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lowQualScore : ...... ............... . . . . . . . .................. . ..... . ....................... .. . .. .... . . .... ... . . . . .. .................. . . .... . .................................. . . ..................... .... .. .. . . .. .. ... ... ...................... .... .................................................. .. .. ... ...... .... . .... .. .. . ... .. ............... ..... . . .. . ... ..... ..... . . .. ......... .... ....... . . ... . ...... . . ............ . . ........... . . .. .. ............. .. ..... .. . ............ .... . . .. . . . ... .............. . . .... ..... . . ... .
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Reference ( gi|3 ) : ATTGCATAAC-CCAGCTGCACTATGATGG---AAT-TATGCG-A-GGAA-A-C-GCTTACCAG--TC---G-T--------AA-AGCGCCGACCGAGTC----------------------AATAA-TATTCTTATTGTAAA--CA--TTTTTTTTTTATT-TAAA---GT-TATG-T-TTT-ATGT-AAAATAA------------------GATGTATTT-G--AATAACATACATAAAAA--------GTT--TAT-AAT-CGTAT--G-TATGTTTG-TTTTAAT-AGC-----TAAAA---A-------TTT---AGTTCAAAAT--ATG--AA-GAAA-ACG--CTGAC--CAA---ATT---CGAG--------T--TAAG-CAGAACAA----CGCTGACCAA-ATT---------AA---------TA--AC--A------A-A--------C--TTATTGTAA--AC---A------T--G-T-TG---T--A--TTTAAAAGCTATATTTT--------------TATA----T-AAA-A--TTAG---ATG-T--TTT-T---AACA-ACATT-CATAAA---------A--A-T--AT-C-AAT-CAGAA-TTTTG-TTTT------AACAGCTTAT------------T-TTTCAGTTTAAAATACACATGTACGAAGAA-A-ACG--CTGAC--CAAATC-CGAGTTAAGC-AGGAAAAC--GCTGA-----CCA--AGTTAA---AAAAA-ATTCT----TAT-TGTAA-AC--A-T-TT-TT---ATTT---A------A---TTAT-TTTGTATG-T--AAATAA---CTTATACTTGATTAATATACATGAA
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gi|13 : ggccactctaaaacgcggacttccatccatatatcagctatggGGAAAAC--GCTGA-----CCA--AGTCAA---TAATA--TTCT----TAT-TGTAA-AC--A-T-TT-TTTAAATATAA-A------A---TTAT-GTTATtgatgtatttgaataacatacataaaacttgatgtaataagaaccagtattttgcttcaataagccatgtaaaaagtttta
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Alignments
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lowQualScore : . .. ..... . . ..... . . ....... . . . .. .......... .... ............................... .. ... . . ... .... ............ . . . . . ................... .... .... ......... .. . ................ . .. . . .. .. .. . ..... ......... ......... .. . . ........ ...... . .. ..... .. ... ...... .. . . . . . . .......... . ... .. ... .. . . . ................ . . . .. . . ...... .. . .......
