lowQualScore : 1111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 0000000000000 1 444444444444 11 111 1 1111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22222 11111111 11111 555555555555555555 3333333333333333333333 33333333 111 22222 11111 1 66666666 111111 1 2222222 1 1111111 111 1 111111 1 1 2 1 22 3333 1 11 11 444444 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 333 222 1 1 11 1 11 3333333333 1111 1 222 2222 2222 1
lowQualScore : 0000000000000 0 777777777777 6 77 2 777 9 33 2 2 33 33 4 33 2 44 5555555555555555555 333 22 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000 22 7 77777777777 2 333 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222 2 33333333 2 0 5555 2 2 88888 555 555 33 999999999999999999 33 2 77 2 2222222222222222222222 33 88888888 888 44 77777 3 3 11111 5 7 2 6 88888888 11 88 4 3 111111 0 6 9 2 0 5 0 1 4444444 1 1 7777777 111 2 3 999999 6 7 6 0 7 0 5 11 6 6 3333 3 4 6 7 5 44 99 333333 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 4 1 6 777 000 8 3 222 7 0 4 88 0 7 5 6 66 3 1111111111 0 3 1111 3 5 6 0 777 3 8888 1111 0
lowQualScore : ............. . ............ . .. . ... . .. . . .. .. . .. . .. ................... ... .. ....................................................................................................................................................................................................... ...... .. . ........... . ... ................................................................................ ..... . ........ . . .... . . ..... ... ... .. .................. .. . .. . ...................... .. ........ ... .. ..... . . ..... . . . . ........ .. .. . . ...... . . . . . . . . ....... . . ....... ... . . ...... . . . . . . . .. . . .... . . . . . .. .. ...... . ........................................................... . . . . ... ... . . ... . . . .. . . . . .. . .......... . . .... . . . . ... . .... .... .
lowQualScore : 0000000000000 5 999999999999 7 55 9 666 1 99 2 7 11 11 1 11 0 88 4444444444444444444 555 99 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 444444 99 6 44444444444 2 999 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 66666 5 11111111 5 2 3333 5 7 99999 555 000 99 000000000000000000 99 9 99 9 1111111111111111111111 99 33333333 333 22 22222 3 3 77777 6 4 3 6 77777777 00 77 0 2 555555 5 0 9 5 1 6 7 7 9999999 4 7 0000000 777 0 3 222222 7 8 4 0 0 0 0 00 0 0 5555 0 0 0 0 0 33 33 777777 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 0 0 0 000 555 2 2 222 8 5 5 22 8 3 0 0 00 2 0000000000 8 2 2222 2 0 0 2 888 2 0000 2222 5
consensus : ATTATAAT-TAATAACAA---ATAGTAATAATAATAA------T---A-AA-TCTTT-ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCC-AGTCTGACATATGG--TCCTCTAAAACATACATA--TTAT--TTACAGCACAT--TTAAACATA-A--A-AT-----T---------AAC---AT--A--------N-------C---------A---A-A---------GT----TA------------T-T---TG----G----TC-TAGA---CG-----A----T----A----TG--------AATAT--CT-A----TA--------------ATAA--------------NT-GTT-------------AC--A-----ATG----T-A--TTAAAGATCAATTA-------C---AT-AAA---A------C------A----AA-----A----TTATGTTTATCAAT------T--AATT---C---AAA----T----A-N-AATGAGTA-NAA-A--A-T--GAT-AATT----CAGATNTTAGA-A---N-ATTGTATA--A---A--AAT---G-AAT-TG-T-TA-TTTA--AA-AGTATTT--AAAA-TA----------------------TGTTTT--ATTGC----A-CGATTA-ATT--AGACTT-A-T-GA-CTTTCTAC-GGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-ACT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGT------AATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CC-ATGTTTTG---AAGAACAT------T-TTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCGCCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAANTACATNTTCATACNATCTTGGTTGATGTATTTTGATAGCAGTTTCATA-GTGTTATTTTN-CTTGTGATATTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTGATCGATGTNTNTNANCTTCNNNTGTTTGAACTTCAGTTGCTTAAATCANANTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTGATA-T-ATTAGATTTGGATCATNAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGTTTCGATAACGG-TATATT-CT-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATGTAAGTCTGTTT--CACAT----TCTTCAGTATATAAGA
Reference ( gi|2 ) : ATTATAATGTGAAAATGAGGTATAGTTATAATAATAA------T---A-AA-TCTT--ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCC-ATTATGACGTATGG--TCCTCTAAAACATACAAA--TTAT--TTACAGCACAT--TTAAACATA-A--A-TT-----T---------GAC---AT--A--------A-------C---------A---A-A---------GT----TA------------T-T---TG----A----TC-TAGA---TGA----A----T----A----TG--------AATAT--CT-A----TA--------------GTAA--------------AT-ATT-------------AC--A-----ATG----T-A--TTAAAGATCAATTA-------C---AT-AAA---A------C------A----AA-----A----TTATGTTTATCAATA----GT--AATC---C---AAA----T----A-T-AATGAGTG-TAA-A--A-T--GAT-AATT----CAGATATTAGA-A---A-ATTGTATA--A---A--AAT---G-GAT-TG-T-T--TTTA--AA-AGTATTT--AAAA-TA----------------------TGTTTT--ATTGC----T-AGATTT-GTT--AGACTT-A-C-GA-CTTTCTAC-GGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACTAGACATAAGGTGTGACTTAAGTGAAGCTTTAAATGACACT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTATTGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGT------GATGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTTTC--TC-ATGTTTTG---AACAACGT------T-TTCACAACAGAGT-ATTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGACCCCATATAATACATCCATAATAAAACAAAGGTAATATGTATACATTACAGAACATTTTCATACTATTTTGGTTTATGTATGTTGATAGCTATTTCATAAGTGTTA-TATA-CTTGTTATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCATACTCAATGTAGAATCAATGTGTATG-CCTTAAAGTGTTTGAACTTTAGTTGCTTGAATTACATTGTTGTCTAATTCAATGTCTAGAG-GTTGTTATTTGATA-A-ATCAGATTTGGATCCCAAAGTCATTGAGAATGTTTTACTGGCATTGATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAACCCACTTACCTTAGTTTGGAGTCAAGTTTCAATAACAGATATATT-CT-TATCTGCGGTGTATATGGTTGTGTAATCGGCATATAAGTCTGTTT--TACAT----TCTTCTGTATATAAGA
gi|8 : ATTATAAT-TAATAACAA----TAATAATAATAATAA------T---TTAA-TCTT--TATTTCTGAGGATAACATATTTTGCTATATAGCC-AGTCTGTCATATGG--TCCTCTAACACATACATA--TTAT--ATACAACACAT--T-----ATA-A--A-AT-----T---------AAC---GT--A--------T-------C---------A---A-ATACATTACTGT----TA------------T-TAAGTGTAGAA----TC-TAAA---TAATTGCA----T----A----TGTGATTAAAAGTAT--TT-G----TAAAAATGTTTTTTTTATGA--------------AT-ATTTATAATAATTGTTAC--A-----CTG----T-A--TTAAAGATCTATTA-------C---A--AAA---ATAAATTT------A----AA-----A----TTATGTTTACCAAT------T--CATT---T---AA--------------GACGA--G-TAA-A--A----AAT-AATT----CAGATCTTAGA-A---T-ATTGCAGA--A---A--AA-------AA-TG-------------A-TG-ATTT--AAAA-TA----------------------TGTTTT--ATTGC----A-CGATTA-ATT--AAACTT-A-
gi|7 : tATAGTAATAACAATAA------A---A-AA-CAAT--AATTTCTGGGGGTAACATATTTTGCTATATAGCC-AGTCTGACATATGG--TCTTCTTAGACATACATA--TTA---TTACAACATAT--TTGAACATA-A--A-AT-----TATCGTATCAAAT---AT--A--------T-------A---------A---A-A---------GT----TC------------T-T---AG----G----TT-TAGAATCTTA----A----T----AATTGCG--------CATATGACT-AAAATTATTT-----------GTAAAAAGCGTGTTATCTAT-ATTACTTGTT------AC--A-----ACG----T-A--TTAAAGACCAGTAA-------C---AT-AAA---A------CAAATATA----AA-----A----CTATGTTTGTCAAT-----TC--AAT----C---AA--------------AATGAGTA-AAA-A--A-T--GAT-AATT----CAGATGTTAGA-A---T-GTTGTATA--A---A--AAC---A-ATT-TGATAT--TTTA--AA-AGTATTT--AAAA-TA----------------------TGTTTT--ATTGC----A-CAATTA-CTT--AGACTTAA-T-GA-CTTTCTAC-GGTAGATACTTGTGCTCATGGTATACCAGACATAAGGTGTGatgacataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|22 : atcatacaagtggtcagcctttcccataatactaataATAATTATAATGATAAAAAAATT---A-AAATCTTTAATTT---GAGGATAACATATTTGGCTATACGGCC-AGTCTTGCATATGA--TCCTTTAATACGTGGATA--TTAT--TTCTCACAAAT--TTAAACTCA-A--A-AT-----T---------AAC---AT--A--------T-------C---------A---A-A---------TA----TATAAAAAACAATCT-T---TG----G----TC-TAGAGTCTTA----A----T-------------------AATTT--CT------TA--------------AT-A--------------AT-TTC-------------AT--AT----ATG------A--TTAAA
gi|5 : aaaattttataataTAGTAATATTAATAA------TTTTA-AA-TCTTT-ATTTTCTGAGTATAACACATTTGGCTGTATGACC-AGCCTGACATATCG--TCTTCTAAGAAATACATA--TTAT--TTTCAACAAAT--CTAAGCACA-GT-A-TTAACACT---------GAT---ATCAA--------A-------TATATA----A---A-A---------GC----TC------------T-T---TG----G----TC-TAGA---
gi|25 : -AA-TCTTT-ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCC-TGTCTGACATATTG--TCCTCTTAAACATATATA--TTAT--TTACAGCACAT--TTAAACATACA--ATTT-----T---------GAC---Aatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaaacatgtataataattgtaaaaatgtaataaagatcaattacatgaaaacttttaaaattccgcttaatagttcaatcaaaattagtcaaaatcgataaatcatatgttaaaaatatttttttaaatccaatatgttattttaacagtattttaaaaatatatttcgtttcacaattagttaaacctaatgattttctatgacaagcacgtgtgcgtatgatgtaccagacgcaaggtgtgccttagatgaagccttaaaaaagcccaatggttttgatgtgtgtattgatgtaggaagtttttccattca
gi|10 : -AA-TCTTT-AATTTCTGAAGGTAACATATTTACCTTTAAAGTC-AGTTTGAGATGCGA--TCAACTGAGAAATGCATA--GTGT--TTGCATCATAC--TCAAACACA-A--A-GT-----T---------AAC---AT--A--------T-------C---------ATATA-T---------GTAGAATA------------CAT---TG----A----TA-TA------GA----A----T----C----TT--------AAT-----T-A----TT--------------GTAA--------------AT-GTT-------------ATTAA-----ATGAACTT-A--TTAAAG-TAATTTA-------CGTGAT-AAA---
gi|4 : taaaacTT--ATTTTTTGAGGATAACATATTTGGCTATAAAGTC-TGTATGACTTATTT--TCCTCAAAAACATACATA--TTAT--TCACAGTACAT--TTAAACATA-A--A-AT-----T---------AAC---AT--A--------T-------CAAATATATAA---A-A---------GT----TC------------T-T---TG----G----TC-TAAA--------------------------------------AT--CT-A-----A--------------ATA------------------ATT-------------GC--AC----ATG----TAA--TTAAA-ATCATTT------------AT-AAA---A------A------A----AC-----ATATTTTATGCATATCAGTA----GT--AATtgagctaaataaacgtgattctaaaataaatatcacaatgtatcaaaattaatataggaaacatttgacattttgctcatctagcttaataaaatgaatcaatgtgatatctcaaatgtcatggatatattttataaaacaatttgatcattcaaaagcatttaaaaatatgtacttctttgcccatataattagtttttattatttt
gi|6 : tctTT--ATTTTCCGAGGATAACACATTTGGCTATAAGGCC-AGTCTGACATATCG--TCCCCT-AAACATATATA--TTAT--TTACAGCACAT--TTAAACATA-A--A-CG-----T---------GAT---AT--A--------A-------CGAATATAT-A---A-A---------GT----TC------------T-T---TG----G----TC-T--C---T---------------------------------CAT--CT------TA--------------ATA------------------ATT-------------GC--AC----ATT----T-AATTTAA--ATTATTTG-------T---A--AAA---A------C------GT---AT-----T----TTATGAATATCTATA----GTA-AATCTGAC---AAAG---T----AGG-AAT-AATA-CAA-A--A-T-------ATT-----GGATATTAAA-AATCA-ATTACACA--AAACA--AATTTAA-AAT-TA-T-G--TTTATCAATAGTAATTCAAAAA-TAATGAGAAAAAGAAATATAAAAGTATTTT--ATTGC----A-CGATTT-ATT--GGAATTGA-T-GA-CTTTCTAC-GGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTCAGTGTAGATTTAAATG---------------------GCGTATTGATGTTGGTACATGTAACTTGTTCCATTCTGTAAGACCGCATATAGAAAACGCCCTGCCATATGATGTTGTCTAAAAGCTAGGAACATGT------AATGTATtgttacaatgtattaaagattaattacataaaacaaatttaaacttatgtttatcaattaaaatttaatgagtaaaagaaagataattcagatattggaatattgtataaaaatgatagtttaaaagtatataaaatgtgttttattgcacgattaatcagacttaatgacttttacggtagttgtatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgactttagtgaagcttttaatgagtgaatttgaatgacgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggaccgcatatagaaaacgccctgtcatataatgtcgtgtgagatctaggaccatgtaaagtatcattggtagacgatctgaagttttccatgttttgaagaacataaaacatattcaacacagagtcatt
gi|11 : tTT--ATTTCCTGAGGATAACATATTTAGTCACATTGCC-AGTCTGAGAAACAG--TCCTCTAAAACATACATA--TTAT--TTACAACGCAT--TTAAACATA-A--A-AT-----T---------AGC---AT--A--------T-------C---------G---A-A---------TA----TA------------T-T---
gi|18 : aaTT--ATTTTCTGAGAATAACATATTTAGCTATATAGCC-AGTCTGACATATGG--TCCTCTAAAACAGACATA--TTAT--TTACAGCACAT--TTAAACATA-A--A-AT-----T---------AAC---AT--A--------T-------CAAATATATAA---A-A---------GT----CC------------T-T---TG----G----TC-AAGA--------------------------------------AT--CT-----------------------TAA--------------GA-ATT-------------GC--AC----ATGA---A-A--TTAAA-ATTAATTG-------T---AT--AA---A------C------G-----------------TATTTTAATGAATAT---CT--AA-G---C---AAATGT-T----A-T-AATGA--A-TAA-A--G-T----T-AA-C----CAATCTTTAGA-A---A-ctttggacttaattcttaataattgcacataattttaaaaaaattgtgaaaatccattttcacaaatatttataatagttgttacagtgtattaaaggtcaactactgatttaaaattatgtttatcacttcaagtgaaatgattaaaaaaatggtaattcagatgttagaatattgtataacaatttgatagtttaaaagtatttaaaatataattcacagcacaattaattagacttaatgatcttttgacaggtacttgtgctcatggtgcaccagacgcatggt
gi|3 : ttctTTGTGAGAATAACATATTTGGTTTCATAGCC-AGTCTGACATATGG--TCCTCTTAAACAAACATA--TTAT--TTACAACATAC--TTAATCATA-A--A-AT-----T---------AAC---AT--A--------T-------C---------A---A-A---------------TA------------T-A---TG----AAAAGTCTTTGG---TG----------T----A-----G--------AATCT--TT-A----TA-----------------------------------ATT-------------GC--AC----ATG----TGA--TTAAA-ATTATTT------------GT-AAA---A------C------G-----------------TATTTCTGTGAATATTTTAT--AAT---------AA----TTGCCA-T-AATGTAT--TAA-A-------GATCAATTAGGACAAACATAAAACA---A-ATT---CA--A---A--ATT---G-AAT-TG-gagagccaagtaaaactttatcaaaataaccgagtgttcctttaagggt
gi|20 : aTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAG-C-A-TGTAAC--ATGGGCTCCTCTATGAGATACATA--TTAT--TAACA--AAAG--TTAAACACA-A--A-GT-----T----------ACTTTAT--A--------ATATACATC---------A---A-C---------GC----TC------------T-T---TA----A----TC-TAGA---T-----------------------------------T--CT-T----TA---------------TAA--------------AT-G-C-------------AC--------ATG----TGG--TTAAA-CTTAATTG-------T---TT-AAA---A------C----------------------------TCGATTAATC----GT--AATT---TTAGAAATATTT----A-T-AATAATTGTTAC-A--G-T--G-T-AAGT----AAGATaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|14 : GCTATATAACCTGTCA-GATATGTGA--CCCTATTAAACATACATA--TTAT--TTACAACACAT--CTAAAGA-A-A--A-AA-----T---------AAC---AT--A--------T-------C---------A---A-
gi|16 : tc-ATTCTGACATATGG--TCATCTAAAACGTACATA--TTAT--TTACAACAT-T--TTAAACATA-A--A-AT-----T---------AAC---AT--A--------A-------C---------A---A-ctatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcattaaagttatttgagaaaacgtatcctatgaatatttttaataattattacaatgttttaaagatccattacataaaacaaatttaaaaatatgtttatcaatttaatttaaatgagtgaaaacggataattcatatcttagaatgttgtataataaaatttaaaaagtattgaaaatatattttattgttcggttagctagacttgatgactttctacggtagatacctgtgttcatga
gi|4 : cgTCTAAAATCTA--AA--TAAT--T----GCACAT--GTAATTAAA-ATCA-TT-----T---------------AT--A--------A-------A---------A---A-A---------ACA---TA------------T-T---T--------------------------------T----A----TG--------CATAT--CA-G----TA--------------GTAA--------------TT-GTT-------------AC--A-----ATG----T-A--TTAAAGATTAATTA-------C---AT-AAA---A------C------A----AATTTAAAC---TTATGTTTATCAAT------T--AA----------AA----T----T-T-AATGAGTA-AAAGA--A-A--GAT-AATT----CAGATATTGGA-A---T-ATTGTATA--A---A--AAT---G--AT-AG-T-T--T--A--AA-AGTATAT--AAAA-TG----------------------TGTTTT--ATTGC----A-CGATTA-ATC--AGACTT-AAT-GA-CTTT-TAC-GGTAGTTGTATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTTAGTGAAGCTTTTAATGA------GTGAATTTGAATG-ACGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATAATGTCGTGTGAGATCTAGGACCATGT------AAAGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTT----CC-ATGTTTTG---AAGAACATAAAACATATTCAACACAGAGTCATTtatataaaagttccttggtatacaaaccttatgattgcacacgtgattaaaactatttgtaaacacgttcttttataaatatggataataattgttacaatgtattaaaaatcatttacattaaacaaattaaaaattatgtttatcaattcaatttaaatgagtaaaaaagataattaagatgttttgatctggttcattaatttaaaagtatttatttattgcac
gi|1 : tctttattttttgaggataacatatttggctataaagtctgtatgacttattttcctcaaaaacatacatattattcacagtacatttaaacataaaattaacatatcaaatatataaaagttctttggACATACATA--TTAT--TTACAGCACAT--TTAAACATA-A--A-AT-----T---------AAC---AT--ATTAAATATA-------T---------A---ATA---------GT----TC------------T-T---TG----G----TC-TA------GA----A----T----
gi|9 : ACA-ACTAG--TTGT--TTA-AGGACCC--ATAAAAATG-T--A-TT-----T-----------T---TT--A--------A-------A---------A---A-A---------------TA------------T-T---T----------------A---TGAT---A----T----A----T-----------TGT--TC-A----TT--------------GT-----------------T-GTT-------------AC--A-----ATG------A--TTAAA-ATCAATAA-------C---AT-AAA---A------CATTT--A----AA-----A----TTTTGATTAT--------------------C---AAA----T----A-A-AATTAGT--CAA-A--A-TTCAGT-AA-T----CAGAGATT-----------TTGTAT---A---A--AAT---A-ATT-TG-A-TAATTTA--AT-AGTATAT--AAAA-AAG---------------------TGTT-----TTGC----A-CAATTA-ATT--AGACTT-T-C-GA----------------------TGCTTCTGGTGTGCCAGGCATAAGGTTTACCTT---TGCGGC---AAAT---------TTATGTTG---G-ACGT---------------------TTGTTTAATTTTGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCGATGTCATAAAATGTCGT------TTTA-------------------TATCATAGGTAGACGGTCTTAAGATTGTC---C-ATGcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|16 : aacacaaaattaacataccaaatatataaaaagttctttggtctagaatcttaataatgcATACAAACCTTATGATTGCA-CACGTGATTAAAACTA------TT-----T---------G------T--A--------A-------A---------C---A-C---------GT----TC------------T-T---T--------------------------------T----A----TA--------AATAT--GG-A----TA--------------ATAA--------------TT-GTT-------------AC--A-----ATG----T-A--TTAAAAATCATTTA-------C---AT-TAA---A------CAAATTAA----AA-----A----TTATGTTTATCAAT-----------TC--------AA----T----T-TAAATGAGTA--AA-A--A-A--GAT-AATT----AAGATGTT-----------TTG-AT-----------CT---G-GTT-CA-T-TAATTTA--AA-AGTATTT--A-------------------------------TTT--ATTGC----
gi|1 : cgattctgacatatggtcatctaaaacgtacatattatttacaacattttaaacataaaattaacataacaatatataaaagttccttggtA-A--A-AT-----T---------GAT---A--------------------C---------A---A-A---------AT----TA------------T-T---TG----T----TC--AAA---CAT----A----TTTTTA----TG--------AATAT--CT-A----TA--------------GTAA--------------TT-GTT-------------AC--A-----ATG----T-A--TTAAATATCAATTA-------C---AT-AAACAAA------TTT----A----AA-----A----TTATGTTGATCAAT------------T---C---AAA----T----A-A-AATGAGT--TAA-AGAA-A--GAT-AATT----CAGACATTAGA-A---T-ATTGTA-A--A---A--AAT---G--AT-AG-T-T--TT----AA-AGTATTT--AAAA-TG----------------------TGTTTT--ATTAC----A-CTATTA-ATT--ATACTT-AAT-GC-CTTTCTAC-GGTAGTTATATGTGCTCATGATATACAAGACATAAGGTGTGTCCTTAGTGAAGCCTTAAATGA-ACTGAGTGATTTTGAATG-CCGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGAC-GC-TATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGAAACATGT------AATGTGTCATTGGTAGACGATATTAAGTTTTTC--CC-ATGTTTTG---AAGAACAT------T-TTAACAACATAGac
gi|17 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatctta-A--A-TT-----G---------GAC---AT--ATG------AT------C---------A---A-A---------AT----TA------------T-T---TG----------T-TAAAG--CGT----ATTTTT----A----TA--------AATAT--TT------TA--------------ATTA--------------TT-GTT-------------AC--AATTATATG----T-T--TTAAAGATCAATTA-------C---AG-AAA---A------CAATTTTA----AA-----A----TTCAGTTTATCAAT------T--A----------AAT----T----A-A-AATGAGTA--AA-A--A-T--GAT-AATT----CAGATGATAGA-A---C-ATTATATA--A---A--AAC---A-ATT-TG-G-TAATTTA--AA-AGTATTC--AAAAGTA----------------------TGCTCT--ATTGC------ACACTTAATA--AGACTTAA-C-GA-CTTTCTAC-AGTAAGTACTTGTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|3 : attaatgtcaacatacatttccttaaaaatcttaat---------A---A-A---------AT----TA------------T-T---TG------------TAAAA--CGT----A----TTTCTG----TG--------AATAT--TTTA----TA--------------ATAA--------------TT-GCC-------------AT--A-----ATG----T-A--TTAAAGATCAATTAGGACAAAC---AT-AAA---A------C------A----AA-----------------T-TCAA----------AATT---G---AAT----T----G-A-AATGAATA-AAA-A--A-T--AAT-AATT----CAGATCGTAGA-G---T-ATTATATC--A---A--AC-------AT-TT-T-TAATTTA--AA-AATACTT--AAAA-TA----------------------TGTTTA--ATTGA------ACAATT-ATTTAAAAGTA-A-T-AG-TTTTCTAC-GGTAGGTACATGTGCTCATGATGAGCCTGATATAAGGTGTGCTTTAAGAGAAGCCTTAAATGA-ATT--TTGGTTTTGA-TG-GCATATTGATGTTG------GTA-CTTGTTCCATTATGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCCCTGTCACACGATGTCGTGTGAGAT-TAAGAATAGGTAGTACAGATCTATCATTGGTAGACAATCTTAAGTATATTGGTA-ATATTTTG---AATAACAT------T-TAGACAACAAAGT-ATTc
gi|14 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgatt---------A---A-A---------GT----TA------------T-T---TG----A----GA--AAA---CGT----A----TCCT-A----TG--------AATAT--TT-T----TA--------------ATAA--------------TT-ATT-------------AC--A-----ATG----T-T--TTAAAGATCCATTA-------C---AT-AAA---A------CAAATTTA----AA-----A----ATATGTTTATCAAT-----TT--AATT---T---A---------------AATGAGTG-AAA-A--C-G--GAT-AATT----CATATCTTAGA-A---T-GTTGTATAATA---A--AA---------------T--TTAA--AA-AGTATTG--AAAA-TA----------------------TATTTT--ATTGT----T-CGGTTA-GCT--AGACTTGA-T-GA-CTTTCTAC-GGTAGATACCTGTGTTCATGAtaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|5 : tcgctatataacctgtcagatatgtgaccctattaaacatacatattatttacaacacatctaaagaaaaaataacatatcaactatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcatt--------AACAT--GT-A----TA--------------ATAA--------------TT-GTA-------------AA--A-----ATG----T-A--ATAAAGATCAATTA-------C---ATGAAA---A------CTTTT--A----AA-----A----TTCCGCTTA---ATA----GTTCAATC---A---AAA----T------T-AGT------CAA-A--A-TC-GAT-AAAT----CATATGTTAAA-A---ATATTTTTTT--A---A--ATC---C-AATATG-T-TATTTTA--AC-AGTATTTTAAAAA-TA----------------------TATTTC--GTTTC----A-CAATTA-GTT--AAACCT-AAT-GA-TTTTCTAT-GACAAGCACGTGTGCGTATGATGTACCAGACGCAAGGTGTGCCTTAGATGAAGCCTTAAAAAAGCCC-AATGGTTTTGA-TGTGTGTATTGATGTAG------GAAGTTT-TTCCATTC
gi|11 : tagtaatattaataattttaaatctttattttctgagtataacacatttggctgtatgaccagcctgacatatcgtcttctaagaaatacatattattttcaacaaatctaagcacagtattaacactgatatcaaatatataaaagctctttggtctagaatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaa--------AATAT--TT-A----TA--------------ATAG--------------TT-GTT-------------AC--A-----GTG----T-A--TTAAAGGTCAACTA-------C----T-GAT---T------T------A----AA-----A----TTATGTTTATCACT------------T---C---AAG----T----G-A-AATGATTA-AAA-A--AAT--GGT-AATT----CAGATGTTAGA-A---T-ATTGTATA--A---C--AAT-------T-TG-A-TAGTTTA--AA-AGTATTT--AAAA-TA----------------------TAATTC--ACAGC----A-CAATTA-ATT--AGACTTAA-T-GATCTTTTGACAGGTACT----TGTGCTCATGGTGCACCAGACGCATGGTa
gi|19 : aattatttcctgaggataacatatttagtcacattgccagtctgagaaacagtcctctaaaacatacatattatttacaacgcatttaaacataaaattagcatatcgaatatattctttggacttaattcttaataattgcacataattttaaaaaaattgtgaaaatccattttcaca--------AATAT--TT-A----TG--------------ATA----------------TCATTG------------AC--A-----ATG----T-T--TTAAAGATAAATCA-------T---AT-TTG---A------C------ATCTAAA-----A----TTCTGCTTGT----------T--AATT---C---AAT----T----A-A-AATGGATA-AAA-A--T-T--AAT-AATT----CAGATATTAGA-A---GTATTGTATA--A---AACAAT---GTGA------------TA--------ATTT--AAAA-TACT--------------------TTTTTC--ATTACACAATGAAATGA-ATT--AGACTC-G-CTGA-TGTTATAT-GATAAGTACGTGTGCT-A-GATGGACTAGATATCAGATGTTAC
gi|24 : aatctgtttaaagatccataaaagcgattttgttaa--TTTA--AA-AATATTT--AAAA-TA----------------------TGTTTTTCGTTGC----A-CAATTA-ATT--AGACTGAA-T-GC-TTTTCTAT-GATAAGTACTTTTGTTTATGTTCTACCAGACATAATGTGTGCCTTagtagtga
gi|8 : taaaaaataatttaacaaGACATAAATTGTGTCTTCAGTGAAGCCTTAAATGA-AC--------------TG-GTGTATTGATGTTG------GTAGCTTATTCCATTtgatgat
gi|28 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgttttttttatgaatatttataataattgttacactgtattaaagatctattacaaaaataaatttaaaattatgtttaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaatACTCAATGATTTTAAATT-ACGTAT-------G------GGAGTTTGTTCAATTCTGT----------ACAGAAAAAGCCCTATCATATGAT
gi|21 : agaTTTGAATG-GCGTAT-GATGTTG------GTAGTTTGTACCATTCTGTAGGACCGCATATAAAAAGCGCCCTGTCATATATTGTCGTGTGAGATTTAGGAACATGT------AATGTGTCATTGGCAGACGATCTTAAG-TTTTC--TC-ATGTTTTG---AAGAACAT------T-TTGACAATACAGT-AT
gi|15 : TTGAAGG-TCGTATTGATGTTA------GTGGCTTGTTCCATTCTGTAGGACAGCATATAAAAAA-GCCATATCATATGATGTATTGTGAGATCTAGGAACATGT------TATGTATCATTGGTAGGCGATCTTTA-TTTTTT--TCGATATTTTGAAAAATAAAGT------T-TTTATAatatatattctggtgcttgttcatttattgatttgtagaccatgatccatttatga
gi|26 : attttgGGAAGATGC-------ATGAAACAATGGTAGACGATCTCAAGTTTTGT--CA-ATGTTTTG---AAGAACAA------T-TATATAACAAAAT-ATTTATtagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatattcgttccattgtcatttgcagagcac
gi|3 : gttatTCATTC-ATTGTTATTTGCAGAGCGCCataggttggtgcttgatt
gi|15 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatatTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCAC
gi|1 : attttgttgaaggtcgtattgatgttagtggcttgttccattctgtaggacagcatataaaaaagccatatcatatgatgtattgtgagatctaggaacatgttatgtatcattggtaggcgatctttatttttttcgatattttgaaaaataaagtttttatatagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatatTTTGCAGAGTACCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAAATACATTTTTATACTATCTTGGTTGATGTTTTTTGATAGCCGTTTCATACGTGTTATTTTA-CTTGTGATTTTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCC-----CAA-----AA-----GTTTTTGAACTTCATTTGTTTGAA---------------TCACAATGTTGTCAAACTTAATGTCTAGTGTGTTGTTTTTTGATATATATTAGA-TTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTAATTGACATTTACAATCAGTTT
gi|27 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATTAAATTACATGTTCATACAATCTTGGATGATGTATTTTGATAGCAATGTCAT--GTGTTATTTTG-CTTGTGATATTTTGACATAcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|12 : TCTTGGTTTATGTATTTTGATAGCAGTTTCATAGGTATTC-TTTTTCTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTGATCGATGTGTATT-CCTTTCAGTAT---AACTTCAGTTGCTTAAATTAAATTGTCGTCTAATTTAATGTCTAGTGTGTTGTTATTTGATA-T-ATTAGATTTTGATCATCAAGTCATTGAAAATGTTTTATTGACATTCATAATCATTTTGTTTTTGCTACACCACATTTTAAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGTTT------------TATT-CT-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCAGCGGCATATAAGTCTGTTT--CACAT----TCTTCAGTATATAAG
gi|13 : GTCATCTAATATAACATCTAGTGTGTTGTTATTTGATA-T-ATAAGATTTGTATCATAAAATTATTGAGAATGTTTAAATGACAGTTATTATCATTTTTGCATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGTTTCAATAACAGATATATTATT-TA-CTCCTGTGTGTATGGTTGTGT----GGCATGTAAGTCTGTTT--CACAT----TCTTCAGTATATAAGAggaaagtcgttaatgaataagagaaataaga
gi|23 : aaaTA-T-ATTATATTTGGAACTTTAAGACATTGAACATGTTTCAATG-TATCT-TAAATACTGTGTTATCGTTACACCACA-GTTTAAAATATTTCTGTCAGCTTGGAGTGAATATTCGATCAGGGTTGT-TT-AT-GATCTGCTGTGTGTATATTCGTGTCATCTGC-TGTGTGTATGTT-----CGTGTCGTCTGCTGTGTGTAatgtgttgttaatgaataagtaaataaaactggccctaagacagagccttgagggacaccgcttttaacaatttcctttgaagaaacacaagagaagtaagtagtgaaccaaacgattgaacaatcagagatttgaagagagacatttttttccaaaagc
gi|1 : TTTACAATCA-GTTTCAA-AACA--TATATT-CTCTCTCTGCTGTGTGAATTGTTGTGTCAACGGCATATAAGTCTGTTTAAAACAT----TCTTCAGTACATAAG
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AATTAAATGCTCGATGTTCTGCACTTCGTTCCTACAAGTGCGATACAAAATGAACCAACGATTGAACCAT
Alignments
lowQualScore : 22 4444444 22222 1111111111111111111 222222222 1111111111111 77777777777777777777777777777777777777777777777 11 111111111111111111111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 555555555555555555555555555555555555555 111111 222 333333333 111111 111111 1111 222222222222 2 222 1 222222 222 1111 11 9999999999999999999999999999999 11111 111
lowQualScore : 33 8888888 0 99999 2 1 2 1 4444 1 3333333333333333333 9999 666 33 999999999 777777777 888888888 2 1111111111111 66666 333 99999999999999999999999999999999999999999999999 1 11 22 333 555555555555555555555555555 3 5 22 88 6666666 1 333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 22 999 2 99999 444 33 4444 2 33333 444 22 888888888888888888888888888888888888888 2 33 55 7777777 4 222222 33 33 1 8888 2 2 555 2 2 1 5 3 33 999999999 6 3 2 000000 1 3 3 0 222222 0 2222 555555555555 11 1 8 3 0 2 2 2 1 1 1 2 3 333 0 3 1 0 6 333333 3 1 1 555 6666 2222 3 4 0 1 1 2 3 33 0 1 1 1 1 3 0 9 3 8 1111111111111111111111111111111 55555 8 0 777 0 444
lowQualScore : .. ....... . ..... . . . . .... . ................... .... ... .. ......... ......... ......... . ............. ..... ... ............................................... . .. .. ... ........................... . . .. .. ....... . ... ....................................................................... . .. ... . ..... ... .. .... . ..... ... .. ....................................... . .. .. ....... . ...... .. .. . .... . . ... . . . . . .. ......... . . . ...... . . . . ...... . .... ............ .. . . . . . . . . . . . . ... . . . . . ...... . . . ... .... .... . . . . . . . .. . . . . . . . . . . ............................... ..... . . ... . ...
