lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 88888 11 2222 11 11 11 222 1 22222222 1111 1 1 1 1111 111111 11 111 1 1 11 11 1 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111 55555555555555555555555 111111111 1111111 444444444444444444444 1 11 555555 1
lowQualScore : 6 5 6 5 99 6 00000 11 0 66 3 5 1111 7 22 0 55 8 5 55 5 5 000 6 3 2 3 3 6 44444444 6 88 7777 44 1 5 3 7 7 5 3 5 11 6 3 4444 666666 1 44 3 3 111 8 5 6 1 7 11 11 3 7 7 6 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 44 1 1 3 666 3333333333333333 99999999999999999999999 22 2 444444 1 0 777777777 888 1 1 1 3333333 555555 1 333333333333333333333 333 4 333 0 44 6 666 1 4 3 00 66 66 4 6 777777 2 4 7 4 6 6
lowQualScore : . . . . .. . ..... .. . .. . . .... . .. . .. . . .. . . ... . . . . . . ........ . .. .... .. . . . . . . . . .. . . .... ...... . .. . . ... . . . . . .. .. . . . . ........................................................................................................................................... . .. . . . ... ................ ....................... .. . ...... . . ......... ... . . . ....... ...... . ..................... ... . ... . .. . ... . . . .. .. .. . . ...... . . . . . .
lowQualScore : 0 0 7 0 88 0 00000 00 8 77 3 0 4444 6 00 6 77 1 0 77 7 7 000 0 0 8 5 5 7 22222222 0 22 0000 88 5 0 2 0 0 7 9 7 11 0 5 2222 333333 0 22 2 3 777 0 0 0 4 0 00 00 0 0 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 33 8 7 6 000 6666666666666666 55555555555555555555555 44 5 666666 7 7 555555555 999 7 7 7 5555555 222222 8 777777777777777777777 555 0 555 3 66 8 444 5 9 6 88 11 99 0 0 555555 5 0 0 0 0 0
consensus : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAACG-TGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGA--GAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCGGTTGTAAT---AGCTTCNATTTGTCCATCAATGATGGAC--ATGGGAGCCTCGATTAT--CT-GAAAG-GTAA---GAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGANGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATAAGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGGGAGAT----AAATAAAAGAAACAATTACCTTGA-TACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGAT-CTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC--TG-GTGTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCAAA--T-TGT-GTTAC--ATC-----C--G-------TAC-------TG-A--G-A-------TTT--ACCTGTAC------CT-AAAACGTA--------GAC--CTAC-CTT-TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TATTN-AA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTNAAATGCGGCAACTACTCGTATATNACTATNACAGTCANTTCATTACATAAAATATGTGTGTCA
Reference ( gi|1 ) : AGTGATTCTACAAGTTTGTAAGTGTAATTGTTAAGATAGTATTTCCCTGAACG-TGTAACTGGACAGGGATATGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATACCCAGAGCATTTTATAAAATACTCAAGTTGACTGT-----CGGA--GAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCTAGTCACATTTCCAATTGTAAT---GGCTTCGATTTGTTTATCAATGATGGAC--ATTGGAGCCTCGATTAT--CT-GAAAG-GTAA---GAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATATTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCGAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACCTCCCCACCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTCATTGGATGGAACGCTTTGAACATAAACTTCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATAAGTGGGATAAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAAGGAGAT----AAATAAAAGAAACAATTACCTTGT-TACTCGAATTTCTCGTAGTATC-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGAT-CTCGCCAAAGTGTAAGTTGGACAGCCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTTCGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC--TG-ATATAACATGTAATGGGTGCTTTTACTAATTTATACACGTGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCAAA--T-TGT-GTTAT--ATC-----T--G-------TAC-------T-------A-------TTT--ATCTGTAC------CT-AGAACGTT--------GAC--ATAC-CTT-TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GAGTGTGCA---TTTTACAAT-TATTT-AA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCAACAAC------TATATGACTATAACTGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCAA
gi|2 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTCATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAACG-TGTTACTGGACAGGGTAAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGA--GAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATTTTCAGTTGTAAT---AGCTTCAATTTGTCCATCAATAATGGAC--ATGGGAGCCTCGATTAT--CT-GAAAT-GTAA---GAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCAAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCATCAAGGCTTGGTTGGGTCTGTTGGTAGTGTGT
gi|3 : ttgtttgctgatggagAGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTTTTTCCATGAACG-TGTAACTGGACCGGGATAGGTAGCCGCTAGCAAACAACATCTTCCATATTATCGACTATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATTCTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGA--GAAGTTTCCATTTTTACGCCTATTTGCTATTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAAT---AGCTTCGATTTGTCCGTCAGTGATGGAC--ATGGGAGCCTCGATTAT--CT-GAAAG-GTAA---GAAAAGTATGTGATTGTGCCAGTTTTGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAACATGAGTCCAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|4 : ttgttttcggatggagAGTGATTTTAGAAATTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCTT-AACGGTGTAACTGAACAGGAATAGGTAGCTGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCATGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGA--GAAGTTTCCATTTT-ACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAAT---AGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGTTC--ATGGGAGCCTCGATTAT--CT-GAAAG-GTAA---GAAAAGTATGTGTATGTGC-AGTAACTTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATTATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTACATGGAATTAAAACTATGAGTGCAGGATTTCAAAACTTGCT-TAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCACGGCTTGGCTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctatggtaattggatggaacgttttgaacattaacatcaatattcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaagatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaataaaagaaacaattaccttaatactcgaatttcccgtagtattaagtccaatgactttctgccactcagaggtgacgcagtggtcaacggaaataaactgacctattgcaaggtcatgagtactatgattctcgccaaagtgtcagctagacagtctccccatcatcagataatgtaattgtccgaatttttgtatcagtggtacccgccatcaccgtacgtatggcgtcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactggtgtaacatgttatgggtgctattaataatttatacacatggagagtttatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaagttgtgttatatctgtactatttatatgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctattaagtgtgcgcattttacaattatttaaaaaatatatattctcttctttttatgctttcactttgtcctggct
gi|7 : tgtttgcgggtggagAGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAACG-TGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCATCCATATCATCGACCATGCCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCTAGTTGACTGT-----AAAGTTGGAGTTTCCATTTTTACGGCTTACTGTTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAAT---AGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGGAA--ATGGGAGCCTCGATTAT--CT-GAAAG-GTAA---GAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTCAATTTGAATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCTAAATTATTAAAAAGCGGGAAAAGAAAGTAACTTCCCCGTCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttacaacttgaatatgtagacagttattataaccgccatatttggctggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattataaggatttgatttgtaattatgggcagggaaatattgttttattgtagactttgtcagtcttatagttccatactaggagatatacttatgatgggatg
gi|8 : AGTGATTTTACAAATTTATAAGTGTA-TTTTTAAAACAATATTTCCCTGAACG-TGTAACTAGACAGGGATAGGTAACCGCTGGCAAACAGCCTCTTCCATATCATCGACCATGTC------CAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAATCGGA--GAAGTTTCCAATTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCATTTGTAAT---AGCTTTTATTTGTCCATCAATGATAGAC--ATGGGAGCTTCGATTAT--CT-GAAAG-GTAA---GAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTAC
gi|17 : ttatttgcggatggagAGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTGTAAGATAGTATTTCCCTGAACG-TGTTACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGTAAACAGCATCTTCCATATTATCGACCA
gi|14 : CATCTTC-ATAACATTTACC-----TATACCCAGAGCAT
gi|2 : tgtatgcaaaattatgtatcatcTACTTTTCT---TACATTTCAGAT---AATCGAGGCTCCCAT--GTCCATTATTGATGGACAAATTGAAGCT---ATTACAACT-GAAAATGTGACTGGAGAAGTAagacctacctttcttagctgtatccaatatttactattcaatgtgcgcattttgctattattaaatatatattttatttttttcaattta
gi|7 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgcTACTTTTCT---TACCTTTCAGAT---AATCGAGGCTCCCATTT--CCATCATTGATGGACAAATTGAAGCT---ATTACAACTGGAGAT-GTGACTGGAGAAGTAtgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|32 : agtgattttacaagtttgtaagtgtaatttttaagatagtatttccctgaacgtgtaactggacagggataggtagccgctggcaaacagcatcatccatatcatcgaccatgcctatgtccagagcattttgtaaaatactctagttgactgtaaagttggagtttccatttttacggcttactgtTTCGAGGTTTAATTTGTATGGAATTTAAAATATGAGTCCAATATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGtgtgtatgtgccagttacgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgttcaatttgaatggaattaaaaatatgagtccaggatttcaaaacttgctaaattattaaaaagcgggaaaagaaagtaacttccccgtcaag
gi|2 : TTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGTTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTA----------------------TGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTTAGTATTAGAGTTTCATACTAGGAGATTAAAGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGGGAGAT----AAATTAAAGAAACAATTACCTTGT-TACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGAAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGAT-CTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATAGAAAAGGTCACTTTGTACATAACATGTTATGGATTCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TTAAA--T-TG-----A-------------------------------------------------------CTGTAC------CT-AGAAC-------------------------TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGTGCA---TTTTGCAAT-TATTC-AA--AAATATATA--TTTTCTTATTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAT------TATATGACTATAATAGTCAATTCATTACATAAAATATGTGTGTCA
gi|3 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctccagtcacattttcagttgtaatagcttcaatttgtccatcaataatggacatgggagcctcgattatctgaaatgtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTA---------------TGGTAATTGGATGGAACGTTTTGAACATTAACATCAATATTCATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAGATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATAAGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGGGAGAT----AAATAAAAGAAACAATTACCTTAA-TACTCGAATTTCCCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAG---GTGACGCAGTGGTCAACGGAAATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGTACTATGATTCTCGCCAAAGTGTCAGCTAGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATTGTCCGAATTTTTGTATCAGTGGTACCCGCCATCACCGTACGTATGGCGTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC--TG-GTGTAACATGTTATGGGTGCTATTAATAATTTATACACATGGAGAGTTTATCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCAAG--T-TGT-GTTAT--ATC-----T--G-------TAC-------T-------A-------TTT--ATATGTAC------CT-AGAACGTT--------GAC--ATAC-CTT-TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TATTTAAA--AAATATATA--TTCTCTTCTTTTTATGCTTTCACTTTGTCCTGGCT
