lowQualScore : 1 1 111 444444444444444444444444444 111111 22222222222222222 3333333333333 111111111111 5555555555555555 11 11 1 1111 1 111 111111 1 11 111111 1 222
lowQualScore : 6 7 9 5 5 4 888 55 4 111111111111111111111111111 111111 88888888888888888 4444444444444 4 777777777777 4 0000000000000000 5 888 3 88 3 2222 0 44 5 0 0 5 0 3333 3 5 1 99 1 000 5 1 6 5 77 222222 5 6 6 3 33 9 6 6 5 555555 0 0 7 55 4 999
lowQualScore : . . . . . . ... .. . ........................... ...... ................. ............. . ............ . ................ . ... . .. . .... . .. . . . . . .... . . . .. . ... . . . . .. ...... . . . . .. . . . . ...... . . . .. . ...
lowQualScore : 0 0 0 3 9 0 333 55 0 222222222222222222222222222 555555 00000000000000000 5555555555555 0 555555555555 0 9999999999999999 1 888 2 11 4 2222 2 55 0 8 7 4 1 9999 0 0 4 33 4 000 7 4 0 4 11 999999 0 0 0 5 11 8 0 0 0 444444 4 2 0 55 0 555
consensus : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAA--NTATATAT-T-T--TTT-A------TTTATT------TATTTT-----------------TGTCGTGAGA--TG---T-TNT-T-ATCT-A----TATCANTT-ATCTTTTA-ATATT------ATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGGTT-TTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGGCCTGACCGTCATA--TTTATGGCGTGTTGAACTTTTCTTCT---CTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCAC-AAAA-TG--TGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACAC-AGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTNNTGTNATATGATAACAATA
Reference ( gi|3 ) : TTACCATAACAGTATCAGAGTGTTCTGTTTTGATTTACTTAAATA-TAGCCTG--TGT-TAA--AAATATAT-T-T-GTCT-A------TTTATT------TGTTTT-----------------TGTCGTGAGA--T----T-TCT-T-ATCT-A----TATCAGTT-ATCTTTAA-ATAAT------AATATATCAATACAAATATCC---TTTCAACAAAGTTCATCAGCAGTGTCTGTT-TTCAAATATTCGTATACATTGGAAATTATACTCCTGACCTGACCGTCATA--TATATGGCGTGCTGAACTTTTGTTCT---CTTTTGACA-TGGCTGTTCCGATAAAACCTAC-AAAC-TA--TGGCGTGTATATAGATTTTAGTCATTTAATACATGGTAAGTGCACGACCTACGC-ATGAATATTGTGCTTTCATTGTCCCAAATAAGTAGTGTAATATAATAATAATA
gi|17 : TTGCCATAACAGTATAAGTGTGTACTGTTTTAATTTACTTTAATC-TA
gi|5 : tagtTGCCATAATAGTATTATAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATTTTG--TGT-TGATTATACATAT-T-T-TTTTTA------TTGATC------TATTTT-----------------TGTCGTGAGA--TGTTTT-TTT-T-ATCT-A----TATCATTT-ATCTTTTTTATATT------ATTATGTCAATATAAAAATCC---TTTTAACAAATTCCTTCATCAATGTCGATT-TTAAAATACCAGTTTACATTGGACAGTATGTTCCTGACCCGACCGCCATA--TTTATGACATGTTG---TTTTTTTTT---CTTTTGAGA-TTGTTGTTTCGATAAAACCTAC---AC-TATGTGGAGAGTATGTAGGTCCTAGTCATTTTATACATAATA
gi|12 : TGCCATAACAGTATCGATGTGTACTGTTTT-ATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAA-----------------CT-A------TATATT------TATTTT-----------------TGTTGTGAAATGT----T-TCA-T-ATCT-A----TATCATTT-ATCTTTTA-ATATT------ATTATGTTAATACAAATAT
gi|8 : CCGTTATAGTATCAGAGTGTAATGTTTTAATTTAGTTTTATA-TATCTTG--TGT-TAA--t
gi|9 : gCCATTACAGTATCAGAATGTACTGTTTTGATTTATTTTAATA-TATCATG--TGC-TAATTATATATAT-TTT-ATTT-ATTAATTTTTGTTGTGAGATGTTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N----N-NNN-N-NNNN-N----NNNCAATTTATTTTTTA-ATATT------ATTATGTCAATACAAATATTC---TTTCAACAAATTTCATAAGCAGTGTCGGTttatttttaatgttattttcccattatttcaaaacaaatgtcctttaaacaaatttcatcagcagtgtcgactttaaaacaatcgtatacattggaaattatactcatgaccccatcatattcatgtcgtgtcgaacttgttttctctattgacatgatagtttcgataaaacccacaacatatggagtatatgtaggtactagtcattt
gi|13 : CCATAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTCATTTGTTTTAATA-TATATTG--TGT-CAA--ATATATAT-A-T--TTT-G------TTCATT------TATTTT-----------------TGTCCTGAGA---------TGT-T-ATCA-ATTGTTATAAATT-ATCa
