatgtatgtatatatgtatctatgt
gi|30 : --GTCTGGT-T--CC---TGGC-CATCTTCA-----TAGCGTTCCTCTTCAT----------------A--AC-GAAGATGT-------A-A--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGAAGTTGGCCAGGGTAC--CAGACT------A
gi|31 : TCTGGTACTTCA---TTCCGTTACTCCA-----T--------------T----------------C---C-G------T-------A-A--------T--G--G-AG--GGTAACGGA-A----TGAAGTTGGGAAGGGTAC--CAGAC
gi|32 : cctggtaccttgct--GTCTGGTAC--CC---TACC-CTACTCCA-----T--------------TCTGTTACTC-------A--CC-A------TTAGG---A-G--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGAAGTGGGGCA----A
gi|33 : ctggtaccCTGGTAC--CC---CGAC-CAACTTCA-----T--------------TCCGTTACCCTCCATGTA--AT-G------T-------A-A--------T--G--G-AG--GGTAACGGA-A----TGAAGTTGGGC
gi|34 : CTCCA-----T--------------T----------------ATTAC--------T-------A-A--------T--G--G-AG--AGTAATGGA-A----TGAAGTTGGGaggatacc
gi|34 : tggttccttCTCCA-----T--------------T----------------A--GT-AA-----T-------A-A--------T--G--G-AG--AGATACGGA-A----TGAAGATGG--------C--CAGGCT------Aagatacggaatgaagatggccaggctacca
gi|35 : tggttccttcccaacttcattccattact--GTCTGGTAC--CC---TGCC-CAACTCCA--------------------T----------------A--CC-G------TGTTATGAA-G--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----CGGAGGTGGGCAGGGTAC--CAGACT------Acca
gi|36 : GGTAC--CC---TGTC-CAACTCTA-----T--------------TCCATTCCCCTCC----ATTAC-G------A-------A-A--------T--G--G-AG--AGAAACGGA-A----TAAAGTTGGGC
gi|37 : --GTCTGGTAC--CC---TGCA-AAACTCCT-----T--------------T----------------C---C-G------T-------T-CCTCCCCTTT--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGGAGTTGGGCAGGATAC--CAGagagtacca
gi|38 : TCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---TTACTGGAC--CCCGC
gi|39 : TCTGGTAC--CC---TGTC-AAACTTCAGTCCTT--------------T----------------A------------T-------A-G--------T--G--G-AG--AGTAACGGA-A----TGAAATTGGGCATGGTAC--CAGA
gi|4 : CAGGAAATTTATTTCTATGTGCATCTTTTTGCTTTTTTTTAGTTTGTCCAAAGTTAGTATGATTTGAGTGTGCAACTTTATCTCGACTAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-TTAGG-AAAACATGTCTGTCTCCTATTTCAGTCCATTTTTCCGGTAAAATCACATTC-TGTAACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAACATT-ACGTCTAAATCTACCTACATTCAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAA-G---GC-AA-----GAAACGCA-----A-----TTAACGACGTACGAGTAGTT--GTGCATTGTAAACCATTAACAGGCGCAAATATGTCACACTCTTGGTGGAAACAGCCTAAAA---------C-CATATTTGCTTTATTTTCCACGCGTCTACCTACTAGCGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACACGATTAGCACA-----TTTGCTTGGCTGATTGAAGTACC--AATGTGTGTTGTG
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGT--AAACATCACGTGACACGATTAGCACATTTGCTTGGCTGATTGAA------G-TACCAATG--TGTGTTGTG----TA--GTCTGGTAC--CC---TGTC-CAACTTTG-----T--------------T-----------------------------T------------------T------------GTTACTTA-A----TGAAGTTGGGCAGGGTAC--CAGACT------Atagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcCGTATGCATA-AATAT--AAAGATCTCGTGACGAGGTAAGCACCTTTGGTTGGTTACTTCAA-ATTTCG-TGCAGA-A--TTTGT--TG----tgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgTTTGTTGGGACTAGCT---------------------T-TTTGGAGAGGAAACATAAAATGTCTGCGTGGTTT--CTTTT-TTTAAAATACAACTACAATATGTCGTAAGAATTAACGT-ATTATATTCTAATCTGTAATAA--------------AG-TTTTTCAAGCC---ATT-------------------------CAATTTTCGAACCCTTGATTTGTCTAAAGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT-----------AAAC-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTA--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTGTCCACCATATTTA-CAATATTAAATTTTATG-------TATGCTAGTA--AAAG-AATTCTTACAAATGGCTCCCCAATACGGTTACGCCA----------CCCAATGCTCTAAACTTTAGAAGCATTC---ggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|43 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaaCTTTGACCACTAACTTCTTTCATTACCGCAAAG-TTATGTCTCatggcggcgcccaata
gi|5 : GTTGCTCTACTAGCAACATGTTCTAATGACATGTC-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTGAGTCCCATTTTCAGATAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGTGAA---TCTG---CTATGTTCGACATTACCAAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACACAATTAATGACATA------GTT--GTACATTTCAAACCATTTAAAGGC--AAATATTTCACAACCTTGGTGGAAATTGCCTAAA----------C-CATCTTTGCTTTCTTTCCCGCATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGCACATTAATTTTGATTGGCTGATTGAAATATC--AC--TGTGTTGTGGAACTCGTATGCATA-AATAT--AAACAT-A---GACGAGGTCAGCACTTCTGATTGGTTGCTTGTA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTG
gi|5 : ------AAAACTTGATAGCACTAGCTAGTATAAT--GACTTTCCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTGGGGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATTCAACTACAATATGTTATACGAATTAACGT-ATTATGTTTTAACCTGTAATACTGGTGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTGATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAATTT-CGATCCCCTGATTTGTC-------------ATTAC--AA------------TA----CTTTCCAAATAAACCAT-------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTGAAACTTTCAGGTTTACTTTCAAAGTACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACATGGAAATTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCC----T--AAAG-AAATCGTACAAATGCCTCCCCTAAACGGTTATGCAACCCCATGCAACCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCCTTC---CTAGTGGAC--CCTGCTACA-TGGCGGTGatagcactagctagtataatgactttccagatatttggagaacaaatataaaatactggggttgttctttttgttttaaattcaactacaatatgttatacgaattaacgtattatgttttaacctgtaatactggtgaataaataagtttttcaagccctgattttaatttttgatctcttgatttttcaatttcgatcccctgatttgtcattacaatactttccaaataaaccataaaaaaattaaggtttcctacatacaactgaaactttcaggtttactttcaaagtacaaaatatacagttaatgtacatggaaattttccaccaaatttataatactacattttgtatatcctaaagaaatcgtacaaatgcctcccctaaacggttatgcaaccccatgcaaccccatgctcaaattctagaagccttcctagtggaccctgctacatggcggtgcccaaaa
gi|6 : gttgctctactagcaacatgttctaatgacatgtccaggtaaaacatgtctatcacctatttgagtcccattttcagataaaatcacattcctgtgaccttgaccactaacttcattcattaccgcaaaattacgtctcaatctgcctacattgaatggtgaatctgctatgttcgacattaccaagctgaaaaaaggcaagcaacacaattaatgacatagttgtacatttcaaaccatttaaaggcaaatatttcacaaccttggtggaaattgcctaaaccatctttgctttctttcccgcatgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcatgtgacaagattagcacattaattttgattggctgattgaaatatcactgtgttgtggaactcgtatgcataaatataaacatagacgaggtcagcacttctgattggttgcttgtaatttcgtgcCTGTCTACATTGAATGGCGAAATGTCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAGGCAAGC-AAC----G-----CA-----A-----TTCACGACATA------ACT--GTACATTGCAATCCATTAAAAGACGCAAATATTTTACACACTTTGTAGAAATTGCCTAAAATTCCCCTTAC-CATCTTTGAGTTCTTTTCCGCACGTTTTCCTACTAACGTGTGTTGAAGAACCCTTATGCAAAATATGTTAACATCACGTGACAATATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGT--TGTGGAACCCGTATGGA-A-AATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACATTTGATTGGCTGATTGAA-ATATCGCTG----------TGT--TG----T-------GGAAC--CCGTATGCA-TAAAT--A-----T--------------A----------------A--AC-A------TC------ACA--------T--GACG-AG---GT--CAGC-ACCTTTGA--TTGGTTG-----CTTCAAATTTCGTGCAAAATGTGTTTGGACTAGCTAATATAAT--GACTTTTCAGATATTTGCAGAACAA-TAAAAAATACATTCATTGTTG--TTTTT--TTTAAATACGACTAAAATAAGTAGTAAGAATAAACGT-TCTATGTTCTAACCTGTAAAAATGGCGAAT-AAATTAG-ATTGTCAAGGTCTAATTTTAATTATTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCGATACCTTGATTTTTCTTAGGGACTAGTCATTAC--ATG-AAGAGTATTCTA----CCGT-AAAACAAACAATT------A----AAAA-ATTCCAGGTTCCCTACATACAACTG--------------------AAAATATAAAATATACAGT-------------TAA-------AGTACTTGGAAGTTTACCACCAAATTTATT-ATACTACACTTTGTA-------TATTCTAGTT--AAAGAAATTCG----------TCCCCAATAC---------A----------TCCCATGCTC-GAATTCTAAAAGCATTCCTACTACTAGTC--CCCACCTTA-TGGCGGCGcccaaaa
gi|7 : GCTCTACTAGTAACATG-------------TT-C-AGATAAAACCTGTCTAGCGACTATTTCAATCCCATTTTCCTGTAAAATCACATTTCTGTGACCATGACCACTAAC------------CGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGTCTACATTGAATGGCGAA---TC----------------ATTACCGAGTT-AAAAAAAG---GC-AA-----G-----CAGCAGAA-----TTAACGACAAA------GCT--GTAAAATGCAATCCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACAATATCGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCT--CTTTTCCAGGCGTCTTCCTGCTGGCG--------------CGCATACAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTAATTGGTTGATTGAAATATT--GCT-----TTGT-------GTATGCGTA-GATAT--CAACACCAAGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTGGAATATTTCG-TGTACA-A--TTTGT--CG----cttaataa
gi|7 : TTTGTCGGGATTAGCTA-----------TTTTTCAGATAATTGGATAACAAATATAAAATACTTGAGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAAAACAACTGCAATATGTAGTAAGAATTAACGT-TTTATGTTTTAACAAGTAATTATGGCGAGT-AAATAAG-TTTTT-------TAACTTTAAATTTTGATATCTTG-ATCATTCAATTTTCGATCCCATCATTTGTCGAAGAGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTACTCTA----TCTTCAAAATAAACAATT------A----AACA-AATCAAGGTTTCCTACATA-AACTG--------------------AACATACAAAATAAACAGT-------------TTA-------GGTACTTTGAAAGTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGAA-------TATCCTAGTT--AAGG-AATTCGTACAAATGCCTCACCAGTACGATTACGCAA----------CCCTATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTAATGGGC--CCCGCTTCC-TGGCTGCGggattagctatttttcagataattggataacaaatataaaatacttgagttgttctttttgttttaaaaacaactgcaatatgtagtaagaattaacgttttatgttttaacaagtaattatggcgagtaaataagttttttaactttaaattttgatatcttgatcattcaattttcgatcccatcatttgtcgaagagactagtcattacaaaaaagtactctatcttcaaaataaacaattaaacaaatcaaggtttcctacataaactgaacatacaaaataaacagtttaggtactttgaaagtttccaccaaatttataatactacattttgaatatcctagttaaggaattcgtacaaatgcctcaccagtacgattacgcaaccctatgatcaaattctagaagcattcctaatgggccccgcttcctggctgcgcccaat
gi|8 : gctctactagtaacatgttcagataaaacctgtctagcgactatttcaatcccattttcctgtaaaatcacatttctgtgaccatgaccactaaccgcaaaattacgtctcaatctgtctacattgaatggcgaatcattaccgagttaaaaaaaggcaagcagcagaattaacgacaaagctgtaaaatgcaatccattaaaaggcgcaaatatttcacaatatcggtggaaattgcctaaaaccatctttgctcttttccaggcgtcttcctgctggcgcgcatacaaataatgtaaacatcacgtgacaagattagcacatttaattggttgattgaaatattgctttgtgtatgcgtagatatcaacaccaagtgacgaggtcagcacctttgattggttgctggaatatttcgtgtacaaCTGCTAGAGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAAAAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGTACA-----TTTGATTGGTTGATTGAAATAAC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATGT--AAACATCACGTGACCAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCGTCAA-ATTTCG-TTCAAA-A--TTTGT--TGGGACTA--G-CTAGTAcccaat
gi|8 : ------AAAATTTGTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGATATTTGGTAAACAAATATAAAATACTTGCTTTGCTC--TTTTTGCTCTAAATACTACTACAATATGTAGTTAGAATAAATGT-ATTATGTTCTAACCTGCAACAATAGCGAAT-AAATTAG--TTATCAAGGCCTAATTTT-ATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCACTTTTCGATCCATTGATTTGTCTAAAGGAATA--CA-TAC--AACTGAAAATA-------------CAAAATGAACAATT------A----Attatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaatacatacaactgaaaatacaaaatgaacaattaatgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|8 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATGAACAAT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTACCAAAAAATTTAT-AATACTACAATT-GTA-------TATCCTAGTA--ACTG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTA-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGT--CCtgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|9 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcaaaatttgttgggactagctagtattatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaaTGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AATAT--AAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACCTTTGATTGGTTGCTAAAA-ATTTTG-T
gi|9 : ------AAATTTTGTAGGGACGAGCTTGTATAAT--GATTTTTCAGATATTTGGAGAATAAATATAAAATACTTGCGTTGTTT--CTTTTATTTTAAA-----CGACAATGTGTAGTAGGAATCAACGT-ATTATGTTCTTACTTGTAATAATGGCGAAC-AAATCAA-TTTTCCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATTTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTTAAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCCA----CCTTCAAAATAAACAATT------ATATTAAAA-AATAAAGGTTTCCAACATACAACTT--------------------AAAATACAAACTATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTTTCTACCATATTTA-TAATACTACATTTTGTATTATTTTTATCCTAGTTAAAAAA-AATTCGTACAAATG-CTCCCCAATACGGTTACGTAA----------CCCCAT-TTCAAAATTCTAAAAGCATTC---TTACTGGGT--CCCGTCTCA-TGGCAGCGagggacgagcttgtataatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CGATTAAAACAATTATATTCGGAACTAATGGTAGTCCCATTTTTTCGGTGTACAAATGAAACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTCTATGAATTGATCTAGTGCATATTGTTAGAAGTTTGCCAAATGATATGGCACTGTCCG
Unaligned ( gi|42 ): TAATTTCCAATAAAAAAAAATGTAGGTGTAAAATGCGGACTTT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333 111 444444444444444444444444 111111111 11111 1111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111 11111111111 22222222222222222222 1111111111111 22 1111111111
lowQualScore : 3 55 0 11111111111111 4 4 555 555 555 3 3 555 3 333333333333333333333333 999999 44 0 777777777 4 0 0 00000 55 3 3 44 5 2 3 44 44 5555 33 33 1 2 55555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 2 333 11 0 2 7 1 44 33 1 2 2 2 3 0 0 3 2 000 3 1 6666 11111111111 6 1 55555555555555555555 6666666666666 9999999 0 55 8888888 33 2 0000000000 5 444 33 3
lowQualScore : . .. . .............. . . ... ... ... . . ... . ........................ ...... .. . ......... . . . ..... .. . . .. . . . .. .. .... .. .. . . ..... .............................................................. . . ... .. . . . . .. .. . . . . . . . . . ... . . .... ........... . . .................... ............. ....... . .. ....... .. . .......... . ... .. .
