lowQualScore : 1 2222 1 11111 22 1 2222222222 1 44444444 22222 111 11111111 8888888888888888888888888888888 11111 3333333333333 3333333 33333333 44444444444444 44444444444 111111 111111111 11111 1 333333333 8888888888888 11 44444444 33333333333 1111 1 3333333 11 1 1111111111111111 888888888888888888888888888888888888888888 1 3333333333333333333333333333333333 11111111111111111 1 11 22 333333 11 33333333333333333 1 1 11 1 11111111111 1 22222222222222222222 1111111111 111111
lowQualScore : 1 3 0000 3 22222 6666 4 3 7 00 5 00 4444444444 3 6 2 1 66666666 7777 55 11111 666 777 44444444 7777777777777777777777777777777 44 77777 88888 0000000000000 0 5 6666666 66 3 44 3 0 44 66666666 3 7777 33333333333333 3 77 3 77777777777 1 555555 222222222 66 4 3 6666 1 00000 33 2 5555 444 2 66 5 333333333 777 1 44 7777777777777 0 4 888 4 55 11 55 4 77777777 0 4 44444444444 4444 4 6 555 6666 0 44 1111111 3 2 555 1 0 44 22 4 8 3 77 3 2 8 2 2 5 5 2 5 33 0 5 66 2 9 555 2 1 1 2 0 4444444444444444 222222222222222222222222222222222222222222 44 1 5 7777777777777777777777777777777777 66666666666666666 0 11 00 5 111111 11 2 55555555555555555 222 0 444444 1 2 9999999 1 1 6 333 1 555555 4 66 3 888 22 3 7 333 22 22 22222222222 77 8 2 55 4444 22222222222222222222 0000000000 2 4444 2 000000 33 2 2 3 2 2
lowQualScore : . . .... . ..... .... . . . .. . .. .......... . . . . ........ .... .. ..... ... ... ........ ............................... .. ..... ..... ............. . . ....... .. . .. . . .. ........ . .... .............. . .. . ........... . ...... ......... .. . . .... . ..... .. . .... ... . .. . ......... ... . .. ............. . . ... . .. .. .. . ........ . . ........... .... . . ... .... . .. ....... . . ... . . .. .. . . . .. . . . . . . . . . .. . . .. . . ... . . . . . ................ .......................................... .. . . .................................. ................. . .. .. . ...... .. . ................. ... . ...... . . ....... . . . ... . ...... . .. . ... .. . . ... .. .. ........... .. . . .. .... .................... .......... . .... . ...... .. . . . . .
lowQualScore : 4 3 1111 3 55555 5555 0 3 5 66 2 77 2222222222 1 5 9 4 88888888 7777 77 33333 000 000 55555555 0000000000000000000000000000000 77 88888 11111 3333333333333 6 9 8888888 33 1 22 1 6 22 22222222 5 7777 00000000000000 6 44 3 99999999999 9 777777 777777777 77 2 1 5555 5 44444 77 7 7777 444 6 77 3 777777777 999 6 22 4444444444444 1 0 666 0 55 00 55 4 99999999 1 0 66666666666 6666 0 3 000 1111 7 22 2222222 6 9 111 8 6 22 66 5 6 3 99 7 6 0 7 7 3 3 7 5 99 8 9 88 9 0 000 9 5 0 9 2 0000000000000000 333333333333333333333333333333333333333333 88 2 0 9999999999999999999999999999999999 44444444444444444 4 99 66 8 555555 11 0 77777777777777777 999 2 999999 9 2 1111111 7 7 3 222 8 111111 8 77 8 444 44 5 8 777 88 88 33333333333 00 7 1 00 4444 33333333333333333333 3333333333 2 7777 2 444444 11 2 2 9 4 5
consensus : AACAAATAAAC-GAAC---GTTATCATCAGAGATTTCCAGGAAN----T----GTNTC-AACCCAGATATTTGCATATTGAATGAGC----ATACT-TT-TATTGTGGTCAACA-AG-ACTT----TTGG-AT-CGCTTGGACACGACGTTT---GAATTA--------GATG--CAC---A-----A---T-C-----G--ATT-TAT----ACCA---T-TATT--T--TNTT----AATTATCGNTTTAT-T-TTA-CTATC-ATCTT-T--TT-TATCCTT--TTTTCACN-T-TTCATCTT----TGTTCAG-----TT-TCT---T-ATG-GAAAT-TAAAA-GAACAAAAATGCAT-----TTACAA--CT--AG-TCATTGCAT-A----TTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGT-CCA-TTCTACCTT---GTACCTTTAT--ATCTATATAT-TAT---TA-ACGTAAAACA-AAGTAGA-AG--AAATAT--T--TTAT-ANCCGT-C-TTTTAA-AAAAA-----TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAA---AGCTATTT----TTGACCATTGTGTTAC--CA-NN--AGGTGACGTCATC-T-G-GGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACANCAANCGGCTTACTCAGATGTCTT-CC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-GTATCGGCGTTTT--AGCCACCTAGCGACTNA--ATT-CAGAAGTGTCAATAT---TACTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGT----TT---CA-----AATTATGA----CT-----------TT---------CA------T---TATTTCATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGAACAAAGGTGACATTTNAATGAANGCAATTTGTAAATTAN-A-AGTTGCAATA-T-A--AA-A-TT----ACACAC--ATGGA---AG-T-AA-AA-------AT-T-GGCATTT---GA-GT-----AAATGTAATTTNTAA-TT-ATCCAGTTG--CAACAT-ACAATTTACA---CA--C--ATGGAAGT------T--A-AAA-ATTGTCA-T--TCAA---ATGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAATTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
Reference ( gi|1 ) : AACAATTAAAC-AAAC---GTTATCATCAGATATTTCCAGGAAG----T----GTATC-AGCCCAGATATTTTTATATTTAATGAGC----TTACG-TT-TATTGTTGTCAATATAG-ACTT----TTGG-GT-CCCATGGACACGAAGTTT---GAATTA--------GA----CAC---A-----A---T-C-----T--ATT-TAT----ACCA---T-TATT--T--TATT----AATTATTGATTTAT-T-TTATCTATT-ATCTT-T--TT-TATCCTT--TTTTCGCA-T-TTCATCTT----TGTTCAG-----TTATGT---T-ATG-AAAAT-TAAAA-GAAAAAAAATACAT-----TTACAA--AT--AA-TCATTGCGT-A----TTGTGACATCTCGATGA----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TTAAGCTTA-TTTTCAGGT-CAG-TTATAACTT---GTACCTTTAT--ATCTATATATATATATATACACGTAAAACA-AAGTGGA-AG--AAATAT--T--TTAT-ATCCGCACATTTTAA-AAAAA-----TA---AATGA-C-TGTTCACTGCTACCTGA---AGCTATTT----TTGACCATTGTGTTGC--CA-GA--AAGTAACGTCATC-T-G-GGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATTAAACGGCTTACTCAGATATTTT-CC--TTTACTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-GTGTCGGTGTTTT--AGCCACCTAGCGACTAA--ATT-CAGACGTGTCAATAT---TACTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGT----TT---TA-----AATTATGA----CT-----------TT---------CA------T---TATTTCATGAAATGAAGATGATA----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATGCACACTTATGAACAAAGGTGGGATTTAAATTAATTGAATTTGTAAATTAG-A-AGTTGCAATA-T-G--AA-A-TT----ACACAC--ATGGA---AG-T-AA-AA-------AT-T-GGAATTT---GA-GT-----AAATATAATTCCTAA-TT-GTCCAGTTG--CAACAT-ACAATATACA---CA--C--ATGGAAGT------T--A-AAA-GTGGTCA-T--TCAA---ATGAATGTCAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAATTATGGCAGATA-ATA-CCCTCC
gi|3 : AACAAACAAAC-GAA----GTCATCATCAGAGATTTCCAGGAAC----T----GTTTT-AACCCAGATATTT--GCATT-------C----TT---------TTGTGGT------------T----TTGG-AT-CGCTTGGATACAACGTTT---AATTTA--------AA----AAT---AG----A---TGCAGAAAT--ATT-GATTAAAACC------TGTT--T--TG------AATTATTGGTTTAT-TCTTA-CTTTC-GTCTT-T--TT-TATCCTT--GTTT-ACT-T-TTTTCCTA----TGTTCAG-----TT-TCT---T-ATG-GAAAT-TAAAA-GAACAAC--TACAT-----TCACAA--CT--AG-TCATTGCAT-A----TACTGACATCTCGATGG----AT--GTGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGT-CCA-TTCTACCTT---GTACCTTTAA--ACCCATATG------------CGTAAAACA-AAA---A-AG--AAATAT--T--GTTT-ATAC---CATTTTGA-AAAAA-----TATTGAAGAA-C-TGTTCACTGCTACCTCA---AGCTATCT----TTGGTCATAGTGTTTT--CA-CC--AATTAAT--------------------------TTTTT-ACAACAAAAACCGCCTTACTCAGATTTCTT-CA--TTTTCCCTTAATGCAGGGAGCGGTCG-T-TT-T-TTAAA-GTATTGGCGTTTT--AGCCACCTAGCGACTTA--ATT-TAGAAGAGTCAATAT---T----AC-T----AAT-------------AT-----GT---AAATTCTAAGT----TT---TA-----AAT---GA----------------------------------------TATT----------AAGCTAATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TACACATTTTATTCTCACTTTAGAACAAAGGTAACATTTCAGTGAATGCAATTTGTAAATTAC-A-AGTTGCAATA-T-A--AATA-TA----ACACAC--ATGAA---AG-T-AC-GA-------AT-TTGGCATCT---GA-GT-----CAATGAAATTTATAA-TT-ATCAATTTG--CAGCAT-ACAACTTACA---CA--C--ATGGAAGT------T--A-AAA-ATTGTCA-A--TAAA---ATGAATGTATT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--CAAATACAATAA-AGCAAC-CTGAATTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|4 : tatcaacatttatcacAACAAACAAAC-GAA----GTTATCATTAGAGATTTCAAGGAAT----T----CTTTT-AACCAAAATATTTGTACATTCAATGAGC----ATACT-TT-T----TTGT-------G-GCTT----TTGG-AT-TGCTTTGTCACGACATTT---GAATTG--------GGTG--CAC---A-----AATAT-C-----G--ATT-GAT----ACCA---TATATT--T--TA-------ATTATTGATTTAT-TATTA-CAATC-ATCTT-T--TT-TAACCTT--GTT-CACA-A-TT--TCCT----TGTTCAG-----TTTTCT---T-ATG-GAAAT-TAAAG----AACAAATGCAT-----TTACAT--CT--AG-TCATTGCAT-A----TTGTAACATCTCGATAG----AG--ATAAATTTACATGAGTTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGAT-CAA-TTCTACCTT---GTACCATTAC--ATCTATATA------------CGTAAAACA-AAATAGA-AG--ACATAT--TGTTTAT-A-CCG----TTTTAATAAAAA-----AA---AAGAA-C-TATTCATTGCTAAGAAA---AGTTATTT----TTGACCATTGTGTT-C--CA--ACTATGTGACGACATC-T-C-GGGAAACACATTGACTTTTG-ACAACAAAAACCATCTTACTCAGATGTTTT-CC--TTTTTTTTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TTGT-C-AGA-GTATCGGCA-CTT--AGCCACCTAGCGACTTA--ATT-TGGAAGTGTCAATAT---TACTAAC-TTGTCAATTCTTAGTTTAA-AA----AAGTTTCAAATTCTAATT----TT---CA-----AATTATGA----CT-----------GT---------C----------------TATGAAATCAAGATGATG----A------TA---GT---------------GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACATTTTCGAACAAAGGTGACATTT
gi|9 : nnnnacaactcgctccacttagttctaaattcactcagcagcgtcaatatttgctaataatatttctttagtcaaaacgaccattacggctatccacactgttcacAACAAATAAAC-GAA----GTTATCATCAGGAATTTACAGGACT----T----GTTTT-AACCCAGATATTTGCATTTTAAATGGGC----ATAAT-GT-TGGTGTGGTCA--ACAG-ACTT----TTTG-AT-CTCTTGAACACAACGTTT---GAATAA--------GATG--CAC---AAAT--A---T-C-----G--ATT-CAT----A-TA-----TATT--T--T-TT----AATAATAG---------------ACC-ATCTT-T--TT-T-TCC-T--TCTTCACAGTGTTCGTA------TGTTCAG-----TTTCCT---T-ATG-GAAAT-TAA----AACAACAATGTATTAATGTTAAAA--CT--AG-TCATTGCAT-A----GTTTGACATATCGATGG----GG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCGAACTTG-TTTTCAGGC-CCA-TTCTACCTT---GTACCTTTAT--ATCCATATACGTA-----------AAAACA-AA---GA-AG--AAATATTGT--TTAT-A-CCG-----TTTAA-AAAAA-----TATTTAATAA-C-TTTTGACTGCTACCCAA---AGCTATCT----TTGGCCATAGTGTTAC--CA-CC--AGGGTACGTCATC-T-T-GGGAAACcagtgac
gi|11 : gcgaacttacttttgctaatatttctttaatcaaaacgacctttaccgctttccacagtgttgcAACAAGTAAAC-GAA----ATTATT-TTAAAAAGTTGCAGGAATCCCTT----GTTTC-AACCCAACTATTTCCATCTTCAAT--------TTATGATTGTGTTGTGGTCAGCAGAC-ACTC----G-GG-GT-CGCTTGGACACACTGTCT---GAATTA--------GA----TACGCAA-----A---T-A-----TTGATG-TAT----TCCAGTCT-TTTT--T--TTTC----AATTATCGTTTTAT-TCTTA-CTATC-ATCTT-TTTTT-TAT-CTT--TATTCA-A-T-TT
gi|17 : acgattccccagactatttccAATTAAAC-AAAG---GTTATCATTAGAGATTTCCAGAAAG----T----ttaaaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaaccatgacatactgcgacatcttgatgactatggttatgaatttacgtaagctttattaagcttgtttccaaaccattctactttgttcctgtattgctctatacacatatgaaaca
gi|2 : cttactttgcaaatatttctttAAAC-AAAC---GTCATCATCAGAGATTTCCAGGCAG----T----GTATC-AACCCAGATATTTGCATATTGAATGAGC----ATACT-TT-TATTGTGGTCAACA--G-ACCT----TTGG-AT-CGCTTGGACACGACGTTT---AAATTA--------GATG--CGC---A-----AATAC-C-----G--ATT-TAT----ACCA---T-TATT--G--TTTT----AATT---GATTC-----TTA-CTATT----------------CCTT--TTTTCGCT-T-TTCAACTT----TGTTCAG-----TT-TGT---TTATG-GAAAT-TAAAA---ATACAAATACAT-----TTACAA--CT--AG-TCATTGCGT-A----TTGTGACATCTCACTTT----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TCAAGCTTA-TTT--AGGT-CAA-TTTTACCTT---GTACCTTTAT--AT--------------ATATACGTAAAACA-AAGTAGA-AG--AAATAT--T--TTAT-ACCCGTACATTT-AA-AAAAA------A---AAT---C-TGTTCACTGCTTCCTAA---AGCTATTT----TTGACCATTATGTTAC--CT-AT--AGGTGACGTCATC-T-G-GG-AAACACATTGGATTGTG-ACAACATCAAACGGCTAACTCAGATGTTTT-CC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-GTATCGGTGTTTT--AACCACTTAGCGACTAA--ATT-CAGAC--GTCAATAT---TACTAAC--TGTAAATTCTTAG-TTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGACT----TTCTCTA-----AGTT---------T-----------TA---------CA------T---TAGTTCATG-------------------------AA---ATG--------A-----GTAAG----------T------TGCACATTTTGTACACACTTATGAACAAATGTGACATTTAAATGAATGCAATTTGTAAATTAG-A-AGTTGCAATA-TAA--AA-A-TT----GCACAC--ATGGA---AG-T-AAGAA-------AT-T-GTTATTT---GA-GT-----AAATGTTATTCTTAA-TT-ATCCAGTTG--CAACAA-ACAA----------------ATGAATGT------------AA-TTTGTAA-TAACCAA---GTTAA----A---------------------AATA-----------------------C----AA--TAAA-ACAAT----------CTAAATTATGGCGGAAA-ATA-CCCTCCtttatattatttcatgaaattaagatgatgaactgggtaacttgaacatttcatacacatctatgaacaaaagtgacattttaatgaatgcaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagtaagaaattggcatttgagtaaatgcaatttttacttatccagttgcaacatacaatttacacagatggaagttaaaaattgtcattcaaatgaatgtaatttgtaataaccaagttaaaaaatacaataaagcaatctggattatggtggataataccctccata
gi|5 : tgcaaacttactttgcaatttttctttaattatttaaaacaactgctaaacAAAC-AAAT---GTTATCATCAGAGATTTCCAGAAAT----T----GTTTT-TACCCAGATATTTGCATATTGAAAGAGC----ATATT-TT-TATTGTGATCAAC-CAG--TTT----TTGA-TTGCCC--GGACACAATGTTT---ACATTA--------GA----CGC---GCAAATA---T-C-----A--AAT-GAT----CCCA---T-TTTT--T--T-TTGTCAAATTGTTGATTTAT-T-CT-TACATTCATCTT-T--TT-TATCCAT--GTT-CATT-T-TTCATCTT----TGTTCAG-----TTTTCT---T-ATG-GAAAT-TAAAA-GAACAA---TGCAT-----TTACAACTATCTAG-TCATTGCAT-A----TTGTGACATCTTGGTAG----AT--ATGAATTTGTAGAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGT-CCA-TTCTACCTT---GCACTTGTAT--ATCTATATA------------CGTAAAGCA-AAGTAGA-AG--AAATAC--C--CTATTGTTTATACTGTTTAA-AAAAACAT--TA---AAAGAAC-TATTCACTGCTACCTTA---AGCTATTT----TTTACCATTGTGTTAC--CA-CT--AGGTGACGTCATC-T-G-GGGAAACTCATTGTTTTTTTTACAACAAAAACCAACTTACTCTGATTTCTT-CC--TTTTTCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-GTAGCTGCATTTT--AACCACATAGCGACTTA--ATT-CATAAGTGTCAATAT---TATTAAT-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAATTTTCAAATTTTAAGT----TT---CA-----AATTATGA----CT-----------GG---------C----------------CATGAAATTAAAATGAT-----G------AA---ATG--------T-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCCAACAAAAATGa
gi|10 : caacAAAC-AAACACAGTTATCATCAGAGGTTTCCAAGAAT----T----GTTTT-AACCCAGATATTCGTATATTAAATGAGCATTTTTGTG-TT---TTG--GTCA--ACAG-GCTT----TTGG-AT-TGCTTGGACACGACGTTT---AAGTTA--------GATG--CAC---A-----A-------------------AT----ATCG------ATT-------TT----AATGATTGATTCAT-TATTATTT-TC-ATCTT-T--TT-TATCCTT--GTT---CG-T-TTTTTTTTGCCATGTTCAG--------------T-ATG-AAAA---AAAA-GA--------ACAT----------A--AT--G---CATT----------TTGTGACATCTCGATGA----AT--ATGAATTTGTATATGCTT----T-A-TCAAGCTCG-TTTTCATGT-CCA-TTCTACATT---GTTCCTTTAT--ATCCATAT------------ACGTAAAACA-AAGT--A-AGGTAAATATTGT--TTAT-AT-----CGTTTTAA-AAAAC-----TATT-AAAGATC-TATTCTCTGCTACCTAA---AGCTATTA----GTGACCAGTGTGTTAC--a
gi|18 : aatgcttgcagtttcatagtttttattatcaaaatgacctttacagttatccacactgttcgcaacAAAC-AAAC---GTTATCATTAGAGATTTCCAGGAAG----T----GTATC-AATCCAGATATTTGCATATTGAATGAGT----ATAC--TT-T-------TCA--ATAG-GCAT----TTGG-AT-CGCTTGGACACTACGTTT---GAATTA--------GATGCTCAA---AT----A---T-C-----G--ATT-TAT----ACCA---T-TATT--T--TTTT----AATTATTAATTCA------ATC-------CTT-T--TT-TATCCAT--TTTTCACT-T-TTCATCTT----TGTTTAGTATTCTTATGTTTAT-ACGTAAAAC-AAGAA-GAg
gi|36 : cgcgctctactttagttctaaattcacttgaaacagttgcaaacttactttgcaaatatttctttaattaattaaaacgacggctttacAAAC-AAAA---GTTATCATCAGAGATTTCCAACAAA----T----GTATC-AACCCAGATATTTGCATATTGAATGAGC----ATACT-TT-TATTGT
gi|43 : agttcttaatactcctgaaacagctacaaacttactttgcaaatagttctttaactaatcaaaaggactcctaaacAAGC-AGAA---GTTATCATCAGAGATTTCCAACAAG----T----GTATC-AACCCAGATATTTGCACATTGAATGAAC----ATACT-TT-TATTGT
gi|13 : aacAAACGAAAC---TATATTCTCAACTAT--CAAGGAAT----TCATAGTATCTATTCCAAAGATTTGCATCTT----GAGC----ATATT-TT-TTTTATTGCGAA------ACTTGCACTTGGCGT-TGCTTGGACAC--AGTTTTTCGAAATAAATGTGCTGA----TAG---A-----G---T-TG----T--ATT-TA--------A---TATATT--TGTTCTC----CATTATCCTTTTATAC-TTA-CTATC-ATCTC-T--TT-TATGTGT--TTTT----------ATCTT----TATTCAC-----TAA--------ATG-TAACT-TAAAC-------AAGTGCAT-----GCACAT--TT--AG-TCGTACCAT-A----TTTTGACATCTTGATGG----AG--ATGAATTTACATTAACATATCAT-AGTCAAGATTG-TTTTCAGTT-C---TCGT--CTT-------CTTTGT--TCCTATGTATTTATAT-TATATG-AAATTATAACTGAATAA--AAAAAT--T--ATAT-A
gi|48 : acaaaatcttctttatggttcttcagtttattcacaacatagaa----T----GTATC-ATCCCGGAAATTTGCATATCT----AGC----ATACT-TT-TATTGTGGTCAACA-AG-TTTT----TTGG-gtttaaa
gi|23 : tatCAGAGATTTGCATTTTCA--GAAC------ATT-TT-TATTGT-GACAAACTGGCACTT----A-GG-GT-TGCTTGGACCTAGTGTTT---CAATTA--------GATGCGCAA---A-----A---T-G-----A--GTTGTAT----TCTA---T-TATT--TG-TTTT----ATTTATCGTTTTATAT-TTA-CTA-C-ATCTT-T--TT-TATCCTTAGTTTTCtcgcttgaataa
gi|21 : cgatctcctttatggctctctaggtaattcgtacatggcaaacgaaactattttcagtcatagtttcttcatcgagatttt-TAT----ACTA---A-TATTATT--TGTTC---AGTTATCGTTTAATAT-TTA-CTATC-ATCTC-T--TT-TATGTTT--TTTTT--A-T----ATCTT----TATTCAC-----TAAA-----T-ATG-AATAT-CCAA-----------TGCAT-----GCACAA--CT--TG-TCAT-ACATTA----TTTTGACATCTCGATGA----AG--AT--AGCTGTATA----T----T-G-CCATACTTGTTTTTCAGGT-----------CCT---GT-CTTCTA------TGTACATCTGTATTTAAATGTGAAATT-TAATGGA-AT--AAATAT--T--c
gi|20 : atgctcttatagtgtcgTTATCGTTTTATAC-TTA-CTGTC-ATCCTAT--TT-TATGTTC--TTTT-------TCTATCTT----TATTCAC-----T---------------AAATATAAAATGAACCAA--TGCAT-----ATACAA--CT--AG-TCAAACCAT-T----TTTTGACATATCGATGG----AG--ATGAATTTAC-------------------AGCTAA-TTTACAGAT-CCT-GTCTACTTT---ATACGTCTGT--ATTTATATGTGAACATATAgtttaaaccaaaatg
gi|32 : tctacccagaaattcgcatcttaggaacattttttatttatcgaattagtgctgataatgttgtatttgatgtgttttctcccATTTATATAT-T-CTTTCTATT-ATCTG-T--TTATATCCTA--TTTAC----T-TTCATCTT----TGTTGCG-----TTTTCT---T-ATG-GAAAA-TAAAA-GAAGAAA--TGCAT-----TTACAA--CT--AG-TTATTGCAT-A----TTGTGACATATCGATGT----AA--ATGAATTTGCATCAGCTT----T-A-TCGAGCTTG-TTTTCAGGT-TTA-TTATAattgattattattgtttaaaataaactac
gi|29 : gacaAAAT-TAACA-GCAATAAAA-GCAT---------GA--AT--AG-TCATATCGT-AAATATTGTGATATCTCGGTGG----GG--ATGCATTTATATTAACCA----T-G-TTAACCTTG-TTTTCACATACA--TTATACTTT---GCACTTTTAT--AT
gi|11 : tattctattttcttctgaatttCGA--AT--AAACCATGACAT-A----CTGCGACATCTTGATGACTATGGTTATGAATTTACGTAAGCTT----T-A-TTAAGCTTG-TTTCCAAAC-CA--TTCTACTTT---GTTCCTGTATTGCTCTATACACATATtggcaaatagcattcaaagtatagtttatatcaatataagtgaaaaa
gi|35 : acgattccccagactatttccaacaagtaaacgaaattattttaaaaagttgcaggaatcccttgtttcaacccaactatttccatcttcaatttatgattgtgttgtggtcagcagacactcggggtcgcttggacacactgtctgaattagatacgcaaatattgatgtattccagtctttttttttcaattatcgttttattcttactatcatcttttttttatctttattcaatttttaaaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttCAT-A----TTTTGACATCTCGATAG----AG--ATGAATGTACGTGATCTT----T-T-TCAAGCTCG--TTTCAGAT-CCT-CCGT-ACTTG--GTACCTCTgaaaca
gi|41 : atgtcacgcGATGG----GG--ATAAATTTACACAAGCTT----T-T-TTAAGCTAG-TTTTCAAATCCAGTTTAT-ACTTTCCACACATTTAT--gagcacttgtgattcgattacacagaaacgcaaacgtaaaaaatataattcattaaaaaagtcattaa
gi|44 : gaatat--ATGAATTTACATAAATTT----TTG-TTAAACATG-TTTTCAAAT-CCA-TT----CTT-------CTTTGT--ATCTTTTTATATATgaaacattttaggtaagaaatactggttatttaaaacaaattaat
gi|6 : tgtggc-AAGTAGA-AG--AAATAT--T--TTAT-AACTGTCC-TTTGAA-AAAAAGAAATTA---AATAA-C-TGTTCAATGCTACCTAA---AGCTATTT----T-GACCATTGTGT----------------GATGTCATC-T-G-GGGAAACACATTGGATTTTG-ACAATATCAATCGGCTAACTCACATGTCTT-CCT-TTTAC-CTTACCGTAGGGAGCAGTTGTT-TT-T-C-AAA-GTATCGGTGTTTA--AGCCACCTAGCGACTTA--ATT-CAGAAGTGTCAATATTAATACTAAC-TTCTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGT----TT---CA-----AATTATGA----CTGTCTCTAAATGTTTA-------CA------T---AATTTAATAAAATTAAGATGAT-----G------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGAACAAAGGTGACATTTTAATGAAAGCAATTTATAAATTAA-A-AGTTGCAATA-T--------------------------------A-T-AA-AA-------AT-T-GGCATTT---GA-GT-----AAATGTAATTCTTAG-TT-ATCCAGTTG--CAACAT-ACAATTTACATAGTA--C--ATAGAAGT------TAAA-AAA-ATTGTCA-T--TCAT---ATGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAATTATGGCAAATA-ATA-CCCTCCcggacaaaaa
gi|7 : -AAGTAGA-AG--AAATAA--T--TTAT-AGCCGTTC-TTTTAA-AAAAGAAAT-TA---AATAA-C-TGTTCACTGCTACCTAA---AGCTATTT----TTGACCATTGTGTTAC--CA-AA--AGGTGACGTTATC-TTG-GGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAATCGGCTTACTCACATGTCTT-CC--TTTAATCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-GTATCGGTGTTTT--AGCCACATGGTGACTTA--TTT-CAAAAGTGTCGATAT---TACTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTGTCAAATTCTAAGT----TT---CA-----AATTATGA----CTGTCTCTAAATGTTTA-------CA------T---AGTTTTATGAAATTAAGAGGAT-----G------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATTTTCTGTCTACACTTTCGAACAAAGGTGACATTTAAATAAAAGCAATTTGTAAATTAA-A-AATTGCAATA------------------------------------T-AA-AA-------AT-T-GGCATTT---GA-GT-----AAATGTAATAATAAA-TT-ATCCAGTTG--CAACGT-ACACTTTACA---TA--C--ATAGAAGT------TA-A-AAA-GT-GTAA-T--TTAT---ATGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----T-ATT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAATTATGGCGGATA-ATA-a
gi|50 : AG-AAAAT-----TA---AAAGAAC-GGTTCAATGCTACCTAA---AGCTATTA----TTGAC
gi|42 : aaag-AAAAT-----TA---AAAGA-AGTGTTCACTGCTACTTTA---AGCTACTT----TTGACatcaaatggattac
gi|8 : gaaaagggTTCTCTGCTACCTAA---AGCTATTT----TTGACCATTGTGTTAC--CATG----GGTGACTTCATC-T-G-GGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAAACGGATTACTCAGATGTTTT-CC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCGTT-TT-T-C-AAA-GTATCGGTGTTTA--AGCCACCTAGCGACTAA--ATT-CGGACGTGTCAATAT---TACTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTCAGT----GT---CA-----AATTATGAT---TT-----------TT---------TATAAGTTT---TACTTTAT----T-----TGAT-----G------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTATGGACAAAGGTGACATTTAAATGAATGCAATTTGTAAGTTAG-A-AGTGACAATA-TAA--AA-A-TT----ACACAC--ATTGA---AG-T-AAGAA-------AT-T-GGCATTT---GA-GT-----AAATGTAATTTTTAA-TT-ATCCAGTTG--CAACAT-ACAATTTACA---CG--A--ATAGAAGT------T--A-AAA-ATTGTCA-T--TCAA---ATGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTTAAAAAA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTAAATTATGGCGGATA-ATA-CCCTCCaaaatcaaaaggattgccgtagggagcagtcgatttcaaaagtatcatc
gi|14 : atacgtaaaacaagaagaaatatCACTGCTGACTTA---AGCTTTTT----TTTACCATTGTGTTAC--CA-AT--AGGTGACGTTATC-T-G-TTGTAACACATTGGA-------CAACATCAAACGGCTTACTCAGATATTTT-CC--TTTTCTCTTACTGTAGGGAGAAGTCG-TCTT-T-C-ATA-GTATCGGTGCTTT--AGCCACCTAGCAAATAA--ATT-CAGACGTGTCAATAT---TACTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTAA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGT----TT---TATACACACTTATGA----
