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lowQualScore                  :     ......    ..  .     ..........................  ... ..  ...     ........    .   ..   ..       .........................................  ..  .. ..... .. .. .  ..  . ....  .  ..    ........   . ....    .........     ....... ...     .... ......   ...  ....      ..        ....    .........  ...  ..  .   ............................. ...    .. .    ..        ..........         
lowQualScore                  :     000000    00  0     99999999999999999999999999  111 99  222     88888888    2   66   44       88888888888888888888888888888888888888888  99  88 22222 99 77 1  99  1 1111  1  11    77777777   1 4444    999999999     9999999 222     5555 000000   777  5555      55        9999    111111111  000  77  2   99999999999999999999999999999 888    88 0    00        0000000000         
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Reference ( gi|1 )            : CCTT--TAATATATTATT-GTCATTTTGCGATTAT--------TTT----TTT-TA--TCCGCCATAA-AT-----TACTGTGT-GATA--TTCTGACCACT------ACT-GCTC--AA-A--T-GA-A--T--T---AA--AC--A-----T--G--C-TA--TT-T-T--TGTTT--TTAGT---G-A-AAA-AT-T-AAAAAT-CATA--TCAGT--CCT--C---ATACC---TTC--T--TAT-GGAT----TAGCCA--ATCAAAATGTG-GCTT-TC-A--G-AATA-TGG-TC-ATC-T-----T--G---TA--AC---GA----ACA-TAAAGTA-TGTACTAAAACATA----------TCTGTTTCTT
gi|2                          : CCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTATATGTACAGTCC----TTT-GA--TCGGTCATAA-TA-----TACTATAT-TATA--TACTGACC--T-------CT-GCTT--GA-A--T-GG-T--A--T---AA--AC--A-----TTTG--C-TA--TT-T-C--TGTTTTATTA-----G-G-AAA-AT-C-AAAAAG-TACA--TCTGT--TCC--C---TTGTC---GTA--T--TAT-CAGT----TAACAA--AT-AAAATACG-CCTTATA-A--A-AATG-TAA-TTGACCGT-----C--A---TA--AC---AAT---AAA-CAAAGAA-T
gi|5                          :                 TT-GTCAT------ATTAT--------TTTCTCTTTTATA--TTGGTCAAAA-ATATTCATA-TATATCAATA--TTCTGACCTCA------GCT-AGTC--TA-A--T-------T--TG--AA--AC--A-----A--G--C-TA--CT-G-C--TGTTTC-TTAGA---G-A-GAG-A----AACAAT-TA-ACCTCTGT--CTG--A---ACACC---TTG--C--TAT-CAAT----TAGCCA--ATCAAAATATT-GCTTATA-A--A-AATG-GGA-TC-ATC-T-----a
gi|4                          :                               ATTCT--------CCT----TTG-CA--TCAAACATAA--T-----TACTACGT-AATA--TTTTGAC--CT-------CT-GCTC--AA-AT-T-G-----T--TCA-AA--AC--A-----T--G----TA--TTAT-T--TCTAT--TTAGGAA-G-G-AAA-AT-TGAGAAATGCGTA----AGC--TTG--C---ATATC---ATG--G--TAT-GGATCTAATAGCTG--ATAAAATTATG-GCTT-ACAA--A-AATG-TAA-TA-GTC-T-----TCCA---TA--ACAATAA----ACA-TGAAGTA-cacccggctatgacagtaaaataaatct
gi|17                         :                    atgcattgtaggtccT--------TCT----TTT-CA--CCAGCTGTAA-AT-----TACTATGT-AATA--TTTTG---ACT------TCT-GCTC--AA-C--TAAA-A--T--T---Agtgc
gi|11                         :                                              T----TTG-CA--TCAGTCATAA-CT-----TACTGTGC-AATT--TTTTGGCGGCT----------GCTC--AG-A----GT-A--T--A---AA--AC--A-----T--G--C-TT--TT-T-C--TATTT--TTAGC---A-G-GAA-AT-T----------TG--TCAGT--TCT--A---ATAAC---TTT--G--TAT--AAT----TATCCA--ATCAAAATACT-GTTG-AT-A--A-AACA-AGA-TC-ATC-tatcagttctcacaccctgctatctattagccaatcaaaatacatgttataaaaatgtgatcatctggaaagaaaactaaaaaagcgtaataaaaaa
gi|16                         :                                          tctcc----TTT-TAGATCAATCATAA-AT-----CACTGTGT-AATA--TTCTGACCTCT------CCT-------------T-GA-A---------AC--AT--G-----T--G--C-TT--TT-T-C--TGTTT--TTAGT---G-G-GGA-AA-T-A------CATT--T--GT--CTG--C---ACACC---TTG--T--TA----ATCAG-TAGCCA--ATTAAAATATG-GCTT-AC-AC-C-AAAG-TGA-TC-A-----------------A--GT---GA----ACA-TGAagggcctgtggtaacagtaaacaaaattg
gi|14                         :                                              c----TTA-TA--TCAGACATTA-TT-----TACCCTGT-AGTA--TTTTGATCTCTGTCAGAAGT-GTAC--AA-AAAT-GA-T--T--T--------T--G-----T--G--C-TA--TT-T-C--TATTT--T-AGA---G-A-AAT-AA-T-AAAA---CATA------------------ATGC-----TG--T--TAT-TGAT----TAGCCA--ATCAAAAGATA-GTTT-ACAA--A-AATG-TGA-GC-ATctg
gi|3                          :                                            ccatcctcccagA--TCGGTCATAACAC-----T-CTGTGT-AATA--ATCTGACCTCT-------CT-GTTC--TA-G--T-AATA--C--A---AA--ACAAA-----C--T--C-TA--TC-C-T--AATTT--GT--T---G----AA-ATGT-AAGATT-CCCA--CCAGT----T--C---ATACG---TCC--TACTGT-CGAG----TATTCA--ATatgagtct
gi|12                         :                                                  gtactctttgatacCATAA-AT-----TACAGAGT-ACTA--TTCTGACCTCT------GCTTGATT--AGTA--T-AA-AACC--T---AA---T--A-----T--G--C-TA--TC-T-C--TGGCT--TTAGC---A-G-AAA-AA-T-AAAAGT-CATG--TCAGT--CTG--C---ATGCCTAATTG--C--TAT-TGAT----TGGCCA--ATCAACA-GTG-AACA-TC-A--G-AGC--TGG-TT-ATtctgtattcaatcaagttacaggcgaaagaagtgacaacctgtatctgtcatatcgataaataaaagtaactgaagta
gi|23                         :                                                        cctttgatCATAA-TG-----TACCATGT-AATA--ATCTGAC--CT-------TT-GCTC--GA-A--TAGC-A--T--G---AACTAT--G-----T--G--T-TG--TT-T-C--TGATT--TTAGC---G-G-GGA-AA-T-AAAAAT-TACG--TCGAT--CCA--C---ACAaccagcaaactaaatgat
gi|21                         :                                                                CATGA-AT-----TACTCTAT-AATA--TTC-AAACAT--------CT-GCTC---G-A--T----A--T--TACAAA--AC--A-----T--G--TGTA--AT-G-C--AGGTT--TTAGC---G-G-GCA-GA-T-AAAATT-CACG--TCAGT--CCGA-CGAAGTAAC----TC--T--CAT----T----TAGCCA--GTCAAatttgctccagcttac
gi|20                         :                                                            ttaatATAA-AT-----GTCTATGT-AATA--TTCTGGCCTCT------GCT-G-----AG-A--TAGT-A--C--A---AA--AC--ATG---T--G--C-TA--TT-T-C--TA-TT--TTAGTTTGG-G-AAA-AT-T-GAGAAA-CATG--TCA----TCTGGC---ATGTC---TTG--C--TAT-GGAC----TA
gi|8                          :                                                  ctcctttgcattgatcaga-AT-----TGCTCTGT-AATA--TTGTAATC--T-------CT-GCGC--GA-A--C-GG-T--T--TT--AA--AC--A-----T--GGAC-C-------------TCT--TTAAA---G-G-GAA-AA-T-GAAAAT-TTTG--TCTGT--CCG--C---ACACC---TTG--C--TAT-CGAT----TATCCA--ATCAGAATAAC-TCTT-CC-AATG-AA-A-TGA-TC-ATC-tg
gi|24                         :                                                                taccttgc-----TACTGTGT-AATA--TTCTGAA-ATT--------T-GCTTGTAA-A----GT-A--T--A---AA--AT--A-----T--GAGC-AA--TT-T-TATTGTTT--TAAGCAG-G-T-AAA-AT---AAACAT-TACA--TCAGT--CTG--C---ATCCT---CTA--T--TAT-CAAT----TAGCCA--cgatcctgtcataccagtaaacaaaatataacgttattatata
gi|13                         :                                                                                  TGT-AATG--TTCTGAC--CT-------CT-GCTT--AG-A--TAGC-A--T--T---TA--ACTTG-----T--G--C-TC--TT-T-C--TGTTTC-TTAG----G-A-GGACAT-T-AAAAAT--ATG--TCGG---CCT------ATG-T---GTC--T--TA----AT------GT----ATCAAAGTATG-GCTG-AC-A--A-AAAACTGG-TC-ACC-T-----
gi|9                          :                                                                                  aGT-CATAAGTTCTGGCC--T-------CT-GCTT--AA-A--T-AG-T--T--T---GA--A---A-----T--GAGC-TA--TT-C-TC-TTTTT--TTACC---A-G-AAA-AG-T-AAATAG-TACA--CCAGT--CAG--C---ACATC---TTA--C--TATCAAAC----TA-CCA--ATCAGAATACA-GCTGATC-A--A-AAGG-TGA-TC-ACC-T-----gaaccagtcatgacagtaaacaaaaattgtgtaatgataca
gi|15                         :                                                                                        ttccattgcatcgCT------ACT-G------A-A--T-TA-G--TACT---AA--AC--AGAACTT--G--A-TAAATT-T-T--TG-TT--TTAGC---G-AGAGA-AT-T-GAGAA---AT---TCAGCAGCTTG-C---ATGTC---ATG--T--TGT-TGAT----TGACCA--ATCAAAGTACG-GCTT-ACAA--A-AATG-TAA-TC-GTC-T-----gatcctgtcacaacagttaataaaagtgacaaaa
gi|29                         :                                                                                                             tCT-GCTCC-AA-A--C-GT-A--T--G---GA--GC--A-----T--G--C-TA--TT-T-T--TGTTT--TTAGTC--G-G-AAA-AT----AAACT-TACG--TCAG---CTT--C---ACACT---TTA--C--TCT-AGAT----TAGCCgattttgtcatagccattattaaaaaagatgaagca
gi|31                         :                                                                                                                                        t---AA--AG--A-----T--G--T-TA--TT-TCT--TATTT--T-------G-A-AAA-AT-A-GAAAAT-AATA--CCAGT--CTG--C---ACACC---TTA--T--TTT-CGAT----TAACCA--ATCAACAAGTG-ta
gi|6                          :                                                                                                                                            gA--AC--A-----T--T--T-CA--CT-T-C--TGTGT--TTAGT---GTG-AAA-AT----AAAAT-CA-A--CCAGT--CCA--C---ACACA---TGG--C--TAT-TGAT----TAACCA--ATCAAAATACA-TCTT-ACTA--A-AAAC-TGA-TC-ATC-T-----T--GACCTATCAT---GACAGTAAA-CAAATAA-TGTAATAATACGTGAATGTT----TCTGTTTCTa
gi|17                         :                                                                                                                                                            attatcggtaacagtcatatttatacatgtacttttcagacctgtgcAAAAT-TATA--TCAGT--TCT--C---ACACC---CTG--C--TAT-CTAT----TAGCCA--ATCAAAATACATGTTA-TA-A--A-AATG-TGA-TC-ATC-------T--G---GA--AA---GA----AAACTAAAAAAGCGTAATAAAAaatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                      ttcttttcaccagctgtaaattactatgtaatattttgacttctgctcaactGT--TCC--C---ACACC---TTTGAC--TAC-CAAT----TAGCCATTATCAAAATACA-GCAT-AC-A--TTAAAG-TGG-CC-ATC-TTGACCT--G---TA--AT---AA----AGG-TAAA-CA-TGAAC---AACATAATATTATGATTCTGTTTCTaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                              gtaaatataaagttacaat--C---ACACC---CTG--C--TAT-CTAT----TAGTCA--ATCAAACTACA-GCTT-AC-A--G-AAAA-TGA-CC-ATC-T-----aat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                         ACC---TTG--C--TAT-CCGT----TAGCCA--ATCAGAATATG-TCTT----------ATA-TGA-GC-ATC-A-----T--G---ga
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                     tctggaa---TTA--T--TAT-TGAT----TATCCA--ATCAAAATACG-GCTT-AC-A--A-AAAA-AAGTTC-ATC-T-----acttacagcttacagcttacaaacagtaaacaaaattgatgtaaaaataggtgtctttctct
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10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): GTCATAAACTCTTGTTAAATAGGCTTTCCTTGGCTCGAATAGTATGAAAGCTGTGTTATTTCAGTTTTAATAGGAAATTCAAAAGTGCACCAGTCTCCACATCTTGCTATTTAGCAGCCTATCATAATACCGCTTACTAACTAGCGATCATCTAAACCAGTCATACAAATTAAATGACGTAATA
Unaligned ( gi|19 ): TCTGTTATATAGGTTGCGTCAGTTCGTAGACTGTGTTACCGATAAACCAACCAAACTAATTATACGGCTTATAAAATAGTGATCACCTGAACCTGTCATAACAATAAACAGAAATGACGTAATCGTTTCTAATTTTAG
Unaligned ( gi|26 ): CCGGTCTCCATATATTGCTATTATTTAACCATCGAAACATGGCTTGACCTGTCCAAACAGTAAACAGGCAACTTAATAATACGTTTTTTTTTGTTGATAATTTA
Unaligned ( gi|27 ): CCTTTACATCAGTTAGAAATTACCATGTAATTGTCTTTAAACCTCCGCTCGACTAGGACAAAACATGCTATTTCTATTTTAACCTGAAAATATATCAACT
Unaligned ( gi|28 ): GATCAGCCAATCTAACTAAGGTTCACAAAAATGTGATTATCTAATCCTGTCATAACAGTAAAAGCAAATTGCGTATTTATTCATTTCCTAATTTT
Unaligned ( gi|30 ): GCTTACAAAATGGGATCATCTGATACTGCCATAACAGTAAACAAACATGAAGTAATGATACTTTTCTGTTTCTATTCGTAACAT
Unaligned ( gi|32 ): CCAACCATAATATGGCTTATACAAAAAACGTAATCATCTGAGCTTGTTGTAACGATAAACATAGATAATGTAATACATTT
Unaligned ( gi|33 ): AGTCATAAATATGGGTAACATTCTGACCTCTACATGTGCTACATATATTTGTTTTTTACATCGGACTGCACACCTTGGT
Unaligned ( gi|34 ): CAATCAAAATACGTCTTACAAAAAAAGAGTCTGACATAACCGTAAAGAATGATCACGTGATAATATATTC
Unaligned ( gi|36 ): GATTTTAGCGAGAAAGTAAAAATGAAGTCGGTCCACACA






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consensus                     :                        CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATT-------CT--GACC-CT-CTGC---T-C--G--AA----------T-GTA-TN--A---A--A-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TC--TGTTT--TTAG--C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCAGTCC-GCACGCC---TT--GCTA-TCGA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-C---A----A-AA-NG-TGATC-----ATC--------T--------T-----G-----TA--A-C-G--A----AA--A-TAAANAA------TGTAATAANACGTGATNNTAT-ATTCTGTTTCT
Reference ( family-421 )      :                        CCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATT-------CT--GACC-CT-CTGC---T-C--A--AA----------T-GNA-TT--A---A--A-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TC--TGTTT--TTAG--C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCAGTCC-GCACGCC---TT--GCTA-TCGA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-C---A----A-AA-NG-TGATC-----ATC--------T--------T-----G-----TA--A-C-G--A----AA--A-TAAAGAA------TGTAATAAAACGTGANNNTNTGATTCTGTTTCT
gi|1                          :                        CCTT--TAATATATTATT-GTCATTTTGCGATTAT--------T----TT---TT--T--T-ATCCGCCA---TAA-AT-----TACTGTGT-GATATT-------CT--GACCACTACTGC---T-C--A--AA----------T-GAA-TT--A---A--A-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TT--TGTTT--TTAG--T---G-AAAAATTAAAAA--T-C-ATATCAGTCC-TCATACC---TT--CTTA-TGGA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATGTGGCTTT-C---A----G-AA-TA-TGGTC-----ATC--------T--------T-----G-----TA--A-C-G--A----AC--A-TAAAGTA------TGTACTAAAACATA----------TCTGTTTCT
gi|10                         :                                                                                          GTCA---TAA-AC-----TCTTGTTA-AATAGG-------CT--T-TC-CT-TGGC---T-C--G--AA----------TAGTA-TG--A---A--AGC-----T-----G-----TG--T-TA--T-T-TC--AGTTT--TAAT--A---G-GAAATTCAAAAG--TGC-AC--CAGTCT-CCACATC---TT--GCTA-TTTA-G----CAGCCT--ATCATA------ATACCGCTTA-CT--A----A-CT-AG-CGATC-----ATC--------T--------t