gi|6 : CATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATCAGTTTTAATA-TATTTTG--TGT-TAA--TTATATAT-T-TTGT-T-A------TGTATC------TATTTT-----------------T-TCGTGATA--TGTT-T-TCT-TTATCT-A----TATCATTT-ACATTTTA-ATATC------ATCATTTCAATACAAATATCT---TTTCAACAAATCCCATCAGCAGTGTCGGTT-TTGCAATATTCGTATACATTGGAAATTATGATCTTGGCCTGACCATCATATTTATGTGGCGTGTTGAAA---TGTTTTAACCTTTTGACA-TGGTTGTTTCAATAAAACGCAC-AAAT-TG--TGGAGTGTATa
gi|4 : TAACAGTATCAGATTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTAATTATATAA--TTATATAT-T-T----T-A------TTTATT------TAATTG-----------------TGTCGCGAGA--T----G-T-T-T-ATCT-A-----ATCATTG-ATCTTTTA-ATATC------ATTATGTCAATACT--TGTCC---TTTCAACAAATTTCAACAGTAGTGTCGGTT-TTGAAATATTCGTTTACATTTGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATA--T----------------TTTTTTTCT---CTTTTGAAA-TGGTTGTTTCAATAAAACCCACAAAACGTG--TGGAGTTTATGTAGGTTTTAATAATTTTATACACAGTAAGTGCACGACTTACACAATG-ATCTCGTGCGTTCATTATCg
gi|1 : AACAGTATCAAAGTGTACTGTTTTAATTTATTTGACTAATATCTTG--TGT-TCA--A--TACAT-T-T-TTTA-A------TTTTTT------TGTTTT-----------------TGTCGTGAGG--TGTA-T-TTT-T-ATCT-A----T--------ATC----------------------ATTGCTACCAGTATCC---CTTT-------TTCATT-------TTTGCCCTTGAAATATTCGTATACATTTGAAATTATTCTCCTTATCTGACCGTCATA--TTTATGGCGTGCTGAA-TTTTCTTCT---CTTTTGGCATTGGCTGTTTCGATAACATCCAC-CAAA-TG--TGAAGTGTATGTAGGTTCTTGTCATTTTATACATAGCAAGTGCACGACTTTCAC-AAGTATCTCATGCTTTCATTACTTCAAACTAGTATTGTTATATGAT-ACAATA
gi|11 : tcctgcATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAA--TTATATATGT-T-TTTT-A------TTTATC------TGTTTT-----------------TGTCGTGAGA--TG---TGTGT-T-ATAT-A----TATCA-TC-ATCTTTTA-ATCTT------ATTATGTAAATACAAATAT-T---TTTCAACAA--TTT-TCAGAAAAGTTATTT-TTTAAATACTtatctccgtttttatctccttattttttattttatatatcctcatatttaataaaacattgcaagtaattttccccccaaacgttgatttttacaaaattacgtatttggttttaagtgaagaacgatttatgtatttgccttttta
gi|7 : TG--TGT-TTA--CTATATAA-T-T--TTT-A------TTTATA------AATTTT-----------------TGTCATGAGT--T----T-T------TCT------------TT-ATCTGTA---TGAT--------TGCA-----ACCAGTATCCCATTTTC-------TTTCT------TGCCC----TTCAAATATTCGTATACATTGGAAATAATGCTCCTGGCCTGAC--TCATA--CTTATGGCTTGTTGAACTTTCCTTCT---TTTTTGACA-TGGCTGTTTCGATAAATCCCAC-AAAA-TG--TGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACAT----AGTGCATAACTTACAC-AGGTATCTTGTGCTTTCATTGTCCCAAtta
gi|8 : a------TGTTTT-----------------AAT--TTAGT--T----T-TATAT-ATCTTG----TGTTAATT-ATTTTTAATGTTATTTTCCCATTATTTCAAAACAAATGTCC---TTTAAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGACT-TTAAAACAATCGTATACATTGGAAATTATACTCATGACC---CCATCATA--TTCATGTCGTGTCGAACTTGTTTTCT---CTATTGACA-TGATAGTTTCGATAAAACCCAC-AACA-TA--TGGAGTATATGTAGGTACTAGTCATTT
gi|2 : gccgttatagtatcagagtgtaa-TTGAAATATTCGTAGACATTTGATAATATGCTCCTGGCCTGGCCGTCATA--TACATGCTGTGTTGAACGTTTCTTCT---CTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCAAC-AAAA-TG--TGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACTTAGTAAATGCATGACTTACAC-AAGGATCTTGTAATTTTATTGTCTAAAATTAGTCGTGTAATATAATAA-AATA
gi|16 : tgctaccagtatcccagtttttttctcgcccATTTTATACATAGTAAGTGCATGACTTACAC-AAGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAatcttctggttttagtattcacgtcctcatatgtacgtgtgcatatgaataaaacattgtaagtaaatttcctccccgaacgttgattttaacaaaaaaatcgttgaatttattaattatgtatttgttttaacggacaatagtataacacaattaatagtatatatcaaaacactctgatactataatagcaaat
gi|14 : taATTTTATACCTAGCAAGTGTACGACTGACAC-AGGGAACTCGTGCATTTATTGTCCCAAA
gi|15 : taTTTA-TACATAATTAGTGCACGATTTACAC-AGCAATCTTGTGCTTTCATTGTCCTAAATgtcat
gi|10 : agTTTA-TACCTAGTTAGTGCACGACTTACAC-AGGAATCTCGTGCGTTCATTGTAACAAATttat
Alignments
lowQualScore : 1111 111 1
lowQualScore : 3 55 3 1 1 2222 3 44 2 88 4 000 777 777 7 1 0 555 0 777 0 1 2 1 0 3 1 3 66 1 0 5 1 5 66 0 22 1 0 7 2
lowQualScore : . .. . . . .... . .. . .. . ... ... ... . . . ... . ... . . . . . . . . .. . . . . . .. . .. . . . .
