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Reference ( gi|11 )           :                                                                                                                                                ATATTAGATCCTT-TA----CATAAAATGA-A--ATATC-TAATGAGTAATTGTCAAGGAAAGGTGGCAAAGTTTTTGACTCAGGC---ATAT---CTAAAAAAG--AGAAACTCCATTTGCACTACTACCT----AATCACCGTAT---T---TCCAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATTAT-TCTATTTATGT-----TCCATTGCTTATTATAATGTGTAATTGCATATTACT
gi|9                          :                                                                                                                                                ATGTTAGATTATA-TA----CATAAAATGA-A--ACATC-TAATGCACACGTTTCAAAGAAAGGAGGTAGAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAATG--TGGAACTC-AGTTATCCTTCTATCT----AATTACAATAT---C---TACAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTATC---TTCATCAT-TATGTTTATGC-----TCCATTGCTAATTATCATTTGATATTGCATATTA
gi|2                          :                                                                                                       aaatgataatgcagcatgttataaaaacctgagactatgtaATATTAAGT---T-TATATTCATAAAATAA-A--ACATC-TTATGACCAATTGTCAAAGATAGGTGGCAACATTTTCGGCGAAAGC---TTGT---TAAAAAAAG--AGAAACTTTATTTATACTACTATTC----AGTTGCCATAT---C---TACAT------CTGTGCTTTTG-AAGTTTACC---TACATTAGATATGTTT-TAA-----CCCATTGCTTATTATTATat
gi|3                          : tttatttaaagacaatgtcgtgggtgaaccgtatgtcatcatgccaggcgcaatagaaacgaattatatttcattttagactctacgttttatgttggctttaataatgcaacactacggggtgtcatgaaaccagagtctcaATGTTGGATTCTG-TA----CATAAAATGG-A--ATATT-TAATGAGCATTTGTCAAAGACGTGTGGAAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---C--------------------TTTACACTACTATTT----AATAA------------------------TTGTGCTTTTGAAAATTTACC---TGCATTAT-TCTTTTTATGT-----TCAATTGCATATTtgatagtgacttgaaggccattgagccagatgctcaattatttatattttcgtaatatatacgcttttgtattactatgcatatgtcacttta
gi|1                          :                                          gtagaagacgagtcacatttcttattagactgttcattttatgtagacttacgaaatgcaaatctacaggttctcattgaaaccagatactattaaaattgaATGTTAGATTATG-TA----CAAAAGAAAA-AGCACAAC-TTATGAACAATTGTCAAAGAAAATAGGCAAACCTGTTAACAAATGC---AAAT---TTAAAAAGGAAAAAAAATCTATTTA---TACTACCTGATAAATTACTATAT---G---TGCAC------CTGTGCTTTAGATAG-GTACC---TACATTAT-TATATTTATGCTTTAATCTATTGCGTTTTATCATATGAAATTGCATATTTCTggcagtgacttatacgcccaccgttcgggtaatctactatttatcatcttgtaatacatacattattgtattgtcatgaacatgtcactgtattaaactactcactcacttaca
gi|15                         :                               gtgatcatggtgcagtagtagaagacaaatcacatgtcttactagcctgtactatatatgttgaattacgaaatacaatcctacgggttatgattgaaaccagagaatatagaATGTAAGATTCTG-TA----CATGGAATGA-A--ATATC-TAATGAcatatttattggcatgggccgggtgctctaagtatcatgttaaatataaacgttattgtaatgtcatgcacatgccacttgaatgcattatttactaacttacttatatgattacataatacgta
gi|16                         :                                                                                                         atgtcaactaaagaaatgcaaccttacacgatgtcattgaaattatataCTTATA----TATAAAATTTTA--ATATTATAATGAAAAATTGTCAAAAAAAAGTGGCCAAGTTTTTGATTTAGGCACTACAT---CTAAAAAaca
