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lowQualScore : 0 0 0 0 0 00 0 0 0 5 0 55 555 00 0 55 55 555555 0 0 0 00 0 55555 3 0 3 333 3 33 0 22222222 2 8 8 8 8 0 2 55555 2 2 888888 88 88 88 2 2 2222 0 0 000000000 5555 5 000000000000000000 000000 333 3 0 3 000000000000000 3 0 3 33 00 33 3 333 3 3 3 3 3 0 7 0 7 33 3 2 2 22222 2 8888 2 55 0 2 22 5 0 0 2 0 2 222222222222222222222222222222 8 22 8 000000 0 444 0 66 00 4 0 0000000 0 7 7 0 55 5555555555555555 2 8 5 2 7 7 7 6666666 9 7 7 6 999 0 4 99 0 0 1 5 6666 5 2 2 8 22 4 0 0 5555 4 555 3 44 0 4444 8 2
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gi|14 : ----TAGCT-TTCCTAAAACTACATCATATTTCTTACATAGTAGTATTAAGA--A-T---ATTTTTAA
gi|14 : TTTTTAAGC-------GAAAAATGTTGTGTAAA-TTTAACTGTAATGACCA-GCTCAATTCAGCTGTCTGTATC--TCATTCATTTGATAACGGA--TTAAATTGTC-ATT---GTTC------------------AGCTTTATAAACATAA-GAACATTTTTAA----AATCAGTTAAT--AAATAAAG-AAGTTAATATGCACTGCCAGCCACCCTTTCTAAA-AGTAACTAAATTTAgcgaaaaatgttgtgtaaatttaactgtaatgaccagctcaattcagctgtctgtatctcattcatttgataacggattaaattgtcattgttcagctttataaacataagaacatttttaaaatcagttaataaataaagaagttaatatgcactgccagccaccctttctaaaagtaactaaattta
gi|15 : tagctttcctaaaactacatcatatttcttacatagtagtattaagaataAC--AAATAAAG-AGGTTAAAATACATCGCCAACTTCCGTTACTAAA-AC-ACCTAAATTGAACGGTACCGCCATATTTTATACCTGTCC
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gi|2 : aaatacAAATGGCCAAAAAATGCCA--CAGGTTGAATCAAAAAAATTAATAGAATAAAA--T-------GCACTTACAGATTACCAGA-----TTGATGCTATTGATAATTTGAGGTAATAAAATGTGT-CT--TA---TGATTCCATAAAGTCTGCGTTAACAGTCC------AGAGAGCT--TTTCGTGAAAATGATCAAGATGTATAT----AA
gi|2 : aATGTTACAATTCTCTATTTCTTATTTGAAAT----TATAGTTCGATACAG----------------------TATGTGAT---T-TT---------TAA-TTATTGATTATGCTTTTAT----G--ACTAT--GT--AATAACTATTGTT-TACACTTTACCGTTT-GC-TTTTTTTATACGCCCATAATT--AT-TAAAAATCGTT-ACCACCATTAATTTATGAACATATTTTTTTTAAAAA--A--GCACAAGGTCAACTCTTCATACTTTCTTCATTTCTAATTTGATTTTGATTTTCTTTATATCACATCGA---CTACAGATTTTCATCATTAT-A------------AAATCAGA--CACACAATAAATA----TTGTAAGGGGT-ACAAACCAGAGTTTTC-CAACGGCACAA------------TT----------------CGATTTGAATTTATATTTTTCA---------GTATGTATTTTGAAAAGCTT---CA--ATTTCCAATA-AATT----TA------TCT--------------TTCCTTAAACAG-CAT-TA---------TG--TTTCTTATA-----TAGGAA-GCTAAAGGGTACCGTCAGGTTTT-CAAGC-------GAAACCTGTTTTGTAAAGTTTAG-AACAATGACTA-GCTCAATTCAACTGTATGTGTC--TCATTCATTTGATAATCGA-TATGAATTATT-TTTTCTATTTCAGAAACAAGTTATTCTAAGCTTCCGAAGTGTAGAAAACA-TATTAA----AATTGGTTAAA--TAATAAAG-ACATTAAGAGGTATCGCCAGCTgatacagatgtttaaagacagatagctgtggactgctgcaaatcaatttgaaaaactcatgcattatcaatatgtaacagaggaaaacggtgtatacatatggcttattgggcgtacatgtgataatcaattcaataaatgttacaattctctatttcttatttgaaattatagttcgatacagtatgtgatttttaattattgattatgcttttatgactatgtaataactattgtttacactttaccgtttgctttttttatacgcccataattattaaaaatcgttaccaccattaatttatgaacatattttttttaaaaaagcacaaggtcaactcttcatactttcttcatttctaatttgattttgattttctttatatcacatcgactacagattttcatcattataaaatcagacacacaataaatattgtaaggggtacaaaccagagttttccaacggcacaattcgatttgaatttatatttttcagtatgtattttgaaaagcttcaatttccaataaatttatctttccttaaacagcattatgtttcttatataggaagctaaagggtaccgtcaggttttcaagcgaaacctgttttgtaaagtttagaacaatgactagctcaattcaactgtatgtgtctcattcatttgataatcgatatgaattattttttctatttcagaaacaagttattctaagcttccgaagtgtagaaaacatattaaaattggttaaataataaagacattaagaggtatcgccagcttctct
