lowQualScore : 11 1111111111111 444444444444444444444444444444444444444444 1 111 44444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111 333333333333333333333333333333333333 44444444444444444444444444 1
lowQualScore : 2 11 22 1 222 2222 111 4 777777 111 111 4444444444444 0 0 222222 222222 8888888888888888888888 33333 777777777777777777777777777777777777777777 5555555555555 3 77777777 0 11111 1 22 22 11111 1 2222 11111 555555555 111 111 11 11 0 22 0 0 11 6666 222 11 3 0 0 88888 0 3 22222 0 22 1111 0 444 0 88888888888888888888888888888888888888888888 222 22 6666666 55555555555555555555555555555555555 11 7777777777777777777777 11 3 999999 111111111111111111111111111111111111 2222 1 1 2 55 55555555555555555555555555 222 1 222 2 66
lowQualScore : . .. .. . ... .... ... . ...... ... ... ............. . . ...... ...... ...................... ..... .......................................... ............. . ........ . ..... . .. .. ..... . .... ..... ......... ... ... .. .. . .. . . .. .... ... .. . . . ..... . . ..... . .. .... . ... . ............................................ ... .. ....... ................................... .. ...................... .. . ...... .................................... .... . . . .. .......................... ... . ... . ..
lowQualScore : 8 99 66 2 999 4444 999 3 777777 777 777 9999999999999 9 9 444444 444444 6666666666666666666666 22222 999999999999999999999999999999999999999999 1111111111111 9 77777777 8 99999 5 11 88 99999 5 4444 99999 555555555 333 333 88 00 7 11 8 8 88 9999 222 11 1 8 8 99999 7 3 99999 9 00 8888 9 555 9 22222222222222222222222222222222222222222222 666 22 3333333 88888888888888888888888888888888888 44 4444444444444444444444 44 4 444444 666666666666666666666666666666666666 6666 2 2 5 99 00000000000000000000000000 777 5 999 3 11
consensus : TAAATT-CAT--C-AA-AC--TTT----TG---AGTCTA------A---A---A-----C-------T-CA-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-G-AAA--T---TAA---CA--ACA-T-TT--T--CTTGC-AAAAA-----C-AG-T----CAA-TT--TC-AA-T--G-----TT---A----------CAT-TA-TC-AN-A---A---AA--TA-T--CT-AAA--A-AAT--A--TG--T---T--TT-N-T---A--ACT--AAA-------------C---AT---TTT--GCTATT-N----AA--NAG-TA-T-T-T--A-A-A-A----T--CGG--CA----A-TTTT-G-AG--TT------GAGTC--NG-A-TT--TT--T---AGAC-TCAA---AAGTTTT--ATGAA
Reference ( gi|7 ) : TAAATT-CAT--C-CA-AC--TTT----TG---AGTTTA------A---A---A-----A-------T-CA-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-G-AAA--T---TAA---CA--AGA-T-TT--C--CTTAC-AAAAA-----C-AG-T----CAA-TG--TC-AC-T--G-----TT---A----------AAC-TA-CC-AT-C---A---AA--TA-T--CT-AAA--C-AAT--A--TG--G---T--TT-C-T---G--ACT--AAA-------------C---AT---TTT--GCTGTT-T----AA--TAA-TA-T-T-C--A-G-A-G----T--CAA--CA----A-TTTT-G-AG--TT--AA--GAGTC--AG-A-TT--TT-GT---AGAC-TCAA---AAGTATT--ATGAA
gi|35 : TAAATT-CCT--T--A-AC--TTT----TA---AGTCGA------ACTCA---A-----A-------G-AA-G------T------C--------T-------------G-----AA-------------A--------------T-------------T-------------T-A--------TTC-----A-TT--T--GT-----AT----A-A-----AAA---------C---A---A--A--TTT-AT--AA-G-AAAA-T---TAA---CA--ACA-T-TT--T--CTTGC-AAAAA-----C-AG-T----CAA-TT--TT-AA-T--A-----TT---A----------CAT-TA-TC-AG-A---A---AA--TA-T--CT-AAAATA-AAT--A--AA--T---T--TT-G-T---A--ACC--AAA-------------C----T---TTT--GCTATT-A----AA--CAG-TATT-T-C--A-A-A-A----T--CAG--C
gi|42 : ctTATATG-CAT--C-CA-AC--TTT----TG---AGTGTA------A---A---A-----A-------A-CA-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------TCTGAAATT-----T-------------T-G--------C-A-----A-TT--T--GC-----AT-G--A-A-----AGA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-G-AAA--T---GAA---CA--TCA-T-TT--T--CCAAC-AAAAA-----C-AA-T----CAA-TT--TC-AA-T--G-----AT---A----------CA------T-GT-C---A---GA--T------C-AGA--A-AAT--A--TA--A---T--TT-C-
gi|8 : ctTAAACT-TAT--T-CA-AC--GTT----TG---AGTCTA------A---A---A-----A-------T-CA-G------T------C--------T------C------A-----AA-------------ATCAAAATCTGAAATT-------------T-------------T-G--------T-G-----A-TT--T--GC-----CT-T----A-----AAA---------T---A---T--T--TTT-AC--AA-A-AAA--T-----------------T-TT--C--TTCAA-AAAAA-----A-AATT----CAA-TG--TA-AC---------------------------AT-TA-TC-AG-A---A---AA--TA-T--CT-CAA--A-TAT--A--TG--T---T--TT-A-T------ATT--GAA-------------CTAGAT---TTT--GCTATT-A----AC--TTA-TA-T-T-T--A-A-A-AT---T--CGA--TA----A-TATT-T-AT--TTTCAA-----TCTGAG-A-TT------T---AGAC-TCAA---A--TATT--cttt
gi|6 : ctTAAATT-TAT--C--A-A----------TG---AGCTTA----------------------------T-CA-A------A------A--------TG-----T------G-----AA-------------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--GT-----AT-T--A-T-----TAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-GAAAA--A---TAA---CA--ACA-T-TT--T--CTTGC-AAAAA-----C-AA-T----AAA-TT--TC-AA-T--G-----AT---A----------CAT-TG-TT-AG-A---A---AT--TA-T--CT-AA-----AAT--C--TGCAT---T--TT-A-T---A--ACT--ACATGTATATACATTGT---AT---TTT--GATGTT-T----AA--ATG-TA-T-T-T--A-A-A---------CAAGGAA----A-ATTT-G-AC--TT------GAGTC--GG-A-TG--CT--T---AGAC-TCTA---AAttat
gi|12 : ccTAAATT-CAT--C-AA-AT--GTT----TG---AGTATA------A---A---ACTCTGA-------TTCA-A------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------T-------------T-------------T-GG-------T-A-----A-TT--T--GA-----AT-------------AC---------C---A---G--T-----------A-G-AAAATT---TAA---CA--TCA-T-TT--T--TTTGT-AAAGA-----C-AA-T----CAA-TT--TC-AA-T--G-----TT---ACGTTATTAGAAAA-TA-TC-A------A---AA--TA-T--CT-AAA--A-AA---A--CG--T---T--TTAC-TA--G--ACT--AA-------------------------T--GATAAT-A----AA--TAG-CA-T-T-A--ATA-A-A----T--CAG--CA----A-TTTT-G-AG--TT--TT--GAGT--------TT--T---T---AAAT-ACAG---TAATGTT--ATGAAttctga
gi|3 : TAAATT-CAT--T-CA-AA--TTT----TA---AATCTA------A---A---AT----A-------T-CC-G------A------C--------T------G------A-----AATTTAA--------A--------------T-------------TC------------T-G--------A-A-----A-TT--TT-GTTATCTAT-TTCA-A-----AAA---------T---A---A--T--TTA-AT--A--G-AAA--T---TAA---CA--CCA-T-TT--TGTCTTGC-AAACT-----C-AG-C----CAG-TT--TC-AA-T--G-----TT---T------------T-TA-TT-AG-G---A---AA--TA-T--CT-AAA--A-AAA--A--TG--T---T--TT----------AC----AA-------------C---ATAACTTT--GCTATT-T----AA--TAG-TT-T-T-TA-A-G-A----------AA--TAGGACA-TTTT-T-AG--TC--CA---AGTC--TG-A-GC--TT-TT---ATCC-TCAA---AGGTTTT--ATAA
gi|21 : tTACATT-CAT--C-AA-AG--TTT----CG---AATCCA------A---A---T-----C-------T-CA-G------A------C--------T------CGCTC--A-----AA-------------A--------------TCATAAATT-----T-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--G-A-----AAA---------C---A---A--A--TTC-AC--AA-G-AAA--T---AAA---CA--A-A-T-TT--C--C-TAT-AAAAA-----C-TA-T----CAA-TT--TC-AT-T--T-----GC---A----------TAT-TT-AC-AT-A---A---AA--TA-T--AT-AGA--A-AAtttaa
gi|47 : tTGAATT-CAT--T-CA-AG--TAT----TG---GGTCCA------A---A---A-----C-------T-GA--------A------C--------T-------------------------------------------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--A-A-----ATA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-G-ATT--T---GGA---CA--ACA-T-TT--C--ACTGC-AAAAAAAACCC-AA-T----AAA-TT--TC-AA-T--G-----AT---A----------CAT-TA-TC-AT-----A---AA---A-T--TT-AAA--C-attttttaaaatcagtaattgtaatgtttgagtctgggtataaagctcaaaagtttgatgaat
gi|24 : tggaccTGAATT-CAT--C-CA-AC--TTT----TC---ATTCTA------A---A---A-----T-------T-CA-G------A------C--------TAA----CTG----A-----AA-------------ATCTGAAAT------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--GC-----GTGT--T-A-----AAA---------C---A---A--C--TTT--C--AA-G-ACA--T---T----------------------CTTGT-AAACT-----C-AG-T----AAA-TT--TT-AA-T--A-----TT---A----------CAT-TA-TCGAT---------AA--TA-----T-AAT--CAAAT--A--TG--T---T--TT-G-T---A--ACT--GAA-------------C----T---TTT---CTG-T-T----AA----------------A-A-A-A----T--CGG--CA----A-ACTT-G-AG--TT--TT--GGTCC--AG-A-GT--TT-AC---AAAT-T
gi|33 : TAAATT-CAC--C-AA-GG--TGC----CG---AGCC-A------A---A---A-----C-------T-CA-A------A------C--------T------C------GGTCTGAA-------------A--------------T-------------T-------------TAG--------T-A-----G-TT--T--GC-----GT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTC-AC--AA-T-AAA--T---GAA---CA--ACA-T-TT--T--CCTAT-AAAAA-----C-AA-C----CAC-TT--TC-AA-----------T---A----------A---TA-TT-AT-C--------A--TA-------AAG--C-AAT--A--TG--at
gi|4 : acgtctatgtaatcttgaccTAAATT-CAT--C-AA-TA--TTT----TG---AGTGT----------------------------------G------A------C-------------------------------------------A--------------T-------------T-------------TCA--------T-A-----A-TT--T--AC-----AG-T--A-A-----TAA---------C---A---C--T--TTT-AT--AA-G-AAA--G---TGG---CA--ACA-T-TT--C--CAAGC--AAAA-----C-AA-T----CAA-AT--CC-AA-T--G-----AT---A----------CAT-TA-TC-AG-A---A---AA--TA-T--CT-AAA--A-AGT--A--AA--T---T--TT-A-A---A--ACT--AAA-------------T---AT---TTA--GCTATT-A----AA--ttataatgatttataattttagtctcaaaggtttgatga
gi|27 : ttagcttacaaacaattgcacctttaaaacagaaagaaagtttattatgaaccttcaacTAAATT-GAT--C-AA-AC--ACT----TG------CTG------A---A---A-----A-------T-CT-G------A------T-----------------------------A-------------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-G-----A-TT--T--GT-----AT-G--A-A-----AAAT--------C---A---A--T--TTA-AC--AA---AAA--C---TAGG--CA--AGA-T-AT--T--CCTAC-AAAAA-----C-AA-T----CAA-T---TC-AA-T--G-----AT---A----------CAT-TA-TC-A------G---AA--TA-T--TT-AAA----AAT-----TG--G---agttttttaaaaaatgtccaatatatgtat
gi|36 : tcagtctattggttacttcttgaccTAAATC-CAT--C-CA-A---TAT----TG---CGTCTA------A---A---A-----C-------T-CA-G------A------C--------T------T------A-----AA-------------A--------------TAAAAAATGAACTTT-------------C-G--------T-A-----A-TG--T--GC-----AT-T--A-A-----AAA-------------A-----------------AA-G-AAA--T---GAA---TA--ATG-T-TT--C--C-TAC-AAAAC-----C-AG-T----CAT-TT--TC-Acagtgttttagttttagtccgagtttcaaactcagaagttaaa
gi|22 : tTAGATT-CAT--C-AC-AG--TGT----TG---AGACTC------A---A---A-----A-------C-C-------------------------T------G------A-----AA-------------A--------------T-------------G-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--G--------------------------------C---A---A--T--TTT-ACAAAA-A-AAA--T---GGA---CA--ACATT-TT--T--CCTACTAAAAC-----C-AA-C----CAA-TT--TC-CA-T--G-----TT---G----------A---TG----A------A---AA--TA-TA-AG-AAA--A-AAT--A--C---A---T--TT-T-T---T--ATG--AAA-------------T---AT---TCC--GC--TC-T----AA--AAAGTA-A-T-T--A-A-A-A----T--GGG--CA----A-TTCT-G-AG--TT---T--GAGTC--AG-A-GT--TT--T---AAAC-TCAA---AAGaagatacgttatccgaaaacattttaactaagtacaaaaagtattgaacaatgtctgggttttacacttaaaagtttg
gi|50 : TAGATT-CAT--CTCA-------------G---AATCCA------A---A---C-----A-------T---------------------------T------T------A-----AC-------------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TC--T--GC-----AT-T--A-G-----AAA---------C---A---A--T--ATT-TC--AG-G-GAA--T---TGA---CT--ACA-TGTT--CTTCCTGC-AAAAA-----A-A-------CAA-TGATTC-AC-T--A-----TG---A----------AAC-cgaga
gi|54 : aTGAATTATAT--C-AA-AC--TTT----TT---AGTCTA------A---A---A-----C-------T-CT-G------A------CTCAGAATTT------C------A-----AA-------------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----T-TC--T--GC-----AT-T--T-A-----AAC---------C---A---A--A--TTT-TCTAAA-G-AAA--
gi|45 : tAGATT-CAT--C----AT--GTC----GG---GATTTA------A---ACTCA-----C-------T-CA-A------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------TCTGAAATT-----T-------------T-G--------T-A-----A-TT--TTAAT-----AT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AA--AG-G-AAA--T---GAA---GA--ACA-T-TT--T--CTTAA-AAAAA-----
gi|16 : caAAATT-CATATT-TA-AA--GTT----TG---AGTTTG------A---A---A-----T-------T-TA-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------G--------------T-------------T-------------C-G--------aaaaaacaatccgaaaatataaaaaatatcatt
gi|44 : atcatatgcatAATT-CAT--C-AA-AC--CTT----TT---AGTCTT------A---A---A-----C-------T-CA-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------TCTGGAATT-----T-------------T-G--------T-A-----G-TT--T--AT-----AT-T--T-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AATG-AAA--T---TAG---CA--A-C-T-TT--T--CTTGC-AAAAA-----C-TG-T----TAA-T---TC-CCAT--G-----TT---A----------TAT-TA-TC-AG-A---A---AA--TG-T--CTAAAA--A-AAT--A--TG--tgaaatttgcattaaaaacaatttttttaagaaatgatttcaatgatacattatcagaaaatatatcaaaaaaacatttttagctaaataatttgctattaaatagtatctaaaaaatcggcattacagagtttgagtccgggatttagatattaaaaaattgatg
gi|2 : tAATT-CAT--C-AAGAC--TTTATTGTGTTCAGTCTA------A---A---A-----C-------T-CA-GGTCCAAA------C--------A------C------A-----AA-------------A--------------TCTTGACATA----T-------------T-G--------T-T-----A-TT--A--GC-----AT-T--A-A-----AA----------C---A---G--T--TAT-AC--TA-G-AAA--T---TAA---CA--ATA-T-TT--T--CCTAC-AAAAA-----C-AA-T----CAA-TT--TC-AT-T--G-----AT---A----------CGT-TA-TC-AG-A---A---AA--TA-TA-CT-AAA--A-AGT--A--TC--T---T--AT-C-T---G----T----A-------------T---AT---TTT--GCCATC-T----AA---AG-TA-T-TGA--A-A-A-A----T--CGG--CA----A-tt
gi|43 : cAATT-CAT--C-AA-GC--TTT----TG---AATCTA------A---A---A-----AA------T-CA-G------A------C--------T------C------A-----AA---------------------------------------------------------------------------------C--GC-----A-------A-----AAT---------CTGAA---A--T--TTT--------G-AA-----------------------TT--T--CTTGT-AAAAA-----C-AG-C----CAA-TA--TC-AA-T--A-----TT---A----------CAT-TA-TT-AG-A---A---AA--TA-T--CT-AAA--A-AAA--A--TT--G---T--TT---T---GTCACA--AAA-------------CTA-AT---TTT--GCTATT-A----AA--TAA-aactatatttaaacaaatacatctaaaagatttataaataatttctatga
gi|55 : tttAATTATAT--C-AA-AC--TTT----TT---AGTCTA------A---A---A-----C-------T-CC-G------A------CTCAGAATTT------C------A-----AA-------------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----T-TC--T--GC-----AT-T--T-T-----AAC---------C---A---AATT--TTC-TC--AA-G-AAA--
gi|9 : tATT-CAT--C-AA-TC--TTT----TG---ATTCTA------A---A---T-----G-------T-CA-G------A------C--------T------C------A-----AACTCAAATTCTGAAA--------------T-------------T-------------TTG--------T-A-----A-TT--T--GC-----TT-A--A-A-----AAA---------T---A---A--T--TTT-AT--AA-G-AAA--T---TGA---C-----A-T-TT--T--CTTGC-AAAAA-----T-AT-T----CAA-TT--TC-AA-G--G-----TT---A----------CAT-TA-TT-A------G---AA--TA-T--CT-AAA--T-AAA--A--AG--G---T--T-----------A----AAA-------------C---A----CTT--GCTATTCT----TT--TGC-TA-T-T-T------A-C----T--CTG--CA----A-TTTT-GAAA--TT------GAGTT--TG-A-GT--AC--T---AGAA-TGAA---AAGATTT--ATGAA
gi|21 : ATT-CAT--C-AA-AC--TTT----TG---AGCTTT------A---T---A-----C-------C-CA-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------C--------------A-------------T-------------T-A--------C-A-----A-TTACT--G------AT-T--T-T-----AAA---------A---A---A--T--TTT-at
gi|16 : ttacattcatcaaagtttcgaatccaaatctcagactcgctcaaaatcataaattttgtaatttgcattgaaaacaaattcacaagaaataaacaaatttcctataaaaactatcaatttcatttgcatatttacataaaatatatagaATG-CAT--C-GA-AC--TTT-----G---AGTCTA------A---A---T-----T-------T-CA-A------A------C--------T------C------A-----AACTTTAAATATGA-A--------------T-------------T-------------TTG--------A-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--A-A-----AAA---------C---A---AT-T--TTT-TT--AA-G-AAA--T--------------GA-T-TT---------C-AATGA-----T-A-------CAT-TA--TC-A-----G----------A----------AAA-TA--T-AT-C---A---AA---A-------AAA--C-A---------------T--TT-T-T---A--GCT--AAA-------------T---AA---TTT--GCTATT-A----AA--TAG-TA-T-C-TAAA-A-A-A----T--CGG--CA----T-TACA-G-AG--TT---T--GAGTCCGGG-A-TT------T---AGATATTAA---AA
gi|25 : atcatATT-CAT--A--A-ACATTTT----TT---ATTTTA------A---A---A-----A-------T-CA-G------T------G--------T------C------A-----AA-------------A--------------T-------------CAAATAATCGGAAAT-G--------T-A-----A-AA--A--GC-----AA-T--A-A-----AAG---------C---A---A--T--TTG-GT--AA-G-ACA--T---TAA---CA--A---------C---------AAAA-----T-AG-T----CAA-T---TCAAA-T--G-----TT---A----------CAT-TA-AC-A------A---AA--CA-TAACT-AAC--A-AAA--A--CG--T---T--TT-A-T---A--A-T--AAA-------------C----T---TTT--GCTATTAT----AA--AAA-AA-T-T-T--A-A-ATA----T--CGG--GA----A-TTTT-T-GG--TT--aattgatg
gi|58 : TC-CAT--C-CA-AC--TAT----TG---AGCCTA------A---C---A-----C-------C-CA-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------C--------------T-------------C-------------T-G----------A-----A-TTGCT--GA-----AT-T--T-T-----AAA---------T---A---G--T--TTTAAT--AG-G-AAA--tgaatcttaa
gi|48 : acatT-CAT--C-AC-AT--TTT----TG---AGT---------A---A---T-----A-------T-CT-G------A------C--------TTGACCTC------A-----AA-------------A--------------TCTTACATT-----T-------------T-G--------C-A-----A-TT--T--TC-----AT-T--A-A-----AAA---------C---A---G--T--ATT-TC--AA-G-AAG--T---GAA---CA--GCA-T-TG--T--CTAGC-AGAAA-----C-A
gi|5 : T-CAT--C-AA-GC--ATT----TG---AATCTACATCCCA---G---A-----C-------T-CA-A------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------T-------------C-------------T-GACA-----T-ATTTTCA-TT--T--GA-----AT-G--A-A-----TAA---------C---A---A--C--TTT-AC--A--G-TAT--T---TTT---TTTTATA-T-TT--T--CTTGC-TTCTA-----T-AA-C----CAA-TT--TC-AA-T--G-----C----------------AT-TA-TC-AT-A---T---TA--TA-T--CT-AAA--A-ATT--A--CA---------TT-CAT---A--ACT--AAA-------------T---AT---TTT--GCTGaataagaatacgttttataa
gi|30 : A-GC--TGT----TG---AATCTG------G---A---A-----C-------T-CA-A------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------TGTGAAATT-----T-------------T-G--------T-A-----G-TT--T--TC-----AT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-G-AAA--T---GGA---C-----A-T-TT--T--CCTAC-AAAAA-----C-AA-T-----AA-T-------T-T--T-----TT---AT---------AACACA-TT-AT-C---AG--AA--TA-T-------------AT--A--TA--C---T--TT-T-T---A--ACT--GAC-------------A---AT---TTTGAGATATT-T----AA--CAG-TA-T-T-TG-A-A-A-A----T--CGG--CA----A-TTTT-G-AGA-TT------GAGTC--caaaaattttttttttttgaaatggcaatttaagtttcagaccaaaaatgttttatgattgcaagccctg
gi|11 : A-AC--TTA----CT---AGACTA------A---A---A-----C-------T-CA-A------A------A--------T------CTG----A-----AA-------------T--------------T-------------T-------------T-G--------A-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-G-AAA--T---TAA---CA--GCA-T-TTTGC--TTTAT-AAAAA-----T-AA-T----CAA-TT--TT-AA-T--G-----TT---A----------CAT-TA-TT-A---------------------T-AAA--A-AAT--A--TT--T---C--TT-T-C---A--ACT--AAAT------------C---AT----------TGTTAT----AAATTAG-TA-T-T-T--T-G-G-A----T--TAA--CA----A-AATT-G-AG--TT---T--GAGT------A-TTAGTT-TT---ACAC-TAAA---AATTG-T--ATGAtgggta
gi|18 : cgtgaaaatgtggagtcttA-AG--TTC----TG---AGTATA------A---A---A-----CC------T-CA-A------A------A--------T------CTG----A-----AA-------------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-T-----A-TT--T--GC-----AT-T--G-A-----AA------------------------TTC-AC--AA-G-AA--------------A--AGA-------------AC-AAAAA-----A-AA-T----CGA-TT--TC-A-----G-----TG---A----------AAC--A-TG-AT-CAGAA---AA--CA-T--GT-AGA----AAG--A--AC--T---T--TT-T-T---A--AAG--AAA-------------A---AA---TTT--GCTATT-A----AA--AAA-TG--------A-A-ATA----T--CGG--CA----A-TTCT-A-AGTTTT--GA--GACTA--AACA-TT--TT-GA---AGCT-TAAA---AAGTTTG--ATG
gi|22 : acctgaatcaataaC--TTT----TG---AGTTTA------A---A---A-----C-------T-CT-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------
gi|60 : tagattcatcacagtgttgagactcaaaacctgaaaatgtgtaatttgcaattttacaaaaaaaatggacaacatttttcctactaaaaccaaccaatttccatgttgatgaaaatataagaaaaaatacattttttatgaaatattccgctctaaaaagtaattaaaatgggcaattctgag--TTT----TG---AGTATA------A---A---A-----C-------T-TG-A------A------A--------T------C------A-----AA-------------A--------------T-------------G-------------T-G--------T-A-----A-TT--C--GC-----AT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTA-AC--AA-A-AAG--T---TAA---cgaga
gi|28 : TT----TG---AATTTACAACA-A---A---G-----A-------C-TATG------A------T--------T------C------A-----AA-------------A--------------TACGAAAT------T-------------T-G--------T-A-----AATT--T--GC-----CT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-T-AAA--T---TAA---TA--TCA-T-TT--T--CTTAC-AAAAA-----C-AG-T----CAA-TT--TC-A
gi|51 : atcagggg----TG---AGTTCATCG---A---A---A-----ACTCGGATT-CA-A------A------C--------T------C------A-----AA-------------AACTGATAT------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--GC-----AT-T----A-----AAA---------C---A---T--TTCTTT-AC--AA-G-AAA--TGTATAA---Caagttgtcttatctgaaaatatatataaaaagacacgtgcttttaaacgtttgcaaattatagtcctggatacaatattttgttt
gi|20 : taattcagtgta---AGTCTAT-----A---A---A-----A-------T-CA-A------AATCGATC--------T------C------G-----AA-------------A--------------TCTAAATTTT----T-------------T-T--------T-A-----A-TT--A--GC-----CT-T--A-A-----AAAAA-------C---A---G--T--TTT-AC--AA-T-AAG--T---TAA---AA--AG--T-TT--T--CTTGC-AAAAT-----C-AG-T----CAA-TA--TC-AA-T--G-----TT---A----------TTT-TA-TT-AC-A---A---AA--TA-T--TT-AAA--A-AAT--A--AG--T---T--GT-G-T---T--ACT--GAA-------------T---G----TTT--GC------------------TA-T-T-A--A-GCA-G----T-------------A-TTTT-G-AG--TT--CA--G-GTC--AG-AGTT--GT-G----AGAC-T--A---AAG-ATTTGATGAA
gi|1 : TTTC------A---G---A-----C-------T-CA-A------A------C--------T------C------A-----AA-------------AAATGAAAT------T-------------T-------------T-G--------T-G-----A-TT--T--GC-----CT-T--A-A-----AG----------C---A---A--C--TTT-GT--AA-G-AAA--TGTGTAA---C-----A-T-GT--T--CTCGC-AAAAAT----C-AG-T----CAA-TT--TC-AA-T--G-----TT---A----------CTT-TA-AC-AG-A---A---AA--AT-T--CT--TA--C-AA---A--TA--C---TCATT-A-T---A--ATC--AAA-------------C----T---TTT--GC--TT-T----A-----------------A-A-A-G----T--CGG--CA----A-TTTT-G-AT--TC---------TG--AG-A-TT--T---T---AGTC-TCAG---AAGTTTT--ATAAAttt
gi|15 : atatgaacaggttcagaaataatacgttatcatcaaagtatgcacaaatcacaaacTTA------A---G---A-----C-------T-CG-G------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------A-------------C-------------T-GAAATAATAT-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--A-A-----TAA-----------------A--T--TTT-AC--AA-G-AAA--T---GAA---------A-T-TT--T--TTTGC-TAAAA-----C-AG-A----CAA-TT--TA-AA-T--G-----TC---A--------------TT-TT-AT-TTGAA---AA--TA-T--CT-AAT--A-AAT--AC-TA--A---TAAAT-A-T---T--ACT--AAA-------------C----C---TTT--GCTATA-A----GA--TAG-TA-T-T-TG-A-T-A-G----T--TAG--CA----A-TTTT-GTGG--TT------GAGTC--TG-A-GT--TT-TT---AGAC----------GTTTT--ATGAAttt