gi|10                         :                                                                                                                                                                      aAAAATGA-A--ATATC-TAATGAACAATTGTCAAAGAAAGATGGCAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAC---ATTAAATTG--AGAAGTTCTATTTACGCTACAATTT----AATCACAATG----------CAA------TTGTGCTTTTAAACGT------------TTAT-TCTAGTTAGGT-----TCACCTGCTAAATATCA--TGTAACTGCATATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                    atgAAGACGA-A--ATATC-TTATGCAAAATTGTAAAAGAAAGGTGGCAATATTTTTTAC--------------------AAAAGC-ATAAAT--------CACTACCATTT----AA----CATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTCAAAAGTGACC---TTAATTAT-TATATATATTT-----TCCATTGCTTATTATCATGTGAAATTGCATATTATTggcattgacttatacgaacactgggctgggtggtctgctatttatcattttttacaacatattc
gi|18                         :               tattctatctaaagacaatttcgtgagtgtaccatttgtgaacatgccgatttttaaaattgaacgatcatttgacactatttaggcgtgatattcttccattgaggattaaaataggcaaaaacgtaggcgaaagtcataatcaaatactttaccggctctgtgtcgcgggggcagtagTGTCAAAGAAAG-TGGCAATGGTTT-GACAAAAGC---ATATTATCTAAAAAGG--AGAAACTCTGTTTATACTACTACCT----AATtctatttattgaca
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                     ttatattcgttacgtaaagactcactacacaGC---ATAT---ATAAAAAGG--AGAAAGCTTAATTACACTACTATTT----AATCACCATAT---TAGGTGAAT------TTGTGCTTTTGTAAGTTTACAAGATACATTAA-TCTATGTACGT-----TCCATTGCTTATTATCATGTGAAATTGCATATTACTtctatttactggcaatgccttatagtcgcagtgtcattataattactc
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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|6 ): TACTTAAAGCCAAATTTGTGAGTGAACACTATGTGAACATGTCGCTTATTAAAAATGAACGAACAATTTTGGCACTATTCAGGTGCAGTATTCTTGCATTGGTTATAGGAACAGGTCGACATGTCGGCGAAAGTCCTAATCAAGATCTTTGCCGGTTCTGTGATAAAGGAACACGGGAATACGAATCACATTTCTTATTAGACTACTTTTTATGTCAACTTAAGAAATACTACCAATCAGGATGTCATTAAAACCAGAGAATATAT
Unaligned ( gi|7 ): GGAGAAATGTTGAGCCTATTTATGCAACTACTTGATTTATTATCATGTGTGTATTGGTGCTTTGCATACATTATTTTATACATATTTAATTCTTAAATTATTATTATGTGAATTTTCATTTTATTCTATTTATTGGCAGTGCCTATTATACAAGAGTTCTACTTATGATTTTGTAATTTATGGTTATTGTTTTGTCATGAACATGTCACTATAAACTACCTACTACTTACCTACTTACTTACTTATGTACGTACGTACGT
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Unaligned ( gi|17 ): ACTTTGCAGGTTCTGTGACACAGTTGCAGTGGAAGACGAATCTCATGTCTTAATCGAATGGTGCTTTCTAAGTTGAATAAAGA
Unaligned ( gi|19 ): TGGACTGGGTGCTCTAATATCTATATTTCGTAATATAAATGTTATACTATTGTTATGCACATGTCACTA
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Reference ( family-306 )      :                                                                                                                                                ATGTTAGATTCTGTA--CATAAAATGA-A--ATATC-TAATGAACAATTGTCAAAGAAAGGTGGCAANGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAAGG--AGAAACTCTATTTACACTA-CTATTTAATCACCATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATTAT-TATATTTATGT-----TCCATTGCTTATTATCATGTGAAATTGCATATTACT
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gi|10                         :                                                   gtgatcatggtgcagtagtagaagacaaatcacatgtcttactagcctgtactatatatgttgaattacgaaatacaatcctacgggttatgattgaaaccagagaatatagaAAAATGA-A--ATATC-TAATGAACAATTGTCAAAGAAAGATGGCAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAC---ATTAAATTG--AGAAGTTCTATTTACGCTA-CAATTTAATCACAA----------TGCAA------TTGTGCTTTTAAACGT------------TTAT-TCTAGTTAGGT-----TCACCTGCTAAATATCATGT--AACTGCATATTcatatttattggcatgggccgggtgctctaagtatcatgttaaatataaacgttattgtaatgtcatgcacatgccacttgaatgcattatttactaacttacttatatgattacataatacgta
