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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                           AAAAAAGAGAATAATCATTGTAATACCGATATTAACTGACATGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTAGTATATTGATA-CAAATGTGCACGTATCTTTAGCCTACTAGTATA--GTATTATCTACGGGAACGTGACTCACGTACCCCTAGA---------ACGCG-AGGCTAGAGG-TACG-GA--CCCGTAACCCTAGGCACTGCCT-T---------CTAAATACGACGTGCACTGTAACCATTAGTCCGTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAACTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTCGATAGCCCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTATC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATT---A-GAATTATTTG--CACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCTT------AACATCTAATTGTAGTTGAAGTTCGGACAGGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAA-TTAACAAAATATTGAAACTAAATCTTGGCCAACCAGT-AGTAAAAGCATTCGTACACGGTACTACATTGTCCGATTTTCGA----AATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGCCAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AA---AAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCAATAGCTCATTTTCTTATCACCACTT-GT---TGG---TG---GAGCTGGCGTTTAGTAGCC
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gi|17                         :                                                                                                                                                           ttttttaacaggaaagATTATAATACC--T-TTATCTG----GTTTGTATGTGTGATATGCGATAACA-ATGGTCTTTGATATATTGATATCAAAC-TG-ACGTACCTGTAGCTTTCCAGTATATAGTATTATCTACGGGTACTGGACCCACATAGCCCTAGA---------ACGCA-AGTGTAGCGG-TTAA-TA--CCCGTACCCCTAGACACTGCCTAT---------TTAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                       tccgtaaatgacaattgttttatacgcgacaaatttggccgctttattacattgttacgaaagaaactactagaaaTA-CA---GTGCACGT--------CGTATTAAGAAA--GCAGTGCCTAGGGTTACGGG--TC-CGTACCTCTAGC----------CTCG-CGTTCAAAGGGTACGTGAATCACGTAACCGTAGATAATACCA-TACCGGTAGGCTAAATAT-ACGTGCA
gi|13                         :            agtacgtgcttgaaaataatatgattaacaaaattattaccaataacaatattaaatattaaatgggcgaagtatgatacattttaattctgtaacttatatttgttaatatacttaactaaaaaatcgctagaatacattttttaacatgaaagaaaacgagaataatcattgtaataccgatatcaactcacaagtttatattatatgattatacacggtctttggtatattgatataaattCGTACCTCTAGCCT-C---------GTGTT--CTGGGGGTACGTGAGTCACGTACCCGTAGATAATACTATACTAGTAGTCTAAAGG-TACG-actattcgtccttgtacatgacttaaacttcgatgctcactttactcatgaatacaaatgattaattcaagttactaactaaccataagacacagcgcaaccactacttgatagctccgccattacagtgatagttccaccgcttttataaatatatgcatatttctcttttaagaaagtttttttttaatcctgatgagttattgtgtaagtattataatatgtgaattatttgcacccgcgaaaatgttcttacagtgtgcctaaacatctaattgtagtagaaattcggacatgtataaaaatatgtaagtgtccgaatcaggagaaaagctcttgacaacacactttaccaaaatattgaaactaaatcgtggccaaccagtagtaaaagtatttgtacacggtactacagtgtccgattttcgaaatgagatctattattaaaaatataagacaaaaagaaaatcatactcacgtgtgtacaaataaaaatactcgttagctccaccgcggatgtgtcgatagctcattttcttatcaccacttgctggtggtagagctggcgtttagtag
gi|9                          :                                                                                                                                                     aatagttaaattaacgagtatttttatttgtacacacgtgagtatgatttaaaaaaatcgttagaatactttttttaacatgaaagaaaacgagaataatcattgtaataccgatatcaactgacaagtttataattatatgattatacacggactctggtatattgatataaatttgcaGCG-AGGCTAGAGG-TACA-GA--CCCGTAACCTTAGGCACTGCCT-T---------CTAAATACGACGTACACTGTAACTATTCATCCTTATACATAACTTAAGCTTCGACGCTCACTTTCATCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAAAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTATC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTATAAGTACTATAATATT---T-GAATTATTTG--CACTCGCGAAAATGTTCTTACAGTGCGCCTA------AACTTCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCAGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACATCA-AA-TTTACAAAATATTGAAACTAAAgacccgtaacactaggcactgccttctaaatacgacgtgcattgtaactattcgtcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGNNN-NNNN-NN--NCCGTTACCCTAGGCACTGCCT-T---------CTAAATACGACGTGCACTGTTACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCATTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATGTATC--TTTTAAGAAAC--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATT---T-GAATTATTTG--CACCCGCGAGAATGTT-TTACATTGTGCCTTAACTAAAACATCTAATTGTATTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATTTGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAA-TTTACAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGT-AGTAAAAGTATTCGTACACGTTACTACATTGCCGGGTTTTCGA----AATGAGATATATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGT-T-------------------CTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGCCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTT-GT---TGG---TGGTAGAGCTGGCGTTTAGTAGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cACTGTTCGTC--TTTACATAACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTACTCACGAA-A-AAATGATTAATTCAAGATACTAACTAAATTTTACCATAAGA-------------------------GCTCAACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTTGAA-AAATT--TTG--CGTCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCTA------AACATCTCATTGTAATTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAA-TTTACAAAATATTGAAACTTAATCGTGGCCAACCAGA-AGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCAATTTTCGA----AATGAGATCT--------------TAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AA---AAATGCCCGTTAGCTCCA---CGGACGTGTCGATAGCTCATATTCTT------ACTTGGTGG-TGG---TG---GAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATGATAAATTCAAGTTTCTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GAGCCTCCAC-AATTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCTCTTTTACAAATATATTTATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTAAAATATG---T-GAATTATTTG--CACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCTA------ATCATCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGTGTCCGAATCAGGAAAAAAGCTCTTGGCAACACAA-TTTACAAAATGTTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGA-AGTTAAAGTATTTGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTTTA----AATGAGATCTATAGAT-AAAAATGTAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACATGTGAACAAAT---AA---AAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGAAAGCTCATTTTCTTATCACCACTT-GTTGGTGG---TG---GAGCAGGCGTTTAGTAGCC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              