lowQualScore : 111111
lowQualScore : 2 1 77777777 2222222222222 2222222222222222222222 111111111111 444444444444444 222 1 3333333333 11 1111111 222222222222222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 22 1 66666666666 1 333 2 1 11 222 22 333 11 555555555 333 1 222 1 2 1 2 111111 1 1 666 1 4 1 1 3333333 1 1 11
lowQualScore : 0 6 5 66666666 0 1111111111111 1111111111111111111111 999999999999 2 222222222222222 777 0 55555 5 2 333 555 22 7777777777 55555 11 2 1 444 5555 2 9999999 2 88888 333 777 666 333 444 3 222222222222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 55 4 2 7 55 5 33333333333 6 2 4 7 4 555 0 3 6 5 55 66 111 3 4 77 555 88 222222222 2 3 222 4 4 4 6 5 111 4 3 5 0 88 3 0 0 555555 7 6 5 111 7 0 7 6 5 6666666 5 3 88 6
lowQualScore : . . . ........ . ............. ...................... ............ . ............... ... . ..... . . ... ... .. .......... ..... .. . . ... .... . ....... . ..... ... ... ... ... ... . .................. ................................................................... .. . . . .. . ........... . . . . . ... . . . . .. .. ... . . .. ... .. ......... . . ... . . . . . ... . . . . .. . . . ...... . . . ... . . . . . ....... . . .. .
lowQualScore : 0 0 0 00000000 7 8888888888888 5555555555555555555555 333333333333 5 111111111111111 222 0 77777 3 8 999 777 99 6666666666 00000 66 0 4 111 2222 4 4444444 9 33333 999 888 111 999 111 6 111111111111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 0 3 3 33 0 33333333333 0 5 0 0 0 000 0 0 0 0 55 55 000 0 0 55 000 00 555555555 5 0 555 0 0 0 0 0 555 0 0 0 0 55 0 5 0 000000 0 0 0 000 0 0 0 0 0 0000000 0 3 33 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGANTATTAT-GCGNGTGTGATGTTAGTGTGAATGGT--GA-------TG---CT----GCTGCTG------------ATGATGA-TG----------T----GTGTGAG-TGTTAGTGTGAATGGTGATGT----T-GCTG---CTG--NT--GATGATGA-TG-T---AT-----GTGTGA--TGTTAGTGT-GAATGG---TGATG-TT-GCT-G-----CTGCTGNT----GATGATG---AT---G---TG---TGTGA---TGTTAGTGTGAATG-----GTT----------ATG-------AT------GC---------------TGC---------TG------TG-TG----------TG--ATG-TTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAANAANTCAATTGTATTNTCTATAGATTTACTCTCNTCTACCTGTACAGTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNNGCTGTACAGCNNAACAGAATTATGTGGAGATCACAATAACAAAAANANCTTTGAAAAGTTATTACCTTAATNTGATGCCTGTCAACATGTAGATGNCTNAGTCCACCACTTNAANCACAGGNAACACTCTCCTTTAGATAAGAATTAAGTGNCNCAAGAAGTAGGTATTGNGCTTNANCAGTTTCTGTCCACAATGAAAGTAAGGAAC------TATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTAAAAAACCAGAAATATCTGATTATTTTTTTCTGAACTCTCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATNNNAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
Reference ( gi|1 ) : CACGATGTTATGCAGTTAATTTTAGTGAATAGCAACGTCAACATCTTAACTGATATAAAAGATTTTGCATTCATTCAATATAAAATAAAGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCTTGTTTATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAGGGATTGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAAGTTGTCTTCTAAAATACCGCATAATCACTAGCGTTAACGATGATATATAGTTTCGGGTACTTTTTCATATCGCCCATATCATGTTGTAACATAATAGCTCTCTGTTTAAAATTCAGTAGACAGTCAGTTCAAAGTTCAGCAGACAGTCACGTGATTTGTGTATGTAAAAGCTTACGATTCAAATTGCTATGGGACACAACTTAACCTAACTGCACAAATGCAGGGTGTGTATTATCATATATGTTAATGAATGTGTTGAAGGTTGAAAAACTAATTCAAATTGTAATATTGTGATGTAAATAACTAGCTGTTTGATCATAGACACAATGAACATAATAAATATATTTGATACTAGTATTTCAAAGGTGTAAATAAAGATTGTATCTATACTTTGTATTTAAATTTTGTTTGCAATATCTCAGTTGAAAAGTAGATTTATGTTAGAATGATGTGTGTTTTTCTCAAAGGCAAAATGAAATAGATAACTGTATTCATTATAAGTGTAGATTAATACAACTATTCTTTATTTACAGCTTATTTACACATGCATAATTAAAAAAGTATTGGTCTGCCATCATCTATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAAATCTGTTACATTTCCAGTTTCAGTAATTGTGAGGTATGAAAAAACTGTTGATGTGCAACACAAATTATCAAGTTTACTG-TGTTTATG----TGTATATCAT-ANNNNNNNNNNGTTAGTGTGAATGGT--TA-------TG---TT----GCTGCTG------------ATGATGA-TG----------T-A--GTGTGAGCCGTTAGTGTGAATGGTTATGT----T-GTTG---CTG--AT--GATGATGA-TACT---AT-----GTGTGA--TGTTAGTGT-GAATGG---TGGTA-TT-GCT-C-----CTGCTGCT----AATGATG---AT---G---TG---TGTGA---TGCTAGTGTGAATG-----ATT----------ATG-------AT------AC---------------TGT---------TG------TG-TG----------TG--ATG-TAAGTGTGAAATTATTCAATTATTTTTAAGCATCCATCTATTAAAATATACAA-----------AAGGTGAATGAACAATTCTATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTATCTGTACATTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTAAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTTGACATGTAGATACTTAAATCCCCCACTTTAAACACAGATAATGCTCTCATTTAAATAAGAATTAAGTAACACAATAAGTAGATA-TGGACTTAACCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTTAAAAACCAGAAATGTGTGATTATTTTTTTT--AACTCACT-TATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTAAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCATAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCGT
gi|3 : TACTGCTGCTGATGATGATGATTATTATGATGAGTGTGATATTAGTGTGAGTGGC--GG-------TG---TTTACTGCTGCTATTAA--------ATGATGA-TG----------T-A--GTGTGTGAGGTAAGTGTGAATGGTTATGT----T-GCTC---CTG--CT--GATAATGA-TGAT---AT-----GTGTGA--TGTTAGTAT-TAATAG---TAATA-TT-GCT-G-----CTAATGAT----GATAATG---AT---G---TG---TGTGA---CG
gi|5 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgatagtgctgctgatgatgatgtgacgttagtgtgaatggggatgctgttgtaaatgttgtcattgtggaaagtgattttgctgctgc-TGCTGATGA---TG-ATGTTA--ACGTGTGATCTGTTAGTGTAAATAGTGATACTGCTGCTG---CT----GCTGCTG------------ATAATGA-CA----------T----GTGTGA--CATTAGTGTGAATGGTGATGC----T-GTTG-----------------------------T-----AGGTAG--TGTTATTGTGGAAT-G---TGGTT-TT-GCT-G-----CTGCTGCT----TATGATG---AT---GA--TG---AATGA---TAATAGTGAGAATG-----GT
gi|7 : cTACCAT-GTGTGTGTGATATTAATGTGAATGTT--GA-------TG---TTTGCTGCTGCTG------------CTGATGA-TG----------A-T--GTGTGAGCTGTTAATGT--ATGGTGATGTTTACT-GCTG---CTG--AT--GATGATGA-TG-T---AT-----GTGggtgttcaactg
