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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                      TAGTT--TGAANNNNNNNNNN-TAAGTCTTTCTGTTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATTACACAAATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGTTGCTATTAAGTCGCATTAGCTCGATAAC--ATAGCA-ACATTTTTAATCACAGTCTTTG-TGTTGTTGTTGTT-TTTGTTTTGTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGTTTGTT-TTGTTTTTTTTGGTGAGGGGGTATATATAAATGCAT-TATTAT--T--AT--TATATACCATTTAAGTCTGTGATATCCATTTAA----ACATGTGGTAAATTAAATCTAACT-GTGCA----AGT--TACAATATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTCGATTATT-AATAAGTTA-TT---AGT---GCAATTAATTGCTATGATAATTAAGGTTT---C--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGACCACAATTGAAATAAGACTTTACTCTTTTTTT-TG-GTTATCCTTGGCGGCGGTGT---GCCTATCATGGCTCACTGTGCATCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTAAATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                      TAGTTATTGAATGGTTTGTATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGC--TTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTTTGTTGTTGCT-TTGTT-TTTTTT
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gi|5                          :                                                                                                                                      tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatc-TAAGGCTTTCTACTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTTCCTGCCAATATCACTTAGACTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAAC--TTAGCA-TAACTTTTAATCACATTCTT---TGTTGTTGTTGTT-TTT-TTTTATgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|17                         : atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttatggttatagggtttgggtc-TAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAAC--TTAGC--ATAATTTTAATCACATTCT------TTGTTGTTTTT-TTatatgaatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccacttaagtctgtgatattcatttaaacatgtgatgaattaaatttaactgtgcaagttacaatataaagtgatatattaaatcaacttaatactgacattgcatgtgatagtctacttcattattaataaattattagtgcaattaatttctatgataattaagg
gi|12                         :                                                                                                                                                   gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctatggttaaatggtttgcgtc-TAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATTTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAAATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGATT--------GTCTCATTTGCTCGATAAT--TTAGCA-TAATTTTTAACCACATTCTTC--TGTT-TTTTTGTT-TTTacatatatataaaaatgctttatcagtatgtaccgtttaactctgtgatattcatttaacatgacatgtgataaattaaatttaac
gi|4                          :                                                                                              cttgattatatgggagaacattttactccacagaatgctattcattcttacgggtcaaaactaagtaacaagggtgcttatgctgtccctacggtaaaagggtttcgggtcAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACTTGCCAATATTACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTATTAAGGCTGCTATTGAGACTCATTTGCTAAA-AAT--TTAGCA-TAATTTTTAATCACATTTTTTG-T-TTGTT-TT-TT-TTTATtcataaaatgcattattgaaagatatttctctgtaaaggatgtgactgttgtttttaataaactttgttttataatgaaccaaatgttgattatggta
gi|7                          :                                                                                                                                                   gtcaagactaagtcacaagggtgcttatgctgtccctattgttaaagagttttggtcgAAGTCTCTCTGATTCAGAGGCTGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTTGCATTTGGTCGATAAC--TTAGC--ATACTTTAAATCATA--TTTTA-T-TTATCATTGTTCTTTGTTTatataaatgcattattattatatgtaccatttatgtctgtgttattcatttaaacatgtgataaattaaatttaactgtataagttacaatataaagtgatatatttttatcaactttatactgatattgcatgtgatagtctactcaattattaataagttattggtgcaattaatttctatgataattaaggtggcgattgattgattgcttctgtatgtcatgctaacaacacaaaggatcacaatggaaataagagtgttttgtgttatccttggtggtgttgtgcatgccgtggctcactatgcctcattatgtaaaaattttatttcaatatacatgttgtttaaattgtccattaccaaaataaatctatc
gi|18                         :                                                                                                                              agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctatggttaaagggttttggcccAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAattatagtatgtaccattaaagtctgtgatacccatttaaacatgtgataaattaaattaaactgagcaagtttctttataaagtgatatatttaatcaacttaataatgatattgcttgtgatagtctacttgattcttaataagttattagtgaaattaattactatgttaattaaggtttcgattgattgattgtctctgtatgccatgctaacaacacaaaggactacaatggaaataaaagtttactctttttttgtgtgttatacttggtggtggtgtgcatgccatggctcacta
gi|21                         :                       atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtccctttggttaaaggatttgggtcttTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCGATA-------------ATTTTTAATCACATTCTT---TGTTGTTGTTGTT-TTgtcacgtcagtatttttttgcatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCCCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATTTGCTCGATAAC--TTAGTA-TAATTTTTAATCACA-TCTTT--TGTT-TTTTTGTT-TTTTTTatatatatatatataaatgcattattatcatgtacacttcaagtctgtgatattcatttgaacatgtgattaatgaaatttaactgtgcacgttataa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTT-TT-TTGTTTTTTTT-----------ATATATAAATGCAT-TATTAA--T--A----ATGTATCATTTAAGTATGTGATATTCATTTAA----ACATGTAAGAAATTAAATGTAACT-GTGCA----AGT--TA---TATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGCACG-AAT-TGT--CTACTTAAGTCTT-ATTTAGTTA-TT---AGT---GCAATTACTTTCTATGATAATTAAGGTTT---T--------------------GA-TTGATTGA-TTGCGTCTATATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAATGACCACAA-TGGAAGAA----TTACTCTTTTTTG-T--GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACAATGCCTTATGTATGTGATAATTTTA-GTTAATGTACATGTTGTTTTAA-CTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGATATAAatatataaatgcattattaataatgtatcatttaagtatgtgatattcatttaaacatgtaagaaattaaatgtaactgtgcaagttatataaagtgatatatttaatcaacttaatactgatattgcacgaattgtctacttaagtcttatttagttattagtgcaattactttctatgataattaaggttttgattgattgattgcgtctatatgtcatgctaacaacacaaatgaccacaatggaagaattactcttttttgtgttatccttggtggtggtgtgcatgccatggctcacaatgccttatgtatgtgataattttagttaatgtacatgttgttttaactgtccatgtatgcattcattactgatataaatatatct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcccttgttttaaggctgcttttaagtctcatttgctcgataacttagtataatttttaatcacatcttttTTTGTT-T-GTTTTTTTT----------TATATATAAATGCAT-TATTAT--T--A---TATGTACCATTTATGTCTGTGTTATTCATTTAA----ACATGTGATAAATTAAATTTAACT-GTATA----AGT--TACAATATAAA-GTGA-TATATTTTTATCAACTTTATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTCAATTATT-AATAAGTTA-TT---GGT---GCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTGG---C--------------------GA-TTGATTGA-TTGCTTCTGTATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGATCACAATGGAAATAAGA---------GTGTTT-TGTGTTATCCTTGGTGGTGTTGT---GCATGCCGTGGCTCACTATGCCTCAT-TATGTAAAAATTTTATTTCAATATACATGTTGTTTAAA-TTGTC-------------CAT----TACCAAAATAAatatatct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                       gtcaagactaagtcacaagggtgcttatgctgtccctattgttaaagagttttggtcgaagtctttctgcttcagaggatgtactttgtggaacagttaacttgccaatattactcagattgagaaacttccttgtattaaggctgctattgagactcatttgctaaaaatttagcataatttttaatcacatttTTTGTT-T-GTTTTTTTC------------TATACAAATGCAT-TATTAT-----AT--TATGTACCATATAAGACTGTGATATTCATTTAA----ACATGTGATAAATTAAATTTAACT-GTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGA-CATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTTGATTCTT-AAAAAGTTA-TT---AGT---ACAATTAATT----------TTGA----T---T--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCAATATATCA-TGC-----TAACAACA---CAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTCTTTTTTG-T--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAATatctatc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                  aggctaagtcacaaggatgattatgcttccctatgggtttagatttaaatccttctgcttcagaggatgtactttgtggaacagtttacctgccaatatcacttagattgagaaactttcttgttttaaggctgctattaagtctcatttgctcgataacttagcataatttttaatcacattaTTTTTT-TTGTTTTTTT--------------ATATAAATGCAT-CATTAT--T--AT-----GTACCATTTAAGTCTCTGATATTCATTTAA----ACATGTGATAA-TTAAATTTAACT-GTGCT----AGT--TACAATATAAA-GCGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGTATGTGAT-AGT--CGACTCGATTATT-AATAAGTTA-TT---AGT---GCAATTAATTTCTATGATAATCAAGATTT---CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNCCTCTGTATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAAccatcca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                          gaacgccatccactcttacagggcaagactaagtcacaaatgtgctaatgctgttcctatggttaaaaggtttgggtctaagtctttctgccttgtggagtttacctgccaatatcactgaaattgagaaactttcttgttttaagattgctattaagtctcaattgctagataacttggcataatttttaatcacattctttgttgtTTTGTT---GTTTTTTTACATA------TATATAAAAATGC---T-TTAT--C--AG--TATGTACCGTTTAACTCTGTGATATTCATTTAACATGACATGTGATAAATTAAATTTAAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                        gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctatggttaaatggtttgcgtctaagtctttctgctttagaggatgtactttgtggaacagttaacctgccaatatcactcagattgagaaacttccttgtttcaatgctgctattaagtctcatttgctcgataacttagcataattttaatcacattcTTTGTTGTTGTTGTTTTATATA----TATATATATAAATGCAT-TATTAT--C--AT---GTACAC--TTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACATGTGATTAATGAAATTTAACT-GTGCA----CGT--TATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tactttgtgggacagtttacctcccaatattactcagattgagaaacgtccttgttttaaggttgcttttaagtctcatttgatcgataatttttaatcacattcTTGCT-TTGTTTTTTTTA------------ATATAAATATAT-TAATAT--T--ATGATATGTACTATTTATGTCTGTGGTATTCATTTAA----ACACGTGATTAATTAAATTTAACT-GTGCA----AGT--TACAATATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGCATGTTAT-AGT--ATATTTGATTCTT-AATAAGTTA-TT---AGT---GCAATTGATTTCTACGATAATAAA---------------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATAATTTTAATT-------AATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
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gi|20                         :                                                                             atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttatggttatagggtttgggtctaaggctttctacttcagaggatgtactttgtggaacagttttcctgccaatatcacttagactgagaaacttccttgttttaaggctgctattaagtctcatttgctcgataacttagcataacttttaatcacattctttgTATATTTA---GTAT-CAT-AT--TGTAT--TACATACCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC--GTGATAAATTAAATTTAGTT-GTGCA----AGT--TACAGTACAAA-GTGA-TCAA-TTTAATCAACTTAATA--ATGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTTAATTCTT-TAT---TTA-TTAAAAGT---GCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT---------------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccacttaagtctgtgatattcatttaaacatgtgatgaattaaatttaactgtgcaagttacaatataaagtgatatattaaatcaacttaatactgacattgcatgtgatagtctacttcattattaataaattattagtgcaattaatttctatgataattaagg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatATA-ATAATTATATATATTATCGT--AT--TATGTACCAATTAAGTTTGTAATATTCATCTAA----ACCTGTGATAAATTAAATTTAATT-GTGCA----AGT--TACCAT-TAAACGTTA-TAAA-TTTAAT---CCTAATA--CTAATATTGCATGTG----------ACTTAACTCTT-AACAAGCTA-AA---ATT---GCAATTAATTTTAAAGATTATTAAGGTTT---T--------------------TA-CTAATTGA-TTGCCTCTATATGCCA-TGC-----TAACAATA---CAAAGGATCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCTCACGTATATAATAATTGCATTat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atagatgttaatataattgatctatttaaTAAATAATTTTATATAGTATCGT--AT--CATGTACCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACATGTGATATATTTAAT-TAACTTGTGCA----AGT--TACAATGTAAA-GTGA-TATA-TCTCATCAACCTAATA--CTGATATTGCATGTGAA-GGT--ATACTTGATTCTT-AATAAGTAA-AA---AGA---GCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTT---T--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCA-TGC-----TAACAACA---TAAAGGaacagttcattaccgaaataaatctatcta
