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lowQualScore : 5 5 5555555555555555555555555555555555555555 7 0 7 0 3 0 0 0 0 0 000 5 55555555555555 33333333 7 0 7 00 7 7 77 7 0 00 77 7 3 0 77 7 7 0 3 77777 77 7 3 000 8 00 22222222222222 0 0 0 44 0 77777777777 666666 6 000000000 88888888 000 8 888888 5 0 2 0 8 0 7 44 4 888 4 1 8 9 1 5555 2 11111111 6666 0 00 99 0 9 88 0 4 6666 99 1 4 0 0 0 55555 0 111111111111111111111111111111111 8 22222 0 1 9 4444 4 7 4 3 4 4 4 11 11 4 4444 1 5 55 55 55 11111111111111111111111 8888 0 6666666 3333333333333 6666666666 00 00 555555 55 6 6 6 2 4 5555 55 666 6 0 6 7777 66 6 2 33 6 88 4 5 1 22 33 1 666666 8888888 888 666666 88 888888 77777 22 1 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444444 222222 7777777777777 99 77777 1
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Reference ( family-2562 ) : ATCATCGCCATCATCATNTTTANTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------------ATATAATCAAGCACGTGTCGGTGTGATAATATATTTAGAGGTACCTCTTATATTGGATTACAGAAAGAAGTACAAAATATNATATAATATTGCATATGCGCCTCACTTATATACATTTACCATGCAAACACAATTCTTTNCAATATTACAAGATACGATTTATATCATAGCAAATGTTCATAATTNAAACATATCGTTCATGCAATAAACCATCACAATATAATATACTATNTATGTACACTTTATCGCCAACACCCCGTGGAGAATTG-----TTGCCCCTAGGACATTTGCCGCTTCCCTTTAATTCCCAAATATACAAATTGTCAGCCAATCAGTAATTATCAGCCAGCATTTACTACAAAACAAGGACTTGTATCTTTATATAATTCCTT--GTTACAA-AGGATTAAAAGGATTAGAT--GAA-AATT-ACTTAAA-TGCAATAGGATTAAAATCATTTATAAATTAGAA-TTTTAAAATAAAAG---TATAATTAAAATAATA-G-TTTCTTGTAATTCTATTTAAAATGTGCACTAAAACTGTAATTTATTAAGAAACTGAAATTATATTATGGGCACT----TA-ATCGCGCCAATTTAGAAAATTATTTAAAAAAAACG-AGTATCACATT---------TGATCATA-TTATATGCTAGACAGAG---ACTAGAGAGACAATACAGATAACAACATAGTAGGTANCCTCCAGGACAGGCACTTTCCGTTCAGTATGAATATTGCTAAATGTGACCGATGCAACATTTGTCACACCTCACACTCACCTGTTAATTGCTCATTGATTAGTTAGAACC-AGATGTACAAACTAATTAAAAAATGTATCATGTAC-TTATTGGCATTT---ACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAAGACTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATATTATGTAATTCGACGTCGTTACGCGAAACGTCTGCAAAAACACCAGTGTTTGAAGAAA---NGTTCTACAGAAA--------TATTTTATAAAACTA----TTGATTCATTTTT--TTATAATAACAGTTATTTA-TTCCTTCTNAAGAAGTCTTAT-GCATAATAAC----AT--CCTTTTTTAATTCCTAATAC-TTAATAA-AATACATAAAAATATAAATACAATG-----ACCATAGA-AT-T-------------------TTTTTTTTAT--AANTTTTAAGCAATTCTATGTGCATGTACGTATTTTACCCCATAACACAA----TTTAAATTGCTTTATAACTTCATG-AAAAGACAAGAAATAAAGACGAT-AAATGTCCC-CGATAATCTCCC-CGGGTGGGCGTCATAACAACGATATAAATTACCGTGC--GGTAATC--TGGAATAT-GTACAGTCA----CGAGAAATCCCGA--AGGTTGCCGAT--GTTTGCCG--ACTTGTA-----------------TTTTAAA---A-A----A-T----TTTTA-------------ATAAA----------A--AT--A------ATATCAATGGAAAG--CTTAATAAAATATC-TT-GTT-ATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTTGGAGATAA----AATATCCAGTTTCTC--C--CAAA-AANT-TCT----TCA--TT-TTGTA-A-TAGAAC--ATATAGAGAAATTGGGTGATTGTCTTAAATC-TT--AAAA--AG-GACCAAAAA------TTAAT-------TAAT---TTAAA------ATTATG-AAAAAATA--ACCAACTTG-T---A-G-G-----------G-------------ACATTT-TA----------------AA----------------GTAC-AAATTTGATA------TT-------------TT--AAACGGTTATTGATTTAT-----GAAGATTAAACTAAA-ATCGTCCTTCTTTGTTTATA
