lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 222222222 444444444444444444444444444444444444444 444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111 555555555555555555555555555555555 44444 3333 111 1 1 2222222 1 2 2222 1 2222 444444444444444444444 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 1111111 444444444444 11 1 1 1 111 11111 333333333 88888888888888888888888888888888888888888 11111111 1 1111 1 222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 222222222 4444444 333 4444 1111111111111 6666666666666666666666 4444444444444444444444444444444444444444 777777777777777777777777777777777777777777777777 1
lowQualScore : 99 9 55 888 1 5555 2 3 000000000 666666666 222 000000000000000000000000000000000000000 1 1 1 666666666666666666666666666666666666666666666 6 333 1 1 3333333333 0 111111111111111111111111111111111 4 0 0 3 1 33333 5 1111 5 6 0 000 11 11 1 0 2 7 3333333 4 5 5 7 7 0 4 2 4 0 4 1 888 1 55 4 3333 4 5 3 2222 88 7 5 99999 7 777 888888888888888888888 00 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 99999 1 6666666 444444444444 33 66 4 2 5 6 666 22222 888888888 5 0 66 777 5 0 0 7 9999 88888888888888888888888888888888888888888 44444444 4 8 4 5555 6 444 8 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 000000000 666 0000000 000 44 0000 3 3 1 6666 8888 99999 88888888888 4444 2222222222222 6 222 555 2 1 333 2 1 2 1 6666666666666666666666 1 11 22222 2222222222222222222222222222222222222222 4 555555555555555555555555555555555555555555555555 6 7
lowQualScore : .. . .. ... . .... . . ......... ......... ... ....................................... . . . ............................................. . ... . . .......... . ................................. . . . . . ..... . .... . . . ... .. .. . . . . ....... . . . . . . . . . . . . ... . .. . .... . . . .... .. . . ..... . ... ..................... .. ....................................................................................................... . ..... . ....... ............ .. .. . . . . ... ..... ......... . . .. ... . . . . .... ......................................... ........ . . . .... . ... . .......................................................................................................................... ......... ... ....... ... .. .... . . . .... .... ..... ........... .... ............. . ... ... . . ... . . . . ...................... . .. ..... ........................................ . ................................................ . .
lowQualScore : 88 3 55 222 7 7777 4 7 000000000 444444444 777 555555555555555555555555555555555555555 5 5 1 888888888888888888888888888888888888888888888 0 000 7 7 2222222222 3 666666666666666666666666666666666 0 8 5 1 9 33333 7 7777 7 0 7 000 66 44 6 4 2 8 7777777 3 6 0 4 0 4 4 9 4 6 4 0 888 0 22 4 1111 8 0 9 1111 77 0 2 99999 2 888 222222222222222222222 66 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 00000 4 2222222 333333333333 66 99 5 6 0 8 999 55555 888888888 0 4 66 000 0 1 8 2 4444 22222222222222222222222222222222222222222 55555555 1 0 4 9999 8 777 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 999999999 444 9999999 444 22 7777 1 1 5 5555 9999 11111 44444444444 0000 7777777777777 2 333 222 4 1 555 2 1 2 1 2222222222222222222222 1 66 99999 3333333333333333333333333333333333333333 4 444444444444444444444444444444444444444444444444 6 0
consensus : AATAGAGCTCT--GTGAGACCGCATAGAG----C-TCCCG---------A---------CGCATAGA---GCT-C-------C------C---------G-----G------GG-A-GCTCTATGCG---T---C-----A-A---G-----CC------TC--G--A----CGCATAGAG---C-T-C----------TATG-CNT--CGAA-----TATACAC-A--TCA-ACTTTA-AAACGGGTCTGACATCTTGACG-CATAGAGCTCCCGAA--TTAAA-AATG-AT-AGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTA---AATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAAT-TCGGA-TTTTTCC-TTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACC-CCTATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTA-CGACGACGGAN-TAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGAT----CC--CG----TCA----TTTT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT----GG-------G-CGTTTATAAAGTGTGTACAAG--G--GGGTCTTTGTTG-------ATTAGGTGTTAATT---G---TTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATT-----AGTGAA--GA-A--A-ATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAA----GAGGTGTT---------G------------T------------CC----TT--------CATAAAGTAACATTTTATATTGTATA-TTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAG-AAANNNNGNNNCGNATNNNGNNNNGNTGNNNNTNNNACGGTGANGACGATGNTGANGNNNNTGGNGACGACGNTGNNGANGANGANGACGATGNTAAANCGANCGNNANTAATGATNGTTATCGTTGTTGTTGT---------G---GAA---GAAGTGGTAGATGTTGTA-CTAG--TTCT-CTAAA-TA-GTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT----ATA----TCCAAAT-----CG-----A-----AGAGCTCTATG----CG--GGA---T----TATGGGG---CAT-ATT-G-A---CG-CAT-AGAGCT-C-C--------C----G----GC-GGGGA-GCT--CTATGC-----G-------G--TT--TT-----ATA------A--T-C---GAC-GCATAGAGC-------T---C---T----C-G---C-----G-----G---------AGCTCTATGCGGTCT
Reference ( gi|1 ) : AATAGAGCACT--GTAGTACTGCATAGAG----C-TCCCG---------A---------CGCATAGA---GCT-T-------C------C---------A-----G------GG-A-GCCCTATGCG---T---T-----A-A---G-----TC------TC--G--A----CGTATAGAG---C-T-C----------TATG-GCC--CAAG-----TATACAA-A--TCA-ACATTA-AAACGGGTCTGACATCTTGACG-CATAGAGCTCTC-----TTAAA-A-TA-AT-AGTCGTACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGAAGTGTCTAAATGTACATCAGCACTGTTGTTTA---CATATACACTAAAATCCTGCATTAGGACCAT-CTTTATTATAAAAT-TCGGA-TTGTTCC-TTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCAAC-GCTATATTCGGTATTAGGACAGTTTGTA-TACCGACGGAA-TAGCGTATTTTCCTTTAATTTGACTCCGAAAATTGG---ACCACCAGTTGAT----TC--CC----TC-----TTTT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT----CG-------G-CGTTTATAAAGTGTGTACAAG--A--GGGTCTTTGTTG-------ATTAGGTGTTAATT---G---TT---CAGCATCTCGGTTACACTAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAAAATTA-AAAATGTTTCATGTGTACCATGTATT-----AGTGA---GA-A--A-ATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTAAAA----GAGGTGTT---------G------------T------------CT----TT--------CATAAAGTAACTTTTTGTATTGTATA-TTTAAGAAATTTTGTCACTGTTATCTGAG-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTGTTGTTGT---------G---GAA---G---TGGTAGATGTTGTA-C-AG--TTCT-T--AA-TA-GTCTTAATTAATATTGAAGTCGAT----ATA----TCCAAAT-----CG-----A-----AGAGCTCTATG----CG--GGA---T----TATGGGG---CAT-ATT-G-A---CG-CAT-AGAGCT-C-C--------CA---A--AAGT-AGGGA-GCT--CTATGC-----G-------G--TT--TT-----ATA------A--T-C---AAC-GCATAGAGC------GT---C---T----C-A---C-----G-----G---------AGCTCTGTGCGGACT
gi|18 : AATA-AGCTCT--AT-GCATTGCGT------------CCG---------A---------CGCATCGA---GCT-C-------C------G---------G-----G------GG-A-GCCCTATGCA---T---T-----A-G---G-----CC------TC--G--A----CGAATAGAG---C-T-CCCAGGAGCTTTATACGTC--CAA------TATACAC-A--TCA-ACTTTA-AATTGTGTCTGACATCTTGACG-CAAAGAGATCCTGAA--TTAAA-AATG-AT-AGTCATACTGGCAGTC---ACGTTATTTGCTAGACACTTAACGCCATCATTAATACAATTATGTAGTGTCTAAATGTCCATCAGCATTATTGTTTA---AATCTTCACTAAAA
gi|6 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccATAAAGCTGT--GTTATACTGTACAGAG----C-CCCTG---------A---------CGCATAGA---GCC-C-------CTGACG-C---------A-----T------AG-A-GCCC---------T---T-----G-A---C-----CC------CT--G--A----CGCATAGAG---CAT-C----------T
gi|24 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatactgaagtcgatatatccaaatatccccgccgtcaggagctccatgcgtcATAG-GCAGT--GTGAGACCGTATAGAG----C-TCATG---------A---------CTGATAGA---GCT-T-------C------catattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|4 : tctgtgcgtcaAGAGCTCTATGTGGGATT--ATGGGG----CATATTG---------A---------CGCATAGA---GCTCT-------C------C---------GCCGCCG------GA-A-TTTCTACGCG---T---TTTTATA-A-----------------TC--G--A-----------AG---C-T-C----------TATG-attgaaac
gi|3 : gtgtttgtatatatagattgccgtccctatattcggtattatgacctattgtacagcgacggatttgtgtattttctttaaatttaactccggacagtggaccactagttgatcccgtcattctttttcacttctattttttcaggtaaatgttaatgtcattggtcgtttataaagtgtgggtctttgttgattaggtgtcaattgttattcagcatctcggttacataagtgtcattatatgtgtcccatgtaataaatagatgatgaatattaaacatgtttcatgtgttaaatatattataagaggaagaagaattcatttttataaatgaacattattcaattattgtttaattattgaaagaggtgttgtttagaattccatcctgcataaagtaacagtttatattgtatatttcaagaatttggtcactgtaaatggagaaaaatgataacgaatctaatgatgatgattgtgatactgtgaaaatgataatgagaattttaaagacaatgttaaagataaagataatgataataaaatcgacagcaatgatgattgttatcgttgttgttgtggaagaagtagtagatgttgtattagttttctaaaatgtcttaatttatgttgaagtcgctcgacttcatatcggcgcatagagctttccgccgccaggagctctgtgtggttttataatcgaGCCCC--ATAATCCCGCATAGAG----C-TCCTG---------A---------CG----G-----------------------C---------G-----G------AG-A-GATCTATGCG---T---C-----A-ATATG-----CC------CC--AT-AATCCCGCATAGAG---C-TCC----------TATcggtctcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|2 : ctgttatttaaagcaacaccaaaaccccgcattaggacaatcgctataataaaattcggattttccctttcatttaatgattattttgtttaataataatattgccacccctatattcagtataaggaccgcttgtacgacgatggattagtgtattttcttttaattttactccggaaattggcggactaccagttgatctagttattctttttcacttctgtttttttcaggtgaaggttatcaacaaatcattgagcgtttataaagtgtgtacaatggggtttatgttgattaggtattagttgttattcagcatctcggttacatcagtgtcatttagtttgtcccatgtaagaaaaaaatgataaagattaaatatgtttcatgtttgcaatgtatcagtgaaagaagaattaatttattttttattaattaacatcattcaattatacactatagttgcatttttaatcattgaaagaggtgttgttatgaattgcgtccttaataaagtaacacttgatattgtatatttcaagaatttaatcactgttggtggaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgacagcaatgatgactgttatcgttgtggaagaagttgtagatgttgtactagttttctaaataatttaattaatactgaaatcgaatgcggttttatGCTCT--GTGAGACCACATAGAGGTCCT-TCCTT---------A---------CGTAT--A---GCC-T-------CGACG--T---------A-----A------AG-A-GCTCTATGCG---T---C-----A-A---atattggcgcatagatctctctgcggtcgggagctctatgtc
gi|8 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcATT--ATAAAACCGCATAGAG----C-TCCAG---------A---------CG----G-----------------------C---------G-----G------GG-A-GCTCTATGCG---T---C-----A-ATATG-----CCCCATAATC--C--A-----GCATAGAG---C-T-C----------Tctttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|4 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaT--GTGAGACCGCATAGAG----C-T-TCGATTATAAAAA---------CGCGTAGA---AAT-T-------CCGGCGGC---------G-----G------AG-A-GCTCTATGCG---T---C-----A-ATATG-----CC------CC--AT-AATCCCACATAGAG---C-T-C----------T------T--CGAT-----TATA-AA-A--CCACACAcgacgc
gi|17 : gtgtttgtatatatagattgccgtccctatattcggtattatgacctattgtacagcgacggatttgtgtattttctttaaatttaactccggacagtggaccactagttgatcccgtcattctttttcacttctattttttcaggtaaatgttaatgtcattggtcgtttataaagtgtgggtctttgttgattaggtgtcaattgttattcagcatctcggttacataagtgtcattatatgtgtcccatgtaataaatagatgatgaatattaaacatgtttcatgtgttaaatatattataagaggaagaagaattcatttttataaatgaacattattcaattattgtttaattattgaaagaggtgttgtttagaattccatcctgcataaagtaacagtttatattgtatatttcaagaatttggtcactgtaaatggagaaaaatgataacgaatctaatgatgatgattgtgatactgtgaaaatgataatgagaattttaaagacaatgttaaagataaagataatgataataaaatcgacagcaatgatgattgttatcgttgttgttgtggaagaagtagtagatgttgtattagttttctaaaatgtcttaatttatgttgaagtcgctcgacttcatatcggcgcatagagctttccgccgccaggagctcT--GCGGGACCACATAGAG----C-TCCTT---------A---------CCC-TAG-----CT-C-------C------C---------C-----G------AGTA-GATTTATGCG---T---T-----A-C---G-----TC------CT--G--A----CGCATAGAG---A-T-C----------cggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|9 : T--GTGAGACCGCAAAGAG----C-T------------------------GC-TGGA----CT-T-------C------CGACGAC---A-----G------GG-T-GCTCTATACG---TCATT-----A-T---G-----CC------CC--ATAATCC-CGTATAGAG---C-T-C----------Tccggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|2 : aaaatagagatgataaagattaaatttgttttatgtgtgcaatatgttagtgaatgaagaattcatttatttttataaattaacatcatttaagtatacactatagttgcattttttaatcattgaaagaggtgttgtccttcacgaagtaacattttttatcgtatagttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaACCGCATAGAG----C-TCCCG---------A---------CA-----A----------------------C---------G-----G------GG-T-GCTCTACGCG---T---C-----A-ATATG-----CC------ACACG--ATCC-CACATAGAG---C-T-C----------TTCG-ATT--TGGA-----TAT-----A--TCA-ACTTCA-AAAt
gi|20 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgaACCGCATAAAG----C-TCC-G---------ATTATAAAACCTCATAGA---GCG-T-------C------C---------C-----GCCGTCGGG-ATGCCCCAT------------------A---A-----TC------CC-----A----C--ATAGAG---C-T-C----------Tttaataatcg
gi|22 : aataaagtctacgactcgtgatgtttggtttacgttgttgatgtggaagaagtggtagatgttgtactagttctctaaatagtctttatatatattgaagtcaatatatccaaacgaACCGCATAGAG----C-TCCTG---------A---------CGCATAGACGCGCT-T-------CTGACG-C---------A-----G------TA-T-GCCCCAT------------------A---A-----TC------C-----------CGCATAGAG---C-T-C----------TTCG-ATT--CGGA-----TATATCG-ACTTCA-GTATTA-ctcacccggc
gi|10 : ggtagatgctgtactagttctctaaatagtctcaaaTGCATAGAG----C-TCCCGGGAAGCCCTA---------TGCGTTAA---GCC-T-------C------C---------C-----G------TG-A-GGTCTATGCG---T---C-----A-A---A-----Tttca
gi|10 : tgaGCATAGAC----C-TCACGGGAGGCTTAA---------CGCATAGG---GCT-T-------C------C---------C-----G------GG-A-GCTCTATGCA---T---C-----A-atacacatcaactttaaaacgggtcctacatctctacgcatagagctcacgaattaaaaatactattcatactgatagtctttacgttatttgctagaccctaaacgccatcattactataaatatatagcactgctgtttaaatctacactaaaaccccgcattagaatcatctctataataaaattcggatttttcctttaaatttgatccttatgtttaataataatattgtcacccctctattttgtattaggaccgcttggatgacgacggaattagtgtattgtcttttaactccggccatggggccaccagtttatcacgtcattcttattcacttctgtttttgttcaggtgaatg
gi|17 : -TCCTG---------A---------CGCATAGA---GAT-C-------C------C---------G-----G------GG-A-GCCCATTGTG---T---T-----A-A---G-----CC------TC--G--G----TGTATAGAG---C-T-CCCGATC----TATG-CGT--CAAA-----TATGCTTTA--T-A-ACTTTATAAATGGATCTGACATTTTGACG-CCTAGAGCTCCCGAA--TTAAA-AACG-AT-AGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGTTAGACCCTAAACGCCATCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCTATTAACACCGTTGTTT----C---TACACTATAACCCTGCATAAGGACgtcaaatatacacatcaactttaaaacgggtcctacatctctacgcatagagctcacgaattaaaaatactattcatactgatagtctttacgttatttgctagaccctaaacgccatcattactataaatatatagcactgctgtttaaatctacactaaaaccccgcattagaatcatctctataataaaattcggatttttcctttaaatttgatccttatgtttaataataatattgtcacccctctattttgtattaggaccgcttggatgacgacggaattagtgtattgtcttttaactccggccatggggccaccagtttatcacgtcattcttattcacttctgtttttgttcaggtgaatg
gi|15 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacg-TCTTG---------A---------CGCATGGA---GCT-C-------C------CCTCCGCCGTA-----G------AG-A-GTTCTGTGCGGTTT---T-----ATA---A-------------TC--G--A----CGAATACAG---T-T-
gi|18 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacaCCTA---------A---------TGCATAGG---GCT-C-------C------C---------C-----C------GG-A-GCTCGATGCG---T---C-----G-----G-----AC------GC--A--A----TGCATAGAG---C-T------------TATagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|4 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccaCG---------G---------CGCATAGA---GCT-TTCCGCCGC------C---------A------------GG-A-GCTCTGTGTGGTTT---T-----ATA---A-------------TC--G--A---------AGAG---C-T-C----------TATG------TGGG----------------------ATT----ATGGG----GCATATTGACG-CATAGAGCTCTC-----cctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|3 : gtgtttgtatatatagattgccgtccctatattcggtattatgacctattgtacagcgacggatttgtgtattttctttaaatttaactccggacagtggaccactagttgatcccgtcattctttttcacttctattttttcaggtaaatgttaatgtcattggtcgtttataaagtgtgggtctttgttgattaggtgtcaattgttattcagcatctcggttacataagtgtcattatatgtgtcccatgtaataaatagatgatgaatattaaacatgtttcatgtgttaaatatattataagaggaagaagaattcatttttataaatgaacattattcaattattgtttaattattgaaagaggtgttgtttagaattccatcctgcataaagtaacagtttatattgtatatttcaagaatttggtcactgtaaatggagaaaaatgataacgaatctaatgatgatgattgtgatactgtgaaaatgataatgagaattttaaagacaatgttaaagataaagataatgataataaaatcgacagcaatgatgattgttatcgttgttgttgtggaagaagtagtagatgttgtattagttttctaaaatgtcttaatttatgttgaagtcgctcgacttcatatG---------A---------CGCATAGA---TCTCT-------C------C---------GCCGTCA------GG-A-GCTCTATGCGGGAT---T-----A-T---GGGGCATA------TT--G--G----CGCATAGAT---C-T-C----------TCTG-cgccgccggaatttctacgcgtttttataatcgaagctctatgcggtctcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|10 : ctgttatttaaagcaacaccaaaaccccgcattaggacaatcgctataataaaattcggattttccctttcatttaatgattattttgtttaataataatattgccacccctatattcagtataaggaccgcttgtacgacgatggattagtgtattttcttttaattttactccggaaattggcggactaccagttgatctagttattctttttcacttctgtttttttcaggtgaaggttatcaacaaatcattgagcgtttataaagtgtgtacaatggggtttatgttgattaggtattagttgttattcagcatctcggttacatcagtgtcatttagtttgtcccatgtaagaaaaaaatgataaagattaaatatgtttcatgtttgcaatgtatcagtgaaagaagaattaatttattttttattaattaacatcattcaattatacactatagttgcatttttaatcattgaaagaggtgttgttatgaattgcgtccttaataaagtaacacttgatattgtatatttcaagaatttaatcactgttggtggaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgacagcaatgatgactgttatcgttgtggaagaagttgtagatgttgtactagttttctaaataatttaattaatactgaaatcgaatgcggttttatataggagctctatgcgggattatggggcatattG---------A---------TGCATAGA---GCT-C-------C------C---------G-----G------GA-A-GCCCTATGCG---T---T-----A-A---G-----CC------TC--C-------CGT---GAG---G-T-C----------TATG-CGT--CAAA-----TATACAC-A--TCA-ACTTTA-AAACGGGTCCTACATCTCTACG-CATAGAGCTCACGAA--TTAAA-AATA-CT-ATTCATACTGATAGTCTTTACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTACTATAAATAT-----------------AT-AGCACTGCTGTTTA---AATCTACACTAAAACCCCGCATTAGAATCAT-CTCTATAATAAAAT-TCGGA-TTTTTCC-TTTAAATT--TGATCC---TTATGTTTA-ATA-ATAATATTGTCACC-CCTCTATTTTGTATTAGGACCGCTTGGA-TGACGACGGAATTAGTGTATTGTCTTTTA-----ACTCCGGCCATGGG---GCCACCAGTTTAT----CA--CG----TCA----TTCTTATTCACT--T-C-T-----GTTT---------T----------TG----------TT---------------CAGGT-----------------cggtcgggagctctatgtc
gi|8 : tG---------A---------CGCATAGA---GCT-C-------C------C---------C-----GCCGTCTGG-A-GCTCTATGCG---gaatg
gi|23 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatatt---------A---------CGTATAAA---GAT-C-------C------C---------G-----G------GT-A-GCCCTATGCG---T---T-----A-A---G-----CC------TC--G--A----CGAAAAGGG---C-T-C----------TATG-gttttataatcgacgc
gi|23 : acgcatagatctcctcgctgatctctatgcgttgcgttctt---------A---------CGCATAGG---GCT-A-------C------C---------C-----G------GG-A-TCTTTATACG---T---A-----A-G---A-----AC------GC--A--A----CGCATAGAG---A-T-C----------cgtcgaa
gi|2 : acgcatagatctcctcgct---------CACATAGA---GGT-C-------C------T----------------------------TCCT-TACG---T---A-----T-A---G-----CC------TC--G--A----CGTAAAGAG---C-T-C----------TATG-CGT--CAAC-----TTTACAC-A--TCA-ACTTTA-AAACTTGTCTGACGTCTTAACG-CATAGAACtaagcctcgacgaaaagggctctatgcgtcgaa
gi|17 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagacGG---GCT-C-------C------C---------C-----G------GG-A-TCTCTATGCG---T---C-----A-G---G-----AC------GT--A--A----CGCATAAA------T-C----------TAgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|3 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgag------GG-A-GCTCTATGCGGGAT---T-----A-T---GGGGCATA------TT--G--A----CGCATAGAT---C-T-C----------TCCG--CCGTCAGGAGCTCTATGCGG-G--------ATTA----TGGG----GCATATTGGCG-CATAGATCTCTC-----Tattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|15 : ctgttatttaaagcaacaccaaaaccccgcattaggacaatcgctataataaaattcggattttccctttcatttaatgattattttgtttaataataatattgccacccctatattcagtataaggaccgcttgtacgacgatggattagtgtattttcttttaattttactccggaaattggcggactaccagttgatctagttattctttttcacttctgtttttttcaggtgaaggttatcaacaaatcattgagcgtttataaagtgtgtacaatggggtttatgttgattaggtattagttgttattcagcatctcggttacatcagtgtcatttagtttgtcccatgtaagaaaaaaatgataaagattaaatatgtttcatgtttgcaatgtatcagtgaaagaagaattaatttattttttattaattaacatcattcaattatacactatagttgcatttttaatcattgaaagaggtgttgttatgaattgcgtccttaataaagtaacacttgatattgtatatttcaagaatttaatcactgttggtggaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgacagcaatgatgactgttatcgttgtggaagaagttgtagatgttgtactagttttctaaataatttaattaatactgaaatcgaatgcggttttatata------TT--G--A----CGCATAGAGGAGC-T-A----------TATG-CGT--CAAA-----TATACAC-A--ACA-ACTTTA-AAACGGGTCTGACATCTTGACG-CATGGAGCTCCC-----CTgcggtcgggagctctatgtc
gi|13 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcata-AAACGGGTTTGACATCTTGACA-CATTGAATTCCCGAA--TTAAA-AATGGAT-AGTCACAAGGACTTTC---ACGCTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCGTTATTATAATTATACAGTGTCTAAATGTCCATCAGTACTGTTGTTTA---AATCTGCACTAAAACCCCGTATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAAT-TCTGA-ATTTTCC-TTTTATTTAATAATCA---TTTAGCTTA-GTA-ACAATATTGCCACC-CCTA-----GGTATTAGGACCGTTTGTA-CAACGGCGGAA-TAGTGTA--------------AACTCCGGAAACTTA---ACCACCACTTGAT----CC--CG----TCATTTTTTTT--TTTACTTCT-C-T------CTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------ccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|12 : TCTGACATCTTGGCG-CATAGAACTCCCAAA--TTAAA-A----ATGAGTCATA----CTG-----ACG--------------------GTCA-CGTTATT-------TGAGGTGTCTCAATGTCCATCAGCA--------------ATCTACACTAAATCCCCGTATTAGGACCAT-CTCTGTAATAAAAT-T--------TTCA-CTTTGTTTGATGATCACTGTTTTTTTTG--TA-ATAATGTTGCCATC-CCTATATTCGGTATTAGGACCGCTTTTA-CAACGACGGAA-TATTGCATCTTCCTTTAATTTAACTCCGGAAACTAG---ACCATCAGTTGA-----TC--CCGTTATT-----TTTT--TTCACTTCT-CTT-----ATTT---------TCAGGTGAAGGTTA---------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT----GG-------G-CGTTTATAAAGTATGTACAAG--G--GGGTCTTTATTG-------ATTAGGTGgaagaatattaacaagccgg
gi|21 : aTCTGACATATTGACGTCA-AGAACTCCCGGA--TTAAAGA-TA-AT-AGTTATACCGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCGTAAACACAAACATTTTTATAATTATGCAATGTCTAAATGTCCATCCGCACTGTTGTTTA---AATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-ACATGTAAT--AGT-T-----TCCCCCC-TTTTATTTAATAATgcgttgttat
gi|8 : GGCATATTGACG-CATAGAGCTCCC-----
gi|2 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggTTGACG-CATAGAGCTCTT-----Tcgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|14 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtTGGCG-TATAGAACTCTCCAAAATAAAA-A-TG-AT-AGTCATACTGACTGTC---ACGT----------------AACGCCGTCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTA---AATCTACACTAAAACCCAGCATTAGGACCAT-CTCTATAATTAAAT-TTGGATTTTTTCC-TTTTGTTTAATGGTCA---TTTTG----------------TGTCATC-CCTATATTCCGTATTATGACCGTGTGTACTA-CGACGGAT-TAGTGTATTTTCTTTTAATATAACTATGGCAATTGG---ACCACCAGTTGATA---TCGTCA----TT-----CTTT--TTCACTTCT-C-T------TTT---------T----------TT----------CTGATGAAGGTTATTAACAAAT-----------------CATT----GG-------G-CGTTTctttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|2 : AACGCCATCATTGTTATAACTACGCAGTGTCTAAAT-T---TC--CACT-TTGTTTA---AATCTACACTAAAATCCCGCATTACG-TCATTCTCTATATTAAAAT-TCGAA-TT-TTCC-TTTTGTTTTATAATCA---TTTTGTTTA-ATT-ATAATATTGCCACCCGGTA-ATCTGGTATTAGGACCGCTTGTA-CGACGATGGAG-TGGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAAATGG---ACCACAAGTTGAT----CC--TG----TCA----TTCG--TTTACTTTT-T-TCTTATATTCAGGTGAAGGT----------TA----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT----TG-------GGCGTTTATAAAATGTATACAAG--G--GGGT-TTTGTCA-------ATTAGGTGTTAATT---G---TTATTCAGCATCTCGGTTACTTCAATGTCATTTTGTTTGTCCCGTGTAAGAAATAGA--TGGTAAAGA-TTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATATATT-----TGTGAAAGGA-G--A-ATTTATTTA--TTATT-ATAAATTACCTTCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTCAATCATTGAAA----GACGTGTT---------G------------TTTTGAATTTCATCC----TT--------CATAAAGTAGTATTTTATATTGCATT-TTTTAAGAATAAAGTCACTGTTAATGGAG-AAtttaa
gi|7 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTA---CATCTACACTAAAACCACGCATTAGGGCCAC-CTCTATAAAAAAAT-TCGGA-TTTTTCC-TTTTGTGAAATGACCA---TTTTGATTA-ATA-ATAATATTGCCACC-ACTATATTCGGTATTAGAACCGCTTGTA-AAACGACGGAT-TAGTGTATTTTCTTTTA-TTTAACTCCGGAAATGGG---GCCACCATTTGAT----CC--CG----TCAT---TCTTA-TTCACTTCCGT-T-----ATTT---------T----------TA----------TT---------------CAGGT-----------------GA-------A-------G--GTT-----AGTA---ACAAGTCACTGGGCGTTTGTTG-------ATTAGGTGTTAATT---G---TTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGAAAGAAATAGA--TAAT-AAAGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATC-----AGTGA---AA-G--GCATT--TTT---TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAGTTATACACCATAGTTGCATTGTTTAATCATTTTAA----GTG--GTT---------G------------T------------GT----TT--------AATacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|3 : CTGTTATTTAAAGCA---ACACCAAAACCCCGCATTAGGACAAT-CGCTATAATAAAAT-TCGGA-TTTTCCC-TTTCATTTAATGATTA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACC-CCTATATTCAGTATAAGGACCGCTTGTA-CGACGATGGAT-TAGTGTATTTTCTTTTAATTTTACTCCGGAAATTGGCGGACTACCAGTTGATCTAGTT--AT----TC-----TTTT--T-CACTTCT-G-T--------T---------T----------TT----------TT---------------CAGGTGAAGGTTATCAACAAATCATT----GA-------G-CGTTTATAAAGTGTGTACAAT--G--GGGTTTATGTTG-------ATTAGGTATTAGTT---G---TTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTAGTTTGTCCCATGTAAGAAAAAAA--TGATAAAGA-TTA-AATATGTTTCATGTTTGCAATGTATC-----AGTGAAA-GA-AG-A-ATTAATTTA--TTTTTTATTAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATT-TTTAATCATTGAAA----GAGGTGTT---------G------------TTATGAATTGCGTCC----TT--------AATAAAGTAACACTTGATATTGTATA-TTTCAAGAATTTAATCACTGTTtcaataatgatgatgattgtgatactgtgatactgatggtgataatgaaaacaatgttaaagataaagataatgaaatcatcagcaatgatgattgttatcgttgctgttgtggaagaagtggtaaatgttgctctaaattgtcttaattaatatagaagccg