gi|7                          :                                                                                                          tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaatTTAT--T--ATAGTATGTACCATTAAAGTCTGTGATACCCATTTAA----ACATGTGATAAATTAAATTAAACT-GAGCA----AGT--TTCTTTATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--ATGATATTGCTTGTGAT-AGT--CTACTTGATTCTT-AATAAGTTA-TT---AGT---GAAATTAATTACTATGTTAATTAAGGTTT---C--------------------GA-TTGATTGA-TTGTCTCTGTATGCCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGACTACAATGGAAATAAAAGTTTACTCTTTTTTTGTGTGTTATACTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                            agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctatggttaaagggttttggcccaagtctctctgattcagaggctgtactttgtggaacagtttacctgccaatatcactcagattgagaaacttccttgttttaagattgctattaagttgcatttggtcgataacttagcatactttaaatcatattttatttatcattgttctttgtTACCACTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACATGTGATGAATTAAATTTAACT-GTGCA----AGT--TACAATATAAA-GTGA-TATA-TTAAATCAACTTAATA--CTGACATTGCATGTGAT-AGT--CTACTTCATTATT-AATAAATTA-TT---AGT---GCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGa
gi|13                         :                                                                                         atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttatggttatagggtttgggtctaaggctttctacttcagaggatgtactttgtggaacagttttcctgccaatatcacttagactgagaaacttccttgttttaaggctgctattaagtctcatttgctcgataacttagcataacttttaatcacattctttgttgttgttgtttttttttatatatgaatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTAAATATATAT-ATACATCATAGT--TACAAAATAA--GTGA-TACA-TTTAATCACCTTAATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTGGATTCTT-AATAAGTTA-TT---AGT---GCAATTACTTTTTATGATAATTAAGGTTT---T--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCTGCATGTCC-TGC-----TAGCAACA---CAAAGAACCAGAATGGAAATAAAAGTTTACTCTTTTTTA-T--GTTATCATTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGACTCGCTATGCCGCATGTATGTAATCATTTTA-TTTAATGTACATATTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAATAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatatacatcatagttaACAATATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAATTTAATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CGACTCGATTATT-A----------T-----T---GCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTT---T--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCA-TAC-----TAACAAAA---CAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATAACACAAA--TGAGTCTA-TT-AATCAA-TTACTAACCAAATAATCCA-ATAATCAGTAATCAATCGGTTATTTAGTAAATCAATT---AATTAAACAATCGATCAAT-TGATAAATCA--TTTAACC--------------------AAATTGATTAA---GC---TATAAATCAATACCAATGTAATATCATTTCGAAGGTAAACAGAGGAAATAAGACTTTAC-CATTTTTA-TG----ATCCTTGTTGG---TGT------TAT----------TGT---TC---TATGTAATATTTTTATTT-ATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAccaattaatc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A-TTGTTTAAGTTGTCTATCCATGTTT-TGC-----TATCAACA---CGAAGGACCAAAATAAAAATATGAGTGTACTCTTTTCTG-TG--TTAACCTATATGGTGGTGT---GCATGCCACGGCTCATTTCTCCTCATATGTGTAATA-TTCTATTT-ACTATACACGTTTTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCCT----TACAGAAATAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatgcatctattattttgaatcaggatatgataatactgcactattggtttgaaatgatattatatatgggttgtatatatgtatataactgtagatttcaattaaagtttcatatgacaccgaaaagcttatacatttgtcattctgcattactatcgatgaacttcgtttatttaaaagttttgccaatcgttgcgctgttaaagtctttatatttgacTCTGTATGTCA-TTC-----TAACAACA---CAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTCTTTTTTG-TG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tCTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctatcta
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|27 ): TTTGAGATAAGGATAACAAACTGTTTTTATAGCGCTGTAACATTAATGTTTATAT






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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                                                       TGGTTAAAAGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTTTAATCACATTCTTTGTGTTGTTGTTGTTTTT---T-TTTGTTT---------TTTTNNNNNNNNNNNNGTT-TGTT-TTGTTTTTTT-----T----------TA--TATA-TA----A-ATG--CAT-TATT-A-T-----T--A---T---TAT-G-TA-CCATTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTCGATT-CTTAATAAGTTA-TT---AGT---GCAATTAATTTCTAT-GATAATTAAGGTTT---C--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCTATATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTC-TTTTTTGTG-GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACAATATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAATTTAATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CGACTCGATT------------A-TT---ATT---GCAATTAATTTTTGT-GATAATTAAGGTTT---T--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCA-TAC-----TAACAAAA---CAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                       TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA--TTTTAATCACATTCT--------TTGTTGTTTTT---T-Tccaattaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTT-TGTT---GTTTTTTT-----A----------CA--TATA-TATAAAA-ATG--C---T-TT-A-T-----C--A---G---TAT-G-TA-CCGTTTAACTCTGTGATATTCATTTAACATGACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-acatatatataaaaatgctttatcagtatgtaccgtttaactctgtgatattcatttaacatgacatgtgataaattaaatttaac
gi|18                         :                     gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctatggttaaatggtttgcgtctaagtctttctgctttagaggatgtactttgtggaacagttaacctgccaatatcactcagattgagaaacttccttgtttcaatgctgctattaagtctcatttgctcgataacttagcataattttaatcacattcTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC----CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                  attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG--TTTTAAGCACATTC--TGTGTTGTTTTTATatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttaTT-----T----------TAATTAAA-TA----A-TTT--TATATAGT-A-TCG---T--A---T---CAT-G-TA-CCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGA-TATA-TCTCATCAACCTAATA--CTGATATTGCATGTGAA-GGT--ATACTTGATT-CTTAATAAGTAA-AA---AGA---GCAATTAATTTTTAT-GATAATAAAGGTTT---T--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCA-TGC-----TAACAACA---TAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                                                                                                tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacata-----T----------TA--TATT-TA--------G--TAT-CAT--A-T-----TGTA---T---TAC-A-TA-CCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGA-TCAA-TTTAATCAACTTAATA--ATGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTTAATT-CTTTAT---TTA-TTAAAAGT---GCAATTAATTTCTAT-GATAATTAAGGTTT---------------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCG----------ATAA-TTTTTAATCACATTCTT--TGTTGTTGTTGTTTTat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGT-CTCATTTGATCGATAATTTTTAATCACATTC--TT-TGTTGTTGTTGTTTTATATATA---------TA--TATA-TA----A-ATG--CAT-TATT-A-T-----C--A---T-------G-TA-CACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAatatatatatatataaatgcattattatcatgtacacttcaagtctgtgatattcatttgaacatgtgattaatgaaatttaactgtgcacgttataa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tactttgtgggacagtttacctcccaatattactcagattgagaaacgCTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCA-TTC-----TAACAACA---CAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                          TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTT--TGTTGTTG-----------C-TTTGTTT---------TTTTTAATATAAATATATT-AA-----------------------------TA--T-TA-TG----ATATG--TAC-TAT----T-----T--A---TGTCTGTGG-TATTCATTTAAACACGTGA-------TTA-------AT-----TAAAT-----TTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGCATGTTAT-AGT--ATATTTGATT-CTTAATAAGTTA-TT---AGT---GCAATTGATTTCTAC-GATAATAAA---------------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                             gtcaagactaagtcacaaggatgcttatgctgtccctttagttaGTTAAAGAGTTT-T----GGTCGAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACTTGCCAATATTACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTATTAAGGCTGCTATTGAGACTCATTTGCTAAA-AATTTAGCATAA-TTTTTAATCACATTTTTTGT-------TTGTTTTT---T-TTTA---------------TATATAAATGCA--------------TTATTA-----T----------TA--TATG-TA--------C--CAT---TT-A-TGTCTGT--G---T---TAT------TCATTTAAACATGTGATA------------------------AATTAAATTTAAC-TGTATA----A--GTTACAATATAAA-GTGA-TATATTTTTATCAACTTTATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTCAATT-ATTAATAAGTTA-TT---GGT---GCAATTAATTTCTAT-GATAATTAAGGTGG---C--------------------GA-TTGATTGA-TTGCTTCTGTATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGATCACAATGGAAATAAGAG--------TGTTTTGT--GTTATCCTTGGTGGTGTTGT---GCATGCCGTGGCTCACTATGCCTCAT-TATGTAAAAATTTTATTTCAATATACATGTTGTTTAAA-TTGTC-------------CAT----TACCAAAATAAatgtatct
gi|5                          :                                                                                                                                                                               gtcaagactaagtcacaagggtgcttatgctgtccctattTGGTTATAGGGTTT-G----GGTCTAAGGCTTTCTACTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTTCCTGCCAATATCACTTAGACTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-CTTTTAATCACATTCTT--TGTTGTTGTTGTTTTT---T-TTTA--T---------ATATGAATGCNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNN-----N----------NN--NNNN-NN----N-NNN--NNG-TACC-ACT-----T--AAGTC---TGT-GATATTCATTTAAACATGTGATG---AATTAA----AT-----------TTAA------C-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGA-TATA-TTAAATCAACTTAATA--CTGACATTGCATGTGAT-AGT--CTACTTCATT-ATTAATAAATTA-TT---AGT---GCAATTAATTTCTAT-GATAATTAAGGatctatc
gi|6                          :                                         atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTTTAATCACATTATTTGT-------TTGTTTTT---T-TCTAT----------------ACAAATGCATTATTATATT-ATG-----------------------TAC-CATA-TA----A-G-----AC-TGTG-A-------T--A---T---T---------CATTTAAACATGTGATA---AATTAA----A-----------------TTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGA-CATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGCATGTGAT-AGT--CTACTTGATT-CTTAAAAAGTTA-TT---AGT---ACAATTAATTT---T-GA-----------T---T--------------------GA-TTGATTGA-TTGCCTCAATATATCA-TGC-----TAACAACA---CAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTC-TTTTTTGT--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                    aggctaagtcacaaggatgattatgcttccctatgTGGTTAAAGGGTTT-T----GGCCCAAGTCTCTCTGATTCAGAGGCTGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTTGCATTTGGTCGATAACTTAGCAT-A-CTTTAAATCATAT--TTTAT-TTATCATTGTTCTT---TGTTTATTccatcca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctaTT-----T----------TA--TTTA-TC----A-TTGTTCTT-TGTTTA-T-----T--A---TAG-TAT-G-TA-CCATTAAAGTCTGTGATACCCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTAAAC-TGAGCA----A--GTTTCTTTATAAA-GTGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--ATGATATTGCTTGTGAT-AGT--CTACTTGATT-CTTAATAAGTTA-TT---AGT---GAAATTAATTACTAT-GTTAATTAAGGTTT---C--------------------GA-TTGATTGA-TTGTCTCTGTATGCCA-TGC-----TAACAACA---CAAAGGACTACAATGGAAATAAAAGTTTACTCTTTTTTTGTGTGTTATACTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTAatagtatgtaccattaaagtctgtgatacccatttaaacatgtgataaattaaattaaactgagcaagtttctttataaagtgatatatttaatcaacttaataatgatattgcttgtgatagtctacttgattcttaataagttattagtgaaattaattactatgttaattaaggtttcgattgattgattgtctctgtatgccatgctaacaacacaaaggactacaatggaaataaaagtttactctttttttgtgtgttatacttggtggtggtgtgcatgccatggctcacta
