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Reference ( gi|1 ) : TTTTTTTTGTTTTATCTTCCTTCTTTCAAACATAATTCCATTAACACCAATTGAAATATATGCACACAGTGAAAAGCC-TATTTATCGGTTTGCATTAATTTATGACTGGCTTTAATTGAGTATCAACACAATCAGCAGATTATGAAGGCAACAATCAGAATATCGTGAGGGCAACAGTTGATAATTGGCAATAATTAGTTGTATTACTTTTCAGATAGTAAATTAAAATAAAAATAAAGTGTTGACAATCTTTAAACCTTTTATTAATCGTAATTACTTGCTGGTAAACTTCAAACAACGACTACTTTACATTTAATTGAGCGTTTGCAGATGGACAAGAAGCTTTTGTCGTCCTGTTTGCCCACCTTTTCAAATCCACCCAGGGACTTTTGCACTAAGATGTTTACTCTTGCAGATATTATAATTTTATTAATTATTATATTAGAATAAAGATATCAAAGTCCAAATA---TTA--GGGGGTAAGGAAT-CAGCTAGTCAA-TTA-----TAACCCCC------------TCC--CCGAAA---GT------AAAAATATAATAA---TG-GGAAAAA-ATCA-G---CA------AGCCAATT-CTTTC-C--CCTAACACACAGTCA--A-AATA------GAAA-------GT-CAAA-ATA--TAAGGA--GG--GAAAGAATC-------------AGCT-AGACA--A---T--TATCT--------C-------A---G--AAAAT-------CAAAA-----TA--TA-AG------------------------CCA--ATTAT------T----TCC-ACC-----AAAAAGTCAACATATA-AGG--GGGATAGA------------------TTATCTCT---CTTCGGAAGGTCAAA-AA-AT-ATGTAGTGATAGGTATGGGGAAATAATCAAC-TAGCCAA----T----------CAC--CCCCAC--C--CCAACAGAA--AGTC-T---------AAATAT-AAG-G-----GGGGAAG-ATTCAGC------TAGCGAATTATTTCCCCCC----G--A---AA-G-TT---------A---AAAC--A-TAAGGGGG-TGTGGGGGAG------GGGGCGGGGGCGGTAGAG-AATCAACTAGTCAAATCT-TTC---C--CCATAGA---AAGT--AA--AAATAT---T-----A--GG---GT-TGA--AAAGA--ATC-AGCTAGCCAATTATC----AACCTCCAACCAC--------CAAAAAA-----T---A-AAGTTTTAT-GGG---------GATTGG-AGTAGGAATGAAAC-AGCTA-GCCAAT--TATT---TCCATCCAAATGAAAGT-----CAAAATATA-AGG-----GGGGATG-AAT--C-ATCTAGCTAACTATTTCTCTC---CA---GAAAG-CAAA--ATTATA-AGTCGGG-AT-GGGAAATA-ATCAGC-G--ACC---CCCACCC---------CTTCAACC---GAAAGTAAAAATATA--AGGAGG-GACATAATCAGTTAGCCAA--TTATTTCCCCGGTGAA-AAAAATCAA------------CT-------GGGG-AGAATCGCA--AACTAATTCCTTCACCAGGTAAATAATTAACAGGAGGTGATATGCTGTTATATTGGGATAATGAATACCTGTTTTGCCTCTACAATAACAATCACTTTTACACTTTGCATTGCGTCATATATATGCATGCACTACGGAATACACAGCATGTTCCGTCCATTATTATTCACCCACTGCCCACAACATTAACGGTAGGGTTACACAAAAAGCTATTTTTCTGTTCTACAAATGTTTGATACATGACCGTTCAGGAGATTTTGCGTTCGTACCGCTGACGGTGCTATTAGACGTTCATTTTCACTTTTATGTGTATAAAGAATACGTACAGCTGTATACCACATTTGTCGCCCACGAAATCTACTTGCCAGTTCGTTCGTACTTCACTTATTGTCAAGGCTACCTACTACCCATATATTGCAGCCAAGCAAAAGCAAACCCTGCTACCACTAGATATATGCATGCTTAAATA---------------------TTATAGATTG-ATCT------AA--ATA-----TCATTTAAACCATTTTTGTAAATGTACAA------TGTATTTCGAAAAGAGTCTAGAAGCGGTACAAAGAGAGAATAACCTAACAAATAAAACATTGATATCACTATCTCTGCTTTTCTGCCTTCTTTTTCGTTTCGTACTTCATTCGCTCATGCTCCGCTACTTAAAAATATTTCGTTCTC-----ATTCTT-CAAATCATT----CTTGCTCTATTTTTTCATCCTCCCTCTCACCTACCATCTGTTGATTTTAGTCAGTA--TAA--AATGCG--CGACAATGGAACATTTATTGGTATTACTTGT-ATA---GTATACCTACAATGTACAGTTATATCAATTCTTGCATTAGCAGTGCGCTGGTACACTGGAGCAGCATTACTGGATA-TACATTTGTATTGGCAGGTCTGGTACCGTGTTACTCGG--CCAA-GATG-TAATAC-ATCTCCAGATACATCTACTGATCCACCGGTTA---TACTTGTCCAGGATGATTTACAGTTTGGATAACAATCTGAAGTGCATGTGAAG-TTGGC--TTGTCTTG--T--ACCCTCTGTCACAATTAAATG-ATGTCCT-TCGCTGATAACA--GCTTTGTCTGGGCCATCTGTATTGT-AA--CATTAAAATCAACCA---TTTAATCTGTTTTGCAATTTACAT-GT-TACCTTATTGACCA-TAAATTATATCAATTAA
gi|2 : TTATTTTTTTTATCTTCTTTCTTTCAAATACAATTCCAGTAACACCAATTGAAATATATGCACACAGTGAAAAGGCATAATTATCGGTTTGCATTCATTTATGACTGACTTTTATTGAGCATTAACACGCTCAG--------------------CAGA---TTGTGA-----ACAGTTGATAATTGGCAATACTTAGTTAGATTACTTTTCAGATAGTAAATTAAGATAAAAATAACGTGTTTACAAACTTTAAACTTTTTATTAATTGTAATTACT----GATAAACTTCAAACAGCAACTACTTTACATTTAATTGAGCGTTTGCAGATGGACAAGGAGCTTTTGTCGTCCTTTTTACCCACCTTTTCAAATTTACCCAGAGGCTTTTCCACTAAGATTTTTACTTTTGCAGATATTATAATTTTATTAATTATAATATTAGAATAAATATATCAAAGTCAAAATA---TAA--GGGGGTAAGCAAT-CAGCTAGTCAA-TTA-----TTTCCCAC------------ACC--CCGAAA---GT------CAAAATATAAGGG---TG-GGAAAGA-ATCA-G---TT------AGATAATT---------------------ATCA--A-CCCA------GAAA-------AT-CAAA-ATA--TAAG-----------ACAATTATTTCCACCCAAAAGTT-AGCCA--A---TTCTATTTCTA-----C-------A---G--AAAGT-------CAAAA-----TA--TA-AGGATAGGAAAGAATCAGCAAA----CCA--ATTATCCCTCCT----TCC-ACC-----ACAAA---AAAATATA--------GCCA-A------------------TTCTCTCT---CATCAGAAGGGTAAA-AATAT-ATGTAGTGATAGGTATGAGGAAATAATCAGC-TAGCCAA----T----------AAC--CCCCAC--A--CCAACAGAA--AGTC-A---------AAATAT-AAG-G-----GGAGAAG-AATCAGC------TAGCCAATTATTTCCACCT----G--A---AA-G-TC---------A---AGAC--A-TAAGGGGGATGTGGG-------------------------AAG-AATTAGCTAGCCAATTAT-TTC---C--ACCT-GA---AAG---AA--AAACAT---A-----AGGGG---GC-AGA--AAAGA--ATC-AGCTAGCCAATTATC----CCCCTACCATCAC--------CAAAAAA-----TAAAA-AAAATATAT-GGG---------GATTAG-AGTAGGAATGAAAC-AGCTA-GCCAAC--TCTT---TCCATCCAAATGCAAGT-----CAAAATATA-AGG-----GGGGATG-AAT--C-AGCTAGCTAACTATTTCTCTC---CA---GAAAG-TAA------------TCAG----------CTT-ACCCCC-C--ACC---CCCACCCCCAAACATACCTCAACA---GAAAGTAAAAATATA--AGGAGG-GACATAATCAGCTAGTCAA--TTATTTCCGCAGAG-A-AATAATCAA------------CTGGAGAGAGGGA-AGAATCGCT--AGCAAATTCCTTCCCCAGGGAAATAATTAACAGGGTATGAT
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