lowQualScore : 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 333 1111 2 111 22222222222 1 1 1 1 1111111 11 4444 44444 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3333 22 1 1 1 88888888888888888888 1 1111111 1111 888888888888888888888888888888888888888888888 2222222222 1 11111 1111 3333 111 1 44444 1 111 11 1 11 11 11 111111 11 2222 11
lowQualScore : 5 4 6 66 5 5 4 2 5 4 0 777 0000 2 3 1 0 6 4 0 0 0 8 3 1 5 5 000 33333333333 6 0 5 3 5 1 0 6 5 4 7777777 6 0 1 0 6 5 5 33 6 1111 44444 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 3333 0 33 5 7 6 7 7 6 8 2 99999999999999999999 3 99 3 99 77 8888888 2222 111111111111111111111111111111111111111111111 77 5 4444444444 66 0 5 11111 4 0 7777 6666 5 555 5 3 5 1 1 66666 6 1 111 1 0 8 33 0 3 3 6 3 44 7 88 88 55 6 6 888888 88 8888 77
lowQualScore : . . . .. . . . . . . . ... .... . . . . . . . . . . . . . . ... ........... . . . . . . . . . . ....... . . . . . . . .. . .... ..... .................................................................. . .... . .. . . . . . . . . .................... . .. . .. .. ....... .... ............................................. .. . .......... .. . . ..... . . .... .... . ... . . . . . ..... . . ... . . . .. . . . . . .. . .. .. .. . . ...... .. .... ..
lowQualScore : 0 0 1 99 0 0 0 1 0 0 4 222 6666 2 9 0 8 0 0 7 1 7 1 9 4 7 7 000 33333333333 0 9 7 7 7 4 3 0 0 4 6666666 0 1 5 1 0 7 7 99 0 7777 33333 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 6666 7 00 9 0 7 0 0 0 0 5 55555555555555555555 5 22 3 22 99 6666666 1111 444444444444444444444444444444444444444444444 99 7 4444444444 33 9 0 11111 4 4 5555 9999 0 555 0 8 7 4 4 00000 0 0 777 4 8 2 88 2 2 2 7 3 00 0 33 33 00 0 0 777777 33 3333 00
consensus : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGG--TGTGA-GTTAGTGCCAGTCA-TTCCCNTT-TATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATA---ATTATTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAATT-GTCAGTTTCTTAGATTAATACTAAATATTGTTTGAAAATCAGGATATGCTTTTAAGATTAGATGACCGCATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAG-C-CAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGTN-AAAAATACT--CCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATT----------------------TTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACT--------------------CTGG-ACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T------A------CAGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAG----TTCTTAGGTAACAAT---------ATC------------TA------TTATA--CTCTATGTG-TTT-N-AA-TTA-CAAAATTA-TAATACTGATATAAGA-TTAGTGACATGTAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA----ATACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTTATAACTAGTCAATGTGCTTCTGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATGTTTATTAATCTATTGCTGTATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATA--ATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAACGGTCGTTACTGT--TAT--TTTATCACACAGTTNNAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCAC-AGCGAAATTATGTACT--GTGG----TATTTTN-ATGTCATGTAC
Reference ( gi|2 ) : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGTAGGCTTTTGG--TGTGA-GTTAGTGCCAGTCA-TCCCCATT-TACAAGTTTGTCTTCTTT-TGTTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAAAAAAATATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAAAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGCCCAATTACGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATA---ATTATTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCAATAAGTTCGATACAGCAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAAGT-GTCAGTTTCTTAGATTAATACTAAATATTGTTTGAAAATCAGGATATGCTTTTAAGATTAGATGACCACATTATTTAATTTGCTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGGCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAATGGACCCAATACTTTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTATATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTGTCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAG-C-AAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGCCAGACAACATCACAGGAAAGACGAAT--AAAAATACT--C--GTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATT----------------------T----------------------T--------------------CTGG-ACTTTTAGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGATCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATTAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATAATTTAAACAAAAGGGGAACTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGAACACATGG------T------A------CAGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAG----TT-----------AT---------AT-------------TA------TTATA--CTCTATGTG-TTT-A-AA-TTG-CAAAATTA-TAATACTAATATAAGA-TTAGTGACATGTAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA----ATAC----T-AGTCAGCTACCTGAGTTTGATATTAATGTTTATAACTAGTCAATGTGCTTCTGTCACTGTTTGTATTATAAACATGTAGTTCATTTCATGTTTATTAATCTATTGCTGTATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAA--A--ATAACCTCCTATCATTGCAATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAGGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTGACTTT--TAT--TTTATCACACAGTTCCAAATGTTTTGTCATTGATGATTTTCAATCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAATCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TATTTTC-ATGTCATGTAC
gi|1 : AGTATAAAATAA-------CTAA-CACTCTAAGGACAGCT-------------TACCTAGGAGACTTTTGA--TGTGA-GTTAGTACCAGTCA-TTCCCTTT-GATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATTAT----ACGGTC-TACAGAAAGGTATTGAATTAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATAACGATACACAATATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAACTGTGT----ATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAAAATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACTGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGCTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATA---ATTATTT---TCTTT---CTCCAGACTGATCTGGT-GTGCCATAACCGGTTGTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAAAATGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAATT-GTCAGTTTCTTAGATAAATACTAAATATTGTTCTAAAATCAGGATATGCTTTTAAGATTAGATGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTCATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAACGCATATGATTAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACA------------TTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAATG-C-CAAAAGGATGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGTA-AAAAATACT--CCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTAT----------------------T--------------------CTGG-ACTTTTGTA-GGGAAAAA-CAGCAAACAAAGACCGTCCTTTTTCCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATGTAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAT-CATTTTATATTATTTATACAATAGGGGAGCTAACTTTATAAAATATATTGGTGTTATA-GGCACACATGG------TAGTACGA------CAGAC--TCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAG----TT-----------CTTAGGTAACCATTTCACTTTCCTTATA------TTATA--CTCTTTGTGTTTT-C-AG-TTA-CAAAATTA-TAATACTGATATAAGA-TTAGTGACATGTAAC-----TTC-ATTTGTTTAATGTTTGATATCTAGTCAATACATAC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGAAAATAATGTTTATAACTAGTCAATGTGCTTCTGTCACTGTTTGTATTATAAACATGTAGTTAATTTCATGTTTATTAATATATTGCTGTATATGATTGGTGCCTTTATGG-GACTAGTTGCTAAATAAAACTTGAAAAGTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCAATGAAAATA--ATAACTTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACACAATGGTCGTGACTGT--TAT--TTTACCACACAGTTAGAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACTATTTACAAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACTAGTGAAATTATGTACT--GTCG----TGTTTTC-ATGTCATGT
gi|3 : AGTATGATATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGGAATAAGTTACCCGGGAGACTTTTGT--TGGGA-GTTAGTGCCAGTCA-TTCCCATT-TATAAGTTTA-------------GGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACAAAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTGTAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTTCAATTACGAAGTACAATATTTACTTTCTTTTCTCTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGAGGATTTGTTATGCCAACATCAAGGACAGGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGAACAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGATTAAAATAACCGATGGCCCTAAAGTGATAAGGTTTTCATTTTTTAACTTATAGCTGTTAATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAAAATACTTAAATA---ATTATTTTTTC---T---CTCCAGAATGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAATTCAATACAGTAAAATGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACAAAAAATT-GTCAGTTTCTTAGATTAATACTAAATATTGTTTGAAAATCAGGATATGCTTTTATGATTAGATGACCACATTATTAAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATTATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAATTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTT--------GAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGTATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAG-C-CAAAAGGAAGATTCTATTTGGGACAATATATGTGTCTTCTGTACCATCTAGAGAGCCATTAGCAATCAGACAACATCACAGGAAAAACGAGTC-AAAAATACT--CCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATT----------------------TTAAAAGGATTGTTTAGGTTTACT--------------------CTGG-ACTTTTTG--AAAAAAAATCAG----CAAAGACATTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACACGGTAGTGAT------A------CAGACTTTCTTATGAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAG----TTCTTAGGTAACAAT---------ATCACCTTCCTTA--TA------TTATA--CTCTATGTG-TTTAA-AA-TTA-CAAAATTA-AAATATT-------GA-TTAGTGACATGTAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA----ATAC----T-ATTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTTATAACTAGTCAATGTGCTTCTGTCACTGTCTG-ATTATATACATGTAG----TTTCAAGTTTATTAATCTATTGCTGTATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACATATAAATCAACCTGTACTCCTATGAAAATA--ATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAG
gi|17 : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAATTACCCGGCAGGCGTTTGA--TGTGA-GTTAGTGCCAGTCA-TTCCCATT-TATAAGTTTATCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTTCTACAAAAAAGTATT
gi|4 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGCGTAATCAATTACCCGGTAGGC-TTTGG--TGTGA-GTTAGTGCCAGTCA-TTCCCATT-TATAAGTTTGACTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ATGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGAAACACAATAATCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGCGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCTATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATA---ATTATTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAATT-GTCAGTTTCTTAGATTAATACTAAATATTGTTTGAAAATCAGGATATGCTTTTAAGATAAGATGACCACATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGCTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAGTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCACAGTACATTAAGTTTTGTTTCAAACCAAGGACATAGTTAGACCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACTGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCATGC-AAATAAG-C-CAAAAGGAAGATTCGATTTCAGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGTC-AAAAACACT--CCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATT----------------------TTAAAAGGATTGGTGGTTTAA--T--------------------CTGG-ACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAACACAT
gi|6 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CAATCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCGTTTGG--TTTGA-GTAAGTGTCAGTCA-TTCCCCTT-TATAAGTGTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTAC-AGAAAATAATGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACAGTACACAACATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATATTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGAAAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCG-GAT-GAAACAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTTATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATATTTATTTTTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACTGGTTATGCATGATTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG--AAAAAATCTGAATTTTTCACATTTCGACACGAAAAATT-GTCAGTTTCTTATATAAATACTAAAAATTGTTTGAAAATCAGGATACGCTTTTAAGATTAGATGACCGCATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTTACCTTTTTCAATGCGATGTCGAAACGAGAAATCTCATATGATAAGCGTTCAGAATATGTGGTAAGT-------CTAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACTC-------TATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATT-AATTT--TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCATTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAACTTATCTTTTCAGAAATCATGCATTTGACGACCAAGCGCGA-AAAAAAG-C-CAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTTTTCAGCACTATCTCGGGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACTGGAAAGACGA------------------GTCAAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATT----------------------TTAATAGGATTGGTGAGGTTTACT--------------------CTGA-ACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTTATTGTAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCATATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGTGAGCGAACTTTATAAAGCAggtagtgatacagactttctgataaagagtatttttttctaaagaaaaaataatgcaagttcttaggtaacaatatcaccttccttatattatatgtgtttaaaattacaaacttataataatgatataagattagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagttaatactagtcagctccttgagtttgatattaatgtttataactagtcaatgtgcttctgtcactatttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttatttatcttttgctgtatatgattgatgcctttatgggtctagttgctgaataaaacttgaaaatttgatgttgaaattaatatttctccatgtatacacataaatcaatctgtacttctatgaaaataataacctcctatc
gi|9 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGACTTTTGG--TGTGA-GTTAGTGCCAGTCA-TTCCCATT-TATAAGTTTGTCTTCTTTATATAGAACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTA---TTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTATGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGAGGTTTATATCCAGTCCATGAAAATGATTAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTACAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATT---ATTATTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAATAATCTGGATTTTTCACATTCCGACACGAAAAATT-GTCAGTTTCTTAGATTAAT
gi|10 : GTATGAAATAATGCACAAGTAA-CACTCTAAGCACAGTTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGA--TGTGA-GTTAGTGCCAGTCA-TTCCCCTT-TATAAGTTTGTCTACTTTATATTGTACTCATCAT----ACGGTCCTAAAGAAAAGTATTGAATCAGGGCACAAGTCATGATATTCCTGTTTAGTATAATTTTACTAATTTAAATAATTATTGTCCAATTACGATACACAGTATTTATTTCCTTTTCTTTTGT-----TATGTCTGTATTATTCACAGGGGATT-----TGCGAACATCAAGGACAAA-GGTGTATATCCTGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAAGT-ttgttcaccacctctggttcatagtacattaagttttgttttaaaccaaggacatagttagatccactgaccgccgtacttaacttaaatactgttgat