gi|11                         :                                                          T--------C----CT---TT--G--C-ATCAGTCA---TAA-CT-----TACTGTGC-AATTTT-------TT--GGCG-G--CTGC---T-C--A--GA------------GTA-TA--A---A--A-------C-----A-----TG--C-TT--T-T-TC--TATTT--TTAG--C---A-GGAAATT------------TGTCAGTTC-TAATAAC---TT--TGTA-T-AA-T----TATCCA--ATCAAA------ATACTGTTGA-T---A----A-AA-CA-AGATC-----ATC--------aaaccagtcatacaaattaaatgacgtaata
gi|12                         :                                                                                     tcTTGATCA---TAA-AT-----TACAGAGT-ACTATT-------CT--GACC--T-CTGC---T-T--G--AT----------TAGTA-TA--A---A--A-------CCTAATA-----TG--C-TA--T-C-TC--TGGCT--TTAG--C---A-GAAAAATAAAAG--T-C-ATGTCAGTCT-GCATGCCTAATT--GCTA-TTGA-T----TGGCCA--ATCAAagggcctgtggtaacagtaaacaaaattg
gi|13                         :                                                                                                              cctTGT-AATGTT-------CT--GA-C-CT-CTGC---T-T--A--GA----------TAGCA-TT--T---A--A-------CTT---G-----TG--C-TC--T-T-TC--TGTTTC-TTAG--G---A-GGACATTAAAAA--T---ATGTCGGCCT-ATGTGTC---TT--AATG-T-----------------ATCAAA------GTATGGCTGA-C---A----A-AA-AACTGGTC-----ACC--------T--------GAACCAG-----TC--A-T-G--A----CA--G-TAAACAAAAATTGTGTAATGATACcagtgaacatcagagctggttataccagcaaactaaatgat
gi|14                         :                                                                                    a-ATCAGACA---TTA-TT-----TACCCTGT-AGTATT-------TT--GATC--T-CTG----T-C--A--GAAG--------T-GTA-CA--A---A--AATGATTTT-----G-----TG--C-TA--T-T-TC--TATTT--T-AG--A---G-AAATAATAAAA-----C-ATA----------ATGC-----T--GTTA-TTGA-T----TAGCCA--ATCAAA------AGATAGTTTA-CA--A----A-AA-TG-TGAGC-----ATa
gi|15                         :                                                                                                                            ccatcctcccagttatT-CTAC---T-G--A--AT----------TAGTA-CT--A---A--A-------C-----AGAACTTG--A-TAAAT-T-TT--TGTTT--T-AG--C---GAGAGAATTGAGAAATT-C-A-G-CAGCTT-GCATGTC---AT--GTTG-TTGA-T----TGACCA--ATCAAA------GTACGGCTTA-CA--A----A-AA-TG-TAATC-----GTC--------T--------atgagtct
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                           AAAA--T-T-ATATCAGTTC-TCACACC---CT--GCTA-TCTA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATACATGTTA-TA--A----A-AA-TG-TGATC-----ATC-----------------T-----G-----GA--A-A-G--A----AA--ACTAAAAAAG-----CGTAATAAAActaaaattatatcagttctcacaccctgctatctattagccaatcaaaatacatgttataaaaatgtgatcatctggaaagaaaactaaaaaagcgtaataaaaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                       ttcttttcaccagctgtaaattactatgtaatattttgacttctgctcaactGTTC-CCACACC---TTTGACTA-CCAA-T----TAGCCATTATCAAA------ATACAGCATA-C---A----TTAA-AG-TGGCC-----ATC--------T--------T-----GACCTGTA--A-T-A--A----AG--G-TAAACA-------TG-AACAA--CATAATATTATGATTCTGTTTCTaa
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gi|2                          :        tctgttatataggttgCCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTATATGTACAGT----CC---TT--T--G-ATCGGTCA---TAA-TA-----TACTATAT-TATATA-------CT--GA-C-CT-CTGC---T-T--G--AA----------T-GGT-AT--A---A--A-------C-----ATT---TG--C-TA--T-T-TC--TGTTTTATTA-------G-GAAAATCAAAAA--G-T-ACATCTGTTC-CCTTGTC---GT--ATTA-TCAG-T----TAACAA--AT-AAA------ATACGCCTTA-TA--A----A-AA-TG-TAATTG----ACCG-------T--------C-----A-----TA--A-C-A--AT---AA--A-CAAAGAA------Tctaattttag
gi|20                         :                                                          T--------C----CT---TT--G--C-ATTGATCAGAATAA-AT-----GTCTATGT-AATATT-------CT--GGCC--T-CTGC---T-G--A--GA----------TAGTA-CA--A---A--A-------C-----A-----TGTGC-TA--T-T-TC--TATTT--T-AG--TTTGG-GAAAATTGAGAA--A-C-ATGTCA-TCTGGCATGTC---TT--GCTA-TGGA-C----TAa
gi|21                         :                                                                                          cTCA---TGA-AT-----TACTCTAT-AATATT-------C---AAAC-AT-CTGC---T-C--G--A--------------TA-TT--ACAAA--A-------C-----A-----TG--TGTA--A-T-GC--AGGTT--TTAG--C---G-GGCAGATAAAAT--T-C-ACGTCAGTCC-G-ACGAA---GTA-ACTC-TCAT-T----TAGCCA--GTCAAtg
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gi|23                         :                                                                                    tctggaaaCA---TAA-TG-----TACCATGT-AATAAT-------CT--GACC-TT--TGC---T-C--G--AA----------TAGCA-TG--A---ACTA-------T-----G-----TG--T-TG--T-T-TC--TGATT--TTAG--C---G-GGGAAATAAAAA--T-T-ACGTCGATCC-ACACAAT---TT--GCTacttacagcttacagcttacaaacagtaaacaaaattgatgtaaaaataggtgtctttctct
gi|24                         :                                                                                                       -----TACTGTGT-AATATT-------CT--GAAA-TT--TGC---T-TGTA--AA------------GTA-TA--A---A--A-------T-----A-----TGAGC-AA--T-T-TTATTGTTT--TAAG--CA--G-GTAAAATAAACA--T-T-ACATCAGTCT-GCATCCT---CT--ATTA-TCAA-T----TAGCCA--ccagcttac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           GTCC-GCTCA-----TT--ATTA-TTGA-T----TATCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-CAAAA----A-AA-AG-T--TC-----ATC--------T--------
gi|27                         :                                                                ttac----CT---TT--A--C-ATCAGTTA---GAA-AT-----TACCATGT-AATTGT-------CTTTAAAC-CT-CCGC---T-C--G--AC----------TAGGA-CA--A---A--A-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TC--TATTT--TAAC--C---T-GAAAATaagcttgtcatagcagtaaacataaaaaaaccgcgttatatata
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cGA-T----CAGCCA--ATCTAA------CTAAGGTTCA-CA--A----A-AA-TG-TGATT-----ATC--------T--------atatcaact
gi|29                         :                                                                                                                                            T-CTGC---T-CC-A--AA----------C-GTA-TG--G---A--G-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TT--TGTTT--TTAGT-C---G-GAAAAT--AAAC--T-T-ACGTCAG-CT-TCACACT---TT--ACTC-TAGA-T----TAGCCaatcctgtcataacagtaaaagcaaattgcgtatttattcatttcctaatttt
gi|3                          :                                                        TAC--------T----CT---TTGATA-C-ATCGGTCA---TAACAC-----T-CTGTGT-AATAAT-------CT--GACCTCT-CTGT---T-CT-AGTAA----------T-ACA-----A---A--A-------C-----A-----AA--C-TC--TAT-CC--TAATT--T--G--T---T-GAAATGTAAGAT--T-C-CCACCAGTTC-ATACGTC---CT--ACTG-TCGA-G----TATTCA--ATta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gGCTTA-C---A----A-AA-TG-GGATC-----ATC--------TGATAC---T-----GCCA--TA--A-CAG--T----AA--A-CAAA-CA------TGAAGTAA----TGATACTT---TTCTGTTTCTtctgtattcaatcaagttacaggcgaaagaagtgacaacctgtatctgtcatatcgataaataaaagtaactgaagta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                 --A---A--A-------G-----A-----TG--T-TA--T-T-TC--TTATT--TT--------G-AAAAATAGAAAA--T-A-ATACCAGTCT-GCACACC---TT--ATTT-TCGA-T----TAACCA--ATCAAattcgtaacat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gCCA--ACCATA------ATATGGCTTA-T---ACAAAA-AA-CG-TAATC-----ATCTGAGCTTGT--------T-----G-----TA--A-C-G--AT---AAACA-TAGATAA------TGTAATAcaagtga
gi|33                         :                                                                                          GTCA---TAA-AT------A-TGGGT-AACATT-------CT--GA-C-CT-CTAC------------A----------T-GTG-CT---------A-------C-----A-----TA----TA--T-T-----TGTTT--TTcattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aCA--ATCAAA------ATACGTCTTA-C---A----A-AA-AA-AGA-------GTC--------TGA------C-----A-----TA--ACC-G-------------TAAAGAA------TG--AT--CACGTGATAATAT-ATTCtacatcggactgcacaccttggt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 CACACC---CT--GCTA-TCTA-T----TAGTCA--ATCAAA------CTACAGCTTA-C---A----G-AA-AA-TGACC-----ATC--------T--------
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                   TT--TTAG--C---G-AGAAAGTAAAAA--T-G-AAGTCGGTCC-ACACga
gi|4                          :                                                  gaC-ATTCT--------C----CT---TT--G--C-ATCAAACA---TAA--T-----TACTACGT-AATATT-------TT--GA-C-CT-CTGC---T-C--A--AA----------T--TG-TTCAA---A--A-------C-----A-----TGTAT-TA--T-T-TC--TA--T--TTAGGAA---G-GAAAATTGAGAA--A-T-GCGTAAGCTT-GCATATC---AT--GGTA-TGGA-TCTAATAGCTG--ATAAAA------TTATGGCTTA-CA--A----A-AA-TG-TAATA-----GTC--------T--------TCC---A-----TA--A-C----------A--A-TAAAa
gi|5                          :                           atgcattgtaggtcTTGTCAT------ATTAT--------TTTCTCT---TT--TA-T-ATTGGTCA---AAA-ATATTCATA-TATATCAATATT-------CT--GA-C-CT-CAGCTAGT-C--T--AA----------T-----TTG-A---A--A-------C-----A-----AG--C-TA--C-T-GC--TGTTTC-TTAG--A---G-AGAGA--AACAA--T-TAACCTCTGTCT-GAACACC---TT--GCTA-TCAA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATATTGCTTA-TA--A----A-AA-TG-GGATC-----ATC--------TCACCCGGCT-----A-----TG--A-C-AGTA----AA--A-TAAAcatgaagtagtgc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                    ---A--A-------C-----A-----TT--T-CA--C-T-TC--TGTGT--TTAG--T---GTGAAAAT--AAAA--T-C-A-ACCAGTCC-ACACACA---TG--GCTA-TTGA-T----TAACCA--ATCAAA------ATACATCTTA-CT--A----A-AA-AC-TGATC-----ATC--------T--------T-----GACC--TATCA-T-G--ACAGTAA--A-CAAATAA------TGTAATAATACGTGAATGT----TTCTGTTTCTtct
gi|7                          : attatcggtaacagtcatatttatacatgtacttttcagacctgtgc---GC-ACTAC--------T----CTCTCTT--TGGC-ATCAGTCA---TAA-AA------ACTATGT-GATATTGTAATGTCT--GCAC-CA-CTGA---TAC--A--AAATAATTTTTAT-GTACTT--A---A--A-------T-----A-----C---C-TA--T-T-T-------T--ATAG--C----------TTGTATG--T-C-ATGTTA------TAGGCC---A---GATA-T-AA-G----TAGCCA--ATCAAA------ATATGGCTTA-C---A----A-AA-TG-TAAAC-----ATCTTAGCCA-T--------T-----G-----TC--A-T-A--A----CA--A-TAAAGaatt
gi|8                          :                                                                                          acacatagtg-AT-----TGCTCTGT-AATATT-------GT--AATC--T-CTGC---G-C--G--AA----------C-GGT-TTT-A---A--A-------C-----A-----TG--G--A--C-C-TC--T------TTAA--A---G-GGAAAATGAAAA--T-T-TTGTCTGTCC-GCACACC---TT--GCTA-TCGA-T----TATCCA--ATCAGA------ATAACTCTTC-C---A----ATGA-AA-TGATCATCCGATC--------C--------T-----G-----TC--A-T-A--C----CA--G-TAAACAA---------AATATAACGTTATTATATt
gi|9                          :                                                                  taccttgc---TT--G--C-ATCGGTCA---TAA-GT-----T---------------------CT--GGCC--T-CTGC---T-T--A--AA----------T-AGT-TT--G---A--A-------------A-----TGAGC-TA--T-TCTC--TTTTT--TTAC--C---A-GAAAAGTAAATA--G-T-ACACCAGTCA-GCACATC---TT--ACTA-TCAAAC----TA-CCA--ATCAGA------ATACAGCTGATC---A----A-AA-GG-TGATCACCTGATC--------C--------T-----G-----TC--A-C-A--A----CA--G-T--------------TAATAAAA-GTGAa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :                        CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT--GACC-CT-CTGCTC-G-A-A-T--G-TA---CGAA--A-------C-----A-----TG--C--TA--T-T-TC--TGTTT--TTAG-C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCA--GTCC-GCACGCC---TT--GCTA-T----C-GA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-C---A----A-AA-NG-TGATC-----AT-----C-T--------T-----G---TA--A-C-G--A----AA-A-TAAACAA------TGTAATAANA-CGTGATNATAT-ATTCTGTTTCT
Reference ( family-421 )      :                        CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT--GACC-CT-CTGCTC-G-A-A-T--G-TA---TNAA--A-------C-----A-----TG--C--TA--T-T-TC--TGTTT--TTAG-C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCA--GTCC-GCACGCC---TT--GCTA-T----C-GA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-C---A----A-AA-NG-TGATC-----AT-----C-T--------T-----G---TA--A-C-G--A----AA-A-TAAANAA------TGTAATAANA-CGTGATNNTAT-ATTCTGTTTCT
gi|1                          :                        CCTT--TAATATATTATT-GTCATTTTGCGATTAT--------T----TT---TT--T--T-ATCCGCCA---TAA-AT-----TACTGTGT-GATATTCT--GACCACTACTGCTC-A-A-A-T--G-AA---TTAA--A-------C-----A-----TG--C--TA--T-T-TT--TGTTT--TTAG-T---G-AAAAATTAAAAA--T-C-ATATCA--GTCC-TCATACC---TT--CTTA-T----G-GA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATGTGGCTTT-C---A----G-AA-TA-TGGTC-----AT-----C-T--------T-----G---TA--A-C-G--A----AC-A-TAAAGTA------TGTACTAAAA-C--------AT-A-TCTGTTTCT
gi|10                         :                                                                                          GTCA---TAA-AC-----TCTTGTTA-AATAGGCT--T-TC-CT-TGGCTC-G-A-A-TA-G-TA---TGAA--AGC-----T-----G-----TG--T--TA--T-T-TC--AGTTT--TAAT-A---G-GAAATTCAAAAG--TGC-AC--CA--GTCT-CCACATC---TT--GCTA-T----T-TA-G-----CAGCCT--ATCATA------ATACCGCTTA-CT--A----A-CT-AG-CGATC-----AT-----C-TAAACC---A-----G---TC--A-T-A--C----AA-ATTAAATGA------CGTAATAt