gi|3 : atcgactaatcatttaaaccttaaaaaagccaatacatttAT-GATGATGTGACGTTAGTGTGAATGGG--GA-------TG---CT----GTTG-TA------------A--ATGT-TG----------TCA--TTGTGGAAAGTGATTTTG-CTGCTGCTAC----T-GCTG---CTG--AT--GATGATGATTATT---ATGATGAGTGTGA--TATTAGTGT-GAGTGG---CGGTG-TT---T-A-----CTGCTGCTATTAAATGATG---ATGTAG---TG---TGTGA---GGTAAGTGTGAATG-----GTT----------ATG-------TT------GC---------------TCC---------TG------C--TGATAA------TG--ATGATATGTGTGATGTTAcca
gi|2 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgatagtgctgctgGCTAGTGTGCATGGT--TA-------TGATATT----GCTGCTG------------TTGATGA-TG----------T-T--GCGTGTGATGTTATTGTGAAgtattaatagtaatattgctgctaatgatgataatgatgtgtgtgacg
gi|8 : tgctgccgctgataatgatgatgtgtgtgatGTTAGTGTGAACAGT--GA-------TG---TT----GCTTCTG------------GTGATGG-TG----------T----GTGTGA--TGTTAGTGTGAACAGTGA-------T-GTTG---CTG--AT--GATGATGA----T---GT-----GTGTGA--TGTTAGTGT-GAACAG---TGATG-T-------------TACTGCT----TATGATG---GT---G---TG---TGTAA---TGTGAGTGTGattatttaattatttaaaagcatccatgtattaaaatataaaaaagatgaatgaacaaatcaattgtattatttattttctctcctctacctgtacagtgttttgtgttggtgcttctgtttagctgtacagcacaacagaattatatggagatcacaataacaaaaataactttaaaaatattataatttaatacctgtcaacatgtagataactcaatccaccactttaaacacagataatactctcctttaaataagaattaagtaacccaagaagtagatatgggcttaatcagttttgtccacaatgaaagtaaggaactatagaagaaattccttaatgaatgtaaaaaaccagaaatatctgattatttttttctgaactctctctataaaatcctcagaaaactatgcttgattttaaaagcatttagcctacatgtatctgtgcacttataaaatcctcagaaaa
gi|12 : GTTAGTGTAAATAGT--GA-------TG---TT----GCTGCTGCTGCTGCTGCTAATAATGA-TG----------T----GTGTGA
gi|4 : gctgatgatgattctatgtgtgatTAGT---ANNNNN--NN-------NN---NT----GCTGATG------------ATGATGA-TG----------T----GTGTGA--TGTTAGTGTGAATAGTTATGT----A-GCTGCAACTG--TT--GATGATG----------T-----ATGAAA--TGTTAGTGT-GAAtgca
gi|9 : GTGTGAATGGT--AA-------TGATCCT----GCTGCTG------------TTGATGA-TG----------T----GTGTGA--TGTTAGTGTGAAatttttcaattatataaagcatccatctattaaaatataaaaaaaaagagttgaagatgaataaaaaattcaattgtattttctatagatttactttcatcta
gi|2 : -------TG---CT----GCCGCTG------------ATAATGA-TG----------A-T--GTGTGTGATGCTAGTGTGCATGGTTATGA----T-ATTG---CTG--CT--GTTGATGA-TGTT---GC-----GTGTGA--TGTTATTGT-GAAattattcaattatttaaaagcatccatctattaaattataaaaaagatgaat
gi|3 : T----GCTGCTG------------ATGATGA-TGATTATTATGATGA--GTGTGA--TATTAGTGTGAGTGGCGGTGT----TTACTG---CTGCTATTAAATGATGA-TGTA---GT-----GTGTGA--GGTAAGTGT-GAATGG---TTATG-TT-GCT-C-----CTGCTGAT----AATGATG---AT---A---TG---TGTGA---TGTTAGTATTAATAGTAATATTGCTGCTAATGATG-------AT------AA---------------TGA---------TG------TG-TG----------TG--ACG-attatttaattatttaaaagcatccatgtattaaaatataaaaaagatgaatgaacaaatcaattgtattatttattttctctcctctacctgtacagtgttttgtgttggtgcttctgtttagctgtacagcacaacagaattatatggagatcacaataacaaaaataactttaaaaatattataatttaatacctgtcaacatgtagataactcaatccaccactttaaacacagataatactctcctttaaataagaattaagtaacccaagaagtagatatgggcttaatcagttttgtccacaatgaaagtaaggaactatagaagaaattccttaatgaatgtaaaaaaccagaaatatctgattatttttttctgaactctctctataaaatcctcagaaaactatgcttgattttaaaagcatttagcctacatgtatctgtgcacttataaaatcctcagaaaa
gi|15 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgatagtgctgctgatgatgatgtgacgttagtgtgaatggggatgctgttgtaaatgttgtcattgtggaaagtgattttgctgctgctacT----GCTGATG------------ATGATGC-TA----------A-T--GTGTGAGCTGTTAGTGTAAAAAGTGATAT----T-G
gi|5 : CTGCTG------------ATGATGA-TGT---------T-AACGTGTGATCTGTTAGTGTAAATAGTGATAC----T-GCTG---CTG--CT--GCTGCTGA-TAATGACAT-----GTGTGA--CATTAGTGT-GAATGG---TGA----T-GCT-G-----TTGTAGGT----AGTGTTA---TT---G---TGGAATGTGGTTTTGCTGCTGC---TG-----CTT----------ATG-------AT------GA---------------TGA---------TG------AA-TGA---------TA--AT----AGTGAGAAc
gi|16 : CTGCTG------------ATGATGA-TGC---------T-AATGTGTGAGCTGTTAGTATAAATAGTtggtggtgttcaactg
gi|12 : GCTG------------ATGATGATTC----------T-AT-GTGTGA--TGTTAGTGTAAATAGTGATGT----T-GCTG---CTG--CT--GCTGCTGC-TAAT---A--------ATGA--TGT--GTGT-GAg
gi|7 : A-TG----------T----GTGTGTGATATTAATGTGAATGTTGATGT----TTGCTG---CTG--CT--GCTGATGA-TG-----AT-----GTGTGAGCTGTTAATGT---ATGG---TGATGTTT-ACT-G-----CTGCTGAT----GATGATG---AT---G---TA---TGTGtgca
gi|8 : atcgactaatcatttaaaccttaaaaaagccaatacattttaccGTTAGTGTGAACAGTGATGT----T-GCTT---CTG--GT--GATGGTG----------T-----GTGTGA--TGTTAGTGT-GAACAG---TGATG-TT-GCT------------GAT----GATGATG---AT---G---TG---TGTGA---TGTTAGTGTGAACA-----GTG----------ATG-------TT------AC---------------TGCTTATGATGGTG------TG-TG----------TA--ATG-TGAGTGTGcca
gi|9 : GTGTGAATGGTAATGA----T-CCTG---CTG--CT--GTTGATGA-TG------T-----GTGTGA--TGTTAGTGT-GAA
gi|2 : TGC----T-GCCG---CTG--AT--AATGATGA-TG------T-----GTGTGA--TGCTAGTGT-GCATGGTTATGATA-TT-G---------CTGCTGTT----GATGATG---TT---G---CG---TGTGA---TGTTATTGTGAA-------ATT----------ATattattcaattatttaaaagcatccatctattaaattataaaaaagatgaat
gi|4 : TG---CTG--AT--GATGATGA-TG------T-----GTGTGA--TGTTAGTGT-GAATAG---TTATG-TA-GCT-G-----CAACTGT-------TGATG---AT---G---TA---TGAAA---TGTTAGTGTGAAttaattatttaaaagcatccatgtattaaaatataaaaaagatgaatgaacaaatcaattgtattatttattttctctcctctacctgtacagtgttttgtgttggtgcttctgtttagctgtacagcacaacagaattatatggagatcacaataacaaaaataactttaaaaatattataatttaatacctgtcaacatgtagataactcaatccaccactttaaacacagataatactctcctttaaataagaattaagtaacccaagaagtagatatgggcttaatcagttttgtccacaatgaaagtaaggaactatagaagaaattccttaatgaatgtaaaaaaccagaaatatctgattatttttttctgaactctctctataaaatcctcagaaaactatgcttgattttaaaagcatttagcctacatgtatctgtgcacttataaaatcctcagaaaa
gi|5 : tagtannnnnnnnnnTG---CTG--AT--GATGATGT-TA-----AC-----GTGTGATCTGTTAGTGT-AAATAG---TGATA-CT-GCT-G-----CTGCTGCT----GCTGATA---AT---GACATG---TGTGA---CATTAGTGTGAATG------------------GTG-------AT------GC---------------TGT---------TG------TA-GG----------TA--GTG-TTATTGTGGAATatttttcaattatataaagcatccatctattaaaatataaaaaaaaagagttgaagatgaataaaaaattcaattgtattttctatagatttactttcatcta
gi|16 : cTG---CTG--AT--GATGATGC-TA-----AT-----GTGTGAGCTGTTAGTAT-AAATAG---TGgtggttttgctgctgctgcttatgatgatgatgaatgataatagtgagaatggtggtgttcaactg
