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consensus : NGTAACGTGGCGGAGCTATGTT-AAT----G---CTC----GCAGTGTGCAACAC-AATAATAAAAATGGTAGCGTAATATAT----TTANATACACACAGCAAGAACGATT---TCTCAATTTGGACT-GAG-TACCTGCTCAAA--A---ATAA-TN-------------------ATTGGT-TT-GATTGTTACAAA-TGATTCGTGTGGGTCCCTCAGTTATAGACTGAGAATCAGCTAATTA-ATCAATATACTAACATATTT--A------TATT--ATA--TACAACGGTTCGTTCGG--CCAGACAGTTTAAT------------TATAATACACGTCAGTGT-GAACGCTC--A---GT-G-GCT-CAATG-CGATAAACAAGC-GCGCAA--TA-GCTCAT-TG-A---CAT---AAAC---GAGA----GCTC-ACTGACATA-----------AACG----AG-AGCTCANTGACA-TA----------------AACGAG--CGCTCANTGGCTCA--A-------T------GC--AGCTC-ACTCA-ATAAA--GAGCGCT-CACTAGCTCAGT--AC-CA------------CA----------GTAG---C-----TC-AAT--GT---C-A-T--A-A-C-------G-A---GC------GCTCGC-T-AGA--CC--G--T----------C---AGCTCAA-TG-----------CATA----------AA--A-CGAGCGCTCG--------GTAGC-T-CGTTG----TC------A-TA--A-AC--C------AGCGT---GT--AC---A--TACA-CA----CATA---CACCT--GT--CTCA-AT-------AATGAGAGC--TCGCTAGCTCGCTGTCAC--TA--CTGNA-----AGTGAGCGTTCA-------CCA-GG-T----------AAACAGTNGTA------TAG---GTA--GA-----C---ACTACCGAAAGGAGCC-GGCAATGATAATT--AC---AACGGC-AGCTCAAATTGTTG-AGCGAAT-CG-TTNGTATT-ATACAGCCAGGTAACCCTTTATACTATATTGT---ATCTAAACCCTATATCCTTCTACGTTTCTACGATGTTAATCTGTCTG-TGGCAAATCGAGA---ACTGA-CA---TTTTN--AGAGGCC-----GC-A-C---G-CTATTTATACCCATT-----CTAAACGATGTGGCTCCCAGCAT-T-----TACATCGTGCTCCGAAATATAACGGAACCAAATC-GGCATGGTTCTCGGCCGATAATTAATAGCATCGCAGCGAAGCTGGGTTCAAGCCG-TA--TTTTCATTTCCGACACGGAAGTAAAACCAT--TTATTGAGTGTT--GAGGT-GGACTTTATCGATTTTT-ATTAATAAAACGTATGTTTNTCATNGTAGCTTCGTTCTTTATGTCTGCTACTGTCATATATCGTTTACTGGTCAT-AAA--ATATTTGTCTTAG-CCGGATCTTATAACTGAAAATATCAC
Reference ( gi|2 ) : TGTAACGTGGCGGAGCTATGTT-AGT----G---CTC----GCAGTGTGCAACAC-AATTATAAAAATGGTAGCGTAATATAT----TTATATACACACAGCAATAAAAATT---TCTCAATTTGGACT-GAG-TACCTGCTCAAA--A---ATAA-TT-------------------ATTAGA-TT-GATTGTTACAAA-TGATTCATGTGGGTCCCTCAGTTATAGACTGAGAATCAGCTAATTA-ATCAATATACTAACATATCT--A------TACT--TTA--TACAACAGTTTGTTCGG--CCAGACAGTTTAAT------------TATAATACACATCAGTGT-TAACGCTC--A---GT-G-GCT-CAATG-CGATAAACAAGT-GCACAA--TA-GCTCAT-TG-A---CAT---AAAC---GAGA----GCTA-ACTAACATA-----------AATG----AG-AGCTCAATAACA-TA----------------AACGAG--CGCTCACTGGCTCA--A-------T------GC--AGCTC-ACTCA-ATAAA--GAGCGCT-CACTAGTTCAGT--AC-CA------------CA----------GTAG---A-----TC-AAT--GT---C-A-C--A-A-C-------C-A---GC------GTTCAC-T-AGA--CC--G--T----------C---AGCTCAA-TG-----------CATA----------AA--A-CGAGCGCTCA--------GTAGC-T-AGTTG----TT------A-TA--A-AC--A------AGCGT---GT--AC---A--TACA-CA----CATA---CACCT--GT--CTCA-AT-------AATGAGAGC--TCGCTAGCTCGCTGTCAC--TA--CTGGA-----AGTGAGCGTTCA-------CCA-GT-T----------AAACAGTGGTA------TAG---GTA--GA-----C---ACTACCGAAAGGAGCC-GGCAATGATAAGA--AT---AACGGC-AGCTCAAATTGTTG-AGTAAAT-CG-TTAGTATT-ATACAGCCAGGTAACCCTTTATATCATATTGT---ATCTAAACCCTACATCCTTCTATGTTTCTACCATGTTAATCTGTCTG-TGACAAATCAAGA---ACTGA-CA---TTTTA--AGAGGCC-----GC-A-C---G-CTATTTATACCCATT-----CTAAATGATGTGGCTCCCAGCAT-T-----TACATCGGGCTCCGAAATATAACGGAACCAAACT-GGCATGGTTCTCGGTTGATAATTAATAGCATAGCAGCAAAGCTGGGTTAAAGCCG-TA--TTTCCATTTCCGACACGGAAGTAATACCAT--TTATTGAGTGTT--GATGA-GGAATTTATCTATTTTT-ATTAATAAAACGTATGTTTATCATTGTAGCTTCGTGCTTTATGTCTGTTACTGTCATATATCGTTTACTGTTCAT-AAA--ATATTTGTCTTAG-CCGACTCATATAGCTGAAAATATCACG