gi|32 : tcaaaaA------A---A---A-----C-------T-CA-A------A------C--------T------CGGTCTGA-----AA-------------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----G-TT--T--GC-----GT-T--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTC-AC--AA-T-AAA--T---GAA---CA--ACA-T-TT--T--CCTAT-AAAAA-----C-AA-C----CAC-TT--TC-AA-----------T---A----------A---TA-TT-AT-C--------A--TA-------AAG--C-AAT--A--Tttca
gi|10 : cgtctatgtaatcttgacctaaatttacaaaggtgccgagcc------A---A---A-----C-------T-CA-A------A------A--------T------C------AGT---AA-------------A--------------T-------------C-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--AC-----AT-T--A-A-----AAAAAAACACATT---A---A--T--TTT-AC--AA-G-AAA--T---GAA---CA--ACA-T-TT--T--CCTAC-AATAA-----C-CA-T----CGA-TT--TC-AA-T--G-----AT---A----------AAC-TA-TC-AG-A---A---AA--TA-T--C--AAA----AAT--A--TA--C---T--TT-T-T---A--ACT--AAA-------------C---AT---TTT--GCTATT-A----AA--AAG-TG-T-T-A--A-A-A-AT---T--CAC--TA----A--------AG--CT------GGGTC--TG---TG--TT-TT---TGAC-TCAG---AGGTTTG--ATAAAtttataatgatttataattttagtctcaaaggtttgatgaa
gi|13 : tcatcaaaaactcacactc------A---A---A-----C-------T-CA-A------A------C--------C------T------G-----AA-------------A--------------T-------------T-------------TTG--------T-A-----A-TT--T--TC-----AAAT--A-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--GA-T-TAA------TAA---TA--ACG-T-TT--T--GTCACAAAAAA-----C-AT-T----CGA-TT--TC-AG-T--G-----TT---A----------CAT-TA-TC-AG-A---G---AA--TA-T--CTAAAA--C-AAT--AATTA---------TT-C-T---A--GCG--AAA-------------C---A----TTT--GCTATT-A----AG--TAG-TA-A-T-T--A-A-A-A----A--TGA--TA----A-TTTT-G-AG--TT---G--GCGTCTGAG-A-TT--TT-tt
gi|26 : tttcattaaaaaaaatttagtaaaaaaacaaactc-------T-CA-A------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------T-------------T-------------T-G--------G-A-----A-TT--TTGGA-----AT-T--G-GCCTTGAAA---------C---A---A--T--TTT--C--AG-G-ATA--T---TAA---CA--GCA-T-TT--T--TCAGC-AAAGA-----C-AG-T----TAA-TA--TC-AG-T--G-----TT---A----------CAT-TA-TC-AG-A---A---AAT-TACT--AT-AAA--C-ACT-----TG---------TT-A-A---A--ACT--AA------------------AT---TTT--GCTATT-T----AA--TAG-TA-TCT-A--A-A-A-A----T--TGG--TA----A-TTTT---------------GAGTC--TG-A-TT--TTAATTTAAGAT-TCAA---Aa
gi|49 : taaattcagat-------T-CA-A------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------C-------------C-------------T-GATTTTCTTT-T-----A-TT--T--GC-----AA-T--A-A-----A-----------C---A---A--T--TTT-AC--GA-G-AAA--T---TAA---CA--AGC-C-TA--T--CTTGC-AAAAA-----G-AG-T----AAATTG--T--AA-T--G-----TT---A----------TAT-TA-TC-AGAA---A---AA--TA-T--CT-AAA--
gi|14 : -------T-CA-A------A------T--------G------C------A-----AA-------------A--------------T-------------C-------------T-G--------A-A-----A-TA--T----------T-T--T-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AA--AA-G-GAT--T---GAA---TA--ACA-T-TT--TTTCTTAC-ACAAA-----C-AG-T----CAA-TG--TC-AA-T--G-----AT---A----------CAT-TATCC-AA-A---A---AA--CACC--CC-AAA--A-AAA--C--CG--GACAT--TT-T-T---A--ATG--ATA-------------T---AT---TTT--ACTACA-T----GA--TTG-TATT-T-T--A-A-A-ATTATT--TAA--AA----A-CCTG-A-AA--TT------GAGCC--TG-G-GT--TT--T---AGAC-ACAA---AAGTTTA--ATGAAaa
gi|23 : ttatttttagtc-CA-C------A------C--------T------C------A-----AA-------------A--------------T-------------C-------------T-G--------A-A-----A-TT--------------------A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AC-G-AAA--T---TAA---CA--ACA-T-TT--T--CTCGC-AAAAA-----C-AG-T----CAT-TT--TC-AG-T--G-----T---------------AAC--A-TT-AT-C---AAACAA--TA-T--CT-AA-----AAT--A--TG--T---T--TT-C-T---A--ATT--AAA-------------C---G----TTA--GCTATT-A----AA------------------------------CAG--TA----A-TGCT-G-AG--TT---T--GATTC--AG-T-GT--TT-GT---AGAC-TTAA---ACGTGTT--ta
gi|38 : aagttaaccaagcttatttcgtatgaagatttccata-CA-G------A------CA-------T------C------A-----AA-------------A--------------TCTGTTTTT-----T-------------T-G--------T-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--A-A-----ATA---------C---A---G--T--TTT-GC--AA-G-AAA--T---AAAACTTA--ACA-T-TT--T--TCTAG-AAAAG-----T----T----CAA-TG--AC-ACATA-A-----TT---A----------GA---------------A---AA--TG-T--CT-AAA--A-ATT--A--C---A---T--TT-G-T---A--ACT--AAG-------------T---A----TTT--GCTATT-A----AA--AAG-TA-T-T-T--A-A-A-AATGTT--CAA-----------TTT-G-AG--T
gi|31 : aaccaggctttca--------T------C------A-----AG-------------A--------------TCA-----------T-------------T-T--------T-A-----AATT--T--CT-----AT-TT-A-A-----AAA---------A---A---A---------AA--AA-A-AAA--T---GAA---CA--AAA-T-TT--T--CTTAC-AAAAA-----C-AA-C----CAA-TT--TC-AA-T--GATACCTT---A----------AA--------AG-A---A---AA--TA-T--AT-AAA--A-AAA--ACCCA--G---T--TT-T-T---A--AATTAAAA-------------T---AT---TTT--GCTATT-C----GA---AG-TG-T-T-T--A-A-A-A----A--CGT--CA----A-TTCT-A-AG--T----------TT--GG-A-TT--T---A---AGAC-TAAA---AATTTTTTGATGAA
gi|37 : ------A-----AA-------------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-T-----A-TT--T--GC-----AT-T--T-A-----AAA---------C---A---A--T--TTT-AC--AA-G-AAA--T--------------GA-------------AC-AAAAA-----C-AA-T----AAA-TA--AT-AC-A--T-----TT---A----------AA------T-AT-C---A---GA-----------AAA--T-AAC--AT-TG--T---T--TT-T-T---T--ACC--AAA-------------C---AT---TTT--G-TATT-T----AA---AA-TG-T-tt
gi|39 : aattaaaatttg-------------A--------------T-------------T-------------T-A--------A-A-----A-TT--T--AC-----AT-T--C-A-----ACA---------C---A---A--A--TTT-AC--AA-G-AAA--T---GAA---CA--AAA-T-GT--T--CATACAAAAAA-----CAAG-TTCAATAA-TG--T--AT-T--T-----CTAGAA----------AAA-TA-CA-AC-A---A---AA-----------AAA--C-A------------------TT-T-T---A--ACT--AAA-------------T---AT---TGT--GCTA-T-C----AA--AAG-TA-T-T-ataaaatataaaaaaaagttttttaaaatctccaattctgaattttagtttggatttta
gi|17 : aaatctgatg--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TT--C--AT-----CT-T--ATC-----AAA---------C---ATTTA--T--TTT-AC--AT-G-CAA--T---TCA---CA--ACG-T-TT--T--CTTTC-AGAAA-----C-TG-T----CAA-TT--TC-AA-T--G-----T--------------------G-TT-AT-------------TA-T--TT-GAA--C-A---------------T--TT-C-TTAAA--ACT--AAA-------------C----T---TTT--GCTATT-T----AA--TAG-TA-T-T-T--ACA-A-A----T--TGA--TA----G-TTTT-C-AG--TT------GAGTT--TG-A-GT--TT-TT---AGAC-TCAA---ACATTTT--AAGAAttaaaatcggagtttgatctgggatttatacgttgatt
gi|29 : ctaaaactcagatccaatctcatgtttctaacat-------------T-G--------T-G-----A-TT--T--GC-----CT-T--A-A-----AA----------C---A---A--T--TGT-AC--AT-G-AAA--T---TAA---AT--ATA-C-TT--T--CTTGC-TAAAA-----C-AG-T----CAA-TT--TA-AA-T--G-----TT---C----------CAT-TA-TT-AG-A---A---AT--TA-T--CA-AAA--A-AAA--G--TG--T---T--TT-A-T---A--ACC--AAA-------------C----T---TTT--GCTATT-A----AA--TAA-TA-T-T-TA-A-A-A-A----T--TAG--CA----A-TTGT-A-AGTTTT--AT--AAGTC--TG-A-GT--TT-TT---GGAC-ACAA---AAGTTTT--ATGgttt
gi|34 : gc--------T-A-----A-TT--T--GC-----AT-T--A-A-----AAAA--------T---A---T--T--TTT-TC--AA-G-AAA--T---GGA---CA--ACA-T-TT--T--CCTAC-AAAAA-----C-AA-T----TAA-TA--TT-AA-T--G-----AT---A----------CAT-TA-CC-A------G---AA--GA-T--AT-AAA--T-AAA--AT-TA--C---T--TT-T-T---T--AAT--AAA-------------T---AT---TTT--GCTATT-A----AA--AAC-TATT-T-C--A-A-A-A----T--AGG--CA----A-TTGT-G-AG--TT---T--GTGTCT-GG-G-TT--TT-AT-----AT-TCAATTGAAGTTTG--ATGAAtgtttaa
gi|41 : -A-----A-TT--T--GC-----CT-T--A-A-----AAA---------T---A---A--T--TT-----------AAA--T---GAA---CA--ACA-T-TT--C--TTTTTGAAAAA-----C-AG-T----CAG-TT--TC-AA-T--G-----TT---A----------CAT-TA-AT-AG-A---A---AA--TA-T--TG-TAA--T-AA---A--TG--T---T--TT-A-T------AGT--AAA-------------C----T---GTT--GCTGTT-T----AA--CTG-TA-T-T-T--G-A-A-A----T--TAA--AA----A-CATT-G-TG--TT--tt
gi|40 : c-----A-TT--A--GC-----AT-T--A-A-----AA----------C---A---A--T--TTT-AC--AA-A-AAA--T---TAG---AA--ACA-T-AT--T--CTTGC-AAAAA-----C-AG-A----CAA-TT--TT-AA-T--G-----TT---T----------CAT-TT-TC-AA-A---A---AA--TA-T--CT-AAA--A-GAT--A--TG--T---T--TT-A-T---A--ACT--AAA------------------------------GTT-T----G----GA-TG-T-T-A--A-A-A-A----T--TGA--CA----A-TTTTGG-AT--TT--AATTGAGTC--TG---TT--T---T---AGAC-Tttttttggacacgttttgtgaattt
gi|19 : -A-----AAA---------C----------T--CCT-AC--AA-G-AAA--T---AAA---CA--ACA-T-TA--T--CGTAC-AAAAA-----C-AA-T----T-A-T---TT-AC-CAGG-----GT---A--------------TA-TT-AT-C---A---AAAGTA-------AAA--A-AATTAA--TA--A---CA-TT-T-T---G--AGT--ACA-------------T---AT---TTT--GCTACC-A----AA--AAG-TA-T-T----A-G-A-AT---T--CGG--TA----A-TTCT-G-AG--TT---G--GAGTCT-AGTA-GG--TT-AT---AAAC-ACCA---AAGTTTT--aatttttttatgaa
gi|54 : aaaatctgatattgaaactagacattaattcaacaaagagttgagcct---T--TT-C-T-------TT--AGA-------------A---AA---TTT--G--GTT-T----AA-------A-T-G-C--A-G-A-A----T----A--CA----AATTTT-G-AAA-TT--CT--GAGTC--AG-A-GT--TT--T---AGAC-TAAA---AAGT
gi|52 : ttgaattatatcaa---T--TT-T-T---A--ACA--TAA-------------T---AT---TTT--GCTATT-A----AA--AAG-TACT-T-A--A-G-A-A----T--CGA--CA----A-TTCT-G-AG--T
gi|59 : taattaatgaattttaaaaaaatacaaatacgtaca--AAA-------------T---AT---TTC--GCTATT-A----AA--ATG-TA-T-T-T--A-A-A-G----T--TGG--CA----T-TTCT-G-AG--TT--T---GAGTCTTAG-A-AT--T-------GGAC-TCAA---AAatgtgt
gi|43 : ta---TTG--GCTGTT-TTTACAA--GAA--A-T-T-C--A-A-A-A----TTTCAG--------A-TTTT-G-CG--TT--T---GAGTC--TG-A-TT--TT-TT---AGAT-TCAA---AAGCTTG--ATGAA
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTCTTGCAAACACAATCAATTTCAATGTGACGTTTACAGGAAATAACAATATTTGAATAATACAGCTTTAACTAGAAAGGATTCTGCAATAAGGTTTCTTTAAAAATGACAGTTCAGAGTTCGAGTCTGACTGTAAGACT
Unaligned ( gi|53 ): TTTACAAGGAATGAACAATATTTTCCTAAAAAAAAAAAAATAAATTCCAATGATACTTTATCAGAATAAATCGAATTACACTTTTTAACT
Unaligned ( gi|56 ): AAAACAAAACTTTTAAACTGAAATTAACAGTTACTAGATATATTTCGAAAAGGAGACAAAGAAATGCTAGCGAGAATCGT
Unaligned ( gi|57 ): CTTTTGCTATTAAACATATTAAAAAATCGACAATTTTTAGTTTGAGGCTGAGTTTTAAGCCCTGAACCTCTTAAACGTT
Unaligned ( gi|61 ): GAATTGATGCTTGTGGAACAATTTTTGGGTATTAAAAACTTTTTCAAGCCAAGACAGTTTACATC
Unaligned ( gi|62 ): AAATCAACCAATCTTACAAAAGCAGTCAGTTGCAATGTTTCACTATCAGAAAATGTGTAAA
Alignments
lowQualScore : 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111111111111 1111111111111111111 11 111111111
lowQualScore : 2 1 11 1 222 2222 111 1 22222 0 333333 1111 444444 2 222222 4444444 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 4 88888888 0 11111 1 22 11111 1 44444444 555555555 111 111 11 11 11 0 22 5555 222 0 11 11 33 111 1111 1 22222 2 11 4 0 111 222 11 666666666 555555 0 66666666 0 11 0 00000000000000000 111 22 4 333 5555555555555555555 11 44444444444 22 4 0 5555555 88888888888888888888 0 77777 1 1 1 33 1 1 2 44444 11 5555 44 2 333 777777777 1 2222 222 11 22
lowQualScore : . . .. . ... .... ... . ..... . ...... .... ...... . ...... ....... ................................................................................. ............. . ........ . ..... . .. ..... . ........ ......... ... ... .. .. .. . .. .... ... . .. .. .. ... .... . ..... . .. . . ... ... .. ......... ...... . ........ . .. . ................. ... .. . ... ................... .. ........... .. . . ....... .................... . ..... . . . .. . . . ..... .. .... .. . ... ......... . .... ... .. ..
lowQualScore : 4 2 66 1 888 3333 888 0 44444 9 555555 9999 111111 6 444444 1111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3333333333333 1 00000000 8 99999 5 99 99999 5 99999999 666666666 333 333 00 00 00 7 77 7777 111 8 11 11 99 333 8888 5 77777 6 11 2 8 444 222 99 777777777 000000 8 99999999 8 99 8 22222222222222222 555 11 3 333 1111111111111111111 33 44444444444 99 6 9 2222222 55555555555555555555 9 33333 9 9 9 00 0 0 0 55555 44 1111 66 2 777 555555555 1 0000 333 99 33
consensus : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---C--A--------GAA------AAT-AT--C-T---A-AA--A-AAT-----A----C---G-T---T--TTNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------TT-AAANA-G-------TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--GA-GTC--TG---A-N---TTT-TAGAC-TC-AA---AA--GTTTT--ATGAA
Reference ( family-3145 ) : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---C--A--------NAA------AAT-AT--C-T---A-AA--A-AAT-----A----T---G-T---T--TTNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------TT-NAANA-G-------TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--GA-GTC--NG---A-T---TTT-TAGAC-TC-AA---AA--GTTTT--ATGAA
gi|1 : AAAT--CA--C--AA-AC--TTT----C----AG-A-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------AAA------T--G------A-----A------------A-------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAG----------C---A---A--C--TTTGT--AA-GAAA--T---GTG---T-A--ACATGT--T--CT---C---GC-AAAAAT----CAGTCAAT--TTCAATGTTACTT-T---AA---C--A--------GAA------AAA-TT--C-T---T-AC--A-AAT-----A----C---T-C---A--TTATAATC---AAA-------------C----TTTT--GC----------------------------------------------------TT-T--A--A-A-AGT-CG-GCAA-T-TTTG-----AT--TC---T--GA-------G---A-----TTT-TAGTC-TC-AG---AA--GTTTT--ATAAA
gi|10 : atatgaacaggttcagaaataatacgttatcatcaaagtatgcac-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--C------AGT---A------------A-------A--------------T-------------C-------------T-G--------T-A-----A-TTT--AC-----AT-T--A-----AAAAAAAACACATT---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AATAA-----CCATCGAT--TTCAATGATAAAC-T---AT---C--A--------GAA------AAT-AT--C-------AA--A-AAT-----A----T---A-C---T--TTTTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------TT-AAAAA-G-------TG--------------------TT-A--A--A-A-A-T-T---CA----CTAA-----AG--C----T--GG-GTC--TGT--G-T---TTT-T-GAC-TC-AG---AG--GTTTG--ATAAAttt
gi|11 : tcatcaaaaactcacaA-AC--TTA----CT---AG-A-----CT-A------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------------T-------------T-------------T-G--------A-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--GCATTT--TGCTT---T---AT-AAAAA-----TAATCAAT--TTTAATGTTACAT-T---AT---T--A---------------------------T---A-AA--A-AAT-----A----T---T-T---C--TTTCAACT---AAAT------------C---A--TT--GTTA-----------TA-AATTA-G-------TA--------------------TT-T--T--G-G-A-T-TA-ACAA-A-ATTG-----AGT-T----T--GA-GTA--TT---A-G---TTT-TACAC-T--AA---AA--ATTGT--ATGAtt
gi|12 : cgtgaaaatgtggagtcttTAAATT-CAT-C--AA-AT--GTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TCTGATTCAA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-GG-------T-A-----A-TTT--GA-----AT------------AC---------C---A---G--T----------A-GAAAATT---TAA---C-A--TCATTT--T--TT---T---GT-AAAGA-----CAATCAAT--TTCAATGTTACGT-T---AT---T--AGAAAATATCAA------AAT-AT--C-T---A-AA--A-AA------A----C---G-T---T--TT---ACT---AGA-------------C----TAAT--GATA-----------AT-AAATA-G-------CA--------------------TT-A--AT-A-A-A-T-CA-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T------TT--GA---G-T---TTT-TAAAT-AC-AG---TA--ATGTT--ATGAA
gi|13 : -----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------C--------C--T------G-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--TC-----AAAT--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-TTAA------TAA---T-A--ACGTTT--T--GT---C---ACAAAAAA-----CATTCGAT--TTCAGTGTTACAT-T---AT---C--A--------GAG------AAT-AT--C-T---A-AA--ACAAT-----A--------A-T---TA-TTCTAGCG---AAA-------------C---A-TTT--GCTA-----------TT-AAGTA-G-------TA--------------------AT-T--A--A-A-A-A-TG-ATAA-T-TTTG-----AG--T----T--GGCGTCTGAG---A-T---TTT-
gi|14 : tttcattaaaaaaaatttagtaaaaaaacaaaC-TC------AA------A------T--------G--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------C-------------T-G--------A-A-----A-TAT----------T-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AA-GGAT--T---GAA---T-A--ACATTT--TTTCT---T---AC-ACAAA-----CAGTCAAT--GTCAATGATACAT-T---ATC--C--A--------AAA------AAC-AC--C-CCA-A-AA--A-AACCGG--A----C---A-T---T--TT-TAATG---ATA-------------T---ATTTT--ACTACATGATTGTATTT-TAAAA-T-------TA--------------------TT-T--A--A-A----------AA-C-CTGA-----AA--T----T--GA-GCC--TG---G-G---TTT-TAGAC-AC-AA---AA--GTTTA--ATGAAa
gi|15 : ttatttttagtT-A------A----G------AC-TC------GG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------A-------------C-------------T-GAAATAATAT-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----ATAA-----------------A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA----------ATTT--T--TT---T---GC-TAAAA-----CAGACAAT--TTAAATGTCATTT-T---AT---T--T--------GAA------AAT-AT--C-T---A-AT--A-AAT-----AC---T---A-A---TAAATATTACT---AAA-------------C----CTTT--GCTA-----------TA-AGATA-G-------TA--------------------TT-T--G--ATA-G-T-TA-GCAA-T-TTTGT----GG--T----T--GA-GTC--TG---AGT---TTT-TAGAC-------------GTTTT--ATGAAta
gi|16 : tcaaaatATG-CAT-C--GA-AC--TTT-----G---AG-T-----CT-A------A----A------TT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------C--------------T-------------T-------------T-A----------A-----A-TAT--GA-----AT-TTTG-----AAA------------------------TTTGC--A--------T---TAA---A-A--ACAATT--T--TT---T---TA-AGAAA-----TG----AT--TTCAATGATACAT-T---AT---C--A--------GAA------AAT-AT--A-T---C-AA--A-AAA-----A----C---A-T---T--TT-TAGCT---AAA-------------T---AATTT--GCTA-----------TT-AAATA-G-------TA--------------------TC-TAAA--A-A-A-T-CG-GCAT-T-ACAG-----AGT-T----T--GA-GTC--CG---G-G---ATT-TAGATATT-AA---AA--AATTG--ATGttca
gi|17 : atcat-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------T--------C--C------A-----ATCTCATGTTTCTA-------ACAT-----------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTC--AT-----CT-T--AT----CAAA---------C---ATTTA--T--TTTAC--AT-GCAA--T---TCA---C-A--ACGTTT--T--CT---T---TC-AGAAA-----CTGTCAAT--TTCAATGT---GT-T---AT--------------------------T-AT--T-T---------G-AAC-----A----T---T-T---C--TTAAAACT---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------TT-TAATA-G-------TA--------------------TT-T--AC-A-A-A-T-TG-ATAG-T-TTTC-----AG--T----T--GA-GTT--TG---AGT---TTT-TAGAC-TC-AA---AC--ATTTT--AAGAA
gi|18 : TGAATC-AAT-A--AA-AG--TTC----TG---AG-T-----AT-A------A----A------ACCTC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAA------------------------TTCAC--AA-GAA--------AA---G-A--ACA--------------------AAAAA------AATCGAT--TTCAGTGAAACAT-G---AT---C--A--------GAA------AAC-AT--G-T---A-GA--A-AGA-----A----C-----T---T--TTTTAAAG---AAA-------------A---AATTT--GCTA-----------TT-AAAAA-A-------TG--------------------------A--A-ATA-T-CG-GCAA-T-TCTA-----AGTTT----T--GA-GAC--TAAACA-T---TTT-GAAGC-TTAAA---AA--GTTTG--ATGgttt
gi|19 : accAATT-CAA-C--AA-AG--AGT----TG---AG-C-----CT-A------A----A------AC-TC------
gi|19 : aaaatctgatattgaaactagacatt-----AAAA---------C----------T--CCTAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--ACATTA--T--CG---T---AC-AAAAA-----CAATTATT--TACCAGGGTATAT-T---AT---C--A---------AA------AGT-A---------A-AA--A-AATTAATAA----C---A-T---T--TTG--AGT---ACA-------------T---ATTTT--GCTA-----------CC-AAAAA-G-------TA--------------------TT-A--G--A-A-T-T-CG-GTAA-T-TCTG-----AG--T----TG-GA-GTC--TA---G-TAGGTTA-TAAAC-AC-CA---AA--GTTTT--ctacaagaaataaacaacattatcgtacaaaaacaattatttaccagggtatattatcaaaagtaaaaaaattaataacattttgagtacatattttgctaccaaaaagtattagaattcggtaattctgagttggagtctagtaggttataaacaccaaagtttta
gi|2 : aaaatctgatattgaaactagacattaattcaacaaagagttgagcctAATT-CAT-C--AAGAC--TTTATTGTGTTCAG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AGGTCCAAA------C--------A--C------A-----A------------A-------A--------------TCTTGACATA----T-------------T-G--------T-T-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---G--T--TATAC--TA-GAAA--T---TAA---C-A--ATATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCATTGATACGT-T---AT---C--A--------GAA------AAT-ATA-C-T---A-AA--A-AGT-----A----------T---C--TTAT--CT---GTA-------------T---ATTTT--GCCA-----------TC-TAA-A-G-------TA--------------------TT-GA-A--A-A-A-T-CG-GCAA-
gi|20 : c---AG-T-----CT-AT-----A----A------AA-TC------AA------AATCGATC--------T--C------G-----A------------A-------A--------------TCTAAATTTT----T-------------T-T--------T-A-----A-TTA--GC-----CT-T--A-----AAAAAA-------C---A---G--T--TTTAC--AA-TAAG--T---TAA---A-A--A-GTTT--T--CT---T---GC-AAAAT-----CAGTCAAT--ATCAATGTTATTT-T---AT---T--A--------CAA------AAT-AT--T-T---A-AA--A-AAT-----A----A---G-T---T--GTGTTACT---GAA-------------T---G-TTT--GCTA-----------TT-AAGCA-G-------T--------------------------------------------A-T-TTTG-----AG--T----T--CAGGTC--AG---AGT---TGT-GAGAC-T--AA---AG--ATTTG--ATGAAaactatatttaaacaaatacatctaaaagatttataaataatttctatga
gi|21 : TACATT-CAT-C--AA-AG--TTT----CG---AA-T-----CC-A------A----A------TC-TC------AG------A------C--------T--CGCTC--A-----A------------A-------A--------------TCATAAATT-----T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAAA---------C---A---A--A--TTCAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--A-A-TT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CTATCAAT--TTC-AT-TTGCA--T---ATTTAC--A--------TAA------AAT-AT--A-T---A-GA--A-AA---------------A-T---T--TTTTA------AAA-------------T-------------------------------CA-G-------TA--------------------AT-T----------------GTAA-T-GT-----------T----T--GA-GTC--TG---G-G---TAT-AAAGC-TC-AA---AA--GTTTG--ATGAAttt
gi|22 : tTAGATT-CAT-C--AC-AG--TGT----TG---AG-A-----CTCA------A----A------AC------------------------C--------T--G------A-----A------------A-------A--------------T-------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----A--------------------------------A--T--TTTAC--AA-AAAAAAT---GGA---C-A--ACATTT--TT-CC---T---ACTAAAAC-----CAACCAAT--TTCCATGTTG--------AT---------------GAA------AAT-AT--AAG---A-AA--A-AAT-----A----C---A-T---T--TTTTA--TG--AAA-------------T---ATTCC--GCT------------CT-AAAAA-G-------TA--------------------AT-T--A--A-A-A-T-GG-GCAA-T-TCTG-----AGT-T----T--GA-GTC--AG---A-G---TTT-TAAAC-TC-AA---AA--Gt