lowQualScore : 6 00 6 4 0 7777 6 88 4 66 5 000 000 000 1 2 7 666 7 888 1 8 0 1 1 2 9 6 99 4 1 6 1 0 99 9 00 0 7 3 0
consensus : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTATTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTA-TATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATATAATAACAATA
Reference ( family-3849 ) : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAANTATATAT----TT-T-TTATTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TNT---T---ATCTA-TATCANTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGGTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGGCCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTNNTGTNATATGATAACAATA
gi|1 : AACAGTATCAAAGTGTACTGTTTTAATTTATTTGACTAATATCTTG--TGT-TCAATACAT-T----TT-T-TAATTTTTTTGTTTTTGTCGTGAGGTGTATTTT---T---ATCTA-TATCATT--------------------GC---TACCAGTATCC---CTT-------TTTCAT------TTTTGCCCTTGAAATATTCGTATACATTTGAAATTATTCTCCTTATCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGCTGAA-TTTTCTTCTCTTTTGGCATTGGCTGTTTCGATAACATCCACCAAA--TGTGAAGTGTATGTAGGTTCTTGTCATTTTATACATAGCAAGTGCACGACTTTCACAAGTATCTCATGCTTTCATTACTTCAAACTAGTATTGTTATATGAT-ACAATA
gi|10 : tcctgcTTTATACCTAGTTAGTGCACGACTTACACAGGAATCTCGTGCGTTCATTGTAACAAATTtatctccgtttttatctccttattttttattttatatatcctcatatttaataaaacattgcaagtaattttccccccaaacgttgatttttacaaaattacgtatttggttttaagtgaagaacgatttatgtatttgccttttta
gi|11 : ATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATATGT--TT-T-TTATTTATCTGTTTTTGTCGTGAGATGTG-TGT---T---ATATA-TATCA-TCATCTTTTA-ATCTTATTATGTAAATACAAATAT-T---TTTCAAC-AATTT--TCAGAAAAGTTATTTTTTAAATACTtataatactattaaacacccccagaacacagtaagttctatctgaaacaaatggcgaagttccactataacgtgttaaattgtttcgcgacaccgtttcatcatccatgtttttgttttaaaagtttgcgcag
gi|12 : TGCCATAACAGTATCGATGTGTACTGTTTTA-TTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAACTATATAT----TT-------------ATTTTTGTTGTGAAATGT--TTCA--T---ATCTA-TATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTTAATACAAATATtta
gi|13 : CCATAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTCATTTGTTTTAATA-TATATTG--TGT-CAAATATATAT----AT-T-TTGTTCATTTATTTTTGTCCTGAGATGT--TAT---C---AATTGTTATAAATTATCt
gi|14 : ATTTTATACCTAGCAAGTGTACGACTGACACAGGGAACTCGTGCATTTATTGTCCCAAAa
gi|15 : taTTTATACATAATTAGTGCACGATTTACACAGCAATCTTGTGCTTTCATTGTCCTAAATTgtcat
gi|16 : agATTTTATACATAGTAAGTGCATGACTTACACAAGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAtat
gi|17 : taTTGCCATAACAGTATAAGTGTGTACTGTTTTAATTTACTTTAATC-TA
gi|2 : tagtTCGCCCTTGAAATATTCGTAGACATTTGATAATATGCTCCTGGCCTGGCCGTCATATACA--TGCTGTGTTGAACGTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCAACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACTTAGTAAATGCATGACTTACACAAGGATCTTGTAATTTTATTGTCTAAAATTAGTCGTGTAATATAATAA-AATA
gi|3 : tgctaccagtatcccagtttttttcTTACCATAACAGTATCAGAGTGTTCTGTTTTGATTTACTTAAATA-TAGCCTG--TGT-TAAAAATATAT----TTGT-CTATTTATTTGTTTTTGTCGTGAGAT-T--TCT---T---ATCTA-TATCAGTTATCTTTAA-ATAATAATATATCAATACAAATATCC---TTTCAACAAAGTTCATCAGCAGTGTCTGTTTTCAAATATTCGTATACATTGGAAATTATACTCCTGACCTGACCGTCATATATA--TGGCGTGCTGAACTTTTGTTCTCTTTTGACA-TGGCTGTTCCGATAAAACCTACAAAC--TATGGCGTGTATATAGATTTTAGTCATTTAATACATGGTAAGTGCACGACCTACGCATGAATATTGTGCTTTCATTGTCCCAAATAAGTAGTGTAATATAATAATAATAatcttctggttttagtattcacgtcctcatatgtacgtgtgcatatgaataaaacattgtaagtaaatttcctccccgaacgttgattttaacaaaaaaatcgttgaatttattaattatgtatttgttttaacggacaatagtataacacaattaatagtatatatcaaaacactctgatactataatagcaaat
gi|4 : TAACAGTATCAGATTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTAATTATATAATTATATAT----TT-T---ATTTATTTAATTGTGTCGCGAGATGT--T-----T---ATCTA--ATCATTGATCTTTTA-ATATCATTATGTCAATACT--TGTCC---TTTCAACAAATTTCAACAGTAGTGTCGGTTTTGAAATATTCGTTTACATTTGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATAT------------------TTTTTTTCTCTTTTGAAA-TGGTTGTTTCAATAAAACCCACAAAACGTGTGGAGTTTATGTAGGTTTTAATAATTTTATACACAGTAAGTGCACGACTTACACAATGATCTCGTGCGTTCATTATC
gi|5 : TGCCATAATAGTATTATAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATTTTG--TGT-TGATTATACATATTTTT-T-TTATTGATCTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---TTTTATCTA-TATCATTTATCTTTTTTATATTATTATGTCAATATAAAAATCC---TTTTAACAAATTCCTTCATCAATGTCGATTTTAAAATACCAGTTTACATTGGACAGTATGTTCCTGACCCGACCGCCATATTTA--TGACATGTTG---TTTTTTTTTCTTTTGAGA-TTGTTGTTTCGATAAAACCTACACTA--TGTGGAGAGTATGTAGGTCCTAGTCATTTTATACATAATA
gi|6 : CATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATCAGTTTTAATA-TATTTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-TGTTATGTATCTATTTTT-TCGTGATATGT--TTTCTTT---ATCTA-TATCATTTACATTTTA-ATATCATCATTTCAATACAAATATCT---TTTCAACAAATCCCATCAGCAGTGTCGGTTTTGCAATATTCGTATACATTGGAAATTATGATCTTGGCCTGACCATCATATTTATGTGGCGTGTTGAAATGTTTTAACCTTTTGACA-TGGTTGTTTCAATAAAACGCACAAAT--TGTGGAGTGTATG
gi|7 : TG--TGT-TTACTATATAA----TT-T-TTATTTATAAATTTTTGTCATGAG------TTT---T----TCT--------TTATCT-----GTATGATTG---CAA--CCAGTATCCCATTTTC------TTTC----------TTGCCCTTCAAATATTCGTATACATTGGAAATAATGCTCCTGGCCTGAC--TCATACTTA--TGGCTTGTTGAACTTTCCTTCTTTTTTGACA-TGGCTGTTTCGATAAATCCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACAT----AGTGCATAACTTACACAGGTATCTTGTGCTTTCATTGTCCCAA
gi|8 : aGCCGTTATAGTATCAGAGTGTAATGTT----------TTAATT-TA--------GT-T--TTATATAT----CT-T-GTGTTAATT-ATTTTTA-------ATGT--TAT---T---TTCC--------------------CATTATT---TCAAAACAAATGTCC---TTTAAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGACTTTAAAACAATCGTATACATTGGAAATTATACTCATGACC---CCATCATATTCA--TGTCGTGTCGAACTTGTTTTCTCTATTGACA-TGATAGTTTCGATAAAACCCACAACA--TATGGAGTATATGTAGGTACTAGTCATTT
gi|9 : CCATTACAGTATCAGAATGTACTGTTTTGATTTATTTTAATA-TATCATG--TGC-TAATTATATAT----AT-T-TTATTTATTAATTTTTGTTGTGAGATGT--TTT---
gi|9 : ATTTATTTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATTC---TTTCAACAAATTTCATAAGCAGTGTCGGTacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatttattttttaatattattatgtcaatacaaatattctttcaacaaatttcataagcagtgtcggta
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111 1 1
lowQualScore : 3 55 3 1 2 2222 3 44 3 0 88 5555555 1 6666 0 777 0 1 2 1 0 1 1 3 66 1 0 5 1 5 66 0 3 55 0 3 2
lowQualScore : . .. . . . .... . .. . . .. ....... . .... . ... . . . . . . . . .. . . . . . .. . . .. . . .
lowQualScore : 6 00 6 4 9 7777 6 88 6 2 66 1111111 8 3333 7 888 1 8 0 1 1 0 9 6 99 4 1 6 1 0 99 9 2 55 0 2 0
consensus : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTA-TTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATA-TAATAACAATA
Reference ( family-3849 ) : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTA-TTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATA-TAATAACAATA
gi|1 : AACAGTATCAAAGTGTACTGTTTTAATTTATTTGACTAATATCTTG--TGT-TCA--ATACAT----TT-T-TTAATTTTTTTGTTTTTGTCGTGAGGTGTATTTT---T---ATCTATATCATT--------------------GC---TACCAGTATCC---CTT-------TTTCAT------TTTTGCCCTTGAAATATTCGTATACATTTGAAATTATTCTCCTTATCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGCTGAA-TTTTCTTCTCTTTTGGCATTGGCTGTTTCGATAACATCCACCAAA--TGTGAAGTGTATGTAGGTTCTTGTCATTTTATACATAGCAAGTGCACGACTTTCACAAGTATCTCATGCTTTCATTACTTCAAACTAGTATTGTTATA-TGAT-ACAATA
gi|10 : tcctgcTTTATACCTAGTTAGTGCACGACTTACACAGGAATCTCGTGCGTTCATTGTAACAAATT-----TATAATACTATTAAtatctccgtttttatctccttattttttattttatatatcctcatatttaataaaacattgcaagtaattttccccccaaacgttgatttttacaaaattacgtatttggttttaagtgaagaacgatttatgtatttgccttttta
gi|11 : ATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATATGT--TT-T-TTA-TTTATCTGTTTTTGTCGTGAGATGTG-TGT---T---ATATATATCA-TCATCTTTTA-ATCTTATTATGTAAATACAAATAT-T---TTTCAAC-AATTT--TCAGAAAAGTTATTTTTTAAATACTacacccccagaacacagtaagttctatctgaaacaaatggcgaagttccactataacgtgttaaattgtttcgcgacaccgtttcatcatccatgtttttgttttaaaagtttgcgcag
gi|12 : TGCCATAACAGTATCGATGTGTACTGTTTTA-TTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAACTATA------------------TATTTATTTTTGTTGTGAAATGT--TTCA--T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTTAATACAAATATtta
gi|13 : CCATAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTCATTTGTTTTAATA-TATATTG--TGT-CAAATATATAT----AT-T-TTG-TTCATTTATTTTTGTCCTGAGATGT--Tt
