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Reference ( gi|8 ) : TATAGTCGA-TTCAAA-GT---TA-G--TG----GATA-CT--TA---GG-CAAG--T-T---CAT---C---AT---TGCAC------G--G--T----A---------TA----------A----AG--T-----G-----GGT-AT----T-TAC--------CG--T-TT------CCA-ATG-G-A----A--------------AT-A-------AT----TCA------TAA-TTGA-----ATA-----C--C---T----A--T--AC-C--TGT----CTTATC-TGTA-------T----C----------A-----GC----CAATG--C-----A-----T-------G-------T----AG-C-------AT-G--TTT-A--CAAC------CG-TT-CTC----A---A-----A-A--T--AA--A--C--A-A---A-A-A----C-G-G---ACT---GT---T-------TA----TACT----T-----------T---T-A--T--A---C-----T-----T-----AC-C-TG-TAT--C-G-AC---------CA--------A--T---A-A-A---T-----C--T-A-T--T---A---T-T-TT---TACAAC------CG-TTCTCAA-----A-A--T--AA--A---------C--A-A---A-AA----C-G-GACT------GT---A-----T--A----T---AC------T--T-T----TA-T-AT---T-----T-----ACCTG-TA-----T----C----------A-----A-----C-C-AATAC-----A-----T--G---------T-----A--G-------T-------A-TGTTT--ACAAC------TGTTCTCA---A-AATAAGC--A-AAA-A----C-GGACTGT
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gi|3 : ttaataaaatgtatcatagagatggatgagtttgtttcattatttagtaaagcagtttgtgaccttgtaaactgacataaatatatacttataaatatggccatgttgttgaaagcaaaatcTACAATCAG-TTCAAA-TT---TC-T--CT----GATA-AT--TG---GG-CAAG--T-T---CAT---C---AT---TGAAC------G--G--A----A---------TAGATC------A----AA--C-----G-----GTT-AA----C-CAC--------CA--T-TT------CAA-ATG-A-A----A--------------AG-A-------GT----TCA------AAA-TTGA-----ATA-----C--C---T----A--T--AC-C--TGT----CTAACC-TGTA-------T----C----------G-----ATGATACAAAG--TCG---A-----T-------G-------T-------T-------AT-A--TTT-G--CAAC------CG-TT-TAC--------A-----A-A--T--TA--A--C--A-A---A-A-C----T-G-G---ACA---GTGGGTGG-----TA----TATTAA--T-----------T---TAA--T--A---T-----A-----T-----AC-G-TGATAT----A-AG---------CATGTT----A--T---A-ATT---T-----C--A-A-T--T---A---T-GATT---TAC-AC------CA-TTCGC---------A--C--AT--A---------C--A--------------------T------GT---T-----T--A----T---AT------T--T-T----TA---AT---TTATGAT-----ATCTGATA-----T----T----------A-----A-----G-T-AA-AC-----A-----T--A---------T-----taggtattctttcatttagtcattatgtaaaaacactgtattggtaa
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gi|5 : gttatacacagatgtgcttttaagtcaggacaaatgacattaaaattaaacaaattacgtgcttgtaggaacatatttacataacagtttaaaataacataacaataacACAGTCGA-TTAAAA-AT---TC-G--TT----GGTAACTATTG---GG-CAAG--T-T---CGT---C---AT---TTAAC------A--G--T----A---------TAGGTA------A----AG--A-----G-----GAT-AG----G-TAC--------CG--G-T-------CGA-GTG-C-A----A--------------TC-A-------AT----TCA------TAA-TTGA-----GTA-----T--G---A----A--T--AC-C--TGT----CTTACC-TGTA-------T----C----------A-----A-----TGATA--C-----AAAGACG-------G-------T----AA-T-------AT-G--T--------AT------CG-TT-CT-----A---A-----A-A-----AA--A--A--A-A---A-A-A----C-G-A---ACTGAAGT---G-------TG----TACT----TAATGAGCTTGAT---T-A--C--A---T-----T-----T------T-G-TG-TAT--C-A-GC---------TT--------A--TC--A-G-A------------T-A-T--T---A-----T-CT---TACA--------------TAAA-----G-A--T--AA--AGGTTTATTGC--A-C---A-AA------G-GGCT------GTGAGA-----T--A--------ACGGCGCGT--T-C----TC-T-AT---T-----T--------TT-TA-----T----C----------------A-----C-C-A--AC-----G-----G--G---------C-----A--G-------T-------A--GTTT---TAA-------TGTT-TCA---GCGATAAAC--A-aaacacgtttcttaacttaaacagctgtaaacaatt
gi|13 : ccaaTAATCAA-TTCAAA-GT---T-----------GATA-AT--AA---GG-CAAGAGTAT---CATGT-C---AT---TGAAT------A--G-------G---------TC----------A----AG--C-----G-----GGT-TG----T-TAC--------AG--T-TT------GTT-GTG-C-A----A--------------CC-A-------AT-----CA------TAA-TTGA-----AT-------------------------C-A--TGT----TTTACC-TGTA-------T----T----------G-----GT----CAATG--T-----------------------------------T-------AT-G--TTT-A--CAACAGTTTCTG-TT-CTC----A---A-----G----T--AA--A--C--A-A---A-A-A----C-A-G---ACT---GT---
gi|1 : attttttatttaactaattgaagtataattttatgtatagatcaatgaaactgaatgatAGTTGA-TTCAAT-GT---TA-G--TT----AATA-AT--TG---GG-CAAG--T-T---CAT---C---AT---TGCAC------T--G--T----ACAGG-----TA----------A----AG--T-----G-----GGT-AA----T-CAC--------CG--T-TT------CAA-ATG-C-A----A--------------AC-A-------AT----TAA------CAA-TTGA-----GTA-----C--C---T----A--TACAC-C--TGT----CTTACC-TGTA-------T----T----------G-----GT----GAA----------A-----T-------A-------A----AGCC-------AA-G------A--AAAA------GGACT-CTC--------A-----A-A--T--AA--A--C--A-A---A-A-T----T-T-G---ACT---GT---agatggttcgttagcatggtgtgaggtattaacctgtttgtaagatggtttggatttctcatggtgtttatatcattatttat
gi|22 : attattaatgtacaacaaaattgaaacttacagagatttgcagtttcAATCGA-TTCAAA-GT---TA-C--TC----GATA-AT--TG---GC-CAAG--T-T---CAC---C---AT---TGCAA------G--G--TGTAAG---------TA----------A----AG--T-----G-----GGA-AA----T-TACTACATTTGTA--T-TT------CTT-ATG-G-A----A--------------CC-A-------AT----TCT------TAA-TTGA-----GTA-----C--CTTAT----A--T--AC-C--TGT----CTTACA-TGTA-------T----CGAATAAATAAA-----AC----CGATA--A-----A-----T--------------------------------T-G--TTT-A--CAAC------CG-TT-CTA----A---A-----G-G--T---A--A--C--A-C---A-A-A----T-G-G---ATT---Gaccatttttgttcagttgttcacgcaaaaaataataataaataattcaaacaattcataattgattacctatatacctgtcttcccattattggagatacaaagtttattaaatatttacaacggttctcaaatccacaaaaacaaactgtaccattgttgttcagttgtttacactaaaaacaacaa
gi|37 : tgttttttaggcatatcaaaaaaAATCAA-TTCAAA-GC---TG-G--TC----GATA-TT--TG---TA-TATG--G-T---CAC---T---AT---TGCAC------------C----T---------TA----------A----AG--T-----G-----GGT-AA----T-TAT--------TG--T-TT------TTT-ATG-C-A----A--------------CT-T-------GT----TTA------TAA-TTGA-----GTA-----C--A---T----A--T--AC-A--TGT----CCTACC-TGTA-------T----T----------G-----GT----CAA--------------------------------T----AA-T-------AT-G--TCT-A--CAAC------AA-TT-CTT--------A-----A-A--T--AA--A--C--A-A---A-A-A----C-A-G---ACT---GT---cagttgttaaaaaaaaagagacacaagcaaaacttatatttctgtaaatatatataatgt
gi|57 : AGTCAA-TTAAAA-GT---TC-G--TT----CATA-GA--TA---TG-CAAG--T-T---CAG---C---AT---TTAAC------G--G--T----AAAGG-----CA----------A----AG--C-----G-----GG
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gi|28 : ataagtgacacttaaaatgacagagtgaatacactcagtactactTTGA-TTCCAA-GT---AA-G--T--------------TA---GT-AAAA--T---------------AT---TACAC------G--G--T----AAGGG-----TT----------A----AG--C-----T-----GGT-AA----T-AAC--------TG--T-TT------GTT-ATG-C-A----A--------------CC-A-------AT----TCA------TAA-TTGA-----GC------C--C---T----ACCT--AC-C--TGT----CTTACT-TATA-------agtaaatgacgcattaatgattgataaattaatatgtgtttttttttttctttttctccattaagtcactgacatggttata
gi|55 : acagctattgtacttgttatatgaaaacataagttatattacacatttctctgctgtaagtatgccgatacttttaTCTA-TTCGGA-TT---TC-G--TT----GATA-AT--TG---GG-AGAG--T-T---CAT---C---AT---TGAAC------A--G--T----AAGG------TA----------C----AG--T-----T-----GGA-AT----aagcataaatgaaaaaataaaacactgcttaaatgcatgcgcaag