lowQualScore : 6 22 7 55555555555555 0 0 222 888 888 3 1 888 3 777777777777777777777777 666666 66 7 888888888 4 7 5 00000 55 4 1 22 3 7 1 22 66 5555 99 22 5 4 33333 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 1 222 66 4 1 5 5 66 77 2 9 9 5 1 8 6 1 8 333 1 6 5555 33333333333 7 0 00000000000000000000 9999999999999 3333333 4 55 7777777 77 7 9999999999 0 777 99 3
consensus : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----T--------------T----------------A--NC-G------T-------AA--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAATTTGTTGGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
Reference ( family-5234 ) : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----T--------------T----------------A--AC-G------T-------AA--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAANTTTGTTGGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|1 : CAAGAAATTAACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTCTTT--AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGTGCAACTTTATCTTCACCAGTTGCTCTACCAACAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTTTCGCCTACTTCAGTCCCGTTTTCCG----------------GTGACCTTGACCACTTACTTCATTCAATACCGCAAAA-CTACATCTAAGTCTGCTTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATA--CGACATTACCGAGCT-GGAAAAAG---GC-AAGCAACG-----CA-----A-----TTATGGACAAA------GTA--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATAATCCACACCCTTGGTGGAAATTGGTTAATA---------C-CATCTTAGCTTTCTTTTACGCGCGTCTTCCTGCTAGCACGTATTGAAGTACCTCCATGCAAATAATGTGAACATCACGTGACAAGAATAGCACA-----TTTGATTTGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCTGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATATCG-TGCCAA-A--TTTGT--TG----TA--ATCTGGTAC--CCTGCC-CAATTTCA-----T--------------T----------------C--CT-T------T-------AC--------TCT-CC--ATT-AC-GA-AGGACATTGGCCAGGATACCAGACTAAA-TTTGTTGTCACTAGCTTGTATAAT--AACTTTTCAGATATTTGAAGAAC-AATATTAAATACTTCCGTTGTT---------------------CTACAATATGTAGTAAGAACTAACAT-ATTATGTTCTAACCGGTAATAATGGCGAATAAAATAAG-TTTTTCAAGTCCAAATTTTAATTTTTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCAATCCCTTGATTTGTCTAAGGGAATAGTCATTAC---AA-AAAAGTAATCTA----CCTCCAAAATTAACAATT------A----AAAC-AAT--ATGTTTCCTACATACAACTG--------------------GAAATACAAAATATACAGTAATATATACAGTATAG-------TGTACTTGCAAAATTCTTACCAACTTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATAAAAGTT--AAAG-AATTCATACAAATGCCTCGCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCCGTCCTA-TGGCGGCG
gi|10 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatgAAATTTGTTGGGACTAGCTAGAATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCATTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATGTTCTAACCTGTTATAATGGCGAAT-TAATAAG-TTTTTCAAGCACTACTTTTAA-TTTTGATCTCTTGTATTAT-----------TCCCTTGATTTCTCTAAGAGATTAGTCATTAC--AAA-AACAGTATTATACAGTCCTTCAAAACAAACAATT------A----AAAATAATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AATATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGAACATTGAAATTTTCCACCAAACTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCCAAGTT--AAAG-AATTTGTACAAATATCTCCCTTATGTGGTTACACAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCTGCCTCA-T-GTGGCGccg
gi|11 : TTGATTGGTTGCTTGAACATTTCG-TGCAAA-AATTTTTT--TGGGACTA--G-CTAGTAT--TATG-----ACTT-------T--------------T----------------C--A--G------A-------AATT------TGG-AG-----AACGGATATAAAATcccaataa
gi|11 : AAATTTTTTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGAAATTTGGAGAACGGATATAAAATACTTGCAATGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAAATATGTTTTAACCTATAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCATAATTTTAAATTTTAATCTCTTG--CTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAA-TATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAATAAATAAGGTCTCCTACATACAAATG--------------------AATATACAGAATAAAGAGT-------------TAA-------GGTACTAGGAAACTTTTAACCAAATTTA-TAATAATACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGTCTCCCCAATATGGTTACGCGA----------CGCCATGCTC-acttgcaatgttctttttgttttaaatacaactacaatatgtagtaagaattaacgtaaatatgttttaacctataataatggcgaataaataagtttttcaagccataattttaaattttaatctcttgctattcaattttcgatcccttgatttgtctaagggactagtcattacaaaaaaatattctaccttcaaaataaacaattaaaaataaataaggtctcctacatacaaatgaatatacagaataaagagttaaggtactaggaaacttttaaccaaatttataataatacattttgtatatcctagttaaagaattcgtacaaatgtctccccaatatggttacgcgacgccatgctc
gi|12 : ttgattggttgcttgaacatttcgtgcaaAAATAATTGCGTTGTTT--CTTTTGTTTTAAATACAACTACAATTAGTAGTTAGAATTGACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATCAG-TTTT-CAAGCCCATATTATAATTTATGATCACTTG-ATTATTCAATTTTTGATTCCTTGATTTGTTTAAGGGACTAGTCATTCC--AAA-AAAAAT---CTA----TTTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATCAAGGTTTCCTACATACAAATA--------------------AAAATACAAAATATATAGT-------------TAAGGTGCAATGTACTTGGAAAGTTTCCATCAAATTTAT-AATACTACATTTTATA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCAAGTACGGTAACTCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGC--CCCGTCTCA-TGCCGGTG
gi|13 : ACTAGATTAGCACATTTGACTGGGTGATTGAA-ATATCGCTG--------TGTGT--TG----TATAGTCTGGTAC--CCTGTC-CCACTTAA-----T--------------T-------------------CC-G------T-----------------T-----------ACTGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTATCAGACTAccctataaaag
gi|13 : GTATGCATA-AATA--TAAATATCACGTGACGAGATAAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-AGTTCG-TGCAAC-A--TTTGT--TT----T---GTCTtgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtAACATTTGTTTTGTCTAACTAGTGTAATATGACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACATGCGTGGTTTCATTTTTaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcTTTTCCATCATATTTAT-AATACTAAATTTTGTA-------TATATTAGTT--AAAG-AAGTCTTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATACTC-AAATTCTTGAAGCATTC---CTA--------CCTTCCTCA-TGGCGGCGtccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|14 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattCAGGATATTTACTTCTACA-GCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTATGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTTGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TTAC-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTCCCGGTAAAATCACATTCCTGTGATCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAA-TTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTTTAT-CGACATTACCGAGCTGGAAAAAAG---GC-AATCAACG-----CA-----A-----TCAATGACATA------GCT--GTAGACTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATATTTCACACCccc
gi|15 : catgtcaatgCTACTAGCAACATG-------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTGCAGTCCCATTTTCTGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGATCGCTAACTTCATTCATTACCGTAAAATT-AAGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---CTTG---CTATAT-CGACATAACCAAGCT-GA----------C-A------------TA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCACATATTTTACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCATCTTCCTGCTAACGT
gi|16 : CAGGAAATTTATTTCTACGTGCACCTTTT-GCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGAAAGCATGATTTGAATGTGC
gi|16 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgTTCCAATATCCGGTAAAATGACATTCCTGTGTCCTTGACCACTACCTCCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAGTGTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATAACCGAGCA-GCAAAAAG---GC---------------------------TCAA-AACATG------GTTTCTTACA-TACAAAttccaatatccggtaaaatgacattcctgtgtccttgaccactacctccattcattaccgcaaaattacgtctcagtgtgcctacattgaatggcgaatctgctatatcgacataaccgagcagcaaaaaggctcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|17 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgcaggaaatttatttctacgtgcaccttttgcgttttttagtttatccaaagaaagcatgatttgaatgtgcCACGCGTCTTCTTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCACATGCAAATAATGTAAACATCACATGACGAGATAAGCACA-----TTTAATTGGCTAATTGAAATATCTCGCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACGTAACGTGACGAGGTCAGCACGTTTGATCGATTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTACC-CAACTTCA-----T--------------T----------------
gi|18 : CATTCCCAAACT-GAAAAAAG---GCTAATAGT-G-----CA-----A-----CTAACGCCATT------GCT--GTACATTGCATGCCCCCATAGGGCAAAAATATTTTAGAACCTTGGTGGAAATTCCCCAGAA---------CACCTCTTccgttatgtgaacattagatattgatag
gi|19 : atcagtgtgagatagatagcgaaattgctgcattggttgcataacatgtgcgtacaaattgttcccttcatacaaaatgcaatcaacatcaacggctgttatagccgaaaaagagtCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTCCCGTTTT---AGTTTATCCAAAGTAAGCCTGATTTGAATGC--AACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTATAACA-------CA--TATTTCGATCCCATTCTaccattgttattgtt
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-tgttctttttgttttaaatacaactacaatatttagtaagagttaacgaattgtgttccaacctgtaataatggcgaat
gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaggaaatttacttctacgtgcaccttttcccgttttagtttatccaaagtaagcctgatttgaatgcaactttatctcgaccagttgctctactagcaacatttcaggtataacacatatttcgatcccattcCAGGAAATTTACTTCTACGAGCACCCTTTTGCGTTTTAC-AGTTTATCCAAAATAAGCATGATTTCAATGTGCAACTTAATCTGGACCAGTTGCTCTACTAGCAACTT--------------TT-C-AGATAAAACATGTCTATCACCTACTGTAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACTTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAAT------CTTAGTCTATCTACATTGAAGGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGATATTAACGAGTT-GAAATAAG---GC-AATCAGCG-----CA-----A-----CTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCACATATTTCACCCCCTTGGTGGAAATTGCCTACAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTAACAAGATAAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCAGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAAGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-GAATTTCA-----T--------------T-------------------CC-G------T-------TA--------TTC-TC--TATTAC-GA-AGGACCTTGGGCAGGGTACCAGACTAAA-TTTGTTGGGACTAGCTAGTATTAC--GGCTTTT-AGATGTTTGAAGAACAAGTATGAAATACGTGCGTTTTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAACATATAGTAAGAATAAACGT-ATTATGTGCAAACCTGTAATAATGACGAAT-AAATTAG-TTTTTAAGGC----AT----GTTTTTAATCTCAAA-ATGTTTAGATTTTCGATGCCTTGGTGTGTCTAAGAAAGATGTCATTACAAAAA-AAAAGTGTTCTA----CCTTCAAAATAAAAAAAT------A----AAAA-AACTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATAGAGT-------------TAA-------TGTACTGGGGAAAGTTTCAACAAATTTA-TAATACAACATTTTGTA-------TATCGTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGC------------------------AATTCTAGAA--------------GGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|20 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaataTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTTCAAGTCTTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ACTATACAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTTAA----C--TCAAAATAAACACTTCAAGTAG----AAAA-AAGTAAGGTTTCCTACAAACAACcacaata
gi|21 : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATTCAAAGTAAGTATGATTTGATTGCGCAACTTTTTCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAA-AT--------------TT-C-AGGTTAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATGTTCCGATAAA
gi|22 : tttcacttgattacgcgatttcacatgttgatgGGTTTCTTACATACAAATG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGGAAATTTTCACCAAATTTAT-AATACTGCATTTTGTA-------TATCTTAGTT--TAAG-AATTAGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGTAGCATTC---CTACTAGACCACTCGCTACATTGGCGcattgaccacta
gi|23 : atC-G------T-------AA--------TGG-AG--AGTAACAGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAta
gi|24 : -------TGTACTTGGAAATTTTACACCAAATCTAT-AATACTATATGTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-ATTTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCGaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|25 : TTATTACCACAAAAATTACGT----------------TGAATGACGAA---TCTGTAGCTATAT-CGACATTACCCGGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACGCAATTAACGAAATA------GTT--GTACAATGCAAACCATTAAAAGGTGCAAATATTTCACACCTTTGGTGGAAATTGCCTAAtccaat
gi|26 : TCCTGTGACTTTGACCACTAACTTAATTCATTACGGCAAA-TTTACGTATCAATCTGCCTACATTGAATATCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAA
gi|27 : atttctatctcatctttttatttcattaaA--GTCTGGAAC--CCTGCC-CAAC-----------------------------------------A--A--G------T-------AA--------TGA-AACCAG----AGA-ATGAAGTAGTGCAGGGTACTAGACTA
gi|28 : acacaatgtgtgccttcttcCAGGAAATTTACTTCTATGTGCACCTTTT-GCGTTGTTT-AGTTTGTCCAAAGTAAGTATAATTTGAATGTGAAAttattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|29 : tttcacttggtgactcgattacacatgtcattgCTGGTAC--CCTATC-AAACTTCA-----T--------------T----------------G--CCTG------T-------GA--------T-----------CCGGA-AAGAAA-TAGACAGGGTACCAGACT
gi|3 : CAGGAAATTTACTTCTACTTGCACCTTTTT-------TT-AGTTTATCCAAAGTAAGTAGGATTTGAATGTGCAATTTTTTCTCAACCAGTTACTCTACTGGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGCCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTTCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGACTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----TA-----A-----TTATCGACAAA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCATATATTTCACACCCGTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCTCATGCAAATAATGTAAACATCACATGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATT--GCTGTATGTTGTCGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGATGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTTA-----T--------------TAA--------------A--AA-G------T-------AA--------TGGTAG--AGTAACAGA-ATGAAGTTGGGC-----ACCAGACTAAATTTTGTTGGGACTTGCTAGTATAAT--GACTTTTCATATATTTGGAAAACAAATATAAAATACTC-TATTGTTC--TTTTTATTTTAAATTCAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATATTCTAACCTGTTGTAATGGCAAAT-AAATAAG-TTTTTTAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTGC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTTAAAGTAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGACATTTTCCACCAAACTTATTAGT-CTACATTTTGTA-------TATCTAAGTT--TAAG-AATTTGTACAAATGCCTCCACAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtgcacatatatattaacatgtatgtatatatgtatctatgt
gi|30 : --GTCTGGT-T--CCTGGC-CATCTTCA-----TAGCGTTCCTCTTCAT----------------A--AC-GAAGATGT-------AA--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGCCAGGGTACCAGACTA
gi|31 : TCTGGTACTTCATTCCGTTACTCCA-----T--------------T----------------C---C-G------T-------AA--------TGG-AG--GGTAACGGA-ATGAAGTTGGGAAGGGTACCAGAC
gi|32 : cctggtaccttgct--GTCTGGTAC--CCTACC-CTACTCCA-----T--------------TCTGTTACTC-------A--CC-A------TTAGG---AG--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTGGGGCAAGGTACCAG
gi|33 : CTGGTAC--CCCGAC-CAACTTCA-----T--------------TCCGTTACCCTCCATGTA--AT-G------T-------AA--------TGG-AG--GGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGATACC
gi|34 : CTCCA-----T--------------T----------------ATTAC--------T-------AA--------TGG-AG--AGTAATGGA-ATGAAGTTGGGAAGGA-ACCA
gi|34 : CTCCA-----T--------------T----------------A--GT-AA-----T-------AA--------TGG-AG--AGATACGGA-ATGAAGATGGCCAGGCTACCAagatacggaatgaagatggccaggctacca
gi|35 : tggttccttcccaacttcattccattact--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTCCA-----T-------------------------------A--CC-G------TGTTATGAAG--------TGG-AG--AGTAACGGA-ACGGAGGTGGGCAGGGTACCAGACTA
gi|36 : GGTAC--CCTGTC-CAACTCTA-----T--------------TCCATTCCCCTCC----ATTAC-G------A-------AA--------TGG-AG--AGAAACGGA-ATAAAGTTGGGCAGAGTACCA
gi|37 : --GTCTGGTAC--CCTGCA-AAACTCCT-----T--------------T----------------C---C-G------T-------TCCTCCCCTTTGG-AG--AGTAACGGA-ATGGAGTTGGGCAGGATACCAG
gi|38 : TCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---TTACTGGAC--CCCGC
gi|39 : TCTGGTAC--CCTGTC-AAACTTCAGTCCTT--------------T----------------A------------T-------AG--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAATTGGGCATGGTACCAGA
gi|4 : CAGGAAATTTATTTCTATGTGCATCTTTTTGCTTTTTTTTAGTTTGTCCAAAGTTAGTATGATTTGAGTGTGCAACTTTATCTCGACTAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-TTAGG-AAAACATGTCTGTCTCCTATTTCAGTCCATTTTTCCGGTAAAATCACATTC-TGTAACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAACATT-ACGTCTAAATCTACCTACATTCAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAA-G---GC-AA-----GAAACGCA-----A-----TTAACGACGTACGAGTAGTT--GTGCATTGTAAACCATTAACAGGCGCAAATATGTCACACTCTTGGTGGAAACAGCCTAAAA---------C-CATATTTGCTTTATTTTCCACGCGTCTACCTACTAGCGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACACGATTAGCACA-----TTTGCTTGGCTGATTGAAGTACC--AATGTGTGTTGTG
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATG--TAAACATCACGTGACACGATTAGCACATTTGCTTGGCTGATTGAA------G-TACCAATG--TGTGTTGTG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-CAACTTTG-----T--------------T-----------------------------T-----------------T--------GTTACTTA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcCGTATGCATA-AATA--TAAAGATCTCGTGACGAGGTAAGCACCTTTGGTTGGTTACTTCAA-ATTTCG-TGCAGA-A--TTTGT--TG----tgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgAGAATTTGTTGGGACTAGCT---------------------T-TTTGGAGAGGAAACATAAAATGTCTGCGTGGTTT--CTTTT-TTTAAAATACAACTACAATATGTCGTAAGAATTAACGT-ATTATATTCTAATCTGTAATAA--------------AG-TTTTTCAAGCC---ATT-------------------------CAATTTTCGAACCCTTGATTTGTCTAAAGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT-----------AAAC-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTA--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTGTCCACCATATTTA-CAATATTAAATTTTATG-------TATGCTAGTA--AAAG-AATTCTTACAAATGGCTCCCCAATACGGTTACGCCA----------CCCAATGCTCTAAACTTTAGAAGCATTC---ggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|43 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcCTTTGACCACTAACTTCTTTCATTACCGCAAAG-TTATGTCTCatggcggcgcccaata
gi|5 : GTTGCTCTACTAGCAACATGTTCTAATGACATGTC-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTGAGTCCCATTTTCAGATAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGTGAA---TCTG---CTATGTTCGACATTACCAAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACACAATTAATGACATA------GTT--GTACATTTCAAACCATTTAAAGGC--AAATATTTCACAACCTTGGTGGAAATTGCCTAAA----------C-CATCTTTGCTTTCTTTCCCGCATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGCACATTAATTTTGATTGGCTGATTGAAATATC--AC--TGTGTTGTGGAACTCGTATGCATA-AATA--TAAACAT-A---GACGAGGTCAGCACTTCTGATTGGTTGCTTGTA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTG
gi|5 : AAAACTTGATAGCACTAGCTAGTATAAT--GACTTTCCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTGGGGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATTCAACTACAATATGTTATACGAATTAACGT-ATTATGTTTTAACCTGTAATACTGGTGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTGATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAATTT-CGATCCCCTGATTTGTC-------------ATTAC--AA------------TA----CTTTCCAAATAAACCAT-------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTGAAACTTTCAGGTTTACTTTCAAAGTACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACATGGAAATTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCC----T--AAAG-AAATCGTACAAATGCCTCCCCTAAACGGTTATGCAACCCCATGCAACCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCCTTC---CTAGTGGAC--CCTGCTACA-TGGCGGTGatagcactagctagtataatgactttccagatatttggagaacaaatataaaatactggggttgttctttttgttttaaattcaactacaatatgttatacgaattaacgtattatgttttaacctgtaatactggtgaataaataagtttttcaagccctgattttaatttttgatctcttgatttttcaatttcgatcccctgatttgtcattacaatactttccaaataaaccataaaaaaattaaggtttcctacatacaactgaaactttcaggtttactttcaaagtacaaaatatacagttaatgtacatggaaattttccaccaaatttataatactacattttgtatatcctaaagaaatcgtacaaatgcctcccctaaacggttatgcaaccccatgcaaccccatgctcaaattctagaagccttcctagtggaccctgctacatggcggtgcccaaaa
gi|6 : gttgctctactagcaacatgttctaatgacatgtccaggtaaaacatgtctatcacctatttgagtcccattttcagataaaatcacattcctgtgaccttgaccactaacttcattcattaccgcaaaattacgtctcaatctgcctacattgaatggtgaatctgctatgttcgacattaccaagctgaaaaaaggcaagcaacacaattaatgacatagttgtacatttcaaaccatttaaaggcaaatatttcacaaccttggtggaaattgcctaaaccatctttgctttctttcccgcatgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcatgtgacaagattagcacattaattttgattggctgattgaaatatcactgtgttgtggaactcgtatgcataaatataaacatagacgaggtcagcacttctgattggttgcttgtaatttcgtgcCTGTCTACATTGAATGGCGAAATGTCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAGGCAAGC-AAC----G-----CA-----A-----TTCACGACATA------ACT--GTACATTGCAATCCATTAAAAGACGCAAATATTTTACACACTTTGTAGAAATTGCCTAAAATTCCCCTTAC-CATCTTTGAGTTCTTTTCCGCACGTTTTCCTACTAACGTGTGTTGAAGAACCCTTATGCAAAATATGTTAACATCACGTGACAATATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GC--TGTGTTGTGGAACCCGTATGGA-A-AATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACATTTGATTGGCTGATTGAA-ATATCG-cccaaaa
gi|6 : TGTGTTGTGGAACCCGTATGGAAAATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTG--TTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTCAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TGTGT--Tctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcaaaatgtgtttggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|6 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgcAAAATGTGTTTGGACTAGCTAATATAAT--GACTTTTCAGATATTTGCAGAACAA-TAAAAAATACATTCATTGTTG--TTTTT--TTTAAATACGACTAAAATAAGTAGTAAGAATAAACGT-TCTATGTTCTAACCTGTAAAAATGGCGAAT-AAATTAG-ATTGTCAAGGTCTAATTTTAATTATTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCGATACCTTGATTTTTCTTAGGGACTAGTCATTAC--ATG-AAGAGTATTCTA----CCGT-AAAACAAACAATT------A----AAAA-ATTCCAGGTTCCCTACATACAACTG--------------------AAAATATAAAATATACAGT-------------TAA-------AGTACTTGGAAGTTTACCACCAAATTTATT-ATACTACACTTTGTA-------TATTCTAGTT--AAAGAAATTCG----------TCCCCAATAC---------A----------TCCCATGCTC-GAATTCTAAAAGCATTCCTACTACTAGTC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|7 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatggaaaatatgtaaacaccacttgacaagatcagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcGCTCTACTAGTAACATG-------------TT-C-AGATAAAACCTGTCTAGCGACTATTTCAATCCCATTTTCCTGTAAAATCACATTTCTGTGACCATGACCACTAAC------------CGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGTCTACATTGAATGGCGAA---TC----------------ATTACCGAGTT-AAAAAAAG---GC-AA-----G-----CAGCAGAA-----TTAACGACAAA------GCT--GTAAAATGCAATCCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACAATATCGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCT--CTTTTCCAGGCGTCTTCCTGCTGGCG--------------CGCATACAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTAATTGGTTGATTGAAATATT--GCT-----TTGT-------GTATGCGTA-GATA--TCAACACCAAGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTGGAATATTTCG-TGTACA-A--TTTGT--CG----cttaataa
gi|7 : TACAATTTGTCGGGATTAGCTA-----------TTTTTCAGATAATTGGATAACAAATATAAAATACTTGAGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAAAACAACTGCAATATGTAGTAAGAATTAACGT-TTTATGTTTTAACAAGTAATTATGGCGAGT-AAATAAG-TTTTT-------TAACTTTAAATTTTGATATCTTG-ATCATTCAATTTTCGATCCCATCATTTGTCGAAGAGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTACTCTA----TCTTCAAAATAAACAATT------A----AACA-AATCAAGGTTTCCTACATA-AACTG--------------------AACATACAAAATAAACAGT-------------TTA-------GGTACTTTGAAAGTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGAA-------TATCCTAGTT--AAGG-AATTCGTACAAATGCCTCACCAGTACGATTACGCAA----------CCCTATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTAATGGGC--CCCGCTTCC-TGGCTGCGggattagctatttttcagataattggataacaaatataaaatacttgagttgttctttttgttttaaaaacaactgcaatatgtagtaagaattaacgttttatgttttaacaagtaattatggcgagtaaataagttttttaactttaaattttgatatcttgatcattcaattttcgatcccatcatttgtcgaagagactagtcattacaaaaaagtactctatcttcaaaataaacaattaaacaaatcaaggtttcctacataaactgaacatacaaaataaacagtttaggtactttgaaagtttccaccaaatttataatactacattttgaatatcctagttaaggaattcgtacaaatgcctcaccagtacgattacgcaaccctatgatcaaattctagaagcattcctaatgggccccgcttcctggctgcgcccaat
gi|8 : gctctactagtaacatgttcagataaaacctgtctagcgactatttcaatcccattttcctgtaaaatcacatttctgtgaccatgaccactaaccgcaaaattacgtctcaatctgtctacattgaatggcgaatcattaccgagttaaaaaaaggcaagcagcagaattaacgacaaagctgtaaaatgcaatccattaaaaggcgcaaatatttcacaatatcggtggaaattgcctaaaaccatctttgctcttttccaggcgtcttcctgctggcgcgcatacaaataatgtaaacatcacgtgacaagattagcacatttaattggttgattgaaatattgctttgtgtatgcgtagatatcaacaccaagtgacgaggtcagcacctttgattggttgctggaatatttcgtgCTGCTAGAGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAAAAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGTACA-----TTTGATTGGTTGATTGAAATAAC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATG--TAAACATCACGTGACCAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCGTCAA-ATTTCG-TTCAAA-A--TTTGT--TGGGACTA--G-CTAGTAcccaat
gi|8 : AAAATTTGTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGATATTTGGTAAACAAATATAAAATACTTGCTTTGCTC--TTTTTGCTCTAAATACTACTACAATATGTAGTTAGAATAAATGT-ATTATGTTCTAACCTGCAACAATAGCGAAT-AAATTAG--TTATCAAGGCCTAATTTT-ATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCACTTTTCGATCCATTGATTTGTCTAAAGGAATA--CA-TAC--AACTGAAAATA-------------CAAAATGAACAATT------A----Attatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaatacatacaactgaaaatacaaaatgaacaattaatgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|8 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATGAACAAT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTACCAAAAAATTTAT-AATACTACAATT-GTA-------TATCCTAGTA--ACTG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTA-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGT--CCtgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|9 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcaaaatttgttgggactagctagtattatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaaTGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACCTTTGATTGGTTGCTAAAA-ATTTTG-T
gi|9 : AAATTTTGTAGGGACGAGCTTGTATAAT--GATTTTTCAGATATTTGGAGAATAAATATAAAATACTTGCGTTGTTT--CTTTTATTTTAAA-----CGACAATGTGTAGTAGGAATCAACGT-ATTATGTTCTTACTTGTAATAATGGCGAAC-AAATCAA-TTTTCCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATTTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTTAAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCCA----CCTTCAAAATAAACAATT------ATATTAAAA-AATAAAGGTTTCCAACATACAACTT--------------------AAAATACAAACTATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTTTCTACCATATTTA-TAATACTACATTTTGTATTATTTTTATCCTAGTTAAAAAA-AATTCGTACAAATG-CTCCCCAATACGGTTACGTAA----------CCCCAT-TTCAAAATTCTAAAAGCATTC---TTACTGGGT--CCCGTCTCA-TGGCAGCGagggacgagcttgtataatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CGATTAAAACAATTATATTCGGAACTAATGGTAGTCCCATTTTTTCGGTGTACAAATGAAACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTCTATGAATTGATCTAGTGCATATTGTTAGAAGTTTGCCAAATGATATGGCACTGTCCG
Unaligned ( gi|42 ): TAATTTCCAATAAAAAAAAATGTAGGTGTAAAATGCGGACTTT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333 111 444444444444444444444444 111111111 11111 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111 11111111111 22222222222222222222 1111111111111 22 1111111111
lowQualScore : 3 55 0 11111111111111 4 4 555 555 555 3 3 555 3 333333333333333333333333 999999 44 0 777777777 4 0 0 00000 55 3 3 44 5 2 3 44 44 5555 33 33 0 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 33 1 44 3 1 44 33 1 2 2 2 3 0 0 3 2 000 3 1 6666 11111111111 6 1 55555555555555555555 6666666666666 9999999 0 55 8888888 33 2 0000000000 5 444 33 3
lowQualScore : . .. . .............. . . ... ... ... . . ... . ........................ ...... .. . ......... . . . ..... .. . . .. . . . .. .. .... .. .. . . .................................................................................................... . .. . .. . . .. .. . . . . . . . . . ... . . .... ........... . . .................... ............. ....... . .. ....... .. . .......... . ... .. .
