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gi|16                         :  ACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTG
gi|3                          :   CCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTGTGTACTCCTTATCTCAGTATCTGTCACGCTCAGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATGAAGGTATTAGGAACATGTTGATAATTTGACACCTTCCTAGTTTAACACATATTTCCAACATT-AAGACTT----CATTTGATGCTTTTTTGGTATATGGAAACTTTGTAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATATAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTATGCATA-AAATTTACTTTTTTTGTTTATTTCTTTT---CCAGA-------AAT-AAA---AA-AAGAA-ACATGTACAGCAAT-CAAAACTAGATCT-AT--ATCGACATGTTTGTTTTATATTT-TTTTT----TAATGAAATAAATATAAAATTTAAATGTATAT----GCAAACTAGATCTACATAATAA-------AAACACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTGACAATAAAATTCCATAAA--CAATGG--AAA-C-AAAGTTGCCTATAAAAAAAGTCTGATGCAATTTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATTTGACATGTATGACCTATTTCCTTTCATAGTTTTGATATTTTATTTGTACACGCTGACGTGACGTCACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAACACACGGTTCCAAATTTAGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCGTGTATAAAACATG-TGCA--GGATTTAATAAATACATGC--ATTATGGTTGTTGTTTATGCGTATGCTACGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAA-AATTA-TCCCATCAATTAC------CATA-------------CT----AGCGAGAA-AAAAAGTTTTCATT--TTAA--------TACGGTAAGAATTTTATTTATTTTGA-AA----ATACAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATT----------------TATAAATC----------------TATTTGCGAGTATGCGGGTATGTTTCTAATTAAATACCCGATTG-AAAAAAAATTGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGTTATCAGTGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTATGACACCGCGATATACCCATGAATTTGTGTCAGCTGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCCGAAAGTCA
gi|7                          :    CCTTTGCCTCATCTAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTGTGTACTCCTTATCTCAGTGTCCGTCACACACAGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATTAAGGTATTAGGAACATGTTGATAATTTGACACCTTGCTACTTTAACACATATTTCCAACATTAAAGACTT----CATTTAATGCTTTTTTTGTATATGGAAAC-TTGTAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCTCAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATGAAATGAAATATAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTATGTATC-AAATTTACTTTTTTGGTTCATTTCATTTCAACTAGATCTACATAAT-AAA---AA-AACAACACA
gi|13                         :      TTTGTCTCATATAGGTATTTTCATATCAACCATGCTTACCAATACTGTGTAATCCTTATCTCAGTGTCTGTCACGCTCA----------------TTACACCGTCCCCACGAAGGTATTTGGAACATGTTGATTATTTGATACCTTGCTACTTTAATTCATATTTCCAACATT-AAGACTT----CGTTTTATGGGTTTT--GTGTATAAAAACaatctagtgtttattggtgacctcatgtaacataaaattccataaacgacggaaacaaagtcgcgtataaaaaatctgtgcaaatttcaatgtccgt
gi|9                          :                       TTATCATATTAACCATGCTAACTAATACTATGTACTCCTTATCTCAGTATCTGTCATGCCCAGGTAATGATAGCCAGATTACAATGTCCCCATGAAGGTATTAGGAACATGTTGA--------CACCTTGCTACTTAAACACATATTTCCAACATT-AAGACTTGAATCATGTTATGCTTTTTTAGTATATGGAAACTTTGTAGAGAAATGAATTCTCTTTGCCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATACAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTCATGCATA-AAATTTAC-TTTTTTGGTTATTTCATTT---CCAGA-------AAT-AAA---AA-AAGAA-ACATGTACAGCAAT-CAAAACTAGCTTT-AA--ATCTACATGTTTGTTTTAT-TTT-TTT
