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Reference ( gi|5 )            :  CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAA-TGGTC------GCCTCGTTTGGT-TCTTGGAATCCAACAACTT----AATTACTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-GGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGTCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGT--TTCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|2                          :  CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAA-TGGTC------GCCTCGTTTGGT-TCTTGGAATCCAACAACCT----AATTACTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-GGGGCACTACAGAC------CATTTAATTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAAAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTGCATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGT--TTCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTCTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATCGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
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gi|8                          :  CCGTCCAATTGCTTT------GATAAGTTGATTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAA-TGGTC------ACCTCGTTTGGT-TCTTGGAATCCAGCAACTT----AATTAGTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-GAGGCACAACAAAC------CATTTGATTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAAGCTTTCAT---AAA-AAAGAA---CATCTAGTCGCAGTATTATTTTACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATAAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTATCTTCCTTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGT--TTCAAGTCCGAATAGGCACGACCCTCCCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCATCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAACTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTTCAGCAATGGCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTCTAA-A----TTCTAAAGTCTAAA
gi|6                          :  CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCACGGAACGTATGATTAA-TGGTC------GCCTCGTTTGGT-TCTTGGAATCCAACAACTT----AATTACTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CTCAA-TAGGCACAATAGAC------CATTAAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGTTTTCAA---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTT-GACTTAGAGAAAGCCTACAACACCACGTGGAAGTATGACATTATGAAAGATCTTTATATA------A---TGGACCTTCGTGACCGCTTAGCTGCTTTAATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGT--TTCAAGTGCGAATGGGAAAAACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTGTTCTGTCTGTCATCCTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGCATAAATCCT--TGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAATGGCAACTGCAACAATGCCTTAATAAACATCAGACTTGGTCTGATGAAAATGGTTTTAAGACT--TTC--AAATCTAAA
gi|10                         :  CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAA-TGGTA------GCCTCGTTTGGT-TCTTGGAATCCAACAACTT----AATTACTA-GTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-GAGGCACTTTAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGCT---A-GGAAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACT--GAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATC---ATAAA------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTAACTTTATTTTAAACTTTTTAGACGATAGACAGT--TTCAG------ATAG-----ACCCTCTTTGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTACAACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACATTTTTTAAT-ATA-------AAAATTA-TTAATATTGT-TA-GAGCATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTGCAACAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTTGTCTGATGAAAACAGTTTTAA-ATT--TTTT-AAGTCTAAA
gi|9                          :  CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTATAACCGTGGAGCGTATGATTAA-TGGTC------GGCTCGATTGGT-TCTTGGAATCTAACAACTT----AATAACTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-AGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTCAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTAGAGAAAGTCTACGACACCACGTGGAAGTATAACATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTAACTTTATTTTAAACTTTT-------TAGACAGT--TTCAAGTCCGAATGGGCAAGACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATTGGCGTACCACAAGGCAGTATTCTTTCTGTCACACTTTTTAAT-ATA-------AAAATTG-ATAATATTGT-TAAGAGCATAATACCT--GGTGTGGATTGCTCTTGATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCGAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTGCAACACTGCCTTAATATACTTCAGATTTG----GATG--AACGGTTTCAA-ATT--TTCT-AAATCTAAA
gi|14                         :  CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAA-TGGTC------GCCTCGTTTGGT-TCTTGGAATCCAACAACTT----AATTACTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-GGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CGTTTAGTCGCTGTATTTTTTTACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGT--TTCAAGTCCGAATGGGAACAATCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTTTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATAT
gi|19                         :  CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCTTGGAACGTATGATTAA-TGGTC------GCCTCGTTTGGT-TCTTGGAATCCAACAACTT----AATTACTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--TCAAA-GGGGCACTACAGGT------CATTTAGTTAGATATGAAGCCTTTGTT---A-GGGAGGCTTT
gi|7                          :   CGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAA-TGGTC------GCCTCGTTTGGT-TCTTGGAATCCAACAACTT----AATTACTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-GGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACATGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGT--TTCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAGTCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAAgtaggagcacatttgt
gi|22                         :   CGCTCAATTGCTTTCAAACTGACAAATTGTATTTGTAAAACCATGGAACG------------GTC------GCCTCGTTTGAT-TCTTGGAATTCAATAACTT----AAT------------AAC----T----GGATTCC--GGTG--CCGAA-GAGGCACAACAGAT------CATTTAATTAGTTTTGAATCGTT