agCATACGAC-AAATGCGCCACCACTACTTGATAGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgttaaactatatcaacttagggaacaaaaGCGCCACCACTAC-TTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTT--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATTCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATT-------------TG--AACCCGCGAGAACGT-CTTACAGTGTGCCTA------AACATCTAATTATAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACAAGCCCGAATCAGGTGAAAAGCTCTTGACAACACAA-TTTACAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAAGTATAA------------------AAATTGCCCGATCATCGA----AATGGGATTTATTAAT-AAATATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAATAAAAA---AAACACTCGTAAGCT-----------------------CATTTTCTTATCACCACTT-GG---TAG---TG---GAGCTGGGGTTTAGTAGCCtccaccacttttataaatatatgcatatttcttttttaagaaagttttattaattctgatgagttcctgtgtaagtattataatatttgaacccgcgagaacgtcttacagtgtgcctaaacatctaattatagttgaaattcggacatgtataaaaatatgcacaagcccgaatcaggtgaaaagctcttgacaacacaatttacaaaatattgaaactaaatcgtggccaaccagtaagtataaaaattgcccgatcatcgaaatgggatttattaataaatatataagacaaaaagtaaatcatactcacgtgtgtacaaataaaaaaaacactcgtaagctcattttcttatcaccacttggtagtggagctggggtttagtagccgt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatgttaaactatatcaacttagggaacaaaacatacgacaaatTTTATCATTTCTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGGGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATC---T-GAATTATTTG--CACCCCCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCTA------ATCATCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACAAGTTCGAATCAGGAGAAAAGTTCTTGACAACAAAA-ATTCCAAAATAGTGAAACTGAATCGTGGCCAACCAGA-AATAAAAGTTTTCGTACTCGGTACTACATTGCTCGATTTTCAA----AATGAGATCTATTAA--------------CAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AA---AATTACCCCTAACCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTCCTTATCACCACTT-GTTGGTGG---TG---GAGCTGGCGTTTAGTAGgt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATTATAAGAAT---AAGAATTATTTG--AACCCGCAAGAATGTTCTTACAGTGTGCATA------AACATGTTATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAATA-TATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGTTCTTGACAACACAA-TTTACAAAATATTGAAACTAAATCGTGGAAAACCAGT-AGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGA----AATGTGATCTATTAATAAAAAATTTAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGAGTGTACAAAT---AA---AAATACCCGTTAGCTCCACCGCAGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTT-GTTGGTGG---TG---GAACTGGCGTTTAATAGCCt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTATTTGTACACACGTGAGTATGAT-TTACTTTTTGTCTT------AAGATCTCATT----TCGAAAATTGGGCA-ATGTAGTACCGTGTACGAAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actgttcgtctttacataacttaagcttcgatgctcactttactcacgaaaaaatgattaattcaagatactaactaaattttaccataagagctcaaccactacagtgatagctccaccacttttataaatatatgcatatttctcttttaagaaagttttattaatcctgatgagttcctgtgtaagtattataatatttgaaaaattttgcgtccgcgagaatgttcttacagtgtgcctaaacatctcattgtaattgaaattcggacatgtataaaaatatgcacgagtccgaatcaggagaaaagctcttgacaacacaatttacaaaatattgaaacttaatcgtggccaaccagaagtaaaagtGACATGTACAAAAATATGCACGAGACCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAT-TTTGCAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGA-AATAAAAATATTCGTACACGGTACCACATAGCCCGATTTTCGA----AAAGAGACCTATTAAT-AGAAATATAAGACAAAAAATAAATCATACTCACGTGTGTGCAAAT---AA---AAATACTCGTAAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTT-GTTAGTGG---TG---GAGCTGGCGTTTAGTAGCaaatgcccgttagctccacggacgtgtcgatagctcatattcttacttggtggtggtggagctggcgtttagtagcc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAA-TTTACAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGT-AGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTTCATTGCCTGATTTTCGA----AATGAGATCTATTAAT-TAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGCACAAAT---AA---AAATACCCGTTAGCTCCACCGCGGTTGTGTGGATAGCTCATTTTCTTATCACCTCTT-GTTTGTGG---TG---GAGCTGGCGTTTAGAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCCGATTCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAA-TTTACAAAATATAGAAACTAAATCGTGGCAAACCAGT-AGTAAAAATATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGA----AATGAGATCTATTAAT-AATAATATAAGACAAAAAGTAAATCGTACTTACGTGTGTACAAAT---AA---AAATACTCATTAGCTCCACCACGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTT-GTTGGTGG---TG---GAGCTGGCGTTTAGAAGC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaatcagTTGACAACACAA-ATTACAAAATATCGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGT-AGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGA----AATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAGTCATACTCACGTGTTTACAAAT---AA---AAATACTCATTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCGACACTT-GTTGGTGG---TG---GAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taTACAT-GTCCGAATTTCAAATACAATTAGATGTTTTAGT--------TAAGGCACAATGTAAAACATTCTCGCGGGTG--CAAAT---AATTCAAATATTg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cagnnnnnnnnnnccgttaccctaggcactgccttctaaatacgacgtgcactgttactattcgtccttgtacatgacttaagcttcgatgctcactttcctcacgaatacaaatgattaattcaagttactaactaaattttaccataagacacagcgccaccactacttgatagctccaccattacagtgatagctccaccacttttataaatatatgcatatgtatcttttaagaaacttttattaatcctgatgagttcctgtgtaagtattatTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AA---AAATACTCGTTAtaaaaatttgcacgagtccgaatcaggagaaaagctcttgacaacacaatttacaaaatattgaaactaaatcgtggccaaccagtagtaaaagtattcgtacacgttactacattgccgggttttcgaaatgagatatattaataaaaatataagacaaaaagtaaatcatactcacgtgttctcgttagctccaccgcggatgtgccgatagctcattttcttatcaccacttgttggtggtagagctggcgtttagtagc
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GTATGTGGTTGAAAATAATATGATTAACACAATTATTACCAATAACAATATTAAATATTAAATGGGCGAAGTATGATGCATTTTAATTCTGTTACTTATATTTGTTAATATACTCAACCAAAAA