gi|5 : AATGTCGGA-CT-TTCCATTTTGTTTAATGATTA---TTTTGTTTT-ATA-ATACTATTGCCACT-CCTTAATTCGATATTAGAACCGCTTGTA-CAACGACGGAA-AAAAGTATTATCTTTTAA-TTAACTCCGTAAATTGG---GGTACCAGTTGAT----CT--CC----TC-----ATTT--TT---TTCT-C-T------TTT---------T----------TTCTGG------TT---------------AAGGT-----------------TATTAACACGACATTGAA-CGTTTATAAAATGTATACAAG--G--AGGTCTTTGTTG-------ATTAGGTTTCAATT---GTTATT---CAGCATCTCAGTTACATCAGCGTCATTTTGTTTGTCCCATATAAGAAATAGA--TGATTAAGATTTATAATATGTTTTATGTGTGCAATGTACT-----AGTGAAAGAA-A--A-AATCATTTATTTTTTT-ATAAAGTAACATAATTCA---------------------GTTTAATCATTGAAA----GAGGTGTT---------G------------T------------CC----TT--------CAAAAAGTAACATTTTATATTGTACA-TTTCAAGAATTAAGTTACTGTTAATGGAGAAAATCATGATCAATATAGTGATTAATTGTGATTTTGATGATGATGACGATGTTAATGCAGATGGTGATGACAATGTTGAAGATAAAGACAATGCTAATGCAATCGAGAGTAATGATGATTGTTATCGTTGTTGTTGTTGTGGGA---GAA---G---TGGTATATTTTGTATT-AG--TTC------------TCTTAATTGATATTAAAGTCAAT----ATA----TCCAAAT-----TG-----A-----AAAACCCTATggtggaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgacagcaatgatgactgttatcgttgtggaagaagttgtagatgttgtactagttttctaaataatttaattaatactgaaatcgaatgcggttttatataggagctctatgcgggattatggggcatattgacgcatagatctctccgccgtcaggagctctatgcgggattatggggcatattggcgcatagatctctctgcggtcgggagctctatgtc
gi|4 : ctctgtaatcTGTTTGTATATATAG-ATTGCCGTC-CCTATATTCGGTATTATGACCTATTGTA-CAGCGACGGAT-TTGTGTATTTTCTTTAAATTTAACTCCGGACAGTGG---ACCACTAGTTGAT----CC--CG----TCATT--CTTT--TTCACTTCT---------ATTT---------T----------TTCAGGTAAATGTT---------------AATGT-----------------CATT----GG-------T-CGTTTATAAAGTGTG------------GGTCTTTGTTG-------ATTAGGTGTCAATT---G---TTATTCAGCATCTCGGTTACATAAGTGTCATTATATGTGTCCCATGTAATAAATAGA--TGAT-GAATATTA-AACATGTTTCATGTGTTAAATATATTATAAGAGGAA---GA-A--G-A---ATTCA--TTTTT-ATAAATGAACATTATTCAATT---------------ATTGTTTAATTATTGAAA----GAGGTGTT---------G------------T------------TTAGAATTCCATCCTGCATAAAGTAACAGTTTATATTGTATA-TTTCAAGAATTTGGTCACTGTAAATGGAG-AAAAATGATAACGAATCTAATGATGATGATTGTGATACTGTGAAAATGATAATGAGAATTTTAAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAATAAAATCGACAGCAATGATGATTGTTATCGTTGTTGTTGT---------GGAAGAA---G---TAGTAGATGTTGTATT-AG--TTTTCT--AA-AATGTCTTAATTTATGTTGAAGTCGCT----CGAC---TTCATAT-----CG-----GCGCATAGAGCTTTCCGCCGCCA--GGAGCTC----TGTGTGGTTTTATAATC-G-A----------AGAGCT-C-T----------------ATGT--GGGA------TTATGG-----G-------G-------C-----AT-------A--T-T---GAC-GCATAGAGC-------T---C---T----C-
gi|6 : g---------T----------TT----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT----GG-------A-CGTTTATTAAGTGTAAACAAA--G--GGGTCTTTGTTG-------ATTTGGTGTTAATTTTTA---TT---CAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGA-GAGAGATTA-ATTATGCTTCATGTGTTCACTGTATT-----AGTGA---AATAATA-ATTCAACTA--TTTTT-ATAAACTAACATTATTCAATTATGCACTATATTTCCATTGTATAAACATTGAAC----GAGGTGCT---------GTTTTTAATTTCAT------------CC----TT--------CATAAAGTAACTTTTTCCATTCTATA-TTTCAAGAATTTAGT-A--GTTATCcgccgccggaatttctacgcgtttttataatcgaagctctatgcggtctcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|8 : tctttttttcaggtgaatg---------------CACGT-----------------CATT----GG-------A-TGTTTATAAAGAGTGTACAAG--G--GGATCTTTGTTGATAAGTAATTAGGTGTTAATT---GTTATT---CAGTATCTCGGTTGCATCAGTGT-ATTTTGTTTATCCTATGTAAGAAATAGA--TGAT-AAAGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTGTT-----AGTGA---AA-G--A-ATTT-------TTTTT-ATTAACTAaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatactgaagtcgatatatccaaatatccccgccgtcaggagctccatgcgtcagatgctctatgcgtcaggggtcaagggctctatgcgtcaggggctctatgcgtcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|9 : cttttgaggtgaaggtcattaaAAATAGAGATGATAAAGA-TTA-AATTTGTTTTATGTGTGCAATATGTT-----AGTGAAT-GA-AG-A-ATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTTAAGTATACACTATAGTTGCATTTTTTAATCATTGAAA----GAGGTGTT---------G------------T------------CC----TT--------CACGAAGTAACATTTTTTATCGTATAGTTCAAG-AATTTAGTCACtcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|11 : aTTATTCAATTATGCCCTATAGTTGAATTGTTTAATCATTGAAAGACTGAAGTGTT---------GTTTTGAATTTCAT------------CC----TT--------CATAAAGTAACATTTTACATTGTTTA-TTTCAAGAATTTAGTTACTGTTAATGGAG-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCGAGAGCAATGATAATTGTTATCG-TTGTTGTGGTTGA------A---GAA---G---TGGTAGA---TGTA-CTAG--TTCT-CTAAA-TA-GTCTTAATTGATATTGAAGTCGAT----ATA----TCCAAAT-----CG-----A-----AGAACTAAATG----TG--GGA---T----TATGGTG---CAT-ATT-G-A---CG-AAT-A-AACT-C-A--------TG---AT-GAAT-A--GA-GCTCACTATGC-----G-------A--TT--TT-----ATA------A--T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaagagctctatacgggattatggggcataatgacgtatagagcaccctgtcgtcggaagtccagcagctctttgcggtctcacat
gi|8 : tATCGCTGGAA----GAGGTGTTTTGAATTTCA------------T------------CC----TT--------CATAAAGTAACATTTTATATTGTATA-TTTCAAGAATTTAGTCAC
gi|16 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaact------------T------------CC----TT--------CATAAAGTAACAACGTATATTGTATA-TTTAACGAATGTAGTCACNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTATCGTTGTTTTTGT---------G---GAA---GAAGTGGCAGTTGTTGTA-CTAG--TTCT-CTAAA-TA-GTTTTAATTGGTATTAATGTCGAT----ATA----TCCAAAT-----CG-----A-----AGAGCTTTGTG----CT--GTT---T----TATA----------ATC-G-A---CG-CAT-AGAGCT-C-C--------Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|3 : gttgttttgaatttcaTTATCGTTGT---------G---GAA---GAAGTTGTAGATGTTGTA-CTAGTTTTCT-A--AA-TA-AT-TTAATTAATACTGAAATCGA-----ATGCGGTTTTATAT------------A-----GGAGCTCTATG----CG--GGA---T----TATGGGG---CAT-ATT-G-A---CG-CAT-AGATCT-C-T--------CC---G--CCGT-CAGGA-GCT--CTATGC-----G-------G--GA--TT-----ATGGGGCATA--T-T---GGC-GCATAGATC-------T---C---T----CTG---CGGTCGG-----G---------AGCTCTATG
gi|2 : ctgttatttaaagcaacaccaaaaccccgcattaggacaatcgctataataaaattcggattttccctttcatttaatgattattttgtttaataataatattgccacccctatattcagtataaggaccgcttgtacgacgatggattagtgtattttcttttaattttactccggaaattggcggactaccagttgatctagttattctttttcacttctgtttttttcaggtgaaggttatcaacaaatcattgagcgtttataaagtgtgtacaatggggtttatgttgattaggtattagttgttattcagcatctcggttacatcagtgtcatttagtttgtcccatgtaagaaaaaaatgataaagattaaatatgtttcatgtttgcaatgtatcagtgaaagaagaattaatttattttttattaattaacatcattcaattatacactatagttgcatttttaatcattgaaagaggtgttgttatgaattgcgtccttaataaagtaacacttgatattgtatatttcaagaatttaatcactgttggtggaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgacagcaatgatgactgTTGTTGGTAT---------G---GAACAAG---TGGTAGATGTTGCA-CTAG--TTCT-CTAAA-TA-GTCTTAGTTGATTTTGAAGTTGAT----ATA----TCCAAAT-----CG-----A-----AGAGCTCTATG----TG--GGA---T----CGTGTGG---CAT-ATT-G-A---CG-CGT-AGAGCA-C-C--------CC---G--TTGT-CGGGA-GCT--CTATGC-----G-------G--TT--TA-----ATA------A--T-C---tc
gi|7 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagTTGCTGTTGT---------G---GAA---GAAGTGGTAAATGTTGC---------TCT-A--AA-TT-GTCTTAATTAATATAGAAGCCGg
gi|6 : agtgtctaaatgtccatcagcactgttgtttacatctacactaaaaccacgcattagggccacctctataaaaaaattcggatttttccttttgtgaaatgaccattttgattaataataatattgccaccactatattcggtattagaaccgcttgtaaaacgacggattagtgtattttcttttatttaactccggaaatggggccaccatttgatcccgtcattcttattcacttccgttatttttattcaggtgaaggttagtaacaagtcactgggcgtttgttgattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgaaagaaatagataataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtatcagtgaaaggcattttttttttataaattaacatcattcagttatacaccatagttgcattgtttaatcattttaagtggttgtgtttaattcaataatgatgatgattgtgatactgtgatactgatggtgataatgaaaacaatgttaaagataaagataatgaaatcatcagcaatgatgattgttatcgTTGTTGTTGC---------G---GAA---GAAGTGGTAGATTGTGTA-CTAG--TTTT-T--AA-AA-GTATTAATGAATACTGAAGTCGAT----ATA----TCCAAATATCCCCGCCGTCA-----GGAGCTCCATG----CGTCAGA---TGCTCTATGCGT---CA------G-G---GGTCA--AGGGCT---C--------TA---T--GCGT-CAGGG-GCT--CTATGC-----G-------
gi|8 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgTTGTTGTTGT---------G---GAA---GAAGTGGTAGATGTTGTA-TTAG--TTCT-CTAAA-TA-GTCTTA-TTAATATTGAAGTCGAT----A-A----TCTAAAT-----CG-----A-----AGAGCTCTATG----CT--GGA---T----TATGGGG---CAT-ATT-G-A---CG-CAT-AGAGCT-C-C--------CC---G--CCGT-CTGGA-GCT--CTATGC-----G-------G--TT--TT-----ATA------A--T-C---GAC-GCtcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|20 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgTTGTTGATGT---------G---GAA---GAAGTGGTAGATGTTGTA-CTAG--TTCT-CTAAA-TA-GTCTTTATATATATTGAAGTCAAT----ATA----TCCAAA------CG-----A-----AGAGCTCTATG----TG--GGA---T----TATGGGG---CAT-CCC-G-A---CG--------GC---------------------------GGGACGCT--CTATGA-----G-------G--TT--TT-----ATA------A--T-C---GGA-GCTTTATGCG-----GT---C---T----C-A---C-----
gi|15 : aataaagtctacgactcgtgatgtttggtttacgTTGTTGTTTT---------G---GAAAAAG---TGTCATATGTTGTA-CTAG--TTCTAT--AAATA-GTCTTAAT-AAT---GAAGTCGAT----ATA----TCCTAAT-----CG-----G-----AGATCTCTTTT----CC--GGA---T----TATGGGG---CAT-ATT-G-A---CG-CAT-AGAGccggc
gi|22 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgGGTAGATGCTGTA-CTAG--TTCT-CTAAA-TA-GTCTCAAATAATACTGAAGTCGAT----ATA----TCCGAAT-----CG-----A-----AGAGCTCTATG----CG--GGA---T----TATGGGG---CAT-ACT-G-----CGTCAGAAGCGCG-T-C--------TA---T--GCGT-CAGGA-GCT--CTATGC-----G-------G--TT--TC-----Agagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacatcttgacgcatggagctcccctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|9 : -AG--TTCT-CTAAA-TA-GTCTAAATTCATATTGAAATCGAT----ATA----TCCAAAT-----CG-----A-----AGAGCTCTATA----CG--GGA---T----TATGGGG---CAT-AAT-G-A---CG-TAT-AGAGCA-C-CCTGTCGT-CG---G--AAGTCCAGCA-GCT--CTTTGC-----G-------G--TC--TC-----ACA------
gi|10 : aaaatagagatgataaagattaaatttgttttatgtgtgcaatatgttagtgaatgaagaattcatttatttttataaattaacatcatttaagtatacactatagttgcattttttaatcattgaaagaggtgttgtccttcacgaagtaacattttttatcgtatagttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctTTAAAGTTGATGTGTATA----TTTGACG-----CA-----T-----AGACCTC---A----CG--GGA-------------GG---C----TT-A-A---CG-CAT-AGGGCTTC-C--------C-------------GGGA-GCT--CTATGC-----t
gi|8 : tgat----TCCAGACGG---CG-----G-----GGAGCTCTATG----CG--TCA---A----TATGCCC---CAT-AAT-C-C---AG-CAT-AGAGCT-C-aacgggtcctacatctctacgcatagagctcacgaattaaaaatactattcatactgatagtctttacgttatttgctagaccctaaacgccatcattactataaatatatagcactgctgtttaaatctacactaaaaccccgcattagaatcatctctataataaaattcggatttttcctttaaatttgatccttatgtttaataataatattgtcacccctctattttgtattaggaccgcttggatgacgacggaattagtgtattgtcttttaactccggccatggggccaccagtttatcacgtcattcttattcacttctgtttttgttcaggtgaatg
gi|17 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaaAGAT-----CG-----G------GAGCTCTATA----C-----A---C----C--GAGG---C----TT-A-A---CA-CAA-TGGGCT-C-C--------CC------------GGGA-TCT--CTATGC-----G--------------TC-----AGG------A--CGT---AAC-GCATAAATC------TA---C---T----C-G---G-----G-----G---------AGCTgctctatgcggttttataatcgacgc
gi|4 : tgcgggaccacatagagctccttaccct-----CG-----G-----AGAGCTCTATG----CG--------T----CA---------AT-A-T-G-C---CC-CAT-AA---T-C-C--------CA---C--A--T-A--GA-GCT--CT-T-C-----G-------A--TT--AT-----AAA------A--C-C---A----CACAGAGC------TC---C---T----G-G---C-----G-----GCGGAA----AGCTCTATGCGatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|17 : gtgtttgtatatatagattgccgtccctatattcggtattatgacctattgtacagcgacggatttgtgtattttctttaaatttaactccggacagtggaccactagttgatcccgtcattctttttcacttctattttttcaggtaaatgttaatgtcattggtcgtttataaagtgtgggtctttgttgattaggtgtcaattgttattcagcatctcggttacataagtgtcattatatgtgtcccatgtaataaatagatgatgaatattaaacatgtttcatgtgttaaatatattataagaggaagaagaattcatttttataaatgaacattattcaattattgtttaattattgaaagaggtgttgtttagaattccatcctgcataaagtaacagtttatattgtatatttcaagaatttggtcactgtaaatggagaaaaatgataacgaatctaatgatgatgattgtgatactgtgaaaatgataatgagaattttaaagacaatgttaaagataaagataatgataataaaatcgacagcaatgatgattgttatcgttgttgttgtggaagaagtagtagatgttgtattagttttctaaaatgtcttaatttatgttgaagtcgctcgacttcatatcgg-----CG-----A-----GTAGATTTATG----CG--------T----TACG--------T-CCT-G-A---CG-CAT-AGAGAT-C-C--------C------------GGGGA-GCC--CATTGT-----G--------------TT-----A-A------GCCT-C---GGT-GTATAGAGC-------T---C---C----C-----------------G---------A--TCTATGCGccgccggaatttctacgcgtttttataatcgaagctctatgcggtctcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|3 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccc-----AGAGATCTATG----CG--CCA---A----TATGCCC---CAT-AAT-C-C---CG-CAT-AGAGCT-C-C--------TG---A--CGGC-GGAGA-GAT--CTATGC-----GTCAATATG--CC--CC-----ATA------A--T-C----CC-GCATAGAGC------tcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|17 : ctgttatttaaagcaacaccaaaaccccgcattaggacaatcgctataataaaattcggattttccctttcatttaatgattattttgtttaataataatattgccacccctatattcagtataaggaccgcttgtacgacgatggattagtgtattttcttttaattttactccggaaattggcggactaccagttgatctagttattctttttcacttctgtttttttcaggtgaaggttatcaacaaatcattgagcgtttataaagtgtgtacaatggggtttatgttgattaggtattagttgttattcagcatctcggttacatcagtgtcatttagtttgtcccatgtaagaaaaaaatgataaagattaaatatgtttcatgtttgcaatgtatcagtgaaagaagaattaatttattttttattaattaacatcattcaattatacactatagttgcatttttaatcattgaaagaggtgttgttatgaattgcgtccttaataaagtaacacttgatattgtatatttcaagaatttaatcactgttggtggaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgacagcaatgatgactgttatcgttgtggaagaagttgtagatgttgtactagttttctaaataatttaattaatactgaaatcgaatgcggttttatataggaGATCTCTATG----CG--------T----CA--GGA---CGT-A-----A---CG-CAT-AAATCT-A-CTCGGGGAGCT---A--GGGT-AAGGA-GCT--CTATGT-----G-------G--Tctgcggtcgggagctctatgtc
gi|18 : tgcgggGAGCTCTATT----CG-------------T-CGAGG---CCT-A-----A---TG-CAT-AGGGCT-C-C--------CC---C---------GGA-GCT--CGATGC-----G--------------TC-----GGA------C--G-C---AAT-GCATAGAGCTTATTGGTGAGC---T----T-AATGCGTCA-G-----G---------AGCTCTATGCGGTCTccggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|18 : gtgAGCTCTATG----C-----A---T----T-----G---CGT--CC-G-A---CG-CAT-CGAGCT-C-C------------------G--GGGGA-GCC--CTATGC-----A--------------TT-----AGGC-----C--T-C---GAC-GAATAGAGC-------T---C---C----C-A---------G-----G---------AGCTTTATACGccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|9 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccaataGCTCTATA----CG--TCA---T----TATGCCC---CAT-AAT-C-C---CG-TAT-AGAGCT-C-tccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|17 : aaaatagagatgataaagattaaatttgttttatgtgtgcaatatgttagtgaatgaagaattcatttatttttataaattaacatcatttaagtatacactatagttgcattttttaatcattgaaagaggtgttgtccttcacgaagtaacattttttatcgtatagttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaa---T----TATAAAG---CAT-ATTTG-A---CG-CAT-AGA--T-C------------------------GGGA-GCT--CTATACACCGAG-------G--CT--T------------------------AAC-ACAATGGGC-------T---C---C----C-C---G-----G-----G---------ATCTCTATGCGaccctgtcgtcggaagtccagcagctctttgcggtctcacat
gi|6 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacgtcctgaATAGAG---CAT--CT-G-A---CG-CAT-GGAGCT-C-C--------TG---A--CGGC-GGGGA-ctttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|12 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatactgaagtcgatatatccaaataGA---CAT-CTT-G-G---CG-CAT-AGAACT-C-C--------CA---A--Agcgtcaggggtcaagggctctatgcgtcaggggctctatgcgtcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|17 : atctGA---CAT-TTT-G-A---CG-CCT-AGAGCT-C-C--------CG---A--Attaaaaatgagtcatactgacggtcacgttatttgaggtgtctcaatgtccatcagcaatctacactaaatccccgtattaggaccatctctgtaataaaattttcactttgtttgatgatcactgttttttttgtaataatgttgccatccctatattcggtattaggaccgcttttacaacgacggaatattgcatcttcctttaatttaactccggaaactagaccatcagttgatcccgttattttttttcacttctcttattttcaggtgaaggttattaacaagtcattgggcgtttataaagtatgtacaagggggtctttattgattaggtggcgttgttat
gi|15 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacgtcctgacgcatagagatcccggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctGA---CAT-CTT-G-A---CG-CAT-GGAGCT-C-C--------CCTCCG--CCGT-AGAGA-GTT--CTGTGC-----G-------G--TT--TT-----ATA------A--T-C---GAC-GAATACAGTTA----GT-------T----A-AT--C-----G-----GAA-------AGCTCTATGCttaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|10 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctG---TAT-ATTTG-A---CG-CAT-AGACCT-C-A--------C-------------GGGA-G--------GC---------------------------------------T-T---AAC-GCATAGGGC------TT---C---C----C-G---------G-----G---------AGCTCTATGCtctatgcggtctcaca
gi|18 : tgatG---TAT-ATT-GGA---CG-TAT-AAAGCT-C-C--------T-------------GGGA-GCT--CTATTC-----G-----------T--CG-----AGG------C--C-T---AAT-GCATAGGGC-------T---C---C----C-C---C-----G-----G---------AGCTCGATGCGacatcaactttaaaacgggtcctacatctctacgcatagagctcacgaattaaaaatactattcatactgatagtctttacgttatttgctagaccctaaacgccatcattactataaatatatagcactgctgtttaaatctacactaaaaccccgcattagaatcatctctataataaaattcggatttttcctttaaatttgatccttatgtttaataataatattgtcacccctctattttgtattaggaccgcttggatgacgacggaattagtgtattgtcttttaactccggccatggggccaccagtttatcacgtcattcttattcacttctgtttttgttcaggtgaatg
gi|15 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccaataagctctatgcattgcgtccgaG---CAT-A---G-A----G-CAT-AGAGCT-TTC--------CG---ATTAACT-AA-----CT--GTATTC-----G----------TCGATT-----ATA------A--------AACCGCACAGAAC-------T---C---T----CTA---C-----G-----GCGGAGGGG-AGCTCCATGCGacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|9 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacatcttga---CAT-ATT-G-AAATCG--AT-ATA--T-C-C-------------A--AATC-GAAGA-GCT--CTATAC-----G-------GGATT--ATGGGGCATA------A--T-----GAC-GTATAGAGC------AC---CCTGT----C-GT--C-----G-----GAAGTCCAGCAGCTCTTTGCGGTCTggtctcaca
gi|2 : aaaatagagatgataaagattaaatttgttttatgtgtgcaatatgttagtgaatgaagaattcatttatttttataaattaacatcatttaagtatacactatagttgcattttttaatcattgaaagaggtgttgtccttcacgaagtaacattttttatcgtatagttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattT-ATT-A-AAC-CG-CAT-AGAGCT-C-C--------CG---A--CAAC-GGGGT-GCT--CTACGC-----G-------cacat
gi|23 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgaTT-A-A---CG-CAT-AGGGCTAC-C--------C-------------GGGA-TCT--TTATAC-----G--------------TA-----AGA------A--CGC---AAC-GCATAGAG-------AT---CA--G----C-G---A-----G-----G---------AGATCTATGCGatcg
gi|10 : aT-G-A---TG-CAT-AGAGCT-C-C--------C------------GGGAA-GCC--CTATGC-----G-------gcctcgacgaaaagggctctatgcgtcgaa
gi|6 : T-G-A---CG-CAT-AGAGC--C-C--------CT---G--ACGC-ATAGA-GCC--CT--------------------------------TG------A--C-CCCTGAC-GCATAGAGC------AT---C---TGACGC-A---T-----G-----G---------AGCTCttaagcctcccgtgaggtctatgcgtcaaatatacacatcaactttaaaacgggtcctacatctctacgcatagagctcacgaattaaaaatactattcatactgatagtctttacgttatttgctagaccctaaacgccatcattactataaatatatagcactgctgtttaaatctacactaaaaccccgcattagaatcatctctataataaaattcggatttttcctttaaatttgatccttatgtttaataataatattgtcacccctctattttgtattaggaccgcttggatgacgacggaattagtgtattgtcttttaactccggccatggggccaccagtttatcacgtcattcttattcacttctgtttttgttcaggtgaatg
gi|2 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatactgaagtcgatatatccaaatatccccgccgtcag-A---CG-TAT-AG-----C-C--------TC---G--ACGT-AAAGA-GCT--CTATGC-----GTCA----A--CT--TT-----ACAC-----A--T-C---AAC-TT-TAAAACTT----GT---C---T----G-A---C-----G-----ggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|8 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttcctt---CG-CAT-AGAGCT-C-C--------AG---A--CGGC-GGGGA-GCT--CTATGC-----GTCAATATG--CC--CC-----ATA------A--T-C---CA--GCATAGAGC-------T---C---T----tcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|3 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcga-CAT-AGAGCT-C-C--------CG---A--CCGC-AGAGA-GAT--CTATGC-----GCCAATATG--CC--CC-----ATA------A--T-C----CC-GCATAGAGC------TC---C---T----G-A---C-----GGCGGAG---------AGATCTATGCGgttttataatcgacgc
gi|16 : ctgttatttaaagcaacaccaaaaccccgcattaggacaatcgctataataaaattcggattttccctttcatttaatgattattttgtttaataataatattgccacccctatattcagtataaggaccgcttgtacgacgatggattagtgtattttcttttaattttactccggaaattggcggactaccagttgatctagttattctttttcacttctgtttttttcaggtgaaggttatcaacaaatcattgagcgtttataaagtgtgtacaatggggtttatgttgattaggtattagttgttattcagcatctcggttacatcagtgtcatttagtttgtcccatgtaagaaaaaaatgataaagattaaatatgtttcatgtttgcaatgtatcagtgaaagaagaattaatttattttttattaattaacatcattcaattatacactatagttgcatttttaatcattgaaagaggtgttgttatgaattgcgtccttaataaagtaacacttgatattgtatatttcaagaatttaatcactgttggtggaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcgacagcaatgatgactgttatcgttgtggaagaagttgtagatgttgtactagttttctaaataatttaattaatactgaaatcgaatgcggttttatataggagctctatgcgggattatggggcatattgaGGGA-GCT--CTATGC-------------G--TCGATT-----ATA------A--------AACAGCACAAAGC-------T---C---T----tc
gi|27 : gttgttttgaatttcatccttcataaagtaacaacgtatattgtatatttaacgaatgtagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttatcgttgtttttgtggaagaagtggcagttgttgtactagttctctaaatagttttaattggtattaatgtcgatatatccaaatcgaGGGA-GCT--CTATGC-----G-------G--TT--TT-----ATA------A--T-C---GAT-GCA
gi|2 : GA-GCT--CTATGT-----G-------GGATC--GT-----GTGGCAT--A--T-T---GAC-GCGTAGAGC------AC---C---C----C-G---TTGTCGG-----G---------AGCTCTATGCGG
gi|8 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaaGA-GCT--CTATGC-----T-------G--GA--TT-----ATGGGGCATA--T-T---GAC-GCATAGAGC------TC---C---C----C-G---CCGTCTG-----G---------AGCTCTATGCGGtttaataatcg
gi|16 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaaGA-GCT--TTGTGC-----T-------G--TT--TT-----ATA------A--T-C---GAC-GCATAGAGC------ttttataatcgacgc
gi|8 : gttgttttgaatttcatccttcataaagtaacaacgtatattgtatatttaacgaatgtagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttatcgttgtttttgtggaagaagtggcagttgttgtactagttctctaaatagttttaattggtattaatgtcgatatatccaaatcgaa--TT-----ATA------A--------AACCGCATAGAGC------TC---C---A----G-A---C-----G-----GCGGGG----AGCTCTATGCGtccc
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATTTTCCAATAACGCCGAAAACGGTATCACACGAAAATTACATTCGATTATATTGAAACTATTGCATTTTATACTAAATACATTGGAATACATTGAATTATACATTTAATTTCTGATTTTTTACAATTAATCACATATTCCTGATGAAAACGAAGTTTTTGCAATTCCACTAGTGTTCGTTATTAAATACGAGTATCAATAACAAC
Unaligned ( gi|25 ): CGTGCAACACACACATAACGCTAGAGAGTATTGTGAGACCGTATGGAGCA
Unaligned ( gi|26 ): GCCTCGGATATACACATCAACTTTAAAATGGGTCTTGGCGCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111 22222222222222222222222 2222222222 1111 11 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 22 11111 2222222 99999999999999999999999999999999999 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222 1111111 222222222222 11111 33333333333333333333333333 555555555555555555555555555 8888888888888888888888888888
lowQualScore : 3 5 2 1 5555555555555555 6 2 99999999 555 44 00000000000000000000000 0 3 555 66666 2222222222 4 1 2 4 5 4 3 3 3 0 5 888 0 0 0 4 0 1 4 0 777 4 4 4 3 2 4 1 0 777 4444 55 11 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 2 9999 0 4444444 66 77 4 11111 8888888 4 66 4 2 7777 66666666666666666666666666666666666 000000 4 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22 22 1 222 1 22 11 1 9999 55 2 111111111111 1 55 555 2 0000000 6666 44 333333333333 11111 44 6666 11111111111111111111111111 5 666 2 444444444444444444444444444 33 3 888888 3 0 3333333333333333333333333333
lowQualScore : . . . . ................ . . ........ ... .. ....................... . . ... ..... .......... . . . . . . . . . . . ... . . . . . . . . ... . . . . . . . . ... .... .. .. .. .................................................................................... . . .... . ....... .. .. . ..... ....... . .. . . .... ................................... ...... . . ............................................................. .. .. . ... . .. .. . .... .. . ............ . .. ... . ....... .... .. ............ ..... .. .... .......................... . ... . ........................... .. . ...... . . ............................