gi|14 : TATCTGAGTAAGCCGTTTGATGTTGTCCAATGTGTTACAACA-GA-----TAACGTCACC-T-ATTGGTAACACAATGGacaaagtaacatttatatgaatgtaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagttaaaaattacattaaagcaatctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|15 : cactgctgacttaagcttttttttaGA---AGCTACTT----TTGACCACTGTATCAC--CA-CT--AAGTGACATCATC-G-G-GGGAAATGCATTGGTTTTTG-ACAACATCAAACAGCTTACTCAGATTTCTTACC--TTT-CCCTTATCGT-------------T-TT-T-C-AAA-GTTTCGGCGTTTT--AACCTCCTACCCACTTA--CTT-CAGAAGTTTCAATAT---TACTAAC-GTGTAAA------GTTTGA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGAAT----GTCGCTA-----AATT---------T-----------TA---------CA------T---TCTCTAATGAAATTAAGATGATG----A------AA----CG--------A-----GTAAT----------T------TGCACATTTTATACACACTTTGGGACAAAGGTGACATTGCAATGAAGACAATTTGTAAATTAC-A-AGTTCCAAAA-TCA--AA-A-TT----ACACAC---------------------------AT-T-GGCATTT---GA-GT----------TAATTTATAA-GT-ATTCAGTTG--CAACAT-ACAATTTACA---CA--C--ttttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaacttgtaaattctaagtttaaaattccaagtttcaaattctaagttttatacacacttatgaacaaagtaacatttatatgaatgtaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagttaaaaattacattaaagcaatctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|7 : CCAATGTGTTTC--CC-CA--AGATAACGTCACCTT-T-TGGTAACACAATGG
gi|26 : aagtagaagaaataatttatagccgttcttttaaaaaagaaattaaataactgttcactgctacctaaagctatttttga--AAGTGACGTCATC-T-A-GGGATACACATTGAGTTTTT-ACAACAAAAACCAGCATACTCAGATTTCTT-CTCATTTTCCCTTATCATAAGTAGCAGTCGTT-TT-T-C-AAA-GTATCGGCGTTTT--AGCAA--TAGCGGTTTA--AT--------------TAT---TGCTAAC-TTGTAATTTCTAAG-TTCA-ACTTCTTAGTTTCAAATTCTAACT----TC---CA-----AATTATAA----attttgacaacatcaatcggcttactcacatgtcttcctttaatcttaccgtagggagcagtcgtttttcaaagtatcggtgttttagccacatggtgacttatttcaaaagtgtcgatattactaacttgtaaattctaagttttaaattccaagtgtcaaattctaagtttcaaattatgactgtctctaaatgtttacatagttttatgaaattaagaggatgaaatgagtaacttgcattttctgtctacactttcgaacaaaggtgacatttaaataaaagcaatttgtaaattaaaaattgcaatataaaaattggcatttgagtaaatgtaataataaattatccagttgcaacgtacactttacatacatagaagttaaaaagtgtaatttatatgaatgttatttgtaataaccatattaaaaaatacaatgaagcaatctgaattatggcggataata
gi|52 : atcactTGACGTCATC-T-G-GGG-AACACATTGGATgtgtcta
gi|25 : ATGTTA-ACAACAGCAAACGGATTGCTCGGATGTTTT-CG--CTTGTCTTTACCGCAGTGAGCAAT------------------ATAAGCGTTCA--AGCCACCTTGTGCCGAA--ATTTCAAA-GTATTAATAT---TGCTTAC-TTGTAAATTTTAA-CTATA-AATTTCTAATTgtgtctgtgatgtcatc
gi|34 : atgttatctaaacctaTTT-CC--TTTTCCCTTTCCGTATGGAGCAGTCG-T-TT-T-T-TTA---GTTATTGCTTTCAGGCAAACTGCCG--TAGTTACT-CAGATGTG---AGAT---TGCTAATACCGCGAATTCAAGGTTCCATGATTCT--GCCTAAAA-TCAAAATGGTGCT---TACC---CATTATGA----TT-----------TT---------catatgatgacaatcatagtacaatatgtaaatgaaattaaaacacgtgcaattaaaaat
gi|12 : agattgaTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-C-AAAAGTATCATCGTTCA--AGCCACCTAGCG-CCAAT-ATT----GCTTGNNNNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-----G-----AGTTATGT----CTCTAAA------TT---------CA------TATTTTTTTCATGAAATGAAGATGGTA----ACCTAGTAA---CTGTAAGCTGTA-----ATAACGTATTTAAAGTA-----TGCAAATTGTATACGCATTGACGAACAAAGATGATATTTAAGTAAAGGCAACTTGT---TTA------TTACA----T-G--AA-AATT----ACCAAC--ATGGA---AG-T-AA-GAC------AT-T-GACATTT---GT-GT-----A-------TT----A-TT-ATCCAGTTG--CAACAT-GCAATTTACA---CA--C--ATGGAAGT------A--AGAAA-GT-GTCA-T--Tt
gi|42 : TTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-CAAAA-GTATCttataatttgttgtaaaaagcagtaatgaattctgggtttttggcgggtctccaccccccaccccaccatgtaaatcgtcacataacaacga
gi|16 : gaaaagggaaaattaaaagaagtgttcactgctactttaagctacttttgacaaaatcaaaagga-T-TT-T-C-AAA-GTATCGGTGTTTT--AGCCACCTAGCGACTTA--ATT-CAGAAGTGTCAATAT---TACTAAC-ATGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGT----TT---CA-----AATTATGATTGTCT-----------CTTAATATTCACA------T---CATTTTATGAAATTAAAATGAT-----G------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGAACAAAGGTGACATTTAAATGAAAGCAGTTTGTAAATTAA-A-AGTTGCAATA------------------------------------T-AA-AA-------AT-T-GACATCT---GA-GT-----AAATGTAATTCTTAA-TT-ATCCATTTG--CAACAT-ACAATTTACA---TA--C--ATAGAAGT------T--A-AAA-ATTGTCA-T--TCAT---ATGAATG-----------------------------------------CA----A--------AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTCAATTATGGCGGATA-ATACCCCTCCatc
gi|19 : AAGTTTCCAATTAT---T----GC---TA-----CGTCATAA-----T-----------TT---------AAAG----T---TATT-CATGTAATTAAGATGATGGCATA------AATACATG--------AAATTTGTAAC----------TGCAGCGTGCA-ATTTTAT--ATGCTT-TGAAGAAAAAAGTAATTT--TTTAAGTGAGC------GTTAT-C-ATTTGCAATA-T-A--CA-ATTT----ACACAC--ATTGC---AG-T-AAGAA-------AT-T-GACATTT---AA-TT-----CAACATTCTTTATAG-TT-ACACAGTTA--CAACAT-GTAATTTACA---CA--C--AACGAAGT------A--T-AAA-CTTGTCATT--TCAG---A-GAATGGAATTGT--------------CGT--TA----------AA-CA----ATATT-----A--TAAATACAATAA-GGCAAT-CTGa
gi|17 : A------T---TATTTCATGAAATTAAGATGATG----A------AC----TG--------G-----GTAAC----------T------TGAACATTTCATACACATCTATGAACAAAAGTGACATTTTAATGAATGCAATTTGTAAATTAG-A-AGTTGCAATA-T-A--AA-AATT----ACACAC--ATGGA---AG-T-AAGAA-------AT-T-GGCATTT---GA-GT-----AAATGCAATTTTTAC-TT-ATCCAGTTG--CAACAT-ACAATTTACA---CA--G--ATGGAAGT------T--A-AAA-ATTGTCA-T--TCAA---ATGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGGATTATGGTGGATA-ATA-CCCTCC
gi|22 : cttactttgcaaatatttctttaattaaacaaaggttatcattagagatttccagaaagttttatTGATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------A------TGCTTATTTTATACACAATTTCGAGCATAGGTGACATTTCACC---------------------A-AGTTGCAATAAC-G--AA-A-TA----GCACAC--ATGTA---TA-C-AA-AA-------AA-T-GGCATTT---TA-AT-----AAATGGAATTTTTAA-CT-ATCCAGTTG--CAACAT-ACAATTTACA---CA--C--AAGGACGT------T--A-CAA--TTGCCA-T--TCAA---ATGAATTTAAT--G--------------TGTAATA----------AA-AA----A-ATT----AA--CAAATACAATGA-AGAAAT-CTTAATTATGGCGTATA-ATA-CCCTCCata
gi|27 : ------AA---ACG--------T-----GTAAC----------T------TTTACATTTTATACGCACTTTTGAACA---------TTTCAGTAAATT----TTGTAAATTAC-A-AGTAGCAATA-TCA--AA-A-CA----ACACAC--ATAAA---A--T-AA-GAC------AT-T-GGTATTT---TA-GT-----AAATGGAATTAATAG-TT-ATTTATTTG--CAACAA-ACAATTTACA---CA--C--ATGTAAAT------C--C-AAA-at
gi|31 : ttaaatcatgACATTTTAAACAAACTTTCGATCAAAGGTGACATTTCAGTGAATGCAATTTGTAAATTAC-A-AGTTGCAATA-TCA--AA-A-TT----ACACAC--ATGGA---AG-T-TA-AA-------ACGT-GTCGTTC---AA-AT-----GTATGTAATTTGTAA-TA-ATCAAGTTA---AAAAT-ACAAtataattatatgtttgaaatat
gi|14 : TTTTATACACACTTATGAACAAAG-TAACATTTATATGAATGTAATTTGTAAATTAG-A-AGTTGCAATA-TAA--AA-A-TT----ACACAC--ATGGA---AGTT-AA-AA-------AT-T-aaaagcaataatgaattatggaaggtaatacccttc
gi|30 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaacttgtaaattctaagtttaaaattccaagtttcaaattctaagAAAATTGGCATTTGAGTAAATGTAATTCTTAA-TTAT-CCAGTTGCAACA-T-A--CA-C-TTT---ACATAC--ATAGA---AG-T-AG-AAGTTAACAAT-T-GTCATTC---AT-AT-----GAATGTAATTTGTAA-TA-ACCAAGTTA--AAAAAT-ACAATacattaaagcaatctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|14 : taaattaaaagttgcaatataTAAATT--CTAAGTTTA-AAATTCC-A-AGTTTCAA-A-T-TCTAA-G-TTTTATACACACTTATGAACAAAG-T-AA-CA-------TT-T----ATAT---GA----------ATGTAATTTGTAAATTAG--AAGTTG--CAATAT-AAAAATTACA---CA--C--ATGGAAGT------T--A-AAA-ATgaagcaatctgaattatggcggataatacccatca
gi|33 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaacttgAATTTATA--TTATTA-ATTTTCATTA------AA-T-TT----AGACGT---TGAA---AA-T-AAGAA-------AT-T-AGCATTT---GA-GT-----AAATGGAATTCATA-------CCATTCG--CAAAAT-tacattaaagcaatctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|30 : TAAATTAA-A-AGTTGCAATA-T------------------------------------AA-AA-------AT-T-GGCATTT---GA-GT-----AAATGTAATTCTTAA-TT-ATCCAGTTG--CAACAT-ACACTTTACA---TA--C--ATAGAAGTAGAAGTT--A-ACA-ATTGTCA-T--TCAT---ATGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAATTATGGCGGATA-ATA-CCCtgtcattcaagtgaatgttatttgtaataaccaagttaataatgcaacaaagcaatccaaattatagcggacaattcccttaa
gi|37 : -AGTTGCAAGA-T-G--CA-T-TT----AAACAC--ATGGA---CG-T-AAGGA-------AT-C-GGCATTT---TA-GC-----GAGTACAGTTTGCAA-TA-ACCAAGATG--AAA----ACAATatca
gi|39 : aatttggcattttggtcaaaggaatatacaatttcct-AGTTGCAACA-T-T--CA-T-TTT---ACACAT--ATGGA---AG-A-AAGAA-------AT-T-GG--TTTTAAGAGGT-----AAATGTctgagttttggcagatgtttacgctccat
gi|40 : C--ATGGC---CG-TTAA-AA-------AC-T-GTCATTT---AA-AT-----GAATGTAACTTGTAA-TT-ACCAAGTTAAACAAAAT-ACAATAtggtaatcgatataatttgccattttgatttatacccacctggtcaggttaagcatcacatgacgatga
gi|31 : attatccacctttccaacaaccgggccA-AA-------GG-T-GACATTT---CA-GT-----GAATGCAATTTGTAAATT-A-CAAGTTG--CAATATCAAAAT-TACA---CA--C--ATGGAAGT------T--A-AAACGT-GTCG-T--TCAA---ATGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AT-CA----A-GTT-----A--AAAATACAAAAA-AGCAATAATGAATTATGGAAGGTA-ATA-CCCTTCaaacaatctgaattatgatgatacactccat
gi|37 : acattttaaacaaactttcgatc-AA-------TT-T-GGCATTT---TG-GTCAAAGGAATATA-----CAA-TT-TCCTAGTTG--CAAGAT-GCATT-TAAA---CA--C--ATGGACGT------A--A-GGA-ATCGGCA-T--TTTA---GCGAGTACAGT--T--------------TGCAATA----------AC-CA----A-G-------------ATG----AA-AACAAT-CTGAGTTTTGGCAGATGTTTA-CGCTCC
gi|38 : AGTTG--CAACATCAAAAT-TGCA---CAGTT--ATGGAAGT------T--A-GAA-GT--TCA-TA-TTAA---TTAAATGT---------------------GTACTA----------AC-CA----A-GTT----GA--AAACTGAAATAACAGGA-----GA---ATGGCGGATA-CTA-CCCTat
gi|39 : ttttaatgaaacatacaAGTTG--CAACAT-TCATTTTACA---CA--T--ATGGAAGA------A--AGAAA-TTGGT---T--TTAAGAGGTAAATG---T--T--------------GGTAATacat
gi|14 : TATACA---CA--CTTATGAAC-------------AAA-GTAA-CA-T--TTAT---ATGAATGTAAT--TTGTAAATTAGAAGTTGCAATATAAAAATTACACACATGGAA-GTT----AA--AAATTACATTAA-AGCAAT-CTGAACTATGGCGGATA-AAG-CCCTTCcgatataatttgccattttgatttatacccacctggtcaggttaagcatcacatgacgatga
gi|40 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaacttgtaaattctaagtttaaaattccaagtttcaaattctaagttt--C--ATGGCCGT------T--A-AAA-ACTGTCA-T--TTAA---ATGAATGTAAC--T--------------TGTAATT----------AC-CA----A-GTT----AAACAAAATACAATAA-AACAAT-CTGAATTAT----GATG-ATA-CACTCCatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|33 : attatccacctttccaacaaccgggcc-AAA-ATTGTCA-T--TCAA---GTGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT-----A--ATAATGCAACAA-AGCAAT-CCAAATTATAGCGGACA-ATT-CCCTat
gi|47 : aatttatattattaattttcattaaatttagacgttgaaaataagaaattagcatttgagtaaatggaattcataccattcgcA-T--TCAT----TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------TC-CA----A-GTT----AA--AAA-TATAATAA-AGCAAT-CTCAATCATGACGGATA-taa
gi|45 : gtcaaaC-CA----A-GTC----AA--AAA-TGAAACAA-AACAAT-CTAAATTATGGCGGATA-TTA-CCCTCCgat
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): CAAAATCTCACTAATGTCACTCCAGATTGATTAAACCAGGCCAACGGAATTATTTTCAGAAATGTCAAGGAATTCATAGTATCTACATTGAGATTTGACTTTATTGTGGTCAACAGTTGAAACGCACTTCAGGTCGCTTGGGCACAATTTTGATACGCAAATGTTTTTATATTCTTTTATTTTTTTCCATAATTGTTTTACTCTTACTGCCATCTTGTTTAT
Unaligned ( gi|28 ): AAATCTCAAATTTTACTCGCGCACCACAGACTAAAATGCAGTTCACCTACGCATCAACTCATCGAAAATCTATAATAGAAAATTGTGGAATACCAGAAACAACTAGATACAGTTTCTTTTTTATTCTCTTAAATTCACTCAGTAACGACAAATTTTTTTCAATATTCCATGTCCACTTCTCAAAAAAAAAATTCT
Unaligned ( gi|46 ): ATTTAGTTCTAAGTTCACTCAACAGCAGCAAACTTACTTTGCTAATATTTCTTTTATCAAAATGACTTTTATGGCTAAC
Unaligned ( gi|49 ): TGTCTGTTTCATATCCATTCTACCTTGCAATTGTATTGTTATATACGTAAAGCACTATCGAAGAAACA
Unaligned ( gi|51 ): CCACGTCGAAATGTGAAATAAAATAATCGAAGTTACGGCGGATATCATCCTCCATA
Unaligned ( gi|53 ): GAGGAGTGAAGTTGTCCTGTATTACTCACCATAGTAAAC
Alignments
lowQualScore : 11 33333333333333 1111111 333333333 222222222222 22222 22222222 2222222 111 1111111 111111 77777777777777 2222222 444444444 22222222222 888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222222222222222222 11111111111111111 111 1 11111111111111
lowQualScore : 1 1 99 2 2 66666 5555 2 2 4 7 1 55555 3 11111111111111 6666 33 1 3 0000000 44 77 000000000 222222222222 2 9999999999 1 3 55555 2 33 2 2 33 11111111 2 7777 3 0000000 0 3 0 7777 3 8888 0 3 888 0000000 6666 000000 2 0 5555 33 5555 333 2 2 2 33 33 88888888888888 3 3 6666 2 0 33 6666666 88 777777777 3 3 77777777777 666 6 3 44 2 3 3 1 1 1 44 5 2 2 7 5 2 2 2 2 1 2 4 444 2 0 0 2 0 999999999 5555 888888888888888888888888888888888888888888888 44 777777777777777777777777777777777 44444444444444444 00 33 1 2 33 1 111 888888 66666666666 2 4 2 2 333 4444 6666 55 4444 1 1 22 22 555 22 1 5555555 1 22 1 1 1 2 22 0 22 11111111111111 8888888888 1 4444 1 66666 22 3 1 1 2 2 2
lowQualScore : . . .. . . ..... .... . . . . . ..... . .............. .... .. . . ....... .. .. ......... ............ . .......... . . ..... . .. . . .. ........ . .... . ....... . . . .... . .... . . ... ....... .... ...... . . .... .. .... ... . . . .. .. .............. . . .... . . .. ....... .. ......... . . ........... ... . . .. . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . ... . . . . . ......... .... ............................................. .. ................................. ................. .. .. . . .. . ... ...... ........... . . . . ... .... .... .. .... . . .. .. ... .. . ....... . .. . . . . .. . .. .............. .......... . .... . ..... .. . . . . . .
lowQualScore : 0 6 00 9 9 77777 7777 0 7 9 6 6 88888 1 88888888888888 5555 66 4 1 0000000 22 33 555555555 666666666666 9 9999999999 6 8 66666 7 77 7 7 99 44444444 6 1111 3 1111111 5 1 2 1111 3 3333 2 3 999 4444444 5555 000000 9 7 7777 44 3333 666 5 4 1 44 44 44444444444444 3 3 1111 9 1 99 9999999 55 555555555 1 1 44444444444 555 7 3 33 3 1 3 0 0 0 22 0 5 5 5 0 5 5 7 7 0 7 0 777 7 8 3 7 1 666666666 7777 777777777777777777777777777777777777777777777 66 444444444444444444444444444444444 77777777777777777 99 44 0 5 00 0 999 222222 44444444444 0 0 0 0 555 2222 9999 00 5555 9 9 66 66 777 66 0 6666666 7 55 9 9 7 0 66 4 66 22222222222222 8888888888 9 0000 9 55555 66 4 9 9 0 1 2
consensus : AACAAACAAACGAA--GT-TATCATCAGAGATT-TCCAGGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--A---A---TCGATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCATTC-TACCTTGTACCTTT--AT--ATCTATATAT----------A-ACGT-AAA-ACA----AA-GTAGAAGAA--ATAT-------T--TTATA-CCG--C-TTTTAA-AA-AAA------TA---AANG-A-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTG-GATTTTGACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTTA-ATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
Reference ( family-2576 ) : AACAAATAAACGAAC-GT-TATCATCAGAGATT-TCCAGGAAN----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--AC--A---A---TCGATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TNTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCATTC-TACCTTGTACCTTT--AT--ATCTATATAT---T--AT-TA-ACGT-AAA-ACA----AA-GTAGAAGAA--ATAT-------T--TTATANCCGT-C-TTTTAA-AA-AAA------TA---AANG-A-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCANNAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTG-GATTTTGACAACANCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTNA-ATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|1 : AACAATTAAACAAAC-GT-TATCATCAGATATT-TCCAGGAAG----T----GTATCAGC-CCAGATATTTTTATATTTAATGAGCTT---ACGTTTATTGTTGTCAATAT---AG-AC---TT----TTGG-GTCCCATGGACACGAAGTTT-GAATT-------AGA--C--AC--A---A---TCTATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TATT----AATTATTGATTTA-T-T-TTATCTATTATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCGC-AT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-TAT-GTTA-TGAA----AAT-TAAAA-G-AAAA-AAAATACAT-----TTACAAATA----ATCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCGATGA----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TTAAGCTTA-TTTTCAGGTCAGTTA-TAACTTGTACCTTT--AT--ATCTATATATATAT--ATATACACGT-AAA-ACA----AA-GTGGAAGAA--ATAT-------T--TTATATCCGCACATTTTAA-AA-AAA------TA---AATG-A-C-TGTTCACTGCTACCTGAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTGCCAGAAAGTAACGTCATCT-GGGGAAACACATTG-GATTTTGACAACATTAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTACTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TGTCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTAA-ATTCAGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---A-----AATTATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATGAAGATGATA----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATGCACACTTATGA--ACAAAGGTGGGATTTAAA-TTAATTGAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-GAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGAAT-TTGA---GTAAAT----ATAATT--CCTAA--TTG----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TATACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--GTGGTCA-T-TCAAA--TGAATGTCAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAGATA-ATA-CCCTCC
gi|10 : AACAAACAAAC--ACAGT-TATCATCAGAGGTT-TCCAAGAAT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTCGTATATTAAATGAGCAT---TTTTGTGTTTTGGTCAAC-----AG-GC---TT----TTGG-ATTGCTTGGACACGACGTTT-AAGTT-------AGATGC--AC--A---A----------ATA--TC--G------AT-T-----TT----AATGATTGATTCA-T-TATTA-TTTTCATC--TT-TTT-TATCCTT--GTT---C-GT-TTTTTTTTGCCATGTT-CAG--------TA-TGAA----AA---AAAA-G-AAC--ATAATGCAT-----T----------------------------TTGTGACATCTCGATGA----AT--ATGAATTTGTATATGCTT----T-A-TCAAGCTCG-TTTTCATGTCCATTC-TACATTGTTCCTTT--AT--ATCCATAT--------------ACGT-AAA-ACA----AA-GTAAGGTAA--ATATTG-----T--TTATAT-CG----TTTTAA-AA-AAC------TATT-AAAG-ATC-TATTCTCTGCTACCTAAAGCTATTAGTGACCAGTGTGTTAC
gi|11 : aatgcttgcagtttcatagtttttattatcaaaatgacctttacagttatccacactgttcgcAACAAGTAAACGAA--AT-TATT-TTAAAAAGT-TGCAGGAATCCCTT----GTTTCAAC-CCAACTATTTCCATCTTCAATT--TAT---GATTGTGTTGTGGTCAGCA-----G-ACA--CT----CGGG-GTCGCTTGGACACACTGTCT-GAATT-------AGATAC--GC--AAATA---TTGATGTATT--CC--AGTCT-TTT-TT--TTTC----AATTATCGTTTTA-T-TCTTA-CTATCATCTTTT-TTT-TAT-CTT--TATTCAA-TT-TTTAg
gi|11 : acgattccccagactatttccCAT----GACAT-ACTGCGACATCTTGATGACTATGGTTATGAATTTACGTAAGCTT----T-A-TTAAGCTTG-TTTCCAAA-CCATTC-TACTTTGTTCCTGT--ATTGCTCTATACAaaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaaccatgacatactgcgacatcttgatgactatggttatgaatttacgtaagctttattaagcttgtttccaaaccattctactttgttcctgtattgctctatacacatatgaaaca
gi|12 : acgattccccagactatttccaacaagtaaacgaaattattttaaaaagttgcaggaatcccttgtttcaacccaactatttccatcttcaatttatgattgtgttgtggtcagcagacactcggggtcgcttggacacactgtctgaattagatacgcaaatattgatgtattccagtctttttttttcaattatcgttttattcttactatcatcttttttttatctttattcaatttttaaaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaacTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-C-AAAAG-TATCATCGTTCAA-GCCACCTAGCG--CCAATATT-----GCTTGNNNNNNN---NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---G-----AGTTATGT----CTCTAAA-------TT---------CATATT----TTT---------TT-CATGAAATGAAGATGGTA----ACCTAGTAA---CTGTAAGCTGTA-----ATAACGTATTTAAAGTA-----TGCAAATTGTATACGCATTGACGA--ACAAAGATGATATTTAAG-TAAAGGCAACTTGTTTATTACA---TG--------AAA-A-TT-ACCAA--CATGGAAG-TAA-GACATT-GACAT-TTG---------T----GTA--T--T---A--TTA----TCCA-GTTGCAACATGC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------AAG-AA--AGTGTCA-T-TT---------TATAAT--T--------------TGT--TG-----------------------T----AA--AAA--GCAGTAA-TGAATT-CTGGGTTTTTGGCGGGTcatatgaaaca
gi|13 : AAACGAAA-CTATATTCTCA---ACTATCAAGGAAT----TCATAGTATCTATTCCAAAGATTTGCATCTTGA----GCAT---ATTTTTTTTATTG----CG----AA-AC---TTGCACTTGGCGTTGCTTGGACACAGTTTTTCGAAAT-------AAATGT--GCT-G---A---TAGAGTTGTA--TTTAA---TATAT-TTGTTCTC----CATTATCCTTTTA-TAC-TTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTGT--TTTT----------ATCTT----TATT-CA-------CTAAATGTA----ACT-TAAA------CA-AG--TGCAT-----GCACATTTA----GTCGT----ACCAT-ATTTTGACATCTTGATGG----AG--ATGAATTTACATTAACATATCAT-AGTCAAGATTG-TTTTCAGTTCTCGTC-TTCTTTGTTCCTAT--GT--ATTTATATTA---T--AT-GA-AATT-ATA-ACT----GA-ATAAAAAAATTATATAG-----T--TTActccaccccccaccccaccatgtaaatcgtcacataacaacga
gi|14 : acaaaatcttctttatggttcttcagtttattcacaacatagaaCACTGCTGACTTAAGCTTTTTTTTACCATTGTGTTACCAATAGGTGACGTTATCT-GTTGTAACACATTG-GA------CAACATCAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTTCTCTTACTGTAGGGAGAAGTCG-TCTT-T-C-ATA-G-TATCGGTGCTTTA-GCCACCTAGCA-AATAA-ATTCAGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTAA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---ATACACACTTATGA----aa
gi|14 : T----GTAAAT--TCTAAGTTTAAAATTCCAAGTTTCAA-ATTCTAAGTTTTATA--CA---CACTT--A--T------GAACAA--AGTAACA-T-TTATA--TGAATGTAAT--TTGTAAATTAGAAGTTGCAATATAAAAATTACACACATGGAA-GTT----AA--AAATTACATTAA-AGCAAT-CTGAA-CTATGGCGGATA-AAG-CCCTTCacaaagtaacatttatatgaatgtaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagttaaaaattacattaaagcaatctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|14 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaactTTTTATACACACTTATGA--ACAAAG-TAACATTTATA-TGAATGTAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-ACACA--CATGGAAGTTAA-AA-ATT--ACAT-TAAA---GCAAatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|15 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaacttgtaaattctaagtttaaaattccaagtttcaaattctaagAAGCTACTTTTGACCACTGTATCACCACTAAGTGACATCATCG-GGGGAAATGCATTG-GTTTTTGACAACATCAAACAGCTTACTCAGATTTCTTAC--CTTTCCCTTATCGT-------------T-TT-T-C-AAA-G-TTTCGGCGTTTTA-ACCTCCTACCC-ACTTA-CTTCAGAAGTTTCAATATTA---CTAAC-GTGTA------AAGTTTGA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGAATGTCGCTA-----AATT---------T------------TA---------CAT-------TCT---------CT-AATGAAATTAAGATGATG-----------AA---ACG--------A-----GTAAT----------T------TGCACATTTTATACACACTTTGGG--ACAAAGGTGACATTGCAA-TGAAGACAATTTGTAAATTACAAGTTCCAAAA-TCAAA-A-TT-ACACA--C---------------ATT-GGCAT-TTGA---GT---------TAATT--TATAA--GTA----TTCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---Ctctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|16 : g-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTTA-ATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-ATGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGATTGTCT------------CTTAATATTCACAT-------CAT---------TT-TATGAAATTAAAATGATG-----------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTAAA-TGAAAGCAGTTTGTAAATTAAAAGTTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GACAT-CTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA--TTA----TCCA-TTTGCAACATAC-AA--TTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGCAA-----------------------------------------------------AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTCAA-TTATGGCGGATA-ATACCCCTCC
