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lowQualScore : . . . . ... . . . . .. ....... . . ..... . ...................... . ...... . ... ... ......... ............................................ . ...... . . . . . . ... . ............... .. ................. . .... . . ............ . . ......... ....... . . ............ . . . . ................................................. .. ..... ... .................. .. .... . ...... . ... . .. . . . .
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gi|9 : gctgtaataagctggctatgcatgatttgcacgtgccaatatgacatttacaaaagtgcgcagtacatgaacagacacatttaatttaacaacccaatcactgaaacacatcaaaaatttatttcacacgatgcctcatttatcagacactttgcgaaaccaagccagctatttctcccaacatgaatccaaatgaacacatctgggatcaactcggggaaacgtgcatcagcctacacactcattgcaatatcattgATTTTAAAA------------TCTGACCACCAGTTCTAAAGTAG------A-A----G-----AATT-T------TTAAAGTATTT-TCTTTACCA--TGACAA-CTGAGTTCCTAACAGATCAAGTTTATTT-TAA--TT--ATTT--GACAGAGGACCAACC---A-AGGCTCATTTCTGTGGTGTTTGATTTAAA-TCGGACAAGCGAATTCAGAGtgctgagtacata
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gi|15 : atgttcaacatttacaagtgggcaaaggaga--TTTT--GGCAGAGGACCA-TCCCAGTATCCTTCCTTCTGTGA---TTGATTTAAA-TTGAATGAGCAAATTCAGAG
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gi|12 : tatctaagATTTCTGCTGTGTTTGATTAAAA-TCGGATGAGCGTATTCAAAGGAtgtcatttgattccaatattttcccgctataaaaaaaattcatttagataattaaggaaaataagttatgtccactgatggcaatgtttttaaacagatcaaattattttggaagtgttatattgatcatttgtactaaattattttgaaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacagctggtgttaaagttccacatggatgaagtttcaacaattttggtagaggaccatt
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|5 : caaattcgttttagtaattttggtagaaaaggaccatctatggtcattccagttatgtttgatttttattggatgagcggattccaatgagttgtcgtttgaagcaatattttccctctatataaaaattcatattaattaacaaaaaaaaatg------TTGTAGCAAATTGTTTTGAAATA-------TGACCACCGCTTTTAAAGTGTGAGGGGAG---GGGATATATT-T----T-TTTTCTTT--A-CGTTGCCATG--------------AGTTCGATATGGATCGAGTTC-GTTTTAGTTCTTTTGGCAG--A---AGACTATCCAAGGATCATTCCTGTGGTGTTTGCTTAAAAATGCATGAGCGGATTCAGAGGAGATgaaaa
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gi|7 : tAGTTATGTC--CACTGATGGCAATGTTTTTAAACAGATCAAATT----------ATTTTGG--AAGT-GTTATAT--TGATCAT------TTGTACTAAATTATTTTGAAACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNN---N-----NNNN-N----N-NNNNNNNN--N-NNNNNNNNTGACAGCTGGTGTTAAAGTTCCACATGGAT-GAA----GTTTCAACAATTTTGGTAG--A---GGACCATtgtcatttgattccaatattttcccgctataaaaaaaattcatttagataattaaggaaaataagttatgtccactgatggcaatgtttttaaacagatcaaattattttggaagtgttatattgatcatttgtactaaattattttgaaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacagctggtgttaaagttccacatggatgaagtttcaacaattttggtagaggaccatt
gi|8 : tatctaaggatcagtcctgtggtttaatttaaatcagataagcggattcagatgtcatttgattccaatattttcccgctataaaaaaaattcatttagataattaaggaaaataAACTTATTTATTTAAACACAAGTTATAATCAACCGGCTATAAAAAAAAC--TATTT-TGCATGATTTTGCACGTGCCAGAGTCTACCAGGTAGATACA----CAAATTTGCATTTCCTAAACAGACACG-TTA--TTAACCAA---ATAATTGAATTCAC-------A----------TA-----ATAATTTTGTGTTTCACAACGATt
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gi|8 : tatctaaggatcagtcctgtggtttaatttaaatcagataagcggattcagatgtcatttgattccaatattttcccgctataaaaaaaattcatttagataattaaggaaaataAACTTATTTATTTAAACACAAGTTATAATCAACCGGCTATAAAAAAAAC--TATTT-TGCATGATTTTGCACGTGCCAGAGTCTACCAGGTAGATACACAAATTTGCATTTCCTAAACAGACACG-TTA--TTAACCAA-ATAATT---GAAT-TCACATAATAATTTTGTGTTTCACAACGATt
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