lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     11111111111       3333333            1    11       11111111111111  3333333333333333    2222222                111        1                3333333333333333333333333333333333333333                                  1          1                        1        222222                44444444444444444                       11111              22222222             11                                  1111        1     1                            1                  11     66666666666666666666666                                                          222222222222                                                       1111                     1                                              333333                   111                     1           111111111111     111                                               1          1                                              44444444444444                      2222222222222222                                                1111111111  1111111  11                  111              222                           7777777777777777777777777777777777777777                                                     444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  3 2     2          66666666666 444   3333333  1      3  6    55 6     22222222222222  0000000000000000    7777777         4  77  444 2  2   0    2    2      7777777777777777777777777777777777777777  2    99999999           0       4       2  8  3        555          5        111111  55555  3  44  44444444444444444      555   2  3       00000  1           55555555  3  66      00  3   77777      5           33   0000        5   2 1     00     8  2   33   2   5 33  2 8888888  2 44 2   11111111111111111111111                   2              2 2                     444444444444  2  5 33  9    8   888  444             66  33        0000  2          33      2  4         2                   5555  2 666   222222            2  44  333   33      2    2    3 2      3  999999999999   3 000  6 4       5555     444 33  444 33 33      2  3 2        1   444           1   33 33  33    33 888888   66666666666666 0 88888888    0      9999999999999999    2        33           55 2  2 4   2 2  1    6666666666  3333333  22            0  4  111    1   1 1   444   22          4    44444  1111111111111111111111111111111111111111  8888888 1      44444          22               333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                         3        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  . .     .          ........... ...   .......  .      .  .    .. .     ..............  ................    .......         .  ..  ... .  .   .    .    .      ........................................  .    ........           .       .       .  .  .        ...          .        ......  .....  .  ..  .................      ...   .  .       .....  .           ........  .  ..      ..  .   .....      .           ..   ....        .   . .     ..     .  .   ..   .   . ..  . .......  . .. .   .......................                   .              . .                     ............  .  . ..  .    .   ...  ...             ..  ..        ....  .          ..      .  .         .                   ....  . ...   ......            .  ..  ...   ..      .    .    . .      .  ............   . ...  . .       ....     ... ..  ... .. ..      .  . .        .   ...           .   .. ..  ..    .. ......   .............. . ........    .      ................    .        ..           .. .  . .   . .  .    ..........  .......  ..            .  .  ...    .   . .   ...   ..          .    .....  ........................................  ....... .      .....          ..               ... ..........................................................................................                         .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  7 9     7          11111111111 777   1111111  1      6  3    99 1     11111111111111  3333333333333333    3333333         8  22  666 5  5   9    5    5      2222222222222222222222222222222222222222  9    77777777           7       6       9  8  9        444          8        666666  99999  1  22  22222222222222222      000   9  1       55555  7           33333333  1  88      11  6   11111      3           99   0000        1   7 7     99     9  7   77   7   2 44  5 1111111  5 44 7   66666666666666666666666                   5              4 4                     222222222222  7  3 77  1    1   222  111             99  44        6666  5          44      2  4         5                   3333  5 999   444444            5  55  222   22      4    4    9 4      8  000000000000   8 666  2 8       0000     111 22  111 22 22      5  6 7        2   777           1   99 99  77    77 222222   33333333333333 6 55555555    2      9999999999999999    2        11           00 1  1 2   0 0  9    5555555555  0000000  00            4  9  444    6   6 6   111   55          6    88888  0000000000000000000000000000000000000000  1111111 9      88888          66               999 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666                         9        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATACATGT-TGGGA-CAACGTATATG----------C---TGA-CC-CCGCTCACCTCACCCAACCT-GATCATTG----------TGGTAG----------------GGGG-------TCATCCCGCCCCGGCTG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTGT-C------------N--------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAA-ATCATCATTATAAT---GACTCGTTCTAATATCATT---TCAAC---GATA-AC--CT---N----T----A---TACTAA---ATA-TC-AGGGTAT-C-TTTTAAACGTTTTACC-C------CA-AA-NATATTA-AATAATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--CGT----TACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGT-ATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-GGA-----C-------N-----C---ATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCA-ANAA--G-N-AA-GG-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACA--ACAAAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATCAAACAAAAAG----AG-A---AAA--AA--CAGGTTATACCA-GG-GTT-G-CCT--ATATCT-ATTT-ACATGG-AAGATGCTT--ATAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A--A--ATAGAC-TAGT-CCGCATATCTTT---CGTAGTCTTGATCAT--C--TC--CGAC--A------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAACAG--ACCT-TTA-A-GAAA-AGAA--ATCGTAGAAGATGGT-----CA-----AGAC--T------A--C----CG-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AA----C----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATACATAT-TGGGA-CAACGTATATA----------C---TGA-GC-CAACTCACCTCATCCTACCT-TATCATTG----------TAGCAG----------------GGGGG------TCATCCCGCTCCAACTA--C-TA-CGCATTTG-CTCT-CATGTG---------------A--------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGACCCACTTTCATCTGAGGTAA-ATAATTATTATAAT---GACTCGTTCTTATATCATT---TTGAC---GGTA-AC--CT---G----T----T---TACTAA---ATA-TC-AGGGTAT-C-TCTTAAACGTTTTACC-A------CA-AA-AATATTA-GATAATA-----CCCTAAAACCAACGAATC--CGT----TACCAAGTTAAT-ACAATTGGAGTAACTGT-ATC--CAA-CCTTT--AT-A-------AA-A--T-GGA-----C-------A-----C---ATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCA-ATAA--G-A-AA-GG-G-ATTGATTTTCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACA--ACAAAATTAGCGTCGGCAC-CTACAAATCAAACAAAAAG----AG-A---AAA--AC-CCAGGTTATACCA-GG-GTT-T-CCT--ATATCT-ATTT-ACATTG-AAGATGTTT--AAAC------TCGTACAGCGTTAATAACCT----GTGTA---T--TA---A--A--ATAGAC-TATT-CTGCATATATTT---CGTAGTCTTGACCAT--C--TC--CGAC--A------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAGCAT--ACCT-TTA-A-GAAT-GGAA--ATCGTAGAAGGTGGT-----CA-----A-----T------A--C----CG-C------T---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG----AA----C----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATACATGT-TGGGA-CAACGTATATG----------C---AGA-CC-CAATTCACCTCACCAAACCT-AATCATTG----------TAATAA----------------GGGG-------TCATCCCGCTCCGACTG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTG---------------T--------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGACCCACTTTTATCGGCTGTAA-ATCATTATTGTAAT---GACTTATTCTGATATCATT---TCAAC---AATA-AC--CT---T----T----A---TACTAA---ATA-TC-AGGGT-------TTA-----TTTA-----------A-AA-AATATTA-AATAATA-----CCCTAAAATCAACGAATT--TGT----TACCAAGTAAAT-ACAATTAGAGTAACTGT-ATC--CAG-CTT------------------A--T-GGA-----C-------T-----CTC-ATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGT-G-GGAAAGTAGCAAGACGAGTTAA-AAAA--G-T-AA-GG-GTATTTATTACCAC---CA---GTCATGGCATATT--AT--TTTGAGTT----TT-GAAATAAACA--ACAAAATTAGCTTCGGCAC-AAACAAATCAAACAAAAAA----GG-A---AAA--TC-TCAGGTTATACCA-GG-GTT-T-CCG--ATATCT-ATTT-ACATGG-AAGATGCTT--ATAC------TCGTACAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TC---A--A--ATAGAC-TAGT-CCGCAAATCTTT---TGTAGTCTTGACCAT--C--TC--TGAT--A------CTA--------------CGC--------TGTAATG-TTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAGCAG--ACCT-TTA-A-GAAA-GGGA--ATCATTGAAGGTGGT-----CA-----A-----GACAACAA--C----CG-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCATAGA--ATACAGATTGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA-----------ATCTTAATACTTAGGCTGGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATACTTGT-TGGGA-CAACGTATATG----------C---TGA-CC-CCACTCGCCTCACCCAACCT-GATCATTG----------TGGTAG----------------GGG--------TCATCCCGCACTTACTGAGC-TA-CACTTTTG-CTCT-ACTGTG---------------T--------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGTCTCACTTTCATCGGAGGTAA-ATCATTTTTATAAT---GACTCGTTCTAATATC---------------GTA---------------T----A---TACTAA---ATA-TC-AGGGTAT-C-TTTTAAACGTTTCACC--------CA-AACAATGTTA-TATAATA-----ACCAAAGACCAACTAATC--CGT----TACCATATAAAC-AAGATTGGAGTAACGGT-ATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AAGA--T-GGA-----C----------------------------TTACCT-C-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGACC--ATAAAGG-T-AA-GG-A-TTTAATTTCTAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTATT----TT-GAAATAAACA--ACAACG-TAATGTGGGCAC-CTACAAACCAAATAAAAAG----AG-A---AAC--AA-ACGGGTGATATCA-GG-GTT-G-CTT--ATATCT-ATTT-ATATGG-AAGATACTT--ATAC------CTGCAAAACGTTGATAACCT----GTATA---T--CA---A--A--ATAGAC-CAGT-CCGC--ATCTTT---TATAGCCTTGATAAT--C--TC--CGAC--ACTTGGGCCAACTGATAT------CGC--------TGTAATGTTT-AGA-------------GACA-GTATAATG--GCCT------------------A-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATGAACTGTGGCAAG----------------AAAT--GAA--ATTTTAGAAGATTGT-----CA-----A-----A------A--CTAAACA-T------TTTATT-------G-TAAAAT-----AAAGGGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA----C----CTATCTTAATACTTTGGTTGGCATCCGTGGAGGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAAAACATGT-TGGGT-CAGTGTATATG----------T---TGA-CC-CCGCTCACCTTACCCAACCTGTA-CATTG----------TGGTAG----------------AGGG-------TCATCCCGCCCCGGCTG--C-TA-CGCTTTTG-CTCT-CATGTGTACAGAAAATAAC--A--------------T-------TTAT-TATC--------GGAGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAA-ATCATTACTATAAA---GACTCGTTCTAATATCATT---TCAAC---TATA-AC--AT---A----T----A---TACTAA---ATA-TC-TGGGTAT-A-TTTTAAACGTTTTACC-C------CA-AA-CGTATTATAAT-ATA-----CCCTAAGACCAAGGAATC--CGG----TACCAAGTAAAT-AAAAGCGGAGTAACGGT-ATC--CAA-TATAT--AT-ATATATATAA-A--T-GGA-----CTCG----ACT---C---ATTAATATGTATAATATAA-ATTGGCAGTTTAGC-G-GGAAACTAGCAAAATGAGTCC--ATAAAGG-A-AG-GG-G-GTTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ACTGTG-T----TT-GAAATA------------------TTGGTAC-CTACAAATCGAAAAGAAAG----GG-G---AAA--AA-ACAGGTTATATCA-GG-TTT-G-CCT--ATATCT-ATTT-ACATGG-AAGATCCTT--ATAC------TCTCAGAACGTTGGTAACCT----GTGTA---TAATATTCA--A--CTAGAC-TAGT-CCGCATATCTGT---CGa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                          gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaAATACATGT-TGGGA-CAACGTATATG----------C---TGA-CT-CCGCTAACCTCACCCAGCTT-AATCATTG----------TGGTAG----------------GGGG-------TCATTCCGTCCCGGGTG--C-TA-CGCATTGG-CTCT-CATATGTACAGAAAAAATAAAA--------------T-------TTAT-TAAC--------GGTGTGAGCCGCTTTCATTGAAAGTAA-ATCACCATTATAAT---GACTCATTCTAACATCATT---TCAAC---GATA-AC--GT---A----T----A---TAGTAA---ATA-TC-AGGATATAC-TTTT-AACGTTTTACC-C------CA-AA-TATATTA-AATTATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--CGT----TACTAAGTAAAT-TAAATTGTGGTAACGGT-GTC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AACT-CAC-----C-------ATT---C---ATTAATAATTATTAGATAA-TTTGGCAATTTGGC-G-GG-AAATAACAAGACTAGTCTA-TTAA--G-G-AA-GGCG-GTTAATTTGCAT---CA---GTCATGGCATATTTAAA--ATTGTGATAAAATT-GAAATAAACA--ACACAAGTTCCGTCGGCAC-CTTCAAAT-AATTAAAAA--------A---AAA-----CCAGTTCATAACA-GG-TTT-G-CCT--ATATCT-ATTT-ACATGG-GAGATGTTT--ACAT------TCGCTGGACGATGACAACCT----GTGTA---T--TA---A--A--ATAGAC-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgatgttccgtagctccaactgatatcatagatatcgctgtaatgtttaaagatagtataatggccaatttataaaaccaaatttaatgatttgataaactgaaacaaacatacctttaagaaaataaatcg
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcgaAATACATGT-TAGGA-CAACGCATATG----------C---TGA------------CTCCGCGAACCT-AATCATTG----------TGGTAG----------------GGAG-------TCATCCCGCCCCGGCTG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATATGTACAGAAAAATAAA-A--------------T-------TTAT-TAAC--------GGTGTTACCCAAGTTCATTGAAGGTAA-ATCAACATTATAAT---GATTCATTCTAACATCGTT---T--------ATATAC--AT--------T----G---TATTAA---ATA-TC-AGGGTAT-C-TTTTTAACGTTTTACC-C------CA-AA-TATATTA-AATTATAGGCTACCCTAAGACCAACGAATC--CGC----AACTAAGTAAAT-GAAATTGT--TTACGGT-TTT--TAAACCTAT--AT-A-------AA-AA-T-GGAATCACC-------ATT---C---ATTAATAATTATTAGATAC-TTTGGCAGTTTGGC-G-GAAAAA-AACAAAACTAGTCTA-TAAA--G-G-AA-GGAG-ATTTATTTGCAT---CA---ATCATGGCATATTTAAA--AGTGTGATAAAATT-GAAATAAACA--ACAAAAGTACCGTCAGAAT-CTACAAATAAAACAACAAC----AATA---AAA--AA-ACAGGT-----CA-AG-TTT-G-TCT--ATATCT-ATTT-ATATAG-AAGATACTT--TTAT------TCGCTGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--CA---A--A--ATAGAA-TAGT-CCGCATAGCTTT---CGTAGTCTTGATCAT--C--AC--AGAC--A------Ctgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctctgtaatgtttagggacatcacaatgacctatttataaaaacaagtttaataatgagataaacatacctttaagaaaaaaaatgtagaagatggccaagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctaacttgatacttaggctggcctcc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caaAATACATGT-TAGGA-AAACGCATATG----------C---TGA-TT-TCGCTAATCTCACGCAACCT-TATCATTG----------CGGTAG----------------GGGG-------TCGTCCCTCCCCGGCTG--C-TG-CGCCTTCG-CTAT-CATATATACAGAAAAAA----A--------------TAAAAAAAT-GC-TAAC--------GTTATGACCAACTTTCA-CCGA------------ATTATAAT---GACTCATTCTAACATCATT---TCAAC---GATA-AC--CT---T----T----A---TACTAA---ATA-TC-AGGGAAT-CGTGTT-CACGCTTTACC-C------TA-AA-TATATTA-AATTATA-----TGCTAAGACCATCTTATC--CGT----AATTAAGTAAAT-GGAATTGTTGTAACGGT-ATC--CAA-CCTAT--ATAA-------AA-A--T-GGACT---C-------ACCATTC---ATTAATATTttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttatcactgtactgtttacggaacgtacagtgacctatttttaaaaacaaatttaatgatttgataaactgaaataaacagacctttaaggaaaaaaatcgtaggagatggccaagcctatataaagcgtagaatacagagtgtttccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctatcctaatactaaggctggcctccgtagaggc
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttttaatcaaAATACATGT-TGGGA-CAACGTATATG----------C---TTA-CC-CCACTCACCTTCCCCAACCT-GGTCATTG----------TGTTAG----------------GGGG-------TCATCCCGTCCCAACTGAGC-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTG---------------T--------------T-------A-AT-TAAC--------GGTGTGACTCACTTTCATCGAAGGTAA-ATCATCATTATAAT---GA--CGTTCT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttttatcaaAAAACATATGTAGGATCAACGTATATA----------C---TGA-CC-CCGCTGACCTCATCCAAACT-GAACATTG----------TGGGAG----------------GGGAA-------CACCCCGCT-CGGCTG--C-TA-CGCATTTG-CCTT-CATGTG---------------T--------------G-------T-AC-AGACAAAAAATAGATGTGACACAATTTCATCGGCGGTAA-ATaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                   ttcattcacaattgtttacaatgatttactgccggaataattagtgtgcctgtctagtgttttaagtatctggcagctacgccgctattttacaagtctttaccAATACATGT-TGGGA-CAGCGTATATT----------C---TGACGT-T-ACTCTCCTCACCAAACCT-GAACATTG----------TGGTAAGGTGGGGGGTGGTGGTGGGGG------TCATTCCACCCAAGCTG--C-TA-CGCTTTTA-CTTT-GATGTGT--------------ACAGAATATAACAT-T-------T-AT-TAAC--------GGTGTTAACCAATCTCATCAGAGGTAATGT-ATCATTATAAA---GAtaacatt
gi|17                         : tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAATATATAT-GGGGA-CAACGTGCATA----------CATATG--GCACTGCTTATCTTACCCAACCT-GAGCATTG----------TGGGAG----------------GGGGT------CCA-CCCACCGCGTCTC--C-TG-TGCCTTTG-CTTT-CAAATG---------------AACAGAAAATAGCATT-------T-ATAAAAA--------GACGCAACCCGATTTCATCGGAGGAAA-ATCATCATTGTAATGGCGACTCGTTCTAACATTATTAGCTTAAC---AG-A-AC--AT--------T----A---TATTAC---ATA-Taaaatgtagaagatgatcaagactgtaccatattgtaaaataaagcgtagaatgcagaatatattcg
gi|29                         :                                                                                                                                                 aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaAATACAAGT-TGGGA-CCACGTATATG----------C---TGG----------------TCCCGCCT-GAACATTGCGGGGGTGGGTGGGGG----------------GGGGGGGGGGATTATCCCGTCCCGGCTG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTGCGC------------AGAAAATAACAT---T-------T-AT-TAAA--------AGTGTGACCagattcaaacaataccctaaataaaatttgagtaccggtatccaacctatgcaaaaaatggacctgttcctcattaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgcagctacaccgtttttttttatcaaAATAAATGT-TGTGA-CAATATATATATATATATATAC---TGG-CC-CCGCCAAACTCACCCAAACTGTA-CATTG----------CGG--G----------------AGAAG------TCAATCCGCCCCGTC-A--CATA-CGCCTTTG-CTTT-CATaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagata
gi|6                          :                                       tgtatcatttctttccattcaaatcgtttgttttaatgtttttttgtagagcctgagtgaattaccaatgcgtaaacattgttaaatttctaataacaccttattgtacgcatgtaccgtaaaccctgtcaaaataatctagtgaatgaatggttgtcttgaattcattcttacacagttgtttacagtattatcactagtactggattcggtgtggccaggaatacttagtgtatcctgtacagtgttaatatatctcttgcagctacatcgtttatttacacggttttaatgaaCATGT-TGGGA-CAATGTATATG----------C---TGA-TC-CCGCTCACCTCACTCAACCT-GATCATTG----------TTGTGGAAGGGGGAGGGGT---GGGGG------TCATCCCGCCCCGACTG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-TATATA---------------T--------------T-------T-AT-TAAT--------GTTGTGAACCACTTATATCGGAGGTAA-AT---------------GATTCGTTCTCATATCATT---TCAAC---GATA-AC--CT---G----T----A---TAATAT---ATA-TCTAGGTTAT-C-TTTGAAACGTTTTACC-C------CA-AA-CATATTA-AATAATA-----ATCAAATACCATCGAATC--CGT----TATCAAGTAAAT-AAAATTGGAATAACAGT-ACC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AA-T-GGA-----C-------TTGCCTC---ATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCATTTTGGC-C-GG-AAATAGCAAGACGAGTAC--ATAAC-GTA-AG-GG-G-ATCAATTTCCAC---CA---GTCATGCCATATA--AA--ACTGTGTT----TT-GAAATAAACA--ACAAAAGTAGCGCCGGCAC-TTACAAATCAAATCAAATG----AG-A---AAA--AA-ACAGGTTATACCA-GA-ATT-G-CCT--ATATCT-ATTT-ACATGG-AAGA---------------------ACA---TTGAC-ATAT----GTGTA------TA---A--A--ATGGAC-TAGT-CCGCATATCTTT---CGCAGTCTTGATCAT--C--TG--AGAC--A------CTAG-------------CGCCATATCGGTGTAATGTTTA-------------------------GATT--GCCTA---------------------TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAGTAA--ACAT-TTA-A-GAAA-AGAA--ATCGTAGCAGATGGT-----AACGACTA-----T------A--C----CG-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NN----NAATACTATCTTAATACATAGGCTGGCCTTCGTAGacagaagataat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TGGGA-CAACGTATATT----------C---TGA-CC-CC-CTCACCTCACCCAACCT-GATCATTG----------TGGCAG----------------GGGG-------TCATCCCGCCCCAATTG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CGTGTG---------------T--------------T-------T-A--------------GGTGTGACTCACTTTCATCGGAGGTAA-ATCGTCATTATAAT---GACTGGTTCAAATATCGTT---C-AAC---GGTA-AC--CT---T----T----A---TACTAA---ATA-TC-AGGGTAT-A-TTTTAAAGGTTTTACC-C------CA-AA-GATATTA-AATAATA-----CCATAAGACCAACTAATC--CGT----TACCAAGTAAAT-A-AATTAGAGTAACTGT-ATC--CAA-CCCAT--AT-A-------AA-A--T-AGA-----C-------C-----C------CACCCCCATT-GAT---ATTGGCAGTTAGGC-G-GGAAAATAGCAAGATGAGTCC--ATAAAGG-T-AG-GG-G-GTCAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATTTT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAACAAACA--ACAAAAGTAGTGTCGGCAC-CTACAAATCAAACAAAAAG----AG-AGGGAAA--A----AGGTTATACTA-GG-GTT-A-ACT--ATGTAT-AGTT-ACATGG-AAGATACTT--ATAC------TCGCAGAACGTTGATAACAT----GTGTA---T--AA---A--A--ATA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A-CAACGTATATG----------C---TGA-CC-CTGCTCACCTCATACAACCT-GAACATTG----------TGGTAG----------------GGGG-------TCATCCTGCCCCGGCTG--C-TA-CACATTTG-CTCT-TATGTGTACAGAATATCAC--G--------------T-------TGAT-CAAC--------GGTGTGACCCACTTTCATCAGAACTAA-ATCATCATTAAAAA---GATTCGGTCTAATATCATT---TCAAC---GATA-AC--CT---A----TATCATAAGTACTAA---ATA-TC-AGGGTAT-A-TTTTAAATATTTTATC-C------CA-AA-CATATTA-AA----A-----CCCCAAGACCAACGAATC--TGT----TAACAAGTAAAT-ACAACTGGAGTAACGGT-ATC--CGA-CCTAT--AT-A-------CC----T-CAC-----C-------T-----C---ATTAATATTTATTAGATAA-ATTTGCAGTATTGC-G-AGAAAATGGCCAGACGAGTCCA-TAAA--G-G-AA-GG-G----GA----------------TCACAGCAGATT--CA--ATTATATT----TT-GAAATAAACA--ACAAACGTACAGTCGGCAC-CTACAAATTAAGCAAAATG----AA-A---AAA-------AGGTTATACGA-AGTGTA-T--CT--ATATCT-ATTT-ACACAG-AGGATGCAT--ACAA------TCGCAGATCGATAATACCCT----GTGTA---T--TA---T--A--ATAGACACA-T-CCGCATATCTTT---CGNNNNNNNNNNNNN--N--NN--NNNN--N------NNN--------------NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTATGACC-GTTCAATAGCGCCAACTGATAACA-AA-A-TAA-G-TT-CAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAACAG--ACCT-ATA-ATAAAT-GAAtag
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gt----------------GGGGA------TCATCCCGTCCCGTCT---C-TACCGCCTTTGTTTCTGCATGTG---------------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agggga--------GATGTGACCAA-TTTCATTGGAGATAA-ATCATCATTATAAT---GTCTCGTTCTAGAATTATT---T-AACTAAGATA-ATAACT---GAAAATAACAT---TAATAACGAATACTC-AGG-TAT-C-T-TCGTGCATTATACC-C------CA-AA-AAGGTTA-AATAATG-----CTC--ACACCAAGAAATC--C-T----T-----GTT--T-AAGATCA-AGTAAATATGACC--TGA-CCTT--------------------------------------------C---ATTAATGTGTAATAGATAA-ATTGGCAGTGTGGC-G-GGAAAAAAGCAAGACGAGTT-------------------G-ATTTATTTCGACTAACG---GCTATGACATAAT--AA--ACAGTGCT----TT-GTAAGAAACG---CAAACGTATCGTCGGCACACTATACA-CATACAATAAA----A---------------CAGGTTATTCTA-AG-ATT-A-CCT--ATATAT-TTTT-GCATGG-AAAATATTTCAAAACCACTGCTAGTAGAACAATGATAATCT----GTATA---C--TA---A--A---TGGAC-GATC-CCGCATATCTTT---CGTTGTCTTGATCAT--C--TT--TGAC--tgcacataaaaataa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T---TCAAC---GATA-AC--CTATAG----T----A---TACTAA---ATA-TC-AGGATAT-C-TTTTAA-CGTT--ACC-T------AA-AA-AATATTA-TATAATA-----ACCTAAGATCAACTAATC--CGT----TACCAAGAAGAT-AAAACTGGTGTAACGGT-ATC--CAA-TCTAT--AT-A-------AA-A--TTGGA-----CTCACCTCATT---C---ATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-A-GGGGAATAGCAAGACGAGTCCA-TAAA--G-G-TA-GG-G-GTTTA------------------ATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACA--ACAAAAGAAGCGTCGGCAC-CTACAAATCAAACAAAAAGGGAAAG-A---AAA--AA-C--GGCTGTACCA-GG-GTT-G-CCT--A------ATCT-ACATGG-AAGATACTT--ATAC------TCGCAGAACGTTGATTACTT----GTATG---T--TA---A--A--AAATAC-TAGT-CTGCATATCTTT---TGTAGCATTGGTCAT--C--AC--CGAC--A------CCAGCACCAACTAATATCGC--------TGTAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GTCTAT--------------------TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACCGAGACAAG------------A-A-AA----GAA--ATCGTAGAAGATGGTCAAGACA-----A-----T------A--C----CG-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAAAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG----AA-----------ATCTTAATCTTTAGGCTGGCCTCCGCAGAGgagtgcttatatataccaataaactggctatcgttctgacagcaagcacaat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttaaaccgccattgctacgcgcttgctcaatcagatcg---GATA-AC--CT---A----T----A---TACCAA---ATA-TC-AGGATAT-A-TTTTAAACATTTTACCCATTTTTCCA-AA-AATGTTA-AATAATA-----CTCTAAATCCAACGAAAC--CGT----TACCAAGTAAAT-AAAATTGGTATAACTGT-ATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-GAA-----C-------T-----CTC-ATAAATTTTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGCT-G-GGAAAATAGTAAGACAAGTCCA-AAAA--G-A-AAAGG-G-ATTGATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACA--ACAAAATTAGCATCAGCAC-CTACAGATCAAAC-AAAAG----AG-A---AAA--AA-ACAGGTTATACCA-GG-GTT-T-CCT--ATATCT-ATTT-ACATGG-AAGATGCTT--ATAC------TCGTACA-----------------GTGTA---T--TT---A--A--ATAGAC-TAGT-CTGCATATCTTT---TGTAGCCTTGATCAT--C--TC--CAAC--A------CTA--------------CAC--------TGTA------------------------ACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAGCAG--ACCT-TTA-A-GAAA-GGAA--ATCGTAGAAGGTGGT-----CAAGACTA-----T------A--C----TG-C------A---TT-------T-TGAAAT-----AAAGCATAAA--ATACAGAA
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---TATTAA---ATA-TC-CATGTGT-G-TTTTAAACATTTCACC-A------AATGA-AAGATGA-AATACTA-----CCTTAAGACCAAGGAATTAATGTCTAACACCGAATAAATAAAAATCGAAGTAAAGGA-ATC--CAC-CCTAT--GC-A-------AA-A--agagtcagattttga
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aATTA-AATTATA-----CCCTGAGATAGAGGAAGC--C-TAA--TGCTAAGTAAAT-ACAATTGAA--AACAGA-ATCTACAA-CCTAT--AT-A-------AA-ACAT-GGA-----C-------------C---ATTA-----TCTCA--TAATATTGAAGGTGTGGC-G-GGAAAATATCTAGACGAGTCTA-actgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agAAT-AAAATTTGAGTACCGGT-ATC--CAA-CCTATGCAA-A-------AA-A--T-GGA-----C-------tcca
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaaatatatatggggacaacgtgcatacatatggcactgcttatcttacccaacctgagcattgtgggagggggtccacccaccgcgtctcctgtgcctttgctttcaaatgaacagaaaatagcatttataaaaagacgcaacccgatttcatcggaggaaaatcatcattgtaatggcgactcgttctaacattattagcttaacagaacattatattacatatagattcaaacaataccctaTT--AT-A-------AA-AA-T-GGA-----CTT-----A-----CCTCATTAATAATTGTTAGATAA-ATGGGCAGTTTGGC-T-GGAAAATAACAAGACGTGTCCATAAAA--G-A-AT-TG-G-ATTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AATTATTATGTT----TT-GAAATAAACA--ACAAAGGTGCTGTCGGCAC-CTACAAATCAAACAAAAAG----GG-A---AAA--AAACTAGGTTATACCA-AG-CTT-G-CCT--ATATCT-ATTT-ACAAGG-AGGATGCTT--ACAT------TCGCAGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--TG---A--A--ATAGAC-TCAT-GTGCATActgttcctcattaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtgaccaaataaatagaatcagatc---ATTAATATTTATCAGATAA-ATTGACATTTTCGCTG-AAAAAATAGCGAgctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggatataatgtttagagacagtataatggcctatttataaaaaaaaagattaatgatttgataagctgagacaaaatggaccttaaagaaaagaaatcgtagaagatggtcgagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatatatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcataatattaaggctggcctccgta
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttTTAATATTTATTTGATAA-TTTGGAAGTTTCGC-A-GGAAAATAGCAAGACGAGTCC--ATAATGG-A-AG-GG-G-GTT-ATTTCCACCAACA---GATATGGCATA
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATAA-ATTGGCTGTTTGGC-GAGGATAATATCTAGAAGA----A-ATCA------------T-ATTTATTTCCAC---CA------ACAGC-TGTT-------TTGTGTG----AT-GAAATAAACAACACAAAAT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATTTTGGC-G-TGAAAATAGCAAGACGAGTCCA-TAAA--G-ATAA-GG-G-ATTATTTTCCAC---CA---GTCATGGTATATT--AA--AATGTGTT----TTTGAAATAAATA--ACAAAAGTAGCGTCGGTAC-CTACAAATCAAATAAAAAG----AA-AC--AAA--AA-GCAGGTTATAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTTCCAA---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----AT-GAAATAAACA--ACGACAGTACCGTTGGCAC-ATACAAATAAAACAAA-------AG-A---AAATTAA-CGTGGTTATACCATTA-GTTAA-CCT--ATATCT-ATTT-ACATGG-AAGATGCTT--ACAT------GCGCAGAATGATGATAACCTGCAAGTGTA---A--TA---A--A--ATAGAC-TAGT-CCGCATATCTTC---CGTAGTCTTGATAAT--T--TC--TGAC--A------Catgtacaagggttatgtgctgttt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aATTTCTAC---CAACAGCTAT--CATAT---AA--ACTGTGTG----AA-GAAATTAACA--ACAGAAATACTGTCGGTTT-ATACAAATTAAACACAAAA----AA-A---AA-------CAGGTTATAATA-AG---T-T-CATAAAAATCTAATTTGACATTGTAGGATttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatcgctgtaatatttagatacagtataaaagtctattgataaaaaacaagcttaatttaggaaataacatttgattaactgagacaaacagaccgttaaaaaaaggaaatggtagaagatgatcaagactataccgtcactgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcttaatacttaggctggcctctgtagaggca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttCAC-ATAAAAATAAAACACATAG-----G-A---A--------CATGTTAAACTA-AG-TTT-A-CCT--ATATAT-GTTT-ACATGG-AAGATGCTTCGAAACTTCCATTCGCAGAACGATGACAATCT----GTAT----T--TT---A--T--ATGGAC-GAGT-CTGCAAACCTTT---CGacta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGTCATAAC--GA-GTT-TGCCT--ATATAT-GTTT-ACATAG-AAGATGTTT--ACAT------TCGCCGAACGATAATTACCT----GTGTAGTCT--TG---ATCATCACCGAC-ACTTGCTGTATA-ACATAAACGTCCTCTT-ACCAC--CGTTCAACAAC--G------CCAACTGATAT------CAC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-GTACAATA--ACTTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GCTAAACTGAGGTAAACAG--ACCT-TCA-A-GAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatcgctgttatgttaaccaacacgtgtaacggtatatttatacagaacatgctttaattgagaagtaagatttgataaactgagactatcagaccttttagaaaagaaagcgtagacaatgagtaagactcgaccgtagttatttatatatagtaaaataaagcgtcaaaaacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaactatctaaatacatagactggcctccatagaggcaatc
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G-GTT-A-CCT--ATATCT-ATTT-ACATGG-AAGATACTT--ATAC------TCGCAGAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A--G--ATAGGC-TAGT-CTGCATATATTT---TGTAGTCTTGATTAT--C--CC--CAAC--A------CTA--------------A-----------ATAATACTTAAaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaagcattaatgggggactgcataATAACGATGATAATCT----GTATA---T--TT---A--C--TTAGAC-TAGT-TCGCATATCTTC---CATATTCCTGATCAT--C--TT--CGAT--A------tactta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cATGTTC---CGTAG-CT---CCAA--C--T----GAT--A------TCATAGATAT-------CGC--------TGTAATGTTTAA-A-------------GATA-GTATAATG--GCCAATTTATA--A-AA-C-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAACAAACAT--ACCT-TTA-A-GAAA-ATAA--ATCGattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatcgctgttatgcttacaggcagaatagcagcattttaataacacaagtttaattttgaaattagttttgataaacttacacaatcagaccattcacaaaagaaatcgcagaagatgatcgaaaccacaccatatttaaaaaaacaaaacaatactggatgcatcggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaaaaacatgttgggtcagtgtatatgttgaccccgctcaccttacccaacctgtacattgtggtagagggtcatcccgccccggctgctacgcttttgctctcatgtgtacagaaaataacatttattatcggagtgacccactttcatcggaggtaaatcattactataaagactcgttctaatatcatttcaactataacatatatactaaatatctgggtatattttaaacgttttaccccaaacgtattataatataccctaagaccaaggaatccggtaccaagtaaataaaagcggagtaacggtatccaatatatatatatatataaatggactcgactcattaatatgtataatataaattggcagtttagcgggaaactagcaaaatgagtccataaaggaagggggttaatttccaccagtcatggcatattaaactgtgtttgaaatattggtacctacaaatcgaaaagaaaggggaaaaaacaggttatatcaggtttgcctatatctatttacatggaagatccttatactctcagaacgttggtaacctgtgtataatattcaactagactagtccgcatatctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgCCATAGC--TC--CAACTGA------TAT--------------CGC--------TGTACTGTTTA-GA-------------TACA-GTATAATG--GCCTATTTAT-----AA-A-TAA-G-TT-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttC--TGAT--A------TCA--------------C----------TGTA-TATTTA-GA-------------GACA-GTACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-AACAA-T-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAA-CAG--ACCT-TTA-C-GAA-----A--ATCAAAGAAAATGGC-----CA-----AGACTAT------A--C----CG-A------A---TT-------G-TAAAAT-----AATGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNAATC----CTGTCTTAATACTAAGGCTGGCTTACGTAGAGGaagaaaggaaatcgtagaatactgtacgttaaaatagattgtagactatacagaaggtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttaatacttaagctggtctccgtaaaagcaagcc