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gi|10 : TATGTAATTCGATGTCGTTTCGCGAAAGGTCTGCATAAACACCAGTTTTGGAAGAAA---AGTTATACAGAAA-------------------ACTA----TCGATTC--TTTT--TTATAACAACAGTTATTAA-GTCCATCTTAAGAGGTTTTAT-GCATAATAAC----AT--CCTTTTT-AATTCCTAATAC-TTAATAAGAATACATAAAAATATAAATACAATG-----ACCATAGA-AT-TGTCGTGTTTTTTTTGTGTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTGATAAACT---TGTGCGTGTACTTATTT-ACCCCATAACACAA----TTTAAATTGCTTTATAATTTCATG-AACACACCAGAATTAAAGACAAA-AAATGTCCC-CGATAATCTCCC-CGGGTGGGGATCATAATAACGATATAAATTACCGTGC--GGTAATA--TGGAATAT-GGAAATTCA----CGATAAAAACTGA--AGGTTGGCGAT--GTTTGCCG--ACTTGAA---------------------AAA---A-A----A--------TAA-------------ATAAA----------
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gi|11 : aatatgtaattcgatgtcgtttcgcgaaaggtctgcataaacaccagttttggaagaaaagttatacagaaaactatcgattcttttttataacaacagttattaagtccatcttaagaggttttatgcataataacatcctttttaattcctaatacttaataagaatacataaaaatataaatacaatgaccatagaattgtcgtgttttttttgtgttttttttttgtttgttttttgataaacttgtgcgtgtacttatttaccccataacacaatttaaattgctttataatttcatgaacacaccagaattaaagacaaaaaatgtccccgataatctccccgggtggggatcataataacgatataaattaccgtgcggtaatatggaatatggaaattcacgataaaaactgaaggttggcgatgtttgccgacttgaaaaaaaataaataaagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccagagagatAAAATGTATCATGTAC-ATTTTGGCATTT---ACCAAATAAATACATGGATTCTGTCTCGAGACTTAAGGCTACGATTAATTGTTATAAGACATT---------------GTTACACGAAACAACTGCAAAAAAAA-AGTGTTTGAAGAAA---AGTTCAACAGAAA--------TATTTTATAAAACTA----TTGATTCATGTTT--TAATAATAGCAGTTATTTA-TTCCTTCTAAAGAAGTGTTAT-GTA-AATACC----AT--CCTTTTT-AATTCCTAATAC-TAAATAA-AATACATCAAA-TATAAATTCAATG-----ATTAAAGC-AT-T-------------------TTTTAAAAAT--AATTTTTAAGCAATTCTTTGTGCATGTACGTATTTTACCCCATGGCACAA----TTTAAATTACTATATAACTTCATG-TAAAGTAAAGAAGTAAAGACAATAAAATGTCCC-CGATAATCTCCCAAGGGTGGGCATCATAACAATGATATAAATCACCGTGC--AGTAATC--TGAAATAT-GT--AGTCA----TGAGAAAT-TTGA--AGGTTGTCGAT--GTTTGCCA--AC----------------------CTTTAAA---A-A----A-
gi|12 : ATGCCGA--AGGTTGCCGAT--GTTTGCTG--ACTTGTAAAATAATACAGTTATGTTTCTAAA---A-A----AGT----GTTTAAAGGACCAAAAGGATAAACTCTTATTTTA--AT--AAAAATAATATCAATGGAAAG--CTTAATAAAATATC-TT-GTT-ATGCTGAT-ATTACAAATTCGGAATGATGTGGTTGAAATATGGTGTTGGAGATAA----AATATCCAGTTTCTC--A--AAAA-AAAG-TCT----TCC--TT-TTGTA-A-T-GAAC--ATATAGAGGA--------ATTGTCTTAAATC-TT--AAAA--TA-GACCAAAAA------ATAAT-------TAAT---T----------ATTAAA-AAAAAATA--ACCAACTTG-T---ACA-G-----------G-------------ACATTT-TAAACATTTTATGAT---AA----------------GTAC-AAATTTGATA------TT-------------TT--AAATGGTTATTGATTTAT-----AAAGATTAAACT-AA-ATCATCCATCTTTGTTTATAatatagtagtgtttctaaaaaagtgtcaaaaggaccaaacacataaactcttatt