gi|15 : cTG---CTG--AT--GATGATGC-TA-----AT-----GTGTGAGCTGTTAGTGT-AAAAAG---TGATA-TT-GC
gi|12 : T--GATGATGA-TTCT---AT-----GTGTGA--TGTTAGTGT-AAATAG---TGATG-TT-GCTGCTGCTGCTGCTGCT----AATAATG---AT---G---TG---TGTGA---TGC
gi|7 : gcT---GT-----GTGTGA--TATTAATGT-GAATGT---TGATG-TTTGCT-G-----CTGCTGCT----GATGATG---AT---G---TG---TGAGC---TGTTAATGT--ATG-----GTG----------ATGT------TT------AC---------------TGC---------TGC-----TGATGATGA------TG--ATG-TATGTGa
gi|9 : atcgactaatcatttaaaccttaaaaaagccaatacattttaccatgGTGT-GAATGG---T---A-AT-GAT-C-----CTGCTGCT----GTTGATG---AT---G---TG---TGTGA---TGTTAGTGTGAA-------ATT----------ATcca
gi|4 : TAG---TANNN-NN-NNN-N-----NTGCTGAT----GATGATG---AT---G---TG---TGTGA---TGTTAGTGTGAATA-----GTT----------ATGTAGCTGCA-------AC---------------TGT---------TGATGA--TG-TA----------TGAAATG-TTAGTGTGAAATTTTTCAATTA-TATAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAAAAAAAGAGTTGAAGATGAATAAAAAATTCAATTGTATTTTCTATAGATTTACTTTCATCTAtcaattatttaaaagcatccatctattaaattataaaaaagatgaat
gi|2 : T-GCT-G-----CCGCTGAT----AATGATG---AT---G---TG---TGTGA---TGCTAGTGTGCATG-----GTT----------ATG-------AT------ATTGCTGCTGTTGATGATGT---------TG------CG-TG----------TG--ATG-TTATTGTGAAATTATTTAATTATTTAAAAGCATCCATGTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAAATCAATTGTATTATTTAT---TTT-CTCTCCTCTACCTGTACAGTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTTAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATAACTTTAAAAA--TATTA---TAATTTAATACCTGTCAACATGTAGATAACTCAATCCACCACTTTAAACACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACCCAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAATCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAAC------TATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTAAAAAACCAGAAATATCTGATTATTTTTTTCTGAACTCTCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAA
gi|16 : -----CTGCTGAT----GATGATGCTAAT---G---TG---TGAGC---TGTTAGTATAAAT
gi|12 : GCT----GATGATG---ATTCTA---TG---TGTGA---TGTTAGTGTAAATA-----GTG----------ATG-------TT------GC---------------TGC---------TGC-----TGCTGCTGCTAATAATG--ATG-T--GTGTGAagtg
gi|9 : GTGTGAATG-----GTA----------ATG-------ATCCTGCTGC---------------TGT---------TGATGATGTG-TG----------TG--ATG-TTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAATTATAAAA-----------AAGATGAATtgca
gi|2 : TTCTGTTGTGCTGTACAGCTAAACAGAA
gi|6 : tgctgccgctgataatgatgatgtgtgtgatgctagtgtgcatggttatgatattgctgctgttgatgatgttgcgtgtgatgttattgtgaaattatttaattatttaaaagcatccatgtattaaaatataaaaaagatgaatgaacaaatcaattgtattatttattttctctcctctacctgtacagtgttttgtgttggtgcTGTAGAAATCA---TAACAAAAAGATTTTTGAAAAGTTATTACCTTAA-GTGATG---------ATATAGATGCTTAAGT---CCACTTAAATCACAGGAAACACTCTTCTTTAGATAAA---TAAGTGTCACAAGAAGTAGGTATTGTGCTTCAACAGTTTCTGTCTACAATGAAAGttatatggagatcacaataacaaaaataactttaaaaatattataatttaatacctgtcaacatgtagataactcaatccaccactttaaacacagataatactctcctttaaataagaattaagtaacccaagaagtagatatgggcttaatcagttttgtccacaatgaaagtaaggaactatagaagaaattccttaatgaatgtaaaaaaccagaaatatctgattatttttttctgaactctctctataaaatcctcagaaaactatgcttgattttaaaagcatttagcctacatgtatctgtgcacttataaaatcctcagaaaa
gi|2 : gTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAActtta
gi|2 : tgctgccgctgataatgatgatgtgtgtgatgctagtgtgcatggttatgatattgctgctgttgatgatgttgcgtgtgatgttattgtgaaattatttaattatttaaaagcatccatgtattaaaatataaaaaagatgaatgaacaaatcaattgtattatttattttctctcctctacctgtacagtgttttgtgttggtgcttctgtttagctgtacagcacaacagaattatatggagatcacaataacaaaaataactttaaaaatattataatttaatacctgtcaacatgtagataactcaatccaccactttaaacacagataatactctcctttaaataagaattaagtaacccaagaagtagatatgggcttaatcagttttgtccacaatgaaagtaaggaactatagaagaaattccttaatgaatgtaaaaaaccagaaatatctgattatttttttctgaactctctcTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTAT
gi|10 : tgctgccgctgataatgatgatgtgtgtgatgctagtgtgcatggttatgatattgctgctgttgatgatgttgcgtgtgatgttattgtgaaattatttaattatttaaaagcatccatgtattaaaatataaaaaagatgaatgaacaaatcaattgtattatttattttctctcctctacctgtacagtgttttgtgttggtgcttctgtttagctgtacagcacaacagaattatatggagatcacaataacaaaaataactttaaaaatattataatttaatacctgtcaacatgtagataactcaatccaccactttaaacacagataatactctcctttaaataagaattaagtaacccaagaagtagatatgggcttaatcagttttgtccacaatgaaagtaaggaactatagaagaaattccttaatgaatgtaaaaaaccagaaatatctgattatttttttctgaactctctcAAAGATTTTTGTTTAATTCAT--GTAATCTTTATTAGTGCATCTTTACATGCActgtgcacttataaaatcctcagaaaa
gi|14 : TTGT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAatcctcacattcttatccacatcttataataaaccttttta
gi|11 : TTT-TTTAAATGTTTTGTAAACTTTATTCGTGCATCTTTACATACAttcctcacataacaaaccttttcaact
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TCTACAAATCATTTAAACCTTAAAAAAGCCAAAATATTTTACCACATGTGTGAGATATTAATGTGAACGTTGATGTTTACTGC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 1111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 33333333333333 2222 11111 22222222222 222222 11111 111111111111 1111111 5555555555555555555555555555 44444444444 333 2 33 333 11 2 555555 11 1 3333333 1 1 11
lowQualScore : 2 3 9999999999999 1 2222 7777777777777777777777777777777777777777777777777 0000 11111111111111 4 3333 11111 33333333333 1 3 0 666666 11111 4 4 666 666 222222222222 666 3 3 8888 66 88 1111111 888 5 7777777777777777777777777777 66 2 9 77777777777 1 1 1 777 3 1 2 22 22 0 6 1 1 0 00 777 88 99999999 222 1 0 6 1 1 11 0 0 7 11 1 0 44 1 1 1 3 777777 4 2 88 4 5 4 2 6666666 5 333 0 33
lowQualScore : . . ............. . .... ................................................. .... .............. . .... ..... ........... . . . ...... ..... . . ... ... ............ ... . . .... .. .. ....... ... . ............................ .. . . ........... . . . ... . . . .. .. . . . . . .. ... .. ........ ... . . . . . .. . . . .. . . .. . . . . ...... . . .. . . . . ....... . ... . ..