gi|11                         :                                                                                                                                             atgATATTAGATCCTTTA--CATAAAATGA-A--ATATC-TAATGAGTAATTGTCAAGGAAAGGTGGCAAAGTTTTTGACTCAGGC---ATAT---CTAAAAAAG--AGAAACTCCATTTGCACTA-CTACCTAATCACCGTAT---T---TCCAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATTAT-TCTATTTATGT-----TCCATTGCTTATTATAATGTGTAATTGCATATTACTggcattgacttatacgaacactgggctgggtggtctgctatttatcattttttacaacatattc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                             AAACGC---ATAT---ATAAAAAGG--AGAAAGCTTAATTACACTA-CTATTTAATCACCATAT---TAGGTGAAT------TTGTGCTTTTGTAAGTTTACAAGATACATTAA-TCTATGTACGT-----TCCATTGCTTATTATCATGTGAAATTGCATATTACT
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gi|15                         :                                                                                                                                                ATGTAAGATTCTGTA--CATGGAATGA-A--ATATC-TAATGAACAttctgttgacttctattg
gi|16                         :                                                                                                          atgtcaactaaagaaatgcaaccttacacgatgtcattgaaattatataTATA--TATAAAATTTTA--ATATTATAATGAAAAATTGTCAAAAAAAAGTGGCCAAGTTTTTGATTTAGGCACTACAT---CTAAAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                             actTGTCAAAGAAAG-TGGCAATGGTTT-GACAAAAGC---ATATTATCTAAAAAGG--AGAAACTCTGTTTATACTA-CTACCTAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                ATATTAAGTT-TATATTCATAAAATAA-A--ACATC-TTATGACCAATTGTCAAAGATAGGTGGCAACATTTTCGGCGAAAGC---TTGT---TAAAAAAAG--AGAAACTTTATTTATACTA-CTATTCAGTTGCCATAT---C---TACAT------CTGTGCTTTTG-AAGTTTACC---TACATTAGATATGTTT-TAA-----CCCATTGCTTATTATTAT-TGAtg
gi|3                          : tttatttaaagacaatgtcgtgggtgaaccgtatgtcatcatgccaggcgcaatagaaacgaattatatttcattttagactctacgttttatgttggctttaataatgcaacactacggggtgtcatgaaaccagagtctcaATGTTGGATTCTGTA--CATAAAATGG-A--ATATT-TAATGAGCATTTGTCAAAGACGTGTGGAAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---C--------------------TTTACACTA-CTATTTAATAA------------------------TTGTGCTTTTGAAAATTTACC---TGCATTAT-TCTTTTTATGT-----TCAATTGCATATTGGCA-GTGAtagtgacttgaaggccattgagccagatgctcaattatttatattttcgtaatatatacgcttttgtattactatgcatatgtcacttta
gi|4                          :                                                              gtagaagacgagtcacatttcttattagactgttcattttatgtagacttacgaaatgcaaatctacaggttctcattgaaaccagatactattaaaattgaAAGACGA-A--ATATC-TTATGCAAAATTGTAAAAGAAAGGTGGCAATATTTTTTACAAAAGC---ATA------------------AAT--------CACTA-CCATTTAA----CATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTCAAAAGTGACC---TTAATTAT-TATATATATTT-----TCCATTGCTTATTATCATGTGAAATTGCATATTATTcttatacgcccaccgttcgggtaatctactatttatcatcttgtaatacatacattattgtattgtcatgaacatgtcactgtattaaactactcactcacttaca
gi|8                          :             tattctatctaaagacaatttcgtgagtgtaccatttgtgaacatgccgatttttaaaattgaacgatcatttgacactatttaggcgtgatattcttccattgaggattaaaataggcaaaaacgtaggcgaaagtcataatcaaatactttaccggctctgtgtcgcgggggcagtagGTCACAGATGGCTGGCAACGGTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTTAAAAGG--GGAAACTTTAATTAAACTA-CTTTTTAATCAACATATAATC---TGCATAAAATGTTTTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATAAT-TCTATTTAAGT-----TCGATTACTTATTATCATGTGAAATTGCATATTATTtctatttattgaca