gi|18 : ATGCACAAACAATCA-TCTAAGCATAATGAAGTGTAATCAGCTACCCGG-A------TGGTATGTGACGCTAGTGGCAGTCATTCCCCGCTATACA--TTTGTCTTGTTTATTTTGGACTTACCATATGAACGGTCCTACAGAAAA
gi|5 : atGTATGTTTGTATTATTCAT------TTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCAGTGTATATCCAGTCCACGCAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAACGCGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAAAGTGTCAATTTACTTTAATA---ATTATTTTCTC---T---CTCCATACTGATCTGGTAGTGCCATAATCGGTTATTCATGACTTCGATCAGTTCGATAAAATAAAACGGATGTTTCG-ACAAAAATCTGAATTTTTCCCATTTCGACACGAAAAAATTGTCAGTTTCTTAGATTAATACTT--TATTGTTTGAAAATCACGATATGCTTTTAAGATTAGATGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCATTGTCTAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCTGAACACCAGTTTGGCCACATCCTC-----------------------TATGTGATTTGTTCACTACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGAAAAAAGTTAGATCCACTGACCGCCGAACTTTACTAAAATACTGTTGGTTAACGGAGTAAAGTGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCACAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGT-AAAAAAGCC-AAAAAGGAAGAATCAATTTGGGACAATATATGCGTCCTTAGCACCATCTCGATGGCCATTACCAGTTGGACAACATCACAGG-AAGACGAGTA-AAAAATACT--CCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATT----------------------TTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACT--------------------CTGGAAGTTTT--A-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTGTCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCTCCTTAATCAACAA
gi|12 : A-GTGTCAATTTACATAAATA---ATTATTT---C---TTCTCTCCAGACCGAATTGGTAGTGCCATAACCGGTTTTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAG-AAAACGGATGTTTCGAAAAAAAATCTGATTTTTTCACATTTCAACACGAAAAATT-GTCAGTTTCTTAGAATAATACTAAACA-TATTTGAAAATCAGGGTAT-------------AATGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACATTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAttgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacgctatgtgttttcaattacaaaagtacaatactgatataagataagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagtcaatacatactagtcagctcattgagtttgatattaatgtttataactagtcttctgtcattgtttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttattaatctattgctgtatatgattgatgcctttatgggcctagttgcttaataaaacttgaaaacttgatgttgaaattaatatttctccatgtctacacataaatcaatctgtactcctatgaaaataataaccttctatcactgcgatacacaccttaataatttaataaaattagttgtttatcttataaagctagaactggcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|9 : TAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTT---AGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAA-ATAC---TGTTGATt
gi|7 : gtatgaaataatgcacaactaacactctaagcacagctaagtgtaatcagttacccgggagacttttggtgtgagttagtgccagtcattcccatttataagtttgtcttctttatatagaactcatcatacggtcctacagaaaagtattaaatcaggacacaagtcatgatattcctgttgagtattttactaatttaaattattattgtccaattatgaaacacaatattcacttccttttcttttgttaaagtatgtttgtattattcacaggggattttttatgcgaacatcaaggacaagaggtttatatccagtccatgaaaatgattaatgcagtgcacaggacgagcgaggtgaaataaccgatggccctacagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaagtgtcaatttacttaaattattatttctctccagactgatctggtagtgccataaccggttattcatgacttcgataagttcgatacagtaaaacggatgtttcgaaaataatctggatttttcacattccgacacgaaaaattgtcagtttcttagattaatttgttcaccacctctggttcatagtacatGTAATTTGTTAACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGAAATAGTTAGATCTACTGACCGCCGTACTAAACTAAAATATTGTTAATAAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAAAGAACATTTCACATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCGGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACACAAAAAAAG-C-CAAAAGGAAGATTCGATTTTGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCAATACCAGTTAGACAACATCAAAGGAAAGACGAGTAAAAAAATACTAAA--GTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATT----------------------TTAATAGGTTTGATGAGATTTACT--------------------CTGG-ACTTTTTGAGAAAAAAAATCAGAAAACAAAGACGGTCCTTTTTCTATTTTATTGCAAAAACTGAACTTTAGTAATATAAAATACGAAATAAATAAGCAGTCACATCTCCTTAATCTACAAAAT-TATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATACTGCTGTTAAAGGGGACACATGGTAGTGAT------A------CAGACTTTCTGATAAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--CAA-A-------TAAG----TT-----------
gi|9 : TAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAAATACTGTTGATtttaggtaacaatatcaccttccttgtgttgtgctgtgttgtgctgtgctgtgctatactatattacattatattattatctatgtgtttttaattacaaaagtaaaatactgatataagattagtgacatgcaacttcatatgtttaatgtttgatatctagtcaatacatactagtcggctccttgaattaatgttaatgtttataactagtcaatgtgcttctgtcactgtttgtattatatacatgtagttcatttcatatttattaatctactgcttatatgattgaagtctttatgagcttagttgctgaatagaacttgaaaacttgatgttgaaagtattatgtctacacataaatcaatctgtactcatatggaaataataacctcctatcattgcgatacacaccttaatagttaaataaaattagttatttattttataaagctagtgctggcttgcaagttttaaagcaaggagtaaaacatcttttaaagtacaaaatggtcgttactgttattttatcacacagttccaaacgttttgtcattgatgattttcagtcttttaaccattcactagaaatttgcccttttccaaaaccacgagtgaaattatgttctgtggtatttttaatgtcatgtacattcattatagaaaaaacgtttaagtgaaattaata
gi|8 : gtatgaaataatgcacaactaacactctaagcacagctaagtgtaatcagttacccgggagacttttggtgtgagttagtgccagtcattcccatttataagtttgtcttctttatatagaactcatcatacggtcctacagaaaagtattaaatcaggacacaagtcatgatattcctgttgagtattttactaatttaaattattattgtccaattatgaaacacaatattcacttccttttcttttgttaaagtatgtttgtattattcacaggggattttttatgcgaacatcaaggacaagaggtttatatccagtccatgaaaatgattaatgcagtgcacaggacgagcgaggtgaaataaccgatggccctacagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaagtgtcaatttacttaaattattatttctctccagactgatctggtagtgccataaccggttattcatgacttcgataagttcgatacagtaaaacggatgtttcgaaaataatctggatttttcacattccgacacgaaaaattgtcagtttcttagatAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTGCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAG-CCAAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGTCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGTC-AAAAACACT--CCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTCTAAATATT----------------------T----------------------TTAAAGGATTGGTGGTTTACTCTGG-ACTTTTTGA-AAAAAA--TCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTACAAAAACTAAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAAGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGTCACATGG------T------AGTGATGCAGACTTTTTGATAAAGA--GCT-TTTTTTTTTCTAAAGAAAA--TAATG-------CAAG----TTCTTAGGTAACAAT---------AT-------------CACCTTCCTTATATTCTCTATGTG-TTT-A-AA-ATAACAAAATTA-TAATACTGACATAAGA-TTAGTGACATGTAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA----ATAC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTCTATAACTAGTCAATGTGCTTCTGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATGTTTATTAATCTATTGCTGTATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTACATGTTTACACATAAATCAATCTGCACTCCTATGAAAATA--ATAACCTCCTATCATTGCGATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATCAG---TTATTTATTTTATTAAGCTAGAGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAA
gi|13 : TTAAA-ACAAAAAGTGGCGA---T------A------CAGACATTCTCATAAAGATCGCA--AGTTTT--GTAAAGAAAA--TAATAACAATATCAAATTCTTT-----------AC---------ATCA-----------TA------TTATA--CTGTTTGTG-TT----------------TTAGTAATACTGATATAAGCTTTAATGACATGTAAC-----TACAATATGCATAATGTTTG
gi|4 : acctaactgcataaacattgtggttaaatatagagatgacatagaggtcggagaggcaaatagtttatatttttttaacgtataaactAACACATGG------T------AGTGATACAGACTTTCTGATAAAGA--GTA-TTTTTTT--CTAAAGAAAAAATAATG-------CAAG----TTCTTAGGTAACAAT---------AT-------------CACCTTCCTTATA--TTATATGTG-TTT-A-AAATTA-CAAACTTA-TAATAATGATATAAGA-TTAGTGACATGTAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA----ATAC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTTATAACTAGTCAATGTGCTTCTGTCACTATTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATGTTTATTTATCTTTTGCTGTATATGATTGATGCCTTTATGG-GTCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAATTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTATACACATAAATCAATCTGTACTTCTATGAAAATA--ATAACCTCCTATC
gi|7 : gtatgaaataatgcacaactaacactctaagcacagctaagcgtaatcaattacccggtaggctttggtgtgagttagtgccagtcattcccatttataagtttgacttctttatattggactcatcatatggtcctacagaaaagtattaaatcaggacacaagtcatgatattcctgttgagtataattttactaatttaaattattattgtccaattacgaaacacaataatcacttccttttcttttgttaaagtatgtttgtattattcacagcggattttttatgcgaacatcaaggacaagcggtttatatccagtccacgaaaatgatcaatgcagtgcacaggacgagcgaggtgaaataacctatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaagtgtcaatttacttaaataattatttctctccagactgatctggtagtgccataaccggttattcatgacttcgataagttcgatacagtaaaacggatgtttcgaaaaaaatctggatttttcacatttcgacacgaaaaattgtcagtttcttagattaatactaaatattgtttgaaaatcaggatatgcttttaagataagatgaccacattatttaatttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcgttgttgaatcgagaaagctcatatgataagggctcagaatatgtggtaagtccgaataccagtttggccacatcctccaacatcagtggacccaatactctatgtaatttgttcaccacctctggttcacagtacattaagttttgtttcaaaccaaggacatagttagacccactgaccgccgtacttaactaaaatactgttgattaactgagtaaagcaaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcagaaatcacgcatttgacgaccaagcatgcaaataagccaaaaggaagattcgatttcagacaatatctgcgtcttcagcaccatctcgagggccattaccagtcagacaacatcacaggaaaggcgagtcaaaaacactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtggtttaatctggactttttgaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtcctttttccatttaattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatccccttaatcaacaaA--TATTA-------CA------TT-----------AT---------AT-------------TA------TTAT-----CTATGTG-TTT-TTAA-TTA-CAAAAGTA-AAATACTGATATAAGA-TTAGTGACATGCAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA----ATACATACT-AGTCGGCTCCTTGAATT-AATGTTAATGTTTATAACTAGTCAATGTGCTTCTGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATATTTATTAATCTACTGCT-TATATGATTGAAGTCTTTATGA-GCTTAGTTGCTGAATAGAACTTGAAAACTTGATGTTGAAA---GTATT-----ATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCATATGGAA--ATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTAAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTAAAGCAAGGAGTAAAACATCTTTTA-AAGTACAAAATGGTCGTTACTGT--TAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTCACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTTCT--GTGG----TATTTTTAATGTCATGTAC
gi|5 : gtaatttgttaaccacctctggttcatagtacattaaattttgttttaaaccaaggaaatagttagatctactgaccgccgtactaaactaaaatattgttaataaacggagtaaagcgaaaatgaatcaatcatgcaaagaacatttcacattatctgtcaaatttatcttttcggaaatcacgcatttgacgaccaagcacacaaaaaaagccaaaaggaagattcgattttggacaatatctgcgtcttcagcaccatctcgagggccaataccagttagacaacatcaaaggaaagacgagtaaaaaaatactaaagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaataggtttgatgagatttactctggactttttgagaaaaaaaatcagaaaacaaagacggtcctttttctattttattgcaaaaactgaactttagtaatataaaatacgaaataaataagcagtcacatctccttaatctacaaaattattttatattatttatacaaaaggggagctaactttataaaacatactgctgttaaaggggacacatggtagtgatacagactttctgataaagagcattttttttctaaagaaaacaaataagtttttaggtaacaatatcaccttccttgtgttgtgctgtgttgtgctgtgctgtgctatactATA--CGCTATGTG-TTTTC-AA-TTA-CAAAAGTA-CAATACTGATATAAGA-TAAGTGACATGTAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA----ATACATACT-AGTCAGCTCATTGAGTTTGATATTAATGTTTATAACTAGTC-------TTCTGTCATTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATGTTTATTAATCTATTGCTGTATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTTAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATA--ATAACCTTCTATCACTGCGATACACACCTTAATAATTTAATAAAATTAG---TTGTTTATCTTATAAAGCTAGAACTGGCTTattcattatagaaaaaacgtttaagtgaaattaata
gi|19 : gtatgtttgtattattcatttttttatgcgaacatcaaggacaagcagtgtatatccagtccacgcaaatgatcaatgcagtgcacaggacgaacgcggtgaaataaccgatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaaagtgtcaatttactttaataattattttctctctccatactgatctggtagtgccataatcggttattcatgacttcgatcagttcgataaaataaaacggatgtttcgacaaaaatctgaatttttcccatttcgacacgaaaaaattgtcagtttcttagattaatactttattgtttgaaaatcacgatatgcttttaagattagatgaccacattatttaacttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcattgtctaatcgagaaagctcatatgataagggttcagaatacgtggtaagtctgaacaccagtttggccacatcctctatgtgatttgttcactacctctggttcatagtacattaaattttgttttaaaccaagaaaaaagttagatccactgaccgccgaactttactaaaatactgttggttaacggagtaaagtgaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcacaaatcacgcatttgacgaccaagcacgtaaaaaagccaaaaaggaagaatcaatttgggacaatatatgcgtccttagcaccatctcgatggccattaccagttggacaacatcacaggaagacgagtaaaaaatactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtgaggtttactctggaagttttaaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtccttttgtcattttattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatctccttaatcaacaattgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TTAGTGAAATGTAACGTAACTTC-ATGTGTAAAATGCTTGATATCTAGTCAAC--ATACAT--T-AGTCAGTTCCTTAAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|14 : agtacaccgtatacatttgatTAATGCCATAAAAT-----TGC-ATATGCATAATGTTTAATATCAGGTCA----ATACACA-TGAGTCAATTTCATAAGTT-GGTATTTATGTTTATATTTAGTCAATATGCATCTGTTACTGTTTGTATAATATACATGT
gi|16 : taatacaaatgccgtaggtgacaaattccattctcttaaacgtcacaaagaaaATGTCAATAACTAGTCAATATGCTTCTGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATGTTTATAAATCTGTTGATGTATATGACAGATGCCCTTATGGAGCCTAGTTGTTGAAAAAAACTTG-AAACTTGA-AACAAGATT--TGTTTC-CCATG
gi|11 : GTCTACACATAAATCAATTTGTACTGCTATGAAA--ATAGTAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATCATTTAATAAAATTAGTAATTATCT-TTTTATAAAGC
gi|20 : TTTTATAAAACTAGTAGTGGC--GCATGTTAACTTAAAC-ATGATT-AAACAT-TTTAATAAATACAAAACGACCATT-CTTTGGCATTGTTTATCATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|15 : TCACTGATGAATTTAAGTATTTCAACCATTTACTAAAAGTTTGCCCGCTTCCAAA--------CGAAATTATGTACTCAGTGGAGGAAATTTTG-ATTTTATGTAC
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GTCATTTTTGTTATAAAATATCAAAATAAAAATGTTTAATGAAAATTCATCAACATTACTGCGTGTCCCTTTAAAA
Alignments
lowQualScore : 2222222 111111 111111 11111 11111 11 11 22222222222 111 1 1111111 9999999999 111111111 11111 222222 11111111 111111 444444444444444444444 11111 111 111 1 11 11 3 11 2222222
lowQualScore : 4 0 1 4 1 9999 1 0 5 5 7777777 888 5 5 444444 0 888 444444 22222 22222 2 0 3 2 8 5 5 5 00 2 0 55 44 1 5 8 44444444444 000 77 1 77 66 6666666 5 0 2 5555555555 66 88 999999999 4 0 4 5 4 8888 00000 4 1 66 4 999999 4 66666666 66 777 66 2 222222 0 5 66 222222222222222222222 22222 66 5 0 000 444 3 0 3 2 0 2 66 33 33 22 33 0 2 33 3333333 1
lowQualScore : . . . . . .... . . . . ....... ... . . ...... . ... ...... ..... ..... . . . . . . . . .. . . .. .. . . . ........... ... .. . .. .. ....... . . . .......... .. .. ......... . . . . . .... ..... . . .. . ...... . ........ .. ... .. . ...... . . .. ..................... ..... .. . . ... ... . . . . . . .. .. .. .. .. . . .. ....... .