lowQualScore : 88 8888888 8 22222 5 5 2 9 0000 9 5555555555555555555 0000 777 66 888888888 666666666 000000000 1 9999999999999 99999 999 66666666666666666666666666666666666666666666666 7 00 33 333 111111111111111111111111111 3 0 33 33 2222222 9 333 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 88 222 1 00000 111 11 7777 2 11111 333 99 666666666666666666666666666666666666666 2 11 33 2222222 4 444444 22 44 9 3333 7 7 777 1 1 9 3 4 44 222222222 5 6 1 555555 1 9 4 2 888888 4 4444 444444444444 66 0 0 3 7 0 5 5 0 0 0 5 5 222 0 2 0 7 7 000000 7 0 0 777 7777 0000 7 0 7 0 0 0 2 88 8 0 0 0 0 8 8 8 2 0 8888888888888888888888888888888 22222 0 8 666 8 000
consensus : ATTATAATG-TAATAATAA---ATAGTAATAATAATAA-TT--AAATCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAACATAA-A----AT-T---------A---------AC----AT---A-TC---------AA---------A---------GT-TA------------TTTG-GTC-TAG---A-------------CG-A----T----ATGA--A----TA--------TC-T-ATAATA--A--TTGT-TA----------------CA-----ATG-T-A--TTAAA-GATCAATTA-------CAT-AAA---A------C------A----AA-----A----T-TATGTTTATCAA-T---T-AATTC-----AAN---TA-AA-ATGA--GT-AAAA-AA-T--GATAATTCAGAT--GT--TA---GA-A---T-ATTGTAT--AAA--A-------------AT--G------AAT-T--G-TT-A-TTT-AAAAGT--ATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCAT-A-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--GATCGATGTGTATG-CCTTNAAGTGTTTGAACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGAT---------------------ATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
Reference ( family-514 ) : ATTATAAT--TAATAACAA---ATAGTAATAATAATAA-T---AAATCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAACATAA-A----AT-T---------A---------AC----AT---A-NC---------AA---------A---------GT-TA------------TTTG-GTC-TAG---A-------------CG-A----T----ATGA--A----TA--------TC-T-ATAATA--A--NTGT-TA----------------CA-----ATG-T-A--TTAAA-GATCAATTA-------CAT-AAA---A------C------A----AA-----A----T-TATGTTTATCAA-T---T-AATTC-----AAA---TA-NA-ATGA--GT-ANAA-AA-T--GATAATTCAGAT--NT--TA---GA-A---N-ATTGTAT--AAA--A-------------AT--G------AAT-T--G-TT-A-TTT-AAAAGT--ATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCGCCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAANTACATNTTCATACNATCTTGGTTGATGTATTTTGATAGCAGTTTCAT-A-G-TGTTATTTTNCTTGTGATATTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTGATCGATGTNTNTNANCTTCNNNTGTTTGAACTTCAGTTGCTTAAATCANANTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATNAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCGATAAC-GGT---------------------ATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATGTAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
gi|1 : ACATACATATTATTTACAGCACATTTAAACATAA-A----AT-T---------A---------AC----AT---A-TT---------AAATATATAATA---------GT-TC------------TTTG-GTC-TAG---A-------------
gi|1 : AA-A----AT-T---------G---------AT----A-------C---------AA---------A---------AT-TA------------TTTG-TTC--AA---A-------------CATA----TTTTTATGA--A----TA--------TC-T-ATAGTA--A--TTGT-TA----------------CA-----ATG-T-A--TTAAA-TATCAATTA-------CAT-AAACAAA------TTT----A----AA-----A----T-TATGTTGATCAA-T---T-----C-----AAA---TA-AA-ATGA--GTTAAAG-AA-A--GATAATTCAGAC--AT--TA---GA-A---T-ATTGTA---AAA--A-------------AT--G------A---------T-AGTTT-TAAAGT--ATTT--A-------AAA-TG------TGT--TTT--ATTACACTAT----T-AATTAT-ACTT-AATGCCTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATATACAAGACATAAGGTGTGTCCTTAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CTGAGTGATTTTGAATG-CCGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGAC-GC-TATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGAAACATGTA------ATGTGTCATTGGTAGACGATATTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTAACAACATAGatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaTTTGCAGAGTACCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAAATACATTTTTATACTATCTTGGTTGATGTTTTTTGATAGCCGTTTCAT-ACG-TGTTATTTTACTTGTGATTTTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCCCAA---AA------------GTTTTTGAACTTCATTTGTTTG---------------AATCACAATGTTGTCAAACTTAATGTCTAGTGTGTTGTTTTTTGATATATATTAGA-TTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTAATTGACATTTACAATCAGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACAATC-AGT-TTCAA-AAC-A-T---------------------ATATT-C---TCTCTCTGCTGTGTGAATTGTTGTGTCAACGGCATATAAGTCTGTTTAAAACATTCTTCAGTACATAAGcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacaAATCTTTAATTTCTGAAGGTAACATATTTACCTTTAAAGTCAGTTTGAGATGCGATCAACTGAGAAATGCATAGTGTTTGCATCATACTCAAACACAA-A----GT-T---------A---------AC----AT---A-TC---------AT---------A------------TA------------TGTA-GAA-TAC---AT------------TG-A----T----ATAG--A-----A--------TC-T--TAATT--A--TTG--TA-----------------A-----ATGTT-A--TTAAATGA--ACTTA-------T-T-AAA---G------T-----------AA-----T----T-TACG-TGATAAA-T---G-AGCT------AAA---TA-AACGTGA--TT-CTAA-AA-T----------AAAT--AT--CA---CA-A-------TGTAT--CAA--A-------------AT--T------AAT-gataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : taaaacATTA-A----AT-G---------A---------AC----TT---A-TT---------AA---------A---------GT-AA------------TTTACGTGATAA---A-------------TG-A----G----CTAA--A----TAAACGTGATTC-T-AAAATA--A--ATAT-CA----------------CA-----ATG-T-A--TCAAA--ATTAA-TA-------TAG-GAA---A------C------ATTTGAC-----A----T-TTTGCTCATC-------T-AGCTT------AA---TA-AA-ATGA--AT--CAA-TG-T--GATATCTCAAAT--GTCATG---GATA---T-ATTTTAT---AA--A-------------AC--A------ATT-T--GATC-A-TTC-AAAAGC--ATTTA-A-------AAA-TA------TGTACTTC--TTTGC-CCATA---T-AATTAGTTTTT-A-TTATTTTataggaaacatttgacattttgctcatctagcttaataaaatgaatcaatgtgatatctcaaatgtcatggatatattttataaaacaatttgatcattcaaaagcatttaaaaatatgtacttctttgcccatataattagtttttattatttt
gi|11 : taaaacaatctttaatttctgaaggtaacatatttacctttaaagtcagtttgagatgcgatcaactgagaaatgcatagtgtttgcatcatactcaaacacaaagttaacatatcatatatgtagaatacattgatatagaatcttaattattgtaaatgttTTATTTCCTGAGGATAACATATTTAGTCACATTGCCAGTCTGAGAAACAGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAACGCATTTAAACATAA-A----AT-T---------A---------GC----AT---A-TC---------GA---------A---------TA-TA------------TTC---TT-TGG---A-------------C-------------TTA--A----T---------TC-T--TAATA--A--TTGCACA----------------TA-----AT--T----TTAAA-AA--AATT
gi|11 : aaA--A----TA--------TT-T-ATAATA--G--TTGT-TA----------------CA-----GTG-T-A--TTAAA-GGTCAACTA-------C-T-GAT---T------T------A----AA-----A----T-TATGTTTATCAC-T---T-----C-----AAG---TG-AA-ATGA--TT-AAAA-AAAT--GGTAATTCAGAT--GT--TA---GA-A---T-ATTGTAT--AAC--A-------------AT-----------T-T--G-AT-AGTTT-AAAAGT--ATTT--A-------AAA-TA------TAA--TTC--ACAGCACAAT----T-AATTAG-ACTTAA-TGATCTTTT--GACAGGTACTTGTGCTCATGGTGCACCAGACGCATGGTgtgaaaatccattttcacaaatatttataatagttgttacagtgtattaaaggtcaactactgatttaaaattatgtttatcacttcaagtgaaatgattaaaaaaatggtaattcagatgttagaatattgtataacaatttgatagtttaaaagtatttaaaatataattcacagcacaattaattagacttaatgatcttttgacaggtacttgtgctcatggtgcaccagacgcatggt
gi|12 : aattatttcctgaggataacatatttagtcacattgccagtctgagaaacagtcctctaaaacatacatattatttacaacgcatttaaacataaaattagcatatcgaatatattctttggacttaattcttaataattgcacataattttaaaaaaattgtgaaaatccattttcacaTCTTGGTTTATGTATTTTGATAGCAGTTTCAT-A-GGTATTCTTTTTCTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTGATCGATGTGTATT-CCTTTCAGTAT---AACTTCAGTTGCTTAAATTAAATTGTCGTCTAATTTAATGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTTGATCATCAAGTCATTGAAAATGTTTTATTGACATTCATAATCATTTTGTTTTTGCTACACCACATTTTAAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TT---------------------------------TATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCAGCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAG
gi|13 : GTCATCTAATATAACATCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATAAGATTTGTATCATAAAATTATTGAGAATGTTTAAATGACAGTTATTATCATTTTTGCATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGAT---------------------ATATTAT---T-TA-CTCCTGTGTGTATGGTTGTGT----GGCATGTAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGAggaaagtcgttaatgaataagagaaataaga
gi|14 : aaaGCTATATAACCTGTCAGATATGTGACCCTATTAAACATACATATTATTTACAACACATCTAAAGA-AA-A----AA-T---------A---------AC----AT---A-TC---------AA---------atgtgttgttaatgaataagtaaataaaactggccctaagacagagccttgagggacaccgcttttaacaatttcctttgaagaaacacaagagaagtaagtagtgaaccaaacgattgaacaatcagagatttgaagagagacatttttttccaaaagc
gi|14 : tc---A-TT---------AA---------A---------GT-TA------------TTTG------AGAAAA-------------CGTATCC-T----ATGA--A----TA--------TT-T-TTAATA--A--TTAT-TA----------------CA-----ATG-T-T--TTAAA-GATCCATTA-------CAT-AAA---A------CAAATTTA----AA-----A----A-TATGTTTATCAATT---T-AATTT-----A---------A-ATGA--GT-GAAA-AC-G--GATAATTCATAT--CT--TA---GA-A---T-GTTGTAT--AAT--A-------------A----------AAT------TT-A-----AAAAGT--ATTG--A-------AAA-TA------TAT--TTT--ATTGTTCGGT----T-AGCTAG-ACTTGA-TGACTTTCTACGGTAGATACCTGTGTTCATGActatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcattaaagttatttgagaaaacgtatcctatgaatatttttaataattattacaatgttttaaagatccattacataaaacaaatttaaaaatatgtttatcaatttaatttaaatgagtgaaaacggataattcatatcttagaatgttgtataataaaatttaaaaagtattgaaaatatattttattgttcggttagctagacttgatgactttctacggtagatacctgtgttcatga
gi|15 : tcgctatataacctgtcagatatgtgaccctattaaacatacatattatttacaacacatctaaagaaaaaataacatatcaactatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcTTGAAGG-TCGTATTGATGTTA------GTGGCTTGTTCCATTCTGTAGGACAGCATATAAAAAA-GCCATATCATATGATGTATTGTGAGATCTAGGAACATGTT------ATGTATCATTGGTAGGCGATCTTTATTTTTTT--CGATATTTTGAAAAATAAAGT--------TTTTATA
gi|15 : attttgTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCACtagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatattcgttccattgtcatttgcagagcac
gi|16 : attttgttgaaggtcgtattgatgttagtggcttgttccattctgtaggacagcatataaaaaagccatatcatatgatgtattgtgagatctaggaacatgttatgtatcattggtaggcgatctttatttttttcgatattttgaaaaataaagtttttatatagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatatTCTGACATATGGTCATCTAAAACGTACATATTATTTACAACAT-TTTAAACATAA-A----AT-T---------A---------AC----AT---A-ACAATATATA-AA---------A---------GT-TC------------CTTG-GTA-TA
gi|16 : cgat----T----ATAA--A----TA--------TG-G-ATAATA--A--TTGT-TA----------------CA-----ATG-T-A--TTAAA-AATCATTTA-------CAT-TAA---A------CAAATTAA----AA-----A----T-TATGTTTATCAA-T---TCAATTT-----A---------A-ATGA--GT-AAAA-AA----GATAATTAAGAT--GT--T--------------TTG-AT---------------------CT--G------GTT-C--A-TTAA-TTT-AAAAGT--ATTT--A------------------------TTT--ATTGCACcaaaccttatgattgcacacgtgattaaaactatttgtaaacacgttcttttataaatatggataataattgttacaatgtattaaaaatcatttacattaaacaaattaaaaattatgtttatcaattcaatttaaatgagtaaaaaagataattaagatgttttgatctggttcattaatttaaaagtatttatttattgcac
gi|17 : cgattctgacatatggtcatctaaaacgtacatattatttacaacattttaaacataaaattaacataacaatatataaaagttccttggtatacaaaccttatgattgcacacgtgattaaaactatttgtaaacacgttctttAACATACAT-TTCCTTAAAA---ATCT-----TAATA----AT-TG--------G---------AC----ATATGA-TC---------AA---------A---------AT-TA------------TTTG---T-TAA---AG------------CGTATTTTT----ATAA--A----TA--------TT-T--TAATT--A--TTGT-TA----------------CAATTATATG-T-T--TTAAA-GATCAATTA-------CAG-AAA---A------CAATTTTA----AA-----A----T-TCAGTTTATCAA-T---T-A---------AAT---TA-AA-ATGA--GT-A-AA-AA-T--GATAATTCAGAT--GA--TA---GA-A---C-ATTATAT--AAA--A-------------AC---------AAT-TTGG-TA-A-TTT-AAAAGT--ATTC--A-------AAAGTA------TGC--TCT--ATTGCACACT----T-AATAAG-ACTTAA-CGACTTTCTACAGTAAGTACTTGTGC
gi|18 : attaatgtcTCTTTATTTTCTGAGAATAACATATTTAGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACAGACATATTATTTACAGCACATTTAAACATAA-A----AT-T---------A---------AC----AT---A-TCAAATATATAAA---------A---------GT-CC------------TTTG-GTC-AAG---A--------------------------------------A--------TC-T--TAAGA--A--TTG--CA----------------C------ATGAA-A--TTAAA--ATTAATTG-------TAT--AA---A------C------G------------------TATTTTAATGAA-TATCT-AA-GC-----AAATGTTA-TA-ATGA--AT-AAAc
gi|19 : tA--A----TA--------TT-T-ATGATATCA--TTG---A----------------CA-----ATG-T-T--TTAAA-GATAAATCA-------TAT-TTG---A------C------ATCTAAA-----A----T-TCTGCTTGT--------T-AATTC-----AAT---TA-AA-ATGG--AT-AAAA-AT-T--AATAATTCAGAT--AT--TA---GA-AG--T-ATTGTAT--AAAACA-------------AT--G----------T--G-AT-A-------------ATTT--A-------AAA-TACT----TTT--TTC--ATTACACAATGAAATGAATTAG-ACTC-GCTGATGTTATATGATAAGTACGTGTGCT-A-GATGGACTAGATATCAGATGTgttaaccaatctttagaaagagagccaagtaaaactttatcaaaataaccgagtgttcctttaagggt
gi|2 : aatctgtttaaagatccataaaagcgattttgttaaATTATAATG-TGAAAATGAGGTATAGTTATAATAATAA-T---AAATCTT-ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCATTATGACGTATGGTCCTCTAAAACATACAAATTATTTACAGCACATTTAAACATAA-A----TT-T---------G---------AC----AT---A-AC---------AA---------A---------GT-TA------------TTTG-ATC-TAG---A-------------TG-AA---T----ATGA--A----TA--------TC-T-ATAGTA--A--ATAT-TA----------------CA-----ATG-T-A--TTAAA-GATCAATTA-------CAT-AAA---A------C------A----AA-----A----T-TATGTTTATCAA-TAG-T-AATCC-----AAA---TA-TA-ATGA--GT-GTAA-AA-T--GATAATTCAGAT--AT--TA---GA-A---A-ATTGTAT--AAA--A-------------AT--G------GAT-T--G-TT---TTT-AAAAGT--ATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCTAGAT----T-TGTTAG-ACTT-A-CGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACTAGACATAAGGTGTGACTTAAGTGAAGCTTTAAATGACA--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTATTGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTG------ATGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTTTC--TCATGTTTTGAACAACG---T--------TTTCACAACAGAGT-ATTAATtacagtagtga
gi|2 : TCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGACCCCATATAATACATCCATAATAAAACAAAGGTAATATGTATACATTACAGAACATTTTCATACTATTTTGGTTTATGTATGTTGATAGCTATTTCATAA-G-TGTTA-TATACTTGTTATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCATACTCAATGTAGAATCAATGTGTATG-CCTTAAAGTGTTTGAACTTTAGTTGCTTGAATTACATTGTTGTCTAATTCAATGTCTAGAG-GTTGTTATTTG--ATAAATCAGATTTGGATCCCAAAGTCATTGAGAATGTTTTACTGGCATTGATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAACCCACTTACCTTAGTTTGGAGTCAAGT-TTCAATAACAGAT---------------------ATATT-C---T-TATCTGCGGTGTATATGGTTGTGTAATCGGCATATAAGTCTGTTT--TACATTCTTCTGTATATAAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgttcattgttatttgcagagcaccgaccccatataatacatccataataaaacaaaggtaatatgtatacattacagaacattttcatactattttggtttatgtatgttgatagctatttcataagtgttatatacttgttatattttgacatacactatctatttgtttttccatactcaatgtagaatcaatgtgtatgccttaaagtgtttgaactttagttgcttgaattacattgttgtctaattcaatgtctagaggttgttatttgataaatcagatttggatcccaaagtcattgagaatgttttactggcattgataatcattttgttatcgttacaccacatttttaacccacttaccttagtttggagtcaagtttcaataacagatatattcttatctgcggtgtatatggttgtgtaatcggcatataagtctgttttacattcttctgtatataaga
gi|20 : attataatgtgaaaatgaggtatagttataataataataaatcttattttctgaggataacatatttggctatatagccattatgacgtatggtcctctaaaacatacaaattatttacagcacatttaaacataaatttgacataacaaagttatttgatctagatgaatatgaatatctatagtaaatattacaatgtattaaagatcaattacataaaacaaaattatgtttatcaatagtaatccaaatataatgagtgtaaaatgataattcagatattagaaaattgtataaaaatggattgtttttaaaagtatttaaaatatgttttattgctagatttgttagacttacgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtactagacataaggtgtgacttaagtgaagctttaaatgacactagtgattttgaatggcgtattgatgttggtagcttgttccattctattggaccgcatatagaaaacgccctgtcatatgatgtcgtgtgagatctaggaacatgtgatgtatcattggtagacgatctgaagtttttctcatgttttgaacaacgttttcacaacagagtattaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGC--ATGTAACATGGGCTCCTCTATGAGATACATATTATTAACA--AAAGTTAAACACAA-A----GT-T---------ACTTTATAATAT----AC---A-TC---------AA---------C---------GC-TC------------TTTA-ATC-TAG---A-------------T---------------------------------TC-T--TTATA--A--ATG--CA----------------C------ATG-TGG--TTAAA--CTTAATTG-------TTT-AAA---A------C------
gi|20 : A--A----TA--------TT-T-ATAATA--A--TTGT-TA----------------CA-----GTG-T-A--tcgattaatcgtaattttagaaatatttataataattgttacagtgtaagtaagat
gi|21 : ttctgaggataacatatttggctatatagcatgtaacatgggctcctctatgagatacatattattaacaaaagttaaacacaaagttactttataatatacatcaacgctctttaatctagattctttataaatgcacatgtggttaaacttaattgtttaaaactcgattaatcgtaattttagaTTTGAATG-GCGTAT-GATGTTG------GTAGTTTGTACCATTCTGTAGGACCGCATATAAAAAGCGCCCTGTCATATATTGTCGTGTGAGATTTAGGAACATGTA------ATGTGTCATTGGCAGACGATCTTAAG-TTTTC--TCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTGACAATACAGT-ATATATagtaagat
gi|22 : --TAATAATAATT-ATAATGATAAAAA-AA-TTA-AAATCTTTAATTT--GAGGATAACATATTTGGCTATACGGCCAGTCTTGCATATGATCCTTTAATACGTGGATATTATTTCTCACAAATTTAAACTCAA-A----AT-T---------A---------AC----AT---A-TC---------AA---------A---------TA-TATAAAAAACAATCTTTG-GTC-TAG---A----------------G----T----CTTA--A----TAATT-----TC-T--TAATA--A--TT-T-CA----------------TAT----ATG---A--TTAAA-atattctggtgcttgttcatttattgatttgtagaccatgatccatttatga
gi|23 : aaaattttaTATATTATATTTGGAACTTTAAGACATTGAACATGTTTCAATG-TATCT-TAAATACTGTGTTATCGTTACACCACAGTTT-AAAATATTTCTGTCAGCTTGGAGT-GAATATTCGATCAG-GGTTGTTTATGATCTGCTGTGTGTATATT-CGTGT-CATCTGCTGTGTGTATGTTCGTGTCGTCTGC-TGT
gi|24 : --AAA--A-------------AT---------AAT-TTAA-CA-A-TTT-AAAAAT--ATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTTTCGTTGCACAAT----T-AATTAG-ACTG-AATGCTTTTCTATGATAAGTACTTTTGTTTATGTTCTACCAGACATAATGTGTGCCTTTGATGAgtgta
gi|25 : taAATCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCTGTCTGACATATTGTCCTCTTAAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAACATAC-A----AT-T---------t
gi|26 : GGAAGATGCA-------TGAAACAATGGTAGACGATCTCAAGTTTTGT--CAATGTTTTGAAGAACA---A--------TTATATAACAAAAT-ATTTATttgaca
gi|27 : gttatCATTAAATTACATGTTCATACAATCTTGGATGATGTATTTTGATAGCAATGTCAT---G-TGTTATTTTGCTTGTGATATTTTGACATAataggttggtgcttgatt
gi|28 : GA-A--CTCAATGATTTTAAATT-ACGTAT-------G------GGAGTTTGTTCAATTCTG----------TACAGAAAAAGCCCTATCATATGAT
gi|3 : aTTGTGAGAATAACATATTTGGTTTCATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTTAAACAAACATATTATTTACAACATACTTAATCATAA-A----AT-T---------A---------AC----AT---A-TC---------AA---------A---------
gi|3 : aTAT-A----AT-T---------GC--------AC----ATGTGA-TT---------AA---------A---------AT-TA------------TTTG-----TAA---AA------------CGTA----TTTCTGTGA--A----TA--------TT-TTATAATA--A--TTGC-CA----------------TA-----ATG-T-A--TTAAA-GATCAATTAGGACAAACAT-AAA---A------C------A----AA------------------T-TCAA-------AATTG-----AAT---TG-AA-ATGA--AT-AAAA-AA-T--AATAATTCAGAT--CG--TA---GA-G---T-ATTATAT--CAA--A-------------C-----------AT-T--T-TT-AATTT-AAAAAT--ACTT--A-------AAA-TA------TGT--TTA--ATTGAACAAT----T-ATTTAA-AAGT-AATAGTTTTCTACGGTAGGTACATGTGCTCATGATGAGCCTGATATAAGGTGTGCTTTAAGAGAAGCCTTAAATGA-A--TT--TTGGTTTTG-ATG-GCATATTGATGTTG------GTA-CTTGTTCCATTATGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCCCTGTCACACGATGTCGTGTGAGAT-TAAGAATAGGTAGTACAGATCTATCATTGGTAGACAATCTTAAGTATATTGGTAATATTTTGAATAACA---T--------TTAGACAACAAAGT-ATTTAtatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|3 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatcttTCATTC-ATTGTTATTTGCAGAGCGCCaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|4 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatatTCTTTATTTTTTGAGGATAACATATTTGGCTATAAAGTCTGTATGACTTATTTTCCTCAAAAACATACATATTATTCACAGTACATTTAAACATAA-A----AT-T---------A---------AC----AT---A-TCAAATATATAAA---------A---------GT-TC------------TTTG-GTC-TAA---A--------------------------------------A--------TC-T-A-AATA--A--TTG--CA----------------C------ATG-TAA--TTAAA--ATCATTT---------AT-AAA---A------A------A----AC-----ATATTT-TATGCATATCAG-TAG-T-AATT-------GT---TA-CA-ATGT--AT-TAAA-GA-T----TAATT
gi|4 : TCTAAAATCTAAATA--ATT----GCACATGTAAT--TAA-A----AT-C---------A---------TTT---AT---A-AA---------AA---------A---------ACATA------------TTT----------------------------------T----ATGC--A----TA--------TC-A-GTAGTA--A--TTGT-TA----------------CA-----ATG-T-A--TTAAA-GATTAATTA-------CAT-AAA---A------C------A----AATTTAAAC---T-TATGTTTATCAA-T---T-AA---------AA---TT-TA-ATGA--GT-AAAAGAA-A--GATAATTCAGAT--AT--TG---GA-A---T-ATTGTAT--AAA--A-------------AT--G------A---------T-AGTTT-AAAAGT--ATAT--A-------AAA-TG------TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATCAG-ACTT-AATGACTTT-TACGGTAGTTGTATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTTAGTGAAGCTTTTAATGA--------GTGAATTTGAATG-ACGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATAATGTCGTGTGAGATCTAGGACCATGTA------AAGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTT----CCATGTTTTGAAGAACA---TAAAACATATTCAAC-ACAGAGTCATTacataaaacaaatttaaacttatgtttatcaattaaaatttaatgagtaaaagaaagataattcagatattggaatattgtataaaaatgatagtttaaaagtatataaaatgtgttttattgcacgattaatcagacttaatgacttttacggtagttgtatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgactttagtgaagcttttaatgagtgaatttgaatgacgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggaccgcatatagaaaacgccctgtcatataatgtcgtgtgagatctaggaccatgtaaagtatcattggtagacgatctgaagttttccatgttttgaagaacataaaacatattcaacacagagtcatt
gi|5 : tctttattttttgaggataacatatttggctataaagtctgtatgacttattttcctcaaaaacatacatattattcacagtacatttaaacataaaattaacatatcaaatatataaaagttctttggTAGTAATATTAATAA-TTTTAAATCTTTATTTTCTGAGTATAACACATTTGGCTGTATGACCAGCCTGACATATCGTCTTCTAAGAAATACATATTATTTTCAACAAATCTAAGCACAG-T----AT-T---------A---------ACACTGAT---A-TCAAATATATAAA---------A---------GC-TC------------TTTG-GTC-TAG---A----------------A----T----CTTA--AG---TGATGC----TCAT-GTAATG--A--A-----A----------------CC-----TTT-T-G--TTAAA-AATC------------CAT-A-------------------A----AA-----A----TGTAAATTTA--AA-------AA--C-----ATG---TA-TA-ATAATTGT-A-AA-AA-T--G-TAATAAAGATCAAT--TACATGA-A---A-ACTTT-T--AAA--A-------------TTCCGCTT---AAT-A--G-TTCA-ATC-AAAATT--AGTC--A-------AAA-T
gi|5 : A--A----CA--------TG-T-ATAATA--A--TTGT-AA----------------AA-----ATG-T-A--ATAAA-GATCAATTA-------CATGAAA---A------CTTTT--A----AA-----A----T-TCCGCTTA---A-T-----AGTTC-----AAT---CA-AA-ATTA--GT--CAA-AA-TC-GATAAATCATAT--GT--TA---AA-A---ATATTTTTT--TAA--A-------------TC--C------AATAT--G-TT-A-TTTTAACAGT--ATTTTAA-------AAA-TA------TAT--TTC--GTTTCACAAT----T-AGTTAA-ACCT-AATGATTTTCTATGACAAGCACGTGTGCGTATGATGTACCAGACGCAAGGTGTGCCTTAGATGAAGCCTTAAA-AA-AGCCC-AATGGTTTTG-ATGTGTGTATTGATGTAG------GAAGTTT-TTCCATTCcgataaatcatatgttaaaaatatttttttaaatccaatatgttattttaacagtattttaaaaatatatttcgtttcacaattagttaaacctaatgattttctatgacaagcacgtgtgcgtatgatgtaccagacgcaaggtgtgccttagatgaagccttaaaaaagcccaatggttttgatgtgtgtattgatgtaggaagtttttccattca
gi|6 : tagtaatattaataattttaaatctttattttctgagtataacacatttggctgtatgaccagcctgacatatcgtcttctaagaaatacatattattttcaacaaatctaagcacagtattaacactgatatcaaatatataaaagctctttggtctagaatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaTTTATTTTCCGAGGATAACACATTTGGCTATAAGGCCAGTCTGACATATCGTCCCCT-AAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAACATAA-ACGTGATAT---------A---------ACGA--AT---ATAT---------AA---------A---------GT-TC------------TTTG-GTC-T-------------------C-------T---------------CA--------TC-T--TAATA--A--TTG--CA----------------C------ATT-T-AATTTAA---ATTATTTG-------TA--AAA---A------C------GT---AT-----T----T-TATGAATATCTA-TAG-T-AAATCTGACAAAG---TAGGA-AT-A--AT-ACAA-AA-T------ATT-GGAT--AT--TA---AA-AATCA-ATTACAC--AAA--ACAAATTTAAAATTAT--GTTTATCAAT-A--G-TA-A-TTC-AAAAAT--AATG--AGAAAAAGAAA-TATAAAAGTAT--TTT--ATTGCACGAT----T-TATTGG-AATTGA-TGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTCAGTG------TAGA----------------TTTAAATG-GCGTATTGATGTTGGTACATGTAACTTGTTCCATTCTGTAAGACCGCATATAGAAAACGCCCTGCCATATGATGTTGTCTAAAAGCTAGGAACATGTA------ATGTATa
gi|7 : ATAATACTAATAA-------TAGTAATAACAATAA-A---AAA-CAATAATTTCTGGGGGTAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCTTCTTAGACATACATATTA-TTACAACATATTTGAACATAA-A----AT-TATCGTATCAA---------AT----AT---A-TA---------AA---------A---------GT-TC------------TTAG-GTT-TAG---AATCTTAATAATTGCGCA----T----ATGACTAAAATTA--------TT-T-GTAAAA--AGCGTGT-TATCTATATTACTTGTTACA-----ACG-T-A--TTAAA-GACCAGTAA-------CAT-AAA---A------CAAATATA----AA-----A----C-TATGTTTGTCAA-T---T-CAATC-----AA--------A-ATGA--GT-AAAA-AA-T--GATAATTCAGAT--GT--TA---GA-A---T-GTTGTAT--AAA--A-------------AC--A------ATT-T--G-AT-ATTTT-AAAAGT--ATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCACAAT----T-ACTTAG-ACTTAA-TGACTTTCTACGGTAGATACTTGTGCTCATGGTATACCAGACATAAGGTGTG
gi|8 : atcatacaagtggtcagcctttcccATTATAAT--TAATAACAA----TAATAATAATAATAATT---TAATCTTTA-TTTCTGAGGATAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGTCATATGGTCCTCTAACACATACATATTATATACAACACATT-----ATAA-A----AT-T---------A---------AC----GT---A-TC---------AA---------ATACATTACTGT-TA------------TTAA-GTG-TAG---A--------------------------------------A--------TC-T-A-AATA--A--TTG--------------------CAT----ATG-TGA--TTAAA-AGT--ATT--------TGT-AAA---A---------------------------------ATGTTT------T---T---TTT-----------------ATGA--AT-AT------T--TATAAT--AATT--GT--T-------A---C-ACTGTAT--TAA--A-----------------G------ATC-T--A-TT-A---C-AAAAATAAATTT--A-------AAATTA------TGT--TT
gi|8 : t----T----ATGA--A----TA--------TT-T-ATAATA--A--TTGT-TA----------------CA-----CTG-T-A--TTAAA-GATCTATTA-------CA--AAA---ATAAATTT------A----AA-----A----T-TATGTTTACCAA-T---T-CATT------------TA-AG-ACGA--GT-AAAA-A------ATAATTCAGAT--CT--TA---GA-A---T-ATTGCAGAAAAA--A-------------AT--G------A---T--G------------------ATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAA-ACTTAA-TGACaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaatgacataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|8 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgtttttttGACATAAATTGTGTCTTCAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C--------------TG-GTGTATTGATGTTG------GTAGCTTATTCCATTataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|9 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgttttttttatgaatatttataataattgttacactgtattaaagatctattacaaaaataaatttaaaattatgtttaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaat----T----ATGAT-A----TA--------TT-G-TTCATT--G--TTGT-TA----------------CA-----ATG---A--TTAAA--ATCAATAA-------CAT-AAA---A------C------ATTTAAA-----A----T-TTTG-------A-T---T-A--TC-----AAA---TA-AA-ATTA--GT--CAA-AA-TTCAGTAAT-CAGAG--AT--T--------------TTGTAT--AAA--A--------------T--A------ATT-T--G-AT-AATTT-AATAGT--ATAT--A-------AAA-AAG-----TGT--TTT-----GCACAAT----T-AATTAG-ACTT-T-CGA--------------------TGCTTCTGGTGTGCCAGGCATAAGGTTTACCTT---TGCGGC---AAAT-----------TTATGTTG---G-ACGT---------------------TTGTTTAATTTTGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCGATGTCATAAAATGTCGT------TTTA-------------------TATCATAGGTAGACGGTCTTAAGATTGT---CCATG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AATTAAATGCTCGATGTTCTGCACTTCGTTCCTACAAGTGCGATACAAAATGAACCAACGATTGAACCAT
Alignments
lowQualScore : 1 4444 1111 11111111111111111111111111111 2222222222222 666666666666666666666666666666666 111111111111111111 555555555555555555555555555555555555555 33333333333333 1111111111111111111111111111111 444444444444444444 222 333333333 111111 111111 1111 222222222222 1 22 1 44444444 111 3333333 11 88888888888888888888888888888 11111 111
lowQualScore : 9 6666 0 7777 4 1 2 22 5 3333 1 77777777777777777777777777777 666 3333333333333 777777777 888888888888 999999999999 555555555555555555555555555555555 222 0 99999999 9 22 666666666666666666 88888 44444 8888 22 99 44444 2 77777777 222222222222222222222222222222222222222 555555 2 4444 22 11111111111111 6666666 4 1 4444444444444444444444444444444 333 2 1 33 2 4 4 444 22 333333333333333333 2 2 33 55 6 55 33 33 1 8888 2 2 555 2 2 1 5 3 33 999999999 6 3 2 000000 1 3 0 222222 0 2222 555555555555 11 1 8 3 1 1 1 1 1 33 0 44 6 55555555 3 333 1 7777777 2 3 33 0 1 1 1 1 3 0 9 3 8 22222222222222222222222222222 55555 8 0 777 444
lowQualScore : . .... . .... . . . .. . .... . ............................. ... ............. ......... ............ ............ ................................. ... . ........ . .. .................. ..... ..... .... .. .. ..... . ........ ....................................... ...... . .... .. .............. ....... . . ............................... ... . . .. . . . ... .. .................. . . .. .. . .. .. .. . .... . . ... . . . . . .. ......... . . . ...... . . . ...... . .... ............ .. . . . . . . . . .. . .. . ........ . ... . ....... . . .. . . . . . . . . . . ............................. ..... . . ... ...
