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gi|7                          :                                                                                                                                                                        tatattctctttatttcctcccttaagaagattatgaacatggattgttaacacaacaaaattaaatgtacacattatacagtattcaatgtgatcaagtatatatgtttacagggaatataaacaaaacatgttatacatatatacatatttcatgacatactatgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggagggggatattgagttctacattaattcaattttacacgaatgacatttttcacacataagTATATTCA-TATGTA----TC------ACAAAGTAACT----------GTGCATGCAATCAGATTTGCTTTCCA-TTTTT---GCTATTTCTTTATGTGC-TG--TT------TTTTTTTAAAAGTT-TTTATCTTAAAAGTT------------A----ATGCAATTTGCAACCAATCCCATTGCTATTCTGAGAAAGTGTTTGTGAACCATTTTACTTTATAATGATAGTAATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTTTATCATATTTGTACCATTATTAGTTTAATTTATGACAAAATAGCCAAATTGTGATTC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                  tattctctttatttcctcccttaaggagattatgaacatggaatgttaccaaaataatatgaaatgtacaagttatacagcatttatgtgaacaagtttatatgttgacagggaacataaacaaataaaatatacatattacataaaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagagagggggagacagagtgagagagaggagaatatagagaaaaatgtagagagaaaatcattcacttaTATATTCA-TATGTA----TA------GCAAAGTAACT----------GTGCATACAAACATATAAGCTTTCCA-TTTTT---ACTATTTCTTCATGTGC-TGGATT------gta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                            tctcttttcctcgcttaaggagattatgaatatggaatgttaacaaaacaatatgaaatttcaaatactacagcattcaatgtgaacaagtatataattatatttgtttacaggaaacataatcacaacattatatacatgtatacatattacatgaaatataatgataaatatcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatagaatattgagttatacattaaatcaatactaaacttatctttttttttcacactTATAT--G-TGCATATGTATA------GCATAGTAACT----------GTGCATGCAAACAGATTTGCTCTCCA--TTTT---------------TGTGC-TGGATT------ATATTA-AAA--TTCTTTATCTTAAAAGTTat
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgaatgatatttcccccacacTTAAATAACATATAATAAAAAGCATTACTAATCATTATTCCGCACAAATGGCATATATATATATATTAGTGTATAATAT-AGG--TTTGGCATATCCACAAATTACTC-ACTGTATGAACACAAGCTAA-GTTTCTGGTCCCGTGATGCATTCGCAGATTATTGCATATTCAGTGTTAATGTGTAACAATTTAGATTTGCTAAAA-TTATCA------------------------ATGATTCTGTTTCAAATCTATGTT--TGT-TAACATTCTACAT-----TTGACATTTTAC--ATTATTTTAGAACTACCG-TAACA-GTAAACAACTGATAAGATAATGCAATATGCC--TATTgt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CCTAAATTATAGCACGCTCAATGTTTTGGCGCAAGTGACGAAATCT-CTGAAAAGAAACATCGTTTT--AAACTCGGAGCCTCCAGGATTGAGTTTCTGCTGTAT-TAATCACATA--TTTACATCTAGGCATTTCCAG--GATGATCTGGTTGGAATAGTTCCATGATTAGCATAT-TGTAA-AAGGTGATGTGATA-GTCTATATTTTTCTAGAACTCC-TGCTATATCAGGAATGAAACCTTTCTG-CT--TATTCTAAC-TGCATATATATA----TATGTAGAAAGACGAGCATTAAATATATGTTCAGCAAGTA-TGTAATTTG--GCATTTTGCATAATCGCCCTAGA-AA---TGACAGTTTT-CTTATATCTATTTCAGAATGCATAGATTTCTATCCTAACATGTTCATACACATGTCTTTGTGTGTTC-TGAT--AAAGTCCAAATATGGACGTTTTT-GCTatcctttcatacatgcatatatagttagacgaatattaaagagttgccttacaagcaacgtatcggacatattgcgtgtacttgtcgatttcaaactgcctatattcccaaacaaatacatgtacgggttcaaatttcaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGCCTATTATCCTTTCATACATGCATATA----TA----GTTAGACGAATATTAAAGAGTTGCCTTACAAGCAACGTA-TCGG--ACATATTGCGTGTACT----------------------------TGTCGATTTCAAACT-------------GCCTA-TATTCCCAAACAAATACATGTACGGGTTCAAATTTCAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttaaataacatataataaaaagcattactaatcattattccgcacaaatggcatatatatatatattagtgtataatataggtttggcatatccacaaattactcactgtatgaacacaagctaagtttctggtcccgtgatgcattcgcagattattgcatattcagtgttaatgtgtaacaatttagatttgctaaaattatcaatgattctgtttcaaatctatgtttgttaacattctacatttgacattttacattattttagaactaccgtaacagtaaacaactgataagataatgcaataA-TTGGTTGCAAATTGCATTAACTTTTAAGATAAA---AAC--TTTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tattctctttatttcctcccttaaggagattatgaacatggaatgttaccaaaataatatgaaatgtacaagttatacagcatttatgtgaacaagtttatatgttgacagggaacataaacaaataaaatatacatattacataaaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagagagggggagacagagtgagagagaggagaatatagagaaaaatgtagagagaaaatcattcacttatatattcatatgtatcacaaagtaactgtgcatgcaatcagatttgctttccatttttgctatttctttatgtgctgtttttttttTTTCGCTGCCAATCGGATGATTATTTCTTATCGATTGTAGTCTCGACGATTTG--TGAGCT-TCCCAAAATTTGGCTTCGATTTGGAATCTAGG--TACACATATCTG-TCCTAGCAATGCGG-------TGGATTTTGGT--------TCA--TTAATAATTGACAAAAGTCCAAATAAAAAC-ATAGGTGCTTTACAACGCGCATTATCACTATTGTCACTATCTGTCAAT-TTACTATTAAGAAAGT--ATG--TCCAGATGCTTcccattgctattctgagaaagtgtttgtgaaccattttactttataatgatagtaatcttcgaccaattaacttttgcagttttatcatatttgtaccattattagtttaatttatgacaaaatagccaaattgtgattcgta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATATGGACGTT-TTTGCTTTACGGCATGCGCTGTCAATGTTGTCTTTATCTGTCAATGTTACTATTAAG-----AAATACCCCCACGTGTTTTATGCAATTACTTT--GCT----TTATAGTATCCGAACCTAGACGA--AACTTA-GAATCTTGCTGACAT-CTCGATCTATTACCAAAAGTTATAATAAGACTTTTGAATGCGTTGATAACG-GT-TCTGAATTTGCATGTATAT-T-----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aagtccaTTACTGTCGCTAAGC-TTACTATTCAG---GTGGTTG--CCGACATGCTT-A-G------CTTAGGGTTTAAGTTATAGCACTAAAATCCA-AGGATAAATTAGCGGGT-TAAT--ACACACGTGACTTGTTACCAAAATCAATGTGAAAGCTTAAAAATGCATTCAT--CACGAATCTGAACCTACATGTGTACATGTACGT-T------AATACTAGCATGCGTTGCAGATTTACCGGACTGATGGCAGAAAATGCTATATCGTCTGCTAGAGTTG-TATTTCgataagttatatttgacatttttttgtaaatttttcgcagccctatatcatccgccaacgttgtgttac
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTTCGCTTCTTTCTAAAATTATCAGAAGTTCGTCTACAAATAGGTTAAAGATA-AGGTGGAGATAACCCCTCGTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAAAAACTTGAATAGATACAATTGGCAAGAATGCAACTAAATATATTAGAATGGATATCAAACGGTATAGACCACATATTCCCATTAACATCTAGC---CGA-TTTAGTTTGTAAAAGACAGgcttctttctaaaattatcagaagttcgtctacaaataggttaaagataaggtggagataacccctcgttgtcggattccttgttttacagcgaaaaaacttgaatagatacaattggcaagaatgcaactaaatatattagaatggatatcaaacggtatagaccacatattcccattaacatctagccgatttagtttgtaaaagacagtac
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): GTTCAGTTCCTAATAGGAGACAAGAAATGGATACATTAGCTACGACTAAAGTGGAGTGTAGTGGGTTTATATATATAGAGTTCAAATAATTACGACACGCATTATCAATGTTGTCTCTATCTGTCAATCTACTGTAA
Unaligned ( gi|15 ): TTATTAGGAGATTGTGAACATGGATAGTTAGCATAGTGATATGAAATGTACAAAAATTTTACAGATTTCAATTATCAATTAGTTTAATTTGTGGACA
Unaligned ( gi|16 ): TAAGAATGATTATGATCATTAATTATTAAACAATTTAACAAATTATATGTACACATTATACAG
Unaligned ( gi|17 ): ATTCTCTTTATTTCCTCTCTTAAAGAGATTATGAACATGGAATTTTAACACAACAAT
Unaligned ( gi|18 ): TATTCAATATGACCTCATAAACTCACCAAAGGTAAT






Alignments
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tctcttttcctcgcttaaggagattatgaatatggaatgttaacaaaacaatatgaaatttcaaatactacagcattcaatgtgaacaagtatataattatatttgtttacaggaaacataatcacaacattatatacatgtatacatattacatgaaatataatgataaatatcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatagaatattgagttatacattaaatcaatactaaacttatctttttttttcacactAATATGGACGTT-TTTGCTTTACGGCATGCGCTGTCAATGTTGTCTTTATCTGTCAATGTTACTATTAAG-----AAATACCCCCACGTGTTTTATGCAATTACTTTGCTTTATAGTATCCGA--ACCTAGACGA-AACTTA--GAATCTTGCTGACAT-CTCGATCTATTACCAAAAGTTATAATAAGACTTTTGAATGCGTTGATAACGGTTCTGAATTTGCATGTATATTGATAAGTTATATTTGACATTTTTTTGTAAATTTTTCG--C-----------AGCCCTATATCATCCGCCAACGTTG-TGTTat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aagtccaTTTCGCTGCCAATCGGATGATTATTTCTTATCGATTGTAGTCTCGACGATTTG--TGAGCT-TCCCAAAATTTGGCTTCGATTTGGAATCTAGGTACACATATCTGTCC-T---AGCAATGCGG-------TGGATTT---TGGTTC--ATTAA---TAATTGACAAAAGTCCAAATAAAAAC-ATAGGTGCTTTACAACGCGCATTATCACTATTGTCACTATCTGTCAAT-TTACTATTAAGAAAGT--ATG--TCCAGATGCTTac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTACGACACGCATTATCAATGTTGTCTCTATCTGTCAAT-CTACTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gttcagttcctaataggagacaagaaatggatacattagctacgactaaagtggagtgtagtgggtttatatatatagagttcaaataaTATATTCA-T--GGGTAAATATA--------GCAAAGTAACTTCAAGTTACTGTGCTTACAAACAGATTAGCTTTCTAATTTTT----ACTATTTCGTTATGTGC-TGGATT-------TTTTTTTAAATTCTTTATTTTAAAAGTTTGGTTA------ATTTCATGCGTTTTGCAACGAATCTGATTGCTATTCGGAGAAAGTGTTTGTGAACCTTCTTACTTGATAATGATAGTTATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTTAGTCTCATTTGTACCGTTATTGAGTTA-ATTTATGACAGAATAGCCAAATTCTGATTCTATGATTCTGTACAGATTTTGTCGCATTATTGTTGAGCGTGAACAATCAAACAACATGTGAGAAATAACATTACTAAACATTATTCCGCATAAATGACATAGATAT------TGGTGTTTATTTTCAGACATTTGATATATCCACAATTTACTC-ACTGTGTGTGCACAAGCTAGTGTTTCTGAGTCGGTACTGCATTCCCAGATTAATGCATGTTCAATGTTAGTGTGTAAGAATCTAAATCTGCT-GAAAGTGTCATCGCTTTGCAGAC---AAGAACGCCAAGATTCGGTTTCGAATCTATGTA--CGC-TAACTTTATAAATGGA--TTTCCATTCAAT--TTTATTTGGGAACGAACC-TAACTGTATGTATCTG-ATAAGATGATGAGACATGTC-ATATTTTGTAAGAATAAT-AACAATATCGGGAATAAATCCGCGTTGACTATTATCCGATC-TACATGTATATA----TC----GAAATGCGCGTATTGAAGATTTGTTTTACAAGTAACGT-ATTGGGCATATTGCATAAACTTCCAAGAAAATTTAAC--TTTTGCT--TGTCGATTTGAGACCACACAGGTTCCCAGCCTAGCATGTTCAAACAAATATCCGTTCGGGTTC----GTGTTTCAAAGTTGTGTACGTTTTTCGCTGCAAGTCTTAAGAATCTTTCTAGTCGATTATAATCTTG----TTTGGTTAAGTTATTCCAGAGCTCGGCTCCAAAGAGTAGTCTAGGGATACACATTT-TCGATATAAGTGATGCTGAACGAATTGGGTTTAGGTATTTGAGGTCAAGTTTAACGGACAAAAGCGAGAATAATGACGAT-TTTGCCTTTTGACATGCGTTATTAACCTTATCACTGTCGCTTAGC-TTACTATTCAG---GTGAATG--CCGACATGTTTTACGCTTTGGGCTTGAGTTATAGCAT--TATTACCCA-AGGATTAATTTACGGGT-TTGT--ACATACGTGACTTGTTACCGAAAACAACGATAAAGCTTTTAGATGCATTCATCGTGTATCTTAATCTACATGTGTACTT-T------AATCCAGCA-TGCGTTGGAGATTTACAGGGCTGATGGCGGAAAGCGCTATGTCGTCTGCAACAGTTG-TATTTCCGGTTTTATGGGTAAGTACGCAAGAACC--AAGTTCGTTTCTTTCTA-AAATGGTCAGTAGTTCGTCTATGAATAAATTATATATCCAGGTGGAGATATCTCCTCCTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAACAATTCGAATGGATACCATCGGCAAGAATGCAGCTAAACATATCAGAGCGGATATCAAACAGTATAGACCACATTTTCCCCTTAACACCTAGTAAGCGA-TTTAGTTTGTAAAGGACAGCGTTTAaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATATCAA-T--GTGTA----TA--------GCAAAGTAACT----------GTACATACAAACAGATTAGCTTTCTA-TTTTTTTTTACTATTTCTTTATGCGC-TGGATT-------TC-TT--AAAT-----ATCTTAAAAGTTTGGTTACATGTAATTTCATGCATTTAACAACAAATCGAATTGCTATGCGGAGAAAGTGTTTGTGAACCTTCTTACTTGATAATGACAGTAATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTCAGTCTCATTTGTACCGTTATTTAGTTC-ATTTATGACAGAATAGTCAAATTCTGATTCTATAATTCTGTAGAGATTTTGTCGCATTATTGTTGAGCGTGAACAATCAAACAACATGTGAGATATAGCATTACTAAACATTAATCCGCAGTAATGGCATAGATAT------TGATGTCTATTTTCAGATATTTTACATATCCACAATTTACTC-ACTGGGTGTGCACAA---------TCT-----AGT--------------TTAATGCATGTTCAATGTTAGTTTGTAAGAATCTAAATCTGCT-AAAAGTGTCATCGCATTGCAGAC---GAGAACGCCAAAATTCGGTTTCGAATCTATGTA--CGT-TAACTTTATAAATGGG--TTTCCATTCGAT--TTTATTTGGGAAC----C-TGACTGTACGTATCTG-ATAAAATGATGAGACATGTC-ATATTTTGTAAGAATATTTAACAATACCAGGAATAAATCCGCGTTGATTATTATCCGATA-TACATGTATATAAATATC----GAAAGGCGCGCATTGAAGATTTGCTTTACAAGTAACGT-ATTAGACATATTGCATAAACTTCCAAGAAAATTTAAC--TTTTGCT--TGTCGATTTGAGACCGCACAGGTTCCCAGCTTAGCATGCGCAAACAAATATCCGTTCGG-TTC----GAATTAAAAAGTTGTGTACCTTTTT-GCTGCAAGTTTTAAGAATTTTACTAGTCGAT-ATAATCTTG----TTTGGTTAAATAATTCCAGAGTTCGGATCCAAAGAGTAGTCTAGGTATACATATTT-TCGATATAAGTGATGCTGAACGAATTGGGTTTAGATACTTCGGGTCAAGTTTAACGGACGAAAGTGAGAATAATGTCGAT-TTTGCCTTTTGACATGCGTTATTAACCTTATCACTGTCGCTTAGC-CTACTATTCAG---GTGAATG--CCGACATGCTTTACGCTTTGGGTTTGAATTATAGCAT--GAATACCCA-AGGATAAATTAACGGGT-TCGT--ACATACGTGACTTGTTACCGAAAACAACGATAAAGCTTTTAGATGCATCCATCATGTATCTGAATCTACATGTGTACTTGTACGTTAAATCCAGCA-TACGTTGAAGATTTACCGGACTGATGGCGGG-------ATGTCGTCTGCTAGAGTTG-TATTTCCGGTTTTATGGGTAAGTACGCAAGTACC--AAGTTCGCTTCTTTCTA-AAATGGTCAGTAGTTCGTCTATAAACAGATTATATATCCAGATGGAGATAACCCCTTCTTGTCGTATTTCTTGTTTTACAGCG-AATAAAATCGAATGGATACCATTGACAAAA
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gi|7                          : tttgattgtttcaatatagttcggtcattcgtatgtttatagatcgttcgtttatttgactatttcaatataattcgcgcaatcgtttgtttatagatcgttcgtttatttgattgtttcaataccattcgtttgtttctagattattatatattctttttatttcctcccttaaagagattatgaacatggactgttaacaaaacaatatgaaatgtacaaattatacagcattcaatgtgaataagtatatatgtttacagggaacataaacaaacattatatacataaaacatgaaatattataatgactatcaacgagagagacacagctagacacatacagacagaaagacagacagacagacaggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagacagacaaatagagagagaaatagaaagaaagagtaagagagatgataggatattgtgtaatacattaattcaattttacacgaatgatgtttttcacataTATATTCA-T--ATGTA----TC--------ACAAAGTAACT----------GTGCATGCAATCAGATTTGCTTTCCA-TTTTT----GCTATTTCTTTATGTGC-TGTTTT-------TT-TTTAAAAGTTTTTATCTTAAAAGTT------------A----ATGCAATTTGCAACCAATCCCATTGCTATTCTGAGAAAGTGTTTGTGAACCATTTTACTTTATAATGATAGTAATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTTTATCATATTTGTACCATTATT-AGTTTAATTTATGACAAAATAGCCAAATTGTGATTC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tattctctttatttcctcccttaaggagattatgaacatggaatgttaccaaaataatatgaaatgtacaagttatacagcatttatgtgaacaagtttatatgttgacagggaacataaacaaataaaatatacatattacataaaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagagagggggagacagagtgagagagaggagaatatagagaaaaatgtagagagaaaatcattcacttaTTACTGTCGCTAAGC-TTACTATTCAG---GTGGTTG--CCGACATGCTT-A-GCTTAGGGTTTAAGTTATAGCAC--TAAAATCCA-AGGATAAATTAGCGGGT-TAAT--ACACACGTGACTTGTTACCAAAATCAATGTGAAAGCTTAAAAATGCATTCATCACGAATCTGAACCTACATGTGTACATGTACGTTAATACTAGCA-TGCGTTGCAGATTTACCGGACTGATGGCAGAAAATGCTATATCGTCTGCTAGAGTTG-TATTT-CGCTTCTTT--CTAA------AATTATCAGAAGTTCG------TCTACAAATAG---GT----------TAA--AGA-TA-------AGGTGGAGATAACCCCTCGTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAAAAACTTGAATAGATACAATTGGCAAGAATGCAACTAAATATATTAGAATGGATATCAAACGGTATAGACCACATATTCCCATTAACATCTAGC---CGA-TTTAGTTTGTAAAAGACAGgta
