lowQualScore                  :              1   1111  1111                33333333                  111111                                              1111111                  111111              1111111                                    11111            1111111111                                                                             
lowQualScore                  :              3   8888  3333   11 0  0  11  77777777 33333 22 111   0 111111 22 333333    2222 222 0 222  5555  11 22222  0000000    333  11 0 333 999999 1 0  00 111  0000000  0 222 0 0 111  1111 2222222  2222 11111   11   11  8888888888  11  0  11 11  22222222 0   1111     111  0 0   11    1111        44444     
lowQualScore                  :              .   ....  ....   .. .  .  ..  ........ ..... .. ...   . ...... .. ......    .... ... . ...  ....  .. .....  .......    ...  .. . ... ...... . .  .. ...  .......  . ... . . ...  .... .......  .... .....   ..   ..  ..........  ..  .  .. ..  ........ .   ....     ...  . .   ..    ....        .....     
lowQualScore                  :              5   6666  5555   44 9  9  22  22222222 11111 99 444   8 999999 66 111111    3333 000 7 000  4444  00 55555  2222222    666  99 7 555 666666 4 7  99 222  2222222  7 333 7 7 999  4444 2222222  9999 88888   77   77  0000000000  00  3  88 00  77777777 7   6666     333  7 7   11    8888        99999     
consensus                     :       TAAGGATGTTG-CT-AGG---AAG--T-TT-TC--AGAT---T--T-----T--C---ATG-T--N---T--A--C---GAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TT------AAATT--GAA--G-T---T--GTATT-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--CAT----T-------AT-C--TT-T-GTTG--CAG--TC-------T--TA--TGGAT--A--TG--------G-ATA----CATTG---AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTT
Reference ( gi|18 )           :       TAAGGATCTTG-CTGAGT---AAG--T-TT-TC--AG-----T--T-----T--C---ATG-T--A---T--A--C---GAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TT------GAATT--AAA--G-T---T--ATGGT-T-CT--T---TT-G-----AG-A---A-A-C--CAT----T-------AT-C--TG-T-ATTG--CAG--TC-------G--TA--TGGAT--A--TG--------G-ATA----CATTG---AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTT
gi|19                         :       TAAGGATGTTGACT-AGA---AAG--T-TT-TC--AAAT---T--T-----T--C---ATG-T--A---T--A--C---ATAT----T---T-T---AT----AT--A-----TT------TGACT--AAA--G-T---T--GTATT-T-CT--T---TT-A-----AG-G---A-A-C--CAG----T-------AT-C--TT-T-GTTG--CAG--TCTTA----A--TA--GGGGT--G--TG--------G-ATA----CATTG---AA-C-TAT--TTAA----GTCAC
gi|32                         :    attTAAGGAT---G-CTGGGTCGAAAG--T-TT-TC--AGAT---T--T-----T--C---ACG-C--G---C--G--C---GAAT----T---C-T---AT----AT--C----------------TT--AAA--C-T---T--A-----T-CT--T-------------------A-A-T--CAT----T-------AT-C--T--T-ATT--------------------------GAT--A--TT--------A-ATA----CATTG---AA-C-AAT--ATAA----GCCACAAA-----TATT
gi|2                          :      tTAAAGATTTTG-CCAAAA---CAG--T-TT-T---AGAT---T--T-----T--A---ATA-T--T---T--A--C---GAAT----T---T-A---AA----AT--G-----TT------TATTT--GAA--G-T---T--GTATT-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-CAAAATTGAAT-------AT-C--TT-T-GCTA--CAG--TT-------T--TA--TCGAT--A--TT--------G-ATT----CATTG---AA-A-ATT--TTAA----GGCACTAA-----TATaacattttttttaaa
gi|54                         :      tTATGGATATAG-CCAAGG---AAG--T-TT-CC--AGAA---T--G-----T--C---ACG-T--G---A--A--T---GAAA----T---T-C---AT----AT--C-----TT------AAATT--GAA--G-T---T--GTATT-T-TC--T---TT-C-----GG-A---A-A-A--CAT----C-------AT-T--TG-T-gtccttttttaacaagcgtta
gi|31                         :    ataTAAGGATGGTG-GAAAAT---AAG--T-TT-G---AG-----TG-T-----T--T---ATG-A--A---T---------TAAT----TA--T-T---ATTA--AT--C-----TT------CAACT--GAA--G-G---T--GTATT-T-CT--T---TT-A-----AT-A---A-A-T--CA----------------------T-GGCG--CAA--TT-------T--TA--TTGAA--A--TG--------G-ATG----CATTG---AT-C-GAT--TTTA----GTCACt
gi|20                         :  atatcTAAATATTTTGGCT-AGG---AAG--T-TT-T---AGAT---T--T-----T--C---ATGGT--A------A--C---TAAC----T---T-T---AT----AA--C-----TT------GTATT--G---------------------CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-T------------------T-C--TT-T-GTTA--CAT--TT-------G--AA--TGGATTCA--T------------TA-----ATTT---AA-A-GAT--TTAA----ACCACAAA-----
gi|12                         :     ctTAAATATGTTGGCT-AGA---AAG--T-TT-AA--AG-----TGGT-----T--C---ATG-T--A---T--A--T---GGAT----T---G-T---AT----AT--C-----TT------ACGTT--TCA--T-TTG-T--ACAGTAT-TTACT---TC-A-----AG-A---A-A-C--T-T----T-------AA-T--TGTT-ATTA--CAGTTTC-------G--T-----GATC-A--TG--------A-ATA----CATTG---AACC-GCT--TTAatatcaactatttaattaat
gi|67                         : gttattTAAAGATGTTGACT-AGA---AAG--A-TT-TC--AAAT---T--T-----T--C---ATG-T--T---C--A--T---GATT----T---T-TTTTAT----AT--C-----TT------AAATT--gca
gi|21                         :        tAGGATGTTG-CCAAGG---ATT--T-TT-TC--AA-----A--T-----T-------TT-T--A---T--AATT---TAAT----C---T-T----T----AT--C-----TT------ATATT--AAA--G-T---T--GTATT-T-CT--G---TC-A-----AT-A---A-A-G--CAT----T-------AT-G--TT-T-GTTG--CAG--TT-------T--TA--AGGAT--A--TT--------G-ATA----CATGT---AA-T-GAT--TTGA----AACATCAA-----CGT
gi|41                         :         tGGATGTTG-GTTAGG---AAG--T-TT-TCATAT-----T--T-----T--C---ATG-T------T--G--CTTTTAAT----G---T-TA--ATGA--AT--A-----TT------AAATT--GAA--G-T---T--GTATT-T-TC--T---TT-A-----AG-A---A-G-C-----------------AT-C--TA-T-ATcca
gi|60                         :            ATGTTG-GTTAGG---AAG--T-TT-TC--A-----------------------TG-T--T---T--A--C---GTAT----T---C-T---AT----AT--C-----TT------AAATT--GGA--G-T---T--ATAGT-G-AT--T---TA-A-----TG-A---A-A-C--CAT----T-------attttagactttttaaacttaaacataca
gi|16                         :             aCTTG-C-GAGG---GAG--T-TT-TC--AG-----A--T-----TGAT---ATG-T--T---T--A--C---GAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TT-------------AAA--G-T---T--GTATT-T-AT--T---TT-A-----AC-A---A-A-C--CAT----T-------AT-A--TT-T-GTTA--CAG--TC-------T--TA--AGGCT--A--TG--------G-AAG----TATTG---AA-C-GAT--TTAA----ATCACAAA-----CATTTctttt
gi|5                          :               TTG-CCTAGC---AAC--T-TT-AC--AGAG---T--T-----G--T---ATG-C--T---T--A--C---GAAT----T---T-T---GT----AT--C-----TT------AAAAT--AAA--G-T---T--GTATT-T-GT--T---TT-T-----AG-A---A-C-C--TAT----A-------AT-C--TT-T-GTTG--T----TT-------GCTCA--TGGAT--A--AG--------ATATA----CATTG---AA-C-AAccaatttgttag
gi|56                         :               TTG-CT-AGG---AAG--T-TT-CC--AG-----A--TGG---T--A---ATA-T--T---T--A--T---GAAT----T---T-T---AT----AC-----------------AATA--AGA--G--------ATGAT-T-TT--T---CT-A-----AG-A---A-A-C--CAT----T-------Aacattttcatttaaatgcatataacaaattcaaa
gi|36                         :               gtG-CTTAG----AAG--T-TA-TC--AGAT---T--T-----T--A---ATA-T--T---T--A--C---AAAT----T---G-T---AT----AT--C-----TT------AAATT--GAA--A-T---T--GTATA-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-T--CAT----T-------AT-C--TT-T-TTTG--CAG--TC-------T--TA--TGTAT--A--TG--------G-AT------AGTG---AA-C-GAG--TTAA----GCTTCAAA-----attttaattgaacattttaag
gi|34                         :             gttgG-CT-AGG---AGA--T-CT-TC--AG---------------------ATG-A--C---T--T--C---AAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TT------AAATG--GGA--G-T---T--GTATT-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--CAC----T-------AT-C--TT-T--TTAT-CAC--TC-------T--TA--TGGAT--T--TG--------A-ATA----CATCC---AA-C-GAT--TTCA----TCTACAAA-----TA
gi|68                         :            tgttgG-CT-AGG---AAG--T-TT-TC--AGA----T--T-----TG-C---ATG-T--G---T--A--T---GGAG----T---T-T---AT----AT--C-----TT------GAATT--GAA--G-T---T--GTag
gi|52                         :            tgttgG-CTG-GA---AAG--T-TT-CC--GGCTT--T--T-----T--C---ACG-G--A---------C---GAAT--------------AT----AT--C-----TT------AAATA--GAA--A-T---T--GCATT-T-CA--T------------AGCA---A-A-C--CAT----T-------AT----TG-A-GTTG--AAG--TC-------T--TA--
gi|15                         :                   tgGAGT---AAG--TATC-TC--AA-----G--TAAACAT--C---GTC-T--A---T--C--A---AAAT----T---T-C---AT----AT--C-----TT------AAATT--GAA--G-T---C--GTATT-T-CT--T---TTAG-----TG-A---A-A-T--TGT----T-------TT-C--TT-T-GTTC--CAG--TC-------T--TA--GGGAT------G--------G-GTA----CATTG---AC-C-GAT--TTAA----GCCACAAAATGTCCATTTcaactgcgtac
gi|37                         :                      AGA---AAG--T-TT-CC--AGA----TG-T-----T--C---ATG-T--T---T--A--T---GAAT----T---T-T---AT----AT--T-----TTC-----AAATT--GAA--G-T---T---TTAT-T-TT--T---TT-A-----GG-G---A-G-T--AAT----T-------AT-C--TT-T-GTTA--AAG--TC-------T--TA--TG-------------------------------A---AA-C-AAG--TTAA----ACCACAAA-----CATatttg
gi|44                         :                   attAGA---AAG--A-TT-CC--AGA----T--T-----T--CCGAAT--T--A------A--T---GCAT----T---T-G---GT----AT--C-----TT------AAAGA--GAA--G-T---T--ATATT-T-CT--T---TT-T-----AG----------------------------------------TG---AG--TC-------T--TA--TGATT--A--TG--------G-ATA----CAT-G---AA-T-AAT--TTAA----GCCATAGA-----CATagtcattattta
gi|64                         :                     tAGG---AAG--T-TT-TC--AGA----TA-T-----T--C---ATG-T--T---T--G--C---AATC----T---T-T---AT----AT--C-----TT------AAATTGCGAA--T-T---T--AT-------T--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--gtccatt
gi|29                         :                  agggtGT---TAG--T-TT-TA--AGAT---C--T-----T--T---ATG----A---C--AA-C---GGAT----T---T-----ATGACAAT--G-----TT------AAATT--GAA--G-T---T--GTATT-T-CT--G---TT-A-----TG-A---A-A-C---------T-------AT-G--TT-T-GTTA--CAG--TC-------T--TA--TGGAT--A--TC--------G-GTA----CATTG---AG-C-AAT--TGAA----GCCACAAA-----CATt
gi|24                         :                 ttgtctcT---AAGACT-TTGTC--AG-----A--T-----TGCC---ATG-T--T---T--A--T---AAAT----T---T-T---AT----AT--C-----AT------GAATT--GAAATG-T---T---T--T-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--AAT----T-------AT----TG-TTGTTG--CAT--TT-------C--TA--TGGAT-----------------ATA----CATTA---AA-C-GAT--ATAA----GCCTCAAA-----CAT
gi|17                         :                     tggc---AAG--T-TT-TA--AGAA---T--T-----C--C---ATG-C--A---T--A--C---GAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TT------AAATT--AAA--A-T---T--GTA-T-T-TT--C---TT-------AG-A---A-A-C--CAT----T-------AT-C--TT-T-ATTG--CAG--TC-------T--TA--AAGAT--A--TG--------C-ATA----CATTG---AA-C-GAT--TTAA----GCAACAAA-----CATatccttttat
gi|23                         :                       ga---AGG--T-TT-TC--AGAT---T--T-----T--C---ATG-T--T---G--A--C---GACT----T---T-T---AT----AA--C-----TT------AAATT--GCA--A-T---T--ATGTT-T-CT--T---TT----------------------AT----T-------G------A-T-ATTG--TAG--TC-------T--TA--CGGAT--C--TG--------A-TTA----TATTG---AA-C-GAT--TCAA----GCAACAAA-----CATgtccattttatgacaaa
gi|6                          :                      gca---AAA--T-GT-TC--AGAT---T--T-----T--C---ATA-A--T---T--G--C---AAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TT------AAATT--GAA--G-T---T--GTATT-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--AAT----T-------AT-C--TT-T-GCTG--GTG--CCTTGTGG-A--TG--TGGAT--A--TG--------G-ATG----CATTGTATAA-T-GATGCTTAA---------AAA-----CATgtccatgtctttctgaaaaaa
gi|39                         :                        g---AAG--T-TT-CC--AGATTATT--T-----T--C---ATG-T--T---G--A--T---GAAT----T---T-C---AT----AT------------------ATT--AAG--G-T------GTGGT-TGTT--T---TT-GTTTTTAA-A---A-A-----------T-------AT-T--TT-T--TTA--CAG--TC-------C--TA--TGG-T--G--TG----------ATA----CATTG---AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----AATatttcatccaattttatccaa
gi|55                         :                       gg---AAG--T-TT-TC--AGAT---T--T-----T--G---ATG-T--T---T--A--C---GAAT----T---G-T---AT----TT--C-----TT------CAA--------------------------------------------G-A---A-A-C--CAG----T-------AT-C--TG-T-GTTG--CAA--TC-------T--TA--TTGAT--G--GG--------A-AAA----CATTG---AA-C-GAT--T
gi|47                         :                   acttgg---AGG--T-TT-TC--AGAT---T--T-----T--C---ATG-T--T---T--A--C---GACT----T---A-T---AG----AA--C-----TA------AAATT--TCA--A-T---T--ATGTT-T-AT--T---TC-A-----AG-A---A-A-C--TAT----T-------ATAC--TG---ATTG--CAG--TC-------T--TA--AGCAT--C--TG--------A-A-G----CAT--------C-GAT--TTAA----
gi|57                         :                     agga---AAG--T-TT-TC--AGA----T--T-----T--C---ATG-TTGA---T--A-------AAT----T---T-T---AT----AT--C-----TT------GAAT----------T---T--GTATT-T-TT--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--CTT----T-------------------TT-----G--TT-------G--TA--TG--------CG--------A-ATA----CATTA---AA-C-
gi|10                         :                      ggtcaagAG--T-TT-TC--AGAT---T--T-----T--C---ATG-A--C---T--A--C---TGAT----T---T-T---AT----AT--C-----TG------AAATT--GTA--G-T---T--GTGTT-T-TT--T---TTTA-----AG-A---A-A-C--CAT----T-------TT-T--TG-T---TA--CAG--TC-------G--TA--TAGAT--A--TC--------G-GTA----TATTG---AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----CAa
gi|22                         :                         tggtAG--T-TT-TC--AAA----TG-T-----T--C---ATG-T--T---TT-A--T---GACT----TATATAT---AT----AT--C-----TT------AAATT--GAA--G-T---T--ATGTT-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--CAT----T-------AT-C--T-----TTG----G--TC----------T-------T--A--TG--------G-ATA----CATTG---AT-C-GGT--TTAA----Gcgtccgtttttttaaccaaa
gi|8                          :            gaggaggttggctaggcAG--T-TT-GT--AGAT---T--T-----T--C---AGG-C------T--A--T---GCAT----T---T-G---AT----AT--T-----TT------AAAAT--GAA--A-T---T--GTA-T-T-TT--T---CT-A-----AG-A---A-G-T--C-T----T-------GT-T--TT-C-ATTGTACAG--TC-------C--TA--TGGAG--T--TG--------A-ATA----TGCTG---AC-C-AAT--TTAA----GTCGTAAA-----CATtgattttaacatgt