gi|17 : AATTAAACAAAG-GT-TATCATTAGAGATT-TCCAGAAAG----T----a
gi|17 : cttactttgcaaatatttctttAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AC----TG--------G-----GTAAC----------T------TGAACATTTCATACACATCTATGA--ACAAAAGTGACATTTTAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GCAATT--TTTAC--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---GATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGGA-TTATGGTGGATA-ATA-CCCTCCtttatattatttcatgaaattaagatgatgaactgggtaacttgaacatttcatacacatctatgaacaaaagtgacattttaatgaatgcaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagtaagaaattggcatttgagtaaatgcaatttttacttatccagttgcaacatacaatttacacagatggaagttaaaaattgtcattcaaatgaatgtaatttgtaataaccaagttaaaaaatacaataaagcaatctggattatggtggataataccctccata
gi|18 : cttactttgcaaatatttctttaattaaacaaaggttatcattagagatttccagaaagttttatACAAACAAAC-GT-TATCATTAGAGATT-TCCAGGAAG----T----GTATCAAT-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGTAT---ACTTT--------TCAAT-----AG-GC---AT----TTGG-ATCGCTTGGACACTACGTTT-GAATT-------AGATGC--TC--AAATA---TCGATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATTAATTCA-----------ATC--C--TT-TTT-TATCCAT--TTTTCAC-TT-TTCATCTT----TGTT-TAGTAT-T-CTTA-TGata
gi|19 : cgcgctctactttagttctaaattcacttgaaacagttgcaaacttactttgcaaatatttctttaattaattaaaacgacggctttAAGTTTC---C-----AATTATTG----CTAC----------GT---------CAT-------AATTTAAAGTTATT-CATGTAATTAAGATGATGGCATA------AATACATG--------AAATTTGTAAC----------TGCAGCGTGCA-ATTTTATATGC---TTTGAAGAAAAAAGTAATTTTTTAAGTGAGCG-----------TTATCATTTGCAATA-T-ACA-ATTT-ACACA--CATTGCAG-TAAGAA-ATT-GACAT-TTAA---TTCAAC----ATTCTT--TATAG--TTA----CACA-GTTACAACATGT-AA--TTTACA--CA---CAACG--AAGT------ATA-AA--CTTGTCATT-TCAGA---GAATGGAATTGT--------------CGT--TA----------AA-CA----ATATT-----A--TAAATACAATAA-GGCAAT-CTGtttatacgtaaaacaagaaga
gi|2 : AAACAAACAAAC-GT-CATCATCAGAGATT-TCCAGGCAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA-----G-AC---CT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-AAATT-------AGATGC--GC--A---AATACCGATTTATA--CC--A---T-TAT-TG--TTTT----AATT---GATTC------TTA-CTAT---------------TCCTT--TTTTCGC-TT-TTCAACTT----TGTT-CAGT-T-TGTTTA-TGGA----AAT-TAAAA----ATA-CAAATACAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCACTTT----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TCAAGCTTA-TTT--AGGTCAATTT-TACCTTGTACCTTT--AT--AT----ATAT------------ACGT-AAA-ACA----AA-GTAGAAGAA--ATAT-------T--TTATACCCGTAC-ATTTAA-AA-AAA-------A---AAT----C-TGTTCACTGCTTCCTAAAGCTATTTTTGACCATTATGTTACCTATAGGTGACGTCATCT-GGG-AAACACATTG-GATTGTGACAACATCAAACGGCTAACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-ACCACTTAGCG-ACTAA-ATTCAGA--CGTCAATATTA---CTAAC--TGTAAATTCTTAG-TTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGACTTTCTCTA-----AGTT---------T------------TA---------CAT-------TAG---------TT-CATG-------------------------AA---ATG--------A-----GTAAG----------T------TGCACATTTTGTACACACTTATGA--ACAAATGTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-GCACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GTTAT-TTGA---GTAAAT----GTTATT--CTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACAAAC-AA----------------ATGA--A-------------------TGTAA-T-T----------TGTA-----------------------ATA----------AC-CA----A-GTT-----A--AAAATACAATAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGAAA-ATA-CCCTCC
gi|20 : tgcaaacttactttgcaatttttctttaattatttaaaacaactgctTCTAC-CCAGAAATTCGCATCTT--AGGAACAT----TTTTTATTa
gi|20 : TC-GAATT-------AG-TGCTGAT--A---A---T-GTTGTATT--TG--A---TGTGT-TT--TCTC----CCTTATCGTTTTA-TAC-TTA-CTGTCATC--CTATTT-TATGTTC--TTTT-------TCTATCTT----TATT-CA-------CT------A----AATATAAAATG-AACC-AA--TGCAT-----ATACAACTA----GTCAA----ACCAT-TTTTTGACATATCGATGG----AG--ATGAATTTAC---AGCT-----------AA------TTTACAGATCCTGTC-TACTTTATACGTCT--GT--ATTTATATGT---tatcgaattagtgctgataatgttgtatttgatgtgttttctcccttatcgttttatacttactgtcatcctattttatgttctttttctatctttattcactaaatataaaatgaaccaatgcatatacaactagtcaaaccattttttgacatatcgatggagatgaatttacagctaatttacagatcctgtctactttatacgtctgtatttatatgtgaacatataattgattattattgtttaaaataaactac
gi|21 : tctacccagaaattcgcatcttaggaacattttttatttaTATA--CT--AATAT-TAT-TT--GTTC----AGTTATCGTTTAA-TAT-TTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTTT--TTTTTAT-------ATCTT----TATT-CA-------CT------A----AAT----AT-G-AATATCCAATGCAT-----GCACAACTT----GTCAT-----ACATTATTTTGACATCTCGATGA----AG--AT--AGCTGTATA----T----T-G-CCATACTTGTTTTTCAGGTC----C-TGTCTTCTA--TGT--AC--ATCTGTAT-T---T--A---A-ATGT-GAA-ATT----TA-ATGGAATAA--ATAT-------T--gaacatataattgattattattgtttaaaataaactac
gi|22 : atgctcttatagtgtcgTGATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------A------TGCTTATTTTATACACAATTTCGA--GCATAGGTGACATTTCA--------C-------------CAAGTTGCAATAAC-GAA-A-TA-GCACA--CATGTATA-CAA-AA-AAT-GGCAT-TTTA---ATAAAT----GGAATT--TTTAA--CTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CAAGG--ACGT------T-A-CA--ATTGCCA-T-TCAAA--TGAATTTAAT--G--------------TGTAATA----------AA-AA----A-ATT----AA--CAAATACAATGA-AGAAAT-CTTAA-TTATGGCGTATA-ATA-CCCTCCgtttaaaccaaaatg
gi|23 : CAGAGATTTGCATTTTCA--GAACAT-----TTTTATTGTGACAAACT----GGCAC----T----TAGG-GTTGCTTGGACCTAGTGTTT-CAATT-------AGATGC--GCAAA---A---T-GAGTTGTATTCT--A---T-TAT-TTG-TTTT----ATTTATCGTTTTA-TAT-TTA-CTA-CATC--TT-TTT-TATCCTTAGTTTTCat
gi|24 : cgatctcctttatggctctctaggtaattcgtacatggcaaacgaaactattttcagtcatagtttcttcatcgagattttAACGGA--AT-TATTTTCAGAAATG-TCAAGGAAT----T--------CA----TAG-TATCTACAT------TGAG-ATTTGACTTT-ATTGTGGTCAACAGTTGAA-ACGCACT----TCAG-GTCGCTTGGGCACAAT-TTT-G-AT----------ACGC--A---A---A---TGTTTTTATATTCT--T---T-TAT-TT--TTTTC---CATAATTGTTTTACT-C-TTA-CTGCCATC--TT-GTT-TATc
gi|25 : caaaatctcactaatgtcactccagattgattaaaccaggccATGTTAACAACAGCAAACGGATTGCTCGGATGTTTTCG--CTTGTCTTTACCGCAGTGAGCAAT-------------------ATAAGCGTTCAA-GCCACCTTGTG-CCGAA-ATTTCAAAGTATTAATATTG---CTTAC-TTGTAAATTTTAA-CTATA-AAT-------------TTCTAA--TTC---A-----TATGATGA----CA------------AT---------CATAGTACAATAT---------GTAAATGAAATTAAAA
gi|26 : atgttatctaaacctaATCACTAAGTGACGTCATCT-AGGGATACACATTG-AGTTTTTACAACAAAAACCAGCATACTCAGATTTCTTCTCATTTTCCCTTATCATAAGTAGCAGTCGTT-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCAA--TAGCG-GTTTA-AT-------------TATTG---CTAAC-TTGTAATTTCTAAG-TTCA-ACTTCTTAGTTTCAAATTCTAACTTCC---A-----AATTATAA----cacgtgcaattaaaaat
gi|27 : TTAA-ATCATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TTTACATTTTATACGCACTTTTGA--ACA---------TTTCAG-TAAAT----TTTGTAAATTACAAGTAGCAATA-TCAAA-A-CA-ACACA--CATAAAA--TAA-GACATT-GGTAT-TTTA---GTAAAT----GGAATT--AATAG--TTA----TTTA-TTTGCAACAAAC-AA--TTTACA--CA---CATGT--AAAT------CCA-AA--gtgtcta
gi|29 : T-T-T-CTTC-TGAATTTAAAT-TAACA-GCAATA-AAA--GCAT---------GAATA----GTCATATCGTAAAT-ATTGTGATATCTCGGTGG----GG--ATGCATTTATATTAACCA----T-G-TTAACCTTG-TTTTCACATACATTA-TACTTTGCACTTTT--AT--ATtataattatatgtttgaaatat
gi|3 : tattctatAACAAACAAACGAA--GT-CATCATCAGAGATT-TCCAGGAAC----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCAT------------------TCTT-TTGTGGT------------------T----TTGG-ATCGCTTGGATACAACGTTT--AATTTAAAAATAGATGC--AG--A---AATATTGATTAAAA--CC--------TGT-TT--TG------AATTATTGGTTTA-T-TCTTA-CTTTCGTC--TT-TTT-TATCCTT--GTTT-AC-TT-TTTTCCTA----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AC--TACAT-----TCACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATACTGACATCTCGATGG----AT--GTGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCATTC-TACCTTGTACCTTT--AA--ACCCATATG--------------CGT-AAA-ACA----AA-A---AAGAA--ATAT-------TGTTTATACCA-----TTTTGA-AA-AAA------TATTGAAGA-A-C-TGTTCACTGCTACCTCAAGCTATCTTTGGTCATAGTGTTTTCACCA------------------------ATTA-ATTTTTTACAACAAAAACCGCCTTACTCAGATTTCTTCA--TTTTCCCTTAATGCAGGGAGCGGTCG-T-TT-T-TTAAA-G-TATTGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTTA-ATTTAGAAGAGTCAATATT-------AC-T----AAT-------------AT-----GT---AAATTCTAAGTTTT---A-----AATGAT--------------------------------------------------------------ATTAAGCTAATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TACACATTTTATTCTCACTTTAGA--ACAAAGGTAACATTTCAG-TGAATGCAATTTGTAAATTACAAGTTGCAATA-T-AAATA-TA-ACACA--CATGAAAG-TAC-GA-ATTTGGCAT-CTGA---GTCAAT----GAAATT--TATAA--TTA----TCAA-TTTGCAGCATAC-AA--CTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-A-TAAAA--TGAATGTATT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--CAAATACAATAA-AGCAAC-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCCtggcaaatagcattcaaagtatagtttatatcaatataagtgaaaaa
gi|30 : tatcaacatttatcacTAAATTAAAAGTTGCAATA-T-AAA-A---------------------------ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AC--TTTACA--TA---CATAG--AAGTAGAAGTTAA-CA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCC
gi|31 : A-AA-GGT-GACAT-TTCA---GTGAAT----GCAATT--TGTAAA-TTA-----CAA-GTTGCAATATCA-AA--ATTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--CGTGTCG-T-TCAAA--TGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AT-CA----A-GTT-----A--AAAATACAAAAA-AGCAATAATGAA-TTATGGAAGGTA-ATA-CCCTTCatca
gi|32 : acattttaaacaaactttcgatcTA-T-TCTTT-CTATTATC--TG-TTTATATCCTA--TTT--AC--T-TTCATCTT----TGTTGCGTT-T-T-CTTA-TGGA----AAA-TAAAA-G-AA---GAAATGCAT-----TTACAACTA----GTTAT----TGCAT-ATTGTGACATATCGATGT----AA--ATGAATTTGCATCAGCTT----T-A-TCGAGCTTG-TTTTCAGGTTTATTA-TA
gi|33 : gacaatttataAATTTATA--TTATTAATTTTCAT--T-AAA-T-TT-AGACG--T-TGAAAA-TAAGAA-ATT-AGCAT-TTGA---GTAAAT----GGAATT----------------------------CATAC-CA--TTCGCA----------------------------AA--ATTGTCA-T-TCAAG--TGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT-----A--ATAATGCAACAA-AGCAAT-CCAAA-TTATAGCGGACA-ATT-CCCT
gi|34 : TTCC--TTTTCCCTTTCCGTATGGAGCAGTCG-T-TT-T-T-TTA-GTTATT-GC-TTTCAGGCAAACTGCCGTAGTT--ACTCAGATGTG---AGATTG---CTAATACCGCGAATTCAAGGTTCCATGATTCtaa
gi|35 : agattgat----GTCAC----GCCAT-ATTTTGACATCTCGATAG----AG--ATGAATGTACGTGATCTT----T-T-TCAAGCTCG--TTTCAGATCC-TCCGTACTTGGTACCTCTGAGC--ACTTGTG-AT---TCGAT-TACACAG-AAACGCA----AACGTAAAAAAT--ATAA-------T--TCATtgcctaaaatcaaaatggtgcttacccattatgattttt
gi|36 : atAAACAAACAAAA-GT-TATCATCAGAGATT-TCCAACAAA----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTtaaaaaagtcattaa
gi|37 : agttcttaatactcctgaaacagctacaaacttactttgcaaatagttctttaactaatcaaaaggactcct-AA-TTT-GGCAT-TTTG---GTCAAA----GGAATA--TACAA--TTT----CCTA-GTTGCAAGATGC-A---TTTAAA--CA---CATGG--ACGT------AAG-GA--ATCGGCA-T-TTTAG--CGAGTACAGT--T--------------TGCAATA----------AC-CA----A-GAT----GA--AAA------------CAAT-CTGAG-TTTTGGCAGATGTTTA-CGCTCC
gi|38 : TTTTAA-TGAAA-CA----------TACAAGTTGCAACA-TCAAA-A-TT-GCACAGTTATGGAAGTTAG-AA-GTT---CATATTAA---TTAAAT----GTat
gi|38 : A-GTTGCAACATCA-AA--ATTGCA--CAGT-TATGG--AAGT------TAG-AA--GTT--CA-TATTAAT--TAAATGT---------------------GTACTA----------AC-CA----A-GTT----GA--AAACTGAAATAACAGGA-----GA----ATGGCGGATA-CTA-CCCTgtactaaccaagttgaaaactgaaataacaggagaatggcggatactaccctacat
gi|39 : ttttaatgaaacatacaA-GTTGCAACATTC-AT--TTTACA--CA---TATGG--AAGA------AAG-AA--ATTGGTT-T-TAAGAGGTAAATG---T--T--------------GGTAATacat
gi|39 : AGTTGCAACA-T-TCA-T-TTTACACA--TATGGAAG-AAAGAA-ATT-GGT-T-TTAAGAGGTAAATGTTGGTAATCGATATAA--TTT----GCCA-TTT--------T-GA--TTTATACCCA---CCTGGTCAGGT------TAA-cgatataatttgccattttgatttatacccacctggtcaggttaagcatcacatgacgatga
gi|4 : AACAAACAAACGAA--GT-TATCATTAGAGATT-TCAAGGAAT----T----CTTTTAAC-CAAAATATTTGTACATTCAATGAGCAT---ACTTTT-TTGTGG--------------C---TT----TTGG-ATTGCTTTGTCACGACATTT-GAATT-------GGGTGC--AC--A---AATATCGATTGATA--CC--A---TATAT-TT--T-------AATTATTGATTTA-T-TATTA-CAATCATC--TT-TTT-TAACCTT--GTT-CAC-AA-TT--TCCT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAA--G-AACA-AA--TGCAT-----TTACATCTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTAACATCTCGATAG----AG--ATAAATTTACATGAGTTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGATCAATTC-TACCTTGTACCATT--AC--ATCTATATA--------------CGT-AAA-ACA----AA-ATAGAAGAC--ATATTG-----T--TTATA-CCG----TTTTAATAA-AAA------AA---AAGA-A-C-TATTCATTGCTAAGAAAAGTTATTTTTGACCATTGTGTTCCAACTATGTGACGACATCT-CGGGAAACACATTG-ACTTTTGACAACAAAAACCATCTTACTCAGATGTTTTCC--TTTTTTTTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TTGT-C-AGA-G-TATCGGCA-CTTA-GCCACCTAGCG-ACTTA-ATTTGGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTCAATTCTTAGTTTAA-AA----AAGTTTCAAATTCTAATTTTC---A-----AATTATGA----CT------------GT---------C------------------------TATGAAATCAAGATGATG----A------TA---GT---------------GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACATTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTCAG-TGAgcatcacatgacgatga
gi|40 : nnnnacaactcgctccacttagttctaaattcactcagcagcgtcaatatttgctaataatatttctttagtcaaaacgaccattacggctatccacactgttcac---CATGG--CCGT------TAA-AA--ACTGTCA-T-TTAAA--TGAATGTAAC--T--------------TGTAATT----------AC-CA----A-GTT----AAACAAAATACAATAA-AACAAT-CTGAA-TTAT----GATG-ATA-CACTCCc
gi|41 : attatccacctttccaacaaccgggccGATGG----GG--ATAAATTTACACAAGCTT----T-T-TTAAGCTAG-TTTTCAAATCCAGT------TTATACTT---------TCCACACAT-------T-TA----T-GAA-ACATTTTAG-GT--AAGAA--ATAC-------TGGTTA-----------TTTAA-AACAAA------TT---AAat
gi|42 : gaatat-AA-AAT------TA---AAAG-A-AGTGTTCACTGCTACTTTAAGCTACTTTTGACt
gi|42 : gaaaagggTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-CAAAA-G-TATCaaaatcaaaaggattgccgtagggagcagtcgatttcaaaagtatcatc
gi|43 : gaaaagggaaaattaaaagaagtgttcactgctactttaagctacttttgacaaaatcaaaaggaAACAAGCAGAA-GT-TATCATCAGAGATT-TCCAACAAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCACATTGAATGAACAT---ACTTTTATTGTatc
gi|44 : --ATGAATTTACATAAATTT----TTG-TTAAACATG-TTTTCAAATCCATTC-TTCTTTGTATCTTT--TT--ATATAT
gi|45 : tgtggcA-AA--TTTGCCA-T--CAAA-----ATGT--T--T--------------TC----------------C-CA----A-GTC----AA--AAA-TGAAACAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-TTA-CCCTCCcggacaaaaa
gi|47 : ttA-AA--ATT--CA-T-T-------GAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------TC-CA----A-GTT----AA--AAA-TATAATAA-AGCAAT-CTCAA-TCATGACGGATA-gta
gi|48 : gtcAT----T----GTATCATC-CCGGAAATTTGCATATC---T-AGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-TT---TT----TTGG--TCGCTTGAATAgat
gi|49 : tTTTCATATCCATTC-TACCTTGCAA--TT--GT--ATTGTTATAT------------ACGT-AAA-GCA----CT-ATCGAAGAA--ACAa
gi|5 : tgtctgAACAAACAAAT-GT-TATCATCAGAGATT-TCCAGAAAT----T----GTTTTTAC-CCAGATATTTGCATATTGAAAGAGCAT---ATTTTTATTGTGATCAACC----AG------TT----TTTG-ATTGCCCGGACACAATGTTT-ACATT-------AGACGC--GC--A---AATATCAAATGATC--CC--A---T-T-T-TT--TTTTGTCAAATTGTTGATTTA-T-TCTTA-CATTCATC--TT-TTT-TATCCAT--GTT-CAT-TT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-A---TGCAT-----TTACAACTATCTAGTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTTGGTAG----AT--ATGAATTTGTAGAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCATTC-TACCTTGCACTTGT--AT--ATCTATAT--------------ACGT-AAA-GCA----AA-GTAGAAGAA--ATACCCTATTGT--TTATA-CTG-----TTTAA-AA-AAACAT---TA---AAAGAA-C-TATTCACTGCTACCTTAAGCTATTTTTTACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACTCATTGTTTTTTTTACAACAAAAACCAACTTACTCTGATTTCTTCC--TTTTTCCTTACCGTAGGGAGCAGTCGTT-TT-T-C-AAA-G-TAGCTGCATTTTA-ACCACATAGCG-ACTTA-ATTCATAAGTGTCAATATTA---TTAAT-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAATTTTCAAATTTTAAGTTTC---A-----AATTATGA----CT------------GG---------C------------------------CATGAAATTAAAATGATG-----------AA---ATG--------T-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCCA--ACAAAAATGA
gi|50 : cAG-AA-AAT------TA---AAAG-AAC-GGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTATTGAC
gi|51 : aaagC-CA----C-GTC----GA--AATGTGAAATAA-AATAAT-CGAAG-TTACGGCGGATA-TCA-TCCTCCatcaaatggattac
gi|52 : TGACGTCATCT-GGGG-AACACATTG-GATata
gi|6 : ----AA-GTAGAAGAA--ATAT-------T--TTATAACTGT-C-CTTTGA-AA-AAAAGAAATTA---AATA-A-C-TGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTTT-GACCATTGTGT-----------GATGTCATCT-GGGGAAACACATTG-GATTTTGACAATATCAATCGGCTAACTCACATGTCTTCC--TTTTACCTTACCGTAGGGAGCAGTTG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG-ACTTA-ATTCAGAAGTGTCAATATTAATACTAAC-TTCTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGA----CTGTCTCTAAATGTTTA--------CAT-------AAT---------TT-AATAAAATTAAGATGATG----A------AA----TG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTTAA-TGAAAGCAATTTATAAATTAAAAGTTGCAATA-T-A------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAG--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--TAGTACATAG--AAGT------TAA-AAAAATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAAATA-ATA-CCCTCCgtgtctgtgatgtcatc
gi|7 : ----AA-GTAGAAGAA--ATAA-------T--TTATAGCCGTTC-TTTTAA-AA-AAGAAAT--TA---AATA-A-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCAAAAGGTGACGTTATCTTGGGGAAACACATTG-GATTTTGACAACATCAATCGGCTTACTCACATGTCTTCC--TTTAATCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACATGGTG-ACTTA-TTTCAAAAGTGTCGATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTGTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGA----CTGTCTCTAAATG-TTTA-------CAT-------AGT---------TT-TATGAAATTAAGAGGATG-----------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATTTTCTGTCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTAAA-TAAAAGCAATTTGTAAATTAAAAATTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATA--ATAAA--TTA----TCCA-GTTGCAACGTAC-AC--TTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAA-AA--AGTGTAA-T-TTATA--TGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----T-ATT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-a
gi|8 : TAA-AA-CAA------GA---AGAA-A-T-ATTTCTCTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCATG-GGTGACTTCATCT-GGGGAAACACATTG-GATTTTGACAACATCAAACGGATTACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG-ACTAA-ATTCGGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTCAGTGTC---A-----AATTATGA----TT------------TT-----------T-------TATAAGT-----TT-TACTTTATT----TGATG----A------AA----TG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTATGG--ACAAAGGTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAGTTAGAAGTGACAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATTGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CG---AATAG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTTAAAAAA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|9 : atacgAACAAATAAACGAA--GT-TATCATCAGGAATT-TACAGGACT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCATTTTAAATGGGCAT---AATGTTGGTGTGGTCAAC-----AG-AC---TT----TTTG-ATCTCTTGAACACAACGTTT-GAATA-------AGATGC--AC--AAATA---TCGATTCATA------------TATATT--TTTT----AATAATAG----------------ACCATC--TT-TTT-T-TCC-T--TCTTCACAGTGTTCGTA------TGTT-CAGT-T-TCCTTA-TGGA----AAT-TAA-----AACA-ACAATGTATTAATGTTAAAACTA----GTCAT----TGCAT-AGTTTGACATATCGATGG----GG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCGAACTTG-TTTTCAGGCCCATTC-TACCTTGTACCTTT--AT--ATCCATAT--------------ACGTAAAA-ACA----A----AGAAGAA--ATATTG-----T--TTATA-CCG-----TTTAA-AA-AAA------TATTTAATA-A-C-TTTTGACTGCTACCCAAAGCTATCTTTGGCCATAGTGTTACCACCAGGGTACGTCATCT-TGGGAAAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): AAATCTCAAATTTTACTCGCGCACCACAGACTAAAATGCAGTTCACCTACGCATCAACTCATCGAAAATCTATAATAGAAAATTGTGGAATACCAGAAACAACTAGATACAGTTTCTTTTTTATTCTCTTAAATTCACTCAGTAACGACAAATTTTTTTCAATATTCCATGTCCACTTCTCAAAAAAAAAATTCT
Unaligned ( gi|46 ): ATTTAGTTCTAAGTTCACTCAACAGCAGCAAACTTACTTTGCTAATATTTCTTTTATCAAAATGACTTTTATGGCTAAC
Unaligned ( gi|53 ): GAGGAGTGAAGTTGTCCTGTATTACTCACCATAGTAAAC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 1111111 333333333 222222222222 22222 22222222 2222222 111 1111111 111111 444444444444444444444 22222222222 44444444444444 2222222222 1 1 11111111 111 888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222222222222222222 11111111111111111 111 1 11111111111111
lowQualScore : 2 1 555 5555 33 33 55555 5555 4 2 4 7 1 55555 3 9999999999999 6666 33 1 66 0000000 44 77 111111111 3 222222222222 2 66 8888 1 3 55555 2 33 2 2 33 11111111 2 7777 3 0000000 0 3 0 7777 3 8888 0 3 888 0000000 6666 000000 2 0 5555 33 5555 333 2 33 2 1 33 1 2 333333333333333333333 2 444 5555 2 55555555555 22222222222222 2 2 4444444444 33 0 3 4 2 3 3 1 1 1 44 2 2 2 0 5 2 2 2 22222222 3 444 2 0 0 2 222 66666 2 2 5555 444444444444444444444444444444444444444444444 44 777777777777777777777777777777777 44444444444444444 00 33 1 2 33 1 111 888888 66666666666 2 4 2 2 333 4444 6666 55 4444 1 1 22 22 555 22 1 5555555 1 22 1 1 1 2 22 0 22 11111111111111 8888888888 1 4444 1 66666 22 3 1 1 2 2 2
lowQualScore : . . ... .... .. .. ..... .... . . . . . ..... . ............. .... .. . .. ....... .. .. ......... . ............ . .. .... . . ..... . .. . . .. ........ . .... . ....... . . . .... . .... . . ... ....... .... ...... . . .... .. .... ... . .. . . .. . . ..................... . ... .... . ........... .............. . . .......... .. . . . . . . . . . .. . . . . . . . . ........ . ... . . . . ... ..... . . .... ............................................. .. ................................. ................. .. .. . . .. . ... ...... ........... . . . . ... .... .... .. .... . . .. .. ... .. . ....... . .. . . . . .. . .. .............. .......... . .... . ..... .. . . . . . .