lowQualScore : 4 1 8 4 0 4444 0 1 0 0 0000000 888 0 0 444444 1 888 444444 55555 55555 0 7 3 5 5 0 0 0 99 5 5 66 44 0 7 0 11111111111 000 99 4 99 99 2222222 0 1 0 6666666666 11 33 333333333 4 9 4 7 0 5555 00000 0 4 11 4 333333 4 11111111 11 888 11 2 888888 1 0 99 555555555555555555555 55555 99 0 1 000 000 2 8 2 5 0 0 22 88 88 00 55 0 0 88 5555555 0
consensus : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTTT-TC---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAGTTCT-TAGGTAACAATATCACCTTCCTT-TATTATA--CTCTA-TGTGTTT-N-AA--T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT---TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
Reference ( family-3688 ) : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCNTTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCGCATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-NAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAGTTCT-TAGGTAACAATATC----------TATTATA--CTCTA-TGTGTTT-N-AA--T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT---TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAACGGTCGTTAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTNNAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCAC-AGCGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
gi|1 : AGTATAAAATAA-------CTAA-CACTCTAAGGACAGCT-------------TACCTAGGAGACTTTTGATGTGA-GTTAGTACCAGTCATTCCCTTTGATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATTAT----ACGGTC-TACAGAAAGGTATTGAATTAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATAACGATACACAATATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAACTGTGT----ATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAAAATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACTGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGCTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT---TCTTT---CTCCAGACTGATCTGGT-GTGCCATAACCGGTTGTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAAAATGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATAAAT------ACTAAATATTGTTC---TAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTCATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAACGCATATGATTAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA------------ACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAATGCC-AAAA-GGATGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTATTCTGGACTTTTGTA-GGGAAAAA-CAGCAAACAAAGACCGTCCTTTTTCCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATGTAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAT-CATTTTATATTATTTATACAATAGGGGAGCTAACTTTATAAAATATATTGGTGTTATA-GGCACACATGGTAG---T---A---CGACAGACT--CTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAGTTCT-TAGGTAACCATTTCACTTTCCTTATATTATA--CTCTT-TGTGTTT-TCAG--T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATTTGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATACT-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGAAAATAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTAATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATATAT-----TGCTG--TATATGATTGGTGCCTTTATGG-GACTAGTTGCTAAATAAAACTTGAAAAGTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCAATGAAAATAATAACTTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT---TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACACAATGGTCGTGAC--TGTTAT--TTTACCACACAGTTAGAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACTATTTACAAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACTAGTGAAATTATGTACT--GTCG----TG-TTTTCATGTCATGT
gi|10 : GTATGAAATAATGCACAAGTAA-CACTCTAAGCACAGTTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCCTTTATAAGTTTGTCTACTTTATATTGTACTCATCAT----ACGGTCCTAAAGAAAAGTATTGAATCAGGGCACAAGTCATGATATTCCTGTTTAGTATAATTTTACTAATTTAAATAATTATTGTCCAATTACGATACACAGTATTTATTTCCTTTTCTTTTGT-----TATGTCTGTATTATTCACAGGGGATT-----TGCGAACATCAAGGACAAA-GGTGTATATCCTGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAAGT-
gi|11 : GTCTACACATAAATCAATTTGTACTGCTATGAAAATAGTAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATCATTTAATAAAATTAGTAATTATCT-TTTTATAAAGC
gi|12 : A-GTGTCAATTTACATAAATAATTATTT---C---TTCTCTCCAGACCGAATTGGTAGTGCCATAACCGGTTTTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAG-AAAACGGATGTTTCGAAAAAAAATCTGATTTTTTCACATTTCAACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGAATAAT------ACTAAACA-TATTT---GAAAATCAGGGTAT------------------------AA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACATTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|13 : TGGCGA---T---A---C---AGACATTCTCATAAAGATCGCA--AGTTTT--GTAAAGAAAA--TAATAACAATATCAAATTCT-T---T----ACATCA---------TATTATA--CTGTT-TGTGTTT-T-A---------------GTAATAC-TGATATAAGCTTTAATGACATG----TAAC-----TACAATATGCATAATGTTTGt
gi|14 : acctaactgcataaacattgtggttaaatatagagatgacatagaggtcggagaggcaaatagtttatatttttttaacgtataaactttaaaacaaaaag--TAATA-------CAAATGCCGTAGGTGACAAATTC----------CATT-----CTCT--------T-A-AACGT-CA-CAAAGAAATAATGC-C---ATAAAA-TTG-----------------------C-ATATGCATAATGTTTAATATCAGGTCA--AT-ACACA-TGAGTCAATTTCATAAGTT-GGTATTTATGTTT-ATATTTAGTCAAT--------AT--GCATCT---GTTACTGTT--TGTATAATATAC------ATGT
gi|15 : TCACTGATGAATTTAAGTATTTCAACCATTTACTAAAAGTTTGCCCGCTTCCAAA--------CGAAATTATGTACTCAGTGGAGGAAA-TTTTGATTTTATGTAC
gi|16 : ATGTCA-ATAACTAGTCAAT--------AT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATAA---------------------ATCTGT-----TGATG--TATATGACAGATGCCCTTATGGAGCCTAGTTGTTGAAAAAAACTTG-AAACTTGA-AACAAGATT--TGTTTC-CCATGataatttcagaaaaggtgtttactgaacatttatgaaagtgaccgtgtgtccctttaagtaa
gi|17 : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAATTACCCGGCAGGCGTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTATCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTTCTACAAAAAAGTATT
gi|18 : ATGCACAAACAATCA-TCTAAGCATAATGAAGTGTAATCAGCTACCCGGATGGT-----ATGTGACGCTAGTGGCAGTCATTCCCCGCTATACATTTGTCTTGTTTATTTTGGACTTACCATATGAACGGTCCTACAGAAAA
gi|19 : at-TTAGTGAAATG----TAACGTAACTTC-ATGTGTAAAATGCTTGATATCTAGTCAACAT-ACAT--T-AGTCAGTTCCTTAAGT
gi|2 : agtacaccgtatacatttgatAGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGTAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATCCCCATTTACAAGTTTGTCTTCTTT-TGTTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAAAAAAATATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAAAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGCCCAATTACGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCAATAAGTTCGATACAGCAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-GTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAATTTGCTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGGCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAATGGACCCAATACTTTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTATATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTGTCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCA-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGCCAGACAACATCACAGGAAAGACGAAT--AAAAATACTC--GTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTT----------------------TCTGGACTTTTAGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGATCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATTAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATAATTTAAACAAAAGGGGAACTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGAACACATG---G---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAGTT------------ATAT-----------TATTATA--CTCTA-TGTGTTT-A-AA--T-TG-CAAAATTATAATAC-TAATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTACCTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAA--AATAACCTCCTATCATTGCAATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAGGTT---TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTGAC--TTTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAATGTTTTGTCATTGATGATTTTCAATCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAATCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTCATGTCATGTAC
gi|20 : TTTTATAAAACTAGTAGTGGC--GCATGTTAACTT-AAACA-TGATTAAA-CAT-TTTAATAAATACAAAACGACCATT-CTTTGGCATTGTTTATCATA
gi|3 : AGTATGATATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGGAATAAGTTACCCGGGAGACTTTTGTTGGGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTA-------------GGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACAAAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTGTAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTTCAATTACGAAGTACAATATTTACTTTCTTTTCTCTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGAGGATTTGTTATGCCAACATCAAGGACAGGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGAACAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGATTAAAATAACCGATGGCCCTAAAGTGATAAGGTTTTCATTTTTTAACTTATAGCTGTTAATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAAAATACTTAAATAATTATTTTTTC---T---CTCCAGAATGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAATTCAATACAGTAAAATGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACAAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAT------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTAAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATTATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAATTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTT--------GAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGTATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCTATTTGGGACAATATATGTGTCTTCTGTACCATCTAGAGAGCCATTAGCAATCAGACAACATCACAGGAAAAACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGTTTAGGTTTACTCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAG----CAAAGACATTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACACGGTAGTGAT---A---C---AGACTTTCTTATGAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATG-------CAAGTTCT-TAGGTAACAATATCACCTTCCTTATATTATA--CTCTA-TGTGTTTAA-AA--T-TA-CAAAATTAAAATAT-T-------GA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC-TA-T---TCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTC--TG-ATTATATAC------ATGTAG----TTTCA-AGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACATATAAATCAACCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAG
gi|4 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGCGTAATCAATTACCCGGTAGGCTTT-GGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGACTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ATGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGAAACACAATAATCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGCGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCTATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TAAGA-----TGACCACATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGCTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAGTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCACAGTACATTAAGTTTTGTTTCAAACCAAGGACATAGTTAGACCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACTGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCATGC-AAATAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTCAGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGT--GGTTTAATCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAACACAT
gi|4 : ACACATGGTAG---TGATA---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GTA-TTTTTTT--CTAAAGAAAAAATAATG-------CAAGTTCT-TAGGTAACAATATCACCTT-----CCTTATA--TTATA-TGTGTTT-A-AAA-T-TA-CAAACTTATAATAA-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTATT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTT---------------------ATCTTT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GTCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAATTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTATACACATAAATCAATCTGTACTTCTATGAAAATAATAACCTCCTATCggtagtgatacagactttctgataaagagtatttttttctaaagaaaaaataatgcaagttcttaggtaacaatatcaccttccttatattatatgtgtttaaaattacaaacttataataatgatataagattagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagttaatactagtcagctccttgagtttgatattaatgtttataactagtcaatgtgcttctgtcactatttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttatttatcttttgctgtatatgattgatgcctttatgggtctagttgctgaataaaacttgaaaatttgatgttgaaattaatatttctccatgtatacacataaatcaatctgtacttctatgaaaataataacctcctatc
gi|5 : gtatgaaataatgcacaactaacactctaagcacagctaagcgtaatcaattacccggtaggctttggtgtgagttagtgccagtcattcccatttataagtttgacttctttatattggactcatcatatggtcctacagaaaagtattaaatcaggacacaagtcatgatattcctgttgagtataattttactaatttaaattattattgtccaattacgaaacacaataatcacttccttttcttttgttaaagtatgtttgtattattcacagcggattttttatgcgaacatcaaggacaagcggtttatatccagtccacgaaaatgatcaatgcagtgcacaggacgagcgaggtgaaataacctatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaagtgtcaatttacttaaataattatttctctccagactgatctggtagtgccataaccggttattcatgacttcgataagttcgatacagtaaaacggatgtttcgaaaaaaatctggatttttcacatttcgacacgaaaaattgtcagtttcttagattaatactaaatattgtttgaaaatcaggatatgcttttaagataagatgaccacattatttaatttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcgttgttgaatcgagaaagctcatatgataagggctcagaatatgtggtaagtccgaataccagtttggccacatcctccaacatcagtggacccaatactctatgtaatttgttcaccacctctggttcacagtacattaagttttgtttcaaaccaaggacatagttagacccactgaccgccgtacttaactaaaatactgttgattaactgagtaaagcaaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcagaaatcacgcatttgacgaccaagcatgcaaataagccaaaaggaagattcgatttcagacaatatctgcgtcttcagcaccatctcgagggccattaccagtcagacaacatcacaggaaaggcgagtcaaaaacactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtggtttaatctggactttttgaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtcctttttccatttaattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatccccttaatcaacaaaGTATGTTTGTATTATTCAT------TTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCAGTGTATATCCAGTCCACGCAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAACGCGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAAAGTGTCAATTTACTTTAATAATTATTTTCTC---T---CTCCATACTGATCTGGTAGTGCCATAATCGGTTATTCATGACTTCGATCAGTTCGATAAAATAAAACGGATGTTTCG-ACAAAAATCTGAATTTTTCCCATTTCGACACGAAAAAATTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTT--TATTGTTT---GAAAATCACGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCATTGTCTAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCTGAACACCAGTTTGGCCACATC-----------------------CTCTATGTGATTTGTTCACTACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGAAAAAAGTTAGATCCACTGACCGCCGAACTTTACTAAAATACTGTTGGTTAACGGAGTAAAGTGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCACAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGT-AAAAAAGCCAAAAA-GGAAGAATCAATTTGGGACAATATATGCGTCCTTAGCACCATCTCGATGGCCATTACCAGTTGGACAACATCACAGG-AAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGAAGTTTT-A-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTGTCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCTCCTTAATCAACAA
gi|5 : ATA--CGCTA-TGTGTTT-TCAA--T-TA-CAAAAGTACAATAC-TGATATAAGA-TAAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATACT-AGTCAGCTCATTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTC-----------------TTCT---GTCATTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTTAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTTCTATCACTGCGATACACACCTTAATAATTTAATAAAATTAG---TTGTTTATCTTATAAAGCTAGAACTGGCTTttgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacgctatgtgttttcaattacaaaagtacaatactgatataagataagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagtcaatacatactagtcagctcattgagtttgatattaatgtttataactagtcttctgtcattgtttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttattaatctattgctgtatatgattgatgcctttatgggcctagttgcttaataaaacttgaaaacttgatgttgaaattaatatttctccatgtctacacataaatcaatctgtactcctatgaaaataataaccttctatcactgcgatacacaccttaataatttaataaaattagttgtttatcttataaagctagaactggcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|6 : gtatgtttgtattattcatttttttatgcgaacatcaaggacaagcagtgtatatccagtccacgcaaatgatcaatgcagtgcacaggacgaacgcggtgaaataaccgatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaaagtgtcaatttactttaataattattttctctctccatactgatctggtagtgccataatcggttattcatgacttcgatcagttcgataaaataaaacggatgtttcgacaaaaatctgaatttttcccatttcgacacgaaaaaattgtcagtttcttagattaatactttattgtttgaaaatcacgatatgcttttaagattagatgaccacattatttaacttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcattgtctaatcgagaaagctcatatgataagggttcagaatacgtggtaagtctgaacaccagtttggccacatcctctatgtgatttgttcactacctctggttcatagtacattaaattttgttttaaaccaagaaaaaagttagatccactgaccgccgaactttactaaaatactgttggttaacggagtaaagtgaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcacaaatcacgcatttgacgaccaagcacgtaaaaaagccaaaaaggaagaatcaatttgggacaatatatgcgtccttagcaccatctcgatggccattaccagttggacaacatcacaggaagacgagtaaaaaatactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtgaggtttactctggaagttttaaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtccttttgtcattttattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatctccttaatcaacaattgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATGAAATAATGCACAACTAA-CAATCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCGTTTGGTTTGA-GTAAGTGTCAGTCATTCCCCTTTATAAGTGTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAA-TAATGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACAGTACACAACATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATATTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGAAAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCG-GAT-GAAACAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTTATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATATTTATTTTTTC---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACTGGTTATGCATGATTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAA-TCTGAATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTATATAAAT------ACTAAAAATTGTTT---GAAAATCAGGATACGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCGCATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTTACCTTTTTCAATGCGATGTCGAAACGAGAAATCTCATATGATAAGCGTTCAGAATATGTGGTAAGTCT-------AGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGAC-------TCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA--TTT-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCATTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAACTTATCTTTTCAGAAATCATGCATTTGACGACCAAGCGCGA-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTTTTCAGCACTATCTCGGGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACTGGAAAGACGAGT-CA---------------AAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGAACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTTATTGTAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCATATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGTGAGCGAACTTTATAAAGCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|7 : GTAATTTGTTAACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGAAATAGTTAGATCTACTGACCGCCGTACTAAACTAAAATATTGTTAATAAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAAAGAACATTTCACATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCGGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACACAAAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTTGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCAATACCAGTTAGACAACATCAAAGGAAAGACGAGTAAAAAAATACTAAAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGTTTGATGAGATTTACTCTGGACTTTTTGAGAAAAAAAATCAGAAAACAAAGACGGTCCTTTTTCTATTTTATTGCAAAAACTGAACTTTAGTAATATAAAATACGAAATAAATAAGCAGTCACATCTCCTTAATCTACAAAAT-TATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATACTGCTGTTAAAGGGGACACATGGTAGTGAT---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--CAA-A-------TAAGTTTT-TAGGTAACAATATCACCTTCCTTGTGTTGTG--CTGTGTTGTGCTG-T-GC--TGTG-CTATACTATATTACATTATAT--TA-TTATCTATGTGTTTTTAAT-----TAC-AAAAGTAAAATA-CTGATATAAGATTA--GTGACATG------CAACTTCATATGTTT------AATGTTTGATATCTAGTCAATACATACTAGTCGGCTCCTTGAATTAATGTTAATGT-TTATA-ACTAGTCAATGTGCTTC-TGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATATTTATTAATCTACTGCTTATATGATTGAAGTCTTTATGA-GCTTAGTTGCTGAATAGAACTTGAAAACTTGATGTTGAA---AGTATT-----ATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCATATGGAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTAAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT---TTAAAGCAAGGAGTAAAACATCTTTTA-AAGTACAAAATGGTCGTTAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTCACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTTCT--GTGG----TATTTTTAATGTCATGTAC
gi|8 : AATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTGCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGTCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTCTAAATATTTTTAAAGGATTGGTG--GTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAA--TCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTACAAAAACTAAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAAGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGTCACATGGTAG---T---GATGC---AGACTTTTTGATAAAGA--GCT-TTTTTTTTTCTAAAGAAAA--TAATG-------CAAGTTCT-TAGGTAACAATATCACCTT-----CCTTATATTCTCTA-TGTGTTT-A-AA--A-TAACAAAATTATAATAC-TGACATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTCT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTACATGTTTACACATAAATCAATCTGCACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATCAG---TTATTTATTTTATTAAGCTAGAGCTGGCTTGCAAGTT---TTGAAACAATGAGTAAAattcattatagaaaaaacgtttaagtgaaattaata
gi|9 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGACTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATAGAACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAT---TTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTATGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGAGGTTTATATCCAGTCCATGAAAATGATTAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTACAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATTATTATTT---C---T---CTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAATAATCTGGATTTTTCACATTCCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTG-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAA-AT---ACTGTTGAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GTCATTTTTGTTATAAAATATCAAAATAAAAATGTTTAATGAAAATTCATCAACATTACTGCGTGTCCCTTTAAAA
Alignments
lowQualScore : 22222 111111 111111 11111 11111 11 11 22222222222 111 1 444444 111 11111 222222 11111111 111111 444444444444444444444 11111 111 111 1 11 11 11 2222222
lowQualScore : 4 0 1 4 1 9999 1 0 5 5 55555 5 5 444444 0 888 444444 22222 22222 0 3 2 8 5 5 5 00 2 0 55 44 1 5 8 44444444444 000 77 1 77 77 3 555555 77 666 5 5 5 5 1 0 4 8888 00000 4 1 66 4 999999 0 4 66666666 66 777 66 2 222222 0 5 66 222222222222222222222 22222 66 5 0 000 444 3 0 3 2 0 44 33 33 33 2 33 3333333 1
lowQualScore : . . . . . .... . . . . ..... . . ...... . ... ...... ..... ..... . . . . . . . .. . . .. .. . . . ........... ... .. . .. .. . ...... .. ... . . . . . . . .... ..... . . .. . ...... . . ........ .. ... .. . ...... . . .. ..................... ..... .. . . ... ... . . . . . .. .. .. .. . .. ....... .