gi|23 : C------AC------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------C-------------T-G--------A-A-----A-TT----------------------AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AC-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---C---GC-AAAAA-----CAGTCATT--TTCAGTGTAACAT-T---AT---C--A--------AAC------AAT-AT--C-T------A--A-AAT-----A----T---G-T---T--TTCTAATT---AAA-------------C---G-TTA--GCTA-----------TT-AAACA-G-------T--------------------------------A-A-T----GC-------TG-----AGT-T----T--GA-TTC--AGT--G-T---TTG-TAGAC-TT-AA---AC--GTGTT--cgaga
gi|24 : aagttaaccaagcttatttcgtatgaagatttccataTGAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TC---AT-T-----CT-A------A----A------AT-TC------AG------A------C--------TAACTG----A-----A------------A-------ATCTGAAAT------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----GTGT--T-----AAAA---------C---A---A--C--TTT-C--AA-G-----------A---C-A-------T--T--CT---T---GT-AAACT-----CAGTAAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---CG-A--------TAA------TATAAT--C-----------A-AAT-----A----T---G-T---T--TTGTAACT---GAA-------------C----TTTT---CTG-----------TT-AA----------------------------------------A--A-A-A-T-CG-GCAA-A-CTTG-----AG--T----T--
gi|25 : ATT-CAT----AA-ACATTTT----TT---AT-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------T------G--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------CAAATAATCGGAAAT-G--------T-A-----A-AAA--GC-----AA-T--A-----AAAG---------C---A---A--T--TTGGT--AA-GACA--T---TAA---C-A--ACA----------------------AAA-----TAGTCAAT--TCAAATGTTACAT-T---AA---C--A--------AAA------CAT-AA--C-T---A-AC--A-AAA-----A----C---G-T---T--TTATAA-T---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------TTATAAAA-A-------AA--------------------TT-T--A--A-ATA-T-CG-GGAATT-TTTG-----GT--T----T--GA-ATC--ttggtccagagtttacaaattat
gi|26 : ------A----G------AT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-G--------G-A-----A-TTTTGGA-----AT-T--GGCCTTGAAA---------C---A---A--T--TTT-C--AG-GATA--T---TAA---C-A--GCATTT--T--TC---A---GC-AAAGA-----CAGTTAAT--ATCAGTGTTACAT-T---AT---C--A--------GAA------AAT-TA--C-T---ATAA--A-CAC-----T----T---G--------TTAAAACT---AA------------------ATTTT--GCTA-----------TT-TAATA-G-------TA--------------------TC-TA-A--A-A-A-T-TG-GTAA-T-TTTG-----AG--TC---T--GA-TTT--TA---A-----TTT-AAGAT-TC-AA---Attaa
gi|27 : taaattcTAAATT-GAT-C--AA-AC--ACT----TG------------CT-G------A----A------AA-TC------TG------A------T-------------------------------------A-------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GT-----AT-G--A-----AAAAT--------C---A---A--T--TTAAC--AA--AAA--C---TAGG--C-A--AGATAT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAA---TTCAATGATACAT-T---AT---C--A--------G--------AAT-AT--T-T---A-AA--A-ATTGGCA-G----T---G-T---T--TT
gi|27 : tcagtctattggttacttcttgaccAGA-A-------TA--------------------TT-T--AA-A-A-A-T-TG-GCAG-TGTTTT-----AGT-T----T--TA-GTC--CG---A-G---TTT-CAAAC-TC-AG---AA--GTTagttttagtccgagtttcaaactcagaagttaaa
gi|28 : tcagtctattggttacttcttgacctaaattgatcaaacacttgctgaaaatctgatattttgtgatttgtatgaaaaatcaatttaacaaaaactaggcaagatattcctacaaaaacaatcaattcaatgatacattatc---AG-A-----CT-A------T----G------AT-TC------AA------A------A--------TA-C------G-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----AATTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-TAAA--T---TAA---T-A--TCATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAAAGTTGTCT-T---AT---C--T--------GAA------AAT-AT--A-TATAA-AA--A-GAC-----A----C---G-T---G--CTTT---T---AAA-------------C---GTTTaaa
gi|29 : atcaggggtttgaatttacaacaa-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TGTAC--AT-GAAA--T---TAA---A-T--ATACTT--T--CT---T---GC-TAAAA-----CAGTCAAT--TTAAATGTTCCAT-T---AT---T--A--------GAA------ATT-AT--C-A---A-AA--A-AAA-----G----T---G-T---T--TTATAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------TT-AAATA-A-------TA--------------------TT-TA-A--A-A-A-T-TA-GCAA-T-TGTA-----AG--TTTTAT--AA-GTC--TG---AGT---TTT-TGGAC-AC-AA---AA--GTTTT--ATGgcaaattatagtcctggatacaatattttgttt
gi|3 : gcTAAATT-CATTC--AA-A---TTT----TA---AA-T-----CT-A------A----A------ATATC------CG------A------C--------T--G------A-----A------------ATTTAA--A--------------T-------------TC------------T-G--------A-A-----A-TTTT-GTTATCTAT-TTCA-----AAAA---------T---A---A--T--TTAAT--A--GAAA--T---TAA---C-A--CCATTT--TGTCT---T---GC-AAACT-----CAGCCAGT--TTCAATGTT--TT-T---AT---T--A--------GGA------AAT-AT--C-T---A-AA--A-AAA-----A----T---G-T---T--TTACAACA---TAA-------------C-----TTT--GCTA-----------TT-TAATA-G-------TT--------------------TT-T--AAGA-A-A-T-AG-GACA-T-TTTT-----AG--TC---C--AA-GTC--TG---AGC---TTT-TATCC-TC-AA---AG--GTTTT--ATAAtgtttaa
gi|30 : tA-GC--TGT----TG---AA-T-----CT-G------G----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------TGTGAAATT-----T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---------G-G--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATAATT--TTTTATAACACAT-T---AT---C--A--------G--------AAT-AT-----------------AT-----A----T---A-C---T--TTTTAACT---GAC-------------A---ATTTTGAGATA-----------TT-TAACA-G-------TA--------------------TT-TG-A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AGA-T----T--GA-GTC--TG---tttaa
gi|31 : --------T--C------A-----A------------G-------A--------------TCA-----------T-------------T-T--------T-A-----AATTT--CT-----AT-TT-A-----AAAA---------A---A---A--------AA--AA-AAAA--T---GAA---C-A--AAATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAACCAAT--TTCAATGATACCT-T---AA---A--A--------GAA------AAT-AT--A-T---A-AA--A-AAA-----A----CCCAG-T---T--TTTAAATTA--AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------TT-CGA-A-G-------TG--------------------TT-T--A--A-A-A-A-CG-TCAA-T-TCTA-----AG--T-----------TT--GG---A-----TTT-AAGAC-TA-AA---AA--TTTTTTGATGAAggta
gi|32 : TAAATT-TAC-A--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--CGGTCTGA-----A------------A-------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---C--A--------TAAAGC---AAT-AT--T-T---T-AT--A---------A----T---G-A---T--TTATAATT---tt
gi|32 : cgtctatgtaatcttgaccTT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tttagtctcaaaggtttgatgaa
gi|33 : cgtctatgtaatcttgacctaaatttacaaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaattttgtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatattttataatgatttatTAAATT-CAC-C--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------GGTCTGA------------A-------A--------------T-------------T-------------TAG--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---C--A--------TAAAGC---AAT-AT--G-T---T-AT--A---------A----T---G-A---T--TTATAATT---
gi|33 : acgtctatgtaatcttgaccT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tttagtctcaaaggtttgatga
gi|34 : acgtctatgtaatcttgacctaaattcaccaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaatttagtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatatgttataatgatttat--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAAA--------T---A---T--T--TTTTC--AA-GAAA--T---GGA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATTAAT--ATTAATGATACAT-T---AC---C--A--------GAA------GAT-AT--A-A---A-TA--A-AAT----------T---ACT---T--TTTTAA-T---AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------TT-AAAAA-C-------TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-T-AG-GCAA-T-TGTG-----AGT-T----T--GT-GTC--TG---G-G---TTT-TATAT-TC-AATTGAA--GTTTG--ATGAA
gi|35 : TAAATT-CCT-T--AA--C--TTT----TA---AG-T-----C---------G----A------AC-TC------AA------AGAAGT-C--------T---------G-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-A--------TTC-----A-TTT--GT-----AT----A-----AAAA---------C---A---A--A--TTTAT--AA-GAAAA-T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---C--A--------GAA------AAT-AT--C-T---A-AAATA-AAT-----A----A---A-T---T--TTGTAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------TT-AAACA-G-------TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-T-CA-GCtt
gi|36 : ctTAAATC-CAT-C--CA-A---TAT----TG---CG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--T------A-----A------------A-------A--------------TAAAAAATGAACTTT-------------C-G--------T-A-----A-TGT--GC-----AT-T--A-----AAAA-------------A----------------AA-GAAA--T---GAA---T-A--ATG-TT--T--CC---T---AC-AAAAC-----CAGTCATT--TTCAAAGATACGT-T---AT---C--C--------GAA------AAC-A-------------------------------------------TTTTAACT---AAG-------------T---A----------------------C-AAAAA-G-------TA--------------------TT-G--A--A-----------CAA-T-------------------------GTC--TG---G-G---TTT-TACAC-TT-AA---AA--GTTT
gi|37 : t----A------AT-TA------AA------A------T--------T--T------G-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------TTG--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA-----------------------------C-AAAAA-----CAATAAAT-----AA---TACAT-T----T-----------------A------AAT-AT--C-----A-GA--A-AAT-----AACATT---G-T---T--TTTTTACC---AAA-------------C---ATTTT--G-TA-----------TT-TAAAATG-------TATAAAATATAAAAAAAAGTTTTT-T--A--A-A-A-T-CT-CCAA-T-TCTG-----AAT-T----T--TA-GTT--TG---G-A---TTT-TAg
gi|38 : C------AG------A------CA-------T--C------A-----A------------A-------A--------------TCTGTTTTT-----T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---G--T--TTTGC--AA-GAAA--T---AAAACTT-A--ACATTT--T--TC---T---AG-AAAAG---------------TTCAATGACACAT-A---AT---T--A--------GAA------AAT-GT--C-T---A-AA--A-ATT-----A----C---A-----T--TTGTAACT---AAG-------------T---A-TTT--GCTA-----------TT-AAAAA-G-------TA--------------------TT-T--A--A-A-A-A-TGTTCAA---TTTG-----AG--T----
gi|39 : aaccaggctttca-------A--------------T-------------T-------------T-A--------A-A-----A-TTT--AC-----AT-T--C-----AACA---------C---A---A--A--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--AAATGT--T--CA---T---AC-AAAAA------A--CAAG--TTCAATAATGTAT-T----T---CTAG--------AAA------AAT-ACAAC-A---A-AA--A-AAC-----A-----------------TTTTAACT---AAA-------------T---ATTGT--GCTA------------T-CAAAA-G-------TAT-------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-G--A-G-TTTG-----AT--C----T--G-------GG---A-T---TTA-TA
gi|4 : aaatctgatgTAAATT-CAT-C--AA-TA--TTT----TG---AG-T-----GT--------------------------------G------A------C---------------------------------------------A--------------T-------------T-------------TCA--------T-A-----A-TTT--AC-----AG-T--A-----ATAA---------C---A---C--T--TTTAT--AA-GAAA--G---TGG---C-A--ACATTT--C--CA---A---GC--AAAA-----CAATCAAA--TCCAATGATACAT-T---AT---C--A--------GAA------AAT-AT--C-T---A-AA--A-AGT-----A----A---A-T---T--TTAAAACT---AAA-------------T---ATTTA--GCTA-----------TT-AAAAG-T-------TT--------------------TT-T--A--A-A-A-cgttgatt
gi|40 : ttagcttacaaacaattgcacctttaaaacagaaagaaagtttattatgaaccttcaac-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TTTAC--AA-AAAA--T---TAG---A-A--ACATAT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGACAAT--TTTAATGTTTCAT-T---TT---C--A--------AAA------AAT-AT--C-T---A-AA--A-GAT-----A----T---G-T---T--TTATAACT---AAA-----------------GTTTG--GATG-----------TT-A-----------------------------------------A--A-A-A-T-TG-ACAA-T-TTTGGATTTAA--T----T--GA-GTC--TG---------TTT-TAGAC-T--AA---TT--TTTTT--ATGAAaatgtccaatatatgtat
gi|41 : -A-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------T---A---A--T--TT---------AAA--T---GAA---C-A--ACATTTCTT--TT---T---G--AAAAA-----CAGTCAGT--TTCAATGTTACAT-T---AA---T--A--------GAA------AAT-AT--TGT---A-AT--A-A-------A----T---G-T---T--TTATAG-T---AAA-------------C----TGTT--GCTG-----------TT-TAACT-G-------TA--------------------TT-T--G--A-A-A-T-TA-AAAA-C-ATTG-----TG--T----T------T----------T---TTT-TGGAC---------AC--GTTTT--GTGAA
gi|42 : cTATATG-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----GT-A------A----A------AA-AC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------TCTGAAATT-----T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--GC-----AT-G--A-----AAGA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--TCATTT--T--CC---A---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCAATGATACATGTCAGAT---C--A--------GAA------AAT-AT--ttt
gi|43 : ctAATT-CAT-C--AA-GC--TTT----TG---AA-T-----CT-A------A----A------AAATC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------------------------------------------------------------------------C--GC-----A-----------AAAT---------CTGAA---A--T--TTT-------GAA----------------------TT--T--CT---T---GT-AAAAA-----CAGCCAAT--ATCAATATTACAT-T---AT---T--A--------GAA------AAT-AT--C-T---A-AA--A-AAA-----AT---T---G-T---T--TTGTCACA---AAA-------------CTA-ATTTT--GCTA-----------TT-AAATA-aatttccttt
gi|44 : tttAATT-CAT-C--AA-AC--CTT----TT---AG-T-----CT-T------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------TCTGGAATT-----T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--AT-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AATGAAA--T---TAG---C-A--AC-TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CTGTTAAT--TCCCATGTTATAT-T---AT---C--A--------GAA------AAT-GT--C-TA--A-AA--A-AAT-----A----T---G-T---T--a
gi|45 : tAGATT-CAT-C--A------TGT----CG---GGAT-----TT-A------A----ACTC---AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------TCTGAAATT-----T-------------T-G--------T-A-----A-TTTTAAT-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AG-GAAA--T---GAA---G-A--ACATTT--T--CT---T---AA-AAAAA-----AAA--AA------------ACA------AT---C--C--------GAA------AAT-A-----T---A-AA--A-AAT-----A----T---
gi|46 : caATTT--T--CT---T---GC-AAACA-----CAATCAAT--TTCAATGTGACGT-T---TA---C--A--------GGAAATAACAAT-AT--T-T---G-AA--T-AAT-----A----CA--G-C---T--T--TAACTAGAAAG-------------G---ATTCT--GCAA-----------T----AAG-GTT-----TC--------------------TT-T--A--A-A-A-A-TG-ACAG-T-TCAG-----AG--T----TC-GA-GTC--TG---A-C---TGT-AAGAC-Tcatt
gi|47 : TGAATT-CAT-T--CA-AG--TAT----TG---GG-T-----CC-A------A----A------AC-TG------A-------A------C--------T---------------------------------------------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GATT--T---GGA---C-A--ACATTT--C--AC---T---GC-AAAAAAAACCCAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---AT---C--A--------TAA------AAT-
gi|48 : tggaccT-CAT-C--AC-AT--TTT----TG---AG-TAATATCT-G------ACTTGA------CC-TC------AA------AAT----C--------T--T------A-----C------------A-------T--------------T-------------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---G--T--ATTTC--AA-GAAG--T---GAA---C-A--GCATTG--T--CT---A---GC-AGAAA-----CAttaaac
gi|49 : -TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------C-------------C-------------T-GATTTTCTTT-T-----A-TTT--GC-----A-----A-----TAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-GAAA--T---TAA---C-A--AGCCTA--T--CT---T---GC-AAAAA-----GAGTAAAT--TGTAATGTTATAT-T---AT---C--AG-------AAA------AAT-AT--C-T---A-AA--A-Aaataagaatacgttttataa
gi|5 : T-CAT-C--AA-GC--ATT----TG---AA-T-----CT-ACATCCCA----G------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------C-------------T-GACA-----T-ATTTTCA-TTT--GA-----AT-G--A-----ATAA---------C---A---A--C--TTTAC--A--GTAT--T---TTT---T-TTTATATTT--T--CT---T---GC-TTCTA-----TAACCAAT--TTCAATG---CAT-T---AT---C--A--------TAT------TAT-AT--C-T---A-AA--A-ATT-----A----C---A-T---T--C-ATAACT---AAA-------------T---ATTTT--GCTG--------------CAAAA-ATTTTTTTTT--------------------TT-T--G--A-A-A-T--G-GCAA---TTTA-----AG-----------------------------TTT-CAGAC--C-AA---AAATGTTTT--ATGA
gi|50 : TAGATT-CAT-C----------TC----AG---AA-T-----CC-A------A----A----------C------A--------------T--------T--T------A-----A------------C-------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TCT--GC-----AT-T--A-----GAAA---------C---A---A--T--ATTTC--AG-GGAA--T---TGA---C-T--ACATGT--T--CTTCCT---GC-AAAAA-----AA--CAATGATTCAttgcaagccctg
gi|51 : aTGAGTT-CAT-CGAAA-AC--TCG-----G---AT-T-----C---------A----A------AC-TC------AA------AAA----C--------T--G------A-----T------------A-------T--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--------AAAA---------C---A---T--TTCTTTAC--AA-GAAA--TGTATAA---C-ctatgaaac
gi|52 : taattcagtgtaAT-T---TT---A--A--------AAA------AAT-AC--------------A-AAT-----A----C---G-TACAT--TTTTAACA---TAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------TT-AAAAA-G-------TA--------------------CT-T--A--AGA-A-T-CG-ACAA-T-TCTG-----AG--T----
gi|53 : taattaatga--TTTAC--AA-GGAA--T---GAA---C-A--ATATTT--T--CC---TAAAAA-AAAAA-----AAATAAAT--TCCAATGATACTT-T---AT---C--A--------GAA------TAA-AT--C--------G--A-ATT-----A----C---A-C---T--TTTTAACT---atgtgt
gi|54 : TGAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------TG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----AAAC---------C---A---A--A--TTTTCTAAA-GAAA--
gi|55 : tAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------CG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----TAAC---------C---A---AATT--TTCTC--AA-GAAA--
gi|57 : tTTTT--GCTA-----------TT-AAACA---------TA--------------------TTAA--A--A-A-A-T-CG-ACAA-T-TTTT-----AGT-T----T--GA-GGC--TG---A-G---TTT-TAAGC-CC-
gi|58 : cA-------------C---ATTTT--CCTA-----------TT-AAA-A-C-------TA--------------------TT-T--A--A-A-A-TTCA-GCAA-T-TCAG-----AG--T----TT-GA-GTC--TG---G-G---TGT-TAGGC-TC-AA---TA--GTTGG--ATGGAtgaacctcttaaacgtt
gi|59 : ---AAA-------------T---ATTTC--GCTA-----------TT-AAAAT-G-------TA--------------------TT-T--A--A-A-G-T-TG-GCAT-T-TCTG-----AGT-T----T--GA-GTC--TT---A-G---AAT-TGGAC-TC-AA---AA--
gi|6 : taTAAATT-TAT-C--AA------------TG---AG-C-----TT-A---------------------TC------AA------A------A--------TG-T------G-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GT-----AT-T--A-----TTAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--AA--TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---GT---T--A--------GAA------ATT-AT--C-T---A-AA--A-TCT-----G----C---A-T---T--TTATAACT---ACATGTATATACATTGT---ATTTT--GATG-----------TT-TAAAT-G-------TA--------------------TT-T--A--A-A-C-A-AG-GAAA-A-TTTG-----AC--T----T--GA-GTC--GG---A-T---GCT-TAGAC-TC-TA---AA--
gi|60 : cc--TTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TT------GA------A------A--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTC--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTAAC--AA-AAAG--T---TAA---ttctga
gi|62 : AAA--T---CAA---CCA--A-------T--CT---T---AC-AAAAG-----CAGTCAGT--TGCAATGTTTCAC-T---AT---C--A--------GAA------AAT-GT--G-T---A-AA--
gi|7 : TAAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------------T-------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--AGATTT--C--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--GTCACTGTTAAAC-T---AC---C--A--------TCA------AAT-AT--C-T---A-AA--C-AAT-----A----T---G-G---T--TTCTGACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTG-----------TT-TAATA-A-------TA--------------------TT-C--A--G-A-G-T-CA-ACAA-T-TTTG-----AG--T----TAAGA-GTC--AG---A-T---TTTGTAGAC-TC-AA---AA--GTATT--ATGAA
gi|8 : TAAACT-TAT-T--CA-AC--GTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AA-TC------AG------T------C--------T--C------A-----A------------A-------ATCAAAATCTGAAATT-------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--------AAAA---------T---A---T--T--TTTAC--AA-AAA--------------------ATTT--T--CT---T----C-AAAAA-----AA---AAA--TTCAATGTAACAT-T---AT---C--A--------GAA------AAT-AT--C-T---C-AA--A-TAT-----A----T---G-T---T--TTAT-ATT---GAA-------------CTAGATTTT--GCTA-----------TT-AACTT-A-------TA--------------------TT-T--A--A-A-ATT-CG-ATAA-TATTTA-----TT--T----T--CA-ATC--TG---A-G---ATT-TAGAC-TC-AA---AT--ATTTT--AT
gi|9 : ctATT-CAT-C--AA-TC--TTT----TG---AT-T-----CT-A------A----ATGTCAGAC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------ATTCTGAAA--------------T-------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--GC-----TT-A--A-----AAAA---------T---A---A--T--TTTAT--AA-GAAA--T---TGA---C-A-----TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----TATTCAAT--TTCAAGGTTACAT-T---AT---------------TAG------AAT-AT--C-T---A-AAT-A-AAA-----A----G---G-T---------TA------AAA-------------C---A-CTT--GCTA-----------TT-CTTTT-GC------TA--------------------TT-T-------A-C-T-CT-GCAA-T-TTTGA----AA--T----T--GA-GTT--TG---A-G---TAC-TAGAA-TG-AA---AA--GATTT--ATGAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|56 ): AAAACAAAACTTTTAAACTGAAATTAACAGTTACTAGATATATTTCGAAAAGGAGACAAAGAAATGCTAGCGAGAATCGT
Unaligned ( gi|61 ): GAATTGATGCTTGTGGAACAATTTTTGGGTATTAAAAACTTTTTCAAGCCAAGACAGTTTACATC
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111 11
lowQualScore : 2 1 11 1 222 2222 111 1 22222 0 333333 1111 444444 2 222222 4444444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 4 88888888 0 11111 1 22 11111 1 33333333 5555555555 111 111 11 11 11 0 22 5555 222 0 11 11 33 111 1111 1 22222 2 11 4 0 111 222 33333333 555555 7777777777 33 0 444444 888888888 111 111 5 333 4444444444444444444 11 55555555555 0 0 4 0 88888888888888888888 0 88888 1 1 1 111 2 44444 33 4444 33 11 2 111 999 1 2 11 1 0 222 11 22
lowQualScore : . . .. . ... .... ... . ..... . ...... .... ...... . ...... ....... ............................................................................ ............. . ........ . ..... . .. ..... . ........ .......... ... ... .. .. .. . .. .... ... . .. .. .. ... .... . ..... . .. . . ... ... ........ ...... .......... .. . ...... ......... ... ... . ... ................... .. ........... . . . . .................... . ..... . . . ... . ..... .. .... .. .. . ... ... . . .. . . ... .. ..