lowQualScore : 0 8888 8 4444 4 5 2 99 5 9999 8 33333333333333333333333333333 111 8888888888888 000000000 555555555555 333333333333 777777777777777777777777777777777 999 1 88888888 6 55 777777777777777777 22222 55555 2222 55 22 88888 0 22222222 222222222222222222222222222222222222222 888888 0 2222 22 77777777777777 5555555 0 5 0000000000000000000000000000000 777 2 8 11 2 4 4 333 99 000000000000000000 2 2 11 33 7 33 11 44 9 3333 7 7 777 1 1 9 3 4 44 222222222 5 6 1 555555 1 9 2 888888 4 4444 444444444444 66 0 0 3 0 0 0 0 0 22 0 55 7 00000000 7 000 0 3333333 0 2 88 8 0 0 0 0 8 8 8 2 0 22222222222222222222222222222 22222 0 8 666 000
consensus : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT-CCTTNAAGTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
Reference ( family-514 ) : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTATGCCTTNAAGTGTTTGAACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
gi|1 : ACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---T---------AAATATATAATA---------GT-TCT------------TTG----GTC-TAG---A-
gi|1 : AA-A----AT-T---------G---------AT--------A---------C---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG----TTC--AA---A-CATA-------TTTTTATGA-ATA--------TCTATAGTA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-TATCAATT-----ACAT-A--------AACAA---A------TTT----A----A-A------A----TT------ATGT-TGA----TCAAT--T----CA-A--ATAA-------A-ATGAGTT-AAA---------G-AA-AG-A--------TAAT---TC-AGACAT--TAGA-A-TATTGTA---AAA--AATGA---------T-AGTTT-TAAA-GT--ATTT--AAAA-TG--TGT--TTT--ATTACACTAT----T-AATTAT-ACTT-AATGCCTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATATACAAGACATAAGGTGTGTCCTTAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CTGAGTGATTTTGAATG-CCGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGAC-GC-TATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGAAACATGTA------ATGTGTCATTGGTAGACGATATTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTAACAACATAGatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaTTTGCAGAGTACCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAAATACATTTTTATACTATCTTGGTTGATGTTTTTTGATAGCCGTTTCATACG-TGTTATTTTACTTGTGATTTTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCCCAA---AA--------------GTTT-----TTGAA---------CTTCATTTGTTTGAATCACAATGTTGTCAAACTTAATGTCTAGTGTGTTGTTTTTTGATATATATTAGA-TTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTAATTGACATTTACAATCAGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACAATC-AGT-TTCAA-AACA------------------------TATATT-C---TCTCTCTGCTGTGTGAATTGTTGTGTCAACGGCATATAAGTCTGTTTAAAACATTCTTCAGTACATAAGcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacaAA-TCTTTAATTTCTGAAGGTAACATATTTACCTTTAAAGTCAGTTTGAGATGCGATCAACTGAGAAATGCATAGTGTTTGCATCATACTCAAA--CACAA-A----GT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AT---------A------------TAT------------GTA----GAA-TAC---ATTG-A-------T----ATAG-A-A--------TCT-TAATT--ATT--------G---------TA-A-----A-----TGT-T-A--TTAAATGA--ACTT-----AT-T-A--------AA------G------T-----------A-A------T----TT------ACG--TGA----TAAAT--GAGCT-A-A--ATAA-------ACGTGATT--CTA---------A-AA-T---------------------AAATAT--CACA-A----TGTAT--CAA--AATTAAT-gataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : taaaacATTA-A----AT-G---------A---------AC--------TT---AT---T---------AA---------A---------GT-AAT------------TTAC---GTGATAA---A-TG-A-------G----CTAA-ATAAACGTGATTCTAAAATA--AAT--------AT--------CACA-----A-----TG--T-A--TCAAA--ATTAA-T-----ATAG-G--------AA------A------C------ATTTGA-C------A----TT------TTGC-TCA----TC-----TAGCTTA-A---TAA-------A-ATGAAT---CA---------A-TG-TG-A--------TATC---TC-AAATGTCATGGATA-TATTTTAT---AA--AACAATT-T--GATC-A-TTC-AAAA-GC--ATTTA-AAAA-TA--TGTACTTC--TTTGC-CCATA---T-AATTAGTTTTT-A-TTATTTTataggaaacatttgacattttgctcatctagcttaataaaatgaatcaatgtgatatctcaaatgtcatggatatattttataaaacaatttgatcattcaaaagcatttaaaaatatgtacttctttgcccatataattagtttttattatttt
gi|11 : taaaacaatctttaatttctgaaggtaacatatttacctttaaagtcagtttgagatgcgatcaactgagaaatgcatagtgtttgcatcatactcaaacacaaagttaacatatcatatatgtagaatacattgatatagaatcttaattattgtaaatgttTTATTTCCTGAGGATAACATATTTAGTCACATTGCCAGTCTGAGAAACAGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAACGCATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------GC--------AT---AT---C---------GA---------A---------TA-TAT------------TC------TT-TGG---A-C----------------TTA-AT---------TCT-TAATA--ATT--------GCA-------CATA-----A-----T---T----TTAAA-AA--AATT-----
gi|11 : aaA-ATA--------TTTATAATA--GTT--------GT--------TACA-----G-----TG--T-A--TTAAA-GGTCAACT-----AC-T-G--------AT------T------T------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCACT--T----CA-A--GTGA-------A-ATGATT--AAA---------A-AAATG-G--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAC--AAT---T-T--G-AT-AGTTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TAA--TTC--ACAGCACAAT----T-AATTAG-ACTTAA-TGATCTTTT--GACAGGTACTTGTGCTCATGGTGCACCAGACGCATGGTgtgaaaatccattttcacaaatatttataatagttgttacagtgtattaaaggtcaactactgatttaaaattatgtttatcacttcaagtgaaatgattaaaaaaatggtaattcagatgttagaatattgtataacaatttgatagtttaaaagtatttaaaatataattcacagcacaattaattagacttaatgatcttttgacaggtacttgtgctcatggtgcaccagacgcatggt
gi|12 : aattatttcctgaggataacatatttagtcacattgccagtctgagaaacagtcctctaaaacatacatattatttacaacgcatttaaacataaaattagcatatcgaatatattctttggacttaattcttaataattgcacataattttaaaaaaattgtgaaaatccattttcacaTCTTGGTTTATGTATTTTGATAGCAGTTTCATA-GGTATTCTTTTTCTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTG--ATCGATGTGTATTCCTTTCAGTAT---AACTTCAGTTGCTTAAATTAAATTGTCGTCTAATTTAATGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTTGATCATCAAGTCATTGAAAATGTTTTATTGACATTCATAATCATTTTGTTTTTGCTACACCACATTTTAAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TT----------------------------------TATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCAGCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAG
gi|13 : GTCATCTAATATAACATCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATAAGATTTGTATCATAAAATTATTGAGAATGTTTAAATGACAGTTATTATCATTTTTGCATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATTAT---T-TA-CTCCTGTGTGTATGGTTGTGT----GGCATGTAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGAggaaagtcgttaatgaataagagaaataaga
gi|14 : aaaGCTATATAACCTGTCAGATATGTGACCCTATTAAACATACATATTATTTACAACACATCTAAA--GA-AA-A----AA-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------atgtgttgttaatgaataagtaaataaaactggccctaagacagagccttgagggacaccgcttttaacaatttcctttgaagaaacacaagagaagtaagtagtgaaccaaacgattgaacaatcagagatttgaagagagacatttttttccaaaagc
gi|14 : tc---AT---T---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG---------AGAAAA-CGTATCC----T----ATGA-ATA--------TTTTTAATA--ATT--------AT--------TACA-----A-----TG--T-T--TTAAA-GATCCATT-----ACAT-A--------AA------A------CAAATTTA----A-A------A----AT------ATGT-TTA----TC------AATTTA-A--TTTA-------A-ATGAGT--GAA---------A-AC-GG-A--------TAAT---TC-ATATCT--TAGA-A-TGTTGTAT--AAT--AA--AAT------TT-A-----AAAA-GT--ATTG--AAAA-TA--TAT--TTT--ATTGTTCGGT----T-AGCTAG-ACTTGA-TGACTTTCTACGGTAGATACCTGTGTTCATGActatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcattaaagttatttgagaaaacgtatcctatgaatatttttaataattattacaatgttttaaagatccattacataaaacaaatttaaaaatatgtttatcaatttaatttaaatgagtgaaaacggataattcatatcttagaatgttgtataataaaatttaaaaagtattgaaaatatattttattgttcggttagctagacttgatgactttctacggtagatacctgtgttcatga
gi|15 : tcgctatataacctgtcagatatgtgaccctattaaacatacatattatttacaacacatctaaagaaaaaataacatatcaactatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcTTGAAGG-TCGTATTGATGTTA------GTGGCTTGTTCCATTCTGTAGGACAGCATATAAAAAA-GCCATATCATATGATGTATTGTGAGATCTAGGAACATGTT------ATGTATCATTGGTAGGCGATCTTTATTTTTTT--CGATATTTTGAAAAATAAAGT--------TTTTATA
gi|15 : attttgTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCACtagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatattcgttccattgtcatttgcagagcac
gi|16 : attttgttgaaggtcgtattgatgttagtggcttgttccattctgtaggacagcatataaaaaagccatatcatatgatgtattgtgagatctaggaacatgttatgtatcattggtaggcgatctttatttttttcgatattttgaaaaataaagtttttatatagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatatTCTGACATATGGTCATCTAAAACGTACATATTATTTACAACAT-TTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------ACATAACAATAT---AT---A---------AA---------A---------GT-TCC------------TTG----GTA-TA
gi|16 : cgat---AT---T---------AA---------A---------AC-TAT------------TTG--------TAA---A-CA-CGTTCTTTT----ATAA-ATA--------TGGATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-AATCATTT-----ACAT-T--------AA------A------CAAATTAA----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TC------AATTCA-A--TTTA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA--G-A--------TAAT---TA-AGATGT--T--------TTG-AT--------CTGGTT-C--A-TTAA-TTT-AAAA-GT--ATTT--A-------------TTT--ATTGCACcaaaccttatgattgcacacgtgattaaaactatttgtaaacacgttcttttataaatatggataataattgttacaatgtattaaaaatcatttacattaaacaaattaaaaattatgtttatcaattcaatttaaatgagtaaaaaagataattaagatgttttgatctggttcattaatttaaaagtatttatttattgcac
gi|17 : cgattctgacatatggtcatctaaaacgtacatattatttacaacattttaaacataaaattaacataacaatatataaaagttccttggtatacaaaccttatgattgcacacgtgAACATACAT-TTCCTTAAAA---ATCT-------TAATA----AT-TG--------G---------AC--------ATATGAT---C---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG------T-TAA---AGCGTATTTT---T----ATAA-ATA--------TTT-TAATT--ATT--------GT--------TACAATTATA-----TG--T-T--TTAAA-GATCAATT-----ACAG-A--------AA------A------CAATTTTA----A-A------A----TT------CAGT-TTA----TCAAT--TA----A-A--TTAA-------A-ATGAGT---AA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGA--TAGA-A-CATTATAT--AAA--AAC-AAT-TTGG-TA-A-TTT-AAAA-GT--ATTC--AAAAGTA--TGC--TCT--ATTGCACACT----T-AATAAG-ACTTAA-CGACTTTCTACAGTAAGTACTTGTGC
gi|18 : attaatgtc-TCTTTATTTTCTGAGAATAACATATTTAGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACAGACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GT-CCT------------TTG----GTC-AAG---A------------------------A--------TCT-TAAGA--ATT--------G---------CAC------A-----TGA-A-A--TTAAA--ATTAATT-----GTAT----------AA------A------C------G-------------------T------ATTT-TAA----TGAAT----ATCTA-A--GCAAATGTTATA-ATGAAT--AAA---------c
gi|19 : tA-ATA--------TTTATGATATCATT--------G----------ACA-----A-----TG--T-T--TTAAA-GATAAATC-----ATAT-T--------TG------A------C------ATCTAA-A------A----TT------CTGC-TTG----T------TAATTCA-A--TTAA-------A-ATGGAT--AAA---------A-AT-TA-A--------TAAT---TC-AGATAT--TAGA-AGTATTGTAT--AAAACAATG----T--G-AT-A--------------ATTT--AAAA-TACTTTT--TTC--ATTACACAATGAAATGAATTAG-ACTC-GCTGATGTTATATGATAAGTACGTGTGCT-A-GATGGACTAGATATCAGATGTgttaaccaatctttagaaagagagccaagtaaaactttatcaaaataaccgagtgttcctttaagggt
gi|2 : aatctgtttaaagatccataaaagcgattttgttaaATTATAATGTGAAAATGAGGTATAGTTATAATAATAAT---AAA-TCTT-ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCATTATGACGTATGGTCCTCTAAAACATACAAATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----TT-T---------G---------AC--------AT---AA---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----ATC-TAG---A-TG-AA------T----ATGA-ATA--------TCTATAGTA--AAT--------AT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAATAGTAATCCA-A--ATAT-------A-ATGAGT--GTA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATAT--TAGA-A-AATTGTAT--AAA--AATGGAT-T--G-TT---TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCTAGAT----T-TGTTAG-ACTT-A-CGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACTAGACATAAGGTGTGACTTAAGTGAAGCTTTAAATGACA--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTATTGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTG------ATGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTTTC--TCATGTTTTGAACAACG---T--------TTTCACAACAGAGT-ATTAATtacagtagtga
gi|2 : TCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGACCCCATATAATACATCCATAATAAAACAAAGGTAATATGTATACATTACAGAACATTTTCATACTATTTTGGTTTATGTATGTTGATAGCTATTTCATAAG-TGTTATAT-ACTTGTTATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCATACTCAATGT--AGAATCAATGTGTATGCCTTAAAGTGTTTGAACTTTAGTTGCTTGAATTACATTGTTGTCTAATTCAATGTCTAGAG-GTTGTTATTTG--ATAAATCAGATTTGGATCCCAAAGTCATTGAGAATGTTTTACTGGCATTGATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAACCCACTTACCTTAGTTTGGAGTCAAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCGGTGTATATGGTTGTGTAATCGGCATATAAGTCTGTTT--TACATTCTTCTGTATATAAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgttcattgttatttgcagagcaccgaccccatataatacatccataataaaacaaaggtaatatgtatacattacagaacattttcatactattttggtttatgtatgttgatagctatttcataagtgttatatacttgttatattttgacatacactatctatttgtttttccatactcaatgtagaatcaatgtgtatgccttaaagtgtttgaactttagttgcttgaattacattgttgtctaattcaatgtctagaggttgttatttgataaatcagatttggatcccaaagtcattgagaatgttttactggcattgataatcattttgttatcgttacaccacatttttaacccacttaccttagtttggagtcaagtttcaataacagatatattcttatctgcggtgtatatggttgtgtaatcggcatataagtctgttttacattcttctgtatataaga
gi|20 : attataatgtgaaaatgaggtatagttataataataataaatcttattttctgaggataacatatttggctatatagccattatgacgtatggtcctctaaaacatacaaattatttacagcacatttaaacataaatttgacataacaaagttatttgatctagatgaatatgaatatctatagtaaatattacaatgtattaaagatcaattacataaaacaaaattatgtttatcaatagtaatccaaatataatgagtgtaaaatgataattcagatattagaaaattgtataaaaatggattgtttttaaaagtatttaaaatatgttttattgctagatttgttagacttacgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtactagacataaggtgtgacttaagtgaagctttaaatgacactagtgattttgaatggcgtattgatgttggtagcttgttccattctattggaccgcatatagaaaacgccctgtcatatgatgtcgtgtgagatctaggaacatgtgatgtatcattggtagacgatctgaagtttttctcatgttttgaacaacgttttcacaacagagtattaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGC--ATGTAACATGGGCTCCTCTATGAGATACATATTATTAACA--AAAGTTAAA--CACAA-A----GT-T---------ACTTTATAATAT--------AC---AT---C---------AA---------C---------GC-TCT------------TTA----ATC-TAG---A-
gi|21 : TTTGAATG-GCGTAT-GATGTTG------GTAGTTTGTACCATTCTGTAGGACCGCATATAAAAAGCGCCCTGTCATATATTGTCGTGTGAGATTTAGGAACATGTA------ATGTGTCATTGGCAGACGATCTTAAG-TTTTC--TCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTGACAATACAGT-ATATATttctttataaatgcacatgtggttaaacttaattgtttaaaactcgattaatcgtaattttagaaatatttataataattgttacagtgtaagtaagat
gi|22 : TATAATAATAATT-ATAATGATAAAAA-AATT--AAAATCTTTAATTT--GAGGATAACATATTTGGCTATACGGCCAGTCTTGCATATGATCCTTTAATACGTGGATATTATTTCTCACAAATTTAAA--CTCAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------TA-TATAAAAAACAATCTTTG----GTC-TAG---A----G-------T----CTTA-ATAATT-----TCT-TAATA--ATT---------T--------CATAT----A-----TG----A--TTAAA-atattctggtgcttgttcatttattgatttgtagaccatgatccatttatga
gi|23 : aaaatttTATATTATATTTGGAACTTTAAGACATTGAACATGTTTCAATG-TATCT-TAAATACTGTGTTATCGTTACACCACAGTTT-AAAATATTTCTGTCAGCTTGGAGT-GAATATTCGAT--CAGGGTTGTTTATGATCTGCTGTGTGTATATT-CGTGT-CATCTGCTGTGTGTATGTTCGTGTCGTCTGC
gi|24 : --AAA--AAT-AAT-TTAA-CA-A-TTT-AAAA-AT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTTTCGTTGCACAAT----T-AATTAG-ACTG-AATGCTTTTCTATGATAAGTACTTTTGTTTATGTTCTACCAGACATAATGTGTGCCTTTGATGAtgtgtgta
gi|25 : taAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCTGTCTGACATATTGTCCTCTTAAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAC-A----AT-T---------t
gi|26 : GGAAGATGCA-------TGAAACAATGGTAGACGATCTCAAGTTTTGT--CAATGTTTTGAAGAACA---A--------TTATATAACAAAAT-ATTTATttgaca
gi|27 : gttatCATTAAATTACATGTTCATACAATCTTGGATGATGTATTTTGATAGCAATGTCAT--G-TGTTATTTTGCTTGTGATATTTTGACATAataggttggtgcttgatt
gi|28 : GA-A--CTCAATGATTTTAAATT-ACGTAT-------G------GGAGTTTGTTCAATTCTGTA----------CAGAAAAAGCCCTATCATATGAT
gi|3 : aTTGTGAGAATAACATATTTGGTTTCATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTTAAACAAACATATTATTTACAACATACTTAAT--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A------------TAT------------ATGAAAAGTC-T-----T-TG-G-------T----GTAG-A-A--------TCT-TTATA--ATT--------G---------CAC------A-----TG--TGA--TTAAA--ATTATTTGTAAAACGT-ATTTCTGTGAATATTTTA------T------A----ATA------A----TTGCCATAATGTATTAAAGATCAAT--TAGGACA-AACATAA-------A-ACAAATTCAAAATTGAATTGA-AA-TG-AATAAAAAATAATAATTC-AGATCG--TAGA-G-TATTATAT--CAA--A---CAT-T--T-TTAA-TTT-AAAA-AT--ACTT--AAAA-TA--TGT--TTA--ATTGAACAAT----T-ATTTAA-AAGTAA-TAGTTTTCTACGGTAGGTACATGTGCTCATGATGAGCCTGATATAAGGTGTGCTTTAAGAGAAGCCTTAAATGA-A--TT--TTGGTTTTG-ATG-GCATATTGATGTTG------GTA-CTTGTTCCATTATGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCCCTGTCACACGATGTCGTGTGAGAT-TAAGAATAGGTAGTACAGATCTATCATTGGTAGACAATCTTAAGTATATTGGTAATATTTTGAATAACA---T--------TTAGACAACAAAGT-ATTTA
gi|3 : aTCATTC-ATTGTTATTTGCAGAGCGCCaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|4 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatat-TCTTTATTTTTTGAGGATAACATATTTGGCTATAAAGTCTGTATGACTTATTTTCCTCAAAAACATACATATTATTCACAGTACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GT-TCT------------TTG----GTC-TAA---A------------------------A--------TCTA-AATA--ATT--------G---------CAC------A-----TG--TAA--TTAAA--ATCATTT-------AT-A--------AA------A------A------A----A-C------ATATTTT------ATGC-ATA----TCAGTAGTAATT---G--TTAC-------A-ATGTAT--TAA---------A-GA-T-----------TAAT---T
gi|4 : TCTAAAATCTAAATA--ATT----GCACATGTAAT----TAA-A----AT-C---------A---------TTT-------AT---AA---A---------AA---------A---------ACATAT------------TT----------------------------T----ATGC-ATA--------TCAGTAGTA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATTAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-ATTTAA-AC---TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAA---A-A--TTTA-------A--TGAGT--AAA---------AGAA-AG-A--------TAAT---TC-AGATAT--TGGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGA---------T-AGTTT-AAAA-GT--ATAT--AAAA-TG--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATCAG-ACTT-AATGACTTT-TACGGTAGTTGTATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTTAGTGAAGCTTTTAATGA--------GTGAATTTGAATG-ACGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATAATGTCGTGTGAGATCTAGGACCATGTA------AAGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTT----CCATGTTTTGAAGAACA---TAAAACATATTCAAC-ACAGAGTCATTacataaaacaaatttaaacttatgtttatcaattaaaatttaatgagtaaaagaaagataattcagatattggaatattgtataaaaatgatagtttaaaagtatataaaatgtgttttattgcacgattaatcagacttaatgacttttacggtagttgtatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgactttagtgaagcttttaatgagtgaatttgaatgacgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggaccgcatatagaaaacgccctgtcatataatgtcgtgtgagatctaggaccatgtaaagtatcattggtagacgatctgaagttttccatgttttgaagaacataaaacatattcaacacagagtcatt
gi|5 : tctttattttttgaggataacatatttggctataaagtctgtatgacttattttcctcaaaaacatacatattattcacagtacatttaaacataaaattaacatatcaaatatataaaagttctttggTAGTAATATTAATAATTTTAAA-TCTTTATTTTCTGAGTATAACACATTTGGCTGTATGACCAGCCTGACATATCGTCTTCTAAGAAATACATATTATTTTCAACAAATCTAAG--CACAG-T----AT-T---------A---------ACACTG----AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GC-TCT------------TTG----GTC-TAG---A-
gi|5 : A-ACA--------TGTATAATA--ATT--------GT--------AAAA-----A-----TG--T-A--ATAAA-GATCAATT-----ACATGA--------AA------A------CTTTT--A----A-A------A----TT------CCGC-TTA-------AT---AGTTCA-A--TCAA-------A-ATTAGT--CAA---------A-AT-CG-A--------TAAA---TC-ATATGT--TAAA-AATATTTTTT--TAA--ATCCAATAT--G-TT-A-TTTTAACA-GT--ATTTTAAAAA-TA--TAT--TTC--GTTTCACAAT----T-AGTTAA-ACCT-AATGATTTTCTATGACAAGCACGTGTGCGTATGATGTACCAGACGCAAGGTGTGCCTTAGATGAAGCCTTAAA-AA-AGCCC-AATGGTTTTG-ATGTGTGTATTGATGTAG------GAAGTTT-TTCCATTCatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaaacatgtataataattgtaaaaatgtaataaagatcaattacatgaaaacttttaaaattccgcttaatagttcaatcaaaattagtcaaaatcgataaatcatatgttaaaaatatttttttaaatccaatatgttattttaacagtattttaaaaatatatttcgtttcacaattagttaaacctaatgattttctatgacaagcacgtgtgcgtatgatgtaccagacgcaaggtgtgccttagatgaagccttaaaaaagcccaatggttttgatgtgtgtattgatgtaggaagtttttccattca
gi|6 : tagtaatattaataattttaaatctttattttctgagtataacacatttggctgtatgaccagcctgacatatcgtcttctaagaaatacatattattttcaacaaatctaagcacagtattaacactgatatcaaatatataaaagctctttggtctagaatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaTTTATTTTCCGAGGATAACACATTTGGCTATAAGGCCAGTCTGACATATCGTCCCCT-AAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-ACGTGATAT---------A---------ACGA------AT---ATA--T---------AA---------A---------GT-TCT------------TTG----GTC-T-------C----------T----------CA--------TCT-TAATA--ATT--------G---------CAC------A-----TT--T-AATTTAA---ATTATTT-----GTA--A--------AA------A------C------G-------------------T------AT-T-TTA----TGAAT----ATCTATA--GTAA-------ATCTGA-C--AAA---------G-TA-GGAA--------TAAT---ACAAAATAT--T-GG-A-TAT----T--AAA--AATCAA-------TT-A-CAC-AAAACAA--ATTT--AAAATTA--TGT--TTa
gi|6 : TAATA----AT-T---------GC--------AC--------ATTTAAT---T---------TA---------A---------AT-TAT------------TTG-----TA-AAA---A-CGTA-------TTTT-ATGA-ATA--------TCTATAGTA--AATCTGACAAAGTAGGAATAATACA-----AAATATTGGAT-A--TTAAA-AATCAATT-----ACAC-A--------AA------A------C------A----A-ATTTAAAA----TT------ATGT-TTA----TCA---------------------------------------------------A-TA-G--------TAAT---TC-AAA--------A-A-TAATG-AG--AAA--AA-GAA----------A-TAT-AAAA-GT--A----------------T--TTT--ATTGCACGAT----T-TATTGG-AATTGA-TGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTCAGTG------TAGA----------------TTTAAATG-GCGTATTGATGTTGGTACATGTAACTTGTTCCATTCTGTAAGACCGCATATAGAAAACGCCCTGCCATATGATGTTGTCTAAAAGCTAGGAACATGTA------ATGTATatcaatagtaattcaaaaataatgagaaaaagaaatataaaagtattttattgcacgatttattggaattgatgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgacttcagtgtagatttaaatggcgtattgatgttggtacatgtaacttgttccattctgtaagaccgcatatagaaaacgccctgccatatgatgttgtctaaaagctaggaacatgtaatgtat
gi|7 : tttattttccgaggataacacatttggctataaggccagtctgacatatcgtcccctaaacatatatattatttacagcacatttaaacataaacgtgatataacgaatatataaagttctttggtctctcatctATAAT--ACTAATAA----TAGTAATAACAATAA----AAA-ACAATAATTTCTGGGGGTAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCTTCTTAGACATACATATTA-TTACAACATATTTGAA--CATAA-A----AT-TATCGTATCAA---------AT--------AT---AT---A---------AA---------A---------GT-TCT------------TAG----GT
gi|7 : atcatacaagtggtcagcctttcccTTTAGAATCTTAATA----AT-T---------GC--------GC--------AT---ATGACT---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG--------TAA---A-AA-G-------C----GTGT--TA--------TCTATATTA--CTT--------GT--------TACA-----A-----CG--T-A--TTAAA-GACCAGTA-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-ATATAAAA----CT------ATGT-TTG----TCAAT--T----CA-A--TCAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TGTTGTAT--AAA--AACAATT-T--G-AT-ATTTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACAAT----T-ACTTAG-ACTTAA-TGACTTTCTACGGTAGATACTTGTGCTCATGGTATACCAGACATAAGGTGTGttagaatcttaataattgcgcatatgactaaaattatttgtaaaaagcgtgttatctatattacttgttacaacgtattaaagaccagtaacataaaacaaatataaaactatgtttgtcaattcaatcaaaatgagtaaaaaatgataattcagatgttagaatgttgtataaaaacaatttgatattttaaaagtatttaaaatatgttttattgcacaattacttagacttaatgactttctacggtagatacttgtgctcatggtataccagacataaggtgtg
gi|8 : atcatacaagtggtcagcctttcccataatactaataatagtaataacaataaaaaacaataatttctgggggtaacatattttgctatatagccagtctgacatatggtcttcttagacatacatattattacaacatatttgaacataaaattatcgtatcaaatatataaaagttcttaggATTATAAT-TAATAACAA----TAATAATAATAATAATT--TAA-TCTTTATTT-CTGAGGATAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGTCATATGGTCCTCTAACACATACATATTATATACAACACATT-------ATAA-A----AT-T---------A---------AC--------GT---AT---C---------AA---------ATACATTACTGT-TAT------------TAA----GTG-TAG---A------------------------A--------TCTA-AATA--ATT--------G-----------CAT----A-----TG--TGA--TTAAA-AGT--ATT------TGT-A--------AA--------------------A----A-T------G----TT------TTTT-TTA----TGAAT----ATTT-----------------------------------------A-TA-A--------TAAT---------TGT--T----A-CACTGTAT--TAA--A--GATC-T--A-TT-A---C-AAAA-ATAAATTT--AAAATTA--TGT--TT