gi|14 : ATTTTATACCTAGCAAGTGTACGACTGACACAGGGAACTCGTGCATTTATTGTCCCAAAatcaattgttataaattatca
gi|15 : taTTTATACATAATTAGTGCACGATTTACACAGCAATCTTGTGCTTTCATTGTCCTAAATTgtcat
gi|16 : agATTTTATACATAGTAAGTGCATGACTTACACAAGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAtat
gi|17 : taTTGCCATAACAGTATAAGTGTGTACTGTTTTAATTTACTTTAATC-TA
gi|2 : tagtTCGCCCTTGAAATATTCGTAGACATTTGATAATATGCTCCTGGCCTGGCCGTCATATACA--TGCTGTGTTGAACGTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCAACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACTTAGTAAATGCATGACTTACACAAGGATCTTGTAATTTTATTGTCTAAAATTAGTCGTGTAATA-TAATAA-AATA
gi|3 : tgctaccagtatcccagtttttttcTTACCATAACAGTATCAGAGTGTTCTGTTTTGATTTACTTAAATA-TAGCCTG--TGT-TAAAAATATAT----TTGT-CTA-TTTATTTGTTTTTGTCGTGAGAT-T--TCT---T---ATCTATATCAGTTATCTTTAA-ATAATAATATATCAATACAAATATCC---TTTCAACAAAGTTCATCAGCAGTGTCTGTTTTCAAATATTCGTATACATTGGAAATTATACTCCTGACCTGACCGTCATATATA--TGGCGTGCTGAACTTTTGTTCTCTTTTGACA-TGGCTGTTCCGATAAAACCTACAAAC--TATGGCGTGTATATAGATTTTAGTCATTTAATACATGGTAAGTGCACGACCTACGCATGAATATTGTGCTTTCATTGTCCCAAATAAGTAGTGTAATA-TAATAATAATAatcttctggttttagtattcacgtcctcatatgtacgtgtgcatatgaataaaacattgtaagtaaatttcctccccgaacgttgattttaacaaaaaaatcgttgaatttattaattatgtatttgttttaacggacaatagtataacacaattaatagtatatatcaaaacactctgatactataatagcaaat
gi|4 : TAACAGTATCAGATTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTAATTATATAATTATATAT----TT-T---A-TTTATTTAATTGTGTCGCGAGATGT--TT--------ATCTA-ATCATTGATCTTTTA-ATATCATTATGTCAATACT--TGTCC---TTTCAACAAATTTCAACAGTAGTGTCGGTTTTGAAATATTCGTTTACATTTGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATAT------------------TTTTTTTCTCTTTTGAAA-TGGTTGTTTCAATAAAACCCACAAAACGTGTGGAGTTTATGTAGGTTTTAATAATTTTATACACAGTAAGTGCACGACTTACACAATGATCTCGTGCGTTCATTATC
gi|5 : TGCCATAATAGTATTATAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATTTTG--TGT-TGATTATACATATTTTT-T-TTA-TTGATCTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---TTTTATCTATATCATTTATCTTTTTTATATTATTATGTCAATATAAAAATCC---TTTTAACAAATTCCTTCATCAATGTCGATTTTAAAATACCAGTTTACATTGGACAGTATGTTCCTGACCCGACCGCCATATTTA--TGACATGTTG---TTTTTTTTTCTTTTGAGA-TTGTTGTTTCGATAAAACCTACACTA--TGTGGAGAGTATGTAGGTCCTAGTCATTTTATACATAATA
gi|6 : CATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATCAGTTTTAATA-TATTTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-TGTTA-TGTATCTATTTTT-TCGTGATATGT--TTTCTTT---ATCTATATCATTTACATTTTA-ATATCATCATTTCAATACAAATATCT---TTTCAACAAATCCCATCAGCAGTGTCGGTTTTGCAATATTCGTATACATTGGAAATTATGATCTTGGCCTGACCATCATATTTATGTGGCGTGTTGAAATGTTTTAACCTTTTGACA-TGGTTGTTTCAATAAAACGCACAAAT--TGTGGAGTGTATG
gi|7 : TG--TGT-TTACTATATAA----TT-T-TTA-TTTATAAATTTTTGTCATGAG------TTT---T----------TC-TTTATCT-----GTATGATTG---CAA--CCAGTATCCCATTTTC------TTTC----------TTGCCCTTCAAATATTCGTATACATTGGAAATAATGCTCCTGGCCTGAC--TCATACTTA--TGGCTTGTTGAACTTTCCTTCTTTTTTGACA-TGGCTGTTTCGATAAATCCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACAT----AGTGCATAACTTACACAGGTATCTTGTGCTTTCATTGTCCCAA
gi|8 : aGCCGTTATAGTATCAGAGTGTAATGTTTTAAT-----TTA--------------GT-T--TTATATAT----CT-T-GTG-TTAATT-ATTTTTA-------ATGT--T------------------ATTT-TCCC------ATTATT---TCAAAACAAATGTCC---TTTAAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGACTTTAAAACAATCGTATACATTGGAAATTATACTCATGACC---CCATCATATTCA--TGTCGTGTCGAACTTGTTTTCTCTATTGACA-TGATAGTTTCGATAAAACCCACAACA--TATGGAGTATATGTAGGTACTAGTCATTT
gi|9 : CCATTACAGTATCAGAATGTACTGTTTTGATTTATTTTAATA-TATCATG--TGC-TAATTATATAT----AT-T-TTA-TTTATTAATTTTTGTTGTGAGATGT--TTT---
gi|9 : ATTTATTTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATTC---TTTCAACAAATTTCATAAGCAGTGTCGGTacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatttattttttaatattattatgtcaatacaaatattctttcaacaaatttcataagcagtgtcggta
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111 1 1
lowQualScore : 3 55 3 1 2 2222 3 44 3 0 88 5555555 1 6666 0 777 0 1 2 1 0 1 1 3 66 1 0 5 1 5 66 0 3 55 0 3 2
lowQualScore : . .. . . . .... . .. . . .. ....... . .... . ... . . . . . . . . .. . . . . . .. . . .. . . .