gi|3 : aaaatggccaaaaaatgccacaggttgaatcaaaaaaattaatagaataaaatgcacttacagattaccagattgatgctattgataatttgaggtaataaaatgtgtcttatgattccataaagtctgcgttaacagtccagagagcttttcgtgaaaatgatcaagatgtatataagatacagatgtttaaagacagatagctgtggactgctgcaaatcaatttgaaaaactcatgcattatcaatatgtaacagaggaaaacggtgtatacatatggcttattgggcgtacatgtgataatcaattcaataaTGACTATGTAATAAATGTTGACCATGCATAAATTGTTGATTGT-CTCATACACCCGTTAGTATTAATTAAATACCAAGTGCGATAAA--TTAT-GTTTCACACCTTTTT---CTCCCTTACCTTGACATGGAACACGTTTACCACTATTAGCCGACGGGCACAATTTGTGGTAAAATAATTGCTCAAGTTCATCGCTTCGTAACTTCTTTATTTCTTATCCAATTTTAATTTTCTATATATCACA--GAAAACAAAAGAGCTTCAGCATTAC-AATCATGTAAAGCAAATTGAAATCAAATAACAAATAAAGATTTTAAGGG-T-ACCG-CCAGGTTTTTC-CTTCAGCAAAA------------TT-TATTGCGAAATATTACATTTTAAGTACGTATTTTGTAAGA------ATGTATCTTCCGTAATACTTGATCA--ATTTTTAATA-ACTT----TAGCT-TTTCTAAAACTACAATATGTTACTTACATAGACATATAAAAA--A-ATGAATTTCTAATAATCAATAAAAAAGTTAAAGGGTACCGCCAGGTTTTTCAAGC-------GGAAAATATGGCGTAAA-TCTAGTCGCAATGATGT-GTTTGTTTTTACCATCCGTATC--TCATTCGTTTGATAATGGA-TTTTTTATATC-TTTTCAGTTTCAGAAACTAGATATTCTAAGCTTTTTAATGATAT-AAACATTTTTAA----AATCTGTTAAT--GAATAAAG-AAGTTATCAGGCACCGCCAGCTACTCCTTCTAAA-AA-TCCTAAATTTAACACTACCGCCAGGTTTTACACCTGTCCtctct
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gi|5 : AATAATAAATGAAAAAGTTAAAGG-TAACGTCAGCTTTTAAGAGCTTTTTTAAAAAAATGT---GCAAA-TTTAATTGCAATGACTAAGCTCAATTCAAATGTCTCTATC--TCATTCATTTGATAATGCATTTTTAATTA---ATTGTAGTTTTGAAATCAAGATATCTTCAGTTTTC-AAACATAT-AAACATGATTAA----AATCTGTTAAC--AAAT---G-AAGTTAAAATACACTGCCAGCTTCCATATCTAAA-A-----------TAACAATACTGCCttttactctgcatcactttttcgtgtttcacaaccaatctcctattgagaccagtcaggttacacaacatcaaacttccatctacttcctattttgtcagtgtataaataaaattaaagataaaagtcaagatactagactggctactaacgtatgcagatgatgtattatagtcgcttattaatatttacatttaatggttcattaggtgtaaagtctttcaaaaccatttaaacatcattgcatggtcttctctgctaaatattcatgatctgaagctttaaatgcagttcagttggatctattctgaacttctttttaccgcgcattcttatagaggagtattttgcaatatatgttaaaagtcaaccaaaagtggatagcatcagaaatccagcattagtactttggcctttggggcaagccctagaccaaagaaaaaacaaaaaacatattatataatgccagattgaattcattcatttgacatttagaatgttttcatttgcataaa
gi|6 : ACAAAATGTCAACATTAT-A--TATATATA------TATA--CATACCATAAA-AACGACTTTAAGGGGT-ACCG-CGAATTTTTTTACATAGGAAAAAAATAATACAATGTCGTA-------------TATTTTCAGGACGTAGTTT--AAAA------GGCTA-----CACGATTCTT--CCGTTATTTTGAATA-A-CG----TAAGTACTCCTGAAACTACATTATGTTTCTAACATAGAAAAATAAAGACTA-TTAAAAT-CAAATAATAAATTAAAACGTGAAATCGTGCTGCGAATTGTTTCGGGC-------GAAACATATTGTGTAAA-TGTAGTCGAAATGAACA-GTTAAGTTCAAATGTCTTTACA--TCATTCATTTAATAATGGA-CTTTTATAACC-TTTTCAGTTTCGG-----AGATATTATTATCTTTCTTGACATAT-AAATATCACGAATATCAATTAATTAAT--CAATTAAG-AAGTTAACTTGAATCGCCAGATACC-CTTCTATA-AA-TACTAAATCTAACAGTACCGCCATGTTTTTCACCGGTCtttccctactctgtatcacttttacatgttacactgcacattgtgagtagctggtgtacatttttgaacccttccagtgaagtttgattacacaacttggacaggttaactctgccatctatgatacataaactggccactgtgtgcagatggggcattatggttgtgcataaaaaaaaaaaaaaatttcaaatttattatggttcattaaggtctaagtctatcaaaataattaatatgtggtcttttctgccagatattttaaataattttgaccgtgcattcattctcacataaaagttatttgcactttttggatggcaatcagccaaaagtggagcttgtca
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blockSeqs : A .
blockSeqs : . .
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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