gi|3 : GTAACGTGGCGGAGCTATGTT-AGT----G---CTT----GCAGTGTGCATCAC-ACTAATAAAAATGGTAGCGTAATATAT----TTATGTACACACAGAAATAACAATT---TCTCAATTTAGACT-TAG-TACCTGCTCAAA--A----TAA-TG-------------------ATTAGC-TT-GATTGTTACAAA-TGGTTCGTGTGGGTCCCTCAGTTATAGACTGAGAATCAGCTAATTA-ATCAAAATACTAACATATCT--A------TATT--ATA--TACAACAGTTCGTCCAT--CCAGACAGTTTAAT------------TATAACACACGTCAGTGT-GAACGCTC--A---GT-G-GCT-CAATG-CAATAAACAAGC-ACACAC--TA-GCTTAT-TG-A---CAT---AAAC---GAGA----GCTC-ACTGACATA-----------AACG----AG-AGCTCAATAACA-TA----------------AACGAG--CGCTCAGTTGCTCA--A-------T------CC--AGCCC-ATTCA-ATAAC--GAGCGCT-CACTTGCTCAGT--AA-CA------------CA----------GTAG---C-----TC-AAT--GT---C-A-C--A-A-C-------G-A---GC------GTTCGC-T-AGA--CC--G--T----------C---AGATCTA-CG-----------CATA----------AA--A-CAAGTGCTCA--------ATAGC-T-CGTTG----TT------A-TA--A-CC--C------AGCGT---GT--AC---A--TACA-TA----AATA---CACTT--GT--CTCA-AT-------AATGAGAGC--TCGCCAGCTCGCTGTCAC--TT--CTGCA-----AGTGAGTGTTCA-------CCA-GG-T----------AAACAGTGGTA------TAG---GTA--GATACTGC---ACTATGGAAAGGAGCC-GGTAATGACAATT--AC---AACCGT-AGCTATAATGGTTG-AGTGAAC-CA-TTTGTATT-GT-CAGCTAGGTAATCCTTTTTACTATAATGT---ATCTAAA-CCTATATTCGTCTATGTTTCTACCATGTTAATCTGCCTG-TGGCAAATCAAGA---ACTGA-CA---TTTTA--AGATTCC-----GC-A-CG--G-CTATTTATACCCATT-----CTACACGATGTGGCTCCCAGCAT-T-----TATATCGGGCTCCAAATTAT----------AATC-GGCATGGTTCTCGACTGACAATTAATAGCATAGCACCGAAGCTGGGTTCAAGCCG-TA--TTTCCGTTTCCAACTCGGAAGTATAACCAT--TTATTGAATGTT--GAGGT-GGATTTTATCGATTGTT-ATTAATAAAACGTATGTTTTTCATTGTAGCTTTGTTCTTTATGTCTGCGACTGTCAAATATCGTTTACTGGTCAT-AAA--ATATTTGTCTTAG-CCGGATCATATAACTGAAAATATCAC
gi|7 : GTAACGTGGCAGAGCTATGTT-AAT----G---CTC----GCAGTGTG-----C-AATTACA
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gi|1 : AACGTGGCGGAGCTATGTT-AGT----G---CTC----GCAGTGTGTAACAC-TATAATAAAAATAGTAGCGTAATATAT----TTAAATACACACAACAATAACGATT---TCACAATTTGGACT-GAG-TACCTGCTCAAA--A---ATAA-TG-------------------ATTGGT-TG-GACTGTTACAAA-TGATTCGTGTGGGTCCCTCAGTTATAGATTGCGAATCAGGTAATTA-ATCAA-AAACTAACATATAT--A------TATT--ATA--TACAACAGTTCGTTCGG--TCAGACGGTTAAAT------------TATAATACACGTCAGTGT-GAACGCTC--A---GT-G-TCT-AAATG-TAATAAACAAGT-GCGTAA--T
gi|14 : AACATGGTGGAGTGATGTC-CATTCTGA---CTC----GCAGTGTGCAACAC-ACTGATATAA-TGGCAGAATGATATAT----TCAAATGCTCAAAGAAAGAA-----------CACTTT--ACT-GAGCTACCTGCTCAAG--T---ATA--TT-------------------ATTGGT-TTTGATT--TGTAAACTGATTCGTATTGTTATTTCAGTTATAAACTGAGAATCAACTAATCA-ATTAATACACTAACGTATTT--AAATAATTATT--ATA--TATATTGGTTCATTGGG--CCACACAGTTTAAT-----------------TACATGCCAGTGT-GGACGCTC--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtggctcaatgcagctcacacaataacgagcgctcactagctcagtaccacagtagcttaatcaataaagagcgttcgctaaaccagtcagctcaacgcataaaacgagcgctcagtagctcgttgttataaaccagtgtgtgcatacacacatacacctgtctcaataatgagagctcgctagctcgctgtcactactggaagtgagcgttcaccaggtaaacagtggtataggtagacactaccgaaaggagccggcaatgataagtataacggcagctcaaattgttgagtgaatcgttagtattatacagccaggtaaccctttatattatattgtatctaaaccctacatccttctatgtttctacgatgttaatatgtctgcggcaaatcaagaactgacattttaagagaccgcacgctatttatacccgttctaaacgatgtggctcccagcaattgcatcgtgctccgaactataacggaaccaaatcggaatggttctcggctgataattaatagcatctcagagaagctgggttcaagccgtttttttcatttccgacacggaagtaaaaccatgtattgggtgttgaaatggactttatcgattgttattaataaaacgtatgtttttcgtggtagctttgttctttatgtctgctactgtcatgtatcgtttactggtcatgaaatatttgacttagccggatcatataactgaaaatatcacac