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Reference ( family-4596 )     :                NAAAACGAGAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTGGTATATTGATATAAATTTGCACGTACCTTTAGCCTACCAGTATA--GTATTATCTACGGGTACGTGACTCACGTACCCCTAGAACGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTAACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAGCTTCGACGCTCACTTTACTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|1                          :                 AAAACGAGAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTCACAAGTTTATA----TTATATG--ATTATACACGGTCTTTGGTATATTGATATAAATTTGCACGTATATTTAGCCTACCGGTATG--GTATTATCTACGGTTACGTGATTCACGTACCCTTTGAACGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCCTAGGCACTGCTT-TCTTAATACGACGTGCACTGTAACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAACTTCGATGCTCACTTTACTCATGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTA------ACCATAAGAC-ACA-GCGCAACCACTACTTGATAGCTCCGCCATTACAGTGATAGTTCCACCGCTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAGTTTTTTTTTAATCCTGATGAGTTATTGTGTAAGTATTATAATATGT-GAATTATTT-GCACCCGCGAAAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTGTAGTAGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGTAAGTGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACACTTTACCAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTACAGTGTCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTATT-AAAAATATAAGACAAAAAGAAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGCTGGTGGTAGAGCTGGCGTTTAGTAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   agtacgtgcttgaaaataatatgattaacaaaattattaccaataacaatattaaatattaaatgggcgaagtatgatacattttaattctgtaacttatatttgttaatatacttaactaaaaaatcgctagaatacattttttaacatgaaagTTTATCATTTCTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGGGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATCT-GAATTATTT-GCACCCCCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AATCATCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACAAGTTCGAATCAGGAGAAAAGTTCTTGACAACAAAAATTC-CAAAATAGTGAAACTGAATCGTGGCCAACCAGAAATAAAAGTTTTCGTACTCGGTACTACATTGCTCGATTTTCAAAATGAGATCTATTA--------------ACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAATTACCCCTAACCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTCCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATTATAAGAATAAGAATTATTT-GAACCCGCAAGAATGTTCTTACAGTGTGCAT------AAACATGTTATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAATA-TATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGTTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGAAAACCAGTAGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGTGATCTATTAATAAAAAATTTAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGAGTGTACAAAT---AAAAATACCCGTTAGCTCCACCGCAGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAACTGGCGTTTAATAGCCt
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gi|13                         :      aatagttaaatAAAACGAGAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGACTCTGGTATATTGATATAAATTTGCACGTACCTTTAGACTACTAGTATA--GTATTATCTACGGGTACGTGACTCACGTACCCCCAGAACACGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACACTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCATTGTAACTATTCGTCCaaaaaatcgttagaatactttttttaacatgaaagaaaacgagaataatcattgtaataccgatatcaactgacaagtttataattatatgattatacacggactctggtatattgatataaatttgcacgtacctttagactactagtatagtattatctacgggtacgtgactcacgtacccccagaacacgaggctagaggtacggacccgtaacactaggcactgccttctaaatacgacgtgcattgtaactattcgtcc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatagttaaattaacgagtatttttatttgtacacacgtgagtatgatttaaaaaaatcgttagaatactttttttaacatgaaagGACATGTACAAAAATATGCACGAGACCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACATTTTG-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGAAATAAAAATATTCGTACACGGTACCACATAGCCCGATTTTCGAAAAGAGACCTATTAAT-AGAAATATAAGACAAAAAATAAATCATACTCACGTGTGTGCAAAT---AAAAATACTCGTAAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTAGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTTCATTGCCTGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-TAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGCACAAAT---AAAAATACCCGTTAGCTCCACCGCGGTTGTGTGGATAGCTCATTTTCTTATCACCTCTTGTTTGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTCCGATTCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATAGAAACTAAATCGTGGCAAACCAGTAGTAAAAATATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AATAATATAAGACAAAAAGTAAATCGTACTTACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCATTAGCTCCACCACGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGAAGC
gi|17                         :                         aaatcagATTATAATACCTTTATC---TG----GTTTGTATGTGTGATATGCGATAACA-ATGGTCTTTGATATATTGATATCAAACTG-ACGTACCTGTAGCTTTCCAGTATATAGTATTATCTACGGGTACTGGACCCACATAGCCCTAGAACGCAAGTGTAGCGGTTAATACCCGTACCCCTAGACACTGCCTATTTAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tccgtaaatgacaattgttttatacgcgacaaatttggccgctttattacattgttacgaaagaaactactagaaaTTGACAACACAAATTA-CAAAATATCGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAGTCATACTCACGTGTTTACAAAT---AAAAATACTCATTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCGACACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|2                          :               taAAAACGAGAAAAATCATTATTATACTGATATTA-CTGACAAGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTGGTTTATTGATATAAATTTGCACATACCTTTAATCTACTAGTATA--GTATTATCTTCAGGTACGTGACT-----------AGAATGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCATAGGCACTGCCT-TCTAAATATGACGTGCACTGTAACTATCCGTCCTTGTTCATAACTTAGGTTTAGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGAACAATTCAAATTACTAACTAAATTTTACCATAA-ACGACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCTCCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTGTTT-ATATCTGCAAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTTATTATAGTTGAAATTCGGACATGTAAAAAAAAATGCACAAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTGTTGACAAAACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCAAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTCCATTGCCCGATTTTTGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTTGATAGCTCCACTGCAGATGTGTCAATAGCTCATTTTCTTATCACCAATTGTTGGTGTTGGCGCTGGCg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttattcacatgcatgatactcttaattttaaataggcagtgtaacttataacttctgtaacttatatttgttaatatactaatccaaaatttcgccagaatacatttttttaacatgaaagAAATCATACTCACGTGTGCACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACTACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTGGTAGCC
gi|21                         :                 AAAACGAGAATAATCATTGTAATATCGATATCAACTGACAAGTTTA--------ATATG--g
gi|3                          : ttttttaacaggaaagAAAAAGAGAATAATCATTGTAATACCGATATTAACTGACATGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTAGTATATTGATACAAATGTGCACGTATCTTTAGCCTACTAGTATA--GTATTATCTACGGGAACGTGACTCACGTACCCCTAGAACGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTAACCATTAGTCCGTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAACTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTCGATAGCCCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTATC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTA-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------TAACATCTAATTGTAGTTGAAGTTCGGACAGGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTAA-CAAAATATTGAAACTAAATCTTGGCCAACCAGTAGTAAAAGCATTCGTACACGGTACTACATTGTCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGCCAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCAATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGT---TGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                           aAGNNNNNNNNNNCCGTTACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTTACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCATTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATGTATC--TTTTAAGAAAC--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTT-TTACATTGTGCCTTAACTAAAACATCTAATTGTATTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATTTGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTCGTACACGTTACTACATTGCCGGGTTTTCGAAATGAGATATATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGT-T----------------CTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGCCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTAGAGCTGGCGTTTAGTAGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                   cACTGTTCGTCTTT--ACATAACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTACTCACGAA-A-AAATGATTAATTCAAGATACTAACTAAATTTTACCATAAGA-------------------------GCTCAACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAAAAATTTTGCGTCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTCATTGTAATTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTTAATCGTGGCCAACCAGAAGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCAATTTTCGAAATGAGATCT--------------TAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATGCCCGTTAGCTCCA---CGGACGTGTCGATAGCTCATATTCTT------ACTTGGTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatgttaaactatatcaacttagggaacaaaaGCGCCACCACTAC-TTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTT--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATTCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAA----------CCCGCGAGAACGT-CTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTATAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACAAGCCCGAATCAGGTGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGT-----AAGTA----TA-A-------AAATTGCCCGATCATCGAAATGGGATTTATTAAT-AAATATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAATAAAAAAAACACTCG-TA----------------------AGCTCATTTTCTTATCACCAC---TTGGTAGTGGAGCTGGGGTTTAGTAGCCtttataaatatatgcatatttcttttttaagaaagttttattaattctgatgagttcctgtgtaagtattataatatttgaacccgcgagaacgtcttacagtgtgcctaaacatctaattatagttgaaattcggacatgtataaaaatatgcacaagcccgaatcaggtgaaaagctcttgacaacacaatttacaaaatattgaaactaaatcgtggccaaccagtaagtataaaaattgcccgatcatcgaaatgggatttattaataaatatataagacaaaaagtaaatcatactcacgtgtgtacaaataaaaaaaacactcgtaagctcattttcttatcaccacttggtagtggagctggggtttagtagccgt
gi|9                          :                                                                                                                                        aatgttaaactatatcaacttagggaacaaaacatacgacaaatGCGAGGCTAGAGGTACAGACCCGTAACCTTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTACACTGTAACTATTCATCCTTATACATAACTTAAGCTTCGACGCTCACTTTCATCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAAAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTATC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTATAAGTACTATAATATTT-GAATTATTT-GCACTCGCGAAAATGTTCTTACAGTGCGCCT------AAACTTCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCAGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACATCA-AATTTA-CAAAATATTGAAACTAAAgt
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Unaligned ( gi|19 ): GTATGTGGTTGAAAATAATATGATTAACACAATTATTACCAATAACAATATTAAATATTAAATGGGCGAAGTATGATGCATTTTAATTCTGTTACTTATATTTGTTAATATACTCAACCAAAAA






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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatagttaaattaacgagtatttttatttgtacacacgtgagtatgatttaaaaaaatcgttagaatactttttttaacatgaaagGACATGTACAAAAATATGCACGAGACCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACATTTTG-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGAAATAAAAATATTCGTACACGGTACCACATAGCCCGATTTTCGAAAAGAGACCTATTAAT-AGAAATATAAGACAAAAAATAAATCATACTCACGTGTGTGCAAAT---AAAAATACTCGTAAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTAGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTTCATTGCCTGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-TAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGCACAAAT---AAAAATACCCGTTAGCTCCACCGCGGTTGTGTGGATAGCTCATTTTCTTATCACCTCTTGTTTGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTCCGATTCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATAGAAACTAAATCGTGGCAAACCAGTAGTAAAAATATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AATAATATAAGACAAAAAGTAAATCGTACTTACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCATTAGCTCCACCACGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGAAGC
gi|17                         :                         aaatcagATTATAATACCTTTATC---TG----GTTTGTATGTGTGATATGCGATAACA-ATGGTCTTTGATATATTGATATCAAACTG-ACGTACCTGTAGCTTTCCAGTATATAGTATTATCTACGGGTACTGGACCCACATAGCCCTAGAACGCAAGTGTAGCGGTTAATACCCGTACCCCTAGACACTGCCTATTTAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tccgtaaatgacaattgttttatacgcgacaaatttggccgctttattacattgttacgaaagaaactactagaaaTTGACAACACAAATTA-CAAAATATCGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAGTCATACTCACGTGTTTACAAAT---AAAAATACTCATTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCGACACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|2                          :               taAAAACGAGAAAAATCATTATTATACTGATATTA-CTGACAAGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTGGTTTATTGATATAAATTTGCACATACCTTTAATCTACTAGTATA--GTATTATCTTCAGGTACGTGACT-----------AGAATGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCATAGGCACTGCCT-TCTAAATATGACGTGCACTGTAACTATCCGTCCTTGTTCATAACTTAGGTTTAGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGAACAATTCAAATTACTAACTAAATTTTACCATAA-ACGACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCTCCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTGTTT-ATATCTGCAAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTTATTATAGTTGAAATTCGGACATGTAAAAAAAAATGCACAAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTGTTGACAAAACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCAAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTCCATTGCCCGATTTTTGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTTGATAGCTCCACTGCAGATGTGTCAATAGCTCATTTTCTTATCACCAATTGTTGGTGTTGGCGCTGGCg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttattcacatgcatgatactcttaattttaaataggcagtgtaacttataacttctgtaacttatatttgttaatatactaatccaaaatttcgccagaatacatttttttaacatgaaagAAATCATACTCACGTGTGCACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACTACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTGGTAGCC
gi|21                         :                 AAAACGAGAATAATCATTGTAATATCGATATCAACTGACAAGTTTA--------ATATG--g
gi|3                          : ttttttaacaggaaagAAAAAGAGAATAATCATTGTAATACCGATATTAACTGACATGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTAGTATATTGATACAAATGTGCACGTATCTTTAGCCTACTAGTATA--GTATTATCTACGGGAACGTGACTCACGTACCCCTAGAACGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTAACCATTAGTCCGTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAACTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTCGATAGCCCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTATC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTA-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------TAACATCTAATTGTAGTTGAAGTTCGGACAGGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTAA-CAAAATATTGAAACTAAATCTTGGCCAACCAGTAGTAAAAGCATTCGTACACGGTACTACATTGTCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGCCAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCAATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGT---TGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                           aAGNNNNNNNNNNCCGTTACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTTACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCATTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATGTATC--TTTTAAGAAAC--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTT-TTACATTGTGCCTTAACTAAAACATCTAATTGTATTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATTTGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTCGTACACGTTACTACATTGCCGGGTTTTCGAAATGAGATATATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGT-T----------------CTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGCCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTAGAGCTGGCGTTTAGTAGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                   cACTGTTCGTCTTT--ACATAACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTACTCACGAA-A-AAATGATTAATTCAAGATACTAACTAAATTTTACCATAAGA-------------------------GCTCAACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAAAAATTTTGCGTCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTCATTGTAATTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTTAATCGTGGCCAACCAGAAGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCAATTTTCGAAATGAGATCT--------------TAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATGCCCGTTAGCTCCA---CGGACGTGTCGATAGCTCATATTCTT------ACTTGGTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAATGATAAATTCAAGTTTCTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GAGCCTCCAC-AATTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCTCTTTTACAAATATATTTATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTAAAATATGT-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AATCATCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGTGTCCGAATCAGGAAAAAAGCTCTTGGCAACACAATTTA-CAAAATGTTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGAAGTTAAAGTATTTGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTTTAAATGAGATCTATAGAT-AAAAATGTAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACATGTGAACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGAAAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCAGGCGTTTAGTAGCC
gi|7                          :               agAAAACGAGAATAATCATTATAATACCGATATCAACTGACACGTTTATA---ATAATATG--ATTATACACAGTCTTTGGAAAATTAATATAAATTTGCACGTACCTTTAGCCTACCAGTATA--GGATTACCTACGGGTACGTGACCCACGAACCCCTAGAACACGAGGTTATAGGTACGGAACCGTAACCCTAAGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTAACTATTCGTCCTTGTACACGACGTATTCTTCGACGCTCACTTTACTCACGAATACAA-----TAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACG-GCGTCACCACTACTTGATAGCTCCACCACTACAGTGGTAGCTCCACAACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGTTGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATGC-GAATTACTT-GCACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTGTAGTTGAAATTC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttgttttaacatgaaagCATACGAC-AAATGCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCACT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatgttaaactatatcaacttagggaacaaaaGCGCCACCACTAC-TTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTT--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATTCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAA----------CCCGCGAGAACGT-CTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTATAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACAAGCCCGAATCAGGTGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGT-----AAGTA----TA-A-------AAATTGCCCGATCATCGAAATGGGATTTATTAAT-AAATATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAATAAAAAAAACACTCG-TA----------------------AGCTCATTTTCTTATCACCAC---TTGGTAGTGGAGCTGGGGTTTAGTAGCCtttataaatatatgcatatttcttttttaagaaagttttattaattctgatgagttcctgtgtaagtattataatatttgaacccgcgagaacgtcttacagtgtgcctaaacatctaattatagttgaaattcggacatgtataaaaatatgcacaagcccgaatcaggtgaaaagctcttgacaacacaatttacaaaatattgaaactaaatcgtggccaaccagtaagtataaaaattgcccgatcatcgaaatgggatttattaataaatatataagacaaaaagtaaatcatactcacgtgtgtacaaataaaaaaaacactcgtaagctcattttcttatcaccacttggtagtggagctggggtttagtagccgt