gi|11                         :                                                          T--------C----CT---TT--G--C-ATCAGTCA---TAA-CT-----TACTGTGC-AATTTTTT--GGCG-G--CTGCTC-A-G-A----G-TA---TAAA--A-------C-----A-----TG--C--TT--T-T-TC--TATTT--TTAG-C---A-GGAAATT------------TGTCA--GTTC-TAATAAC---TT--TGTA-T------AA-T-----TATCCA--ATCAAA------ATACTGTTGA-T---A----A-AA-CA-AGATC-----ATCAGGGC-C--------T-----G---TG--G-T-A--A----CA-G-TAAACAA------
gi|12                         :                                                                                     tcTTGATCA---TAA-AT-----TACAGAGT-ACTATTCT--GACC--T-CTGCTT-G-A-T-TA-G-TA---TAAA--A-------CCTAATA-----TG--C--TA--T-C-TC--TGGCT--TTAG-C---A-GAAAAATAAAAG--T-C-ATGTCA--GTCT-GCATGCCTAATT--GCTA-T----T-GA-T-----TGGCCA--ATCAAaattg
gi|13                         :                                                                                                              cctTGT-AATGTTCT--GA-C-CT-CTGCTT-A-G-A-TA-G-CA---TTTA--A-------CTT---G-----TG--C--TC--T-T-TC--TGTTTC-TTAG-G---A-GGACATTAAAAA--T---ATGTCG--GCCT-ATGTGTC---TT--AATG-T-----------------------ATCAAA------GTATGGCTGA-C---A----A-AA-AACTGGTC-----AC-----C-T--------GAACCAG---TC--A-T-G--A----CA-G-TAAACAAAAATTGTGTAATGATA-Ccagtgaacatcagagctggttataccagcaaactaaatgat
gi|14                         :                                                                                    a-ATCAGACA---TTA-TT-----TACCCTGT-AGTATTTT--GATC--T-CTGTCA-G-A-AGT--G-TA---CAAA--AATGATTTT-----G-----TG--C--TA--T-T-TC--TATTT--T-AG-A---G-AAATAATAAAA-----C-ATA------------ATGC-----T--GTTA-T----T-GA-T-----TAGCCA--ATCAAA------AGATAGTTTA-CA--A----A-AA-TG-TGAGC-----AT-----a
gi|15                         :                                                                                                                     ccatcctcccagttatT-CTACT--G-A-A-TTAG-TA---CTAA--A-------C-----AGAACTTG--A--TAAAT-T-TT--TGTTT--T-AG-C---GAGAGAATTGAGAAATT-C-A-G-CA--GCTT-GCATGTC---AT--GTTG-T----T-GA-T-----TGACCA--ATCAAA------GTACGGCTTA-CA--A----A-AA-TG-TAATC-----GT-----C-T--------atgagtct
gi|16                         :                                                                    ----CT---TT--T--AGATCAATCA---TAA-AT-----CACTGTGT-AATATTCT--GACC--T-CTCCT------------------TGAA--A-------C-----A-----TGTGC--TT--T-T-TC--TGTTT--TTAG-T---G-GGGAA------A--T---ACATTT--GTCT-GCACACC---TT--GTTAAT----C--A-G-----TAGCCA--ATTAAA------ATATGGCTTA-C---AC---C-AA-AG-TGATC-----Agattttgtcatagccattattaaaaaagatgaagca
gi|17                         :                                                          T--------T----CT---TT--T--C-ACCAGCTG---TAA-AT-----TACTATGT-AATATTTT--GA-C-TT-CTGCTC-A-A-agtgaacatgactg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                     AAAA--T-T-ATATCA--GTTC-TCACACC---CT--GCTA-T----C-TA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATACATGTTA-TA--A----A-AA-TG-TGATC-----AT-----C----------T-----G---GA--A-A-G--A----AA-ACTAAAAAAG-----CGTAATAAAA-ctaaaattatatcagttctcacaccctgctatctattagccaatcaaaatacatgttataaaaatgtgatcatctggaaagaaaactaaaaaagcgtaataaaaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                 ttcttttcaccagctgtaaattactatgtaatattttgacttctgctcaact--GTTC-CCACACC---TTTGACTA-C----C-AA-T-----TAGCCATTATCAAA------ATACAGCATA-C---AT---T-AA-AG-TGGCC-----AT-----C-TTGACC---T-----G---TA--A-T-A--A----AG-G-TAAAC-A------TG-AACAACA---TAATATTATGATTCTGTTTCTaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             gtaaatataaagttacaatCGTCA--GTTC-GTAGACT---GT--GTTA-C----C-GA-T-----AAACCA--ACCAAACTAATTATACGGCTTA-T---A----A-AATAG-TGATC-----AC-----C-TGAACC---T-----G---TC--A-T-A--A----CA-A-TAAACA--------GAAAT--GA-CGTAATCGT----TTCTaat
gi|2                          :        tctgttatataggttgCCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTATATGTACAGT----CC---TT--T--G-ATCGGTCA---TAA-TA-----TACTATAT-TATATACT--GA-C-CT-CTGCTT-G-A-A-TG-G-TA---T-AA--A-------C-----ATT---TG--C--TA--T-T-TC--TGTTTTATTA------G-GAAAATCAAAAA--G-T-ACATCT--GTTC-CCTTGTC---GT--ATTA-T----C-AG-T-----TAACAA--AT-AAA------ATACGCCTTA-TA--A----A-AA-TG-TAATTG----AC-----CGT--------C-----A---TA--A-C-A--AT---AA-A-CAAAGAA------Taattttag
gi|20                         :                                                          T--------C----CT---TT--G--C-ATTGATCAGAATAA-AT-----GTCTATGT-AATATTCT--GGCC--T-CTGCTG-A-G-A-TA-G-TA---CAAA--A-------C-----A-----TGTGC--TA--T-T-TC--TATTT--T-AG-TTTGG-GAAAATTGAGAA--A-C-ATGTCA---TCTGGCATGTC---TT--GCTA-T----G-GA-C-----TAa
gi|21                         :                                                                                          cTCA---TGA-AT-----TACTCTAT-AATATTC---AAAC-AT-CTGCTC-G-ATA-T----TA---CAAA--A-------C-----A-----TG--TG-TA--A-T-GC--AGGTT--TTAG-C---G-GGCAGATAAAAT--T-C-ACGTCA--GTCC-G-ACGAA---GTA-ACTC-T----C-AT-T-----TAGCCA--GTCAAtg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                             ttaaCC---TT--GCTA-T----C-CG-T-----TAGCCA--ATCAGA------ATATGTCTTA-T---A------------TGAGC-----AT-----C-A--------T-----G---
gi|23                         :                                                                                    tctggaaaCA---TAA-TG-----TACCATGT-AATAATCT--GACC-TT--TGCTC-G-A-A-TA-G-CA---TGAACTA-------T-----G-----TG--T--TG--T-T-TC--TGATT--TTAG-C---G-GGGAAATAAAAA--T-T-ACGTCG--ATCC-ACACAAT---TT--GCTacttacagcttacagcttacaaacagtaaacaaaattgatgtaaaaataggtgtctttctct
gi|24                         :                                                                                                       -----TACTGTGT-AATATTCT--GAAA-TT--TGCTT-GTA-A-A--G-TA---TAAA--A-------T-----A-----TGAGC--AA--T-T-TTATTGTTT--TAAG-CA--G-GTAAAATAAACA--T-T-ACATCA--GTCT-GCATCCT---CT--ATTA-T----C-AA-T-----TAGCCA--ccagcttac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                     --GTCC-GCTCA-----TT--ATTA-T----T-GA-T-----TATCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-CAAAA----A-AA-AG-T--TC-----ATCTAAGC-T--------T-----G---TC--A-T-A--G----CA-G-TAAACA---------TAAAAAAACCGCG-TTATAT-A
gi|27                         :                                                                ttac----CT---TT--A--C-ATCAGTTA---GAA-AT-----TACCATGT-AATTGTCTTTAAAC-CT-CCGCTC-G-A-C-TA-G-GA---CAAA--A-------C-----A-----TG--C--TA--T-T-TC--TATTT--TAAC-C---T-GAAAATa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    c-GA-T-----CAGCCA--ATCTAA------CTAAGGTTCA-CA--A----A-AA-TG-TGATT-----AT-----C-T--------atatcaact
gi|29                         :                                                                                                                                     T-CTGCTCCA-A-A-C--G-TA---TGGA--G-------C-----A-----TG--C--TA--T-T-TT--TGTTT--TTAGTC---G-GAAAAT--AAAC--T-T-ACGTCA--G-CT-TCACACT---TT--ACTC-T----A-GA-T-----TAGCCaatcctgtcataacagtaaaagcaaattgcgtatttattcatttcctaatttt
gi|3                          :                                                        TAC--------T----CT---TTGATA-C-ATCGGTCA---TAACAC-----T-CTGTGT-AATAATCT--GACCTCT-CTGTTC-T-A-G-TA-A-TA---CAAA--A-------C-----A-----AA--C--TC--TAT-CC--TAATT--T--G-T---T-GAAATGTAAGAT--T-C-CCACCA--GTTC-ATACGTC---CT--ACTG-T----C-GA-G-----TATTCA--ATta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gGCTTA-C---A----A-AA-TG-GGATC-----AT-----C-TGATAC---T-----GCCATA--A-CAG--T----AA-A-CAAAC-A------TGAAGTAA-----TGATACT-T--TTCTGTTTCTtctgtattcaatcaagttacaggcgaaagaagtgacaacctgtatctgtcatatcgataaataaaagtaactgaagta
gi|31                         :                                                                                                                                                                AA--A-------G-----A-----TG--T--TA--T-T-TC--TTATT--TT-------G-AAAAATAGAAAA--T-A-ATACCA--GTCT-GCACACC---TT--ATTT-T----C-GA-T-----TAACCA--ATCAAattcgtaacat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gCCA--ACCATA------ATATGGCTTA-T---ACAAAA-AA-CG-TAATC-----AT-----C-TGAGCTTGTT-----G---TA--A-C-G--ATA--AACA-TAGATAA------TGTAATAcaagtga
gi|33                         :                                                                                          GTCA---TAA-AT------A-TGGGT-AACATTCT--GA-C-CT-CTAC-------A-T--G-TG---CT----A-------C-----A-----TA-----TA--T-T-----TGTTT--TTcattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aCA--ATCAAA------ATACGTCTTA-C---A----A-AA-AA-AGA-------GT-----C-TGA------C-----A---TA--ACC-G------------TAAAGAA------TG--AT--CA-CGTGATAATAT-ATTCtacatcggactgcacaccttggt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                             CACACC---CT--GCTA-T----C-TA-T-----TAGTCA--ATCAAA------CTACAGCTTA-C---A----G-AA-AA-TGACC-----AT-----C-T--------
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                              TT--TTAG-C---G-AGAAAGTAAAAA--T-G-AAGTCG--GTCC-ACACga
gi|4                          :                                                  gaC-ATTCT--------C----CT---TT--G--C-ATCAAACA---TAA--T-----TACTACGT-AATATTTT--GACC--T-CTGCTC-A-A-A-TT-G-TT---CAAA--A-------C-----A-----TG--TATTA--T-T-TC--TATTT----AG-GAA-G-GAAAATTGAGAA--A-T-GCGTAA--GCTT-GCATATC---AT--GGTA-T----G-GA-TCTAA-TAGCTG--ATAAAA------TTATGGCTTA-CA--A----A-AA-TG-TAATA-----GT-----C-T--------TCC---A---TA--A-C----------A-A-TAAACAa
gi|5                          :                           atgcattgtaggtcTTGTCAT------ATTAT--------TTTCTCT---TT--TA-T-ATTGGTCA---AAA-ATATTCATA-TATATCAATATTCT--GA-C-CT-CAGCT----A-G-T--C-TAATTTGAA--A-------C-----A-----AG--C--TA--C-T-GC--TGTTTC-TTAG-A---G-AGAGA--AACAA--T-TAACCTCT--GTCT-GAACACC---TT--GCTA-T----C-AA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATATTGCTTA-TA--A----A-AA-TG-GGATC-----AT-----C-TCACCCGGCT-----A---TG--A-C-AGTA----AA-A-TAAAtgaagtagtgc
gi|6                          :                                                                                                                                                                 A--A-------C-----A-----TT--T--CA--C-T-TC--TGTGT--TTAG-T---GTGAAAAT--AAAA--T-C-A-ACCA--GTCC-ACACACA---TG--GCTA-T----T-GA-T-----TAACCA--ATCAAA------ATACATCTTA-CT--A----A-AA-AC-TGATC-----AT-----C-T--------T-----GACCTATCA-T-G--ACAGTAA-A-CAAATAA------TGTAATAATA-CGTGA--ATGT--TTCTGTTTCTtct
gi|7                          : attatcggtaacagtcatatttatacatgtacttttcagacctgtgc---GC-ACTAC--------T----CTCTCTT--TGGC-ATCAGTCA---TAA-AA------ACTATGT-GATATTGT--AATG--T-CTGCAC-C-A-C-T--GATA---CAAA--A-------T-----A-------------A--T-T-TT--TATGT----------------ACTTAAATA--C-CTATTTTATAGCTT-GTATGTC---AT--GTTA-TAGGCCAGA-TATAAGTAGCCA--ATCAAA------ATATGGCTTA-C---A----A-AA-TG-TAAAC-----AT-----C-T--------T-----aatt
gi|8                          :                                                                                          acacatagtg-AT-----TGCTCTGT-AATATTGT--AATC--T-CTGCGC-G-A-A-C--GGTT---TTAA--A-------C-----A-----TG--G---A--C-C-TC--T------TTAA-A---G-GGAAAATGAAAA--T-T-TTGTCT--GTCC-GCACACC---TT--GCTA-T----C-GA-T-----TATCCA--ATCAGA------ATAACTCTTC-C---A----ATGA-AA-TGATCATCCGAT-----C-C--------T-----G---TC--A-T-A--C----CA-G-TAAACAA---------AATATAA-CGTTATTATAT-Aagccattgtcataacaataaagt
gi|9                          :                                                                  taccttgc---TT--G--C-ATCGGTCA---TAA-GT-----T--------------CT--GGCC--T-CTGCTT-A-A-A-TA-G-TT---TGAA--A-------T-----G-----AG--C--TA--T-TCTC--TTTTT--TTAC-C---A-GAAAAGTAAATA--G-T-ACACCA--GTCA-GCACATC---TT--ACTA-T----C-AAAC-----TA-CCA--ATCAGA------ATACAGCTGATC---A----A-AA-GG-TGATCACCTGAT-----C-C--------T-----G---TC--A-C----------------AACAG------T-TAATAAAA--GTGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): CCGGTCTCCATATATTGCTATTATTTAACCATCGAAACATGGCTTGACCTGTCCAAACAGTAAACAGGCAACTTAATAATACGTTTTTTTTTGTTGATAATTTA






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consensus                     :                   CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT--GACC-CT-CTGC---TC-G-A-A-T--G-TACGAA--A-------C-----G-----TG--C-TA--T-T-TC--TGTTT--TTAG--C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCA--GTCC-GCACGCC---TT--GCTA-T----C-GA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-C---A----A-AA-NG-TGATC-----AT-----C-T--------T-----G---TN--A-CG--A----NA-A-TAAACAA------TGTAATAANA-CGTGATNATA-T-ATTCTGTTTCT
Reference ( family-421 )      :                   CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT--GACC-CT-CTGC---TC-G-A-A-T--G-TACGAA--A-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TC--TGTTT--TTAG--C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCA--GTCC-GCACGCC---TT--GCTA-T----C-GA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-C---A----A-AA-NG-TGATC-----AT-----C-T--------T-----G---TA--A-CG--A----AA-A-TAAACAA------TGTAATAANA-CGTGATNATA-T-ATTCTGTTTCT
gi|1                          :                   CCTT--TAATATATTATT-GTCATTTTGCGATTAT--------T----TT---TT--T--T-ATCCGCCA---TAA-AT-----TACTGTGT-GATATTCT--GACCACTACTGC---TC-A-A-A-T--G-AATTAA--A-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TT--TGTTT--TTAG--T---G-AAAAATTAAAAA--T-C-ATATCA--GTCC-TCATACC---TT--CTTA-T----G-GA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATGTGGCTTT-C---A----G-AA-TA-TGGTC-----AT-----C-T--------T-----G---TA--A-CG--A----AC-A-TAAAGTA------TGTACTAAAA-C------ATA-----TCTGTTTCT
