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gi|4 : gcgaaggacattcaaaaataaatcatgcaaaagaataaaaaatacattattgaaaaccttcatctttctgctacatgtaataaatatatttgataatgtgagaccattttacaatacaacagcacggtttaaaagcaggcacctaggtagacccggcgcacccagtggatattgataacgacgtctgtaacgtcaataacttgcttgtctttttttttttcattgtatgccacgcatttacgatgtcgttttacccacttatcgaaaatgtctatataccagtcctggtcgtaccatgcgataatatttgaagtttcagaacgtagttctgacggtgatgagaatcggcagtccttcaattgcgactgggaataggcctagggcaaaatcaaatggcgccaggtctggtggatacggcaggtggtcaactcgaccgaaaaccagccaatagatctctaactgtgttggtacagccgtatgtggcggtgcgttgtcctggtgttacaggtaatgctctagtggtatccctggtcgctttttttcatccgttattatcatcctgtctaggaattcatcaccgtcctttttgtattgcttaagattttttttaaatccttcacacgtcgctcttttccattatccttcaaaaacctgggcacccaccgtgcatatacctttgacatatttaaatattccgttagaattgtataaattgtacccacactaacaccgatcctgatggataacgccttaactgtcaatcatcgatcgttttcaagtgcacctcgaacagacgtcacgacgtcattgctaattttcgactttcgtcccctcctcttatcatttccaatgaatcacgtccgtcggcaaatttcttattccgcctaaacactagttcacgttttAGGGACATTCAAAAATAAATCAAGACTTTTTGTCTAGGAAAAATCT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--TACATCATTGAAAACCGGTATCTTTCTGTTACATGTTATAAAGACATTTGATAATATGAAACCATTTTACAATATAACAGTACAGTTCAAAAGCAGGCACATTGCGCACC-----------T-----------AGTGGATAAATAT---GACATCGGTAACGTCAATAACTTGCTTGTCATTTTTTTTGAAAATATTCTCCATTGTAT---GCCACGCATTTACGATGCCATTTTACCCACTTATCGGAAATGTCTCTAT--TAATCCTGGTCGTACTGTTTGATAATATTTGAAGTGGCAGAATGTA----------GTTCTGACAGTGATGAGAACCGGCG-CCCTTCAATTGCGATTTAATTACTGGAAATAGG------GCAAATTCAAATGGGGCCAGGTCT---GGTGAAGATGGTGGGTGGTCAACTCGGCCAAAACCAATTAAATCGATCTCAAACTACCATTATGTCGATGCAGCCTTATGTGGTGGTGCGTTGTCCTGGTGTCACAGGTAATGCTAGAGTGGTATCCATGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGAGTGTGCTAGGAATTCATAACCGTCTTTTTT-TTTTTATCGCTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTTCACACGTTGCTCTT-TTTCTTTATCCTTCAAAA-TTCTGAGCACCCATTACACATGTACCTTGGACATC-TTTAAAATAAATTAATGTTCCG-TTAGAATTGTATAAATTGTTCCCACACTAACACCGATCCTGATTGATAATACCATAACTGTCAATTGTCGATCTTTATCAAGTACATCTCAAACAGATGTCACAACGTCATTGCTAATATTCGACTTTCGTCCTCTCCCCTTATCATCTGCCAATAAATCTTGCCCGTCGGCAAACTTCTTATGACACCTAAACACTAGTCCACGTTTTACAAAACTGTTGCA-TGGTACTT-TCTT-CATTAACTTACATGTTTCCATTGGTGTT----TTTCCAA-GATCCACGCAAAATTTTATGTTTGT-CCTAATTTCTTACTTTTCCgtat
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gi|6 : TCATTTATTCTCAAAGTAATCAGCATTATAT---GTCACACATTTATGATGTCCCTTGGTCCATTTGTTGAA--TGTCTCCATACAAATGCTGG----------------TATTTGCAGTGGCAGTA--TA--------TAGTTCTGACtaactaaagcgcacaatatcactgatcatttattctcaaagtaatcagcattatatgtcacacatttatgatgtcccttggtccatttgttgaatgtctccatacaaatgctggtatttgcagtggcagtatatagttctgaccaggat
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Alignments
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Reference ( family-3907 ) : CGAGGGACGTTCAAAAATAAATCA-GACTTTTTCTCTAGGAAATATAT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--TACATCATTGAAAACCGTTATCTTTCTGCTACATGTAATAAAGACATTTGATAATGTGAGACCATTTTACAATATAACAGCACGGTTTAAAAGCAGGCACATCGGTAGACC-GG-CGCAC-C-AGTGGATATACATAACGACGTCGGTAACGTCGATAACTTGCTTGTCATTT-TTTTT-AAAATATTCTCCATTGTAT---GCCACGCATTTACGATGCCGTTTTACCCACTTATCGAAAATGTCTCTATACCAATCCTGGTCGTACTGTGCGATAATATTTGAAGTGGCAGAACGTA--------TAGTTCTGACAGTGATGAGAACCGGCGGCCCTTCAATTGCGACTTAATTACTGGGAATAGG------GCAAAATCGAATGGCGCCAGGTCT---GGTGAATACGGCGGGTGGTCAACTCGGCCGAAACCNAGCAAATCGATCTCCAACTG------TGTCGATGCAGCCNTATGTGGCGGTGCGTTGTCCTGGTGTNACAGGTAATGCTCGAGTGGTATCCCTGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGCGTGTGCTAGGAATTCATAACCGTCTTTTTT-T----ATCGCTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTTCACACGTCGCTCTT-TTTCGTTATCCTTCAAAA-TCCTGGGCACCCATCGTGCATGTACCTTGGACATC-TTTAAA---------TGTTCCGTTAGAATTGTATAAATTGTTCCCGCACTAACACCGATC----CTGATGGATAATGCCTTAACTGTCAATCGTCGATCGTTATCAAGTGCATCTCGAACAGACGTCACGACGTCACTGCTAATNTTCGACTTTCGTCCTCTCCCCTTATCATCTTCCAATGAATCTCGTCCGTCGGCAAACTTCTTATNCCACCTAAACACTAGTTCACGTTTTACAAAACTGTTGCG-TGGTAC---TTTCTGCATCAACTTATATGTTTCCGTTGGCGCCAT-TTC-AAGATCCACGCAAAACTTTATGTTTGT-CCTAATTTCCAACTTTTCCGATGACGCCATATTTCCATGCAAATATCTCTATCACAGTCTTCGAAAACGCGGTTTACGTTTGTATTTGAAATGCGAATGACGTCAAATTTAGNAGTTATGTTACTATAGACGTTACGTTACAATTTG--GCGGATTATTTAAAGCTNTTGGACAAC-CATAGTTGCAATTGTCGCGGCGTTTTAAT----AC-TTTT-AAGGAATGTNAAACGACGTGCGCCGCATACGCGTTACTATGGTAAATGGAACGTTCGTTGCTTTGGACGTATCATCCTAGTTGCGCATAAAACTATTCAGAAAGTTTCAAAA-TGGAAAGCGGTTTACATTTATGTAAGTTTTGTTATCCTGAGGAAAATAATAATATCATTAGAGAAAAAGTCCGATTTATTTTTTAACGTCCCTC
gi|1 : CGAGGGACATTCAAAAATAAATCA-GACTTTTTCTCTAGGAAATATGT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--CACTTCATTGAAAACCGTTATCTTTCTGCTACATGAAATGAAGATATTTGATAATGTGAGACCATTTTACAATATAGTAGCACGGTTTAAAAGCAGGCACATCGGTAGAC-------------AGTGGATACACATAACGACGTCGGTAACGTCAATTACTT-TTT----TTT-TTTTT-AAAATATTATCCATTGTAT---GCCACGCGTTCACGGTGCTGTTTTACCCACATATCGAAAATGTCTCTATAACAATCCTGGTCGTACTGTGCGATAATATTTGAAGTGGCAGAACGTAGCAGAACGTAGTTCTGACAGTGATGAGAACCAGCGGCCCTTCAATTGCGACTTAATTTCTGGGAATAGG------GCAAAATTGAATGGCGCCAGGTCTTCTGGTGAATACGATGGGTCGTCAACTCAGCTGAAACCAGGCAAATCGATCTCCAACTG------TGTCGATGTAGCCGTATGT-------------CCTGGTGTAATAGGTAATGCTCGAGTGGTATCCCTGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGCGTTTGCTAGGAATTCATAACCGTCATTTTT------ATCACTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTCCTCATGTCGCTCTT-TTTCGTTATCCTTCAAAA-TCCTGGGCATCCATCGTGCATGTACTTTGGAAATCCTTTAAA---------T-------TA--ATTGTATAAATTGTTCCCACACTCACACCAATC----CTAATGAATAATGCCTTAAGTGTCAATCGTCGATCGAAATCAAATGCATCTCGAACAAACGTCAGGACGTCACTGCTAATTTTCGACTTTTGTCTTCTCTCCTTATCATCTTCCAATGAATCTCGTCCGTCGGCAAACTTCTTATGCCACGTTAACACTAGTTCACGTTTTACAAAACTGTTGCG-TGGTAC---TTTCTGCATCAACTTATATGTTTCCGTTGGCGTCAT-TCC-AAGATCCACGCAAAACTTTATGTTTAA-CCTAATTTCCAACTTTTCCGATGACGCCATATTTCCATGCAAATATCTCTATCACAGTCTTCGTGAACGCAGTTAACGTTTGTATTTGAAGTGAAAATGACGTCAAATTTAGCAGTTATGTTACTAT-GACGTTACGTTACAATTTA--ACGGATTA-TTAAAGCTTTTGGACAAC-CATAGTTGCAATTATCACGGCGTTTTAAT----AC-GTTTAAAGGAATGTTAAACGACGGGCGCCGCATACGCGTTAAAATGGCAAATGGAATGTTCGTTGCTTTGGACGTATCATCCTAGTTGCGCATAAAACTATTCAGAAAGTTTCAAAA-TGGAAAGCGTTTTACATTTGTGAAAGTTTTATAATCCTGAGGAAAATAATAATATCATAAGAGAAAAAGTCGGATATATTTTTTAACGTTCCTC
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gi|18 : CGAGGGACGTTCAAAAATAAATCG-GAATTTTTCgtatat