lowQualScore : 6 22 7 55555555555555 0 0 222 888 888 3 1 888 3 777777777777777777777777 666666 66 7 888888888 4 7 5 00000 55 4 1 22 3 7 1 22 66 5555 99 22 1 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 22 6 66 3 5 66 77 2 9 9 5 1 8 6 1 8 333 1 6 5555 33333333333 7 0 00000000000000000000 9999999999999 3333333 4 55 7777777 77 7 9999999999 0 777 99 3
consensus : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTT---------------CA-----T--------------T----------------ACC-G------T-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGAATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
Reference ( family-5234 ) : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTT---------------CA-----T--------------T----------------ANC-G------T-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGAATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|1 : CAAGAAATTAACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTCTTT--AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGTGCAACTTTATCTTCACCAGTTGCTCTACCAACAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTTTCGCCTACTTCAGTCCCGTTTTCCG----------------GTGACCTTGACCACTTACTTCATTCAATACCGCAAAA-CTACATCTAAGTCTGCTTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATA--CGACATTACCGAGCT-GGAAAAAG---GC-AAGCAACG-----CA-----A-----TTATGGACAAA------GTA--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATAATCCACACCCTTGGTGGAAATTGGTTAATA---------C-CATCTTAGCTTTCTTTTACGCGCGTCTTCCTGCTAGCACGTATTGAAGTACCTCCATGCAAATAATGTGAACATCACGTGACAAGAATAGCACA-----TTTGATTTGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCTGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATATCG-TGCCAA-A--TTTGT--TG----TA--ATCTGGTAC--CCTGCC-CAATTT---------------CA-----T--------------T----------------CCT-T------T-------A-----------------C--------TCT-CC--ATT-AC-GAAGGACATTGGCCAGGATACCAGACT-AAA--TTTGTT-GTCACTAGCTTGTATAAT--AACTTTTCAGATATTTGAAGAAC-AATATTAAATACTTCCGTTGTT---------------------CTACAATATGTAGTAAGAACTAACAT-ATTATGTTCTAACCGGTAATAATGGCGAATAAAATAAG-TTTTTCAAGTCCAAATTTTAATTTTTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCAATCCCTTGATTTGTCTAAGGGAATAGTCATTAC---AA-AAAAGTAATCTA----CCTCCAAAATTAACAATT------A----AAAC-AAT--ATGTTTCCTACATACAACTG--------------------GAAATACAAAATATACAGTAATATATACAGTATAG-------TGTACTTGCAAAATTCTTACCAACTTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATAAAAGTT--AAAG-AATTCATACAAATGCCTCGCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCCGTCCTA-TGGCGGCG
gi|10 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatgAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGAATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCATTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATGTTCTAACCTGTTATAATGGCGAAT-TAATAAG-TTTTTCAAGCACTACTTTTAA-TTTTGATCTCTTGTATTAT-----------TCCCTTGATTTCTCTAAGAGATTAGTCATTAC--AAA-AACAGTATTATACAGTCCTTCAAAACAAACAATT------A----AAAATAATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AATATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGAACATTGAAATTTTCCACCAAACTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCCAAGTT--AAAG-AATTTGTACAAATATCTCCCTTATGTGGTTACACAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCTGCCTCA-T-GTGGCGccg
gi|11 : TTGATTGGTTGCTTGAACATTTCG-TGCAAA-AATTTTTT--TGGGACTA--G-CTAGTAcccaataa
gi|11 : AAAA--TTTTTTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGAAATTTGGAGAACGGATATAAAATACTTGCAATGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAAATATGTTTTAACCTATAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCATAATTTTAAATTTTAATCTCTTG--CTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAA-TATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAATAAATAAGGTCTCCTACATACAAATG--------------------AATATACAGAATAAAGAGT-------------TAA-------GGTACTAGGAAACTTTTAACCAAATTTA-TAATAATACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGTCTCCCCAATATGGTTACGCGA----------CGCCATGCTC-ttatgacttttcagaaatttggagaacggatataaaatacttgcaatgttctttttgttttaaatacaactacaatatgtagtaagaattaacgtaaatatgttttaacctataataatggcgaataaataagtttttcaagccataattttaaattttaatctcttgctattcaattttcgatcccttgatttgtctaagggactagtcattacaaaaaaatattctaccttcaaaataaacaattaaaaataaataaggtctcctacatacaaatgaatatacagaataaagagttaaggtactaggaaacttttaaccaaatttataataatacattttgtatatcctagttaaagaattcgtacaaatgtctccccaatatggttacgcgacgccatgctc
gi|12 : ttgattggttgcttgaacatttcgtgcaAAATAATTGCGTTGTTT--CTTTTGTTTTAAATACAACTACAATTAGTAGTTAGAATTGACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATCAG-TTTT-CAAGCCCATATTATAATTTATGATCACTTG-ATTATTCAATTTTTGATTCCTTGATTTGTTTAAGGGACTAGTCATTCC--AAA-AAAAAT---CTA----TTTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATCAAGGTTTCCTACATACAAATA--------------------AAAATACAAAATATATAGT-------------TAAGGTGCAATGTACTTGGAAAGTTTCCATCAAATTTAT-AATACTACATTTTATA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCAAGTACGGTAACTCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGC--CCCGTCTCA-TGCCGGTG
gi|13 : ACTAGATTAGCACATTTGACTGGGTGATTGAA-ATATCGCTG--------TGTGT--TG----TATAGTCTGGTAC--CCTGTC-CCACTT---------------AA-----T--------------T-----------------CC-G------T--------------------------------------------TA-CTGAATGAAGTTGGGCAGGGTATCAGACTAccctataaaag
gi|13 : GTATGCATA-AATA--TAAATATCACGTGACGAGATAAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-AGTTCG-TGCAAC-A--TTTGT--TT----T---GTCTtgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtAACA--TTTGTT-TTGTCTAACTAGTGTAATATGACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACATGCGTGGTTTCATTTTTaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcTTTTCCATCATATTTAT-AATACTAAATTTTGTA-------TATATTAGTT--AAAG-AAGTCTTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATACTC-AAATTCTTGAAGCATTC---CTA--------CCTTCCTCA-TGGCGGCGtccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|14 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattCAGGATATTTACTTCTACA-GCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTATGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTTGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TTAC-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTCCCGGTAAAATCACATTCCTGTGATCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAA-TTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTTTAT-CGACATTACCGAGCTGGAAAAAAG---GC-AATCAACG-----CA-----A-----TCAATGACATA------GCT--GTAGACTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATATTTCACACCccc
gi|15 : catgtcaatgCTACTAGCAACATG-------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTGCAGTCCCATTTTCTGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGATCGCTAACTTCATTCATTACCGTAAAATT-AAGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---CTTG---CTATAT-CGACATAACCAAGCT-GA----------C-A------------TA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCACATATTTTACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCATCTTCCTGCTAACGT
gi|16 : CAGGAAATTTATTTCTACGTGCACCTTTT-GCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGAAAGCATGATTTGAATGTGC
gi|16 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgTTCCAATATCCGGTAAAATGACATTCCTGTGTCCTTGACCACTACCTCCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAGTGTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATAACCGAGCA-GCAAAAAG---GC---------------------------TCAA-AACATG------GTTTCTTACA-TACAAAttccaatatccggtaaaatgacattcctgtgtccttgaccactacctccattcattaccgcaaaattacgtctcagtgtgcctacattgaatggcgaatctgctatatcgacataaccgagcagcaaaaaggctcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|17 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgcaggaaatttatttctacgtgcaccttttgcgttttttagtttatccaaagaaagcatgatttgaatgtgcCACGCGTCTTCTTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCACATGCAAATAATGTAAACATCACATGACGAGATAAGCACA-----TTTAATTGGCTAATTGAAATATCTCGCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACGTAACGTGACGAGGTCAGCACGTTTGATCGATTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTACC-CAACTT---------------CA-----T--------------T-----------------CC-G------T-------T-----------------A--------TG
gi|18 : CATTCCCAAACT-GAAAAAAG---GCTAATAGT-G-----CA-----A-----CTAACGCCATT------GCT--GTACATTGCATGCCCCCATAGGGCAAAAATATTTTAGAACCTTGGTGGAAATTCCCCAGAA---------CACCTCTTtgaacattagatattgatag
gi|19 : atcagtgtgagatagatagcgaaattgctgcattggttgcataacatgtgcgtacaaattgttcccttcatacaaaatgcaatcaacatcaacggctgttatagccgaaaaagagtCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTCCCGTTTT---AGTTTATCCAAAGTAAGCCTGATTTGAATGC--AACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTATAACA-------CA--TATTTCGATCCCATTCTaccattgttattgtt
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-tgttctttttgttttaaatacaactacaatatttagtaagagttaacgaattgtgttccaacctgtaataatggcgaat
gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaggaaatttacttctacgtgcaccttttcccgttttagtttatccaaagtaagcctgatttgaatgcaactttatctcgaccagttgctctactagcaacatttcaggtataacacatatttcgatcccattcCAGGAAATTTACTTCTACGAGCACCCTTTTGCGTTTTAC-AGTTTATCCAAAATAAGCATGATTTCAATGTGCAACTTAATCTGGACCAGTTGCTCTACTAGCAACTT--------------TT-C-AGATAAAACATGTCTATCACCTACTGTAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACTTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAAT------CTTAGTCTATCTACATTGAAGGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGATATTAACGAGTT-GAAATAAG---GC-AATCAGCG-----CA-----A-----CTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCACATATTTCACCCCCTTGGTGGAAATTGCCTACAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTAACAAGATAAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCAGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAAGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-GAATTT---------------CA-----T--------------T-----------------CC-G------T-------T-----------------A--------TTC-TC--TATTAC-GAAGGACCTTGGGCAGGGTACCAGACT-AAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATTAC--GGCTTTT-AGATGTTTGAAGAACAAGTATGAAATACGTGCGTTTTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAACATATAGTAAGAATAAACGT-ATTATGTGCAAACCTGTAATAATGACGAAT-AAATTAG-TTTTTAAGGC----AT----GTTTTTAATCTCAAA-ATGTTTAGATTTTCGATGCCTTGGTGTGTCTAAGAAAGATGTCATTACAAAAA-AAAAGTGTTCTA----CCTTCAAAATAAAAAAAT------A----AAAA-AACTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATAGAGT-------------TAA-------TGTACTGGGGAAAGTTTCAACAAATTTA-TAATACAACATTTTGTA-------TATCGTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGC------------------------AATTCTAGAA--------------GGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|20 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaataTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTTCAAGTCTTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ACTATACAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTTAA----C--TCAAAATAAACACTTCAAGTAG----AAAA-AAGTAAGGTTTCCTACAAACAACcacaata
gi|21 : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATTCAAAGTAAGTATGATTTGATTGCGCAACTTTTTCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAA-AT--------------TT-C-AGGTTAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATGTTCCGATAAA
gi|22 : tttcacttgattacgcgatttcacatgttgatgGGTTTCTTACATACAAATG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGGAAATTTTCACCAAATTTAT-AATACTGCATTTTGTA-------TATCTTAGTT--TAAG-AATTAGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGTAGCATTC---CTACTAGACCACTCGCTACATTGGCGcattgaccacta
gi|23 : atC-G------T-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACAGAATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAta
gi|24 : -------TGTACTTGGAAATTTTACACCAAATCTAT-AATACTATATGTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-ATTTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCGaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|25 : TTATTACCACAAAAATTACGT----------------TGAATGACGAA---TCTGTAGCTATAT-CGACATTACCCGGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACGCAATTAACGAAATA------GTT--GTACAATGCAAACCATTAAAAGGTGCAAATATTTCACACCTTTGGTGGAAATTGCCTAAtccaat
gi|26 : TCCTGTGACTTTGACCACTAACTTAATTCATTACGGCAAA-TTTACGTATCAATCTGCCTACATTGAATATCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAA
gi|27 : atttctatctcatctttttatttcattaaA--GTCTGGAAC--CCTGCC-CAAC--------------------------------------------------------AA--G------T-------A-----------------A--------TGA-AACCAG----AGAATGAAGTAGTGCAGGGTACTAGACTA
gi|28 : acacaatgtgtgccttcttcCAGGAAATTTACTTCTATGTGCACCTTTT-GCGTTGTTT-AGTTTGTCCAAAGTAAGTATAATTTGAATGTGAAAttattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|29 : tttcacttggtgactcgattacacatgtcattgCTGGTAC--CCTATC-AAACTT---------------CA-----T--------------T----------------GCCTG------T-------G-----------------A--------T-----------CCGGAAAGAAA-TAGACAGGGTACCAGACT
gi|3 : CAGGAAATTTACTTCTACTTGCACCTTTTT-------TT-AGTTTATCCAAAGTAAGTAGGATTTGAATGTGCAATTTTTTCTCAACCAGTTACTCTACTGGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGCCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTTCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGACTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----TA-----A-----TTATCGACAAA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCATATATTTCACACCCGTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCTCATGCAAATAATGTAAACATCACATGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATT--GCTGTATGTTGTCGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGATGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTT---------------TA-----T--------------TAA--------------AAA-G------T-------A-----------------A--------TGGTAG--AGTAACAGAATGAAGTTGGGC-----ACCAGACTAAAT--TTTGTT-GGGACTTGCTAGTATAAT--GACTTTTCATATATTTGGAAAACAAATATAAAATACTC-TATTGTTC--TTTTTATTTTAAATTCAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATATTCTAACCTGTTGTAATGGCAAAT-AAATAAG-TTTTTTAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTGC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTTAAAGTAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGACATTTTCCACCAAACTTATTAGT-CTACATTTTGTA-------TATCTAAGTT--TAAG-AATTTGTACAAATGCCTCCACAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtgcacatatatattaacatgtatgtatatatgtatctatgt
gi|30 : --GTCTGGT-T--CCTGGC-CATCTT---------------CA-----TAGCGTTCCTCTTCAT----------------AAC-GAAGATGT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGAATGAAGTTGGCCAGGGTACCAGACTA
gi|31 : TCTGGTACTTCATTCCGTTACTC---------------CA-----T--------------T-----------------CC-G------T-------A-----------------A--------TGG-AG--GGTAACGGAATGAAGTTGGGAAGGGTACCAGAC
gi|32 : cctggtaccttgct--GTCTGGTAC--CCTACC-CTACTC---------------CA-----T--------------TCTGTTACTC-------ACC-A------TTAGG---A-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGAATGAAGTGGGGCAAGGTACCAG
gi|33 : CTGGTAC--CCCGAC-CAACTT---------------CA-----T--------------TCCGTTACCCTCCATGTAAT-G------T-------A-----------------A--------TGG-AG--GGTAACGGAATGAAGTTGGGCAGGATACC
gi|34 : TGGTAG--CCTGGC-CATCTT---------------CA-----T--------------T-----------------CC-G------T-------ATCTCTCCATTATTACTAA--------TGG-AG--AGTAATGGAATGAAGTTGGGAAGGA-ACCA
gi|35 : --GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTC---------------CA-----T-------------------------------ACC-G------TGTTATGAA-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGAACGGAGGTGGGCAGGGTACCAGACTA
gi|36 : GGTAC--CCTGTC-CAACTCTATTCCATTCCCCTCCA-----T--------------T----------------A-C-G------A-------A-----------------A--------TGG-AG--AGAAACGGAATAAAGTTGGGCAGAGTACCA
gi|37 : --GTCTGGTAC--CCTGCA-AAACTC---------------CT-----T--------------T-----------------CC-G------T-------T-----------------CCTCCCCTTTGG-AG--AGTAACGGAATGGAGTTGGGCAGGATACCAG
gi|38 : TCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---TTACTGGAC--CCCGC
gi|39 : TCTGGTAC--CCTGTC-AAACTT---------------CAGTCCTT--------------T----------------A----------T-------A-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGAATGAAATTGGGCATGGTACCAGA
gi|4 : CAGGAAATTTATTTCTATGTGCATCTTTTTGCTTTTTTTTAGTTTGTCCAAAGTTAGTATGATTTGAGTGTGCAACTTTATCTCGACTAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-TTAGG-AAAACATGTCTGTCTCCTATTTCAGTCCATTTTTCCGGTAAAATCACATTC-TGTAACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAACATT-ACGTCTAAATCTACCTACATTCAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAA-G---GC-AA-----GAAACGCA-----A-----TTAACGACGTACGAGTAGTT--GTGCATTGTAAACCATTAACAGGCGCAAATATGTCACACTCTTGGTGGAAACAGCCTAAAA---------C-CATATTTGCTTTATTTTCCACGCGTCTACCTACTAGCGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACACGATTAGCACA-----TTTGCTTGGCTGATTGAAGTACC--AATGTGTGTTGTG
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATG--TAAACATCACGTGACACGATTAGCACATTTGCTTGGCTGATTGAA------G-TACCAATG--TGTGTTGTG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-CAACTT---------------TG-----T--------------T----------------TT-----------------------------------------------------GTTACTTAATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcCGTATGCATA-AATA--TAAAGATCTCGTGACGAGGTAAGCACCTTTGGTTGGTTACTTCAA-ATTTCG-TGCAGA-A--TTTGT--TG----tgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgAGAA--TTTGTT-GGGACTAGCT---------------------T-TTTGGAGAGGAAACATAAAATGTCTGCGTGGTTT--CTTTT-TTTAAAATACAACTACAATATGTCGTAAGAATTAACGT-ATTATATTCTAATCTGTAATAA--------------AG-TTTTTCAAGCC---ATT-------------------------CAATTTTCGAACCCTTGATTTGTCTAAAGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT-----------AAAC-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTA--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTGTCCACCATATTTA-CAATATTAAATTTTATG-------TATGCTAGTA--AAAG-AATTCTTACAAATGGCTCCCCAATACGGTTACGCCA----------CCCAATGCTCTAAACTTTAGAAGCATTC---ggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|43 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcCTTTGACCACTAACTTCTTTCATTACCGCAAAG-TTATGTCTCatggcggcgcccaata
gi|5 : GTTGCTCTACTAGCAACATGTTCTAATGACATGTC-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTGAGTCCCATTTTCAGATAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGTGAA---TCTG---CTATGTTCGACATTACCAAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACACAATTAATGACATA------GTT--GTACATTTCAAACCATTTAAAGGC--AAATATTTCACAACCTTGGTGGAAATTGCCTAAA----------C-CATCTTTGCTTTCTTTCCCGCATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGCACATTAATTTTGATTGGCTGATTGAAATATC--AC--TGTGTTGTGGAACTCGTATGCATA-AATA--TAAACAT-A---GACGAGGTCAGCACTTCTGATTGGTTGCTTGTA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTG
gi|5 : AAAA--CTTGAT-AGCACTAGCTAGTATAAT--GACTTTCCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTGGGGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATTCAACTACAATATGTTATACGAATTAACGT-ATTATGTTTTAACCTGTAATACTGGTGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTGATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAATTT-CGATCCCCTGATTTGTC-------------ATTAC--AA------------TA----CTTTCCAAATAAACCAT-------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTGAAACTTTCAGGTTTACTTTCAAAGTACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACATGGAAATTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCC----T--AAAG-AAATCGTACAAATGCCTCCCCTAAACGGTTATGCAACCCCATGCAACCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCCTTC---CTAGTGGAC--CCTGCTACA-TGGCGGTGatagcactagctagtataatgactttccagatatttggagaacaaatataaaatactggggttgttctttttgttttaaattcaactacaatatgttatacgaattaacgtattatgttttaacctgtaatactggtgaataaataagtttttcaagccctgattttaatttttgatctcttgatttttcaatttcgatcccctgatttgtcattacaatactttccaaataaaccataaaaaaattaaggtttcctacatacaactgaaactttcaggtttactttcaaagtacaaaatatacagttaatgtacatggaaattttccaccaaatttataatactacattttgtatatcctaaagaaatcgtacaaatgcctcccctaaacggttatgcaaccccatgcaaccccatgctcaaattctagaagccttcctagtggaccctgctacatggcggtgcccaaaa
gi|6 : gttgctctactagcaacatgttctaatgacatgtccaggtaaaacatgtctatcacctatttgagtcccattttcagataaaatcacattcctgtgaccttgaccactaacttcattcattaccgcaaaattacgtctcaatctgcctacattgaatggtgaatctgctatgttcgacattaccaagctgaaaaaaggcaagcaacacaattaatgacatagttgtacatttcaaaccatttaaaggcaaatatttcacaaccttggtggaaattgcctaaaccatctttgctttctttcccgcatgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcatgtgacaagattagcacattaattttgattggctgattgaaatatcactgtgttgtggaactcgtatgcataaatataaacatagacgaggtcagcacttctgattggttgcttgtaatttcgtgcCTGTCTACATTGAATGGCGAAATGTCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAGGCAAGC-AAC----G-----CA-----A-----TTCACGACATA------ACT--GTACATTGCAATCCATTAAAAGACGCAAATATTTTACACACTTTGTAGAAATTGCCTAAAATTCCCCTTAC-CATCTTTGAGTTCTTTTCCGCACGTTTTCCTACTAACGTGTGTTGAAGAACCCTTATGCAAAATATGTTAACATCACGTGACAATATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GC--TGTGTTGTGGAACCCGTATGGA-A-AATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACATTTGATTGGCTGATTGAA-ATATCG-cccaaaa
gi|6 : TGTGTTGTGGAACCCGTATGGAAAATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTG--TTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTCAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TGTGT--Tctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcaaaatgtgtttggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|6 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgcAAAA--TGTGTT-TGGACTAGCTAATATAAT--GACTTTTCAGATATTTGCAGAACAA-TAAAAAATACATTCATTGTTG--TTTTT--TTTAAATACGACTAAAATAAGTAGTAAGAATAAACGT-TCTATGTTCTAACCTGTAAAAATGGCGAAT-AAATTAG-ATTGTCAAGGTCTAATTTTAATTATTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCGATACCTTGATTTTTCTTAGGGACTAGTCATTAC--ATG-AAGAGTATTCTA----CCGT-AAAACAAACAATT------A----AAAA-ATTCCAGGTTCCCTACATACAACTG--------------------AAAATATAAAATATACAGT-------------TAA-------AGTACTTGGAAGTTTACCACCAAATTTATT-ATACTACACTTTGTA-------TATTCTAGTT--AAAGAAATTCG----------TCCCCAATAC---------A----------TCCCATGCTC-GAATTCTAAAAGCATTCCTACTACTAGTC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|7 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatggaaaatatgtaaacaccacttgacaagatcagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcGCTCTACTAGTAACATG-------------TT-C-AGATAAAACCTGTCTAGCGACTATTTCAATCCCATTTTCCTGTAAAATCACATTTCTGTGACCATGACCACTAAC------------CGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGTCTACATTGAATGGCGAA---TC----------------ATTACCGAGTT-AAAAAAAG---GC-AA-----G-----CAGCAGAA-----TTAACGACAAA------GCT--GTAAAATGCAATCCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACAATATCGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCT--CTTTTCCAGGCGTCTTCCTGCTGGCG--------------CGCATACAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTAATTGGTTGATTGAAATATT--GCT-----TTGT-------GTATGCGTA-GATA--TCAACACCAAGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTGGAATATTTCG-TGTACA-A--TTTGT--CG----cttaataa
gi|7 : TACAA--TTTGTC-GGGATTAGCTA-----------TTTTTCAGATAATTGGATAACAAATATAAAATACTTGAGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAAAACAACTGCAATATGTAGTAAGAATTAACGT-TTTATGTTTTAACAAGTAATTATGGCGAGT-AAATAAG-TTTTT-------TAACTTTAAATTTTGATATCTTG-ATCATTCAATTTTCGATCCCATCATTTGTCGAAGAGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTACTCTA----TCTTCAAAATAAACAATT------A----AACA-AATCAAGGTTTCCTACATA-AACTG--------------------AACATACAAAATAAACAGT-------------TTA-------GGTACTTTGAAAGTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGAA-------TATCCTAGTT--AAGG-AATTCGTACAAATGCCTCACCAGTACGATTACGCAA----------CCCTATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTAATGGGC--CCCGCTTCC-TGGCTGCGggattagctatttttcagataattggataacaaatataaaatacttgagttgttctttttgttttaaaaacaactgcaatatgtagtaagaattaacgttttatgttttaacaagtaattatggcgagtaaataagttttttaactttaaattttgatatcttgatcattcaattttcgatcccatcatttgtcgaagagactagtcattacaaaaaagtactctatcttcaaaataaacaattaaacaaatcaaggtttcctacataaactgaacatacaaaataaacagtttaggtactttgaaagtttccaccaaatttataatactacattttgaatatcctagttaaggaattcgtacaaatgcctcaccagtacgattacgcaaccctatgatcaaattctagaagcattcctaatgggccccgcttcctggctgcgcccaat
gi|8 : gctctactagtaacatgttcagataaaacctgtctagcgactatttcaatcccattttcctgtaaaatcacatttctgtgaccatgaccactaaccgcaaaattacgtctcaatctgtctacattgaatggcgaatcattaccgagttaaaaaaaggcaagcagcagaattaacgacaaagctgtaaaatgcaatccattaaaaggcgcaaatatttcacaatatcggtggaaattgcctaaaaccatctttgctcttttccaggcgtcttcctgctggcgcgcatacaaataatgtaaacatcacgtgacaagattagcacatttaattggttgattgaaatattgctttgtgtatgcgtagatatcaacaccaagtgacgaggtcagcacctttgattggttgctggaatatttcgtgCTGCTAGAGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAAAAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGTACA-----TTTGATTGGTTGATTGAAATAAC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATG--TAAACATCACGTGACCAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCGTCAA-ATTTCG-TTCAAA-A--TTTGT--TGGGACTA--G-CTAGTAcccaat
gi|8 : AAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGATATTTGGTAAACAAATATAAAATACTTGCTTTGCTC--TTTTTGCTCTAAATACTACTACAATATGTAGTTAGAATAAATGT-ATTATGTTCTAACCTGCAACAATAGCGAAT-AAATTAG--TTATCAAGGCCTAATTTT-ATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCACTTTTCGATCCATTGATTTGTCTAAAGGAATA--CA-TAC--AACTGAAAATA-------------CAAAATGAACAATT------A----Attatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaatacatacaactgaaaatacaaaatgaacaattaatgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|8 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATGAACAAT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTACCAAAAAATTTAT-AATACTACAATT-GTA-------TATCCTAGTA--ACTG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTA-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGT--CCtgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|9 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcaaaatttgttgggactagctagtattatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaaTGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACCTTTGATTGGTTGCTAAAA-ATTTTG-T
gi|9 : CTAAAAATTTTGTA-GGGACGAGCTTGTATAAT--GATTTTTCAGATATTTGGAGAATAAATATAAAATACTTGCGTTGTTT--CTTTTATTTTAAA-----CGACAATGTGTAGTAGGAATCAACGT-ATTATGTTCTTACTTGTAATAATGGCGAAC-AAATCAA-TTTTCCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATTTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTTAAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCCA----CCTTCAAAATAAACAATT------ATATTAAAA-AATAAAGGTTTCCAACATACAACTT--------------------AAAATACAAACTATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTTTCTACCATATTTA-TAATACTACATTTTGTATTATTTTTATCCTAGTTAAAAAA-AATTCGTACAAATG-CTCCCCAATACGGTTACGTAA----------CCCCAT-TTCAAAATTCTAAAAGCATTC---TTACTGGGT--CCCGTCTCA-TGGCAGCGagggacgagcttgtataatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CGATTAAAACAATTATATTCGGAACTAATGGTAGTCCCATTTTTTCGGTGTACAAATGAAACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTCTATGAATTGATCTAGTGCATATTGTTAGAAGTTTGCCAAATGATATGGCACTGTCCG
Unaligned ( gi|42 ): TAATTTCCAATAAAAAAAAATGTAGGTGTAAAATGCGGACTTT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333 111 444444444444444444444444 111111111 11111 1111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 11111111111 22222222222222222222 1111111111111 22 1111111111
lowQualScore : 3 55 0 11111111111111 4 4 555 555 555 3 3 555 3 333333333333333333333333 999999 44 0 777777777 4 0 0 00000 55 3 3 44 5 2 3 44 44 4444 33 33 1 2 55555 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 444 0 2 44 3 1 44 33 1 2 2 2 3 0 0 3 2 000 3 1 6666 11111111111 6 1 55555555555555555555 6666666666666 9999999 0 55 8888888 33 2 0000000000 5 444 33 3
lowQualScore : . .. . .............. . . ... ... ... . . ... . ........................ ...... .. . ......... . . . ..... .. . . .. . . . .. .. .... .. .. . . ..... .......................................................................... . ... . . .. . . .. .. . . . . . . . . . ... . . .... ........... . . .................... ............. ....... . .. ....... .. . .......... . ... .. .
lowQualScore : 6 22 7 55555555555555 0 0 222 888 888 3 1 888 3 777777777777777777777777 666666 66 7 888888888 4 7 5 00000 55 4 1 22 3 7 1 22 66 2222 99 11 4 2 33333 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 000 4 1 66 3 5 66 77 2 9 9 5 1 8 6 1 8 333 1 6 5555 33333333333 7 0 00000000000000000000 9999999999999 3333333 4 55 7777777 77 7 9999999999 0 777 99 3
consensus : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----TT---------AC---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
Reference ( family-5234 ) : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----TT---------AC---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|1 : CAAGAAATTAACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTCTTT--AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGTGCAACTTTATCTTCACCAGTTGCTCTACCAACAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTTTCGCCTACTTCAGTCCCGTTTTCCG----------------GTGACCTTGACCACTTACTTCATTCAATACCGCAAAA-CTACATCTAAGTCTGCTTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATA--CGACATTACCGAGCT-GGAAAAAG---GC-AAGCAACG-----CA-----A-----TTATGGACAAA------GTA--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATAATCCACACCCTTGGTGGAAATTGGTTAATA---------C-CATCTTAGCTTTCTTTTACGCGCGTCTTCCTGCTAGCACGTATTGAAGTACCTCCATGCAAATAATGTGAACATCACGTGACAAGAATAGCACA-----TTTGATTTGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCTGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATATCG-TGCCAA-A--TTTGT--TG----TA--ATCTGGTAC--CCTGCC-CAATTTCA-----TT---------CC---------------T-----------TT-------A-----------------C--------TCT-CC--ATT-AC-GA-AGGACATTGGCCAGGATACCAGACT-AAA--TTTGTT-GTCACTAGCTTGTATAAT--AACTTTTCAGATATTTGAAGAAC-AATATTAAATACTTCCGTTGTT---------------------CTACAATATGTAGTAAGAACTAACAT-ATTATGTTCTAACCGGTAATAATGGCGAATAAAATAAG-TTTTTCAAGTCCAAATTTTAATTTTTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCAATCCCTTGATTTGTCTAAGGGAATAGTCATTAC---AA-AAAAGTAATCTA----CCTCCAAAATTAACAATT------A----AAAC-AAT--ATGTTTCCTACATACAACTG--------------------GAAATACAAAATATACAGTAATATATACAGTATAG-------TGTACTTGCAAAATTCTTACCAACTTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATAAAAGTT--AAAG-AATTCATACAAATGCCTCGCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCCGTCCTA-TGGCGGCG
gi|10 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatgAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGAATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCATTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATGTTCTAACCTGTTATAATGGCGAAT-TAATAAG-TTTTTCAAGCACTACTTTTAA-TTTTGATCTCTTGTATTAT-----------TCCCTTGATTTCTCTAAGAGATTAGTCATTAC--AAA-AACAGTATTATACAGTCCTTCAAAACAAACAATT------A----AAAATAATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AATATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGAACATTGAAATTTTCCACCAAACTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCCAAGTT--AAAG-AATTTGTACAAATATCTCCCTTATGTGGTTACACAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCTGCCTCA-T-GTGGCGccg
gi|11 : TTGATTGGTTGCTTGAACATTTCG-TGCAAA-AATTTTTT--TGGGACTA--G-CTAGTAT--TATG-----ACTT-------TT----------C---------------A-----------GA-------A-----------------ATT------TGG-AG-----AACGGATATAAAATcccaataa
gi|11 : AAAA--TTTTTTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGAAATTTGGAGAACGGATATAAAATACTTGCAATGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAAATATGTTTTAACCTATAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCATAATTTTAAATTTTAATCTCTTG--CTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAA-TATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAATAAATAAGGTCTCCTACATACAAATG--------------------AATATACAGAATAAAGAGT-------------TAA-------GGTACTAGGAAACTTTTAACCAAATTTA-TAATAATACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGTCTCCCCAATATGGTTACGCGA----------CGCCATGCTC-acttgcaatgttctttttgttttaaatacaactacaatatgtagtaagaattaacgtaaatatgttttaacctataataatggcgaataaataagtttttcaagccataattttaaattttaatctcttgctattcaattttcgatcccttgatttgtctaagggactagtcattacaaaaaaatattctaccttcaaaataaacaattaaaaataaataaggtctcctacatacaaatgaatatacagaataaagagttaaggtactaggaaacttttaaccaaatttataataatacattttgtatatcctagttaaagaattcgtacaaatgtctccccaatatggttacgcgacgccatgctc
gi|12 : ttgattggttgcttgaacatttcgtgcaAAATAATTGCGTTGTTT--CTTTTGTTTTAAATACAACTACAATTAGTAGTTAGAATTGACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATCAG-TTTT-CAAGCCCATATTATAATTTATGATCACTTG-ATTATTCAATTTTTGATTCCTTGATTTGTTTAAGGGACTAGTCATTCC--AAA-AAAAAT---CTA----TTTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATCAAGGTTTCCTACATACAAATA--------------------AAAATACAAAATATATAGT-------------TAAGGTGCAATGTACTTGGAAAGTTTCCATCAAATTTAT-AATACTACATTTTATA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCAAGTACGGTAACTCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGC--CCCGTCTCA-TGCCGGTG
gi|13 : ACTAGATTAGCACATTTGACTGGGTGATTGAA-ATATCGCTG--------TGTGT--TG----TATAGTCTGGTAC--CCTGTC-CCACTTAA-----TT----------C---------------C-----------GT--------------------------------------------TA-CTGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTATCAGACTAccctataaaag
gi|13 : GTATGCATA-AATA--TAAATATCACGTGACGAGATAAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-AGTTCG-TGCAAC-A--TTTGT--TT----T---GTCTtgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtAACA--TTTGTT-TTGTCTAACTAGTGTAATATGACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACATGCGTGGTTTCATTTTTaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcTTTTCCATCATATTTAT-AATACTAAATTTTGTA-------TATATTAGTT--AAAG-AAGTCTTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATACTC-AAATTCTTGAAGCATTC---CTA--------CCTTCCTCA-TGGCGGCGtccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|14 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattCAGGATATTTACTTCTACA-GCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTATGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTTGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TTAC-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTCCCGGTAAAATCACATTCCTGTGATCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAA-TTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTTTAT-CGACATTACCGAGCTGGAAAAAAG---GC-AATCAACG-----CA-----A-----TCAATGACATA------GCT--GTAGACTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATATTTCACACCccc
gi|15 : catgtcaatgCTACTAGCAACATG-------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTGCAGTCCCATTTTCTGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGATCGCTAACTTCATTCATTACCGTAAAATT-AAGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---CTTG---CTATAT-CGACATAACCAAGCT-GA----------C-A------------TA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCACATATTTTACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCATCTTCCTGCTAACGT
gi|16 : CAGGAAATTTATTTCTACGTGCACCTTTT-GCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGAAAGCATGATTTGAATGTGC
gi|16 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgTTCCAATATCCGGTAAAATGACATTCCTGTGTCCTTGACCACTACCTCCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAGTGTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATAACCGAGCA-GCAAAAAG---GC---------------------------TCAA-AACATG------GTTTCTTACA-TACAAAttccaatatccggtaaaatgacattcctgtgtccttgaccactacctccattcattaccgcaaaattacgtctcagtgtgcctacattgaatggcgaatctgctatatcgacataaccgagcagcaaaaaggctcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|17 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgcaggaaatttatttctacgtgcaccttttgcgttttttagtttatccaaagaaagcatgatttgaatgtgcCACGCGTCTTCTTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCACATGCAAATAATGTAAACATCACATGACGAGATAAGCACA-----TTTAATTGGCTAATTGAAATATCTCGCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACGTAACGTGACGAGGTCAGCACGTTTGATCGATTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTACC-CAACTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------A--------TG
gi|18 : CATTCCCAAACT-GAAAAAAG---GCTAATAGT-G-----CA-----A-----CTAACGCCATT------GCT--GTACATTGCATGCCCCCATAGGGCAAAAATATTTTAGAACCTTGGTGGAAATTCCCCAGAA---------CACCTCTTtgaacattagatattgatag
gi|19 : atcagtgtgagatagatagcgaaattgctgcattggttgcataacatgtgcgtacaaattgttcccttcatacaaaatgcaatcaacatcaacggctgttatagccgaaaaagagtCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTCCCGTTTT---AGTTTATCCAAAGTAAGCCTGATTTGAATGC--AACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTATAACA-------CA--TATTTCGATCCCATTCTaccattgttattgtt
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-tgttctttttgttttaaatacaactacaatatttagtaagagttaacgaattgtgttccaacctgtaataatggcgaat
gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaggaaatttacttctacgtgcaccttttcccgttttagtttatccaaagtaagcctgatttgaatgcaactttatctcgaccagttgctctactagcaacatttcaggtataacacatatttcgatcccattcCAGGAAATTTACTTCTACGAGCACCCTTTTGCGTTTTAC-AGTTTATCCAAAATAAGCATGATTTCAATGTGCAACTTAATCTGGACCAGTTGCTCTACTAGCAACTT--------------TT-C-AGATAAAACATGTCTATCACCTACTGTAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACTTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAAT------CTTAGTCTATCTACATTGAAGGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGATATTAACGAGTT-GAAATAAG---GC-AATCAGCG-----CA-----A-----CTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCACATATTTCACCCCCTTGGTGGAAATTGCCTACAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTAACAAGATAAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCAGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAAGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-GAATTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------A--------TTC-TC--TATTAC-GA-AGGACCTTGGGCAGGGTACCAGACT-AAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATTAC--GGCTTTT-AGATGTTTGAAGAACAAGTATGAAATACGTGCGTTTTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAACATATAGTAAGAATAAACGT-ATTATGTGCAAACCTGTAATAATGACGAAT-AAATTAG-TTTTTAAGGC----AT----GTTTTTAATCTCAAA-ATGTTTAGATTTTCGATGCCTTGGTGTGTCTAAGAAAGATGTCATTACAAAAA-AAAAGTGTTCTA----CCTTCAAAATAAAAAAAT------A----AAAA-AACTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATAGAGT-------------TAA-------TGTACTGGGGAAAGTTTCAACAAATTTA-TAATACAACATTTTGTA-------TATCGTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGC------------------------AATTCTAGAA--------------GGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|20 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaataTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTTCAAGTCTTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ACTATACAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTTAA----C--TCAAAATAAACACTTCAAGTAG----AAAA-AAGTAAGGTTTCCTACAAACAACcacaata
gi|21 : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATTCAAAGTAAGTATGATTTGATTGCGCAACTTTTTCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAA-AT--------------TT-C-AGGTTAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATGTTCCGATAAA
gi|22 : tttcacttgattacgcgatttcacatgttgatgGGTTTCTTACATACAAATG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGGAAATTTTCACCAAATTTAT-AATACTGCATTTTGTA-------TATCTTAGTT--TAAG-AATTAGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGTAGCATTC---CTACTAGACCACTCGCTACATTGGCGcattgaccacta
gi|23 : at---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACAGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAta
gi|24 : -------TGTACTTGGAAATTTTACACCAAATCTAT-AATACTATATGTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-ATTTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCGaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|25 : TTATTACCACAAAAATTACGT----------------TGAATGACGAA---TCTGTAGCTATAT-CGACATTACCCGGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACGCAATTAACGAAATA------GTT--GTACAATGCAAACCATTAAAAGGTGCAAATATTTCACACCTTTGGTGGAAATTGCCTAAtccaat
gi|26 : TCCTGTGACTTTGACCACTAACTTAATTCATTACGGCAAA-TTTACGTATCAATCTGCCTACATTGAATATCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAA
gi|27 : atttctatctcatctttttatttcattaaA--GTCTGGAAC--CCTGCC-CAAC---A----------------A----------------------------GT-------A-----------------A--------TGA-AACCAG----AGA-ATGAAGTAGTGCAGGGTACTAGACTA
gi|28 : acacaatgtgtgccttcttcCAGGAAATTTACTTCTATGTGCACCTTTT-GCGTTGTTT-AGTTTGTCCAAAGTAAGTATAATTTGAATGTGAAAttattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|29 : tttcacttggtgactcgattacacatgtcattgCTGGTAC--CCTATC-AAACTTCA-----TT---------GC---------------CT----------GT-------G-----------------A--------T-----------CCGGA-AAGAAA-TAGACAGGGTACCAGACT
gi|3 : CAGGAAATTTACTTCTACTTGCACCTTTTT-------TT-AGTTTATCCAAAGTAAGTAGGATTTGAATGTGCAATTTTTTCTCAACCAGTTACTCTACTGGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGCCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTTCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGACTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----TA-----A-----TTATCGACAAA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCATATATTTCACACCCGTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCTCATGCAAATAATGTAAACATCACATGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATT--GCTGTATGTTGTCGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGATGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTTA-----TTAA-------AA---------------A-----------GT-------A-----------------A--------TGGTAG--AGTAACAGA-ATGAAGTTGGGC-----ACCAGACTAAAT--TTTGTT-GGGACTTGCTAGTATAAT--GACTTTTCATATATTTGGAAAACAAATATAAAATACTC-TATTGTTC--TTTTTATTTTAAATTCAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATATTCTAACCTGTTGTAATGGCAAAT-AAATAAG-TTTTTTAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTGC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTTAAAGTAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGACATTTTCCACCAAACTTATTAGT-CTACATTTTGTA-------TATCTAAGTT--TAAG-AATTTGTACAAATGCCTCCACAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtgcacatatatattaacatgtatgtatatatgtatctatgt
gi|30 : CTTCA-----TA---------ACGAAGA----------T-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGCCAGGGTACCAGACTA
gi|30 : ----TA--GTCTGGTAC--CCTGGC-CAACTTCATTCCGTT---------ACTCTCCATTACATCTTC-----------GT-------T-----------------A--------TGA-AG--AGGAACGCT-ATGAAGATGGCCAGGA-ACCAGACaggaacgctatgaagatggccaggaaccagac
gi|31 : TCTGGTACTTCATTCCGTTACTCCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGTAACGGA-ATGAAGTTGGGAAGGGTACCAGAC
gi|32 : cctggtaccttgct--GTCTGGTAC--CCTACC-CTACTCCA-----TTCTGTTACTCAC---------------C-----------ATTAGG---A-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTGGGGCAAGGTACCAG
gi|33 : CTGGTAC--CCCGAC-CAACTTCA-----TTCCGTT----AC---------------CCTCCATGTAATGT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGATACC
gi|34 : TGGTAG--CCTGGC-CATCTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------ATCTCTCCATTATTACTAA--------TGG-AG--AGTAATGGA-ATGAAGTTGGGAAGGA-ACCA
gi|35 : --GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTCCA-----T----------AC---------------C-----------GTGTTATGAA-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ACGGAGGTGGGCAGGGTACCAGACTA
gi|36 : TGGTAC--TCTGCC-CAACTTTA-----TT---------CCGTTTCTCTCCATTT-C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGGAATGGA-ATAGAGTTGGACAGGGTACC
gi|37 : --GTCTGGTAC--CCTGCA-AAACTCCT-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------CCTCCCCTTTGG-AG--AGTAACGGA-ATGGAGTTGGGCAGGATACCAG
gi|38 : TCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---TTACTGGAC--CCCGC
gi|39 : TCTGGTAC--CCTGTC-AAACTTCA-----GT----------C---------------CTTT--------AT-------A-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAATTGGGCATGGTACCAGA
gi|4 : CAGGAAATTTATTTCTATGTGCATCTTTTTGCTTTTTTTTAGTTTGTCCAAAGTTAGTATGATTTGAGTGTGCAACTTTATCTCGACTAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-TTAGG-AAAACATGTCTGTCTCCTATTTCAGTCCATTTTTCCGGTAAAATCACATTC-TGTAACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAACATT-ACGTCTAAATCTACCTACATTCAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAA-G---GC-AA-----GAAACGCA-----A-----TTAACGACGTACGAGTAGTT--GTGCATTGTAAACCATTAACAGGCGCAAATATGTCACACTCTTGGTGGAAACAGCCTAAAA---------C-CATATTTGCTTTATTTTCCACGCGTCTACCTACTAGCGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACACGATTAGCACA-----TTTGCTTGGCTGATTGAAGTACC--AATGTGTGTTGTG
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATG--TAAACATCACGTGACACGATTAGCACATTTGCTTGGCTGATTGAA------G-TACCAATG--TGTGTTGTG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-CAACTTTG-----TT---------------------------------------T----------------------------------T--------GTTACTTA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcCGTATGCATA-AATA--TAAAGATCTCGTGACGAGGTAAGCACCTTTGGTTGGTTACTTCAA-ATTTCG-TGCAGA-A--TTTGT--TG----tgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgAGAA--TTTGTT-GGGACTAGCT---------------------T-TTTGGAGAGGAAACATAAAATGTCTGCGTGGTTT--CTTTT-TTTAAAATACAACTACAATATGTCGTAAGAATTAACGT-ATTATATTCTAATCTGTAATAA--------------AG-TTTTTCAAGCC---ATT-------------------------CAATTTTCGAACCCTTGATTTGTCTAAAGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT-----------AAAC-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTA--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTGTCCACCATATTTA-CAATATTAAATTTTATG-------TATGCTAGTA--AAAG-AATTCTTACAAATGGCTCCCCAATACGGTTACGCCA----------CCCAATGCTCTAAACTTTAGAAGCATTC---ggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|43 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcCTTTGACCACTAACTTCTTTCATTACCGCAAAG-TTATGTCTCatggcggcgcccaata
gi|5 : GTTGCTCTACTAGCAACATGTTCTAATGACATGTC-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTGAGTCCCATTTTCAGATAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGTGAA---TCTG---CTATGTTCGACATTACCAAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACACAATTAATGACATA------GTT--GTACATTTCAAACCATTTAAAGGC--AAATATTTCACAACCTTGGTGGAAATTGCCTAAA----------C-CATCTTTGCTTTCTTTCCCGCATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGCACATTAATTTTGATTGGCTGATTGAAATATC--AC--TGTGTTGTGGAACTCGTATGCATA-AATA--TAAACAT-A---GACGAGGTCAGCACTTCTGATTGGTTGCTTGTA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTG
gi|5 : AAAA--CTTGAT-AGCACTAGCTAGTATAAT--GACTTTCCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTGGGGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATTCAACTACAATATGTTATACGAATTAACGT-ATTATGTTTTAACCTGTAATACTGGTGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTGATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAATTT-CGATCCCCTGATTTGTC-------------ATTAC--AA------------TA----CTTTCCAAATAAACCAT-------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTGAAACTTTCAGGTTTACTTTCAAAGTACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACATGGAAATTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCC----T--AAAG-AAATCGTACAAATGCCTCCCCTAAACGGTTATGCAACCCCATGCAACCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCCTTC---CTAGTGGAC--CCTGCTACA-TGGCGGTGatagcactagctagtataatgactttccagatatttggagaacaaatataaaatactggggttgttctttttgttttaaattcaactacaatatgttatacgaattaacgtattatgttttaacctgtaatactggtgaataaataagtttttcaagccctgattttaatttttgatctcttgatttttcaatttcgatcccctgatttgtcattacaatactttccaaataaaccataaaaaaattaaggtttcctacatacaactgaaactttcaggtttactttcaaagtacaaaatatacagttaatgtacatggaaattttccaccaaatttataatactacattttgtatatcctaaagaaatcgtacaaatgcctcccctaaacggttatgcaaccccatgcaaccccatgctcaaattctagaagccttcctagtggaccctgctacatggcggtgcccaaaa
gi|6 : gttgctctactagcaacatgttctaatgacatgtccaggtaaaacatgtctatcacctatttgagtcccattttcagataaaatcacattcctgtgaccttgaccactaacttcattcattaccgcaaaattacgtctcaatctgcctacattgaatggtgaatctgctatgttcgacattaccaagctgaaaaaaggcaagcaacacaattaatgacatagttgtacatttcaaaccatttaaaggcaaatatttcacaaccttggtggaaattgcctaaaccatctttgctttctttcccgcatgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcatgtgacaagattagcacattaattttgattggctgattgaaatatcactgtgttgtggaactcgtatgcataaatataaacatagacgaggtcagcacttctgattggttgcttgtaatttcgtgcCTGTCTACATTGAATGGCGAAATGTCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAGGCAAGC-AAC----G-----CA-----A-----TTCACGACATA------ACT--GTACATTGCAATCCATTAAAAGACGCAAATATTTTACACACTTTGTAGAAATTGCCTAAAATTCCCCTTAC-CATCTTTGAGTTCTTTTCCGCACGTTTTCCTACTAACGTGTGTTGAAGAACCCTTATGCAAAATATGTTAACATCACGTGACAATATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GC--TGTGTTGTGGAACCCGTATGGA-A-AATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACATTTGATTGGCTGATTGAA-ATATCG-cccaaaa
gi|6 : TGTGTTGTGGAACCCGTATGGAAAATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTG--TTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTCAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TGTGT--Tctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcaaaatgtgtttggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|6 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgcAAAA--TGTGTT-TGGACTAGCTAATATAAT--GACTTTTCAGATATTTGCAGAACAA-TAAAAAATACATTCATTGTTG--TTTTT--TTTAAATACGACTAAAATAAGTAGTAAGAATAAACGT-TCTATGTTCTAACCTGTAAAAATGGCGAAT-AAATTAG-ATTGTCAAGGTCTAATTTTAATTATTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCGATACCTTGATTTTTCTTAGGGACTAGTCATTAC--ATG-AAGAGTATTCTA----CCGT-AAAACAAACAATT------A----AAAA-ATTCCAGGTTCCCTACATACAACTG--------------------AAAATATAAAATATACAGT-------------TAA-------AGTACTTGGAAGTTTACCACCAAATTTATT-ATACTACACTTTGTA-------TATTCTAGTT--AAAGAAATTCG----------TCCCCAATAC---------A----------TCCCATGCTC-GAATTCTAAAAGCATTCCTACTACTAGTC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|7 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatggaaaatatgtaaacaccacttgacaagatcagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcGCTCTACTAGTAACATG-------------TT-C-AGATAAAACCTGTCTAGCGACTATTTCAATCCCATTTTCCTGTAAAATCACATTTCTGTGACCATGACCACTAAC------------CGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGTCTACATTGAATGGCGAA---TC----------------ATTACCGAGTT-AAAAAAAG---GC-AA-----G-----CAGCAGAA-----TTAACGACAAA------GCT--GTAAAATGCAATCCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACAATATCGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCT--CTTTTCCAGGCGTCTTCCTGCTGGCG--------------CGCATACAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTAATTGGTTGATTGAAATATT--GCT-----TTGT-------GTATGCGTA-GATA--TCAACACCAAGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTGGAATATTTCG-TGTACA-A--TTTGT--CG----cttaataa
gi|7 : TACAA--TTTGTC-GGGATTAGCTA-----------TTTTTCAGATAATTGGATAACAAATATAAAATACTTGAGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAAAACAACTGCAATATGTAGTAAGAATTAACGT-TTTATGTTTTAACAAGTAATTATGGCGAGT-AAATAAG-TTTTT-------TAACTTTAAATTTTGATATCTTG-ATCATTCAATTTTCGATCCCATCATTTGTCGAAGAGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTACTCTA----TCTTCAAAATAAACAATT------A----AACA-AATCAAGGTTTCCTACATA-AACTG--------------------AACATACAAAATAAACAGT-------------TTA-------GGTACTTTGAAAGTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGAA-------TATCCTAGTT--AAGG-AATTCGTACAAATGCCTCACCAGTACGATTACGCAA----------CCCTATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTAATGGGC--CCCGCTTCC-TGGCTGCGggattagctatttttcagataattggataacaaatataaaatacttgagttgttctttttgttttaaaaacaactgcaatatgtagtaagaattaacgttttatgttttaacaagtaattatggcgagtaaataagttttttaactttaaattttgatatcttgatcattcaattttcgatcccatcatttgtcgaagagactagtcattacaaaaaagtactctatcttcaaaataaacaattaaacaaatcaaggtttcctacataaactgaacatacaaaataaacagtttaggtactttgaaagtttccaccaaatttataatactacattttgaatatcctagttaaggaattcgtacaaatgcctcaccagtacgattacgcaaccctatgatcaaattctagaagcattcctaatgggccccgcttcctggctgcgcccaat
gi|8 : gctctactagtaacatgttcagataaaacctgtctagcgactatttcaatcccattttcctgtaaaatcacatttctgtgaccatgaccactaaccgcaaaattacgtctcaatctgtctacattgaatggcgaatcattaccgagttaaaaaaaggcaagcagcagaattaacgacaaagctgtaaaatgcaatccattaaaaggcgcaaatatttcacaatatcggtggaaattgcctaaaaccatctttgctcttttccaggcgtcttcctgctggcgcgcatacaaataatgtaaacatcacgtgacaagattagcacatttaattggttgattgaaatattgctttgtgtatgcgtagatatcaacaccaagtgacgaggtcagcacctttgattggttgctggaatatttcgtgCTGCTAGAGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAAAAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGTACA-----TTTGATTGGTTGATTGAAATAAC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATG--TAAACATCACGTGACCAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCGTCAA-ATTTCG-TTCAAA-A--TTTGT--TGGGACTA--G-CTAGTAcccaat
gi|8 : AAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGATATTTGGTAAACAAATATAAAATACTTGCTTTGCTC--TTTTTGCTCTAAATACTACTACAATATGTAGTTAGAATAAATGT-ATTATGTTCTAACCTGCAACAATAGCGAAT-AAATTAG--TTATCAAGGCCTAATTTT-ATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCACTTTTCGATCCATTGATTTGTCTAAAGGAATA--CA-TAC--AACTGAAAATA-------------CAAAATGAACAATT------A----Attatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaatacatacaactgaaaatacaaaatgaacaattaatgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|8 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATGAACAAT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTACCAAAAAATTTAT-AATACTACAATT-GTA-------TATCCTAGTA--ACTG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTA-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGT--CCtgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|9 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcaaaatttgttgggactagctagtattatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaaTGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACCTTTGATTGGTTGCTAAAA-ATTTTG-T
gi|9 : CTAAAAATTTTGTA-GGGACGAGCTTGTATAAT--GATTTTTCAGATATTTGGAGAATAAATATAAAATACTTGCGTTGTTT--CTTTTATTTTAAA-----CGACAATGTGTAGTAGGAATCAACGT-ATTATGTTCTTACTTGTAATAATGGCGAAC-AAATCAA-TTTTCCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATTTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTTAAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCCA----CCTTCAAAATAAACAATT------ATATTAAAA-AATAAAGGTTTCCAACATACAACTT--------------------AAAATACAAACTATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTTTCTACCATATTTA-TAATACTACATTTTGTATTATTTTTATCCTAGTTAAAAAA-AATTCGTACAAATG-CTCCCCAATACGGTTACGTAA----------CCCCAT-TTCAAAATTCTAAAAGCATTC---TTACTGGGT--CCCGTCTCA-TGGCAGCGagggacgagcttgtataatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CGATTAAAACAATTATATTCGGAACTAATGGTAGTCCCATTTTTTCGGTGTACAAATGAAACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTCTATGAATTGATCTAGTGCATATTGTTAGAAGTTTGCCAAATGATATGGCACTGTCCG
Unaligned ( gi|42 ): TAATTTCCAATAAAAAAAAATGTAGGTGTAAAATGCGGACTTT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333 111 444444444444444444444444 111111111 11111 1111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 11111111111 22222222222222222222 1111111111111 22 1111111111
lowQualScore : 3 55 0 11111111111111 4 4 555 555 555 3 3 555 3 333333333333333333333333 999999 44 0 777777777 4 0 0 00000 55 3 3 44 5 2 3 44 44 4444 33 33 1 2 55555 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 444 0 2 44 3 1 44 33 1 2 2 2 3 0 0 3 2 000 3 1 6666 11111111111 6 1 55555555555555555555 6666666666666 9999999 0 55 8888888 33 2 0000000000 5 444 33 3
lowQualScore : . .. . .............. . . ... ... ... . . ... . ........................ ...... .. . ......... . . . ..... .. . . .. . . . .. .. .... .. .. . . ..... .......................................................................... . ... . . .. . . .. .. . . . . . . . . . ... . . .... ........... . . .................... ............. ....... . .. ....... .. . .......... . ... .. .