lowQualScore : 4 1 8 4 9 4444 0 1 0 0 22222 0 0 444444 1 888 444444 55555 55555 7 3 5 5 0 0 0 66 5 5 66 44 0 7 0 11111111111 000 99 4 99 99 0 000000 44 000 0 0 0 0 4 1 4 5555 00000 0 4 11 4 333333 1 4 11111111 11 888 11 2 888888 1 0 99 555555555555555555555 55555 99 0 1 000 000 2 8 2 5 0 22 88 88 55 5 88 5555555 0
consensus : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT---TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
Reference ( family-3688 ) : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT------TATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT---TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
gi|1 : AGTATAAAATAA-------CTAA-CACTCTAAGGACAGCT-------------TACCTAGGAGACTTTTGATGTGA-GTTAGTACCAGTCATTCCCTTTGATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATTAT----ACGGTC-TACAGAAAGGTATTGAATTAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATAACGATACACAATATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAACTGTGT----ATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAAAATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACTGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGCTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-TCT-TTCTCCAGACTGATCTGGT-GTGCCATAACCGGTTGTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAAAATGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATAAAT------ACTAAATATTGTTC---TAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTCATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAACGCATATGATTAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA------------ACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAATGCC-AAAA-GGATGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTATTCTGGACTTTTGTA-GGGAAAAA-CAGCAAACAAAGACCGTCCTTTTTCCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATGTAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAT-CATTTTATATTATTTATACAATAGGGGAGCTAACTTTATAAAATATATTGGTGTTATA-GGCACACATGGTAG---T---A---CGACAGACT--CTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACCATTTCACTTTCCTTA-----TATTATACTCTT-TGTGTTT-TCAG-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATTTGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATACT-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGAAAATAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTAATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATATAT-----TGCTG--TATATGATTGGTGCCTTTATGG-GACTAGTTGCTAAATAAAACTTGAAAAGTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCAATGAAAATAATAACTTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT---TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACACAATGGTCGTGAC--TGTTAT--TTTACCACACAGTTAGAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACTATTTACAAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACTAGTGAAATTATGTACT--GTCG----TG-TTTTCATGTCATGT
gi|10 : GTATGAAATAATGCACAAGTAA-CACTCTAAGCACAGTTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCCTTTATAAGTTTGTCTACTTTATATTGTACTCATCAT----ACGGTCCTAAAGAAAAGTATTGAATCAGGGCACAAGTCATGATATTCCTGTTTAGTATAATTTTACTAATTTAAATAATTATTGTCCAATTACGATACACAGTATTTATTTCCTTTTCTTTTGT-----TATGTCTGTATTATTCACAGGGGATT-----TGCGAACATCAAGGACAAA-GGTGTATATCCTGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAAGT-
gi|11 : GTCTACACATAAATCAATTTGTACTGCTATGAAAATAGTAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATCATTTAATAAAATTAGTAATTATCT-TTTTATAAAGC
gi|12 : A-GTGTCAATTTACATAAATAATTATTTCT-T-CTCTCCAGACCGAATTGGTAGTGCCATAACCGGTTTTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAG-AAAACGGATGTTTCGAAAAAAAATCTGATTTTTTCACATTTCAACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGAATAAT------ACTAAACA-TATTT---GAAAATCAGGGTAT------------------------AA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACATTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|13 : TGGCGA---T---A---C---AGACATTCTCATAAAGATCGCA-AGTTTTG---TAAAGAAAA--TAAT--------------AACAATATCAAATTCTTTACATCATATTATACTGTT-TGTGTTT-T-AG-T-------------AATAC-TGATATAAGCTTTAATGACATG----TAAC-----TACAATATGCATAATGTTTGt
gi|14 : acctaactgcataaacattgtggttaaatatagagatgacatagaggtcggagaggcaaatagtttatatttttttaacgtataaactttaaaacaaaaagTAATGCCATA----AAAT-----TGC-ATATGCATAATGTTTAATATCAGGTCA--AT-ACACA-TGAGTCAATTTCATAAGTT-GGTATTTATGTTT-ATATTTAGTCAAT--------AT--GCATCT---GTTACTGTT--TGTATAATATAC------ATGT
gi|15 : taatacaaatgccgtaggtgacaaattccattctcttaaacgtcacaaagaaaTCACTGATGAATTTAAGTATTTCAACCATTTACTAAAAGTTTGCCCGCTTCCAAA--------CGAAATTATGTACTCAGTGGAGGAAA-TTTTGATTTTATGTAC
gi|16 : ATGTCA-ATAACTAGTCAAT--------AT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATAA---------------------ATCTGT-----TGATG--TATATGACAGATGCCCTTATGGAGCCTAGTTGTTGAAAAAAACTTG-AAACTTGA-AACAAGATT--TGTTTC-CCATGataatttcagaaaaggtgtttactgaacatttatgaaagtgaccgtgtgtccctttaagtaa
gi|17 : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAATTACCCGGCAGGCGTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTATCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTTCTACAAAAAAGTATT
gi|18 : ATGCACAAACAATCA-TCTAAGCATAATGAAGTGTAATCAGCTACCCGGATGGT-----ATGTGACGCTAGTGGCAGTCATTCCCCGCTATACATTTGTCTTGTTTATTTTGGACTTACCATATGAACGGTCCTACAGAAAA
gi|19 : at-TTAGTGAAATG----TAACGTAACTTC-ATGTGTAAAATGCTTGATATCTAGTCAACAT-ACAT--T-AGTCAGTTCCTTAAGT
gi|2 : agtacaccgtatacatttgatAGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGTAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATCCCCATTTACAAGTTTGTCTTCTTT-TGTTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAAAAAAATATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAAAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGCCCAATTACGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-----CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCAATAAGTTCGATACAGCAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-GTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAATTTGCTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGGCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAATGGACCCAATACTTTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTATATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTGTCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCA-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGCCAGACAACATCACAGGAAAGACGAAT--AAAAATACTC--GTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTT----------------------TCTGGACTTTTAGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGATCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATTAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATAATTTAAACAAAAGGGGAACTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGAACACATG---G---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTT-----------ATA----------T------TATTATACTCTA-TGTGTTT-A-AA-T-TG-CAAAATTATAATAC-TAATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTACCTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAA--AATAACCTCCTATCATTGCAATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAGGTT---TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTGAC--TTTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAATGTTTTGTCATTGATGATTTTCAATCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAATCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTCATGTCATGTAC
gi|20 : TTTTATAAAACTAGTAGTGGC--GCATGTTAACTT-AAACA-TGATTAAA-CAT-TTTAATAAATACAAAACGACCATT-CTTTGGCATTGTTTATCATA
gi|3 : AGTATGATATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGGAATAAGTTACCCGGGAGACTTTTGTTGGGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTA-------------GGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACAAAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTGTAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTTCAATTACGAAGTACAATATTTACTTTCTTTTCTCTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGAGGATTTGTTATGCCAACATCAAGGACAGGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGAACAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGATTAAAATAACCGATGGCCCTAAAGTGATAAGGTTTTCATTTTTTAACTTATAGCTGTTAATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAAAATACTTAAATAATTATTT-TTT-CTCTCCAGAATGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAATTCAATACAGTAAAATGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACAAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAT------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTAAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATTATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAATTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTT--------GAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGTATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCTATTTGGGACAATATATGTGTCTTCTGTACCATCTAGAGAGCCATTAGCAATCAGACAACATCACAGGAAAAACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGTTTAGGTTTACTCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAG----CAAAGACATTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACACGGTAGTGAT---A---C---AGACTTTCTTATGAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATTATACTCTA-TGTGTTTAA-AA-T-TA-CAAAATTAAAATAT-T-------GA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC-TA-T---TCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTC--TG-ATTATATAC------ATGTAG----TTTCA-AGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACATATAAATCAACCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAG
gi|4 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGCGTAATCAATTACCCGGTAGGCTTT-GGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGACTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ATGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGAAACACAATAATCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGCGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCTATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-----CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TAAGA-----TGACCACATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGCTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAGTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCACAGTACATTAAGTTTTGTTTCAAACCAAGGACATAGTTAGACCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACTGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCATGC-AAATAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTCAGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGT--GGTTTAATCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAACACAT
gi|4 : ACACATGGTAG---TGATA---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GTA-TTTTTTT--CTAAAGAAAAAATAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATTATA------TGTGTTT-A-AAAT-TA-CAAACTTATAATAA-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTATT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTT---------------------ATCTTT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GTCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAATTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTATACACATAAATCAATCTGTACTTCTATGAAAATAATAACCTCCTATCggtagtgatacagactttctgataaagagtatttttttctaaagaaaaaataatgcaagttcttaggtaacaatatcaccttccttatattatatgtgtttaaaattacaaacttataataatgatataagattagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagttaatactagtcagctccttgagtttgatattaatgtttataactagtcaatgtgcttctgtcactatttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttatttatcttttgctgtatatgattgatgcctttatgggtctagttgctgaataaaacttgaaaatttgatgttgaaattaatatttctccatgtatacacataaatcaatctgtacttctatgaaaataataacctcctatc
gi|5 : gtatgaaataatgcacaactaacactctaagcacagctaagcgtaatcaattacccggtaggctttggtgtgagttagtgccagtcattcccatttataagtttgacttctttatattggactcatcatatggtcctacagaaaagtattaaatcaggacacaagtcatgatattcctgttgagtataattttactaatttaaattattattgtccaattacgaaacacaataatcacttccttttcttttgttaaagtatgtttgtattattcacagcggattttttatgcgaacatcaaggacaagcggtttatatccagtccacgaaaatgatcaatgcagtgcacaggacgagcgaggtgaaataacctatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaagtgtcaatttacttaaataattatttctctccagactgatctggtagtgccataaccggttattcatgacttcgataagttcgatacagtaaaacggatgtttcgaaaaaaatctggatttttcacatttcgacacgaaaaattgtcagtttcttagattaatactaaatattgtttgaaaatcaggatatgcttttaagataagatgaccacattatttaatttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcgttgttgaatcgagaaagctcatatgataagggctcagaatatgtggtaagtccgaataccagtttggccacatcctccaacatcagtggacccaatactctatgtaatttgttcaccacctctggttcacagtacattaagttttgtttcaaaccaaggacatagttagacccactgaccgccgtacttaactaaaatactgttgattaactgagtaaagcaaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcagaaatcacgcatttgacgaccaagcatgcaaataagccaaaaggaagattcgatttcagacaatatctgcgtcttcagcaccatctcgagggccattaccagtcagacaacatcacaggaaaggcgagtcaaaaacactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtggtttaatctggactttttgaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtcctttttccatttaattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatccccttaatcaacaaaGTATGTTTGTATTATTCAT------TTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCAGTGTATATCCAGTCCACGCAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAACGCGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAAAGTGTCAATTTACTTTAATAATTATTT-TCT-CTCTCCATACTGATCTGGTAGTGCCATAATCGGTTATTCATGACTTCGATCAGTTCGATAAAATAAAACGGATGTTTCG-ACAAAAATCTGAATTTTTCCCATTTCGACACGAAAAAATTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTT--TATTGTTT---GAAAATCACGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCATTGTCTAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCTGAACACCAGTTTGGCCACATC-----------------------CTCTATGTGATTTGTTCACTACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGAAAAAAGTTAGATCCACTGACCGCCGAACTTTACTAAAATACTGTTGGTTAACGGAGTAAAGTGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCACAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGT-AAAAAAGCCAAAAA-GGAAGAATCAATTTGGGACAATATATGCGTCCTTAGCACCATCTCGATGGCCATTACCAGTTGGACAACATCACAGG-AAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGAAGTTTT-A-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTGTCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCTCCTTAATCAACAA
gi|5 : ATACGCTA-TGTGTTT-TCAA-T-TA-CAAAAGTACAATAC-TGATATAAGA-TAAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATACT-AGTCAGCTCATTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTC-----------------TTCT---GTCATTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTTAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTTCTATCACTGCGATACACACCTTAATAATTTAATAAAATTAG---TTGTTTATCTTATAAAGCTAGAACTGGCTTttgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacgctatgtgttttcaattacaaaagtacaatactgatataagataagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagtcaatacatactagtcagctcattgagtttgatattaatgtttataactagtcttctgtcattgtttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttattaatctattgctgtatatgattgatgcctttatgggcctagttgcttaataaaacttgaaaacttgatgttgaaattaatatttctccatgtctacacataaatcaatctgtactcctatgaaaataataaccttctatcactgcgatacacaccttaataatttaataaaattagttgtttatcttataaagctagaactggcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|6 : gtatgtttgtattattcatttttttatgcgaacatcaaggacaagcagtgtatatccagtccacgcaaatgatcaatgcagtgcacaggacgaacgcggtgaaataaccgatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaaagtgtcaatttactttaataattattttctctctccatactgatctggtagtgccataatcggttattcatgacttcgatcagttcgataaaataaaacggatgtttcgacaaaaatctgaatttttcccatttcgacacgaaaaaattgtcagtttcttagattaatactttattgtttgaaaatcacgatatgcttttaagattagatgaccacattatttaacttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcattgtctaatcgagaaagctcatatgataagggttcagaatacgtggtaagtctgaacaccagtttggccacatcctctatgtgatttgttcactacctctggttcatagtacattaaattttgttttaaaccaagaaaaaagttagatccactgaccgccgaactttactaaaatactgttggttaacggagtaaagtgaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcacaaatcacgcatttgacgaccaagcacgtaaaaaagccaaaaaggaagaatcaatttgggacaatatatgcgtccttagcaccatctcgatggccattaccagttggacaacatcacaggaagacgagtaaaaaatactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtgaggtttactctggaagttttaaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtccttttgtcattttattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatctccttaatcaacaattgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATGAAATAATGCACAACTAA-CAATCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCGTTTGGTTTGA-GTAAGTGTCAGTCATTCCCCTTTATAAGTGTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAA-TAATGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACAGTACACAACATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATATTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGAAAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCG-GAT-GAAACAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTTATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATATTTATTT-T-TTCTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACTGGTTATGCATGATTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAA-TCTGAATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTATATAAAT------ACTAAAAATTGTTT---GAAAATCAGGATACGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCGCATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTTACCTTTTTCAATGCGATGTCGAAACGAGAAATCTCATATGATAAGCGTTCAGAATATGTGGTAAGTCT-------AGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGAC-------TCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA--TTT-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCATTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAACTTATCTTTTCAGAAATCATGCATTTGACGACCAAGCGCGA-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTTTTCAGCACTATCTCGGGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACTGGAAAGACGAGT-CA---------------AAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGAACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTTATTGTAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCATATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGTGAGCGAACTTTATAAAGCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|7 : GTAATTTGTTAACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGAAATAGTTAGATCTACTGACCGCCGTACTAAACTAAAATATTGTTAATAAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAAAGAACATTTCACATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCGGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACACAAAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTTGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCAATACCAGTTAGACAACATCAAAGGAAAGACGAGTAAAAAAATACTAAAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGTTTGATGAGATTTACTCTGGACTTTTTGAGAAAAAAAATCAGAAAACAAAGACGGTCCTTTTTCTATTTTATTGCAAAAACTGAACTTTAGTAATATAAAATACGAAATAAATAAGCAGTCACATCTCCTTAATCTACAAAAT-TATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATACTGCTGTTAAAGGGGACACATGGTAGTGAT---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--CAA-ATAAGTTTTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTG-----TGTTGTGCTGTGTTGTGCTG-T-GC-TGTG-CTATACTATATTACATTATAT--TA-TTATCTATGTGTTTTTAAT-----TAC-AAAAGTAAAATA-CTGATATAAGATTA--GTGACATG------CAACTTCATATGT------TTAATGTTTGATATCTAGTCAATACATACTAGTCGGCTCCTTGAATTAATGTTAATGT-TTATA-ACTAGTCAATGTGCTTC-TGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATATTTATTAATCTACTGCTTATATGATTGAAGTCTTTATGA-GCTTAGTTGCTGAATAGAACTTGAAAACTTGATGTTGAA---AGTATT-----ATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCATATGGAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTAAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT---TTAAAGCAAGGAGTAAAACATCTTTTA-AAGTACAAAATGGTCGTTAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTCACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTTCT--GTGG----TATTTTTAATGTCATGTAC
gi|8 : AATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTGCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGTCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTCTAAATATTTTTAAAGGATTGGTG--GTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAA--TCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTACAAAAACTAAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAAGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGTCACATGGTAG---T---GATGC---AGACTTTTTGATAAAGA--GCT-TTTTTTTTTCTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATT---CTCTA-TGTGTTT-A-AA-A-TAACAAAATTATAATAC-TGACATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTCT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTACATGTTTACACATAAATCAATCTGCACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATCAG---TTATTTATTTTATTAAGCTAGAGCTGGCTTGCAAGTT---TTGAAACAATGAGTAAAattcattatagaaaaaacgtttaagtgaaattaata
gi|9 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGACTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATAGAACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAT---TTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTATGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGAGGTTTATATCCAGTCCATGAAAATGATTAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTACAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATTATTA--T-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAATAATCTGGATTTTTCACATTCCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTG-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAA-AT---ACTGTTGAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GTCATTTTTGTTATAAAATATCAAAATAAAAATGTTTAATGAAAATTCATCAACATTACTGCGTGTCCCTTTAAAA
Alignments
lowQualScore : 22222 111111 111111 11111 11111 11 11 22222222222 111 1 11111 11111111 11111 222222 11111111 111111 444444444444444444444 11111 111 11 1 11 11 11 2222222
lowQualScore : 4 0 1 4 1 9999 1 0 5 5 55555 5 5 444444 0 888 444444 22222 22222 0 3 2 8 5 5 5 00 2 0 55 44 1 5 8 44444444444 000 77 1 77 77 3 44444 77 88888888 5 5 1 0 4 8888 00000 4 1 66 4 999999 0 4 66666666 66 777 66 2 222222 0 5 66 222222222222222222222 22222 66 5 0 000 11 0 0 2 0 44 33 33 33 2 33 3333333 1
lowQualScore : . . . . . .... . . . . ..... . . ...... . ... ...... ..... ..... . . . . . . . .. . . .. .. . . . ........... ... .. . .. .. . ..... .. ........ . . . . . .... ..... . . .. . ...... . . ........ .. ... .. . ...... . . .. ..................... ..... .. . . ... .. . . . . .. .. .. .. . .. ....... .