lowQualScore : 4 2 66 1 888 3333 888 0 44444 9 555555 9999 111111 6 444444 1111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3333333333333 1 00000000 8 99999 5 99 99999 5 99999999 6666666666 333 333 00 00 00 7 77 3333 111 8 11 11 99 333 8888 5 77777 6 11 2 8 444 222 66666666 000000 2222222222 11 9 888888 999999999 666 666 0 444 7777777777777777777 33 33333333333 9 9 9 9 55555555555555555555 9 11111 9 9 9 888 0 55555 88 1111 66 55 2 999 777 1 2 55 2 4 333 99 33
consensus : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-TCG-GCAAT-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---TGA--GTT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
Reference ( family-3145 ) : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-TCG-GCAAT-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---TGA--NTT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
gi|1 : AAAT--CA--C--AA-AC--TTT----C----AG-A-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------AAA------T--G------A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAG----------C---A---A--C--TTTGT--AA-GAAA--T---GTG---T-A--ACATGT--T--CT---C---GC-AAAAAT----CAGTCAAT--TTCAATGTTACTT-T---AA---CAG--------AA------AAATT-C-T---T--AC--A-AAT-----A----C---TC---AT---TATAATC---AAA-------------C----TTTT--GCT------------T-TA-----------------------------------A--A-A-G-TCG-GCAAT-TTTG-----A---T-------------TC---TGAG-ATT-T-T--AGTC-TCAG---AA--GTTTT--ATAAA
gi|10 : atatgaacaggttcagaaataatacgttatcatcaaagtatgcac-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--C------AGT---A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------T-A-----A-TTT--AC-----AT-T--A-----AAAAAAAACACATT---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AATAA-----CCATCGAT--TTCAATGATAAAC-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C--------AA--A-AAT-----A----T---AC---TT---TTTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TG--------------------TT-A--A--A-A-A-TT---CA---CTAA-----AG--C----T--G--G-GTC---TGT--GTT-T-T--TGAC-TCAG---AG--GTTTG--ATAAAttt
gi|11 : tcatcaaaaactcacaA-AC--TTA----CT---AG-A-----CT-A------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------A-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--GCATTT--TGCTT---T---AT-AAAAA-----TAATCAAT--TTTAATGTTACAT-T---AT---TA-------------------------T---A--AA--A-AAT-----A----T---TT---CT---TTCAACT---AAAT------------C---A--TT--GTTA-----------T-AA-ATTAG-TA--------------------TT-T--T--G-G-A-TTA-ACAAA-ATTG-----AGT-T----T--G--A-GTA---TTA--GTT-T-T--ACAC-T-AA---AA--ATTGT--ATGAtt
gi|12 : cgtgaaaatgtggagtcttTAAATT-CAT-C--AA-AT--GTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TCTGATTCAA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-GG-------T-A-----A-TTT--GA-----AT------------AC---------C---A---G--T----------A-GAAAATT---TAA---C-A--TCATTT--T--TT---T---GT-AAAGA-----CAATCAAT--TTCAATGTTACGT-T---AT---TAGAAAATATCAA------AATAT-C-T---A--AA--A-AA------A----C---GT---TT---T---ACT---AGA-------------C----TAAT--GATA-----------A-TA-AATAG-CA--------------------TT-A--AT-A-A-A-TCA-GCAAT-TTTG-----AGTTT----T--G--A-GT----------TT-T-T--AAAT-ACAG---TA--ATGTT--ATGAA
gi|13 : -----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------C--------C--T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--TC-----AAAT--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-TTAA------TAA---T-A--ACGTTT--T--GT---C---ACAAAAAA-----CATTCGAT--TTCAGTGTTACAT-T---AT---CAG--------AG------AATAT-C-T---A--AA--ACAAT-----A----A---TT---AT---TCTAGCG---AAA-------------C---A-TTT--GCTA-----------T-TA-AGTAG-TA--------------------AT-T--A--A-A-A-ATG-ATAAT-TTTG-----AG--T----T--G--GCGTC---TGAG-ATT-T-T--A
gi|14 : tttcattaaaaaaaatttagtaaaaaaacaaaC-TC------AA------A------T--------G--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------A-A-----A-TAT----------T-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AA-GGAT--T---GAA---T-A--ACATTT--TTTCT---T---AC-ACAAA-----CAGTCAAT--GTCAATGATACAT-T---ATC--CAA--------AA------AACAC-C-CCA-A--AA--A-AACCGG--A----C---AT---TT---T-TAATG---ATA-------------T---ATTTT--ACTACATGATTGTATT-TT-AAAAT-TA--------------------TT-T--A--A-A---------AAC-CTGA-----AA--T----T--G--A-GCC---TGG--GTT-T-T--AGAC-ACAA---AA--GTTTA--ATGAA
gi|15 : ttatttttagtT-A------A----G------AC-TC------GG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------A--------------C-------------T-GAAATAATAT-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----ATAA-----------------A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA----------ATTT--T--TT---T---GC-TAAAA-----CAGACAAT--TTAAATGTCATTT-T---AT---TTG--------AA------AATAT-C-T---A--AT--A-AAT-----A----C---TA---ATAAATATTACT---AAA-------------C----CTTT--GCTA-----------T-AA-GATAG-TA--------------------TT-T--G--ATA-G-TTA-GCAAT-TTTGT----GG--T----T--G--A-GTC---TGAG-TTT-T-T--AGAC------------GTTTT--ATGAAta
gi|16 : tcaaaatATG-CAT-C--GA-AC--TTT-----G---AG-T-----CT-A------A----A------TT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------C--------T--------------T-------------T-A----------A-----A-TAT--GA-----AT-TTTG-----AAA------------------------TTTGC--A--------T---TAA---A-A--ACAATT--T--TT---T---TA-AGAAA-----TG----AT--TTCAATGATACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-A-T---C--AA--A-AAA-----A----C---AT---TT---T-TAGCT---AAA-------------T---AATTT--GCTA-----------T-TA-AATAG-TA--------------------TC-TAAA--A-A-A-TCG-GCATT-ACAG-----AGT-T----T--G--A-GTC---CGG--GAT-T-T--AGATATTAA---AA--AATTG--ATGttca
gi|17 : atcat-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------T--------C--C------A-----ATCTCATGTTTCTA-------ACAT-----T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTC--AT-----CT-T--AT----CAAA---------C---ATTTA--T--TTTAC--AT-GCAA--T---TCA---C-A--ACGTTT--T--CT---T---TC-AGAAA-----CTGTCAAT--TTCAATGTGTTAT-T---AT---TTG--------AA------CATTT-C-T---T--AA----------------------------------AACT---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TA--------------------TT-T--AC-A-A-A-TTG-ATAGT-TTTC-----AG--T----T--G--A-GTT---TGAG-TTT-T-T--AGAC-TCAA---AC--ATTTT--AAGAA
gi|18 : TGAATC-AAT-A--AA-AG--TTC----TG---AG-T-----AT-A------A----A------ACCTC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAA------------------------TTCAC--AA-GAA--------AA---G-A--ACA--------------------AAAAA------AATCGAT--TTCAGTGAAACAT-G---AT---CAG--------AA------AACAT-G-T---A--GA--A-AGA-----A----C----T---TT---TTTAAAG---AAA-------------A---AATTT--GCTA-----------T-TA-AAAAA-TG--------------------------A--A-ATA-TCG-GCAAT-TCTA-----AGTTT----T--G--A-GAC---TAAACATT-T-TGAAGCT-TAAA---AA--GTTTG--ATGgttt
gi|19 : accAATT-CAA-C--AA-AG--AGT----TG---AG-C-----CT-A------A----A------AC-TC------
gi|19 : aaaatctgatattgaaactagacatt-----AAAA---------C----------T--CCTAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--ACATTA--T--CG---T---AC-AAAAA-----CAATTATT--TACCAGGGTATAT-T---AT---CA---------AA------AGTA--------A--AA--A-AATTAATAA----C---AT---TT---TG--AGT---ACA-------------T---ATTTT--GCTA-----------C-CA-AAAAG-TA--------------------TT-A--G--A-A-T-TCG-GTAAT-TCTG-----AG--T----TG-G--A-GTCTAGTAG--GTT-A-T--AAAC-ACCA---AA--GTTTT--ctacaagaaataaacaacattatcgtacaaaaacaattatttaccagggtatattatcaaaagtaaaaaaattaataacattttgagtacatattttgctaccaaaaagtattagaattcggtaattctgagttggagtctagtaggttataaacaccaaagtttta
gi|2 : aaaatctgatattgaaactagacattaattcaacaaagagttgagcctAATT-CAT-C--AAGAC--TTTATTGTGTTCAG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AGGTCCAAA------C--------A--C------A-----A------------A-------A--------TCTTGACATA-----T-------------T-G--------T-T-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---G--T--TATAC--TA-GAAA--T---TAA---C-A--ATATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCATTGATACGT-T---AT---CAG--------AA------AATATAC-T---A--AA--A-AGT-----A---------T---CT---TAT--CT---GTA-------------T---ATTTT--GCCA-----------TCTA-A--AG-TA--------------------TT-GA-A--A-A-A-TCG-GCAA
gi|20 : c---AG-T-----CT-AT-----A----A------AA-TC------AA------AATCGATC--------T--C------G-----A------------A-------A--------TCTAAATTTT-----T-------------T-T--------T-A-----A-TTA--GC-----CT-T--A-----AAAAAA-------C---A---G--T--TTTAC--AA-TAAG--T---TAA---A-A--A-GTTT--T--CT---T---GC-AAAAT-----CAGTCAAT--ATCAATGTTATTT-T---AT---TAC--------AA------AATAT-T-T---A--AA--A-AAT-----A----A---GT---TG---TGTTACT---GAA-------------T---G-TTT--GCTA-----------T-TA-AGCAG-T-------------------------------------------AT-TTTG-----AG--T----T--C--AGGTC---AGA--GTTGT-G--AGAC-T-AA---AG--ATTTG--ATGAAaactatatttaaacaaatacatctaaaagatttataaataatttctatga
gi|21 : TACATT-CAT-C--AA-AG--TTT----CG---AA-T-----CC-A------A----A------TC-TC------AG------A------C--------T--CGCTC--A-----A------------A-------A--------TCATAAATT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAAA---------C---A---A--A--TTCAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--A-A-TT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CTATCAAT--TTC-AT-TTGCA--T---ATTTACAT--------AA------AATAT-A-T---A--GA--A-AA---------------AT---TT---TTTAA--------------------------------------------------A-ATCAG-TA--------------------AT-T---------------GTAAT-GT-----------T----T--G--A-GTC---TGG--GTA-T-A--AAGC-TCAA---AA--GTTTG--ATGAAttt
gi|22 : tTAGATT-CAT-C--AC-AG--TGT----TG---AG-A-----CTCA------A----A------AC------------------------C--------T--G------A-----A------------A-------A--------T--------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----A--------------------------------A--T--TTTAC--AA-AAAAAAT---GGA---C-A--ACATTT--TT-CC---T---ACTAAAAC-----CAACCAAT--TTCCATGTTG--------AT-----G--------AA------AATAT-AAG---A--AA--A-AAT-----A----C---AT---TT---TTTA--TG--AAA-------------T---ATTCC--GCT------------C-TA-AAAAG-TA--------------------AT-T--A--A-A-A-TGG-GCAAT-TCTG-----AGT-T----T--G--A-GTC---AGA--GTT-T-T--AAAC-TCAA---AA--Gt
gi|23 : C------AC------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------A-A-----A-TT----------------------AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AC-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---C---GC-AAAAA-----CAGTCATT--TTCAGTGTAACAT-T---AT---CAA--------AC------AATAT-C-T-------A--A-AAT-----A----T---GT---TT---TCTAATT---AAA-------------C---G-TTA--GCTA-----------T-TA-AACAG-T--------------------------------A-A-T---GC------TG-----AGT-T----T--G--A-TTC---AGT--GTT-TGT--AGAC-TTAA---AC--GTGTT--cgaga
gi|24 : aagttaaccaagcttatttcgtatgaagatttccataTGAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TC---AT-T-----CT-A------A----A------AT-TC------AG------A------C--------TAACTG----A-----A------------A-------ATCTGAAATT--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----GTGT--T-----AAAA---------C---A---A--C--TTT-C--AA-G-----------A---C-A-------T--T--CT---T---GT-AAACT-----CAGTAAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---C-G--------AT------AATAT----------AATCA-AAT-----A----T---GT---TT---TGTAACT---GAA-------------C----TTTT---CTG-----------T-TA-A---------------------------------A--A-A-A-TCG-GCAAA-CTTG-----AG--T----T--
gi|25 : ATT-CAT----AA-ACATTTT----TT---AT-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------T------G--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------CAAATAATCGGAAAT-G--------T-A-----A-AAA--GC-----AA-T--A-----AAAG---------C---A---A--T--TTGGT--AA-GACA--T---TAA---C-A--ACA----------------------AAA-----TAGTCAAT--TCAAATGTTACAT-T---AA---CAA--------AA------CATAA-C-T---A--AC--A-AAA-----A----C---GT---TT---TATAA-T---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TATAAAAA-AA--------------------TT-T--A--A-ATA-TCG-GGAAT-TT-----------T----T--G----GTT---TGA--ATC-T-T--Attggtccagagtttacaaattat
gi|26 : ------A----G------AT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------G-A-----A-TTTTGGA-----AT-T--GGCCTTGAAA---------C---A---A--T--TTT-C--AG-GATA--T---TAA---C-A--GCATTT--T--TC---A---GC-AAAGA-----CAGTTAAT--ATCAGTGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATTA-C-T------AT--A-AAC-----A----C---TT---GT---TAAAACT---AA------------------ATTTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TA--------------------TC-TA-A--A-A-A-TTG-GTAAT-TTTG-----AG--TC---T--G--A--TT---TTA--ATT-T-A--AGAT-TCAA---Aa
gi|27 : taaattcTAAATT-GAT-C--AA-AC--ACT----TG------------CT-G------A----A------AA-TC------TG------A------T-------------------------------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GT-----AT-G--A-----AAAAT--------C---A---A--T--TTAAC--AA--AAA--C---TAGG--C-A--AGATAT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAA---TTCAATGATACAT-T---AT---CAG----------------AATAT-T-T---A--AA--A-A
gi|27 : tcagtctattggttacttcttgaccAGAA-TA--------------------TT-T--AA-A-A-A-TTG-GCAGTGTTTT-----AGT-T----T--T--A-GTC---CGA--GTT-T-C--AAAC-TCAG---AA--GTTttggcagtgttttagttttagtccgagtttcaaactcagaagttaaa
gi|28 : tcagtctattggttacttcttgacctaaattgatcaaacacttgctgaaaatctgatattttgtgatttgtatgaaaaatcaatttaacaaaaactaggcaagatattcctacaaaaacaatcaattcaatgatacattatc---AG-A-----CT-A------T----G------AT-TC------AA------A------A--------TA-C------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----AATTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-TAAA--T---TAA---T-A--TCATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAAAGTTGTCT-T---AT---CTG--------AA------AATAT-A-TATAA--AA--A-GAC-----A----C---GT---GC---TTT---T---AAA-------------C---GTTTaaa
gi|29 : atcaggggtttgaatttacaacaa-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TGTAC--AT-GAAA--T---TAA---A-T--ATACTT--T--CT---T---GC-TAAAA-----CAGTCAAT--TTAAATGTTCCAT-T---AT---TAG--------AA------ATTAT-C-A---A--AA--A-AAA-----G----T---GT---TT---TATAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TA-AATAA-TA--------------------TT-TA-A--A-A-A-TTA-GCAAT-TGTA-----AG--TTTTAT--A--A-GTC---TGAG-TTT-T-T--GGAC-ACAA---AA--GTTTT--ATGgcaaattatagtcctggatacaatattttgttt
gi|3 : gcTAAATT-CATTC--AA-A---TTT----TA---AA-T-----CT-A------A----A------ATATC------CG------A------C--------T--G------A-----A------------ATTTAA--A--------T--------------TC------------T-G--------A-A-----A-TTTT-GTTATCTAT-TTCA-----AAAA---------T---A---A--T--TTAAT--A--GAAA--T---TAA---C-A--CCATTT--TGTCT---T---GC-AAACT-----CAGCCAGT--TTCAATGTTT--T-T---AT---TAG--------GA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAA-----A----T---GT---TT---TACAACA---TAA-------------C-----TTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TT--------------------TT-T--AAGA-A-A-TAG-GACAT-TTTT-----AG--TC---C--A--A-GTC---TGAG-CTT-T-T--ATCC-TCAA---AG--GTTTT--ATAAtgtttaa
gi|30 : tA-GC--TGT----TG---AA-T-----CT-G------G----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TGTGAAATT------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---------G-G--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATAATT--TTTTATAACACAT-T---AT---CAG--------AA------TATAT-----------------AT-----A----C--------TT---TTTAACT---GAC-------------A---ATTTTGAGATA-----------T-TT-AACAG-TA--------------------TT-TG-A--A-A-A-TCG-GCAAT-TTTG-----AGA-T----T--G--A-GTC---TGG--GTtttaa
gi|31 : --------T--C------A-----A------------G-------A--------TCA------------T-------------T-T--------T-A-----AATTT--CT-----AT-TT-A-----AAAA---------A---A---A--------AA--AA-AAAA--T---GAA---C-A--AAATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAACCAAT--TTCAATGATACCT-T---AA---AAG--------AA------AATAT-A-T---A--AA--A-AAA-----A----CCCAGT---TT---TTAAATTA--AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TC-GA-AG-TG--------------------TT-T--A--A-A-A-ACG-TCAAT-TCTA-----AG--T----T-------------TGG--ATT-T-A--AGAC-TAAA---AA--TTTTTTGATGAAa
gi|32 : TAAATT-TAC-A--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--CGGTCTGA-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---CAT--------AAAGC---AATAT-T-T---T--AT--A---------A----T---GA---TT---TATAATT---tt
gi|32 : cgtctatgtaatcttgaccTT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tttagtctcaaaggtttgatgaa
gi|33 : cgtctatgtaatcttgacctaaatttacaaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaattttgtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatattttataatgatttatTAAATT-CAC-C--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------GGTCTGA------------A-------A--------T--------------T-------------TAG--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---CAT--------AAAGC---AATAT-
gi|33 : acgtctatgtaatcttgaccT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tgttataatgatttataattttagtctcaaaggtttgatga
gi|34 : acgtctatgtaatcttgacctaaattcaccaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaatttagtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatatgttataatgatttat--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAAA--------T---A---T--T--TTTTC--AA-GAAA--T---GGA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATTAAT--ATTAATGATACAT-T---AC---CAG--------AA------GATAT-A-A---AT-AA--A-ATT-----A----C----T---TT---TTTAA-T---AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAC-TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-TAG-GCAAT-TGTG-----AGT-T----T--G--T-GTC---TGG--GTT-T-T--ATAT-TCAATTGAA--GTTTG--ATGAA
gi|35 : TAAATT-CCT-T--AA--C--TTT----TA---AG-T-----C---------G----A------AC-TC------AA------AGAAGT-C--------T---------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-A--------TTC-----A-TTT--GT-----AT----A-----AAAA---------C---A---A--A--TTTAT--AA-GAAAA-T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AAATA-AAT-----A----A---AT---TT---TGTAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TA-AACAG-TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-TCA-GCtt
gi|36 : ctTAAATC-CAT-C--CA-A---TAT----TG---CG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--T------A-----A------------A-------A--------TAAAAAATGAACTT-T-------------C-G--------T-A-----A-TGT--GC-----AT-T--A-----AAAA-------------A----------------AA-GAAA--T---GAA---T-A--ATG-TT--T--CC---T---AC-AAAAC-----CAGTCATT--TTCAAAGATACGT-T---AT---CCG--------AA------AACA----------------------------------------T---TTTAACT---AAG-------------T---A-----------------------CA-AAAAG-TA--------------------TT-G--A--A----------CAAT---------------------------GTC---TGG--GTT-T-T--ACAC-TTAA---AA--GTTT
gi|37 : t----A------AT-TA------AA------A------T--------T--T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------TTG--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA-----------------------------C-AAAAA-----CAATAAAT-----AA---TACAT-T----T---------------A------AATAT-C-----A--GA--A-AAT-----AACATT---GT---TT---TTTTACC---AAA-------------C---ATTTT--G-TAT----------T-TA-AAATG-TATAAAATATAAAAAAAAGTTTTT-T--A--A-A-A-TCT-CCAAT-TCTG-----AAT-T----T--T--A-GTT---TGG--ATT-T-T--Ag
gi|38 : C------AG------A------CA-------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGTTTTT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---G--T--TTTGC--AA-GAAA--T---AAAACTT-A--ACATTT--T--TC---T---AG-AAAAG---------------TTCAATGACACAT-A---AT---TAG--------AA------AATGT-C-T---A--AA--A-ATT-----A----C---A----TT---TGTAACT---AAG-------------T---A-TTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-ATGTTCAA--TTTG-----AG--T----
gi|39 : aaccaggctttca-------A--------T--------------T-------------T-A--------A-A-----A-TTT--AC-----AT-T--C-----AACA---------C---A---A--A--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--AAATGT--T--CA---T---AC-AAAAA------A--CAAG--TTCAATAATGTAT-T---TC---TAG--------AA------AA-AT-A-C---AACAA--A-AAA-----A----C---AT---TT-----TAACT---AAA-------------T---ATTGT--GCTA-----------T-CA-AA-AG-TAT-------------------TT-T--A--A-A-A-TCG-G--AG-TTTG-----A-----------------TC---TGG--GAT-T-T--ATAC-
gi|4 : aaatctgatgTAAATT-CAT-C--AA-TA--TTT----TG---AG-T-----GT--------------------------------G------A------C---------------------------------------------A--------T--------------T-------------TCA--------T-A-----A-TTT--AC-----AG-T--A-----ATAA---------C---A---C--T--TTTAT--AA-GAAA--G---TGG---C-A--ACATTT--C--CA---A---GC--AAAA-----CAATCAAA--TCCAATGATACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AGT-----A----A---AT---TT---TAAAACT---AAA-------------T---ATTTA--GCTA-----------T-TA-AAAGT-TT--------------------TT-T--A--A-A-A-gttgatt
gi|40 : ttagcttacaaacaattgcacctttaaaacagaaagaaagtttattatgaaccttcaac-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TTTAC--AA-AAAA--T---TAG---A-A--ACATAT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGACAAT--TTTAATGTTTCAT-T---TT---CAA--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-GAT-----A----T---GT---TT---TATAACT---AAA-----------------GTTTG--GATG-----------T-TA-----------------------------------A--A-A-A-TTG-ACAAT-TTTGGATTTAA--T----T--G--A-GTC---TG----TT-T-T--AGAC-T-AA---TT--TTTTT--ATGAAaatgtccaatatatgtat
gi|41 : -A-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------T---A---A--T--TT---------AAA--T---GAA---C-A--ACATTTCTT--TT---T---G--AAAAA-----CAGTCAGT--TTCAATGTTACAT-T---AA---TAG--------AA------AATAT-TGT---A--AT--A-AAT--------------GT---TT---TATAG-T---AAA-------------C----TGTT--GCTG-----------T-TT-AACTG-TA--------------------TT-T--G--A-A-A-TTA-AAAAC-ATTG-----TG--T----T--------T---------TTT-T-T--GGAC--------AC--GTTTT--GTGAA
gi|42 : cTATATG-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----GT-A------A----A------AA-AC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGAAATT------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--GC-----AT-G--A-----AAGA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--TCATTT--T--CC---A---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCAATGATACATGTCAGAT---CAG--------AA------AATAT-ttt
gi|43 : ctAATT-CAT-C--AA-GC--TTT----TG---AA-T-----CT-A------A----A------AAATC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A--------------------------------------------------------------------C--GC-----A-----------AAAT---------CTGAA---A--T--TTT-------GAA----------------------TT--T--CT---T---GT-AAAAA-----CAGCCAAT--ATCAATATTACAT-T---AT---TAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAA-----AT---T---GT---TT---TGTCACA---AAA-------------CTA-ATTTT--GCTA-----------T-TA-AATAaatttccttt
gi|44 : tttAATT-CAT-C--AA-AC--CTT----TT---AG-T-----CT-T------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGGAATT------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--AT-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AATGAAA--T---TAG---C-A--AC-TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CTGTTAAT--TCCCATGTTATAT-T---AT---CAG--------AA------AATGT-C-TA--A--AA--A-AAT-----A----T---GT---Ta
gi|45 : tAGATT-CAT-C--A------TGT----CG---GGAT-----TT-A------A----ACTC---AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGAAATT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTTTAAT-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AG-GAAA--T---GAA---G-A--ACATTT--T--CT---T---AA-AAAAA-----AAA--AA------------ACA------AT---CCG--------AA------AATA----T---A--AA--A-AAT-----A----
gi|46 : caATTT--T--CT---T---GC-AAACA-----CAATCAAT--TTCAATGTGACGT-T---TA---CAG--------GAAATAACAATAT-T-T---G--AA--T-AAT-----A----CA--GC---TT-----TAACTAGAAAG-------------G---ATTCT--GC-A-----------A-TA-AGGTT-TC--------------------TT-T--A--A-A-A-ATG-ACAGT-TCAG-----AG--T----TC-G--A-GTC---TGA--CTG-T-A--AGAC-Ttcatt
gi|47 : TGAATT-CAT-T--CA-AG--TAT----TG---GG-T-----CC-A------A----A------AC-TG------A-------A------C--------T---------------------------------------------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GATT--T---GGA---C-A--ACATTT--C--AC---T---GC-AAAAAAAACCCAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---AT---CAT--------AA------AAT
gi|48 : tggaccT-CAT-C--AC-AT--TTT----TG---AG-TAATATCT-G------ACTTGA------CC-TC------AA------AAT----C--------T--T------A-----C------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---G--T--ATTTC--AA-GAAG--T---GAA---C-A--GCATTG--T--CT---A---GC-AGAAA-----CAttaaac
gi|49 : -TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------C--------------C-------------T-GATTTTCTTT-T-----A-TTT--GC-----A-----A-----TAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-GAAA--T---TAA---C-A--AGCCTA--T--CT---T---GC-AAAAA-----GAGTAAAT--TGTAATGTTATAT-T---AT---CAGA-------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-Aaataagaatacgttttataa
gi|5 : T-CAT-C--AA-GC--ATT----TG---AA-T-----CT-ACATCCCA----G------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-GACA-----T-ATTTTCA-TTT--GA-----AT-G--A-----ATAA---------C---A---A--C--TTTAC--A--GTAT--T---TTT---T-TTTATATTT--T--CT---T---GC-TTCTA-----TAACCAAT--TTCAATG---CAT-T---AT---CAT--------AT------TATAT-C-T---A--AA--A-ATT-----A----C---A----TT---CATAACT---AAA-------------T---ATTTT--GCTG-------------CA-AAAAT-TT--------------------TT-T-----------TT------T-TTTG-----AA--A----T--GGCA-ATT---TAA--GTT-T-C--AGAC--CAA---AAATGTTTT--ATGA
gi|50 : TAGATT-CAT-C----------TC----AG---AA-T-----CC-A------A----A----------C------A--------------T--------T--T------A-----A------------C-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TCT--GC-----AT-T--A-----GAAA---------C---A---A--T--ATTTC--AG-GGAA--T---TGA---C-T--ACATGT--T--CTTCCT---GC-AAAAA-----AA--CAATGATTCAttgcaagccctg
gi|51 : aTGAGTT-CAT-CGAAA-AC--TCG-----G---AT-T-----C---------A----A------AC-TC------AA------AAA----C--------T--G------A-----T------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--------AAAA---------C---A---T--TTCTTTAC--AA-GAAA--TGTATAA---C-ctatgaaac
gi|52 : taattcagtgtaAT-T---TT---AAA--------AA------AATAC--------------A-AAT-----A----C---GTACATT---TTTAACA---TAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TA--------------------CT-T--A--AGA-A-TCG-ACAAT-TCTG-----AG--T----
gi|53 : taattaatga--TTTAC--AA-GGAA--T---GAA---C-A--ATATTT--T--CC---TAAAAA-AAAAA-----AAATAAAT--TCCAATGATACTT-T---AT---CAG--------AA------TAAAT-C---------G--A-ATT-----A----C---AC---TT---TTTAACT---atgtgt
gi|54 : TGAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------TG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----AAAC---------C---A---A--A--TTTTCTAAA-GAAA--
gi|55 : tAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------CG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----TAAC---------C---A---AATT--TTCTC--AA-GAAA--
gi|57 : tTTTT--GCTA-----------T-TA-AACA--TA--------------------TTAA--A--A-A-A-TCG-ACAAT-TTTT-----AGT-T----T--G--A-GGC---TGA--GTT-T-T--AAGC-CC
gi|58 : cA-------------C---ATTTT--CCTA-----------T-TA-AA-AC-TA--------------------TT-T--A--A-A-ATTCA-GCAAT-TCAG-----AGT-T----T--G--A-GTC---TGG--GTG-T-T--AGGC-TCAA---TA--GTTGG--ATGGAtgaacctcttaaacgtt
gi|59 : ---AAA-------------T---ATTTC--GCTA-----------T-TA-AAATG-TA--------------------TT-T--A--A-A-G-TTG-GCATT-TCTG-----AGT-T----T--G--A-GTC---TTA--GAA-T-T--GGAC-TCAA---AA--
gi|6 : taTAAATT-TAT-C--AA------------TG---AG-C-----TT-A---------------------TC------AA------A------A--------TG-T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GT-----AT-T--A-----TTAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--AA--TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---GT---TAG--------AA------ATTAT-C-T---A--AA--A-TCT-----G----C---AT---TT---TATAACT---ACATGTATATACATTGT---ATTTT--GATG-----------T-TT-AAATG-TA--------------------TT-T--A--A-A-C-AAG-GAAAA-TTTG-----AC--T----T--G--A-GTC---GGA--TGC-T-T--AGAC-TCTA---AA--
gi|60 : cc--TTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TT------GA------A------A--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTC--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTAAC--AA-AAAG--T---TAA---ttctga
gi|62 : AAA--T---CAA---CCA--A-------T--CT---T---AC-AAAAG-----CAGTCAGT--TGCAATGTTTCAC-T---AT---CAG--------AA------AATGT-G-T---A--AA--
gi|7 : TAAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--AGATTT--C--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--GTCACTGTTAAAC-T---AC---CAT--------CA------AATAT-C-T---A--AA--C-AAT-----A----T---GG---TT---TCTGACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTG-----------T-TT-AATAA-TA--------------------TT-C--A--G-A-G-TCA-ACAAT-TTTG-----AG--T----TAAG--A-GTC---AGA--TTT-TGT--AGAC-TCAA---AA--GTATT--ATGAA
gi|8 : TAAACT-TAT-T--CA-AC--GTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AA-TC------AG------T------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCAAAATCTGAAATTT-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------T---A---T--T--TTTAC--AA-AAAA--T---T---------------T--T--CT---T----C-AAAAA-----AA---AAA--TTCAATGTAACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---C--AA--A-TAT-----A----T---GT---TT---TAT-ATT---GAA-------------CTAGATTTT--GCTA-----------T-TA-ACTTA-TA--------------------TT-T--A--A-A-ATTCG-ATAATATTTA-----TT--T----T--C--A-ATC---TGA--GAT-T-T--AGAC-TCAA---AT--ATTTT--AT
gi|9 : ctATT-CAT-C--AA-TC--TTT----TG---AT-T-----CT-A------A----ATGTCAGAC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------ATTCTGAAA--------T--------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--GC-----TT-A--A-----AAAA---------T---A---A--T--TTTAT--AA-GAAA--T---TGA---C-A-----TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----TATTCAAT--TTCAAGGTTACAT-T---AT---TAG----------------AATAT-C-T---A--AAT-A-AAA-----A----G---GT----------TA------AAA-------------C---A-CTT--GCTA-----------T-TC-TTTTGCTA--------------------TT-T-------A-C-TCT-GCAAT-TTTGA----AA--T----T--G--A-GTT---TGA--GTA-C-T--AGAA-TGAA---AA--GATTT--ATGAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|56 ): AAAACAAAACTTTTAAACTGAAATTAACAGTTACTAGATATATTTCGAAAAGGAGACAAAGAAATGCTAGCGAGAATCGT
Unaligned ( gi|61 ): GAATTGATGCTTGTGGAACAATTTTTGGGTATTAAAAACTTTTTCAAGCCAAGACAGTTTACATC
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111 11
lowQualScore : 2 1 11 1 222 2222 111 1 22222 0 333333 1111 444444 2 222222 4444444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 4 88888888 0 11111 1 22 11111 1 33333333 5555555555 111 111 11 11 11 0 22 5555 222 0 11 11 33 111 1111 1 22222 2 11 4 0 111 222 33333333 555555 7777777777 33 0 444444 888888888 111 111 5 333 4444444444444444444 11 55555555555 0 0 4 0 88888888888888888888 0 88888 1 1 0 2222 1 2 44444 22 4444 44444 2 111 1 11 7 1 2 11 1 0 222 11 22
lowQualScore : . . .. . ... .... ... . ..... . ...... .... ...... . ...... ....... ............................................................................ ............. . ........ . ..... . .. ..... . ........ .......... ... ... .. .. .. . .. .... ... . .. .. .. ... .... . ..... . .. . . ... ... ........ ...... .......... .. . ...... ......... ... ... . ... ................... .. ........... . . . . .................... . ..... . . . .... . . ..... .. .... ..... . ... . .. . . . .. . . ... .. ..