lowQualScore : 6 00 6 4 9 7777 6 88 6 2 66 1111111 8 3333 7 888 1 8 0 1 1 0 9 6 99 4 1 6 1 0 99 9 2 55 0 2 0
consensus : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTA-TTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATA-TAATAACAATA
Reference ( family-3849 ) : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTA-TTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATA-TAATAACAATA
gi|1 : AACAGTATCAAAGTGTACTGTTTTAATTTATTTGACTAATATCTTG--TGT-TCA--ATACAT----TT-T-TTAATTTTTTTGTTTTTGTCGTGAGGTGTATTTT---T---ATCTATATCATT--------------------GC---TACCAGTATCC---CTT-------TTTCAT------TTTTGCCCTTGAAATATTCGTATACATTTGAAATTATTCTCCTTATCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGCTGAA-TTTTCTTCTCTTTTGGCATTGGCTGTTTCGATAACATCCACCAAA--TGTGAAGTGTATGTAGGTTCTTGTCATTTTATACATAGCAAGTGCACGACTTTCACAAGTATCTCATGCTTTCATTACTTCAAACTAGTATTGTTATA-TGAT-ACAATA
gi|10 : tcctgcTTTATACCTAGTTAGTGCACGACTTACACAGGAATCTCGTGCGTTCATTGTAACAAATT-----TATAATACTATTAAtatctccgtttttatctccttattttttattttatatatcctcatatttaataaaacattgcaagtaattttccccccaaacgttgatttttacaaaattacgtatttggttttaagtgaagaacgatttatgtatttgccttttta
gi|11 : ATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATATGT--TT-T-TTA-TTTATCTGTTTTTGTCGTGAGATGTG-TGT---T---ATATATATCA-TCATCTTTTA-ATCTTATTATGTAAATACAAATAT-T---TTTCAAC-AATTT--TCAGAAAAGTTATTTTTTAAATACTacacccccagaacacagtaagttctatctgaaacaaatggcgaagttccactataacgtgttaaattgtttcgcgacaccgtttcatcatccatgtttttgttttaaaagtttgcgcag
gi|12 : TGCCATAACAGTATCGATGTGTACTGTTTTA-TTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAACTATA------------------TATTTATTTTTGTTGTGAAATGT--TTCA--T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTTAATACAAATATtta
gi|13 : CCATAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTCATTTGTTTTAATA-TATATTG--TGT-CAAATATATAT----AT-T-TTG-TTCATTTATTTTTGTCCTGAGATGT--Tt
gi|14 : ATTTTATACCTAGCAAGTGTACGACTGACACAGGGAACTCGTGCATTTATTGTCCCAAAatcaattgttataaattatca
gi|15 : taTTTATACATAATTAGTGCACGATTTACACAGCAATCTTGTGCTTTCATTGTCCTAAATTgtcat
gi|16 : agATTTTATACATAGTAAGTGCATGACTTACACAAGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAtat
gi|17 : taTTGCCATAACAGTATAAGTGTGTACTGTTTTAATTTACTTTAATC-TA
gi|2 : tagtTCGCCCTTGAAATATTCGTAGACATTTGATAATATGCTCCTGGCCTGGCCGTCATATACA--TGCTGTGTTGAACGTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCAACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACTTAGTAAATGCATGACTTACACAAGGATCTTGTAATTTTATTGTCTAAAATTAGTCGTGTAATA-TAATAA-AATA
gi|3 : tgctaccagtatcccagtttttttcTTACCATAACAGTATCAGAGTGTTCTGTTTTGATTTACTTAAATA-TAGCCTG--TGT-TAAAAATATAT----TTGT-CTA-TTTATTTGTTTTTGTCGTGAGAT-T--TCT---T---ATCTATATCAGTTATCTTTAA-ATAATAATATATCAATACAAATATCC---TTTCAACAAAGTTCATCAGCAGTGTCTGTTTTCAAATATTCGTATACATTGGAAATTATACTCCTGACCTGACCGTCATATATA--TGGCGTGCTGAACTTTTGTTCTCTTTTGACA-TGGCTGTTCCGATAAAACCTACAAAC--TATGGCGTGTATATAGATTTTAGTCATTTAATACATGGTAAGTGCACGACCTACGCATGAATATTGTGCTTTCATTGTCCCAAATAAGTAGTGTAATA-TAATAATAATAatcttctggttttagtattcacgtcctcatatgtacgtgtgcatatgaataaaacattgtaagtaaatttcctccccgaacgttgattttaacaaaaaaatcgttgaatttattaattatgtatttgttttaacggacaatagtataacacaattaatagtatatatcaaaacactctgatactataatagcaaat
gi|4 : TAACAGTATCAGATTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTAATTATATAATTATATAT----TT-T---A-TTTATTTAATTGTGTCGCGAGATGT--TT--------ATCTA-ATCATTGATCTTTTA-ATATCATTATGTCAATACT--TGTCC---TTTCAACAAATTTCAACAGTAGTGTCGGTTTTGAAATATTCGTTTACATTTGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATAT------------------TTTTTTTCTCTTTTGAAA-TGGTTGTTTCAATAAAACCCACAAAACGTGTGGAGTTTATGTAGGTTTTAATAATTTTATACACAGTAAGTGCACGACTTACACAATGATCTCGTGCGTTCATTATC
gi|5 : TGCCATAATAGTATTATAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATTTTG--TGT-TGATTATACATATTTTT-T-TTA-TTGATCTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---TTTTATCTATATCATTTATCTTTTTTATATTATTATGTCAATATAAAAATCC---TTTTAACAAATTCCTTCATCAATGTCGATTTTAAAATACCAGTTTACATTGGACAGTATGTTCCTGACCCGACCGCCATATTTA--TGACATGTTG---TTTTTTTTTCTTTTGAGA-TTGTTGTTTCGATAAAACCTACACTA--TGTGGAGAGTATGTAGGTCCTAGTCATTTTATACATAATA
gi|6 : CATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATCAGTTTTAATA-TATTTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-TGTTA-TGTATCTATTTTT-TCGTGATATGT--TTTCTTT---ATCTATATCATTTACATTTTA-ATATCATCATTTCAATACAAATATCT---TTTCAACAAATCCCATCAGCAGTGTCGGTTTTGCAATATTCGTATACATTGGAAATTATGATCTTGGCCTGACCATCATATTTATGTGGCGTGTTGAAATGTTTTAACCTTTTGACA-TGGTTGTTTCAATAAAACGCACAAAT--TGTGGAGTGTATG
gi|7 : TG--TGT-TTACTATATAA----TT-T-TTA-TTTATAAATTTTTGTCATGAG------TTT---T----------TC-TTTATCT-----GTATGATTG---CAA--CCAGTATCCCATTTTC------TTTC----------TTGCCCTTCAAATATTCGTATACATTGGAAATAATGCTCCTGGCCTGAC--TCATACTTA--TGGCTTGTTGAACTTTCCTTCTTTTTTGACA-TGGCTGTTTCGATAAATCCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACAT----AGTGCATAACTTACACAGGTATCTTGTGCTTTCATTGTCCCAA
gi|8 : aGCCGTTATAGTATCAGAGTGTAATGTTTTAAT-----TTA--------------GT-T--TTATATAT----CT-T-GTG-TTAATT-ATTTTTA-------ATGT--T------------------ATTT-TCCC------ATTATT---TCAAAACAAATGTCC---TTTAAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGACTTTAAAACAATCGTATACATTGGAAATTATACTCATGACC---CCATCATATTCA--TGTCGTGTCGAACTTGTTTTCTCTATTGACA-TGATAGTTTCGATAAAACCCACAACA--TATGGAGTATATGTAGGTACTAGTCATTT
gi|9 : CCATTACAGTATCAGAATGTACTGTTTTGATTTATTTTAATA-TATCATG--TGC-TAATTATATAT----AT-T-TTA-TTTATTAATTTTTGTTGTGAGATGT--TTT---
gi|9 : ATTTATTTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATTC---TTTCAACAAATTTCATAAGCAGTGTCGGTacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatttattttttaatattattatgtcaatacaaatattctttcaacaaatttcataagcagtgtcggta
blockSeqs : . AT A A T ATTT G GT . G TTTT T TTTT CAT A A C T T A TG C C C . CG A CG C A T
blockSeqs : . . . A C GT . T . . CTTT T TTA . A A C C G A . G C G . . A AG . A .
