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Reference ( gi|1 ) : CGTTTATCCTCAAGTATTATGCGTG-T-TTT-TTTCCA--AACTTTTA---AGATCTTCGAGAAGGGATGCGCG----A---A-ATACATAAG-----------------TACAGAAGATTTCAT-TTTTTT-T---T----AGGT-A-AAATTT-TCAAAGATTTATCGA--T-TCAGAAA---AA---G-----TTTTG-TG---------CACCGGTATGTTCAGATATTAATTTCAGGACAAT---T-TC---TAAATG---TGAGCTTGATTATAGGTGATGATTTACCTAGCGGAGAATGT---TTT--TTT-CAAATTCAGTCCTTAT-------ACATTATATATGTAGTAAAACATT-T-CAAATAAATCGAA-AAATAAGAAAGTGTT---TACTGCTTATTTA---T--GT--CGAGAC----CGT----AAATAACATT-----TA---------A---------G-------ACTGGTT-TACGTAAAGGTGAAAGTGTATTGACGAA-TGCGGAATAAATGCAATACT------G------T------CATA------AATGTTTTTATTCACACGTATATCTTTTGTTTGTGCAATTT--G-T-AGTA--GTTTA----TGTTTATAAAATAAAATCAATATAAT---ATGTGGTATTTCGTTATGATTGAAAAAAAAATATTGTAAGATTTTT-AAAAAA-AAA-AAC-ATGACTTGTGTTT--A-AGTGTCAACA-GTCATTTCAGAGTTTTGAAA--G-CATGTGCTGCCATG-----TGGCTTCTGCATATTACCAGTAGTTGACATTTTAATTAGCACAACTGGGCAGGTATCGACAGCTC-TGATTATAAAAAATTGTCAAAAATAAACAATAATATATTCATAACAAAATATAACTCGATTAAATCTTGGGAACAAATTCAGTATTTTTTAG---CGAGT-----ACCAGTCTA---C------TG-------TTTTTTTCC-GGACCAATCAAATTCTGTTTAACATATCAAGTCAGG-TATTCCTTCCAACATGTC-GCCACAGCCGA-A--TCTGAACGAGAT-TTCAAAA----T---GA-TGATGCGCTAT-------ATACACATTTAAAGGAGAA-TTGTAT--TTTTT-TTC------TTAGTTATT--GA--TCTT-AAAACATGGATG--CGCGAT--ATACACGGATGCGCGATATATGTGAGG
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gi|4 : tctttctttatttagttattttgttagatcaagttggagatgtttttttagaaagaaATTATAGGTGATGATTTACCTAGAGGAGAGTGTGTTTTT--TTT-CAAATTTAGTCCTAAT-------ACATTATATATGCAGTAAAACATG-A-CAAATAAATCGAA----TAAGAAAGTGTT---TACTGCTTATTTA---T--GT--CGTGAC----CGG----AAATAACATT-----TA---------AAATGGCACAG-------ACTGGTT-TATGTAAAGGTGAAAGTGTATTGATGAA-TGCGGA-TAAATGCAATACT------G------T------TATGGTCTTTAATGTATTTATTCACACGTATATCTTTTGTTTGTGCGACTTAAG-T-AGTA---TTTA----TGTTTATAAAATCAAATCAATATAAT---ATGTGGTATTTCGTTATGATTGAAAA-AAAATATTGTAAGATTTTT-AAAAAA-AAA-AAC-ATGACTTGTTTAC--A-AGTGTCAACG-GTCATTTCGGAGTATTGAAA--G-CGGGTGCTGCCATG-----TGGCTTCTGCATATTACCGGTAGTTGACATCTTAATTGGCA--------CAGGTGTTGACAGCTC-TTAGTATAAAAAATTGTCAGAAATAA
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gi|12 : aaattgtttaataaatctagaagtaaacaagtgtttactattcctttcctttgtaaccagatatgttgtaaatagcacagactggttatggtaaggcgaacgtgtattgacgaatgtggaataaatacaaaactgttgttatcatttatatattttaattcttttgttaataatgtttataggtgcttatgaaataaaccctatctagtctaatgtggtgttttgttatgaatagtttttaaaataaaaaacaacaacttttagttacagttactaaataatcaaaagcatttaacctacaacttctcccattaataataaattgtggtccatcttaattgaaattggctccaaacctaaattaggttttcaagtgtcacatgtctttttgaagtactgaaattgtcatatcttatcatggcttatggcttctcTTCAATCATTTTCAC---CAAGTTATATACCAGTCTGGGGC------CA-------ATAATTTCT-G-ACCAATCTAATTCCATTTAACATAACTAGTAAG
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Alignments