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gi|2 : acaattctaatcatttgattcatgtacgtttaA-TTCAAA-GA---TT-T--TT----AATA-AT--TT---GG-CAAG--T-T---TGT---C---AT---TGAAC------G--GAGT----AGA-------TA----------A----AA--C-----G-----GGT-AA----C-CAC--------CG--T-TT------CAA-ACG-A-ACGCAA--------------AC-A-------AT----TCA------TTA-TTGA-----GTA-----C--C---T----A--T--AC-C--TGT----CTCACC-TCTA-------T----C----------C-----ATGTTACAAAG--T-----C-----G-------A-------T----AT-T-------AT-A--TTT-A--CAAC------CG-TT-CTC--------A-----A-A--T--AA--A--C--A-A---A-A-C----T-G-G---ACT---GTAG-TTGG----TA----TATTAG--T-----------T---TAA--T--A---------------T-----AC-A-CG-T------G-GC-------------------A--T---A-A-A---T-----A--T-G-T--T---A---T-T-GT---TTCAAacatgttaaaattaaagcatatttctatattacggcatatagataatttagatttttttttaactttgtacatatgttgttttacataaattttacataaa
gi|38 : gataagttaacagtttaaatggaaaggatacgttaacaagtcaatattatgaccgacagcaaA-TTTAAA--T---TA-GATTG----G-TG-AT--TAATGGG-TAAG--T-T---CAT---C---A------------------------------------------------A----AG--A-----G-----GGC-AA----T-TAC--------TG--T-TT------CGA-ATG-A-A----A--------------AT-A-------AT----TCT------CAA-TTGA-----GTA-----C--C---T----A--T--AT-A--TGC----CTTACC-TGTA-------T----T----------G-----GT----CGA----------A--------------------------AA-C-------AT-G--TTT-A--TAAC------CG-TT-CT-----G---A-----A-A--T--TA--G--C--A-A---A-A-T----CGG-G---ACT---GT---gtatgatttattccattagcacttacatatttatattttaaataaataatatctggtatgaagtaaacatatttatcaggtattcccaaatatatttcttc
gi|9 : aacgcc-TTCAAA-GT---TA-G--TT----GATA-TT--TG---GG-CAAG--T-T---CAT---C---A---------------G--G--T----A---------------------A----AG--C-----G-----AGT-AA----T-TAC--------AG--T-TT------CTT-ATG------------------------T----------T----TC-----------CTG---------------------T----A--T--AC-C--TGT----CTTACC-TGTG-------TAGAAT----------A-----AA----AAATA--------A-----T-------G-------C----CG-A-------AT-G--TTT-A--CAAC------CG-TT-CCC--------A-----A-G--T--AA--A--C--A-A---A-A-A----T-C-G---ACT---GTACCT-------TA-----ATTTG--T-----------T---T-A--C--A---T-----T-----T-----GC-T-TT-TAT--A-G-A-----------A--------A--C-------A---T-----C--T-T-T--T---A---T-T-TG---TAacta
gi|21 : tacatgtagtctaagatgattatcatttataaagtgtataaaaaaactttataaatggtatggttacattactcacttgaatttattttttgtttactatcacaaaaaaacatgctttaatatgtatgctatcacgtacaattat-TTTAAA-GT------G--TGTTATGAT---T--TG---AG-CAAG--T-T---CAT---C---AC---CGAAC------G--G--TGA--A---------TGTT--------A----AG--C-----G-----GGT-AA----T-TA---------------TA------TAA-ATT-C-A----A--------------AT-ATGTTCACGT----CCA------TGA-TTGG-----GTA-----C--C---T----A--T--AC-C--TGT----TTTACC-TGTA-------T----CG---------A-----G---------G----------------------A-------C----AG-T-------AT----------------------G-TT-CTC--------A-----A-A--T--A---------A-A---A-A-A----C-G-G---ACT---GT---
gi|62 : tataactgcaattag-TTCAAA-TT---TC-T--CT----GATA-AT--TG---GG-CATG--T-T---TAT---C---AT---TGAAT------GGAG--TAG--A---------TA----------A----AA--C-----G-----GAT-AC----T-CAaccattcaaccgtttcggttgcattcatgtaaatataaacacattgatgacgatgtagtatttttacagatataatacaaaacatcattgatgcaatttatgacga
gi|36 : TCAAA-GT---AC-G--TT----GCTA-AT--TG---GG-CAGG--T-A---TTT---C---AT---TGAAC------G--G--T----A---------TTGGTT------A----AG--C-----T-----GGT-AA----T-TAC--------CG--T-TT------CGA-ATG-C-A----A--------------AC-A-------AT----TCA------TGA-TGGA-----GTA------------T----A--C--A---------------A------------------------------A-----GT----CGA--------------------------------T----AA-T-------AT-G--TTT----TAAC------GG-TT-CTC--------A-----A-A--T--AA--A--C--A-A---A-A-C----T-G-A---ACT---GA---CAG-----TA-----ACT----T-----------T---T-A--
gi|20 : -GT---TA-G--TC----AAAA-TT--T----GG-CAAG--T-C---CAT---A---AT---TGTAT------G--G--TCTTGG---------TT----------A----AG--T-----G-----GGT-AA----T-TAC--------TG--T-TT------CCA-AAG-C-A----A--------------AT-A-------AT----ACA------TAA-TTGA-----GAA-----C--C---T----A--C--AC-C--TGT----CTAACC-TGTA-------T----------------------------ATTG--------A-----T---------------T----A--T-------AT-G--TTT-A--CAAC------CA-TT-CTC--------A-----A-A--T--AA--A--C--A-A---A-A-A----C-A-G---ACT---GT---atttttcgcgcaatataatatacataat
gi|40 : attgcatacctttaaattctttatttgtgatttataaggtaaaaataaatgataggtatttA-G--TG----GATA-AT--TG---GG-AAAA--T-T---CAT---C---AT---TGAAT------G--A--C----A---------TA----------acctggagtttttttatttcatccttaagccaatctttctctttctccccaatttttctataaa
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gi|23 : t----GATA-AT--TG---GA-CAAA--A-A---CAT---C---AT---TGCAC------A--G--T----A---------TAGGTA------A----AG--C-----G-----GAT-AA----T-TAC--------CG--T-TC------CTA-ATG-C-A----A--------------AC-A-------AT----TCA------TAA-TTGA-----ATA-------------------------------------TTTCC-TGTA-------T----C----------G-----CC----CAAT---------A-----T-------G-------T---------------------TTT-T--CAAC------TG-TT-CTA----A---A-----A-G--C--AC--A--C--A-C---A-A-A----C-A-A---ACagctgtagtg
gi|59 : aagagtaaatattATA-AC--TG---GG-CAAG--T-T---CAT---C---AT---TGCAC------G--G--T----ATGAG-----TA----------A----AG--C-----G-----GGaacaacaaacaaacggagtgcagaagtattgatattgtttgtttatcccaactctagtctttgccatctgtgacacttgctactgtaaacgacaatatgaaagttgtatac
gi|48 : aatccagcaactccacgtactctttATA-AT--TG---GG-CAAG--T-T---CAT---C---AT---T--AC------A--G--T----G---------TA----------G----AGGTT-----A-----AGC-ATATAAT-TAC--------CG--T-TT------TGA-ATA-C-A----A--------------G--A-------AT----TCA------AAA-
gi|43 : aaagatacagtaaatgaatagaaccattaT--TA---GG-AAA---------CAT---CGATAT---TGCACCAC---G--G--T----A---------TATATA------A----AG--C-----G-----GGT-AA----T-AAC--------CG--T-TT------AAA-ATG-C-A----A--------------AC-A-------AT----TCA------AAT-TTTA-----GTA-----C--A---T----A--T--AC-C--TGC----CTTACC-TGTA-------T----C----------G-----G-----TAATA--C-----A-----T-------agaaatattt
gi|47 : taaaatgtcttccatcagT--TG---GG-CAAG--T-T---CGT---C---AT---TGAAT------G--T--TTG--G---------TA----------A----AG--T-----G-----GGT-TA----T-TAC--------TG----TT------CTA-ATG-acactgacccaa
gi|15 : attcttatcctttttctatcattgaactataaatttcgtttaaaa--TG---GG-CAAG--T-T---CAT---C---AT---TGCCC------A--G--T----A---------T-----------A----AG--TATA--G-----AGG-A-------TAC--------TG--T-TT------CTT-ATG-C-A----A--------------CC-A-------AT----TCC------TAA-TTGA-----GCA-----T--C---T----ATCT--AC-C--TGT----CTTACC-TGTA-------T----------------------C----CA---------------------------------T----AA-A-------AT-G--TTT-A--CAAC------CA-TT-CTC--------A-----A-G--T--AA--A--C--G-A---A-A-A----C-G-A---ACT---GT---tccacaccgtgatttagt
gi|27 : --T-T---CTT---C---AT---TGCAC------A--G--T----A---------TA----------GGTATAG--C-----G-----AAT-AA----T-TAC--------TG--T-TA------CTA-ATG-C-A----T--------------TG-C-------AT----TCA------TAC-ATGT-----ATA-----A--A---T----A--T--AC-C--TGT----TTTACC-TGAA-------T----T----------A-----AT----AAA----------A-----T-------G-------A----AG-CCTATAA-AT-G--TTT-A--TAAC------CA--T-CTC--------A-----A-G--T--AA--A--C--A-A---A-A-A----C-A-G---Aagaacgtatcattaaggattgtaactctacatgattataacatggataactgctgatttaaaaataatatttcaatgcagaataaaaacctgcccacggtttaaatgaacaattagatttcatatgtgaatagttaatcatagtgctaaatactttgttttca