gi|12                         :   tGTCCAGTTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGCATGATTAA-TGGTC------GCCTCGTTCGAT-TCTTGGAATCCAACAACTT----AATTACTAAGTATCAAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-GAGGCACAATAGAC------CATTTAGTTGGATTTGAATCGATTGTT---A-GGGAGACTTTCAT---AGAGAAAGAA---CATTAAGTCGCTGTATTTTTTTACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------AATATGAGCCTTCATGGCCGTTTAGCTACCTTTATTTTAAATTTTTTAGATGATAGACAGT--TTCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTATGATGTTCACAAATAAGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCGGTCTCT-ACACTTTTTAAT-ATC-------GAAATTA-ATAATATTGT-TTAGAGAATAAATCCT--GGTGTGGATTGTTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCTTTCAAAAAATAT-------------TGAAAG-----------AATGCCTTAATAAACTTCAAACTTGcataa
gi|23                         :     TCTAATTA-TTT------GACAAATTG-GTTTGTAAAATCATTGAACGTATGACAAA-TGGTC------ACCTCGTTTCTT-TCTGGGAATCCAAC---TT----AATTACTAAGTAACAAAG----T----GAATTCC--GACG--CCGAA-AAAGCACAACAGACCAATGGCATTTGATTAGATa
gi|29                         :      CCAATTGCTTT------GGCAAGTTGTATTTGTAAAACCGTGGAACGTAAGATTAA-TGGTC------ACCTCGTTTTGT-TC
gi|8                          :                                                      ATGGTTTG-TTGT-------GCCTC-TTTGGCGTC--GGAATCCA----CTTTGATACTTACTAATTA----AG----TTGCTGGATTCC--AA-GAACCAAACGAGGT------GAC------CATTTA
gi|2                          :     ccgtccaattgctttgataagttgattttgtaaaaccatggaacgtatgaTAATTAAATGGTCTGTAGTGCCCC-TTTGGCGTC--GGAATCCA----CTT----TGATACTTAGTAATTAGG----TTGTTGGATTCCAAGA-A--CCAAACGAGGC------GAC------CATTttgattagatttgaatcgtttgttagggaagctttcataaaaaagaacatctagtcgcagtattattttacttggagaaagcctacgacaccacgtggaagtatggcattataaaagatcttcataatatgggccttcgtggccgtttatcttcctttattttaaactttttagatgatagacagtttcaagtccgaataggcacgaccctccccgatgttcacaaacaggagatgggcatcccacaaggcagtattctgtctgtcacactttttaatattaaaactaataatattgttaagagtataaatcctggtgtggattgctctttatatgttgacgattttgtaatttgttaccgttcaaaaaatatgaaaactattgaaaggcaacttcagcaatggcttaataaacttcagacttggtctgatgaaaacggttctaaattctaaagtctaaa
gi|6                          :      ccgtccaattgctttgacaagttgtgtttgtaaaaccatggaacgtatgattTTAA-TGGTCTATTGTGCCTA--TTGAG-CGTCGGAATCC----ACTT----TGATACTTAGTAATTAAGTTGTT----GGATTCCAAGA-A--CCAAACGAGGC------GAC------CATTgatttgaatcgtttgttagggaggctttcataaagaaaaaacatttagtcgctgtattttttgacttggagaaagcctacgacaccacgtggaagtatggcattatgaaagatcttcataatatgggccttcgtggccgtttagctgcatttattttaaactttttagatgatagacagtttcaagtccgaatgggaacaaccctctccgatgttcacaaacaggagatgggcgtcccacaaggcagtattctgtctctcacactttttaatattaaaattaataatattgttaagagtataaatcctggtgtggattgctctttatatgttgacgattttgtaatttgttaccgttcaaaaaatatgaaaactatcgaaaggcaactacagcaatgccttaataaacttcagacttggtctgatgaaaacggttttaaattttctaagtctaaa
gi|7                          :        ccgtccaattgctttgacaagttgtgtttgtaaaaccacggaacgtatgattAA-TGGTCTGTAGTGCCCC-TTTGGCGTC--GGAATCCA----CTT----TGATACTTAGTAATTAAG----TTGTTGGATTCCAAGA-A--CCAAACGAGGC------GAC------CATTgttagatttgaatcgtttgttagggaggttttcaaaaagaaagaacatttagtcgctgtatttttgacttagagaaagcctacaacaccacgtggaagtatgacattatgaaagatctttatataatggaccttcgtgaccgcttagctgctttaattttaaactttttagatgatagacagtttcaagtgcgaatgggaaaaaccctctctgatgttcacaaacaggagatgggcgtcccacaaggcagtgttctgtctgtcatcctttttaatattaaaattaataatattgttaagagcataaatccttgtgtggattgctctttatatgttgacgattttgtaatttgttaccgttaaaaaaatatgaaaactattgaatggcaactgcaacaatgccttaataaacatcagacttggtctgatgaaaatggttttaagactttcaaatctaaa
gi|3                          :         cgtccaattgctttgacaagttgtgtttgtaaaaccatggaacgtatgattAA-TGGTCTGTAGTGCCCC-TTTGGCGTC--GGAATCCA----CTT----TGATACTTAGTAATTAAG----TTGTTGGATTCCAAGA-A--CCAAACGAGGC------GAC------CATTtagttagatttgaatcgtttgttagggaggctttcataaagaaagaacatttagtcgctgtattttttgacttggagaaagcctacgacaccacatggaagtatggcattatgaaagatcttcataatatgggccttcgtggccgtttagctacatttattttaaactttttagatgatagacagtttcaagtccgaatgggaacaaccctctccgatgttcacaaacaggagatgggcgtcccacaaggcagtattctgtctgtcacactttttaatattaaaattaataatattgttaagagtataagtcctggtgtggattgctctttatatgttgacgattttgtaatttgttaccgttcaaaaaatatgaaaactattgaaaggcaactacagcaatgccttaataaacttcagacttggtctgatgaaaacggttttaaattttctaagtctaaa
gi|11                         :        ccgtccaattgcattgataagttgtgtttgtaagacaatggaacgtatgattAA-TGGTCTGTAGTGCCCC-TTTGGCGTC--GGAATCCA----CTT----TGATACTTAGTAATTAAG----TTGTTGGATTCCAAGA-A--CCAAACGAGGC------GAC------CATTtagttagatttgaatcgtttgttagggaggctttcataaagaaagaacatttagtcgctgtattttttgacttggagaaagcctacgacaccacgtggaagtatggcattatgaaagatcttcataatatgggccttcgtggccgtttagctacatttattttaaactttttagatgatagacagtttcaagtccgaatgggaacaaccctctccgatgttctcaaacaggagatgggcgtcccacaaggcagtattctgtctgtcacactttttaatattaaaattaataatattgttaagagtataaatcctggtgtggattgctctttatatgttgacgattttgtaatttgttaccgttaaaaaaatatgaaaactattgaaaggcaactacagcaatgccttaaaaaacttcagacttggtctgatgaaaacggttttaaattttctaagtctaaa
gi|10                         :        ccgtccaattgctttgacaagttgtgtttgtaaaaccatggaacgtatgattAA-TGGTCTAAAGTGCCTC-TTTGGCGTC--GGAATCCA----CTT----TGATACTA-GTAATTAAG----TTGTTGGATTCCAAGA-A--CCAAACGAGGCtagttagatttgaatcgtttgttagggaggctttcataaagaaagaacatttagtcgcagtattttttgacttggagaaagcctacgacaccacgtggaagtatggcattatgaaagatcttcataatatgggccttcgtggccatttagctacatttattttaaactttttagatgatagacagtttcaagtccgaatgggaacaaccctctcagatgttcacaaacaggagatgggcgtcccacaaggcagtattctgtctgtcacactttttaatattaaaattaataatattgttaagagtataaatcctggtgtggattgctctttatatgttgacgattttgtaatttgttaccgttcaaaaaatatgaaaactattgaaaggcaactacagcaataccttaataaacttcagacttggtctg
gi|14                         : ccgtccaattgctttgacaagttgtgtttgtaaaaccatggaacgtatgattaatggtaAA-TGGTCTGTAGTGCCCC-TTTGGCGTC--GGAATCCA----CTT----TGATACTTAGTAATTAAG----TTGTTGGATTCCAAGA-A--CCAAACGAGGC------GAC------CATTtagttagatttgaatcgtttgctaggaaggctttcataaagaaagaacatttagtcgctgtattttttgactgagaaagcctacgacaccacgtggaagtatggcattatgaaagatcataaaatgggccttcgtggccgtttagctaactttattttaaactttttagacgatagacagtttcagatagaccctctttgatgttcacaaacaggagatgggcgtacaacaaggcagtattctgtctgtcacattttttaatataaaaattattaatattgttagagcataaatcctggtgtggattgctctttatatgttgacgattttgtaatttgttaccgttcaaaaaatatgaaaactattgaaaggcaactgcaacaatgccttaataaacttcagactttgtctgatgaaaacagttttaaattttttaagtctaaa