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Reference ( family-5064 ) : CGTTTATCCTCANGTATTAGGC--GCA-T-TTT-TTTCCA--AACTTTTA---AGATCTTCGAGAAGGGATGCGCGNT-----ATA--CACA----AG-----------------TACAGAAGATTTCAC-TTTTTT---CT----AGGT---AAAATTTGTCAAAGATTTATC--GA-T-TCAGA-----AA-AN---GTTTTGN-ACACCG--------GTATGTTCAGATGTTAATTTCAGGACAATTTCTTCATGNGAGNTCGATTATAGATGATGATTTACCT--AGC---GGAGAAT---CTTTT--ATT-CAAATTCAGTCCNTAT-------ACATTATATATGCAGTAAAACATGT---CAAATAAATCGAAAAGTAAGAAAGTGTTTACTGCTTATTTACGTCGTGACCGNAAATAA-CA----TTTAAAATG--A--CAGACTGGTT-TACGNAAAGGTGAAAGTGTATTGACGAA-TGCGGAATAAATGCAATACT------G------T------C------ATA------AATGTATTTATTCACACGTATATCTTTTGTTTGTGCGATTT--G-T-AGTA--GTTTA----TGTTTATAAAATAAAATCAATATAAT---ATGTGGTATTTCGTTATGATTGAAAAAAAAATATTGTAAGATTTTT-AAAAAA-AAA-AACATGACTTGTGTACAAGTGTCAACGGTCATTTCGGAGTATTGAAAGCGGGTGCTGCCATGTGGCTTCTGCATATTACCGGTAGTTGACATCTTAATTGGCACGCCTGGGCAGGTGTTGACAGCTC-CGAGTATAAAAAATTGTCAGAAATAAAC---AATATATTCATAACAAAATATAACTCGATTAAATCTTGGGAACAAATTCAATATTTTTTAG---CGAGT-----ACCAGTCTA---C------TG-------TTTTTTTCC-GGACCAATCAAATTCCGTTTNACATATCGAGTCAGG-TATTTNTTCCAANATGTC-GCCACAGCCGA-A--TCTGAACGAGAT-TTCAAAA-TNA-TGATGCGCGATAT-ACACATATATAGGAGAA-TTGTATTTTTT-TTC-TTAGTTCTTGA--TCTTAAAACATGGATG--CGCGAT--ATACACGGATGCGCGATATACGTGAGG
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Alignments
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Reference ( family-5064 ) : CGTTTATCCTCANGTATNAGGC--GCA-T-TTT-TTTCCA--AACTTTTA---AGATCTTCGAGAAGGGATGCGCGNT-----ATA--CACA----AG-----------------TACAGAAGATTTCAC-TTTTTT---CT----AGGT---AAAATTTGTCAAAGATTTATC--GA-T-TCAGA-----AA-A---TGTTTTGN-ANACCG--------GTATGTTCAGATGTTAATTTCAGGACAATTTCTTCATGNGAGNTCGATTATAGGTGATGATTTACCT--AGC---GGAGAAT---CTTTT--ATT-CAAATTCAGTCCTTAT-------ACATTATATATGCAGTAAAACATGT---CAAATAAATCGAAAAGTAAGAAAGTGTTTACTGCTTATTTACGTCGTGACCGGAAATAA-CA----TTTAAAATAGCACAGACTGGTT-TACGTAAAGGTGAAAGTGTATTGACGAA-TGCGGAATAAATGCAATACT------G------T------C------ATA------AATGTATTTATTCACACGTATATCTTTTGTTTGTGCGATTT--G-T-AGTA--GTTTA----TGTTTATAAAATAAAATCAATATAAT---ATGTGGTATTTCGTTATGATTGAAAAAAAAATATTGTAAGATTTTT-AAAAAA-AAA-AACATGACTTGTGTACAAGTGTCAACGGTCATTTCGGAGTATTGAAAGCGGGTGCTGCCATGTGGCTTCTGCATATTACCGGTAGTTGACATCTTAATTGGCACGCCTGGGCAGGTGTTGACAGCTC-TGAGTATAAAAAATTGTCAAAAATAAACAATAATATATTCATAACAAAATATAACTCGATTAAATCTTGGGAACAAATTCAATATTTTTTAG---CGAGT-----ACCAGTCTA---C------TG-------TTTTTTTCC-GGACCAATCAAATTCTGTTTAACATATCGAGTCAGG-TATTCNTTCCAANATGTC-GCCACGGCCGA-A--TCTGAACGAGAT-TTC-AAAATNA-TGATGCGCGNTA-TACACATATATAGGAGAA-TTGTATTTTTT-TTC-TTAGTTCTTGA--TCTTAAAACGTGGATG--CGCGA--TATACACGGATGCGCGATATACGTGAGG
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Alignments