lowQualScore : 4 2 66 1 888 3333 888 0 44444 9 555555 9999 111111 6 444444 1111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3333333333333 1 00000000 8 99999 5 99 99999 5 99999999 6666666666 333 333 00 00 00 7 77 3333 111 8 11 11 99 333 8888 5 77777 6 11 2 8 444 222 66666666 000000 2222222222 11 9 888888 999999999 666 666 0 444 7777777777777777777 33 33333333333 9 9 9 9 55555555555555555555 9 11111 9 9 9 8888 0 0 55555 88 1111 88888 1 888 1 55 6 1 2 66 2 4 333 99 33
consensus : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---T-GA--G-TT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
Reference ( family-3145 ) : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---T-GA--G-TT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
gi|1 : AAAT--CA--C--AA-AC--TTT----C----AG-A-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------AAA------T--G------A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAG----------C---A---A--C--TTTGT--AA-GAAA--T---GTG---T-A--ACATGT--T--CT---C---GC-AAAAAT----CAGTCAAT--TTCAATGTTACTT-T---AA---CAG--------AA------AAATT-C-T---T--AC--A-AAT-----A----C---TC---AT---TATAATC---AAA-------------C----TTTT--GCT------------T-TA-----------------------------------A--A-A-G-T-CG-GCAA-T-TTTG-----A---T-------------TC---T-GA--GATT-T-T--AGTC-TCAG---AA--GTTTT--ATAAA
gi|10 : atatgaacaggttcagaaataatacgttatcatcaaagtatgcac-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--C------AGT---A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------T-A-----A-TTT--AC-----AT-T--A-----AAAAAAAACACATT---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AATAA-----CCATCGAT--TTCAATGATAAAC-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C--------AA--A-AAT-----A----T---AC---TT---TTTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TG--------------------TT-A--A--A-A-A-T-T---CA----CTAA-----AG--C----T--G--G-GTC---T-GT--G-TT-T-T--TGAC-TCAG---AG--GTTTG--ATAAAttt
gi|11 : tcatcaaaaactcacaA-AC--TTA----CT---AG-A-----CT-A------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------A-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--GCATTT--TGCTT---T---AT-AAAAA-----TAATCAAT--TTTAATGTTACAT-T---AT---TA-------------------------T---A--AA--A-AAT-----A----T---TT---CT---TTCAACT---AAAT------------C---A--TT--GTTA-----------T-AA-ATTAG-TA--------------------TT-T--T--G-G-A-T-TA-ACAA-A-ATTG-----AGT-T----T--G--A-GTA---T-TA--G-TT-T-T--ACAC-T-AA---AA--ATTGT--ATGAtt
gi|12 : cgtgaaaatgtggagtcttTAAATT-CAT-C--AA-AT--GTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TCTGATTCAA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-GG-------T-A-----A-TTT--GA-----AT------------AC---------C---A---G--T----------A-GAAAATT---TAA---C-A--TCATTT--T--TT---T---GT-AAAGA-----CAATCAAT--TTCAATGTTACGT-T---AT---TAGAAAATATCAA------AATAT-C-T---A--AA--A-AA------A----C---GT---TT---T---ACT---AGA-------------C----TAAT--GATA-----------A-TA-AATAG-CA--------------------TT-A--AT-A-A-A-T-CA-GCAA-T-TTTG-----AG--T-------------TT---T-GA--GTTT-T-T--AAAT-ACAG---TA--ATGTT--ATGAA
gi|13 : -----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------C--------C--T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--TC-----AAAT--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-TTAA------TAA---T-A--ACGTTT--T--GT---C---ACAAAAAA-----CATTCGAT--TTCAGTGTTACAT-T---AT---CAG--------AG------AATAT-C-T---A--AA--ACAAT-----A----A---TT---AT---TCTAGCG---AAA-------------C---A-TTT--GCTA-----------T-TA-AGTAG-TA--------------------AT-T--A--A-A-A-A-TG-ATAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--GCGTC---T-GA--GATT-T-T--A
gi|14 : tttcattaaaaaaaatttagtaaaaaaacaaaC-TC------AA------A------T--------G--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------A-A-----A-TAT----------T-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AA-GGAT--T---GAA---T-A--ACATTT--TTTCT---T---AC-ACAAA-----CAGTCAAT--GTCAATGATACAT-T---ATC--CAA--------AA------AACAC-C-CCA-A--AA--A-AACCGG--A----C---AT---TT---T-TAATG---ATA-------------T---ATTTT--ACTACATGATTGTATT-TT-AAAAT-TA--------------------TT-T--A--A-A----------AA-C-CTGA-----AA--T----T--G--A-GCC---T-GG--G-TT-T-T--AGAC-ACAA---AA--GTTTA--ATGAA
gi|15 : ttatttttagtT-A------A----G------AC-TC------GG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------A--------------C-------------T-GAAATAATAT-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----ATAA-----------------A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA----------ATTT--T--TT---T---GC-TAAAA-----CAGACAAT--TTAAATGTCATTT-T---AT---TTG--------AA------AATAT-C-T---A--AT--A-AAT-----A----C---TA---ATAAATATTACT---AAA-------------C----CTTT--GCTA-----------T-AA-GATAG-TA--------------------TT-T--G--ATA-G-T-TA-GCAA-T-TTTGT----GG--T----T--G--A-GTC---T-GA--GTTT-T-T--AGAC------------GTTTT--ATGAAta
gi|16 : tcaaaatATG-CAT-C--GA-AC--TTT-----G---AG-T-----CT-A------A----A------TT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------C--------T--------------T-------------T-A----------A-----A-TAT--GA-----AT-TTTG-----AAA------------------------TTTGC--A--------T---TAA---A-A--ACAATT--T--TT---T---TA-AGAAA-----TG----AT--TTCAATGATACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-A-T---C--AA--A-AAA-----A----C---AT---TT---T-TAGCT---AAA-------------T---AATTT--GCTA-----------T-TA-AATAG-TA--------------------TC-TAAA--A-A-A-T-CG-GCAT-T-ACAG-----AGT-T----T--G--A-GTC---C-GG--G-AT-T-T--AGATATTAA---AA--AATTG--ATGttca
gi|17 : atcat-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------T--------C--C------A-----ATCTCATGTTTCTA-------ACAT-----T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTC--AT-----CT-T--AT----CAAA---------C---ATTTA--T--TTTAC--AT-GCAA--T---TCA---C-A--ACGTTT--T--CT---T---TC-AGAAA-----CTGTCAAT--TTCAATGTGTTAT-T---AT---TTG--------AA------CATTT-C-T---T--AA----------------------------------AACT---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TA--------------------TT-T--AC-A-A-A-T-TG-ATAG-T-TTTC-----AG--T----T--G--A-GTT---T-GA--GTTT-T-T--AGAC-TCAA---AC--ATTTT--AAGAA
gi|18 : TGAATC-AAT-A--AA-AG--TTC----TG---AG-T-----AT-A------A----A------ACCTC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAA------------------------TTCAC--AA-GAA--------AA---G-A--ACA--------------------AAAAA------AATCGAT--TTCAGTGAAACAT-G---AT---CAG--------AA------AACAT-G-T---A--GA--A-AGA-----A----C----T---TT---TTTAAAG---AAA-------------A---AATTT--GCTA-----------T-TA-AAAAA-TG--------------------------A--A-ATA-T-CG-GCAA-T-TCTA-----AGTTT----T--G--A-GAC---T-AAACA-TT-T-TGAAGCT-TAAA---AA--GTTTG--ATGgttt
gi|19 : accAATT-CAA-C--AA-AG--AGT----TG---AG-C-----CT-A------A----A------AC-TC------
gi|19 : aaaatctgatattgaaactagacatt-----AAAA---------C----------T--CCTAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--ACATTA--T--CG---T---AC-AAAAA-----CAATTATT--TACCAGGGTATAT-T---AT---CA---------AA------AGTA--------A--AA--A-AATTAATAA----C---AT---TT---TG--AGT---ACA-------------T---ATTTT--GCTA-----------C-CA-AAAAG-TA--------------------TT-A--G--A-A-T-T-CG-GTAA-T-TCTG-----AG--T----TG-G--A-GTCTAGT-AG--G-TT-A-T--AAAC-ACCA---AA--GTTTT--ctacaagaaataaacaacattatcgtacaaaaacaattatttaccagggtatattatcaaaagtaaaaaaattaataacattttgagtacatattttgctaccaaaaagtattagaattcggtaattctgagttggagtctagtaggttataaacaccaaagtttta
gi|2 : aaaatctgatattgaaactagacattaattcaacaaagagttgagcctAATT-CAT-C--AAGAC--TTTATTGTGTTCAG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AGGTCCAAA------C--------A--C------A-----A------------A-------A--------TCTTGACATA-----T-------------T-G--------T-T-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---G--T--TATAC--TA-GAAA--T---TAA---C-A--ATATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCATTGATACGT-T---AT---CAG--------AA------AATATAC-T---A--AA--A-AGT-----A---------T---CT---TAT--CT---GTA-------------T---ATTTT--GCCA-----------TCTA-A--AG-TA--------------------TT-GA-A--A-A-A-T-CG-GCAA-
gi|20 : c---AG-T-----CT-AT-----A----A------AA-TC------AA------AATCGATC--------T--C------G-----A------------A-------A--------TCTAAATTTT-----T-------------T-T--------T-A-----A-TTA--GC-----CT-T--A-----AAAAAA-------C---A---G--T--TTTAC--AA-TAAG--T---TAA---A-A--A-GTTT--T--CT---T---GC-AAAAT-----CAGTCAAT--ATCAATGTTATTT-T---AT---TAC--------AA------AATAT-T-T---A--AA--A-AAT-----A----A---GT---TG---TGTTACT---GAA-------------T---G-TTT--GCTA-----------T-TA-AGCAG-T--------------------------------------------A-T-TTTG-----AG--T----T--C--AGGTC---A-GA--G-TTGT-G--AGAC-T-AA---AG--ATTTG--ATGAAaactatatttaaacaaatacatctaaaagatttataaataatttctatga
gi|21 : TACATT-CAT-C--AA-AG--TTT----CG---AA-T-----CC-A------A----A------TC-TC------AG------A------C--------T--CGCTC--A-----A------------A-------A--------TCATAAATT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAAA---------C---A---A--A--TTCAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--A-A-TT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CTATCAAT--TTC-AT-TTGCA--T---ATTTACAT--------AA------AATAT-A-T---A--GA--A-AA---------------AT---TT---TTTAA--------------------------------------------------A-ATCAG-TA--------------------AT-T----------------GTAA-T-GT-----------T----T--G--A-GTC---T-GG--G-TA-T-A--AAGC-TCAA---AA--GTTTG--ATGAAttt
gi|22 : tTAGATT-CAT-C--AC-AG--TGT----TG---AG-A-----CTCA------A----A------AC------------------------C--------T--G------A-----A------------A-------A--------T--------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----A--------------------------------A--T--TTTAC--AA-AAAAAAT---GGA---C-A--ACATTT--TT-CC---T---ACTAAAAC-----CAACCAAT--TTCCATGTTG--------AT-----G--------AA------AATAT-AAG---A--AA--A-AAT-----A----C---AT---TT---TTTA--TG--AAA-------------T---ATTCC--GCT------------C-TA-AAAAG-TA--------------------AT-T--A--A-A-A-T-GG-GCAA-T-TCTG-----AGT-T----T--G--A-GTC---A-GA--G-TT-T-T--AAAC-TCAA---AA--Gt
gi|23 : C------AC------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------A-A-----A-TT----------------------AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AC-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---C---GC-AAAAA-----CAGTCATT--TTCAGTGTAACAT-T---AT---CAA--------AC------AATAT-C-T-------A--A-AAT-----A----T---GT---TT---TCTAATT---AAA-------------C---G-TTA--GCTA-----------T-TA-AACAG-T--------------------------------A-A-T----GC-------TG-----AGT-T----T--G--A-TTC---A-GT--G-TT-TGT--AGAC-TTAA---AC--GTGTT--cgaga
gi|24 : aagttaaccaagcttatttcgtatgaagatttccataTGAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TC---AT-T-----CT-A------A----A------AT-TC------AG------A------C--------TAACTG----A-----A------------A-------ATCTGAAATT--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----GTGT--T-----AAAA---------C---A---A--C--TTT-C--AA-G-----------A---C-A-------T--T--CT---T---GT-AAACT-----CAGTAAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---C-G--------AT------AATAT----------AATCA-AAT-----A----T---GT---TT---TGTAACT---GAA-------------C----TTTT---CTG-----------T-TA-A---------------------------------A--A-A-A-T-CG-GCAA-A-CTTG-----AGTTT----T--G----GTC---CAGA--G-TT-T-
gi|25 : ATT-CAT----AA-ACATTTT----TT---AT-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------T------G--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------CAAATAATCGGAAAT-G--------T-A-----A-AAA--GC-----AA-T--A-----AAAG---------C---A---A--T--TTGGT--AA-GACA--T---TAA---C-A--ACA----------------------AAA-----TAGTCAAT--TCAAATGTTACAT-T---AA---CAA--------AA------CATAA-C-T---A--AC--A-AAA-----A----C---GT---TT---TATAA-T---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TATAAAAA-AA--------------------TT-T--A--A-ATA-T-CG-GGAATT-TTTG-----GT--T----T--G--A-ATC---T-acaaattat
gi|26 : ------A----G------AT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------G-A-----A-TTTTGGA-----AT-T--GGCCTTGAAA---------C---A---A--T--TTT-C--AG-GATA--T---TAA---C-A--GCATTT--T--TC---A---GC-AAAGA-----CAGTTAAT--ATCAGTGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATTA-C-T------AT--A-AAC-----A----C---TT---GT---TAAAACT---AA------------------ATTTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TA--------------------TC-TA-A--A-A-A-T-TG-GTAA-T-TTTG-----AG--TC---T--G--A--TT---T-TA--A-TT-T-A--AGAT-TCAA---Ataa
gi|27 : taaattcTAAATT-GAT-C--AA-AC--ACT----TG------------CT-G------A----A------AA-TC------TG------A------T-------------------------------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GT-----AT-G--A-----AAAAT--------C---A---A--T--TTAAC--AA--AAA--C---TAGG--C-A--AGATAT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAA---TTCAATGATACAT-T---AT---CAG----------------AATAT-T-T---A--AA--A-A
gi|27 : tcagtctattggttacttcttgaccAGAA-TA--------------------TT-T--AA-A-A-A-T-TG-GCAG-TGTTTT-----AGT-T----T--T--A-GTC---C-GA--G-TT-T-C--AAAC-TCAG---AA--GTTttggcagtgttttagttttagtccgagtttcaaactcagaagttaaa
gi|28 : tcagtctattggttacttcttgacctaaattgatcaaacacttgctgaaaatctgatattttgtgatttgtatgaaaaatcaatttaacaaaaactaggcaagatattcctacaaaaacaatcaattcaatgatacattatc---AG-A-----CT-A------T----G------AT-TC------AA------A------A--------TA-C------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----AATTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-TAAA--T---TAA---T-A--TCATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAAAGTTGTCT-T---AT---CTG--------AA------AATAT-A-TATAA--AA--A-GAC-----A----C---GT---GC---TTT---T---AAA-------------C---GTTTaaa
gi|29 : atcaggggtttgaatttacaacaa-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TGTAC--AT-GAAA--T---TAA---A-T--ATACTT--T--CT---T---GC-TAAAA-----CAGTCAAT--TTAAATGTTCCAT-T---AT---TAG--------AA------ATTAT-C-A---A--AA--A-AAA-----G----T---GT---TT---TATAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TA-AATAA-TA--------------------TT-TA-A--A-A-A-T-TA-GCAA-T-TGTA-----AG--TTTTAT--A--A-GTC---T-GA--GTTT-T-T--GGAC-ACAA---AA--GTTTT--ATGgcaaattatagtcctggatacaatattttgttt
gi|3 : gcTAAATT-CATTC--AA-A---TTT----TA---AA-T-----CT-A------A----A------ATATC------CG------A------C--------T--G------A-----A------------ATTTAA--A--------T--------------TC------------T-G--------A-A-----A-TTTT-GTTATCTAT-TTCA-----AAAA---------T---A---A--T--TTAAT--A--GAAA--T---TAA---C-A--CCATTT--TGTCT---T---GC-AAACT-----CAGCCAGT--TTCAATGTTT--T-T---AT---TAG--------GA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAA-----A----T---GT---TT---TACAACA---TAA-------------C-----TTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TT--------------------TT-T--AAGA-A-A-T-AG-GACA-T-TTTT-----AG--TC---C--A--A-GTC---T-GA--GCTT-T-T--ATCC-TCAA---AG--GTTTT--ATAAtgtttaa
gi|30 : tA-GC--TGT----TG---AA-T-----CT-G------G----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TGTGAAATT------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---------G-G--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATAATT--TTTTATAACACAT-T---AT---CAG--------AA------TATAT-----------------AT-----A----C--------TT---TTTAACT---GAC-------------A---ATTTTGAGATA-----------T-TT-AACAG-TA--------------------TT-TG-A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AGA-T----T--G--A-GTC---T-GG--G-Ttttaa
gi|31 : --------T--C------A-----A------------G-------A--------TCA------------T-------------T-T--------T-A-----AATTT--CT-----AT-TT-A-----AAAA---------A---A---A--------AA--AA-AAAA--T---GAA---C-A--AAATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAACCAAT--TTCAATGATACCT-T---AA---AAG--------AA------AATAT-A-T---A--AA--A-AAA-----A----CCCAGT---TT---TTAAATTA--AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TC-GA-AG-TG--------------------TT-T--A--A-A-A-A-CG-TCAA-T-TCTA-----AG--T----T-------------T-GG--A-TT-T-A--AGAC-TAAA---AA--TTTTTTGATGAAa
gi|32 : TAAATT-TAC-A--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--CGGTCTGA-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---CAT--------AAAGC---AATAT-T-T---T--AT--A---------A----T---GA---TT---TATAATT---tt
gi|32 : cgtctatgtaatcttgaccTT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tttagtctcaaaggtttgatgaa
gi|33 : cgtctatgtaatcttgacctaaatttacaaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaattttgtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatattttataatgatttatTAAATT-CAC-C--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------GGTCTGA------------A-------A--------T--------------T-------------TAG--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---CAT--------AAAGC---AATAT-
gi|33 : acgtctatgtaatcttgaccT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tgttataatgatttataattttagtctcaaaggtttgatga
gi|34 : acgtctatgtaatcttgacctaaattcaccaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaatttagtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatatgttataatgatttat--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAAA--------T---A---T--T--TTTTC--AA-GAAA--T---GGA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATTAAT--ATTAATGATACAT-T---AC---CAG--------AA------GATAT-A-A---AT-AA--A-ATT-----A----C----T---TT---TTTAA-T---AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAC-TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-T-AG-GCAA-T-TGTG-----AGT-T----T--G--T-GTC---T-GG--G-TT-T-T--ATAT-TCAATTGAA--GTTTG--ATGAA
gi|35 : TAAATT-CCT-T--AA--C--TTT----TA---AG-T-----C---------G----A------AC-TC------AA------AGAAGT-C--------T---------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-A--------TTC-----A-TTT--GT-----AT----A-----AAAA---------C---A---A--A--TTTAT--AA-GAAAA-T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AAATA-AAT-----A----A---AT---TT---TGTAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TA-AACAG-TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-T-CA-GCtt
gi|36 : ctTAAATC-CAT-C--CA-A---TAT----TG---CG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--T------A-----A------------A-------A--------TAAAAAATGAACTT-T-------------C-G--------T-A-----A-TGT--GC-----AT-T--A-----AAAA-------------A----------------AA-GAAA--T---GAA---T-A--ATG-TT--T--CC---T---AC-AAAAC-----CAGTCATT--TTCAAAGATACGT-T---AT---CCG--------AA------AACA----------------------------------------T---TTTAACT---AAG-------------T---A-----------------------CA-AAAAG-TA--------------------TT-G--A--A-----------CAA-T---------------------------GTC---T-GG--G-TT-T-T--ACAC-TTAA---AA--GTTT
gi|37 : t----A------AT-TA------AA------A------T--------T--T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------TTG--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA-----------------------------C-AAAAA-----CAATAAAT-----AA---TACAT-T----T---------------A------AATAT-C-----A--GA--A-AAT-----AACATT---GT---TT---TTTTACC---AAA-------------C---ATTTT--G-TAT----------T-TA-AAATG-TATAAAATATAAAAAAAAGTTTTT-T--A--A-A-A-T-CT-CCAA-T-TCTG-----AAT-T----T--T--A-GTT---T-GG--A-TT-T-T--Ag
gi|38 : C------AG------A------CA-------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGTTTTT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---G--T--TTTGC--AA-GAAA--T---AAAACTT-A--ACATTT--T--TC---T---AG-AAAAG---------------TTCAATGACACAT-A---AT---TAG--------AA------AATGT-C-T---A--AA--A-ATT-----A----C---A----TT---TGTAACT---AAG-------------T---A-TTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-A-TGTTCAA---TTTG-----AG--T----
gi|39 : aaccaggctttca-------A--------T--------------T-------------T-A--------A-A-----A-TTT--AC-----AT-T--C-----AACA---------C---A---A--A--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--AAATGT--T--CA---T---AC-AAAAA------A--CAAG--TTCAATAATGTAT-T---TC---TAG--------AA------AA-AT-A-C---AACAA--A-AAA-----A----C---AT---TT-----TAACT---AAA-------------T---ATTGT--GCTA-----------T-CA-AA-AG-TAT-------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-G--A-G-TTTG-----A-----------------TC---T-GG--G-AT-T-T--ATAC-
gi|4 : aaatctgatgTAAATT-CAT-C--AA-TA--TTT----TG---AG-T-----GT--------------------------------G------A------C---------------------------------------------A--------T--------------T-------------TCA--------T-A-----A-TTT--AC-----AG-T--A-----ATAA---------C---A---C--T--TTTAT--AA-GAAA--G---TGG---C-A--ACATTT--C--CA---A---GC--AAAA-----CAATCAAA--TCCAATGATACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AGT-----A----A---AT---TT---TAAAACT---AAA-------------T---ATTTA--GCTA-----------T-TA-AAAGT-TT--------------------TT-T--A--A-A-A-gttgatt
gi|40 : ttagcttacaaacaattgcacctttaaaacagaaagaaagtttattatgaaccttcaac-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TTTAC--AA-AAAA--T---TAG---A-A--ACATAT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGACAAT--TTTAATGTTTCAT-T---TT---CAA--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-GAT-----A----T---GT---TT---TATAACT---AAA-----------------GTTTG--GATG-----------T-TA-----------------------------------A--A-A-A-T-TG-ACAA-T-TTTGGATTTAA--T----T--G--A-GTC---T-----G-TT-T-T--AGAC-T-AA---TT--TTTTT--ATGAAaatgtccaatatatgtat
gi|41 : -A-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------T---A---A--T--TT---------AAA--T---GAA---C-A--ACATTTCTT--TT---T---G--AAAAA-----CAGTCAGT--TTCAATGTTACAT-T---AA---TAG--------AA------AATAT-TGT---A--AT--A-AAT--------------GT---TT---TATAG-T---AAA-------------C----TGTT--GCTG-----------T-TT-AACTG-TA--------------------TT-T--G--A-A-A-T-TA-AAAA-C-ATTG-----TG--T----T--------TT-----------TT-T-T--GGAC--------AC--GTTTT--GTGAA
gi|42 : cTATATG-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----GT-A------A----A------AA-AC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGAAATT------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--GC-----AT-G--A-----AAGA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--TCATTT--T--CC---A---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCAATGATACATGTCAGAT---CAG--------AA------AATAT-ttt
gi|43 : ctAATT-CAT-C--AA-GC--TTT----TG---AA-T-----CT-A------A----A------AAATC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A--------------------------------------------------------------------C--GC-----A-----------AAAT---------CTGAA---A--T--TTT-------GAA----------------------TT--T--CT---T---GT-AAAAA-----CAGCCAAT--ATCAATATTACAT-T---AT---TAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAA-----AT---T---GT---TT---TGTCACA---AAA-------------CTA-ATTTT--GCTA-----------T-TA-AATAaatttccttt
gi|44 : tttAATT-CAT-C--AA-AC--CTT----TT---AG-T-----CT-T------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGGAATT------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--AT-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AATGAAA--T---TAG---C-A--AC-TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CTGTTAAT--TCCCATGTTATAT-T---AT---CAG--------AA------AATGT-C-TA--A--AA--A-AAT-----A----T---GT---Ta
gi|45 : tAGATT-CAT-C--A------TGT----CG---GGAT-----TT-A------A----ACTC---AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGAAATT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTTTAAT-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AG-GAAA--T---GAA---G-A--ACATTT--T--CT---T---AA-AAAAA-----AAA--AA------------ACA------AT---CCG--------AA------AATA----T---A--AA--A-AAT-----A----
gi|46 : caATTT--T--CT---T---GC-AAACA-----CAATCAAT--TTCAATGTGACGT-T---TA---CAG--------GAAATAACAATAT-T-T---G--AA--T-AAT-----A----CA--GC---TT-----TAACTAGAAAG-------------G---ATTCT--GC-A-----------A-TA-AGGTT-TC--------------------TT-T--A--A-A-A-A-TG-ACAG-T-TCAG-----AG--T----TC-G--A-GTC---T-GA--C-TG-T-A--AGAC-Ttcatt
gi|47 : TGAATT-CAT-T--CA-AG--TAT----TG---GG-T-----CC-A------A----A------AC-TG------A-------A------C--------T---------------------------------------------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GATT--T---GGA---C-A--ACATTT--C--AC---T---GC-AAAAAAAACCCAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---AT---CAT--------AA------AAT
gi|48 : tggaccT-CAT-C--AC-AT--TTT----TG---AG-TAATATCT-G------ACTTGA------CC-TC------AA------AAT----C--------T--T------A-----C------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---G--T--ATTTC--AA-GAAG--T---GAA---C-A--GCATTG--T--CT---A---GC-AGAAA-----CAttaaac
gi|49 : -TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------C--------------C-------------T-GATTTTCTTT-T-----A-TTT--GC-----A-----A-----TAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-GAAA--T---TAA---C-A--AGCCTA--T--CT---T---GC-AAAAA-----GAGTAAAT--TGTAATGTTATAT-T---AT---CAGA-------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-Aaataagaatacgttttataa
gi|5 : T-CAT-C--AA-GC--ATT----TG---AA-T-----CT-ACATCCCA----G------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-GACA-----T-ATTTTCA-TTT--GA-----AT-G--A-----ATAA---------C---A---A--C--TTTAC--A--GTAT--T---TTT---T-TTTATATTT--T--CT---T---GC-TTCTA-----TAACCAAT--TTCAATG---CAT-T---AT---CAT--------AT------TATAT-C-T---A--AA--A-ATT-----A----C---A----TT---CATAACT---AAA-------------T---ATTTT--GCTG-------------CA-AAAAT-TT--------------------TT-T-----------T-T-------T-TTTG-----AA--A----T--GGCA-ATT---T-AA--G-TT-T-C--AGAC--CAA---AAATGTTTT--ATGA
gi|50 : TAGATT-CAT-C----------TC----AG---AA-T-----CC-A------A----A----------C------A--------------T--------T--T------A-----A------------C-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TCT--GC-----AT-T--A-----GAAA---------C---A---A--T--ATTTC--AG-GGAA--T---TGA---C-T--ACATGT--T--CTTCCT---GC-AAAAA-----AA--CAATGATTCAttgcaagccctg
gi|51 : aTGAGTT-CAT-CGAAA-AC--TCG-----G---AT-T-----C---------A----A------AC-TC------AA------AAA----C--------T--G------A-----T------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--------AAAA---------C---A---T--TTCTTTAC--AA-GAAA--TGTATAA---C-ctatgaaac
gi|52 : taattcagtgtaAT-T---TT---AAA--------AA------AATAC--------------A-AAT-----A----C---GTACATT---TTTAACA---TAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TA--------------------CT-T--A--AGA-A-T-CG-ACAA-T-TCTG-----AG--T----
gi|53 : taattaatga--TTTAC--AA-GGAA--T---GAA---C-A--ATATTT--T--CC---TAAAAA-AAAAA-----AAATAAAT--TCCAATGATACTT-T---AT---CAG--------AA------TAAAT-C---------G--A-ATT-----A----C---AC---TT---TTTAACT---atgtgt
gi|54 : TGAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------TG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----AAAC---------C---A---A--A--TTTTCTAAA-GAAA--
gi|55 : tAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------CG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----TAAC---------C---A---AATT--TTCTC--AA-GAAA--
gi|57 : tTTTT--GCTA-----------T-TA-AACA--TA--------------------TTAA--A--A-A-A-T-CG-ACAA-T-TTTT-----AGT-T----T--G--A-GGC---T-GA--G-TT-T-T--AAGC-CC
gi|58 : cA-------------C---ATTTT--CCTA-----------T-TA-AA-AC-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-TTCA-GCAA-T-TCAG-----AG--T----TT-G--A-GTC---T-GG--G-TG-T-T--AGGC-TCAA---TA--GTTGG--ATGGAtgaacctcttaaacgtt
gi|59 : ---AAA-------------T---ATTTC--GCTA-----------T-TA-AAATG-TA--------------------TT-T--A--A-A-G-T-TG-GCAT-T-TCTG-----AGT-T----T--G--A-GTC---T-TA--G-AA-T-T--GGAC-TCAA---AA--
gi|6 : taTAAATT-TAT-C--AA------------TG---AG-C-----TT-A---------------------TC------AA------A------A--------TG-T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GT-----AT-T--A-----TTAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--AA--TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---GT---TAG--------AA------ATTAT-C-T---A--AA--A-TCT-----G----C---AT---TT---TATAACT---ACATGTATATACATTGT---ATTTT--GATG-----------T-TT-AAATG-TA--------------------TT-T--A--A-A-C-A-AG-GAAA-A-TTTG-----AC--T----T--G--A-GTC---G-GA--T-GC-T-T--AGAC-TCTA---AA--
gi|60 : cc--TTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TT------GA------A------A--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTC--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTAAC--AA-AAAG--T---TAA---ttctga
gi|62 : AAA--T---CAA---CCA--A-------T--CT---T---AC-AAAAG-----CAGTCAGT--TGCAATGTTTCAC-T---AT---CAG--------AA------AATGT-G-T---A--AA--
gi|7 : TAAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--AGATTT--C--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--GTCACTGTTAAAC-T---AC---CAT--------CA------AATAT-C-T---A--AA--C-AAT-----A----T---GG---TT---TCTGACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTG-----------T-TT-AATAA-TA--------------------TT-C--A--G-A-G-T-CA-ACAA-T-TTTG-----AG--T----TAAG--A-GTC---A-GA--T-TT-TGT--AGAC-TCAA---AA--GTATT--ATGAA
gi|8 : TAAACT-TAT-T--CA-AC--GTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AA-TC------AG------T------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCAAAATCTGAAATTT-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------T---A---T--T--TTTAC--AA-AAAA--T---T---------------T--T--CT---T----C-AAAAA-----AA---AAA--TTCAATGTAACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---C--AA--A-TAT-----A----T---GT---TT---TAT-ATT---GAA-------------CTAGATTTT--GCTA-----------T-TA-ACTTA-TA--------------------TT-T--A--A-A-ATT-CG-ATAA-TATTTA-----TT--T----T--C--A-ATC---T-GA--G-AT-T-T--AGAC-TCAA---AT--ATTTT--AT
gi|9 : ctATT-CAT-C--AA-TC--TTT----TG---AT-T-----CT-A------A----ATGTCAGAC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------ATTCTGAAA--------T--------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--GC-----TT-A--A-----AAAA---------T---A---A--T--TTTAT--AA-GAAA--T---TGA---C-A-----TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----TATTCAAT--TTCAAGGTTACAT-T---AT---TAG----------------AATAT-C-T---A--AAT-A-AAA-----A----G---GT----------TA------AAA-------------C---A-CTT--GCTA-----------T-TC-TTTTGCTA--------------------TT-T-------A-C-T-CT-GCAA-T-TTTGA----AA--T----T--G--A-GTT---T-GA--G-TA-C-T--AGAA-TGAA---AA--GATTT--ATGAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|56 ): AAAACAAAACTTTTAAACTGAAATTAACAGTTACTAGATATATTTCGAAAAGGAGACAAAGAAATGCTAGCGAGAATCGT
Unaligned ( gi|61 ): GAATTGATGCTTGTGGAACAATTTTTGGGTATTAAAAACTTTTTCAAGCCAAGACAGTTTACATC
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111 11
lowQualScore : 2 1 11 1 222 2222 111 1 22222 0 333333 1111 444444 2 222222 4444444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 4 88888888 0 11111 1 22 11111 1 33333333 5555555555 111 111 11 11 11 0 22 5555 222 0 11 11 33 111 1111 1 22222 2 11 4 0 111 222 33333333 555555 7777777777 33 0 444444 888888888 111 111 5 333 4444444444444444444 11 55555555555 0 0 4 0 88888888888888888888 0 88888 1 1 0 2222 1 2 44444 22 4444 44444 2 111 1 11 7 1 2 11 1 0 222 11 22
lowQualScore : . . .. . ... .... ... . ..... . ...... .... ...... . ...... ....... ............................................................................ ............. . ........ . ..... . .. ..... . ........ .......... ... ... .. .. .. . .. .... ... . .. .. .. ... .... . ..... . .. . . ... ... ........ ...... .......... .. . ...... ......... ... ... . ... ................... .. ........... . . . . .................... . ..... . . . .... . . ..... .. .... ..... . ... . .. . . . .. . . ... .. ..
