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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-481 )      : TTTTT-GTA-ATAAATTGTTTTATTTCATATTCTTTACATATACATGTAT--GTA-TTATATTT-TT-----A-CAGCACAGAACAAA-----TATACAA--TAT------TATT-T-TA-----A--ATACA--TAC----AATACAT------CATGACATTCACA-ATTTTACTCTGGATAGTAGTAAAANGCCTG--AAAACGAATTATTTTAACA-----AATACAGAATAG--TA------GTATTGTCCATA--TGTTTCCATTTCAAGCNTC-AAACA--TTTTTCTTTTGTGGATGTTT---TAAT-----GTGTGAGTGTTGACGTCTTC-TGTGTGATGAAATA-------------AT-TTTA---------T---A-----TT--T-----TTTNAAAAAA-----A--A-TAAAGAGA---C-NAAATAATATAGAAGGAAGA-AAA-AA-A-A-AGACGATTTTTAGAGAAGAGAGA---TACAGATAGACGA--GA----TA-------------T------AT------------------ATATAT----A-ATATATCCTCTC--ACTGCTTCTTTGTCAT-----------AATTAATATTGCTTTGCTTTCCCCTCGTGTTTGTAGTATATTACTGTT-TTTNTTT--AAA-TATNATTAGCCTTAC-TATTTATTTTC-------AAG--T-TTT-CCATTTGATTTCATGGTTTTCTGATNTATTATGATCCATTGCGATTTG-TTTTT---CAAGTTCTATTTGTTTATATAAGTATTNCTTGTAT-TC-ATAAATTGTAGTAT-T-AC-T--TAT----TG---------TTAA--ATAT-ACA-ATAT
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gi|16                         : TTTTT-GTA-ATAAATTGTTTTATTTCATATTCTTTACATAAACATATAT--ATA--TATTTTT-TTTTTTCA-CCGCACAAAACAAA-----TATATAG--TATAACATGTATT-T-TAAAGTCA--ATACA--TAC----AGTATAT------CATGACATaacat
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-481 )      : TTTTT-GTA-ATAAATTGTTTTATTTCATATTCTTTACATATACATGTAT--GTA-TTATATTT-TT-----A-CAGCACAGAACAAA-----TATACAA--TAT------TATT-T-TA-----A--ATACA--TAC----AATACAT------CATGACATTCACA-ATTTTACTCTGGATAGTAGTAAAANGCCTG--AAAACGAATTATTTTAACA-----AATACAGAATAG--TA------GTATTGTCCATA--TGTTTCCATTTCAAGCATC-AAA-CA--TTTTTCTTTTGTGGATGTTT---TAAT-----GTGTGAGTGTTGACGTCTTC-TGTGTGATGAAATA-------------NT-TTTA---------T---A------TT--T-----TTTAAAAAAAA--A-T----------A-A-GAGACNAAATAATATGGAAGGAAGA-AAA-AAAA-AGACGATTTTTAGAGAAGAGAGA---TACAGATAGACGA--GA----TA-------------T------AT------------------ATANAT----A-ATATATCCTCTC--ACTGCTTCTTTGTCAT-----------AATTAATATTGCTTTGCTTTCCCCTCGTGTTAGTAGTATATTACTGTT-TTTTTTT--AAA-TATTATTAGCCTTAC-TATTCGTTTTCA-----A----G-TTTTGCCATTTGATTTCATGACTTTCTAATTTATTATGATCCATTGCAATTTG-TTTTT---CAAGTTCTATTTGTTTATATAAGTATTCCTTGTAT-TC-ATAAATTGTGGTATCGAC-T--TAT----TG---------TTAA--ATATATA-ATAT
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gi|4                          :   TTT-GTA-ATAAATTGTTTTATTCCATATTCTTTACATATACATATATATGTA-TTATATTT-TT-----A-CAGCACAGAACAAA-----TATACAA--TAG------TATT-T-TA-----A--ATACA--TAC----AAAATGT------CATGACATTCACA-ATTTTACTATGGATAGTAGTAAAAGGCCTG--AAAACAAATAATTTTAA-A-----TATACAGAAAAG--TAAATATTGTATTGTCCATA--TGTTTCCATTTC-AGCATC-AAA-CA--TTTTTCTTTTGTGGATGCTT---TAAT-----GTGTGAGTG--------TTC-TGTGTGGTAAAATAATGTTTTTTATTTAT-TTTA---------T---A------TT--T-----TTTAAAAAATA---------------A-A-GAGACTAAATAATATGGAATGGAGACAAA-AAAA-AGAAGATTTTTAGAGAAGAGAGA---TACAGATAGATGAGTGA----T--------------T------ATTCTTTTANNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNNNNNCTCTCTGACTGCTTCTTTGTCAT-----------GATTAATATTGCTTTGCTTTCCCCTCGTGTTTGTAGTATATAACT-TT-TTTTTTT--AAA-TATTATTAGCCTTACATATTCATTTTCA-----A----G-TTTTGCCATTTGATTTCATGGTTATTTAATTTATTATGATCCATTGCAATTTG-TTTTT---CAAGTTCTATgacatattttgcacgtaaagttatgttcttttcttatgtatttcaataatttgaaagcttaccgttttcatattcaaatctatgtttatataattgggttcgcacatgtatattcccagaagagatga
