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Reference ( gi|1 ) : TGCATATTTTTCTCGTCCTGTTACACATGTAACATCATATAAAGAAATTTTAAATGTTTCAAAGGCCACAACGCTGATATTAC---TTATCAAATTTAGTCAGTCCAAAAAGTTATATTTATTATATATAGTTATATTATGGTTACATAACTACTGTGCAAGT----TAAAT----ATCAAATGAAAACTACATG--TGCTAGAGTGCACACATGGTCAAACAAGACATTTTTTTA-ATTATTCAAGGGCCAGAAATTCAGCAT--TAATTTTCT-GATTTGATCAGTCCAAGAACTTGTCTGAGATGTTATGATAATATAATTACTATGTAAGCTTGGTGTGGATCAAATGCAAAAATGAAGGTTCTAGTGTGCACACAATGTAAAATATTTACATTCCAACTGCAATCGGCCTAAAAGAACTATATAGATTTACTGCATTTCATATCCCAATGAAAAA-CACTTGCAGCTGGGTGGAGCTA-AAAGGCCCA------GTTTGCATTTTAATTGATTGC-A-CGATTTT---G-TTTTACTGGTGAGATGTCACT-TGC----CGTTA-GTTT--CA---CGTGACGTTTGCTG-----TAAGTTGTTCTGCAA-ATGTG------TGCACTTATTCATTATG--TT--AACAACGT-CGCCATTACAT-TCATGACA--ATGGCTTTGCTGTTTAATGCGTATCATTTGT-TTTTTAAAT---AT--CAAA-AT-TCAT-CAAAA---ATAA-C-ATAGT-AG---TTT-T-----A-T-CTGAAATAGCTGGAGAATATAATG-TAAA-TATAAGGAT-----TAA-AAGCCGAATTTTGAGTTTTCATCGGGTGATGAAAAACATAAGGCCAGTTCAATGT---T-T--GT---GAAGCCCTCCTTCAGGCTTCACG--AACACTGAACTGGCCTAATGTTTTTCACCATTCGATGAAAACTCAAAA-TGCG-GCTTTTA--ATTCTTCA-ATAATG
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gi|6 : AATGTGTATAGTCCGC-TTTTTAC-T---AT--TAAG-AT-GAGC-CAA------TGA-C-GTA---AG---TTT-TTTTTTA-T-CTCAATTAGTTAGAAAGTATAATG-TA---CATAAGTAT-----AGA-AAACGCAATTTTGAGTTTTCAGCTAATGATGGAAATCATTAGACTAGTTgcagccaaagtattgtaac
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gi|6 : gtccgatttttattacatttttttAACTAGTCTAATGATTTCCATCATTAGCTGAAAACTCAAAATTGCG-TTTTCTA--gca
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|14 : AATCGGTCTAAATGAACTGTATGGACCAACTGTATTTCATTTCTAAATGAAAAAGC-AATTGCAGTTGGTTGA-AGCTAGAG-AGAAACGGTGTGCATTCA-AATGG-TGC-ATCTAACTTGT------TTTTGCTCGTGTGACGTC
gi|15 : aGGCATCACGGAAATTTAGCTGGCCTTATAATTTTCATCACC-GATGAAAACTCAAAATTGGGGTTTTA--ATCCTCAA-AT
gi|17 : gtccgatttttattacatttttttAAAT-ATGTAATTTCCCACTGCAGTCAGCTTAAATGAACTATATATATGTACAGTATATCATgca
gi|2 : ATGATTATTTAACTACTTTGTAAGTTTA---ATGAGGATCAAATACAAAATGTGGCTGCTAGAGTGCACACAACATCAAATAATGCAATTTTTGACA--ATTCAAGAGTAATAAATT--ATATTATAAATTA-CTGGATTTGGGCAGTTCAAGAACTTGCTCAAGATATTATGATTATGTAACTACAGTGCAAGTTTGCTGAAGATCAAATG-AAAACTGCACGTCCAAGAGTGCATACAACATTAAATAATGCAAGTTTTGACa