gi|12                         :        ccgtccaattgctttgacaagttgtgtttgtaaaaccatggaacgtatgattAA-TGGTCTATTGTGCCTC-TTTGGCGTC--GGAATCCA----CTT----TGATACTTAGTAATTAAG----TTGTTGGATTCCAAGAAT--CGAAC-GAGGC------GAC------CATTtagttagatttgaatcgtttgttagggaggctttcataaagaaagaacgtttagtcgctgtatttttttacttggagaaagcctacgacaccacgtggaagtatggcattatgaaagatcttcataatatgggccttcgtggccgtttagctacatttattttaaactttttagatgatagacagtttcaagtccgaatgggaacaatcctctccgatgttcacaaacaggagatgggcgtcccacaaggcagtattctgtctttcacactttttaatattaaaattaataatattgttaagagtataaatcctggtgtggattgctctttatat
gi|13                         :                                                                           gtccagttgctttgacaagttgtgtttgtaaaaccatggaacgcatgattAAG----T----GGATTCC--GACG--CCAAA-GAGGCACAACAGAC------CATTTGACTAGATTTGAATCGTT-GTA---AAGGGAGGCTTTCAT---AAA-AAAGAA---CATCTAGTCGCAGTATTTTTTGACTTGGTGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGTCTTTGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAATATTTTAGATGATAGACAGT--TTCAAGTCCGAATGGGCACGACCCTTTCCGTTGT-CACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTATCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTG-ATAATATTGT-TAAGAGCATTAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTTATTTGTTACCGTTCTAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTCAAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAAtagttggatttgaatcgattgttagggagactttcatagagaaagaacattaagtcgctgtatttttttacttggagaaagcctacgacaccacgtggaagtatggcattatgaaagatcttcataataatatgagccttcatggccgtttagctacctttattttaaattttttagatgatagacagtttcaagtccgaatgggaacaaccctctatgatgttcacaaataagagatgggcgtcccacaaggcagtattcggtctctacactttttaatatcgaaattaataatattgtttagagaataaatcctggtgtggattgttctttatatgttgacgattttgtaatttgttacctttcaaaaaatattgaaagaatgccttaataaacttcaaacttga
gi|27                         :                                                                                                                                              CT--GACG--CCTAA-AAGGAACAACCGAC------AACTGAATAAGATTTGAATCGTTCATT---A-GGGAGACTTGTATTTAAAAAAAACAACAGCACTTAGTTGCTGCAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                       TTTGTTCATA-GGGAGGCTGTCAT---AAA-AAAGAA---CATTTAGTCACTGTATCTTTTTACTTAGAGAAAGCCTACGATACCACGTGGAAGTATGGCATTAacgataccaattagaagt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           cgtAAGACTATGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTTACCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAAT--TTTAAGTCCGAATGGGAACAGCCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGACGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATATTTTAATTATTTACCATTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGTAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCCAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTTTCATAATTCTAGTA---TAAACCTTCCAAGCCGTTTAGCTAC--TTCTTTTTAACTTTTTAGATGATAGACAGT--TTCAATTCCGAATGAGCACGACCCACTCCGGTGTTCACAAACAGGAGATGGGCAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATAGTTATTT-AAACTCTTTAGATG--AAATATTTGTTAAAGTTCAACT---AATTAACCTCTTATATATT-ACAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaattttcctagtataattctttagaactttgataCCCCCTCGGATGTACACAAACAGGAGATGGG-GTCCCACAAGGCAATATATGGTTTGTCACACTTTTTTAT-ATT-------AAAATTA-AGTGTATTGT-TAAGAGCATTAATACT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGATGATTTTGTAATTTGTTACCGTTC-AAAAATATGAAA----ACTATCGAAAGGCAACTACAACAATGCCTTGATAAACTTCTGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCC-AAGTCTAAAgcaaaattctgtctggtacactttaataattaaaaaaaaaaaatacataatattacataagagcattaatctaaggttatattgctcttttatgttatattttgttatagttaaaacatatgaaacaccactatttaggcaaataatacaatgcatgtatttatttcgaggaaatcggtttcatttttttaatctaaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTTGACAAACAATATATGGGCGTCCCACAAAGCAGTGTTTTGTATGTCAC-TTTTTTAAT-AGC-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAATTCATTAATCCA--GATGAGGATTGTCCCTTATATGTCGACCATTACGTTATTTGTTATCGTTAAAAACATATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCACTAGCCATTATTCTGTCTGGCACTCTTTTTAAT-ATG-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAGGAGCATTAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTAATATGTTGATGTTTTTGTAATTTGTTACATTTAAAAAAATATGAAA----ACTACTGAAAGGCATCTACAACAGTGCCTCAATAAACTTCA-----GGTCTGATGAAAATGGTTTTAA-ATT--TTCC-AAGTCTAAAtcgatgatctaactttaaatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACAAAGCAAAATTCTGTCTGGTACAC--TTTAATAATTAAAAAAAAAAAATACATAATATTACATAAGAGCATTAAT-CTAAGGT-TATATTGCTCTTT-TATG---------TTATATTTTGTTATAGTT-AAAACATATGAAACACCACTATTT--AGGCAAATAATACAATGC----ATGTATTT---ATTT----CGAGGAAATCGGTTTC---ATT--TTTT-TAATCTAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaattttcctagtataattctttagaactttgatatatagttatttaaactctttagatgaaatatttgttaaagttcaactaattaacctcttatatattAAT-ATA-------ATAAATA-ATGCTATTGT-TAAGAGCATTGATCCT--GGTGTGGATTACACTTTATATACGGACAAGTTTGTAATTTGTCACCGTTC-AAAAATACGAAA----------GAG----AACTACAACAATGCCTTTA-AAAATACAGACTTGGTCTGATGTAGACGATTTTAA-ATT--TTCC-AAACCGAAA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATAGTTATTT-AAACTCTTTAGATG--AAATATTTGTTAAAGTTCAACT---AATTAACCTCTTATATATT-----------------------ACAAAGCAAAATTCTGTCTGGTACAC--TTTAATAATTAAAAAAAAAAAATACATAATATTACATAAGAGCATTAAT-CTAAGGT-TATATTGCTCTTT-TATG---------TTATATTTTGTTATAGTT-AAAACATATGAAACACCACTATTT--AGGCAAATAATACAATGC----ATGTATTT---ATTT----CGAGGAAATCGGTTTC---ATT--TTTT-TAATCTAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaattttcctagtataattctttagaactttgataCCCCCTCGGATGTACACAAACAGGAGATGGG-GTCCCACAAGGCAATATATGGTTTGTCACACTTTTTTAT-ATT-------AAAATTA-AGTGTATTGT-TAAGAGCATTAATACT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGATGATTTTGTAATTTGTTACCGTTC-AAAAATATGAAA----ACTATCGAAAGGCAACTACAACAATGCCTTGATAAACTTCTGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCC-AAGTCTAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCACTAGCCATTATTCTGTCTGGCACTCTTTTTAAT-ATG-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAGGAGCATTAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTAATATGTTGATGTTTTTGTAATTTGTTACATTTAAAAAAATATGAAA----ACTACTGAAAGGCATCTACAACAGTGCCTCAATAAACTTCA-----GGTCTGATGAAAATGGTTTTAA-ATT--TTCC-AAGTCTAAA