gi|9                          :                                                                                                                 ttatattcgttacgtaaagactcactacacaATGTTAGATTATATA--CATAAAATGA-A--ACATC-TAATGCACACGTTTCAAAGAAAGGAGGTAGAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAATG--TGGAACTC-AGTTATCCTT-CTATCTAATTACAATAT---C---TACAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTATC---TTCATCAT-TATGTTTATGC-----TCCATTGCTAATTATCATTTGATATTGCATATTAtctatttactggcaatgccttatagtcgcagtgtcattataattactc
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|6 ): TACTTAAAGCCAAATTTGTGAGTGAACACTATGTGAACATGTCGCTTATTAAAAATGAACGAACAATTTTGGCACTATTCAGGTGCAGTATTCTTGCATTGGTTATAGGAACAGGTCGACATGTCGGCGAAAGTCCTAATCAAGATCTTTGCCGGTTCTGTGATAAAGGAACACGGGAATACGAATCACATTTCTTATTAGACTACTTTTTATGTCAACTTAAGAAATACTACCAATCAGGATGTCATTAAAACCAGAGAATATAT
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Unaligned ( gi|12 ): TTGTTTAAAAACAAGTTTGTGCGTAAACCACATGTGGACATGCTGCTTATTAAACGTTAACGATGAATTCTGAAACAAAATGATGATTAAAACAGGTCGATGCGTGAGTAGAAGTCAGATTCAGAGACTCTGCTGATTCTGTGGCACAGGTGAAGTAG
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Unaligned ( gi|19 ): TGGACTGGGTGCTCTAATATCTATATTTCGTAATATAAATGTTATACTATTGTTATGCACATGTCACTA
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Reference ( family-306 )      :                                                                                                                                                ATGTTAGATTCTGTA--CATAAAATGA-A--ATATC-TAATGAACAATTGTCAAAGAAAGGTGGCAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAAGG--AGAAAC------TCTATTTAC---ACTA-CT--ATTTAATCACCATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATTAT-TNTATTTATGT-----TCCATTGCTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTACT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                             AAACGC---ATAT---ATAAAAAGG--AGAAAG------CTTAATTAC---ACTA-CT--ATTTAATCACCATAT---TAGGTGAAT------TTGTGCTTTTGTAAGTTTACAAGATACATTAA-TCTATGTACGT-----TCCATTGCTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        tTTAT---ACTA-CT--GTTTAATCACCATAT---T---TACAT------TTGCGTTTTTGAAAGTTTACC---TGTATTAT-TATATTTATGT-----TCCATTGCTTA-----TTATCtctatt
gi|15                         :                                                                                                                                                ATGTAAGATTCTGTA--CATGGAATGA-A--ATATC-TAATGAACAttctgttgacttctattg
gi|16                         :                                                                                                          atgtcaactaaagaaatgcaaccttacacgatgtcattgaaattatataTATA--TATAAAATTTTA--ATATTATAATGAAAAATTGTCAAAAAAAAGTGGCCAAGTTTTTGATTTAGGCACTACAT---CTAAAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                             actTGTCAAAGAAAG-TGGCAATGGTTT-GACAAAAGC---ATATTATCTAAAAAGG--AGAAAC------TCTGTTTAT---ACTA-CT--ACCTAAT
gi|2                          :                                                                                                                                                ATATTAAGTT-TATATTCATAAAATAA-A--ACATC-TTATGACCAATTGTCAAAGATAGGTGGCAACATTTTCGGCGAAAGC---TTGT---TAAAAAAAG--AGAAAC------TTTATTTAT---ACTA-CT--ATTCAGTTGCCATAT---C---TACAT------CTGTGCTTTTG-AAGTTTACC---TACATTAGATATGTTT-TAA-----CCCATTGCTTA-----TTATTAT-TGAtg
gi|3                          : tttatttaaagacaatgtcgtgggtgaaccgtatgtcatcatgccaggcgcaatagaaacgaattatatttcattttagactctacgttttatgttggctttaataatgcaacactacggggtgtcatgaaaccagagtctcaATGTTGGATTCTGTA--CATAAAATGG-A--ATATT-TAATGAGCATTTGTCAAAGACGTGTGGAAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---C--------------------------TTTAC---ACTA-CT--ATTTAATAA------------------------TTGTGCTTTTGAAAATTTACC---TGCATTAT-TCTTTTTATGT-----TCAATTGCATA-----TTGGCA-GTGAtagtgacttgaaggccattgagccagatgctcaattatttatattttcgtaatatatacgcttttgtattactatgcatatgtcacttta