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): TAAGAATGATTATGATCATTAATTATTAAACAATTTAACAAATTATATGTACACATTATACAG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tctcttttcctcgcttaaggagattatgaatatggaatgttaacaaaacaatatgaaatttcaaatactacagcattcaatgtgaacaagtatataattatatttgtttacaggaaacataatcacaacattatatacatgtatacatattacatgaaatataatgataaatatcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatagaatattgagttatacattaaatcaatactaaacttatctttttttttcacactAATATGGACGTT-TTTGCTTTACGGCATGCGCTGTCAATGTTGTCTTTATCTGTCAATGTTACTATTAAG-----AAATACCCCCACGTGTTTTATGCAATTACTTTGCTTTATAGTATCCGA--ACCTAGACGA-AACTTA--GAATCTTGCTGACAT-CTCGATCTATTACCAAAAGTTATAATAAGACTTTTGAATGCGTTGATAACGGTTCTGAATTTGCATGTATATTGATAAGTTATATTTGACATTTTTTTGTAAATTTTTC--GC-----------AGCCCTATATCATCCGCCAACGTTG-TGTTat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aagtccaTTTCGCTGCCAATCGGATGATTATTTCTTATCGATTGTAGTCTCGACGATTTG--TGAGCT-TCCCAAAATTTGGCTTCGATTTGGAATCTAGGTACACATATCTGTC----CTAGCAATGCGG-------TGGATTT---TGGTTCA--TTAA---TAATTGACAAAAGTCCAAATAAAAAC-ATAGGTGCTTTACAACGCGCATTATCACTATTGTCACTATCTGTCAAT-TTACTATTAAGAAAGT--ATG--TCCAGATGCTTac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTACGACACGCATTATCAATGTTGTCTCTATCTGTCAAT-CTACTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gttcagttcctaataggagacaagaaatggatacattagctacgactaaagtggagtgtagtgggtttatatatatagagttcaaataaTATATTCA-T--GGGTAAATATA--------GCAAAGTAACTTCAAGTTACTGTGCTTACAAACAGATTAGCTTTCTAATTTTT----ACTATTTCGTTATGTGC-TGGATT-------TTTTTTTAAATTCTTTATTTTAAAAGTTTGGTTA------ATTTCATGCGTTTTGCAACGAATCTGATTGCTATTCGGAGAAAGTGTTTGTGAACCTTCTTACTTGATAATGATAGTTATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTTAGTCTCATTTGTACCGTTATTGAGTTA-ATTTATGACAGAATAGCCAAATTCTGATTCTATGATTCTGTACAGATTTTGTCGCATTATTGTTGAGCGTGAACAATCAAACAACATGTGAGAAATAACATTACTAAACATTATTCCGCATAAATGACATAGATAT------TGGTGTTTATTTTCAGACATTTGATATATCCACAATTTACTC-ACTGTGTGTGCACAAGCTAGTGTTTCTGAGTCGGTACTGCATTCCCAGATTAATGCATGTTCAATGTTAGTGTGTAAGAATCTAAATCTGCT-GAAAGTGTCATCGCTTTGCAGAC---AAGAACGCCAAGATTCGGTTTCGAATCTATGTA--CGC-TAACTTTATAAATGGA--TTTCCATTCAAT--TTTATTTGGGAACGAACC-TAACTGTATGTATCTG-ATAAGATGATGAGACATGTC-ATATTTTGTAAGAATAAT-AACAATATCGGGAATAAATCCGCGTTGACTATTATCCGATC-TACATGTATATA----TC----GAAATGCGCGTATTGAAGATTTGTTTTACAAGTAACGTA-TTGGGCATATTGCATAAACTTCCAAGAAAATTTAAC--TTTTGCT--TGTCGATTTGAGACCACACAGGTTCCCAGCCTAGCATGTTCAAACAAATATCCGTTCGGGTTC----GTGTTTCAAAGTTGTGTACGTTTTTCGCTGCAAGTCTTAAGAATCTTTCTAGTCGATTATAATCTTG----TTTGGTTAAGTTATTCCAGAGCTCGGCTCCAAAGAGTAGTCTAGGGATACACATTT-TCGATATAAGTGATGCTGAACGAATTGGGTTTAGGTATTTGAGGTCAAGTTTAACGGACAAAAGCGAGAATAATGACGAT-TTTGCCTTTTGACATGCGTTATTAACCTTATCACTGTCGCTTAGC-TTACTATTCAG---GTGAATG--CCGACATGTTTTACGCTTTGGGCTTGAGTTATAGCAT--TATTACCCA-AGGATTAATTTACGGGT-TTGT--ACATACGTGACTTGTTACCGAAAACAACGATAAAGCTTTTAGATGCATTCATCGTGTATCTTAATCTACATGTGTACTT-T------AATCCAGCA-TGCGTTGGAGATTTACAGGGCTGATGGCGGAAAGCGCTATGTCGTCTGCAACAGTTG-TATTTCCGGTTTTATGGGTAAGTACGCAAGAACC--AAGTTCGTTTCTTTCTA-AAATGGTCAGTAGTTCGTCTATGAATAAATTATATATCCAGGTGGAGATATCTCCTCCTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAACAATTCGAATGGATACCATCGGCAAGAATGCAGCTAAACATATCAGAGCGGATATCAAACAGTATAGACCACATT-TTCCCCTTAACACCTAGTAAGCGA-TTTAGTTTGTAAAGGACAGCGTTTAaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATATCAA-T--GTGTA----TA--------GCAAAGTAACT----------GTACATACAAACAGATTAGCTTTCTA-TTTTTTTTTACTATTTCTTTATGCGC-TGGATT-------TC-TT--AAAT-----ATCTTAAAAGTTTGGTTACATGTAATTTCATGCATTTAACAACAAATCGAATTGCTATGCGGAGAAAGTGTTTGTGAACCTTCTTACTTGATAATGACAGTAATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTCAGTCTCATTTGTACCGTTATTTAGTTC-ATTTATGACAGAATAGTCAAATTCTGATTCTATAATTCTGTAGAGATTTTGTCGCATTATTGTTGAGCGTGAACAATCAAACAACATGTGAGATATAGCATTACTAAACATTAATCCGCAGTAATGGCATAGATAT------TGATGTCTATTTTCAGATATTTTACATATCCACAATTTACTC-ACTGGGTGTGCACAA---------TCT-----AGT--------------TTAATGCATGTTCAATGTTAGTTTGTAAGAATCTAAATCTGCT-AAAAGTGTCATCGCATTGCAGAC---GAGAACGCCAAAATTCGGTTTCGAATCTATGTA--