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atatcttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgatcgttcaaaagcgccaa--------------CAC--------TGTACTGTTTACGG-------------AAC--GTACAGTG--ACCTATTTTTA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAATAAACAG--ACCT-TTA-A-GGAA-AAAA--ATCGTAGGAGATGGC-----CA-----A---------------------G-C------C---T------------ATAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAGTGTTTCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNAATC----CTATCCTAATACTAAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                caaaatacatgttaggacaacgcatatgctgactccgcgaacctaatcattgtggtagggagtcatcccgccccggctgctacgcctttgctctcatatgtacagaaaaataaaatttattaacggtgttacccaagttcattgaaggtaaatcaacattataatgattcattctaacatcgtttatatacattgtattaaatatcagggtatctttttaacgttttaccccaaatatattaaattataggctaccctaagaccaacgaatccgcaactaagtaaatgaaattgtttacggtttttaaacctatataaaaatggaatcaccattcattaataattattagatactttggcagtttggcggaaaaaaacaaaactagtctataaaggaaggagatttatttgcatcaatcatggcatatttaaaagtgtgataaaattgaaataaacaacaaaagtaccgtcagaatctacaaataaaacaacaacaataaaaaaacaggtcaagtttgtctatatctatttatatagaagatacttttattcgctgaacgatgataacctgtgtatcaaaatagaatagtccgcatagctttcgtagtcttgatcatcacagacacttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttat--------------CGC--------TGTAATATTTA-GA-------------TACA-GTATAAAA--GTCTATTGATA--A-AA-AACAA-G-CT-TAATTTAG------GAAATAACATTT-GATTAACTGAGACAAACAG--ACCG-TTA-A-AAAAAGGAA--ATGGTAGAAGATGAT-----CA-----AGACTAT------A--C----CGTC------A---CT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCT---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA----C----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatttccaacagtcatggcatattaaattgtgttatgaaataaacaacgacagtaccgttggcacatacaaataaaacaaaagaaaattaacgtggttataccattagttaacctatatctatttacatggaagatgcttacatgcgcagaatgatgataacctgcaagtgtaataaaatagactagtccgcatatcttccgtagtcttgataatttctgacacttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatat--------------CGC--------TGTTATGTT-AACC-------------AACACGTGTAACG--GTATATTTATAC-A-GA-A-CAT-GCTT-TAATTGAGAAGTAAGA-------TTT-GATAAACTGAGACTATCAG--ACCT-TTT-A-GAAA-AGAA--AGCGTAGACAATGAG-----TA-----AGAC--TCG----A--C----CG-TAGTTA-T---TTATATATAG-TAAAAT-----AAAGCGTCAA--AAACAGAATGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAA----A----CTATCTAAATACATAGACTGGCCTCCATAGAGGCa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cacataaaaataaaacacataggaacatgttaaactaagtttacctatatatgtttacatggaagatgcttcgaaacttccattcgcagaacgatgacaatctgtattttatatggacgagtctgcaaacctttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatat--------------CGC--------TGTTATGCTTAC-A-------------GGCA-GAATAGCA--GC--ATTT-TA--ATAACA-CAA-G-TT-TAATTTT-------GAAATTAGTTTT-GATAAACTTACACAATCAG--ACCA-TTC-A-CAAA-AGAA--ATCGCAGAAGATGAT-----CG-----A-----A------A--C----CA-CACCATAT---TTA------A-AAAAAC-----AAAAC----A--ATACTGGATGCATCaatc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cataacgatgataatctgtatatttacttagactagttcgcatatcttccatattcctgatcatcttcgataattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-TCACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------AA-------T-----------GAGATAAACAT--ACCT-TTA-A-GAAA-AAAA--AT-GTAGAAGATGGC-----CA-----AGACTAT------A--C----CG-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNAAT-C----CTAACTTGATACTTAGGCTGGCCTCggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcgaaatacatgttgggacaacgtatatgctgactccgctaacctcacccagcttaatcattgtggtagggggtcattccgtcccgggtgctacgcattggctctcatatgtacagaaaaaataaaatttattaacggtgtgagccgctttcattgaaagtaaatcaccattataatgactcattctaacatcatttcaacgataacgtatatagtaaatatcaggatatacttttaacgttttaccccaaatatattaaattataccctaagaccaacgaatccgttactaagtaaattaaattgtggtaacggtgtccaacctatataaaaactcaccattcattaataattattagataatttggcaatttggcgggaaataacaagactagtctattaaggaaggcggttaatttgcatcagtcatggcatatttaaaattgtgataaaattgaaataaacaacacaagttccgtcggcaccttcaaataattaaaaaaaaaccagttcataacaggtttgcctatatctatttacatgggagatgtttacattcgctggacgatgacaacctgtgtattaaaatagacttgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatct--------TATAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-AAAAG-AT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAGCTGAGACAAA-ATGGACCT-TAA-A-GAAA-AGAA--ATCGTAGAAGATGGT-----CG-----AGACTAT------A--C----CG-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAATATATCT---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA----C----CTATCATAATATTAAGGCTGGCCTCCGTAc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtgaccaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagataaatgggcagtttggctggaaaataacaagacgtgtccataaaagaattggattaatttccaccagtcatggcatattaattattatgttttgaaataaacaacaaaggtgctgtcggcacctacaaatcaaacaaaaagggaaaaaaactaggttataccaagcttgcctatatctatttacaaggaggatgcttacattcgcagaacgatgataacctgtgtattgaaatagactcatgtgcatagctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggaAGA-------------AACT-TTATAAT--------TTTA-A--G-AA-A-AAA-G------------------AA-------TTG--ATATACTGAATCAAATCG--ACAT-TTT-A-GAAA-AGAA--AGCATAGAAGATGAT-----CG-----A-----G------A--C----TA-G------A---CT-------G-TATGTTCTGCCAAAGTGTAAA--AATCAGAATGTATGC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA-------------AA----G----CTATCTAAATACATAGGCTGGCCTCCATAGAGGC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcatgaatgtagagatacat-GTATAATG--ACCTTTTTATA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAACAG--ACCT-TTA-A-GAA--AAAA--ATCGTAGAAGATGGC-----CA-----AGACTTT------A--T----CG-A------T---TT-------G-TAAA--------------------TACAGAATGTTTAC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNAATC----CTATCATAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cttgcttttctataagataaacatccacttacgatcgttcaaaagcgccaactgatatcactgtacaat--A-AA-A-AAA-G-TTGTAA-----------GA-------TTTTGATAAACTGAGACAAACAG--ACAT-TTT-A-GAAA-AGAAGCATAGTAGaggc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AA-G-T----AT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACGAATGG--ACCT-TTT-A-TAAA-AGAA--ATGGTGGA---TGAT-----CA-----A-----TAGTAG-A--C----TG-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCG-------TACAGAATGTATCC---G--tctagtcttta
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TAA-----------GA-------TTT-GAAAAACTGAGATAAATAT--ACAT-TTT-A-GAAatatcgatggtaccatgtgccacattgcgctgtactgacttgtttcattttgtacagggtacctaacagggtatgaaacaatatctaaatccgtagaggcaag
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attgtccaatagcgccaactgatattgctgaacattagaaagATTGAGACAAGCAG--ACCT-TTA-A-------GAA--ATCGTGGAGGATGGT-----CAAGACTA-----T------G--C----CG-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AA-----------ATTTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTGAGACAAGCAG--ACCT-TTA-A-GAAA-GGAA--ATCGTAGAAGGTGGT-----CA-----A-----G------A--CTATACG-C------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGAGTAGA--ATACAGAATGTATACAAAN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----AA----A----CTATCTCAATACTAAGGC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAAGACAAACAT--ACCTATCACA-CAA---GAA--AGCGTAGAAGACGAT-----CA-----AGAC--T------AGAC----CG-T------A---AT-------G-TGAAAT-----AAAGTGTCGA--ATACAGAATGTATCaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatccaGAGGTAA-TGT--ATCA-TTA-T-AAAG-AAAA--AT-GTAGAAGATGAT-----CA-----AGACTGT------A--C----CA-T------A---TT-------G-TAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATGCAGAATATATTC---G--t
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatacatgttgggacagcgtatattctgacgttactctcctcaccaaacctgaacattgtggtaaggtggggggtggtggtgggggtcattccacccaagctgctacgcttttactttgatgtgtacagaatataacatttattaacggtgttaaccaatctcatca-TTA-A-GAAA-GGAA--ATCGTAG--------------A-----A-----T------A--C----TG--------T---AC-------GTTAAAAT-----AGATTGTAGACTATACAGAAGGTATCC---G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------------C----TTA-----ATACTTAAGCTGGTCTCCGTAAAAGC
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatcgctgtactgtttagatacagtataatggcctatttataaataagTAGAAGATGAT-----CA-----AGACTTT------A--C----CG-T------A---TT-------A-AAAAAT-----AAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCT---G--aagcc
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----CTATCTAAATCAATAGGCGGGCCTCCGTAGAGGCa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aggTTAATACTTAGGCTGACCTCCTTAGAGGCaa
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): ATCACCCGTAAAAGTTTAATATTTGAAACACCAATTGCTGCATTCTGGTTTAGTGAGTGTTAAAGATAAAACCGAAAGTCAATAAAAATAAAACACCGACCGCATTTCAAAGCTTTGTTGAATAATTAATTTGTAAATTGCAAATGGCTTTGATTAACATCTCTTTGTTGATATACCATACATCTGAAATGTTTTATCCTGTAATAAACATTCCAGTTCGTGAATGGTTGTCAAAAATTCACTCATACACAACAGTTTACAATGTGGCAAACACTGGGATCGCTGCCGTCAGGAAGAAT
Unaligned ( gi|24 ): GATCGCCCGTAAATTTTATTATTAAGACACCAAACTCCTGCATTCTATATTCTAGTGAGTGTGTATGATAAAACAAGCTAATCTGTTACATCATACACCGAAAGTCCATCAAACAACCACTGCATTAATGCTTGAGCGAATTAACATTTGTAACATGCACGCAACTCTGATTAACATCTTATTGTATGTTACCCTGTCTAGTTCATTCCAGTTAATGAATGGTTGTCTGAAATTCATTCATCTGCAATTATTTACAACATCACAAGCATTGGATTCTTTGCAGTCATAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): ACCTAATCTTGTTTACGATAATATCGAAAGGCAATCACTCAATCCCTTTTAAAACTTGTGAATAAACACTTTATAAATTGCACATACCTCTGATTAGCATATCATTGTATGGATATAACATACATTTAAACTGTGTTAATCTGTCAAAAGCATTCCCATTCGTGAATGGTTGTCTAAAATTCACTCA
Unaligned ( gi|40 ): AATATTTAAAATATTATTTCTGCATTCTTCATTCTAGTAAGTGTTTAAGATATAACAGGCTTCAAATGAGGTACCTCTTACGCACTGAAAATCCATAAAAAAACTTGCATACAACTCTGAATAAAATCT
Unaligned ( gi|44 ): TGTCCGTTACTCTTGTCGTTGTTTATGAATGGTTATCGTTATCTGAAATACACTCATACACAAATGTTTACAATGTCACAAGC
Unaligned ( gi|49 ): AGACAAAAAAAATACCACCAAGCCCTTTCTTCTGATACCAAAACAACAATTA
Unaligned ( gi|50 ): GTAACGATGGTAGATCTATTACTTTTCTTTTTACTATTACGCTCAACCGA
Unaligned ( gi|54 ): ATGATGATTCATCTTAATATTATCAGTGACACATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1111111111                                      111111111111111  11111111111111111111111111     1111111111                                            111111111    222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                    222222222222222                    1111111                                                                                                      111111111                                                            11            3333333333333333333333333333333333                                                          111                                                            1111                                                     111111111                                                                 1111111                                                                                                                           33333333333333                      2222222222222222                                                1111111111  1111111                                                                   2222222222                                                                3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     0000000000 444          1                2      444444444444444  77777777777777777777777777     2222222222             0  66  2  2        2    2 33   000000000 2  222222222222222222222222222222222222222222222 5  2    99999999                                         444 2            555      000000000000000    77777   2  0 6  3333333         2  2   1   44   2              8888888   444 1      2   6666   66666                  33 33  111111111           2 1      33    2     33   2     33 33 7777777  2 00 2 55555 33 2222222222222222222222222222222222                  2              2 2                      666   44  7  5 22  1        777  333             66  33        0000  2             2      1         2         2         666666666 2  2 33 2 55  2          2  2  22         2    2   2            0000000 2   666666          1         4444     333 33  333 2   55555                    33     2   555        33  33     888888   55555555555555   88888888           6666666666666666    2        22        0  44 2  2 4   1 1  1    6666666666  3333333   2               44                 1  22                   333  7777777777 1   1 1 3333 88888888888  333                              333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .......... ...          .                .      ...............  ..........................     ..........             .  ..  .  .        .    . ..   ......... .  ............................................. .  .    ........                                         ... .            ...      ...............    .....   .  . .  .......         .  .   .   ..   .              .......   ... .      .   ....   .....                  .. ..  .........           . .      ..    .     ..   .     .. .. .......  . .. . ..... .. ..................................                  .              . .                      ...   ..  .  . ..  .        ...  ...             ..  ..        ....  .             .      .         .         .         ......... .  . .. . ..  .          .  .  ..         .    .   .            ....... .   ......          .         ....     ... ..  ... .   .....                    ..     .   ...        ..  ..     ......   ..............   ........           ................    .        ..        .  .. .  . .   . .  .    ..........  .......   .               ..                 .  ..                   ...  .......... .   . . .... ...........  ...                              ... ........................................................................................                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     9999999999 444          9                2      777777777777777  33333333333333333333333333     6666666666             1  55  4  4        4    4 22   000000000 5  555555555555555555555555555555555555555555555 3  7    11111111                                         777 7            444      444444444444444    33333   9  7 6  3333333         7  7   5   33   7              7777777   777 0      5   4444   22222                  77 22  000000000           2 6      11    9     11   2     11 66 2222222  2 66 4 99999 22 5555555555555555555555555555555555                  4              2 2                      888   44  5  0 99  8        888  999             55  22        0000  4             4      9         4         4         444444444 4  4 22 4 66  2          4  9  66         2    2   2            9999999 4   888888          8         7777     999 11  999 2   66666                    22     9   000        99  77     222222   33333333333333   11111111           8888888888888888    1        99        1  88 0  0 0   9 9  9    5555555555  0000000   0               22                 7  33                   222  7777777777 8   8 8 9999 66666666666  222                              777 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--GC-TA-CGCCTTTG-CTCT-C--ATG---------T-GTA----------C-----------A-------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCA-NAAAGN-AA-GG-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA-GGNTT-GCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAA----C----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
Reference ( family-293 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--GC-TA-CGCCTTTG-CTCT-C--ATG---------T-GT-----------C-----------N-------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------N-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCA-ANAAGN-AA-GG-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA-GGGTT-GCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA----C----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTAGGACAACGCATATG----------C---TGACTCCGCG----------AACCTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGAG----------TCATCCCGCCCCGGCT--GC-TA-CGCCTTTG-CTCT-C--ATA---------T-GTA----------C-----------AGAAAAATAAAAT-T-------T-AT-TAAC--------GGTGTTACCCAAGTTCATTGAAGGTAAATCAACATTATAAT---G-ATTCATTCTAAC---ATCGTT---T--------------------ATATACAT-TG-------TATTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TTAACGTTTTACCC-------CAA---ATATATTA-AAT---TATAGGCTACCCTAAGACCAACGAATC--C--GC----A----ACTAAGTAAAT-GAAATTGT--TTACGGTTTT--TAAACCTAT--AT-A-------AA-AA-T-G-----G--AATCACCAT-------T-----C--A---------TTAATAATTATTAGATAC-TTTGGCAGTTTGGC-G-GAAAAA-AACAAAACTAGTCTA-TAAAGG-AA-GGAG-ATTTATTTGCAT---CA---ATCATGGCATATTTAAA--AGTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-AAAGTACCGTCAGAAT-CTACAAATA-AAACAACAAC----AATAA-AA-A--A-A--CA-GGT-----CA-AGTTT-GTCTATATCT-ATTT-ATA-TAGAAGATACTT-------T-TAT------TCGCTGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--CA---A-AAT-----AGAATAGTCCGCATAGCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--AC--AGACA------C
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caa--------------CAC--------TGTACTGTTTACGG-------------AAC--GTACAGTG--ACCTATTTTTA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAATAAA-CAGACCTTTAAGGAAAA-AA--ATCGTAGGAGATGGCCAAG---CC--T----A--T--------------------------------ATAAAGCGTAGAATACAGAGTGTTTCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATC----CTATCCTAATACTAAGGCTGGCCTCCGTAGAGGCttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttatcactgtactgtttacggaacgtacagtgacctatttttaaaaacaaatttaatgatttgataaactgaaataaacagacctttaaggaaaaaaatcgtaggagatggccaagcctatataaagcgtagaatacagagtgtttccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctatcctaatactaaggctggcctccgtagaggc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                      caaaatacatgttaggacaacgcatatgctgactccgcgaacctaatcattgtggtagggagtcatcccgccccggctgctacgcctttgctctcatatgtacagaaaaataaaatttattaacggtgttacccaagttcattgaaggtaaatcaacattataatgattcattctaacatcgtttatatacattgtattaaatatcagggtatctttttaacgttttaccccaaatatattaaattataggctaccctaagaccaacgaatccgcaactaagtaaatgaaattgtttacggtttttaaacctatataaaaatggaatcaccattcattaataattattagatactttggcagtttggcggaaaaaaacaaaactagtctataaaggaaggagatttatttgcatcaatcatggcatatttaaaagtgtgataaaattgaaataaacaacaaaagtaccgtcagaatctacaaataaaacaacaacaataaaaaaacaggtcaagtttgtctatatctatttatatagaagatacttttattcgctgaacgatgataacctgtgtatcaaaatagaatagtccgcatagctttcgtagtcttgatcatcacagacacttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttat--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------TTACCTC--A---------TTAATAATTGTTAGATAA-ATGGGCAGTTTGGC-T-GGAAAATAACAAGACGTGTCCATAAAAGA-AT-TG-G-ATTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AATTATTATGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAGGTGCTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----GG--A-AA-A--A-AACTA-GGTTATACCA-AGCTT-GCCTATATCT-ATTT-ACA-AGGAGGATGCTT-------A-CAT------TCGCAGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--TG---A-AAT-----AGACTCATGTGCATAGCTGT--CG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --------TATAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-AAAAG-AT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAGCTGAGACAAAATGGACCTTAAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCGAG---AC--T----ATAC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATATATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA----C----CTATCATAATATTAAGGCTGGCCTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggatataatgtttagagacagtataatggcctatttataaaaaaaaagattaatgatttgataagctgagacaaaatggaccttaaagaaaagaaatcgtagaagatggtcgagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatatatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcataatattaaggctggcctccgta
gi|11                         :                         gtgaccaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagataaatgggcagtttggctggaaaataacaagacgtgtccataaaagaattggattaatttccaccagtcatggcatattaattattatgttttgaaataaacaacaaaggtgctgtcggcacctacaaatcaaacaaaaagggaaaaaaactaggttataccaagcttgcctatatctatttacaaggaggatgcttacattcgcagaacgatgataacctgtgtattgaaatagactcatgtgcatagctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggaAATACATGTTGGGACAGCGTATATT----------C---TGACGTTACTCTCCTCACCAAACCTGAACATTGT---------------GG-------TAAGGTGGGGGGTGGTGGTGGGGG----------TCATTCCACCCAAGCT--GC-TA-CGCTTTTA-CTTT-G--ATG---------T-GTA----------CAGAATATAACAT-------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTTAACCAATCTCATCAGAGGTAATGTATCATTATAAA---G-A
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATAAAGAA-AA--AT-GTAGAAGATGATCAAG---AC--TGT--A--C-CAT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATGCAGAATATATTC---G----aaaatgtagaagatgatcaagactgtaccatattgtaaaataaagcgtagaatgcagaatatattcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                             tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatacatgttgggacagcgtatattctgacgttactctcctcaccaaacctgaacattgtggtaaggtggggggtggtggtgggggtcattccacccaagctgctacgcttttactttgatgtgtacagaatataacatttattaacggtgttaaccaatctcatcagaggtaatgtatca----GATA-ACCTATA-------TACCAAATA-TC-AGGATAT-ATTT-TAAACATTTTACCCATTTTTCCAA---AAATGTTA-AAT---AATA-----CTCTAAATCCAACGAAAC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGTATAACTGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----A--A-------C-------T-----CTCA---------TAAATTTTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGCT-G-GGAAAATAGTAAGACAAGTCCA-AAAAGA-AAAGG-G-ATTGATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCATCAGCAC-CTACAGATC-AAAC-AAAAG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA-GGGTT-TCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACA-----------------GTGTA---T--TT---A-AAT-----AGACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CCT---TGATCATC--TC--CAACA------CTA--------------CAC--------TGTA------------------------ACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAG---ACTAT----A--C-TGC-A-T----T-----------TT---GAAATAAAGCATAAAATACAGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tATTTCCAA---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----AT-GAAATAAACAACG-ACAGTACCGTTGGCAC-ATACAAATA-AAACAAA-------AG--A-AA-ATTA-A--CGTGGTTATACCATTAGTTAACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-CAT------GCGCAGAATGATGATAACCTGCAAGTGTA---A--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTC--CGTAG-TCT---TGATAATT--TC--TGACA------Cagagtcagattttga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           a--------------CGC--------TGTAATATTTA-GA-------------TACA-GTATAAAA--GTCTATTGATA--A-AA-AACAA-G-CT-TAATTTAG------GAAATAACATTT-GATTAACTGAGACAAA-CAGACCGTTAAAAAAAGGAA--ATGGTAGAAGATGATCAAG---AC--T----ATAC-CGTCA-C----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA----C----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGCttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatcgctgtaatatttagatacagtataaaagtctattgataaaaaacaagcttaatttaggaaataacatttgattaactgagacaaacagaccgttaaaaaaaggaaatggtagaagatgatcaagactataccgtcactgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcttaatacttaggctggcctctgtagaggca
gi|14                         :                                                                                                                                                                      aatttccaacagtcatggcatattaaattgtgttatgaaataaacaacgacagtaccgttggcacatacaaataaaacaaaagaaaattaacgtggttataccattagttaacctatatctatttacatggaagatgcttacatgcgcagaatgatgataacctgcaagtgtaataaaatagactagtccgcatatcttccgtagtcttgataatttctgacacttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatTGGGACAACGTATATT----------C---TGACCCC-CTCACCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------CA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCAATT--GC-TA-CGCCTTTG-CTCT-C--GTG---------T-GT------------------------------------------------T-TA----------GGTGTGACTCACTTTCATCGGAGGTAAATCGTCATTATAAT---G-ACTGGTTCAAAT---ATCGTT---------------CAAC----GGTA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAAGGTTTTACCC-------CAA---AGATATTA-AAT---AATA-----CCATAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAA-TTAGAGTAACTGTATC--CAA-CCCAT--AT-A-------AA-A--T-A-----G--A-------C-------C-----C--C------------ACCCCCATT-GATA---TTGGCAGTTAGGC-G-GGAAAATAGCAAGATGAGTCCATAAAGGT-AG-GG-G-GTCAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATTTT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAACAAACAACA-AAAGTAGTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--AGGG-A--A-A--AA-GGTTATACTA-GGGTT-AACTATGTAT-AGTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATAACAT----GTGTA---T--AA---A-AAT-----Aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --------GATGTGACCAA-TTTCATTGGAGATAAATCATCATTATAAT---G-TCTCGTTCTAGA---ATTATT---TAACTAAGATAATAACTGAAAATA-ACATTAA-------TAACGAATACTC-AGG-TAT-CTTCGTG--CATTATACCC-------CAA---AAAGGTTA-AAT---AATG-----CTC--ACACCAAGAAATC--CTTGT----TTAAGATCAAGTAAAT-A---------TGAC-----C--TGA-CCT------------------------------------------------T-----C--A---------TTAATGTGTAATAGATAA-ATTGGCAGTGTGGC-G-GGAAAAAAGCAAGACGAGTT----------------G-ATTTATTTCGACTAACG---GCTATGACATAAT--AA--ACAGTGCT----TT-GTAAGAAACG-CA-AACGTATCGTCGGCACACTATACA-C-ATACAATAA-----------------A-A--CA-GGTTATTCTA-AGATT-ACCTATATAT-TTTT-GCA-TGGAAAATATTTCAAAACCACTGC------TAGTAGAACAATGATAATCT----GTATA---C--TA---A-A-T-----GGACGATCCCGCATATCTTT--CGTTG-TCT---TGATCATC--TT--TGACtag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAC-ATAAAAATA-AAACACATAG----G-----------A-A--CA-TGTTAAACTA-AGTTT-ACCTATATAT-GTTT-ACA-TGGAAGATGCTTCG-----A-AACTTCCATTCGCAGAACGATGACAATCT----GTAT----T--TT---A-TAT-----GGACGAGTCTGCAAACCTTT--CGgagtgcttatatataccaataaactggctatcgttctgacagcaagcacaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --------------CGC--------TGTTATGTT-AACC-------------AACACGTGTAACG--GTATATTTATAC-A-GA-A-CAT-GCTT-TAATTGAGAAGTAAGA-------TTT-GATAAACTGAGACTAT-CAGACCTTTTAGAAAAG-AA--AGCGTAGACAATGAGTAAG---AC--TCG--A--C-CGT-AGT----TATTTATATATAGT---AAAATAAAGCGTCAAAAACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAA----A----CTATCTAAATACATAGACTGGCCTCCATAGAGGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatcgctgttatgttaaccaacacgtgtaacggtatatttatacagaacatgctttaattgagaagtaagatttgataaactgagactatcagaccttttagaaaagaaagcgtagacaatgagtaagactcgaccgtagttatttatatatagtaaaataaagcgtcaaaaacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaactatctaaatacatagactggcctccatagaggcaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                       cacataaaaataaaacacataggaacatgttaaactaagtttacctatatatgtttacatggaagatgcttcgaaacttccattcgcagaacgatgacaatctgtattttatatggacgagtctgcaaacctttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatAATATATATGGGGACAACGTGCATA----------CATATGGCACTGCTTATCTTACCCAACCTGAGCATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGG----------TCCACCCACCGCGTCT--CC-TG-TGCCTTTG-CTTT-CAAATGAACAGAAAATAGC-----------A-----------T-------------T-------T-ATAAAAA--------GACGCAACCCGATTTCATCGGAGGAAAATCATCATTGTAATGGCG-ACTCGTTCTAAC---ATTATTAGCT-----------TAAC-----AGA-ACAT-TA-------TATTACATA-T--AGA-------TT-CAAACA--ATACCC-------TAA---ATA----A-AATTTGAGTA-----CCaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaTAAAT-AAAATTTGAGTACCGGTATC--CAA-CCTATGCAA-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------C-----T--G---------TTggtatccaacctatgcaaaaaatggacctgttcctcattaa
gi|18                         : aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaaatatatatggggacaacgtgcatacatatggcactgcttatcttacccaacctgagcattgtgggagggggtccacccaccgcgtctcctgtgcctttgctttcaaatgaacagaaaatagcatttataaaaagacgcaacccgatttcatcggaggaaaatcatcattgtaatggcgactcgttctaacattattagcttaacagaacattatattacatatagattcaaacaatacccAATAAATGTTGTGACAATATATATATATATATATAC---TGGCCCCGCCAAACTCACCCAAACTGTACATTGC---------------GG-------GA------------------GAAG----------TCAATCCGCCCCGTC---ACATA-CGCCTTTG-CTTT-C--ATcctcattaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtatcatttctttccattcaaatcgtttgttttaatgtttttttgtagagcctgagtgaattaccaatgcgtaaacattgttaaatttctaataacaccttattgtacgcatgtaccgtaaaccctgtcaaaataatctagtgaatgaatggttgtcttgaattcattcttacacagttgtttacagtattatcactagtactggattcggtgtggccaggaatacttagtgtatcctgtacagtgttaatatatctcttgcagctacatcgtttatttacacggttttaatgaaCATAACGATGATAATCT----GTATA---T--TT---A-CTT-----AGACTAGTTCGCATATCTTC--CATAT-TCC---TGATCATC--TT--CGATA------acagaagataat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --------------CGC--------TGTTATGCTTAC-A-------------GGCA-GAATAGCA--GC--ATTT-TA--ATAACA-CAA-G-TT-TAATTTT-------GAAATTAGTTTT-GATAAACTTACACAAT-CAGACCATTCACAAAAG-AA--ATCGCAGAAGATGATCGAA---ACCAC----A--C-CAT-A-T----T------------TAAAAAAACAAAAC----AATACTGGATGCATCattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatcgctgttatgcttacaggcagaatagcagcattttaataacacaagtttaattttgaaattagttttgataaacttacacaatcagaccattcacaaaagaaatcgcagaagatgatcgaaaccacaccatatttaaaaaaacaaaacaatactggatgcatcggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cataacgatgataatctgtatatttacttagactagttcgcatatcttccatattcctgatcatcttcgataattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatAATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACTCCGCTAACCTCACCCAGCTTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATTCCGTCCCGGGT--GC-TA-CGCATTGG-CTCT-C--ATA---------T-GTA----------C-----------AGAAAAAATAAAATT-------T-AT-TAAC--------GGTGTGAGCCGCTTTCATTGAAAGTAAATCACCATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACGTATA-------TAGTAAATA-TC-AGGATATACTTT-T-AACGTTTTACCC-------CAA---ATATATTA-AAT---TATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACTAAGTAAAT-TAAATTGTGGTAACGGTGTC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AACT-C-----ACCA-------T-------T-----C--A---------TTAATAATTATTAGATAA-TTTGGCAATTTGGC-G-GG-AAATAACAAGACTAGTCTA-TTAAGG-AA-GGCG-GTTAATTTGCAT---CA---GTCATGGCATATTTAAA--ATTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-CAAGTTCCGTCGGCAC-CTTCAAAT--AATTAAAA----------A-AA-A--A-C--CA-GTTCATAACA-GGTTT-GCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGGAGATGTTT-------A-CAT------TCGCTGGACGATGACAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcgaC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-TCACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------AA-------T-----------GAGATAAA-CATACCTTTAAGAAAAA-AA--AT-GTAGAAGATGGCCAAG---AC--T----ATAC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAT-C----CTAACTTGATACTTAGGCTGGCCTCCtgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctctgtaatgtttagggacatcacaatgacctatttataaaaacaagtttaataatgagataaacatacctttaagaaaaaaaatgtagaagatggccaagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctaacttgatacttaggctggcctcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcgaaatacatgttgggacaacgtatatgctgactccgctaacctcacccagcttaatcattgtggtagggggtcattccgtcccgggtgctacgcattggctctcatatgtacagaaaaaataaaatttattaacggtgtgagccgctttcattgaaagtaaatcaccattataatgactcattctaacatcatttcaacgataacgtatatagtaaatatcaggatatacttttaacgttttaccccaaatatattaaattataccctaagaccaacgaatccgttactaagtaaattaaattgtggtaacggtgtccaacctatataaaaactcaccattcattaataattattagataatttggcaatttggcgggaaataacaagactagtctattaaggaaggcggttaatttgcatcagtcatggcatatttaaaattgtgataaaattgaaataaacaacacaagttccgtcggcaccttcaaataattaaaaaaaaaccagttcataacaggtttgcctatatctatttacatgggagatgtttacattcgctggacgatgacaacctgtgtattaaaatagacttgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctC--TGATA------TCA--------------C----------TGTA-TATTTA-GA-------------GACA-GTACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-AACAA-T-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAA--CAGACCTTTACGAAAA-------TCAAAGAAAATGGCCAAG---AC--T----ATAC-CGA-A-T----T-----------GT---AAAATAATGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATC----CTGTCTTAATACTAAGGCTGGCTTACGTAGAGG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atatcttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgatcgttcaaaagcgccaaAATACATGTTAGGAAAACGCATATG----------C---TGATTTCGCTAATCTCACGCAACCTTATCATTGC---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCGTCCCTCCCCGGCT--GC-TG-CGCCTTCG-CTAT-C--ATA---------T-ATA----------C-----------AGAAAAAAA-----TAAAAAAAT-GC-TAAC--------GTTATGACCAACTTTCACCGA------------ATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGAAT-CGTG-TTCACGCTTTACCC-------TAA---ATATATTA-AAT---TATA-----TGCTAAGACCATCTTATC--C--GT----A----ATTAAGTAAAT-GGAATTGTTGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--ATAA-------AA-A--T-G-----G--A-------CTCACCATT-----C--A---------TTAATATT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttaatcaa-GTATAATG--ACCTTTTTATA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTTTAAGAAAA--AA--ATCGTAGAAGATGGCCAAG---ACTTT----A--T-CGA-T-T----T-----------GT---A-------------AATACAGAATGTTTAC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATC----CTATCATAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cttgcttttctataagataaacatccacttacgatcgttcaaaagcgccaactgatatcactgtacaat--------------CGC--------TGTACTGTTTA-GA-------------TACA-GTATAATG--GCCTATTTAT-----AA-A-TAA-G-TT-aggc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAA-----------------T----A--C-TGT-A-C----G-----------TT---AAAATAGATTGTA-------GACTATA-----------CAGAAGGTATCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N----NNNTCTTAATACTTAAGCTGGTCTCCGTAAAAGCaagaaaggaaatcgtagaatactgtacgttaaaatagattgtagactatacagaaggtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttaatacttaagctggtctccgtaaaagcaagcc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatcgctgtactgtttagatacagtataatggcctatttataaataagAACATATGTAGGATCAACGTATATA----------C---TGACCCCGCTGACCTCATCCAAACTGAACATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------ACACCCCGCTC-GGCT--GC-TA-CGCATTTG-CCTT-C--ATG---------T-GT-----------G---------------------------------T-AC-AGACAAAAAATAGATGTGACACAATTTCATCGGCGGTAAATTAACATTaagcc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttcattcacaattgtttacaatgatttactgccggaataattagtgtgcctgtctagtgttttaagtatctggcagctacgccgctattttacaagtctttaccaaAGA-------------AACT-TTATAAT--------TTTA-A--G-AA-A-AAA-G-----AAT---------------------T-GATATACTGAATCAAA-TCGACATTTTAGAAAAG-AA--AGCATAGAAGATGATCGAG---AC--TAG--A--C-TGT-A-TGTTCT-----------GC-------CAAAGTGTAAAAATCAGAATGTATGC---G-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAA----G----CTATCTAAATACATAGGCTGGCCTCCATAGAGGC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcatgaatgtagagatacatA-GGTCATAACG-AGTTT-GCCTATATAT-GTTT-ACA-TAGAAGATGTTT-------A-CAT------TCGCCGAACGATAATTACCT----GTGTAGTCT--TG---ATCATCACCGACACTTG-CTGTATAACATAAACGTCC-TCT---T-ACCACCGTTCAACAACG------CCAACTGATAT------CAC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-GTACAATA--ACTTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GCTAAACTGAGGTAAA-CAGACCTTCAAGAAAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACAAGTTGGGACCACGTATATG----------C---TGGTCCCGC--------------CTGAACATTGC---------------GGGGGTGGGTG-----------------GGGGGGGGGGGGGGATTATCCCGTCCCGGCT--GC-TA-CGCCTTTG-CTCT-C--ATG---------T-GCG----------CAGAAAATAACAT-------------T-------T-AT-TAAA--------AGTGTGACC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgcagctacaccgtttttttttatcaa--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------TTACCTC--A---------TTAATAATTGTTAGATAaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         tgcagctacaccgtttttttttatcaaaatacaagttgggaccacgtatatgctggtcccgcctgaacattgcgggggtgggtgggggggggggggggattatcccgtcccggctgctacgcctttgctctcatgtgcgcagaaaataacatttattaaaagtAATACATATTGGGACAACGTATATA----------C---TGAGCCAACTCACCTCATCCTACCTTATCATTGT---------------AG-------CA-----------------GGGGGG---------TCATCCCGCTCCAACT--AC-TA-CGCATTTG-CTCT-C--ATG---------T-G------------------------A-------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGACCCACTTTCATCTGAGGTAAATAATTATTATAAT---G-ACTCGTTCTTAT---ATCATT---T-----------TGAC----GGTA-ACCTGTT-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTCT-TAAACGTTTTACCA-------CAA---AAATATTA-GAT---AATA-----CCCTAAAACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTTAAT-ACAATTGGAGTAACTGTATC--CAA-CCTTT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------A-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCA-ATAAGA-AA-GG-G-ATTGATTTTCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--ACC--CA-GGTTATACCA-GGGTT-TCCTATATCT-ATTT-ACA-TTGAAGATGTTT-------A-AAC------TCGTACAGCGTTAATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTATTCTGCATATATTT--CGTAG-TCT---TGACCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CATACCTTTAAGAATGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAA--------T----A--C-CGC-T-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA----C----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AA-G-T----AT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACGAA-TGGACCTTTTATAAAAG-AA--ATGGT---GGATGATCAAT---AG--TAG--A--C-TGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCG-----TACAGAATGTATCC---G----
