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gi|1 : aaaacagttttcattccaaattaactttgcattttggcatttttaactttaatcctatcttataatatatgtattttgttgtttacatactgggatggcattgttttctctcgaatgtcagcgttaggctggtttctagagatcaactggtatccattttttggggttaaatttcaaaaggtgtctttatatcaaatcgtggtttggaaccagtgtttagttcctacaaatattgaattatatatgcatatattggaaatttggatgcataatgcagaggccaatattagacttagtgaagttaaaatattatagtactccacattacatcgtataacggagtacctttgTGCT--------CGAAATTACAGAGAAAAGTA-ATGGTTAC-ATGTACTCCATTTACACAACAATACGGAACATCAATCGGATAA-ATATTGTTTATC---AA---GTTAT-----T-----C--TGATC-ATATTGAATA----TGTAGGCATATCGTTCATAAAATA--------TT-TT-AAAGAATGAAGCCC-GACATTTAGTGGT-AAAA---GACATTTGATAATTGGGCACAGGTTTCCAGAGCTTTA-CGTCTTTGGTTTTT-CCTGGGCGAGTTGA-CCACGTT-TTGAAAATacctttaatcat
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gi|1 : attcatggcgccacaatagccaaagtaaaattttaaatataagttgagtactatttttcccgacattacagagaaaaataattgttacatgtatttcatttacataacaatatgaaacaccagtctgtgagtgtcgtttatcaataagttatttttgtcaaactgaatatacaggcgcagtgtttgcataagattttcaagaacgaagctcgacatttagtggtaaatatatacac-TT-AAAATACATGCCTATTA--TGTTT-GATACATCTGTTTAC--ATATATGgcagatgcgcattcacgttgttgttcgacattgctctttagcatttgggtatccaactgcattatctttgggtgggctatagagtggcggacagttgccaagcttttgc
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3386 ) : TTGTACTCCGCGTTACATCGTATAGCGGAGTACCTTT-GTCCT-GGCGTTATTGTTATACAAAACCTGTTTTGAACGCTCGAGTGATTCGAGATTACATATAAATATAGATTTTTGGCGGTAAGAAATCAGTTCTAGCGATTNACTCTGAGCGACGACATCGGGAAAAATT--A-AATNTAAAT-TCAATGCT--------CGAAATTACAGAGAAANA-TAATTGTTACATGTATTTCATTTACATAACAATACGAAACATCAATCTGATAAATGTCGTTTAT-CA--A--A-G----TTAT-----T-----C--AA---ATT-AT------TATGCAGGCGTAT-TGTT----CATAAAAGATTTT-CAA-GAATGAAGC-CCGACATTCAG-TGGT-AAAAGACATTTGATAAACGGGCACAGGTTTCCAGAG-TTTACCGTCTTTGGTTTTT-CCTGGGCGAGTCGACCACGTTTTGAAAATCTTTTATGAC--TGTCATTT-AA----AAATGTGNAATGTATTTC-AAANATT-GTTCC-TT-AACATATGCGTATTA--TGTTT-TATGCATCTGA---TTAT--ATATATGTATCTATGGCTTGTCTAGTTAAACGTATGTCGTCACTCTATATAAATGCGTCTCGCAAATCGCAAAAANCAGTGTCTGTTGTTTGTTTGGA-----TTTTTGTATGGNAAATAGATAGGACGTAT--TGTT--CTTTA-ATTAT
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Reference ( family-3386 ) : TTGTACTCCGCGTTACATCGTATAGCGGAGTACCTTT-GTCCT-GGCGTTATTGTTATACAAAACCTGTTTTGAACGCTCGAGTGATTCGAGATTACATATAAATATAGATTTTTGGCGGTAAGAAATCAGTTCTAGCGATTNACTCTGAGCGACGACATCGGAAAAAATT--A-AATNTAAAT-TCAATGCT--------CGAAATTACAGAGAAANA-TAATTGTTACATGTATTTCATTTACATAACAATACGAAACATCAATCTGATAAATGTCGTTTAT-CAA-AAGT---TAT-----T-----C--AA---ATT-AT------TATGCAGGCGTAT-TGTT----CATAAAAGATTTT-CAA-GAATGAAGC-CCGACATTCAG-TGGT-AAAAGACATTTGATAAACGGGCACAGGTTTCCAGAG-TTTACCGTCTTTGGTTTTT-CCTGGGCGAGTCGACCACGTTTTGAAAATCTTTTATGAC--TGTCATTT-AA----AAATGTGNAATGTATTTC-AAANATT-GTTCC-TT-AACATATGCGTATTA--TGTTT-TATGCATCTGA---TTAT--ATATATGTATCTATGGCTTGTCTAGTTAAACGTATGTCGTCACTCTATATAAATGCGTCTCGCAAATCGCAAAAANCAGTGTCTGTTGTTTGTTTGA----NTTTTTGTATGGNAAATAGATAGGACGTAT--TG----TTACCTTTAATCAT
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Unaligned ( gi|16 ): TGATTTATATAAGCAATGGTGAGTATTCTGAATGATATTACAAATCATATTTGGATAGGCTGTATAGTGGCGGATTGTTGCCCACCTTTTGC