lowQualScore : 7 7 666 7777 77 77 88888 7777 5 5 9 6 6 88888 1 7777777777777 5555 66 4 44 0000000 22 33 888888888 1 666666666666 9 88 9999 6 8 66666 7 77 7 7 99 44444444 6 1111 3 1111111 5 1 2 1111 3 3333 2 3 999 4444444 5555 000000 9 7 7777 44 3333 666 5 22 4 4 44 7 5 888888888888888888888 7 777 3333 7 99999999999 44444444444444 7 9 3333333333 22 0 3 6 3 1 3 7 0 0 22 5 5 5 0 0 5 5 7 33333333 1 777 7 8 3 7 000 77777 7 7 7777 999999999999999999999999999999999999999999999 66 444444444444444444444444444444444 77777777777777777 99 44 0 5 00 0 999 222222 44444444444 0 0 0 0 555 2222 9999 00 5555 9 9 66 66 777 66 0 6666666 7 55 9 9 7 0 66 4 66 22222222222222 8888888888 9 0000 9 55555 66 4 9 9 0 1 2
consensus : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--A---A---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---A---------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CC---G------TTTTAA-AA-AAA-----TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
Reference ( family-2576 ) : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--A---A---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---A---------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CC---G--C---TTTTAA-AA-AAA-----TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|1 : AACAATTAAAC-AAACG-TTATCATCAG----ATATTTC--CA--GGAAG----T----GTATCAGC-CCAGATATTTTTATATTTAATGAGCTT---ACGTTTATTGTTGTCAATAT---AG-AC---TT----TTGG-GTCCCATGGACACGAAGTTT-GAATT-------AGA--C--AC--A---A---TCT-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TATT----AATTATTGATTTA-T-T-TTATCTATTATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCGC-AT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-TAT-GTTA-TGAA----AAT-TAAAA-G-AAAA-AAAATACAT-----TTACAAATA----ATCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCGATGA----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TTAAGCTTA-TTTTCAGGTCAG--TTA-TAACTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---ATATATATACACGT-AAAA---CA----AA-GTGGAAGAAATAT-------T--TTATATCC---G--CACATTTTAA-AA-AAA-----TA---AATGA-C-TGTTCACTGCTACCTGAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTGCCAGAAAGTAACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATTAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTACTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TGTCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTAAATTCAGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATGAAGATGATA----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATGCACACTTATGA--ACAAAGGTGGGATTTAAA-TTAATTGAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-GAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGAAT-TTGA---GTAAAT----ATAATT--CCTAA--TTG----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TATACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--GTGGTCA-T-TCAAA--TGAATGTCAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAGATA-ATA-CCCTCC
gi|10 : AACAAACAAAC-ACA-G-TTATCATCAG----AGGTTTC--CA--AGAAT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTCGTATATTAAATGAGCAT---TTTTGTGTTTTGGTCAAC-----AG-GC---TT----TTGG-ATTGCTTGGACACGACGTTT-AAGTT-------AGATGC--AC--A---A-----------ATA--TC--G------A------TTTT----AATGATTGATTCA-T-TATTA-TTTTCATC--TT-TTT-TATCCTT--GTT---C-GT-TTTTTTTTGCCATGTT-CAG--------TA-TGAA----AA---AAAA-G-AAC--ATAATGCAT-----T----------------------------TTGTGACATCTCGATGA----AT--ATGAATTTGTATATGCTT----T-A-TCAAGCTCG-TTTTCATGTCCA--TTC-TACATTGTTCCTTT--ATATCCAT-A-T------------------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAAGGTAAATATTG-----T--TTATA-TC---G------TTTTAA-AA-AAC-----TATT-AAAGATC-TATTCTCTGCTACCTAAAGCTATTAGTGACCAGTGTGTTAC
gi|11 : aatgcttgcagtttcatagtttttattatcaaaatgacctttacagttatccacactgttcgcAACAAGTAAAC-GAA-A-TTATT-TTAA----AAAGTTG--CA--GGAATCCCTT----GTTTCAAC-CCAACTATTTCCATCTTCAATT--TAT---GATTGTGTTGTGGTCAGCA-----G-ACA--CT----CGGG-GTCGCTTGGACACACTGTCT-GAATT-------AGATAC--GC--AAATA---TTG-ATGTATT--CC--AGTCT-TTT-TT--TTTC----AATTATCGTTTTA-T-TCTTA-CTATCATCTTTT-TTT-TAT-CTT--TATTCAA-TT-TTTAg
gi|11 : acgattccccagactatttccCAT----GACAT-ACTGCGACATCTTGATGACTATGGTTATGAATTTACGTAAGCTT----T-A-TTAAGCTTG-TTTCCAAA-CCA--TTC-TACTTTGTTCCTGT--ATTGCTCT-A-T---AC---AC--------ATAT-GAAA---CA----aaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaaccatgacatactgcgacatcttgatgactatggttatgaatttacgtaagctttattaagcttgtttccaaaccattctactttgttcctgtattgctctatacacatatgaaaca
gi|12 : acgattccccagactatttccaacaagtaaacgaaattattttaaaaagttgcaggaatcccttgtttcaacccaactatttccatcttcaatttatgattgtgttgtggtcagcagacactcggggtcgcttggacacactgtctgaattagatacgcaaatattgatgtattccagtctttttttttcaattatcgttttattcttactatcatcttttttttatctttattcaatttttaaaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaacTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-C-AAAAG-TATCATCGTTCAA-GCCACCTAGCGCCAATATTGCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNGAGT-TATGTCTCT--A-----AATTCAT-A----TT------------TT---------------------T---------TT-CATGAAATGAAGATGGTA----ACCTAGTAA---CTGTAAGCTGTA-----ATAACGTATTTAAAGTA-----TGCAAATTGTATACGCATTGACGA--ACAAAGATGATATTTAAG-TAAAGGCAACTTGTTTATTACA---TG--------AAA-A-TT-ACCAA--CATGGAAG-TAA-GACATT-GACAT-TTG---------T----GTA--T--T---A--TTA----TCCA-GTTGCAACATGC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------AAG-AA--AGTGTCA-T-TT---------TATAAT--T--------------TGT--TG-----------------------T----AA--AAA--GCAGTAA-TGAATT-CTGGGTTTTTGGCGGGT
gi|13 : AAAC-GAA-A-CTATATTCTC----AACTATC--AA--GGAAT----TCATAGTATCTATTCCAAAGATTTGCATCTTGA----GCAT---ATTTTTTTTATTG----CG----AA-AC---TTGCACTTGGCGTTGCTTGGACACAGTTTTTCGAAAT-------AAATGT--GCT-G---A---TAG-AGTTGTA--TTTAA---TATAT-TTGTTCTC----CATTATCCTTTTA-TAC-TTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTGT--TTTT----------ATCTT----TATT-CA-------CTAAATGTA----ACT-TAAA------CA-AG--TGCAT-----GCACATTTA----GTCGT----ACCAT-ATTTTGACATCTTGATGG----AG--ATGAATTTACATTAACATATCAT-AGTCAAGATTG-TTTTCAGTTCTC--GTC-TTCTTTGTTCCTAT--GTATTTAT-ATT---ATATGA---------AATT-ATAA---CT----GA-ATAAAAAAA--------------TTATA-TA---G-------TTTAA-Actccaccccccaccccaccatgtaaatcgtcacataacaacga
gi|14 : acaaaatcttctttatggttcttcagtttattcacaacatagaaCACTGCTGACTTAAGCTTTTTTTTACCATTGTGTTACCAATAGGTGACGTTATCT-GTTGTAACACATTGGA-------CAACATCAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTTCTCTTACTGTAGGGAGAAGTCG-TCTT-T-C-ATA-G-TATCGGTGCTTTA-GCCACCTAGCA--------AATAAATTCAGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTAA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---ATACACACTT-ATGA----
gi|14 : T----GTAAAT--TCTAAGTTTAAAATTCCAAGTTTCAA-ATTCTAAGTTTTATA--CA---CACTT--A--T------GAACAA--AGTAACA-T-TTATA--TGAATGTAAT--TTGTAAATTAGAAGTTGCAATATAAAAATTACACACATGGAA-GTT----AA--AAATTACATTAA-AGCAAT-CTGAA-CTATGGCGGATA-AAG-CCCTTCacaaagtaacatttatatgaatgtaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagttaaaaattacattaaagcaatctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|14 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaactTTTTATACACACTTATGA--ACAAAG-TAACATTTATA-TGAATGTAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-ACACA--CATGGAAGTTAA-AA-ATT--ACAT-TAAA---GCAAatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|15 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaacttgtaaattctaagtttaaaattccaagtttcaaattctaagAAGCTACTTTTGACCACTGTATCACCACTAAGTGACATCATCG-GGGGAAATGCATTGGTTTTTG-ACAACATCAAACAGCTTACTCAGATTTCTTAC--CTTTCCCTTATCGT-------------T-TT-T-C-AAA-G-TTTCGGCGTTTTA-ACCTCCTACCC--------ACTTACTTCAGAAGTTTCAATATTA---CTAAC-GTGTA------AAGTTTGA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGAATGTCGCTA-----AATT----------T------------TA---------CAT-------TCT---------CT-AATGAAATTAAGATGATG-----------AA---ACG--------A-----GTAAT----------T------TGCACATTTTATACACACTTTGGG--ACAAAGGTGACATTGCAA-TGAAGACAATTTGTAAATTACAAGTTCCAAAA-TCAAA-A-TT-ACACA--C---------------ATT-GGCAT-TTGA---GT---------TAATT--TATAA--GTA----TTCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---Ctctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|16 : g-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-ATGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGATTGTCT------------CTTAATATTCACAT-------CAT---------TT-TATGAAATTAAAATGATG-----------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTAAA-TGAAAGCAGTTTGTAAATTAAAAGTTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GACAT-CTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA--TTA----TCCA-TTTGCAACATAC-AA--TTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGCAA-----------------------------------------------------AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTCAA-TTATGGCGGATA-ATACCCCTCC
gi|17 : AAAC-AAA-GGTTATCATTAG----AGATTTC--CA--GAAAa
gi|17 : cttactttgcaaatatttctttaattAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AC----TG--------G-----GTAAC----------T------TGAACATTTCATACACATCTATGA--ACAAAAGTGACATTTTAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GCAATT--TTTAC--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---GATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGGA-TTATGGTGGATA-ATA-CCCTCCgttttatattatttcatgaaattaagatgatgaactgggtaacttgaacatttcatacacatctatgaacaaaagtgacattttaatgaatgcaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagtaagaaattggcatttgagtaaatgcaatttttacttatccagttgcaacatacaatttacacagatggaagttaaaaattgtcattcaaatgaatgtaatttgtaataaccaagttaaaaaatacaataaagcaatctggattatggtggataataccctccata
gi|18 : cttactttgcaaatatttctttaattaaacaaaggttatcattagagatttccagaaagttttatACAAACAAAC-G-----TTATCATTAG----AGATTTC--CA--GGAAG----T----GTATCAAT-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGTAT---ACTTT--------TCAAT-----AG-GC---AT----TTGG-ATCGCTTGGACACTACGTTT-GAATT-------AGATGC--TC--AAATA---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATTAATTCA-----------ATC--C--TT-TTT-TATCCAT--TTTTCAC-TT-TTCATCTT----TGTT-TAGTAT-T-CTTA-TGata
gi|19 : cgcgctctactttagttctaaattcacttgaaacagttgcaaacttactttgcaaatatttctttaattaattaaaacgacggctttAAGTTTC---C-----AATT-ATTG----CTAC----------GT---------CAT-------AATTTAAAGTTATT-CATGTAATTAAGATGATGGCATA------AATACATG--------AAATTTGTAAC----------TGCAGCGTGCA-ATTTTATATGC---TTTGAAGAAAAAAGTAATTTTTTAAGTGAGCG-----------TTATCATTTGCAATA-T-ACA-ATTT-ACACA--CATTGCAG-TAAGAA-ATT-GACAT-TTAA---TTCAAC----ATTCTT--TATAG--TTA----CACA-GTTACAACATGT-AA--TTTACA--CA---CAACG--AAGT------ATA-AA--CTTGTCATT-TCAGA---GAATGGAATTGT--------------CGT--TA----------AA-CA----ATATT-----A--TAAATACAATAA-GGCAAT-CTGtttatacgtaaaacaagaaga
gi|2 : AACAAACAAAC-G-----TCATCATCAG----AGATTTC--CA--GGCAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA-----G-AC---CT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-AAATT-------AGATGC--GC--A---AATACCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TG--TTTT----AATT---GATTC------TTA-CTAT---------------TCCTT--TTTTCGC-TT-TTCAACTT----TGTT-CAGT-T-TGTTTA-TGGA----AAT-TAAAA----ATA-CAAATACAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCACTTT----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TCAAGCTTA-TTT--AGGTCAA--TTT-TACCTTGTACCTTT--ATAT-----A-T---AT---A----------CGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CCCGTA--C---ATTTAA-AA-AAA------A---AAT---C-TGTTCACTGCTTCCTAAAGCTATTTTTGACCATTATGTTACCTATAGGTGACGTCATCT-GGG-AAACACATTGGATTGTG-ACAACATCAAACGGCTAACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-ACCACTTAGCG--------ACTAAATTCAGA--CGTCAATATTA---CTAAC--TGTAAATTCTTAG-TTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGACTTTCTCTA-----AGTT----------T------------TA---------CAT-------TAG---------TT-CATG-------------------------AA---ATG--------A-----GTAAG----------T------TGCACATTTTGTACACACTTATGA--ACAAATGTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-GCACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GTTAT-TTGA---GTAAAT----GTTATT--CTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACAAAC-AA----------------ATGA--A-------------------TGTAA-T-T----------TGTA-----------------------ATA----------AC-CA----A-GTT-----A--AAAATACAATAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGAAA-ATA-CCCTCC
gi|20 : tgcaaacttactttgcaatttttctttaattatttaaaacaactgctaTCTAC-CCAGAAATTCGCATCTT--AGGAACAT----TTTTTATTa
gi|20 : TC-GAATT-------AG-TGCTGAT--A---A---T-G-TTGTATT--TG--A---TGTGT-TT--TCTC----CCTTATCGTTTTA-TAC-TTA-CTGTCATC--CTATTT-TATGTTC--TTTT-------TCTATCTT----TATT-CA-------CT------A----AATATAAAATG-AACC-AA--TGCAT-----ATACAACTA----GTCAA----ACCAT-TTTTTGACATATCGATGG----AG--ATGAATTTAC---AGCT-----------AA------TTTACAGATCCT--GTC-TACTTTATACGTCT--GTATTTAT-A-T---GTG--A---------ACAT-ATAA---tatcgaattagtgctgataatgttgtatttgatgtgttttctcccttatcgttttatacttactgtcatcctattttatgttctttttctatctttattcactaaatataaaatgaaccaatgcatatacaactagtcaaaccattttttgacatatcgatggagatgaatttacagctaatttacagatcctgtctactttatacgtctgtatttatatgtgaacatataattgattattattgtttaaaataaactac
gi|21 : tctacccagaaattcgcatcttaggaacattttttatttaTATA--CT--AATAT-TAT-TT--GTTC----AGTTATCGTTTAA-TAT-TTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTTT--TTTTTAT-------ATCTT----TATT-CA-------CT------A----AAT----AT-G-AATATCCAATGCAT-----GCACAACTT----GTCAT-----ACATTATTTTGACATCTCGATGA----AG--AT--AGCTGTATA----T----T-G-CCATACTTGTTTTTCAGGTCCT--GTC-TTCTATGTACATCT--GTATTTA-------------A---------ATGT-GAAA---TT----TA-ATGGAATAAATATTG-----T--TTAAA-CC---ttgattattattgtttaaaataaactac
gi|22 : atgctcttatagtgtcgTGATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------A------TGCTTATTTTATACACAATTTCGA--GCATAGGTGACATTTCA--------C-------------CAAGTTGCAATAAC-GAA-A-TA-GCACA--CATGTATA-CAA-AA-AAT-GGCAT-TTTA---ATAAAT----GGAATT--TTTAA--CTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CAAGG--ACGT------TAC-AA---TTGCCA-T-TCAAA--TGAATTTAAT--G--------------TGTAATA----------AA-AA----A-ATT----AA--CAAATACAATGA-AGAAAT-CTTAA-TTATGGCGTATA-ATA-CCCTCCaaaatg
gi|23 : CAAAC-GAA-A-CTATTTTCAGTCATAG-TTTCTTCATCGAGAT----T----TT--------CAGAGATTTGCATTTTCA--GAACAT-----TTTTATTGTGACAAACT----GGCAC---TT----A-GG-GTTGCTTGGACCTAGTGTTT-CAATT-------AGATGC--GCAAA---A---T-G-AGTTGTATTCT--A---T-TAT-TTG-TTTT----ATTTATCGTTTTA-TAT-TTA-CTA-CATC--TT-TTT-TATCCTTAGTTTTCat
gi|24 : cgatctcctttatggctctctaggtaattcgtacatggCAGGCCAAC-GGA-A-TTATTTTCAG----AAATGTC--AA--GGAAT------------TCA----TAG-TATCTACAT------TGAG-ATTTGAC-TTTATTGTGGTCAACAGTTGAA-ACGCACT----TCAG-GTCGCTTGGGCACAAT-TTT--------------GATAC--GC--A---A---ATGTTTTTATATTCT--T---T-TAT-TT--TTTTC---CATAATTGTTTTACT-C-TTA-CTGCCATC--TT-GTT-TATc
gi|25 : caaaatctcactaatgtcactccagattgattaaacATGTTA-ACAACAGCAAACGGATTGCTCGGATGTTTTCG--CTTGTCTTTACCGCAGTGAGCAAT-------------------ATAAGCGTTCAA-GCCACCTTGTG--------CCGAAATTTCAAAGTATTAATATTG---CTTAC-TTGTAAATTTTAA-CTATA-AAT-------------TTCTAA--TTC---A-----TATG-ATGA----CA------------AT---------CATAGTACAATAT---------GTAAATGAAATTAAAA
gi|26 : atgttatctaaacctaATCACTAAGTGACGTCATCT-AGGGATACACATTGAGTTTTT-ACAACAAAAACCAGCATACTCAGATTTCTTCTCATTTTCCCTTATCATAAGTAGCAGTCGTT-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCAA--TAGCG--------GTTTAAT-------------TATTG---CTAAC-TTGTAATTTCTAAG-TTCA-ACTTCTTAGTTTCAAATTCTAACTTCC---A-----AATT-ATAA----cacgtgcaattaaaaat
gi|27 : TTAA-ATCATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TTTACATTTTATACGCACTTTTGA--ACA---------TTTCAG-TAAAT----TTTGTAAATTACAAGTAGCAATA-TCAAA-A-CA-ACACA--CATAAAA--TAA-GACATT-GGTAT-TTTA---GTAAAT----GGAATT--AATAG--TTA----TTTA-TTTGCAACAAAC-AA--TTTACA--CA---CATGT--AAAT------CCA-AA--gtgtcta
gi|29 : T-T-T-CTTC-TGAATTTAAAT-TAACA-GCAATA-AAA--GCAT---------GAATA----GTCATATCGTAAAT-ATTGTGATATCTCGGTGG----GG--ATGCATTTATATTAACCA----T-G-TTAACCTTG-TTTTCACATACA--TTA-TACTTTGCACTTTT--ATATTGGC-A-A---AT---A---------GCAT----T---CA----AA-GT-------ATAG-------T--TTATA-TC---tataattatatgtttgaaatat
gi|3 : tattctatAACAAACAAAC-GAA-G-TCATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAC----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCAT------------------TCTT-TTGTGGT------------------T----TTGG-ATCGCTTGGATACAACGTTT--AATTTAAAAATAGATGC--AG--A---AATATTG-ATTAAAA--CC----------T-GT--TTTG----AATTATTGGTTTA-T-TCTTA-CTTTCGTC--TT-TTT-TATCCTT--GTTT-AC-TT-TTTTCCTA----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AC--TACAT-----TCACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATACTGACATCTCGATGG----AT--GTGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--AAACCCAT-A-T---G---------------CGT-AAAA---CA----AA-A---AAGAAATAT-------TGTTTATA-CC---A------TTTTGA-AA-AAA-----TATTGAAGAA-C-TGTTCACTGCTACCTCAAGCTATCTTTGGTCATAGTGTTTTCACCA------------------------ATTAATTTTTT-ACAACAAAAACCGCCTTACTCAGATTTCTTCA--TTTTCCCTTAATGCAGGGAGCGGTCG-T-TT-T-TTAAA-G-TATTGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTTAGAAGAGTCAATATT-------AC-T----AAT-------------AT-----GT---AAATTCTAAGTTTT---A-----AATG-AT--------------------------------------------------------------ATTAAGCTAATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TACACATTTTATTCTCACTTTAGA--ACAAAGGTAACATTTCAG-TGAATGCAATTTGTAAATTACAAGTTGCAATA-T-AAATA-TA-ACACA--CATGAAAG-TAC-GA-ATTTGGCAT-CTGA---GTCAAT----GAAATT--TATAA--TTA----TCAA-TTTGCAGCATAC-AA--CTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-A-TAAAA--TGAATGTATT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--CAAATACAATAA-AGCAAC-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCCaatataagtgaaaaa
gi|30 : tatcaacatttatcacTAAATTAAAAGTTGCAATA-T-AAA-A---------------------------ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AC--TTTACA--TA---CATAG--AAGTAGAAGTTAA-CA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCC
gi|31 : A-AA-GGT-GACAT-TTCA---GTGAAT----GCAATT--TGTAAA-TTA-----CAA-GTTGCAATATCA-AA--ATTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--CGTGTCG-T-TCAAA--TGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AT-CA----A-GTT-----A--AAAATACAAAAA-AGCAATAATGAA-TTATGGAAGGTA-ATA-CCCTTCatca
gi|32 : acattttaaacaaactttcgatcTA-T-TCTTT-CTATTATC--TG-TTTATATCCTA--TTT--AC--T-TTCATCTT----TGTTGCGTT-T-T-CTTA-TGGA----AAA-TAAAA-G-AA---GAAATGCAT-----TTACAACTA----GTTAT----TGCAT-ATTGTGACATATCGATGT----AA--ATGAATTTGCATCAGCTT----T-A-TCGAGCTTG-TTTTCAGGTTTA--TTA-TA
gi|33 : gacaatttataAATTTATA--TTATTAATTTTCAT--T-AAA-T-TT-AGACG--T-TGAAAA-TAAGAA-ATT-AGCAT-TTGA---GTAAAT----GGAATT----------------------------CATAC-CA--TTCGCA----------------------------AA--ATTGTCA-T-TCAAG--TGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT-----A--ATAATGCAACAA-AGCAAT-CCAAA-TTATAGCGGACA-ATT-CCCT
gi|34 : TTCC--TTTTCCCTTTCCGTATGGAGCAGTCG-T-TT-T-T-TTA-GTTATT-GC-TTTCAGGCAAACTGCCGT-------AGTT-ACTCAGATGTG---AGATTG---CTAATACCGCGAATTCAAGGTTCCATGATTCtaa
gi|35 : agattgat----GTCAC----GCCAT-ATTTTGACATCTCGATAG----AG--ATGAATGTACGTGATCTT----T-T-TCAAGCTCG--TTTCAGATCC---TCCGTACTTGGTACCTCTGAGCACTTGTGA-TTCGAT---T---------ACAC-AGAAACGCA----AACGTAAAAAATATAA-------T--TCA-----------------TTAA-AA-AAG-----Ttgcctaaaatcaaaatggtgcttacccattatgattttt
gi|36 : atAACAAACAAA----A-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--ACAAA----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTcattaa
gi|37 : agttcttaatactcctgaaacagctacaaacttactttgcaaatagttctttaactaatcaaaaggactccta-AA-TTT-GGCAT-TTTG---GTCAAA----GGAATA--TACAA--TTT----CCTA-GTTGCAAGATGC-A---TTTAAA--CA---CATGG--ACGT------AAG-GA--ATCGGCA-T-TTTAG--CGAGTACAGT--T--------------TGCAATA----------AC-CA----A-GAT----GA--AAA------------CAAT-CTGAG-TTTTGGCAGATGTTTA-CGCTCC
gi|38 : TTTTAA-TGAAA-CA----------TACAAGTTGCAACA-TCAAA-A-TT-GCACAGTTATGGAAGTTAG-AA-GTT---CATATTAA---TTAAAT----GTat
gi|38 : A-GTTGCAACATCA-AA--ATTGCA--CAGT-TATGG--AAGT------TAG-AA--GTT--CA-TATTAAT--TAAATGT---------------------GTACTA----------AC-CA----A-GTT----GA--AAACTGAAATAACAGGA-----GA----ATGGCGGATA-CTA-CCCTgtactaaccaagttgaaaactgaaataacaggagaatggcggatactaccctacat
gi|39 : ttttaatgaaacatacaA-GTTGCAACATTC-AT--TTTACA--CA---TATGG--AAGA------AAG-AA--ATTGGTT-T-TAAGAGGTAAATG---T--T--------------GGTAATacat
gi|39 : AGTTGCAACA-T-TCA-T-TTTACACA--TATGGAAG-AAAGAA-ATT-GGT-T-TTAAGAGGTAAATGTTGGTAATCGATATAA--TTT----GCCA-TTT--------T-GA--TTTATACCCA---CCTGGTCAGGT------TAA-cgatataatttgccattttgatttatacccacctggtcaggttaagcatcacatgacgatga
gi|4 : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATTAG----AGATTTC--AA--GGAAT----T----CTTTTAAC-CAAAATATTTGTACATTCAATGAGCAT---ACTTTT-TTGTGG--------------C---TT----TTGG-ATTGCTTTGTCACGACATTT-GAATT-------GGGTGC--AC--A---AATATCG-ATTGATA--CC--A---TATAT-TT--T-------AATTATTGATTTA-T-TATTA-CAATCATC--TT-TTT-TAACCTT--GTT-CAC-AA-TT--TCCT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAA--G-AACA-AA--TGCAT-----TTACATCTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTAACATCTCGATAG----AG--ATAAATTTACATGAGTTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGATCAA--TTC-TACCTTGTACCATT--ACATCTAT-A-T---A---------------CGT-AAAA---CA----AA-ATAGAAGACATAT-------TGTTTATA-CC---G------TTTTAATAA-AAA-----AA---AAGAA-C-TATTCATTGCTAAGAAAAGTTATTTTTGACCATTGTGTTCCAACTATGTGACGACATCT-CGGGAAACACATTGACTTTTG-ACAACAAAAACCATCTTACTCAGATGTTTTCC--TTTTTTTTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TTGT-C-AGA-G-TATCGGCA-CTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTTGGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTCAATTCTTAGTTTAA-AA----AAGTTTCAAATTCTAATTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------GT---------C------------------------TATGAAATCAAGATGATG----A------TA---GT---------------GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACATTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTCAG-TGAgcatcacatgacgatga
gi|40 : nnnnacaactcgctccacttagttctaaattcactcagcagcgtcaatatttgctaataatatttctttagtcaaaacgaccattacggctatccacactgttcac---CATGG--CCGT------TAA-AA--ACTGTCA-T-TTAAA--TGAATGTAAC--T--------------TGTAATT----------AC-CA----A-GTT----AAACAAAATACAATAA-AACAAT-CTGAA-TTAT----GATG-ATA-CACTCCc
gi|41 : attatccacctttccaacaaccgggccGATGG----GG--ATAAATTTACACAAGCTT----T-T-TTAAGCTAG-TTTTCAAATCCAGTTTA-TACTTTCCAC------ACATTTAT-G--------------------------AAA---CATTTTAG-GTA--AGAAATAC-------TGGTTA----------------TTTAA-AACAAA-----TT---AAat
gi|42 : gaatat-AA-AAT-----TA---AAAGA-AGTGTTCACTGCTACTTTAAGCTACTTTTGACt
gi|42 : gaaaagggTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-CAAAA-G-TATCaaaatcaaaaggattgccgtagggagcagtcgatttcaaaagtatcatc
gi|43 : gaaaagggaaaattaaaagaagtgttcactgctactttaagctacttttgacaaaatcaaaaggaAACAAGCAGAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--ACAAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCACATTGAATGAACAT---ACTTTTATTGTatc
gi|44 : --ATGAATTTACATAAATTT----TTG-TTAAACATG-TTTTCAAATCCA--TTC-TTCTTTGTATCTTT--TTATATAT-
gi|45 : tgtggcA-AA--TTTGCCA-T--CAAA-----ATGT--T--T--------------TC----------------C-CA----A-GTC----AA--AAA-TGAAACAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-TTA-CCCTCCcggacaaaaa
gi|47 : ttA-AA--ATT--CA-T-T-------GAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------TC-CA----A-GTT----AA--AAA-TATAATAA-AGCAAT-CTCAA-TCATGACGGATA-gta
gi|48 : gtcAT----T----GTATCATC-CCGGAAATTTGCATATC---T-AGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-TT---TT----TTGG--TCGCTTGAATAgat
gi|49 : tTTTCATATCCA--TTC-TACCTTGCAA--TT--GTATTGTT-A-T---AT-------------ACGT-AAAG---CA----CT-ATCGAAGAAACAa
gi|5 : tgtctgAACAAAC-AAATG-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GAAAT----T----GTTTTTAC-CCAGATATTTGCATATTGAAAGAGCAT---ATTTTTATTGTGATCAACC----AG------TT----TTTG-ATTGCCCGGACACAATGTTT-ACATT-------AGACGC--GC--A---AATATCA-AATGATC--CC--A---T-T-T-TT--TTTTGTCAAATTGTTGATTTA-T-TCTTA-CATTCATC--TT-TTT-TATCCAT--GTT-CAT-TT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-A---TGCAT-----TTACAACTATCTAGTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTTGGTAG----AT--ATGAATTTGTAGAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGCACTTGT--ATATCTAT-A-T---A---------------CGT-AAAG---CA----AA-GTAGAAGAAATACCCTATTGT--TTATA-CT---G-------TTTAA-AA-AAACAT--TA---AAAGAAC-TATTCACTGCTACCTTAAGCTATTTTTTACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACTCATTGTTTTTTTTACAACAAAAACCAACTTACTCTGATTTCTTCC--TTTTTCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TAGCTGCATTTTA-ACCACATAGCG--------ACTTAATTCATAAGTGTCAATATTA---TTAAT-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAATTTTCAAATTTTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------GG---------C------------------------CATGAAATTAAAATGATG-----------AA---ATG--------T-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCCA--ACAAAAATGA
gi|50 : cAG-AA-AAT-----TA---AAAGAAC-GGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTATTGAC
gi|51 : aaagC-CA----C-GTC----GA--AATGTGAAATAA-AATAAT-CGAAG-TTACGGCGGATA-TCA-TCCTCCatcaaatggattac
gi|52 : TGACGTCATCT-GGGG-AACACATTGGATata
gi|6 : ----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATAACT---GTCC---TTTGAA-AA-AAAGAAATTA---AATAA-C-TGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTTT-GACCATTGTGT-----------GATGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAATATCAATCGGCTAACTCACATGTCTTCC--TTTTACCTTACCGTAGGGAGCAGTTG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTAATACTAAC-TTCTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CTGTCTCTAAATGTTTA--------CAT-------AAT---------TT-AATAAAATTAAGATGATG----A------AA----TG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTTAA-TGAAAGCAATTTATAAATTAAAAGTTGCAATA-T-A------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAG--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--TAGTACATAG--AAGT------TAA-AAAAATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAAATA-ATA-CCCTCCgtgtctgtgatgtcatc
gi|7 : ----AA-GTAGAAGAAATAA-------T--TTATAGCC---GTTC---TTTTAA-AA-AAGAAAT-TA---AATAA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCAAAAGGTGACGTTATCTTGGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAATCGGCTTACTCACATGTCTTCC--TTTAATCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACATGGTG--------ACTTATTTCAAAAGTGTCGATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTGTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CTGTCTCTAAATG-TTTA-------CAT-------AGT---------TT-TATGAAATTAAGAGGATG-----------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATTTTCTGTCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTAAA-TAAAAGCAATTTGTAAATTAAAAATTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATA--ATAAA--TTA----TCCA-GTTGCAACGTAC-AC--TTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAA-AA--AGTGTAA-T-TTATA--TGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----T-ATT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-a
gi|8 : TAA-AA-CAA-----GA---AGAAA-T-ATTTCTCTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCA-TGGGTGACTTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAAACGGATTACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG--------ACTAAATTCGGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTCAGTGTC---A-----AATT-ATGA----TT------------TT-----------T-------TATAAGT-----TT-TACTTTATT----TGATG----A------AA----TG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTATGG--ACAAAGGTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAGTTAGAAGTGACAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATTGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CG---AATAG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTTAAAAAA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|9 : atacgAACAAATAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----GAATTTA--CA--GGACT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCATTTTAAATGGGCAT---AATGTTGGTGTGGTCAAC-----AG-AC---TT----TTTG-ATCTCTTGAACACAACGTTT-GAATA-------AGATGC--AC--AAATA---TCG-ATTCATA------------TATATT--TTTT----AATAATAG----------------ACCATC--TT-TTT-T-TCC-T--TCTTCACAGTGTTCGTA------TGTT-CAGT-T-TCCTTA-TGGA----AAT-TAA-----AACA-ACAATGTATTAATGTTAAAACTA----GTCAT----TGCAT-AGTTTGACATATCGATGG----GG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCGAACTTG-TTTTCAGGCCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCCAT-A-T------------------ACGTAAAAA---CA----A----AGAAGAAATATTG-----T--TTATA-CC---G-------TTTAA-AA-AAA-----TATTTAATAA-C-TTTTGACTGCTACCCAAAGCTATCTTTGGCCATAGTGTTACCACCAGGGTACGTCATCT-TGGGAAAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): AAATCTCAAATTTTACTCGCGCACCACAGACTAAAATGCAGTTCACCTACGCATCAACTCATCGAAAATCTATAATAGAAAATTGTGGAATACCAGAAACAACTAGATACAGTTTCTTTTTTATTCTCTTAAATTCACTCAGTAACGACAAATTTTTTTCAATATTCCATGTCCACTTCTCAAAAAAAAAATTCT
Unaligned ( gi|46 ): ATTTAGTTCTAAGTTCACTCAACAGCAGCAAACTTACTTTGCTAATATTTCTTTTATCAAAATGACTTTTATGGCTAAC
Unaligned ( gi|53 ): GAGGAGTGAAGTTGTCCTGTATTACTCACCATAGTAAAC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 1111111 333333333 222222222222 22222 22222222 2222222 111 1111111 111111 444444444444444444444 22222222222 2222222222222 22222222222 1 1 11111111 111 888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222222222222222222 11111111111111111 111 1 11111111111111
lowQualScore : 2 1 555 5555 33 33 55555 5555 4 2 4 7 1 55555 3 9999999999999 6666 33 1 66 0000000 44 77 111111111 3 222222222222 2 66 8888 1 3 55555 2 33 2 2 33 11111111 2 7777 3 0000000 0 3 0 7777 3 8888 0 3 888 0000000 6666 000000 2 0 5555 33 5555 333 2 33 2 1 33 1 2 333333333333333333333 2 444 5555 2 55555555555 2222222222222 555 666 2 44444444444 33 0 3 4 2 3 3 1 1 1 44 2 2 2 0 5 2 2 2 22222222 3 444 2 0 0 2 222 66666 2 2 5555 444444444444444444444444444444444444444444444 44 777777777777777777777777777777777 44444444444444444 00 33 1 2 33 1 111 888888 66666666666 2 4 2 2 333 4444 6666 55 4444 1 1 22 22 555 22 1 5555555 1 22 1 1 1 2 22 0 22 11111111111111 8888888888 1 4444 1 66666 22 3 1 1 2 2 2
lowQualScore : . . ... .... .. .. ..... .... . . . . . ..... . ............. .... .. . .. ....... .. .. ......... . ............ . .. .... . . ..... . .. . . .. ........ . .... . ....... . . . .... . .... . . ... ....... .... ...... . . .... .. .... ... . .. . . .. . . ..................... . ... .... . ........... ............. ... ... . ........... .. . . . . . . . . . .. . . . . . . . . ........ . ... . . . . ... ..... . . .... ............................................. .. ................................. ................. .. .. . . .. . ... ...... ........... . . . . ... .... .... .. .... . . .. .. ... .. . ....... . .. . . . . .. . .. .............. .......... . .... . ..... .. . . . . . .