blockSeqs : . . . A A . . T . . AT T TTA . A T C G C T . A A T . . . . . A
blockSeqs : . . . A A . . C . . T T TAA . A A C G G T . G C T . .
blockSeqs : . . . A T . . T . . T T TTA . A A C A A T . G C T . .
blockSeqs : . . . G T . . T . . T . TTA . A A C G G T . T . C . .
blockSeqs : . . . A T . . G . . . . TTA . . . A C C . . . . T . .
blockSeqs : . . . T C . . T . . . . . . . . . A A
blockSeqs : . . . A T . . . . . . G
blockSeqs : . . . . T . . . . .
blockSeqCons : ** TTA*
originalCons : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTA-TTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATA-TAATAACAATA
finalCons : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTA-TTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATA-TAATAACAATA
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111 1 1
lowQualScore : 3 55 3 1 2 2222 3 44 3 0 88 5555555 1 6666 0 777 0 1 2 1 0 1 1 3 66 1 0 5 1 5 66 0 3 55 0 3 2
lowQualScore : . .. . . . .... . .. . . .. ....... . .... . ... . . . . . . . . .. . . . . . .. . . .. . . .
lowQualScore : 6 00 6 4 9 7777 6 88 6 2 66 1111111 8 3333 7 888 1 8 0 1 1 0 9 6 99 4 1 6 1 0 99 9 2 55 0 2 0
consensus : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTA-TTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATA-TAATAACAATA
Reference ( family-3849 ) : TTGCCATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-T-TTA-TTTATTTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATCC---TTTCAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGNTTTTGAAATATTCGTATACATTGGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGTTGAACTTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACATAGTAAGTGCACGACTTACACAGGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAATTAGTAGTGTAATA-TAATAACAATA
gi|1 : AACAGTATCAAAGTGTACTGTTTTAATTTATTTGACTAATATCTTG--TGT-TCA--ATACAT----TT-T-TTAATTTTTTTGTTTTTGTCGTGAGGTGTATTTT---T---ATCTATATCATT--------------------GC---TACCAGTATCC---CTT-------TTTCAT------TTTTGCCCTTGAAATATTCGTATACATTTGAAATTATTCTCCTTATCTGACCGTCATATTTA--TGGCGTGCTGAA-TTTTCTTCTCTTTTGGCATTGGCTGTTTCGATAACATCCACCAAA--TGTGAAGTGTATGTAGGTTCTTGTCATTTTATACATAGCAAGTGCACGACTTTCACAAGTATCTCATGCTTTCATTACTTCAAACTAGTATTGTTATA-TGAT-ACAATA
gi|10 : tcctgcTTTATACCTAGTTAGTGCACGACTTACACAGGAATCTCGTGCGTTCATTGTAACAAATT-----TATAATACTATTAAtatctccgtttttatctccttattttttattttatatatcctcatatttaataaaacattgcaagtaattttccccccaaacgttgatttttacaaaattacgtatttggttttaagtgaagaacgatttatgtatttgccttttta
gi|11 : ATTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAATTATATATGT--TT-T-TTA-TTTATCTGTTTTTGTCGTGAGATGTG-TGT---T---ATATATATCA-TCATCTTTTA-ATCTTATTATGTAAATACAAATAT-T---TTTCAAC-AATTT--TCAGAAAAGTTATTTTTTAAATACTacacccccagaacacagtaagttctatctgaaacaaatggcgaagttccactataacgtgttaaattgtttcgcgacaccgtttcatcatccatgtttttgttttaaaagtttgcgcag
gi|12 : TGCCATAACAGTATCGATGTGTACTGTTTTA-TTTATTTTAATA-TATCTTG--TGT-TAACTATA------------------TATTTATTTTTGTTGTGAAATGT--TTCA--T---ATCTATATCATTTATCTTTTA-ATATTATTATGTTAATACAAATATtta
gi|13 : CCATAATAGTATCAGAGTGTACTGTTTTCATTTGTTTTAATA-TATATTG--TGT-CAAATATATAT----AT-T-TTG-TTCATTTATTTTTGTCCTGAGATGT--Tt
gi|14 : ATTTTATACCTAGCAAGTGTACGACTGACACAGGGAACTCGTGCATTTATTGTCCCAAAatcaattgttataaattatca
gi|15 : taTTTATACATAATTAGTGCACGATTTACACAGCAATCTTGTGCTTTCATTGTCCTAAATTgtcat