gi|4 : ttgttttcggatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtaatttttaagatagtttttccatgaacgtgtaactggaccgggataggtagccgctagcaaacaacatcttccatattatcgactatgtctatgtccagagcattttgtaaaattctcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacgcctatttgctatttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcgatttgtccgtcagtgatggacatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgattgtgccagttttgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgaggtttaatttgcatggaattaaaaacatgagtccaggatttcaaaatttgctaatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGTTACAACTTGAATATGTAGACAG----TTATTATAACCGCCATATTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATTATGGGCAGGGAAATATTGTTTTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTATAGTTCCATACTAGGAGATATA
gi|11 : tgtttgcgggtggagagtgattttagaaatttgtaagtgtaatttttaagatagtatttccttaacggtgtaactgaacaggaataggtagctgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtcatgagcattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccattttacggctaactgctacttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcaatttgtccatcaatgatgttcatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgcagtaactttatgttctatatggcaaatggcaaaattatgtttacgattcgatgtttaatttacatggaattaaaactatgagtgcaggatttcaaaacttgcttatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcacggcttggctgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATGAGATGGAAGGCTTTGAAAATTAACATCAATAT-CATTAAAAGGATTTGATTT-GCAATCATGGGCGGAAAAATATTGTTCTATTGTTGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATAAGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTATG-AAGGAGAT----AAATAAAAGAAACAATTACCTTGA-TACTCGAATTTCTGGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAAGTTGTGACGcttatgatgggatg
gi|10 : TTGAATGTGTTAACACAAAGTGATTTTAAATGCCATTTACGTCTGAAAAC-GGATGAAACATTATGAACATTAGCATCAAAAG-CAA-ACAAGATTTTGATTT-GTAGTCATGGGCAGGAAGGTAgtgactgactgcaata
gi|5 : CCATTTTGGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTCAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTTTGTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATTCAAGTGGGATGAAGGTAATTTATAGTAGGTAAGAAAGGAAAT----AAACAAA-GAAACAGTTAC--------CTTGA---------------------CAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTAGTGCAAGGTCATGAGAACTATGAT-CTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCGTCAGATAATGTAATCGTCCGTATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACATATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC--TG-GTGTAAAATGTTATGGGTGTTATTACTAATGTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCAAA--T-TGT-GTTAT--ATC-----T--G-------TAC-------T-------A-------TTT--ATCTGTAC------CT-AGAACGTT--------GAC--ATAC-CTT-TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGTGCA---TTTTACAAT-TATTT-GA--AAATATATA--TTTTCTGCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTagtgtgatgtagacaattatgtagaaagatgatttataaataaaacgaacaatcacatgtatggttgaattccttgttgtgtttaagccgatgacattttgccactctgaggtgacacaatggtcaattgaaacgaactgacctatagcaaggtcacgagagctaagctctcgccaaactgtcagtggaatggtttccccatcttctgacaaagtaattgtacgtatattggtattgatgct
gi|6 : CTTTGAATATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-TTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAAATTCATACTAGGAGATAAAAGTGGGATGAAGGTAAATTCAAATATGTAAGAAGGGAGAT----ACATAAAAGAAACAATTACATTGA-TACTCAAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGAT-CTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTTCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACTAACCATCAACGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTAAC--TG-GTGTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCAAA--T-TGT-GTTAT--TTC-----T--G-------TTC-------T-------A-------TTT--ATCTGTAC------CT-AGAACGTT--------GAA--ATAC-CGT-TC-T------GAG------T-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TATTT-AA--AAATATATATTTTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCATTTTGTCCTG
gi|10 : AGGA-AGGTAAGTGTGATGTAGACAATT------ATGTA-GAAAGATGATTTATAAATAAAACGAACAATCACAT-GTATGGTTGAATTCCTTGTTGTGTTTAAG-CCGATGACATTTTGCCACTCTGAG---GTGACACAATGGTCAATTGAAACGAACTGACCTATAGCAAGGTCACGAGAGCTAAGCT-CTCGCCAAACTGTCAGTGGAATGGTTTCCCCATCTTCTGACAAAGTAATTGTACGTATATTGGTATTGATG
gi|9 : ttgaatgtgttaacacaaagtgattttaaatgccatttacgtctgaaaacggatgaaacattatgaacattagcatcaaaagcaaacaagattttgatttgtagtcatgggcAATAGATAAGGTTAC--TG-GTGTGACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACct
gi|9 : GATCGTAT-TCAAA--T-TGT-GTTAT--ATC-----T--G-------TAC-------T-------A-------TTT--ATTTGTAC------CT-AGAACGTT--------GAC--ATAC-CTT-TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTG--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TATTT-AA--AAATATATA--TTTTCTTCCTTTTGTGCTTTCACATTGACCTGGCTTAAATGCGGCAACTACTCGTATATTACTATTACAGTCATTTCATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatttgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttggtgtgcgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttccttttgtgctttcacattgacctggcttaaatgcggcaactactcgtatattactattacagtcatttcatta
gi|19 : aatagataaggttactggtgtgacatgttatgggtgctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATCGTGGATAAAA--T-TTT-GTTAC--ATC-----C--GAATTGCATAG-------C-------A-------TTT--ATCTGTAC------CT-AAAACGT--------------AGAC-CTTAGC-TA-----GAT------A-T--A------T-----A-----T---GT-TGC---ACGGTAGTTTCTGTTT
gi|35 : GATCATAG-GCAAAA-T-TGT-GTTAC--ATC-----C--A-------TAC-------T-------GCATAGCTTTT--ACCTGTAC------C
gi|12 : CGTAA-GCAAA--C-TTTCGTTAC--ATC-----C--G-------TAC-------TGCATGGTA-------TTTTGACCTGTAC------CC-AAAACATA--------CAC--CTGC-CTT-TT-TAGATA-GAT------C-T--G------TATACATG----T---AT-TAT---CCGATATTTTCTTTTTA--GTGTATGCA---TTTGGCTAT-TAATG-AAGTATATATATA--TTTT
gi|14 : GTAT-GCAAAATTATGT-ATCATCCATC-----TTCA-------TAA-------C-------A-------TTT--ACCTATAC------CC-AGAGCATA--------GAC--CTAC-CTT-TC-T------TAG------C-T--G------T-------------------AT---CCAATATTTACTATTCA--ATGTGCGCA---TTTTGCTAT-TATT------AAATATATA--TTTTATTTTTTTaatt
gi|27 : t-TCAAA--A-TATTGTTAC--ATC-----T--G-------TAC-------C-------ACATAGCATTT--ACCTGTAC------CT-AAAATGTA--------GGC--CTAC-CTT-TG-T------TAG------C-T--caattta
gi|16 : AAA--T-TGT-GTTAC--ATC-----C--G-------TAG-------C-------A-------TTT--ACCTGTAC------CT-AAAACGTA--------GAC--CTTA-CTT-TC-G------CAG------C-TAGA------T-----T-----TAAAGTGTAT---CAGATAGTTTCTATTTA--GTGTGCACA---TTTTGCTAT-TAagatctatatgttagtttct
gi|15 : tgtgggcaAAA--T-TTT-GTTAC--ATC-----C--G-------AAC-------TGCATCGCA-------TTT--ACCTGTACATGTAGCT-TAAACGTA--------GAC--CTAC-CTT-TC-T------TAG------C-T--AGAT---T-----TATA--T---AT-TAC---CCGATAGTTTCTATTTA--GCGTGTGCG---TTTAGCTAT-TAgat
gi|22 : ggataAAA--T-TTT-GTTAC--ATC-----C--G-------TAC-------TGCATGGCA-------TTT--ACTTGTAC------CT-AAAACCAT--------GAC--ATAC-CTT-TC-T------GAG------C-TA-G------A-----TCTAAAT---GC-TTT---TCAATATTTTgatat
gi|20 : gtgcaAAA--T-CAT-GTTAC--ATC-----T--G-------TAC-------TGCATAGAA-------TTT--ACTTGTAC------CT-AAAATGTA--------GAC--CTAT-CTT-TT-TTTGCTAGAT------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTT
gi|23 : ttgtggacaAAA--T-TTT-GTTAC--ATCCAAACT--G-------TATAG-----C-------A-------TTC--ACCTTTAC------CT-AAAACATC--------GAC--CTAC-CTT-TC-T------CAG------C-TAGA------T-----TTAAA-T---GT-TAT---CC-ATAGTTTCTAT
gi|18 : taAAA--T-TTG-GTTAC--ATC-----C--A-------AAC-------TGCATAGCA-------TTT--ACCTGTAT------CA-AAAACATA--------GAC--CTAC-CTT-TC-T------TAG------C-T--GGATATAT-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTTCTATT
gi|13 : tggataAAA--T-TGT-GTTGC--ATC-----T--G-------TATTGCATGGT-------A-------TTT--ACCTATAC------CC-AAAAGGTA--------GAC--CTGC-CTT-TCAT------ATG------CAT--G------TA----TA----T---GT-TAT---CCCATTTTTTGAATTTA--GTGTGTCCAGAGTTTCGCAATATAACA-AA--GAATTTAAA--TTTT
gi|30 : gtaggcaAAG--T-TGT-GTTAC--ATC-----C--G-------TAT-------TGTATGGCA-------TTT--ACCAGTAC------CC-AGAACATC--------AAC--CTAC-CTT-CC-T------tatc
gi|31 : ataggaaAAA--T-TGT-GTTAC--ATC-----C--A-------TAC-------TGCATAGCA-------TTT--ACCTGTAC------TC-TGAACACA--------GAC--CTAC-CTT-
gi|25 : cataggtgAAA--T-TTT-GTTAC--ATCCATGAT--GCA-----TAG-------C-------A-------TTT--ACCTATAC------CT-AAAATGTA--------GAC--C--C-CTT-TC-T------TAGCTAAATC-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---C
gi|24 : gtcgtgggcaAAA--T-ATT-GTTAT--ATC-----C--G-------TAC-------TGCAGAACA-------CTT--ACCTATAC------GT-AAAATGTA--------GGCCTGTAG-CTT-TC-T------CAG------C-T--tg
gi|21 : ccgtgggcaAA--T-TTT-GTTAC--ATC-----C--G-------TAT-------TGTATAGCA-------TTT--ACATGTAC------CT-AAAACATTAAAACGTAAAC--CTAT-CTT-TC-T------CAT------C-T--A----------------------G---AT---CTAA-ATTTTATATagatctaaatgttatct
gi|26 : tgttgtaat-------A-------TTT--ATCTGTAC------CT-AAAACGTA--------GAC--CTAC-CTT-TC-T------GAG------C-TAGA------T-----C-----T---GTACATTCCCCAATAGTATCTTTTTA--G
gi|28 : tacattagaactgcatagcTGTAC------CTTAAAAAGT----------AC--ATG---------T------AAG------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---TAAATATTTTCTATCAAGTGTGTGTGCA---TTTTTT--T-TATTG-AA--AAtg
gi|34 : aacttgagTGTAC------CT-AAAATGAA--------GA---ATTCTCTT-TC-T------AAG------C-TAGG------T-----CTATA-T---GT-TAT---CCAATA
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GATTGTAGGCATACTTTTGTTACATACATACTGTAAAGAATTCACCTGTACTCAGAATGTAAACTTACATTTCAT
Unaligned ( gi|33 ): GGTATAGTGTTGTGATATCTATACTACATATAGAACTGACTTAAACACAAGACGAAGGTCCAC
Unaligned ( gi|36 ): GTCGTGGATAAAACTTTGTTGCATCCAAACTGCATTGCATTTACC
Unaligned ( gi|37 ): ATCGTGGGCCAAAGTTTGATACATCCGTAATGAAAATACTCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222222 1111 11111 111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 77777777777777 1111111 444444444444444444444 555555
lowQualScore : 5 3 6 1 0 1 0 5 00000000 4444 1 1 5 5 22222 1 5 77 4 1 5 1 000 6 6 99 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 1 3 2 3 1 55555555555555 4 22 444444 1 55555555 1 33 1 0000000 555555 1 000000000000000000000 333 4 333 2 0 44 555 3 3 3 4 55 66 1 0 777777 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . . . ........ .... . . . . ..... . . .. . . . . ... . . .. ................................................................................................................................ . . . . . . .............. . .. ...... . ........ . .. . ....... ...... . ..................... ... . ... . . .. ... . . . . .. .. . . ...... . . .