gi|8                          : agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctatggttaaagggttttggcccaagtctctctgattcagaggctgtactttgtggaacagtttacctgccaatatcactcagattgagaaacttccttgttttaagattgctattaagttgcatttggtcgataacttagcatactttaaatcataTGGTTAAAAGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCCT--------------TGTGGA---GTTTACCTGCCAATATCACTGAAATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTCTCAATTGCTAGATAACTTGGCATAA-TTTTTAATCACATTCT--------TTGTTGTTTTT---T-TTTGTTT---------TTTTATATAAATGCATCAT-TATT-ATG-----------------------TAC-CATT-TA----A-GT---CTC-TGAT-A-T-----T--------------------CATTTAAACATGTGATA---ATT----------------------AAATTTAAC-TGTGCT----A--GTTACAATATAAA-GCGA-TATA-TTTAATCAACTTAATA--CTGATATTGTATGTGAT-AGT--CGACTCGATT-ATTAATAAGTTA-TT---AGT---GCAATTAATTTCTAT-GATAATCAAGATTT---CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNCCTCTGTATGTCA-TGC-----TAACAACA---CAAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                           gaacgccatccactcttacagggcaagactaagtcacaaatgtgctaatgctgttcctaTCCCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGTATAA-TTTTTAATCACATCTTTTGT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                                                       TGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTTTAATCACATTCTTTG-TGTTGTTGTTGTTTTT---T-TTTATTT---------TTTTNNATAANNNNNTGT-TTGTT-TTGTTTTTTTT----------TA--TA-TA-TA----A-NTG--CAT-TATT-AT--T--AT--TATGTACCATTTAAGTNTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTC-TTTTTTGTG-GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                  attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG--TTTTAAGCACATTC--TG-TGTTGTTTTTATatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttaTTT----------TAATTA-AA-TA----A-TTT--TATATAGT-ATCGT--AT--CATGTACCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                                                                                                 tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacataT----------TA--TA-TT-TA--------G--TAT-CAT--AT--TGTAT--TACATACCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCG----------ATAA-TTTTTAATCACATTCTT---TGTTGTTGTTGTTTTat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCCTTG-TTTTAAGGTTGCTTTTAAGT-CTCATTTGATCGATAATTTTTAATCACATTCTTTGTTGTTGTTGTTTTATATATA-------TA--TA-TA-TA----A-ATG--CAT-TATT-AT--C--AT-----GTACACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAatatatatatatataaatgcattattatcatgtacacttcaagtctgtgatattcatttgaacatgtgattaatgaaatttaactgtgcacgttataa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tactttgtgggacagtttacctcccaatattactcagattgagaaacgCTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                          TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTTTGTTGTTGCT-TTGTTTTT---T-TTAAT-----------------ATAAATATA-------------------TT----------AA--TATTA-TG----ATATG--TAC-TAT----------T--TATGT-----------CTGTGGTATTCATTTAA----ACAC-GTGATTAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctaTTT----------TA--TT-TA-TC----A-TTGTTCTT-TGTTTAT--T--ATAGTATGTACCATTAAAGTCTGTGATACCCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTAAAC-TGAGCA----A--GTTTCTTTATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCTTGTGATAGTCTACTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGAAATTAATTACTATGTTAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGTCTCTGTATGCCATGCTAACAACACAAAGGACTACAATGGAAATAAAAGTTTACTCTTTTTTTGTGTGTTATACTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTAatagtatgtaccattaaagtctgtgatacccatttaaacatgtgataaattaaattaaactgagcaagtttctttataaagtgatatatttaatcaacttaataatgatattgcttgtgatagtctacttgattcttaataagttattagtgaaattaattactatgttaattaaggtttcgattgattgattgtctctgtatgccatgctaacaacacaaaggactacaatggaaataaaagtttactctttttttgtgtgttatacttggtggtggtgtgcatgccatggctcacta
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                                                       TGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTCTTTGTGTTGTTGTTGTTTTT-T-T----------TTAT---------TTTTTTT---ATAAATGCATTTGTTT-GTTTTTTTT----------TA--TATA-----TAANTG--CAT-TATT-AT--T--AT--TATGTACCATTTAAGTCTGTGATATTCATTTAAACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTC-TTTTTTGTG-GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttgattatatgggagaacattttactccacagaatgctattcattcttacgggtcaaaactaagtaacaagggtgcttatgctgtccctacATATACAT-----CATAGTTATAAAT---ATATA---TATACATCATA--GTTACAAAATAA--GTGATACA-TTTAATCACCTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTGGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTACTTTTTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGCATGTCCTGCTAGCAACACAAAGAACCAGAATGGAAATAAAAGTTTACTC-TTTTTTAT--GTTATCATTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGACTCGCTATGCCGCATGTATGTAATCATTTTA-TTTAATGTACATATTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAATAAaatgttgattatggta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                      tTGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTC---CTGCTACTGAGGGTGTATATTGAGGAAAAGTTTATCTGCCAATATCACTCAGATTGAAACACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGGTCGATAACTTAGCCTAATTTTA-AAACACATTCTTTGTTTTatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttactccacagaacgctattcattattacaggataagtatgctaatgctgttcctaACAGAGGAAATAAGACTTTAC-C-ATTTTTATG----ATCCTTGTTGGTGTT------------ATTGTTC-------------TATGTAATATTTTTA-TTTATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAtaatgaaaataataaatgcattattgaaatatatttttcgtttataggatgtcatctttaactaactgtttgttttatgacgaaccaaatgttgattatggtaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ataacacaaatgagtctattaatcaattactaaccaaataatccaataatcagtaatcaatcggttatttagtaaatcaattaattaaacaatcgatcaattgataaatcatttaaccaaattgattaagctataaatcaataccaatgtaatatcatttcgaaggtaaACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAATTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCGACTCGATT-----------ATT---ATTGCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCATACTAACAAAACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                       TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTT-AATCACATTCT--------TTGTTGTTTTT-T-T----------ACA----------TATATAT---AAAAATGC-TTTATCA-G------------------TA--TGTACCGTTTAACT-----C-TGTG-A---T--AT--T------CATTTAA------------CAT---GACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-ccaattaatc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                  gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                  attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG-TTTT-AAGCACATTC--TGTGTTGTTTTTATatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttaTTT----------TAATTAAA-----TAATTT--TATATAGT-ATCGT--AT--CATGTACCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAAACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                                                                                                      tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacataT----------TA--TATT-----TA---G--TAT-CAT--AT--TGTAT--TACATACCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAAAC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCGATAA----------TTTTT-AATCACATTCTTTGT--TGTTGTTG-----------------------------------TTTT---ATATATA-----------------------------TA--TATA-----TAAATG--CAT-TATT-AT--C--AT-----GTACACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGAACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                          TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCT--------TTGTTGT----------------------------------------------TGC-----TTT-G-TTTTTTT----------TA---ATA-----TAAATA--TAT-TAAT-AT--T--ATGATATGTACTATTTATGTCTGTGGTATTCATTTAAACAC-GTGATTAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                             gtcaagactaagtcacaaggatgcttatgctgtccctttagttaGTTAAAGAGTTT-T----GGTCGAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACTTGCCAATATTACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTATTAAGGCTGCTATTGAGACTCATTTGCTAAA-AATTTAGCATAATTTTT-AATCACATTTTTTGT-------TTGTTTTT-T-T----------TTA--------------TAT---ATAAATGCA----------TTATTAT----------TA--TATG-----TA--------------------------------CCATTTATGTCTGTGTTATTCATTTAAACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTATA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATATTTTTATCAACTTTATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCAATTATTAATAAGTTATT---GGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTGGC--------------------GATTGATTGA-TTGCTTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAG--------TGTTTTGT--GTTATCCTTGGTGGTGTTGT---GCATGCCGTGGCTCACTATGCCTCAT-TATGTAAAAATTTTATTTCAATATACATGTTGTTTAAA-TTGTC-------------CAT----TACCAAAATAAatgtatct
gi|5                          :                                                                                                                                                                               gtcaagactaagtcacaagggtgcttatgctgtccctattTGGTTATAGGGTTT-G----GGTCTAAGGCTTTCTACTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTTCCTGCCAATATCACTTAGACTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAACTTTT-AATCACATTCTTTGT--TGTTGTTGTTTTT-T-T----------TTAT---------AT--------ATGAATGCNNNNNNNN-NNNNNNNNN----------NN--NNNN-----NNNNNN--NNN-NNNN-NN------------GTACCACTTAAGTCTGTGATATTCATTTAAACAT-GTGATGAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTAAATCAACTTAATACTGACATTGCATGTGATAGTCTACTTCATTATTAATAAATTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGatctatc
gi|6                          :                                        atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTATTTGT-------TTGTTTTT-T-T----------CTA----------------T---ACAAATGCATT----------------------------------------ATTA--TAT-TAT----------------GTACCATATAAGACTGTGATATTCATTTAAACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGACATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTTGATTCTTAAAAAGTTATT---AGTACAATTAATTT---TGA-----------TT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCAATATATCATGCTAACAACACAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTC-TTTTTTGT--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                     aggctaagtcacaaggatgattatgcttccctatTGGTTAAAGGGTTT-T----GGCCCAAGTCTCTCTGATTCAGAGGCTGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTTGCATTTGGTCGATAACTTAGCAT-ACTTTA-AATCATAT--TTTAT-TTATCATTGTTCTT-TGT----------TTAT---------Tccatcca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctaTTT----------TA--TTTA-----TCATTGTTCTT-TGTTTAT--T--ATAGTATGTACCATTAAAGTCTGTGATACCCATTTAAACAT-GTGATAAATTAAATTAAAC-TGAGCA----A--GTTTCTTTATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCTTGTGATAGTCTACTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGAAATTAATTACTATGTTAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGTCTCTGTATGCCATGCTAACAACACAAAGGACTACAATGGAAATAAAAGTTTACTCTTTTTTTGTGTGTTATACTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTAatagtatgtaccattaaagtctgtgatacccatttaaacatgtgataaattaaattaaactgagcaagtttctttataaagtgatatatttaatcaacttaataatgatattgcttgtgatagtctacttgattcttaataagttattagtgaaattaattactatgttaattaaggtttcgattgattgattgtctctgtatgccatgctaacaacacaaaggactacaatggaaataaaagtttactctttttttgtgtgttatacttggtggtggtgtgcatgccatggctcacta
gi|8                          : agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctatggttaaagggttttggcccaagtctctctgattcagaggctgtactttgtggaacagtttacctgccaatatcactcagattgagaaacttccttgttttaagattgctattaagttgcatttggtcgataacttagcatactttaaatcataTGGTTAAAAGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCCT--------------TGTGGA---GTTTACCTGCCAATATCACTGAAATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTCTCAATTGCTAGATAACTTGGCATAATTTTT-AATCACATTCTTTGT--------TGTTTTT-T-T----------TT--------------------------------------GTTTTTTT----------------ATA-----TAAATG--CAT-CATT-AT--T--AT-----GTACCATTTAAGTCTCTGATATTCATTTAAACAT-GTGATAA-TTAAATTTAAC-TGTGCT----A--GTTACAATATAAA-GCGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGTATGTGATAGTCGACTCGATTATTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATCAAGATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                         atagatgttaatataattgatctaGGTAAAAGGGTTTCG----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATTTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAAATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAG------ATT--GTCTCATTTGCTCGATAATTTAGCATAATTTTT-AACCACATTCTT----------CTGTTTTT-T-TGT-TTTTTCATAAAATG-C-A---------------Taacagttcattaccgaaataaatctatcta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cttgattatatgggagaacattttactccacagaatgctattcattcttacgggtcaaaactaagtaacaagggtgcttatgctgtccctacATATACAT---------CATAGTTATAAAT---ATATA---TATACATCATA--GTTACAAAATAA--GTGATACA-TTTAATCACCTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTGGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTACTTTTTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGCATGTCCTGCTAGCAACACAAAGAACCAGAATGGAAATAAAAGTTTACTC-TTTTTTAT--GTTATCATTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGACTCGCTATGCCGCATGTATGTAATCATTTTA-TTTAATGTACATATTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAATAAtattgaaagatatttctctgtaaaggatgtgactgttgtttttaataaactttgttttataatgaaccaaatgttgattatggta
gi|14                         :                                                                                                                                                                               tTGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTC---CTGCTACTGAGGGTGTATATTGAGGAAAAGTTTATCTGCCAATATCACTCAGATTGAAACACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGGTCGATAACTTAGCCTAATTTTA-AAACACATTCTTTGT-TTatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttactccacagaacgctattcattattacaggataagtatgctaatgctgttcctaACAGAGGAAATAAGACTTTAC-C-ATTTTTATG----ATCCTTGTTGGTGTT------------ATTGTTC-------------TATGTAATATTTTTA-TTTATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAttaatgaaaataataaatgcattattgaaatatatttttcgtttataggatgtcatctttaactaactgtttgttttatgacgaaccaaatgttgattatggtaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataacacaaatgagtctattaatcaattactaaccaaataatccaataatcagtaatcaatcggttatttagtaaatcaattaattaaacaatcgatcaattgataaatcatttaaccaaattgattaagctataaatcaataccaatgtaatatcatttcgaaggtaaACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAATTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCGACTCGATT-----------ATT---ATTGCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCATACTAACAAAACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTT-AATCACATTCT--------TTGTTGTTTTT-T-----------------TA-C-A---------------TA-------T-----------ATATA-AAAATGC-T---TTAT--C--AG--TATG-TA-CCGTTTAACTCTGTGATATTCATTTAACATGACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-ccaattaatc
gi|18                         :                                                                                                                                           gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                           attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTTA---TAGTTTT--AAGCACATTCT-------GT-GTTGTTTTT------AT-----GT-AAATG-C-A---------------Tatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttaATTTAATGT-AATTGAC-A---------------TATTTTAATT-----------A-A-A-TAATTTTATATAGTATCGT--AT--CATG-TA-CCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCtattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                                                                    tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggTT-----------ATATT-TA---GTAT-CAT-AT--TGTAT--TACA-TA-CCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                              aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCG----------ATAATTTTT-AATCACATTCTTTG--TTGTTGTTG--------------TTTTAT-ATATA----------------------------T-----------ATATA-TAAATGC----ATTAT--T--AT--CATG-TA-CACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                   TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTTTGT-T----GTTGCTTT------------------------------------------GTTTTTTTT-----------A-ATA-TAAATATAT-TAATAT--T--ATGATATG-TA-CTATTTATGTCTGTGGTATTCATTTAA----ACAC-GTGATTAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
gi|4                          :                                                                                                                                      gtcaagactaagtcacaaggatgcttatgctgtccctttagttaGTTAAAGAGTTT-T----GGTCGAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACTTGCCAATATTACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTATTAAGGCTGCTATTGAGACTCATTTGCTAAA-AATTTAGCATAATTTTT-AATCACATTTT-----TTGT--TTGTTTTT-T-TTT-------------------------------------------------------ATATA-TAAATGCAT-TATTAT--T--A---TATG-TA-CCATTTATGTCTGTGTTATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTATA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATATTTTTATCAACTTTATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCAATTATTAATAAGTTATT---GGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTGGC--------------------GATTGATTGA-TTGCTTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAG--------TGTTTTGT--GTTATCCTTGGTGGTGTTGT---GCATGCCGTGGCTCACTATGCCTCAT-TATGTAAAAATTTTATTTCAATATACATGTTGTTTAAA-TTGTC-------------CAT----TACCAAAATAAatgtatct
gi|5                          :                                                                                                                                        gtcaagactaagtcacaagggtgcttatgctgtccctattTGGTTATAGGGTTT-G----GGTCTAAGGCTTTCTACTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTTCCTGCCAATATCACTTAGACTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAACTTTT-AATCACATTCTTTG--TTGTTGTTGTTTTT-T-TTTA---TATAT-GAATG-CNN---------------NNNNNNNNNN-----------NNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNN--N--NN--NNNG-TA-CCACTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATGAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTAAATCAACTTAATACTGACATTGCATGTGATAGTCTACTTCATTATTAATAAATTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGatctatc
gi|6                          : atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTATTTGT-------TTGTTTTT-T-TCTA-----TAC-AAA----------------------------------------------------TGCAT-TATTA---T--AT--TATG-TA-CCATATAAGACTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGACATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTTGATTCTTAAAAAGTTATT---AGTACAATTAATTT---TGA-----------TT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCAATATATCATGCTAACAACACAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTC-TTTTTTGT--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
gi|7                          :                                                                                                                                              aggctaagtcacaaggatgattatgcttccctatTGGTTAAAGGGTTT-T----GGCCCAAGTCTCTCTGATTCAGAGGCTGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTTGCATTTGGTCGATAACTTAGCAT-ACTTTA-AATCATAT--TTTAT-TTATCATTGTTCTT-TGTTTA----TTAT-A---G-T-A---------------TGT--------------------------AC--CAT-TAAAGT------C--TGTGATACCCATTTAAACATGTGA--------TAA----AT-------TAAATTA-----AAC-TGAGCA----A--GTTTCTTTATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCTTGTGATAGTCTACTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGAAATTAATTACTATGTTAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGTCTCTGTATGCCATGCTAACAACACAAAGGACTACAATGGAAATAAAAGTTTACTCTTTTTTTGTGTGTTATACTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTAccatcca
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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                TGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGT-TTGT-GTTGTTTTT------TTTTATTT--TATAAA--------TG-C---AT-GTTTT--TT-------------ATATA-TAAATGCAT-TATTAT--T--AT--TATGTACCATTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTC-TTTTTTGTG-GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cttgattatatgggagaacattttactccacagaatgctattcattcttacgggtcaaaactaagtaacaagggtgcttatgctgtccctacATATACAT---------CATAGTTATAAAT---ATATA---TATACATCATA--GTTACAAAATAA--GTGATACA-TTTAATCACCTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTGGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTACTTTTTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGCATGTCCTGCTAGCAACACAAAGAACCAGAATGGAAATAAAAGTTTACTC-TTTTTTAT--GTTATCATTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGACTCGCTATGCCGCATGTATGTAATCATTTTA-TTTAATGTACATATTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAATAAtattgaaagatatttctctgtaaaggatgtgactgttgtttttaataaactttgttttataatgaaccaaatgttgattatggta