gi|8 : t-------T----ATGA-ATA--------TTTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----C-----TG--T-A--TTAAA-GATCTATT-----ACA--A--------AA------ATAAATTT------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----CCAAT--TCATT-------TAA-------G-ACGAGT--AAA---------A-A-----A--------TAAT---TC-AGATCT--TAGA-A-TATTGCAGAAAAA--AATGA---T--G-------------------ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAA-ACTTAA-TGACaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaatgacataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|8 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgtttttttGACATAAATTGTGTCTTCAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C--------------TG-GTGTATTGATGTTG------GTAGCTTATTCCATTataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|9 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgttttttttatgaatatttataataattgttacactgtattaaagatctattacaaaaataaatttaaaattatgtttaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaat-------T----ATGATATA--------TTGTTCATT--GTT--------GT--------TACA-----A-----TG----A--TTAAA--ATCAATA-----ACAT-A--------AA------A------C------ATTTAA-A------A----TT------TTG------------AT--TA--TCA-A--ATAA-------A-ATTAGT--CAA---------A-A-----------------T---TC-AGTAAT--CAGAGA-TTTTGTAT--AAA--A-TAATT-T--G-AT-AATTT-AATA-GT--ATAT--AAAA-AAG-TGT--TTT-----GCACAAT----T-AATTAG-ACTT-T-CGA--------------------TGCTTCTGGTGTGCCAGGCATAAGGTTTACCTT---TGCGGC---AAAT-----------TTATGTTG---G-ACGT---------------------TTGTTTAATTTTGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCGATGTCATAAAATGTCGT------TTTA-------------------TATCATAGGTAGACGGTCTTAAGATTGT---CCATG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AATTAAATGCTCGATGTTCTGCACTTCGTTCCTACAAGTGCGATACAAAATGAACCAACGATTGAACCAT
Alignments
lowQualScore : 1 4444 1111 11111111111111111111111111111 2222222222222 666666666666666666666666666666666 111111111111111111 555555555555555555555555555555555555555 33333333333333 1111111111111111111111111111111 444444444444444444 222 333333333 111111 111111 1111 222222222222 1 22 1 77777777777777777777777777777777 11 88888888888888888888888888888 11111 111
lowQualScore : 9 6666 0 7777 4 1 2 22 5 3333 1 77777777777777777777777777777 666 3333333333333 777777777 888888888888 999999999999 555555555555555555555555555555555 222 0 99999999 9 22 666666666666666666 88888 44444 8888 22 99 44444 2 77777777 222222222222222222222222222222222222222 555555 2 4444 22 11111111111111 6666666 4 1 4444444444444444444444444444444 333 2 1 33 2 4 4 444 22 333333333333333333 2 2 33 55 6 55 33 33 1 8888 2 2 555 2 2 1 5 3 33 999999999 6 3 2 000000 1 3 0 222222 0 2222 555555555555 11 1 8 3 1 1 1 1 1 33 0 44 6 7 55555555555555555555555555555555 2 3 33 0 1 1 1 1 3 0 9 3 8 22222222222222222222222222222 55555 8 0 777 444
lowQualScore : . .... . .... . . . .. . .... . ............................. ... ............. ......... ............ ............ ................................. ... . ........ . .. .................. ..... ..... .... .. .. ..... . ........ ....................................... ...... . .... .. .............. ....... . . ............................... ... . . .. . . . ... .. .................. . . .. .. . .. .. .. . .... . . ... . . . . . .. ......... . . . ...... . . . ...... . .... ............ .. . . . . . . . . .. . .. . . ................................ . . .. . . . . . . . . . . ............................. ..... . . ... ...
lowQualScore : 0 8888 8 4444 4 5 2 99 5 9999 8 33333333333333333333333333333 111 8888888888888 000000000 555555555555 333333333333 777777777777777777777777777777777 999 1 88888888 6 55 777777777777777777 22222 55555 2222 55 22 88888 0 22222222 222222222222222222222222222222222222222 888888 0 2222 22 77777777777777 5555555 0 5 0000000000000000000000000000000 777 2 8 11 2 4 4 333 99 000000000000000000 2 2 11 33 7 33 11 44 9 3333 7 7 777 1 1 9 3 4 44 222222222 5 6 1 555555 1 9 2 888888 4 4444 444444444444 66 0 0 3 0 0 0 0 0 22 0 55 7 3 33333333333333333333333333333333 0 2 88 8 0 0 0 0 8 8 8 2 0 22222222222222222222222222222 22222 0 8 666 000
consensus : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT-CCTTT-AGTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
Reference ( family-514 ) : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT-CCTTNAAGTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
gi|1 : ACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---T---------AAATATATAATA---------GT-TCT------------TTG----GTC-TAG---A-
gi|1 : AA-A----AT-T---------G---------AT--------A---------C---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG----TTC--AA---A-CATA-------TTTTTATGA-ATA--------TCTATAGTA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-TATCAATT-----ACAT-A--------AACAA---A------TTT----A----A-A------A----TT------ATGT-TGA----TCAAT--T----CA-A--ATAA-------A-ATGAGTT-AAA---------G-AA-AG-A--------TAAT---TC-AGACAT--TAGA-A-TATTGTA---AAA--AATGA---------T-AGTTT-TAAA-GT--ATTT--AAAA-TG--TGT--TTT--ATTACACTAT----T-AATTAT-ACTT-AATGCCTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATATACAAGACATAAGGTGTGTCCTTAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CTGAGTGATTTTGAATG-CCGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGAC-GC-TATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGAAACATGTA------ATGTGTCATTGGTAGACGATATTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTAACAACATAGatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaTTTGCAGAGTACCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAAATACATTTTTATACTATCTTGGTTGATGTTTTTTGATAGCCGTTTCATACG-TGTTATTTTACTTGTGATTTTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCCCAA---AA-GT--------------------TTT---TG----AACTTCATTTGTTTGAATCACAATGTTGTCAAACTTAATGTCTAGTGTGTTGTTTTTTGATATATATTAGA-TTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTAATTGACATTTACAATCAGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACAATC-AGT-TTCAA-AACA------------------------TATATT-C---TCTCTCTGCTGTGTGAATTGTTGTGTCAACGGCATATAAGTCTGTTTAAAACATTCTTCAGTACATAAGcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacaAA-TCTTTAATTTCTGAAGGTAACATATTTACCTTTAAAGTCAGTTTGAGATGCGATCAACTGAGAAATGCATAGTGTTTGCATCATACTCAAA--CACAA-A----GT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AT---------A------------TAT------------GTA----GAA-TAC---ATTG-A-------T----ATAG-A-A--------TCT-TAATT--ATT--------G---------TA-A-----A-----TGT-T-A--TTAAATGA--ACTT-----AT-T-A--------AA------G------T-----------A-A------T----TT------ACG--TGA----TAAAT--GAGCT-A-A--ATAA-------ACGTGATT--CTA---------A-AA-T---------------------AAATAT--CACA-A----TGTAT--CAA--AATTAAT-gataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : taaaacATTA-A----AT-G---------A---------AC--------TT---AT---T---------AA---------A---------GT-AAT------------TTAC---GTGATAA---A-TG-A-------G----CTAA-ATAAACGTGATTCTAAAATA--AAT--------AT--------CACA-----A-----TG--T-A--TCAAA--ATTAA-T-----ATAG-G--------AA------A------C------ATTTGA-C------A----TT------TTGC-TCA----TC-----TAGCTTA-A---TAA-------A-ATGAAT---CA---------A-TG-TG-A--------TATC---TC-AAATGTCATGGATA-TATTTTAT---AA--AACAATT-T--GATC-A-TTC-AAAA-GC--ATTTA-AAAA-TA--TGTACTTC--TTTGC-CCATA---T-AATTAGTTTTT-A-TTATTTTataggaaacatttgacattttgctcatctagcttaataaaatgaatcaatgtgatatctcaaatgtcatggatatattttataaaacaatttgatcattcaaaagcatttaaaaatatgtacttctttgcccatataattagtttttattatttt
gi|11 : taaaacaatctttaatttctgaaggtaacatatttacctttaaagtcagtttgagatgcgatcaactgagaaatgcatagtgtttgcatcatactcaaacacaaagttaacatatcatatatgtagaatacattgatatagaatcttaattattgtaaatgttTTATTTCCTGAGGATAACATATTTAGTCACATTGCCAGTCTGAGAAACAGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAACGCATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------GC--------AT---AT---C---------GA---------A---------TA-TAT------------TC------TT-TGG---A-C----------------TTA-AT---------TCT-TAATA--ATT--------GCA-------CATA-----A-----T---T----TTAAA-AA--AATT-----
gi|11 : aaA-ATA--------TTTATAATA--GTT--------GT--------TACA-----G-----TG--T-A--TTAAA-GGTCAACT-----AC-T-G--------AT------T------T------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCACT--T----CA-A--GTGA-------A-ATGATT--AAA---------A-AAATG-G--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAC--AAT---T-T--G-AT-AGTTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TAA--TTC--ACAGCACAAT----T-AATTAG-ACTTAA-TGATCTTTT--GACAGGTACTTGTGCTCATGGTGCACCAGACGCATGGTgtgaaaatccattttcacaaatatttataatagttgttacagtgtattaaaggtcaactactgatttaaaattatgtttatcacttcaagtgaaatgattaaaaaaatggtaattcagatgttagaatattgtataacaatttgatagtttaaaagtatttaaaatataattcacagcacaattaattagacttaatgatcttttgacaggtacttgtgctcatggtgcaccagacgcatggt
gi|12 : aattatttcctgaggataacatatttagtcacattgccagtctgagaaacagtcctctaaaacatacatattatttacaacgcatttaaacataaaattagcatatcgaatatattctttggacttaattcttaataattgcacataattttaaaaaaattgtgaaaatccattttcacaTCTTGGTTTATGTATTTTGATAGCAGTTTCATA-GGTATTCTTTTTCTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTG--ATCGATGTGTATTCCTTTCAGTAT---AACTTCAGTTGCTTAAATTAAATTGTCGTCTAATTTAATGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTTGATCATCAAGTCATTGAAAATGTTTTATTGACATTCATAATCATTTTGTTTTTGCTACACCACATTTTAAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TT----------------------------------TATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCAGCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAG
gi|13 : GTCATCTAATATAACATCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATAAGATTTGTATCATAAAATTATTGAGAATGTTTAAATGACAGTTATTATCATTTTTGCATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATTAT---T-TA-CTCCTGTGTGTATGGTTGTGT----GGCATGTAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGAggaaagtcgttaatgaataagagaaataaga
gi|14 : aaaGCTATATAACCTGTCAGATATGTGACCCTATTAAACATACATATTATTTACAACACATCTAAA--GA-AA-A----AA-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------atgtgttgttaatgaataagtaaataaaactggccctaagacagagccttgagggacaccgcttttaacaatttcctttgaagaaacacaagagaagtaagtagtgaaccaaacgattgaacaatcagagatttgaagagagacatttttttccaaaagc
gi|14 : tc---AT---T---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG---------AGAAAA-CGTATCC----T----ATGA-ATA--------TTTTTAATA--ATT--------AT--------TACA-----A-----TG--T-T--TTAAA-GATCCATT-----ACAT-A--------AA------A------CAAATTTA----A-A------A----AT------ATGT-TTA----TC------AATTTA-A--TTTA-------A-ATGAGT--GAA---------A-AC-GG-A--------TAAT---TC-ATATCT--TAGA-A-TGTTGTAT--AAT--AA--AAT------TT-A-----AAAA-GT--ATTG--AAAA-TA--TAT--TTT--ATTGTTCGGT----T-AGCTAG-ACTTGA-TGACTTTCTACGGTAGATACCTGTGTTCATGActatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcattaaagttatttgagaaaacgtatcctatgaatatttttaataattattacaatgttttaaagatccattacataaaacaaatttaaaaatatgtttatcaatttaatttaaatgagtgaaaacggataattcatatcttagaatgttgtataataaaatttaaaaagtattgaaaatatattttattgttcggttagctagacttgatgactttctacggtagatacctgtgttcatga
gi|15 : tcgctatataacctgtcagatatgtgaccctattaaacatacatattatttacaacacatctaaagaaaaaataacatatcaactatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcTTGAAGG-TCGTATTGATGTTA------GTGGCTTGTTCCATTCTGTAGGACAGCATATAAAAAA-GCCATATCATATGATGTATTGTGAGATCTAGGAACATGTT------ATGTATCATTGGTAGGCGATCTTTATTTTTTT--CGATATTTTGAAAAATAAAGT--------TTTTATA
gi|15 : attttgTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCACtagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatattcgttccattgtcatttgcagagcac
gi|16 : attttgttgaaggtcgtattgatgttagtggcttgttccattctgtaggacagcatataaaaaagccatatcatatgatgtattgtgagatctaggaacatgttatgtatcattggtaggcgatctttatttttttcgatattttgaaaaataaagtttttatatagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatatTCTGACATATGGTCATCTAAAACGTACATATTATTTACAACAT-TTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------ACATAACAATAT---AT---A---------AA---------A---------GT-TCC------------TTG----GTA-TA
gi|16 : cgat---AT---T---------AA---------A---------AC-TAT------------TTG--------TAA---A-CA-CGTTCTTTT----ATAA-ATA--------TGGATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-AATCATTT-----ACAT-T--------AA------A------CAAATTAA----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TC------AATTCA-A--TTTA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA--G-A--------TAAT---TA-AGATGT--T--------TTG-AT--------CTGGTT-C--A-TTAA-TTT-AAAA-GT--ATTT--A-------------TTT--ATTGCACcaaaccttatgattgcacacgtgattaaaactatttgtaaacacgttcttttataaatatggataataattgttacaatgtattaaaaatcatttacattaaacaaattaaaaattatgtttatcaattcaatttaaatgagtaaaaaagataattaagatgttttgatctggttcattaatttaaaagtatttatttattgcac
gi|17 : cgattctgacatatggtcatctaaaacgtacatattatttacaacattttaaacataaaattaacataacaatatataaaagttccttggtatacaaaccttatgattgcacacgtgAACATACAT-TTCCTTAAAA---ATCT-------TAATA----AT-TG--------G---------AC--------ATATGAT---C---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG------T-TAA---AGCGTATTTT---T----ATAA-ATA--------TTT-TAATT--ATT--------GT--------TACAATTATA-----TG--T-T--TTAAA-GATCAATT-----ACAG-A--------AA------A------CAATTTTA----A-A------A----TT------CAGT-TTA----TCAAT--TA----A-A--TTAA-------A-ATGAGT---AA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGA--TAGA-A-CATTATAT--AAA--AAC-AAT-TTGG-TA-A-TTT-AAAA-GT--ATTC--AAAAGTA--TGC--TCT--ATTGCACACT----T-AATAAG-ACTTAA-CGACTTTCTACAGTAAGTACTTGTGC
gi|18 : attaatgtc-TCTTTATTTTCTGAGAATAACATATTTAGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACAGACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GT-CCT------------TTG----GTC-AAG---A------------------------A--------TCT-TAAGA--ATT--------G---------CAC------A-----TGA-A-A--TTAAA--ATTAATT-----GTAT----------AA------A------C------G-------------------T------ATTT-TAA----TGAAT----ATCTA-A--GCAAATGTTATA-ATGAAT--AAA---------c
gi|19 : tA-ATA--------TTTATGATATCATT--------G----------ACA-----A-----TG--T-T--TTAAA-GATAAATC-----ATAT-T--------TG------A------C------ATCTAA-A------A----TT------CTGC-TTG----T------TAATTCA-A--TTAA-------A-ATGGAT--AAA---------A-AT-TA-A--------TAAT---TC-AGATAT--TAGA-AGTATTGTAT--AAAACAATG----T--G-AT-A--------------ATTT--AAAA-TACTTTT--TTC--ATTACACAATGAAATGAATTAG-ACTC-GCTGATGTTATATGATAAGTACGTGTGCT-A-GATGGACTAGATATCAGATGTgttaaccaatctttagaaagagagccaagtaaaactttatcaaaataaccgagtgttcctttaagggt
gi|2 : aatctgtttaaagatccataaaagcgattttgttaaATTATAATGTGAAAATGAGGTATAGTTATAATAATAAT---AAA-TCTT-ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCATTATGACGTATGGTCCTCTAAAACATACAAATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----TT-T---------G---------AC--------AT---AA---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----ATC-TAG---A-TG-AA------T----ATGA-ATA--------TCTATAGTA--AAT--------AT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAATAGTAATCCA-A--ATAT-------A-ATGAGT--GTA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATAT--TAGA-A-AATTGTAT--AAA--AATGGAT-T--G-TT---TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCTAGAT----T-TGTTAG-ACTT-A-CGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACTAGACATAAGGTGTGACTTAAGTGAAGCTTTAAATGACA--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTATTGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTG------ATGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTTTC--TCATGTTTTGAACAACG---T--------TTTCACAACAGAGT-ATTAATtacagtagtga
gi|2 : TCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGACCCCATATAATACATCCATAATAAAACAAAGGTAATATGTATACATTACAGAACATTTTCATACTATTTTGGTTTATGTATGTTGATAGCTATTTCATAAG-TGTTATAT-ACTTGTTATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCATACTCAATGT--AGAATCAATGTGTATGCCTTAAAGTGTTTGAACTTTAGTTGCTTGAATTACATTGTTGTCTAATTCAATGTCTAGAG-GTTGTTATTTG--ATAAATCAGATTTGGATCCCAAAGTCATTGAGAATGTTTTACTGGCATTGATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAACCCACTTACCTTAGTTTGGAGTCAAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCGGTGTATATGGTTGTGTAATCGGCATATAAGTCTGTTT--TACATTCTTCTGTATATAAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgttcattgttatttgcagagcaccgaccccatataatacatccataataaaacaaaggtaatatgtatacattacagaacattttcatactattttggtttatgtatgttgatagctatttcataagtgttatatacttgttatattttgacatacactatctatttgtttttccatactcaatgtagaatcaatgtgtatgccttaaagtgtttgaactttagttgcttgaattacattgttgtctaattcaatgtctagaggttgttatttgataaatcagatttggatcccaaagtcattgagaatgttttactggcattgataatcattttgttatcgttacaccacatttttaacccacttaccttagtttggagtcaagtttcaataacagatatattcttatctgcggtgtatatggttgtgtaatcggcatataagtctgttttacattcttctgtatataaga
gi|20 : attataatgtgaaaatgaggtatagttataataataataaatcttattttctgaggataacatatttggctatatagccattatgacgtatggtcctctaaaacatacaaattatttacagcacatttaaacataaatttgacataacaaagttatttgatctagatgaatatgaatatctatagtaaatattacaatgtattaaagatcaattacataaaacaaaattatgtttatcaatagtaatccaaatataatgagtgtaaaatgataattcagatattagaaaattgtataaaaatggattgtttttaaaagtatttaaaatatgttttattgctagatttgttagacttacgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtactagacataaggtgtgacttaagtgaagctttaaatgacactagtgattttgaatggcgtattgatgttggtagcttgttccattctattggaccgcatatagaaaacgccctgtcatatgatgtcgtgtgagatctaggaacatgtgatgtatcattggtagacgatctgaagtttttctcatgttttgaacaacgttttcacaacagagtattaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGC--ATGTAACATGGGCTCCTCTATGAGATACATATTATTAACA--AAAGTTAAA--CACAA-A----GT-T---------ACTTTATAATAT--------AC---AT---C---------AA---------C---------GC-TCT------------TTA----ATC-TAG---A-
gi|21 : TTTGAATG-GCGTAT-GATGTTG------GTAGTTTGTACCATTCTGTAGGACCGCATATAAAAAGCGCCCTGTCATATATTGTCGTGTGAGATTTAGGAACATGTA------ATGTGTCATTGGCAGACGATCTTAAG-TTTTC--TCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTGACAATACAGT-ATATATttctttataaatgcacatgtggttaaacttaattgtttaaaactcgattaatcgtaattttagaaatatttataataattgttacagtgtaagtaagat
gi|22 : TATAATAATAATT-ATAATGATAAAAA-AATT--AAAATCTTTAATTT--GAGGATAACATATTTGGCTATACGGCCAGTCTTGCATATGATCCTTTAATACGTGGATATTATTTCTCACAAATTTAAA--CTCAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------TA-TATAAAAAACAATCTTTG----GTC-TAG---A----G-------T----CTTA-ATAATT-----TCT-TAATA--ATT---------T--------CATAT----A-----TG----A--TTAAA-atattctggtgcttgttcatttattgatttgtagaccatgatccatttatga
gi|23 : aaaatttTATATTATATTTGGAACTTTAAGACATTGAACATGTTTCAATG-TATCT-TAAATACTGTGTTATCGTTACACCACAGTTT-AAAATATTTCTGTCAGCTTGGAGT-GAATATTCGAT--CAGGGTTGTTTATGATCTGCTGTGTGTATATT-CGTGT-CATCTGCTGTGTGTATGTTCGTGTCGTCTGC
gi|24 : --AAA--AAT-AAT-TTAA-CA-A-TTT-AAAA-AT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTTTCGTTGCACAAT----T-AATTAG-ACTG-AATGCTTTTCTATGATAAGTACTTTTGTTTATGTTCTACCAGACATAATGTGTGCCTTTGATGAtgtgtgta
gi|25 : taAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCTGTCTGACATATTGTCCTCTTAAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAC-A----AT-T---------t
gi|26 : GGAAGATGCA-------TGAAACAATGGTAGACGATCTCAAGTTTTGT--CAATGTTTTGAAGAACA---A--------TTATATAACAAAAT-ATTTATttgaca
gi|27 : gttatCATTAAATTACATGTTCATACAATCTTGGATGATGTATTTTGATAGCAATGTCAT--G-TGTTATTTTGCTTGTGATATTTTGACATAataggttggtgcttgatt
gi|28 : GA-A--CTCAATGATTTTAAATT-ACGTAT-------G------GGAGTTTGTTCAATTCTGTA----------CAGAAAAAGCCCTATCATATGAT
gi|3 : aTTGTGAGAATAACATATTTGGTTTCATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTTAAACAAACATATTATTTACAACATACTTAAT--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A------------TAT------------ATGAAAAGTC-T-----T-TG-G-------T----GTAG-A-A--------TCT-TTATA--ATT--------G---------CAC------A-----TG--TGA--TTAAA--ATTATTTGTAAAACGT-ATTTCTGTGAATATTTTA------T------A----ATA------A----TTGCCATAATGTATTAAAGATCAAT--TAGGACA-AACATAA-------A-ACAAATTCAAAATTGAATTGA-AA-TG-AATAAAAAATAATAATTC-AGATCG--TAGA-G-TATTATAT--CAA--A---CAT-T--T-TTAA-TTT-AAAA-AT--ACTT--AAAA-TA--TGT--TTA--ATTGAACAAT----T-ATTTAA-AAGTAA-TAGTTTTCTACGGTAGGTACATGTGCTCATGATGAGCCTGATATAAGGTGTGCTTTAAGAGAAGCCTTAAATGA-A--TT--TTGGTTTTG-ATG-GCATATTGATGTTG------GTA-CTTGTTCCATTATGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCCCTGTCACACGATGTCGTGTGAGAT-TAAGAATAGGTAGTACAGATCTATCATTGGTAGACAATCTTAAGTATATTGGTAATATTTTGAATAACA---T--------TTAGACAACAAAGT-ATTTA
gi|3 : aTCATTC-ATTGTTATTTGCAGAGCGCCaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|4 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatat-TCTTTATTTTTTGAGGATAACATATTTGGCTATAAAGTCTGTATGACTTATTTTCCTCAAAAACATACATATTATTCACAGTACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GT-TCT------------TTG----GTC-TAA---A------------------------A--------TCTA-AATA--ATT--------G---------CAC------A-----TG--TAA--TTAAA--ATCATTT-------AT-A--------AA------A------A------A----A-C------ATATTTT------ATGC-ATA----TCAGTAGTAATT---G--TTAC-------A-ATGTAT--TAA---------A-GA-T-----------TAAT---T
gi|4 : TCTAAAATCTAAATA--ATT----GCACATGTAAT----TAA-A----AT-C---------A---------TTT-------AT---AA---A---------AA---------A---------ACATAT------------TT----------------------------T----ATGC-ATA--------TCAGTAGTA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATTAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-ATTTAA-AC---TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAA---A-A--TTTA-------A--TGAGT--AAA---------AGAA-AG-A--------TAAT---TC-AGATAT--TGGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGA---------T-AGTTT-AAAA-GT--ATAT--AAAA-TG--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATCAG-ACTT-AATGACTTT-TACGGTAGTTGTATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTTAGTGAAGCTTTTAATGA--------GTGAATTTGAATG-ACGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATAATGTCGTGTGAGATCTAGGACCATGTA------AAGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTT----CCATGTTTTGAAGAACA---TAAAACATATTCAAC-ACAGAGTCATTacataaaacaaatttaaacttatgtttatcaattaaaatttaatgagtaaaagaaagataattcagatattggaatattgtataaaaatgatagtttaaaagtatataaaatgtgttttattgcacgattaatcagacttaatgacttttacggtagttgtatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgactttagtgaagcttttaatgagtgaatttgaatgacgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggaccgcatatagaaaacgccctgtcatataatgtcgtgtgagatctaggaccatgtaaagtatcattggtagacgatctgaagttttccatgttttgaagaacataaaacatattcaacacagagtcatt
gi|5 : tctttattttttgaggataacatatttggctataaagtctgtatgacttattttcctcaaaaacatacatattattcacagtacatttaaacataaaattaacatatcaaatatataaaagttctttggTAGTAATATTAATAATTTTAAA-TCTTTATTTTCTGAGTATAACACATTTGGCTGTATGACCAGCCTGACATATCGTCTTCTAAGAAATACATATTATTTTCAACAAATCTAAG--CACAG-T----AT-T---------A---------ACACTG----AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GC-TCT------------TTG----GTC-TAG---A-
gi|5 : A-ACA--------TGTATAATA--ATT--------GT--------AAAA-----A-----TG--T-A--ATAAA-GATCAATT-----ACATGA--------AA------A------CTTTT--A----A-A------A----TT------CCGC-TTA-------AT---AGTTCA-A--TCAA-------A-ATTAGT--CAA---------A-AT-CG-A--------TAAA---TC-ATATGT--TAAA-AATATTTTTT--TAA--ATCCAATAT--G-TT-A-TTTTAACA-GT--ATTTTAAAAA-TA--TAT--TTC--GTTTCACAAT----T-AGTTAA-ACCT-AATGATTTTCTATGACAAGCACGTGTGCGTATGATGTACCAGACGCAAGGTGTGCCTTAGATGAAGCCTTAAA-AA-AGCCC-AATGGTTTTG-ATGTGTGTATTGATGTAG------GAAGTTT-TTCCATTCatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaaacatgtataataattgtaaaaatgtaataaagatcaattacatgaaaacttttaaaattccgcttaatagttcaatcaaaattagtcaaaatcgataaatcatatgttaaaaatatttttttaaatccaatatgttattttaacagtattttaaaaatatatttcgtttcacaattagttaaacctaatgattttctatgacaagcacgtgtgcgtatgatgtaccagacgcaaggtgtgccttagatgaagccttaaaaaagcccaatggttttgatgtgtgtattgatgtaggaagtttttccattca
gi|6 : tagtaatattaataattttaaatctttattttctgagtataacacatttggctgtatgaccagcctgacatatcgtcttctaagaaatacatattattttcaacaaatctaagcacagtattaacactgatatcaaatatataaaagctctttggtctagaatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaTTTATTTTCCGAGGATAACACATTTGGCTATAAGGCCAGTCTGACATATCGTCCCCT-AAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-ACGTGATAT---------A---------ACGA------AT---ATA--T---------AA---------A---------GT-TCT------------TTG----GTC-T-------C----------T----------CA--------TCT-TAATA--ATT--------G---------CAC------A-----TT--T-AATTTAA---ATTATTT-----GTA--A--------AA------A------C------G-------------------T------AT-T-TTA----TGAAT----ATCTATA--GTAA-------ATCTGA-C--AAA---------G-TA-GGAA--------TAAT---ACAAAATAT--T-GG-A-TAT----T--AAA--AATCAA-------TT-A-CAC-AAAACAA--ATTT--AAAATTA--TGT--TTa