gi|38                         :                     gacatggcAG--A-TT-TT--AA-----T--T-----T--T---A-------------A--T---GAAT----T---C-T---AT----AG--TAAACGTT------AAGTT--AAA--AATG--T--ATG---T-CT--T---TG-G-----CG-A---A---C--TAT----T-------AT-T--TG-T-A--G--CAC--TC-------T--TA---------A---G--------G-ATA----CAATG---AA-C-GAT--TTTA----GTCACAAA-----CAgttcatttttaaaaat
gi|35                         :                          ttcAG--T-TT-TC--AGAA---T--T-----T--T---AAA-A--C---T--T--C---GGAT----T---T-A---AT----GT--C-----TT------AAACT--GAA--G-T---T--GTGTT-T-CT--T---TT-A-----A-------------CA--------------------G-T-AT---------------------TA--TGGAT--T--TC--------G-GTA----CAATG---AA-T-GTT--TAAA----GACAGAAA-----CAcgtccattat
gi|48                         :                    ttggcacgctG--T-TT-TC--AGA----T--C-----T--C---ATA-T--G---T--G--T---GAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TA------AAATT--AAA----T---T--GTATC-A-CG--T---TT-A-----AG-A---A-A-T--TAT----T-------AT-C--TT-T-GTTG--CAG--TG-------G--TA--TGGAT--A--TG--------G-ATA----CATTG---AA-C-GAT--TTAA----GCcgtcgagtttataacaa
gi|49                         :                               --T-TT-TC--AG-----A--T-----T--C---CTA-T--A---TTTA--T---GAATG---T---T-T---A-----AG--C-----TT------AAATT--GAT--G-T---T--GTAAT-T-AT--T---TT-A-----AG-A---A-A-T--CAT----C-------AT-TAATG-T-A--G--CAA--TT-------T--TG--CG--------TG--------T-ATA------------AA-C-GAT--TTAT----GCCACAAA-----CA
gi|58                         :                               --T-TT-TC--TT-----C--T-----T--C---ATG-T--T---T--A--T---GTAT----T---T-T---AT----AT--CT----TT------CAATT--TAA--G-T---T--A-ATT-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--CAT----T-------
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gi|3                          :                                  -TT-TC--AGGT---T--T-----T--C---ATG-T--T---TT-A--T---AAAT----T---T-T---AT-----C--C-----TT-------AATT--GAA--G-T---TC-ATAGTAT-TT--T---TT-A-----AG-A---A-A-C--TAC----T-------AC-T--TT-T-GTTA--CAG--TC-------T--TA--TATAT--A--TATATAGATAG-ATA----CATTG---AA-C-TAT--TTAA----GCCACtgtctatttttaaacaaaaaa
gi|30                         :                          tttgaatc-TT-CC--AGAA---T--T-----T--A---ATA-T--T---T--A--T---GAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TTATACATGTATT--GAA--G-T---T--GTATT-T-CT--T---TT-C-----AG-A---A-A-C--CTT----T-------AT-T--T--T------------------------------GAT--A--TA--------G-ATA----CATGG---CA---GAT--TTAA----GCAACAAA-----ttatatgttcgggttttttttaaa
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gi|43                         :                          tgcttaagacgtctttacaatgtcata-----T--C---ATG-A--G---T--G--T---GAAT----T---T-T---AT----AT--C-----TT------AAATA--AAA--A-T---T--GTATT-T-CT--T---TT-A-----AG-A---A-A-T--CAT----T-------AC-C--T--T-GTTG--CAG--TC-------T--TG--TTGAT--A--TG--------G-ATA----CATTG---AA-A-GAT--TTAA----ACCATAA
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gi|27                         :                                                atttttaaatctttttaacG-C--A---T--A--T---CAAT----A---T-T---AT----ATTGC-----TA------AAATT--GAT--A-T---T--GTGTA-T-AT--T---TT-A-----AA-A---A-T-C--TGT----T-------AT-T--TC-T-ATTG--CAG--CC-------T--GA--TGAAA--A--TT--------G-ATA----CATTG---CA-C-AAC--TTAA----GCCACACA-----CGTtttccgttaaacgagtaaagcatgtccatatttataccaaaaaa
gi|14                         :                                                                        ttctgattttgatgcaAT----T---T-T---AG----GT--C-----TT------AAATT--CAA--A-T---T--A--GT-T-CT--TCGTTT-A-----AG-A---A-A-C--CAT----T-------AT-T--T--T-GTTG--CAG--TCTT-----G--TACATGTAT--ACATA--------G-ATA----CATTG---AC-C-GAC--TTGA----ACCACAAA-----TAgtccatttttc
gi|7                          :                                                                          ggatactggcttgggc----T---T-T---ATGA--AT--C-----TT------AAATT--GAA--T-T---T--GTGTT-C-CC--T---TT-G-----AG-ATGCA-C-C--TAT----T--------T-T--TG-T-A--A--CAT--AC-------G--TA--TGGAT--A--TG--------G-ATA----TATTG---AA-C-GAT--TTAA----ACCA-AAA-----TATcgtccatttctaaaaaagaattttt
gi|9                          :                                                      taacaaatttattacgttatttatttgatatccttg----T---T-T---ATGA--AT--C-----TT------AAATT--GAA--T-T---T--GTGTT-C-CC--T---TT-G-----AG-ATGCA-C-C--TAT----T--------T-T--TG-T-AACA--CA----C-------G--TA--TGGAT--A--TG--------G-AGA----AATTG---AA-C-GAT--TTAA----AGCA-AAA-----CATgtctttttggtaata
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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-4591 )     :                                                TAAGGATGTT-G-C-T-A-GGA-AG-T-TTTCAGAT--T---TT------CATG-TN---T--ACGA---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-A---A---ATTG-AAGT-T----GTA-----TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CAT----T-------ATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTT
gi|1                          :                                                                                           T------CGTG-TG---T--G------AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-A---A---ATTA-TAAT-T----ATA-----TTTATTTT-AA-A-A--A-A-AAATAT----T-------ATTTT--TGT--T-G--CAG-TCA-------T----AT--AGATA--TG--------G-CTA----CATTG----AA-T-TAT--TT
gi|10                         :                                                     gttggctcggaag-GGT-AG-T-TTTCAGAT--T---TT------CATG-AC---T--ACTG---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TG-A---A---ATTG-TAGT-T----GTGT----TTTTTTTT-AA-G-A--A-A-C--CAT-------------TTTT--TGT--T-A--CAG-TCG-------T----AT--AGATA--TC--------G-GTA----TATTG----AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----CAtatcaacagttctgtccaattttttacatttatttttcgatatttttttttttaacatttttgaatattttttcta
gi|11                         :                                                                                                                                                      tT-A---A---ATTA-AAGT-T----GTG-----TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CAT----T-------ATCTA--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAATGTC-CATTTcgtccgtttttttaaccaaa
gi|12                         : atgatggatcggacattttaagatgtgtgaaaacccaataccatcagTAAATATGTT-GGC-T-A-GAA-AG-T-TT--AAAG--TGG-TT------CATG-TA---T--ATGG---AT----T-----G-TA-T----AT--C-----TT-A---C---GTTT-CATT-T----GTACAGTATTTACTTC-AA-G-A--A-A-C--TTT----A-------ATTGT--TAT--T-A--CAG-TTT-------C----GT--GATCA--TG--------A-ATA----CATTG----AACC-GCT--TTAtttcg
gi|13                         :                                                            gttatt-GGATAG-G-TTCCAGAG--T---TT------CGTG-TTGTTT--ATAA---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-A---A---ATTG-AAGT-T----TTA-----TGCCCTT--AA-G-G--A-A-C--CCT----TTGTTTTTATTTT--TAT--T-G---AGCTTT-------T----AT--AAATA--TG--------G-ATA----AATGG----AA-C-AAT--TTAA----ACCACAAA-----CATgca
gi|14                         :                                                                                                                 tt---AT----T-----T-TA-G----GT--C-----TT-A---A---ATTC-AAAT-TA---GTT-----CTTCGTTT-AA-G-A--A-A-C--CAT----T-------AT-TT--TGT--T-G--CAG-TCT-------TGTACAT--GTATACATA--------G-ATA----CATTG----AC-C-GAC--TTGA----ACCACAAA-----TAggccag
gi|15                         :                                                                                                  ggatactggcttgggcA---AT----T-----T-CA-T----AT--C-----TT-A---A---ATTG-AAGT-C----GTA-----TTTCTTTT-AGTG-A--A-A-T--TGT----T-------TTCTT--TGT--T-C--CAG-TCT-------T----AG--GG--A--TG--------G-GTA----CATTG----AC-C-GAT--TTAA----GCCACAAAATGTCCATTTcgtccatttctaaaaaagaattttt
gi|16                         :                       gagtaagtatctcaagtaaacatcgtctatcaaTT-G-C-G-A-GGG-AG-T-TTTCAGAT--T---GA------TATG-TT---T--ACGA---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-A---A---A------GT-T----GTA-----TTTATTTT-AA-C-A--A-A-C--CAT----T-------ATATT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AA--GGCTA--TG--------G-AAG----TATTG----AA-C-GAT--TTAA----ATCACAAA-----CATTTatttg
gi|17                         :                                                                 c-GAA-AG-T-TTTAAGAA--T---TC------CATG-CA---T--ACGA---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-A---A---ATTA-AAAT-T----GTA-----TTTTCTT---A-G-A--A-A-C--CAT----T-------ATCTT--TAT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--AGATA--TG--------C-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCAACAAA-----CATccaatttgttag
gi|18                         :                                                TAAGGATCTT-G-C-TGA-GTA-AG-T-TTTCAG----T---TT------CATG-TA---T--ACGA---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-G---A---ATTA-AAGT-T----ATG-----GTTCTTTT-GA-G-A--A-A-C--CAT----T-------ATCTG--TAT--T-G--CAG-TCG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTTgtccattttatgacaaa
gi|19                         :                                                TAAGGATGTT-GAC-T-A-GAA-AG-T-TTTCAAAT--T---TT------CATG-TA---T--ACAT---AT----T-----T-TA-T----AT--A-----TT-T---G---ACTA-AAGT-T----GTA-----TTTCTTTT-AA-G-G--A-A-C--CAG----T-------ATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------TA---ATAGGGGTG--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GTCAC
gi|2                          :                                             attTAAAGATTTT-G-C-C-A-AAACAG-T-TTT-AGAT--T---TT------AATA-TT---T--ACGA---AT----T-----T-AA-A----AT--G-----TT-T---A---TTTG-AAGT-T----GTA-----TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-CAAAATTGAAT-------ATCTT--TGC--T-A--CAG-TTT-------T----AT--CGATA--TT--------G-ATT----CATTG----AA-A-ATT--TTAA----GGCACTAA-----TAT
gi|20                         :                                               tTAAATATTTT-GGC-T-A-GGA-AG-T-TTT-AGAT--T---TT------CATG-GT---A--ACTA---AC----T-----T-TA-T------------------------------AACT-T----GTA-----TTGCTTTT-AA-G-A--A-A-T------------------TCTT--TGT--T-A--CA----T-------T-----T--GA--A--TG--------G-ATT----CATTAATTTAA-A-GAT--TTAA----ACCACAAA-----gtccttttttaacaagcgtta
gi|21                         :                                                ctAGGATGTT-G-C-C-AAGGA-TT-T-TTTCAAAT--T---TT------TATAATT---T--A------AT----C-----T-T--T----AT--C-----TT-A---T---ATTA-AAGT-T----GTA-----TTTCTGTC-AA-T-A--A-A-G--CAT----T-------ATGTT--TGT--T-G--CAG-TTT-------T----AA--GGATA--TT--------G-ATA----CATGT----AA-T-GAT--TTGA----AACATCAA-----CGTatatcaactatttaattaat
gi|22                         :                                                 tAGGAGGTT-GGC-T-A-GGC-AG-T-TTTCAAAT--G---TT------CATG-TT---TT-ATGA---CT----TATA--TATA-T----AT--C-----TT-A---A---ATTG-AAGT-T----ATG-----TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CAT----T-------ATCTT--TG----------G-TCT-------------------TA--TG--------G-ATA----CATTG----AT-C-GGT--TTAA----Gcca
gi|23                         :                                                                    gA-GG-T-TTTCAGAT--T---TT------CATG-TT---G--ACGA---CT----T-----T-TA-T----AA--C-----TT-A---A---ATTG-CAAT-T----ATG-----TTTCTTTT-A--------------------------------TTGATAT--T-G--TAG-TCT-------T----AC--GGATC--TG--------A-TTA----TATTG----AA-C-GAT--TCAA----GCAACAAA-----CATtgattttaacatgt
gi|24                         :                                                       gca-G-C-T-A-AGA-CT-T-TGTCAGAT--T---GC------CATG-TT---T--ATAA---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----AT-G---A---ATTG-AAAT------GTT-----TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--AAT----T-------ATTGT--TGT--T-G--CAT-TTC-------T----AT--GGAT---------------ATA----CATTA----AA-C-GAT--ATAA----GCCTCAAA-----CATgtccatgtctttctgaaaaaa
gi|25                         :                                                                       tg-T-TTTTAAAT--C---TTTTTAACCATG-TG---A--ACGC---ATCAAAT-----T-GA-T----AT--C-----TT-A---A---ATCA-CAGT-T----GTA-----TTTATTTT-AA----------C--CGT----T-------ATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--Gatccttttat
gi|26                         :                                                                          a-TTTCAGAT--T---TT------CTTG-AC---T--ACGG---AT----T-----C--A-T----AT--C-----TT-G---A---ATTG-AAGT-T----GAA-----ATTCTTTT-AA-G-A--A-A-C---AT----T-------TTTTTC-TGT--T-T--CAG-TCT-------T----AC--GGATA--TC--------G-TTC----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCAACAtttccgttaaacgagtaaagcatgtccatatttataccaaaaaa
gi|27                         :                                                                             TTCTGAT--T---TT------GATG-CAGCAT--ATCA---AT----A-----T-TA-T----ATTGC-----TA-A---A---ATTG-ATAT-T----GTG-----TATATTTT-AA-A-A--A-T-C--TGT----T-------ATTTC--TAT--T-G--CAG-CCT-------G----AT--GAAAA--TT--------G-ATA----CATTG----CA-C-AAC--TTAA----GCCACACA-----CGTtgtctatttttaaacaaaaaa
gi|28                         :                                                                           -TTTCAGAT--T---TT------CATG-AG---T--GCGG---AC----T-----T-TA-T----AT--C-----TA-A---A---ATTA-AAGT-T----GTA-----TTTCTTTT-AA-A-A--A-AAT--CAT----T-------ATCTT--TAT--T-G--CAG-TCT-------T----GT--GTATA--TG--------G-GTA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GCCACAAA-----CATgtccatttttc
gi|29                         :                                                                      -AG-T-TTTAAGAT--C---TT------TATG-AC---A--ACGG---AT----T-----T--A-TGACAAT--G-----TT-A---A---ATTG-AAGT-T----GTA-----TTTCTGTT-AT-G-A--A-A-C---------T-------ATGTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TC--------G-GTA----CATTG----AG-C-AAT--TGAA----GCCACAAA-----CATgaccttttttta