lowQualScore : 2 0 0 7 7777777777777777 2 1 55555555 111 66 22222222222222222222222 8 1 444 22222 3333333333 0 0 1 0 0 4 6 3 6 2 0 888 1 2 1 0 9 6 0 4 888 0 0 0 4 1 0 0 7 000 0000 55 00 00 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 4444 1 4444444 11 00 4 11111 4444444 7 11 4 4 7777 88888888888888888888888888888888888 555555 4 4 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44 11 0 333 0 22 33 9 1111 00 4 888888888888 0 00 888 0 0000000 5555 22 555555555555 99999 22 5555 99999999999999999999999999 0 999 5 444444444444444444444444444 44 6 888888 3 7 0000000000000000000000000000
consensus : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCC------TGA-------CGCATAGAGCTC-CCGG-----GG-AGCC--CT--ATGCGTTAA----------GC--------CTCGACG-CATAG---AG---C-TC----------T-ATGCGTCGA-ATATACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CCTTCATAAAGTAACATT------TTATATTGTATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAA-TGGAG-AAANNTTGTNNNNAATNNAATNATGATGATGNTNATACNGTGATAAC---GATGNTGATGNTNNTGANGACGACGNTANNGANGANGANAATGATAAT-AAAN-CGANCGGCAATG---ATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------AT-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
Reference ( family-2494 ) : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCC------CGA-------CGCATAGAGCTC-CCGG-----GG-AGCT--CT--ATGCGTCAA----------GC--------CTCGACG-CATAG---AG---C-TC----------T-ATGCNTCGA-ATATACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CCTTCATAAAGTAACATT------TTATATTGTATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAA-TGGAG-AAANNNNGNNNCGNATNNNGNNNNGNTGNNNNTNNNACGGTGANGAC---GATGNTGANGNNNNTGGNGACGACGNTGNNGANGANGANGACGATGNT-AAAN-CGANCGNNANTA---ATGATNG--TTATC---GTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------AT-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
gi|1 : AATAGAGCACTGTAGTACTGCATAGAGCTCC------CGA-------CGCATAGAGCTT-CCAG-----GG-AGCC--CT--ATGCGTTAA----------GT--------CTCGACG-TATAG---AG---C-TC----------T-ATGGCCCAA-GTATACAA-ATCAACATTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-TC---TTAAAA-TA-ATAGTCGTACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGAAGTGTCTAAATGTACATCAGCACTGTTGTTTACATATACACTAAAATCCTGCATTAGGACCAT-CTTTATTATAAAATTCGGA-TTGTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCAACGC-TATATTCGGTATTAGGACAGTTTGTATACCGACGG-AATAGCGTATTTTCCTTTAATTTGACTCCGAAAATTGG---ACCACCAGTTGATTCCCTC-----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-CGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----AGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTG---TTCAGCATCTCGGTTACACTAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAAAATTA-AAAATGTTTCATGTGTACCATGTATTA-----GTG-A--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTAAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CTTTCATAAAGTAACTTT------TTGTATTGTATATTTAAGAAATTTTGTCACTGTTAT-CTGAG-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---ATTGTTGTTGTG---GAAGTGGTAGATGTTGTAC-AGTTCTT--AATAGTCTTAATTAATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----CAAA-A--GTA--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------AT-CAACGCATAGAGCGT----------C-T---C-AC-----GGAGCTCTGTGCGGACT
gi|10 : GA-------TGCATAGAGCTC-CCGG-----GA-AGCC--CT--ATGCGTTAA----------GC--------CTC--C--CGT-G---AG---G-TC----------T-ATGCGTCAA-ATATACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCCT-ACATCTCTACG-CATAGAGCTC-ACGAATTAAAAATA-CTATTCATACTGATAGTCTTTACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTACTATAAATAT-----------------AT-AGCACTGCTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGAATCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTAAATT--TGATCC---TTATGTTTA-ATA-ATAATATTGTCACCCC-TCTATTTTGTATTAGGACCGCTTGGATGACGACGGAATTAGTGTATTGTCT-----TTTAACTCCGGCCATGGG---GCCACCAGTTTATCACGTCA----T--T--CTTATTCACT--T-C-T-----GTTT---------T----------TG----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|11 : tTTATTCAATTATGCCCTATAGTTGAATTGTTTAATCATTGAAAGACTGAAGTGTT---------G------------TTTTGAATTTCATCCTTCATAAAGTAACATT------TTACATTGTTTATTTCAAGAATTTAGTTACTGTTAA-TGGAG-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNAT-CGAGAGCAA-TG---ATAATTG--TTATC---GTTGTTGTGGTTGAAGAAGTGGTAGATGT---ACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTGATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAACTAAATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGTGCATATTGACG-AATA-AAC---T-C-A----T----G--ATG--AAT-----AGAGCTCACTATGCGATTTTATA------AT-gaatg
gi|12 : tTCTG-ACATCTTGGCG-CATAGAACTC-CCAAATTAAAAATG-A--GTCATA----CTG-----ACG--------------------GTCA-CGTTATT-------TGAGGTGTCTCAATGTCCATCAGCA-----------ATCTACACTAAATCCCCGTATTAGGACCAT-CTCTGTAATAAAATT--------TTCACTTTGTTTGATGATCACTGTTTTTTTTG--TA-ATAATGTTGCCATCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTTTACAACGACGG-AATATTGCATCTTCCTTTAATTTAACTCCGGAAACTAG---ACCATCAGTTGATCCCGTTATT--T--T--TT--TTCACTTCT-CTT-----ATTT---------TCAGGTGAAGGTTA---------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTATGTACAAG----GGGGTCTTTATTGAT-------TAGGTGGC-GTTGTTAT
gi|13 : a-AAACGGGTTTG-ACATCTTGACA-CATTGAATTC-CCGAATTAAAAATGGATAGTCACAAGGACTTTC---ACGCTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCGTTATTATAATTATACAGTGTCTAAATGTCCATCAGTACTGTTGTTTAAATCTGCACTAAAACCCCGTATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCTGA-ATTTTCCTTTTATTTAATAATCA---TTTAGCTTA-GTA-ACAATATTGCCACCCC-TA-----GGTATTAGGACCGTTTGTACAACGGCGG-AATAGTGTA--------------AACTCCGGAAACTTA---ACCACCACTTGATCCCGTCATTTTT--T--TT--TTTACTTCT-C-T------CTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|14 : TGGCG-TATAGAACTCTCCAAAATAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGT----------------AACGCCGTCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCAGCATTAGGACCAT-CTCTATAATTAAATTTGGATTTTTTCCTTTTGTTTAATGGTCA---TTTTG----------------TGTCATCCC-TATATTCCGTATTATGACCGTGTGTACTACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATATAACTATGGCAATTGG---ACCACCAGTTGATATCGTCA----TTCT--TT--TTCACTTCT-C-T------TTT---------T----------TT----------CTGATGAAGGTTATTAACAAAT-----------------CATT-GGGCGTTTgaagaatattaacaagccgg
gi|15 : TAATGATGAATATAATGATAAT-GAAG-TCAACAGCAAGG---ATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTTTGGAAAAAGTGTCATATGTTGTACTAGTTCTATAAATAGTCTTA----ATAATGAAGTCGAT-------ATA----TC--CTAAT------------CG-----GAGATCTCTTTTCC--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGA-----------------------------------GGAGCT--ATATGCGtttaa
gi|15 : atTTGACG-CATAG---AGGAGC-TA----------T-ATGCGTCAA-ATATACAC-AACAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATGGAGCTC-CCtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacatcttgacgcatggagctcccctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcataTGTGAGACCGCATAGAGC----------------------ATAGAGCTTTCCGA-----TT-AACTAACTGTATTCGTCGATTATAAAACCGCACAGAACTCTCTACGGCGGAGGGGAG---C-TC----------C-ATGCGTCAAGATGT-CAG-ACCCGTTTTA-AAGTTGTTGTGTATAT-TTGACG-CATATAGCTC-Cctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaGACATCTTGACG-CATGGAGC---T-C-C----CCTCCG--CCGTAG-------AGAGTT--CTGTGCGGTTTTATA------AT-CGACGAATACAGT-TAGTTA-----A-T---C-GG-----AAAGCTCTATGC
gi|16 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtct------------T------------CCTTCATAAAGTAACAAC------GTATATTGTATATTTAACGAATGTAGTCACNNNNNN-NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNN---NNNNNTG--TTATC---GTTGTTTTTGTGGAAGAAGTGGCAGTTGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTTTTAATTGGTATTAATGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTTTGTGCT--GTTT----TAT--------------------------A------ATCGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----tctatgcggtctcaca
gi|17 : gttgttttgaatttcaTGCGGGACCACATAGAGCTCC------TTA-------CCC-TAG--CTC-CCCG-----AGTAGAT--TT--ATGCGTTAC----------GT--------CCTGACG-CATAG---AG---A-TC----------
gi|17 : GAGCTCTAT-ACACCG---AG-GCTT--------AA-------CACAATGGGCTC-CCCG-----GG-ATCT--CT--ATGCGTCAG----------GA--------CGTAACG-CATAA---A------TC----------T-Accggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|17 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagTCC------TGA-------CGCATAGAGATC-CCGG-----GG-AGCC--CA--TTGTGTTAA----------GC--------CTCGGTG-TATAG---AG---C-TCCCGATC----T-ATGCGTCAA-ATATGCTTTAT-AACTTTATAAATGGATCTG-ACATTTTGACG-CCTAGAGCTC-CCGAATTAAAAACG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGTTAGACCCTAAACGCCATCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCTATTAACACCGTTGTT----TCTACACTATAACCCTGCATAAGGACccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|18 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacgGTGAGACCGCATAGAGCTCC------TGA-------CGCATTAAGCTCACCAA-----TA-AGCT--CT--ATGCATTGC----------GT--------C-CGACG-CATCG---AG---C-TC----------
gi|18 : GAGCTCTATTCG----------T-C--------------------------GAGGCCTA---ATG-CATAGGGC---T-C-C----C----C---CG--G---------AGCT--CGATGCG---TCGGA------CG-CAATGCATAGAGC-TTATTGGTGAGC-TTAAT-GCGTCA-GGAGCTCTATGCGGTCTcgggggagccctatgcattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgTGACG-CATTAAGC---T-C-A----C--------CA--A-------TAAGCT--CTATGCA---TTGCG------TC-CGACGCATCGAGC-T----------C-C---G-GG-----GGAGCCCTATGCccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgagaccgcatagagctccAATA-AGCTCTATG------CATTGCGT--C------CGA-------CGCATCGAGCTC-CGGG-----GG-AGCC--CT--ATGCATTAG----------GC--------CTCGACG-AATAG---AG---C-TCCCAGGAGCTTT-ATACGTCCA-ATATACAC-ATCAACTTTA-AATTGTGTCTG-ACATCTTGACG-CAAAGAGATC-CTGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGGCAGTC---ACGTTATTTGCTAGACACTTAACGCCATCATTAATACAATTATGTAGTGTCTAAATGTCCATCAGCATTATTGTTTAAATCTTCACTAAAAattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|2 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccGCTCTGTGAGACCACATAGAGGTCC------T-------------------TC-CT---------------------TACGTATA----------GC--------CTCGACG-TAAAG---AG---C-TC----------T-ATGCGTCAA-CTTTACAC-ATCAACTTTA-AAACTTGTCTG-ACGTCTTAACG-CATAGAACGC-C
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcAACGCCATCATTGTTATAACTACGCAGTGTCTAAATTTCCA------CT-TTGTTTAAATCTACACTAAAATCCCGCATTACG-TCATTCTCTATATTAAAATTCGAA-TTTT-CCTTTTGTTTTATAATCA---TTTTGTTTA-ATT-ATAATATTGCCACCCGGTA-ATCTGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGATGG-AGTGGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAAATGG---ACCACAAGTTGATCCTGTCA----T--T--CG--TTTACTTTT-T-TCTTATATTCAGGTGAAGGT----------TA----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATTTGGGCGTTTATAAAATGTATACAAG----GGGGT-TTTGTCAAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACTTCAATGTCATTTTGTTTGTCCCGTGTAAGAAATAGA--TGGTAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATATATTT-----GTGAAAGG-AG-AATTTATTTA--TTATT-ATAAATTACCTTCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTCAATCATTGAAAGA----CGTGTT---------GTTTTGAATTTCAT------------CCTTCATAAAGTAGTATT------TTATATTGCATTTTTTAAGAATAAAGTCACTGTTAA-TGGAG-AAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNT---CTTATAG--TT---------GTTGGTATGGAACAAGTGGTAGATGTTGCACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAGTTGATTTTGAAGTTGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----CGT--------------------------GTGGCATATTGACG-CGTAGAGCA--C-C-C----C----GTTGTC--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTAATA------AT-CGatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|20 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagTG---ATGTTTGGTTTA-C---GTTGTTGATGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTTATATATATTGAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAA-------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATCCCGA-----------------------C----G--GCG--G-------GACGCT--CTATGAGGTTTTATA------AT-----------------------------------C-----GGAGCTTTATGCGGTCT
gi|21 : aataaagtctacgactcgTCTG-ACATATTGACGTCA-AGAACTC-CCGGATTAAAGATA-ATAGTTATACCGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCGTAAACACAAACATTTTTATAATTATGCAATGTCTAAATGTCCATCCGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-ACATGTAAT--AGTT-----TCCCCCCTTTTATTTAATAATcacccggc
gi|22 : GGTAGATGCTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTCAAATAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CGAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATACTG-CGTCAGA-AGCGCGT-C-T----A----T--GCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGTTTCA
gi|23 : TTAACG-CATAGGGC---TAC-C----C------------G-------GGATCT--TTATACG---TAAGA------ACGCAACGCATAGAGA-T----------CAG---C-GA-----GGAGATCTATGCG
gi|23 : aCGCATAGAGCCCTTTTCGTCGAGGCTTAACGCATAGGGCTA-CCCG-----GG-ATCT--TT--ATACGTAAG----------AA--------CGCAACG-CATAG---AG---A-TC----------gcctcgacgaaaagggctctatgcgtcgaa
gi|23 : acgcatagatctcctcgctA-------CGTATAAAGATC-CCGG-----GT-AGCC--CT--ATGCGTTAA----------GC--------CTCGACG-AAAAG---GG---C-TC----------T-ATGCGTCGA-Atcgaa
gi|24 : acgcatagatctcctcgctgatctctatgcgttgcgttcttATAGAGCTC-ATGA--CTG-ATAGAGCTTC------TGA-------CGCACAGA
gi|24 : TGTGAGACCGTATAGAGCTCA------TGA-------CTGATAGAGCTT-CTGacggtctcacactgcctatattgaaac
gi|26 : tctgtgcgtGCCTCGG-ATATACAC-ATCAACTTTA-AAATGGG--------TCTTGGCG-CATctgcctatattgaaac
gi|27 : --G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------AT-CGATGCA
gi|3 : CTGTTATTTAAAGCAACACCAAAACCCCGCATTAGGACAAT-CGCTATAATAAAATTCGGA-TTTTCCCTTTCATTTAATGATTA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCAGTATAAGGACCGCTTGTACGACGATGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATTTTACTCCGGAAATTGGCGGACTACCAGTTGATCTAGTTA----T--TCTTT--TTCACTTCT-G-T--------T---------T----------TT----------TT---------------CAGGTGAAGGTTATCAACAAATCATT-GAGCGTTTATAAAGTGTGTACAAT----GGGGTTTATGTTGAT-------TAGGTATTAGTTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTAGTTTGTCCCATGTAAGAAAAAAA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTTTGCAATGTATCA-----GTGAAA-G-AAGAATTAATTTA--TTTTTTATTAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATT-TTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTATGAATTGCGTCCTTAATAAAGTAACACT------TGATATTGTATATTTCAAGAATTTAATCACTGTTGG-TGGAA-AAA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NAAT-CGA-CAGCAATG---ATGACTG--TTATC---------GTTGTGGAAGAAGTTGTAGATGTTGTACTAGTTTTCTAAATAAT-TTAATTAATACTGAAATCGA--------ATGCGGTTT--TATAT-------------------AGGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGATC---T-CTC----C----G--CCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGGATTATGGGGCATAT-TGGCGCATAGATC-T----------C-T---CTGCGGTCGGGAGCTCTATG
gi|4 : TGTTTGTATATATAG-ATTGCCGTCCC-TATATTCGGTATTATGACCTATTGTACAGCGACGG-ATTTGTGTATTTTCTTTAAATTTAACTCCGGACAGTGG---ACCACTAGTTGATCCCGTCA----T--TCTTT--TTCACTTCT---------ATTT---------T----------TTCAGGTAAATGTT---------------AATGT-----------------CATT-GGTCGTTTATAAAGTGTG------------GGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTCAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATAAGTGTCATTATATGTGTCCCATGTAATAAATAGA--TGATGAAT-ATTA-AACATGTTTCATGTGTTAAATATATTATAAGAG-GAA--G-AA-GA---ATTCA--TTTTT-ATAAATGAACATTATTCAATTAT---------------TGTTTAATTATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTTAGAATTCCATCCTGCATAAAGTAACAGT------TTATATTGTATATTTCAAGAATTTGGTCACTGTAAA-TGGAG-AAAAATGATAACGAATCTAATGATGATGATTGTGATACTGTGAAAAT---GATAATGAGAATTTTAAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAAT-AAAATCGA-CAGCAATG---ATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTGTGGAAGAAGTAGTAGATGTTGTATTAGTTTTCTAAAATGTCTTAATTTATGTTGAAGTCGCTCGACTTCATA----TCGGCGCATAGAGCTTTCCGCCGCC---AGGAGCTCTGTGTG--GTTT----TATAATCGAAGAGCTCTATGTGGGATTATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-CTC----C----GCCGCC--G-------GAATTT--CTACGCGTTTTTATA------AT-CGA---------------------------------------AGCTCTATGCGGTCTtc
gi|5 : g-CTCTGTAATCAATGTCGGA-CTTTCCATTTTGTTTAATGATTA---TTTTGTTTT-ATA-ATACTATTGCCACTCC-TTAATTCGATATTAGAACCGCTTGTACAACGACGG-AAAAAAGTATTATCTTTTAATT-AACTCCGTAAATTGG---GGTACCAGTTGATCTCCTCA----T--T--TT--TT----TCT-C-T------TTT---------T----------TTCTGG------TT---------------AAGGTTATTAACACGA------CATT-GAACGTTTATAAAATGTATACAAG----GAGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTTTCAATTGTTATTCAGCATCTCAGTTACATCAGCGTCATTTTGTTTGTCCCATATAAGAAATAGA--TGATTAAGATTTATAATATGTTTTATGTGTGCAATGTACTA-----GTGAAAGA-AA-AAATCATTTATTTTTTT-ATAAAGTAACATAATTCA---------------------GTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CCTTCAAAAAGTAACATT------TTATATTGTACATTTCAAGAATTAAGTTACTGTTAA-TGGAGAAAATCATGATCAATATAGTGATTAATTGTGATTTTGATGATGATGAC---GATGTTAATGCAGATGGTGATGACAATGTTGAAGATAAAGACAATGCT-AATG-CAATCGAGAGTAATGATGATTG--TTATCGTTGTTGTTGTTGTGGGAGAAGTGGTATATTTTGTATTAGTTC---------TCTTAATTGATATTAAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAAT------------TG-----AAAAACCCTATcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|6 : ---------T----------TT----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGACGTTTATTAAGTGTAAACAAA----GGGGTCTTTGTTGAT-------TTGGTGTTAATTTTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGAGAGA-GATTA-ATTATGCTTCATGTGTTCACTGTATTA-----GTGAA--ATAATAATTCAACTA--TTTTT-ATAAACTAACATTATTCAATTATGCACTATATTTCCATTGTATAAACATTGAACGA----GGTGCT---------GTTTTTAATTTCAT------------CCTTCATAAAGTAACTTT------TTCCATTCTATATTTCAAGAATTTAGTAGTTATCAA-TAAAG-AAA----------------------ATGATGATGATAC--TGATAAT---AATGAT------TGTGAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAACGAAAT-TGACAGCA---A---ATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTGCGGAAGAAGTGGTAGATTGTGTACTAGTT-TTTAAA-AGTATTAATGAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAATATCCC-------CGCCGTCAGGAGCTCCATGCGTCAGATGCTCTAT--------------------------GCGTCA----GGGGTCA-AGGGC---T-C-TATG-C----G--TCA--G-------GG-GCT--CTATGCG
gi|6 : tctttttttcaggtgaatgATAAAGCTGTGTTATACTGTACAGAGCCCC------TGA-------CGCATAGAGCCC-CTGACGCATAG-AGCC--CT---TG-----A----------CC--------CCTGACG-CATAG---AG---CATC----------TGACGCATGGA-tcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|7 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatactgaagtcgatatatccaaatatccccgccgtcaggagcAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTACATCTACACTAAAACCACGCATTAGGGCCAC-CTCTATAAAAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTGAAATGACCA---TTTTGATTA-ATA-ATAATATTGCCACCAC-TATATTCGGTATTAGAACCGCTTGTAAAACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTT-ATTTAACTCCGGAAATGGG---GCCACCATTTGATCCCGTCA----T--T--CTTATTCACTTCCGT-T-----ATTT---------T----------TA----------TT---------------CAGG---------------------T-GAAGGTT-----AGTA---ACAAGTCACTGGGCGTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGAAAGAAATAGA--TAATAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATCA-----GTGAA--A-GG-CATT--TTT---TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAGTTATACACCATAGTTGCATTGTTTAATCATTTTAAGT----GGTcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|7 : TGCAATGT---ATCAGTGAAAGG----CATTTT----------------------T------------TTTTTATAAATTAACATCATTCAGTTATACACCATAGTTGCATTGTTTAATCATT-TTAAGTGG--------TTGTGTTTAATTCAATAATGATGATGATT-----GTGAT-ACTGTGATACTGATGGTGATAATGAAAACAATGTTAAAGATAAAGATAATG---AAAT-C-ATCAGCAATG---ATGATTG--TTATC---GTTGCTGTTGTGGAAGAAGTGGTAAATGTTG--------CTCTAAATTGTCTTAATTAATATAGAAGCCGtgtgtttaattcaataatgatgatgattgtgatactgtgatactgatggtgataatgaaaacaatgttaaagataaagataatgaaatcatcagcaatgatgattgttatcgttgctgttgtggaagaagtggtaaatgttgctctaaattgtcttaattaatatagaagccg
gi|8 : agtgtctaaatgtccatcagcactgttgtttacatctacactaaaaccacgcattagggccacctctataaaaaaattcggatttttccttttgtgaaatgaccattttgattaataataatattgccaccactatattcggtattagaaccgcttgtaaaacgacggattagtgtattttcttttatttaactccggaaatggggccaccatttgatcccgtcattcttattcacttccgttatttttattcaggtgaaggttagtaacaagtcactgggcgtttgttgattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgaaagaaatagataataaagattaaatatgtttcatgtg---------------CACGT-----------------CATT-GGATGTTTATAAAGAGTGTACAAG----GGGATCTTTGTTGATAAGTAATTAGGTGTTAATTGTTATTCAGTATCTCGGTTGCATCAGTGT-ATTTTGTTTATCCTATGTAAGAAATAGA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTGTTA-----GTGAA----AG-AATTT-------TTTTT-ATTAACTA
gi|8 : cttttgaggtgaaggtcattaaATCGCTGGAAGA----GGTGTTTTGAATTTCA------------T------------CCTTCATAAAGTAACATT------TTATATTGTATATTTCAAGAATTTAGTCACtcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|8 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactTATC---GTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTATTAGTTCTCTAAATAGTCTT-ATTAATATTGAAGTCGAT-------A-A----TC--TAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCT--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----C--GCC--GTCT----GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------AT-CGACGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|9 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATAGAGATGATAAAG-ATTA-AATTTGTTTTATGTGTGCAATATGTTA-----GTGAAT-G-AAGAATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTTAAGTATACACTATAGTTGCATTTTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CCTTCACGAAGTAACATT------TTTTATCGTATAGTTCAAGAATTTAGTCAC
gi|9 : aCTAGTTCTCTAAATAGTCTAAATTCATATTGAAATCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATACG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATAATGACG-TATAGAGC---A-C-CCTGTC----G--TCG--GAAGTCCAGCAGCT--CTTTGCGGTCTCACA------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaagagctctatacgggattatggggcataatgacgtatagagcaccctgtcgtcggaagtccagcagctctttgcggtctcacat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATTTTCCAATAACGCCGAAAACGGTATCACACGAAAATTACATTCGATTATATTGAAACTATTGCATTTTATACTAAATACATTGGAATACATTGAATTATACATTTAATTTCTGATTTTTTACAATTAATCACATATTCCTGATGAAAACGAAGTTTTTGCAATTCCACTAGTGTTCGTTATTAAATACGAGTATCAATAACAAC
Unaligned ( gi|25 ): CGTGCAACACACACATAACGCTAGAGAGTATTGTGAGACCGTATGGAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 1111111111111 11111111 111 2222222222 1111 11 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 22 11111 2222222 88888888888888888888888888888888888 111111 3333333333333333333333333333333333333333333 11111111 222 1111111 222222222222 11111 22222222222222222222222222 555555555555555555555555555 111111111 6666666666666666666666666
lowQualScore : 6 3 1 0 3 3 55555555 55 55 666666666 2222222222222 44444444 3 3 222 6666666666 4 777 4 9999 4 4 3 3 3 0 5 888 0 0 0 4 0 1 4 0 777 4 4 4 3 2 4 1 0 777 4444 55 11 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 2 9999 0 4444444 66 77 4 11111 8888888 4 66 4 2 7777 77777777777777777777777777777777777 44 3 3 3 222222 3 0 4 9999999999999999999999999999999999999999999 5 44 1 55555555 1 3 3 1 22 11 1 1 0 999 55 0 000 0 55 555 2 0000000 6666 44 111111111111 11111 444 5555 77777777777777777777777777 2 0 4 666 2 111111111111111111111111111 33 999 2 222222222 2 0 4 9999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . ........ .. .. ......... ............. ........ . . ... .......... . ... . .... . . . . . . . ... . . . . . . . . ... . . . . . . . . ... .... .. .. .. .................................................................................... . . .... . ....... .. .. . ..... ....... . .. . . .... ................................... .. . . . ...... . . . ........................................... . .. . ........ . . . . .. .. . . . ... .. . ... . .. ... . ....... .... .. ............ ..... ... .... .......................... . . . ... . ........................... .. ... . ......... . . . .........................