gi|35 : tgaagtgtataaggaaaacattattaaatattgcggagttttaattcaaagtttAT---C---AA---TGCAC------G--G--T----AAAGCGTA--TA----------A----TG--TCAATCA-----GGT-AA----T-TGT--------CG--T-TT------CGA-ATG-C-A----A--------------AC-A-------CT----TCG------TA------------TG-----T--C---T----G--C--GC-C--TGT----CTAACC-TGTA-------T----C----------G-----GT----CAAtcataagtgtatacgattggaaaacagatcataa
gi|45 : taattgatattgtacacactgcacatgaatttaaagatataaatagattgacaatcccaatctaactgcaacggtcggattacactggataT---C---AT---TGCAC------A--G--T----ATAGG-----TA----------A----AG--C-----G-----GGC-AA----T-TAC--------TG--T-GT------C----------------------------------------------TCA------TAA-TAGT-----ATA-----C--CTG-T----A--T--GC-C--TGTCGTACTTACC-TGTA-------C----C----------G------------AATA--A-----A-----TAAAGTCGA-------T----AA-A-------AT-G--TTT-A--CAAT------CA-TT-CTC----A---A-----
gi|44 : gatT---C---AT---TGCAC------G--G--A----A---------CATGTGTTGGTCA----AG--C-----G-----GGT-AA----G-CACAG------CG--TGCTAAGCAACCA-ATT-C-AT---A--------------AT-A-------AT----T-A------TTA-TTGA-----ATA-----T--C---T-----------------GT----CTTACT-TGTA-------T----C----------G-----GT----CAATG--T-----------------------------------T-------AT-G--TT------AAC------TT-TT-CTC----A---A-----G-A-----AA--A--C--A-A---A-A-gtaa
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gi|30 : ------G--G--T----A---------TAGGTC------A----AG--C-----A-----GGT-AA----T-TAC--------CG--T-TT------CGA-GTG-A-A----A--------------GC-A-------AT----TCT------TAA-TTGA-----ATA-----C--C---A----G--T--TC-A--TGT----CTTACT-TGTA-------T----C----------G-----GT----GATCG--CGGGCGA-----T-------A-------C----TA-CTT-----AT-G--TTT-A--CAAC------AG-CT-CTC--------A-----A-C--T--AA--A--CAAA-A---A-A-A----C-G-G---ATC---GT---aaatttagtgttaatgtataagtgaatttcactgaccaaatcttgtttaaggcataaatttaaatttttatgtgtaatatttagtc
gi|11 : aatgtcccattcgctattgacatattcaaaagtgtgactttttataattgattcaaa---------TA----------A----AG--C-----T-----GGT-AA----T-TAT--------CA--T-TT------TGA-ATG-C-A----A--------------AC-A-------AT----TCA------TAA-CTGA-----ATA-----TAGC---TATACA--T--AC-C--TGT----CTTACC-TGTA-------A----C----------G-----G-----TGATA--G-----A-----T-------AAT-----T----GA-T-------AT-G--TTT-A--CAAC------CG-TT-CTC--------A-----A-A--T--AA--A--CA-A-A---A-A-A----C-A-G---ATT---Gagcgttattgtgtgtaagg
gi|46 : tacatctaatcattatgttgagtactgttcataataaactgtgttccatttattacaatttttaacagttaattgaaaggtcattgttaattgaacaaaattgg-ATG-T-A----A--------------CT-A-------AT----TCA------TAC-CTGT-----TTA-----C--C---T----AG-T--AC-C--TGT----TTCTTC-TGAAAAAAAAAT----G----------A-----ACT---CGATA--G-----A-----T--------------------AA-A-------AC-G--TTT-G--CAAC------CG-TT-CTC--------A-----A-G--T--AA--A--C--A-A---A-A-ATAG-C-G-G---ACT---GTGTAT-------TA----CACA----T-----------T---T-G--T--gaaatgtgcagctcaaatgaatagaaactagtcaaattatgcttttttttctaaaaatgctaaattttaaatgtcagatttactc
gi|60 : t-ATG-C-A----A--------------CC-A-------AT----TCA------TAA-TTCA-----GTA-----C--C---T----A--C--GC-T--TAT----CTCACC-TGTA-------T----
gi|40 : gttagttgataactgcttattA------TGA-TTGA-----GTA-----C--C---TTT--A--T--AC-C--TAC----CTTACT-TGTA-------T----CG---------A-----AT----AAATGAAC-----A-----C-------GA------T----AA-C-------GT-G--TTT-A--TAAC------CG-TT-ATT--------A-----A-G--T---A--A--C--A-A---A-A-A----
gi|18 : agtggataattgggaaaattcatcattgaatgacatatA-TTTA-----GTA-----C--A---T----G--T--ACACA-TGT----CTTACC-TGTA------------------------------C----CGA----C-----A-------------G-------T----AA-T-------AT-G--TTT-A--CAAC------AG-TT-CT-----G---A-----A-A--T--AA--A--T--A-A---A-A-AAAATC-A-G---ACT---AT---acaacaacaacaataaaatgatgacatcatattcaatgtt
gi|54 : ctacaaccgatttaaatgtcattgattataggacgagttcatctttgaacggtaggagtaaagcggataataaccattccgaataaaaaaagttcgtaatattttaaaacaggttttgaaacatgatgttaccatagcaccattgtatcacagac---T----A--T--AC-C--TGT----CTTTCC-TGAA-------T----C----------A-----GT----CA-TA--C-----AAAGTCT-------A-------T----AA-A-------AT-G--TTT-A--CAAC------GG-TT-CTC--------A-----A-A--T--AA--A--C--A-A---A-G-A----T-G-G---ACT---Gaagtctgttatcacgatctgaatgctgtcaataatagttgatgttt
gi|58 : ta--T--AC-C--TGT----CTAACC-TG-A-------T----T----------G-----GA----TAATA--G-----AGATT-T-------GC------T----GG-T-------TG-G--GTT-A--CAAC------GG-TT-CTC--------A-----A-G--T--AA--A--C--A-A---A-A-
gi|53 : C-C--TGT----CTTACC-TGTA-------T----C----------A-----GA----CAATG----------------------------------------------------TTT-----------------TT-CT-----A---A-----A-G--T--AA--A--C--G-A---A-A-A----T-G-G---ACT---GT---T-------
gi|1 : -----T-------G-------T----AC-C-------AT-T--TTT-GTTCAGT------TG-TT-CACGCAAA---A-----A-A--T--AATAA--T--A-A---ATA-ATT--C-A-A---ACA---AT---T-------CA----TAAT----TGA---------T---T-ACCT--A---T-----A-----T-----AC-C-TG-TCTTCC-C-AT---------TATTGGAGATA--C---A-A-AG--T-----T--T-A-T--T---AAA-T-A-TT---TACAAC------GG-TTCTC-A-----A-A--T--CC--A---------C--A-A---A-AA----C-A-AACT------GT---A-----cgtgacaacctctgattttacttattttacataaac
gi|14 : attattaatgtacaacaaaattgaaacttacagagatttgcagtttcagttgattcaatgttagttaataattgggcaagttcatcattgcactgtacaggtaaagtgggtaatcaccgtttcaaatgcaaacaattaacaattgagtacctatacacctgtcttacctgtattggtgaaataaagccaagaaaaaggactctcaaataaacaaaatttgac-------G-------T----AA-C-------ATTG--GTA-A--TAAC------TG-TTTCTT----GTGCA-----A-A--C--AA--T--C--C-A---T-A-A----T-T-G---AGT---CC---C-------TA----TACA----C-----------C---T-G--T------C-----T-----T-----AC-T-TG-TTT--A-G-AA---------TA--------AA-T---G-G-A---T-----C--C-A-A--T---AGAAT-G-TT---TACAAC------TG-TTCTCAA-----G----T--AA--A---------T--A-A---A-AA----T-G-GACT------GTTA-G-----T--ATTGCT---AC------T--T-T----TGTT-AT---T-----ccattgttgttcagttgtttacactaaaaacaacaa
gi|50 : acagctgctttcacagcacttgttgtacctaatgacaataaattgtatgcaagtaacttgaaataaatattataatcgattcaaagttagttggtaattggtcatcattgttctgtaatgtaactgtaag-------T----AA-C-------AT-G--TTA-A--CAAC------GG-TT-CTC--------A-----A-A--T--AA--A--C--A-A---A-AGG----C-G-G---GCG---GT---gttttttcatgattttgttttataaa
gi|66 : ctgtcttatatacaccgaatatacaaagtcga-------AT-A--CTT-A--CAAC------CG-TT-CTC--------A-----A-G--T---A--A--T--A-A---A-A-A----C-G-G---ACT---acaatcatttactattcctcttgcagc
gi|68 : cgacaca-G--TTT-A--CAAC------CA-TT-CTC--------A-----A-G--T--AA--A--C--T-A---A-A-A----C-A-G---ACA---GT---T-------TA----ttag
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gi|37 : gttgtgtttacattaaatggtgtttagtgattataaggatgtagtgtatgtatgattgaattcaacgttatatgataaatggccaagttccaaat-GAGT------AC---A-----T--A----T---AC-----------------A-T-GT---CC----T-----ACCTG-TA-----T----T----------G-----G-----T-C-AATA----------------------------------A-------T-------A-TGTCT--ACAAC------AATTCTTA---A-A-TAAAC--A-AAA-A----C-AGACTGTta