gi|5 : gaACATTGCAGACCTATGTT-TAT----A---CGT----GCAGTGTGCAACACTAAT----AAAATGGTAGCGTAATGTATAAATTTAAATACACACAGCAAGAGCGATG---TCTTAATTTGGACC-AAG-TACCTACGCAAA--A---TAAA-TA-------------------ATTTGT-TT-GGTTATTACAAA-TGATT--TGT----------ATTATAAACTG-GAATCTGCTAATTATATCAATACACTAACATATTT--A------TATT--ATA--TACAAAGGTTCATTTAA--CCAG---------------------------------TCAGTG--TGACGCTC--A---TT-G-ACT-CAAAG-TGATACACTAGT-GCACAA--TA-GCTCAT-TG-A---CAT---AAAC---AAGC----GCTttagtc
gi|4 : GTGGCGGAGCTATGTT-TAT----G---ATC----GCAGTGTGCAACAA-TATAATAAAAACGGAAGTGTAATATAT----TAACATACACACAGCAAGAACAATT---TCTCAATTTGGACT-GAACTACCTG-TC-AA--A---ATAA-AT-------------------GATAGGTTT-GATTGTTACAAA-TGATTCGTGTATGTCCCTTAGTTATACACTGAGAATCAGCTAATTA-ATCAATATACTAACATATTT--A------TATT--ATG--TACA------------G--CTAG--AGCTC-AT------------TG------ACATAAACG---AGTGCTC--A---GT-G-GCT-CACT--TGACCAACAGCT-GATC----TA-ACTCA----------AT----AAC---GAGC----GCTC-ACT----------------------------AGCT---TAGTA-CA----------------ATCGAA--CGCTCAGTAGCTCA--G-------T------GC--AGCTC-ACTCA-ACTGA--TAGCGTT-CACTAGACCAGT-------------------CA----------GC-----------TC-AGT--GT---C-A-TAAA-A-C-------G-A---GC------GCTCGG-T-AGC--TC--G--TTGTTATAAACC---AGATT-G-TA-----------CATACACCTGTCTCAATGA-TGAGAGCTCG--------CTAGC-T-CGTTG----TC------ACTA--ATAC--A------A--GT---GT--AC---A--cagtggttcactaggccttctgctgagctaccttaattatgcgtgctgactagctcagtatcataaccaaacactcagtagctcaatcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgtactgcacttcagaaaggagcccgcaatgataattttaacggcaattcaaactgttgagtgaatcgttcctgttatacagccaggtaaccctttatactatattgtatctgaaccctatatcaaatgattctacgacgttaatctgtttgcgagaactgacaattttttaggctgcgcagctatttataccaattcagaacttaacgatgtggctcttagcatttacacatgctctgaaacaaaatgaaactaaatcggcatggttcttgtccgataattaatagtatcacagcaaagctgggttaaagccataattttactgagtgtttaggtgaacattattgatttttattaataaaacatatgtttatcattgttgtttcgttcttgatacctgttactgtcatttattatttattgttcataaaacatttgtcttagccagatcttataactcaaaatatcaca
gi|10 : CTATGTT-AAT----G---CTC----GCAGTGTGCAACAA-TATAATAAAA-TGGTAGCGTAATATAT----TTATATGAACACATCAA-AAAatattaattacaacggcagctcaaactgttgagcggatcgtttgtattatacagccaggtaaccctttatactacgtagtatctaaaccctatattcttctacgttttcacgatattaatctgacatttttcgaggccgcactgctatttaaaccattctaaacgatgtggctcccagcatttacatcgtactcgaaatacaacggaacaaactcgacatggttcttttccgataattagtcgtatcacagcgaagctgggttcaagccgtattttcattttttacacggaagtaaaaaataataattgagggttgagatggactttatcgatttttcattaataaaacgtgtgtttattatagtagtttcgtctgctaccgtcgtatatcgtttattggtcatcaaatatttgtcttagccggatcttatgactgaatatatcaca
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gi|6 : gtaacgtggcagagctatgttaatgctcgcagtgtgcaaA--A---ATAAATG-------------------ATGGGT-TT-GGTTGTTACAAA-TGATTCGTGTGGGTCCCTCAGTTATAGACTGAGAATCAGCTAATTA--TCAAAATACTAACATAGCT--A------TATT--ATA--TACAACAGTTCGTTCGG--CCAGACAGTTTAAT------------TATAATACACGTCAGTGT-GAACGCTC--A---GT-G-GTT-CAATG-TGATAAATAAGT-GCACAA--TA-GCTCAT-TG-A---CAA---AAAC---GAGA----GCTC-ATTGACATA-----------AACG----AG-CGCCCAGTGGCT-CA----------------ATTGA----GCTCAATAAAT-A--A-------C------G---GGTTC-------ATAAAACGAGCGCT-CGATAGCTC
