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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TACAATAA--GAA---ACAAGAGGCCCAAGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAGCACTTTTTG----AAATTCCACAATATCTAC---CCTCCTTG--GGGG-A---GTC-ATCTT--ATCAACTTATGGATAAATACCTC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAA--CTTAAT-TGCTATGAAAAA--GAAATAATTCAAA---------------TTCCCATAC----CATTCATCAGTAAAAAAAAAAATATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATGTGTCAGAA-CTTCAATCACCCACGTCCAACTATT-----T-GTAATGAGCAGA-AATGATTCAAATTT--TA------AAAAGAAG--TCTTTT-TGTACA---CATG-----AATGC-AAA-A-TGGAAAA--A----------AT-CAGTTT---TCCCTATA--ATATTCCTAAG-----TAAAA------GTCA--CA-T--------T-ACAGG
gi|11                         : aaacccactttaatagtgaaataacatgtgtcataatatgttcactgtcacattgatgtcatgggacatttagtgaaaaagacagcatgttcattctgtacataaagttaggcatgtgtagttataaatataactctctttacagattgtataaataatgaattaaatagtaattcttttttatcaaattgctatattgaaaataaacattttagaagacaaccagttcaagtactaacctttaattattatgtttttattttttttccgcttgatatctatagtgccccttatttaaatgtggtaaactgtgacttaatcaatttcacataggcattagataaaaagagtgtcagcgttcttcaaagaaagaaggtaaacatccagactattaattttgcaaattgtATGAGCAA------CAAGAGGGCATGAGGACATTCTACTGGCTTATACTAGTTTTG----TTTTTGTTTTAAAT----TAATATAAAC---CTTTTTGGCAA----------CAATCTTAGTCC--CTAATGGAT-AATATCTC-TGCCCCACT-GTT-------------AATGGACACAAA--TTTAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ataacattagtcaactcatagctACAAAAGCTCCAAGAGGGCCTGAAGACACTTAACTGGCTCATAGTGGCCATAGAACTTTTTG----AAATTTCACAATATTGAC---CCTCTTTG-----G-G---GTT-GTCTT--AACAACTTATAGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAA--CTTAAT-TGCTATGAAAAG--GAATTATTTTAAA---------------TTCCCATAC----CATTCATCTGT-AAAAAAT----ATATAGACCCC-ATACAGAACCCTTATACAACCCAGTCCATTGATTCATCAGAA-CTTCAATCACC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaaacaaGTGTCCATGTCATTTTTTG----AAATGTCATAAAATGAAC---CCT------AATGA-GAA-GTC-GTCTT--ATCAACTTATGGATAAATACCCC-CACCACATC-tg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTTTTTT----AAATTTCACA----TTACAATCCCATTTG---GGG-AACTGTCCATCTG--AACCTCTTATGG-TATATACCCC-CACC-CACC-CATCCCCCACACTCTGGCTGGACAAAAAGTTTTAAT-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaaacagaagaggccagagggggcacgaagaaactttaatgacttACAATATTAAC---CCTTTTTG-------G---GTC-GTCTT--CACCACTTACGGATAAATACCC--CACCCCAAC-CTT-------------ACTGAACAAAAA--GTTAAT-TGCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttttttctaaCTTTG--AGGGTG---GTC-----T--AACAACTTATGGATAAATACCCC-CACCACATC-CAT-------------ACT-AACAAAAA--GTTAAT-aggga
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C-GTCTT--AACAACTTAAGGATAAATACCCT-CACCACACC-CAT-------------ACTTTACAAAAA--CTTAAT-TGaactatg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACAACTTATGGATAAACACCCC-CACCACACC-TA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taAACTTATGAATAAATACCC--CACC-CACC-CAT-------------AATGAACAAAAA--CTTAAT-TGCT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttTTATGGATTAATACCCC-CACCACACCGCA--------------GCTGAACAAAAA--GTTAAT-TACTatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATGAATAAGTGCACC-CACCACATC-CTT-------------ACTAAACAAAAA--GTCAAT-TGCTTTGAAAAG--agaat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATGAACAAATACCTC-CACCAAAAC-CTT-------------ACTGAATAAAAA--GTTAAT-TACTATGAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGTATCCTTCACCCCACT-TTT-------------ACTGGGCAAAAA--GTTATTCTG-TATGAAAAA--GAAAGGCTTTAAAACAGAAATTTGCAGTTTCCCATAC----TATTCCTATATCAAACATA----AGAT---CCCCT-TACATGACCCATATAAACCCCAGCCCCTTAATTTGTCCAAA-TCGCAATC---C-CTT---GTCATTGGGATTAGCTATGATCAGACAATGCTTCAGATCT--CA------T----ATGGATTTTTT-TGTACAAAACA-GAATCTGATCC-AAA-ACT-GAAAT--AT---------AT-TCGTTT---TCCCCAGG--CTATCCCTATA-----TAAAATTAAATGTCC--CT-T--------T-ACAGGGGC----CCTAA-ACATC-CTAGACCATTGAT--TTG-TAGAGATTTCAAT-CCTTTGCTGATGTAAAGATAATTTATAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaACC-CAT-------------ACTGAGCAAGAA--GTTAAT-TGCTATGAAATG--GAATTACTTTAAA---------------TTACTATAC----CATTCATCTGTAAAAAAg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-------------ACTGGACAAAAA--ATTATT-TGCTATGAAAAG--GAAATGCTTT-AA---------------TTC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atggtcatattcatttttgtaatttcacatattttcatatggcatatcatataaaaaatatatacacccctttttAAAGATGAAATATTTCAGT---------------TTACCATATATCATATTCATATG-AAAAGTAA----A---AGTCAC--ATAAAGGGTCCTTACACATCATAGGCC-TTGATTT-TCAGAATCTTTAATC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atttctttttataggaaagtttggggtttaatagaagttttttatgtacacatagattcATT-----T-CTTTTTA-TAGG-AAAGTTTGGGGTTTAATA------G----AAG--TTTTTTATGTACA---CATA-----GATTC-AAAGA-T-GAAAT--A----------TTTCAGTTT---ACCATATATCATATTCATATGAAAAGTAAAA------GTCA--CA----------T-AAAGGG-T----CCTTACACATCATAGGCC--TTGAT--TTT-CAGAATCTTTAAT-CCCTTGCTGATGTAAG---AATTTATAT-------GAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAAAACTTTTGAAAccttgctgatgtaagaatttatatgaacaagttcgatagaaaggtcattgagaaaaaaacttttgaaatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGACAATGCTTTAGGTTT--TATATTGAA----GAG--TTTT----GTAAA---CATG-----AACGCGAAA-A-T-----A--ATTTTTTTTTTAT-CTGTTT---TCCCTATA--ATTACCCTATG-----TGAAA------GTAAGTCATC--------TGACAGGG-CGGGTCCCTATTCATC-CCAGCTCCTTGAT--TTA-CAGAATATTCAATCCC-TTGCTTATGTAAGGATCATTTATATCCCATATGtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -A-T-GAAAAGGA----------AT-TATTTTAAATTCCCATA--CCATTCATCTG-----TAAAA------AATA--TA-TAGACCCCAT-ACAGAA-C----CCTTATACAAC-CCAGTCCATTGATTCAT--CAGAA-CTTCAAT-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaaacaaacaaaagctccaagagggcctgaagacacttaactggctcatagtggccatagaactttttgaaatttcacaatattgaccctctttggggttgtcttaacaacttatagataaatacccccaccacacccatactgaacaaaaacttaattgct--------T-ACAGAA-C----CCTTATACAAC-CCAGCCCCTTAAT--GTGTCAGAA-CTTCAAT-Cacctg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaacccactttaatagtgaaataacatgtgtcataatatgttcactgtcacattgatgtcatgggacatttagtgaaaaagacagcatgttcattctgtacataaagttaggcatgtgtagttataaatataactctctttacagattgtataaataatgaattaaatagtaattcttttttatcaaattgctatattgaaaataaacattttagaagacaaccagttcaagtactaacctttaattattatgtttttattttttttccgcttgatatctatagtgccccttatttaaatgtggtaaactgtgacttaatcaatttcacataggcattagataaaaagagtgtcagcgttcttcaaagaaagaaggtaaacatccagactattaattttgcaaattgttacaataagaaacaagaggcccaagagggcctgaggacgctctactgactcatagtggccatagcactttttgaaattccacaatatctaccctccttgggggagtcatcttatcaacttatggataaatacctccaccacacccatactgaacaaaaacttaattgctatgaaaaagaaataattcaaattcccataccattcatcagtaaaaaaaaaaatatatagtcccctgTTTAACTTTTTTTTGGTCCATC-------CTGGACATTTATGGGAATATAATCTTCTTTATTGAACCAAGTGTAATTATTTTGAATTTTTATTACACAATGGT-------TCAAAT-----------TGAACATTTC-TTTTTACACAAATGAA-ATG-AATGACA---A--AATGA--------------GA---ATATT--------ATA----A--CACT--TGTATacccacgtccaactatttgtaatgagcagaaatgattcaaattttaaaaagaagtctttttgtacacatgaatgcaaaatggaaaaaatcagttttccctataatattcctaagtaaaagtcacattacagg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcccatttaaacctTATGATCAGACAATGCTTCAGATCTCATATGGATTTTTTTGTACAAA--ACAGAAT--C-----TGA------TCCAAAACTGA--AAT-A--------------TATTCGTTTTC------CCCA----GGCTATC--CCTATATAAAATTAA-A-----TGT--C-CCT-TTACAGGGG----CCCTAAACATCCTAGA--CCATTGATTTGTAGA-GATTTCAATCCTTTGCTGA--TGTAAAGATAATTTATAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCCATAC-----------TGAACA--AAA-----AC-----TTAA-TTGCTATGAAA---AGGAATTA--------------------TTTTAAATTCCCATA----C--CATT--CATCTGTAAAA---A-ATATATAGA--C-CCCAT-ACAGAAC----CCTTATACAACCCA--GTCCATTGATTCAT-CAGAACTTCAATcccatatg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaaacaaacaaaagctccaagagggcctgaagacacttaactggctcatagtggccatagaactttttgaaatttcacaatattgaccctctttggggttgtcttaacaacttatagataaatacccccaccacaAA---A--GATGA--------------AAT--ATTTCAGTTTACCATATATCA--TATT--CATATG-AAAAGTAA-A-----AGT--C-ACA-T-AAAGGGT----CCTTACACATCATAG-G--CCTTGATTTTCAGA-ATCTTTAATCCCTTGCTGA--T---GTAAGAATTTA-------TATGAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAA---AACTTTTGA-AATTcacctg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaagtatccttcaccccacttttactgggcaaaaagttattctgtatgaaaaagaaaggctttaaaacagaaatttgcAATATATA--GTCAATTAAATTAAAGTAATAAAATA----AATTTAATAATAAT-------------------AGAAATG----------A--G-AAT-G-TT--------CTCTTTTCTC-ATA--GTATC--CTTGTGTAA-AATTC-TA-AG-TCCCCTAA------------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTA---TCT-------TTA-AGC-----C--AAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC---------GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCTGGACtagctatgatcagacaatgcttcagatctcatatggatttttttgtacaaaacagaatctgatccaaaactgaaatatattcgttttccccaggctatccctatataaaattaaatgtccctttacaggggccctaaacatcctagaccattgatttgtagagatttcaatcctttgctgatgtaaagataatttatatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aacAAAGTAA--TAA-------TGATAATAAAATA-AATTTAATAATAAT-------------------AGAAATG----------A--G-AAT-G-TT--------CTCTTTTCTC-ATA--GTATC--CTTATGTAA-AATTC-TA-AG-TCCCCTAA------------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTA---TCT-------TTA-AGC-----C--AAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC---------GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttATTGAAGAGT---TTTG--TAAACA--TGAACGCGAAA-----------A--T-AAT-T-TTTTTTTTATCTGTTTTCCCTATA----ATTACCCTATGTGA-AAGT---A-AG-TCATCTGACAGGGCGGGTCCCTATTCATCCCAGCTCCTTGAT--TTA----CAG-AATATTCA-ATCCCTTGCTTATGTAAGGATCATTTATATCCCATATtgga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agacaatgctttaggttttatTTTTGTACACATGAATGCAAAATGGAA----------A--A-AAT-------------CAGTTTTCCCTATA--ATATT--CCTAAGTAA--------A-AG-TCACATTACAGGg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaacccactttaatagtgaaataacatgtgtcataatatgttcactgtcacattgatgtcatgggacatttagtgaaaaagacagcatgttcattctgtacataaagttaggcatgtgtagttataaatataactctctttacagattgtataaataatgaattaaatagtaattcttttttatcaaattgctatattgaaaataaacattttagaagacaaccagttcaagtactaacctttaattattatgtttttattttttttccgcttgatatctatagtgccccttatttaaatgtggtaaactgtgacttaatcaatttcacataggcattagataaaaagagtgtcagcgttcttcaaagaaagaaggtaaacatccagactattaattttgcaaattgttacaataagaaacaagaggcccaagagggcctgaggacgctctactgactcatagtggccatagcactttttgaaattccacaatatctaccctccttgggggagtcatcttatcaacttatggataaatacctccaccacacccatactgaacaaaaacttaattgctatgaaaaagaaataattcaaattcccataccattcatcagtaaaaaaaaaaatatatagtcccctgtacagaacccttatacaacccagccccttaatgtgtcagaacttcaatcacccacgtccaactatttgtaatgagcagaaatgattcaaattttaaaaagaagtctATGAAAAAGAAAGGCTTTAAAACA--GAAAT-T-TG--------CAGTTTCCC--ATA--CTATT--CCTATATCA-AA--CATA-AGATCCCCTTACATGAC----CCATATAAACCCCAGCCCCTTAAT--TTG---TCCA-AA---TCGCAATCCCTTG--TCATTGGGATTAGCTATG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaagtatccttcaccccacttttactgggcaaaaagttattctgtAAAAG-------------G-AAT-TATT--------TTAAATTCCC-ATA--CCATT--CATCTGTAAAAAATA-TATAG-ACCCCATACAGAAC----CCTTATAatcagacaatgcttcagatctcatatggatttttttgtacaaaacagaatctgatccaaaactgaaatatattcgttttccccaggctatccctatataaaattaaatgtccctttacaggggccctaaacatcctagaccattgatttgtagagatttcaatcctttgctgatgtaaagataatttatatg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaaacaaacaaaagctccaagagggcctgaagacacttaactggctcatagtggccatagaactttttgaaatttcacaatattgaccctctttggggttgtcttaacaacttatagataaatacccccaccacacccatactgaacaaaaacttaattgctatgAAAG----------ATGA-AATAT-TT--------CAGTTTACCATATATCATATT--CATATG-AA-AAGTA-AA-AG-TCACAT-AAAGGGT----CCTTACACATCATAGGCCTTGA-TTTTCAGAATCTTTAA---TC-----CCTTGCTGATGTAAG---AATTT-------ATATGAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAAAACTTTTGAAATTcaacccagtccattgattcatcagaacttcaatcacctg
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): AAACCTTTATCTATAGTAGGGAGTAAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGACGTCATCGGACATTGGCACAAGGCATTAAGGAAAGGGACAGCGTGTTCATTCTGTGCATAAATTTAGGCATGTGTTACTGTAGTTATAAACATAACTCTCTTTACGGATTGTATCAATTTAATAGTAATTCTTTTTTTAAGAAATTAGTATACTGAAAATAAACATTTTAGAAGACAACTAGTTACAAACAAACACTAACCTTTAATTATTATTATGTTGTTGTTTTTTTCGTTTGTTATCTGTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACCTGAGGTAAATTGTGATGTAATCACTTGCATATCAGCATTAGATCAAAAGTGTAACGTCGGCGTACTTCAAAGAAAGTAGGCAACCGTTCAGACTAGTAATTTTGCAAGTGTTACAATGAAAACA
Unaligned ( gi|20 ): ACCCCTGCCAAGCTCTTAATAGACAAAAAGTTATTTACTAAGAAGAGGAAATGCTTCA






Alignments