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gi|9 : acagctgctttcacagcacttgttgtacctaatgacaataaattgtatgcaagtaacttgaaataaatattataatcgattcaaagttagttggtaattggtcatcattgttctgtaatgtaactgtaaggtaacattggtaataactgtttcttgtgcaaacaatccataattgagtcccT---G-----T--A----T---AC------C--T-G----T-----C---T-----T-----ACCTG-TG-----TAGAAT----------A-----A-----A-A-AATA------A-----T--G---------C-----C--G-------A-------A-TGTTT--ACAAC------CGTTCCC----A-AGTAAAC--A-AAA-A----T-CGACTGTtagtattgctacttttgttattgttttttcatgattttgttttataaa
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gi|17 : ataagtgacacttaaaatgacagagtgaatacactcagtacTACGTTTAATTCAAA-GTTTG-TTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGAA----------A--T----G---------T------A----------A----GATG--------------GGTAAT--T-AC--------CATC-TC----AA-ATG-CAA-AC-A-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--T---A----A--T--AC-C--TGT----CTTAC-C-TGTA--------------T----C----A------A---T----------A----T-------------------T---ATG--T----TTACAAC------CATTCTC-AAA--TAAAC--A-AAA-G----C-GG---ACTGT---agtaaatgacgcattaatgattgataaattaatatgtgtttttttttttctttttctccattaagtcactgacatggttata
gi|18 : acaattctaatcatttgattcatgTACAACCGATTTAAATGTCA--TTGATTA---TA---GGA--CGAG--T---TCAT---C---TTTGAAC------G--G--T----AGGAG-----T------A----------A----AGCG--------------GATAAT--A-AC--------CATT-CC----GA-ATA-AAA-AA-A-------GTTC--------GTAA-T--acatgttaaaattaaagcatatttctatattacggcatatagataatttagatttttttttaactttgtacatatgttgttttacataaattttacataaa
gi|18 : cA-T--TTA-----GT------------AC--A---T----G--T--ACACA-TGT----CTTAC-C-TGTA-------CCG-A-------C----A----------------------------G-----T-----A--A--T---ATG--T----TTACAAC------AGTTCT-GAAA--TAAAT--A-AAA-AAAATC-AG---ACTA------------TA-A----GTC--TGT------TA---TCACGATC-TG-AATGCT--GTCA----ATA-A-------TAGT--TGATG-TTTattttaaaacaggttttgaaacatgatgttaccatagcaccattgtatcacagacatttagtacatgtacacatgtcttacctgtaccgacagtaatatgtttacaacagttctgaaataaataaaaaaaatcagactataagtctgttatcacgatctgaatgctgtcaataatagttgatgttt
gi|19 : ctacaaccgatttaaatgtcattgattataggacgagttcatctttgaacggtaggagtaaagcggataataaccattccgaataaaaaaagttcgtaatattttaaaacaggttttgaaacatgatgttaccatagcaccattgtatcacagacTACAGTCAATTCAAA-GT-------------------GGC--CATG--T---GCAT---T---TTTGAAC------G--G--T----AATTGAATGGT------ACAGGT-----A----AGCG--------------GATAAT--T-TC--------CGTT-TC----GA-ATG-AAA-AC-T-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----G-----------------------------T--GT-C--TGT----CTTACACATGTA-------CCG-A--T----C----AT-----A---TATAGTCG---A----T-G--------------A--T---ATG--T----ATACAAC------GGTTCT-AAAA--C----------A-A----C-GG---ACT
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gi|37 : tcaaagtacgttgctaattgggcaggtatttcattgaacggtattggttaagctggtaattaccgtttcgaatgcaaacaattcatgatggagtatacaaaAATCAATTCAAA-GCTGG-TCGATAT---TT---GTA--TATG--G---TCAC---T---ATTGCAC------------C----T---------T------A----------A----AGTG--------------GGTAAT--T-AT--------TGTT-TT----TT-ATG-CAA-CT-T-------GTTT--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--A---T----A--T--AC-A--TGT----CCTAC-C-TGTA-------TTG-G--T----C----A------A---------------------------T-----A--A--T---ATG--T----CTACAAC------AATTCTT-AAA--TAAAC--A-AAA-A----C-AG---ACTGT---acataat
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gi|47 : tAAA-TTTCG-TTTAAAA---TT---GGG--CAAG--T---TCGT---C---ATTGAAT------G--T--TTG--G---------T------A----------A----AGTG--------------GGTTAT--T-AC--------TG-T-TC----TA-ATG-TCC-AC-A---------CC--------GTGA-T--TTA-----GT------------tacacatttgt
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Reference ( family-347 ) : TACAGTCGATTCAAAGTTNG-TTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGNAC------G--G--T----A---------T------A----------A----AGCG--------------GGTAAT--T-AC--------CGTT-TC----GA-ATG-CAA-AC-A-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--C---T----A--T--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TCG-G--T----CA------A----T------G--A----T-G-----TA--A--TA---TG--T----TT-ACAAC------CGTTCT-CAAG--TAAAC--A-AAA-A----C-GGACTGT---T---TA-TACC-TG---T---ATAC--T-TAC---C-TG-TAT-CG--GNCA----ATA-A-A-TCTA-T--T-A-TG-TTTACAACCGTTCTCAAAATAAACAAA----A-ACGGACT---G--TA-TATACTTTTA--ATTTACCCG-TATCGG----GCAATA-ATGT-A--ATATGTTTACAACNGTTCTCAAAATNCGCAAAAACGGACTGT
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gi|13 : tactgtattatataatttgatttcaggtccaaatataaaaggcaaacgctatataaggttagtagtttaacaattacatgtcttaaattatttgataagtatataaatgttgatacattaataatagcatgtttggAATCAATTCAAAGTT-----GATAA---TA---AGG--CAAGAGTA--TCATGT-C---ATTGAAT------A--G-------G---------T------C----------A----AGCG--------------GGTTGT--T-AC--------AGTT-TG----TT-GTG-CAA-CC-A-------AT-C--------ATAA-T--TGA-----AT--------------------------------C--A--TGT----TTTAC-C-TGTA-------TTG-G--T----CA------A----T------G---------------T------TA---TG--T----TT-ACAACAGTTTCTGTTCT-CAAG--TAAAC--A-AAA-A----C-AGACTGT---a
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gi|15 : acagctgctttcacagcacttgttgtacctaatgacaataaattgtatgcaagtaacttgaaataaatatT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGCCC------A--G--T----A---------T------A----------AGTATAGAG--------------GA------T-AC--------TGTT-TC----TT-ATG-CAA-CC-A-------ATTC--------CTAA-T--TGA-----GC------------AT--C---T----ATCT--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TC----------CA----------------------------------TA--A--AA---TG--T----TT-ACAAC------CATTCT-CAAG--TAAAC--G-AAA-A----C-GAACTGT---agtattgctacttttgttattgttttttcatgattttgttttataaa
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gi|19 : ctacaaccgatttaaatgtcattgattataggacgagttcatctttgaacggtaggagtaaagcggataataaccattccgaataaaaaaagttcgtaatattttaaaacaggttttgaaacatgatgttaccatagcaccattgtatcacagacTACAGTCAATTCAAAGT-------------------GGC--CATG--T---GCAT---T---TTTGAAC------G--G--T----AATTGAATGGT------ACAGGT-----A----AGCG--------------GATAAT--T-TC--------CGTT-TC----GA-ATG-AAA-AC-T-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----G-----------------------------T--GT--C--TGT----CTTACACATGTA-------CCG-A--T----CAT-----A----TATAGTCG--A----T-G---------A--TA---TG--T----AT-ACAAC------GGTTCT--A-----AAAC------A-A----C-GGACT
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gi|2 : aactacagtcaattcaaagtggccatgtgcatttttgaacggtaattgaatggtacaggtaagcggataatttccgtttcgaatgaaaactattcataattgagtgtACAGCAAATTCAAAGATTT-TTAATAA---TT---TGG--CAAG--T---TTGT---C---ATTGAAC------G--GAGT----AGA-------T------A----------A----AACG--------------GGTAAC--C-AC--------CGTT-TCAAACGA-ACG-CAA-AC-A-------ATTC--------ATTA-T--TGA-----GT------------AC--C---T----A--T--AC--C--TGT----CTCAC-C-TCTA-------TCC-A--TGTTACA------AAGT-C------G--A----T-A-----T------TA---TA--T----TT-ACAAC------CGTTCT-CAAA--TAAAC--A-AAA-C----T-GGACTGTAG-TTGGTA-TATT-AG---T---TTAA--TATAC---A-CG-T----G--GC------ATA-A-A-TATG-T--T-ATTG-TTT-CAAattctttatacacagattgatttcacgtaattttcatttcaacattttgagttaaaattgtctttttttatatttttattttattata