lowQualScore : 5 9 1 4 6 6 44444444 55 55 000000000 2222222222222 55555555 6 6 777 4444444444 0 666 0 4444 4 0 6 3 6 2 0 888 1 2 1 0 9 6 0 4 888 0 0 0 4 1 0 0 7 000 0000 55 00 00 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 4444 1 4444444 11 00 4 11111 4444444 7 11 4 4 7777 00000000000000000000000000000000000 66 3 3 3 999999 3 2 0 7777777777777777777777777777777777777777777 3 55 2 99999999 0 2 2 0 00 33 0 0 9 444 00 8 555 4 00 888 0 0000000 5555 22 888888888888 11111 777 7777 77777777777777777777777777 7 4 4 111 2 777777777777777777777777777 11 222 7 222222222 9 2 0 1111111111111111111111111
consensus : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT------TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAA-TGGAGAAA-ATCGTGANNAATNNAATGATGA----TGATNNTN---ATACNGTGATAATGATGGTGAT---GATNNTGAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAAT-G-AAT-CGAGCAGCAATGATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
Reference ( family-2494 ) : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT------TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAA-TGGAGAAANNTTGTNNNNAATNNAATNATGA----TGATGNTN---ATACNGTGATAACGATGNTGAT---GNTNNTGANGACGACGNTANNGANGANGANAATGATAAT-A-AAN-CGANCGGCAATGATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
gi|1 : AATAGAGCACTGTAGTACTGCATAGAGCTCCCGACGCATAGAGC-TT-CCAG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GT--------CTC-GAC-GTATAGAG---CTC----------TATG-GCCC--AA-GTAT----ACAA-ATCAACATTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-TC---TTAAAA-TA-ATAGTCGTACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGAAGTGTCTAAATGTACATCAGCACTGTTGTTTACATATACACTAAAATCCTGCATTAGGACCAT-CTTTATTATAAAATTCGGA-TTGTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCAACGC-TATATTCGGTATTAGGACAGTTTGTATACCGACGG-AATAGCGTATTTTCCTTTAATTTGACTCCGAAAATTGG---ACCACCAGTTGATTCCCTC-----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-CGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----AGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTG---TTCAGCATCTCGGTTACACTAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAAAATTA-AAAATGTTTCATGTGTACCATGTATTA-----GTG-A--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTAAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CT--TTC-ATAAAG-TAAC-TTT------TTGTATTGT-ATATTTAAGAAATTTTGTCACTGTTAT-CTGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---ATTGTTGTTGTG---GAAGTGGTAGATGTTGTAC-AGTTCTT--AATAGTCTTAATTAATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----CAAA-A--GTA--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CAACGCATAGAGCGT----------C-T---C-AC-----GGAGCTCTGTGCGGACT
gi|10 : TGATGCATAGAGC-TC-CCGG-----GA-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC---C--CGT-GAG---GTC----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCCT-ACATCTCTACG-CATAGAGCTC-ACGAATTAAAAATA-CTATTCATACTGATAGTCTTTACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTACTATAAATAT-----------------AT-AGCACTGCTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGAATCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTAAATT--TGATCC---TTATGTTTA-ATA-ATAATATTGTCACCCC-TCTATTTTGTATTAGGACCGCTTGGATGACGACGGAATTAGTGTATTGTCT-----TTTAACTCCGGCCATGGG---GCCACCAGTTTATCACGTCA----T--T--CTTATTCACT--T-C-T-----GTTT---------T----------TG----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|11 : TTATTCAATTATGCCCTATAGTTGAATTGTTTAATCATTGAAAGACTGAAGTGTT---------G------------TTTTGAATTTCATCC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT------TTACATTGT-TTATTTCAAGAATTTAGTTACTGTTAA-TGGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NAT-CGAG-AGCAATGATAATTG--TTATC---GTTGTTGTGGTTGAAGAAGTGGTAGATGT---ACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTGATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAACTAAATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGTGCATATTGACG-AATA-AAC---T-C-A----T----G--ATG--AAT-----AGAGCTCACTATGCGATTTTATA------A--T-gaatg
gi|12 : tTCTG-ACATCTTGGCG-CATAGAACTC-CCAAATTAAAAATG-A--GTCATA----CTG-----ACG--------------------GTCA-CGTTATT-------TGAGGTGTCTCAATGTCCATCAGCA-----------ATCTACACTAAATCCCCGTATTAGGACCAT-CTCTGTAATAAAATT--------TTCACTTTGTTTGATGATCACTGTTTTTTTTG--TA-ATAATGTTGCCATCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTTTACAACGACGG-AATATTGCATCTTCCTTTAATTTAACTCCGGAAACTAG---ACCATCAGTTGATCCCGTTATT--T--T--TT--TTCACTTCT-CTT-----ATTT---------TCAGGTGAAGGTTA---------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTATGTACAAG----GGGGTCTTTATTGAT-------TAGGTGGC-GTTGTTAT
gi|13 : a-AAACGGGTTTG-ACATCTTGACA-CATTGAATTC-CCGAATTAAAAATGGATAGTCACAAGGACTTTC---ACGCTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCGTTATTATAATTATACAGTGTCTAAATGTCCATCAGTACTGTTGTTTAAATCTGCACTAAAACCCCGTATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCTGA-ATTTTCCTTTTATTTAATAATCA---TTTAGCTTA-GTA-ACAATATTGCCACCCC-TA-----GGTATTAGGACCGTTTGTACAACGGCGG-AATAGTGTA--------------AACTCCGGAAACTTA---ACCACCACTTGATCCCGTCATTTTT--T--TT--TTTACTTCT-C-T------CTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|14 : TGGCG-TATAGAACTCTCCAAAATAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGT----------------AACGCCGTCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCAGCATTAGGACCAT-CTCTATAATTAAATTTGGATTTTTTCCTTTTGTTTAATGGTCA---TTTTG----------------TGTCATCCC-TATATTCCGTATTATGACCGTGTGTACTACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATATAACTATGGCAATTGG---ACCACCAGTTGATATCGTCA----TTCT--TT--TTCACTTCT-C-T------TTT---------T----------TT----------CTGATGAAGGTTATTAACAAAT-----------------CATT-GGGCGTTTgaagaatattaacaagccgg
gi|15 : TAATGATGAATATAATGATAAT-G-AAG-TCAACAGCAAGGATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTTTGGAAAAAGTGTCATATGTTGTACTAGTTCTATAAATAGTCTTA----ATAATGAAGTCGAT-------ATA----TC--CTAAT------------CG-----GAGATCTCTTTTCC--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGA-----------------------------------GGAGCT--ATATGCGtttaa
gi|15 : atTT-GAC-GCATAGAGGAGCTA----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-AACAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATGGAGCTC-CCtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacatcttgacgcatggagctcccctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcataTGTGAGACCGCATAGA---------GCATAGAGCTTT-CCGA-----TT-AACTAACTGT---------ATTCGTCGATTATAAAACCGCACAGAACTCTC-TACGGCGGAGGGGAGCTC----------CATG-CGTC--AAGATGT-----CAG-ACCCGTTTTA-AAGTTGTTGTGTATAT-TTGACG-CATATAGCTC-Cctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaGACATCTTGACG-CATGGAGC---T-C-C----CCTCCG--CCGTAG-------AGAGTT--CTGTGCGGTTTTATA------A--T-CGACGAATACAGT-TAGTTA-----A-T---C-GG-----AAAGCTCTATGC
gi|16 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtct------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-AAC------GTATATTGT-ATATTTAACGAATGTAGTCACNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTG--TTATC---GTTGTTTTTGTGGAAGAAGTGGCAGTTGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTTTTAATTGGTATTAATGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTTTGTGCT--GTTT----TAT--------------------------A------ATCGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----tctatgcggtctcaca
gi|17 : gttgttttgaatttcaTGCGGGACCACATAGAGCTCCTTACCC-TAG--C-TC-CCCG-----AGTAGAT--T--T---------ATGCGT------TAC----GT--------CCT-GAC-GCATAGAG---ATC----------
gi|17 : ------------CG-----AGTAGATTTATGCG-----T----TAC--------------------------G-----TCCTGACG-CATAGAGA---T-C-C-------------CG--G-------GGAGCC--CATTGTG---TTA-A------GCCT-CGGTGTATAGAGC-T----------C-C---C---------GA--TCTATGCGccggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|17 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctcccTCCTGACGCATAGAGA-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--A---------TTGTGT------TAA----GC--------CTC-GGT-GTATAGAG---CTCCCGATC----TATG-CGTC--AA-ATAT----GCTTTAT-AACTTTATAAATGGATCTG-ACATTTTGACG-CCTAGAGCTC-CCGAATTAAAAACG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGTTAGACCCTAAACGCCATCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCTATTAACACCGTTGTT----TCTACACTATAACCCTGCATAAGGACtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|18 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacgGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATTAAGC-TCACCAA-----TA-AGCT--C--T---------ATGCAT------TGC----GT--------C-C-GAC-GCATCGAG---CTC----------
gi|18 : GAGCTCTATTCG----------T-C--------------------------GAGGCCTA---ATG-CATAGGGC---T-C-C----C----C---CG--G---------AGCT--CGATGCG---TCGGA------C--G-CAATGCATAGAGC-TTATTGGTGAGC-TTAAT-GCGTCA-GGAGCTCTATGCGGTCTcgggggagccctatgcattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgTGACG-CATTAAGC---T-C-A----C--------CA--A-------TAAGCT--CTATGCA---TTGCG------T--C-CGACGCATCGAGC-T----------C-C---G-GG-----GGAGCCCTATGCccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgagaccgcatagagctccAATA-AGCTCTATG------CATTGCG-TCC-GACGCATCGAGC-TC-CGGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCAT------TAG----GC--------CTC-GAC-GAATAGAG---CTCCCAGGAGCTTTATA-CGTC--CA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AATTGTGTCTG-ACATCTTGACG-CAAAGAGATC-CTGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGGCAGTC---ACGTTATTTGCTAGACACTTAACGCCATCATTAATACAATTATGTAGTGTCTAAATGTCCATCAGCATTATTGTTTAAATCTTCACTAAAAattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|2 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccGCTCTGTGAGACCACATAGAGGTCCT-------------TC-CT-------------------T---------ACGTAT--------A----GC--------CTC-GAC-GTAAAGAG---CTC----------TATG-CGTC--AA-CTTT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACTTGTCTG-ACGTCTTAACG-CATAGAACGC-C
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcAACGCCATCATTGTTATAACTACGCAGTGTCTAAATTTCCA------CT-TTGTTTAAATCTACACTAAAATCCCGCATTACG-TCATTCTCTATATTAAAATTCGAA-TTTT-CCTTTTGTTTTATAATCA---TTTTGTTTA-ATT-ATAATATTGCCACCCGGTA-ATCTGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGATGG-AGTGGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAAATGG---ACCACAAGTTGATCCTGTCA----T--T--CG--TTTACTTTT-T-TCTTATATTCAGGTGAAGGT----------TA----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATTTGGGCGTTTATAAAATGTATACAAG----GGGGT-TTTGTCAAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACTTCAATGTCATTTTGTTTGTCCCGTGTAAGAAATAGA--TGGTAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATATATTT-----GTGAAAGG-AG-AATTTATTTA--TTATT-ATAAATTACCTTCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTCAATCATTGAAAGA----CGTGTT---------GTTTTGAATTTCAT------------CC--TTC-ATAAAG-TAGT-ATT------TTATATTGC-ATTTTTTAAGAATAAAGTCACTGTTAA-TGGAGAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNNNNNNTCTTATAG--TT------GTTGGTAT---GGAACAAGTGGTAGATGTTGCACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAGTTGATTTTGAAGTTGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----CGT--------------------------GTGGCATATTGACG-CGTAGAGCA--C-C-C----C----GTTGTC--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTAATA------A--T-CGatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|20 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagTGATGTTTGGTTTA-C---GTTGTTGATGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTTATATATATTGAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAA-------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATCCCGA-----------------------C----G--GCG--G-------GACGCT--CTATGAGGTTTTATA------A--T-----------------------------------C-----GGAGCTTTATGCGGTCT
gi|21 : aataaagtctacgactcgTCTG-ACATATTGACGTCA-AGAACTC-CCGGATTAAAGATA-ATAGTTATACCGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCGTAAACACAAACATTTTTATAATTATGCAATGTCTAAATGTCCATCCGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-ACATGTAAT--AGTT-----TCCCCCCTTTTATTTAATAATcacccggc
gi|22 : GGTAGATGCTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTCAAATAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CGAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATACTG-CGTCAGA-AGCGCGT-C-T----A----T--GCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGTTTCA
gi|23 : TTAACG-CATAGGGC---TAC-C----C------------G-------GGATCT--TTATACG---TAAGA------A--CGCAACGCATAGAGA-T----------CAG---C-GA-----GGAGATCTATGCG
gi|23 : aGATCTCTATGCG-----T----T-------------------------------GCGTTCTTACG-TATAAAGA---T-C-C-------------CG--G-------GTAGCC--CTATGCG---TTA-A------GCCT-CGACGAAAAGGGC-T----------C-T---gcctcgacgaaaagggctctatgcgtcgaa
gi|23 : acgcatagatctcctcgctTTCTTACGTATAAAGA-TC-CCGG-----GT-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GAAAAGGG---CTC----------TATG-CGTC--GA-Aatgcgtcgaa
gi|24 : acgcatagatctcctcgctgatctctatgcgttgcgATAGAGCTC-ATGA--CTG-ATAGAGCTTCTGACGCACAGA
gi|24 : TGTGAGACCGTATAGAGCTCATGACTGATAGAGC-TT-CTGacggtctcacactgcctatattgaaac
gi|26 : tctgtgcgtG-CCTC--GG-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAATGGG--------TCTTGGCG-CATctgcctatattgaaac
gi|27 : --G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGATGCA
gi|3 : CTGTTATTTAAAGCAACACCAAAACCCCGCATTAGGACAAT-CGCTATAATAAAATTCGGA-TTTTCCCTTTCATTTAATGATTA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCAGTATAAGGACCGCTTGTACGACGATGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATTTTACTCCGGAAATTGGCGGACTACCAGTTGATCTAGTTA----T--TCTTT--TTCACTTCT-G-T--------T---------T----------TT----------TT---------------CAGGTGAAGGTTATCAACAAATCATT-GAGCGTTTATAAAGTGTGTACAAT----GGGGTTTATGTTGAT-------TAGGTATTAGTTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTAGTTTGTCCCATGTAAGAAAAAAA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTTTGCAATGTATCA-----GTGAAA-G-AAGAATTAATTTA--TTTTTTATTAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATT-TTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTATGAATTGCGTCC--TTA-ATAAAG-TAAC-ACT------TGATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAATCACTGTTGG-TGGAAAAA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-AAT-CGA-CAGCAATGATGACTG--TTATC---------GTTGTGGAAGAAGTTGTAGATGTTGTACTAGTTTTCTAAATAAT-TTAATTAATACTGAAATCGA--------ATGCGGTTT--TATAT-------------------AGGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGATC---T-CTC----C----G--CCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGGATTATGGGGCATA--T-TGGCGCATAGATC-T----------C-T---CTGCGGTCGGGAGCTCTATG
gi|4 : TGTTTGTATATATAG-ATTGCCGTCCC-TATATTCGGTATTATGACCTATTGTACAGCGACGG-ATTTGTGTATTTTCTTTAAATTTAACTCCGGACAGTGG---ACCACTAGTTGATCCCGTCA----T--TCTTT--TTCACTTCT---------ATTT---------T----------TTCAGGTAAATGTT---------------AATGT-----------------CATT-GGTCGTTTATAAAGTGTG------------GGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTCAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATAAGTGTCATTATATGTGTCCCATGTAATAAATAGA--TGATGAAT-ATTA-AACATGTTTCATGTGTTAAATATATTATAAGAG-GAA--G-AA-GA---ATTCA--TTTTT-ATAAATGAACATTATTCAATTAT---------------TGTTTAATTATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTTAGAATTCCATCC--TGC-ATAAAG-TAAC-AGT------TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTGGTCACTGTAAA-TGGAGAAAAATGATAACGAATCTAATGATGA----TGATTGTG---ATACTGTGAAAATGATAATGAG---AATTTTAAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAAT-A-AAATCGA-CAGCAATGATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTGTGGAAGAAGTAGTAGATGTTGTATTAGTTTTCTAAAATGTCTTAATTTATGTTGAAGTCGCTCGACTTCATA----TCGGCGCATAGAGCTTTCCGCCGCC---AGGAGCTCTGTGTG--GTTT----TATAATCGAAGAGCTCTATGTGGGATTATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-CTC----C----GCCGCC--G-------GAATTT--CTACGCGTTTTTATA------A--T-CGA---------------------------------------AGCTCTATGCGGTCTtc
gi|5 : g-CTCTGTAATCAATGTCGGA-CTTTCCATTTTGTTTAATGATTA---TTTTGTTTT-ATA-ATACTATTGCCACTCC-TTAATTCGATATTAGAACCGCTTGTACAACGACGG-AAAAAAGTATTATCTTTTAATT-AACTCCGTAAATTGG---GGTACCAGTTGATCTCCTCA----T--T--TT--TT----TCT-C-T------TTT---------T----------TTCTGG------TT---------------AAGGTTATTAACACGA------CATT-GAACGTTTATAAAATGTATACAAG----GAGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTTTCAATTGTTATTCAGCATCTCAGTTACATCAGCGTCATTTTGTTTGTCCCATATAAGAAATAGA--TGATTAAGATTTATAATATGTTTTATGTGTGCAATGTACTA-----GTGAAAGA-AA-AAATCATTTATTTTTTT-ATAAAGTAACATAATTCA---------------------GTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-AAAAAG-TAAC-ATT------TTATATTGT-ACATTTCAAGAATTAAGTTACTGTTAA-TGGAGAAA-ATCATGATCAATATAGTGATTAATTGTGATTTTG---AT--GATGATGACGATGTTAATGCAGATGGTGATGACAATGTTGAAGATAAAGACAATGCTAAT-GCAAT-CGAG-AGTAATGATGATTG--TTATCGTTGTTGTTGTTGTGGGAGAAGTGGTATATTTTGTATTAGTTC---------TCTTAATTGATATTAAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAAT------------TG-----AAAAACCCTATcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|6 : ---------T----------TT----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGACGTTTATTAAGTGTAAACAAA----GGGGTCTTTGTTGAT-------TTGGTGTTAATTTTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGAGAGA-GATTA-ATTATGCTTCATGTGTTCACTGTATTA-----GTGAA--ATAATAATTCAACTA--TTTTT-ATAAACTAACATTATTCAATTATGCACTATATTTCCATTGTATAAACATTGAACGA----GGTGCT---------GTTTTTAATTTCAT------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-TTT------TTCCATTCT-ATATTTCAAGAATTTAGTAGTTATCAA-TAAAGAAA-------------------ATGA----TGATG------ATAC--TGATAA------TAAT---GATTGTGAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAACGA-AAT-TGA-CAGCAA--ATGATTG--TTATC---GTTGTTGTTGCGGAAGAAGTGGTAGATTGTGTACTAGTT-TTTAAA-AGTATTAATGAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAATATCCC-------CGCCGTCAGGAGCTCCATGCGTCAGATGCTCTAT--------------------------GCGTCA----GGGGTCA-AGGGC---T-C-TATG-C----G--TCA--G-------GG-GCT--CTATGCG
gi|6 : tctttttttcaggtgaatgATAAAGCTGTGTTATACTGTACAGAGCCCCTGACGCATAGAGC-CC-CTGACGCATAG-AGCC--C--TTGACCCCTGACGCAT------AGA----GC--------ATCTGAC-GCATGGAG---CTC----------C-TGACGGCGGGG-ATATTTGGATAT-ATCGACTTCA-tcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|7 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatacAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTACATCTACACTAAAACCACGCATTAGGGCCAC-CTCTATAAAAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTGAAATGACCA---TTTTGATTA-ATA-ATAATATTGCCACCAC-TATATTCGGTATTAGAACCGCTTGTAAAACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTT-ATTTAACTCCGGAAATGGG---GCCACCATTTGATCCCGTCA----T--T--CTTATTCACTTCCGT-T-----ATTT---------T----------TA----------TT---------------CAGG---------------------T-GAAGGTT-----AGTA---ACAAGTCACTGGGCGTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGAAAGAAATAGA--TAATAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATCA-----GTGAA--A-GG-CATT--TTT---TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAGTTATACACCATAGTTGCATTGTTTAATCATTTTAAGT----GGTTGT---------G------------T------------TTAATTCAATAATGATGATGATTG-----TGATACTGTGATACT----GA---TGGTGA----TAA-TG--AAAACAATGTTAAAGATAAA--GATAA----TGA-AATC---AT-CAGCAATGATGATTGTTATC--GTTGCTGcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|7 : TGCAATGT---ATCAGTGAAAGG----CATTTT----------------------T------------TT--TTT-ATAAAT-TAAC-ATCATTCAGTTATACACC-ATAGTTGCATTGTTTAATCATT-TTAAGTGG-------TTGTGTTTAATTCAATAATGA----TGATGATTGTGATACTGTGATACTGATGGTGAT------AATGAAAACAATGTTAAAGATAAAGATAATGA-------AAT-C-ATCAGCAATGATGATTG--TTATC---GTTGCTGTTGTGGAAGAAGTGGTAAATGTTG--------CTCTAAATTGTCTTAATTAATATAGAAGCCGttgtggaagaagtggtaaatgttgctctaaattgtcttaattaatatagaagccg
gi|8 : agtgtctaaatgtccatcagcactgttgtttacatctacactaaaaccacgcattagggccacctctataaaaaaattcggatttttccttttgtgaaatgaccattttgattaataataatattgccaccactatattcggtattagaaccgcttgtaaaacgacggattagtgtattttcttttatttaactccggaaatggggccaccatttgatcccgtcattcttattcacttccgttatttttattcaggtgaaggttagtaacaagtcactgggcgtttgttgattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgaaagaaatagataataaagattaaatatgtttcatgtg---------------CACGT-----------------CATT-GGATGTTTATAAAGAGTGTACAAG----GGGATCTTTGTTGATAAGTAATTAGGTGTTAATTGTTATTCAGTATCTCGGTTGCATCAGTGT-ATTTTGTTTATCCTATGTAAGAAATAGA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTGTTA-----GTGAA----AG-AATTT-------TTTTT-ATTAACTA
gi|8 : cttttgaggtgaaggtcattaaATCGCTGGAAGA----GGTGTTTTGAATTTCA------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT------TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACtcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|8 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactTATC---GTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTATTAGTTCTCTAAATAGTCTT-ATTAATATTGAAGTCGAT-------A-A----TC--TAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCT--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----C--GCC--GTCT----GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|9 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactatcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATAGAGATGATAAAG-ATTA-AATTTGTTTTATGTGTGCAATATGTTA-----GTGAAT-G-AAGAATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTTAAGTATACACTATAGTTGCATTTTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ACGAAG-TAAC-ATT------TTTTATCGT-ATAGTTCAAGAATTTAGTCAC
gi|9 : aCTAGTTCTCTAAATAGTCTAAATTCATATTGAAATCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATACG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATAATGACG-TATAGAGC---A-C-CCTGTC----G--TCG--GAAGTCCAGCAGCT--CTTTGCGGTCTCACA------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaagagctctatacgggattatggggcataatgacgtatagagcaccctgtcgtcggaagtccagcagctctttgcggtctcacat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATTTTCCAATAACGCCGAAAACGGTATCACACGAAAATTACATTCGATTATATTGAAACTATTGCATTTTATACTAAATACATTGGAATACATTGAATTATACATTTAATTTCTGATTTTTTACAATTAATCACATATTCCTGATGAAAACGAAGTTTTTGCAATTCCACTAGTGTTCGTTATTAAATACGAGTATCAATAACAAC
Unaligned ( gi|25 ): CGTGCAACACACACATAACGCTAGAGAGTATTGTGAGACCGTATGGAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 1111111111111 11111111 111 2222222222 1111 11 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 22 11111 2222222 99999999999999999999999999999999999 22222222222222 1111 111111 4444444444444444444444 11111 11 1111111 222222222222 11111 22222222222222222222222222 555555555555555555555555555 111111111 6666666666666666666666666
lowQualScore : 6 3 1 0 3 3 55555555 55 55 666666666 2222222222222 44444444 3 3 222 6666666666 4 777 4 9999 4 4 3 3 3 0 5 888 0 0 0 4 0 1 4 0 777 4 4 4 3 2 4 1 0 777 4444 55 11 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 2 9999 0 4444444 66 77 4 11111 8888888 4 66 4 2 8888 11111111111111111111111111111111111 55 3 3 3 3 3 66666666666666 4 0 0000 444 1 888888 2222222222222222222222 1 33333 88 1 55 77777 666 2 0000000 6666 44 111111111111 11111 444 5555 77777777777777777777777777 2 0 4 666 2 111111111111111111111111111 33 999 2 222222222 2 0 4 9999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . ........ .. .. ......... ............. ........ . . ... .......... . ... . .... . . . . . . . ... . . . . . . . . ... . . . . . . . . ... .... .. .. .. .................................................................................... . . .... . ....... .. .. . ..... ....... . .. . . .... ................................... .. . . . . . .............. . . .... ... . ...... ...................... . ..... .. . .. ..... ... . ....... .... .. ............ ..... ... .... .......................... . . . ... . ........................... .. ... . ......... . . . .........................
