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gi|11 : taatgtaaaggtaatcaatcaagaaagttcggaaatctattacatatgcataatcaataacaaataaaccatataatcaacaacaaatacagaatttataattgtcacatcatgagaaaactgtatatttatattttcattcaaaaatttcctcagggaagtaaccatattacacaagATCCTG-TATGGACAACGTCAAAAGACGTAACGT----CA---TTTTCCGCACT----------ATACAT-----TA----------AT-----------TA-AG-G-AAGGTGAATTCA--------AA----T--GT-T------TT----------A------TTTAA--TATT-GCAA--CC-A-TGT-G-GAATTTATG--TT--ACC-AGTT---T---CCTT---A---TCCATTTTTCCTCTACTA-------TTTGTG-TGCAAACACGA-------CCTTATTGATATATCT-TTTG--CAAC-------ACAACACAT-TTTAAGTCTATT-TCA-GAA--TGC--CCTTTAAAATGGCAATTGAACGGTTTGTCA-GATTGTTACCTGGTATCACGCAAATGTTCACTTATTCTCTCTTTTAACATTTGTTCTG--TCTCTCCAACATACACTGTTTTGTTACATTGCTTACAGAGTAATC---AATACACCAGATT-TGTATCACTACAGCTTGTGTTACTAACTGTCTCGTACATGTG-TCTGTTTGCTGTA-TCTGCTAC-----ATCCC---TTTCATGTATTAGTAGACAAATATGGCAGG-AACA----AATAGCAG-CAGAAG----------A-------TTT--ACACGCTATGTTAGTTTTGCCATGTACCGATACATCACTAATAT
gi|12 : ATGACGTGA---CGCTA-------------GCAACGTCAATTGACGTCGCGTTGGCCA---TT-CCCGAACTTTTAAG----ATGCAT-----GA----------ATAGTTCCAGTTATA-AG-T-AAGTT--ATTCACAAGAGTTAG----T--ATGT------AT----------AATTTGATTTAA--CGTT-ACAT--CC-A-TTTGGTG--TTT-TG--T--------GTT---TAGTCGTTGC-A---TCCAAATGTCGTCCACAA-------GAAGCC-TGTATGTTTTC-------CCTTCATTGTATATTT-TTTG--TACA-------ATGGCTACC-TGGATGTCA----TCATCAACGTGT--CCTACGAAATGATTGTTGATAGGCTTATCT-GTTTGCATCCTAACATCTCTTCGGTGCTCGTCAAGTCGTTCTTTTATGGTTCGTTCCG--TTTCTCCAACATATATTGTCTCTTTACATCTTCTACACAAGAGAC---AATATACTACATTACGTG-CAATACAACTAACATCACTCACCGACTTATA-TTGTGTTCTACCTGTAGTG-TCGGATATG----GT-CC---CTCTATATATTGATTGAC
gi|13 : acaggaaatgacgtaacgtcaaaacattaaaaaggaaTTCAATTTAATTAACTCAATAT----------TT-AAT-TTTCGGCCACCTGG----CCTTTAT-CAAAAAT--TGAAAA---TTTAATATTGCAGC--TAGGTA---ACGTCCATGTT-CCTTTA---AATTGTTT--TTCTATAATGATGACGTGA---CGTCACATCCTG-TATGGACAACGTCAAAAGACGTAACGT----CA---TTTCCCGCACT----------ATGTAA-----TA----------AT-----------TA-AA-G-AAGTTGAATTCA--------AA----T--GT-T------AT----------A------TTTAA--CATT-GCAA--CC-A-TGCGG-GAATTT-TG--TT--ACC-AGTT---T---CCTT---A---TCCATTTTTCCTCTACTA-------TATGTC-TGTAAACACGA-------CCTTCTTGGTATATCC-TTTG--CAAC-------ACAACAACT-TTCAAGTCTGTT-TCAT-AA--TGT--CATTCAAAATGGCGATTGATCGGTTTGTCA-GATTGCTGCCTTATATCACGCAGATGTTC
gi|14 : catgtgtgtaatatttgtaaatagtttcttgtttaaaataaatgttgaaaatacgattccattttttatatattacatacttttatacaagTTCAGTTTAATTCACTCAATAT----------TT-AAT-TTTCGGCCTTTTGGGAAATATTT-T-GGGAAAT--TTAAAA---TTTAATATTGCAGT--TAGGTA---ACGTCCATTTT-ACTATC---AATTGTTT--TTCTATAATGATGACGTGA---CATCACATTCTG-TATGGACAACATGAAAAGACGTAACGT----CA---TTTCCCGCACT----------ATACAT-----TA----------AT-----------TA-AA-G-AAGTTGAAATAA--------AA----T--GT-T------AT----------A------TTTAA--CATT-GCAA--CC-A-TGCGG-GAATTT-TG--TT--GCC-AGTT---T---CCTT---A---TCCATTTCTCCTCTACTA-------TTTGTC-TGTAAACATGA-------CCTTCTTGGTATATCC-TTTG--CAAC-------A-----------CAAGTCTGTT-TCA-GAA--TGT--CCTTCATAATGGCGATTGATCAG--TGCCA-GATTGCTGCCTTATATCACACAGATGTTCACTTATCCACTCCTTTAACATTTGTTCTG--TCTCTCCAAAATACACTGT