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gi|7                          : TTTTT-GTA-ATAAATTGTTTTATTTCATATTCTGAACATATACATATAT--GTA-TTTTATTT-TA-----A-CAGCACAGAACAAA-----TATACAA--TAT------TATT-T-TA-----T--ATTCA--TACA---AATACAT------CATGACATTCACA-ATTTTACTATGGATCGTAGTTAAAAGCCTG--AAAACCAATAATTTTAACC-----AATAGAGA---------------TAATGTCCATA--TGTTTCCATTTCAAGCGTCAAAA-CA--TTTTTCTTTTGTGGATGGTC---TGAT-----GTGTGAGTGTTGACGTCTTT-TGTG-GAT
gi|8                          :                                                                                                    t--TAT------TGTT-T-TA-----A--ACCAA--TAC----AAT-TAT------CAAGACATTCACT-ATTTTACTCTG---------------TCTG--AAA-CGAATTATTTAAACA-----ATTACAGAATAG--TA------GTAGCGTCCATATTTTTTTCTATTCCAAGCCTC-AAA-CA--TATTTCTTTTGTAAAT-CTT---TAATGTCAGGTGTGAGTGTTGACGTCTTC-CGTGTGACGAAATA-------------TT-TT----------------------TT--T-----TTTAAAAAAAA--A-GAGAACAAAGAA-A-GAGCAAAAATAATATAGAAGAAAGA-AAA-AGAATAGACGA
gi|9                          :                    TTTATTTCATATTACGTACATATTAATTTAT--GTA-AAATATTT-TTTC---A-CAGAACAGACCAAA-----TG---AA--T-T------T-------------A--GTACA--TAC----AATACAT--------TGTCATTGAAACATTTTG-TTTGGATAGTCGT-AAATGCCTG---AAACGAACTATTTTAACACAATTAATGCAAAGCAGAATA------GTA--GTC----------------TCAAATAT--AA-------------TTTGTGAACG-TC---CAATGTCAGGTGTGAGTGTTG----------GTGTGATGGAATA-------------CC-TTT


blockSeqs                     :      .   T                                        AT   CTT      A  TTTTCA   G           AATTG   A   AG   AACATG    G G  AAGTC CG     TG   CGTG       CTTGCC             C                    A   A     AAA  A     T         CAATT            AA  AATATT   T        TT                   A   A  TT                 G  ATG    GTCAG                    A              ATTTTACTTTTTTATTATTTTTTAAAAAAAAAATAAA                                                T             A   T C   .    TA  A                   TTT          C  GT  TTATTCTTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNN                                        TG                GTTAGTCAAAA                         T     AGT            TT       T     C   T       T   ATA          CTCTTAAAAT T    T                A        G                      T     TTA     G         TAT                 GCGA            ATCT  ATCA A TATATTTGTTC        TG       .
blockSeqs                     :      .   .                                        .    TT       .  TCA      G           .       G   G    .         . .  .     .      .    A          .                  .                    A   T     A    A     A         .                .   .        T        .                    A   .  .                  T  .      GTCAG                    .              ATGTTTTTTATTTATTTTATATTTTTTAAAAAATAAA                                                T             G   G .   .    A   T                   .            T  .   GAATTATCTTTTAATATAGATACTGAA                                           .                 C                                   T     TGG            TT       T     .   A       T   T            A          .    G                C        T                      .     .       T         TAT                 GTGA            ATTG  T    A TG                 .        .