lowQualScore : 6 22 7 55555555555555 0 0 222 888 888 3 1 888 3 777777777777777777777777 666666 66 7 888888888 4 7 5 00000 55 4 1 22 3 7 1 22 66 2222 99 11 4 2 33333 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 000 4 1 66 3 5 66 77 2 9 9 5 1 8 6 1 8 333 1 6 5555 33333333333 7 0 00000000000000000000 9999999999999 3333333 4 55 7777777 77 7 9999999999 0 777 99 3
consensus : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----TT---------AC---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
Reference ( family-5234 ) : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----TT---------AC---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|1 : CAAGAAATTAACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTCTTT--AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGTGCAACTTTATCTTCACCAGTTGCTCTACCAACAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTTTCGCCTACTTCAGTCCCGTTTTCCG----------------GTGACCTTGACCACTTACTTCATTCAATACCGCAAAA-CTACATCTAAGTCTGCTTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATA--CGACATTACCGAGCT-GGAAAAAG---GC-AAGCAACG-----CA-----A-----TTATGGACAAA------GTA--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATAATCCACACCCTTGGTGGAAATTGGTTAATA---------C-CATCTTAGCTTTCTTTTACGCGCGTCTTCCTGCTAGCACGTATTGAAGTACCTCCATGCAAATAATGTGAACATCACGTGACAAGAATAGCACA-----TTTGATTTGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCTGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATATCG-TGCCAA-A--TTTGT--TG----TA--ATCTGGTAC--CCTGCC-CAATTTCA-----TT---------CC---------------T-----------TT-------A-----------------C--------TCT-CC--ATT-AC-GA-AGGACATTGGCCAGGATACCAGACT-AAA--TTTGTT-GTCACTAGCTTGTATAAT--AACTTTTCAGATATTTGAAGAAC-AATATTAAATACTTCCGTTGTT---------------------CTACAATATGTAGTAAGAACTAACAT-ATTATGTTCTAACCGGTAATAATGGCGAATAAAATAAG-TTTTTCAAGTCCAAATTTTAATTTTTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCAATCCCTTGATTTGTCTAAGGGAATAGTCATTAC---AA-AAAAGTAATCTA----CCTCCAAAATTAACAATT------A----AAAC-AAT--ATGTTTCCTACATACAACTG--------------------GAAATACAAAATATACAGTAATATATACAGTATAG-------TGTACTTGCAAAATTCTTACCAACTTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATAAAAGTT--AAAG-AATTCATACAAATGCCTCGCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCCGTCCTA-TGGCGGCG
gi|10 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatgAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGAATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCATTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATGTTCTAACCTGTTATAATGGCGAAT-TAATAAG-TTTTTCAAGCACTACTTTTAA-TTTTGATCTCTTGTATTAT-----------TCCCTTGATTTCTCTAAGAGATTAGTCATTAC--AAA-AACAGTATTATACAGTCCTTCAAAACAAACAATT------A----AAAATAATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AATATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGAACATTGAAATTTTCCACCAAACTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCCAAGTT--AAAG-AATTTGTACAAATATCTCCCTTATGTGGTTACACAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCTGCCTCA-T-GTGGCGccg
gi|11 : TTGATTGGTTGCTTGAACATTTCG-TGCAAA-AATTTTTT--TGGGACTA--G-CTAGTAT--TATG-----ACTT-------TT----------C---------------A-----------GA-------A-----------------ATT------TGG-AG-----AACGGATATAAAATcccaataa
gi|11 : AAAA--TTTTTTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGAAATTTGGAGAACGGATATAAAATACTTGCAATGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAAATATGTTTTAACCTATAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCATAATTTTAAATTTTAATCTCTTG--CTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAA-TATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAATAAATAAGGTCTCCTACATACAAATG--------------------AATATACAGAATAAAGAGT-------------TAA-------GGTACTAGGAAACTTTTAACCAAATTTA-TAATAATACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGTCTCCCCAATATGGTTACGCGA----------CGCCATGCTC-acttgcaatgttctttttgttttaaatacaactacaatatgtagtaagaattaacgtaaatatgttttaacctataataatggcgaataaataagtttttcaagccataattttaaattttaatctcttgctattcaattttcgatcccttgatttgtctaagggactagtcattacaaaaaaatattctaccttcaaaataaacaattaaaaataaataaggtctcctacatacaaatgaatatacagaataaagagttaaggtactaggaaacttttaaccaaatttataataatacattttgtatatcctagttaaagaattcgtacaaatgtctccccaatatggttacgcgacgccatgctc
gi|12 : ttgattggttgcttgaacatttcgtgcaAAATAATTGCGTTGTTT--CTTTTGTTTTAAATACAACTACAATTAGTAGTTAGAATTGACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATCAG-TTTT-CAAGCCCATATTATAATTTATGATCACTTG-ATTATTCAATTTTTGATTCCTTGATTTGTTTAAGGGACTAGTCATTCC--AAA-AAAAAT---CTA----TTTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATCAAGGTTTCCTACATACAAATA--------------------AAAATACAAAATATATAGT-------------TAAGGTGCAATGTACTTGGAAAGTTTCCATCAAATTTAT-AATACTACATTTTATA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCAAGTACGGTAACTCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGC--CCCGTCTCA-TGCCGGTG
gi|13 : ACTAGATTAGCACATTTGACTGGGTGATTGAA-ATATCGCTG--------TGTGT--TG----TATAGTCTGGTAC--CCTGTC-CCACTTAA-----TT----------C---------------C-----------GT--------------------------------------------TA-CTGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTATCAGACTAccctataaaag
gi|13 : GTATGCATA-AATA--TAAATATCACGTGACGAGATAAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-AGTTCG-TGCAAC-A--TTTGT--TT----T---GTCTtgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtAACA--TTTGTT-TTGTCTAACTAGTGTAATATGACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACATGCGTGGTTTCATTTTTaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcTTTTCCATCATATTTAT-AATACTAAATTTTGTA-------TATATTAGTT--AAAG-AAGTCTTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATACTC-AAATTCTTGAAGCATTC---CTA--------CCTTCCTCA-TGGCGGCGtccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|14 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattCAGGATATTTACTTCTACA-GCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTATGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTTGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TTAC-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTCCCGGTAAAATCACATTCCTGTGATCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAA-TTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTTTAT-CGACATTACCGAGCTGGAAAAAAG---GC-AATCAACG-----CA-----A-----TCAATGACATA------GCT--GTAGACTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATATTTCACACCccc
gi|15 : catgtcaatgCTACTAGCAACATG-------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTGCAGTCCCATTTTCTGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGATCGCTAACTTCATTCATTACCGTAAAATT-AAGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---CTTG---CTATAT-CGACATAACCAAGCT-GA----------C-A------------TA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCACATATTTTACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCATCTTCCTGCTAACGT
gi|16 : CAGGAAATTTATTTCTACGTGCACCTTTT-GCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGAAAGCATGATTTGAATGTGC
gi|16 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgTTCCAATATCCGGTAAAATGACATTCCTGTGTCCTTGACCACTACCTCCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAGTGTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATAACCGAGCA-GCAAAAAG---GC---------------------------TCAA-AACATG------GTTTCTTACA-TACAAAttccaatatccggtaaaatgacattcctgtgtccttgaccactacctccattcattaccgcaaaattacgtctcagtgtgcctacattgaatggcgaatctgctatatcgacataaccgagcagcaaaaaggctcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|17 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgcaggaaatttatttctacgtgcaccttttgcgttttttagtttatccaaagaaagcatgatttgaatgtgcCACGCGTCTTCTTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCACATGCAAATAATGTAAACATCACATGACGAGATAAGCACA-----TTTAATTGGCTAATTGAAATATCTCGCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACGTAACGTGACGAGGTCAGCACGTTTGATCGATTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTACC-CAACTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------A--------TG
gi|18 : CATTCCCAAACT-GAAAAAAG---GCTAATAGT-G-----CA-----A-----CTAACGCCATT------GCT--GTACATTGCATGCCCCCATAGGGCAAAAATATTTTAGAACCTTGGTGGAAATTCCCCAGAA---------CACCTCTTtgaacattagatattgatag
gi|19 : atcagtgtgagatagatagcgaaattgctgcattggttgcataacatgtgcgtacaaattgttcccttcatacaaaatgcaatcaacatcaacggctgttatagccgaaaaagagtCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTCCCGTTTT---AGTTTATCCAAAGTAAGCCTGATTTGAATGC--AACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTATAACA-------CA--TATTTCGATCCCATTCTaccattgttattgtt
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-tgttctttttgttttaaatacaactacaatatttagtaagagttaacgaattgtgttccaacctgtaataatggcgaat
gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaggaaatttacttctacgtgcaccttttcccgttttagtttatccaaagtaagcctgatttgaatgcaactttatctcgaccagttgctctactagcaacatttcaggtataacacatatttcgatcccattcCAGGAAATTTACTTCTACGAGCACCCTTTTGCGTTTTAC-AGTTTATCCAAAATAAGCATGATTTCAATGTGCAACTTAATCTGGACCAGTTGCTCTACTAGCAACTT--------------TT-C-AGATAAAACATGTCTATCACCTACTGTAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACTTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAAT------CTTAGTCTATCTACATTGAAGGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGATATTAACGAGTT-GAAATAAG---GC-AATCAGCG-----CA-----A-----CTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCACATATTTCACCCCCTTGGTGGAAATTGCCTACAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTAACAAGATAAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCAGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAAGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-GAATTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------A--------TTC-TC--TATTAC-GA-AGGACCTTGGGCAGGGTACCAGACT-AAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATTAC--GGCTTTT-AGATGTTTGAAGAACAAGTATGAAATACGTGCGTTTTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAACATATAGTAAGAATAAACGT-ATTATGTGCAAACCTGTAATAATGACGAAT-AAATTAG-TTTTTAAGGC----AT----GTTTTTAATCTCAAA-ATGTTTAGATTTTCGATGCCTTGGTGTGTCTAAGAAAGATGTCATTACAAAAA-AAAAGTGTTCTA----CCTTCAAAATAAAAAAAT------A----AAAA-AACTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATAGAGT-------------TAA-------TGTACTGGGGAAAGTTTCAACAAATTTA-TAATACAACATTTTGTA-------TATCGTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGC------------------------AATTCTAGAA--------------GGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|20 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaataTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTTCAAGTCTTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ACTATACAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTTAA----C--TCAAAATAAACACTTCAAGTAG----AAAA-AAGTAAGGTTTCCTACAAACAACcacaata
gi|21 : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATTCAAAGTAAGTATGATTTGATTGCGCAACTTTTTCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAA-AT--------------TT-C-AGGTTAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATGTTCCGATAAA
gi|22 : tttcacttgattacgcgatttcacatgttgatgGGTTTCTTACATACAAATG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGGAAATTTTCACCAAATTTAT-AATACTGCATTTTGTA-------TATCTTAGTT--TAAG-AATTAGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGTAGCATTC---CTACTAGACCACTCGCTACATTGGCGcattgaccacta
gi|23 : at---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACAGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAta
gi|24 : -------TGTACTTGGAAATTTTACACCAAATCTAT-AATACTATATGTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-ATTTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCGaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|25 : TTATTACCACAAAAATTACGT----------------TGAATGACGAA---TCTGTAGCTATAT-CGACATTACCCGGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACGCAATTAACGAAATA------GTT--GTACAATGCAAACCATTAAAAGGTGCAAATATTTCACACCTTTGGTGGAAATTGCCTAAtccaat
gi|26 : TCCTGTGACTTTGACCACTAACTTAATTCATTACGGCAAA-TTTACGTATCAATCTGCCTACATTGAATATCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAA
gi|27 : atttctatctcatctttttatttcattaaA--GTCTGGAAC--CCTGCC-CAAC---A----------------A----------------------------GT-------A-----------------A--------TGA-AACCAG----AGA-ATGAAGTAGTGCAGGGTACTAGACTA
gi|28 : acacaatgtgtgccttcttcCAGGAAATTTACTTCTATGTGCACCTTTT-GCGTTGTTT-AGTTTGTCCAAAGTAAGTATAATTTGAATGTGAAAttattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|29 : tttcacttggtgactcgattacacatgtcattgCTGGTAC--CCTATC-AAACTTCA-----TT---------GC---------------CT----------GT-------G-----------------A--------T-----------CCGGA-AAGAAA-TAGACAGGGTACCAGACT
gi|3 : CAGGAAATTTACTTCTACTTGCACCTTTTT-------TT-AGTTTATCCAAAGTAAGTAGGATTTGAATGTGCAATTTTTTCTCAACCAGTTACTCTACTGGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGCCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTTCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGACTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----TA-----A-----TTATCGACAAA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCATATATTTCACACCCGTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCTCATGCAAATAATGTAAACATCACATGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATT--GCTGTATGTTGTCGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGATGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTTA-----TTAA-------AA---------------A-----------GT-------A-----------------A--------TGGTAG--AGTAACAGA-ATGAAGTTGGGC-----ACCAGACTAAAT--TTTGTT-GGGACTTGCTAGTATAAT--GACTTTTCATATATTTGGAAAACAAATATAAAATACTC-TATTGTTC--TTTTTATTTTAAATTCAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATATTCTAACCTGTTGTAATGGCAAAT-AAATAAG-TTTTTTAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTGC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTTAAAGTAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGACATTTTCCACCAAACTTATTAGT-CTACATTTTGTA-------TATCTAAGTT--TAAG-AATTTGTACAAATGCCTCCACAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtgcacatatatattaacatgtatgtatatatgtatctatgt
gi|30 : CTTCA-----TA---------ACGAAGA----------T-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGCCAGGGTACCAGACTA
gi|30 : ----TA--GTCTGGTAC--CCTGGC-CAACTTCATTCCGTT---------ACTCTCCATTACATCTTC-----------GT-------T-----------------A--------TGA-AG--AGGAACGCT-ATGAAGATGGCCAGGA-ACCAGACaggaacgctatgaagatggccaggaaccagac
gi|31 : TCTGGTACTTCATTCCGTTACTCCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGTAACGGA-ATGAAGTTGGGAAGGGTACCAGAC
gi|32 : cctggtaccttgct--GTCTGGTAC--CCTACC-CTACTCCA-----TTCTGTTACTCAC---------------C-----------ATTAGG---A-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTGGGGCAAGGTACCAG
gi|33 : CTGGTAC--CCCGAC-CAACTTCA-----TTCCGTT----AC---------------CCTCCATGTAATGT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGATACC
gi|34 : TGGTAG--CCTGGC-CATCTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------ATCTCTCCATTATTACTAA--------TGG-AG--AGTAATGGA-ATGAAGTTGGGAAGGA-ACCA
gi|35 : --GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTCCA-----T----------AC---------------C-----------GTGTTATGAA-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ACGGAGGTGGGCAGGGTACCAGACTA
gi|36 : TGGTAC--TCTGCC-CAACTTTA-----TT---------CCGTTTCTCTCCATTT-C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGGAATGGA-ATAGAGTTGGACAGGGTACC
gi|37 : --GTCTGGTAC--CCTGCA-AAACTCCT-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------CCTCCCCTTTGG-AG--AGTAACGGA-ATGGAGTTGGGCAGGATACCAG
gi|38 : TCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---TTACTGGAC--CCCGC
gi|39 : TCTGGTAC--CCTGTC-AAACTTCA-----GT----------C---------------CTTT--------AT-------A-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAATTGGGCATGGTACCAGA
gi|4 : CAGGAAATTTATTTCTATGTGCATCTTTTTGCTTTTTTTTAGTTTGTCCAAAGTTAGTATGATTTGAGTGTGCAACTTTATCTCGACTAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-TTAGG-AAAACATGTCTGTCTCCTATTTCAGTCCATTTTTCCGGTAAAATCACATTC-TGTAACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAACATT-ACGTCTAAATCTACCTACATTCAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAA-G---GC-AA-----GAAACGCA-----A-----TTAACGACGTACGAGTAGTT--GTGCATTGTAAACCATTAACAGGCGCAAATATGTCACACTCTTGGTGGAAACAGCCTAAAA---------C-CATATTTGCTTTATTTTCCACGCGTCTACCTACTAGCGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACACGATTAGCACA-----TTTGCTTGGCTGATTGAAGTACC--AATGTGTGTTGTG
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATG--TAAACATCACGTGACACGATTAGCACATTTGCTTGGCTGATTGAA------G-TACCAATG--TGTGTTGTG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-CAACTTTG-----TT---------------------------------------T----------------------------------T--------GTTACTTA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcCGTATGCATA-AATA--TAAAGATCTCGTGACGAGGTAAGCACCTTTGGTTGGTTACTTCAA-ATTTCG-TGCAGA-A--TTTGT--TG----tgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgAGAA--TTTGTT-GGGACTAGCT---------------------T-TTTGGAGAGGAAACATAAAATGTCTGCGTGGTTT--CTTTT-TTTAAAATACAACTACAATATGTCGTAAGAATTAACGT-ATTATATTCTAATCTGTAATAA--------------AG-TTTTTCAAGCC---ATT-------------------------CAATTTTCGAACCCTTGATTTGTCTAAAGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT-----------AAAC-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTA--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTGTCCACCATATTTA-CAATATTAAATTTTATG-------TATGCTAGTA--AAAG-AATTCTTACAAATGGCTCCCCAATACGGTTACGCCA----------CCCAATGCTCTAAACTTTAGAAGCATTC---ggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|43 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcCTTTGACCACTAACTTCTTTCATTACCGCAAAG-TTATGTCTCatggcggcgcccaata
gi|5 : GTTGCTCTACTAGCAACATGTTCTAATGACATGTC-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTGAGTCCCATTTTCAGATAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGTGAA---TCTG---CTATGTTCGACATTACCAAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACACAATTAATGACATA------GTT--GTACATTTCAAACCATTTAAAGGC--AAATATTTCACAACCTTGGTGGAAATTGCCTAAA----------C-CATCTTTGCTTTCTTTCCCGCATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGCACATTAATTTTGATTGGCTGATTGAAATATC--AC--TGTGTTGTGGAACTCGTATGCATA-AATA--TAAACAT-A---GACGAGGTCAGCACTTCTGATTGGTTGCTTGTA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTG
gi|5 : AAAA--CTTGAT-AGCACTAGCTAGTATAAT--GACTTTCCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTGGGGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATTCAACTACAATATGTTATACGAATTAACGT-ATTATGTTTTAACCTGTAATACTGGTGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTGATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAATTT-CGATCCCCTGATTTGTC-------------ATTAC--AA------------TA----CTTTCCAAATAAACCAT-------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTGAAACTTTCAGGTTTACTTTCAAAGTACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACATGGAAATTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCC----T--AAAG-AAATCGTACAAATGCCTCCCCTAAACGGTTATGCAACCCCATGCAACCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCCTTC---CTAGTGGAC--CCTGCTACA-TGGCGGTGatagcactagctagtataatgactttccagatatttggagaacaaatataaaatactggggttgttctttttgttttaaattcaactacaatatgttatacgaattaacgtattatgttttaacctgtaatactggtgaataaataagtttttcaagccctgattttaatttttgatctcttgatttttcaatttcgatcccctgatttgtcattacaatactttccaaataaaccataaaaaaattaaggtttcctacatacaactgaaactttcaggtttactttcaaagtacaaaatatacagttaatgtacatggaaattttccaccaaatttataatactacattttgtatatcctaaagaaatcgtacaaatgcctcccctaaacggttatgcaaccccatgcaaccccatgctcaaattctagaagccttcctagtggaccctgctacatggcggtgcccaaaa
gi|6 : gttgctctactagcaacatgttctaatgacatgtccaggtaaaacatgtctatcacctatttgagtcccattttcagataaaatcacattcctgtgaccttgaccactaacttcattcattaccgcaaaattacgtctcaatctgcctacattgaatggtgaatctgctatgttcgacattaccaagctgaaaaaaggcaagcaacacaattaatgacatagttgtacatttcaaaccatttaaaggcaaatatttcacaaccttggtggaaattgcctaaaccatctttgctttctttcccgcatgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcatgtgacaagattagcacattaattttgattggctgattgaaatatcactgtgttgtggaactcgtatgcataaatataaacatagacgaggtcagcacttctgattggttgcttgtaatttcgtgcCTGTCTACATTGAATGGCGAAATGTCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAGGCAAGC-AAC----G-----CA-----A-----TTCACGACATA------ACT--GTACATTGCAATCCATTAAAAGACGCAAATATTTTACACACTTTGTAGAAATTGCCTAAAATTCCCCTTAC-CATCTTTGAGTTCTTTTCCGCACGTTTTCCTACTAACGTGTGTTGAAGAACCCTTATGCAAAATATGTTAACATCACGTGACAATATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GC--TGTGTTGTGGAACCCGTATGGA-A-AATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACATTTGATTGGCTGATTGAA-ATATCG-cccaaaa
gi|6 : TGTGTTGTGGAACCCGTATGGAAAATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTG--TTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTCAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TGTGT--Tctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcaaaatgtgtttggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|6 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgcAAAA--TGTGTT-TGGACTAGCTAATATAAT--GACTTTTCAGATATTTGCAGAACAA-TAAAAAATACATTCATTGTTG--TTTTT--TTTAAATACGACTAAAATAAGTAGTAAGAATAAACGT-TCTATGTTCTAACCTGTAAAAATGGCGAAT-AAATTAG-ATTGTCAAGGTCTAATTTTAATTATTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCGATACCTTGATTTTTCTTAGGGACTAGTCATTAC--ATG-AAGAGTATTCTA----CCGT-AAAACAAACAATT------A----AAAA-ATTCCAGGTTCCCTACATACAACTG--------------------AAAATATAAAATATACAGT-------------TAA-------AGTACTTGGAAGTTTACCACCAAATTTATT-ATACTACACTTTGTA-------TATTCTAGTT--AAAGAAATTCG----------TCCCCAATAC---------A----------TCCCATGCTC-GAATTCTAAAAGCATTCCTACTACTAGTC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|7 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatggaaaatatgtaaacaccacttgacaagatcagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcGCTCTACTAGTAACATG-------------TT-C-AGATAAAACCTGTCTAGCGACTATTTCAATCCCATTTTCCTGTAAAATCACATTTCTGTGACCATGACCACTAAC------------CGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGTCTACATTGAATGGCGAA---TC----------------ATTACCGAGTT-AAAAAAAG---GC-AA-----G-----CAGCAGAA-----TTAACGACAAA------GCT--GTAAAATGCAATCCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACAATATCGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCT--CTTTTCCAGGCGTCTTCCTGCTGGCG--------------CGCATACAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTAATTGGTTGATTGAAATATT--GCT-----TTGT-------GTATGCGTA-GATA--TCAACACCAAGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTGGAATATTTCG-TGTACA-A--TTTGT--CG----cttaataa
gi|7 : TACAA--TTTGTC-GGGATTAGCTA-----------TTTTTCAGATAATTGGATAACAAATATAAAATACTTGAGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAAAACAACTGCAATATGTAGTAAGAATTAACGT-TTTATGTTTTAACAAGTAATTATGGCGAGT-AAATAAG-TTTTT-------TAACTTTAAATTTTGATATCTTG-ATCATTCAATTTTCGATCCCATCATTTGTCGAAGAGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTACTCTA----TCTTCAAAATAAACAATT------A----AACA-AATCAAGGTTTCCTACATA-AACTG--------------------AACATACAAAATAAACAGT-------------TTA-------GGTACTTTGAAAGTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGAA-------TATCCTAGTT--AAGG-AATTCGTACAAATGCCTCACCAGTACGATTACGCAA----------CCCTATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTAATGGGC--CCCGCTTCC-TGGCTGCGggattagctatttttcagataattggataacaaatataaaatacttgagttgttctttttgttttaaaaacaactgcaatatgtagtaagaattaacgttttatgttttaacaagtaattatggcgagtaaataagttttttaactttaaattttgatatcttgatcattcaattttcgatcccatcatttgtcgaagagactagtcattacaaaaaagtactctatcttcaaaataaacaattaaacaaatcaaggtttcctacataaactgaacatacaaaataaacagtttaggtactttgaaagtttccaccaaatttataatactacattttgaatatcctagttaaggaattcgtacaaatgcctcaccagtacgattacgcaaccctatgatcaaattctagaagcattcctaatgggccccgcttcctggctgcgcccaat
gi|8 : gctctactagtaacatgttcagataaaacctgtctagcgactatttcaatcccattttcctgtaaaatcacatttctgtgaccatgaccactaaccgcaaaattacgtctcaatctgtctacattgaatggcgaatcattaccgagttaaaaaaaggcaagcagcagaattaacgacaaagctgtaaaatgcaatccattaaaaggcgcaaatatttcacaatatcggtggaaattgcctaaaaccatctttgctcttttccaggcgtcttcctgctggcgcgcatacaaataatgtaaacatcacgtgacaagattagcacatttaattggttgattgaaatattgctttgtgtatgcgtagatatcaacaccaagtgacgaggtcagcacctttgattggttgctggaatatttcgtgCTGCTAGAGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAAAAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGTACA-----TTTGATTGGTTGATTGAAATAAC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATG--TAAACATCACGTGACCAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCGTCAA-ATTTCG-TTCAAA-A--TTTGT--TGGGACTA--G-CTAGTAcccaat
gi|8 : AAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGATATTTGGTAAACAAATATAAAATACTTGCTTTGCTC--TTTTTGCTCTAAATACTACTACAATATGTAGTTAGAATAAATGT-ATTATGTTCTAACCTGCAACAATAGCGAAT-AAATTAG--TTATCAAGGCCTAATTTT-ATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCACTTTTCGATCCATTGATTTGTCTAAAGGAATA--CA-TAC--AACTGAAAATA-------------CAAAATGAACAATT------A----Attatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaatacatacaactgaaaatacaaaatgaacaattaatgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|8 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATGAACAAT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTACCAAAAAATTTAT-AATACTACAATT-GTA-------TATCCTAGTA--ACTG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTA-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGT--CCtgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|9 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcaaaatttgttgggactagctagtattatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaaTGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACCTTTGATTGGTTGCTAAAA-ATTTTG-T
gi|9 : CTAAAAATTTTGTA-GGGACGAGCTTGTATAAT--GATTTTTCAGATATTTGGAGAATAAATATAAAATACTTGCGTTGTTT--CTTTTATTTTAAA-----CGACAATGTGTAGTAGGAATCAACGT-ATTATGTTCTTACTTGTAATAATGGCGAAC-AAATCAA-TTTTCCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATTTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTTAAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCCA----CCTTCAAAATAAACAATT------ATATTAAAA-AATAAAGGTTTCCAACATACAACTT--------------------AAAATACAAACTATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTTTCTACCATATTTA-TAATACTACATTTTGTATTATTTTTATCCTAGTTAAAAAA-AATTCGTACAAATG-CTCCCCAATACGGTTACGTAA----------CCCCAT-TTCAAAATTCTAAAAGCATTC---TTACTGGGT--CCCGTCTCA-TGGCAGCGagggacgagcttgtataatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
blockSeqs : T TT GTTCTAATGACATG A T ATT ATG TAG T G CAA T TCAACGCAA CGAGTA TC TTCCCCTTA A TTAAT TC T T TG C C T AT TG GGAC TA TT T G TTCCG CCGTTACCCTCCATGTAATGTAA T CCA T AT T A AT CA G A . A T T A AAA T T CAGT CAAGTAG T T AAACTTTCAGGTTTACTTTC . GGTGCAA TT TTATTTT AA A CCCCATGCAA T CTA CA T
blockSeqs : C T G . . TTT . . . . . . TCAGCGCAA . . . . . . A . . T . . . . GGAC . . C . . CCGTATCTCTCCATTATTACTAA . T . . . T . . G . . A . . A A . T . ATATT T T . . . TT . . . . A . . .
