lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 9999999999999999999999 2 1 111111 22222222222222 44444444444444444444 222 333333 1 11 5555555555555555 11 11 2222222 1 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 1111111 111 111 22222222 1 333333333333333 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 22222222222222222 11111 222222 11111 1 44444 1 33333333 5555555555555555555555555555555555555555 33333333333 1 22222 7777777777777777777777777777777 11
lowQualScore : 6 7777777777777777777777 0 3 666666 4 66 99999999999999 00000000000000000000 8 4 777 1 888 1 555555 0 4 66 9 5 66 888 2222222222222222 0 77 5 5 66 4 4 3333333 5 88 777 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 6 9 0 6 8888888 1 88 8 000 333 88888888 3 44 888 5 777777777777777 5 5 6 99 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 666666 3 2 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0000 5 66 00000000000000000 4 1 1 66 44444 4 111111 55555 77 99999 4 6 44 3 7777 44 77777 99999 3 3 3 0 7 77777 3 5 4 9 0 3 55 4 3 22222222 1 3 666 3 3333333333333333333333333333333333333333 1 3 11111111111 3 9 3 2 0 66 6 1 7 77777 99 3 555 3 3 1111111111111111111111111111111 777 3 4 2 3 4 66 66
lowQualScore : . ...................... . . ...... . .. .............. .................... . . ... . ... . ...... . . .. . . .. ... ................ . .. . . .. . . ....... . .. ... . ..................................................................................................................................... . . . . . ....... . .. . ... ... ........ . .. ... . ............... . . . .. ...................................................................... . ........................................................ ...... . . . ..................................................................................................................................................................................................................................... .... . .. ................. . . . .. ..... . ...... ..... .. ..... . . .. . .... .. ..... ..... . . . . . ..... . . . . . . .. . . ........ . . ... . ........................................ . . ........... . . . . . .. . . . ..... .. . ... . . ............................... ... . . . . . .. ..
lowQualScore : 0 5555555555555555555555 0 3 444444 4 11 88888888888888 22222222222222222222 9 4 888 9 333 8 999999 0 4 11 2 0 99 888 3333333333333333 7 99 0 0 88 4 4 2222222 0 33 888 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 5 6 8 1 5555555 4 77 9 000 444 00000000 4 33 333 7 999999999999999 7 7 7 22 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 444444 3 5 4 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6666 0 99 44444444444444444 4 4 9 33 11111 4 000000 11111 44 11111 8 8 66 3 1111 22 77777 22222 3 3 3 4 5 55555 6 5 6 6 5 6 00 5 3 99999999 2 6 444 6 6666666666666666666666666666666666666666 8 3 55555555555 3 9 0 8 5 66 0 0 3 88888 00 6 888 3 3 5555555555555555555555555555555 888 4 7 1 2 4 00 11
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAGGCC-GGGGTTCACTA------TATCG-AAAA--A-----C-C-A-CCGGTAAGCAATTA-----G-GC---AT---AT-ATAGA-AG---AGAAGGTGT-GGCTAAACTACTGGCCTGCTT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTTTGGA-TTGATAGCTGT-GTGA---ACTAC--TGATTNACAACAGATAAGGTGAA-T-GGTCA-GTG-TA-TGTAA-N-----AATCAACATTCTTGTAA-TG---AATACATACTAATT-----GC-------A--CTTT-----------G-AT-CAAAT-------NA--C-G-TTTGAATAA------------T-------------A---CATT--CGTTA-------AT-------TT--------TAATTTCTAAAACAATNTATAATCATTTAATTGCTT------CTTCT-TTNAA---TGATN--ATT----N---ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CT-T-TAT-ATTGA--AGNAT-G-TTCAA----A----T-TC-CGCT-T---CTGT-------A-------A--T------------TCCCACAA-AA---A-GTTA-----A------TT---G-------A---TCAG-T-TA---------TGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACA-AA----TA-TT-------------C-------AAA-TCAA----CACAAT-NTTCCTNAAAGGG-AATAATGACAAAGTA--T---NTTCT--TT---T--TTAATTTA----TACN-CG-AT----T-CC--------------A----TG----C---------------------AAAACA----TTCATAT-AG--CA---------CA----N-CTAAACA-CTATGTATGTAG---CATTT-A-N----TATAG-TTTTTAATT-----CCCCGCCATAT--GTC-AAAA----GAG--T-----G-A-TGCACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTG-GGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGG-AGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAG-TTTTC---AAA-AAAAGATNTT-T-GAATG----T-GACA--C-----------TTATAAAGTAC-ACAT-TG-TTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGA-CTTTTGAAATTT---TA-A-AA--AT-CC------TC--CACTGATGNTN-TGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
Reference ( gi|2 ) : ATGCGTTGTTTTTATTCGTATGTCAATTTTATTGATAAGCAATAACATCTATAGATGAAAATTTAAAACAGAGCATGGTTATCAATGTTATCATACGCATGG--TTAAAAG-CC-GGGGTTCACTA------TATCG-AAAA--A-----C-C-ATCCGGTAAGCAATTA-----A-GA---AT---AT-ATAGA-AG---AGAAGGTGT-G-CTAAACTACTGGCCAGCTTTGCTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTTTTGA-TTGATAGCTGT-CTGA---ACTAC--TGATTTACATCAGATAAGGTTGA-T-GGTCA-TTG-TA-TGTAA-A-----AATGAACATTCTTGTAT-TG---AATACATACTGATT-----GT-------G--CTTT-----------G-AT-TAAA--------GA--C-G-TTTGAAT--------------T-------------A---CATT--TGTTA-------AT-------TT--------TAATTTCTTAAACAATATATAATTATTTAATTGCTT------TTTCT-CTTAA---TGATA--ATT----A---ACTGAAACGCC-T-TAA-AA--------------CT-T-TAT-ATTGA--AGTAT-G-TTCAA----A----T-TCACCCT-----CTGT-------A-------A--T------------TCCCACAA-AA---A-GTTA-----A------TT---G-------A---TCAG-TATA---------TGCTAA------TGTTGGGCCTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACA-AA----T-----------------C-------AAA-TCAA----CAGGAT-ATTCCTTGATGGG-ATTATTGGCAAAGTA-GT---TTTCT--TT---T--TTAATTTA----TACA-TG-AT----T-CC--------------A----TG--------------------------AAAACA----TTCATAT-AG--CA---------CA----A-CTAAACA-CTATGTATGTAA---TATTT-A-A----TATGG-TCTTCGATT-----CCCTGCCATTT--GTC-AAAA----GAG--T-----G-----CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTG-GACTGTAGTTGGCCGGAGAGCCGGGTCATGAACTCAGATC-AACTGTTAATCACCACTGG-AGGA--AAAATT-GAATTTTA-A------ACAG-TTTTC---AAA-AAAAGGTATT-T-GTTTG----T-GTCA--C-----------TTATAAAGTAC-AC-T-TA-TTTCCAAA-TTCACTTGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGACCTGCCAAGTTTTAACCAAATTTGTTATTTATGA-TTTTTGAAATTT---TA-A-AA--ATCCC------TC--CACTGGTGGTA-TGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGACTTTTATACTGCGACTCCGGCCT
gi|25 : GATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAG-CCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAATTA-----C-C----------GCAA--------------------AT-ATAGA-AG---AGAATGTGT-GGCTAAACTACTGGCCTGC-TTGCTCATATCTC-A--A
gi|10 : accatatatata--TTAAAAGGCC-GAGGTTCACTACCGATATATCA-AAAA--A-----C-A-A-CCGGTAAGCAATTACCACAA-AA---AT---ATTATGGA-AG---GGAAAGTGT-GGCTA--CTACTTGCTTGCTT-GCTTTTATCTT-A--AAATTTGCATACATAAACATGTGGTTTGGA-TTTATAGCTGT-GTGA---ACCA-------TTAC------TGAG-TTGAAT-GGTCA-GTG-TA-TGCAA-A-----AATCAACATTCTTACATGTT---AAT---TGTTTAGT-----GC-------A--CTTT-----------G-AT-CAAAT-------CA--A-G-TTTGAATGAGTTTAAATAAAAT-------------A---CATT--GTTTATTCTAACAT-------CT--------TAATTTTTAAAACAACTTATTATCAGTTAATTGCTT------CTTTT-a
gi|4 : tcatcagtgtttttt-GGAGTTCACTA------TGTCG-AAAA--A-----C-CGAT----TAGACAA--------------------GT-ATAGA-AG---AGAAAGTAT-GGCTTAGCTACTGGCCTGCCA-GCTCTAATCTT-A--ACATTTGCAAACATAAACGTGTAGATTGGA-TTGATAGCTGT-GTGAGCTACTAC--TGATTAACAACATATAAGGTGAA-T-GGTCA-GTG-TA-TGTAA-C-----AATCACCATTCTTGTAA-TG---AATACATACTGATT-----GC-------A--CATT-----------G-AT-TAAATCAAGTTTGAATCAG-TTTGAATAAAA----------T-------------A---CA-G--CGTTA-------TT-------AT--------TAATTTCTGAAACAATGTATAGTTATTTAATTGCCT------CTTAT-TTAAA---TAAGT--ATT----T---ACTAAAATGCC-A-TAACAATTCTCACGCTGTTCCT-TGTATAATTAA--AAT-T-G-ATCGATGCGA----T-TT-TTCT-----TTAC-------A-------A-----------------CAACAATAA---A-ACTA-----C------CT---A-------AATGTTAGTTATAGGTCAATTATGCTAA------TGTCGGGCCAAGTTTTGACACAAAAGGGACATTA-GAAAAA--------------ATATGTTCT-----------AGAAATGGTT--ATACAA----T-----------------CTTTTCCTAAA-TCAA----CACGAT-ATTCCTTGATGGG-AATAATGCCATAGTATGTA--TTTCTAACT---T--ATACTTGA----TACT-TG-AT----A-CC--------------A----TGCATGCAATCTTACGACAATTTTCTATAAAACA----TGCATAT-AG--CA---------CA----A-TTAAATA-CTATGTATTTAG---CATTT-A-A----CAATT-CCCCCGGT-------CCCGCCATAT--GTC-AAAA----GAGTTT-----GT----CACTATGGCTT-ATCCCCATAGAA-ACTG-GACTATATTTAGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCTGATC-AGCTGTCAATCACAAATGG-AGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAG-TTTTT----AA-ACACGATTTTAT-GAATG----T-ATCA--C-----------TTATAAAGTAT-ACAA-TA-ATTCCAAA-TTCACATGATATAAAGTTCATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAATTAAATCTGTTATGTATGA-CTTTTGAAtacgtctttaagttctttaagtatacttctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcagtaaaacattcataaa
gi|13 : GGTTCACTA------TAATG-AAAA--A-----C-C-AATTAGTAAGCAATTA-----G-GC---AT---AT-ATAGA-AG---AGAAGGTGT-GTCTAAACCACTGGCCTG-TTTGGTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAACTGTGGGTTGGA-TTGATAGCAGT-GTGA---ACTA-----------A--AAATAAAGTGAA-T-GGT--------A-TGTAA-C-----AATCAACATTCTTGTAA-TG---AATACATACTAATT-----GC-------A--CTTT-----------G-AC-TAAATAAAGTTTGAGTCAG-TTCGAAT--------------T-------------AATACATT---GTTA-------AT-------TT--------TAATTTCTAAAACAATGTGTAATTATTTAATTGCTT------CTTCT-TTAAA---TGATT--ATT----T---ACTAGAGTGCC-T-TAA-AA--------------AT-T-
gi|1 : GTTCACAA------TATTG-AAAA--AAAAAACAC-AACCGGTAAGCCATTA-----AAGC---AA---AT-ATGGA-AG---AGAAGGTGTAG-CTACACTACTGGCCTGATT-GCTCGTATCTTGA--ACATT-GTAAAGGTGAACACGTGGTTTGGA-CTGATAGCTGC-GGGA---ACTACAGTGATTGACAACAGATAAGGT-GA-TAGGTCA-GTG-TA-TGCAA-T-----AATCATCATTATTGTAA-TG---ACTACAAATTAACA-----GT-----------TTA-----------GTATACAAA--------AT--C-A-TTT-AAT--------------T-------------G---C-TT--CGTC---------T-------TT--------TAAT-------A-AGTATATA-CTA---AAACGCCTAAAAACTTTGTACTGAAGCATGATAGAATTGTATA---ATT-AAACTCC-CACAA-AA--------------ATGT-TA--GTTGATCAATAA-G-TTT-----------T-TCTTTCTTT---CTTT-------A-------A------------------AACAA-AA---A---TA-----AAACTGCTT---A-------AG--TCAA-T-TA---------TGTTAAAATTGATGTTAGGCCTAGTTATGTCACAGTATGGACATTGTGAAAA-----------------GTGTT-T-----------AGAACTGGTTACACA-AA----TATTTTC-----------C-------AAA-TCAA----CGCAAT-GTTCCTTAAAGGG-GATAATGATAAAGTA--------TGT--AT---T--TTAATTTA----TATT-TG-ATATAAT-GC--------------A----TGCAATCCTGCAACTGTTGTCAAT----AAAACA----TTTATAT-AG--AA---------CATATGATCTAAATA-CTATGTAAGTAG---CATTT-A-T----TATAG-TTTTCAATT-----CCCGGCCATAT--GTC-AAAA----GAA--TTGAAAG-----CATTGTGAC---ATCTCCATAGAA-GCTG-GACTGTAGATGGCTGGAG-GCTCGGTTGTGAACTCAGATC-AGCTGTCAATTACAACTGG-GGAA--AAGTTT-GAATTTTACA------ATAG-TTTTC---AAATAAAA--TATT-T-GAGTT----T-GACA--C-----------TTATAAAGTAC-ACAT-TG-TCTTAAAA-TTCACATGACATAAAGATCATATATTCAAGAATAGACATGTCACGTTTCAACCAAATCTGTTTTGTATGACTTTTTTAAATTT---TA-A-AA--AT-CC------TC--TGATGATGATT-TTCT---TCCGGTAAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-GTCAGTGCTGCTAGCTTTTGTACTGTTACTCCGGCCTctcacactgttcattgtataattgaaatcacacaaaaatgttcattg
gi|28 : ccatgtgaatatatattaccttatattgctatgcttataaatgcataaaatgtcGTTCACTA------TATCT-AAAT--A-----C-C-ACACGGTAAGCTATTA-----A-GG---AC---AA-GCTGA-AC---AAAGGGTGTGG-CTAAACTACTGATCTGGTTAGCTCTTATCTC-A--ACttacgaagtattaaaacacttaaactaatgaaaagctgcctatcagaacgtaaacgtcaaataaagttagtacattgaccag
gi|11 : TTCACTA------TATCGCAAAA--A-----C-G-A-CCGGTCAGCAAT-A-----A-GACAAATTTAAT-ATAGA-AG---AGA---------------TACTTGCCTGCTA-GCTATTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAGATGTGGTTTAGA-TTAATAGCTGT-GTGA---ACTAC--TGATATATAACAGATAAGGTGAA-T-GACCA-GTG-TA-TGTAA-C-----AATCAACATTCTTGTAA-TG---AATACATACTGATT-----GC-------A--CTTT-----------G-AT-TAAAT-------CA--A-G-TTTGAAT--------------------------------CAGT----TTA-------AC-------TA--------TAATTTCTAAAACAATGTTTAATTGTTTAAGTGCTT------CCTGT-TTTAA---TAATA--TTT----A---ACTTAAATGCC-T-TAA-AA--------------CT-T-CAT-GTTGA--AGCAT-G-TTCAA----A----T-TTTCATT-----GTAT-------A-------A--TTAAAA-------TCCCACAA-AA---A-GGTAT----A------CT---G-------A---GCAG-TGTtgtcggaatttgctaca
gi|3 : gtaG-AAAA--C-----C-C-TTCTTGTAAGGAATTA-----G-GC---AA---AT-ATGGG-AG---AGAAGGTGT-GGCTAAACTATTGGTCTGCTC-GCTCTTGTCTT-TTTGCATTTGTAAACATAAACGTGTGATTTGGA-TTTATTGCTGT-GTGA---ACTAC--T-ACTGACA--AAATGA-----A-C-AGTCA-GTG-TA-TGTAA-T-----AATCAACGTCTTTGTAA-TGAATAATATATACTAATT-----GTTTGGTTCA--CTTTCATAAATTCAAG-AT-TAAA--------TC--A-G-TTTGGATAA------------A-------------A---TATTAATATTA-------ATTCTTGCATT--------CAATTTCTAAAACACTTTATAATCAGTTAGTTGCTC------CTTCT-TTTAA---TATTC--ATA----T---ACTTAAATGCC-T-TGA-AA---------------T-T-TAT-ACTGA--AGGATAA-TTCAA----G----T-----CTTGTA--CTGT-------A-------AACTGAAAAAGCAAAATCCCACAA-AATTTT-TTTA-----A------TT---G-------A---TCA------------------TAA------TGTTtttgtttttctttctgtttttgtaacattaacaggaag
gi|22 : -AAAA--A-----A-T-GTACAGTAAGCAATTG-----G-GC---AT---ATCATATATAGCCTAGAATGTGT-GGCTGAACTACTAGTCTACAT-GCTCTTTTCTC-A--AC-TTTGTAAACAAAAGTATGTGGTTTTGA-TTGATAACTGT-GTGA---ACTTC--TGA-TTACAtttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctaaaggttagttataggtcaatcaattatactaatggtaggcataattaagtcacagaaggaacaatatggaaatgttttccaaatcaacacaatctttctaaagggaagaataacaacgtatgtacatgtacttgatacaatgcatgtactcctacaacatttgtcaataaaacattcatgttacacatcttaacaccatgtataaagcatttattataaattttagttacctgccatatgtcaaaacgtagcatgcactttggcttatctccatagaagttggactgtagtaggctggagagttgggtcatgaactcagatcagctgtcaatcactaagggaaatttgaattttacaacagtttgcaaaaaagatttttagcacgtgacactaataaagtacaaattgttttcatattcacatgacaaatattatacattcaaaaacagatctgccaagtttcaaccaaatctgtttcgtatgacttttgaaatttaaaa
gi|26 : ttttaatggccagagtttacatgtgtacttcataaacaaAACATAAACACGTGGTTATGAGTTGATAGCTGTACT-A---ACTCC--TG-------------AAGGTGAA-T-AGTCA-GTGTTA-TGTAATATCAGTAATCAACATTTATGT--------AAGACATACattg
gi|5 : tgctggacattattcatctA-T-GGTCAAGTG-TA-TGTAA-T-----AATCAACATTCTTGAAA-TG---ATTACATACTAATTTTTTAGT-------GCACATT-----------G-AT-CAAAT-------CA--A-G-TTTGAAT--------------CAGTTTGGATAAAAA---CA-T--TGTTA-------AT-------TCTTACATAGTAATATCTAAAACAATTCATTATCAGTTAATTGTTT------CTTCT-TTTAA---TAATT--ATA----T---ACTAAATTGCCTT-TAA-AA--------------CT-T-AAT-ATTGA--AGGAT-GATACAA----T----TCTCACGCTTTTTACTGTAAAATCAA-------A--T------------TCCCATAA-AA---A-TTT------A------TT---G-------A---TTAT-TATG---------T
gi|19 : aaTCA-T-G-TAATATTA-A-----AATCAACACTCATGTAA-TG---CATACATACTAATT-----GTTTAGTTCA--CTCT-----------G-AT-CAAG--------TC--C-AATTTGAATAAAA----------T-------------A---CAT---------------AG-------TT--------TAATTTCTAAATCAATTTATTATCATTTAATAGCTT------CCTCT-TT------TGATA--ATT----ATATACTAAATTGCC-T-AAA-AT--------------CT-T-TAT-ACAGA--AGCA----TTAAA----AAACTC-TCATGCTGTTCACTGT-------ACGAACAGA--A------------CCCCACAA-AA---GTGTTC-----A------TT---A-------A---Ttttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacctaaaggttagttataggtcatttatactaatgttacacataattatgtcgcataaggtacattatgaaaatgtgtgttttagaaatagttacacaaatactttcaaaatcaacacaatctttttcaaagggaataataataaggtgtgtactttaaatacaatgtatgcaattctacaactgtcagcaaaacattcatattcgcacatttaagcactatgtttatagcatttattatagtttttaattctctgccatatgtcaaaagagtggaatgcactgtggcttatctacgttgaagctgaactcaaatcaactgtcaatcacaactggaggaaaatttga
gi|3 : cagtgtaA-AA---G-GTTA-----G------TT---ATAGGTCAA---TCAA-T-TA---------TACTAA------TGGTAGGCATAATTAAGTCACAGAAGGAACAATATGGAAA----------------TGT-TT-T---------------------------------C-----------------C-------AAA-TCAA----CACAAT-CTTTCTAAA-GGG-AAGAATAACAACGTA--T---GTACA--TG---TACTTGATACAA---TGCA-TGTAC----T-CCTACAACATTTGTCAA----T---------------------------AAAACA----TTCATGT-TA--CA---------CA----T-CTTAACA-CCATGTATAAAG---CATTT-A-T----TATAA-ATTTTAGTT-----ACCTGCCATAT--GTC-AAAACGTAGCA--T-----G-----CACTTTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GTTG-GACTGTAGTAGGCTGGAGAGTTGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACTA-----AGGG--AAATTT-GAATTTTACA------ACAG-TTTGC----AA-AAAAGATTTT-TAGCACG----T-GACA--C-----------TAATAAAGTACAAA-T-TG-TTTTCATA-TTCACATGAC--AAATATTATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTTCGTATGA-CTTTTGAAA-TT---TA-A-AA--t
gi|5 : gaaaacccttcttgtaaggaattaggcaaatatgggagagaaggtgtggctaaactattggtctgctcgctcttgtctttttgcatttgtaaacataaacgtgtgatttggatttattgctgtgtgaactactactgacaaaatgaacagtcagtgtatgtaataatcaacgtctttgtaatgaataatatatactaattgtttggttcactttcataaattcaagattaaatcagtttggataaaatattaatattaattcttgcattcaatttctaaaacactttataatcagttagttgctccttcttttaatattcatatacttaaatgccttgaaatttatactgaaggataattcaagtcttgtactgtaaactgaaaaagcaaaatcccacaaaatttttttaattgatcataatgtttttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctA-AA---G-GTTA-----G------TTATAG-------G---TCAT-T-TA---------TACTAA------TGTTACACATAATTATGTCGCATAAGGTACATTATGAAAAT--------------GTGTGTT-TTAGAAATAGTTAC----------ACA-AA----TACTTT------------C-------AAAATCAA----CACAAT-CTTTTTCAAAGGG-AATAATAATAAGGT--GT---GTACT--TTAAAT--ACAATGTA----TGCA----AT----T-CT--------------ACAACTGTCAGC---------------------AAAACA----TTCATATTCG--CA---------CA----T-TTAAGCA-CTATGTTTATAG---CATTT-A-T----TATAG-TTTTTAATT-----CTCTGCCATAT--GTC-AAAA----GAG--T-----GGAATGCACTGTGGCTT-ATCT---------------AC----GTTGA------AGC-------TGAACTCAAATC-AACTGTCAATCACAACTGG-AGGA--AAATTT-GA
gi|9 : aaatggtcaagtgtatgtaataatcaacattcttgaaatgattacatactaattttttagtgcacattgatcaaatcaagtttgaatcagtttggataaaaacattgttaattcttacatagtaatatctaaaacaattcattatcagttaattgtttcttcttttaataattatatactaaattgcctttaaaacttaatattgaaggatgatacaattctcacgctttttactgtaaaatcaaattcccataaaaatttattgattattatgttttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacct-AA---A-GTTATAGTTA------TA---G-------G---TCAG-T-TA---------TGCTAA------TGTAAGACATAACTACGTCACATAAGGGTCATCATGAAAAT--------------GGGTGTT-T-----------T-----------ACA-AATGG-T-----------------T-------AAA--CAAATGTCACAAT-CTTCATAAA-GGA-AATAAGAACAAAGCA--TGAACTTGA--TA---TAATGAATGTACCCCTACAACA-AT----TGTC--------------A----AG--------------------------AAAACA----TTCATAT-AG--CT---------CA----C-CTAAACA-CCATGTACATAG---CATTT-A-T----TATAGTTTTTTAATT-----CCCGGCCATAT--GTG-AAAA----GAG--T-----G-----
gi|6 : cattcgatggtaatatactatatttaattgaatgtgtattttttacagttgataaagtactcaaccttatttgatatccaatgattttaaaatgccttaaaattcatattgaagaatgataaaattcttgcgttgtttgcatgtatacatgtaataaaaaaagttcattgctcagtacgtgtttctttctttctttaaaataaaaataaaactgccttA---------TGATAA------TTTTAGGACAAGTTATATCACAGCAAGATCATTATGAAAAAACAATGTATTTTAGGTATGGT-T-----------AC----------ACA-ATGTTTT-----------------C-------AAA-CCAG----CACAATGATCCCC--ACAGG-TCTAATGAGAAA-----------TGT--TT---T--TAAATTTA----TACT-CG-AT----A-CA--------------A----TA--------------------------AATTCAGTGTTTGACAT-AATCCAAAGAATTGTCA----A-CGAAACATCCATATA-GTAC---TATGT-A-GCATCTATAA-CTTTTAATT-----ATCTGCCATGT--GTC-AAAA----TAG--T-----GGGTTGCGCTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTG-GGCTGTAGTTGGCTGAAGAGATGTGTCATGAACTAAGATT-AGCTGTCAATCACAAC--G-GGGATTGGATTT-AAATTTTATAACTGTTACAA-TTTTTAAAAAA-AAAAGATTTT-T-GAATG----T-GACT--C-----------TAATCATGTAC-ACAT-TG-TTTTAAAA-ATCACAGGACATAAAGATCATACATTCAAGAACGGATATGCCATGTTTCAACAAAATCTG-------TGA-CTTTTAAACTTG---TATA-AT--AT-CT------TT--CACAGATGGTT-TGCT---TCCATTGAGTACAGAGAAGTCAGTGTAAATGGCCATTTGTTCAGTGTTTCTAGCTTTCATACTGGTACTCAGACC
gi|15 : gaatttaatgctataattaaactacatgaAGTTATGCCATGGAAGAAAAAAATTGAAAAA--------------GGGTGTT-T-----------T-----------AGA-AA----TAGTTCCAAAATTGTTTCC-------AAA-TCAA----CAGAAT-GTTCCTCAAAGGGAATAATTGGGAAA-TA------TGTC--------T--TTAATTTA----TACA-TG-ATACA-T-GC--------------A----TG--------------------------A
gi|8 : ttaacaaatacttcacaggaaaaaacacattctgattcttatttatcgaagaaaatattaattcatagttaaaattagtttgttatggagttatattgctattttctttcttgttttcttaacaactaaaatataactgcacaaggtgcaa--------------------------AAAACA----TTCATAA-AG--CA---------CA----T-CTAAACA-TTATACATGTAG---CAATA-A-T----TCTAG-TTTTTAATT-----ACACGCCAAAT--GTC-AAAA----GAG--T-----GAAATGCACTGTGGTTT-ATCGCTATAGAA-GCTA-GACTGAAGTTGGCTGGAGAGTCAGGTTATGAACTCATATC-AGCTGTCAATCATAACTGA-AGGA--AAATTT-AAATTTAACA------ACAG-TTTTC---AAA-AAAG---ATT-T-TTTTGAATAT-GAAA--C-----------TTATATTGTAT-AC----AGTTTTCAAA-TTCACATCGCATACAGATCATATATTCAAGAACAGATCTGCGAAGTTTCAATTGAATCTGCAAGGTACAA-CTCTTGAAAATT---TA-A-AG-----CC------T------------------------CAG-------AGA--ATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGTTGCTGGCTTTTATACTGTAACTCCAGCCTgtgtttgacacagtcgtaagacttttgtcaataaaacattcatat
gi|24 : tctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcagtA----TACATGT-AT--CA---------CA----A-CTTGATG-TTAC-----TGG---TATTT-CTA----TAGAG-TATTTAATT-----CCC-ACCACAT--GGC-AAAT----GAG--T-----GAACTGCATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTG-TCATGTAGTTTACTGGAGttaagtattcaatatgataataaacaacata
gi|18 : cttgcaatgaacaaatccttcatacatgtAACA-C-ATTTATATAACGCTATTTTA-A----TGTTG-C-----ACT-----CCCTGTCATATAAGCC-GTAC----GAG--T-----G-----GAAT----TCT-ACGTCCACAGAA-GCTG-TGTT-TATTTGGTTGAAGGGTATGGTCATAAACATACATCCAGCTGTCAATCACAACTGA-TGGA--AAATTTTGAATTTTA-A------ATAGATTTTT---AAA-A
gi|17 : acaacaataacaacaacaaaacatcataagatgtccttcaataaacctgtcaat-TTTTCAATTTCCCGCCCTGCCATAT--GTTTGAAA---------T-----A-----CACTGTGACTTTATTGCCGCAGAAAGTTG-TGC-GTCATTAGCGGGAGAGTCGGGTCATGGAATCAGATC-ACCTGTTAATCGCCATTGT-AGGA--TTTCTT-TTATTTTACA------ACAG-TTTTC---AAT-TAGAAGC-TT-T-G------------CA---------------TAT--AGTAC-AC-TGTG-TTT--AAA-TTCAC-TG----AAAGATT---CA---AAAAACAGGTTTGTAAAACTTCAACAAAATGGGACAGGTATGA-CTTTTGAAATTC---TA-A-AA--tagatttaacgtagcactaat
gi|7 : T-----CCCCGCCACAT--GTC-AAAA----GAG--T-----GAAATGCACTGTGGCTT-ATTTCTATAGAT-GCTG-GGCTGTAGTTGGCTGGAG--TCAGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGCCAGTCACAACTAG-AGGA--AAATTT-GTATTTCACA------ACAG-TTTTC---AAA-AAAAAATTTT-T-GAATG----C-GACA--C-----------TTATAAAGTAC-ACAT-TG-TTTTCAAA-TTCAC-----ATAA---TCATACATTCAAGAACTGAACTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTT-TTTACCA-CTTTTGAAAATT---TA-A-AA--AATCC------TC--AACTGATGCTT-TGCT---TCC---GAGTACAGAGAAATCTGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTGACTGCGGCCT
gi|12 : tttaaaCCGGCCATAT--GTC-AAAA----GAA--T-----GGAATGCACTGTGACTT-ATCTCAATAGAA-TCTG-GGCCGTTGTTGGCTGGAGTGTCGGGTCATGAACTCAGCTT-AGCTATCAATCACAACAGG-AGAA--ATATTT-GAATTTTACA------ATAA-TTTTC---AAA-AA----CATC-T--TTTGAA--T-GTTAAGT-----------TTATAAAATAC-ACAA-TG-CTTTAAAA-GCCACATGGCATAAAGTTCAAACATTAAAGAATAGACCTACCAA-TTGCATCGAAATTTGTGAGGTAAGA-CTTTTGAAATTTAAATA-A-AA--AT-CC------TC--CATTGATGTTT-TGCT---TCCAGTGAGTTCAGAGAATTCAATGCAAGTGGCCA-TT-TTCAATGTTTCTGGCTTTTATACTGTAACTCttgaatccatttcatcaacacacatttttaaagaagaatactttaatcttttgggcagttagctataaagttgatagcatcacaaatccagcattgcagctatagaacagaggcaaggcccgggtcaaaaa
gi|14 : cttttcatcta--T-----G-----CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTGA-TGTAGTTTACTGGAGA-TCTGGTCATGAAT----ATA-AGTTGTCATTTACCAATGGTAG----AAAAT----ATTTTA-T------A-AG-TTTTC---AGA-AAAGATTGTT-T-AAATG----TAGTAA--TTAATATATATATTATAAACTAC-ACAT-TG-T--------TTCACATGGCACATAGATCATAAAT-------------TACCAAGTTTCAACAAAATCTGTGAGATGTGA-CTTTTGGCATTT---AA-A-AA--A-----------C--AAC----AGTATTGCTTAATACAGGGTGTATAGA-AATTGTTTTTCAATTGCCATTT-TTC----------ACTTTTATACT
gi|16 : TT-GAATTTAA-A------AAGG-TTTTC---AAA-GA-----ATT-T-TTTT--------TTA--T-----------TTATAA------AC-T-T--TT---AAA-TCAACATGACATACA-CTCATGTATTCATCAACAGTTTTGCTAATTTTCAATCAAATAAATTAAGTATGA-ATTTTTAA--TT---TA-A-AA--AGACA------TCGTCACT-AT-GTA-----------AGCAAATACAGAAAAATCAATGGGAATGGCCATTT-TTCATTGCTGCTGGTATTTATACCGTTACTCCGGTCTcttacttctacagccttttaagttcaaaggtataataataaacatatataaa
gi|21 : tTT-T-GAATG----T-GACA--C-----------TTATAGA-TAC-ACAT-TG-TTTTCAAA-TTCACCTGACAAAAAGGCCATACATTCAAGAACAAATCTGCCAAGTTTCAATCAAATCTGGTTTGTAAGA-CTTTTGAAAACT---TA-A-AA--A------------------------A-AACT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAATGCTGCTAGCTTTTAAACTttaatgagatgtttaattaagatctaatgggagttgtaaataaacaaaatagccgtatagattaagtaccattgcccag
gi|20 : tTATAAACTAC-ACAT-TA-TTTTTAAAATTCATATTTCATAAAGTTCATATATCCTAGAAC----------AGTTTCAATCAAATATGCAAAAAACGG-CATTTGAATTGT---TA-A-AAATATCCCGACGTGTC--CATTG
gi|27 : aattgaaaaaaaacaacaatagtttccattactgtttgaaagttgcatttaAATTT---TA-ATGA--ATCC-------TC--CACAACTGCTA-TGCT---TCCAGTTAGTATAGAA---------------GCCATTT-T-CAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCAGTCTctcagtgttgttgtctttgatagtattactcca
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCGACAGCTTACTCATTACGATGACATATTCGTCGTCAGTATGTCGTTTGTAGCAATGAATTCGGCGACATCGGTAAGTGACATAAAATCTAGTAAGCGCCTCTACAAAATTATATAACATTTTCAGTTTAACATACGAAACCATGCTTTGTTAGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTCTACAATGCCTTAAACCGTTATATAGACGCATGATAAACCTCGCATGCTGTTAACGGCTGCTCATCAAAAGCTCAGGACAGTGTTCATTTATA
Unaligned ( gi|30 ): TGATTGTTTAACTAACTTTGATTAAATCCAGTTTGAATCAGTTTGAATAAAATATATTGTTAAACTTCATTTCTAAAACAATTTGTAAACAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 1 2222222 222 111111 1111111 111 111111111111111 2222222222222222 1111111111111 555555555555555 11111111111 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 11 11111 333333333333333333 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222222222222222222222222 22222222222 111111 44444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 1 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111 111111 1111111 1111111 33333333 1111111111111 22222222222222222222222
lowQualScore : 0 3 5555555 666 8 3 444444 5 6666666 1 222 1 444444444444444 4 8 4 777 0 0 4 4 1 55 4 4 777 2222222222222222 4 4 777 3333333333333 777 4 000000000000000 99999999999 777 4 1 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44444444 1 55 0 1 1 00 666 777 00000 0 4 4 111111111111111111 4 4 1 55 2 4 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 666666 66666666666666666666666666666 5 4 11111111111 444444 11 00000000000000000 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 5 0000 1 0 0 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 66 9999 4 66 777777777 222222 4 0 2222222 1 0 1 77 0000000 5 77777 44 3 3 22222222 3 3 3 22 3 1 44 3 2 888888 0 9999 3 9999 4 2 2 8888888888888 2 44 2 22 1 3 1 00 0 888 4 3 3 0 555 3 3 22222222222222222222222 777 2 3 1 1 3 1
lowQualScore : . . ....... ... . . ...... . ....... . ... . ............... . . . ... . . . . . .. . . ... ................ . . ... ............. ... . ............... ........... ... . . . ......................................................... ........ . .. . . . .. ... ... ..... . . . .................. . . . .. . . . .................................................................. . ...... ............................. . . ........... ...... .. ................. . ...................................................... .. . .... . . . . .................................................................................................................... .. .... . .. ......... ...... . . ....... . . . .. ....... . ..... .. . . ........ . . . .. . . .. . . ...... . .... . .... . . . ............. . .. . .. . . . .. . ... . . . . ... . . ....................... ... . . . . . .