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAA--------TCGTGGAGGATGGTCAAG---AC--T----ATGC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA-----------ATTTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGatatcgatggtaccatgtgccacattgcgctgtactgacttgtttcattttgtacagggtacctaacagggtatgaaacaatatctaaatccgtagaggcaag
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAG---AC--T----A--TACGC-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGAGTAGAATACAGAATGTATACAAAN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA----A----CTATCTCAATACTAAGGC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TTACCCCACTCACCTTCCCCAACCTGGTCATTGT---------------GT-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGTCCCAACTGAGC-TA-CGCCTTTG-CTCT-C--ATG---------T-GT-----------T-----------A-----------------------AT-TAAC--------GGTGTGACTCACTTTCATCGAAGGTAAATCATCATTATAAT---G-A--CGTTCTAAaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttttatcaaCATTTTGGC-G-TGAAAATAGCAAGACGAGTCCA-TAAAGATAA-GG-G-ATTATTTTCCAC---CA---GTCATGGTATATT--AA--AATGTGTT----TTTGAAATAAATAACA-AAAGTAGCGTCGGTAC-CTACAAATC-AAATAAAAAG----AAACA-AA-A--A-G--CA-GGTTATAC
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGTT-ACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-GAT-----AGGCTAGTCTGCATATATTT--TGTAG-TCT---TGATTATC--CC--CAACA------CTA--------------A-----------ATAATACTTAAatgtacaagggttatgtgctgttt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaagcattaatgggggactgcataATTA-AAT---TATA-----CCCTGAGATAGAGGAAGC--C---TAA--T----GCTAAGTAAAT-ACAATTGAA--AACAGAATCTACAA-CCTAT--AT-A-------AA-ACAT-G-----G--A-------C-------------C--A---------TTA-----TCTCA--TAATATTGAAGGTGTGGC-G-GGAAAATATCTAGACGAGTCTA-tactta
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agTTATTTCTAC---CAACAGCTAT--CATAT---AA--ACTGTGTG----AA-GAAATTAACAACA-GAAATACTGTCGGTTT-ATACAAATT-AAACACAAA---------A-AA-A--A-A--CA-GGTTATAATA-AGTTC-ATAAAAATCTAATTTGACATTGTAGGATACTtcca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A-------TATTAAATA-TC-CATGTGT-GTTT-TAAACATTTCA--C-------CAAATGAAAGATGA-AAT---ACTA-----CCTTAAGACCAAGGAATTAAT--GTCTAAC----ACCGAATAAATAAAAATCGAAGTAAAGGAATC--CAC-CCTAT--GC-A-------AA-A--a
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAACATGTTGGGTCAGTGTATATG----------T---TGACCCCGCTCACCTTACCCAACCTGTACATTGT---------------GG-------TA-----------------GAGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--GC-TA-CGCTTTTG-CTCT-C--ATG---------T-GTACAGAAAATAAC-----------A-------------T-------TTAT-TATC--------GGAGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTACTATAAA---G-ACTCGTTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----TATA-ACATATA-------TACTAAATA-TC-TGGGTAT-ATTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ACGTATTATAAT----ATA-----CCCTAAGACCAAGGAATC--C--GG----T----ACCAAGTAAAT-AAAAGCGGAGTAACGGTATC--CAA-TATAT--AT-ATATATATAA-A--T-GGACTCG--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATGTATAATATAA-ATTGGCAGTTTAGC-G-GGAAACTAGCAAAATGAGTCCA-TAAAGG-AAGGG-G-GTTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ACTGTG-T----TT-GAAATA-----------------TTGGTAC-CTACAAATCGAAAAGAAAGG----GG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATATCA-GGTTT-GCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATCCTT-------A-TAC------TCTCAGAACGTTGGTAACCT----GTGTA---TAATATTCA-ACT-----AGACTAGTCCGCATATCTGT--CGactgac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaATGTTC--CGTAGCTCCAACTGAT-ATC--AT--AGATA------TC----------------GC--------TGTAATGTTTAA-A-------------GATA-GTATAATG--GCCAATTTATA--A-AA-C-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAACAAA-CATACCTTTAAGAAAAT-AA--ATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgatgttccgtagctccaactgatatcatagatatcgctgtaatgtttaaagatagtataatggccaatttataaaaccaaatttaatgatttgataaactgaaacaaacatacctttaagaaaataaatcg
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaaaaacatgttgggtcagtgtatatgttgaccccgctcaccttacccaacctgtacattgtggtagagggtcatcccgccccggctgctacgcttttgctctcatgtgtacagaaaataacatttattatcggagtgacccactttcatcggaggtaaatcattactataaagactcgttctaatatcatttcaactataacatatatactaaatatctgggtatattttaaacgttttaccccaaacgtattataatataccctaagaccaaggaatccggtaccaagtaaataaaagcggagtaacggtatccaatatatatatatatataaatggactcgactcattaatatgtataatataaattggcagtttagcgggaaactagcaaaatgagtccataaaggaagggggttaatttccaccagtcatggcatattaaactgtgtttgaaatattggtacctacaaatcgaaaagaaaggggaaaaaacaggttatatcaggtttgcctatatctatttacatggaagatccttatactctcagaacgttggtaacctgtgtataatattcaactagactagtccgcatatctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgTAAGACAAA-CATACCTATCACACAAG-AA--AGCGTAGAAGACGATCAAG---AC--TAG--A--C-CGT-A-A----T-----------GT---GAAATAAAGTGTCGAATACAGAATGTATC
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatccaATAA-ATTGGCTGTTTGGC-GAGGATAATATCTAGAAGA--------AATC-A-----T-ATTTATTTCCAC---CA------ACAGC-TGTT-------TTGTGTG----AT-GAAATAAACAACACAAAATt
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------TTAATATTTATTTGATAA-TTTGGAAGTTTCGC-A-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCA-TAATGG-AA-GG-G-GGTTATTTCCACCAACA---GATATGGCATA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A-AA-A-AAA-G-TTGTAA-----------GA-------TTTTGATAAACTGAGACAAA-CAGACATTTTAGAAAAG-AAGCATAGTAG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------TCATCCCGTCCCGTCT---C-TACCGCCTTTGTTTCTGC--ATG---------T-GT-----------tctagtcttta
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agTAGAAGATGATCAAG---AC--TTT--A--C-CGT-A-T----T-----------AA---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCT---G----gcacataaaaataa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---AGACCCAATTCACCTCACCAAACCTAATCATTGT---------------AA-------TA-----------------AGGGG----------TCATCCCGCTCCGACT--GC-TA-CGCCTTTG-CTCT-C--ATG---------T-GT-------------------------------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGACCCACTTTTATCGGCTGTAAATCATTATTGTAAT---G-ACTTATTCTGAT---ATCATT---T-----------CAAC----AATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGT------T-TA-----TTTA-----------AA---AAATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAAATCAACGAATT--T--GT----T----ACCAAGTAAAT-ACAATTAGAGTAACTGTATC--CAG-CTTAT---------------------G-----G--A-------C-------T-----CTCA---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGT-G-GGAAAGTAGCAAGACGAGTTAA-AAAAGT-AA-GG-GTATTTATTACCAC---CA---GTCATGGCATATT--AT--TTTGAGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCTTCGGCAC-AAACAAATC-AAACAAAAAA----GG--A-AA-A--T-CT-CA-GGTTATACCA-GGGTT-TCCGATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TC---A-AAT-----AGACTAGTCCGCAAATCTTT--TGTAG-TCT---TGACCATC--TC--TGATA------CTA--------------CGC--------TGTAATG-TTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-GA--ATCATTGAAGGTGGTCAAGACAAC--A----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCATAGAATACAGATTGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA-----------ATCTTAATACTTAGGCTGGCa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --A---------TTAATATTTATCAGATAA-ATTGACATTTTCGCTG-AAAAAATAGCGA
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tt----CTATCTAAATCAATAGGCGGGCCTCCGTAGAGGC
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aggTTAATACTTAGGCTGACCTCCTTAGAGGCaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGTTGGGACAATGTATATG----------C---TGATCCCGCTCACCTCACTCAACCTGATCATTGTTGTGGAAGGGGGAGGGG-------T------------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGACT--GC-TA-CGCCTTTG-CTCT-T--ATA---------T-AT-------------------------------------T-------T-AT-TAAT--------GTTGTGAACCACTTATATCGGAGGTAAAT---------------G-ATTCGTTCTCAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTGTA-------TAATATATA-TCTAGGTTAT-CTTT-GAAACGTTTTACCC-------CAA---ACATATTA-AAT---AATA-----ATCAAATACCATCGAATC--C--GT----T----ATCAAGTAAAT-AAAATTGGAATAACAGTACC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AA-T-G-----G--A-------C-------TTGCCTC--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCATTTTGGC-C-GG-AAATAGCAAGACGAGTACA-TAACGT-AAGGG-G-ATCAATTTCCAC---CA---GTCATGCCATATA--AA--ACTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTAGCGCCGGCAC-TTACAAATC-AAATCAAATG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA-GAATT-GCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGA------------------------------AGAACATTGAC-ATAT----GTGTA------TA---A-AAT-----GGACTAGTCCGCATATCTTT--CGCAG-TCT---TGATCATC--TG--AGACA------CTAG-------------CGCCATATCGGTGTAATGTTTA-------------------------GATT--GCCTA---------------------TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-TAAACATTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGCAGATGGTAACG---ACTAT----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NAATACTATCTTAATACATAGGCTGGCCTTCGTAGaagcca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACTTGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCACTCGCCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------TA------------------GGGG----------TCATCCCGCACTTACTGAGC-TA-CACTTTTG-CTCT-A--CTG---------T-GT-------------------------------------T-------T-AT-TAAC--------GGTGTGTCTCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTTTTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCG---------------------------------TATA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTCACCC-------AAA---CAATGTTA-TAT---AATA-----ACCAAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCATATAAAC-AAGATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AAGA--T-G-----G--A-------C-------T----------------------TACCT--------C-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGACCATAAAGGT-AA-GG-A-TTTAATTTCTAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTATT----TT-GAAATAAACAAC--AACGTAATGTGGGCAC-CTACAAACC-AAATAAAAAG----AG--A-AACA--A-A--CG-GGTGATATCA-GGGTT-GCTTATATCT-ATTT-ATA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------CTGCAAAACGTTGATAACCT----GTATA---T--CA---A-AAT-----AGACCAGTCCGC--ATCTTT--TATAG-CCT---TGATAATC--TC--CGACACTTGGGCCAACTGATAT------CGC--------TGTAATGTTT-AGA-------------GACA-GTATAATG--GCCT------------------A-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATGAACTGTGGC-------------AAGAAATG-AA--ATTTTAGAAGATTGTCAAA---AC--TAAACA--T-TTT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGGGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA----C----CTATCTTAATACTTTGGTTGGCATCCGTGGAGGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTAAACCGCCATTGCTAC---GCGCTTGCTC-AATCAGATCGTT---------------CAAC----GATA-ACCTATAGTA----TACTAAATA-TC-AGGATAT-CTTT-TAA-CGTT--ACCT-------AAA---AAATATTA-TAT---AATA-----ACCTAAGATCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGAAGAT-AAAACTGGTGTAACGGTATC--CAA-TCTAT--AT-A-------AA-A--TTG-----G--A-------C-------T-----C--ACCTCATTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-A-GGGGAATAGCAAGACGAGTCCA-TAAAGG-TA-GG-G-GTTTA------------------ATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGAAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAGGGAAAG--A-AA-A--A-A--C--GGCTGTACCA-GGGTT-GCCTA------ATCT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATTACTT----GTATG---T--TA---A-AAA-----ATACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CAT---TGGTCATC--AC--CGACA------CCAGCACCAACTAATATCGC--------TGTAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GTCTATTT---------------------TAAT----------GA-------TTT-GATAAACCGAGACAA-------------GAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---ACAAT----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAAAATGTATCC---GNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA-----------ATCTTAATCTTTAGGCTGGCCTCCGCAGAGa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tACAACGTATATG----------C---TGACCCTGCTCACCTCATACAACCTGAACATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCTGCCCCGGCT--GC-TA-CACATTTG-CTCT-T--ATG---------T-GTACAGAATATCAC-----------G-------------T-------TGAT-CAAC--------GGTGTGACCCACTTTCATCAGAACTAAATCATCATTAAAAA---G-ATTCGGTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTATATCATAAGTACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAATATTTTATCC-------CAA---ACATATTA-AA-------A-----CCCCAAGACCAACGAATC--T--GT----T----AACAAGTAAAT-ACAACTGGAGTAACGGTATC--CGA-CCTAT--AT---------AC-C--T-C-----A--C-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTTGCAGTATTGC-G-AGAAAATGGCCAGACGAGTCCA-TAAAGG-AA-GG-G-----------------G---ATCACAGCAGATT--CA--ATTATATT----TT-GAAATAAACAACA-AACGTACAGTCGGCAC-CTACAAATT-AAGCAAAATG----AA--A-AA-A--------A-GGTTATACGA-AGTGT-ATCTATATCT-ATTT-ACA-CAGAGGATGCAT-------A-CAA------TCGCAGATCGATAATACCCT----GTGTA---T--TA---T-AAT-----AGACACATCCGCATATCTTT--CGNNN-NNN---NNNNNNNN--NN--NNNNN------NNN--------------NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTATGACC-GTTCAATAGCGCCAACTGATAACA-AA-A-TAA-G-TT-CAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTATAATAAATG-AA--
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): ATCACCCGTAAAAGTTTAATATTTGAAACACCAATTGCTGCATTCTGGTTTAGTGAGTGTTAAAGATAAAACCGAAAGTCAATAAAAATAAAACACCGACCGCATTTCAAAGCTTTGTTGAATAATTAATTTGTAAATTGCAAATGGCTTTGATTAACATCTCTTTGTTGATATACCATACATCTGAAATGTTTTATCCTGTAATAAACATTCCAGTTCGTGAATGGTTGTCAAAAATTCACTCATACACAACAGTTTACAATGTGGCAAACACTGGGATCGCTGCCGTCAGGAAGAAT
Unaligned ( gi|24 ): GATCGCCCGTAAATTTTATTATTAAGACACCAAACTCCTGCATTCTATATTCTAGTGAGTGTGTATGATAAAACAAGCTAATCTGTTACATCATACACCGAAAGTCCATCAAACAACCACTGCATTAATGCTTGAGCGAATTAACATTTGTAACATGCACGCAACTCTGATTAACATCTTATTGTATGTTACCCTGTCTAGTTCATTCCAGTTAATGAATGGTTGTCTGAAATTCATTCATCTGCAATTATTTACAACATCACAAGCATTGGATTCTTTGCAGTCATAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): ACCTAATCTTGTTTACGATAATATCGAAAGGCAATCACTCAATCCCTTTTAAAACTTGTGAATAAACACTTTATAAATTGCACATACCTCTGATTAGCATATCATTGTATGGATATAACATACATTTAAACTGTGTTAATCTGTCAAAAGCATTCCCATTCGTGAATGGTTGTCTAAAATTCACTCA
Unaligned ( gi|40 ): AATATTTAAAATATTATTTCTGCATTCTTCATTCTAGTAAGTGTTTAAGATATAACAGGCTTCAAATGAGGTACCTCTTACGCACTGAAAATCCATAAAAAAACTTGCATACAACTCTGAATAAAATCT
Unaligned ( gi|44 ): TGTCCGTTACTCTTGTCGTTGTTTATGAATGGTTATCGTTATCTGAAATACACTCATACACAAATGTTTACAATGTCACAAGC
Unaligned ( gi|45 ): ATTGTCCAATAGCGCCAACTGATATTGCTGAACATTAGAAAGTAAGATTTGAAAAACTGAGATAAATATACATTTTAGAAA
Unaligned ( gi|49 ): AGACAAAAAAAATACCACCAAGCCCTTTCTTCTGATACCAAAACAACAATTA
Unaligned ( gi|50 ): GTAACGATGGTAGATCTATTACTTTTCTTTTTACTATTACGCTCAACCGA
Unaligned ( gi|54 ): ATGATGATTCATCTTAATATTATCAGTGACACATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1111111111                                      111111111111111  11111111111111111111111111     1111111111                                               111111111111111111111111111111                                                                             222222222222222                    1111111                                                                                                      111111111                                                            11            3333333333333333333333333333333333                                                                                                                          1111                                                     111111111                                                                 1111111                                                                                                                           33333333333333                      2222222222222222                                                1111111111  1111111                                                                   2222222222                                                                222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222      11111                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     0000000000 444          1                1      444444444444444  77777777777777777777777777     2222222222             0  33 33 2  2        2    2       333333333333333333333333333333 2  2    2                                         444 2            555   1  000000000000000    77777   2  0 6  3333333         2  2   1   44   2              8888888   444 1      2   6666   66666                  33 33  111111111           2 1      33    2     33   2     33 33 7777777  2 00 2 55555 33 0000000000000000000000000000000000                  2              2 2                      1   2 77  7 2 5 44  1        777  333             66  33        0000  2             2      1         2         2         666666666 2  2 33 2 55  2          33  1  0         2    2   2            0000000 2   666666          1         4444     333 33  333 2   55555                    33     2   555        33  33     888888   55555555555555   88888888           6666666666666666    2        22        0  44 2  2 4   1 1  1    6666666666  3333333   2               44                 1  22                   333  7777777777 1   1 1 3333 88888888888  333                              333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  33  00000                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .......... ...          .                .      ...............  ..........................     ..........             .  .. .. .  .        .    .       .............................. .  .    .                                         ... .            ...   .  ...............    .....   .  . .  .......         .  .   .   ..   .              .......   ... .      .   ....   .....                  .. ..  .........           . .      ..    .     ..   .     .. .. .......  . .. . ..... .. ..................................                  .              . .                      .   . ..  . . . ..  .        ...  ...             ..  ..        ....  .             .      .         .         .         ......... .  . .. . ..  .          ..  .  .         .    .   .            ....... .   ......          .         ....     ... ..  ... .   .....                    ..     .   ...        ..  ..     ......   ..............   ........           ................    .        ..        .  .. .  . .   . .  .    ..........  .......   .               ..                 .  ..                   ...  .......... .   . . .... ...........  ...                              ... ...........................................................................  ..  .....                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     9999999999 444          9                0      777777777777777  33333333333333333333333333     6666666666             1  22 22 4  4        4    4       333333333333333333333333333333 7  7    5                                         777 7            444   1  444444444444444    33333   9  7 6  3333333         7  7   5   33   7              7777777   777 0      5   4444   22222                  77 22  000000000           2 6      11    9     11   2     11 66 2222222  2 66 4 99999 22 4444444444444444444444444444444444                  4              2 2                      9   5 88  5 5 0 44  8        888  999             55  22        0000  4             4      9         4         4         444444444 4  4 22 4 66  2          22  0  4         2    2   2            9999999 4   888888          8         7777     999 11  999 2   66666                    22     9   000        99  77     222222   33333333333333   11111111           8888888888888888    1        99        1  88 0  0 0   9 9  9    5555555555  0000000   0               22                 7  33                   222  7777777777 8   8 8 9999 66666666666  222                              777 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888  44  44444                                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTGT------ACAGAA-A--A-A---T-------T-AT-TAAC-GGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAA-GG-AA-G-G-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
Reference ( family-293 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTGT------ACA-------------T-------T-AT-TAAC-GGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCANAAA-GN-AA-G-G-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTAGGACAACGCATATG----------C---TGACTCCGCG----------AACCTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGAG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATATGT------ACAGAAAAATAAAAT-T-------T-AT-TAAC-GGTGTTACCCAAGTTCATTGAAGGTAAATCAACATTATAAT---G-ATTCATTCTAAC---ATCGTT---T--------------------ATATACAT-TG-------TATTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TTAACGTTTTACCC-------CAA---ATATATTA-AAT---TATAGGCTACCCTAAGACCAACGAATC--C--GC----A----ACTAAGTAAAT-GAAATTGT--TTACGGTTTT--TAAACCTAT--AT-A-------AA-AA-T-G-----G--AATCACCAT-------T-----C--A---------TTAATAATTATTAGATAC-TTTGGCAGTTTGGC-G-GAAAAA-AACAAAACTAGTCTATAAA-GG-AA-G-GAG-ATTTATTTGCAT---CA---ATCATGGCATATTTAAA--AGTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-AAAGTACCGTCAGAAT-CTACAAATA-AAACAACAAC----AATAA-AA-A--A-A--CA-GGT-----CA--AGTTTGTCTATATCT-ATTT-ATA-TAGAAGATACTT-------T-TAT------TCGCTGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--CA---A-AAT-----AGAATAGTCCGCATAGCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--AC--AGACA------C
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caa--------------CAC--------TGTACTGTTTACGG-------------AAC--GTACAGTG--ACCTATTTTTA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAATAAA-CAGACCTTTAAGGAAAA-AA--ATCGTAGGAGATGGCCAAG---CC--T----A--T--------------------------------ATAAAGCGTAGAATACAGAGTGTTTCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTATCCTAATACTAAGGCTGGCCTCCGTAGAGGCttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttatcactgtactgtttacggaacgtacagtgacctatttttaaaaacaaatttaatgatttgataaactgaaataaacagacctttaaggaaaaaaatcgtaggagatggccaagcctatataaagcgtagaatacagagtgtttccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctatcctaatactaaggctggcctccgtagaggc
gi|10                         :                                                                                                                                                                      caaaatacatgttaggacaacgcatatgctgactccgcgaacctaatcattgtggtagggagtcatcccgccccggctgctacgcctttgctctcatatgtacagaaaaataaaatttattaacggtgttacccaagttcattgaaggtaaatcaacattataatgattcattctaacatcgtttatatacattgtattaaatatcagggtatctttttaacgttttaccccaaatatattaaattataggctaccctaagaccaacgaatccgcaactaagtaaatgaaattgtttacggtttttaaacctatataaaaatggaatcaccattcattaataattattagatactttggcagtttggcggaaaaaaacaaaactagtctataaaggaaggagatttatttgcatcaatcatggcatatttaaaagtgtgataaaattgaaataaacaacaaaagtaccgtcagaatctacaaataaaacaacaacaataaaaaaacaggtcaagtttgtctatatctatttatatagaagatacttttattcgctgaacgatgataacctgtgtatcaaaatagaatagtccgcatagctttcgtagtcttgatcatcacagacacttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttat--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------TTACCTC--A---------TTAATAATTGTTAGATAA-ATGGGCAGTTTGGC-T-GGAAAATAACAAGACGTGTCCATAAA-AG-AA-TTG-G-ATTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AATTATTATGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAGGTGCTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----GG--A-AA-A--A-AACTA-GGTTATACCA--AGCTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-AGGAGGATGCTT-------A-CAT------TCGCAGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--TG---A-AAT-----AGACTCATGTGCATAGCTGT--CG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --------TATAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-AAAAG-AT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAGCTGAGACAAAATGGACCTTAAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCGAG---AC--T----ATAC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATATATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCATAATATTAAGGCTGGCCTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggatataatgtttagagacagtataatggcctatttataaaaaaaaagattaatgatttgataagctgagacaaaatggaccttaaagaaaagaaatcgtagaagatggtcgagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatatatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcataatattaaggctggcctccgta
gi|11                         :                         gtgaccaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagataaatgggcagtttggctggaaaataacaagacgtgtccataaaagaattggattaatttccaccagtcatggcatattaattattatgttttgaaataaacaacaaaggtgctgtcggcacctacaaatcaaacaaaaagggaaaaaaactaggttataccaagcttgcctatatctatttacaaggaggatgcttacattcgcagaacgatgataacctgtgtattgaaatagactcatgtgcatagctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggaAATACATGTTGGGACAGCGTATATT----------C---TGACGTTACTCTCCTCACCAAACCTGAACATTGT---------------GG-------TAAGGTGGGGGGTGGTGGTGGGGG----------TCATTCCACCCAAGCT--G--C-TA-CGCTTTTA-CTTT-GATGTGT------ACAGAATATAACAT--T-------T-AT-TAAC-GGTGTTAACCAATCTCATCAGAGGTAATGTATCATTATAAA---G-A
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATAAAGAA-AA--AT-GTAGAAGATGATCAAG---AC--TGT--A--C-CAT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATGCAGAATATATTC---G----aaaatgtagaagatgatcaagactgtaccatattgtaaaataaagcgtagaatgcagaatatattcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                             tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatacatgttgggacagcgtatattctgacgttactctcctcaccaaacctgaacattgtggtaaggtggggggtggtggtgggggtcattccacccaagctgctacgcttttactttgatgtgtacagaatataacatttattaacggtgttaaccaatctcatcagaggtaatgtatca----GATA-ACCTATA-------TACCAAATA-TC-AGGATAT-ATTT-TAAACATTTTACCCATTTTTCCAA---AAATGTTA-AAT---AATA-----CTCTAAATCCAACGAAAC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGTATAACTGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----A--A-------C-------T-----CTCA---------TAAATTTTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGCT-G-GGAAAATAGTAAGACAAGTCCAAAAA-GA-AAAG-G-G-ATTGATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCATCAGCAC-CTACAGATC-AAAC-AAAAG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACA-----------------GTGTA---T--TT---A-AAT-----AGACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CCT---TGATCATC--TC--CAACA------CTA--------------CAC--------TGTA------------------------ACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAG---ACTAT----A--C-TGC-A-T----T-----------TT---GAAATAAAGCATAAAATACAGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tATTTCCAA---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----AT-GAAATAAACAACG-ACAGTACCGTTGGCAC-ATACAAATA-AAACAAA-------AG--A-AA-ATTA-A--CGTGGTTATACCATTAGTTAACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-CAT------GCGCAGAATGATGATAACCTGCAAGTGTA---A--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTC--CGTAG-TCT---TGATAATT--TC--TGACA------Cagagtcagattttga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            a--------------CGC--------TGTAATATTTA-GA-------------TACA-GTATAAAA--GTCTATTGATA--A-AA-AACAA-G-CT-TAATTTAG------GAAATAACATTT-GATTAACTGAGACAAA-CAGACCGTTAAAAAAAGGAA--ATGGTAGAAGATGATCAAG---AC--T----ATAC-CGTCA-C----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGCttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatcgctgtaatatttagatacagtataaaagtctattgataaaaaacaagcttaatttaggaaataacatttgattaactgagacaaacagaccgttaaaaaaaggaaatggtagaagatgatcaagactataccgtcactgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcttaatacttaggctggcctctgtagaggca
gi|14                         :                                                                                                                                                                      aatttccaacagtcatggcatattaaattgtgttatgaaataaacaacgacagtaccgttggcacatacaaataaaacaaaagaaaattaacgtggttataccattagttaacctatatctatttacatggaagatgcttacatgcgcagaatgatgataacctgcaagtgtaataaaatagactagtccgcatatcttccgtagtcttgataatttctgacacttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatTGGGACAACGTATATT----------C---TGACCCC-CTCACCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------CA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCAATT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CGTGTGT---------------------------------T-TA---GGTGTGACTCACTTTCATCGGAGGTAAATCGTCATTATAAT---G-ACTGGTTCAAAT---ATCGTT---------------CAAC----GGTA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAAGGTTTTACCC-------CAA---AGATATTA-AAT---AATA-----CCATAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAA-TTAGAGTAACTGTATC--CAA-CCCAT--AT-A-------AA-A--T-A-----G--A-------C-------C-----C--C------------ACCCCCATT-GATA---TTGGCAGTTAGGC-G-GGAAAATAGCAAGATGAGTCCATAAA-GGTAG-G-G-G-GTCAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATTTT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAACAAACAACA-AAAGTAGTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--AGGG-A--A-A--AA-GGTTATACTA--GGGTTAACTATGTAT-AGTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATAACAT----GTGTA---T--AA---A-AAT-----Aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -GATGTGACCAA-TTTCATTGGAGATAAATCATCATTATAAT---G-TCTCGTTCTAGA---ATTATT---TAACTAAGATAATAACTGAAAATA-ACATTAA-------TAACGAATACTC-AGG-TAT-CTTCGTG--CATTATACCC-------CAA---AAAGGTTA-AAT---AATG-----CTC--ACACCAAGAAATC--CTTGT----TTAAGATCAAGTAAAT-A---------TGAC-----C--TGA-CCT------------------------------------------------T-----C--A---------TTAATGTGTAATAGATAA-ATTGGCAGTGTGGC-G-GGAAAAAAGCAAGACGAGTT-----------------G-ATTTATTTCGACTAACG---GCTATGACATAAT--AA--ACAGTGCT----TT-GTAAGAAACG-CA-AACGTATCGTCGGCACACTATACA-C-ATACAATAA-----------------A-A--CA-GGTTATTCTA--AGATTACCTATATAT-TTTT-GCA-TGGAAAATATTTCAAAACCACTGC------TAGTAGAACAATGATAATCT----GTATA---C--TA---A-A-T-----GGACGATCCCGCATATCTTT--CGTTG-TCT---TGATCATC--TT--TGACtag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CAC-ATAAAAATA-AAACACATAG----G-----------A-A--CA-TGTTAAACTA--AGTTTACCTATATAT-GTTT-ACA-TGGAAGATGCTTCG-----A-AACTTCCATTCGCAGAACGATGACAATCT----GTAT----T--TT---A-TAT-----GGACGAGTCTGCAAACCTTT--CGgagtgcttatatataccaataaactggctatcgttctgacagcaagcacaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --------------CGC--------TGTTATGTT-AACC-------------AACACGTGTAACG--GTATATTTATAC-A-GA-A-CAT-GCTT-TAATTGAGAAGTAAGA-------TTT-GATAAACTGAGACTAT-CAGACCTTTTAGAAAAG-AA--AGCGTAGACAATGAGTAAG---AC--TCG--A--C-CGT-AGT----TATTTATATATAGT---AAAATAAAGCGTCAAAAACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA--AAA----CTATCTAAATACATAGACTGGCCTCCATAGAGGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatcgctgttatgttaaccaacacgtgtaacggtatatttatacagaacatgctttaattgagaagtaagatttgataaactgagactatcagaccttttagaaaagaaagcgtagacaatgagtaagactcgaccgtagttatttatatatagtaaaataaagcgtcaaaaacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaactatctaaatacatagactggcctccatagaggcaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                       cacataaaaataaaacacataggaacatgttaaactaagtttacctatatatgtttacatggaagatgcttcgaaacttccattcgcagaacgatgacaatctgtattttatatggacgagtctgcaaacctttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatAATATATATGGGGACAACGTGCATA----------CATATGGCACTGCTTATCTTACCCAACCTGAGCATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGG----------TCCACCCACCGCGTCT--C--C-TG-TGCCTTTG-CTTT-CAAATGA------ACAGAAAATAGCAT--T-------T-ATAAAAA-GACGCAACCCGATTTCATCGGAGGAAAATCATCATTGTAATGGCG-ACTCGTTCTAAC---ATTATTAGCT-----------TAAC-----AGA-ACAT-TA-------TATTACATA-T--AGA-------TT-CAAACA--ATACCC-------TAA---ATA----A-AATTTGAGTA-----CCaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaTAAAT-AAAATTTGAGTACCGGTATC--CAA-CCTATGCAA-A-------AA-A--T-G-----G--ACCTGTTCC-------T-----C--A---------TTAAggtatccaacctatgcaaaaaatggacctgttcctcattaa