gi|16 : agATTTTATACATAGTAAGTGCATGACTTACACAAGGATCTCGTGCTTTCATTGTCCCAAtat
gi|17 : taTTGCCATAACAGTATAAGTGTGTACTGTTTTAATTTACTTTAATC-TA
gi|2 : tagtTCGCCCTTGAAATATTCGTAGACATTTGATAATATGCTCCTGGCCTGGCCGTCATATACA--TGCTGTGTTGAACGTTTCTTCTCTTTTGACA-TGGTTGTTTCGATAAAACCAACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACTTAGTAAATGCATGACTTACACAAGGATCTTGTAATTTTATTGTCTAAAATTAGTCGTGTAATA-TAATAA-AATA
gi|3 : tgctaccagtatcccagtttttttcTTACCATAACAGTATCAGAGTGTTCTGTTTTGATTTACTTAAATA-TAGCCTG--TGT-TAAAAATATAT----TTGT-CTA-TTTATTTGTTTTTGTCGTGAGAT-T--TCT---T---ATCTATATCAGTTATCTTTAA-ATAATAATATATCAATACAAATATCC---TTTCAACAAAGTTCATCAGCAGTGTCTGTTTTCAAATATTCGTATACATTGGAAATTATACTCCTGACCTGACCGTCATATATA--TGGCGTGCTGAACTTTTGTTCTCTTTTGACA-TGGCTGTTCCGATAAAACCTACAAAC--TATGGCGTGTATATAGATTTTAGTCATTTAATACATGGTAAGTGCACGACCTACGCATGAATATTGTGCTTTCATTGTCCCAAATAAGTAGTGTAATA-TAATAATAATAatcttctggttttagtattcacgtcctcatatgtacgtgtgcatatgaataaaacattgtaagtaaatttcctccccgaacgttgattttaacaaaaaaatcgttgaatttattaattatgtatttgttttaacggacaatagtataacacaattaatagtatatatcaaaacactctgatactataatagcaaat
gi|4 : TAACAGTATCAGATTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATCTTAATTATATAATTATATAT----TT-T---A-TTTATTTAATTGTGTCGCGAGATGT--TT--------ATCTA-ATCATTGATCTTTTA-ATATCATTATGTCAATACT--TGTCC---TTTCAACAAATTTCAACAGTAGTGTCGGTTTTGAAATATTCGTTTACATTTGAAATTATGCTCCTGACCTGACCGTCATAT------------------TTTTTTTCTCTTTTGAAA-TGGTTGTTTCAATAAAACCCACAAAACGTGTGGAGTTTATGTAGGTTTTAATAATTTTATACACAGTAAGTGCACGACTTACACAATGATCTCGTGCGTTCATTATC
gi|5 : TGCCATAATAGTATTATAGTGTACTGTTTTAATTTATTTTAATA-TATTTTG--TGT-TGATTATACATATTTTT-T-TTA-TTGATCTATTTTTGTCGTGAGATGT--TTT---TTTTATCTATATCATTTATCTTTTTTATATTATTATGTCAATATAAAAATCC---TTTTAACAAATTCCTTCATCAATGTCGATTTTAAAATACCAGTTTACATTGGACAGTATGTTCCTGACCCGACCGCCATATTTA--TGACATGTTG---TTTTTTTTTCTTTTGAGA-TTGTTGTTTCGATAAAACCTACACTA--TGTGGAGAGTATGTAGGTCCTAGTCATTTTATACATAATA
gi|6 : CATAACAGTATCAGAGTGTACTGTTTTAATCAGTTTTAATA-TATTTTG--TGT-TAATTATATAT----TT-TGTTA-TGTATCTATTTTT-TCGTGATATGT--TTTCTTT---ATCTATATCATTTACATTTTA-ATATCATCATTTCAATACAAATATCT---TTTCAACAAATCCCATCAGCAGTGTCGGTTTTGCAATATTCGTATACATTGGAAATTATGATCTTGGCCTGACCATCATATTTATGTGGCGTGTTGAAATGTTTTAACCTTTTGACA-TGGTTGTTTCAATAAAACGCACAAAT--TGTGGAGTGTATG
gi|7 : TG--TGT-TTACTATATAA----TT-T-TTA-TTTATAAATTTTTGTCATGAG------TTT---T----------TC-TTTATCT-----GTATGATTG---CAA--CCAGTATCCCATTTTC------TTTC----------TTGCCCTTCAAATATTCGTATACATTGGAAATAATGCTCCTGGCCTGAC--TCATACTTA--TGGCTTGTTGAACTTTCCTTCTTTTTTGACA-TGGCTGTTTCGATAAATCCCACAAAA--TGTGGAGTGTATGTAGGTTCTAGTCATTTTATACAT----AGTGCATAACTTACACAGGTATCTTGTGCTTTCATTGTCCCAA
gi|8 : aGCCGTTATAGTATCAGAGTGTAATGTTTTAAT-----TTA--------------GT-T--TTATATAT----CT-T-GTG-TTAATT-ATTTTTA-------ATGT--T------------------ATTT-TCCC------ATTATT---TCAAAACAAATGTCC---TTTAAACAAATTTCATCAGCAGTGTCGACTTTAAAACAATCGTATACATTGGAAATTATACTCATGACC---CCATCATATTCA--TGTCGTGTCGAACTTGTTTTCTCTATTGACA-TGATAGTTTCGATAAAACCCACAACA--TATGGAGTATATGTAGGTACTAGTCATTT
gi|9 : CCATTACAGTATCAGAATGTACTGTTTTGATTTATTTTAATA-TATCATG--TGC-TAATTATATAT----AT-T-TTA-TTTATTAATTTTTGTTGTGAGATGT--TTT---
gi|9 : ATTTATTTTTTA-ATATTATTATGTCAATACAAATATTC---TTTCAACAAATTTCATAAGCAGTGTCGGTacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatttattttttaatattattatgtcaatacaaatattctttcaacaaatttcataagcagtgtcggta