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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attatttttttttaaatACCTGAA-TAGCTCTACTGACAA------CAG---ATGCTGTATGTAAAATATCTAAGGGTTAGGCCT----TGAACTTTCAG-A----------------CAAATCTTACTTAAAATGTGC----TTA--TAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAAT-GACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTC-TATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGcctgtggcagagaaatttatttgtggttgaacgacactggttcaagaacttgtctgagatcatgtggttataaaactgttgtgcaaattggttaagatttaatga
gi|4                          :                                                                            acacttcaacatcagtctttcgttgtcatagtcacctcctgaaagacaaaaaggttatagttaaaactttgtttatgaaatatgggtcttccgtggcagagtgttctaaggcgcagtctcaagatcacttacctctcaccacggaagccgcaggttcgagtccagctcaattatgtgaaaagtggtctacatggattcattctgattaaaaaaacaacaataaaattggatctgcattgcataacctagaatgtgttgaaaaaagtgataa---ATGCTACACATAACAAATCTAATGTCTAGGCCT----TGAACTTTCAG-AGAAATTTTTTTTTT--AAAGTTTTGTTTGAAATGTGC----TTA--TAA--------------A---C
gi|11                         : aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactcctgtaagacctaaggtataggccttgaatttcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgca---ATGATGCATGTAAAATATCTAAAGTATAGGCGTAAAAGAAAATTAAAA-AAAAA-AGGTTTTcccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttctcttcataacactatgtataactgttactgctgtgccagatcctaatcttggtagatgacttttaattaGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCT----TAAACTTTCAG-AG-AA-ATGTTTTT-----AGTTTTGCTTAAAATGTGC----TTA--TAA--------------G---CC---ATG
gi|12                         :                                                                                                      gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaagAGTTTTGCTTAAAATGTTC----TTA--TAA--------------G---TA---ATtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttTGTGCAGATTTAATTAA--------------GATTCA---ATGG-AAAAT-GA-G--GATAT---TATTGTGACAGTGACATTTTCCCTATATAACTCGTATATAAAATAGTGACTCATGTGGCAGCCCAAAATTTGAT-GCCA--GG----G-ACC-CAACTTGGCAAAC--AT-TTTAGGGGACCCCTATGCA-ATGCTACACATAACAAATCTAATGTCTAGGCCTT----GAAC-TTTCAGAGAAAT-TTTTTTTTT-AAAGTTTTGTTTGAAATGTGCTTATAAACCCCATGGCAGGGGCAT---TT-GC-AGTTGAATCGCACTGGTTCAAtttagtaggcttgtggttaacatgcttgctcaaagatacaaagacttgcagtttgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactcctgtaagacctaaggtataggccttgaatttcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtc--TAA--------------GATTCA---ATGG-GAAAT-AA-A--CGGGT---TGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTATGACTC-TATGTAAAACGGTGACGCCTGTGGCGGCCCCAAATTTGAC-ACCA--GA----T-A-TCCGA------------CT-TTTACAGGACCTTCATGCA-ATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTT----GAAC-GTTCAGAGAAAA-TGTTTTT---GAAATTTAGCTTAAACTGTGCTTATAAGCAATGTGGAGGGGGCAT---TT-GT-GGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTACTGC--TATGCAAGTTTGGTTAAAATTCAA--TGAAGAATAAAGGTGCTATCTCGTCTTCA-----A--Tcaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                    aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgttA---ATGA-AAATT-GG-A--C-TGC---TACCGCACCTACA---TTCTCCCC-TATAACAC-TATATAAAACAGTGACCCCTGTGGTGGCCCCAAATTTGAC-CCCATGGACCA-A-ACTTCAAC-----AAAT--CT-TTTAGGTGACCTCCTTGCA-AGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTT----AAAC-TTTCAGAGAAA--TGTTTTT-----AGTTTTGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCATGTGGTGGGAGCAT---GT----GGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTATTTAACTGC--TGTGAAAGTTTGGTTAAGATTCAA--TAAAAAATGAAGGTGCTATCGCATCTACA-----A--aaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttA-GAAATAGA-A--GGTTC---TATCGCGTCTTCAACATTTTCCCTATATGACTC-TATGTGAAACATTGATCCCTGTGGCGGCCCCAAATTTGACTCCAG--GGACCCG-ACTTTAAC-----AAAT--CA-TTTAGGAGATATCCGTGCA-ATGTTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTCTCTTCATAACAC-TATGTATAACTGTTACTGCTGTG------CCAGAT----C-CTAA--T--------CTT-GGT-----AGATGACT-TTTA----------AT-TA-ATGATGCATGTAAAATATCTAAAGTATAGG-CGTAAAAGAAA-ATTAAAAAAAAAAGGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGC-CAAA--GA----GGACTTGAAT-----CGCT--CT---------ACTTGCA-ACAGATGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCAT----AAAC-GGTCTGAAAAAAATGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGGCAT---TT-GT-GGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGC--TGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAATA--AACGGGTTGTTGCGTCAACGAT---A--TTTTCCCTGTATGACT-CTATGTAAAACGGTGACGCC-TGTG----GC------------------GGCCCCAAATTTG--A-CA------CC--AG-----A-TATC---CGA--CT-TTTACAGGACCTTCATGCAATG--CTACATGTAAAATAT-------CGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTG--AAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGG----CATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTC--CGAGATCTTATGGTTATATTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatcatttcgttttgataaaagcaagaGGC-CCAA--GA----GGACCTGAAC-----GC-T--CTACTTACAAGACCTCCATACA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTT----GAAC-TTTCAG--AGAGATGTTTTTTTAAAAATTTGGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCAGAGAAATTTATT-TGTGGTTGAACGACACTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCATGTGGTTATAAAACTGT--TGTGCAAA-TTGGTTAAGATTctgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attatttttttttaaattaaaaaacaaga-ATGCTGTATGTAAAATATCTAAGGGTTAGGCCTT----GAAC-TTTCAGACAAA----------------TCTTACTTAAAATGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGGCAT---TT-AT-GGTCAAATGACACTGGTGCAAAAATGTGTCTACAACATTTTCCCTATATAACT-CTATGTAAAAtaatga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acacttcaacatcagtctttcgttgtcatagtcacctcctgaaagacaaaaaggttatagttaaaactttgtttatgaaatatgggtcttccgtggcagagtgttctaaggcgcagtctcaagatcacttacctctcaccacggaagccgcaggttcgagtccagctcaattatgtgaaaagtggtctacatggattcattctgattaaaaaaacaacaataaaattggatctgcattgcataacctagaatgtgttgaaaaaagtgataaacctgaatagctctactgacaacagTGTAAGAC--CTAAGGTATAGGCCTT----GAA--TTTCAGAGAAA---------------GTTTTGCTAAAAATATGCTTATAAGCCCTGTGGTGGGGGCAT---TT-GT-TGTCGAATCACGCATGTTCAAGAACTTGTCTG-------------------------TGCAGA--TTTAATTAAGATTCAA--TGGAAAATGAGGATATTATTGTG---ACAGTGACA--TTTTCCCTATATAACTCGTATATAAAATAGTGACT---------------CATGTGGCA--------GCCCAAAATTTGA-TGCCAGGGACCC--AA-----C-T-T-G-GCAAACAT-TTTAGGGGACCCCTATGCAATGCTACACATAACAAA--T-------CTAATGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAATTTTTTTTTT--AAAGTTTTGTTTGAAATGTGCTT----ATAAACCCCATGGCAGGGG----CATTTGCAGTTGAATCGCACTGGTTCAACAACcggtgacccctgtgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactccT----GAACATTTCAAA-------GTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGACAT---TTGTA-A-TTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGC--TGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAA--TGAAAATTGGAC-TGCTACCGCACCTACA-----T--TCTCCCCTATAACACT-AT--ATAAAACAGTGACCCC---TG---TG------GT-----------GGCCCCAAATTTGACC-CCATGGACCA--AA-----C-T-TCA-ACAAATCT-TTTAGGTGACCTCCTTGCAAGG--CTACATGTAAAATAT-------CCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT-----AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAG----CA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAAC--CGAGAT-CTaaatctttaaccctttacttcatata
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacata--AGAAATA-GAAGGTTCTATCGCGTCTTCA-----ACATTTTCCCTATATGACT-CTATGTGAAACATTGATCCC-TGTG----GC------------------GGCCCCAAATTTGACT-CCAGGGACCC--GA-----C-T-TTA-ACAAATCA-TTTAGGAGATATCCGTGCAATtgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTGTCTACA-----ACATTTTCCCTATATAACT-CTATGTAAAACGGTGACCCC-gtt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acacttcaacatcagtctttcgttgtcatagtcacctcctgaaagacaaaaaggttatagttaaaactttgtttatgaaatatgggtcttccgtggcagagtgttctaaggcgcagtctcaagatcacttacctctcaccacggaagccgcaggttcgagtccagctcaattatgtgaaaagtggtctacatggattcattctgattaaaaaaacaacaataaaattggatctgcattgcataacctagaatgtgttgaaaaaagtgataaacctgaatagctctactgacaacagatgctgtatgtaaaatatctaagggttaggccttgaactttcagacaaatcttacttaaaatgtgcttataatccctgtgacaggggcatttatggtcaaatgacactggtgcaaaaatTGACTTTTAAT-TAATGATGCATGTAAAATATCTAAAGTtgtgg
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   attatttttttttaaattaaaaaacaagaggcccaagaggacctgaacgctctacttacaaATGCTGTATGTAAAATATCTAAGG----------G--T-TA---GGCCTTGAA-----CTT-TCAGACAAATCT-Ttaggccttgaactttcagagagatgtttttttaaaaatttggcttaaaatgtgcttataagccctgtggcagagaaatttatttgtggttgaacgacactggttcaagaacttgtctgagatcatgtggttataaaactgttgtgcaaattggttaagatttaatga
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7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|8 ): TCTCAAGATCACTTACCTGTCACACAATGGTTGATGGTTCAAATCCAGTTTAGTTAAAAAAAACAACAACGTACAATTGTCACTGTGAATGAAACAAAGTATAAATAAACTGCAACTTACTGGATCTGTGAACATTGCCCTGGAATGTG
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Unaligned ( gi|13 ): AAAATTATATGAAATCATTAATGGATAAATGAAACATGAGAACCAAAAGGACCTGAATCGCTTTACTTGCAACATGTTGACAGATGGATATTTCAGA
Unaligned ( gi|14 ): ATAATCAAAAATGTTCAAACTAAGGTTTTTCTGTGTTCACGTGATCCAAGGCCCCGTCTAAACATCACTTAACTCTCATCAT
Unaligned ( gi|15 ): TAACTGCATTAGACAACAGATGAGCTGCTAACAAATTACCATGACATAAGTATTTTGGCCAGTAGTTCTAATAAAAC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttAGTTTTGCTTAAAATGTTCTT----ATAAGTAATTTTAGTAGG----CTTGTGGTTAACATG---CTTGCTCAAAGATACA---AAGAC-TTGCAGTTtttagtaggcttgtggttaacatgcttgctcaaagatacaaagacttgcagtttgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttGATAAATGA---AACATGAGAACCAAAAGGACCTGAATC-GCTTTACTTGCAACAtgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaattatatgaaatcattaatg---AACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATC-ACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGATAAA--A----GCAAGAGGCCAAAGAGGACTTGAATC-GCTCTACTTGCAACAGA-TGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAAC-GGTCTGAAAAAAATGTTTTGTAAAGTTTAACT-TAGAA-TGTGCTTATAA--------------G---
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aatcatttcgtttATGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAA--AAAAATGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAATAAACGGGTTGTTGCGTCAACGAT---ATTTTCCCTGTA-------TGACTC-T--ATGTAAAACGGTGACGCCT---GTG--GC------------------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGA-----------CTTTTACAGGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGC-AATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGG-ATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTAtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagAAGTTTGG-T-TAAAA-T-------T--------------------CA---ATGAA-GAAT-AA-A--GGTGCTA---TCTCGTCTctgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATC-GCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA-----------------------TGAACATTTCAA-AG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------tcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGAACA-TTTCAA--AG-----TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATTGGAC-TGCTACCGCACCTACA-----TTCTCCCCTATA---------ACAC-T--ATATAAAACAGTGAC-CCCT--GTGGTG--------------------GCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGC-CATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAA-ATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAAA-AAAT-GA-A--GGTGCTA---TCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtgAAAATGGGAATGCTATCACATCTACAAC---ATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTC-TAGATGTAAAACAGTGACTCCT---GTAAGACC-----TAAGGTAT---AGGCCTTGAATTTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AAAT-GG-G--AATGCTA---TCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTCTAGATGTAAAACAGTGACTCCTGTcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgcaatgctacacataacaaatctaatgtctaggccttgaactttcagagaaattttttttttaaagttttgtttgaaatgtgcttataaaccccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTGTAAGAC--CTAAGGTATAGGCCTTGAA---TTTCAG--AGAAA-------------GTTTTGCTAAAAATATGCTTATAAGCCCTGTGGTGGGGG----CATTTGTTGTCGAATCACGCATGTTCAAGAACTTGTC-------------------------TGTGCAGATTTAATTAAGATTCAATGGAAAATGAGGATATTATTGTG---ACAGTGACATTTTCCCTATA-------TAACTCGT--ATATAAAATAGTGAC--------------T-CATGTGGCA--------GCCCAAAATTTGATGCCAGGGACCCAACTT-GGCAAACATTTTAGGGGACCCCTATGCAATGCTACACATAACAAATCTAATGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAATTTTTTTTTTAAAGTTTTGTTTGAAATGTGCTT----ATAAAC-CCCATGGCAGGGGCATTTGCAGTTGA-ATCGCACTGGTTCAACAACaagacctaaggtataggccttgaatttcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgcaatgctacacataacaaatctaatgtctaggccttgaactttcagagaaattttttttttaaagttttgtttgaaatgtgcttataaaccccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactccACCTGAA-TAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGGTTAGGCCTTGAAC-TTTCAG-ACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAAT-GACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATA-------TAACTCT--ATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|9 ): AACTTATCCGGGGTATTAAGGCTTTAAATAACATAACCAAGTTTGATTAAAATCAAATTGCTTATACAGCTTCAATTGAATCAACGTGGTGGAAACGTTAACGAACAAACGACAGACAACGGACAAATTACCATCACAT
Unaligned ( gi|14 ): ATAATCAAAAATGTTCAAACTAAGGTTTTTCTGTGTTCACGTGATCCAAGGCCCCGTCTAAACATCACTTAACTCTCATCAT
Unaligned ( gi|15 ): TAACTGCATTAGACAACAGATGAGCTGCTAACAAATTACCATGACATAAGTATTTTGGCCAGTAGTTCTAATAAAAC






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Reference ( family-2703 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAAA--A---AACAAGAGGCCGAAGAGGACCTGAATCGCTCTACTTGCAACAGA-TGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC-TTTCAGAGAAAATGTTTTTTAAAGTTTTGCT-TAAAA-TGTGCTTATAA--------------G---CA---ATGA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACAGTGACCCCTGTGGCGGCCCCAAAT-TTGAC-CCAAGA----G-ACTTNAA-CGAATCT-TTTAGGAGACCTCCATGCA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAG--AGAAATGTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCGGGGG----CATTTGTGGTCGAATCACGCTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCTTGTGGTTATATAACTGCTGTGCAAGTTTGGTTAAGATTCAATGAAAAATGAANGTGCTATCGCGTCTACAATATTTTCCCTATA-------TAACTC-T--ATGTAAAACAGTGAC-CCC---GTGATGCT-CATGT-AAATAT---AGGCCCCAAATTTGACNCCAGGGACCCAACTTCGACAAATCTTTTAGGGGACCCCCATGCAATGCTACACGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAA-ATGTTTTTTAAAGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCNTGTGGCGGGGGCATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAGAACNCGTCCGAGATCTTGCGGTTATATTA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttGATAAATGA---AACATGAGAACCAAAAGGACCTGAATCGCTTTACTTGCAACAtgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaattatatgaaatcattaatg---AACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGC-CAAAGA----GGACTTGAATCG---CT-CT------ACTTGCA-ACAGATGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAA--AAAAATGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAATAAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTA-------TGACTC-T--ATGTAAAACGGTGACGCCT---GTG--GC------------------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatcatttcgttttgataaaagcaagaAAGTTTGG-T-TAAAA-T-------T--------------------CA---ATGA-AGAAT-AA-A--GGTGC---TATCTCGTCTTCAATActgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA-----------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAACA-TTTCAA--AG-----TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGT--TATAACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATTGGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TA-------TAACAC-T--ATATAAAACAGTGAC-CCCT--GTGGT--------------------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtgAAAATGGGAATGCTATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTC-TAGATGTAAAACAGTGACTCCT---GTAAGACC-TA----AGGTAT---AGGCCTTGAATTTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactccACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGGTTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAAT-GACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
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Reference ( family-2703 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATAAATGAAACAAGAGGNCGAAGAGGACCTGAATCGCTCTACTTNCAACAAA-TGCTACATGTAAAATATCTAA-GG-CTAGGCCTTGAAC-TTTCAGAGAAA-TGTTTTTTAAAGTTTTGCT-TAAAA-TGTGCTTATAA--------------G---CA---ATGA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGCGGCCCCAAAT-TTGGCCCAAGAG----GACTTNAA-CGAATCT-TTTAGGAGACCTCCATGCA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAAA--TGTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCGGGGG----CATTTGTGGTCGAATCACGCTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCTTGTGGTTATATAACTGCTGTGCAAGTTTGGTTAAGATTCAATGAAAAATGAANGTGCTATCGCGTCTACGACATTTTCCCTATA-------TAACTC-T--ATGTAAAACAGTGAC-CCC---GTGATGCT-CATGT--AGTAT---AGGCCCCAAATTTGACNCCAGGGACCCAACTTCGACAAATCTTTTAGGGGACCCCCATGCAATGCTACACGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAA-ATGTTTTTTAAAGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGCGGGGGCATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAGAACNCGTCCGAGATCTTGCGGTTATATTA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaattatatgaaatcattaatgAACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGCCAAAGAG----GACTTGAATCG---CT-CT------ACTTGCA-ACAGATGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAAAAAAA--TGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAATAAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTA-------TGACTC-T--ATGTAAAACGGTGACGCCT---GTG--GC------------------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
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gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA------------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAACA-TTTCAAAG-------TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATTGGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TA-------TAACAC-T--ATATAAAACAGTGAC-CCC--------------TGT--GGT------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtgAAAATGGGAATGCTATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTC-TAGATGTAAAACAGTGACTCCT---GTAAGACC-TAAG----GTAT---AGGCCTTGAATTTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGTAAGAC--CTAAGGTATAGGCCTTGAA---TTTCAGAGAAA---------------GTTTTGCTAAAAATATGCTTATAAGCCCTGTGGTGGGGG----CATTTGTTGTCGAATCACGCATGTTCAAGAACTTGTCTG-------------------------TGCAGATTTAATTAAGATTCAATGGAAAATGAGGATATTATTGTGACAGTGACATTTTCCCTATA-------TAACTCGT--ATATAAAATAGTGAC--------------T-CATGT--GGCA------GCCCAAAATTTGATGCCAGGGACCCAACTT-GGCAAACATTTTAGGGGACCCCTATGCAATGCTACACATAACAAATCTAATGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAATTTTTTTTTTAAAGTTTTGTTTGAAATGTGCTT----ATAAACCCCATGGCAGGGGCATTTGCAGTTGAATCGCACTGGTTCAACAACcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgcaatgctacacataacaaatctaatgtctaggccttgaactttcagagaaattttttttttaaagttttgtttgaaatgtgcttataaaccccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactccACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGG-TTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAAT-GACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acacttcaacatcagtctttcgttgtcatagtcacctcctgaaagacaaaaaggttatagttaaaactttgtttatgaaatatgggtcttccgtggcagagtgttctaaggcgcagtctcaagatcacttacctctcaccacggaagccgcaggttcgagtccagctcaattatgtgaaaagtggtctacatggattcattctgattaaaaaaacaacaataaaattggatctgcattgcataacctagaatgtgttgaaaaaagtgataaGGCCCAAGAG----GACCTGAA-CG-CTCTACTTACAAGACCTCCATACA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAGA--TGTTTTTTTAAAAATTTGGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCAGAGAAATTTATTTGTGGTTGAACGACACTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCATGTGGTTATAAAACTGTTGTGCAAA-TTGGTTAAGATTTAATGA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TGGTTATGAAAAATATATCCAAGTTTGATTAAAAATTCTATCAAAATTGTAACTTATCTTCAATGAAGGAGACAAAATATTTACAGATGACTGACTATTGACAACAGACAATGTAAAAATTACCATGACACAAGTTATTTAGCCAATAGTGCTAAAAAAACA
Unaligned ( gi|8 ): TCTCAAGATCACTTACCTGTCACACAATGGTTGATGGTTCAAATCCAGTTTAGTTAAAAAAAACAACAACGTACAATTGTCACTGTGAATGAAACAAAGTATAAATAAACTGCAACTTACTGGATCTGTGAACATTGCCCTGGAATGTG
Unaligned ( gi|9 ): AACTTATCCGGGGTATTAAGGCTTTAAATAACATAACCAAGTTTGATTAAAATCAAATTGCTTATACAGCTTCAATTGAATCAACGTGGTGGAAACGTTAACGAACAAACGACAGACAACGGACAAATTACCATCACAT
Unaligned ( gi|14 ): ATAATCAAAAATGTTCAAACTAAGGTTTTTCTGTGTTCACGTGATCCAAGGCCCCGTCTAAACATCACTTAACTCTCATCAT
Unaligned ( gi|15 ): TAACTGCATTAGACAACAGATGAGCTGCTAACAAATTACCATGACATAAGTATTTTGGCCAGTAGTTCTAATAAAAC






Alignments
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Reference ( family-2703 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAAATGNAACAAGAGGNCGAAGAGGACCTGAATCGCTCTACTTNCAACAAA-TGCTACATGTAAAATATCTAA-GG-CTAGGCCTTGAAC-TTTCAGAGAAA-TGTTTTTTAAAGTTTTGCT-TAAAA-TGTGCTTATAA--------------G---CA---ATGA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGCGGCCCCAAAT-TTGGCCCAAGAG----GACTTNAA-CGAATCT-CTTAGGAGACCTCCATGCA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAAA--TGTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCGGGGG----CATTTGTGGTCGAATCACGCTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCTTGTGGTTATATAACTGCTGTGCAAGTTTGGTTAAGATTCAATGAAAAATGAANGTGCTATCGCGTCTACGACATTTTCCCTATA-------TAACTC-T--ATGTAAAACAGTGAC-CCC---GTAA-GCT-CATGT--GGTAT---AGGCCCCAAATTTGACNCCAGGGACCCAACTTCGACAAATCTTTTAGGGGACCCCCATGCAATGCTACACGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAA-ATGTTTTTTAAAGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGCGGGGGCATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAGAACNCGTCCGAGATCTTGCGGTTATATTA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttGATAAATGAAACATGAGAACCAAAAGGACCTGAATCGCTTTACTTGCAACAtgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaattatatgaaatcattaatgAACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGCCAAAGAG----GACTTGAATCG---CT-CT------ACTTGCA-ACAGATGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAAAAAAA--TGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAATAAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTA-------TGACTC-T--ATGTAAAACGGTGAC-GCC--------------TGT--GGC------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatcatttcgttttgataaaagcaagaAAGTTTGG-T-TAAAA-T-------T--------------------CA---ATGA-AGAAT-AA-A--GGTGC---TATCTCGTCTTCAATActgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA------------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAACA-TTTCAAAG-------TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATTGGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TA-------TAACAC-T--ATATAAAACAGTGAC-CCC--------------TGT--GGT------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtgAAAATGGGAATGCTATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTC-TAGATGTAAAACAGTGACTCCT---GTAA-GAC-C-TAA--GGTAT---AGGCCTTGAATTTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactccACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGG-TTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAAT-GACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
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Reference ( family-2703 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAAATGNAACAAGAGGNCGAAGAGGACCTGAATCGCTCTACTTNCAACAAA-TGCTACATGTAAAATATCTAA-GG-CTAGGCCTTGAAC-TTTCAGAGAAA-TGTTTTTTAAAGTTTTGCT-TAAAA-TGTGCTTATAA--------------G---CA---ATGA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGCGGCCCCAAAT-TTGGCCCAAGAG----GACTTNAA-CGAATCT-CTTAGGAGACCTCCATGCA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAAA--TGTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCGGGGG----CATTTGTGGTCGAATCACGCTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCTTGTGGTTATATAACTGCTGTGCAAGTTTGGTTAAGATTCAATGAAAAATGAANGTGCTATCGCGTCTACGACATTTTCCCTATA-------TAACTC-T--ATGTAAAACAGTGAC-CCCG-A---AGT----CATGT--GGTAT---AGGCCCCAAATTTGACNCCAGGGACCCAACTTCGACAAATCTTTTAGGGGACCCCCATGCAATGCTACACGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAA-ATGTTTTTTAAAGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGCGGGGGCATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAGAACNCGTCCGAGATCTTGCGGTTATATTA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttGATAAATGAAACATGAGAACCAAAAGGACCTGAATCGCTTTACTTGCAACAtgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaattatatgaaatcattaatgAACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGCCAAAGAG----GACTTGAATCG---CT-CT------ACTTGCA-ACAGATGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAAAAAAA--TGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAATAAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTA-------TGACTC-T--ATGTAAAACGGTGAC-GCC---------------TGT--GGC------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
