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Reference ( gi|2 )            :                                             TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTCTCGAATTGA-GTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGGCC-AAGGGCACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGA-TGATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCTT-GAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCCGTCTAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCTCTCTTGTGTAGGTTGTTGTCATGGGAACTAAGTAAATGTCTGCAGGGACAGCTATAAGATGGTACACTACCCTGTACATCATTACAAGCCTAGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATCTGACGCTGCTTGTTCTCCTGTAATCGCAAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGGTCCCAAACTACAGATACATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACTTATTTTGGACAACTGTATGTGCTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCAACATGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTAATAGTAACAC-----C----------CAAATATTTGGCTTCTTTGACCATTTGTAGCTCGATGCTGTGTATCTTGTAAGGAGATAGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|5                          :                                             TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTC--GAGTTG--------------------CTTTGAGGACC-AAGTGCACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGA-TGATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCTT-GAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGTAGGAAA-----TCTGTTCTAGATTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGAAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCTTGAATATCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGGTTGTTTTCATGGGAACTAAGTAAATGTCTGCAGGGACAGCTATAAGATGGTACACTACTCTGTACATCAATACAAGCCTAGCATGCTGGC-----------AATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTAACGCTGCTTGTTTTCCTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGCTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGCATGGGTCCCAAACTACAGATGCATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAAAAACATTGTTGTTTTACTTGGTTTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCATCATGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTGATAATAACAC-----C----------AAAATATTTGGCTTCTTTGACCGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTATCTTTTAAGGAGATTGAAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|1                          :                                          ttcTTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAAGAAC--TGAGACAGAGTATTGTC---GATTGA-GTT--TATATATATGTAGCATTGAGGACC-AAGTGTGCTT--AGTTAAAA--TCACACAA-ATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGA-TGATT-TTTCATGGCATCTTGCAACCCCATCTT-GAAGGATGGTAGGCTGGGA------ATCGGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTTGGGAAGAAGGAATGTAGATTACAATTAACATTCGACTG--GGATCGTGAATCTCGAAGTATGCTTTCTTGTGAAGGTTGTTGTCAAGGGTACCAAGTAAATGTCTGCAGTGACGGGGA-AAATTGGTACACTACCCTGTACATCATAACAAGCCTGGCATGCTGGCGACGGGATTGCAATGTGTCCTAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGAAGCTGCTTGATCTCCTATAATTGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCTGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGATCCCAAACTGCAGATGCATATTCAATGGATGGTCAAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACTTGTTTTGGACAACTGTATGTGTTCCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCAACGTGGTTGTTCCGTGAAAGATTGGAACTGAGAGTAACACAATAACAAATATTTCGCAAATATTTGGCTTCTTTGATGGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTTTCTAGTGAGGAGATTGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
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gi|17                         :                                        gcttcTTCTTCCAAGTAATTCATCCATCAAGAAC--TGAG------TATTCTC
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Reference ( family-3278 )     :                                                TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTC--GAATTGAGTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGACCAAGTG-CGCTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGCTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGGTTGTTGTCATGGGNACCAAGTAAATGTCTGCAGGGACGGCGATAAGNTGGTACACTACCCTGTACATCATTACAAGCCTGGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGACGCTGCTTGTTCTCCTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGGTCCCAAACTACAGATGCATATTCAATGGATGGTCGAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACTTGTTTTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCAACGTGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTGATAGTAACAC-----C----------CAAATATTTGGCTTCTTTGACCGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTATCTTGTAAGGAGATTGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|1                          :                                                TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAAGAAC--TGAGACAGAGTATTGTC--GA-TTGAGTT--TATATATATGTAGCATTGAGGACCAAGTG-TGCTT--AGTTAAAA--TCACACAA-ATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATT-TTTCATGGCATCTTGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGCTGGGA------ATCGGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTTGGGAAGAAGGAATGTAGATTACAATTAACATTCGACTG--GGATCGTGAATCTCGAAGTATGCTTTCTTGTGAAGGTTGTTGTCAAGGGTACCAAGTAAATGTCTGCAGTGACGGGGA-AAATTGGTACACTACCCTGTACATCATAACAAGCCTGGCATGCTGGCGACGGGATTGCAATGTGTCCTAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGAAGCTGCTTGATCTCCTATAATTGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCTGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGATCCCAAACTGCAGATGCATATTCAATGGATGGTCAAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACTTGTTTTGGACAACTGTATGTGTTCCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCAACGTGGTTGTTCCGTGAAAGATTGGAACTGAGAGTAACACAATAACAAATATTTCGCAAATATTTGGCTTCTTTGATGGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTTTCTAGTGAGGAGATTGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
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Reference ( family-3278 )     :                                                TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTC--GAATTGAGTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGACCAAGTG-CGCTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGCTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGGTTGTTGTCATGGGNACCAAGTAAATGTCTGCAGGGACGGCGATAAGNTGGTACACTACCCTGTACATCATTACAAGCCTGGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGACGCTGCTTGTTCTCCTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGGTCCCAAACTACAGATGCATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACTTGTTTTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCAACGTGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTGATAGTAACAC-----C----------CAAATATTTGGCTTCTTTGACCGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTATCTTGTAAGGAGATTGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|1                          :                                                TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAAGAAC--TGAGACAGAGTATTGTC--GA-TTGAGTT--TATATATATGTAGCATTGAGGACCAAGTG-TGCTT--AGTTAAAA--TCACACAA-ATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATT-TTTCATGGCATCTTGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGCTGGGA------ATCGGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTTGGGAAGAAGGAATGTAGATTACAATTAACATTCGACTG--GGATCGTGAATCTCGAAGTATGCTTTCTTGTGAAGGTTGTTGTCAAGGGTACCAAGTAAATGTCTGCAGTGACGGGGA-AAATTGGTACACTACCCTGTACATCATAACAAGCCTGGCATGCTGGCGACGGGATTGCAATGTGTCCTAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGAAGCTGCTTGATCTCCTATAATTGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCTGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGATCCCAAACTGCAGATGCATATTCAATGGATGGTCAAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACTTGTTTTGGACAACTGTATGTGTTCCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCAACGTGGTTGTTCCGTGAAAGATTGGAACTGAGAGTAACACAATAACAAATATTTCGCAAATATTTGGCTTCTTTGATGGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTTTCTAGTGAGGAGATTGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|10                         :                                                                                                                                                         AA--TTACGTTA-ATACTATTTTAGACAATACCGG----TAATTTAGGAT-GATTACTTCATGGCATCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATTGTAGGCTGGAAGTTGGGATCATTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTCGTGGTACTCGGGAGGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCAACTGTGGGATCGTTAATCTCGAAGTATGCCC
gi|11                         :                                                TTCTACCAAGTAATTCATCCCT-ATAAACCTTGAG------TATTTTC--GAATTGAGTG--TATGTACATATGGCGTTGAAGACCAAGTG-TGCTT--ATTT
gi|12                         :                                                                                atcaattctacatttcttgataaagtactagctttatgttatacGTTGAAGACCAAGTG-TGCTT--AGTTAAAA--TACCAT-ATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGATTGATTACTTCATTGCATCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAAGCTAGGAGTTGTGATCCGTCCATCAAGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAtttttacaaatatttaaagtttaagaattttgaattttacttgacatcattccttccagtcttg
gi|13                         :                                                                                                              tATGTACATGTGGTGTTGAGGACAAAGTG-CACTT--GGTTAAAA--TCACATTATTTAC-AGGTTAAAAAC----------T--TCTATGA