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-355 ) : ATTGCCTGACGTCAGCTATGGGC----TGACCAAAT-T-A-----TGC-GA-GG-------AA-A-C-GCTGACCAG--TC----------GGAAAA----CGCTG----------------------AC-------CAAGTCAA--TA---A-TATTCTTATTGTAA---ACA--TTTTTTTTT-TATT--T-AAAGTTATG-T-T-T-T-ATG-------------------TAAAATAAGATGT---ATTT-G--AATAACATACATAAAA--A-TT--TAT--A-ATCGNA-G-A-----TG-TTTG-TTT--TAATAGCTTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACCAAATCCGAG-TT-A-G-CA-GGAAAACGCTGACCAAGTT---------AA---------TA--ACANACTTA--------TTGTAAACA------TGTTNT--ATTTAAAA----GCTAT-ATTTTTATGT--AAAATA------AGATG-TTTT-TAACA-ACATACATAAAAATAT-TAATCAGAA-TTTTGTTTTAATAGCTTATTTTTCAGTTCAAAAT--AT-----TATGAAGAA-A-ACG--CT---GACCAAATCCGAGTTANGCGAGGAAAACGCTGACCAAGTT-AANNAAATTCTTATTGTAA-ACA-TTTTTATTT--AATTATTTTGTATGTA------AATAACTTATATTTGATTAATATACATGAA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|9 : ggccactctatatcgctgactttcataCTTATTGTAA---ACA--TGGTTTATC-TA------AAAGCTATA-TAT-T-T-ATG-------------------TAAAACACTATTT---TTTTTA--AACAAAATACCTAGCATTA-TT--AAT--A-A-AAAA-G-T-----TG-TTTT-TATACTAGTAG-TTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAA-CGCTGACCAAATCCGAG-TT-TTG-CA-GGAAAACGCTGACCA---------------------------------CTTA--------TTGTAAACA------TATTGT--ATCTCCAA----ATTGT-ATTTTTATGT--AAAATC------AGAT--TTTT-TAACA-ACAAAAATAAAAATATCTAATCAGAA-TTTTGTTTTAACAGCTTATTTTTCAGTTCAAAGTAAATG----TATGAAAAg
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blockSeqs : G . . . . . T A . A . . . . ACAATTTTT . . . A . TT T T TTT . . . . . . A TA TTATTA . . CGTATGTATG . . . . AA A . AA CA T . . G . . A A . T . . A T T . CATAAAAT TT GA . TC T G . A T . . . A . ATT
blockSeqs : A . . . . . . A . A . . . . AC . . . T . TT T A TTT . . . . . . A G ATTAT . . AAAAGTTG . . . . AA A . AA AT T . . T . . A A . G . . A A T . TATAAAAT A . . TC G G . C T . . . A . TT
blockSeqs : A . . . . . . . . A . . . . AC . . . T . TT C G TAT . . . . . . A G AGTTT . . TCAAAGT . . . . AA . . AA AC A . . G . . A A . T . . G A T . TAAATGT A . . TC T . . A . . . . A . A
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . AC . . . A . TT T A TTT . . . . . . A G ATTT . . CAGAATT . . . . AT . . AA AC T . . G . . A A . G . . A A T . TATA A . . C A . . A . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . AC . . . T . TG T T TTT . . . . . . A G ATTT . . GCATATG . . . . TT . . AA AC T . . G . . A A . G . . A A C . TAT A . . . A . . A
