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gi|3                          :                                                                              TT----TTAATTTCGTAAGTTTTGATAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGTCTGTaa
gi|4                          : cataatgttatcagtgttcttttttaaaaaaaaaaataCAAAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATAAACATTGCCTGTATA
gi|5                          :                                       CATAGAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAGTTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGGGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATAAACATTGCCTGTATA
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Reference ( family-4120 )     :                                      CCATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAATTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGCCTGTATA
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gi|2                          :           aatatagcccattacggtcccactaccCCATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAGTTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACTTCTTCTCTATATACATTGCCTGTATAc
gi|20                         :                                             AGTATTGGAGTGTACTGTTTTAATTTG----GTTT----TT------GTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGCCTGTATA
gi|21                         :                                        tTAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAATTTGTTTTTTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTT
gi|22                         :                                      tCATAAAAGTATCCCAGAGTACTGTTTCAATGTGT---TTTT----TTAATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCT
gi|23                         :                                        ATAAAAGTATCCTAGTGTACTGTTTCAATGTG----TTTT----TTAATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAACTTC
gi|24                         :                                       CATAAAAGTACCCCAGTGTACTGTTTCATTGTG----ATTT----TTAATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAAC
gi|25                         :                                       CATAAAAGTATCCCAGTGTTCTGTTTC--T-------TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTT
gi|26                         :                                                                                         TCTGTAAGTGTTGGTAGCAA-CTCTT-----TATACATTGCCTGTATA
gi|27                         :                                     tgCATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAATGTG----TTTT----TTAAca
gi|28                         :                                      CCATAAAAGTATCAGAGAGCACTGTTTTAATTTG----TTTT----g
gi|3                          :                                                                              TT----TTAATTTCGTAAGTTTTGATAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGTCTGTaa
gi|4                          : cataatgttatcagtgttcttttttaaaaaaaaaaataCAAAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATAAACATTGCCTGTATA
gi|5                          :                                       CATAGAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAGTTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGGGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATAAACATTGCCTGTATA
gi|6                          :                                      CCATAAAATTATCCCAGTGTACTGTTTCAATGTG----TTTT----T-AATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTAAAAATACATTGCCTGTATA
gi|7                          :                                       CATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCCATGTA----TTTT----TTAATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTTTATATATGCATTGCCTGTATA
gi|8                          :                                           AAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAGTTTG----TTTTGT--TTTATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATATACATTTCCTGTATA
gi|9                          :                                     ttCATAAAAGTATCACAGTGTACTGTTTCAAAGTG----TTTT----TTAATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTATATTTACATTGCCTGAATA


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blockSeqCons                  :                                                                                ****
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finalCons                     :                                      CCATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAATTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGCCTGTATA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TTTCAATTTATTATTTTGGCAGGTTAAAAAAGATATC






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consensus                     :                                      CCATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAATTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGCCTGTATA
Reference ( family-4120 )     :                                      CCATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAATTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGCCTGTATA
gi|1                          :                                        ATAAAAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTG----TTTTGTTTTTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCCCTTCTCTACATACATTGCCTGTA
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gi|16                         :                                         TAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTG----TTTT----TTTATTTTGGAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTACATATATTGCCTGTATA
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gi|18                         :                                       CATAATAGTATCAAAGTGTACTGTTTTAATTT------TTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCCCTTCTCTACATACATTGCCT
gi|19                         :                                                                                ----TTAATTTGGTAAATGTTGGTAGCAACCTCTTCTATATATACATTGCCTGTATAtt
gi|2                          :           aatatagcccattacggtcccactaccCCATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAGTTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACTTCTTCTCTATATACATTGCCTGTATAc
gi|20                         :                                             AGTATTGGAGTGTACTGTTTTAATTTG----GTTT----TT------GTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGCCTGTATA
gi|21                         :                                        tTAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAATTTGTTTTTTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTT
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gi|25                         :                                       CATAAAAGTATCCCAGTGTTCTGTTTC--T-------TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTT
gi|26                         :                                                                                         TCTGTAAGTGTTGGTAGCAA-CTCTT-----TATACATTGCCTGTATA
gi|27                         :                                     tgCATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAATGTG----TTTT----TTAAca
gi|28                         :                                      CCATAAAAGTATCAGAGAGCACTGTTTTAATTTG----TTTT----g
gi|3                          :                                                                              TT----TTAATTTCGTAAGTTTTGATAGCAACCTCTTCTCTATATACATTGTCTGTaa
gi|4                          : cataatgttatcagtgttcttttttaaaaaaaaaaataCAAAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATAAACATTGCCTGTATA
gi|5                          :                                       CATAGAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCAGTTTG----TTTT----TTAATTTTGTAAGGGTTGGTAGCAACCTCTTCTCTATAAACATTGCCTGTATA
gi|6                          :                                      CCATAAAATTATCCCAGTGTACTGTTTCAATGTG----TTTT----T-AATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTAAAAATACATTGCCTGTATA
gi|7                          :                                       CATAAAAGTATCCCAGTGTACTGTTTCCATGTA----TTTT----TTAATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTTTATATATGCATTGCCTGTATA
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gi|9                          :                                     ttCATAAAAGTATCACAGTGTACTGTTTCAAAGTG----TTTT----TTAATTTGGTAAGTGTTGGTAGCAACCTCTTCTATATTTACATTGCCTGAATA
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Unaligned ( gi|29 ): TTTCAATTTATTATTTTGGCAGGTTAAAAAAGATATC