lowQualScore : 0 3 3333333 777 8 2 444444 0 2222222 4 777 9 888888888888888 0 0 0 000 7 7 0 0 2 55 0 4 888 3333333333333333 0 0 000 5555555555555 000 0 666666666666666 00000000000 000 0 0 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 55555555 0 55 7 6 0 66 888 111 44444 1 0 0 444444444444444444 0 0 1 55 4 0 6 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 666666 11111111111111111111111111111 7 0 11111111111 444444 88 44444444444444444 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 6666 0 8 2 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 99 4444 4 11 888888888 111111 0 4 2222222 4 9 0 99 0000000 8 77777 22 1 1 99999999 1 1 1 22 3 2 66 1 1 888888 7 7777 1 8888 0 9 9 0000000000000 9 22 8 88 4 1 9 33 2 333 4 1 1 6 444 1 1 66666666666666666666666 000 2 2 0 4 6 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATC--TT-AACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGATT-ACAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATG---A-ATACATACTAATT-------G-------CACTTT-----------GAT---TAAA-TCAAGTTTGAA-----------T-AGTTT--ATA-AA--TACATT---GTTA-------AT-------TTT--------AATTTCTAAAACAATNTAT--AATCATTTAATTGCTTCTTCTTTNA--AT--AATN--ATTT----ACTAAAATGCC-TTAA-AA--------------CT--T-TAT-ATTGA--AGNAT-GNTCAA----ATTT---CGC-T-T----C------------TGT-------AA--T--AAA-------TCCCACAA-AA---A-GTTA-----A------TT---G-------A---TCAGT-TA-----------TGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAAGTA-T---GTNCT--T--T---T--TTAATTTA----TACA-CG-AT----T-CC------AT--------GCA-------------------------A---------------------AA--CA----TTCATAT-AG--CA---------CAN-----CTAAACA-CTATG------TATGTAGCATTTATTATAG--TTTTCAATTC-------CCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TTTT-T-GAATGTG-----------ACAC-TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AAA----T-CCTCCACTG-ATG-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
Reference ( family-3662 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATC--TT-AACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGATTNACAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------NA-----ATCAACATTCTTGTAATG---A-ATACATACTAATT-------G-------CACTTT-----------GAT---CAAA-TNACGTTTGAA-----------T------------AA--TACATT--CGTTA-------AT-------TTT--------AATTTCTAAAACAATNTAT--AATCATTTAATTGCTTCTTCTTTNA--AT--GATN--ATTN----ACTAAAATGCC-TTAA-AA--------------CT--T-TAT-ATTGA--AGNAT-GTTCAA----ATTC---CGC-T-T----C------------TGT-------AA--T------------TCCCACAA-AA---A-GTTA-----A------TT---G-------A---TCAGT-TA-----------TGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTNAAAGGGAATAATGACAAAGTA-T---NTTCT--T--T---T--TTAATTTA----TACN-CG-AT----T-CC------AT--------GCA-------------------------A---------------------AA--CA----TTCATAT-AG--CA---------CAN-----CTAAACA-CTATG------TATGTAGCATTTANTATAG--TTTTTAATTC-------CCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TNTT-T-GAATGTG-----------ACAC-TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AAA----T-CCTCCACTG-ATGNTNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
gi|1 : -TTAT--AA---ATGCA--TAAAATGTCG---TTCACAA------TATTG-AAAAAAAAAACACAA-C-CGGTAAGCCATTA-----AAGCA----AA-T-ATGGA-AG---AGAAGGTGTAGCTACACTACTGGCCTGA-TT-GCTCGTATC--TTGAACATT-GTAAAGGTGAACACGTGGTT-TGGACTGATAGCTGCGGGA---ACTACAGTGATTGACAACAGATAAGGTGATAGGTCA-GTG-TAT---GCAA------TA-----ATCATCATTATTGTAATG---A-CTACAAATTAA-----------------CAGTTT-----------AGTATACAAAATCA--TTT-AA-----------T----------------TGC-TT--CGTC---------T-------TTT--------AAT------AAGTATATACTAAAACGCCTAAAAACTTTGTACTGAAGCAT--GATAGAATTGTATAATTAAACTCCC-ACAA-AA--------------ATG-T-TA--GTTGATCAATAA-GTTTTT----CTTT---C-T-T-T----C------------TTT-------AA------------------AACAA-AA---A---TA-----AAACTGCTT---A-------AG--TCAAT-TA-----------TGTTAAAATTGATGTTAGGCCTAGTTATGTCACAGTATGGACATTGTGAAAA-----------------GTGTT-T-----------AGAACTGGTTACACAA-----ATA--------------TTTTCC--AAA-TCAA----CGCAATGTTCCTTAAAGGGGATAATGATAAAGTA-T---GTA-------T---T--TTAATTTA----TATT-TG-ATATAAT-GC------AT--------GCA-------------------------ATCCTGCAACTGTTGTCAATAAAA--CA----TTTATAT-AG--AA---------CATATGATCTAAATA-CTATG------TAAGTAGCATTTATTATAG--TTTTCAATTC-------CCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AATTGA--A--AG-CATTGTGAC---ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGATGGCTGGAGGCTCGG-TTGTGAACTCAGATC-AGCTGTCAATTACAACTGGGGAA--AAGTTT-GAATTTTACA------ATAGTTTTC---AAA-TAAA-A--TATT-T-GAGTTTG-----------ACAC-TTATA--AAGTACACATTGTCTTAAAA-TTCACATGACATAAAGATCATATATTCAAGAATAGACATGTCACGTTTCAACCAAATCTGTTTTGTATGACTTTTTT-AAATTT---TA-A-AAA----T-CCTCTGATG-ATGATTTTCT---TCCGGTAAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-GTCAGTGCTGCTAGCTTTTGTACTGTTACTCCGGCCT
gi|10 : ccatgtgaatatatattaccttatattgctatgcTTAAAAGGCCGAGGTTCACTACCGATATATCA-AAAAA-------CAA-C-CGGTAAGCAATTACCACAA-AAA----TA-TTATGGA-AG---GGAAAGTGTGGCTA--CTACTTGCTTGC-TT-GCTTTTATC--TT-AAAATTTGCATACATAAACATGTGGTT-TGGATTTATAGCTGTGTGA---ACCA-------TTAC------TGAGTTGAATGGTCA-GTG-TAT---GCAA------AA-----ATCAACATTCTT-------------ACATGTTAATT-------GTTTAGTGCACTTT-----------GAT---CAAA-TCAAGTTTGAA-----------TGAGTTTAAATAAAA--TACATT--GTTTATTCTAACAT-------CTT--------AATTTTTAAAACAACTTAT--TATCAGTTAATTGCTTCTTTTTttacgaagtattaaaacacttaaactaatgaaaagctgcctatcagaacgtaaacgtcaaataaagttagtacattgaccag
gi|11 : tcatcagtgttttttTTCACTA------TATCGCAAAAA-------CGA-C-CGGTCAGCAATAA-----G-ACAAATTTAAT-ATAGA-AG---AGA--------------TACTTGCCTGC-TA-GCTATTATC--TT-AACATTTGTAAACATAAAGATGTGGTT-TAGATTAATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGATATATAACAGATAAGGTGAATGACCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATG---A-ATACATACTGATT-------G-------CACTTT-----------GAT---TAAA-TCAAGTTTGAA-----------T------------------CAGT----TTA-------AC-------TAT--------AATTTCTAAAACAATGTTT--AATTGTTTAAGTGCTTCCTGTTTTA--AT--AATA--TTTA----ACTTAAATGCC-TTAA-AA--------------CT--T-CAT-GTTGA--AGCAT-GTTCAA----ATTT---TCA-T-T----G------------TAT-------AA--TTAAAA-------TCCCACAA-AA---A-GGTAT----A------CT---G-------A---GCAGT-acgtctttaagttctttaagtatacttctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcagtaaaacattcataaa
gi|12 : gta--TTTTCATCTA-------CCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AAT--GGAA--TG-CACTGTGACTT-ATCTCAATAGAA-TCTGGGCCGTTGTTGGCTGGAGTGTCGGGTCATGAACTCAGCTT-AGCTATCAATCACAACAGGAGAA--ATATTT-GAATTTTACA------ATAATTTTC---AAA-AACATC--T-TT-T-GAATGTT-----------AAGT-TTATA--AAATACACAATGCTTTAAAA-GCCACATGGCATAAAGTTCAAACATTAAAGAATAGACCTACCAA-TTGCATCGAAATTTGTGAGGTAAGAC-TTTTG-AAATTTAAATA-A-AAA----T-CCTCCATTG-ATGTTTTGCT---TCCAGTGAGTTCAGAGAATTCAATGCAAGTGGCCA-TT-TTCAATGTTTCTGGCTTTTATACTGTAACTCgttttgtttttctttctgtttttgtaacattaacaggaag
gi|13 : cGGTTCACTA------TAATG-AAAAA-------CCAAT-TAGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGTCTAAACCACTGGCCTGT-TT-GGTCATATC--TT-AACATTTGTAAACATAAAACTGTGGGT-TGGATTGATAGCAGTGTGA---ACTA-----A--------AAATAAAGTGAATG-------G-TAT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATG---A-ATACATACTAATT-------G-------CACTTT-----------GAC---TAAA-TAAAGTTTGAGTCAGTTCGAATT------------AA--TACATT---GTTA-------AT-------TTT--------AATTTCTAAAACAATGTGT--AATTATTTAATTGCTTCTTCTTTAA--AT--GATT--ATTT----ACTAGAGTGCC-TTAA-AA--------------ATTCT-CAC-AC---------T-GTTCA----------------T-T----G------------TAT-------AA--TTGAAA-------TCACACAA-AA---ATGTTC-----A------TT---G-------
gi|14 : --TG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTGATGTAGTTTACTGGAGA-TCTGGTCATGAAT----ATA-AGTTGTCATTTACCAATGGTAGA--AAAT-----ATTTTATA------A--GTTTTC---AGA-AAAGAT--TGTT-T-AAATGTAGTAATTAATATATATATTATA--AACTACACATTGTTT--------CACATGGCACATAGATCATAAATT-------------ACCAAGTTTCAACAAAATCTGTGAGATGTGAC-TTTTG-GCATTT---AA-A-AAA---------CAACAGTAT----TGCTTAATACAGGGTGTATAGA-AATTGTTTTTCAATTGCCATTT-TTCA----------CTTTTATACTCTTACTTC
gi|15 : GCAAAGTTATGCCATGGAAGAAAAAAATTGAAAAA--------------GGGTGTT-T-----------T-----------AGAA-----ATAGTTCCAAAATTGTTTC---C--AAA-TCAA----CAGAATGTTCCTCAAAGGGAATAATTGGGAAATA-T---G------T--C---T--TTAATTTA----TACA-TG-A-----T-AC------AT--------GCA-------------------------tacagccttttaagttcaaaggtataataataaacatatataaa
gi|16 : ttaacaaatacttcacaggaaaaaacacattctgattcttatttatcgaagaaaatattaattcatagttaaaattagtttgttatggagttatattgctattttctttcttgttttcttaacaactaaaatataactgcacaaggtTTT-GAATTT-AAA------AAGGTTTTC---AAA-GAA-----TTTT-T----TTT-------------TAT-TTATA--AA----------CTTTTAAA-TCAACATGACATACAC-TCATGTATTCATCAACAGTTTTGCTAATTTTCAATCAAATAAATTAAGTATGAA-TTTTT-AA--TT---TA-A-AAAGACAT-CGTC-ACT--ATG-TA----------AGCAAATACAGAAAAATCAATGGGAATGGCCATTT-TTCATTGCTGCTGGTATTTATACCGTTACTCCGGTCTtgagtgtttgacacagtcgtaagacttttgtcaataaaacattcatat
gi|17 : --TTTTCAATTT-------CCCGCCCTGCCATAT--GTTTGAA-----------A--TA-CACTGTGACTTTATTGCCGCAGAAAGTTGTGC-GTCATTAGCGGGAGAGTCGGGTCATGGAATCAGATC-ACCTGTTAATCGCCATTGTAGGA--TTTCTT-TTATTTTACA------ACAGTTTTC---AATTAGAAG----CTT-T-GCATAT-------------------------AGTACAC--TGTGTTTAAA-TTCAC-TGA----AAGATT---CA---AAAAACAGGTTTGTAAAACTTCAACAAAATGGGACAGGTATGAC-TTTTG-AAATTC---TA-A-AAttaatgagatgtttaattaagatctaatgggagttgtaaataaacaaaatagccgtatagattaagtaccattgcccag
gi|18 : AACA-C-ATT------TATATAACGCT-ATTTTAA--TGTTGCACTC-------CCTGTC-----ATATAAGCCGTAC-G-AGT--G------G-AATT-----CT-ACGTCCACAGAA-GCTGTGTT-TATTTGGTTGAAGGGTATGGTCATAAACATACATCCAGCTGTCAATCACAACTGATGGA--AAATTTTGAATTTTA-A------ATAGATTTT---TAA-AATAGA--TTT-----AACGTA-----------GCAC-TAAT
gi|19 : acaacaataacaacaacaaaacatcataagatgtccttcaataaacctgtcaatCA-GTG-TATCATGTAA------TATTAAAATCAACACTCATGTAATG---C-ATACATACTAATT-------GTTTAGTTCACTCT-----------GAT---CAAG-TCCAATTTGAA-----------T------------AAAATACAT---------------AG-------TTT--------AATTTCTAAATCAATTTAT--TATCATTTAATAGCTTCCTCTTTTG--AT--AATT--ATAT----ACTAAATTGCC-TAAA-AT--------------CT--T-TAT-ACAGA--AGCAT-
gi|2 : GGTTATCAATGTTATCATACGCATGG--TTAAAAG-CCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCATC-CGGTAAGCAATTA-----A-GAA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGT-GCTAAACTACTGGCCAGCTTT-GCTCATATC--TT-AACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TTGATTGATAGCTGTCTGA---ACTAC--TGATTTACATCAGATAAGGTTGATGGTCA-TTG-TAT---GTAA------AA-----ATGAACATTCTTGTATTG---A-ATACATACTGATT-------G-------TGCTTT-----------GAT---TAAA--GACGTTTGAA-----------T----------------TACATT--TGTTA-------AT-------TTT--------AATTTCTTAAACAATATAT--AATTATTTAATTGCTTTTTCTCTTA--AT--GATA--ATTA----ACTGAAACGCC-TTAA-AA--------------CT--T-TAT-ATTGA--AGTAT-GTTCAA----ATTC---ACC-C-T----C------------TGT-------AA--T------------TCCCACAA-AA---A-GTTA-----A------TT---G-------A---TCAGTATA-----------TGCTAA------TGTTGGGCCTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----A-----------------T---C--AAA-TCAA----CAGGATATTCCTTGATGGGATTATTGGCAAAGTAGT---TTTCT--T--T---T--TTAATTTA----TACA-TG-AT----T-CC------AT--------G-A-------------------------A---------------------AA--CA----TTCATAT-AG--CA---------CAA-----CTAAACA-CTATG------TATGTAATATTTAATATGG--TCTTCGATTC-------CCTGCC-----ATTT--GTCAAAA-G-AG---------TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGTTGGCCGGAGAGCCGGGTCATGAACTCAGATC-AACTGTTAATCACCACTGGAGGA--AAAATT-GAATTTTA-A------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGG--TATT-T-GTTTGTG-----------TCAC-TTATA--AAGTACAC-TTATTTCCAAA-TTCACTTGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGACCTGCCAAGTTTTAACCAAATTTGTTATTTATGAT-TTTTG-AAATTT---TA-A-AAA----TCCCTCCACTG-GTGGTATGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGACTTTTATACTGCGACTCCGGCCTtaaaaaactctcatgctgttcactgtacgaacagaaccccacaaaagtgttcattaatt
gi|20 : atgcgttgtttttattcgtatgtcaattttattgataagcaataacatctatagatgaaaatttaaaacagagcatACA------ATAGTTTCC---ATT-AC------TGTT-T-GAAAGTT-----------GCAT-TTATATAAACTACACATTATTTTTAAAATTCATATTTCATAAAGTTCATATATCCTAGAAC----------AGTTTCAATCAAATATGCAAAAAACGGC-ATTTG-AATTGT---TA-A-AAA----T-
gi|20 : aattgaaaaaaaacaGTGTCCATTG-CTCAGTGTTGTTGTCTTTGATAGTATTACTCCatcccgacgtgtccattgctcagtgttgttgtctttgatagtattactcca
gi|21 : aattgaaaaaaaacaacaatagtttccattactgtttgaaagttgcatttatataaactacacattatttttaaaattcatatttcataaagttcatatatcctagaacagtttcaatcaaatatgcaaaaaacggcatttgaattgttaaaaatatcccgacTT-T-GAATGTG-----------ACAC-TTATA--GA-TACACATTGTTTTCAAA-TTCACCTGACAAAAAGGCCATACATTCAAGAACAAATCTGCCAAGTTTCAATCAAATCTGGTTTGTAAGAC-TTTTG-AAAACT---TA-A-AAA--------------A-A------ACT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAATGCTGCTAGCTTTTAAACTa
gi|22 : t-CAGTAAGCAATTG-----G-GCA----TA-TCATATATAGCCTAGAATGTGTGGCTGAACTACTAGTCTAC-AT-GCTCTTTTC--TC-AAC-TTTGTAAACAAAAGTATGTGGTT-TTGATTGATAACTGTGTGA---ACTTC--TGATT-ACAA
gi|24 : ttttaatggccagagtttacatgtgtacttcataaacaaaaaaaatgtaA----TACATGT-AT--CA---------CAA-----CTTGATG-TTAC-----------TGGTATTT-CTATAGAGTATTTAATTC-------CC-ACC-----ACAT--GGCAAAT-G-AGT--G--AACTG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTCATGTAGTTTACTGGAGttg
gi|25 : cttgcaatgaacaaatccttcatacatgtGATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAGCCCGGGGTTCACTA------TATCG--AAAA-------TTA-C-C-----GCAA------------------A-T-ATAGA-AG---AGAATGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCATATC--TC-AA
gi|26 : accatatatataAACATAAACACGTGGTTATGAGTTGATAGCTGTACTA---ACTCC--TG-------------AAGGTGAATAGTCA-GTGTTAT---GTAATATCAGTA-----ATCAACATTTATGTAA-G---ACATACa
gi|27 : tgctggacattattcatctAATTT---TA-ATGAA----T-CCTCCACAA-CTGCTATGCT---TCCAGTTAGTATAGAA---------------GCCATTT-T-CAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCAGTCT
gi|28 : GTTCACTA------TATCT-AAATA-------CCA-CACGGTAAGCTATTA-----A-GGA----CA-A-GCTGA-AC---AAAGGGTGTGGCTAAACTACTGATCTGG-TTAGCTCTTATC--TC-AACtataacttacggataaagaaatattgaa
gi|29 : CTACAATGCC-TTAA-AC--------------CG--T-TAT-ATAGA--CGCAT-GAT-AA----ACCT---CGCAT-G----C------------TGT-------tgtcggaatttgctaca
gi|3 : ttGTAAGGAATTA-----G-GCA----AA-T-ATGGG-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTATTGGTCTGC-TC-GCTCTTGTCTTTT-TGCATTTGTAAACATAAACGTGTGATT-TGGATTTATTGCTGTGTGA---ACTAC--T-ACTGACAA-----AA--TGAACAGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACGTCTTTGTAATGAATA-ATATATACTAATT-------GTTTGGTTCACTTTCATAAATTCAAGAT---TAAA-TCA-GTTTGGA-----------T------------AA--AATATTAATATTA-------ATTCTTGCATTC--------AATTTCTAAAACACTTTAT--AATCAGTTAGTTGCTCCTTCTTTTA--AT--ATTC--ATAT----ACTTAAATGCC-TTGA-AA---------------T--T-TAT-ACTGA--AGGATAATTCAA----GTCT---TG--T-A----C------------TGT-------AAACTGAAAAAGCAAAATCCCACAA-AATTTT-TTTA-----A------TT---G-------A---TCA-------------------TAA------TGTTtaacggctgctcatcaaaagctcaggacagtgttcatttata
gi|3 : gaaaacccttcttA-AA---G-GTTA-----G------TT---ATAGGTCAA---TCAAT-TA-----------TACTAA------TGGTAGGCATAATTAAGTCACAGAAGGAACAATATGGAAA------------------TGTT-T-------------------------------------------------TC---C--AAA-TCAA----CACAATCTTTCT-AAAGGGAAGAATAACAACGTA-T---GTACA--T--G---TACTTGATACAA---TGCA-TGTAC----T-CCTACAACATTTGTCA--ATA-------------------------A---------------------AA--CA----TTCATGT-TA--CA---------CAT-----CTTAACA-CCATG------TATAAAGCATTTATTATAA--ATTTTAGTTA-------CCTGCC-----ATAT--GTCAAAACGTAGC-----A--TG-CACTTTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GTTGGACTGTAGTAGGCTGGAGAGTTGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACTA----AGGG--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTGC----AA-AAAAGA--TTTT-TAGCACGTG-----------ACAC-TAATA--AAGTACAAATTGTTTTCATA-TTCACATGAC--AAATATTATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTTCGTATGAC-TTTTG-AAA-TT---TA-A-AAtttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctaaaggttagttataggtcaatcaattatactaatggtaggcataattaagtcacagaaggaacaatatggaaatgttttccaaatcaacacaatctttctaaagggaagaataacaacgtatgtacatgtacttgatacaatgcatgtactcctacaacatttgtcaataaaacattcatgttacacatcttaacaccatgtataaagcatttattataaattttagttacctgccatatgtcaaaacgtagcatgcactttggcttatctccatagaagttggactgtagtaggctggagagttgggtcatgaactcagatcagctgtcaatcactaagggaaatttgaattttacaacagtttgcaaaaaagatttttagcacgtgacactaataaagtacaaattgttttcatattcacatgacaaatattatacattcaaaaacagatctgccaagtttcaaccaaatctgtttcgtatgacttttgaaatttaaaa
gi|30 : gaaaacccttcttgtaaggaattaggcaaatatgggagagaaggtgtggctaaactattggtctgctcgctcttgtctttttgcatttgtaaacataaacgtgtgatttggatttattgctgtgtgaactactactgacaaaatgaacagtcagtgtatgtaataatcaacgtctttgtaatgaataatatatactaattgtttggttcactttcataaattcaagattaaatcagtttggataaaatattaatattaattcttgcattcaatttctaaaacactttataatcagttagttgctccttcttttaatattcatatacttaaatgccttgaaatttatactgaaggataattcaagtcttgtactgtaaactgaaaaagcaaaatcccacaaaatttttttaattgatcataatgtttttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctACTTT-----------GAT---TAAA-TCCAGTTTGAA-----------TCAGTTTGAATAAAA--TATATT---GTTA-------AA-------CTT--------CATTTCTAAAACAATTTGT--AAACA
gi|4 : tgattgtttaactaGGAGTTCACTA------TGTCG-AAAAA-------CCG------------ATTA-----G-ACA----AG-T-ATAGA-AG---AGAAAGTATGGCTTAGCTACTGGCCTGC-CA-GCTCTAATC--TT-AACATTTGCAAACATAAACGTGTAGAT-TGGATTGATAGCTGTGTGAGCTACTAC--TGATTAACAACATATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCACCATTCTTGTAATG---A-ATACATACTGATT-------G-------CACATT-----------GAT---TAAA-TCAAGTTTGAA-----------TCAGTTTGAATAAAA--TACA-G--CGTTA-------TT-------ATT--------AATTTCTGAAACAATGTAT--AGTTATTTAATTGCCTCTTATTTAA--AT--AAGT--ATTT----ACTAAAATGCC-ATAACAATTCTCACGCTGTTCCT--TGTATAATTAA--AAT-T-GATCGATGCGATTT---TTC-T-T-----------------TAC-------AA-----------------CAACAATAA---A-ACTA-----C------CT---A-------AATGTTAGT-TATAGGTCAATTATGCTAA------TGTCGGGCCAAGTTTTGACACAAAAGGGACATTA-GAAAAA--------------ATATGTTCT-----------A-----------GAAATGGTTATACAATCTT-------TT---CCTAAA-TCAA----CACGATATTCCTTGATGGGAATAATGCCATAGTA-TGTATTTCTAAC--T---T--ATACTTGA----TACT-TG-AT----A-CC------AT--------GCATGCAATCTTACGACAATTTTCTATAA---------------------AA--CA----TGCATAT-AG--CA---------CAA-----TTAAATA-CTATG------TATTTAGCATTTAA-----------CAATTCCCCCGGTCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--T-----TGTCACTATGGCTT-ATCCCCATAGAA-ACTGGACTATATTTAGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCTGATC-AGCTGTCAATCACAAATGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTT----AA-ACACGA--TTTTAT-GAATGTA-----------TCAC-TTATA--AAGTATACAATAATTCCAAA-TTCACATGATATAAAGTTCATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAATTAAATCTGTTATGTATGAC-TTTTG-AAat
gi|5 : AATGGTCAAGTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGAAATG---A-TTACATACTAATTTTTTAGTG-------CACATT-----------GAT---CAAA-TCAAGTTTGAA-----------TCAGTTTGGATA-AA--AACATT---GTTA-------AT-------TCTTACATAGTAATATCTAAAACAATTCAT--TATCAGTTAATTGTTTCTTCTTTTA--AT--AATT--ATAT----ACTAAATTGCCTTTAA-AA--------------CT--T-AAT-ATTGA--AGGAT-GATACA----ATTCTCACGC-T-TTTTAC------------TGTAAAATCAAA--T------------TCCCATAA-AA---A-TTT------A------TT---G-------A---TTA-T-TA-----------TGTT
gi|5 : aA-AA---G-GTTA-----G------TTATAG-------G---TCATT-TA-----------TACTAA------TGTTACACATAATTATGTCGCATAAGGTACATTATGAAAAT--------------GTGTGTT-TTAGAAATAGTTAC----------ACAA-----ATACT------------TT---C--AAAATCAA----CACAATCTTTTTCAAAGGGAATAATAATAAGGTG-T---GTACT--T--TAAAT--ACAATGTA----TGCA----AT----T-CT------ACAACTGTCAGCA-------------------------A---------------------AA--CA----TTCATATTCG--CA---------CAT-----TTAAGCA-CTATG------TTTATAGCATTTATTATAG--TTTTTAATTC-------TCTGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--GGAA--TG-CACTGTGGCTT-ATCTACGTTGAA-GCTGAACTCAAATCAACT----------GTCA---------ATC-A-----CAA------CTGGAGGA--AAATTT-GAttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacctaaaggttagttataggtcatttatactaatgttacacataattatgtcgcataaggtacattatgaaaatgtgtgttttagaaatagttacacaaatactttcaaaatcaacacaatctttttcaaagggaataataataaggtgtgtactttaaatacaatgtatgcaattctacaactgtcagcaaaacattcatattcgcacatttaagcactatgtttatagcatttattatagtttttaattctctgccatatgtcaaaagagtggaatgcactgtggcttatctacgttgaagctgaactcaaatcaactgtcaatcacaactggaggaaaatttga
gi|6 : aaatggtcaagtgtatgtaataatcaacattcttgaaatgattacatactaattttttagtgcacattgatcaaatcaagtttgaatcagtttggataaaaacattgttaattcttacatagtaatatctaaaacaattcattatcagttaattgtttcttcttttaataattatatactaaattgcctttaaaacttaatattgaaggatgatacaattctcacgctttttactgtaaaatcaaattcccataaaaatttattgattattatgttttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacctA-----------TGATAA------TTTTAGGACAAGTTATATCACAGCAAGATCATTATGAAAAAACAATGTATTTTAGGTATGGT-T-----------AC----------ACAAT----GTT--------------TT---C--AAA-CCAG----CACAATGATCCCCACAGGT-CTAATGAGAAA----------TGT--T--T---T--TAAATTTA----TACT-CG-AT----A-CA------AT------------------------------------A---------------------AATTCAGTGTTTGACAT-AATCCAAAGAATTGTCAA-----CGAAACATCCATATAGTACTATGTAGCAT---CTATAA--CTTTTAATTA-------TCTGCC-----ATGT--GTCAAAA-T-AGT--G--GGTTG-CGCTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGAAGAGATGTGTCATGAACTAAGATT-AGCTGTCAATCACAAC--GGGGATTGGATTT-AAATTTTATAACTGTTACAATTTTTAAAAAA-AAAAGA--TTTT-T-GAATGTG-----------ACTC-TAATC--ATGTACACATTGTTTTAAAA-ATCACAGGACATAAAGATCATACATTCAAGAACGGATATGCCATGTTTCAACAAAATCTGT-------GAC-TTTTA-AACTTG---TATA-ATA----T-CTTTCACAG-ATGGTTTGCT---TCCATTGAGTACAGAGAAGTCAGTGTAAATGGCCATTTGTTCAGTGTTTCTAGCTTTCATACTGGTACTCAGACC
gi|7 : gaatttaatgctataattaaactacatgaTTTAAATC-------CCCGCC-----ACAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGCTT-ATTTCTATAGAT-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAG--TCAGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGCCAGTCACAACTAGAGGA--AAATTT-GTATTTCACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAAA--TTTT-T-GAATGCG-----------ACAC-TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACAT--------AATCATACATTCAAGAACTGAACTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTT-TTTACCAC-TTTTGAAAATTT---AA-A-AAA----T-CCTCAACTG-ATGCTTTGCT---TCC---GAGTACAGAGAAATCTGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTGACTGCGGCCT
gi|8 : --------GTA-------------------------A---------------------AA--CA----TTCATAA-AG--CA---------CAT-----CTAAACA-TTATA------CATGTAGCAATAATTCTAG--TTTTTAATTA-------CACGCC-----AAAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGTTT-ATCGCTATAGAA-GCTAGACTGAAGTTGGCTGGAGAGTCAGGTTATGAACTCATATC-AGCTGTCAATCATAACTGAAGGA--AAATTT-AAATTTAACA------ACAGTTTTC----AA-AAAAGATTTTTT-T-GAATATG-----------AAAC-TTATA--TTGTATACA--GTTTTCAAA-TTCACATCGCATACAGATCATATATTCAAGAACAGATCTGCGAAGTTTCAATTGAATCTGCAAGGTACAAC-TCTTG-AAAATT---TA-A-AG-------CCT----------------------CAG-------AGA--ATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGTTGCTGGCTTTTATACTGTAACTCCAGCCTttgaatccatttcatcaacacacatttttaaagaagaatactttaatcttttgggcagttagctataaagttgatagcatcacaaatccagcattgcagctatagaacagaggcaaggcccgggtcaaaaa
gi|9 : tctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcaCTTATTTGAT-ATCCAATG--ATTT------TAAAATGCC-TTAA-AA---------------T--T-CAT-ATTGA--AGAAT-GATAAA----ATTCTTGCGT-TGT----TTGCATGTATACATGT-------AA--T----------------AAAA-AA---A-GTTC-----A------TT---G-------C---TCAGT-ttaagtattcaatatgataataaacaacata
gi|9 : cattcgatggtaatatactatatttaattgaatgtgtattttttacagttgataaagtactcaac-AA---A-GTTATAGTTA------TA---G-------G---TCAGT-TA-----------TGCTAA------TGTAAGACATAACTACGTCACATAAGGGTCATCATGAAAAT--------------GGGTGTT-T-----------T-----------ACAA-----ATG--------------GT---T--AAA--CAAATGTCACAATCTTCAT-AAAGGAAATAAGAACAAAGCA-T---GAACT--TGATA--TAATGAATGTACCCCTACAACA-AT----TGTC------AA--------G-A-------------------------A---------------------AA--CA----TTCATAT-AG--CT---------CAC-----CTAAACA-CCATG------TACATAGCATTTATTATAGT-TTTTTAATTC-------CCGGCC-----ATAT--GTGAAAA-G-AGT--G--acgtgtttctttctttctttaaaataaaaataaaactgccttaaagttatagttataggtcagttatgctaatgtaagacataactacgtcacataagggtcatcatgaaaatgggtgttttacaaatggttaaacaaatgtcacaatcttcataaaggaaataagaacaaagcatgaacttgatataatgaatgtacccctacaacaattgtcaagaaaacattcatatagctcacctaaacaccatgtacatagcatttattatagttttttaattcccggccatatgtgaaaagagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCGACAGCTTACTCATTACGATGACATATTCGTCGTCAGTATGTCGTTTGTAGCAATGAATTCGGCGACATCGGTAAGTGACATAAAATCTAGTAAGCGCCTCTACAAAATTATATAACATTTTCAGTTTAACATACGAAACCATGCTTTGTTAGTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 2222222 111 111111 1111111 111 111111111111111 22222222222222222222 1111111111111 44444444444444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 222222222222222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 1111111111111111111111111111 111111 44444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 111111 1111111 33333333 1111 3333333333333
lowQualScore : 5 3 5555555 888 3 8 3 444444 5 6666666 1 222 1 444444444444444 4 8 4 777 0 0 4 4 1 55 4 4 777 88888888888888888888 4 4 777 3333333333333 777 4 44444444444444444444444 4 777 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 3333333 1 2 4 66 9 2 4 444 3 999999999999999999 3 3 0 55 44 3 2 77 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 11111 9999999999999999999999999999 7 4 444444 11 00000000000000000 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 5 0000 1 8 0 0 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 9999 4 66 777777777 222222 4 0 2222222 1 0 4 3 444 0 5 77777 44 3 3 22222222 3 3 3 22 3 1 44 3 2 888888 3333 3 0 6666 8888 2 2 9999999 44 77777 44 2 22 1 3 00 0 888 4 3 3 0 555 3 3 7777777 0000000000000 777 1 1 3 1
lowQualScore : . . ....... ... . . . ...... . ....... . ... . ............... . . . ... . . . . . .. . . ... .................... . . ... ............. ... . ....................... . ... ................................................................ . ....... . . . .. . . . ... . .................. . . . .. .. . . .. ..................................................................... . ..... ............................ . . ...... .. ................. . ...................................................... .. . .... . . . . . ............................................................................................................. .. .... . .. ......... ...... . . ....... . . . . ... . . ..... .. . . ........ . . . .. . . .. . . ...... .... . . .... .... . . ....... .. ..... .. . .. . . .. . ... . . . . ... . . ....... ............. ... . . . .
lowQualScore : 0 3 0000000 333 2 8 2 444444 0 2222222 4 777 9 888888888888888 0 0 0 000 7 7 0 0 2 55 0 4 888 00000000000000000000 0 0 000 2222222222222 000 0 22222222222222222222222 0 000 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0000000 6 6 4 11 7 3 4 444 6 999999999999999999 6 6 2 00 44 6 3 33 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 66666 9999999999999999999999999999 3 0 444444 88 44444444444444444 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 6666 0 5 4 2 0 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99 4444 4 11 888888888 111111 0 4 2222222 4 9 0 3 888 8 8 77777 22 1 1 99999999 1 1 1 22 3 2 66 1 1 888888 5555 1 5 6666 9999 9 9 3333333 44 11111 22 8 88 4 1 33 2 333 4 1 1 6 444 1 1 7777777 1111111111111 000 0 4 6 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATC--TT-AACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATG---A-ATACATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTGG-------AT-AAA-TACA-T---TGTTAAT-------T--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTA-AT--AATTATTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CT--T-TATA-TTGA--AGNAT-GNT-CAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAAGTA-TGTACTT--T---TA--TTA-ATTT-A----TAC-A-CG-AT----T-CC------AT--------GCA---------------------A---------------------AA--CA----TTCATAT-AG--CA---------CAN-----CTAAACA-CTATG------TATGTAGCATTTAT-TATAG-TTTTC--AATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
Reference ( family-3662 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATC--TT-AACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATG---A-ATACATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAAT-AGTTT---------AT-AAA-TACA-T---TGTTAAT-------T--------TT--------AATTTCTAAAACAATNTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTNA-AT--AATNATTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CT--T-TATA-TTGA--AGNAT-GNT-CAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAAGTA-TGTNCTT--T---T---TTA-ATTT-A----TAC-A-CG-AT----T-CC------AT--------GCA---------------------A---------------------AA--CA----TTCATAT-AG--CA---------CAN-----CTAAACA-CTATG------TATGTAGCATTTAT-TATAG-TTTTC--AATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
gi|1 : -TTAT--AA---ATGCA-T-AAAATGTCG---TTCACAA------TATTG-AAAAAAAAAACACAA-C-CGGTAAGCCATTA-----AAGCA----AA-T-ATGGA-AG---AGAAGGTGTAGCTACACTACTGGCCTGA-TT-GCTCGTATC--TTGAACATT-GTAAAGGTGAACACGTGGTT-TGGACTGATAGCTGCGGGA---ACTACAGTGA-T-TGA-CAACAGATAAGGTGATAGGTCA-GTG-TAT---GCAA------TA-----ATCATCATTATTGTAATG---A-CTACAAATTAA------------------------CAGTTTAGTATACAAAATCA--TTT-AAT-TGCTTCGTCTTTTAAT-AAG-TATA-T----ACTAA---------------------------AACGCCTAAAA-ACTTTGTACTGAAGCATGATAGAATTGT------------AT--AAT--------TAAACTCCC-A-CAA-AA---------------------ATG-TT----AGT-T-GAT-CAATAA-G---TTT---T--TC-T-TT----CTTT-------------C---T---TT--------A-----AA-----ACAAAA---A---TA-----AAACTGCTT---A-------AGTCAAT-TATGTTAAAATTGATGTTAGGCCTAGTTATGTCACAGTATGGACATTGTGAAAA-----------------GTGTT-T-----------AGAACTGGTTACACAA-----ATA--------------TTTTCC--AAA-TCAA----CGCAATGTTCCTTAAAGGGGATAATGATAAAGTA-TGTA-----T---T---TTA-ATTT-A----TAT-T-TG-ATATAAT-GC------AT--------GCA---------------------ATCCTGCAACTGTTGTCAATAAAA--CA----TTTATAT-AG--AA---------CATATGATCTAAATA-CTATG------TAAGTAGCATTTAT-TATAG-TTTTC--AATTCCCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AATTGA--A--AG-CATTGTGAC---ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGATGGCTGGAGGCTCGG-TTGTGAACTCAGATC-AGCTGTCAATTACAACTGGGGAA--AAGTTT-GAATTTTACA------ATAGTTTTC---AAA-TAAA-A--TA----TT-T-GAGTT-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTCTTAAAA-TTCACATGACATAAAGATCATATATTCAAGAATAGACATGTCACGTTTCAACCAAATCTGTTTTGTATGACTTTTTT-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCTGATGAT-GATTTTCT---TCCGGTAAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-GTCAGTGCTGCTAGCTTTTGTACTGTTACTCCGGCCT
gi|10 : ccatgtgaatatatattaccttatattgctatgc-TTAAAAGGCCGAGGTTCACTACCGATATATCA-AAAAA-------CAA-C-CGGTAAGCAATTACCACAA-AAA----TA-TTATGGA-AG---GGAAAGTGTGGCTA--CTACTTGCTTGC-TT-GCTTTTATC--TT-AAAATTTGCATACATAAACATGTGGTT-TGGATTTATAGCTGTGTGA---ACC------A-T-T-A-C------TGAGTTGAATGGTCA-GTG-TAT---GCAA------AA-----ATCAACATTCT-------------TACATGTTAATTGTTTAGT-------G-------CACTTTGAT-CA---AATCAAGTTTGAATGAGTTTAA-------ATAAAA-TACA-T---TGTTTAT-------TCTAACATCTT--------AATTTTTAAAACAACTTATT-------ATCAGTTAATTGCTTCTTTTTttacgaagtattaaaacacttaaactaatgaaaagctgcctatcagaacgtaaacgtcaaataaagttagtacattgaccag
gi|11 : tcatcagtgttttttTTCACTA------TATCGCAAAAA-------CGA-C-CGGTCAGCAATAA-----G-ACAAATTTAAT-ATAGA-AG---AGA--------------TACTTGCCTGC-TA-GCTATTATC--TT-AACATTTGTAAACATAAAGATGTGGTT-TAGATTAATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-TAT-A-TAACAGATAAGGTGAATGACCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATG---A-ATACATACTGAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTT---------A-------AC---------TA-------------------T--------AATTTCTAAAACAATGTTTA-------ATTGTTTAAGTGCTTCCTGTTTTA-AT--AAT-ATTTAACTTAAATGCC-T-TAA-AA--------------CT--T-CATG-TTGA--AGCAT-GTT-CAA----A---TTT---T--CA-T-T-----GTAT-------------A---A---TTA-------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GGTAT----A------CT---G-------A-GCAGT-acgtctttaagttctttaagtatacttctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcagtaaaacattcataaa
gi|12 : gta-TTTTC--ATCTACCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AAT--GGAA--TG-CACTGTGACTT-ATCTCAATAGAA-TCTGGGCCGTTGTTGGCTGGAGTGTCGGGTCATGAACTCAGCTT-AGCTATCAATCACAACAGGAGAA--ATATTT-GAATTTTACA------ATAATTTTC---AAA-AACAT---CT----TT-T-GAATG-------TTAAGT-----TTATA--AAATACACAATGCTTTAAAA-GCCACATGGCATAAAGTTCAAACATTAAAGAATAGACCTACCAA-TTGCATCGAAATTTGTGAGGTAAGAC-TTTTG-AAATTTAAATA-A-AA----AT-CCTCCATTGAT-GTTTTGCT---TCCAGTGAGTTCAGAGAATTCAATGCAAGTGGCCA-TT-TTCAATGTTTCTGGCTTTTATACTGTAACTCgttttgtttttctttctgtttttgtaacattaacaggaag
gi|13 : cGGTTCACTA------TAATG-AAAAA-------CCAAT-TAGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGTCTAAACCACTGGCCTGT-TT-GGTCATATC--TT-AACATTTGTAAACATAAAACTGTGGGT-TGGATTGATAGCAGTGTGA---ACTA-----A-----------AAATAAAGTGAATG-------G-TAT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATG---A-ATACATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAC-TA---AATAAAGTTTGAGTCAGTTCGA-------AT-TAA-TACA-T---TGTTAAT-------T--------TT--------AATTTCTAAAACAATGTGTA-------ATTATTTAATTGCTTCTTCTTTAA-AT--GATTATTT-ACTAGAGTGCC-T-TAA-AA--------------ATTCT-CACA-C---------T-GTT-CA---------------------T-T-----GTAT-------------A---A---TTG-------A-----AA-TCACACAAAA---ATGTTC-----A------TT---G-------
gi|14 : --TG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTGATGTAGTTTACTGGAGA-TCTGGTCATGAAT----ATA-AGTTGTCATTTACCAATGGTAGA--AAAT-----ATTTTATA--------AGTTTTC----AG-AAAAGA--TTG---TT-T-AAATGTAGTAATTAATATATATATTATA--AACTACACATTGT--------TTCACATGGCACATAGATCATAAAT-------------TACCAAGTTTCAACAAAATCTGTGAGATGTGAC-TTTTG-GCATTT---AA-A-AA----A-----CAACAG-T-A-T-TGCTTAATACAGGGTGTATAGA-AATTGTTTTTCAATTGCCATTT-TTCA----------CTTTTATACTCTTACTTC
gi|15 : GCAAAGTTATGCCATGGAAGAAAAAAATTGAAAAA--------------GGGTGTT-T-----------T-----------AGAA-----ATAGTTCCAAAATTGTTTC---C--AAA-TCAA----CAGAATGTTCCTCAAAGGGAATAATTGGGAAATA-TGTC---------T---TTA-ATTT-A----TAC-A-TG-A-----T-AC------AT--------GCA---------------------tacagccttttaagttcaaaggtataataataaacatatataaa
gi|16 : ttaacaaatacttcacaggaaaaaacacattctgattcttatttatcgaagaaaatattaattcatagttaaaattagtttgttatggagttatattgctattttctttcttgttttcttaacaactaaaatataactgcacaaggtTTT-GAATTT-AAA------AAGGTTTTC---AAA-GA---A--TT----TT-T----TT-------T--TAT-----TTATA--AA----------CTTTTAAA-TCAACATGACATACA-CTCATGTATTCATCAACAGTTTTGCTAATTTTCAATCAAATAAATTAAGTATGAA-TTTTT-AA--TT---TA-A-AAAGACAT-CGT-CACT-AT-G-TA----------AGCAAATACAGAAAAATCAATGGGAATGGCCATTT-TTCATTGCTGCTGGTATTTATACCGTTACTCCGGTCTtgagtgtttgacacagtcgtaagacttttgtcaataaaacattcatat
gi|17 : -TTTTC--AATTTCCCGCCCTGCCATAT--GTTTGAA-----------A--TA-CACTGTGACTTTATTGCCGCAGAAAGTTGTGC-GTCATTAGCGGGAGAGTCGGGTCATGGAATCAGATC-ACCTGTTAATCGCCATTGTAGGA--TTTCTT-TTATTTTACA------ACAGTTTTC---AATTAGAAG----C----TT-T-GCATA-------T------------------AGTACAC--TGTGTTTAAA-TTCAC-TGA----AAGATT---CA---AAAAACAGGTTTGTAAAACTTCAACAAAATGGGACAGGTATGAC-TTTTG-AAATTC---TA-A-AA----ttaatgagatgtttaattaagatctaatgggagttgtaaataaacaaaatagccgtatagattaagtaccattgcccag
gi|18 : AACA-C-ATT------TATATAACGCT-AT-TTTAA-TGTTG--CACTCCCTGTC-----ATATAAGCCGTAC-G-AGT--G------G-AATT-----CT-ACGTCCACAGAA-GCTGTGTT-TATTTGGTTGAAGGGTATGGTCATAAACATACATCCAGCTGTCAATCACAACTGATGGA--AAATTTTGAATTTTA-A------ATAGATTTT---TAA-AATAGA--TT----T-----AACG-------TAGCAC-----TAAT
gi|19 : acaacaataacaacaacaaaacatcataagatgtccttcaataaacctgtcaatCA-GTG-TATCATGTAA------TATTAAAATCAACACTCATGTAATG---C-ATACATACTAAT-------T-------GTTTAGTTCACTCTGAT-CA---AGTCCAATTTGAAT-A----------------AAA-TACA-T--------AG-------T--------TT--------AATTTCTAAATCAATTTATT-------ATCATTTAATAGCTTCCTCTTTTG-AT--AATTATAT-ACTAAATTGCC-T-AAA-AT--------------CT--T-TATA-CAGA--AGCAT---T-AAA----AAACTCT---CATGC-TGTTCA--CTGTACG----------A---A---C---------AG----AA-CCCCACAAAA---GTGTTC-----A------TT---A-------A-T
gi|2 : GGTTATCAATGTTATCATACGCATGG--TTAAAAG-CCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCATC-CGGTAAGCAATTA-----A-GAA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGT-GCTAAACTACTGGCCAGCTTT-GCTCATATC--TT-AACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TTGATTGATAGCTGTCTGA---ACTAC--TGATT-T-A-CATCAGATAAGGTTGATGGTCA-TTG-TAT---GTAA------AA-----ATGAACATTCTTGTATTG---A-ATACATACTGAT-------T-------G-------TGCTTTGAT-TA---AA-GACGTTTGAAT----------------------TACATT---TGTTAAT-------T--------TT--------AATTTCTTAAACAATATATA-------ATTATTTAATTGCTTTTTCTCTTA-AT--GATAATTA-ACTGAAACGCC-T-TAA-AA--------------CT--T-TATA-TTGA--AGTAT-GTT-CAA----A---TTC---A--CC-C-T-----CTGT-------------A---A---T------------------TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGTATATGCTAA------TGTTGGGCCTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----A-----------------T---C--AAA-TCAA----CAGGATATTCCTTGATGGGATTATTGGCAAAGTAGTTTTCTT--T---T---TTA-ATTT-A----TAC-A-TG-AT----T-CC------AT--------G-A---------------------A---------------------AA--CA----TTCATAT-AG--CA---------CAA-----CTAAACA-CTATG------TATGTAATATTTAA-TATGG-TCTTC--GATTCCCTGCC-----ATTT--GTCAAAA-G-AG---------TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGTTGGCCGGAGAGCCGGGTCATGAACTCAGATC-AACTGTTAATCACCACTGGAGGA--AAAATT-GAATTTTA-A------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGG--TA----TT-T-GTTTG-------TGTCAC-----TTATA--AAGTACAC-TTATTTCCAAA-TTCACTTGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGACCTGCCAAGTTTTAACCAAATTTGTTATTTATGAT-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----ATCCCTCCACTGGTGG-TATGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGACTTTTATACTGCGACTCCGGCCTt
gi|20 : atgcgttgtttttattcgtatgtcaattttattgataagcaataacatctatagatgaaaatttaaaacagagcatACA------ATAGTTTCC---A-----------TTACTGTT-T-GAAAG-------TTGCAT-----TTATATAAACTACACATTATTTTTAAAATTCATATTTCATAAAGTTCATATATCCTAGAAC----------AGTTTCAATCAAATATGCAAAAAACGGC-ATTTG-AATTGT---TA-A-AA----AT-
gi|20 : aattgaaaaaaaacaGTGTCCATTG-CTCAGTGTTGTTGTCTTTGATAGTATTACTCCatcccgacgtgtccattgctcagtgttgttgtctttgatagtattactcca
gi|21 : aattgaaaaaaaacaacaatagtttccattactgtttgaaagttgcatttatataaactacacattatttttaaaattcatatttcataaagttcatatatcctagaacagtttcaatcaaatatgcaaaaaacggcatttgaattgttaaaaatatcccgacT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--GA-TACACATTGTTTTCAAA-TTCACCTGACAAAAAGGCCATACATTCAAGAACAAATCTGCCAAGTTTCAATCAAATCTGGTTTGTAAGAC-TTTTG-AAAACT---TA-A-AA----A----------AA-------ACT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAATGCTGCTAGCTTTTAAACTa
gi|22 : -CAGTAAGCAATTG-----G-GCA----TA-TCATATATAGCCTAGAATGTGTGGCTGAACTACTAGTCTAC-AT-GCTCTTTTC--TC-AAC-TTTGTAAACAAAAGTATGTGGTT-TTGATTGATAACTGTGTGA---ACTTC--TGA-T-T-A-CAA
gi|24 : ttttaatggccagagtttacatgtgtacttcataaacaaaaaaaatgtaA----TACATGT-AT--CA---------CAA-----CTTGATG-TTAC-----------TGGTATTTCTATAGAG-TATTT--AATTCCC-ACC-----ACAT--GGCAAAT-G-AGT--G--AACTG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTCATGTAGTTTACTGGAGttg
gi|25 : cttgcaatgaacaaatccttcatacatgtGATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAGCCCGGGGTTCACTA------TATCG--AAAA-------TTA-C-C-----GCAA------------------A-T-ATAGA-AG---AGAATGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCATATC--TC-AA
gi|26 : accatatatataAACATAAACACGTGGTTATGAGTTGATAGCTGTACTA---ACTCC--TG----------------AAGGTGAATAGTCA-GTGTTAT---GTAATATCAGTA-----ATCAACATTTATGTAA-G---ACATACa
gi|27 : tgctggacattattcatctAATTT---TA-ATGA----AT-CCTCCACAACT-GCTATGCT---TCCAGTTAGTATAGAA---------------GCCATTT-T-CAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCAGTCT
gi|28 : GTTCACTA------TATCT-AAATA-------CCA-CACGGTAAGCTATTA-----A-GGA----CA-A-GCTGA-AC---AAAGGGTGTGGCTAAACTACTGATCTGG-TTAGCTCTTATC--TC-AACtataacttacggataaagaaatattgaa
gi|29 : CTACAATGCC-T-TAA-AC--------------CG--T-TATA-TAGA--CGCAT-GAT--AA----A---CCT---C--GCAT-G-----CTGT-------------tgtcggaatttgctaca
gi|3 : ttGTAAGGAATTA-----G-GCA----AA-T-ATGGG-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTATTGGTCTGC-TC-GCTCTTGTCTTTT-TGCATTTGTAAACATAAACGTGTGATT-TGGATTTATTGCTGTGTGA---ACTAC--T-----------ACTGACAAAATGAACAGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACGTCTTTGTAATGAATA-ATATATACTAAT-------T-------GTTTGGTTCACTTTCAT-AA---ATTCAAGATTAAATCAGTTTGG-------AT-AAA--ATA-TTAATATTAATTCTTGCAT--------TC--------AATTTCTAAAACACTTTATA-------ATCAGTTAGTTGCTCCTTCTTTTA-AT--ATTCATAT-ACTTAAATGCC-T-TGA-AA---------------T--T-TATA-CTGA--AGGATAATT-CAA----G---TCT---T--G--T-A-----CTGT-------------A---AAC-TGAAAAAGCAA-----AA-TCCCACAAAATTTT-TTTA-----A------TT---G-------A-TCA--------TAA------TGTTtaacggctgctcatcaaaagctcaggacagtgttcatttata
gi|3 : gaaaacccttcttAAA---G-GTTA-----G------TT---ATAGGTCAA-TCAAT-TATACTAA------TGGTAGGCATAATTAAGTCACAGAAGGAACAATATGGAAA------------------TGTT-T-------------------------------------------------TC---C--AAA-TCAA----CACAATCTTTCT-AAAGGGAAGAATAACAACGTA-TGTACAT--G---TAC-TTG-ATAC-AA---TGC-A-TGTAC----T-CCTACAACATTTGTCA--ATA---------------------A---------------------AA--CA----TTCATGT-TA--CA---------CAT-----CTTAACA-CCATG------TATAAAGCATTTAT-TATAA-ATTTT--AGTTACCTGCC-----ATAT--GTCAAAACGTAGC-----A--TG-CACTTTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GTTGGACTGTAGTAGGCTGGAGAGTTGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACTA----AGGG--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTGC----AA-AAAAGA--TT----TT-TAGCACG-------TGACAC-----TAATA--AAGTACAAATTGTTTTCATA-TTCACATGAC--AAATATTATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTTCGTATGAC-TTTTG-AAA-TT---TA-A-AA----tttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctaaaggttagttataggtcaatcaattatactaatggtaggcataattaagtcacagaaggaacaatatggaaatgttttccaaatcaacacaatctttctaaagggaagaataacaacgtatgtacatgtacttgatacaatgcatgtactcctacaacatttgtcaataaaacattcatgttacacatcttaacaccatgtataaagcatttattataaattttagttacctgccatatgtcaaaacgtagcatgcactttggcttatctccatagaagttggactgtagtaggctggagagttgggtcatgaactcagatcagctgtcaatcactaagggaaatttgaattttacaacagtttgcaaaaaagatttttagcacgtgacactaataaagtacaaattgttttcatattcacatgacaaatattatacattcaaaaacagatctgccaagtttcaaccaaatctgtttcgtatgacttttgaaatttaaaa
gi|30 : gaaaacccttcttgtaaggaattaggcaaatatgggagagaaggtgtggctaaactattggtctgctcgctcttgtctttttgcatttgtaaacataaacgtgtgatttggatttattgctgtgtgaactactactgacaaaatgaacagtcagtgtatgtaataatcaacgtctttgtaatgaataatatatactaattgtttggttcactttcataaattcaagattaaatcagtttggataaaatattaatattaattcttgcattcaatttctaaaacactttataatcagttagttgctccttcttttaatattcatatacttaaatgccttgaaatttatactgaaggataattcaagtcttgtactgtaaactgaaaaagcaaaatcccacaaaatttttttaattgatcataatgtttttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctACTTTGAT-TA---AATCCAGTTTGAATCAGTTTGA-------AT-AAAATATA-T---TGTTAAA-------C--------TT--------CATTTCTAAAACAATTTGTA-------AACA
gi|4 : tgattgtttaactaGGAGTTCACTA------TGTCG-AAAAA-------CCG------------ATTA-----G-ACA----AG-T-ATAGA-AG---AGAAAGTATGGCTTAGCTACTGGCCTGC-CA-GCTCTAATC--TT-AACATTTGCAAACATAAACGTGTAGAT-TGGATTGATAGCTGTGTGAGCTACTAC--TGA-T-T-AACAACATATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCACCATTCTTGTAATG---A-ATACATACTGAT-------T-------G-------CACATTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTGA-------AT-AAAATACA-G---CGTTATT-------A--------TT--------AATTTCTGAAACAATGTATA-------GTTATTTAATTGCCTCTTATTTAA-AT--AAGTATTT-ACTAAAATGCC-A-TAACAATTCTCACGCTGTTCCT--TGTATAATTAA--AAT-T-GAT-CGATGCGA---TTT---T--TC-T-TTACAACAAC-------------A---A---T---------A-----AA-ACTACCTAAA---T-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCAAT-TATGCTAA------TGTCGGGCCAAGTTTTGACACAAAAGGGACATTA-GAAAAA--------------ATATGTTCT-----------A-----------GAAATGGTTATACAATCTT-------TT---CCTAAA-TCAA----CACGATATTCCTTGATGGGAATAATGCCATAGTA-TGTATTT--C---TAACTTATACTTGA----TAC-T-TG-ATACCAT-GC------AT--------GCAATCTTACGACAATTTTCTATAA---------------------AA--CA----TGCATAT-AG--CA---------CAA-----TTAAATA-CTATG------TATTTAGCATTTA---ACAA-TTCCCCCGGT--CCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--T-----TGTCACTATGGCTT-ATCCCCATAGAA-ACTGGACTATATTTAGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCTGATC-AGCTGTCAATCACAAATGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTT----AA-ACACGA--TT----TTAT-GAATG-------TATCAC-----TTATA--AAGTATACAATAATTCCAAA-TTCACATGATATAAAGTTCATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAATTAAATCTGTTATGTATGAC-TTTTG-AAat