lowQualScore : 4 1 8 4 9 4444 0 1 0 0 22222 0 0 444444 1 888 444444 55555 55555 7 3 5 5 0 0 0 66 5 5 66 44 0 7 0 11111111111 000 99 4 99 99 0 33333 44 11111111 0 0 4 1 4 5555 00000 0 4 11 4 333333 1 4 11111111 11 888 11 2 888888 1 0 99 555555555555555555555 55555 99 0 1 000 00 8 8 5 0 22 88 88 55 5 88 5555555 0
consensus : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
Reference ( family-3688 ) : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
gi|1 : AGTATAAAATAA-------CTAA-CACTCTAAGGACAGCT-------------TACCTAGGAGACTTTTGATGTGA-GTTAGTACCAGTCATTCCCTTTGATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATTAT----ACGGTC-TACAGAAAGGTATTGAATTAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATAACGATACACAATATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAACTGTGT----ATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAAAATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACTGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGCTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-TCT-TTCTCCAGACTGATCTGGT-GTGCCATAACCGGTTGTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAAAATGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATAAAT------ACTAAATATTGTTC---TAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTCATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAACGCATATGATTAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA------------ACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAATGCC-AAAA-GGATGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTATTCTGGACTTTTGTA-GGGAAAAA-CAGCAAACAAAGACCGTCCTTTTTCCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATGTAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAT-CATTTTATATTATTTATACAATAGGGGAGCTAACTTTATAAAATATATTGGTGTTATA-GGCACACATGGTAG---T---A---CGACAGACT--CTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACCATTTCACTTTCCTT-----ATATTATACTCTT-TGTGTTT-TCAG-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATTTGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATACT-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGAAAATAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTAATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATATAT-----TGCTG--TATATGATTGGTGCCTTTATGG-GACTAGTTGCTAAATAAAACTTGAAAAGTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCAATGAAAATAATAACTTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACACAATGGTCGTGAC--TGTTAT--TTTACCACACAGTTAGAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACTATTTACAAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACTAGTGAAATTATGTACT--GTCG----TG-TTTTCATGTCATGT
gi|10 : GTATGAAATAATGCACAAGTAA-CACTCTAAGCACAGTTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCCTTTATAAGTTTGTCTACTTTATATTGTACTCATCAT----ACGGTCCTAAAGAAAAGTATTGAATCAGGGCACAAGTCATGATATTCCTGTTTAGTATAATTTTACTAATTTAAATAATTATTGTCCAATTACGATACACAGTATTTATTTCCTTTTCTTTTGT-----TATGTCTGTATTATTCACAGGGGATT-----TGCGAACATCAAGGACAAA-GGTGTATATCCTGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAAGT-
gi|11 : GTCTACACATAAATCAATTTGTACTGCTATGAAAATAGTAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATCATTTAATAAAATTAGTAATTATCT-TTTTATAAAGC
gi|12 : A-GTGTCAATTTACATAAATAATTATTTCT-T-CTCTCCAGACCGAATTGGTAGTGCCATAACCGGTTTTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAG-AAAACGGATGTTTCGAAAAAAAATCTGATTTTTTCACATTTCAACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGAATAAT------ACTAAACA-TATTT---GAAAATCAGGGTAT------------------------AA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACATTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|13 : TGGCGA---T---A---C---AGACATTCTCATAAAGATCGCA-AGTTTTG---TAAAGAAAA--TAAT--------------AACAATATCAAATTCTTTACATCATATTATACTGTT-TGTGTTT-T-A--------------GTAATAC-TGATATAAGCTTTAATGACATG----TAAC-----TACAATATGCATAATGTTTGt
gi|14 : acctaactgcataaacattgtggttaaatatagagatgacatagaggtcggagaggcaaatagtttatatttttttaacgtataaactttaaaacaaaaagTAATGCCATA----AAAT-----TGC-ATATGCATAATGTTTAATATCAGGTCA--AT-ACACA-TGAGTCAATTTCATAAGTT-GGTATTTATGTTT-ATATTTAGTCAAT--------AT--GCATCT---GTTACTGTT--TGTATAATATAC------ATGT
gi|15 : taatacaaatgccgtaggtgacaaattccattctcttaaacgtcacaaagaaaTCACTGATGAATTTAAGTATTTCAACCATTTACTAAAAGTTTGCCCGCTTCCAAA--------CGAAATTATGTACTCAGTGGAGGAAA-TTTTGATTTTATGTAC
gi|16 : ATGTCA-ATAACTAGTCAAT--------AT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATAA---------------------ATCTGT-----TGATG--TATATGACAGATGCCCTTATGGAGCCTAGTTGTTGAAAAAAACTTG-AAACTTGA-AACAAGATT--TGTTTC-CCATGataatttcagaaaaggtgtttactgaacatttatgaaagtgaccgtgtgtccctttaagtaa
gi|17 : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAATTACCCGGCAGGCGTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTATCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTTCTACAAAAAAGTATT
gi|18 : ATGCACAAACAATCA-TCTAAGCATAATGAAGTGTAATCAGCTACCCGGATGGT-----ATGTGACGCTAGTGGCAGTCATTCCCCGCTATACATTTGTCTTGTTTATTTTGGACTTACCATATGAACGGTCCTACAGAAAA
gi|19 : at-TTAGTGAAATG----TAACGTAACTTC-ATGTGTAAAATGCTTGATATCTAGTCAACAT-ACAT--T-AGTCAGTTCCTTAAGT
gi|2 : agtacaccgtatacatttgatAGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGTAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATCCCCATTTACAAGTTTGTCTTCTTT-TGTTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAAAAAAATATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAAAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGCCCAATTACGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-----CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCAATAAGTTCGATACAGCAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-GTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAATTTGCTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGGCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAATGGACCCAATACTTTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTATATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTGTCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCA-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGCCAGACAACATCACAGGAAAGACGAAT--AAAAATACTC--GTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTT----------------------TCTGGACTTTTAGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGATCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATTAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATAATTTAAACAAAAGGGGAACTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGAACACATG---G---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTT-----------ATAT----------------TATTATACTCTA-TGTGTTT-A-AA-T-TG-CAAAATTATAATAC-TAATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTACCTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAA--AATAACCTCCTATCATTGCAATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAGGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTGAC--TTTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAATGTTTTGTCATTGATGATTTTCAATCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAATCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTCATGTCATGTAC
gi|20 : TTTTATAAAACTAGTAGTGGC--GCATGTTAACTTAAAC-ATGATT-AAACAT-TTTAATAAATACAAAACGACCATT-CTTTGGCATTGTTTATCATA
gi|3 : AGTATGATATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGGAATAAGTTACCCGGGAGACTTTTGTTGGGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTA-------------GGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACAAAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTGTAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTTCAATTACGAAGTACAATATTTACTTTCTTTTCTCTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGAGGATTTGTTATGCCAACATCAAGGACAGGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGAACAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGATTAAAATAACCGATGGCCCTAAAGTGATAAGGTTTTCATTTTTTAACTTATAGCTGTTAATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAAAATACTTAAATAATTATTT-TTT-CTCTCCAGAATGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAATTCAATACAGTAAAATGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACAAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAT------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTAAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATTATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAATTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTT--------GAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGTATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCTATTTGGGACAATATATGTGTCTTCTGTACCATCTAGAGAGCCATTAGCAATCAGACAACATCACAGGAAAAACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGTTTAGGTTTACTCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAG----CAAAGACATTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACACGGTAGTGAT---A---C---AGACTTTCTTATGAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATACTCTA-TGTGTTTAA-AA-T-TA-CAAAATTAAAATAT-T-------GA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC-TA-T---TCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTC--TG-ATTATATAC------ATGTAG----TTTCA-AGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACATATAAATCAACCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAG
gi|4 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGCGTAATCAATTACCCGGTAGGCTTT-GGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGACTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ATGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGAAACACAATAATCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGCGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCTATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-----CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TAAGA-----TGACCACATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGCTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAGTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCACAGTACATTAAGTTTTGTTTCAAACCAAGGACATAGTTAGACCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACTGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCATGC-AAATAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTCAGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGT--GGTTTAATCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAACACAT
gi|4 : ACACATGGTAG---TGATA---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GTA-TTTTTTT--CTAAAGAAAAAATAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATA------TGTGTTT-A-AAAT-TA-CAAACTTATAATAA-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTATT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTT---------------------ATCTTT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GTCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAATTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTATACACATAAATCAATCTGTACTTCTATGAAAATAATAACCTCCTATCggtagtgatacagactttctgataaagagtatttttttctaaagaaaaaataatgcaagttcttaggtaacaatatcaccttccttatattatatgtgtttaaaattacaaacttataataatgatataagattagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagttaatactagtcagctccttgagtttgatattaatgtttataactagtcaatgtgcttctgtcactatttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttatttatcttttgctgtatatgattgatgcctttatgggtctagttgctgaataaaacttgaaaatttgatgttgaaattaatatttctccatgtatacacataaatcaatctgtacttctatgaaaataataacctcctatc
gi|5 : gtatgaaataatgcacaactaacactctaagcacagctaagcgtaatcaattacccggtaggctttggtgtgagttagtgccagtcattcccatttataagtttgacttctttatattggactcatcatatggtcctacagaaaagtattaaatcaggacacaagtcatgatattcctgttgagtataattttactaatttaaattattattgtccaattacgaaacacaataatcacttccttttcttttgttaaagtatgtttgtattattcacagcggattttttatgcgaacatcaaggacaagcggtttatatccagtccacgaaaatgatcaatgcagtgcacaggacgagcgaggtgaaataacctatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaagtgtcaatttacttaaataattatttctctccagactgatctggtagtgccataaccggttattcatgacttcgataagttcgatacagtaaaacggatgtttcgaaaaaaatctggatttttcacatttcgacacgaaaaattgtcagtttcttagattaatactaaatattgtttgaaaatcaggatatgcttttaagataagatgaccacattatttaatttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcgttgttgaatcgagaaagctcatatgataagggctcagaatatgtggtaagtccgaataccagtttggccacatcctccaacatcagtggacccaatactctatgtaatttgttcaccacctctggttcacagtacattaagttttgtttcaaaccaaggacatagttagacccactgaccgccgtacttaactaaaatactgttgattaactgagtaaagcaaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcagaaatcacgcatttgacgaccaagcatgcaaataagccaaaaggaagattcgatttcagacaatatctgcgtcttcagcaccatctcgagggccattaccagtcagacaacatcacaggaaaggcgagtcaaaaacactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtggtttaatctggactttttgaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtcctttttccatttaattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatccccttaatcaacaaaGTATGTTTGTATTATTCAT------TTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCAGTGTATATCCAGTCCACGCAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAACGCGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAAAGTGTCAATTTACTTTAATAATTATTT-TCT-CTCTCCATACTGATCTGGTAGTGCCATAATCGGTTATTCATGACTTCGATCAGTTCGATAAAATAAAACGGATGTTTCG-ACAAAAATCTGAATTTTTCCCATTTCGACACGAAAAAATTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTT--TATTGTTT---GAAAATCACGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCATTGTCTAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCTGAACACCAGTTTGGCCACATC-----------------------CTCTATGTGATTTGTTCACTACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGAAAAAAGTTAGATCCACTGACCGCCGAACTTTACTAAAATACTGTTGGTTAACGGAGTAAAGTGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCACAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGT-AAAAAAGCCAAAAA-GGAAGAATCAATTTGGGACAATATATGCGTCCTTAGCACCATCTCGATGGCCATTACCAGTTGGACAACATCACAGG-AAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGAAGTTTT-A-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTGTCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCTCCTTAATCAACAA
gi|5 : ATACGCTA-TGTGTTT-TCAA-T-TA-CAAAAGTACAATAC-TGATATAAGA-TAAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATACT-AGTCAGCTCATTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTC-----------------TTCT---GTCATTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTTAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTTCTATCACTGCGATACACACCTTAATAATTTAATAAAATTAG---TTGTTTATCTTATAAAGCTAGAACTGGCTTttgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacgctatgtgttttcaattacaaaagtacaatactgatataagataagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagtcaatacatactagtcagctcattgagtttgatattaatgtttataactagtcttctgtcattgtttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttattaatctattgctgtatatgattgatgcctttatgggcctagttgcttaataaaacttgaaaacttgatgttgaaattaatatttctccatgtctacacataaatcaatctgtactcctatgaaaataataaccttctatcactgcgatacacaccttaataatttaataaaattagttgtttatcttataaagctagaactggcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|6 : gtatgtttgtattattcatttttttatgcgaacatcaaggacaagcagtgtatatccagtccacgcaaatgatcaatgcagtgcacaggacgaacgcggtgaaataaccgatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaaagtgtcaatttactttaataattattttctctctccatactgatctggtagtgccataatcggttattcatgacttcgatcagttcgataaaataaaacggatgtttcgacaaaaatctgaatttttcccatttcgacacgaaaaaattgtcagtttcttagattaatactttattgtttgaaaatcacgatatgcttttaagattagatgaccacattatttaacttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcattgtctaatcgagaaagctcatatgataagggttcagaatacgtggtaagtctgaacaccagtttggccacatcctctatgtgatttgttcactacctctggttcatagtacattaaattttgttttaaaccaagaaaaaagttagatccactgaccgccgaactttactaaaatactgttggttaacggagtaaagtgaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcacaaatcacgcatttgacgaccaagcacgtaaaaaagccaaaaaggaagaatcaatttgggacaatatatgcgtccttagcaccatctcgatggccattaccagttggacaacatcacaggaagacgagtaaaaaatactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtgaggtttactctggaagttttaaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtccttttgtcattttattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatctccttaatcaacaattgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATGAAATAATGCACAACTAA-CAATCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCGTTTGGTTTGA-GTAAGTGTCAGTCATTCCCCTTTATAAGTGTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAA-TAATGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACAGTACACAACATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATATTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGAAAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCG-GAT-GAAACAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTTATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATATTTATTT-T-TTCTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACTGGTTATGCATGATTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAA-TCTGAATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTATATAAAT------ACTAAAAATTGTTT---GAAAATCAGGATACGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCGCATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTTACCTTTTTCAATGCGATGTCGAAACGAGAAATCTCATATGATAAGCGTTCAGAATATGTGGTAAGTCT-------AGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGAC-------TCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA--TTT-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCATTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAACTTATCTTTTCAGAAATCATGCATTTGACGACCAAGCGCGA-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTTTTCAGCACTATCTCGGGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACTGGAAAGACGAGT-CA---------------AAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGAACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTTATTGTAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCATATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGTGAGCGAACTTTATAAAGCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|7 : GTAATTTGTTAACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGAAATAGTTAGATCTACTGACCGCCGTACTAAACTAAAATATTGTTAATAAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAAAGAACATTTCACATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCGGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACACAAAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTTGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCAATACCAGTTAGACAACATCAAAGGAAAGACGAGTAAAAAAATACTAAAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGTTTGATGAGATTTACTCTGGACTTTTTGAGAAAAAAAATCAGAAAACAAAGACGGTCCTTTTTCTATTTTATTGCAAAAACTGAACTTTAGTAATATAAAATACGAAATAAATAAGCAGTCACATCTCCTTAATCTACAAAAT-TATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATACTGCTGTTAAAGGGGACACATGGTAGTGAT---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--CAA-ATAAGTTTTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----GTGTTGTGCTGTGTTGTGCTG-T-GC-TGTG-CTATACTATATTACATTATAT--TA-TTATCTATGTGTTTTTAAT-----TAC-AAAAGTAAAATA-CTGATATAAGATTA--GTGACATG------CAACTTCATATGT------TTAATGTTTGATATCTAGTCAATACATACTAGTCGGCTCCTTGAATTAATGTTAATGT-TTATA-ACTAGTCAATGTGCTTC-TGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATATTTATTAATCTACTGCTTATATGATTGAAGTCTTTATGA-GCTTAGTTGCTGAATAGAACTTGAAAACTTGATGTTGAA---AGTATT-----ATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCATATGGAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTAAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTAAAGCAAGGAGTAAAACATCTTTTA-AAGTACAAAATGGTCGTTAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTCACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTTCT--GTGG----TATTTTTAATGTCATGTAC
gi|8 : AATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTGCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGTCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTCTAAATATTTTTAAAGGATTGGTG--GTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAA--TCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTACAAAAACTAAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAAGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGTCACATGGTAG---T---GATGC---AGACTTTTTGATAAAGA--GCT-TTTTTTTTTCTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATT---CTCTA-TGTGTTT-A-AA-A-TAACAAAATTATAATAC-TGACATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTCT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTACATGTTTACACATAAATCAATCTGCACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATCAG---TTATTTATTTTATTAAGCTAGAGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAattcattatagaaaaaacgtttaagtgaaattaata
gi|9 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGACTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATAGAACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAT---TTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTATGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGAGGTTTATATCCAGTCCATGAAAATGATTAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTACAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATTATTA--T-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAATAATCTGGATTTTTCACATTCCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTG-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAA-AT---ACTGTTGAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GTCATTTTTGTTATAAAATATCAAAATAAAAATGTTTAATGAAAATTCATCAACATTACTGCGTGTCCCTTTAAAA
Alignments
lowQualScore : 22222 111111 111111 11111 11111 11 11 22222222222 111 1 11111 11111111 11111 222222 11111111 111111 444444444444444444444 11111 111 11 1 11 11 11 2222222
lowQualScore : 4 0 1 4 1 9999 1 0 5 5 55555 5 5 444444 0 888 444444 22222 22222 0 3 2 8 5 5 5 00 2 0 55 44 1 5 8 44444444444 000 77 1 77 77 3 44444 77 88888888 5 5 1 0 4 8888 00000 4 1 66 4 999999 0 4 66666666 66 777 66 2 222222 0 5 66 222222222222222222222 22222 66 5 0 000 11 0 0 2 0 44 33 33 33 2 33 3333333 1
lowQualScore : . . . . . .... . . . . ..... . . ...... . ... ...... ..... ..... . . . . . . . .. . . .. .. . . . ........... ... .. . .. .. . ..... .. ........ . . . . . .... ..... . . .. . ...... . . ........ .. ... .. . ...... . . .. ..................... ..... .. . . ... .. . . . . .. .. .. .. . .. ....... .