lowQualScore : 5 9 1 4 6 6 44444444 55 55 000000000 2222222222222 55555555 6 6 777 4444444444 0 666 0 4444 4 0 6 3 6 2 0 888 1 2 1 0 9 6 0 4 888 0 0 0 4 1 0 0 7 000 0000 55 00 00 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 4444 1 4444444 11 00 4 11111 4444444 7 11 4 4 5555 88888888888888888888888888888888888 00 6 6 6 6 6 22222222222222 0 6 6666 111 0 000000 6666666666666666666666 8 22222 88 3 00 00000 444 1 0000000 5555 22 888888888888 11111 777 7777 77777777777777777777777777 7 4 4 111 2 777777777777777777777777777 11 222 7 222222222 9 2 0 1111111111111111111111111
consensus : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-TNATNANNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATG-A-A-TCGAGCAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
Reference ( family-2494 ) : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-TCGTGANNAATNNAATGATGA----TGATNNTNATACNGTGATAATGATGGTGA----T---GATNNT---GAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAATG-A-A-TCGAGCAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
gi|1 : AATAGAGCACTGTAGTACTGCATAGAGCTCCCGACGCATAGAGC-TT-CCAG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GT--------CTC-GAC-GTATAGAG---CTC----------TATG-GCCC--AA-GTAT----ACAA-ATCAACATTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-TC---TTAAAA-TA-ATAGTCGTACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGAAGTGTCTAAATGTACATCAGCACTGTTGTTTACATATACACTAAAATCCTGCATTAGGACCAT-CTTTATTATAAAATTCGGA-TTGTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCAACGC-TATATTCGGTATTAGGACAGTTTGTATACCGACGG-AATAGCGTATTTTCCTTTAATTTGACTCCGAAAATTGG---ACCACCAGTTGATTCCCTC-----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-CGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----AGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTG---TTCAGCATCTCGGTTACACTAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAAAATTA-AAAATGTTTCATGTGTACCATGTATTA-----GTG-A--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTAAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CT--TTC-ATAAAG-TAAC-TTT-TTGTATTGT-ATATTTAAGAAATTTTGTCACTGTTATCTGAGAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NATTGTT---GTTGTG---GAAGTGGTAGATGTTGTAC-AGTTCTT--AATAGTCTTAATTAATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----CAAA-A--GTA--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CAACGCATAGAGCGT----------C-T---C-AC-----GGAGCTCTGTGCGGACT
gi|10 : TGATGCATAGAGC-TC-CCGG-----GA-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC---C--CGT-GAG---GTC----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCCT-ACATCTCTACG-CATAGAGCTC-ACGAATTAAAAATA-CTATTCATACTGATAGTCTTTACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTACTATAAATAT-----------------AT-AGCACTGCTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGAATCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTAAATT--TGATCC---TTATGTTTA-ATA-ATAATATTGTCACCCC-TCTATTTTGTATTAGGACCGCTTGGATGACGACGGAATTAGTGTATTGTCT-----TTTAACTCCGGCCATGGG---GCCACCAGTTTATCACGTCA----T--T--CTTATTCACT--T-C-T-----GTTT---------T----------TG----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|11 : TTATTCAATTATGCCCTATAGTTGAATTGTTTAATCATTGAAAGACTGAAGTGTT---------G------------TTTTGAATTTCATCC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTACATTGT-TTATTTCAAGAATTTAGTTACTGTTAATGGAGAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNA-TCGAG-AGCAATGATAATTG--TTATC---G-TTGTT---GTGGTTGAAGAAGTGGTAGATGT---ACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTGATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAACTAAATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGTGCATATTGACG-AATA-AAC---T-C-A----T----G--ATG--AAT-----AGAGCTCACTATGCGATTTTATA------A--T-gaatg
gi|12 : tTCTG-ACATCTTGGCG-CATAGAACTC-CCAAATTAAAAATG-A--GTCATA----CTG-----ACG--------------------GTCA-CGTTATT-------TGAGGTGTCTCAATGTCCATCAGCA-----------ATCTACACTAAATCCCCGTATTAGGACCAT-CTCTGTAATAAAATT--------TTCACTTTGTTTGATGATCACTGTTTTTTTTG--TA-ATAATGTTGCCATCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTTTACAACGACGG-AATATTGCATCTTCCTTTAATTTAACTCCGGAAACTAG---ACCATCAGTTGATCCCGTTATT--T--T--TT--TTCACTTCT-CTT-----ATTT---------TCAGGTGAAGGTTA---------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTATGTACAAG----GGGGTCTTTATTGAT-------TAGGTGGC-GTTGTTAT
gi|13 : a-AAACGGGTTTG-ACATCTTGACA-CATTGAATTC-CCGAATTAAAAATGGATAGTCACAAGGACTTTC---ACGCTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCGTTATTATAATTATACAGTGTCTAAATGTCCATCAGTACTGTTGTTTAAATCTGCACTAAAACCCCGTATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCTGA-ATTTTCCTTTTATTTAATAATCA---TTTAGCTTA-GTA-ACAATATTGCCACCCC-TA-----GGTATTAGGACCGTTTGTACAACGGCGG-AATAGTGTA--------------AACTCCGGAAACTTA---ACCACCACTTGATCCCGTCATTTTT--T--TT--TTTACTTCT-C-T------CTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|14 : TGGCG-TATAGAACTCTCCAAAATAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGT----------------AACGCCGTCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCAGCATTAGGACCAT-CTCTATAATTAAATTTGGATTTTTTCCTTTTGTTTAATGGTCA---TTTTG----------------TGTCATCCC-TATATTCCGTATTATGACCGTGTGTACTACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATATAACTATGGCAATTGG---ACCACCAGTTGATATCGTCA----TTCT--TT--TTCACTTCT-C-T------TTT---------T----------TT----------CTGATGAAGGTTATTAACAAAT-----------------CATT-GGGCGTTTgaagaatattaacaagccgg
gi|15 : TTAATGATGAATATAATGATAATG-A-AGTC-AACAGCAAGGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTTTGGAAAAAGTGTCATATGTTGTACTAGTTCTATAAATAGTCTTA----ATAATGAAGTCGAT-------ATA----TC--CTAAT------------CG-----GAGATCTCTTTTCC--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGA-----------------------------------GGAGCT--ATATGCGtttaa
gi|15 : aTT-GAC-GCATAGAGGAGCTA----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-AACAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATGGAGCTC-CCtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacatcttgacgcatggagctcccctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcataTGTGAGACCGCATAGA---------GCATAGAGCTTT-CCGA-----TT-AACTAACTGT---------ATTCGTCGATTATAAAACCGCACAGAACTCTC-TACGGCGGAGGGGAGCTC----------CATG-CGTC--AAGATGT-----CAG-ACCCGTTTTA-AAGTTGTTGTGTATAT-TTGACG-CATATAGCTC-Cctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaGACATCTTGACG-CATGGAGC---T-C-C----CCTCCG--CCGTAG-------AGAGTT--CTGTGCGGTTTTATA------A--T-CGACGAATACAGT-TAGTTA-----A-T---C-GG-----AAAGCTCTATGC
gi|16 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtct------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-AAC-GTATATTGT-ATATTTAACGAATGTAGTCACtctatgcggtctcaca
gi|16 : gttgttttgaatttcaTG--TTATC---G-TTGTT---TTTGTGGAAGAAGTGGCAGTTGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTTTTAATTGGTATTAATGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTTTGTGCT--GTTT----TAT--------------------------A------ATCGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttatcgttgtttttgtggaagaagtggcagttgttgtactagttctctaaatagttttaattggtattaatgtcgatatatccaaatcgaagagctttgtgctgttttataatcgacgcatagagctccc
gi|17 : gttgttttgaatttcatccttcataaagtaacaacgtatattgtatatttaacgaatgtagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCGGGACCACATAGAGCTCCTTACCC-TAG--C-TC-CCCG-----AGTAGAT--T--T---------ATGCGT------TAC----GT--------CCT-GAC-GCATAGAG---ATC----------
gi|17 : ------------CG-----AGTAGATTTATGCG-----T----TAC--------------------------G-----TCCTGACG-CATAGAGA---T-C-C-------------CG--G-------GGAGCC--CATTGTG---TTA-A------GCCT-CGGTGTATAGAGC-T----------C-C---C---------GA--TCTATGCGccggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|17 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctcccTCCTGACGCATAGAGA-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--A---------TTGTGT------TAA----GC--------CTC-GGT-GTATAGAG---CTCCCGATC----TATG-CGTC--AA-ATAT----GCTTTAT-AACTTTATAAATGGATCTG-ACATTTTGACG-CCTAGAGCTC-CCGAATTAAAAACG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGTTAGACCCTAAACGCCATCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCTATTAACACCGTTGTT----TCTACACTATAACCCTGCATAAGGACtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|18 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacgGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATTAAGC-TCACCAA-----TA-AGCT--C--T---------ATGCAT------TGC----GT--------C-C-GAC-GCATCGAG---CTC----------
gi|18 : GAGCTCTATTCG----------T-C--------------------------GAGGCCTA---ATG-CATAGGGC---T-C-C----C----C---CG--G---------AGCT--CGATGCG---TCGGA------C--G-CAATGCATAGAGC-TTATTGGTGAGC-TTAAT-GCGTCA-GGAGCTCTATGCGGTCTcgggggagccctatgcattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgTGACG-CATTAAGC---T-C-A----C--------CA--A-------TAAGCT--CTATGCA---TTGCG------T--C-CGACGCATCGAGC-T----------C-C---G-GG-----GGAGCCCTATGCccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgagaccgcatagagctccAATA-AGCTCTATG------CATTGCG-TCC-GACGCATCGAGC-TC-CGGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCAT------TAG----GC--------CTC-GAC-GAATAGAG---CTCCCAGGAGCTTTATA-CGTC--CA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AATTGTGTCTG-ACATCTTGACG-CAAAGAGATC-CTGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGGCAGTC---ACGTTATTTGCTAGACACTTAACGCCATCATTAATACAATTATGTAGTGTCTAAATGTCCATCAGCATTATTGTTTAAATCTTCACTAAAAattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|2 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccGCTCTGTGAGACCACATAGAGGTCCT-------------TC-CT-------------------T---------ACGTAT--------A----GC--------CTC-GAC-GTAAAGAG---CTC----------TATG-CGTC--AA-CTTT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACTTGTCTG-ACGTCTTAACG-CATAGAACGC-C
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcAACGCCATCATTGTTATAACTACGCAGTGTCTAAATTTCCA------CT-TTGTTTAAATCTACACTAAAATCCCGCATTACG-TCATTCTCTATATTAAAATTCGAA-TTTT-CCTTTTGTTTTATAATCA---TTTTGTTTA-ATT-ATAATATTGCCACCCGGTA-ATCTGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGATGG-AGTGGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAAATGG---ACCACAAGTTGATCCTGTCA----T--T--CG--TTTACTTTT-T-TCTTATATTCAGGTGAAGGT----------TA----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATTTGGGCGTTTATAAAATGTATACAAG----GGGGT-TTTGTCAAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACTTCAATGTCATTTTGTTTGTCCCGTGTAAGAAATAGA--TGGTAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATATATTT-----GTGAAAGG-AG-AATTTATTTA--TTATT-ATAAATTACCTTCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTCAATCATTGAAAGA----CGTGTT---------GTTTTGAATTTCAT------------CC--TTC-ATAAAG-TAGT-ATT-TTATATTGC-ATTTTTTAAGAATAAAGTCACTGTTAATGGAGAAAatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatag--TTATA---G-TTGTT---GGTATGGAACAAGTGGTAGATGTTGCACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAGTTGATTTTGAAGTTGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----CGT--------------------------GTGGCATATTGACG-CGTAGAGCA--C-C-C----C----GTTGTC--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTAATA------A--T-CGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|20 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcTGATGTTTGGTTTA-C---G-TTGTT---GATGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTTATATATATTGAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAA-------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATCCCGA-----------------------C----G--GCG--G-------GACGCT--CTATGAGGTTTTATA------A--T-----------------------------------C-----GGAGCTTTATGCGGTCT
gi|21 : aataaagtctacgactcgTCTG-ACATATTGACGTCA-AGAACTC-CCGGATTAAAGATA-ATAGTTATACCGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCGTAAACACAAACATTTTTATAATTATGCAATGTCTAAATGTCCATCCGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-ACATGTAAT--AGTT-----TCCCCCCTTTTATTTAATAATcacccggc
gi|22 : GGTAGATGCTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTCAAATAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CGAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATACTG-CGTCAGA-AGCGCGT-C-T----A----T--GCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGTTTCA
gi|23 : TTAACG-CATAGGGC---TAC-C----C------------G-------GGATCT--TTATACG---TAAGA------A--CGCAACGCATAGAGA-T----------CAG---C-GA-----GGAGATCTATGCG
gi|23 : aGATCTCTATGCG-----T----T-------------------------------GCGTTCTTACG-TATAAAGA---T-C-C-------------CG--G-------GTAGCC--CTATGCG---TTA-A------GCCT-CGACGAAAAGGGC-T----------C-T---gcctcgacgaaaagggctctatgcgtcgaa
gi|23 : acgcatagatctcctcgctTTCTTACGTATAAAGA-TC-CCGG-----GT-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GAAAAGGG---CTC----------TATG-CGTC--GA-Aatgcgtcgaa
gi|24 : acgcatagatctcctcgctgatctctatgcgttgcgATAGAGCTC-ATGA--CTG-ATAGAGCTTCTGACGCACAGA
gi|24 : TGTGAGACCGTATAGAGCTCATGACTGATAGAGC-TT-CTGacggtctcacactgcctatattgaaac
gi|26 : tctgtgcgtG-CCTC--GG-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAATGGG--------TCTTGGCG-CATctgcctatattgaaac
gi|27 : --G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGATGCA
gi|3 : CTGTTATTTAAAGCAACACCAAAACCCCGCATTAGGACAAT-CGCTATAATAAAATTCGGA-TTTTCCCTTTCATTTAATGATTA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCAGTATAAGGACCGCTTGTACGACGATGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATTTTACTCCGGAAATTGGCGGACTACCAGTTGATCTAGTTA----T--TCTTT--TTCACTTCT-G-T--------T---------T----------TT----------TT---------------CAGGTGAAGGTTATCAACAAATCATT-GAGCGTTTATAAAGTGTGTACAAT----GGGGTTTATGTTGAT-------TAGGTATTAGTTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTAGTTTGTCCCATGTAAGAAAAAAA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTTTGCAATGTATCA-----GTGAAA-G-AAGAATTAATTTA--TTTTTTATTAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATT-TTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTATGAATTGCGTCC--TTA-ATAAAG-TAAC-ACT-TGATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAATCACTGTTGGTGGA-AAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-A-A-TCGA-CAGCAATGATGACTG--TTATC-------------GTTGTGGAAGAAGTTGTAGATGTTGTACTAGTTTTCTAAATAAT-TTAATTAATACTGAAATCGA--------ATGCGGTTT--TATAT-------------------AGGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGATC---T-CTC----C----G--CCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGGATTATGGGGCATA--T-TGGCGCATAGATC-T----------C-T---CTGCGGTCGGGAGCTCTATG
gi|4 : TGTTTGTATATATAG-ATTGCCGTCCC-TATATTCGGTATTATGACCTATTGTACAGCGACGG-ATTTGTGTATTTTCTTTAAATTTAACTCCGGACAGTGG---ACCACTAGTTGATCCCGTCA----T--TCTTT--TTCACTTCT---------ATTT---------T----------TTCAGGTAAATGTT---------------AATGT-----------------CATT-GGTCGTTTATAAAGTGTG------------GGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTCAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATAAGTGTCATTATATGTGTCCCATGTAATAAATAGA--TGATGAAT-ATTA-AACATGTTTCATGTGTTAAATATATTATAAGAG-GAA--G-AA-GA---ATTCA--TTTTT-ATAAATGAACATTATTCAATTAT---------------TGTTTAATTATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTTAGAATTCCATCC--TGC-ATAAAG-TAAC-AGT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTGGTCACTGTAAATGGAGAAAAATGATAACGAATCTAATGATGA----TGATTGTGATACTGTGAAAATGATAATGA----G---AATTTT---AAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAATA-A-AATCGA-CAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTAGTAGATGTTGTATTAGTTTTCTAAAATGTCTTAATTTATGTTGAAGTCGCTCGACTTCATA----TCGGCGCATAGAGCTTTCCGCCGCC---AGGAGCTCTGTGTG--GTTT----TATAATCGAAGAGCTCTATGTGGGATTATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-CTC----C----GCCGCC--G-------GAATTT--CTACGCGTTTTTATA------A--T-CGA---------------------------------------AGCTCTATGCGGTCTtc
gi|5 : g-CTCTGTAATCAATGTCGGA-CTTTCCATTTTGTTTAATGATTA---TTTTGTTTT-ATA-ATACTATTGCCACTCC-TTAATTCGATATTAGAACCGCTTGTACAACGACGG-AAAAAAGTATTATCTTTTAATT-AACTCCGTAAATTGG---GGTACCAGTTGATCTCCTCA----T--T--TT--TT----TCT-C-T------TTT---------T----------TTCTGG------TT---------------AAGGTTATTAACACGA------CATT-GAACGTTTATAAAATGTATACAAG----GAGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTTTCAATTGTTATTCAGCATCTCAGTTACATCAGCGTCATTTTGTTTGTCCCATATAAGAAATAGA--TGATTAAGATTTATAATATGTTTTATGTGTGCAATGTACTA-----GTGAAAGA-AA-AAATCATTTATTTTTTT-ATAAAGTAACATAATTCA---------------------GTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-AAAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ACATTTCAAGAATTAAGTTACTGTTAATGGAGAAAA-TCATGATCAATATAGTGATTAATTGTGATTTTGAT--GATGATGACGATGTTAA----TGCAGATGGT---GATGACAATGTTGAAGATAAAGACAATGCTAATGCA-A-TCGAG-AGTAATGATGATTG--TTATCGTTG-TTGTT---GTTGTGGGAGAAGTGGTATATTTTGTATTAGTTC---------TCTTAATTGATATTAAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAAT------------TG-----AAAAACCCTATcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|6 : ---------T----------TT----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGACGTTTATTAAGTGTAAACAAA----GGGGTCTTTGTTGAT-------TTGGTGTTAATTTTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGAGAGA-GATTA-ATTATGCTTCATGTGTTCACTGTATTA-----GTGAA--ATAATAATTCAACTA--TTTTT-ATAAACTAACATTATTCAATTATGCACTATATTTCCATTGTATAAACATTGAACGA----GGTGCT---------GTTTTTAATTTCAT------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-TTT-TTCCATTCT-ATATTTCAAGAATTTAGTAGTTATCAATAAAGAA----------------AATGATGA----TGATACTGATA-----ATAATGAT--TG--------------T---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAACGAA-A-TTGA-CAGCAA--ATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGCGGAAGAAGTGGTAGATTGTGTACTAGTT-TTTAAA-AGTATTAATGAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAATATCCC-------CGCCGTCAGGAGCTCCATGCGTCAGATGCTCTAT--------------------------GCGTCA----GGGGTCA-AGGGC---T-C-TATG-C----G--TCA--G-------GG-GCT--CTATGCG
gi|6 : tctttttttcaggtgaatgATAAAGCTGTGTTATACTGTACAGAGCCCCTGACGCATAGAGC-CC-CTGACGCATAG-AGCC--C--TTGACCCCTGACGCAT------AGA----GC--------ATCTGAC-GCATGGAG---CTC----------C-TGACGGCGGGG-ATATTTGGATAT-ATCGACTTCA-tcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|7 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatacAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTACATCTACACTAAAACCACGCATTAGGGCCAC-CTCTATAAAAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTGAAATGACCA---TTTTGATTA-ATA-ATAATATTGCCACCAC-TATATTCGGTATTAGAACCGCTTGTAAAACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTT-ATTTAACTCCGGAAATGGG---GCCACCATTTGATCCCGTCA----T--T--CTTATTCACTTCCGT-T-----ATTT---------T----------TA----------TT---------------CAGG---------------------T-GAAGGTT-----AGTA---ACAAGTCACTGGGCGTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGAAAGAAATAGA--TAATAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATCA-----GTGAA--A-GG-CATT--TTT---TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAGTTATACACCATAGTTGCATTGTTTAATCATTTTAAGT----GGTTGT---------G------------T------------TTAATTCAATAATGATGATGATTGTGATACTGTGATACT----GA---TGGTGA----TAATGAAAACAA-T-GTTAAAGATAAA--GATAA----TGA-AATCAT-CAGCAATGATGATTGTTATCGTT---GCTGTTGTGGAAGA-AGTGGTAAAcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|8 : ---------------CACGT-----------------CATT-GGATGTTTATAAAGAGTGTACAAG----GGGATCTTTGTTGATAAGTAATTAGGTGTTAATTGTTATTCAGTATCTCGGTTGCATCAGTGT-ATTTTGTTTATCCTATGTAAGAAATAGA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTGTTA-----GTGAA----AG-AATTT-------TTTTT-ATTAACTAtgttgctctaaattgtcttaattaatatagaagccg
gi|8 : cttttgaggtgaaggtcattaaATCGCTGGAAGA----GGTGTTTTGAATTTCA------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNT---A-TCGTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTATTAGTTCTCTAAATAGTCTT-ATTAATATTGAAGTCGAT-------A-A----TC--TAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCT--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----C--GCC--GTCT----GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCtcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|9 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactAAATAGAGATGATAAAG-ATTA-AATTTGTTTTATGTGTGCAATATGTTA-----GTGAAT-G-AAGAATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTTAAGTATACACTATAGTTGCATTTTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ACGAAG-TAAC-ATT-TTTTATCGT-ATAGTTCAAGAATTTAGTCAC
gi|9 : aCTAGTTCTCTAAATAGTCTAAATTCATATTGAAATCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATACG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATAATGACG-TATAGAGC---A-C-CCTGTC----G--TCG--GAAGTCCAGCAGCT--CTTTGCGGTCTCACA------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaagagctctatacgggattatggggcataatgacgtatagagcaccctgtcgtcggaagtccagcagctctttgcggtctcacat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATTTTCCAATAACGCCGAAAACGGTATCACACGAAAATTACATTCGATTATATTGAAACTATTGCATTTTATACTAAATACATTGGAATACATTGAATTATACATTTAATTTCTGATTTTTTACAATTAATCACATATTCCTGATGAAAACGAAGTTTTTGCAATTCCACTAGTGTTCGTTATTAAATACGAGTATCAATAACAAC
Unaligned ( gi|25 ): CGTGCAACACACACATAACGCTAGAGAGTATTGTGAGACCGTATGGAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 1111111111111 11111111 111 2222222222 1111 11 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 22 11111 2222222 99999999999999999999999999999999999 1111111111111 1111 111111 3333333333333333333333 11111 11 1111111 222222222222 11111 22222222222222222222222222 555555555555555555555555555 111111111 6666666666666666666666666
lowQualScore : 6 3 1 0 3 3 55555555 55 55 666666666 2222222222222 44444444 3 3 222 6666666666 4 777 4 9999 4 4 3 3 3 0 5 888 0 0 0 4 0 1 4 0 777 4 4 4 3 2 4 1 0 777 4444 55 11 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 2 9999 0 4444444 66 77 4 11111 8888888 4 66 4 2 8888 11111111111111111111111111111111111 55 3 3 3 3 3 1 9999999999999 0 0000 444 999999 8888888888888888888888 1 33333 88 1 55 77777 666 2 0000000 6666 44 111111111111 11111 444 5555 77777777777777777777777777 2 0 4 666 2 111111111111111111111111111 33 999 2 222222222 2 0 4 9999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . ........ .. .. ......... ............. ........ . . ... .......... . ... . .... . . . . . . . ... . . . . . . . . ... . . . . . . . . ... .... .. .. .. .................................................................................... . . .... . ....... .. .. . ..... ....... . .. . . .... ................................... .. . . . . . . ............. . .... ... ...... ...................... . ..... .. . .. ..... ... . ....... .... .. ............ ..... ... .... .......................... . . . ... . ........................... .. ... . ......... . . . .........................