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gi|14 : taTATCATTAGTT-AT--TGATAA------ATTTGGAA--GCATGGT-GGAGTATGATGTTTGAAATTATTATAATATCCAGTTTGCC--C-------AACT-TTTCCCATCA--TT-TT----A-TAGAAT-------------TTAGTTGATCGACTTAAATA-AA--AAAA--AG-GACCGACAT------TTGAT-------CAAT---CTAAA------ATTATG----AAAT-------TCTT--T---A-G-G-----------GATTTTAAACA---ACATTT-TATGAC------------AA----------------GTAC-AGATTTGATA------TTTAACTTTGATATCTT--AAATGTTTATTGATATAT-----TAAGAGTAAAC-AAG-ATGGTCATTCTTTGTgtaaaaatattatcggattttcacgtgacaccgatatagaaactttggta
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gi|16 : -----TTGCCCCTAGGACATTTGCCATTTCCCTTTAATTCTCATATGTAGAAACTGTCAGCCAATCAGTAATTATCAGCCAGCACTTACTACAAAA----GA-TTAGA----TGGACAA-TACTTAAATTACAATAGGATT----------------AA-AATC-ATTT--A-TG-AAT----TTGAAATT-----TAAA-----------AAAATATA-----TATAATTAAAATAATA-G-GCTCTTGTAATTCTATTTAAAATGTGCACTAAAACTGTAATTTATTAAGAAACTGAAATTATATTATGG
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gi|21 : ATTATCGCCATCATCATCTTTAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATAATCAAGCACGTGTCGGTGTGATAATACATTTAGACGTA--TTTTATAtgtaaaaatgttatcggatttttacgcgacattgatatcgaaagtcgggta
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gi|1 : ATCATCATCATCATCATATTTATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------------ATATAATCAAGCATTTGTCGGTGTGATAATATATTTAGAGGTACCTCTTATATTGGATTACAGAAAGAAGTACAAAATATTATATAATATTGCATATGCGCCTCACTTATATACATTTACCATGCAAACACAATTCTTTTCAATATTACAAGATACGATTTATATCATAGCAAATGTTCATAATTTAAACATATTGTTCATGCAATAAACCATCACAATATAATATACTATTTATGTACACTTTATCGCCAACACCCCGTGGAGAATTGGTAATTTGCCCCTAGGACATTTGTCACTTCCCTTTAATTCCCAAATATACAAATTGTCAGCCAATCATTAATTATCAGCCAGCATTTACTACAAA-CAAGGACTTGTATTTTTATATAATTCCTT--GTTACAA-AGGATTAAAAGGATTAGAT--GAACAATTTACTTAAAATGCAATAGGATTAAAATCATTTATAAATCAGAA-TCTTAAAAAAAAAGAAGTATAATAAAAATAATA-G-TTTCTTGTAATTCTATTTAAAATGTGCACTAAAACTGTAATTTATTAAGAAACTGAAATTATATTATGGGCACTCACTTA-ATCGCGCCAATTTAGAAAATTATTAAAAAAAATCA-AGTATCACATTATTAAATTTTGATCATAATTATATGCTAGACAGAG---ACTAAAGAGACAATACAGATAACAACATAGTAAGTATCCTCCAGGACAGGCACTTTCCATTCAGTATGAATATTGCTAAATGTGACCGATGCAACATTTGTCACACCTCACACTCACCTGTTAATTGCTCATTGATTAGTTAGAACC-AGATGTACAAACTTATTAAAAAATGTATCATGTAC-TTATTGGTATTT---ACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAAGACTGAAGGCTGCAATTAATTGTTATAAGATATTATGTAATTTGGCGTCGTTACGCGAAACATCTGCAAAAACACCATTGGTTGAAGAAA---TGTTCTTCAGAAA--------TATTTTATAAAACTA----TTGATTCTTTTTT--TTATAGTAACAGCTATTGA-TTCCTTCCAAAGAAGTATTGT-GCATAATAAC----AT--CCTTTTTTAATTCCTAATAC-TTAATAA-ATTACATAAAAATATAAATACAATA-----AACATAGA-AT-T-------------------TTTTTTTTAG--AATTTTTAAGCAATTCTATGTGCATGTACGTATTTTACCCCATAACACAA----TTTAAATTTCTTTATAACTTCATG-AAAAGACAAGAAATAAAAACGAT-AAATGTCCC-CAATAATCTCCT-CGGGTGGGTGTCATAACAACGATATAAATTACGGTGC--GGTAACC--AGGAATAT-GTACAGTCA----TGAGATATCCCGA--AGGTTGCCGAT--GTTTGCCA--ACTTGTA-----------------TTTTAAT---A-A