lowQualScore : 4 2 66 1 888 3333 888 0 44444 9 555555 9999 111111 6 444444 1111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3333333333333 1 00000000 8 99999 5 99 99999 5 99999999 6666666666 333 333 00 00 00 7 77 3333 111 8 11 11 99 333 8888 5 77777 6 11 2 8 444 222 66666666 000000 2222222222 11 9 888888 999999999 666 666 0 444 7777777777777777777 33 33333333333 9 9 9 9 55555555555555555555 9 11111 9 9 9 8888 0 0 55555 88 1111 88888 1 888 1 55 6 1 2 66 2 4 333 99 33
consensus : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---T-GA--G-TT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
Reference ( family-3145 ) : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---T-GA--G-TT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
gi|1 : AAAT--CA--C--AA-AC--TTT----C----AG-A-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------AAA------T--G------A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAG----------C---A---A--C--TTTGT--AA-GAAA--T---GTG---T-A--ACATGT--T--CT---C---GC-AAAAAT----CAGTCAAT--TTCAATGTTACTT-T---AA---CAG--------AA------AAATT-C-T---T--AC--A-AAT-----A----C---TC---AT---TATAATC---AAA-------------C----TTTT--GCT------------T-TA-----------------------------------A--A-A-G-T-CG-GCAA-T-TTTG-----A---T-------------TC---T-GA--GATT-T-T--AGTC-TCAG---AA--GTTTT--ATAAA
gi|10 : atatgaacaggttcagaaataatacgttatcatcaaagtatgcac-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--C------AGT---A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------T-A-----A-TTT--AC-----AT-T--A-----AAAAAAAACACATT---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AATAA-----CCATCGAT--TTCAATGATAAAC-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C--------AA--A-AAT-----A----T---AC---TT---TTTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TG--------------------TT-A--A--A-A-A-T-T---CA----CTAA-----AG--C----T--G--G-GTC---T-GT--G-TT-T-T--TGAC-TCAG---AG--GTTTG--ATAAAttt
gi|11 : tcatcaaaaactcacaA-AC--TTA----CT---AG-A-----CT-A------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------A-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--GCATTT--TGCTT---T---AT-AAAAA-----TAATCAAT--TTTAATGTTACAT-T---AT---TA-------------------------T---A--AA--A-AAT-----A----T---TT---CT---TTCAACT---AAAT------------C---A--TT--GTTA-----------T-AA-ATTAG-TA--------------------TT-T--T--G-G-A-T-TA-ACAA-A-ATTG-----AGT-T----T--G--A-GTA---T-TA--G-TT-T-T--ACAC-T-AA---AA--ATTGT--ATGAtt
gi|12 : cgtgaaaatgtggagtcttTAAATT-CAT-C--AA-AT--GTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TCTGATTCAA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-GG-------T-A-----A-TTT--GA-----AT------------AC---------C---A---G--T----------A-GAAAATT---TAA---C-A--TCATTT--T--TT---T---GT-AAAGA-----CAATCAAT--TTCAATGTTACGT-T---AT---TAGAAAATATCAA------AATAT-C-T---A--AA--A-AA------A----C---GT---TT---T---ACT---AGA-------------C----TAAT--GATA-----------A-TA-AATAG-CA--------------------TT-A--AT-A-A-A-T-CA-GCAA-T-TTTG-----AG--T-------------TT---T-GA--GTTT-T-T--AAAT-ACAG---TA--ATGTT--ATGAA
gi|13 : -----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------C--------C--T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--TC-----AAAT--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-TTAA------TAA---T-A--ACGTTT--T--GT---C---ACAAAAAA-----CATTCGAT--TTCAGTGTTACAT-T---AT---CAG--------AG------AATAT-C-T---A--AA--ACAAT-----A----A---TT---AT---TCTAGCG---AAA-------------C---A-TTT--GCTA-----------T-TA-AGTAG-TA--------------------AT-T--A--A-A-A-A-TG-ATAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--GCGTC---T-GA--GATT-T-T--A
gi|14 : tttcattaaaaaaaatttagtaaaaaaacaaaC-TC------AA------A------T--------G--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------A-A-----A-TAT----------T-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AA-GGAT--T---GAA---T-A--ACATTT--TTTCT---T---AC-ACAAA-----CAGTCAAT--GTCAATGATACAT-T---ATC--CAA--------AA------AACAC-C-CCA-A--AA--A-AACCGG--A----C---AT---TT---T-TAATG---ATA-------------T---ATTTT--ACTACATGATTGTATT-TT-AAAAT-TA--------------------TT-T--A--A-A----------AA-C-CTGA-----AA--T----T--G--A-GCC---T-GG--G-TT-T-T--AGAC-ACAA---AA--GTTTA--ATGAA
gi|15 : ttatttttagtT-A------A----G------AC-TC------GG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------A--------------C-------------T-GAAATAATAT-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----ATAA-----------------A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA----------ATTT--T--TT---T---GC-TAAAA-----CAGACAAT--TTAAATGTCATTT-T---AT---TTG--------AA------AATAT-C-T---A--AT--A-AAT-----A----C---TA---ATAAATATTACT---AAA-------------C----CTTT--GCTA-----------T-AA-GATAG-TA--------------------TT-T--G--ATA-G-T-TA-GCAA-T-TTTGT----GG--T----T--G--A-GTC---T-GA--GTTT-T-T--AGAC------------GTTTT--ATGAAta
gi|16 : tcaaaatATG-CAT-C--GA-AC--TTT-----G---AG-T-----CT-A------A----A------TT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------C--------T--------------T-------------T-A----------A-----A-TAT--GA-----AT-TTTG-----AAA------------------------TTTGC--A--------T---TAA---A-A--ACAATT--T--TT---T---TA-AGAAA-----TG----AT--TTCAATGATACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-A-T---C--AA--A-AAA-----A----C---AT---TT---T-TAGCT---AAA-------------T---AATTT--GCTA-----------T-TA-AATAG-TA--------------------TC-TAAA--A-A-A-T-CG-GCAT-T-ACAG-----AGT-T----T--G--A-GTC---C-GG--G-AT-T-T--AGATATTAA---AA--AATTG--ATGttca
gi|17 : atcat-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------T--------C--C------A-----ATCTCATGTTTCTA-------ACAT-----T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTC--AT-----CT-T--AT----CAAA---------C---ATTTA--T--TTTAC--AT-GCAA--T---TCA---C-A--ACGTTT--T--CT---T---TC-AGAAA-----CTGTCAAT--TTCAATGTGTTAT-T---AT---TTG--------AA------CATTT-C-T---T--AA----------------------------------AACT---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TA--------------------TT-T--AC-A-A-A-T-TG-ATAG-T-TTTC-----AG--T----T--G--A-GTT---T-GA--GTTT-T-T--AGAC-TCAA---AC--ATTTT--AAGAA
gi|18 : TGAATC-AAT-A--AA-AG--TTC----TG---AG-T-----AT-A------A----A------ACCTC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAA------------------------TTCAC--AA-GAA--------AA---G-A--ACA--------------------AAAAA------AATCGAT--TTCAGTGAAACAT-G---AT---CAG--------AA------AACAT-G-T---A--GA--A-AGA-----A----C----T---TT---TTTAAAG---AAA-------------A---AATTT--GCTA-----------T-TA-AAAAA-TG--------------------------A--A-ATA-T-CG-GCAA-T-TCTA-----AGTTT----T--G--A-GAC---T-AAACA-TT-T-TGAAGCT-TAAA---AA--GTTTG--ATGgttt
gi|19 : accAATT-CAA-C--AA-AG--AGT----TG---AG-C-----CT-A------A----A------AC-TC------
gi|19 : aaaatctgatattgaaactagacatt-----AAAA---------C----------T--CCTAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--ACATTA--T--CG---T---AC-AAAAA-----CAATTATT--TACCAGGGTATAT-T---AT---CA---------AA------AGTA--------A--AA--A-AATTAATAA----C---AT---TT---TG--AGT---ACA-------------T---ATTTT--GCTA-----------C-CA-AAAAG-TA--------------------TT-A--G--A-A-T-T-CG-GTAA-T-TCTG-----AG--T----TG-G--A-GTCTAGT-AG--G-TT-A-T--AAAC-ACCA---AA--GTTTT--ctacaagaaataaacaacattatcgtacaaaaacaattatttaccagggtatattatcaaaagtaaaaaaattaataacattttgagtacatattttgctaccaaaaagtattagaattcggtaattctgagttggagtctagtaggttataaacaccaaagtttta
gi|2 : aaaatctgatattgaaactagacattaattcaacaaagagttgagcctAATT-CAT-C--AAGAC--TTTATTGTGTTCAG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AGGTCCAAA------C--------A--C------A-----A------------A-------A--------TCTTGACATA-----T-------------T-G--------T-T-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---G--T--TATAC--TA-GAAA--T---TAA---C-A--ATATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCATTGATACGT-T---AT---CAG--------AA------AATATAC-T---A--AA--A-AGT-----A---------T---CT---TAT--CT---GTA-------------T---ATTTT--GCCA-----------TCTA-A--AG-TA--------------------TT-GA-A--A-A-A-T-CG-GCAA-
gi|20 : c---AG-T-----CT-AT-----A----A------AA-TC------AA------AATCGATC--------T--C------G-----A------------A-------A--------TCTAAATTTT-----T-------------T-T--------T-A-----A-TTA--GC-----CT-T--A-----AAAAAA-------C---A---G--T--TTTAC--AA-TAAG--T---TAA---A-A--A-GTTT--T--CT---T---GC-AAAAT-----CAGTCAAT--ATCAATGTTATTT-T---AT---TAC--------AA------AATAT-T-T---A--AA--A-AAT-----A----A---GT---TG---TGTTACT---GAA-------------T---G-TTT--GCTA-----------T-TA-AGCAG-T--------------------------------------------A-T-TTTG-----AG--T----T--C--AGGTC---A-GA--G-TTGT-G--AGAC-T-AA---AG--ATTTG--ATGAAaactatatttaaacaaatacatctaaaagatttataaataatttctatga
gi|21 : TACATT-CAT-C--AA-AG--TTT----CG---AA-T-----CC-A------A----A------TC-TC------AG------A------C--------T--CGCTC--A-----A------------A-------A--------TCATAAATT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAAA---------C---A---A--A--TTCAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--A-A-TT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CTATCAAT--TTC-AT-TTGCA--T---ATTTACAT--------AA------AATAT-A-T---A--GA--A-AA---------------AT---TT---TTTAA--------------------------------------------------A-ATCAG-TA--------------------AT-T----------------GTAA-T-GT-----------T----T--G--A-GTC---T-GG--G-TA-T-A--AAGC-TCAA---AA--GTTTG--ATGAAttt
gi|22 : tTAGATT-CAT-C--AC-AG--TGT----TG---AG-A-----CTCA------A----A------AC------------------------C--------T--G------A-----A------------A-------A--------T--------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----A--------------------------------A--T--TTTAC--AA-AAAAAAT---GGA---C-A--ACATTT--TT-CC---T---ACTAAAAC-----CAACCAAT--TTCCATGTTG--------AT-----G--------AA------AATAT-AAG---A--AA--A-AAT-----A----C---AT---TT---TTTA--TG--AAA-------------T---ATTCC--GCT------------C-TA-AAAAG-TA--------------------AT-T--A--A-A-A-T-GG-GCAA-T-TCTG-----AGT-T----T--G--A-GTC---A-GA--G-TT-T-T--AAAC-TCAA---AA--Gt
gi|23 : C------AC------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------A-A-----A-TT----------------------AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AC-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---C---GC-AAAAA-----CAGTCATT--TTCAGTGTAACAT-T---AT---CAA--------AC------AATAT-C-T-------A--A-AAT-----A----T---GT---TT---TCTAATT---AAA-------------C---G-TTA--GCTA-----------T-TA-AACAG-T--------------------------------A-A-T----GC-------TG-----AGT-T----T--G--A-TTC---A-GT--G-TT-TGT--AGAC-TTAA---AC--GTGTT--cgaga
gi|24 : aagttaaccaagcttatttcgtatgaagatttccataTGAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TC---AT-T-----CT-A------A----A------AT-TC------AG------A------C--------TAACTG----A-----A------------A-------ATCTGAAATT--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----GTGT--T-----AAAA---------C---A---A--C--TTT-C--AA-G-----------A---C-A-------T--T--CT---T---GT-AAACT-----CAGTAAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---C-G--------AT------AATAT----------AATCA-AAT-----A----T---GT---TT---TGTAACT---GAA-------------C----TTTT---CTG-----------T-TA-A---------------------------------A--A-A-A-T-CG-GCAA-A-CTTG-----AGTTT----T--G----GTC---CAGA--G-TT-T-
gi|25 : ATT-CAT----AA-ACATTTT----TT---AT-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------T------G--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------CAAATAATCGGAAAT-G--------T-A-----A-AAA--GC-----AA-T--A-----AAAG---------C---A---A--T--TTGGT--AA-GACA--T---TAA---C-A--ACA----------------------AAA-----TAGTCAAT--TCAAATGTTACAT-T---AA---CAA--------AA------CATAA-C-T---A--AC--A-AAA-----A----C---GT---TT---TATAA-T---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TATAAAAA-AA--------------------TT-T--A--A-ATA-T-CG-GGAATT-TTTG-----GT--T----T--G--A-ATC---T-acaaattat
gi|26 : ------A----G------AT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------G-A-----A-TTTTGGA-----AT-T--GGCCTTGAAA---------C---A---A--T--TTT-C--AG-GATA--T---TAA---C-A--GCATTT--T--TC---A---GC-AAAGA-----CAGTTAAT--ATCAGTGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATTA-C-T------AT--A-AAC-----A----C---TT---GT---TAAAACT---AA------------------ATTTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TA--------------------TC-TA-A--A-A-A-T-TG-GTAA-T-TTTG-----AG--TC---T--G--A--TT---T-TA--A-TT-T-A--AGAT-TCAA---Ataa
gi|27 : taaattcTAAATT-GAT-C--AA-AC--ACT----TG------------CT-G------A----A------AA-TC------TG------A------T-------------------------------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GT-----AT-G--A-----AAAAT--------C---A---A--T--TTAAC--AA--AAA--C---TAGG--C-A--AGATAT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAA---TTCAATGATACAT-T---AT---CAG----------------AATAT-T-T---A--AA--A-A
gi|27 : tcagtctattggttacttcttgaccAGAA-TA--------------------TT-T--AA-A-A-A-T-TG-GCAG-TGTTTT-----AGT-T----T--T--A-GTC---C-GA--G-TT-T-C--AAAC-TCAG---AA--GTTttggcagtgttttagttttagtccgagtttcaaactcagaagttaaa
gi|28 : tcagtctattggttacttcttgacctaaattgatcaaacacttgctgaaaatctgatattttgtgatttgtatgaaaaatcaatttaacaaaaactaggcaagatattcctacaaaaacaatcaattcaatgatacattatc---AG-A-----CT-A------T----G------AT-TC------AA------A------A--------TA-C------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----AATTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-TAAA--T---TAA---T-A--TCATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAAAGTTGTCT-T---AT---CTG--------AA------AATAT-A-TATAA--AA--A-GAC-----A----C---GT---GC---TTT---T---AAA-------------C---GTTTaaa
gi|29 : atcaggggtttgaatttacaacaa-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TGTAC--AT-GAAA--T---TAA---A-T--ATACTT--T--CT---T---GC-TAAAA-----CAGTCAAT--TTAAATGTTCCAT-T---AT---TAG--------AA------ATTAT-C-A---A--AA--A-AAA-----G----T---GT---TT---TATAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TA-AATAA-TA--------------------TT-TA-A--A-A-A-T-TA-GCAA-T-TGTA-----AG--TTTTAT--A--A-GTC---T-GA--GTTT-T-T--GGAC-ACAA---AA--GTTTT--ATGgcaaattatagtcctggatacaatattttgttt
gi|3 : gcTAAATT-CATTC--AA-A---TTT----TA---AA-T-----CT-A------A----A------ATATC------CG------A------C--------T--G------A-----A------------ATTTAA--A--------T--------------TC------------T-G--------A-A-----A-TTTT-GTTATCTAT-TTCA-----AAAA---------T---A---A--T--TTAAT--A--GAAA--T---TAA---C-A--CCATTT--TGTCT---T---GC-AAACT-----CAGCCAGT--TTCAATGTTT--T-T---AT---TAG--------GA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAA-----A----T---GT---TT---TACAACA---TAA-------------C-----TTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TT--------------------TT-T--AAGA-A-A-T-AG-GACA-T-TTTT-----AG--TC---C--A--A-GTC---T-GA--GCTT-T-T--ATCC-TCAA---AG--GTTTT--ATAAtgtttaa
gi|30 : tA-GC--TGT----TG---AA-T-----CT-G------G----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TGTGAAATT------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---------G-G--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATAATT--TTTTATAACACAT-T---AT---CAG--------AA------TATAT-----------------AT-----A----C--------TT---TTTAACT---GAC-------------A---ATTTTGAGATA-----------T-TT-AACAG-TA--------------------TT-TG-A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AGA-T----T--G--A-GTC---T-GG--G-Ttttaa
gi|31 : --------T--C------A-----A------------G-------A--------TCA------------T-------------T-T--------T-A-----AATTT--CT-----AT-TT-A-----AAAA---------A---A---A--------AA--AA-AAAA--T---GAA---C-A--AAATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAACCAAT--TTCAATGATACCT-T---AA---AAG--------AA------AATAT-A-T---A--AA--A-AAA-----A----CCCAGT---TT---TTAAATTA--AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TC-GA-AG-TG--------------------TT-T--A--A-A-A-A-CG-TCAA-T-TCTA-----AG--T----T-------------T-GG--A-TT-T-A--AGAC-TAAA---AA--TTTTTTGATGAAa
gi|32 : TAAATT-TAC-A--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--CGGTCTGA-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---CAT--------AAAGC---AATAT-T-T---T--AT--A---------A----T---GA---TT---TATAATT---tt
gi|32 : cgtctatgtaatcttgaccTT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tttagtctcaaaggtttgatgaa
gi|33 : cgtctatgtaatcttgacctaaatttacaaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaattttgtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatattttataatgatttatTAAATT-CAC-C--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------GGTCTGA------------A-------A--------T--------------T-------------TAG--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---CAT--------AAAGC---AATAT-
gi|33 : acgtctatgtaatcttgaccT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tgttataatgatttataattttagtctcaaaggtttgatga
gi|34 : acgtctatgtaatcttgacctaaattcaccaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaatttagtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatatgttataatgatttat--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAAA--------T---A---T--T--TTTTC--AA-GAAA--T---GGA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATTAAT--ATTAATGATACAT-T---AC---CAG--------AA------GATAT-A-A---AT-AA--A-ATT-----A----C----T---TT---TTTAA-T---AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAC-TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-T-AG-GCAA-T-TGTG-----AGT-T----T--G--T-GTC---T-GG--G-TT-T-T--ATAT-TCAATTGAA--GTTTG--ATGAA
gi|35 : TAAATT-CCT-T--AA--C--TTT----TA---AG-T-----C---------G----A------AC-TC------AA------AGAAGT-C--------T---------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-A--------TTC-----A-TTT--GT-----AT----A-----AAAA---------C---A---A--A--TTTAT--AA-GAAAA-T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AAATA-AAT-----A----A---AT---TT---TGTAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TA-AACAG-TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-T-CA-GCtt
gi|36 : ctTAAATC-CAT-C--CA-A---TAT----TG---CG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--T------A-----A------------A-------A--------TAAAAAATGAACTT-T-------------C-G--------T-A-----A-TGT--GC-----AT-T--A-----AAAA-------------A----------------AA-GAAA--T---GAA---T-A--ATG-TT--T--CC---T---AC-AAAAC-----CAGTCATT--TTCAAAGATACGT-T---AT---CCG--------AA------AACA----------------------------------------T---TTTAACT---AAG-------------T---A-----------------------CA-AAAAG-TA--------------------TT-G--A--A-----------CAA-T---------------------------GTC---T-GG--G-TT-T-T--ACAC-TTAA---AA--GTTT
gi|37 : t----A------AT-TA------AA------A------T--------T--T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------TTG--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA-----------------------------C-AAAAA-----CAATAAAT-----AA---TACAT-T----T---------------A------AATAT-C-----A--GA--A-AAT-----AACATT---GT---TT---TTTTACC---AAA-------------C---ATTTT--G-TAT----------T-TA-AAATG-TATAAAATATAAAAAAAAGTTTTT-T--A--A-A-A-T-CT-CCAA-T-TCTG-----AAT-T----T--T--A-GTT---T-GG--A-TT-T-T--Ag
gi|38 : C------AG------A------CA-------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGTTTTT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---G--T--TTTGC--AA-GAAA--T---AAAACTT-A--ACATTT--T--TC---T---AG-AAAAG---------------TTCAATGACACAT-A---AT---TAG--------AA------AATGT-C-T---A--AA--A-ATT-----A----C---A----TT---TGTAACT---AAG-------------T---A-TTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-A-TGTTCAA---TTTG-----AG--T----
gi|39 : aaccaggctttca-------A--------T--------------T-------------T-A--------A-A-----A-TTT--AC-----AT-T--C-----AACA---------C---A---A--A--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--AAATGT--T--CA---T---AC-AAAAA------A--CAAG--TTCAATAATGTAT-T---TC---TAG--------AA------AA-AT-A-C---AACAA--A-AAA-----A----C---AT---TT-----TAACT---AAA-------------T---ATTGT--GCTA-----------T-CA-AA-AG-TAT-------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-G--A-G-TTTG-----A-----------------TC---T-GG--G-AT-T-T--ATAC-