gi|5 : AATGGTCAAGTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGAAATG---A-TTACATACTAAT-------TTTTTAGTG-------CACATTGAT-CA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTGG-------AT-AAA-AACA-T---TGTTAAT-------T--------CTTACATAGTAATATCTAAAACAATTCATT-------ATCAGTTAATTGTTTCTTCTTTTA-AT--AATTATAT-ACTAAATTGCCTT-TAA-AA--------------CT--T-AATA-TTGA--AGGAT-GATACAA----T---TCTCA-C--GC-T-TTTTA-CTGT-------------A---AAATC---------A-----AATTCCCATAAAA---A-TTT------A------TT---G-------A-TTA-T-TATGTT
gi|5 : aAAATTCC-CATAA-AA--------------AT--T-TAT---TGATTATTAT-GTT------------TTT---T--GT-T-T-----CTTTCTTAACAACAACAA---A---T---------A-----AG-TACCT--AAA---G-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCATT-TATACTAA------TGTTACACATAATTATGTCGCATAAGGTACATTATGAAAAT--------------GTGTGTT-TTAGAAATAGTTAC----------ACAA-----ATACT------------TT---C--AAAATCAA----CACAATCTTTTTCAAAGGGAATAATAATAAGGTG-TGTACTT--TAAAT---ACA-ATGT-A----TGC-A----AT----T-CT------ACAACTGTCAGCA---------------------A---------------------AA--CA----TTCATATTCG--CA---------CAT-----TTAAGCA-CTATG------TTTATAGCATTTAT-TATAG-TTTTT--AATTCTCTGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--GGAA--TG-CACTGTGGCTT-ATCTACGTTGAA-GCTGAACTCAAATCAACT----------GTCA---------ATC-A-----CAA------CTGGAGGA--AAATTT-GAttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacctaaaggttagttataggtcatttatactaatgttacacataattatgtcgcataaggtacattatgaaaatgtgtgttttagaaatagttacacaaatactttcaaaatcaacacaatctttttcaaagggaataataataaggtgtgtactttaaatacaatgtatgcaattctacaactgtcagcaaaacattcatattcgcacatttaagcactatgtttatagcatttattatagtttttaattctctgccatatgtcaaaagagtggaatgcactgtggcttatctacgttgaagctgaactcaaatcaactgtcaatcacaactggaggaaaatttga
gi|6 : aaatggtcaagtgtatgtaataatcaacattcttgaaatgattacatactaattttttagtgcacattgatcaaatcaagtttgaatcagtttggataaaaacattgttaattcttacatagtaatatctaaaacaattcattatcagttaattgtttcttcttttaataattatatactaaattgcctttaaaacttaatattgaaggatgatacaattctcacgctttttactgtaaaatcATGATAA------TTTTAGGACAAGTTATATCACAGCAAGATCATTATGAAAAAACAATGTATTTTAGGTATGGT-T-----------AC----------ACAAT----GTT--------------TT---C--AAA-CCAG----CACAATGATCCCCACAGGTC-TAATGAGAAA----TGT---T--T---T---TAA-ATTT-A----TAC-T-CG-AT----A-CA------AT--------------------------------A---------------------AATTCAGTGTTTGACAT-AATCCAAAGAATTGTCAA-----CGAAACATCCATATAGTACTATGTAGCAT---C-TATAA-CTTTT--AATTATCTGCC-----ATGT--GTCAAAA-T-AGT--G--GGTTG-CGCTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGAAGAGATGTGTCATGAACTAAGATT-AGCTGTCAATCACAAC--GGGGATTGGATTT-AAATTTTATAACTGTTACAATTTTTAAAAAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACTC-----TAATC--ATGTACACATTGTTTTAAAA-ATCACAGGACATAAAGATCATACATTCAAGAACGGATATGCCATGTTTCAACAAAATCTGT-------GAC-TTTTA-AACTTG---TATA-AT----AT-CTTTCACAGATGG-TTTGCT---TCCATTGAGTACAGAGAAGTCAGTGTAAATGGCCATTTGTTCAGTGTTTCTAGCTTTCATACTGGTACTCAGACC
gi|7 : gaatttaatgctataattaaactacatgaTTT--AAATCCCCGCC-----ACAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGCTT-ATTTCTATAGAT-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAG--TCAGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGCCAGTCACAACTAGAGGA--AAATTT-GTATTTCACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAAA--TT----TT-T-GAATG-------CGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACAT--------AATCATACATTCAAGAACTGAACTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTT-TTTACCAC-TTTTGAAAATTT---AA-A-AA----AT-CCTCAACTGAT-GCTTTGCT---TCC---GAGTACAGAGAAATCTGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTGACTGCGGCCT
gi|8 : ----TAC-AACA-AT----TGTC------A---------GTA---------------------A---------------------AA--CA----TTCATAA-AG--CA---------CAT-----CTAAACA-TTATA------CATGTAGCAATAAT-TCTAG-TTTTT--AATTACACGCC-----AAAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGTTT-ATCGCTATAGAA-GCTAGACTGAAGTTGGCTGGAGAGTCAGGTTATGAACTCATATC-AGCTGTCAATCATAACTGAAGGA--AAATTT-AAATTTAACA------ACAGTTTTC----AA-AAAAGATTTT----TT-T-GAATA-------TGAAAC-----TTATA--TTGTATACA--GTTTTCAAA-TTCACATCGCATACAGATCATATATTCAAGAACAGATCTGCGAAGTTTCAATTGAATCTGCAAGGTACAAC-TCTTG-AAAATT---TA-A-AG-------CCTC-------------------------------AGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGTTGCTGGCTTTTATACTGTAACTCCAGCCTttgaatccatttcatcaacacacatttttaaagaagaatactttaatcttttgggcagttagctataaagttgatagcatcacaaatccagcattgcagctatagaacagaggcaaggcccgggtcaaaaa
gi|9 : tctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatccCTTATTTGATATCCAATGATTT---TAAAATGCC-T-TAA-AA---------------T--T-CATA-TTGA--AGAAT-GAT-AAA----A---TTCTTGC--GT-TGT-----TTGC-------------ATGTA---T---------ACATGTAA-T---AAAAAA---A-GTTC-----A------TT---G-------C-TCAGT-ttaagtattcaatatgataataaacaacata
gi|9 : cattcgatggtaatatactatatttaattgaatgtgtattttttacagttgataaagtactcaacAA---A-GTTATAGTTA------TA---G-------G-TCAGT-TATGCTAA------TGTAAGACATAACTACGTCACATAAGGGTCATCATGAAAAT--------------GGGTGTT-T-----------T-----------ACAA-----ATG--------------GT---T--AAA--CAAATGTCACAATCTTCAT-AAAGGAAATAAGAACAAAGCA-TGAACTTGATA--TAA-TGA-ATGT-ACCCCTACAA-CA-AT----TGTC------AA--------G-A---------------------A---------------------AA--CA----TTCATAT-AG--CT---------CAC-----CTAAACA-CCATG------TACATAGCATTTAT-TATAGTTTTTT--AATTCCCGGCC-----ATAT--GTGAAAA-G-AGT--G--acgtgtttctttctttctttaaaataaaaataaaactgccttaaagttatagttataggtcagttatgctaatgtaagacataactacgtcacataagggtcatcatgaaaatgggtgttttacaaatggttaaacaaatgtcacaatcttcataaaggaaataagaacaaagcatgaacttgatataatgaatgtacccctacaacaattgtcaagaaaacattcatatagctcacctaaacaccatgtacatagcatttattatagttttttaattcccggccatatgtgaaaagagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCGACAGCTTACTCATTACGATGACATATTCGTCGTCAGTATGTCGTTTGTAGCAATGAATTCGGCGACATCGGTAAGTGACATAAAATCTAGTAAGCGCCTCTACAAAATTATATAACATTTTCAGTTTAACATACGAAACCATGCTTTGTTAGTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 2222222 111 111111 1111111 111 111111111111111 22222222222222222222 1111111111111 44444444444444444444444 2222222222222 333333333333333333 1111111 222222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 1111111111111111111111111111 111111 44444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 33333333 1111 3333333333333
lowQualScore : 5 3 5555555 888 3 8 3 444444 5 6666666 1 222 1 444444444444444 4 8 4 777 0 0 4 4 1 4 55 4 777 88888888888888888888 4 4 777 3333333333333 4 777 44444444444444444444444 4 777 4 6666666666666 0 4 99999 2 444444444444444444 0 3333333 0 0 9999 1 4 3 3 3 777777777777777 55 3 88 4 55 44 444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 11111 9999999999999999999999999999 7 4 444444 11 00000000000000000 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 5 0000 1 8 0 0 4 4 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 333333 1 1 1 0 4 3 44 0 0 5 77777 44 3 3 22222222 3 3 3 22 3 1 44 3 2 888888 3333 3 0 6666 8888 2 2 9999999 44 77777 44 2 22 1 3 00 0 888 4 3 3 0 555 3 3 7777777 0000000000000 777 1 1 3 1
lowQualScore : . . ....... ... . . . ...... . ....... . ... . ............... . . . ... . . . . . . .. . ... .................... . . ... ............. . ... ....................... . ... . ............. . . ..... . .................. . ....... . . .... . . . . . ............... .. . .. . .. .. ... ......................................................................... . ..... ............................ . . ...... .. ................. . ...................................................... .. . .... . . . . . . ................................................................................................................................................... . ...... . . . . . . .. . . . ..... .. . . ........ . . . .. . . .. . . ...... .... . . .... .... . . ....... .. ..... .. . .. . . .. . ... . . . . ... . . ....... ............. ... . . . .
lowQualScore : 0 3 0000000 333 2 8 2 444444 0 2222222 4 777 9 888888888888888 0 0 0 000 7 7 0 0 2 0 55 4 888 33333333333333333333 0 0 000 2222222222222 0 000 22222222222222222222222 0 000 1 5555555555555 9 0 99999 4 444444444444444444 8 0000000 1 5 4444 3 4 6 6 6 333333333333333 00 6 66 6 00 44 222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 66666 9999999999999999999999999999 3 0 444444 88 44444444444444444 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 6666 0 5 4 2 4 4 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 777777 3 6 4 9 0 3 22 5 8 8 77777 22 1 1 99999999 1 1 1 22 3 2 66 1 1 888888 5555 1 5 6666 9999 9 9 3333333 44 11111 22 8 88 4 1 33 2 333 4 1 1 6 444 1 1 7777777 1111111111111 000 0 4 6 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAATACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CT--T-TAT--ATTGA--AGNAT-GTT-CAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------CG-AT----T-C------CA------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
Reference ( family-3662 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------GAT-AAATACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CT--T-TAT--ATTGA--AGNAT-GNT-CAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------CG-AT----T-C------CA------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
gi|1 : -TTAT--AA---ATGCA-T-AAAATGTCG---TTCACAA------TATTG-AAAAAAAAAACACAA-C-CGGTAAGCCATTA-----AAGCA----AA-T-ATGGA-AG---AGAAGGTGTAGCTACACTACTGGCCTGA-TT-GCTCGTATCTTGA--ACATT-GTAAAGGTGAACACGTGGTT-TGGACTGATAGCTGCGGGA---ACTACAGTGA-T-TGA-CAACAGATAAGGTGATAGGTCA-GTG-TAT---GCAA------TA-----ATCATCATTATTGTAATGA-CTA---CAAATTAA------------------------CAGTTTAGTATACAAAATCA--TTT-AATTGCTTCGTCTTTTAAT-AAGTATA-T-A---CTAA--------------------AACGCCTAAAA-ACTTTGTACTGAAGCATGATAGAATTGT-----------ATAATTAAACTCCC-ACAAAAATG---T-TAG------------------T--T-GATCAAT--A--AGT-T-TTT-C----------TTT---C---T-T-T-----CT-T---------------------T---------A-----AA-----ACAAAA---A---TA-----AAACTGCTT---A-------AGTCAAT-TATGTTAAAATTGATGTTAGGCCTAGTTATGTCACAGTATGGACATTGTGAAAA-----------------GTGTT-T-----------AGAACTGGTTACACAA-----ATA--------------TTTTCC--AAA-TCAA----CGCAATGTTCCTTAAAGGGGATAATGATAAA-GTA-TGTATTT----T------------------A--A--------T-TT-A----TATT---------TG-ATATAAT-G------CA------T--------G----CA-------------------------ATCCTGCAACTGTTGTCAATAAAACATTTATAT-AGAACATATGATCTAAATACTATGTAAGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AATTGA--A--AG-CATTGTGAC---ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGATGGCTGGAGGCTCGG-TTGTGAACTCAGATC-AGCTGTCAATTACAACTGGGGAA--AAGTTT-GAATTTTACA------ATAGTTTTC---AAA-TAAA-A--TA----TT-T-GAGTT-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTCTTAAAA-TTCACATGACATAAAGATCATATATTCAAGAATAGACATGTCACGTTTCAACCAAATCTGTTTTGTATGACTTTTTT-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCTGATGAT-GATTTTCT---TCCGGTAAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-GTCAGTGCTGCTAGCTTTTGTACTGTTACTCCGGCCT
gi|10 : ccatgtgaatatatattaccttatattgctatgc-TTAAAAGGCCGAGGTTCACTACCGATATATCA-AAAAA-------CAA-C-CGGTAAGCAATTACCACAA-AAA----TA-TTATGGA-AG---GGAAAGTGTGGCTA--CTACTTGCTTGC-TT-GCTTTTATCTT-A--AAATTTGCATACATAAACATGTGGTT-TGGATTTATAGCTGTGTGA---ACC------A-T-T-A-C------TGAGTTGAATGGTCA-GTG-TAT---GCAA------AA-----ATCAACATTCT----------TA---CATGTTAATTGTTTAGT-------G-------CACTTTGAT-CA---AATCAAGTTTGAATGAGTTTA------AATAAAATACA-TTG---TTTATTCTAACATCTT--------AATTTTTAAAACAACTTATT-------ATCAGTTAATTGCTTCTTTTTttacgaagtattaaaacacttaaactaatgaaaagctgcctatcagaacgtaaacgtcaaataaagttagtacattgaccag
gi|11 : tcatcagtgttttttTTCACTA------TATCGCAAAAA-------CGA-C-CGGTCAGCAATAA-----G-ACAAATTTAAT-ATAGA-AG---AGA--------------TACTTGCCTGC-TA-GCTATTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAGATGTGGTT-TAGATTAATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-TAT-A-TAACAGATAAGGTGAATGACCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGT---------------------------TTAACT--------AT--------AATTTCTAAAACAATGTTTA-------ATTGTTTAAGTGCTTCCTGTTTTAATAA-TA----TTTAACTTAAATGCC-T-TAA-AA--------------CT--T-CAT--GTTGA--AGCAT-GTT-CAA----A---TTT---T--CA-T-T-----GTAT-------------A---A---TTA-------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GGTAT----A------CT---G-------A-GCAGT-acgtctttaagttctttaagtatacttctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcagtaaaacattcataaa
gi|12 : gta-TT--TTCATCTACCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AAT--GGAA--TG-CACTGTGACTT-ATCTCAATAGAA-TCTGGGCCGTTGTTGGCTGGAGTGTCGGGTCATGAACTCAGCTT-AGCTATCAATCACAACAGGAGAA--ATATTT-GAATTTTACA------ATAATTTTC---AAA-AACAT---CT----TT-T-GAATG-------TTAAGT-----TTATA--AAATACACAATGCTTTAAAA-GCCACATGGCATAAAGTTCAAACATTAAAGAATAGACCTACCAA-TTGCATCGAAATTTGTGAGGTAAGAC-TTTTG-AAATTTAAATA-A-AA----AT-CCTCCATTGAT-GTTTTGCT---TCCAGTGAGTTCAGAGAATTCAATGCAAGTGGCCA-TT-TTCAATGTTTCTGGCTTTTATACTGTAACTCgttttgtttttctttctgtttttgtaacattaacaggaag
gi|13 : cGGTTCACTA------TAATG-AAAAA-------CCAAT-TAGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGTCTAAACCACTGGCCTGT-TT-GGTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAACTGTGGGT-TGGATTGATAGCAGTGTGA---ACTA---------------A-AAATAAAGTGAATGGT--------AT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAC-TA---AATAAAGTTTGAGTCAGTTCG------AAT-TAATACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATGTGTA-------ATTATTTAATTGCTTCTTCTTTAAATGATTA----TTT-ACTAGAGTGCC-T-TAA-AA--------------ATTCT-CAC--AC---------T-GTT-CA---------------------T-T-----GTAT-------------A---A---TTG-------A-----AA-TCACACAAAA---ATGTTC-----A------TT---G-------
gi|14 : --TG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTGATGTAGTTTACTGGAGA-TCTGGTCATGAAT----ATA-AGTTGTCATTTACCAATGGTAGA--AAAT-----ATTTTATA--------AGTTTTC----AG-AAAAGA--TTG---TT-T-AAATGTAGTAATTAATATATATATTATA--AACTACACATTGT--------TTCACATGGCACATAGATCATAAAT-------------TACCAAGTTTCAACAAAATCTGTGAGATGTGAC-TTTTG-GCATTT---AA-A-AA----A-----CAACAG-T-A-T-TGCTTAATACAGGGTGTATAGA-AATTGTTTTTCAATTGCCATTT-TTCA----------CTTTTATACTCTTACTTC
gi|15 : GCAAAGTTATGCCATGGAAGAAAAAAATTGAAAAA--------------GGGTGTT-T-----------T-----------AGAA-----ATAGTTCCAAAATTGTTTC---C--AAA-TCAA----CAGAATGTTCCTCAAAGGGAATAATTGGGAA-ATA-TGT-CT-----------T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------TG-A-----T-A------CA------T--------G----CA-------------------------tacagccttttaagttcaaaggtataataataaacatatataaa
gi|16 : ttaacaaatacttcacaggaaaaaacacattctgattcttatttatcgaagaaaatattaattcatagttaaaattagtttgttatggagttatattgctattttctttcttgttttcttaacaactaaaatataactgcacaaggtTTT-GAATTT-AAA------AAGGTTTTC---AAA-GA---A--TT----TT-T----TT-------T--TAT-----TTATA--AA----------CTTTTAAA-TCAACATGACATACA-CTCATGTATTCATCAACAGTTTTGCTAATTTTCAATCAAATAAATTAAGTATGAA-TTTTT-AA--TT---TA-A-AAAGACAT-CGT-CACT-AT-G-TA----------AGCAAATACAGAAAAATCAATGGGAATGGCCATTT-TTCATTGCTGCTGGTATTTATACCGTTACTCCGGTCTtgagtgtttgacacagtcgtaagacttttgtcaataaaacattcatat
gi|17 : -TT--TTCAATTTCCCGCCCTGCCATAT--GTTTGAA-----------A--TA-CACTGTGACTTTATTGCCGCAGAAAGTTGTGC-GTCATTAGCGGGAGAGTCGGGTCATGGAATCAGATC-ACCTGTTAATCGCCATTGTAGGA--TTTCTT-TTATTTTACA------ACAGTTTTC---AATTAGAAG----C----TT-T-GCATA-------T------------------AGTACAC--TGTGTTTAAA-TTCAC-TGA----AAGATT---CA---AAAAACAGGTTTGTAAAACTTCAACAAAATGGGACAGGTATGAC-TTTTG-AAATTC---TA-A-AA----ttaatgagatgtttaattaagatctaatgggagttgtaaataaacaaaatagccgtatagattaagtaccattgcccag
gi|18 : AACAC-ATTTATATAACGCT-AT-TTTAA-TG--TTGCACTCCCTGTC-----ATATAAGCCGTAC-G-AGT--G------G-AATT-----CT-ACGTCCACAGAA-GCTGTGTT-TATTTGGTTGAAGGGTATGGTCATAAACATACATCCAGCTGTCAATCACAACTGATGGA--AAATTTTGAATTTTA-A------ATAGATTTT---TAA-AATAGA--TT----T-----AACG-------TAGCAC-----TAAT
gi|19 : acaacaataacaacaacaaaacatcataagatgtccttcaataaacctgtcaatCA-GTG-TATCATGTAA------TATTAAAATCAACACTCATGTAATGC-ATA---CATACTAAT-------T-------GTTTAGTTCACTCTGAT-CA---AGTCCAATTTGAAT--------------A--AAATACA-T--------AGT--------TT--------AATTTCTAAATCAATTTATT-------ATCATTTAATAGCTTCCTCTTTTGATAATTA----TAT-ACTAAATTGCC-T-AAA-AT--------------CT--T-TAT--ACAGA--AGCAT---T-AAA----AAACTCT---CATGC-TGTTCA--CTGTACG----------A---A---C---------AG----AA-CCCCACAAAA---GTGTTC-----A------TT---A-------A-T
gi|2 : GGTTATCAATGTTATCATACGCATGG--TTAAAAG-CCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCATC-CGGTAAGCAATTA-----A-GAA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGT-GCTAAACTACTGGCCAGCTTT-GCTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TTGATTGATAGCTGTCTGA---ACTAC--TGATT-T-A-CATCAGATAAGGTTGATGGTCA-TTG-TAT---GTAA------AA-----ATGAACATTCTTGTATTGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------TGCTTTGAT-TA---AA-GACGTTTGAAT--------------------TACATTTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTTAAACAATATATA-------ATTATTTAATTGCTTTTTCTCTTAATGATAA----TTA-ACTGAAACGCC-T-TAA-AA--------------CT--T-TAT--ATTGA--AGTAT-GTT-CAA----A---TTC---A--CC-C-T-----CTGT-------------A---A---T------------------TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGTATATGCTAA------TGTTGGGCCTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----A-----------------T---C--AAA-TCAA----CAGGATATTCCTTGATGGGATTATTGGCAAA-GTAGTTTTCTT----T-T---T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------TG-AT----T-C------CA------T--------G-----A-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAA-----CTAAACACTATGTATGTAATATTTAA-TATGG-TC--TTCGATTCCCTGCC-----ATTT--GTCAAAA-G-AG---------TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGTTGGCCGGAGAGCCGGGTCATGAACTCAGATC-AACTGTTAATCACCACTGGAGGA--AAAATT-GAATTTTA-A------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGG--TA----TT-T-GTTTG-------TGTCAC-----TTATA--AAGTACAC-TTATTTCCAAA-TTCACTTGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGACCTGCCAAGTTTTAACCAAATTTGTTATTTATGAT-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----ATCCCTCCACTGGTGG-TATGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGACTTTTATACTGCGACTCCGGCCTt
gi|20 : atgcgttgtttttattcgtatgtcaattttattgataagcaataacatctatagatgaaaatttaaaacagagcatACA------ATAGTTTCC---A-----------TTACTGTT-T-GAAAG-------TTGCAT-----TTATATAAACTACACATTATTTTTAAAATTCATATTTCATAAAGTTCATATATCCTAGAAC----------AGTTTCAATCAAATATGCAAAAAACGGC-ATTTG-AATTGT---TA-A-AA----AT-
gi|20 : aattgaaaaaaaacaGTGTCCATTG-CTCAGTGTTGTTGTCTTTGATAGTATTACTCCatcccgacgtgtccattgctcagtgttgttgtctttgatagtattactcca
gi|21 : aattgaaaaaaaacaacaatagtttccattactgtttgaaagttgcatttatataaactacacattatttttaaaattcatatttcataaagttcatatatcctagaacagtttcaatcaaatatgcaaaaaacggcatttgaattgttaaaaatatcccgacT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--GA-TACACATTGTTTTCAAA-TTCACCTGACAAAAAGGCCATACATTCAAGAACAAATCTGCCAAGTTTCAATCAAATCTGGTTTGTAAGAC-TTTTG-AAAACT---TA-A-AA----A----------AA-------ACT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAATGCTGCTAGCTTTTAAACTa
gi|22 : -CAGTAAGCAATTG-----G-GCA----TA-TCATATATAGCCTAGAATGTGTGGCTGAACTACTAGTCTAC-AT-GCTCTTTTCTC-A--AC-TTTGTAAACAAAAGTATGTGGTT-TTGATTGATAACTGTGTGA---ACTTC--TGA-T-T-A-CAA
gi|24 : ttttaatggccagagtttacatgtgtacttcataaacaaaaaaaatgtaATACATGT-ATCACAA-----CTTGATGTTAC-----TGGTATTTCTATAGAG-TA--TTTAATTCCC-ACC-----ACAT--GGCAAAT-G-AGT--G--AACTG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTCATGTAGTTTACTGGAGttg
gi|25 : cttgcaatgaacaaatccttcatacatgtGATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAGCCCGGGGTTCACTA------TATCG--AAAA-------TTA-C-C-----GCAA------------------A-T-ATAGA-AG---AGAATGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCATATCTC-A--A
gi|26 : accatatatataAACATAAACACGTGGTTATGAGTTGATAGCTGTACTA---ACTCC--TG----------------AAGGTGAATAGTCA-GTGTTAT---GTAATATCAGTA-----ATCAACATTTATGTAA-GACATA---Ca
gi|27 : tgctggacattattcatctAATTT---TA-ATGA----AT-CCTCCACAACT-GCTATGCT---TCCAGTTAGTATAGAA---------------GCCATTT-T-CAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCAGTCT
gi|28 : GTTCACTA------TATCT-AAATA-------CCA-CACGGTAAGCTATTA-----A-GGA----CA-A-GCTGA-AC---AAAGGGTGTGGCTAAACTACTGATCTGG-TTAGCTCTTATCTC-A--ACtataacttacggataaagaaatattgaa
gi|29 : CTACAATGCC-T-TAA-AC--------------CG--T-TAT--ATAGA--CGCAT-GAT--AA----A---CCT---C--GCAT-G-----CTGT-------------tgtcggaatttgctaca
gi|3 : ttGTAAGGAATTA-----G-GCA----AA-T-ATGGG-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTATTGGTCTGC-TC-GCTCTTGTCTT-TTTGCATTTGTAAACATAAACGTGTGATT-TGGATTTATTGCTGTGTGA---ACTAC--T-----------ACTGACAAAATGAACAGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACGTCTTTGTAATGA-ATAATATATACTAAT-------T-------GTTTGGTTCACTTTCAT-AA---ATTCAAGATTAAATCAGTTTG------GAT-AAA-ATA-TTAATATTAATT--------CTTGCATTC-AATTTCTAAAACACTTTATA-------ATCAGTTAGTTGCTCCTTCTTTTAATATTCA----TAT-ACTTAAATGCC-T-TGA-AA---------------T--T-TAT--ACTGA--AGGATAATT-CAA----G---TCT---T--G--T-A-----CTGT-------------A---AAC-TGAAAAAGCAA-----AA-TCCCACAAAATTTT-TTTA-----A------TT---G-------A-TCA--------TAA------TGTTtaacggctgctcatcaaaagctcaggacagtgttcatttata