gi|6 : TAATA----AT-T---------GC--------AC--------ATTTAAT---T---------TA---------A---------AT-TAT------------TTG-----TA-AAA---A-CGTA-------TTTT-ATGA-ATA--------TCTATAGTA--AATCTGACAAAGTAGGAATAATACA-----AAATATTGGAT-A--TTAAA-AATCAATT-----ACAC-A--------AA------A------C------A----A-ATTTAAAA----TT------ATGT-TTA----TCA---------------------------------------------------A-TA-G--------TAAT---TC-AAA--------A-A-TAATG-AG--AAA--AA-GAA----------A-TAT-AAAA-GT--A----------------T--TTT--ATTGCACGAT----T-TATTGG-AATTGA-TGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTCAGTG------TAGA----------------TTTAAATG-GCGTATTGATGTTGGTACATGTAACTTGTTCCATTCTGTAAGACCGCATATAGAAAACGCCCTGCCATATGATGTTGTCTAAAAGCTAGGAACATGTA------ATGTATatcaatagtaattcaaaaataatgagaaaaagaaatataaaagtattttattgcacgatttattggaattgatgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgacttcagtgtagatttaaatggcgtattgatgttggtacatgtaacttgttccattctgtaagaccgcatatagaaaacgccctgccatatgatgttgtctaaaagctaggaacatgtaatgtat
gi|7 : tttattttccgaggataacacatttggctataaggccagtctgacatatcgtcccctaaacatatatattatttacagcacatttaaacataaacgtgatataacgaatatataaagttctttggtctctcatctATAAT--ACTAATAA----TAGTAATAACAATAA----AAA-ACAATAATTTCTGGGGGTAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCTTCTTAGACATACATATTA-TTACAACATATTTGAA--CATAA-A----AT-TATCGTATCAA---------AT--------AT---AT---A---------AA---------A---------GT-TCT------------TAG----GT
gi|7 : atcatacaagtggtcagcctttcccTTTAGAATCTTAATA----AT-T---------GC--------GC--------AT---ATGACT---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG--------TAA---A-AA-G-------C----GTGT--TA--------TCTATATTA--CTT--------GT--------TACA-----A-----CG--T-A--TTAAA-GACCAGTA-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-ATATAAAA----CT------ATGT-TTG----TCAAT--T----CA-A--TCAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TGTTGTAT--AAA--AACAATT-T--G-AT-ATTTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACAAT----T-ACTTAG-ACTTAA-TGACTTTCTACGGTAGATACTTGTGCTCATGGTATACCAGACATAAGGTGTGttagaatcttaataattgcgcatatgactaaaattatttgtaaaaagcgtgttatctatattacttgttacaacgtattaaagaccagtaacataaaacaaatataaaactatgtttgtcaattcaatcaaaatgagtaaaaaatgataattcagatgttagaatgttgtataaaaacaatttgatattttaaaagtatttaaaatatgttttattgcacaattacttagacttaatgactttctacggtagatacttgtgctcatggtataccagacataaggtgtg
gi|8 : atcatacaagtggtcagcctttcccataatactaataatagtaataacaataaaaaacaataatttctgggggtaacatattttgctatatagccagtctgacatatggtcttcttagacatacatattattacaacatatttgaacataaaattatcgtatcaaatatataaaagttcttaggATTATAAT-TAATAACAA----TAATAATAATAATAATT--TAA-TCTTTATTT-CTGAGGATAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGTCATATGGTCCTCTAACACATACATATTATATACAACACATT-------ATAA-A----AT-T---------A---------AC--------GT---AT---C---------AA---------ATACATTACTGT-TAT------------TAA----GTG-TAG---A------------------------A--------TCTA-AATA--ATT--------G-----------CAT----A-----TG--TGA--TTAAA-AGT--ATT------TGT-A--------AA--------------------A----A-T------G----TT------TTTT-TTA----TGAAT----ATTT-----------------------------------------A-TA-A--------TAAT---------TGT--T----A-CACTGTAT--TAA--A--GATC-T--A-TT-A---C-AAAA-ATAAATTT--AAAATTA--TGT--TT
gi|8 : t-------T----ATGA-ATA--------TTTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----C-----TG--T-A--TTAAA-GATCTATT-----ACA--A--------AA------ATAAATTT------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----CCAAT--TCATT-------TAA-------G-ACGAGT--AAA---------A-A-----A--------TAAT---TC-AGATCT--TAGA-A-TATTGCAGAAAAA--AATGA---T--G-------------------ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAA-ACTTAA-TGACaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaatgacataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|8 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgtttttttGACATAAATTGTGTCTTCAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C--------------TG-GTGTATTGATGTTG------GTAGCTTATTCCATTataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|9 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgttttttttatgaatatttataataattgttacactgtattaaagatctattacaaaaataaatttaaaattatgtttaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaat-------T----ATGATATA--------TTGTTCATT--GTT--------GT--------TACA-----A-----TG----A--TTAAA--ATCAATA-----ACAT-A--------AA------A------C------ATTTAA-A------A----TT------TTG------------AT--TA--TCA-A--ATAA-------A-ATTAGT--CAA---------A-A-----------------T---TC-AGTAAT--CAGAGA-TTTTGTAT--AAA--A-TAATT-T--G-AT-AATTT-AATA-GT--ATAT--AAAA-AAG-TGT--TTT-----GCACAAT----T-AATTAG-ACTT-T-CGA--------------------TGCTTCTGGTGTGCCAGGCATAAGGTTTACCTT---TGCGGC---AAAT-----------TTATGTTG---G-ACGT---------------------TTGTTTAATTTTGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCGATGTCATAAAATGTCGT------TTTA-------------------TATCATAGGTAGACGGTCTTAAGATTGT---CCATG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AATTAAATGCTCGATGTTCTGCACTTCGTTCCTACAAGTGCGATACAAAATGAACCAACGATTGAACCAT
Alignments
lowQualScore : 1 4444 1111 11111111111111111111111111111 2222222222222 666666666666666666666666666666666 111111111111111111 555555555555555555555555555555555555555 33333333333333 1111111111111111111111111111111 444444444444444444 222 333333333 111111 111111 1111 222222222222 1 22 1 9999999999999999999999999999999999 11 88888888888888888888888888888 11111 111
lowQualScore : 9 6666 0 7777 4 1 2 22 5 3333 1 77777777777777777777777777777 666 3333333333333 777777777 888888888888 999999999999 555555555555555555555555555555555 222 0 99999999 9 22 666666666666666666 88888 44444 8888 22 99 44444 2 77777777 222222222222222222222222222222222222222 555555 2 4444 22 11111111111111 6666666 4 1 4444444444444444444444444444444 333 2 1 33 2 4 4 444 22 333333333333333333 2 2 33 55 6 55 33 33 1 8888 2 2 555 2 2 1 5 3 33 999999999 6 3 2 000000 1 3 0 222222 0 2222 555555555555 11 1 8 3 1 1 1 1 1 33 0 44 6 7 0000000000000000000000000000000000 2 3 33 0 1 1 1 1 3 0 9 3 8 22222222222222222222222222222 55555 8 0 777 444
lowQualScore : . .... . .... . . . .. . .... . ............................. ... ............. ......... ............ ............ ................................. ... . ........ . .. .................. ..... ..... .... .. .. ..... . ........ ....................................... ...... . .... .. .............. ....... . . ............................... ... . . .. . . . ... .. .................. . . .. .. . .. .. .. . .... . . ... . . . . . .. ......... . . . ...... . . . ...... . .... ............ .. . . . . . . . . .. . .. . . .................................. . . .. . . . . . . . . . . ............................. ..... . . ... ...
lowQualScore : 0 8888 8 4444 4 5 2 99 5 9999 8 33333333333333333333333333333 111 8888888888888 000000000 555555555555 333333333333 777777777777777777777777777777777 999 1 88888888 6 55 777777777777777777 22222 55555 2222 55 22 88888 0 22222222 222222222222222222222222222222222222222 888888 0 2222 22 77777777777777 5555555 0 5 0000000000000000000000000000000 777 2 8 11 2 4 4 333 99 000000000000000000 2 2 11 33 7 33 11 44 9 3333 7 7 777 1 1 9 3 4 44 222222222 5 6 1 555555 1 9 2 888888 4 4444 444444444444 66 0 0 3 0 0 0 0 0 22 0 55 7 3 0000000000000000000000000000000000 0 2 88 8 0 0 0 0 8 8 8 2 0 22222222222222222222222222222 22222 0 8 666 000
consensus : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT--CTTT-A--GTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
Reference ( family-514 ) : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT-CCTTT-A--GTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
gi|1 : ACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---T---------AAATATATAATA---------GT-TCT------------TTG----GTC-TAG---A-
gi|1 : AA-A----AT-T---------G---------AT--------A---------C---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG----TTC--AA---A-CATA-------TTTTTATGA-ATA--------TCTATAGTA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-TATCAATT-----ACAT-A--------AACAA---A------TTT----A----A-A------A----TT------ATGT-TGA----TCAAT--T----CA-A--ATAA-------A-ATGAGTT-AAA---------G-AA-AG-A--------TAAT---TC-AGACAT--TAGA-A-TATTGTA---AAA--AATGA---------T-AGTTT-TAAA-GT--ATTT--AAAA-TG--TGT--TTT--ATTACACTAT----T-AATTAT-ACTT-AATGCCTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATATACAAGACATAAGGTGTGTCCTTAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CTGAGTGATTTTGAATG-CCGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGAC-GC-TATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGAAACATGTA------ATGTGTCATTGGTAGACGATATTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTAACAACATAGatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaTTTGCAGAGTACCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAAATACATTTTTATACTATCTTGGTTGATGTTTTTTGATAGCCGTTTCATACG-TGTTATTTTACTTGTGATTTTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCCCAA---AA-GT--------------------TTT-----TG----AACTTCATTTGTTTGAATCACAATGTTGTCAAACTTAATGTCTAGTGTGTTGTTTTTTGATATATATTAGA-TTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTAATTGACATTTACAATCAGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACAATC-AGT-TTCAA-AACA------------------------TATATT-C---TCTCTCTGCTGTGTGAATTGTTGTGTCAACGGCATATAAGTCTGTTTAAAACATTCTTCAGTACATAAGcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacaAA-TCTTTAATTTCTGAAGGTAACATATTTACCTTTAAAGTCAGTTTGAGATGCGATCAACTGAGAAATGCATAGTGTTTGCATCATACTCAAA--CACAA-A----GT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AT---------A------------TAT------------GTA----GAA-TAC---ATTG-A-------T----ATAG-A-A--------TCT-TAATT--ATT--------G---------TA-A-----A-----TGT-T-A--TTAAATGA--ACTT-----AT-T-A--------AA------G------T-----------A-A------T----TT------ACG--TGA----TAAAT--GAGCT-A-A--ATAA-------ACGTGATT--CTA---------A-AA-T---------------------AAATAT--CACA-A----TGTAT--CAA--AATTAAT-gataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : taaaacATTA-A----AT-G---------A---------AC--------TT---AT---T---------AA---------A---------GT-AAT------------TTAC---GTGATAA---A-TG-A-------G----CTAA-ATAAACGTGATTCTAAAATA--AAT--------AT--------CACA-----A-----TG--T-A--TCAAA--ATTAA-T-----ATAG-G--------AA------A------C------ATTTGA-C------A----TT------TTGC-TCA----TC-----TAGCTTA-A---TAA-------A-ATGAAT---CA---------A-TG-TG-A--------TATC---TC-AAATGTCATGGATA-TATTTTAT---AA--AACAATT-T--GATC-A-TTC-AAAA-GC--ATTTA-AAAA-TA--TGTACTTC--TTTGC-CCATA---T-AATTAGTTTTT-A-TTATTTTataggaaacatttgacattttgctcatctagcttaataaaatgaatcaatgtgatatctcaaatgtcatggatatattttataaaacaatttgatcattcaaaagcatttaaaaatatgtacttctttgcccatataattagtttttattatttt
gi|11 : taaaacaatctttaatttctgaaggtaacatatttacctttaaagtcagtttgagatgcgatcaactgagaaatgcatagtgtttgcatcatactcaaacacaaagttaacatatcatatatgtagaatacattgatatagaatcttaattattgtaaatgttTTATTTCCTGAGGATAACATATTTAGTCACATTGCCAGTCTGAGAAACAGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAACGCATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------GC--------AT---AT---C---------GA---------A---------TA-TAT------------TC------TT-TGG---A-C----------------TTA-AT---------TCT-TAATA--ATT--------GCA-------CATA-----A-----T---T----TTAAA-AA--AATT-----
gi|11 : aaA-ATA--------TTTATAATA--GTT--------GT--------TACA-----G-----TG--T-A--TTAAA-GGTCAACT-----AC-T-G--------AT------T------T------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCACT--T----CA-A--GTGA-------A-ATGATT--AAA---------A-AAATG-G--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAC--AAT---T-T--G-AT-AGTTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TAA--TTC--ACAGCACAAT----T-AATTAG-ACTTAA-TGATCTTTT--GACAGGTACTTGTGCTCATGGTGCACCAGACGCATGGTgtgaaaatccattttcacaaatatttataatagttgttacagtgtattaaaggtcaactactgatttaaaattatgtttatcacttcaagtgaaatgattaaaaaaatggtaattcagatgttagaatattgtataacaatttgatagtttaaaagtatttaaaatataattcacagcacaattaattagacttaatgatcttttgacaggtacttgtgctcatggtgcaccagacgcatggt
gi|12 : aattatttcctgaggataacatatttagtcacattgccagtctgagaaacagtcctctaaaacatacatattatttacaacgcatttaaacataaaattagcatatcgaatatattctttggacttaattcttaataattgcacataattttaaaaaaattgtgaaaatccattttcacaTCTTGGTTTATGTATTTTGATAGCAGTTTCATA-GGTATTCTTTTTCTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTG--ATCGATGTGTATTCCTTTCA--GTAT---AACTTCAGTTGCTTAAATTAAATTGTCGTCTAATTTAATGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTTGATCATCAAGTCATTGAAAATGTTTTATTGACATTCATAATCATTTTGTTTTTGCTACACCACATTTTAAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TT----------------------------------TATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCAGCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAG
gi|13 : GTCATCTAATATAACATCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATAAGATTTGTATCATAAAATTATTGAGAATGTTTAAATGACAGTTATTATCATTTTTGCATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATTAT---T-TA-CTCCTGTGTGTATGGTTGTGT----GGCATGTAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGAggaaagtcgttaatgaataagagaaataaga
gi|14 : aaaGCTATATAACCTGTCAGATATGTGACCCTATTAAACATACATATTATTTACAACACATCTAAA--GA-AA-A----AA-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------atgtgttgttaatgaataagtaaataaaactggccctaagacagagccttgagggacaccgcttttaacaatttcctttgaagaaacacaagagaagtaagtagtgaaccaaacgattgaacaatcagagatttgaagagagacatttttttccaaaagc
gi|14 : tc---AT---T---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG---------AGAAAA-CGTATCC----T----ATGA-ATA--------TTTTTAATA--ATT--------AT--------TACA-----A-----TG--T-T--TTAAA-GATCCATT-----ACAT-A--------AA------A------CAAATTTA----A-A------A----AT------ATGT-TTA----TC------AATTTA-A--TTTA-------A-ATGAGT--GAA---------A-AC-GG-A--------TAAT---TC-ATATCT--TAGA-A-TGTTGTAT--AAT--AA--AAT------TT-A-----AAAA-GT--ATTG--AAAA-TA--TAT--TTT--ATTGTTCGGT----T-AGCTAG-ACTTGA-TGACTTTCTACGGTAGATACCTGTGTTCATGActatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcattaaagttatttgagaaaacgtatcctatgaatatttttaataattattacaatgttttaaagatccattacataaaacaaatttaaaaatatgtttatcaatttaatttaaatgagtgaaaacggataattcatatcttagaatgttgtataataaaatttaaaaagtattgaaaatatattttattgttcggttagctagacttgatgactttctacggtagatacctgtgttcatga
gi|15 : tcgctatataacctgtcagatatgtgaccctattaaacatacatattatttacaacacatctaaagaaaaaataacatatcaactatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcTTGAAGG-TCGTATTGATGTTA------GTGGCTTGTTCCATTCTGTAGGACAGCATATAAAAAA-GCCATATCATATGATGTATTGTGAGATCTAGGAACATGTT------ATGTATCATTGGTAGGCGATCTTTATTTTTTT--CGATATTTTGAAAAATAAAGT--------TTTTATA
gi|15 : attttgTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCACtagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatattcgttccattgtcatttgcagagcac
gi|16 : attttgttgaaggtcgtattgatgttagtggcttgttccattctgtaggacagcatataaaaaagccatatcatatgatgtattgtgagatctaggaacatgttatgtatcattggtaggcgatctttatttttttcgatattttgaaaaataaagtttttatatagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatatTCTGACATATGGTCATCTAAAACGTACATATTATTTACAACAT-TTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------ACATAACAATAT---AT---A---------AA---------A---------GT-TCC------------TTG----GTA-TA
gi|16 : cgat---AT---T---------AA---------A---------AC-TAT------------TTG--------TAA---A-CA-CGTTCTTTT----ATAA-ATA--------TGGATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-AATCATTT-----ACAT-T--------AA------A------CAAATTAA----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TC------AATTCA-A--TTTA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA--G-A--------TAAT---TA-AGATGT--T--------TTG-AT--------CTGGTT-C--A-TTAA-TTT-AAAA-GT--ATTT--A-------------TTT--ATTGCACcaaaccttatgattgcacacgtgattaaaactatttgtaaacacgttcttttataaatatggataataattgttacaatgtattaaaaatcatttacattaaacaaattaaaaattatgtttatcaattcaatttaaatgagtaaaaaagataattaagatgttttgatctggttcattaatttaaaagtatttatttattgcac
gi|17 : cgattctgacatatggtcatctaaaacgtacatattatttacaacattttaaacataaaattaacataacaatatataaaagttccttggtatacaaaccttatgattgcacacgtgAACATACAT-TTCCTTAAAA---ATCT-------TAATA----AT-TG--------G---------AC--------ATATGAT---C---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG------T-TAA---AGCGTATTTT---T----ATAA-ATA--------TTT-TAATT--ATT--------GT--------TACAATTATA-----TG--T-T--TTAAA-GATCAATT-----ACAG-A--------AA------A------CAATTTTA----A-A------A----TT------CAGT-TTA----TCAAT--TA----A-A--TTAA-------A-ATGAGT---AA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGA--TAGA-A-CATTATAT--AAA--AAC-AAT-TTGG-TA-A-TTT-AAAA-GT--ATTC--AAAAGTA--TGC--TCT--ATTGCACACT----T-AATAAG-ACTTAA-CGACTTTCTACAGTAAGTACTTGTGC
gi|18 : attaatgtc-TCTTTATTTTCTGAGAATAACATATTTAGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACAGACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GT-CCT------------TTG----GTC-AAG---A------------------------A--------TCT-TAAGA--ATT--------G---------CAC------A-----TGA-A-A--TTAAA--ATTAATT-----GTAT----------AA------A------C------G-------------------T------ATTT-TAA----TGAAT----ATCTA-A--GCAAATGTTATA-ATGAAT--AAA---------c
gi|19 : tA-ATA--------TTTATGATATCATT--------G----------ACA-----A-----TG--T-T--TTAAA-GATAAATC-----ATAT-T--------TG------A------C------ATCTAA-A------A----TT------CTGC-TTG----T------TAATTCA-A--TTAA-------A-ATGGAT--AAA---------A-AT-TA-A--------TAAT---TC-AGATAT--TAGA-AGTATTGTAT--AAAACAATG----T--G-AT-A--------------ATTT--AAAA-TACTTTT--TTC--ATTACACAATGAAATGAATTAG-ACTC-GCTGATGTTATATGATAAGTACGTGTGCT-A-GATGGACTAGATATCAGATGTgttaaccaatctttagaaagagagccaagtaaaactttatcaaaataaccgagtgttcctttaagggt
gi|2 : aatctgtttaaagatccataaaagcgattttgttaaATTATAATGTGAAAATGAGGTATAGTTATAATAATAAT---AAA-TCTT-ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCATTATGACGTATGGTCCTCTAAAACATACAAATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----TT-T---------G---------AC--------AT---AA---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----ATC-TAG---A-TG-AA------T----ATGA-ATA--------TCTATAGTA--AAT--------AT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAATAGTAATCCA-A--ATAT-------A-ATGAGT--GTA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATAT--TAGA-A-AATTGTAT--AAA--AATGGAT-T--G-TT---TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCTAGAT----T-TGTTAG-ACTT-A-CGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACTAGACATAAGGTGTGACTTAAGTGAAGCTTTAAATGACA--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTATTGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTG------ATGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTTTC--TCATGTTTTGAACAACG---T--------TTTCACAACAGAGT-ATTAATtacagtagtga
gi|2 : TCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGACCCCATATAATACATCCATAATAAAACAAAGGTAATATGTATACATTACAGAACATTTTCATACTATTTTGGTTTATGTATGTTGATAGCTATTTCATAAG-TGTTATAT-ACTTGTTATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCATACTCAATGT--AGAATCAATGTGTAT-GCCTT-AAAGTGTTTGAACTTTAGTTGCTTGAATTACATTGTTGTCTAATTCAATGTCTAGAG-GTTGTTATTTG--ATAAATCAGATTTGGATCCCAAAGTCATTGAGAATGTTTTACTGGCATTGATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAACCCACTTACCTTAGTTTGGAGTCAAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCGGTGTATATGGTTGTGTAATCGGCATATAAGTCTGTTT--TACATTCTTCTGTATATAAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgttcattgttatttgcagagcaccgaccccatataatacatccataataaaacaaaggtaatatgtatacattacagaacattttcatactattttggtttatgtatgttgatagctatttcataagtgttatatacttgttatattttgacatacactatctatttgtttttccatactcaatgtagaatcaatgtgtatgccttaaagtgtttgaactttagttgcttgaattacattgttgtctaattcaatgtctagaggttgttatttgataaatcagatttggatcccaaagtcattgagaatgttttactggcattgataatcattttgttatcgttacaccacatttttaacccacttaccttagtttggagtcaagtttcaataacagatatattcttatctgcggtgtatatggttgtgtaatcggcatataagtctgttttacattcttctgtatataaga
gi|20 : attataatgtgaaaatgaggtatagttataataataataaatcttattttctgaggataacatatttggctatatagccattatgacgtatggtcctctaaaacatacaaattatttacagcacatttaaacataaatttgacataacaaagttatttgatctagatgaatatgaatatctatagtaaatattacaatgtattaaagatcaattacataaaacaaaattatgtttatcaatagtaatccaaatataatgagtgtaaaatgataattcagatattagaaaattgtataaaaatggattgtttttaaaagtatttaaaatatgttttattgctagatttgttagacttacgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtactagacataaggtgtgacttaagtgaagctttaaatgacactagtgattttgaatggcgtattgatgttggtagcttgttccattctattggaccgcatatagaaaacgccctgtcatatgatgtcgtgtgagatctaggaacatgtgatgtatcattggtagacgatctgaagtttttctcatgttttgaacaacgttttcacaacagagtattaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGC--ATGTAACATGGGCTCCTCTATGAGATACATATTATTAACA--AAAGTTAAA--CACAA-A----GT-T---------ACTTTATAATAT--------AC---AT---C---------AA---------C---------GC-TCT------------TTA----ATC-TAG---A-
gi|21 : TTTGAATG-GCGTAT-GATGTTG------GTAGTTTGTACCATTCTGTAGGACCGCATATAAAAAGCGCCCTGTCATATATTGTCGTGTGAGATTTAGGAACATGTA------ATGTGTCATTGGCAGACGATCTTAAG-TTTTC--TCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTGACAATACAGT-ATATATttctttataaatgcacatgtggttaaacttaattgtttaaaactcgattaatcgtaattttagaaatatttataataattgttacagtgtaagtaagat
gi|22 : TATAATAATAATT-ATAATGATAAAAA-AATT--AAAATCTTTAATTT--GAGGATAACATATTTGGCTATACGGCCAGTCTTGCATATGATCCTTTAATACGTGGATATTATTTCTCACAAATTTAAA--CTCAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------TA-TATAAAAAACAATCTTTG----GTC-TAG---A----G-------T----CTTA-ATAATT-----TCT-TAATA--ATT---------T--------CATAT----A-----TG----A--TTAAA-atattctggtgcttgttcatttattgatttgtagaccatgatccatttatga
gi|23 : aaaatttTATATTATATTTGGAACTTTAAGACATTGAACATGTTTCAATG-TATCT-TAAATACTGTGTTATCGTTACACCACAGTTT-AAAATATTTCTGTCAGCTTGGAGT-GAATATTCGAT--CAGGGTTGTTTATGATCTGCTGTGTGTATATT-CGTGT-CATCTGCTGTGTGTATGTTCGTGTCGTCTGC
gi|24 : --AAA--AAT-AAT-TTAA-CA-A-TTT-AAAA-AT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTTTCGTTGCACAAT----T-AATTAG-ACTG-AATGCTTTTCTATGATAAGTACTTTTGTTTATGTTCTACCAGACATAATGTGTGCCTTTGATGAtgtgtgta
gi|25 : taAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCTGTCTGACATATTGTCCTCTTAAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAC-A----AT-T---------t
gi|26 : GGAAGATGCA-------TGAAACAATGGTAGACGATCTCAAGTTTTGT--CAATGTTTTGAAGAACA---A--------TTATATAACAAAAT-ATTTATttgaca
gi|27 : gttatCATTAAATTACATGTTCATACAATCTTGGATGATGTATTTTGATAGCAATGTCAT--G-TGTTATTTTGCTTGTGATATTTTGACATAataggttggtgcttgatt
gi|28 : GA-A--CTCAATGATTTTAAATT-ACGTAT-------G------GGAGTTTGTTCAATTCTGTA----------CAGAAAAAGCCCTATCATATGAT
gi|3 : aTTGTGAGAATAACATATTTGGTTTCATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTTAAACAAACATATTATTTACAACATACTTAAT--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A------------TAT------------ATGAAAAGTC-T-----T-TG-G-------T----GTAG-A-A--------TCT-TTATA--ATT--------G---------CAC------A-----TG--TGA--TTAAA--ATTATTTGTAAAACGT-ATTTCTGTGAATATTTTA------T------A----ATA------A----TTGCCATAATGTATTAAAGATCAAT--TAGGACA-AACATAA-------A-ACAAATTCAAAATTGAATTGA-AA-TG-AATAAAAAATAATAATTC-AGATCG--TAGA-G-TATTATAT--CAA--A---CAT-T--T-TTAA-TTT-AAAA-AT--ACTT--AAAA-TA--TGT--TTA--ATTGAACAAT----T-ATTTAA-AAGTAA-TAGTTTTCTACGGTAGGTACATGTGCTCATGATGAGCCTGATATAAGGTGTGCTTTAAGAGAAGCCTTAAATGA-A--TT--TTGGTTTTG-ATG-GCATATTGATGTTG------GTA-CTTGTTCCATTATGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCCCTGTCACACGATGTCGTGTGAGAT-TAAGAATAGGTAGTACAGATCTATCATTGGTAGACAATCTTAAGTATATTGGTAATATTTTGAATAACA---T--------TTAGACAACAAAGT-ATTTA
gi|3 : aTCATTC-ATTGTTATTTGCAGAGCGCCaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|4 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatat-TCTTTATTTTTTGAGGATAACATATTTGGCTATAAAGTCTGTATGACTTATTTTCCTCAAAAACATACATATTATTCACAGTACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GT-TCT------------TTG----GTC-TAA---A------------------------A--------TCTA-AATA--ATT--------G---------CAC------A-----TG--TAA--TTAAA--ATCATTT-------AT-A--------AA------A------A------A----A-C------ATATTTT------ATGC-ATA----TCAGTAGTAATT---G--TTAC-------A-ATGTAT--TAA---------A-GA-T-----------TAAT---T