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . AC . . . T . TT A T TTT . . . . . . A T ATTG . . CGTATG . . . . TT . . AA CA T . . T . . T A . G . . A T C . TAC A . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . AA . . . A . TT T T TTT . . . . . . A G ATTG . . CAGATG . . . . A . . AA AC A . . G . . A A . A . . A A T . T A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . AC . . . T . AT T T TCT . . . . . . A G TT . . CATATG . . . . A . . AT AC A . . A . . A A . G . . A A T . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . AC . . . T . TG G T . . . . . . . T G TT . . CAAAA . . . . T . . AA AA T . . T . . A A . . . . A A T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . T . . . . . . . . A T A . . CATA . . . . A . . AA AA T . . G . . . . . . . . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . T G . . C . . . . A . . AA AC A . . T . . . . . . . . A . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . G . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ***** ** ********** *** TTT*** ATTT***** CANATG********** A** AA****************** ******** ****** G* TAAT******* **
originalCons : ATTGCCTGACGTCAGCTATGGGC----TGACCAAAT-T-A-----TGC-GA-GG-------AA-A-C-GCTGACCAG--TC----------GGAAAA----CGCTG----------------------AC-------CAAGTCAA--TA---A-TATTCTTATTGTAA---ACA--TTTTTTTTT-TATT--T-AAAGTTATG-T-T-T-T-ATG-------------------TAAAATAAGATGT---ATTT-G--AATAACATACATAAAA--A-TT--TAT--A-ATCGNA-G-A-----TG-TTTG-TTT--TAATAGCTTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACCAAATCCGAG-TT-A-G-CA-GGAAAACGCTGACCAAGTT---------AA---------TA--ACANACTTA--------TTGTAAACA------TGTTNT--ATTTAAAA----GCTAT-ATTTTTATGT--AAAATA------AGATG-TTTT-TAACA-ACATACATAAAAATAT-TAATCAGAA-TTTTGTTTTAATAGCTTATTTTTCAGTTCAAAAT--AT-----TATGAAGAA-A-ACG--CT---GACCAAATCCGAGTTANGCGAGGAAAACGCTGACCAAGTT-AATAAAATTCTTATTGTAA-ACA-TTTTTATTT--AATTATTTTGTATGTA------AATAACTTATATTTGATTTATATACATGAA
finalCons : ATTGCCTGACGTCAGCTATGGGC----TGACCAAAT-T-A-----TGC-GA-GG-------AA-A-C-GCTGACCAG--TC----------GGAAAA----CGCTG----------------------AC-------CAAGTCAA--TA---A-TATTCTTATTGTAA---ACA--TTTTTTTTT-TATTT---AAAGTTATG-T-T-T-T-ATG-------------------TAAAATAAGATGT---ATTT-G--AATAACATACATAAAAATTT-----AT--A-ATCANATG----------TTTG-TTT--TAATAGCTTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACCAAATCCGAG-TTA--G-CA-GGAAAACGCTGACCAAGTTAA------------------TA--ACANACTTA--------TTGTAAACA------TGTTNT--ATTTAAAA----GCTAT-ATTTTTATGT--AAAATA------AGATG-TTTT-TAACA-ACATACATAAAAATAT-TAATCAGAA-TTTTGTTTTAATAGCTTATTTTTCAGTTCAAAATAAT-------ATGAAGAA-A-ACG--CT---GACCAAATCCGAGTTANGCGAGGAAAACGCTGACCAAGTT-AATAAAATTCTTATTGTAA-ACA-TTTTTATTT--AATTATTTTGTATGTA------AATAACTTATATTTGATTTATATACATGAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): GTTTCACGGTTACAGAGTGCTCTACCTTGCAAATTTATTTGATCATAGGTGGCACCCCGTTTTCATCA
Alignments
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lowQualScore : . .... . . ..... . . ....... . . . .. .......... .... ............................... .. ... . . ... .... . .. ...... . . . . ................... .. .... . ............ .................. . ...... ............ . ..... .................... .... . ........ ...... . .. .... .. ... ...... .. . . . . . .. . . ................... ... ........ ...... . . . . . . . .. . ...... . ... .