gi|16 : tacacaagTTCAATTTAATTCACTCAATAT----------TT-AAT-TTTCAGCCACCTGG----CCTTTAT-CAAAACT--TGAAAA---TTTAATATTGCAGC--TAGGTATAAACGTCCATT-------------------------------GATGACGTGA---CGTCATATCCTG-TATAAACAAGGTCAAA----------------------TCCCGCATT----------AAACAT-----TA----------AT-----------TA-AA-G-AAGTTGAATTTA--------AA----T--GT-T------AT----------A------TTTAA--CATT-GCAA--CC-A-TGCGG-GAATTT-TG--TT--GCA-AGTT---T---CCTT---A---TCCATATCTCCTCTACTG-------TTTGTtggtatatttaaaaatatatagtgaatca
gi|17 : ataagtaaagcaataatacgaaatattgcatattgcatatgcatttttttcaatagattataactaaccatgtagacatagcggttacaggtacataactattcttgtttgtatattcattcataaatcttcccagggaagtaatcttatgacacaag----------A------TTTAA--CGTT-ACAT--CC-A-TTTGGTG--TTT-TG--T--------GTT---TAG-CCTTTGCA---TCAAAATGTCTTCCACGAGAATCC-TTTGTT-TTC---------------CCCTCATTGTATAGCT-TCTG--TACA-------ATGGCTACC-TG-AA---TATCACCATCAACGTGT--CCGACAAAATGGTTGTTGATGGGCTTATCT-GTTTGCATCCTAACATCTCTTCGGTGCTCATCAAGTCGTTCTTTTATAGTTCGTTCCG--TTTCTCCACCATATACTGTCTCTTTCCATTTTCTTTACAAGAGACAATAATATACTACATTACGT-TCAATACA
gi|18 : taaaattccccgaactcttaagatacatacagagttttagctataataagtcattcatagagttagtatgtaaaatttgATTCTCTC--TAT-------------AAT-TTTCAGCCACCTGG----CCATTAT-CAAAA-T--TGAAAA---ATTGTTATTACAGC--TATGTA---GCATCCATTTT-AATATT---ACTTGTTT--T--TGTAATGATGATGTGA---CGTCATATCCTG-TAGGG---ATGTCAAAAGACGCAATGT----CG---Ta
gi|2 : gtttatcccctttgtacaaagagatccagaagaatggctagaattgccatataaactacagtgttgctgcccttgaattgataaaattatacattttttgtctgtctaggcaatttaatattttataatgttttcattcaagaatgtttcttaggatggtaaatatatcacattagttcaaaataactcatcTTCAATTCAATTCACTCAATAT----------TT-AAT-TTTCGTCCACTTGA----CCTTTAT-CAAAAAT--TGAAAA---TTTAGTATTGCAGC--TAGGTA---ACGTCCATTTT-CCTATA---AATTGTTT--TTCTATAATGATGACGTGA---CGTCACATCCTG-TATGGACAACGTCAAAAGACGTAACGT----CA---TTTCCCGCACT----------ATACAT-----TA----------AT-----------TA-AA-G-AAGTTGAATTCA--------AG----T--GT-T------AT----------A------TTTAA--CATT-GCAA--CC-A-TGCGG-GAATTT-TG--TT--GCC-AGAT---T---CCTT---A---TCCATTTCTCCTCTACTA-------TTTGTC-TGTAAACACGA-------CCTTCTTGGTATATCC-TTTG--CAAC-------ACAACAACT-TTCAAGTCCGTT-TCAT-AA--TGT--CCTTCAAAATGACAATTGATCGGTTTGTCA-GATTGCTGCCTTATATCACGCAGATGTTCACTTATCCTCTCCTTTAACATTCGTTCTG--TCTCTCCAACATACACTGTTTTGTTACATTGCTTACATAGTAAAC---CATACACCAGATT-TGAATCAATACAGCTTGCATTCCCAACTGTCTTGTAAATGTGT-CTGTTCGTTGTG-TCAAGTAAC----ATCCC---CTTCATGAATCATTAGACAAACATGGCAGA-AACG----TATAGCAG-CAGAAG----------A-------CTT--ACACGCTCTGTTTGTTTTGCTGTGTACCAAAACATCACTGATATTTTTATCCCACCAAAAGGCTA--ACATTG--G-T----AG-ACCT--TGAAAAACAGATTTCATACGTTCCGAATTATGTAGAA-CTTTCTGATGTCTACGTAGAATGTTCCTTATGTCCGGTAACATTTTGGAGTAAGACAGCACTAACGTAACTCTTT-TTTCTTTTGACTTATTTTTCTTTT-TTGTTTGCAGCAACTCTTGTCTGTCTATCTTGTCTACCCGTTGCAGTTGTTG-TTCGATCT-CATTAC-AGCTGTATTCTCTTTTTCTTAGCTGTTGCTTCAGGTCTTCTCT-TTG-TTTACTATAATCTGTTTG--TCTTTCGCATATTCTTTTGATTCTTATTCCTAGGCCATAGGCCAACGCTCTCTTAGTATGC----GCCGGATGACATGACATTTTTCTGTAGA------TAAAGTTGTTTATCTGATGGTTTCTTGTATAGTTT--TGTATGAATGTGGCCATTTTCCA-ACTTCACAAGCGTGTCTAGAAATTCAATTTGATGACAACTCCACCTAAATTCAACTTTTATGTTTATATGTATGTTATTTGCAAATATAGCAAATTGTTTTA--ACTTGTC-AATCCCACCTG--TCCACAACCCAAAGCCATCATCAATAAATCTTTTGTAGAA-CAATGGCTGTATCTCAAAGT--TCAACAGTTGCT-CGTCCCATTTCCGCATATAGCTGCATGCAAAACTTTTACCTA-ATCTTGAACCTATTGCAACCCCATCAGTTTGTATGTTGTGTTTGTCTCCTAAAACAAAACTGTTGTTGTC-AA-GTACAGTTTCTATCATTTGTAAGACATATCCAGTTGGAATAATTGGATTTGATCGTTTTGCC---AACCCTTCACCACATGCTCGAAGGCCTTCACGTTTTGGAACTGACGGATTAAGCTTGCAAACATCAAAACAGAAAAGTATAGTCTCACTT--GGGATG-GGTTTTACA---A--TCAGCGTAAGCTTCTGTAGAAAATCGGAAGTGTCCC----GTAAATAACTAGGTG-ACT-GTTTGACATATTCATTTAGTTCATATTCAACTACCTCTGCTAAC-CTTTCAGTTG---GTGTGTTAATATCATTGACAATGGCTCTGAATGGTGCATCTGGTTTATGTAGTTTAGGTTTGCCATTTAATTTACCTGCCCTCGGG-TATCTTGGAATAAGGTATGCCTGCATTTC-TT-TTGATAT-GGC--CCCGACCCTGTACATTTTGTTAACCAG----TTTCTTGATTTTTTTGAGAG--ATTTTAGAGTGAGATCTGCTTAGGTCTCCTTTTACGATTGATT-----TGAT-TCC-------ATTTTTCTATATAATT-TGTCTATATACTCCACATTGTCAAT---------ACCAGATCCTTTGTCAGCTGGTCGGATAACGATATTATCATTGTGAAGTAGTGACTGGAATGCTG
gi|20 : aTGTCGATTGGCG-AT-T-GATTGTTGCCTGATATCGAACAAATGTATACTTATTCTCTCTTTTAACATTCGTTCTA--TCTCTCCAACATACACTGT-TCTTAAC
gi|20 : TAACTGCCTTGTACATGCGT-CTGTTTGC--TG-T---ATATGTTACATCCC---CATCATGTATTAGTAGACAAATATGGCAGA-AACA----TGTAACAG-CAGAAG----------A-------TTT--GCACAC--TGTTAGTTTTGCCATGTACCAATACATCACTGATATTTTTATCTtgccttgtacatgcgtctgtttgctgtatatgttacatccccatcatgtattagtagacaaatatggcagaaacatgtaacagcagaagatttgcacactgttagttttgccatgtaccaatacatcactgatatttttatct
gi|21 : tgtcgattggcgattgattgttgcctgatatcgaacaaatgtatacttattctctcttttaacattcgttctatctctccaacatacactgttctTAT----------CT-AAT-TTTTG-CCTCCTGG----TCTTTAT--AAAAATAACGAAAA---GTAATGAACACAGC--TATATG---ACACCCAGTTTACCGACATTTGATTGGTT---------ATGATGACGTGGTGCCGTCTCATCCTGTTAGGAACA
gi|22 : aagggatactgttgtcaaatattagaacagaatctattaatttatatttccattcaaacatcttgctcagggaaatagatatataataaaagtaaaaataatccttTTAAAATTAATTCACTCA---T----------TT-AAT-TTTCGGCCACCTGG----CCTTTCT-C-AAAAT--TAAAAA---TTTATTATAACAGCTATAGGTA---ACGTCCATTcg