lowQualScore : 7 5 0 0 7 0 4 7 77777777 2222 8 4 0 0 55555 7 7 99 3 9 7 4 000 7 7 22 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 7 3 4 3 6 44444444444444 8 22 333333 5 66666666 5 77 6 6666666 222222 8 444444444444444444444 555 0 555 6 3 22 888 8 3 3 9 55 11 0 7 777777 0 0 0
consensus : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTA-CT----GCATAGC---A-TTT--ACCTGTAC------CT-AAAAC--------GTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
Reference ( family-3397 ) : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCGGTTGTAATAGCTTCNATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGANGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTACATCCGTA-CT----G---AG----A-TTT--ACCTGTAC------CT-AAAAC--------GTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTNAAATGCGGCAACTACTCGTATATNACTATNACAGTCANTTCATTACATAAAATATGTGTGTCA
gi|1 : AGTGATTCTACAAGTTTGTAAGTGTAATTGTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATATGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATACCCAGAGCATTTTATAAAATACTCAAGTTGACTGT-----CGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCTAGTCACATTTCCAATTGTAATGGCTTCGATTTGTTTATCAATGATGGACATTGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATATTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCGAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACCTCCCCACCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGT
gi|1 : TTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTCATTGGATGGAACGCTTTGAACATAAACTTCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATAAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAAG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGTTACTCGAATTTCTCGTAGTATC-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTAAGTTGGACAGCCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTTCGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGAT--ATAACATGTAATGGGTGCTTTTACTAATTTATACACGTGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTA-CT--------------A-TTT--ATCTGTAC------CT-AGAAC--------GTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GAGTGTGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCAACAAC------TATATGACTATAACTGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggctggtcattggatggaacgctttgaacataaacttcaatatcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggataaaggtaatttctaatatgtaagaaaggagataaataaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtatcaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacggagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtaagttggacagcctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgttcgtatggcctcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactgatataacatgtaatgggtgcttttactaatttatacacgtggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatctgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttagagtgtgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttctttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcaacaactatatgactataactgtcaattcattacataaaatatgcgtgccaa
gi|10 : agtgattctacaagtttgtaagtgtaattgttaagatagtatttccctgaacgtgtaactggacagggatatgtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatacccagagcattttataaaatactcaagttgactgtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctctagtcacatttccaattgtaatggcttcgatttgtttatcaatgatggacattggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatatttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcgaggatttcaaaatttgctaatagcgggaaaaggaagttacctccccaccaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGAATGTGTTAACACAAAGTGATTTTAAATGCCATTTACGTCTGAAAAC-GGATGAAACATTATGAACATTAGCATCAAAAG-CAA-ACAAGATTTTGATTT-GTAGTCATGGGCAGGAAGGTAa
gi|10 : AGGA-AGGTA-----AGTGTGATGTAGACAATT------ATGTAGAAAGATGATTTATAAATAAAACGAACAATCACATGTATGGTTGAATTCCTTGTTGTGTTTAAG-CCGATGACATTTTGCCACTCTGAG---GTGACACAATGGTCAATTGAAACGAACTGACCTATAGCAAGGTCACGAGAGCTAAGC-TCTCGCCAAACTGTCAGTGGAATGGTTTCCCCATCTTCTGACAAAGTAATTGTACGTATATTGGTATTGATGagtgtgatgtagacaattatgtagaaagatgatttataaataaaacgaacaatcacatgtatggttgaattccttgttgtgtttaagccgatgacattttgccactctgaggtgacacaatggtcaattgaaacgaactgacctatagcaaggtcacgagagctaagctctcgccaaactgtcagtggaatggtttccccatcttctgacaaagtaattgtacgtatattggtattgatgct
gi|11 : ttgaatgtgttaacacaaagtgattttaaatgccatttacgtctgaaaacggatgaaacattatgaacattagcatcaaaagcaaacaagattttgatttgtagtcatgggcGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATGAGATGGAAGGCTTTGAAAATTAACATCAATAT-CATTAAAAGGATTTGATTT-GCAATCATGGGCGGAAAAATATTGTTCTATTGTTGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTATGAA-G-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTGGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAAGTTGTGACGct
gi|12 : CGTAA-GCA-AA-CTTTCGTTACATCCGTA-CT----GCATGGT---A-TTTTGACCTGTAC------CC-AAAAC--------ATA-CACC--TGCCTTTT-TAGATA-GAT------C-T--G------TATACATG----T---AT-TAT---CCGATATTTTCTTTTTA--GTGTATGCA---TTTGGCTAT-TA-ATGAAGTATATATATA--TTTTgtgactgactgcaata
gi|13 : A-AA-TTGT-GTTGCATCTGTA-TT----GCATGGT---A-TTT--ACCTATAC------CC-AAAAG--------GTA-GACC--TGCCTTTCAT------ATG------CAT--G------TA----TA----T---GT-TAT---CCCATTTTTTGAATTTA--GTGTGTCCAGAGTTTCGCAATATA-ACAAA--GAATTTAAA--TTTTaatt
gi|14 : gtaggcaGTAT-GCA-AAATTAT-GTATCATCCAT--CTTCATA---AC----A-TTT--ACCTATAC------CC-AGAGC--------ATA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-T--G-------------------------TAT---CCAATATTTACTATTCA--ATGTGCGCA---TTTTGCTAT-TA-TT-----AAATATATA--TTTTATTTTTTTtatc
gi|15 : tA-AA-TTTT-GTTACATCCGAA-CT----G---CATCGCA-TTT--ACCTGTACATGTAGCT-TAAAC--------GTA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-TAGA------T-----TTATA-T---AT-TAC---CCGATAGTTTCTATTTA--GCGTGTGCG---TTTAGCTAT-TA-caattta
gi|16 : ggataA-AA-TTGT-GTTACATCCGTAGC---------------A-TTT--ACCTGTAC------CT-AAAAC--------GTA-GACC--TTACTTTC-G------CAG------C-T--AGA----T-----T-----TAAAGTGTAT---CAGATAGTTTCTATTTA--GTGTGCACA---TTTTGCTAT-TA-gatat
gi|17 : tgtgggcaAGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTGTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTTACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGTAAACAGCATCTTCCATATTATCGACCAgat
gi|18 : A-AA-TTTG-GTTACATCCAAA-CT----GCATAGC---A-TTT--ACCTGTAT------CA-AAAAC--------ATA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-T--GGATATAT-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTTCTATT
gi|19 : tggataGATCGTGGATAA-AA-TTTT-GTTACATCCGAA-TT----GCATAGC---A-TTT--ATCTGTAC------CT-AAAAC--------GTA-GACCT-TAGCT----A------GAT------A-T--A------T-----A-----T---GT-TGC---ACGGTAGTTTCTGTTT
gi|2 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTCATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTTACTGGACAGGGTAAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATTTTCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATAATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAATGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCAAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCATCAAGGCTTGGTTGGGTCTGTTGGTAGTGTGT
gi|2 : ttgtttgctgatggagTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGTTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTAT----------------------GGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTTAGTATTAGAGTTTCATACTAGGAGATTAA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATTAAAGAAACAATTACCTTGTTACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGAAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATAGAAAAGGTCACTTTGTACATAACATGTTATGGATTCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TTA-AA-TTG-----AC----------------------------------TGTAC------CT-AGAAC------------------------TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGTGCA---TTTTGCAAT-TA-TTCAA--AAATATATA--TTTTCTTATTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAT------TATATGACTATAATAGTCAATTCATTACATAAAATATGTGTGTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|20 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctccagtcacattttcagttgtaatagcttcaatttgtccatcaataatggacatgggagcctcgattatctgaaatgtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AA-TCAT-GTTACATCTGTA-CT----GCATAG----AATTT--ACTTGTAC------CT-AAAAT--------GTA-GACC--TATCTTTT-TTTGCTAGAT------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTT
gi|21 : ttgtggaca-AA-TTTT-GTTACATCCGTA-TT----GTATAGC---A-TTT--ACATGTAC------CT-AAAACATTAAAACGTA-AACC--TATCTTTC-T------
gi|22 : tgttgtaatA-AA-TTTT-GTTACATCCGTA-CT----GCATGGC---A-TTT--ACTTGTAC------CT-AAAAC---------CATGACA--TACCTTTC-T------GAG------C-TA-G------A-----TCTAAAT---GC-TTT---TCAATATTTTcatctagatctaaattttatat
gi|23 : gtgcaA-AA-TTTT-GTTACATCCAAA-CT----GTATAGC---A-TTC--ACCTTTAC------CT-AAAAC--------ATC-GACC--TACCTTTC-T------CAG------C-TAGA------T-----TTAAA-T---GT-TAT---CC-ATAGTTTCTAT
gi|24 : taA-AA-TATT-GTTATATCCGTA-CT----GC--AGAAC-A-CTT--ACCTATAC------GT-AAAAT--------GTA-GGCCTGTAGCTTTC-T------CAG------C-T--
gi|25 : ccgtgggcaA-AA-TTTT-GTTACATCCATG-AT----GCATAGC---A-TTT--ACCTATAC------CT-AAAAT--------GTA-GACC----CCTTTC-T------TAGCTAAATC-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CTGagatctaaatgttatct
gi|26 : gtcgtgggcaTACATTAGAA-CT----GCATAGC---A-TTT--ATCTGTAC------CT-AAAAC--------GTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-TAGA------T-----C-----T---GTACATTCCCCAATAGTATCTTTTTA--GTG
gi|27 : -TCA-AA-ATATTGTTACATCTGTA-CC----ACATAGC---A-TTT--ACCTGTAC------CT-AAAAT--------GTA-GGCC--TACCTTTG-T------TAG------C-T--
gi|28 : TGTAC------CTTAAAAA--------GTA-CATG--TA---------------AG------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---TAAATATTTTCTATCAAGTGTGTGTGCA---TTTTTT--T-TA-TTGAA--AAagatctatatgttagtttct
gi|29 : aacttgagGATTGTAG-GCATAC-TTTT-GTTACATACATA-CT----GTAAAG----AATTC--ACCTGTAC------TC-AGAAT--------GTA-AACT--TACATTTC-
gi|3 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTTTTTCCATGAAC-GTGTAACTGGACCGGGATAGGTAGCCGCTAGCAAACAACATCTTCCATATTATCGACTATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATTCTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGCCTATTTGCTATTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCGTCAGTGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGATTGTGCCAGTTTTGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAACATGAGTCCAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTat
gi|3 : ttgttttcggatggagTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTA---------------TGGTAATTGGATGGAACGTTTTGAACATTAACATCAATATTCATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAGATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTAATACTCGAATTTCCCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAG---GTGACGCAGTGGTCAACGGAAATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGTACTATGATTCTCGCCAAAGTGTCAGCTAGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATTGTCCGAATTTTTGTATCAGTGGTACCCGCCATCACCGTACGTATGGCGTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTAATAATTTATACACATGGAGAGTTTATCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AG-TTGT-GTTATATCTGTA-CT--------------A-TTT--ATATGTAC------CT-AGAAC--------GTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TATTTAAA--AAATATATA--TTCTCTTCTTTTTATGCTTTCACTTTGTCCTGGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctatggtaattggatggaacgttttgaacattaacatcaatattcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaagatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaataaaagaaacaattaccttaatactcgaatttcccgtagtattaagtccaatgactttctgccactcagaggtgacgcagtggtcaacggaaataaactgacctattgcaaggtcatgagtactatgattctcgccaaagtgtcagctagacagtctccccatcatcagataatgtaattgtccgaatttttgtatcagtggtacccgccatcaccgtacgtatggcgtcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactggtgtaacatgttatgggtgctattaataatttatacacatggagagtttatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaagttgtgttatatctgtactatttatatgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctattaagtgtgcgcattttacaattatttaaaaaatatatattctcttctttttatgctttcactttgtcctggct
gi|30 : ttgttttcggatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtaatttttaagatagtttttccatgaacgtgtaactggaccgggataggtagccgctagcaaacaacatcttccatattatcgactatgtctatgtccagagcattttgtaaaattctcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacgcctatttgctatttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcgatttgtccgtcagtgatggacatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgattgtgccagttttgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgaggtttaatttgcatggaattaaaaacatgagtccaggatttcaaaatttgctaatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AG-TTGT-GTTACATCCGTA-TT----GTATGGC---A-TTT--ACCAGTAC------CC-AGAAC--------ATC-AACC--TACCTTCC-T------
gi|31 : ataggaaA-AA-TTGT-GTTACATCCATA-CT----GCATAGC---A-TTT--ACCTGTAC------TC-TGAAC--------ACA-GACC--TACCTT
gi|32 : cataggtgTTCGAGGTTTAATTTGTATGGAATTTAAAATATGAGTCCAATATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCG
gi|34 : TGTAC------CT-AAAAT--------GAA-GAAT--TCTCTTTC-T------AAG------C-TAGG------T-----CTATA-T---GT-TAT---CCAATA
gi|35 : ttgtGATCATAG-GCA-AAATTGT-GTTACATCCATA-CT----GCATAG----CTTTT--ACCTGTAC------Cg
gi|4 : AGTGATTTTAGAAATTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCTT-AACGGTGTAACTGAACAGGAATAGGTAGCTGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCATGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCA-TTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGTTCATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTG-CAGTAACTTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATTATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTACATGGAATTAAAACTATGAGTGCAGGATTTCAAAACTTGCT-TAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCACGGCTTGGCTGGGTCAGTTGGTAGTGTGT