gi|10                         :                                                                                     GTCA---TAA-AC-----TCTTGTTA-AATAGGCT--T-TC-CT-TGGC---TC-G-A-A-TA-G-TATGAA--AGC-----T-----G-----TG--T-TA--T-T-TC--AGTTT--TAAT--A---G-GAAATTCAAAAG--TGC-AC--CA--GTCT-CCACATC---TT--GCTA-T----T-TA-G-----CAGCCT--ATCATA------ATACCGCTTA-CT--A----A-CT-AG-CGATC-----AT-----C-TAAACC---A-----G---TC--A-TA--C----AA-ATTAAATGA------CGTAATAt
gi|11                         :                                                     T--------C----CT---TT--G--C-ATCAGTCA---TAA-CT-----TACTGTGC-AATTTTTT--GGCG-G--CTGC---TC-A-G-A----G-TATAAA--A-------C-----A-----TG--C-TT--T-T-TC--TATTT--TTAG--C---A-GGAAATT------------TGTCA--GTTC-TAATAAC---TT--TGTA-T------AA-T-----TATCCA--ATCAAA------ATACTGTTGA-T---A----A-AA-CA-AGATC-----ATCAGGGC-C--------T-----G---TG--G-TA--A----CA-G-TAAACAA------
gi|12                         :                                                                                tcTTGATCA---TAA-AT-----TACAGAGT-ACTATTCT--GACC--T-CTGC---TT-G-A-T-TA-G-TATAAA--A-------CCTAATA-----TG--C-TA--T-C-TC--TGGCT--TTAG--C---A-GAAAAATAAAAG--T-C-ATGTCA--GTCT-GCATGCCTAATT--GCTA-T----T-GA-T-----TGGCCA--ATCAAaattg
gi|13                         :                                                                                                         cctTGT-AATGTTCT--GA-C-CT-CTGC---TT-A-G-A-TA-G-CATTTA--A-------CTT---G-----TG--C-TC--T-T-TC--TGTTTC-TTAG--G---A-GGACATTAAAAA--T---ATGTCG--GCCT-ATGTGTC---TT--AATG-T-----------------------ATCAAA------GTATGGCTGA-C---A----A-AA-AACTGGTC-----AC-----C-T--------GAACCAG---TC--A-TG--A----CA-G-TAAACAAAAATTGTGTAATGATA-Ccagtgaacatcagagctggttataccagcaaactaaatgat
gi|14                         :                                                                               a-ATCAGACA---TTA-TT-----TACCCTGT-AGTATTTT--GATC--T-CTGT---CA-G-A-AGT--G-TACAAA--AATGATTTT-----G-----TG--C-TA--T-T-TC--TATTT--T-AG--A---G-AAATAATAAAA-----C-ATA------------ATGC-----T--GTTA-T----T-GA-T-----TAGCCA--ATCAAA------AGATAGTTTA-CA--A----A-AA-TG-TGAGC-----AT-----a
gi|15                         :                                                                                                                ccatcctcccagttatT-CTAC---T--G-A-A-TTAG-TACTAA--A-------C-----AGAACTTG--A-TAAAT-T-TT--TGTTT--T-AG--C---GAGAGAATTGAGAAATT-C-A-G-CA--GCTT-GCATGTC---AT--GTTG-T----T-GA-T-----TGACCA--ATCAAA------GTACGGCTTA-CA--A----A-AA-TG-TAATC-----GT-----C-T--------atgagtct
gi|16                         :                                                               ----CT---TT--T--AGATCAATCA---TAA-AT-----CACTGTGT-AATATTCT--GACC--T-CTCC---TT-G-A-A-------AC-----A-------T-----G-----TG--C-TT--T-T-TC--TGTTT--TTAG--T---G-GGGAA------A--T---ACATTT--GTCT-GCACACC---TT--GTTAAT----C--A-G-----TAGCCA--ATTAAA------ATATGGCTTA-C---AC---C-AA-AG-TGATC-----Agattttgtcatagccattattaaaaaagatgaagca
gi|17                         :                                                     T--------T----CT---TT--T--C-ACCAGCTG---TAA-AT-----TACTATGT-AATATTTT--GA-C-TT-CTGC---TC-A-A-agtgaacatgactg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                AAAA--T-T-ATATCA--GTTC-TCACACC---CT--GCTA-T----C-TA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATACATGTTA-TA--A----A-AA-TG-TGATC-----AT-----C----------T-----G---GA--A-AG--A----AA-ACTAAAAAAG-----CGTAATAAAA-ctaaaattatatcagttctcacaccctgctatctattagccaatcaaaatacatgttataaaaatgtgatcatctggaaagaaaactaaaaaagcgtaataaaaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                            ttcttttcaccagctgtaaattactatgtaatattttgacttctgctcaact--GTTC-CCACACC---TTTGACTA-C----C-AA-T-----TAGCCATTATCAAA------ATACAGCATA-C---AT---T-AA-AG-TGGCC-----AT-----C-TTGACC---T-----G---TA--A-TA--A----AG-G-TAAAC-A------TG-AACAACA---TAATATTA-TGATTCTGTTTCTaa
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gi|2                          :   tctgttatataggttgCCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTATATGTACAGT----CC---TT--T--G-ATCGGTCA---TAA-TA-----TACTATAT-TATATACT--GA-C-CT-CTGC---TT-G-A-A-TG-G-TAT-AA--A-------C-----ATT---TG--C-TA--T-T-TC--TGTTTTATTA-------G-GAAAATCAAAAA--G-T-ACATCT--GTTC-CCTTGTC---GT--ATTA-T----C-AG-T-----TAACAA--AT-AAA------ATACGCCTTA-TA--A----A-AA-TG-TAATTG----AC-----CGT--------C-----A---TA--A-C---------A-A-TAAACAA------AG-AATAaattttag
gi|20                         :                                                     T--------C----CT---TT--G--C-ATTGATCAGAATAA-AT-----GTCTATGT-AATATTCT--GGCC--T-CTGC---TG-A-G-A-TA-G-TACAAA--A-------C-----A-----TGTGC-TA--T-T-TC--TATTT--T-AG--TTTGG-GAAAATTGAGAA--A-C-ATGTCA---TCTGGCATGTC---TT--GCTA-T----G-GA-C-----TA
gi|21                         :                                                                                     cTCA---TGA-AT-----TACTCTAT-AATATTC---AAAC-AT-CTGC---TC-G-ATA-T----TACAAA--A-------C-----A-----TG--TGTA--A-T-GC--AGGTT--TTAG--C---G-GGCAGATAAAAT--T-C-ACGTCA--GTCC-G-ACGAA---GTA-ACTC-T----C-AT-T-----TAGCCA--GTCAAtg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                        ttaaCC---TT--GCTA-T----C-CG-T-----TAGCCA--ATCAGA------ATATGTCTTA-T---A------------TGAGC-----AT-----C-A--------T-----G---
gi|23                         :                                                                               tctggaaaCA---TAA-TG-----TACCATGT-AATAATCT--GACC-TT--TGC---TC-G-A-A-TA-G-CATGAACTA-------T-----G-----TG--T-TG--T-T-TC--TGATT--TTAG--C---G-GGGAAATAAAAA--T-T-ACGTCG--ATCC-ACACAAT---TT--GCTacttacagcttacagcttacaaacagtaaacaaaattgatgtaaaaataggtgtctttctct
gi|24                         :                                                                                                  -----TACTGTGT-AATATTCT--GAAA-TT--TGC---TT-GTA-A-A--G-TATAAA--A-------T-----A-----TGAGC-AA--T-T-TTATTGTTT--TAAG--CA--G-GTAAAATAAACA--T-T-ACATCA--GTCT-GCATCCT---CT--ATTA-T----C-AA-T-----TAGCCA--ccagcttac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                --GTCC-GCTCA-----TT--ATTA-T----T-GA-T-----TATCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-CAAAA----A-AA-AG-T--TC-----ATCTAAGC-T--------T-----G---TC--A-TA--G----CA-G-TAAACA---------TAAAAAAACCGCG-TTATA-T-A
gi|27                         :                                                           ttac----CT---TT--A--C-ATCAGTTA---GAA-AT-----TACCATGT-AATTGTCTTTAAAC-CT-CCGC---TC-G-A-C-TA-G-GACAAA--A-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TC--TATTT--TAAC--C---T-GAAAATa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               c-GA-T-----CAGCCA--ATCTAA------CTAAGGTTCA-CA--A----A-AA-TG-TGATT-----AT-----C-T--------atatcaact
gi|29                         :                                                                                                                                T-CTGC---TCCA-A-A-C--G-TATGGA--G-------C-----A-----TG--C-TA--T-T-TT--TGTTT--TTAGT-C---G-GAAAAT--AAAC--T-T-ACGTCA--G-CT-TCACACT---TT--ACTC-T----A-GA-T-----TAGCCaatcctgtcataacagtaaaagcaaattgcgtatttattcatttcctaatttt
gi|3                          :                                                   TAC--------T----CT---TTGATA-C-ATCGGTCA---TAACAC-----T-CTGTGT-AATAATCT--GACCTCT-CTGT---TC-T-A-G-TA-A-TACAAA--A-------C-----A-----AA--C-TC--TAT-CC--TAATT--T--G--T---T-GAAATGTAAGAT--T-C-CCACCA--GTTC-ATACGTC---CT--ACTG-T----C-GA-G-----TATTCA--ATta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gGCTTA-C---A----A-AA-TG-GGATC-----AT-----C-TGATAC---T-----G---CC--A-TA--A----CA-G-TAAACA----------AACATGA-AGTAATGATACT-TTTCTGTTTCTtctgtattcaatcaagttacaggcgaaagaagtgacaacctgtatctgtcatatcgataaataaaagtaactgaagta
gi|31                         :                                                                                                                                                          GAA--A-------G-----A-----TG--T-TA--T-T-TC--TTATT--TT--------G-AAAAATAGAAAA--T-A-ATACCA--GTCT-GCACACC---TT--ATTT-T----C-GA-T-----TAACCA--ATCAAattcgtaacat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCA--ACCATA------ATATGGCTTA-T---ACAAAA-AA-CG-TAATC-----AT-----C-TGAGCTTGTT-----G---TA--A-CG--ATA--AACA-TAGATAA------TGTAATAcaagtga
gi|33                         :                                                                                     GTCA---TAA-AT------A-TGGGT-AACATTCT--GA-C-CT-CTAC----------A-T--G-TGCT----A-------C-----A-----TA----TA--T-T-----TGTTT--TTcattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             aCA--ATCAAA------ATACGTCTTA-C---A----A-AA-AA-AGA-------GT-----C-TGA------C-----A---TA--ACCG------------TAAAGAA------TG--AT--CA-CGTGATAATA-T-ATTCtacatcggactgcacaccttggt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                        CACACC---CT--GCTA-T----C-TA-T-----TAGTCA--ATCAAA------CTACAGCTTA-C---A----G-AA-AA-TGACC-----AT-----C-T--------
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gi|4                          :                                             gaC-ATTCT--------C----CT---TT--G--C-ATCAAACA---TAA--T-----TACTACGT-AATATTTT--GA-C-CT-CTGC---TC-A-A-ATT--G-TTCAAA--A-------C-----A-----TGTAT-TA--T-T-TC--TA--T--TTAGGAA---G-GAAAATTGAGAA--A-T-GCGTAA--GCTT-GCATATC---AT--GGTA-T----G-GA-TCTAA-TAGCTG--ATAAAA------TTATGGCTTA-CA--A----A-AA-TG-TAATA-----GT-----C-T--------TCC---A---TA--A-C---------A-A-TAAACAa
gi|5                          :                      atgcattgtaggtcTTGTCAT------ATTAT--------TTTCTCT---TT--TA-T-ATTGGTCA---AAA-ATATTCATA-TATATCAATATTCT--GA-C-CT-CAGCTAGTC-T-A-A-T--T-T--GAA--A-------C-----A-----AG--C-TA--C-T-GC--TGTTTC-TTAG--A---G-AGAGA--AACAA--T-TAACCTCT--GTCT-GAACACC---TT--GCTA-T----C-AA-T-----TAGCCA--ATCAAA------ATATTGCTTA-TA--A----A-AA-TG-GGATC-----AT-----C-TCACCCGGCT-----A---TG--A-CAGTA----AA-A-TAAAtgaagtagtgc
gi|6                          :                                                                                                                                                 -T--G-TGC--A--A-------C-----A-----TT--T-CA--C-T-TC--TGTGT--TTAG--T---GTGAAAAT--AAAA--T-C-A-ACCA--GTCC-ACACACA---TG--GCTA-T----T-GA-T-----TAACCA--ATCAAA------ATACATCTTA-CT--A----A-AA-AC-TGATC-----AT-----C-T--------T-----GACCTATCA-TG--ACAGTAA-A-CAAATAA------TGTAATAATA-CGTGA--ATG-T--TTCTGTTTCTtct
gi|7                          : attatcggtaacagtcatatttatacatgtacttttcagacc---GC-ACTAC--------T----CTCTCTT--TGGC-ATCAGTCA---TAA-AA------ACTATGT-GATATTGT--AATG--T-CTGC---AC-C-A-C-T--GATACAAA--A-------T-----A------------A--T-T-TT--TATGT-----------------ACTTAAATA--C-CTATTTTATAGCTT-GTATGTC---AT--GTTA-TAGGCCAGA-TATAAGTAGCCA--ATCAAA------ATATGGCTTA-C---A----A-AA-TG-TAAAC-----AT-----C-T--------T-----aatt
gi|8                          :                                                                                     acacatagtg-AT-----TGCTCTGT-AATATTGT--AATC--T-CTGC---GC-G-A-A-C--GGTTTTAA--A-------C-----A-----TG--G--A--C-C-TC--T------TTAA--A---G-GGAAAATGAAAA--T-T-TTGTCT--GTCC-GCACACC---TT--GCTA-T----C-GA-T-----TATCCA--ATCAGA------ATAACTCTTC-C---A----ATGA-AA-TGATCATCCGAT-----C-C--------T-----G---TC--A-TA--C----CA-G-TAAACAA---------AATATAA-CGTTATTATA-T-Aagccattgtcataacaataaagt
gi|9                          :                                                             taccttgc---TT--G--C-ATCGGTCA---TAA-GT-----T--------------CT--GGCC--T-CTGC---TT-A-A-A-TA-G-TTTGAA--A-------T-----G-----AG--C-TA--T-TCTC--TTTTT--TTAC--C---A-GAAAAGTAAATA--G-T-ACACCA--GTCA-GCACATC---TT--ACTA-T----C-AAAC-----TA-CCA--ATCAGA------ATACAGCTGATC---A----A-AA-GG-TGATCACCTGAT-----C-C--------T-----G---TC--A-C---------------AACAG------T-TAATAAAA--GTGACAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): CCGGTCTCCATATATTGCTATTATTTAACCATCGAAACATGGCTTGACCTGTCCAAACAGTAAACAGGCAACTTAATAATACGTTTTTTTTTGTTGATAATTTA






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lowQualScore                  :                       77   1        2     333333     9999999999999  555  77777 3        333   2  55555    1   1        22  9999 1    333  333 1 9999 3   8  22 00000000000000000000000  22 1 222 22 1 1  22  1  55 1   00000000     4 0    22 666 1        22   1  222  33    1 33 1 3333      22      555555          1 777 6666 1  33 1     00000  88888 1111111111111111111111 55555 1 888888888     333333333333333    11 66  0 44   6666          
lowQualScore                  :                       ..   .        .     ......     .............  ...  ..... .        ...   .  .....    .   .        ..  .... .    ...  ... . .... .   .  .. .......................  .. . ... .. . .  ..  .  .. .   ........     . .    .. ... .        ..   .  ...  ..    . .. . ....      ..      ......          . ... .... .  .. .     .....  ..... ...................... ..... . .........     ...............    .. ..  . ..   ....          