gi|23 : aaagaaatttaaaaaaaaatggaatcgcggcgaaaatacaaacactgtttttataagttcaaaacatgttttagattgatttaaaacttaaagtttttattttcattcatcttcctcagggaagtatatatatcacatgagTTCAATTTAATTCACTCAATAT----------TT-AAT-TTTCGGCCA
gi|24 : ttaattatgtatataggtgttgttataggtgtcatctttcttaaactaacaattcggatatggtaaagcactggaaacattagataagatatatatatatattttcattcaaaaatcttcctcagggaagtaaccatattacacaagATGTAATTCA-TCAATATAACCATTTGTTTGAAT-TTTCAGTCTCTTGG----CCTTTGTTCAAAAAA--TGAAAT---TTTATTACAGCATC--TGTGTG---ACATCTACTTT-----GA---ATTTATTTTGTTTTGTTATGATGTTGTGA---TGTCATATATTG--ATG
gi|26 : ttgatttatacatatttatctcaaacTTGTACAAGTTAGTGTGTA-ACGTGCCTGTTTTCTATAA-TGACAAAGGTGTCTAGAAACTTAACCTTCTGACTATCCTTTCTTAGTTATATTTTGATACCTTTATGTATACAGTAAGCATATTCAGCGAATGCCTTCAACACTTTTA-G-T-GTTCCCG--TCCATATTCC
gi|28 : CACTCATCAT----------TT-AAA-TGTTGGCCTCCTCT----CCTTAAT-CAAAA----TGAAAA---GTTGTTATTACAGC--TAAGTA---AC
gi|29 : gtttgtcgatacaatatatgtgtatcatcattcacaaatcttcctcaaggaagtaaatatatcacatagttcaaagtacT-AAT-TTTCGACCAACTGG----CTTTTAT-CAAAAAT--TGAAAA---TTTAATATTGCAGC--TAGGTA---ACGTCCATTTT-CCTATA---AATTGTTT--TTCTATA---ATGACGTGA---TGTCACATCCTG-TATGGACAACGTCAAAAG-CGGAACGT----CA---TTTC
gi|3 : GACGTAACGT----CA---TTTCCTG
gi|3 : aATGATATGA---CGTTA-----------GGA--ACGTCAACTGACGTCGCGT----TAGAATTTCCCAAACTTTTAAG----ATACAT----------------------------------A-C-A----GAGTTCA--------------T--GT-T------AT----------A------AGTAAGTCATTCACAAAGTT-AGTTTGT-AAAATT-TGATTT--AAC--GTTACAT---CC-----A---TCTAAATGTCTTCCACAA-------GAAGCC-TGTAAA-ACTATGTTTTCCCCTCATTGTATATTT-TCTG--TACA-------ATGGCTACC-TGGATATCA----TCATCAACGTGT--CCTACAAAATGGTTGTTGATGGGCTTATCT-GTTTGCATCCTAACACCTCTTCGGTGCTCATCAAGTCGTTCTTTAATGGTTTGTTCCT--TTTCTCCAACATATATTGTCTCTTTACATCTTCTTCACAAGTGAC---AATATACTACATTACGT-TCAATACAATTAGCTTCACTCACCAATTTATAT-TGTGTTCTACCTGTAGTG-TCGGATATG----GTCCCTGACT--ATATATTGAT---------TGACAGG---------TTCTGTAGTCACAAGCTTTTATTCTA-------TTTTTAAAGGCTTTGTTTGTTTTGCCATGTATTAAAATGCCATTTATGTTCCGATCTCTATGGTAAGCAA--AGAGTG--GGT----TT-TTTT--TGAAAATCTT-TACTATACGGTCCGATTGGTGGAGAA-CTTTTTCCTGTTTCTATAAAATGCCCCTAATGTCTTGTAATAGATTCCAATAAGTAAACACTAAAGGTACCCTTTCTTTGTTTT--CTT-TTCTTGTTTTATTATTT--AATA------GTCTG------------ACCCTGTT-AACTGTGT-TTCTATTTGCCTACC-A-TTATATCCTCTCTTTCTCAGCTGTCTTTTCAGTTGTTTCCTATTG-TCAAA-GTAATCTGTGTC--TTTTTCGCATATTCTACAAATCTGTAGTCCCAATCTGAATGCAAGTCCTTCTTTAGTATGA----GATGGATGACATGAT-TTATTATGTACA------TACATTTGTTTGTCTGTTGGCTTTTTGTGCAAGTT--TGTGTATACATGCCTGTCTTCTATACT-GACAATGGTGTCTAAGAACTCAGTTTTCTGTCTGTTCCATCTCAACTCTATTATGATGTTTTTATGTATACTGTTGGCATATTTTGCAAATGCTTTTA--ATTCTTC---TGGCATTCGGCTCCATATCCCAATGCAATCGTCAATAAATCTCTTGTAGAAATAA-GGCT-T-TTG-ATAGTAATCCATAAGTGCTTCATCCCATTTTCTCATGTAAGTGCAAGCGAAATATTTACCCA-GTTTTGATCCTATGGCGATACCATCTTTCTGAATATAGTGTTTGTCTTCAATGTTGAAATTGTTATTTTC-TATG-ACAGTTTCTATCATTTCTAGCACATTCTTAGTTGGAATAAGTGGATTTGATC---TTGCCTCCAGCCCTTCTTTGCATACTTGTTATCCTTTATACTTAGGTACCGATGGGTAGAGTTTACAAACATCAAAACAAAATAGAATTGCGTTTTCT--GGTA-GCGGTTCA-CGT--ATTTC--TTT---TTTTTGTATAAAATCACTTGTGTCTCTGATGTAAG-A---AGGTGAATT-TATT-ACAAATTCATTAAGTTCATACTCTGCTACTTCTGCCATC-TTTTCTGTTG---GCGAGTTAATTCCATTTACTATACTCCTAAAAGGAGCCCCCTTCTAATGTAGTTCTGGGTTTCCTTTCAACATACCTGCATTTGGG-TATTTTGGAATGAGGTAGTTCTTCACTTT-TT-TCGTTACTA-C--TCCTTCTCTATACATCCTATAAACAAGTTGTTTTTTTTACTTTCTTCAGaaaacattaaaaaggaaatgatatgacgttaggaacgtcaactgacgtcgcgttagaatttcccaaacttttaagatacatacagagttcatgttataagtaagtcattcacaaagttagtttgtaaaatttgatttaacgttacatccatctaaatgtcttccacaagaagcctgtaaaactatgttttcccctcattgtatattttctgtacaatggctacctggatatcatcatcaacgtgtcctacaaaatggttgttgatgggcttatctgtttgcatcctaacacctcttcggtgctcatcaagtcgttctttaatggtttgttccttttctccaacatatattgtctctttacatcttcttcacaagtgacaatatactacattacgttcaatacaattagcttcactcaccaatttatattgtgttctacctgtagtgtcggatatggtccctgactatatattgattgacaggttctgtagtcacaagcttttattctatttttaaaggctttgtttgttttgccatgtattaaaatgccatttatgttccgatctctatggtaagcaaagagtgggttttttttgaaaatctttactatacggtccgattggtggagaactttttcctgtttctataaaatgcccctaatgtcttgtaatagattccaataagtaaacactaaaggtaccctttctttgttttcttttcttgttttattatttaatagtctgaccctgttaactgtgtttctatttgcctaccattatatcctctctttctcagctgtcttttcagttgtttcctattgtcaaagtaatctgtgtctttttcgcatattctacaaatctgtagtcccaatctgaatgcaagtccttctttagtatgagatggatgacatgatttattatgtacatacatttgtttgtctgttggctttttgtgcaagtttgtgtatacatgcctgtcttctatactgacaatggtgtctaagaactcagttttctgtctgttccatctcaactctattatgatgtttttatgtatactgttggcatattttgcaaatgcttttaattcttctggcattcggctccatatcccaatgcaatcgtcaataaatctcttgtagaaataaggcttttgatagtaatccataagtgcttcatcccattttctcatgtaagtgcaagcgaaatatttacccagttttgatcctatggcgataccatctttctgaatatagtgtttgtcttcaatgttgaaattgttattttctatgacagtttctatcatttctagcacattcttagttggaataagtggatttgatcttgcctccagcccttctttgcatacttgttatcctttatacttaggtaccgatgggtagagtttacaaacatcaaaacaaaatagaattgcgttttctggtagcggttcacgtatttcttttttttgtataaaatcacttgtgtctctgatgtaagaaggtgaatttattacaaattcattaagttcatactctgctacttctgccatcttttctgttggcgagttaattccatttactatactcctaaaaggagcccccttctaatgtagttctgggtttcctttcaacatacctgcatttgggtattttggaatgaggtagttcttcacttttttcgttactactccttctctatacatcctataaacaagttgttttttttactttcttcagtgacgcttccattgtatcatgatctgtttcctc
gi|30 : acaggaaatgacgttacgtcaaaacattaaaaaggaa----------TT-AATATTTCGGCGACCTGG----TCTTTA--CAAAATA--TGAAAAGCTCTTAATAtgacgcttccattgtatcatgatctgtttcctc
gi|32 : agtagtttcgttcaaacattttccttaggaaagtagatatataacaaacgttaaacaatcattttctaACCTACATTTTGG-TATTTTGCAATAAGGTAGTTTTTTATTTC-TT-TGGTTAC---CAATTCTTCTATATAAATTTCATCAACACA----TTTCTTCATTTCCTTCAGTGGCACTTCAGAaaccaataagacaaccattctaaca