lowQualScore : 5 2 4444444444444 0 0000 3333333333333333333333333333333333333333333333333 6666 55555555555555 4 1111 11111 44444444444 0 6 5 000000 44444 0 7 444 444 555555555555 444 6 6 5555 11 44 8888888 888 0 0000000000000000000000000000 99 2 8 55555555555 0 0 0 333 7 0 5 00 00 7 7 0 0 7 33 000 33 77777777 333 0 7 7 0 0 77 7 7 3 77 0 7 77 0 0 0 3 555555 0 5 00 0 0 0 5 0000000 0 000 0 88
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATG-NATATTA-TG-TGNGTGTG-A--TGTTAGTGTGAATG---------------GTGA---------T------------G-------CTGCTGCTG----ATGATGAT----G-----T---GTG-TGAG-T-GT-----TAGTGTGAATGGTGATG-T----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATG-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATAGTGAT---GTTGCTGC---TGCTG---NTG------ATGA---TGATG-TGTG-TGACGTTAGTG----TGA--ATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAACACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATATTGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
Reference ( family-2502 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATG-ANTATTA-TG-CGNGTGTG-A--TGTTAGTGTGAATG---------------GTGA---------T------------G-------CTGCTGCTG----ATGATGAT----G-----T---GTG-TGAG-T-GT-----TAGTGTGAATGGTGATG-T----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATG-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATGGTGAT---GTTGCTGC---TGCTG---NTG------ATGA---TGATG-TGTG-TGATGTTAGTG----TGA--ATGGTTATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAANAANTCAATTGTATTNTCTATAGATTTACTCTCNTCTACCTGTACAGTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNNGCTGTACAGCNNAACAGAATTATGTGGAGATCACAATAACAAAAANANCTTTGAAAAGTTATTACCTTAATNTGATGCCTGTCAACATGTAGATGNCTNAGTCCACCACTTNAANCACAGGNAACACTCTCCTTTAGATAAGAATTAAGTGNCNCAAGAAGTAGGTATTGNGCTTNANCAGTTTCTGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTA------TAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTAAAAAACCAGAAATATCTGATTATTTTTTTCTGAACTCTCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATNNNAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|1 : TACTG-TGTTTATG----TG-TATATCA-TA-NNNNNNNN-N--NGTTAGTGTGAATG---------------GTTA---------T------------G-------TTGCTGCTG----ATGATGAT----G-----TA--GTG-TGAG-CCGT-----TAGTGTGAATGGTTATG-T----T----GTTGCTGATGA-TGATGATACT--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATGGTGGT---ATTGCTCC---TGCTG---CTA------ATGA---TGATG-TGTG-TGATGCTAGTG----TGA--ATGATTATGA---T---ACTG---TT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTAAGTGTGAAATTATTCAATTATTTTTAAGCATCCATCTATTAAAATATACAA-----------AAGGTGAATGAACAATTCTATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTATCTGTACATTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTAAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTTGACATGTAGATACTTAAATCCCCCACTTTAAACACAGATAATGCTCTCATTTAAATAAGAATTAAGTAACACAATAAGTAGATAT-GGACTTAACCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTTAAAAACCAGAAATGTGTGATTATTTTTTTT--AACTCACT-TATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTAAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCATAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCGT
gi|10 : cacgatgttatgcagttaattttagtgaatagcaacgtcaacatcttaactgatataaaagattttgcattcattcaatataaaataaagtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcttgtttatatctattgagtgtgtcatcttgagggattggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttgtcttctaaaataccgcataatcactagcgttaacgatgatatatagtttcgggtactttttcatatcgcccatatcatgttgtaacataatagctctctgtttaaaattcagtagacagtcagttcaaagttcagcagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaaagcttacgattcaaattgctatgggacacaacttaacctaactgcacaaatgcagggtgtgtattatcatatatgttaatgaatgtgttgaaggttgaaaaactaattcaaattgtaatattgtgatgtaaataactagctgtttgatcatagacacaatgaacataataaatatatttgatactagtatttcaaaggtgtaaataaagattgtatctatactttgtatttaaattttgtttgcaatatctcagttgaaaagtagatttatgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaaatgaaatagataactgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagcttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtctgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaaatctgttacatttccagtttcagtaattgtgaggtatgaaaaaactgttgatgtgcaacacaaattatcaagttAAAGATTTTTGTTTAATTCAT--GTAATCTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|11 : TTT-TTTAAATGTTTTGTAAACTTTATTCGTGCATCTTTACATACATatcctcacattcttatccacatcttataataaaccttttta
gi|12 : taGCTGATGA-TGAT--TC-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-AAATAGTGAT---GTTGCTGC---TGCTG---CTGCTGCTAATAA---TGATG-TGTG-TGATGatcctcacataacaaaccatttcaactannnnnnnnnnnnnnnn
gi|13 : -----T---GTG-TGAGAT-AT-----TAATGTGAACGTTGATGTT----T----ACTGCca
gi|14 : tctacaaatcatttaaaccttaaaaaagccaaaatattttaccacaTTGT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|15 : TGCTGA-TGATGATG-CTAA-TGTGTGAGCT--GTTAGTGT-AAAAAGTGAT---ATTGCttcctcacataacaaaccttttcaact
gi|16 : CTGCTG----ATGATGAT----GCTAA-T---GTG-TGAGCT-GT-----TAGTATAAATAGTG
gi|2 : TGCTGC---CGCTG---ATA------ATGA---TGATG-TGTG-TGATGCTAGTG----TGC--ATGGTTATGATATT---GCTG---CT-G-------TTGATGATGTTGCG-TG----TG--ATGTTATTGTGAAATTATTTAATTATTTAAAAGCATCCATGTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAAATCAATTGTATTATTTAT---TTT-CTCTCCTCTACCTGTACAGTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTTAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATAACTTTAAAAA--TATTA---TAATTTAATACCTGTCAACATGTAGATAACTCAATCCACCACTTTAAACACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACCCAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAATCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTA------TAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTAAAAAACCAGAAATATCTGATTATTTTTTTCTGAACTCTCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAA
gi|3 : TGA-TGATAATA-CTAA-TGTGTGAGCT--GTAAATGT-AAATAGTGAT---AGTGCTGC------------TG------ATGA---TGA-----TG-TGACGTTAGTG----TGA--ATGG---GGA---T---GCTG---TT-G-------T------------A-AA----TG--TTGTCATTGTGGAA
gi|3 : TG----ATGATAATACTAA-----T---GTG-TGAGCT-GT-----AAATGTAAATAGTGATA-G----T----GCTGCTGATGA-TGA-------------TGTGA--C--GTTAGTGT-GAATGGGGAT---GCTGTTGTAAATGTTGTCATTG------TGGAAAGTGAT--TTTGCTGCTGCTACTGCTGCTGATGATGATGATTA---T---TATG---AT-G-------A------------G-TG----TG--ATATTAGTGTGAagtgattttgctgctgctactgctgctgatgatgatgattattatgatgagtgtgatattagtgtgagtggcggtgtttactgctgctattaaatgatgatgtagtgtgtgaggtaagtgtgaatggttatgttgctcctgctgataatgatgatatgtgtgatgttagtattaatagtaatattgctgctaatgatgataatgatgtgtgtgacg
gi|3 : TAGTGCTGCTGATGATGATGTGACGTTAGTG-TGAATGGGGA--TGCTGTTGTAAATGTTGTCATTGTGGAAAGTGA---------TTTTGCTGCTGCTA-------CTGCTGCTG----ATGATGAT----GATTATT---ATGATGAG-T-GTGATATTAGTGTGAGTGGCGGTG-T----TTACTGCTGCTATTAAATGATGATG-T--AGTGTGTGA--G--GTAAGTGT-GAATGGTTAT---GTTGCTCC---TGCTG---ATA------ATGA---TGATA-TGTG-TGATGTTAGTA----TTA--ATAGTAATAT---T---GCTG---CTAA-------T------------GATGATAATG--ATGT--GTGTGAgtggcggtgtttactgctgctattaaatgatgatgtagtgtgtgaggtaagtgtgaatggttatgttgctcctgctgataatgatgatatgtgtgatgttagtattaatagtaatattgctgctaatgatgataatgatgtgtgtgacg
gi|3 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgaTACTGCTGCTGATGATGATG-ATTATTA-TGATGAGTGTG-A--TATTAGTGTGAGTG---------------GCGG---------T------------GTTTA---CTGCTGCTATTAAATGATGAT----G-----TAGTGTG-TGAG---GT-----AAGTGTGAATGGTTATG-T----T----GCTCCTGCTGA-TAATGATGAT--A-TGTGTGA--T--GTTAGTAT-TAATAGTAAT---ATTGCTGC---TAATG---ATG------ATAA---TGATG-TGTG-TGACGcg
gi|4 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgatagtgctgctgatgatgatgtgacgttagtgtgaatggggatgctgttgtaaatgttgtcattgtggaaagtgattttgctgctgcTAGTANN---NNNNNNNN---TGCTG---ATG------ATGA---TGATG-TGTG-TGATGTTAGTG----TGA--ATAGTTATGT---A---GCTGCAACT-GTTGATGAT------------G-TA----TGAAATGTTAGTGTGAAATTTTTCAATTATAT-AAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAAAAAAAGAGTTGAAGATGAATAAAAAATTCAATTGTATTTTCTATAGATTTACTTTCATCTA
gi|5 : CTGCTGA-TGATGATG-TTAA-CGTGTGA--TCTGTTAGTGT-AAATAGTGATACTGCTGCTGC---TGCTG---CTG------ATAA---TGACA-TGTG-TGACATTAGTG----TGA--ATGG---TGA---T---GCTG---TT-G-------T------------A-GG----TA--GTGTTATTGTGGAAT
gi|5 : CTGCTGATGATGATG-----TTA-----ACGTGTG-ATCTGTTAGTGTAAATA---------------GTGATACTGCTGCT------------G-------CTGCTGCTG----ATAATGAC----A-----T---GTG-TGA--C-AT-----TAGTGTGAATGGTGA---------------TGCTGTTG----------------TAGGTAG--T--GTTATTGTGGAAT-GTGGT---TTTGCTGC---TGCTG---CTT------ATGA---TGATGATGAA-TGATAATAGTG----AGA--ATGGTgtggttttgctgctgctgcttatgatgatgatgaatgataatagtgagaatggtggtgttcaactg
gi|6 : TGTAGAAATCA---TAACAAAAAGATTTTTGAAAAGTTATTACCTTAA-GTGATG---------ATATAGATGCTTAAGTCCAC---TTAAATCACAGGAAACACTCTTCTTTAGATAAA---TAAGTGTCACAAGAAGTAGGTATTGTGCTTCAACAGTTTCTGTCTACAATGAAAGggtgttcaactg
gi|7 : gTACCA-TG-TGTGTGTG-A--TATTAATGTGAATG---------------TTGA---------T------------GTTTGCTGCTGCTGCTG----ATGATGA-----------T---GTG-TGAGCT-GT-----TAATGT--ATGGTGATG-TTTACT----GCTGCTGATGA-TGATGATG-T--A-TGTGcttta
gi|8 : atcgactaatcatttaaaccttaaaaaagccaatacatttGTTAGTGTGAACA---------------GTGA---------T------------G-------TTGCTTCTG----GTGATGGT----G-----T---GTG-TGA--T-GT-----TAGTGTGAACAGTGATG-T-----------TGCTGATGA-TGATGATG------TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAACAGTGAT---GTTACTGC---T--T-------------ATGA---TGGTG-TGTG-TAATGTGAGTG----TGcca
gi|9 : GTG----TGA--ATGGTAATGA---TCCTGCTG---CT-G-------TTGATGATGT---G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAATTATAAAA-----------AAGATGAAT
Alignments
lowQualScore : 222 1111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 222222222 2222 11111 22222222222 2222 11 111111 1111111 111 6666666666666666666666666666 44444444444 222 1 11 222 1 2 1 222222 11 1 1 11
lowQualScore : 2 3 444 5555 1 8 99 7777777777777777777777777777777777777777777777777 4444 1 111111111 5 3333 44444 55555555555 1 3 9999 3 66 55 44 777 3 111111 4 1 77 4444444 000 5 6666666666666666666666666666 77 3 0 9 77777777777 333 3 1 1 6 88 333 7 8888888 6 3 7 3 1 3 999999 1 1 88 1 5 1 1 0 33
lowQualScore : . . ... .... . . .. ................................................. .... . ......... . .... ..... ........... . . .... . .. .. .. ... . ...... . . .. ....... ... . ............................ .. . . . ........... ... . . . . .. ... . ....... . . . . . . ...... . . .. . . . . . ..