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gi|6 : aatgcgaaggctcaattcatcattatgtGAA--CGCTCAGTGGTTCA--A-------T------GT--G-----------ATAAAT-AAGTGCA-CAATAGCTCATT--GA-CAAAAA--------CG----------AGAG---C-----TC-ATT--GA---C-A-T--A-A-A-------CGA---GC------GCCCAG-T-GGC--TC--AATT----------G---AGCTCAA-TAAATAACGGGTTCATA----------AA--A-CGAGCGCTCG--------ATAGC-T-CGTTG----TT------A-TA--A-AC--C------TGCGT---GT--AC---A--TACA-CG----AATA---CACCT--GT--CTCA-CT-------AATGAGAAC--TCGCTAGCTCGCTGTCAC--CA--CTGCA-----AGTAAGCGTTCA-------CCA-GG-T----------AAACAGTCGTA------TAG---GTA--GATACGGC---ACTTCCAAAAGGAGCC-GGCAGTGGCAATT--AT---AACGGC-AGCTCAAAATGTTG-AGTGAAT-AA-TTAGTTTT-ATGCAGTCAGGTAACCCTTTATACTATATTGT---ATCTGAACTCTTTTTTCTTATACGTTTCTGC-AT---AATCTGTCTG-TGGCAAATCAAGA---ACTGA-CA---TTTTT--ATGGG-------------------TATTATTACCCATT-----CTCAACAAAATGGCTCCCAGCAT-T-----TGCATCGGGCTCCGAACTATAACGGAACCAAATC-GGCATGGTTCTCGGCTGATAATTTATAACATAGCAGCGAAGCTAGGTTCAATCCG-TA--TTTTCGTTTCCGACACGGAAGTAAAACCAT--TTATTGAGTGTT--GAGGT-GGACTTTATATATTTTT-ATTAAT-AAACGTATGATTTTCAC--TAGCTTTGTTCTTTATGTCTGCTACAGTCATATATCGTTTACTGTTTAT-AAAATATATTTGTCTTTG-CCGGATCTTATAACTAAAAATATCACaa
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gi|4 : aacgtggcggagctatgttagtgctcgcagtgtgtaacactataataaaaatagtagcgtaatatatttaaatacacacaacaataacgatttcacaatttggactgagtacctgctcaaaaataatgattggttggactgttacaaatgattcgtgtgggtccctcagttatagattgcgaatcaggtaattaatcaaaaactaacatatatatattatatacaacagttcgttcggtcagacggttaaattataatacacgtcagtgtgaacgctcagtgtctaaatgtaataaacaagtgcgtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng--AGCTC-ATTGACATAAAC-GAGTGCT-CAGTGGCTCACTTGAC-CAA-----------CA----------GCTG---A-----TCTAAC---T---C-AAT--A-A-C-------G-A---GC------GCTCAC-T-AG---------------------------CTTAG-TA-----------CA-------------A--T-CGAACGCTCA--------GTAGC-TCAGT-GCAGCTC------ACTC--A-ACTGAT-----AGCGT---TC--AC------TAGA-C-----CAGT---CAGCTCAGT--GTCATAA-------AACGAGCGC--TCGGTAGCTCGTTGTTA---TAAACCAGA------TTGTACATACA-------CCT-GTCT----------CAATGATGAGAGCTCGCTAGCTCGTT--GT-----C---ACTA---ATACAAGTG-TACAATATTAATT--AC---AACGGC-AGCTCAAACTGTTG-AGCGGAT-CG-TTTGTATT-ATACAGCCAGGTAACCCTTTATACTACGTAGT---ATCTAAACCCTATATTCTTCTACGTTTTCACGATATTAATCT-------------------------GA-CA---TTTTT--CGAGGCC-----GC-A-CT--G-CTATTTA-AACCATT-----CTAAACGATGTGGCTCCCAGCAT-T-----TACATCGTACTC-GAAATACAACGGAAC-AAACTCGACATGGTTCTTTTCCGATAATTAGTCGTATCACAGCGAAGCTGGGTTCAAGCCG-TA--TTTTCATTTTTTACACGGAAGTAA-AAAATAATAATTGAGGGTT--GA-GATGGACTTTATCGATTTTTCATTAATAAAACGTGTGTTTATTATAGTAGTTTC---------GTCTGCTACCGTCGTATATCGTTTATTGGTCAT-CAA--ATATTTGTCTTAG-CCGGATCTTATGACTGAATATATCACac
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gi|26 : ATAAAACTTGTGTTTATTTTAGTAGTTTTGTTGTTTATGTCTGCTACTGTCATATATCGTTTATTGGTCAT-AAA--ATATTTGTCTTAG-CAGA-TCTTAAAACTGAAAATATCAC
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|23 ): AACCTGGATTCAAGCTACATCACGAAAGTAAAACAAATTTTTGAGTATTGAAGTGGATACTATCGATTATCATCAATATTTTCATAACTGCTGTGTTATTTATGTATTGTATGATAAATTATATTTCGTGAAATATGTGCTTAGTTAATTACCTTCTTACACTGATATTATCACAC