gi|18                         : aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaaatatatatggggacaacgtgcatacatatggcactgcttatcttacccaacctgagcattgtgggagggggtccacccaccgcgtctcctgtgcctttgctttcaaatgaacagaaaatagcatttataaaaagacgcaacccgatttcatcggaggaaaatcatcattgtaatggcgactcgttctaacattattagcttaacagaacattatattacatatagattcaaacaatacccAATAAATGTTGTGACAATATATATATATATATATAC---TGGCCCCGCCAAACTCACCCAAACTGTACATTGC---------------GG-------GA------------------GAAG----------TCAATCCGCCCCGTC---A--CATA-CGCCTTTG-CTTT-CAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtatcatttctttccattcaaatcgtttgttttaatgtttttttgtagagcctgagtgaattaccaatgcgtaaacattgttaaatttctaataacaccttattgtacgcatgtaccgtaaaccctgtcaaaataatctagtgaatgaatggttgtcttgaattcattcttacacagttgtttacagtattatcactagtactggattcggtgtggccaggaatacttagtgtatcctgtacagtgttaatatatctcttgcagctacatcgtttatttacacggttttaatgaaCATAACGATGATAATCT----GTATA---T--TT---A-CTT-----AGACTAGTTCGCATATCTTC--CATAT-TCC---TGATCATC--TT--CGATA------acagaagataat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --------------CGC--------TGTTATGCTTAC-A-------------GGCA-GAATAGCA--GC--ATTT-TA--ATAACA-CAA-G-TT-TAATTTT-------GAAATTAGTTTT-GATAAACTTACACAAT-CAGACCATTCACAAAAG-AA--ATCGCAGAAGATGATCGAA---ACCAC----A--C-CAT-A-T----T------------TAAAAAAACAAAAC----AATACTGGATGCATCattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatcgctgttatgcttacaggcagaatagcagcattttaataacacaagtttaattttgaaattagttttgataaacttacacaatcagaccattcacaaaagaaatcgcagaagatgatcgaaaccacaccatatttaaaaaaacaaaacaatactggatgcatcggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cataacgatgataatctgtatatttacttagactagttcgcatatcttccatattcctgatcatcttcgataattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatAATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACTCCGCTAACCTCACCCAGCTTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATTCCGTCCCGGGT--G--C-TA-CGCATTGG-CTCT-CATATGT------ACAGAAAAAATAAAATT-------T-AT-TAAC-GGTGTGAGCCGCTTTCATTGAAAGTAAATCACCATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACGTATA-------TAGTAAATA-TC-AGGATATACTTT-T-AACGTTTTACCC-------CAA---ATATATTA-AAT---TATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACTAAGTAAAT-TAAATTGTGGTAACGGTGTC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AACT-C-----ACCA-------T-------T-----C--A---------TTAATAATTATTAGATAA-TTTGGCAATTTGGC-G-GG-AAATAACAAGACTAGTCTATTAA-GG-AA-G-GCG-GTTAATTTGCAT---CA---GTCATGGCATATTTAAA--ATTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-CAAGTTCCGTCGGCAC-CTTCAAAT--AATTAAAA----------A-AA-A--A-C--CA-GTTCATAACA--GGTTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGGAGATGTTT-------A-CAT------TCGCTGGACGATGACAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcgaC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-TCACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------AA-------T-----------GAGATAAA-CATACCTTTAAGAAAAA-AA--AT-GTAGAAGATGGCCAAG---AC--T----ATAC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTAACTTGATACTTAGGCTGGCCTCCtgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctctgtaatgtttagggacatcacaatgacctatttataaaaacaagtttaataatgagataaacatacctttaagaaaaaaaatgtagaagatggccaagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctaacttgatacttaggctggcctcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcgaaatacatgttgggacaacgtatatgctgactccgctaacctcacccagcttaatcattgtggtagggggtcattccgtcccgggtgctacgcattggctctcatatgtacagaaaaaataaaatttattaacggtgtgagccgctttcattgaaagtaaatcaccattataatgactcattctaacatcatttcaacgataacgtatatagtaaatatcaggatatacttttaacgttttaccccaaatatattaaattataccctaagaccaacgaatccgttactaagtaaattaaattgtggtaacggtgtccaacctatataaaaactcaccattcattaataattattagataatttggcaatttggcgggaaataacaagactagtctattaaggaaggcggttaatttgcatcagtcatggcatatttaaaattgtgataaaattgaaataaacaacacaagttccgtcggcaccttcaaataattaaaaaaaaaccagttcataacaggtttgcctatatctatttacatgggagatgtttacattcgctggacgatgacaacctgtgtattaaaatagacttgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctC--TGATA------TCA--------------C----------TGTA-TATTTA-GA-------------GACA-GTACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-AACAA-T-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAA--CAGACCTTTACGAAAA-------TCAAAGAAAATGGCCAAG---AC--T----ATAC-CGA-A-T----T-----------GT---AAAATAATGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTGTCTTAATACTAAGGCTGGCTTACGTAGAGG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atatcttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgatcgttcaaaagcgccaaAATACATGTTAGGAAAACGCATATG----------C---TGATTTCGCTAATCTCACGCAACCTTATCATTGC---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCGTCCCTCCCCGGCT--G--C-TG-CGCCTTCG-CTAT-CATATAT------ACAGAAAAAAA-----TAAAAAAAT-GC-TAAC-GTTATGACCAACTTTCACCGA------------ATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGAAT-CGTG-TTCACGCTTTACCC-------TAA---ATATATTA-AAT---TATA-----TGCTAAGACCATCTTATC--C--GT----A----ATTAAGTAAAT-GGAATTGTTGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--ATAA-------AA-A--T-G-----G--A-------CTCACCATT-----C--A---------TTAATATT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttttaatcaa-GTATAATG--ACCTTTTTATA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTTTAAGAAAA--AA--ATCGTAGAAGATGGCCAAG---ACTTT----A--T-CGA-T-T----T-----------GT---A-------------AATACAGAATGTTTAC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTATCATAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cttgcttttctataagataaacatccacttacgatcgttcaaaagcgccaactgatatcactgtacaat--------------CGC--------TGTACTGTTTA-GA-------------TACA-GTATAATG--GCCTATTTAT-----AA-A-TAA-G-TT-aggc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAA-----------------T----A--C-TGT-A-C----G-----------TT---AAAATAGATTGTA-------GACTATA-----------CAGAAGGTATCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN----NNNTCTTAATACTTAAGCTGGTCTCCGTAAAAGCaagaaaggaaatcgtagaatactgtacgttaaaatagattgtagactatacagaaggtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttaatacttaagctggtctccgtaaaagcaagcc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatcgctgtactgtttagatacagtataatggcctatttataaataagAACATATGTAGGATCAACGTATATA----------C---TGACCCCGCTGACCTCATCCAAACTGAACATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------ACACCCCG-CTCGGCT--G--C-TA-CGCATTTG-CCTT-CATGTGTGTACAGACA-----------------------AA-AAATAGATGTGACACAATTTCATCGGCGGTAAATTAACATTaagcc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttcattcacaattgtttacaatgatttactgccggaataattagtgtgcctgtctagtgttttaagtatctggcagctacgccgctattttacaagtctttaccaaAGA-------------AACT-TTATAAT--------TTTA-A--G-AA-A-AAA-G-----AAT---------------------T-GATATACTGAATCAAA-TCGACATTTTAGAAAAG-AA--AGCATAGAAGATGATCGAG---AC--TAG--A--C-TGT-A-TGTTCT-----------GC-------CAAAGTGTAAAAATCAGAATGTATGC---G-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--AAG----CTATCTAAATACATAGGCTGGCCTCCATAGAGGC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatcatgaatgtagagatacatA-GGTCATAACG--AGTTTGCCTATATAT-GTTT-ACA-TAGAAGATGTTT-------A-CAT------TCGCCGAACGATAATTACCT----GTGTAGTCT--TG---ATCATCACCGACACTTG-CTGTATAACATAAACGTCC-TCT---T-ACCACCGTTCAACAACG------CCAACTGATAT------CAC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-GTACAATA--ACTTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GCTAAACTGAGGTAAA-CAGACCTTCAAGAAAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACAAGTTGGGACCACGTATATG----------C---TGGTCCCGC--------------CTGAACATTGC---------------GGGGGTGGGTG-----------------GGGGGGGGGGGGGGATTATCCCGTCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTGC------GCAGAAAATAACAT--T-------T-AT-TAAA-AGTGTGACC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgcagctacaccgtttttttttatcaa--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------TTACCTC--A---------TTAATAATTGTTAGATAaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         tgcagctacaccgtttttttttatcaaaatacaagttgggaccacgtatatgctggtcccgcctgaacattgcgggggtgggtgggggggggggggggattatcccgtcccggctgctacgcctttgctctcatgtgcgcagaaaataacatttattaaaagtAATACATATTGGGACAACGTATATA----------C---TGAGCCAACTCACCTCATCCTACCTTATCATTGT---------------AG-------CA-----------------GGGGGG---------TCATCCCGCTCCAACT--A--C-TA-CGCATTTG-CTCT-CATGTG---------A-------------T-------T-AT-TAAC-GGTGTGACCCACTTTCATCTGAGGTAAATAATTATTATAAT---G-ACTCGTTCTTAT---ATCATT---T-----------TGAC----GGTA-ACCTGTT-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTCT-TAAACGTTTTACCA-------CAA---AAATATTA-GAT---AATA-----CCCTAAAACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTTAAT-ACAATTGGAGTAACTGTATC--CAA-CCTTT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------A-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCAATAA-GA-AA-G-G-G-ATTGATTTTCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--ACC--CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCTATATCT-ATTT-ACA-TTGAAGATGTTT-------A-AAC------TCGTACAGCGTTAATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTATTCTGCATATATTT--CGTAG-TCT---TGACCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CATACCTTTAAGAATGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAA--------T----A--C-CGC-T-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA-G-T----AT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACGAA-TGGACCTTTTATAAAAG-AA--ATGGT---GGATGATCAAT---AG--TAG--A--C-TGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCG-----TACAGAATGTATCC---G----
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAA--------TCGTGGAGGATGGTCAAG---AC--T----ATGC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AA-------ATTTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGatatcgatggtaccatgtgccacattgcgctgtactgacttgtttcattttgtacagggtacctaacagggtatgaaacaatatctaaatccgtagaggcaag
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAG---AC--T----A--TACGC-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGAGTAGAATACAGAATGTATACAAAN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAA----CTATCTCAATACTAAGGC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TTACCCCACTCACCTTCCCCAACCTGGTCATTGT---------------GT-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGTCCCAACTGAG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTGT----------------------T-------A-AT-TAAC-GGTGTGACTCACTTTCATCGAAGGTAAATCATCATTATAAT---G-A--CGTTCTAAaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttttatcaaCATTTTGGC-G-TGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAA-GATAA-G-G-G-ATTATTTTCCAC---CA---GTCATGGTATATT--AA--AATGTGTT----TTTGAAATAAATAACA-AAAGTAGCGTCGGTAC-CTACAAATC-AAATAAAAAG----AAACA-AA-A--A-G--CA-GGTTATAC
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTTACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-GAT-----AGGCTAGTCTGCATATATTT--TGTAG-TCT---TGATTATC--CC--CAACA------CTA--------------A-----------ATAATACTTAAatgtacaagggttatgtgctgttt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaagcattaatgggggactgcataATTA-AAT---TATA-----CCCTGAGATAGAGGAAGC--C---TAA--T----GCTAAGTAAAT-ACAATTGAA--AACAGAATCTACAA-CCTAT--AT-A-------AA-ACAT-G-----G--A-------C-------------C--A---------TTA-----TCTCA--TAATATTGAAGGTGTGGC-G-GGAAAATATCTAGACGAGTCTAtactta
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agTTATTTCTAC---CAACAGCTAT--CATAT---AA--ACTGTGTG----AA-GAAATTAACAACA-GAAATACTGTCGGTTT-ATACAAATT-AAACACAAA---------A-AA-A--A-A--CA-GGTTATAATA--AGTTCATAAAAATCTAATTTGACATTGTAGGATACTtcca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A-------TATTAAATA-TC-CATGTGT-GTTT-TAAACATTTCA--C-------CAAATGAAAGATGA-AAT---ACTA-----CCTTAAGACCAAGGAATTAAT--GTCTAAC----ACCGAATAAATAAAAATCGAAGTAAAGGAATC--CAC-CCTAT--GC-A-------AA-A--a
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAACATGTTGGGTCAGTGTATATG----------T---TGACCCCGCTCACCTTACCCAACCTGTACATTGT---------------GG-------TA-----------------GAGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCTTTTG-CTCT-CATGTGT------ACAGAAAATAACAT--T-------T-AT-TATC-GGAGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTACTATAAA---G-ACTCGTTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----TATA-ACATATA-------TACTAAATA-TC-TGGGTAT-ATTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ACGTATTATAAT----ATA-----CCCTAAGACCAAGGAATC--C--GG----T----ACCAAGTAAAT-AAAAGCGGAGTAACGGTATC--CAA-TATAT--AT-ATATATATAA-A--T-GGACTCG--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATGTATAATATAA-ATTGGCAGTTTAGC-G-GGAAACTAGCAAAATGAGTCCATAAA-GG-AAGG-G-G-GTTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ACTGTG-T----TT-GAAATA-----------------TTGGTAC-CTACAAATCGAAAAGAAAGG----GG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATATCA--GGTTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATCCTT-------A-TAC------TCTCAGAACGTTGGTAACCT----GTGTA---TAATATTCA-ACT-----AGACTAGTCCGCATATCTGT--CGactgac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaATGTTC--CGTAGCTCCAACTGAT-ATC--AT--AGATA------TC----------------GC--------TGTAATGTTTAA-A-------------GATA-GTATAATG--GCCAATTTATA--A-AA-C-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAACAAA-CATACCTTTAAGAAAAT-AA--ATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgatgttccgtagctccaactgatatcatagatatcgctgtaatgtttaaagatagtataatggccaatttataaaaccaaatttaatgatttgataaactgaaacaaacatacctttaagaaaataaatcg
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaaaaacatgttgggtcagtgtatatgttgaccccgctcaccttacccaacctgtacattgtggtagagggtcatcccgccccggctgctacgcttttgctctcatgtgtacagaaaataacatttattatcggagtgacccactttcatcggaggtaaatcattactataaagactcgttctaatatcatttcaactataacatatatactaaatatctgggtatattttaaacgttttaccccaaacgtattataatataccctaagaccaaggaatccggtaccaagtaaataaaagcggagtaacggtatccaatatatatatatatataaatggactcgactcattaatatgtataatataaattggcagtttagcgggaaactagcaaaatgagtccataaaggaagggggttaatttccaccagtcatggcatattaaactgtgtttgaaatattggtacctacaaatcgaaaagaaaggggaaaaaacaggttatatcaggtttgcctatatctatttacatggaagatccttatactctcagaacgttggtaacctgtgtataatattcaactagactagtccgcatatctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgTAAGACAAA-CATACCTATCACACAAG-AA--AGCGTAGAAGACGATCAAG---AC--TAG--A--C-CGT-A-A----T-----------GT---GAAATAAAGTGTCGAATACAGAATGTATC
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatccaATAA-ATTGGCTGTTTGGC-GAGGATAATATCTAGAAGAAATCATA----------------TTTATTTCCAC---CA------ACAGC-TGTT-------TTGTGTG----AT-GAAATAAACAACACAAAATt
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------TTAATATTTATTTGATAA-TTTGGAAGTTTCGC-A-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAT-GG-AA-G-G-G-GGTTATTTCCACCAACA---GATATGGCATA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --A-AA-A-AAA-G-TTGTAA-----------GA-------TTTTGATAAACTGAGACAAA-CAGACATTTTAGAAAAG-AAGCATAGTAG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------TCATCCCGTCCCGTCT-----C-TACCGCCTTTGTTTCTGCATGTGT------GCA-------------tctagtcttta
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agTAGAAGATGATCAAG---AC--TTT--A--C-CGT-A-T----T-----------AA---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCT---G----cataaaaataa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---AGACCCAATTCACCTCACCAAACCTAATCATTGT---------------AA-------TA-----------------AGGGG----------TCATCCCGCTCCGACT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CATGTGT----------------------T-------T-AT-TAAC-GGTGTGACCCACTTTTATCGGCTGTAAATCATTATTGTAAT---G-ACTTATTCTGAT---ATCATT---T-----------CAAC----AATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGT------T-TA-----TTTA-----------AA---AAATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAAATCAACGAATT--T--GT----T----ACCAAGTAAAT-ACAATTAGAGTAACTGTATC--CAG-CTTAT---------------------G-----G--A-------C-------T-----CTCA---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGT-G-GGAAAGTAGCAAGACGAGTTAAAAAA-GT-AA-G-G-GTATTTATTACCAC---CA---GTCATGGCATATT--AT--TTTGAGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCTTCGGCAC-AAACAAATC-AAACAAAAAA----GG--A-AA-A--T-CT-CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCGATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TC---A-AAT-----AGACTAGTCCGCAAATCTTT--TGTAG-TCT---TGACCATC--TC--TGATA------CTA--------------CGC--------TGTAATG-TTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-GA--ATCATTGAAGGTGGTCAAGACAAC--A----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCATAGAATACAGATTGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AA-------ATCTTAATACTTAGGCTGGCa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -------T-----T--A---------TTAATATTTATCAGATAA-ATTGACATTTTCGCTG-AAAAAATAGCGA
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----CTATCTAAATCAATAGGCGGGCCTCCGTAGAGGC
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aggTTAATACTTAGGCTGACCTCCTTAGAGGCaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGTTGGGACAATGTATATG----------C---TGATCCCGCTCACCTCACTCAACCTGATCATTGTTGTGGAAGGGGGAGGGG-------T------------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGACT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-TATATAT----------------------T-------T-AT-TAAT-GTTGTGAACCACTTATATCGGAGGTAAAT---------------G-ATTCGTTCTCAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTGTA-------TAATATATA-TCTAGGTTAT-CTTT-GAAACGTTTTACCC-------CAA---ACATATTA-AAT---AATA-----ATCAAATACCATCGAATC--C--GT----T----ATCAAGTAAAT-AAAATTGGAATAACAGTACC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AA-T-G-----G--A-------C-------TTGCCTC--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCATTTTGGC-C-GG-AAATAGCAAGACGAGTACATAAC-GT-AAGG-G-G-ATCAATTTCCAC---CA---GTCATGCCATATA--AA--ACTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTAGCGCCGGCAC-TTACAAATC-AAATCAAATG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GAATTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGA------------------------------AGAACATTGAC-ATAT----GTGTA------TA---A-AAT-----GGACTAGTCCGCATATCTTT--CGCAG-TCT---TGATCATC--TG--AGACA------CTAG-------------CGCCATATCGGTGTAATGTTTA-------------------------GATT--GCCTA---------------------TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-TAAACATTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGCAGATGGTAACG---ACTAT----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNAATACTATCTTAATACATAGGCTGGCCTTCGTAGaagcca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACTTGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCACTCGCCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGG-----------TCATCCCGCACTTACT--GAGC-TA-CACTTTTG-CTCT-ACTGTGT----------------------T-------T-AT-TAAC-GGTGTGTCTCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTTTTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGT---------------------------------ATA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTCACCC-------AAA---CAATGTTA-TAT---AATA-----ACCAAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCATATAAAC-AAGATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AAGA--T-G-----G--A-------C-------T----------------------TACCT--------C-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGACCATAAAGGT-AA-G-G-A-TTTAATTTCTAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTATT----TT-GAAATAAACAAC--AACGTAATGTGGGCAC-CTACAAACC-AAATAAAAAG----AG--A-AACA--A-A--CG-GGTGATATCA--GGGTTGCTTATATCT-ATTT-ATA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------CTGCAAAACGTTGATAACCT----GTATA---T--CA---A-AAT-----AGACCAGTCCGC--ATCTTT--TATAG-CCT---TGATAATC--TC--CGACACTTGGGCCAACTGATAT------CGC--------TGTAATGTTT-AGA-------------GACA-GTATAATG--GCCT------------------A-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATGAACTGTGGC-------------AAGAAATG-AA--ATTTTAGAAGATTGTCAAA---AC--TAAACA--T-TTT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGGGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCTTAATACTTTGGTTGGCATCCGTGGAGGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTAAACCGCCATTGCTAC---GCGCTTGCTC-AATCAGATCGTT---------------CAAC----GATA-ACCTATAGTA----TACTAAATA-TC-AGGATAT-CTTT-TAA-CGTT--ACCT-------AAA---AAATATTA-TAT---AATA-----ACCTAAGATCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGAAGAT-AAAACTGGTGTAACGGTATC--CAA-TCTAT--AT-A-------AA-A--TTG-----G--A-------C-------T-----C--ACCTCATTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-A-GGGGAATAGCAAGACGAGTCCATAAA-GG-TA-G-G-G-GTTTA------------------ATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGAAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAGGGAAAG--A-AA-A--A-A--C--GGCTGTACCA--GGGTTGCCTA------ATCT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATTACTT----GTATG---T--TA---A-AAA-----ATACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CAT---TGGTCATC--AC--CGACA------CCAGCACCAACTAATATCGC--------TGTAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GTCTATTT---------------------TAAT----------GA-------TTT-GATAAACCGAGACAA-------------GAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---ACAAT----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAAAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA-------ATCTTAATCTTTAGGCTGGCCTCCGCAGAGa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tACAACGTATATG----------C---TGACCCTGCTCACCTCATACAACCTGAACATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCTGCCCCGGCT--G--C-TA-CACATTTG-CTCT-TATGTGT------ACAGAATATCACG---T-------TGAT-CAAC-GGTGTGACCCACTTTCATCAGAACTAAATCATCATTAAAAA---G-ATTCGGTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTATATCATAAGTACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAATATTTTATCC-------CAA---ACATATTA-AA-------A-----CCCCAAGACCAACGAATC--T--GT----T----AACAAGTAAAT-ACAACTGGAGTAACGGTATC--CGA-CCTAT--AT---------AC-C--T-C-----A--C-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTTGCAGTATTGC-G-AGAAAATGGCCAGACGAGTCCATAAA-GG-AA-G-G-G-----------------G---ATCACAGCAGATT--CA--ATTATATT----TT-GAAATAAACAACA-AACGTACAGTCGGCAC-CTACAAATT-AAGCAAAATG----AA--A-AA-A--------A-GGTTATACGA--AGTGTATCTATATCT-ATTT-ACA-CAGAGGATGCAT-------A-CAA------TCGCAGATCGATAATACCCT----GTGTA---T--TA---T-AAT-----AGACACATCCGCATATCTTT--CGNNN-NNN---NNNNNNNN--NN--NNNNN------NNN--------------NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTATGACC-GTTCAATAGCGCCAACTGATAACA-AA-A-TAA-G-TT-CAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTATAATAAATG-AA--
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): ATCACCCGTAAAAGTTTAATATTTGAAACACCAATTGCTGCATTCTGGTTTAGTGAGTGTTAAAGATAAAACCGAAAGTCAATAAAAATAAAACACCGACCGCATTTCAAAGCTTTGTTGAATAATTAATTTGTAAATTGCAAATGGCTTTGATTAACATCTCTTTGTTGATATACCATACATCTGAAATGTTTTATCCTGTAATAAACATTCCAGTTCGTGAATGGTTGTCAAAAATTCACTCATACACAACAGTTTACAATGTGGCAAACACTGGGATCGCTGCCGTCAGGAAGAAT
Unaligned ( gi|24 ): GATCGCCCGTAAATTTTATTATTAAGACACCAAACTCCTGCATTCTATATTCTAGTGAGTGTGTATGATAAAACAAGCTAATCTGTTACATCATACACCGAAAGTCCATCAAACAACCACTGCATTAATGCTTGAGCGAATTAACATTTGTAACATGCACGCAACTCTGATTAACATCTTATTGTATGTTACCCTGTCTAGTTCATTCCAGTTAATGAATGGTTGTCTGAAATTCATTCATCTGCAATTATTTACAACATCACAAGCATTGGATTCTTTGCAGTCATAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): ACCTAATCTTGTTTACGATAATATCGAAAGGCAATCACTCAATCCCTTTTAAAACTTGTGAATAAACACTTTATAAATTGCACATACCTCTGATTAGCATATCATTGTATGGATATAACATACATTTAAACTGTGTTAATCTGTCAAAAGCATTCCCATTCGTGAATGGTTGTCTAAAATTCACTCA
Unaligned ( gi|40 ): AATATTTAAAATATTATTTCTGCATTCTTCATTCTAGTAAGTGTTTAAGATATAACAGGCTTCAAATGAGGTACCTCTTACGCACTGAAAATCCATAAAAAAACTTGCATACAACTCTGAATAAAATCT
Unaligned ( gi|44 ): TGTCCGTTACTCTTGTCGTTGTTTATGAATGGTTATCGTTATCTGAAATACACTCATACACAAATGTTTACAATGTCACAAGC
Unaligned ( gi|45 ): ATTGTCCAATAGCGCCAACTGATATTGCTGAACATTAGAAAGTAAGATTTGAAAAACTGAGATAAATATACATTTTAGAAA
Unaligned ( gi|49 ): AGACAAAAAAAATACCACCAAGCCCTTTCTTCTGATACCAAAACAACAATTA
Unaligned ( gi|50 ): GTAACGATGGTAGATCTATTACTTTTCTTTTTACTATTACGCTCAACCGA
Unaligned ( gi|54 ): ATGATGATTCATCTTAATATTATCAGTGACACATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1111111111                                      111111111111111  11111111111111111111111111     1111111111                                                 666666666666666666666666666666666666666                                                                              222222222222222                    1111111                                                                                                      111111111                                                            11            3333333333333333333333333333333333                                                                                                                         1111                                                     111111111                                                                 1111111                                                                                                                           33333333333333                      2222222222222222                                                1111111111  1111111                                                                   2222222222                                                                222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222      11111                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     0000000000 444          1                1      444444444444444  77777777777777777777777777     2222222222             0  33 33 2  2        2    2  33     444444444444444444444444444444444444444   66666                                            444 2            555   1  000000000000000    77777   2  0 6  3333333         2  2   1   44   2              8888888   444 1      2   6666   66666                  33 33  111111111           2 1      33    2     33   2     33 33 7777777  2 00 2 55555 33 0000000000000000000000000000000000                  2              2 2                            7  7 2 5 22  1        777  333             66  33        0000  2             2      1         2         2         666666666 2  2 33 2 55  2          33  1  0         2    2   2            0000000 2   666666          1         4444     333 33  333 2   55555                    33     2   555        33  33     888888   55555555555555   88888888           6666666666666666    2        22        0  44 2  2 4   1 1  1    6666666666  3333333   2               44                 1  22                   333  7777777777 1   1 1 3333 88888888888  333                              333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  33  00000                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .......... ...          .                .      ...............  ..........................     ..........             .  .. .. .  .        .    .  ..     .......................................   .....                                            ... .            ...   .  ...............    .....   .  . .  .......         .  .   .   ..   .              .......   ... .      .   ....   .....                  .. ..  .........           . .      ..    .     ..   .     .. .. .......  . .. . ..... .. ..................................                  .              . .                            .  . . . ..  .        ...  ...             ..  ..        ....  .             .      .         .         .         ......... .  . .. . ..  .          ..  .  .         .    .   .            ....... .   ......          .         ....     ... ..  ... .   .....                    ..     .   ...        ..  ..     ......   ..............   ........           ................    .        ..        .  .. .  . .   . .  .    ..........  .......   .               ..                 .  ..                   ...  .......... .   . . .... ...........  ...                              ... ...........................................................................  ..  .....                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     9999999999 444          9                0      777777777777777  33333333333333333333333333     6666666666             1  22 22 4  4        4    4  22     666666666666666666666666666666666666666   77777                                            777 7            444   1  444444444444444    33333   9  7 6  3333333         7  7   5   33   7              7777777   777 0      5   4444   22222                  77 22  000000000           2 6      11    9     11   2     11 66 2222222  2 66 4 99999 22 4444444444444444444444444444444444                  4              2 2                            5  5 5 0 99  8        888  999             55  22        0000  4             4      9         4         4         444444444 4  4 22 4 66  2          22  0  4         2    2   2            9999999 4   888888          8         7777     999 11  999 2   66666                    22     9   000        99  77     222222   33333333333333   11111111           8888888888888888    1        99        1  88 0  0 0   9 9  9    5555555555  0000000   0               22                 7  33                   222  7777777777 8   8 8 9999 66666666666  222                              777 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888  44  44444                                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT--ACAG--AA----A-A----A-------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGG-AA-G-G-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
Reference ( family-293 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT--ACAG--AA----A-A----A-------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGG-AA-G-G-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTAGGACAACGCATATG----------C---TGACTCCGCG----------AACCTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGAG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TATGT--ACAG--AA----A-A----A-------TAAAATT-T-ATT-----AACGGTGTTACCCAAGTTCATTGAAGGTAAATCAACATTATAAT---G-ATTCATTCTAAC---ATCGTT---T--------------------ATATACAT-TG-------TATTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TTAACGTTTTACCC-------CAA---ATATATTA-AAT---TATAGGCTACCCTAAGACCAACGAATC--C--GC----A----ACTAAGTAAAT-GAAATTGT--TTACGGTTTT--TAAACCTAT--AT-A-------AA-AA-T-G-----G--AATCACCAT-------T-----C--A---------TTAATAATTATTAGATAC-TTTGGCAGTTTGGC-G-GAAAAA-AACAAAACTAGTCTATAAAGG-AA-G-GAG-ATTTATTTGCAT---CA---ATCATGGCATATTTAAA--AGTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-AAAGTACCGTCAGAAT-CTACAAATA-AAACAACAAC----AATAA-AA-A--A-A--CA-GGT-----CA--AGTTTGTCTATATCT-ATTT-ATA-TAGAAGATACTT-------T-TAT------TCGCTGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--CA---A-AAT-----AGAATAGTCCGCATAGCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--AC--AGACA------C
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caa--------------CAC--------TGTACTGTTTACGG-------------AAC--GTACAGTG--ACCTATTTTTA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAATAAA-CAGACCTTTAAGGAAAA-AA--ATCGTAGGAGATGGCCAAG---CC--T----A--T--------------------------------ATAAAGCGTAGAATACAGAGTGTTTCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTATCCTAATACTAAGGCTGGCCTCCGTAGAGGCttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttatcactgtactgtttacggaacgtacagtgacctatttttaaaaacaaatttaatgatttgataaactgaaataaacagacctttaaggaaaaaaatcgtaggagatggccaagcctatataaagcgtagaatacagagtgtttccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctatcctaatactaaggctggcctccgtagaggc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                  caaaatacatgttaggacaacgcatatgctgactccgcgaacctaatcattgtggtagggagtcatcccgccccggctgctacgcctttgctctcatatgtacagaaaaataaaatttattaacggtgttacccaagttcattgaaggtaaatcaacattataatgattcattctaacatcgtttatatacattgtattaaatatcagggtatctttttaacgttttaccccaaatatattaaattataggctaccctaagaccaacgaatccgcaactaagtaaatgaaattgtttacggtttttaaacctatataaaaatggaatcaccattcattaataattattagatactttggcagtttggcggaaaaaaacaaaactagtctataaaggaaggagatttatttgcatcaatcatggcatatttaaaagtgtgataaaattgaaataaacaacaaaagtaccgtcagaatctacaaataaaacaacaacaataaaaaaacaggtcaagtttgtctatatctatttatatagaagatacttttattcgctgaacgatgataacctgtgtatcaaaatagaatagtccgcatagctttcgtagtcttgatcatcacagacacttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttat--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------TTACCTC--A---------TTAATAATTGTTAGATAA-ATGGGCAGTTTGGC-T-GGAAAATAACAAGACGTGTCCATAAAAG-AA-TTG-G-ATTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AATTATTATGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAGGTGCTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----GG--A-AA-A--A-AACTA-GGTTATACCA--AGCTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-AGGAGGATGCTT-------A-CAT------TCGCAGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--TG---A-AAT-----AGACTCATGTGCATAGCTGT--CG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --------TATAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-AAAAG-AT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAGCTGAGACAAAATGGACCTTAAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCGAG---AC--T----ATAC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATATATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCATAATATTAAGGCTGGCCTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggatataatgtttagagacagtataatggcctatttataaaaaaaaagattaatgatttgataagctgagacaaaatggaccttaaagaaaagaaatcgtagaagatggtcgagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatatatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcataatattaaggctggcctccgta
gi|11                         :                         gtgaccaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagataaatgggcagtttggctggaaaataacaagacgtgtccataaaagaattggattaatttccaccagtcatggcatattaattattatgttttgaaataaacaacaaaggtgctgtcggcacctacaaatcaaacaaaaagggaaaaaaactaggttataccaagcttgcctatatctatttacaaggaggatgcttacattcgcagaacgatgataacctgtgtattgaaatagactcatgtgcatagctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggaAATACATGTTGGGACAGCGTATATT----------C---TGACGTTACTCTCCTCACCAAACCTGAACATTGT---------------GG-------TAAGGTGGGGGGTGGTGGTGGGGG----------TCATTCCACCCAAGCT--G--C-TA-CGCTTTTA-CTTT-GA--TGTGT--ACAG--AAT---ATA----ACAT----T-------T-ATT-----AACGGTGTTAACCAATCTCATCAGAGGTAATGTATCATTATAAA---G-A