lowQualScore : 4 1 8 4 9 4444 0 1 0 0 22222 0 0 444444 1 888 444444 55555 55555 7 3 5 5 0 0 0 66 5 5 66 44 0 7 0 11111111111 000 99 4 99 99 0 33333 44 11111111 0 0 4 1 4 5555 00000 0 4 11 4 333333 1 4 11111111 11 888 11 2 888888 1 0 99 555555555555555555555 55555 99 0 1 000 00 8 8 5 0 22 88 88 55 5 88 5555555 0
consensus : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
Reference ( family-3688 ) : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
gi|1 : AGTATAAAATAA-------CTAA-CACTCTAAGGACAGCT-------------TACCTAGGAGACTTTTGATGTGA-GTTAGTACCAGTCATTCCCTTTGATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATTAT----ACGGTC-TACAGAAAGGTATTGAATTAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATAACGATACACAATATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAACTGTGT----ATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAAAATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACTGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGCTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-TCT-TTCTCCAGACTGATCTGGT-GTGCCATAACCGGTTGTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAAAATGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATAAAT------ACTAAATATTGTTC---TAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTCATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAACGCATATGATTAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA------------ACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAATGCC-AAAA-GGATGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTATTCTGGACTTTTGTA-GGGAAAAA-CAGCAAACAAAGACCGTCCTTTTTCCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATGTAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAT-CATTTTATATTATTTATACAATAGGGGAGCTAACTTTATAAAATATATTGGTGTTATA-GGCACACATGGTAG---T---A---CGACAGACT--CTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACCATTTCACTTTCCTT-----ATATTATACTCTT-TGTGTTT-TCAG-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATTTGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATACT-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGAAAATAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTAATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATATAT-----TGCTG--TATATGATTGGTGCCTTTATGG-GACTAGTTGCTAAATAAAACTTGAAAAGTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCAATGAAAATAATAACTTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACACAATGGTCGTGAC--TGTTAT--TTTACCACACAGTTAGAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACTATTTACAAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACTAGTGAAATTATGTACT--GTCG----TG-TTTTCATGTCATGT
gi|10 : GTATGAAATAATGCACAAGTAA-CACTCTAAGCACAGTTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCCTTTATAAGTTTGTCTACTTTATATTGTACTCATCAT----ACGGTCCTAAAGAAAAGTATTGAATCAGGGCACAAGTCATGATATTCCTGTTTAGTATAATTTTACTAATTTAAATAATTATTGTCCAATTACGATACACAGTATTTATTTCCTTTTCTTTTGT-----TATGTCTGTATTATTCACAGGGGATT-----TGCGAACATCAAGGACAAA-GGTGTATATCCTGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAAGT-
gi|11 : GTCTACACATAAATCAATTTGTACTGCTATGAAAATAGTAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATCATTTAATAAAATTAGTAATTATCT-TTTTATAAAGC
gi|12 : A-GTGTCAATTTACATAAATAATTATTTCT-T-CTCTCCAGACCGAATTGGTAGTGCCATAACCGGTTTTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAG-AAAACGGATGTTTCGAAAAAAAATCTGATTTTTTCACATTTCAACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGAATAAT------ACTAAACA-TATTT---GAAAATCAGGGTAT------------------------AA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACATTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|13 : TGGCGA---T---A---C---AGACATTCTCATAAAGATCGCA-AGTTTTG---TAAAGAAAA--TAAT--------------AACAATATCAAATTCTTTACATCATATTATACTGTT-TGTGTTT-T-A--------------GTAATAC-TGATATAAGCTTTAATGACATG----TAAC-----TACAATATGCATAATGTTTGt
gi|14 : acctaactgcataaacattgtggttaaatatagagatgacatagaggtcggagaggcaaatagtttatatttttttaacgtataaactttaaaacaaaaagTAATGCCATA----AAAT-----TGC-ATATGCATAATGTTTAATATCAGGTCA--AT-ACACA-TGAGTCAATTTCATAAGTT-GGTATTTATGTTT-ATATTTAGTCAAT--------AT--GCATCT---GTTACTGTT--TGTATAATATAC------ATGT
gi|15 : taatacaaatgccgtaggtgacaaattccattctcttaaacgtcacaaagaaaTCACTGATGAATTTAAGTATTTCAACCATTTACTAAAAGTTTGCCCGCTTCCAAA--------CGAAATTATGTACTCAGTGGAGGAAA-TTTTGATTTTATGTAC
gi|16 : ATGTCA-ATAACTAGTCAAT--------AT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATAA---------------------ATCTGT-----TGATG--TATATGACAGATGCCCTTATGGAGCCTAGTTGTTGAAAAAAACTTG-AAACTTGA-AACAAGATT--TGTTTC-CCATGataatttcagaaaaggtgtttactgaacatttatgaaagtgaccgtgtgtccctttaagtaa
gi|17 : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAATTACCCGGCAGGCGTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTATCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTTCTACAAAAAAGTATT
gi|18 : ATGCACAAACAATCA-TCTAAGCATAATGAAGTGTAATCAGCTACCCGGATGGT-----ATGTGACGCTAGTGGCAGTCATTCCCCGCTATACATTTGTCTTGTTTATTTTGGACTTACCATATGAACGGTCCTACAGAAAA
gi|19 : at-TTAGTGAAATG----TAACGTAACTTC-ATGTGTAAAATGCTTGATATCTAGTCAACAT-ACAT--T-AGTCAGTTCCTTAAGT
gi|2 : agtacaccgtatacatttgatAGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGTAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATCCCCATTTACAAGTTTGTCTTCTTT-TGTTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAAAAAAATATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAAAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGCCCAATTACGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-----CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCAATAAGTTCGATACAGCAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-GTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAATTTGCTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGGCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAATGGACCCAATACTTTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTATATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTGTCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCA-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGCCAGACAACATCACAGGAAAGACGAAT--AAAAATACTC--GTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTT----------------------TCTGGACTTTTAGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGATCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATTAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATAATTTAAACAAAAGGGGAACTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGAACACATG---G---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTT-----------ATAT----------------TATTATACTCTA-TGTGTTT-A-AA-T-TG-CAAAATTATAATAC-TAATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTACCTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAA--AATAACCTCCTATCATTGCAATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAGGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTGAC--TTTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAATGTTTTGTCATTGATGATTTTCAATCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAATCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTCATGTCATGTAC
gi|20 : TTTTATAAAACTAGTAGTGGC--GCATGTTAACTTAAAC-ATGATT-AAACAT-TTTAATAAATACAAAACGACCATT-CTTTGGCATTGTTTATCATA
gi|3 : AGTATGATATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGGAATAAGTTACCCGGGAGACTTTTGTTGGGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTA-------------GGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACAAAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTGTAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTTCAATTACGAAGTACAATATTTACTTTCTTTTCTCTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGAGGATTTGTTATGCCAACATCAAGGACAGGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGAACAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGATTAAAATAACCGATGGCCCTAAAGTGATAAGGTTTTCATTTTTTAACTTATAGCTGTTAATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAAAATACTTAAATAATTATTT-TTT-CTCTCCAGAATGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAATTCAATACAGTAAAATGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACAAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAT------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTAAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATTATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAATTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTT--------GAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGTATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCTATTTGGGACAATATATGTGTCTTCTGTACCATCTAGAGAGCCATTAGCAATCAGACAACATCACAGGAAAAACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGTTTAGGTTTACTCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAG----CAAAGACATTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACACGGTAGTGAT---A---C---AGACTTTCTTATGAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATACTCTA-TGTGTTTAA-AA-T-TA-CAAAATTAAAATAT-T-------GA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC-TA-T---TCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTC--TG-ATTATATAC------ATGTAG----TTTCA-AGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACATATAAATCAACCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAG
gi|4 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGCGTAATCAATTACCCGGTAGGCTTT-GGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGACTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ATGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGAAACACAATAATCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGCGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCTATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-----CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TAAGA-----TGACCACATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGCTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAGTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCACAGTACATTAAGTTTTGTTTCAAACCAAGGACATAGTTAGACCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACTGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCATGC-AAATAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTCAGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGT--GGTTTAATCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAACACAT
gi|4 : ACACATGGTAG---TGATA---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GTA-TTTTTTT--CTAAAGAAAAAATAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATA------TGTGTTT-A-AAAT-TA-CAAACTTATAATAA-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTATT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTT---------------------ATCTTT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GTCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAATTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTATACACATAAATCAATCTGTACTTCTATGAAAATAATAACCTCCTATCggtagtgatacagactttctgataaagagtatttttttctaaagaaaaaataatgcaagttcttaggtaacaatatcaccttccttatattatatgtgtttaaaattacaaacttataataatgatataagattagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagttaatactagtcagctccttgagtttgatattaatgtttataactagtcaatgtgcttctgtcactatttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttatttatcttttgctgtatatgattgatgcctttatgggtctagttgctgaataaaacttgaaaatttgatgttgaaattaatatttctccatgtatacacataaatcaatctgtacttctatgaaaataataacctcctatc
gi|5 : gtatgaaataatgcacaactaacactctaagcacagctaagcgtaatcaattacccggtaggctttggtgtgagttagtgccagtcattcccatttataagtttgacttctttatattggactcatcatatggtcctacagaaaagtattaaatcaggacacaagtcatgatattcctgttgagtataattttactaatttaaattattattgtccaattacgaaacacaataatcacttccttttcttttgttaaagtatgtttgtattattcacagcggattttttatgcgaacatcaaggacaagcggtttatatccagtccacgaaaatgatcaatgcagtgcacaggacgagcgaggtgaaataacctatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaagtgtcaatttacttaaataattatttctctccagactgatctggtagtgccataaccggttattcatgacttcgataagttcgatacagtaaaacggatgtttcgaaaaaaatctggatttttcacatttcgacacgaaaaattgtcagtttcttagattaatactaaatattgtttgaaaatcaggatatgcttttaagataagatgaccacattatttaatttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcgttgttgaatcgagaaagctcatatgataagggctcagaatatgtggtaagtccgaataccagtttggccacatcctccaacatcagtggacccaatactctatgtaatttgttcaccacctctggttcacagtacattaagttttgtttcaaaccaaggacatagttagacccactgaccgccgtacttaactaaaatactgttgattaactgagtaaagcaaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcagaaatcacgcatttgacgaccaagcatgcaaataagccaaaaggaagattcgatttcagacaatatctgcgtcttcagcaccatctcgagggccattaccagtcagacaacatcacaggaaaggcgagtcaaaaacactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtggtttaatctggactttttgaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtcctttttccatttaattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatccccttaatcaacaaaGTATGTTTGTATTATTCAT------TTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCAGTGTATATCCAGTCCACGCAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAACGCGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAAAGTGTCAATTTACTTTAATAATTATTT-TCT-CTCTCCATACTGATCTGGTAGTGCCATAATCGGTTATTCATGACTTCGATCAGTTCGATAAAATAAAACGGATGTTTCG-ACAAAAATCTGAATTTTTCCCATTTCGACACGAAAAAATTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTT--TATTGTTT---GAAAATCACGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCATTGTCTAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCTGAACACCAGTTTGGCCACATC-----------------------CTCTATGTGATTTGTTCACTACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGAAAAAAGTTAGATCCACTGACCGCCGAACTTTACTAAAATACTGTTGGTTAACGGAGTAAAGTGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCACAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGT-AAAAAAGCCAAAAA-GGAAGAATCAATTTGGGACAATATATGCGTCCTTAGCACCATCTCGATGGCCATTACCAGTTGGACAACATCACAGG-AAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGAAGTTTT-A-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTGTCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCTCCTTAATCAACAA
gi|5 : ATACGCTA-TGTGTTT-TCAA-T-TA-CAAAAGTACAATAC-TGATATAAGA-TAAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATACT-AGTCAGCTCATTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTC-----------------TTCT---GTCATTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTTAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTTCTATCACTGCGATACACACCTTAATAATTTAATAAAATTAG---TTGTTTATCTTATAAAGCTAGAACTGGCTTttgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacgctatgtgttttcaattacaaaagtacaatactgatataagataagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagtcaatacatactagtcagctcattgagtttgatattaatgtttataactagtcttctgtcattgtttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttattaatctattgctgtatatgattgatgcctttatgggcctagttgcttaataaaacttgaaaacttgatgttgaaattaatatttctccatgtctacacataaatcaatctgtactcctatgaaaataataaccttctatcactgcgatacacaccttaataatttaataaaattagttgtttatcttataaagctagaactggcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|6 : gtatgtttgtattattcatttttttatgcgaacatcaaggacaagcagtgtatatccagtccacgcaaatgatcaatgcagtgcacaggacgaacgcggtgaaataaccgatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaaagtgtcaatttactttaataattattttctctctccatactgatctggtagtgccataatcggttattcatgacttcgatcagttcgataaaataaaacggatgtttcgacaaaaatctgaatttttcccatttcgacacgaaaaaattgtcagtttcttagattaatactttattgtttgaaaatcacgatatgcttttaagattagatgaccacattatttaacttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcattgtctaatcgagaaagctcatatgataagggttcagaatacgtggtaagtctgaacaccagtttggccacatcctctatgtgatttgttcactacctctggttcatagtacattaaattttgttttaaaccaagaaaaaagttagatccactgaccgccgaactttactaaaatactgttggttaacggagtaaagtgaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcacaaatcacgcatttgacgaccaagcacgtaaaaaagccaaaaaggaagaatcaatttgggacaatatatgcgtccttagcaccatctcgatggccattaccagttggacaacatcacaggaagacgagtaaaaaatactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtgaggtttactctggaagttttaaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtccttttgtcattttattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatctccttaatcaacaattgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATGAAATAATGCACAACTAA-CAATCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCGTTTGGTTTGA-GTAAGTGTCAGTCATTCCCCTTTATAAGTGTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAA-TAATGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACAGTACACAACATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATATTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGAAAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCG-GAT-GAAACAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTTATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATATTTATTT-T-TTCTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACTGGTTATGCATGATTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAA-TCTGAATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTATATAAAT------ACTAAAAATTGTTT---GAAAATCAGGATACGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCGCATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTTACCTTTTTCAATGCGATGTCGAAACGAGAAATCTCATATGATAAGCGTTCAGAATATGTGGTAAGTCT-------AGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGAC-------TCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA--TTT-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCATTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAACTTATCTTTTCAGAAATCATGCATTTGACGACCAAGCGCGA-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTTTTCAGCACTATCTCGGGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACTGGAAAGACGAGT-CA---------------AAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGAACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTTATTGTAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCATATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGTGAGCGAACTTTATAAAGCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|7 : GTAATTTGTTAACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGAAATAGTTAGATCTACTGACCGCCGTACTAAACTAAAATATTGTTAATAAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAAAGAACATTTCACATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCGGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACACAAAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTTGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCAATACCAGTTAGACAACATCAAAGGAAAGACGAGTAAAAAAATACTAAAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGTTTGATGAGATTTACTCTGGACTTTTTGAGAAAAAAAATCAGAAAACAAAGACGGTCCTTTTTCTATTTTATTGCAAAAACTGAACTTTAGTAATATAAAATACGAAATAAATAAGCAGTCACATCTCCTTAATCTACAAAAT-TATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATACTGCTGTTAAAGGGGACACATGGTAGTGAT---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--CAA-ATAAGTTTTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----GTGTTGTGCTGTGTTGTGCTG-T-GC-TGTG-CTATACTATATTACATTATAT--TA-TTATCTATGTGTTTTTAAT-----TAC-AAAAGTAAAATA-CTGATATAAGATTA--GTGACATG------CAACTTCATATGT------TTAATGTTTGATATCTAGTCAATACATACTAGTCGGCTCCTTGAATTAATGTTAATGT-TTATA-ACTAGTCAATGTGCTTC-TGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATATTTATTAATCTACTGCTTATATGATTGAAGTCTTTATGA-GCTTAGTTGCTGAATAGAACTTGAAAACTTGATGTTGAA---AGTATT-----ATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCATATGGAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTAAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTAAAGCAAGGAGTAAAACATCTTTTA-AAGTACAAAATGGTCGTTAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTCACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTTCT--GTGG----TATTTTTAATGTCATGTAC
gi|8 : AATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTGCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGTCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTCTAAATATTTTTAAAGGATTGGTG--GTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAA--TCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTACAAAAACTAAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAAGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGTCACATGGTAG---T---GATGC---AGACTTTTTGATAAAGA--GCT-TTTTTTTTTCTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATT---CTCTA-TGTGTTT-A-AA-A-TAACAAAATTATAATAC-TGACATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--AT-AC----T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTCT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTACATGTTTACACATAAATCAATCTGCACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATCAG---TTATTTATTTTATTAAGCTAGAGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAattcattatagaaaaaacgtttaagtgaaattaata
gi|9 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGACTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATAGAACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAT---TTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTATGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGAGGTTTATATCCAGTCCATGAAAATGATTAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTACAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATTATTA--T-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAATAATCTGGATTTTTCACATTCCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTG-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAA-AT---ACTGTTGAT
blockSeqs : T T C C ATGA T T A CTT A A TTGTTC ATA ACCAAG CATAG TCCAC A C A A A A AA C TA AG A A G TGATA . TC T TT AA C ACATC GT AAAAT A A G T TTTT GTAAC A A AC G ACATG G ACATACTA CG TGA AA T TAGTCA C TG TATACATGTAGTTCATTTCAT TAATC CT A TAA AA C T GA TT TG AT G CA AGGAAA G
blockSeqs : . G . A . A . . TTT . . . . . . . T C G . . . C C GA A A . . TGATA . . T . . C . T AAAAT . . A . . . . A . . ATACT . . . . . T . . . . . . . . . C . TA . . AC G . TAT C
blockSeqs : . T . C . A . . TCT . . . . . . . G C G . . . C C GA A A . . TGATA . . . . . T . A TCAAT . . G . . . . A . . ATT . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . TA A
blockSeqs : . T . A . A . . TTT . . . . . . . T . A . . . A A GA A T . . TGATG . . . . . C . A TGCTG . . G . . . . T . . TAT . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . A . T . . TT . . . . . . . . . A . . . C C G . T . TA . . . . . . . A AAAT . . T . . . . T . . ATG . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . G . A . A . . . . . . . . . . G . . . C . . . T . TA . . . . . . . A AAAA . . G . . . . T . . T . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TA . . . . . . . T . . T . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . A . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . T
blockSeqCons : A* TGATA****** *** ATT***
originalCons : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAG---T---A---C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATA-T-AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
finalCons : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAGTGATA------C---AGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTT-----ATATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--AT-ACATT---AGTCAGCTCCTTGAGTTTGATATTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GTCATTTTTGTTATAAAATATCAAAATAAAAATGTTTAATGAAAATTCATCAACATTACTGCGTGTCCCTTTAAAA
Alignments
lowQualScore : 22222 111111 111111 11111 11111 11 11 1 11111 111 11111 333333 11111111 111111 444444444444444444444 11111 111 11 1 11 11 11 2222222
lowQualScore : 4 0 1 4 1 9999 1 0 5 5 55555 5 5 444444 0 888 444444 22222 22222 0 3 2 8 5 5 5 00 2 0 55 44 1 5 6 1 77 1 77 77 3 44444 77 666 5 5 5 5 1 0 4 8888 00000 4 1 66 222222 4 888 4 66666666 66 777 66 2 222222 0 5 66 222222222222222222222 22222 66 5 0 000 11 0 0 2 0 44 33 33 33 2 33 3333333 1
lowQualScore : . . . . . .... . . . . ..... . . ...... . ... ...... ..... ..... . . . . . . . .. . . .. .. . . . . .. . .. .. . ..... .. ... . . . . . . . .... ..... . . .. ...... . ... . ........ .. ... .. . ...... . . .. ..................... ..... .. . . ... .. . . . . .. .. .. .. . .. ....... .
lowQualScore : 4 1 8 4 9 4444 0 1 0 0 22222 0 0 444444 1 888 444444 55555 55555 7 3 5 5 0 0 0 66 5 5 66 44 0 7 7 0 99 4 99 99 0 33333 44 000 0 0 0 0 4 1 4 5555 00000 0 4 11 888888 4 888 4 11111111 11 888 11 2 888888 1 0 99 555555555555555555555 55555 99 0 1 000 00 8 8 5 0 22 88 88 55 5 88 5555555 0
consensus : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAGTGATACAGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--ATACA--T--TAGTCAGCTCCTTG-AGTTTGATA---TTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
Reference ( family-3688 ) : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGANACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTNATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACATGGTAGTGATACAGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATTATACTCTA-TGTGTTT-N-AA-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--ATACA--T--TAGTCAGCTCCTTG-AGTTTGATA---TTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTNAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTNATGTCATGTAC
gi|1 : AGTATAAAATAA-------CTAA-CACTCTAAGGACAGCT-------------TACCTAGGAGACTTTTGATGTGA-GTTAGTACCAGTCATTCCCTTTGATAAGTTTGTCTTCTTTATATTGGACTCATTAT----ACGGTC-TACAGAAAGGTATTGAATTAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATAACGATACACAATATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAACTGTGT----ATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAAAATCAAGGACAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACTGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGCTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-TCT-TTCTCCAGACTGATCTGGT-GTGCCATAACCGGTTGTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAAAATGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATAAAT------ACTAAATATTGTTC---TAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTCATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAACGCATATGATTAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA------------ACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAATGCC-AAAA-GGATGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTATTCTGGACTTTTGTA-GGGAAAAA-CAGCAAACAAAGACCGTCCTTTTTCCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATGTAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAT-CATTTTATATTATTTATACAATAGGGGAGCTAACTTTATAAAATATATTGGTGTTATA-GGCACACATGGTAGTACGACAGACT--CTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACCATTTCACTTTCCTTA-----TATTATACTCTT-TGTGTTT-TCAG-T-TA-CAAAATTATAATAC-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATTTGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--ATACA--TACTAGTCAGCTCCTTG-AGTTTGAAA---ATAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTAATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATATAT-----TGCTG--TATATGATTGGTGCCTTTATGG-GACTAGTTGCTAAATAAAACTTGAAAAGTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCAATGAAAATAATAACTTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACACAATGGTCGTGAC--TGTTAT--TTTACCACACAGTTAGAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACTATTTACAAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACTAGTGAAATTATGTACT--GTCG----TG-TTTTCATGTCATGT
gi|10 : GTATGAAATAATGCACAAGTAA-CACTCTAAGCACAGTTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCTTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCCTTTATAAGTTTGTCTACTTTATATTGTACTCATCAT----ACGGTCCTAAAGAAAAGTATTGAATCAGGGCACAAGTCATGATATTCCTGTTTAGTATAATTTTACTAATTTAAATAATTATTGTCCAATTACGATACACAGTATTTATTTCCTTTTCTTTTGT-----TATGTCTGTATTATTCACAGGGGATT-----TGCGAACATCAAGGACAAA-GGTGTATATCCTGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAAGT-
gi|11 : GTCTACACATAAATCAATTTGTACTGCTATGAAAATAGTAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATCATTTAATAAAATTAGTAATTATCT-TTTTATAAAGC
gi|12 : A-GTGTCAATTTACATAAATAATTATTTCT-T-CTCTCCAGACCGAATTGGTAGTGCCATAACCGGTTTTTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAG-AAAACGGATGTTTCGAAAAAAAATCTGATTTTTTCACATTTCAACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGAATAAT------ACTAAACA-TATTT---GAAAATCAGGGTAT------------------------AA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACATTTCTCAATGCGTTGTCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|13 : TTAAA----ACAAAAAGTGGCGATACAGACATTCTCATAAAGATCGCA-AGTTTTG---TAAAGAAAA--TAAT--------------AACAATATCAAATTCTTTACATCATATTATACTGTT-TGTGTTT-T-AG-T-------------AATAC-TGATATAAGCTTTAATGACATG----TAAC-----TACAATATGCATAATGTTTGt
gi|14 : acctaactgcataaacattgtggttaaatatagagatgacatagaggtcggagaggcaaatagtttatatttttttaacgtataaactTAATGCCATA----AAAT-----TGC-ATATGCATAATGTTTAATATCAGGTCA--ATACACAT--GAGTCAATTTCATA-AGTT-GGTA---TTTATGTTT-ATATTTAGTCAAT--------AT--GCATCT---GTTACTGTT--TGTATAATATAC------ATGT
gi|15 : taatacaaatgccgtaggtgacaaattccattctcttaaacgtcacaaagaaaTCACTGATGAATTTAAGTATTTCAACCATTTACTAAAAGTTTGCCCGCTTCCAAA--------CGAAATTATGTACTCAGTGGAGGAAA-TTTTGATTTTATGTAC
gi|16 : ATGTCA-ATAACTAGTCAAT--------AT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATAA---------------------ATCTGT-----TGATG--TATATGACAGATGCCCTTATGGAGCCTAGTTGTTGAAAAAAACTTG-AAACTTGA-AACAAGATT--TGTTTC-CCATGataatttcagaaaaggtgtttactgaacatttatgaaagtgaccgtgtgtccctttaagtaa
gi|17 : AGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAATTACCCGGCAGGCGTTTGATGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTATCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTTCTACAAAAAAGTATT
gi|18 : ATGCACAAACAATCA-TCTAAGCATAATGAAGTGTAATCAGCTACCCGGATGGT-----ATGTGACGCTAGTGGCAGTCATTCCCCGCTATACATTTGTCTTGTTTATTTTGGACTTACCATATGAACGGTCCTACAGAAAA
gi|19 : at-TTAGTGAAATG----TAACGTAACTTC-ATGTGTAAAATGCTTGATATCTAGTCAACATACA--T--TAGTCAGTTCCTTA-AGT
gi|2 : agtacaccgtatacatttgatAGTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGTAGGCTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATCCCCATTTACAAGTTTGTCTTCTTT-TGTTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAAAAAAATATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAAAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGCCCAATTACGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-----CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCAATAAGTTCGATACAGCAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-GTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAATTTGCTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGGCGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAATGGACCCAATACTTTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTATATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTGTCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCA-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGCCAGACAACATCACAGGAAAGACGAAT--AAAAATACTC--GTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTT----------------------TCTGGACTTTTAGA-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGATCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATTAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATAATTTAAACAAAAGGGGAACTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGAACACATGG------TACAGACTTTCTGATAAAGA--GCA-TTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTT-----------ATAT----------------TATTATACTCTA-TGTGTTT-A-AA-T-TG-CAAAATTATAATAC-TAATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--ATAC------TAGTCAGCTACCTG-AGTTTGATA---TTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATAAAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAA--AATAACCTCCTATCATTGCAATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAGGTT--TTGAAACAATGAGTAAAACATCTTTAA-AAATACAAAATGGTCGTGAC--TTTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAATGTTTTGTCATTGATGATTTTCAATCTTTTAACCATTTACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAATCACGAGTGAAATTATGTACT--GTGG----TA-TTTTCATGTCATGTAC