gi|14                         : gcttctgccggataatggccaccatcatcttgttaattattatgccatgaatattattattgtgccatatttcAAC--TGGG------TATTTTTT-GAACTGTGTGACTATGCACATGTGCCGTTAAGGATCGAATGACATTCCAATTTAAAACTTCATATT---TAT-AGTTTAAAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cggtttcagtttatAAGTTGATA-ACTACCTTGTACATCATTACAAGCTTGGCATGCTGGCGTTGGGATTGCAATGTGTCCCAGTCTCAATgataaaaacatcctgagtttgggccagtgtggtactt
gi|16                         :                                          tcaaggTTCTTCCAAGTAATTCATCCTTCAAAATC--TGAG------TGTTTAC--CATTTATGTT--TATGTAtt
gi|17                         :                                            ttttTTCTTCCAAGTAATTCATCCATCAAGAAC--TGAG------TATTCTC--AA
gi|18                         :                                           tcttcTTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAAAAAC--TGAG------TATTCT
gi|19                         :                                                  gcttcAAGTTATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTGTC--GAACTGAGT
gi|2                          :                                                TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTCTCGAATTGAGTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGGCCAAGGG-CACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCCGTCTAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCTCTCTTGTGTAGGTTGTTGTCATGGGAACTAAGTAAATGTCTGCAGGGACAGCTATAAGATGGTACACTACCCTGTACATCATTACAAGCCTAGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATCTGACGCTGCTTGTTCTCCTGTAATCGCAAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGGTCCCAAACTACAGATACATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACTTATTTTGGACAACTGTATGTGCTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCAACATGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTAATAGTAACAC-----C----------CAAATATTTGGCTTCTTTGACCATTTGTAGCTCGATGCTGTGTATCTTGTAAGGAGATAGGAGTGGTTTACGTTTGTTGt
gi|3                          :                                                TTCTTCCAAATAATTAATCCTTCAAAAAC--TGAG------TATTCTC--GAATTAAGTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGACCAAGTG-TGCTT--AGTTAAAC--TCCCAT-ATATAT-AAGTTAAAAACTT--GG----T--TCCAGGAT-GATTACTTCATGGTATTCCGCAACCCAATCT-TGGAGGATGGTAGGCTGGGGGTTGCGATGAGTCCAGCAAGAATTTAATGCTGTTCTAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAATAGGAATGTAGGTGACAAATAACTTTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCTCTCTTGTGTAAGTTGTTGTCATGGGTACCAAGTATATGTCTGCAGGGACGGCGATAAGTTGGTACACTACCCTGTACATCATTACAAGCCTGGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAAAGTGTCACAGTCT-TATGTCTTCAGCATTGATGCG--------TGTTCGACTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGACGTACCTCTGTGTTTGTGTAGGTCCCAAACTACAGAGGCATATTCAATGGATGGTCGAACTAAAGTGGAGACACATTGTTGTTTGACTTGTTGTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCCAGATTACTATTGGCATTTCTGCAGATATTGTCAACATGGTTGTTCCATGAAAGGTTGAAACTGATAGTAACAC-----C----------CAAGTA-TTGGCTTCTTTGACCGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTATATTGTAAGGAGATTGGAGTGGTTTACGGTTGTTG
gi|4                          :                                                   tctcAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTC--GAATTGAGTG--TATGTACATGTTGCGTTGAGGACCAAGTG-CACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATTACTTAATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCGGATGGTATTCGGAAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGGTCGTGAATCTCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGGTTGTTGTCATGGGAACTAAGAAAATGTCTGCAGGGACAGTGATAAGATGGTACACTACCCTGAACATCATTACAAGCCTGACATGCTTGCGTCACAATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGACGCTGCTTGTTCTCCTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGAATTGTTCCAG---CTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGGTCCCAAACTACAGATGCATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACATGTTTTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGACTTTACTGCAGATATTGTCAACGTGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTGATAGTAACAC-----C----------CAAATATTTGGCTTCTTTGACCATCGGTAGCTCGATGTTGTGTATCTTGTAAAGAGATTGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|5                          :                                                TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTC--GAGTTG-------------------CTTTGAGGACCAAGTG-CACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGTAGGAAA-----TCTGTTCTAGATTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGAAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCTTGAATATCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGGTTGTTTTCATGGGAACTAAGTAAATGTCTGCAGGGACAGCTATAAGATGGTACACTACTCTGTACATCAATACAAGCCTAGCATGCTGGC-----------AATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTAACGCTGCTTGTTTTCCTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGCTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGCATGGGTCCCAAACTACAGATGCATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAAAAACATTGTTGTTTTACTTGGTTTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCATCATGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTGATAATAACAC-----C----------AAAATATTTGGCTTCTTTGACCGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTATCTTTTAAGGAGATTGAAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|6                          :                                             ttcTTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGA------------------ATTGAATG--TATGTACATGTGGTGTTGAGGACCAAGTG-CACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAAGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGAC--TGGGATCGTAAATCTCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGATTGTTGTCATGGGAACTAAGTAAATGTCTGTAGGGACAACAATAAGATGGTACACTACCCTGTACATCATCACAAGCCTGGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGA
gi|7                          :                                               cTTCCTCCAAGTAATTCATCCCTCAAAATC--TGAG------TATTCTC--GAGTTGAGTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGACCAAGAG-TGTTT--AGTTAAAA--TCCCAT-ATATAC-AGGTTAAAAACTG--GGTGGGT--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCATCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAATTGCGATCAGTCCTGCAGGAAG-----GCTGTTCCAAAGTCAGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGGTGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAAGTTGTTGTCATGGGTACCCAGTATATGTTTGCAGGGACGGCGATTAATTGGTACACTACCCTGTACATCATTACAAGCCTGGCATGCTGGCATCGAGATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AAT
gi|8                          :                                                 tcTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--T-------------CTC--GAAATGAGTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGACCAAGTG-CACTA--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GA----T--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GCTCTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCCTTCTTGTGTAGGTTGTTGTCATGGGAACTAAGTAAATGTCTGCAGGGACAGCTATAAGATGGTACACTACCCTGTATATCATTACAAGCCTAGCATGCTGGCGTCGGG
gi|9                          :                                                TTCTTCCAAGTAATTAATCACTCAAAAAC-------------------------TGAGTG--TATGTACATGTTGCATTGAGGACCAAGT---GCTT--AGTTAAAC--TACCA-TATAAAC-AGGTTAAAAACTG--CG----T--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCATCCCGCAACCCCATCTCCGAACGATGGTAAGCTGGGAGATGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GTTGTTCCAGAGTCGGATGGTACTCGG---GAAGGAATGTAGATGAGAATTAACATTCGACTGTGGGGTCGTGGATCTCGAAGTATACCCTC-TGTGTAAGTTGTTGTCATGGGTACCA


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blockSeqs                     :                                                                             .     .            T           .                              .     .         .       T      .             .   .    .         .                               .                                           .                                                                                                                      T                          G     A                                                                     .                                                                                                          .                                                                                                                                                                                           C               
blockSeqs                     :                                                                             .     .            .           .                              .     .         .       T      .             .   .    .         .                               .                                           .                                                                                                                      A                          G     T                                                                     .                                                                                                          .                                                                                                                                                                                           C               