gi|14                         :                                                                                                                                                                               tTGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTC---CTGCTACTGAGGGTGTATATTGAGGAAAAGTTTATCTGCCAATATCACTCAGATTGAAACACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGGTCGATAACTTAGCCTAATTTTA-AAACACATTCTT-TGT-TTatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttactccacagaacgctattcattattacaggataagtatgctaatgctgttcctaACAGAGGAAATAAGACTTTAC-C-ATTTTTATG----ATCCTTGTTGGTGTT------------ATTGTTC-------------TATGTAATATTTTTA-TTTATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAttaatgaaaataataaatgcattattgaaatatatttttcgtttataggatgtcatctttaactaactgtttgttttatgacgaaccaaatgttgattatggtaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataacacaaatgagtctattaatcaattactaaccaaataatccaataatcagtaatcaatcggttatttagtaaatcaattaattaaacaatcgatcaattgataaatcatttaaccaaattgattaagctataaatcaataccaatgtaatatcatttcgaaggtaaACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAATTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCGACTCGATT-----------ATT---ATTGCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCATACTAACAAAACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTT-AATCACATTCTT--------T-GTTGTTTTT------T-----------------------TA-C---AT-A-------T-------------ATATA-AAAATGC-T---TTAT--C--AG--TATGTACCGTTTAACTCTGTGATATTCATTTAACATGACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-ccaattaatc
gi|18                         :                                                                                                                                           gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                           attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG-TTTT-AAGCACATTC--------TGT-GTTG----T------TTTTA-----TGTAAA--------TG-C---AT-atctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttaATTTAATGTAAT--------TGAC---AT-ATTTTAATT-------------A-A-A-TAATTTTATATAGTATCGT--AT--CATGTACCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCtattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                                                                  tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatatagg--TT-------------ATATT-TA---GTAT-CAT-AT--TGTAT--TACATACCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                              aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCGATAA----------TTTTT-AATCACATTCTT-TGT-T----GTTGTTGTT------TTATAT-----ATA----------------------------T-------------ATATA-TAAATGCAT-TATTAT--C--AT-----GTACACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                   TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTT-TGT-T----GTTGCTTTG------TTTT---------------------------------TT--TT-------------A-ATA-TAAATATAT-TAATAT--T--ATGATATGTACTATTTATGTCTGTGGTATTCATTTAA----ACAC-GTGATTAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
gi|4                          :                                                                                                                                      gtcaagactaagtcacaaggatgcttatgctgtccctttagttaGTTAAAGAGTTT-T----GGTCGAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACTTGCCAATATTACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTATTAAGGCTGCTATTGAGACTCATTTGCTAAA-AATTTAGCATAATTTTT-AATCACATTTTT-TGT-TTG-----------------------TT--T------------------------TTTT--TT-------------ATATA-TAAATGCAT-TATTAT--T--A---TATGTACCATTTATGTCTGTGTTATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTATA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATATTTTTATCAACTTTATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCAATTATTAATAAGTTATT---GGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTGGC--------------------GATTGATTGA-TTGCTTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAG--------TGTTTTGT--GTTATCCTTGGTGGTGTTGT---GCATGCCGTGGCTCACTATGCCTCAT-TATGTAAAAATTTTATTTCAATATACATGTTGTTTAAA-TTGTC-------------CAT----TACCAAAATAAatgtatct
gi|5                          :                                                                                                                                        gtcaagactaagtcacaagggtgcttatgctgtccctattTGGTTATAGGGTTT-G----GGTCTAAGGCTTTCTACTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTTCCTGCCAATATCACTTAGACTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAACTTTT-AATCACATTCTT-TGT-TGTT-GTTGTTTTT------TTTTA-TA--TATGAA--------TG-CNNNNN-NNNNN--NN-------------NNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNN--N--NN--NNNGTACCACTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATGAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTAAATCAACTTAATACTGACATTGCATGTGATAGTCTACTTCATTATTAATAAATTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGatctatc
gi|6                          : atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTATT-TGT-TTGT-----TTTTT------TCT-------------------------------------------------------ATA-CAAATGCAT-TATTA---T--AT--TATGTACCATATAAGACTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGACATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTTGATTCTTAAAAAGTTATT---AGTACAATTAATTT---TGA-----------TT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCAATATATCATGCTAACAACACAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTC-TTTTTTGT--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                    gaacgccatccactcttacagggcaagactaagtcacaaatgtgctaatgctgttcctaTCCCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGTATAATTTTT-AATCACATCTTT-TGT-TT------------------TTTTGTTT--T--------------------------TT--TT-------------ATATA-TAAATGCAT-TATTAA--T--A----ATGTATCATTTAAGTATGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTAAGAAATTAAATGTAAC-TGTGCA----A--GTTA---TATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCACG-AATTGTCTACTTAAGTCTTATTTAGTTATT---AGTGCAATTACTTTCTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCGTCTATATGTCATGCTAACAACACAAATGACCACAATGG----AAGAA-TTACTC-TTTTTTGT--GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACAATGCCTTATGTATGTGATAATTTTA-GTTAATGTACATGTTGTTTTAA-CTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGATATAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                TGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGT--T-TTGTTGTTTTT------TTTTAT-T-TTAA-----------TGCA--T-G---TTTTTT-------------A--TATA-TAAATGCAT-TATTAT--T--AT--TAT---GTACCATTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTC-TTTTTTGTG-GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cttgattatatgggagaacattttactccacagaatgctattcattcttacgggtcaaaactaagtaacaagggtgcttatgctgtccctacATATACAT---------CATAGTTATAAAT---ATATA---TATACATCATA--GTTACAAAATAA--GTGATACA-TTTAATCACCTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTGGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTACTTTTTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGCATGTCCTGCTAGCAACACAAAGAACCAGAATGGAAATAAAAGTTTACTC-TTTTTTAT--GTTATCATTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGACTCGCTATGCCGCATGTATGTAATCATTTTA-TTTAATGTACATATTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAATAAtattgaaagatatttctctgtaaaggatgtgactgttgtttttaataaactttgttttataatgaaccaaatgttgattatggta
gi|14                         :                                                                                                                                                                               tTGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTC---CTGCTACTGAGGGTGTATATTGAGGAAAAGTTTATCTGCCAATATCACTCAGATTGAAACACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGGTCGATAACTTAGCCTAATTTTA-AAACACATTCTT-TGT--T-TTatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttactccacagaacgctattcattattacaggataagtatgctaatgctgttcctaACAGAGGAAATAAGACTTTAC-C-ATTTTTATG----ATCCTTGTTGGTGTT------------ATTGTTC-------------TATGTAATATTTTTA-TTTATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAtaatgaaaataataaatgcattattgaaatatatttttcgtttataggatgtcatctttaactaactgtttgttttatgacgaaccaaatgttgattatggtaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ataacacaaatgagtctattaatcaattactaaccaaataatccaataatcagtaatcaatcggttatttagtaaatcaattaattaaacaatcgatcaattgataaatcatttaaccaaattgattaagctataaatcaataccaatgtaatatcatttcgaaggtaaACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAATTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCGACTCGATT-----------ATT---ATTGCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCATACTAACAAAACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTT--AATCACATTCTT-TGT--T------GTTTTT------TT-----------------------ACA--T-A---T------------------A--TATA-AAAATGC---T-TTAT--C--AG--TAT---GTACCGTTTAACTCTGTGATATTCATTTAACATGACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-ccaattaatc
gi|18                         :                                                                                                                                           gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                           attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG-TTTT-AAGCACATTC---TG------TGTTG----T------TTTTAT-G-TAAA-----------TGCA--T-atctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtcctta-T-TTAA-----------TGTAATT-GACATATTTT-------------AATTAAA-TAATTTTATATAGTATCGT--AT--CAT---GTACCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCtattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                                                                  tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggaTT-------------A--TATT-TA---GTAT-CAT-AT--TGTAT--TAC---ATACCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                              aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCGATAA----------TTTTT-AATCACATTCTT-TGT--TGTTGTTGTTTT-------------------A-----------TATA--T-A---T------------------A--TATA-TAAATGCAT-TATTAT--C--AT--------GTACACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                   TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTT-TGT--T---GTTGCTTTG------TTTT----------------------------------TTTT-------------A---ATA-TAAATATAT-TAATAT--T--ATGATAT---GTACTATTTATGTCTGTGGTATTCATTTAA----ACAC-GTGATTAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
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gi|6                          : atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTATT-TGT-------TTGTTTTT------TTC-------------------------------------------------------TATA-CAAATGCAT-TATTA---T--AT--TAT---GTACCATATAAGACTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGACATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTTGATTCTTAAAAAGTTATT---AGTACAATTAATTT---TGA-----------TT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCAATATATCATGCTAACAACACAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTC-TTTTTTGT--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                TGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGTT-TTGTTGTTTTTTTTTAT-TATGCATG--------TTTTTAT-ATA-TAAATGCAT-TATTAT--T--AT--TATGTACCATTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTC-TTTTTTGTG-GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                         atagatgttaatataattgatctaGGTAAAAGGGTTTCG----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATTTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAAATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAG------ATT--GTCTCATTTGCTCGATAATTTAGCATAATTTTT-AACCACATTCTTCTGTT-TTTTTGTTTTTTCATAA-AATGCATaacagttcattaccgaaataaatctatcta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cttgattatatgggagaacattttactccacagaatgctattcattcttacgggtcaaaactaagtaacaagggtgcttatgctgtccctacATATACAT---------CATAGTTATAAAT---ATATA---TATACATCATA--GTTACAAAATAA--GTGATACA-TTTAATCACCTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTGGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTACTTTTTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGCATGTCCTGCTAGCAACACAAAGAACCAGAATGGAAATAAAAGTTTACTC-TTTTTTAT--GTTATCATTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGACTCGCTATGCCGCATGTATGTAATCATTTTA-TTTAATGTACATATTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAATAAtattgaaagatatttctctgtaaaggatgtgactgttgtttttaataaactttgttttataatgaaccaaatgttgattatggta