gi|20 : TTTTATAAAACTAGTAGTGGC--GCATGTTAACTTAAAC-ATGATT-AAACAT-TTTAATAAATACAAAACGACCATT-CTTTGGCATTGTTTATCATA
gi|3 : AGTATGATATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGGAATAAGTTACCCGGGAGACTTTTGTTGGGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTA-------------GGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTGAATCAGGACAAAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTGTAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTTCAATTACGAAGTACAATATTTACTTTCTTTTCTCTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGAGGATTTGTTATGCCAACATCAAGGACAGGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGAACAATGCAGTGCACAGGATGAGCGAGATTAAAATAACCGATGGCCCTAAAGTGATAAGGTTTTCATTTTTTAACTTATAGCTGTTAATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAAAATACTTAAATAATTATTT-TTT-CTCTCCAGAATGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAATTCAATACAGTAAAATGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACAAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAT------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTAAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATTATAAGGGTTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAATTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTT--------GAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGTATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCTATTTGGGACAATATATGTGTCTTCTGTACCATCTAGAGAGCCATTAGCAATCAGACAACATCACAGGAAAAACGAGT-CAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGTTTAGGTTTACTCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAG----CAAAGACATTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGACACACGGTAGTGATACAGACTTTCTTATGAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATTATACTCTA-TGTGTTTAA-AA-T-TA-CAAAATTAAAATAT-T-------GA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--ATAC------TATTCAGCTCCTTG-AGTTTGATA---TTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTC--TG-ATTATATAC------ATGTAG----TTTCA-AGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACATATAAATCAACCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTTAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAG
gi|4 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGCGTAATCAATTACCCGGTAGGCTTT-GGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGACTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ATGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACGAAACACAATAATCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGCGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCGGTTTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCTATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATAATTATTT-----CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAAATCTGGATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTAAATATTGTTT---GAAAATCAGGATATGCTTTTAA------GA-----TAAGA-----TGACCACATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCGTTGTTGAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGCTCAGAATATGTGGTAAGTCCGAATACCAGTTTGGCCACATCCTCCAACATCAGTGGACCCAATACTCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCACAGTACATTAAGTTTTGTTTCAAACCAAGGACATAGTTAGACCCACTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACTGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCATGC-AAATAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTCAGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGT--GGTTTAATCTGGACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCCCCTTAATCAACAAAACACAT
gi|4 : ACACATGGTAGTGATACAGACTTTCTGATAAAGA--GTA-TTTTTTT--CTAAAGAAAAAATAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATTATA------TGTGTTT-A-AAAT-TA-CAAACTTATAATAA-TGATATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--ATAC------TAGTCAGCTCCTTG-AGTTTGATA---TTAATGTTT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTATT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTT---------------------ATCTTT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GTCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAATTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTATACACATAAATCAATCTGTACTTCTATGAAAATAATAACCTCCTATCggtagtgatacagactttctgataaagagtatttttttctaaagaaaaaataatgcaagttcttaggtaacaatatcaccttccttatattatatgtgtttaaaattacaaacttataataatgatataagattagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagttaatactagtcagctccttgagtttgatattaatgtttataactagtcaatgtgcttctgtcactatttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttatttatcttttgctgtatatgattgatgcctttatgggtctagttgctgaataaaacttgaaaatttgatgttgaaattaatatttctccatgtatacacataaatcaatctgtacttctatgaaaataataacctcctatc
gi|5 : gtatgaaataatgcacaactaacactctaagcacagctaagcgtaatcaattacccggtaggctttggtgtgagttagtgccagtcattcccatttataagtttgacttctttatattggactcatcatatggtcctacagaaaagtattaaatcaggacacaagtcatgatattcctgttgagtataattttactaatttaaattattattgtccaattacgaaacacaataatcacttccttttcttttgttaaagtatgtttgtattattcacagcggattttttatgcgaacatcaaggacaagcggtttatatccagtccacgaaaatgatcaatgcagtgcacaggacgagcgaggtgaaataacctatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaagtgtcaatttacttaaataattatttctctccagactgatctggtagtgccataaccggttattcatgacttcgataagttcgatacagtaaaacggatgtttcgaaaaaaatctggatttttcacatttcgacacgaaaaattgtcagtttcttagattaatactaaatattgtttgaaaatcaggatatgcttttaagataagatgaccacattatttaatttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcgttgttgaatcgagaaagctcatatgataagggctcagaatatgtggtaagtccgaataccagtttggccacatcctccaacatcagtggacccaatactctatgtaatttgttcaccacctctggttcacagtacattaagttttgtttcaaaccaaggacatagttagacccactgaccgccgtacttaactaaaatactgttgattaactgagtaaagcaaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcagaaatcacgcatttgacgaccaagcatgcaaataagccaaaaggaagattcgatttcagacaatatctgcgtcttcagcaccatctcgagggccattaccagtcagacaacatcacaggaaaggcgagtcaaaaacactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtggtttaatctggactttttgaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtcctttttccatttaattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatccccttaatcaacaaaGTATGTTTGTATTATTCAT------TTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGCAGTGTATATCCAGTCCACGCAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAACGCGGT-GAAATAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAAAGTGTCAATTTACTTTAATAATTATTT-TCT-CTCTCCATACTGATCTGGTAGTGCCATAATCGGTTATTCATGACTTCGATCAGTTCGATAAAATAAAACGGATGTTTCG-ACAAAAATCTGAATTTTTCCCATTTCGACACGAAAAAATTGTCAGTTTCTTAGATTAAT------ACTT--TATTGTTT---GAAAATCACGATATGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCACATTATTTAACTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTAACCTTTCTCAATGCATTGTCTAATCGAGAAAGCTCATATGATAAGGGTTCAGAATACGTGGTAAGTCTGAACACCAGTTTGGCCACATC-----------------------CTCTATGTGATTTGTTCACTACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGAAAAAAGTTAGATCCACTGACCGCCGAACTTTACTAAAATACTGTTGGTTAACGGAGTAAAGTGAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCACAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGT-AAAAAAGCCAAAAA-GGAAGAATCAATTTGGGACAATATATGCGTCCTTAGCACCATCTCGATGGCCATTACCAGTTGGACAACATCACAGG-AAGACGAGT-AAAAAATACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAAAAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGGAAGTTTT-A-AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTGTCATTTTATTGCAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCACATCTCCTTAATCAACAA
gi|5 : ATACGCTA-TGTGTTT-TCAA-T-TA-CAAAAGTACAATAC-TGATATAAGA-TAAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCA--ATACA--TACTAGTCAGCTCATTG-AGTTTGATA---TTAATGTTT-ATAACTAGTC-----------------TTCT---GTCATTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTTAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTCCATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCCTATGAAAATAATAACCTTCTATCACTGCGATACACACCTTAATAATTTAATAAAATTAG---TTGTTTATCTTATAAAGCTAGAACTGGCTTttgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacgctatgtgttttcaattacaaaagtacaatactgatataagataagtgacatgtaacttcatatgtttaatgtttgatatctagtcaatacatactagtcagctcattgagtttgatattaatgtttataactagtcttctgtcattgtttgtattatatacatgtagttcatttcatgtttattaatctattgctgtatatgattgatgcctttatgggcctagttgcttaataaaacttgaaaacttgatgttgaaattaatatttctccatgtctacacataaatcaatctgtactcctatgaaaataataaccttctatcactgcgatacacaccttaataatttaataaaattagttgtttatcttataaagctagaactggcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|6 : gtatgtttgtattattcatttttttatgcgaacatcaaggacaagcagtgtatatccagtccacgcaaatgatcaatgcagtgcacaggacgaacgcggtgaaataaccgatggccctatagtgataaggttttcatttttaaacttatagctgttgattcccatgaaggacctgaaaaaagtgtcaatttactttaataattattttctctctccatactgatctggtagtgccataatcggttattcatgacttcgatcagttcgataaaataaaacggatgtttcgacaaaaatctgaatttttcccatttcgacacgaaaaaattgtcagtttcttagattaatactttattgtttgaaaatcacgatatgcttttaagattagatgaccacattatttaacttactatacaactgttgatctactgcactaacctttctcaatgcattgtctaatcgagaaagctcatatgataagggttcagaatacgtggtaagtctgaacaccagtttggccacatcctctatgtgatttgttcactacctctggttcatagtacattaaattttgttttaaaccaagaaaaaagttagatccactgaccgccgaactttactaaaatactgttggttaacggagtaaagtgaaaatgaatcaatcatgcaatgaacatttcatattatctgtcaaatttatcttttcacaaatcacgcatttgacgaccaagcacgtaaaaaagccaaaaaggaagaatcaatttgggacaatatatgcgtccttagcaccatctcgatggccattaccagttggacaacatcacaggaagacgagtaaaaaatactccagtctaaaagacttggcattgaattttaaatattttaaaaggattggtgaggtttactctggaagttttaaaaaaaaatcagcaaacaaagacagtccttttgtcattttattgcaaaaactgaacttcagtaatataaaatacgaaataaataggcaatcacatctccttaatcaacaattgtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATGAAATAATGCACAACTAA-CAATCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGGCGTTTGGTTTGA-GTAAGTGTCAGTCATTCCCCTTTATAAGTGTGTCTTCTTTATATTGGACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAA-TAATGAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTATAATTTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTACAGTACACAACATTTACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATATTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGAAAAGCGGTGTATATCCAGTCCACGAAAATGATCAATGCAGTGCACAGGACGAGCG-GAT-GAAACAACCGATGGCCCTATAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTTATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATATTTATTT-T-TTCTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACTGGTTATGCATGATTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAAAA-TCTGAATTTTTCACATTTCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTATATAAAT------ACTAAAAATTGTTT---GAAAATCAGGATACGCTTTTAA------GA-----TTAGA-----TGACCGCATTATTTAATTTACTATACAACTGTTGATCTACTGCACTTACCTTTTTCAATGCGATGTCGAAACGAGAAATCTCATATGATAAGCGTTCAGAATATGTGGTAAGTCT-------AGTTTGGCCACATCCTCCAACATCATTGGAC-------TCTATGTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAA--TTT-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCATTGACCGCCGTACTTAACTAAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTTCATATTATCTGTCAAACTTATCTTTTCAGAAATCATGCATTTGACGACCAAGCGCGA-AAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTTTTCAGCACTATCTCGGGGGCCATTACCAGTCAGACAACATCACTGGAAAGACGAGT-CA---------------AAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGATTGGTGAGGTTTACTCTGAACTTTTTG--AAAAAAAATCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTTATTGTAAAAACTGAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGCAATCATATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAGGTGAGCGAACTTTATAAAGCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaat
gi|7 : GTAATTTGTTAACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAATTTTGTTTTAAACCAAGGAAATAGTTAGATCTACTGACCGCCGTACTAAACTAAAATATTGTTAATAAACGGAGTAAAGCGAAAATGAATCAATCATGCAAAGAACATTTCACATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCGGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACACAAAAAAAGCC-AAAA-GGAAGATTCGATTTTGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGCCAATACCAGTTAGACAACATCAAAGGAAAGACGAGTAAAAAAATACTAAAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTTTAAATATTTTAATAGGTTTGATGAGATTTACTCTGGACTTTTTGAGAAAAAAAATCAGAAAACAAAGACGGTCCTTTTTCTATTTTATTGCAAAAACTGAACTTTAGTAATATAAAATACGAAATAAATAAGCAGTCACATCTCCTTAATCTACAAAAT-TATTTTATATTATTTATACAAAAGGGGAGCTAACTTTATAAAACATACTGCTGTTAAAGGGGACACATGGTAGTGATACAGACTTTCTGATAAAGA--GCATTTTTTTT--CTAAAGAAAA--CAA-ATAAGTTTTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTG-----TGTTGTGCTGTGTTGTGCTG-T-GC-TGTG-CTATACTATATTACATTATAT--TA-TTATCTATGTGTTTTTAAT-----TAC-AAAAGTAAAATA-CTGATATA-AG---------A--T--TAGTGA----CATGCAACTTCATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTCAATACATACTAGTCGGCTCCTTGAATTAATGTTAATGT-TTATA-ACTAGTCAATGTGCTTC-TGTCACTGTTTGTATTATATACATGTAGTTCATTTCATATTTATTAATCTACTGCTTATATGATTGAAGTCTTTATGA-GCTTAGTTGCTGAATAGAACTTGAAAACTTGATGTTGAA---AGTATT-----ATGTCTACACATAAATCAATCTGTACTCATATGGAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACACCTTAATAGTTAAATAAAATTAG---TTATTTATTTTATAAAGCTAGTGCTGGCTTGCAAGTT--TTAAAGCAAGGAGTAAAACATCTTTTA-AAGTACAAAATGGTCGTTAC--TGTTAT--TTTATCACACAGTTCCAAACGTTTTGTCATTGATGATTTTCAGTCTTTTAACCATTCACTAGAAATTTGCCCTTTTCCAAAACCACGAGTGAAATTATGTTCT--GTGG----TATTTTTAATGTCATGTAC
gi|8 : AATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTGTTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAAATACTGTTGATTAACGGAGTAAAGCAAAAATGAATCAATCATGCAATGAACATTGCATATTATCTGTCAAATTTATCTTTTCAGAAATCACGCATTTGACGACCAAGCACGC-AAAAAAGCC-AAAAAGGAAGATTCGATTTGGGACAATATCTGCGTCTTCAGCACCATCTCGAGGGTCATTACCAGTCAGACAACATCACAGGAAAGGCGAGT-CAAAAACACTCCAGTCTAAAAGACTTGGCATTGAATTCTAAATATTTTTAAAGGATTGGTG--GTTTACTCTGGACTTTTTGA-AAAAAA--TCAGCAAACAAAGACAGTCCTTTTTCCATTTAATTACAAAAACTAAACTTCAGTAATATAAAATACGAAATAAATAGGTAATCACATCCCCTTAATCAACAAAAC-CATTTTATATTATTTATACAAAAAGGGAGCTAACTTTATAAAACATATTGGTGTTAAA-GGGTCACATGGTAGTGATGCAGACTTTTTGATAAAGA--GCT-TTTTTTTTTCTAAAGAAAA--TAATGCAAGTTCTTAGGTAACAATATCACCTTCCTTA-----TATT---CTCTA-TGTGTTT-A-AA-A-TAACAAAATTATAATAC-TGACATAAGA-TTAGTGACATG----TAAC-----TTC-ATATGTTTAATGTTTGATATCTAGTTA--ATAC------TAGTCAGCTCCTTG-AGTTTGATA---TTAATGTCT-ATAACTAGTCAAT--------GT--GCTTCT---GTCACTGTT--TGTATTATATAC------ATGTAGTTCATTTCA-TGTT--TATTA---------------------ATCTAT-----TGCTG--TATATGATTGATGCCTTTATGG-GCCTAGTTGCTGAATAAAACTTGAAAACTTGATGTTGAAATTAATATTTCTACATGTTTACACATAAATCAATCTGCACTCCTATGAAAATAATAACCTCCTATCATTGCGATACACAACTTAATAGTTTAATAAAATCAG---TTATTTATTTTATTAAGCTAGAGCTGGCTTGCAAGTT--TTGAAACAATGAGTAAAattcattatagaaaaaacgtttaagtgaaattaata
gi|9 : GTATGAAATAATGCACAACTAA-CACTCTAAGCACAGCTAAGTGTAATCAGTTACCCGGGAGACTTTTGGTGTGA-GTTAGTGCCAGTCATTCCCATTTATAAGTTTGTCTTCTTTATATAGAACTCATCAT----ACGGTCCTACAGAAAAGTATTAAATCAGGACACAAGTCATGATATTCCTGTTGAGTAT---TTTACTAATTTAAATTATTATTGTCCAATTATGAAACACAATATTCACTTCCTTTTCTTTTGTTAAAGTATGTTTGTATTATTCACAGGGGATTTTTTATGCGAACATCAAGGACAAGAGGTTTATATCCAGTCCATGAAAATGATTAATGCAGTGCACAGGACGAGCGAGGT-GAAATAACCGATGGCCCTACAGTGATAAGGTTTTCATTTTTAAACTTATAGCTGTTGATTCCCATGAAGGACCTGAAAAA-GTGTCAATTTACTTAAATTATTA--T-T-T-CTCTCCAGACTGATCTGGTAGTGCCATAACCGGTTATTCATGACTTCGATAAGTTCGATACAGTAAAACGGATGTTTCG-AAAATAATCTGGATTTTTCACATTCCGACACGAAAAA-TTGTCAGTTTCTTAGATTAATTTGTTCACCACCTCTGGTTCATAGTACATTAAGTTTTG-TTTTAAACCAAGGACATAGTTAGATCCACTGACCGCCGTACTTAACTTAA-AT---ACTGTTGAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GTCATTTTTGTTATAAAATATCAAAATAAAAATGTTTAATGAAAATTCATCAACATTACTGCGTGTCCCTTTAAAA