gi|9                          :                                                                                                                                        aatgttaaactatatcaacttagggaacaaaacatacgacaaatGCGAGGCTAGAGGTACAGACCCGTAACCTTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTACACTGTAACTATTCATCCTTATACATAACTTAAGCTTCGACGCTCACTTTCATCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAAAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTATC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTATAAGTACTATAATATTT-GAATTATTT-GCACTCGCGAAAATGTTCTTACAGTGCGCCT------AAACTTCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCAGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACATCA-AATTTA-CAAAATATTGAAACTAAAgt


blockSeqs                     :                                                                 TGTG       CG                                                             TA                                                                                A                                                                 A                                                     G   T                                                                          AT           .                                             A         T                               TAACTA                                                                                       .                                                                                            A                                             AAA
blockSeqs                     :                                                                 A          .                                                              .                                                                                 .                                                                 C                                                     .   .                                                                          .            .                                             .         .                               .                                                                                            .                                                                                            .                                             .  
blockSeqs                     :                                                                 A          .                                                              .                                                                                 .                                                                 C                                                     .   .                                                                          .            .                                             .         .                               .                                                                                            .                                                                                            .                                             .  
blockSeqs                     :                                                                 A          .                                                              .                                                                                 .                                                                 C                                                     .   .                                                                          .            .                                             .         .                               .                                                                                            .                                                                                            .                                             .  
blockSeqs                     :                                                                 A          .                                                              .                                                                                 .                                                                 A                                                     .   .                                                                          .            .                                             .         .                               .                                                                                            .                                                                                            .                                             .  
blockSeqs                     :                                                                 A          .                                                              .                                                                                 .                                                                 A                                                     .   .                                                                          .            .                                             .         .                               .                                                                                            .                                                                                            .                                             .  
