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gi|7 : tatcttcATT--CATAT-G--TAATTCAGTCATTTTGATT-ATTTA--TTTG-----AATTTTATATCGCCGTAATTATATATAC----T--T----TCAAATTGTT---A--TA----T--C--TGTGTATTGACTGTGATA-TCATT--TAGGCCCGTCAGGCTGGTTTCTTCATTTTCAATTAGTGT-ATACATGCTCTCTATTGATTTGATAATGAACATGTCACTTGAA-TAA--A-A--TACTTAC--
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Reference ( family-4484 ) : NCCAAATAAAAGACTTTGCA-ATTCTGTGATACTAGCTCCGTTGAAAACGAACCGNATCTTT-TA--TAACTGTC-----TATGATGATGCAAGAAGTGATGTATTTCGT-GTAAATA-TTNATAACATAGCTTATTTAACTCTTGATTGTACAGAGAAA-----T---TT-AAACACATCATACTTAGTGATCAAA--------GAAAG-TTGCCAAGATTTT-AACCAAAGCGTTCC---TA--AAAAGAAGAA-AC--TCAGCTTACAATA-ACTCGTAACTACA--TTCATT---TATTCGGTATTATTTGTTAAAA-------------GTAAAACACGTT--TATAT-T--TAGTACAGCCATTTTGTNT-ATTTA--TTTG-----AATTTGATATCGCCATAACTGTTTATATCATGT--T----TTAAA----T---A--TG----A--C--TTTGTATTGTC---GATAGTGACTTATAGGCCCATCGGGCCGGGTGCTTCATTCTCATTTANTGT-TTANATGCTTTTTATTGATTTGTTAATGCACATGTCACTTTAATAAAAAA--TACTTAC--TTAC
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gi|10 : tTT--TATAT-A--TAATATAGCCATTT-GTTT-ATTTTGTTTTGTTTTTAGTTTAATATCGCCATAACTGTTTATATCATGT--A----TTAAA----T---A--TGAT--A--C--TTTGTA--GTC---GATAGCGACTTATAGGTCGATCTGGCAGGATGTTTCATTTTCATTTATTGTGTTA-ATTCTTTCAATTGATTTGTCAATGTGCATgagttaatttacattct
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Alignments
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lowQualScore : ..... . . . ..... ...... . . . . . . .. ......... . . . ........ . . .. .... . ..... ... . .. . .. .. ... . ........................... ... . .. .... . . . .. ..... ....... .... ... .. .... .. .. ... . . . . . . . . . . . ..... ..
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Reference ( family-4484 ) : NCCAAATAAAAGACTTTGCA-ATTCTGTGATACTAGCTCCGTTGAAAACGAACCGNATCTTT-TA--TAACTGTC-----TATGATGATGCAAGAAGTGATGTATTTCGT-GTAAATA-TTNATAACATAGCTTATTTAACTCTTGATTGTACAGAGAAA-----T---TT-AAACACATCATACTTAGTGATCAAA--------GAAAG-TTGCCAAGATTTT-AACCAAAGCGTTCC---TA--AAAAGAAGAA-AC--TCAGCTTACAATA-ACTCGTAACTACA--TTCATT---TATTCGGTATTATTTGT----T--A-------------------AAA--CACGTT--TATAT-T--TAGTACAGCCATTTTGTNT-ATTTA--TTTG-----AATTTGATATCGCCATAACTGTTTATATCATGT--T----TTAAA----T---A--TG----A--C--TTTGTATTGTC---GATAGTGACTTATAGGCCCATCGGGCCGGGTGCTTCATTCTCATTTANTGT-TTANATGCTTTTTATTGATTTGTTAATGCACATGTCACTTT-AATAAAA----TACTTAC--TTAC
gi|1 : CCAAATCAAAGACATTGCAGATTCTGTGATACAAGCTCCATTGAAAACGAACCGTATCTTT-TACTTAACTGTTAATATTATTATG-TGTAAGAAGTGATTTAGTTCGT-GTAAATA-ATTATAACATAGCTTATTTAATTCTTGATTGTTCAAAGAAA-----T---TT-AAACATATCATACTTAGTGATCGAA--------GAAAG-TTGCCAAGATTT--AACCAAAGCGTTCC---TA--TAAAGAAGAA-AC--TCCGCTTACAATA-ATTCATAACTCCA--TTCATT---AATTCAGTATTATTTGT----T--AAAAACTATTTTACTTTGTAAAA--CACGTT--TATAT-T--TAGTACAACAATTTCGTAT-ATTAA--TTTG-----AATTTAATATCGGCATAACTGTTTATATCATGT--C----TGAAA----T---A--TG----A--C--TTTGTATTGTC---TATAGAGACTTATAGGTCCATCGAGCCGGGTGCATCATTCTCATTTAGTGT-TTATATGCTTTTCATTTACTTGTCAATGCACATGTCACTTTAAAAAAAA----TACTTACAGTTAC
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gi|11 : aAAACAAAAGACTTTACACATTATGTGATACTAGCTCCGTAGTAGACGAACTTCATCTTTATA--TAACTGTC-----------AGCACAAGAGACGATGTATTTCTT-TTAAGTT-TTAATATCAGAGACTATTCAATTCTTAATTGT