lowQualScore : 5 2 222 0000 0 0 22 3333333333333333333333333333333333333333333333333 2222 7 000000000 7 7777 33333 99999999999 0 6 0000 6 55 55 55 000 8 555555 0 2 88 7777777 000 7 9999999999999999999999999999 99 9 7 8 55555555555 333 3 0 0 7 33 333 3 7777777 7 3 3 7 0 3 000000 0 0 00 0 0 0 0 0 88
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGT-ATATTA-TG-TGNGTGTG-AT--GTTAGTGTGAATG---------------GTGA---------T------------G-------CTGCTGCTG----ATGATGATG-----T---GTG-TGAG-C-GT-----TAGTGTGAACGGTGATG-T----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATG-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGNTG------ATGATGATG-TGTGTGACGTTAGTGTGAATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
Reference ( family-2502 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGN-ATATTA-TG-TGNGTGTG-AT--GTTAGTGTGAATG---------------GTGA---------T------------G-------CTGCTGCTG----ATGATGATG-----T---GTG-TGAG-T-GT-----TAGTGTGAATGGTGATG-T----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATG-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGNTG------ATGATGATG-TGTGTGACGTTAGTGTGAATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATATTGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|1 : TACTG-TGTTTATG----TGT-ATATCA-TA-NNNNNNNN-NN--GTTAGTGTGAATG---------------GTTA---------T------------G-------TTGCTGCTG----ATGATGATG-----TA--GTG-TGAG-CCGT-----TAGTGTGAATGGTTATG-T----T----GTTGCTGATGA-TGATGATACT--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATGGTGGT---ATTGCTCCTGCTGCTA------ATGATGATG-TGTGTGATGCTAGTGTGAATGATTATGA---T---ACTG---TT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTAAGTGTGAAATTATTCAATTATTTTTAAGCATCCATCTATTAAAATATACAA-----------AAGGTGAATGAACAATTCTATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTATCTGTACATTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTAAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTTGACATGTAGATACTTAAATCCCCCACTTTAAA-CACAGATAATGCTCTCATTTAAATAAGAATTAAGTAACACAATAAGTAGATA-TGGACTTAACCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTTAAAAACCAGAAATGTGTGATTATTTTTTTT--AACTCACT-TATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTAAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCATAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCGT
gi|10 : cacgatgttatgcagttaattttagtgaatagcaacgtcaacatcttaactgatataaaagattttgcattcattcaatataaaataaagtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcttgtttatatctattgagtgtgtcatcttgagggattggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttgtcttctaaaataccgcataatcactagcgttaacgatgatatatagtttcgggtactttttcatatcgcccatatcatgttgtaacataatagctctctgtttaaaattcagtagacagtcagttcaaagttcagcagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaaagcttacgattcaaattgctatgggacacaacttaacctaactgcacaaatgcagggtgtgtattatcatatatgttaatgaatgtgttgaaggttgaaaaactaattcaaattgtaatattgtgatgtaaataactagctgtttgatcatagacacaatgaacataataaatatatttgatactagtatttcaaaggtgtaaataaagattgtatctatactttgtatttaaattttgtttgcaatatctcagttgaaaagtagatttatgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaaatgaaatagataactgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagcttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtctgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaaatctgttacatttccagtttcagtaattgtgaggtatgaaaaaactgttgatgtgcaacacaaattatcaagttAAAGATTTTTGTTTAATTCAT--GTAATCTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|11 : TTT-TTTAAATGTTTTGTAAACTTTATTCGTGCATCTTTACATACATatcctcacattcttatccacatcttataataaaccttttta
gi|12 : taGCTGATGA-TGAT--TC-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-AAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAATAATGATG-TGTGTGATGatcctcacataacaaaccatttcaactannnnnnnnnnnnnnnn
gi|13 : -----T---GTG-TGAGAT-AT-----TAATGTGAACGTTGATGTT----T----ACTGCca
gi|14 : tctacaaatcatttaaaccttaaaaaagccaaaatattttaccacaTTGT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|15 : TGCTGA-TGATGATG-CTAA-TGTGTGAGCT--GTTAGTGT-AAAAAGTGAT---ATTGCttcctcacataacaaaccttttcaact
gi|16 : CTGCTGA-TGATGATG-CTAA-TGTGTGAGCT--GTTAGTAT-AAATAGTG
gi|2 : TGCTGCCGCTGATA------ATGATGATG-TGTGTGATGCTAGTGTGCATGGTTATGATATT---GCTG---CT-G-------TTGATGATGTTGCG-TG----TG--ATGTTATTGTGAAATTATTTAATTATTTAAAAGCATCCATGTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAAATCAATTGTATTATTTAT---TTT-CTCTCCTCTACCTGTACAGTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTTAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATAACTTTAAAAA--TATTA---TAATTTAATACCTGTCAACATGTAGATAACTCAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACCCAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAATCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAAC------TATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTAAAAAACCAGAAATATCTGATTATTTTTTTCTGAACTCTCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAA
gi|3 : TGA-TGATAATA-CTAA-TGTGTGAGCT--GTAAATGT-AAATAGTGAT---AGTGCTGC------TG------ATGATGA-----TGTGACGTTAGTGTGAATGG---GGA---T---GCTG---TT-G-------T------------A-AA----TG--TTGTCATTGTGGAA
gi|3 : TAGTGCTGCTGATGATGATGTGACGTTAGTG-TGAATGGGGAT--GCTGTTGTAAATGTTGTCATTGTGGAAAGTGA---------TTTTGCTGCTGCTA-------CTGCTGCTG----ATGATGATGATTATT---ATGATGAG-T-GTGATATTAGTGTGAGTGGCGGTG-T----TTACTGCTGCTATTAAATGATGATG-T--AGTGTGTGA--G--GTAAGTGT-GAATGGTTAT---GTTGCTCCTGCTGATA------ATGATGATA-TGTGTGATGTTAGTATTAATAGTAATAT---T---GCTG---CTAA-------T------------GATGATAATG--ATGT--GTGTGAagtgattttgctgctgctactgctgctgatgatgatgattattatgatgagtgtgatattagtgtgagtggcggtgtttactgctgctattaaatgatgatgtagtgtgtgaggtaagtgtgaatggttatgttgctcctgctgataatgatgatatgtgtgatgttagtattaatagtaatattgctgctaatgatgataatgatgtgtgtgacg
gi|3 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgaTACTGCTGCTGATGATGATGA-TTATTA-TGATGAGTGTG-AT--ATTAGTGTGAGTG---------------GCGG---------T------------GTTTA---CTGCTGCTATTAAATGATGATG-----TAGTGTG-TGAG---GT-----AAGTGTGAATGGTTATG-T----T----GCTCCTGCTGA-TAATGATGAT--A-TGTGTGA--T--GTTAGTAT-TAATAGTAAT---ATTGCTGCTAATGATG------ATAATGATG-TGTGTGACGcg
gi|4 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgatagtgctgctgatgatgatgtgacgttagtgtgaatggggatgctgttgtaaatgttgtcattgtggaaagtgattttgctgctgcTAGTANN---NNNNNNNNTGCTGATG------ATGATGATG-TGTGTGATGTTAGTGTGAATAGTTATGT---A---GCTGCAACT-GTTGATGAT------------G-TA----TGAAATGTTAGTGTGAAATTTTTCAATTATAT-AAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAAAAAAAGAGTTGAAGATGAATAAAAAATTCAATTGTATTTTCTATAGATTTACTTTCATCTA