gi|33 : TTTAATTTAATTCACTCAATAT----------TT-AAT-TTTCGGCCACCTGG----CCTTTAT-CAAAAAT--TGAcatatcatgatttgtttcttc
gi|34 : aaaag-TTTT--TGAAAATATC-TGCCATACGGTCTGATCGTTAGATAA-CTT--------------AATATGCCTTTAACGTCTGGTAAAAATCTCG------TTAACGCTAAAGG----CTTTCTTTATTTT--------CTTGTTTTATTTTGT--AATAGTTCtaccagattagtatcccttacatcactgatatttttactataattaattcgaagagataaaaata
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10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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blockSeqs : . . . . . A . . T . . A . TTC . T T A . . TTTTAA TAAT . . . G AA . . . . . A . . GC . A . . TACCA . AG . . TT T T TTT . TGTTTTC T G . . CA A A . TC A TGTT C TG T C A A TG T A ACA TCA TA . . . A T A T A C . . T A . G CTTC ACGGAT TAATGCTCTTTTCTTATAAT . A G T A T G . . . . . . T C G CG T G T T C . . A . . . A GAATGCATATAATT C CT A C A . A . G A T . AT . G . . T T . TG T C G T . T TG T . T A A A G . . . T C C . . . . . A T AT C T G A . G . . C A . A AT . A A .
blockSeqs : . . . . . A . . G . . C . TTC . T T A . . . TAAT . . . G AA . . . . . A . . GC . A . . TACCA . . . . TT C T GAA . AACACGA T G . . AC G T . GA A CGTT C CT T G A T AT A T TTC CTT AC . . . A T A A C A . . T A . G CATC . AACAAATAGCAGCAGAAG . A G A A T G . . . . . . G C T CG T G A A C . . A . . . A GAAC G G A C T . A . G C . . GT . G . . T T . TG T C G T G . T
blockSeqs : . . . . . A . . T . . C . T . C T A . . . TAAT . . . G AA . . . . . A . . GC . A . . TGCCA . . . . TA C T TAT . AACATGA A T . . AC A A . TC T A C CG A C T A TG T A GCA CTT AC . . . A G A A T A . . T A . G ATTC . AACGTATAGCAGCAGAAG . A G T A T T . . . . . . G C G TG T T T T C . . A . . . . . . G A . . . T . G A . . . . TT
blockSeqs : . . . . . A . . T . . C . . . C T A . . . TAAT . . . G AA . . . . . T . . TT . A . . TGCAA . . . . AA G G TTT . AACACGA T G . . CA G T . GG A A C CG T T A A TG G G ACA TCA TG . . . A G A A T A . . T A . G TCT . AACATGTAACAGCAGAAG . A G T A T . . A . . . C A C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . T . . . . . . T T A . . . TAAT . . . . AA . . . . . A . . GC . G . . TGCCA . . . . TT C T TTT . TGTTTTC A T . . AC G T . GG T A C . A G T T AT A T TTC TCA TG . . . . G . . C A . . . A . G TCT . TTTTATT . A G . . T
blockSeqs : . . . . . T . . T . . . . . C T T . . . TAAT . . . . AG . . . . . T . . TT . A . . TAAC . . . . AA G A TTT . TGTTTTC A T . . CA G T . GG T A C . A G T T AT A T TTC TCA TG . . . . T C A . . . . . . TCT
blockSeqs : . . . . . A . . A . . . A C T . . . . . . . . . . . . . . T . . TT . G . . TGT . . . . AA G A GAA . TATTC A G . . CA G T . GG T A . . A A T T AT A T TTC TGA TG . .
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finalCons : NTTCAATTTAATTCACTCAATAT----------TT-AAT-TTTCGGCCACCTGG----CCTTTAT-CAAAAAT--TGAAAA---TTTANTATTGCAGC--TAGGTA---ACGTCCATTTT-CCTATA---AATTGTTT--TTCTATAATGATGACGTGA---CGTCACATCCTG-TATGGACAACGTCAAAAGACGTAACGT----CA---TTTCCCGCACT----------ATACAT-----TA----------AT-----------TA-AA-G-AAGTTGAATTCA--------AA----T--GT-T------AT----------A------TTTAACGTTGCANCC-A---------TNCGG-GAATTT-TG--TT--GCC-AGTT---T---CCTT---A---TCCANNTNTCCTCCACNA-------TNTGTC-TGTAAACACGA-------CCCTCNTGGTATATCC-TCTG--CAAC-------ACGGCNAC---CTGNANGTCA---TCATCAACGTGTCCTNCAAAATGGTTGTTGATNGGCTTGTCN-GNTTGCNNCCTNACATCTCNCNGATGTTCACCNAGTCGTTCTTTTANCGTTCGTTCCG--TTTCTCCAACATATACTGTCTCTTTAC-ATCTTCTACACAAGAGAC---AATATACTACATTACGTG-CAATACAACTAGCGTCACTNACCGACTTAT-AT-TGTGTTCTGCCTGTAGTG-TCGGATATG----GTCCC---CTTCATATATTGATACA------TGGCAGGTNCTGCAGTCAGAAGTTTTATTT-----------ATTT--AAAGGCTTTGTTTGTTTTGCCATGTACCAAAACGTCACTTATGTTCCGATCTCTACGGTAAGCGA--GGAGTG--G-T----TGTTTT--T-GAAAATCTN-TGCCATACGGTCCGATCGGTGGAGAACTTTTTCGTGTTTCCGTAATATGCCCCTAATGTCTGGTAACANTTTCGAATAAGTTAACACTAAAGGTACCCTTTCTTTGTTTT--CTT-TTCTTGTTTTATTATTT--AACAGTTCGTCCC--T--GTTAAGAATGTCTACCCTCTNCAACTGTCG-TTCTATTTGCCTACCGCTATATCCTCTCTTTCTCAGCTGTCTTTTCAGTTGTTTCCTATTG-TCAANGTAATCTGTGTC--TTTTTCGCATATTCTACGAATCCGCAGTCCCAGTCCGAATGCAAGTCCTTTTTTAGTATGA----GACGGATGACATGAT-TTGTTATGTACA------TACATTTGTTTGTCTGTTGGCTTTTTGTACAAGTT--TGTGTATACGTGCCCGTCTTCTATAC-TGACAATGGTGTCTAGGAACTCAATTTTCTGNCTGTTCCATCTCAACTCTATTTTGATGTTTTTATGTATACTGTTGGCATATTTNGCAAATGCTTTTAAC-TTTTCAGTCGCACCCG--TCCATATCCCAANGCCATCGTCAATAAATCTCTTGTAGAAACAATGGCTGTATCTNANAGTAATCNACAGGTGCTTCGTCCCATTTCCNCATGTAGNTGCANGCGAAACTTTTACCTA-GTCTTGANCCTATNGCGACNCCATCNNTCTGNATGTAGTGTTTGTCTCCNANGNCGAAATTGTTGTTNTC-AAGTACAGTTTCTATCATTTNTAGNACATNCCCAGTTGGAATAANTGGATTTGATCGTTTTGCCTCCAGCCCTTCNTCGCATGCTTGNNGNCCTTCACACTTNGGTACCGATGGGTAGAGCTTGCAAACATCAAAACAGAANAGNATNGCGTCACCT--GGTA-GCGNTTCACGTATCANC-GTAAGCTTCTGTANAAAATCGNTNGTGTCCCTGATGTAAGTAACTAGGTGAACTGTATNACAAATTCATTAAGTTCATATTCAGCTACCTCTGCCANC-TTTTCAGTTGGCGTGTTAATNCCATTNACNATGNCCCTGAANGGAGCNCCCGTTTTATGTAGTTTNGGGTTTCCTTTTAACNTACCTGCATTCGG-GTATTTTGGAATAAGGTANTCCTTCATTTC-TT-TCGAT-ACGGCCCCGTCTCTGTACATTTTGTTAACAAG----TTTCTTNACTTTCTTCAGAG--ATTTCAGAGTGAGATCTTCTTAGGTCTCCTTNTACGATTCATTACGATTCCATNTCTCTATATAATTTGTCTATATACTCCACG-TTGTC-A--AT------AATACCAGATCCTTTGTCAGCTGGTCGGATAACGATATCATCATCGTGAANTAGTGACTGGAATGCTG