gi|20 : gataagttaacagtttaaatggaaaggatacgttaacaagtcaatattatgaccgGTTAG-TCAA-AA---TT---TGG--CAAG--T---CCAT---A---ATTGTAT------G--G--TCTTGG---------T------T----------A----AGTG--------------GGTAAT--T-AC--------TGTT-TC----CA-AAG-CAA-AT-A-------ATAC--------ATAA-T--TGA-----GA------------AC--C---T----A--C--AC--C--TGT----CTAAC-C-TGTA-------T------------A------T----T------G--A----T-------T---A--TA---TG--T----TT-ACAAC------CATTCT-CAAA--TAAAC--A-AAA-A----C-AGACTG-----------TACC-TG---gtatgatttattccattagcacttacatatttatattttaaataaataatatctggtatgaagtaaacatatttatcaggtattcccaaatatatttcttc
gi|21 : attgcatacctttaaattctttatttgtgatttataaggtaaaaataaatgataggtatttTGCAATTAGTTTAAAGTGTG-TT-ATGA---TTT--GAG--CAAG--T---TCAT---C---ACCGAAC------G--G--TGA--A---------T------GTT--------A----AGCG--------------GGTAAT--T-A------------T-AT----AA-ATT-CAA-AT-ATGTTCACGTCC--------ATGA-T--TGG-----GT------------AC--C---T----A--T--AC--C--TGT----TTTAC-C-TGTA-------TCG-----------------A----G------G--A------------CA--G--TA---T-----------------------GTTCT-CAAA--TA-----A-AAA-A----C-GGACTGT---gagtttttttatttcatccttaagccaatctttctctttctccccaatttttctataaa
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gi|3 : cacggaataggTACAATCAGTTCAAATTTCT-CTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGAAC------G--G--A----A---------T------AGATC------A----AACG--------------GTTAAC--C-AC--------CATT-TC----AA-ATG-AAA-AG-A-------GTTC--------AAAA-T--TGA-----AT------------AC--C---T----A--T--AC--C--TGT----CTAAC-C-TGTA-------TCG-A--TGATACA------AAGT-C------G--A----T-G-----T------TA---TA--T----TT-GCAAC------CGTTTA-CAAA--TTAAC--A-AAA-C----T-GGACAGTGGGTGG-TA-TATT-AA---TTTAATAT--A-TAC---G-TGATAT-AA--G-CATGTTATA-ATT-TCAA-T--T-A-TGATTTAC-ACCATTCGC---ACATACA--------------T---G--TT-TATATTTTTA--ATTTAaaatttagtgttaatgtataagtgaatttcactgaccaaatcttgtttaaggcataaatttaaatttttatgtgtaatatttagtc
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gi|36 : taattgatattgtacacactgcacatgaatttaaagatataaatagattgacaatcccaatctaactgcaacggtcggattacactggataTCAAAGTACG-TTGCTAA---TT---GGG--CAGG--T---ATTT---C---ATTGAAC------G--G--T----A---------T------TGGTT------A----AGCT--------------GGTAAT--T-AC--------CGTT-TC----GA-ATG-CAA-AC-A-------ATTC--------ATGA-T--GGA-----GT------------A-------T----A--C--A----------------A-----------------A-G--T----CG------A---------------------------TA--A--TA---TG--T----TT--TAAC------GGTTCT-CAAA--TAAAC--A-AAA-C----T-GAACTG
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gi|37 : tcaaagtacgttgctaattgggcaggtatttcattgaacggtattggttaagctggtaattaccgtttcgaatgcaaacaattcatgatggagtatacaAATCAATTCAAAGCTGG-TCGATAT---TT---GTA--TATG--G---TCAC---T---ATTGCAC------------C----T---------T------A----------A----AGTG--------------GGTAAT--T-AT--------TGTT-TT----TT-ATG-CAA-CT-T-------GTTT--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--A---T----A--T--AC--A--TGT----CCTAC-C-TGTA-------TTG-G--T----CA------A---------------------------TA--A--TA---TG--T----CT-ACAAC------AATTCT-TAAA--TAAAC--A-AAA-A----C-AGACTGT---acataat
gi|38 : ATTTAAA-TTAGATTGGTGA---TTAATGGG--TAAG--T---TCAT---C---A---------------------------------------------------A----AGAG--------------GGCAAT--T-AC--------TGTT-TC----GA-ATG-AAA-AT-A-------ATTC--------TCAA-T--TGA-----GT------------AC--C---T----A--T--AT--A--TGC----CTTAC-C-TGTA-------TTG-G--T----CG------A--------------A-------------A--A--CA---TG--T----TT-ATAAC------CGTTCT-GAAA--TTAGC--A-AAA-T----CGGGACTGT---
gi|39 : aacgccTATAATTGATTCAAAGTTAG-TTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TGATATAC---A-TATA-------G--G-----------------T------A----------A----AGCA--------------G------------------------------GA-ATG-ATA-ACTG-------ATTC--------ATAC-C--TGT-----AT------------AC--T---TA---A--T--AC--C--TGacta
gi|4 : tatatataatatataatgtttaatatttacataccagtgtatatggcaagttacttataaaatattgtTACAGTCAGTTCAAAGTTCG-TTAATAG---AT---GGG--CAAG--T---TCAT---T---ATTCTAC------G--G--T----ATAGG-----T------A----------A----AGCG--------------GGTAAA--T-GG--------CTTT-TC----AA-ATG-CAA-AA-G-------ATTA--------ATAC-T--TGA-----GT------------GT--T---T----G--T--AC--CGATGT----C--AC-C-TGCA-------TCGAA--TATA-CA------A----A------G--A----CAA-----TA--G--TA---TG--T----TT-ACAAC------CGTTCT-AAAA--TAAACA-A-AAA-A----C-GGAC--T---T---TAGTACC-TG---T---ATA
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gi|40 : aAAT--TCAT--------CATT-------GA-ATG-----AC-AT------AT----------ATGA-T--TGA-----GT------------AC--C---TTT--A--T--AC--C--TAC----CTTAC-T-TGTA-------TCG-AA-T----AA------A----T------G--AACA-C-GA----TA--A--CG---TG--T----TT-ATAAC------CGTTAT-TAAG--T-AAC--A-AAA-A----tatgattgagtacctttatacctaccttacttgtatcgaataaatgaacacgataacgtgtttataaccgttattaagtaacaaaaaacaacaacaacaataaaatgatgacatcatattcaatgtt
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gi|30 : ttaaatacgataagaaacagctcaaatggaacagtgacgataatcaatcaatattgtaacc---ATTCAAA------G--G--T----A---------T------AGGTC------A----AGCA--------------GGTAAT--T-AC--------CGTT-TC----GA-GTG-AAA-GC-A-------ATTC--------TTAA-T--TGA-----AT------------AC--C---A----G--T--TC--A--TGT----CTTAC-T-TGTA-------TCG-G--T----GATCGCGGG----C------G--A----T-A-----CT--ACTTA---TG--T----TT-ACAAC------AGCTCT-C-AAC--TAAACAAA-AAA-A----C-GGATCGT---tgatatctgatattaagtaaacatat
gi|31 : aatgtcccattcgctattgacatattcaaaagtgtgactttttataattgTATAGTCTATTCAAAGTTA-----ATAA---AT---GGGTTCATA--C---CCGT---A---ACTGAAC------A--A--T----A---------T------A----------G----GTCA--------------AGTTAT--T-GC--------CATT-TC-----A-ATA-TAA-GC-C-------ATTC--------ATAA-C--TGA-----GC------------AC--C---T----A--T--AC--C--TGT----CTTAC-T-TGTA-------TCA-A--T-----A------A----TA-----G--AAAT-T-C-----TA--A--AA---TGTTT----TT-ACAAC------TTTTCT-C-AAA--TAAAC--A-AAA-A----T-Gagcgttattgtgtgtaagg
gi|32 : ctaatgttttgaactcgtacttgtttgataatgtaactatatatTATAGTCAATTCAAAGTTTG-TTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGAAC------G--G--TGTAGA---------T------A----------A----AGCA--------------TGTAAT--T-GC--------CAAT-TC----AA-ATG-CAA-GC---------ATTCTTGAGTATATAA-TA-TGATCAC-GTTTGTGATTGTAAAC--C-----------T--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TCT-A--T----TT------A----TC-----A--A----A-G-----TATTG--TA---TG--T----TT-ACAAC------AGTTCT-C-AAA--TAAAC--A-AAA-A----C-AGACTGT---
gi|33 : gtgcATTCAACGTTAT-ATGATAA---AT---GGC--CAAG--T---TCCA---A---ATTCAAC------G--G--A----A---------T------AGGTAC-----A----AG-----------------GTAA-----AC-------------------GG-ATT-TAA-CT-A-------ATAT--------ATAA-T--TAA--------------------------------A--T--AC--C--TGT----CTGAT-C-TGTA-------TCA-G--T----CA------A----T------G---------------TA--A--T-----G--T----TT-AAAAC------TGTTCT-T-AGG--TAAAC--A-GAA-A----T-GTACTag