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                AAGGCCTG--AAA-CTAACTGTGTTCACA-----AATATAAAACTG--CA------GTAGTGTGCACA--TACTTCCATACCAAGCCTCAAAACA--TTTTTATTTTGTGAATATCTATGTAAG-----TTGTGTATGTTGACGTCTTCATTTGTGATGAAATA-------------GT-TTTA---------TGAGA------TT--TGTTTATTTAAAAAAGG--T-T----------A----AGGCAAAACAACGTGGA---AAGA-CAA-AAA----ATGATTTTAAGAGAA---AGATTTTAAAGAAGGA--A--AA----TA-------------T------TT------------------ATGCAT--------------TCAC--ACTGCTATTTCGTTATGTTAGTCAAAAAGTTGATATTGCTTTGCTTTTCCTCTATGTTTGGAATACAT---TGTG-GAATAT---AAACTATAATTGA---TAC-T-TTCATTTTCACTCTTAAAATG-TTTT--CATTAAATTTAAAGATTTTATGATATATTTTGATATTTTATGATTTG-TTTTT---CAAGTTCTGAGTGTTTATATAAGTATTTGTTGTATGTG-ATAAAATGCAGT----AC-T--T-T----TG---------TTAA--ATATtttgcacataaattaatgaagttcatcctattcatttctttttcagttttgataatcccaaaacttacagttctcaaattcagattaatatttacatttaacgtgtttataaaagctcacaactttgaccaaaactgttgagcatgcctacattcccagaagagatgatttaaacattcaacattcatgg
gi|4                          :   TTT-GTA-ATAAATTGTTTTATTCCATATTCTTTACATATACATATATATGTA-TTATATTT-TT-----A-CAGCACAGAACAAA-----TATACAA--TAG------TATT-T-TA-----A--ATACA--TAC----AAAATGT------CATGACATTCACA-ATTTTACTATGGATAGTAGTAAAAGGCCTG--AAAACAAATAATTTTAA-A-----TATACAGAAAAG--TAAATATTGTATTGTCCATA--TGTTTCCATTTC-AGCATC-AAACA--TTTTTCTTTTGTGGATGCTT---TAAT-----GTGTGAGTG--------TTC-TGTGTGGTAAAATAATGTTTTTTATTTAT-TTTA---------T---A------TT--T-----TTTAAAAAATA---------------A-A-GAGACTAAATAATATGGAATGGAGACAAA-AAAA-AGAAGATTTTTAGAGAAGAGAGA---TACAGATAGATGAGTGA----T--------------T------ATTCTTTTANNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNNNNNNCTCTCTGACTGCTTCTTTGTCAT-----------GATTAATATTGCTTTGCTTTCCCCTCGTGTTTGTAGTATATAACTTTT-TTTTTT---AAA-TATTATTAGCCTTACATATTCATTTTCA-----A----G-TTTTGCCATTTGATTTCATGGTTATTTAATTTATTATGATCCATTGCAATTTG-TTTTT---CAAGTTCTATgacatattttgcacgtaaagttatgttcttttcttatgtatttcaataatttgaaagcttaccgttttcatattcaaatctatgtttatataattgggttcgcacatgtatattcccagaagagatga
gi|5                          :  TTTT-GTA-ATAAATGGTTTTATTTCATATTCTTTATATAT-------------------TTT-CT-----AACCGCACAGAACAAA-----TATACAA--TAT------TATT-T-CA-----A--ATACA--TAC----AATACAT------AATGACAATCACA-ATTTTACTCTATATAGTAGTAAAAAGCCAG--AAAACGAGTTATTTTATTA-----AATACAGAATAG--TA------GTATTGCCCATA--TGTTTCCATTTCAAGCATC-AAACATTTTTTTCTTTCGCGGATGTTT---TAAT-----TTATCAGTTTTAACGTCTTC-TATGTGATAATATA-------------------A---------T---A------TT--T-----TTT------------T------------------TCAAATAATAAGGAA--AAAA-AGA-TATA-AAACGAT----------GAGAGA---TACAGATAGACGA--GAGAATTA-------------TCTTTTAAT------------------ATAGATACTGA-ACATATCCTCTC--ACTGCTTCTTTGTCATC----------AATCAATATTGCTTTGCTTTCCCCTGGTGTTA-----ATATTACTGTT-TTTTTT----AA-TATAATTAGCCTT