lowQualScore                  :                       55   0        0     000000     8888888888888  888  00000 1        999   1  00000    4   9        66  6666 7    000  444 7 2222 5   1  33 00000000000000000000000  33 7 999 33 7 7  33  3  44 6   44444444     6 2    33 666 4        88   0  555  44    5 66 4 0000      00      000000          7 999 9999 7  22 7     00000  77777 6666666666666666666666 00000 0 999999999     444444444444444    11 11  9 99   5555          
consensus                     :                   CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT--GACC-CT-CTGC---TC-G-A-A-T--G-TACGAA--A-------C---------G-----TG--C-T---A--T-T-TC--TGTTT--T-TAG--C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCAGTCC-GCACGCC---TT--GCTA-TCGA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-C---A----A-AA-NG-TGATC-----AT-----C-------T--------T-----G-----TCATAACAG---TAAAC----AA------TGTAATAANA-CGTGATNATA-T-ATTCTGTTTCT
Reference ( family-421 )      :                   CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT--GACC-CT-CTGC---TC-G-A-A-T--G-TACGAA--A-------C---------G-----TG--C-T---A--T-T-TC--TGTTT--T-TAG--C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCAGTCC-GCACGCC---TT--GCTA-TCGA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-C---A----A-AA-NG-TGATC-----AT-----C-------T--------T-----G-----TNACGANAA---TAAAC----AA------TGTAATAANA-CGTGATNATA-T-ATTCTGTTTCT
gi|1                          :                   CCTT--TAATATATTATT-GTCATTTTGCGATTAT--------T----TT---TT--T--T-ATCCGCCA---TAA-AT-----TACTGTGT-GATATTCT--GACCACTACTGC---TC-A-A-A-T--G-AATTAA--A-------C---------A-----TG--C-T---A--T-T-TT--TGTTT--T-TAG--T---G-AAAAATTAAAAA--T-C-ATATCAGTCC-TCATACC---TT--CTTA-TGGA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATGTGGCTTT-C---A----G-AA-TA-TGGTC-----AT-----C-------T--------T-----G-----TAACGAACA---TAAAG----TA------TGTACTAAAA-C------ATA-----TCTGTTTCT
gi|10                         :                                                                                     GTCA---TAA-AC-----TCTTGTTA-AATAGGCT--T-TC-CT-TGGC---TC-G-A-A-TA-G-TATGAA--AGC-----T---------G-----TG--T-T---A--T-T-TC--AGTTT--T-AAT--A---G-GAAATTCAAAAG--TGC-AC--CAGTCT-CCACATC---TT--GCTA-TTTA-G----CAGCCT--ATCATA------ATACCGCTTA-CT--A----A-CT-AG-CGATC-----AT-----C-------TAAACC---A-----G-----TCAT-ACAAAT-TAAAT----GA------CGTAATAt
gi|11                         :                                                     T--------C----CT---TT--G--C-ATCAGTCA---TAA-CT-----TACTGTGC-AATTTTTT--GGCG-G--CTGC---TC-A-G-A----G-TATAAA--A-------C---------A-----TG--C-T---T--T-T-TC--TATTT--T-TAG--C---A-GGAAATT------------TGTCAGTTC-TAATAAC---TT--TGTA-T-AA-T----TATCCA--ATCAAA------ATACTGTTGA-T---A----A-AA-CA-AGATC-----ATCAGGGC-------C--------T-----G-----TGGTAACAG---TAAAC----AA------
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gi|13                         :                                                                                                         cctTGT-AATGTTCT--GA-C-CT-CTGC---TT-A-G-A-TA-G-CATTTA--A-------CTT-------G-----TG--C-T---C--T-T-TC--TGTTTC-T-TAG--G---A-GGACATTAAAAA--T---ATGTCGGCCT-ATGTGTC---TT--AATG-T-----------------ATCAAA------GTATGGCTGA-C---A----A-AA-AACTGGTC-----AC-----C-------T--------GAACCAG-----TCATGACAG---TAAAC----AAAAATTGTGTAATGATA-Ccagtgaacatcagagctggttataccagcaaactaaatgat
gi|14                         :                                                                               a-ATCAGACA---TTA-TT-----TACCCTGT-AGTATTTT--GATC--T-CTGT---CA-G-A-AGT--G-TACAAA--AATGATTTT---------G-----TG--C-T---A--T-T-TC--TA-TT--T-TAG--A---G-AAATAATAAAA-----C-ATA----------ATGC-----T--GTTA-TTGA-T----TAGCCA--ATCAAA------AGATAGTTTA-CA--A----A-AA-TG-TGAGC-----AT-----a
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gi|16                         :                                                               ----CT---TT--T--AGATCAATCA---TAA-AT-----CACTGTGT-AATATTCT--GACC--T-CTCC---TT-G-A-A-------AC-----A-------T---------G-----TG--C-T---T--T-T-TC--TGTTT--T-TAG--T---G-GGGAA------A--T---ACATTTGTCT-GCACACC---TT--GTTAATC-A-G----TAGCCA--ATTAAA------ATATGGCTTA-C---AC---C-AA-AG-TGATC-----Agattttgtcatagccattattaaaaaagatgaagca
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                        AAAA--T-T-ATATCAGTTC-TCACACC---CT--GCTA-TCTA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATACATGTTA-TA--A----A-AA-TG-TGATC-----AT-----C----------------T-----G-----GAAAGAAAAC--TAAAA----AAG-----CGTAATAAAA-ctaaaattatatcagttctcacaccctgctatctattagccaatcaaaatacatgttataaaaatgtgatcatctggaaagaaaactaaaaaagcgtaataaaaaa
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gi|2                          :   tctgttatataggttgCCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTATATGTACAGT----CC---TT--T--G-ATCGGTCA---TAA-TA-----TACTATAT-TATATACT--GA-C-CT-CTGC---TT-G-A-A-TG-G-TAT-AA--A-------C---------ATT---TG--C-T---A--T-T-TC--TGTTTTAT-TA-------G-GAAAATCAAAAA--G-T-ACATCTGTTC-CCTTGTC---GT--ATTA-TCAG-T----TAACAA--AT-AAA------ATACGCCTTA-TA--A----A-AA-TG-TAATTG----AC-----C----------------------G-----TCATAACAA---TAAAC----AA------AG-AATAaattttag
gi|20                         :                                                     T--------C----CT---TT--G--C-ATTGATCAGAATAA-AT-----GTCTATGT-AATATTCT--GGCC--T-CTGC---TG-A-G-A-TA-G-TACAAA--A-------CAT-------G-----TG--C-T---A--T-T-TC--TATTT--T--AG--TTTGG-GAAAATTGAGAA--A-C-ATGTCA-TCTGGCATGTC---TT--GCTA-TGGA-C----TA
gi|21                         :                                                                                     cTCA---TGA-AT-----TACTCTAT-AATATTC---AAAC-AT-CTGC---TC-G-ATA-T----TACAAA--A-------C---------A-----TG--TGT---A--A-T-GC--AGGTT--T-TAG--C---G-GGCAGATAAAAT--T-C-ACGTCAGTCC-G-ACGAA---GTA-ACTC-TCAT-T----TAGCCA--GTCAAtg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                              ttaaCC---TT--GCTA-TCCG-T----TAGCCA--ATCAGA------ATATGTCTTA-T---A------------TGAGC-----AT-----C-------A--------T-----G-----
gi|23                         :                                                                               tctggaaaCA---TAA-TG-----TACCATGT-AATAATCT--GACC-TT--TGC---TC-G-A-A-TA-G-CATGAACTA-------T---------G-----TG--T-T---G--T-T-TC--TGATT--T-TAG--C---G-GGGAAATAAAAA--T-T-ACGTCGATCC-ACACAAT---TT--GCTacttacagcttacagcttacaaacagtaaacaaaattgatgtaaaaataggtgtctttctct
gi|24                         :                                                                                                  -----TACTGTGT-AATATTCT--GAAA-TT--TGC---TT-GTA-A-A--G-TATAAA--A-------T---------A-----TGAGC-A---A--T-T-TTATTGTTT--T-AAG--CA--G-GTAAAATAAACA--T-T-ACATCAGTCT-GCATCCT---CT--ATTA-TCAA-T----TAGCCA--ccagcttac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GTCC-GCTCA-----TT--ATTA-TTGA-T----TATCCA--ATCAAA------ATACGGCTTA-CAAAA----A-AA-AG-T--TC-----ATCTAAGC-------T--------T-----G-----TCATAGCAG---TAAAC----A---------TAAAAAAACCGCG-TTATA-T-A
gi|27                         :                                                           ttac----CT---TT--A--C-ATCAGTTA---GAA-AT-----TACCATGT-AATTGTCTTTAAAC-CT-CCGC---TC-G-A-C-TA-G-GACAAA--A-------C---------A-----TG--C-T---A--T-T-TC--TATTT--T-AAC--C---T-GAAAATa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 cGA-T----CAGCCA--ATCTAA------CTAAGGTTCA-CA--A----A-AA-TG-TGATT-----AT-----C-------TAATCC---T-----G-----TCATAACAG---TAAAatatcaact
gi|29                         :                                                                                                                                T-CTGC---TCCA-A-A-C--G-TATGGA--G-------C---------A-----TG--C-T---A--T-T-TT--TGTTT--T-TAGT-C---G-GAAAAT--AAAC--T-T-ACGTCAG-CT-TCACACT---TT--ACTC-TAGA-T----TAGCCagcaaattgcgtatttattcatttcctaatttt
gi|3                          :                                                   TAC--------T----CT---TTGATA-C-ATCGGTCA---TAACAC-----T-CTGTGT-AATAATCT--GACCTCT-CTGT---TC-T-A-G-TA-A-TACAAA--A-------C---------A-----AA--C-T---C--TAT-CC--TAATT--T---G--T---T-GAAATGTAAGAT--T-C-CCACCAGTTC-ATACGTC---CT--ACTG-TCGA-G----TATTCA--ATta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gGCTTA-C---A----A-AA-TG-GGATC-----AT-----C-------TGATAC---T-----G-----CCATAACAG---TAAAC----A----------AACATGA-AGTAATGATACT-TTTCTGTTTCTtctgtattcaatcaagttacaggcgaaagaagtgacaacctgtatctgtcatatcgataaataaaagtaactgaagta
gi|31                         :                                                                                                                                                          GAA--A-------G---------A-----TG--T-T---A--T-T-TC--TTATT--T-T--------G-AAAAATAGAAAA--T-A-ATACCAGTCT-GCACACC---TT--ATTT-TCGA-T----TAACCA--ATCAAattcgtaacat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCA--ACCATA------ATATGGCTTA-T---ACAAAA-AA-CG-TAATC-----AT-----C-------TGAGCTTGTT-----G-----TAACGATAAACATAGAT----AA------TGTAATAcaagtga
gi|33                         :                                                                                     GTCA---TAA-AT------A-TGGGT-AACATTCT--GA-C-CT-CTAC----------A-T--G-TGCTAC--A-----------------------------T---A--T-A-TT--TGTTT--T-Tcattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             aCA--ATCAAA------ATACGTCTTA-C---A----A-AA-AA-AGA-------GT-----C----------------T-----G-----ACATAACCG---TAAAG----AA------TG--AT--CA-CGTGATAATA-T-ATTCtacatcggactgcacaccttggt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                              CACACC---CT--GCTA-TCTA-T----TAGTCA--ATCAAA------CTACAGCTTA-C---A----G-AA-AA-TGACC-----AT-----C-------T--------
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                               TT--T-TAG--C---G-AGAAAGTAAAAA--T-G-AAGTCGGTCC-ACACga
gi|4                          :                                             gaC-ATTCT--------C----CT---TT--G--C-ATCAAACA---TAA--T-----TACTACGT-AATATTTT--GA-C-CT-CTGC---TC-A-A-ATT--G-TTCAAA--A-------CAT-------G-----TA--T-T---A--T-T-TC--TA--T--T-TAGGAA---G-GAAAATTGAGAA--A-T-GCGTAAGCTT-GCATATC---AT--GGTA-TGGA-TCTAATAGCTG--ATAAAA------TTATGGCTTA-CA--A----A-AA-TG-TAATA-----GT-----C-------T--------T-----------CCATAACAA---TAAAC----Aa
gi|5                          :                      atgcattgtaggtcTTGTCAT------ATTAT--------TTTCTCT---TT--TA-T-ATTGGTCA---AAA-ATATTCATA-TATATCAATATTCT--GA-C-CT-CAGCTAGTC-T-A-A-T--T-T--GAA--A-------C---------A-----AG--C-T---A--C-T-GC--TGTTTC-T-TAG--A---G-AGAGA--AACAA--T-TAACCTCTGTCT-GAACACC---TT--GCTA-TCAA-T----TAGCCA--ATCAAA------ATATTGCTTA-TA--A----A-AA-TG-GGATC-----AT-----C-------T--------CACCCGG-----CTATGACAG---TAAAtgaagtagtgc
gi|6                          :                                                                                                                                                 -T--G-TGC--A--A-------C---------A-----TT--T-C---A--C-T-TC--TGTGT--T-TAG--T---GTGAAAAT--AAAA--T-C-A-ACCAGTCC-ACACACA---TG--GCTA-TTGA-T----TAACCA--ATCAAA------ATACATCTTA-CT--A----A-AA-AC-TGATC-----AT-----C-------T--------T-----GACCTATCATGACAG---TAAACAAATAA------TGTAATAATA-CGTGA--ATG-T--TTCTGTTTCTataaatct
gi|7                          : attatcggtaacagtcatatttatacatgtacttttcagacc---GC-ACTAC--------T----CTCTCTT--TGGC-ATCAGTCA---TAA-AA------ACTATGT-GATATTGT--AATG--T-CTGC---AC-C-A-C-T--GATACAAA--A-------TAATTTTTATG-----TA--C-TTAAA--T-A-CC--TATTT--TATAG--C----------TTGTATG--T-C-ATGTTA------TAGGCC---A---GATA-T-AA-G----TAGCCA--ATCAAA------ATATGGCTTA-C---A----A-AA-TG-TAAAC-----AT-----CTTAGCCAT--------T-----G-----TCATAACAA---TAAAaatt
gi|8                          :                                                                                     acacatagtg-AT-----TGCTCTGT-AATATTGT--AATC--T-CTGC---GC-G-A-A-C--GGTTTTAA--A-------C---------A-----TG--G-----A--C-C-TC--T------T-TAA--A---G-GGAAAATGAAAA--T-T-TTGTCTGTCC-GCACACC---TT--GCTA-TCGA-T----TATCCA--ATCAGA------ATAACTCTTC-C---A----ATGA-AA-TGATCATCCGAT-----C-------C--------T-----G-----TCATACCAG---TAAAC----AA---------AATATAA-CGTTATTATA-T-Agt
gi|9                          :                                                             taccttgc---TT--G--C-ATCGGTCA---TAA-GT-----T--------------CT--GGCC--T-CTGC---TT-A-A-A-TA-G-TTTGAA--A-------T---------G-----AG--C-T---A--T-TCTC--TTTTT--T-TAC--C---A-GAAAAGTAAATA--G-T-ACACCAGTCA-GCACATC---TT--ACTA-TCAAAC----TA-CCA--ATCAGA------ATACAGCTGATC---A----A-AA-GG-TGATCACCTGAT-----C-------C--------T-----G-----TCAC----------AAC----AG------T-TAATAAAA--GTGACAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): CCGGTCTCCATATATTGCTATTATTTAACCATCGAAACATGGCTTGACCTGTCCAAACAGTAAACAGGCAACTTAATAATACGTTTTTTTTTGTTGATAATTTA






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Reference ( family-421 )      :                   CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT--GACC-CT-CTGC---TC-G-A-A-T--G-TACGAA--A-------C---------G-----TG--C--T---A--T-T-TC--TGTTT--T-TAG-C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCAGTCC-GCACGCC---TT--GCTA-TCGA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATAC-GGCTTA-C---A----A-AA-N-G-TGAT------C-----AT-----C-------T-----T-----G-----TCAT-A-ACAGTAAAC------A------A------TGTAATAANA-CGTGATNATA-T-ATTCTGTTTCT