lowQualScore : 7 7 666 7777 77 77 88888 7777 5 5 9 6 6 88888 1 7777777777777 5555 66 4 44 0000000 22 33 888888888 1 666666666666 9 88 9999 6 8 66666 7 77 7 7 99 44444444 6 1111 3 1111111 5 1 2 1111 3 3333 2 3 999 4444444 5555 000000 9 7 7777 44 3333 666 5 22 4 4 44 7 5 888888888888888888888 7 777 3333 7 99999999999 8888888888888 444 999 7 11111111111 22 0 3 6 3 1 3 7 0 0 22 5 5 5 0 0 5 5 7 33333333 1 777 7 8 3 7 000 77777 7 7 7777 999999999999999999999999999999999999999999999 66 444444444444444444444444444444444 77777777777777777 99 44 0 5 00 0 999 222222 44444444444 0 0 0 0 555 2222 9999 00 5555 9 9 66 66 777 66 0 6666666 7 55 9 9 7 0 66 4 66 22222222222222 8888888888 9 0000 9 55555 66 4 9 9 0 1 2
consensus : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--A---A---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---A---------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CC-G----T---T---TTAA---AA-AAA------TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
Reference ( family-2576 ) : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--A---A---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---A---------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CC-G----T---T---TTAA---AA-AAA------TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|1 : AACAATTAAAC-AAACG-TTATCATCAG----ATATTTC--CA--GGAAG----T----GTATCAGC-CCAGATATTTTTATATTTAATGAGCTT---ACGTTTATTGTTGTCAATAT---AG-AC---TT----TTGG-GTCCCATGGACACGAAGTTT-GAATT-------AGA--C--AC--A---A---TCT-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TATT----AATTATTGATTTA-T-T-TTATCTATTATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCGC-AT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-TAT-GTTA-TGAA----AAT-TAAAA-G-AAAA-AAAATACAT-----TTACAAATA----ATCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCGATGA----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TTAAGCTTA-TTTTCAGGTCAG--TTA-TAACTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---ATATATATACACGT-AAAA---CA----AA-GTGGAAGAAATAT-------T--TTATATCC-GCACAT---T---TTAA---AA-AAA------TA---AATGA-C-TGTTCACTGCTACCTGAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTGCCAGAAAGTAACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATTAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTACTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TGTCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTAAATTCAGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATGAAGATGATA----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATGCACACTTATGA--ACAAAGGTGGGATTTAAA-TTAATTGAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-GAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGAAT-TTGA---GTAAAT----ATAATT--CCTAA--TTG----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TATACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--GTGGTCA-T-TCAAA--TGAATGTCAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAGATA-ATA-CCCTCC
gi|10 : AACAAACAAAC-ACA-G-TTATCATCAG----AGGTTTC--CA--AGAAT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTCGTATATTAAATGAGCAT---TTTTGTGTTTTGGTCAAC-----AG-GC---TT----TTGG-ATTGCTTGGACACGACGTTT-AAGTT-------AGATGC--AC--A---A-----------ATA--TC--G------A------TTTT----AATGATTGATTCA-T-TATTA-TTTTCATC--TT-TTT-TATCCTT--GTT---C-GT-TTTTTTTTGCCATGTT-CAG--------TA-TGAA----AA---AAAA-G-AAC--ATAATGCAT-----T----------------------------TTGTGACATCTCGATGA----AT--ATGAATTTGTATATGCTT----T-A-TCAAGCTCG-TTTTCATGTCCA--TTC-TACATTGTTCCTTT--ATATCCAT-A-T------------------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAAGGTAAATATTG-----T--TTATA-TC-G----T---T---TTAA---AA-AAC------TATT-AAAGATC-TATTCTCTGCTACCTAAAGCTATTAGTGACCAGTGTGTTAC
gi|11 : aatgcttgcagtttcatagtttttattatcaaaatgacctttacagttatccacactgttcgcAACAAGTAAAC-GAA-A-TTATT-TTAA----AAAGTTG--CA--GGAATCCCTT----GTTTCAAC-CCAACTATTTCCATCTTCAATT--TAT---GATTGTGTTGTGGTCAGCA-----G-ACA--CT----CGGG-GTCGCTTGGACACACTGTCT-GAATT-------AGATAC--GC--AAATA---TTG-ATGTATT--CC--AGTCT-TTT-TT--TTTC----AATTATCGTTTTA-T-TCTTA-CTATCATCTTTT-TTT-TAT-CTT--TATTCAA-TT-TTTAg
gi|11 : acgattccccagactatttccCAT----GACAT-ACTGCGACATCTTGATGACTATGGTTATGAATTTACGTAAGCTT----T-A-TTAAGCTTG-TTTCCAAA-CCA--TTC-TACTTTGTTCCTGT--ATTGCTCT-A-T---AC---AC--------ATAT-GAAA---CA----aaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaaccatgacatactgcgacatcttgatgactatggttatgaatttacgtaagctttattaagcttgtttccaaaccattctactttgttcctgtattgctctatacacatatgaaaca
gi|12 : acgattccccagactatttccaacaagtaaacgaaattattttaaaaagttgcaggaatcccttgtttcaacccaactatttccatcttcaatttatgattgtgttgtggtcagcagacactcggggtcgcttggacacactgtctgaattagatacgcaaatattgatgtattccagtctttttttttcaattatcgttttattcttactatcatcttttttttatctttattcaatttttaaaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaacTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-C-AAAAG-TATCATCGTTCAA-GCCACCTAGCGCCAATATTGCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNGAGT-TATGTCTCT--A-----AATTCAT-A----TT------------TT---------------------T---------TT-CATGAAATGAAGATGGTA----ACCTAGTAA---CTGTAAGCTGTA-----ATAACGTATTTAAAGTA-----TGCAAATTGTATACGCATTGACGA--ACAAAGATGATATTTAAG-TAAAGGCAACTTGTTTATTACA---TG--------AAA-A-TT-ACCAA--CATGGAAG-TAA-GACATT-GACAT-TTG---------T----GTA--T--T---A--TTA----TCCA-GTTGCAACATGC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------AAG-AA--AGTGTCA-T-TT---------TATAAT--T--------------TGT--TG-----------------------T----AA--AAA--GCAGTAA-TGAATT-CTGGGTTTTTGGCGGGT
gi|13 : AAAC-GAA-A-CTATATTCTC----AACTATC--AA--GGAAT----TCATAGTATCTATTCCAAAGATTTGCATCTTGA----GCAT---ATTTTTTTTATTG----CG----AA-AC---TTGCACTTGGCGTTGCTTGGACACAGTTTTTCGAAAT-------AAATGT--GCT-G---A---TAG-AGTTGTA--TTTAA---TATAT-TTGTTCTC----CATTATCCTTTTA-TAC-TTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTGT--TTTT----------ATCTT----TATT-CA-------CTAAATGTA----ACT-TAAA------CA-AG--TGCAT-----GCACATTTA----GTCGT----ACCAT-ATTTTGACATCTTGATGG----AG--ATGAATTTACATTAACATATCAT-AGTCAAGATTG-TTTTCAGTTCTC--GTC-TTCTTTGTTCCTAT--GTATTTAT-ATT---ATATGA---------AATT-ATAA---CT----GA-ATAAAAAAA--------------TTATA-TA-G--------T---TTAA---Actccaccccccaccccaccatgtaaatcgtcacataacaacga
gi|14 : acaaaatcttctttatggttcttcagtttattcacaacatagaaCACTGCTGACTTAAGCTTTTTTTTACCATTGTGTTACCAATAGGTGACGTTATCT-GTTGTAACACATTGGA-------CAACATCAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTTCTCTTACTGTAGGGAGAAGTCG-TCTT-T-C-ATA-G-TATCGGTGCTTTA-GCCACCTAGCA--------AATAAATTCAGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTAA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---ATACACACTT-ATGA----
gi|14 : T----GTAAAT--TCTAAGTTTAAAATTCCAAGTTTCAA-ATTCTAAGTTTTATA--CA---CACTT--A--T------GAACAA--AGTAACA-T-TTATA--TGAATGTAAT--TTGTAAATTAGAAGTTGCAATATAAAAATTACACACATGGAA-GTT----AA--AAATTACATTAA-AGCAAT-CTGAA-CTATGGCGGATA-AAG-CCCTTCacaaagtaacatttatatgaatgtaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagttaaaaattacattaaagcaatctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|14 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaactTTTTATACACACTTATGA--ACAAAG-TAACATTTATA-TGAATGTAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-ACACA--CATGGAAGTTAA-AA-ATT--ACAT-TAAA---GCAAatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|15 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaacttgtaaattctaagtttaaaattccaagtttcaaattctaagAAGCTACTTTTGACCACTGTATCACCACTAAGTGACATCATCG-GGGGAAATGCATTGGTTTTTG-ACAACATCAAACAGCTTACTCAGATTTCTTAC--CTTTCCCTTATCGT-------------T-TT-T-C-AAA-G-TTTCGGCGTTTTA-ACCTCCTACCC--------ACTTACTTCAGAAGTTTCAATATTA---CTAAC-GTGTA------AAGTTTGA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGAATGTCGCTA-----AATT----------T------------TA---------CAT-------TCT---------CT-AATGAAATTAAGATGATG-----------AA---ACG--------A-----GTAAT----------T------TGCACATTTTATACACACTTTGGG--ACAAAGGTGACATTGCAA-TGAAGACAATTTGTAAATTACAAGTTCCAAAA-TCAAA-A-TT-ACACA--C---------------ATT-GGCAT-TTGA---GT---------TAATT--TATAA--GTA----TTCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---Ctctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|16 : g-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-ATGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGATTGTCT------------CTTAATATTCACAT-------CAT---------TT-TATGAAATTAAAATGATG-----------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTAAA-TGAAAGCAGTTTGTAAATTAAAAGTTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GACAT-CTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA--TTA----TCCA-TTTGCAACATAC-AA--TTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGCAA-----------------------------------------------------AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTCAA-TTATGGCGGATA-ATACCCCTCC
gi|17 : AAAC-AAA-GGTTATCATTAG----AGATTTC--CA--GAAAa
gi|17 : cttactttgcaaatatttctttaattAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AC----TG--------G-----GTAAC----------T------TGAACATTTCATACACATCTATGA--ACAAAAGTGACATTTTAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GCAATT--TTTAC--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---GATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGGA-TTATGGTGGATA-ATA-CCCTCCgttttatattatttcatgaaattaagatgatgaactgggtaacttgaacatttcatacacatctatgaacaaaagtgacattttaatgaatgcaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagtaagaaattggcatttgagtaaatgcaatttttacttatccagttgcaacatacaatttacacagatggaagttaaaaattgtcattcaaatgaatgtaatttgtaataaccaagttaaaaaatacaataaagcaatctggattatggtggataataccctccata
gi|18 : cttactttgcaaatatttctttaattaaacaaaggttatcattagagatttccagaaagttttatACAAACAAAC-G-----TTATCATTAG----AGATTTC--CA--GGAAG----T----GTATCAAT-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGTAT---ACTTT--------TCAAT-----AG-GC---AT----TTGG-ATCGCTTGGACACTACGTTT-GAATT-------AGATGC--TC--AAATA---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATTAATTCA-----------ATC--C--TT-TTT-TATCCAT--TTTTCAC-TT-TTCATCTT----TGTT-TAGTAT-T-CTTA-TGata
gi|19 : cgcgctctactttagttctaaattcacttgaaacagttgcaaacttactttgcaaatatttctttaattaattaaaacgacggctttAAGTTTC---C-----AATT-ATTG----CTAC----------GT---------CAT-------AATTTAAAGTTATT-CATGTAATTAAGATGATGGCATA------AATACATG--------AAATTTGTAAC----------TGCAGCGTGCA-ATTTTATATGC---TTTGAAGAAAAAAGTAATTTTTTAAGTGAGCG-----------TTATCATTTGCAATA-T-ACA-ATTT-ACACA--CATTGCAG-TAAGAA-ATT-GACAT-TTAA---TTCAAC----ATTCTT--TATAG--TTA----CACA-GTTACAACATGT-AA--TTTACA--CA---CAACG--AAGT------ATA-AA--CTTGTCATT-TCAGA---GAATGGAATTGT--------------CGT--TA----------AA-CA----ATATT-----A--TAAATACAATAA-GGCAAT-CTGtttatacgtaaaacaagaaga
gi|2 : AACAAACAAAC-G-----TCATCATCAG----AGATTTC--CA--GGCAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA-----G-AC---CT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-AAATT-------AGATGC--GC--A---AATACCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TG--TTTT----AATT---GATTC------TTA-CTAT---------------TCCTT--TTTTCGC-TT-TTCAACTT----TGTT-CAGT-T-TGTTTA-TGGA----AAT-TAAAA----ATA-CAAATACAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCACTTT----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TCAAGCTTA-TTT--AGGTCAA--TTT-TACCTTGTACCTTT--ATAT-----A-T---AT---A----------CGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CCCG----TACAT---TTAA---AA-AAA-------A---AAT---C-TGTTCACTGCTTCCTAAAGCTATTTTTGACCATTATGTTACCTATAGGTGACGTCATCT-GGG-AAACACATTGGATTGTG-ACAACATCAAACGGCTAACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-ACCACTTAGCG--------ACTAAATTCAGA--CGTCAATATTA---CTAAC--TGTAAATTCTTAG-TTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGACTTTCTCTA-----AGTT----------T------------TA---------CAT-------TAG---------TT-CATG-------------------------AA---ATG--------A-----GTAAG----------T------TGCACATTTTGTACACACTTATGA--ACAAATGTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-GCACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GTTAT-TTGA---GTAAAT----GTTATT--CTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACAAAC-AA----------------ATGA--A-------------------TGTAA-T-T----------TGTA-----------------------ATA----------AC-CA----A-GTT-----A--AAAATACAATAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGAAA-ATA-CCCTCC
gi|20 : tgcaaacttactttgcaatttttctttaattatttaaaacaactgctaTCTAC-CCAGAAATTCGCATCTT--AGGAACAT----TTTTTATTa
gi|20 : TC-GAATT-------AG-TGCTGAT--A---A---T-G-TTGTATT--TG--A---TGTGT-TT--TCTC----CCTTATCGTTTTA-TAC-TTA-CTGTCATC--CTATTT-TATGTTC--TTTT-------TCTATCTT----TATT-CA-------CT------A----AATATAAAATG-AACC-AA--TGCAT-----ATACAACTA----GTCAA----ACCAT-TTTTTGACATATCGATGG----AG--ATGAATTTAC---AGCT-----------AA------TTTACAGATCCT--GTC-TACTTTATACGTCT--GTATTTAT-A-T---GTG--A---------ACAT-ATAA---tatcgaattagtgctgataatgttgtatttgatgtgttttctcccttatcgttttatacttactgtcatcctattttatgttctttttctatctttattcactaaatataaaatgaaccaatgcatatacaactagtcaaaccattttttgacatatcgatggagatgaatttacagctaatttacagatcctgtctactttatacgtctgtatttatatgtgaacatataattgattattattgtttaaaataaactac
gi|21 : tctacccagaaattcgcatcttaggaacattttttatttaTATA--CT--AATAT-TAT-TT--GTTC----AGTTATCGTTTAA-TAT-TTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTTT--TTTTTAT-------ATCTT----TATT-CA-------CT------A----AAT----AT-G-AATATCCAATGCAT-----GCACAACTT----GTCAT-----ACATTATTTTGACATCTCGATGA----AG--AT--AGCTGTATA----T----T-G-CCATACTTGTTTTTCAGGTCCT--GTC-TTCTATGTACATCT--GTATTTA-------------A---------ATGT-GAAA---TT----TA-ATGGAATAAATATTG-----T--TTAAA-CC-ttgattattattgtttaaaataaactac
gi|22 : atgctcttatagtgtcgTGATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------A------TGCTTATTTTATACACAATTTCGA--GCATAGGTGACATTTCA--------C-------------CAAGTTGCAATAAC-GAA-A-TA-GCACA--CATGTATA-CAA-AA-AAT-GGCAT-TTTA---ATAAAT----GGAATT--TTTAA--CTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CAAGG--ACGT------TAC-AA---TTGCCA-T-TCAAA--TGAATTTAAT--G--------------TGTAATA----------AA-AA----A-ATT----AA--CAAATACAATGA-AGAAAT-CTTAA-TTATGGCGTATA-ATA-CCCTCCaaaatg
gi|23 : CAAAC-GAA-A-CTATTTTCAGTCATAG-TTTCTTCATCGAGAT----T----TT--------CAGAGATTTGCATTTTCA--GAACAT-----TTTTATTGTGACAAACT----GGCAC---TT----A-GG-GTTGCTTGGACCTAGTGTTT-CAATT-------AGATGC--GCAAA---A---T-G-AGTTGTATTCT--A---T-TAT-TTG-TTTT----ATTTATCGTTTTA-TAT-TTA-CTA-CATC--TT-TTT-TATCCTTAGTTTTCat
gi|24 : cgatctcctttatggctctctaggtaattcgtacatggCAGGCCAAC-GGA-A-TTATTTTCAG----AAATGTC--AA--GGAAT------------TCA----TAG-TATCTACAT------TGAG-ATTTGAC-TTTATTGTGGTCAACAGTTGAA-ACGCACT----TCAG-GTCGCTTGGGCACAAT-TTT--------------GATAC--GC--A---A---ATGTTTTTATATTCT--T---T-TAT-TT--TTTTC---CATAATTGTTTTACT-C-TTA-CTGCCATC--TT-GTT-TATc
gi|25 : caaaatctcactaatgtcactccagattgattaaacATGTTA-ACAACAGCAAACGGATTGCTCGGATGTTTTCG--CTTGTCTTTACCGCAGTGAGCAAT-------------------ATAAGCGTTCAA-GCCACCTTGTG--------CCGAAATTTCAAAGTATTAATATTG---CTTAC-TTGTAAATTTTAA-CTATA-AAT-------------TTCTAA--TTC---A-----TATG-ATGA----CA------------AT---------CATAGTACAATAT---------GTAAATGAAATTAAAA
gi|26 : atgttatctaaacctaATCACTAAGTGACGTCATCT-AGGGATACACATTGAGTTTTT-ACAACAAAAACCAGCATACTCAGATTTCTTCTCATTTTCCCTTATCATAAGTAGCAGTCGTT-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCAA--TAGCG--------GTTTAAT-------------TATTG---CTAAC-TTGTAATTTCTAAG-TTCA-ACTTCTTAGTTTCAAATTCTAACTTCC---A-----AATT-ATAA----cacgtgcaattaaaaat
gi|27 : TTAA-ATCATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TTTACATTTTATACGCACTTTTGA--ACA---------TTTCAG-TAAAT----TTTGTAAATTACAAGTAGCAATA-TCAAA-A-CA-ACACA--CATAAAA--TAA-GACATT-GGTAT-TTTA---GTAAAT----GGAATT--AATAG--TTA----TTTA-TTTGCAACAAAC-AA--TTTACA--CA---CATGT--AAAT------CCA-AA--gtgtcta
gi|29 : T-T-T-CTTC-TGAATTTAAAT-TAACA-GCAATA-AAA--GCAT---------GAATA----GTCATATCGTAAAT-ATTGTGATATCTCGGTGG----GG--ATGCATTTATATTAACCA----T-G-TTAACCTTG-TTTTCACATACA--TTA-TACTTTGCACTTTT--ATATTGGC-A-A---AT---A---------GCAT----T---CA----AA-GT-------ATAG-------T--TTATA-TC-A----A---T---ATAAGTGAA-AAA------tataattatatgtttgaaatat
gi|3 : tattctatAACAAACAAAC-GAA-G-TCATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAC----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCAT------------------TCTT-TTGTGGT------------------T----TTGG-ATCGCTTGGATACAACGTTT--AATTTAAAAATAGATGC--AG--A---AATATTG-ATTAAAA--CC----------T-GT--TTTG----AATTATTGGTTTA-T-TCTTA-CTTTCGTC--TT-TTT-TATCCTT--GTTT-AC-TT-TTTTCCTA----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AC--TACAT-----TCACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATACTGACATCTCGATGG----AT--GTGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--AAACCCAT-A-T---G---------------CGT-AAAA---CA----AA-A---AAGAAATAT-------TGTTTATA-CC-A----T---T---TTGA---AA-AAA------TATTGAAGAA-C-TGTTCACTGCTACCTCAAGCTATCTTTGGTCATAGTGTTTTCACCA------------------------ATTAATTTTTT-ACAACAAAAACCGCCTTACTCAGATTTCTTCA--TTTTCCCTTAATGCAGGGAGCGGTCG-T-TT-T-TTAAA-G-TATTGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTTAGAAGAGTCAATATT-------AC-T----AAT-------------AT-----GT---AAATTCTAAGTTTT---A-----AATG-AT--------------------------------------------------------------ATTAAGCTAATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TACACATTTTATTCTCACTTTAGA--ACAAAGGTAACATTTCAG-TGAATGCAATTTGTAAATTACAAGTTGCAATA-T-AAATA-TA-ACACA--CATGAAAG-TAC-GA-ATTTGGCAT-CTGA---GTCAAT----GAAATT--TATAA--TTA----TCAA-TTTGCAGCATAC-AA--CTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-A-TAAAA--TGAATGTATT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--CAAATACAATAA-AGCAAC-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|30 : tatcaacatttatcacTAAATTAAAAGTTGCAATA-T-AAA-A---------------------------ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AC--TTTACA--TA---CATAG--AAGTAGAAGTTAA-CA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCC
gi|31 : A-AA-GGT-GACAT-TTCA---GTGAAT----GCAATT--TGTAAA-TTA-----CAA-GTTGCAATATCA-AA--ATTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--CGTGTCG-T-TCAAA--TGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AT-CA----A-GTT-----A--AAAATACAAAAA-AGCAATAATGAA-TTATGGAAGGTA-ATA-CCCTTCatca
gi|32 : acattttaaacaaactttcgatcTA-T-TCTTT-CTATTATC--TG-TTTATATCCTA--TTT--AC--T-TTCATCTT----TGTTGCGTT-T-T-CTTA-TGGA----AAA-TAAAA-G-AA---GAAATGCAT-----TTACAACTA----GTTAT----TGCAT-ATTGTGACATATCGATGT----AA--ATGAATTTGCATCAGCTT----T-A-TCGAGCTTG-TTTTCAGGTTTA--TTA-TA
gi|33 : gacaatttataAATTTATA--TTATTAATTTTCAT--T-AAA-T-TT-AGACG--T-TGAAAA-TAAGAA-ATT-AGCAT-TTGA---GTAAAT----GGAATT----------------------------CATAC-CA--TTCGCA----------------------------AA--ATTGTCA-T-TCAAG--TGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT-----A--ATAATGCAACAA-AGCAAT-CCAAA-TTATAGCGGACA-ATT-CCCT
gi|34 : TTCC--TTTTCCCTTTCCGTATGGAGCAGTCG-T-TT-T-T-TTA-GTTATT-GC-TTTCAGGCAAACTGCCGT-------AGTT-ACTCAGATGTG---AGATTG---CTAATACCGCGAATTCAAGGTTCCATGATTCtaa
gi|35 : agattgat----GTCAC----GCCAT-ATTTTGACATCTCGATAG----AG--ATGAATGTACGTGATCTT----T-T-TCAAGCTCG--TTTCAGATCC---TCCGTACTTGGTACCTCTGAGCACTTGTGA-TTCGAT---T---------ACAC-AGAAACGCA----AACGTAAAAAATATAA-------T--TCA-------------------TTAA---AA-AAG------Ttgcctaaaatcaaaatggtgcttacccattatgattttt
gi|36 : atAACAAACAAA----A-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--ACAAA----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTcattaa
gi|37 : agttcttaatactcctgaaacagctacaaacttactttgcaaatagttctttaactaatcaaaaggactccta-AA-TTT-GGCAT-TTTG---GTCAAA----GGAATA--TACAA--TTT----CCTA-GTTGCAAGATGC-A---TTTAAA--CA---CATGG--ACGT------AAG-GA--ATCGGCA-T-TTTAG--CGAGTACAGT--T--------------TGCAATA----------AC-CA----A-GAT----GA--AAA------------CAAT-CTGAG-TTTTGGCAGATGTTTA-CGCTCC
gi|38 : TTTTAA-TGAAA-CA----------TACAAGTTGCAACA-TCAAA-A-TT-GCACAGTTATGGAAGTTAG-AA-GTT---CATATTAA---TTAAAT----GTat
gi|38 : A-GTTGCAACATCA-AA--ATTGCA--CAGT-TATGG--AAGT------TAG-AA--GTT--CA-TATTAAT--TAAATGT---------------------GTACTA----------AC-CA----A-GTT----GA--AAACTGAAATAACAGGA-----GA----ATGGCGGATA-CTA-CCCTgtactaaccaagttgaaaactgaaataacaggagaatggcggatactaccctacat
gi|39 : ttttaatgaaacatacaA-GTTGCAACATTC-AT--TTTACA--CA---TATGG--AAGA------AAG-AA--ATTGGTT-T-TAAGAGGTAAATG---T--T--------------GGTAATacat
gi|39 : AGTTGCAACA-T-TCA-T-TTTACACA--TATGGAAG-AAAGAA-ATT-GGT-T-TTAAGAGGTAAATGTTGGTAATCGATATAA--TTT----GCCA-TTT--------T-GA--TTTATACCCA---CCTGGTCAGGT------TAA-cgatataatttgccattttgatttatacccacctggtcaggttaagcatcacatgacgatga
gi|4 : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATTAG----AGATTTC--AA--GGAAT----T----CTTTTAAC-CAAAATATTTGTACATTCAATGAGCAT---ACTTTT-TTGTGG--------------C---TT----TTGG-ATTGCTTTGTCACGACATTT-GAATT-------GGGTGC--AC--A---AATATCG-ATTGATA--CC--A---TATAT-TT--T-------AATTATTGATTTA-T-TATTA-CAATCATC--TT-TTT-TAACCTT--GTT-CAC-AA-TT--TCCT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAA--G-AACA-AA--TGCAT-----TTACATCTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTAACATCTCGATAG----AG--ATAAATTTACATGAGTTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGATCAA--TTC-TACCTTGTACCATT--ACATCTAT-A-T------------------ACGT-AAAA---CA----AA-ATAGAAGACATATTG-----T--TTATA-CC-G----T---T---TTAAT--AA-AAA------AA---AAGAA-C-TATTCATTGCTAAGAAAAGTTATTTTTGACCATTGTGTTCCAACTATGTGACGACATCT-CGGGAAACACATTGACTTTTG-ACAACAAAAACCATCTTACTCAGATGTTTTCC--TTTTTTTTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TTGT-C-AGA-G-TATCGGCA-CTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTTGGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTCAATTCTTAGTTTAA-AA----AAGTTTCAAATTCTAATTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------GT---------C------------------------TATGAAATCAAGATGATG----A------TA---GT---------------GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACATTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTCAG-TGAgcatcacatgacgatga
gi|40 : nnnnacaactcgctccacttagttctaaattcactcagcagcgtcaatatttgctaataatatttctttagtcaaaacgaccattacggctatccacactgttcac---CATGG--CCGT------TAA-AA--ACTGTCA-T-TTAAA--TGAATGTAAC--T--------------TGTAATT----------AC-CA----A-GTT----AAACAAAATACAATAA-AACAAT-CTGAA-TTAT----GATG-ATA-CACTCCc
gi|41 : attatccacctttccaacaaccgggccGATGG----GG--ATAAATTTACACAAGCTT----T-T-TTAAGCTAG-TTTTCAAATCCAGTTTA-TACTTTCCAC------ACATTTAT-G--------------------------AAA---CATTTTAG-GTA--AGAAATAC-------TGGTTA---------------T---TTAA---AACAAA------TT---AAat
gi|42 : gaatat---AA-AAT------TA---AAAGA-AGTGTTCACTGCTACTTTAAGCTACTTTTGACt
gi|42 : gaaaagggTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-CAAAA-G-TATCaaaatcaaaaggattgccgtagggagcagtcgatttcaaaagtatcatc
gi|43 : gaaaagggaaaattaaaagaagtgttcactgctactttaagctacttttgacaaaatcaaaaggaAACAAGCAGAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--ACAAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCACATTGAATGAACAT---ACTTTTATTGTatc
gi|44 : --ATGAATTTACATAAATTT----TTG-TTAAACATG-TTTTCAAATCCA--TTC-TTCTTTGTATCTTT--TTATATAT-
gi|45 : tgtggcA-AA--TTTGCCA-T--CAAA-----ATGT--T--T--------------TC----------------C-CA----A-GTC----AA--AAA-TGAAACAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-TTA-CCCTCCcggacaaaaa
gi|47 : ttA-AA--ATT--CA-T-T-------GAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------TC-CA----A-GTT----AA--AAA-TATAATAA-AGCAAT-CTCAA-TCATGACGGATA-gta
gi|48 : gtcAT----T----GTATCATC-CCGGAAATTTGCATATC---T-AGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-TT---TT----TTGG--TCGCTTGAATAgat
gi|49 : tTTTCATATCCA--TTC-TACCTTGCAA--TT--GTATTGTT-A-T---AT-------------ACGT-AAAG---CA----CT-ATCGAAGAAACAa
gi|5 : tgtctgAACAAAC-AAATG-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GAAAT----T----GTTTTTAC-CCAGATATTTGCATATTGAAAGAGCAT---ATTTTTATTGTGATCAACC----AG------TT----TTTG-ATTGCCCGGACACAATGTTT-ACATT-------AGACGC--GC--A---AATATCA-AATGATC--CC--A---T-T-T-TT--TTTTGTCAAATTGTTGATTTA-T-TCTTA-CATTCATC--TT-TTT-TATCCAT--GTT-CAT-TT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-A---TGCAT-----TTACAACTATCTAGTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTTGGTAG----AT--ATGAATTTGTAGAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGCACTTGT--ATATCTAT-A-T---A---------------CGT-AAAG---CA----AA-GTAGAAGAAATACCCTATTGT--TTATA-CT-G----T---T---T-AA---AA-AAACAT---TA---AAAGAAC-TATTCACTGCTACCTTAAGCTATTTTTTACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACTCATTGTTTTTTTTACAACAAAAACCAACTTACTCTGATTTCTTCC--TTTTTCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TAGCTGCATTTTA-ACCACATAGCG--------ACTTAATTCATAAGTGTCAATATTA---TTAAT-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAATTTTCAAATTTTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------GG---------C------------------------CATGAAATTAAAATGATG-----------AA---ATG--------T-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCCA--ACAAAAATGA
gi|50 : cAG---AA-AAT------TA---AAAGAAC-GGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTATTGAC
gi|51 : aaagC-CA----C-GTC----GA--AATGTGAAATAA-AATAAT-CGAAG-TTACGGCGGATA-TCA-TCCTCCatcaaatggattac
gi|52 : TGACGTCATCT-GGGG-AACACATTGGATata
gi|6 : ----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATAACT-G----TCC-T---TTGA---AA-AAAAGAAATTA---AATAA-C-TGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTTT-GACCATTGTGT-----------GATGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAATATCAATCGGCTAACTCACATGTCTTCC--TTTTACCTTACCGTAGGGAGCAGTTG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTAATACTAAC-TTCTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CTGTCTCTAAATGTTTA--------CAT-------AAT---------TT-AATAAAATTAAGATGATG----A------AA----TG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTTAA-TGAAAGCAATTTATAAATTAAAAGTTGCAATA-T-A------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAG--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--TAGTACATAG--AAGT------TAA-AAAAATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAAATA-ATA-CCCTCCgtgtctgtgatgtcatc
gi|7 : ----AA-GTAGAAGAAATAA-------T--TTATAGCC-G----T---TCTTTTAA---AA-AAGAAAT--TA---AATAA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCAAAAGGTGACGTTATCTTGGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAATCGGCTTACTCACATGTCTTCC--TTTAATCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACATGGTG--------ACTTATTTCAAAAGTGTCGATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTGTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CTGTCTCTAAATG-TTTA-------CAT-------AGT---------TT-TATGAAATTAAGAGGATG-----------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATTTTCTGTCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTAAA-TAAAAGCAATTTGTAAATTAAAAATTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATA--ATAAA--TTA----TCCA-GTTGCAACGTAC-AC--TTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAA-AA--AGTGTAA-T-TTATA--TGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----T-ATT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-a
gi|8 : TAA---AA-CAA------GA---AGAAA-T-ATTTCTCTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCA-TGGGTGACTTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAAACGGATTACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG--------ACTAAATTCGGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTCAGTGTC---A-----AATT-ATGA----TT------------TT-----------T-------TATAAGT-----TT-TACTTTATT----TGATG----A------AA----TG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTATGG--ACAAAGGTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAGTTAGAAGTGACAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATTGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CG---AATAG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTTAAAAAA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|9 : atacgAACAAATAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----GAATTTA--CA--GGACT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCATTTTAAATGGGCAT---AATGTTGGTGTGGTCAAC-----AG-AC---TT----TTTG-ATCTCTTGAACACAACGTTT-GAATA-------AGATGC--AC--AAATA---TCG-ATTCATA------------TATATT--TTTT----AATAATAG----------------ACCATC--TT-TTT-T-TCC-T--TCTTCACAGTGTTCGTA------TGTT-CAGT-T-TCCTTA-TGGA----AAT-TAA-----AACA-ACAATGTATTAATGTTAAAACTA----GTCAT----TGCAT-AGTTTGACATATCGATGG----GG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCGAACTTG-TTTTCAGGCCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCCAT-A-T------------------ACGTAAAAA---CA----A----AGAAGAAATATTG-----T--TTATA-CC-G--------T---TTAA---AA-AAA------TATTTAATAA-C-TTTTGACTGCTACCCAAAGCTATCTTTGGCCATAGTGTTACCACCAGGGTACGTCATCT-TGGGAAAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): AAATCTCAAATTTTACTCGCGCACCACAGACTAAAATGCAGTTCACCTACGCATCAACTCATCGAAAATCTATAATAGAAAATTGTGGAATACCAGAAACAACTAGATACAGTTTCTTTTTTATTCTCTTAAATTCACTCAGTAACGACAAATTTTTTTCAATATTCCATGTCCACTTCTCAAAAAAAAAATTCT
Unaligned ( gi|46 ): ATTTAGTTCTAAGTTCACTCAACAGCAGCAAACTTACTTTGCTAATATTTCTTTTATCAAAATGACTTTTATGGCTAAC
Unaligned ( gi|53 ): GAGGAGTGAAGTTGTCCTGTATTACTCACCATAGTAAAC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 1111111 333333333 222222222222 22222 22222222 2222222 111 1111111 111111 444444444444444444444 22222222222 2222222222222 22222222222 1 1 11111111 111 888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222222222222222222 11111111111111111 111 1 11111111111111
lowQualScore : 2 1 555 5555 33 33 55555 5555 4 2 4 7 1 55555 3 9999999999999 6666 33 1 66 0000000 44 77 111111111 3 222222222222 2 66 8888 1 3 55555 2 33 2 2 33 11111111 2 7777 3 0000000 0 3 0 7777 3 8888 0 3 888 0000000 6666 000000 2 0 5555 33 5555 333 2 33 2 1 33 1 2 333333333333333333333 2 444 5555 2 55555555555 2222222222222 555 666 2 44444444444 33 0 3 4 2 3 3 1 1 1 44 2 2 2 0 5 2 2 2 22222222 3 444 2 0 0 2 222 66666 2 2 5555 444444444444444444444444444444444444444444444 44 777777777777777777777777777777777 44444444444444444 00 33 1 2 33 1 111 888888 66666666666 2 4 2 2 333 4444 6666 55 4444 1 1 22 22 555 22 1 5555555 1 22 1 1 1 2 22 0 22 11111111111111 8888888888 1 4444 1 66666 22 3 1 1 2 2 2
lowQualScore : . . ... .... .. .. ..... .... . . . . . ..... . ............. .... .. . .. ....... .. .. ......... . ............ . .. .... . . ..... . .. . . .. ........ . .... . ....... . . . .... . .... . . ... ....... .... ...... . . .... .. .... ... . .. . . .. . . ..................... . ... .... . ........... ............. ... ... . ........... .. . . . . . . . . . .. . . . . . . . . ........ . ... . . . . ... ..... . . .... ............................................. .. ................................. ................. .. .. . . .. . ... ...... ........... . . . . ... .... .... .. .... . . .. .. ... .. . ....... . .. . . . . .. . .. .............. .......... . .... . ..... .. . . . . . .