gi|19                         : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCTTGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGTCAAAGGGGCACTA-CAGGT------CATTTAGTTAGATATGAAGCCTTTGTT---A-GGGAGGCTTT
gi|2                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACCTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTA-CAGAC------CATTTAATTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAAAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTGCATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTCTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATCGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAAgtaggagcacatttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTGACAAACAATATATGGGCGTCCCACAAAGCAGTGTTTTGTATGTCAC-TTTTTTAAT-AGC-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAATTCATTAATCCA--GATGAGGATTGTCCCTTATATGTCGACCATTACGTTATTTGTTATCGTTAAAAACATATAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAT-ATA-------ATAAATA-ATGCTATTGT-TAAGAGCATTGATCCT--GGTGTGGATTACACTTTATATACGGACAAGTTTGTAATTTGTCACCGTTC-AAAAATACGAAA----------GAG----AACTACAACAATGCCTTTA-AAAATACAGACTTGGTCTGATGTAGACGATTTTAA-ATT--TTCC-AAACCGAAAtcgatgatctaactttaaatg
gi|22                         :  CGCTCAATTGCTTTCAAACTGACAAATTGTATTTGTAAAACCATGGAACG-----------GTCGCCTCGTTTGATTCTTGGAATTCAATAACTTAAT------------AACTGGATTCCGGTGCCGAAGAGGCAC-AACAGAT------CATTTAATTAGTTTTGAATCGTT
gi|23                         :   tTCTAATTA-TTT------GACAAATTG-GTTTGTAAAATCATTGAACGTATGACAAATGGTCACCTCGTTTCTTTCTGGGAATC---CAACTTAATTACTAAGTAACAAAGTGAATTCCGACGCCGAAAAAGCACAA-CAGACCAATGGCATTTGATTAGATcataa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTGTATGTTGACGATTTTGTAATGTTTTACC-TTCAAAAA-TATTAAA-----CTATTGAAAGGCAACTTCAACAGTGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAATGTAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTTTCATAATTCTAGTA---TAAACCTTCCAAGCCGTTTAGCTAC--TTCTTTTTAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAATTCCGAATGAGCACGACCCACTCCGGTGTTCACAAACAGGAGATGGGCAT
gi|27                         :                                                                                                                         CTGACGCCTAAAAGGAAC-AACCGAC------AACTGAATAAGATTTGAATCGTTCATT---A-GGGAGACTTGTATTTAAAAAAAACAACAGCACTTAGTTGCTGCAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                              TTTGTTCATA-GGGAGGCTGTCAT---AAA-AAAGAA---CATTTAGTCACTGTATCTTTTTACTTAGAGAAAGCCTACGATACCACGTGGAAGTATGGCATTAacgataccaattagaagt
gi|29                         :  cgtCCAATTGCTTT------GGCAAGTTGTATTTGTAAAACCGTGGAACGTAAGATTAATGGTCACCTCGTTTTGTTC
gi|3                          : CCGTCCAATTGCATT------GATAAGTTGTGTTTGTAAGACAATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTA-CAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCTCAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAAAAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|4                          : CCATCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAATGGTCGCCTCGTGTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAATTGATTCCGACGCCAAAGAGGCAC-AACATAC------AGTTTAGTTAGATTTGAATCATTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAAAAAGAA---CATTTAGTTGCTGTATTTTTTGACTTAGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAGT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGAAGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATTGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTGTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGGTTTTGTAATTTGTTACTGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAGCTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|5                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTA-CAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGTCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|6                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCACGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCTCAATAGGCACAA-TAGAC------CATTAAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGTTTTCAA---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTA-TTTTTGACTTAGAGAAAGCCTACAACACCACGTGGAAGTATGACATTATGAAAGATCTTTATATA------A---TGGACCTTCGTGACCGCTTAGCTGCTTTAATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTGCGAATGGGAAAAACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTGTTCTGTCTGTCATCCTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGCATAAATCCT--TGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAATGGCAACTGCAACAATGCCTTAATAAACATCAGACTTGGTCTGATGAAAATGGTTTTAAGACT--TTC--AAATCTAAA
gi|7                          :  CGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTA-CAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACATGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAGTCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|8                          : CCGTCCAATTGCTTT------GATAAGTTGATTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAATGGTCACCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAGCAACTTAATTAGTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGAGGCACAA-CAAAC------CATTTGATTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAAGCTTTCAT---AAA-AAAGAA---CATCTAGTCGCAGTATTATTTTACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATAAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTATCTTCCTTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATAGGCACGACCCTCCCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCATCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAACTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTTCAGCAATGGCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTCTAA-A----TTCTAAAGTCTAAA