gi|3 : gaaaacccttcttAAA---G-GTTA-----G------TT---ATAGGTCAA-TCAAT-TATACTAA------TGGTAGGCATAATTAAGTCACAGAAGGAACAATATGGAAA------------------TGTT-T-------------------------------------------------TC---C--AAA-TCAA----CACAATCTTTCT-AAAGGGAAGAATAACAAC-GTA-TGTACAT----G-TAC-T-----------TG--A--------TACA-A----TGCA---------TGTAC----T-CCTACAACA------TTTGTCA--A----TA-------------------------A---------------------AACATTCATGT-TACACAT-----CTTAACACCATGTATAAAGCATTTAT-TATAA-AT--TTTAGTTACCTGCC-----ATAT--GTCAAAACGTAGC-----A--TG-CACTTTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GTTGGACTGTAGTAGGCTGGAGAGTTGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACTA----AGGG--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTGC----AA-AAAAGA--TT----TT-TAGCACG-------TGACAC-----TAATA--AAGTACAAATTGTTTTCATA-TTCACATGAC--AAATATTATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTTCGTATGAC-TTTTG-AAA-TT---TA-A-AA----tttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctaaaggttagttataggtcaatcaattatactaatggtaggcataattaagtcacagaaggaacaatatggaaatgttttccaaatcaacacaatctttctaaagggaagaataacaacgtatgtacatgtacttgatacaatgcatgtactcctacaacatttgtcaataaaacattcatgttacacatcttaacaccatgtataaagcatttattataaattttagttacctgccatatgtcaaaacgtagcatgcactttggcttatctccatagaagttggactgtagtaggctggagagttgggtcatgaactcagatcagctgtcaatcactaagggaaatttgaattttacaacagtttgcaaaaaagatttttagcacgtgacactaataaagtacaaattgttttcatattcacatgacaaatattatacattcaaaaacagatctgccaagtttcaaccaaatctgtttcgtatgacttttgaaatttaaaa
gi|30 : gaaaacccttcttgtaaggaattaggcaaatatgggagagaaggtgtggctaaactattggtctgctcgctcttgtctttttgcatttgtaaacataaacgtgtgatttggatttattgctgtgtgaactactactgacaaaatgaacagtcagtgtatgtaataatcaacgtctttgtaatgaataatatatactaattgtttggttcactttcataaattcaagattaaatcagtttggataaaatattaatattaattcttgcattcaatttctaaaacactttataatcagttagttgctccttcttttaatattcatatacttaaatgccttgaaatttatactgaaggataattcaagtcttgtactgtaaactgaaaaagcaaaatcccacaaaatttttttaattgatcataatgtttttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctACTTTGAT-TA---AATCCAGTTTGAATCAGTTTG------AATAAAATATA-TTG---TTAAAC--------TT--------CATTTCTAAAACAATTTGTA-------AACA
gi|4 : tgattgtttaactaGGAGTTCACTA------TGTCG-AAAAA-------CCG------------ATTA-----G-ACA----AG-T-ATAGA-AG---AGAAAGTATGGCTTAGCTACTGGCCTGC-CA-GCTCTAATCTT-A--ACATTTGCAAACATAAACGTGTAGAT-TGGATTGATAGCTGTGTGAGCTACTAC--TGA-T-T-AACAACATATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCACCATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------CACATTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AATAAAATACA-GCG---TTATTA--------TT--------AATTTCTGAAACAATGTATA-------GTTATTTAATTGCCTCTTATTTAAATAAGTA----TTT-ACTAAAATGCC-A-TAACAATTCTCACGCTGTTCCT--TGTATA-ATTAA--AAT-T-GAT-CGATGCGA---TTT---T--TC-T-TTACAACAAC-------------A---A---T---------A-----AA-ACTACCTAAA---T-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCAAT-TATGCTAA------TGTCGGGCCAAGTTTTGACACAAAAGGGACATTA-GAAAAA--------------ATATGTTCT-----------A-----------GAAATGGTTATACAATCTT-------TT---CCTAAA-TCAA----CACGATATTCCTTGATGGGAATAATGCCATA-GTA-TGTATTT----C-TAACT-----------TAT-A--------C-TTGA----TACT---------TG-AT----A-C------CA------T--------G----CATGCAATCTTACGACAATTTTCTATAA---------------------AACATGCATAT-AGCACAA-----TTAAATACTATGTATTTAGCATTTA---ACAA-TTCCCCCGGT--CCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--T-----TGTCACTATGGCTT-ATCCCCATAGAA-ACTGGACTATATTTAGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCTGATC-AGCTGTCAATCACAAATGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTT----AA-ACACGA--TT----TTAT-GAATG-------TATCAC-----TTATA--AAGTATACAATAATTCCAAA-TTCACATGATATAAAGTTCATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAATTAAATCTGTTATGTATGAC-TTTTG-AAat
gi|5 : AATGGTCAAGTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGAAATGA-TTA---CATACTAAT-------TTTTTAGTG-------CACATTGAT-CA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------GAT-AAAAACA-TTG---TTAATT--------CTTACATAGTAATATCTAAAACAATTCATT-------ATCAGTTAATTGTTTCTTCTTTTAATAATTA----TAT-ACTAAATTGCCTT-TAA-AA--------------CT--T-AAT--ATTGA--AGGAT-GATACAA----T---TCTCA-C--GC-T-TTTTA-CTGT-------------A---AAATC---------A-----AATTCCCATAAAA---A-TTT------A------TT---G-------A-TTA-T-TATGTT
gi|5 : aAAATTCC-CATAA-AA--------------AT--T-TAT----TGATTATTAT-GTT------------TTT---T--GT-T-T-----CTTTCTTAACAACAACAA---A---T---------A-----AG-TACCT--AAA---G-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCATT-TATACTAA------TGTTACACATAATTATGTCGCATAAGGTACATTATGAAAAT--------------GTGTGTT-TTAGAAATAGTTAC----------ACAA-----ATACT------------TT---C--AAAATCAA----CACAATCTTTTTCAAAGGGAATAATAATAAG-GTG-TGTACTT----T-AA--A-----------TACAA--------T-GT-A----TGCA------------AT----T-C------TA------CAACTGTCAG----CA-------------------------A---------------------AACATTCATATTCGCACAT-----TTAAGCACTATGTTTATAGCATTTAT-TATAG-TT--TTTAATTCTCTGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--GGAA--TG-CACTGTGGCTT-ATCTACGTTGAA-GCTGAACTCAAATCAACT----------GTCA---------ATC-A-----CAA------CTGGAGGA--AAATTT-GAttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacctaaaggttagttataggtcatttatactaatgttacacataattatgtcgcataaggtacattatgaaaatgtgtgttttagaaatagttacacaaatactttcaaaatcaacacaatctttttcaaagggaataataataaggtgtgtactttaaatacaatgtatgcaattctacaactgtcagcaaaacattcatattcgcacatttaagcactatgtttatagcatttattatagtttttaattctctgccatatgtcaaaagagtggaatgcactgtggcttatctacgttgaagctgaactcaaatcaactgtcaatcacaactggaggaaaatttga
gi|6 : aaatggtcaagtgtatgtaataatcaacattcttgaaatgattacatactaattttttagtgcacattgatcaaatcaagtttgaatcagtttggataaaaacattgttaattcttacatagtaatatctaaaacaattcattatcagttaattgtttcttcttttaataattatatactaaattgcctttaaaacttaatattgaaggatgatacaattctcacgctttttactgtaaaatcATGATAA------TTTTAGGACAAGTTATATCACAGCAAGATCATTATGAAAAAACAATGTATTTTAGGTATGGT-T-----------AC----------ACAAT----GTT--------------TT---C--AAA-CCAG----CACAATGATCCCCACAGGTC-TAATGAGAAATGTT-TTTAAAT----T-TA--TACTCGATACAATA--AATTCAGTGT-TT-G-----ACA---------TA-AT------C------CAAAGAATT--------GTCAACG-------------------------A---------------------AACATCCATAT-AGTAC-------------------TATGTAGCAT---C-TATAA-CT--TTTAATTATCTGCC-----ATGT--GTCAAAA-T-AGT--G--GGTTG-CGCTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGAAGAGATGTGTCATGAACTAAGATT-AGCTGTCAATCACAAC--GGGGATTGGATTT-AAATTTTATAACTGTTACAATTTTTAAAAAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACTC-----TAATC--ATGTACACATTGTTTTAAAA-ATCACAGGACATAAAGATCATACATTCAAGAACGGATATGCCATGTTTCAACAAAATCTGT-------GAC-TTTTA-AACTTG---TATA-AT----AT-CTTTCACAGATGG-TTTGCT---TCCATTGAGTACAGAGAAGTCAGTGTAAATGGCCATTTGTTCAGTGTTTCTAGCTTTCATACTGGTACTCAGACC
gi|7 : gaatttaatgctataattaaactacatga--TTTAAATCCCCGCC-----ACAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGCTT-ATTTCTATAGAT-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAG--TCAGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGCCAGTCACAACTAGAGGA--AAATTT-GTATTTCACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAAA--TT----TT-T-GAATG-------CGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACAT--------AATCATACATTCAAGAACTGAACTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTT-TTTACCAC-TTTTGAAAATTT---AA-A-AA----AT-CCTCAACTGAT-GCTTTGCT---TCC---GAGTACAGAGAAATCTGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTGACTGCGGCCT
gi|8 : AA-GTA-TGTACTT----GATA--TGGTA-------CA--A--------T-GC-A----TGCAATCCTACAACA-AT----TGT------CA---------------G----TA-------------------------A---------------------AACATTCATAA-AGCACAT-----CTAAACATTATACATGTAGCAATAAT-TCTAG-TT--TTTAATTACACGCC-----AAAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGTTT-ATCGCTATAGAA-GCTAGACTGAAGTTGGCTGGAGAGTCAGGTTATGAACTCATATC-AGCTGTCAATCATAACTGAAGGA--AAATTT-AAATTTAACA------ACAGTTTTC----AA-AAAAGATTTT----TT-T-GAATA-------TGAAAC-----TTATA--TTGTATACA--GTTTTCAAA-TTCACATCGCATACAGATCATATATTCAAGAACAGATCTGCGAAGTTTCAATTGAATCTGCAAGGTACAAC-TCTTG-AAAATT---TA-A-AG-------CCTC-------------------------------AGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGTTGCTGGCTTTTATACTGTAACTCCAGCCTttgaatccatttcatcaacacacatttttaaagaagaatactttaatcttttgggcagttagctataaagttgatagcatcacaaatccagcattgcagctatagaacagaggcaaggcccgggtcaaaaa
gi|9 : tctttAATGA----TTT---TAAAATGCC-T-TAA-AA---------------T--T-CAT--ATTGA--AGAAT-GAT-AAA----A---TTCTTGC--GT-TGT-----TTGC-------------ATGTA---T---------ACATGTAA-T---AAAAAA---A-GTTC-----A------TT---G-------C-TCAGT-ttaagtattcaatatgataataaacaacata
gi|9 : cattcgatggtaatatactatatttaattgaatgtgtattttttacagttgataaagtactcaaccttatttgatatccAA---A-GTTATAGTTA------TA---G-------G-TCAGT-TATGCTAA------TGTAAGACATAACTACGTCACATAAGGGTCATCATGAAAAT--------------GGGTGTT-T-----------T-----------ACAA-----ATG--------------GT---T--AAA--CAAATGTCACAATCTTCAT-AAAGGAAATAAGAACAAA-GCA-TGAACTTGATAT-AA--T-----------GA--A--------T-GT-ACCCCTACAA--------CA-AT----TGT------CA------A--------G-----A-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCTCAC-----CTAAACACCATGTACATAGCATTTAT-TATAGTTT--TTTAATTCCCGGCC-----ATAT--GTGAAAA-G-AGT--G--acgtgtttctttctttctttaaaataaaaataaaactgccttaaagttatagttataggtcagttatgctaatgtaagacataactacgtcacataagggtcatcatgaaaatgggtgttttacaaatggttaaacaaatgtcacaatcttcataaaggaaataagaacaaagcatgaacttgatataatgaatgtacccctacaacaattgtcaagaaaacattcatatagctcacctaaacaccatgtacatagcatttattatagttttttaattcccggccatatgtgaaaagagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCGACAGCTTACTCATTACGATGACATATTCGTCGTCAGTATGTCGTTTGTAGCAATGAATTCGGCGACATCGGTAAGTGACATAAAATCTAGTAAGCGCCTCTACAAAATTATATAACATTTTCAGTTTAACATACGAAACCATGCTTTGTTAGTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 2222222 111 111111 1111111 111 111111111111111 22222222222222222222 1111111111111 44444444444444444444444 111111 1 33333333333333333333 1111111 222222222222222 11 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 1111111111111111111111111111 111111 44444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 33333333 1111 3333333333333
lowQualScore : 5 3 5555555 888 3 8 3 444444 5 6666666 1 222 1 444444444444444 4 8 4 777 0 0 4 4 1 4 55 4 777 88888888888888888888 4 4 777 3333333333333 4 777 44444444444444444444444 4 777 11 111111 2 44 4 99999 77777777777777777777 0 3333333 0 0 9999 1 4 3 3 3 555555555555555 6666 22 99 444444 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 444 2 11111 9999999999999999999999999999 7 4 444444 11 00000000000000000 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 5 0000 1 8 0 0 4 4 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 333333 1 1 1 0 4 3 44 0 0 5 77777 44 3 3 22222222 3 3 3 22 3 1 44 3 2 888888 3333 3 0 6666 8888 2 2 9999999 44 77777 44 2 22 1 3 00 0 888 4 3 3 0 555 3 3 7777777 0000000000000 777 1 1 3 1
lowQualScore : . . ....... ... . . . ...... . ....... . ... . ............... . . . ... . . . . . . .. . ... .................... . . ... ............. . ... ....................... . ... .. ...... . .. . ..... .................... . ....... . . .... . . . . . ............... .... .. .. ...... ........................................................................ ... . ..... ............................ . . ...... .. ................. . ...................................................... .. . .... . . . . . . ................................................................................................................................................... . ...... . . . . . . .. . . . ..... .. . . ........ . . . .. . . .. . . ...... .... . . .... .... . . ....... .. ..... .. . .. . . .. . ... . . . . ... . . ....... ............. ... . . . .
lowQualScore : 0 3 0000000 333 2 8 2 444444 0 2222222 4 777 9 888888888888888 0 0 0 000 7 7 0 0 2 0 55 4 888 33333333333333333333 0 0 000 2222222222222 0 000 22222222222222222222222 0 000 44 555555 0 99 0 99999 44444444444444444444 8 0000000 1 5 4444 3 4 3 3 3 555555555555555 8888 55 22 777777 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222 8 66666 9999999999999999999999999999 3 0 444444 88 44444444444444444 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 6666 0 5 4 2 4 4 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 777777 3 6 4 9 0 3 22 5 8 8 77777 22 1 1 99999999 1 1 1 22 3 2 66 1 1 888888 5555 1 5 6666 9999 9 9 3333333 44 11111 22 8 88 4 1 33 2 333 4 1 1 6 444 1 1 7777777 1111111111111 000 0 4 6 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--ATTGA--AGNAT-G-TTCAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------CG-AT----T-C------CA------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
Reference ( family-3662 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--ATTGA--AGNAT-G-TTCAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------CG-AT----T-C------CA------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
gi|1 : -TTAT--AA---ATGCA-T-AAAATGTCG---TTCACAA------TATTG-AAAAAAAAAACACAA-C-CGGTAAGCCATTA-----AAGCA----AA-T-ATGGA-AG---AGAAGGTGTAGCTACACTACTGGCCTGA-TT-GCTCGTATCTTGA--ACATT-GTAAAGGTGAACACGTGGTT-TGGACTGATAGCTGCGGGA---ACTACAGTGA-T-TGA-CAACAGATAAGGTGATAGGTCA-GTG-TAT---GCAA------TA-----ATCATCATTATTGTAATGA-CTA---CAAATTAA------------------------CAGTTTAGTATACAAAATCA--TTT-AATTGCTTCGTCTTTTAAT-AAG-TATA-T-A---CTAA--------------------AACGCCTAAAA-ACTTTGTACTGAAGCATGATAGAATTGT-----------ATAATTAAACTCCC-ACAAAAATG---T-TAG------------------TT-G--ATCAAT--A--AGT-T-T-TTC----------TTT---C---T-T-T-----CT-T---------------------T---------A-----AA-----ACAAAA---A---TA-----AAACTGCTT---A-------AGTCAAT-TATGTTAAAATTGATGTTAGGCCTAGTTATGTCACAGTATGGACATTGTGAAAA-----------------GTGTT-T-----------AGAACTGGTTACACAA-----ATA--------------TTTTCC--AAA-TCAA----CGCAATGTTCCTTAAAGGGGATAATGATAAA-GTA-TGTATTT----T------------------A--A--------T-TT-A----TATT---------TG-ATATAAT-G------CA------T--------G----CA-------------------------ATCCTGCAACTGTTGTCAATAAAACATTTATAT-AGAACATATGATCTAAATACTATGTAAGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AATTGA--A--AG-CATTGTGAC---ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGATGGCTGGAGGCTCGG-TTGTGAACTCAGATC-AGCTGTCAATTACAACTGGGGAA--AAGTTT-GAATTTTACA------ATAGTTTTC---AAA-TAAA-A--TA----TT-T-GAGTT-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTCTTAAAA-TTCACATGACATAAAGATCATATATTCAAGAATAGACATGTCACGTTTCAACCAAATCTGTTTTGTATGACTTTTTT-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCTGATGAT-GATTTTCT---TCCGGTAAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-GTCAGTGCTGCTAGCTTTTGTACTGTTACTCCGGCCT
gi|10 : ccatgtgaatatatattaccttatattgctatgc-TTAAAAGGCCGAGGTTCACTACCGATATATCA-AAAAA-------CAA-C-CGGTAAGCAATTACCACAA-AAA----TA-TTATGGA-AG---GGAAAGTGTGGCTA--CTACTTGCTTGC-TT-GCTTTTATCTT-A--AAATTTGCATACATAAACATGTGGTT-TGGATTTATAGCTGTGTGA---ACC------A-T-T-A-C------TGAGTTGAATGGTCA-GTG-TAT---GCAA------AA-----ATCAACATTCT----------TA---CATGTTAATTGTTTAGT-------G-------CACTTTGAT-CA---AATCAAGTTTGAATGAGTTTA------AATAAAA-TACA-TTG---TTTATTCTAACATCTT--------AATTTTTAAAACAACTTATT-------ATCAGTTAATTGCTTCTTTTTttacgaagtattaaaacacttaaactaatgaaaagctgcctatcagaacgtaaacgtcaaataaagttagtacattgaccag
gi|11 : tcatcagtgttttttTTCACTA------TATCGCAAAAA-------CGA-C-CGGTCAGCAATAA-----G-ACAAATTTAAT-ATAGA-AG---AGA--------------TACTTGCCTGC-TA-GCTATTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAGATGTGGTT-TAGATTAATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-TAT-A-TAACAGATAAGGTGAATGACCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTA------ACT-A-----------------------------T--------AATTTCTAAAACAATGTTTA-------ATTGTTTAAGTGCTTCCTGTTTTAATAA-TA----TTTAACTTAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-C--AT--GTTGA--AGCAT-G-TTCAA----A---TTT---T--CA-T-T-----GTAT-------------A---A---TTA-------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GGTAT----A------CT---G-------A-GCAGT-acgtctttaagttctttaagtatacttctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcagtaaaacattcataaa
gi|12 : gta-TT--TTCATCTACCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AAT--GGAA--TG-CACTGTGACTT-ATCTCAATAGAA-TCTGGGCCGTTGTTGGCTGGAGTGTCGGGTCATGAACTCAGCTT-AGCTATCAATCACAACAGGAGAA--ATATTT-GAATTTTACA------ATAATTTTC---AAA-AACAT---CT----TT-T-GAATG-------TTAAGT-----TTATA--AAATACACAATGCTTTAAAA-GCCACATGGCATAAAGTTCAAACATTAAAGAATAGACCTACCAA-TTGCATCGAAATTTGTGAGGTAAGAC-TTTTG-AAATTTAAATA-A-AA----AT-CCTCCATTGAT-GTTTTGCT---TCCAGTGAGTTCAGAGAATTCAATGCAAGTGGCCA-TT-TTCAATGTTTCTGGCTTTTATACTGTAACTCgttttgtttttctttctgtttttgtaacattaacaggaag
gi|13 : cGGTTCACTA------TAATG-AAAAA-------CCAAT-TAGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGTCTAAACCACTGGCCTGT-TT-GGTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAACTGTGGGT-TGGATTGATAGCAGTGTGA---ACTA---------------A-AAATAAAGTGAATGGT--------AT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAC-TA---AATAAAGTTTGAGTCAGTTCG------AAT-TAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATGTGTA-------ATTATTTAATTGCTTCTTCTTTAAATGATTA----TTT-ACTAGAGTGCC-T-TAA-AA--------------ATT-CTCAC--ACTG-----------TTCA---------------------T-T-----GTAT-------------A---A---TTG-------A-----AA-TCACACAAAA---ATGTTC-----A------TT---G-------
gi|14 : --TG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTGATGTAGTTTACTGGAGA-TCTGGTCATGAAT----ATA-AGTTGTCATTTACCAATGGTAGA--AAAT-----ATTTTATA--------AGTTTTC----AG-AAAAGA--TTG---TT-T-AAATGTAGTAATTAATATATATATTATA--AACTACACATTGT--------TTCACATGGCACATAGATCATAAAT-------------TACCAAGTTTCAACAAAATCTGTGAGATGTGAC-TTTTG-GCATTT---AA-A-AA----A-----CAACAG-T-A-T-TGCTTAATACAGGGTGTATAGA-AATTGTTTTTCAATTGCCATTT-TTCA----------CTTTTATACTCTTACTTC
gi|15 : GCAAAGTTATGCCATGGAAGAAAAAAATTGAAAAA--------------GGGTGTT-T-----------T-----------AGAA-----ATAGTTCCAAAATTGTTTC---C--AAA-TCAA----CAGAATGTTCCTCAAAGGGAATAATTGGGAA-ATA-TGT-CT-----------T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------TG-A-----T-A------CA------T--------G----CA-------------------------tacagccttttaagttcaaaggtataataataaacatatataaa
gi|16 : ttaacaaatacttcacaggaaaaaacacattctgattcttatttatcgaagaaaatattaattcatagttaaaattagtttgttatggagttatattgctattttctttcttgttttcttaacaactaaaatataactgcacaaggtTTT-GAATTT-AAA------AAGGTTTTC---AAA-GA---A--TT----TT-T----TT-------T--TAT-----TTATA--AA----------CTTTTAAA-TCAACATGACATACA-CTCATGTATTCATCAACAGTTTTGCTAATTTTCAATCAAATAAATTAAGTATGAA-TTTTT-AA--TT---TA-A-AAAGACAT-CGT-CACT-AT-G-TA----------AGCAAATACAGAAAAATCAATGGGAATGGCCATTT-TTCATTGCTGCTGGTATTTATACCGTTACTCCGGTCTtgagtgtttgacacagtcgtaagacttttgtcaataaaacattcatat
gi|17 : -TT--TTCAATTTCCCGCCCTGCCATAT--GTTTGAA-----------A--TA-CACTGTGACTTTATTGCCGCAGAAAGTTGTGC-GTCATTAGCGGGAGAGTCGGGTCATGGAATCAGATC-ACCTGTTAATCGCCATTGTAGGA--TTTCTT-TTATTTTACA------ACAGTTTTC---AATTAGAAG----C----TT-T-GCATA-------T------------------AGTACAC--TGTGTTTAAA-TTCAC-TGA----AAGATT---CA---AAAAACAGGTTTGTAAAACTTCAACAAAATGGGACAGGTATGAC-TTTTG-AAATTC---TA-A-AA----ttaatgagatgtttaattaagatctaatgggagttgtaaataaacaaaatagccgtatagattaagtaccattgcccag
gi|18 : AACAC-ATTTATATAACGCT-AT-TTTAA-TG--TTGCACTCCCTGTC-----ATATAAGCCGTAC-G-AGT--G------G-AATT-----CT-ACGTCCACAGAA-GCTGTGTT-TATTTGGTTGAAGGGTATGGTCATAAACATACATCCAGCTGTCAATCACAACTGATGGA--AAATTTTGAATTTTA-A------ATAGATTTT---TAA-AATAGA--TT----T-----AACG-------TAGCAC-----TAAT
gi|19 : acaacaataacaacaacaaaacatcataagatgtccttcaataaacctgtcaatCA-GTG-TATCATGTAA------TATTAAAATCAACACTCATGTAATGC-ATA---CATACTAAT-------T-------GTTTAGTTCACTCTGAT-CA---AGTC----------CAATTTG------AAT-AAAATACA-T--------AGT--------TT--------AATTTCTAAATCAATTTATT-------ATCATTTAATAGCTTCCTCTTTTGATAATTA----TAT-ACTAAATTGCC-T-AAA-AT--------------CTT-T--AT--ACAGA--AGCA----TTAAA----AAACTCT---CATGC-TGTTCA--CTGTACG----------A---A---C---------AG----AA-CCCCACAAAA---GTGTTC-----A------TT---A-------A-T
gi|2 : GGTTATCAATGTTATCATACGCATGG--TTAAAAG-CCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCATC-CGGTAAGCAATTA-----A-GAA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGT-GCTAAACTACTGGCCAGCTTT-GCTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TTGATTGATAGCTGTCTGA---ACTAC--TGATT-T-A-CATCAGATAAGGTTGATGGTCA-TTG-TAT---GTAA------AA-----ATGAACATTCTTGTATTGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------TGCTTTGAT-TA---AA--------GA--C-GTTTG------AAT-----TACATTTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTTAAACAATATATA-------ATTATTTAATTGCTTTTTCTCTTAATGATAA----TTA-ACTGAAACGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--ATTGA--AGTAT-G-TTCAA----A---TTC---A--CC-C-T-----CTGT-------------A---A---T------------------TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGTATATGCTAA------TGTTGGGCCTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----A-----------------T---C--AAA-TCAA----CAGGATATTCCTTGATGGGATTATTGGCAAA-GTAGTTTTCTT----T-T---T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------TG-AT----T-C------CA------T--------G-----A-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAA-----CTAAACACTATGTATGTAATATTTAA-TATGG-TC--TTCGATTCCCTGCC-----ATTT--GTCAAAA-G-AG---------TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGTTGGCCGGAGAGCCGGGTCATGAACTCAGATC-AACTGTTAATCACCACTGGAGGA--AAAATT-GAATTTTA-A------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGG--TA----TT-T-GTTTG-------TGTCAC-----TTATA--AAGTACAC-TTATTTCCAAA-TTCACTTGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGACCTGCCAAGTTTTAACCAAATTTGTTATTTATGAT-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----ATCCCTCCACTGGTGG-TATGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGACTTTTATACTGCGACTCCGGCCTt
gi|20 : atgcgttgtttttattcgtatgtcaattttattgataagcaataacatctatagatgaaaatttaaaacagagcatACA------ATAGTTTCC---A-----------TTACTGTT-T-GAAAG-------TTGCAT-----TTATATAAACTACACATTATTTTTAAAATTCATATTTCATAAAGTTCATATATCCTAGAAC----------AGTTTCAATCAAATATGCAAAAAACGGC-ATTTG-AATTGT---TA-A-AA----AT-
gi|20 : aattgaaaaaaaacaGTGTCCATTG-CTCAGTGTTGTTGTCTTTGATAGTATTACTCCatcccgacgtgtccattgctcagtgttgttgtctttgatagtattactcca
gi|21 : aattgaaaaaaaacaacaatagtttccattactgtttgaaagttgcatttatataaactacacattatttttaaaattcatatttcataaagttcatatatcctagaacagtttcaatcaaatatgcaaaaaacggcatttgaattgttaaaaatatcccgacT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--GA-TACACATTGTTTTCAAA-TTCACCTGACAAAAAGGCCATACATTCAAGAACAAATCTGCCAAGTTTCAATCAAATCTGGTTTGTAAGAC-TTTTG-AAAACT---TA-A-AA----A----------AA-------ACT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAATGCTGCTAGCTTTTAAACTa
gi|22 : -CAGTAAGCAATTG-----G-GCA----TA-TCATATATAGCCTAGAATGTGTGGCTGAACTACTAGTCTAC-AT-GCTCTTTTCTC-A--AC-TTTGTAAACAAAAGTATGTGGTT-TTGATTGATAACTGTGTGA---ACTTC--TGA-T-T-A-CAA
gi|24 : ttttaatggccagagtttacatgtgtacttcataaacaaaaaaaatgtaATACATGT-ATCACAA-----CTTGATGTTAC-----TGGTATTTCTATAGAG-TA--TTTAATTCCC-ACC-----ACAT--GGCAAAT-G-AGT--G--AACTG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTCATGTAGTTTACTGGAGttg
gi|25 : cttgcaatgaacaaatccttcatacatgtGATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAGCCCGGGGTTCACTA------TATCG--AAAA-------TTA-C-C-----GCAA------------------A-T-ATAGA-AG---AGAATGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCATATCTC-A--A
gi|26 : accatatatataAACATAAACACGTGGTTATGAGTTGATAGCTGTACTA---ACTCC--TG----------------AAGGTGAATAGTCA-GTGTTAT---GTAATATCAGTA-----ATCAACATTTATGTAA-GACATA---Ca
gi|27 : tgctggacattattcatctAATTT---TA-ATGA----AT-CCTCCACAACT-GCTATGCT---TCCAGTTAGTATAGAA---------------GCCATTT-T-CAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCAGTCT
gi|28 : GTTCACTA------TATCT-AAATA-------CCA-CACGGTAAGCTATTA-----A-GGA----CA-A-GCTGA-AC---AAAGGGTGTGGCTAAACTACTGATCTGG-TTAGCTCTTATCTC-A--ACtataacttacggataaagaaatattgaa
gi|29 : CTACAATGCC-T-TAA-AC--------------CGT-T--AT--ATAGA--CGCAT-G-AT-AA----A---CCT---C--GCAT-G-----CTGT-------------tgtcggaatttgctaca
gi|3 : ttGTAAGGAATTA-----G-GCA----AA-T-ATGGG-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTATTGGTCTGC-TC-GCTCTTGTCTT-TTTGCATTTGTAAACATAAACGTGTGATT-TGGATTTATTGCTGTGTGA---ACTAC--T-----------ACTGACAAAATGAACAGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACGTCTTTGTAATGA-ATAATATATACTAAT-------T-------GTTTGGTTCACTTTCAT-AA---ATTCAAGATTAAATCAGTTTG------GAT-AAA--ATA-TTAATATTAATT--------CTTGCATTC-AATTTCTAAAACACTTTATA-------ATCAGTTAGTTGCTCCTTCTTTTAATATTCA----TAT-ACTTAAATGCC-T-TGA-AA---------------TT-T--AT--ACTGA--AGGATAA-TTCAA----G---TCT---T--G--T-A-----CTGT-------------A---AAC-TGAAAAAGCAA-----AA-TCCCACAAAATTTT-TTTA-----A------TT---G-------A-TCA--------TAA------TGTTtaacggctgctcatcaaaagctcaggacagtgttcatttata
gi|3 : gaaaacccttcttAAAATCCC-A-CAA-AA--------------TTT-T--TTTAATTGATCATAAT-G-TT-----------TTT---C--TT-T-T-----TTCTTTAAAACGAAAAAA---A---T---------A-----AC-TGCCT--AAA---G-GTTA-----G------TT---ATAGGTCAA-TCAAT-TATACTAA------TGGTAGGCATAATTAAGTCACAGAAGGAACAATATGGAAA------------------TGTT-T-------------------------------------------------TC---C--AAA-TCAA----CACAATCTTTCT-AAAGGGAAGAATAACAAC-GTA-TGTACAT----G-TAC-T-----------TG--A--------TACA-A----TGCA---------TGTAC----T-CCTACAACA------TTTGTCA--A----TA-------------------------A---------------------AACATTCATGT-TACACAT-----CTTAACACCATGTATAAAGCATTTAT-TATAA-AT--TTTAGTTACCTGCC-----ATAT--GTCAAAACGTAGC-----A--TG-CACTTTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GTTGGACTGTAGTAGGCTGGAGAGTTGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACTA----AGGG--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTGC----AA-AAAAGA--TT----TT-TAGCACG-------TGACAC-----TAATA--AAGTACAAATTGTTTTCATA-TTCACATGAC--AAATATTATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTTCGTATGAC-TTTTG-AAA-TT---TA-A-AA----tttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctaaaggttagttataggtcaatcaattatactaatggtaggcataattaagtcacagaaggaacaatatggaaatgttttccaaatcaacacaatctttctaaagggaagaataacaacgtatgtacatgtacttgatacaatgcatgtactcctacaacatttgtcaataaaacattcatgttacacatcttaacaccatgtataaagcatttattataaattttagttacctgccatatgtcaaaacgtagcatgcactttggcttatctccatagaagttggactgtagtaggctggagagttgggtcatgaactcagatcagctgtcaatcactaagggaaatttgaattttacaacagtttgcaaaaaagatttttagcacgtgacactaataaagtacaaattgttttcatattcacatgacaaatattatacattcaaaaacagatctgccaagtttcaaccaaatctgtttcgtatgacttttgaaatttaaaa
gi|30 : gaaaacccttcttgtaaggaattaggcaaatatgggagagaaggtgtggctaaactattggtctgctcgctcttgtctttttgcatttgtaaacataaacgtgtgatttggatttattgctgtgtgaactactactgacaaaatgaacagtcagtgtatgtaataatcaacgtctttgtaatgaataatatatactaattgtttggttcactttcataaattcaagattaaatcagtttggataaaatattaatattaattcttgcattcaatttctaaaacactttataatcagttagttgctccttcttttaatattcatatacttaaatgccttgaaatttatactgaaggataattcaagtcttgtactgtaaactgaaaaagcACTTTGAT-TA---AATCCAGTTTGAATCAGTTTG------AATAAAA-TATA-TTG---TTAAAC--------TT--------CATTTCTAAAACAATTTGTA-------AACA
gi|4 : tgattgtttaactaGGAGTTCACTA------TGTCG-AAAAA-------CCG------------ATTA-----G-ACA----AG-T-ATAGA-AG---AGAAAGTATGGCTTAGCTACTGGCCTGC-CA-GCTCTAATCTT-A--ACATTTGCAAACATAAACGTGTAGAT-TGGATTGATAGCTGTGTGAGCTACTAC--TGA-T-T-AACAACATATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCACCATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------CACATTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AATAAAA-TACA-GCG---TTATTA--------TT--------AATTTCTGAAACAATGTATA-------GTTATTTAATTGCCTCTTATTTAAATAAGTA----TTT-ACTAAAATGCC-A-TAACAATTCTCACGCTGTTCCTTGT--ATA-ATTAA--AAT-T-G-ATCGATGCGA---TTT---T--TC-T-TTACAACAAC-------------A---A---T---------A-----AA-ACTACCTAAA---T-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCAAT-TATGCTAA------TGTCGGGCCAAGTTTTGACACAAAAGGGACATTA-GAAAAA--------------ATATGTTCT-----------A-----------GAAATGGTTATACAATCTT-------TT---CCTAAA-TCAA----CACGATATTCCTTGATGGGAATAATGCCATA-GTA-TGTATTT----C-TAACT-----------TAT-A--------C-TTGA----TACT---------TG-AT----A-C------CA------T--------G----CATGCAATCTTACGACAATTTTCTATAA---------------------AACATGCATAT-AGCACAA-----TTAAATACTATGTATTTAGCATTTA---ACAA-TTCCCCCGGT--CCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--T-----TGTCACTATGGCTT-ATCCCCATAGAA-ACTGGACTATATTTAGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCTGATC-AGCTGTCAATCACAAATGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTT----AA-ACACGA--TT----TTAT-GAATG-------TATCAC-----TTATA--AAGTATACAATAATTCCAAA-TTCACATGATATAAAGTTCATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAATTAAATCTGTTATGTATGAC-TTTTG-AAat
gi|5 : AATGGTCAAGTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGAAATGA-TTA---CATACTAAT-------TTTTTAGTG-------CACATTGAT-CA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------GAT-AAA-AACA-TTG---TTAATT--------CTTACATAGTAATATCTAAAACAATTCATT-------ATCAGTTAATTGTTTCTTCTTTTAATAATTA----TAT-ACTAAATTGCCTT-TAA-AA--------------CTT-A--AT--ATTGA--AGGAT-GATACAA----T---TCTCA-C--GC-T-TTTTA-CTGT-------------A---AAATC---------A-----AATTCCCATAAAA---A-TTT------A------TT---G-------A-TTA-T-TATGTT
gi|5 : aAAATTCC-CATAA-AA--------------ATT-T--AT----TGATTATTAT-G-TT-----------TTT---T--GT-T-T-----CTTTCTTAACAACAACAA---A---T---------A-----AG-TACCT--AAA---G-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCATT-TATACTAA------TGTTACACATAATTATGTCGCATAAGGTACATTATGAAAAT--------------GTGTGTT-TTAGAAATAGTTAC----------ACAA-----ATACT------------TT---C--AAAATCAA----CACAATCTTTTTCAAAGGGAATAATAATAAG-GTG-TGTACTT----T-AA--A-----------TACAA--------T-GT-A----TGCA------------AT----T-C------TA------CAACTGTCAG----CA-------------------------A---------------------AACATTCATATTCGCACAT-----TTAAGCACTATGTTTATAGCATTTAT-TATAG-TT--TTTAATTCTCTGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--GGAA--TG-CACTGTGGCTT-ATCTACGTTGAA-GCTGAACTCAAATCAACT----------GTCA---------ATC-A-----CAA------CTGGAGGA--AAATTT-GAttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacctaaaggttagttataggtcatttatactaatgttacacataattatgtcgcataaggtacattatgaaaatgtgtgttttagaaatagttacacaaatactttcaaaatcaacacaatctttttcaaagggaataataataaggtgtgtactttaaatacaatgtatgcaattctacaactgtcagcaaaacattcatattcgcacatttaagcactatgtttatagcatttattatagtttttaattctctgccatatgtcaaaagagtggaatgcactgtggcttatctacgttgaagctgaactcaaatcaactgtcaatcacaactggaggaaaatttga
gi|6 : aaatggtcaagtgtatgtaataatcaacattcttgaaatgattacatactaattttttagtgcacattgatcaaatcaagtttgaatcagtttggataaaaacattgttaattcttacatagtaatatctaaaacaattcattatcagttaattgtttcttcttttaataattatatactaaattgcctttaaaacttaatattgaaggatgatacaattctcacgctttttactgtaaaatcATGATAA------TTTTAGGACAAGTTATATCACAGCAAGATCATTATGAAAAAACAATGTATTTTAGGTATGGT-T-----------AC----------ACAAT----GTT--------------TT---C--AAA-CCAG----CACAATGATCCCCACAGGTC-TAATGAGAAATGTT-TTTAAAT----T-TA--TACTCGATACAATA--AATTCAGTGT-TT-G-----ACA---------TA-AT------C------CAAAGAATT--------GTCAACG-------------------------A---------------------AACATCCATAT-AGTAC-------------------TATGTAGCAT---C-TATAA-CT--TTTAATTATCTGCC-----ATGT--GTCAAAA-T-AGT--G--GGTTG-CGCTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGAAGAGATGTGTCATGAACTAAGATT-AGCTGTCAATCACAAC--GGGGATTGGATTT-AAATTTTATAACTGTTACAATTTTTAAAAAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACTC-----TAATC--ATGTACACATTGTTTTAAAA-ATCACAGGACATAAAGATCATACATTCAAGAACGGATATGCCATGTTTCAACAAAATCTGT-------GAC-TTTTA-AACTTG---TATA-AT----AT-CTTTCACAGATGG-TTTGCT---TCCATTGAGTACAGAGAAGTCAGTGTAAATGGCCATTTGTTCAGTGTTTCTAGCTTTCATACTGGTACTCAGACC
gi|7 : gaatttaatgctataattaaactacatga--TTTAAATCCCCGCC-----ACAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGCTT-ATTTCTATAGAT-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAG--TCAGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGCCAGTCACAACTAGAGGA--AAATTT-GTATTTCACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAAA--TT----TT-T-GAATG-------CGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACAT--------AATCATACATTCAAGAACTGAACTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTT-TTTACCAC-TTTTGAAAATTT---AA-A-AA----AT-CCTCAACTGAT-GCTTTGCT---TCC---GAGTACAGAGAAATCTGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTGACTGCGGCCT
gi|8 : AA-GTA-TGTACTT----GATA--TGGTA-------CA--A--------T-GC-A----TGCAATCCTACAACA-AT----TGT------CA---------------G----TA-------------------------A---------------------AACATTCATAA-AGCACAT-----CTAAACATTATACATGTAGCAATAAT-TCTAG-TT--TTTAATTACACGCC-----AAAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGTTT-ATCGCTATAGAA-GCTAGACTGAAGTTGGCTGGAGAGTCAGGTTATGAACTCATATC-AGCTGTCAATCATAACTGAAGGA--AAATTT-AAATTTAACA------ACAGTTTTC----AA-AAAAGATTTT----TT-T-GAATA-------TGAAAC-----TTATA--TTGTATACA--GTTTTCAAA-TTCACATCGCATACAGATCATATATTCAAGAACAGATCTGCGAAGTTTCAATTGAATCTGCAAGGTACAAC-TCTTG-AAAATT---TA-A-AG-------CCTC-------------------------------AGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGTTGCTGGCTTTTATACTGTAACTCCAGCCTttgaatccatttcatcaacacacatttttaaagaagaatactttaatcttttgggcagttagctataaagttgatagcatcacaaatccagcattgcagctatagaacagaggcaaggcccgggtcaaaaa
gi|9 : tctttAATGA----TTT---TAAAATGCC-T-TAA-AA---------------TT-C--AT--ATTGA--AGAAT-G-ATAAA----A---TTCTTGC--GT-TGT-----TTGC-------------ATGTA---T---------ACATGTAA-T---AAAAAA---A-GTTC-----A------TT---G-------C-TCAGT-ttaagtattcaatatgataataaacaacata
gi|9 : cattcgatggtaatatactatatttaattgaatgtgtattttttacagttgataaagtactcaaccttatttgatatccAA---A-GTTATAGTTA------TA---G-------G-TCAGT-TATGCTAA------TGTAAGACATAACTACGTCACATAAGGGTCATCATGAAAAT--------------GGGTGTT-T-----------T-----------ACAA-----ATG--------------GT---T--AAA--CAAATGTCACAATCTTCAT-AAAGGAAATAAGAACAAA-GCA-TGAACTTGATAT-AA--T-----------GA--A--------T-GT-ACCCCTACAA--------CA-AT----TGT------CA------A--------G-----A-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCTCAC-----CTAAACACCATGTACATAGCATTTAT-TATAGTTT--TTTAATTCCCGGCC-----ATAT--GTGAAAA-G-AGT--G--acgtgtttctttctttctttaaaataaaaataaaactgccttaaagttatagttataggtcagttatgctaatgtaagacataactacgtcacataagggtcatcatgaaaatgggtgttttacaaatggttaaacaaatgtcacaatcttcataaaggaaataagaacaaagcatgaacttgatataatgaatgtacccctacaacaattgtcaagaaaacattcatatagctcacctaaacaccatgtacatagcatttattatagttttttaattcccggccatatgtgaaaagagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCGACAGCTTACTCATTACGATGACATATTCGTCGTCAGTATGTCGTTTGTAGCAATGAATTCGGCGACATCGGTAAGTGACATAAAATCTAGTAAGCGCCTCTACAAAATTATATAACATTTTCAGTTTAACATACGAAACCATGCTTTGTTAGTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 2222222 111 111111 1111111 111 111111111111111 22222222222222222222 1111111111111 44444444444444444444444 111111 1 33333333333333333333 1111111 222222222222222 11 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 1111111111111111111111111111 111111 44444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 33333333 1111 3333333333333
lowQualScore : 5 3 5555555 888 3 8 3 444444 5 6666666 1 222 1 444444444444444 4 8 4 777 0 0 4 4 1 4 55 4 777 88888888888888888888 4 4 777 3333333333333 4 777 44444444444444444444444 4 777 11 111111 2 44 4 99999 77777777777777777777 0 3333333 0 0 9999 1 4 3 3 3 555555555555555 6666 22 99 444444 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 444 2 11111 9999999999999999999999999999 7 4 444444 11 00000000000000000 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 5 0000 1 8 0 0 4 4 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 333333 1 1 1 0 4 3 44 0 0 5 77777 44 3 3 22222222 3 3 3 22 3 1 44 3 2 888888 3333 3 0 6666 8888 2 2 9999999 44 77777 44 2 22 1 3 00 0 888 4 3 3 0 555 3 3 7777777 0000000000000 777 1 1 3 1
lowQualScore : . . ....... ... . . . ...... . ....... . ... . ............... . . . ... . . . . . . .. . ... .................... . . ... ............. . ... ....................... . ... .. ...... . .. . ..... .................... . ....... . . .... . . . . . ............... .... .. .. ...... ........................................................................ ... . ..... ............................ . . ...... .. ................. . ...................................................... .. . .... . . . . . . ................................................................................................................................................... . ...... . . . . . . .. . . . ..... .. . . ........ . . . .. . . .. . . ...... .... . . .... .... . . ....... .. ..... .. . .. . . .. . ... . . . . ... . . ....... ............. ... . . . .
lowQualScore : 0 3 0000000 333 2 8 2 444444 0 2222222 4 777 9 888888888888888 0 0 0 000 7 7 0 0 2 0 55 4 888 33333333333333333333 0 0 000 2222222222222 0 000 22222222222222222222222 0 000 44 555555 0 99 0 99999 44444444444444444444 8 0000000 1 5 4444 3 4 3 3 3 555555555555555 8888 55 22 777777 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222 8 66666 9999999999999999999999999999 3 0 444444 88 44444444444444444 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 6666 0 5 4 2 4 4 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 777777 3 6 4 9 0 3 22 5 8 8 77777 22 1 1 99999999 1 1 1 22 3 2 66 1 1 888888 5555 1 5 6666 9999 9 9 3333333 44 11111 22 8 88 4 1 33 2 333 4 1 1 6 444 1 1 7777777 1111111111111 000 0 4 6 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--ATTGA--AGNAT-G-TTCAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------CG-AT----T-C------CA------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
Reference ( family-3662 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--ATTGA--AGNAT-G-TTCAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------CG-AT----T-C------CA------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
gi|1 : -TTAT--AA---ATGCA-T-AAAATGTCG---TTCACAA------TATTG-AAAAAAAAAACACAA-C-CGGTAAGCCATTA-----AAGCA----AA-T-ATGGA-AG---AGAAGGTGTAGCTACACTACTGGCCTGA-TT-GCTCGTATCTTGA--ACATT-GTAAAGGTGAACACGTGGTT-TGGACTGATAGCTGCGGGA---ACTACAGTGA-T-TGA-CAACAGATAAGGTGATAGGTCA-GTG-TAT---GCAA------TA-----ATCATCATTATTGTAATGA-CTA---CAAATTAA------------------------CAGTTTAGTATACAAAATCA--TTT-AATTGCTTCGTCTTTTAAT-AAG-TATA-T-A---CTAA--------------------AACGCCTAAAA-ACTTTGTACTGAAGCATGATAGAATTGT-----------ATAATTAAACTCCC-ACAAAAATG---T-TAG------------------TT-G--ATCAAT--A--AGT-T-T-TTC----------TTT---C---T-T-T-----CT-T---------------------T---------A-----AA-----ACAAAA---A---TA-----AAACTGCTT---A-------AGTCAAT-TATGTTAAAATTGATGTTAGGCCTAGTTATGTCACAGTATGGACATTGTGAAAA-----------------GTGTT-T-----------AGAACTGGTTACACAA-----ATA--------------TTTTCC--AAA-TCAA----CGCAATGTTCCTTAAAGGGGATAATGATAAA-GTA-TGTATTT----T------------------A--A--------T-TT-A----TATT---------TG-ATATAAT-G------CA------T--------G----CA-------------------------ATCCTGCAACTGTTGTCAATAAAACATTTATAT-AGAACATATGATCTAAATACTATGTAAGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AATTGA--A--AG-CATTGTGAC---ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGATGGCTGGAGGCTCGG-TTGTGAACTCAGATC-AGCTGTCAATTACAACTGGGGAA--AAGTTT-GAATTTTACA------ATAGTTTTC---AAA-TAAA-A--TA----TT-T-GAGTT-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTCTTAAAA-TTCACATGACATAAAGATCATATATTCAAGAATAGACATGTCACGTTTCAACCAAATCTGTTTTGTATGACTTTTTT-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCTGATGAT-GATTTTCT---TCCGGTAAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-GTCAGTGCTGCTAGCTTTTGTACTGTTACTCCGGCCT
gi|10 : ccatgtgaatatatattaccttatattgctatgc-TTAAAAGGCCGAGGTTCACTACCGATATATCA-AAAAA-------CAA-C-CGGTAAGCAATTACCACAA-AAA----TA-TTATGGA-AG---GGAAAGTGTGGCTA--CTACTTGCTTGC-TT-GCTTTTATCTT-A--AAATTTGCATACATAAACATGTGGTT-TGGATTTATAGCTGTGTGA---ACC------A-T-T-A-C------TGAGTTGAATGGTCA-GTG-TAT---GCAA------AA-----ATCAACATTCT----------TA---CATGTTAATTGTTTAGT-------G-------CACTTTGAT-CA---AATCAAGTTTGAATGAGTTTA------AATAAAA-TACA-TTG---TTTATTCTAACATCTT--------AATTTTTAAAACAACTTATT-------ATCAGTTAATTGCTTCTTTTTttacgaagtattaaaacacttaaactaatgaaaagctgcctatcagaacgtaaacgtcaaataaagttagtacattgaccag
gi|11 : tcatcagtgttttttTTCACTA------TATCGCAAAAA-------CGA-C-CGGTCAGCAATAA-----G-ACAAATTTAAT-ATAGA-AG---AGA--------------TACTTGCCTGC-TA-GCTATTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAGATGTGGTT-TAGATTAATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-TAT-A-TAACAGATAAGGTGAATGACCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTA------ACT-A-----------------------------T--------AATTTCTAAAACAATGTTTA-------ATTGTTTAAGTGCTTCCTGTTTTAATAA-TA----TTTAACTTAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-C--AT--GTTGA--AGCAT-G-TTCAA----A---TTT---T--CA-T-T-----GTAT-------------A---A---TTA-------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GGTAT----A------CT---G-------A-GCAGT-acgtctttaagttctttaagtatacttctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcagtaaaacattcataaa
gi|12 : gta-TT--TTCATCTACCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AAT--GGAA--TG-CACTGTGACTT-ATCTCAATAGAA-TCTGGGCCGTTGTTGGCTGGAGTGTCGGGTCATGAACTCAGCTT-AGCTATCAATCACAACAGGAGAA--ATATTT-GAATTTTACA------ATAATTTTC---AAA-AACAT---CT----TT-T-GAATG-------TTAAGT-----TTATA--AAATACACAATGCTTTAAAA-GCCACATGGCATAAAGTTCAAACATTAAAGAATAGACCTACCAA-TTGCATCGAAATTTGTGAGGTAAGAC-TTTTG-AAATTTAAATA-A-AA----AT-CCTCCATTGAT-GTTTTGCT---TCCAGTGAGTTCAGAGAATTCAATGCAAGTGGCCA-TT-TTCAATGTTTCTGGCTTTTATACTGTAACTCgttttgtttttctttctgtttttgtaacattaacaggaag
gi|13 : cGGTTCACTA------TAATG-AAAAA-------CCAAT-TAGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGTCTAAACCACTGGCCTGT-TT-GGTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAACTGTGGGT-TGGATTGATAGCAGTGTGA---ACTA---------------A-AAATAAAGTGAATGGT--------AT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAC-TA---AATAAAGTTTGAGTCAGTTCG------AAT-TAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATGTGTA-------ATTATTTAATTGCTTCTTCTTTAAATGATTA----TTT-ACTAGAGTGCC-T-TAA-AA--------------ATT-CTCAC--ACTG-----------TTCA---------------------T-T-----GTAT-------------A---A---TTG-------A-----AA-TCACACAAAA---ATGTTC-----A------TT---G-------
gi|14 : --TG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTGATGTAGTTTACTGGAGA-TCTGGTCATGAAT----ATA-AGTTGTCATTTACCAATGGTAGA--AAAT-----ATTTTATA--------AGTTTTC----AG-AAAAGA--TTG---TT-T-AAATGTAGTAATTAATATATATATTATA--AACTACACATTGT--------TTCACATGGCACATAGATCATAAAT-------------TACCAAGTTTCAACAAAATCTGTGAGATGTGAC-TTTTG-GCATTT---AA-A-AA----A-----CAACAG-T-A-T-TGCTTAATACAGGGTGTATAGA-AATTGTTTTTCAATTGCCATTT-TTCA----------CTTTTATACTCTTACTTC
gi|15 : GCAAAGTTATGCCATGGAAGAAAAAAATTGAAAAA--------------GGGTGTT-T-----------T-----------AGAA-----ATAGTTCCAAAATTGTTTC---C--AAA-TCAA----CAGAATGTTCCTCAAAGGGAATAATTGGGAA-ATA-TGT-CT-----------T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------TG-A-----T-A------CA------T--------G----CA-------------------------tacagccttttaagttcaaaggtataataataaacatatataaa
gi|16 : ttaacaaatacttcacaggaaaaaacacattctgattcttatttatcgaagaaaatattaattcatagttaaaattagtttgttatggagttatattgctattttctttcttgttttcttaacaactaaaatataactgcacaaggtTTT-GAATTT-AAA------AAGGTTTTC---AAA-GA---A--TT----TT-T----TT-------T--TAT-----TTATA--AA----------CTTTTAAA-TCAACATGACATACA-CTCATGTATTCATCAACAGTTTTGCTAATTTTCAATCAAATAAATTAAGTATGAA-TTTTT-AA--TT---TA-A-AAAGACAT-CGT-CACT-AT-G-TA----------AGCAAATACAGAAAAATCAATGGGAATGGCCATTT-TTCATTGCTGCTGGTATTTATACCGTTACTCCGGTCTtgagtgtttgacacagtcgtaagacttttgtcaataaaacattcatat
gi|17 : -TT--TTCAATTTCCCGCCCTGCCATAT--GTTTGAA-----------A--TA-CACTGTGACTTTATTGCCGCAGAAAGTTGTGC-GTCATTAGCGGGAGAGTCGGGTCATGGAATCAGATC-ACCTGTTAATCGCCATTGTAGGA--TTTCTT-TTATTTTACA------ACAGTTTTC---AATTAGAAG----C----TT-T-GCATA-------T------------------AGTACAC--TGTGTTTAAA-TTCAC-TGA----AAGATT---CA---AAAAACAGGTTTGTAAAACTTCAACAAAATGGGACAGGTATGAC-TTTTG-AAATTC---TA-A-AA----ttaatgagatgtttaattaagatctaatgggagttgtaaataaacaaaatagccgtatagattaagtaccattgcccag
gi|18 : AACAC-ATTTATATAACGCT-AT-TTTAA-TG--TTGCACTCCCTGTC-----ATATAAGCCGTAC-G-AGT--G------G-AATT-----CT-ACGTCCACAGAA-GCTGTGTT-TATTTGGTTGAAGGGTATGGTCATAAACATACATCCAGCTGTCAATCACAACTGATGGA--AAATTTTGAATTTTA-A------ATAGATTTT---TAA-AATAGA--TT----T-----AACG-------TAGCAC-----TAAT
gi|19 : acaacaataacaacaacaaaacatcataagatgtccttcaataaacctgtcaatCA-GTG-TATCATGTAA------TATTAAAATCAACACTCATGTAATGC-ATA---CATACTAAT-------T-------GTTTAGTTCACTCTGAT-CA---AGTC----------CAATTTG------AAT-AAAATACA-T--------AGT--------TT--------AATTTCTAAATCAATTTATT-------ATCATTTAATAGCTTCCTCTTTTGATAATTA----TAT-ACTAAATTGCC-T-AAA-AT--------------CTT-T--AT--ACAGA--AGCA----TTAAA----AAACTCT---CATGC-TGTTCA--CTGTACG----------A---A---C---------AG----AA-CCCCACAAAA---GTGTTC-----A------TT---A-------A-T