gi|4                          :                                                              gtagaagacgagtcacatttcttattagactgttcattttatgtagacttacgaaatgcaaatctacaggttctcattgaaaccagatactattaaaattgaAAGACGA-A--ATATC-TTATGCAAAATTGTAAAAGAAAGGTGGCAATATTTTTTACAAAAGC---ATA------------------AAT--------------C---ACTA-CC--ATTTAA----CATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTCAAAAGTGACC---TTAATTAT-TATATATATTT-----TCCATTGCTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTATTcttatacgcccaccgttcgggtaatctactatttatcatcttgtaatacatacattattgtattgtcatgaacatgtcactgtattaaactactcactcacttaca
gi|7                          :                                                                tattctatctaaagacaatttcgtgagtgtaccatttgtgaacatgccgatttttaaaattgaacgatcatttgacactatttaggcgtgatattcttccattgaggattaaaataggcaaaaacgtaggcgaaagtcataatcaaatactttaccggctctgtgtcgcgggggcagtagGG--AGAAATGTTGAGCCTATTTATGCAACTA-CTTGATTTA-TTATCATGT---G---TGTAT------TGGTGCTTT---------GCA---TACATTAT-TTTATACATAT-----TTAATT-CTTAAATTATTATTATGTGAATTTTCATTTTATTtctatttattgaca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                 GTCACAGATGGCTGGCAACGGTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTTAAAAGG--GGAAAC------TTTAATTAA---ACTA-CT--TTTTAATCAACATATAATC---TGCATAAAATGTTTTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATAAT-TCTATTTAAGT-----TCGATTACTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTATTctatttattggcagtgcctattatacaagagttctacttatgattttgtaatttatggttattgttttgtcatgaacatgtcactataaactacctactacttacctacttacttacttatgtacgtacgtacgt
gi|9                          :                                                                                                                 ttatattcgttacgtaaagactcactacacaATGTTAGATTATATA--CATAAAATGA-A--ACATC-TAATGCACACGTTTCAAAGAAAGGAGGTAGAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAATG--TGGAAC------TC-AGTTAT---CCTT-CT--ATCTAATTACAATAT---C---TACAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTATC---TTCATCAT-TATGTTTATGC-----TCCATTGCTAA-----TTATCATTTGATATTGCATATTAtctatttactggcaatgccttatagtcgcagtgtcattataattactc
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-306 )      :                                                                                                                                                ATGTTAGATTCTGTA--CATAAAATGA-A--ATATC-TAATGAACAATTGTCAAAGAAAGGTGGCAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAAGG--AGAAAC------TCTATTTAC---ACTA-CT--ATTTAATCACCATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATTAT-TNTATTTATGT-----TCCATTGCTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTACT
gi|1                          :                                                                                                                                                ATGTTAGATTATGTA--CAAAAGAAAA-AGCACAAC-TTATGAACAATTGTCAAAGAAAATAGGCAAACCTGTTAACAAATGC---AAAT---TTAAAAAGGAAAAAAAA------TCTATTTAT---ACTACCT--GATAAATTACTATAT---G---TGCAC------CTGTGCTTTAGATAG-GTACC---TACATTAT-TATATTTATGCTTTAATCTATTGCGTT-----TTATCATATGAAATTGCATATTTCT