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gi|6 : acattgcagacctatgtttatacgtgcagtgtgcaacactaataaaatggtagcgtaatgtataaatttaaatacacacagcaagagcgatgtcttaatttggaccaagtacctacgcaaaataaataatttgtttggttattacaaatgatttgtattataaactggaatctgctaattatatcaatacactaacatatttatattatatacaaaggttcatttaaccagtcagtgtgaA--A---------------AT-------AAATGATGGGTTT-GGTTGTTACAAA-TGATTCGTGTGGGTCCCTCAGTTATAGACTGAGAATCAGCTAATTA--TCAAAATACTAACATAGCTA------TATTATATACAACAGTTCGTTCGG--CCAGACAGTTTAATTATAATACA--CGTCAG----------TGTGAACGCTCAGTGGTTCAATGTGATAAATAAGTGCACAATAGCTCATTGACAAAAACGAGAGCTCATTGACATAAACGAGCGCCCAGTGGCTCAATTGA--GCTCAATAAAT-AACG-GGTTC-----ATAAAAC--GAGCGC---TCG-A----TAGCTCGT-----TG-----T-------TA----TAA-ACCTGCGTGTAC-AT--ACA-CGA---A-------------------TAC------ACCT--GT-------------CTCAC-T---------------------------A--A-TGAGAACTCG--------CT-AGCTCGCTGTCA-a
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Reference ( family-2976 ) : NGTAACGTGGCGGAGCTATGTTAAT----GCTC----GCAGTGTGCA---------ACACAATAATAAAAATGGTAGCGTAATATAT----TTANATACACACAGCAAGAACGATT---TCTCAATTTGGACT-GAG-TACCTGCTCAAA--A---------------AT-------AA-TGATTGGTTT-GATTGTTACAAA-TGATTCGTGTGGGTCCCTCAGTTATAGACTGAGAATCAGCTAATTA-ATCAATATACTAACATATCTA------TATTATATACAACGGTTCGTTCGG--CCAGACAGTTTAATTATAATACA--CGTCAG----------TGTGAACGCTCAGTGGCTCAATGCGATAAACAAGCGCACAATAGCTCATTGACATAAACGAGAGCTCACTGACATAAACGAGAGCTCAATGACATAAACGAGCGCTCAGTGGCTCAATGCG--GCTCACTCAATAAA----GAGCGC---T-CA-C----TAGCTCAGTA-----CCA----CAGTAGCTCAATGT-C-AT--A-A-CGA---GCGCTC----G--------CTAG------ACC---GT----------CAGCTCAA-TG-----------CATA----------AA--A-CGAGCGCTCG--------GT-AGCTCGTTGTTA-T-AA-ACCAGCGT---GTA---------CA--TACAC--------ACATACA--------CCTGT--CTCAAT-------AATGAGAGCTCGCTAGCTCG----C---TG-TCACTACTGCAAGTGAGCGTTCAC--CAGG-TAAACAGTNGTATAG--GTA--GA-----C---ACTACC-----GAAAGGAGCCGGCAATGATAATTACAACGGC-AGCTCAAATTGTTG-AGCGAATCG-TTNGTATTATACAGCCAGGTAACCCTTTATACTATATTGT---ATCTAAACCCTATATCCTTCTACGTTTCTACGATGTTAATCTGTCTG-TGGCAAATC-GAGAACTGA-CA-TTTTN--AGAGGCC-----G------C-A-C---G-CTATTTATACCCATT-----CTAAACGATGTGGCTCCCAGCAT-T-----TACATCGTGCTCCGAAATATAACGGAACCAAATCGGCATGGTTCTCGGCCGATAATTAATAGCATCGCAGCGAAGCTGGGTTCAAGCCG-TATT---TTCATTTCCGACACGGAAGTAAAACNAT--TTATTGAGTGTTGAGGTGGACTTTATCGATTNTT-ATTAATAAAACGTATGTTTNTCATNGTAGCTTCGTTCTTTATGTCTGCTACTGTCATATATCGTTTACTGGTCATAAA--A-TATTTGT---CTTAGCCGG--A---TCTTATAACTGAAAATATCAC
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gi|11 : ctatgttaatgctcgcagtgtgcaacaatataataaaatggtagcgtaatatatttatatgaacacatcaaaaacGTAATACGGTAGAGAGATGTTGGT----ACTTATCTGCGTTGTAAA---------GTACAATAATTAAA-TGGTATCGTAA-ACATAAA-TGAAATACACATAGCAAGAATTATTGTTTCTCAATTTATAATAGAC-TGCCCGTTCAAATAA---------------AT-------AG-T--TT--TTT-AATTGTGACAAA-T---TCCTTTGAATCTTTCCGTTATAGAATGAGAATCAGCTAATCA-CTGTATAGGGTAACTTATTTA------CATAACATACAAAGGCTCATTCCGATCAAGGAAGTTCAACGA-AAGAAATCCGT-AGAATTCTAATATGTGAGCGCTCAGTAGCTCACT----TGAACTAGCTCAGA--AGTTTGGTGTCACAAACAAGTGCTtccttgtttaaatatttgaattatgctttatctttgatcagtggaacgagtagaaaacatattcaaaatagacggttaactgtgcgaataatttgt
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gi|14 : AACATGGTGGAGTGATGTCCATTCTGACTC----GCAGTGTGCA---------ACACACTGATATAA-TGGCAGAATGATATAT----TCAAATGCTCAAAGAAAGAACACTT---T----------ACT-GAGCTACCTGCTCAAG--T---------------AT-------A--TTATTGGTTTTGATT--TGTAAACTGATTCGTATTGTTATTTCAGTTATAAACTGAGAATCAACTAATCA-ATTAATACACTAACGTATTTAAATAATTATTATATATATTGGTTCATTGGG--CCACACAGTTTAAT-----TACA--TGCCAG----------TGTGGACGCTCAttagtc