gi|2 : GGTTATCAATGTTATCATACGCATGG--TTAAAAG-CCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCATC-CGGTAAGCAATTA-----A-GAA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGT-GCTAAACTACTGGCCAGCTTT-GCTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TTGATTGATAGCTGTCTGA---ACTAC--TGATT-T-A-CATCAGATAAGGTTGATGGTCA-TTG-TAT---GTAA------AA-----ATGAACATTCTTGTATTGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------TGCTTTGAT-TA---AA--------GA--C-GTTTG------AAT-----TACATTTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTTAAACAATATATA-------ATTATTTAATTGCTTTTTCTCTTAATGATAA----TTA-ACTGAAACGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--ATTGA--AGTAT-G-TTCAA----A---TTC---A--CC-C-T-----CTGT-------------A---A---T------------------TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGTATATGCTAA------TGTTGGGCCTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----A-----------------T---C--AAA-TCAA----CAGGATATTCCTTGATGGGATTATTGGCAAA-GTAGTTTTCTT----T-T---T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------TG-AT----T-C------CA------T--------G-----A-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAA-----CTAAACACTATGTATGTAATATTTAA-TATGG-TC--TTCGATTCCCTGCC-----ATTT--GTCAAAA-G-AG---------TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGTTGGCCGGAGAGCCGGGTCATGAACTCAGATC-AACTGTTAATCACCACTGGAGGA--AAAATT-GAATTTTA-A------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGG--TA----TT-T-GTTTG-------TGTCAC-----TTATA--AAGTACAC-TTATTTCCAAA-TTCACTTGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGACCTGCCAAGTTTTAACCAAATTTGTTATTTATGAT-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----ATCCCTCCACTGGTGG-TATGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGACTTTTATACTGCGACTCCGGCCTt
gi|20 : atgcgttgtttttattcgtatgtcaattttattgataagcaataacatctatagatgaaaatttaaaacagagcatACA------ATAGTTTCC---A-----------TTACTGTT-T-GAAAG-------TTGCAT-----TTATATAAACTACACATTATTTTTAAAATTCATATTTCATAAAGTTCATATATCCTAGAAC----------AGTTTCAATCAAATATGCAAAAAACGGC-ATTTG-AATTGT---TA-A-AA----AT-
gi|20 : aattgaaaaaaaacaGTGTCCATTG-CTCAGTGTTGTTGTCTTTGATAGTATTACTCCatcccgacgtgtccattgctcagtgttgttgtctttgatagtattactcca
gi|21 : aattgaaaaaaaacaacaatagtttccattactgtttgaaagttgcatttatataaactacacattatttttaaaattcatatttcataaagttcatatatcctagaacagtttcaatcaaatatgcaaaaaacggcatttgaattgttaaaaatatcccgacT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--GA-TACACATTGTTTTCAAA-TTCACCTGACAAAAAGGCCATACATTCAAGAACAAATCTGCCAAGTTTCAATCAAATCTGGTTTGTAAGAC-TTTTG-AAAACT---TA-A-AA----A----------AA-------ACT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAATGCTGCTAGCTTTTAAACTa
gi|22 : -CAGTAAGCAATTG-----G-GCA----TA-TCATATATAGCCTAGAATGTGTGGCTGAACTACTAGTCTAC-AT-GCTCTTTTCTC-A--AC-TTTGTAAACAAAAGTATGTGGTT-TTGATTGATAACTGTGTGA---ACTTC--TGA-T-T-A-CAA
gi|24 : ttttaatggccagagtttacatgtgtacttcataaacaaaaaaaatgtaATACATGT-ATCACAA-----CTTGATGTTAC-----TGGTATTTCTATAGAG-TA--TTTAATTCCC-ACC-----ACAT--GGCAAAT-G-AGT--G--AACTG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTCATGTAGTTTACTGGAGttg
gi|25 : cttgcaatgaacaaatccttcatacatgtGATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAGCCCGGGGTTCACTA------TATCG--AAAA-------TTA-C-C-----GCAA------------------A-T-ATAGA-AG---AGAATGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCATATCTC-A--A
gi|26 : accatatatataAACATAAACACGTGGTTATGAGTTGATAGCTGTACTA---ACTCC--TG----------------AAGGTGAATAGTCA-GTGTTAT---GTAATATCAGTA-----ATCAACATTTATGTAA-GACATA---Ca
gi|27 : tgctggacattattcatctAATTT---TA-ATGA----AT-CCTCCACAACT-GCTATGCT---TCCAGTTAGTATAGAA---------------GCCATTT-T-CAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCAGTCT
gi|28 : GTTCACTA------TATCT-AAATA-------CCA-CACGGTAAGCTATTA-----A-GGA----CA-A-GCTGA-AC---AAAGGGTGTGGCTAAACTACTGATCTGG-TTAGCTCTTATCTC-A--ACtataacttacggataaagaaatattgaa
gi|29 : CTACAATGCC-T-TAA-AC--------------CGT-T--AT--ATAGA--CGCAT-G-AT-AA----A---CCT---C--GCAT-G-----CTGT-------------tgtcggaatttgctaca
gi|3 : ttGTAAGGAATTA-----G-GCA----AA-T-ATGGG-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTATTGGTCTGC-TC-GCTCTTGTCTT-TTTGCATTTGTAAACATAAACGTGTGATT-TGGATTTATTGCTGTGTGA---ACTAC--T-----------ACTGACAAAATGAACAGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACGTCTTTGTAATGA-ATAATATATACTAAT-------T-------GTTTGGTTCACTTTCAT-AA---ATTCAAGATTAAATCAGTTTG------GAT-AAA--ATA-TTAATATTAATT--------CTTGCATTC-AATTTCTAAAACACTTTATA-------ATCAGTTAGTTGCTCCTTCTTTTAATATTCA----TAT-ACTTAAATGCC-T-TGA-AA---------------TT-T--AT--ACTGA--AGGATAA-TTCAA----G---TCT---T--G--T-A-----CTGT-------------A---AAC-TGAAAAAGCAA-----AA-TCCCACAAAATTTT-TTTA-----A------TT---G-------A-TCA--------TAA------TGTTtaacggctgctcatcaaaagctcaggacagtgttcatttata
gi|3 : gaaaacccttcttAAAATCCC-A-CAA-AA--------------TTT-T--TTTAATTGATCATAAT-G-TT-----------TTT---C--TT-T-T-----TTCTTTAAAACGAAAAAA---A---T---------A-----AC-TGCCT--AAA---G-GTTA-----G------TT---ATAGGTCAA-TCAAT-TATACTAA------TGGTAGGCATAATTAAGTCACAGAAGGAACAATATGGAAA------------------TGTT-T-------------------------------------------------TC---C--AAA-TCAA----CACAATCTTTCT-AAAGGGAAGAATAACAAC-GTA-TGTACAT----G-TAC-T-----------TG--A--------TACA-A----TGCA---------TGTAC----T-CCTACAACA------TTTGTCA--A----TA-------------------------A---------------------AACATTCATGT-TACACAT-----CTTAACACCATGTATAAAGCATTTAT-TATAA-AT--TTTAGTTACCTGCC-----ATAT--GTCAAAACGTAGC-----A--TG-CACTTTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GTTGGACTGTAGTAGGCTGGAGAGTTGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACTA----AGGG--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTGC----AA-AAAAGA--TT----TT-TAGCACG-------TGACAC-----TAATA--AAGTACAAATTGTTTTCATA-TTCACATGAC--AAATATTATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTTCGTATGAC-TTTTG-AAA-TT---TA-A-AA----tttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctaaaggttagttataggtcaatcaattatactaatggtaggcataattaagtcacagaaggaacaatatggaaatgttttccaaatcaacacaatctttctaaagggaagaataacaacgtatgtacatgtacttgatacaatgcatgtactcctacaacatttgtcaataaaacattcatgttacacatcttaacaccatgtataaagcatttattataaattttagttacctgccatatgtcaaaacgtagcatgcactttggcttatctccatagaagttggactgtagtaggctggagagttgggtcatgaactcagatcagctgtcaatcactaagggaaatttgaattttacaacagtttgcaaaaaagatttttagcacgtgacactaataaagtacaaattgttttcatattcacatgacaaatattatacattcaaaaacagatctgccaagtttcaaccaaatctgtttcgtatgacttttgaaatttaaaa
gi|30 : gaaaacccttcttgtaaggaattaggcaaatatgggagagaaggtgtggctaaactattggtctgctcgctcttgtctttttgcatttgtaaacataaacgtgtgatttggatttattgctgtgtgaactactactgacaaaatgaacagtcagtgtatgtaataatcaacgtctttgtaatgaataatatatactaattgtttggttcactttcataaattcaagattaaatcagtttggataaaatattaatattaattcttgcattcaatttctaaaacactttataatcagttagttgctccttcttttaatattcatatacttaaatgccttgaaatttatactgaaggataattcaagtcttgtactgtaaactgaaaaagcACTTTGAT-TA---AATCCAGTTTGAATCAGTTTG------AATAAAA-TATA-TTG---TTAAAC--------TT--------CATTTCTAAAACAATTTGTA-------AACA
gi|4 : tgattgtttaactaGGAGTTCACTA------TGTCG-AAAAA-------CCG------------ATTA-----G-ACA----AG-T-ATAGA-AG---AGAAAGTATGGCTTAGCTACTGGCCTGC-CA-GCTCTAATCTT-A--ACATTTGCAAACATAAACGTGTAGAT-TGGATTGATAGCTGTGTGAGCTACTAC--TGA-T-T-AACAACATATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCACCATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTGAT-------T-------G-------CACATTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AATAAAA-TACA-GCG---TTATTA--------TT--------AATTTCTGAAACAATGTATA-------GTTATTTAATTGCCTCTTATTTAAATAAGTA----TTT-ACTAAAATGCC-A-TAACAATTCTCACGCTGTTCCTTGT--ATA-ATTAA--AAT-T-G-ATCGATGCGA---TTT---T--TC-T-TTACAACAAC-------------A---A---T---------A-----AA-ACTACCTAAA---T-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCAAT-TATGCTAA------TGTCGGGCCAAGTTTTGACACAAAAGGGACATTA-GAAAAA--------------ATATGTTCT-----------A-----------GAAATGGTTATACAATCTT-------TT---CCTAAA-TCAA----CACGATATTCCTTGATGGGAATAATGCCATA-GTA-TGTATTT----C-TAACT-----------TAT-A--------C-TTGA----TACT---------TG-AT----A-C------CA------T--------G----CATGCAATCTTACGACAATTTTCTATAA---------------------AACATGCATAT-AGCACAA-----TTAAATACTATGTATTTAGCATTTA---ACAA-TTCCCCCGGT--CCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--T-----TGTCACTATGGCTT-ATCCCCATAGAA-ACTGGACTATATTTAGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCTGATC-AGCTGTCAATCACAAATGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTT----AA-ACACGA--TT----TTAT-GAATG-------TATCAC-----TTATA--AAGTATACAATAATTCCAAA-TTCACATGATATAAAGTTCATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAATTAAATCTGTTATGTATGAC-TTTTG-AAat
gi|5 : AATGGTCAAGTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGAAATGA-TTA---CATACTAAT-------TTTTTAGTG-------CACATTGAT-CA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------GAT-AAA-AACA-TTG---TTAATT--------CTTACATAGTAATATCTAAAACAATTCATT-------ATCAGTTAATTGTTTCTTCTTTTAATAATTA----TAT-ACTAAATTGCCTT-TAA-AA--------------CTT-A--AT--ATTGA--AGGAT-GATACAA----T---TCTCA-C--GC-T-TTTTA-CTGT-------------A---AAATC---------A-----AATTCCCATAAAA---A-TTT------A------TT---G-------A-TTA-T-TATGTT
gi|5 : aAAATTCC-CATAA-AA--------------ATT-T--AT----TGATTATTAT-G-TT-----------TTT---T--GT-T-T-----CTTTCTTAACAACAACAA---A---T---------A-----AG-TACCT--AAA---G-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCATT-TATACTAA------TGTTACACATAATTATGTCGCATAAGGTACATTATGAAAAT--------------GTGTGTT-TTAGAAATAGTTAC----------ACAA-----ATACT------------TT---C--AAAATCAA----CACAATCTTTTTCAAAGGGAATAATAATAAG-GTG-TGTACTT----T-AA--A-----------TACAA--------T-GT-A----TGCA------------AT----T-C------TA------CAACTGTCAG----CA-------------------------A---------------------AACATTCATATTCGCACAT-----TTAAGCACTATGTTTATAGCATTTAT-TATAG-TT--TTTAATTCTCTGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--GGAA--TG-CACTGTGGCTT-ATCTACGTTGAA-GCTGAACTCAAATCAACT----------GTCA---------ATC-A-----CAA------CTGGAGGA--AAATTT-GAttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacctaaaggttagttataggtcatttatactaatgttacacataattatgtcgcataaggtacattatgaaaatgtgtgttttagaaatagttacacaaatactttcaaaatcaacacaatctttttcaaagggaataataataaggtgtgtactttaaatacaatgtatgcaattctacaactgtcagcaaaacattcatattcgcacatttaagcactatgtttatagcatttattatagtttttaattctctgccatatgtcaaaagagtggaatgcactgtggcttatctacgttgaagctgaactcaaatcaactgtcaatcacaactggaggaaaatttga
gi|6 : aaatggtcaagtgtatgtaataatcaacattcttgaaatgattacatactaattttttagtgcacattgatcaaatcaagtttgaatcagtttggataaaaacattgttaattcttacatagtaatatctaaaacaattcattatcagttaattgtttcttcttttaataattatatactaaattgcctttaaaacttaatattgaaggatgatacaattctcacgctttttactgtaaaatcATGATAA------TTTTAGGACAAGTTATATCACAGCAAGATCATTATGAAAAAACAATGTATTTTAGGTATGGT-T-----------AC----------ACAAT----GTT--------------TT---C--AAA-CCAG----CACAATGATCCCCACAGGTC-TAATGAGAAATGTT-TTTAAAT----T-TA--TACTCGATACAATA--AATTCAGTGT-TT-G-----ACA---------TA-AT------C------CAAAGAATT--------GTCAACG-------------------------A---------------------AACATCCATAT-AGTAC-------------------TATGTAGCAT---C-TATAA-CT--TTTAATTATCTGCC-----ATGT--GTCAAAA-T-AGT--G--GGTTG-CGCTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGAAGAGATGTGTCATGAACTAAGATT-AGCTGTCAATCACAAC--GGGGATTGGATTT-AAATTTTATAACTGTTACAATTTTTAAAAAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACTC-----TAATC--ATGTACACATTGTTTTAAAA-ATCACAGGACATAAAGATCATACATTCAAGAACGGATATGCCATGTTTCAACAAAATCTGT-------GAC-TTTTA-AACTTG---TATA-AT----AT-CTTTCACAGATGG-TTTGCT---TCCATTGAGTACAGAGAAGTCAGTGTAAATGGCCATTTGTTCAGTGTTTCTAGCTTTCATACTGGTACTCAGACC
gi|7 : gaatttaatgctataattaaactacatga--TTTAAATCCCCGCC-----ACAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGCTT-ATTTCTATAGAT-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAG--TCAGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGCCAGTCACAACTAGAGGA--AAATTT-GTATTTCACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAAA--TT----TT-T-GAATG-------CGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACAT--------AATCATACATTCAAGAACTGAACTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTT-TTTACCAC-TTTTGAAAATTT---AA-A-AA----AT-CCTCAACTGAT-GCTTTGCT---TCC---GAGTACAGAGAAATCTGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTGACTGCGGCCT
gi|8 : AA-GTA-TGTACTT----GATA--TGGTA-------CA--A--------T-GC-A----TGCAATCCTACAACA-AT----TGT------CA---------------G----TA-------------------------A---------------------AACATTCATAA-AGCACAT-----CTAAACATTATACATGTAGCAATAAT-TCTAG-TT--TTTAATTACACGCC-----AAAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGTTT-ATCGCTATAGAA-GCTAGACTGAAGTTGGCTGGAGAGTCAGGTTATGAACTCATATC-AGCTGTCAATCATAACTGAAGGA--AAATTT-AAATTTAACA------ACAGTTTTC----AA-AAAAGATTTT----TT-T-GAATA-------TGAAAC-----TTATA--TTGTATACA--GTTTTCAAA-TTCACATCGCATACAGATCATATATTCAAGAACAGATCTGCGAAGTTTCAATTGAATCTGCAAGGTACAAC-TCTTG-AAAATT---TA-A-AG-------CCTC-------------------------------AGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGTTGCTGGCTTTTATACTGTAACTCCAGCCTttgaatccatttcatcaacacacatttttaaagaagaatactttaatcttttgggcagttagctataaagttgatagcatcacaaatccagcattgcagctatagaacagaggcaaggcccgggtcaaaaa
gi|9 : tctttAATGA----TTT---TAAAATGCC-T-TAA-AA---------------TT-C--AT--ATTGA--AGAAT-G-ATAAA----A---TTCTTGC--GT-TGT-----TTGC-------------ATGTA---T---------ACATGTAA-T---AAAAAA---A-GTTC-----A------TT---G-------C-TCAGT-ttaagtattcaatatgataataaacaacata
gi|9 : cattcgatggtaatatactatatttaattgaatgtgtattttttacagttgataaagtactcaaccttatttgatatccAA---A-GTTATAGTTA------TA---G-------G-TCAGT-TATGCTAA------TGTAAGACATAACTACGTCACATAAGGGTCATCATGAAAAT--------------GGGTGTT-T-----------T-----------ACAA-----ATG--------------GT---T--AAA--CAAATGTCACAATCTTCAT-AAAGGAAATAAGAACAAA-GCA-TGAACTTGATAT-AA--T-----------GA--A--------T-GT-ACCCCTACAA--------CA-AT----TGT------CA------A--------G-----A-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCTCAC-----CTAAACACCATGTACATAGCATTTAT-TATAGTTT--TTTAATTCCCGGCC-----ATAT--GTGAAAA-G-AGT--G--acgtgtttctttctttctttaaaataaaaataaaactgccttaaagttatagttataggtcagttatgctaatgtaagacataactacgtcacataagggtcatcatgaaaatgggtgttttacaaatggttaaacaaatgtcacaatcttcataaaggaaataagaacaaagcatgaacttgatataatgaatgtacccctacaacaattgtcaagaaaacattcatatagctcacctaaacaccatgtacatagcatttattatagttttttaattcccggccatatgtgaaaagagtg
blockSeqs : . G CATACGC AAA T G A CCGATA C . A AT G CCACAAAAAT A T T CCT T A T . TT A GCT ACTGATATATAACAG A T CAT TATCAGTA C ATA TGTTTAGTG . . AA . A AT T TAATA TTCTAACATCTT . . T A T A C TTCTCACGCTGTTCC CTC TA TC GATAA AAAAAACTCTCATGCTGTTCACTGTACGAACAG TTC C TTTT AGTTATAGGTCAA G A . AA AACAATGTATTTTAGGT C TAGAAATAGTTCCAAAATTGTTTC CT A ATGT G C T G CTAACTTATACTTGATACTTGATACCATGCATGCAATCTTACGACAATTTTCTATAA T A T T A A T CC G CTGCC AA C T GGAA T T A TG C A TT T C ACTGTT AAAA T GATT ACTG A A TAGTAAT TA ATATA TA A AA A A GAG A . A AAA T T AGACAT CATTGATGTTTT TAA T A G A
blockSeqs : . TAAA G T C G . . . G TC G GACAAATTT . C . . . . T . . . . ACTGATTTACATCAG . . . TATTAAA . . TGTTTAGTT . . AA . A T . TG TTCTTACATAGT . . T . . . . C GT A TT GATGA AAAATTCTTGCGTTGTTTGCATGTATACATGT TC C AT ATAGTTATAGG G . . CT AGG . TAGAAATAGTTACACAAATACTTT . . . A T . . TTATACTCGATACAATAAATTCAGTGTTTGACATAATCCAAAGAATTGTCAACGA . A T G G . . . C . . . . GAAC . . . AG . C . . T . A . GA G . . . AA . . C AT T . GAG T . . . . . ATC CACTGGTGGTAT . T T . T
blockSeqs : T . G . . . C CA A GGCAT . . . . . . A . . . . ACTGATTAACAACAT . . . AA . . TGTTTGGTT . . AA . A T . TG TTCTTGCATTC . . A . . . . A C . . CATG CAAGTCTTGTACTGTAAACTGAAAAAGCAA TC C GT AGTTATAGG A . . AT AGT . AGAAATGGTTATACAATCTTTT . . . C T . . GTACTTGATACAATGCATGTACTCCTACAACATTTGTCAATAA . T C G A . . . T . . . . GGAA . . . GG . C . . A . A . GA . . . . AG . . G AT T . TAA T . . . . . AT CACAACTGCTAT . A A . T
blockSeqs : G . . . C C G AGAAT . . . . . . A . . . . ACTACTG . . . CA . . TTTTTAGTG . . AA . . T . TG TTTT . . T . . . . C T . . TATG TTTCTTTTTTCTTTAAAACGAAAAAAATA CC C A AGTTATAGG A . . CA AAT . ACACAATGTTTT . . . A C . . GATATGGTACAATGCATGCAATCCTACAACAATTGTCAGTAA . A T G T . . . T . . . . GGGT . . . AG . A . . C . A . GG . . . . GT . . G AT C . CAG T . . . . . AT CACAGATGGTTT . T A . G
blockSeqs : . . . T C A GGCAT . . . . . . T . . . . ATTAC . . . CA . . TG . . CA . . T . TG GTTT . . A . . . . C T . . CATG CGATGCGATTTTTCTTTACAACAACAATA TC C A ATACTGA T . . AT TGT . TACAAATGGT . . . C C . . GATATAATGAATGTACCCCTACAACAATTGTCAAGAA . T T G A . . . T . . . . GAAA . . . AG . C . . C . T . GA . . . . TG . . C AT T . TAT T . . . . . AT AACTGATGCTTT . T A . T
blockSeqs : . . . C C G AGGAC . . . . . . A . . . . AAAA . . . AA . . TG . . AA . . T . CG TTTT . . T . . . . C T . . AATG CAATTCTCACGCTTTTTACTGTAAAATCA TC C G CATTAA G . . CA TGG . AACAAAT . . . G . . . TAAATACAATGTATGCAATTCTACAACTGTCAGCAA . T T A G . . . C . . . . GAAA . . . AG . T . . C . A . GA . . . . GA . . G AA C . AAA C . . . . . AT AACAGTATT . G G . T
blockSeqs : . . . C . . GGCAA . . . . . . T . . . . CCTG . . . TA . . TG . . AA . . A . TG ACTT . . A . . . . T T . . TATG TTTTGTTTCTTTCTTAACAACAACAAATA TG T T AATTGA G . . AT . . TC . . . C . . . TTTTAATTTATACATGATTCCATGAA . C C G G . . . T . . . . A . . . AG . A . . C . A . GA . . . . GA . . G AT C . TTT A . . . . . AT CACTATGTA . A G . T
blockSeqs : . GACAA . . . . . . T . . . . . . . CA . . TG . . . . . . . . TATT . . T . . . . C T . . AATG CAAATTTTCATTGTATAATTAA AC A A AATTGA . . . . . . . . A . . . T . . . . G . . . AG . A . . T . A . AA . . . . AT . . G AT C . TTC T . . . . . A AA . T G . G
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . TA . . . . . . . . . . T . . . . A A . . TTG CAAATTCACCCTCTGTAAT TA . G CATTGC . . . . . . . . C . . . . A . . . A . A . . C . . . T . . . . GA . . G T A . TAT T . . . . . A . . . . . A
blockSeqs : . . . . T . . CA CATTGTATAATTGA T . A ATTGA . . C . . . . T . . . . . A . . C . . . A . . . . GA . . G A C . AAG C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . GA . . . . C . TT C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ******* C** GGCAN********** ACTATTACAAG********* TTTTGTG**************** *** AA ****** TG*** TTTT**************** ******* **** C************** ** NATG** TC* AATTGA********************** ****** AGT************** N***** GA**
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTA-----G-GCA----TA-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTAC--TGA-T-T-A-CAACAGATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT-------T-------G-------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--ATTGA--AGNAT-G-TTCAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------CG-AT----T-C------CA------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCAC--CGGTAAGCAATTAGGCAN----------A-T-ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGA---ACTACTATTACAAG---------ATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAATTTTTGTG----------------CACTTTGAT-TA---AATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAA-TACA-TTG---TTAATTTT----------------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AAC--------------TT-T--AT--ATTGA--AGNATG--TTCAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AATC-CCACAAAA---A-GTTAATTGA----------------------TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAAGT--------------GTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------T-TT-A----TACA---------CG-AT----T-C------CA------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCGACAGCTTACTCATTACGATGACATATTCGTCGTCAGTATGTCGTTTGTAGCAATGAATTCGGCGACATCGGTAAGTGACATAAAATCTAGTAAGCGCCTCTACAAAATTATATAACATTTTCAGTTTAACATACGAAACCATGCTTTGTTAGTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 2222222 111 111111 1111111 111 11111111111 555555555555555555555555 1111111111111 44444444 111111 111111 33333333333333333333 1111111 222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 1111111111111111111111111111 111111 44444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 33333333 1111 3333333333333
lowQualScore : 5 3 5555555 888 3 8 3 444444 5 6666666 1 222 1 0 8 1 77777777777 4 777 0 0 4 4 1 4 55 4 999999999999999999999999 66 4 4 777 3333333333333 4 777 66 22222222 1 0 11 111111 111111 4 99999 77777777777777777777 0 3333333 0 0 9999 1 4 3 3 3 555555555555555 6666 99 3 99 444444 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 444 2 11111 9999999999999999999999999999 7 4 444444 11 00000000000000000 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 5 0000 1 8 0 0 4 4 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 333333 1 1 1 0 4 3 44 0 0 5 77777 44 3 3 22222222 3 3 3 22 3 1 44 3 2 888888 3333 3 0 6666 8888 2 2 9999999 44 77777 44 2 22 1 3 00 0 888 4 3 3 0 555 3 3 7777777 0000000000000 777 1 1 3 1
lowQualScore : . . ....... ... . . . ...... . ....... . ... . . . . ........... . ... . . . . . . .. . ........................ .. . . ... ............. . ... .. ........ . . .. ...... ...... . ..... .................... . ....... . . .... . . . . . ............... .... .. . .. ...... ........................................................................ ... . ..... ............................ . . ...... .. ................. . ...................................................... .. . .... . . . . . . .................................................................................................................................................. . ...... . . . . . . .. . . . ..... .. . . ........ . . . .. . . .. . . ...... .... . . .... .... . . ....... .. ..... .. . .. . . .. . ... . . . . ... . . ....... ............. ... . . . .