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gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA------------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAACA-TTTCAAAG-------TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATTGGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TA-------TAACAC-T--ATATAAAACAGTGAC-CCC---------------TGT--GGT------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtgAAAATGGGAATGCTATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTC-TAGATGTAAAACAGTGACTCCTGTA---AGA----CCTAA--GGTAT---AGGCCTTGAATTTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGTAAGAC--CTAAGGTATAGGCCTTGAA---TTTCAGAGAAA---------------GTTTTGCTAAAAATATGCTTATAAGCCCTGTGGTGGGGG----CATTTGTTGTCGAATCACGCATGTTCAAGAACTTGTCTG-------------------------TGCAGATTTAATTAAGATTCAATGGAAAATGAGGATATTATTGTGACAGTGACATTTTCCCTATA-------TAACTCGT--ATATAAAATAGTGAC------------T----CATGT--GGCA------GCCCAAAATTTGATGCCAGGGACCCAACTT-GGCAAACATTTTAGGGGACCCCTATGCAATGCTACACATAACAAATCTAATGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAATTTTTTTTTTAAAGTTTTGTTTGAAATGTGCTT----ATAAACCCCATGGCAGGGGCATTTGCAGTTGAATCGCACTGGTTCAACAACcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgcaatgctacacataacaaatctaatgtctaggccttgaactttcagagaaattttttttttaaagttttgtttgaaatgtgcttataaaccccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactccACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGG-TTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAAT-GACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acacttcaacatcagtctttcgttgtcatagtcacctcctgaaagacaaaaaggttatagttaaaactttgtttatgaaatatgggtcttccgtggcagagtgttctaaggcgcagtctcaagatcacttacctctcaccacggaagccgcaggttcgagtccagctcaattatgtgaaaagtggtctacatggattcattctgattaaaaaaacaacaataaaattggatctgcattgcataacctagaatgtgttgaaaaaagtgataaGGCCCAAGAG----GACCTGAA-CG-CTCTACTTACAAGACCTCCATACA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAGA--TGTTTTTTTAAAAATTTGGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCAGAGAAATTTATTTGTGGTTGAACGACACTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCATGTGGTTATAAAACTGTTGTGCAAA-TTGGTTAAGATTTAATGA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TGGTTATGAAAAATATATCCAAGTTTGATTAAAAATTCTATCAAAATTGTAACTTATCTTCAATGAAGGAGACAAAATATTTACAGATGACTGACTATTGACAACAGACAATGTAAAAATTACCATGACACAAGTTATTTAGCCAATAGTGCTAAAAAAACA
Unaligned ( gi|8 ): TCTCAAGATCACTTACCTGTCACACAATGGTTGATGGTTCAAATCCAGTTTAGTTAAAAAAAACAACAACGTACAATTGTCACTGTGAATGAAACAAAGTATAAATAAACTGCAACTTACTGGATCTGTGAACATTGCCCTGGAATGTG
Unaligned ( gi|9 ): AACTTATCCGGGGTATTAAGGCTTTAAATAACATAACCAAGTTTGATTAAAATCAAATTGCTTATACAGCTTCAATTGAATCAACGTGGTGGAAACGTTAACGAACAAACGACAGACAACGGACAAATTACCATCACAT
Unaligned ( gi|14 ): ATAATCAAAAATGTTCAAACTAAGGTTTTTCTGTGTTCACGTGATCCAAGGCCCCGTCTAAACATCACTTAACTCTCATCAT
Unaligned ( gi|15 ): TAACTGCATTAGACAACAGATGAGCTGCTAACAAATTACCATGACATAAGTATTTTGGCCAGTAGTTCTAATAAAAC






Alignments
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Reference ( family-2703 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAAATGNAACAAGAGGNCGAAGAGGACCTGAATCGCTCTACTTNCAACAAA-TGCTACATGTAAAATATCTAA-GG-CTAGGCCTTGAAC-TTTCAGAGAAA-TGTTTTTTAAAGTTTTGCT-TAAAA-TGTGCTTATAA--------------G---CA---ATGA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGCGGCCCCAAAT-TTGGCCCAAGAG----GACTTNAA-CGAATCT-CTTAGGAGACCTCCATGCA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAAA--TGTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCGGGGG----CATTTGTGGTCGAATCACGCTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCTTGTGGTTATATAACTGCTGTGCAAGTTTGGTTAAGATTCAATGAAAAATGAANGTGCTATCGCGTCTACGACATTTTCCCTATA-------TAACTC-T--ATGTAAAACAGTGACCCC----AAT---------CATGT--GGTAT---AGGCCCCAAATTTGACNCCAGGGACCCAACTTCGACAAATCTTTTAGGGGACCCCCATGCAATGCTACACGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAA-ATGTTTTTTAAAGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGCGGGGGCATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAGAACNCGTCCGAGATCTTGCGGTTATATTA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttGATAAATGAAACATGAGAACCAAAAGGACCTGAATCGCTTTACTTGCAACAtgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaattatatgaaatcattaatgAACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGCCAAAGAG----GACTTGAATCG---CT-CT------ACTTGCA-ACAGATGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAAAAAAA--TGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAATAAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTA-------TGACTC-T--ATGTAAAACGGTGACGCC------------------TGT--GGC------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatcatttcgttttgataaaagcaagaAAGTTTGG-T-TAAAA-T-------T--------------------CA---ATGA-AGAAT-AA-A--GGTGC---TATCTCGTCTTCAATActgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA------------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAACA-TTTCAAAG-------TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATTGGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TA-------TAACAC-T--ATATAAAACAGTGACCCC------------------TGT--GGT------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAAT-GA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtgAAAATGGGAATGCTATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTC-TAGATGTAAAACAGTGACTCCTGTAAGA---------CCTAA--GGTAT---AGGCCTTGAATTTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactccACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGG-TTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAAT-GACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