gi|5                          :                                                                                                                                AACATGTTGATAATTTGACACCTTGCTACTTTAACACATATTTCCAACATT-AAGACTT----CATTTGATGCTTTTTTGGTATATGGAAACTTTGTAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATATAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTATGCATA-AAATTTACTTTTTTTGTTTATTTCATTT---CCAGA-------AAT-AAA---AA-AAGAA-ACATGTACAGCAAT-CAAAACTAGATCT-AT----CTACATGTTTGTTTTATATTT-TTTTT----AAATGAAATAAACATAAAATTTAAATGTATAT----GCAAACTAGATCTACATAATAA-------AAACACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTGACAGTAAAATTCCATAAA--CAATGG--AAA-C-AAAGTTGCCTATAAAAAAAGTCTGATGCAATTTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATTTGACATGTATGACCTATTTCCTTTCATAGTTTTGATATTTTATTTGTACACGCTGACGTGACGTCACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAACACACGGTTCCAAATTTAGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCGTGTATAAAACATG-TGCA--GGATTTAATAAATACATGC--ATTATGGTTGTTGTTTATGCGTATGCTACGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAA-AATTA-TCCCATCAATTAC------CATA-------------CT----AGCGAAAA-AACATATTTTCATT--TTAA--------TACGGTAAGAATTTTATTTATTTTGA-AA----ATACAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATT----------------TATAAATC----------------TATTTGCGAGTATGCGGGTATGTTTCTAATTAAATACCCGATTG-AAAAAAAATTGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGTTATCAGTGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTATGACACCGCGATATACCCATGAATTTGTGTCAGCTGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCCGAAAGTCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                      cGCTTTTTGAGTATATAGACACTTTGTAGAAAAATGAGTTCTCTTAATAACAGGTTGTAA--CTCACTGACTGTTTGGCAAACTTCAAATGATATTTAGGACCAGAGGTTAAGAGGAAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGCATATACATTTAAATTTTATATTTATTTCATT------AAA-------AAA-AAATATAA-AACAA-ACATGT----CGATATAGATCTAGTTTTGATTGCTGTACATGTTTCTTTT---TTTATTTCTGG--AAAAGAAATAAACAAAAAAAGTAAATTT-TAT----GCA
gi|5                          :           ccctttgcctcatataggtattatcatatcaaccatgctaaccaatactgtgtactccttatctcagtatctgtcacgctcaggtaatgatagccagattacactgtccccatgaaggtattaggaacatgttgataatttgacaccttcctagtttaacacatatttccaacattaagacttcatttgatgcttttttggtatatggaaactttgtagagaaattaattctctttgtcacagtgtaaagtttaaaattgtaaggcaaatattaaatgaaatataggaacagaaaataagaggaagtaaaaatttaTGCATATACATTTAAATTTTATGTTTATTTCATTT-----AAA-------AA--AAATATAA-AACAA-ACATGTA----GAT--AGATCTAGTTTTGATTGCTGTACATGTTTCTTTT---TTTATTTCTGG--AAATGAAATAAACAAAAAAAGTAAATTT-TAT----GCAaactagatctacataataaaaacacaacacaaatctagtgtttattggtgacctcatgtgacaataaaattccataaacaatggaaacaaagttgcctataaaaaaagtctgatgcaattttcaatgtccgtttcatcatttgacatgtatgacctatttcctttcatagttttgatattttatttgtacacgctgacgtgacgtcactgaaatgtgacatttaaaacttaacacacggttccaaatttagggtaattttatagcaatcgtgtagacgtcgtgtataaaacatgtgcaggatttaataaatacatgcattatggttgttgtttatgcgtatgctacggaaataatatgaatctttattaaaaattatcccatcaattaccatactagcgagaaaaaaagttttcattttaatacggtaagaattttatttattttgaaaatacaatcaatctgcttgtgaagcgataatttataaatctatttgcgagtatgcgggtatgtttctaattaaatacccgattgaaaaaaaattgttcgatctttcaaacacagcgggattcttatttgatctttcttaattggcaaaatcttaccgttatcagtgatttattgccccctgtttggtcagtatgacaccgcgatatacccatgaatttgtgtcagctgtgaaaacacaacaacttcaaaagtgtgccgaaagtca
gi|4                          :                                                                                                                                       caacatgttgataatttgacaccttgctactttaacacatatttccaacattaagacttcatttgatgcttttttggtatatggaaactttgtagagaaattaattctctttgtcacagtgtaaagtttaaaattgtaaggcaaatattaaatgaaatataggaacagaaaataagaggaagtaaaaatttaTGCATATACATTTAAATTTTATGTTTATTTCATTT-----AAA-------AA--AAT---GA-AACAA-ACATGTAGAT--AT--AGATCTAGTTTTGATTGCTGTACATGTTTCTTTT---TTT-TATTTCTGGAAATGAAATAAAC-CAAAA-GTAAATTT-TAT----GCAaactagatctacataataaaaacacaacacaaatctagtgtttattggtgacctcatgtgacagtaaaattccataaacaatggaaacaaagttgcctataaaaaaagtctgatgcaattttcaatgtccgtttcatcatttgacatgtatgacctatttcctttcatagttttgatattttatttgtacacgctgacgtgacgtcactgaaatgtgacatttaaaacttaacacacggttccaaatttagggtaattttatagcaatcgtgtagacgtcgtgtataaaacatgtgcaggatttaataaatacatgcattatggttgttgtttatgcgtatgctacggaaataatatgaatctttattaaaaattatcccatcaattaccatactagcgaaaaaacatattttcattttaatacggtaagaattttatttattttgaaaatacaatcaatctgcttgtgaagcgataatttataaatctatttgcgagtatgcgggtatgtttctaattaaatacccgattgaaaaaaaattgttcgatctttcaaacacagcgggattcttatttgatctttcttaattggcaaaatcttaccgttatcagtgatttattgccccctgtttggtcagtatgacaccgcgatatacccatgaatttgtgtcagctgtgaaaacacaacaacttcaaaagtgtgccgaaagtca
gi|14                         :                                                                                                     aaccctttgcctcatataggtattatcatatcaaccatgctaaccaatactttgtactccttatctcagtatctgtcacgctcaggtaatgatagccagattacactgtccccatgaaggtattaggaacatgttgataatttgacaccttgctactttaacacatattttcaacattaagacttcattttatgcttttttggtatatggaaactgtagagaaatgaattctctttgtcacagtgtaaagtttaaaattgttaagcaaatattaaatataggaacagaaaataagaggaagtaaaaatttaAAAACTAGATGT-CT--TTCTACATGTTTGTTTTAT--TT-TTTTG----AAATGAAATAAACATCAAATTTACATGTATATTTTGGAAAATGAAACAGAAATACTAAAGGAATTAAACA-AACAGTTTGAATATGGGATTCATTGGCAGACCTaactagatctacataataaaaacacaacacaaatctagtgtttattggtgacctcaatgacagtaaaattccataaacgatggaaaccaagttgcgtataaaaaaatctgatgcaaatttcaatgtccatttcttcatttgacatgtatgacctatttcttttcatatttctggtattttatttctacacgctgatgtcactgaaatgtgacatttaaaacttaacacacagttccaaatttaggataattttatagcaatcgtgtagacgtcgtgtataaaacatgtgcaggatttaataaatatatgcattatggttgcgtatgcgatggaaataatatgaatctttattaaaaattatcccatcaattacgatactagcgagaaaacaacttttcattttaatacggtaagaattttatttattttgaaaatacaatcaatctgcttgtgaagcgataatttattaatctatttgcgagtatgcgggtatgtttctaattaaatacccgattgaaaaaaaaaatgttcgatcttccaaacacagtgggattcttatttgatatttcttaattggcaaaatcttaccgatatcagtgatttattgccccctgtttggtcagtatgacaccgtgatatacccattaatttgtgtcagcagtgaaaacacaacaacttcaaaagtgtgccgaaaatcag
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taAACTAGATCTACATAATAA-------AAAAACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTAACA-TAAAATTCCATAAA--CGACGG--AAA-C-AAAGTCGCGTATAAAAAA--TCTG-TGCAAATTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATTTAACATGTATGACCTATTTCTTTTCATAATTTTGGTATTTTATTTGTACAAGCTGACGT-----CACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAACACACAGTTCCAAATTTTGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACATTGTGTATAAAACATG-CG-A--GGATTTAATAAATATATGC--ATTATG--TGTTGTTTATGTGTATGCTATGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAA-AATCA-CCCCATCAATTAC------GATA-------------CT----AGCGAGAA-AACAGTTTTTCATT--TGAA--------TACGGTTAGTATTTTATTTATTTTGA-AA----ATACAATCAATCTGCTTGTGAAACTATAATT----------------TATAAATCTTACAATGTATAAATTTATTTACGAGTATGCGGGTATGTTTCTAATTAAATACCCGATTG-AAAAAAAAATGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCAATATCAGTGATTTATTGCCCCCCTGTTTGGTCAGTACGACACCGTGATATACCCATGAACTTGTGTCAGCTGTGAAAATACAACAACTTCAAAAGTGTGCCAAAAGTCAGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACTAGATCTACATAATAA-------AAAAACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTAACA-TAAAATTCCATAAA--CGACGG--AAA-CAAA-GTCGCGTATAAAAAA--TCTG-TGCAAATTTCA-AT---GTCCGT