----A-T----TTTTA-------------ATAAA----------A--AT--A------ATATCAATAG--AG--CTTAATAAAATATC-TT-GTT-ATGCTGATCAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTTGGAGATAA----AACATCCAGTTTCTC--C--CAAA-AAAT-TCT----TCA--TT-TTGTATATTAGAACATATATAGAGAAATTGGGTGATTGTCTT-AATC-TT--AAAA--AG-GACCAAAAA------TTAAT-------TAAT---TTAAT------ATTATG-AAAAAATA--ACCAACTTG-T---A-G------------------------------------------CTCC------------------AGGAC-AA-ATTTGATA------TT-------------TT--AAACAGTTATTGATTTAT-----GAAAATTAAACTAAA-ATTGTCCTTCTTTGTTTATA
gi|10 : TATGTAATTCGATGTCGTTTCGCGAAAGGTCTGCATAAACACCAGTTTTGGAAGAAA---AGTTATACAGAAA-------------------ACTA----TCGATTC--TTTT--TTATAACAACAGTTATTAA-GTCCATCTTAAGAGGTTTTAT-GCATAATAAC----AT--CCTTTTT-AATTCCTAATAC-TTAATAAGAATACATAAAAATATAAATACAATG-----ACCATAGA-AT-TGTCGTGTTTTTTTTGTGTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTGATAAACT---TGTGCGTGTACTTATTT-ACCCCATAACACAA----TTTAAATTGCTTTATAATTTCATG-AACACACCAGAATTAAAGACAAA-AAATGTCCC-CGATAATCTCCC-CGGGTGGGGATCATAATAACGATATAAATTACCGTGC--GGTAATA--TGGAATAT-GGAAATTCA----CGATAAAAACTGA--AGGTTGGCGAT--GTTTGCCG--ACTTGAA---------------------AAA---A-A----A--------TAA-------------ATAAA----------
gi|10 : aaA---A-A----A-TCTTATTTAA-------------ATATC----------A--AT--A------ATGTCATTGGAAAG--TTTAATACAATATC-GT-GTT-ATGCTAATAAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGTGTCGGAGAgtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccagagagataaaatcttatttaaatatcaataatgtcattggaaagtttaatacaatatcgtgttatgctaataagtacaaatttggaataatgtggttgaaataaggtgtcggaga
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gi|12 : ATGCCGA--AGGTTGCCGAT--GTTTGCTG--ACTTGTAAAATAATACAGTTATGTTTCTAAA---A-A----AGT----GTTTAAAGGACCAAAAGGATAAACTCTTATTTTA--AT--AAAAATAATATCAATGGAAAG--CTTAATAAAATATC-TT-GTT-ATGCTGAT-ATTACAAATTCGGAATGATGTGGTTGAAATATGGTGTTGGAGATAA----AATATCCAGTTTCTC--A--AAAA-AAAG-TCT----TCC--TT-TTGTA-A-T-GAAC--ATATAGAGGA--------ATTGTCTTAAATC-TT--AAAA--TA-GACCAAAAA------ATAAT-------TAAT---T----------ATTAAA-AAAAAATA--ACCAACTTG-TAC-A-G-GACATTTTA---A-------------AC------------ATTTTA------------TGATAAGTAC-AA-ATTTGATA------TT-------------TT--AAATGGTTATTGATTTAT-----AAAGATTAAACT-AA-ATCATCCATCTTTGTTTATAatatagtagtgtttctaaaaaagtgtcaaaaggaccaaacacataaactcttatt
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gi|14 : taTATCATTAGTT-AT--TGATAA------ATTTGGAA--GCATGGT-GGAGTATGATGTTTGAAATTATTATAATATCCAGTTTGCC--C-------AACT-TTTCCCATCA--TT-TT----A-TAGAAT-------------TTAGTTGATCGACTTAAATA-AA--AAAA--AG-GACCGACAT------TTGAT-------CAAT---CTAAA------ATTATG----AAAT-------TCTT--T---A-G-G-----------GATTTTAAACA---AC------------ATTTTA------------TGACAAGTAC-AG-ATTTGATA------TTTAACTTTGATATCTT--AAATGTTTATTGATATAT-----TAAGAGTAAAC-AAG-ATGGTCATTCTTTGTgtaaaaatattatcggattttcacgtgacaccgatatagaaactttggta