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Reference ( family-3043 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACAATAA--GAATGAACAAGAG-C-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGGCTCATAGTGGCCATGGCACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATNNACCCTCTTTG--AGGG-G--GTC-GTCTTAACAACTTATGGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAAGTTAAT-TGCTATGAAAAGGAAATACTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGTAAAAAAAA----ATATAGTCCCCTATACAGGACCCTTATACANCCCAGCCCCTTGATTTGTCAGAACTTCAATCACCCA-CNTCCAGCCATTTGTTATGA-CAGACAATGCTTCAGGTTT--TA------A----AAG--TTTTTT-TGTACA---CATG-----GATNC-AAA-A-T---GAAAAAT---------ATCAGTTTTCCCTATA--ATATTCCTATG-----TAA------AA------GTCA--CATT--ACAGGGC----CCTTATACATCCCAGCCCNT------TGATTTGCAGAATCTTCAATCCCTTGCTGATGTAAGGATAATTTATATCCCATATGAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAAAACTTTTGAAANNNNNNNNNTTTAACTTTTTTTTGGTCCATC-------CTGGACATTTATGGGAATATAATCT--TCTTTATTGAACCAAGTGTAATTATTTTGAA---TTNTNATCAGACAATGCTTCAGGTCTCATATTGAANA---AC--ATTTAC-----TGAAATGNACGAAAAAATGAGAGTTTTCCATANTATTCNTATGTAAAANTAAAAGTCCCTTACAGGGCCCCTATACATCCCAG-GCCCCTTGATTTGTAGAAACTTCAATCCCTTGCTNATAGGGATAATTTATAT----TATGAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAA---AACTTTTGA-AATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATATATAAAGTNAATTAAATTAA-AGTGATAANANAAT-AAATTTAATAATAATTTTGC---AAC-GATGAAAAGAAAAGAGAATTTTCNGTTTTCCCTATANTATTCCTATGTAAAANTCTAAGTCCCCTNACAGGGCCCCTATAAATCCTAGCTCCTTAATACTTATCT--AATCAAGCCCTTGCTACGTANGGAT-ATTTAT--CAAATAT-GAC--GCC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCTGGAC
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gi|10                         : tataataattgaatggacaaacaagagggcctgaggatgctctactgactcatagtggccatagcactttttgaaatgccacaatatttaccctctttgtaagggggtcatctttacaacttatggataaataccctcaccacacccatactgaacaaaaacttaattgctctggaaaggaaatactttaaattcccataccattcatctgtaaaaaaaaatatagtcccctgtacagagcccttatacaacccagcccctttatttgtcagaactttaatcacccacttaaagtcatttgttattagcagaaatgattcaaattttaaaagtttttttgtacacatggatgcaaaatgaaaaaatcagttttccctataatattcctatgtaaaagtcacactatagggccccaatatatccaagccccttgatatgcagaatcttcaatccttgctgatgtaaggataatttatatcaaatatgaactagtttgattgaaatgctattgagaggaaatttgtgaaaattcccaactttaaccttatttccccatctgcccaactggccacttatggaaattcaatcctctttattgaacaaaatcaaatttattattactagacaatgctttagatctcaaattaaacaacatatttactaaaatgtacaaaaaaatgagaattttacatagtatttctatgtaaaactcaaagacccttacagagcctctatacatcccagtgtcccttgatttgtacaaactttgatttcttaatcatagggataatttatataaagtatgaacaaatttaactgaccagttgttgaaaatagttcaattttgataattttgtgaccccatctggccctttttagaaagtcaatccttcgtatcgatcaaaatcatatttgttatgactagaagttgcttcaaaactctaactgaatataaaaagtcataaacgaatgataaaaaactccaattgaataataaTTTAACTTTTTTTTGGTCCATC-------CTGGACATTTATGGGAATATAATCT--TCTTTATTGAACCAAGTGTAATTATTTTGAA---TTTTTATTACACAATGGTTCAA-------ATTGAACATTTCT--TTTTACACAAATGAAATGAATGACAAAATGAGAATATT--ATAACACTTGTATtatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C-GTCTTAACAACTTAAGGATAAATACCCT-CACCACACC-CAT-------------ACTTTACAAAAACTTAAT-TG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGAATAAGTGCACC-CACCACATC-CTT-------------ACTAAACAAAAAGTCAAT-TGCTTTGAAAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aTACAATAA--GAA---ACAAGAGGC-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAGCACTTTTTG----AAATTCC---ACAATATCTACCCTCCTTG--GGGG-A--GTC-ATCTTATCAACTTATGGATAAATACCTC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAAGAAATAATTCAAA---------------TTCCCATACCATTCATCAGTAAAAAAAAAAATATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATGTGTCAGAACTTCAATCACCCA-CGTCCAACTATTTGTAATGAGCAGA-AATGATTCAAATTT--TA------AAAAGAAG--TCTTTT-TGTACA---CATG-----AATGC-AAA-A-T---GGAAAAA---------ATCAGTTTTCCCTATA--ATATTCCTAAG-----TAA------AA------GTCA--CATT--ACAGG
gi|20                         :                                                                          aaacccactttaatagtgaaataacatgtgtcataatatgttcactgtcacattgatgtcatgggacatttagtgaaaaagacagcatgttcattctgtacataaagttaggcatgtgtagttataaatataactctctttacagattgtataaataatgaattaaatagtaattcttttttatcaaattgctatattgaaaataaacattttagaagacaaccagttcaagtactaacctttaattattatgtttttattttttttccgcttgatatctatagtgccccttatttaaatgtggtaaactgtgacttaatcaatttcacataggcattagataaaaagagtgtcagcgttcttcaaagaaagaaggtaaacatccagactattaattttgcaaattgtACCCC-TGCCAAGCT-CTT-------------AATAGACAAAAAGTTATT-TACTAAGAAGAGGAAATGCTTCA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTTATGAATAAATACCCC--ACC-CACC-CAT-------------AATGAACAAAAACTTAAT-TGCTAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttTTATGGATTAATACCCC-CACCACACCGCA--------------GCTGAACAAAAAGTTAAT-TACTA-GAAt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGAACAAATACCTC-CACCAAAAC-CTT-------------ACTGAATAAAAAGTTAAT-TACTATGAAt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAACAACTTATGGATAAACACCCC-CACCACACC-TA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGTATCCTTCACCCCACT-TTT-------------ACTGGGCAAAAAGTTATTCTG-TATGAAAAAGAAAGGCTTTAAAACAGAAATTTGCAGTTTCCCATACTATTCCTATATCAAACATA----AGAT---CCCCT-TACATGACCCATATAAACCCCAGCCCCTTAATTTGTCCAAATCGCAATCCCTTGTCATTGGG--ATTAGCTATGATCAGACAATGCTTCAGATCT--CA------T----ATGGATTTTTT-TGTACAAAACA-GAATCTGATCC-AAA-ACT---GAAATAT---------ATTCGTTTTCCCCAGG--CTATCCCTATA-----TAA------AATTAAATGTCC--CTTT--ACAGGGG----CCCTAAACATCCTAGACCAT------TGATTTGTAGAGATTTCAATCCTTTGCTGATGTAAAGATAATTTATAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaAACAAACAAAAG-CTCCA-AGAGGGCCTGAAGACACTTAACTGGCTCATAGTGGCCATAGAACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATTGACCCTCTTTG-----G-G--GTT-GTCTTAACAACTTATAGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAGGAATTATTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGT-AAAAAAT----ATATAGACCCC-ATACAGAACCCTTATACAACCCAGTCCATTGATTCATCAGAACTTCAATCACCg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaATTTCTTTTTA-TAGGAAA-GTTTGGGGTTTAATA------G----AAG--TTTTTTATGTACA---CATA-----GATTC-AAAGA-T---GAAATAT---------TTCAGTTTACCATATATCATATTCATATGAAAAGTAA------AA------GTCA--CAT---AAAGGGT----CCTTACACATCATAGGCC-T------TGATTTTCAGAATCTTTAATCCCTTGCTGATGTAAG---AATTTATAT-------GAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAAAACTTTTGAAAtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATATATA--GTCAATTAAATTAA-AGTAATAA---AAT-AAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTC-ATAGTATCCTTGTGTAAAATTCTAAGTCCCCTAAC--------TATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGCC------AAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCTGGACtt
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3043 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACAATAATTGAACGAACAAGAG-C-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAG-CACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATNAACCCTCTTTG--AGGG-G--GTC-GTCTTAACAACTTATGGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAAGTTAAT-TGCTATGAAAAGGAAATGCTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGTAAAAAAAA----ATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATTCGTCAGAACTTCAATCACCCG-CGTCGAGCCATTTGTTATNAGCAGACAATGNTTCAGATTT--TA------A----AAG--TTTTTT-TGTACA---CATG-----GATGC-AAA-A-T---GAAAAAT---------ATCNGTTTTCCCTATA--ATATTCCTATG-----TAAAA------GTCA--CATT--ACAGGGC----CCCTATACATCCTAGCCCCT------TGATTTGCAGAATCTTCAATCCCTTGCTGATGTAAGGATAATTTATATCAAATATGAACAAGTTCGAT-GAAAGGTTATTGAGAAAAAAATTTTTGAAANTCCCNAACTTTAACCTTTTTTCGGCCCATC-------CTGGCCACTTATGGGAATNNAATCT--TCTTTATTGAACAAAGT-CAA--ATTTTGAA---TTTTTACTANACAATGCTTCAGATCTCAAATTGAACATTTNCATNTTTACACAAATGAAATGNACGANAAAATGAGAATNTTACATAGCACTTNTATGTAAAACTCAAAGACCCTTACAGAGCCTCTATACATCCCAGTGTCCCTTGATTTGTACAAACTTTGATTTCTTAATCATAGGGATAATTTATATAAAGTATGAACAAATTTAACTGACCAGTTGTTGAAAATAGTTCAATTTTGATAATTTTGTGACCCCATCTGGCCCTTTTTAGAAAGTCAATCCTTCGTATCGATCAAAATCATATTTGTTATGACTAGAAGTTGCTTCAAAACTCTAACTGAATATANAAAGTCAATTAAANTAA-AGTGATAA-AAAA--TAAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTATGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCCGGAC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTT-TGCCTA---AATA-----GATGA-AAA-A-AAAAGAGAATT---------TTCTGTTTTCCA-ATA--GTATTCCTATG-----TAAAATTCTAAGTCC--CCTT--ACAGGGC----CTCTATAAATTGTAGCCCCTAAATTCTTATCTGCAA-----TCAAACCCCTAC--ACATAGGGATAATTTATGCCAAATATAAACAAATCTG-------GGTTCTTAAGAAAAAGATTTTTGTAATTCCCAAATTTTACCCTTTTTTGGGCCCCTC-------CTGACCCCTTCAGAGAGTGGAACCTAGTCATTTTT--ACAAA----------TCTGAACCTCCTTCACCAAACAATGCTTCcccttcagagagtggaacctagtcatttttacaaatctgaacctccttcaccaaacaatgcttctatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
gi|10                         : tataataattgaatggacaaacaagagggcctgaggatgctctactgactcatagtggccatagcactttttgaaatgccacaatatttaccctctttgtaagggggtcatctttacaacttatggataaataccctcaccacacccatactgaacaaaaacttaattgctctggaaaggaaatactttaaattcccataccattcatctgtaaaaaaaaatatagtcccctgtacagagcccttatacaacccagcccctttatttgtcagaactttaatcacccacttaaagtcatttgttattagcagaaatgattcaaattttaaaagtttttttgtacacatggatgcaaaatgaaaaaatcagttttccctataatattcctatgtaaaagtcacactatagggccccaatatatccaagccccttgatatgcagaatcttcaatccttgctgatgtaaggataatttatatcaaatatgaactagtttgattgaaatgctattgagaggaaatttgtgaaaattcccaactttaaccttatttccccatctgcccaactggccacttatggaaattcaatcctctttattgaacaaaatcaaatttattattactagacaatgctttagatctcaaattaaacaacatatttactaaaatgtacaaaaaaatgagaattttacatagtatttctatgtaaaactcaaagacccttacagagcctctatacatcccagtgtcccttgatttgtacaaactttgatttcttaatcatagggataatttatataaagtatgaacaaatttaactgaccagttgttgaaaatagttcaattttgataattttgtgaccccatctggccctttttagaaagtcaatccttcgtatcgatcaaaatcatatttgttatgactagaagttgcttcaaaactctaactgaatataaaaagtcataaacgaatgataaaaaactccaattgaataataaTTTAACTTTTTTTTGGTCCATC-------CTGGACATTTATGGGAATATAATCT--TCTTTATTGAACCAAGTGTAATTATTTTGAA---TTTTTATTACACAATGGT-------TCAAATTGAACATTTC--TTTTTACACAAATGAAATGAATGACAAAATGAGAATATT--ATAACACTTGTATtatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcccatttaaacctCA-AGAGGGCATGAGGACATTCTACTGGCTTATACTAGTTTTG-----TTTTTGTTTTAAATT-------AATATAAACCTTTTT-----GGC-A--ACA-ATCTTAGTCCCTAATGGAT-AATATCTC-TGCCCCACT-GTT-------------AATGGACACAAATTTAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataacattagtcaactcatagctatgagcaaAAGAG-G-CCAGAGGGGGCACGAAGAAACTTTAATGACTT-----------------TTTTTT----AAATTTC---ACATTA-CAATCCCATTTG--GGGA-ACTGTCCATCTGAACCTCTTATGG-TATATACCCC-CACC-CACC-CATCCCCCACACTCTGGCTGGACAAAAAGTT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C-GTCTTAACAACTTAAGGATAAATACCCT-CACCACACC-CAT-------------ACTTTACAAAAACTTAAT-TG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGAATAAGTGCACC-CACCACATC-CTT-------------ACTAAACAAAAAGTCAAT-TGCTTTGAAAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTACAATAA--GAA---ACAAGAGGC-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAG-CACTTTTTG----AAATTCC---ACAATATCTACCCTCCTTG--GGGG-A--GTC-ATCTTATCAACTTATGGATAAATACCTC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAAGAAATAATTCAAA---------------TTCCCATACCATTCATCAGTAAAAAAAAAAATATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATGTGTCAGAACTTCAATCACCCA-CGTCCAACTATTTGTAATGAGCAGA-AATGATTCAAATTT--TA------AAAAGAAG--TCTTTT-TGTACA---CATG-----AATGC-AAA-A-T---GGAAAAA---------ATCAGTTTTCCCTATA--ATATTCCTAAG-----TAAAA------GTCA--CATT--ACAGG
gi|20                         :                                                                                aaacccactttaatagtgaaataacatgtgtcataatatgttcactgtcacattgatgtcatgggacatttagtgaaaaagacagcatgttcattctgtacataaagttaggcatgtgtagttataaatataactctctttacagattgtataaataatgaattaaatagtaattcttttttatcaaattgctatattgaaaataaacattttagaagacaaccagttcaagtactaacctttaattattatgtttttattttttttccgcttgatatctatagtgccccttatttaaatgtggtaaactgtgacttaatcaatttcacataggcattagataaaaagagtgtcagcgttcttcaaagaaagaaggtaaacatccagactattaattttgcaaattgtACCCC-TGCCAAGCT-CTT-------------AATAGACAAAAAGTTATT-TACTAAGAAGAGGAAATGCTTCA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACTTATGAATAAATACCCC--ACC-CACC-CAT-------------AATGAACAAAAACTTAAT-TGCTAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttTTATGGATTAATACCCC-CACCACACCGCA--------------GCTGAACAAAAAGTTAAT-TACTA-GAAt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGAACAAATACCTC-CACCAAAAC-CTT-------------ACTGAATAAAAAGTTAAT-TACTATGAAt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAACAACTTATGGATAAACACCCC-CACCACACC-TA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGTATCCTTCACCCCACT-TTT-------------ACTGGGCAAAAAGTTATTCTG-TATGAAAAAGAAAGGCTTTAAAACAGAAATTTGCAGTTTCCCATACTATTCCTATATCAAACATA----AGAT---CCCCT-TACATGACCCATATAAACCCCAGCCCCTTAATTTGTCCAAATCGCAATCCCTTGTCATTGGG--ATTAGCTATGATCAGACAATGCTTCAGATCT--CA------T----ATGGATTTTTT-TGTACAAAACA-GAATCTGATCC-AAA-ACT---GAAATAT---------ATTCGTTTTCCCCAGG--CTATCCCTATA-----TAAAATTAAATGTCC--CTTT--ACAGGGG----CCCTAAACATCCTAGACCAT------TGATTTGTAGAGATTTCAATCCTTTGCTGATGTAAAGATAATTTATAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaAACAAACAAAAG-CTCCA-AGAGGGCCTGAAGACACTTAACTGGCTCATAGTGGCCATAG-AACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATTGACCCTCTTTG-----G-G--GTT-GTCTTAACAACTTATAGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAGGAATTATTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGT-AAAAAAT----ATATAGACCCC-ATACAGAACCCTTATACAACCCAGTCCATTGATTCATCAGAACTTCAATCACCTG-g