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Reference ( family-4833 )     :     AACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTGTGTACTCCTTATCTCAGTGTCTGTCACGCTCAGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATGAAGGTATTAGGAACATGTTGATAATTTGACACCTTGCTACTTTAACACATATTTCCAACATT-AAGACTT----CATTTTATGCTTTTTTGGTATATGGAAACTTTGTAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATATAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTATGCATAAAATTTACTTTTTTTGTTTATTTCATTT---CCAGA---A-ATAAAAA-AA-GAAACATGTACAGCGATCAAANCTAG-NTCTATNTCTACATGTTTGTTTTAT-TTTTTTTTAAATGAAATAAACATAAAATTTAAATGTATAT----GCAAACTAGATCTACATAATAA-------AAACACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTGACAGTAAAATTCCATAAA--CGATGG--AAACAAAGTCGCGTAT-AAAAAAA-TCTGATGCAAATTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATTTGACATGTATGACCTATTTCCTTTCATANTTTTGGTATTTTATTTGTACACGCTGACGTGACGTCACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAACACACGGTTCCAAATTTAGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCGTGTATAAAACATG-TGCA--GGATTTAATAAATACATG--CATTATGGTTGTTGTTTATGCGTATGCTACGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAAAATTATCCCATCAATTACNATAC-----TA--------------------GCGAGAAA-ACAANTTTTCATT--TTAA--------TACGGTNAGNATTTTATTTATTTTGA-AA----ATACAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATTTATA----------------AATC----------------T--------ATTTGCGAGTATGCGGGT-----ATGTTTCTAATTAAATACCCGATTGAAAAAAAAATTGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGATATCAGTGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTATGACACCGCGATATACCCATGAATTTGTGTCAGCTGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCCGAAAGTCAGC
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gi|4                          :     AACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTTTGTACTCCTTATCTCAGTATCTGTCACGCTCAGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATGAAGGTATTAGGAACATGTTGATAATTTGACACCTTGCTACTTTAACACATATTTTCAACATT-AAGACTT----CATTTTATGCTTTTTTGGTATATGGAAACT--GTAGAGAAATGAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTTAAGCAAATATTAAAT-----ATAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTATGCATAAAATTTACTTTTG--GTTTATTTCATTT---CCAGA---A-ATAAAAA-AAAGAAACATGTACAGCAATCAAAACTAG-ATCTATATCTACATGTTTGTTTCAT-TTTTTT--AAATGAAATAAACATAAAATTTAAATGTATAT----GCAAACTAGATCTACATAATAA-------AAACACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCA-ATGACAGTAAAATTCCATAAA--CGATGG--AAACCAAGTTGCGTAT-AAAAAAA-TCTGATGCAAATTTCA-AT---GTCCATTTCTTCATTTGACATGTATGACCTATTTCTTTTCATATTTCTGGTATTTTATTTCTACACGCTGATGT-----CACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAACACACAGTTCCAAATTTAGGATAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCGTGTATAAAACATG-TGCA--GGATTTAATAAATATATG--CATTATGGTTG---------CGTATGCGATGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAAAATTATCCCATCAATTACGATAC-----TA--------------------GCGAGAAA-ACAACTTTTCATT--TTAA--------TACGGTAAGAATTTTATTTATTTTGA-AA----ATACAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATTTATT----------------AATC----------------T--------ATTTGCGAGTATGCGGGT-----ATGTTTCTAATTAAATACCCGATTGAAAAAAAAAATGTTCGATCTTCCAAACACAGTGGGATTCTTATTTGATATTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGATATCAGTGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTATGACACCGTGATATACCCATTAATTTGTGTCAGCAGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCCGAAAATCAG
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Reference ( family-4833 )     :                                                                                                                                                                                                                         AACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTGTGTACTCCTTATCTCAGTATCTGTCACGCTCAGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATGAAGGTATTAGGAACATGTTGATAATTTGACACCTTGCTACTTTAACACATATTTCCAACATT-AAGACTT----CATTTTATGCTTTTTTGGTATATGGAAACTTTGTAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATATAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTATGCATAAAATTTACTTTTTTTGTTTATTTCATTT---CCAGA-------AATAAAAA-AA-GAA-ACATGTACAGCAATCAAAACTAGATCTATATCTACATGTTTGTTTTATATTTTTTTTAAATGAAATAAACATAAAATTTAAATGTATAT----GCAAACTAGATCTACATAATAA-------AAACACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTGACAGTAAAATTCCATAAA--CGATGG--AAACAAAGTCGCGTAT-AAAAAAA-TCTGATGCAANTTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATTTGACATGTATGACCTATTTCCTTTCATANTTTTGGTATTTTATTTGTACACGCTGACGTGACGTCACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAACACACGGTTCCAAATTTAGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCGTGTATAAAACATG-TGCA--GGATTTAATAAATACATG--CATTATGGTTGTTGTTTATGCGTATGCTACGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAAAATTATCCCATCAATTACNATACTAGCGAGAAAACAANTTTTCATTT--TAATACGGTAAGAATTTTATTTATTTTGA-AA----ATACAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATTTATA----------------AATC----------------T--------ATTTGCGAGTATGCGGGT-----ATGTTTCTAATTAAATACCCGATTGAAAAAAAAATTGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGNTATCAGTGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTATGACACCGCGATATACCCATGAATTTGTGTCAGCTGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCCGAAAGTCAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                         AACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCGTATCAACCATGCTAACCAATACTGTGGACTCCTTATCTCAGTATCTGTCACTCTCTGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATAAAGGTATAAGGAACATGTTGATAATTTGACACGTTGCTACTTTAACACATATTTCCAACATT-AAGACTT----CATTTTATGCTTTTTTGGTATATGGAAAATTTGAAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATATA-GAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTACGCATAAAATTTACTTTTTTGGTTTATTTTATTT---CAAGA-------AATAAAAATAA-GAA-ACATGTACAGCAATCAAATTTAGATCTATATCTAAATGTTTGTTTTA---TTTTTTTAAATCAAATAAACATAAAATTTAAATGCATAT----GCAAACTAGATTTACATATTAA-------AAATACAACA---CAAATCTAGTGTTCATTGGT-GACCTCATGTGACAGTAAAATTCCATAAA--CGATGGATAAACAAAGTTGCGTATAAAAAAAA-TCTGATGCAAATTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATCTGACATGTATGACCTATTTCTTTTCATATTTGTGGTATTTTATTTGTACACGC-----TGACGTCACTGAAATGTGACGTTTAAAACTTAACACACGGTTCCAAATTTAGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCATGTATAAAACATG-TGCA--GGA-TTAATAAATACATG--CATTATGGTTGTTGTTTATGCGTATGCTATGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAAAAATATCCCATCAATTACGATACTAGCGAGAAAACAACTTTTCATTT--TAATACGTTTAGACTTTTATTTATTTTGA-AA----ATAAAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATTTATAAATCTTACAATGTATAAATC----------------T--------ATTTACGAGTATGCGGGT-----ATTTTTCTAATTAAATACTCGATTGAAAAAAAAATTGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGATATCAGCGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTTTGACACCCTGATATATCCATGAATTTGTGTCAGCTGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAAATGTAACA-----TTTCAAAATGATGGTAATTTT----------CCAGCA--C-----------AC-----------AACATAATGCACTGGATT----AAATAGATG--TTTTATGGTTGTT-TTTACG-GT---------AAATATTATGAATGTTAAAACTTTAATAAACAATGCCTCCCCAATTACGATACT--C-ATATAACAACTTTTCACTTGGCAATGCG--AGGAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttacATTTCAATTACTTTAATAATAGTATAGAACTAATCAGCTTGTGAAGCTATAATAAATA----------------AATC----------------TTTAAACGTATTTA----TCTGCGCGTGAACAACGATTCTAATTAACAAACAGACTGTAAAATAAcacaattcactgattaaatgatgtatacagttagtatttcaattactttaataatagtatagaactaatcagcttgtgaagctataataaataaatctttaaacgtatttatctgcgcgtgaacaacgattctaattaacaaacagactgtaaaataa
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                          ttatTTTGTCTCATATAGGTATTTTCATATCAACCATGCTTACCAATACTGTGTAATCCTTATCTCAGTGTCTGTCACGCTCA----------------TTACACCGTCCCCACGAAGGTATTTGGAACATGTTGATTATTTGATACCTTGCTACTTTAATTCATATTTCCAACATT-AAGACTT----CGTTTTATGGGTTTT--GTGTATAAAAAC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taGCTTTTTGAGTATATAGACACTTTGTAGAAAAATGAGTTCTCTTAATAACAGGTTGTAA--CTCACTGACTGTTTGGCAAACTTCAAATGATATTTAGGACCAGAGGTTAAGAGGAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                          ACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTG
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Reference ( family-4833 )     :                                                                                                                                                                                                                         AACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTGTGTACTCCTTATCTCAGTATCTGTCACGCTCAGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATGAAGGTATTAGGAACATGTTGATAATTTGACACCTTGCTACTTTAACACATATTTCCAACATT-AAGACTT----CATTTTATGCTTTTTTGGTATATGGAAACTTTGTAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATATAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTATGCATAAAATTTACTTTTTTTGTTTATTTCATTT---CCAGA-------AATAAAAA-AA-GAA-ACATGTACAGCAATCAAAACTAGATCTATATCTACATGTTTGTTTTATATTTTTTTTAAATGAAATAAACATAAAATTTAAATGTATAT----GCAAACTAGATCTACATAATAA-------AAACACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTGACAGTAAAATTCCATAAA--CGATGG--AAACAAAGTCGCGTAT-AAAAAAA-TCTGATGCAANTTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATTTGACATGTATGACCTATTTCCTTTCATANTTTTGGTATTTTATTTGTACACGCTGACGTGACGTCACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAACACACGGTTCCAAATTTAGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCGTGTATAAAACATG-TGCA--GGATTTAATAAATACATG--CATTATGGTTGTTGTTTATGCGTATGCTACGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAAAATTATCCCATCAATTACNATACTAGCGAGAAAACAACTTTTCATTT--TAATACGGTAAGAATTTTATTTATTTTGA-AA----ATACAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATTTATA----------------AATC----------------T--------ATTTGCGAGTATGCGGGT-----ATGTTTCTAATTAAATACCCGATTGAAAAAAAAATTGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGNTATCAGTGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTATGACACCGCGATATACCCATGAATTTGTGTCAGCTGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCCGAAAGTCAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                         AACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCGTATCAACCATGCTAACCAATACTGTGGACTCCTTATCTCAGTATCTGTCACTCTCTGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATAAAGGTATAAGGAACATGTTGATAATTTGACACGTTGCTACTTTAACACATATTTCCAACATT-AAGACTT----CATTTTATGCTTTTTTGGTATATGGAAAATTTGAAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATATA-GAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTACGCATAAAATTTACTTTTTTGGTTTATTTTATTT---CAAGA-------AATAAAAATAA-GAA-ACATGTACAGCAATCAAATTTAGATCTATATCTAAATGTTTGTTTTA---TTTTTTTAAATCAAATAAACATAAAATTTAAATGCATAT----GCAAACTAGATTTACATATTAA-------AAATACAACA---CAAATCTAGTGTTCATTGGT-GACCTCATGTGACAGTAAAATTCCATAAA--CGATGGATAAACAAAGTTGCGTATAAAAAAAA-TCTGATGCAAATTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATCTGACATGTATGACCTATTTCTTTTCATATTTGTGGTATTTTATTTGTACACGC-----TGACGTCACTGAAATGTGACGTTTAAAACTTAACACACGGTTCCAAATTTAGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCATGTATAAAACATG-TGCA--GGA-TTAATAAATACATG--CATTATGGTTGTTGTTTATGCGTATGCTATGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAAAAATATCCCATCAATTACGATACTAGCGAGAAAACAACTTTTCATTT--TAATACGTTTAGACTTTTATTTATTTTGA-AA----ATAAAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATTTATAAATCTTACAATGTATAAATC----------------T--------ATTTACGAGTATGCGGGT-----ATTTTTCTAATTAAATACTCGATTGAAAAAAAAATTGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGATATCAGCGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTTTGACACCCTGATATATCCATGAATTTGTGTCAGCTGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAAATGTAACA-----TTTCAAAATGATGGTAATTTT----------CCAGCA--C-----------AC-----------AACATAATGCACTGGATT----AAATAGATG--TTTTATGGTTGTT-TTTACG-GT---------AAATATTATGAATGTTAAAACTTTAATAAACAATGCCTCCCCAATTACGATACT--C-ATATAACAACTTTTCACTTGGCAATGCG--AGGAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttacATTTCAATTACTTTAATAATAGTATAGAACTAATCAGCTTGTGAAGCTATAATAAATA----------------AATC----------------TTTAAACGTATTTA----TCTGCGCGTGAACAACGATTCTAATTAACAAACAGACTGTAAAATAAcacaattcactgattaaatgatgtatacagttagtatttcaattactttaataatagtatagaactaatcagcttgtgaagctataataaataaatctttaaacgtatttatctgcgcgtgaacaacgattctaattaacaaacagactgtaaaataa
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                          ttatTTTGTCTCATATAGGTATTTTCATATCAACCATGCTTACCAATACTGTGTAATCCTTATCTCAGTGTCTGTCACGCTCA----------------TTACACCGTCCCCACGAAGGTATTTGGAACATGTTGATTATTTGATACCTTGCTACTTTAATTCATATTTCCAACATT-AAGACTT----CGTTTTATGGGTTTT--GTGTATAAAAAC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taGCTTTTTGAGTATATAGACACTTTGTAGAAAAATGAGTTCTCTTAATAACAGGTTGTAA--CTCACTGACTGTTTGGCAAACTTCAAATGATATTTAGGACCAGAGGTTAAGAGGAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                          ACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTG
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cctttgcctcatctaggtattatcatatcaaccatgctaaccaatactgtgtactccttatctcagtgtccgtcacacacaggtaatgatagccagattacactgtccccattaaggtattaggaacatgttgataatttgacaccttgctactttaacacatatttccaacattaaagacttcatttaatgctttttttgtatatggaaacttgtagagaaattaattctctttgtctcagtgtaaagtttaaaattgtaaggcaaatatgaaatgaaatataggaacagaaaataagaggaagtaaaaatttatgtatcaaatttacttttttggttcatttcatttcCAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTGTCAGTGAAATTCCATAAA--CATTGG--AATCAAAGTCG--TAT-CAATAAA-TCTGATGCAAATTTCA-TT---GTCCGTTTCATCATTTGACATGTTTCACCTATTTCTTTTCATAATTTTGGTGTTTTATTTGTACACGCTGAC----C-TCACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAAAACACGGTTCCAAATTTATGGTAATTTT----------ATAGCAATCA-----TGTAGACGCCGTGTATAATACATG-TGCA--GGATT----AAATAAATG--CATTATGATTGTTGTTTATGTGTATGCTATGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAAAATTATCCCACCAATTACTATACTAGTGAGAAAACAACTTTTCATTT--TAATACGGTAAGTATTTTAATTATTTTGA-TA----ATACAATC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                               TTATCATATTAACCATGCTAACTAATACTATGTACTCCTTATCTCAGTATCTGTCATGCCCAGGTAATGATAGCCAGATTACAATGTCCCCATGAAGGTATTAGGAACATGTTGA--------CACCTTGCTACTTAAACACATATTTCCAACATT-AAGACTTGAATCATGTTATGCTTTTTTAGTATATGGAAACTTTGTAGAGAAATGAATTCTCTTTGCCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATACAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTCATGCATAAAATTTAC-TTTTTTGGTTATTTCATTT---CCAGA-------AATAAAAA-AA-GAA-ACATGTACAGCAATCAAAACTAGCTTTAAATCTACATGTTTGTTTTAT-TTTTTT


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Reference ( family-4833 )     :                                                                                                                                                                                                                         AACCCTTTGCCTCATATAGGTATTATCATATCAACCATGCTAACCAATACTGTGTACTCCTTATCTCAGTATCTGTCACGCTCAGGTAATGATAGCCAGATTACACTGTCCCCATGAAGGTATTAGGAACATGTTGATAATTTGACACCTTGCTACTTTAACACATATTTCCAACATT-AAGACTT----CATTTTATGCTTTTTTGGTATATGGAAACTTTGTAGAGAAATTAATTCTCTTTGTCACAG--TGTAAAGTTTAA-AATTGTAAGGCAAATATTAAATGAAATATAGGAACAGAAAATAAGAGGAAGTAAAAATTTATGCATAAAATTTACTTTTTTTGTTTATTTCATTT---CCAGA-------AATAAAAA-AA-GAA-ACATGTACAGCAATCAAAACTAGATCTATATCTACATGTTTGTTTTATATTTTTTTTAAATGAAATAAACATAAAATTTAAATGTATAT----GCAAACTAGATCTACATAATAA-------AAACACAACA---CAAATCTAGTGTTTATTGGT-GACCTCATGTGACAGTAAAATTCCATAAA--CGATGG--AAACAAAGTCGCGTAT-AAAAAAA-TCTGATGCAANTTTCA-AT---GTCCGTTTCATCATTTGACATGTATGACCTATTTCCTTTCATANTTTTGGTATTTTATTTGTACACGCTGACGT--C-TCACTGAAATGTGACATTTAAAACTTAACACACGGTTCCAAATTTAGGGTAATTTT----------ATAGCAATCG-----TGTAGACGTCGTGTATAAAACATG-TGCA--GGATTTAATAAATACATG--CATTATGGTTGTTGTTTATGCGTATGCTACGGAAATAATATGAAT-------CTTTATTAAAAATTATCCCATCAATTACNATACTAGCGAGAAAACAACTTTTCATTT--TAATACGGTAAGAATTTTATTTATTTTGA-AA----ATACAATCAATCTGCTTGTGAAGCGATAATTTATA----------------AATC----------------T--------ATTTGCGAGTATGCGGGT-----ATGTTTCTAATTAAATACCCGATTGAAAAAAAAATTGTTCGATCTTTCAAACACAGCGGGATTCTTATTTGATCTTTCTTAATTGGCAAAATCTTACCGNTATCAGTGATTTATTG-CCCCCTGTTTGGTCAGTATGACACCGCGATATACCCATGAATTTGTGTCAGCTGTGAAAACACAACAACTTCAAAAGTGTGCCGAAAGTCAGC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taGCTTTTTGAGTATATAGACACTTTGTAGAAAAATGAGTTCTCTTAATAACAGGTTGTAA--CTCACTGACTGTTTGGCAAACTTCAAATGATATTTAGGACCAGAGGTTAAGAGGAAG
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