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gi|26 : ATAAAACTTGTGTTTATTTTAGTAGTTTTGTTGTTTATGTCTGCTACTGTCATATATCGTTTATTGGTCATAAA--A-TATTTGT---CTTAG-CAG--A---TCTTAAAACTGAAAATATCACattc
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gi|5 : gtggcggagctatgtttatgatcgcagtgtgcaacaatataataaaaacggaagtgtaatatattaacatacacacagcaagaacaatttctcaatttggactgaactacctgtcaaaataaatgataggtttgattgttacaaatgattcgtgtatgtcccttagttatacactgagaatcagctaattaatcaatatactaacatatttatattatgtacagctagagctcattgacataaacgagtgctcagtggctcacttgaccaacagctgatctaactcaataacgagcgctcactagcttagtacaatcgaacgctcagtagctcagtgcagctcactcaactgatagcgttcactagaccagtcagctcagtgtcataaaacgagcgctcggtagctcgttgttataaaccagattgtacatacacctgtctcaatgatgagagctcgctagctcgttgtcactaatacaagtgtaACATTGCAGACCTATGTTTAT----ACGT----GCAGTGTGCA---------ACAC--TAATAAAA-TGGTAGCGTAATGTATAAATTTAAATACACACAGCAAGAGCGATG---TCTTAATTTGGACC-AAG-TACCTACGCAAA--A---------------TA-------AA-TAATTTGTTT-GGTTATTACAAA-TGATTTGT------------ATTATAAACTG-GAATCTGCTAATTATATCAATACACTAACATATTTA------TATTATATACAAAGGTTCATTTAA--CCA-----------------------GTCAG----------TGTG-ACGCTCATTGACTCAAAGTGATACACTAGTGCACAATAGCTCATTGACATAAACAAGCGCTCAGTGa
gi|5 : TCAGTGTGACGCTCATTGACTCAA-----AGTGA---TACA-C----TAGT---G--------CA----CAATAGCTCATTGA-C-AT--A-AACAA---GCGCTC----AGTGGTTCACTAG------GCC---TT----------CTGCTGAGCTA-----------CCTT----------AATTA-TGCGTGCTGA--------CT-AGCTCAGTATCA-T-AA--CCAA-----------------------ACAC--------TCA---------------GTAGCTCAAT-------CAANNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-NNNNNNNNNNNNTAT--GTACTG------C---ACTTCA-----GAAAGGAGCCCGCAATGATAATTTTAACGGC-AATTCAAACTGTTG-AGTGAATCG-TTCCTGTTATACAGCCAGGTAACCCTTTATACTATATTGT---ATCTGAACCCTATATC---AAATGATTCTACGACGTTAATCTGTTTG---------C-GAGAACTGA-CA-ATTTT--TTAGGCT-----G------C-G-CA--G-CTATTTATACCAATTCAGAACTTAACGATGTGGCTCTTAGCAT-T-----TACA-CATGCTCTGAAACAAAATGAAACTAAATCGGCATGGTTCTTGTCCGATAATTAATAGTATCACAGCAAAGCTGGGTTAAAGCCA-TA--------ATT------------------------TTACTGAGTGTTTAGGTGAACATTATTGATTTTT-ATTAATAAAACATATGTTTATCATTGTTGTTTCGTTCTTGATACCTGTTACTGTCATTTATTATTTATTGTTCATAAA--A-CATTTGT---CTTAGCCAG--A---TCTTATAACTCAAAATATCACgttcactaggccttctgctgagctaccttaattatgcgtgctgactagctcagtatcataaccaaacactcagtagctcaatcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgtactgcacttcagaaaggagcccgcaatgataattttaacggcaattcaaactgttgagtgaatcgttcctgttatacagccaggtaaccctttatactatattgtatctgaaccctatatcaaatgattctacgacgttaatctgtttgcgagaactgacaattttttaggctgcgcagctatttataccaattcagaacttaacgatgtggctcttagcatttacacatgctctgaaacaaaatgaaactaaatcggcatggttcttgtccgataattaatagtatcacagcaaagctgggttaaagccataattttactgagtgtttaggtgaacattattgatttttattaataaaacatatgtttatcattgttgtttcgttcttgatacctgttactgtcatttattatttattgttcataaaacatttgtcttagccagatcttataactcaaaatatcaca