gi|6                          : aTTTT-GTA-ATAAATTGCTTTATTTCATAATCTATACGTATACGTGTAT--GTA-TAATATTT-TT-----A-CAGAACAGACCATA-----TTTACAA--TAT------TATT-T-TA-----A--ATACA--TAT----AATACAT------CATGACATTCACA-ATTTTACTCTGGATAGTAGCAAAAAGCCTGAAAAAACGAATTATTTTAACA-----AATACAGAATAG--TA------GTATTGTCCATA--TGTATCCATCTGAAGCATC-AAACA--TTTTTCTTTTGTGGATATTT---TAAT-----GTGTGAGTGTTGACGTCTTC-TGTGTGATGAAATAT------------TT-TTTAT--------T---A------TT--T-----TTT-TAAAAAA--A-T---------------AGACTAAATAATATAGAAGGAAGT-AAA-AAAA-----GATTCTTAGAGAAGAGAGA---TACAGATAGAAAA--GA----TAAATATTTTTATTTC------AT------------------ATATAT----ATATATATCCTCTC--ACTGCTTCTTTGTCAT-----------AATTAATATTTCTTCACTTTTCCCTtacata
gi|7                          : TTTTT-GTA-ATAAATTGTTTTATTTCATATTCTGAACATATACATATAT--GTA-TTTTATTT-TA-----A-CAGCACAGAACAAA-----TATACAA--TAT------TATT-T-TA-----T--ATTCA--TACA---AATACAT------CATGACATTCACA-ATTTTACTATGGATCGTAGTTAAAAGCCTG--AAAACCAATAATTTTAACC-----AATAGAGA---------------TAATGTCCATA--TGTTTCCATTTCAAGCGTCAAAACA--TTTTTCTTTTGTGGATGGTC---TGAT-----GTGTGAGTGTTGACGTCTTT-TGTG-GAT
gi|8                          :                                                                                                    t--TAT------TGTT-T-TA-----A--ACCAA--TAC----AAT-TAT------CAAGACATTCACT-ATTTTACTCTG---------------TCTG--AAA-CGAATTATTTAAACA-----ATTACAGAATAG--TA------GTAGCGTCCATATTTTTTTCTATTCCAAGCCTC-AAACA--TATTTCTTTTGTAAAT-CTT---TAATGTCAGGTGTGAGTGTTGACGTCTTC-CGTGTGACGAAATA-------------TT-TT----------------------TT--T-----TTTAAAAAAAA--A-GAGAACAAAGAA-A-GAGCAAAAATAATATAGAAGAAAGA-AAA-AGAATAGACGA
gi|9                          :                    TTTATTTCATATTACGTACATATTAATTTAT--GTA-AAATATTT-TTTC---A-CAGAACAGACCAAA-----TG---AA--T-T------T-------------A--GTACA--TAC----AATACAT--------TGTCATTGAAACATTTTG-TTTGGATAGTCGT-AAATGCCTG---AAACGAACTATTTTAACACAATTAATGCAAAGCAGAATA------GTA--GTC----------------TCAAATAT--AA------------TTTGTGAACG-TC---CAATGTCAGGTGTGAGTGTTG----------GTGTGATGGAATA-------------CC-TTT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AAAAAGAAGAAAATATGGAAAGATAATGATATGGGTACTGAGAGAAGAGAGATACAGATGGGAATGTAATCACACATCTATTTCGTCATTTTAATAAAATAGTAGGTAATGCGTTGTTTCCTCTTTCTTTTAGGAATAAATACTTGGTAATTAAAATATTATTGATAC
Unaligned ( gi|20 ): TTTGATAATTCCAAAATTTACAGTTCTCAAATTTAAATTTATATTTACATTTATTGTGCCTTTTA
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