gi|14                         :                                                                                                                                                                               tTGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTC---CTGCTACTGAGGGTGTATATTGAGGAAAAGTTTATCTGCCAATATCACTCAGATTGAAACACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGGTCGATAACTTAGCCTAATTTTA-AAACACATTCTT-TGTT-TTatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttactccacagaacgctattcattattacaggataagtatgctaatgctgttcctaACAGAGGAAATAAGACTTTAC-C-ATTTTTATG----ATCCTTGTTGGTGTT------------ATTGTTC-------------TATGTAATATTTTTA-TTTATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAtaatgaaaataataaatgcattattgaaatatatttttcgtttataggatgtcatctttaactaactgtttgttttatgacgaaccaaatgttgattatggtaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataacacaaatgagtctattaatcaattactaaccaaataatccaataatcagtaatcaatcggttatttagtaaatcaattaattaaacaatcgatcaattgataaatcatttaaccaaattgattaagctataaatcaataccaatgtaatatcatttcgaaggtaaACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAATTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCGACTCGATT-----------ATT---ATTGCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCATACTAACAAAACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTT-AATCACATTC------T-TTGTTGTTTTTT--------TACATA------------TAT-ATA-AAAATGC-T---TTAT--C--AG--TATGTACCGTTTAACTCTGTGATATTCATTTAACATGACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-ccaattaatc
gi|18                         :                                                                                                                                           gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                           attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG-TTTT-AAGCACATTC---TG----TGTTGTTTTTATGTA--AATGCATatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttaCATA--------TTTTAATTAAA-TAATTTTATATAGTATCGT--AT--CATGTACCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCtattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                              tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgaTTAT-ATT-TA---GTAT-CAT-AT--TGTAT--TACATACCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                              aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCG----------ATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGTTGTTGTTGTT--------T-TATATATA------------TAT-ATA-TAAATGC----ATTAT--T--AT--CATGTACACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                   TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTT-TGTT---GTTGCTTTGTTTT--------------------TTTTA--ATA-TAAATATAT-TAATAT--T--ATGATATGTACTATTTATGTCTGTGGTATTCATTTAA----ACAC-GTGATTAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
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gi|6                          : atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTATT-TGT-----TTGTTTTTTTC--------------------------T-ATA-CAAATGCAT-TATTA---T--AT--TATGTACCATATAAGACTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGACATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTTGATTCTTAAAAAGTTATT---AGTACAATTAATTT---TGA-----------TT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCAATATATCATGCTAACAACACAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTC-TTTTTTGT--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
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gi|8                          :                                                                                                                    agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctaTGGTTAAAAGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCCT--------------TGTGGA---GTTTACCTGCCAATATCACTGAAATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTCTCAATTGCTAGATAACTTGGCATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGTT------GTTTTTTTTT----------G--------TTTTTTT-ATA-TAAATGCAT-CATTAT--T--AT-----GTACCATTTAAGTCTCTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAA-TTAAATTTAAC-TGTGCT----A--GTTACAATATAAA-GCGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGTATGTGATAGTCGACTCGATTATTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATCAAGATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                TGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTCTTTGTT-TTGTTGTTTTTTTTTAT-A--T---GATG--------TTTTTA--TATA-TAAATGCAT-TATTAT--T--AT--TATGTACCATTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTC-TTTTTTGTG-GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                      atagatgttaaGGTAAAAGGGTTTCG----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATTTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAAATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAG------ATT--GTCTCATTTGCTCGATAATTTAGCATAATTTTT-AACCACATTCTTC--------TGTTTTTTT---------------G--------TTTTTT--CATA--AAATGCAT-TATTaacagttcattaccgaaataaatctatcta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cttgattatatgggagaacattttactccacagaatgctattcattcttacgggtcaaaactaagtaacaagggtgcttatgctgtccctacATATACAT---------CATAGTTATAAAT---ATATA---TATACATCATA--GTTACAAAATAA--GTGATACA-TTTAATCACCTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTGGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTACTTTTTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGCATGTCCTGCTAGCAACACAAAGAACCAGAATGGAAATAAAAGTTTACTC-TTTTTTAT--GTTATCATTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGACTCGCTATGCCGCATGTATGTAATCATTTTA-TTTAATGTACATATTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAATAAgaaagatatttctctgtaaaggatgtgactgttgtttttaataaactttgttttataatgaaccaaatgttgattatggta
gi|14                         :                                                                                                                                                                               tTGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTC---CTGCTACTGAGGGTGTATATTGAGGAAAAGTTTATCTGCCAATATCACTCAGATTGAAACACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGGTCGATAACTTAGCCTAATTTTA-AAACACATTCTTTG-------------TTTTTA--A--T---GAAA-------------A--TA-A-TAAATGCAT-TATTatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttactccacagaacgctattcattattacaggataagtatgctaatgctgttcctaACAGAGGAAATAAGACTTTAC-C-ATTTTTATG----ATCCTTGTTGGTGTT------------ATTGTTC-------------TATGTAATATTTTTA-TTTATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAgaaatatatttttcgtttataggatgtcatctttaactaactgtttgttttatgacgaaccaaatgttgattatggtaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataacacaaatgagtctattaatcaattactaaccaaataatccaataatcagtaatcaatcggttatttagtaaatcaattaattaaacaatcgatcaattgataaatcatttaaccaaattgattaagctataaatcaataccaatgtaatatcatttcgaaggtaaACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAATTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCGACTCGATT-----------ATT---ATTGCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCATACTAACAAAACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTT-AATCACATTC-----T-TTGTTGTTTTTTTACAT-A----------------------TA--TATA-AAAATGC-T---TTAT--C--AG--TATGTACCGTTTAACTCTGTGATATTCATTTAACATGACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-ccaattaatc
gi|18                         :                                                                                                                                           gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                           attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG-TTTT-AAGCACATTC--TG----TGTTGTTTT-----------------------------------TATG-TAAATGCAT-TATTatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttaTTTTAATTAAA-TAATTTTATATAGTATCGT--AT--CATGTACCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                            tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacataTTA--TATT-TA---GTAT-CAT-AT--TGTAT--TACATACCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                              aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCG----------ATAATTTTT-AATCACATTCTTTG---TTGTTGTTGTTTTATAT-A--T---A---------------TA--TATA-TAAATGC----ATTAT--T--AT--CATGTACACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                   TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTTTGTT---GTTGCTTTGTTTT-----------------------TTTTA---ATA-TAAATATAT-TAATAT--T--ATGATATGTACTATTTATGTCTGTGGTATTCATTTAA----ACAC-GTGATTAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
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gi|6                          : atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTATTTGT-----TTGTTTTTTTC-------------------------------TATA-CAAATGCAT-TATTA---T--AT--TATGTACCATATAAGACTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGACATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTTGATTCTTAAAAAGTTATT---AGTACAATTAATTT---TGA-----------TT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCAATATATCATGCTAACAACACAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTC-TTTTTTGT--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                TGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGTT-TTGTTGTTTTTTTTTAT-ATGT---------------TTTA--TAT-A-TAAATGCAT-TA---TTAT--T--AT--TATGTACCATTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTC-TTTTTTGTG-GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cttgattatatgggagaacattttactccacagaatgctattcattcttacgggtcaaaactaagtaacaagggtgcttatgctgtccctacATATACAT---------CATAGTTATAAAT---ATATA---TATACATCATA--GTTACAAAATAA--GTGATACA-TTTAATCACCTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTGGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTACTTTTTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGCATGTCCTGCTAGCAACACAAAGAACCAGAATGGAAATAAAAGTTTACTC-TTTTTTAT--GTTATCATTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGACTCGCTATGCCGCATGTATGTAATCATTTTA-TTTAATGTACATATTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAATAAgaaagatatttctctgtaaaggatgtgactgttgtttttaataaactttgttttataatgaaccaaatgttgattatggta