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Reference ( family-2703 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAAATGNAACAAGAGGNCGAAGAGGACCTGAATCGCTCTACTTNCAACAAA-TGCTACATGTAAAATATCTAA-GG-CTAGGCCTTGAAC-TTTCAGAGAAA-TGTTTTTTAAAGTTTTGCT-TAAAA-TGTGCTTATAA--------------G---CA---ATGA-AAAATGA-A--GGTGC---TATCGCGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGCGGCCCCAAAT-TTGGCCCAAGAGGACTTNAA-CGAATCT-CTTAGGAGACCTCCATGCA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAAA--TGTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCGGGGG----CATTTGTGGTCGAATCACGCTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCTTGTGGTTATATAACTGCTGTGCAAGTTTGGTTAAGATTCAATGAAAAAT-GAANGTGCTATCGCGTCTACGACATTTTCCCTATA-------TAACTC-TA--TGTAAAACAGTGACCCC------A---------T-CATGTGG--TAT---AGGCCCCAAATTTGACNCCAGGGACCCAACTTCGACAAATCTTTTAGGGGACCCCCATGCAATGCTACACGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAA-ATGTTTTTTAAAGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGCGGGGGCATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAGAACNCGTCCGAGATCTTGCGGTTATATTA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaattatatgaaatcattaatgAACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGCCAAAGAGGACTTGAATCG---CT-CT------ACTTGCA-ACAGATGCTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAAAAAAA--TGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAAT-AAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTA-------TGACTC-TA--TGTAAAACGGTGACGCC--------------------TGTGG--C------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatcatttcgttttgataaaagcaagaAAGTTTGG-T-TAAAA-T-------T--------------------CA---ATGA-AGAATAA-A--GGTGC---TATCTCGTCTTCAATActgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA------------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGAACA-TTTCAAAG-------TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATT-GGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TA-------TAACAC-TA--TATAAAACAGTGACCCC--------------------TGTGG--T------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAATGA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtgAAAAT-GGGAATGCTATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTC-TAGATGTAAAACAGTGACTCCTGTAAGA---------C-C-TAAGG--TAT---AGGCCTTGAATTTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTAAGAC--CTAAGGTATAGGCCTTGAA---TTTCAGAGAAA---------------GTTTTGCTAAAAATATGCTTATAAGCCCTGTGGTGGGGG----CATTTGTTGTCGAATCACGCATGTTCAAGAACTTGTCTG-------------------------TGCAGATTTAATTAAGATTCAATGGAAAAT-GAGGATATTATTGTGACAGTGACATTTTCCCTATA-------TAACTCGTA--TATAAAATAGTGAC-------------------T-CATGTGG--CA------GCCCAAAATTTGATGCCAGGGACCCAACTT-GGCAAACATTTTAGGGGACCCCTATGCAATGCTACACATAACAAATCTAATGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAATTTTTTTTTTAAAGTTTTGTTTGAAATGTGCTT----ATAAACCCCATGGCAGGGGCATTTGCAGTTGAATCGCACTGGTTCAACAACcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgcaatgctacacataacaaatctaatgtctaggccttgaactttcagagaaattttttttttaaagttttgtttgaaatgtgcttataaaccccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaacagtgactccACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGG-TTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAATGACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATATAACTCTATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acacttcaacatcagtctttcgttgtcatagtcacctcctgaaagacaaaaaggttatagttaaaactttgtttatgaaatatgggtcttccgtggcagagtgttctaaggcgcagtctcaagatcacttacctctcaccacggaagccgcaggttcgagtccagctcaattatgtgaaaagtggtctacatggattcattctgattaaaaaaacaacaataaaattggatctgcattgcataacctagaatgtgttgaaaaaagtgataaGGCCCAAGAGGACCTGAA-CG-CTCTACTTACAAGACCTCCATACA-ATGCTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAGA--TGTTTTTTTAAAAATTTGGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCAGAGAAATTTATTTGTGGTTGAACGACACTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCATGTGGTTATAAAACTGTTGTGCAAA-TTGGTTAAGATTTAATGA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TGGTTATGAAAAATATATCCAAGTTTGATTAAAAATTCTATCAAAATTGTAACTTATCTTCAATGAAGGAGACAAAATATTTACAGATGACTGACTATTGACAACAGACAATGTAAAAATTACCATGACACAAGTTATTTAGCCAATAGTGCTAAAAAAACA
Unaligned ( gi|8 ): TCTCAAGATCACTTACCTGTCACACAATGGTTGATGGTTCAAATCCAGTTTAGTTAAAAAAAACAACAACGTACAATTGTCACTGTGAATGAAACAAAGTATAAATAAACTGCAACTTACTGGATCTGTGAACATTGCCCTGGAATGTG
Unaligned ( gi|9 ): AACTTATCCGGGGTATTAAGGCTTTAAATAACATAACCAAGTTTGATTAAAATCAAATTGCTTATACAGCTTCAATTGAATCAACGTGGTGGAAACGTTAACGAACAAACGACAGACAACGGACAAATTACCATCACAT
Unaligned ( gi|14 ): ATAATCAAAAATGTTCAAACTAAGGTTTTTCTGTGTTCACGTGATCCAAGGCCCCGTCTAAACATCACTTAACTCTCATCAT
Unaligned ( gi|15 ): TAACTGCATTAGACAACAGATGAGCTGCTAACAAATTACCATGACATAAGTATTTTGGCCAGTAGTTCTAATAAAAC






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Reference ( family-2703 