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gi|3 : gAAATAAAT-------CATGC---AA-AAG-AATAAAAAA--TACATTATTGAAAACCTTCATCTTTCTGCTACATGTAATAAATATATTTGATAATGTGAGACCATTTTACAATACAACAGCACGGTTTAAAAGCAGGCACCTAGGTAGACCCGG-CGCAC-CCAGTGGATATTGATAACGACGTCTGTAACGTCAATAACTTGCTTGTCTTTT-TTTTT----------TTCATTGTAT---GCCACGCATTTACGATGTCGTTTTACCCACTTATCGAAAATGTCTATATACCAGTCCTGGTCGTACCATGCGATAATATTTGAAGTTTCAGAACGTA----------GTTCTGACGGTGATGAGAATCGGCAGTCCTTCAATTGCGACT--------GGGAATAGGCCTAGGGCAAAATCAAATGGCGCCAGGTCT---GGTGGATACGGCAGGTGGTCAACTCGACCGAAAACCAGCCAATAGATCTCTAACTG------TGTTGGTACAGCCGTATGTGGCGGTGCGTTGTCCTGGTGTTACAGGTAATGCTCTAGTGGTATCCCTGGTCGCTTTTTTTCATCCGTTATTATCATCC-TGT-CTAGGAATTCATCACCGTCCTTTTTGT----ATTGCTTAAGATTTTTTTTA-AATCCTTCACACGTCGCTCTT-TTCCATTATCCTTCAAAA-ACCTGGGCACCCACCGTGCATATACCTTTGACATA-TTTAAA---------TATTCCGTTAGAATTGTATAAATTGTACCCACACTAACACCGATC----CTGATGGATAACGCCTTAACTGTCAATCATCGATCGTTTTCAAGTGCACCTCGAACAGACGTCACGACGTCATTGCTAATTTTCGACTTTCGTCCCCTCCTCTTATCAT-TTCCAATGAATCACGTCCGTCGGCAAATTTCTTATTCCGCCTAAACACTAGTTCACGTTTT-----ACT-TTATGTTTGTACCTATTTC-----CAACT------TTTCCGATGACGCCATATT------TTCATGCAAATATCTATATtgcaaaagaataaaaaatacattattgaaaaccttcatctttctgctacatgtaataaatatatttgataatgtgagaccattttacaatacaacagcacggtttaaaagcaggcacctaggtagacccggcgcacccagtggatattgataacgacgtctgtaacgtcaataacttgcttgtctttttttttttcattgtatgccacgcatttacgatgtcgttttacccacttatcgaaaatgtctatataccagtcctggtcgtaccatgcgataatatttgaagtttcagaacgtagttctgacggtgatgagaatcggcagtccttcaattgcgactgggaataggcctagggcaaaatcaaatggcgccaggtctggtggatacggcaggtggtcaactcgaccgaaaaccagccaatagatctctaactgtgttggtacagccgtatgtggcggtgcgttgtcctggtgttacaggtaatgctctagtggtatccctggtcgctttttttcatccgttattatcatcctgtctaggaattcatcaccgtcctttttgtattgcttaagattttttttaaatccttcacacgtcgctcttttccattatccttcaaaaacctgggcacccaccgtgcatatacctttgacatatttaaatattccgttagaattgtataaattgtacccacactaacaccgatcctgatggataacgccttaactgtcaatcatcgatcgttttcaagtgcacctcgaacagacgtcacgacgtcattgctaattttcgactttcgtcccctcctcttatcatttccaatgaatcacgtccgtcggcaaatttcttattccgcctaaacactagttcacgttttactttatgtttgtacctatttccaacttttccgatgacgccatattttcatgcaaatatctatatcacagtcttcgaaaacgcggtttatgcttgtatttaaaatgcaaatgacgtcaaataaagcagttatgtaactattacgttacgtaacaatttatcggatttctaaagctattgggcaaccataattgcaactgtcgccgtgacaattgcaactatactaacggcgtgcgccgcatatgcgttactacggtaaatggaacgttcgttgctttggacgtatcatcctcgttgtgcatacaacttttgagaaaaatttaaaatggaaagcggtttgcatttatgtaagttttgttatcctgaggacgataataatatcattagagaaaaagtccgatttgtttttgaacgtccctcgtat
gi|3 : gcgaaggacattcaaACTTTATGTTTGTACCTA-TTTCCAACTTTTCCGATGACGCCATATTTTCATGCAAATATCTATATCACAGTCTTCGAAAACGCGGTTTATGCTTGTATTTAAAATGCAAATGACGTCAAATAAAGCAGTTATGTAACTAT-TACGTTACGTAACAATTTA--TCGGATT-TCTAAAGCTATTGGGCAAC-CATAATTGCAACTGTCGC--CGTGACAATTGCAAC-T---------ATACTAA-CGGCGTGCGCCGCATATGCGTTACTACGGTAAATGGAACGTTCGTTGCTTTGGACGTATCATCCTCGTTGTGCATACAACTTTTGAGAAAAATTTAAAA-TGGAAAGCGGTTTGCATTTATGTAAGTTTTGTTATCCTGAGGACGATAATAATATCATTAGAGAAAAAGTCCGATTTGTTTTTGAACGTCCCTCcacagtcttcgaaaacgcggtttatgcttgtatttaaaatgcaaatgacgtcaaataaagcagttatgtaactattacgttacgtaacaatttatcggatttctaaagctattgggcaaccataattgcaactgtcgccgtgacaattgcaactatactaacggcgtgcgccgcatatgcgttactacggtaaatggaacgttcgttgctttggacgtatcatcctcgttgtgcatacaacttttgagaaaaatttaaaatggaaagcggtttgcatttatgtaagttttgttatcctgaggacgataataatatcattagagaaaaagtccgatttgtttttgaacgtccctcgtat