gi|4 : tgtttgcgggtggagTTGTTACAACTTGAATATGTAGACAG----TTATTATAACCGCCATATTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATTATGGGCAGGGAAATATTGTTTTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTATAGTTCCATACTAGGAGATATACTTATGATGGGATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttacaacttgaatatgtagacagttattataaccgccatatttggctggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattataaggatttgatttgtaattatgggcagggaaatattgttttattgtagactttgtcagtcttatagttccatactaggagatatacttatgatgggatg
gi|5 : tgtttgcgggtggagagtgattttagaaatttgtaagtgtaatttttaagatagtatttccttaacggtgtaactgaacaggaataggtagctgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtcatgagcattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccattttacggctaactgctacttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcaatttgtccatcaatgatgttcatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgcagtaactttatgttctatatggcaaatggcaaaattatgtttacgattcgatgtttaatttacatggaattaaaactatgagtgcaggatttcaaaacttgcttatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcacggcttggctgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCATTTTGGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTCAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTTTGTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATTCA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTATAGTAGGTAAGAAAG-GAA--ATAAACAAA-GAAACAGTTAC-------CTTGA---------------------CAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTAGTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCGTCAGATAATGTAATCGTCCGTATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACATATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAAAATGTTATGGGTGTTATTACTAATGTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTA-CT--------------A-TTT--ATCTGTAC------CT-AGAAC--------GTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGTGCA---TTTTACAAT-TA-TTTGA--AAATATATA--TTTTCTGCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCT
gi|6 : CTTTGAATATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-TTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAAATTCATACTAGGAGATAAA-----AGTGGGATGAAGGTAAATTCAAATATGTAAGAAGG-GAG--ATACATAAAAGAAACAATTACATTGATACTCAAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTTCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACTAACCATCAACGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTAAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATTTCTGTT-CT--------------A-TTT--ATCTGTAC------CT-AGAAC--------GTT-GAAA--TACCGTTC-T------GAG------T-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATATTTTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCATTTTGTCCTG
gi|7 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCATCCATATCATCGACCATGCCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCTAGTTGACTGTAAAGTTGGAG---TTTCCATTTTTACGGCTTACTGTTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGGAAATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTCAATTTGAATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCTAAATTATTAAAAAGCGGGAAAAGAAAGTAACTTCCCCGTCAAG
gi|8 : AGTGATTTTACAAATTTATAAGTGTA-TTTTTAAAACAATATTTCCCTGAAC-GTGTAACTAGACAGGGATAGGTAACCGCTGGCAAACAGCCTCTTCCATATCATCGACCATGTC------CAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAATCGGAGAAGTTTCCAATTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCATTTGTAATAGCTTTTATTTGTCCATCAATGATAGACATGGGAGCTTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTAC
gi|9 : ttatttgcggatggagAATAGATAAGGTTAC-TGGT--GTGACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCAC
gi|9 : GATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTA-CT--------------A-TTT--ATTTGTAC------CT-AGAAC--------GTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTG--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATA--TTTTCTTCCTTTTGTGCTTTCACATTGACCTGGCTTAAATGCGGCAACTACTCGTATATTACTATTACAGTCATTTCATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatttgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttggtgtgcgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttccttttgtgctttcacattgacctggcttaaatgcggcaactactcgtatattactattacagtcatttcatta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GGTATAGTGTTGTGATATCTATACTACATATAGAACTGACTTAAACACAAGACGAAGGTCCAC
Unaligned ( gi|36 ): GTCGTGGATAAAACTTTGTTGCATCCAAACTGCATTGCATTTACC
Unaligned ( gi|37 ): ATCGTGGGCCAAAGTTTGATACATCCGTAATGAAAATACTCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222222 1111 11111 111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 444444444444444444444 333333
lowQualScore : 5 3 2 0 1 0 5 00000000 4444 1 1 5 5 22222 1 5 77 4 1 5 1 000 6 6 99 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555 1 3 1 1 2 1 22 444444 55555555 1 1 33 1 0000000 555555 1 000000000000000000000 333 4 333 2 0 44 555 3 3 3 4 55 66 888888
lowQualScore : . . . . . . . ........ .... . . . . ..... . . .. . . . . ... . . .. ................................................................................................................................ ... . . . . . . .. ...... ........ . . .. . ....... ...... . ..................... ... . ... . . .. ... . . . . .. .. ......
lowQualScore : 7 5 2 7 3 4 7 77777777 2222 8 4 0 0 55555 7 7 99 3 9 7 4 000 7 7 22 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 7 3 0 7 6 2 22 333333 44444444 5 5 77 6 6666666 222222 8 222222222222222222222 555 0 555 6 3 22 888 8 3 3 9 55 11 333333
consensus : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
Reference ( family-3397 ) : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
gi|1 : AGTGATTCTACAAGTTTGTAAGTGTAATTGTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATATGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATACCCAGAGCATTTTATAAAATACTCAAGTTGACTGT-----CGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCTAGTCACATTTCCAATTGTAATGGCTTCGATTTGTTTATCAATGATGGACATTGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATATTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCGAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACCTCCCCACCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGT
gi|1 : TTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTCATTGGATGGAACGCTTTGAACATAAACTTCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATAAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAAG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGTTACTCGAATTTCTCGTAGTATC-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTAAGTTGGACAGCCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTTCGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGAT--ATAACATGTAATGGGTGCTTTTACTAATTTATACACGTGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GAGTGTGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCAACAAC------TATATGACTATAACTGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggctggtcattggatggaacgctttgaacataaacttcaatatcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggataaaggtaatttctaatatgtaagaaaggagataaataaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtatcaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacggagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtaagttggacagcctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgttcgtatggcctcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactgatataacatgtaatgggtgcttttactaatttatacacgtggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatctgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttagagtgtgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttctttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcaacaactatatgactataactgtcaattcattacataaaatatgcgtgccaa
gi|10 : agtgattctacaagtttgtaagtgtaattgttaagatagtatttccctgaacgtgtaactggacagggatatgtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatacccagagcattttataaaatactcaagttgactgtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctctagtcacatttccaattgtaatggcttcgatttgtttatcaatgatggacattggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatatttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcgaggatttcaaaatttgctaatagcgggaaaaggaagttacctccccaccaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGAATGTGTTAACACAAAGTGATTTTAAATGCCATTTACGTCTGAAAAC-GGATGAAACATTATGAACATTAGCATCAAAAG-CAA-ACAAGATTTTGATTT-GTAGTCATGGGCAGGAAGGTAa
gi|10 : AGGA-AGGTA-----AGTGTGATGTAGACAATT------ATGTAGAAAGATGATTTATAAATAAAACGAACAATCACATGTATGGTTGAATTCCTTGTTGTGTTTAAG-CCGATGACATTTTGCCACTCTGAG---GTGACACAATGGTCAATTGAAACGAACTGACCTATAGCAAGGTCACGAGAGCTAAGC-TCTCGCCAAACTGTCAGTGGAATGGTTTCCCCATCTTCTGACAAAGTAATTGTACGTATATTGGTATTGATGagtgtgatgtagacaattatgtagaaagatgatttataaataaaacgaacaatcacatgtatggttgaattccttgttgtgtttaagccgatgacattttgccactctgaggtgacacaatggtcaattgaaacgaactgacctatagcaaggtcacgagagctaagctctcgccaaactgtcagtggaatggtttccccatcttctgacaaagtaattgtacgtatattggtattgatgct
gi|11 : ttgaatgtgttaacacaaagtgattttaaatgccatttacgtctgaaaacggatgaaacattatgaacattagcatcaaaagcaaacaagattttgatttgtagtcatgggcGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATGAGATGGAAGGCTTTGAAAATTAACATCAATAT-CATTAAAAGGATTTGATTT-GCAATCATGGGCGGAAAAATATTGTTCTATTGTTGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTATGAA-G-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTGGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAAGTTGTGACGct
gi|12 : CGTAA-GCA-AA-CTTTCGTTACATCCGTACTGCATGGTATTTTGACCTGTAC------C--------C-AAAACATA-CACC--TGCCTTTT-TAGATA-GAT------C-T--G------TATACATG----T---AT-TAT---CCGATATTTTCTTTTTA--GTGTATGCA---TTTGGCTAT-TA-ATGAAGTATATATATA--TTTTgtgactgactgcaata
gi|13 : A-AA-TTGT-GTTGCATCTGTATTGCATGGTATTT--ACCTATAC------C--------C-AAAAGGTA-GACC--TGCCTTTCAT------ATG------CAT--G------TA----TA----T---GT-TAT---CCCATTTTTTGAATTTA--GTGTGTCCAGAGTTTCGCAATATA-ACAAA--GAATTTAAA--TTTTaatt
gi|14 : gtaggcaGTAT-GCA-AAATTAT-GTATCATCCAT-CTTCATAACATTT--ACCTATAC------C--------C-AGAGCATA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-T--G-------------------------TAT---CCAATATTTACTATTCA--ATGTGCGCA---TTTTGCTAT-TA-TT-----AAATATATA--TTTTATTTTTTTtatc
gi|15 : tA-AA-TTTT-GTTACATCCGAACTGCATCGCATTT--ACCTGTACATGTAGC--------T-TAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-TAGA------T-----TTATA-T---AT-TAC---CCGATAGTTTCTATTTA--GCGTGTGCG---TTTAGCTAT-TA-caattta
gi|16 : ggataA-AA-TTGT-GTTACATCCGTA-------GCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TTACTTTC-G------CAG------C-TAGA------T-----T-----TAAAGTGTAT---CAGATAGTTTCTATTTA--GTGTGCACA---TTTTGCTAT-TA-gatat
gi|17 : tgtgggcaAGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTGTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTTACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGTAAACAGCATCTTCCATATTATCGACCAgat
gi|18 : A-AA-TTTG-GTTACATCCAAACTGCATAGCATTT--ACCTGTAT------C--------A-AAAACATA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-T--GGATATAT-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTTCTATT
gi|19 : tggataGATCGTGGATAA-AA-TTTT-GTTACATCCGAATTGCATAGCATTT--ATCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACCT-TAGCT----A------GAT------A-T--A------T-----A-----T---GT-TGC---ACGGTAGTTTCTGTTT
gi|2 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTCATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTTACTGGACAGGGTAAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATTTTCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATAATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAATGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCAAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCATCAAGGCTTGGTTGGGTCTGTTGGTAGTGTGT
gi|2 : ttgtttgctgatggagTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGTTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTAT----------------------GGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTTAGTATTAGAGTTTCATACTAGGAGATTAA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATTAAAGAAACAATTACCTTGTTACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGAAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATAGAAAAGGTCACTTTGTACATAACATGTTATGGATTCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|2 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctccagtcacattttcagttgtaatagcttcaatttgtccatcaataatggacatgggagcctcgattatctgaaatgtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGTAC------C--------T-AGAAC----------------TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGTGCA---TTTTGCAAT-TA-TTCAA--AAATATATA--TTTTCTTATTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAT------TATATGACTATAATAGTCAATTCATTACATAAAATATGTGTGTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|20 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctccagtcacattttcagttgtaatagcttcaatttgtccatcaataatggacatgggagcctcgattatctgaaatgtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgaA-AA-TCAT-GTTACATCTGTACTGCATAGAATTT--ACTTGTAC------C--------T-AAAATGTA-GACC--TATCTTTT-TTTGCTAGAT------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTT
gi|21 : ttgtggaca-AA-TTTT-GTTACATCCGTATTGTATAGCATTT--ACATGTAC------CTAAAACATT-AAAACGTA-AACC--TATCTTTC-T------
gi|22 : tgttgtaatA-AA-TTTT-GTTACATCCGTACTGCATGGCATTT--ACTTGTAC------C--------T-AAAAC-CATGACA--TACCTTTC-T------GAG------C-TA-G------A-----TCTAAAT---GC-TTT---TCAATATTTTcatctagatctaaattttatat
gi|23 : gtgcaA-AA-TTTT-GTTACATCCAAACTGTATAGCATTC--ACCTTTAC------C--------T-AAAACATC-GACC--TACCTTTC-T------CAG------C-TAGA------T-----TTAAA-T---GT-TAT---CC-ATAGTTTCTAT
gi|24 : taA-AA-TATT-GTTATATCCGTACTGCAGAACACTT--ACCTATAC------G--------T-AAAATGTA-GGCCTGTAGCTTTC-T------CAG------C-T--