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Reference ( family-3458 )     : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACGACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGCATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
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gi|19                         : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCTTGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGTCAAAGGGGCACTACAGGT------CATTTAGTTAGATATGAAGCCTTTGTT---A-GGGAGGCTTT
gi|2                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACCTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAATTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAAAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTGCATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTCTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATCGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAAgtaggagcacatttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTGACAAACAATATATGGGCGTCCCACAAAGCAGTGTTTTGTATGTCAC-TTTTTTAAT-AGC-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAATTCATTAATCCA--GATGAGGATTGTCCCTTATATGTCGACCATTACGTTATTTGTTATCGTTAAAAACATATAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAT-ATA-------ATAAATA-ATGCTATTGT-TAAGAGCATTGATCCT--GGTGTGGATTACACTTTATATACGGACAAGTTTGTAATTTGTCACCGTTC-AAAAATACGAAA----------GAG----AACTACAACAATGCCTTTA-AAAATACAGACTTGGTCTGATGTAGACGATTTTAA-ATT--TTCC-AAACCGAAAtcgatgatctaactttaaatg
gi|22                         :  CGCTCAATTGCTTTCAAACTGACAAATTGTATTTGTAAAACCATGGAACG-----------GTCGCCTCGTTTGATTCTTGGAATTCAATAACTTAAT------------AACTGGATTCCGGTGCCGAAGAGGCACAACAGAT------CATTTAATTAGTTTTGAATCGTT
gi|23                         :   tTCTAATTA-TTT------GACAAATTG-GTTTGTAAAATCATTGAACGTATGACAAATGGTCACCTCGTTTCTTTCTGGGAATCCAAC---TTAATTACTAAGTAACAAAGTGAATTCCGACGCCGAAAAAGCACAACAGACCAATGGCATTTGATTAGATcataa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTGTATGTTGACGATTTTGTAATGTTTTACC-TTCAAAAA-TATTAAA-----CTATTGAAAGGCAACTTCAACAGTGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAATGTAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTTCATAATTCTAGTA---TAAACCTTCCAAGCCGTTTAGCTAC--TTCTTTTTAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAATTCCGAATGAGCACGACCCACTCCGGTGTTCACAAACAGGAGATGGGCAT
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gi|28                         :                                                                                                                                                                             TTTGTTCATA-GGGAGGCTGTCAT---AAA-AAAGAA---CATTTAGTCACTGTATCTTTTTACTTAGAGAAAGCCTACGATACCACGTGGAAGTATGGCATTAacgataccaattagaagt
gi|29                         :  cgtCCAATTGCTTT------GGCAAGTTGTATTTGTAAAACCGTGGAACGTAAGATTAATGGTCACCTCGTTTTGTTC
gi|3                          : CCGTCCAATTGCATT------GATAAGTTGTGTTTGTAAGACAATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCTCAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAAAAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|4                          : CCATCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAATGGTCGCCTCGTGTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAATTGATTCCGACGCCAAAGAGGCACAACATAC------AGTTTAGTTAGATTTGAATCATTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAAAAAGAA---CATTTAGTTGCTGTATTTTTTGACTTAGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAGT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGAAGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATTGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTGTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGGTTTTGTAATTTGTTACTGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAGCTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|5                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGTCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|6                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCACGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCTCAATAGGCACAATAGAC------CATTAAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGTTTTCAA---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTT-GACTTAGAGAAAGCCTACAACACCACGTGGAAGTATGACATTATGAAAGATCTTTATATA------A---TGGACCTTCGTGACCGCTTAGCTGCTTTAATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTGCGAATGGGAAAAACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTGTTCTGTCTGTCATCCTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGCATAAATCCT--TGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAATGGCAACTGCAACAATGCCTTAATAAACATCAGACTTGGTCTGATGAAAATGGTTTTAAGACT--TTC--AAATCTAAA
gi|7                          :  CGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACATGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAGTCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|8                          : CCGTCCAATTGCTTT------GATAAGTTGATTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAATGGTCACCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAGCAACTTAATTAGTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGAGGCACAACAAAC------CATTTGATTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAAGCTTTCAT---AAA-AAAGAA---CATCTAGTCGCAGTATTATTTTACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATAAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTATCTTCCTTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATAGGCACGACCCTCCCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCATCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAACTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTTCAGCAATGGCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTCTAA-A----TTCTAAAGTCTAAA