lowQualScore : 5 9 1 4 6 6 44444444 55 55 000000000 2222222222222 55555555 6 6 777 4444444444 0 666 0 4444 4 0 6 3 6 2 0 888 1 2 1 0 9 6 0 4 888 0 0 0 4 1 0 0 7 000 0000 55 00 00 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 4444 1 4444444 11 00 4 11111 4444444 7 11 4 4 5555 88888888888888888888888888888888888 00 6 6 6 6 6 3 1111111111111 6 6666 111 888888 9999999999999999999999 8 22222 88 3 00 00000 444 1 0000000 5555 22 888888888888 11111 777 7777 77777777777777777777777777 7 4 4 111 2 777777777777777777777777777 11 222 7 222222222 9 2 0 1111111111111111111111111
consensus : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-CGATGATNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATG-A-A-TCGAGCAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
Reference ( family-2494 ) : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-TNATNANNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATG-A-A-TCGAGCAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
gi|1 : AATAGAGCACTGTAGTACTGCATAGAGCTCCCGACGCATAGAGC-TT-CCAG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GT--------CTC-GAC-GTATAGAG---CTC----------TATG-GCCC--AA-GTAT----ACAA-ATCAACATTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-TC---TTAAAA-TA-ATAGTCGTACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGAAGTGTCTAAATGTACATCAGCACTGTTGTTTACATATACACTAAAATCCTGCATTAGGACCAT-CTTTATTATAAAATTCGGA-TTGTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCAACGC-TATATTCGGTATTAGGACAGTTTGTATACCGACGG-AATAGCGTATTTTCCTTTAATTTGACTCCGAAAATTGG---ACCACCAGTTGATTCCCTC-----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-CGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----AGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTG---TTCAGCATCTCGGTTACACTAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAAAATTA-AAAATGTTTCATGTGTACCATGTATTA-----GTG-A--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTAAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CT--TTC-ATAAAG-TAAC-TTT-TTGTATTGT-ATATTTAAGAAATTTTGTCACTGTTATCTGAGAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NATTGTT---GTTGTG---GAAGTGGTAGATGTTGTAC-AGTTCTT--AATAGTCTTAATTAATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----CAAA-A--GTA--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CAACGCATAGAGCGT----------C-T---C-AC-----GGAGCTCTGTGCGGACT
gi|10 : TGATGCATAGAGC-TC-CCGG-----GA-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC---C--CGT-GAG---GTC----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCCT-ACATCTCTACG-CATAGAGCTC-ACGAATTAAAAATA-CTATTCATACTGATAGTCTTTACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTACTATAAATAT-----------------AT-AGCACTGCTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGAATCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTAAATT--TGATCC---TTATGTTTA-ATA-ATAATATTGTCACCCC-TCTATTTTGTATTAGGACCGCTTGGATGACGACGGAATTAGTGTATTGTCT-----TTTAACTCCGGCCATGGG---GCCACCAGTTTATCACGTCA----T--T--CTTATTCACT--T-C-T-----GTTT---------T----------TG----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|11 : TTATTCAATTATGCCCTATAGTTGAATTGTTTAATCATTGAAAGACTGAAGTGTT---------G------------TTTTGAATTTCATCC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTACATTGT-TTATTTCAAGAATTTAGTTACTGTTAATGGAGAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNA-TCGAG-AGCAATGATAATTG--TTATC---G-TTGTT---GTGGTTGAAGAAGTGGTAGATGT---ACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTGATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAACTAAATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGTGCATATTGACG-AATA-AAC---T-C-A----T----G--ATG--AAT-----AGAGCTCACTATGCGATTTTATA------A--T-gaatg
gi|12 : tTCTG-ACATCTTGGCG-CATAGAACTC-CCAAATTAAAAATG-A--GTCATA----CTG-----ACG--------------------GTCA-CGTTATT-------TGAGGTGTCTCAATGTCCATCAGCA-----------ATCTACACTAAATCCCCGTATTAGGACCAT-CTCTGTAATAAAATT--------TTCACTTTGTTTGATGATCACTGTTTTTTTTG--TA-ATAATGTTGCCATCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTTTACAACGACGG-AATATTGCATCTTCCTTTAATTTAACTCCGGAAACTAG---ACCATCAGTTGATCCCGTTATT--T--T--TT--TTCACTTCT-CTT-----ATTT---------TCAGGTGAAGGTTA---------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTATGTACAAG----GGGGTCTTTATTGAT-------TAGGTGGC-GTTGTTAT
gi|13 : a-AAACGGGTTTG-ACATCTTGACA-CATTGAATTC-CCGAATTAAAAATGGATAGTCACAAGGACTTTC---ACGCTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCGTTATTATAATTATACAGTGTCTAAATGTCCATCAGTACTGTTGTTTAAATCTGCACTAAAACCCCGTATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCTGA-ATTTTCCTTTTATTTAATAATCA---TTTAGCTTA-GTA-ACAATATTGCCACCCC-TA-----GGTATTAGGACCGTTTGTACAACGGCGG-AATAGTGTA--------------AACTCCGGAAACTTA---ACCACCACTTGATCCCGTCATTTTT--T--TT--TTTACTTCT-C-T------CTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|14 : TGGCG-TATAGAACTCTCCAAAATAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGT----------------AACGCCGTCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCAGCATTAGGACCAT-CTCTATAATTAAATTTGGATTTTTTCCTTTTGTTTAATGGTCA---TTTTG----------------TGTCATCCC-TATATTCCGTATTATGACCGTGTGTACTACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATATAACTATGGCAATTGG---ACCACCAGTTGATATCGTCA----TTCT--TT--TTCACTTCT-C-T------TTT---------T----------TT----------CTGATGAAGGTTATTAACAAAT-----------------CATT-GGGCGTTTgaagaatattaacaagccgg
gi|15 : TTAATGATGAATATAATGATAATG-A-AGTC-AACAGCAAGGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTTTGGAAAAAGTGTCATATGTTGTACTAGTTCTATAAATAGTCTTA----ATAATGAAGTCGAT-------ATA----TC--CTAAT------------CG-----GAGATCTCTTTTCC--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGA-----------------------------------GGAGCT--ATATGCGtttaa
gi|15 : aTT-GAC-GCATAGAGGAGCTA----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-AACAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATGGAGCTC-CCtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacatcttgacgcatggagctcccctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcataTGTGAGACCGCATAGA---------GCATAGAGCTTT-CCGA-----TT-AACTAACTGT---------ATTCGTCGATTATAAAACCGCACAGAACTCTC-TACGGCGGAGGGGAGCTC----------CATG-CGTC--AAGATGT-----CAG-ACCCGTTTTA-AAGTTGTTGTGTATAT-TTGACG-CATATAGCTC-Cctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaGACATCTTGACG-CATGGAGC---T-C-C----CCTCCG--CCGTAG-------AGAGTT--CTGTGCGGTTTTATA------A--T-CGACGAATACAGT-TAGTTA-----A-T---C-GG-----AAAGCTCTATGC
gi|16 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtct------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-AAC-GTATATTGT-ATATTTAACGAATGTAGTCACtctatgcggtctcaca
gi|16 : gttgttttgaatttcaTG--TTATC---G-TTGTT---TTTGTGGAAGAAGTGGCAGTTGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTTTTAATTGGTATTAATGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTTTGTGCT--GTTT----TAT--------------------------A------ATCGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttatcgttgtttttgtggaagaagtggcagttgttgtactagttctctaaatagttttaattggtattaatgtcgatatatccaaatcgaagagctttgtgctgttttataatcgacgcatagagctccc
gi|17 : gttgttttgaatttcatccttcataaagtaacaacgtatattgtatatttaacgaatgtagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCGGGACCACATAGAGCTCCTTACCC-TAG--C-TC-CCCG-----AGTAGAT--T--T---------ATGCGT------TAC----GT--------CCT-GAC-GCATAGAG---ATC----------
gi|17 : ------------CG-----AGTAGATTTATGCG-----T----TAC--------------------------G-----TCCTGACG-CATAGAGA---T-C-C-------------CG--G-------GGAGCC--CATTGTG---TTA-A------GCCT-CGGTGTATAGAGC-T----------C-C---C---------GA--TCTATGCGccggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|17 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctcccTCCTGACGCATAGAGA-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--A---------TTGTGT------TAA----GC--------CTC-GGT-GTATAGAG---CTCCCGATC----TATG-CGTC--AA-ATAT----GCTTTAT-AACTTTATAAATGGATCTG-ACATTTTGACG-CCTAGAGCTC-CCGAATTAAAAACG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGTTAGACCCTAAACGCCATCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCTATTAACACCGTTGTT----TCTACACTATAACCCTGCATAAGGACtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|18 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacgGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATTAAGC-TCACCAA-----TA-AGCT--C--T---------ATGCAT------TGC----GT--------C-C-GAC-GCATCGAG---CTC----------
gi|18 : GAGCTCTATTCG----------T-C--------------------------GAGGCCTA---ATG-CATAGGGC---T-C-C----C----C---CG--G---------AGCT--CGATGCG---TCGGA------C--G-CAATGCATAGAGC-TTATTGGTGAGC-TTAAT-GCGTCA-GGAGCTCTATGCGGTCTcgggggagccctatgcattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgTGACG-CATTAAGC---T-C-A----C--------CA--A-------TAAGCT--CTATGCA---TTGCG------T--C-CGACGCATCGAGC-T----------C-C---G-GG-----GGAGCCCTATGCccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgagaccgcatagagctccAATA-AGCTCTATG------CATTGCG-TCC-GACGCATCGAGC-TC-CGGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCAT------TAG----GC--------CTC-GAC-GAATAGAG---CTCCCAGGAGCTTTATA-CGTC--CA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AATTGTGTCTG-ACATCTTGACG-CAAAGAGATC-CTGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGGCAGTC---ACGTTATTTGCTAGACACTTAACGCCATCATTAATACAATTATGTAGTGTCTAAATGTCCATCAGCATTATTGTTTAAATCTTCACTAAAAattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|2 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccGCTCTGTGAGACCACATAGAGGTCCT-------------TC-CT-------------------T---------ACGTAT--------A----GC--------CTC-GAC-GTAAAGAG---CTC----------TATG-CGTC--AA-CTTT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACTTGTCTG-ACGTCTTAACG-CATAGAACGC-C
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcAACGCCATCATTGTTATAACTACGCAGTGTCTAAATTTCCA------CT-TTGTTTAAATCTACACTAAAATCCCGCATTACG-TCATTCTCTATATTAAAATTCGAA-TTTT-CCTTTTGTTTTATAATCA---TTTTGTTTA-ATT-ATAATATTGCCACCCGGTA-ATCTGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGATGG-AGTGGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAAATGG---ACCACAAGTTGATCCTGTCA----T--T--CG--TTTACTTTT-T-TCTTATATTCAGGTGAAGGT----------TA----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATTTGGGCGTTTATAAAATGTATACAAG----GGGGT-TTTGTCAAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACTTCAATGTCATTTTGTTTGTCCCGTGTAAGAAATAGA--TGGTAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATATATTT-----GTGAAAGG-AG-AATTTATTTA--TTATT-ATAAATTACCTTCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTCAATCATTGAAAGA----CGTGTT---------GTTTTGAATTTCAT------------CC--TTC-ATAAAG-TAGT-ATT-TTATATTGC-ATTTTTTAAGAATAAAGTCACTGTTAATGGAGAAAatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatag--TTATA---G-TTGTT---GGTATGGAACAAGTGGTAGATGTTGCACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAGTTGATTTTGAAGTTGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----CGT--------------------------GTGGCATATTGACG-CGTAGAGCA--C-C-C----C----GTTGTC--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTAATA------A--T-CGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|20 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcTGATGTTTGGTTTA-C---G-TTGTT---GATGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTTATATATATTGAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAA-------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATCCCGA-----------------------C----G--GCG--G-------GACGCT--CTATGAGGTTTTATA------A--T-----------------------------------C-----GGAGCTTTATGCGGTCT
gi|21 : aataaagtctacgactcgTCTG-ACATATTGACGTCA-AGAACTC-CCGGATTAAAGATA-ATAGTTATACCGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCGTAAACACAAACATTTTTATAATTATGCAATGTCTAAATGTCCATCCGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-ACATGTAAT--AGTT-----TCCCCCCTTTTATTTAATAATcacccggc
gi|22 : GGTAGATGCTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTCAAATAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CGAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATACTG-CGTCAGA-AGCGCGT-C-T----A----T--GCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGTTTCA
gi|23 : TTAACG-CATAGGGC---TAC-C----C------------G-------GGATCT--TTATACG---TAAGA------A--CGCAACGCATAGAGA-T----------CAG---C-GA-----GGAGATCTATGCG
gi|23 : aGATCTCTATGCG-----T----T-------------------------------GCGTTCTTACG-TATAAAGA---T-C-C-------------CG--G-------GTAGCC--CTATGCG---TTA-A------GCCT-CGACGAAAAGGGC-T----------C-T---gcctcgacgaaaagggctctatgcgtcgaa
gi|23 : acgcatagatctcctcgctTTCTTACGTATAAAGA-TC-CCGG-----GT-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GAAAAGGG---CTC----------TATG-CGTC--GA-Aatgcgtcgaa
gi|24 : acgcatagatctcctcgctgatctctatgcgttgcgATAGAGCTC-ATGA--CTG-ATAGAGCTTCTGACGCACAGA
gi|24 : TGTGAGACCGTATAGAGCTCATGACTGATAGAGC-TT-CTGacggtctcacactgcctatattgaaac
gi|26 : tctgtgcgtG-CCTC--GG-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAATGGG--------TCTTGGCG-CATctgcctatattgaaac
gi|27 : --G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGATGCA
gi|3 : CTGTTATTTAAAGCAACACCAAAACCCCGCATTAGGACAAT-CGCTATAATAAAATTCGGA-TTTTCCCTTTCATTTAATGATTA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCAGTATAAGGACCGCTTGTACGACGATGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATTTTACTCCGGAAATTGGCGGACTACCAGTTGATCTAGTTA----T--TCTTT--TTCACTTCT-G-T--------T---------T----------TT----------TT---------------CAGGTGAAGGTTATCAACAAATCATT-GAGCGTTTATAAAGTGTGTACAAT----GGGGTTTATGTTGAT-------TAGGTATTAGTTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTAGTTTGTCCCATGTAAGAAAAAAA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTTTGCAATGTATCA-----GTGAAA-G-AAGAATTAATTTA--TTTTTTATTAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATT-TTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTATGAATTGCGTCC--TTA-ATAAAG-TAAC-ACT-TGATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAATCACTGTTGGTGGA-AAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-A-A-TCGA-CAGCAATGATGACTG--TTATC-------------GTTGTGGAAGAAGTTGTAGATGTTGTACTAGTTTTCTAAATAAT-TTAATTAATACTGAAATCGA--------ATGCGGTTT--TATAT-------------------AGGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGATC---T-CTC----C----G--CCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGGATTATGGGGCATA--T-TGGCGCATAGATC-T----------C-T---CTGCGGTCGGGAGCTCTATG
gi|4 : TGTTTGTATATATAG-ATTGCCGTCCC-TATATTCGGTATTATGACCTATTGTACAGCGACGG-ATTTGTGTATTTTCTTTAAATTTAACTCCGGACAGTGG---ACCACTAGTTGATCCCGTCA----T--TCTTT--TTCACTTCT---------ATTT---------T----------TTCAGGTAAATGTT---------------AATGT-----------------CATT-GGTCGTTTATAAAGTGTG------------GGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTCAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATAAGTGTCATTATATGTGTCCCATGTAATAAATAGA--TGATGAAT-ATTA-AACATGTTTCATGTGTTAAATATATTATAAGAG-GAA--G-AA-GA---ATTCA--TTTTT-ATAAATGAACATTATTCAATTAT---------------TGTTTAATTATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTTAGAATTCCATCC--TGC-ATAAAG-TAAC-AGT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTGGTCACTGTAAATGGAGAAAAATGATAACGAATCTAATGATGA----TGATTGTGATACTGTGAAAATGATAATGA----G---AATTTT---AAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAATA-A-AATCGA-CAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTAGTAGATGTTGTATTAGTTTTCTAAAATGTCTTAATTTATGTTGAAGTCGCTCGACTTCATA----TCGGCGCATAGAGCTTTCCGCCGCC---AGGAGCTCTGTGTG--GTTT----TATAATCGAAGAGCTCTATGTGGGATTATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-CTC----C----GCCGCC--G-------GAATTT--CTACGCGTTTTTATA------A--T-CGA---------------------------------------AGCTCTATGCGGTCTtc
gi|5 : g-CTCTGTAATCAATGTCGGA-CTTTCCATTTTGTTTAATGATTA---TTTTGTTTT-ATA-ATACTATTGCCACTCC-TTAATTCGATATTAGAACCGCTTGTACAACGACGG-AAAAAAGTATTATCTTTTAATT-AACTCCGTAAATTGG---GGTACCAGTTGATCTCCTCA----T--T--TT--TT----TCT-C-T------TTT---------T----------TTCTGG------TT---------------AAGGTTATTAACACGA------CATT-GAACGTTTATAAAATGTATACAAG----GAGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTTTCAATTGTTATTCAGCATCTCAGTTACATCAGCGTCATTTTGTTTGTCCCATATAAGAAATAGA--TGATTAAGATTTATAATATGTTTTATGTGTGCAATGTACTA-----GTGAAAGA-AA-AAATCATTTATTTTTTT-ATAAAGTAACATAATTCA---------------------GTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-AAAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ACATTTCAAGAATTAAGTTACTGTTAATGGAGAAAA-TCATGATCAATATAGTGATTAATTGTGATTTTGAT--GATGATGACGATGTTAA----TGCAGATGGT---GATGACAATGTTGAAGATAAAGACAATGCTAATGCA-A-TCGAG-AGTAATGATGATTG--TTATCGTTG-TTGTT---GTTGTGGGAGAAGTGGTATATTTTGTATTAGTTC---------TCTTAATTGATATTAAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAAT------------TG-----AAAAACCCTATcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|6 : ---------T----------TT----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGACGTTTATTAAGTGTAAACAAA----GGGGTCTTTGTTGAT-------TTGGTGTTAATTTTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGAGAGA-GATTA-ATTATGCTTCATGTGTTCACTGTATTA-----GTGAA--ATAATAATTCAACTA--TTTTT-ATAAACTAACATTATTCAATTATGCACTATATTTCCATTGTATAAACATTGAACGA----GGTGCT---------GTTTTTAATTTCAT------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-TTT-TTCCATTCT-ATATTTCAAGAATTTAGTAGTTATCAATAAAGAA----------------AATGATGA----TGATACTGATA-----ATAATGAT--TG--------------T---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAACGAA-A-TTGA-CAGCAA--ATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGCGGAAGAAGTGGTAGATTGTGTACTAGTT-TTTAAA-AGTATTAATGAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAATATCCC-------CGCCGTCAGGAGCTCCATGCGTCAGATGCTCTAT--------------------------GCGTCA----GGGGTCA-AGGGC---T-C-TATG-C----G--TCA--G-------GG-GCT--CTATGCG
gi|6 : tctttttttcaggtgaatgATAAAGCTGTGTTATACTGTACAGAGCCCCTGACGCATAGAGC-CC-CTGACGCATAG-AGCC--C--TTGACCCCTGACGCAT------AGA----GC--------ATCTGAC-GCATGGAG---CTC----------C-TGACGGCGGGG-ATATTTGGATAT-ATCGACTTCA-tcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|7 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatacAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTACATCTACACTAAAACCACGCATTAGGGCCAC-CTCTATAAAAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTGAAATGACCA---TTTTGATTA-ATA-ATAATATTGCCACCAC-TATATTCGGTATTAGAACCGCTTGTAAAACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTT-ATTTAACTCCGGAAATGGG---GCCACCATTTGATCCCGTCA----T--T--CTTATTCACTTCCGT-T-----ATTT---------T----------TA----------TT---------------CAGG---------------------T-GAAGGTT-----AGTA---ACAAGTCACTGGGCGTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGAAAGAAATAGA--TAATAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATCA-----GTGAA--A-GG-CATT--TTT---TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAGTTATACACCATAGTTGCATTGTTTAATCATTTTAAGT----GGTTGT---------G------------T------------TTAATTCAATAATGATGATGATTGTGATACTGTGATACT----GA---TGGTGA----TAAT---GAAAA-CAATGTTAAAGATAAAGATAA----TGA-AATCAT-CAGCAATGATGATTGTTATCGTT---GCTGTTGTGGAAGA-AGTGGTAAAcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|8 : ---------------CACGT-----------------CATT-GGATGTTTATAAAGAGTGTACAAG----GGGATCTTTGTTGATAAGTAATTAGGTGTTAATTGTTATTCAGTATCTCGGTTGCATCAGTGT-ATTTTGTTTATCCTATGTAAGAAATAGA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTGTTA-----GTGAA----AG-AATTT-------TTTTT-ATTAACTAtgttgctctaaattgtcttaattaatatagaagccg
gi|8 : cttttgaggtgaaggtcattaaATCGCTGGAAGA----GGTGTTTTGAATTTCA------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNT---A-TCGTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTATTAGTTCTCTAAATAGTCTT-ATTAATATTGAAGTCGAT-------A-A----TC--TAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCT--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----C--GCC--GTCT----GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCtcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|9 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactAAATAGAGATGATAAAG-ATTA-AATTTGTTTTATGTGTGCAATATGTTA-----GTGAAT-G-AAGAATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTTAAGTATACACTATAGTTGCATTTTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ACGAAG-TAAC-ATT-TTTTATCGT-ATAGTTCAAGAATTTAGTCAC
gi|9 : aCTAGTTCTCTAAATAGTCTAAATTCATATTGAAATCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATACG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATAATGACG-TATAGAGC---A-C-CCTGTC----G--TCG--GAAGTCCAGCAGCT--CTTTGCGGTCTCACA------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaagagctctatacgggattatggggcataatgacgtatagagcaccctgtcgtcggaagtccagcagctctttgcggtctcacat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATTTTCCAATAACGCCGAAAACGGTATCACACGAAAATTACATTCGATTATATTGAAACTATTGCATTTTATACTAAATACATTGGAATACATTGAATTATACATTTAATTTCTGATTTTTTACAATTAATCACATATTCCTGATGAAAACGAAGTTTTTGCAATTCCACTAGTGTTCGTTATTAAATACGAGTATCAATAACAAC
Unaligned ( gi|25 ): CGTGCAACACACACATAACGCTAGAGAGTATTGTGAGACCGTATGGAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 1111111111111 11111111 111 2222222222 1111 11 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 22 11111 2222222 99999999999999999999999999999999999 1111111111111 1111 111111 3333333333333333333333 11111 11 1111111 222222222222 11111 22222222222222222222222222 555555555555555555555555555 111111111 6666666666666666666666666
lowQualScore : 6 3 1 0 3 3 55555555 55 55 666666666 2222222222222 44444444 3 3 222 6666666666 4 777 4 9999 4 4 3 3 3 0 5 888 0 0 0 4 0 1 4 0 777 4 4 4 3 2 4 1 0 777 4444 55 11 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 2 9999 0 4444444 66 77 4 11111 8888888 4 66 4 2 8888 11111111111111111111111111111111111 55 3 3 3 3 3 1 7777777777777 0 0000 444 999999 8888888888888888888888 1 33333 88 1 55 77777 666 2 0000000 6666 44 111111111111 11111 444 5555 77777777777777777777777777 2 0 4 666 2 111111111111111111111111111 33 999 2 222222222 2 0 4 9999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . ........ .. .. ......... ............. ........ . . ... .......... . ... . .... . . . . . . . ... . . . . . . . . ... . . . . . . . . ... .... .. .. .. .................................................................................... . . .... . ....... .. .. . ..... ....... . .. . . .... ................................... .. . . . . . . ............. . .... ... ...... ...................... . ..... .. . .. ..... ... . ....... .... .. ............ ..... ... .... .......................... . . . ... . ........................... .. ... . ......... . . . .........................