gi|34 : gttgtgtttacattaaatggtgtttagtgattataaggatgtagtgtatgtatgattgaTATAGTCAATTTAAACTTGA-TTGATGG---AT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGAAC------A--G--T----ATAGG-----T------A----------A----AGCG--------------GTGAAT--T-GC--------CGTT-TC----AA-ATGAAAA-AA-A-------ATTC--------Ata
gi|35 : agattttgttttattcacaactatttaactttgaatattacagttggaagtcgtcaataaaatgtcactatAT---C---AATGCAC------G--G--T----A---------------------------A----AGCGTATAATGTCAATCAGGTAAT--T-GT--------CGTT-TC----GA-ATG-CAA-AC-A-------CTTC--------GTA--------------T------------GT--C---T----G--C--GC--C--TGT----CTAAC-C-TGTA-------TCG-G--T----CA------A----atatgtagtatgtttatgtcagtgg
gi|36 : taattgatattgtacacactgcacatgaatttaaagatataaatagattgacaatcccaatctaactgcaacggtcggattacactggataTCAAAGTACG-TTGCTAA---TT---GGG--CAGG--T---ATTT---C---ATTGAAC------G--G--T----A---------T------TGGTT------A----AGCT--------------GGTAAT--T-AC--------CGTT-TC----GA-ATG-CAA-AC-A-------ATTC--------ATGA-T--GGA-----GT------------A-------T----A--C--A----------------A-----------------A-G--T----CG------A---------------------------TA--A--TA---TG--T----TT--TAAC------GGTTCT-C-AAA--TAAAC--A-AAA-C----T-GAACTG
gi|36 : A-A-G-TCGA-TAAT-A-TG-TTT-TAACGGTTCTCAAA-TAAACAAAACTGA-ACTGACA---G--TA----ACTTTTA--ATTT------T-TCGC----GCAATA----T-A--ATATacagtaacttttaatttttcgcgcaatataatatacataat
gi|37 : tcaaagtacgttgctaattgggcaggtatttcattgaacggtattggttaagctggtaattaccgtttcgaatgcaaacaattcatgatggagtatacaAATCAATTCAAAGCTGG-TCGATAT---TT---GTA--TATG--G---TCAC---T---ATTGCAC------------C----T---------T------A----------A----AGTG--------------GGTAAT--T-AT--------TGTT-TT----TT-ATG-CAA-CT-T-------GTTT--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--A---T----A--T--AC--A--TGT----CCTAC-C-TGTA-------TTG-G--T----CA------A---------------------------TA--A--TA---TG--T----CT-ACAAC------AATTCT-T-AAA--TAAAC--A-AAA-A----C-AGACTGT---acataat
gi|38 : ATTTAAA-TTAGATTGGTGA---TTAATGGG--TAAG--T---TCAT---C---A---------------------------------------------------A----AGAG--------------GGCAAT--T-AC--------TGTT-TC----GA-ATG-AAA-AT-A-------ATTC--------TCAA-T--TGA-----GT------------AC--C---T----A--T--AT--A--TGC----CTTAC-C-TGTA-------TTG-G--T----CG------A--------------A-------------A--A--CA---TG--T----TT-ATAAC------CGTTCT-G-AAA--TTAGC--A-AAA-T----CGGGACTGT---
gi|39 : aacgccTATAATTGATTCAAAGTTAG-TTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TGATATAC---A-TATA-------G--G-----------------T------A----------A----AGCA--------------G------------------------------GA-ATG-ATA-ACTG-------ATTC--------ATAC-C--TGT-----AT------------AC--T---TA---A--T--AC--C--TGacta
gi|4 : tatatataatatataatgtttaatatttacataccagtgtatatggcaagttacttataaaatattgtTACAGTCAGTTCAAAGTTCG-TTAATAG---AT---GGG--CAAG--T---TCAT---T---ATTCTAC------G--G--T----ATAGG-----T------A----------A----AGCG--------------GGTAAA--T-GG--------CTTT-TC----AA-ATG-CAA-AA-G-------ATTA--------ATAC-T--TGA-----GT------------GT--T---T----G--T--AC--CGATGT----C--AC-C-TGCA-------TCGAA--TATA-CA------A----A------G--A----CAA-----TA--G--TA---TG--T----TT-ACAAC------CGTTCT-A-AAA--TAAACA-A-AAA-A----C-GGAC--T---T---TAGTACC-TG---T---ATA
gi|40 : ttaataaaatgtatcatagagatggatgagtttgtttcattatttagtaaagcagtttgtgaccttgtaaactgacataaatatatacttataaatatggccatgttgttgaaagcaaaatcG-TGGATAA---TT---GGG--AAAA--T---TCAT---C---ATTGAAT------G--A--C----A---------T------A----------taggtattctttcatttagtcattatgtaaaaacactgtattggtaa
gi|40 : aAAT--TCAT--------CATT-------GA-ATG-----AC-AT------AT----------ATGA-T--TGA-----GT------------AC--C---TTT--A--T--AC--C--TAC----CTTAC-T-TGTA-------TCG-AA-T----AA------A----T------G--AACA-C-GA----TA--A--CG---TG--T----TT-ATAAC------CGTTAT-T-AAG--T-AAC--A-AAA-A----tatgattgagtacctttatacctaccttacttgtatcgaataaatgaacacgataacgtgtttataaccgttattaagtaacaaaaaacaacaacaacaataaaatgatgacatcatattcaatgtt
gi|41 : agtggataattgggaaTGATAA---CT---GGG--TAAG--T---TTAT---C---ATAACAC------G--G--T----A---------T------A----------AGTAAAGTG--------------TGAAAT--A-AC--------CGTT-TT----GA-ATG-CAA-AC-T-------CTTT--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--CCA-T----A--C--AC--C--TGT----TTCAC-C-TGTA-------TCG-G--G----CA------A---------------------------TA--A--CA---TG--T----TT-ACAAC------CGT------AAA--TAAA---A-AAA--------GAACTG-----------TAGC-TG---T---Aacaacaacaacaataaaatgatgacatcatattcaatgtt
gi|42 : TATAGTCGATTCAAATTTCG-TCGATAG---TT---TGT--TAAG--TTGGTCAT---A---ATTGAAC------G--G--T----A---------TAGGA--A----------A----AGCT--------------GGTAAA--T-AC--------TGTT-T-----GA-ATG-TTT-AC---------GTCC--------GTGA-T--TGA-----AC------------GC--A---T----G--T--AT--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------CCgtg
gi|43 : acaacttgcgatatgcaacaacAG---TT---AGG--AAA--------CAT---CGATATTGCACCAC---G--G--T----A---------T------ATATA------A----AGCG--------------GGTAAT--A-AC--------CGTT-TA----AA-ATG-CAA-AC-A-------ATTC--------AAAT-T--TTA-----GT------------AC--A---T----A--T--AC--C--TGC----CTTAC-C-TGTA-------TCG-G--T-----A------A----T------tatgata
gi|44 : taaaatgtcttccatcT---C---ATTGCAC------G--G--A----A---------C------ATGTGTTGGTCA----AGCG--------------GGTAAG--C-ACAG------CGTG--C----TA-A-G-CAA-CC-A-------ATTC--------ATAA-TAATTA-----TT------------AT--T---G----AA-T--AT--C--TGT----CTTAC-T-TGTA-------TCG-G--T----CA------A----T------G-------T--------------TA---TG--T----T----AAC------TTTTCT-C-AAG--AAAAC--A-AAA-acatacactgacccaa
gi|45 : T---C---ATTGCAC------A--G--T----A---------T------AGGTA------A----AGCG--------------GGCAAT--T-AC--------TGTG-TC----------------------------TC--------ATAA-T--AGT-----AT------------AC--CTG-T----A--T--GC--C--TGTCGTACTTAC-C-TGTA-------CCGAA--T----AA------A----T------A--A----A-GTCGA-TA--A--AA---TG--T----TT-ACAAT------CATTCT-C-AAG--TAAcg
gi|46 : gat-ATG-TAA-CT-A-------ATTC--------ATAC-C--TGT-----TT------------AC--C---T----AG-T--AC--C--TGT----TTCTT-C-TGAAAAAAAAAT-G-AACT----CG------A----TA-----G--A----T--------A--A--AA---CG--T----TT-GCAAC------CGTTCT-C-AAG--TAAAC--A-AAA-ATAG-C-GGACTGT---G---TA-T
gi|47 : tAAATTTCG-TTTAAAA---TT---GGG--CAAG--T---TCGT---C---ATTGAAT------G--T--TTG--G---------T------A----------A----AGTG--------------GGTTAT--T-AC--------TG-T-TC----TA-ATG-TCC-AC-A---------CC--------GTGA-T--TTA-----GT------------tacacatttgt
gi|48 : attcttatcctttttctatcattgaactat-TTAATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATT--AC------A--G--T----G---------T------AGAGGTT----A----AGCA--------------TATAAT--T-AC--------CGTT-TT----GA-ATA-CAA-G--A-------ATTC--------AAAA-
gi|5 : aaagatacagtaaatgaatagaaccaACAGTCGATTAAAAATTCG-TTGGTAACTATT---GGG--CAAG--T---TCGT---C---ATTTAAC------A--G--T----A---------T------AGGTA------A----AGAG--------------GATAGG--T-AC--------CGGT--C----GA-GTG-CAA-TC-A-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----GT------------AT--G---A----A--T--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TCA-A--TGATACA------A----A------G--A----CGG-----TA--A--TA---TG--T----------AT------CGTTCT-A-AAA---AAAA--A-AAA-A----C-GAACTG------------AAG-TG---T---GTAC--T-TAagaaatattt