blockSeqs : T T G . . TTT . . . . . . GCAACGCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . ACTCTCCATTACATCTTCGTTA . A . . . A . . G . . C . . A A . T . A . C . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : T C . . . TT . . . . . . GAAACGCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . CCGTTTCTCTCCATTTCGTAA . A . . . T . . G . . T . . T A . T . A . T . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : T T . . . TT . . . . . . GCAACACAA . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . CTGTTACTCACCATTAGGAG . A . . . A . . G . . A . . A A . T . A . T . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : T T . . . TT . . . . . . GCAGCAGAA . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . ACCGTGTTATGAAG . A . . . A . . G . . A . . A A . T . A . T . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . TT . . . . . . TAGTGCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . G . . CCGTTCCTCCCCTT . G . . . A . . A . . A . . T A . T . A . T . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TT . . . . . . CGCAA . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . ACGAAGATGTAA . A . . . T . . G . . T . . T A . C . A . T . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TT . . . . . . GTAA . . . . . . . . . . . . . . . C . . AAAAAGTAA . G . . . A . . G . . A . . A A . T . A . C . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : TT . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . A . . CCTTTATAG . A . . . . . . G . . T . . T . . . . A . C . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . CAGAAATT . A . . . . . . A . . C . . A . . . . A . A . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . GCCTGTGA . G . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . CCGTTA . A . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . CCGTTA . A . . T . . . . . .
blockSeqs : . T . . CCGTAA . . . . .
blockSeqs : . T . . AGTAA . . .
blockSeqs : . . . . CCGT . . .
blockSeqs : . T . . .
blockSeqCons : T* A** *************
originalCons : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----TT---------AC---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
finalCons : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----TT---------AC---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTACA--AA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CGATTAAAACAATTATATTCGGAACTAATGGTAGTCCCATTTTTTCGGTGTACAAATGAAACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTCTATGAATTGATCTAGTGCATATTGTTAGAAGTTTGCCAAATGATATGGCACTGTCCG
Unaligned ( gi|42 ): TAATTTCCAATAAAAAAAAATGTAGGTGTAAAATGCGGACTTT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333 111 444444444444444444444444 111111111 11111 1111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 11111111111 22222222222222222222 1111111111111 22 1111111111
lowQualScore : 3 55 0 11111111111111 4 4 555 555 555 3 3 555 3 333333333333333333333333 999999 44 0 777777777 4 0 0 00000 55 3 3 44 5 2 3 44 44 4444 33 33 1 2 55555 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 444 0 2 44 3 1 44 33 1 2 2 2 3 0 0 3 2 000 3 1 6666 11111111111 6 1 55555555555555555555 6666666666666 9999999 0 55 8888888 33 2 0000000000 5 444 33 3
lowQualScore : . .. . .............. . . ... ... ... . . ... . ........................ ...... .. . ......... . . . ..... .. . . .. . . . .. .. .... .. .. . . ..... .......................................................................... . ... . . .. . . .. .. . . . . . . . . . ... . . .... ........... . . .................... ............. ....... . .. ....... .. . .......... . ... .. .
lowQualScore : 6 22 7 55555555555555 0 0 222 888 888 3 1 888 3 777777777777777777777777 666666 66 7 888888888 4 7 5 00000 55 4 1 22 3 7 1 22 66 2222 99 11 4 2 33333 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 000 4 1 66 3 5 66 77 2 9 9 5 1 8 6 1 8 333 1 6 5555 33333333333 7 0 00000000000000000000 9999999999999 3333333 4 55 7777777 77 7 9999999999 0 777 99 3
consensus : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----TT---------AC---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
Reference ( family-5234 ) : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCGCGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTCA-----TT---------AC---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTTCCACCAAATTTATTAATACTACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|1 : CAAGAAATTAACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTCTTT--AGTTTATCCAAAGTAAGCATGATTTGAATGTGCAACTTTATCTTCACCAGTTGCTCTACCAACAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTTTCGCCTACTTCAGTCCCGTTTTCCG----------------GTGACCTTGACCACTTACTTCATTCAATACCGCAAAA-CTACATCTAAGTCTGCTTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATA--CGACATTACCGAGCT-GGAAAAAG---GC-AAGCAACG-----CA-----A-----TTATGGACAAA------GTA--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATAATCCACACCCTTGGTGGAAATTGGTTAATA---------C-CATCTTAGCTTTCTTTTACGCGCGTCTTCCTGCTAGCACGTATTGAAGTACCTCCATGCAAATAATGTGAACATCACGTGACAAGAATAGCACA-----TTTGATTTGCTGATTGAAATATC--GCTGTGTGTTGTGGAACCTGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATATCG-TGCCAA-A--TTTGT--TG----TA--ATCTGGTAC--CCTGCC-CAATTTCA-----TT---------CC---------------T-----------TT-------A-----------------C--------TCT-CC--ATT-AC-GA-AGGACATTGGCCAGGATACCAGACT-AAA--TTTGTT-GTCACTAGCTTGTATAAT--AACTTTTCAGATATTTGAAGAAC-AATATTAAATACTTCCGTTGTT---------------------CTACAATATGTAGTAAGAACTAACAT-ATTATGTTCTAACCGGTAATAATGGCGAATAAAATAAG-TTTTTCAAGTCCAAATTTTAATTTTTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCAATCCCTTGATTTGTCTAAGGGAATAGTCATTAC---AA-AAAAGTAATCTA----CCTCCAAAATTAACAATT------A----AAAC-AAT--ATGTTTCCTACATACAACTG--------------------GAAATACAAAATATACAGTAATATATACAGTATAG-------TGTACTTGCAAAATTCTTACCAACTTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATAAAAGTT--AAAG-AATTCATACAAATGCCTCGCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCCGTCCTA-TGGCGGCG
gi|10 : tacacttgatgtctcgatttcatatgtcaatgAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGAATAAT--GACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTTGCATTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATGTTCTAACCTGTTATAATGGCGAAT-TAATAAG-TTTTTCAAGCACTACTTTTAA-TTTTGATCTCTTGTATTAT-----------TCCCTTGATTTCTCTAAGAGATTAGTCATTAC--AAA-AACAGTATTATACAGTCCTTCAAAACAAACAATT------A----AAAATAATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AATATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGAACATTGAAATTTTCCACCAAACTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCCAAGTT--AAAG-AATTTGTACAAATATCTCCCTTATGTGGTTACACAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTT---CTACTGGAC--CCTGCCTCA-T-GTGGCGccg
gi|11 : TTGATTGGTTGCTTGAACATTTCG-TGCAAA-AATTTTTT--TGGGACTA--G-CTAGTAT--TATG-----ACTT-------TT----------C---------------A-----------GA-------A-----------------ATT------TGG-AG-----AACGGATATAAAATcccaataa
gi|11 : AAAA--TTTTTTTGGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGAAATTTGGAGAACGGATATAAAATACTTGCAATGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATGTAGTAAGAATTAACGTAAATATGTTTTAACCTATAATAATGGCGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCATAATTTTAAATTTTAATCTCTTG--CTATTCAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAA-TATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT------A----AAAATAAATAAGGTCTCCTACATACAAATG--------------------AATATACAGAATAAAGAGT-------------TAA-------GGTACTAGGAAACTTTTAACCAAATTTA-TAATAATACATTTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGTCTCCCCAATATGGTTACGCGA----------CGCCATGCTC-acttgcaatgttctttttgttttaaatacaactacaatatgtagtaagaattaacgtaaatatgttttaacctataataatggcgaataaataagtttttcaagccataattttaaattttaatctcttgctattcaattttcgatcccttgatttgtctaagggactagtcattacaaaaaaatattctaccttcaaaataaacaattaaaaataaataaggtctcctacatacaaatgaatatacagaataaagagttaaggtactaggaaacttttaaccaaatttataataatacattttgtatatcctagttaaagaattcgtacaaatgtctccccaatatggttacgcgacgccatgctc
gi|12 : ttgattggttgcttgaacatttcgtgcaAAATAATTGCGTTGTTT--CTTTTGTTTTAAATACAACTACAATTAGTAGTTAGAATTGACGT-ATTATGTTCTAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATCAG-TTTT-CAAGCCCATATTATAATTTATGATCACTTG-ATTATTCAATTTTTGATTCCTTGATTTGTTTAAGGGACTAGTCATTCC--AAA-AAAAAT---CTA----TTTTCAAAATAAACAATT------A----AAAA-AATCAAGGTTTCCTACATACAAATA--------------------AAAATACAAAATATATAGT-------------TAAGGTGCAATGTACTTGGAAAGTTTCCATCAAATTTAT-AATACTACATTTTATA-------TATCCTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCAAGTACGGTAACTCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGC--CCCGTCTCA-TGCCGGTG
gi|13 : ACTAGATTAGCACATTTGACTGGGTGATTGAA-ATATCGCTG--------TGTGT--TG----TATAGTCTGGTAC--CCTGTC-CCACTTAA-----TT----------C---------------C-----------GT--------------------------------------------TA-CTGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTATCAGACTAccctataaaag
gi|13 : GTATGCATA-AATA--TAAATATCACGTGACGAGATAAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-AGTTCG-TGCAAC-A--TTTGT--TT----T---GTCTtgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtAACA--TTTGTT-TTGTCTAACTAGTGTAATATGACTTTTCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACATGCGTGGTTTCATTTTTaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattttttccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|13 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcTTTTCCATCATATTTAT-AATACTAAATTTTGTA-------TATATTAGTT--AAAG-AAGTCTTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATACTC-AAATTCTTGAAGCATTC---CTA--------CCTTCCTCA-TGGCGGCGtccatcatatttataatactaaattttgtatatattagttaaagaagtcttacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatactcaaattcttgaagcattcctaccttcctcatggcggcgccc
gi|14 : actagattagcacatttgactgggtgattgaaatatcgctgtgtgttgtatagtctggtaccctgtcccacttaattccgttactgaatgaagttgggcagggtatcagactatgtgtatgcataaatataaatatcacgtgacgagataagcacctttgattggttgcttgaaagttcgtgcaacatttgttttgtctaactagtgtaatatgacttttcagatatttggagaacaaatataaaatacatgcgtggtttcattCAGGATATTTACTTCTACA-GCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGTATGCATGATTTGAATGCGCAACTTTATCTTGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TTAC-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTCCCGGTAAAATCACATTCCTGTGATCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAA-TTACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTTTAT-CGACATTACCGAGCTGGAAAAAAG---GC-AATCAACG-----CA-----A-----TCAATGACATA------GCT--GTAGACTGCAAACCATTAAAAGACGCAAATATTTCACACCccc
gi|15 : catgtcaatgCTACTAGCAACATG-------------TT-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTGCAGTCCCATTTTCTGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGATCGCTAACTTCATTCATTACCGTAAAATT-AAGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGCGAA---CTTG---CTATAT-CGACATAACCAAGCT-GA----------C-A------------TA-----A-----TTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCACATATTTTACACCCTTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCATCTTCCTGCTAACGT
gi|16 : CAGGAAATTTATTTCTACGTGCACCTTTT-GCGTTTTTT-AGTTTATCCAAAGAAAGCATGATTTGAATGTGC
gi|16 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgTTCCAATATCCGGTAAAATGACATTCCTGTGTCCTTGACCACTACCTCCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAGTGTGCCTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATAACCGAGCA-GCAAAAAG---GC---------------------------TCAA-AACATG------GTTTCTTACA-TACAAAttccaatatccggtaaaatgacattcctgtgtccttgaccactacctccattcattaccgcaaaattacgtctcagtgtgcctacattgaatggcgaatctgctatatcgacataaccgagcagcaaaaaggctcaaaacatggtttcttacatacaaa
gi|17 : tttcacttgattactcgacttcacatgtcaatgcaggaaatttatttctacgtgcaccttttgcgttttttagtttatccaaagaaagcatgatttgaatgtgcCACGCGTCTTCTTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCACATGCAAATAATGTAAACATCACATGACGAGATAAGCACA-----TTTAATTGGCTAATTGAAATATCTCGCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACGTAACGTGACGAGGTCAGCACGTTTGATCGATTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTACC-CAACTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------A--------TG
gi|18 : CATTCCCAAACT-GAAAAAAG---GCTAATAGT-G-----CA-----A-----CTAACGCCATT------GCT--GTACATTGCATGCCCCCATAGGGCAAAAATATTTTAGAACCTTGGTGGAAATTCCCCAGAA---------CACCTCTTtgaacattagatattgatag
gi|19 : atcagtgtgagatagatagcgaaattgctgcattggttgcataacatgtgcgtacaaattgttcccttcatacaaaatgcaatcaacatcaacggctgttatagccgaaaaagagtCAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTCCCGTTTT---AGTTTATCCAAAGTAAGCCTGATTTGAATGC--AACTTTATCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-C-AGGTATAACA-------CA--TATTTCGATCCCATTCTaccattgttattgtt
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-tgttctttttgttttaaatacaactacaatatttagtaagagttaacgaattgtgttccaacctgtaataatggcgaat
gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaggaaatttacttctacgtgcaccttttcccgttttagtttatccaaagtaagcctgatttgaatgcaactttatctcgaccagttgctctactagcaacatttcaggtataacacatatttcgatcccattcCAGGAAATTTACTTCTACGAGCACCCTTTTGCGTTTTAC-AGTTTATCCAAAATAAGCATGATTTCAATGTGCAACTTAATCTGGACCAGTTGCTCTACTAGCAACTT--------------TT-C-AGATAAAACATGTCTATCACCTACTGTAGTCCCATTTTCCGGTAAAATCACATTCCTGTGACTTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAAT------CTTAGTCTATCTACATTGAAGGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGATATTAACGAGTT-GAAATAAG---GC-AATCAGCG-----CA-----A-----CTAACGACATA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGACGCACATATTTCACCCCCTTGGTGGAAATTGCCTACAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACGCGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTAACAAGATAAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCAGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACGTGACGAAGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-GAATTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------A--------TTC-TC--TATTAC-GA-AGGACCTTGGGCAGGGTACCAGACT-AAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATTAC--GGCTTTT-AGATGTTTGAAGAACAAGTATGAAATACGTGCGTTTTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAACATATAGTAAGAATAAACGT-ATTATGTGCAAACCTGTAATAATGACGAAT-AAATTAG-TTTTTAAGGC----AT----GTTTTTAATCTCAAA-ATGTTTAGATTTTCGATGCCTTGGTGTGTCTAAGAAAGATGTCATTACAAAAA-AAAAGTGTTCTA----CCTTCAAAATAAAAAAAT------A----AAAA-AACTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATAGAGT-------------TAA-------TGTACTGGGGAAAGTTTCAACAAATTTA-TAATACAACATTTTGTA-------TATCGTAGTT--AAAG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGC------------------------AATTCTAGAA--------------GGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCG
gi|20 : tttcacttgattactcgatttcacatgtcaataTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATACAACTACAATATTTAGTAAGAGTTAACGA-ATTGTGTTCCAACCTGTAATAATGGCGAAT-AAATAAGTTTTTTCAAGTCTTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ACTATACAATTTTCGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTTAA----C--TCAAAATAAACACTTCAAGTAG----AAAA-AAGTAAGGTTTCCTACAAACAACcacaata
gi|21 : CAGGAAATTTACTTCTACGTGCACCTTTTTGCGTTTTTT-AGTTTATTCAAAGTAAGTATGATTTGATTGCGCAACTTTTTCTCGACCAGTTGCTCTACTAGCAA-AT--------------TT-C-AGGTTAAACATGTCTATCACCTATTTCAGTCCCATGTTCCGATAAA
gi|22 : tttcacttgattacgcgatttcacatgttgatgGGTTTCTTACATACAAATG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGGAAATTTTCACCAAATTTAT-AATACTGCATTTTGTA-------TATCTTAGTT--TAAG-AATTAGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGTAGCATTC---CTACTAGACCACTCGCTACATTGGCGcattgaccacta
gi|23 : at---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACAGA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAta
gi|24 : -------TGTACTTGGAAATTTTACACCAAATCTAT-AATACTATATGTTGTA-------TATCCTAGTT--AAAG-ATTTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCGCCTCA-TGGCGGCGaaggtcaggtattggctagattattctcgaagtgaatcttcgtatataactaaaataaattatatgcaagggacttattggtctattgtttctttttcatgctttgtacaatctgcagacattg
gi|25 : TTATTACCACAAAAATTACGT----------------TGAATGACGAA---TCTGTAGCTATAT-CGACATTACCCGGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACGCAATTAACGAAATA------GTT--GTACAATGCAAACCATTAAAAGGTGCAAATATTTCACACCTTTGGTGGAAATTGCCTAAtccaat
gi|26 : TCCTGTGACTTTGACCACTAACTTAATTCATTACGGCAAA-TTTACGTATCAATCTGCCTACATTGAATATCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAA
gi|27 : atttctatctcatctttttatttcattaaA--GTCTGGAAC--CCTGCC-CAAC---A----------------A----------------------------GT-------A-----------------A--------TGA-AACCAG----AGA-ATGAAGTAGTGCAGGGTACTAGACTA
gi|28 : acacaatgtgtgccttcttcCAGGAAATTTACTTCTATGTGCACCTTTT-GCGTTGTTT-AGTTTGTCCAAAGTAAGTATAATTTGAATGTGAAAttattatttcttatataaatggataatgatgtcat