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gi|16 : -----TTGCCCCTAGGACATTTGCCATTTCCCTTTAATTCTCATATGTAGAAACTGTCAGCCAATCAGTAATTATCAGCCAGCACTTACTACAAAA----GA-TTAGA----TGGACAA-TACTTAAATTACAATAGGATT----------------AA-AATC-ATTT--A-TG-AAT----TTGAAATT-----TAAA-----------AAAATATA-----TATAATTAAAATAATA-G-GCTCTTGTAATTCTATTTAAAATGTGCACTAAAACTGTAATTTATTAAGAAACTGAAATTATATTATGG
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gi|21 : ATTATCGCCATCATCATCTTTAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATAATCAAGCACGTGTCGGTGTGATAATACATTTAGACGTA--TTTTATAtgtaaaaatgttatcggatttttacgcgacattgatatcgaaagtcgggta
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gi|5 : a----TTTTA-------------ATTAA----------A--AT--A------ATATCAATGGAAAG--CTTTATAAAATATC-TT-GTT-ATGCTGATAAGTACAAATTCGTAATAATGTGGCTGAAATATGGTGTTGGAGATAA----AATATCCAGTTTCTC--C--CAAA-ACTT-TCT----TCA--TT-TTGT--A-TAGAAC--ATATAGAGAAATTGGGTGATTGTCTTAAATC-TT--AAAA--AA-GACCAAAAA------TTAAT-------TAAT---TTAAA------ATCATG-AAAAAATA--ACGAACTTG-T---C-G-AC----------G-------------AC------------ATTTTA-------------GATAAGTAC-AA-ATTTGATA------TT-------------CT--GAACGGTTATTGATTTAaatatagtaatgtttctaaaaaagtgttaaaaggaccaaagagataaactcttgttttaattaaaataatatcaatggaaagctttataaaatatcttgttatgctgataagtacaaattcgtaataatgtggctgaaatatggtgttggagataaaatatccagtttctcccaaaactttcttcattttgtatagaacatatagagaaattgggtgattgtcttaaatcttaaaaaagaccaaaaattaattaatttaaaatcatgaaaaaataacgaacttgtcgacgacattttagataagtacaaatttgatattctgaacggttattgatttaaatttaatttggttattttggtttaaaagatacgatta
gi|6 : acgattaattgttatatgatattatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgaaaaagcaccagtgtttgaagaaatgttctacagaaatattttataaacctattgattcatttttttataataacagctatttattttcttctaaagaagtcttatgcataataacatccttttttaattcataataattcataaaatacataaaaatataaatacactgaccatagatatatttttttttataaattttaagcaattgtatgtgcatgtacgtattttaccccataatacaatttaaactgctttataacttcatgaaaaagacaaaaaataaagacgataaattttccaaaataatctccccgggtgggcgttataacaacgatataaattaccgtgcggtaatctggaatttgtacagtcacgagaaatcccggagattgccgatgtttgccgatttgtaaaaaaaaatatagtaatgtttctaaaaaagtgttaaaaggaccaaagagataaactcttgTATAATCAAGCATGTGTCGGTGTGATTATATATTTAGAGGTATCTCTTATATTGGATTACAGAAAGAAGTACAAAATATAATATAATATTGCATATGCGCCTCACTTATATACATTTACCATGCAAACACAATTCTTTACAATATTATAAGATACGATT-ATATCATAGCAAATGTTCATAATTAAAACATATC-TTCATGCAATAAACCATCACAATATA---TATTATGTATGTACACT--------------CCGTGGAGAATTG--------CCCCTAAGACATTTGCAGCTTCCCTTTAATTCCCAAATATACTAATTGTTAGCCAATCAGTAATTATCAGCCAGCATTTACTACAAAATAAGGACTTGTATCTTTATATAATTCCTT--GCTACAA-AGAATTAAAAGGATTAGATAAAAA-AAAT-ACTTAAATTGCTATAGGATTAAA--CATTTATAAATTAGAT-TTTTTTTTTAAAAG---TATAATTAAAGTAATA-GTTTTCTCGAAACTCTATTTAAAATGTGCACTAAAACTGTACTTTATTGAGAAACTGAAATTATATTATGGGCACC----T---TCGCGCCAATTTAGAAAATTATTTAAAAAAAACG-AGTATCACATT---------TGATCA----TATATGCTAGACAGAG---ACTAGAGAGAT-GTACAAAaatttaatttggttattttggtttaaaagatacgatta
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