gi|4 : TCTAAAATCTAAATA--ATT----GCACATGTAAT----TAA-A----AT-C---------A---------TTT-------AT---AA---A---------AA---------A---------ACATAT------------TT----------------------------T----ATGC-ATA--------TCAGTAGTA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATTAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-ATTTAA-AC---TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAA---A-A--TTTA-------A--TGAGT--AAA---------AGAA-AG-A--------TAAT---TC-AGATAT--TGGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGA---------T-AGTTT-AAAA-GT--ATAT--AAAA-TG--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATCAG-ACTT-AATGACTTT-TACGGTAGTTGTATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTTAGTGAAGCTTTTAATGA--------GTGAATTTGAATG-ACGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATAATGTCGTGTGAGATCTAGGACCATGTA------AAGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTT----CCATGTTTTGAAGAACA---TAAAACATATTCAAC-ACAGAGTCATTacataaaacaaatttaaacttatgtttatcaattaaaatttaatgagtaaaagaaagataattcagatattggaatattgtataaaaatgatagtttaaaagtatataaaatgtgttttattgcacgattaatcagacttaatgacttttacggtagttgtatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgactttagtgaagcttttaatgagtgaatttgaatgacgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggaccgcatatagaaaacgccctgtcatataatgtcgtgtgagatctaggaccatgtaaagtatcattggtagacgatctgaagttttccatgttttgaagaacataaaacatattcaacacagagtcatt
gi|5 : tctttattttttgaggataacatatttggctataaagtctgtatgacttattttcctcaaaaacatacatattattcacagtacatttaaacataaaattaacatatcaaatatataaaagttctttggTAGTAATATTAATAATTTTAAA-TCTTTATTTTCTGAGTATAACACATTTGGCTGTATGACCAGCCTGACATATCGTCTTCTAAGAAATACATATTATTTTCAACAAATCTAAG--CACAG-T----AT-T---------A---------ACACTG----AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GC-TCT------------TTG----GTC-TAG---A-
gi|5 : A-ACA--------TGTATAATA--ATT--------GT--------AAAA-----A-----TG--T-A--ATAAA-GATCAATT-----ACATGA--------AA------A------CTTTT--A----A-A------A----TT------CCGC-TTA-------AT---AGTTCA-A--TCAA-------A-ATTAGT--CAA---------A-AT-CG-A--------TAAA---TC-ATATGT--TAAA-AATATTTTTT--TAA--ATCCAATAT--G-TT-A-TTTTAACA-GT--ATTTTAAAAA-TA--TAT--TTC--GTTTCACAAT----T-AGTTAA-ACCT-AATGATTTTCTATGACAAGCACGTGTGCGTATGATGTACCAGACGCAAGGTGTGCCTTAGATGAAGCCTTAAA-AA-AGCCC-AATGGTTTTG-ATGTGTGTATTGATGTAG------GAAGTTT-TTCCATTCatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaaacatgtataataattgtaaaaatgtaataaagatcaattacatgaaaacttttaaaattccgcttaatagttcaatcaaaattagtcaaaatcgataaatcatatgttaaaaatatttttttaaatccaatatgttattttaacagtattttaaaaatatatttcgtttcacaattagttaaacctaatgattttctatgacaagcacgtgtgcgtatgatgtaccagacgcaaggtgtgccttagatgaagccttaaaaaagcccaatggttttgatgtgtgtattgatgtaggaagtttttccattca
gi|6 : tagtaatattaataattttaaatctttattttctgagtataacacatttggctgtatgaccagcctgacatatcgtcttctaagaaatacatattattttcaacaaatctaagcacagtattaacactgatatcaaatatataaaagctctttggtctagaatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaTTTATTTTCCGAGGATAACACATTTGGCTATAAGGCCAGTCTGACATATCGTCCCCT-AAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-ACGTGATAT---------A---------ACGA------AT---ATA--T---------AA---------A---------GT-TCT------------TTG----GTC-T-------C----------T----------CA--------TCT-TAATA--ATT--------G---------CAC------A-----TT--T-AATTTAA---ATTATTT-----GTA--A--------AA------A------C------G-------------------T------AT-T-TTA----TGAAT----ATCTATA--GTAA-------ATCTGA-C--AAA---------G-TA-GGAA--------TAAT---ACAAAATAT--T-GG-A-TAT----T--AAA--AATCAA-------TT-A-CAC-AAAACAA--ATTT--AAAATTA--TGT--TTa
gi|6 : TAATA----AT-T---------GC--------AC--------ATTTAAT---T---------TA---------A---------AT-TAT------------TTG-----TA-AAA---A-CGTA-------TTTT-ATGA-ATA--------TCTATAGTA--AATCTGACAAAGTAGGAATAATACA-----AAATATTGGAT-A--TTAAA-AATCAATT-----ACAC-A--------AA------A------C------A----A-ATTTAAAA----TT------ATGT-TTA----TCA---------------------------------------------------A-TA-G--------TAAT---TC-AAA--------A-A-TAATG-AG--AAA--AA-GAA----------A-TAT-AAAA-GT--A----------------T--TTT--ATTGCACGAT----T-TATTGG-AATTGA-TGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTCAGTG------TAGA----------------TTTAAATG-GCGTATTGATGTTGGTACATGTAACTTGTTCCATTCTGTAAGACCGCATATAGAAAACGCCCTGCCATATGATGTTGTCTAAAAGCTAGGAACATGTA------ATGTATatcaatagtaattcaaaaataatgagaaaaagaaatataaaagtattttattgcacgatttattggaattgatgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgacttcagtgtagatttaaatggcgtattgatgttggtacatgtaacttgttccattctgtaagaccgcatatagaaaacgccctgccatatgatgttgtctaaaagctaggaacatgtaatgtat
gi|7 : tttattttccgaggataacacatttggctataaggccagtctgacatatcgtcccctaaacatatatattatttacagcacatttaaacataaacgtgatataacgaatatataaagttctttggtctctcatctATAAT--ACTAATAA----TAGTAATAACAATAA----AAA-ACAATAATTTCTGGGGGTAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCTTCTTAGACATACATATTA-TTACAACATATTTGAA--CATAA-A----AT-TATCGTATCAA---------AT--------AT---AT---A---------AA---------A---------GT-TCT------------TAG----GT
gi|7 : atcatacaagtggtcagcctttcccTTTAGAATCTTAATA----AT-T---------GC--------GC--------AT---ATGACT---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG--------TAA---A-AA-G-------C----GTGT--TA--------TCTATATTA--CTT--------GT--------TACA-----A-----CG--T-A--TTAAA-GACCAGTA-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-ATATAAAA----CT------ATGT-TTG----TCAAT--T----CA-A--TCAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TGTTGTAT--AAA--AACAATT-T--G-AT-ATTTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACAAT----T-ACTTAG-ACTTAA-TGACTTTCTACGGTAGATACTTGTGCTCATGGTATACCAGACATAAGGTGTGttagaatcttaataattgcgcatatgactaaaattatttgtaaaaagcgtgttatctatattacttgttacaacgtattaaagaccagtaacataaaacaaatataaaactatgtttgtcaattcaatcaaaatgagtaaaaaatgataattcagatgttagaatgttgtataaaaacaatttgatattttaaaagtatttaaaatatgttttattgcacaattacttagacttaatgactttctacggtagatacttgtgctcatggtataccagacataaggtgtg
gi|8 : atcatacaagtggtcagcctttcccataatactaataatagtaataacaataaaaaacaataatttctgggggtaacatattttgctatatagccagtctgacatatggtcttcttagacatacatattattacaacatatttgaacataaaattatcgtatcaaatatataaaagttcttaggATTATAAT-TAATAACAA----TAATAATAATAATAATT--TAA-TCTTTATTT-CTGAGGATAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGTCATATGGTCCTCTAACACATACATATTATATACAACACATT-------ATAA-A----AT-T---------A---------AC--------GT---AT---C---------AA---------ATACATTACTGT-TAT------------TAA----GTG-TAG---A------------------------A--------TCTA-AATA--ATT--------G-----------CAT----A-----TG--TGA--TTAAA-AGT--ATT------TGT-A--------AA--------------------A----A-T------G----TT------TTTT-TTA----TGAAT----ATTT-----------------------------------------A-TA-A--------TAAT---------TGT--T----A-CACTGTAT--TAA--A--GATC-T--A-TT-A---C-AAAA-ATAAATTT--AAAATTA--TGT--TT
gi|8 : t-------T----ATGA-ATA--------TTTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----C-----TG--T-A--TTAAA-GATCTATT-----ACA--A--------AA------ATAAATTT------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----CCAAT--TCATT-------TAA-------G-ACGAGT--AAA---------A-A-----A--------TAAT---TC-AGATCT--TAGA-A-TATTGCAGAAAAA--AATGA---T--G-------------------ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAA-ACTTAA-TGACaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaatgacataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|8 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgtttttttGACATAAATTGTGTCTTCAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C--------------TG-GTGTATTGATGTTG------GTAGCTTATTCCATTataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|9 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgttttttttatgaatatttataataattgttacactgtattaaagatctattacaaaaataaatttaaaattatgtttaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaat-------T----ATGATATA--------TTGTTCATT--GTT--------GT--------TACA-----A-----TG----A--TTAAA--ATCAATA-----ACAT-A--------AA------A------C------ATTTAA-A------A----TT------TTG------------AT--TA--TCA-A--ATAA-------A-ATTAGT--CAA---------A-A-----------------T---TC-AGTAAT--CAGAGA-TTTTGTAT--AAA--A-TAATT-T--G-AT-AATTT-AATA-GT--ATAT--AAAA-AAG-TGT--TTT-----GCACAAT----T-AATTAG-ACTT-T-CGA--------------------TGCTTCTGGTGTGCCAGGCATAAGGTTTACCTT---TGCGGC---AAAT-----------TTATGTTG---G-ACGT---------------------TTGTTTAATTTTGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCGATGTCATAAAATGTCGT------TTTA-------------------TATCATAGGTAGACGGTCTTAAGATTGT---CCATG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AATTAAATGCTCGATGTTCTGCACTTCGTTCCTACAAGTGCGATACAAAATGAACCAACGATTGAACCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 4444 1111 11111111111111111111111111111 2222222222222 666666666666666666666666666666666 111111111111111111 555555555555555555555555555555555555555 33333333333333 1111111111111111111111111111111 444444444444444444 222 333333333 111111 111111 1111 222222222222 1 22 1 0000000000000000000000000000000000 11 88888888888888888888888888888 11111 111
lowQualScore : 9 6666 0 7777 4 1 2 22 5 3333 1 77777777777777777777777777777 666 3333333333333 777777777 888888888888 999999999999 555555555555555555555555555555555 222 0 99999999 9 22 666666666666666666 88888 44444 8888 22 99 44444 2 77777777 222222222222222222222222222222222222222 555555 2 4444 22 11111111111111 6666666 4 1 4444444444444444444444444444444 333 2 1 33 2 4 4 444 22 333333333333333333 2 2 33 55 6 55 33 33 1 8888 2 2 555 2 2 1 5 3 33 999999999 6 3 2 000000 1 3 0 222222 0 2222 555555555555 11 1 8 3 1 1 1 1 1 33 0 44 6 7 1111111111111111111111111111111111 2 3 33 0 1 1 1 1 3 0 9 3 8 22222222222222222222222222222 55555 8 0 777 444
lowQualScore : . .... . .... . . . .. . .... . ............................. ... ............. ......... ............ ............ ................................. ... . ........ . .. .................. ..... ..... .... .. .. ..... . ........ ....................................... ...... . .... .. .............. ....... . . ............................... ... . . .. . . . ... .. .................. . . .. .. . .. .. .. . .... . . ... . . . . . .. ......... . . . ...... . . . ...... . .... ............ .. . . . . . . . . .. . .. . . .................................. . . .. . . . . . . . . . . ............................. ..... . . ... ...
lowQualScore : 0 8888 8 4444 4 5 2 99 5 9999 8 33333333333333333333333333333 111 8888888888888 000000000 555555555555 333333333333 777777777777777777777777777777777 999 1 88888888 6 55 777777777777777777 22222 55555 2222 55 22 88888 0 22222222 222222222222222222222222222222222222222 888888 0 2222 22 77777777777777 5555555 0 5 0000000000000000000000000000000 777 2 8 11 2 4 4 333 99 000000000000000000 2 2 11 33 7 33 11 44 9 3333 7 7 777 1 1 9 3 4 44 222222222 5 6 1 555555 1 9 2 888888 4 4444 444444444444 66 0 0 3 0 0 0 0 0 22 0 55 7 3 7777777777777777777777777777777777 0 2 88 8 0 0 0 0 8 8 8 2 0 22222222222222222222222222222 22222 0 8 666 000
consensus : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT--CTTT-A--GTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
Reference ( family-514 ) : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT--CTTT-A--GTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
gi|1 : ACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---T---------AAATATATAATA---------GT-TCT------------TTG----GTC-TAG---A-
gi|1 : AA-A----AT-T---------G---------AT--------A---------C---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG----TTC--AA---A-CATA-------TTTTTATGA-ATA--------TCTATAGTA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-TATCAATT-----ACAT-A--------AACAA---A------TTT----A----A-A------A----TT------ATGT-TGA----TCAAT--T----CA-A--ATAA-------A-ATGAGTT-AAA---------G-AA-AG-A--------TAAT---TC-AGACAT--TAGA-A-TATTGTA---AAA--AATGA---------T-AGTTT-TAAA-GT--ATTT--AAAA-TG--TGT--TTT--ATTACACTAT----T-AATTAT-ACTT-AATGCCTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATATACAAGACATAAGGTGTGTCCTTAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CTGAGTGATTTTGAATG-CCGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGAC-GC-TATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGAAACATGTA------ATGTGTCATTGGTAGACGATATTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTAACAACATAGatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaTTTGCAGAGTACCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAAATACATTTTTATACTATCTTGGTTGATGTTTTTTGATAGCCGTTTCATACG-TGTTATTTTACTTGTGATTTTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCCCAA---AA-GT--------------------TTT-----TG----AACTTCATTTGTTTGAATCACAATGTTGTCAAACTTAATGTCTAGTGTGTTGTTTTTTGATATATATTAGA-TTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTAATTGACATTTACAATCAGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACAATC-AGT-TTCAA-AACA------------------------TATATT-C---TCTCTCTGCTGTGTGAATTGTTGTGTCAACGGCATATAAGTCTGTTTAAAACATTCTTCAGTACATAAGcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacaAA-TCTTTAATTTCTGAAGGTAACATATTTACCTTTAAAGTCAGTTTGAGATGCGATCAACTGAGAAATGCATAGTGTTTGCATCATACTCAAA--CACAA-A----GT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AT---------A------------TAT------------GTA----GAA-TAC---ATTG-A-------T----ATAG-A-A--------TCT-TAATT--ATT--------G---------TA-A-----A-----TGT-T-A--TTAAATGA--ACTT-----AT-T-A--------AA------G------T-----------A-A------T----TT------ACG--TGA----TAAAT--GAGCT-A-A--ATAA-------ACGTGATT--CTA---------A-AA-T---------------------AAATAT--CACA-A----TGTAT--CAA--AATTAAT-gataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : taaaacATTA-A----AT-G---------A---------AC--------TT---AT---T---------AA---------A---------GT-AAT------------TTAC---GTGATAA---A-TG-A-------G----CTAA-ATAAACGTGATTCTAAAATA--AAT--------AT--------CACA-----A-----TG--T-A--TCAAA--ATTAA-T-----ATAG-G--------AA------A------C------ATTTGA-C------A----TT------TTGC-TCA----TC-----TAGCTTA-A---TAA-------A-ATGAAT---CA---------A-TG-TG-A--------TATC---TC-AAATGTCATGGATA-TATTTTAT---AA--AACAATT-T--GATC-A-TTC-AAAA-GC--ATTTA-AAAA-TA--TGTACTTC--TTTGC-CCATA---T-AATTAGTTTTT-A-TTATTTTataggaaacatttgacattttgctcatctagcttaataaaatgaatcaatgtgatatctcaaatgtcatggatatattttataaaacaatttgatcattcaaaagcatttaaaaatatgtacttctttgcccatataattagtttttattatttt
gi|11 : taaaacaatctttaatttctgaaggtaacatatttacctttaaagtcagtttgagatgcgatcaactgagaaatgcatagtgtttgcatcatactcaaacacaaagttaacatatcatatatgtagaatacattgatatagaatcttaattattgtaaatgttTTATTTCCTGAGGATAACATATTTAGTCACATTGCCAGTCTGAGAAACAGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAACGCATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------GC--------AT---AT---C---------GA---------A---------TA-TAT------------TC------TT-TGG---A-C----------------TTA-AT---------TCT-TAATA--ATT--------GCA-------CATA-----A-----T---T----TTAAA-AA--AATT-----
gi|11 : aaA-ATA--------TTTATAATA--GTT--------GT--------TACA-----G-----TG--T-A--TTAAA-GGTCAACT-----AC-T-G--------AT------T------T------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCACT--T----CA-A--GTGA-------A-ATGATT--AAA---------A-AAATG-G--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAC--AAT---T-T--G-AT-AGTTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TAA--TTC--ACAGCACAAT----T-AATTAG-ACTTAA-TGATCTTTT--GACAGGTACTTGTGCTCATGGTGCACCAGACGCATGGTgtgaaaatccattttcacaaatatttataatagttgttacagtgtattaaaggtcaactactgatttaaaattatgtttatcacttcaagtgaaatgattaaaaaaatggtaattcagatgttagaatattgtataacaatttgatagtttaaaagtatttaaaatataattcacagcacaattaattagacttaatgatcttttgacaggtacttgtgctcatggtgcaccagacgcatggt
gi|12 : aattatttcctgaggataacatatttagtcacattgccagtctgagaaacagtcctctaaaacatacatattatttacaacgcatttaaacataaaattagcatatcgaatatattctttggacttaattcttaataattgcacataattttaaaaaaattgtgaaaatccattttcacaTCTTGGTTTATGTATTTTGATAGCAGTTTCATA-GGTATTCTTTTTCTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTG--ATCGATGTGTATTCCTTTCA--GTAT---AACTTCAGTTGCTTAAATTAAATTGTCGTCTAATTTAATGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTTGATCATCAAGTCATTGAAAATGTTTTATTGACATTCATAATCATTTTGTTTTTGCTACACCACATTTTAAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TT----------------------------------TATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCAGCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAG
gi|13 : GTCATCTAATATAACATCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATAAGATTTGTATCATAAAATTATTGAGAATGTTTAAATGACAGTTATTATCATTTTTGCATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATTAT---T-TA-CTCCTGTGTGTATGGTTGTGT----GGCATGTAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGAggaaagtcgttaatgaataagagaaataaga
gi|14 : aaaGCTATATAACCTGTCAGATATGTGACCCTATTAAACATACATATTATTTACAACACATCTAAA--GA-AA-A----AA-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------atgtgttgttaatgaataagtaaataaaactggccctaagacagagccttgagggacaccgcttttaacaatttcctttgaagaaacacaagagaagtaagtagtgaaccaaacgattgaacaatcagagatttgaagagagacatttttttccaaaagc
gi|14 : tc---AT---T---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG---------AGAAAA-CGTATCC----T----ATGA-ATA--------TTTTTAATA--ATT--------AT--------TACA-----A-----TG--T-T--TTAAA-GATCCATT-----ACAT-A--------AA------A------CAAATTTA----A-A------A----AT------ATGT-TTA----TC------AATTTA-A--TTTA-------A-ATGAGT--GAA---------A-AC-GG-A--------TAAT---TC-ATATCT--TAGA-A-TGTTGTAT--AAT--AA--AAT------TT-A-----AAAA-GT--ATTG--AAAA-TA--TAT--TTT--ATTGTTCGGT----T-AGCTAG-ACTTGA-TGACTTTCTACGGTAGATACCTGTGTTCATGActatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcattaaagttatttgagaaaacgtatcctatgaatatttttaataattattacaatgttttaaagatccattacataaaacaaatttaaaaatatgtttatcaatttaatttaaatgagtgaaaacggataattcatatcttagaatgttgtataataaaatttaaaaagtattgaaaatatattttattgttcggttagctagacttgatgactttctacggtagatacctgtgttcatga
gi|15 : tcgctatataacctgtcagatatgtgaccctattaaacatacatattatttacaacacatctaaagaaaaaataacatatcaactatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcTTGAAGG-TCGTATTGATGTTA------GTGGCTTGTTCCATTCTGTAGGACAGCATATAAAAAA-GCCATATCATATGATGTATTGTGAGATCTAGGAACATGTT------ATGTATCATTGGTAGGCGATCTTTATTTTTTT--CGATATTTTGAAAAATAAAGT--------TTTTATA
gi|15 : attttgTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCACtagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatattcgttccattgtcatttgcagagcac
gi|16 : attttgttgaaggtcgtattgatgttagtggcttgttccattctgtaggacagcatataaaaaagccatatcatatgatgtattgtgagatctaggaacatgttatgtatcattggtaggcgatctttatttttttcgatattttgaaaaataaagtttttatatagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatatTCTGACATATGGTCATCTAAAACGTACATATTATTTACAACAT-TTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------ACATAACAATAT---AT---A---------AA---------A---------GT-TCC------------TTG----GTA-TA
gi|16 : cgat---AT---T---------AA---------A---------AC-TAT------------TTG--------TAA---A-CA-CGTTCTTTT----ATAA-ATA--------TGGATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-AATCATTT-----ACAT-T--------AA------A------CAAATTAA----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TC------AATTCA-A--TTTA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA--G-A--------TAAT---TA-AGATGT--T--------TTG-AT--------CTGGTT-C--A-TTAA-TTT-AAAA-GT--ATTT--A-------------TTT--ATTGCACcaaaccttatgattgcacacgtgattaaaactatttgtaaacacgttcttttataaatatggataataattgttacaatgtattaaaaatcatttacattaaacaaattaaaaattatgtttatcaattcaatttaaatgagtaaaaaagataattaagatgttttgatctggttcattaatttaaaagtatttatttattgcac
gi|17 : cgattctgacatatggtcatctaaaacgtacatattatttacaacattttaaacataaaattaacataacaatatataaaagttccttggtatacaaaccttatgattgcacacgtgAACATACAT-TTCCTTAAAA---ATCT-------TAATA----AT-TG--------G---------AC--------ATATGAT---C---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG------T-TAA---AGCGTATTTT---T----ATAA-ATA--------TTT-TAATT--ATT--------GT--------TACAATTATA-----TG--T-T--TTAAA-GATCAATT-----ACAG-A--------AA------A------CAATTTTA----A-A------A----TT------CAGT-TTA----TCAAT--TA----A-A--TTAA-------A-ATGAGT---AA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGA--TAGA-A-CATTATAT--AAA--AAC-AAT-TTGG-TA-A-TTT-AAAA-GT--ATTC--AAAAGTA--TGC--TCT--ATTGCACACT----T-AATAAG-ACTTAA-CGACTTTCTACAGTAAGTACTTGTGC
gi|18 : attaatgtc-TCTTTATTTTCTGAGAATAACATATTTAGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACAGACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GT-CCT------------TTG----GTC-AAG---A------------------------A--------TCT-TAAGA--ATT--------G---------CAC------A-----TGA-A-A--TTAAA--ATTAATT-----GTAT----------AA------A------C------G-------------------T------ATTT-TAA----TGAAT----ATCTA-A--GCAAATGTTATA-ATGAAT--AAA---------c
gi|19 : tA-ATA--------TTTATGATATCATT--------G----------ACA-----A-----TG--T-T--TTAAA-GATAAATC-----ATAT-T--------TG------A------C------ATCTAA-A------A----TT------CTGC-TTG----T------TAATTCA-A--TTAA-------A-ATGGAT--AAA---------A-AT-TA-A--------TAAT---TC-AGATAT--TAGA-AGTATTGTAT--AAAACAATG----T--G-AT-A--------------ATTT--AAAA-TACTTTT--TTC--ATTACACAATGAAATGAATTAG-ACTC-GCTGATGTTATATGATAAGTACGTGTGCT-A-GATGGACTAGATATCAGATGTgttaaccaatctttagaaagagagccaagtaaaactttatcaaaataaccgagtgttcctttaagggt
gi|2 : aatctgtttaaagatccataaaagcgattttgttaaATTATAATGTGAAAATGAGGTATAGTTATAATAATAAT---AAA-TCTT-ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCATTATGACGTATGGTCCTCTAAAACATACAAATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----TT-T---------G---------AC--------AT---AA---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----ATC-TAG---A-TG-AA------T----ATGA-ATA--------TCTATAGTA--AAT--------AT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAATAGTAATCCA-A--ATAT-------A-ATGAGT--GTA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATAT--TAGA-A-AATTGTAT--AAA--AATGGAT-T--G-TT---TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCTAGAT----T-TGTTAG-ACTT-A-CGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACTAGACATAAGGTGTGACTTAAGTGAAGCTTTAAATGACA--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTATTGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTG------ATGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTTTC--TCATGTTTTGAACAACG---T--------TTTCACAACAGAGT-ATTAATtacagtagtga
gi|2 : TCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGACCCCATATAATACATCCATAATAAAACAAAGGTAATATGTATACATTACAGAACATTTTCATACTATTTTGGTTTATGTATGTTGATAGCTATTTCATAAG-TGTTATAT-ACTTGTTATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCATACTCAATGT--AGAATCAATGTGTATG-CCTT-AAAGTGTTTGAACTTTAGTTGCTTGAATTACATTGTTGTCTAATTCAATGTCTAGAG-GTTGTTATTTG--ATAAATCAGATTTGGATCCCAAAGTCATTGAGAATGTTTTACTGGCATTGATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAACCCACTTACCTTAGTTTGGAGTCAAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCGGTGTATATGGTTGTGTAATCGGCATATAAGTCTGTTT--TACATTCTTCTGTATATAAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgttcattgttatttgcagagcaccgaccccatataatacatccataataaaacaaaggtaatatgtatacattacagaacattttcatactattttggtttatgtatgttgatagctatttcataagtgttatatacttgttatattttgacatacactatctatttgtttttccatactcaatgtagaatcaatgtgtatgccttaaagtgtttgaactttagttgcttgaattacattgttgtctaattcaatgtctagaggttgttatttgataaatcagatttggatcccaaagtcattgagaatgttttactggcattgataatcattttgttatcgttacaccacatttttaacccacttaccttagtttggagtcaagtttcaataacagatatattcttatctgcggtgtatatggttgtgtaatcggcatataagtctgttttacattcttctgtatataaga
gi|20 : attataatgtgaaaatgaggtatagttataataataataaatcttattttctgaggataacatatttggctatatagccattatgacgtatggtcctctaaaacatacaaattatttacagcacatttaaacataaatttgacataacaaagttatttgatctagatgaatatgaatatctatagtaaatattacaatgtattaaagatcaattacataaaacaaaattatgtttatcaatagtaatccaaatataatgagtgtaaaatgataattcagatattagaaaattgtataaaaatggattgtttttaaaagtatttaaaatatgttttattgctagatttgttagacttacgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtactagacataaggtgtgacttaagtgaagctttaaatgacactagtgattttgaatggcgtattgatgttggtagcttgttccattctattggaccgcatatagaaaacgccctgtcatatgatgtcgtgtgagatctaggaacatgtgatgtatcattggtagacgatctgaagtttttctcatgttttgaacaacgttttcacaacagagtattaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGC--ATGTAACATGGGCTCCTCTATGAGATACATATTATTAACA--AAAGTTAAA--CACAA-A----GT-T---------ACTTTATAATAT--------AC---AT---C---------AA---------C---------GC-TCT------------TTA----ATC-TAG---A-
gi|21 : TTTGAATG-GCGTAT-GATGTTG------GTAGTTTGTACCATTCTGTAGGACCGCATATAAAAAGCGCCCTGTCATATATTGTCGTGTGAGATTTAGGAACATGTA------ATGTGTCATTGGCAGACGATCTTAAG-TTTTC--TCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTGACAATACAGT-ATATATttctttataaatgcacatgtggttaaacttaattgtttaaaactcgattaatcgtaattttagaaatatttataataattgttacagtgtaagtaagat
gi|22 : TATAATAATAATT-ATAATGATAAAAA-AATT--AAAATCTTTAATTT--GAGGATAACATATTTGGCTATACGGCCAGTCTTGCATATGATCCTTTAATACGTGGATATTATTTCTCACAAATTTAAA--CTCAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------TA-TATAAAAAACAATCTTTG----GTC-TAG---A----G-------T----CTTA-ATAATT-----TCT-TAATA--ATT---------T--------CATAT----A-----TG----A--TTAAA-atattctggtgcttgttcatttattgatttgtagaccatgatccatttatga