lowQualScore : 5 9 1 4 6 6 44444444 55 55 000000000 2222222222222 55555555 6 6 777 4444444444 0 666 0 4444 4 0 6 3 6 2 0 888 1 2 1 0 9 6 0 4 888 0 0 0 4 1 0 0 7 000 0000 55 00 00 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 4444 1 4444444 11 00 4 11111 4444444 7 11 4 4 5555 88888888888888888888888888888888888 00 6 6 6 6 6 3 9999999999999 6 6666 111 888888 9999999999999999999999 8 22222 88 3 00 00000 444 1 0000000 5555 22 888888888888 11111 777 7777 77777777777777777777777777 7 4 4 111 2 777777777777777777777777777 11 222 7 222222222 9 2 0 1111111111111111111111111
consensus : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-CGATGATNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATG-A-A-TCGAGCAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
Reference ( family-2494 ) : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-CGATGATNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATG-A-A-TCGAGCAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
gi|1 : AATAGAGCACTGTAGTACTGCATAGAGCTCCCGACGCATAGAGC-TT-CCAG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GT--------CTC-GAC-GTATAGAG---CTC----------TATG-GCCC--AA-GTAT----ACAA-ATCAACATTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-TC---TTAAAA-TA-ATAGTCGTACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGAAGTGTCTAAATGTACATCAGCACTGTTGTTTACATATACACTAAAATCCTGCATTAGGACCAT-CTTTATTATAAAATTCGGA-TTGTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCAACGC-TATATTCGGTATTAGGACAGTTTGTATACCGACGG-AATAGCGTATTTTCCTTTAATTTGACTCCGAAAATTGG---ACCACCAGTTGATTCCCTC-----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-CGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----AGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTG---TTCAGCATCTCGGTTACACTAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAAAATTA-AAAATGTTTCATGTGTACCATGTATTA-----GTG-A--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTAAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CT--TTC-ATAAAG-TAAC-TTT-TTGTATTGT-ATATTTAAGAAATTTTGTCACTGTTATCTGAGAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NATTGTT---GTTGTG---GAAGTGGTAGATGTTGTAC-AGTTCTT--AATAGTCTTAATTAATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----CAAA-A--GTA--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CAACGCATAGAGCGT----------C-T---C-AC-----GGAGCTCTGTGCGGACT
gi|10 : TGATGCATAGAGC-TC-CCGG-----GA-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC---C--CGT-GAG---GTC----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCCT-ACATCTCTACG-CATAGAGCTC-ACGAATTAAAAATA-CTATTCATACTGATAGTCTTTACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTACTATAAATAT-----------------AT-AGCACTGCTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGAATCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTAAATT--TGATCC---TTATGTTTA-ATA-ATAATATTGTCACCCC-TCTATTTTGTATTAGGACCGCTTGGATGACGACGGAATTAGTGTATTGTCT-----TTTAACTCCGGCCATGGG---GCCACCAGTTTATCACGTCA----T--T--CTTATTCACT--T-C-T-----GTTT---------T----------TG----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|11 : TTATTCAATTATGCCCTATAGTTGAATTGTTTAATCATTGAAAGACTGAAGTGTT---------G------------TTTTGAATTTCATCC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTACATTGT-TTATTTCAAGAATTTAGTTACTGTTAATGGAGAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNA-TCGAG-AGCAATGATAATTG--TTATC---G-TTGTT---GTGGTTGAAGAAGTGGTAGATGT---ACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTGATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAACTAAATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGTGCATATTGACG-AATA-AAC---T-C-A----T----G--ATG--AAT-----AGAGCTCACTATGCGATTTTATA------A--T-gaatg
gi|12 : tTCTG-ACATCTTGGCG-CATAGAACTC-CCAAATTAAAAATG-A--GTCATA----CTG-----ACG--------------------GTCA-CGTTATT-------TGAGGTGTCTCAATGTCCATCAGCA-----------ATCTACACTAAATCCCCGTATTAGGACCAT-CTCTGTAATAAAATT--------TTCACTTTGTTTGATGATCACTGTTTTTTTTG--TA-ATAATGTTGCCATCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTTTACAACGACGG-AATATTGCATCTTCCTTTAATTTAACTCCGGAAACTAG---ACCATCAGTTGATCCCGTTATT--T--T--TT--TTCACTTCT-CTT-----ATTT---------TCAGGTGAAGGTTA---------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTATGTACAAG----GGGGTCTTTATTGAT-------TAGGTGGC-GTTGTTAT
gi|13 : a-AAACGGGTTTG-ACATCTTGACA-CATTGAATTC-CCGAATTAAAAATGGATAGTCACAAGGACTTTC---ACGCTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCGTTATTATAATTATACAGTGTCTAAATGTCCATCAGTACTGTTGTTTAAATCTGCACTAAAACCCCGTATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCTGA-ATTTTCCTTTTATTTAATAATCA---TTTAGCTTA-GTA-ACAATATTGCCACCCC-TA-----GGTATTAGGACCGTTTGTACAACGGCGG-AATAGTGTA--------------AACTCCGGAAACTTA---ACCACCACTTGATCCCGTCATTTTT--T--TT--TTTACTTCT-C-T------CTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|14 : TGGCG-TATAGAACTCTCCAAAATAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGT----------------AACGCCGTCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCAGCATTAGGACCAT-CTCTATAATTAAATTTGGATTTTTTCCTTTTGTTTAATGGTCA---TTTTG----------------TGTCATCCC-TATATTCCGTATTATGACCGTGTGTACTACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATATAACTATGGCAATTGG---ACCACCAGTTGATATCGTCA----TTCT--TT--TTCACTTCT-C-T------TTT---------T----------TT----------CTGATGAAGGTTATTAACAAAT-----------------CATT-GGGCGTTTgaagaatattaacaagccgg
gi|15 : TTAATGATGAATATAATGATAATG-A-AGTC-AACAGCAAGGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTTTGGAAAAAGTGTCATATGTTGTACTAGTTCTATAAATAGTCTTA----ATAATGAAGTCGAT-------ATA----TC--CTAAT------------CG-----GAGATCTCTTTTCC--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGA-----------------------------------GGAGCT--ATATGCGtttaa
gi|15 : aTT-GAC-GCATAGAGGAGCTA----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-AACAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATGGAGCTC-CCtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacatcttgacgcatggagctcccctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcataTGTGAGACCGCATAGA---------GCATAGAGCTTT-CCGA-----TT-AACTAACTGT---------ATTCGTCGATTATAAAACCGCACAGAACTCTC-TACGGCGGAGGGGAGCTC----------CATG-CGTC--AAGATGT-----CAG-ACCCGTTTTA-AAGTTGTTGTGTATAT-TTGACG-CATATAGCTC-Cctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaGACATCTTGACG-CATGGAGC---T-C-C----CCTCCG--CCGTAG-------AGAGTT--CTGTGCGGTTTTATA------A--T-CGACGAATACAGT-TAGTTA-----A-T---C-GG-----AAAGCTCTATGC
gi|16 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtct------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-AAC-GTATATTGT-ATATTTAACGAATGTAGTCACtctatgcggtctcaca
gi|16 : gttgttttgaatttcaTG--TTATC---G-TTGTT---TTTGTGGAAGAAGTGGCAGTTGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTTTTAATTGGTATTAATGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTTTGTGCT--GTTT----TAT--------------------------A------ATCGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttatcgttgtttttgtggaagaagtggcagttgttgtactagttctctaaatagttttaattggtattaatgtcgatatatccaaatcgaagagctttgtgctgttttataatcgacgcatagagctccc
gi|17 : gttgttttgaatttcatccttcataaagtaacaacgtatattgtatatttaacgaatgtagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCGGGACCACATAGAGCTCCTTACCC-TAG--C-TC-CCCG-----AGTAGAT--T--T---------ATGCGT------TAC----GT--------CCT-GAC-GCATAGAG---ATC----------
gi|17 : ------------CG-----AGTAGATTTATGCG-----T----TAC--------------------------G-----TCCTGACG-CATAGAGA---T-C-C-------------CG--G-------GGAGCC--CATTGTG---TTA-A------GCCT-CGGTGTATAGAGC-T----------C-C---C---------GA--TCTATGCGccggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|17 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctcccTCCTGACGCATAGAGA-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--A---------TTGTGT------TAA----GC--------CTC-GGT-GTATAGAG---CTCCCGATC----TATG-CGTC--AA-ATAT----GCTTTAT-AACTTTATAAATGGATCTG-ACATTTTGACG-CCTAGAGCTC-CCGAATTAAAAACG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGTTAGACCCTAAACGCCATCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCTATTAACACCGTTGTT----TCTACACTATAACCCTGCATAAGGACtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|18 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacgGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATTAAGC-TCACCAA-----TA-AGCT--C--T---------ATGCAT------TGC----GT--------C-C-GAC-GCATCGAG---CTC----------
gi|18 : GAGCTCTATTCG----------T-C--------------------------GAGGCCTA---ATG-CATAGGGC---T-C-C----C----C---CG--G---------AGCT--CGATGCG---TCGGA------C--G-CAATGCATAGAGC-TTATTGGTGAGC-TTAAT-GCGTCA-GGAGCTCTATGCGGTCTcgggggagccctatgcattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgTGACG-CATTAAGC---T-C-A----C--------CA--A-------TAAGCT--CTATGCA---TTGCG------T--C-CGACGCATCGAGC-T----------C-C---G-GG-----GGAGCCCTATGCccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgagaccgcatagagctccAATA-AGCTCTATG------CATTGCG-TCC-GACGCATCGAGC-TC-CGGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCAT------TAG----GC--------CTC-GAC-GAATAGAG---CTCCCAGGAGCTTTATA-CGTC--CA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AATTGTGTCTG-ACATCTTGACG-CAAAGAGATC-CTGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGGCAGTC---ACGTTATTTGCTAGACACTTAACGCCATCATTAATACAATTATGTAGTGTCTAAATGTCCATCAGCATTATTGTTTAAATCTTCACTAAAAattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|2 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccGCTCTGTGAGACCACATAGAGGTCCT-------------TC-CT-------------------T---------ACGTAT--------A----GC--------CTC-GAC-GTAAAGAG---CTC----------TATG-CGTC--AA-CTTT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACTTGTCTG-ACGTCTTAACG-CATAGAACGC-C
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcAACGCCATCATTGTTATAACTACGCAGTGTCTAAATTTCCA------CT-TTGTTTAAATCTACACTAAAATCCCGCATTACG-TCATTCTCTATATTAAAATTCGAA-TTTT-CCTTTTGTTTTATAATCA---TTTTGTTTA-ATT-ATAATATTGCCACCCGGTA-ATCTGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGATGG-AGTGGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAAATGG---ACCACAAGTTGATCCTGTCA----T--T--CG--TTTACTTTT-T-TCTTATATTCAGGTGAAGGT----------TA----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATTTGGGCGTTTATAAAATGTATACAAG----GGGGT-TTTGTCAAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACTTCAATGTCATTTTGTTTGTCCCGTGTAAGAAATAGA--TGGTAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATATATTT-----GTGAAAGG-AG-AATTTATTTA--TTATT-ATAAATTACCTTCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTCAATCATTGAAAGA----CGTGTT---------GTTTTGAATTTCAT------------CC--TTC-ATAAAG-TAGT-ATT-TTATATTGC-ATTTTTTAAGAATAAAGTCACTGTTAATGGAGAAAatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatag--TTATA---G-TTGTT---GGTATGGAACAAGTGGTAGATGTTGCACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAGTTGATTTTGAAGTTGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----CGT--------------------------GTGGCATATTGACG-CGTAGAGCA--C-C-C----C----GTTGTC--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTAATA------A--T-CGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|20 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcTGATGTTTGGTTTA-C---G-TTGTT---GATGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTTATATATATTGAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAA-------------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATCCCGA-----------------------C----G--GCG--G-------GACGCT--CTATGAGGTTTTATA------A--T-----------------------------------C-----GGAGCTTTATGCGGTCT
gi|21 : aataaagtctacgactcgTCTG-ACATATTGACGTCA-AGAACTC-CCGGATTAAAGATA-ATAGTTATACCGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCGTAAACACAAACATTTTTATAATTATGCAATGTCTAAATGTCCATCCGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-ACATGTAAT--AGTT-----TCCCCCCTTTTATTTAATAATcacccggc
gi|22 : GGTAGATGCTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTCAAATAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CGAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATACTG-CGTCAGA-AGCGCGT-C-T----A----T--GCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGTTTCA
gi|23 : TTAACG-CATAGGGC---TAC-C----C------------G-------GGATCT--TTATACG---TAAGA------A--CGCAACGCATAGAGA-T----------CAG---C-GA-----GGAGATCTATGCG
gi|23 : aGATCTCTATGCG-----T----T-------------------------------GCGTTCTTACG-TATAAAGA---T-C-C-------------CG--G-------GTAGCC--CTATGCG---TTA-A------GCCT-CGACGAAAAGGGC-T----------C-T---gcctcgacgaaaagggctctatgcgtcgaa
gi|23 : acgcatagatctcctcgctTTCTTACGTATAAAGA-TC-CCGG-----GT-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GAAAAGGG---CTC----------TATG-CGTC--GA-Aatgcgtcgaa
gi|24 : acgcatagatctcctcgctgatctctatgcgttgcgATAGAGCTC-ATGA--CTG-ATAGAGCTTCTGACGCACAGA
gi|24 : TGTGAGACCGTATAGAGCTCATGACTGATAGAGC-TT-CTGacggtctcacactgcctatattgaaac
gi|26 : tctgtgcgtG-CCTC--GG-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAATGGG--------TCTTGGCG-CATctgcctatattgaaac
gi|27 : --G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGATGCA
gi|3 : CTGTTATTTAAAGCAACACCAAAACCCCGCATTAGGACAAT-CGCTATAATAAAATTCGGA-TTTTCCCTTTCATTTAATGATTA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCAGTATAAGGACCGCTTGTACGACGATGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATTTTACTCCGGAAATTGGCGGACTACCAGTTGATCTAGTTA----T--TCTTT--TTCACTTCT-G-T--------T---------T----------TT----------TT---------------CAGGTGAAGGTTATCAACAAATCATT-GAGCGTTTATAAAGTGTGTACAAT----GGGGTTTATGTTGAT-------TAGGTATTAGTTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTAGTTTGTCCCATGTAAGAAAAAAA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTTTGCAATGTATCA-----GTGAAA-G-AAGAATTAATTTA--TTTTTTATTAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATT-TTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTATGAATTGCGTCC--TTA-ATAAAG-TAAC-ACT-TGATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAATCACTGTTGGTGGA-AAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-A-A-TCGA-CAGCAATGATGACTG--TTATC-------------GTTGTGGAAGAAGTTGTAGATGTTGTACTAGTTTTCTAAATAAT-TTAATTAATACTGAAATCGA--------ATGCGGTTT--TATAT-------------------AGGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGATC---T-CTC----C----G--CCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGGATTATGGGGCATA--T-TGGCGCATAGATC-T----------C-T---CTGCGGTCGGGAGCTCTATG
gi|4 : TGTTTGTATATATAG-ATTGCCGTCCC-TATATTCGGTATTATGACCTATTGTACAGCGACGG-ATTTGTGTATTTTCTTTAAATTTAACTCCGGACAGTGG---ACCACTAGTTGATCCCGTCA----T--TCTTT--TTCACTTCT---------ATTT---------T----------TTCAGGTAAATGTT---------------AATGT-----------------CATT-GGTCGTTTATAAAGTGTG------------GGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTCAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATAAGTGTCATTATATGTGTCCCATGTAATAAATAGA--TGATGAAT-ATTA-AACATGTTTCATGTGTTAAATATATTATAAGAG-GAA--G-AA-GA---ATTCA--TTTTT-ATAAATGAACATTATTCAATTAT---------------TGTTTAATTATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------TTTAGAATTCCATCC--TGC-ATAAAG-TAAC-AGT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTGGTCACTGTAAATGGAGAAAAATGATAACGAATCTAATGATGA----TGATTGTGATACTGTGAAAATGATAATGA----G---AATTTT---AAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAATA-A-AATCGA-CAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTAGTAGATGTTGTATTAGTTTTCTAAAATGTCTTAATTTATGTTGAAGTCGCTCGACTTCATA----TCGGCGCATAGAGCTTTCCGCCGCC---AGGAGCTCTGTGTG--GTTT----TATAATCGAAGAGCTCTATGTGGGATTATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-CTC----C----GCCGCC--G-------GAATTT--CTACGCGTTTTTATA------A--T-CGA---------------------------------------AGCTCTATGCGGTCTtc
gi|5 : g-CTCTGTAATCAATGTCGGA-CTTTCCATTTTGTTTAATGATTA---TTTTGTTTT-ATA-ATACTATTGCCACTCC-TTAATTCGATATTAGAACCGCTTGTACAACGACGG-AAAAAAGTATTATCTTTTAATT-AACTCCGTAAATTGG---GGTACCAGTTGATCTCCTCA----T--T--TT--TT----TCT-C-T------TTT---------T----------TTCTGG------TT---------------AAGGTTATTAACACGA------CATT-GAACGTTTATAAAATGTATACAAG----GAGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTTTCAATTGTTATTCAGCATCTCAGTTACATCAGCGTCATTTTGTTTGTCCCATATAAGAAATAGA--TGATTAAGATTTATAATATGTTTTATGTGTGCAATGTACTA-----GTGAAAGA-AA-AAATCATTTATTTTTTT-ATAAAGTAACATAATTCA---------------------GTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-AAAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ACATTTCAAGAATTAAGTTACTGTTAATGGAGAAAA-TCATGATCAATATAGTGATTAATTGTGATTTTGAT--GATGATGACGATGTTAA----TGCAGATGGT---GATGACAATGTTGAAGATAAAGACAATGCTAATGCA-A-TCGAG-AGTAATGATGATTG--TTATCGTTG-TTGTT---GTTGTGGGAGAAGTGGTATATTTTGTATTAGTTC---------TCTTAATTGATATTAAAGTCAAT-------ATA----TC--CAAAT------------TG-----AAAAACCCTATcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|6 : ---------T----------TT----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGACGTTTATTAAGTGTAAACAAA----GGGGTCTTTGTTGAT-------TTGGTGTTAATTTTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGAGAGA-GATTA-ATTATGCTTCATGTGTTCACTGTATTA-----GTGAA--ATAATAATTCAACTA--TTTTT-ATAAACTAACATTATTCAATTATGCACTATATTTCCATTGTATAAACATTGAACGA----GGTGCT---------GTTTTTAATTTCAT------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-TTT-TTCCATTCT-ATATTTCAAGAATTTAGTAGTTATCAATAAAGAA----------------AATGATGA----TGATACTGATA-----ATAATGAT--TG--------------T---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAACGAA-A-TTGA-CAGCAA--ATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGCGGAAGAAGTGGTAGATTGTGTACTAGTT-TTTAAA-AGTATTAATGAATACTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAATATCCC-------CGCCGTCAGGAGCTCCATGCGTCAGATGCTCTAT--------------------------GCGTCA----GGGGTCA-AGGGC---T-C-TATG-C----G--TCA--G-------GG-GCT--CTATGCG
gi|6 : tctttttttcaggtgaatgATAAAGCTGTGTTATACTGTACAGAGCCCCTGACGCATAGAGC-CC-CTGACGCATAG-AGCC--C--TTGACCCCTGACGCAT------AGA----GC--------ATCTGAC-GCATGGAG---CTC----------C-TGACGGCGGGG-ATATTTGGATAT-ATCGACTTCA-tcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|7 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatacAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTACATCTACACTAAAACCACGCATTAGGGCCAC-CTCTATAAAAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTGAAATGACCA---TTTTGATTA-ATA-ATAATATTGCCACCAC-TATATTCGGTATTAGAACCGCTTGTAAAACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTT-ATTTAACTCCGGAAATGGG---GCCACCATTTGATCCCGTCA----T--T--CTTATTCACTTCCGT-T-----ATTT---------T----------TA----------TT---------------CAGG---------------------T-GAAGGTT-----AGTA---ACAAGTCACTGGGCGTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGAAAGAAATAGA--TAATAAA-GATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATCA-----GTGAA--A-GG-CATT--TTT---TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAGTTATACACCATAGTTGCATTGTTTAATCATTTTAAGT----GGTTGT---------G------------T------------TTAATTCAATAATGATGATGATTGTGATACTGTGATACT----GA---TGGTGA----TAAT---GAAAA-CAATGTTAAAGATAAAGATAA----TGA-AATCAT-CAGCAATGATGATTGTTATCGTT---GCTGTTGTGGAAGA-AGTGGTAAAcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|8 : ---------------CACGT-----------------CATT-GGATGTTTATAAAGAGTGTACAAG----GGGATCTTTGTTGATAAGTAATTAGGTGTTAATTGTTATTCAGTATCTCGGTTGCATCAGTGT-ATTTTGTTTATCCTATGTAAGAAATAGA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTGTTA-----GTGAA----AG-AATTT-------TTTTT-ATTAACTAtgttgctctaaattgtcttaattaatatagaagccg
gi|8 : cttttgaggtgaaggtcattaaATCGCTGGAAGA----GGTGTTTTGAATTTCA------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNT---A-TCGTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTATTAGTTCTCTAAATAGTCTT-ATTAATATTGAAGTCGAT-------A-A----TC--TAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCT--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----C--GCC--GTCT----GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCtcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|9 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactAAATAGAGATGATAAAG-ATTA-AATTTGTTTTATGTGTGCAATATGTTA-----GTGAAT-G-AAGAATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTTAAGTATACACTATAGTTGCATTTTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ACGAAG-TAAC-ATT-TTTTATCGT-ATAGTTCAAGAATTTAGTCAC
gi|9 : aCTAGTTCTCTAAATAGTCTAAATTCATATTGAAATCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATACG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATAATGACG-TATAGAGC---A-C-CCTGTC----G--TCG--GAAGTCCAGCAGCT--CTTTGCGGTCTCACA------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaagagctctatacgggattatggggcataatgacgtatagagcaccctgtcgtcggaagtccagcagctctttgcggtctcacat
blockSeqs : G G C T A CGCATAG AA TG TGACCCCTG CGATTATAAAACC ACAGAACT T G GAG CCAGGAGCTT A GGG G TTGG T T T T T G TTT T C T CTG T T G T G A T CGG TTTT TC CT TA TTCTTATATTCAGGTGAAGGTTATTAACAAGT T T TCAC AAGTAAT GA GA T TAAGA AGGAG T TT T G CTGA GTTTTGAATTTCAT AA A A G G G G ATGATAACGAATC ATTG NNN NNNNNN TGTTATCGTTGCTGTTGTG N NNA AC T GT GTTG GTT G CGACTTC CGGT GG AGAGCTTTCCGC CCGTC TCA GCTC AATCGAAGAGCTCTATGTGGGATTAT G T GCG A CCTGTCGTCGGAAGTCCA CA ATT T GGGCATA G . TATTGGTGAGCTTAATGCGTCA
blockSeqs : A G C . . AGT . . . TAA . . . GAG CCGATC . A . . . . . . . . . . C . . . . . T A . A . TT . CT TA CTTATTTTCAGGTGAAGGTTATTAACAAGT . T . . . G . . AGAAG A . . A . GTTTTGAATTTCAT . . . . . . G NNNNNNNNNNNN . NNN NNNNNN GTTAATGCAGATGGT N AAG NN G . G . G . . . ATCCC CC G . . G T A . CCCTCCGCCGTAG . GTT T GCC . . CTCTGCGGTCG
blockSeqs : . G G . . GA . . . TAC . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . T A . A . . . . . CTTTTTTTCTGATGAAGGTTATTAACAAAT . T . . . G . . AGAAA C . . A . GTTATGAATTGCGT . . . . . . G NNNNNNNNNNNN . TTG ACTGTG NNNNNNNNNNNN C AAA G T . G . G . . . . . G . . A . . . TCCGCCGTCA . GTT G GCC . . AGTTAATCGG
blockSeqs : G C . . TT . . . TAA . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . T T . T . . . . . GTTTTTTTCAGGTGAAGGTTATCAACAAAT . T . . . T . . ATAAT C . . G . GTTTAGAATTCCAT . . . . . . G TCATGATCAATA . TTT NNNNNN NNNNNNNNNNNN C CAA C T . G . T . . . . . G . . T . . . TCCGCCGCCG . GTT C A . . CAGCGA
blockSeqs : G C . . GG . . . TGC . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . T G . G . . . . . CTTTTTTTCTGGTTAAGGTTATTAACACGA . A . . . G . . TGAAG T . . A . GTTTTTAATTTCAT . . . . . . G CAATGTTAAAGA . TAC CAGCA AATGAGAATTTT C AAA C T . G . A . . . . . G . . G . . . TATGCGTCAG . GTT T A . . CCGGG
blockSeqs : T C . . TA . . . TAG . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . . A G . T . . . . . ATTTTTTCAGGTAAATGTTAATGT . T . . . G . . GAA C . . A . TTGAATTTCAT . . . . . . A NNNNNNNNNNNN . NNN GATG NNNNNNNNNNNN N AA G T . G . A . . . . . G . . G . . . CCCGCCGTCT . GTT T C . . CCC
blockSeqs : . . . . GG . . . TAA . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . T A . T . . . . . CTGTTTTTGTTCAGGT . . . . . G . . AGG . . . . . GT . . . . . . N . . AA A TGT . NN C N . G . T . . . . . G . . G . . . ATGATGAAT . GGA G T . . C
blockSeqs : . . . . GT . . . AGA . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . GTTATTTTTATTCAGG . . . . . G . . AG . . . . . GT . . . . . . . . . G . G . . . . . G . . G . . . CCGTTGTCG . TTT T A . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . CTCTTTTTTTCAGGT . . GT . . . . . . . A . A . . . . . G . . C . . . TATGCGTCA . GTT T A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . G . . . CCCCGG . GTC T A .
blockSeqs : . C . . . . . G . . G . . . CGGCGG . . T A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . ACCAA . . C A .
blockSeqs : . . . . . . . . . CCGG . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . CCGG . . .
blockSeqs : . . . CCG . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : G* AGAAG** GTTTTGAATTTCAT********************* AAA** C* G**** CGCGG********************
originalCons : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAGGATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAA--G-AA-AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTT---------G------------T------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-CGATGATNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATG-A-A-TCGAGCAGCAATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T----------C-T---C-GC-----GGAGCTCTATGCGGTCT
finalCons : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAG-ATTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA-----GTGAAAGAAG--AATTCATTTA--TTTTT-ATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTTGTTTTGAATTTCAT---------------------CC--TTC-ATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-CGATGATNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATGAAA--TCGAC-AGCAATGATGATTG--TTATCG----TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGAT-------ATA----TC--CAAAT------------CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TAT--------------------------GGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-TCGCGG--------------------GGAGCTCTATGCGGTCT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATTTTCCAATAACGCCGAAAACGGTATCACACGAAAATTACATTCGATTATATTGAAACTATTGCATTTTATACTAAATACATTGGAATACATTGAATTATACATTTAATTTCTGATTTTTTACAATTAATCACATATTCCTGATGAAAACGAAGTTTTTGCAATTCCACTAGTGTTCGTTATTAAATACGAGTATCAATAACAAC
Unaligned ( gi|25 ): CGTGCAACACACACATAACGCTAGAGAGTATTGTGAGACCGTATGGAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 1111111111111 11111111 111 2222222222 1111 11 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 111 22222222222222 1111 111111 3333333333333333333333 555555555555555555555555555 55555555555555555555555555555555555
lowQualScore : 6 3 1 0 3 3 55555555 55 55 666666666 2222222222222 44444444 3 3 222 6666666666 4 777 4 9999 4 4 3 3 3 0 5 888 0 0 0 4 0 1 4 0 777 4 4 4 3 2 4 1 0 777 4444 55 11 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 2 9999 0 4444444 66 4 4 4 777 2 2 777 2 8888 77777 2 1 3 3 3 3 1 33333333333333 0 0000 444 999999 8888888888888888888888 1 4 1 55 77777 666 2 6666 66666 66666 555 5555 2 22 4 777 2 333333333333333333333333333 22 7 2 999999999 2 2 0 0 3 99999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . ........ .. .. ......... ............. ........ . . ... .......... . ... . .... . . . . . . . ... . . . . . . . . ... . . . . . . . . ... .... .. .. .. .................................................................................... . . .... . ....... .. . . . ... . . ... . .... ..... . . . . . . . .............. . .... ... ...... ...................... . . . .. ..... ... . .... ..... ..... ... .... . .. . ... . ........................... .. . . ......... . . . . . ...................................