gi|3                          :                                                          ttgtctcgttGA-AT-C-TTTCAGGT--T---TT------CATG-TT---TT-ATAA---AT----T-----T-TA-T-----C--C-----TT-A---A----TTG-AAGT-TCATAGTA-----TTT--TTT-AA-G-A--A-A-C--TAC----T-------ACTTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AT--ATATA--TATATAGATAG-ATA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GCCAC
gi|30                         :                                                   tttTGTT-G-G-C-G-GGA-AG-GATTCCAGAA--T---TT------AATA-TT---T--ATGA---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-ATACATGTATTG-AAGT-T----GTA-----TTTCTTTT-CA-G-A--A-A-C--CTT----T-------ATTTT------------------------------------GATA--TA--------G-ATA----CATGG----CA---GAT--TTAA----GCAACAAA-----ttatatgttcgggttttttttaaa
gi|31                         :                                                TAAGGATGGT-G-------GAA-AA-T-----AAGT--T---TG------AGTG-TT---T--ATGA---AT----TAATTAT-TA-TTA--AT--C-----TT-C---A---ACTG-AAGG-T----GTA-----TTTCTTTT-AA-T-A--A-A-T--CA--------------------TGG--C-G--CAA-TTT-------T----AT--TGAAA--TG--------G-ATG----CATTG----AT-C-GAT--TTTA----GTCACgtacatgtcc
gi|32                         :                                           atatcTAAGGATGCT-G-GGT-C-GAA-AG-T-TTTCAGAT--T---TT------CACG-CG---C--GCGA---AT----T-----C-TA-T----AT--C-----TT-A---A---ACT-------------TA-------TCTT-----------A-A-T--CAT----T-------A--------------------TCT-------T----AT--TGATA--TT--------A-ATA----CATTG----AA-C-AAT--ATAA----GCCACAAA-----TATT
gi|33                         :                                                                                 tAT--A---TT------CATG-TT---T--ACAG---AT----T-----G-TA-T----AT--C-----TT-A---A---ATTA-AAGTCT----TTA-----TTTATTTT-AA-G----A-A-C--CAT----T-------ATCTG--TGT--T-A--CAG-TTT-------T----AT--GTATA--TG--------A-TTATTTGCATTG----AA-C-GAC--TTAA----aacattttttttaaa
gi|34                         :                              tgcttaagacgtctttacaatgtcTGTT-GGC-T-A-GGA-GA-T-CTTCAGATGAC---TT------CA--------------A---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-A---A---ATGG-GAGT-T----GTA-----TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CAC----T-------ATCTT--TTT--A-T--CAC-TCT-------T----AT--GGATT--TG--------A-ATA----CATCC----AA-C-GAT--TTCA----TCTACAAA-----TA
gi|35                         :                                                                      -AG-T-TTTCAGAA--T---TT------TAAA-AC---T--TCGG---AT----T-----T-AA-T----GT--C-----TT-A---A---ACTG-AAGT-T----GTG-----TTTCTTTT-AA---------------------------------------------CAG-TAT-------T----AT--GGATT--TC--------G-GTA----CAATG----AA-T-GTT--TAAA----GACAGAAA-----CAag
gi|36                         :                                             ttggcacgctGTT-GGC-T-T-AGA-AG-T-TATCAGAT--T---TT------AATA-TT---T--ACAA---AT----T-----G-TA-T----AT--C-----TT-A---A---ATTG-AAAT-T----GTA-----TATCTTTT-AA-G-A--A-A-T--CAT----T-------ATCTT--TTT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GTATA--TG--------G-AT------AGTG----AA-C-GAG--TTAA----GCTTCAAA-----cgtcgagtttataacaa
gi|37                         :                                                              -T-A-GAA-AG-T-TTCCAGAT--G---TT------CATG-TT---T--ATGA---AT----T-----T-TA-T----AT--T-----TTCA---A---ATTG-AAGT-T----TTA-----TTT-TTTT-AG-G-G--A-G-T--AAT----T-------ATCTT--TGT--T-A--AAG-TCT-------T----AT--G-----------------------------A----AA-C-AAG--TTAA----ACCACAAA-----CAT
gi|38                         :                                                                           atTTCAGAT--T---TT------AATT-TT---A--ATGA---AT----T-----C-TA-T----AG--TAAACGTT-A---A---GTTA-AAAA-T----GTA-----TGTCTTTG-GC-G-A--A---C--TAT----T-------AT--T--TGT--A-G--CAC-TCT-------T----A-------A---G--------G-ATA----CAATG----AA-C-GAT--TTTA----GTCACAAA-----CAagtcattattta
gi|39                         :                                                                  -GGA-AG-T-TTCCAGAT--TATTTT------CATG-TT---G--ATGA---AT----T-----T-CA-T----AT--A-----TT-A---A---GGTG-TGGT-T----GTT-----TTTGTTTT-TA-A-A--A-A-----------T-------ATTTT--T-T--T-A--CAG-TCC-------T----AT--GG-TG--T---------G-ATA----CATTG----AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----AATcgtccattat
gi|4                          :                                                     ATGTT-GGC-T-A-GGA-AG-T-CACCGGAT--G---TT------TATG-TT---T--ACGA---AT----T-----C-TA-T----AA--C-----TT-G---C---TTTG-CAGT-T----GTA-----TGTCTTTT-AT-G-A--A-A-C--CTT----T-------ATCTT--TGC--T-G--CAG-TTT-------T----AT--GGGTA--TA--------G-ATT----CATTT----GA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CAT
gi|40                         :                                                              aaat-GGA-GG-A-TTCTATGT--T---TT------CAAG-TT---T--ATGA---AT----T-----G-TA-T----AT--A-----TT-A---A---ATTG-AAGT-T----GTA-----TTTCTGTT-AA-G-A--A-A-C--CAT----T-------GTCTT--TGT--T-G--CTG-TCT-------T----GT--GACTA--TG------------A----CAT-------------T--TTAA----GCGACACA-----CATgtcaacatttggca
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gi|42                         :                                                    GACGCT-G-C-TTA-GGA-AG-T-TCCAAGGT--T---C-------CATG-T-------------------------------T----A------------A---A---ATTC-AAGT-T----GTA-----TTTATTT--AA-G-A--A-C-C--CAT----T-------ACTTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------G----GT--GAATA--TG--------G-ATA----CATTT----TA-C-ACT--GTTA----GCCACAGA-----CAatctatatattttagactttttaaacttaaacataca
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gi|5                          :                                                        TT-G-CCT-A-GCA-AC-T-TTACAGAG--T---TG------TATG-CT---T--ACGA---AT----T-----T-TG-T----AT--C-----TT-A---A---AATA-AAGT-T----GTA-----TTTGTTTT-TA-G-A--A-C-C--TAT----A-------ATCTT--TGT--T-G--TTT-GCT-------C----AT--GGATA--AG--------ATATA----CATTG----AA-C-AA
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gi|55                         :                                                         ata-C-T-T-GGA-AG-T-TTTCAGAT--T---TT------GATG-TT---T--ACGA---AT----T---------------------------------------------------GTA-----TTTCTTC--AA-G-A--A-A-C--CAG----T-------ATCTG--TGT--T-G--CAA-TCT-------T----AT--TGATG--GG--------A-AAA----CATTG----AA-C-GAT--T
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gi|57                         :                                                              gt-A-AGA-AG-T-TTTCAGAT--T---T-------CATG-TT---G--ATAA---AT----T-----T-TA-T----AT--C-----TT-G---A---ATT-------T----GTA-----TTTTTTTT-AA-G-A--A-A-C--C---------------TTTT--TGT--T-G----------------T----AT--G------CG--------A-ATA----CATTA----AA-C-aattgaacattttaag
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gi|62                         :                                                                                                                                                                                 tg-----TTTTTTTT-AAAG-A--A-A-G--CAT----T-------ATTTT--TTT--TTG--CGG-TCT-------A----AT--GGTT----------------T-----CATTG----G------T--ATAA-----CCACAAA-----CATgtccatttctttg
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gi|65                         :                                                                                                                                                                                               aggg-G-A--ATA-T--CGT----T-------ATCTT--TGT--T-G--CAG-TC-------------------GTA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATt
gi|66                         :                                                                             TCCAGGT--T---TT------CATG-TT---T--ATAA---AT----T-----T-TA-T----AT--A-----TT-A---A---G-TA-AACT-T----GTG-----TATCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CAgtccattttttt
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gi|9                          :                                                gacatATGTC-GGT-T-A-GGA-AG-T-TTG-AGAT--T---GT------CATG-TT---A--AC-----AT----TCTTGTT-TA-TGA--AT--C-----TT-A---A---ATTG-AATT-T----GTG-----TTCCCTTT-GA-G-ATGC-A-C--C------T-------ATTTT--TGT--A-A--CAC-ACG-------T----AT--GGATA--TG--------G-AGA----AATTG----AA-C-GAT--TTAA----AGCA-AAA-----CATgttcatttttaaaaat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4591 )     :                                                TAAGGATGTTGGCT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTT
gi|1                          :                                                       GTTGGCT-CGGAAG-T-----------------------CGTG-TG---T-G------AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-TAAT-T-----ATA-TTTATTTT-AA-A-A--A-A-AAATA-------T----TATTTT--TGT--T-G--CAG-TCA-------T----AT--AGATA--TG--------G-CTA----CATTG----AA-T-TAT--TT
gi|10                         :                                                                GGTAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-AC---T-ACTG---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TG-A-A-----ATTG-TAGT-T-----GTGTTTTTTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T------TTTT--TGT--T-A--CAG-TCG-------T----AT--AGATA--TC--------G-GTA----TATTG----AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----CAtatcaacagttctgtccaattttttacatttatttttcgatatttttttttttaacatttttgaatattttttcta
gi|11                         :                                                                                                                                                 tT-A-A-----ATTA-AAGT-T-----GTG-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTA--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAATGTC-CATTTcgtccgtttttttaaccaaa
gi|12                         : atgatggatcggacattttaagatgtgtgaaaacccaataccatcagTAAATATGTTGGCT-AGAAAG-TTT--AA-AG--TGG-TT------CATG-TA---T-ATGG---AT----T-----G-T-AT----AT--C-----TT-A-C-----GTTT-CATT-TGTACAGTA-TTTACTTC-AA-G-A--A-A-C--TT-------T----AATTGT--TAT--T-A--CAG-TTT-------C----GT--GATCA--TG--------A-ATA----CATTG----AACC-GCT--TTAtttcg
gi|13                         :                                                  gttattTTGGAT-AGG-----TTCCAG-AG--T---TT------CGTG-TTGTTT-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----TTA--TGCCCTT-AA-G-G--A-A-C--CCTTTGTTTT----TATTTT--TAT--T-G---AGCTTT-------T----AT--AAATA--TG--------G-ATA----AATGG----AA-C-AAT--TTAA----ACCACAAA-----CATgca
gi|14                         :                                                                                                              ---AT----T-----T-T-AG----GT--C-----TT-A-A-----ATTC-AAAT-TA----GTT-CTTCGTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TAT-TT--TGT--T-G--CAG-TCT-------TGTACAT--GTATACATA--------G-ATA----CATTG----AC-C-GAC--TTGA----ACCACAAA-----TAggccag
gi|15                         :                                                                                             ggatactggcttgggcA---AT----T-----T-C-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-C-----GTA-TTTCTTTT-AGTG-A--A-A-T--TG-------T----TTTCTT--TGT--T-C--CAG-TCT-------T----AG--GG--A--TG--------G-GTA----CATTG----AC-C-GAT--TTAA----GCCACAAAATGTCCATTTcgtccatttctaaaaaagaattttt
gi|16                         :                          gagtaagtatctcaagtaaacatcgtctatcaaGCG-AGGGAG-TTTTCAG-AT--T---GA------TATG-TT---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----A------GT-T-----GTA-TTTATTTT-AA-C-A--A-A-C--CA-------T----TATATT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AA--GGCTA--TG--------G-AAG----TATTG----AA-C-GAT--TTAA----ATCACAAA-----CATTTatttg
gi|17                         :                                                             cttGAAAG-TTTTAAG-AA--T---TC------CATG-CA---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-AAAT-T-----GTA-TTTTCTT---A-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTT--TAT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--AGATA--TG--------C-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCAACAAA-----CATccaatttgttag
gi|18                         :                                                TAAGGATCTTG-CTGAGTAAG-TTTTCAG-----T---TT------CATG-TA---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----ATTA-AAGT-T-----ATG-GTTCTTTT-GA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTG--TAT--T-G--CAG-TCG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTTgtccattttatgacaaa
gi|19                         :                                                TAAGGATGTTGACT-AGAAAG-TTTTCAA-AT--T---TT------CATG-TA---T-ACAT---AT----T-----T-T-AT----AT--A-----TT-T-G-----ACTA-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-G--A-A-C--CA-------G----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------TA---ATAGGGGTG--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GTCAC
gi|2                          :                                             attTAAAGATTTTGCCA-AAACAG-TTTT-AG-AT--T---TT------AATA-TT---T-ACGA---AT----T-----T-A-AA----AT--G-----TT-T-A-----TTTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-CAAAA-------TTGAATATCTT--TGC--T-A--CAG-TTT-------T----AT--CGATA--TT--------G-ATT----CATTG----AA-A-ATT--TTAA----GGCACTAA-----TAT
gi|20                         :                                               tTAAATATTTTGGCT-AGGAAG-TTTT-AG-AT--T---TT------CATG-GT---A-ACTA---AC----T-----T-T-AT------------------------------AACT-T-----GTA-TTGCTTTT-AA-G-A--A-A-T------------------TCTT--TGT--T-A--CA----T-------T-----T--GA--A--TG--------G-ATT----CATTAATTTAA-A-GAT--TTAA----ACCACAAA-----gtccttttttaacaagcgtta