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaAAAGTTTGGGGTTTAATA------G----AAG--TTTTTTATGTACA---CATA-----GATTC-AAAGA-T---GAAATAT---------TTCAGTTTACCATATATCATATTCATATGAAAAGTAAAA------GTCA--CAT---AAAGGGT----CCTTACACATCATAGGCC-T------TGATTTTCAGAATCTTTAATCCCTTGCTGATGTAAG---AATTT-------ATATGAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAAAACTTTTGAAATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttctttttataggAATATATA--GTCAATTAAATTAA-AGTAATAA-AA----TAAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTGTGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCTGGAC
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3043 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACAATAATTGAACGGACAAGAG-C-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAG-CACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATNAACCCTCTTTG--AGGG-G--GTC-GTCTTAACAACTTATGGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAAGTTAAT-TGCTATGAAAAGGAAATGCTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGTAAAAAAAA----ATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATTCGTCAGAACTTCAATCACCCG-CGTCGAGCCATTTGTTATGAGCAGACAATGNTTCAGATTT--T------AA----AAG--TTTTTT-TGTACA---CATG-----GATGC-AAA-A-T---GAAAAA---------TATCNGTTTTCCCTATA--ATATTCCTATG-----TAAAA------GTCA--CATT--ACAGGGC----CCCTATACATCCTAGCCCCT------TGATTTGCAGAATCTTCAATCCCTTGCTGATGTAAGGATAATTTATATCAAATATGAACAAGTTCGAT-GAAAGGTTATTGAGAAAAAAATTTTTGAAATTCCCNAACTTTAACCTTTTTTCGGCCCATC-------CTGGCCACTTATGGGAATNNAATCT--TCTTTATTGAACAAAGT-CAA--ATTTTGAA---TTTTTACTANACAATGCTTCAGATCTCAAATTGAACATTTNCATNTTTACACAAATGAAATGNACGANAAAATGAGAATNTTACATAGCACTTNTATGTAAAACTCAAAGACCCTTACAGAGCCTCTATACATCCCAGTGTCCCTTGATTTGTACAAACTTTGATTTCTTAATCATAGGGATAATTTATATAAAGTATGAACAAATTTAACTGACCAGTTGTTGAAAATAGTTCAATTTTGATAATTTTGTGACCCCATCTGGCCCTTTTTAGAAAGTCAATCCTTCGTATCGATCAAAATCATATTTGTTATGACTAGAAGTTGCTTCAAAACTCTAACTGAATATANAAAGTCAATTAAANTAA-AGTGATAA-AAAAT--AAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTATGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCCGGAC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTT-TGCCTA---AATA-----GATGA-AAA-A-AAAAGAGAAT---------TTTCTGTTTTCCA-ATA--GTATTCCTATG-----TAAAATTCTAAGTCC--CCTT--ACAGGGC----CTCTATAAATTGTAGCCCCTAAATTCTTATCTGCAA-----TCAAACCCCTAC--ACATAGGGATAATTTATGCCAAATATAAACAAATCTG-------GGTTCTTAAGAAAAAGATTTTTGTAATTCCCAAATTTTACCCTTTTTTGGGCCCCTC-------CTGACCCCTTCAGAGAGTGGAACCTAGTCATTTTT--ACAAA----------TCTGAACCTCCTTCACCAAACAATGCTTCcccttcagagagtggaacctagtcatttttacaaatctgaacctccttcaccaaacaatgcttctatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
gi|10                         : tataataattgaatggacaaacaagagggcctgaggatgctctactgactcatagtggccatagcactttttgaaatgccacaatatttaccctctttgtaagggggtcatctttacaacttatggataaataccctcaccacacccatactgaacaaaaacttaattgctctggaaaggaaatactttaaattcccataccattcatctgtaaaaaaaaatatagtcccctgtacagagcccttatacaacccagcccctttatttgtcagaactttaatcacccacttaaagtcatttgttattagcagaaatgattcaaattttaaaagtttttttgtacacatggatgcaaaatgaaaaaatcagttttccctataatattcctatgtaaaagtcacactatagggccccaatatatccaagccccttgatatgcagaatcttcaatccttgctgatgtaaggataatttatatcaaatatgaactagtttgattgaaatgctattgagaggaaatttgtgaaaattcccaactttaaccttatttccccatctgcccaactggccacttatggaaattcaatcctctttattgaacaaaatcaaatttattattactagacaatgctttagatctcaaattaaacaacatatttactaaaatgtacaaaaaaatgagaattttacatagtatttctatgtaaaactcaaagacccttacagagcctctatacatcccagtgtcccttgatttgtacaaactttgatttcttaatcatagggataatttatataaagtatgaacaaatttaactgaccagttgttgaaaatagttcaattttgataattttgtgaccccatctggccctttttagaaagtcaatccttcgtatcgatcaaaatcatatttgttatgactagaagttgcttcaaaactctaactgaatataaaaagtcataaacgaatgataaaaaactccaattgaataataaTTTAACTTTTTTTTGGTCCATC-------CTGGACATTTATGGGAATATAATCT--TCTTTATTGAACCAAGTGTAATTATTTTGAA---TTTTTATTACACAATGGT-------TCAAATTGAACATTTC--TTTTTACACAAATGAAATGAATGACAAAATGAGAATATT--ATAACACTTGTATtatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcccatttaaacctCA-AGAGGGCATGAGGACATTCTACTGGCTTATACTAGTTTTG-----TTTTTGTTTTAAATT-------AATATAAACCTTTTT-----GGC-A--ACA-ATCTTAGTCCCTAATGGAT-AATATCTC-TGCCCCACT-GTT-------------AATGGACACAAATTTAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ataacattagtcaactcatagctatgagcaaAACAGA--AGAG-G-CCAGAGGGGGCACGAAGAAACTTTAATGACTT-----------------TTTTTT----AAATTTC---ACATTA-CAATCCCATTTG--GGGA-ACTGTCCATCTGAACCTCTTATGG-TATATACCCC-CACC-CACC-CATCCCCCACACTCTGGCTGGACAAAAAGTT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C-GTCTTAACAACTTAAGGATAAATACCCT-CACCACACC-CAT-------------ACTTTACAAAAACTTAAT-TG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGAATAAGTGCACC-CACCACATC-CTT-------------ACTAAACAAAAAGTCAAT-TGCTTTGAAAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTACAATAA--GAA---ACAAGAGGC-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAG-CACTTTTTG----AAATTCC---ACAATATCTACCCTCCTTG--GGGG-A--GTC-ATCTTATCAACTTATGGATAAATACCTC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAAGAAATAATTCAAA---------------TTCCCATACCATTCATCAGTAAAAAAAAAAATATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATGTGTCAGAACTTCAATCACCCA-CGTCCAACTATTTGTAATGAGCAGA-AATGATTCAAATTT--T------AAAAAGAAG--TCTTTT-TGTACA---CATG-----AATGC-AAA-A-T---GGAAAA---------AATCAGTTTTCCCTATA--ATATTCCTAAG-----TAAAA------GTCA--CATT--ACAGG