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATAAAGAA-AA--AT-GTAGAAGATGATCAAG---AC--TGT--A--C-CAT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATGCAGAATATATTC---G----aaaatgtagaagatgatcaagactgtaccatattgtaaaataaagcgtagaatgcagaatatattcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                         tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatacatgttgggacagcgtatattctgacgttactctcctcaccaaacctgaacattgtggtaaggtggggggtggtggtgggggtcattccacccaagctgctacgcttttactttgatgtgtacagaatataacatttattaacggtgttaaccaatctcatcagaggtaatgtatca----GATA-ACCTATA-------TACCAAATA-TC-AGGATAT-ATTT-TAAACATTTTACCCATTTTTCCAA---AAATGTTA-AAT---AATA-----CTCTAAATCCAACGAAAC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGTATAACTGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----A--A-------C-------T-----CTCA---------TAAATTTTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGCT-G-GGAAAATAGTAAGACAAGTCCAAAAAGA-AAAG-G-G-ATTGATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCATCAGCAC-CTACAGATC-AAAC-AAAAG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACA-----------------GTGTA---T--TT---A-AAT-----AGACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CCT---TGATCATC--TC--CAACA------CTA--------------CAC--------TGTA------------------------ACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAG---ACTAT----A--C-TGC-A-T----T-----------TT---GAAATAAAGCATAAAATACAGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tATTTCCAA---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----AT-GAAATAAACAACG-ACAGTACCGTTGGCAC-ATACAAATA-AAACAAA-------AG--A-AA-ATTA-A--CGTGGTTATACCATTAGTTAACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-CAT------GCGCAGAATGATGATAACCTGCAAGTGTA---A--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTC--CGTAG-TCT---TGATAATT--TC--TGACA------Cagagtcagattttga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       a--------------CGC--------TGTAATATTTA-GA-------------TACA-GTATAAAA--GTCTATTGATA--A-AA-AACAA-G-CT-TAATTTAG------GAAATAACATTT-GATTAACTGAGACAAA-CAGACCGTTAAAAAAAGGAA--ATGGTAGAAGATGATCAAG---AC--T----ATAC-CGTCA-C----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGCttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatcgctgtaatatttagatacagtataaaagtctattgataaaaaacaagcttaatttaggaaataacatttgattaactgagacaaacagaccgttaaaaaaaggaaatggtagaagatgatcaagactataccgtcactgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcttaatacttaggctggcctctgtagaggca
gi|14                         :                                                                                                                                                                      aatttccaacagtcatggcatattaaattgtgttatgaaataaacaacgacagtaccgttggcacatacaaataaaacaaaagaaaattaacgtggttataccattagttaacctatatctatttacatggaagatgcttacatgcgcagaatgatgataacctgcaagtgtaataaaatagactagtccgcatatcttccgtagtcttgataatttctgacacttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatTGGGACAACGTATATT----------C---TGACCCC-CTCACCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------CA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCAATT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CG--TGTGT----------------------------------------TT-----A--GGTGTGACTCACTTTCATCGGAGGTAAATCGTCATTATAAT---G-ACTGGTTCAAAT---ATCGTT---------------CAAC----GGTA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAAGGTTTTACCC-------CAA---AGATATTA-AAT---AATA-----CCATAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAA-TTAGAGTAACTGTATC--CAA-CCCAT--AT-A-------AA-A--T-A-----G--A-------C-------C-----C--C------------ACCCCCATT-GATA---TTGGCAGTTAGGC-G-GGAAAATAGCAAGATGAGTCCATAAAGGTAG-G-G-G-GTCAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATTTT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAACAAACAACA-AAAGTAGTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--AGGG-A--A-A--AA-GGTTATACTA--GGGTTAACTATGTAT-AGTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATAACAT----GTGTA---T--AA---A-AAT-----Aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATGTGACCAA-TTTCATTGGAGATAAATCATCATTATAAT---G-TCTCGTTCTAGA---ATTATT---TAACTAAGATAATAACTGAAAATA-ACATTAA-------TAACGAATACTC-AGG-TAT-CTTCGTG--CATTATACCC-------CAA---AAAGGTTA-AAT---AATG-----CTC--ACACCAAGAAATC--CTTGT----TTAAGATCAAGTAAAT-A---------TGAC-----C--TGA-CCT------------------------------------------------T-----C--A---------TTAATGTGTAATAGATAA-ATTGGCAGTGTGGC-G-GGAAAAAAGCAAGACGAGTT----------------G-ATTTATTTCGACTAACG---GCTATGACATAAT--AA--ACAGTGCT----TT-GTAAGAAACG-CA-AACGTATCGTCGGCACACTATACA-C-ATACAATAA-----------------A-A--CA-GGTTATTCTA--AGATTACCTATATAT-TTTT-GCA-TGGAAAATATTTCAAAACCACTGC------TAGTAGAACAATGATAATCT----GTATA---C--TA---A-A-T-----GGACGATCCCGCATATCTTT--CGTTG-TCT---TGATCATC--TT--TGACtag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAC-ATAAAAATA-AAACACATAG----G-----------A-A--CA-TGTTAAACTA--AGTTTACCTATATAT-GTTT-ACA-TGGAAGATGCTTCG-----A-AACTTCCATTCGCAGAACGATGACAATCT----GTAT----T--TT---A-TAT-----GGACGAGTCTGCAAACCTTT--CGgagtgcttatatataccaataaactggctatcgttctgacagcaagcacaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --------------CGC--------TGTTATGTT-AACC-------------AACACGTGTAACG--GTATATTTATAC-A-GA-A-CAT-GCTT-TAATTGAGAAGTAAGA-------TTT-GATAAACTGAGACTAT-CAGACCTTTTAGAAAAG-AA--AGCGTAGACAATGAGTAAG---AC--TCG--A--C-CGT-AGT----TATTTATATATAGT---AAAATAAAGCGTCAAAAACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA--AAA----CTATCTAAATACATAGACTGGCCTCCATAGAGGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatcgctgttatgttaaccaacacgtgtaacggtatatttatacagaacatgctttaattgagaagtaagatttgataaactgagactatcagaccttttagaaaagaaagcgtagacaatgagtaagactcgaccgtagttatttatatatagtaaaataaagcgtcaaaaacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaactatctaaatacatagactggcctccatagaggcaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                       cacataaaaataaaacacataggaacatgttaaactaagtttacctatatatgtttacatggaagatgcttcgaaacttccattcgcagaacgatgacaatctgtattttatatggacgagtctgcaaacctttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatAATATATATGGGGACAACGTGCATA----------CATATGGCACTGCTTATCTTACCCAACCTGAGCATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGG----------TCCACCCACCGCGTCT--C--C-TG-TGCCTTTG-CTTT-CA--AATGA--ACAG--AA----A-AT---A-------G-------C-ATTTATAAAAAGACGCAACCCGATTTCATCGGAGGAAAATCATCATTGTAATGGCG-ACTCGTTCTAAC---ATTATTAGCT-----------TAAC-----AGA-ACAT-TA-------TATTACATA-T--AGA-------TT-CAAACA--ATACCC-------TAA---ATA----A-AATTTGAGTA-----CCaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaTAAAT-AAAATTTGAGTACCGGTATC--CAA-CCTATGCAA-A-------AA-A--T-G-----G--ACCTGTTCC-------T-----C--A---------TTAAggtatccaacctatgcaaaaaatggacctgttcctcattaa
gi|18                         : aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaaatatatatggggacaacgtgcatacatatggcactgcttatcttacccaacctgagcattgtgggagggggtccacccaccgcgtctcctgtgcctttgctttcaaatgaacagaaaatagcatttataaaaagacgcaacccgatttcatcggaggaaaatcatcattgtaatggcgactcgttctaacattattagcttaacagaacattatattacatatagattcaaacaatacccAATAAATGTTGTGACAATATATATATATATATATAC---TGGCCCCGCCAAACTCACCCAAACTGTACATTGC---------------GG-------GA------------------GAAG----------TCAATCCGCCCCGTC---A--CATA-CGCCTTTG-CTTT-CA------T--ACAG--AA----G-A----
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtatcatttctttccattcaaatcgtttgttttaatgtttttttgtagagcctgagtgaattaccaatgcgtaaacattgttaaatttctaataacaccttattgtacgcatgtaccgtaaaccctgtcaaaataatctagtgaatgaatggttgtcttgaattcattcttacacagttgtttacagtattatcactagtactggattcggtgtggccaggaatacttagtgtatcctgtacagtgttaatatatctcttgcagctacatcgtttatttacacggttttaatgaaCATAACGATGATAATCT----GTATA---T--TT---A-CTT-----AGACTAGTTCGCATATCTTC--CATAT-TCC---TGATCATC--TT--CGATA------taat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --------------CGC--------TGTTATGCTTAC-A-------------GGCA-GAATAGCA--GC--ATTT-TA--ATAACA-CAA-G-TT-TAATTTT-------GAAATTAGTTTT-GATAAACTTACACAAT-CAGACCATTCACAAAAG-AA--ATCGCAGAAGATGATCGAA---ACCAC----A--C-CAT-A-T----T------------TAAAAAAACAAAAC----AATACTGGATGCATCattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatcgctgttatgcttacaggcagaatagcagcattttaataacacaagtttaattttgaaattagttttgataaacttacacaatcagaccattcacaaaagaaatcgcagaagatgatcgaaaccacaccatatttaaaaaaacaaaacaatactggatgcatcggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cataacgatgataatctgtatatttacttagactagttcgcatatcttccatattcctgatcatcttcgataattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatAATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACTCCGCTAACCTCACCCAGCTTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATTCCGTCCCGGGT--G--C-TA-CGCATTGG-CTCT-CA--TATGT--ACAG--AA----A-A----AATAAAATT-------T-ATT-----AACGGTGTGAGCCGCTTTCATTGAAAGTAAATCACCATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACGTATA-------TAGTAAATA-TC-AGGATATACTTT-T-AACGTTTTACCC-------CAA---ATATATTA-AAT---TATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACTAAGTAAAT-TAAATTGTGGTAACGGTGTC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AACT-C-----ACCA-------T-------T-----C--A---------TTAATAATTATTAGATAA-TTTGGCAATTTGGC-G-GG-AAATAACAAGACTAGTCTATTAAGG-AA-G-GCG-GTTAATTTGCAT---CA---GTCATGGCATATTTAAA--ATTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-CAAGTTCCGTCGGCAC-CTTCAAAT--AATTAAAA----------A-AA-A--A-C--CA-GTTCATAACA--GGTTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGGAGATGTTT-------A-CAT------TCGCTGGACGATGACAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcgaC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-TCACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------AA-------T-----------GAGATAAA-CATACCTTTAAGAAAAA-AA--AT-GTAGAAGATGGCCAAG---AC--T----ATAC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTAACTTGATACTTAGGCTGGCCTCCtgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctctgtaatgtttagggacatcacaatgacctatttataaaaacaagtttaataatgagataaacatacctttaagaaaaaaaatgtagaagatggccaagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctaacttgatacttaggctggcctcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcgaaatacatgttgggacaacgtatatgctgactccgctaacctcacccagcttaatcattgtggtagggggtcattccgtcccgggtgctacgcattggctctcatatgtacagaaaaaataaaatttattaacggtgtgagccgctttcattgaaagtaaatcaccattataatgactcattctaacatcatttcaacgataacgtatatagtaaatatcaggatatacttttaacgttttaccccaaatatattaaattataccctaagaccaacgaatccgttactaagtaaattaaattgtggtaacggtgtccaacctatataaaaactcaccattcattaataattattagataatttggcaatttggcgggaaataacaagactagtctattaaggaaggcggttaatttgcatcagtcatggcatatttaaaattgtgataaaattgaaataaacaacacaagttccgtcggcaccttcaaataattaaaaaaaaaccagttcataacaggtttgcctatatctatttacatgggagatgtttacattcgctggacgatgacaacctgtgtattaaaatagacttgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctC--TGATA------TCA--------------C----------TGTA-TATTTA-GA-------------GACA-GTACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-AACAA-T-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAA--CAGACCTTTACGAAAA-------TCAAAGAAAATGGCCAAG---AC--T----ATAC-CGA-A-T----T-----------GT---AAAATAATGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTGTCTTAATACTAAGGCTGGCTTACGTAGAGG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atatcttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgatcgttcaaaagcgccaaAATACATGTTAGGAAAACGCATATG----------C---TGATTTCGCTAATCTCACGCAACCTTATCATTGC---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCGTCCCTCCCCGGCT--G--C-TG-CGCCTTCG-CTAT-CA--TATAT--ACAG--AA----A-A----AAA-----TAAAAAAAT-GCT-----AACGTTATGACCAACTTTCACCGA------------ATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGAAT-CGTG-TTCACGCTTTACCC-------TAA---ATATATTA-AAT---TATA-----TGCTAAGACCATCTTATC--C--GT----A----ATTAAGTAAAT-GGAATTGTTGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--ATAA-------AA-A--T-G-----G--A-------CTCACCATT-----C--A---------TTAATATT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttaatcaa-GTATAATG--ACCTTTTTATA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTTTAAGAAAA--AA--ATCGTAGAAGATGGCCAAG---ACTTT----A--T-CGA-T-T----T-----------GT---A-------------AATACAGAATGTTTAC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTATCATAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cttgcttttctataagataaacatccacttacgatcgttcaaaagcgccaactgatatcactgtacaat--------------CGC--------TGTACTGTTTA-GA-------------TACA-GTATAATG--GCCTATTTAT-----AA-A-TAA-G-TT-aggc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAA-----------------T----A--C-TGT-A-C----G-----------TT---AAAATAGATTGTA-------GACTATA-----------CAGAAGGTATCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN----NNNTCTTAATACTTAAGCTGGTCTCCGTAAAAGCaagaaaggaaatcgtagaatactgtacgttaaaatagattgtagactatacagaaggtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttaatacttaagctggtctccgtaaaagcaagcc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatcgctgtactgtttagatacagtataatggcctatttataaataagAACATATGTAGGATCAACGTATATA----------C---TGACCCCGCTGACCTCATCCAAACTGAACATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------ACACCCCG-CTCGGCT--G--C-TA-CGCATTTG-CCTT-CATGTGTGT--ACAGACAA----A-A----A-------A-------T-A----------GATGTGACACAATTTCATCGGCGGTAAATTAACATTaagcc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttcattcacaattgtttacaatgatttactgccggaataattagtgtgcctgtctagtgttttaagtatctggcagctacgccgctattttacaagtctttaccaaAGA-------------AACT-TTATAAT--------TTTA-A--G-AA-A-AAA-G-----AAT---------------------T-GATATACTGAATCAAA-TCGACATTTTAGAAAAG-AA--AGCATAGAAGATGATCGAG---AC--TAG--A--C-TGT-A-TGTTCT-----------GC-------CAAAGTGTAAAAATCAGAATGTATGC---G-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--AAG----CTATCTAAATACATAGGCTGGCCTCCATAGAGGC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatcatgaatgtagagatacatA-GGTCATAACG--AGTTTGCCTATATAT-GTTT-ACA-TAGAAGATGTTT-------A-CAT------TCGCCGAACGATAATTACCT----GTGTAGTCT--TG---ATCATCACCGACACTTG-CTGTATAACATAAACGTCC-TCT---T-ACCACCGTTCAACAACG------CCAACTGATAT------CAC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-GTACAATA--ACTTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GCTAAACTGAGGTAAA-CAGACCTTCAAGAAAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACAAGTTGGGACCACGTATATG----------C---TGGTCCCGC--------------CTGAACATTGC---------------GGGGGTGGGTG-----------------GGGGGGGGGGGGGGATTATCCCGTCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGC--GCAG--AA----A-AT---AACAT---T-------T-ATT-----AAAAGTGTGACC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgcagctacaccgtttttttttatcaa--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------TTACCTC--A---------TTAATAATTGTTAGATAaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         tgcagctacaccgtttttttttatcaaaatacaagttgggaccacgtatatgctggtcccgcctgaacattgcgggggtgggtgggggggggggggggattatcccgtcccggctgctacgcctttgctctcatgtgcgcagaaaataacatttattaaaagtAATACATATTGGGACAACGTATATA----------C---TGAGCCAACTCACCTCATCCTACCTTATCATTGT---------------AG-------CA-----------------GGGGGG---------TCATCCCGCTCCAACT--A--C-TA-CGCATTTG-CTCT-CA--TGTG----------------------A-------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCTGAGGTAAATAATTATTATAAT---G-ACTCGTTCTTAT---ATCATT---T-----------TGAC----GGTA-ACCTGTT-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTCT-TAAACGTTTTACCA-------CAA---AAATATTA-GAT---AATA-----CCCTAAAACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTTAAT-ACAATTGGAGTAACTGTATC--CAA-CCTTT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------A-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCAATAAGA-AA-G-G-G-ATTGATTTTCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--ACC--CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCTATATCT-ATTT-ACA-TTGAAGATGTTT-------A-AAC------TCGTACAGCGTTAATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTATTCTGCATATATTT--CGTAG-TCT---TGACCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CATACCTTTAAGAATGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAA--------T----A--C-CGC-T-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA-G-T----AT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACGAA-TGGACCTTTTATAAAAG-AA--ATGGT---GGATGATCAAT---AG--TAG--A--C-TGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCG-----TACAGAATGTATCC---G----
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAA--------TCGTGGAGGATGGTCAAG---AC--T----ATGC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AA-------ATTTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGatatcgatggtaccatgtgccacattgcgctgtactgacttgtttcattttgtacagggtacctaacagggtatgaaacaatatctaaatccgtagaggcaag
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAG---AC--T----A--TACGC-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGAGTAGAATACAGAATGTATACAAAN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAA----CTATCTCAATACTAAGGC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TTACCCCACTCACCTTCCCCAACCTGGTCATTGT---------------GT-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGTCCCAACTGAG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT-----------------------------T-------A-ATT-----AACGGTGTGACTCACTTTCATCGAAGGTAAATCATCATTATAAT---G-A--CGTTCTAAaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttttatcaaCATTTTGGC-G-TGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGATAA-G-G-G-ATTATTTTCCAC---CA---GTCATGGTATATT--AA--AATGTGTT----TTTGAAATAAATAACA-AAAGTAGCGTCGGTAC-CTACAAATC-AAATAAAAAG----AAACA-AA-A--A-G--CA-GGTTATAC
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTTACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-GAT-----AGGCTAGTCTGCATATATTT--TGTAG-TCT---TGATTATC--CC--CAACA------CTA--------------A-----------ATAATACTTAAatgtacaagggttatgtgctgttt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaagcattaatgggggactgcataATTA-AAT---TATA-----CCCTGAGATAGAGGAAGC--C---TAA--T----GCTAAGTAAAT-ACAATTGAA--AACAGAATCTACAA-CCTAT--AT-A-------AA-ACAT-G-----G--A-------C-------------C--A---------TTA-----TCTCA--TAATATTGAAGGTGTGGC-G-GGAAAATATCTAGACGAGTCTATtactta
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agTTATTTCTAC---CAACAGCTAT--CATAT---AA--ACTGTGTG----AA-GAAATTAACAACA-GAAATACTGTCGGTTT-ATACAAATT-AAACACAAA---------A-AA-A--A-A--CA-GGTTATAATA--AGTTCATAAAAATCTAATTTGACATTGTAGGATACTcca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-------TATTAAATA-TC-CATGTGT-GTTT-TAAACATTTCA--C-------CAAATGAAAGATGA-AAT---ACTA-----CCTTAAGACCAAGGAATTAAT--GTCTAAC----ACCGAATAAATAAAAATCGAAGTAAAGGAATC--CAC-CCTAT--GC-A-------AA-A--a
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAACATGTTGGGTCAGTGTATATG----------T---TGACCCCGCTCACCTTACCCAACCTGTACATTGT---------------GG-------TA-----------------GAGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCTTTTG-CTCT-CA--TGTGT--ACAG--AA----A-ATAACA-------T-------TTATT-----ATCGGAGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTACTATAAA---G-ACTCGTTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----TATA-ACATATA-------TACTAAATA-TC-TGGGTAT-ATTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ACGTATTATAAT----ATA-----CCCTAAGACCAAGGAATC--C--GG----T----ACCAAGTAAAT-AAAAGCGGAGTAACGGTATC--CAA-TATAT--AT-ATATATATAA-A--T-GGACTCG--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATGTATAATATAA-ATTGGCAGTTTAGC-G-GGAAACTAGCAAAATGAGTCCATAAAGG-AAGG-G-G-GTTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ACTGTG-T----TT-GAAATA-----------------TTGGTAC-CTACAAATCGAAAAGAAAGG----GG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATATCA--GGTTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATCCTT-------A-TAC------TCTCAGAACGTTGGTAACCT----GTGTA---TAATATTCA-ACT-----AGACTAGTCCGCATATCTGT--CGactgac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaATGTTC--CGTAGCTCCAACTGAT-ATC--AT--AGATA------TC----------------GC--------TGTAATGTTTAA-A-------------GATA-GTATAATG--GCCAATTTATA--A-AA-C-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAACAAA-CATACCTTTAAGAAAAT-AA--ATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgatgttccgtagctccaactgatatcatagatatcgctgtaatgtttaaagatagtataatggccaatttataaaaccaaatttaatgatttgataaactgaaacaaacatacctttaagaaaataaatcg
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaaaaacatgttgggtcagtgtatatgttgaccccgctcaccttacccaacctgtacattgtggtagagggtcatcccgccccggctgctacgcttttgctctcatgtgtacagaaaataacatttattatcggagtgacccactttcatcggaggtaaatcattactataaagactcgttctaatatcatttcaactataacatatatactaaatatctgggtatattttaaacgttttaccccaaacgtattataatataccctaagaccaaggaatccggtaccaagtaaataaaagcggagtaacggtatccaatatatatatatatataaatggactcgactcattaatatgtataatataaattggcagtttagcgggaaactagcaaaatgagtccataaaggaagggggttaatttccaccagtcatggcatattaaactgtgtttgaaatattggtacctacaaatcgaaaagaaaggggaaaaaacaggttatatcaggtttgcctatatctatttacatggaagatccttatactctcagaacgttggtaacctgtgtataatattcaactagactagtccgcatatctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgTAAGACAAA-CATACCTATCACACAAG-AA--AGCGTAGAAGACGATCAAG---AC--TAG--A--C-CGT-A-A----T-----------GT---GAAATAAAGTGTCGAATACAGAATGTATC
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatccaATAA-ATTGGCTGTTTGGC-GAGGATAATATCTAGAAGAAATCAT---------------ATTTATTTCCAC---CA------ACAGC-TGTT-------TTGTGTG----AT-GAAATAAACAACACAAAATt
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---------TTAATATTTATTTGATAA-TTTGGAAGTTTCGC-A-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAATGG-AA-G-G-G-GGTTATTTCCACCAACA---GATATGGCATA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --A-AA-A-AAA-G-TTGTAA-----------GA-------TTTTGATAAACTGAGACAAA-CAGACATTTTAGAAAAG-AAGCATAGTAG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------TCATCCCGTCCCGTCT-----C-TACCGCCTTTGTTTCTGCA--TGTGTGCACAT--AA----A-A----A-------T-------tctagtcttta
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agTAGAAGATGATCAAG---AC--TTT--A--C-CGT-A-T----T-----------AA---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCT---G----aa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---AGACCCAATTCACCTCACCAAACCTAATCATTGT---------------AA-------TA-----------------AGGGG----------TCATCCCGCTCCGACT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT-----------------------------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTTATCGGCTGTAAATCATTATTGTAAT---G-ACTTATTCTGAT---ATCATT---T-----------CAAC----AATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGT------T-TA-----TTTA-----------AA---AAATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAAATCAACGAATT--T--GT----T----ACCAAGTAAAT-ACAATTAGAGTAACTGTATC--CAG-CTTAT---------------------G-----G--A-------C-------T-----CTCA---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGT-G-GGAAAGTAGCAAGACGAGTTAAAAAAGT-AA-G-G-GTATTTATTACCAC---CA---GTCATGGCATATT--AT--TTTGAGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCTTCGGCAC-AAACAAATC-AAACAAAAAA----GG--A-AA-A--T-CT-CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCGATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TC---A-AAT-----AGACTAGTCCGCAAATCTTT--TGTAG-TCT---TGACCATC--TC--TGATA------CTA--------------CGC--------TGTAATG-TTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-GA--ATCATTGAAGGTGGTCAAGACAAC--A----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCATAGAATACAGATTGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AA-------ATCTTAATACTTAGGCTGGCa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -------T-----T--A---------TTAATATTTATCAGATAA-ATTGACATTTTCGCTG-AAAAAATAGCGA
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----CTATCTAAATCAATAGGCGGGCCTCCGTAGAGGC
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aggTTAATACTTAGGCTGACCTCCTTAGAGGCaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGTTGGGACAATGTATATG----------C---TGATCCCGCTCACCTCACTCAACCTGATCATTGTTGTGGAAGGGGGAGGGG-------T------------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGACT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-TA--TATAT-----------------------------T-------T-ATT-----AATGTTGTGAACCACTTATATCGGAGGTAAAT---------------G-ATTCGTTCTCAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTGTA-------TAATATATA-TCTAGGTTAT-CTTT-GAAACGTTTTACCC-------CAA---ACATATTA-AAT---AATA-----ATCAAATACCATCGAATC--C--GT----T----ATCAAGTAAAT-AAAATTGGAATAACAGTACC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AA-T-G-----G--A-------C-------TTGCCTC--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCATTTTGGC-C-GG-AAATAGCAAGACGAGTACATAACGT-AAGG-G-G-ATCAATTTCCAC---CA---GTCATGCCATATA--AA--ACTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTAGCGCCGGCAC-TTACAAATC-AAATCAAATG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GAATTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGA------------------------------AGAACATTGAC-ATAT----GTGTA------TA---A-AAT-----GGACTAGTCCGCATATCTTT--CGCAG-TCT---TGATCATC--TG--AGACA------CTAG-------------CGCCATATCGGTGTAATGTTTA-------------------------GATT--GCCTA---------------------TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-TAAACATTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGCAGATGGTAACG---ACTAT----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNAATACTATCTTAATACATAGGCTGGCCTTCGTAGaagcca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACTTGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCACTCGCCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGG-----------TCATCCCGCACTTACT--GAGC-TA-CACTTTTG-CTCT-AC--TGTGT-----------------------------T-------T-ATT-----AACGGTGTGTCTCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTTTTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGT---------------------------------ATA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTCACCC-------AAA---CAATGTTA-TAT---AATA-----ACCAAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCATATAAAC-AAGATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AAGA--T-G-----G--A-------C-------T----------------------TACCT--------C-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGACCATAAAGGTAA-G-G-A-TTTAATTTCTAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTATT----TT-GAAATAAACAAC--AACGTAATGTGGGCAC-CTACAAACC-AAATAAAAAG----AG--A-AACA--A-A--CG-GGTGATATCA--GGGTTGCTTATATCT-ATTT-ATA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------CTGCAAAACGTTGATAACCT----GTATA---T--CA---A-AAT-----AGACCAGTCCGC--ATCTTT--TATAG-CCT---TGATAATC--TC--CGACACTTGGGCCAACTGATAT------CGC--------TGTAATGTTT-AGA-------------GACA-GTATAATG--GCCT------------------A-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATGAACTGTGGC-------------AAGAAATG-AA--ATTTTAGAAGATTGTCAAA---AC--TAAACA--T-TTT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGGGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCTTAATACTTTGGTTGGCATCCGTGGAGGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTAAACCGCCATTGCTAC---GCGCTTGCTC-AATCAGATCGTT---------------CAAC----GATA-ACCTATAGTA----TACTAAATA-TC-AGGATAT-CTTT-TAA-CGTT--ACCT-------AAA---AAATATTA-TAT---AATA-----ACCTAAGATCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGAAGAT-AAAACTGGTGTAACGGTATC--CAA-TCTAT--AT-A-------AA-A--TTG-----G--A-------C-------T-----C--ACCTCATTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-A-GGGGAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGG-TA-G-G-G-GTTTA------------------ATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGAAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAGGGAAAG--A-AA-A--A-A--C--GGCTGTACCA--GGGTTGCCTA------ATCT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATTACTT----GTATG---T--TA---A-AAA-----ATACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CAT---TGGTCATC--AC--CGACA------CCAGCACCAACTAATATCGC--------TGTAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GTCTATTT---------------------TAAT----------GA-------TTT-GATAAACCGAGACAA-------------GAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---ACAAT----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAAAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA-------ATCTTAATCTTTAGGCTGGCCTCCGCAGAGa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tACAACGTATATG----------C---TGACCCTGCTCACCTCATACAACCTGAACATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCTGCCCCGGCT--G--C-TA-CACATTTG-CTCT-TA--TGTGT--ACAG--AATATCA-C----G-------T-------TGATC-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCAGAACTAAATCATCATTAAAAA---G-ATTCGGTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTATATCATAAGTACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAATATTTTATCC-------CAA---ACATATTA-AA-------A-----CCCCAAGACCAACGAATC--T--GT----T----AACAAGTAAAT-ACAACTGGAGTAACGGTATC--CGA-CCTAT--AT---------AC-C--T-C-----A--C-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTTGCAGTATTGC-G-AGAAAATGGCCAGACGAGTCCATAAAGG-AA-G-G-G-----------------G---ATCACAGCAGATT--CA--ATTATATT----TT-GAAATAAACAACA-AACGTACAGTCGGCAC-CTACAAATT-AAGCAAAATG----AA--A-AA-A--------A-GGTTATACGA--AGTGTATCTATATCT-ATTT-ACA-CAGAGGATGCAT-------A-CAA------TCGCAGATCGATAATACCCT----GTGTA---T--TA---T-AAT-----AGACACATCCGCATATCTTT--CGNNN-NNN---NNNNNNNN--NN--NNNNN------NNN--------------NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTATGACC-GTTCAATAGCGCCAACTGATAACA-AA-A-TAA-G-TT-CAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTATAATAAATG-AA--
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): ATCACCCGTAAAAGTTTAATATTTGAAACACCAATTGCTGCATTCTGGTTTAGTGAGTGTTAAAGATAAAACCGAAAGTCAATAAAAATAAAACACCGACCGCATTTCAAAGCTTTGTTGAATAATTAATTTGTAAATTGCAAATGGCTTTGATTAACATCTCTTTGTTGATATACCATACATCTGAAATGTTTTATCCTGTAATAAACATTCCAGTTCGTGAATGGTTGTCAAAAATTCACTCATACACAACAGTTTACAATGTGGCAAACACTGGGATCGCTGCCGTCAGGAAGAAT
Unaligned ( gi|24 ): GATCGCCCGTAAATTTTATTATTAAGACACCAAACTCCTGCATTCTATATTCTAGTGAGTGTGTATGATAAAACAAGCTAATCTGTTACATCATACACCGAAAGTCCATCAAACAACCACTGCATTAATGCTTGAGCGAATTAACATTTGTAACATGCACGCAACTCTGATTAACATCTTATTGTATGTTACCCTGTCTAGTTCATTCCAGTTAATGAATGGTTGTCTGAAATTCATTCATCTGCAATTATTTACAACATCACAAGCATTGGATTCTTTGCAGTCATAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): ACCTAATCTTGTTTACGATAATATCGAAAGGCAATCACTCAATCCCTTTTAAAACTTGTGAATAAACACTTTATAAATTGCACATACCTCTGATTAGCATATCATTGTATGGATATAACATACATTTAAACTGTGTTAATCTGTCAAAAGCATTCCCATTCGTGAATGGTTGTCTAAAATTCACTCA
Unaligned ( gi|40 ): AATATTTAAAATATTATTTCTGCATTCTTCATTCTAGTAAGTGTTTAAGATATAACAGGCTTCAAATGAGGTACCTCTTACGCACTGAAAATCCATAAAAAAACTTGCATACAACTCTGAATAAAATCT
Unaligned ( gi|44 ): TGTCCGTTACTCTTGTCGTTGTTTATGAATGGTTATCGTTATCTGAAATACACTCATACACAAATGTTTACAATGTCACAAGC
Unaligned ( gi|45 ): ATTGTCCAATAGCGCCAACTGATATTGCTGAACATTAGAAAGTAAGATTTGAAAAACTGAGATAAATATACATTTTAGAAA
Unaligned ( gi|49 ): AGACAAAAAAAATACCACCAAGCCCTTTCTTCTGATACCAAAACAACAATTA
Unaligned ( gi|50 ): GTAACGATGGTAGATCTATTACTTTTCTTTTTACTATTACGCTCAACCGA
Unaligned ( gi|54 ): ATGATGATTCATCTTAATATTATCAGTGACACATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1111111111                                      111111111111111  11111111111111111111111111     1111111111                                                 666666666666666666666666666666666666666                                                                              222222222222222                    1111111                                                                                                      111111111                                                            11            3333333333333333333333333333333333                                                                                                                         1111                                                     111111111                                                                 1111111                                                                                                                           33333333333333                      2222222222222222                                                1111111111  1111111                                                                   2222222222                                                                222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222      11111                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     0000000000 444          1                1      444444444444444  77777777777777777777777777     2222222222             0  33 33 2  2        2    2  33     444444444444444444444444444444444444444   66666                                            444 2            555   1  000000000000000    77777   2  0 6  3333333         2  2   1   44   2              8888888   444 1      2   6666   66666                  33 33  111111111           2 1      33    2     33   2     33 33 7777777  2 00 2 55555 33 0000000000000000000000000000000000                  2              2 2                            7  7 2 5 22  1        777  333             66  33        0000  2             2      1         2         2         666666666 2  2 33 2 55  2          33  1  0         2    2   2            0000000 2   666666          1         4444     333 33  333 2   55555                    33     2   555        33  33     888888   55555555555555   88888888           6666666666666666    2        22        0  44 2  2 4   1 1  1    6666666666  3333333   2               44                 1  22                   333  7777777777 1   1 1 3333 88888888888  333                              333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  33  00000                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .......... ...          .                .      ...............  ..........................     ..........             .  .. .. .  .        .    .  ..     .......................................   .....                                            ... .            ...   .  ...............    .....   .  . .  .......         .  .   .   ..   .              .......   ... .      .   ....   .....                  .. ..  .........           . .      ..    .     ..   .     .. .. .......  . .. . ..... .. ..................................                  .              . .                            .  . . . ..  .        ...  ...             ..  ..        ....  .             .      .         .         .         ......... .  . .. . ..  .          ..  .  .         .    .   .            ....... .   ......          .         ....     ... ..  ... .   .....                    ..     .   ...        ..  ..     ......   ..............   ........           ................    .        ..        .  .. .  . .   . .  .    ..........  .......   .               ..                 .  ..                   ...  .......... .   . . .... ...........  ...                              ... ...........................................................................  ..  .....                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     9999999999 444          9                0      777777777777777  33333333333333333333333333     6666666666             1  22 22 4  4        4    4  22     666666666666666666666666666666666666666   77777                                            777 7            444   1  444444444444444    33333   9  7 6  3333333         7  7   5   33   7              7777777   777 0      5   4444   22222                  77 22  000000000           2 6      11    9     11   2     11 66 2222222  2 66 4 99999 22 4444444444444444444444444444444444                  4              2 2                            5  5 5 0 99  8        888  999             55  22        0000  4             4      9         4         4         444444444 4  4 22 4 66  2          22  0  4         2    2   2            9999999 4   888888          8         7777     999 11  999 2   66666                    22     9   000        99  77     222222   33333333333333   11111111           8888888888888888    1        99        1  88 0  0 0   9 9  9    5555555555  0000000   0               22                 7  33                   222  7777777777 8   8 8 9999 66666666666  222                              777 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888  44  44444                                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT--ACAG--AA----A-A----A-------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGG-AA-G-G-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