gi|14                         :                                                                                                                                                                               tTGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTC---CTGCTACTGAGGGTGTATATTGAGGAAAAGTTTATCTGCCAATATCACTCAGATTGAAACACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGGTCGATAACTTAGCCTAATTTTA-AAACACATTCTT-TG-------------TTTTTA--ATG------------------AA--AATAA-TAAATGCAT-TA---TTatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttactccacagaacgctattcattattacaggataagtatgctaatgctgttcctaACAGAGGAAATAAGACTTTAC-C-ATTTTTATG----ATCCTTGTTGGTGTT------------ATTGTTC-------------TATGTAATATTTTTA-TTTATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAgaaatatatttttcgtttataggatgtcatctttaactaactgtttgttttatgacgaaccaaatgttgattatggtaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ataacacaaatgagtctattaatcaattactaaccaaataatccaataatcagtaatcaatcggttatttagtaaatcaattaattaaacaatcgatcaattgataaatcatttaaccaaattgattaagctataaatcaataccaatgtaatatcatttcgaaggtaaACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAATTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCGACTCGATT-----------ATT---ATTGCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCATACTAACAAAACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTT-AATCACATTC------T-TTGTTGTTTTTTTACAT-A--------------------TA--TAT-A-AAAATGC-T------TTAT--C--AG--TATGTACCGTTTAACTCTGTGATATTCATTTAACATGACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-ccaattaatc
gi|18                         :                                                                                                                                           gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTT-TTTTTTGTG--TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                           attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG-TTTT-AAGCACATTC---TG----TGTTGTTTT---------------------------------TAT-G-TAAATGCAT-TA---TTatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttaTTGAC-ATAT---------------TTTAATTAA-A-TAATTTTATATA---GTATCGT--AT--CATGTACCTTTTAAATCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATATATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA----------GTGCATTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                                                   tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaaTTA--TAT-T-TA---GTAT-CA---T-AT--TGTAT--TACATACCATTTAAGTCTGGGATATTCATTTAA----AC---GTGATAAATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                              aaTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCG----------ATAATTTTT-AATCACATTCTT-TG---TTGTTGTTGTTTTATAT-ATA------------------TA--TAT-A-TAAATGC----A---TTAT--T--AT--CATGTACACTTCAAGTCTGTGATATTCATTTGA----ACAT-GTGATTAATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTC-TTTTTTGTG--TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                   TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTT-TGTT---GTTGCTTTGTTTT------T---------------TTTA---AT-A-TAAATATAT-TA---ATAT--T--ATGATATGTACTATTTATGTCTGTGGTATTCATTTAA----ACAC-GTGATTAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCAC-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
gi|4                          :                                                                                                                                      gtcaagactaagtcacaaggatgcttatgctgtccctttagttaGTTAAAGAGTTT-T----GGTCGAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACTTGCCAATATTACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTATTAAGGCTGCTATTGAGACTCATTTGCTAAA-AATTTAGCATAATTTTT-AATCACATTTTT-TGTT-T----GTTTTTTTTTAT-AT---------------------------A-TAAATGCAT-TA---TTAT--T--A---TATGTACCATTTATGTCTGTGTTATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTATA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATATTTTTATCAACTTTATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCAATTATTAATAAGTTATT---GGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTGGC--------------------GATTGATTGA-TTGCTTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAG--------TGTTTTGT--GTTATCCTTGGTGGTGTTGT---GCATGCCGTGGCTCACTATGCCTCAT-TATGTAAAAATTTTATTTCAATATACATGTTGTTTAAA-TTGTC-------------CAT----TACCAAAATAAatgtatct
gi|5                          :                                                                                                                                        gtcaagactaagtcacaagggtgcttatgctgtccctattTGGTTATAGGGTTT-G----GGTCTAAGGCTTTCTACTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTTCCTGCCAATATCACTTAGACTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAACTTTT-AATCACATTCTT-TGTTGTTGTTGTTTTTTTTTAT-ATATGAATGCNNNNNNNNNNNNN--NNN-N-NNNNNNNNN-NN---NNNN--N--NN--NNNGTACCACTTAAGTCTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATGAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTAAATCAACTTAATACTGACATTGCATGTGATAGTCTACTTCATTATTAATAAATTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGatctatc
gi|6                          : atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTATT-TGT-----TTGTTTTTTTC-----------------------------TAT-A-CAAATGCAT-TA---TTA---T--AT--TATGTACCATATAAGACTGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGACATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTTGATTCTTAAAAAGTTATT---AGTACAATTAATTT---TGA-----------TT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCAATATATCATGCTAACAACACAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTC-TTTTTTGT--GTTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
gi|7                          :                                                                                                                                              aggctaagtcacaaggatgattatgcttccctatTGGTTAAAGGGTTT-T----GGCCCAAGTCTCTCTGATTCAGAGGCTGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTTGCATTTGGTCGATAACTTAGCATA-CTTTA-AATCATATTTTA-TTTA-TCATTGTTCTTT--------GT---------------TT---------------------A---TTAT-----AG--TATGTACCATTAAAGTCTGTGATACCCATTTAA----ACAT-GTGATAAATTAAATTAAAC-TGAGCA----A--GTTTCTTTATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCTTGTGATAGTCTACTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGAAATTAATTACTATGTTAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGTCTCTGTATGCCATGCTAACAACACAAAGGACTACAATGGAAATAAAAGTTTACTCTTTTTTTGTGTGTTATACTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTAccatcca
gi|8                          :                                                                                                                    agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctaTGGTTAAAAGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCCT--------------TGTGGA---GTTTACCTGCCAATATCACTGAAATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTCTCAATTGCTAGATAACTTGGCATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGTT------GTTTTTTTTTGT----T---------------TTTT--TAT-A-TAAATGCAT-CA---TTAT--T--AT-----GTACCATTTAAGTCTCTGATATTCATTTAA----ACAT-GTGATAA-TTAAATTTAAC-TGTGCT----A--GTTACAATATAAA-GCGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGTATGTGATAGTCGACTCGATTATTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATCAAGATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                    gaacgccatccactcttacagggcaagactaagtcacaaatgtgctaatgctgttcctaTCCCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGTATAATTTTT-AATCACATCTTT-TGTT-TTTTTGTTTTTTTT--------------------------A--TAT-A-TAAATGCAT-TA---TTAA--T--A----ATGTATCATTTAAGTATGTGATATTCATTTAA----ACAT-GTAAGAAATTAAATGTAAC-TGTGCA----A--GTTA---TATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCACG-AATTGTCTACTTAAGTCTTATTTAGTTATT---AGTGCAATTACTTTCTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCGTCTATATGTCATGCTAACAACACAAATGACCACAATGG----AAGAA-TTACTC-TTTTTTGT--GTTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACAATGCCTTATGTATGTGATAATTTTA-GTTAATGTACATGTTGTTTTAA-CTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGATATAA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              C TTTG                                                                                                                                     T            C  TTGTTG          TTATATATGAATGCNNNNNNNNNNNNNN     A A         A  .      CGT   TGA                                 CATG    A                   T      TCAT AT             C        T                                         T    C             AAA                                CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN          G                                                   GT      T        GCA                   GGG                                    A     T                      T               T     TTAA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . .                                                                                                                                        .            .  TTTTG           TGACATATTTTAATT                  . .         A  .      CGT   T                                   .       .                   .      .    .              .        .                                         G    C             .                                  T                              .                                                   NN      .        GTG                   .                                      A     T                      .               .     .   
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGTTGGTCAGATTGTCTGTTGTCATGTGTTTACAGTAAAAAATGGGTTAGCCCCTGATTATATGGGAGAACATTTTACTCCAAAGAATGCA
Unaligned ( gi|27 ): TTTGAGATAAGGATAACAAACTGTTTTTATAGCGCTGTAACATTAATGTTTATAT






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Reference ( family-4514 )     :                                                                                                                                                                                TGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGTT-TTG--TTGTTTT-TT-TTTA-----T----ATATAT--AAATGCAT-TATTAT--T--AT--TATGTACCATTTAAGTCTGTGATATT-----CATTTAA----ACAT-GTGATA-------------------AATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGACCACAATGGAAATAAGAGTTTACTCTTTTT---TGTG-TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGCCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAATAA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                               tTGGTTAAAGGGTTT-G----GGTCTAAGTC---CTGCTACTGAGGGTGTATATTGAGGAAAAGTTTATCTGCCAATATCACTCAGATTGAAACACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGGTCGATAACTTAGCCTAATTTTA-AAACACATTCTT-TGTT-TT---------------TAA-----TGAAAATA-AT--AAATGCAT-TATTatctatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttactccacagaacgctattcattattacaggataagtatgctaatgctgttcctaACAGAGGAAATAAGACTTTAC-CATTTT---TATG---ATCCTTGTTGGTGTT------------ATTGTTC-------------TATGTAATATTTTTA-TTTATTGTACATGTTGTTTCAATTTGTTCATGTATACA-CTCCT----TACCGAAAgaaatatatttttcgtttataggatgtcatctttaactaactgtttgttttatgacgaaccaaatgttgattatggtaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ataacacaaatgagtctattaatcaattactaaccaaataatccaataatcagtaatcaatcggttatttagtaaatcaattaattaaacaatcgatcaattgataaatcatttaaccaaattgattaagctataaatcaataccaatgtaatatcatttcgaaggtaaACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAATTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCGACTCGATT-----------ATT---ATTGCAATTAATTTTTGTGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATTTGTCATACTAACAAAACAAAGGACCACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATGCCTCATGTACGTTTTACTTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACCGAAAaccgaaataaatatatcaatttat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                TGGTTAAATGGTTT-G----CGTCTAAGTCTTTCTGCTTTAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTCAATGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAA-TTTT-AATCACATTC------T-TTG--TTGTTTT-TT-TACA-----T----ATATATAAAAATGC-T---TTAT--C--AG--TATGTACCGTTTAACTCTGTGATATT-----CATTTAACATGACAT-GTGATA-------------------AATTAAATTTAAC-ccaattaatc