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consensus                     :                NAAAACGAGAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTGGTATATTGATATAAATTTGCACGTACCTTTAGCCTACCAGTATA--GTATTATCTACGGGTACGTGACTCACGTACCCCTAGAACGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTAACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTNCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
Reference ( family-4596 )     :                NAAAACGAGAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTGGTATATTGATATAAATTTGCACGTACCTTTAGCCTACCAGTATA--GTATTATCTACGGGTACGTGACTCACGTACCCCTAGAACGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTAACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTNCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|1                          :                 AAAACGAGAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTCACAAGTTTATA----TTATATG--ATTATACACGGTCTTTGGTATATTGATATAAATTTGCACGTATATTTAGCCTACCGGTATG--GTATTATCTACGGTTACGTGATTCACGTACCCTTTGAACGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCCTAGGCACTGCTT-TCTTAATACGACGTGCACTGTAACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAACTTCGATGCTCACTTTACTCATGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTA------ACCATAAGAC-ACA-GCGCAACCACTACTTGATAGCTCCGCCATTACAGTGATAGTTCCACCGCTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAGTTTTTTTTTAATCCTGATGAGTTATTGTGTAAGTATTATAATATGT-GAATTATTT-GCACCCGCGAAAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTGTAGTAGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGTAAGTGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACACTTTACCAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTACAGTGTCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTATT-AAAAATATAAGACAAAAAGAAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGCTGGTGGTAGAGCTGGCGTTTAGTAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   agtacgtgcttgaaaataatatgattaacaaaattattaccaataacaatattaaatattaaatgggcgaagtatgatacattttaattctgtaacttatatttgttaatatacttaactaaaaaatcgctagaatacattttttaacatgaaagTTTATCATTTCTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGGGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATCT-GAATTATTT-GCACCCCCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AATCATCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACAAGTTCGAATCAGGAGAAAAGTTCTTGACAACAAAAATTC-CAAAATAGTGAAACTGAATCGTGGCCAACCAGAAATAAAAGTTTTCGTACTCGGTACTACATTGCTCGATTTTCAAAATGAGATCTATTA--------------ACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAATTACCCCTAACCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTCCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATTATAAGAATAAGAATTATTT-GAACCCGCAAGAATGTTCTTACAGTGTGCAT------AAACATGTTATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAATA-TATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGTTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGAAAACCAGTAGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGTGATCTATTAATAAAAAATTTAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGAGTGTACAAAT---AAAAATACCCGTTAGCTCCACCGCAGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAACTGGCGTTTAATAGCCt
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gi|13                         :      aatagttaaatAAAACGAGAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGACTCTGGTATATTGATATAAATTTGCACGTACCTTTAGACTACTAGTATA--GTATTATCTACGGGTACGTGACTCACGTACCCCCAGAACACGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACACTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCATTGTAACTATTCGTCCaaaaaatcgttagaatactttttttaacatgaaagaaaacgagaataatcattgtaataccgatatcaactgacaagtttataattatatgattatacacggactctggtatattgatataaatttgcacgtacctttagactactagtatagtattatctacgggtacgtgactcacgtacccccagaacacgaggctagaggtacggacccgtaacactaggcactgccttctaaatacgacgtgcattgtaactattcgtcc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatagttaaattaacgagtatttttatttgtacacacgtgagtatgatttaaaaaaatcgttagaatactttttttaacatgaaagGACATGTACAAAAATATGCACGAGACCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACATTTTG-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGAAATAAAAATATTCGTACACGGTACCACATAGCCCGATTTTCGAAAAGAGACCTATTAAT-AGAAATATAAGACAAAAAATAAATCATACTCACGTGTGTGCAAAT---AAAAATACTCGTAAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTAGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTTCATTGCCTGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-TAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGCACAAAT---AAAAATACCCGTTAGCTCCACCGCGGTTGTGTGGATAGCTCATTTTCTTATCACCTCTTGTTTGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTCCGATTCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATAGAAACTAAATCGTGGCAAACCAGTAGTAAAAATATTCGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AATAATATAAGACAAAAAGTAAATCGTACTTACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCATTAGCTCCACCACGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGAAGC
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tccgtaaatgacaattgttttatacgcgacaaatttggccgctttattacattgttacgaaagaaactactagaaaTTGACAACACAAATTA-CAAAATATCGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTACATTGCCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAGTCATACTCACGTGTTTACAAAT---AAAAATACTCATTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCGACACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|2                          :               taAAAACGAGAAAAATCATTATTATACTGATATTA-CTGACAAGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTGGTTTATTGATATAAATTTGCACATACCTTTAATCTACTAGTATA--GTATTATCTTCAGGTACGTGACT-----------AGAATGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCATAGGCACTGCCT-TCTAAATATGACGTGCACTGTAACTATCCGTCCTTGTTCATAACTTAGGTTTAGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGAACAATTCAAATTACTAACTAAATTTTACCATAA-ACGACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCTCCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTGTTT-ATATCTGCAAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTTATTATAGTTGAAATTCGGACATGTAAAAAAAAATGCACAAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTGTTGACAAAACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCAAACCAGTAGTAAAAGTATTTGTACACGGTACTCCATTGCCCGATTTTTGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTTGATAGCTCCACTGCAGATGTGTCAATAGCTCATTTTCTTATCACCAATTGTTGGTGTTGGCGCTGGCg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttattcacatgcatgatactcttaattttaaataggcagtgtaacttataacttctgtaacttatatttgttaatatactaatccaaaatttcgccagaatacatttttttaacatgaaagAAATCATACTCACGTGTGCACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCGATAGCTCATTTTCTTATCACTACTTGTTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTGGTAGCC
gi|21                         :                 AAAACGAGAATAATCATTGTAATATCGATATCAACTGACAAGTTTA--------ATATG--g
gi|3                          : ttttttaacaggaaagAAAAAGAGAATAATCATTGTAATACCGATATTAACTGACATGTTTATA---ATTATATG--ATTATACACGGTCTTTAGTATATTGATACAAATGTGCACGTATCTTTAGCCTACTAGTATA--GTATTATCTACGGGAACGTGACTCACGTACCCCTAGAACGCGAGGCTAGAGGTACGGACCCGTAACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTAACCATTAGTCCGTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAACTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTCGATAGCCCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTATC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTA-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------TAACATCTAATTGTAGTTGAAGTTCGGACAGGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTAA-CAAAATATTGAAACTAAATCTTGGCCAACCAGTAGTAAAAGCATTCGTACACGGTACTACATTGTCCGATTTTCGAAATGAGATCTATTAAT-AAAAATATAAGCCAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATACTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGTCAATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGT---TGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                           aAGNNNNNNNNNNCCGTTACCCTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTGCACTGTTACTATTCGTCCTTGTACATGACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTCCTCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAGAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCATTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATGTATC--TTTTAAGAAAC--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAATTATTT-GCACCCGCGAGAATGTT-TTACATTGTGCCTTAACTAAAACATCTAATTGTATTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATTTGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGTAGTAAAAGTATTCGTACACGTTACTACATTGCCGGGTTTTCGAAATGAGATATATTAAT-AAAAATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGT-T----------------CTCGTTAGCTCCACCGCGGATGTGCCGATAGCTCATTTTCTTATCACCACTTGTTGGTGGTAGAGCTGGCGTTTAGTAGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                   cACTGTTCGTCTTT--ACATAACTTAAGCTTCGATGCTCACTTTACTCACGAA-A-AAATGATTAATTCAAGATACTAACTAAATTTTACCATAAGA-------------------------GCTCAACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAAAAATTTTGCGTCCGCGAGAATGTTCTTACAGTGTGCCT------AAACATCTCATTGTAATTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCCGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTTAATCGTGGCCAACCAGAAGTAAAAGTATTCGTACACGGTACTACATTGCCCAATTTTCGAAATGAGATCT--------------TAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAAT---AAAAATGCCCGTTAGCTCCA---CGGACGTGTCGATAGCTCATATTCTT------ACTTGGTGGTGGTGGAGCTGGCGTTTAGTAGCC
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatgttaaactatatcaacttagggaacaaaaGCGCCACCACTAC-TTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTCTT--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATTCTGATGAGTTCCTGTGTAAGTATTATAATATTT-GAA----------CCCGCGAGAACGT-CTTACAGTGTGCCT------AAACATCTAATTATAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACAAGCCCGAATCAGGTGAAAAGCTCTTGACAACACAATTTA-CAAAATATTGAAACTAAATCGTGGCCAACCAGT-----AAGTA----TA-A-------AAATTGCCCGATCATCGAAATGGGATTTATTAAT-AAATATATAAGACAAAAAGTAAATCATACTCACGTGTGTACAAATAAAAAAAACACTCG-TA----------------------AGCTCATTTTCTTATCACCAC---TTGGTAGTGGAGCTGGGGTTTAGTAGCCtttataaatatatgcatatttcttttttaagaaagttttattaattctgatgagttcctgtgtaagtattataatatttgaacccgcgagaacgtcttacagtgtgcctaaacatctaattatagttgaaattcggacatgtataaaaatatgcacaagcccgaatcaggtgaaaagctcttgacaacacaatttacaaaatattgaaactaaatcgtggccaaccagtaagtataaaaattgcccgatcatcgaaatgggatttattaataaatatataagacaaaaagtaaatcatactcacgtgtgtacaaataaaaaaaacactcgtaagctcattttcttatcaccacttggtagtggagctggggtttagtagccgt
gi|9                          :                                                                                                                                        aatgttaaactatatcaacttagggaacaaaacatacgacaaatGCGAGGCTAGAGGTACAGACCCGTAACCTTAGGCACTGCCT-TCTAAATACGACGTACACTGTAACTATTCATCCTTATACATAACTTAAGCTTCGACGCTCACTTTCATCACGAATACAAATGATTAATTCAAGTTACTAACTAAATTTTACCATAAAAC-ACA-GCGCCACCACTACTTGATAGCTCCACCACTACAGTGATAGCTCCACCACTTTTATAAATATATGCATATTTATC--TTTTAAGAAAG--TTTTATTAATCCTGATGAGTTCCTGTATAAGTACTATAATATTT-GAATTATTT-GCACTCGCGAAAATGTTCTTACAGTGCGCCT------AAACTTCTAATTGTAGTTGAAATTCGGACATGTATAAAAATATGCACGAGTCAGAATCAGGAGAAAAGCTCTTGACATCA-AATTTA-CAAAATATTGAAACTAAAgt
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Unaligned ( gi|19 ): GTATGTGGTTGAAAATAATATGATTAACACAATTATTACCAATAACAATATTAAATATTAAATGGGCGAAGTATGATGCATTTTAATTCTGTTACTTATATTTGTTAATATACTCAACCAAAAA