gi|29 : tttcacttggtgactcgattacacatgtcattgCTGGTAC--CCTATC-AAACTTCA-----TT---------GC---------------CT----------GT-------G-----------------A--------T-----------CCGGA-AAGAAA-TAGACAGGGTACCAGACT
gi|3 : CAGGAAATTTACTTCTACTTGCACCTTTTT-------TT-AGTTTATCCAAAGTAAGTAGGATTTGAATGTGCAATTTTTTCTCAACCAGTTACTCTACTGGCAACAT--------------TT-C-AGGTAAAACATGCCTATCACCTATTTCAGTCCCATTTTTCGGTAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATTTACGTCTCAATCTGACTACATTGAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----TA-----A-----TTATCGACAAA------GTT--GTACATTGCAAACCATTAAAAGGCGCATATATTTCACACCCGTGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCTTTCTTTTCCACATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCTCATGCAAATAATGTAAACATCACATGACAAGATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATT--GCTGTATGTTGTCGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGATGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTGAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TTTGT--TG----TA--GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTTTA-----TTAA-------AA---------------A-----------GT-------A-----------------A--------TGGTAG--AGTAACAGA-ATGAAGTTGGGC-----ACCAGACTAAAT--TTTGTT-GGGACTTGCTAGTATAAT--GACTTTTCATATATTTGGAAAACAAATATAAAATACTC-TATTGTTC--TTTTTATTTTAAATTCAACTACAATATGTAGTAAGAACTAATGT-ATTATATTCTAACCTGTTGTAATGGCAAAT-AAATAAG-TTTTTTAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTCTAAGGGACTAGTCATTGC--AAA-AAAAGTATTCTA----CCTTTAAAGTAAACAATT------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACTTGGACATTTTCCACCAAACTTATTAGT-CTACATTTTGTA-------TATCTAAGTT--TAAG-AATTTGTACAAATGCCTCCACAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGAC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtgcacatatatattaacatgtatgtatatatgtatctatgt
gi|30 : CTTCA-----TA---------ACGAAGA----------T-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTTGGCCAGGGTACCAGACTA
gi|30 : ----TA--GTCTGGTAC--CCTGGC-CAACTTCATTCCGTT---------ACTCTCCATTACATCTTC-----------GT-------T-----------------A--------TGA-AG--AGGAACGCT-ATGAAGATGGCCAGGA-ACCAGACaggaacgctatgaagatggccaggaaccagac
gi|31 : TCTGGTACTTCATTCCGTTACTCCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGTAACGGA-ATGAAGTTGGGAAGGGTACCAGAC
gi|32 : cctggtaccttgct--GTCTGGTAC--CCTACC-CTACTCCA-----TTCTGTTACTCAC---------------C-----------ATTAGG---A-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAGTGGGGCAAGGTACCAG
gi|33 : CTGGTAC--CCCGAC-CAACTTCA-----TTCCGTT----AC---------------CCTCCATGTAATGT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGTAACGGA-ATGAAGTTGGGCAGGATACC
gi|34 : TGGTAG--CCTGGC-CATCTTCA-----TT----------C---------------C-----------GT-------ATCTCTCCATTATTACTAA--------TGG-AG--AGTAATGGA-ATGAAGTTGGGAAGGA-ACCA
gi|35 : --GTCTGGTAC--CCTGCC-CAACTCCA-----T----------AC---------------C-----------GTGTTATGAA-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ACGGAGGTGGGCAGGGTACCAGACTA
gi|36 : TGGTAC--TCTGCC-CAACTTTA-----TT---------CCGTTTCTCTCCATTT-C-----------GT-------A-----------------A--------TGG-AG--GGGAATGGA-ATAGAGTTGGACAGGGTACC
gi|37 : --GTCTGGTAC--CCTGCA-AAACTCCT-----TT----------C---------------C-----------GT-------T-----------------CCTCCCCTTTGG-AG--AGTAACGGA-ATGGAGTTGGGCAGGATACCAG
gi|38 : TCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTATGCAA----------CCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCATTC---TTACTGGAC--CCCGC
gi|39 : TCTGGTAC--CCTGTC-AAACTTCA-----GT----------C---------------CTTT--------AT-------A-----------------G--------TGG-AG--AGTAACGGA-ATGAAATTGGGCATGGTACCAGA
gi|4 : CAGGAAATTTATTTCTATGTGCATCTTTTTGCTTTTTTTTAGTTTGTCCAAAGTTAGTATGATTTGAGTGTGCAACTTTATCTCGACTAGTTGCTCTACTAGCAACAT--------------TT-TTAGG-AAAACATGTCTGTCTCCTATTTCAGTCCATTTTTCCGGTAAAATCACATTC-TGTAACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAACATT-ACGTCTAAATCTACCTACATTCAATGGCGAA---TCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAA-G---GC-AA-----GAAACGCA-----A-----TTAACGACGTACGAGTAGTT--GTGCATTGTAAACCATTAACAGGCGCAAATATGTCACACTCTTGGTGGAAACAGCCTAAAA---------C-CATATTTGCTTTATTTTCCACGCGTCTACCTACTAGCGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATGTAAACATCACGTGACACGATTAGCACA-----TTTGCTTGGCTGATTGAAGTACC--AATGTGTGTTGTG
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgGTGTTTTGAAGAACCTGCATGCAAATAATG--TAAACATCACGTGACACGATTAGCACATTTGCTTGGCTGATTGAA------G-TACCAATG--TGTGTTGTG----TA--GTCTGGTAC--CCTGTC-CAACTTTG-----TT---------------------------------------T----------------------------------T--------GTTACTTA-ATGAAGTTGGGCAGGGTACCAGACTAtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcCGTATGCATA-AATA--TAAAGATCTCGTGACGAGGTAAGCACCTTTGGTTGGTTACTTCAA-ATTTCG-TGCAGA-A--TTTGT--TG----tgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcagaatttgttgggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|4 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgAGAA--TTTGTT-GGGACTAGCT---------------------T-TTTGGAGAGGAAACATAAAATGTCTGCGTGGTTT--CTTTT-TTTAAAATACAACTACAATATGTCGTAAGAATTAACGT-ATTATATTCTAATCTGTAATAA--------------AG-TTTTTCAAGCC---ATT-------------------------CAATTTTCGAACCCTTGATTTGTCTAAAGGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTATTCTA----CCTTCAAAATAAACAATT-----------AAAC-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTA--------------------AAAATACAAAATATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTGTCCACCATATTTA-CAATATTAAATTTTATG-------TATGCTAGTA--AAAG-AATTCTTACAAATGGCTCCCCAATACGGTTACGCCA----------CCCAATGCTCTAAACTTTAGAAGCATTC---ggactagctttttggagaggaaacataaaatgtctgcgtggtttctttttttaaaatacaactacaatatgtcgtaagaattaacgtattatattctaatctgtaataaagtttttcaagccattcaattttcgaacccttgatttgtctaaaggactagtcattacaaaaaagtattctaccttcaaaataaacaattaaacaattaaggtttcctacatacaactaaaaatacaaaatatacagttaaggtacttggaaattgtccaccatatttacaatattaaattttatgtatgctagtaaaagaattcttacaaatggctccccaatacggttacgccacccaatgctctaaactttagaagcattcatggcggcgcccaata
gi|43 : ctttcacttggtgactctatgtcacatgtcaatgcaggaaatttatttctatgtgcatctttttgcttttttttagtttgtccaaagttagtatgatttgagtgtgcaactttatctcgactagttgctctactagcaacatttttaggaaaacatgtctgtctcctatttcagtccatttttccggtaaaatcacattctgtaaccttgaccactaacttcattcattaccgcaacattacgtctaaatctacctacattcaatggcgaatctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagaaacgcaattaacgacgtacgagtagttgtgcattgtaaaccattaacaggcgcaaatatgtcacactcttggtggaaacagcctaaaaccatatttgctttattttccacgcgtctacctactagcgtgttttgaagaacctgcatgcaaataatgtaaacatcacgtgacacgattagcacatttgcttggctgattgaagtaccaatgtgtgttgtgtagtctggtaccctgtccaactttgttttgttacttaatgaagttgggcagggtaccagactatgcgtatgcataaatataaagatctcgtgacgaggtaagcacctttggttggttacttcaaatttcgtgcCTTTGACCACTAACTTCTTTCATTACCGCAAAG-TTATGTCTCatggcggcgcccaata
gi|5 : GTTGCTCTACTAGCAACATGTTCTAATGACATGTC-C-AGGTAAAACATGTCTATCACCTATTTGAGTCCCATTTTCAGATAAAATCACATTCCTGTGACCTTGACCACTAACTTCATTCATTACCGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGCCTACATTGAATGGTGAA---TCTG---CTATGTTCGACATTACCAAGCT-GAAAAAAG---GC-AA-----G-----CA-----ACACAATTAATGACATA------GTT--GTACATTTCAAACCATTTAAAGGC--AAATATTTCACAACCTTGGTGGAAATTGCCTAAA----------C-CATCTTTGCTTTCTTTCCCGCATGTCTTCCTGCTAGCGTGTATTGAAGAACCCGCATGCAAATAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGCACATTAATTTTGATTGGCTGATTGAAATATC--AC--TGTGTTGTGGAACTCGTATGCATA-AATA--TAAACAT-A---GACGAGGTCAGCACTTCTGATTGGTTGCTTGTA-ATTTCG-TGCAAA-A--CTTG
gi|5 : AAAA--CTTGAT-AGCACTAGCTAGTATAAT--GACTTTCCAGATATTTGGAGAACAAATATAAAATACTGGGGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAATTCAACTACAATATGTTATACGAATTAACGT-ATTATGTTTTAACCTGTAATACTGGTGAAT-AAATAAG-TTTTTCAAGCCCTGATTTTAATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCAATTT-CGATCCCCTGATTTGTC-------------ATTAC--AA------------TA----CTTTCCAAATAAACCAT-------A----AAAA-AATTAAGGTTTCCTACATACAACTGAAACTTTCAGGTTTACTTTCAAAGTACAAAATATACAGT-------------TAA-------TGTACATGGAAATTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGTA-------TATCC----T--AAAG-AAATCGTACAAATGCCTCCCCTAAACGGTTATGCAACCCCATGCAACCCCATGCTC-AAATTCTAGAAGCCTTC---CTAGTGGAC--CCTGCTACA-TGGCGGTGatagcactagctagtataatgactttccagatatttggagaacaaatataaaatactggggttgttctttttgttttaaattcaactacaatatgttatacgaattaacgtattatgttttaacctgtaatactggtgaataaataagtttttcaagccctgattttaatttttgatctcttgatttttcaatttcgatcccctgatttgtcattacaatactttccaaataaaccataaaaaaattaaggtttcctacatacaactgaaactttcaggtttactttcaaagtacaaaatatacagttaatgtacatggaaattttccaccaaatttataatactacattttgtatatcctaaagaaatcgtacaaatgcctcccctaaacggttatgcaaccccatgcaaccccatgctcaaattctagaagccttcctagtggaccctgctacatggcggtgcccaaaa
gi|6 : gttgctctactagcaacatgttctaatgacatgtccaggtaaaacatgtctatcacctatttgagtcccattttcagataaaatcacattcctgtgaccttgaccactaacttcattcattaccgcaaaattacgtctcaatctgcctacattgaatggtgaatctgctatgttcgacattaccaagctgaaaaaaggcaagcaacacaattaatgacatagttgtacatttcaaaccatttaaaggcaaatatttcacaaccttggtggaaattgcctaaaccatctttgctttctttcccgcatgtcttcctgctagcgtgtattgaagaacccgcatgcaaataatgtaaacatcatgtgacaagattagcacattaattttgattggctgattgaaatatcactgtgttgtggaactcgtatgcataaatataaacatagacgaggtcagcacttctgattggttgcttgtaatttcgtgcCTGTCTACATTGAATGGCGAAATGTCTG---CTATAT-CGACATTACCGAGCT-GAAAAAGGCAAGC-AAC----G-----CA-----A-----TTCACGACATA------ACT--GTACATTGCAATCCATTAAAAGACGCAAATATTTTACACACTTTGTAGAAATTGCCTAAAATTCCCCTTAC-CATCTTTGAGTTCTTTTCCGCACGTTTTCCTACTAACGTGTGTTGAAGAACCCTTATGCAAAATATGTTAACATCACGTGACAATATTAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GC--TGTGTTGTGGAACCCGTATGGA-A-AATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACATTTGATTGGCTGATTGAA-ATATCG-cccaaaa
gi|6 : TGTGTTGTGGAACCCGTATGGAAAATATGTAAACACCACTTGACAAGATCAGCACA-----TTTGATTGGCTGATTGAAATATC--GCTGTG--TTGTGGAACCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCACATGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTTCAA-ATTTCG-TGCAAA-A--TGTGT--Tctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcaaaatgtgtttggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|6 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgcAAAA--TGTGTT-TGGACTAGCTAATATAAT--GACTTTTCAGATATTTGCAGAACAA-TAAAAAATACATTCATTGTTG--TTTTT--TTTAAATACGACTAAAATAAGTAGTAAGAATAAACGT-TCTATGTTCTAACCTGTAAAAATGGCGAAT-AAATTAG-ATTGTCAAGGTCTAATTTTAATTATTAATCTCTTG-ATTTTTCAATTTTCGATACCTTGATTTTTCTTAGGGACTAGTCATTAC--ATG-AAGAGTATTCTA----CCGT-AAAACAAACAATT------A----AAAA-ATTCCAGGTTCCCTACATACAACTG--------------------AAAATATAAAATATACAGT-------------TAA-------AGTACTTGGAAGTTTACCACCAAATTTATT-ATACTACACTTTGTA-------TATTCTAGTT--AAAGAAATTCG----------TCCCCAATAC---------A----------TCCCATGCTC-GAATTCTAAAAGCATTCCTACTACTAGTC--CCCACCTTA-TGGCGGCGtggactagctaatataatgacttttcagatatttgcagaacaataaaaaatacattcattgttgttttttttaaatacgactaaaataagtagtaagaataaacgttctatgttctaacctgtaaaaatggcgaataaattagattgtcaaggtctaattttaattattaatctcttgatttttcaattttcgataccttgatttttcttagggactagtcattacatgaagagtattctaccgtaaaacaaacaattaaaaaattccaggttccctacatacaactgaaaatataaaatatacagttaaagtacttggaagtttaccaccaaatttattatactacactttgtatattctagttaaagaaattcgtccccaatacatcccatgctcgaattctaaaagcattcctactactagtccccaccttatggcggcgcttaataa
gi|7 : ctgtctacattgaatggcgaaatgtctgctatatcgacattaccgagctgaaaaaggcaagcaacgcaattcacgacataactgtacattgcaatccattaaaagacgcaaatattttacacactttgtagaaattgcctaaaattccccttaccatctttgagttcttttccgcacgttttcctactaacgtgtgttgaagaacccttatgcaaaatatgttaacatcacgtgacaatattagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatggaaaatatgtaaacaccacttgacaagatcagcacatttgattggctgattgaaatatcgctgtgttgtggaacccgtatgcataaatataaacatcacatgacgaggtcagcacctttgattggttgcttcaaatttcgtgcGCTCTACTAGTAACATG-------------TT-C-AGATAAAACCTGTCTAGCGACTATTTCAATCCCATTTTCCTGTAAAATCACATTTCTGTGACCATGACCACTAAC------------CGCAAAATT-ACGTCTCAATCTGTCTACATTGAATGGCGAA---TC----------------ATTACCGAGTT-AAAAAAAG---GC-AA-----G-----CAGCAGAA-----TTAACGACAAA------GCT--GTAAAATGCAATCCATTAAAAGGCGCAAATATTTCACAATATCGGTGGAAATTGCCTAAAA---------C-CATCTTTGCT--CTTTTCCAGGCGTCTTCCTGCTGGCG--------------CGCATACAAATAATGTAAACATCACGTGACAAGATTAGCACA-----TTTAATTGGTTGATTGAAATATT--GCT-----TTGT-------GTATGCGTA-GATA--TCAACACCAAGTGACGAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCTGGAATATTTCG-TGTACA-A--TTTGT--CG----cttaataa
gi|7 : TACAA--TTTGTC-GGGATTAGCTA-----------TTTTTCAGATAATTGGATAACAAATATAAAATACTTGAGTTGTTC--TTTTTGTTTTAAAAACAACTGCAATATGTAGTAAGAATTAACGT-TTTATGTTTTAACAAGTAATTATGGCGAGT-AAATAAG-TTTTT-------TAACTTTAAATTTTGATATCTTG-ATCATTCAATTTTCGATCCCATCATTTGTCGAAGAGACTAGTCATTAC---AA-AAAAGTACTCTA----TCTTCAAAATAAACAATT------A----AACA-AATCAAGGTTTCCTACATA-AACTG--------------------AACATACAAAATAAACAGT-------------TTA-------GGTACTTTGAAAGTTTCCACCAAATTTA-TAATACTACATTTTGAA-------TATCCTAGTT--AAGG-AATTCGTACAAATGCCTCACCAGTACGATTACGCAA----------CCCTATGATC-AAATTCTAGAAGCATTC---CTAATGGGC--CCCGCTTCC-TGGCTGCGggattagctatttttcagataattggataacaaatataaaatacttgagttgttctttttgttttaaaaacaactgcaatatgtagtaagaattaacgttttatgttttaacaagtaattatggcgagtaaataagttttttaactttaaattttgatatcttgatcattcaattttcgatcccatcatttgtcgaagagactagtcattacaaaaaagtactctatcttcaaaataaacaattaaacaaatcaaggtttcctacataaactgaacatacaaaataaacagtttaggtactttgaaagtttccaccaaatttataatactacattttgaatatcctagttaaggaattcgtacaaatgcctcaccagtacgattacgcaaccctatgatcaaattctagaagcattcctaatgggccccgcttcctggctgcgcccaat
gi|8 : gctctactagtaacatgttcagataaaacctgtctagcgactatttcaatcccattttcctgtaaaatcacatttctgtgaccatgaccactaaccgcaaaattacgtctcaatctgtctacattgaatggcgaatcattaccgagttaaaaaaaggcaagcagcagaattaacgacaaagctgtaaaatgcaatccattaaaaggcgcaaatatttcacaatatcggtggaaattgcctaaaaccatctttgctcttttccaggcgtcttcctgctggcgcgcatacaaataatgtaaacatcacgtgacaagattagcacatttaattggttgattgaaatattgctttgtgtatgcgtagatatcaacaccaagtgacgaggtcagcacctttgattggttgctggaatatttcgtgCTGCTAGAGTGTGTTGAAGAACCCGTACGCAAAAAATGTAAACATCATGTGACAAGATTAGTACA-----TTTGATTGGTTGATTGAAATAAC--GCTGTGTGTTGTGGAACCCGTATGCATA-AATG--TAAACATCACGTGACCAGGTCAGCACCTTTGATTGGTTGCGTCAA-ATTTCG-TTCAAA-A--TTTGT--TGGGACTA--G-CTAGTAcccaat
gi|8 : AAAA--TTTGTT-GGGACTAGCTAGTATTAT--GACTTTTCAGATATTTGGTAAACAAATATAAAATACTTGCTTTGCTC--TTTTTGCTCTAAATACTACTACAATATGTAGTTAGAATAAATGT-ATTATGTTCTAACCTGCAACAATAGCGAAT-AAATTAG--TTATCAAGGCCTAATTTT-ATTTTTGATCTCTTG-ATTTTTCACTTTTCGATCCATTGATTTGTCTAAAGGAATA--CA-TAC--AACTGAAAATA-------------CAAAATGAACAATT------A----Attatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaatacatacaactgaaaatacaaaatgaacaattaatgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|8 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcTACATACAACTG--------------------AAAATACAAAATGAACAAT-------------TAA-------TGTACTTGGAAATTTACCAAAAAATTTAT-AATACTACAATT-GTA-------TATCCTAGTA--ACTG-AATTCGTACAAATGCCTCCCCAATACGGTTACGCAA----------CCCCATGCTA-AAATTCTAGAAGCATTC---CTACTGGGT--CCtgtacttggaaatttaccaaaaaatttataatactacaattgtatatcctagtaactgaattcgtacaaatgcctccccaatacggttacgcaaccccatgctaaaattctagaagcattcctactgggtcc
gi|9 : ctgctagagtgtgttgaagaacccgtacgcaaaaaatgtaaacatcatgtgacaagattagtacatttgattggttgattgaaataacgctgtgtgttgtggaacccgtatgcataaatgtaaacatcacgtgaccaggtcagcacctttgattggttgcgtcaaatttcgttcaaaatttgttgggactagctagtattatgacttttcagatatttggtaaacaaatataaaatacttgctttgctctttttgctctaaatactactacaatatgtagttagaataaatgtattatgttctaacctgcaacaatagcgaataaattagttatcaaggcctaattttatttttgatctcttgatttttcacttttcgatccattgatttgtctaaaggaaTGTGTTGTGGAATCCGTATGCATA-AATA--TAAACATCATGTGTCGAGGTAAGCACCTTTGATTGGTTGCTAAAA-ATTTTG-T
gi|9 : CTAAAAATTTTGTA-GGGACGAGCTTGTATAAT--GATTTTTCAGATATTTGGAGAATAAATATAAAATACTTGCGTTGTTT--CTTTTATTTTAAA-----CGACAATGTGTAGTAGGAATCAACGT-ATTATGTTCTTACTTGTAATAATGGCGAAC-AAATCAA-TTTTCCAAGCCCTAATTTTAATTTTTGATTTCTTG-ATTATTCAGTTTTTGATCCCTTGATTTGTTAAAGGGACTAGTCATTAC--AAA-AAAAGTATTCCA----CCTTCAAAATAAACAATT------ATATTAAAA-AATAAAGGTTTCCAACATACAACTT--------------------AAAATACAAACTATACAGT-------------TAA-------GGTACTTGGAAATTTTCTACCATATTTA-TAATACTACATTTTGTATTATTTTTATCCTAGTTAAAAAA-AATTCGTACAAATG-CTCCCCAATACGGTTACGTAA----------CCCCAT-TTCAAAATTCTAAAAGCATTC---TTACTGGGT--CCCGTCTCA-TGGCAGCGagggacgagcttgtataatgatttttcagatatttggagaataaatataaaatacttgcgttgtttcttttattttaaacgacaatgtgtagtaggaatcaacgtattatgttcttacttgtaataatggcgaacaaatcaattttccaagccctaattttaatttttgatttcttgattattcagtttttgatcccttgatttgttaaagggactagtcattacaaaaaaagtattccaccttcaaaataaacaattatattaaaaaataaaggtttccaacatacaacttaaaatacaaactatacagttaaggtacttggaaattttctaccatatttataatactacattttgtattatttttatcctagttaaaaaaaattcgtacaaatgctccccaatacggttacgtaaccccatttcaaaattctaaaagcattcttactgggtcccgtctcatggcagcg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): CGATTAAAACAATTATATTCGGAACTAATGGTAGTCCCATTTTTTCGGTGTACAAATGAAACAC
Unaligned ( gi|41 ): GTCTATGAATTGATCTAGTGCATATTGTTAGAAGTTTGCCAAATGATATGGCACTGTCCG
Unaligned ( gi|42 ): TAATTTCCAATAAAAAAAAATGTAGGTGTAAAATGCGGACTTT