gi|23 : aaaatttTATATTATATTTGGAACTTTAAGACATTGAACATGTTTCAATG-TATCT-TAAATACTGTGTTATCGTTACACCACAGTTT-AAAATATTTCTGTCAGCTTGGAGT-GAATATTCGAT--CAGGGTTGTTTATGATCTGCTGTGTGTATATT-CGTGT-CATCTGCTGTGTGTATGTTCGTGTCGTCTGC
gi|24 : --AAA--AAT-AAT-TTAA-CA-A-TTT-AAAA-AT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTTTCGTTGCACAAT----T-AATTAG-ACTG-AATGCTTTTCTATGATAAGTACTTTTGTTTATGTTCTACCAGACATAATGTGTGCCTTTGATGAtgtgtgta
gi|25 : taAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCTGTCTGACATATTGTCCTCTTAAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAC-A----AT-T---------t
gi|26 : GGAAGATGCA-------TGAAACAATGGTAGACGATCTCAAGTTTTGT--CAATGTTTTGAAGAACA---A--------TTATATAACAAAAT-ATTTATttgaca
gi|27 : gttatCATTAAATTACATGTTCATACAATCTTGGATGATGTATTTTGATAGCAATGTCAT--G-TGTTATTTTGCTTGTGATATTTTGACATAataggttggtgcttgatt
gi|28 : GA-A--CTCAATGATTTTAAATT-ACGTAT-------G------GGAGTTTGTTCAATTCTGTA----------CAGAAAAAGCCCTATCATATGAT
gi|3 : aTTGTGAGAATAACATATTTGGTTTCATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTTAAACAAACATATTATTTACAACATACTTAAT--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A------------TAT------------ATGAAAAGTC-T-----T-TG-G-------T----GTAG-A-A--------TCT-TTATA--ATT--------G---------CAC------A-----TG--TGA--TTAAA--ATTATTTGTAAAACGT-ATTTCTGTGAATATTTTA------T------A----ATA------A----TTGCCATAATGTATTAAAGATCAAT--TAGGACA-AACATAA-------A-ACAAATTCAAAATTGAATTGA-AA-TG-AATAAAAAATAATAATTC-AGATCG--TAGA-G-TATTATAT--CAA--A---CAT-T--T-TTAA-TTT-AAAA-AT--ACTT--AAAA-TA--TGT--TTA--ATTGAACAAT----T-ATTTAA-AAGTAA-TAGTTTTCTACGGTAGGTACATGTGCTCATGATGAGCCTGATATAAGGTGTGCTTTAAGAGAAGCCTTAAATGA-A--TT--TTGGTTTTG-ATG-GCATATTGATGTTG------GTA-CTTGTTCCATTATGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCCCTGTCACACGATGTCGTGTGAGAT-TAAGAATAGGTAGTACAGATCTATCATTGGTAGACAATCTTAAGTATATTGGTAATATTTTGAATAACA---T--------TTAGACAACAAAGT-ATTTA
gi|3 : aTCATTC-ATTGTTATTTGCAGAGCGCCaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|4 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatat-TCTTTATTTTTTGAGGATAACATATTTGGCTATAAAGTCTGTATGACTTATTTTCCTCAAAAACATACATATTATTCACAGTACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GT-TCT------------TTG----GTC-TAA---A------------------------A--------TCTA-AATA--ATT--------G---------CAC------A-----TG--TAA--TTAAA--ATCATTT-------AT-A--------AA------A------A------A----A-C------ATATTTT------ATGC-ATA----TCAGTAGTAATT---G--TTAC-------A-ATGTAT--TAA---------A-GA-T-----------TAAT---T
gi|4 : TCTAAAATCTAAATA--ATT----GCACATGTAAT----TAA-A----AT-C---------A---------TTT-------AT---AA---A---------AA---------A---------ACATAT------------TT----------------------------T----ATGC-ATA--------TCAGTAGTA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATTAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-ATTTAA-AC---TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAA---A-A--TTTA-------A--TGAGT--AAA---------AGAA-AG-A--------TAAT---TC-AGATAT--TGGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGA---------T-AGTTT-AAAA-GT--ATAT--AAAA-TG--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATCAG-ACTT-AATGACTTT-TACGGTAGTTGTATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTTAGTGAAGCTTTTAATGA--------GTGAATTTGAATG-ACGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATAATGTCGTGTGAGATCTAGGACCATGTA------AAGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTT----CCATGTTTTGAAGAACA---TAAAACATATTCAAC-ACAGAGTCATTacataaaacaaatttaaacttatgtttatcaattaaaatttaatgagtaaaagaaagataattcagatattggaatattgtataaaaatgatagtttaaaagtatataaaatgtgttttattgcacgattaatcagacttaatgacttttacggtagttgtatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgactttagtgaagcttttaatgagtgaatttgaatgacgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggaccgcatatagaaaacgccctgtcatataatgtcgtgtgagatctaggaccatgtaaagtatcattggtagacgatctgaagttttccatgttttgaagaacataaaacatattcaacacagagtcatt
gi|5 : tctttattttttgaggataacatatttggctataaagtctgtatgacttattttcctcaaaaacatacatattattcacagtacatttaaacataaaattaacatatcaaatatataaaagttctttggTAGTAATATTAATAATTTTAAA-TCTTTATTTTCTGAGTATAACACATTTGGCTGTATGACCAGCCTGACATATCGTCTTCTAAGAAATACATATTATTTTCAACAAATCTAAG--CACAG-T----AT-T---------A---------ACACTG----AT---AT---CAAATATATAAA---------A---------GC-TCT------------TTG----GTC-TAG---A-
gi|5 : A-ACA--------TGTATAATA--ATT--------GT--------AAAA-----A-----TG--T-A--ATAAA-GATCAATT-----ACATGA--------AA------A------CTTTT--A----A-A------A----TT------CCGC-TTA-------AT---AGTTCA-A--TCAA-------A-ATTAGT--CAA---------A-AT-CG-A--------TAAA---TC-ATATGT--TAAA-AATATTTTTT--TAA--ATCCAATAT--G-TT-A-TTTTAACA-GT--ATTTTAAAAA-TA--TAT--TTC--GTTTCACAAT----T-AGTTAA-ACCT-AATGATTTTCTATGACAAGCACGTGTGCGTATGATGTACCAGACGCAAGGTGTGCCTTAGATGAAGCCTTAAA-AA-AGCCC-AATGGTTTTG-ATGTGTGTATTGATGTAG------GAAGTTT-TTCCATTCatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaaacatgtataataattgtaaaaatgtaataaagatcaattacatgaaaacttttaaaattccgcttaatagttcaatcaaaattagtcaaaatcgataaatcatatgttaaaaatatttttttaaatccaatatgttattttaacagtattttaaaaatatatttcgtttcacaattagttaaacctaatgattttctatgacaagcacgtgtgcgtatgatgtaccagacgcaaggtgtgccttagatgaagccttaaaaaagcccaatggttttgatgtgtgtattgatgtaggaagtttttccattca
gi|6 : tagtaatattaataattttaaatctttattttctgagtataacacatttggctgtatgaccagcctgacatatcgtcttctaagaaatacatattattttcaacaaatctaagcacagtattaacactgatatcaaatatataaaagctctttggtctagaatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaatgtaaatttaaaTTTATTTTCCGAGGATAACACATTTGGCTATAAGGCCAGTCTGACATATCGTCCCCT-AAACATATATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-ACGTGATAT---------A---------ACGA------AT---ATA--T---------AA---------A---------GT-TCT------------TTG----GTC-T-------C----------T----------CA--------TCT-TAATA--ATT--------G---------CAC------A-----TT--T-AATTTAA---ATTATTT-----GTA--A--------AA------A------C------G-------------------T------AT-T-TTA----TGAAT----ATCTATA--GTAA-------ATCTGA-C--AAA---------G-TA-GGAA--------TAAT---ACAAAATAT--T-GG-A-TAT----T--AAA--AATCAA-------TT-A-CAC-AAAACAA--ATTT--AAAATTA--TGT--TTa
gi|6 : TAATA----AT-T---------GC--------AC--------ATTTAAT---T---------TA---------A---------AT-TAT------------TTG-----TA-AAA---A-CGTA-------TTTT-ATGA-ATA--------TCTATAGTA--AATCTGACAAAGTAGGAATAATACA-----AAATATTGGAT-A--TTAAA-AATCAATT-----ACAC-A--------AA------A------C------A----A-ATTTAAAA----TT------ATGT-TTA----TCA---------------------------------------------------A-TA-G--------TAAT---TC-AAA--------A-A-TAATG-AG--AAA--AA-GAA----------A-TAT-AAAA-GT--A----------------T--TTT--ATTGCACGAT----T-TATTGG-AATTGA-TGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTCAGTG------TAGA----------------TTTAAATG-GCGTATTGATGTTGGTACATGTAACTTGTTCCATTCTGTAAGACCGCATATAGAAAACGCCCTGCCATATGATGTTGTCTAAAAGCTAGGAACATGTA------ATGTATatcaatagtaattcaaaaataatgagaaaaagaaatataaaagtattttattgcacgatttattggaattgatgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgacttcagtgtagatttaaatggcgtattgatgttggtacatgtaacttgttccattctgtaagaccgcatatagaaaacgccctgccatatgatgttgtctaaaagctaggaacatgtaatgtat
gi|7 : tttattttccgaggataacacatttggctataaggccagtctgacatatcgtcccctaaacatatatattatttacagcacatttaaacataaacgtgatataacgaatatataaagttctttggtctctcatctATAAT--ACTAATAA----TAGTAATAACAATAA----AAA-ACAATAATTTCTGGGGGTAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCTTCTTAGACATACATATTA-TTACAACATATTTGAA--CATAA-A----AT-TATCGTATCAA---------AT--------AT---AT---A---------AA---------A---------GT-TCT------------TAG----GT
gi|7 : atcatacaagtggtcagcctttcccTTTAGAATCTTAATA----AT-T---------GC--------GC--------AT---ATGACT---------AA---------A---------AT-TAT------------TTG--------TAA---A-AA-G-------C----GTGT--TA--------TCTATATTA--CTT--------GT--------TACA-----A-----CG--T-A--TTAAA-GACCAGTA-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-ATATAAAA----CT------ATGT-TTG----TCAAT--T----CA-A--TCAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TGTTGTAT--AAA--AACAATT-T--G-AT-ATTTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACAAT----T-ACTTAG-ACTTAA-TGACTTTCTACGGTAGATACTTGTGCTCATGGTATACCAGACATAAGGTGTGttagaatcttaataattgcgcatatgactaaaattatttgtaaaaagcgtgttatctatattacttgttacaacgtattaaagaccagtaacataaaacaaatataaaactatgtttgtcaattcaatcaaaatgagtaaaaaatgataattcagatgttagaatgttgtataaaaacaatttgatattttaaaagtatttaaaatatgttttattgcacaattacttagacttaatgactttctacggtagatacttgtgctcatggtataccagacataaggtgtg
gi|8 : atcatacaagtggtcagcctttcccataatactaataatagtaataacaataaaaaacaataatttctgggggtaacatattttgctatatagccagtctgacatatggtcttcttagacatacatattattacaacatatttgaacataaaattatcgtatcaaatatataaaagttcttaggATTATAAT-TAATAACAA----TAATAATAATAATAATT--TAA-TCTTTATTT-CTGAGGATAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGTCATATGGTCCTCTAACACATACATATTATATACAACACATT-------ATAA-A----AT-T---------A---------AC--------GT---AT---C---------AA---------ATACATTACTGT-TAT------------TAA----GTG-TAG---A------------------------A--------TCTA-AATA--ATT--------G-----------CAT----A-----TG--TGA--TTAAA-AGT--ATT------TGT-A--------AA--------------------A----A-T------G----TT------TTTT-TTA----TGAAT----ATTT-----------------------------------------A-TA-A--------TAAT---------TGT--T----A-CACTGTAT--TAA--A--GATC-T--A-TT-A---C-AAAA-ATAAATTT--AAAATTA--TGT--TT
gi|8 : t-------T----ATGA-ATA--------TTTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----C-----TG--T-A--TTAAA-GATCTATT-----ACA--A--------AA------ATAAATTT------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----CCAAT--TCATT-------TAA-------G-ACGAGT--AAA---------A-A-----A--------TAAT---TC-AGATCT--TAGA-A-TATTGCAGAAAAA--AATGA---T--G-------------------ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAA-ACTTAA-TGACaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaatgacataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|8 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgtttttttGACATAAATTGTGTCTTCAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C--------------TG-GTGTATTGATGTTG------GTAGCTTATTCCATTataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|9 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgttttttttatgaatatttataataattgttacactgtattaaagatctattacaaaaataaatttaaaattatgtttaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaat-------T----ATGATATA--------TTGTTCATT--GTT--------GT--------TACA-----A-----TG----A--TTAAA--ATCAATA-----ACAT-A--------AA------A------C------ATTTAA-A------A----TT------TTG------------AT--TA--TCA-A--ATAA-------A-ATTAGT--CAA---------A-A-----------------T---TC-AGTAAT--CAGAGA-TTTTGTAT--AAA--A-TAATT-T--G-AT-AATTT-AATA-GT--ATAT--AAAA-AAG-TGT--TTT-----GCACAAT----T-AATTAG-ACTT-T-CGA--------------------TGCTTCTGGTGTGCCAGGCATAAGGTTTACCTT---TGCGGC---AAAT-----------TTATGTTG---G-ACGT---------------------TTGTTTAATTTTGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCGATGTCATAAAATGTCGT------TTTA-------------------TATCATAGGTAGACGGTCTTAAGATTGT---CCATG
blockSeqs : A TTA TTTT A A T AT T CGTG A ACTTTATAATAT ATG CAAATATATA . TACATTACTGT AAAAAACAATCT TAAACACGTTCTTTTA GAT AACGTGAT A TC CTGACAAAGTAGGAATAA ATTAT AATAT GAT AT TG GTAAA G TTTCTGTG TATTTTATAATAA GCCATA A AAGA AA AGTAATCCAAA ATGTTAT C T TCAAAATTGAATTGAAATGAATAAAAAA AAT A A CA A T G AAA AC ACAATTTGATCAT T C AA TA G CT AC TC C GAAA G T AA G T A A T TG AGCCCAA A T T GTACAT A C GTACAG TTGG TAAAACATA TT G C . C A G T A AA G TT C T AGAATCAATGTGTATGCCTTAAAGTGTTTG T T . A C T T A T G A TCAGGGTTGTTTATGATCTGCTGTGTG CGTG . CAG C
blockSeqs : . . TT . T A . T . . ATCGTATCAAAT TTA CAAATATATA . ACA . TTAAAGCGTATTTTTA AG ATT A . GCA T . TT . A . . . ACAAATTTAAAA . . . AC TAGGACAAACA . T A AAAAAAATGG . . G . G G A C . CTGGTTCATTAAT . . . A T G . . A A . . GA A C C T C TG CACTAG A . T . C C . TT AAGT TC C . . T T T A . TG C T TTGATCGATGTGTATTCCTTTCAGTAT C T . A A A A A T G . TAACAGA AT . AAT C
blockSeqs : . . TT . A A . T . . AACATAACAAT . CAAATATATA . AT . AGAAAACGTATCCTA AA . T . AT T . AA . G . . . ACAAATTAAAAA . . . AA TAATTCAAT . . T AAAAGAAAGA . . G . A . . A . ACAATTTGGTAAT . . . . T . . . G . . . AA G T C A T TG ACTCAA A . T . C A . TC T TG A . G A . . A T . . C A T C G . A . TAACAGA C . CGT T
blockSeqs : . . A A . . . . AACACTG . GACT . GT . TAAAAACGTATTTTA TA . A . GT . . TG . G . . . ACAATTTTAAAA . . . AA AGTAATTGT . . G AAAGTAGGAA . . C . A . . A . ATAATTTAACAAT . . . . . . . . A . . . GC G G A T C TG ATTT A . T . C A . TC T AT A . T T C A . G . . C . .
blockSeqs : . A A . . . . AACGA . AT . TA . CGTGATAAATGAGC GA . A . AT . . TA . A . . . ACAAATTTAAAC . . . AA GAGCTAAA . . G GAAAACGGA . . G . A . . A . TCCAATATGTTAT . . . . . . . . A . . . AA T A C A C A AC A . T . C C . GT A AG G
blockSeqs : . A G . . . . GGAC . C . GT . AAAAGTCTTTGGTG AA . A . GT . . TG . G . . . ACAAATTTAAAA . . . AA TAGCTTAA . . G AAAAATTAA . . G . A . . A . ACAATTTGATATT . . . . . . . . G . . . AA G T A C . T G A . T . C C . T T CA
blockSeqs : . A G . . . . ATTT . C . GT . GAATACATTGATA AA . A . GT . . T . G . . . ACAAATATAAAA . . . AG AATTTAAT . . A GTAAAATGA . . A . A . . A . TAATTTGATAAT . . . . . . . . A . . . AA G A T C . . . . . T . C A . .
blockSeqs : . T A . . . . GCAC . T . AC . ATCTAGATGAATA GA . G . AT . . T . G . . . ATAAATTTAAAA . . . AA AATTCAAT . . A CAAAATCGA . . A . A . . A . ATGGATTGTTT . . . . . . . . A . . . AA T A C . . . . . . . . .
blockSeqs : T G . . . . GCGC . C . AT . GTCTAGAGTC TA . A . GT . . T . G . . . ACATTTGACA . . . AA AGTTCAAT . . G AAAAAATGA . . C . G . . C . ATTTGATAGT . . . . . . . . G . . . GA G G . . . .
blockSeqs : A A . . . . GAT . C . GT . TAAAAAGCG AG . A . GT . . T . G . . . ACATCTAAAA . . . AA ATCTATAG . . A CAATGTGA . . A . A . . A . CATTTTTAAT . . . . . . . . A . . . AA T A . . . .
blockSeqs : A G . . . . AAC . T . GT . TTTGGAC GC . A . GT . . T . A . . . AAAACATATT . . . AA ATCTAAG . . A AAAAAAGA . . G . A . . T . ATCAATTAC . . . . . . . . G . . . AA A T
blockSeqs : A G . . . . AAC . A . GC . GTCAAGA GA . A . GT . . T . G . . . ACTTTTAAAA . . . AA TATCAAA . . G AAAAATGA . . A . A . . A . GATCTATTA . . . . . . . . A . . . A . .
blockSeqs : T A . . . . AGC . T . TA . GTCTAAA GT . A . GT . . T . A . . . ACATTTAAAA . . . A TAAAAT . . G CTAAAAT . . G . A . . A . ATGTGATA . . . . . . . . G . . . A
blockSeqs : A G . . . . AAC . C . GT . GTGTAGA GA . T . G . . T . G . . . TTAAAA . . . A TCAAG . . G TAAAGAT . . G . . . . A . ATGATAGT . . . . . . . . A . . . T
blockSeqs : . A . . . . AAC . C . GC . GTCTCT . . . . G . . T . . . . . ACAAAA . . . A TAAAT . . G AAAAAA . . C . . . . T . AAATTTA . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . GAC . C . GT . TA . . . . G . . T . . . . . GTAAT . . . . TCAAT . . G CAAAA . . A . . . . A . AGAAAT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAC . C . AT . . . . . T . . T . . . . . AATG . . . . TCATT . . . ATAG . . . . . . . . . ATGATG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AAC . C . GT . . . . . G . . T . . . . . ACG . . . . ATTT . . . ATAA . . .
blockSeqs : . . . AAC . A . AT . . . . G . . T . . . . . ACG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . AAC . T . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . C .
blockSeqCons : TT** ********* TNAAGACGTTTA********************* ACAAATTTAAAA*************************** TAATTCAAT***** AAAAAATGA********************** ACAATTTGATAAT***** AC******* TCAGG************************
originalCons : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTG----GTC-TAG---A-CG-A-------T----ATGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AA------A------C------A----A-A------A----TT------ATGT-TTA----TCAAT--TAATTCA-A--NTAA-------A-ATGAGT--AAA---------A-AA-TG-A--------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AATGAAT-T--G-TT-A-TTT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--CT-AGTGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT--CTTT-A--GTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
finalCons : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATACATATTATTTACAGCACATTTAAA--CATAA-A----AT-T---------A---------AC--------AT---AT---C---------AA---------A---------GT-TAT------------TTGTNAAGACGTTTA---------------------TGA-ATA--------TCTATAATA--ATT--------GT--------TACA-----A-----TG--T-A--TTAAA-GATCAATT-----ACAT-A--------AAACAAATTTAAAA---------------------------TT------ATGT-TTA----TCAATTAATTCAAT-----TAA-------A-ATGAGTAAAAAATGA----------------------TAAT---TC-AGATGT--TAGA-A-TATTGTAT--AAA--AACAATTTGATAAT-----TT-AAAA-GT--ATTT--AAAA-TA--TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGAAC-------TGATTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT--CTTT-A--GTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATCAGG------------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AATTAAATGCTCGATGTTCTGCACTTCGTTCCTACAAGTGCGATACAAAATGAACCAACGATTGAACCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 4444 1111 11111111111111 111111111 11111 111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111111 444444444444444444444444 1111111111111 111111111 1111 1111111111111111111 222 4444444444444444444 111111 111111 1111 222222222222 1 22 1 0000000000000000000000000000000000 11 99999999999999999999999999999 11111 111
lowQualScore : 9 6666 0 7777 4 2 33333333333333 5555 666666 55 88888888 22 3 6666 66666 555555555 333 6666 555 11111 555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 666 777 77777777 44444 2222222222222 66 8888888 1 33 777777777 333 666 1 1 555555 333 55 111111111111111111111111 0 0000000000000 22 22 44444 555 333 2 444444444 2 2 77777777 2 555 2 22 777 4 22 2 2 66 22 6666 5555555555555555555 2 4444 55 7777777 2 999999 33 33 1 8888 2 2 555 2 2 1 5 3 11 6666666666666666666 4 3 2 000000 1 3 0 222222 0 2222 555555555555 11 1 8 3 1 1 1 1 1 33 0 44 6 7 1111111111111111111111111111111111 2 3 33 0 1 1 1 1 3 0 9 3 8 99999999999999999999999999999 55555 8 0 777 444
lowQualScore : . .... . .... . . .............. .... ...... .. ........ .. . .... ..... ......... ... .... ... ..... ... ............................................................................... ... ... ........ ..... ............. .. ....... . .. ......... ... ... . . ...... ... .. ........................ . ............. .. .. ..... ... ... . ......... . . ........ . ... . .. ... . .. . . .. .. .... ................... . .... .. ....... . ...... .. .. . .... . . ... . . . . . .. ................... . . . ...... . . . ...... . .... ............ .. . . . . . . . . .. . .. . . .................................. . . .. . . . . . . . . . . ............................. ..... . . ... ...
lowQualScore : 0 8888 8 4444 4 2 88888888888888 0000 888888 22 11111111 99 6 4444 44444 222222222 000 1111 666 22222 555 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444 555 66666666 55555 6666666666666 88 8888888 9 55 666666666 333 777 9 1 555555 333 33 000000000000000000000000 3 5555555555555 66 66 88888 666 333 0 000000000 1 1 66666666 1 888 1 99 999 2 99 1 6 55 88 6666 2222222222222222222 8 2222 66 6666666 4 777777 44 44 9 3333 7 7 777 1 1 9 3 4 88 2222222222222222222 3 6 1 555555 1 9 2 888888 4 4444 444444444444 66 0 0 3 0 0 0 0 0 22 0 55 7 3 7777777777777777777777777777777777 0 2 88 8 0 0 0 0 8 8 8 2 0 00000000000000000000000000000 22222 0 8 666 000
consensus : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATA--------------CATATTAT----TTA------CAA-CACATT--------TAAA--CATAA-A----AT-----TA---------A---C----AT---AT-----CAAAGT-TAT-----------T--T--G-T-NA-AAA--CGT----T----T-----A---T--GA-AT----A--------TCT-A--TAA---TAATTGT-TAC------A-AT-----G--------T-A--TTAAA-GATCAATTA-------C-AT-AAA---------A---CAA--ATT-TAAAA------TTA---TGT-TTA----TC-AAT--TA---ATTC--AATTA-------------AAAT--G--AG-----T-A-A---AA-AATG------AT-AAT-T--------CA-GATG--TT-A--GA---A-T--AT-TGTATA-AA--A-AC-AATTTGA------------------TAAT----TTAAAAGTATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C----T---GA----TTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT--CTTT-A--GTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
Reference ( family-514 ) : ATTATAATGTAATAATAA---ATAGTAATAATAATAATT--AAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACATA--------------CATATTAT----TTA------CAG-CACATT--------TAAA--CATAA-A----AT-----TA---------A---C----AT---AT-----CAAAGT-TAT-----------T--T--G-T-NA-AGA--CGT----T----T-----A---T--GA-AT----A--------TCT-A--TAA---TAATTGT-TAC------A-AT-----G--------T-A--TTAAA-GATCAATTA-------C-AT-AAA---------A---CAA--ATT-TAAAA------TTA---TGT-TTA----TC-AAT--TA---ATTC--AATTA-------------AAAT--G--AG-----T-A-A---AA-AATG------AT-AAT-T--------CA-GATG--TT-A--GA---A-T--AT-TGTATA-AA--A-AC-AATTTGA------------------TAAT----TTAAAAGTATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAG-ACTT-A-TGACTTTCTACGGTAGGTACNTGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGCCTTNAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C----T---GA----TTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTA------ATGTATCATTGGTAGACGATCTTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTNACAACANAGT-ATTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGANCCCATATAATACATCCATAACNAAACAAAGGTAATATGTATGCATTAAANTACATTTTCATACTATCTTGGTTNATGTATTTTGATAGCNGTTTCATA-G-TGTTATTTTACTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGT--G--ATCGATGTGTAT--CTTT-A--GTGT---AACTTCAGTTGCTTGAATTACATTGTCGTCTAATTTAACGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTNANTGACATTTATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAAT--CAGG----------------------TATATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCANCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGA
gi|1 : ACATA--------------CATATTAT----TTA------CAG-CACATT--------TAAA--CATAA-A----AT-----TA---------A---C----AT---AT-----TAAA
gi|1 : AA-A----AT-----TG---------A---T----A-----------CAAAAT-TAT-----------T--T--G-T-TC-AAA--CATATTTT----T-----A---T--GA-AT----A--------TCT-A--TAG---TAATTGT-TAC------A-AT-----G--------T-A--TTAAA-TATCAATTA-------C-AT-AAA-------------CAA--ATT-TAAAA------TTA---TGT-TGA----TC-AAT--T-------C--AAATA-------------AAAT--G--AG-----TTA-A---AG-AAAG------AT-AAT-T--------CA-GACA--TT-A--GA---A-T--AT-TGTA-A-AA--A-A------TGA------------------TAGT----TTTAAAGTATTT--A-------AAA-TG------TGT--TTT--ATTACACTAT----T-AATTAT-ACTT-AATGCCTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATATACAAGACATAAGGTGTGTCCTTAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C----T---GAGTGATTTTGAATG-CCGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGAC-GC-TATAGAAAACGCCCTGTCATACGATGTCGTGTGAGATCTAGAAACATGTA------ATGTGTCATTGGTAGACGATATTAAGTTTTTC--CCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTAACAACATAGtatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaTTTGCAGAGTACCGAGCCCATATAATACATCCATAACCAAACAAAGGTAATATATATGCATTAAAATACATTTTTATACTATCTTGGTTGATGTTTTTTGATAGCCGTTTCATACG-TGTTATTTTACTTGTGATTTTTTGACATACACTATCTGTTTGTTTTTCCCAA---AA-GT--------------------TTT-----TG----AACTTCATTTGTTTGAATCACAATGTTGTCAAACTTAATGTCTAGTGTGTTGTTTTTTGATATATATTAGA-TTGGATCATAAAGTCATTGAGAATGTTTAATTGACATTTACAATCAGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacatttacaatcagtttcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|1 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACAATC-AGT-TTCAA---AACA----------------------TATATT-C---TCTCTCTGCTGTGTGAATTGTTGTGTCAACGGCATATAAGTCTGTTTAAAACATTCTTCAGTACATAAGcaaaacatatattctctctctgctgtgtgaattgttgtgtcaacggcatataagtctgtttaaaacattcttcagtacataaggataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : acatacatattatttacagcacatttaaacataaaattaacatattaaatatataatagttctttggtctagaatcttaaaaattgatacaaaattatttgttcaaacatatttttatgaatatctatagtaattgttacaatgtattaaatatcaattacataaacaaatttaaaattatgttgatcaattcaaataaaatgagttaaagaaagataattcagacattagaatattgtaaaaaatgatagttttaaagtatttaaaatgtgttttattacactattaattatacttaatgcctttctacggtagttatatgtgctcatgatatacaagacataaggtgtgtccttagtgaagccttaaatgaactgagtgattttgaatgccgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggacgctatagaaaacgccctgtcatacgatgtcgtgtgagatctagaaacatgtaatgtgtcattggtagacgatattaagtttttcccatgttttgaagaacattttaacaacatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcagagtaccgagcccatataatacatccataaccaaacaaaggtaatatatatgcattaaaatacatttttatactatcttggttgatgttttttgatagccgtttcatacgtgttattttacttgtgattttttgacatacactatctgtttgtttttcccaaaagtttttgaacttcatttgtttgaatcacaatgttgtcaaacttaatgtctagtgtgttgttttttgatatatattagattggatcataaagtcattgagaatgtttaattgacaAA-TCTTTAATTTCTGAAGGTAACATATTTACCTTTAAAGTCAGTTTGAGATGCGATCAACTGAGAAATG--------------CATAGTGT----TTG------CAT-CATACT--------CAAA--CACAA-A----GT-----TA---------A---C----AT---AT-----CA-----TAT-----------A--T--G-TAGA-ATA--CAT----TGA--T-----A---T--AG-A-----A--------TCT----TAA---TTATTG--TA-------A-AT-----GT-------T-A--TTAAATGA--ACTTA-------T--T-AAA---------G---T-A--ATT-TA----------CG---TG----A----TA-AAT--GA---GCTA--AATAA-------------ACGT--G--AT-----T-C-T---AA-AATA---------AATAT--------CACAATGTATC-A--AA---A-T---T-AATATAGGA--A-AC--ATTTGA------------------CATT----TTgataaaccattaatgaataagagaaataaaacttgcctgacgtaatgcactgcgttctacaagagagataagaagtgaaccaaccgattgaacaatcagagattttgtagggagacacttttttttcttcaaaagtatgtcatgatctacaatatcaaatgccttttgtaaatcaaagtttatggaacttatcgagtcgccgttgtctatatatgcaagccacttatctataaatttgactagtaccgtttggcacgagtgattttggcgaaaacgagattgtgatacgtgtatgagtttatattcattcaggtatgcaaacaaatgtttcgttacacgtttttcaaaaaccttagacagaactggtaaaacagatataggtctatgttttgggggatcacattttgatcctcctttatgtataggaaacagttttgcctcctcgagtgcttgaggaaaagaac