gi|1                          :                   CCTT--TAATATATTATT-GTCATTTTGCGATTAT--------T----TT---TT--T--T-ATCCGCCA---TAA-AT-----TACTGTGT-GATATTCT--GACCACTACTGC---TC-A-A-A-T--G-AATTAA--A-------C---------A-----TG--C--T---A--T-T-TT--TGTTT--T-TAG-T---G-AAAAATTAAAAA--T-C-ATATCAGTCC-TCATACC---TT--CTTA-TGGA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATGT-GGCTTT-C---A----G-AA-T-A-TGGT------C-----AT-----C-------T-----T-----G-----TAACGA-ACA-TAAAG------T------A------TGTACTAAAA-C------ATA-----TCTGTTTCT
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gi|13                         :                                                                                                         cctTGT-AATGTTCT--GA-C-CT-CTGC---TT-A-G-A-TA-G-CATTTA--A-------CTT-------G-----TG--C--T---C--T-T-TC--TGTTTC-T-TAG-G---A-GGACATTAAAAA--T---ATGTCGGCCT-ATGTGTC---TT--AATG-T-----------------------------ATCAAA------GTAT-GGCTGA-C---A----A-AA-A-ACTGGT------C-----AC-----C-------T-----GAACCAG-----TCAT-G-ACAGTAAAC------A------AAAATTGTGTAATGATA-Cat
gi|14                         :                                                                               a-ATCAGACA---TTA-TT-----TACCCTGT-AGTATTTT--GATC--T-CTGT---CA-G-A-AGT--G-TACAAA--AATGATTTT---------G-----TG--C--T---A--T-T-TC--TA-TT--T-TAG-A---G-AAATAATAAAA-----C-ATA----------ATGC-----T--GTTA-TTGA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------AGAT-AGTTTA-CA--A----A-AA-T-G-TGAG------C-----AT-----a
gi|15                         :                                                                                                                ccatcctcccagttatT-CTAC---T--G-A-A-TTAG-TACTAA--A-------C---------AGAACTTG--A--T---AAAT-T-TT--TGTTT--T--AG-C---GAGAGAATTGAGAAATT-C-A-G-CAGCTT-GCATGTC---AT--GTTG-TTGA-T----TG---------A---CCA--ATCAAA------GTAC-GGCTTA-CA--A----A-AA-T-G-TAAT------C-----GT-----CTGATT--T-----T-----G-----TCAT-A-GCatgagtct
gi|16                         :                                                               ----CT---TT--T--AGATCAATCA---TAA-AT-----CACTGTGT-AATATTCT--GACC--T-CTCC---TT-G-A-A-------AC-----A-------T---------G-----TG--C--T---T--T-T-TC--TGTTT--T-TAG-T---G-GGGAA------A--T---ACATTTGTCT-GCACACC---TT--GTTAATC-A-G----TA---------G---CCA--ATTAAA------ATAT-GGCTTA-C---AC---C-AA-A-G-TGAT------C-----Acattattaaaaaagatgaagca
gi|17                         :                                                     T--------T----CT---TT--T--C-ACCAGCTG---TAA-AT-----TACTATGT-AATATTTT--GA-C-TT-CTGC---TC-A-A-agtgaacatgactg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                        AAAA--T-T-ATATCAGTTC-TCACACC---CT--GCTA-TCTA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATAC-ATGTTA-TA--A----A-AA-T-G-TGAT------C-----AT-----C-------T-----G-----G-----AAAG-A-AAACTAAAA------A------AG-----CGTAATAAAA-ctaaaattatatcagttctcacaccctgctatctattagccaatcaaaatacatgttataaaaatgtgatcatctggaaagaaaactaaaaaagcgtaataaaaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                    ttcttttcaccagctgtaaattactatgtaatattttgacttctgctcaactGTTC-CCACACC---TTTGACTA-CCAA-T----TA---------G---CCATTATCAAA------ATAC-AGCATA-C---AT---T-AA-A-G-TGGC------C-----AT-----C-------TTGACCT-----G-----TAAT-A-AAGGTAAAC-------------A------TG-AACAACA---TAATATTA-TGATTCTGTTTCTaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                gtaaatataaagttacaatCGTCAGTTC-GTAGACT---GT--GTTA-CCGA-T----AA---------A---CCA--ACCAAACTAATTATAC-GGCTTA-T---A----A-AATA-G-TGAT------C-----AC-----C-------TGAACCT-----G-----TCAT-A-ACAATAAAC------A--------------GAAAT--GA-CGTAATCGT-----TTCTaat
gi|2                          :   tctgttatataggttgCCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTATATGTACAGT----CC---TT--T--G-ATCGGTCA---TAA-TA-----TACTATAT-TATATACT--GA-C-CT-CTGC---TT-G-A-A-TG-G-TAT-AA--A-------C---------ATT---TG--C--T---A--T-T-TC--TGTTTTAT-TA------G-GAAAATCAAAAA--G-T-ACATCTGTTC-CCTTGTC---GT--ATTA-TCAG-T----TA---------A---CAA--AT-AAA------ATAC-GCCTTA-TA--A----A-AA-T-G-TAAT------TG----AC-----C-------------------G-----TCAT-A-ACAATAAAC------A------A------AG-AATAaattttag
gi|20                         :                                                     T--------C----CT---TT--G--C-ATTGATCAGAATAA-AT-----GTCTATGT-AATATTCT--GGCC--T-CTGC---TG-A-G-A-TA-G-TACAAA--A-------CAT-------G-----TG--C--T---A--T-T-TC--TATTT--T--AG-TTTGG-GAAAATTGAGAA--A-C-ATGTCA-TCTGGCATGTC---TT--GCTA-TGGA-C----TA---------
gi|21                         :                                                                                     cTCA---TGA-AT-----TACTCTAT-AATATTC---AAAC-AT-CTGC---TC-G-ATA-T----TACAAA--A-------C---------A-----TG--TG-T---A--A-T-GC--AGGTT--T-TAG-C---G-GGCAGATAAAAT--T-C-ACGTCAGTCC-G-ACGAA---GTA-ACTC-TCAT-T----TA---------G---CCA--GTCAAtg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                              ttaaCC---TT--GCTA-TCCG-T----TA---------G---CCA--ATCAGA------ATAT-GTCTTA-T---AT---G-AG-C-A-TCATGACTTAC-----AG-----C-------T-----T-----ACAGC-TTACAA-ACAGTAAAC------AAAATTGA------TGTAAAAATA-GGTG
gi|23                         :                                                                               tctggaaaCA---TAA-TG-----TACCATGT-AATAATCT--GACC-TT--TGC---TC-G-A-A-TA-G-CATGAACTA-------T---------G-----TG--T--T---G--T-T-TC--TGATT--T-TAG-C---G-GGGAAATAAAAA--T-T-ACGTCGATCC-ACACAAT---TT--GCTtctttctct
gi|24                         :                                                                                                  -----TACTGTGT-AATATTCT--GAAA-TT--TGC---TT-GTA-A-A--G-TATAAA--A-------T---------A-----TGAGC--A---A--T-T-TTATTGTTT--T-AAG-CA--G-GTAAAATAAACA--T-T-ACATCAGTCT-GCATCCT---CT--ATTA-TCAA-T----TA---------G---CCA--ccagcttac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GTCC-GCTCA-----TT--ATTA-TTGA-T----TA---------T---CCA--ATCAAA------ATAC-GGCTTA-CAAAA----A-AA-A-G-T--T------C-----ATCTAAGC-------T-----T-----G-----TCAT-A-GCAGTAAAC------A---------------TAAAAAAACCGCG-TTATA-T-A
gi|27                         :                                                           ttac----CT---TT--A--C-ATCAGTTA---GAA-AT-----TACCATGT-AATTGTCTTTAAAC-CT-CCGC---TC-G-A-C-TA-G-GACAAA--A-------C---------A-----TG--C--T---A--T-T-TC--TATTT--T-AAC-C---T-GAAAATa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 cGA-T----CA---------G---CCA--ATCTAA------CTAA-GGTTCA-C---A----A-AA-ATG-TGAT------T-----AT-----C-------TAATCCT-----G-----TCAT-A-ACAGTAAAatatcaact
gi|29                         :                                                                                                                                T-CTGC---TCCA-A-A-C--G-TATGGA--G-------C---------A-----TG--C--T---A--T-T-TT--TGTTT--T-TAGTC---G-GAAAAT--AAAC--T-T-ACGTCAG-CT-TCACACT---TT--ACTC-TAGA-T----TA---------G---CCagcaaattgcgtatttattcatttcctaatttt
gi|3                          :                                                   TAC--------T----CT---TTGATA-C-ATCGGTCA---TAACAC-----T-CTGTGT-AATAATCT--GACCTCT-CTGT---TC-T-A-G-TA-A-TACAAA--A-------C---------A-----AA--C--T---C--TAT-CC--TAATT--T---G-T---T-GAAATGTAAGAT--T-C-CCACCAGTTC-ATACGTC---CT--ACTG-TCGA-G----TATTCAATTCTGTATTCA--ATCAAG------TTACAGGC--G-A---A----A-GA-A-G-TGAC------A-----AC-----C-------TGTATCT-----G-----TCAT-A-TCGATAAAT------A------A------ta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gGCTTA-C---A----A-AA-T-G-GGAT------C-----AT-----C-------TGATACT-----G-----CCAT-A-ACAGTAAAC------A----------------AACATGA-AGTAATGATACT-TTTCTGTTTCTaagtaactgaagta
gi|31                         :                                                                                                                                                          GAA--A-------G---------A-----TG--T--T---A--T-T-TC--TTATT--T-T-------G-AAAAATAGAAAA--T-A-ATACCAGTCT-GCACACC---TT--ATTT-TCGA-T----TA---------A---CCA--ATCAAattcgtaacat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---CCA--ACCATA------ATAT-GGCTTA-T---ACAAAA-AA-C-G-TAAT------C-----ATCTGAGC-------T-----T-----G-----TTGT-A-ACGATAAACATAGATA------A------TGTAATAcaagtga
gi|33                         :                                                                                     GTCA---TAA-AT------A-TGGGT-AACATTCT--GA-C-CT-CTAC----------A-T--G-TGCTAC--A------------------------------T---A--T-A-TT--TGTTT--T-Tcattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aCA--ATCAAA------ATAC-GTCTTA-C---A----A-AA-A-A-AGA-------------GT-----C-------------T-----G-----ACAT-A-ACCGTAAAG------A------A------TG--AT--CA-CGTGATAATA-T-ATTCtacatcggactgcacaccttggt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                              CACACC---CT--GCTA-TCTA-T----TA---------G---TCA--ATCAAA------CTAC-AGCTTA-C---A----G-AA-A-A-TGAC------C-----AT-----C-------T-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                TT--T-TAG-C---G-AGAAAGTAAAAA--T-G-AAGTCGGTCC-ACACga
gi|4                          :                                             gaC-ATTCT--------C----CT---TT--G--C-ATCAAACA---TAA--T-----TACTACGT-AATATTTT--GACC--T-CTGC---TC-A-A-A-TT-G-TTCAAA--A-------C---------A-----TG--TATT---A--T-T-TC--TATTT-----AG-GAA-G-GAAAATTGAGAA--A-T-GCGTAAGCTT-GCATATC---AT--GGTA-TGGA-TCTAATA---------G---CTG--ATAAAA------TTAT-GGCTTA-CA--A----A-AA-T-G-TAAT------A-----GT-----C-------T-----T-----------CCAT-A-ACAATAAAC------A------a
gi|5                          :                      atgcattgtaggtcTTGTCAT------ATTAT--------TTTCTCT---TT--TA-T-ATTGGTCA---AAA-ATATTCATA-TATATCAATATTCT--GA-C-CT-CAGCTAGTC-T-A-A-T--T-T--GAA--A-------C---------A-----AG--C--T---A--C-T-GC--TGTTTC-T-TAG-A---G-AGAGA--AACAA--T-TAACCTCTGTCT-GAACACC---TT--GCTA-TCAA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATAT-TGCTTA-TA--A----A-AA-T-G-GGAT------C-----AT-----C-------T-----CACCCGG-----CTAT-G-ACAGTAAAtgaagtagtgc
gi|6                          :                                                                                                                                                 -T--G-TGC--A--A-------C---------A-----TT--T--C---A--C-T-TC--TGTGT--T-TAG-T---GTGAAAAT--AAAA--T-C-A-ACCAGTCC-ACACACA---TG--GCTA-TTGA-T----TA---------A---CCA--ATCAAA------ATAC-ATCTTA-CT--A----A-AA-A-C-TGAT------C-----AT-----C-------T-----T-----GACCTATCAT-G-ACAGTAAACAAAT--A------A------TGTAATAATA-CGTGA--ATG-T--TTCTGTTTCTataaatct
gi|7                          : attatcggtaacagtcatatttatacatgtacttttcagacc---GC-ACTAC--------T----CTCTCTT--TGGC-ATCAGTCA---TAA-AA------ACTATGT-GATATTGT--AATG--T-CTGC---AC-C-A-C-T--GATACAAA--A-------TAATTTTTATG-----TA--C--TTAAA--T-A-CC--TATTT--TATAG-C----------TTGTATG--T-C-ATGTTA------TAGGCC---A---GATA-T-AA-G----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATAT-GGCTTA-C---A----A-AA-T-G-TAAA------C-----AT-----CTTAGCCAT-----T-----G-----TCAT-A-ACAATAAAaatt
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gi|9                          :                                                             taccttgc---TT--G--C-ATCGGTCA---TAA-GT-----T--------------CT--GGCC--T-CTGC---TT-A-A-A-TA-G-TTTGAA--A-------T---------G-----AG--C--T---A--T-TCTC--TTTTT--T-TAC-C---A-GAAAAGTAAATA--G-T-ACACCAGTCA-GCACATC---TT--ACTA-TCAAAC----TA-------------CCA--ATCAGA------ATAC-AGCTGATC---A----A-AA-G-G-TGAT------CACCTGAT-----C-------C-----T-----G-----TCAC-A-ACAGT--------------------------TAATAAAA--GTGACAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): CCGGTCTCCATATATTGCTATTATTTAACCATCGAAACATGGCTTGACCTGTCCAAACAGTAAACAGGCAACTTAATAATACGTTTTTTTTTGTTGATAATTTA






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Reference ( family-421 )      :                   CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT--GACC-CT-CTGC---TC-G-A-A-T--G-TACGAA--A-------C---------G-----TG--C--T---A--T-T-TC--TGTTT--T-TAG-C---G-GAAAATTAAAAA--T-C-ACGTCAGTCC-GCACGCC---TT--GCTA-TCGA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATAC-GGCTTA-C---A----A-AA-N-G-TGAT------C-----AT-----C-------T-----T-----G-----TCAT-A-ACAGTAAAC------A------A------TGTAATAANA-CGTGATNATA-T-ATTCTGTTTCT
gi|1                          :                   CCTT--TAATATATTATT-GTCATTTTGCGATTAT--------T----TT---TT--T--T-ATCCGCCA---TAA-AT-----TACTGTGT-GATATTCT--GACCACTACTGC---TC-A-A-A-T--G-AATTAA--A-------C---------A-----TG--C--T---A--T-T-TT--TGTTT--T-TAG-T---G-AAAAATTAAAAA--T-C-ATATCAGTCC-TCATACC---TT--CTTA-TGGA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATGT-GGCTTT-C---A----G-AA-T-A-TGGT------C-----AT-----C-------T-----T-----G-----TAACGA-ACA-TAAAG------T------A------TGTACTAAAA-C------ATA-----TCTGTTTCT
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gi|16                         :                                                               ----CT---TT--T--AGATCAATCA---TAA-AT-----CACTGTGT-AATATTCT--GACC--T-CTCC---TT-G-A-A-------AC-----A-------T---------G-----TG--C--T---T--T-T-TC--TGTTT--T-TAG-T---G-GGGAA------A--T---ACATTTGTCT-GCACACC---TT--GTTAATC-A-G----TA---------G---CCA--ATTAAA------ATAT-GGCTTA-C---AC---C-AA-A-G-TGAT------C-----Acattattaaaaaagatgaagca