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gi|23                         :                                                                 gAGG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---G-ACGA---CT----T-----T-T-AT----AA--C-----TT-A-A-----ATTG-CAAT-T-----ATG-TTTCTTTT-A--------------------------------TTGATAT--T-G--TAG-TCT-------T----AC--GGATC--TG--------A-TTA----TATTG----AA-C-GAT--TCAA----GCAACAAA-----CATtgattttaacatgt
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gi|25                         :                                                                     -TTTTTAA-AT--C---TTTTTAACCATG-TG---A-ACGC---ATCAAAT-----T-G-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATCA-CAGT-T-----GTA-TTTATTTT-AA----------C--CG-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--Gatccttttat
gi|26                         :                                                                      aTTTCAG-AT--T---TT------CTTG-AC---T-ACGG---AT----T-----C---AT----AT--C-----TT-G-A-----ATTG-AAGT-T-----GAA-ATTCTTTT-AA-G-A--A-A-C---A-------T----TTTTTTC-TGT--T-T--CAG-TCT-------T----AC--GGATA--TC--------G-TTC----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCAACAtttccgttaaacgagtaaagcatgtccatatttataccaaaaaa
gi|27                         :                                                                        TTCTG-AT--T---TT------GATG-CAGCAT-ATCA---AT----A-----T-T-AT----ATTGC-----TA-A-A-----ATTG-ATAT-T-----GTG-TATATTTT-AA-A-A--A-T-C--TG-------T----TATTTC--TAT--T-G--CAG-CCT-------G----AT--GAAAA--TT--------G-ATA----CATTG----CA-C-AAC--TTAA----GCCACACA-----CGTtgtctatttttaaacaaaaaa
gi|28                         :                                                                       TTTCAG-AT--T---TT------CATG-AG---T-GCGG---AC----T-----T-T-AT----AT--C-----TA-A-A-----ATTA-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-A-A--A-AAT--CA-------T----TATCTT--TAT--T-G--CAG-TCT-------T----GT--GTATA--TG--------G-GTA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GCCACAAA-----CATgtccatttttc
gi|29                         :                                                                   AG-TTTTAAG-AT--C---TT------TATG-AC---A-ACGG---AT----T-----T---ATGACAAT--G-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTGTT-AT-G-A--A-A-C----------------TATGTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TC--------G-GTA----CATTG----AG-C-AAT--TGAA----GCCACAAA-----CATgaccttttttta
gi|3                          :                                                       ttgtctcgttGAAT-CTTTCAG-GT--T---TT------CATG-TT---TTATAA---AT----T-----T-T-AT-----C--C-----TT-A-A------TTG-AAGT-TCATA-GTA-TTT--TTT-AA-G-A--A-A-C--TA-------C----TACTTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AT--ATATA--TATATAGATAG-ATA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GCCAC
gi|30                         :                                                   tttTGTTGGCG-GGAAGG-ATTCCAG-AA--T---TT------AATA-TT---T-ATGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-ATACATGTATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-CA-G-A--A-A-C--CT-------T----TATTTT------------------------------------GATA--TA--------G-ATA----CATGG----CA---GAT--TTAA----GCAACAAA-----ttatatgttcgggttttttttaaa
gi|31                         :                                                TAAGGATGGTGGAA-AATAAG-TTT---G-A----------------GTG-TT---T-ATGA---AT----TAATTAT-T-ATTA--AT--C-----TT-C-A-----ACTG-AAGG-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-T-A--A-A-T--CA--------------------TGG--C-G--CAA-TTT-------T----AT--TGAAA--TG--------G-ATG----CATTG----AT-C-GAT--TTTA----GTCACgtacatgtcc
gi|32                         :                                           atatcTAAGGATGCTGGGT-CGAAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CACG-CG---C-GCGA---AT----T-----C-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ACT--------------TA---TCTT-----------A-A-T--CA-------T----TA--------------------TCT-------T----AT--TGATA--TT--------A-ATA----CATTG----AA-C-AAT--ATAA----GCCACAAA-----TATT
gi|33                         :                                                                            t-AT--A---TT------CATG-TT---T-ACAG---AT----T-----G-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-AAGTCT-----TTA-TTTATTTT-AA-G----A-A-C--CA-------T----TATCTG--TGT--T-A--CAG-TTT-------T----AT--GTATA--TG--------A-TTATTTGCATTG----AA-C-GAC--TTAA----aacattttttttaaa
gi|34                         :                              tgcttaagacgtctttacaatgtcTGTTGGCT-AGGAGA-TCTTCAG-ATGAC---TT------CA-------------A---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATGG-GAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------C----TATCTT--TTT--A-T--CAC-TCT-------T----AT--GGATT--TG--------A-ATA----CATCC----AA-C-GAT--TTCA----TCTACAAA-----TA
gi|35                         :                                                                   AG-TTTTCAGAAT--T---TT------AAAA-CT---T--CGG---AT----T-----T-A-AT----GT--C-----TT-A-A-----ACTG-AAGT-T-----GTG-TTTCTTTT-AA---------------------------------------------CAG-TAT-------T----AT--GGATT--TC--------G-GTA----CAATG----AA-T-GTT--TAAA----GACAGAAA-----CAag
gi|36                         :                                             ttggcacgctGTTGGCT-TAGAAG-TTATCAG-AT--T---TT------AATA-TT---T-ACAA---AT----T-----G-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAAT-T-----GTA-TATCTTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----TATCTT--TTT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GTATA--TG--------G-AT------AGTG----AA-C-GAG--TTAA----GCTTCAAA-----cgtcgagtttataacaa
gi|37                         :                                                             T-AGAAAG-TTTCCAG-AT--G---TT------CATG-TT---T-ATGA---AT----T-----T-T-AT----AT--T-----TTCA-A-----ATTG-AAGT-T-----TTA-TTT-TTTT-AG-G-G--A-G-T--AA-------T----TATCTT--TGT--T-A--AAG-TCT-------T----AT--G-----------------------------A----AA-C-AAG--TTAA----ACCACAAA-----CAT
gi|38                         :                                                                      atTTCAG-AT--T---TT------AATT-TT---A-ATGA---AT----T-----C-T-AT----AG--TAAACGTT-A-A-----GTTA-AAAA-T-----GTA-TGTCTTTG-GC-G-A--A---C--TA-------T----TAT--T--TGT--A-G--CAC-TCT-------T----A-------A---G--------G-ATA----CAATG----AA-C-GAT--TTTA----GTCACAAA-----CAagtcattattta
gi|39                         :                                                                GGAAG-TTTCCAG-AT--TATTTT------CATG-TT---G-ATGA---AT----T-----T-C-AT----AT--A-----TT-A-A-----GGTG-TGGT-T-----GTT-TTTGTTTT-TA-A-A--A-A------------------TATTTT--T-T--T-A--CAG-TCC-------T----AT--GG-TG--T---------G-ATA----CATTG----AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----AATcgtccattat
gi|4                          :                                                     ATGTTGGCT-AGGAAG-TCACCGG-AT--G---TT------TATG-TT---T-ACGA---AT----T-----C-T-AT----AA--C-----TT-G-C-----TTTG-CAGT-T-----GTA-TGTCTTTT-AT-G-A--A-A-C--CT-------T----TATCTT--TGC--T-G--CAG-TTT-------T----AT--GGGTA--TA--------G-ATT----CATTT----GA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CAT
gi|40                         :                                                            aaatGGAGG-ATTCTAT-GT--T---TT------CAAG-TT---T-ATGA---AT----T-----G-T-AT----AT--A-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTGTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TGTCTT--TGT--T-G--CTG-TCT-------T----GT--GACTA--TG------------A----CAT-------------T--TTAA----GCGACACA-----CATgtcaacatttggca
gi|41                         :                                                  tGGATGTTGGTT-AGGAAG-TTTTCAT-AT--T---TT------CATG-TTGC-T-TTTA---AT----G-----T-TAATGA--AT--A-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTTCTTT-AA-G-A--A-G-C--gtca
gi|42                         :                                                    GACGCTGCTT-AGGAAG-TTCCAAG-GT--T---C-------CATG-TT----------------------------------A------------A-A-----ATTC-AAGT-T-----GTA-TTTATTT--AA-G-A--A-C-C--CA-------T----TACTTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------G----GT--GAATA--TG--------G-ATA----CATTT----TA-C-ACT--GTTA----GCCACAGA-----CAatctatatattttagactttttaaacttaaacataca
gi|43                         :                                                                                       T------CATG-AG---T-GTGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATAA-AAAT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----TA-CCT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----GT--TGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-A-GAT--TTAA----ACCATAAg
gi|44                         :                                                            aT-AGAAAG-ATTCCAG-AT--T---TC------CGAA-TT---A-ATGC---AT----T-----T-G-GT----AT--C-----TT-A-A-----AGAG-AAGT-T-----ATA-TTTCTTTT-TA-G---------------------------------TG---------AG-TCT-------T----AT--GATTA--TG--------G-ATA----CA-TG----AA-T-AAT--TTAA----GCCATAGA-----CATttatgtccattta
gi|45                         :                                                  AAGATGTTGGCT-CGTTAC-TTTTCAG-AC--T---T------------------------------------------AT----AT--C-----TT-A-G-----AATG-AAAT-T-----GTT-GTTGTTTT----------------------------------TT--TA---------AG-TCT-------T----TC--AGATA--TC--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----CCCACAAA-----CATTTgtccatt
gi|46                         :                                                                       TTCCAG-TT--T---TC------TGTA-TT---G-ATGA---AT------------------------C-----TT-A-A-----ATTG-AAGA-T-----ACA-TTTCCTTT-AG-G-A--A-A-C--T--------T----TTTTTT--TTT--T-A----------------T----AT--AAATA--TG--------T-ATA----CATGG----AC-C-AAT--TTCA----AACACAAT-----CATccattttttaa
gi|47                         :                                                             a-AGGAAGGTTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---T-ACGA---CT----T-----A-T-AG----AA--C-----TA-A-A-----ATTT-CAAT-T-----ATG-TTTATTTC-AA-G-A--A-A-C--TA-------T----TATACT--GAT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--GCATC--TG--------A-A-G----CAT---------C-GAT--TTAA----gtccttttt
gi|48                         :                                                                    G-TTTTCAG-AT--C---T-------CATA-TG---T-GTGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TA-A-A-----ATTA-AA-T-T-----GTA-TCACGTTT-AA-G-A--A-A-T--TA-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TGG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GC
gi|49                         :                                                                     -TTTTCAG-AT--T---CC------TATA-TT---T-ATGA---ATG---T-----T-T-A-----AG--C-----TT-A-A-----ATTG-ATGT-T-----GTA-ATTATTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----CATTAA--TGT--A-G--CAA-TTT-------T----GC--G------TG--------T-ATA-------------AA-C-GAT--TTAT----GCCACAAA-----CA
gi|5                          :                                                        TTGCCT-AGCAAC-TTTACAG-AG--T---TG------TATG-CT---T-ACGA---AT----T-----T-T-GT----AT--C-----TT-A-A-----AATA-AAGT-T-----GTA-TTTGTTTT-TA-G-A--A-C-C--TA-------T----AATCTT--TGT--T-G--TTT-GCT-------C----AT--GGATA--AG--------ATATA----CATTG----AA-C-AA
gi|50                         :                                                           GCT-ACAAAG-TGGCCAG-AT--G---TT------CATG-GT---T-ACAA---AT----T-----T-G-AT--------C-----TT-A-TT----ATTG-AATG-T-----GTT-TTTCTTTTGAA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATTTT--T-T--T----CAG-ATT-------T----CT--GAATA--CA--------G-Aacattttcatttaaatgcatataacaaattcaaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                              cgtatCTTTT-AT-G-A--A-A-C--CT-------T----TATCTT--TGC--T-G--CAG-TTT-------T----AT--GGGTA--TA--------G-ATT----CATTT----GA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CAT
gi|52                         :                                                         TGGCT-GGAAAG-TTTCCGG-CT--T---TTT-----CACG-G------ACGA---AT--------------AT----AT--C-----TT-A-A-----ATAG-AAAT-T-----GCA-TTTCAT----A-GCA--A-A-C--CA-------T----TAT-TG--AGT--T-G--AAG-TCT-------T----Agtcaacatttggcataattttcttaccaaga
gi|53                         :                                                TAAAGATGTTTACT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CAAG-TC---T-GTG---------------------T----AT--C-----TT-A---------TG-AAGA---------A-TTT---------------------------------------TT--TGT--T-G--CAG-TTT-------T----AT--AGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-caactgcgtac
gi|54                         :                                          acatttTATGGATATAGCCA-AGGAAG-TTTCCAG-AA--T---GT------CACG-TG---A-ATGA---AA----T-----T-C-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTTCTTT-CG-G-A--A-A-A--CA-------T----CA--TT--TGT--T-
gi|55                         :                                                         ataCT-TGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------GATG-TT---T-ACGA---AT----T----------------------------------------------------GTA-TTTCTTC--AA-G-A--A-A-C--CA-------G----TATCTG--TGT--T-G--CAA-TCT-------T----AT--TGATG--GG--------A-AAA----CATTG----AA-C-GAT--T
gi|56                         :                                                      aGTTTGCT-AGGAAG-TTTCCAG-AT--G---GT------AATA-TT---T-ATGA---AT----T-----T-T-AT----AC-------------A-----ATAA-GAGA-T-----G-A-TTT-TTCT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TAATTT--T
gi|57                         :                                                          GGTC-AAGAAG-TTTTCAG-AT--T---T-------CATG-TT---G-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----AT------T-T-----GTA-TTTTTTTT-AA-G-A--A-A-C--C---------------TTTT--TGT--T-G----------------T----AT--G------CG--------A-ATA----CATTA----AA-C-aattgaacattttaag