lowQualScore : 5 9 1 4 6 6 44444444 55 55 000000000 2222222222222 55555555 6 6 777 4444444444 0 666 0 4444 4 0 6 3 6 2 0 888 1 2 1 0 9 6 0 4 888 0 0 0 4 1 0 0 7 000 0000 55 00 00 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 4444 1 4444444 11 4 4 4 888 9 9 999 4 5555 55555 0 1 6 6 6 6 3 55555555555555 6 6666 111 888888 9999999999999999999999 8 4 3 00 00000 444 1 5555 22222 22222 999 0000 7 55 0 555 0 111111111111111111111111111 88 1 9 666666666 5 4 1 4 3 33333333333333333333333333333333333
consensus : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGAT-AAAGA-TTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA---GTGAAAGAAGAATTCATTTA--TTTTTATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTTGTTTTGAATTTCATCCTTCATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-CGATGATNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATGAAATCGACAGC-AATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGATATA----TCCAAAT-----CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T---------------C------G-----CG---GGGAGCTCTATGCGGTCT
Reference ( family-2494 ) : AATAGAGCTCTGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATAGAGC-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GCATAGAG---CTC----------TATG-CGTC--GA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-CCGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGACGG-ANTAGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAATTGG---ACCACCAGTTGATCCCGTCA----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----GGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGAT-AAAGA-TTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATTA---GTGAAAGAAGAATTCATTTA--TTTTTATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTTGTTTTGAATTTCATCCTTCATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACTGTTAATGGAGAAAA-CGATGATNAATATAATGATGA----TGATNNTGATACNGCGATGATGATNNTGA----T---GATGTT---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAATGAAATCGACAGC-AATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTNATATTGAAGTCGATATA----TCCAAAT-----CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----G--GCG--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCATAGAGC-T---------------C------G-----CG---GGGAGCTCTATGCGGTCT
gi|1 : AATAGAGCACTGTAGTACTGCATAGAGCTCCCGACGCATAGAGC-TT-CCAG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GT--------CTC-GAC-GTATAGAG---CTC----------TATG-GCCC--AA-GTAT----ACAA-ATCAACATTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATAGAGCTC-TC---TTAAAA-TA-ATAGTCGTACTGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTATTATAATTATGAAGTGTCTAAATGTACATCAGCACTGTTGTTTACATATACACTAAAATCCTGCATTAGGACCAT-CTTTATTATAAAATTCGGA-TTGTTCCTTTTGTTTAATGATCA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCAACGC-TATATTCGGTATTAGGACAGTTTGTATACCGACGG-AATAGCGTATTTTCCTTTAATTTGACTCCGAAAATTGG---ACCACCAGTTGATTCCCTC-----T--T--TT--TTCACTTCT-C-T-----ATTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------CATT-CGGCGTTTATAAAGTGTGTACAAG----AGGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTG---TTCAGCATCTCGGTTACACTAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGATAAAAAA-TTA-AAAATGTTTCATGTGTACCATGTATTA---GTG--AGAA-AATTCATTTA--TTTTTATAAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTTAATCATTAAAAGA----GGTGTTG------------TCTTTCATAAAG-TAAC-TTT-TTGTATTGT-ATATTTAAGAAATTTTGTCACTGTTATCTGAGAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNN---NATTGTT---GTTGTG---GAAGTGGTAGATGTTGTAC-AGTTCTT--AATAGTCTTAATTAATATTGAAGTCGATATA----TCCAAAT-----CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----CAAA-A--GTA--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CAACGCATAGAGCGT---------------C------T-----CA---CGGAGCTCTGTGCGGACT
gi|10 : TGATGCATAGAGC-TC-CCGG-----GA-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC---C--CGT-GAG---GTC----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACGGGTCCT-ACATCTCTACG-CATAGAGCTC-ACGAATTAAAAATA-CTATTCATACTGATAGTCTTTACGTTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCATTACTATAAATAT-----------------AT-AGCACTGCTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGAATCAT-CTCTATAATAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTAAATT--TGATCC---TTATGTTTA-ATA-ATAATATTGTCACCCC-TCTATTTTGTATTAGGACCGCTTGGATGACGACGGAATTAGTGTATTGTCT-----TTTAACTCCGGCCATGGG---GCCACCAGTTTATCACGTCA----T--T--CTTATTCACT--T-C-T-----GTTT---------T----------TG----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|11 : TTATTCAATTATGCCCTATAGTTGAATTGTTTAATCATTGAAAGACTGAAGTGTTGTTTTGAATTTCATCCTTCATAAAG-TAAC-ATT-TTACATTGT-TTATTTCAAGAATTTAGTTACTGTTAATGGAGAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCGAGAGC-AATGATAATTG--TTATC---G-TTGTT---GTGGTTGAAGAAGTGGTAGATGT---ACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAATTGATATTGAAGTCGATATA----TCCAAAT-----CG-----AAGAACTAAATGTG--GGAT----TATGGTGCATATTGACG-AATA-AAC---T-C-A----T----G--ATG--AAT-----AGAGCTCACTATGCGATTTTATA------A--T-gaatg
gi|12 : tTCTG-ACATCTTGGCG-CATAGAACTC-CCAAATTAAAAATG-A--GTCATA----CTG-----ACG--------------------GTCA-CGTTATT-------TGAGGTGTCTCAATGTCCATCAGCA-----------ATCTACACTAAATCCCCGTATTAGGACCAT-CTCTGTAATAAAATT--------TTCACTTTGTTTGATGATCACTGTTTTTTTTG--TA-ATAATGTTGCCATCCC-TATATTCGGTATTAGGACCGCTTTTACAACGACGG-AATATTGCATCTTCCTTTAATTTAACTCCGGAAACTAG---ACCATCAGTTGATCCCGTTATT--T--T--TT--TTCACTTCT-CTT-----ATTT---------TCAGGTGAAGGTTA---------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGGCGTTTATAAAGTATGTACAAG----GGGGTCTTTATTGAT-------TAGGTGGC-GTTGTTAT
gi|13 : a-AAACGGGTTTG-ACATCTTGACA-CATTGAATTC-CCGAATTAAAAATGGATAGTCACAAGGACTTTC---ACGCTATTTGCTAGACCCTAAACGCCATCGTTATTATAATTATACAGTGTCTAAATGTCCATCAGTACTGTTGTTTAAATCTGCACTAAAACCCCGTATTAGGACCAT-CTCTATAATAAAATTCTGA-ATTTTCCTTTTATTTAATAATCA---TTTAGCTTA-GTA-ACAATATTGCCACCCC-TA-----GGTATTAGGACCGTTTGTACAACGGCGG-AATAGTGTA--------------AACTCCGGAAACTTA---ACCACCACTTGATCCCGTCATTTTT--T--TT--TTTACTTCT-C-T------CTT---------T----------TT----------TT---------------CAGGT-----------------
gi|14 : TGGCG-TATAGAACTCTCCAAAATAAAAATG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGT----------------AACGCCGTCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCAGCATTAGGACCAT-CTCTATAATTAAATTTGGATTTTTTCCTTTTGTTTAATGGTCA---TTTTG----------------TGTCATCCC-TATATTCCGTATTATGACCGTGTGTACTACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATATAACTATGGCAATTGG---ACCACCAGTTGATATCGTCA----TTCT--TT--TTCACTTCT-C-T------TTT---------T----------TT----------CTGATGAAGGTTATTAACAAAT-----------------CATT-GGGCGTTTgaagaatattaacaagccgg
gi|15 : TTAATGATGAATATAATGATAATGAAGTCAACAGC-AAGGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTTTGGAAAAAGTGTCATATGTTGTACTAGTTCTATAAATAGTCTTA----ATAATGAAGTCGATATA----TCCTAAT-----CG-----GAGATCTCTTTTCC--GGAT----TATGGGGCATATTGACG-CATAGA-----------------------------------GGAGCT--ATATGCGtttaa
gi|15 : aTT-GAC-GCATAGAGGAGCTA----------TATG-CGTC--AA-ATAT----ACAC-AACAACTTTA-AAACGGGTCTG-ACATCTTGACG-CATGGAGCTC-CCtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctgacatcttgacgcatggagctcccctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcataTGTGAGACCGCATAGA---------GCATAGAGCTTT-CCGA-----TT-AACTAACTGT---------ATTCGTCGATTATAAAACCGCACAGAACTCTC-TACGGCGGAGGGGAGCTC----------CATG-CGTC--AAGATGT-----CAG-ACCCGTTTTA-AAGTTGTTGTGTATAT-TTGACG-CATATAGCTC-Cctccgccgtagagagttctgtgcggttttataatcgacgaatacagttagttaatcggaaagctctatgctctatgcggtctcaca
gi|15 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaGACATCTTGACG-CATGGAGC---T-C-C----CCTCCG--CCGTAG-------AGAGTT--CTGTGCGGTTTTATA------A--T-CGACGAATACAGT-T---------------A------GTTAATCG---GAAAGCTCTATGC
gi|16 : attaatgatgaatataatgataatgaagtcaacagcaaggatgattgttatcgttgttgttttggaaaaagtgtcatatgttgtactagttctataaatagtcttaataatgaagtcgatatatcctaatcggagatctcttttccggattatggggcatattgacgcatagaggagctatatgcgtcaaatatacacaacaactttaaaacgggtctGTTGTTTTGAATTTCATCCTTCATAAAG-TAAC-AAC-GTATATTGT-ATATTTAACGAATGTAGTCACtctatgcggtctcaca
gi|16 : TG--TTATC---G-TTGTT---TTTGTGGAAGAAGTGGCAGTTGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTTTTAATTGGTATTAATGTCGATATA----TCCAAAT-----CG-----AAGAGCTTTGTGCT--GTTT----TATA------ATCGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttatcgttgtttttgtggaagaagtggcagttgttgtactagttctctaaatagttttaattggtattaatgtcgatatatccaaatcgaagagctttgtgctgttttataatcgacgcatagagctccc
gi|17 : gttgttttgaatttcatccttcataaagtaacaacgtatattgtatatttaacgaatgtagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCGGGACCACATAGAGCTCCTTACCC-TAG--C-TC-CCCG-----AGTAGAT--T--T---------ATGCGT------TAC----GT--------CCT-GAC-GCATAGAG---ATC----------
gi|17 : -----CG-----AGTAGATTTATGCG-----T----TACG-----TCCTGACG-CATAGAGA---T-C-C-------------CG--G-------GGAGCC--CATTGTG---TTA-A------GCCT-CGGTGTATAGAGC-T---------------C------C-----CG---A-----TCTATGCGccggggagcccattgtgttaagcctcggtgtatagagctcccgatctatgcgtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|17 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctcccTCCTGACGCATAGAGA-TC-CCGG-----GG-AGCC--C--A---------TTGTGT------TAA----GC--------CTC-GGT-GTATAGAG---CTCCCGATC----TATG-CGTC--AA-ATAT----GCTTTAT-AACTTTATAAATGGATCTG-ACATTTTGACG-CCTAGAGCTC-CCGAATTAAAAACG-ATAGTCATACTGACTGTC---ACGTTATTTGTTAGACCCTAAACGCCATCATCATTATAATTATGCAGTGTCTAAATGTCTATTAACACCGTTGTT----TCTACACTATAACCCTGCATAAGGACtcaaatatgctttataactttataaatggatctgacattttgacgcctagagctcccgaattaaaaacgatagtcatactgactgtcacgttatttgttagaccctaaacgccatcatcattataattatgcagtgtctaaatgtctattaacaccgttgtttctacactataaccctgcataaggac
gi|18 : tgcgggaccacatagagctccttaccctagctccccgagtagatttatgcgttacgGTGAGACCGCATAGAGCTCCTGACGCATTAAGC-TCACCAA-----TA-AGCT--C--T---------ATGCAT------TGC----GT--------C-C-GAC-GCATCGAG---CTC----------
gi|18 : GAGCTCTATTCG----------T-CGAGGCCTA---ATG-CATAGGGC---T-C-C----C----C---CG--G---------AGCT--CGATGCG---TCGGA------C--G-CAATGCATAGAGC-TTATTGGTGAGCTTAAT------G-----CGTC-AGGAGCTCTATGCGGTCTcgggggagccctatgcattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgTGACG-CATTAAGC---T-C-A----C--------CA--A-------TAAGCT--CTATGCA---TTGCG------T--C-CGACGCATCGAGC-T---------------C------C-----GG---GGGAGCCCTATGCccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|18 : gtgagaccgcatagagctccAATA-AGCTCTATG------CATTGCG-TCC-GACGCATCGAGC-TC-CGGG-----GG-AGCC--C--T---------ATGCAT------TAG----GC--------CTC-GAC-GAATAGAG---CTCCCAGGAGCTTTATA-CGTC--CA-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AATTGTGTCTG-ACATCTTGACG-CAAAGAGATC-CTGAATTAAAAATG-ATAGTCATACTGGCAGTC---ACGTTATTTGCTAGACACTTAACGCCATCATTAATACAATTATGTAGTGTCTAAATGTCCATCAGCATTATTGTTTAAATCTTCACTAAAAattaggcctcgacgaatagagctcccaggagctttatacgtccaatatacacatcaactttaaattgtgtctgacatcttgacgcaaagagatcctgaattaaaaatgatagtcatactggcagtcacgttatttgctagacacttaacgccatcattaatacaattatgtagtgtctaaatgtccatcagcattattgtttaaatcttcactaaaa
gi|2 : gtgagaccgcatagagctcctgacgcattaagctcaccGCTCTGTGAGACCACATAGAGGTCCT-------------TC-CT-------------------T---------ACGTAT--------A----GC--------CTC-GAC-GTAAAGAG---CTC----------TATG-CGTC--AA-CTTT----ACAC-ATCAACTTTA-AAACTTGTCTG-ACGTCTTAACG-CATAGAACGC-C
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcAACGCCATCATTGTTATAACTACGCAGTGTCTAAATTTCCA------CT-TTGTTTAAATCTACACTAAAATCCCGCATTACG-TCATTCTCTATATTAAAATTCGAA-TTTT-CCTTTTGTTTTATAATCA---TTTTGTTTA-ATT-ATAATATTGCCACCCGGTA-ATCTGGTATTAGGACCGCTTGTACGACGATGG-AGTGGTGTATTTTCTTTTAATTTAACTCCGGAAAATGG---ACCACAAGTTGATCCTGTCA----T--T--CG--TTTACTTTT-T-TCTTATATTCAGGTGAAGGT----------TA----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATTTGGGCGTTTATAAAATGTATACAAG----GGGGT-TTTGTCAAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACTTCAATGTCATTTTGTTTGTCCCGTGTAAGAAATAGA--TGGT-AAAGA-TTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATATATTT---GTGAAAGGAGAATTTATTTA--TTATTATAAATTACCTTCATTCAATTATACACTATAGTTGCATTGTTCAATCATTGAAAGA----CGTGTTGTTTTGAATTTCATCCTTCATAAAG-TAGT-ATT-TTATATTGC-ATTTTTTAAGAATAAAGTCACTGTTAATGGAGAAAatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|2 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatag--TTATA---G-TTGTT---GGTATGGAACAAGTGGTAGATGTTGCACTAGTTCTCTAAATAGTCTTAGTTGATTTTGAAGTTGATATA----TCCAAAT-----CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----CGTGTGGCATATTGACG-CGTAGAGCA--C-C-C----C----GTTGTC--G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTAATA------A--T-CGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttatagttgttggtatggaacaagtggtagatgttgcactagttctctaaatagtcttagttgattttgaagttgatatatccaaatcgaagagctctatgtgggatcgtgtggcatattgacgcgtagagcaccccgttgtcgggagctctatgcggtttaataatcg
gi|20 : cagttaagtgattaattttgtttgtagctaggcgcgctctgtgagaccacatagaggtccttccttacgtatagcctcgacgtaaagagctctatgcgtcaactttacacatcaactttaaaacttgtctgacgtcttaacgcatagaacgccatcattgttataactacgcagtgtctaaatttccactttgtttaaatctacactaaaatcccgcattacgtcattctctatattaaaattcgaattttccttttgttttataatcattttgtttaattataatattgccacccggtaatctggtattaggaccgcttgtacgacgatggagtggtgtattttcttttaatttaactccggaaaatggaccacaagttgatcctgtcattcgtttacttttttcttatattcaggtgaaggttattaacaagtcatttgggcgtttataaaatgtatacaagggggttttgtcaattaggtgttaattgttattcagcatctcggttacttcaatgtcattttgtttgtcccgtgtaagaaatagatggtaaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatatatttgtgaaaggagaatttatttattattataaattaccttcattcaattatacactatagttgcattgttcaatcattgaaagacgtgttgttttgaatttcatccttcataaagtagtattttatattgcattttttaagaataaagtcactgttaatggagaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcAATAAAGTCTACGACTCGTGATGTTTGGTTTA-C---G-TTGTT---GATGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTTTATATATATTGAAGTCAATATA----TCCAAA------CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----TATGGGGCATCCCGA-----------------------C----G--GCG--G-------GACGCT--CTATGAGGTTTTATA------A--T-C------------------------------------------------GGAGCTTTATGCGGTCT
gi|21 : TCTG-ACATATTGACGTCA-AGAACTC-CCGGATTAAAGATA-ATAGTTATACCGACTGTC---ACGTTATTTGCTAGACCGTAAACACAAACATTTTTATAATTATGCAATGTCTAAATGTCCATCCGCACTGTTGTTTAAATCTACACTAAAACCCCGCATTAGGACCAT-ACATGTAAT--AGTT-----TCCCCCCTTTTATTTAATAATcacccggc
gi|22 : GGTAGATGCTGTACTAGTTCTCTAAATAGTCTCAAATAATACTGAAGTCGATATA----TCCGAAT-----CG-----AAGAGCTCTATGCG--GGAT----TATGGGGCATACTG-CGTCAGA-AGCGCGT-C-T----A----T--GCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGTTTCA
gi|23 : TTAACG-CATAGGGC---TAC-C----C----G--G-------------GATCT--TTATACG---TAAGA------A--CGCAACGCATAGAGA-T---------------CA-----G-----CG---AGGAGATCTATGCG
gi|23 : aGATCTCTATGCG-----T----T-----GCGTTCTTACG-TATAAAGA---T-C-C-------------CG--G-------GTAGCC--CTATGCG---TTA-A------GCCT-CGACGAAAAGGGC-T---------------C------gcctcgacgaaaagggctctatgcgtcgaa
gi|23 : acgcatagatctcctcgctTTCTTACGTATAAAGA-TC-CCGG-----GT-AGCC--C--T---------ATGCGT------TAA----GC--------CTC-GAC-GAAAAGGG---CTC----------TATG-CGTC--GA-Atatgcgtcgaa
gi|24 : acgcatagatctcctcgctgatctctatgcgttgcgATAGAGCTC-ATGA--CTG-ATAGAGCTTCTGACGCACAGA
gi|24 : TGTGAGACCGTATAGAGCTCATGACTGATAGAGC-TT-CTGacggtctcacactgcctatattgaaac
gi|26 : tctgtgcgtG-CCTC--GG-ATAT----ACAC-ATCAACTTTA-AAATGGG--------TCTTGGCG-CATctgcctatattgaaac
gi|27 : --G-------GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGATGCA
gi|3 : CTGTTATTTAAAGCAACACCAAAACCCCGCATTAGGACAAT-CGCTATAATAAAATTCGGA-TTTTCCCTTTCATTTAATGATTA---TTTTGTTTA-ATA-ATAATATTGCCACCCC-TATATTCAGTATAAGGACCGCTTGTACGACGATGG-ATTAGTGTATTTTCTTTTAATTTTACTCCGGAAATTGGCGGACTACCAGTTGATCTAGTTA----T--TCTTT--TTCACTTCT-G-T--------T---------T----------TT----------TT---------------CAGGTGAAGGTTATCAACAAATCATT-GAGCGTTTATAAAGTGTGTACAAT----GGGGTTTATGTTGAT-------TAGGTATTAGTTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTAGTTTGTCCCATGTAAGAAAAAAA--TGAT-AAAGA-TTA-AATATGTTTCATGTTTGCAATGTATCA---GTGAAAGAAGAATTAATTTAT-TTTTTATTAATTAACATCATTCAATTATACACTATAGTTGCATT-TTTAATCATTGAAAGA----GGTGTTGTTATGAATTGCGTCCTTAATAAAG-TAAC-ACT-TGATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAATCACTGTTGGTGGAAAAA---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCGACAGC-AATGATGACTG--TTATC-------------GTTGTGGAAGAAGTTGTAGATGTTGTACTAGTTTTCTAAATAAT-TTAATTAATACTGAAATCGA-ATGCGGTTTTATAT------------AGGAGCTCTATGCG--GGAT----TATGGGGCATATTGACG-CATAGATC---T-CTC----C----G--CCGTCA-------GGAGCT--CTATGCGGGATTATGGGGCATA--T-TGGCGCATAGATC-T---------------CTCT---G-----CGGTCGGGAGCTCTATG
gi|4 : TGTTTGTATATATAG-ATTGCCGTCCC-TATATTCGGTATTATGACCTATTGTACAGCGACGG-ATTTGTGTATTTTCTTTAAATTTAACTCCGGACAGTGG---ACCACTAGTTGATCCCGTCA----T--TCTTT--TTCACTTCT---------ATTT---------T----------TTCAGGTAAATGTT---------------AATGT-----------------CATT-GGTCGTTTATAAAGTGTG------------GGTCTTTGTTGAT-------TAGGTGTCAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATAAGTGTCATTATATGTGTCCCATGTAATAAATAGA--TGAT-GAATA-TTA-AACATGTTTCATGTGTTAAATATATTATAAGAGGAAGAAGAATTCATTT------TTATAAATGAACATTATTCAATTAT---------------TGTTTAATTATTGAAAGA----GGTGTTGTTTAGAATTCCATCCTGCATAAAG-TAAC-AGT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTGGTCACTGTAAATGGAGAAAAATGATAACGAATCTAATGATGA----TGATTGTGATACTGTGAAAATGATAATGA----G---AATTTT---AAAGACAATGTTAAAGATAAAGATAATGATAATAAAATCGACAGC-AATGATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGTGGAAGAAGTAGTAGATGTTGTATTAGTTTTCTAAAATGTCTTAATTTATGTTGAAGTCG----------C----T-----CG-----A----CTTCAT-------AT------CGGCGCAT-----------AGAGCT--T-T-C----C----GCCGCC--A-------GGAGCT--CTGTGTGGTTTTATA------A--T-CGA-----AGAGC-T---------------C------tc
gi|4 : g-----CG-----GAGAGCTCTATGCG--TCAA----TATGCCCCATAATCCCA-CATAGAGC---T-C--------------------------------------TTCGATTATAAA------A--C----CACACAGAGC-T---------------CCTGGCGG-----CG---GAAAGCTCTATGCGtatgtgggattatggggcatattgacgcatagagctctccgccgccggaatttctacgcgtttttataatcgaagctctatgcggtctcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|4 : gtgtttgtatatatagattgccgtccctatattcggtattatgacctattgtacagcgacggatttgtgtattttctttaaatttaactccggacagtggaccactagttgatcccgtcattctttttcacttctattttttcaggtaaatgttaatgtcattggtcgtttataaagtgtgggtctttgttgattaggtgtcaattgttattcagcatctcggttacataagtgtcattatatgtgtcccatgtaataaatagatgatgaatattaaacatgtttcatgtgttaaatatattataagaggaagaagaattcatttttataaatgaacattattcaattattgtttaattattgaaagaggtgttgtttagaattccatcctgcataaagtaacagtttatattgtatatttcaagaatttggtcactgtaaatggagaaaaatgataacgaatctaatgatgatgattgtgatactgtgaaaatgataatgagaattttaaagacaatgttaaagataaagataatgataataaaatcgacagcaatgatgattgttatcgttgttgttgtggaagaagtagtagatgttgtattagttttctaaaatgtcttaatttatgttgaagtcgctcgacttcatatcggAAT-----CG-----AAGAGCTCTATGTG--GGAT----TATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-CTC----C----GCCGCC--G-------GAATTT--CTACGCGTTTTTATA------A--T-CGA------------------------------------------------AGCTCTATGCGGTCTccgccggaatttctacgcgtttttataatcgaagctctatgcggtctcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|5 : gtgtttgtatatatagattgccgtccctatattcggtattatgacctattgtacagcgacggatttgtgtattttctttaaatttaactccggacagtggaccactagttgatcccgtcattctttttcacttctattttttcaggtaaatgttaatgtcattggtcgtttataaagtgtgggtctttgttgattaggtgtcaattgttattcagcatctcggttacataagtgtcattatatgtgtcccatgtaataaatagatgatgaatattaaacatgtttcatgtgttaaatatattataagaggaagaagaattcatttttataaatgaacattattcaattattgtttaattattgaaagaggtgttgtttagaattccatcctgcataaagtaacagtttatattgtatatttcaagaatttggtcactgtaaatggagaaaaatgataacgaatctaatgatgatgattgtgatactgtgaaaatgataatgagaattttaaagacaatgttaaagataaagataatgataataaaatcgacagcaatgatgattgttatcgttgttgttgtggaagaagtagtagatgttgtattagttttctaaaatgtcttaatttatgttgaagtcgctcgacttcatatcggcgcatagagctttccgccgccaggagctctgtgtggttttat-CTCTGTAATCAATGTCGGA-CTTTCCATTTTGTTTAATGATTA---TTTTGTTTT-ATA-ATACTATTGCCACTCC-TTAATTCGATATTAGAACCGCTTGTACAACGACGG-AAAAAAGTATTATCTTTTAATT-AACTCCGTAAATTGG---GGTACCAGTTGATCTCCTCA----T--T--TT--TT----TCT-C-T------TTT---------T----------TTCTGG------TT---------------AAGGTTATTAACACGA------CATT-GAACGTTTATAAAATGTATACAAG----GAGGTCTTTGTTGAT-------TAGGTTTCAATTGTTATTCAGCATCTCAGTTACATCAGCGTCATTTTGTTTGTCCCATATAAGAAATAGA--TGAT-TAAGATTTATAATATGTTTTATGTGTGCAATGTACTA---GTGAAAGAAAAAATCATTTATTTTTTTATAAAGTAACATAATTCA---------------------GTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTTG------------TCCTTCAAAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ACATTTCAAGAATTAAGTTACTGTTAATGGAGAAAA-TCATGATCAATATAGTGATTAATTGTGATTTTGAT--GATGATGACGATGTTAA----TGCAGATGGT---GATGACAATGTTGAAGATAAAGACAATGCTAATGCAATCGAGAGT-AATGATGATTG--TTATCGTTG-TTGTT---GTTGTGGGAGAAGTGGTATATTTTGTATTAGTTC---------TCTTAATTGATATTAAAGTCAATATA----TCCAAAT-----TG-----AAAAACCCTATcacacggctagtacatttaacaacagttaataacaattggatacaacttaccaacacgtgtatgaactatttaatttgatatt
gi|6 : ---------T----------TT----------TTAA-------------CAAGT-----------------CATT-GGACGTTTATTAAGTGTAAACAAA----GGGGTCTTTGTTGAT-------TTGGTGTTAATTTTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGTAAGAAATAGA--TGAG-AGAGA-TTA-ATTATGCTTCATGTGTTCACTGTATTA---GTGAAATAATAATTCAACTA--TTTTTATAAACTAACATTATTCAATTATGCACTATATTTCCATTGTATAAACATTGAACGA----GGTGCTGTTTTTAATTTCATCCTTCATAAAG-TAAC-TTT-TTCCATTCT-ATATTTCAAGAATTTAGTAGTTATCAATAAAGAA----------------AATGATGA----TGATACTGATA-----ATAATGAT--TG--------------T---GAAGACAATGTTAAAGATGAAGATAATGATAACGAAATTGACAGC-AA--ATGATTG--TTATC---G-TTGTT---GTTGCGGAAGAAGTGGTAGATTGTGTACTAGTT-TTTAAA-AGTATTAATGAATACTGAAGTCGATATA----TCCAAATATCCCCGCCGTCAGGAGCTCCATGCGTCAGATGCTCTATGCGTCA----GGGGTCA-AGGGC---T-C-TATG-C----G--TCA--G-------GG-GCT--CTATGCG
gi|6 : tctttttttcaggtgaatgATAAAGCTGTGTTATACTGTACAGAGCCCCTGACGCATAGAGC-CC-CTGACGCATAG-AGCC--C--TTGACCCCTGACGCAT------AGA----GC--------ATCTGAC-GCATGGAG---CTC----------C-TGACGGCGGGG-ATATTTGGATAT-ATCGACTTCA-tcaggggctctgtacagtataacacagctttatcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|7 : tctttttttcaggtgaatgtttttaacaagtcattggacgtttattaagtgtaaacaaaggggtctttgttgatttggtgttaatttttattcagcatctcggttacatcagtgtcattttgtttgtcccatgtaagaaatagatgagagagattaattatgcttcatgtgttcactgtattagtgaaataataattcaactatttttataaactaacattattcaattatgcactatatttccattgtataaacattgaacgaggtgctgtttttaatttcatccttcataaagtaactttttccattctatatttcaagaatttagtagttatcaataaagaaaatgatgatgatactgataataatgattgtgaagacaatgttaaagatgaagataatgataacgaaattgacagcaaatgattgttatcgttgttgttgcggaagaagtggtagattgtgtactagtttttaaaagtattaatgaatacAGTGTCTAAATGTCCATCAGCACTGTTGTTTACATCTACACTAAAACCACGCATTAGGGCCAC-CTCTATAAAAAAATTCGGA-TTTTTCCTTTTGTGAAATGACCA---TTTTGATTA-ATA-ATAATATTGCCACCAC-TATATTCGGTATTAGAACCGCTTGTAAAACGACGG-ATTAGTGTATTTTCTTTT-ATTTAACTCCGGAAATGGG---GCCACCATTTGATCCCGTCA----T--T--CTTATTCACTTCCGT-T-----ATTT---------T----------TA----------TT---------------CAGG---------------------T-GAAGGTT-----AGTA---ACAAGTCACTGGGCGTTTGTTGAT-------TAGGTGTTAATTGTTATTCAGCATCTCGGTTACATCAGTGTCATTTTGTTTGTCCCATGAAAGAAATAGA--TAAT-AAAGA-TTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTATCA---GTGAAAG--GCATT--TTT---TTTTTATAAATTAACATCATTCAGTTATACACCATAGTTGCATTGTTTAATCATTTTAAGT----G--GTTGTGTTTAA-TTCA------ATAATGATGATGATTGTGATACTGTGATACT----GA---TGGTGA----TAAT---GAAAA-CAATGTTAAAGATAAAGATAA----TGA-AATCAT-CAGCAATGATGATTGTTATCGTT---GCTGTTGTGGAAGA-AGTGGTAAAcatattcaagaaacgctcactcaatacaaataatatcaac
gi|8 : ---------------CACGT-----------------CATT-GGATGTTTATAAAGAGTGTACAAG----GGGATCTTTGTTGATAAGTAATTAGGTGTTAATTGTTATTCAGTATCTCGGTTGCATCAGTGT-ATTTTGTTTATCCTATGTAAGAAATAGA--TGAT-AAAGA-TTA-AATATGTTTCATGTGTGCAATGTGTTA---GTGAAAGA-------ATTT---TTTTTATTAACTAtgttgctctaaattgtcttaattaatatagaagccg
gi|8 : cttttgaggtgaaggtcattaaATCGCTGGAAGA----GGTGTT---TTGAATTTCATCCTTCATAAAG-TAAC-ATT-TTATATTGT-ATATTTCAAGAATTTAGTCACNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNT---A-TCGTTGTTGTTGTGGAAGAAGTGGTAGATGTTGTATTAGTTCTCTAAATAGTCTT-ATTAATATTGAAGTCGATA-A----TCTAAAT-----CG-----AAGAGCTCTATGCT--GGAT----TATGGGGCATATTGACG-CATAGAGC---T-C-C----C----C--GCC--GTCT----GGAGCT--CTATGCGGTTTTATA------A--T-CGACGCtcgctggaagaggtgttttgaatttcatccttcataaagtaacattttatattgtatatttcaagaatttagtcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgttgttgttgtggaagaagtggtagatgttgtattagttctctaaatagtcttattaatattgaagtcgataatctaaatcgaagagctctatgctggattatggggcatattgacgcatagagctccccgccgtctggagctctatgcggttttataatcgacgc
gi|9 : cttttgaggtgaaggtcattaacacgtcattggatgtttataaagagtgtacaaggggatctttgttgataagtaattaggtgttaattgttattcagtatctcggttgcatcagtgtattttgtttatcctatgtaagaaatagatgataaagattaaatatgtttcatgtgtgcaatgtgttagtgaaagaattttttttattaactAAATAGAGATGAT-AAAGA-TTA-AATTTGTTTTATGTGTGCAATATGTTA---GTGAATGAAGAATTCATTTA--TTTTTATAAATTAACATCATTTAAGTATACACTATAGTTGCATTTTTTAATCATTGAAAGA----GGTGTTGT------------CCTTCACGAAG-TAAC-ATT-TTTTATCGT-ATAGTTCAAGAATTTAGTCAC
gi|9 : aCTAGTTCTCTAAATAGTCTAAATTCATATTGAAATCGATATA----TCCAAAT-----CG-----AAGAGCTCTATACG--GGAT----TATGGGGCATAATGACG-TATAGAGC---A-C-CCTGTC----G--TCG--GAAGTCCAGCAGCT--CTTTGCGGTCTCACA------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctagttctctaaatagtctaaattcatattgaaatcgatatatccaaatcgaagagctctatacgggattatggggcataatgacgtatagagcaccctgtcgtcggaagtccagcagctctttgcggtctcacat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATTTTCCAATAACGCCGAAAACGGTATCACACGAAAATTACATTCGATTATATTGAAACTATTGCATTTTATACTAAATACATTGGAATACATTGAATTATACATTTAATTTCTGATTTTTTACAATTAATCACATATTCCTGATGAAAACGAAGTTTTTGCAATTCCACTAGTGTTCGTTATTAAATACGAGTATCAATAACAAC
Unaligned ( gi|25 ): CGTGCAACACACACATAACGCTAGAGAGTATTGTGAGACCGTATGGAGCA