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gi|4                          :                                                              gtagaagacgagtcacatttcttattagactgttcattttatgtagacttacgaaatgcaaatctacaggttctcattgaaaccagatactattaaaattgaAAGACGA-A--ATATC-TTATGCAAAATTGTAAAAGAAAGGTGGCAATATTTTTTACAAAAGC---ATA------------------AAT--------------C---ACTA-CC--ATTTAA----CATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTCAAAAGTGACC---TTAATTAT-TATATATATTT-----TCCATTGCTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTATTcttatacgcccaccgttcgggtaatctactatttatcatcttgtaatacatacattattgtattgtcatgaacatgtcactgtattaaactactcactcacttaca
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gi|9                          :                                                                                                                 ttatattcgttacgtaaagactcactacacaATGTTAGATTATATA--CATAAAATGA-A--ACATC-TAATGCACACGTTTCAAAGAAAGGAGGTAGAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAATG--TGGAAC------TC-AGTTAT---CCTT-CT--ATCTAATTACAATAT---C---TACAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTATC---TTCATCAT-TATGTTTATGC-----TCCATTGCTAA-----TTATCATTTGATATTGCATATTAtctatttactggcaatgccttatagtcgcagtgtcattataattactc


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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore                  :                                                                                                                                                          7 4  99          4 11     4                       6      0               444    444  1    0 00     1111111111 1   9999    3  66       4 5     2222222     555555                     444 6      6 0         11111  5        11111                         
consensus                     :                                                                                                                                                ATGTTAGATTCTGTA--CATAAAATGA-A--ATATC-TAATGAACAATTGTCAAAGAAAGGTGGCAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAAGG--AGAAAC------TCTATTTAC---ACTA-CT--ATTTAATCACCATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATTAT-TNTATTTATGT-----TCCATTGCTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTACT
Reference ( family-306 )      :                                                                                                                                                ATGTTAGATTCTGTA--CATAAAATGA-A--ATATC-TAATGAACAATTGTCAAAGAAAGGTGGCAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAAGG--AGAAAC------TCTATTTAC---ACTA-CT--ATTTAATCACCATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATTAT-TNTATTTATGT-----TCCATTGCTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTACT
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gi|16                         :                                                                                                          atgtcaactaaagaaatgcaaccttacacgatgtcattgaaattatataTATA--TATAAAATTTTA--ATATTATAATGAAAAATTGTCAAAAAAAAGTGGCCAAGTTTTTGATTTAGGCACTACAT---CTAAAAA
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gi|2                          :                                                                                                                                                ATATTAAGTT-TATATTCATAAAATAA-A--ACATC-TTATGACCAATTGTCAAAGATAGGTGGCAACATTTTCGGCGAAAGC---TTGT---TAAAAAAAG--AGAAAC------TTTATTTAT---ACTA-CT--ATTCAGTTGCCATAT---C---TACAT------CTGTGCTTTTG-AAGTTTACC---TACATTAGATATGTTT-TAA-----CCCATTGCTTA-----TTATTAT-TGAtg