Reference ( family-293 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT--ACAG--AA----A-A----A-------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGG-AA-G-G-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTAGGACAACGCATATG----------C---TGACTCCGCG----------AACCTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGAG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TATGT--ACAG--AA----A-A----A-------TAAAATT-T-ATT-----AACGGTGTTACCCAAGTTCATTGAAGGTAAATCAACATTATAAT---G-ATTCATTCTAAC---ATCGTT---T--------------------ATATACAT-TG-------TATTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TTAACGTTTTACCC-------CAA---ATATATTA-AAT---TATAGGCTACCCTAAGACCAACGAATC--C--GC----A----ACTAAGTAAAT-GAAATTGT--TTACGGTTTT--TAAACCTAT--AT-A-------AA-AA-T-G-----G--AATCACCAT-------T-----C--A---------TTAATAATTATTAGATAC-TTTGGCAGTTTGGC-G-GAAAAA-AACAAAACTAGTCTATAAAGG-AA-G-GAG-ATTTATTTGCAT---CA---ATCATGGCATATTTAAA--AGTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-AAAGTACCGTCAGAAT-CTACAAATA-AAACAACAAC----AATAA-AA-A--A-A--CA-GGT-----CA--AGTTTGTCTATATCT-ATTT-ATA-TAGAAGATACTT-------T-TAT------TCGCTGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--CA---A-AAT-----AGAATAGTCCGCATAGCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--AC--AGACA------C
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caa--------------CAC--------TGTACTGTTTACGG-------------AAC--GTACAGTG--ACCTATTTTTA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAATAAA-CAGACCTTTAAGGAAAA-AA--ATCGTAGGAGATGGCCAAG---CC--T----A--T--------------------------------ATAAAGCGTAGAATACAGAGTGTTTCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTATCCTAATACTAAGGCTGGCCTCCGTAGAGGCttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttatcactgtactgtttacggaacgtacagtgacctatttttaaaaacaaatttaatgatttgataaactgaaataaacagacctttaaggaaaaaaatcgtaggagatggccaagcctatataaagcgtagaatacagagtgtttccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctatcctaatactaaggctggcctccgtagaggc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                  caaaatacatgttaggacaacgcatatgctgactccgcgaacctaatcattgtggtagggagtcatcccgccccggctgctacgcctttgctctcatatgtacagaaaaataaaatttattaacggtgttacccaagttcattgaaggtaaatcaacattataatgattcattctaacatcgtttatatacattgtattaaatatcagggtatctttttaacgttttaccccaaatatattaaattataggctaccctaagaccaacgaatccgcaactaagtaaatgaaattgtttacggtttttaaacctatataaaaatggaatcaccattcattaataattattagatactttggcagtttggcggaaaaaaacaaaactagtctataaaggaaggagatttatttgcatcaatcatggcatatttaaaagtgtgataaaattgaaataaacaacaaaagtaccgtcagaatctacaaataaaacaacaacaataaaaaaacaggtcaagtttgtctatatctatttatatagaagatacttttattcgctgaacgatgataacctgtgtatcaaaatagaatagtccgcatagctttcgtagtcttgatcatcacagacacttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttat--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------TTACCTC--A---------TTAATAATTGTTAGATAA-ATGGGCAGTTTGGC-T-GGAAAATAACAAGACGTGTCCATAAAAG-AA-TTG-G-ATTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AATTATTATGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAGGTGCTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----GG--A-AA-A--A-AACTA-GGTTATACCA--AGCTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-AGGAGGATGCTT-------A-CAT------TCGCAGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--TG---A-AAT-----AGACTCATGTGCATAGCTGT--CG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --------TATAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-AAAAG-AT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAGCTGAGACAAAATGGACCTTAAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCGAG---AC--T----ATAC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATATATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCATAATATTAAGGCTGGCCTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggatataatgtttagagacagtataatggcctatttataaaaaaaaagattaatgatttgataagctgagacaaaatggaccttaaagaaaagaaatcgtagaagatggtcgagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatatatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcataatattaaggctggcctccgta
gi|11                         :                         gtgaccaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagataaatgggcagtttggctggaaaataacaagacgtgtccataaaagaattggattaatttccaccagtcatggcatattaattattatgttttgaaataaacaacaaaggtgctgtcggcacctacaaatcaaacaaaaagggaaaaaaactaggttataccaagcttgcctatatctatttacaaggaggatgcttacattcgcagaacgatgataacctgtgtattgaaatagactcatgtgcatagctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggaAATACATGTTGGGACAGCGTATATT----------C---TGACGTTACTCTCCTCACCAAACCTGAACATTGT---------------GG-------TAAGGTGGGGGGTGGTGGTGGGGG----------TCATTCCACCCAAGCT--G--C-TA-CGCTTTTA-CTTT-GA--TGTGT--ACAG--AAT---ATA----ACAT----T-------T-ATT-----AACGGTGTTAACCAATCTCATCAGAGGTAATGTATCATTATAAA---G-A
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATAAAGAA-AA--AT-GTAGAAGATGATCAAG---AC--TGT--A--C-CAT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATGCAGAATATATTC---G----aaaatgtagaagatgatcaagactgtaccatattgtaaaataaagcgtagaatgcagaatatattcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                         tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatacatgttgggacagcgtatattctgacgttactctcctcaccaaacctgaacattgtggtaaggtggggggtggtggtgggggtcattccacccaagctgctacgcttttactttgatgtgtacagaatataacatttattaacggtgttaaccaatctcatcagaggtaatgtatca----GATA-ACCTATA-------TACCAAATA-TC-AGGATAT-ATTT-TAAACATTTTACCCATTTTTCCAA---AAATGTTA-AAT---AATA-----CTCTAAATCCAACGAAAC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGTATAACTGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----A--A-------C-------T-----CTCA---------TAAATTTTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGCT-G-GGAAAATAGTAAGACAAGTCCAAAAAGA-AAAG-G-G-ATTGATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCATCAGCAC-CTACAGATC-AAAC-AAAAG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACA-----------------GTGTA---T--TT---A-AAT-----AGACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CCT---TGATCATC--TC--CAACA------CTA--------------CAC--------TGTA------------------------ACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAG---ACTAT----A--C-TGC-A-T----T-----------TT---GAAATAAAGCATAAAATACAGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tATTTCCAA---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----AT-GAAATAAACAACG-ACAGTACCGTTGGCAC-ATACAAATA-AAACAAA-------AG--A-AA-ATTA-A--CGTGGTTATACCATTAGTTAACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-CAT------GCGCAGAATGATGATAACCTGCAAGTGTA---A--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTC--CGTAG-TCT---TGATAATT--TC--TGACA------Cagagtcagattttga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       a--------------CGC--------TGTAATATTTA-GA-------------TACA-GTATAAAA--GTCTATTGATA--A-AA-AACAA-G-CT-TAATTTAG------GAAATAACATTT-GATTAACTGAGACAAA-CAGACCGTTAAAAAAAGGAA--ATGGTAGAAGATGATCAAG---AC--T----ATAC-CGTCA-C----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGCttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatcgctgtaatatttagatacagtataaaagtctattgataaaaaacaagcttaatttaggaaataacatttgattaactgagacaaacagaccgttaaaaaaaggaaatggtagaagatgatcaagactataccgtcactgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcttaatacttaggctggcctctgtagaggca
gi|14                         :                                                                                                                                                                      aatttccaacagtcatggcatattaaattgtgttatgaaataaacaacgacagtaccgttggcacatacaaataaaacaaaagaaaattaacgtggttataccattagttaacctatatctatttacatggaagatgcttacatgcgcagaatgatgataacctgcaagtgtaataaaatagactagtccgcatatcttccgtagtcttgataatttctgacacttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatTGGGACAACGTATATT----------C---TGACCCC-CTCACCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------CA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCAATT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CG--TGTGT----------------------------------------TT-----A--GGTGTGACTCACTTTCATCGGAGGTAAATCGTCATTATAAT---G-ACTGGTTCAAAT---ATCGTT---------------CAAC----GGTA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAAGGTTTTACCC-------CAA---AGATATTA-AAT---AATA-----CCATAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAA-TTAGAGTAACTGTATC--CAA-CCCAT--AT-A-------AA-A--T-A-----G--A-------C-------C-----C--C------------ACCCCCATT-GATA---TTGGCAGTTAGGC-G-GGAAAATAGCAAGATGAGTCCATAAAGGTAG-G-G-G-GTCAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATTTT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAACAAACAACA-AAAGTAGTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--AGGG-A--A-A--AA-GGTTATACTA--GGGTTAACTATGTAT-AGTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATAACAT----GTGTA---T--AA---A-AAT-----Aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATGTGACCAA-TTTCATTGGAGATAAATCATCATTATAAT---G-TCTCGTTCTAGA---ATTATT---TAACTAAGATAATAACTGAAAATA-ACATTAA-------TAACGAATACTC-AGG-TAT-CTTCGTG--CATTATACCC-------CAA---AAAGGTTA-AAT---AATG-----CTC--ACACCAAGAAATC--CTTGT----TTAAGATCAAGTAAAT-A---------TGAC-----C--TGA-CCT------------------------------------------------T-----C--A---------TTAATGTGTAATAGATAA-ATTGGCAGTGTGGC-G-GGAAAAAAGCAAGACGAGTT----------------G-ATTTATTTCGACTAACG---GCTATGACATAAT--AA--ACAGTGCT----TT-GTAAGAAACG-CA-AACGTATCGTCGGCACACTATACA-C-ATACAATAA-----------------A-A--CA-GGTTATTCTA--AGATTACCTATATAT-TTTT-GCA-TGGAAAATATTTCAAAACCACTGC------TAGTAGAACAATGATAATCT----GTATA---C--TA---A-A-T-----GGACGATCCCGCATATCTTT--CGTTG-TCT---TGATCATC--TT--TGACtag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAC-ATAAAAATA-AAACACATAG----G-----------A-A--CA-TGTTAAACTA--AGTTTACCTATATAT-GTTT-ACA-TGGAAGATGCTTCG-----A-AACTTCCATTCGCAGAACGATGACAATCT----GTAT----T--TT---A-TAT-----GGACGAGTCTGCAAACCTTT--CGgagtgcttatatataccaataaactggctatcgttctgacagcaagcacaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --------------CGC--------TGTTATGTT-AACC-------------AACACGTGTAACG--GTATATTTATAC-A-GA-A-CAT-GCTT-TAATTGAGAAGTAAGA-------TTT-GATAAACTGAGACTAT-CAGACCTTTTAGAAAAG-AA--AGCGTAGACAATGAGTAAG---AC--TCG--A--C-CGT-AGT----TATTTATATATAGT---AAAATAAAGCGTCAAAAACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA--AAA----CTATCTAAATACATAGACTGGCCTCCATAGAGGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatcgctgttatgttaaccaacacgtgtaacggtatatttatacagaacatgctttaattgagaagtaagatttgataaactgagactatcagaccttttagaaaagaaagcgtagacaatgagtaagactcgaccgtagttatttatatatagtaaaataaagcgtcaaaaacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaactatctaaatacatagactggcctccatagaggcaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                       cacataaaaataaaacacataggaacatgttaaactaagtttacctatatatgtttacatggaagatgcttcgaaacttccattcgcagaacgatgacaatctgtattttatatggacgagtctgcaaacctttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatAATATATATGGGGACAACGTGCATA----------CATATGGCACTGCTTATCTTACCCAACCTGAGCATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGG----------TCCACCCACCGCGTCT--C--C-TG-TGCCTTTG-CTTT-CA--AATGA--ACAG--AA----A-AT---A-------G-------C-ATTTATAAAAAGACGCAACCCGATTTCATCGGAGGAAAATCATCATTGTAATGGCG-ACTCGTTCTAAC---ATTATTAGCT-----------TAAC-----AGA-ACAT-TA-------TATTACATA-T--AGA-------TT-CAAACA--ATACCC-------TAA---ATA----A-AATTTGAGTA-----CCaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaTAAAT-AAAATTTGAGTACCGGTATC--CAA-CCTATGCAA-A-------AA-A--T-G-----G--ACCTGTTCC-------T-----C--A---------TTAAggtatccaacctatgcaaaaaatggacctgttcctcattaa
gi|18                         : aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaaatatatatggggacaacgtgcatacatatggcactgcttatcttacccaacctgagcattgtgggagggggtccacccaccgcgtctcctgtgcctttgctttcaaatgaacagaaaatagcatttataaaaagacgcaacccgatttcatcggaggaaaatcatcattgtaatggcgactcgttctaacattattagcttaacagaacattatattacatatagattcaaacaatacccAATAAATGTTGTGACAATATATATATATATATATAC---TGGCCCCGCCAAACTCACCCAAACTGTACATTGC---------------GG-------GA------------------GAAG----------TCAATCCGCCCCGTC---A--CATA-CGCCTTTG-CTTT-CA------T--ACAG--AA----G-A----
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtatcatttctttccattcaaatcgtttgttttaatgtttttttgtagagcctgagtgaattaccaatgcgtaaacattgttaaatttctaataacaccttattgtacgcatgtaccgtaaaccctgtcaaaataatctagtgaatgaatggttgtcttgaattcattcttacacagttgtttacagtattatcactagtactggattcggtgtggccaggaatacttagtgtatcctgtacagtgttaatatatctcttgcagctacatcgtttatttacacggttttaatgaaCATAACGATGATAATCT----GTATA---T--TT---A-CTT-----AGACTAGTTCGCATATCTTC--CATAT-TCC---TGATCATC--TT--CGATA------taat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --------------CGC--------TGTTATGCTTAC-A-------------GGCA-GAATAGCA--GC--ATTT-TA--ATAACA-CAA-G-TT-TAATTTT-------GAAATTAGTTTT-GATAAACTTACACAAT-CAGACCATTCACAAAAG-AA--ATCGCAGAAGATGATCGAA---ACCAC----A--C-CAT-A-T----T------------TAAAAAAACAAAAC----AATACTGGATGCATCattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatcgctgttatgcttacaggcagaatagcagcattttaataacacaagtttaattttgaaattagttttgataaacttacacaatcagaccattcacaaaagaaatcgcagaagatgatcgaaaccacaccatatttaaaaaaacaaaacaatactggatgcatcggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cataacgatgataatctgtatatttacttagactagttcgcatatcttccatattcctgatcatcttcgataattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatAATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACTCCGCTAACCTCACCCAGCTTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATTCCGTCCCGGGT--G--C-TA-CGCATTGG-CTCT-CA--TATGT--ACAG--AA----A-A----AATAAAATT-------T-ATT-----AACGGTGTGAGCCGCTTTCATTGAAAGTAAATCACCATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACGTATA-------TAGTAAATA-TC-AGGATATACTTT-T-AACGTTTTACCC-------CAA---ATATATTA-AAT---TATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACTAAGTAAAT-TAAATTGTGGTAACGGTGTC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AACT-C-----ACCA-------T-------T-----C--A---------TTAATAATTATTAGATAA-TTTGGCAATTTGGC-G-GG-AAATAACAAGACTAGTCTATTAAGG-AA-G-GCG-GTTAATTTGCAT---CA---GTCATGGCATATTTAAA--ATTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-CAAGTTCCGTCGGCAC-CTTCAAAT--AATTAAAA----------A-AA-A--A-C--CA-GTTCATAACA--GGTTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGGAGATGTTT-------A-CAT------TCGCTGGACGATGACAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcgaC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-TCACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------AA-------T-----------GAGATAAA-CATACCTTTAAGAAAAA-AA--AT-GTAGAAGATGGCCAAG---AC--T----ATAC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTAACTTGATACTTAGGCTGGCCTCCtgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctctgtaatgtttagggacatcacaatgacctatttataaaaacaagtttaataatgagataaacatacctttaagaaaaaaaatgtagaagatggccaagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctaacttgatacttaggctggcctcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcgaaatacatgttgggacaacgtatatgctgactccgctaacctcacccagcttaatcattgtggtagggggtcattccgtcccgggtgctacgcattggctctcatatgtacagaaaaaataaaatttattaacggtgtgagccgctttcattgaaagtaaatcaccattataatgactcattctaacatcatttcaacgataacgtatatagtaaatatcaggatatacttttaacgttttaccccaaatatattaaattataccctaagaccaacgaatccgttactaagtaaattaaattgtggtaacggtgtccaacctatataaaaactcaccattcattaataattattagataatttggcaatttggcgggaaataacaagactagtctattaaggaaggcggttaatttgcatcagtcatggcatatttaaaattgtgataaaattgaaataaacaacacaagttccgtcggcaccttcaaataattaaaaaaaaaccagttcataacaggtttgcctatatctatttacatgggagatgtttacattcgctggacgatgacaacctgtgtattaaaatagacttgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctC--TGATA------TCA--------------C----------TGTA-TATTTA-GA-------------GACA-GTACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-AACAA-T-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAA--CAGACCTTTACGAAAA-------TCAAAGAAAATGGCCAAG---AC--T----ATAC-CGA-A-T----T-----------GT---AAAATAATGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTGTCTTAATACTAAGGCTGGCTTACGTAGAGG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atatcttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgatcgttcaaaagcgccaaAATACATGTTAGGAAAACGCATATG----------C---TGATTTCGCTAATCTCACGCAACCTTATCATTGC---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCGTCCCTCCCCGGCT--G--C-TG-CGCCTTCG-CTAT-CA--TATAT--ACAG--AA----A-A----AAA-----TAAAAAAAT-GCT-----AACGTTATGACCAACTTTCACCGA------------ATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGAAT-CGTG-TTCACGCTTTACCC-------TAA---ATATATTA-AAT---TATA-----TGCTAAGACCATCTTATC--C--GT----A----ATTAAGTAAAT-GGAATTGTTGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--ATAA-------AA-A--T-G-----G--A-------CTCACCATT-----C--A---------TTAATATT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttaatcaa-GTATAATG--ACCTTTTTATA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTTTAAGAAAA--AA--ATCGTAGAAGATGGCCAAG---ACTTT----A--T-CGA-T-T----T-----------GT---A-------------AATACAGAATGTTTAC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTATCATAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cttgcttttctataagataaacatccacttacgatcgttcaaaagcgccaactgatatcactgtacaat--------------CGC--------TGTACTGTTTA-GA-------------TACA-GTATAATG--GCCTATTTAT-----AA-A-TAA-G-TT-aggc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAA-----------------T----A--C-TGT-A-C----G-----------TT---AAAATAGATTGTA-------GACTATA-----------CAGAAGGTATCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN----NNNTCTTAATACTTAAGCTGGTCTCCGTAAAAGCaagaaaggaaatcgtagaatactgtacgttaaaatagattgtagactatacagaaggtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttaatacttaagctggtctccgtaaaagcaagcc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatcgctgtactgtttagatacagtataatggcctatttataaataagAACATATGTAGGATCAACGTATATA----------C---TGACCCCGCTGACCTCATCCAAACTGAACATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------ACACCCCG-CTCGGCT--G--C-TA-CGCATTTG-CCTT-CATGTGTGT--ACAGACAA----A-A----A-------A-------T-A----------GATGTGACACAATTTCATCGGCGGTAAATTAACATTaagcc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttcattcacaattgtttacaatgatttactgccggaataattagtgtgcctgtctagtgttttaagtatctggcagctacgccgctattttacaagtctttaccaaAGA-------------AACT-TTATAAT--------TTTA-A--G-AA-A-AAA-G-----AAT---------------------T-GATATACTGAATCAAA-TCGACATTTTAGAAAAG-AA--AGCATAGAAGATGATCGAG---AC--TAG--A--C-TGT-A-TGTTCT-----------GC-------CAAAGTGTAAAAATCAGAATGTATGC---G-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--AAG----CTATCTAAATACATAGGCTGGCCTCCATAGAGGC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatcatgaatgtagagatacatA-GGTCATAACG--AGTTTGCCTATATAT-GTTT-ACA-TAGAAGATGTTT-------A-CAT------TCGCCGAACGATAATTACCT----GTGTAGTCT--TG---ATCATCACCGACACTTG-CTGTATAACATAAACGTCC-TCT---T-ACCACCGTTCAACAACG------CCAACTGATAT------CAC--------TGTAATGTTTAGG--------------GACA-GTACAATA--ACTTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GCTAAACTGAGGTAAA-CAGACCTTCAAGAAAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACAAGTTGGGACCACGTATATG----------C---TGGTCCCGC--------------CTGAACATTGC---------------GGGGGTGGGTG-----------------GGGGGGGGGGGGGGATTATCCCGTCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGC--GCAG--AA----A-AT---AACAT---T-------T-ATT-----AAAAGTGTGACC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgcagctacaccgtttttttttatcaa--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------TTACCTC--A---------TTAATAATTGTTAGATAaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         tgcagctacaccgtttttttttatcaaaatacaagttgggaccacgtatatgctggtcccgcctgaacattgcgggggtgggtgggggggggggggggattatcccgtcccggctgctacgcctttgctctcatgtgcgcagaaaataacatttattaaaagtAATACATATTGGGACAACGTATATA----------C---TGAGCCAACTCACCTCATCCTACCTTATCATTGT---------------AG-------CA-----------------GGGGGG---------TCATCCCGCTCCAACT--A--C-TA-CGCATTTG-CTCT-CA--TGTG----------------------A-------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCTGAGGTAAATAATTATTATAAT---G-ACTCGTTCTTAT---ATCATT---T-----------TGAC----GGTA-ACCTGTT-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTCT-TAAACGTTTTACCA-------CAA---AAATATTA-GAT---AATA-----CCCTAAAACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTTAAT-ACAATTGGAGTAACTGTATC--CAA-CCTTT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------A-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCAATAAGA-AA-G-G-G-ATTGATTTTCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--ACC--CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCTATATCT-ATTT-ACA-TTGAAGATGTTT-------A-AAC------TCGTACAGCGTTAATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTATTCTGCATATATTT--CGTAG-TCT---TGACCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CATACCTTTAAGAATGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAA--------T----A--C-CGC-T-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA-G-T----AT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACGAA-TGGACCTTTTATAAAAG-AA--ATGGT---GGATGATCAAT---AG--TAG--A--C-TGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCG-----TACAGAATGTATCC---G----
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAA--------TCGTGGAGGATGGTCAAG---AC--T----ATGC-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---GNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AA-------ATTTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGatatcgatggtaccatgtgccacattgcgctgtactgacttgtttcattttgtacagggtacctaacagggtatgaaacaatatctaaatccgtagaggcaag
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAG---AC--T----A--TACGC-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGAGTAGAATACAGAATGTATACAAAN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAA----CTATCTCAATACTAAGGC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TTACCCCACTCACCTTCCCCAACCTGGTCATTGT---------------GT-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGTCCCAACTGAG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT-----------------------------T-------A-ATT-----AACGGTGTGACTCACTTTCATCGAAGGTAAATCATCATTATAAT---G-A--CGTTCTAAaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttttatcaaCATTTTGGC-G-TGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGATAA-G-G-G-ATTATTTTCCAC---CA---GTCATGGTATATT--AA--AATGTGTT----TTTGAAATAAATAACA-AAAGTAGCGTCGGTAC-CTACAAATC-AAATAAAAAG----AAACA-AA-A--A-G--CA-GGTTATAC
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTTACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-GAT-----AGGCTAGTCTGCATATATTT--TGTAG-TCT---TGATTATC--CC--CAACA------CTA--------------A-----------ATAATACTTAAatgtacaagggttatgtgctgttt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaagcattaatgggggactgcataATTA-AAT---TATA-----CCCTGAGATAGAGGAAGC--C---TAA--T----GCTAAGTAAAT-ACAATTGAA--AACAGAATCTACAA-CCTAT--AT-A-------AA-ACAT-G-----G--A-------C-------------C--A---------TTA-----TCTCA--TAATATTGAAGGTGTGGC-G-GGAAAATATCTAGACGAGTCTATtactta
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agTTATTTCTAC---CAACAGCTAT--CATAT---AA--ACTGTGTG----AA-GAAATTAACAACA-GAAATACTGTCGGTTT-ATACAAATT-AAACACAAA---------A-AA-A--A-A--CA-GGTTATAATA--AGTTCATAAAAATCTAATTTGACATTGTAGGATACTcca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-------TATTAAATA-TC-CATGTGT-GTTT-TAAACATTTCA--C-------CAAATGAAAGATGA-AAT---ACTA-----CCTTAAGACCAAGGAATTAAT--GTCTAAC----ACCGAATAAATAAAAATCGAAGTAAAGGAATC--CAC-CCTAT--GC-A-------AA-A--a
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAACATGTTGGGTCAGTGTATATG----------T---TGACCCCGCTCACCTTACCCAACCTGTACATTGT---------------GG-------TA-----------------GAGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCTTTTG-CTCT-CA--TGTGT--ACAG--AA----A-ATAACA-------T-------TTATT-----ATCGGAGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTACTATAAA---G-ACTCGTTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----TATA-ACATATA-------TACTAAATA-TC-TGGGTAT-ATTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ACGTATTATAAT----ATA-----CCCTAAGACCAAGGAATC--C--GG----T----ACCAAGTAAAT-AAAAGCGGAGTAACGGTATC--CAA-TATAT--AT-ATATATATAA-A--T-GGACTCG--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATGTATAATATAA-ATTGGCAGTTTAGC-G-GGAAACTAGCAAAATGAGTCCATAAAGG-AAGG-G-G-GTTAATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ACTGTG-T----TT-GAAATA-----------------TTGGTAC-CTACAAATCGAAAAGAAAGG----GG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATATCA--GGTTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATCCTT-------A-TAC------TCTCAGAACGTTGGTAACCT----GTGTA---TAATATTCA-ACT-----AGACTAGTCCGCATATCTGT--CGactgac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaATGTTC--CGTAGCTCCAACTGAT-ATC--AT--AGATA------TC----------------GC--------TGTAATGTTTAA-A-------------GATA-GTATAATG--GCCAATTTATA--A-AA-C-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAACAAA-CATACCTTTAAGAAAAT-AA--ATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgatgttccgtagctccaactgatatcatagatatcgctgtaatgtttaaagatagtataatggccaatttataaaaccaaatttaatgatttgataaactgaaacaaacatacctttaagaaaataaatcg
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaaaaacatgttgggtcagtgtatatgttgaccccgctcaccttacccaacctgtacattgtggtagagggtcatcccgccccggctgctacgcttttgctctcatgtgtacagaaaataacatttattatcggagtgacccactttcatcggaggtaaatcattactataaagactcgttctaatatcatttcaactataacatatatactaaatatctgggtatattttaaacgttttaccccaaacgtattataatataccctaagaccaaggaatccggtaccaagtaaataaaagcggagtaacggtatccaatatatatatatatataaatggactcgactcattaatatgtataatataaattggcagtttagcgggaaactagcaaaatgagtccataaaggaagggggttaatttccaccagtcatggcatattaaactgtgtttgaaatattggtacctacaaatcgaaaagaaaggggaaaaaacaggttatatcaggtttgcctatatctatttacatggaagatccttatactctcagaacgttggtaacctgtgtataatattcaactagactagtccgcatatctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgTAAGACAAA-CATACCTATCACACAAG-AA--AGCGTAGAAGACGATCAAG---AC--TAG--A--C-CGT-A-A----T-----------GT---GAAATAAAGTGTCGAATACAGAATGTATC
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatccaATAA-ATTGGCTGTTTGGC-GAGGATAATATCTAGAAGAAATCAT---------------ATTTATTTCCAC---CA------ACAGC-TGTT-------TTGTGTG----AT-GAAATAAACAACACAAAATt
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---------TTAATATTTATTTGATAA-TTTGGAAGTTTCGC-A-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAATGG-AA-G-G-G-GGTTATTTCCACCAACA---GATATGGCATA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --A-AA-A-AAA-G-TTGTAA-----------GA-------TTTTGATAAACTGAGACAAA-CAGACATTTTAGAAAAG-AAGCATAGTAG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------TCATCCCGTCCCGTCT-----C-TACCGCCTTTGTTTCTGCA--TGTGTGCACAT--AA----A-A----A-------T-------tctagtcttta
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agTAGAAGATGATCAAG---AC--TTT--A--C-CGT-A-T----T-----------AA---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCT---G----aa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---AGACCCAATTCACCTCACCAAACCTAATCATTGT---------------AA-------TA-----------------AGGGG----------TCATCCCGCTCCGACT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT-----------------------------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTTATCGGCTGTAAATCATTATTGTAAT---G-ACTTATTCTGAT---ATCATT---T-----------CAAC----AATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGT------T-TA-----TTTA-----------AA---AAATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAAATCAACGAATT--T--GT----T----ACCAAGTAAAT-ACAATTAGAGTAACTGTATC--CAG-CTTAT---------------------G-----G--A-------C-------T-----CTCA---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGT-G-GGAAAGTAGCAAGACGAGTTAAAAAAGT-AA-G-G-GTATTTATTACCAC---CA---GTCATGGCATATT--AT--TTTGAGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCTTCGGCAC-AAACAAATC-AAACAAAAAA----GG--A-AA-A--T-CT-CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCGATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TC---A-AAT-----AGACTAGTCCGCAAATCTTT--TGTAG-TCT---TGACCATC--TC--TGATA------CTA--------------CGC--------TGTAATG-TTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-GA--ATCATTGAAGGTGGTCAAGACAAC--A----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCATAGAATACAGATTGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AA-------ATCTTAATACTTAGGCTGGCa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -------T-----T--A---------TTAATATTTATCAGATAA-ATTGACATTTTCGCTG-AAAAAATAGCGA
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----CTATCTAAATCAATAGGCGGGCCTCCGTAGAGGC
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aggTTAATACTTAGGCTGACCTCCTTAGAGGCaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGTTGGGACAATGTATATG----------C---TGATCCCGCTCACCTCACTCAACCTGATCATTGTTGTGGAAGGGGGAGGGG-------T------------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGACT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-TA--TATAT-----------------------------T-------T-ATT-----AATGTTGTGAACCACTTATATCGGAGGTAAAT---------------G-ATTCGTTCTCAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTGTA-------TAATATATA-TCTAGGTTAT-CTTT-GAAACGTTTTACCC-------CAA---ACATATTA-AAT---AATA-----ATCAAATACCATCGAATC--C--GT----T----ATCAAGTAAAT-AAAATTGGAATAACAGTACC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AA-T-G-----G--A-------C-------TTGCCTC--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCATTTTGGC-C-GG-AAATAGCAAGACGAGTACATAACGT-AAGG-G-G-ATCAATTTCCAC---CA---GTCATGCCATATA--AA--ACTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTAGCGCCGGCAC-TTACAAATC-AAATCAAATG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GAATTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGA------------------------------AGAACATTGAC-ATAT----GTGTA------TA---A-AAT-----GGACTAGTCCGCATATCTTT--CGCAG-TCT---TGATCATC--TG--AGACA------CTAG-------------CGCCATATCGGTGTAATGTTTA-------------------------GATT--GCCTA---------------------TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-TAAACATTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGCAGATGGTAACG---ACTAT----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNAATACTATCTTAATACATAGGCTGGCCTTCGTAGaagcca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACTTGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCACTCGCCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGG-----------TCATCCCGCACTTACT--GAGC-TA-CACTTTTG-CTCT-AC--TGTGT-----------------------------T-------T-ATT-----AACGGTGTGTCTCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTTTTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGT---------------------------------ATA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTCACCC-------AAA---CAATGTTA-TAT---AATA-----ACCAAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCATATAAAC-AAGATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AAGA--T-G-----G--A-------C-------T----------------------TACCT--------C-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGACCATAAAGGTAA-G-G-A-TTTAATTTCTAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTATT----TT-GAAATAAACAAC--AACGTAATGTGGGCAC-CTACAAACC-AAATAAAAAG----AG--A-AACA--A-A--CG-GGTGATATCA--GGGTTGCTTATATCT-ATTT-ATA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------CTGCAAAACGTTGATAACCT----GTATA---T--CA---A-AAT-----AGACCAGTCCGC--ATCTTT--TATAG-CCT---TGATAATC--TC--CGACACTTGGGCCAACTGATAT------CGC--------TGTAATGTTT-AGA-------------GACA-GTATAATG--GCCT------------------A-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATGAACTGTGGC-------------AAGAAATG-AA--ATTTTAGAAGATTGTCAAA---AC--TAAACA--T-TTT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGGGTAGAATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCTTAATACTTTGGTTGGCATCCGTGGAGGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTAAACCGCCATTGCTAC---GCGCTTGCTC-AATCAGATCGTT---------------CAAC----GATA-ACCTATAGTA----TACTAAATA-TC-AGGATAT-CTTT-TAA-CGTT--ACCT-------AAA---AAATATTA-TAT---AATA-----ACCTAAGATCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGAAGAT-AAAACTGGTGTAACGGTATC--CAA-TCTAT--AT-A-------AA-A--TTG-----G--A-------C-------T-----C--ACCTCATTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-A-GGGGAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGG-TA-G-G-G-GTTTA------------------ATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGAAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAGGGAAAG--A-AA-A--A-A--C--GGCTGTACCA--GGGTTGCCTA------ATCT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATTACTT----GTATG---T--TA---A-AAA-----ATACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CAT---TGGTCATC--AC--CGACA------CCAGCACCAACTAATATCGC--------TGTAATGTTTA-GA-------------GACA-GTATAATG--GTCTATTT---------------------TAAT----------GA-------TTT-GATAAACCGAGACAA-------------GAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---ACAAT----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAAAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA-------ATCTTAATCTTTAGGCTGGCCTCCGCAGAGa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tACAACGTATATG----------C---TGACCCTGCTCACCTCATACAACCTGAACATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCTGCCCCGGCT--G--C-TA-CACATTTG-CTCT-TA--TGTGT--ACAG--AATATCA-C----G-------T-------TGATC-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCAGAACTAAATCATCATTAAAAA---G-ATTCGGTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTATATCATAAGTACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAATATTTTATCC-------CAA---ACATATTA-AA-------A-----CCCCAAGACCAACGAATC--T--GT----T----AACAAGTAAAT-ACAACTGGAGTAACGGTATC--CGA-CCTAT--AT---------AC-C--T-C-----A--C-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTTGCAGTATTGC-G-AGAAAATGGCCAGACGAGTCCATAAAGG-AA-G-G-G-----------------G---ATCACAGCAGATT--CA--ATTATATT----TT-GAAATAAACAACA-AACGTACAGTCGGCAC-CTACAAATT-AAGCAAAATG----AA--A-AA-A--------A-GGTTATACGA--AGTGTATCTATATCT-ATTT-ACA-CAGAGGATGCAT-------A-CAA------TCGCAGATCGATAATACCCT----GTGTA---T--TA---T-AAT-----AGACACATCCGCATATCTTT--CGNNN-NNN---NNNNNNNN--NN--NNNNN------NNN--------------NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTATGACC-GTTCAATAGCGCCAACTGATAACA-AA-A-TAA-G-TT-CAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTATAATAAATG-AA--