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAAATGNAACAAGAGGNCGAAGAGGACCTGAATCGCTCTACTTNCAACAAA-TGCTACATGTAAAATATCTAA-GG-CTAGGCCTTGAAC-TTTCAGAGAAA-TGTTTTTTAAAGTTTTGCT-TAAAA-TGTGCTTATAA--------------G---CA---ATGA-AAAATGA-A--GGTGC---TATCGCGTCTACAACATTTTCCCTATA-------TAACTCT--ATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGCGGNCCCNAATCTTGGCCCAAGAGGACTTGAA-CG--TCT-CTTA-GGG-ACCTCCATACA-ATG-CTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAAA--TGTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCGGGGG----CATTTGTGGTCGAATCACGCTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCTTGTGGTTATATAACTGCTGTGCAAGTTTGGTTAAGATTCAATGAAAAAT-GAAGGTGCTATCGCGTCTACGACATTTTCCCTATA-------TAACTC-T--ATGTAAAACAGTGACCCCT-------CTGTG--G--C-----------------AGGCCCCAAATTTGACNCCAGGGACCCGACTTCGACAAATCTTTTAGGGGACCTCCATGCAATGCTACACGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAA-ATGTTTTTTAAAGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGCGGGGGCATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAGAACNCGTCCGAGATCTTGCGGTTATATTA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaattatatgaaatcattaatgAACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGCCAAAGAGGACTTGAATCG---CT-CT-------ACTTGCA-ACAGATG-CTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAAAAAAA--TGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAAT-AAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTA-------TGACTC-T--ATGTAAAACGGTGACGC---------CTGTG--G--C------------------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatcatttcgttttgataaaagcaagaAAGTTTGG-T-TAAAA-T-------T--------------------CA---ATGA-AGAATAA-A--GGTGC---TATCTCGTCTTCAATActgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA------------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGAACA-TTTCAAAG-------TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATT-GGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TA-------TAACAC-T--ATATAAAACAGTGACCCCT---------GTG--G--T------------------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAATGA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                     gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtg-AAAATGG-G--AATGC---TATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTCTAGATGTAAAACAGTGACTCCTGTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAAAT-GGGAATGCTATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTC-TAGATGTAAAACAGTGACTCCTGTAAGACCTAAG--GTAT-----------------AGGCCTTGAATTTaagacctaaggtataggccttgaatttcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgcaatgctacacataacaaatctaatgtctaggccttgaactttcagagaaattttttttttaaagttttgtttgaaatgtgcttataaaccccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGG-TTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAATGACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATA-------TAACTCT--ATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCTCTTCA-------TAACACT--ATGTATAACTGTTACTGCTGTGCCAGATCCTAATCTTGGT---AGATGACTT-------------TTA-----------AT-TA-ATG-ATGCATGTAAAATATCTAAAGTATAGGC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttGATAAATGAAACATGAGAACCAAAAGGACCTGAATCGCTTTACTTGCAACAtgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaattatatgaaatcattaatgAACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGCCAAAGAGGACTTGAATCG---CT-CT-------ACTTGCA-ACAGATG-CTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAAAAAAA--TGTTTTGT--AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTATATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAAT-AAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTATGACTC-TATGTAAAACGGTGACGCC-------TGTGGC---------------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatcatttcgttttgataaaagcaagaAAGTTTGG-T-TAAAA-T-------T--------------------CA---ATGA-AGAATAA-A--GGTGC---TATCTCGTCTTCAATActgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA------------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGAACA-TTTCAAAG-------TTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTATA--ACTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATT-GGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TATAACAC-TATATAAAACAGTGACCCC--T-----GTGGT---------------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAATGA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                     gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtg-AAAATGG-G--AATGC---TATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTCTAGATGTAAAACAGTGACTCCTGTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACA-GTGACTCC-TGTAAGAC--CTAAGGTATAGGCCTTGAA---TTTCAGAGAAA---------------GTTTTGCTAAAAATATGCTTATAAGCCCTGTGGTGGGGG----CATTTGTTGTCGAATCACGCATGTTCAAGAACTTGTCTG-------------------------TGCAGATTTAATTAAGATTCAATGGAAAAT-GAGGATATTATTGTGACAGTGACATTTTCCCTATATAACTCGTATATAAAATAGTGACTCA--T-----GTGGC--------------AG-CCCAAAATTTGATGCCAGGGACCCAACTT-GGCAAACATTTTAGGGGACCCCTATGCAATGCTACACATAACAAATCTAATGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAATTTTTTTTTTAAAGTTTTGTTTGAAATGTGCTT----ATAAACCCCATGGCAGGGGCATTTGCAGTTGAATCGCACTGGTTCAACAACaagacctaaggtataggccttgaatttcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgcaatgctacacataacaaatctaatgtctaggccttgaactttcagagaaattttttttttaaagttttgtttgaaatgtgcttataaaccccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGG-TTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAATGACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATA-------TAACTCT--ATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acacttcaacatcagtctttcgttgtcatagtcacctcctgaaagacaaaaaggttatagttaaaactttgtttatgaaatatgggtcttccgtggcagagtgttctaaggcgcagtctcaagatcacttacctctcaccacggaagccgcaggttcgagtccagctcaattatgtgaaaagtggtctacatggattcattctgattaaaaaaacaacaataaaattggatctgcattgcataacctagaatgtgttgaaaaaagtgataaGGCCCAAGAGGACCTGAA-CGC-TCTACTTACAAG-ACCTCCATACA-ATG-CTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAGA--TGTTTTTTTAAAAATTTGGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCAGAGAAATTTATTTGTGGTTGAACGACACTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCATGTGGTTATAAAACTGTTGTGCAAA-TTGGTTAAGATTTAATGA