gi|4 : gcgaaggacattcaaaaataaatcatgcaaaagaataaaaaatacattattgaaaaccttcatctttctgctacatgtaataaatatatttgataatgtgagaccattttacaatacaacagcacggtttaaaagcaggcacctaggtagacccggcgcacccagtggatattgataacgacgtctgtaacgtcaataacttgcttgtctttttttttttcattgtatgccacgcatttacgatgtcgttttacccacttatcgaaaatgtctatataccagtcctggtcgtaccatgcgataatatttgaagtttcagaacgtagttctgacggtgatgagaatcggcagtccttcaattgcgactgggaataggcctagggcaaaatcaaatggcgccaggtctggtggatacggcaggtggtcaactcgaccgaaaaccagccaatagatctctaactgtgttggtacagccgtatgtggcggtgcgttgtcctggtgttacaggtaatgctctagtggtatccctggtcgctttttttcatccgttattatcatcctgtctaggaattcatcaccgtcctttttgtattgcttaagattttttttaaatccttcacacgtcgctcttttccattatccttcaaaaacctgggcacccaccgtgcatatacctttgacatatttaaatattccgttagaattgtataaattgtacccacactaacaccgatcctgatggataacgccttaactgtcaatcatcgatcgttttcaagtgcacctcgaacagacgtcacgacgtcattgctaattttcgactttcgtcccctcctcttatcatttccaatgaatcacgtccgtcggcaaatttcttattccgcctaaacactagttcacgttttAGGGACATTCAAAAATAAATCAAGACTTTTTGTCTAGGAAAAATCT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--TACATCATTGAAAACCGGTATCTTTCTGTTACATGTTATAAAGACATTTGATAATATGAAACCATTTTACAATATAACAGTACAGTTCAAAAGCAGGCACATTG-----------CGCAC-CTAGTGGATAAATAT---GACATCGGTAACGTCAATAACTTGCTTGTCATTT-TTTTTGAAAATATTCTCCATTGTAT---GCCACGCATTTACGATGCCATTTTACCCACTTATCGGAAATGTCTCTAT--TAATCCTGGTCGTACTGTTTGATAATATTTGAAGTGGCAGAATGTA----------GTTCTGACAGTGATGAGAACCGGCG-CCCTTCAATTGCGATTTAATTACTGGAAATAGG------GCAAATTCAAATGGGGCCAGGTCT---GGTGAAGATGGTGGGTGGTCAACTCGGCCAAAACCAATTAAATCGATCTCAAACTACCATTATGTCGATGCAGCCTTATGTGGTGGTGCGTTGTCCTGGTGTCACAGGTAATGCTAGAGTGGTATCCATGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGAGTGTGCTAGGAATTCATAACCGTCTTTTTT-TTTTTATCGCTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTTCACACGTTGCTCTT-TTTCTTTATCCTTCAAAA-TTCTGAGCACCCATTACACATGTACCTTGGACATC-TTTAAAATAAATTAATGTTCCGTTAGAATTGTATAAATTGTTCCCACACTAACACCGATC----CTGATTGATAATACCATAACTGTCAATTGTCGATCTTTATCAAGTACATCTCAAACAGATGTCACAACGTCATTGCTAATATTCGACTTTCGTCCTCTCCCCTTATCATCTGCCAATAAATCTTGCCCGTCGGCAAACTTCTTATGACACCTAAACACTAGTCCACGTTTTACAAAACTGTTGCA-TGGTAC---TTTCTTCATTAACTTACATGTTTCCATTGGTGTTTT-TCC-AAGATCCACGCAAAATTTTATGTTTGT-CCTAATTTCTTACTTTTCCgtat
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gi|6 : aGGATGTTCAAAAATAA-------CTTTTTCTCTCTGAGGTTTGT--TATTC--TTCGCAAACTCGCAATGTAAAAGTTACATTATTGTGAGCAACTGTCTTTTAGCTACGT----TAA------CTGATAA-----AATCATTTT-CATGATGACAGAGTAGTTTAAAAGAAGta
gi|6 : TCATTTATTCTC-AAAGTAATCAGCATTATAT---GTCACACATTTATGATGTCCCTTGGTCCATTTGTTGAA--TGTCTCCATACAAATGCTGG----------------TATTTGCAGTGGCAGTA--TA--------TAGTTCTGACtaactaaagcgcacaatatcactgatcatttattctcaaagtaatcagcattatatgtcacacatttatgatgtcccttggtccatttgttgaatgtctccatacaaatgctggtatttgcagtggcagtatatagttctgaccaggat
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Alignments
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lowQualScore : . . .. ... . . ... . . . .... .... . . ..... . . . .. . . . . . ... . . ... . . . .......... . . . ...... . ... .. . . . . ...... . . .. . . . ........... .. .. . . ...... . . . . . . ................ . . . .... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . .. . . .. . ..... . . . ............. . . . . . . . .. . .