gi|20                         :                                                                                aaacccactttaatagtgaaataacatgtgtcataatatgttcactgtcacattgatgtcatgggacatttagtgaaaaagacagcatgttcattctgtacataaagttaggcatgtgtagttataaatataactctctttacagattgtataaataatgaattaaatagtaattcttttttatcaaattgctatattgaaaataaacattttagaagacaaccagttcaagtactaacctttaattattatgtttttattttttttccgcttgatatctatagtgccccttatttaaatgtggtaaactgtgacttaatcaatttcacataggcattagataaaaagagtgtcagcgttcttcaaagaaagaaggtaaacatccagactattaattttgcaaattgtACCCC-TGCCAAGCT-CTT-------------AATAGACAAAAAGTTATT-TACTAAGAAGAGGAAATGCTTCA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACTTATGAATAAATACCCC--ACC-CACC-CAT-------------AATGAACAAAAACTTAAT-TGCTAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttTTATGGATTAATACCCC-CACCACACCGCA--------------GCTGAACAAAAAGTTAAT-TACTA-GAAt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGAACAAATACCTC-CACCAAAAC-CTT-------------ACTGAATAAAAAGTTAAT-TACTATGAAt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAACAACTTATGGATAAACACCCC-CACCACACC-TA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGTATCCTTCACCCCACT-TTT-------------ACTGGGCAAAAAGTTATTCTG-TATGAAAAAGAAAGGCTTTAAAACAGAAATTTGCAGTTTCCCATACTATTCCTATATCAAACATA----AGAT---CCCCT-TACATGACCCATATAAACCCCAGCCCCTTAATTTGTCCAAATCGCAATCCCTTGTCATTGGG--ATTAGCTATGATCAGACAATGCTTCAGATCT--C------AT----ATGGATTTTTT-TGTACAAAACA-GAATCTGATCC-AAA-ACT---GAAATA---------TATTCGTTTTCCCCAGG--CTATCCCTATA-----TAAAATTAAATGTCC--CTTT--ACAGGGG----CCCTAAACATCCTAGACCAT------TGATTTGTAGAGATTTCAATCCTTTGCTGATGTAAAGATAATTTATAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaAACAAACAAAAG-CTCCA-AGAGGGCCTGAAGACACTTAACTGGCTCATAGTGGCCATAG-AACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATTGACCCTCTTTG-----G-G--GTT-GTCTTAACAACTTATAGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAGGAATTATTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGT-AAAAAAT----ATATAGACCCC-ATACAGAACCCTTATACAACCCAGTCCATTGATTCATCAGAACTTCAATCACCTG-g
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaAAAGTTTGGGGTTTAAT------AG----AAG--TTTTTTATGTACA---CATA-----GATTC-AAAGA-T---GAAATA---------TTTCAGTTTACCATATATCATATTCATATGAAAAGTAAAA------GTCA--CAT---AAAGGGT----CCTTACACATCATAGGCC-T------TGATTTTCAGAATCTTTAATCCCTTGCTGATGTAAG---AATTT-------ATATGAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAAAACTTTTGAAATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttctttttataggAATATATA--GTCAATTAAATTAA-AGTAATAA-AA--T--AAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTGTGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCTGGAC
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3043 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACAATAATTGAACGGACAAGAG-C-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAG-CACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATNAACCCTCTTTG--AGGG-G--GTC-GTCTTAACAACTTATGGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAAGTTAAT-TGCTATGAAAAGGAAATGCTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGTAAAAAAAA----ATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATTCGTCAGAACTTCAATCACCCG-CGTCGAGCCATTTGTTATGAGCAGACAATGNTTCAGATTT--T------AA----AAG--TTTTTT-TGTACA---CATG-----GATGC-AAA-A-T---GAAAAA---------TATCNGTTTTCCCTATA--ATATTCCTATG-----TAAAA------GTCA--CATT--ACAGGGC----CCCTATACATCCTAGCCCCT------TGATTTGCAGAATCTTCAATCCCTTGCTGATGTAAGGATAATTTATATCAAATATGAACAAGTTCGAT-GAAAGGTTATTGAGAAAAAAATTTTTGAAATTCCCNAACTTTAACCTTTTTTCGGCCCATC-------CTGGCCACTTATGGGAATNNAATCT--TCTTTATTGAACAAAGT-CAA--ATTTTGAA---TTTTTACTANACAATGCTTCAGATCTCAAATTGAACATTTNCATNTTTACACAAATGAAATGNACGANAAAATGAGAATNTTACATAGCACTTNTATGTAAAACTCAAAGACCCTTACAGAGCCTCTATACATCCCAGTGTCCCTTGATTTGTACAAACTTTGATTTCTTAATCATAGGGATAATTTATATAAAGTATGAACAAATTTAACTGACCAGTTGTTGAAAATAGTTCAATTTTGATAATTTTGTGACCCCATCTGGCCCTTTTTAGAAAGTCAATCCTTCGTATCGATCAAAATCATATTTGTTATGACTAGAAGTTGCTTCAAAACTCTAACTGAATATANAAAGTCAATTAAANTAA-AGTGATAA-AAAAT--AAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTATGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCCGGAC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTT-TGCCTA---AATA-----GATGA-AAA-A-AAAAGAGAAT---------TTTCTGTTTTCCA-ATA--GTATTCCTATG-----TAAAATTCTAAGTCC--CCTT--ACAGGGC----CTCTATAAATTGTAGCCCCTAAATTCTTATCTGCAA-----TCAAACCCCTAC--ACATAGGGATAATTTATGCCAAATATAAACAAATCTG-------GGTTCTTAAGAAAAAGATTTTTGTAATTCCCAAATTTTACCCTTTTTTGGGCCCCTC-------CTGACCCCTTCAGAGAGTGGAACCTAGTCATTTTT--ACAAA----------TCTGAACCTCCTTCACCAAACAATGCTTCcccttcagagagtggaacctagtcatttttacaaatctgaacctccttcaccaaacaatgcttctatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
gi|10                         : tataataattgaatggacaaacaagagggcctgaggatgctctactgactcatagtggccatagcactttttgaaatgccacaatatttaccctctttgtaagggggtcatctttacaacttatggataaataccctcaccacacccatactgaacaaaaacttaattgctctggaaaggaaatactttaaattcccataccattcatctgtaaaaaaaaatatagtcccctgtacagagcccttatacaacccagcccctttatttgtcagaactttaatcacccacttaaagtcatttgttattagcagaaatgattcaaattttaaaagtttttttgtacacatggatgcaaaatgaaaaaatcagttttccctataatattcctatgtaaaagtcacactatagggccccaatatatccaagccccttgatatgcagaatcttcaatccttgctgatgtaaggataatttatatcaaatatgaactagtttgattgaaatgctattgagaggaaatttgtgaaaattcccaactttaaccttatttccccatctgcccaactggccacttatggaaattcaatcctctttattgaacaaaatcaaatttattattactagacaatgctttagatctcaaattaaacaacatatttactaaaatgtacaaaaaaatgagaattttacatagtatttctatgtaaaactcaaagacccttacagagcctctatacatcccagtgtcccttgatttgtacaaactttgatttcttaatcatagggataatttatataaagtatgaacaaatttaactgaccagttgttgaaaatagttcaattttgataattttgtgaccccatctggccctttttagaaagtcaatccttcgtatcgatcaaaatcatatttgttatgactagaagttgcttcaaaactctaactgaatataaaaagtcataaacgaatgataaaaaactccaattgaataataaTTTAACTTTTTTTTGGTCCATC-------CTGGACATTTATGGGAATATAATCT--TCTTTATTGAACCAAGTGTAATTATTTTGAA---TTTTTATTACACAATGGT-------TCAAATTGAACATTTC--TTTTTACACAAATGAAATGAATGACAAAATGAGAATATT--ATAACACTTGTATtatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcccatttaaacctCA-AGAGGGCATGAGGACATTCTACTGGCTTATACTAGTTTTG-----TTTTTGTTTTAAATT-------AATATAAACCTTTTT-----GGC-A--ACA-ATCTTAGTCCCTAATGGAT-AATATCTC-TGCCCCACT-GTT-------------AATGGACACAAATTTAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ataacattagtcaactcatagctatgagcaaAACAGA--AGAG-G-CCAGAGGGGGCACGAAGAAACTTTAATGACTT-----------------TTTTTT----AAATTTC---ACATTA-CAATCCCATTTG--GGGA-ACTGTCCATCTGAACCTCTTATGG-TATATACCCC-CACC-CACC-CATCCCCCACACTCTGGCTGGACAAAAAGTT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C-GTCTTAACAACTTAAGGATAAATACCCT-CACCACACC-CAT-------------ACTTTACAAAAACTTAAT-TG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGAATAAGTGCACC-CACCACATC-CTT-------------ACTAAACAAAAAGTCAAT-TGCTTTGAAAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTACAATAA--GAA---ACAAGAGGC-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAG-CACTTTTTG----AAATTCC---ACAATATCTACCCTCCTTG--GGGG-A--GTC-ATCTTATCAACTTATGGATAAATACCTC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAAGAAATAATTCAAA---------------TTCCCATACCATTCATCAGTAAAAAAAAAAATATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATGTGTCAGAACTTCAATCACCCA-CGTCCAACTATTTGTAATGAGCAGA-AATGATTCAAATTT--T------AAAAAGAAG--TCTTTT-TGTACA---CATG-----AATGC-AAA-A-T---GGAAAA---------AATCAGTTTTCCCTATA--ATATTCCTAAG-----TAAAA------GTCA--CATT--ACAGG