lowQualScore : 7 7 666 7777 77 77 88888 7777 5 5 9 6 6 88888 1 7777777777777 5555 66 4 44 0000000 22 33 888888888 1 666666666666 9 88 9999 6 8 66666 7 77 7 7 99 44444444 6 1111 3 1111111 5 1 2 1111 3 3333 2 3 999 4444444 5555 000000 9 7 7777 44 3333 666 5 22 4 4 44 7 5 888888888888888888888 7 777 3333 7 99999999999 8888888888888 444 999 7 11111111111 22 0 3 6 3 1 3 7 0 0 22 5 5 5 0 0 5 5 7 33333333 1 777 7 8 3 7 000 77777 7 7 7777 999999999999999999999999999999999999999999999 66 444444444444444444444444444444444 77777777777777777 99 44 0 5 00 0 999 222222 44444444444 0 0 0 0 555 2222 9999 00 5555 9 9 66 66 777 66 0 6666666 7 55 9 9 7 0 66 4 66 22222222222222 8888888888 9 0000 9 55555 66 4 9 9 0 1 2
consensus : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--A---A---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---A---------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CC-G----T---T---TTAA---AA-AAA------TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
Reference ( family-2576 ) : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--A---A---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---A---------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CC-G----T---T---TTAA---AA-AAA------TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|1 : AACAATTAAAC-AAACG-TTATCATCAG----ATATTTC--CA--GGAAG----T----GTATCAGC-CCAGATATTTTTATATTTAATGAGCTT---ACGTTTATTGTTGTCAATAT---AG-AC---TT----TTGG-GTCCCATGGACACGAAGTTT-GAATT-------AGA--C--AC--A---A---TCT-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TATT----AATTATTGATTTA-T-T-TTATCTATTATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCGC-AT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-TAT-GTTA-TGAA----AAT-TAAAA-G-AAAA-AAAATACAT-----TTACAAATA----ATCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCGATGA----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TTAAGCTTA-TTTTCAGGTCAG--TTA-TAACTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---ATATATATACACGT-AAAA---CA----AA-GTGGAAGAAATAT-------T--TTATATCC-GCACAT---T---TTAA---AA-AAA------TA---AATGA-C-TGTTCACTGCTACCTGAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTGCCAGAAAGTAACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATTAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTACTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TGTCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTAAATTCAGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATGAAGATGATA----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATGCACACTTATGA--ACAAAGGTGGGATTTAAA-TTAATTGAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-GAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGAAT-TTGA---GTAAAT----ATAATT--CCTAA--TTG----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TATACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--GTGGTCA-T-TCAAA--TGAATGTCAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAGATA-ATA-CCCTCC
gi|10 : AACAAACAAAC-ACA-G-TTATCATCAG----AGGTTTC--CA--AGAAT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTCGTATATTAAATGAGCAT---TTTTGTGTTTTGGTCAAC-----AG-GC---TT----TTGG-ATTGCTTGGACACGACGTTT-AAGTT-------AGATGC--AC--A---A-----------ATA--TC--G------A------TTTT----AATGATTGATTCA-T-TATTA-TTTTCATC--TT-TTT-TATCCTT--GTT---C-GT-TTTTTTTTGCCATGTT-CAG--------TA-TGAA----AA---AAAA-G-AAC--ATAATGCAT-----T----------------------------TTGTGACATCTCGATGA----AT--ATGAATTTGTATATGCTT----T-A-TCAAGCTCG-TTTTCATGTCCA--TTC-TACATTGTTCCTTT--ATATCCAT-A-T------------------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAAGGTAAATATTG-----T--TTATA-TC-G----T---T---TTAA---AA-AAC------TATT-AAAGATC-TATTCTCTGCTACCTAAAGCTATTAGTGACCAGTGTGTTAC
gi|11 : aatgcttgcagtttcatagtttttattatcaaaatgacctttacagttatccacactgttcgcAACAAGTAAAC-GAA-A-TTATT-TTAA----AAAGTTG--CA--GGAATCCCTT----GTTTCAAC-CCAACTATTTCCATCTTCAATT--TAT---GATTGTGTTGTGGTCAGCA-----G-ACA--CT----CGGG-GTCGCTTGGACACACTGTCT-GAATT-------AGATAC--GC--AAATA---TTG-ATGTATT--CC--AGTCT-TTT-TT--TTTC----AATTATCGTTTTA-T-TCTTA-CTATCATCTTTT-TTT-TAT-CTT--TATTCAA-TT-TTTAg
gi|11 : acgattccccagactatttccCAT----GACAT-ACTGCGACATCTTGATGACTATGGTTATGAATTTACGTAAGCTT----T-A-TTAAGCTTG-TTTCCAAA-CCA--TTC-TACTTTGTTCCTGT--ATTGCTCT-A-T---AC---AC--------ATAT-GAAA---CA----aaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaaccatgacatactgcgacatcttgatgactatggttatgaatttacgtaagctttattaagcttgtttccaaaccattctactttgttcctgtattgctctatacacatatgaaaca
gi|12 : acgattccccagactatttccaacaagtaaacgaaattattttaaaaagttgcaggaatcccttgtttcaacccaactatttccatcttcaatttatgattgtgttgtggtcagcagacactcggggtcgcttggacacactgtctgaattagatacgcaaatattgatgtattccagtctttttttttcaattatcgttttattcttactatcatcttttttttatctttattcaatttttaaaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaacTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-C-AAAAG-TATCATCGTTCAA-GCCACCTAGCGCCAATATTGCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNGAGT-TATGTCTCT--A-----AATTCAT-A----TT------------TT---------------------T---------TT-CATGAAATGAAGATGGTA----ACCTAGTAA---CTGTAAGCTGTA-----ATAACGTATTTAAAGTA-----TGCAAATTGTATACGCATTGACGA--ACAAAGATGATATTTAAG-TAAAGGCAACTTGTTTATTACA---TG--------AAA-A-TT-ACCAA--CATGGAAG-TAA-GACATT-GACAT-TTG---------T----GTA--T--T---A--TTA----TCCA-GTTGCAACATGC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------AAG-AA--AGTGTCA-T-TT---------TATAAT--T--------------TGT--TG-----------------------T----AA--AAA--GCAGTAA-TGAATT-CTGGGTTTTTGGCGGGT
gi|13 : AAAC-GAA-A-CTATATTCTC----AACTATC--AA--GGAAT----TCATAGTATCTATTCCAAAGATTTGCATCTTGA----GCAT---ATTTTTTTTATTG----CG----AA-AC---TTGCACTTGGCGTTGCTTGGACACAGTTTTTCGAAAT-------AAATGT--GCT-G---A---TAG-AGTTGTA--TTTAA---TATAT-TTGTTCTC----CATTATCCTTTTA-TAC-TTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTGT--TTTT----------ATCTT----TATT-CA-------CTAAATGTA----ACT-TAAA------CA-AG--TGCAT-----GCACATTTA----GTCGT----ACCAT-ATTTTGACATCTTGATGG----AG--ATGAATTTACATTAACATATCAT-AGTCAAGATTG-TTTTCAGTTCTC--GTC-TTCTTTGTTCCTAT--GTATTTAT-ATT---ATATGA---------AATT-ATAA---CT----GA-ATAAAAAAA--------------TTATA-TA-G--------T---TTAA---Actccaccccccaccccaccatgtaaatcgtcacataacaacga
gi|14 : acaaaatcttctttatggttcttcagtttattcacaacatagaaCACTGCTGACTTAAGCTTTTTTTTACCATTGTGTTACCAATAGGTGACGTTATCT-GTTGTAACACATTGGA-------CAACATCAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTTCTCTTACTGTAGGGAGAAGTCG-TCTT-T-C-ATA-G-TATCGGTGCTTTA-GCCACCTAGCA--------AATAAATTCAGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTAA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---ATACACACTT-ATGA----
gi|14 : T----GTAAAT--TCTAAGTTTAAAATTCCAAGTTTCAA-ATTCTAAGTTTTATA--CA---CACTT--A--T------GAACAA--AGTAACA-T-TTATA--TGAATGTAAT--TTGTAAATTAGAAGTTGCAATATAAAAATTACACACATGGAA-GTT----AA--AAATTACATTAA-AGCAAT-CTGAA-CTATGGCGGATA-AAG-CCCTTCacaaagtaacatttatatgaatgtaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagttaaaaattacattaaagcaatctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|14 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaactTTTTATACACACTTATGA--ACAAAG-TAACATTTATA-TGAATGTAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-ACACA--CATGGAAGTTAA-AA-ATT--ACAT-TAAA---GCAAatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|15 : cactgctgacttaagcttttttttaccattgtgttaccaataggtgacgttatctgttgtaacacattggacaacatcaaacggcttactcagatattttccttttctcttactgtagggagaagtcgtctttcatagtatcggtgctttagccacctagcaaataaattcagacgtgtcaatattactaacttgtaaattctaagtttaaaattccaagtttcaaattctaagAAGCTACTTTTGACCACTGTATCACCACTAAGTGACATCATCG-GGGGAAATGCATTGGTTTTTG-ACAACATCAAACAGCTTACTCAGATTTCTTAC--CTTTCCCTTATCGT-------------T-TT-T-C-AAA-G-TTTCGGCGTTTTA-ACCTCCTACCC--------ACTTACTTCAGAAGTTTCAATATTA---CTAAC-GTGTA------AAGTTTGA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGAATGTCGCTA-----AATT----------T------------TA---------CAT-------TCT---------CT-AATGAAATTAAGATGATG-----------AA---ACG--------A-----GTAAT----------T------TGCACATTTTATACACACTTTGGG--ACAAAGGTGACATTGCAA-TGAAGACAATTTGTAAATTACAAGTTCCAAAA-TCAAA-A-TT-ACACA--C---------------ATT-GGCAT-TTGA---GT---------TAATT--TATAA--GTA----TTCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---Ctctgaactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|16 : g-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-ATGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGATTGTCT------------CTTAATATTCACAT-------CAT---------TT-TATGAAATTAAAATGATG-----------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTAAA-TGAAAGCAGTTTGTAAATTAAAAGTTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GACAT-CTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA--TTA----TCCA-TTTGCAACATAC-AA--TTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGCAA-----------------------------------------------------AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTCAA-TTATGGCGGATA-ATACCCCTCC
gi|17 : AAAC-AAA-GGTTATCATTAG----AGATTTC--CA--GAAAa
gi|17 : cttactttgcaaatatttctttaattAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AC----TG--------G-----GTAAC----------T------TGAACATTTCATACACATCTATGA--ACAAAAGTGACATTTTAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GCAATT--TTTAC--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---GATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGGA-TTATGGTGGATA-ATA-CCCTCCgttttatattatttcatgaaattaagatgatgaactgggtaacttgaacatttcatacacatctatgaacaaaagtgacattttaatgaatgcaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagtaagaaattggcatttgagtaaatgcaatttttacttatccagttgcaacatacaatttacacagatggaagttaaaaattgtcattcaaatgaatgtaatttgtaataaccaagttaaaaaatacaataaagcaatctggattatggtggataataccctccata
gi|18 : cttactttgcaaatatttctttaattaaacaaaggttatcattagagatttccagaaagttttatACAAACAAAC-G-----TTATCATTAG----AGATTTC--CA--GGAAG----T----GTATCAAT-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGTAT---ACTTT--------TCAAT-----AG-GC---AT----TTGG-ATCGCTTGGACACTACGTTT-GAATT-------AGATGC--TC--AAATA---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATTAATTCA-----------ATC--C--TT-TTT-TATCCAT--TTTTCAC-TT-TTCATCTT----TGTT-TAGTAT-T-CTTA-TGata
gi|19 : cgcgctctactttagttctaaattcacttgaaacagttgcaaacttactttgcaaatatttctttaattaattaaaacgacggctttAAGTTTC---C-----AATT-ATTG----CTAC----------GT---------CAT-------AATTTAAAGTTATT-CATGTAATTAAGATGATGGCATA------AATACATG--------AAATTTGTAAC----------TGCAGCGTGCA-ATTTTATATGC---TTTGAAGAAAAAAGTAATTTTTTAAGTGAGCG-----------TTATCATTTGCAATA-T-ACA-ATTT-ACACA--CATTGCAG-TAAGAA-ATT-GACAT-TTAA---TTCAAC----ATTCTT--TATAG--TTA----CACA-GTTACAACATGT-AA--TTTACA--CA---CAACG--AAGT------ATA-AA--CTTGTCATT-TCAGA---GAATGGAATTGT--------------CGT--TA----------AA-CA----ATATT-----A--TAAATACAATAA-GGCAAT-CTGtttatacgtaaaacaagaaga
gi|2 : AACAAACAAAC-G-----TCATCATCAG----AGATTTC--CA--GGCAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA-----G-AC---CT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-AAATT-------AGATGC--GC--A---AATACCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TG--TTTT----AATT---GATTC------TTA-CTAT---------------TCCTT--TTTTCGC-TT-TTCAACTT----TGTT-CAGT-T-TGTTTA-TGGA----AAT-TAAAA----ATA-CAAATACAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCACTTT----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TCAAGCTTA-TTT--AGGTCAA--TTT-TACCTTGTACCTTT--ATAT-----A-T---AT---A----------CGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CCCG----TACAT---TTAA---AA-AAA-------A---AAT---C-TGTTCACTGCTTCCTAAAGCTATTTTTGACCATTATGTTACCTATAGGTGACGTCATCT-GGG-AAACACATTGGATTGTG-ACAACATCAAACGGCTAACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-ACCACTTAGCG--------ACTAAATTCAGA--CGTCAATATTA---CTAAC--TGTAAATTCTTAG-TTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGACTTTCTCTA-----AGTT----------T------------TA---------CAT-------TAG---------TT-CATG-------------------------AA---ATG--------A-----GTAAG----------T------TGCACATTTTGTACACACTTATGA--ACAAATGTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-GCACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GTTAT-TTGA---GTAAAT----GTTATT--CTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACAAAC-AA----------------ATGA--A-------------------TGTAA-T-T----------TGTA-----------------------ATA----------AC-CA----A-GTT-----A--AAAATACAATAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGAAA-ATA-CCCTCC
gi|20 : tgcaaacttactttgcaatttttctttaattatttaaaacaactgctaTCTAC-CCAGAAATTCGCATCTT--AGGAACAT----TTTTTATTa
gi|20 : TC-GAATT-------AG-TGCTGAT--A---A---T-G-TTGTATT--TG--A---TGTGT-TT--TCTC----CCTTATCGTTTTA-TAC-TTA-CTGTCATC--CTATTT-TATGTTC--TTTT-------TCTATCTT----TATT-CA-------CT------A----AATATAAAATG-AACC-AA--TGCAT-----ATACAACTA----GTCAA----ACCAT-TTTTTGACATATCGATGG----AG--ATGAATTTAC---AGCT-----------AA------TTTACAGATCCT--GTC-TACTTTATACGTCT--GTATTTAT-A-T---GTG--A---------ACAT-ATAA---tatcgaattagtgctgataatgttgtatttgatgtgttttctcccttatcgttttatacttactgtcatcctattttatgttctttttctatctttattcactaaatataaaatgaaccaatgcatatacaactagtcaaaccattttttgacatatcgatggagatgaatttacagctaatttacagatcctgtctactttatacgtctgtatttatatgtgaacatataattgattattattgtttaaaataaactac
gi|21 : tctacccagaaattcgcatcttaggaacattttttatttaTATA--CT--AATAT-TAT-TT--GTTC----AGTTATCGTTTAA-TAT-TTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTTT--TTTTTAT-------ATCTT----TATT-CA-------CT------A----AAT----AT-G-AATATCCAATGCAT-----GCACAACTT----GTCAT-----ACATTATTTTGACATCTCGATGA----AG--AT--AGCTGTATA----T----T-G-CCATACTTGTTTTTCAGGTCCT--GTC-TTCTATGTACATCT--GTATTTA-------------A---------ATGT-GAAA---TT----TA-ATGGAATAAATATTG-----T--TTAAA-CC-ttgattattattgtttaaaataaactac
gi|22 : atgctcttatagtgtcgTGATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------A------TGCTTATTTTATACACAATTTCGA--GCATAGGTGACATTTCA--------C-------------CAAGTTGCAATAAC-GAA-A-TA-GCACA--CATGTATA-CAA-AA-AAT-GGCAT-TTTA---ATAAAT----GGAATT--TTTAA--CTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CAAGG--ACGT------TAC-AA---TTGCCA-T-TCAAA--TGAATTTAAT--G--------------TGTAATA----------AA-AA----A-ATT----AA--CAAATACAATGA-AGAAAT-CTTAA-TTATGGCGTATA-ATA-CCCTCCaaaatg
gi|23 : CAAAC-GAA-A-CTATTTTCAGTCATAG-TTTCTTCATCGAGAT----T----TT--------CAGAGATTTGCATTTTCA--GAACAT-----TTTTATTGTGACAAACT----GGCAC---TT----A-GG-GTTGCTTGGACCTAGTGTTT-CAATT-------AGATGC--GCAAA---A---T-G-AGTTGTATTCT--A---T-TAT-TTG-TTTT----ATTTATCGTTTTA-TAT-TTA-CTA-CATC--TT-TTT-TATCCTTAGTTTTCat
gi|24 : cgatctcctttatggctctctaggtaattcgtacatggCAGGCCAAC-GGA-A-TTATTTTCAG----AAATGTC--AA--GGAAT------------TCA----TAG-TATCTACAT------TGAG-ATTTGAC-TTTATTGTGGTCAACAGTTGAA-ACGCACT----TCAG-GTCGCTTGGGCACAAT-TTT--------------GATAC--GC--A---A---ATGTTTTTATATTCT--T---T-TAT-TT--TTTTC---CATAATTGTTTTACT-C-TTA-CTGCCATC--TT-GTT-TATc
gi|25 : caaaatctcactaatgtcactccagattgattaaacATGTTA-ACAACAGCAAACGGATTGCTCGGATGTTTTCG--CTTGTCTTTACCGCAGTGAGCAAT-------------------ATAAGCGTTCAA-GCCACCTTGTG--------CCGAAATTTCAAAGTATTAATATTG---CTTAC-TTGTAAATTTTAA-CTATA-AAT-------------TTCTAA--TTC---A-----TATG-ATGA----CA------------AT---------CATAGTACAATAT---------GTAAATGAAATTAAAA
gi|26 : atgttatctaaacctaATCACTAAGTGACGTCATCT-AGGGATACACATTGAGTTTTT-ACAACAAAAACCAGCATACTCAGATTTCTTCTCATTTTCCCTTATCATAAGTAGCAGTCGTT-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCAA--TAGCG--------GTTTAAT-------------TATTG---CTAAC-TTGTAATTTCTAAG-TTCA-ACTTCTTAGTTTCAAATTCTAACTTCC---A-----AATT-ATAA----cacgtgcaattaaaaat
gi|27 : TTAA-ATCATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TTTACATTTTATACGCACTTTTGA--ACA---------TTTCAG-TAAAT----TTTGTAAATTACAAGTAGCAATA-TCAAA-A-CA-ACACA--CATAAAA--TAA-GACATT-GGTAT-TTTA---GTAAAT----GGAATT--AATAG--TTA----TTTA-TTTGCAACAAAC-AA--TTTACA--CA---CATGT--AAAT------CCA-AA--gtgtcta
gi|29 : T-T-T-CTTC-TGAATTTAAAT-TAACA-GCAATA-AAA--GCAT---------GAATA----GTCATATCGTAAAT-ATTGTGATATCTCGGTGG----GG--ATGCATTTATATTAACCA----T-G-TTAACCTTG-TTTTCACATACA--TTA-TACTTTGCACTTTT--ATATTGGC-A-A---AT---A---------GCAT----T---CA----AA-GT-------ATAG-------T--TTATA-TC-A----A---T---ATAAGTGAA-AAA------tataattatatgtttgaaatat
gi|3 : tattctatAACAAACAAAC-GAA-G-TCATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAC----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCAT------------------TCTT-TTGTGGT------------------T----TTGG-ATCGCTTGGATACAACGTTT--AATTTAAAAATAGATGC--AG--A---AATATTG-ATTAAAA--CC----------T-GT--TTTG----AATTATTGGTTTA-T-TCTTA-CTTTCGTC--TT-TTT-TATCCTT--GTTT-AC-TT-TTTTCCTA----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AC--TACAT-----TCACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATACTGACATCTCGATGG----AT--GTGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--AAACCCAT-A-T---G---------------CGT-AAAA---CA----AA-A---AAGAAATAT-------TGTTTATA-CC-A----T---T---TTGA---AA-AAA------TATTGAAGAA-C-TGTTCACTGCTACCTCAAGCTATCTTTGGTCATAGTGTTTTCACCA------------------------ATTAATTTTTT-ACAACAAAAACCGCCTTACTCAGATTTCTTCA--TTTTCCCTTAATGCAGGGAGCGGTCG-T-TT-T-TTAAA-G-TATTGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTTAGAAGAGTCAATATT-------AC-T----AAT-------------AT-----GT---AAATTCTAAGTTTT---A-----AATG-AT--------------------------------------------------------------ATTAAGCTAATG----A------AA----CG--------T-----GTAAC----------T------TACACATTTTATTCTCACTTTAGA--ACAAAGGTAACATTTCAG-TGAATGCAATTTGTAAATTACAAGTTGCAATA-T-AAATA-TA-ACACA--CATGAAAG-TAC-GA-ATTTGGCAT-CTGA---GTCAAT----GAAATT--TATAA--TTA----TCAA-TTTGCAGCATAC-AA--CTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-A-TAAAA--TGAATGTATT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTC----AA--CAAATACAATAA-AGCAAC-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|30 : tatcaacatttatcacTAAATTAAAAGTTGCAATA-T-AAA-A---------------------------ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AC--TTTACA--TA---CATAG--AAGTAGAAGTTAA-CA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCC
gi|31 : A-AA-GGT-GACAT-TTCA---GTGAAT----GCAATT--TGTAAA-TTA-----CAA-GTTGCAATATCA-AA--ATTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--CGTGTCG-T-TCAAA--TGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AT-CA----A-GTT-----A--AAAATACAAAAA-AGCAATAATGAA-TTATGGAAGGTA-ATA-CCCTTCatca
gi|32 : acattttaaacaaactttcgatcTA-T-TCTTT-CTATTATC--TG-TTTATATCCTA--TTT--AC--T-TTCATCTT----TGTTGCGTT-T-T-CTTA-TGGA----AAA-TAAAA-G-AA---GAAATGCAT-----TTACAACTA----GTTAT----TGCAT-ATTGTGACATATCGATGT----AA--ATGAATTTGCATCAGCTT----T-A-TCGAGCTTG-TTTTCAGGTTTA--TTA-TA
gi|33 : gacaatttataAATTTATA--TTATTAATTTTCAT--T-AAA-T-TT-AGACG--T-TGAAAA-TAAGAA-ATT-AGCAT-TTGA---GTAAAT----GGAATT----------------------------CATAC-CA--TTCGCA----------------------------AA--ATTGTCA-T-TCAAG--TGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT-----A--ATAATGCAACAA-AGCAAT-CCAAA-TTATAGCGGACA-ATT-CCCT
gi|34 : TTCC--TTTTCCCTTTCCGTATGGAGCAGTCG-T-TT-T-T-TTA-GTTATT-GC-TTTCAGGCAAACTGCCGT-------AGTT-ACTCAGATGTG---AGATTG---CTAATACCGCGAATTCAAGGTTCCATGATTCtaa
gi|35 : agattgat----GTCAC----GCCAT-ATTTTGACATCTCGATAG----AG--ATGAATGTACGTGATCTT----T-T-TCAAGCTCG--TTTCAGATCC---TCCGTACTTGGTACCTCTGAGCACTTGTGA-TTCGAT---T---------ACAC-AGAAACGCA----AACGTAAAAAATATAA-------T--TCA-------------------TTAA---AA-AAG------Ttgcctaaaatcaaaatggtgcttacccattatgattttt
gi|36 : atAACAAACAAA----A-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--ACAAA----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTcattaa
gi|37 : agttcttaatactcctgaaacagctacaaacttactttgcaaatagttctttaactaatcaaaaggactccta-AA-TTT-GGCAT-TTTG---GTCAAA----GGAATA--TACAA--TTT----CCTA-GTTGCAAGATGC-A---TTTAAA--CA---CATGG--ACGT------AAG-GA--ATCGGCA-T-TTTAG--CGAGTACAGT--T--------------TGCAATA----------AC-CA----A-GAT----GA--AAA------------CAAT-CTGAG-TTTTGGCAGATGTTTA-CGCTCC
gi|38 : TTTTAA-TGAAA-CA----------TACAAGTTGCAACA-TCAAA-A-TT-GCACAGTTATGGAAGTTAG-AA-GTT---CATATTAA---TTAAAT----GTat
gi|38 : A-GTTGCAACATCA-AA--ATTGCA--CAGT-TATGG--AAGT------TAG-AA--GTT--CA-TATTAAT--TAAATGT---------------------GTACTA----------AC-CA----A-GTT----GA--AAACTGAAATAACAGGA-----GA----ATGGCGGATA-CTA-CCCTgtactaaccaagttgaaaactgaaataacaggagaatggcggatactaccctacat
gi|39 : ttttaatgaaacatacaA-GTTGCAACATTC-AT--TTTACA--CA---TATGG--AAGA------AAG-AA--ATTGGTT-T-TAAGAGGTAAATG---T--T--------------GGTAATacat
gi|39 : AGTTGCAACA-T-TCA-T-TTTACACA--TATGGAAG-AAAGAA-ATT-GGT-T-TTAAGAGGTAAATGTTGGTAATCGATATAA--TTT----GCCA-TTT--------T-GA--TTTATACCCA---CCTGGTCAGGT------TAA-cgatataatttgccattttgatttatacccacctggtcaggttaagcatcacatgacgatga
gi|4 : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATTAG----AGATTTC--AA--GGAAT----T----CTTTTAAC-CAAAATATTTGTACATTCAATGAGCAT---ACTTTT-TTGTGG--------------C---TT----TTGG-ATTGCTTTGTCACGACATTT-GAATT-------GGGTGC--AC--A---AATATCG-ATTGATA--CC--A---TATAT-TT--T-------AATTATTGATTTA-T-TATTA-CAATCATC--TT-TTT-TAACCTT--GTT-CAC-AA-TT--TCCT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAA--G-AACA-AA--TGCAT-----TTACATCTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTAACATCTCGATAG----AG--ATAAATTTACATGAGTTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGATCAA--TTC-TACCTTGTACCATT--ACATCTAT-A-T------------------ACGT-AAAA---CA----AA-ATAGAAGACATATTG-----T--TTATA-CC-G----T---T---TTAAT--AA-AAA------AA---AAGAA-C-TATTCATTGCTAAGAAAAGTTATTTTTGACCATTGTGTTCCAACTATGTGACGACATCT-CGGGAAACACATTGACTTTTG-ACAACAAAAACCATCTTACTCAGATGTTTTCC--TTTTTTTTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TTGT-C-AGA-G-TATCGGCA-CTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTTGGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTCAATTCTTAGTTTAA-AA----AAGTTTCAAATTCTAATTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------GT---------C------------------------TATGAAATCAAGATGATG----A------TA---GT---------------GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACATTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTCAG-TGAgcatcacatgacgatga
gi|40 : nnnnacaactcgctccacttagttctaaattcactcagcagcgtcaatatttgctaataatatttctttagtcaaaacgaccattacggctatccacactgttcac---CATGG--CCGT------TAA-AA--ACTGTCA-T-TTAAA--TGAATGTAAC--T--------------TGTAATT----------AC-CA----A-GTT----AAACAAAATACAATAA-AACAAT-CTGAA-TTAT----GATG-ATA-CACTCCc
gi|41 : attatccacctttccaacaaccgggccGATGG----GG--ATAAATTTACACAAGCTT----T-T-TTAAGCTAG-TTTTCAAATCCAGTTTA-TACTTTCCAC------ACATTTAT-G--------------------------AAA---CATTTTAG-GTA--AGAAATAC-------TGGTTA---------------T---TTAA---AACAAA------TT---AAat
gi|42 : gaatat---AA-AAT------TA---AAAGA-AGTGTTCACTGCTACTTTAAGCTACTTTTGACt