gi|5 : CTGCTGA-TGATGATG-TTAA-CGTGTGA--TCTGTTAGTGT-AAATAGTGATACTGCTGCTGCTGCTGCTG------ATAATGACA-TGTGTGACATTAGTGTGAATGG---TGA---T---GCTG---TT-G-------T------------A-GG----TA--GTGTTATTGTGGAAT
gi|5 : CTGCTGATGATGATG-----TTA-----ACGTGTG-ATCTGTTAGTGTAAATA---------------GTGATACTGCTGCT------------G-------CTGCTGCTG----ATAATGACA-----T---GTG-TGA--C-AT-----TAGTGTGAATGGTGA---------------TGCTGTTG----------------TAGGTAG--T--GTTATTGTGGAAT-GTGGT---TTTGCTGCTGCTGCTT------ATGATGATGATGAATGATAATAGTGAGAATGGTGGTGgtggttttgctgctgctgcttatgatgatgatgaatgataatagtgagaatggtggtgttcaactg
gi|6 : TGTAGAAATCA---TAACAAAAAGATTTTTGAAAAGTTATTACCTTAA-GTGATG---------ATATAGATGCTTAAGTCCAC----TTAAATCACAGGAAACACTCTTCTTTAGATAAA---TAAGTGTCACAAGAAGTAGGTATTGTGCTTCAACAGTTTCTGTCTACAATGAAAGttcaactg
gi|7 : gTACCA-TG-TGTGTGTG-AT--ATTAATGTGAATG---------------TTGA---------T------------GTTTGCTGCTGCTGCTG----ATGATGA-------T---GTG-TGAGCT-GT-----TAATGT--ATGGTGATG-TTTACT----GCTGCTGATGA-TGATGATG-T--A-TGTGcttta
gi|8 : atcgactaatcatttaaaccttaaaaaagccaatacattt--GTTAGTGTGAACA---------------GTGA---------T------------G-------TTGCTTCTG----GTGATGGTG-----T---GTG-TGA--T-GT-----TAGTGTGAACAGTGATG-T-----------TGCTGATGA-TGATGATG------TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAACAGTGAT---GTTACTGCT--T----------ATGATGGTG-TGTGTAATGTGAGTGTGcca
gi|9 : GTGTGAATGGTAATGA---TCCTGCTG---CT-G-------TTGATGATGT---G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAATTATAAAA-----------AAGATGAAT
Alignments
lowQualScore : 11 1111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 222222222 2222 11111 222222222 2222 11 111111 1111111 111 6666666666666666666666666666 44444444444 222 1 11 222 1 1 1 222222 11 1 1 11
lowQualScore : 2 3 99 5555 1 8 99 7777777777777777777777777777777777777777777777777 2222 0 777777777 5 4444 22222 3 5 111111111 1 4 5555 4 22 66 4 777 3 111111 4 1 77 4444444 000 5 6666666666666666666666666666 77 3 0 9 77777777777 333 3 1 1 6 88 333 7 8888888 6 3 7 3 1 3 999999 1 1 88 1 5 1 1 0 33
lowQualScore : . . .. .... . . .. ................................................. .... . ......... . .... ..... . . ......... . . .... . .. .. . ... . ...... . . .. ....... ... . ............................ .. . . . ........... ... . . . . .. ... . ....... . . . . . . ...... . . .. . . . . . ..
lowQualScore : 5 2 88 0000 0 0 22 3333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1 999999999 0 8888 55555 1 0 444444444 0 0 8888 0 22 11 4 888 8 555555 0 2 88 7777777 000 7 9999999999999999999999999999 99 9 7 8 55555555555 333 3 0 0 7 33 333 3 7777777 7 3 3 3 0 3 000000 0 0 00 0 0 0 0 0 88
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGT-ATATTA-TG-TGNGTGTG-AT--GTTAGTGTGAATG---------------GTGA---------T------------G-------CTGCTGCTG----ATGATGATG-----T---GTG-TGAG-C-GT-----TAGTGTGAACGGTGATG-T----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATG-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGNTG------ATGATGATG-TGTGTGACGTTAGTGTGAATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
Reference ( family-2502 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGT-ATATTA-TG-TGNGTGTG-AT--GTTAGTGTGAATG---------------GTGA---------T------------G-------CTGCTGCTG----ATGATGATG-----T---GTG-TGAG-C-GT-----TAGTGTGAACGGTGATG-T----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATG-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGNTG------ATGATGATG-TGTGTGACGTTAGTGTGAATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|1 : TACTG-TGTTTATG----TGT-ATATCA-TA-NNNNNNNN-NN--GTTAGTGTGAATG---------------GTTA---------T------------G-------TTGCTGCTG----ATGATGATG-----TA--GTG-TGAG-CCGT-----TAGTGTGAATGGTTATG-T----T----GTTGCTGATGA-TGATGATACT--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATGGTGGT---ATTGCTCCTGCTGCTA------ATGATGATG-TGTGTGATGCTAGTGTGAATGATTATGA---T---ACTG---TT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTAAGTGTGAAATTATTCAATTATTTTTAAGCATCCATCTATTAAAATATACAA-----------AAGGTGAATGAACAATTCTATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTATCTGTACATTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTAAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTTGACATGTAGATACTTAAATCCCCCACTTTAAA-CACAGATAATGCTCTCATTTAAATAAGAATTAAGTAACACAATAAGTAGATA-TGGACTTAACCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTTAAAAACCAGAAATGTGTGATTATTTTTTTT--AACTCACT-TATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTAAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCATAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCGT
gi|10 : cacgatgttatgcagttaattttagtgaatagcaacgtcaacatcttaactgatataaaagattttgcattcattcaatataaaataaagtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcttgtttatatctattgagtgtgtcatcttgagggattggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttgtcttctaaaataccgcataatcactagcgttaacgatgatatatagtttcgggtactttttcatatcgcccatatcatgttgtaacataatagctctctgtttaaaattcagtagacagtcagttcaaagttcagcagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaaagcttacgattcaaattgctatgggacacaacttaacctaactgcacaaatgcagggtgtgtattatcatatatgttaatgaatgtgttgaaggttgaaaaactaattcaaattgtaatattgtgatgtaaataactagctgtttgatcatagacacaatgaacataataaatatatttgatactagtatttcaaaggtgtaaataaagattgtatctatactttgtatttaaattttgtttgcaatatctcagttgaaaagtagatttatgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaaatgaaatagataactgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagcttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtctgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaaatctgttacatttccagtttcagtaattgtgaggtatgaaaaaactgttgatgtgcaacacaaattatcaagttAAAGATTTTTGTTTAATTCAT--GTAATCTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|11 : TTT-TTTAAATGTTTTGTAAACTTTATTCGTGCATCTTTACATACATatcctcacattcttatccacatcttataataaaccttttta
gi|12 : taGCTGATGA-TGAT--TC-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-AAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAATAATGATG-TGTGTGATGatcctcacataacaaaccatttcaactannnnnnnnnnnnnnnn
gi|13 : -----T---GTG-TGAGAT-AT-----TAATGTGAACGTTGATGTT----T----ACTGCca
gi|14 : tctacaaatcatttaaaccttaaaaaagccaaaatattttaccacaTTGT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|15 : TGCTG----ATGATGATGCTAA-T---GTG-TGAG-CTGT-----TAGTGTAAAAAGTGATA-T----T----GCttcctcacataacaaaccttttcaact
gi|16 : CTGCTGA-TGATGATG-CTAA-TGTGTGAGCT--GTTAGTAT-AAATAGTG
