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gi|6 : acTATTAACCGAAATTATTAAAGTG---TTTCATTAT------TACCAATATATGACAAAATAAATGTACATACACACATGTGACATATCTGAACAAAGTTA--TAACAT------------------------T-ATGTTACTCT--AGAATCTTTTGAAT-GT---TTTTTAAA--T--CG-TC-TTTGT--GT
gi|7 : atgttaaaacaaacgttttctatgatagatggatatatattttTTA--AAATATA--CAGTTTAATTTT-------ATA-ATGTTACTTT--CGAATCTTTTGCGT-GT---TTGTTAAA--T--CA-GT-TTTGT--TTCT-AA---A--------AGAGGATGATCTTTC--CTCAGACATGGAAAATGA-TTT--------ATAT---AA-AT---TTAG--TCTGTAACAACATTTGGTGTTGAATGTCCTTATTTAA-ACGCTTTc
gi|8 : TAATGATTTAAAC------AGTG---TTTCATCTT------TTCAAATATA--------------CACATATACACACGTGAAATATCTGAACAAATCTA--CAAAATA--CATGTTAAATGT-------TTTAACCTTATTCT----AATAT----AAT-GC---TTTT--AA--TGACG----TTTGT--GTAT-AA---ggatagat
gi|9 : atagagagacatatctATTGACTTAAACTATTACAGTT---TTTTACCAT------AACAAATATATGACAAAATAAATACACATACATATTCTTGACATATCTGAACACAGTTA--TAATATA--CAGTTTAATTAT-------ATT-ATGCTtagcggatg
blockSeqs : T CTT . C TCT CT C AAAAAAA A AA A AAC G TT CGTATA T G AAGAGAATGAT TC AG TA GGTCTGTG TGGAGATGCA T AC A T
blockSeqs : T . . C A . A . . . . . G . TGGG C . AAGAGGAT TC . A G AAAA T . C .
blockSeqs : C . . C A . T . . . . . T . CGGT A . AAC TA . A . TTGT T . T .
blockSeqs : T . . C A . A . . . . . C . CGTC T . AAT GG . A . AAAT A . A .
blockSeqs : T . . C A . A . . . . . T . CAGT G . CAC TC . T . AAAT T .
blockSeqs : T . . C T . T . . . . . G . GACG T . AGG C . T . AAA T .
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blockSeqs : . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . T .
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originalCons : TATTGACTTAAACTATTACAGTT---TTTCATCAT------TACAAATATATGACAAAATAAATACACATACACACACGTGACATATCTGAACAAAGTTA--NAATATA--CAGTTTAATTNT-------ATT-ATGTTACTCT--CGAATCTTTTGAAT-GT---TTNTTAAA--T--CG-GT-TTTGT--NTAT-AA---A--------A-----CGATCTTTT--CTCAAACATGGAAAATAA-ATT--------ATAT---AA-AT---TTAG--TCTGTAACAACATTTGGTATTGAACATCTTAATTTAA-ACGCTTTT
finalCons : TATTGACTTAAACTATTACAGTT---TTTCATCAT------TACAAATATATGACAAAATAAATACACATACACACACGTGACATATCTGAACAAAGTTA--NAATATA--CAGTTTAATTNT-------ATT-ATGTTACTCT--CGAATCTTTTGAAT-GT---TTNTTAAA--T--CG-GT-TTTGTN--TAT-AAAAC----------------GATCTTTT--CTCAAACATGGAAAATAAA-TT--------ATATAAAT-------TTAG--TCTGTAACAACATTTGGTATTGAACATCTTAATTTAA-ACGCTTTT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TATTGTCTGTTTGATATATATATATATCGTATGTGTTAATTGAAATACATGCATCGAATTTTTAATTTATCTCTCAATCAGATATA
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Unaligned ( gi|18 ): TACACAGAATGATAGTTGACCATAAATTGTTGGAT
Alignments
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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