gi|4 : aaatctgatgTAAATT-CAT-C--AA-TA--TTT----TG---AG-T-----GT--------------------------------G------A------C---------------------------------------------A--------T--------------T-------------TCA--------T-A-----A-TTT--AC-----AG-T--A-----ATAA---------C---A---C--T--TTTAT--AA-GAAA--G---TGG---C-A--ACATTT--C--CA---A---GC--AAAA-----CAATCAAA--TCCAATGATACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AGT-----A----A---AT---TT---TAAAACT---AAA-------------T---ATTTA--GCTA-----------T-TA-AAAGT-TT--------------------TT-T--A--A-A-A-gttgatt
gi|40 : ttagcttacaaacaattgcacctttaaaacagaaagaaagtttattatgaaccttcaac-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TTTAC--AA-AAAA--T---TAG---A-A--ACATAT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGACAAT--TTTAATGTTTCAT-T---TT---CAA--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-GAT-----A----T---GT---TT---TATAACT---AAA-----------------GTTTG--GATG-----------T-TA-----------------------------------A--A-A-A-T-TG-ACAA-T-TTTGGATTTAA--T----T--G--A-GTC---T-----G-TT-T-T--AGAC-T-AA---TT--TTTTT--ATGAAaatgtccaatatatgtat
gi|41 : -A-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------T---A---A--T--TT---------AAA--T---GAA---C-A--ACATTTCTT--TT---T---G--AAAAA-----CAGTCAGT--TTCAATGTTACAT-T---AA---TAG--------AA------AATAT-TGT---A--AT--A-AAT--------------GT---TT---TATAG-T---AAA-------------C----TGTT--GCTG-----------T-TT-AACTG-TA--------------------TT-T--G--A-A-A-T-TA-AAAA-C-ATTG-----TG--T----T--------TT-----------TT-T-T--GGAC--------AC--GTTTT--GTGAA
gi|42 : cTATATG-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----GT-A------A----A------AA-AC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGAAATT------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--GC-----AT-G--A-----AAGA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--TCATTT--T--CC---A---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCAATGATACATGTCAGAT---CAG--------AA------AATAT-ttt
gi|43 : ctAATT-CAT-C--AA-GC--TTT----TG---AA-T-----CT-A------A----A------AAATC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A--------------------------------------------------------------------C--GC-----A-----------AAAT---------CTGAA---A--T--TTT-------GAA----------------------TT--T--CT---T---GT-AAAAA-----CAGCCAAT--ATCAATATTACAT-T---AT---TAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAA-----AT---T---GT---TT---TGTCACA---AAA-------------CTA-ATTTT--GCTA-----------T-TA-AATAaatttccttt
gi|44 : tttAATT-CAT-C--AA-AC--CTT----TT---AG-T-----CT-T------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGGAATT------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--AT-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AATGAAA--T---TAG---C-A--AC-TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CTGTTAAT--TCCCATGTTATAT-T---AT---CAG--------AA------AATGT-C-TA--A--AA--A-AAT-----A----T---GT---Ta
gi|45 : tAGATT-CAT-C--A------TGT----CG---GGAT-----TT-A------A----ACTC---AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGAAATT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTTTAAT-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AG-GAAA--T---GAA---G-A--ACATTT--T--CT---T---AA-AAAAA-----AAA--AA------------ACA------AT---CCG--------AA------AATA----T---A--AA--A-AAT-----A----
gi|46 : caATTT--T--CT---T---GC-AAACA-----CAATCAAT--TTCAATGTGACGT-T---TA---CAG--------GAAATAACAATAT-T-T---G--AA--T-AAT-----A----CA--GC---TT-----TAACTAGAAAG-------------G---ATTCT--GC-A-----------A-TA-AGGTT-TC--------------------TT-T--A--A-A-A-A-TG-ACAG-T-TCAG-----AG--T----TC-G--A-GTC---T-GA--C-TG-T-A--AGAC-Ttcatt
gi|47 : TGAATT-CAT-T--CA-AG--TAT----TG---GG-T-----CC-A------A----A------AC-TG------A-------A------C--------T---------------------------------------------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GATT--T---GGA---C-A--ACATTT--C--AC---T---GC-AAAAAAAACCCAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---AT---CAT--------AA------AAT
gi|48 : tggaccT-CAT-C--AC-AT--TTT----TG---AG-TAATATCT-G------ACTTGA------CC-TC------AA------AAT----C--------T--T------A-----C------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---G--T--ATTTC--AA-GAAG--T---GAA---C-A--GCATTG--T--CT---A---GC-AGAAA-----CAttaaac
gi|49 : -TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------C--------------C-------------T-GATTTTCTTT-T-----A-TTT--GC-----A-----A-----TAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-GAAA--T---TAA---C-A--AGCCTA--T--CT---T---GC-AAAAA-----GAGTAAAT--TGTAATGTTATAT-T---AT---CAGA-------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-Aaataagaatacgttttataa
gi|5 : T-CAT-C--AA-GC--ATT----TG---AA-T-----CT-ACATCCCA----G------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-GACA-----T-ATTTTCA-TTT--GA-----AT-G--A-----ATAA---------C---A---A--C--TTTAC--A--GTAT--T---TTT---T-TTTATATTT--T--CT---T---GC-TTCTA-----TAACCAAT--TTCAATG---CAT-T---AT---CAT--------AT------TATAT-C-T---A--AA--A-ATT-----A----C---A----TT---CATAACT---AAA-------------T---ATTTT--GCTG-------------CA-AAAAT-TT--------------------TT-T-----------T-T-------T-TTTG-----AA--A----T--GGCA-ATT---T-AA--G-TT-T-C--AGAC--CAA---AAATGTTTT--ATGA
gi|50 : TAGATT-CAT-C----------TC----AG---AA-T-----CC-A------A----A----------C------A--------------T--------T--T------A-----A------------C-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TCT--GC-----AT-T--A-----GAAA---------C---A---A--T--ATTTC--AG-GGAA--T---TGA---C-T--ACATGT--T--CTTCCT---GC-AAAAA-----AA--CAATGATTCAttgcaagccctg
gi|51 : aTGAGTT-CAT-CGAAA-AC--TCG-----G---AT-T-----C---------A----A------AC-TC------AA------AAA----C--------T--G------A-----T------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--------AAAA---------C---A---T--TTCTTTAC--AA-GAAA--TGTATAA---C-ctatgaaac
gi|52 : taattcagtgtaAT-T---TT---AAA--------AA------AATAC--------------A-AAT-----A----C---GTACATT---TTTAACA---TAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TA--------------------CT-T--A--AGA-A-T-CG-ACAA-T-TCTG-----AG--T----
gi|53 : taattaatga--TTTAC--AA-GGAA--T---GAA---C-A--ATATTT--T--CC---TAAAAA-AAAAA-----AAATAAAT--TCCAATGATACTT-T---AT---CAG--------AA------TAAAT-C---------G--A-ATT-----A----C---AC---TT---TTTAACT---atgtgt
gi|54 : TGAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------TG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----AAAC---------C---A---A--A--TTTTCTAAA-GAAA--
gi|55 : tAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------CG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----TAAC---------C---A---AATT--TTCTC--AA-GAAA--
gi|57 : tTTTT--GCTA-----------T-TA-AACA--TA--------------------TTAA--A--A-A-A-T-CG-ACAA-T-TTTT-----AGT-T----T--G--A-GGC---T-GA--G-TT-T-T--AAGC-CC
gi|58 : cA-------------C---ATTTT--CCTA-----------T-TA-AA-AC-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-TTCA-GCAA-T-TCAG-----AG--T----TT-G--A-GTC---T-GG--G-TG-T-T--AGGC-TCAA---TA--GTTGG--ATGGAtgaacctcttaaacgtt
gi|59 : ---AAA-------------T---ATTTC--GCTA-----------T-TA-AAATG-TA--------------------TT-T--A--A-A-G-T-TG-GCAT-T-TCTG-----AGT-T----T--G--A-GTC---T-TA--G-AA-T-T--GGAC-TCAA---AA--
gi|6 : taTAAATT-TAT-C--AA------------TG---AG-C-----TT-A---------------------TC------AA------A------A--------TG-T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GT-----AT-T--A-----TTAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--AA--TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---GT---TAG--------AA------ATTAT-C-T---A--AA--A-TCT-----G----C---AT---TT---TATAACT---ACATGTATATACATTGT---ATTTT--GATG-----------T-TT-AAATG-TA--------------------TT-T--A--A-A-C-A-AG-GAAA-A-TTTG-----AC--T----T--G--A-GTC---G-GA--T-GC-T-T--AGAC-TCTA---AA--
gi|60 : cc--TTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TT------GA------A------A--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTC--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTAAC--AA-AAAG--T---TAA---ttctga
gi|62 : AAA--T---CAA---CCA--A-------T--CT---T---AC-AAAAG-----CAGTCAGT--TGCAATGTTTCAC-T---AT---CAG--------AA------AATGT-G-T---A--AA--
gi|7 : TAAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--AGATTT--C--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--GTCACTGTTAAAC-T---AC---CAT--------CA------AATAT-C-T---A--AA--C-AAT-----A----T---GG---TT---TCTGACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTG-----------T-TT-AATAA-TA--------------------TT-C--A--G-A-G-T-CA-ACAA-T-TTTG-----AG--T----TAAG--A-GTC---A-GA--T-TT-TGT--AGAC-TCAA---AA--GTATT--ATGAA
gi|8 : TAAACT-TAT-T--CA-AC--GTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AA-TC------AG------T------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCAAAATCTGAAATTT-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------T---A---T--T--TTTAC--AA-AAAA--T---T---------------T--T--CT---T----C-AAAAA-----AA---AAA--TTCAATGTAACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---C--AA--A-TAT-----A----T---GT---TT---TAT-ATT---GAA-------------CTAGATTTT--GCTA-----------T-TA-ACTTA-TA--------------------TT-T--A--A-A-ATT-CG-ATAA-TATTTA-----TT--T----T--C--A-ATC---T-GA--G-AT-T-T--AGAC-TCAA---AT--ATTTT--AT
gi|9 : ctATT-CAT-C--AA-TC--TTT----TG---AT-T-----CT-A------A----ATGTCAGAC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------ATTCTGAAA--------T--------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--GC-----TT-A--A-----AAAA---------T---A---A--T--TTTAT--AA-GAAA--T---TGA---C-A-----TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----TATTCAAT--TTCAAGGTTACAT-T---AT---TAG----------------AATAT-C-T---A--AAT-A-AAA-----A----G---GT----------TA------AAA-------------C---A-CTT--GCTA-----------T-TC-TTTTGCTA--------------------TT-T-------A-C-T-CT-GCAA-T-TTTGA----AA--T----T--G--A-GTT---T-GA--G-TA-C-T--AGAA-TGAA---AA--GATTT--ATGAA
blockSeqs : A T GA G CAT ATTG TTC A AATAT CATCCC CTTG TGTCAG C TGATTC GGTCCAA TCCAATCTCATGTTTCTAACATT AAATAATCGGAAA T AAATAATA TTTTC A TG TATCT A GGCCTT AAAAACACAT TGA TTT AT TC TA AT GTAT ACT TT CT GC TCC AAAA A AAACC A GA A CAG TTA AAAATATC AATAAC ATATAA TC TTAATA ACATTG ACA AAA T AGA TGTATATACATTGTAT GA CATGATTGTAT A TAAAATATAAAAAAAAGTTT AAA T T TGT G GATTT TT TTTA GGC C TAG A AC T G G GA A TTG AT TG
blockSeqs : A . . . C . . . . T . CTC A . A ATCGATCTCGAAATCTAAATTTT C A ATTTTCTT . A TA . G TTG AAA . . . . . AA AT G . . TT . A T . A . T . C A AGC CCCAA AT CCGG CCCAG . . T G CTAGAT . T T T AAG G T TCA A T TT C AAG G . . . A . G . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . A . A CTCAAAATCAAAATCTGAAATT . T ACA . . T . . TCA AT . . . . . A G . . . GT . A . . A . T . . . AGC ACAAC T T TTG . . C A CTAAT . . T . AT . . TA . A T C GG . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . A CTTAAAATAAAAAATGAACTT . C G . . . . . AT AA . . . . . . T . . . T . G . . T . T . . . . ACTA . T CAG . . A . CAT . . T . AC . . CA . . T . CG . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . A CTCGCTCAAAATCATAAATT . T . . . . . . TA A . . . . . . T . . . . . A . . G . A . . . . AAGA . T TA . . T . TCA . . A . AA . . TG . . T . TG . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . A CTAACTGAAAATCTGAAATT . . . . . . . . A C . . . . . . T . . . . . A . . G . T . . . . AAAT . T TT . . G . TAT . . T . AA . . TA . . T . G . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G CACAAAATCTTGACATA . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . G . . G . A . . . . TGTA . A CG . . A . TAA . . T . AA . . CG . . T . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . A CATCAAAATCTGTTTTT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . T . . A . T . . . . CTAA . A AT . . G . AAA . . T . AA . . TG . . A . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . G CTCAAAATGTGAAATT . . . . . . . . T A . . . . . . T . . . . . T . . A . A . . . . CTA . T CA . . T . TAT . . A . GA . . CG . . T . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . A CTCAAAATCTGAAATT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . A . . A . G . . . . CTA . T CT . . T . TAT . . A . CA . . CG . . T . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . A CTCAAAATCTGGAATT . . . . . . . . G A . . . . . . A . . . . . A . . G . A . . . . CTA . T CA . . C . TAT . . C . CA . . CG . . T . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G CTCAAAATCTGAAATT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . A . T . . . . ATC . T CA . . G . CGT . . C . A . . GG . . T . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . C CTCAGAATTTCAAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . A . . A . T . . . . CTT . T AG . . A . AAT . . A . T . . CG . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G CTCAGAATTTCAAAAT . . . . . . . . G A . . . . . . A . . . . . A . . G . T . . . . GTA . A CA . . A . TAT . . C . A . . CG . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . G CTCAAATTCTGAAAT . . . . . . . . T G . . . . . . G . . . . . G . . G . T . . . . TTA . C TG . . T . TAT . . A . A . . TG . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . A CTCGGTCTGAAATT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . G . T . . . . ATA . C TG . . A . CAT . . T . G . . TG . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G CTGAAATTTAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . G . T . . . . CTA . A CG . . A . TAT . . G . A . . TA . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . A CTCGGTCTGAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . A . . A . T . . . . TTA . A CT . . T . TAT . . T . G . . AG . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G GAAGTCTGAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . A . . G . A . . . . CAA . T CG . . T . GAT . . T . A . . CG . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . A ATCAGTAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . G . T . . . . CTA . A TG . . A . TAT . . C . A . . CG . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . A ATCTGAAATT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . G . T . . . . ATA . T TG . . T . TAT . . A . A . . AG . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . A ATCTGAAATT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . A . . A . T . . . . TTT . T TG . . G . CAT . . C . A . . CA . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . A ATCTTACATT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . A . . A . A . . . . CTA . T AA . . T . TAT . . A . A . . CT . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G AACTGATATT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . A . . A . A . . . . CTA . T CA . . T . CAT . . A . A . . CG . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . A ATACGAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . A . . A . A . . . . CTA . A CA . . G . CT . . A . A . . TG . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G ATGTGAAAT . . . . . . . . T A . . . . . . G . . . . . A . . A . T . . . . CTA . T AA . . A . CA . . A . A . . TA . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G CTCAAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . G . A . . . . CTA . T TG . . A . CC . . C . A . . TG . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G CCTGAAAT . . . . . . . . C A . . . . . . G . . . . . A . . G . A . . . . TTG . T TG . . A . CT . . T . A . . CG . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G TGCAAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . A . . A . A . . . . CTA . A CA . . G . TG . . G . G . . CG . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . G CTCAAAAA . . . . . . . . A A . . . . . . A . . . . . A . . A . A . . . . CTA . T CG . . A . CG . . A . A . . TG . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A CTCAAACT . . . . . . . . A T . . . . . . G . . . . . G . . G . T . . . . CTA . T CA . . T . CT . . A . A . . AG . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A CTGAAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . G . T . . . . GTA . T CA . . T . CT . . C . A . . CA . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A CTCAAAAT . . . . . . . . T A . . . . . . T . . . . . G . . A . A . . . . CTA . T TG . . A . AT . . A . A . . CG . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A GTCAAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . A . . G . T . . . . CTC . T TG . . C . CT . . A . A . . CT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A CTCAAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . G . . G . T . . . . CTA . T GG . . A . CT . . T . A . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G TTTGAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . A . T . . . . TA . T C . . . . TA . . T . A . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G CTCAAAAC . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . A . . A . A . . . . CT . T A . . . . TA . . T . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CTCAAAAT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . G . . A . T . . . . CT . T C . . . . GT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A TTTAACAT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . G . . G . A . . . . CA . A C . . . . CT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G ATCAAAAT . . . . . . . . T C . . . . . . T . . . . . G . . A . A . . . . TA . . G . . . . CA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G CTCAAAAT . . . . . . . . T C . . . . . . T . . . . . G . . A . T . . . . C . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A CTCAAA . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . A . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TATT . . . . . . . . A A . . . . . . G . . . . . G . . G . T . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAT . . . . . . . . A A . . . . . . T . . . . . G . . G . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . CTT . . . . . . . . A A . . . . . . C . . . . . A . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : A********* ***** CAT**************** G****
originalCons : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---T-GA--G-TT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
finalCons : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAACAT----------------TTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----TG----A-GTC---T-GA--G-TT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|56 ): AAAACAAAACTTTTAAACTGAAATTAACAGTTACTAGATATATTTCGAAAAGGAGACAAAGAAATGCTAGCGAGAATCGT
Unaligned ( gi|61 ): GAATTGATGCTTGTGGAACAATTTTTGGGTATTAAAAACTTTTTCAAGCCAAGACAGTTTACATC
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111 11
lowQualScore : 2 1 11 1 222 2222 111 1 22222 0 333333 1111 444444 2 222222 4444444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555555555555 4 88888888 0 11111 1 22 11111 1 33333333 5555555555 111 111 11 11 11 0 22 5555 222 0 11 11 33 111 1111 1 22222 2 11 4 0 111 222 33333333 555555 7777777777 33 0 444444 888888888 111 111 5 333 4444444444444444444 11 55555555555 0 0 4 0 88888888888888888888 0 88888 1 1 0 2222 1 2 44444 22 4444 44444 2 111 1 11 7 1 2 11 1 0 222 11 22
lowQualScore : . . .. . ... .... ... . ..... . ...... .... ...... . ...... ....... ............................................................................ ............. . ........ . ..... . .. ..... . ........ .......... ... ... .. .. .. . .. .... ... . .. .. .. ... .... . ..... . .. . . ... ... ........ ...... .......... .. . ...... ......... ... ... . ... ................... .. ........... . . . . .................... . ..... . . . .... . . ..... .. .... ..... . ... . .. . . . .. . . ... .. ..
