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Reference ( gi|4 ) : TATTT--AGTTA--TTTATTTA-----CGTGAAATGA-CTATA-A-TA----TAATACAAACATAGACAAA-CA----------A-ACAT-A-AT-A--GT--TGTAA--TAA--AA----AAG-----T--G-T-AC----T-------CA-GT-T-T-----AAACAG---TAT-TATCTG--TTAC-----TATA-ATA-AAGTGTCCTGT---T---TTAT--AAA---TGAT--TT-T----TGGGTTGGTTA-----ATAATACTTTTATATTTT-CTG-------T-TTTGTTAGCATCAACTTAACAC-AGT-ATGGTTATTGTTTGAAGAATGTCA--ATACG-TTA------TACATTGTTTCTCTCAC---AGTAAAGTAGGAAGTGTATTTCGGTTTCAAAACATTGAGCCTGGCATTGTTTACACATTCTTACATCTCTCGGA-ATTCGTTGATACCTCCCCAACTCTATTTCGA--TGG-----G-TAATGAACCTGCCCTGAATTGAGCTGTAACT-GAACGGATATA-TT--TTT-AAAGTTCAATTTTACATAGTTTTCACATTCAAAGTGGGTTTTAAATAATCT------ATAATTACTTAGCTTACTTTAAGAATG-CACATCGTTTA--ACCATTTTACTT--TATAGTTCGCCAT-CAAAGTGGTGCGAACTTCATTAATAAAATTTGCAGAATTAAAACAGTGCAGTGAATAGTTGTCAAAAGCAGCAACACAATTAATTTCTTTAAAAATATTTTTAAC-GTCATGTGACCAATTATTTTTTACACCTTGAGTAATCCCATAGAAAAATACGCTTTGTTAATCTTTTATTGCTCA------TAGCT-AT-TAACTTTTTCCACAGCCGTTAACTGTTACATTGTCATTTTATTTTTGGGGGTACCC-TTCCAATATCACATTGGATTGC-CGGGTTGAATGTACATTTATGAACTCCTAAGAAAAACCTTATAACTCTATTGTGCAATGTATCTGGTTCTGTATAAACTTTAAGCCCCCAGACACTTGATGAATA-ATC-CATAATTAGTACAAT-TTAACTCTCATA--------TAGCTTAGTGTATGATGAATACATGACATCAACTTTAAACAGTTTACATAA
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2745 ) : TATTTAT--TTA--TTTATTT-ACGTGACATGAT-T-A-CAAT-A----TAATACAAACATAGAC-A---A-------T---CAAACAT-AAT-A--GT--TGTAA--T---AAN----A--AGTT-GTAC-------CCA--GCCTAAACAGGCTTAT---CTGTCAC-----TATA-ATAAAGTGTCCTGT-T---T--TAGAAATGAT-TGTTGGGTTGGTTAATAGTACTTTTATTT--------TTT-CTGTTTCGCTAGCATCAACTGGACAC-AGTGTTGTTAATGTTTGAAGCATGTCAAAACGATA------TACATTGTTTCTCTCAC---AGTAAAGTAGGAAGTGT-ATTTCGGTTTCGACACATTGAGCCTGGCATTGCTTACACATTCTTTCATCTCTTGGA-ATTCGTTGATACCTCCCCAACTCTATTTCGA--TGG-----GTAATGAACCTGCCCTGAATTGAGCTATAACT-GAACGGATATA-TT--TTTAAAGTTCAATTTTACATAGTTTTCACATTCAAAG----TTGGTTTTAAATAATCTATAATTACTTAGCTTACTTTGAGAATG-CACATCGTTTA--ACCATTTTACTTTAT-AGTTCGTCAT-CAAAGTGGTGCGAACTTCATTAATAAAATNTGCAGGATTAAAACCGTGCAGTGAATGGTTGTCAAAAGCAGCAACACAATTAATTTCTTT-AAAAT--ATTT-CTAACGTCGTGTGACCAATTA-TTTTTACACCTTGAGTAATCCCATAGAAAAATACGCTTTGTTAATCTGTTATTGCTCA------TAGNT-AT-TAACTTTTTCCACAGCCGTAAGCTNNTACATTGTCGTCTTATTTTTGGAGGTACCCGTCCCATATCACCTTGGATTNC-CGGGTTGGATGTACATTTATGAANTCCTAAGAAAAA-CG-TATAACTCTATTGTGCAATGTATCTGGTTTTGAATAAACTTTAAGCCCCCAGACACTTGATGAATACATC-CGTAATTGGTACAACTTTACTATCATA--------TAGCTTAGTGTATGATGAATACATGACATCAACTTTA
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|5 : TTAT--TTA--TTTATGT-ACGTGACATGAT-T-A-CAAC-A----TAATACAAAAATAGAC-A---A-------A---CAAACATAAAT-A--TT--TGTAA--T---AAA----C--AACT-GTAC-------TCA--GTCTAAACAGGCTTAT---CTGTCAT-----Taacagtttacataa