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gi|3 : cagtgtttttttccatcattttgggaagatgacccatacccttggaattgggaattttttgcagtaaatatatttgttcaacttcataaaaatgtgtacacttgcttctctggccatttaattaaagagtcaatgtcatactcaatgtagaatggggaaactttgttaattttatcaaggaattatggcaagtttcaatttacaacttttgaagctttcaattgggaatttttagtttgggaaaaatgattatttaactactttgtaagtttaatgaggatcaaatacaaaatgtggctgctagagAA-CGATTTACTACTGAACGGTACTTG-AA-AGTACGACTGTGCATTTC-AATGGTGTT-A-TAAT-TTA-------TTCCAC-GGTACAACGTCAC------C---------TC-GTATCA--TTTGCTGTG----AATTGC-TA-TA----A--AAAAG--------TT--CGGTTATTTGGCTTG--TTG--ATAACA----TGTGTCTAC-ATGG----AAAA-T-G-AC-G-TCGATACGTATACTCTGC-TCTTT-ACTATTAAAT-TCA--GAAAATAACGATA---TAG------TTTT-ATCTAAAG----TAGAAAATATAATAATTAA-TAT------TATTGAAAG-CAT-AGTTAAGAGTTTTTACCGAGTGACGAAAAACATTAGTCTAA-TCTAATATTACAGGAA----------TA---GGGTTTTATGGACAATAAAGTAACCTTATGTTTTTCATCACGCGATGTAATCTGAAAATT--GCTCTTACCATCATTCGTATAATGttgaatgaatg
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gi|5 : GAAAAA-C-ATTTGCTATTGGGCAG-AGCTA-AA-AGGACCTGTTTGAGTTTC-ATTGGT-GCTA-CAATATTA-------TTTTGTCAAAGGGACGTAACGATAT-CACGAG----TT-TTGCAATGCTTGATGT-------TTG--TGGT-----C--AGTTG--------TGGTCATTTATTTGACGTG--TTG--AT----TTACTGTTTCAATGATGAAATTGGCT-TTGTGC-T-TTCAT----------CGC-TTTTTAAATATCAAAA-TGG--GAAAGTATCGTAA---TAA------TTTTAATCTAAAACAGCTAGAAAATATAAT-GAAAA-TTTAAGCAATACT--AAG-A-C-AATTTTGAGTTTTCACCGTATAATGAAacacaaac
gi|6 : --TTG--ATAACATCTCTGTTTTAAAAATGCCA---AAT-----A------AATGTGTATAGTCCGC-TTTTTAC-TATTAAGA-TGA--GCCAATGACGTAAGTTTTT------TTTT-ATCTCAATTAGTTAGAAAGTATAAT-GTA---CATAAG---TATAGAAAA-C-GCAATTTTGAGTTTTCAGCTAATGATGGAAATCATTAGACTAGTTTTAAT
gi|7 : ttccttaATGCCTATAAGCCGCATTTTTA--TATCAAAA-TTA--TAAAATAATATTA---TAG------TTTG-ATGTAAAA------------A-AAT-GTAAA-TGTTAG---TATTGAAAA-T-A-AATAT-GAGTTTTAA-CACGTAGT-AGACACAT------AG-TTTAAAGTAACTTAGAAGCC------------------ATGTACATTAAATTAACTTAATGGTTTTTATCACTCGATGGACATTCGAAAGTGTGCTTTCA--ATCCTTAA-atcaaagaacttaagagtattgctagtcggaatttaataaataagcatgtgacatcatattttgattaacattattgaagt
gi|8 : ttgAAAATAACGTAA---CAG------TTTT-ATCTAAAATAGCTGGAGAATATAAT-GTAAA-TATAAG---GATTAAAAGCC-A-AATTTTGAGTTTTCATCGCGTAATGAAAAA-ATAAGGCTAG-TTTAATGTTGTCGAAAAGCCA-----TTA--GGGCTTCACGAAGATTAAACTGGCCTAATGTCTTTCATCACCCAATGAAAACTgcagccaaagtattgtaac
gi|9 : aatttacaCTAG-TTTAATGTCTCAAAGAAGCC------CTTC-GCGCTTCATCAACATTAAACTGGCCTAACATTTTTCATCACCTGATGAAAACTCAAAGTTCTGCTTTTA--ATCTTTAA-ATatatatcaatgcaactcacattactttatttcaatt
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Unaligned ( gi|19 ): ATTTCCGAGTCCAATTCTCAGACTCAAATTGTTGATG