lowQualScore : 4 5555 7 7 77777 7 3 0000000 7 7 7 99 0000000000 1111 2222222222222222222222222222222 22 444 1 8 999 8888 0 99 444444 3 7 7 9 1111111111111111111 99 1111 7 777777777777 999999999999999999 1 888888 888888888888 3 11111 55555555555555555555 8888 9 77777777 777777 0 77 7777 11 444 222222 99 9 9 2 4 7 99 1 6 1111111111111111111 444 99999999 000000 0 2 7 3 7 7 7 22 2 222222 8 666 8
consensus : ATTGCCTGACGTCAGCTATGGGC----TGACCAAAT-T-A-----TGC-GA-GG-------AA-A-C-GCTGACCAG--TC----------GGAAAA----CGCTG----------------------AC-------CAAGTCAA--TA---A-TATTCTTATTGTAA---ACA--TTTTTTTTT-TATT--T-AAAGTTATG-T-T-T-TATG-------------------TAAAATAAGATG--T---ATTT-GAATAACATACATAAAAA-TT--TA-T--AAT------CA-TATGT----TTG-TTTT------AATAGCTTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACCAAATCCGAG-TT-A-G-CAGGAAAACGCTGACCAAGTT---------AA---------TA--ACANACTTA--------TTGTAAACA------TGTTNT--ATTTAAAA----GCTAT-ATTTTTATGT--AAAATA------AGATG-TTTT-TAACA-ACATACATAAAAATAT-TAATCAGAATTTT-GTTTTAATAGCTTATTTTTCAGTTCAAA--AT----A-----A---TATGAAGAA-A-AC-----G--CTGACCAAATCCGAGTTANGCGAGGAAAACGCTGACCAAGTT-AATAAAATTCTTATTGTAA-ACA-TTTTTATTT--AATTATTTTGTATGTA------AATAACTTATATTTGATTTATATACATGAA
Reference ( family-355 ) : ATTGCCTGACGTCAGCTATGGGC----TGACCAAAT-T-A-----TGC-GA-GG-------AA-A-C-GCTGACCAG--TC----------GGAAAA----CGCTG----------------------AC-------CAAGTCAA--TA---A-TATTCTTATTGTAA---ACA--TTTTTTTTT-TATT--T-AAAGTTATG-T-T-T-TATG-------------------TAAAATAAGATG--T---ATTT-GAATAACATACATAAAAA-TT--TA-T--AAT------CA-NATGT----TTG-TTTT------AATAGCTTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACCAAATCCGAG-TT-A-G-CAGGAAAACGCTGACCAAGTT---------AA---------TA--ACANACTTA--------TTGTAAACA------TGTTNT--ATTTAAAA----GCTAT-ATTTTTATGT--AAAATA------AGATG-TTTT-TAACA-ACATACATAAAAATAT-TAATCAGAATTTT-GTTTTAATAGCTTATTTTTCAGTTCAAA--AT----A-----A---TATGAAGAA-A-AC-----G--CTGACCAAATCCGAGTTANGCGAGGAAAACGCTGACCAAGTT-AATAAAATTCTTATTGTAA-ACA-TTTTTATTT--AATTATTTTGTATGTA------AATAACTTATATTTGATTTATATACATGAA
gi|1 : TACATAATAA-T---------AAT---------TATGT----TTG-TTTT------AATACCTTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACCAAATTCAAGTTT-T-G-CTGGTAAACGCCGACCAAATTCGACTTTTGAAGGAAAACGCTG--ACCAAGTTAATAACTTATTGCAAATACATGTATGTTTT--ATTTAAAA----GCTAT-ATTTCCATGT--AAAATA------AGATGTTTTT-TAACA-ACATGCAT---ATTAT-TATTCAAAGTTTT-GTTTTAATACCTTACTTTTCAGTTCAA---------A-----A---TATGAAGAA-A-AC-----G--CTGACCAAATACGAATTAAGC-AGGAAAACGATTGCCAAGGT-AATACAATTCTTATTGTAA-ACATTTTTTATTTAAAATTGTTTTGTATGTA------AATAACTT-TATTTGATATATATGGATGAA