gi|42 : gaaaagggTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-CAAAA-G-TATCaaaatcaaaaggattgccgtagggagcagtcgatttcaaaagtatcatc
gi|43 : gaaaagggaaaattaaaagaagtgttcactgctactttaagctacttttgacaaaatcaaaaggaAACAAGCAGAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--ACAAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCACATTGAATGAACAT---ACTTTTATTGTatc
gi|44 : --ATGAATTTACATAAATTT----TTG-TTAAACATG-TTTTCAAATCCA--TTC-TTCTTTGTATCTTT--TTATATAT-
gi|45 : tgtggcA-AA--TTTGCCA-T--CAAA-----ATGT--T--T--------------TC----------------C-CA----A-GTC----AA--AAA-TGAAACAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-TTA-CCCTCCcggacaaaaa
gi|47 : ttA-AA--ATT--CA-T-T-------GAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------TC-CA----A-GTT----AA--AAA-TATAATAA-AGCAAT-CTCAA-TCATGACGGATA-gta
gi|48 : gtcAT----T----GTATCATC-CCGGAAATTTGCATATC---T-AGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-TT---TT----TTGG--TCGCTTGAATAgat
gi|49 : tTTTCATATCCA--TTC-TACCTTGCAA--TT--GTATTGTT-A-T---AT-------------ACGT-AAAG---CA----CT-ATCGAAGAAACAa
gi|5 : tgtctgAACAAAC-AAATG-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GAAAT----T----GTTTTTAC-CCAGATATTTGCATATTGAAAGAGCAT---ATTTTTATTGTGATCAACC----AG------TT----TTTG-ATTGCCCGGACACAATGTTT-ACATT-------AGACGC--GC--A---AATATCA-AATGATC--CC--A---T-T-T-TT--TTTTGTCAAATTGTTGATTTA-T-TCTTA-CATTCATC--TT-TTT-TATCCAT--GTT-CAT-TT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-A---TGCAT-----TTACAACTATCTAGTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTTGGTAG----AT--ATGAATTTGTAGAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGCACTTGT--ATATCTAT-A-T---A---------------CGT-AAAG---CA----AA-GTAGAAGAAATACCCTATTGT--TTATA-CT-G----T---T---T-AA---AA-AAACAT---TA---AAAGAAC-TATTCACTGCTACCTTAAGCTATTTTTTACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACTCATTGTTTTTTTTACAACAAAAACCAACTTACTCTGATTTCTTCC--TTTTTCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TAGCTGCATTTTA-ACCACATAGCG--------ACTTAATTCATAAGTGTCAATATTA---TTAAT-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAATTTTCAAATTTTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------GG---------C------------------------CATGAAATTAAAATGATG-----------AA---ATG--------T-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCCA--ACAAAAATGA
gi|50 : cAG---AA-AAT------TA---AAAGAAC-GGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTATTGAC
gi|51 : aaagC-CA----C-GTC----GA--AATGTGAAATAA-AATAAT-CGAAG-TTACGGCGGATA-TCA-TCCTCCatcaaatggattac
gi|52 : TGACGTCATCT-GGGG-AACACATTGGATata
gi|6 : ----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATAACT-G----TCC-T---TTGA---AA-AAAAGAAATTA---AATAA-C-TGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTTT-GACCATTGTGT-----------GATGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAATATCAATCGGCTAACTCACATGTCTTCC--TTTTACCTTACCGTAGGGAGCAGTTG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTAATACTAAC-TTCTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CTGTCTCTAAATGTTTA--------CAT-------AAT---------TT-AATAAAATTAAGATGATG----A------AA----TG--------A-----GTAAC----------T------TGCATATTCTATCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTTAA-TGAAAGCAATTTATAAATTAAAAGTTGCAATA-T-A------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAG--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--TAGTACATAG--AAGT------TAA-AAAAATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAAATA-ATA-CCCTCCgtgtctgtgatgtcatc
gi|7 : ----AA-GTAGAAGAAATAA-------T--TTATAGCC-G----T---TCTTTTAA---AA-AAGAAAT--TA---AATAA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCAAAAGGTGACGTTATCTTGGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAATCGGCTTACTCACATGTCTTCC--TTTAATCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACATGGTG--------ACTTATTTCAAAAGTGTCGATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTGTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CTGTCTCTAAATG-TTTA-------CAT-------AGT---------TT-TATGAAATTAAGAGGATG-----------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCATTTTCTGTCTACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTAAA-TAAAAGCAATTTGTAAATTAAAAATTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATA--ATAAA--TTA----TCCA-GTTGCAACGTAC-AC--TTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAA-AA--AGTGTAA-T-TTATA--TGAATGTTAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----T-ATT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-a
gi|8 : TAA---AA-CAA------GA---AGAAA-T-ATTTCTCTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCA-TGGGTGACTTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAAACGGATTACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG--------ACTAAATTCGGACGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTCAGTGTC---A-----AATT-ATGA----TT------------TT-----------T-------TATAAGT-----TT-TACTTTATT----TGATG----A------AA----TG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTATGG--ACAAAGGTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAGTTAGAAGTGACAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATTGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TTTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CG---AATAG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGTATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTTAAAAAA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|9 : atacgAACAAATAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----GAATTTA--CA--GGACT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCATTTTAAATGGGCAT---AATGTTGGTGTGGTCAAC-----AG-AC---TT----TTTG-ATCTCTTGAACACAACGTTT-GAATA-------AGATGC--AC--AAATA---TCG-ATTCATA------------TATATT--TTTT----AATAATAG----------------ACCATC--TT-TTT-T-TCC-T--TCTTCACAGTGTTCGTA------TGTT-CAGT-T-TCCTTA-TGGA----AAT-TAA-----AACA-ACAATGTATTAATGTTAAAACTA----GTCAT----TGCAT-AGTTTGACATATCGATGG----GG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCGAACTTG-TTTTCAGGCCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCCAT-A-T------------------ACGTAAAAA---CA----A----AGAAGAAATATTG-----T--TTATA-CC-G--------T---TTAA---AA-AAA------TATTTAATAA-C-TTTTGACTGCTACCCAAAGCTATCTTTGGCCATAGTGTTACCACCAGGGTACGTCATCT-TGGGAAAC
blockSeqs : A C GG TCAT TT TC TCCCT CATA T T A A A TTGAC G AGTTGAAACGCA GCAC CG G CG TAAAAAT TG AA AATATT T CCAGTCT A GT GTCA T A TTA . TT A A AG TCACAGTG T GCCA G GTATT A TTTA A ATG T TAA TAATGTT TCTA ATCGTA T CTAT TT ATCA AG T GT G C GA C G TTATATGAA A ACG TTTT C CCCTATTGT CCCGTACA CTT GTG C AGAAATTA AG T G A G T T T A A CA T C G T T A T G CCAATATT N ATA A T GCT TACAC C G TTGT GTCTCTAAATGTTTACATAAT AA ACCTAGTAACTGTAAGCTGTA GTATTTAAAGTA AG A G GG C TA AATT GTTATGGAAGT G C T A GAG GTTG GATA GT AAAT A T GT CC GTA TC AGAAGTT C AA T A T T GG TG TGTAAATTAGAAGT TAAAAATTAC A TGGA T AAAAA AC T C A T T C
blockSeqs : . A TG . . . T . T . C C A TT G TGGCAC . A A A . . T AATATC . TTTAATA . G C C T TTC . . . . . TCAATT T . . GTTTG . . . AGC . AAA GC . GA . . . . TG . . . C . C . TTCGATTA . . . . TTGT ACTGTCC . T . AAATTA GA A . C A . . T A T . . . . T A . . . T C . . . TCT . . G . GTCTCTAAATGTTTACATAGT C GCATAAATACATGAAATTT TGCAGCG . A . TG G TC ATTT CATGGAAGT G C . . . . TC A . . . . . GT . A . . . . T T . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . A G . . . T . A . C G A GA T AGACA . G A G . . . AATACC . CTAATAT . . . C T TAC . . . . . TCACTT C . . GTTTT . . . AG . CAA TT . AC . . . . A . . . C . T . TACACA . . . . TTGT GCCGT . . . TATTG GA A . A G . . T A G . . . . T . . . . . A . . . T . . T . ACGTCATAATTTAAAGTTA A AAACGA T . C . GA C TA TATA CATGGAAG G . . . . . TA . . . . . . . . G . . . . C A . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . A A . . . G . A . A G A AT A GAAAC . A T G . . . AATATT . TTCTAT . . . T A TAC . . . . . TCGCTT C . . GTTTT . . . TG . AAA AT . TG . . . . A . . . C . T . TGTGAA . . . . TTGT TCGT . . . CATTA AG . . C A . . G A G . . . . T . . . . . A . . . . . . G . CTTAATATTCACATCAT T AAATGA T . A . AG A AC TTTT CATGGAAG G . . . . . CT . . . . . . . . T . . . . C G . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . A A . . . G . A . A G A AC A AAGTT . A G A . . . AATATC . TTCTTT . . . C A TAT . . . . . TACTT T . . GTTTC . . . AG . CAA GC . AC . . . . A . . . G . T . AATAG . . . . TTGT TCAA . . . TATTT AG . . C T . . A C T . . . . . . . . . . A . . . . . . A . ATCATAGTACAATAT C AACTGG T . T . TG G TC AATT CATTGCAG G . . . . . TT . . . . . . . . T . . . . C A . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . G A . . . T . T . C C A AC A AGGC . G A G . . . AATATC . TGATG . . . C T TAT . . . . . CACAA T . . GTTT . . . AG . AA TC . TG . . . . G . . . A . T . TATA . . . . CTGG CCAT . . . TATT AG . . C G . . A C T . . . . . . . . . . A . . . . . . G . TTTTATAAGT C AAATGA T . T . CG T TC ATT CATGGAAG G . . . . . TA . . . . . . . . A . . . . C A . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . A A . . . T . A . T G A AC A AGGC . G A C . . . AATATC . CCATA . . . C T CTC . . . . . CATTT C . . TTTT . . . AG . G TT . TG . . . . G . . . T . C . TATA . . . . TTGT CCGT . . . AA TA . . C G . . A C G . . . . . . . . . . T . . . . . . G . TACATTCT C AAACGT A . A . TG G T ATT CATGTATA . . . . . . CT . . . . . . . . T . . . . A T . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . A G . . . C . T . A C A AC A AGAC . A A G . . . ATA . CCAT . . . T T TTC . . . . . TTAT C . . G . . . A . A TT . GC . . . . A . . . C . T . TA . . . . TT CTGT . . . TT TA . . A G . . A C T . . . . . . . . . . A . . . . . . G . TACATTAG T AAACGT T . C . TG C T ATT CATGAAAG . . . . . . TT . . . . . . . . C . . . . C A . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . A G . . . A . A . A G A AC A AGAC . A G A . . . AAT . CCAT . . . T T TTC . . . . . CGT C . . . . . . G . C TT . TG . . . . A . . . C . C . AA . . . . GT TAG . . . TA AA . . C G . . T T G . . . . . . . . . . A . . . . . . G . TTT C AAACGT T . C . AG C T ATT TATGGAAG . . . . . . AA . . . . . . . . T . . . . C A . . . . . . . G . A . . . . .
blockSeqs : . A G . . . T . A . A G A AC A CAG . A A G . . . AT . CCAT . . . T G TTA . . . . . ACT . . . . . . . . . A T . TG . . . . T . . . C . T . TG . . . . AT CCG . . . TA TA . . . . . . T T G . . . . . . . . . . A . . . . . . G . GTC A AAATGT T . C . AG C T ATA CATTGAAG . . . . . . TA . . . . . . . . T . . . . C A . . . . . . . G . A . . . . .
blockSeqs : . A G . . . G . T . A A . AT A C . A A . . . . AT . TCG . . . T A TTC . . . . . T . . . . . . . . . . . . TG . . . . A . . . C . A . TA . . . . TT . . . . GA T . . . . . . T A G . . . . . . . . . . A . . . . . . . . GGC T AAATGA T . T . TG A T ACA CATAAAA . . . . . . CT . . . . . . . . A . . . . T A . . . . . . . A . C . . . . .
blockSeqs : . . G . . . T . T . A . . AA G . . . . . . . A . CC . . . A A . . . . . . T . . . A . . . . T . . . T . T . TA . . . . AT . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . T AAATGA T . C . T T T TTT TTGAAAA . . . . . . TG . . . . . . . . T . . . . T G . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . C . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAATGA T . T . A C T ATT C . . . . . . TA . . . . . . . . A . . . . A A . . . . . . . A . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGT T . A . . A T A . . . . . . . CT . . . . . . . . T . . . . T A . . . . . . . G . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . AT . . . . . . . . T . . . . C T . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . TT . . . . . . . . T . . . . C T . . . . . . . A . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : G** AGAC********* AATATC*** CCAT******** TTC** TA******************* TTGT******* CCGT********* CTTACATT************************************* AAACGN***************************
originalCons : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACA----AG-AC---TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--A---A---TCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTA-T-T-TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCTAT-A-T---AT---A---------ACGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATAT-------T--TTATA-CC-G----T---T---TTAA---AA-AAA------TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CT------------TT---------CAT-------TAT---------TT-CATGAAATTAAGATGATG----A------AA---ATG--------A-----GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
finalCons : AACAAACAAAC-GAAG--TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAACAGAC---------TT----TTGG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGC--GC--AAATATC---G-ATTTATACCAT--------TAT-TT--TTTT----AATTATCGNTTTATTC--TTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCTTT--ATATCTAT-ATA-------------------CGT-AAAA---CA----AA-GTAGAAGAAATATTGT-------TTATACCGT---------T---TTAA---AA-AAA------TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG--------ACTTAATTCAGAAGTGTCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATT-ATGA----CTCTTACATT-------------------------------------TT-CATGAAATTAAGATGATGAAACGN---------------------------GTAAC----------T------TGCACATTTTATACACACTTTCGA--ACAAAGGTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA--TTA----TCCA-GTTGCAACATAC-AA--TTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAA-AA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--T--------------TGTAATA----------AC-CA----A-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): AAATCTCAAATTTTACTCGCGCACCACAGACTAAAATGCAGTTCACCTACGCATCAACTCATCGAAAATCTATAATAGAAAATTGTGGAATACCAGAAACAACTAGATACAGTTTCTTTTTTATTCTCTTAAATTCACTCAGTAACGACAAATTTTTTTCAATATTCCATGTCCACTTCTCAAAAAAAAAATTCT
Unaligned ( gi|46 ): ATTTAGTTCTAAGTTCACTCAACAGCAGCAAACTTACTTTGCTAATATTTCTTTTATCAAAATGACTTTTATGGCTAAC
Unaligned ( gi|53 ): GAGGAGTGAAGTTGTCCTGTATTACTCACCATAGTAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111111111 1111111 222222222222 22222222 1111111 11 22222 111111 111111111111 111111111111 22222222222 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111111 22222222222222222222 111111111111 1
lowQualScore : 2 1 555 5555 33 33 55555 5555 4 2 4 7 1 55555 4 8888888888888888 3 6666 3 33 1 3 0000000 3 0 3 444444444444 0 2 66 0 6666 2 1 4 33 2 33 2 2 33 11111111 2 7777 3 8888888 2 3 0 7777 3 00 3 0 22222 999999 6666 000000 2 0 5555 33 5555 333 2 33 2 999999999 33 33 444 444444444444 6666 2 33 555 5555 2 2 33 66666 1 33 888888888888 555 2 2 22222222222 44 9 3 4 2 33 3 1 1 1 44 2 2 2 0 5 2 2 2 2 1 2 33 444 2 0 0 2 0 888888888 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 2 3333333333333 777777 3 1 2 77777777777777777777 1 2 66666 0 33 33 1 2 33 0 1 333333333333 88888888888 2 4 2 2 333 4444 7777 2 22 666 22 555555 22 2 2 1 1 333 0 22 2 77777 22 2 2 2 2 2 2
lowQualScore : . . ... .... .. .. ..... .... . . . . . ..... . ................ . .... . .. . . ....... . . . ............ . . .. . .... . . . .. . .. . . .. ........ . .... . ....... . . . .... . .. . . ..... ...... .... ...... . . .... .. .... ... . .. . ......... .. .. ... ............ .... . .. ... .... . . .. ..... . .. ............ ... . . ........... .. . . . . .. . . . . .. . . . . . . . . . . . .. ... . . . . . ......... ............................................................ . . ............. ...... . . . .................... . . ..... . .. .. . . .. . . ............ ........... . . . . ... .... .... . .. ... .. ...... .. . . . . ... . .. . ..... .. . . . . . .
lowQualScore : 7 7 666 7777 77 77 88888 7777 5 5 9 6 6 88888 6 4444444444444444 1 5555 1 66 4 1 0000000 1 7 1 555555555555 9 9 88 2 1111 9 6 8 33 7 77 7 7 99 44444444 6 1111 3 3333333 4 1 2 1111 3 88 3 2 66666 666666 5555 000000 9 7 7777 44 3333 666 5 22 4 666666666 44 44 777 666666666666 1111 9 99 000 3333 7 7 77 77777 2 66 222222222222 888 7 7 44444444444 22 2 1 6 3 99 3 7 0 0 22 5 5 5 0 0 5 5 7 7 3 4 77 777 7 8 3 7 1 222222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 8 5 8888888888888 222222 7 0 5 55555555555555555555 8 5 22222 7 44 44 9 5 00 2 0 000000000000 99999999999 6 2 1 1 777 5555 8888 2 88 000 88 888888 66 0 0 5 3 000 9 88 0 33333 88 8 0 0 1 2 4
consensus : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAAC-A--G---------AC-TT----TT-GG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGCGCA-AATATCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----A-ATTATCGNTTTATTCTTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCT--------TTAT--A--TCTA---TATA------------CG----T-A--AAA---CA----AA-GTAGAAGAA--ATA-----TTGTTTAT-A-CCG----T---T---TTAA-AA-AAA------TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTTAATTCAGAAGTG--TCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGA----C--T-----------T----T--T-------A---C---A--T-----T--TTC--ATGAAATTAAGATGAT-G-------------A------AACGNGTAA-CT--------------------TGCACAT-T-----TTATACACACTTTCGAA--CAAAG--GTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA-TTATCCAGTTGCAACATACAATTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAAAA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--TTGTAATAACCAA-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
Reference ( family-2576 ) : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAT----T----GTNTCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAAC-A--G---------AC-TT----TT-GG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-GAATT-------AGATGCGCA-AATATCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----A-ATTATCGNTTTATTCTTA-CTATCATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCAC-NT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AAAATGCAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTCGATGG----AG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCT--------TTAT--A--TCTA---TATA------------CG----T-A--AAA---CA----AA-GTAGAAGAA--ATA-----TTGTTTAT-A-CCG----T---T---TTAA-AA-AAA------TA---AANGA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAANCGGCTTACTCAGATGTCTTCC--TTTTCCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTTAATTCAGAAGTG--TCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGA----C--T-----------C----T--T-------A---C---A--T-----T--TTC--ATGAAATTAAGATGAT-G-------------A------AACGNGTAA-CT--------------------TGCACAT-T-----TTATACACACTTTCGAA--CAAAG--GTGACATTTNAA-TGAANGCAATTTGTAAATTANAAGTTGCAATA-T-AAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TNTAA-TTATCCAGTTGCAACATACAATTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAAAA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--TTGTAATAACCAA-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|1 : AACAATTAAAC-AAACG-TTATCATCAG----ATATTTC--CA--GGAAG----T----GTATCAGC-CCAGATATTTTTATATTTAATGAGCTT---ACGTTTATTGTTGTCAAT-ATAG---------AC-TT----TT-GG-GTCCCATGGACACGAAGTTT-GAATT-------AGA--CACA-A---TCT-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TATT----A-ATTATTGATTTATT-TTATCTATTATC--TT-TTT-TATCCTT--TTTTCGC-AT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-TAT-GTTA-TGAA----AAT-TAAAA-G-AAAA-AAAATACAT-----TTACAAATA----ATCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCGATGA----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TTAAGCTTA-TTTTCAGGTCAG--TTA-TAACTTGTACCT--------TTAT--A--TCTA---TATATATATATATACACG----T-A--AAA---CA----AA-GTGGAAGAA--ATA-----TT--TTAT-ATCCGCACAT---T---TTAA-AA-AAA------TA---AATGA-C-TGTTCACTGCTACCTGAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTGCCAGAAAGTAACGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATTAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTACTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TGTCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTAAATTCAGACGTG--TCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---A-----AATTATGA----C--T-----------T----T--------------C---A--TTA---T--TTC--ATGAAATGAAGATGATAA-------------A------AATGAGTAA-CT--------------------TGCACAT-T-----TTATGCACACTTATGAA--CAAAG--GTGGGATTTAAA-TTAATTGAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-GAA-A-TT-ACACA--CATGGAAG-TAA-AA-ATT-GGAAT-TTGA---GTAAAT----ATAATT--CCTAA-TTGTCCAGTTGCAACATACAATATACA--CA---CATGG--AAGT------TAAAA--GTGGTCA-T-TCAAA--TGAATGTCAT--TTGTAATAACCAA-GTC----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAGATA-ATA-CCCTCC
gi|10 : AACAAACAAAC-ACA-G-TTATCATCAG----AGGTTTC--CA--AGAAT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTCGTATATTAAATGAGCAT---TTTTGTGTTTTGGTCAAC-A--G---------GC-TT----TT-GG-ATTGCTTGGACACGACGTTT-AAGTT-------AGATGCACA-AATATCG-ATTT--------------------------T----A-ATGATTGATTCATTATTA-TTTTCATC--TT-TTT-TATCCTT--GTT---C-GT-TTTTTTTTGCCATGTT-CAGT--------A-TGAA----AA---AAAA-G-AACA-TAA-TGCAT-----TT----------------------------TGTGACATCTCGATGA----AT--ATGAATTTGTATATGCTT----T-A-TCAAGCTCG-TTTTCATGTCCA--TTC-TACATTGTTCCT--------TTAT--A--TCCA---TATA------------CG----T-A--AAA---CA----AA-GTAAGGTAA--ATA-----TTGTTTAT-A-TCG----T---T---TTAA-AA-AAC------TATT-AAAGATC-TATTCTCTGCTACCTAAAGCTATTAGTGACCAGTGTGTTAC
gi|11 : aatgcttgcagtttcatagtttttattatcaaaatgacctttacagttatccacactgttcgcAACAAGTAAAC-GAA-A-TTATT-TTAA----AAAGTTG--CA--GGAATCCCTT----GTTTCAAC-CCAACTATTTCCATCTTCAATT--TAT---GATTGTGTTGTGGTCAGC-A--G---------ACACT----CG-GG-GTCGCTTGGACACACTGTCT-GAATT-------AGATACGCA-AATATTG-ATGTATT--CC--AGTCT-TTT-TT--TTTC----A-ATTATCGTTTTATTCTTA-CTATCATCTTTT-TTT-TAT-CTT--TATTCAA-TT-TTTAg
gi|11 : acgattccccagactatttccCAT----GACAT-ACTGCGACATCTTGATGACTATGGTTATGAATTTACGTAAGCTT----T-A-TTAAGCTTG-TTTCCAAA-CCA--TTC-TACTTTGTTCCT--------GTATTGC--TCTA---TACA------------CA----T-ATGAAA---CA----aaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaaccatgacatactgcgacatcttgatgactatggttatgaatttacgtaagctttattaagcttgtttccaaaccattctactttgttcctgtattgctctatacacatatgaaaca
gi|12 : acgattccccagactatttccaacaagtaaacgaaattattttaaaaagttgcaggaatcccttgtttcaacccaactatttccatcttcaatttatgattgtgttgtggtcagcagacactcggggtcgcttggacacactgtctgaattagatacgcaaatattgatgtattccagtctttttttttcaattatcgttttattcttactatcatcttttttttatctttattcaatttttaaaaaaaacaacattttcttaaaactcaatgaaccaatgaacgtacaacacgatggttattcgtttacgtgtatatagagttgcgctgactaacccttcgaataaacTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-C-AAAAG-TATCATCGTTCAA-GCCACCTAGCG-CC--AAT-----ATTGCTTGNNNNNNN---NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---G-----AGTTATGT----C--T-----------C----T--A-------AATTC---A--TATTTTT--TTC--ATGAAATGAAGATGGT-A-------------ACCTAGTAAC-TGTAAGCTGTAATAACGTATTTAAAGTATGCAAAT-T-----GTATACGCATTGACGAA--CAAAG--ATGATATTTAAG-TAAAGGCAACTTGTTTATTACA---TG--------AAA-A-TT-ACCAA--CATGGAAG-TAA-GACATT-GACAT-TTG---------T----GTA--T--T---A-TTATCCAGTTGCAACATGCAATTTACA--CA---CATGG--AAGT------AAGAA--AGTGTCA-T-TT---------TATAAT--TTGT--TG--------T----AA--AAA--GCAGTAA-TGAATT-CTGGGTTTTTGGCGGGT