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATATATATA ATA          C                A      TGTGGAAGGGGGAGG  TAAGGTGGGGGGTGGTGGT            GGGGGGGGGA                GA AG A  C        T    G  TG     ACAGAAAAAAATAAAAAAAT                      TATAA                                            GGC C            CAG   G  TAACTAAGATAA       TGAAA   .    A  TCATAAG         C  T   A   AC   G              ATTTTTC   ATG A      T   TTGA   .                      AA TT  TTAAG               A G      TA    T     TA   .     GC TA TATATAT  G AC T GACTC CC CTCACCTCATTCA                                       T              T A                            T  A T C TA  A        TAA  ACA             TA  TT        AAAA  T             C      C         A         G         GGGAAAG   G  C TT C AC  T          TT  C            A    G   T            CAAAACC C   TTCCAT          A         GCAA     GTC AA  TTC T   CACCG                    AA     C   AAC        GT  AA     CTTGGG   GCACCAACTAATAT   CATATCGG           NNNNNNNNNNTTTTAT    C        GC           AC T  C A   A C  G    TGAGAAGTAA  AATAACA   T               AA                 G  GC                   ACA  TAAACA     A   C G GTTC ATTTATATATA  AAA                              AAA NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN  NG  NAATA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            C                T      .                GGGTGGGTG                      G                         .  .  .  .        .    .  .      ACAGAAAAAATAAAATTT                        .                                                .   .            .     A  AGCT               G       .    T  GTA             .  .   G   A    .              .         .   G      .   A      .                      .  .   CTAAC               . A      AG    T     .    .     .  T  .        . CA . .     .  CCTGTTCCTCA                                         .              . .                            T  G . . A   G        CAA  .               .   .         .     .             .      G         .         .         GAAAC     .  . .  . T   .          .   G            .    .   .            CG      .   .               A         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        ACTGATAT         .                  ACC                 .        .            C  .  . A   . .  .    TTAG        AATTAGT   .               G                  .  .                    .    TATA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN  .   C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            T                G      .                CA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      ACAGAATATAACATTT                          .                                                .   .            .     A  T                  G       .    T  .               .  .   A   A    .              .         .   A      .   A      .                      .  .   AAT                 . A      AG    G     .    .     .  T  .        . A  . .     .  CTCACCATTCA                                         .              . .                            T  G . . A   A        .    .               .   .         .     .             .      C         .         .         GAGA      .  . .  . .   .          .   T            .    .   .            .       .   .               T         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        ACTGATAT         .                  AGA                 .        .            .  .  . .   . .  .    TTT         .         .               A                  .  .                    .    TGTA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG  .   C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            A                A      .                GA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      GCAGAAAATAACATTT                          .                                                .   .            .     A  T                  G       .    A  .               .  .   G   C    .              .         .   T      .   A      .                      .  .   G                   . A      GG    G     .    .     .  A  .        . .  . .     .  CTTACCTCA                                           .              . .                            .  . . . G   T        .    .               .   .         .     .             .      G         .         .         GAGA      .  . .  . .   .          .   G            .    .   .            .       .   .               A         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        G                .                  AGA                 .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               T                  .  .                    .    TATA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN  .   A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            A                T      .                GA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      ACAGAAAATAACATTT                          .                                                .   .            .     A  T                  G       .    T  .               .  .   G   C    .              .         .   T      .   T      .                      .  .   T                   . A      TG    G     .    .     .  T  .        . .  . .     .  CTTACCTCA                                           .              . .                            .  . . . A   A        .    .               .   .         .     .             .      T         .         .         GGG       .  . .  . .   .          .   A            .    .   .            .       .   .               A         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  AGA                 .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               T                  .  .                    .    TATA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN  .   C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            A                T      .                TA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      ACAGAATATCACGTTG                          .                                                .   .            .     A  T                  G       .    G  .               .  .   G   C    .              .         .   T      .   T      .                      .  .   T                   . G      AG    T     .    .     .  T  .        . .  . .     .  CTTGCCTCA                                           .              . .                            .  . . . G   G        .    .               .   .         .     .             .      C         .         .         GAG       .  . .  . .   .          .   T            .    .   .            .       .   .               A         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  AGA                 .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    TCGA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN  .   C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            G                A      .                TA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      ACAGACAAAAAAT                             .                                                .   .            .     A  T                  T       .    A  .               .  .   G   G    .              .         .   A      .   A      .                      .  .   T                   . G      AG    A     .    .     .  T  .        . .  . .     .  CTCTCA                                              .              . .                            .  . . . A   A        .    .               .   .         .     .             .      G         .         .         GAG       .  . .  . .   .          .   T            .    .   .            .       .   .               A         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  GA                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    CACA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN  .   C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            C                A      .                GA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      ACAGAAAATAGC                              .                                                .   .            .     A  T                  A       .    T  .               .  .   G   A    .              .         .   A      .   T      .                      .  .   A                   . C      AG    G     .    .     .  C  .        . .  . .     .  CTCTCA                                              .              . .                            .  . . . A   T        .    .               .   .         .     .             .      G         .         .         GGG       .  . .  . .   .          .   T            .    .   .            .       .   .               A         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  GA                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    TATA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN   .   N    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            C                T      .                CA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      ATT                                       .                                                .   .            .     A  T                  G       .    G  .               .  .   T   C    .              .         .   C      .   A      .                      .  .   G                   . C      AG    G     .    .     .  T  .        . .  . .     .  CCCC                                                .              . .                            .  . . . G   A        .    .               .   .         .     .             .      C         .         .         AGG       .  . .  . .   .          .   G            .    .   .            .       .   .               T         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  CA                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    TATA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN    .   G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            C                T      .                TA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      TA                                        .                                                .   .            .     G  .                  G       .    A  .               .  .   G   C    .              .         .   A      .   A      .                      .  .   T                   . A      AA    T     .    .     .  T  .        . .  . .     .  TTCA                                                .              . .                            .  . . . A   T        .    .               .   .         .     .             .      G         .         .         GAG       .  . .  . .   .          .   G            .    .   .            .       .   .               T         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  GG                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               G                  .  .                    .    TTTA       .   . . .    .            .                                .   CAGAAGGTATCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN      .   C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            C                A      .                TA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      TT                                        .                                                .   .            .     G  .                  G       .    A  .               .  .   A   C    .              .         .   C      .   A      .                      .  .   T                   . A      AG    A     .    .     .  T  .        . .  . .     .  CACA                                                .              . .                            .  . . . G   T        .    .               .   .         .     .             .      G         .         .         GAA       .  . .  . .   .          .   T            .    .   .            .       .   .               T         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  GA                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    TAGA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN      .   A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            C                T      .                GA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      TT                                        .                                                .   .            .     A  .                  .       .    A  .               .  .   G   A    .              .         .   A      .   A      .                      .  .   T                   . C      TG    G     .    .     .  T  .        . .  . .     .  CTCA                                                .              . .                            .  . . . A   T        .    .               .   .         .     .             .      A         .         .         AG        .  . .  . .   .          .   T            .    .   .            .       .   .               T         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  GA                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               G                  .  .                    .    TAGA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN      .   C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            C                T      .                TA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      TT                                        .                                                .   .                                        .       .    .  .               .  .   .   .    .              .         .   A      .   A      .                      .  .   T                   . A      AG    G     .    .     .  T  .        . .  . .     .  CTCA                                                .              . .                            .  . . . T   A        .    .               .   .         .     .             .      G         .         .         GG        .  . .  . .   .          .   G            .    .   .            .       .   .               T         .        .   .   .   .   .                        .      .   .          .   .      .        .                .                  GG                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               G                  .  .                    .    TATG       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN      .   .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            C                T      .                TA                             .                         .  .  .  .        .    .  .      .                                         .                                                .   .                                                        .               .  .   .   .    .              .         .   C      .   .      .                      .  .   T                   . A      A     G     .    .     .  .  .        . .  . .     .  TCA                                                 .              . .                            .  . . . G   A        .    .               .   .         .     .             .      C         .         .         .         .  . .  . .   .          .   A            .    .   .            .       .   .               T         .        .   .   .   .   .                        .                         .               .                .                  AA                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    TAGA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN      .   .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .          .            .                A      .                TA                             .                         .  .  .  .        .    .  .                                                                                                                                                                                                                                  .   .      .                         .   T                   . A      A     .     .    .     .  .  .        . .  . .     .  CCA                                                 .              . .                            .  . . . .   T        .    .               .   .         .     .             .      .         .         .         .         .  . .  . .   .          .   G            .    .   .            .       .   .               T         .        .   .   .   .   .                        .                                         .                .                  GA                  .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    TTTA       .   . . .    .            .                                .   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA               .   .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .                T                              .                         .  .  .  .        .    .  .                                                                                                                                                                                                                                                                       .   T                   . C      A     .     .    .     .  .  .        . .  . .     .  CT                                                  .              . .                                         .        .    .               .   .         .     .             .                .         .         .         .  . .  . .   .          .   G            .    .   .            .       .   .               A         .        .   .   .   .   .                        .                                                          .                  .                   .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    TATA       .   . . .    .            .                                .                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         . .      .     .     .    .     .  .  .        . .                                                                                . .                                                  .    .                                                                                                              .              T            .    .   .                                        .         .        .   .   .   .   .                                                                                   .                  .                   .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               G                  .  .                    .    AATA       .   . . .    .            .                                .                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .        .            .  .  . .   . .  .    .           .         .               G                  .  .                    .    TA         .   . . .    .            .                                .                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      .  .  . .   . .  .    .           .         .               A                  .  .                    .    TA         .   . . .    .            .                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  . .  .                                          .                  .  .                    .    TA         .   . . .    .            .                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .                  .  .                    .    AA         .   . . .    .            .                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .                  .  .                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .  .                                                                                                                                                                                         


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAGAAATAATT***************************                                                                                                 G****                                                                                          *****                                                      AG                                      **            CTCCTCA***************************                                                                                                           **            ****                                                     GAG******                                                                                                                                                                                                                                       GA**************                                                                                                                                      TATA******
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT--ACAG--AA----A-A----A-------T-------T-ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--A-------C-------T-----C--A---------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGG-AA-G-G-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA-------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---AC--T----A--C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGTACAGAAATAATT---------------------------ATT-----AACGGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAACG----ATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAA---ANATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-G-----G--ACTCCTCA---------------------------TTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAGG-AA-G-G-G-ATTNATTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAGAG------A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAGA--------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAG---ACTATA------C-CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGAATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): ATCACCCGTAAAAGTTTAATATTTGAAACACCAATTGCTGCATTCTGGTTTAGTGAGTGTTAAAGATAAAACCGAAAGTCAATAAAAATAAAACACCGACCGCATTTCAAAGCTTTGTTGAATAATTAATTTGTAAATTGCAAATGGCTTTGATTAACATCTCTTTGTTGATATACCATACATCTGAAATGTTTTATCCTGTAATAAACATTCCAGTTCGTGAATGGTTGTCAAAAATTCACTCATACACAACAGTTTACAATGTGGCAAACACTGGGATCGCTGCCGTCAGGAAGAAT
Unaligned ( gi|24 ): GATCGCCCGTAAATTTTATTATTAAGACACCAAACTCCTGCATTCTATATTCTAGTGAGTGTGTATGATAAAACAAGCTAATCTGTTACATCATACACCGAAAGTCCATCAAACAACCACTGCATTAATGCTTGAGCGAATTAACATTTGTAACATGCACGCAACTCTGATTAACATCTTATTGTATGTTACCCTGTCTAGTTCATTCCAGTTAATGAATGGTTGTCTGAAATTCATTCATCTGCAATTATTTACAACATCACAAGCATTGGATTCTTTGCAGTCATAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): ACCTAATCTTGTTTACGATAATATCGAAAGGCAATCACTCAATCCCTTTTAAAACTTGTGAATAAACACTTTATAAATTGCACATACCTCTGATTAGCATATCATTGTATGGATATAACATACATTTAAACTGTGTTAATCTGTCAAAAGCATTCCCATTCGTGAATGGTTGTCTAAAATTCACTCA
Unaligned ( gi|40 ): AATATTTAAAATATTATTTCTGCATTCTTCATTCTAGTAAGTGTTTAAGATATAACAGGCTTCAAATGAGGTACCTCTTACGCACTGAAAATCCATAAAAAAACTTGCATACAACTCTGAATAAAATCT
Unaligned ( gi|44 ): TGTCCGTTACTCTTGTCGTTGTTTATGAATGGTTATCGTTATCTGAAATACACTCATACACAAATGTTTACAATGTCACAAGC
Unaligned ( gi|45 ): ATTGTCCAATAGCGCCAACTGATATTGCTGAACATTAGAAAGTAAGATTTGAAAAACTGAGATAAATATACATTTTAGAAA
Unaligned ( gi|49 ): AGACAAAAAAAATACCACCAAGCCCTTTCTTCTGATACCAAAACAACAATTA
Unaligned ( gi|50 ): GTAACGATGGTAGATCTATTACTTTTCTTTTTACTATTACGCTCAACCGA
Unaligned ( gi|54 ): ATGATGATTCATCTTAATATTATCAGTGACACATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1111111111                                      111111111111111  11111111111111111111111111     1111111111                                                 55555555555555555555555                                                                                     222222222222222                    1111111                                                                                                      111111111                                                                    44444444444444                                                                                                                               1111                                                     111111111                                                                 1111111                                                                                                                           33333333333333                         11111111111111                                                1111111111  1111111                                                                                                                                        33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     0000000000 444          1                1      444444444444444  77777777777777777777777777     2222222222             0  33 33 2  2        2    2  33     77777777777777777777777  2 99999999 2                                             444 2            555   1  000000000000000    77777   2  0 6  3333333         2  2   1   44   2              8888888    5555      2   6666   66666                  33 33  111111111           2 1      33    1     33   2     33 33 7777777  2 8888    11111111111111          0           2              2 2                           666  5 2 5 2   1 2       777  333             66  33        0000  2             2      1         2         2         666666666 2  2 33 2 55  2          33  1  0         2    2   2            0000000 2   666666          1         4444     333 33  333 2   55555                    33     2   555        33  33     888888   55555555555555   88888888    0     2   33333333333333    2        22        0  44 2  2 4   1 1  1    6666666666  3333333   2               44                 1  22                        1  22   1 1 3333 88888888888  333               22               333 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .......... ...          .                .      ...............  ..........................     ..........             .  .. .. .  .        .    .  ..     .......................  . ........ .                                             ... .            ...   .  ...............    .....   .  . .  .......         .  .   .   ..   .              .......    ....      .   ....   .....                  .. ..  .........           . .      ..    .     ..   .     .. .. .......  . ....    ..............          .           .              . .                           ...  . . . .   . .       ...  ...             ..  ..        ....  .             .      .         .         .         ......... .  . .. . ..  .          ..  .  .         .    .   .            ....... .   ......          .         ....     ... ..  ... .   .....                    ..     .   ...        ..  ..     ......   ..............   ........    .     .   ..............    .        ..        .  .. .  . .   . .  .    ..........  .......   .               ..                 .  ..                        .  ..   . . .... ...........  ...               ..               ... ......................................................................................                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     9999999999 444          9                0      777777777777777  33333333333333333333333333     6666666666             1  22 22 4  4        4    4  22     22222222222222222222222  7 77777777 7                                             777 7            444   1  444444444444444    33333   9  7 6  3333333         7  7   5   33   7              7777777    7777      5   4444   22222                  77 22  000000000           2 6      11    5     11   2     11 66 2222222  2 0000    11111111111111          3           4              2 2                           888  0 5 0 5   8 2       888  999             55  22        0000  4             4      9         4         4         444444444 4  4 22 4 66  2          22  0  4         2    2   2            9999999 4   888888          8         7777     999 11  999 2   66666                    22     9   000        99  77     222222   33333333333333   55555555    2     2   11111111111111    1        99        1  88 0  0 0   9 9  9    5555555555  0000000   0               22                 7  33                        8  55   8 8 9999 66666666666  222               55               777 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444                                  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGTAC----AG-A-A-A---TAA---TT-A--------T-TAACGGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAAAN---ATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-GGAC----T--C------CTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAG-G-AA-G-G-G-ATTNA-TTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTT-AGA--------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAGACTAT-AC--CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
Reference ( family-293 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCGCTCACCTCACCCAACCTGANCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGTAC----AG-A-A-A---TAA---TT-A--------T-TAACGGTGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATCATTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGTT---T-----------CAAC----GATA-ACCTNTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTTACCC-------CAAAN---ATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-GGAC----T--C------CTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAG-G-AA-G-G-G-ATTNA-TTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTANCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGNTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGCAGAACGNTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTT-AGA--------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACAAA-CAGACCTTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAGACTAT-AC--CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTAGGACAACGCATATG----------C---TGACTCCGCG----------AACCTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGAG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TATGTAC----AG-A-A-AAA-TAAAATTT-A--------T-TAACGGTGTTACCCAAGTTCATTGAAGGTAAATCAACATTATAAT---G-ATTCATTCTAAC---ATCGTT---T--------------------ATATACAT-TG-------TATTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TTAACGTTTTACCC-------CAAAT---ATATTA-AAT---TATAGGCTACCCTAAGACCAACGAATC--C--GC----A----ACTAAGTAAAT-GAAATTGT--TTACGGTTTT--TAAACCTAT--AT-A-------AA-AA-T-GGAA----T--CACCA--TTCATTAATAATTATTAGATAC-TTTGGCAGTTTGGC-G-GAAAAA-AACAAAACTAGTCTATAAAG-G-AA-G-GAG-ATTTA-TTTGCAT---CA---ATCATGGCATATTTAAA--AGTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-AAAGTACCGTCAGAAT-CTACAAATA-AAACAACAAC----AATAA-AA-A--A-A--CA-GGT-----CA--AGTTTGTCTATATCT-ATTT-ATA-TAGAAGATACTT-------T-TAT------TCGCTGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--CA---A-AAT-----AGAATAGTCCGCATAGCTTT--CGTAG-TCT---TGATCATC--AC--AGACA------C
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caa--------------CAC--------TGTACTGTTT-ACG--------------GAAC-GTACAGTG--ACCTATTTTTA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAATAAA-CAGACCTTTAAGGAAAA-AA--ATCGTAGGAGATGGCCAAGCCTAT------------------------------------ATAAAGCGTAGA--ATACAGAGTGTTTCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTATCCTAATACTAAGGCTGGCCTCCGTAGAGGCttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttatcactgtactgtttacggaacgtacagtgacctatttttaaaaacaaatttaatgatttgataaactgaaataaacagacctttaaggaaaaaaatcgtaggagatggccaagcctatataaagcgtagaatacagagtgtttccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctatcctaatactaaggctggcctccgtagaggc