gi|9                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTATAACCGTGGAGCGTATGATTAATGGTCGGCTCGATTGGTTCTTGGAATCTAACAACTTAATAACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAAGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTCAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTAGAGAAAGTCTACGACACCACGTGGAAGTATAACATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTAACTTTATTTTAAACTTTT-------TAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGCAAGACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATTGGCGTACCACAAGGCAGTATTCTTTCTGTCACACTTTTTAAT-ATA-------AAAATTG-ATAATATTGT-TAAGAGCATAATACCT--GGTGTGGATTGCTCTTGATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCGAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTGCAACACTGCCTTAATATACTTCAGATTTG----GATG--AACGGTTTCAA-ATT--TTCT-AAATCTAAA

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Reference ( family-3458 )     : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACNACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACGACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGCATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
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gi|19                         : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCTTGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGTCAAAGGGGCACTACAGGT------CATTTAGTTAGATATGAAGCCTTTGTT---A-GGGAGGCTTT
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gi|23                         :   tTCTAATTA-TTT------GACAAATTG-GTTTGTAAAATCATTGAACGTATGACAAATGGTCACCTCGTTTCTTTCTGGGAATCCAAC---TTAATTACTAAGTAACAAAGTGAATTCCGACGCCGAAAAAGCACAACAGACCAATGGCATTTGATTAGATcataa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTGTATGTTGACGATTTTGTAATGTTTTACC-TTCAAAAA-TATTAAA-----CTATTGAAAGGCAACTTCAACAGTGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAATGTAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTTCATAATTCTAGTA---TAAACCTTCCAAGCCGTTTAGCTAC--TTCTTTTTAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAATTCCGAATGAGCACGACCCACTCCGGTGTTCACAAACAGGAGATGGGCAT
gi|27                         :                                                                                                                         CTGACGCCTAAAAGGAACAACCGAC------AACTGAATAAGATTTGAATCGTTCATT---A-GGGAGACTTGTATTTAAAAAAAACAACAGCACTTAGTTGCTGCAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                             TTTGTTCATA-GGGAGGCTGTCAT---AAA-AAAGAA---CATTTAGTCACTGTATCTTTTTACTTAGAGAAAGCCTACGATACCACGTGGAAGTATGGCATTAacgataccaattagaagt
gi|29                         :  cgtCCAATTGCTTT------GGCAAGTTGTATTTGTAAAACCGTGGAACGTAAGATTAATGGTCACCTCGTTTTGTTC
gi|3                          : CCGTCCAATTGCATT------GATAAGTTGTGTTTGTAAGACAATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCTCAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAAAAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|4                          : CCATCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAATGGTCGCCTCGTGTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAATTGATTCCGACGCCAAAGAGGCACAACATAC------AGTTTAGTTAGATTTGAATCATTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAAAAAGAA---CATTTAGTTGCTGTATTTTTTGACTTAGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAGT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGAAGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATTGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTGTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGGTTTTGTAATTTGTTACTGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAGCTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|5                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGTCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|6                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCACGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCTCAATAGGCACAATAGAC------CATTAAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGTTTTCAA---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTT-GACTTAGAGAAAGCCTACAACACCACGTGGAAGTATGACATTATGAAAGATCTTTATATA------A---TGGACCTTCGTGACCGCTTAGCTGCTTTAATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTGCGAATGGGAAAAACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTGTTCTGTCTGTCATCCTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGCATAAATCCT--TGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAATGGCAACTGCAACAATGCCTTAATAAACATCAGACTTGGTCTGATGAAAATGGTTTTAAGACT--TTC--AAATCTAAA
gi|7                          :  CGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACATGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAGTCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|8                          : CCGTCCAATTGCTTT------GATAAGTTGATTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAATGGTCACCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAGCAACTTAATTAGTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGAGGCACAACAAAC------CATTTGATTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAAGCTTTCAT---AAA-AAAGAA---CATCTAGTCGCAGTATTATTTTACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATAAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTATCTTCCTTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATAGGCACGACCCTCCCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCATCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAACTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTTCAGCAATGGCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTCTAA-A----TTCTAAAGTCTAAA