lowQualScore : 0 3 0000000 333 2 8 2 444444 0 2222222 4 777 9 8 0 0 66666666666 0 000 7 7 0 0 2 0 55 4 000000000000000000000000 99 0 0 000 2222222222222 0 000 11 00000000 1 5 44 555555 000000 0 99999 44444444444444444444 8 0000000 1 5 4444 3 4 3 3 3 555555555555555 8888 22 3 22 777777 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222 8 66666 9999999999999999999999999999 3 0 444444 88 44444444444444444 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99 0 6666 0 5 4 2 4 4 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 777777 3 6 4 9 0 3 22 5 8 8 77777 22 1 1 99999999 1 1 1 22 3 2 66 1 1 888888 5555 1 5 6666 9999 9 9 3333333 44 11111 22 8 88 4 1 33 2 333 4 1 1 6 444 1 1 7777777 1111111111111 000 0 4 6 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTAG-GCAAA-----T-----ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGAACTAC--T-A--T-T-----ACA--A--GATA--AGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT--T-TTT--G-TGCACTTTGATTAAATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--A-TTGA--AGNAT-G-TTCAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------TTT-A----TACA---------CG-AT----T-CC------A------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
Reference ( family-3662 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTATCAAT-TTATCAAA---ATGNA-TTAAAAGGCCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCA-C-CGGTAAGCAATTAG-GCANA-----T-----ATAGA-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCTTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TGGATTGATAGCTGTGTGAACTAC--T-A--T-T-----ACA--A--GATA--AGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT--T-TTT--G-TGCACTTTGATTAAATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATTTATA-------ATCATTTAATTGCTTCTTCTTTTAATAATTA----TTT-ACTAAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--A-TTGA--AGNAT-G-TTCAA----A---TTT---C--GC-T-T-----CTGT-------------A---A---T---------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGT-TATGCTAA------TGTTAGGCNTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----ATA--------------TT---C--AAA-TCAA----CACAATNTTCCTCAAAGGGAATAATGACAAA-GTA-TGTACTT----T-TA--T-----------TA--A--------TTT-A----TACA---------CG-AT----T-CC------A------T--------G----CA-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAN-----CTAAACACTATGTATGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--G--A--TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACAACTGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACATGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTANGTACGAC-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCCACTGAT-G-TNTGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGGCTTTTATACTGTTACTCCGGCCT
gi|1 : -TTAT--AA---ATGCA-T-AAAATGTCG---TTCACAA------TATTG-AAAAAAAAAACACAA-C-CGGTAAGCCATTAAAGCAAA-----T-----ATGGA-AG---AGAAGGTGTAGCTACACTACTGGCCTGA-TT-GCTCGTATCTTGA--ACATT-GTAAAGGTGAACACGTGGTT-TGGACTGATAGCTGCGGGAACTACAGTGA--T-TG----ACA--ACAGATA--AGGTGATAGGTCA-GTG-TAT---GCAA------TA-----ATCATCATTATTGTAATGA-CTA---CAAATTAACAGT-TTA--G-TATAC----A--AAATCA--TTT-AATTGCTTCGTCTTTTAAT-AAG-TATA-T-A---CTAA--------------------AACGCCTAAAA-ACTTTGTACTGAAGCATGATAGAATTGT-----------ATAATTAAACTCCC-ACAAAAATG---T-TAG------------------TT-G--ATCAA-T--A--AGT-T-T-TTC----------TTT---C---T-T-T-----CT-T---------------------T---------A-----AA-----ACAAAA---A---TA-----AAACTGCTT---A-------AGTCAAT-TATGTTAAAATTGATGTTAGGCCTAGTTATGTCACAGTATGGACATTGTGAAAA-----------------GTGTT-T-----------AGAACTGGTTACACAA-----ATA--------------TTTTCC--AAA-TCAA----CGCAATGTTCCTTAAAGGGGATAATGATAAA-GTA-TGTATTT----T------------------A--A--------TTT-A----TATT---------TG-ATATAAT-GC------A------T--------G----CA-------------------------ATCCTGCAACTGTTGTCAATAAAACATTTATAT-AGAACATATGATCTAAATACTATGTAAGTAGCATTTAT-TATAG-TT--TTCAATTCCCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AATTGA--A--AG-CATTGTGAC---ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGATGGCTGGAGGCTCGG-TTGTGAACTCAGATC-AGCTGTCAATTACAACTGGGGAA--AAGTTT-GAATTTTACA------ATAGTTTTC---AAA-TAAA-A--TA----TT-T-GAGTT-------TGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTCTTAAAA-TTCACATGACATAAAGATCATATATTCAAGAATAGACATGTCACGTTTCAACCAAATCTGTTTTGTATGACTTTTTT-AAATTT---TA-A-AA----AT-CCTCTGATGAT-GATTTTCT---TCCGGTAAGTACAGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-GTCAGTGCTGCTAGCTTTTGTACTGTTACTCCGGCCT
gi|10 : ccatgtgaatatatattaccttatattgctatgc-TTAAAAGGCCGAGGTTCACTACCGATATATCA-AAAAA-------CAA-C-CGGTAAGCAATTACCACAAAAATATT-----ATGGA-AG---GGAAAGTGTGGCTA--CTACTTGCTTGC-TT-GCTTTTATCTT-A--AAATTTGCATACATAAACATGTGGTT-TGGATTTATAGCTGTGTGA---AC--C-A--T-T-----AC--------TG--AGTTGAATGGTCA-GTG-TAT---GCAA------AA-----ATCAACATTCT----------TA---CATGTTAAT--TGTTTA-G-TGCACTTTGATCAAATCAAGTTTGAATGAGTTTA------AATAAAA-TACA-TTG---TTTATTCTAACATCTT--------AATTTTTAAAACAACTTATT-------ATCAGTTAATTGCTTCTTTTTttacgaagtattaaaacacttaaactaatgaaaagctgcctatcagaacgtaaacgtcaaataaagttagtacattgaccag
gi|11 : tcatcagtgttttttTTCACTA------TATCGCAAAAA-------CGA-C-CGGTCAGCAATAAG-ACAAA-----TTTAATATAGA-AG---AGA--------------TACTTGCCTGC-TA-GCTATTATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAGATGTGGTT-TAGATTAATAGCTGTGTGAACTAC--TGA--TAT-----ATA--ACAGATA--AGGTGAATGACCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTGAT--T---------GCACTTTGATTAAATCAAGTTTGAATCAGTTTA------ACT-A-----------------------------T--------AATTTCTAAAACAATGTTTA-------ATTGTTTAAGTGCTTCCTGTTTTAATAA-TA----TTTAACTTAAATGCC-T-TAA-AA--------------CTT-C--AT--G-TTGA--AGCAT-G-TTCAA----A---TTT---T--CA-T-T-----GTAT-------------A---A---TTA-------A-----AA-TCCCACAAAA---A-GGTAT----A------CT---G-------A-GCAGT-acgtctttaagttctttaagtatacttctttaagtatgtacttgatatggtacaatgcatgcaatcctacaacaattgtcagtaaaacattcataaa
gi|12 : gta-TT--TTCATCTACCGGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AAT--GGAA--TG-CACTGTGACTT-ATCTCAATAGAA-TCTGGGCCGTTGTTGGCTGGAGTGTCGGGTCATGAACTCAGCTT-AGCTATCAATCACAACAGGAGAA--ATATTT-GAATTTTACA------ATAATTTTC---AAA-AACAT---CT----TT-T-GAATG-------TTAAGT-----TTATA--AAATACACAATGCTTTAAAA-GCCACATGGCATAAAGTTCAAACATTAAAGAATAGACCTACCAA-TTGCATCGAAATTTGTGAGGTAAGAC-TTTTG-AAATTTAAATA-A-AA----AT-CCTCCATTGAT-GTTTTGCT---TCCAGTGAGTTCAGAGAATTCAATGCAAGTGGCCA-TT-TTCAATGTTTCTGGCTTTTATACTGTAACTCgttttgtttttctttctgtttttgtaacattaacaggaag
gi|13 : cGGTTCACTA------TAATG-AAAAA-------CCAAT-TAGTAAGCAATTAG-GCATA-----T-----ATAGA-AG---AGAAGGTGTGTCTAAACCACTGGCCTGT-TT-GGTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAAACTGTGGGT-TGGATTGATAGCAGTGTGAACTA------------------A--A--AATA--AAGTGAATGGT--------AT---GTAA------CA-----ATCAACATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTAAT--T---------GCACTTTGACTAAATAAAGTTTGAGTCAGTTCG------AAT-TAA-TACA-TTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTAAAACAATGTGTA-------ATTATTTAATTGCTTCTTCTTTAAATGATTA----TTT-ACTAGAGTGCC-T-TAA-AA--------------ATT-CTCAC--A-CTG-----------TTCA---------------------T-T-----GTAT-------------A---A---TTG-------A-----AA-TCACACAAAA---ATGTTC-----A------TT---G-------
gi|14 : --TG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTGATGTAGTTTACTGGAGA-TCTGGTCATGAAT----ATA-AGTTGTCATTTACCAATGGTAGA--AAAT-----ATTTTATA--------AGTTTTC----AG-AAAAGA--TTG---TT-T-AAATGTAGTAATTAATATATATATTATA--AACTACACATTGT--------TTCACATGGCACATAGATCATAAAT-------------TACCAAGTTTCAACAAAATCTGTGAGATGTGAC-TTTTG-GCATTT---AA-A-AA----A-----CAACAG-T-A-T-TGCTTAATACAGGGTGTATAGA-AATTGTTTTTCAATTGCCATTT-TTCA----------CTTTTATACTCTTACTTC
gi|15 : GCAAAGTTATGCCATGGAAGAAAAAAATTGAAAAA--------------GGGTGTT-T-----------T-----------AGAA-----ATAGTTCCAAAATTGTTTC---C--AAA-TCAA----CAGAATGTTCCTCAAAGGGAATAATTGGGAA-ATA-TGT-CT-----------T-----------TA--A--------TTT-A----TACA---------TG-A-----T-AC------A------T--------G----CA-------------------------tacagccttttaagttcaaaggtataataataaacatatataaa
gi|16 : ttaacaaatacttcacaggaaaaaacacattctgattcttatttatcgaagaaaatattaattcatagttaaaattagtttgttatggagttatattgctattttctttcttgttttcttaacaactaaaatataactgcacaaggtTTT-GAATTT-AAA------AAGGTTTTC---AAA-GA---A--TT----TT-T----TT-------T--TAT-----TTATA--AA----------CTTTTAAA-TCAACATGACATACA-CTCATGTATTCATCAACAGTTTTGCTAATTTTCAATCAAATAAATTAAGTATGAA-TTTTT-AA--TT---TA-A-AAAGACAT-CGT-CACT-AT-G-TA----------AGCAAATACAGAAAAATCAATGGGAATGGCCATTT-TTCATTGCTGCTGGTATTTATACCGTTACTCCGGTCTtgagtgtttgacacagtcgtaagacttttgtcaataaaacattcatat
gi|17 : -TT--TTCAATTTCCCGCCCTGCCATAT--GTTTGAA-----------A--TA-CACTGTGACTTTATTGCCGCAGAAAGTTGTGC-GTCATTAGCGGGAGAGTCGGGTCATGGAATCAGATC-ACCTGTTAATCGCCATTGTAGGA--TTTCTT-TTATTTTACA------ACAGTTTTC---AATTAGAAG----C----TT-T-GCATA-------T------------------AGTACAC--TGTGTTTAAA-TTCAC-TGA----AAGATT---CA---AAAAACAGGTTTGTAAAACTTCAACAAAATGGGACAGGTATGAC-TTTTG-AAATTC---TA-A-AA----ttaatgagatgtttaattaagatctaatgggagttgtaaataaacaaaatagccgtatagattaagtaccattgcccag
gi|18 : AACAC-ATTTATATAACGCT-AT-TTTAA-TG--TTGCACTCCCTGTC-----ATATAAGCCGTAC-G-AGT--G------G-AATT-----CT-ACGTCCACAGAA-GCTGTGTT-TATTTGGTTGAAGGGTATGGTCATAAACATACATCCAGCTGTCAATCACAACTGATGGA--AAATTTTGAATTTTA-A------ATAGATTTT---TAA-AATAGA--TT----T-----AACG-------TAGCAC-----TAAT
gi|19 : acaacaataacaacaacaaaacatcataagatgtccttcaataaacctgtcaatCA-GTG-TATCATGTAA------TATTAAAATCAACACTCATGTAATGC-ATA---CATACTAAT--TGTTTA-G-TTCACTCTGATCAAGTC----------CAATTTG------AAT-AAAATACA-T--------AGT--------TT--------AATTTCTAAATCAATTTATT-------ATCATTTAATAGCTTCCTCTTTTGATAATTA----TAT-ACTAAATTGCC-T-AAA-AT--------------CTT-T--AT--A-CAGA--AGCA----TTAAA----AAACTCT---CATGC-TGTTCA--CTGTACG----------A---A---C---------AG----AA-CCCCACAAAA---GTGTTC-----A------TT---A-------A-T
gi|2 : GGTTATCAATGTTATCATACGCATGG--TTAAAAG-CCGGGGTTCACTA------TATCG-AAAAA-------CCATC-CGGTAAGCAATTAA-GAATA-----T-----ATAGA-AG---AGAAGGTGT-GCTAAACTACTGGCCAGCTTT-GCTCATATCTT-A--ACATTTGTAAACATAAACATGTGGTT-TTGATTGATAGCTGTCTGAACTAC--T-GATT-T-----ACATCA--GATA--AGGTTGATGGTCA-TTG-TAT---GTAA------AA-----ATGAACATTCTTGTATTGA-ATA---CATACTGA------TT--G-TG--CTTTGATTAAA--------GA--C-GTTTG------AAT-----TACATTTG---TTAATT--------TT--------AATTTCTTAAACAATATATA-------ATTATTTAATTGCTTTTTCTCTTAATGATAA----TTA-ACTGAAACGCC-T-TAA-AA--------------CTT-T--AT--A-TTGA--AGTAT-G-TTCAA----A---TTC---A--CC-C-T-----CTGT-------------A---A---T------------------TCCCACAAAA---A-GTTA-----A------TT---G-------A-TCAGTATATGCTAA------TGTTGGGCCTAGTTATGTCACAGAAGGGACATTATGAAAAA--------------GTGTGTT-T-----------A-----------ACAA-----A-----------------T---C--AAA-TCAA----CAGGATATTCCTTGATGGGATTATTGGCAAA-GTAGTTTTCTT----T-T---T-----------TA--A--------TTT-A----TACA---------TG-AT----T-CC------A------T--------G-----A-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCACAA-----CTAAACACTATGTATGTAATATTTAA-TATGG-TC--TTCGATTCCCTGCC-----ATTT--GTCAAAA-G-AG---------TG-CACTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGACTGTAGTTGGCCGGAGAGCCGGGTCATGAACTCAGATC-AACTGTTAATCACCACTGGAGGA--AAAATT-GAATTTTA-A------ACAGTTTTC---AAA-AAAAGG--TA----TT-T-GTTTG-------TGTCAC-----TTATA--AAGTACAC-TTATTTCCAAA-TTCACTTGACATAAAGATCATACATTCAAGAACAGACCTGCCAAGTTTTAACCAAATTTGTTATTTATGAT-TTTTG-AAATTT---TA-A-AA----ATCCCTCCACTGGTGG-TATGCT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTGACTTTTATACTGCGACTCCGGCCTt
gi|20 : atgcgttgtttttattcgtatgtcaattttattgataagcaataacatctatagatgaaaatttaaaacagagcatACA------ATAGTTTCC---A-----------TTACTGTT-T-GAAAG-------TTGCAT-----TTATATAAACTACACATTATTTTTAAAATTCATATTTCATAAAGTTCATATATCCTAGAAC----------AGTTTCAATCAAATATGCAAAAAACGGC-ATTTG-AATTGT---TA-A-AA----AT-
gi|20 : aattgaaaaaaaacaGTGTCCATTG-CTCAGTGTTGTTGTCTTTGATAGTATTACTCCatcccgacgtgtccattgctcagtgttgttgtctttgatagtattactcca
gi|21 : aattgaaaaaaaacaacaatagtttccattactgtttgaaagttgcatttatataaactacacattatttttaaaattcatatttcataaagttcatatatcctagaacagtttcaatcaaatatgcaaaaaacggcatttgaattgttaaaaatatcccgacT----TT-T-GAATG-------TGACAC-----TTATA--GA-TACACATTGTTTTCAAA-TTCACCTGACAAAAAGGCCATACATTCAAGAACAAATCTGCCAAGTTTCAATCAAATCTGGTTTGTAAGAC-TTTTG-AAAACT---TA-A-AA----A----------AA-------ACT---TCCAGTGAGTACAGAGAATTCAATGTAAGTGGCCATTT-TTCAATGCTGCTAGCTTTTAAACTa
gi|22 : -CAGTAAGCAATTGG-GCATA-----TC----ATATATAGCCTAGAATGTGTGGCTGAACTACTAGTCTAC-AT-GCTCTTTTCTC-A--AC-TTTGTAAACAAAAGTATGTGGTT-TTGATTGATAACTGTGTGAACTTC--TGA--T-T-----ACA--A--
gi|24 : ttttaatggccagagtttacatgtgtacttcataaacaaaaaaaatgtaATACATGT-ATCACAA-----CTTGATGTTAC-----TGGTATTTCTATAGAG-TA--TTTAATTCCC-ACC-----ACAT--GGCAAAT-G-AGT--G--AACTG-CATTGTGGCTT-ATCTCCACAGAA-GTTGTCATGTAGTTTACTGGAGttg
gi|25 : cttgcaatgaacaaatccttcatacatgtGATTAT-AAT-TTATTAAA---ATGAAATTAAAAGCCCGGGGTTCACTA------TATCG--AAAA-------TTA-C-C--------------GCAAA-----T-----ATAGA-AG---AGAATGTGTGGCTAAACTACTGGCCTGC-TT-GCTCATATCTC-A--A
gi|26 : accatatatataAACATAAACACGTGGTTATGAGTTGATAGCTGTACTAACTCC--T-G---------------------A--AGGTGAATAGTCA-GTGTTAT---GTAATATCAGTA-----ATCAACATTTATGTAA-GACATA---Ca
gi|27 : tgctggacattattcatctAATTT---TA-ATGA----AT-CCTCCACAACT-GCTATGCT---TCCAGTTAGTATAGAA---------------GCCATTT-T-CAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTTACTCCAGTCT
gi|28 : GTTCACTA------TATCT-AAATA-------CCA-CACGGTAAGCTATTAA-GGACA-----A-----GCTGA-AC---AAAGGGTGTGGCTAAACTACTGATCTGG-TTAGCTCTTATCTC-A--ACtataacttacggataaagaaatattgaa
gi|29 : CTACAATGCC-T-TAA-AC--------------CGT-T--AT--A-TAGA--CGCAT-G-AT-AA----A---CCT---C--GCAT-G-----CTGT-------------tgtcggaatttgctaca
gi|3 : ttGTAAGGAATTAG-GCAAA-----T-----ATGGG-AG---AGAAGGTGTGGCTAAACTATTGGTCTGC-TC-GCTCTTGTCTT-TTTGCATTTGTAAACATAAACGTGTGATT-TGGATTTATTGCTGTGTGAACTAC--T-A--C-T-------------GACA--AAATGAACAGTCA-GTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACGTCTTTGTAATGA-ATAATATATACTAAT--TGTTT--GGTTCACTTTCATAAATTCAAGATTAAATCAGTTTG------GAT-AAA--ATA-TTAATATTAATT--------CTTGCATTC-AATTTCTAAAACACTTTATA-------ATCAGTTAGTTGCTCCTTCTTTTAATATTCA----TAT-ACTTAAATGCC-T-TGA-AA---------------TT-T--AT--A-CTGA--AGGATAA-TTCAA----G---TCT---T--G--T-A-----CTGT-------------A---AAC-TGAAAAAGCAA-----AA-TCCCACAAAATTTT-TTTA-----A------TT---G-------A-TCA--------TAA------TGTTtaacggctgctcatcaaaagctcaggacagtgttcatttata
gi|3 : gaaaacccttcttAAAATCCC-A-CAA-AA--------------TTT-T--TTTAA-TTGATCATAAT-G-TT-----------TTT---C--TT-T-T-----TTCTTTAAAACGAAAAAA---A---T---------A-----AC-TGCCT--AAA---G-GTTA-----G------TT---ATAGGTCAA-TCAAT-TATACTAA------TGGTAGGCATAATTAAGTCACAGAAGGAACAATATGGAAA------------------TGTT-T-------------------------------------------------TC---C--AAA-TCAA----CACAATCTTTCT-AAAGGGAAGAATAACAAC-GTA-TGTACAT----G-TAC-T-----------TG--A--------TAC-AA---TGCA---------TGTAC----T-CCTACAACA------TTTGTCA--A----TA-------------------------A---------------------AACATTCATGT-TACACAT-----CTTAACACCATGTATAAAGCATTTAT-TATAA-AT--TTTAGTTACCTGCC-----ATAT--GTCAAAACGTAGC-----A--TG-CACTTTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GTTGGACTGTAGTAGGCTGGAGAGTTGGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGTCAATCACTA----AGGG--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTGC----AA-AAAAGA--TT----TT-TAGCACG-------TGACAC-----TAATA--AAGTACAAATTGTTTTCATA-TTCACATGAC--AAATATTATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTTTCGTATGAC-TTTTG-AAA-TT---TA-A-AA----tttcttttttctttaaaacgaaaaaaataactgcctaaaggttagttataggtcaatcaattatactaatggtaggcataattaagtcacagaaggaacaatatggaaatgttttccaaatcaacacaatctttctaaagggaagaataacaacgtatgtacatgtacttgatacaatgcatgtactcctacaacatttgtcaataaaacattcatgttacacatcttaacaccatgtataaagcatttattataaattttagttacctgccatatgtcaaaacgtagcatgcactttggcttatctccatagaagttggactgtagtaggctggagagttgggtcatgaactcagatcagctgtcaatcactaagggaaatttgaattttacaacagtttgcaaaaaagatttttagcacgtgacactaataaagtacaaattgttttcatattcacatgacaaatattatacattcaaaaacagatctgccaagtttcaaccaaatctgtttcgtatgacttttgaaatttaaaa
gi|30 : gaaaacccttcttgtaaggaattaggcaaatatgggagagaaggtgtggctaaactattggtctgctcgctcttgtctttttgcatttgtaaacataaacgtgtgatttggatttattgctgtgtgaactactactgacaaaatgaacagtcagtgtatgtaataatcaacgtctttgtaatgaataatatatactaattgtttggttcactttcataaattcaagattaaatcagtttggataaaatattaatattaattcttgcattcaatttctaaaacactttataatcagttagttgctccttcttttaatattcatatacttaaatgccttgaaatttatactgaaggataattcaagtcttgtactgtaaactgaaaaagcACTTTGATTAAATCCAGTTTGAATCAGTTTG------AATAAAA-TATA-TTG---TTAAAC--------TT--------CATTTCTAAAACAATTTGTA-------AACA
gi|4 : tgattgtttaactaGGAGTTCACTA------TGTCG-AAAAA-------CCG------------ATTAG-ACAAG-----T-----ATAGA-AG---AGAAAGTATGGCTTAGCTACTGGCCTGC-CA-GCTCTAATCTT-A--ACATTTGCAAACATAAACGTGTAGAT-TGGATTGATAGCTGTGTGAGCTAC--T-A--C-TGATTAACA--A--CATATAAGGTGAATGGTCA-GTG-TAT---GTAA------CA-----ATCACCATTCTTGTAATGA-ATA---CATACTGAT--T---------GCACATTGATTAAATCAAGTTTGAATCAGTTTG------AAT-AAAATACA-GCG---TTATTA--------TT--------AATTTCTGAAACAATGTATA-------GTTATTTAATTGCCTCTTATTTAAATAAGTA----TTT-ACTAAAATGCC-A-TAACAATTCTCACGCTGTTCCTTGT--AT--AATTAA--AAT-T-G-ATCGATGCGA---TTT---T--TC-T-TTACAACAAC-------------A---A---T---------A-----AA-ACTACCTAAA---T-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCAAT-TATGCTAA------TGTCGGGCCAAGTTTTGACACAAAAGGGACATTA-GAAAAA--------------ATATGTTCT-----------A-----------GAAATGGTTATACAATCTT-------TT---CCTAAA-TCAA----CACGATATTCCTTGATGGGAATAATGCCATA-GTA-TGTATTT----C-TAACT-----------TAT-A--------CTTGA----TACT---------TG-AT----A-CC------A------T--------G----CATGCAATCTTACGACAATTTTCTATAA---------------------AACATGCATAT-AGCACAA-----TTAAATACTATGTATTTAGCATTTA---ACAA-TTCCCCCGGT--CCCGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--T-----TGTCACTATGGCTT-ATCCCCATAGAA-ACTGGACTATATTTAGCTGGAGAGTCGGGTCATGAACTCTGATC-AGCTGTCAATCACAAATGGAGGA--AAATTT-GAATTTTACA------ACAGTTTTT----AA-ACACGA--TT----TTAT-GAATG-------TATCAC-----TTATA--AAGTATACAATAATTCCAAA-TTCACATGATATAAAGTTCATACATTCAAAAACAGATCTGCCAAGTTTCAATTAAATCTGTTATGTATGAC-TTTTG-AAat
gi|5 : AATGGTCAAGTG-TAT---GTAA------TA-----ATCAACATTCTTGAAATGA-TTA---CATACTAAT--T-TTTTAG-TGCACATTGATCAAATCAAGTTTGAATCAGTTTG------GAT-AAA-AACA-TTG---TTAATT--------CTTACATAGTAATATCTAAAACAATTCATT-------ATCAGTTAATTGTTTCTTCTTTTAATAATTA----TAT-ACTAAATTGCCTT-TAA-AA--------------CTT-A--AT--A-TTGA--AGGAT-GATACAA----T---TCTCA-C--GC-T-TTTTA-CTGT-------------A---AAATC---------A-----AATTCCCATAAAA---A-TTT------A------TT---G-------A-TTA-T-TATGTT
gi|5 : aAAATTCC-CATAA-AA--------------ATT-T--AT-----TGATTATTAT-G-TT-----------TTT---T--GT-T-T-----CTTTCTTAACAACAACAA---A---T---------A-----AG-TACCT--AAA---G-GTTA-----G------TTATAG-------G-TCATT-TATACTAA------TGTTACACATAATTATGTCGCATAAGGTACATTATGAAAAT--------------GTGTGTT-TTAGAAATAGTTAC----------ACAA-----ATACT------------TT---C--AAAATCAA----CACAATCTTTTTCAAAGGGAATAATAATAAG-GTG-TGTACTT----T-AA--A-----------TACAA--------TGT-A----TGCA------------AT----T-CT------A------CAACTGTCAG----CA-------------------------A---------------------AACATTCATATTCGCACAT-----TTAAGCACTATGTTTATAGCATTTAT-TATAG-TT--TTTAATTCTCTGCC-----ATAT--GTCAAAA-G-AGT--GGAA--TG-CACTGTGGCTT-ATCTACGTTGAA-GCTGAACTCAAATCAACT----------GTCA---------ATC-A-----CAA------CTGGAGGA--AAATTT-GAttttgtttctttcttaacaacaacaaataagtacctaaaggttagttataggtcatttatactaatgttacacataattatgtcgcataaggtacattatgaaaatgtgtgttttagaaatagttacacaaatactttcaaaatcaacacaatctttttcaaagggaataataataaggtgtgtactttaaatacaatgtatgcaattctacaactgtcagcaaaacattcatattcgcacatttaagcactatgtttatagcatttattatagtttttaattctctgccatatgtcaaaagagtggaatgcactgtggcttatctacgttgaagctgaactcaaatcaactgtcaatcacaactggaggaaaatttga
gi|6 : aaatggtcaagtgtatgtaataatcaacattcttgaaatgattacatactaattttttagtgcacattgatcaaatcaagtttgaatcagtttggataaaaacattgttaattcttacatagtaatatctaaaacaattcattatcagttaattgtttcttcttttaataattatatactaaattgcctttaaaacttaatattgaaggatgatacaattctcacgctttttactgtaaaatcATGATAA------TTTTAGGACAAGTTATATCACAGCAAGATCATTATGAAAAAACAATGTATTTTAGGTATGGT-T-----------AC----------ACAAT----GTT--------------TT---C--AAA-CCAG----CACAATGATCCCCACAGGTC-TAATGAGAAATGTT-TTTAAAT----T-TA--TACTCGATACAATA--AATTCAGTGTTT-G-----ACA---------TA-AT------CC------AAAGAATT--------GTCAACG-------------------------A---------------------AACATCCATAT-AGTAC-------------------TATGTAGCAT---C-TATAA-CT--TTTAATTATCTGCC-----ATGT--GTCAAAA-T-AGT--G--GGTTG-CGCTGTGGCTT-ATCTCCATAGAA-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGAAGAGATGTGTCATGAACTAAGATT-AGCTGTCAATCACAAC--GGGGATTGGATTT-AAATTTTATAACTGTTACAATTTTTAAAAAA-AAAAGA--TT----TT-T-GAATG-------TGACTC-----TAATC--ATGTACACATTGTTTTAAAA-ATCACAGGACATAAAGATCATACATTCAAGAACGGATATGCCATGTTTCAACAAAATCTGT-------GAC-TTTTA-AACTTG---TATA-AT----AT-CTTTCACAGATGG-TTTGCT---TCCATTGAGTACAGAGAAGTCAGTGTAAATGGCCATTTGTTCAGTGTTTCTAGCTTTCATACTGGTACTCAGACC
gi|7 : gaatttaatgctataattaaactacatga--TTTAAATCCCCGCC-----ACAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGCTT-ATTTCTATAGAT-GCTGGGCTGTAGTTGGCTGGAG--TCAGGTCATGAACTCAGATC-AGCTGCCAGTCACAACTAGAGGA--AAATTT-GTATTTCACA------ACAGTTTTC---AAA-AAAAAA--TT----TT-T-GAATG-------CGACAC-----TTATA--AAGTACACATTGTTTTCAAA-TTCACAT--------AATCATACATTCAAGAACTGAACTGCCAAGTTTCAACCAAATCTGTT-TTTACCAC-TTTTGAAAATTT---AA-A-AA----AT-CCTCAACTGAT-GCTTTGCT---TCC---GAGTACAGAGAAATCTGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGCTGCTAGCTTTTATACTGTGACTGCGGCCT
gi|8 : AA-GTA-TGTACTT----GATA--TGGTA-------CA--A--------TGC-A----TGCAATCCTACAACA-AT----TGTC------A---------------G----TA-------------------------A---------------------AACATTCATAA-AGCACAT-----CTAAACATTATACATGTAGCAATAAT-TCTAG-TT--TTTAATTACACGCC-----AAAT--GTCAAAA-G-AGT--G--AAATG-CACTGTGGTTT-ATCGCTATAGAA-GCTAGACTGAAGTTGGCTGGAGAGTCAGGTTATGAACTCATATC-AGCTGTCAATCATAACTGAAGGA--AAATTT-AAATTTAACA------ACAGTTTTC----AA-AAAAGATTTT----TT-T-GAATA-------TGAAAC-----TTATA--TTGTATACA--GTTTTCAAA-TTCACATCGCATACAGATCATATATTCAAGAACAGATCTGCGAAGTTTCAATTGAATCTGCAAGGTACAAC-TCTTG-AAAATT---TA-A-AG-------CCTC-------------------------------AGAGAATTCAGTGTAAGTGGCCATTT-TTCAGTGTTGCTGGCTTTTATACTGTAACTCCAGCCTttgaatccatttcatcaacacacatttttaaagaagaatactttaatcttttgggcagttagctataaagttgatagcatcacaaatccagcattgcagctatagaacagaggcaaggcccgggtcaaaaa
gi|9 : tctttAATGA----TTT---TAAAATGCC-T-TAA-AA---------------TT-C--AT--A-TTGA--AGAAT-G-ATAAA----A---TTCTTGC--GT-TGT-----TTGC-------------ATGTA---T---------ACATGTAA-T---AAAAAA---A-GTTC-----A------TT---G-------C-TCAGT-ttaagtattcaatatgataataaacaacata
gi|9 : cattcgatggtaatatactatatttaattgaatgtgtattttttacagttgataaagtactcaaccttatttgatatccAA---A-GTTATAGTTA------TA---G-------G-TCAGT-TATGCTAA------TGTAAGACATAACTACGTCACATAAGGGTCATCATGAAAAT--------------GGGTGTT-T-----------T-----------ACAA-----ATG--------------GT---T--AAA--CAAATGTCACAATCTTCAT-AAAGGAAATAAGAACAAA-GCA-TGAACTTGATAT-AA--T-----------GA--A--------TGT-ACCCCTACAA--------CA-AT----TGTC------A------A--------G-----A-------------------------A---------------------AACATTCATAT-AGCTCAC-----CTAAACACCATGTACATAGCATTTAT-TATAGTTT--TTTAATTCCCGGCC-----ATAT--GTGAAAA-G-AGT--G--acgtgtttctttctttctttaaaataaaaataaaactgccttaaagttatagttataggtcagttatgctaatgtaagacataactacgtcacataagggtcatcatgaaaatgggtgttttacaaatggttaaacaaatgtcacaatcttcataaaggaaataagaacaaagcatgaacttgatataatgaatgtacccctacaacaattgtcaagaaaacattcatatagctcacctaaacaccatgtacatagcatttattatagttttttaattcccggccatatgtgaaaagagtg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCGACAGCTTACTCATTACGATGACATATTCGTCGTCAGTATGTCGTTTGTAGCAATGAATTCGGCGACATCGGTAAGTGACATAAAATCTAGTAAGCGCCTCTACAAAATTATATAACATTTTCAGTTTAACATACGAAACCATGCTTTGTTAGTT