gi|2 : TGCTGCCGCTGATA------ATGATGATG-TGTGTGATGCTAGTGTGCATGGTTATGATATT---GCTG---CT-G-------TTGATGATGTTGCG-TG----TG--ATGTTATTGTGAAATTATTTAATTATTTAAAAGCATCCATGTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAAATCAATTGTATTATTTAT---TTT-CTCTCCTCTACCTGTACAGTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTTAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATAACTTTAAAAA--TATTA---TAATTTAATACCTGTCAACATGTAGATAACTCAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACCCAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAATCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAAC------TATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTAAAAAACCAGAAATATCTGATTATTTTTTTCTGAACTCTCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAA
gi|3 : TGA-TGATAATA-CTAA-TGTGTGAGCT--GTAAATGT-AAATAGTGAT---AGTGCTGC------TG------ATGATGA-----TGTGACGTTAGTGTGAATGG---GGA---T---GCTG---TT-G-------T------------A-AA----TG--TTGTCATTGTGGAA
gi|3 : TAGTGCTGCTGATGATGATGTGACGTTAGTG-TGAATGGGGAT--GCTGTTGTAAATGTTGTCATTGTGGAAAGTGA---------TTTTGCTGCTGCTA-------CTGCTGCTG----ATGATGATGATTATT---ATGATGAG-T-GTGATATTAGTGTGAGTGGCGGTG-T----TTACTGCTGCTATTAAATGATGATG-T--AGTGTGTGA--G--GTAAGTGT-GAATGGTTAT---GTTGCTCCTGCTGATA------ATGATGATA-TGTGTGATGTTAGTATTAATAGTAATAT---T---GCTG---CTAA-------T------------GATGATAATG--ATGT--GTGTGAagtgattttgctgctgctactgctgctgatgatgatgattattatgatgagtgtgatattagtgtgagtggcggtgtttactgctgctattaaatgatgatgtagtgtgtgaggtaagtgtgaatggttatgttgctcctgctgataatgatgatatgtgtgatgttagtattaatagtaatattgctgctaatgatgataatgatgtgtgtgacg
gi|3 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgaTACTGCTGCTGATGATGATGA-TTATTA-TGATGAGTGTG-AT--ATTAGTGTGAGTG---------------GCGG---------T------------GTTTA---CTGCTGCTATTAAATGATGATG-----TAGTGTG-TGAG---GT-----AAGTGTGAATGGTTATG-T----T----GCTCCTGCTGA-TAATGATGAT--A-TGTGTGA--T--GTTAGTAT-TAATAGTAAT---ATTGCTGCTAATGATG------ATAATGATG-TGTGTGACGcg
gi|4 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgatagtgctgctgatgatgatgtgacgttagtgtgaatggggatgctgttgtaaatgttgtcattgtggaaagtgattttgctgctgcTAGTANN---NNNNNNNNTGCTGATG------ATGATGATG-TGTGTGATGTTAGTGTGAATAGTTATGT---A---GCTGCAACT-GTTGATGAT------------G-TA----TGAAATGTTAGTGTGAAATTTTTCAATTATAT-AAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAAAAAAAGAGTTGAAGATGAATAAAAAATTCAATTGTATTTTCTATAGATTTACTTTCATCTA
gi|5 : CTGCTGA-TGATGATG-TTAA-CGTGTGA--TCTGTTAGTGT-AAATAGTGATACTGCTGCTGCTGCTGCTG------ATAATGACA-TGTGTGACATTAGTGTGAATGG---TGA---T---GCTG---TT-G-------T------------A-GG----TA--GTGTTATTGTGGAAT
gi|5 : CTGCTGATGATGATGT-----TA-----ACGTGTG-ATCTGTTAGTGTAAATA---------------GTGATACTGCTGCT------------G-------CTGCTGCTG----ATAATGACA-----T---GTG-TGA--C-AT-----TAGTGTGAATGGTGA---------------TGCTGTTG----------------TAGGTAG--T--GTTATTGTGGAAT-GTGGT---TTTGCTGCTGCTGCTT------ATGATGATGATGAATGATAATAGTGAGAATGGTGGTGgtggttttgctgctgctgcttatgatgatgatgaatgataatagtgagaatggtggtgttcaactg
gi|6 : TGTAGAAATCA---TAACAAAAAGATTTTTGAAAAGTTATTACCTTAA-GTGATG---------ATATAGATGCTTAAGTCCAC----TTAAATCACAGGAAACACTCTTCTTTAGATAAA---TAAGTGTCACAAGAAGTAGGTATTGTGCTTCAACAGTTTCTGTCTACAATGAAAGttcaactg
gi|7 : gTACCA-TG-TGTGTGTG-AT--ATTAATGTGAATG---------------TTGA---------T------------GTTTGCTGCTGCTGCTG----ATGATGA-------T---GTG-TGAG-CTGT-----TAATGT--ATGGTGATG-TTTACT----GCTGCTGATGA-TGATGATG-T--A-TGTGcttta
gi|8 : atcgactaatcatttaaaccttaaaaaagccaatacattt--GTTAGTGTGAACA---------------GTGA---------T------------G-------TTGCTTCTG----GTGATGGTG-----T---GTG-TGA--T-GT-----TAGTGTGAACAGTGATG-T-----------TGCTGATGA-TGATGATG------TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAACAGTGAT---GTTACTGCT--T----------ATGATGGTG-TGTGTAATGTGAGTGTGcca
gi|9 : GTGTGAATGGTAATGA---TCCTGCTG---CT-G-------TTGATGATGT---G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAATTATAAAA-----------AAGATGAAT
blockSeqs : C A GA GTG A G CT TTGTCATTGTGGAAAGTGATTTTGCTGCTGCTA TTAA ATTATT A GAT GATAT C T TTACT A A CTA G GC CT G ACT C CTGCTA A T TT TATT CAA A TTGATGATGTTGCGTG AA T A AAAAAGAGTTG AGA A G T C GT CCT T CCTGTCA C T A T T C . A C TG T C T G G TT
blockSeqs : C A T TGA A . . GTGATACTGCTGCTG . CTAAT . GCT . A . TTACT C . CTA . GC . . . A . . T TA TCCT . . TTGATGATGTGTG . C A . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : C A . TG C . . TTGATGTTTGCTG . TAGT . GCT . T . T T . TTA . . . . . A . . C TT T . . TTGATGATGTA . T . . . .
blockSeqs : . T . . GCGGTGTTTA . T . GT . T . T C . AT . . . . . A . . T TG T . . TGATGATAA . T
blockSeqs : . GTGATG . T . G . T . T C . T . . . . . A . . C TA A . . TAAA . T
blockSeqs : . T . C . T . . T . T . . . . . C . . T . T . . TAGG . .
blockSeqs : T . T . C . . A . T . . . . . C . . C .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqCons : TG** GTGATGTTTGCTG************************************ T******** TTA*
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGT-ATATTA-TG-TGNGTGTG-AT--GTTAGTGTGAATG---------------GTGA---------T------------G-------CTGCTGCTG----ATGATGATG-----T---GTG-TGAG-C-GT-----TAGTGTGAACGGTGATG-T----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATG-T--A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGNTG------ATGATGATG-TGTGTGACGTTAGTGTGAATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGT-ATATTATG--TGNGTGTG-AT--GTTAGTGTGAATGGTGATGTTTGCTG------------------------------------CTGCTGCTG----ATGATGATGT--------GTG-TGAG-C-GT-----TAGTGTGAACGGTGATG-T----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATGTTA-A-TGTGTGA--T--GTTAGTGT-GAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGNTG------ATGATGATG-TGTGTGACGTTAGTGTGAATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
Alignments
lowQualScore : 11 1111 333333333333333 1111 111111 222222222 2222222222 333333333 1111 11111 1111111 1111111 111 6666666666666666666666666666 44444444444 222 1 11 222 1 1 1 222222 11 1 1 11
lowQualScore : 2 3 99 4444 1 1 6 77 555555555555555 4444 999999 6 1 666666666 6 4444444444 3 111111111 1 1 3 2222 77777 0 777 3 3333333 4 1 77 4444444 000 5 6666666666666666666666666666 77 3 0 9 77777777777 333 3 1 1 6 88 333 7 8888888 6 3 7 3 1 3 999999 1 1 88 1 5 1 1 0 33
lowQualScore : . . .. .... . . . .. ............... .... ...... . . ......... . .......... . ......... . . . .... ..... . ... . ....... . . .. ....... ... . ............................ .. . . . ........... ... . . . . .. ... . ....... . . . . . . ...... . . .. . . . . . ..