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Reference ( family-5064 ) : CGTTTATCCTCACGTATNAGGC--GCA-T-TTT-TTTCCA--AACTTTTA---AGATCTTCGAGAAGGGATGCGCGNT-----ATA--CACA----AG-----------------TACAGAAGATTTCAC-TTTTTT---CT----AGGT---AAAATTTGTCAAAGATTTATC--GA-T-TCAGA-----AA-A---TGTTTTGN-AGACCG--------GTATGTTCAGATGTTAATTTCAGGACAATTTCTTCATGNGAGNTCGATTATAGGTGATGATTTACCT--AGC---GGAGAAT---CTTTT--ATT-CAAATTCAGTCCTTAT-------ACATTATATATGCAGTAAAACATGT---CAAATAAATCGAAAAGTAAGAAAGTGTTTACTGCTTATTTACGTCGTGACCGGAAATAA-CA----TTTAAAATAGCACAGACTGGTT-TACGTAAAGGTGAAAGTGTATTGACGAA-TGCGGAATAAATGCAATACT------G------T------C------ATA------AATGTATTTATTCACACGTATATCTTTTGTTTGTGCGATTT--G-T-AGTA--GTTTA----TGTTTATAAAATAAAATCAATATAAT---ATGTGGTATTTCGTTATGATTGAAAAAAAAATATTGTAAGATTTTT-AAAAAA-AAA-AACATGACTTGTGTACAAGTGTCAACGGTCATTTCGGAGTATTGAAAGCGGGTGCTGCCATGTGGCTTCTGCATATTACCGGTAGTTGACATCTTAATTGGCACGCCTGGGCAGGTGTTGACAGCTC-TGAGTATAAAAAATTGTCAAAAATAAACAATAATATATTCATAACAAAATATAACTCGATTAAATCTTGGGAACAAATTCAATATTTTTTAG---CGAGT-----ACCAGTCTA---C------TG-------TTTTTTTCC-GGACCAATCAAATTCTGTTTAACATATCGAGTCAGG-TATTCNTTCCAANATGTC-GCCACGGCCGA-A--TCTGAACGAGAT-TTC-AAAATNA-TGATGCGCGNTA-TACACATATATAGGAGAA-TTGTATTTTTT-TTC-TTAGTTCTTGA--TCTTAAAACGTGGATG--CGCGA--TATACACGGATGCGCGATATACGTGAGG
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Reference ( family-5064 ) : CGTTTATCCTCACGTATNAGGC--GCA-T-TTT-TTTCCA--AACTTTTA---AGATCTTCGAGAAGGGATGCGCGNT-----ATA--CACA----AG-----------------TACAGAAGATTTCAC-TTTTTT---CT----AGGT----AA--TTT-GTCAAAGATTTATCGA--T-TCAGA-----AAA---T-GTTTTGN-AGACCG--------GTATGTTCAGATGTTAATTTCAGGACAATTTCTTCATGNGAGNTCGATTATAGGTGATGATTTACCT--AGC---GGAGAAT---CTTTT--ATT-CAAATTCAGTCCTTAT-------ACATTATATATGCAGTAAAACATGT---CAAATAAATCGAAAAGTAAGAAAGTGTTTACTGCTTATTTACGTCGTGACCGGAAATAA-CA----TTTAAAATAGCACAGACTGGTT-TACGTAAAGGTGAAAGTGTATTGACGAA-TGCGGAATAAATGCAATACTGTTATTGTCATAAATGTATTTATTCACACGTATATCTTTTGTTTGTGCGATTT--G-T-AGTAGTTTATGTTTATAAAATAAAATCAATATAAT---ATGTGGTATTTCGTTATGATTGAAAAAAAAATATTGTAAGATTTTT-AAAAAA-AAA-AACATGACTTGTGTACAAGTGTCAACGGTCATTTCGGAGTATTGAAAGCGGGTGCTGCCATGTGGCTTCTGCATATTACCGGTAGTTGACATCTTAATTGGCACGCCTGGGCAGGTGTTGACAGCTC-TGAGTATAAAAAATTGTCAAAAATAAACAATAATATATTCATAACAAAATATAACTCGATTAAATCTTGGGAACAAATTCAATATTTTTTAG---CGAGT-----ACCAGTCTA---C------TG-------TTTTTTTCC-GGACCAATCAAATTCTGTTTAACATATCGAGTCAGG-TATTCNTTCCAANATGTC-GCCACGGCCGA-A--TCTGAACGAGAT-TTC-AAAATNA-TGATGCGCGNTA-TACACATATATAGGAGAA-TTGTATTTTTT-TTC-TTAGTTCTTGA--TCTTAAAACGTGGATG--CGCGA--TATACACGGATGCGCGATATACGTGAGG
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gi|14 : tcCTAATGTATAATGC--GCA-TACTT-TTTCCT--AA-TTTTA---AAATCTTAAAGAAGGGATGCGTATT-----ATA--CACA----AG-----------------TACAGAAGATTTCAC-TTTTCT---CA----TGCT----AA--TTT-ATCAAAGATCAACTGA--GATC-GG-----ACA---T-GCTTTGG-AGACCA--------GTATGTTCCTATGTTAAGTTCAGGACAATTTCTTTATGGGATGAAGATTATAGATGTTGATTTCCCT--AG
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gi|18 : GAA-TTGTATTTT-T-TTC-TTAGTTCTTGA--TCTTAAAACATGGATG--CGCGA--TATACACAGATGCGCAATAAACGTGAG
gi|19 : tcaaaacttaaagaatgtgaaaattttcagTCGACAAAATGTGAAA-AAATGCAGTACTGTCGTTATCATAAAT-TATTTATTTACACATATTTCTTTCATGTATACTGTTT--ATT-AGTATTTT---TTTAT-ATATAAAATtgaatac
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