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gi|6 : ttatttatttatgtacgtgacatgattacaacataatacaaaaatagacaaacaaacataaatatttgtaataaacaactgtactcagtctaaacaggcttatctgtcattttttaaacatatttataagttataaagaattatatagaataatggtgtttcaaagtgagaacacagtcggtcgtaaaattaagagtaaaatcattatatcggtaatatgcaatattataattattatgaaatatatttaagaagtatttaccaatcttaaacaaaatttgtataatatcaagtaattcgatttttcaaagtgtttatacaTTTAT--TTA--TCTATTT-TCGTGACATGAG-T-ATCTGT-A----TACTACAAACATA--C-A---A-------A---CAAACAT-AAT-A----------A--T---AAA----A--AGTT-GTTA-------CCA--ACCTAAACAGTCTTAT---CTGTCAC-----T-TT-TTAAAATATC
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gi|7 : -----TATA-ATAAAGTGTCCTGT-A---T--TAGAAATGAT-TGTTGAGTTGGTTAATAGAACTTTTATTT--------TTT-CTGTTTCGCTAGCGTCAACTGGACAC-AGTGTTGTTAATGTCTAAAGCATATCAAAACGATA------TAAATTATTTCTCTCAC---AGTAAAGTAGGAAGTGA-TTTTCTGTTTCGACACATTGAGCCTGGCATTGCTTACATATTCTTTTTTCTCTTGAT-ATTTGTTGGTACATCGCCAACTCTATTTCGA------------------------------TGAGCTAACACT-GAACGGATATA-TTTGTTTAAAGTTCAATTTTACATAGTTTTCACACTCAACG----TTGGTTTTGAATAACCTATAATTACTTAGCCTACTTTAAGAATG-TATATttttgtagtattaaataaaatttgtataatatcaaattatacgattttccaaaacgtttataataaagtgtcctgtattagaaatgattgttgagttggttaatagaacttttattttttctgtttcgctagcgtcaactggacacagtgttgttaatgtctaaagcatatcaaaacgatataaattatttctctcacagtaaagtaggaagtgattttctgtttcgacacattgagcctggcattgcttacatattcttttttctcttgatatttgttggtacatcgccaactctatttcgatgagctaacactgaacggatatatttgtttaaagttcaattttacatagttttcacactcaacgttggttttgaataacctataattacttagcctactttaagaatgtatat
gi|8 : tatttatttatttacgtgacatgattacaatacgtataatgcaaatatagacaaacacatataaacaaatataattagttgcaataaaaagttgtacccagcctaaacaagcttatttgtcattttttgtagtattaaataaaatttgtataatatcaaattatacgattttccaaaacgttT-ACGTGACATGAT-A-A-CAAT-A----TAATAGAAACATAAAC-A---C-------T---CAAAC---AAT-G--AT--TGTAA--T---AAT----A--AGTT-A------------------TAAACAGGTTTAT---ATGTCAT-----T
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10 : attatgaaatatatttaagtagcattttaccattattaaacaaagtttgtatacaatcaagttacacgatttttcaaagggttT--TTA--TTTATTA-ACGTGACATGAT-T-A-CAGTA----TAATACAAACATAGACA---A-------A---CAAACAT-AAT-A--GT--TGTAA--T---AAA----AATAATT-GTAC-------CCA--GCCTAAACAGGCTTAT---CCGTCACATTTTTTTA-ATAACATGTtcatacaaattcgaaactattcgaaactctccaagcactttcatgtccatgaaatttaaaaactcatttaaaacaatacctactagatagttgtagttgtggcatatatcaggttttcagttaccgaaatgaaaatagtattcagtttttaattgagttgttttgtcctaaaatgaataatattcgatttatttatatttactgacattcgattttatagcaccaggtatataaaaaaatcatcattaacagcaaattcagttccgaagagaatgcctacttaaagttaattatccatggaaactcatttatgccagaaaaacgtcatttataaaaatagaaaaaaatgtcggcgatatacgtctctttgtttaacaccggatgtgatatcaaaaattatgtgaaactgcaattaacgttagttgctgctgaacattcatcgtacaaactc
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