lowQualScore : 5 2 88 5555 0 0 7 99 777777777777777 6666 222222 7 7 000000000 7 0000000000 3 555555555 0 0 6 4444 88888 5 000 8 8888888 0 2 88 7777777 000 7 9999999999999999999999999999 99 9 7 8 55555555555 333 3 0 0 7 33 333 3 7777777 7 3 3 3 0 3 000000 0 0 00 0 0 0 0 0 88
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGT-ATATCA-TG-TGNGTGTG-AT--GTTAGTGTGAACG---------------GTGATGTT--TGCTGCTGCT------GCTGA-TGATGATG-----T---GTG-TGAGC-GT-----TAGTGTGAATGGTGATGT----T----GCTGCTGCTGA-TGATGATGCTAATGTGTGA--T--GTTAGTGTGAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGNTG------ATGATGATG-TGTGTGACGTTAGTGTGAATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
Reference ( family-2502 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTGCTGCTGATGATGATGT-ATATTA-TG-TGNGTGTG-AT--GTTAGTGTGAATG---------------GTGATGTT--TGCTGCTGCT------GCTGA-TGATGATG-----T---GTG-TGAGC-GT-----TAGTGTGAACGGTGATGT----T----GCTGCTGNTGA-TGATGATGTTAATGTGTGA--T--GTTAGTGTGAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGNTG------ATGATGATG-TGTGTGACGTTAGTGTGAATGGTNATGA---T---GCTG---CT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAATTCAATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTACCTGTACANTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTNAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTCGACATGTAGATACTTAAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACACAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAANCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTNAAAAACCAGAAATGTNTGATTATTTTTTTCTGAACTCNCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTNAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCANAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|1 : TACTG-TGTTTATG----TGT-ATATCA-TA-NNNNNNNN-NN--GTTAGTGTGAATG---------------GTTATGTT---------GCT------GCTGA-TGATGATG-----TA--GTG-TGAGCCGT-----TAGTGTGAATGGTTATGT----T----GTTGCTGATGA-TGATGATACTA-TGTGTGA--T--GTTAGTGTGAATGGTGGT---ATTGCTCCTGCTGCTA------ATGATGATG-TGTGTGATGCTAGTGTGAATGATTATGA---T---ACTG---TT-G-------T------------G-TG----TG--ATGTAAGTGTGAAATTATTCAATTATTTTTAAGCATCCATCTATTAAAATATACAA-----------AAGGTGAATGAACAATTCTATTGTATTATCTAT---TTT-CTCTCATCTATCTGTACATTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTAAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATATCTTTAAAAA--TATTA---TAATGTGATACCTGTTGACATGTAGATACTTAAATCCCCCACTTTAAA-CACAGATAATGCTCTCATTTAAATAAGAATTAAGTAACACAATAAGTAGATA-TGGACTTAACCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAACTACCAGTATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTTAAAAACCAGAAATGTGTGATTATTTTTTTT--AACTCACT-TATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTAAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATGAAATCCTCATAAAACTATGCTTGATTTTTTAATCCTTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCGTACATGTATGTAAAAGATTTTT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCGT
gi|10 : cacgatgttatgcagttaattttagtgaatagcaacgtcaacatcttaactgatataaaagattttgcattcattcaatataaaataaagtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcttgtttatatctattgagtgtgtcatcttgagggattggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttgtcttctaaaataccgcataatcactagcgttaacgatgatatatagtttcgggtactttttcatatcgcccatatcatgttgtaacataatagctctctgtttaaaattcagtagacagtcagttcaaagttcagcagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaaagcttacgattcaaattgctatgggacacaacttaacctaactgcacaaatgcagggtgtgtattatcatatatgttaatgaatgtgttgaaggttgaaaaactaattcaaattgtaatattgtgatgtaaataactagctgtttgatcatagacacaatgaacataataaatatatttgatactagtatttcaaaggtgtaaataaagattgtatctatactttgtatttaaattttgtttgcaatatctcagttgaaaagtagatttatgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaaatgaaatagataactgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagcttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtctgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaaatctgttacatttccagtttcagtaattgtgaggtatgaaaaaactgttgatgtgcaacacaaattatcaagttAAAGATTTTTGTTTAATTCAT--GTAATCTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|11 : TTT-TTTAAATGTTTTGTAAACTTTATTCGTGCATCTTTACATACATatcctcacattcttatccacatcttataataaaccttttta
gi|12 : taGCTGA-TGATGATTCTA-TGTGTGA--T--GTTAGTGTAAATAGTGAT---GTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAATAATGATG-TGTGTGATGatcctcacataacaaaccatttcaactannnnnnnnnnnnnnnn
gi|13 : TACCA-CA-TGTGTGAG-AT--ATTAATGTGAACG---------------TTGATGTT--TACTGCca
gi|14 : tctacaaatcatttaaaccttaaaaaagccaaaatatttTTGT-TTTAATTGAT--GTAAACTTTATTAGTGCATCTTTACATGCAT
gi|15 : TGCTGA-TGATGATGCTAATGTGTGAGCT--GTTAGTGTAAAAAGTGAT---ATTGCttcctcacataacaaaccttttcaact
gi|16 : CTGCTGA-TGATGATGCTAATGTGTGAGCT--GTTAGTATAAATAGTG
gi|2 : TGCTGCCGCTGATA------ATGATGATG-TGTGTGATGCTAGTGTGCATGGTTATGATATT---GCTG---CT-G-------TTGATGATGTTGCG-TG----TG--ATGTTATTGTGAAATTATTTAATTATTTAAAAGCATCCATGTATTAAAATATAAAA-----------AAGATGAATGAACAAATCAATTGTATTATTTAT---TTT-CTCTCCTCTACCTGTACAGTGTTTTGTGTTGGTGCTTCTGTTTAGCTGTACAGCACAACAGAATTATATGGAGATCACAATAACAAAAATAACTTTAAAAA--TATTA---TAATTTAATACCTGTCAACATGTAGATAACTCAATCCACCACTTTAAA-CACAGATAATACTCTCCTTTAAATAAGAATTAAGTAACCCAAGAAGTAGATA-TGGGCTTAATCAGTTT-TGTCCACAATGAAAGTAAGGAAC------TATAGAAGAAATTCCTTAATGAATGTAAAAAACCAGAAATATCTGATTATTTTTTTCTGAACTCTCTCTATAAAATCCTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGCACTTATAAAATCCTCAGAAAA
gi|3 : TGA-TGATAATACTAATGTGTGAGCT--GTAAATGTAAATAGTGAT---AGTGCTGCTG------------ATGATGATG-TG----ACGTTAGTGTGAATGG---GGA---T---GCTG---TT-G-------T------------A-AA----TG--TTGTCATTGTGGAA
gi|3 : TAGTGCTGCTGATGATGATGTGACGTTAGTG-TGAATGGGGAT--GCTGTTGTAAATGTTGTCATTGTGGAAAGTGAT-TT--TGCTGCTGCTACTGCTGCTGA-TGATGATGATTATT---ATGATGAGT-GTGATATTAGTGTGAGTGGCGGTGT----TTACTGCTGCTATTAAATGATGATGT-AGTGTGTGA--G--GTAAGTGTGAATGGTTAT---GTTGCTCCTGCTGATA------ATGATGATA-TGTGTGATGTTAGTATTAATAGTAATAT---T---GCTG---CTAA-------T------------GATGATAATG--ATGT--GTGTGAagtgattttgctgctgctactgctgctgatgatgatgattattatgatgagtgtgatattagtgtgagtggcggtgtttactgctgctattaaatgatgatgtagtgtgtgaggtaagtgtgaatggttatgttgctcctgctgataatgatgatatgtgtgatgttagtattaatagtaatattgctgctaatgatgataatgatgtgtgtgacg
gi|3 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgaTACTGCTGCTGATGATGATGA-TTATTA-TGATGAGTGTG-AT--ATTAGTGTGAGTG---------------GCGGTGTT--TACTGCTGCT------ATTAAATGATGATG-----TAGTGTG-TGAG--GT-----AAGTGTGAATGGTTATGT----T----GCTCCTGCTGA-TAATGATGATA-TGTGTGA--T--GTTAGTATTAATAGTAAT---ATTGCTGCTAATGATG------ATAATGATG-TGTGTGACGcg
gi|4 : tgatgataatactaatgtgtgagctgtaaatgtaaatagtgatagtgctgctgatgatgatgtgacgttagtgtgaatggggatgctgttgtaaatgttgtcattgtggaaagtgattttgctgctgcTAGTANN---NNNNNNNNTGCTGATG------ATGATGATG-TGTGTGATGTTAGTGTGAATAGTTATGT---A---GCTGCAACT-GTTGATGAT------------G-TA----TGAAATGTTAGTGTGAAATTTTTCAATTATAT-AAAGCATCCATCTATTAAAATATAAAAAAAAAGAGTTGAAGATGAATAAAAAATTCAATTGTATTTTCTATAGATTTACTTTCATCTA
gi|5 : CTGCTGA-TGATGATGTTAACGTGTGA--TCTGTTAGTGTAAATAGTGATACTGCTGCTGCTGCTGCTG------ATAATGACA-TGTGTGACATTAGTGTGAATGG---TGA---T---GCTG---TT-G-------T------------A-GG----TA--GTGTTATTGTGGAAT
gi|5 : CTGCTGATGATGATGT-----TA-----ACGTGTG-ATCTGTTAGTGTAAATA---------------GTGATACTGCTGCTGCTGCT------GCTGA-TAATGACA-----T---GTG-TGA-C-AT-----TAGTGTGAATGGTGA--------------TGCTGTTGT-AGGTAGTGTTATTGTG----------------GAAT-GTGGT---TTTGCTGCTGCTGCTT------ATGATGATGATGAATGATAATAGTGAGAATGGTGGTGgtggttttgctgctgctgcttatgatgatgatgaatgataatagtgagaatggtggtgttcaactg
gi|6 : TGTAGAAATCA---TAACAAAAAGATTTTTGAAAAGTTATTACCTTAA-GTGATG---------ATATAGATGCTTAAGTCCAC----TTAAATCACAGGAAACACTCTTCTTTAGATAAA---TAAGTGTCACAAGAAGTAGGTATTGTGCTTCAACAGTTTCTGTCTACAATGAAAGttcaactg
gi|7 : gTACCA-TG-TGTGTGTG-AT--ATTAATGTGAATG---------------TTGATGTT--TGCTGCTGCT------GCTGA-TGATGA-------T---GTG-TGAGCTGT-----TAATGT--ATGGTGATGTTTACT----GCTGCTGATGA-TGATGATGT--ATGTGcttta
gi|8 : atcgactaatcatttaaaccttaaaaaagccaatacattt--GTTAGTGTGAACA---------------GTGATGTT---------GCT------TCTGG-TGATGGTG-----T---GTG-TGA-T-GT-----TAGTGTGAACAGTGATGT-----------TGCTGATGA-TGATGATG----TGTGTGA--T--GTTAGTGTGAACAGTGAT---GTTACTGCT--T----------ATGATGGTG-TGTGTAATGTGAGTGTGcca
gi|9 : GTGTGAATGGTAATGA---TCCTGCTG---CT-G-------TTGATGATGT---G-TG----TG--ATGTTAGTGTGAAATTATTCAATTATTTAAAAGCATCCATCTATTAAATTATAAAA-----------AAGATGAAT