gi|3                          : tttatttaaagacaatgtcgtgggtgaaccgtatgtcatcatgccaggcgcaatagaaacgaattatatttcattttagactctacgttttatgttggctttaataatgcaacactacggggtgtcatgaaaccagagtctcaATGTTGGATTCTGTA--CATAAAATGG-A--ATATT-TAATGAGCATTTGTCAAAGACGTGTGGAAAAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---C--------------------------TTTAC---ACTA-CT--ATTTAATAA------------------------TTGTGCTTTTGAAAATTTACC---TGCATTAT-TCTTTTTATGT-----TCAATTGCATA-----TTGGCA-GTGAtagtgacttgaaggccattgagccagatgctcaattatttatattttcgtaatatatacgcttttgtattactatgcatatgtcacttta
gi|4                          :                                                              gtagaagacgagtcacatttcttattagactgttcattttatgtagacttacgaaatgcaaatctacaggttctcattgaaaccagatactattaaaattgaAAGACGA-A--ATATC-TTATGCAAAATTGTAAAAGAAAGGTGGCAATATTTTTTACAAAAGC---ATA------------------AAT--------------C---ACTA-CC--ATTTAA----CATAT---C---TGCAT------TTGTGCTTTTCAAAAGTGACC---TTAATTAT-TATATATATTT-----TCCATTGCTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTATTcttatacgcccaccgttcgggtaatctactatttatcatcttgtaatacatacattattgtattgtcatgaacatgtcactgtattaaactactcactcacttaca
gi|7                          :                                                                tattctatctaaagacaatttcgtgagtgtaccatttgtgaacatgccgatttttaaaattgaacgatcatttgacactatttaggcgtgatattcttccattgaggattaaaataggcaaaaacgtaggcgaaagtcataatcaaatactttaccggctctgtgtcgcgggggcagtagGG--AGAAATGTTGAGCCTATTTATGCAACTA-CTTGATTTA-TTATCATGT---G---TGTAT------TGGTGCTTT---------GCA---TACATTAT-TTTATACATAT-----TTAATT-CTTAAATTATTATTATGTGAATTTTCATTTTATTtctatttattgaca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                 GTCACAGATGGCTGGCAACGGTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTTAAAAGG--GGAAAC------TTTAATTAA---ACTA-CT--TTTTAATCAACATATAATC---TGCATAAAATGTTTTGCTTTTGAAAGTTTACC---TACATAAT-TCTATTTAAGT-----TCGATTACTTA-----TTATCATGTGAAATTGCATATTATTctatttattggcagtgcctattatacaagagttctacttatgattttgtaatttatggttattgttttgtcatgaacatgtcactataaactacctactacttacctacttacttacttatgtacgtacgtacgt
gi|9                          :                                                                                                                 ttatattcgttacgtaaagactcactacacaATGTTAGATTATATA--CATAAAATGA-A--ACATC-TAATGCACACGTTTCAAAGAAAGGAGGTAGAGTTTTTGACAAAGGC---ATAT---CTAAAAATG--TGGAAC------TC-AGTTAT---CCTT-CT--ATCTAATTACAATAT---C---TACAT------TTGTGCTTTTGAAAGTTTATC---TTCATCAT-TATGTTTATGC-----TCCATTGCTAA-----TTATCATTTGATATTGCATATTAtctatttactggcaatgccttatagtcgcagtgtcattataattactc
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|6 ): TACTTAAAGCCAAATTTGTGAGTGAACACTATGTGAACATGTCGCTTATTAAAAATGAACGAACAATTTTGGCACTATTCAGGTGCAGTATTCTTGCATTGGTTATAGGAACAGGTCGACATGTCGGCGAAAGTCCTAATCAAGATCTTTGCCGGTTCTGTGATAAAGGAACACGGGAATACGAATCACATTTCTTATTAGACTACTTTTTATGTCAACTTAAGAAATACTACCAATCAGGATGTCATTAAAACCAGAGAATATAT
Unaligned ( gi|12 ): TTGTTTAAAAACAAGTTTGTGCGTAAACCACATGTGGACATGCTGCTTATTAAACGTTAACGATGAATTCTGAAACAAAATGATGATTAAAACAGGTCGATGCGTGAGTAGAAGTCAGATTCAGAGACTCTGCTGATTCTGTGGCACAGGTGAAGTAG
Unaligned ( gi|17 ): ACTTTGCAGGTTCTGTGACACAGTTGCAGTGGAAGACGAATCTCATGTCTTAATCGAATGGTGCTTTCTAAGTTGAATAAAGA
Unaligned ( gi|19 ): TGGACTGGGTGCTCTAATATCTATATTTCGTAATATAAATGTTATACTATTGTTATGCACATGTCACTA
Unaligned ( gi|20 ): TAGACATTTCATTATGGCGATAAAAATAAAACCTATAAAACAACAAAACCTTAAATTGT
Unaligned ( gi|21 ): CTACCATTCATCATTTTGTAATACATTTATTATTGTACTGTTATGTACAT
Unaligned ( gi|22 ): TTATATTCATAATACGACCATGCACATGTTACTTTAAT