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gi|13 : GTCATAAAG--------GAAAG-TTGCTAAG--TTT-A--TAAAG-GTTTT---TATTAAAACAAGAC-AC--TCGGTTAACAATATACTAGTAcatgc
gi|14 : AAA-----TG--TTGAAACACGCCATACTTAGTGATCAAATTGCCAGGGGAAG-TTGTTAAGTTATT-AATT-AAGCCTTCCCTTTA--AAAATAAGAAGACGTTAAGCTTACGATA-ccagaacagactaatatcgtaataataaaaataacattaatagtaacgataatat
gi|15 : CTTCATTCTCAT---ATGC-TTATATACGTTTTATTGATTTGCTAATGCATATGTCAATTT-AATAGAA----TATTTAC--TTAC
gi|16 : TTTT-AACCAAAGCGTTGT---TG--AAAAGAAGAA-AC--TCAGCTTACAATA-ACTCATAACTACAGCTTCATcttcctacttacttatttacttact
gi|17 : A-TTAATTGCATAGCTTATTTAACTCTTGATTGTAC-GAGAA
gi|2 : TC-----TATGATGATATAATAAGTGATATATTTCGT-ATAGATA-TTAATAACATAGCTTTTTTAACTCTTGATTGTACAGAGAAA-----T---TT-AAAAATATCATACTTAGTGATCAAAG-------GAAAG-TTGCCAAATTTTT-AACGAAAGTGTACC---TA--AAAAGAAGAA-AC--TCAGCTTACAATA-ACTCACAACTCCA--TTCATT---TAATCGGTATTATTTGT----A--A-------------------AAACCCACATT--TATATATTATAGTATAACCATTTTGTAT-ATTTA--TTTG-----AATTTGATATCGCTAAAACTGTTTATATCATGT--T----TTAAA----TTCGA--T-----A--C--TTTAT
gi|3 : gttcatTTCGT-GTT--TAGTTTA-AACATA-----TTTAACTCTTGATTATACACAGAAA-----T---TT-TAAT---------TTAGTGATCAAA--------GGAAGGTTGCCAAGATTTT-AACCAAAGCGTTCC---TG--AAAAGAAGAA-AC--TCAGCTTAAAATA-ACTCGTAGCTACA--TTCATT---TATTCAGTATCATTTGT----TAAA-------------------AAA--AACATT--TATATATTATAGTATAACCATTTTGTAT-ATCAA--TTTG-----AATTTGATATCGCCATAACTGTTTATATCATGT--T----TTAAC----T---A--GG----A--C--ACTGTGT
gi|4 : CATAACT-TTTATATCATGT--T----TTGAA----T---A--TG----A--CACTTTGTATTATT---GTTTGTGACTTATAGGTCCATCGGTCTGGATGCTTCATTCTTATTTATTGT-TTAAATGCTTTTTATTGATTTGTTAATGCACAAGTTAATTT-AATTAAAGATCTACTTAT--TTAC
gi|5 : tactttgtatgacaaacacaaatatgtaacattggcagcaaactcgtaaaagaaaaataggtgaaagtagacatatgTA-ACC--TACCTATA--TTCATT---TATTCAGTATTATTTGT----T--A-------------------AG---CACATTCATATAT-TA-TAGTACAACCATTCTGTAT-ATTTA--TTTA-----AATTTGATATTGCCATAACTGTTTATATCTTGT--T----TTGAA----T---A--TGAT--A--C--TTTGTATTATT---GATAGTGACTTATAGGCCCATCAGGCCGGGTGC-------------------TTAAA-----TTTATTGATTTGTTAATGCATACGTCACTTT-AATACAA----GATTTAC--ATACttacctacttatgccttctgtttttgt
gi|6 : C-----TATGATG--GCAGGGAGTGGCATATATCAT-ATAAATA-TTTATAGCATAGATGATTTAACTCTTGATAGTAGAGAGAAAAACTTTGAATT-AAACACATCATACTCAGTGATCAAAG-------GAAAG-GTGCC-AGATTTTCAATAAAAACTTTTC---T---AAAAGAAGAA-AC--TTAGTTTACAATA-ATTC-TGACTACA--TTCACTTAATATTTGGTA--ACTTGTATAGT--A-------------------AAA--ttacttgtttactatatt
gi|7 : tatcttcTT--CATAT-G--TAATTCAGTCATTTTGATT-ATTTA--TTTG-----AATTTTATATCGCCGTAATTATATATAC----T--T----TCAAATTGTT---A--TA----T--C--TGTGTATTGACTGTGATA-TCATT--TAGGCCCGTCAGGCTGGTTTCTTCATTTTCAATTAGTGT-ATACATGCTCTCTATTGATTTGATAATGAACATGTCACTTG-AATAAAA----TACTTAC--
gi|8 : ataattaaattaattcataaT--TATAT-T----ATATAGCCATTTTGTTTTCTTTG--CTTG-----AACTTAAGTTTACCATAACTGTCAATATCATGT--T----TTAAA----T---A--TG----ATAC--TTTGTATTGTC---GATAGTGAATTATAGGCCCATTGGGCCGGGTGATCCATTCTTATTTATTGT-TTATATGCTTTATATTGATTTGGAAATCCATGTGTCAC-TC-AATAAAA-----ACTT
gi|9 : ccCCAAATAAAAGACTT--------CTGTGTTACTAGCTTCATTGAAATGGAACTGAGTTTTT-T---------TC-----TATGATGATGCCAGGAGTGATGTATATCATAGTATATA-TTAATAACAT--TCTATTT-----TTGAGCGTACAGACAAA-----T---AC-ACACAAATCATACTTAGTGACC-------------TAG-TTGTCA--ATT------------GTT-----TA--AAAAGAAG-A-AC--TCGGCTTATAAtg