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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCTCTTCA-------TAACACT--ATGTATAACTGTTACTGCTGTGCCAGATCCTAATCTTGGT---AGATGACTT--------------TTA----------AT-TA-ATG-ATGCATGTAAAATATCTAAAGTATAGGC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttGATAAATGAAACATGAGAACCAAAAGGACCTGAATCGCTTTACTTGCAACAtgatttctgtaaagaatccatttttaatttctacaaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaattatatgaaatcattaatgAACAAGAGGTCAAATAGGGCCTGAATCACTCTACCTGAACCAAATTGCTAtgttgacagatggatatttcaga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGCCAAAGAGGACTTGAATC--G--CT-CT------ACTTGCA-ACAGATG-CTACATGTAAAATATCGACGGTCTAGACCATAAACGGTCTGAAAAAAA---TGTTTTGT-AAAGTTTAACTTAGAATGTGCTTATAAGTCCTGTGTCGGAGG----CATTTGTGGTCGAATGACGCTGGTTCAAAAGCTCGTCCGAGATCTTGTAGTTAT-ATAATTGCTGTGCAAGTTTGTTTAAGATTCAATGGGAAAT-AAACGGGTTGTTGCGTCAACGATATTTTCCCTGTATGACTC-TATGTAAAACGGTGACGCCTGTG----GC------------------GGCCCCAAATTTGACACCAGATATCCGACTTTTACA-----------GGACCTTCATGCAATGCTACATGTAAAATATCGAAGGTCTAGGCCTTGAACGTTCAGAGAAA-ATGTTTTTGAAA-TTTAGCTTAAACTGTGCTT----ATAAGCAATGTGGAGGGGGCATTTGTGGTCGGATGACACTGGTTCAAGAACTCTTCCGAGATCTTATGGTTATATTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatcatttcgttttgataaaagcaagaAAGTTTGG-T-TAAAA-T-------T--------------------CA---ATGA-AGAATAA-A--GGTGC---TATCTCGTCTTCAATActgctatgcaagtttggttaaaattcaatgaagaataaaggtgctatctcgtcttcaataaaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          : aatcatttcgttttgataaaagcaagaggccaaagaggacttgaatcgctctacttgcaacagatgctacatgtaaaatatcgacggtctagaccataaacggtctgaaaaaaatgttttgtaaagtttaacttagaatgtgcttataagtcctgtgtcggaggcatttgtggtcgaatgacgctggttcaaaagctcgtccgagatcttgtagttatataattgctgtgcaagtttgtttaagattcaatgggaaataaacgggttgttgcgtcaacgatattttccctgtatgactctatgtaaaacggtgacgcctgtggcggccccaaatttgacaccagatatccgacttttacaggaccttcatgcaatgctacatgtaaaatatcgaaggtctaggccttgaacgttcagagaaaatgtttttgaaatttagcttaaactgtgcttataagcaatgtggagggggcatttgtggtcggatgacactggttcaagaactcttccgagatcttatggttatattactgctatgcGAGGCCCTGAATCGCTCTACTTCCAACAAA-TG-GACATA------------------------TGAACATTTCAAAG----T-TTTTTTAAAGTTTCGCT-TAAAT-TGTGCTT-TAA--------------aaatgttaacggatgaacgacgaacgacggacaatttagcatgacataagcccagcaggcctttggccagtacagcaaaaaataacaaaatccttattttattttgtttcataataatggcagcatgtagatatcttgtaatttaaatgcttttatatataaatttaatagtataattaact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGAACA-TTTCA----AA---GTTTTTTT-AAAGTTTCGCTTAAATTGTGCTTTAAAGTCCTGCAGCAGTGA----CATTTGTAATTAAATCAAACTGATTCAAGAACTTGTATGAGATCTTGTGGTTAT-A-A-CTGCTGCGCAAGTTTGGTTAAGATTTAATGAAAATT-GGAC-TGCTACCGCACCTAC---ATTCTCCCC-TATAACAC-TATATAAAACAGTGACCCCTGTG----GT------------------GGCCCCAAATTTGACCCCATGGACCAAACTTCAACAAATCTTTTAGGTGACCTCCTTGCAAGGCTACATGTAAAATATCCAAGGTCTAGGCCTTAAACTTTCAGAG-AA-ATGTTTTT---AGTTTTGCTTAAAATGTGCTT----ATAAGCCATGTGGTGGGAGCA--TGTGGTCAAATAACGCTGGCTCAAGAAAACAACCGAGATCTTGTGGTTAT-TTAagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtggttatttaactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacataGTTATTTAA----CTGCTGTGAAAGTTTGGTTA--A--------------GATTCA---ATAA-AAAATGA-A--GGTGC---TATCGCATCTACAAactgctgtgaaagtttggttaagattcaataaaaaatgaaggtgctatcgcatctacaagagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                     gaggccctgaatcgctctacttccaacaaatggacatatgaacatttcaaagtttttttaaagtttcgcttaaattgtgctttaaagtcctgcagcagtgacatttgtaattaaatcaaactgattcaagaacttgtatgagatcttgtggttataactgctgcgcaagtttggttaagatttaatgaaaattggactgctaccgcacctacattctcccctataacactatataaaacagtgacccctgtggtggccccaaatttgaccccatggaccaaacttcaacaaatcttttaggtgacctccttgcaaggctacatgtaaaatatccaaggtctaggccttaaactttcagagaaatgtttttagttttgcttaaaatgtgcttataagccatgtggtgggagcatgtggtcaaataacgctggctcaagaaaacaaccgagatcttgtg-AAAATGG-G--AATGC---TATCACATCTACAACATTTTCCTTATAAATTTTGTAACTCTAGATGTAAAACAGTGACTCCTGTgagaccaatgagggatcattaaccacgacataagtc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACA-GTGACTCC-TGTAAGAC--CTAAGGTATAGGCCTTGAA---TTTCAGAGAAA---GTTTT------------GCTAAAAATATGCTTATAAGCCCTGTGGTGGGGG----CATTTGTTGTCGAATCACGCATGTTCAAGAACTTGTCTG--------------------------TGCAGATTTAATTAAGATTCAATGGAAAAT-GAGGATATTATTGTGACAGTGACATTTTCCCTATATAACTCGTATATAAAATAGTGACTCATGTG----GC------------------AGCCCAAAATTTGATGCCAGGGACCCAACTT-GGCAAACATTTTAGGGGACCCCTATGCAATGCTACACATAACAAATCTAATGTCTAGGCCTTGAACTTTCAGAGAAATTTTTTTTTTAAAGTTTTGTTTGAAATGTGCTT----ATAAACCCCATGGCAGGGGCATTTGCAGTTGAATCGCACTGGTTCAACAACaagacctaaggtataggccttgaatttcagagaaagttttgctaaaaatatgcttataagccctgtggtgggggcatttgttgtcgaatcacgcatgttcaagaacttgtctgtgcagatttaattaagattcaatggaaaatgaggatattattgtgacagtgacattttccctatataactcgtatataaaatagtgactcatgtggcagcccaaaatttgatgccagggacccaacttggcaaacattttaggggacccctatgcaatgctacacataacaaatctaatgtctaggccttgaactttcagagaaattttttttttaaagttttgtttgaaatgtgcttataaaccccatggcaggggcatttgcagttgaatcgcactggttcaacaacaaatctttaaccctttacttcatata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaatgggaatgctatcacatctacaacattttccttataaattttgtaactctagatgtaaaACCTGAATAGCTCTACTGACAACAGA-TGCTGTATGTAAAATATCTAAGGG-TTAGGCCTTGAAC-TTTCAGACAAA-------------TCTTACT-TAAAA-TGTGCTTATAATCCCTGTGACAGGGG---CATTTATGGTCAAATGACACTGGTGCAAAAAT-GTGTCTACAACATTTTCCCTATA-------TAACTCT--ATGTAAAACGGTGACCCCTGTGGaaatctttaaccctttacttcatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acacttcaacatcagtctttcgttgtcatagtcacctcctgaaagacaaaaaggttatagttaaaactttgtttatgaaatatgggtcttccgtggcagagtgttctaaggcgcagtctcaagatcacttacctctcaccacggaagccgcaggttcgagtccagctcaattatgtgaaaagtggtctacatggattcattctgattaaaaaaacaacaataaaattggatctgcattgcataacctagaatgtgttgaaaaaagtgataaGGCCCAAGAGGACCTGAA-C--GCTCTACTTACAAGACCTCCATACA-ATG-CTACATGTAAAATATCTAAGGTCTAGGCCTTGAAC--TTTCAGAGAGAT--GTTTTTTTAAAAATTTGGCTTAAAATGTGCTTATAAGCCCTGTGGCAGAGAAATTTATTTGTGGTTGAACGACACTGGTTCAAGAACTTGTCTGAGATCATGTGGTTATAA-AACTGTTGTGCAAA-TTGGTTAAGATTTAATGA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TGGTTATGAAAAATATATCCAAGTTTGATTAAAAATTCTATCAAAATTGTAACTTATCTTCAATGAAGGAGACAAAATATTTACAGATGACTGACTATTGACAACAGACAATGTAAAAATTACCATGACACAAGTTATTTAGCCAATAGTGCTAAAAAAACA
Unaligned ( gi|8 ): TCTCAAGATCACTTACCTGTCACACAATGGTTGATGGTTCAAATCCAGTTTAGTTAAAAAAAACAACAACGTACAATTGTCACTGTGAATGAAACAAAGTATAAATAAACTGCAACTTACTGGATCTGTGAACATTGCCCTGGAATGTG
Unaligned ( gi|9 ): AACTTATCCGGGGTATTAAGGCTTTAAATAACATAACCAAGTTTGATTAAAATCAAATTGCTTATACAGCTTCAATTGAATCAACGTGGTGGAAACGTTAACGAACAAACGACAGACAACGGACAAATTACCATCACAT
Unaligned ( gi|14 ): ATAATCAAAAATGTTCAAACTAAGGTTTTTCTGTGTTCACGTGATCCAAGGCCCCGTCTAAACATCACTTAACTCTCATCAT
Unaligned ( gi|15 ): TAACTGCATTAGACAACAGATGAGCTGCTAACAAATTACCATGACATAAGTATTTTGGCCAGTAGTTCTAATAAAAC