gi|9                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTATAACCGTGGAGCGTATGATTAATGGTCGGCTCGATTGGTTCTTGGAATCTAACAACTTAATAACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAAGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTCAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTAGAGAAAGTCTACGACACCACGTGGAAGTATAACATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTAACTTTATTTTAAACTTTT-------TAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGCAAGACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATTGGCGTACCACAAGGCAGTATTCTTTCTGTCACACTTTTTAAT-ATA-------AAAATTG-ATAATATTGT-TAAGAGCATAATACCT--GGTGTGGATTGCTCTTGATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCGAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTGCAACACTGCCTTAATATACTTCAGATTTG----GATG--AACGGTTTCAA-ATT--TTCT-AAATCTAAA


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blockSeqs                     :                .                                                                                                                          T      .                                .   .             .     G      .                                                                                   .      .                           A                                .                   A                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
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blockSeqs                     :                .                                                                                                                          T      .                                .   .             .     G      .                                                                                   .      .                           A                                .                   A                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
blockSeqs                     :                .                                                                                                                          T      .                                .   .             .     A      .                                                                                   .      .                           A                                .                   A                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
blockSeqs                     :                .                                                                                                                          T      .                                .   .             .     G      .                                                                                   .      .                           A                                .                   T                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
blockSeqs                     :                .                                                                                                                          A      .                                .   .             .     A      .                                                                                   .      .                           A                                .                   A                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
blockSeqs                     :                .                                                                                                                          A      .                                .   .             .     G      .                                                                                   .      .                           A                                .                   G                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
blockSeqs                     :                .                                                                                                                          A      .                                .   .             .     G      .                                                                                   .      .                           A                                .                   A                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
blockSeqs                     :                .                                                                                                                          T      .                                .   .             .     G      .                                                                                   .      .                           A                                .                   A                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
blockSeqs                     :                .                                                                                                                          A      .                                .   .             .     G      .                                                                                   .      .                           T                                .                   A                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
blockSeqs                     :                .                                                                                                                          T      .                                .   .             .     .      .                                                                                   .      .                           A                                .                   A                                                                        .   .             .          .                .                                                                .                                                                       .   .     .