gi|18                         :                                                                                                                                           gccaagactaagccacatggtgcttttgctgtccctaTGGTTAAAGGATTT-G----GGTCTTAGTCTTTTTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTTGAACAATTTACCTGCCAATATCAGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgttagtctctttaaacgtgttaccaattaacaaacgtgttgatcagattgtctgttgtcttgtgcttacgataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatgggagcatattttactccacagaacacttttcacgcttacatgtcaaaattaagccacaagagtgtttatgctgtcccttAAC-CAAAGAACCACAATGGAAACA---GTTTACTTTTTTT---TGTG-TTATCCTTGG-GGTGGTGT---GCATGCCATTGCTCACTATACCTCATGTATGTAATAATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTCA-CTGTCCATGTATGCA-TTAAT----TACCGAAAGAAcgtcagtatttttttgcatt
gi|2                          :                                                                                                                                           attatttctactgtttataaaaaggatatggtaaatgTGGTTAAAGGGTTT-GTTTGGATCTAAGTCCTTCTGCTTCAGATGATGTACTTTGTGGAATATTTTAACTGCCAATATTCCTCAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATCTGCTCGATAACTT---ATAG-TTTT-AAGCACATTC---TG----TG--TTGTTTT-------------------TATGT--AAATGCAT-TATTatctatctataaatctatctataaatctatctataaatctatctgtgtaactaactaactgtaaaacattaatgtaattgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtcctta-TT-TTAA-----T-----TAAAT--AATTTTATATAGTATCGT--AT--CATGTACCTTTTAAATCTGTGATATT-----CATTTAA----ACAT-GTGATA-------------------TATTTAA-TTAACTTGTGCA----A--GTTACAATGTAAA-GTGATATA-TCTCATCAACCTAATACTGATATTGCATGTGAAGGTATACTTGATTCTTAATAAGTAAAA---AGAGCAATTAATTTTTATGATAATAAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCTATGTGTCATGCTAACAACATAAAGG---TCAACG-----------TTA-------G---TGCA-TTATCCTTGGTGGTAGTTT---GCATGCgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacatattttaattaaataattttatatagtatcgtatcatgtaccttttaaatctgtgatattcatttaaacatgtgatatatttaattaacttgtgcaagttacaatgtaaagtgatatatctcatcaacctaatactgatattgcatgtgaaggtatacttgattcttaataagtaaaaagagcaattaatttttatgataataaaggttttgattgattgattgcctctatgtgtcatgctaacaacataaaggtcaacgttagtgcattatccttggtggtagtttgcatgct
gi|20                         :                                         tcttaatggtcaagacaaagtcacaagggtgtttatgctgtccttatggttaaagggtttgtttggatctaagtccttctgcttcagatgatgtactttgtggaatattttaactgccaatattcctcagattgagaaactttcttgttttaaggctgcttttaagtctcatctgctcgataacttatagttttaagcacattctgtgttgtttttatgtaaatgcattattgaaagatatatttcggcatagggtgtctttttaataaactatttcttttataacaaacaaaacttttaaatataggatttaatgtaattgacata-----T----ATATTT--A---GTAT-CAT-AT--TGTAT--TACATACCATTTAAGTCTGGGATATT-----CATTTAA----AC---GTGATA-------------------AATTAAATTTAGT-TGTGCA----A--GTTACAGTACAAA-GTGATCAA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCATGTGATAGTCTACTTAATTCTTTAT---TTATTAAAAGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTTT-----------------------TT-ATTGA-TTGTCTC--TATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAGTTTACTt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                             aatTACTTTGTGGGACAGTTTACCTCCCAATATTACTCAGATTGAGAAACGTCCTTGTTTTAAGGTTGCTTTTAAGTCTCATTTGATCG----------ATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGTTGTTG--TTGTTTTATA-TATA-----T----ATATAT--AAATGC----ATTAT--T--AT--CATGTACACTTCAAGTCTGTGATATT-----CATTTGA----ACAT-GTGATT-------------------AATGAAATTTAAC-TGTGCA----C--GTTATAAat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTATGCCTCATGTATGTTATACTTTTATTT-ACTGTACAGGCTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atcgattctcatttttccaaacttgcaattaaatgaacacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGTATGTCATTCTAACAACACAAAGGACCACAATTGAAATAAGAATTTACTCTTTTT---TGTG-TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGTCATGGCCCACTATACCTCATATATGTAATAATTTTATTTCAATGTTCATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGTA-TTCAT----TACCGAAATAAatctatcta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTATGTCTCAAGTATGTAACAATTGTATTTTGGTG------------TAA-TTGTCCATTT----A-TTCAT----TAGCGAAATAAatctatct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCAGGTATGTGATCATTTTATTTTAATGTACATGTTGTTTTAA-TTGTACATGTGTGCA-TTCATTTAATACCGAAATAAatctaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAatctatct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                   TTGAATGGTTT-G----TATATAATTCCTGCTGCTTCAAAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCCGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCCATTAAGTCTCATTTGCTCGAAAGCTTAGCATAATTTTTTAACCACATTCTT-TGTTGTTGCTTTGTTTT-TT-TT------------A-ATAT--AAATATAT-TAATAT--T--ATGATATGTACTATTTATGTCTGTGGTATT-----CATTTAA----ACAC-GTGATT-------------------AATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTTATAGTATATTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGCAATTGATTTCTACGATAATAAA-----------------------------------A-TTGCCTCTATATGCCATGCTAACAACACAAAGGACCACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNTCACAATGCCTCATGTATGTAATA-----ATTTTAAT-TA-ATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATACATTTCAT----TACCGAAAGAA
gi|4                          :                                                                                                                                      gtcaagactaagtcacaaggatgcttatgctgtccctttagttaGTTAAAGAGTTT-T----GGTCGAAGTCTTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTAACTTGCCAATATTACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTATTAAGGCTGCTATTGAGACTCATTTGCTAAA-AATTTAGCATAATTTTT-AATCACATTTTT-TGTT-T------GTTTT-TT-TTTA-----T----ATATA----AATGCAT-TATTAT--T--A---TATGTACCATTTATGTCTGTGTTATT-----CATTTAA----ACAT-GTGATA-------------------AATTAAATTTAAC-TGTATA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATATTTTTATCAACTTTATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTCAATTATTAATAAGTTATT---GGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGTGGC--------------------GATTGATTGA-TTGCTTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAAGGATCACAATGGAAATAAGAG-------TGTTT---TGTG-TTATCCTTGGTGGTGTTGT---GCATGCCGTGGCTCACTATGCCTCAT-TATGTAAAAATTTTATTTCAATATACATGTTGTTTAAA-TTGTC-------------CAT----TACCAAAATAAatgtatct
gi|5                          :                                                                                                                                        gtcaagactaagtcacaagggtgcttatgctgtccctattTGGTTATAGGGTTT-G----GGTCTAAGGCTTTCTACTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTTCCTGCCAATATCACTTAGACTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAACTTTT-AATCACATTCTT-TGTTGTTG--TTGTTTT-TT-TT-------T----ATATAT--GAATGCNN-NNNNNN--N--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACCACTTAA----GTCT-GTGATATTCATTTAAACATGTGATGAATTAAATTTAAC-TGTGCA----A--GTTACAATATAAA-GTGATATA-TTAAATCAACTTAATACTGACATTGCATGTGATAGTCTACTTCATTATTAATAAATTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATTAAGGatctatc
gi|6                          : atgccagaccttaaaactggttaccaattaacaaacttgttgatcagattgtctgtcgtcatgtggttaagataaaaaaaaatgggttagcccctgattatatatgagaacattttactccacagaacgctattcattcttacaggtcaatactacgtcacacgggtgcctatggtgtccttaGGGTTT-A----GATTTAAATCCTTCTGCTTCAGAGGATGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTTAGATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGGCTGCTATTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGCATAATTTTT-AATCACATTATT-TGT-------TTGTTTT-TT-TC-------------TATAC--AAATGCAT-TATTA---T--AT--TATGTACCATATAAGACTGTGATATT-----CATTTAA----ACAT-GTGATA-------------------AATTAAATTTAAC-TGTGCA----AATATTATGATATAAA-GTGACATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCATGTGATAGTCTACTTGATTCTTAAAAAGTTATT---AGTACAATTAATTT---TGA-----------TT--------------------GATTGATTGA-TTGCCTCAATATATCATGCTAACAACACAAAAGACCACAGTTGAAATAAA-----ACTCTTTTT---TGTG-TTATTCTTGGTGGTGGGGTGGGGTGGGCCATGGCTCACTTTGCCTCATGTATGTAATAATTTTA-TTTAACGTACATGTTGTTTTAA-TTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGAAAT
gi|7                          :                                                                                                                                              aggctaagtcacaaggatgattatgcttccctatTGGTTAAAGGGTTT-T----GGCCCAAGTCTCTCTGATTCAGAGGCTGTACTTTGTGGAACAGTTTACCTGCCAATATCACTCAGATTGAGAAACTTCCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTTGCATTTGGTCGATAACTTAGCATA-CTTTA-AATCATATT--T-TATT-T-A--TCATTGT-TC-TTTG-----T-------------------T-TATTAT-----AG--TATGTACCATTAAAGTCTGTGATACC-----CATTTAA----ACAT-GTGATA-------------------AATTAAATTAAAC-TGAGCA----A--GTTTCTTTATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATAATGATATTGCTTGTGATAGTCTACTTGATTCTTAATAAGTTATT---AGTGAAATTAATTACTATGTTAATTAAGGTTTC--------------------GATTGATTGA-TTGTCTCTGTATGCCATGCTAACAACACAAAGGACTACAATGGAAATAAAAGTTTACTCTTTTTTTGTGTG-TTATACTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACTAccatcca
gi|8                          :                                                                                                                    agaacgctaaacagtattacaggtcaagactacgtcacaaggatgattatgctttccctaTGGTTAAAAGGTTT-G----GGTCTAAGTCTTTCTGCCT--------------TGTGGA---GTTTACCTGCCAATATCACTGAAATTGAGAAACTTTCTTGTTTTAAGATTGCTATTAAGTCTCAATTGCTAGATAACTTGGCATAATTTTT-AATCACATTCTT-TGTT---G--TTTTTTT-TTGTTTT-----T----TTATAT--AAATGCAT-CATTAT--T--AT-----GTACCATTTAAGTCTCTGATATT-----CATTTAA----ACAT-GTGATA-------------------A-TTAAATTTAAC-TGTGCT----A--GTTACAATATAAA-GCGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGTATGTGATAGTCGACTCGATTATTAATAAGTTATT---AGTGCAATTAATTTCTATGATAATCAAGATTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNCCTCTGTATGTCATGCTAACAACACAAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                    gaacgccatccactcttacagggcaagactaagtcacaaatgtgctaatgctgttcctaTCCCTTGTTTTAAGGCTGCTTTTAAGTCTCATTTGCTCGATAACTTAGTATAATTTTT-AATCACATCTTT-TGTT-TTT--TTGTTTT-TT-TT------------ATATAT--AAATGCAT-TATTAA--T--A----ATGTATCATTTAAGTATGTGATATT-----CATTTAA----ACAT-GTAAGA-------------------AATTAAATGTAAC-TGTGCA----A--GTTA---TATAAA-GTGATATA-TTTAATCAACTTAATACTGATATTGCACG-AATTGTCTACTTAAGTCTTATTTAGTTATT---AGTGCAATTACTTTCTATGATAATTAAGGTTTT--------------------GATTGATTGA-TTGCGTCTATATGTCATGCTAACAACACAAATGACCACAATGG----AAGAA-TTACTCTTTTT---TGTG-TTATCCTTGGTGGTGGTGT---GCATGCCATGGCTCACAATGCCTTATGTATGTGATAATTTTA-GTTAATGTACATGTTGTTTTAA-CTGTCCATGTATGCA-TTCAT----TACTGATATAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TGTTGGTCAGATTGTCTGTTGTCATGTGTTTACAGTAAAAAATGGGTTAGCCCCTGATTATATGGGAGAACATTTTACTCCAAAGAATGCA
Unaligned ( gi|27 ): TTTGAGATAAGGATAACAAACTGTTTTTATAGCGCTGTAACATTAATGTTTATAT