gi|25 : ccgtgggcaA-AA-TTTT-GTTACATCCATGATGCATAGCATTT--ACCTATAC------C--------T-AAAATGTA-GACC----CCTTTC-T------TAGCTAAATC-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CTGagatctaaatgttatct
gi|26 : gtcgtgggcaTACATTAGAACTGCATAGCATTT--ATCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-TAGA------T-----C-----T---GTACATTCCCCAATAGTATCTTTTTA--GTG
gi|27 : A-AA-TATT-GTTACATCTGTACCACATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAATGTA-GGCC--TACCTTTG-T------TAG------C-T--
gi|28 : tcaTGTAC------C--------TTAAAAAGTA-CATG--TA---------------AG------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---TAAATATTTTCTATCAAGTGTGTGTGCA---TTTTTT--T-TA-TTGAA--AAagatctatatgttagtttct
gi|29 : aacttgagGATTGTAG-GCATAC-TTTT-GTTACATACATACTGTAAAGAATTC--ACCTGTAC------T--------C-AGAATGTA-AACT--TACATTTC-
gi|3 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTTTTTCCATGAAC-GTGTAACTGGACCGGGATAGGTAGCCGCTAGCAAACAACATCTTCCATATTATCGACTATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATTCTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGCCTATTTGCTATTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCGTCAGTGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGATTGTGCCAGTTTTGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAACATGAGTCCAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTat
gi|3 : ttgttttcggatggagTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTA---------------TGGTAATTGGATGGAACGTTTTGAACATTAACATCAATATTCATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAGATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTAATACTCGAATTTCCCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAG---GTGACGCAGTGGTCAACGGAAATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGTACTATGATTCTCGCCAAAGTGTCAGCTAGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATTGTCCGAATTTTTGTATCAGTGGTACCCGCCATCACCGTACGTATGGCGTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTAATAATTTATACACATGGAGAGTTTATCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AG-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATATGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TATTTAAA--AAATATATA--TTCTCTTCTTTTTATGCTTTCACTTTGTCCTGGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctatggtaattggatggaacgttttgaacattaacatcaatattcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaagatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaataaaagaaacaattaccttaatactcgaatttcccgtagtattaagtccaatgactttctgccactcagaggtgacgcagtggtcaacggaaataaactgacctattgcaaggtcatgagtactatgattctcgccaaagtgtcagctagacagtctccccatcatcagataatgtaattgtccgaatttttgtatcagtggtacccgccatcaccgtacgtatggcgtcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactggtgtaacatgttatgggtgctattaataatttatacacatggagagtttatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaagttgtgttatatctgtactatttatatgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctattaagtgtgcgcattttacaattatttaaaaaatatatattctcttctttttatgctttcactttgtcctggct
gi|30 : ttgttttcggatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtaatttttaagatagtttttccatgaacgtgtaactggaccgggataggtagccgctagcaaacaacatcttccatattatcgactatgtctatgtccagagcattttgtaaaattctcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacgcctatttgctatttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcgatttgtccgtcagtgatggacatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgattgtgccagttttgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgaggtttaatttgcatggaattaaaaacatgagtccaggatttcaaaatttgctaatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AG-TTGT-GTTACATCCGTATTGTATGGCATTT--ACCAGTAC------C--------C-AGAACATC-AACC--TACCTTCC-T------
gi|31 : ataggaaA-AA-TTGT-GTTACATCCATACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------T--------C-TGAACACA-GACC--TACCTT
gi|32 : cataggtgTTCGAGGTTTAATTTGTATGGAATTTAAAATATGAGTCCAATATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCG
gi|34 : TGTAC------C--------T-AAAATGAA-GAAT--TCTCTTTC-T------AAG------C-TAGG------T-----CTATA-T---GT-TAT---CCAATA
gi|35 : ttgtGATCATAG-GCA-AAATTGT-GTTACATCCATACTGCATAGCTTTT--ACCTGTAC------C--------g
gi|36 : A-AA-CTTT-GTTGCATCCAAACTGCATTGCATTT--ACC
gi|4 : gtcgtggataAGTGATTTTAGAAATTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCTT-AACGGTGTAACTGAACAGGAATAGGTAGCTGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCATGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCA-TTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGTTCATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTG-CAGTAACTTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATTATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTACATGGAATTAAAACTATGAGTGCAGGATTTCAAAACTTGCT-TAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCACGGCTTGGCTGGGTCAGTTGGTAGTGTGT
gi|4 : tgtttgcgggtggagTTGTTACAACTTGAATATGTAGACAG----TTATTATAACCGCCATATTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATTATGGGCAGGGAAATATTGTTTTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTATAGTTCCATACTAGGAGATATACTTATGATGGGATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttacaacttgaatatgtagacagttattataaccgccatatttggctggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattataaggatttgatttgtaattatgggcagggaaatattgttttattgtagactttgtcagtcttatagttccatactaggagatatacttatgatgggatg
gi|5 : tgtttgcgggtggagagtgattttagaaatttgtaagtgtaatttttaagatagtatttccttaacggtgtaactgaacaggaataggtagctgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtcatgagcattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccattttacggctaactgctacttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcaatttgtccatcaatgatgttcatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgcagtaactttatgttctatatggcaaatggcaaaattatgtttacgattcgatgtttaatttacatggaattaaaactatgagtgcaggatttcaaaacttgcttatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcacggcttggctgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCATTTTGGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTCAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTTTGTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATTCA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTATAGTAGGTAAGAAAG-GAA--ATAAACAAA-GAAACAGTTAC-------CTTGA---------------------CAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTAGTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCGTCAGATAATGTAATCGTCCGTATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACATATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAAAATGTTATGGGTGTTATTACTAATGTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGTGCA---TTTTACAAT-TA-TTTGA--AAATATATA--TTTTCTGCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCT
gi|6 : CTTTGAATATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-TTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAAATTCATACTAGGAGATAAA-----AGTGGGATGAAGGTAAATTCAAATATGTAAGAAGG-GAG--ATACATAAAAGAAACAATTACATTGATACTCAAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTTCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACTAACCATCAACGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTAAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATTTCTGTTCT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GAAA--TACCGTTC-T------GAG------T-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATATTTTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCATTTTGTCCTG
gi|7 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCATCCATATCATCGACCATGCCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCTAGTTGACTGTAAAGTTGGAG---TTTCCATTTTTACGGCTTACTGTTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGGAAATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTCAATTTGAATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCTAAATTATTAAAAAGCGGGAAAAGAAAGTAACTTCCCCGTCAAG
gi|8 : AGTGATTTTACAAATTTATAAGTGTA-TTTTTAAAACAATATTTCCCTGAAC-GTGTAACTAGACAGGGATAGGTAACCGCTGGCAAACAGCCTCTTCCATATCATCGACCATGTC------CAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAATCGGAGAAGTTTCCAATTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCATTTGTAATAGCTTTTATTTGTCCATCAATGATAGACATGGGAGCTTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTAC
gi|9 : ttatttgcggatggagAATAGATAAGGTTAC-TGGT--GTGACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCAC
gi|9 : GATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATTTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTG--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATA--TTTTCTTCCTTTTGTGCTTTCACATTGACCTGGCTTAAATGCGGCAACTACTCGTATATTACTATTACAGTCATTTCATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatttgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttggtgtgcgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttccttttgtgctttcacattgacctggcttaaatgcggcaactactcgtatattactattacagtcatttcatta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GGTATAGTGTTGTGATATCTATACTACATATAGAACTGACTTAAACACAAGACGAAGGTCCAC
Unaligned ( gi|37 ): ATCGTGGGCCAAAGTTTGATACATCCGTAATGAAAATACTCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222222 1111 11111 111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 444444444444444444444 333333
lowQualScore : 5 3 2 0 1 0 5 00000000 4444 1 1 5 5 22222 1 5 77 4 1 5 1 000 6 6 99 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555 1 3 1 1 2 1 22 444444 55555555 1 1 33 1 0000000 555555 1 000000000000000000000 333 4 333 2 0 44 555 3 3 3 4 55 66 888888
lowQualScore : . . . . . . . ........ .... . . . . ..... . . .. . . . . ... . . .. ................................................................................................................................ ... . . . . . . .. ...... ........ . . .. . ....... ...... . ..................... ... . ... . . .. ... . . . . .. .. ......
lowQualScore : 7 5 2 7 3 4 7 77777777 2222 8 4 0 0 55555 7 7 99 3 9 7 4 000 7 7 22 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 7 3 0 7 6 2 22 333333 44444444 5 5 77 6 6666666 222222 8 222222222222222222222 555 0 555 6 3 22 888 8 3 3 9 55 11 333333
consensus : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
Reference ( family-3397 ) : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
gi|1 : AGTGATTCTACAAGTTTGTAAGTGTAATTGTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATATGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATACCCAGAGCATTTTATAAAATACTCAAGTTGACTGT-----CGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCTAGTCACATTTCCAATTGTAATGGCTTCGATTTGTTTATCAATGATGGACATTGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATATTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCGAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACCTCCCCACCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGT
gi|1 : TTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTCATTGGATGGAACGCTTTGAACATAAACTTCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATAAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAAG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGTTACTCGAATTTCTCGTAGTATC-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTAAGTTGGACAGCCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTTCGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGAT--ATAACATGTAATGGGTGCTTTTACTAATTTATACACGTGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GAGTGTGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCAACAAC------TATATGACTATAACTGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggctggtcattggatggaacgctttgaacataaacttcaatatcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggataaaggtaatttctaatatgtaagaaaggagataaataaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtatcaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacggagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtaagttggacagcctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgttcgtatggcctcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactgatataacatgtaatgggtgcttttactaatttatacacgtggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatctgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttagagtgtgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttctttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcaacaactatatgactataactgtcaattcattacataaaatatgcgtgccaa
gi|10 : agtgattctacaagtttgtaagtgtaattgttaagatagtatttccctgaacgtgtaactggacagggatatgtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatacccagagcattttataaaatactcaagttgactgtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctctagtcacatttccaattgtaatggcttcgatttgtttatcaatgatggacattggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatatttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcgaggatttcaaaatttgctaatagcgggaaaaggaagttacctccccaccaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGAATGTGTTAACACAAAGTGATTTTAAATGCCATTTACGTCTGAAAAC-GGATGAAACATTATGAACATTAGCATCAAAAG-CAA-ACAAGATTTTGATTT-GTAGTCATGGGCAGGAAGGTAa
gi|10 : AGGA-AGGTA-----AGTGTGATGTAGACAATT------ATGTAGAAAGATGATTTATAAATAAAACGAACAATCACATGTATGGTTGAATTCCTTGTTGTGTTTAAG-CCGATGACATTTTGCCACTCTGAG---GTGACACAATGGTCAATTGAAACGAACTGACCTATAGCAAGGTCACGAGAGCTAAGC-TCTCGCCAAACTGTCAGTGGAATGGTTTCCCCATCTTCTGACAAAGTAATTGTACGTATATTGGTATTGATGagtgtgatgtagacaattatgtagaaagatgatttataaataaaacgaacaatcacatgtatggttgaattccttgttgtgtttaagccgatgacattttgccactctgaggtgacacaatggtcaattgaaacgaactgacctatagcaaggtcacgagagctaagctctcgccaaactgtcagtggaatggtttccccatcttctgacaaagtaattgtacgtatattggtattgatgct
gi|11 : ttgaatgtgttaacacaaagtgattttaaatgccatttacgtctgaaaacggatgaaacattatgaacattagcatcaaaagcaaacaagattttgatttgtagtcatgggcGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATGAGATGGAAGGCTTTGAAAATTAACATCAATAT-CATTAAAAGGATTTGATTT-GCAATCATGGGCGGAAAAATATTGTTCTATTGTTGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTATGAA-G-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTGGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAAGTTGTGACGct
gi|12 : CGTAA-GCA-AA-CTTTCGTTACATCCGTACTGCATGGTATTTTGACCTGTAC------C--------C-AAAACATA-CACC--TGCCTTTT-TAGATA-GAT------C-T--G------TATACATG----T---AT-TAT---CCGATATTTTCTTTTTA--GTGTATGCA---TTTGGCTAT-TA-ATGAAGTATATATATA--TTTTgtgactgactgcaata
gi|13 : A-AA-TTGT-GTTGCATCTGTATTGCATGGTATTT--ACCTATAC------C--------C-AAAAGGTA-GACC--TGCCTTTCAT------ATG------CAT--G------TA----TA----T---GT-TAT---CCCATTTTTTGAATTTA--GTGTGTCCAGAGTTTCGCAATATA-ACAAA--GAATTTAAA--TTTTaatt
gi|14 : gtaggcaGTAT-GCA-AAATTAT-GTATCATCCAT-CTTCATAACATTT--ACCTATAC------C--------C-AGAGCATA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-T--G-------------------------TAT---CCAATATTTACTATTCA--ATGTGCGCA---TTTTGCTAT-TA-TT-----AAATATATA--TTTTATTTTTTTtatc
gi|15 : tA-AA-TTTT-GTTACATCCGAACTGCATCGCATTT--ACCTGTACATGTAGC--------T-TAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-TAGA------T-----TTATA-T---AT-TAC---CCGATAGTTTCTATTTA--GCGTGTGCG---TTTAGCTAT-TA-caattta
gi|16 : ggataA-AA-TTGT-GTTACATCCGTA-------GCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TTACTTTC-G------CAG------C-TAGA------T-----T-----TAAAGTGTAT---CAGATAGTTTCTATTTA--GTGTGCACA---TTTTGCTAT-TA-gatat
gi|17 : tgtgggcaAGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTGTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTTACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGTAAACAGCATCTTCCATATTATCGACCAgat
gi|18 : A-AA-TTTG-GTTACATCCAAACTGCATAGCATTT--ACCTGTAT------C--------A-AAAACATA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-T--GGATATAT-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTTCTATT
gi|19 : tggataGATCGTGGATAA-AA-TTTT-GTTACATCCGAATTGCATAGCATTT--ATCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACCT-TAGCT----A------GAT------A-T--A------T-----A-----T---GT-TGC---ACGGTAGTTTCTGTTT
gi|2 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTCATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTTACTGGACAGGGTAAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATTTTCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATAATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAATGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCAAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCATCAAGGCTTGGTTGGGTCTGTTGGTAGTGTGT
gi|2 : ttgtttgctgatggagTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGTTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTAT----------------------GGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTTAGTATTAGAGTTTCATACTAGGAGATTAA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATTAAAGAAACAATTACCTTGTTACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGAAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATAGAAAAGGTCACTTTGTACATAACATGTTATGGATTCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|2 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctccagtcacattttcagttgtaatagcttcaatttgtccatcaataatggacatgggagcctcgattatctgaaatgtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGTAC------C--------T-AGAAC----------------TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGTGCA---TTTTGCAAT-TA-TTCAA--AAATATATA--TTTTCTTATTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAT------TATATGACTATAATAGTCAATTCATTACATAAAATATGTGTGTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|20 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctccagtcacattttcagttgtaatagcttcaatttgtccatcaataatggacatgggagcctcgattatctgaaatgtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgaA-AA-TCAT-GTTACATCTGTACTGCATAGAATTT--ACTTGTAC------C--------T-AAAATGTA-GACC--TATCTTTT-TTTGCTAGAT------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTT
gi|21 : ttgtggaca-AA-TTTT-GTTACATCCGTATTGTATAGCATTT--ACATGTAC------CTAAAACATT-AAAACGTA-AACC--TATCTTTC-T------
gi|22 : tgttgtaatA-AA-TTTT-GTTACATCCGTACTGCATGGCATTT--ACTTGTAC------C--------T-AAAAC-CATGACA--TACCTTTC-T------GAG------C-TA-G------A-----TCTAAAT---GC-TTT---TCAATATTTTcatctagatctaaattttatat
gi|23 : gtgcaA-AA-TTTT-GTTACATCCAAACTGTATAGCATTC--ACCTTTAC------C--------T-AAAACATC-GACC--TACCTTTC-T------CAG------C-TAGA------T-----TTAAA-T---GT-TAT---CC-ATAGTTTCTAT
gi|24 : taA-AA-TATT-GTTATATCCGTACTGCAGAACACTT--ACCTATAC------G--------T-AAAATGTA-GGCCTGTAGCTTTC-T------CAG------C-T--
gi|25 : ccgtgggcaA-AA-TTTT-GTTACATCCATGATGCATAGCATTT--ACCTATAC------C--------T-AAAATGTA-GACC----CCTTTC-T------TAGCTAAATC-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CTGagatctaaatgttatct
gi|26 : gtcgtgggcaTACATTAGAACTGCATAGCATTT--ATCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-TAGA------T-----C-----T---GTACATTCCCCAATAGTATCTTTTTA--GTG
gi|27 : A-AA-TATT-GTTACATCTGTACCACATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAATGTA-GGCC--TACCTTTG-T------TAG------C-T--
gi|28 : tcaTGTAC------C--------TTAAAAAGTA-CATG--TA---------------AG------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---TAAATATTTTCTATCAAGTGTGTGTGCA---TTTTTT--T-TA-TTGAA--AAagatctatatgttagtttct
gi|29 : aacttgagGATTGTAG-GCATAC-TTTT-GTTACATACATACTGTAAAGAATTC--ACCTGTAC------T--------C-AGAATGTA-AACT--TACATTTC-
gi|3 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTTTTTCCATGAAC-GTGTAACTGGACCGGGATAGGTAGCCGCTAGCAAACAACATCTTCCATATTATCGACTATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATTCTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGCCTATTTGCTATTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCGTCAGTGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGATTGTGCCAGTTTTGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAACATGAGTCCAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTat
gi|3 : ttgttttcggatggagTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTA---------------TGGTAATTGGATGGAACGTTTTGAACATTAACATCAATATTCATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAGATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTAATACTCGAATTTCCCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAG---GTGACGCAGTGGTCAACGGAAATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGTACTATGATTCTCGCCAAAGTGTCAGCTAGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATTGTCCGAATTTTTGTATCAGTGGTACCCGCCATCACCGTACGTATGGCGTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTAATAATTTATACACATGGAGAGTTTATCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AG-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATATGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TATTTAAA--AAATATATA--TTCTCTTCTTTTTATGCTTTCACTTTGTCCTGGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctatggtaattggatggaacgttttgaacattaacatcaatattcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaagatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaataaaagaaacaattaccttaatactcgaatttcccgtagtattaagtccaatgactttctgccactcagaggtgacgcagtggtcaacggaaataaactgacctattgcaaggtcatgagtactatgattctcgccaaagtgtcagctagacagtctccccatcatcagataatgtaattgtccgaatttttgtatcagtggtacccgccatcaccgtacgtatggcgtcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactggtgtaacatgttatgggtgctattaataatttatacacatggagagtttatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaagttgtgttatatctgtactatttatatgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctattaagtgtgcgcattttacaattatttaaaaaatatatattctcttctttttatgctttcactttgtcctggct
gi|30 : ttgttttcggatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtaatttttaagatagtttttccatgaacgtgtaactggaccgggataggtagccgctagcaaacaacatcttccatattatcgactatgtctatgtccagagcattttgtaaaattctcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacgcctatttgctatttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcgatttgtccgtcagtgatggacatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgattgtgccagttttgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgaggtttaatttgcatggaattaaaaacatgagtccaggatttcaaaatttgctaatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AG-TTGT-GTTACATCCGTATTGTATGGCATTT--ACCAGTAC------C--------C-AGAACATC-AACC--TACCTTCC-T------
gi|31 : ataggaaA-AA-TTGT-GTTACATCCATACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------T--------C-TGAACACA-GACC--TACCTT
gi|32 : cataggtgTTCGAGGTTTAATTTGTATGGAATTTAAAATATGAGTCCAATATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCG
gi|34 : TGTAC------C--------T-AAAATGAA-GAAT--TCTCTTTC-T------AAG------C-TAGG------T-----CTATA-T---GT-TAT---CCAATA
gi|35 : ttgtGATCATAG-GCA-AAATTGT-GTTACATCCATACTGCATAGCTTTT--ACCTGTAC------C--------g
gi|36 : A-AA-CTTT-GTTGCATCCAAACTGCATTGCATTT--ACC
gi|4 : gtcgtggataAGTGATTTTAGAAATTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCTT-AACGGTGTAACTGAACAGGAATAGGTAGCTGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCATGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCA-TTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGTTCATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTG-CAGTAACTTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATTATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTACATGGAATTAAAACTATGAGTGCAGGATTTCAAAACTTGCT-TAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCACGGCTTGGCTGGGTCAGTTGGTAGTGTGT
gi|4 : tgtttgcgggtggagTTGTTACAACTTGAATATGTAGACAG----TTATTATAACCGCCATATTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATTATGGGCAGGGAAATATTGTTTTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTATAGTTCCATACTAGGAGATATACTTATGATGGGATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttacaacttgaatatgtagacagttattataaccgccatatttggctggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattataaggatttgatttgtaattatgggcagggaaatattgttttattgtagactttgtcagtcttatagttccatactaggagatatacttatgatgggatg
gi|5 : tgtttgcgggtggagagtgattttagaaatttgtaagtgtaatttttaagatagtatttccttaacggtgtaactgaacaggaataggtagctgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtcatgagcattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccattttacggctaactgctacttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcaatttgtccatcaatgatgttcatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgcagtaactttatgttctatatggcaaatggcaaaattatgtttacgattcgatgtttaatttacatggaattaaaactatgagtgcaggatttcaaaacttgcttatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcacggcttggctgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCATTTTGGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTCAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTTTGTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATTCA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTATAGTAGGTAAGAAAG-GAA--ATAAACAAA-GAAACAGTTAC-------CTTGA---------------------CAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTAGTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCGTCAGATAATGTAATCGTCCGTATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACATATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAAAATGTTATGGGTGTTATTACTAATGTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGTGCA---TTTTACAAT-TA-TTTGA--AAATATATA--TTTTCTGCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCT
gi|6 : CTTTGAATATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-TTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAAATTCATACTAGGAGATAAA-----AGTGGGATGAAGGTAAATTCAAATATGTAAGAAGG-GAG--ATACATAAAAGAAACAATTACATTGATACTCAAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTTCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACTAACCATCAACGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTAAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATTTCTGTTCT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GAAA--TACCGTTC-T------GAG------T-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATATTTTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCATTTTGTCCTG
gi|7 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCATCCATATCATCGACCATGCCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCTAGTTGACTGTAAAGTTGGAG---TTTCCATTTTTACGGCTTACTGTTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGGAAATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTCAATTTGAATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCTAAATTATTAAAAAGCGGGAAAAGAAAGTAACTTCCCCGTCAAG
gi|8 : AGTGATTTTACAAATTTATAAGTGTA-TTTTTAAAACAATATTTCCCTGAAC-GTGTAACTAGACAGGGATAGGTAACCGCTGGCAAACAGCCTCTTCCATATCATCGACCATGTC------CAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAATCGGAGAAGTTTCCAATTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCATTTGTAATAGCTTTTATTTGTCCATCAATGATAGACATGGGAGCTTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTAC
gi|9 : ttatttgcggatggagAATAGATAAGGTTAC-TGGT--GTGACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCAC
gi|9 : GATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATTTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTG--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATA--TTTTCTTCCTTTTGTGCTTTCACATTGACCTGGCTTAAATGCGGCAACTACTCGTATATTACTATTACAGTCATTTCATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatttgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttggtgtgcgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttccttttgtgctttcacattgacctggcttaaatgcggcaactactcgtatattactattacagtcatttcatta
blockSeqs : G T A T A TATTAAAA AAAG A G T T CTTAT G T TT A A T T GTT T T AC NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN GAT T A T C G G TG ATGTAG TAAAACAT T T TG A TTGCTAG CTAAAT A GTATACATG AAA G TCC G GT GAG T A T G GT TT TACTCG
blockSeqs : . T G G . . . T T . . . G . . C A . T . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN AG . A G . G G . . . . . T . AGATAG . . AGATTTATA . A . C . . A . . A . . .