gi|58                         :                                                    GATTTTGACT-AGGAAC-TTTTTTT-CT--TC--TT------CATG-TT---T-ATGT---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TTTC-A-----ATTT-AAGT-T-----A-A-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TTTATT--CGT--a
gi|59                         :                                                                                                                                                                                   atTTT-AA-G-A--A-A-C--TA-------T----CA--TT--TGTAAT-A--CAG-TCT-------C----GT--GGACA--TG--------G-CTA----CATTG----AG-C-GAT--TTAACTAGACCACAAA-----CAT
gi|6                          :                                                                 GAAA-TGTTCAG-AT--T---TT------CATA-AT---T-GCAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--AA-------T----TATCTT--TGC--T-G--GTG-CCTTGTGGA-T----GT--GGATA--TG--------G-ATG----CATTGTAT-AA-T-GATGCTTAA---------AAA-----CATgtccattctttagaa
gi|60                         :                                                     ATGTTGGTT-AGGAAG-TTTT--------------------CATG-TT---T-ACGT---AT----T-----C-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-GAGT-T-----ATA-GTGATTTA-AT-G-A--A-A-C--CA-------T------TCTT--Tatttcatccaattttatccaa
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                         a-------T----TATATT--TGT--T-A--CAA-TCTCTATATAT----AT--ATATG--TG--------G-ACA----CATTG----AG-TGGAT--TT-A----TCCACAGA-----CATt
gi|62                         :                                                                                                                                                                             tg-TTTTTTTT-AAAG-A--A-A-G--CA-------T----TATTTT--TTT--TTG--CGG-TCT-------A----AT--GGTT----------------T-----CATTG----G------T--ATAA-----CCACAAA-----CATgtccatttctttg
gi|64                         :                                                          GGGT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--A---TT------CATG-TT---T-GCAA---TC----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTGCGAAT-T------TA-T---TTTT-AA-G-A--A-A-C--gtccatctttta
gi|65                         :                                                                                                                                                                                          a-G-A--ATA-T--CG-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TC-------------------GTA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATt
gi|66                         :                                                                        TCCAG-GT--T---TT------CATG-TT---T-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--A-----TT-A-A-----G-TA-AACT-T-----GTG-TATCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------gtccattttttt
gi|67                         :                                                TAAAGATGTTGACT-AGAAAG-ATTTCAA-AT--T---TT------CATG-TT---C-ATGATTTTT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTgtt
gi|68                         :                                                     tTGTTGGCT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TG------CATG-TG---T-ATGG---AG----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----ATTG-AAGT-T-----GT
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                                                    -G--CAG-TCT-------T----CT--GTATA--TG--------G-ATA----CGTTG----AC-C-GAT--TTAG----TTCACAAA-----CGT
gi|7                          :                                                                            G-AT--A---TC------CTTG-TT---T-ATGA---AT------------------------C-----TT-A-A-----ATTG-AATT-T-----GTG-TTCCCTTT-GA-G-ATGC-A-C--C-------------TATTTT--TGT--A-A--CAT-ACG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----TATTG----AA-C-GAT--TTAA----ACCA-AAA-----TATgtccatttttt
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                      taacaaatttattacgttatttatttGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAgtctttttggtaata
gi|8                          :                                                                GGCAG-TTTGTAG-AT--T---TT------CAGG-CT-----ATGC---AT----T-----T-G-AT----AT--T-----TT-A-A-----AATG-AAAT-T-----GTA-TTT-TTCT-AA-G-A--A-G-T--C--------T----TGTTTT--CAT--T-GTACAG-TCC-------T----AT--GGAGT--TG--------A-ATA----TGCTG----AC-C-AAT--TTAA----GTCGTAAA-----CAT
gi|9                          :                                                gacatATGTCGGTT-AGGAAG-TTTG-AG-AT--T---GT------CATG-TT---A-AC-----AT----TCTTGTT-T-ATGA--AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AATT-T-----GTG-TTCCCTTT-GA-G-ATGC-A-C--C-------------TATTTT--TGT--A-A--CAC-ACG-------T----AT--GGATA--TG--------G-AGA----AATTG----AA-C-GAT--TTAA----AGCA-AAA-----CATgttcatttttaaaaat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|63 ): ATGGTTCATTCCTGCAGTTTCTGTATGAAGATATATGTTTGGTATACAAACTCAAGTTATATTCGTCCCCGCTC
Unaligned ( gi|70 ): TATGTGTCCGAGTGCAGTTGCAGGCGAGGGTAGATAAGTTGAGCTACCTCCGTCG
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Reference ( family-4591 )     :                                                TAAGGATGTTGGCT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTT
gi|1                          :                                                       GTTGGCT-CGGAAG-T-----------------------CGTG-TG---T-G------AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-TAAT-T-----ATA-TTTATTTT-AA-A-A--A-A-AAATA-------T----TATTTT--TGT--T-G--CAG-TCA-------T----AT--AGATA--TG--------G-CTA----CATTG----AA-T-TAT--TT
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gi|11                         :                                                                                                                                                 tT-A-A-----ATTA-AAGT-T-----GTG-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTA--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAATGTC-CATTTcgtccgtttttttaaccaaa
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gi|13                         :                                                  gttattTTGGAT-AGG-----TTCCAG-AG--T---TT------CGTG-TTGTTT-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----TTA--TGCCCTT-AA-G-G--A-A-C--CCTTTGTTTT----TATTTT--TAT--T-G---AGCTTT-------T----AT--AAATA--TG--------G-ATA----AATGG----AA-C-AAT--TTAA----ACCACAAA-----CATgca
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gi|15                         :                                                                                             ggatactggcttgggcA---AT----T-----T-C-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-C-----GTA-TTTCTTTT-AGTG-A--A-A-T--TG-------T----TTTCTT--TGT--T-C--CAG-TCT-------T----AG--GG--A--TG--------G-GTA----CATTG----AC-C-GAT--TTAA----GCCACAAAATGTCCATTTcgtccatttctaaaaaagaattttt
gi|16                         :                          gagtaagtatctcaagtaaacatcgtctatcaaGCG-AGGGAG-TTTTCAG-AT--T---GA------TATG-TT---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----A------GT-T-----GTA-TTTATTTT-AA-C-A--A-A-C--CA-------T----TATATT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AA--GGCTA--TG--------G-AAG----TATTG----AA-C-GAT--TTAA----ATCACAAA-----CATTTatttg
gi|17                         :                                                             cttGAAAG-TTTTAAG-AA--T---TC------CATG-CA---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-AAAT-T-----GTA-TTTTCTT---A-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTT--TAT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--AGATA--TG--------C-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCAACAAA-----CATccaatttgttag
gi|18                         :                                                TAAGGATCTTG-CTGAGTAAG-TTTTCAG-----T---TT------CATG-TA---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----ATTA-AAGT-T-----ATG-GTTCTTTT-GA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTG--TAT--T-G--CAG-TCG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTTgtccattttatgacaaa
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gi|27                         :                                                                        TTCTG-AT--T---TT------GATG-CAGCAT-ATCA---AT----A-----T-T-AT----ATTGC-----TA-A-A-----ATTG-ATAT-T-----GTG-TATATTTT-AA-A-A--A-T-C--TG-------T----TATTTC--TAT--T-G--CAG-CCT-------G----AT--GAAAA--TT--------G-ATA----CATTG----CA-C-AAC--TTAA----GCCACACA-----CGTtgtctatttttaaacaaaaaa
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gi|32                         :                                           atatcTAAGGATGCTGGGT-CGAAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CACG-CG---C-GCGA---AT----T-----C-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ACT--------------TA---TCTT-----------A-A-T--CA-------T----TA--------------------TCT-------T----AT--TGATA--TT--------A-ATA----CATTG----AA-C-AAT--ATAA----GCCACAAA-----TATT
gi|33                         :                                                                            t-AT--A---TT------CATG-TT---T-ACAG---AT----T-----G-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-AAGTCT-----TTA-TTTATTTT-AA-G----A-A-C--CA-------T----TATCTG--TGT--T-A--CAG-TTT-------T----AT--GTATA--TG--------A-TTATTTGCATTG----AA-C-GAC--TTAA----aacattttttttaaa
gi|34                         :                              tgcttaagacgtctttacaatgtcTGTTGGCT-AGGAGA-TCTTCAG-ATGAC---TT------CA-------------A---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATGG-GAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------C----TATCTT--TTT--A-T--CAC-TCT-------T----AT--GGATT--TG--------A-ATA----CATCC----AA-C-GAT--TTCA----TCTACAAA-----TA
gi|35                         :                                                                   AG-TTTTCAGAAT--T---TT------AAAA-CT---T--CGG---AT----T-----T-A-AT----GT--C-----TT-A-A-----ACTG-AAGT-T-----GTG-TTTCTTTT-AA---------------------------------------------CAG-TAT-------T----AT--GGATT--TC--------G-GTA----CAATG----AA-T-GTT--TAAA----GACAGAAA-----CAag
gi|36                         :                                             ttggcacgctGTTGGCT-TAGAAG-TTATCAG-AT--T---TT------AATA-TT---T-ACAA---AT----T-----G-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAAT-T-----GTA-TATCTTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----TATCTT--TTT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GTATA--TG--------G-AT------AGTG----AA-C-GAG--TTAA----GCTTCAAA-----cgtcgagtttataacaa
gi|37                         :                                                             T-AGAAAG-TTTCCAG-AT--G---TT------CATG-TT---T-ATGA---AT----T-----T-T-AT----AT--T-----TTCA-A-----ATTG-AAGT-T-----TTA-TTT-TTTT-AG-G-G--A-G-T--AA-------T----TATCTT--TGT--T-A--AAG-TCT-------T----AT--G-----------------------------A----AA-C-AAG--TTAA----ACCACAAA-----CAT
gi|38                         :                                                                      atTTCAG-AT--T---TT------AATT-TT---A-ATGA---AT----T-----C-T-AT----AG--TAAACGTT-A-A-----GTTA-AAAA-T-----GTA-TGTCTTTG-GC-G-A--A---C--TA-------T----TAT--T--TGT--A-G--CAC-TCT-------T----A-------A---G--------G-ATA----CAATG----AA-C-GAT--TTTA----GTCACAAA-----CAagtcattattta
gi|39                         :                                                                GGAAG-TTTCCAG-AT--TATTTT------CATG-TT---G-ATGA---AT----T-----T-C-AT----AT--A-----TT-A-A-----GGTG-TGGT-T-----GTT-TTTGTTTT-TA-A-A--A-A------------------TATTTT--T-T--T-A--CAG-TCC-------T----AT--GG-TG--T---------G-ATA----CATTG----AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----AATcgtccattat
gi|4                          :                                                     ATGTTGGCT-AGGAAG-TCACCGG-AT--G---TT------TATG-TT---T-ACGA---AT----T-----C-T-AT----AA--C-----TT-G-C-----TTTG-CAGT-T-----GTA-TGTCTTTT-AT-G-A--A-A-C--CT-------T----TATCTT--TGC--T-G--CAG-TTT-------T----AT--GGGTA--TA--------G-ATT----CATTT----GA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CAT
gi|40                         :                                                            aaatGGAGG-ATTCTAT-GT--T---TT------CAAG-TT---T-ATGA---AT----T-----G-T-AT----AT--A-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTGTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TGTCTT--TGT--T-G--CTG-TCT-------T----GT--GACTA--TG------------A----CAT-------------T--TTAA----GCGACACA-----CATgtcaacatttggca
gi|41                         :                                                  tGGATGTTGGTT-AGGAAG-TTTTCAT-AT--T---TT------CATG-TTGC-T-TTTA---AT----G-----T-TAATGA--AT--A-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTTCTTT-AA-G-A--A-G-C--gtca
gi|42                         :                                                    GACGCTGCTT-AGGAAG-TTCCAAG-GT--T---C-------CATG-TT----------------------------------A------------A-A-----ATTC-AAGT-T-----GTA-TTTATTT--AA-G-A--A-C-C--CA-------T----TACTTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------G----GT--GAATA--TG--------G-ATA----CATTT----TA-C-ACT--GTTA----GCCACAGA-----CAatctatatattttagactttttaaacttaaacataca
gi|43                         :                                                                                       T------CATG-AG---T-GTGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATAA-AAAT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----TA-CCT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----GT--TGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-A-GAT--TTAA----ACCATAAg