gi|20                         :                                                                                aaacccactttaatagtgaaataacatgtgtcataatatgttcactgtcacattgatgtcatgggacatttagtgaaaaagacagcatgttcattctgtacataaagttaggcatgtgtagttataaatataactctctttacagattgtataaataatgaattaaatagtaattcttttttatcaaattgctatattgaaaataaacattttagaagacaaccagttcaagtactaacctttaattattatgtttttattttttttccgcttgatatctatagtgccccttatttaaatgtggtaaactgtgacttaatcaatttcacataggcattagataaaaagagtgtcagcgttcttcaaagaaagaaggtaaacatccagactattaattttgcaaattgtACCCC-TGCCAAGCT-CTT-------------AATAGACAAAAAGTTATT-TACTAAGAAGAGGAAATGCTTCA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACTTATGAATAAATACCCC--ACC-CACC-CAT-------------AATGAACAAAAACTTAAT-TGCTAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttTTATGGATTAATACCCC-CACCACACCGCA--------------GCTGAACAAAAAGTTAAT-TACTA-GAAt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGAACAAATACCTC-CACCAAAAC-CTT-------------ACTGAATAAAAAGTTAAT-TACTATGAAt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAACAACTTATGGATAAACACCCC-CACCACACC-TA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGTATCCTTCACCCCACT-TTT-------------ACTGGGCAAAAAGTTATTCTG-TATGAAAAAGAAAGGCTTTAAAACAGAAATTTGCAGTTTCCCATACTATTCCTATATCAAACATA----AGAT---CCCCT-TACATGACCCATATAAACCCCAGCCCCTTAATTTGTCCAAATCGCAATCCCTTGTCATTGGG--ATTAGCTATGATCAGACAATGCTTCAGATCT--C------AT----ATGGATTTTTT-TGTACAAAACA-GAATCTGATCC-AAA-ACT---GAAATA---------TATTCGTTTTCCCCAGG--CTATCCCTATA-----TAAAATTAAATGTCC--CTTT--ACAGGGG----CCCTAAACATCCTAGACCAT------TGATTTGTAGAGATTTCAATCCTTTGCTGATGTAAAGATAATTTATAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaAACAAACAAAAG-CTCCA-AGAGGGCCTGAAGACACTTAACTGGCTCATAGTGGCCATAG-AACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATTGACCCTCTTTG-----G-G--GTT-GTCTTAACAACTTATAGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAGGAATTATTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGT-AAAAAAT----ATATAGACCCC-ATACAGAACCCTTATACAACCCAGTCCATTGATTCATCAGAACTTCAATCACCTG-g
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaAAAGTTTGGGGTTTAAT------AG----AAG--TTTTTTATGTACA---CATA-----GATTC-AAAGA-T---GAAATA---------TTTCAGTTTACCATATATCATATTCATATGAAAAGTAAAA------GTCA--CAT---AAAGGGT----CCTTACACATCATAGGCC-T------TGATTTTCAGAATCTTTAATCCCTTGCTGATGTAAG---AATTT-------ATATGAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAAAACTTTTGAAATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttctttttataggAATATATA--GTCAATTAAATTAA-AGTAATAA-AA--T--AAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTGTGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCTGGAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aacTTAAAGTAATAATGATAATAAAAT--AAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTATGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCTGGA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3043 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TACAATAATTGAACGGACAAGAG-C-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAG-CACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATNAACCCTCTT-TG--GGGG-G--GTC-GTCTTAACAACTTATGGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAAGTTAAT-TGCTATGAAAAGGAAATGCTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGTAAAAAAAA----ATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATTCGTCAGAACTTCAATCACCCG-CGTCGAGCCATTTGTTATGAGCAGACAATGNTTCAGATTT--NATA--GAAGTTTTTT-TGTACA---CATG-----GATGC-AAA-A-T---GAAAAA---------TATCNGTTTTCCCTATA--ATATTCCTATG-----TAAAA------GTCA--CATT--ACAGGGC----CCCTATACATCCTAGCCCCT------TGATTTGCAGAATCTTCAATCCCTTGCTGATGTAAGGATAATTTATATCAAATATGAACAAGTTCGAT-GAAAGGTTATTGAGAAAAAAATTTTTGAAATTCCCNAACTTTAACCTTTTTTCGGCCCATC-------CTGGCCACTTATGGGAATNNAATCT--TCTTTATTGAACAAAGT-CAA--ATTTTGAA---TTTTTACTANACAATGCTTCAGATCTCAAATTGAACATTTNCATNTTTACACAAATGAAATGNACGANAAAATGAGAATNTTACATAGCACTTNTATGTAAAACTCAAAGACCCTTACAGAGCCTCTATACATCCCAGTGTCCCTTGATTTGTACAAACTTTGATTTCTTAATCATAGGGATAATTTATATAAAGTATGAACAAATTTAACTGACCAGTTGTTGAAAATAGTTCAATTTTGATAATTTTGTGACCCCATCTGGCCCTTTTTAGAAAGTCAATCCTTCGTATCGATCAAAATCATATTTGTTATGACTAGAAGTTGCTTCAAAACTCTAACTGAATATANAAAGTCAATTAAANTAA-AGTGATAA-AAAAT--AAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTATGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCCGGAC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTT-TGCCTA---AATA-----GATGA-AAA-A-AAAAGAGAAT---------TTTCTGTTTTCCA-ATA--GTATTCCTATG-----TAAAATTCTAAGTCC--CCTT--ACAGGGC----CTCTATAAATTGTAGCCCCTAAATTCTTATCTGCAA-----TCAAACCCCTAC--ACATAGGGATAATTTATGCCAAATATAAACAAATCTG-------GGTTCTTAAGAAAAAGATTTTTGTAATTCCCAAATTTTACCCTTTTTTGGGCCCCTC-------CTGACCCCTTCAGAGAGTGGAACCTAGTCATTTTT--ACAAA----------TCTGAACCTCCTTCACCAAACAATGCTTCcccttcagagagtggaacctagtcatttttacaaatctgaacctccttcaccaaacaatgcttctatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