gi|1 : tcaaccttggtGC----TGACCAAAT-TCAAGTTTTGC-TG-GT-------AA-A-C-GCCGACCAAATTCGACTTTTGAAGGAAAA----CGCTG----------------------AC-------CAAGTTAA--TA---A-----CTTATTGCAAAT-ACA--TGTATGTTT-TATT--TAAAAGCTATA-T-T-TCCATG-------------------TAAAATAAGATG--T---TTTT-TAACAACATGCATA------T--TATT--ATT------CA-AAGTT----TTG-TTTT------AATACCTTAC------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACCAAATACGAA-TTAA-G-CAGGAAAACGATTGCCAAGGT---------AA---------TA--CAATTCTTA--------TTGTAAACA------TTTTTT--ATTTAAAA-----TTGT--TTTGTATGT---AAATA------A-CTT-TATT-TGATATATATGGATGAAAAT-----AGCAGATGTTT-ATTTTAATAATTTATTGTTAAGCTCAAAATAT----A-----A---TATATAAAC-A-GCTATGGA--CTGACCAAA------TTATGCGAGGAAAACACTGACCAAGTC-AACACTACAC-TACAGTAA-ACA-TTTACA-TT--AATC-TTTTGTA-GCA------AAAAAaatagcagatgtttattttaataatttattgttaagctcaaaatataatatataaacagctatggactgaccaaattatgcgaggaaaacactgaccaagtcaacactacactacagtaaacatttacattaatcttttgtagcaaaaaaaaaa
gi|10 : tcaaccttggttacataataataattatgtttgttttaataccttatttttcagttcaaaatatgaagaaaacCTGACCTCAGCTATGGGC----TAACCAAAT-T-A-----TGC-GA-GG-------AA-AAC-GTTGACCAG--TC----------GGAAAA----AGCTG----------------------AC-------CAAGTTAA--TA---A-TATTCTTATTGTAA---ACA-----TATTTT-TATT--T-AAAGTTATG-T-T-T-TATG-------------------AAAAATAAGATG--T---ATTT-GAAT--CA-----AGGAA-TTA-TA-T--AGT------C------C----TTGATTTG------AATAACATACATAAAAAAAACATTTTCAGTTTAAAATATGAAGAAAACGCTGACCA------AG-TT-A-A-TA--AAA-----------------------------------------TATTTG--------TTGTAAACA------TGTTGT--ATTTAAAA----GCTAT-ATTaaaa
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gi|13 : ggccactctaaaacgcggacttccatccatataCTGACGTCAGCTATGGGT----TGACCTAAT-T-A-----TGC-GA-GG-------AC-A-CCGCTAGCCAG--TC----------GGAAAA----CGCTG----------------------AC-------CAAGTCAA--TA---A-TATTCTTATTGTAA---ACA----TTTTTTA-AATA--T-AAAATTATG-T-T-agccatgtaaaaagtttta
gi|13 : gccacactaagacgctgggtttcatgAG-CC-A-G-TCGGAAAACGCTGACCAAGTC---------AA---------TA--ATATTCTTA--------TTGTAAACA------TTTTTTAAATATAAAATTATGTTATGACTTTTCAGTTCAAAATA------TGAatgacttttcagttcaaaatatgaagaaaacacggacaaaattcgagatttgcaggaaaacgctgaccaagttaataacaaactt
gi|13 : gccacactaagacgctgggtttcatgctgacgtcagctatgggttgacctaattatgcgaggacaccgctAAATAT------AAAATTAT-GTT---ATGACTT----TTCAGTTCAAA--AT----A-----------TGAAGAA-A-AC-----A--CGGACAAAATTCGAGATTTGC-AGGAAAACGCTGACCAAGTT-AATAAagaaaacacggacaaaattcgagatttgcaggaaaacgctgaccaagttaataacaaactt
gi|13 : gccacactaagacgctgggtttcatgctgacgtcagctatgggttgacctaattatgcgaggacaccgctagccagtcggaaaacgctgaccaagtcaataatattcttattgtaaacattttttAC------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACACGGACAAAATTCGAGATT-T-G-CAGGAAAACGCTGACCAAGTT---------AA---------TA--ACAAACTTcaaactt