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                        AAAA--T-T-ATATCAGTTC-TCACACC---CT--GCTA-TCTA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATAC-ATGTTA-TA--A----A-AA-T-G-TGAT------C-----AT-----C-------T-----G-----G-----AAAG-A-AAACTAAAA------A------AG-----CGTAATAAAA-ctaaaattatatcagttctcacaccctgctatctattagccaatcaaaatacatgttataaaaatgtgatcatctggaaagaaaactaaaaaagcgtaataaaaaa
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gi|2                          :   tctgttatataggttgCCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTATATGTACAGT----CC---TT--T--G-ATCGGTCA---TAA-TA-----TACTATAT-TATATACT--GA-C-CT-CTGC---TT-G-A-A-TG-G-TAT-AA--A-------C---------ATT---TG--C--T---A--T-T-TC--TGTTTTAT-TA------G-GAAAATCAAAAA--G-T-ACATCTGTTC-CCTTGTC---GT--ATTA-TCAG-T----TA---------A---CAA--AT-AAA------ATAC-GCCTTA-TA--A----A-AA-T-G-TAAT------TG----AC-----C-------------------G-----TCAT-A-ACAATAAAC------A------A------AG-AATAaattttag
gi|20                         :                                                     T--------C----CT---TT--G--C-ATTGATCAGAATAA-AT-----GTCTATGT-AATATTCT--GGCC--T-CTGC---TG-A-G-A-TA-G-TACAAA--A-------CAT-------G-----TG--C--T---A--T-T-TC--TATTT--T--AG-TTTGG-GAAAATTGAGAA--A-C-ATGTCA-TCTGGCATGTC---TT--GCTA-TGGA-C----TA---------
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                              ttaaCC---TT--GCTA-TCCG-T----TA---------G---CCA--ATCAGA------ATAT-GTCTTA-T---AT---G-AG-C-A-TCATGACTTAC-----AG-----C-------T-----T-----ACAGC-TTACAA-ACAGTAAAC------AAAATTGA------TGTAAAAATA-GGTG
gi|23                         :                                                                               tctggaaaCA---TAA-TG-----TACCATGT-AATAATCT--GACC-TT--TGC---TC-G-A-A-TA-G-CATGAACTA-------T---------G-----TG--T--T---G--T-T-TC--TGATT--T-TAG-C---G-GGGAAATAAAAA--T-T-ACGTCGATCC-ACACAAT---TT--GCTtctttctct
gi|24                         :                                                                                                  -----TACTGTGT-AATATTCT--GAAA-TT--TGC---TT-GTA-A-A--G-TATAAA--A-------T---------A-----TGAGC--A---A--T-T-TTATTGTTT--T-AAG-CA--G-GTAAAATAAACA--T-T-ACATCAGTCT-GCATCCT---CT--ATTA-TCAA-T----TA---------G---CCA--ccagcttac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                        GTCC-GCTCA-----TT--ATTA-TTGA-T----TA---------T---CCA--ATCAAA------ATAC-GGCTTA-CAAAA----A-AA-A-G-T--T------C-----ATCTAAGC-------T-----T-----G-----TCAT-A-GCAGTAAAC------A---------------TAAAAAAACCGCG-TTATA-T-A
gi|27                         :                                                           ttac----CT---TT--A--C-ATCAGTTA---GAA-AT-----TACCATGT-AATTGTCTTTAAAC-CT-CCGC---TC-G-A-C-TA-G-GACAAA--A-------C---------A-----TG--C--T---A--T-T-TC--TATTT--T-AAC-C---T-GAAAATa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 cGA-T----CA---------G---CCA--ATCTAA------CTAA-GGTTCA-C---A----A-AA-ATG-TGAT------T-----AT-----C-------TAATCCT-----G-----TCAT-A-ACAGTAAAatatcaact
gi|29                         :                                                                                                                                T-CTGC---TCCA-A-A-C--G-TATGGA--G-------C---------A-----TG--C--T---A--T-T-TT--TGTTT--T-TAGTC---G-GAAAAT--AAAC--T-T-ACGTCAG-CT-TCACACT---TT--ACTC-TAGA-T----TA---------G---CCagcaaattgcgtatttattcatttcctaatttt
gi|3                          :                                                   TAC--------T----CT---TTGATA-C-ATCGGTCA---TAACAC-----T-CTGTGT-AATAATCT--GACCTCT-CTGT---TC-T-A-G-TA-A-TACAAA--A-------C---------A-----AA--C--T---C--TAT-CC--TAATT--T---G-T---T-GAAATGTAAGAT--T-C-CCACCAGTTC-ATACGTC---CT--ACTG-TCGA-G----TATTCAATTCTGTATTCA--ATCAAG------TTACAGGC--G-A---A----A-GA-A-G-TGAC------A-----AC-----C-------TGTATCT-----G-----TCAT-A-TCGATAAAT------A------A------ta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gGCTTA-C---A----A-AA-T-G-GGAT------C-----AT-----C-------TGATACT-----G-----CCAT-A-ACAGTAAAC------A----------------AACATGA-AGTAATGATACT-TTTCTGTTTCTaagtaactgaagta
gi|31                         :                                                                                                                                                          GAA--A-------G---------A-----TG--T--T---A--T-T-TC--TTATT--T-T-------G-AAAAATAGAAAA--T-A-ATACCAGTCT-GCACACC---TT--ATTT-TCGA-T----TA---------A---CCA--ATCAAattcgtaacat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---CCA--ACCATA------ATAT-GGCTTA-T---ACAAAA-AA-C-G-TAAT------C-----ATCTGAGC-------T-----T-----G-----TTGT-A-ACGATAAACATAGATA------A------TGTAATAcaagtga
gi|33                         :                                                                                     GTCA---TAA-AT------A-TGGGT-AACATTCT--GA-C-CT-CTAC----------A-T--G-TGCTAC--A------------------------------T---A--T-A-TT--TGTTT--T-Tcattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aCA--ATCAAA------ATAC-GTCTTA-C---A----A-AA-A-A-AGA-------------GT-----C-------------T-----G-----ACAT-A-ACCGTAAAG------A------A------TG--AT--CA-CGTGATAATA-T-ATTCtacatcggactgcacaccttggt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                              CACACC---CT--GCTA-TCTA-T----TA---------G---TCA--ATCAAA------CTAC-AGCTTA-C---A----G-AA-A-A-TGAC------C-----AT-----C-------T-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                TT--T-TAG-C---G-AGAAAGTAAAAA--T-G-AAGTCGGTCC-ACACga
gi|4                          :                                             gaC-ATTCT--------C----CT---TT--G--C-ATCAAACA---TAA--T-----TACTACGT-AATATTTT--GACC--T-CTGC---TC-A-A-A-TT-G-TTCAAA--A-------C---------A-----TG--TATT---A--T-T-TC--TATTT-----AG-GAA-G-GAAAATTGAGAA--A-T-GCGTAAGCTT-GCATATC---AT--GGTA-TGGA-TCTAATA---------G---CTG--ATAAAA------TTAT-GGCTTA-CA--A----A-AA-T-G-TAAT------A-----GT-----C-------T-----T-----------CCAT-A-ACAATAAAC------A------a
gi|5                          :                      atgcattgtaggtcTTGTCAT------ATTAT--------TTTCTCT---TT--TA-T-ATTGGTCA---AAA-ATATTCATA-TATATCAATATTCT--GA-C-CT-CAGCTAGTC-T-A-A-T--T-T--GAA--A-------C---------A-----AG--C--T---A--C-T-GC--TGTTTC-T-TAG-A---G-AGAGA--AACAA--T-TAACCTCTGTCT-GAACACC---TT--GCTA-TCAA-T----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATAT-TGCTTA-TA--A----A-AA-T-G-GGAT------C-----AT-----C-------T-----CACCCGG-----CTAT-G-ACAGTAAAtgaagtagtgc
gi|6                          :                                                                                                                                                 -T--G-TGC--A--A-------C---------A-----TT--T--C---A--C-T-TC--TGTGT--T-TAG-T---GTGAAAAT--AAAA--T-C-A-ACCAGTCC-ACACACA---TG--GCTA-TTGA-T----TA---------A---CCA--ATCAAA------ATAC-ATCTTA-CT--A----A-AA-A-C-TGAT------C-----AT-----C-------T-----T-----GACCTATCAT-G-ACAGTAAACAAAT--A------A------TGTAATAATA-CGTGA--ATG-T--TTCTGTTTCTataaatct
gi|7                          : attatcggtaacagtcatatttatacatgtacttttcagacc---GC-ACTAC--------T----CTCTCTT--TGGC-ATCAGTCA---TAA-AA------ACTATGT-GATATTGT--AATG--T-CTGC---AC-C-A-C-T--GATACAAA--A-------TAATTTTTATG-----TA--C--TTAAA--T-A-CC--TATTT--TATAG-C----------TTGTATG--T-C-ATGTTA------TAGGCC---A---GATA-T-AA-G----TA---------G---CCA--ATCAAA------ATAT-GGCTTA-C---A----A-AA-T-G-TAAA------C-----AT-----CTTAGCCAT-----T-----G-----TCAT-A-ACAATAAAaatt
gi|8                          :                                                                                     acacatagtg-AT-----TGCTCTGT-AATATTGT--AATC--T-CTGC---GC-G-A-A-C--GGTTTTAA--A-------C---------A-----TG--G------A--C-C-TC--T------T-TAA-A---G-GGAAAATGAAAA--T-T-TTGTCTGTCC-GCACACC---TT--GCTA-TCGA-T----TA---------T---CCA--ATCAGA------ATAA-CTCTTC-C---A----ATGA-A-A-TGAT------CATCCGAT-----C-------C-----T-----G-----TCAT-A-CCAGTAAAC------A------A---------AATATAA-CGTTATTATA-T-Agt
gi|9                          :                                                             taccttgc---TT--G--C-ATCGGTCA---TAA-GT-----T--------------CT--GGCC--T-CTGC---TT-A-A-A-TA-G-TTTGAA--A-------T---------G-----AG--C--T---A--T-TCTC--TTTTT--T-TAC-C---A-GAAAAGTAAATA--G-T-ACACCAGTCA-GCACATC---TT--ACTA-TCAAAC----TA-------------CCA--ATCAGA------ATAC-AGCTGATC---A----A-AA-G-G-TGAT------CACCTGAT-----C-------C-----T-----G-----TCAC-A-ACAGT--------------------------TAATAAAA--GTGACAA


blockSeqs                     :                       GC   A        C     GC         ATGTACAGT      CTC  GATA  G        GAA   C  ATTCA    G   C        TT  CCTC .    TAG  GT  T G GATACAAAATAATTTTTATG                  AG AT TAA AA A C  AT     TA AT  TTTGG       T      AT GC  C        GG   A  TAA  TG    A TT A CTAA  TTCAATTCTGTAT   TT      CTAATT    A      T AAA CAAA T  TA  C    GACTTA ATCCG  CTTAGCCATTG                        A C         AAAAATTGTGT                 T CC    TA   TGA 
blockSeqs                     :                                     T     GC         TTTCT          .    TGG   .        .     .  .        G   .        .   TCC  .    .    CA  . . GTACAAAAATGATTTTG                     .  G  .   .  . .  .      C  A   GAAG        T      .  TA  T        C    A  .    A     . TG . .     G               .       .         .      . T   C    .  AT  .    .      ACCTG  CTAAACCAG                          . .         AAAATTGATGT                 A C     TC   CTT 
blockSeqs                     :                                           .          C              .    TA    .        .     .  .        G   .        .   CGG  .    .    G   . . TAGTACTAAACAGAACT                     .  .  .   .  . .  .      C  T   CGA         A      .  C   T        T    G  .    .     . TG . .     T               .       .         .      . A   T    .  A   .    .      G      CAGGGCCTG                          . .         ATAGATAATGT                 C C     TT   TA  
blockSeqs                     :                                                      T              .    G     .        .     .  .        C   .        .   ACA  .    .    A   . . AGTATAAAACCTAATA                      .  .  .   .  . .  .      .  T   CAG         T      .  C   T        G    G  .    .     . TG . .     G               .       .         .      . A   T    .  C   .    .      .      CAGAGCTGG                          . .         AAATAATGT                   G G     TG   TA  
blockSeqs                     :                                                      C              .    T     .        .     .  .        G   .        .   CCT  .    .    G   . . AGTATGAAAGCTG                         .  .  .   .  . .  .      .  T   TCG         A      .  C   T        A    G  .    .     . CT . .     G               .       .         .      . A   .    .  A   .    .      .      CTGAACCAG                          . .         AAGCGT                      T A     TA   TA  
blockSeqs                     :                                                      T              .    T     .        .     .  .        A   .        .   AAT  .    .    A   . . AGCATTTAACTTG                         .  .  .   .  . .  .      .  T   TGT         T      .  T   C        G    G  .    .     . CA . .     A               .       .         .      . A   .    .  T   .    .      .      CTGATTTTG                          . .         GACGT                       A C     TT   T   
blockSeqs                     :                                                      C              .    T     .        .     .  .        A   .        .   ACC  .    .    G   . . AGTACAAAACATG                         .  .  .   .  . .  .      .  T   AG          T      .  T   T        G    A  .    .     . CG . .     G               .       .         .      . A   .    .  T   .    .      .      CTTGACCTG                          . .         AAAG                        G C     CA   .   
blockSeqs                     :                                                      T              .    G     .        .     .  .        A   .        .   CC   .    .    G   . . AGCATGAACTATG                         .  .  .   .  . .  .      .  T   CA          T      .  C   C        T    A  .    .     . CA . .     G               .       .         .      . A   .    .  A   .    .      .      CTGAACCTG                          . .         AATG                        C C     .        
blockSeqs                     :                                                                     .    A     .        .     .  .        C   .        .   CC   .    .    G   . . GGTATAAACATT                          .  .  .   .  . .  .      .  T   CA          A      .  C   C        C    A  .    .     . GG . .     G               .       .         .      . T   .    .  T   .    .      .      CTAAGCTTG                          . .         ATG                         T .              
blockSeqs                     :                                                                     .    G     .        .     .  .        A   .        .   TC   .    .    A   . . AGGACAAAACA                           .  .  .   .  . .  .      .  T   GA          A      .  T   T        G    A  .    .     . CA . .     A               .       .         .      . .   .    .  A   .    .      .      CTAATCCTG                          . .         AGA                         A .              
