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Reference ( gi|2 )            : GGACATGTAAGATACAAAATCGCTCAAA-TAATGC-------AT-------AGGAAAGGTTTGTATCTGTATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAGTATGACATTACAATGTATGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTATTATAATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACATTTACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGAT---GA-GAGACAACCAGATTGGTTCCCATACTTTCTGCCAATCTGTTGTTTTTTTTGG----CTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGACAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTATCGGTATAAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGATTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTT
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gi|4                          :       GTTAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATAC-------AC-------AGGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATC--TATGACATTA-------TGTACCAGTATCAATCAATGCTTGAACAAATTAAAGACTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTGCTGGTATATTATTATGATGTACACAATACTTTA-CCTTTGTTCATTTACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAACATGTA---GA-GAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCGAAT-TGAT-TTTTTTTGGG----CTTGGAATGGTGATTGGAAAAAACCTGATAAGCTGTTCGTATGGTGCTTTATTGTTGAGCTGTCGATATAAAGATTGGTCACTTTTATATGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTc
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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consensus                     :      GGACACGTAAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTACTATGATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACGTTTACATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCCAATCTG----TTTTTT----GGGCTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTGTCGATATAAAGGTTGGTCACCTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGANGAAGTACTTGTT
Reference ( family-408 )      :      GGACACGTAAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTACTATGATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACGTTTACATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCCAATCTG----TTTTTT----GGGCTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTGTCGATATAAAGGTTGGTCACCTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGANGAAGTACTTGTT
gi|1                          :         CACGTAGGATACAAAATTTCTATAA-TAATGC-------ACA--TGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTAGCAGTGGATGGGGTAAATCAATATGACAATG-------TGCACAAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATAAAATTTTAGAAATATCCAAAAGATACTGGTATACTACTATGATGTACATAATACACTAGCCTTGATACGTTTACATTTTTCGAAAAAACATTTGTCAGCATGT--AGAATGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTT-CTAATCTG-----TTTTT----GGACTTTGAGTGGTGGCAGGAAAATACCTGATAAGCTGTTTGTCTGGTGCGTGATAGCTGAGCTGTCGATCTAAAGGTTGATCACCTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                     CATTTGTTGGCATGT--AAAGAGACGACTAGATTGGTTCTCATACTTTTTCA-AATCTG----TTTTTTTGGGGGGCTTTGAATGATGATAGGAAAAGACTTGATAAGCTGTTCGTTTAGTGCGTTTCAGCTGGACTGACGATTGAAAGGTTGGTCACCTTTATGTGTGAACATTTCCTCTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTTgggacaaatacaaatcatttgtggaccatgtggttcagtggtagagcaccgaacccatggtcggttttttcctccaccacggccatgtaaccttgcgcaggatttgcttatgtttagtactggttcaacccaggaagacttcgaacgtaatttttattagttgtaagaacttgtttcgcaatcgaagtaaaataaataagtgtaaactaaagtagtgaatatagtttcaaatgccttattgttcccggtttcccctgctctatagttttcctttcccactaaata
gi|11                         :        ACACATACGAAACAAAATTGCATAAA-TAATACTTGGAAAAGA--GCAAAGGTTTGTACCTATATGCAAAATAAAGTGGGTGGGGTAAAGGGATATGACATTA-------TATTACAGAATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGgggacaaata
gi|12                         :                GATACAAAATTGCTAAA--TAATGCTTTAA--ACAAAGCAAAGGTTTGTATCTATATGCAAATTAAAGTGGGTGAGGTAAATCAATATGACATTA-------AGTACCAATTTCAGTCAATG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gacAAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTCAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTACTTGTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcgAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTAAATTTGATGAAGTACTTGTTgaga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cggAGGTTGGTCACTTTTATGTGTGAACAATTTCTTTAAGGACTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTggga
gi|2                          :      GGACATGTAAGATACAAAATCGCTCAAA-TAATGC-------ATA--GGAAAGGTTTGTATCTGTATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAGTATGACATTACAATGTATGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTATTATAATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACATTTACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGA--TGAGAGACAACCAGATTGGTTCCCATACTTTCTGCCAATCTGTTGTTTTTTT----TGGCTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGACAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTATCGGTATAAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGATTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTg
gi|3                          :      GGACATGTAAGATA-AAAATTGCTAAAAATAATGC-------ATA--GGAAAGGTTTGAATCTATATGCAACATGAAGTGGGTGGGGAAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATAAAATTTTAGAAATACCCAACAGCTACTGGTATATTAATATGATGTACACAATACTTTAGCCTTTAAATA-TAACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGTAGAGAGAGATGACCAGATTGGTTACCATACTTTTTCCCAATCTGT---TTTTTT----GGGCTTGAAATTGTGATAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTTTGTTTGGTGCGTTATAGCCAAGCTGTCGATATAAAGGTTGGTGACCTTTTTGTGTGAACAATTCCTTTATGGACTCATTTACATTTGATGAAGTAC
gi|4                          :            GTTAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATAC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATC--TATGACATTA-------TGTACCAGTATCAATCAATGCTTGAACAAATTAAAGACTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTGCTGGTATATTATTATGATGTACACAATACTTTA-CCTTTGTTCATTTACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAACATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCGAAT-TGATT-TTTTTT----GGGCTTGGAATGGTGATTGGAAAAAACCTGATAAGCTGTTCGTATGGTGCTTTATTGTTGAGCTGTCGATATAAAGATTGGTCACTTTTATATGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTgaatacaa
gi|5                          :      GGACATGTAATATACAAAATTGCTAAAA-TAATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTACATGTAACTTAAAGTGGATGGGATAAATTAACATGGCATTA-------TGTATTAGCATCGGTCAATGCTAAAACAAATTAAAGATTAAATTTTTAAATTATCCAACAGCTACTGGTATATTACTATGATATACACAAT------------GTACGTTTACATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGT--AATGAGACGACCATATTGGCTCCCATACTTTT-CCAAAGCTA----TTTTG-----GGGCTTGTAA-AATGAGAGAAAAAGACCTGATAAGCTGTTCGTTTAGTGCGTTATAGCTGAGCTGTCGATATAAAAGCTGATCACCTTCATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTTgggacgaataca
gi|6                          :      GGACATGTAGGGTA-AAATTTGCTAAAA-AAATGC-------AAA--ACAAAGATTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGATTGGGTAAATCAATATGACAGTA-------TGTACCAGCATCGGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATGAAATTTTAGAAATATTCAACAGCTACTGGTATATAACTATGATGTGCACAATACTTTAGCCTTGGTGCGTTTATATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGC--AGAGAGACGACCAGACTGGTTCCCATACGTTTT-CCAATCTG-----TTTTA----GGGCTTTAAATGATGAAAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTgggacaaataca
gi|7                          :                     AGAATTGCTAAAA-ACATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATAA-------TACACCAACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAACTTAAGAAATATCCAACAGTTACTGGTATATTATTATGATCAACAC-ATTCTTTAATCTGTGTACGCTTATATCTTTTAAAATAAAACTTGTCAGCATAT--AGAGAGACGACCAGATCGGTTCCAATA-TTTTTCCCAATCTC----TTTTTT----AGGCTTGGAATAGTGTTAGGAAACTACTTGATAAGCTGTTCatagtt
gi|9                          : atgtaGGACATGTAAGATACAAAATTGTTAAAA-CGATGC-------ATA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGACAATGCTAGAACAATTAAAAGATTAAATTTAAAAAAAAT-AAACAGCTACTGGTATATTATTATGATGTACACAATAGTTTAGCCTTTGTACATTGACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCCAAc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): ATAAAACAGAGTCATGTTATAGTAGAGACAAAATATATTATCATTTGAGTGACATGTCTTTTAAATCTGTTTAGGTAGCGCATCAGCCCTATGATTGGAGGGTTCTTGGTTTGATCCTCCATTATGACTGTGTAGTGTCCTTGAGCAAGACACTTTATCTGCATATGTTGCAGTATTGGTTCTACACAGGAAAACTTTGAGCATGATTTGTCTAAGTTGTGTCGTCTTGTTTTTACAATCTATGTAAAATGAATAAATTTGTTATCGCTTTAGTGACACATGTTTTAAATCTGCTTTGT
Unaligned ( gi|16 ): TTATGTTGCAAATATGAAACTTTGGAGCATGTGGTTCAGTGGAAGAGCGTCGGACCCATGGTTT






Alignments
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Reference ( family-408 )      :      GGACACGTAAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTACTATGATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACGTTTACATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCCAATCTG----TTTTTT----GGGCTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTGTCGATATAAAGGTTGGTCACCTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGANGAAGTACTTGTT
gi|1                          :         CACGTAGGATACAAAATTTCTATAA-TAATGC-------ACA--TGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTAGCAGTGGATGGGGTAAATCAATATGACAATG-------TGCACAAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATAAAATTTTAGAAATATCCAAAAGATACTGGTATACTACTATGATGTACATAATACACTAGCCTTGATACGTTTACATTTTTCGAAAAAACATTTGTCAGCATGT--AGAATGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTT-CTAATCTG-----TTTTT----GGACTTTGAGTGGTGGCAGGAAAATACCTGATAAGCTGTTTGTCTGGTGCGTGATAGCTGAGCTGTCGATCTAAAGGTTGATCACCTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                     CATTTGTTGGCATGT--AAAGAGACGACTAGATTGGTTCTCATACTTTTTCA-AATCTG----TTTTTTTGGGGGGCTTTGAATGATGATAGGAAAAGACTTGATAAGCTGTTCGTTTAGTGCGTTTCAGCTGGACTGACGATTGAAAGGTTGGTCACCTTTATGTGTGAACATTTCCTCTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTTgggacaaatacaaatcatttgtggaccatgtggttcagtggtagagcaccgaacccatggtcggttttttcctccaccacggccatgtaaccttgcgcaggatttgcttatgtttagtactggttcaacccaggaagacttcgaacgtaatttttattagttgtaagaacttgtttcgcaatcgaagtaaaataaataagtgtaaactaaagtagtgaatatagtttcaaatgccttattgttcccggtttcccctgctctatagttttcctttcccactaaata
gi|11                         :        ACACATACGAAACAAAATTGCATAAA-TAATACTTGGAAAAGA--GCAAAGGTTTGTACCTATATGCAAAATAAAGTGGGTGGGGTAAAGGGATATGACATTA-------TATTACAGAATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGgggacaaata
gi|12                         :                GATACAAAATTGCTAAA--TAATGCTTTAA--ACAAAGCAAAGGTTTGTATCTATATGCAAATTAAAGTGGGTGAGGTAAATCAATATGACATTA-------AGTACCAATTTCAGTCAATG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gacAAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTCAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTACTTGTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcgAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTAAATTTGATGAAGTACTTGTTgaga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cggAGGTTGGTCACTTTTATGTGTGAACAATTTCTTTAAGGACTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTggga
gi|2                          :      GGACATGTAAGATACAAAATCGCTCAAA-TAATGC-------ATA--GGAAAGGTTTGTATCTGTATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAGTATGACATTACAATGTATGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTATTATAATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACATTTACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGA--TGAGAGACAACCAGATTGGTTCCCATACTTTCTGCCAATCTGTTGTTTTTTT----TGGCTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGACAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTATCGGTATAAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGATTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTg
gi|3                          :      GGACATGTAAGATA-AAAATTGCTAAAAATAATGC-------ATA--GGAAAGGTTTGAATCTATATGCAACATGAAGTGGGTGGGGAAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATAAAATTTTAGAAATACCCAACAGCTACTGGTATATTAATATGATGTACACAATACTTTAGCCTTTAAATA-TAACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGTAGAGAGAGATGACCAGATTGGTTACCATACTTTTTCCCAATCTGT---TTTTTT----GGGCTTGAAATTGTGATAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTTTGTTTGGTGCGTTATAGCCAAGCTGTCGATATAAAGGTTGGTGACCTTTTTGTGTGAACAATTCCTTTATGGACTCATTTACATTTGATGAAGTAC
gi|4                          :            GTTAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATAC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATC--TATGACATTA-------TGTACCAGTATCAATCAATGCTTGAACAAATTAAAGACTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTGCTGGTATATTATTATGATGTACACAATACTTTA-CCTTTGTTCATTTACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAACATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCGAAT-TGATT-TTTTTT----GGGCTTGGAATGGTGATTGGAAAAAACCTGATAAGCTGTTCGTATGGTGCTTTATTGTTGAGCTGTCGATATAAAGATTGGTCACTTTTATATGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTgaatacaa
gi|5                          :      GGACATGTAATATACAAAATTGCTAAAA-TAATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTACATGTAACTTAAAGTGGATGGGATAAATTAACATGGCATTA-------TGTATTAGCATCGGTCAATGCTAAAACAAATTAAAGATTAAATTTTTAAATTATCCAACAGCTACTGGTATATTACTATGATATACACAAT------------GTACGTTTACATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGT--AATGAGACGACCATATTGGCTCCCATACTTTT-CCAAAGCTA----TTTTG-----GGGCTTGTAA-AATGAGAGAAAAAGACCTGATAAGCTGTTCGTTTAGTGCGTTATAGCTGAGCTGTCGATATAAAAGCTGATCACCTTCATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTTgggacgaataca
gi|6                          :      GGACATGTAGGGTA-AAATTTGCTAAAA-AAATGC-------AAA--ACAAAGATTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGATTGGGTAAATCAATATGACAGTA-------TGTACCAGCATCGGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATGAAATTTTAGAAATATTCAACAGCTACTGGTATATAACTATGATGTGCACAATACTTTAGCCTTGGTGCGTTTATATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGC--AGAGAGACGACCAGACTGGTTCCCATACGTTTT-CCAATCTG-----TTTTA----GGGCTTTAAATGATGAAAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTgggacaaataca
gi|7                          :                     AGAATTGCTAAAA-ACATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATAA-------TACACCAACATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAACTTAAGAAATATCCAACAGTTACTGGTATATTATTATGATCAACAC-ATTCTTTAATCTGTGTACGCTTATATCTTTTAAAATAAAACTTGTCAGCATAT--AGAGAGACGACCAGATCGGTTCCAATA-TTTTTCCCAATCTC----TTTTTT----AGGCTTGGAATAGTGTTAGGAAACTACTTGATAAGCTGTTCatagtt