gi|10                         : tataataattgaatggacaaacaagagggcctgaggatgctctactgactcatagtggccatagcactttttgaaatgccacaatatttaccctctttgtaagggggtcatctttacaacttatggataaataccctcaccacacccatactgaacaaaaacttaattgctctggaaaggaaatactttaaattcccataccattcatctgtaaaaaaaaatatagtcccctgtacagagcccttatacaacccagcccctttatttgtcagaactttaatcacccacttaaagtcatttgttattagcagaaatgattcaaattttaaaagtttttttgtacacatggatgcaaaatgaaaaaatcagttttccctataatattcctatgtaaaagtcacactatagggccccaatatatccaagccccttgatatgcagaatcttcaatccttgctgatgtaaggataatttatatcaaatatgaactagtttgattgaaatgctattgagaggaaatttgtgaaaattcccaactttaaccttatttccccatctgcccaactggccacttatggaaattcaatcctctttattgaacaaaatcaaatttattattactagacaatgctttagatctcaaattaaacaacatatttactaaaatgtacaaaaaaatgagaattttacatagtatttctatgtaaaactcaaagacccttacagagcctctatacatcccagtgtcccttgatttgtacaaactttgatttcttaatcatagggataatttatataaagtatgaacaaatttaactgaccagttgttgaaaatagttcaattttgataattttgtgaccccatctggccctttttagaaagtcaatccttcgtatcgatcaaaatcatatttgttatgactagaagttgcttcaaaactctaactgaatataaaaagtcataaacgaatgataaaaaactccaattgaataataaTTTAACTTTTTTTTGGTCCATC-------CTGGACATTTATGGGAATATAATCT--TCTTTATTGAACCAAGTGTAATTATTTTGAA---TTTTTATTACACAATGGT-------TCAAATTGAACATTTC--TTTTTACACAAATGAAATGAATGACAAAATGAGAATATT--ATAACACTTGTATtatgaaaatacaggcaaaatcatttccatttaaaaaggcttttgaattattaggtgaattacgtttacatgtatattaactgacagagtggaaaacagtgcaggaagtgttcagattgctcattacgagcaatctgaactcttcctgcactgttttcaaaagccttctgttattggtgtgggaaaacgcgtatctatggagtaaagagttaaaccccaaatcaaatcaaaggatgatggaattgttaattacaactactacat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tcccatttaaacctCA-AGAGGGCATGAGGACATTCTACTGGCTTATACTAGTTTTG-----TTTTTGTTTTAAATT-------AATATAAACCTTTTT------GGC-A--ACA-ATCTTAGTCCCTAATGGAT-AATATCTC-TGCCCCACT-GTT-------------AATGGACACAAATTTAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataacattagtcaactcatagctatgagcaaAACAGA--AGAG-G-CCAGAGGGGGCACGAAGAAACTTTAATGACTT-----------------TTTTTT----AAATTTC---ACATTA-CAATCCCATT-TG--GGGA-ACTGTCCATCTGAACCTCTTATGG-TATATACCCC-CACC-CACC-CATCCCCCACACTCTGGCTGGACAAAAAGTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaaTGGTCATATTCA-TTTTTG----TAATTTC---ACA-TATT----TTCATATG--G-------------CATATCA---TATAAA-AAATATATA-CACCCCTTT-TTT-------------ACTGGACAAAAAATTATT-TGCTATGAAAAGGAAATGCTTT-AA---------------TTCttaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTTTCTAAACAATATTAACCCTTTT-TG--GG-------TC-GTCTTCACCACTTACGGATAAATACCCC--ACCCCAAC-CTT-------------ACTGAACAAAAAGTTAAT-TGCTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttttGTGTCCATGT-CATTTTTTG----AAATGTC---ATAAAATGAACCCTAAT-----GAGA-A--GTC-GTCTTATCAACTTATGGATAAATACCCC-CACCACATC-ggga
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       C-GTCTTAACAACTTAAGGATAAATACCCT-CACCACACC-CAT-------------ACTTTACAAAAACTTAAT-TG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGAATAAGTGCACC-CACCACATC-CTT-------------ACTAAACAAAAAGTCAAT-TGCTTTGAAAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTACAATAA--GAA---ACAAGAGGC-CCA-AGAGGGCCTGAGGACGCTCTACTGACTCATAGTGGCCATAG-CACTTTTTG----AAATTCC---ACAATATCTACCCTCCT-TG--GGGG-A--GTC-ATCTTATCAACTTATGGATAAATACCTC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAAGAAATAATTCAAA---------------TTCCCATACCATTCATCAGTAAAAAAAAAAATATATAGTCCCCTGTACAGAACCCTTATACAACCCAGCCCCTTAATGTGTCAGAACTTCAATCACCCA-CGTCCAACTATTTGTAATGAGCAGA-AATGATTCAAATTTTAAAAA--GAAGTCTTTT-TGTACA---CATG-----AATGC-AAA-A-T---GGAAAA---------AATCAGTTTTCCCTATA--ATATTCCTAAG-----TAAAA------GTCA--CATT--ACAGG
gi|20                         :                                                                                        aaacccactttaatagtgaaataacatgtgtcataatatgttcactgtcacattgatgtcatgggacatttagtgaaaaagacagcatgttcattctgtacataaagttaggcatgtgtagttataaatataactctctttacagattgtataaataatgaattaaatagtaattcttttttatcaaattgctatattgaaaataaacattttagaagacaaccagttcaagtactaacctttaattattatgtttttattttttttccgcttgatatctatagtgccccttatttaaatgtggtaaactgtgacttaatcaatttcacataggcattagataaaaagagtgtcagcgttcttcaaagaaagaaggtaaacatccagactattaattttgcaaattgtACCCC-TGCCAAGCT-CTT-------------AATAGACAAAAAGTTATT-TACTAAGAAGAGGAAATGCTTCA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACTTATGAATAAATACCCC--ACC-CACC-CAT-------------AATGAACAAAAACTTAAT-TGCTAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttTTATGGATTAATACCCC-CACCACACCGCA--------------GCTGAACAAAAAGTTAAT-TACTA-GAAt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGAACAAATACCTC-CACCAAAAC-CTT-------------ACTGAATAAAAAGTTAAT-TACTATGAAt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAACAACTTATGGATAAACACCCC-CACCACACC-TA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAGTATCCTTCACCCCACT-TTT-------------ACTGGGCAAAAAGTTATTCTG-TATGAAAAAGAAAGGCTTTAAAACAGAAATTTGCAGTTTCCCATACTATTCCTATATCAAACATA----AGAT---CCCCT-TACATGACCCATATAAACCCCAGCCCCTTAATTTGTCCAAATCGCAATCCCTTGTCATTGGG--ATTAGCTATGATCAGACAATGCTTCAGATCT--CATA--TGGATTTTTT-TGTACAAAACA-GAATCTGATCC-AAA-ACT---GAAATA---------TATTCGTTTTCCCCAGG--CTATCCCTATA-----TAAAATTAAATGTCC--CTTT--ACAGGGG----CCCTAAACATCCTAGACCAT------TGATTTGTAGAGATTTCAATCCTTTGCTGATGTAAAGATAATTTATAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaAACAAACAAAAG-CTCCA-AGAGGGCCTGAAGACACTTAACTGGCTCATAGTGGCCATAG-AACTTTTTG----AAATTTC---ACAATATTGACCCTCTT-TG--GGG------TT-GTCTTAACAACTTATAGATAAATACCCC-CACCACACC-CAT-------------ACTGAACAAAAACTTAAT-TGCTATGAAAAGGAATTATTTTAAA---------------TTCCCATACCATTCATCTGT-AAAAAAT----ATATAGACCCC-ATACAGAACCCTTATACAACCCAGTCCATTGATTCATCAGAACTTCAATCACCTG-g
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acaaaaatcaagaaaacgtagtgtacactacattacatttggtcaAAAGTTTGGGGTTT--AATA--GAAGTTTTTTATGTACA---CATA-----GATTC-AAAGA-T---GAAATA---------TTTCAGTTTACCATATATCATATTCATATGAAAAGTAAAA------GTCA--CAT---AAAGGGT----CCTTACACATCATAGGCC-T------TGATTTTCAGAATCTTTAATCCCTTGCTGATGTAAG---AATTT-------ATATGAACAAGTTCGATAGAAAGGTCATTGAGAAAAAAACTTTTGAAATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttctttttataggAATATATA--GTCAATTAAATTAA-AGTAATAA-AA--T--AAATTTAATAATAAT-------------------AGAAATGAGAATGTTCTCTTTTCTCATAGTATCCTTGTGTAAAATTCTAAGTCCCCTAA--------CTATAAATATTAACTACTTAATACTTATCT----TTAAGC-----CAAATATGAA----------CAAATAT-GAC--ACC--GATTCTTCAG-AAAACATTTTTGTAATTTCCAATTTTTACC--TTTTTGAGGACCCTCTGGAC
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGACAATGCTTTAGGTTT--TATATTGAAGAGTTTT--GTAAA---CATG-----AACGCGAAA-A-T-------AATTTTTTTTTTATCTGTTTTCCCTATA--ATTACCCTATG-----TGAAA------GTAAGTCATCTGACAGGGCGGGTCCCTATTCATCCCAGCTCCT------TGATTTACAGAATATTCAATCCCTTGCTTATGTAAGGATCATTTATATCCCATATG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): AAACCTTTATCTATAGTAGGGAGTAAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGACGTCATCGGACATTGGCACAAGGCATTAAGGAAAGGGACAGCGTGTTCATTCTGTGCATAAATTTAGGCATGTGTTACTGTAGTTATAAACATAACTCTCTTTACGGATTGTATCAATTTAATAGTAATTCTTTTTTTAAGAAATTAGTATACTGAAAATAAACATTTTAGAAGACAACTAGTTACAAACAAACACTAACCTTTAATTATTATTATGTTGTTGTTTTTTTCGTTTGTTATCTGTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACCTGAGGTAAATTGTGATGTAATCACTTGCATATCAGCATTAGATCAAAAGTGTAACGTCGGCGTACTTCAAAGAAAGTAGGCAACCGTTCAGACTAGTAATTTTGCAAGTGTTACAATGAAAACA