gi|14 : gccacactaagacgctgggtttcatgctgacgtcagctatgggttgacctaattatgcgaggacaccgctagccagtcggaaaacgctgaccaagtcaataatattcttattgtaaacattttttaaatataaaattatgttatgCTGATGTCAGCTATGGGC----TGACCAAAT-T-A-----TGC-AATGA-------AA-A-C-GCTGACCAG--TC----------GGAAAA----CACTG----------------------AC-------CAAGTCAA--TA---A-TATTCTTATTGTAA---ACA----TTTTTTT-GATT--T-AAAGTTATG-T-T-T-TATA-------------------T-AAATAAGATG--T---ATTT-GAATAACTTACAT
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gi|2 : atttCAGCTATGGAC----TGACCAAAT-T-A-----TGC-GA-GGA------AA-A-C-GCTGACCAA--TT----------CAACAATATGCGTTA----------------------ACAATTTTTTAAATAAATTTACATA-TATTCTT-TTATAATATATA--TTTTTTTTTATATTCCT-CAAG--ACG-T-TAT-TGT--------------------TAAAACGATATA--TACAATAT-GAACAAGA-ACACAAAAttcctcaagacgttattgttaaaacgatatatacaatatgaacaagaacacaaaacagtgttttcctcgcataatttgatcagcccatagctgatgtcagcatgaaagtcagctttttagagtagctcgagttgtctaccttagatttaattatcaaacgaaccaattttcctcat
gi|2 : atttttttaacaacgtacataaaattattgaacaaaattttaatggcttatttttcagttcaaaatacgaagaaaacgctgaccaaatccgagtttgacagaataacgcggaccaagttaatacaattcatattgtaatttttttttattcaattgctttgtatgtaaataacttatatatgatttatatacatggaaatagcagatgtttattttagtaatttattgtaaagctcaaaacataaaatattaaCTGACATCAGCTATGGGC----TGATCAAAT-T-A-----TGC-GA-GGA------AA-A-C-ACTGcagtgttttcctcgcataatttgatcagcccatagctgatgtcagcatgaaagtcagctttttagagtagctcgagttgtctaccttagatttaattatcaaacgaaccaattttcctcat
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gi|23 : AA----GTTAT-ATTTC-ATGT--AATATA------AGAT----------TA-ACATACAAAAAAGTAT-TAATCAGAATTTT-GT
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gi|4 : --TA-T--AAT------CG-TATGT----TTG-TTTT------AATAGCTTAA------------AGTTTAGTTCAATATATGAAGAAAACGCTGACCAAATTCGAG-TT-AAG-CAGAAAAACGCTGACCAAATT---------AA---------TA--ACAAACTTA--------TTGTAAACA------TGTTAT--ATTTAAAA----GCTAT-ATTTTTATGT--AAAA-A------AGATG-TTTT-TAACA-ACATGCATAAAAATTT-CAATCAGAATTTTTGTTTTAACAGCTTATTTTTCAGTTTAAA--AT----A-----------CGAAGAA-A-AC-----G--CTGACCAAATCCGAGTTAAGC-AGGAAAACGCTGACCATGTT-ATTAAAATTCTTATTGTAA-ACA-TTTTTATTT--AATTATTTTGTATGTA------AATAACTTATACTTGA--TAT-TACATGAA
gi|4 : AATAT-A-----TG--AA-GA-------AA-A-C-GCTGACCAAATTCGAGTTAAGCAGAAAAA----CGCTG----------------------AC-------CAAATTAA--TA---A-CAAACTTATTGTAA---ACA--TGTTATATT-TA------AAAGCTATATT-T-T-TATG-------------------TAAAA-AAGATG--T----TTT-TAACAACATGCATAAAAA-TT--T--C--AAT------CAGAATTT----TTG-TTTT------AACAGCTTAT------------TTTTCAGTTTAAAATACGAAGAAAACGCTGACCAAATCCGAG-TTAA-G-CAGGAAAACGCTGACCATGTT---------AT---------TA--AAATTCTTA--------TTGTAAACA------T-TTTT--ATTTAA-------TTAT--TTTGTATGT---AAATA------ACTTA-TACT-TGATA---TTACAT--GAACAT-TGCT--GATGTTT-ATTTTAATAATTTATTGTTAAGCTCAAA--ATATAAA-----A---TATAAATAGTT-AT-----GGACTGACCAAA------TTATACGAGGAAAACGCTGGCCAcattgctgatgtttattttaataatttattgttaagctcaaaatataaaatataaatagttatggactgaccaaattatacgaggaaaacgctggcca