gi|13 : AAAC-GAA-A-CTATATTCTC----AACTATC--AA--GGAAT----TCATAGTATCTATTCCAAAGATTTGCATCTTGA----GCAT---ATTTTTTTTATTGCGAA---------------AC-TTGCACTT-GGCGTTGCTTGGACACAGTTTTTCGAAAT-------AAATGTGCT-GATA--G-AGTTGTA--TTTAA---TATAT-TTGTTCTC----C-ATTATCCTTTTATACTTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTGT--TTTT----------ATCTT----TATT-CA-------CTAAATGTA----ACT-TAAA------CA-AG--TGCAT-----GCACATTTA----GTCGT----ACCAT-ATTTTGACATCTTGATGG----AG--ATGAATTTACATTAACATATCAT-AGTCAAGATTG-TTTTCAGTTCTC--GTC-TTCTTTGTTCCT--------ATGT--A--TTTATATTATA------------TGAAATT-A--TAA---CT----GA-ATAAAAAAATTATA-----TAGTTTActccaccccccaccccaccatgtaaatcgtcacataacaacga
gi|14 : acaaaatcttctttatggttcttcagtttattcacaacatagaaCACTGCTGACTTAAGCTTTTTTTTACCATTGTGTTACCAATAGGTGACGTTATCT-GTTGTAACACATTGGA-------CAACATCAAACGGCTTACTCAGATATTTTCC--TTTTCTCTTACTGTAGGGAGAAGTCG-TCTT-T-C-ATA-G-TATCGGTGCTTTA-GCCACCTAGCA-AATAAATTCAGACGTG--TCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTAA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTT---ATACACACTTATGA----A--------------CAAAGT--A-------A---C---A--T-----T--TAT--ATGAATGTAATTTG-T---------------A------AATTAG-AA-GT--------------------TGCA-ATATAAAAATTACACACA---TGGAAGTTAAAA--ATTACATT-------AAAGCAATCTGaa
gi|15 : AAGCTACTTTTGACCACTGTATCACCACTAAGTGACATCATCG-GGGGAAATGCATTGGTTTTTG-ACAACATCAAACAGCTTACTCAGATTTCTTAC--CTTTCCCTTATCGT-------------T-TT-T-C-AAA-G-TTTCGGCGTTTTA-ACCTCCTACCC-ACTTACTTCAGAAGTT--TCAATATTA---CTAAC-GTGTA------AAGTTTGA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGAATGTCGCTA-----AATT----------------------------T--T-------A---C---A--T-----T--CTCTAATGAAATTAAGATGAT-G-------------A------AACGAGTAA-TT--------------------TGCACAT-T-----TTATACACACTTTGGGA--CAAAG--GTGACATTGCAA-TGAAGACAATTTGTAAATTACAAGTTCCAAAA-TCAAA-A-TT-ACACA--C---------------ATT-GGCAT-TTGA---GT---------TAATT--TATAA-GTATTCAGTTGCAACATACAATTTACA--CA---Caactatggcggataaagcccttcatactttacactgtattgattcaaaaaatacttcaatcgtaagt
gi|16 : g-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTTAATTCAGAAGTG--TCAATATTA---CTAAC-ATGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGATTGTC--T-----------C----T--TAATATTCA---C---A--TCA---T--TTT--ATGAAATTAAAATGAT-G-------------A------AATGAGTAA-CT--------------------TGCATAT-T-----CTATCTACACTTTCGAA--CAAAG--GTGACATTTAAA-TGAAAGCAGTTTGTAAATTAAAAGTTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GACAT-CTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA-TTATCCATTTGCAACATACAATTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAAAA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGCAA------------------------AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTCAA-TTATGGCGGATA-ATACCCCTCC
gi|17 : AAAC-AAA-GGTTATCATTAG----AGATTTC--CA--GAAAa
gi|17 : cttactttgcaaatatttctttaatt--T-----------T----T--T-------A---T---A--T-----TATTTC--ATGAAATTAAGATGAT-G-------------A------ACTGGGTAA-CT--------------------TGAACAT-T-----TCATACACATCTATGAA--CAAAA--GTGACATTTTAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GCAATT--TTTAC-TTATCCAGTTGCAACATACAATTTACA--CA---GATGG--AAGT------TAAAA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGAATGTAAT--TTGTAATAACCAA-GTT----AA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTGGA-TTATGGTGGATA-ATA-CCCTCCgttttatattatttcatgaaattaagatgatgaactgggtaacttgaacatttcatacacatctatgaacaaaagtgacattttaatgaatgcaatttgtaaattagaagttgcaatataaaaattacacacatggaagtaagaaattggcatttgagtaaatgcaatttttacttatccagttgcaacatacaatttacacagatggaagttaaaaattgtcattcaaatgaatgtaatttgtaataaccaagttaaaaaatacaataaagcaatctggattatggtggataataccctccata
gi|18 : cttactttgcaaatatttctttaattaaacaaaggttatcattagagatttccagaaagACAAACAAAC-G-----TTATCATTAG----AGATTTC--CA--GGAAG----T----GTATCAAT-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGTAT---ACTTTT--------CAAT-A--G---------GC-AT----TT-GG-ATCGCTTGGACACTACGTTT-GAATT-------AGATGCTCA-AATATCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TT--TTTT----A-ATTATTAATTCA---------ATC--C--TT-TTT-TATCCAT--TTTTCAC-TT-TTCATCTT----TGTT-TAGTAT-T-CTTA-TGata
gi|19 : cgcgctctactttagttctaaattcacttgaaacagttgcaaacttactttgcaaatatttctttaattaattaaaacgacggctttAAGTTTC---C-----AATTATTG----C--TACGTCATAA--T----T--T-------A---A---AG-T-----TA-TTC--ATGTAATTAAGATGAT-GGCATAAATACATGA------AATTTGTAA-CTGCAGCG--------------TGCA-AT-T-----TTATATGC---TTTGAA--GAAAAAAGTAATTTTTTAAGTGAGCG-----------TTATCATTTGCAATA-T-ACA-A-TTTACACA--CATTGCAG-TAAGAA-ATT-GACAT-TTAA---TTCAAC----ATTCTT--TATAG-TTACACAGTTACAACATGTAATTTACA--CA---CAACG--AAGT------ATAAA--CTTGTCATT-TCAGA---GAATGGAATTGTCGT--TAAACAATATT-----A--TAAATACAATAA-GGCAAT-CTGtttatacgtaaaacaagaaga
gi|2 : AACAAACAAAC-G-----TCATCATCAG----AGATTTC--CA--GGCAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAAC-A--G---------AC-CT----TT-GG-ATCGCTTGGACACGACGTTT-AAATT-------AGATGCGCA-AATACCG-ATTTATA--CC--A---T-TAT-TG--TTTT----A-ATTG-------ATTCTTA-CTAT---------------TCCTT--TTTTCGC-TT-TTCAACTT----TGTT-CAGT-T-TGTTTA-TGGA----AAT-TAAA----AATA-CAAATACAT-----TTACAACTA----GTCAT----TGCGT-ATTGTGACATCTCACTTT----AG--ATGAATTTGCATAAGCGT----T-A-TCAAGCTTA-TTT--AGGTCAA--TTT-TACCTTGTACCT--------TTAT--A----TA---TATA------------CG----T-A--AAA---CA----AA-GTAGAAGAA--ATA-----T--TTTAT-ACCCG----TACAT---TTAA-AA-AAA-------A---AAT---C-TGTTCACTGCTTCCTAAAGCTATTTTTGACCATTATGTTACCTATAGGTGACGTCATCT--GGGAAACACATTGGATTGTG-ACAACATCAAACGGCTAACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-T-C-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-ACCACTTAGCG-ACTAAATTCAGA--CG--TCAATATTA---CTAAC--TGTAAATTCTTAG-TTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTATGACTTTC------------TCTAA----G--T-----------T----T--T-------A---C---A--T-----TAGTTC--ATGAAAT----------------------------------GAGTAA-GT--------------------TGCACAT-T-----TTGTACACACTTATGAA--CAAAT--GTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAATTAGAAGTTGCAATA-TAAAA-A-TT-GCACA--CATGGAAG-TAAGAA-ATT-GTTAT-TTGA---GTAAAT----GTTATT--CTTAA-TTATCCAGTTGCAACAAACAA--------------ATGA--A------------------TGTAA-T-T----------TGTA---------ATAACCAA-GTT-----A--AAAATACAATAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGAAA-ATA-CCCTCC
gi|20 : tgcaaacttactttgcaatttttctttaattatttaaaacaactgctaTCTAC-CCAGAAATTCGCATCTT--AGGAACAT----TTTTTATTa
gi|20 : TC-GAATT-------AG-TGCTGATAATGTTGTATTTG--------A---TGTGT-TT--TCTC----C-CTTATCGTTTTATACTTA-CTGTCATC--CTATTT-TATGTTC--TTTT-------TCTATCTT----TATT-CA-------CT------A----AATATAAAATG-AACC-AA--TGCAT-----ATACAACTA----GTCAA----ACCAT-TTTTTGACATATCGATGG----AG--ATGAATTTACA---GCT-----------AA------TTTACAGATCCT--GTC-TACTTTATACGT--------CTGT--A--TTTA---TATG------------TG----------AA---CA--------TATAA-------------TTGATTATTA-TTG----T---T---T-----A-AAA------TA---AACTA-C-tatcgaattagtgctgataatgttgtatttgatgtgttttctcccttatcgttttatacttactgtcatcctattttatgttctttttctatctttattcactaaatataaaatgaaccaatgcatatacaactagtcaaaccattttttgacatatcgatggagatgaatttacagctaatttacagatcctgtctactttatacgtctgtatttatatgtgaacatataattgattattattgtttaaaataaactac
gi|21 : tctacccagaaattcgcatcttaggaacattttttatttaTATA--CT--AATAT-TAT-TT--GTTC----A-GTTATCGTTTAATATTTA-CTATCATC--TC-TTT-TATGTTT--TTTTTAT-------ATCTT----TATT-CA-------CT------A----AAT----AT-G-AATATCCAATGCAT-----GCACAACTT----GTCAT-----ACATTATTTTGACATCTCGATGA----AG--AT--AGCTGTATA----T----T-G-CCATACTTGTTTTTCAGGTCCT--GTC-TTCTATGTACAT--------CTGT--A--TTTA---AAT--------------G----T-G--AAA---TT----TA-ATGGAATAA--ATA-----TTGTTTAA-A-CC
gi|22 : atgctcttatagtgtcgTGAT-G-------------A------AACGTGTAA-CA--------------------TGCTTAT-T-----TTATACACAATTTCGAG--CATAG--GTGACATTTCA--------C-------------CAAGTTGCAATAAC-GAA-A-TA-GCACA--CATGTATA-CAA-AA-AAT-GGCAT-TTTA---ATAAAT----GGAATT--TTTAA-CTATCCAGTTGCAACATACAATTTACA--CA---CAAGG--ACGT------TACAA---TTGCCA-T-TCAAA--TGAATTTAAT--GTGTAATAAAAAA-ATT----AA--CAAATACAATGA-AGAAAT-CTTAA-TTATGGCGTATA-ATA-CCCTCCaaaatg
gi|23 : CAAAC-GAA-A-CTATTTTCAGTCATAG-TTTCTTCATCGAGAT----T----TT--------CAGAGATTTGCATTTTCA--GAACAT-----TTTTATTGTGACAAAC-T--G---------GC-AC----TTAGG-GTTGCTTGGACCTAGTGTTT-CAATT-------AGATGCGCA-AA-AT-G-AGTTGTATTCT--A---T-TAT-TTG-TTTT----A-TTTATCGTTTTATATTTA-CTA-CATC--TT-TTT-TATCCTTAGTTTTCat
gi|24 : cgatctcctttatggctctctaggtaattcgtacatggCAGGCCAAC-GGA-A-TTATTTTCAG----AAATGTC--AA--GGAAT----T--------CA----TAG-TATCTACAT------TGAG-ATTTGACTTT-ATTGTGGTCAAC-A--GTTGAAACGCAC-TT----CA-GG--TCGCTTGGGCACAAT-TTT-GA-------------TACGCA-AATGTT---TTTATATTCT--T---T-TAT-TT--TTTT----CCATAATTGTTTTACTCTTA-CTGCCATC--TT-GTT-TATc
gi|25 : caaaatctcactaatgtcactccagattgattaaacATGTTA-ACAACAGCAAACGGATTGCTCGGATGTTTTCG--CTTGTCTTTACCGCAGTGAGCAAT-------------------ATAAGCGTTCAA-GCCACCTTGTG-CCGAAATTTCAAAGTA--TTAATATTG---CTTAC-TTGTAAATTTTAA-CTATA-AAT-------------TTCTAA--TTC---A-----TATGATGA----CAAT-----------CA---TAGT-------A---CAATA--T-----G--TAA--ATGAAATTAAAA
gi|26 : atgttatctaaacctaATCACTAAGTGACGTCATCT-AGGGATACACATTGAGTTTTT-ACAACAAAAACCAGCATACTCAGATTTCTTCTCATTTTCCCTTATCATAAGTAGCAGTCGTT-TT-T-C-AAA-G-TATCGGCGTTTTA-GCAA--TAGCG-GTTTAAT---------------TATTG---CTAAC-TTGTAATTTCTAAG-TTCA-ACTTCTTAGTTTCAAATTCTAACTTCC---A-----AATTATAA----cacgtgcaattaaaaat
gi|27 : TTAA-ATCAT-G-------------A------AACGTGTAA-CT--------------------TTTACAT-T-----TTATACGCACTTTTGAA--CA-----------TTTCAG-TAAAT----TTTGTAAATTACAAGTAGCAATA-TCAAA-A-CA-ACACA--CATAAAA--TAA-GACATT-GGTAT-TTTA---GTAAAT----GGAATT--AATAG-TTATTTATTTGCAACAAACAATTTACA--CA---CATGT--AAAT------CCAAA--gtgtcta
gi|29 : T-T-T-CTTC-TGAATTTAAAT-TAACA-GCAATA-AAA--GCAT---------GAATA----GTCATATCGTAAAT-ATTGTGATATCTCGGTGG----GG--ATGCATTTATATTAACCA----T-G-TTAACCTTG-TTTTCACATACA--TTA-TACTTTGCACTT--------TTAT--A--Ttataattatatgtttgaaatat
gi|3 : tattctatAACAAACAAAC-GAA-G-TCATCATCAG----AGATTTC--CA--GGAAC----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCAT------------------TCTT-TTGTGGT----------------------T----TT-GG-ATCGCTTGGATACAACGTTT--AATTTAAAAATAGATGCAGA-AATATTG-ATTAAAA--CC----------T-GT--TTTG----A-ATTATTGGTTTATTCTTA-CTTTCGTC--TT-TTT-TATCCTT--GTTT-AC-TT-TTTTCCTA----TGTT-CAGT-T-T-CTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-AC--TACAT-----TCACAACTA----GTCAT----TGCAT-ATACTGACATCTCGATGG----AT--GTGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGTACCT--------TTAA--A--CCCA---TATG------------CG----T-A--AAA---CA----AA-A---AAGAA--ATA-----TTGTTTAT-A-CCA----T---T---TTGA-AA-AAA------TATTGAAGAA-C-TGTTCACTGCTACCTCAAGCTATCTTTGGTCATAGTGTTTTCACCA------------------------ATTAATTTTTT-ACAACAAAAACCGCCTTACTCAGATTTCTTCA--TTTTCCCTTAATGCAGGGAGCGGTCG-T-TT-T-TTAAA-G-TATTGGCGTTTTA-GCCACCTAGCG-ACTTAATTTAGAAGAG--TCAATATT-------AC-T----AAT-------------AT-----GT---AAATTCTAAGTTTT---A-----AATGAT-------------------------------------------------------------------ATTAAGCTAAT-G-------------A------AACGTGTAA-CT--------------------TACACAT-T-----TTATTCTCACTTTAGAA--CAAAG--GTAACATTTCAG-TGAATGCAATTTGTAAATTACAAGTTGCAATA-T-AAATA-TA-ACACA--CATGAAAG-TAC-GA-ATTTGGCAT-CTGA---GTCAAT----GAAATT--TATAA-TTATCAATTTGCAGCATACAACTTACA--CA---CATGG--AAGT------TAAAA--ATTGTCA-A-TAAAA--TGAATGTATT--TTGTAATAACCAA-GTC----AA--CAAATACAATAA-AGCAAC-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCCtggcaaatagcattcaaagtatagtttatatcaatataagtgaaaaa
gi|30 : tatcaacatttatcacTAAATTAAAAGTTGCAATA-T-AAA-A---------------------------ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAA-TTATCCAGTTGCAACATACACTTTACA--TA---CATAG--AAGTAGAAGTTAACA--ATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--TTGTAATAACCAA-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCC
gi|31 : A-AA-GGT-GACAT-TTCA---GTGAAT----GCAATT--TGTAAATTA-CAAGTTGCAATATCAAAATTACA--CA---CATGG--AAGT------TAAAA--CGTGTCG-T-TCAAA--TGTATGTAAT--TTGTAATAATCAA-GTT-----A--AAAATACAAAAA-AGCAATAATGAA-TTATGGAAGGTA-ATA-CCCTTCatca
gi|32 : acattttaaacaaactttcgatcTATTCTTT-CTATTATC--TG-TTTATATCCTA--TTT--AC--T-TTCATCTT----TGTTGCGTT-T-T-CTTA-TGGA----AAA-TAAAA-G-AA---GAAATGCAT-----TTACAACTA----GTTAT----TGCAT-ATTGTGACATATCGATGT----AA--ATGAATTTGCATCAGCTT----T-A-TCGAGCTTG-TTTTCAGGTTTA--TTA-TA
gi|33 : gacaatttataAATTTATA--TTATTAATTTTCAT--T-AAA-T-TT-AGACG--T-TGAAAA-TAAGAA-ATT-AGCAT-TTGA---GTAAAT----GGAATT----------------------CATACCATTCGCA---------------------------AA--ATTGTCA-T-TCAAG--TGAATGTTAT--TTGTAATAACCAA-GTT-----A--ATAATGCAACAA-AGCAAT-CCAAA-TTATAGCGGACA-ATT-CCCT
gi|34 : TTCC--TTTTCCCTTTCCGTATGGAGCAGTCG-T-TT-T-T-TTA-GTTATT-GC-TTTCAGGCAAACTGCCGTAGTT-ACTCAGATGTG-----AGATTG---CTAATACCGCGAATTCAAGGTTCCATGATTCtaa
gi|35 : agattgat----GTCAC----GCCAT-ATTTTGACATCTCGATAG----AG--ATGAATGTACGTGATCTT----T-T-TCAAGCTCG--TTTCAGATCC---TCCGTACTTGGTACCTCTGAGCACTTGT--GATTCGA---T-TA------------CA----C-A--GAAACGCA----AACGT--AAAAA--ATA-----TAATTCA-------------------TTAA-AA-AAG------Ttgcctaaaatcaaaatggtgcttacccattatgattttt
gi|36 : atAACAAACAAA----A-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--ACAAA----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCATATTGAATGAGCAT---ACTTTTATTGTcattaa
gi|37 : agttcttaatactcctgaaacagctacaaacttactttgcaaatagttctttaactaatcaaaaggactccta-AA-TTT-GGCAT-TTTG---GTCAAA----GGAATA--TACAA-TTTCCTAGTTGCAAGATGCA-TTTAAA--CA---CATGG--ACGT------AAGGA--ATCGGCA-T-TTTAG--CGAGTACAGT--TTGCAATAACCAA-GAT----GA--AAA------------CAAT-CTGAG-TTTTGGCAGATGTTTA-CGCTCC
gi|38 : TTTTAA-TGAAA-CA----------TACAAGTTGCAACA-TCAAA-A-TT-GCACAGTTATGGAAGTTAG-AA-GTT---CATATTAA---TTAAAT----GTat
gi|38 : AGTTGCAACATCAAAATTGCA--CAGT-TATGG--AAGT------TAGAA--GTT--CA-TATTAAT--TAAATGT-------GTACTAACCAA-GTT----GA--AAACTGAAATAACAGGA-----GA----ATGGCGGATA-CTA-CCCTgtactaaccaagttgaaaactgaaataacaggagaatggcggatactaccctacat
gi|39 : ttttaatgaaacatacaAGTTGCAACATTCATTTTACA--CA---TATGG--AAGA------AAGAA--ATTGGTT-T-TAAGAGGTAAATG---T--TGGTAATacat
gi|39 : AGTTGCAACA-T-TCA-T-TTTACACA--TATGGAAG-AAAGAA-ATT-GGT-T-TTAAGAGGTAAATGTTGGTAATCGATATAA-TTTGCCATTT--------TGATTTATACCCA---CCTGGTCAGGT------TAAcgatataatttgccattttgatttatacccacctggtcaggttaagcatcacatgacgatga
gi|4 : AACAAACAAAC-GAA-G-TTATCATTAG----AGATTTC--AA--GGAAT----T----CTTTTAAC-CAAAATATTTGTACATTCAATGAGCAT---ACTTTT-TTGTGG--------------------C-TT----TT-GG-ATTGCTTTGTCACGACATTT-GAATT-------GGGTGCACA-AATATCG-ATTGATA--CC--A---TATAT-TT--T-------A-ATTATTGATTTATTATTA-CAATCATC--TT-TTT-TAACCTT--GTT-CAC-AA-TT--TCCT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAA--G-AACA-AA--TGCAT-----TTACATCTA----GTCAT----TGCAT-ATTGTAACATCTCGATAG----AG--ATAAATTTACATGAGTTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGATCAA--TTC-TACCTTGTACCA--------TTAC--A--TCTA---TATA------------CG----T-A--AAA---CA----AA-ATAGAAGAC--ATA-----TTGTTTAT-A-CCG----T---T---TTAATAA-AAA------AA---AAGAA-C-TATTCATTGCTAAGAAAAGTTATTTTTGACCATTGTGTTCCAACTATGTGACGACATCT-CGGGAAACACATTGACTTTTG-ACAACAAAAACCATCTTACTCAGATGTTTTCC--TTTTTTTTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TTGT-C-AGA-G-TATCGGCA-CTTA-GCCACCTAGCG-ACTTAATTTGGAAGTG--TCAATATTA---CTAAC-TTGTCAATTCTTAGTTTAA-AA----AAGTTTCAAATTCTAATTTTC---A-----AATTATGA----C--T-----------------------------------G--T-----C--T----ATGAAATCAAGATGAT-G-------------A------TA-GTGTAA-CT--------------------TGCACAT-T-----TTATACACATTTTCGAA--CAAAG--GTGACATTTCAG-TGAgcatcacatgacgatga
gi|40 : nnnnacaactcgctccacttagttctaaattcactcagcagcgtcaatatttgctaataatatttctttagtcaaaacgaccattacggctatccacactgttcac---CATGG--CCGT------TAAAA--ACTGTCA-T-TTAAA--TGAATGTAAC--TTGTAATTACCAA-GTT----AAACAAAATACAATAA-AACAAT-CTGAA-TTAT----GATG-ATA-CACTCCc
gi|41 : attatccacctttccaacaaccgggccGATGG----GG--ATAAATTTACACAAGCTT----T-T-TTAAGCTAG-TTTTCAAATCCAGTTTA-TACTTTCCAC------------AC--A--TTTA-------------------------T-G--AAA---CATTTTAG-GT--AAGAA--ATA-----CTGGTTA---------------T---TTAA-AACAAA------TT---AAat
gi|42 : gaatat-AA-AAT------TA---AAAGA-AGTGTTCACTGCTACTTTAAGCTACTTTTGACt
gi|42 : gaaaagggTTGCCGTAGGGAGCAGTCG-A-TT-T-CAAAA-G-TATCaaaatcaaaaggattgccgtagggagcagtcgatttcaaaagtatcatc
gi|43 : gaaaagggaaaattaaaagaagtgttcactgctactttaagctacttttgacaaaatcaaaaggaAACAAGCAGAA-G-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--ACAAG----T----GTATCAAC-CCAGATATTTGCACATTGAATGAACAT---ACTTTTATTGTatc
gi|44 : --ATGAATTTACATAAATTT----TTG-TTAAACATG-TTTTCAAATCCA--TTC-TTCTTTGTATCT--------TTTT--A--TATA---T
gi|45 : tgtggcAAA--TTTGCCA-T--CAAA-----ATGT--T--TTC------CCAA-GTC----AA--AAA-TGAAACAA-AACAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-TTA-CCCTCCcggacaaaaa
gi|47 : ttAAA--ATT--CA-T-T-------GAATGTAAT--TTGTAATATCCAA-GTT----AA--AAA-TATAATAA-AGCAAT-CTCAA-TCATGACGGATA-gta
gi|48 : gtcAT----T----GTATCATC-CCGGAAATTTGCATATC---T-AGCAT---ACTTTTATTGTGGTCAAC-A--A---------GT-TT----TT-TG-GTCGCTTGAATAgat
gi|49 : tTTTCATATCCA--TTC-TACCTTGCAATT--------GTAT--T--GTTA---TATA------------CG----T-A--AAG---CA----CT-ATCGAAGAA--ACA-----a
gi|5 : tgtctgAACAAAC-AAATG-TTATCATCAG----AGATTTC--CA--GAAAT----T----GTTTTTAC-CCAGATATTTGCATATTGAAAGAGCAT---ATTTTTATTGTGATCAACCA--G------------TT----TT-TG-ATTGCCCGGACACAATGTTT-ACATT-------AGACGCGCA-AATATCA-AATGATC--CC--A---T-T-T-TT--TTTTGTCAA-ATTGTTGATTTATTCTTA-CATTCATC--TT-TTT-TATCCAT--GTT-CAT-TT-TTCATCTT----TGTT-CAGT-T-TTCTTA-TGGA----AAT-TAAAA-G-AACA-A---TGCAT-----TTACAACTATCTAGTCAT----TGCAT-ATTGTGACATCTTGGTAG----AT--ATGAATTTGTAGAAGCTT----T-A-TCAAGCTTG-TTTTCAGGTCCA--TTC-TACCTTGCACTT--------GTAT--A--TCTA---TATA------------CG----T-A--AAG---CA----AA-GTAGAAGAA--ATACCCTATTGTTTAT-A-CTG----T---T---T-AA-AA-AAACAT---TA---AAAGAAC-TATTCACTGCTACCTTAAGCTATTTTTTACCATTGTGTTACCACTAGGTGACGTCATCT-GGGGAAACTCATTGTTTTTTTTACAACAAAAACCAACTTACTCTGATTTCTTCC--TTTTTCCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TAGCTGCATTTTA-ACCACATAGCG-ACTTAATTCATAAGTG--TCAATATTA---TTAAT-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAATTTTCAAATTTTAAGTTTC---A-----AATTATGA----C--TGG---------C-------------------------------------C--ATGAAATTAAAATGAT-G-------------A------AATGTGTAA-CT--------------------TGCACAT-T-----TTATACACACTTTCCAA--CAAAA--ATGA
gi|50 : cAG-AA-AAT------TA---AAAGAAC-GGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTATTGAC
gi|51 : aaagCCAC-GTC----GA--AATGTGAAATAA-AATAAT-CGAAG-TTACGGCGGATA-TCA-TCCTCCatcaaatggattac
gi|52 : TGACGTCATCT-GGGG-AACACATTGGATata
gi|6 : ----AA-GTAGAAGAA--ATA-----TT--TTAT-AACTG----TCC-T---TTGA-AA-AAAAGAAATTA---AATAA-C-TGTTCAATGCTACCTAAAGCTATTTT-GACCATTGTGT-----------GATGTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAATATCAATCGGCTAACTCACATGTCTTCC--TTTTACCTTACCGTAGGGAGCAGTTG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG-ACTTAATTCAGAAGTG--TCAATATTAATACTAAC-TTCTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGA----C--TGTCTCTAAATGT----T--T-------A---C---A--TAA---T--TTA--ATAAAATTAAGATGAT-G-------------A------AATGAGTAA-CT--------------------TGCATAT-T-----CTATCTACACTTTCGAA--CAAAG--GTGACATTTTAA-TGAAAGCAATTTATAAATTAAAAGTTGCAATA-T-A------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--CTTAG-TTATCCAGTTGCAACATACAATTTACA--TAGTACATAG--AAGT------TAAAAAAATTGTCA-T-TCATA--TGAATGTAAT--TTGTAATAACCAA-GTT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCAAATA-ATA-CCCTCCgtgtctgtgatgtcatc
gi|7 : ----AA-GTAGAAGAA--ATA-------ATTTAT-AGCCG----T---TCTTTTAA-AA-AAGAAAT--TA---AATAA-C-TGTTCACTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCAAAAGGTGACGTTATCTTGGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAATCGGCTTACTCACATGTCTTCC--TTTAATCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTTA-GCCACATGGTG-ACTTATTTCAAAAGTG--TCGATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTGTCAAATTCTAAGTTTC---A-----AATTATGA----C--TGTCTCTAAATGT----T--T-------A---C---A--TAG---T--TTT--ATGAAATTAAGAGGAT-G-------------A------AATGAGTAA-CT--------------------TGCATTT-T-----CTGTCTACACTTTCGAA--CAAAG--GTGACATTTAAA-TAAAAGCAATTTGTAAATTAAAAATTGCAATA----------------------------TAA-AA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATA--ATAAA-TTATCCAGTTGCAACGTACACTTTACA--TA---CATAG--AAGT------TAAAA--AGTGTAA-T-TTATA--TGAATGTTAT--TTGTAATAACCAT-ATT----AA--AAAATACAATGA-AGCAAT-CTGAA-TTATGGCGGATA-ATA-a
gi|8 : TAA-AA-CAA------GA---AGAAA-T-ATTTCTCTGCTACCTAAAGCTATTTTTGACCATTGTGTTACCA-TGGGTGACTTCATCT-GGGGAAACACATTGGATTTTG-ACAACATCAAACGGATTACTCAGATGTTTTCC--TTTTCTCTTACCGTAGGGAGCAGTCG-T-TT-TTC-AAA-G-TATCGGTGTTTAA-GCCACCTAGCG-ACTAAATTCGGACGTG--TCAATATTA---CTAAC-TTGTAAATTCTAAGTTTTA-AATTCCAAGTTTCAAATTCTCAGTGTC---A-----AATTATGA----T--T-----------T----T--TT------A---T---AAGT-----T--TT-------ACTTTATTTGAT-G-------------A------AATGAGTAA-CT--------------------TGCACAT-T-----TTATACACACTTATGGA--CAAAG--GTGACATTTAAA-TGAATGCAATTTGTAAGTTAGAAGTGACAATA-T-AAA-AATT-ACACA--CATTGAAG-TAAGAA-ATT-GGCAT-TTGA---GTAAAT----GTAATT--TTTAA-TTATCCAGTTGCAACATACAATTTACA--CG---AATAG--AAGT------TAAAA--ATTGTCA-T-TCAAA--TGTATGTAAT--TTGTAATAACCAA-GTTAAAAAA--AAAATACAATAA-AGCAAT-CTAAA-TTATGGCGGATA-ATA-CCCTCC
gi|9 : atacgAACAAATAAAC-GAA-G-TTATCATCAG----GAATTTA--CA--GGACT----T----GTTTTAAC-CCAGATATTTGCATTTTAAATGGGCAT---AATGTTGGTGTGGTCAAC-A--G---------AC-TT----TT-TG-ATCTCTTGAACACAACGTTT-GAATA-------AGATGCACA-AATATCG-ATTCATA------------TATATT--TTTT----A-ATAATAG--------------ACCATC--TT-TTT-T-TCC-T--TCTTCACAGTGTTCGTA------TGTT-CAGT-T-TCCTTA-TGGA----AAT-TAA-----AACA-ACAATGTATTAATGTTAAAACTA----GTCAT----TGCAT-AGTTTGACATATCGATGG----GG--ATGAATTTGCATAAGCTT----T-A-TCGAACTTG-TTTTCAGGCCCA--TTC-TACCTTGTACCT--------TTAT--A--TCCA---TATA------------CG----TAA--AAA---CA----A----AGAAGAA--ATA-----TTGTTTAT-A-CCG--------T---TTAA-AA-AAA------TATTTAATAA-C-TTTTGACTGCTACCCAAAGCTATCTTTGGCCATAGTGTTACCACCAGGGTACGTCATCT-TGGGAAAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): AAATCTCAAATTTTACTCGCGCACCACAGACTAAAATGCAGTTCACCTACGCATCAACTCATCGAAAATCTATAATAGAAAATTGTGGAATACCAGAAACAACTAGATACAGTTTCTTTTTTATTCTCTTAAATTCACTCAGTAACGACAAATTTTTTTCAATATTCCATGTCCACTTCTCAAAAAAAAAATTCT
Unaligned ( gi|46 ): ATTTAGTTCTAAGTTCACTCAACAGCAGCAAACTTACTTTGCTAATATTTCTTTTATCAAAATGACTTTTATGGCTAAC
Unaligned ( gi|53 ): GAGGAGTGAAGTTGTCCTGTATTACTCACCATAGTAAAC