gi|10 : taaaacATTA-A----AT-----GA---------A---C----TT---AT-----TAAAGT-AAT-----------T--TACG-T-GATAAA--TG----------------AGC-T--AA-AT----AAACGTGATTCT-A--AAA---TAAATAT-CAC------A-AT-----G--------T-A--TCAAA--ATTAAT-A-------T-AG-GAA---------A---CA----TT-TGACA------TTT---TGC-TCA----TC------TA---GCTT--AAT-A-------------AAAT--G--AA-----T-C-A---AT-G-TG------AT-ATC-T--------CA-AATG--TC-ATGGAT--A-T--AT-TTTATA-AA--A--C-AATTTGA------------------TCAT----TCAAAAGCATTTA-A-------AAA-TA------TGTACTTC--TTTGC-CCATA---T-AATTAGTTTTT-A-TTATTTTgctcatctagcttaataaaatgaatcaatgtgatatctcaaatgtcatggatatattttataaaacaatttgatcattcaaaagcatttaaaaatatgtacttctttgcccatataattagtttttattatttt
gi|11 : taaaacaatctttaatttctgaaggtaacatatttacctttaaagtcagtttgagatgcgatcaactgagaaatgcatagtgtttgcatcatactcaaacacaaagttaacatatcatatatgtagaatacattgatatagaatcttaattattgtaaatgttTTATTTCCTGAGGATAACATATTTAGTCACATTGCCAGTCTGAGAAACAGTCCTCTAAAACATA--------------CATATTAT----TTA------CAA-CGCATT--------TAAA--CATAA-A----AT-----TA---------G---C----AT---AT-----CGAA---TATA----------T--T--C-T-TT-GGA--C-T----T------------------A-AT-------------TCT----TAA---TAATTGCACAT------A-AT--------------T----TTAAA-AA--AATTG-------T-GA-AAATCCATTTTCA---CAAATATT-TATAATAGTTGTTACAGTGTATTAAAGGTC-AAC--TACTGATTTAAAATTATGTTTATCACTTCAAGT--G--AAATGATT-AAA---AA-AATG------GT-AAT-T--------CA-GATG--TT-A--GA---A-T--AT-TGTAT------A-AC-AATTTGA------------------TAGT----TTAAAAGTATTT--A-------AAA-TA------TAA--TTC--ACAGCACAAT----T-AATTAG-ACTTAA-TGATCTTTT--GACAGGTACTTGTGCTCATGGTGCACCAGACGCATGGT
gi|12 : aaTCTTGGTTTATGTATTTTGATAGCAGTTTCATA-GGTATTCTTTTTCTTGTGATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCCAACTCAATGTTTG--ATCGATGTGTATTCCTTTCA--GTAT---AACTTCAGTTGCTTAAATTAAATTGTCGTCTAATTTAATGTCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATTAGATTTTGATCATCAAGTCATTGAAAATGTTTTATTGACATTCATAATCATTTTGTTTTTGCTACACCACATTTTAAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TT----------------------------------TATT-C---T-TATCTGCTGTGTGTATGGTTGTGTCAGCGGCATATAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAG
gi|13 : GTCATCTAATATAACATCTAGTGTGTTGTTATTTG--ATATATAAGATTTGTATCATAAAATTATTGAGAATGTTTAAATGACAGTTATTATCATTTTTGCATCGTTACACCACATTTTTAAACCATTTACGCTAGTTTGGAGTCGAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATTAT---T-TA-CTCCTGTGTGTATGGTTGTGT----GGCATGTAAGTCTGTTT--CACATTCTTCAGTATATAAGAggaaagtcgttaatgaataagagaaataaga
gi|14 : aaaGCTATATAACCTGTCAGATATGTGACCCTATTAAACATA--------------CATATTAT----TTA------CAA-CACATC--------TAAA--GAAAA-A----AT------A---------A---C----AT---AT-----CAACTA-TAT-----------TAAT--G-T-T-------CTT----T----T-----A---TCTAA-GA----A--------TCT----------TAATTAC-TGC------AGAT-----G--------TCA--TTAAA-GTT--ATTT-------G-AG-AAA---------A---CGT--ATCCTATGA------ATA---TTT-TTA--------AT---A---ATT----ATTA-------------CAAT--G--TT-----T-T-A---AA-GATCCATTACAT-AAA-A--------CA-AATT--TA-A--AA---A-T--ATGTTTAT---------C-AATTT---------------------AAT----TTAAAatgtgttgttaatgaataagtaaataaaactggccctaagacagagccttgagggacaccgcttttaacaatttcctttgaagaaacacaagagaagtaagtagtgaaccaaacgattgaacaatcagagatttgaagagagacatttttttccaaaagc
gi|14 : tc---AT-----TAAAGT-TAT-----------T--T--G-A-GA-AAA--CGTATC-C----T-----A---T--GA-AT----A--------TTT-T--TAA---TAATTAT-TAC------A-AT-----G--------T-T--TTAAA-GATCCATTA-------C-AT-AAA---------A---CAA--ATT-TAAAA------ATA---TGT-TTA----TC-------A---ATTT--AATTT-------------AAAT--G--AG-----T-G-A---AA-ACGG------AT-AAT-T--------CA-TATC--TT-A--GA---A-T--GT-TGTATA-AT--A-A--AATTTA-----------------------------AAAAGTATTG--A-------AAA-TA------TAT--TTT--ATTGTTCGGT----T-AGCTAG-ACTTGA-TGACTTTCTACGGTAGATACCTGTGTTCATGAtgagtgaaaacggataattcatatcttagaatgttgtataataaaatttaaaaagtattgaaaatatattttattgttcggttagctagacttgatgactttctacggtagatacctgtgttcatga
gi|15 : tcgctatataacctgtcagatatgtgaccctattaaacatacatattatttacaacacatctaaagaaaaaataacatatcaactatattaatgttcttttatctaagaatcttaattactgcagatgtcTTGAAGG-TCGTATTGATGTTA------GTGGCTTGTTCCATTCTGTAGGACAGCATATAAAAAA-GCCATATCATATGATGTATTGTGAGATCTAGGAACATGTT------ATGTATCATTGGTAGGCGATCTTTATTTTTTT--CGATATTTTGAAAAATAAAGT--------TTTTATA
gi|15 : attttgTCGTTCCATTGTCATTTGCAGAGCACtagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatattcgttccattgtcatttgcagagcac
gi|16 : attttgttgaaggtcgtattgatgttagtggcttgttccattctgtaggacagcatataaaaaagccatatcatatgatgtattgtgagatctaggaacatgttatgtatcattggtaggcgatctttatttttttcgatattttgaaaaataaagtttttatatagtttggtggttgatcctgtattgatttgtagcacgtatgctatttgattcgcttgtgaaaaggtagcaattgaagagcattacatattggattggaggatgtaatcaattcaacttcttcgatcagcctagtagctctttttgtggctttaatatTCTGACATATGGTCATCTAAAACGTA--------------CATATTAT----TTA------CAA-CAT-TT--------TAAA--CATAA-A----AT-----TA---------A---C----AT---AA-----CAA
gi|16 : cgat---AT-----TAAAAC-TAT-----------T--T--G-T-AA-ACA--CGT----TCTTTT-----A---T--AA-AT----A--------TGG-A--TAA---TAATTGT-TAC------A-AT-----G--------T-A--TTAAA-AATCATTTA-------C-AT-TAA---------A---CAA--ATT-AAAAA------TTA---TGT-TTA----TC-------A---ATTC--AATTT-------------AAAT--G--AG-----T-A-A---AA-AA-G------AT-AAT-T--------AA-GATG--TT---------------T-TG-AT---------CTGGTTCAT------------------TAAT----TTAAAAGTATTT--A------------------------TTT--ATTGCACtatataaaagttccttggtatacaaaccttatgattgcacacgtgattaaaactatttgtaaacacgttcttttataaatatggataataattgttacaatgtattaaaaatcatttacattaaacaaattaaaaattatgtttatcaattcaatttaaatgagtaaaaaagataattaagatgttttgatctggttcattaatttaaaagtatttatttattgcac
gi|17 : cgattctgacatatggtcatctaaaacgtacatattatttacaacattttaaacataaaattaacataacaatatataaaagttccttggtatacaaaccttatgattgcacacgtgAACATA--------------CAT-TTCC----TTA------AAA----ATC--------T-------TAATA----AT-----TGG--------A---C----AT---ATGAT--CAAAAT-TAT-----------T--T--G-T-TA-AAG--CGTATTTT----T-----A---T--AA-AT----A--------TTT----TAA---TTATTGT-TAC------A-ATTATATG--------T-T--TTAAA-GATCAATTA-------C-AG-AAA---------A---CAA--TTT-TAAAA------TTC---AGT-TTA----TC-AAT--TA---A------ATTA-------------AAAT--G--AG-----T---A---AA-AATG------AT-AAT-T--------CA-GATG--AT-A--GA---A-C--AT-TATATA-AA--A-AC-AATTTGG------------------TAAT----TTAAAAGTATTC--A-------AAAGTA------TGC--TCT--ATTGCACACT----T-AATAAG-ACTTAA-CGACTTTCTACAGTAAGTACTTGTGC
gi|18 : attaatgtc-TCTTTATTTTCTGAGAATAACATATTTAGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTAAAACAGA--------------CATATTAT----TTA------CAG-CACATT--------TAAA--CATAA-A----AT-----TA---------A---C----AT---AT-----CAAA---TAT-----------A--T--A---AA-AGT--CCT----T----TG----G---T--CA-AGA---A--------TCT----TAA---GAATTG--CAC--------AT-----GA-------A-A--TTAAA--ATTAATTG-------T-AT--AA---------A---CGT--ATT-T----------TAA---TGA-ATA----TCTAAG--CA---AAT----GTTA-------------TAAT--G--AA-----T-A-A---Ac
gi|19 : t---C----AT---A-------AAAGC-GAT-----------T--TT-G-T-TA-AAA--TAT----T----T-----A---T--G--AT----A--------TC-------------ATTG---AC------A-AT-----G--------T-T--TTAAA-GATAAATCA-------T-AT-TTG---------A---C----ATC-TAAAA------TTC---TGC-TT---------GT--TA---ATTC--AATTA-------------AAAT--G--GA-----T-A-A---AA-ATTA------AT-AAT-T--------CA-GATA--TT-A--GA---AGT--AT-TGTAT--AA--A-AC-AATGTGA------------------TAAT----TTAAAA-TACTT--------------T---------T--TTC--ATTACACAATGAAATGAATTAG-ACTC-GCTGATGTTATATGATAAGTACGTGTGCT-A-GATGGACTAGATATCAGATGTgttaaccaatctttagaaagagagccaagtaaaactttatcaaaataaccgagtgttcctttaagggt
gi|2 : aatctgtttaaagatcATTATAATGTGAAAATGAGGTATAGTTATAATAATAAT---AAA-TCTT-ATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCATTATGACGTATGGTCCTCTAAAACATA--------------CAAATTAT----TTA------CAG-CACATT--------TAAA--CATAA-A----TT-----TG---------A---C----AT---AA-----CAAAGT-TAT-----------T--T--GAT-CT-AGA--TGA----A----T-----A---T--GA-AT----A--------TCT-A--TAG---TAAATAT-TAC------A-AT-----G--------T-A--TTAAA-GATCAATTA-------C-AT-AAA---------A---CAA--A-------A------TTA---TGT-TTA----TC-AATAGTA---ATCC--AAATA-------------TAAT--G--AG-----T-G-T---AA-AATG------AT-AAT-T--------CA-GATA--TT-A--GA---A-A--AT-TGTATA-AA--A-AT-GGATTGT------------------T--T----TTAAAAGTATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCTAGAT----T-TGTTAG-ACTT-A-CGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACTAGACATAAGGTGTGACTTAAGTGAAGCTTTAAATGACA--C----TAGTGA----TTTTGAATG-GCGTATTGATGTTG------GTAGCTTGTTCCATTCTATTGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATGATGTCGTGTGAGATCTAGGAACATGTG------ATGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTTTC--TCATGTTTTGAACAACG---T--------TTTCACAACAGAGT-ATTAATtacagtagtga
gi|2 : TCGTTC-ATTGTTATTTGCAGAGCACCGACCCCATATAATACATCCATAATAAAACAAAGGTAATATGTATACATTACAGAACATTTTCATACTATTTTGGTTTATGTATGTTGATAGCTATTTCATAAG-TGTTATAT-ACTTGTTATATTTTGACATACACTATCTATTTGTTTTTCCATACTCAATGT--AGAATCAATGTGTATG-CCTT-AAAGTGTTTGAACTTTAGTTGCTTGAATTACATTGTTGTCTAATTCAATGTCTAGAG-GTTGTTATTTG--ATAAATCAGATTTGGATCCCAAAGTCATTGAGAATGTTTTACTGGCATTGATAATCATTTTGTTATCGTTACACCACATTTTTAACCCACTTACCTTAGTTTGGAGTCAAGT-TTCAATAACAGA----------------------TATATT-C---T-TATCTGCGGTGTATATGGTTGTGTAATCGGCATATAAGTCTGTTT--TACATTCTTCTGTATATAAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgttcattgttatttgcagagcaccgaccccatataatacatccataataaaacaaaggtaatatgtatacattacagaacattttcatactattttggtttatgtatgttgatagctatttcataagtgttatatacttgttatattttgacatacactatctatttgtttttccatactcaatgtagaatcaatgtgtatgccttaaagtgtttgaactttagttgcttgaattacattgttgtctaattcaatgtctagaggttgttatttgataaatcagatttggatcccaaagtcattgagaatgttttactggcattgataatcattttgttatcgttacaccacatttttaacccacttaccttagtttggagtcaagtttcaataacagatatattcttatctgcggtgtatatggttgtgtaatcggcatataagtctgttttacattcttctgtatataaga
gi|20 : attataatgtgaaaatgaggtatagttataataataataaatcttattttctgaggataacatatttggctatatagccattatgacgtatggtcctctaaaacatacaaattatttacagcacatttaaacataaatttgacataacaaagttatttgatctagatgaatatgaatatctatagtaaatattacaatgtattaaagatcaattacataaaacaaaattatgtttatcaatagtaatccaaatataatgagtgtaaaatgataattcagatattagaaaattgtataaaaatggattgtttttaaaagtatttaaaatatgttttattgctagatttgttagacttacgactttctacggtagttatatgtgctcatgatgtactagacataaggtgtgacttaagtgaagctttaaatgacactagtgattttgaatggcgtattgatgttggtagcttgttccattctattggaccgcatatagaaaacgccctgtcatatgatgtcgtgtgagatctaggaacatgtgatgtatcattggtagacgatctgaagtttttctcatgttttgaacaacgttttcacaacagagtattaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGC--ATGTAACATGGGCTCCTCTATGAGATA--------------CATATTAT----TAA------CA---AAAGT--------TAAA--CACAA-A----GT-----TACTTTATAATA---T----AC---AT-----CAACGC-TCT-----------T--TA-A-T-CT-AGATTC-T----T----T-----A---T--AA-ATGCACA--------TGT-GGTTAAACTTAATTGT---------------------------------TTAAA-ACTCGATTAAT-----C-GT------------------AA--TTT-TAGAA--------A---TAT-TTA----T--AA---TA---ATT----GTTA-------------CAGT--GTAAG-----T-A-A---GA-
gi|21 : TTTGAATG-GCGTAT-GATGTTG------GTAGTTTGTACCATTCTGTAGGACCGCATATAAAAAGCGCCCTGTCATATATTGTCGTGTGAGATTTAGGAACATGTA------ATGTGTCATTGGCAGACGATCTTAAG-TTTTC--TCATGTTTTGAAGAACA---T--------TTTGACAATACAGT-ATATATt
gi|22 : TATAATAATAATT-ATAATGATAAAAA-AATT--AAAATCTTTAATTT--GAGGATAACATATTTGGCTATACGGCCAGTCTTGCATATGATCCTTTAATACGTG--------------GATATTAT----TTC------TCA-CAAATT--------TAAA--CTCAA-A----AT-----TA---------A---C----AT---AT-----CAAATA-TATAAAAAACAATCT--TTGG-T-CT-AGA---GTC---T----T-----A---A--TA-AT----T--------TCT----TAA---TAATT-T-CAT------ATAT-----G----------A--TTAAA-atattctggtgcttgttcatttattgatttgtagaccatgatccatttatga
gi|23 : aaaatttTATATTATATTTGGAACTTTAAGACATTGAACATGTTTCAATG-TATCT-TAAATACTGTGTTATCGTTACACCACAGTTT-AAAATATTTCTGTCAGCTTGGAGT-GAATATTCGAT--CAGGGTTGTTTATGATCTGCTGTGTGTATATT-CGTGT-CATCTGCTGTGTGTATGTTCGTGTCGTCTGC
gi|24 : A-AA--A-AT-AATTTAA------------------CAAT----TTAAAAATATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTTTCGTTGCACAAT----T-AATTAG-ACTG-AATGCTTTTCTATGATAAGTACTTTTGTTTATGTTCTACCAGACATAATGTGTGCCTTTGATGAtgtgtgta
gi|25 : taAA-TCTTTATTTTCTGAGGATAACATATTTGGCTATATAGCCTGTCTGACATATTGTCCTCTTAAACATA--------------TATATTAT----TTA------CAG-CACATT--------TAAA--CATAC-A----AT-----Tt
gi|26 : GGAAGATGCA-------TGAAACAATGGTAGACGATCTCAAGTTTTGT--CAATGTTTTGAAGAACA---A--------TTATATAACAAAAT-ATTTATttgaca
gi|27 : gttatCATTAAATTACATGTTCATACAATCTTGGATGATGTATTTTGATAGCAATGTCAT--G-TGTTATTTTGCTTGTGATATTTTGACATAataggttggtgcttgatt
gi|28 : ----T---GA----TTTTAAATT-ACGTAT-------G------GGAGTTTGTTCAATTCTGTA----------CAGAAAAAGCCCTATCATATGAT
gi|3 : agaactcaaTTGTGAGAATAACATATTTGGTTTCATAGCCAGTCTGACATATGGTCCTCTTAAACAAA--------------CATATTAT----TTA------CAA-CATACT--------TAAT--CATAA-A----AT-----TA---------A---C----AT---AT-----CAAA---TAT-----------A--T--G-A-AA-AG
gi|3 : aTAT-A----AT-----TGC--------A---C----ATGTGAT-----TAAAAT-TAT-----------T--T--G-T-AA-A-A--CGTATTTC----T-----G---T--GA-AT----A--------TTTTA--TAA---TAATTGC-CAT------A-AT-----G--------T-A--TTAAA-GATCAATTAGGACAAAC-AT-AAA---------A---CAA--ATT-CAAAA------TTG---------------------------------AATTG-------------AAAT--G--AA-----T-A-A---AA-AATA------AT-AAT-T--------CA-GATC--GT-A--GA---G-T--AT-TATATC-AA--A--C-ATTTT--------------------TAAT----TTAAAAATACTT--A-------AAA-TA------TGT--TTA--ATTGAACAAT----T-ATTTAA-AAGT-AATAGTTTTCTACGGTAGGTACATGTGCTCATGATGAGCCTGATATAAGGTGTGCTTTAAGAGAAGCCTTAAATGA-ATTT----T---GG----TTTTG-ATG-GCATATTGATGTTG------GTA-CTTGTTCCATTATGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCCCTGTCACACGATGTCGTGTGAGAT-TAAGAATAGGTAGTACAGATCTATCATTGGTAGACAATCTTAAGTATATTGGTAATATTTTGAATAACA---T--------TTAGACAACAAAGT-ATTTAtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|3 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatcttTCATTC-ATTGTTATTTGCAGAGCGCCaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatattcattcattgttatttgcagagcgcc
gi|4 : attgtgagaataacatatttggtttcatagccagtctgacatatggtcctcttaaacaaacatattatttacaacatacttaatcataaaattaacatatcaaatatatgaaaagtctttggtgtagaatctttataattgcacatgtgattaaaattatttgtaaaacgtatttctgtgaatattttataataattgccataatgtattaaagatcaattaggacaaacataaaacaaattcaaaattgaattgaaatgaataaaaaataataattcagatcgtagagtattatatcaaacatttttaatttaaaaatacttaaaatatgtttaattgaacaattatttaaaagtaatagttttctacggtaggtacatgtgctcatgatgagcctgatataaggtgtgctttaagagaagccttaaatgaattttggttttgatggcatattgatgttggtacttgttccattatgtaggaccgcatatagaaaaagccctgtcacacgatgtcgtgtgagattaagaataggtagtacagatctatcattggtagacaatcttaagtatattggtaatattttgaataacatttagacaacaaagtatttaaatgttctggtgctttaccatttattgatatgtagaccataatgcacgtatcgtttttgatttgtttattaaaaggaagccattgaagagcattaaacatttgacttgagggagaagtaaattcagctcctaaacgtattagtctagcattcttatttgtagttttaatat-TCTTTATTTTTTGAGGATAACATATTTGGCTATAAAGTCTGTATGACTTATTTTCCTCAAAAACATA--------------CATATTAT----TCA------CAG-TACATT--------TAAA--CATAA-A----AT-----TA---------A---C----AT---AT-----CAAA---TAT-----------A--T--A---AA-AGT--TCT----T----T-----GGTCT--AA-A-----A--------TCT-A---AA---TAATTG--CAC--------AT-----G--------TAA--TTAAA--ATCATTTA-------TAAA-AAA---------A---CAT--ATT------------TTA---TGC-ATA----TC-AGTAGTA---ATT----GTTA-------------CAAT--G--TA-----T-T-A---AA-GAT--------T-AAT-TACATAAAACA-AAT---TT-A--AACTTA-T--GT-T-TATC-AATTA-A--AATTTAA------------------TGA-----GTAAAAG
gi|4 : AAA--TCTAA-ATA--AT-----TGC--------A---C----ATGTAAT-----TAAAAT-CAT-----------T--T--A-T-AA-AAAAACATATT-T----T-----A---T--GC-AT----A--------TCA-G--TAG---TAATTGT-TAC------A-AT-----G--------T-A--TTAAA-GATTAATTA-------C-AT-AAA---------A---CAA--ATT-TAAAC------TTA---TGT-TTA----TC-AAT--TA---A-----AATTT-------------AA-T--G--AG-----T-A-A---AAGAAAG------AT-AAT-T--------CA-GATA--TT-G--GA---A-T--AT-TGTATA-AA--A-A------TGA------------------TAGT----TTAAAAGTATAT--A-------AAA-TG------TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATCAG-ACTT-AATGACTTT-TACGGTAGTTGTATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTTAGTGAAGCTTTTAATGA-G-------T---GA----ATTTGAATG-ACGTATTGATGTTG------GTAGTTTGTTCCATTCTGTAGGACCGCATATAGAAAACGCCCTGTCATATAATGTCGTGTGAGATCTAGGACCATGTA------AAGTATCATTGGTAGACGATCTGAAGTTTT----CCATGTTTTGAAGAACA---TAAAACATATTCAAC-ACAGAGTCATTaaagataattcagatattggaatattgtataaaaatgatagtttaaaagtatataaaatgtgttttattgcacgattaatcagacttaatgacttttacggtagttgtatgtgctcatgatgtaccagacataaggtgtgactttagtgaagcttttaatgagtgaatttgaatgacgtattgatgttggtagtttgttccattctgtaggaccgcatatagaaaacgccctgtcatataatgtcgtgtgagatctaggaccatgtaaagtatcattggtagacgatctgaagttttccatgttttgaagaacataaaacatattcaacacagagtcatt
gi|5 : tctttattttttgaggataacatatttggctataaagtctgtatgacttattttcctcaaaaacatacatattattcacagtacatttaaacataaaattaacatatcaaatatataaaagttctttggtctaTAGTAATATTAATAATTTTAAA-TCTTTATTTTCTGAGTATAACACATTTGGCTGTATGACCAGCCTGACATATCGTCTTCTAAGAAATA--------------CATATTAT----TTT------CAA-CAAATC--------TAAG--CACAG-T----AT-----TA---------A---CACTGAT---AT-----CAAA---TA---------------T--A-T-AA-AAG--CTC----T----T---------T--G--------G--------TCT-A--GAATCTTAAGTGA-TGCTCATGTA-AT-----GAAACCTTTT-G--TTAAA-AATC------------C-AT-AAA---------AATGTAA--ATT-TAAAA------ACA---TG---TA----T--AA---TA---ATT----GTAA-------------AAAT------G-----T-A-A---TA-AA-G------ATCAAT-T---------A-CATG-----A--AA---A-C--TT-T---TA-AA--ATTC-CGCTTAA------------------TAGTTCAATCAAAATTAGTC--A-------AAA-T
gi|5 : --T--G-T-AA-A------T----T----T-----A---A--AA-AC----A--------TGT-A--TAA---TAATTGT-AAA------A-AT-----G--------T-A--ATAAA-GATCAATTA-------C-ATGAAA---------A---CT----TT-TAAAA------TTC---CGC-TTA--------AT---A---GTTC--AATCA-------------AAAT--T--AG-----T-C-A---AA-ATCG------AT-AAA-T--------CA-TATG--TT-A--AA---AAT--AT-TTTTTT-AA--ATCC-AATATGT------------------TATT----TTAACAGTATTTTAA-------AAA-TA------TAT--TTC--GTTTCACAAT----T-AGTTAA-ACCT-AATGATTTTCTATGACAAGCACGTGTGCGTATGATGTACCAGACGCAAGGTGTGCCTTAGATGAAGCCTTAAAAAA-G--CCCAAT---GG----TTTTG-ATGTGTGTATTGATGTAG------GAAGTTT-TTCCATTCcgataaatcatatgttaaaaatatttttttaaatccaatatgttattttaacagtattttaaaaatatatttcgtttcacaattagttaaacctaatgattttctatgacaagcacgtgtgcgtatgatgtaccagacgcaaggtgtgccttagatgaagccttaaaaaagcccaatggttttgatgtgtgtattgatgtaggaagtttttccattca
gi|6 : tagtaatattaataattttaaatctttattttctgagtataacacatttggctgtatgaccagcctgacatatcgtcttctaagaaatacatattattttcaacaaatctaagcacagtattaacactgatatcaaatatataaaagctctttggtctagaatcttaagtgatgctcatgtaatgaaaccttttgttaaaaatccataaaaaTTTATTTTCCGAGGATAACACATTTGGCTATAAGGCCAGTCTGACATATCGTCCCCT-AAACATA--------------TATATTAT----TTA------CAG-CACATT--------TAAA--CATAA-ACGTGATA----TA---------A---CGA--AT---ATA----TAAAGT-TCT-----------T--T--G------------GT----C----T-----C---T------C----A--------TCT----TAA---TAATTG--CAC--------AT-----T--------T-AATTTAA---ATTATTTG-------T-A--AAA---------A---CGT--ATT------------TTA---TGA-ATA----TC-TATAGTA---AATC--TGACA-------------AAGTAGG--AA-----T-A-ATACAA-AAT-----------AT-T---------G-GATA--TTAA--AA---A-TCAAT-TACACA-AA--A-CA-AATTTAAAATTATGTTTATCAATAGTAAT----TCAAAAATAATG--AGAAAAAGAAA-TATAAAAGTAT--TTT--ATTGCACGAT----T-TATTGG-AATTGA-TGACTTTCTACGGTAGTTATATGTGCTCATGATGTACCAGACATAAGGTGTGACTTCAGTG------TAGA-----------------------TTTAAATG-GCGTATTGATGTTGGTACATGTAACTTGTTCCATTCTGTAAGACCGCATATAGAAAACGCCCTGCCATATGATGTTGTCTAAAAGCTAGGAACATGTA------ATGTATa
gi|7 : ATAAT--ACTAATAA----TAGTAATAACAATAA----AAA-ACAATAATTTCTGGGGGTAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGACATATGGTCTTCTTAGACATA--------------CATATTA-----TTA------CAA-CATATT--------TGAA--CATAA-A----AT-----TA---------T---C----GT---AT-----CAAA
gi|7 : atcatacaagtggtcagcctttcccTT--------TAGAATCTTAATA----AT-----TGC--------G---C----AT---ATGAC--TAAAAT-TAT-----------T--T--G-T-AA-AAAG-CGT----G----T----------------T----A--------TCT-A--TAT---TACTTGT-TAC------A-AC-----G--------T-A--TTAAA-GACCAGTAA-------C-AT-AAA---------A---CAA--ATA-TAAAA------CTA---TGT-TTG----TC-AAT--T-------C--AATCA-------------AAAT--G--AG-----T-A-A---AA-AATG------AT-AAT-T--------CA-GATG--TT-A--GA---A-T--GT-TGTATA-AA--A-AC-AATTTGA------------------TATT----TTAAAAGTATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCACAAT----T-ACTTAG-ACTTAA-TGACTTTCTACGGTAGATACTTGTGCTCATGGTATACCAGACATAAGGTGTGtatataaaagttcttaggtttagaatcttaataattgcgcatatgactaaaattatttgtaaaaagcgtgttatctatattacttgttacaacgtattaaagaccagtaacataaaacaaatataaaactatgtttgtcaattcaatcaaaatgagtaaaaaatgataattcagatgttagaatgttgtataaaaacaatttgatattttaaaagtatttaaaatatgttttattgcacaattacttagacttaatgactttctacggtagatacttgtgctcatggtataccagacataaggtgtg
gi|8 : atcatacaagtggtcagcctttcccataatactaataatagtaataacaataaaaaacaataatttctgggggtaacatattttgctatatagccagtctgacatatggtcttcttagacatacatattattacaacatatttgaacataaaattatcgtatcaaatatataaaagttcttaggATTATAAT-TAATAACAA----TAATAATAATAATAATT--TAA-TCTTTATTT-CTGAGGATAACATATTTTGCTATATAGCCAGTCTGTCATATGGTCCTCTAACACATACATATTATATACAACACATTATAAAATTAACGTATCAAATACATTACTGTTATTAAG--TGTAG-A----ATCTAAATA---------ATTGC----AT---ATGTGATTAAAAG-TAT-----------T--T--G-T-AA-AAA--TGT----T----TTTTTTA---T--GA-AT----A--------TTT-A--TAA---TAATTGT-TAC------A-CT-----G--------T-A--TTAAA-GATCTATTA-------C-A--AAA---------A---TAA--ATT-TAAAA------TTA---TGT-TTA----CC-AAT--TC---AT------TTA-------------AGAC--G--AG-----T-A-A---AA-A---------AT-AAT-T--------CA-GATC--TT-A--GA---A-T--AT-TGCAGA-AA--A-A--AA--TGA------------------TG--------------ATTT--A-------AAA-TA------TGT--TTT--ATTGCACGAT----T-AATTAA-ACTTAA-TGAC
gi|8 : tGACATAAATTGTGTCTTCAGTGAAGCCTTAAATGA-A--C---------------------TG-GTGTATTGATGTTG------GTAGCTTATTCCATTataaattgtgtcttcagtgaagccttaaatgaactggtgtattgatgttggtagcttattccatt
gi|9 : tattataattaataacaataataataataataatttaatctttatttctgaggataacatattttgctatatagccagtctgtcatatggtcctctaacacatacatattatatacaacacattataaaattaacgtatcaaatacattactgttattaagtgtagaatctaaataattgcatatgtgattaaaagtatttgtaaaaatgttttttttatgaatatttataataattgttacactgtattaaagatctattacaaaaataaatttaaaattatgtttaccaattcatttaagacgagtaaaaaataattcagatcttagaatattgcagaaaaaaatgatgatttaaaatatgttttattgcacgattaattaaacttaat---C----AT---A-------AAAATGTAT-----------T--T--T-T-TA-AAAAATAT----T----T-----A---T--GATAT----A--------TTG-T--TCA---TTGTTGT-TAC------A-AT-----G----------A--TTAAA--ATCAATAA-------C-AT-AAA---------A---CA----TT-TAAAA------TTT---TGA-TTA----TC-AA---------------AT-A-------------AAAT--T--AG-----T-C-A---AA-A--------------T-T--------CA-GTAA--TC-A--GAG--A-T--TT-TGTATA-AA--A--T-AATTTGA------------------TAAT----TTAATAGTATAT--A-------AAA-AAG-----TGT--T-----TTGCACAAT----T-AATTAG-ACTT-T-CGA--------------------TGCTTCTGGTGTGCCAGGCATAAGGTTTACCTT---TGCGGC---AAAT---------------------TT----------------ATGTTG------GACGTTTGTTTAATTTTGTAGGACCGCATATAGAAAAAGCGATGTCATAAAATGTCGT------TTTA-------------------TATCATAGGTAGACGGTCTTAAGATTGT---CCATG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AATTAAATGCTCGATGTTCTGCACTTCGTTCCTACAAGTGCGATACAAAATGAACCAACGATTGAACCAT