gi|5 : tataatcgtatgtttgttttaatagcttaaagtttagttcTGGCTGGCGTCAGCTATGGGC----TGACCAAAT-T-A-----TGT-CA-GG-------AA-AAT-GCTGACCAG--TC----------GGGAAA----CGCTG----------------------AA-------AAAGTCAA--TA---C-TATTATTATTGTAA---ACAGTTTTTTTTTT-TATT--T-AAAGTTATG-T-T-T-TATG-------------------TTAAATAATTCG--T---ATTT-GAATAACATCCATAAAAA-AT---A-T--ATG------CA-TATGT----TTG-TTTT------ATTGGCTTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACCAAAATCGAG-TT-ATG-CAGGAAAACGCTGACTAAGTT---------AA---------TA--AAATATTTA--------TTGTAAACA------TGTTGT--ATTTACAA----GCTAT-TCATTTATAT--AAAATA------ACATGTTTTT-TAACA-ACGCACATAAAACCAT-TAATCAAAATT
gi|6 : ggccactctaaaacgctgactttcaAT-T-A-----TGC-AA-GG-------AA-AAC-GCTGACAAG--CC----------GGTAAA----CGCTGACCAAGTCTATGTAATTCCATGAT-------CAAGTCAA--TG---C-TATTCTTGCTGTAA---ACA--TTTTTTT----ATT--T-AAAGTTGTG-T-T-T-TATG-------------------TTAAATAACATC--T---ATTT-GAATAGCATACATAGACA-TT--TA-C--AAT------CA-TAT--------------------ACTA-------------------TTTCAGTTCAAAATATGAAGAAAACGCTGACTAACTCCGAG-TT-TTG-CAGAAAAACGTTGACCAGATT---------AA---------CA--ACAAACTTA--------TTGTAAACA------TGTTTT--ATTTAAAA----GCTAT-A-TTTTATGT--AAAATA------AGA---TTTT-TAACA-ACATAAATAAAAATAT-TAATCAGGATTTT-GTat
gi|7 : cacctaacttaaccggtaatttctgggatcactcttCTGATATCAGATATGGGC----TGACCAAAT-T-A-----TGC-GA-GG-------AA-A-C-GCTGATCAA---------------------------------------------------AC-------CAAGTAAA--AA---AATATACTTATTGTAA---ACA-----TTTGTT-GATT--A-AAAGTTATGTT-T-T-TATG-------------------TGAAATAAGATGTTT---TTTT-TAATAACATACATAAATA-TT--GA-T--AAT------CA-GATGT----TTA-TTTT------TATAGTTTAT------------TTTTCAGTTAAAAATATGAAGAAAACGCTAAC
gi|8 : ggccactctaaatcggtgactttcaggCTAATATCAGCTATACGC----TGACCAAAT-T-A-----TTC-GA-GA-------AA-AAC-GCTGACAAG--TC----------GGAAAA----TGCTG----------------------AC-------CAACACAA--TA---C-TATACGTATTGTAA----CA--ATTTTTTTT--ATC--T-AAAGTTATG-T-T-T-TATG-------------------TAAAATAAGATG--T---ATTT-GAATAACATACATAGGAA-TT--GA-T--AAT------CA-TATGT----TTG-TTTT------AACAGCTTAT------------TTT---ATTC-AACTATGAAGAAAACGCTGACCAAATCCGAA-TT-A-GAAAGGAAAATGCTGACCAAGTT---------AA---------TATGAAAAATTTA--------TT-T-AACA------TGTTTT--ATTTAAAA----ACTAT-ATTTTTATGT--AAAATA------AGATG-TTTT-TAACA-ACTAACATGAAgataaattatgaattcagaacaaaattagttgagtgatatttaaaaaattacctaaactaaataaactaaatgttataagtttaactttgatatcaaaattaagtcactgatataataatatattc
gi|9 : ggccactctatatcgctgactttcataCTTATTGTAA---ACA--TGGTTTATC-TA------AAAGCTATA-TAT-T-TATG-------------------TAAAACACTATT--T---TTTTTAAACAAAATACCTAGCA---T--TA-TT-AAT------AA-AAAAG----TTG-TTTTTATACTAGTAG-TTAT------------TTTTCAGTTCAAAATATGAAGAAA-CGCTGACCAAATCCGAG-TT-TTG-CAGGAAAACGCTGACCA---------------------------------CTTA--------TTGTAAACA------TATTGT--ATCTCCAA----ATTGT-ATTTTTATGT--AAAATC------AGAT--TTTT-TAACA-ACAAAAATAAAAATATCTAATCAGAATTTT-GTTTTAACAGCTTATTTTTCAGTTCAAA--GT----A-----AATGTATGAAAAg
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