gi|44                         :                                                            aT-AGAAAG-ATTCCAG-AT--T---TC------CGAA-TT---A-ATGC---AT----T-----T-G-GT----AT--C-----TT-A-A-----AGAG-AAGT-T-----ATA-TTTCTTTT-TA-G---------------------------------TG---------AG-TCT-------T----AT--GATTA--TG--------G-ATA----CA-TG----AA-T-AAT--TTAA----GCCATAGA-----CATttatgtccattta
gi|45                         :                                                  AAGATGTTGGCT-CGTTAC-TTTTCAG-AC--T---T------------------------------------------AT----AT--C-----TT-A-G-----AATG-AAAT-T-----GTT-GTTGTTTT----------------------------------TT--TA---------AG-TCT-------T----TC--AGATA--TC--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----CCCACAAA-----CATTTgtccatt
gi|46                         :                                                                       TTCCAG-TT--T---TC------TGTA-TT---G-ATGA---AT------------------------C-----TT-A-A-----ATTG-AAGA-T-----ACA-TTTCCTTT-AG-G-A--A-A-C--T--------T----TTTTTT--TTT--T-A----------------T----AT--AAATA--TG--------T-ATA----CATGG----AC-C-AAT--TTCA----AACACAAT-----CATccattttttaa
gi|47                         :                                                             a-AGGAAGGTTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---T-ACGA---CT----T-----A-T-AG----AA--C-----TA-A-A-----ATTT-CAAT-T-----ATG-TTTATTTC-AA-G-A--A-A-C--TA-------T----TATACT--GAT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--GCATC--TG--------A-A-G----CAT---------C-GAT--TTAA----gtccttttt
gi|48                         :                                                                    G-TTTTCAG-AT--C---T-------CATA-TG---T-GTGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TA-A-A-----ATTA-AA-T-T-----GTA-TCACGTTT-AA-G-A--A-A-T--TA-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TGG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GC
gi|49                         :                                                                     -TTTTCAG-AT--T---CC------TATA-TT---T-ATGA---ATG---T-----T-T-A-----AG--C-----TT-A-A-----ATTG-ATGT-T-----GTA-ATTATTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----CATTAA--TGT--A-G--CAA-TTT-------T----GC--G------TG--------T-ATA-------------AA-C-GAT--TTAT----GCCACAAA-----CA
gi|5                          :                                                        TTGCCT-AGCAAC-TTTACAG-AG--T---TG------TATG-CT---T-ACGA---AT----T-----T-T-GT----AT--C-----TT-A-A-----AATA-AAGT-T-----GTA-TTTGTTTT-TA-G-A--A-C-C--TA-------T----AATCTT--TGT--T-G--TTT-GCT-------C----AT--GGATA--AG--------ATATA----CATTG----AA-C-AA
gi|50                         :                                                           GCT-ACAAAG-TGGCCAG-AT--G---TT------CATG-GT---T-ACAA---AT----T-----T-G-AT--------C-----TT-A-TT----ATTG-AATG-T-----GTT-TTTCTTTTGAA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATTTT--T-T--T----CAG-ATT-------T----CT--GAATA--CA--------G-Aacattttcatttaaatgcatataacaaattcaaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                              cgtatCTTTT-AT-G-A--A-A-C--CT-------T----TATCTT--TGC--T-G--CAG-TTT-------T----AT--GGGTA--TA--------G-ATT----CATTT----GA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CAT
gi|52                         :                                                         TGGCT-GGAAAG-TTTCCGG-CT--T---TTT-----CACG-G------ACGA---AT--------------AT----AT--C-----TT-A-A-----ATAG-AAAT-T-----GCA-TTTCAT----A-GCA--A-A-C--CA-------T----TAT-TG--AGT--T-G--AAG-TCT-------T----Agtcaacatttggcataattttcttaccaaga
gi|53                         :                                                TAAAGATGTTTACT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CAAG-TC---T-GTG---------------------T----AT--C-----TT-A---------TG-AAGA---------A-TTT---------------------------------------TT--TGT--T-G--CAG-TTT-------T----AT--AGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-caactgcgtac
gi|54                         :                                          acatttTATGGATATAGCCA-AGGAAG-TTTCCAG-AA--T---GT------CACG-TG---A-ATGA---AA----T-----T-C-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTTCTTT-CG-G-A--A-A-A--CA-------T----CA--TT--TGT--T-
gi|55                         :                                                         ataCT-TGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------GATG-TT---T-ACGA---AT----T----------------------------------------------------GTA-TTTCTTC--AA-G-A--A-A-C--CA-------G----TATCTG--TGT--T-G--CAA-TCT-------T----AT--TGATG--GG--------A-AAA----CATTG----AA-C-GAT--T
gi|56                         :                                                      aGTTTGCT-AGGAAG-TTTCCAG-AT--G---GT------AATA-TT---T-ATGA---AT----T-----T-T-AT----AC-------------A-----ATAA-GAGA-T-----G-A-TTT-TTCT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TAATTT--T
gi|57                         :                                                          GGTC-AAGAAG-TTTTCAG-AT--T---T-------CATG-TT---G-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----AT------T-T-----GTA-TTTTTTTT-AA-G-A--A-A-C--C---------------TTTT--TGT--T-G----------------T----AT--G------CG--------A-ATA----CATTA----AA-C-aattgaacattttaag
gi|58                         :                                                    GATTTTGACT-AGGAAC-TTTTTTT-CT--TC--TT------CATG-TT---T-ATGT---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TTTC-A-----ATTT-AAGT-T-----A-A-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TTTATT--CGT--a
gi|59                         :                                                                                                                                                                                   atTTT-AA-G-A--A-A-C--TA-------T----CA--TT--TGTAAT-A--CAG-TCT-------C----GT--GGACA--TG--------G-CTA----CATTG----AG-C-GAT--TTAACTAGACCACAAA-----CAT
gi|6                          :                                                                 GAAA-TGTTCAG-AT--T---TT------CATA-AT---T-GCAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--AA-------T----TATCTT--TGC--T-G--GTG-CCTTGTGGA-T----GT--GGATA--TG--------G-ATG----CATTGTAT-AA-T-GATGCTTAA---------AAA-----CATgtccattctttagaa
gi|60                         :                                                     ATGTTGGTT-AGGAAG-TTTT--------------------CATG-TT---T-ACGT---AT----T-----C-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-GAGT-T-----ATA-GTGATTTA-AT-G-A--A-A-C--CA-------T------TCTT--Tatttcatccaattttatccaa
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                         a-------T----TATATT--TGT--T-A--CAA-TCTCTATATAT----AT--ATATG--TG--------G-ACA----CATTG----AG-TGGAT--TT-A----TCCACAGA-----CATt
gi|62                         :                                                                                                                                                                             tg-TTTTTTTT-AAAG-A--A-A-G--CA-------T----TATTTT--TTT--TTG--CGG-TCT-------A----AT--GGTT----------------T-----CATTG----G------T--ATAA-----CCACAAA-----CATgtccatttctttg
gi|64                         :                                                          GGGT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--A---TT------CATG-TT---T-GCAA---TC----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTGCGAAT-T------TA-T---TTTT-AA-G-A--A-A-C--gtccatctttta
gi|65                         :                                                                                                                                                                                          a-G-A--ATA-T--CG-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TC-------------------GTA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATt
gi|66                         :                                                                        TCCAG-GT--T---TT------CATG-TT---T-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--A-----TT-A-A-----G-TA-AACT-T-----GTG-TATCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------gtccattttttt
gi|67                         :                                                TAAAGATGTTGACT-AGAAAG-ATTTCAA-AT--T---TT------CATG-TT---C-ATGATTTTT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTgtt
gi|68                         :                                                     tTGTTGGCT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TG------CATG-TG---T-ATGG---AG----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----ATTG-AAGT-T-----GT
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                                                    -G--CAG-TCT-------T----CT--GTATA--TG--------G-ATA----CGTTG----AC-C-GAT--TTAG----TTCACAAA-----CGT
gi|7                          :                                                                            G-AT--A---TC------CTTG-TT---T-ATGA---AT------------------------C-----TT-A-A-----ATTG-AATT-T-----GTG-TTCCCTTT-GA-G-ATGC-A-C--C-------------TATTTT--TGT--A-A--CAT-ACG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----TATTG----AA-C-GAT--TTAA----ACCA-AAA-----TATgtccatttttt
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                      taacaaatttattacgttatttatttGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAgtctttttggtaata
gi|8                          :                                                                GGCAG-TTTGTAG-AT--T---TT------CAGG-CT-----ATGC---AT----T-----T-G-AT----AT--T-----TT-A-A-----AATG-AAAT-T-----GTA-TTT-TTCT-AA-G-A--A-G-T--C--------T----TGTTTT--CAT--T-GTACAG-TCC-------T----AT--GGAGT--TG--------A-ATA----TGCTG----AC-C-AAT--TTAA----GTCGTAAA-----CAT
gi|9                          :                                                gacatATGTCGGTT-AGGAAG-TTTG-AG-AT--T---GT------CATG-TT---A-AC-----AT----TCTTGTT-T-ATGA--AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AATT-T-----GTG-TTCCCTTT-GA-G-ATGC-A-C--C-------------TATTTT--TGT--A-A--CAC-ACG-------T----AT--GGATA--TG--------G-AGA----AATTG----AA-C-GAT--TTAA----AGCA-AAA-----CATgttcatttttaaaaat


blockSeqs                     :                                                              G                    ATT  TTTAAC       GTTT     TTT  CAAA AATTA      GACA     AAACG  C   CATGT           GTACA       T       T   TG     CCTTTGTTT   TGAA   T  GA                 CTATATA GTAC             TATAGATA     TTTG     ATTT        GC    CTAG        ATGTC
blockSeqs                     :                                                              .                    GG   T            GCAT     .    G    CTTGT      TA       .      T   T               CATA        C       A   TG     AAAA        .      C  C                  TGTGGA  A                .            .        TAT         .     .           TGTC 
blockSeqs                     :                                                              .                    C    .            GCT      .    .    ATA        GA       .      .   .               A           A       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            TT       .    .    .          GA       .      .   .               .           C       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            TT       .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      TT          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      A  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           A       .   .      TG          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           T       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      G  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            A        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      AA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            G        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CG          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      TG          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            A        .    .    .          .        .      .   .               .           A       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      TA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           A       .   .      CT          .      G  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            A        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            C        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           A       .   .      AA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      TA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CT          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            A        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            G        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           G       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      TA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      TA          .      A  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            A        .    .    .          .        .      .   .               .           T       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            G        .    .    .          .        .      .   .               .           A       .   .      TA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                              .                    .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CT          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           G       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           A       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .           .    