blockSeqs                     :                                                                     .    G     .        .     .  .        G   .        .   CC   .    .    G   . . AATACAAAACA                           .  .  .   .  . .  .      .  A   AG          A      .  T   C        C    G  .    .     . CC . .     A               .       .         .      . .   .    .  T   .    .      .      CTGTATCTG                          . .         AT                          A                
blockSeqs                     :                                                                                .        .     .  .        A   .        .   CT   .    .    A   . . TGTTCAAAACA                           .  .  .   .  . .  .      .  A   TG          T      .  T   C        G    G  .    .     . CA . .     G               .       .         .      . .   .    .  C   .    .      .      CTGATACTG                          . .         AA                                           
blockSeqs                     :                                                                                         .     .  .        G   .        .   CC   .    .    G   . . GGTTTTAAACA                           .  .  .   .  . .  .      .  T   CG          T      .  C   C        A    G  .    .     . TG . .     G               .       .         .      . .   .    .  A   .    .      .      CTGAGCTTG                          . .         A                                            
blockSeqs                     :                                                                                         .     .  .        G   .        .   CC   .    .    G   . . AGTTTGAAATG                           .  .  .   .  . .  .      .  T   CG          G      .  A   C        G    A  .    .     . AG . .     G               .       .         .      . .   .    .  A   .    .      .      CTCACCCGG                          . .         T                                            
blockSeqs                     :                                                                                         .     .  .        A   .        .   CC   .    .    G   . . GTATAAAACA                            .  .  .   .  . .  .      .  T   CT          T      .  G   C        G    C  .    .     . CG . .     T               .       .         .      . .   .    .  T   .    .      .      CTTGACCTA                          . .                                                      
blockSeqs                     :                                                                                         .     .  .        A   .        .   CC   .    .    T   . . GTATAAAATA                            .  .  .   .  . .  .      .  T   TT          G      .  T   T        T    A  .    .     . CG . .     G               .       .         .      . .   .    .  C   .    .      .      CTTACAGC                           . .                                                      
blockSeqs                     :                                                                                         .     .  .        A   .        .   CC   .    .    A   . . GTATGGAGCA                            .  .  .   .  . .  .      .  T   CG          T      .  C   A        A    A  .    .     . CT . .     G               .       .         .      . .   .    .  A   .    .      .      CTGG                               . .                                                      
blockSeqs                     :                                                                                               .  .        C   .        .   TG   .    .    T   . . TACAAAACA                             .  .  .   .  . .  .      .  T   AG          T      .  C   C        G    G  .    .     . GG . .     A               .       .         .      . .   .    .  A   .    .      .      CCTG                               . .                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                  .        .   .        .   TC   .    .    C   . . GTGCTACA                              .  .  .   .  . .  .      .  T   AG          T      .  T   C        A    A  .    .     . CA . .     G               .       .         .      . .   .    .  T   .    .      .      CCTG                               . .                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                               .        .   CC   .    .    G   . . TTGAAACA                              .  .  .   .  . .  .      .  T   CA          A      .  T   T        G    A  .    .     . TG . .     G               .       .         .      . .   .    .  T   .    .      .      CTG                                . .                                                      
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): CCGGTCTCCATATATTGCTATTATTTAACCATCGAAACATGGCTTGACCTGTCCAAACAGTAAACAGGCAACTTAATAATACGTTTTTTTTTGTTGATAATTTA






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Reference ( family-421 )      :                 CCTTGCTGANATATCGTTCGTCAT---GC-ATTAT--------T----CT---TT--T--C-ATCGGTCA---TAA-AT-----TACTGTGT-AATATTCT---GAC--CT-CT--GCTCGAAT-AGTACGAAAC---A-------TG------TGC----T------ATT-T--CTGTTT--T-TAG--C---G-GAAAATTAAAAA--T-CA-CGTCAGTCC-GCACGCC---TT--GCT-ATCGA-T----TA---------GC---CA--ATCAAA------ATAC-GGCTTA-C---A----A-AAN-G-TGATCATC-TG------ANCC--TG----TCAT-A-ACAGT-AAA--C-A-----A-----A-----TGTAATAANA-CGTGATNATA-T-ATTCTGTTTCT
gi|1                          :                 CCTT--TAATATATTATT-GTCATTTTGCGATTAT--------T----TT---TT--T--T-ATCCGCCA---TAA-AT-----TACTGTGT-GATATTCT---GACCACTACT--GCTCAAAT--GAATTAAAC---A---------------TGC----T------ATT-T--TTGTTT--T-TAG--T---G-AAAAATTAAAAA--T-CA-TATCAGTCC-TCATACC---TT--CTT-ATGGA-T----TA---------GC---CA--ATCAAA------ATGT-GGCTTT-C---A----G-AAT-A-TGGTCATC-T-------------TG----TAACGA-ACA-T-AAA----G-----T-----A-----TGTACTAAAA-C------ATA-----TCTGTTTCT
gi|10                         :                                                                                   GTCA---TAA-AC-----TCTTGTTA-AATAGGCT---TTC--CT-TG--GCTCGAAT-AGTATGAAAG---C-------TG------TGT----T------ATT-T--CAGTTT--T-AAT--A---G-GAAATTCAAAAG--TGCA-C--CAGTCT-CCACATC---TT--GCT-ATTTA-G----CA---------GC---CT--ATCATA------ATAC-CGCTTA-CT--A----A-CTA-G-CGATCATC-TA------AACC--AG----TCAT-ACAAATT-AAA--T-------G-----A-----CGTAATAt
gi|11                         :                                                   T--------C----CT---TT--G--C-ATCAGTCA---TAA-CT-----TACTGTGC-AATTTTTT---GGC--GG-CT--GCTC--AG-AGTATAAAAC---A-------TG--------C----T------TTT-T--CTATTT--T-TAG--C---A-GGAAATT------------TGTCAGTTC-TAATAAC---TT--TGT-AT-AA-T----TA---------TC---CA--ATCAAA------ATAC-TGTTGA-T---A----A-AAC-A-AGATCATC-AG------GGCC--TG----TGGT-A-ACAGT-AAA--C-A-----A-----A-----
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gi|15                         :                                                                                                               ccatcctcccagttatT-CT--ACT-GAATTAGTACTAAAC---A--------G------AAC----TTGATAAATT-T--TTGTTT--T--AG--C---GAGAGAATTGAGAAATT-CA--G-CAGCTT-GCATGTC---AT--GTT-GTTGA-T----TG---------AC---CA--ATCAAA------GTAC-GGCTTA-CA--A----A-AAT-G-TAATCGTC-TG------ATTT--TG----TCAT-A-GC
gi|16                         :                                                             ----CT---TT--T--AGATCAATCA---TAA-AT-----CACTGTGT-AATATTCT---GAC--CT-CT--CCT----------TGAAAC---A-------TG------TGC----T------TTT-T--CTGTTT--T-TAG--T---G-G------GGAAA--T--A-CATTTGTCT-GCACACC---TT--GTTAATC-A-G----TA---------GC---CA--ATTAAA------ATAT-GGCTTA-C---AC---C-AAA-G-TGATCAAG-TG------AACA--TG----cattattaaaaaagatgaagca
gi|17                         :                                                   T--------T----CT---TT--T--C-ACCAGCTG---TAA-AT-----TACTATGT-AATATTTT---GAC--TT-CT--GCTCAACT-Aactg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                             AAAA--T-TA-TATCAGTTC-TCACACC---CT--GCT-ATCTA-T----TA---------GC---CA--ATCAAA------ATAC-ATGTTA-TA--A----A-AAT-G-TGATCATC-TG-------------G----AAAG-A-AAACT-AAA--A-A-----A-----G-----CGTAATAAAA-aaattatatcagttctcacaccctgctatctattagccaatcaaaatacatgttataaaaatgtgatcatctggaaagaaaactaaaaaagcgtaataaaaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                         ttcttttcaccagctgtaaattactatgtaatattttgacttctgctcaactGTTC-CCACACC---TTTGACT-ACCAA-T----TA---------GC---CATTATCAAA------ATAC-AGCATA-C---A----TTAAA-G-TGGCCATC-TT------GACC--TG----TAAT-A-AAGGT-AAA--C-------------A-----TG-AACAACA---TAATATTA-TGATTCTGTTTCTaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                    gtaaatataaagttacaat-CGTCAGTTC-GTAGACT---GT--GTT-ACCGA-T----AA---------AC---CA--ACCAAACTAATTATAC-GGCTTA-T---A----A-AATAG-TGATCACC-TG------AACC--TG----TCAT-A-ACAAT-AAA--C-A-----G-----A--------AAT--GA-CGTAATCGT-----TTCTaat
gi|2                          : tctgttatataggttgCCTTGCTGAAATATCGTTCGTCAT---GC-ATTATATGTACAGT----CC---TT--T--G-ATCGGTCA---TAA-TA-----TACTATAT-TATATACT---GAC--CT-CT--GCTTGAAT-GGTAT-AAAC---A-------TT------TGC----T------ATT-T--CTGTTTTAT-TA-------G-GAAAATCAAAAA--G-TA-CATCTGTTC-CCTTGTC---GT--ATT-ATCAG-T----TA---------AC---AA--AT-AAA------ATAC-GCCTTA-TA--A----A-AAT-G-TAAT-----TG------ACC----G----TCAT-A-ACAAT-AAA--C-A-----A-----A-----aattttag
gi|20                         :                                                   T--------C----CT---TT--G--C-ATTGATCAGAATAA-AT-----GTCTATGT-AATATTCT---GGC--CT-CT--GCTGAGAT-AGTACAAAAC---A-------TG------TGC----T------ATT-T--CTA-TT--T-TAG--TTTGG-GAAAATTGAGAA--A-CA-TGTCA-TCTGGCATGTC---TT--GCT-ATGGA-C----TA---------gaata
gi|21                         :                                                                                   cTCA---TGA-AT-----TACTCTAT-AATATTCA---AAC--AT-CT--GCTCG-AT-ATTACAAAAC---A-------TG------TG-----T------AAT-G--CAGGTT--T-TAG--C---G-GGCAGATAAAAT--T-CA-CGTCAGTCC-G-ACGAA---GTA-ACT-CTCAT-T----TA---------GC---CA--GTCAAtg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                   ttaaCC---TT--GCT-ATCCG-T----TA---------GC---CA--ATCAGA------ATAT-GTCTTA-T---A------------TGAGCATCATGACTTACAGCT--TACAGCTTACAA-ACAGT-AAA--C-A-----AAATTGA-----TGTAAAAATA-GGTG
gi|23                         :                                                                             tctggaaaCA---TAA-TG-----TACCATGT-AATAATCT---GAC--CT-TT--GCTCGAAT-AGCATGAACT---A-------TG------TGT----T------GTT-T--CTGATT--T-TAG--C---G-GGGAAATAAAAA--T-TA-CGTCGATCC-ACACAAT---TT--GCT-tctttctct
gi|24                         :                                                                                                -----TACTGTGT-AATATTCT---GAA--AT-TT--GCTTGTAA-AGTATAAAAT---A-------TG------AGC----A------ATT-TTATTGTTT--T-AAG--CA--G-GTAAAATAAACA--T-TA-CATCAGTCT-GCATCCT---CT--ATT-ATCAA-T----TA---------GC---CA--ccagcttac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                             GTCC-GCTCA-----TT--ATT-ATTGA-T----TA---------TC---CA--ATCAAA------ATAC-GGCTTA-CAAAA----A-AAA-G-T--TCATC-TA------AGCT--TG----TCAT-A-GCAGT-AAA--C-A-------------------TAAAAAAACCGCG-TTATA-T-A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ttac---TT--GCT-ATTAT-T----TA---------AC---CA---TCGAA------ACAT-GGCTT-----------------------------G------A-CC--TG----TCCA-A-ACAGT-AAA--C-AGGC--A-----A-----CTTAATAATA-CGTa
gi|27                         :                                               ccggtctccatata----CT---TT--A--C-ATCAGTTA---GAA-AT-----TACCATGT-AATTGTCTTTAAAC--CT-CC--GCTCGACT-AGGACAAAAC---A---------------TGC----T------ATT-T--CTATTT--T-AAC--C---T-GAAAATttttttttgttgataattta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      cGA-T----CA---------GC---CA--ATCTAA------CTAA-GGTTCA-C---A----A-AAATG-TGATTATC-TA------ATCC--TG----TCAT-A-ACAGT-AAAAGC-A-----A-----A-----Tatatcaact
gi|29                         :                                                                                                                               T-CT--GCTCCAAA-CGTATGGAGC---A-------TG--------C----T------ATT-T--TTGTTT--T-TAGT-C---G-GAAAAT--AAAC--T-TA-CGTCAG-CT-TCACACT---TT--ACT-CTAGA-T----TA---------GC---Ctgcgtatttattcatttcctaatttt
gi|3                          :                                                 TAC--------T----CT---TTGATA-C-ATCGGTCA---TAACAC-----T-CTGTGT-AATAATCT---GAC--CT-CTCTGTTCTAGT-AATACAAAAC---A-------AA------CTC----T------ATC----CTAATT--T---G--T---T-GAAATGTAAGAT--T-CC-CACCAGTTC-ATACGTC---CT--ACT-GTCGA-G----TATTCAATTCTGTATTCA--ATCAAG------TTACAGGC--G-A---A----A-GAA-G-TGACAACC-TG------TATC--TG----TCAT-A-TCGAT-AAA--T-A-----A-----A-----AGTAAta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gGCTTA-C---A----A-AAT-G-GGATCATC-TG------ATAC--TG----CCAT-A-ACAGT-AAA--C-A-----A-----A-----C---ATGAA---GTAATGATACT-TTTCTGTTTCTctgaagta
gi|31                         :                                                                                                                                                   GAAAG---A-------TG------T------T------ATT-T--CTTATT--T-T--------G-AAAAATAGAAAA--T-AA-TACCAGTCT-GCACACC---TT--ATT-TTCGA-T----TA---------AC---CA--ATCAAattcgtaacat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           C---CA--ACCATA------ATAT-GGCTTA-T---ACAAAA-AAC-G-TAATCATC-TG------AGCT--TG----TTGT-A-ACGAT-AAA--C-ATAGATA-----A-----TGTAATAcaagtga
gi|33                         :                                                                                   GTCA---TAA-AT------A-TGGGT-AACATTCT---GAC--CT-CT-------------------AC---A-------TG------TGCTACAT------ATA-T--TTGTTT--T-Tcattt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a---CA--ATCAAA------ATAC-GTCTTA-C---A----A-AAA-A-AGA--GTC-TG------A------------CAT-A-ACCGT-AAA----G-----A-----A-----TG--AT--CA-CGTGATAATA-T-ATTCtacatcggactgcacaccttggt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                   CACACC---CT--GCT-ATCTA-T----TA---------GT---CA--ATCAAA------CTAC-AGCTTA-C---A----G-AAA-A-TGACCATC-TG------A
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                    TT--T-TAG--C---G-AGAAAGTAAAAA--T-GA-AGTCGGTCC-ACAC
gi|4                          :                                           gaC-ATTCT--------C----CT---TT--G--C-ATCAAACA---TAA--T-----TACTACGT-AATATTTT---GAC--CT-CT--GCTCAAAT-TGTTCAAAAC---A-------TG------TAT----T------ATT-T--CTA--T--T-TAGGAA---G-GAAAATTGAGAA--A-TG-CGTAAGCTT-GCATATC---AT--GGT-ATGGA-TCTAATA---------GC---TG--ATAAAA------TTAT-GGCTTA-CA--A----A-AAT-G-TAAT-------------AGTC--TT----CCAT-A-ACAAT-AAA--C-A-----a
gi|5                          :                    atgcattgtaggtcTTGTCAT------ATTAT--------TTTCTCT---TT--TA-T-ATTGGTCA---AAA-ATATTCATA-TATATCAATATTCT---GAC--CT-CA--GCTAGTCT-AATTTGAAAC---A-------AG--------C----T------ACT-G--CTGTTTC-T-TAG--A---G-AGAGA--AACAA--T-TAACCTCTGTCT-GAACACC---TT--GCT-ATCAA-T----TA---------GC---CA--ATCAAA------ATAT-TGCTTA-TA--A----A-AAT-G-GGATCATC-TC------ACCC--GG----CTAT-G-ACAGTAAAA--T-A-----A-----A-----Ttgaagtagtgc
gi|6                          :                                                                                 CAGTCA---TAT-TTA----TAC-ATGT-ACTTTTCA---GAC--CT-GT--GC--------------AAC---A-------TT------T------C------ACT-T--CTGTGT--T-TAG--T---GTGAAAAT--AAAA--T-CA--ACCAGTCC-ACACACA---TG--GCT-ATTGA-T----TA---------AC---CA--ATCAAA------ATAC-ATCTTA-CT--A----A-AAA-C-TGATCATC-TT------GACC--TA----TCAT-G-ACAGT-AAA--C-AAAT--A-----A-----TGTAATAATA-CGTGA--ATG-T--TTCTGTTTCTct
gi|7                          :                              attatcggtaa---GC-ACTAC--------T----CTCTCTT--TGGC-ATCAGTCA---TAA-AA------ACTATGT-GATATTGT---AAT--GT-CT--GCACCACT-GATACAAAAT---AATTTTTATG------TAC----TTAA---ATA-C--CTATTT--TATAG--C----------TTGTATG--T-CA-TGTTA------TAGGCC---A---GAT-AT-AA-G----TA---------GC---CA--ATCAAA------ATAT-GGCTTA-C---A----A-AAT-G-TAAACATC-TT------AGCCATTG----TCAT-A-ACAAT-AAA--aatt
gi|8                          :                                                                                   acacatagtg-AT-----TGCTCTGT-AATATTGT---AAT--CT-CT--GCGCGAAC-GGTTTTAAAC---A-------TG------GAC----C----------------TCT--T-TAA--A---G-GGAAAATGAAAA--T-TT-TGTCTGTCC-GCACACC---TT--GCT-ATCGA-T----TA---------TC---CA--ATCAGA------ATAA-CTCTTC-C---A----ATGAA-A-TGATCATC-CG------ATCC--TG----TCAT-A-CCAGT-AAA--C-A-----A--------------AATATAA-CGTTATTATA-T-Agt
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