gi|6 : acattgcagacctatgtttatacgtgcagtgtgcaacactaataaaatggtagcgtaatgtataaatttaaatacacacagcaagagcgatgtcttaatttggaccaagtacctacgcaaaataaataatttgtttggttattacaaatgatttgtattataaactggaatctgctaattatatcaatacactaacatatttatattatatacaaaggttcatttaaccagA--A---------------AT-------AAATGATGGGTTT-GGTTGTTACAAA-TGATTCGTGTGGGTCCCTCAGTTATAGACTGAGAATCAGCTAATTA--TCAAAATACTAACATAGCTA------TATTATATACAACAGTTCGTTCGG--CCAGACAGTTTAATTATAATACA--CGTCAG----------TGTGAACGCTCAGTGGTTCAATGTGATAAATAAGTGCACAATAGCTCATTGACAAAAACGAGAGCTCATTGACATAAACGAGCGCCCAGTGGCTCAATTGA--GCTCAATAAAT-AACG-G--GTTC-----ATAAAAC--GAGCGC---T-CG-A----TAGCTCGTTG-----TTA----TAA-ACCTGCGTGTAC-AT--ACA-CGA---A-------------------TAC------ACCT--GT-------------CTCAC-T---------------------------A--A-TGAGAACTCG--------CT-AGCTCGCTGTCA-a
gi|6 : GAACGCTCAGTGGTTCAATGTG-----------ATAAAT---AAGTGC---A-CA-A----TAGCTCATTG-----ACAAAAACGAGAGCTCATTGA-C-AT--A-AACGA---GCGCCCAGTGG--------CTCA------ATT---G------------AGCTCAA-TAAATAACGGGTTCATA----------AA--A-CGAGCGCTCG--------AT-AGCTCGTTGTTA-T-AA-ACCTGCGT---GTA---------CA--TACAC--------GAATACA--------CCTGT--CTCACT-------AATGAGAACTCGCTAGCTCG----C---TG-TCACCACTGCAAGTAAGCGTTCAC--CAGG-TAAACAGTCGTATAG--GTA--GATACGGC---ACTTCC-----AAAAGGAGCCGGCAGTGGCAATTATAACGGC-AGCTCAAAATGTTG-AGTGAATAA-TTAGTTTTATGCAGTCAGGTAACCCTTTATACTATATTGT---ATCTGAACTCTTTTTTCTTATACGTTTCTGCA----TAATCTGTCTG-TGGCAAATC-AAGAACTGA-CA-TTTTT--ATGGG-------------------------TATTATTACCCATT-----CTCAACAAAATGGCTCCCAGCAT-T-----TGCATCGGGCTCCGAACTATAACGGAACCAAATCGGCATGGTTCTCGGCTGATAATTTATAACATAGCAGCGAAGCTAGGTTCAATCCG-TATT---TTCGTTTCCGACACGGAAGTAAAACCAT--TTATTGAGTGTTGAGGTGGACTTTATATATTTTT-ATTAATAAA-CGTATGATTTTCAC--TAGCTTTGTTCTTTATGTCTGCTACAGTCATATATCGTTTACTGTTTATAAAATA-TATTTGT---CTTTGCCGG--A---TCTTATAACTAAAAATATCACccactgcaagtaagcgttcaccaggtaaacagtcgtataggtagatacggcacttccaaaaggagccggcagtggcaattataacggcagctcaaaatgttgagtgaataattagttttatgcagtcaggtaaccctttatactatattgtatctgaactcttttttcttatacgtttctgcataatctgtctgtggcaaatcaagaactgacatttttatgggtattattacccattctcaacaaaatggctcccagcatttgcatcgggctccgaactataacggaaccaaatcggcatggttctcggctgataatttataacatagcagcgaagctaggttcaatccgtattttcgtttccgacacggaagtaaaaccatttattgagtgttgaggtggactttatatatttttattaataaacgtatgattttcactagctttgttctttatgtctgctacagtcatatatcgtttactgtttataaaatatatttgtctttgccggatcttataactaaaaatatcac
gi|7 : aaataaatgatgggtttggttgttacaaatgattcgtgtgggtccctcagttatagactgagaatcagctaattatcaaaatactaacatagctatattatatacaacagttcgttcggccagacagtttaattataatacacgtcagtgtGTAACGTGGCAGAGCTATGTTAAT----GCTC----GCAGTGTGCAATTACATACACACAATAACAA
gi|7 : ----TTACATACACACA---ATAACAATT---TCTCAATCTAGACT-GAG-TACCTGCTCAAA--A----------------T-------AA-TGATTAGATT-GATTGTTACAAA-TAATTTGTGTGGGTCCTTCAGTTATAGAATGAGAATCAGCTAAATA-ATCAAAATACTAACATATCTA------TATTGTATATAA------------------A-AGTTTAACTACAACACA--CGTCAG----------TGTGAACGCTCAGTGGCTCAATGCAATAAACAAGCACACAATCGCT--------TAAAT----------TGACATAAACAAGAGCTCACTGACATAAACGAGAGCTCA----TTTAA----------ACTTAATT------GAGTTC---T-CA-C----TAG-----TA-----CAA----CAGTAGCTCAATGT-C-AC--A-A-CAA---GCGTTC----G--------CTAG------ACC---AT----------CAGAACAA-CG-----------CATA----------AA--A-CGAGCGCTCG--------GT-GGCTTGTTGTTA-T-AA-ACCAGCAT---GTA---------CA--TACAC--------AAATACA--------CCTGT--CTCAAT-------AATAAGAGCTCACTAGCTCG----C---TG-TCACTTCTGCAAGTGAGTGTTCAC--CAGG-TAAACAGTGGTATAG--GTA--GATACTGC---ACTATG-----GAAAGGAGCCGGCAAAGATGATTACAATGGC-AGCTCAAATTG-TG-AGTGAAACA-TTAGTAATTTACAGCCAGGTAACCCTTTAAACCATATTGT---ATCTAAACCCTATATTCTTCTGTTTTTCTACGATGTTAATCTGTCTG-TAGCAAATC-AAAAACTGA-CA-TTTtttctcaatctagactgagtacctgctcaaaataatgattagattgattgttacaaataatttgtgtgggtccttcagttatagaatgagaatcagctaaataatcaaaatactaacatatctatattgtatataaaagtttaactacaacacacgtcagtgtgaacgctcagtggctcaatgcaataaacaagcacacaatcgcttaaattgacataaacaagagctcactgacataaacgagagctcatttaaacttaattgagttctcactagtacaacagtagctcaatgtcacaacaagcgttcgctagaccatcagaacaacgcataaaacgagcgctcggtggcttgttgttataaaccagcatgtacatacacaaatacacctgtctcaataataagagctcactagctcgctgtcacttctgcaagtgagtgttcaccaggtaaacagtggtataggtagatactgcactatggaaaggagccggcaaagatgattacaatggcagctcaaattgtgagtgaaacattagtaatttacagccaggtaaccctttaaaccatattgtatctaaaccctatattcttctgtttttctacgatgttaatctgtctgtagcaaatcaaaaactgacattt
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Reference ( family-2976 ) : NGTAACGTGGCGGAGCTATGTTAAT----GCTC----GCAGTGTGCA---------ACACAATAATAAAAATGGTAGCGTAATATAT----TTANATACACACAGCAAGAACGATT---TCTCAATTTGGACT-GAG-TACCTGCTCAAA--A---------------AT-------AA-TGATTGGTTT-GATTGTTACAAA-TGATTCGTGTGGGTCCCTCAGTTATAGACTGAGAATCAGCTAATTA-ATCAATATACTAACATATCTA------TATTATATACAACGGTTCGTTCGG--CCAGACAGTTTAATTATAATACA--CGTCAG----------TGTGAACGCTCA---GT-GGCTCAATG-CGATAAACAAGCGCACAATAGCTCATTG-ACATAAACGAGAGCTCACTGACATAAACGAGAGCTCAATGACATAAACGAGCGCTCAGTGGCTCAATGCG--GCTCACTCAATAAA----GAGCGC---T-CA-C----TAGCTCAGTA-----CC----A-CAGTAGCTCAATGT-C-A-T--A-A-CGA---GCGCTC----G--------CTAG------ACC---GT----------CAGCTCAA-TG-----------CATA----------AA--A-CGAGCGCTCGGTAGCTCGTTGTTA-TAA-ACCAGCGTGTACA--TACAC-A-A-T-CACCTGT--CTCAATAATGAGAGCTCGCTAGCTCG----C---TG-TCACTACTGCAAGTGAGCGTTCAC--CAGG-TAAACAGTNGTATAG--GTA--GA-----C---ACTACC-----GAAAGGAGCCGGCAATGATAATTACAACGGC-AGCTCAAATTGTTG-AGCGAATCG-TTNGTATTATACAGCCAGGTAACCCTTTATACTATATTGT---ATCTAAACCCTATATCCTTCTACGTTTCTACGATGTTAATCTGTCTG-TGGCAAAT-CGAGAACTGA-CA-TTTT-NAGAGGCCGCG-------CGGCTATTTATACCCATT-----CTAAACGATGTGGCTCCCAGCAT-T-----TACATCGTGCTCCGAAATATAACGGAACCAAATCGGCATGGTTCTCGGCCGATAATTAATAGCATCGCAGCGAAGCTGGGTTCAAGCCG-TATT---TTCATTTCCGACACGGAAGTAAAACNAT--TTATTGAGTGTTGAGGTGGACTTTATCGATTNTT-ATTAATAAAACGTATGTTTNTCATNGTAGCTTCGTTCTTTATGTCTGCTACTGTCATATATCGTTTACTGGTCATAAA--A-TATTTGT---CTTAGCCGG--A---TCTTATAACTGAAAATATCAC
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gi|10 : aacgtggcggagctatgttagtgctcgcagtgtgtaacactataataaaaatagtagcgtaatatatttaaatacacacaacaataacgatttcacaatttggactgagtacctgctcaaaaataatgattggttggactgttacaaatgattcgtgtgggtccctcagttatagattgcgaatcaggtaattaatcaaaaactaacatatatatattatatacaacagttcgttcggtcagacggttaaattataatacacgtcagtgtgaacgctcagtgtctaaatgtaataaacaagtgcgtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTATGTTAAT----GCTC----GCAGTGTGCA---------ACAATATAAT-AAAATGGTAGCGTAATATAT----TTATATGAACACATCAAAAACac
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gi|17 : cgcaatagtcctatacagctgacctaataacgatgaacgtgcacacgttagctcaatgtcaAT-T-----TACATCGGGCTACAAAATATAACGGAACCAAGTCGGC---------------------ATAGAACCG-----AAGCTGGGTTCAAGTCT-TATT---TCCAT------CATGGAAGTTAAACCAT--TTATTGAATGTTGAGGTGGACTT---CGATTGTT-ATT---------CATGTTTTTCATGGTAGCTTTGTTCTTTATGTCTGCTTCTGTCATATATCGCTTACTGATCATAAA--A-TATTTGT---CTTAGTCAG--A---TCATATAACTGAATATTTCAC
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