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            A        .    .    .          .        .      .   .               .           A       .   .      CA          .      A  .                  .       .                .            .        .           .     .                
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           G       .   .      TA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .                
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      AA          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .                
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            G        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      A  .                  .       .                .            .        .           .     .                
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .                
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           T       .   .      CG          .      C  .                  .       .                .            .        .           .     .                
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      CA          .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .                
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blockSeqs                     :                                                                                   .    .            T        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      T           .      T  .                  .       .                .            .        .           .     .                
blockSeqs                     :                                                                                   .    .            C        .    .    .          .        .      .   .               .           C       .   .      C           .      .  .                  .       .                .            .        .           .     .                
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finalCons                     :                                                TAAGGATGTTGGCT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-CCA---------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|63 ): ATGGTTCATTCCTGCAGTTTCTGTATGAAGATATATGTTTGGTATACAAACTCAAGTTATATTCGTCCCCGCTC
Unaligned ( gi|70 ): TATGTGTCCGAGTGCAGTTGCAGGCGAGGGTAGATAAGTTGAGCTACCTCCGTCG
Unaligned ( gi|71 ): ACATTTTCTTTTTTCGATATTTTTTTATCAGATTTTGACATATTTTTCA






Alignments
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consensus                     :                                                TAAGGATGTTGGCT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTT
Reference ( family-4591 )     :                                                TAAGGATGTTGGCT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTT
gi|1                          :                                                       GTTGGCT-CGGAAG-T-----------------------CGTG-TG---T-G------AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-TAAT-T-----ATA-TTTATTTT-AA-A-A--A-A-AAATA-------T----TATTTT--TGT--T-G--CAG-TCA-------T----AT--AGATA--TG--------G-CTA----CATTG----AA-T-TAT--TT
gi|10                         :                                                                GGTAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-AC---T-ACTG---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TG-A-A-----ATTG-TAGT-T-----GTGTTTTTTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T------TTTT--TGT--T-A--CAG-TCG-------T----AT--AGATA--TC--------G-GTA----TATTG----AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----CAtatcaacagttctgtccaattttttacatttatttttcgatatttttttttttaacatttttgaatattttttcta
gi|11                         :                                                                                                                                                 tT-A-A-----ATTA-AAGT-T-----GTG-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTA--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAATGTC-CATTTcgtccgtttttttaaccaaa
gi|12                         : atgatggatcggacattttaagatgtgtgaaaacccaataccatcagTAAATATGTTGGCT-AGAAAG-TTT--AA-AG--TGG-TT------CATG-TA---T-ATGG---AT----T-----G-T-AT----AT--C-----TT-A-C-----GTTT-CATT-TGTACAGTA-TTTACTTC-AA-G-A--A-A-C--TT-------T----AATTGT--TAT--T-A--CAG-TTT-------C----GT--GATCA--TG--------A-ATA----CATTG----AACC-GCT--TTAtttcg
gi|13                         :                                                  gttattTTGGAT-AGG-----TTCCAG-AG--T---TT------CGTG-TTGTTT-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----TTA--TGCCCTT-AA-G-G--A-A-C--CCTTTGTTTT----TATTTT--TAT--T-G---AGCTTT-------T----AT--AAATA--TG--------G-ATA----AATGG----AA-C-AAT--TTAA----ACCACAAA-----CATgca
gi|14                         :                                                                                                              ---AT----T-----T-T-AG----GT--C-----TT-A-A-----ATTC-AAAT-TA----GTT-CTTCGTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TAT-TT--TGT--T-G--CAG-TCT-------TGTACAT--GTATACATA--------G-ATA----CATTG----AC-C-GAC--TTGA----ACCACAAA-----TAggccag
gi|15                         :                                                                                             ggatactggcttgggcA---AT----T-----T-C-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-C-----GTA-TTTCTTTT-AGTG-A--A-A-T--TG-------T----TTTCTT--TGT--T-C--CAG-TCT-------T----AG--GG--A--TG--------G-GTA----CATTG----AC-C-GAT--TTAA----GCCACAAAATGTCCATTTcgtccatttctaaaaaagaattttt
gi|16                         :                          gagtaagtatctcaagtaaacatcgtctatcaaGCG-AGGGAG-TTTTCAG-AT--T---GA------TATG-TT---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----A------GT-T-----GTA-TTTATTTT-AA-C-A--A-A-C--CA-------T----TATATT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AA--GGCTA--TG--------G-AAG----TATTG----AA-C-GAT--TTAA----ATCACAAA-----CATTTatttg
gi|17                         :                                                             cttGAAAG-TTTTAAG-AA--T---TC------CATG-CA---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-AAAT-T-----GTA-TTTTCTT---A-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTT--TAT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--AGATA--TG--------C-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCAACAAA-----CATccaatttgttag
gi|18                         :                                                TAAGGATCTTG-CTGAGTAAG-TTTTCAG-----T---TT------CATG-TA---T-ACGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----ATTA-AAGT-T-----ATG-GTTCTTTT-GA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTG--TAT--T-G--CAG-TCG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATTTgtccattttatgacaaa
gi|19                         :                                                TAAGGATGTTGACT-AGAAAG-TTTTCAA-AT--T---TT------CATG-TA---T-ACAT---AT----T-----T-T-AT----AT--A-----TT-T-G-----ACTA-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-G--A-A-C--CA-------G----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------TA---ATAGGGGTG--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GTCAC
gi|2                          :                                             attTAAAGATTTTGCCA-AAACAG-TTTT-AG-AT--T---TT------AATA-TT---T-ACGA---AT----T-----T-A-AA----AT--G-----TT-T-A-----TTTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-CAAAA-------TTGAATATCTT--TGC--T-A--CAG-TTT-------T----AT--CGATA--TT--------G-ATT----CATTG----AA-A-ATT--TTAA----GGCACTAA-----TAT
gi|20                         :                                               tTAAATATTTTGGCT-AGGAAG-TTTT-AG-AT--T---TT------CATG-GT---A-ACTA---AC----T-----T-T-AT------------------------------AACT-T-----GTA-TTGCTTTT-AA-G-A--A-A-T------------------TCTT--TGT--T-A--CA----T-------T-----T--GA--A--TG--------G-ATT----CATTAATTTAA-A-GAT--TTAA----ACCACAAA-----gtccttttttaacaagcgtta
gi|21                         :                                                ctAGGATGTTGCCA-AGGATT-TTTTCAA-AT--T---TT------TATAATT---T-A------AT----C-----T-T--T----AT--C-----TT-A-T-----ATTA-AAGT-T-----GTA-TTTCTGTC-AA-T-A--A-A-G--CA-------T----TATGTT--TGT--T-G--CAG-TTT-------T----AA--GGATA--TT--------G-ATA----CATGT----AA-T-GAT--TTGA----AACATCAA-----CGTatatcaactatttaattaat
gi|22                         :                                                 tAGGAGGTTGGCT-AGGCAG-TTTTCAA-AT--G---TT------CATG-TT---TTATGA---CT----TATA--TAT-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----ATG-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATCTT--TG----------G-TCT-------------------TA--TG--------G-ATA----CATTG----AT-C-GGT--TTAA----Gcca
gi|23                         :                                                                 gAGG-TTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---G-ACGA---CT----T-----T-T-AT----AA--C-----TT-A-A-----ATTG-CAAT-T-----ATG-TTTCTTTT-A--------------------------------TTGATAT--T-G--TAG-TCT-------T----AC--GGATC--TG--------A-TTA----TATTG----AA-C-GAT--TCAA----GCAACAAA-----CATtgattttaacatgt
gi|24                         :                                                      gcaTGGCT-AAGACT-TTGTCAG-AT--T---GC------CATG-TT---T-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----AT-G-A-----ATTG-AAA--T-----GTT-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--AA-------T----TATTGT--TGT--T-G--CAT-TTC-------T----AT--GGAT---------------ATA----CATTA----AA-C-GAT--ATAA----GCCTCAAA-----CATgtccatgtctttctgaaaaaa
gi|25                         :                                                                     -TTTTTAA-AT--C---TTTTTAACCATG-TG---A-ACGC---ATCAAAT-----T-G-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATCA-CAGT-T-----GTA-TTTATTTT-AA----------C--CG-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--Gatccttttat
gi|26                         :                                                                      aTTTCAG-AT--T---TT------CTTG-AC---T-ACGG---AT----T-----C---AT----AT--C-----TT-G-A-----ATTG-AAGT-T-----GAA-ATTCTTTT-AA-G-A--A-A-C---A-------T----TTTTTTC-TGT--T-T--CAG-TCT-------T----AC--GGATA--TC--------G-TTC----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCAACAtttccgttaaacgagtaaagcatgtccatatttataccaaaaaa
gi|27                         :                                                                        TTCTG-AT--T---TT------GATG-CAGCAT-ATCA---AT----A-----T-T-AT----ATTGC-----TA-A-A-----ATTG-ATAT-T-----GTG-TATATTTT-AA-A-A--A-T-C--TG-------T----TATTTC--TAT--T-G--CAG-CCT-------G----AT--GAAAA--TT--------G-ATA----CATTG----CA-C-AAC--TTAA----GCCACACA-----CGTtgtctatttttaaacaaaaaa
gi|28                         :                                                                       TTTCAG-AT--T---TT------CATG-AG---T-GCGG---AC----T-----T-T-AT----AT--C-----TA-A-A-----ATTA-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-A-A--A-AAT--CA-------T----TATCTT--TAT--T-G--CAG-TCT-------T----GT--GTATA--TG--------G-GTA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GCCACAAA-----CATgtccatttttc
gi|29                         :                                                                   AG-TTTTAAG-AT--C---TT------TATG-AC---A-ACGG---AT----T-----T---ATGACAAT--G-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTGTT-AT-G-A--A-A-C----------------TATGTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AT--GGATA--TC--------G-GTA----CATTG----AG-C-AAT--TGAA----GCCACAAA-----CATgaccttttttta
gi|3                          :                                                       ttgtctcgttGAAT-CTTTCAG-GT--T---TT------CATG-TT---TTATAA---AT----T-----T-T-AT-----C--C-----TT-A-A------TTG-AAGT-TCATA-GTA-TTT--TTT-AA-G-A--A-A-C--TA-------C----TACTTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------T----AT--ATATA--TATATAGATAG-ATA----CATTG----AA-C-TAT--TTAA----GCCAC
gi|30                         :                                                   tttTGTTGGCG-GGAAGG-ATTCCAG-AA--T---TT------AATA-TT---T-ATGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-ATACATGTATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-CA-G-A--A-A-C--CT-------T----TATTTT------------------------------------GATA--TA--------G-ATA----CATGG----CA---GAT--TTAA----GCAACAAA-----ttatatgttcgggttttttttaaa
gi|31                         :                                                TAAGGATGGTGGAA-AATAAG-TTT---G-A----------------GTG-TT---T-ATGA---AT----TAATTAT-T-ATTA--AT--C-----TT-C-A-----ACTG-AAGG-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-T-A--A-A-T--CA--------------------TGG--C-G--CAA-TTT-------T----AT--TGAAA--TG--------G-ATG----CATTG----AT-C-GAT--TTTA----GTCACgtacatgtcc
gi|32                         :                                           atatcTAAGGATGCTGGGT-CGAAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CACG-CG---C-GCGA---AT----T-----C-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ACT--------------TA---TCTT-----------A-A-T--CA-------T----TA--------------------TCT-------T----AT--TGATA--TT--------A-ATA----CATTG----AA-C-AAT--ATAA----GCCACAAA-----TATT
gi|33                         :                                                                            t-AT--A---TT------CATG-TT---T-ACAG---AT----T-----G-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTA-AAGTCT-----TTA-TTTATTTT-AA-G----A-A-C--CA-------T----TATCTG--TGT--T-A--CAG-TTT-------T----AT--GTATA--TG--------A-TTATTTGCATTG----AA-C-GAC--TTAA----aacattttttttaaa
gi|34                         :                              tgcttaagacgtctttacaatgtcTGTTGGCT-AGGAGA-TCTTCAG-ATGAC---TT------CA-------------A---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATGG-GAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------C----TATCTT--TTT--A-T--CAC-TCT-------T----AT--GGATT--TG--------A-ATA----CATCC----AA-C-GAT--TTCA----TCTACAAA-----TA