gi|10                         :                                                                                                                                                                         caaaatacatgttaggacaacgcatatgctgactccgcgaacctaatcattgtggtagggagtcatcccgccccggctgctacgcctttgctctcatatgtacagaaaaataaaatttattaacggtgttacccaagttcattgaaggtaaatcaacattataatgattcattctaacatcgtttatatacattgtattaaatatcagggtatctttttaacgttttaccccaaatatattaaattataggctaccctaagaccaacgaatccgcaactaagtaaatgaaattgtttacggtttttaaacctatataaaaatggaatcaccattcattaataattattagatactttggcagtttggcggaaaaaaacaaaactagtctataaaggaaggagatttatttgcatcaatcatggcatatttaaaagtgtgataaaattgaaataaacaacaaaagtaccgtcagaatctacaaataaaacaacaacaataaaaaaacaggtcaagtttgtctatatctatttatatagaagatacttttattcgctgaacgatgataacctgtgtatcaaaatagaatagtccgcatagctttcgtagtcttgatcatcacagacacttgaattctataagataaatgtgaacttacgatcgttcaaaagcgccaactgaactgttat--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-GGAC----TTAC------CTCATTAATAATTGTTAGATAA-ATGGGCAGTTTGGC-T-GGAAAATAACAAGACGTGTCCATAAAA-G-AA-TTG-G-ATTAA-TTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AATTATTATGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAGGTGCTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----GG--A-AA-A--A-AACTA-GGTTATACCA--AGCTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-AGGAGGATGCTT-------A-CAT------TCGCAGAACGATGATAACCT----GTGTA---T--TG---A-AAT-----AGACTCATGTGCATAGCTGT--CG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --------TATAATGTTT-AGA--------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-AAAAG-AT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAGCTGAGACAAAATGGACCTTAAAGAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCGAGACTAT-AC--CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATATATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCATAATATTAAGGCTGGCCTCCGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggatataatgtttagagacagtataatggcctatttataaaaaaaaagattaatgatttgataagctgagacaaaatggaccttaaagaaaagaaatcgtagaagatggtcgagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatatatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcataatattaaggctggcctccgta
gi|11                         :                         gtgaccaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagataaatgggcagtttggctggaaaataacaagacgtgtccataaaagaattggattaatttccaccagtcatggcatattaattattatgttttgaaataaacaacaaaggtgctgtcggcacctacaaatcaaacaaaaagggaaaaaaactaggttataccaagcttgcctatatctatttacaaggaggatgcttacattcgcagaacgatgataacctgtgtattgaaatagactcatgtgcatagctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaacgtcctccaacgaccgttccataaagccaacggaAATACATGTTGGGACAGCGTATATT----------C---TGACGTTACTCTCCTCACCAAACCTGAACATTGT---------------GG-------TAAGGTGGGGGGTGGTGGTGGGGG----------TCATTCCACCCAAGCT--G--C-TA-CGCTTTTA-CTTT-GA--TGTGTAC----AG-A-ATA---TAACATTT-A--------T-TAACGGTGTTAACCAATCTCATCAGAGGTAATGTATCATTATAAA---G-A
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATAAAGAA-AA--AT-GTAGAAGATGATCAAGACTGT-AC--CAT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATGCAGAATATATTC---G----aaaatgtagaagatgatcaagactgtaccatattgtaaaataaagcgtagaatgcagaatatattcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                tgtaatatttaaaacactattttatgcattctacgttgtagtaagtgttaaaaataaaacaagctttttaggtactgaaatcgggtacctcttatgcactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacctctcattgtatagatataccatcaattaaaatatgtaacactgtaaaacattctaggtaatgaatggttgtctgaaattcattcaaaaacaattgtttactgcaatataacaagcactggattcgctgctgcaaggaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatacatgttgggacagcgtatattctgacgttactctcctcaccaaacctgaacattgtggtaaggtggggggtggtggtgggggtcattccacccaagctgctacgcttttactttgatgtgtacagaatataacatttattaacggtgttaaccaatctcatcagaggtaatgtatca----GATA-ACCTATA-------TACCAAATA-TC-AGGATAT-ATTT-TAAACATTTTACCCATTTTTCCAAAA---ATGTTA-AAT---AATA-----CTCTAAATCCAACGAAAC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAAATTGGTATAACTGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A--T-GAAC----T---------CTCATAAATTTTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGCT-G-GGAAAATAGTAAGACAAGTCCAAAAAGAA-AA-G-G-G-ATTGA-TTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCATCAGCAC-CTACAGATC-AAAC-AAAAG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACA-----------------GTGTA---T--TT---A-AAT-----AGACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CCT---TGATCATC--TC--CAACA------CTA--------------CAC--------TGTA-------------------------ACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAGACTAT-AC--TGC-A-T----T-----------TT---GAAATAAAGCATAAA--ATACAGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tA-TTTCCAA---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----AT-GAAATAAACAACG-ACAGTACCGTTGGCAC-ATACAAATA-AAACAAA-------AG--A-AA-ATTA-A--CGTGGTTATACCATTAGTTAACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-CAT------GCGCAGAATGATGATAACCTGCAAGTGTA---A--TA---A-AAT-----AGACTAGTCCGCATATCTTC--CGTAG-TCT---TGATAATT--TC--TGACA------Cagagtcagattttga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          a--------------CGC--------TGTAATATTT-AGA--------------TACA-GTATAAAA--GTCTATTGATA--A-AA-AACAA-G-CT-TAATTTAG------GAAATAACATTT-GATTAACTGAGACAAA-CAGACCGTTAAAAAAAGGAA--ATGGTAGAAGATGATCAAGACTAT-AC--CGTCA-C----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGCttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatcgctgtaatatttagatacagtataaaagtctattgataaaaaacaagcttaatttaggaaataacatttgattaactgagacaaacagaccgttaaaaaaaggaaatggtagaagatgatcaagactataccgtcactgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacctatcttaatacttaggctggcctctgtagaggca
gi|14                         :                                                                                                                                                                      aatttccaacagtcatggcatattaaattgtgttatgaaataaacaacgacagtaccgttggcacatacaaataaaacaaaagaaaattaacgtggttataccattagttaacctatatctatttacatggaagatgcttacatgcgcagaatgatgataacctgcaagtgtaataaaatagactagtccgcatatcttccgtagtcttgataatttctgacacttgcttttctataagataaacaacatttccatcacgccaactgatatTGGGACAACGTATATT----------C---TGACCCC-CTCACCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------CA-----------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCAATT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CG--TGTGT-----------------------------------T-TA--GGTGTGACTCACTTTCATCGGAGGTAAATCGTCATTATAAT---G-ACTGGTTCAAAT---ATCGTT---------------CAAC----GGTA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAAGGTTTTACCC-------CAAAG---ATATTA-AAT---AATA-----CCATAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGTAAAT-AAA-TTAGAGTAACTGTATC--CAA-CCCAT--AT-A-------AA-A--T-AGAC----C--C------C------ACCCCCATT-GATA---TTGGCAGTTAGGC-G-GGAAAATAGCAAGATGAGTCCATAAAG-GTAG-G-G-G-GTCAA-TTTCCAC---CA---GTCATGGCATTTT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAACAAACAACA-AAAGTAGTGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--AGGG-A--A-A--AA-GGTTATACTA--GGGTTAACTATGTAT-AGTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATAACAT----GTGTA---T--AA---A-AAT-----Aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GATGTGACCAA-TTTCATTGGAGATAAATCATCATTATAAT---G-TCTCGTTCTAGA---ATTATT---TAACTAAGATAATAACTGAAAATA-ACATTAA-------TAACGAATACTC-AGG-TAT-CTTCGTG--CATTATACCC-------CAAAA---AGGTTA-AAT---AATG-----CTC--ACACCAAGAAATC--CTTGT----TTAAGATCAAGTAAAT-A----TG-----------------A-CCT------------------------GAC-------C------TTCATTAATGTGTAATAGATAA-ATTGGCAGTGTGGC-G-GGAAAAAAGCAAGACGAGTT-----------------G-ATTTA-TTTCGACTAACG---GCTATGACATAAT--AA--ACAGTGCT----TT-GTAAGAAACG-CA-AACGTATCGTCGGCACACTATACA-C-ATACAATAA-----------------A-A--CA-GGTTATTCTA--AGATTACCTATATAT-TTTT-GCA-TGGAAAATATTTCAAAACCACTGC------TAGTAGAACAATGATAATCT----GTATA---C--TA---A-A-T-----GGACGATCCCGCATATCTTT--CGTTG-TCT---TGATCATC--TT--TGACtag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAC-ATAAAAATA-AAACACATAG----G-----------A-A--CA-TGTTAAACTA--AGTTTACCTATATAT-GTTT-ACA-TGGAAGATGCTTCG-----A-AACTTCCATTCGCAGAACGATGACAATCT----GTAT----T--TT---A-TAT-----GGACGAGTCTGCAAACCTTT--CGgagtgcttatatataccaataaactggctatcgttctgacagcaagcacaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --------------CGC--------TGTTATGTTA-ACC--------------AACACGTGTAACG--GTATATTTATAC-A-GA-A-CAT-GCTT-TAATTGAGAAGTAAGA-------TTT-GATAAACTGAGACTAT-CAGACCTTTTAGAAAAG-AA--AGCGTAGACAATGAGTAAGACTCG-AC--CGT-AGT----TATTTATATATAGT---AAAATAAAGCGTCAA--AAACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA--AAA----CTATCTAAATACATAGACTGGCCTCCATAGAGGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatcgctgttatgttaaccaacacgtgtaacggtatatttatacagaacatgctttaattgagaagtaagatttgataaactgagactatcagaccttttagaaaagaaagcgtagacaatgagtaagactcgaccgtagttatttatatatagtaaaataaagcgtcaaaaacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaactatctaaatacatagactggcctccatagaggcaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                       cacataaaaataaaacacataggaacatgttaaactaagtttacctatatatgtttacatggaagatgcttcgaaacttccattcgcagaacgatgacaatctgtattttatatggacgagtctgcaaacctttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgactttgtgcatagcaccaactgatatAATATATATGGGGACAACGTGCATA----------CATATGGCACTGCTTATCTTACCCAACCTGAGCATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGG----------TCCACCCACCGCGTCT--C--C-TG-TGCCTTTG-CTTT-CA--AATGAAC----AGAA-A-A---TAGCATTT-A--------TAAAAAGACGCAACCCGATTTCATCGGAGGAAAATCATCATTGTAATGGCG-ACTCGTTCTAAC---ATTATTAGCT-----------TAAC-----AGA-ACAT-TA-------TATTACATA-T--AGA-------TT-CAAACA--ATACCC-------TAAAT---A----A-AATTTGAGTA-----CCaatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaTAAAT-AAAATTTGAGTACCGGTATC--CAA-CCTATGCAA-A-------AA-A--T-GGACCTGTT--C------CTCATTAAggtatccaacctatgcaaaaaatggacctgttcctcattaa
gi|18                         : aaatgaattaacagtttgtaacttgcacatacctaatttaaaatatgttaccctatcaaaacattccagttaatgaaatgtacatttattttactggactggctaccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacaagtttgtaatcaaaatatatatggggacaacgtgcatacatatggcactgcttatcttacccaacctgagcattgtgggagggggtccacccaccgcgtctcctgtgcctttgctttcaaatgaacagaaaatagcatttataaaaagacgcaacccgatttcatcggaggaaaatcatcattgtaatggcgactcgttctaacattattagcttaacagaacattatattacatatagattcaaacaatacccAATAAATGTTGTGACAATATATATATATATATATAC---TGGCCCCGCCAAACTCACCCAAACTGTACATTGC---------------GG-------GA------------------GAAG----------TCAATCCGCCCCGTC---A--CATA-CGCCTTTG-CTTT-CA------TAC----AG-A-AGA---TAA---T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtatcatttctttccattcaaatcgtttgttttaatgtttttttgtagagcctgagtgaattaccaatgcgtaaacattgttaaatttctaataacaccttattgtacgcatgtaccgtaaaccctgtcaaaataatctagtgaatgaatggttgtcttgaattcattcttacacagttgtttacagtattatcactagtactggattcggtgtggccaggaatacttagtgtatcctgtacagtgttaatatatctcttgcagctacatcgtttatttacacggttttaatgaaCATAACGATGATAATCT----GTATA---T--TT---A-CTT-----AGACTAGTTCGCATATCTTC--CATAT-TCC---TGATCATC--TT--CGATA------
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --------------CGC--------TGTTATGCTT-ACA--------------GGCA-GAATAGCA--GC--ATTT-TA--ATAACA-CAA-G-TT-TAATTTT-------GAAATTAGTTTT-GATAAACTTACACAAT-CAGACCATTCACAAAAG-AA--ATCGCAGAAGATGATCGAAACCAC-AC--CAT-A-T----T------------TAAAAAAACAAAAC----A--ATACTGGATGCATCattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatcgctgttatgcttacaggcagaatagcagcattttaataacacaagtttaattttgaaattagttttgataaacttacacaatcagaccattcacaaaagaaatcgcagaagatgatcgaaaccacaccatatttaaaaaaacaaaacaatactggatgcatcggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cataacgatgataatctgtatatttacttagactagttcgcatatcttccatattcctgatcatcttcgataattgcgtttctataagacaaacgttctcttacgaccgtttcatagcgccaacttatatAATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACTCCGCTAACCTCACCCAGCTTAATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATTCCGTCCCGGGT--G--C-TA-CGCATTGG-CTCT-CA--TATGTAC----AG-A-A-AAAATAAAATTT-A--------T-TAACGGTGTGAGCCGCTTTCATTGAAAGTAAATCACCATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACGTATA-------TAGTAAATA-TC-AGGATATACTTT-T-AACGTTTTACCC-------CAAAT---ATATTA-AAT---TATA-----CCCTAAGACCAACGAATC--C--GT----T----ACTAAGTAAAT-TAAATTGTGGTAACGGTGTC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-A------AC----T--CACCA--TTCATTAATAATTATTAGATAA-TTTGGCAATTTGGC-G-GG-AAATAACAAGACTAGTCTATTAAG-G-AA-G-GCG-GTTAA-TTTGCAT---CA---GTCATGGCATATTTAAA--ATTGTGATAAAATT-GAAATAAACAACA-CAAGTTCCGTCGGCAC-CTTCAAAT--AATTAAAA----------A-AA-A--A-C--CA-GTTCATAACA--GGTTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGGAGATGTTT-------A-CAT------TCGCTGGACGATGACAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTggattttaaatagtacccgtgccatattgcgctttacactgtcttaatatgtagcctttcttcaacaaaggcaagccaaaaag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcgaC--------TGTAATGTTT-AGG--------------GACA-TCACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------AA-------T-----------GAGATAAA-CATACCTTTAAGAAAAA-AA--AT-GTAGAAGATGGCCAAGACTAT-AC--CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---GNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTAACTTGATACTTAGGCTGGCCTCCtgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctctgtaatgtttagggacatcacaatgacctatttataaaaacaagtttaataatgagataaacatacctttaagaaaaaaaatgtagaagatggccaagactataccgtattgtaaaataaagcgtagaatacagaatgtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcctaacttgatacttaggctggcctcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcgaaatacatgttgggacaacgtatatgctgactccgctaacctcacccagcttaatcattgtggtagggggtcattccgtcccgggtgctacgcattggctctcatatgtacagaaaaaataaaatttattaacggtgtgagccgctttcattgaaagtaaatcaccattataatgactcattctaacatcatttcaacgataacgtatatagtaaatatcaggatatacttttaacgttttaccccaaatatattaaattataccctaagaccaacgaatccgttactaagtaaattaaattgtggtaacggtgtccaacctatataaaaactcaccattcattaataattattagataatttggcaatttggcgggaaataacaagactagtctattaaggaaggcggttaatttgcatcagtcatggcatatttaaaattgtgataaaattgaaataaacaacacaagttccgtcggcaccttcaaataattaaaaaaaaaccagttcataacaggtttgcctatatctatttacatgggagatgtttacattcgctggacgatgacaacctgtgtattaaaatagacttgctttcgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgaccgttcaaaagcgccaactgatatctC--TGATA------TCA--------------C----------TGTA-TATTT-AGA--------------GACA-GTACAATG--ACCTATTTATA--A-AA-AACAA-T-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAA--CAGACCTTTACGAAAA-------TCAAAGAAAATGGCCAAGACTAT-AC--CGA-A-T----T-----------GT---AAAATAATGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTGTCTTAATACTAAGGCTGGCTTACGTAGAGG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atatcttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttacgatcgttcaaaagcgccaaAATACATGTTAGGAAAACGCATATG----------C---TGATTTCGCTAATCTCACGCAACCTTATCATTGC---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCGTCCCTCCCCGGCT--G--C-TG-CGCCTTCG-CTAT-CA--TATATAC----AG-A-A-A---AAA---AT-AAAAAAATGC-TAACGTTATGACCAACTTTCACCGA------------ATTATAAT---G-ACTCATTCTAAC---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGAAT-CGTG-TTCACGCTTTACCC-------TAAAT---ATATTA-AAT---TATA-----TGCTAAGACCATCTTATC--C--GT----A----ATTAAGTAAAT-GGAATTGTTGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--ATAA-------AA-A--T-GGAC----T--CACCA--TTCATTAATATT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttaatcaa-GTATAATG--ACCTTTTTATA--A-AA-A-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTTTAAGAAAA--AA--ATCGTAGAAGATGGCCAAGACTTT-AT--CGA-T-T----T-----------GT---A-------------A--ATACAGAATGTTTAC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--ATC----CTATCATAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cttgcttttctataagataaacatccacttacgatcgttcaaaagcgccaactgatatcactgtacaat--------------CGC--------TGTACTGTTT-AGA--------------TACA-GTATAATG--GCCTATTTAT-----AA-A-TAA-G-TT-aggc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAA-----T----ACTGT-AC---GT---------------------T---AAAATAGATTGTAGACTATACAGAAGGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------C----TTA-----ATACTTAAGCTGGTCTCCGTAAAAGCaagaaaggaaatcgtagaatactgtacgttaaaatagattgtagactatacagaaggtatccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttaatacttaagctggtctccgtaaaagcaagcc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcatctccgaaacttgcttttctataagataaatcatcctcttacgaccgttccatagctccaactgatatcgctgtactgtttagatacagtataatggcctatttataaataagAACATATGTAGGATCAACGTATATA----------C---TGACCCCGCTGACCTCATCCAAACTGAACATTGT---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------ACACCCCG-CTCGGCT--G--C-TA-CGCATTTG-CCTT-CATGTGTGTAC----AG-ACA-A---AAA---AT-A--------------GATGTGACACAATTTCATCGGCGGTAAATTAACATTaagcc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcattcacaattgtttacaatgatttactgccggaataattagtgtgcctgtctagtgttttaagtatctggcagctacgccgctattttacaagtctttaccaaT-AGA--------------AACT-TTATAAT--------TTTA-A--G-AA-A-AAA-G-----AAT---------------------T-GATATACTGAATCAAA-TCGACATTTTAGAAAAG-AA--AGCATAGAAGATGATCGAGACTAG-AC--TGT-A-TGTTCT-----------GC-------CAAAGTGTAAA--AATCAGAATGTATGC---G-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--AAG----CTATCTAAATACATAGGCTGGCCTCCATAGAGGC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcatgaatgtagagatacaA-GGTCATAACG--AGTTTGCCTATATAT-GTTT-ACA-TAGAAGATGTTT-------A-CAT------TCGCCGAACGATAATTACCT----GTGTAGTCT--TG---ATCATCACCGACACTTG-CTGTATAACATAAACGTCC-TCT---T-ACCACCGTTCAACAACG------CCAACTGATAT------CAC--------TGTAATGTTT-AGG--------------GACA-GTACAATA--ACTTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTT-GCTAAACTGAGGTAAA-CAGACCTTCAAGAAAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACAAGTTGGGACCACGTATATG----------C---TGGTCCCGC--------------CTGAACATTGC---------------GGGGGTGGGTG-----------------GGGGGGGGGGGGGGATTATCCCGTCCCGGCT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGCGC----AGAA-A-A---TAACATTT-A--------T-TAAAAGTGTGACC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgcagctacaccgtttttttttatcaa--GT----G----ACCAAATAAAT-AGAATCAGA---------TC--T-----TAT--A--A-------AA-A--T-GGAC----TTAC------CTCATTAATAATTGTTAGATAaaataaatagaatcagatcttataaaaatggacttacctcattaataattgttagata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         tgcagctacaccgtttttttttatcaaaatacaagttgggaccacgtatatgctggtcccgcctgaacattgcgggggtgggtgggggggggggggggattatcccgtcccggctgctacgcctttgctctcatgtgcgcagaaaataacatttattaaaagtAATACATATTGGGACAACGTATATA----------C---TGAGCCAACTCACCTCATCCTACCTTATCATTGT---------------AG-------CA-----------------GGGGGG---------TCATCCCGCTCCAACT--A--C-TA-CGCATTTG-CTCT-CA--TGTG--------------------A---TT-A--------T-TAACGGTGTGACCCACTTTCATCTGAGGTAAATAATTATTATAAT---G-ACTCGTTCTTAT---ATCATT---T-----------TGAC----GGTA-ACCTGTT-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTCT-TAAACGTTTTACCA-------CAAAA---ATATTA-GAT---AATA-----CCCTAAAACCAACGAATC--C--GT----T----ACCAAGTTAAT-ACAATTGGAGTAACTGTATC--CAA-CCTTT--AT-A-------AA-A--T-GGA---------------CACATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCAATAAG-A-AA-G-G-G-ATTGA-TTTTCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAG----AG--A-AA-A--ACC--CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCTATATCT-ATTT-ACA-TTGAAGATGTTT-------A-AAC------TCGTACAGCGTTAATAACCT----GTGTA---T--TA---A-AAT-----AGACTATTCTGCATATATTT--CGTAG-TCT---TGACCATC--TC--CGACA------CCA--------------CGC--------TGTAATGTTTAAGA--------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CATACCTTTAAGAATGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCA-----AT-AC--CGC-T-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AAC----CTATCTTAATACTTAGGCTGGCCTCTGTAGAGGC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AA-G-T----AT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGACGAA-TGGACCTTTTATAAAAG-AA--ATGGT---GGATGATCAATAGTAG-AC--TGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCG-------TACAGAATGTATCC---G----
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAA--------TCGTGGAGGATGGTCAAGACTAT-GC--CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---GNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AA-------ATTTTAATACTTAGGCTGGCCTCCGTAGAGatatcgatggtaccatgtgccacattgcgctgtactgacttgtttcattttgtacagggtacctaacagggtatgaaacaatatctaaatccgtagaggcaag
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTGAGACAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-AA--ATCGTAGAAGGTGGTCAAGACTAT-A---CGC-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGAGTAGA--ATACAGAATGTATACAAAN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAA----CTATCTCAATACTAAGGC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---TTACCCCACTCACCTTCCCCAACCTGGTCATTGT---------------GT-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCCGTCCCAACTGAG--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT-----------------TA-------A--------T-TAACGGTGTGACTCACTTTCATCGAAGGTAAATCATCATTATAAT---G-A--CGTTCTAAaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttttatcaaCATTTTGGC-G-TGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAAAG-ATAA-G-G-G-ATTAT-TTTCCAC---CA---GTCATGGTATATT--AA--AATGTGTT----TTTGAAATAAATAACA-AAAGTAGCGTCGGTAC-CTACAAATC-AAATAAAAAG----AAACA-AA-A--A-G--CA-GGTTATAC
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGTTACCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TA---A-GAT-----AGGCTAGTCTGCATATATTT--TGTAG-TCT---TGATTATC--CC--CAACA------CTA--------------atgtacaagggttatgtgctgttt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gaagcattaatgggggactgcataATTA-AAT---TATA-----CCCTGAGATAGAGGAAGC--C---TAA--T----GCTAAGTAAAT-ACAATTGAA--AACAGAATCTACAA-CCTAT--AT-A-------AA-ACAT-GGAC----------------CATTA-----TCTCA--TAATATTGAAGGTGTGGC-G-GGAAAATATCTAGACGAGTCTATaataatacttaatactta
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agTTA-TTTCTAC---CAACAGCTAT--CATAT---AA--ACTGTGTG----AA-GAAATTAACAACA-GAAATACTGTCGGTTT-ATACAAATT-AAACACAAA---------A-AA-A--A-A--CA-GGTTATAATA--AGTTCATAAAAATCTAATTTGACATTGTAGGATACTcca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-------TATTAAATA-TC-CATGTGT-GTTT-TAAACATTTCACC---------AAATGAAAGATGA-AAT---ACTA-----CCTTAAGACCAAGGAATTAAT--GTCTAAC----ACCGAATAAATAAAAATCGAAGTAAAGGAATC--CAC-CCTAT--GC-A-------AA-A--a
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAACATGTTGGGTCAGTGTATATG----------T---TGACCCCGCTCACCTTACCCAACCTGTACATTGT---------------GG-------TA-----------------GAGGG----------TCATCCCGCCCCGGCT--G--C-TA-CGCTTTTG-CTCT-CA--TGTGTAC----AG-A-A-AA--TAACATTT-A--------T-TATCGGAGTGACCCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTACTATAAA---G-ACTCGTTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----TATA-ACATATA-------TACTAAATA-TC-TGGGTAT-ATTT-TAAACGTTTTACCC-------CAAAC---GTATTATAAT----ATA-----CCCTAAGACCAAGGAATC--C--GG----T----ACCAAGTAAAT-AAAAGCGGAGTAACGGTATC--CAA-TATAT--AT-ATATATATAA-A--T-GGAC----T--CGA----CTCATTAATATGTATAATATAA-ATTGGCAGTTTAGC-G-GGAAACTAGCAAAATGAGTCCATAAAG-G-AAGG-G-G-GTTAA-TTTCCAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ACTGTG-T----TT-GAAATA-----------------TTGGTAC-CTACAAATCGAAAAGAAAGG----GG--A-AA-A--A-A--CA-GGTTATATCA--GGTTTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATCCTT-------A-TAC------TCTCAGAACGTTGGTAACCT----GTGTA---TAATATTCA-ACT-----AGACTAGTCCGCATATCTGT--CGactgac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaATGTTC--CGTAGCTCCAACTGAT-ATC--AT--AGATA------TC----------------GC--------TGTAATGTTT-AAA--------------GATA-GTATAATG--GCCAATTTATA--A-AA-C-CAA-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAAACAAA-CATACCTTTAAGAAAAT-AA--ATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgatgttccgtagctccaactgatatcatagatatcgctgtaatgtttaaagatagtataatggccaatttataaaaccaaatttaatgatttgataaactgaaacaaacatacctttaagaaaataaatcg
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtgtcactgccgtaaaacaagcactggattcgctgccgccaggaataactagtgagctacaccgttaaggttttgataaaaaaaacatgttgggtcagtgtatatgttgaccccgctcaccttacccaacctgtacattgtggtagagggtcatcccgccccggctgctacgcttttgctctcatgtgtacagaaaataacatttattatcggagtgacccactttcatcggaggtaaatcattactataaagactcgttctaatatcatttcaactataacatatatactaaatatctgggtatattttaaacgttttaccccaaacgtattataatataccctaagaccaaggaatccggtaccaagtaaataaaagcggagtaacggtatccaatatatatatatatataaatggactcgactcattaatatgtataatataaattggcagtttagcgggaaactagcaaaatgagtccataaaggaagggggttaatttccaccagtcatggcatattaaactgtgtttgaaatattggtacctacaaatcgaaaagaaaggggaaaaaacaggttatatcaggtttgcctatatctatttacatggaagatccttatactctcagaacgttggtaacctgtgtataatattcaactagactagtccgcatatctgtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcacgTAAGACAAA-CATACCTATCACACAAG-AA--AGCGTAGAAGACGATCAAGACTAG-AC--CGT-A-A----T-----------GT---GAAATAAAGTGTCGA--ATACAGAATGTATC
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatccaATAA-ATTGGCTGTTTGGC-GAGGATAATATCTAGAAGAAATCAT----------------ATTTA-TTTCCAC---CA------ACAGC-TGTT-------TTGTGTG----AT-GAAATAAACAACACAAAATt
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTAATATTTATTTGATAA-TTTGGAAGTTTCGC-A-GGAAAATAGCAAGACGAGTCCATAATG-G-AA-G-G-G-GGTTA-TTTCCACCAACA---GATATGGCATA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A-AA-A-AAA-G-TTGTAA-----------GA-------TTTTGATAAACTGAGACAAA-CAGACATTTTAGAAAAG-AAGCATAGTAG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------------GG-------GA-----------------GGGGA----------TCATCCCGTCCCGTCT-----C-TACCGCCTTTGTTTCTGCA--TGTGTGCACATAA-A-A-A---TAA---tctagtcttta
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agTAGAAGATGATCAAGACTTT-AC--CGT-A-T----T-----------AA---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCT---G----
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACATGTTGGGACAACGTATATG----------C---AGACCCAATTCACCTCACCAAACCTAATCATTGT---------------AA-------TA-----------------AGGGG----------TCATCCCGCTCCGACT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-CA--TGTGT-----------------------TT-A--------T-TAACGGTGTGACCCACTTTTATCGGCTGTAAATCATTATTGTAAT---G-ACTTATTCTGAT---ATCATT---T-----------CAAC----AATA-ACCTTTA-------TACTAAATA-TC-AGGGT------T-TA-----TTTA-----------AAAA---ATATTA-AAT---AATA-----CCCTAAAATCAACGAATT--T--GT----T----ACCAAGTAAAT-ACAATTAGAGTAACTGTATC--CAG-CTTAT---------------------GGAC----T--C-------TCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGT-G-GGAAAGTAGCAAGACGAGTTAAAAAAG-T-AA-G-G-GTATTTA-TTACCAC---CA---GTCATGGCATATT--AT--TTTGAGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAATTAGCTTCGGCAC-AAACAAATC-AAACAAAAAA----GG--A-AA-A--T-CT-CA-GGTTATACCA--GGGTTTCCGATATCT-ATTT-ACA-TGGAAGATGCTT-------A-TAC------TCGTACAGCGTTGATAACCT----GTGTA---T--TC---A-AAT-----AGACTAGTCCGCAAATCTTT--TGTAG-TCT---TGACCATC--TC--TGATA------CTA--------------CGC--------TGTAATGTTA-AGA--------------GACA-GTATAATG--GCCTATTTATA--A-AA-A-CAA-G-TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGATAAG-CAGACCTTTAAGAAAGG-GA--ATCATTGAAGGTGGTCAAGACAACAAC--CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCATAGA--ATACAGATTGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AA-------ATCTTAATACTTAGGCTGGCa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTATTAATATTTATCAGATAA-ATTGACATTTTCGCTG-AAAAAATAGCGA
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----CTATCTAAATCAATAGGCGGGCCTCCGTAGAGGC
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aggTTAATACTTAGGCTGACCTCCTTAGAGGCaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGTTGGGACAATGTATATG----------C---TGATCCCGCTCACCTCACTCAACCTGATCATTGTTGTGGAAGGGGGAGGGG-------T------------------GGGGG----------TCATCCCGCCCCGACT--G--C-TA-CGCCTTTG-CTCT-TA--T-----------------A---TAT---TT-A--------T-TAATGTTGTGAACCACTTATATCGGAGGTAAAT---------------G-ATTCGTTCTCAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTGTA-------TAATATATA-TCTAGGTTAT-CTTT-GAAACGTTTTACCC-------CAAAC---ATATTA-AAT---AATA-----ATCAAATACCATCGAATC--C--GT----T----ATCAAGTAAAT-AAAATTGGAATAACAGTACC--CAA-CCTAT--AT-A-------AA-AA-T-GGAC----TTGC------CTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCATTTTGGC-C-GG-AAATAGCAAGACGAGTACATAACG-T-AAGG-G-G-ATCAA-TTTCCAC---CA---GTCATGCCATATA--AA--ACTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGTAGCGCCGGCAC-TTACAAATC-AAATCAAATG----AGA-A-AA-A--A-A--CA-GGTTATACCA--GAATTGCCTATATCT-ATTT-ACA-TGGA------------------------------AGAACATTGAC-ATAT----GTGTA------TA---A-AAT-----GGACTAGTCCGCATATCTTT--CGCAG-TCT---TGATCATC--TG--AGACA------CTAG-------------CGCCATATCGGTGTAATGTTT-AG-------------------------ATT--GCCTA---------------------TT-TAAT----------GA-------TTG-GATAAACTGAGACAAG-TAAACATTTAAGAAAAG-AA--ATCGTAGCAGATGGTAACGACTAT-AC--CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAGAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNAATACTATCTTAATACATAGGCTGGCCTTCGTAGaagcca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATACTTGTTGGGACAACGTATATG----------C---TGACCCCACTCGCCTCACCCAACCTGATCATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGG-----------TCATCCCGCACTTACT--GAGC-TA-CACTTTTG-CTCT-AC--TGTGT-----------------------TT-A--------T-TAACGGTGTGTCTCACTTTCATCGGAGGTAAATCATTTTTATAAT---G-ACTCGTTCTAAT---ATCGT---------------------------------ATA-------TACTAAATA-TC-AGGGTAT-CTTT-TAAACGTTTCACCC-------AAACA---ATGTTA-TAT---AATA-----ACCAAAGACCAACTAATC--C--GT----T----ACCATATAAAC-AAGATTGGAGTAACGGTATC--CAA-CCTAT--AT-A-------AAGA--T-GGAC----TTAC------CTCATT--------------------GGCAGTTTGGC-G-GGAAAATAGCAAGACGAGACCATAAAG-G-TA-A-G-G-ATTTAATTTCTAC---CA---GTCATGGCATATT--AA--ATTGTATT----TT-GAAATAAACAAC--AACGTAATGTGGGCAC-CTACAAACC-AAATAAAAAG----AG--A-AACA--A-A--CG-GGTGATATCA--GGGTTGCTTATATCT-ATTT-ATA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------CTGCAAAACGTTGATAACCT----GTATA---T--CA---A-AAT-----AGACCAGTCCGC--ATCTTT--TATAG-CCT---TGATAATC--TC--CGACACTTGGGCCAACTGATAT------CGC--------TGTAATGTTT-AGA--------------GACA-GTATAATG--GCCT------------------A-A-TT-TAAT----------GA-------TTT-GATGAACTGTGGC-------------AAGAAATG-AA--ATTTTAGAAGATTGTCAAAACTAA-ACATTTT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGGGTAGA--ATACAGAATGTATCC---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAC----CTATCTTAATACTTTGGTTGGCATCCGTGGAGGC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTAAACCGCCATTGCTAC---GCGCTTGCTC-AATCAGATCGTT---------------CAAC----GATA-ACCTATAGTA----TACTAAATA-TC-AGGATAT-CTTT-TAA-CGTT--ACCT-------AAAAA---ATATTA-TAT---AATA-----ACCTAAGATCAACTAATC--C--GT----T----ACCAAGAAGAT-AAAACTGGTGTAACGGTATC--CAA-TCTAT--AT-A-------AA-A--TTGGAC----T--CACCTCATTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTGGCAGTTTGGC-A-GGGGAATAGCAAGACGAGTCCATAAAG-G-TA-G-G-G-GTTTA-------------------ATGGCATATT--AA--ATTGTGTT----TT-GAAATAAACAACA-AAAGAAGCGTCGGCAC-CTACAAATC-AAACAAAAAGGGAAAG--A-AA-A--A-A--C--GGCTGTACCA--GGGTTGCCTA------ATCT-ACA-TGGAAGATACTT-------A-TAC------TCGCAGAACGTTGATTACTT----GTATG---T--TA---A-AAA-----ATACTAGTCTGCATATCTTT--TGTAG-CAT---TGGTCATC--AC--CGACA------CCAGCACCAACTAATATCGC--------TGTAATGTTT-AGA--------------GACA-GTATAATG--GTCTATTT---------------------TAAT----------GA-------TTT-GATAAACCGAGACAA-------------GAAAAG-AA--ATCGTAGAAGATGGTCAAGACAAT-AC--CGT-A-T----T-----------GT---AAAATAAAGCGTAGA--ATACAAAATGTATCC---G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA-------ATCTTAATCTTTAGGCTGGCCTCCGCAGAGa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tACAACGTATATG----------C---TGACCCTGCTCACCTCATACAACCTGAACATTGT---------------GG-------TA-----------------GGGGG----------TCATCCTGCCCCGGCT--G--C-TA-CACATTTG-CTCT-TA--TGTGTAC----AG-A-ATA---TCACG-TTGA--------T-CAACGGTGTGACCCACTTTCATCAGAACTAAATCATCATTAAAAA---G-ATTCGGTCTAAT---ATCATT---T-----------CAAC----GATA-ACCTATATCATAAGTACTAAATA-TC-AGGGTAT-ATTT-TAAATATTTTATCC-------CAAAC---ATATTA-AA-------A-----CCCCAAGACCAACGAATC--T--GT----T----AACAAGTAAAT-ACAACTGGAGTAACGGTATC--CGA-CCTAT--AT-A-----------------CC----TCAC------CTCATTAATATTTATTAGATAA-ATTTGCAGTATTGC-G-AGAAAATGGCCAGACGAGTCCATAAAG-G-AA-G-G-G------------------G---ATCACAGCAGATT--CA--ATTATATT----TT-GAAATAAACAACA-AACGTACAGTCGGCAC-CTACAAATT-AAGCAAAATG----AA--A-AA-A--------A-GGTTATACGA--AGTGTATCTATATCT-ATTT-ACA-CAGAGGATGCAT-------A-CAA------TCGCAGATCGATAATACCCT----GTGTA---T--TA---T-AAT-----AGACACATCCGCATATCTTT--CGNNN-NNN---NNNNNNNN--NN--NNNNN------NNN--------------NNN--------NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNTTTTATGACC-GTTCAATAGCGCCAACTGATAACA-AA-A-TAA-G-TT-CAAT----------GA-------TTT-GATAAACTGAGATAAA-CAGACCTATAATAAATG-AA--
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): ATCACCCGTAAAAGTTTAATATTTGAAACACCAATTGCTGCATTCTGGTTTAGTGAGTGTTAAAGATAAAACCGAAAGTCAATAAAAATAAAACACCGACCGCATTTCAAAGCTTTGTTGAATAATTAATTTGTAAATTGCAAATGGCTTTGATTAACATCTCTTTGTTGATATACCATACATCTGAAATGTTTTATCCTGTAATAAACATTCCAGTTCGTGAATGGTTGTCAAAAATTCACTCATACACAACAGTTTACAATGTGGCAAACACTGGGATCGCTGCCGTCAGGAAGAAT
Unaligned ( gi|24 ): GATCGCCCGTAAATTTTATTATTAAGACACCAAACTCCTGCATTCTATATTCTAGTGAGTGTGTATGATAAAACAAGCTAATCTGTTACATCATACACCGAAAGTCCATCAAACAACCACTGCATTAATGCTTGAGCGAATTAACATTTGTAACATGCACGCAACTCTGATTAACATCTTATTGTATGTTACCCTGTCTAGTTCATTCCAGTTAATGAATGGTTGTCTGAAATTCATTCATCTGCAATTATTTACAACATCACAAGCATTGGATTCTTTGCAGTCATAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): ACCTAATCTTGTTTACGATAATATCGAAAGGCAATCACTCAATCCCTTTTAAAACTTGTGAATAAACACTTTATAAATTGCACATACCTCTGATTAGCATATCATTGTATGGATATAACATACATTTAAACTGTGTTAATCTGTCAAAAGCATTCCCATTCGTGAATGGTTGTCTAAAATTCACTCA
Unaligned ( gi|40 ): AATATTTAAAATATTATTTCTGCATTCTTCATTCTAGTAAGTGTTTAAGATATAACAGGCTTCAAATGAGGTACCTCTTACGCACTGAAAATCCATAAAAAAACTTGCATACAACTCTGAATAAAATCT
Unaligned ( gi|44 ): TGTCCGTTACTCTTGTCGTTGTTTATGAATGGTTATCGTTATCTGAAATACACTCATACACAAATGTTTACAATGTCACAAGC
Unaligned ( gi|45 ): ATTGTCCAATAGCGCCAACTGATATTGCTGAACATTAGAAAGTAAGATTTGAAAAACTGAGATAAATATACATTTTAGAAA
Unaligned ( gi|49 ): AGACAAAAAAAATACCACCAAGCCCTTTCTTCTGATACCAAAACAACAATTA
Unaligned ( gi|50 ): GTAACGATGGTAGATCTATTACTTTTCTTTTTACTATTACGCTCAACCGA
Unaligned ( gi|54 ): ATGATGATTCATCTTAATATTATCAGTGACACATA