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Reference ( family-3278 )     :                                                TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTC--GAATTGAGTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGACCAAGTG-CGCTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGCTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGGTTGTTGTCATGGGNACCAAGTAAATGTCTGCAGGGACGGCGATAAGNTGGTACACTACCCTGTACATCATTACAAGCCTGGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGACGCTGCTTGTTCTCCTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGGTCCCAAACTACAGATGCATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACTTGTTTTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCAACGTGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTGATAGTAACAC-----C----------CAAATATTTGGCTTCTTTGACCGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTATCTTGTAAGGAGATTGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
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gi|3                          :                                                TTCTTCCAAATAATTAATCCTTCAAAAAC--TGAG------TATTCTC--GAATTAAGTG--TATGTACATGTGGCGTTGAGGACCAAGTG-TGCTT--AGTTAAAC--TCCCAT-ATATAT-AAGTTAAAAACTT--GG----T--TCCAGGAT-GATTACTTCATGGTATTCCGCAACCCAATCT-TGGAGGATGGTAGGCTGGGGGTTGCGATGAGTCCAGCAAGAATTTAATGCTGTTCTAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAATAGGAATGTAGGTGACAAATAACTTTCGACTGTGGGATCGTGAATCTCGAAGTATGCTCTCTTGTGTAAGTTGTTGTCATGGGTACCAAGTATATGTCTGCAGGGACGGCGATAAGTTGGTACACTACCCTGTACATCATTACAAGCCTGGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAAAGTGTCACAGTCT-TATGTCTTCAGCATTGATGCG--------TGTTCGACTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGACGTACCTCTGTGTTTGTGTAGGTCCCAAACTACAGAGGCATATTCAATGGATGGTCGAACTAAAGTGGAGACACATTGTTGTTTGACTTGTTGTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCCAGATTACTATTGGCATTTCTGCAGATATTGTCAACATGGTTGTTCCATGAAAGGTTGAAACTGATAGTAACAC-----C----------CAAGTA-TTGGCTTCTTTGACCGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTATATTGTAAGGAGATTGGAGTGGTTTACGGTTGTTG
gi|4                          :                                                   tctcAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTC--GAATTGAGTG--TATGTACATGTTGCGTTGAGGACCAAGTG-CACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATTACTTAATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCGGATGGTATTCGGAAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGGTCGTGAATCTCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGGTTGTTGTCATGGGAACTAAGAAAATGTCTGCAGGGACAGTGATAAGATGGTACACTACCCTGAACATCATTACAAGCCTGACATGCTTGCGTCACAATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGACGCTGCTTGTTCTCCTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGTTGGAATTGTTCCAG---CTTGATGTTCCTCTGTG--TGTATGGGTCCCAAACTACAGATGCATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAGAAACATTGTTGTTTTACATGTTTTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGACTTTACTGCAGATATTGTCAACGTGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTGATAGTAACAC-----C----------CAAATATTTGGCTTCTTTGACCATCGGTAGCTCGATGTTGTGTATCTTGTAAAGAGATTGGAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|5                          :                                                TTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGAG------TATTCTC--GAGTTG-------------------CTTTGAGGACCAAGTG-CACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAGGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGTAGGAAA-----TCTGTTCTAGATTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGAAGATGACAATTAACATTCGACTGTGGGATCTTGAATATCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGGTTGTTTTCATGGGAACTAAGTAAATGTCTGCAGGGACAGCTATAAGATGGTACACTACTCTGTACATCAATACAAGCCTAGCATGCTGGC-----------AATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTAACGCTGCTTGTTTTCCTGTAATCGCCAGTGACATATCTGGCTCCTCTCCGCTGGACTTGTTCCAGCTTCTTGATGTTCCTCTGTG--TGCATGGGTCCCAAACTACAGATGCATATTCAATAGATGGTCGAACTAAAGTGGAAAAACATTGTTGTTTTACTTGGTTTGGACAACTGTATGTGTTTCGACGGATGAATGCTAGGTTACTATTGGCTTTACTGCAGATATTGTCATCATGGTTGTTCCATGAAAGGTTGGAACTGATAATAACAC-----C----------AAAATATTTGGCTTCTTTGACCGTCGGTAGCTCGATGTTGTGTATCTTTTAAGGAGATTGAAGTGGTTTACGTTTGTTG
gi|6                          :                                             ttcTTCTTCCAAGTAATTCATCCCTCAGGAAC--TGA------------------ATTGAATG--TATGTACATGTGGTGTTGAGGACCAAGTG-CACTT--AGTTAAAA--TCACATTATATAC-AGGTTAAAAACTG--GG----T--TCTAAGAT-GATTACTTCATGGCGTCCCGCAACCCCATCT-TGAAGGATGGTAGGTTGGGAGTTGCGATCAGTCCAGCAGGAAG-----GCTGTTCCAGAGTCTGATGGTACTCGGGAAGAAGGAATGTAGATGACAATTAACATTCGAC--TGGGATCGTAAATCTCGAAGTATGCCCTCTTGTGTAGATTGTTGTCATGGGAACTAAGTAAATGTCTGTAGGGACAACAATAAGATGGTACACTACCCTGTACATCATCACAAGCCTGGCATGCTGGCGTCGGGATTGCAATGTGTCCCAGTCT-AATGTCTTCAGCATTGATGTGA
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