gi|35                         :                                                                   AG-TTTTCAGAAT--T---TT------AAAA-CT---T--CGG---AT----T-----T-A-AT----GT--C-----TT-A-A-----ACTG-AAGT-T-----GTG-TTTCTTTT-AA---------------------------------------------CAG-TAT-------T----AT--GGATT--TC--------G-GTA----CAATG----AA-T-GTT--TAAA----GACAGAAA-----CAag
gi|36                         :                                             ttggcacgctGTTGGCT-TAGAAG-TTATCAG-AT--T---TT------AATA-TT---T-ACAA---AT----T-----G-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAAT-T-----GTA-TATCTTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----TATCTT--TTT--T-G--CAG-TCT-------T----AT--GTATA--TG--------G-AT------AGTG----AA-C-GAG--TTAA----GCTTCAAA-----cgtcgagtttataacaa
gi|37                         :                                                             T-AGAAAG-TTTCCAG-AT--G---TT------CATG-TT---T-ATGA---AT----T-----T-T-AT----AT--T-----TTCA-A-----ATTG-AAGT-T-----TTA-TTT-TTTT-AG-G-G--A-G-T--AA-------T----TATCTT--TGT--T-A--AAG-TCT-------T----AT--G-----------------------------A----AA-C-AAG--TTAA----ACCACAAA-----CAT
gi|38                         :                                                                      atTTCAG-AT--T---TT------AATT-TT---A-ATGA---AT----T-----C-T-AT----AG--TAAACGTT-A-A-----GTTA-AAAA-T-----GTA-TGTCTTTG-GC-G-A--A---C--TA-------T----TAT--T--TGT--A-G--CAC-TCT-------T----A-------A---G--------G-ATA----CAATG----AA-C-GAT--TTTA----GTCACAAA-----CAagtcattattta
gi|39                         :                                                                GGAAG-TTTCCAG-AT--TATTTT------CATG-TT---G-ATGA---AT----T-----T-C-AT----AT--A-----TT-A-A-----GGTG-TGGT-T-----GTT-TTTGTTTT-TA-A-A--A-A------------------TATTTT--T-T--T-A--CAG-TCC-------T----AT--GG-TG--T---------G-ATA----CATTG----AA-C-CAT--TTAA----GCCACAAA-----AATcgtccattat
gi|4                          :                                                     ATGTTGGCT-AGGAAG-TCACCGG-AT--G---TT------TATG-TT---T-ACGA---AT----T-----C-T-AT----AA--C-----TT-G-C-----TTTG-CAGT-T-----GTA-TGTCTTTT-AT-G-A--A-A-C--CT-------T----TATCTT--TGC--T-G--CAG-TTT-------T----AT--GGGTA--TA--------G-ATT----CATTT----GA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CAT
gi|40                         :                                                            aaatGGAGG-ATTCTAT-GT--T---TT------CAAG-TT---T-ATGA---AT----T-----G-T-AT----AT--A-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTGTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TGTCTT--TGT--T-G--CTG-TCT-------T----GT--GACTA--TG------------A----CAT-------------T--TTAA----GCGACACA-----CATgtcaacatttggca
gi|41                         :                                                  tGGATGTTGGTT-AGGAAG-TTTTCAT-AT--T---TT------CATG-TTGC-T-TTTA---AT----G-----T-TAATGA--AT--A-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTTCTTT-AA-G-A--A-G-C--gtca
gi|42                         :                                                    GACGCTGCTT-AGGAAG-TTCCAAG-GT--T---C-------CATG-TT----------------------------------A------------A-A-----ATTC-AAGT-T-----GTA-TTTATTT--AA-G-A--A-C-C--CA-------T----TACTTT--TGT--T-A--CAG-TCT-------G----GT--GAATA--TG--------G-ATA----CATTT----TA-C-ACT--GTTA----GCCACAGA-----CAatctatatattttagactttttaaacttaaacataca
gi|43                         :                                                                                       T------CATG-AG---T-GTGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATAA-AAAT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----TA-CCT--TGT--T-G--CAG-TCT-------T----GT--TGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-A-GAT--TTAA----ACCATAAg
gi|44                         :                                                            aT-AGAAAG-ATTCCAG-AT--T---TC------CGAA-TT---A-ATGC---AT----T-----T-G-GT----AT--C-----TT-A-A-----AGAG-AAGT-T-----ATA-TTTCTTTT-TA-G---------------------------------TG---------AG-TCT-------T----AT--GATTA--TG--------G-ATA----CA-TG----AA-T-AAT--TTAA----GCCATAGA-----CATttatgtccattta
gi|45                         :                                                  AAGATGTTGGCT-CGTTAC-TTTTCAG-AC--T---T------------------------------------------AT----AT--C-----TT-A-G-----AATG-AAAT-T-----GTT-GTTGTTTT----------------------------------TT--TA---------AG-TCT-------T----TC--AGATA--TC--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----CCCACAAA-----CATTTgtccatt
gi|46                         :                                                                       TTCCAG-TT--T---TC------TGTA-TT---G-ATGA---AT------------------------C-----TT-A-A-----ATTG-AAGA-T-----ACA-TTTCCTTT-AG-G-A--A-A-C--T--------T----TTTTTT--TTT--T-A----------------T----AT--AAATA--TG--------T-ATA----CATGG----AC-C-AAT--TTCA----AACACAAT-----CATccattttttaa
gi|47                         :                                                             a-AGGAAGGTTTTCAG-AT--T---TT------CATG-TT---T-ACGA---CT----T-----A-T-AG----AA--C-----TA-A-A-----ATTT-CAAT-T-----ATG-TTTATTTC-AA-G-A--A-A-C--TA-------T----TATACT--GAT--T-G--CAG-TCT-------T----AA--GCATC--TG--------A-A-G----CAT---------C-GAT--TTAA----gtccttttt
gi|48                         :                                                                    G-TTTTCAG-AT--C---T-------CATA-TG---T-GTGA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TA-A-A-----ATTA-AA-T-T-----GTA-TCACGTTT-AA-G-A--A-A-T--TA-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TGG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GC
gi|49                         :                                                                     -TTTTCAG-AT--T---CC------TATA-TT---T-ATGA---ATG---T-----T-T-A-----AG--C-----TT-A-A-----ATTG-ATGT-T-----GTA-ATTATTTT-AA-G-A--A-A-T--CA-------T----CATTAA--TGT--A-G--CAA-TTT-------T----GC--G------TG--------T-ATA-------------AA-C-GAT--TTAT----GCCACAAA-----CA
gi|5                          :                                                        TTGCCT-AGCAAC-TTTACAG-AG--T---TG------TATG-CT---T-ACGA---AT----T-----T-T-GT----AT--C-----TT-A-A-----AATA-AAGT-T-----GTA-TTTGTTTT-TA-G-A--A-C-C--TA-------T----AATCTT--TGT--T-G--TTT-GCT-------C----AT--GGATA--AG--------ATATA----CATTG----AA-C-AA
gi|50                         :                                                           GCT-ACAAAG-TGGCCAG-AT--G---TT------CATG-GT---T-ACAA---AT----T-----T-G-AT--------C-----TT-A-TT----ATTG-AATG-T-----GTT-TTTCTTTTGAA-G-A--A-A-C--CA-------T----TATTTT--T-T--T----CAG-ATT-------T----CT--GAATA--CA--------G-Aacattttcatttaaatgcatataacaaattcaaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                              cgtatCTTTT-AT-G-A--A-A-C--CT-------T----TATCTT--TGC--T-G--CAG-TTT-------T----AT--GGGTA--TA--------G-ATT----CATTT----GA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CAT
gi|52                         :                                                         TGGCT-GGAAAG-TTTCCGG-CT--T---TTT-----CACG-G------ACGA---AT--------------AT----AT--C-----TT-A-A-----ATAG-AAAT-T-----GCA-TTTCAT----A-GCA--A-A-C--CA-------T----TAT-TG--AGT--T-G--AAG-TCT-------T----Agtcaacatttggcataattttcttaccaaga
gi|53                         :                                                TAAAGATGTTTACT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------CAAG-TC---T-GTG---------------------T----AT--C-----TT-A---------TG-AAGA---------A-TTT---------------------------------------TT--TGT--T-G--CAG-TTT-------T----AT--AGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-caactgcgtac
gi|54                         :                                          acatttTATGGATATAGCCA-AGGAAG-TTTCCAG-AA--T---GT------CACG-TG---A-ATGA---AA----T-----T-C-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTTCTTT-CG-G-A--A-A-A--CA-------T----CA--TT--TGT--T-
gi|55                         :                                                         ataCT-TGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TT------GATG-TT---T-ACGA---AT----T----------------------------------------------------GTA-TTTCTTC--AA-G-A--A-A-C--CA-------G----TATCTG--TGT--T-G--CAA-TCT-------T----AT--TGATG--GG--------A-AAA----CATTG----AA-C-GAT--T
gi|56                         :                                                      aGTTTGCT-AGGAAG-TTTCCAG-AT--G---GT------AATA-TT---T-ATGA---AT----T-----T-T-AT----AC-------------A-----ATAA-GAGA-T-----G-A-TTT-TTCT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TAATTT--T
gi|57                         :                                                          GGTC-AAGAAG-TTTTCAG-AT--T---T-------CATG-TT---G-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----AT------T-T-----GTA-TTTTTTTT-AA-G-A--A-A-C--C---------------TTTT--TGT--T-G----------------T----AT--G------CG--------A-ATA----CATTA----AA-C-aattgaacattttaag
gi|58                         :                                                    GATTTTGACT-AGGAAC-TTTTTTT-CT--TC--TT------CATG-TT---T-ATGT---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TTTC-A-----ATTT-AAGT-T-----A-A-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------T----TTTATT--CGT--a
gi|59                         :                                                                                                                                                                                   atTTT-AA-G-A--A-A-C--TA-------T----CA--TT--TGTAAT-A--CAG-TCT-------C----GT--GGACA--TG--------G-CTA----CATTG----AG-C-GAT--TTAACTAGACCACAAA-----CAT
gi|6                          :                                                                 GAAA-TGTTCAG-AT--T---TT------CATA-AT---T-GCAA---AT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AAGT-T-----GTA-TTTCTTTT-AA-G-A--A-A-C--AA-------T----TATCTT--TGC--T-G--GTG-CCTTGTGGA-T----GT--GGATA--TG--------G-ATG----CATTGTAT-AA-T-GATGCTTAA---------AAA-----CATgtccattctttagaa
gi|60                         :                                                     ATGTTGGTT-AGGAAG-TTTT--------------------CATG-TT---T-ACGT---AT----T-----C-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTG-GAGT-T-----ATA-GTGATTTA-AT-G-A--A-A-C--CA-------T------TCTT--Tatttcatccaattttatccaa
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                         a-------T----TATATT--TGT--T-A--CAA-TCTCTATATAT----AT--ATATG--TG--------G-ACA----CATTG----AG-TGGAT--TT-A----TCCACAGA-----CATt
gi|62                         :                                                                                                                                                                             tg-TTTTTTTT-AAAG-A--A-A-G--CA-------T----TATTTT--TTT--TTG--CGG-TCT-------A----AT--GGTT----------------T-----CATTG----G------T--ATAA-----CCACAAA-----CATgtccatttctttg
gi|64                         :                                                          GGGT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--A---TT------CATG-TT---T-GCAA---TC----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTGCGAAT-T------TA-T---TTTT-AA-G-A--A-A-C--gtccatctttta
gi|65                         :                                                                                                                                                                                          a-G-A--ATA-T--CG-------T----TATCTT--TGT--T-G--CAG-TC-------------------GTA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAA-----CATt
gi|66                         :                                                                        TCCAG-GT--T---TT------CATG-TT---T-ATAA---AT----T-----T-T-AT----AT--A-----TT-A-A-----G-TA-AACT-T-----GTG-TATCTTTT-AA-G-A--A-A-C--CA-------gtccattttttt
gi|67                         :                                                TAAAGATGTTGACT-AGAAAG-ATTTCAA-AT--T---TT------CATG-TT---C-ATGATTTTT----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-A-A-----ATTgtt
gi|68                         :                                                     tTGTTGGCT-AGGAAG-TTTTCAG-AT--T---TG------CATG-TG---T-ATGG---AG----T-----T-T-AT----AT--C-----TT-G-A-----ATTG-AAGT-T-----GT
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                                                    -G--CAG-TCT-------T----CT--GTATA--TG--------G-ATA----CGTTG----AC-C-GAT--TTAG----TTCACAAA-----CGT
gi|7                          :                                                                            G-AT--A---TC------CTTG-TT---T-ATGA---AT------------------------C-----TT-A-A-----ATTG-AATT-T-----GTG-TTCCCTTT-GA-G-ATGC-A-C--C-------------TATTTT--TGT--A-A--CAT-ACG-------T----AT--GGATA--TG--------G-ATA----TATTG----AA-C-GAT--TTAA----ACCA-AAA-----TATgtccatttttt
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                      taacaaatttattacgttatttatttGATA--TG--------G-ATA----CATTG----AA-C-GAT--TTAA----GCCACAAgtctttttggtaata
gi|8                          :                                                                GGCAG-TTTGTAG-AT--T---TT------CAGG-CT-----ATGC---AT----T-----T-G-AT----AT--T-----TT-A-A-----AATG-AAAT-T-----GTA-TTT-TTCT-AA-G-A--A-G-T--C--------T----TGTTTT--CAT--T-GTACAG-TCC-------T----AT--GGAGT--TG--------A-ATA----TGCTG----AC-C-AAT--TTAA----GTCGTAAA-----CAT
gi|9                          :                                                gacatATGTCGGTT-AGGAAG-TTTG-AG-AT--T---GT------CATG-TT---A-AC-----AT----TCTTGTT-T-ATGA--AT--C-----TT-A-A-----ATTG-AATT-T-----GTG-TTCCCTTT-GA-G-ATGC-A-C--C-------------TATTTT--TGT--A-A--CAC-ACG-------T----AT--GGATA--TG--------G-AGA----AATTG----AA-C-GAT--TTAA----AGCA-AAA-----CATgttcatttttaaaaat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|63 ): ATGGTTCATTCCTGCAGTTTCTGTATGAAGATATATGTTTGGTATACAAACTCAAGTTATATTCGTCCCCGCTC
Unaligned ( gi|70 ): TATGTGTCCGAGTGCAGTTGCAGGCGAGGGTAGATAAGTTGAGCTACCTCCGTCG
Unaligned ( gi|71 ): ACATTTTCTTTTTTCGATATTTTTTTATCAGATTTTGACATATTTTTCA