gi|50 : ccaaC-TG---T------C--T-TAT---A-TA-CAC-CG--AATAT---ACA-A-AGTCGA-TAAC-A-TG-TTAACAACGGTTCTC-AAATAAACAAA----AGGCGGGCG---G--TA-CAatgagcttgattacattttgtgtatcagcttatcagatattatcttacataaagataaaggtttattgcacaaagggctgtgagataacggcgcgttctctattttttatcaccaacgggcagtagttttaatgtttcagcgataaaca
gi|50 : -----TA--A--CA---TG--T----TA-ACAAC------GGTTCT-C-AAA--TAAAC--A-AAAGG----C-GGGCGGT---atcatttactattcctcttgcagc
gi|52 : ctgtcttatatacaccgaatatacaaagtcgaTACAGTAGATTCA----TAG-TTGATAA---TT---GAG--CAAG--T---TAAT---C---ATTGCAA------A--G--TC---A---------T------------------------TG--------------GGTAAT--T-AC--------TGTT-TC----AA-AGG-CAA-TC-A-------ATTC--------acaatcatttactattcctcttgcagc
gi|53 : tatgttgtcgtC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TCA-G--A----CA------A----T------G-------------------------------T----TT--------------TTCT-A-AAG--TAAAC--G-AAA-A----T-GGACTGT---T---
gi|54 : ---T----A--T--AC--C--TGT----CTTTC-C-TGAA-------TCA-G--T----CAT-----A----C------A--AAGTCT-A-----TA--A--AA---TG--T----TT-ACAAC------GGTTCT-C-AAA--TAAAC--A-AAG-A----T-GGACTGcgtgacaacctctgattttacttattttacataaac
gi|55 : taTCTATTCGGATTTCG-TTGATAA---TT---GGG--AGAG--T---TCAT---C---ATTGAAC------A--G--T----A---------
gi|56 : --T----TT-ACAAC------AAT-CG-C-AAG--TAAAC--A-AAA-A----C-GGACTGT---aggtacagttggaatggaatggaaacattct
gi|56 : a-TTTACAACAAT-CGCAAG-TAAACAAA----A-ACGGACT---G--TAGTGTACATTagtgtacattattatatgctttaatatatacatga
gi|57 : aAGTCAATTAAAAGTTCG-TTCATAG---AT---ATG--CAAG--T---TCAG---C---ATTTAAC------G--G--T----AAAGG-----C------A----------A----AGCG--------------GGattatatgctttaatatatacatga
gi|58 : aaagtta--T--AC--C--TGT----CTAAC-C-TG-A-------TTG-G--A----TA------A----TAGA---G--A----T-T-----TG--C--TG----G--TTGGGTT-ACAAC------GGTTCT-C-AAG--TAAAC--A-AAA-
gi|59 : -TTTATAA---CT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGCAC------G--G--T----ATGAG-----T------A----------A----AGCG--------------GG
gi|6 : aatccagcaactccacgtactcTACAGTCAACTCAAATGTAG-TTGATAA---TT---TGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGCAT------G--G--T----A---------T------AGGTT------A----AGCA--------------ATTA-T--T-AT--------TGTT-TT----GG-ATG-TAA-CC-A-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--C---T----A--T--AC--C--TGT----CTTGC-C-TGTA-------TTT-G--------------------T------G--A------------TA--A--TA---TG--T----TT-ACAAC------CATTCT-A-AAA--TAAAC--A-AAA-A----T-GGACTGT---TC--TA--GTT-TGCAAC---ACAC--T-CAT---T-GG-TA--CA--TAAA----ACA-T-A-TTTA-TG-T-A-TG-TATACAATG
gi|60 : ttaggtcatgtcagtttataaacaacagttcacatgatacataaaaa-ATG-CAA-CC-A-------ATTC--------ATAA-T--TCA-----GT------------AC--C---T----A--C--GC--T--TAT----CTCAC-C-TGTA-------Ttacatgtcttttactacacaattaatggtacataaaacatagtttgatacatgtatgctgaaacat
gi|61 : gttagttgataactgcttattTACAATAGATTCAAAGTGTG-TTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCA
gi|62 : ccaatttaagcaacagaaatggtatgTTCAAATTTCT-CTGATAA---TT---GGG--CATG--T---TTAT---C---ATTGAAT------GGAG--TAG--A---------T------A----------A----AACG--------------GATA
gi|63 : TATAGTCAATTCAAA----G-TTGATAA---AT---GG------G--T---TCAT---A---ACTGAAC------A--A--T----A---------T------A----------ctca
gi|65 : tat---------T------A----------A----AGCA--------------GAAAAT--C-AG--------CCTT-TA----GA-ATG-CAA-GC-A-------ATTA--------ACAA-C--TGA-----GT------------AC--C---C----A--ggtca
gi|66 : A---TA--C----TT-ACAAC------CGTTCT-C-AAG--T-AAT--A-AAA-A----C-GGACT
gi|67 : cgacacaTAAAGTCGATTCAAAGTTCG-TTGATAA---TT---GGG--AAAA--T---TCAT---T---Attag
gi|68 : G--T----TT-ACAAC------CATTCT-C-AAG--TAAAC--T-AAA-A----C-AGACAGT---T---TA-
gi|7 : ATAATCATTTGAAAGTTAA-TTCATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGTGC------A--GATT----AAG-------T------A----------A----AGCA--------------GGTAAT--T-AC--------TGTT-TC----TT-ATG-CAA-AC-G-------ATTC--------GTAA-T--TGA-----GT------------AC--C---TAC--A--T--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TCG-A--A----TAT-----A----T------A--AAGC-T-GA----TA--A--AA---TG--T----TT-ACAAC-------------C-AAACCTGAAC--A-AAA-A----C-CTACTGT---
gi|8 : gttatacacagatgtgcttttaagtcaggacaaatgacattaaaattaaacaaattacgtgcttgtaggaacatatttacataacagtttaaaataacataacaataacTATAGTCGATTCAAAGTTAG-TGGATAC---TT---AGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGCAC------G--G--T----A---------T------A----------A----AGTG--------------GGTATT--T-AC--------CGTT-TC----CA-ATG-GAA-AT-A-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----AT------------AC--C---T----A--T--AC--C--TGT----CTTAT-C-TGTA-------TCA-G--C----CA------A----T------GC-A----T-G-----TA--G--CA---TG--T----TT-ACAAC------CGTTCT-CAAAA--TAAAC--A-AAA-A----C-GGACTGT---T---TA-TACT-TT---T---ATAC--T-TAC---C-TG-TAT-CG--ACCA----ATA-A-A-TCTA-T--T-A-TT-TTTACAACCGTTCTCAAAATAAACAAA----A-ACGGACT---G--TA-TATACTTTTAT-ATTTACCTG-TATCAA----CCAATACATGT-A--GTATGTTTACAACTGTTCTCAAAATAAGCAAAAACGGACTGTgatattacatttacaaacacgtttcttaacttaaacagctgtaaacaatt
gi|9 : TACAATTATTTCAAAGTTAG-TTGATAT---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---A------------G--G--T----A---------------------------A----AGCG--------------AGTAAT--T-AC--------AGTT-TC----TT-ATG-T---------------TTC-------------C--TG----------------------------T----A--T--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTG-------TAG-A--A----TA------AAAAAT------A--A----T-G-----CC--G--AA---TG--T----TT-ACAAC------CGTTCC-C-AAG--TAAAC--A-AAA-A----T-CGACTGTACCT---TA--ATT-TG---T---TTACATT-TGC---T-TT-TAT-AG-----A----A-A-C-A-TCTT-T--T-A-T
blockSeqs : A CTA AAT TT AG TGG ATA GAT C GGAATA GA AG AATTGAATGGTACAGGT GTAT TATAATGTCAATCA TA TACATTTG AAACG TG TGTTCAC TTGAGTAT AA TGCTC TTGTGATTGTAA AGCTATAC TC AC AC GA CGTA AAAAAAA GTGATCGCGGGCGATACTACTT GAA TT TGGG AGTTTCT CC CA AAAT AGTTGG GT TC CAA TTAATAT A ACATGTACCGATCATATATAGTCGATGAT T A A G TCA A CAAAACTG G ACA . GTG T T TC AACCGTT GTTGCATTCATGTAA T A AA
blockSeqs : C . T . . A GT . G CAC . AT ACATGTGTTGGTC GTAT ACATT . AG G A T . A TCAC . CTTAT CC . A GA . . AATAAATAAAACCGATAAAT . . . AT . AA TAG GGGTGG A TT . TTACAT . GTGATATAAGCATGTTATAATTTCAATT . . A C TCA A CAAA . . . TA T T T ACCTGTA ACCAATACATGTA
blockSeqs : A . . . . . . . C . . . AATGTAACTGTA GTAA . . AG G A . . . . . CTCT A . . A . . ATCATATATAGTCGATGAT . . . T . A . ACCT T CC . TTAA . ATACACCGAATATACAAAGTCGATAAC . . A G GCA A CAAA . . . CA T T . T CGCAATATA
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . ATTAGGTAA . . . . A C . . . . . CTTT G . . . . . ATGTTACAAAGTCGATATT . . . C . A . TC T CC . ATAC . GATCTGAATGCTGTCAATAATAGTTG . . A G TCA A CAAA . . . TA A T .