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Reference ( family-3907 ) : CGAGGGACGTTCAAAAATAAATCA-GACTTTTTCTCTAGGAAATATAT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--TACATCATTGAAAACCGTTATCTTTCTGCTACATGTAATAAAGACATTTGATAATGTGAGACCATTTTACAATATAACAGCACGGTTTAAAAGCAGGCACATCGGTAGACC-GG-CGCACACAGTGGATATACATAACGACGTCGGTAACGTCGATAACTTGCTTGTCATTT-TTTTT-AAAATATTCTCCATTGTAT---GCCACGCATTTACGATGCCGTTTTACCCACTTATCGAAAATGTCTCTATACCAATCCTGGTCGTACTGTGCGATAATATTTGAAGTGGCAGAACGTA--------TAGTTCTGACAGTGATGAGAACCGGCGGCCCTTCAATTGCGACTTAATTACTGGGAATAGG------GCAAAATCGAATGGCGCCAGGTCT---GGTGAATACGGCGGGTGGTCAACTCGGCCGAAACCNAGCAAATCGATCTCCAACTG------TGTCGATGCAGCCNTATGTGGCGGTGCGTTGTCCTGGTGTNACAGGTAATGCTCGAGTGGTATCCCTGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGCGTGTGCTAGGAATTCATAACCGTCTTTTTT-T----ATCGCTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTTCACACGTCGCTCTT-TTTCGTTATCCTTCAAAA-TCCTGGGCACCCATCGTGCATGTACCTTGGACATC-TTTAAA---------TGTTCCGTTAGAATTGTATAAATTGTTCCCGCACTAACACCGATC----CTGATGGATAATGCCTTAACTGTCAATCGTCGATCGTTATCAAGTGCATCTCGAACAGACGTCACGACGTCACTGCTAATNTTCGACTTTCGTCCTCTCCCCTTATCATCTTCCAATGAATCTCGTCCGTCGGCAAACTTCTTATNCCACCTAAACACTAGTTCACGTTTTACAAAACTGTTGCG-TGGTACTTTCTNCATCAACTTATATGTTTCCGTTGGCGCCATTCCAAGATCCACGCAAAACTTTATGTTTGT-CCTAATTTCCAACTTTTCCGATGACGCCATATTTCCATGCAAATATCTCTATCACAGTCTTCGAAAACGCGGTTTACGTTTGTATTTGAAATGCGAATGACGTCAAATTTAGNAGTTATGTTACTAC-GACGTTACGTTACAATTTG--GCGGATTATTTAAAGCTNTTGGACAAC-CATAGTTGCAATTGTCGCGGCGTTTTAAT----AC--T-TT-AAGGAATGTNAAACGACGTGCGCCGCATACGCGTTACTATGGTAAATGGAACGTTCGTTGCTTTGGACGTATCATCCTAGTTGCGCATAAAACTATTCAGAAAGTTTCAAAA-TGGAAAGCGGTTTACATTTATGTAAGTTTTGTTATCCTGAGGAAAATAATAATATCATTAGAGAAAAAGTCCGATTTATTTTTTAACGTCCCTC
gi|1 : CGAGGGACATTCAAAAATAAATCA-GACTTTTTCTCTAGGAAATATGT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--CACTTCATTGAAAACCGTTATCTTTCTGCTACATGAAATGAAGATATTTGATAATGTGAGACCATTTTACAATATAGTAGCACGGTTTAAAAGCAGGCACATCGGTAGAC------------AGTGGATACACATAACGACGTCGGTAACGTCAATTACTT-TTT----TTT-TTTTT-AAAATATTATCCATTGTAT---GCCACGCGTTCACGGTGCTGTTTTACCCACATATCGAAAATGTCTCTATAACAATCCTGGTCGTACTGTGCGATAATATTTGAAGTGGCAGAACGTAGCAGAACGTAGTTCTGACAGTGATGAGAACCAGCGGCCCTTCAATTGCGACTTAATTTCTGGGAATAGG------GCAAAATTGAATGGCGCCAGGTCTTCTGGTGAATACGATGGGTCGTCAACTCAGCTGAAACCAGGCAAATCGATCTCCAACTG------TGTCGATGTAGCCGTATGT-------------CCTGGTGTAATAGGTAATGCTCGAGTGGTATCCCTGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGCGTTTGCTAGGAATTCATAACCGTCATTTTT------ATCACTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTCCTCATGTCGCTCTT-TTTCGTTATCCTTCAAAA-TCCTGGGCATCCATCGTGCATGTACTTTGGAAATCCTTTAAA---------T-------TA--ATTGTATAAATTGTTCCCACACTCACACCAATC----CTAATGAATAATGCCTTAAGTGTCAATCGTCGATCGAAATCAAATGCATCTCGAACAAACGTCAGGACGTCACTGCTAATTTTCGACTTTTGTCTTCTCTCCTTATCATCTTCCAATGAATCTCGTCCGTCGGCAAACTTCTTATGCCACGTTAACACTAGTTCACGTTTTACAAAACTGTTGCG-TGGTACTTTCTGCATCAACTTATATGTTTCCGTTGGCGTCATTCCAAGATCCACGCAAAACTTTATGTTTAA-CCTAATTTCCAACTTTTCCGATGACGCCATATTTCCATGCAAATATCTCTATCACAGTCTTCGTGAACGCAGTTAACGTTTGTATTTGAAGTGAAAATGACGTCAAATTTAGCAGTTATGTTACTAT-GACGTTACGTTACAATTTA--ACGGATTA-TTAAAGCTTTTGGACAAC-CATAGTTGCAATTATCACGGCGTTTTAAT----ACG-T-TTAAAGGAATGTTAAACGACGGGCGCCGCATACGCGTTAAAATGGCAAATGGAATGTTCGTTGCTTTGGACGTATCATCCTAGTTGCGCATAAAACTATTCAGAAAGTTTCAAAA-TGGAAAGCGTTTTACATTTGTGAAAGTTTTATAATCCTGAGGAAAATAATAATATCATAAGAGAAAAAGTCGGATATATTTTTTAACGTTCCTC
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gi|15 : A-TGAAAAGCGGTTTTCATTTATATCAGTTTTGATCTCCTGAGGAAAGTCATAATCTCAAAAGAGAAAAA----AACTTA-TTTTTAACGTCCCTCgta
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gi|17 : accCCTGAGGAAAACC------TCAATAGAGAAAAATTCTGATTCTTTTTTTAACGTCCCTC
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gi|18 : CGAGGGACGTTCAAAAATAAATCG-GAATTTTTCgtatat
gi|19 : aaaaaatgatttaagtaatATAATATCATTAAAGAAAAAGGCCGATTTATTTTTCAACGTCtatat
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gi|3 : gcgaaggacattcaaACTTTATGTTTGTACCTA-TTTCCAACTTTTCCGATGACGCCATATTTTCATGCAAATATCTATATCACAGTCTTCGAAAACGCGGTTTATGCTTGTATTTAAAATGCAAATGACGTCAAATAAAGCAGTTATGTAACTAT-TACGTTACGTAACAATTTA--TCGGATT-TCTAAAGCTATTGGGCAAC-CATAATTGCAACTGTCGC--CGTGACAATTGCAAC--T---------ATACTAA-CGGCGTGCGCCGCATATGCGTTACTACGGTAAATGGAACGTTCGTTGCTTTGGACGTATCATCCTCGTTGTGCATACAACTTTTGAGAAAAATTTAAAA-TGGAAAGCGGTTTGCATTTATGTAAGTTTTGTTATCCTGAGGACGATAATAATATCATTAGAGAAAAAGTCCGATTTGTTTTTGAACGTCCCTCcacagtcttcgaaaacgcggtttatgcttgtatttaaaatgcaaatgacgtcaaataaagcagttatgtaactattacgttacgtaacaatttatcggatttctaaagctattgggcaaccataattgcaactgtcgccgtgacaattgcaactatactaacggcgtgcgccgcatatgcgttactacggtaaatggaacgttcgttgctttggacgtatcatcctcgttgtgcatacaacttttgagaaaaatttaaaatggaaagcggtttgcatttatgtaagttttgttatcctgaggacgataataatatcattagagaaaaagtccgatttgtttttgaacgtccctcgtat
gi|4 : gcgaaggacattcaaaaataaatcatgcaaaagaataaaaaatacattattgaaaaccttcatctttctgctacatgtaataaatatatttgataatgtgagaccattttacaatacaacagcacggtttaaaagcaggcacctaggtagacccggcgcacccagtggatattgataacgacgtctgtaacgtcaataacttgcttgtctttttttttttcattgtatgccacgcatttacgatgtcgttttacccacttatcgaaaatgtctatataccagtcctggtcgtaccatgcgataatatttgaagtttcagaacgtagttctgacggtgatgagaatcggcagtccttcaattgcgactgggaataggcctagggcaaaatcaaatggcgccaggtctggtggatacggcaggtggtcaactcgaccgaaaaccagccaatagatctctaactgtgttggtacagccgtatgtggcggtgcgttgtcctggtgttacaggtaatgctctagtggtatccctggtcgctttttttcatccgttattatcatcctgtctaggaattcatcaccgtcctttttgtattgcttaagattttttttaaatccttcacacgtcgctcttttccattatccttcaaaaacctgggcacccaccgtgcatatacctttgacatatttaaatattccgttagaattgtataaattgtacccacactaacaccgatcctgatggataacgccttaactgtcaatcatcgatcgttttcaagtgcacctcgaacagacgtcacgacgtcattgctaattttcgactttcgtcccctcctcttatcatttccaatgaatcacgtccgtcggcaaatttcttattccgcctaaacactagttcacgttttAGGGACATTCAAAAATAAATCAAGACTTTTTGTCTAGGAAAAATCT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--TACATCATTGAAAACCGGTATCTTTCTGTTACATGTTATAAAGACATTTGATAATATGAAACCATTTTACAATATAACAGTACAGTTCAAAAGCAGGCACATTG-----------CGCACCTAGTGGATAAATAT---GACATCGGTAACGTCAATAACTTGCTTGTCATTT-TTTTTGAAAATATTCTCCATTGTAT---GCCACGCATTTACGATGCCATTTTACCCACTTATCGGAAATGTCTCTAT--TAATCCTGGTCGTACTGTTTGATAATATTTGAAGTGGCAGAATGTA----------GTTCTGACAGTGATGAGAACCGGCG-CCCTTCAATTGCGATTTAATTACTGGAAATAGG------GCAAATTCAAATGGGGCCAGGTCT---GGTGAAGATGGTGGGTGGTCAACTCGGCCAAAACCAATTAAATCGATCTCAAACTACCATTATGTCGATGCAGCCTTATGTGGTGGTGCGTTGTCCTGGTGTCACAGGTAATGCTAGAGTGGTATCCATGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGAGTGTGCTAGGAATTCATAACCGTCTTTTTT-TTTTTATCGCTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTTCACACGTTGCTCTT-TTTCTTTATCCTTCAAAA-TTCTGAGCACCCATTACACATGTACCTTGGACATC-TTTAAAATAAATTAATGTTCCGTTAGAATTGTATAAATTGTTCCCACACTAACACCGATC----CTGATTGATAATACCATAACTGTCAATTGTCGATCTTTATCAAGTACATCTCAAACAGATGTCACAACGTCATTGCTAATATTCGACTTTCGTCCTCTCCCCTTATCATCTGCCAATAAATCTTGCCCGTCGGCAAACTTCTTATGACACCTAAACACTAGTCCACGTTTTACAAAACTGTTGCA-TGGTACTTTCTTCATTAACTTACATGTTTCCATTGGTGTTTTTCCAAGATCCACGCAAAATTTTATGTTTGT-CCTAATTTCTTACTTTTCCgtat
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Alignments
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Reference ( family-3907 ) : CGAGGGACGTTCAAAAATAAATCA-GACTTTTTCTCTAGGAAATATAT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--TACATCATTGAAAACCGTTATCTTTCTGCTACATGTAATAAAGACATTTGATAATGTGAGACCATTTTACAATATAACAGCACGGTTTAAAAGCAGGCACATCGGTAGACC-GG-CGCACNCAGTGGATATACATAACGACGTCGGTAACGTCGATAACTTGCTTGTCATTT-TTTTT-AAAATATTCTCCATTGTAT---GCCACGCATTTACGATGCCGTTTTACCCACTTATCGAAAATGTCTCTATACCAATCCTGGTCGTACTGTGCGATAATATTTGAAGTGGCAGAACGTA--------TAGTTCTGACAGTGATGAGAACCGGCGGCCCTTCAATTGCGACTTAATTACTGGGAATAGG------GCAAAATCGAATGGCGCCAGGTCT---GGTGAATACGGCGGGTGGTCAACTCGGCCGAAACCNAGCAAATCGATCTCCAACTG------TGTCGATGCAGCCNTATGTGGCGGTGCGTTGTCCTGGTGTNACAGGTAATGCTCGAGTGGTATCCCTGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGCGTGTGCTAGGAATTCATAACCGTCTTTTTT-T----ATCGCTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTTCACACGTCGCTCTT-TTTCGTTATCCTTCAAAA-TCCTGGGCACCCATCGTGCATGTACCTTGGACATC-TTTAAA---------TGTTCCGTTAGAATTGTATAAATTGTTCCCGCACTAACACCGATC----CTGATGGATAATGCCTTAACTGTCAATCGTCGATCGTTATCAAGTGCATCTCGAACAGACGTCACGACGTCACTGCTAATNTTCGACTTTCGTCCTCTCCCCTTATCATCTTCCAATGAATCTCGTCCGTCGGCAAACTTCTTATNCCACCTAAACACTAGTTCACGTTTTACAAAACTGTTGCG-TGGTACTTTCTNCATCAACTTATATGTTTCCGTTGGCGCCNTTCCAAGATCCACGCAAAACTTTATGTTTGT-CCTAATTTCCAACTTTTCCGATGACGCCATATTTCCATGCAAATATCTCTATCACAGTCTTCGAAAACGCGGTTTACGTTTGTATTTGAAATGCGAATGACGTCAAATTTAGNAGTTATGTTACTAC-GACGTTACGTTACAATTTG--GCGGATTATTTAAAGCTNTTGGACAAC-CATAGTTGCAATTGTCGCGGCGTTTTAAT----AC--T-TT-AAGGAATGTNAAACGACGTGCGCCGCATACGCGTTACTATGGTAAATGGAACGTTCGTTGCTTTGGACGTATCATCCTAGTTGCGCATAAAACTATTCAGAAAGTTTCAAAA-TGGAAAGCGGTTTACATTTATGTAAGTTTTGTTATCCTGAGGAAAATAATAATATCATTAGAGAAAAAGTCCGATTTATTTTTTAACGTCCCTC
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gi|18 : CGAGGGACGTTCAAAAATAAATCG-GAATTTTTCgtatat
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Reference ( family-3907 ) : CGAGGGACGTTCAAAAATAAATCA-GACTTTTTCTCTAGGAAATATAT--TATTCCATTC---AA-TAG-AATAAAAAA--TACATCATTGAAAACCGTTATCTTTCTGCTACATGTAATAAAGACATTTGATAATGTGAGACCATTTTACAATATAACAGCACGGTTTAAAAGCAGGCACATCGGTAGACCCGGCGCACNCAGTGGATATACATAACGACGTCGGTAACGTCGATAACTTGCTTGTCATTT-TTTTT-AAAATATTCTCCATTG---TATGCCACGCATTTACGATGCCGTTTTACCCACTTATCGAAAATGTCTCTATACCAATCCTGGTCGTACTGTGCGATAATATTTGAAGTGGCAGAACG----------TAGTTCTGACAGTGATGAGAACCGGCGGCCCTTCAATTGCGACTTAATTACTGGGAATAGG------GCAAAATCGAATGGCGCCAGGTCT---GGTGAATACGGCGGGTGGTCAACTCGGCCGAAACCNAGCAAATCGATCTCCAACTG------TGTCGATGCAGCCNTATGTGGCGGTGCGTTGTCCTGGTGTNACAGGTAATGCTCGAGTGGTATCCCTGGTCGCTTTTT-----CC----TTA--ATGCGTGTGCTAGGAATTCATAACCGTCTTTTTT-T----ATCGCTTAAGAATTTCTTTAGAATCCTTCACACGTCGCTCTT-TTTCGTTATCCTTCAAAA-TCCTGGGCACCCATCGTGCATGTACCTTGGACATC-TTTAAA---------TGTTCNGTTAGAATTGTATAAATTGTTCCCGCACTAACACCGATC----CTGATGGATAATGCCTTAACTGTCAATCGTCGATCGTTATCAAGTGCATCTCGAACAGACGTCACGACGTCACTGCTAATNTTCGACTTTCGTCCTCTCCCCTTATCATCTTCCAATGAATCTCGTCCGTCGGCAAACTTCTTATNCCACCTAAACACTAGTTCACGTTTTACAAAACTGTTGCG-TGGTACTTTCTNCATCAACTTATATGTTTCCGTTGGCGCCNTTCCAAGATCCACGCAAAACTTTATGTTTGT-CCTAATTTCCAACTTTTCCGATGACGCCATATTTCCATGCAAATATCTCTATCACAGTCTTCGAAAACGCGGTTTACGTTTGTATTTGAAATGCGAATGACGTCAAATTTAGNAGTTATGTTACTAC-GACGTTACGTTACAATTTG--GCGGATTATTTAAAGCTNTTGGACAAC-CATAGTTGCAATTGTCGCGGCGTTTTAAT----AC--T-TT-AAGGAATGTNAAACGACGTGCGCCGCATACGCGTTACTATGGTAAATGGAACGTTCGTTGCTTTGGACGTATCATCCTAGTTGCGCATAAAACTATTCAGAAAGTTTCAAAA-TGGAAAGCGGTTTACATTTATGTAAGTTTTGTTATCCTGAGGAAAATAATAATATCATTAGAGAAAAAGTCCGATTTATTTTTTAACGTCCCTC
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gi|16 : AGGGATGTTAGAAAATAAATCA-GACGTTTTCTGTAGGAAACCTAT--TAATCCATGC---AA-AAG-AATAAAA------------T-AAAAC--TTATCTTTCTGCTTCATgta
gi|17 : accCCTGAGGAAAACC------TCAATAGAGAAAAATTCTGATTCTTTTTTTAACGTCCCTC
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