blockSeqs : . T A G . . . T T . . . G . . C T . T . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TG . . A . T A . . . . . . . A . . GGATATATA . . . A . . T . . C . .
blockSeqs : . A A T . . . C T . . . A . . C A . T . . . . GG . . T . G C . . . . . . . T . . AGATCTAAA . . . G . . T . . G . .
blockSeqs : . . T T . . . . T . . . G . . A A . . . . . . TT . . G . G A . . . . . . . T . . AGATTTAAA . . . G . . T . . A . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . GG . . T . G A . . . . . . . C . . AGGTCTATA . . . G . . A . . T . .
blockSeqs : . . . TT . . T . G A . . . . . . . T . . GTATA . . . G . . A . . T . .
blockSeqs : TT . . A . G A . . . . . . . G . . AGATT . . . A . . A . . T . .
blockSeqs : TT . . T . G G . . . . . . . G . . AGATC . . . G . . A . . . .
blockSeqs : . . T . G A . . . . . . . G . . ATA . . . A . . A . .
blockSeqs : . . T . G A . . . . . . . C . . GTT . . . G . . . . .
blockSeqs : . . T . G A . . . . . . . C . . ATA . . . A .
blockSeqs : . . T . G A . . . . . . . T . . ATA . . . A
blockSeqs : . . T . A A . . . . . . . G . . ATA . . . A
blockSeqs : . . T . G A . . . . . . . T . . GTT . . . A
blockSeqs : . . G . G G . . . . . . . G . . GTT . . . A
blockSeqs : . . G . G A . . . . . . . A . . GTT . . . A
blockSeqs : . . G . G A . . . . . . . G . . GTT . . . A
blockSeqs : . . G . G T . . . . . . . G . . G . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
finalCons : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GGTATAGTGTTGTGATATCTATACTACATATAGAACTGACTTAAACACAAGACGAAGGTCCAC
Unaligned ( gi|37 ): ATCGTGGGCCAAAGTTTGATACATCCGTAATGAAAATACTCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222222 1111 11111 111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 444444444444444444444 333333
lowQualScore : 5 3 2 0 1 0 5 00000000 4444 1 1 5 5 22222 1 5 77 4 1 5 1 000 6 6 99 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555 1 3 1 1 2 1 22 444444 55555555 1 1 33 1 0000000 555555 1 000000000000000000000 333 4 333 2 0 44 555 3 3 3 4 55 66 888888
lowQualScore : . . . . . . . ........ .... . . . . ..... . . .. . . . . ... . . .. ................................................................................................................................ ... . . . . . . .. ...... ........ . . .. . ....... ...... . ..................... ... . ... . . .. ... . . . . .. .. ......
lowQualScore : 7 5 2 7 3 4 7 77777777 2222 8 4 0 0 55555 7 7 99 3 9 7 4 000 7 7 22 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 7 3 0 7 6 2 22 333333 44444444 5 5 77 6 6666666 222222 8 222222222222222222222 555 0 555 6 3 22 888 8 3 3 9 55 11 333333
consensus : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
Reference ( family-3397 ) : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCATCAATGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTNT-GTTACATCCGTACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCGATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTGCAAT-TA-TTNAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAC------TATATGACTATAACAGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCA
gi|1 : AGTGATTCTACAAGTTTGTAAGTGTAATTGTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATATGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATACCCAGAGCATTTTATAAAATACTCAAGTTGACTGT-----CGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCTAGTCACATTTCCAATTGTAATGGCTTCGATTTGTTTATCAATGATGGACATTGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATATTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCGAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACCTCCCCACCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGT
gi|1 : TTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTCATTGGATGGAACGCTTTGAACATAAACTTCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATAAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAAG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGTTACTCGAATTTCTCGTAGTATC-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTAAGTTGGACAGCCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTTCGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGAT--ATAACATGTAATGGGTGCTTTTACTAATTTATACACGTGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GAGTGTGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATA--TTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCAACAAC------TATATGACTATAACTGTCAATTCATTACATAAAATATGCGTGCCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggctggtcattggatggaacgctttgaacataaacttcaatatcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggataaaggtaatttctaatatgtaagaaaggagataaataaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtatcaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacggagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtaagttggacagcctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgttcgtatggcctcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactgatataacatgtaatgggtgcttttactaatttatacacgtggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatctgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttagagtgtgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttctttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcaacaactatatgactataactgtcaattcattacataaaatatgcgtgccaa
gi|10 : agtgattctacaagtttgtaagtgtaattgttaagatagtatttccctgaacgtgtaactggacagggatatgtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatacccagagcattttataaaatactcaagttgactgtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctctagtcacatttccaattgtaatggcttcgatttgtttatcaatgatggacattggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatatttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcgaggatttcaaaatttgctaatagcgggaaaaggaagttacctccccaccaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGAATGTGTTAACACAAAGTGATTTTAAATGCCATTTACGTCTGAAAAC-GGATGAAACATTATGAACATTAGCATCAAAAG-CAA-ACAAGATTTTGATTT-GTAGTCATGGGCAGGAAGGTAa
gi|10 : AGGA-AGGTA-----AGTGTGATGTAGACAATT------ATGTAGAAAGATGATTTATAAATAAAACGAACAATCACATGTATGGTTGAATTCCTTGTTGTGTTTAAG-CCGATGACATTTTGCCACTCTGAG---GTGACACAATGGTCAATTGAAACGAACTGACCTATAGCAAGGTCACGAGAGCTAAGC-TCTCGCCAAACTGTCAGTGGAATGGTTTCCCCATCTTCTGACAAAGTAATTGTACGTATATTGGTATTGATGagtgtgatgtagacaattatgtagaaagatgatttataaataaaacgaacaatcacatgtatggttgaattccttgttgtgtttaagccgatgacattttgccactctgaggtgacacaatggtcaattgaaacgaactgacctatagcaaggtcacgagagctaagctctcgccaaactgtcagtggaatggtttccccatcttctgacaaagtaattgtacgtatattggtattgatgct
gi|11 : ttgaatgtgttaacacaaagtgattttaaatgccatttacgtctgaaaacggatgaaacattatgaacattagcatcaaaagcaaacaagattttgatttgtagtcatgggcGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGCTGGTAATGAGATGGAAGGCTTTGAAAATTAACATCAATAT-CATTAAAAGGATTTGATTT-GCAATCATGGGCGGAAAAATATTGTTCTATTGTTGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTATGAA-G-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTGATACTCGAATTTCTGGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAAGTTGTGACGct
gi|12 : CGTAA-GCA-AA-CTTTCGTTACATCCGTACTGCATGGTATTTTGACCTGTAC------C--------C-AAAACATA-CACC--TGCCTTTT-TAGATA-GAT------C-T--G------TATACATG----T---AT-TAT---CCGATATTTTCTTTTTA--GTGTATGCA---TTTGGCTAT-TA-ATGAAGTATATATATA--TTTTgtgactgactgcaata
gi|13 : A-AA-TTGT-GTTGCATCTGTATTGCATGGTATTT--ACCTATAC------C--------C-AAAAGGTA-GACC--TGCCTTTCAT------ATG------CAT--G------TA----TA----T---GT-TAT---CCCATTTTTTGAATTTA--GTGTGTCCAGAGTTTCGCAATATA-ACAAA--GAATTTAAA--TTTTaatt
gi|14 : gtaggcaGTAT-GCA-AAATTAT-GTATCATCCAT-CTTCATAACATTT--ACCTATAC------C--------C-AGAGCATA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-T--G-------------------------TAT---CCAATATTTACTATTCA--ATGTGCGCA---TTTTGCTAT-TA-TT-----AAATATATA--TTTTATTTTTTTtatc
gi|15 : tA-AA-TTTT-GTTACATCCGAACTGCATCGCATTT--ACCTGTACATGTAGC--------T-TAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-TAGA------T-----TTATA-T---AT-TAC---CCGATAGTTTCTATTTA--GCGTGTGCG---TTTAGCTAT-TA-caattta
gi|16 : ggataA-AA-TTGT-GTTACATCCGTA-------GCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TTACTTTC-G------CAG------C-TAGA------T-----T-----TAAAGTGTAT---CAGATAGTTTCTATTTA--GTGTGCACA---TTTTGCTAT-TA-gatat
gi|17 : tgtgggcaAGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTGTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTTACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGTAAACAGCATCTTCCATATTATCGACCAgat
gi|18 : A-AA-TTTG-GTTACATCCAAACTGCATAGCATTT--ACCTGTAT------C--------A-AAAACATA-GACC--TACCTTTC-T------TAG------C-T--GGATATAT-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTTCTATT
gi|19 : tggataGATCGTGGATAA-AA-TTTT-GTTACATCCGAATTGCATAGCATTT--ATCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACCT-TAGCT----A------GAT------A-T--A------T-----A-----T---GT-TGC---ACGGTAGTTTCTGTTT
gi|2 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTCATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTTACTGGACAGGGTAAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCCAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATTTTCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATAATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAATGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTGTATGGAATTAAAAATATGAGTCAAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTACTTCCCCATCAAGGCTTGGTTGGGTCTGTTGGTAGTGTGT
gi|2 : ttgtttgctgatggagTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTAATTGCCATTTTTGGTTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTAT----------------------GGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTTAGTATTAGAGTTTCATACTAGGAGATTAA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATTAAAGAAACAATTACCTTGTTACTCGAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGGCTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGAAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATAGAAAAGGTCACTTTGTACATAACATGTTATGGATTCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|2 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctccagtcacattttcagttgtaatagcttcaatttgtccatcaataatggacatgggagcctcgattatctgaaatgtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGTAC------C--------T-AGAAC----------------TC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGTGCA---TTTTGCAAT-TA-TTCAA--AAATATATA--TTTTCTTATTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCTAAAATGCGACAAT------TATATGACTATAATAGTCAATTCATTACATAAAATATGTGTGTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgactgtacctagaactctgagctgtttgttatccaatattttctatttagtgtgtgcattttgcaattattcaaaaatatatattttcttatttttgtgctttcactttgtcctggctaaaatgcgacaattatatgactataatagtcaattcattacataaaatatgtgtgtca