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATCGAAAAGAAATGCACAGCTTGTTTATAATGTATTTTACTAGCATGGATTTCAAATCAAAACAATTTAATTCCTGTTATATAGTATAATTATTGGAGAATATAATCTCAGGATTTCATTAAAGAATTCCAATGCATTACAGCTATAGGGCTGTTGGAGCAACATGACTATCACTAAGTCAGTAACACACATGCAGCAGTATTGTGACCTGCACTTGCTCCATTCCATATAGCAGTAACATTAAGACATGTTTGGGCTGAAATTGTTGTAGTCATTGCCTCATTTTTTTCACATTTCAACATAAAGCAGTCGGTATATGTGAGGTTGTAGTTACGGAACATTTTTAAGTGTGAAGAATTGTGTAAATTGTCATTTTGGGTAACTTTGCACGAGGAAATTTTGTTTTCAA
Unaligned ( gi|19 ): TAAATAGATATTTGACAGGAAATGACGTAACGCAAAAACAGAGCGAATGTTATTTGGACACATAACGAGTTCGAGCTATCATAGAAGTCATAATTATGATAATTATGTGAAAATATATTTAACATTACACCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCGCTGTATCAGAAGACACTTGTGTGTTTTCCACTTATTATATATCTAGCTGGATATCACCATCACTTGTTTCCCATCTATCTGTATTCTGACTTATCTCTGGTACTCATCATGTCGT
Unaligned ( gi|25 ): TAACAGGAAATGATGTATCATAAAAAACAATAAAAAGGAAATGATGTAATGTTAACAACGTCAAATGAAGTCGCTTTAAAATTTTCTGAACTTTTTAGACACATAAAGAATTCCAGCTATCAGTAAGTCACTCATGAAGTTAGTATGTGAAATTTGATTTAACATAACATC
Unaligned ( gi|27 ): CTGACAGAAAATGACGTAACGTCTAAACTCTAAAAAGTAAATTGTGTAAAGTCAACGGCGTGAAATGACGTCGATTAAAAATCATAAATTTGTAAAATAACTGATATAAAATTACCGACATAATACGATTGGGACTTTCATTCAGATAAGTTTTAC
Unaligned ( gi|31 ): AAACTTACTTTAAGAAATATGAATAAAAACTACTAATTTATATTTCCATTCTAACATCTTGCTCAGGGAGGTAGATGTATAATAACATCTGGCTTATTGTGAAAAATCATTCATTATTAAAATGTTCGGCCACCT
Unaligned ( gi|35 ): GAAATGATGTAATGTCAAAACATTAAAGAGGAAATGCGACGTTGTTTGACATCGTTAACGTTACATTATCTTTAAAGTTTTGACGTAACGTCATAAGTTG
Unaligned ( gi|36 ): GACAGGAAATGACGTAACGTCAAAACATTAAAAAGGAAATGACGTGACGCTAGCAACGTCAATTGACGTCGTGTTAGAAATTCCCGAACTTTTAAGAT
Unaligned ( gi|38 ): GTATCTACTAAAATTAATTGAAAATCAATTCATTTTCCATTTCATAGTATAATTATTGGTGAATATAATCTCAGATTTCATAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): TGTCAGGAAATGACGTAACGTCAAAACATTAAAAAGGAAGCGTGACGCTAGC
Unaligned ( gi|41 ): CTGACAGGAAATGACGTAACGTCAAAACATTAAA
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10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATCGAAAAGAAATGCACAGCTTGTTTATAATGTATTTTACTAGCATGGATTTCAAATCAAAACAATTTAATTCCTGTTATATAGTATAATTATTGGAGAATATAATCTCAGGATTTCATTAAAGAATTCCAATGCATTACAGCTATAGGGCTGTTGGAGCAACATGACTATCACTAAGTCAGTAACACACATGCAGCAGTATTGTGACCTGCACTTGCTCCATTCCATATAGCAGTAACATTAAGACATGTTTGGGCTGAAATTGTTGTAGTCATTGCCTCATTTTTTTCACATTTCAACATAAAGCAGTCGGTATATGTGAGGTTGTAGTTACGGAACATTTTTAAGTGTGAAGAATTGTGTAAATTGTCATTTTGGGTAACTTTGCACGAGGAAATTTTGTTTTCAA
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