lowQualScore : 4 2 66 1 888 3333 888 0 44444 9 555555 9999 111111 6 444444 1111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3333333333333 1 00000000 8 99999 5 99 99999 5 99999999 6666666666 333 333 00 00 00 7 77 3333 111 8 11 11 99 333 8888 5 77777 6 11 2 8 444 222 66666666 000000 2222222222 11 9 888888 999999999 666 666 0 444 7777777777777777777 33 33333333333 9 9 9 9 55555555555555555555 9 11111 9 9 9 8888 0 0 55555 88 1111 88888 1 888 1 55 6 1 2 66 2 4 333 99 33
consensus : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---T-GA--G-TT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
Reference ( family-3145 ) : TAAATT-CAT-C--AA-AC--TTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAATGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAT-----A----C---GT---TT---TNTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AANAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--A-GTC---T-GA--G-TT-T-T--AGAC-TCAA---AA--GTTTT--ATGAA
gi|1 : AAAT--CA--C--AA-AC--TTT----C----AG-A-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------AAA------T--G------A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAG----------C---A---A--C--TTTGT--AA-GAAA--T---GTG---T-A--ACATGT--T--CT---C---GC-AAAAAT----CAGTCAAT--TTCAATGTTACTT-T---AA---CAG--------AA------AAATT-C-T---T--AC--A-AAT-----A----C---TC---AT---TATAATC---AAA-------------C----TTTT--GCT------------T-TA-----------------------------------A--A-A-G-T-CG-GCAA-T-TTTG-----A---T-------------TC---T-GA--GATT-T-T--AGTC-TCAG---AA--GTTTT--ATAAA
gi|10 : atatgaacaggttcagaaataatacgttatcatcaaagtatgcac-----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--C------AGT---A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------T-A-----A-TTT--AC-----AT-T--A-----AAAAAAAACACATT---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AATAA-----CCATCGAT--TTCAATGATAAAC-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C--------AA--A-AAT-----A----T---AC---TT---TTTAACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TG--------------------TT-A--A--A-A-A-T-T---CA----CTAA-----AG--C----T--G--G-GTC---T-GT--G-TT-T-T--TGAC-TCAG---AG--GTTTG--ATAAAttt
gi|11 : tcatcaaaaactcacaA-AC--TTA----CT---AG-A-----CT-A------A----A------AC-TC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------A-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--GCATTT--TGCTT---T---AT-AAAAA-----TAATCAAT--TTTAATGTTACAT-T---AT---TA-------------------------T---A--AA--A-AAT-----A----T---TT---CT---TTCAACT---AAAT------------C---A--TT--GTTA-----------T-AA-ATTAG-TA--------------------TT-T--T--G-G-A-T-TA-ACAA-A-ATTG-----AGT-T----T--G--A-GTA---T-TA--G-TT-T-T--ACAC-T-AA---AA--ATTGT--ATGAtt
gi|12 : cgtgaaaatgtggagtcttTAAATT-CAT-C--AA-AT--GTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TCTGATTCAA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-GG-------T-A-----A-TTT--GA-----AT------------AC---------C---A---G--T----------A-GAAAATT---TAA---C-A--TCATTT--T--TT---T---GT-AAAGA-----CAATCAAT--TTCAATGTTACGT-T---AT---TAGAAAATATCAA------AATAT-C-T---A--AA--A-AA------A----C---GT---TT---T---ACT---AGA-------------C----TAAT--GATA-----------A-TA-AATAG-CA--------------------TT-A--AT-A-A-A-T-CA-GCAA-T-TTTG-----AG--T-------------TT---T-GA--GTTT-T-T--AAAT-ACAG---TA--ATGTT--ATGAA
gi|13 : -----CT-C------A----A------AC-TC------AA------A------C--------C--T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--TC-----AAAT--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-TTAA------TAA---T-A--ACGTTT--T--GT---C---ACAAAAAA-----CATTCGAT--TTCAGTGTTACAT-T---AT---CAG--------AG------AATAT-C-T---A--AA--ACAAT-----A----A---TT---AT---TCTAGCG---AAA-------------C---A-TTT--GCTA-----------T-TA-AGTAG-TA--------------------AT-T--A--A-A-A-A-TG-ATAA-T-TTTG-----AG--T----T--G--GCGTC---T-GA--GATT-T-T--A
gi|14 : tttcattaaaaaaaatttagtaaaaaaacaaaC-TC------AA------A------T--------G--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------A-A-----A-TAT----------T-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AA-GGAT--T---GAA---T-A--ACATTT--TTTCT---T---AC-ACAAA-----CAGTCAAT--GTCAATGATACAT-T---ATC--CAA--------AA------AACAC-C-CCA-A--AA--A-AACCGG--A----C---AT---TT---T-TAATG---ATA-------------T---ATTTT--ACTACATGATTGTATT-TT-AAAAT-TA--------------------TT-T--A--A-A----------AA-C-CTGA-----AA--T----T--G--A-GCC---T-GG--G-TT-T-T--AGAC-ACAA---AA--GTTTA--ATGAA
gi|15 : ttatttttagtT-A------A----G------AC-TC------GG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------A--------------C-------------T-GAAATAATAT-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----ATAA-----------------A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA----------ATTT--T--TT---T---GC-TAAAA-----CAGACAAT--TTAAATGTCATTT-T---AT---TTG--------AA------AATAT-C-T---A--AT--A-AAT-----A----C---TA---ATAAATATTACT---AAA-------------C----CTTT--GCTA-----------T-AA-GATAG-TA--------------------TT-T--G--ATA-G-T-TA-GCAA-T-TTTGT----GG--T----T--G--A-GTC---T-GA--GTTT-T-T--AGAC------------GTTTT--ATGAAta
gi|16 : tcaaaatATG-CAT-C--GA-AC--TTT-----G---AG-T-----CT-A------A----A------TT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------C--------T--------------T-------------T-A----------A-----A-TAT--GA-----AT-TTTG-----AAA------------------------TTTGC--A--------T---TAA---A-A--ACAATT--T--TT---T---TA-AGAAA-----TG----AT--TTCAATGATACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-A-T---C--AA--A-AAA-----A----C---AT---TT---T-TAGCT---AAA-------------T---AATTT--GCTA-----------T-TA-AATAG-TA--------------------TC-TAAA--A-A-A-T-CG-GCAT-T-ACAG-----AGT-T----T--G--A-GTC---C-GG--G-AT-T-T--AGATATTAA---AA--AATTG--ATGttca
gi|17 : atcat-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------T--------C--C------A-----ATCTCATGTTTCTA-------ACAT-----T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTC--AT-----CT-T--AT----CAAA---------C---ATTTA--T--TTTAC--AT-GCAA--T---TCA---C-A--ACGTTT--T--CT---T---TC-AGAAA-----CTGTCAAT--TTCAATGTGTTAT-T---AT---TTG--------AA------CATTT-C-T---T--AA----------------------------------AACT---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TA--------------------TT-T--AC-A-A-A-T-TG-ATAG-T-TTTC-----AG--T----T--G--A-GTT---T-GA--GTTT-T-T--AGAC-TCAA---AC--ATTTT--AAGAA
gi|18 : TGAATC-AAT-A--AA-AG--TTC----TG---AG-T-----AT-A------A----A------ACCTC------AA------A------A--------T--CTG----A-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAA------------------------TTCAC--AA-GAA--------AA---G-A--ACA--------------------AAAAA------AATCGAT--TTCAGTGAAACAT-G---AT---CAG--------AA------AACAT-G-T---A--GA--A-AGA-----A----C----T---TT---TTTAAAG---AAA-------------A---AATTT--GCTA-----------T-TA-AAAAA-TG--------------------------A--A-ATA-T-CG-GCAA-T-TCTA-----AGTTT----T--G--A-GAC---T-AAACA-TT-T-TGAAGCT-TAAA---AA--GTTTG--ATGgttt
gi|19 : accAATT-CAA-C--AA-AG--AGT----TG---AG-C-----CT-A------A----A------AC-TC------
gi|19 : aaaatctgatattgaaactagacatt-----AAAA---------C----------T--CCTAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--ACATTA--T--CG---T---AC-AAAAA-----CAATTATT--TACCAGGGTATAT-T---AT---CA---------AA------AGTA--------A--AA--A-AATTAATAA----C---AT---TT---TG--AGT---ACA-------------T---ATTTT--GCTA-----------C-CA-AAAAG-TA--------------------TT-A--G--A-A-T-T-CG-GTAA-T-TCTG-----AG--T----TG-G--A-GTCTAGT-AG--G-TT-A-T--AAAC-ACCA---AA--GTTTT--ctacaagaaataaacaacattatcgtacaaaaacaattatttaccagggtatattatcaaaagtaaaaaaattaataacattttgagtacatattttgctaccaaaaagtattagaattcggtaattctgagttggagtctagtaggttataaacaccaaagtttta
gi|2 : aaaatctgatattgaaactagacattaattcaacaaagagttgagcctAATT-CAT-C--AAGAC--TTTATTGTGTTCAG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AGGTCCAAA------C--------A--C------A-----A------------A-------A--------TCTTGACATA-----T-------------T-G--------T-T-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---G--T--TATAC--TA-GAAA--T---TAA---C-A--ATATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCATTGATACGT-T---AT---CAG--------AA------AATATAC-T---A--AA--A-AGT-----A---------T---CT---TAT--CT---GTA-------------T---ATTTT--GCCA-----------TCTA-A--AG-TA--------------------TT-GA-A--A-A-A-T-CG-GCAA-
gi|20 : c---AG-T-----CT-AT-----A----A------AA-TC------AA------AATCGATC--------T--C------G-----A------------A-------A--------TCTAAATTTT-----T-------------T-T--------T-A-----A-TTA--GC-----CT-T--A-----AAAAAA-------C---A---G--T--TTTAC--AA-TAAG--T---TAA---A-A--A-GTTT--T--CT---T---GC-AAAAT-----CAGTCAAT--ATCAATGTTATTT-T---AT---TAC--------AA------AATAT-T-T---A--AA--A-AAT-----A----A---GT---TG---TGTTACT---GAA-------------T---G-TTT--GCTA-----------T-TA-AGCAG-T--------------------------------------------A-T-TTTG-----AG--T----T--C--AGGTC---A-GA--G-TTGT-G--AGAC-T-AA---AG--ATTTG--ATGAAaactatatttaaacaaatacatctaaaagatttataaataatttctatga
gi|21 : TACATT-CAT-C--AA-AG--TTT----CG---AA-T-----CC-A------A----A------TC-TC------AG------A------C--------T--CGCTC--A-----A------------A-------A--------TCATAAATT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--G-----AAAA---------C---A---A--A--TTCAC--AA-GAAA--T---AAA---C-A--A-A-TT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CTATCAAT--TTC-AT-TTGCA--T---ATTTACAT--------AA------AATAT-A-T---A--GA--A-AA---------------AT---TT---TTTAA--------------------------------------------------A-ATCAG-TA--------------------AT-T----------------GTAA-T-GT-----------T----T--G--A-GTC---T-GG--G-TA-T-A--AAGC-TCAA---AA--GTTTG--ATGAAttt
gi|22 : tTAGATT-CAT-C--AC-AG--TGT----TG---AG-A-----CTCA------A----A------AC------------------------C--------T--G------A-----A------------A-------A--------T--------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----A--------------------------------A--T--TTTAC--AA-AAAAAAT---GGA---C-A--ACATTT--TT-CC---T---ACTAAAAC-----CAACCAAT--TTCCATGTTG--------AT-----G--------AA------AATAT-AAG---A--AA--A-AAT-----A----C---AT---TT---TTTA--TG--AAA-------------T---ATTCC--GCT------------C-TA-AAAAG-TA--------------------AT-T--A--A-A-A-T-GG-GCAA-T-TCTG-----AGT-T----T--G--A-GTC---A-GA--G-TT-T-T--AAAC-TCAA---AA--Gt
gi|23 : C------AC------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-G--------A-A-----A-TT----------------------AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AC-GAAA--T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---C---GC-AAAAA-----CAGTCATT--TTCAGTGTAACAT-T---AT---CAA--------AC------AATAT-C-T-------A--A-AAT-----A----T---GT---TT---TCTAATT---AAA-------------C---G-TTA--GCTA-----------T-TA-AACAG-T--------------------------------A-A-T----GC-------TG-----AGT-T----T--G--A-TTC---A-GT--G-TT-TGT--AGAC-TTAA---AC--GTGTT--cgaga
gi|24 : aagttaaccaagcttatttcgtatgaagatttccataTGAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TC---AT-T-----CT-A------A----A------AT-TC------AG------A------C--------TAACTG----A-----A------------A-------ATCTGAAATT--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----GTGT--T-----AAAA---------C---A---A--C--TTT-C--AA-G-----------A---C-A-------T--T--CT---T---GT-AAACT-----CAGTAAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---C-G--------AT------AATAT----------AATCA-AAT-----A----T---GT---TT---TGTAACT---GAA-------------C----TTTT---CTG-----------T-TA-A---------------------------------A--A-A-A-T-CG-GCAA-A-CTTG-----AGTTT----T--G----GTC---CAGA--G-TT-T-
gi|25 : ATT-CAT----AA-ACATTTT----TT---AT-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------T------G--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------CAAATAATCGGAAAT-G--------T-A-----A-AAA--GC-----AA-T--A-----AAAG---------C---A---A--T--TTGGT--AA-GACA--T---TAA---C-A--ACA----------------------AAA-----TAGTCAAT--TCAAATGTTACAT-T---AA---CAA--------AA------CATAA-C-T---A--AC--A-AAA-----A----C---GT---TT---TATAA-T---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TATAAAAA-AA--------------------TT-T--A--A-ATA-T-CG-GGAATT-TTTG-----GT--T----T--G--A-ATC---T-acaaattat
gi|26 : ------A----G------AT-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------G-A-----A-TTTTGGA-----AT-T--GGCCTTGAAA---------C---A---A--T--TTT-C--AG-GATA--T---TAA---C-A--GCATTT--T--TC---A---GC-AAAGA-----CAGTTAAT--ATCAGTGTTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATTA-C-T------AT--A-AAC-----A----C---TT---GT---TAAAACT---AA------------------ATTTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TA--------------------TC-TA-A--A-A-A-T-TG-GTAA-T-TTTG-----AG--TC---T--G--A--TT---T-TA--A-TT-T-A--AGAT-TCAA---Ataa
gi|27 : taaattcTAAATT-GAT-C--AA-AC--ACT----TG------------CT-G------A----A------AA-TC------TG------A------T-------------------------------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GT-----AT-G--A-----AAAAT--------C---A---A--T--TTAAC--AA--AAA--C---TAGG--C-A--AGATAT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATCAA---TTCAATGATACAT-T---AT---CAG----------------AATAT-T-T---A--AA--A-A
gi|27 : tcagtctattggttacttcttgaccAGAA-TA--------------------TT-T--AA-A-A-A-T-TG-GCAG-TGTTTT-----AGT-T----T--T--A-GTC---C-GA--G-TT-T-C--AAAC-TCAG---AA--GTTttggcagtgttttagttttagtccgagtttcaaactcagaagttaaa
gi|28 : tcagtctattggttacttcttgacctaaattgatcaaacacttgctgaaaatctgatattttgtgatttgtatgaaaaatcaatttaacaaaaactaggcaagatattcctacaaaaacaatcaattcaatgatacattatc---AG-A-----CT-A------T----G------AT-TC------AA------A------A--------TA-C------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----AATTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-TAAA--T---TAA---T-A--TCATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTCAAAGTTGTCT-T---AT---CTG--------AA------AATAT-A-TATAA--AA--A-GAC-----A----C---GT---GC---TTT---T---AAA-------------C---GTTTaaa
gi|29 : atcaggggtttgaatttacaacaa-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TGTAC--AT-GAAA--T---TAA---A-T--ATACTT--T--CT---T---GC-TAAAA-----CAGTCAAT--TTAAATGTTCCAT-T---AT---TAG--------AA------ATTAT-C-A---A--AA--A-AAA-----G----T---GT---TT---TATAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TA-AATAA-TA--------------------TT-TA-A--A-A-A-T-TA-GCAA-T-TGTA-----AG--TTTTAT--A--A-GTC---T-GA--GTTT-T-T--GGAC-ACAA---AA--GTTTT--ATGgcaaattatagtcctggatacaatattttgttt
gi|3 : gcTAAATT-CATTC--AA-A---TTT----TA---AA-T-----CT-A------A----A------ATATC------CG------A------C--------T--G------A-----A------------ATTTAA--A--------T--------------TC------------T-G--------A-A-----A-TTTT-GTTATCTAT-TTCA-----AAAA---------T---A---A--T--TTAAT--A--GAAA--T---TAA---C-A--CCATTT--TGTCT---T---GC-AAACT-----CAGCCAGT--TTCAATGTTT--T-T---AT---TAG--------GA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAA-----A----T---GT---TT---TACAACA---TAA-------------C-----TTT--GCTA-----------T-TT-AATAG-TT--------------------TT-T--AAGA-A-A-T-AG-GACA-T-TTTT-----AG--TC---C--A--A-GTC---T-GA--GCTT-T-T--ATCC-TCAA---AG--GTTTT--ATAAtgtttaa
gi|30 : tA-GC--TGT----TG---AA-T-----CT-G------G----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TGTGAAATT------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---------G-G--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATAATT--TTTTATAACACAT-T---AT---CAG--------AA------TATAT-----------------AT-----A----C--------TT---TTTAACT---GAC-------------A---ATTTTGAGATA-----------T-TT-AACAG-TA--------------------TT-TG-A--A-A-A-T-CG-GCAA-T-TTTG-----AGA-T----T--G--A-GTC---T-GG--G-Ttttaa
gi|31 : --------T--C------A-----A------------G-------A--------TCA------------T-------------T-T--------T-A-----AATTT--CT-----AT-TT-A-----AAAA---------A---A---A--------AA--AA-AAAA--T---GAA---C-A--AAATTT--T--CT---T---AC-AAAAA-----CAACCAAT--TTCAATGATACCT-T---AA---AAG--------AA------AATAT-A-T---A--AA--A-AAA-----A----CCCAGT---TT---TTAAATTA--AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TC-GA-AG-TG--------------------TT-T--A--A-A-A-A-CG-TCAA-T-TCTA-----AG--T----T-------------T-GG--A-TT-T-A--AGAC-TAAA---AA--TTTTTTGATGAAa
gi|32 : TAAATT-TAC-A--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--CGGTCTGA-----A------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---CAT--------AAAGC---AATAT-T-T---T--AT--A---------A----T---GA---TT---TATAATT---tt
gi|32 : cgtctatgtaatcttgaccTT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tttagtctcaaaggtttgatgaa
gi|33 : cgtctatgtaatcttgacctaaatttacaaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaattttgtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatattttataatgatttatTAAATT-CAC-C--AA-GG--TGC----CG---AG-C-----C--A------A----A------AC-TC------AA------A------C--------T--C------GGTCTGA------------A-------A--------T--------------T-------------TAG--------T-A-----G-TTT--GC-----GT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTCAC--AA-TAAA--T---GAA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AT-AAAAA-----CAACCACT--TTCAATA--ATAT-T---AT---CAT--------AAAGC---AATAT-
gi|33 : acgtctatgtaatcttgaccT-CAT-C--AA-AC--CTT----TG---AG-A-----CT-A------A----A------AT-Tgttataatgatttataattttagtctcaaaggtttgatga
gi|34 : acgtctatgtaatcttgacctaaattcaccaaggtgccgagccaaaactcaaactcggtctgaaatttagtagtttgcgttaaaaacaatttcacaataaatgaacaacattttcctataaaaacaaccactttcaataatattatcataaagcaatatgttataatgatttat--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAAA--------T---A---T--T--TTTTC--AA-GAAA--T---GGA---C-A--ACATTT--T--CC---T---AC-AAAAA-----CAATTAAT--ATTAATGATACAT-T---AC---CAG--------AA------GATAT-A-A---AT-AA--A-ATT-----A----C----T---TT---TTTAA-T---AAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAC-TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-T-AG-GCAA-T-TGTG-----AGT-T----T--G--T-GTC---T-GG--G-TT-T-T--ATAT-TCAATTGAA--GTTTG--ATGAA
gi|35 : TAAATT-CCT-T--AA--C--TTT----TA---AG-T-----C---------G----A------AC-TC------AA------AGAAGT-C--------T---------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-A--------TTC-----A-TTT--GT-----AT----A-----AAAA---------C---A---A--A--TTTAT--AA-GAAAA-T---TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGTCAAT--TTTAATATTACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AAATA-AAT-----A----A---AT---TT---TGTAACC---AAA-------------C----TTTT--GCTA-----------T-TA-AACAG-TA--------------------TT-TC-A--A-A-A-T-CA-GCtt
gi|36 : ctTAAATC-CAT-C--CA-A---TAT----TG---CG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--T------A-----A------------A-------A--------TAAAAAATGAACTT-T-------------C-G--------T-A-----A-TGT--GC-----AT-T--A-----AAAA-------------A----------------AA-GAAA--T---GAA---T-A--ATG-TT--T--CC---T---AC-AAAAC-----CAGTCATT--TTCAAAGATACGT-T---AT---CCG--------AA------AACA----------------------------------------T---TTTAACT---AAG-------------T---A-----------------------CA-AAAAG-TA--------------------TT-G--A--A-----------CAA-T---------------------------GTC---T-GG--G-TT-T-T--ACAC-TTAA---AA--GTTT
gi|37 : t----A------AT-TA------AA------A------T--------T--T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------TTG--------T-T-----A-TTT--GC-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA-----------------------------C-AAAAA-----CAATAAAT-----AA---TACAT-T----T---------------A------AATAT-C-----A--GA--A-AAT-----AACATT---GT---TT---TTTTACC---AAA-------------C---ATTTT--G-TAT----------T-TA-AAATG-TATAAAATATAAAAAAAAGTTTTT-T--A--A-A-A-T-CT-CCAA-T-TCTG-----AAT-T----T--T--A-GTT---T-GG--A-TT-T-T--Ag
gi|38 : C------AG------A------CA-------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGTTTTT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---G--T--TTTGC--AA-GAAA--T---AAAACTT-A--ACATTT--T--TC---T---AG-AAAAG---------------TTCAATGACACAT-A---AT---TAG--------AA------AATGT-C-T---A--AA--A-ATT-----A----C---A----TT---TGTAACT---AAG-------------T---A-TTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-A-TGTTCAA---TTTG-----AG--T----
gi|39 : aaccaggctttca-------A--------T--------------T-------------T-A--------A-A-----A-TTT--AC-----AT-T--C-----AACA---------C---A---A--A--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--AAATGT--T--CA---T---AC-AAAAA------A--CAAG--TTCAATAATGTAT-T---TC---TAG--------AA------AA-AT-A-C---AACAA--A-AAA-----A----C---AT---TT-----TAACT---AAA-------------T---ATTGT--GCTA-----------T-CA-AA-AG-TAT-------------------TT-T--A--A-A-A-T-CG-G--A-G-TTTG-----A-----------------TC---T-GG--G-AT-T-T--ATAC-
gi|4 : aaatctgatgTAAATT-CAT-C--AA-TA--TTT----TG---AG-T-----GT--------------------------------G------A------C---------------------------------------------A--------T--------------T-------------TCA--------T-A-----A-TTT--AC-----AG-T--A-----ATAA---------C---A---C--T--TTTAT--AA-GAAA--G---TGG---C-A--ACATTT--C--CA---A---GC--AAAA-----CAATCAAA--TCCAATGATACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AGT-----A----A---AT---TT---TAAAACT---AAA-------------T---ATTTA--GCTA-----------T-TA-AAAGT-TT--------------------TT-T--A--A-A-A-gttgatt
gi|40 : ttagcttacaaacaattgcacctttaaaacagaaagaaagtttattatgaaccttcaac-----A-TTA--GC-----AT-T--A-----AAA----------C---A---A--T--TTTAC--AA-AAAA--T---TAG---A-A--ACATAT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAGACAAT--TTTAATGTTTCAT-T---TT---CAA--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-GAT-----A----T---GT---TT---TATAACT---AAA-----------------GTTTG--GATG-----------T-TA-----------------------------------A--A-A-A-T-TG-ACAA-T-TTTGGATTTAA--T----T--G--A-GTC---T-----G-TT-T-T--AGAC-T-AA---TT--TTTTT--ATGAAaatgtccaatatatgtat
gi|41 : -A-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAAA---------T---A---A--T--TT---------AAA--T---GAA---C-A--ACATTTCTT--TT---T---G--AAAAA-----CAGTCAGT--TTCAATGTTACAT-T---AA---TAG--------AA------AATAT-TGT---A--AT--A-AAT--------------GT---TT---TATAG-T---AAA-------------C----TGTT--GCTG-----------T-TT-AACTG-TA--------------------TT-T--G--A-A-A-T-TA-AAAA-C-ATTG-----TG--T----T--------TT-----------TT-T-T--GGAC--------AC--GTTTT--GTGAA
gi|42 : cTATATG-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----GT-A------A----A------AA-AC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGAAATT------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--GC-----AT-G--A-----AAGA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---GAA---C-A--TCATTT--T--CC---A---AC-AAAAA-----CAATCAAT--TTCAATGATACATGTCAGAT---CAG--------AA------AATAT-ttt
gi|43 : ctAATT-CAT-C--AA-GC--TTT----TG---AA-T-----CT-A------A----A------AAATC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A--------------------------------------------------------------------C--GC-----A-----------AAAT---------CTGAA---A--T--TTT-------GAA----------------------TT--T--CT---T---GT-AAAAA-----CAGCCAAT--ATCAATATTACAT-T---AT---TAG--------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-AAA-----AT---T---GT---TT---TGTCACA---AAA-------------CTA-ATTTT--GCTA-----------T-TA-AATAaatttccttt
gi|44 : tttAATT-CAT-C--AA-AC--CTT----TT---AG-T-----CT-T------A----A------AC-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGGAATT------T-------------T-G--------T-A-----G-TTT--AT-----AT-T--T-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AATGAAA--T---TAG---C-A--AC-TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CTGTTAAT--TCCCATGTTATAT-T---AT---CAG--------AA------AATGT-C-TA--A--AA--A-AAT-----A----T---GT---Ta
gi|45 : tAGATT-CAT-C--A------TGT----CG---GGAT-----TT-A------A----ACTC---AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCTGAAATT------T-------------T-G--------T-A-----A-TTTTAAT-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAA--AG-GAAA--T---GAA---G-A--ACATTT--T--CT---T---AA-AAAAA-----AAA--AA------------ACA------AT---CCG--------AA------AATA----T---A--AA--A-AAT-----A----
gi|46 : caATTT--T--CT---T---GC-AAACA-----CAATCAAT--TTCAATGTGACGT-T---TA---CAG--------GAAATAACAATAT-T-T---G--AA--T-AAT-----A----CA--GC---TT-----TAACTAGAAAG-------------G---ATTCT--GC-A-----------A-TA-AGGTT-TC--------------------TT-T--A--A-A-A-A-TG-ACAG-T-TCAG-----AG--T----TC-G--A-GTC---T-GA--C-TG-T-A--AGAC-Ttcatt
gi|47 : TGAATT-CAT-T--CA-AG--TAT----TG---GG-T-----CC-A------A----A------AC-TG------A-------A------C--------T---------------------------------------------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AATA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GATT--T---GGA---C-A--ACATTT--C--AC---T---GC-AAAAAAAACCCAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---AT---CAT--------AA------AAT
gi|48 : tggaccT-CAT-C--AC-AT--TTT----TG---AG-TAATATCT-G------ACTTGA------CC-TC------AA------AAT----C--------T--T------A-----C------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------C-A-----A-TTT--TC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---G--T--ATTTC--AA-GAAG--T---GAA---C-A--GCATTG--T--CT---A---GC-AGAAA-----CAttaaac
gi|49 : -TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------C--------------C-------------T-GATTTTCTTT-T-----A-TTT--GC-----A-----A-----TAAA---------C---A---A--T--TTTAC--GA-GAAA--T---TAA---C-A--AGCCTA--T--CT---T---GC-AAAAA-----GAGTAAAT--TGTAATGTTATAT-T---AT---CAGA-------AA------AATAT-C-T---A--AA--A-Aaataagaatacgttttataa
gi|5 : T-CAT-C--AA-GC--ATT----TG---AA-T-----CT-ACATCCCA----G------AC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------C-------------T-GACA-----T-ATTTTCA-TTT--GA-----AT-G--A-----ATAA---------C---A---A--C--TTTAC--A--GTAT--T---TTT---T-TTTATATTT--T--CT---T---GC-TTCTA-----TAACCAAT--TTCAATG---CAT-T---AT---CAT--------AT------TATAT-C-T---A--AA--A-ATT-----A----C---A----TT---CATAACT---AAA-------------T---ATTTT--GCTG-------------CA-AAAAT-TT--------------------TT-T-----------T-T-------T-TTTG-----AA--A----T--GGCA-ATT---T-AA--G-TT-T-C--AGAC--CAA---AAATGTTTT--ATGA
gi|50 : TAGATT-CAT-C----------TC----AG---AA-T-----CC-A------A----A----------C------A--------------T--------T--T------A-----A------------C-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TCT--GC-----AT-T--A-----GAAA---------C---A---A--T--ATTTC--AG-GGAA--T---TGA---C-T--ACATGT--T--CTTCCT---GC-AAAAA-----AA--CAATGATTCAttgcaagccctg
gi|51 : aTGAGTT-CAT-CGAAA-AC--TCG-----G---AT-T-----C---------A----A------AC-TC------AA------AAA----C--------T--G------A-----T------------A-------T--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--------AAAA---------C---A---T--TTCTTTAC--AA-GAAA--TGTATAA---C-ctatgaaac
gi|52 : taattcagtgtaAT-T---TT---AAA--------AA------AATAC--------------A-AAT-----A----C---GTACATT---TTTAACA---TAA-------------T---ATTTT--GCTA-----------T-TA-AAAAG-TA--------------------CT-T--A--AGA-A-T-CG-ACAA-T-TCTG-----AG--T----
gi|53 : taattaatga--TTTAC--AA-GGAA--T---GAA---C-A--ATATTT--T--CC---TAAAAA-AAAAA-----AAATAAAT--TCCAATGATACTT-T---AT---CAG--------AA------TAAAT-C---------G--A-ATT-----A----C---AC---TT---TTTAACT---atgtgt
gi|54 : TGAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------TG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----AAAC---------C---A---A--A--TTTTCTAAA-GAAA--
gi|55 : tAATTATAT-C--AA-AC--TTT----TT---AG-T-----CT-A------A----A------AC-TC------CG------A------CTCAGAATTT--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----T-TCT--GC-----AT-T--T-----TAAC---------C---A---AATT--TTCTC--AA-GAAA--
gi|57 : tTTTT--GCTA-----------T-TA-AACA--TA--------------------TTAA--A--A-A-A-T-CG-ACAA-T-TTTT-----AGT-T----T--G--A-GGC---T-GA--G-TT-T-T--AAGC-CC
gi|58 : cA-------------C---ATTTT--CCTA-----------T-TA-AA-AC-TA--------------------TT-T--A--A-A-A-TTCA-GCAA-T-TCAG-----AG--T----TT-G--A-GTC---T-GG--G-TG-T-T--AGGC-TCAA---TA--GTTGG--ATGGAtgaacctcttaaacgtt
gi|59 : ---AAA-------------T---ATTTC--GCTA-----------T-TA-AAATG-TA--------------------TT-T--A--A-A-G-T-TG-GCAT-T-TCTG-----AGT-T----T--G--A-GTC---T-TA--G-AA-T-T--GGAC-TCAA---AA--
gi|6 : taTAAATT-TAT-C--AA------------TG---AG-C-----TT-A---------------------TC------AA------A------A--------TG-T------G-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GT-----AT-T--A-----TTAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--AA--TAA---C-A--ACATTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----CAATAAAT--TTCAATGATACAT-T---GT---TAG--------AA------ATTAT-C-T---A--AA--A-TCT-----G----C---AT---TT---TATAACT---ACATGTATATACATTGT---ATTTT--GATG-----------T-TT-AAATG-TA--------------------TT-T--A--A-A-C-A-AG-GAAA-A-TTTG-----AC--T----T--G--A-GTC---G-GA--T-GC-T-T--AGAC-TCTA---AA--
gi|60 : cc--TTT----TG---AG-T-----AT-A------A----A------AC-TT------GA------A------A--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------G-------------T-G--------T-A-----A-TTC--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTAAC--AA-AAAG--T---TAA---ttctga
gi|62 : AAA--T---CAA---CCA--A-------T--CT---T---AC-AAAAG-----CAGTCAGT--TGCAATGTTTCAC-T---AT---CAG--------AA------AATGT-G-T---A--AA--
gi|7 : TAAATT-CAT-C--CA-AC--TTT----TG---AG-T-----TT-A------A----A------AA-TC------AG------A------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------T--------------T-------------T-G--------T-A-----A-TTT--GC-----AT-T--A-----AAAA---------C---A---A--T--TTTAC--AA-GAAA--T---TAA---C-A--AGATTT--C--CT---T---AC-AAAAA-----CAGTCAAT--GTCACTGTTAAAC-T---AC---CAT--------CA------AATAT-C-T---A--AA--C-AAT-----A----T---GG---TT---TCTGACT---AAA-------------C---ATTTT--GCTG-----------T-TT-AATAA-TA--------------------TT-C--A--G-A-G-T-CA-ACAA-T-TTTG-----AG--T----TAAG--A-GTC---A-GA--T-TT-TGT--AGAC-TCAA---AA--GTATT--ATGAA
gi|8 : TAAACT-TAT-T--CA-AC--GTT----TG---AG-T-----CT-A------A----A------AA-TC------AG------T------C--------T--C------A-----A------------A-------A--------TCAAAATCTGAAATTT-------------T-G--------T-G-----A-TTT--GC-----CT-T--A-----AAA----------T---A---T--T--TTTAC--AA-AAAA--T---T---------------T--T--CT---T----C-AAAAA-----AA---AAA--TTCAATGTAACAT-T---AT---CAG--------AA------AATAT-C-T---C--AA--A-TAT-----A----T---GT---TT---TAT-ATT---GAA-------------CTAGATTTT--GCTA-----------T-TA-ACTTA-TA--------------------TT-T--A--A-A-ATT-CG-ATAA-TATTTA-----TT--T----T--C--A-ATC---T-GA--G-AT-T-T--AGAC-TCAA---AT--ATTTT--AT
gi|9 : ctATT-CAT-C--AA-TC--TTT----TG---AT-T-----CT-A------A----ATGTCAGAC-TC------AA------A------C--------T--C------A-----A------------ATTCTGAAA--------T--------------T-------------TTG--------T-A-----A-TTT--GC-----TT-A--A-----AAAA---------T---A---A--T--TTTAT--AA-GAAA--T---TGA---C-A-----TTT--T--CT---T---GC-AAAAA-----TATTCAAT--TTCAAGGTTACAT-T---AT---TAG----------------AATAT-C-T---A--AAT-A-AAA-----A----G---GT----------TA------AAA-------------C---A-CTT--GCTA-----------T-TC-TTTTGCTA--------------------TT-T-------A-C-T-CT-GCAA-T-TTTGA----AA--T----T--G--A-GTT---T-GA--G-TA-C-T--AGAA-TGAA---AA--GATTT--ATGAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|56 ): AAAACAAAACTTTTAAACTGAAATTAACAGTTACTAGATATATTTCGAAAAGGAGACAAAGAAATGCTAGCGAGAATCGT
Unaligned ( gi|61 ): GAATTGATGCTTGTGGAACAATTTTTGGGTATTAAAAACTTTTTCAAGCCAAGACAGTTTACATC