lowQualScore                  :                  4        6                                           
lowQualScore                  :                  .        .                                           
lowQualScore                  :                  8        3                                           
consensus                     : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
Reference ( gi|7 )            : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
gi|8                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
gi|10                         : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGTTGACAGAATCCAGTGTCTA
gi|4                          : TTGTACAGAATATTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|12                         : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACATAATCCAGTGTCTAgg
gi|6                          : TTGTACAAAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTACTGGCTGACAGAATCCAGTGTTTAgg
gi|11                         : TTTTACAGAATGTATTAAACAACACTTACATTCATATCATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|1                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGTTTACAGAAACCAGTGTCTAgg
gi|18                         : TTGTACAGATTGTTTTAATCAACACTTA-ATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAggt
gi|5                          : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGTGGACAGAATCCAGTGTCTAg
gi|3                          : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|2                          : TTGTACAGAAGGTTTTATACAACACTAACATTCATTTTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|9                          : TTGTACAGAAAGTTTAATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATGgg
gi|13                         : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGACTAT
gi|17                         : TCGTACAGAATTTTTTATACAACACAAATAACCATGTTATAGTTCTGGCTTACAGAATCCAGTGTCT
gi|16                         : TCGTACAGAATTTTTTATACAACACAAATAACCATGTTATAGTTCTGGCTTACAGAATCCAGTGTCTcg
gi|14                         : TTGCACAGAATGTTTTATACAACACCAGCATTCATTTTATAGTTCTGGCTAACA-ACTTCAGTTCCTAcg
gi|15                         :  TGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGTCTAgg





Alignments
lowQualScore                  :                  1        2                                           
lowQualScore                  :                  .        .                                           
lowQualScore                  :                  0        6                                           
consensus                     : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTNACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
Reference ( family-5180 )     : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
gi|1                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGTTTACAGAAACCAGTGTCTA
gi|10                         : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGTTGACAGAATCCAGTGTCTAggt
gi|11                         : TTTTACAGAATGTATTAAACAACACTTACATTCATATCATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|12                         : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACATAATCCAGTGTCTAgg
gi|13                         : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGACTATgg
gi|14                         : TTGCACAGAATGTTTTATACAACACCAGCATTCATTTTATAGTTCTGGCTAACA-ACTTCAGTTCCTA
gi|15                         :  TGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|16                         : TCGTACAGAATTTTTTATACAACACAAATAACCATGTTATAGTTCTGGCTTACAGAATCCAGTGTCTgg
gi|17                         : TCGTACAGAATTTTTTATACAACACAAATAACCATGTTATAGTTCTGGCTTACAGAATCCAGTGTCTcg
gi|18                         : TTGTACAGATTGTTTTAATCAACACTTA-ATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAcg
gi|2                          : TTGTACAGAAGGTTTTATACAACACTAACATTCATTTTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAg
gi|3                          : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|4                          : TTGTACAGAATATTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|5                          : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGTGGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|6                          : TTGTACAAAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTACTGGCTGACAGAATCCAGTGTTTAgg
gi|7                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATGgg
gi|8                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
gi|9                          : TTGTACAGAAAGTTTAATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG





Alignments
lowQualScore                  :                  1        1                                           
lowQualScore                  :                  .        .                                           
lowQualScore                  :                  0        0                                           
consensus                     : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTNACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
Reference ( family-5180 )     : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTNACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
gi|1                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGTTTACAGAAACCAGTGTCTA
gi|10                         : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGTTGACAGAATCCAGTGTCTAggt
gi|11                         : TTTTACAGAATGTATTAAACAACACTTACATTCATATCATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|12                         : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACATAATCCAGTGTCTAgg
gi|13                         : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGACTATgg
gi|14                         : TTGCACAGAATGTTTTATACAACACCAGCATTCATTTTATAGTTCTGGCTAACA-ACTTCAGTTCCTA
gi|15                         :  TGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|16                         : TCGTACAGAATTTTTTATACAACACAAATAACCATGTTATAGTTCTGGCTTACAGAATCCAGTGTCTgg
gi|17                         : TCGTACAGAATTTTTTATACAACACAAATAACCATGTTATAGTTCTGGCTTACAGAATCCAGTGTCTcg
gi|18                         : TTGTACAGATTGTTTTAATCAACACTTA-ATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAcg
gi|2                          : TTGTACAGAAGGTTTTATACAACACTAACATTCATTTTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAg
gi|3                          : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|4                          : TTGTACAGAATATTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|5                          : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGTGGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|6                          : TTGTACAAAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTACTGGCTGACAGAATCCAGTGTTTAgg
gi|7                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATGgg
gi|8                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
gi|9                          : TTGTACAGAAAGTTTAATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG


blockSeqs                     :                  A        T
blockSeqs                     :                  A        T
blockSeqs                     :                  A        A
blockSeqs                     :                  T        A
blockSeqs                     :                  T        A
blockSeqs                     :                  T        A
blockSeqs                     :                  T        A
blockSeqs                     :                  T        A
blockSeqs                     :                  A        T
blockSeqs                     :                  T        A
blockSeqs                     :                  T        A
blockSeqs                     :                  A        T
blockSeqs                     :                  T        A
blockSeqs                     :                  A        T
blockSeqs                     :                  A        T
blockSeqs                     :                  A        T
blockSeqs                     :                  T        A


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTNACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
finalCons                     : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTNACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG





Alignments
lowQualScore                  :                  1        1                                           
lowQualScore                  :                  .        .                                           
lowQualScore                  :                  0        0                                           
consensus                     : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTNACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
Reference ( family-5180 )     : TTGTACAGAATGTTTTANACAACACTNACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
gi|1                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGTTTACAGAAACCAGTGTCTA
gi|10                         : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGTTGACAGAATCCAGTGTCTAggt
gi|11                         : TTTTACAGAATGTATTAAACAACACTTACATTCATATCATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|12                         : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACATAATCCAGTGTCTAgg
gi|13                         : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGACTATgg
gi|14                         : TTGCACAGAATGTTTTATACAACACCAGCATTCATTTTATAGTTCTGGCTAACA-ACTTCAGTTCCTA
gi|15                         :  TGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|16                         : TCGTACAGAATTTTTTATACAACACAAATAACCATGTTATAGTTCTGGCTTACAGAATCCAGTGTCTgg
gi|17                         : TCGTACAGAATTTTTTATACAACACAAATAACCATGTTATAGTTCTGGCTTACAGAATCCAGTGTCTcg
gi|18                         : TTGTACAGATTGTTTTAATCAACACTTA-ATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAcg
gi|2                          : TTGTACAGAAGGTTTTATACAACACTAACATTCATTTTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAg
gi|3                          : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTAACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|4                          : TTGTACAGAATATTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|5                          : TTGTACAGAATGTTTTATACAACACTAACATTCATATTATAGTTCTGGTGGACAGAATCCAGTGTCTAgg
gi|6                          : TTGTACAAAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTACTGGCTGACAGAATCCAGTGTTTAgg
gi|7                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATGgg
gi|8                          : TTGTACAGAATGTTTTAAACAACACTTACATTCATATTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG
gi|9                          : TTGTACAGAAAGTTTAATACAACACTAATATTCATGTTATAGTTCTGGCTGACAGAATCCAGTGTCTATG