blockSeqs : A . . . . . . . T . . . GTAGAGGTT . . . . T C . . . . . CCAT . . . . . . GTGAATAAAGGTTGACAAT . . . T . . . T T AG . GTAC . TGGTACATAAAACATATTTATGT . . A A TA . CA . . . T T T .
blockSeqs : T . . . . . . . C . . . ATAGGTAC . . . . T A . . . . . CTGT . . . . . . ATAATGCAAAGTCCATAAT . . . T . . . T T TT . ACAC . CTGTATCGACCAATAAATCTATT . . A G GC . A . . . C . .
blockSeqs : C . . . . . . . C . . . ATAGGTT . . . . T C . . . . . CTAC . . . . . . ATGATACAAAGTCGATGTT . . . C . . . T T CC . ATAC . TTTTATAGAAACATCTTTT . . . C TC . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . AGGAGTA . . . . A T . . . . . TTA . . . . . . AATATACAAAGACAATAGT . . . C . . . T T GC . TA . ACGTGGCATAAATATGTT . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . CTTGGTT . . . . A A . . . . . CT . . . . . . AATAAATGAACACGATAAC . . . A . . . G T AG . C . CTGTATCGAGGACAGTA . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . GAATGTT . . . . G A . . . . . CT . . . . . . AATAAATAAAGTCGATAAA . . . G . . . T T TT . T . . .
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . GTAAGTA . . . . G A . . . . . CT . . . . . . ATGATACAAAGACGGTAAT . . . C . . . T T CT . C
blockSeqs : C . . . . . . . T . . . ATAGGTA . . . . C A . . . . . GA . . . . . . GTCATACAAAGTCTATAAA . . . C . . . T . TT .
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . ATGGATA . . . . A A . . . . . TA . . . . . . AATATATAAAGCTGATAAA . . . C . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . C . . . ATAGGTA . . . . T A . . . . . AT . . . . . . ATAAAATGAAGCCTATAA . . . T . . . . . .
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blockSeqs : A . . . . . . . C . . . ATAGGTC . . . . G A . . . . . CT . . . . . . ATTTATCAAAGTATTGT . . . T . . .
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blockSeqs : A . . . . . . . A . . . ATATATA . . . . G G . . . . . CT . . . . . . GCCAATGCATGTAGC . . . A . . .
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blockSeqs : C . . . . . . . A . . . ATAGGTA . . . . G G . . . . . CT . . . . . . CCCAATATGT . . . G . . .
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Reference ( family-347 ) : TACAGTCGATTCAAAGTTNG-TTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGNAC------G--G--T----A---------T------A----------A----AGCG--------------GGTAAT--T-AC--------CGTT-TC----GA-ATG-CAA-AC-A-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--C---T----A--T--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TCG-G--T----CA------A----T------G--A----T-G-----TA--A--TA---TG--T----TT-ACAAC------CGTTCT-C-AAG--TAAAC--A-AAAA----C-GGACTGT-----T---TA-TANCT----G------T---AT--AC--T-----TACN--TG-TAC-CG-ANCATA-TA-AA-TCT--AT--TA-TG-TTTACAACGGTTCTCAAAATAAACAAA----A-ACGGACT---G--TA-TATACTTTTA--ATTTACCCG-TATCGG----GCAATA-ATGT-AATA--TGTTTACAACNGTTCTCAAAATNCGCAAAAACGGACTGT
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gi|15 : acagctgctttcacagcacttgttgtacctaatgacaataaattgtatgcaagtaacttgaaataaatatT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGCCC------A--G--T----A---------T------A----------AGTATAGAG--------------GA------T-AC--------TGTT-TC----TT-ATG-CAA-CC-A-------ATTC--------CTAA-T--TGA-----GC------------AT--C---T----ATCT--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TC----------CA----------------------------------TA--A--AA---TG--T----TT-ACAAC------CATTCT-C-AAG--TAAAC--G-AAAA----C-GAACTGT-----ttgttattgttttttcatgattttgttttataaa
gi|16 : TACTGTCAATTCTAAGTTAG-CTGAT------T---GGA--CAAG--T---TCAT---C---ATTACAT------G--G--T----A---------T------AGGTT------A----AATG--------------GGTAAT--C-AC--------TGTT-TC----AA-AAT-CAA-TT-G-------ATTC--------ATCA-T--TGA-----GT------------AT--G---A----A--T--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA-------TCG-G-----------------------------------T-G-----TA--T--TA---AG--T----TTGACAATA-----TGTTTA-C-AAA--TAAAT--A-AAAG----G-GAACTGT-----agaacgtatcattaaggattgtaactctacatgattataacatggataactgctgatttaaaaataatatttcaatgcagaataaaaacctgcccacggtttaaatgaacaattagatttcatatgtgaatagttaatcatagtgctaaatactttgttttca
gi|17 : ataagtgacacttaaaatgacagagtgaatacactcagtacTACGTTTAATTCAAAGTTTG-TTGATAA---TT---GGG--CAAG--T---TCAT---C---ATTGAA----------A--T----G---------T------A----------A----GATG--------------GGTAAT--T-AC--------CATC-TC----AA-ATG-CAA-AC-A-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----GT------------AC--T---A----A--T--AC--C--TGT----CTTAC-C-TGTA--------------T----CA------A----T---------A----T--------------TA---TG--T----TT-ACAAC------CATTCT-C-AAA--TAAAC--A-AAAG----C-GGACTGTACATGT---TA-AAATTAAA-G------C---AT--AT--T-----TCTA--TA-TTA-CG--GCATA-TA-GA-Tagtaaatgacgcattaatgattgataaattaatatgtgtttttttttttctttttctccattaagtcactgacatggttata
gi|18 : acaattctaatcatttgattcatgTACAACCGATTTAAATGTCA-TTGATTA---TA---GGA--CGAG--T---TCAT---C---TTTGAAC------G--G--T----AGGAG-----T------A----------A----AGCG--------------GATAAT--A-AC--------CATT-CC----GA-ATA-AAA-AA-A-------GTTC--------GTAA-T--aatttagatttttttttaactttgtacatatgttgttttacataaattttacataaa
gi|18 : cA-T--TTA-----GT------------AC--A---T----G--T--ACA-CA-TGT----CTTAC-C-TGTA-------CCG-A-------CA----------------------------G-----TA--A--TA---TG--T----TT-ACAAC------AGTTCT-G-AAA--TAAAT--A-AAAAAAATC-AGACTAT-----attttaaaacaggttttgaaacatgatgttaccatagcaccattgtatcacagacatttagtacatgtacacatgtcttacctgtaccgacagtaatatgtttacaacagttctgaaataaataaaaaaaatcagactataagtctgttatcacgatctgaatgctgtcaataatagttgatgttt
gi|19 : ctacaaccgatttaaatgtcattgattataggacgagttcatctttgaacggtaggagtaaagcggataataaccattccgaataaaaaaagttcgtaatattttaaaacaggttttgaaacatgatgttaccatagcaccattgtatcacagacTACAGTCAATTCAAAGT-------------------GGC--CATG--T---GCAT---T---TTTGAAC------G--G--T----AATTGAATGGT------ACAGGT-----A----AGCG--------------GATAAT--T-TC--------CGTT-TC----GA-ATG-AAA-AC-T-------ATTC--------ATAA-T--TGA-----G-----------------------------T--GT--C--TGT----CTTACACATGTA-------CCG-A--T----CAT-----A----TATAGTCG--A----T-G---------A--TA---TG--T----AT-ACAAC------GGTTCT---A-----AAAC------AA----C-GGACTaagtctgttatcacgatctgaatgctgtcaataatagttgatgttt
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gi|27 : ctgagaagaaaatgaataaaaaatattcaaaggtgttttttttacacatcataattatat--T---TCTT---C---ATTGCAC------A--G--T----A---------T------A----------GGTATAGCG--------------AATAAT--T-AC--------TGTT-AC----TA-ATG-CATTGC-A--------TTC--------ATAC-A--TGT-----AT------------AA--A---T----A--T--AC--C--TGT----TTTAC-C-TGAA-------TTA-A--TA---AA------A----T------G--AAGCCT-A-----TA--A---A---TG--T----TT-ATAAC------CA-TCT-C-AAG--TAAAC--A-AAAA----C-AGA---------T---CA-TAAGT----G------T---AT--AC--
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