CGT-TAACTTTATAAATGGG--TTTCCATTCGAT--TTTATTTGGGAAC----C-TGACTGTACGTATCTG-ATAAAATGATGAGACATGTC-ATATTTTGTAAGAATATTTAACAATACCAGGAATAAATCCGCGTTGATTATTATCCGATA-TACATGTATATAAATATC----GAAAGGCGCGCATTGAAGATTTGCTTTACAAGTAACGTA-TTAGACATATTGCATAAACTTCCAAGAAAATTTAAC--TTTTGCT--TGTCGATTTGAGACCGCACAGGTTCCCAGCTTAGCATGCGCAAACAAATATCCGTTCGG-TTC----GAATTAAAAAGTTGTGTACCTTTTT-GCTGCAAGTTTTAAGAATTTTACTAGTCGAT-ATAATCTTG----TTTGGTTAAATAATTCCAGAGTTCGGATCCAAAGAGTAGTCTAGGTATACATATTT-TCGATATAAGTGATGCTGAACGAATTGGGTTTAGATACTTCGGGTCAAGTTTAACGGACGAAAGTGAGAATAATGTCGAT-TTTGCCTTTTGACATGCGTTATTAACCTTATCACTGTCGCTTAGC-CTACTATTCAG---GTGAATG--CCGACATGCTTTACGCTTTGGGTTTGAATTATAGCAT--GAATACCCA-AGGATAAATTAACGGGT-TCGT--ACATACGTGACTTGTTACCGAAAACAACGATAAAGCTTTTAGATGCATCCATCATGTATCTGAATCTACATGTGTACTTGTACGTTAAATCCAGCA-TACGTTGAAGATTTACCGGACTGATGGCGGG-------ATGTCGTCTGCTAGAGTTG-TATTTCCGGTTTTATGGGTAAGTACGCAAGTACC--AAGTTCGCTTCTTTCTA-AAATGGTCAGTAGTTCGTCTATAAACAGATTATATATCCAGATGGAGATAACCCCTTCTTGTCGTATTTCTTGTTTTACAGCG-AATAAAATCGAATGGATACCATTGACAAAA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tattctctttatttcctcccttaaggagattatgaacatggaatgttaccaaaataatatgaaatgtacaagttatacagcatttatgtgaacaagtttatatgttgacagggaacataaacaaataaaatatacatattacataaaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagagagggggagacagagtgagagagaggagaatatagagaaaaatgtagagagaaaatcattcacttaTTACTGTCGCTAAGC-TTACTATTCAG---GTGGTTG--CCGACATGCTT-A-GCTTAGGGTTTAAGTTATAGCAC--TAAAATCCA-AGGATAAATTAGCGGGT-TAAT--ACACACGTGACTTGTTACCAAAATCAATGTGAAAGCTTAAAAATGCATTCATCACGAATCTGAACCTACATGTGTACATGTACGTTAATACTAGCA-TGCGTTGCAGATTTACCGGACTGATGGCAGAAAATGCTATATCGTCTGCTAGAGTTG-TATTT-CGCTTCTTT--CTAA------AATTATCAGAAGTTCG------TCTACAAATAG---GT----------TAA--AGA-TA-------AGGTGGAGATAACCCCTCGTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAAAAACTTGAATAGATACAATTGGCAAGAATGCAACTAAATATATTAGAATGGATATCAAACGGTATAGACCACA-TATTCCCATTAACATCTAGC---CGA-TTTAGTTTGTAAAAGACAGgta
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): TAAGAATGATTATGATCATTAATTATTAAACAATTTAACAAATTATATGTACACATTATACAG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tctcttttcctcgcttaaggagattatgaatatggaatgttaacaaaacaatatgaaatttcaaatactacagcattcaatgtgaacaagtatataattatatttgtttacaggaaacataatcacaacattatatacatgtatacatattacatgaaatataatgataaatatcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatagaatattgagttatacattaaatcaatactaaacttatctttttttttcacactAATATGGACGTT-TTTGCTTTACGGCATGCGCTGTCAATGTTGTCTTTATCTGTCAATGTTACTATTAAG-----AAATACCCCCACGTGTTTTATGCAATTACTTTGCTTTATAGTATCCGA--ACCTAGACGA-AACTTA--GAATCTTGCTGACAT-CTCGATCTATTACCAAAAGTTATAATAAGACTTTTGAATGCGTTGATAACGGTTCTGAATTTGCATGTATATTGATAAGTTATATTTGACATTTTTTTGTAAATTTTTC--GC-----------AGCCCTATATCATCCGCCAACGTTG-TGTTat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aagtccaTTTCGCTGCCAATCGGATGATTATTTCTTATCGATTGTAGTCTCGACGATTTG--TGAGCT-TCCCAAAATTTGGCTTCGATTTGGAATCTAGGTACACATATCTGTC----CTAGCAATGCGG-------TGGATTT---TGGTTCA--TTAA---TAATTGACAAAAGTCCAAATAAAAAC-ATAGGTGCTTTACAACGCGCATTATCACTATTGTCACTATCTGTCAAT-TTACTATTAAGAAAGT--ATG--TCCAGATGCTTac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTACGACACGCATTATCAATGTTGTCTCTATCTGTCAAT-CTACTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gttcagttcctaataggagacaagaaatggatacattagctacgactaaagtggagtgtagtgggtttatatatatagagttcaaataaTATATTCA-T--GGGTAAATATA--------GCAAAGTAACTTCAAGTTACTGTGCTTACAAACAGATTAGCTTTCTAATTTTT----ACTATTTCGTTATGTGC-TGGATT-------TTTTTTTAAATTCTTTATTTTAAAAGTTTGGTTA------ATTTCATGCGTTTTGCAACGAATCTGATTGCTATTCGGAGAAAGTGTTTGTGAACCTTCTTACTTGATAATGATAGTTATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTTAGTCTCATTTGTACCGTTATTGAGTTA-ATTTATGACAGAATAGCCAAATTCTGATTCTATGATTCTGTACAGATTTTGTCGCATTATTGTTGAGCGTGAACAATCAAACAACATGTGAGAAATAACATTACTAAACATTATTCCGCATAAATGACATAGATAT------TGGTGTTTATTTTCAGACATTTGATATATCCACAATTTACTC-ACTGTGTGTGCACAAGCTAGTGTTTCTGAGTCGGTACTGCATTCCCAGATTAATGCATGTTCAATGTTAGTGTGTAAGAATCTAAATCTGCT-GAAAGTGTCATCGCTTTGCAGAC---AAGAACGCCAAGATTCGGTTTCGAATCTATGTA--CGC-TAACTTTATAAATGGA--TTTCCATTCAAT--TTTATTTGGGAACGAACC-TAACTGTATGTATCTG-ATAAGATGATGAGACATGTC-ATATTTTGTAAGAATAAT-AACAATATCGGGAATAAATCCGCGTTGACTATTATCCGATC-TACATGTATATA----TC----GAAATGCGCGTATTGAAGATTTGTTTTACAAGTAACGTA-TTGGGCATATTGCATAAACTTCCAAGAAAATTTAAC--TTTTGCT--TGTCGATTTGAGACCACACAGGTTCCCAGCCTAGCATGTTCAAACAAATATCCGTTCGGGTTC----GTGTTTCAAAGTTGTGTACGTTTTTCGCTGCAAGTCTTAAGAATCTTTCTAGTCGATTATAATCTTG----TTTGGTTAAGTTATTCCAGAGCTCGGCTCCAAAGAGTAGTCTAGGGATACACATTT-TCGATATAAGTGATGCTGAACGAATTGGGTTTAGGTATTTGAGGTCAAGTTTAACGGACAAAAGCGAGAATAATGACGAT-TTTGCCTTTTGACATGCGTTATTAACCTTATCACTGTCGCTTAGC-TTACTATTCAG---GTGAATG--CCGACATGTTTTACGCTTTGGGCTTGAGTTATAGCAT--TATTACCCA-AGGATTAATTTACGGGT-TTGT--ACATACGTGACTTGTTACCGAAAACAACGATAAAGCTTTTAGATGCATTCATCGTGTATCTTAATCTACATGTGTACTT-T------AATCCAGCA-TGCGTTGGAGATTTACAGGGCTGATGGCGGAAAGCGCTATGTCGTCTGCAACAGTTG-TATTTCCGGTTTTATGGGTAAGTACGCAAGAACC--AAGTTCGTTTCTTTCTA-AAATGGTCAGTAGTTCGTCTATGAATAAATTATATATCCAGGTGGAGATATCTCCTCCTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAACAATTCGAATGGATACCATCGGCAAGAATGCAGCTAAACATATCAGAGCGGATATCAAACAGTATAGACCACATT-TTCCCCTTAACACCTAGTAAGCGA-TTTAGTTTGTAAAGGACAGCGTTTAaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATATCAA-T--GTGTA----TA--------GCAAAGTAACT----------GTACATACAAACAGATTAGCTTTCTA-TTTTTTTTTACTATTTCTTTATGCGC-TGGATT-------TC-TT--AAAT-----ATCTTAAAAGTTTGGTTACATGTAATTTCATGCATTTAACAACAAATCGAATTGCTATGCGGAGAAAGTGTTTGTGAACCTTCTTACTTGATAATGACAGTAATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTCAGTCTCATTTGTACCGTTATTTAGTTC-ATTTATGACAGAATAGTCAAATTCTGATTCTATAATTCTGTAGAGATTTTGTCGCATTATTGTTGAGCGTGAACAATCAAACAACATGTGAGATATAGCATTACTAAACATTAATCCGCAGTAATGGCATAGATAT------TGATGTCTATTTTCAGATATTTTACATATCCACAATTTACTC-ACTGGGTGTGCACAA---------TCT-----AGT--------------TTAATGCATGTTCAATGTTAGTTTGTAAGAATCTAAATCTGCT-AAAAGTGTCATCGCATTGCAGAC---GAGAACGCCAAAATTCGGTTTCGAATCTATGTA--CGT-TAACTTTATAAATGGG--TTTCCATTCGAT--TTTATTTGGGAAC----C-TGACTGTACGTATCTG-ATAAAATGATGAGACATGTC-ATATTTTGTAAGAATATTTAACAATACCAGGAATAAATCCGCGTTGATTATTATCCGATA-TACATGTATATAAATATC----GAAAGGCGCGCATTGAAGATTTGCTTTACAAGTAACGTA-TTAGACATATTGCATAAACTTCCAAGAAAATTTAAC--TTTTGCT--TGTCGATTTGAGACCGCACAGGTTCCCAGCTTAGCATGCGCAAACAAATATCCGTTCGG-TTC----GAATTAAAAAGTTGTGTACCTTTTT-GCTGCAAGTTTTAAGAATTTTACTAGTCGAT-ATAATCTTG----TTTGGTTAAATAATTCCAGAGTTCGGATCCAAAGAGTAGTCTAGGTATACATATTT-TCGATATAAGTGATGCTGAACGAATTGGGTTTAGATACTTCGGGTCAAGTTTAACGGACGAAAGTGAGAATAATGTCGAT-TTTGCCTTTTGACATGCGTTATTAACCTTATCACTGTCGCTTAGC-CTACTATTCAG---GTGAATG--CCGACATGCTTTACGCTTTGGGTTTGAATTATAGCAT--GAATACCCA-AGGATAAATTAACGGGT-TCGT--ACATACGTGACTTGTTACCGAAAACAACGATAAAGCTTTTAGATGCATCCATCATGTATCTGAATCTACATGTGTACTTGTACGTTAAATCCAGCA-TACGTTGAAGATTTACCGGACTGATGGCGGG-------ATGTCGTCTGCTAGAGTTG-TATTTCCGGTTTTATGGGTAAGTACGCAAGTACC--AAGTTCGCTTCTTTCTA-AAATGGTCAGTAGTTCGTCTATAAACAGATTATATATCCAGATGGAGATAACCCCTTCTTGTCGTATTTCTTGTTTTACAGCG-AATAAAATCGAATGGATACCATTGACAAAA
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gi|6                          :                                                                                                                                                                           tatattctctttatttcctcccttaagaagattatgaacatggattgttaacacaacaaaattaaatgtacacattatacagtattcaatgtgatcaagtatatatgtttacagggaatataaacaaaacatgttatacatatatacatatttcatgacatactatgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggagggggatattgagttctacattaattcaattttacacgaatgacatttttcacacataagTATGTGCA-T--ATGTA----TA--------GCATAGTAACT----------GTGCATGCAAACAGATTTGCTCTCCA-TTTT-----------------TGTGC-TGGATT-------AT-ATTAAAATTCTTTATCTTAAAA-----GTTA------ACTT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tattctctttatttcctcccttaaggagattatgaacatggaatgttaccaaaataatatgaaatgtacaagttatacagcatttatgtgaacaagtttatatgttgacagggaacataaacaaataaaatatacatattacataaaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagagagggggagacagagtgagagagaggagaatatagagaaaaatgtagagagaaaatcattcacttaTTACTGTCGCTAAGC-TTACTATTCAG---GTGGTTG--CCGACATGCTT-A-GCTTAGGGTTTAAGTTATAGCAC--TAAAATCCA-AGGATAAATTAGCGGGT-TAAT--ACACACGTGACTTGTTACCAAAATCAATGTGAAAGCTTAAAAATGCATTCATCACGAATCTGAACCTACATGTGTACATGTACGTTAATACTAGCA-TGCGTTGCAGATTTACCGGACTGATGGCAGAAAATGCTATATCGTCTGCTAGAGTTG-TATTT-CGCTTCTTT--CTAA------AATTATCAGAAGTTCG------TCTACAAATAG---GT----------TAA--AGA-TA-------AGGTGGAGATAACCCCTCGTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAAAAACTTGAATAGATACAATTGGCAAGAATGCAACTAAATATATTAGAATGGATATCAAACGGTATAGACCACA-TATTCCCATTAACATCTAGC---CGA-TTTAGTTTGTAAAAGACAGgta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tTTAAATAACATATAATAAAAAGCATTACTAATCATTATTCCGCACAAATGGCATATATATATATATTAGTGTATAATAT-AG--GTTTGGCATATCCACAAATTACTC-ACTGTATGAACACAAGCTAA-GTTTCTGGTCCCGTGATGCATTCGCAGATTATTGCATATTCAGTGTTAATGTGTAACAATTTAGATTTGCT-AAAATTATCA-------------------------ATGATTCTGTTTCAAATCTATGTT--TGT-TAACATTCTACAT-----TTGACATTTTAC--ATTATTTTAGAACTACCG-TAACAGTAAACAACTG-ATAAGATAATGCAATATGCC--TATTtac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGCCTATTATCCTTTCATACATGCATATA----TA----GTTAGACGAATATTAAAGAGTTGCCTTACAAGCAACGTA-TCGGACATATTGCGTG-------------------------TACT--TGTCGATTTCAAACT-------------GCCTA-TATTCCCAAACAAATACATGTACGGGTTC----AAATTTCAAatcctttcatacatgcatatatagttagacgaatattaaagagttgccttacaagcaacgtatcggacatattgcgtgtacttgtcgatttcaaactgcctatattcccaaacaaatacatgtacgggttcaaatttcaa


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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tctcttttcctcgcttaaggagattatgaatatggaatgttaacaaaacaatatgaaatttcaaatactacagcattcaatgtgaacaagtatataattatatttgtttacaggaaacataatcacaacattatatacatgtatacatattacatgaaatataatgataaatatcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatagaatattgagttatacattaaatcaatactaaacttatctttttttttcacactAATATGGACGTT-TTTGCTTTACGGCATGCGCTGTCAATGTTGTCTTTATCTGTCAATGTTACTATTAAG-----AAATACCCCCACGTGTTTTATGCAATTACTTTGCTTTATAGTATCCGA--ACCTAGACGA-AACTTA--GAATCTTGCTGACAT-CTCGATCTATTACCAAAAGTTATAATAAGACTTTTGAATGCGTTGATAACGGTTCTGAATTTGCATGTATATTGATAAGTTATATTTGACATTTTTTTGTAAATTTTTC--GC-----------AGCCCTATATCATCCGCCAACGTTG-TGTTat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aagtccaTTTCGCTGCCAATCGGATGATTATTTCTTATCGATTGTAGTCTCGACGATTTG--TGAGCT-TCCCAAAATTTGGCTTCGATTTGGAATCTAGGTACACATATCTGTC----CTAGCAATGCGG-------TGGATTT---TGGTTCA--TTAA---TAATTGACAAAAGTCCAAATAAAAAC-ATAGGTGCTTTACAACGCGCATTATCACTATTGTCACTATCTGTCAAT-TTACTATTAAGAAAGT--ATG--TCCAGATGCTTac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTACGACACGCATTATCAATGTTGTCTCTATCTGTCAAT-CTACTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gttcagttcctaataggagacaagaaatggatacattagctacgactaaagtggagtgtagtgggtttatatatatagagttcaaataaTATATTCA-T--GGGTAAATATA--------GCAAAGTAACTTCAAGTTACTGTGCTTACAAACAGATTAGCTTTCTAATTTTT----ACTATTTCGTTATGTGC-TGGATT-------TTTTTTTAAATTCTTTATTTTAAAAGTTTGGTTA------ATTTCATGCGTTTTGCAACGAATCTGATTGCTATTCGGAGAAAGTGTTTGTGAACCTTCTTACTTGATAATGATAGTTATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTTAGTCTCATTTGTACCGTTATTGAGTTA-ATTTATGACAGAATAGCCAAATTCTGATTCTATGATTCTGTACAGATTTTGTCGCATTATTGTTGAGCGTGAACAATCAAACAACATGTGAGAAATAACATTACTAAACATTATTCCGCATAAATGACATAGATAT------TGGTGTTTATTTTCAGACATTTGATATATCCACAATTTACTC-ACTGTGTGTGCACAAGCTAGTGTTTCTGAGTCGGTACTGCATTCCCAGATTAATGCATGTTCAATGTTAGTGTGTAAGAATCTAAATCTGCT-GAAAGTGTCATCGCTTTGCAGAC---AAGAACGCCAAGATTCGGTTTCGAATCTATGTA--CGC-TAACTTTATAAATGGA--TTTCCATTCAAT--TTTATTTGGGAACGAACC-TAACTGTATGTATCTG-ATAAGATGATGAGACATGTC-ATATTTTGTAAGAATAAT-AACAATATCGGGAATAAATCCGCGTTGACTATTATCCGATC-TACATGTATATA----TC----GAAATGCGCGTATTGAAGATTTGTTTTACAAGTAACGTA-TTGGGCATATTGCATAAACTTCCAAGAAAATTTAAC--TTTTGCT--TGTCGATTTGAGACCACACAGGTTCCCAGCCTAGCATGTTCAAACAAATATCCGTTCGGGTTC----GTGTTTCAAAGTTGTGTACGTTTTTCGCTGCAAGTCTTAAGAATCTTTCTAGTCGATTATAATCTTG----TTTGGTTAAGTTATTCCAGAGCTCGGCTCCAAAGAGTAGTCTAGGGATACACATTT-TCGATATAAGTGATGCTGAACGAATTGGGTTTAGGTATTTGAGGTCAAGTTTAACGGACAAAAGCGAGAATAATGACGAT-TTTGCCTTTTGACATGCGTTATTAACCTTATCACTGTCGCTTAGC-TTACTATTCAG---GTGAATG--CCGACATGTTTTACGCTTTGGGCTTGAGTTATAGCAT--TATTACCCA-AGGATTAATTTACGGGT-TTGT--ACATACGTGACTTGTTACCGAAAACAACGATAAAGCTTTTAGATGCATTCATCGTGTATCTTAATCTACATGTGTACTT-T------AATCCAGCA-TGCGTTGGAGATTTACAGGGCTGATGGCGGAAAGCGCTATGTCGTCTGCAACAGTTG-TATTTCCGGTTTTATGGGTAAGTACGCAAGAACC--AAGTTCGTTTCTTTCTA-AAATGGTCAGTAGTTCGTCTATGAATAAATTATATATCCAGGTGGAGATATCTCCTCCTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAACAATTCGAATGGATACCATCGGCAAGAATGCAGCTAAACATATCAGAGCGGATATCAAACAGTATAGACCACATT-TTCCCCTTAACACCTAGTAAGCGA-TTTAGTTTGTAAAGGACAGCGTTTAaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATATCAA-T--GTGTA----TA--------GCAAAGTAACT----------GTACATACAAACAGATTAGCTTTCTA-TTTTTTTTTACTATTTCTTTATGCGC-TGGATT-------TC-TT--AAAT-----ATCTTAAAAGTTTGGTTACATGTAATTTCATGCATTTAACAACAAATCGAATTGCTATGCGGAGAAAGTGTTTGTGAACCTTCTTACTTGATAATGACAGTAATCTTCGACCAATTAACTTTTGCAGTTCAGTCTCATTTGTACCGTTATTTAGTTC-ATTTATGACAGAATAGTCAAATTCTGATTCTATAATTCTGTAGAGATTTTGTCGCATTATTGTTGAGCGTGAACAATCAAACAACATGTGAGATATAGCATTACTAAACATTAATCCGCAGTAATGGCATAGATAT------TGATGTCTATTTTCAGATATTTTACATATCCACAATTTACTC-ACTGGGTGTGCACAA---------TCT-----AGT--------------TTAATGCATGTTCAATGTTAGTTTGTAAGAATCTAAATCTGCT-AAAAGTGTCATCGCATTGCAGAC---GAGAACGCCAAAATTCGGTTTCGAATCTATGTA--CGT-TAACTTTATAAATGGG--TTTCCATTCGAT--TTTATTTGGGAAC----C-TGACTGTACGTATCTG-ATAAAATGATGAGACATGTC-ATATTTTGTAAGAATATTTAACAATACCAGGAATAAATCCGCGTTGATTATTATCCGATA-TACATGTATATAAATATC----GAAAGGCGCGCATTGAAGATTTGCTTTACAAGTAACGTA-TTAGACATATTGCATAAACTTCCAAGAAAATTTAAC--TTTTGCT--TGTCGATTTGAGACCGCACAGGTTCCCAGCTTAGCATGCGCAAACAAATATCCGTTCGG-TTC----GAATTAAAAAGTTGTGTACCTTTTT-GCTGCAAGTTTTAAGAATTTTACTAGTCGAT-ATAATCTTG----TTTGGTTAAATAATTCCAGAGTTCGGATCCAAAGAGTAGTCTAGGTATACATATTT-TCGATATAAGTGATGCTGAACGAATTGGGTTTAGATACTTCGGGTCAAGTTTAACGGACGAAAGTGAGAATAATGTCGAT-TTTGCCTTTTGACATGCGTTATTAACCTTATCACTGTCGCTTAGC-CTACTATTCAG---GTGAATG--CCGACATGCTTTACGCTTTGGGTTTGAATTATAGCAT--GAATACCCA-AGGATAAATTAACGGGT-TCGT--ACATACGTGACTTGTTACCGAAAACAACGATAAAGCTTTTAGATGCATCCATCATGTATCTGAATCTACATGTGTACTTGTACGTTAAATCCAGCA-TACGTTGAAGATTTACCGGACTGATGGCGGG-------ATGTCGTCTGCTAGAGTTG-TATTTCCGGTTTTATGGGTAAGTACGCAAGTACC--AAGTTCGCTTCTTTCTA-AAATGGTCAGTAGTTCGTCTATAAACAGATTATATATCCAGATGGAGATAACCCCTTCTTGTCGTATTTCTTGTTTTACAGCG-AATAAAATCGAATGGATACCATTGACAAAA
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gi|6                          :                                                                                                                                                                           tatattctctttatttcctcccttaagaagattatgaacatggattgttaacacaacaaaattaaatgtacacattatacagtattcaatgtgatcaagtatatatgtttacagggaatataaacaaaacatgttatacatatatacatatttcatgacatactatgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggagggggatattgagttctacattaattcaattttacacgaatgacatttttcacacataagTATGTGCA-T--ATGTA----TA--------GCATAGTAACT----------GTGCATGCAAACAGATTTGCTCTCCA-TTTT-----------------TGTGC-TGGATT-------AT-ATTAAAATTCTTTATCTTAAAA-----GTTA------ACTT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tattctctttatttcctcccttaaggagattatgaacatggaatgttaccaaaataatatgaaatgtacaagttatacagcatttatgtgaacaagtttatatgttgacagggaacataaacaaataaaatatacatattacataaaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagagagggggagacagagtgagagagaggagaatatagagaaaaatgtagagagaaaatcattcacttaTTACTGTCGCTAAGC-TTACTATTCAG---GTGGTTG--CCGACATGCTT-A-GCTTAGGGTTTAAGTTATAGCAC--TAAAATCCA-AGGATAAATTAGCGGGT-TAAT--ACACACGTGACTTGTTACCAAAATCAATGTGAAAGCTTAAAAATGCATTCATCACGAATCTGAACCTACATGTGTACATGTACGTTAATACTAGCA-TGCGTTGCAGATTTACCGGACTGATGGCAGAAAATGCTATATCGTCTGCTAGAGTTG-TATTT-CGCTTCTTT--CTAA------AATTATCAGAAGTTCG------TCTACAAATAG---GT----------TAA--AGA-TA-------AGGTGGAGATAACCCCTCGTTGTCGGATTCCTTGTTTTACAGCG-AAAAAACTTGAATAGATACAATTGGCAAGAATGCAACTAAATATATTAGAATGGATATCAAACGGTATAGACCACA-TATTCCCATTAACATCTAGC---CGA-TTTAGTTTGTAAAAGACAGgta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tTTAAATAACATATAATAAAAAGCATTACTAATCATTATTCCGCACAAATGGCATATATATATATATTAGTGTATAATAT-AG--GTTTGGCATATCCACAAATTACTC-ACTGTATGAACACAAGCTAA-GTTTCTGGTCCCGTGATGCATTCGCAGATTATTGCATATTCAGTGTTAATGTGTAACAATTTAGATTTGCT-AAAATTATCA-------------------------ATGATTCTGTTTCAAATCTATGTT--TGT-TAACATTCTACAT-----TTGACATTTTAC--ATTATTTTAGAACTACCG-TAACAGTAAACAACTG-ATAAGATAATGCAATATGCC--TATTtac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGCCTATTATCCTTTCATACATGCATATA----TA----GTTAGACGAATATTAAAGAGTTGCCTTACAAGCAACGTA-TCGGACATATTGCGTG-------------------------TACT--TGTCGATTTCAAACT-------------GCCTA-TATTCCCAAACAAATACATGTACGGGTTC----AAATTTCAAatcctttcatacatgcatatatagttagacgaatattaaagagttgccttacaagcaacgtatcggacatattgcgtgtacttgtcgatttcaaactgcctatattcccaaacaaatacatgtacgggttcaaatttcaa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): TTATTAGGAGATTGTGAACATGGATAGTTAGCATAGTGATATGAAATGTACAAAAATTTTACAGATTTCAATTATCAATTAGTTTAATTTGTGGACA
Unaligned ( gi|16 ): TAAGAATGATTATGATCATTAATTATTAAACAATTTAACAAATTATATGTACACATTATACAG
Unaligned ( gi|17 ): ATTCTCTTTATTTCCTCTCTTAAAGAGATTATGAACATGGAATTTTAACACAACAAT
Unaligned ( gi|18 ): TATTCAATATGACCTCATAAACTCACCAAAGGTAAT