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Reference ( family-3458 )     : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACNACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACGACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGCATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
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gi|19                         : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCTTGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGTCAAAGGGGCACTACAGGT------CATTTAGTTAGATATGAAGCCTTTGTT---A-GGGAGGCTTT
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gi|23                         :   tTCTAATTA-TTT------GACAAATTG-GTTTGTAAAATCATTGAACGTATGACAAATGGTCACCTCGTTTCTTTCTGGGAATCCAAC---TTAATTACTAAGTAACAAAGTGAATTCCGACGCCGAAAAAGCACAACAGACCAATGGCATTTGATTAGATcataa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTGTATGTTGACGATTTTGTAATGTTTTACC-TTCAAAAA-TATTAAA-----CTATTGAAAGGCAACTTCAACAGTGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAATGTAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTTCATAATTCTAGTA---TAAACCTTCCAAGCCGTTTAGCTAC--TTCTTTTTAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAATTCCGAATGAGCACGACCCACTCCGGTGTTCACAAACAGGAGATGGGCAT
gi|27                         :                                                                                                                         CTGACGCCTAAAAGGAACAACCGAC------AACTGAATAAGATTTGAATCGTTCATT---A-GGGAGACTTGTATTTAAAAAAAACAACAGCACTTAGTTGCTGCAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                             TTTGTTCATA-GGGAGGCTGTCAT---AAA-AAAGAA---CATTTAGTCACTGTATCTTTTTACTTAGAGAAAGCCTACGATACCACGTGGAAGTATGGCATTAacgataccaattagaagt
gi|29                         :  cgtCCAATTGCTTT------GGCAAGTTGTATTTGTAAAACCGTGGAACGTAAGATTAATGGTCACCTCGTTTTGTTC
gi|3                          : CCGTCCAATTGCATT------GATAAGTTGTGTTTGTAAGACAATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCTCAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAAAAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|4                          : CCATCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAATGGTCGCCTCGTGTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAATTGATTCCGACGCCAAAGAGGCACAACATAC------AGTTTAGTTAGATTTGAATCATTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAAAAAGAA---CATTTAGTTGCTGTATTTTTTGACTTAGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAGT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGAAGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATTGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTGTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGGTTTTGTAATTTGTTACTGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAGCTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|5                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGTCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|6                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCACGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCTCAATAGGCACAATAGAC------CATTAAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGTTTTCAA---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTT-GACTTAGAGAAAGCCTACAACACCACGTGGAAGTATGACATTATGAAAGATCTTTATATA------A---TGGACCTTCGTGACCGCTTAGCTGCTTTAATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTGCGAATGGGAAAAACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTGTTCTGTCTGTCATCCTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGCATAAATCCT--TGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTAAAAAAATATGAAA----ACTATTGAATGGCAACTGCAACAATGCCTTAATAAACATCAGACTTGGTCTGATGAAAATGGTTTTAAGACT--TTC--AAATCTAAA
gi|7                          :  CGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATTAATGGTCGCCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAACAACTTAATTACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACATGGAAGTATGGCATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTACATTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGAACAACCCTCTCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCGTCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAATTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAGTCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTACAGCAATGCCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTTTAA-ATT--TTCT-AAGTCTAAA
gi|8                          : CCGTCCAATTGCTTT------GATAAGTTGATTTTGTAAAACCATGGAACGTATGATAAATGGTCACCTCGTTTGGTTCTTGGAATCCAGCAACTTAATTAGTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAGAGGCACAACAAAC------CATTTGATTAGATTTGAATCGTTTGTT---A-GGGAAGCTTTCAT---AAA-AAAGAA---CATCTAGTCGCAGTATTATTTTACTTGGAGAAAGCCTACGACACCACGTGGAAGTATGGCATTATAAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTATCTTCCTTTATTTTAAACTTTTTAGATGATAGACAGTT--TCAAGTCCGAATAGGCACGACCCTCCCCGATGTTCACAAACAGGAGATGGGCATCCCACAAGGCAGTATTCTGTCTGTCACACTTTTTAAT-ATT-------AAAACTA-ATAATATTGT-TAAGAGTATAAATCCT--GGTGTGGATTGCTCTTTATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCAAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTTCAGCAATGGCTTAATAAACTTCAGACTTGGTCTGATGAAAACGGTTCTAA-A----TTCTAAAGTCTAAA
gi|9                          : CCGTCCAATTGCTTT------GACAAGTTGTGTTTGTATAACCGTGGAGCGTATGATTAATGGTCGGCTCGATTGGTTCTTGGAATCTAACAACTTAATAACTAAGTATCAAAGTGGATTCCGACGCCAAAAGGGCACTACAGAC------CATTTAGTTAGATTTCAATCGTTTGTT---A-GGGAGGCTTTCAT---AAAGAAAGAA---CATTTAGTCGCTGTATTTTTTGACTTAGAGAAAGTCTACGACACCACGTGGAAGTATAACATTATGAAAGATCTTCATAAT------A---TGGGCCTTCGTGGCCGTTTAGCTAACTTTATTTTAAACTTTT-------TAGACAGTT--TCAAGTCCGAATGGGCAAGACCCTCTCTGATGTTCACAAACAGGAGATTGGCGTACCACAAGGCAGTATTCTTTCTGTCACACTTTTTAAT-ATA-------AAAATTG-ATAATATTGT-TAAGAGCATAATACCT--GGTGTGGATTGCTCTTGATATGTTGACGATTTTGTAATTTGTTACCGTTCGAAAAATATGAAA----ACTATTGAAAGGCAACTGCAACACTGCCTTAATATACTTCAGATTTG----GATG--AACGGTTTCAA-ATT--TTCT-AAATCTAAA