gi|20 : ttgtttgctgatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtcatttttaagatagtatttccctgaacgtgttactggacagggtaaggtagccgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtccagaacattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacggctaactgctacttctccagtcacattttcagttgtaatagcttcaatttgtccatcaataatggacatgggagcctcgattatctgaaatgtaagaaaagtatgtgtatgtgccagttatgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgatgtttaatttgtatggaattaaaaatatgagtcaaggatttcaaaacttgctaatagcgggaaaaggaagttacttccccatcaaggcttggttgggtctgttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctaattgccatttttggttggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattatgggcgggaaaatattgttctattgtagactttgttagtattagagtttcatactaggagattaaagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaattaaagaaacaattaccttgttactcgaatttctcgtagtattaagtccaatggctttctgccactcagaagtgacgcagtggtcaacgaagataaactgacctattgcaaggtcatgagaactatgatctcgccaaagtgtcagttggacagtctccccatcatcagataatgtaatcgtccgaatatttgtatcagtggtacccaccatcaccgtacgtatggcctcgtcctgaaacagaatagaaaaggtcactttgtacataacatgttatggattctattactaatttatacacatggagagtttatcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtatttaaattgaA-AA-TCAT-GTTACATCTGTACTGCATAGAATTT--ACTTGTAC------C--------T-AAAATGTA-GACC--TATCTTTT-TTTGCTAGAT------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CCGATAGTTT
gi|21 : ttgtggaca-AA-TTTT-GTTACATCCGTATTGTATAGCATTT--ACATGTAC------CTAAAACATT-AAAACGTA-AACC--TATCTTTC-T------
gi|22 : tgttgtaatA-AA-TTTT-GTTACATCCGTACTGCATGGCATTT--ACTTGTAC------C--------T-AAAAC-CATGACA--TACCTTTC-T------GAG------C-TA-G------A-----TCTAAAT---GC-TTT---TCAATATTTTcatctagatctaaattttatat
gi|23 : gtgcaA-AA-TTTT-GTTACATCCAAACTGTATAGCATTC--ACCTTTAC------C--------T-AAAACATC-GACC--TACCTTTC-T------CAG------C-TAGA------T-----TTAAA-T---GT-TAT---CC-ATAGTTTCTAT
gi|24 : taA-AA-TATT-GTTATATCCGTACTGCAGAACACTT--ACCTATAC------G--------T-AAAATGTA-GGCCTGTAGCTTTC-T------CAG------C-T--
gi|25 : ccgtgggcaA-AA-TTTT-GTTACATCCATGATGCATAGCATTT--ACCTATAC------C--------T-AAAATGTA-GACC----CCTTTC-T------TAGCTAAATC-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---CTGagatctaaatgttatct
gi|26 : gtcgtgggcaTACATTAGAACTGCATAGCATTT--ATCTGTAC------C--------T-AAAACGTA-GACC--TACCTTTC-T------GAG------C-TAGA------T-----C-----T---GTACATTCCCCAATAGTATCTTTTTA--GTG
gi|27 : A-AA-TATT-GTTACATCTGTACCACATAGCATTT--ACCTGTAC------C--------T-AAAATGTA-GGCC--TACCTTTG-T------TAG------C-T--
gi|28 : tcaTGTAC------C--------TTAAAAAGTA-CATG--TA---------------AG------C-T--A------T-----A-----T---GT-TAT---TAAATATTTTCTATCAAGTGTGTGTGCA---TTTTTT--T-TA-TTGAA--AAagatctatatgttagtttct
gi|29 : aacttgagGATTGTAG-GCATAC-TTTT-GTTACATACATACTGTAAAGAATTC--ACCTGTAC------T--------C-AGAATGTA-AACT--TACATTTC-
gi|3 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTTTTTCCATGAAC-GTGTAACTGGACCGGGATAGGTAGCCGCTAGCAAACAACATCTTCCATATTATCGACTATGTCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATTCTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCATTTTTACGCCTATTTGCTATTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCGATTTGTCCGTCAGTGATGGACATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGATTGTGCCAGTTTTGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAACATGAGTCCAGGATTTCAAAATTTGCT-AAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCAAGGCTTGGTTGGGTCAGTTGGTAGTGTGTat
gi|3 : ttgttttcggatggagTTGTTAGAACTTGAATATGTAGACAT----TAATTCTA---------------TGGTAATTGGATGGAACGTTTTGAACATTAACATCAATATTCATTATAAGGATTTGATTT-GTAATCATGGGCGGGAAGATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATATA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTCTAATATGTAAGAAGG-GAG--ATAAATAAAAGAAACAATTACCTTAATACTCGAATTTCCCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAG---GTGACGCAGTGGTCAACGGAAATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGTACTATGATTCTCGCCAAAGTGTCAGCTAGACAGTCTCCCCATCATCAGATAATGTAATTGTCCGAATTTTTGTATCAGTGGTACCCGCCATCACCGTACGTATGGCGTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTAATAATTTATACACATGGAGAGTTTATCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AG-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATATGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TATTTAAA--AAATATATA--TTCTCTTCTTTTTATGCTTTCACTTTGTCCTGGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttagaacttgaatatgtagacattaattctatggtaattggatggaacgttttgaacattaacatcaatattcattataaggatttgatttgtaatcatgggcgggaagatattgttctattgtagactttgtcagtcttagagtttcatactaggagatataagtgggatgaaggtaatttctaatatgtaagaagggagataaataaaagaaacaattaccttaatactcgaatttcccgtagtattaagtccaatgactttctgccactcagaggtgacgcagtggtcaacggaaataaactgacctattgcaaggtcatgagtactatgattctcgccaaagtgtcagctagacagtctccccatcatcagataatgtaattgtccgaatttttgtatcagtggtacccgccatcaccgtacgtatggcgtcgtcctgaaacagaatggaaaaggtcactggtgtaacatgttatgggtgctattaataatttatacacatggagagtttatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaagttgtgttatatctgtactatttatatgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctattaagtgtgcgcattttacaattatttaaaaaatatatattctcttctttttatgctttcactttgtcctggct
gi|30 : ttgttttcggatggagagtgattttacaagtttgtaagtgtaatttttaagatagtttttccatgaacgtgtaactggaccgggataggtagccgctagcaaacaacatcttccatattatcgactatgtctatgtccagagcattttgtaaaattctcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccatttttacgcctatttgctatttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcgatttgtccgtcagtgatggacatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgattgtgccagttttgttatgttctatatggcaaatggcaaaataatgtttacgattcgaggtttaatttgcatggaattaaaaacatgagtccaggatttcaaaatttgctaatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcaaggcttggttgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AG-TTGT-GTTACATCCGTATTGTATGGCATTT--ACCAGTAC------C--------C-AGAACATC-AACC--TACCTTCC-T------
gi|31 : ataggaaA-AA-TTGT-GTTACATCCATACTGCATAGCATTT--ACCTGTAC------T--------C-TGAACACA-GACC--TACCTT
gi|32 : cataggtgTTCGAGGTTTAATTTGTATGGAATTTAAAATATGAGTCCAATATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCG
gi|34 : TGTAC------C--------T-AAAATGAA-GAAT--TCTCTTTC-T------AAG------C-TAGG------T-----CTATA-T---GT-TAT---CCAATA
gi|35 : ttgtGATCATAG-GCA-AAATTGT-GTTACATCCATACTGCATAGCTTTT--ACCTGTAC------C--------g
gi|36 : A-AA-CTTT-GTTGCATCCAAACTGCATTGCATTT--ACC
gi|4 : gtcgtggataAGTGATTTTAGAAATTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCTT-AACGGTGTAACTGAACAGGAATAGGTAGCTGCTGGCAAACAGCATCTTCCATATCATCGACCATGTCTATGTCATGAGCATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAGTCGGAGAAGTTTCCA-TTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGTTCATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTG-CAGTAACTTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATTATGTTTACGATTCGATGTTTAATTTACATGGAATTAAAACTATGAGTGCAGGATTTCAAAACTTGCT-TAT--------AGCGAGAAAAGGAAGTTACTTCCCCGTCACGGCTTGGCTGGGTCAGTTGGTAGTGTGT
gi|4 : tgtttgcgggtggagTTGTTACAACTTGAATATGTAGACAG----TTATTATAACCGCCATATTTGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTGAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-GTAATTATGGGCAGGGAAATATTGTTTTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTATAGTTCCATACTAGGAGATATACTTATGATGGGATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttacaacttgaatatgtagacagttattataaccgccatatttggctggtaattggatggaacgctttgaacattaacatcaatatcattataaggatttgatttgtaattatgggcagggaaatattgttttattgtagactttgtcagtcttatagttccatactaggagatatacttatgatgggatg
gi|5 : tgtttgcgggtggagagtgattttagaaatttgtaagtgtaatttttaagatagtatttccttaacggtgtaactgaacaggaataggtagctgctggcaaacagcatcttccatatcatcgaccatgtctatgtcatgagcattttgtaaaatactcaagttgactgtaaagtcggagaagtttccattttacggctaactgctacttctccagtcacatctccagttgtaatagcttcaatttgtccatcaatgatgttcatgggagcctcgattatctgaaaggtaagaaaagtatgtgtatgtgcagtaactttatgttctatatggcaaatggcaaaattatgtttacgattcgatgtttaatttacatggaattaaaactatgagtgcaggatttcaaaacttgcttatagcgagaaaaggaagttacttccccgtcacggcttggctgggtcagttggtagtgtgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCATTTTGGGCTGGTAATTGGATGGAACGCTTTCAACATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTTTGTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAGTTTCATACTAGGAGATTCA-----AGTGGGATGAAGGTAATTTATAGTAGGTAAGAAAG-GAA--ATAAACAAA-GAAACAGTTAC-------CTTGA---------------------CAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTAGTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTCCCCATCGTCAGATAATGTAATCGTCCGTATATTTGTATCAGTGGTACCCACCATCACCGTACATATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTCAC-TGGT--GTAAAATGTTATGGGTGTTATTACTAATGTATACACATGGAGAGTTTATCACTTAATGCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTAA--GTGTGTGCA---TTTTACAAT-TA-TTTGA--AAATATATA--TTTTCTGCTTTTTGTGCTTTCACTTTGTCCTGGCT
gi|6 : CTTTGAATATTAACATCAATAT-CATTATAAGGATTTGATTT-TTAATCATGGGCGGGAAAATATTGTTCTATTGTAGACTTTGTCAGTCTTAGAAATTCATACTAGGAGATAAA-----AGTGGGATGAAGGTAAATTCAAATATGTAAGAAGG-GAG--ATACATAAAAGAAACAATTACATTGATACTCAAATTTCTCGTAGTATT-AAGTCCAATGACTTTCTGCCACTCAGAA---GTGACGCAGTGGTCAACGGAGATAAACTGACCTATTGCAAGGTCATGAGAACTATGA-TCTCGCCAAAGTGTCAGTTGGACAGTCTTCCCATCATCAGATAATGTAATCGTCCGAATATTTGTATCAGTGGTACTAACCATCAACGTACGTATGGCCTCGTCCTGAAACAGAATGGAAAAGGTAAC-TGGT--GTAACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATTTCTGTTCT-------ATTT--ATCTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GAAA--TACCGTTC-T------GAG------T-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTA--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATATTTTTTCTTCTTTTTGTGCTTTCATTTTGTCCTG
gi|7 : AGTGATTTTACAAGTTTGTAAGTGTAATTTTTAAGATAGTATTTCCCTGAAC-GTGTAACTGGACAGGGATAGGTAGCCGCTGGCAAACAGCATCATCCATATCATCGACCATGCCTATGTCCAGAGCATTTTGTAAAATACTCTAGTTGACTGTAAAGTTGGAG---TTTCCATTTTTACGGCTTACTGTTACTTCTCCAGTCACATCTCCAGTTGTAATAGCTTCAATTTGTCCATCAATGATGGAAATGGGAGCCTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTACGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGATGTTCAATTTGAATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCTAAATTATTAAAAAGCGGGAAAAGAAAGTAACTTCCCCGTCAAG
gi|8 : AGTGATTTTACAAATTTATAAGTGTA-TTTTTAAAACAATATTTCCCTGAAC-GTGTAACTAGACAGGGATAGGTAACCGCTGGCAAACAGCCTCTTCCATATCATCGACCATGTC------CAGAACATTTTGTAAAATACTCAAGTTGACTGTAAAATCGGAGAAGTTTCCAATTTTACGGCTAACTGCTACTTCTCCAGTCACATCTCCATTTGTAATAGCTTTTATTTGTCCATCAATGATAGACATGGGAGCTTCGATTATCTGAAAGGTAAGAAAAGTATGTGTATGTGCCAGTTATGTTATGTTCTATATGGCAAATGGCAAAATAATGTTTACGATTCGAGGTTTAATTTGCATGGAATTAAAAATATGAGTCCAGGATTTCAAAACTTGCT-AAT--------AGCGGGAAAAGGAAGTTAC
gi|9 : ttatttgcggatggagAATAGATAAGGTTAC-TGGT--GTGACATGTTATGGGTGCTATTACTAATTTATACACATGGAGAGTTTATCAC
gi|9 : GATCGTAT-TCA-AA-TTGT-GTTATATCTGTACT-------ATTT--ATTTGTAC------C--------T-AGAACGTT-GACA--TACCTTTC-T------GAG------C-T--G------T-----T-----T---GT-TAT---CCAATATTTTCTATTTG--GTGTGCGCA---TTTTACAAT-TA-TTTAA--AAATATATA--TTTTCTTCCTTTTGTGCTTTCACATTGACCTGGCTTAAATGCGGCAACTACTCGTATATTACTATTACAGTCATTTCATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgtattcaaattgtgttatatctgtactatttatttgtacctagaacgttgacatacctttctgagctgtttgttatccaatattttctatttggtgtgcgcattttacaattatttaaaaatatatattttcttccttttgtgctttcacattgacctggcttaaatgcggcaactactcgtatattactattacagtcatttcatta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GGTATAGTGTTGTGATATCTATACTACATATAGAACTGACTTAAACACAAGACGAAGGTCCAC
Unaligned ( gi|37 ): ATCGTGGGCCAAAGTTTGATACATCCGTAATGAAAATACTCA