gi|9                          : atgtaGGACATGTAAGATACAAAATTGTTAAAA-CGATGC-------ATA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGACAATGCTAGAACAATTAAAAGATTAAATTTAAAAAAAAT-AAACAGCTACTGGTATATTATTATGATGTACACAATAGTTTAGCCTTTGTACATTGACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCCAAc


blockSeqs                     :           C        C             A      TTGGAAA   AA                                                          CAATGTA                                                                           T                     G                              A             AG                                 C C      TTGTT    TTGGG                                                                                                                                A
blockSeqs                     :           T        C             .      TTTAA     .                                                           .                                                                                 A                     G                              C             .                                  G C      ATTT     T                                                                                                                                    A
blockSeqs                     :           T        C             .      .         .                                                           .                                                                                 T                     G                              C             .                                  C G      TT       T                                                                                                                                    T
blockSeqs                     :           T        C             .      .         .                                                           .                                                                                 C                     A                              C             .                                  C A      T        T                                                                                                                                    T
blockSeqs                     :           T        C             .      .         .                                                           .                                                                                 C                     G                              A             .                                  C C      T        A                                                                                                                                    T
blockSeqs                     :           T        C             .      .         .                                                           .                                                                                 T                     .                              A             .                                  C C      T        T                                                                                                                                    T
blockSeqs                     :                    .             .      .         .                                                           .                                                                                 T                     .                              A             .                                  C C      .        .                                                                                                                                    T
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blockSeqs                     :                                  .      .         .                                                           .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               


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consensus                     :      GGACACGTAAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTACTATGATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACGTTTACATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCCAATCTG----TTTTTT----GGGCTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTGTCGATATAAAGGTTGGTCACCTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGANGAAGTACTTGTT
Reference ( family-408 )      :      GGACACGTAAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTACTATGATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACGTTTACATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCCAATCTG----TTTTTT----GGGCTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTGTCGATATAAAGGTTGGTCACCTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGANGAAGTACTTGTT
gi|1                          :         CACGTAGGATACAAAATTTCTATAA-TAATGC-------ACA--TGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTAGCAGTGGATGGGGTAAATCAATATGACAATG-------TGCACAAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATAAAATTTTAGAAATATCCAAAAGATACTGGTATACTACTATGATGTACATAATACACTAGCCTTGATACGTTTACATTTTTCGAAAAAACATTTGTCAGCATGT--AGAATGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTT-CTAATCTG-----TTTTT----GGACTTTGAGTGGTGGCAGGAAAATACCTGATAAGCTGTTTGTCTGGTGCGTGATAGCTGAGCTGTCGATCTAAAGGTTGATCACCTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                     CATTTGTTGGCATGT--AAAGAGACGACTAGATTGGTTCTCATACTTTTTCA-AATCTG----TTTTTTTGGGGGGCTTTGAATGATGATAGGAAAAGACTTGATAAGCTGTTCGTTTAGTGCGTTTCAGCTGGACTGACGATTGAAAGGTTGGTCACCTTTATGTGTGAACATTTCCTCTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTTgggacaaatacaaatcatttgtggaccatgtggttcagtggtagagcaccgaacccatggtcggttttttcctccaccacggccatgtaaccttgcgcaggatttgcttatgtttagtactggttcaacccaggaagacttcgaacgtaatttttattagttgtaagaacttgtttcgcaatcgaagtaaaataaataagtgtaaactaaagtagtgaatatagtttcaaatgccttattgttcccggtttcccctgctctatagttttcctttcccactaaata
gi|11                         :        ACACATACGAAACAAAATTGCATAAA-TAATACTTGGAAAAGA--GCAAAGGTTTGTACCTATATGCAAAATAAAGTGGGTGGGGTAAAGGGATATGACATTA-------TATTACAGAATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGgggacaaata
gi|12                         :                GATACAAAATTGCTAAA--TAATGCTTTAA--ACAAAGCAAAGGTTTGTATCTATATGCAAATTAAAGTGGGTGAGGTAAATCAATATGACATTA-------AGTACCAATTTCAGTCAATG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gacAAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTCAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTACTTGTT
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gi|2                          :      GGACATGTAAGATACAAAATCGCTCAAA-TAATGC-------ATA--GGAAAGGTTTGTATCTGTATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATCAGTATGACATTACAATGTATGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTACTGGTATATTATTATAATGTACACAATACTTTAGCCTTTGTACATTTACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGA--TGAGAGACAACCAGATTGGTTCCCATACTTTCTGCCAATCTGTTGTTTTTTT----TGGCTTGGAATGGTGATAGGAAAAGACCTGACAAGCTGTTCGTTTGGTGCGTTATAGCTGAGCTATCGGTATAAAGGTTGGTCACTTTTATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGATTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTg
gi|3                          :      GGACATGTAAGATA-AAAATTGCTAAAAATAATGC-------ATA--GGAAAGGTTTGAATCTATATGCAACATGAAGTGGGTGGGGAAAATCAATATGACATTA-------TGTACCAGCATCAGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATAAAATTTTAGAAATACCCAACAGCTACTGGTATATTAATATGATGTACACAATACTTTAGCCTTTAAATA-TAACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAGCATGTAGAGAGAGATGACCAGATTGGTTACCATACTTTTTCCCAATCTGT---TTTTTT----GGGCTTGAAATTGTGATAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTTTGTTTGGTGCGTTATAGCCAAGCTGTCGATATAAAGGTTGGTGACCTTTTTGTGTGAACAATTCCTTTATGGACTCATTTACATTTGATGAAGTAC
gi|4                          :            GTTAGATACAAAATTGCTAAAA-TAATAC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGGTGGGGTAAATC--TATGACATTA-------TGTACCAGTATCAATCAATGCTTGAACAAATTAAAGACTAAATTTTAGAAATATCCAACAGCTGCTGGTATATTATTATGATGTACACAATACTTTA-CCTTTGTTCATTTACATCTTTTGAAATACCCTTTGTCAACATGT--AGAGAGACGACCAGATTGGTTCCCATACTTTTTCCGAAT-TGATT-TTTTTT----GGGCTTGGAATGGTGATTGGAAAAAACCTGATAAGCTGTTCGTATGGTGCTTTATTGTTGAGCTGTCGATATAAAGATTGGTCACTTTTATATGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGATGAAGTACTTGTTgaatacaa
gi|5                          :      GGACATGTAATATACAAAATTGCTAAAA-TAATGC-------ACA--GGAAAGGTTTGTATCTACATGTAACTTAAAGTGGATGGGATAAATTAACATGGCATTA-------TGTATTAGCATCGGTCAATGCTAAAACAAATTAAAGATTAAATTTTTAAATTATCCAACAGCTACTGGTATATTACTATGATATACACAAT------------GTACGTTTACATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGT--AATGAGACGACCATATTGGCTCCCATACTTTT-CCAAAGCTA----TTTTG-----GGGCTTGTAA-AATGAGAGAAAAAGACCTGATAAGCTGTTCGTTTAGTGCGTTATAGCTGAGCTGTCGATATAAAAGCTGATCACCTTCATGTGTGAACAATTCCTTTAAGGACTCATTTACATTTGAAGAAGTCATTGTTgggacgaataca
gi|6                          :      GGACATGTAGGGTA-AAATTTGCTAAAA-AAATGC-------AAA--ACAAAGATTTGTATCTATATGCAACTTAAAGTGGATTGGGTAAATCAATATGACAGTA-------TGTACCAGCATCGGTCAATGCTAGAACAAATTAAAGATGAAATTTTAGAAATATTCAACAGCTACTGGTATATAACTATGATGTGCACAATACTTTAGCCTTGGTGCGTTTATATCTTTTGAAATACCATTTGTCAGCATGC--AGAGAGACGACCAGACTGGTTCCCATACGTTTT-CCAATCTG-----TTTTA----GGGCTTTAAATGATGAAAGGAAAAGACCTGATAAGCTGTgggacaaataca
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): TTATGTTGCAAATATGAAACTTTGGAGCATGTGGTTCAGTGGAAGAGCGTCGGACCCATGGTTT